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G T 79.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;DP=31;Dels=0.00;FS=5.473;HaplotypeScore=27.6616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.77;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=2.55;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-6.550e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:48:109,0,48 chrI 893 . T A 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.054;DP=34;Dels=0.00;FS=2.189;HaplotypeScore=33.6125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.017;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:71:71,0,153 chrI 899 . C T 67.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;DP=32;Dels=0.00;FS=4.715;HaplotypeScore=43.1488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.38;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.564;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:97:97,0,143 chrI 900 . A G 74.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;DP=31;Dels=0.00;FS=9.098;HaplotypeScore=41.1621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.18;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-6.302e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:31:77:104,0,77 chrI 904 . G A 317 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.4651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.12;MQ0=0;QD=9.61;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:39:350,39,0 chrI 907 . A T 168.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;DP=36;Dels=0.00;FS=9.259;HaplotypeScore=24.3112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.75;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:87:198,0,87 chrI 925 . T C 330 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=0;QD=8.68;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:42:363,42,0 chrI 929 . A C 178.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.658;DP=38;Dels=0.00;FS=9.889;HaplotypeScore=10.6095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.32;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-6.515e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:84:208,0,84 chrI 937 . C T 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.648;DP=54;Dels=0.00;FS=10.209;HaplotypeScore=10.6095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.81;MQ0=0;MQRankSum=1.984;QD=1.11;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:90:90,0,387 chrI 956 . C T 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.765;DP=51;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=14.7357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=0.45;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:53:53,0,437 chrI 961 . A T 309.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.431;DP=65;Dels=0.00;FS=7.249;HaplotypeScore=42.1712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=4.75;ReadPosRankSum=-3.268;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:65:99:339,0,446 chrI 968 . C T 792.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.156;DP=81;Dels=0.00;FS=2.934;HaplotypeScore=49.1571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.44;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=9.78;ReadPosRankSum=-3.283;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,55:81:99:822,0,232 chrI 970 . G A 121.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.333;DP=81;Dels=0.00;FS=12.282;HaplotypeScore=57.7353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.44;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.381;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:151,0,916 chrI 980 . A G 375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.209;DP=77;Dels=0.00;FS=5.356;HaplotypeScore=18.6461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=4.87;ReadPosRankSum=4.030;SB=-4.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,38:77:99:405,0,535 chrI 981 . A C 529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=79;Dels=0.00;FS=7.076;HaplotypeScore=5.7685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=6.70;ReadPosRankSum=3.721;SB=-3.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:559,0,544 chrI 993 . T G 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.128;DP=99;Dels=0.00;FS=12.782;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.61;MQ0=2;MQRankSum=-0.094;QD=0.37;ReadPosRankSum=0.576;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,22:99:67:67,0,1023 chrI 1008 . A G 319.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.740;DP=107;Dels=0.00;FS=5.826;HaplotypeScore=20.2929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.23;MQ0=4;MQRankSum=-1.495;QD=2.98;ReadPosRankSum=-3.612;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,36:107:99:349,0,998 chrI 1012 . C T 324.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.633;DP=118;Dels=0.00;FS=5.286;HaplotypeScore=23.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.43;MQ0=4;MQRankSum=-1.309;QD=2.75;ReadPosRankSum=-4.491;SB=-7.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,38:118:99:354,0,1024 chrI 1025 . C T 1048.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.729;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.38;MQ0=6;MQRankSum=0.849;QD=7.65;ReadPosRankSum=5.905;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1078,0,704 chrI 1035 . A T 1202.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;DP=147;Dels=0.00;FS=4.057;HaplotypeScore=21.3030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.02;MQ0=6;MQRankSum=-0.515;QD=8.18;ReadPosRankSum=3.464;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,87:147:99:1232,0,872 chrI 1042 . T C 766.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;DP=153;Dels=0.00;FS=2.974;HaplotypeScore=26.4869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.29;MQ0=6;MQRankSum=1.326;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,63:153:99:796,0,1325 chrI 1065 . A T 1319.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.959;DP=169;Dels=0.00;FS=1.238;HaplotypeScore=24.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.91;MQ0=6;MQRankSum=1.595;QD=7.80;ReadPosRankSum=3.896;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,83:169:99:1349,0,1169 chrI 1074 . C A 835.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;DP=176;Dels=0.00;FS=2.882;HaplotypeScore=26.1784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.07;MQ0=6;MQRankSum=1.179;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.333;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,58:176:99:865,0,1777 chrI 1101 . G A 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.718;DP=182;Dels=0.00;FS=4.796;HaplotypeScore=2.9361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.73;MQ0=2;MQRankSum=-1.662;QD=4.42;ReadPosRankSum=3.586;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,57:182:99:834,0,2310 chrI 1209 . A T 134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.883;DP=110;Dels=0.00;FS=7.508;HaplotypeScore=19.4258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.79;MQ0=1;MQRankSum=-0.076;QD=1.22;ReadPosRankSum=-1.788;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,16:110:99:164,0,1173 chrI 1223 . G T 600.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.358;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.6269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.91;MQ0=2;MQRankSum=1.286;QD=6.59;ReadPosRankSum=-1.428;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,53:91:99:630,0,439 chrI 1224 . A G 559.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.523;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.6269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.74;MQ0=3;MQRankSum=1.078;QD=6.08;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:589,0,475 chrI 1235 . C T 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.036;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.4545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.57;MQ0=4;MQRankSum=0.323;QD=0.78;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,7:72:86:86,0,695 chrI 1238 . C T 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;DP=73;Dels=0.00;FS=2.842;HaplotypeScore=18.4545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.70;MQ0=5;MQRankSum=0.624;QD=1.00;ReadPosRankSum=1.232;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:103,0,679 chrI 1255 . T C 207.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.712;DP=52;Dels=0.00;FS=15.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.54;MQ0=8;MQRankSum=0.790;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:237,0,315 chrI 1260 . T G 152.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.001;DP=45;Dels=0.00;FS=22.515;HaplotypeScore=4.7241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.78;MQ0=8;MQRankSum=0.107;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:182,0,276 chrI 1263 . C T 398 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7241;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.86;MQ0=9;QD=10.47;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:48:431,48,0 chrI 1279 . C T 323.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.067;DP=65;Dels=0.00;FS=28.203;HaplotypeScore=8.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.96;MQ0=9;MQRankSum=0.164;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.082;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:353,0,236 chrI 1309 . C T 191.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.047;DP=76;Dels=0.00;FS=47.396;HaplotypeScore=2.8799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.71;MQ0=9;MQRankSum=-0.687;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.137;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:221,0,546 chrI 1312 . A G 211.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.738;DP=75;Dels=0.00;FS=48.309;HaplotypeScore=27.8569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.67;MQ0=9;MQRankSum=-0.713;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.273;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:241,0,488 chrI 1320 . G C 239.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;DP=83;Dels=0.00;FS=52.096;HaplotypeScore=45.5319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.88;MQ0=8;MQRankSum=-0.449;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.935;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:269,0,597 chrI 1321 . C T 287.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.689;DP=83;Dels=0.00;FS=4.358;HaplotypeScore=43.5989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.88;MQ0=8;MQRankSum=1.976;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.171;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:83:99:317,0,267 chrI 1329 . G A 132.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.028;DP=83;Dels=0.00;FS=5.106;HaplotypeScore=44.5567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.92;MQ0=7;MQRankSum=0.731;QD=1.59;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,13:83:99:162,0,721 chrI 1334 . C A,T 906.01 SnpCluster;filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=22.88;MQ0=7;QD=11.92;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,24,52:76:99:966,697,664,269,0,182 chrI 1335 . T A 143.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.648;DP=76;Dels=0.00;FS=32.263;HaplotypeScore=13.7424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.92;MQ0=6;MQRankSum=-1.788;QD=1.88;ReadPosRankSum=2.394;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:173,0,668 chrI 1337 . G A 154.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.205;DP=76;Dels=0.00;FS=32.263;HaplotypeScore=13.7424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.92;MQ0=6;MQRankSum=-1.899;QD=2.03;ReadPosRankSum=1.404;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:184,0,647 chrI 1352 . A G 474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.531;DP=79;Dels=0.00;FS=13.340;HaplotypeScore=10.2604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.71;MQ0=2;MQRankSum=3.258;QD=6.00;ReadPosRankSum=4.658;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:504,0,282 chrI 1364 . T C 547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.617;DP=82;Dels=0.00;FS=33.014;HaplotypeScore=9.9521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.15;MQ0=1;MQRankSum=1.841;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.139;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,49:82:99:577,0,215 chrI 1370 . A T 138.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.231;DP=82;Dels=0.00;FS=25.728;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.15;MQ0=1;MQRankSum=-1.338;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,32:82:99:168,0,586 chrI 1377 . G A 443.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.026;DP=57;Dels=0.00;FS=7.908;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.56;MQ0=1;MQRankSum=2.167;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.605;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:29:473,0,29 chrI 1379 . T C 585 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.65;MQ0=1;QD=10.45;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:72:618,72,0 chrI 1382 . G A 571 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.85;MQ0=0;QD=10.38;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:69:604,69,0 chrI 1408 . C T 186.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.829;DP=40;Dels=0.00;FS=5.593;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.15;MQ0=2;MQRankSum=1.226;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,25:40:3:216,3,0 chrI 1414 . C A 83.27 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;DP=31;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.77;MQ0=2;MQRankSum=1.820;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.206;SB=-1.293e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:9:113,0,9 chrI 1462 . G C 107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.049;DP=46;Dels=0.00;FS=2.821;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.464;QD=2.33;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:137,0,616 chrI 1470 . A G 577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.621;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.07;MQ0=0;MQRankSum=3.229;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.426;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,32:47:99:607,0,162 chrI 1483 . C A 1022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9179;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.64;MQ0=0;QD=20.86;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1055,120,0 chrI 1491 . C T 131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.471;DP=51;Dels=0.00;FS=1.121;HaplotypeScore=3.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.31;MQ0=0;MQRankSum=-3.177;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.497;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:161,0,616 chrI 1506 . T G 1094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.44;MQ0=0;QD=20.64;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1127,132,0 chrI 1518 . T C 1012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.10;MQ0=0;QD=19.46;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1045,129,0 chrI 1547 . G A 271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.07;MQ0=0;QD=10.04;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:36:304,36,0 chrI 1558 . G A 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.427;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.06;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=0.49;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:44:44,0,177 chrI 1562 . T C 94.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=3.24;ReadPosRankSum=1.688;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:92:124,0,92 chrI 1565 . A T 265 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.86;MQ0=0;QD=8.83;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:33:298,33,0 chrI 1568 . G A 59.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.704;DP=31;Dels=0.00;FS=2.783;HaplotypeScore=8.4980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.04;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.640;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:89:89,0,145 chrI 1570 . T C 59.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;DP=31;Dels=0.00;FS=2.783;HaplotypeScore=8.4345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.04;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.392;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:89:89,0,149 chrI 1589 . G T 200.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=53.1839;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.17;MQ0=0;QD=13.33;SB=-5.302e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:233,27,0 chrI 1590 . T C 198.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.17;MQ0=0;QD=13.20;SB=-5.302e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:231,27,0 chrI 1592 . T C 198.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=31.1795;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.17;MQ0=0;QD=13.20;SB=-5.302e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:231,27,0 chrI 1598 . A G 144.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.87;MQ0=0;QD=10.29;SB=-5.306e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:21:177,21,0 chrI 1599 . C G 173.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.87;MQ0=0;QD=12.36;SB=-5.203e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:24:206,24,0 chrI 1601 . A G 169.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.87;MQ0=0;QD=12.07;SB=-5.303e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:24:202,24,0 chrI 1609 . G A 235 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.36;MQ0=0;QD=9.79;SB=-5.402e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:30:268,30,0 chrI 1628 . C T 139.02 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.44;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-5.626e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:23:169,0,23 chrI 1632 . G A 122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.659;DP=28;Dels=0.00;FS=2.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.28;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.364;SB=-5.297e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:48:152,0,48 chrI 1707 . A G 420.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.966;DP=27;Dels=0.00;FS=31.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.52;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=15.57;ReadPosRankSum=3.090;SB=-6.134e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,22:27:14:453,14,0 chrI 1747 . T C 127.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.935;DP=17;Dels=0.00;FS=3.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.491;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:157,0,170 chrI 1757 . G A 255 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.70;MQ0=0;QD=21.25;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:33:288,33,0 chrI 1761 . A C 148.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.18;MQ0=0;QD=18.51;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:181,21,0 chrI 1885 . A G 78.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.083;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.21;MQ0=2;MQRankSum=-0.583;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:108,0,224 chrI 1889 . C T 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;DP=37;Dels=0.00;FS=1.908;HaplotypeScore=6.5153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.31;MQ0=3;MQRankSum=2.327;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.791;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,6:37:62:62,0,238 chrI 1918 . A G 484 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.01;MQ0=8;QD=9.68;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:60:517,60,0 chrI 1927 . G A 297.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.050;DP=58;Dels=0.00;FS=6.412;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.20;MQ0=9;MQRankSum=3.688;QD=5.12;ReadPosRankSum=2.080;SB=-1.198e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,28:58:99:327,0,152 chrI 2029 . T C 775 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.96;MQ0=10;QD=11.74;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:93:808,93,0 chrI 2068 . C A 296.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.609;DP=101;Dels=0.00;FS=15.277;HaplotypeScore=3.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.49;MQ0=10;MQRankSum=2.397;QD=2.93;ReadPosRankSum=1.399;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:326,0,674 chrI 2113 . A G 326.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.080;DP=132;Dels=0.00;FS=32.341;HaplotypeScore=3.9278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.39;MQ0=20;MQRankSum=4.170;QD=2.47;ReadPosRankSum=-1.556;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,24:132:99:356,0,804 chrI 2146 . G A 961 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.757;DP=100;Dels=0.00;FS=2.109;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.93;MQ0=21;MQRankSum=-1.424;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,97:100:76:994,76,0 chrI 2211 . G T 129.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;DP=53;Dels=0.00;FS=56.776;HaplotypeScore=29.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.75;MQ0=4;MQRankSum=-2.918;QD=2.43;ReadPosRankSum=-3.004;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:159,0,610 chrI 2214 . A G 124.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;DP=53;Dels=0.00;FS=56.776;HaplotypeScore=29.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.75;MQ0=4;MQRankSum=-2.788;QD=2.34;ReadPosRankSum=-3.004;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:154,0,614 chrI 2219 . A G 98.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;DP=48;Dels=0.00;FS=85.875;HaplotypeScore=31.9668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.51;MQ0=3;MQRankSum=-3.169;QD=2.04;ReadPosRankSum=-3.077;SB=1.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:48:99:128,0,464 chrI 2223 . T A 549.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.894;DP=48;Dels=0.00;FS=69.305;HaplotypeScore=32.0175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.36;MQ0=3;MQRankSum=3.318;QD=11.44;ReadPosRankSum=2.592;SB=-9.402e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:94:579,0,94 chrI 2225 . A C 402.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.894;DP=48;Dels=0.00;FS=77.768;HaplotypeScore=33.9488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.36;MQ0=3;MQRankSum=3.529;QD=8.38;ReadPosRankSum=3.301;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:432,0,232 chrI 2243 . C G 373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.287;DP=43;Dels=0.00;FS=78.912;HaplotypeScore=34.7866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.59;MQ0=1;MQRankSum=2.884;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:403,0,265 chrI 2253 . A G 199.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.563;DP=54;Dels=0.00;FS=76.395;HaplotypeScore=26.0191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=3.69;ReadPosRankSum=2.738;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:229,0,603 chrI 2256 . C T 198.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;DP=55;Dels=0.00;FS=79.648;HaplotypeScore=18.3277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=3.60;ReadPosRankSum=3.130;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:228,0,559 chrI 2273 . A G 126.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.258;DP=71;Dels=0.00;FS=27.951;HaplotypeScore=18.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.41;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=1.77;ReadPosRankSum=-3.959;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:156,0,954 chrI 2287 . T C 321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.801;DP=68;Dels=0.00;FS=6.869;HaplotypeScore=36.3122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.340;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:351,0,774 chrI 2331 . A C 1614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.79;MQ0=0;QD=22.11;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1647,189,0 chrI 2340 . T C 1621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.75;MQ0=0;QD=21.91;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1654,192,0 chrI 2353 . T C 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.506;DP=83;Dels=0.00;FS=28.415;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.915;QD=0.51;ReadPosRankSum=-3.691;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,14:83:72:72,0,1326 chrI 2358 . C G 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.161;DP=89;Dels=0.00;FS=16.808;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.75;MQ0=0;MQRankSum=-3.118;QD=0.21;ReadPosRankSum=-3.961;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,15:88:49:49,0,1404 chrI 2371 . T A 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=7.99;ReadPosRankSum=-2.205;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,51:81:99:677,0,525 chrI 2383 . C A 596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.678;DP=83;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=8.8403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.98;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.18;ReadPosRankSum=1.311;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,45:83:99:626,0,508 chrI 2384 . T C 565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.226;DP=84;Dels=0.00;FS=1.803;HaplotypeScore=8.8403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.48;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.514;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,46:84:99:595,0,639 chrI 2406 . A C 1911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=34.2658;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.50;MQ0=0;QD=20.33;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:1944,222,0 chrI 2413 . C G 177.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;DP=95;Dels=0.01;FS=2.132;HaplotypeScore=37.1904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.287;QD=1.86;ReadPosRankSum=0.635;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,21:94:99:207,0,1275 chrI 2418 . G A 297.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;DP=101;Dels=0.01;FS=0.804;HaplotypeScore=43.8987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.75;MQ0=0;MQRankSum=-3.485;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.894;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,33:100:99:327,0,1256 chrI 2419 . T C 509.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.546;DP=108;Dels=0.00;FS=3.712;HaplotypeScore=43.8987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.85;MQ0=0;MQRankSum=-3.152;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,40:108:99:539,0,1227 chrI 2482 . G T 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.188;DP=108;Dels=0.00;FS=5.338;HaplotypeScore=14.8179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=8.02;ReadPosRankSum=6.082;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:896,0,1218 chrI 2485 . A T 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.960;DP=109;Dels=0.00;FS=2.779;HaplotypeScore=14.8179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=7.48;ReadPosRankSum=5.451;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:845,0,1245 chrI 2501 . A G 416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.225;DP=100;Dels=0.00;FS=7.664;HaplotypeScore=2.8751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,35:100:99:446,0,1385 chrI 2512 . A G 2227 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;DP=104;Dels=0.00;FS=17.323;HaplotypeScore=2.8539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.79;MQ0=1;MQRankSum=2.481;QD=21.41;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,101:104:99:2260,239,0 chrI 2519 . T G 320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.968;DP=108;Dels=0.00;FS=13.049;HaplotypeScore=5.4847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.69;MQ0=1;MQRankSum=-1.401;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.465;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,36:108:99:350,0,1470 chrI 2524 . T C 1913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;DP=101;Dels=0.00;FS=4.159;HaplotypeScore=7.1117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.11;MQ0=1;MQRankSum=1.662;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,98:101:99:1946,234,0 chrI 2533 . G T 1321 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.090;DP=80;Dels=0.00;FS=9.372;HaplotypeScore=10.5860;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.04;MQ0=1;MQRankSum=2.886;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.988;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,76:80:99:1354,156,0 chrI 2535 . C A 1330 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.157;DP=79;Dels=0.00;FS=3.067;HaplotypeScore=8.7873;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.13;MQ0=1;MQRankSum=1.597;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:79:99:1363,156,0 chrI 2536 . A G 1263 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;DP=79;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=9.3657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.13;MQ0=1;MQRankSum=2.118;QD=15.99;ReadPosRankSum=-1.778;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,74:79:99:1296,153,0 chrI 2542 . T G 1239 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.33;MQ0=1;MQRankSum=1.618;QD=13.47;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,90:92:99:1272,153,0 chrI 2577 . T A 371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;DP=83;Dels=0.00;FS=13.193;HaplotypeScore=3.7636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.22;MQ0=1;MQRankSum=1.104;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.577;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:401,0,444 chrI 2578 . G A 365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.756;DP=83;Dels=0.00;FS=13.193;HaplotypeScore=3.7636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.22;MQ0=1;MQRankSum=1.827;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.660;SB=-1.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:395,0,423 chrI 2588 . A T 360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.628;DP=95;Dels=0.00;FS=11.280;HaplotypeScore=3.7844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.83;MQ0=1;MQRankSum=1.548;QD=3.79;ReadPosRankSum=2.331;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:390,0,560 chrI 2610 . T C 133.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.528;DP=98;Dels=0.00;FS=14.605;HaplotypeScore=21.7434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.53;MQ0=8;MQRankSum=1.014;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,20:98:99:163,0,947 chrI 2611 . G A 189.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.261;DP=99;Dels=0.00;FS=25.844;HaplotypeScore=21.7434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.61;MQ0=8;MQRankSum=0.752;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.701;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,29:99:99:219,0,888 chrI 2612 . A T 106.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.937;DP=99;Dels=0.00;FS=14.540;HaplotypeScore=21.7434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.61;MQ0=8;MQRankSum=0.302;QD=1.07;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:136,0,993 chrI 2625 . T C 77.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.257;DP=100;Dels=0.00;FS=14.712;HaplotypeScore=6.9463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.66;MQ0=8;MQRankSum=-0.201;QD=0.77;ReadPosRankSum=-4.366;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,17:100:99:107,0,1083 chrI 2643 . G A 1187 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8610;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.20;MQ0=8;QD=14.65;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1220,126,0 chrI 2679 . A G 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.656;DP=92;Dels=0.00;FS=11.613;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.96;MQ0=8;MQRankSum=0.962;QD=0.21;ReadPosRankSum=-1.850;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:49:49,0,1129 chrI 2706 . A G 462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.531;DP=100;Dels=0.00;FS=14.107;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.58;MQ0=3;MQRankSum=-0.794;QD=4.62;ReadPosRankSum=2.221;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,38:100:99:492,0,1178 chrI 2748 . A T 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.807;DP=108;Dels=0.00;FS=19.115;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.419;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:738,0,1225 chrI 2790 . C A 776.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.498;DP=113;Dels=0.00;FS=4.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.846;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.509;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,44:113:99:806,0,1434 chrI 2796 . G A 592.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;DP=103;Dels=0.00;FS=2.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQ0=0;MQRankSum=-3.399;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.674;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,37:103:99:622,0,1407 chrI 2797 . A G 582.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.885;DP=105;Dels=0.00;FS=2.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=0;MQRankSum=-3.585;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.908;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,37:105:99:612,0,1478 chrI 2823 . A G 597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.838;DP=95;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.415;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,38:95:99:627,0,1237 chrI 2825 . G C 2198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=23.63;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2231,258,0 chrI 2891 . G T 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.95;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2840,306,0 chrI 2914 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.643;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=2.137;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.350;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1233,0,874 chrI 2970 . T C 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8869;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=24.18;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2741,297,0 chrI 3049 . A T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.120;DP=103;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=3.1977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.402;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:988,0,990 chrI 3056 . C A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.488;DP=104;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.493;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1014,0,977 chrI 3141 . C T 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.817;DP=95;Dels=0.00;FS=6.696;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.378;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:847,0,1078 chrI 3187 . T C 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2681,291,0 chrI 3279 . G A 2023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=25.61;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2056,219,0 chrI 3311 . C G 2425 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2458,258,0 chrI 3313 . A C 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=100;Dels=0.00;FS=3.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=24.39;ReadPosRankSum=1.212;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2472,258,0 chrI 3328 . T C 2123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2156,234,0 chrI 3389 . C T 2461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2494,276,0 chrI 3462 . A C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3176,342,0 chrI 3518 . G A 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3271;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3334,357,0 chrI 3522 . A C 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3537;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3399,372,0 chrI 3620 . G A 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.028;DP=93;Dels=0.00;FS=24.014;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=7.80;ReadPosRankSum=-2.766;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:755,0,1085 chrI 3688 . G A 711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.117;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.633;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:741,0,876 chrI 3785 . T C 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;DP=100;Dels=0.00;FS=5.297;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.145;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:991,0,994 chrI 3807 . A C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.338;DP=121;Dels=0.00;FS=10.157;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.648;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1296,0,1088 chrI 3934 . C T 460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;DP=70;Dels=0.00;FS=3.211;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.022;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:490,0,802 chrI 3942 . G A 1737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=23.47;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1770,201,0 chrI 3990 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.297;DP=114;Dels=0.00;FS=21.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=10.00;ReadPosRankSum=2.494;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1170,0,1137 chrI 4022 . G A 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.461;DP=108;Dels=0.00;FS=34.474;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1012,0,1158 chrI 4034 . A T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.243;DP=117;Dels=0.00;FS=20.889;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=9.84;ReadPosRankSum=3.023;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1181,0,1219 chrI 4067 . A G 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2812,306,0 chrI 4119 . G A 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2628,282,0 chrI 4138 . T C 643.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.587;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.674;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:673,0,1290 chrI 4145 . T C 1112.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.385;DP=90;Dels=0.00;FS=1.824;HaplotypeScore=30.5009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=2.020;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.422;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,55:90:99:1142,0,657 chrI 4146 . A C 566.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.175;DP=87;Dels=0.00;FS=0.850;HaplotypeScore=31.4956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:87:99:596,0,1110 chrI 4182 . T A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.907;DP=99;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.854;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,61:98:99:1336,0,654 chrI 4324 . G A 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3166,333,0 chrI 4436 . G A 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;DP=100;Dels=0.00;FS=4.976;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.083;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:970,0,1011 chrI 4508 . T C 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3193,345,0 chrI 4597 . G C 2634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2667,291,0 chrI 4696 . G A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.875;DP=102;Dels=0.00;FS=8.203;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1142,0,959 chrI 4738 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;DP=107;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=9.70;ReadPosRankSum=2.122;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1068,0,1067 chrI 4769 . C A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=4.415;QD=10.87;ReadPosRankSum=-2.658;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1160,0,902 chrI 4774 . A C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.244;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.30;MQ0=0;MQRankSum=4.228;QD=9.52;ReadPosRankSum=-2.774;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:915,0,861 chrI 4801 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.729;DP=106;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.658;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1034,0,1081 chrI 4818 . C T 2295 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.10;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2328,255,0 chrI 4819 . C T 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.357;DP=91;Dels=0.00;FS=2.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=-4.456;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.872;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:842,0,914 chrI 4831 . A T 2096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.54;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2129,234,0 chrI 4836 . A G 690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.786;DP=89;Dels=0.00;FS=1.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-4.906;QD=7.75;ReadPosRankSum=-2.270;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:720,0,954 chrI 4859 . T C 1939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.71;MQ0=0;QD=22.55;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1972,210,0 chrI 4907 . G A 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.392;DP=104;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=2.523;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.050;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1179,0,812 chrI 4949 . C G 662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;DP=94;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=2.5510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.846;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,41:94:99:692,0,1060 chrI 4993 . C T 1752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.933;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=22.46;ReadPosRankSum=1.599;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,77:78:99:1785,183,0 chrI 5020 . C T 607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.392;DP=67;Dels=0.00;FS=4.927;HaplotypeScore=65.2727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:637,0,579 chrI 5030 . A G 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.169;DP=66;Dels=0.00;FS=3.535;HaplotypeScore=8.9217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.85;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=0.55;ReadPosRankSum=0.164;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:66:54:66,0,54 chrI 5031 . C A 68.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.767;DP=66;Dels=0.00;FS=5.192;HaplotypeScore=5.9491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=1.03;ReadPosRankSum=1.434;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:97:98,0,97 chrI 5035 . C G 716 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.052;DP=71;Dels=0.00;FS=6.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.67;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,37:71:31:749,31,0 chrI 5047 . G T 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.555;DP=88;Dels=0.00;FS=9.046;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.94;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.397;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:925,0,156 chrI 5218 . C T 2123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.18;MQ0=0;QD=24.40;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2156,228,0 chrI 5237 . C A 2220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:90:99:2253,231,0 chrI 5451 . C T 2261 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1435;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.95;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:96:99:2294,258,0 chrI 5463 . A G 2015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.23;MQ0=0;QD=22.39;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2048,240,0 chrI 5466 . A G 2401 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.27;MQ0=0;QD=22.87;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2434,273,0 chrI 5487 . A T 2239 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.74;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2272,246,0 chrI 5569 . G A 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2838,294,0 chrI 5576 . G C 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2957,315,0 chrI 5627 . A G 2774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2807,303,0 chrI 5646 . C T 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2886,312,0 chrI 5718 . T G 2348 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2381,264,0 chrI 5741 . T C 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2833,306,0 chrI 5756 . G T 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3424,357,0 chrI 5763 . T C 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2629;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2974,318,0 chrI 5814 . C T 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2888,300,0 chrI 5924 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=144;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=4.8065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.658;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:144:99:1308,0,1506 chrI 6001 . A G 2577 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=51.1892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=23.43;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2610,303,0 chrI 6030 . G A 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;DP=98;Dels=0.00;FS=2.819;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.167;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1007,0,890 chrI 6031 . A G 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=23.89;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2470,282,0 chrI 6059 . A T 2611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=21.94;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2644,276,0 chrI 6093 . C T 1460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.676;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.1081;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.559;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:1493,153,0 chrI 6136 . G A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.391;DP=96;Dels=0.00;FS=4.114;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.656;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:807,0,846 chrI 6201 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.766;DP=116;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=10.86;ReadPosRankSum=2.040;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1290,0,1098 chrI 6356 . A C 2549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.24;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2582,282,0 chrI 6365 . G A 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2750,300,0 chrI 6556 . A G 2573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2606,297,0 chrI 6962 . T C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;DP=101;Dels=0.00;FS=3.695;HaplotypeScore=2.4637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:914,0,1048 chrI 7076 . A T 2103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2136,225,0 chrI 7167 . T C 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.354;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=1;MQRankSum=0.425;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.958;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:763,0,1125 chrI 7268 . G T 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.69;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2947,306,0 chrI 7403 . A G 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3160,336,0 chrI 7646 . G A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.077;DP=86;Dels=0.00;FS=1.772;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.51;ReadPosRankSum=-1.711;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,50:86:99:1020,0,613 chrI 8776 . C G 598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.821;DP=95;Dels=0.00;FS=3.870;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.282;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:628,0,1072 chrI 8859 . T C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.208;DP=113;Dels=0.00;FS=4.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-0.818;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1135,0,1190 chrI 9376 . T G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;DP=117;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=2.7487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.428;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1100,0,1152 chrI 9439 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.523;DP=127;Dels=0.00;FS=3.251;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.919;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1187,0,1303 chrI 9473 . A G 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3494,375,0 chrI 9538 . T C,G 3633.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.15;MQ0=0;QD=22.15;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,79,85:164:99:3633,1880,1659,1753,0,1510 chrI 9661 . A T 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;DP=115;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=3.6152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.050;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1052,0,1270 chrI 9700 . A G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.896;DP=122;Dels=0.00;FS=3.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1116,0,1373 chrI 9742 . T G 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.952;DP=111;Dels=0.01;FS=3.567;HaplotypeScore=2.9224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1004,0,1210 chrI 9786 . T C 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.818;DP=90;Dels=0.00;FS=1.721;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=1.624;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.616;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:843,0,976 chrI 9873 . G A 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.556;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.517;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.819;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:94:99:704,0,1147 chrI 9882 . T C 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-3.447;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:862,0,1188 chrI 9910 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.591;DP=101;Dels=0.00;FS=4.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=2.231;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.536;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1149,0,776 chrI 9913 . C G 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;DP=98;Dels=0.00;FS=5.920;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:701,0,1089 chrI 9930 . G A 565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.984;DP=88;Dels=0.00;FS=6.035;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.412;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,37:88:99:595,0,1096 chrI 9931 . C T 566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.654;DP=87;Dels=0.00;FS=6.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.262;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.077;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:596,0,1031 chrI 9971 . C T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.075;DP=105;Dels=0.00;FS=9.226;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1041,0,1042 chrI 10025 . G A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;DP=120;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=9.70;ReadPosRankSum=2.454;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1194,0,1186 chrI 10064 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.495;DP=114;Dels=0.00;FS=5.727;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.281;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1146,0,1067 chrI 10088 . A G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.872;DP=121;Dels=0.00;FS=4.383;HaplotypeScore=10.7778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.896;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:943,0,1347 chrI 10103 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;DP=112;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1074,0,1060 chrI 10108 . A T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.201;DP=112;Dels=0.00;FS=3.556;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1072,0,1126 chrI 10314 . T C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;DP=105;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=4.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.311;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1051,0,1035 chrI 10317 . C T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;DP=117;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.306;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1158,0,1143 chrI 10325 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.627;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.886;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1238,0,1144 chrI 10417 . A G 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.276;DP=122;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.161;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.461;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1319,0,1095 chrI 10548 . A T 560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.256;DP=78;Dels=0.00;FS=1.006;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.157;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:590,0,968 chrI 10579 . A G 678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.488;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:708,0,849 chrI 10664 . T C 2010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2043,225,0 chrI 10815 . C G 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;DP=138;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=2.7635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1492,0,1170 chrI 10855 . A T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.766;DP=139;Dels=0.00;FS=3.234;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,80:139:99:1626,0,1192 chrI 11022 . C T 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.186;DP=102;Dels=0.00;FS=11.373;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.490;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.247;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:783,0,1188 chrI 11041 . G T 817.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;DP=106;Dels=0.00;FS=11.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.999;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:847,0,1115 chrI 11044 . C T 897.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;DP=107;Dels=0.00;FS=10.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=-4.269;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:927,0,1125 chrI 11045 . A C 1054.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.652;DP=107;Dels=0.00;FS=10.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=5.486;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.319;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1084,0,935 chrI 11102 . C A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.977;DP=112;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.013;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1155,0,1087 chrI 11107 . G A 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2904,300,0 chrI 11224 . G T 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.870;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:915,0,850 chrI 11370 . T C 1907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1940,222,0 chrI 11447 . A G 2186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=24.84;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2219,243,0 chrI 11469 . G A 2340 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.22;MQ0=0;QD=24.63;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2373,258,0 chrI 11504 . A G 2014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.611;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.363;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:2047,222,0 chrI 11561 . G T 2206 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.88;MQ0=0;QD=24.24;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2239,237,0 chrI 11601 . A G 2296 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.49;MQ0=0;QD=23.19;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2329,261,0 chrI 11676 . A T 1887 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.92;MQ0=0;QD=21.69;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1920,207,0 chrI 11684 . T C 1730 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.08;MQ0=0;QD=20.84;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1763,195,0 chrI 11685 . T C 1728 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.08;MQ0=0;QD=20.82;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1761,195,0 chrI 11732 . A G 1391 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.679;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=21.40;ReadPosRankSum=1.412;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:1424,150,0 chrI 11734 . C T 1360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.75;MQ0=0;QD=21.94;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1393,144,0 chrI 11750 . T C 1138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.92;MQ0=3;QD=20.69;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,54:55:99:1171,126,0 chrI 11835 . A G 169.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.18;MQ0=4;QD=8.45;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:24:202,24,0 chrI 11852 . T G 70.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=1;QD=5.88;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:12:103,12,0 chrI 11969 . C G 120.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.32;MQ0=3;QD=6.67;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:18:153,18,0 chrI 11997 . T A 251 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.04;MQ0=8;QD=8.66;SB=-2.600e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:33:284,33,0 chrI 12059 . C T 89.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=49;Dels=0.00;FS=12.740;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.76;MQ0=23;MQRankSum=-0.870;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,10:49:99:119,0,253 chrI 12118 . C T 191.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.25;MQ0=11;QD=7.96;SB=-2.702e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:27:224,27,0 chrI 12150 . C T 76.27 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;DP=18;Dels=0.00;FS=10.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.03;MQ0=7;MQRankSum=-0.791;QD=4.24;ReadPosRankSum=1.423;SB=-3.146e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:9:106,0,9 chrI 12361 . G A 413 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.79;MQ0=43;QD=6.45;SB=-6.554e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:64:51:446,51,0 chrI 12373 . G A 523 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.12;MQ0=39;QD=8.44;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:63:556,63,0 chrI 12396 . T C 672 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.77;MQ0=32;QD=10.18;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:78:705,78,0 chrI 12529 . A G 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;DP=43;Dels=0.00;FS=11.239;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.80;MQ0=1;MQRankSum=-1.789;QD=0.33;ReadPosRankSum=2.767;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,7:43:44:44,0,706 chrI 12546 . T A 48.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.929;DP=34;Dels=0.00;FS=4.042;HaplotypeScore=8.9208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=1.41;ReadPosRankSum=0.094;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:78:78,0,456 chrI 12551 . T C 46.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.378;DP=32;Dels=0.00;FS=4.607;HaplotypeScore=16.2093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:76:76,0,406 chrI 12552 . A G 183.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.3426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.47;MQ0=0;MQRankSum=2.429;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.528;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:31:99:213,0,108 chrI 12553 . A G 54.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;DP=30;Dels=0.00;FS=5.228;HaplotypeScore=15.3426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:84:84,0,348 chrI 12561 . A G 294.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.102;DP=30;Dels=0.00;FS=8.538;HaplotypeScore=27.1321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.14;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.738;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:324,0,128 chrI 12566 . C T 523 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=0;QD=18.03;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:66:556,66,0 chrI 12570 . C T 56.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.562;DP=29;Dels=0.00;FS=8.306;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.830;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.123;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:86:86,0,303 chrI 12571 . G A 51.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.342;DP=29;Dels=0.00;FS=8.306;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.927;QD=1.76;ReadPosRankSum=-2.757;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:81:81,0,311 chrI 12594 . A T 74.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;DP=12;Dels=0.00;FS=19.956;HaplotypeScore=5.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.45;MQ0=0;MQRankSum=1.788;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.831;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,5:12:12:107,12,0 chrI 12599 . T C 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=13;Dels=0.00;FS=2.920;HaplotypeScore=11.5247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:33:63,0,33 chrI 12601 . A G 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=2.920;HaplotypeScore=11.5247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:32:63,0,32 chrI 12609 . A G 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=13;Dels=0.00;FS=2.920;HaplotypeScore=14.4034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=2.54;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:34:63,0,34 chrI 12618 . T C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=0.94;ReadPosRankSum=-2.533;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:37:41,0,37 chrI 12620 . T C 68.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=12;Dels=0.00;FS=6.818;HaplotypeScore=5.7613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.932;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:12:101,12,0 chrI 12648 . A G,T 55.27 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=21.64;MQ0=0;QD=4.61;SB=-4.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,8,4:12:40:115,49,40,66,0,60 chrI 12667 . G A 66.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=4.5794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.34;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=6.65;ReadPosRankSum=2.166;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,7:10:12:99,12,0 chrI 12668 . T C 66.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.34;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.393;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:12:99,12,0 chrI 12690 . A T 10.42 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.48;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=1.04;ReadPosRankSum=1.214;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:37:40,0,37 chrI 12695 . T C 13.25 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:18:43,0,18 chrI 12697 . A G 14.20 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=1.58;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:19:44,0,19 chrI 12705 . A G 44.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;DP=15;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=2.8787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=2.93;ReadPosRankSum=1.002;SB=-9.952e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:74:74,0,75 chrI 12714 . T C 11.34 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.916;DP=19;Dels=0.00;FS=2.098;HaplotypeScore=12.5055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=0.60;ReadPosRankSum=1.479;SB=-6.518e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:41:41,0,191 chrI 12715 . G A 107.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.5055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.63;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-5.900e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:88:137,0,88 chrI 12744 . A G 202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.373;DP=29;Dels=0.00;FS=12.788;HaplotypeScore=22.0516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.045;SB=-5.998e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:29:39:232,0,39 chrI 12753 . A G 132.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.099;DP=30;Dels=0.00;FS=1.826;HaplotypeScore=19.9378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.69;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-7.500e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:162,0,141 chrI 12762 . T C 127.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.640;DP=29;Dels=0.00;FS=1.862;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.95;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.938;SB=-6.900e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:157,0,139 chrI 12763 . G A 111.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=29;Dels=0.00;FS=1.862;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:141,0,136 chrI 12764 . T C 339 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.95;MQ0=0;QD=11.69;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:45:372,45,0 chrI 12786 . T A 270.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;DP=58;Dels=0.00;FS=17.034;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.07;MQ0=4;MQRankSum=0.261;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:300,0,537 chrI 12809 . T C 20.05 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.292;DP=54;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.08;MQ0=4;MQRankSum=-0.194;QD=0.37;ReadPosRankSum=1.769;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,10:54:50:50,0,669 chrI 12810 . T C 798 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.19;MQ0=4;QD=15.35;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:96:831,96,0 chrI 12814 . G C 860 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.82;MQ0=4;QD=15.93;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:893,102,0 chrI 12821 . T C 968 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.12;MQ0=4;QD=16.41;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1001,114,0 chrI 12836 . A G 173.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.324;DP=61;Dels=0.00;FS=33.210;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.12;MQ0=4;MQRankSum=-0.466;QD=2.84;ReadPosRankSum=4.037;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:203,0,786 chrI 12964 . A G 665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.30;MQ0=1;QD=20.78;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:78:698,78,0 chrI 13011 . A T 53.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.29;MQ0=1;MQRankSum=1.511;QD=2.30;ReadPosRankSum=-3.207;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:83:83,0,83 chrI 13013 . G A 133.98 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.29;MQ0=1;MQRankSum=-0.670;QD=5.83;ReadPosRankSum=2.296;SB=-9.749e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:3:163,0,3 chrI 13014 . G A 53.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.470;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.29;MQ0=1;MQRankSum=1.069;QD=2.30;ReadPosRankSum=-3.207;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:79:83,0,79 chrI 13025 . A C 205.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5249;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=0;QD=8.20;SB=-2.380e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:27:238,27,0 chrI 13081 . A G 197.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.5768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.80;MQ0=4;MQRankSum=0.829;QD=7.32;ReadPosRankSum=-1.734;SB=-1.770e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:6:229,6,0 chrI 13099 . T A 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.172;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.04;MQ0=6;MQRankSum=1.020;QD=0.96;ReadPosRankSum=-1.813;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:51:51,0,139 chrI 13231 . G A 69.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.42;MQ0=0;QD=11.59;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:102,12,0 chrI 13239 . G A 69.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.84;MQ0=0;QD=6.32;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:11:12:102,12,0 chrI 13246 . C G 92.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.22;MQ0=0;QD=7.69;SB=-2.642e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:15:125,15,0 chrI 13251 . A G 92.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.95;MQ0=0;QD=8.39;SB=-2.642e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:125,15,0 chrI 13252 . G A 68.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.95;MQ0=0;QD=6.23;SB=-5.053e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:101,12,0 chrI 13260 . A G 92.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=10.25;SB=-2.556e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:15:125,15,0 chrI 13263 . G A 92.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.422;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:15:125,15,0 chrI 13269 . G A 94.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=10.47;ReadPosRankSum=2.054;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:15:127,15,0 chrI 13278 . T C 90.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.895;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,7:10:15:123,15,0 chrI 13279 . T A 99.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=9.93;SB=-2.642e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:15:132,15,0 chrI 13280 . G A 96.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=9.63;SB=-2.044e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:10:15:129,15,0 chrI 13281 . A G 92.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.663;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,7:11:15:125,15,0 chrI 13287 . A G 91.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=8.30;SB=-2.685e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:124,15,0 chrI 13290 . G T 99.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.520;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=9.02;ReadPosRankSum=2.037;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,7:11:15:132,15,0 chrI 13299 . A G 54.14 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.03;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.741;SB=-1.414e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:12:84,0,12 chrI 13302 . A G 54.14 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.03;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.741;SB=-1.414e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:12:84,0,12 chrI 13308 . C T 99.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.067;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:15:132,15,0 chrI 13311 . A T 58.14 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.92;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-1.414e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:12:88,0,12 chrI 13314 . A G 91.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9286;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.067;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:15:124,15,0 chrI 13317 . A T 77.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9286;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=9.69;SB=-3.871e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:8:12:110,12,0 chrI 13320 . C A 72.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.36;SB=-4.542e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:105,12,0 chrI 13323 . A T 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=4.56;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:6:54,6,0 chrI 17866 . C T 100.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.11;MQ0=0;QD=14.32;SB=-2.044e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:133,15,0 chrI 17910 . T C 173.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=21.63;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:206,24,0 chrI 17914 . G A 128.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.56;MQ0=0;QD=21.36;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:161,18,0 chrI 17929 . G A 129.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.56;MQ0=0;QD=21.52;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:162,18,0 chrI 17938 . G C 96.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.04;MQ0=0;QD=19.25;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:129,15,0 chrI 18005 . T C 533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.46;MQ0=0;QD=23.17;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:60:566,60,0 chrI 18058 . A G 988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.78;MQ0=0;QD=24.10;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1021,108,0 chrI 18105 . G T 698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.35;MQ0=0;QD=23.27;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:72:731,72,0 chrI 18172 . A G 148.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.15;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:181,21,0 chrI 18264 . A G 97.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.45;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:130,15,0 chrI 18279 . G A 98.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.65;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:131,15,0 chrI 24159 . A G 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.08;MQ0=44;MQRankSum=-0.572;QD=0.40;ReadPosRankSum=1.067;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,43:52:6:52,6,0 chrI 24181 . C T 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.426;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.53;MQ0=51;MQRankSum=0.259;QD=0.18;ReadPosRankSum=-0.779;SB=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:37:41,0,37 chrI 24357 . T A 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.73;MQ0=1;QD=4.16;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:52,6,0 chrI 24431 . A G 461 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.30;MQ0=16;QD=12.13;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:57:494,57,0 chrI 24491 . T C 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.19;MQ0=6;MQRankSum=0.158;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:27:99:103,0,177 chrI 24514 . C T 331 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.77;MQ0=4;QD=13.24;SB=-6.930e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:42:364,42,0 chrI 24601 . C T 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;DP=30;Dels=0.00;FS=4.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.77;MQ0=5;MQRankSum=-0.198;QD=1.17;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:37:65,0,37 chrI 24603 . A G 91.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.02;MQ0=4;QD=3.15;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:15:124,15,0 chrI 24613 . G A 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.97;MQ0=9;MQRankSum=1.214;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.925;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:33:90,0,33 chrI 24627 . T C 116.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.49;MQ0=14;QD=2.98;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:18:149,18,0 chrI 24659 . C T 360.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.352;DP=83;Dels=0.00;FS=17.310;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.39;MQ0=28;MQRankSum=-2.654;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.864;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,53:83:99:390,0,360 chrI 24814 . G A 260 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.94;MQ0=50;QD=4.06;SB=-1.339e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:33:293,33,0 chrI 24826 . G A 226.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;DP=61;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.26;MQ0=46;MQRankSum=-2.293;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.444;SB=-6.907e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,58:61:14:256,0,14 chrI 24861 . A G 277 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.32;MQ0=41;QD=4.86;SB=-1.579e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:36:310,36,0 chrI 24909 . G A 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;DP=19;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=3.8313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.57;MQ0=7;MQRankSum=1.932;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.289;SB=-6.502e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:81:81,0,98 chrI 24937 . A G 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.961;DP=22;Dels=0.00;FS=7.829;HaplotypeScore=3.8701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.128;SB=-9.959e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:28:103,0,28 chrI 24956 . T C 30.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.72;MQ0=1;MQRankSum=0.332;QD=1.50;ReadPosRankSum=1.129;SB=-6.782e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:34:60,0,34 chrI 24958 . A G 28.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.72;MQ0=1;MQRankSum=0.465;QD=1.40;ReadPosRankSum=1.129;SB=-6.882e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:35:58,0,35 chrI 24966 . A G 225.64 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.624;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.7154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.35;MQ0=1;MQRankSum=0.901;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-1.636e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:11:258,11,0 chrI 24974 . T C 34.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.012;DP=28;Dels=0.00;FS=1.983;HaplotypeScore=11.5697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.83;MQ0=1;MQRankSum=-0.204;QD=1.21;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:64:64,0,240 chrI 24975 . T C 315.04 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.593;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.11;MQ0=1;MQRankSum=1.346;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.280;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,25:29:23:348,23,0 chrI 25001 . A G 431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.139;DP=64;Dels=0.00;FS=8.966;HaplotypeScore=5.7088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.97;MQ0=1;MQRankSum=1.681;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.892;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:461,0,420 chrI 25055 . C A 1195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.276;DP=74;Dels=0.00;FS=2.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.69;MQ0=3;MQRankSum=-1.025;QD=16.15;ReadPosRankSum=2.276;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,72:74:81:1228,81,0 chrI 25070 . C T 1063 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.41;MQ0=4;QD=15.87;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1096,111,0 chrI 25076 . C T 959 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.28;MQ0=4;QD=15.22;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:992,99,0 chrI 25142 . G A 43.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.22;MQ0=3;QD=4.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:76,9,0 chrI 25151 . C T 44.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.92;MQ0=2;QD=6.42;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:9:77,9,0 chrI 25178 . G A 124.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.696;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.348;SB=-2.549e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:18:157,18,0 chrI 25190 . A C 121.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.28;MQ0=0;QD=10.09;SB=-2.607e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:18:154,18,0 chrI 25191 . T A 58.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;DP=13;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.68;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.369;SB=-8.673e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:30:88,0,30 chrI 25194 . A G 55.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.016;DP=13;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.68;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.093;SB=-8.227e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:31:85,0,31 chrI 25216 . G A 60.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.281;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.24;MQ0=3;MQRankSum=0.555;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.101;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:29:90,0,29 chrI 25222 . A G 57.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.58;MQ0=4;MQRankSum=0.555;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:30:87,0,30 chrI 25223 . G A 63.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.627;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.58;MQ0=4;MQRankSum=0.312;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:29:93,0,29 chrI 25231 . G A 60.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.627;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.4812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.97;MQ0=5;MQRankSum=0.935;QD=3.33;ReadPosRankSum=-1.791;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:28:90,0,28 chrI 25246 . A G 32.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;DP=17;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=17.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.27;MQ0=5;MQRankSum=1.599;QD=1.90;ReadPosRankSum=-1.932;SB=-4.921e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:10:62,0,10 chrI 25264 . T A 10.44 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=13;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=10.6093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.79;MQ0=5;MQRankSum=0.322;QD=0.80;ReadPosRankSum=-0.956;SB=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:19:40,0,19 chrI 25340 . C A 287 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.90;MQ0=2;QD=11.48;SB=-1.359e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:33:320,33,0 chrI 25351 . A G 299 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=2;QD=11.50;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:36:332,36,0 chrI 25374 . A T 164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;DP=28;Dels=0.00;FS=1.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.13;MQ0=2;MQRankSum=0.830;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.038;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:64:194,0,64 chrI 25418 . T C 303 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.79;MQ0=1;QD=11.65;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:39:336,39,0 chrI 25431 . A G 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.36;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=2.30;ReadPosRankSum=2.662;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:58:76,0,58 chrI 25441 . T A 62.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.47;MQ0=0;QD=3.91;SB=-4.326e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:12:95,12,0 chrI 25442 . G C 41.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.3719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.68;MQ0=0;QD=2.80;SB=-2.247e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:15:9:74,9,0 chrI 25461 . G A 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.56;MQ0=0;QD=1.30;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:52,6,0 chrI 25464 . G A 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.56;MQ0=0;QD=1.30;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:52,6,0 chrI 25479 . T C 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=1.11;ReadPosRankSum=-0.189;SB=1.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,14:17:6:50,6,0 chrI 25494 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.37;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.791;SB=1.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,12:17:6:53,6,0 chrI 25497 . G A 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.688;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.264;SB=1.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,12:17:6:53,6,0 chrI 26373 . C T 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 chrI 26388 . A G 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.40;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 chrI 26397 . A T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 chrI 26400 . G A 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrI 26412 . G C 45.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.49;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:78,9,0 chrI 26418 . A T 46.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.74;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:79,9,0 chrI 26430 . G T 47.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.99;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:80,9,0 chrI 26440 . T C 19.81 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.60;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 chrI 26442 . G A 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrI 26443 . T G 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrI 26451 . C T 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.60;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 chrI 26453 . G C 20.80 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.93;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:52,6,0 chrI 26454 . A G 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.27;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:50,6,0 chrI 26457 . T C 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.27;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:50,6,0 chrI 26463 . C T 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.60;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 chrI 26802 . A T 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 chrI 26805 . G A 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 chrI 26811 . T G 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.95;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 chrI 26819 . A T 99.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.54;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:132,15,0 chrI 26823 . G A,T 60.27 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.61;SB=-2.699e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,3,4:7:40:120,71,65,49,0,40 chrI 26826 . A G 58.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.684;SB=-7.599e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:33:88,0,33 chrI 26829 . A C,T 80.33 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=27.79;MQ0=0;QD=8.93;SB=-1.312e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,3,6:9:32:139,95,89,44,0,32 chrI 26835 . G T 55.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.248;SB=-7.377e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:34:85,0,34 chrI 26846 . T C 121.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=0;QD=13.46;SB=-1.076e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:154,18,0 chrI 26847 . G A 126.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=14.01;ReadPosRankSum=0.751;SB=4.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:18:159,18,0 chrI 26848 . T G 124.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=0;QD=13.79;SB=-1.076e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:157,18,0 chrI 26856 . C T 53.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.92;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.580;SB=-7.195e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:35:83,0,35 chrI 26859 . A G 117.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=11.71;SB=-1.247e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:18:150,18,0 chrI 26862 . T C 56.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.580;SB=-7.200e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:35:86,0,35 chrI 26878 . G C 226 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=16.14;SB=-1.410e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:30:259,30,0 chrI 26880 . G T 159.02 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=11.36;ReadPosRankSum=2.491;SB=-1.722e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:23:189,0,23 chrI 26896 . C T 186.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.10;MQ0=0;QD=15.50;SB=-3.661e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:219,24,0 chrI 26900 . T C 174.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=15.82;SB=-3.228e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:24:207,24,0 chrI 26901 . T A 182.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=16.55;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:24:215,24,0 chrI 26923 . C G 205.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.08;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:27:238,27,0 chrI 26931 . A G 193.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.488;SB=-1.252e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:7:225,7,0 chrI 26945 . C T 216.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.86;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=12.71;ReadPosRankSum=2.548;SB=-7.867e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:32:246,0,32 chrI 26946 . T A 236.52 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.86;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.953;SB=-5.117e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:6:266,0,6 chrI 26949 . G A 236.52 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.86;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.449;SB=-5.117e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:6:266,0,6 chrI 26954 . A T 242.42 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.315;SB=-4.141e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:7:272,0,7 chrI 26955 . T C 210.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.86;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.396;SB=-7.373e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:34:240,0,34 chrI 26958 . G A 245.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.814;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.584;SB=-9.873e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:28:275,0,28 chrI 26964 . A C 161.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.172;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.86;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.906;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:17:67:191,0,67 chrI 26970 . G A 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.001;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.78;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:16:69:69,0,167 chrI 26973 . A G 274 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4654;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.70;MQ0=0;QD=18.27;SB=-8.426e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:36:307,36,0 chrI 26974 . A G 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.70;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:66:66,0,177 chrI 26979 . G A 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.740;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:44:44,0,152 chrI 26981 . T C 216 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4738;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=18.00;SB=-1.302e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:30:249,30,0 chrI 26982 . G A 123.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.37;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-6.111e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:42:153,0,42 chrI 26983 . T G 222 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8955;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=18.50;SB=-1.302e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:30:255,30,0 chrI 26994 . A G 85.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.298;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:73:115,0,73 chrI 27000 . A G 57.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.325;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:87:87,0,144 chrI 27006 . G T 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.92;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=0.75;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:44:44,0,214 chrI 27027 . A T 274 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=1;MQRankSum=0.385;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.771;SB=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:36:307,36,0 chrI 27031 . C T 258 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=1;QD=14.33;SB=-1.080e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:33:291,33,0 chrI 27035 . T C 194.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.67;MQ0=1;MQRankSum=1.488;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.736;SB=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:15:27:227,27,0 chrI 27036 . G A 177.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.67;MQ0=1;MQRankSum=1.240;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.736;SB=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:15:24:210,24,0 chrI 27044 . C T 227 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.273;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.82;MQ0=1;MQRankSum=0.579;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.810;SB=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,14:16:30:260,30,0 chrI 27045 . G A 93.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.82;MQ0=1;MQRankSum=-0.412;QD=5.81;ReadPosRankSum=-2.180;SB=-6.530e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:53:123,0,53 chrI 27060 . A T 309 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.36;MQ0=1;QD=14.71;SB=-7.578e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:21:39:342,39,0 chrI 27063 . G A 341 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.57;MQ0=1;MQRankSum=0.980;QD=14.21;ReadPosRankSum=-1.583;SB=-6.632e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:42:374,42,0 chrI 27072 . A G 431 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.898;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.7330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.13;MQ0=1;MQRankSum=-0.046;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.065;SB=-6.445e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,25:29:54:464,54,0 chrI 27075 . G A 464 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.918;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.7730;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.13;MQ0=1;MQRankSum=1.293;QD=16.00;ReadPosRankSum=1.918;SB=-5.443e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,26:29:57:497,57,0 chrI 27078 . G A 91.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.076;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.98;MQ0=1;MQRankSum=0.208;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.194;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:121,0,216 chrI 27080 . C T 433 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.254;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8354;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.90;MQ0=1;MQRankSum=1.352;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.250;SB=7.191e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,23:26:54:466,54,0 chrI 27081 . G A 419 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8354;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.90;MQ0=1;MQRankSum=1.156;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-6.381e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:26:54:452,54,0 chrI 27084 . G A 469 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.896;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.53;MQ0=1;MQRankSum=0.657;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:60:502,60,0 chrI 27090 . T C 531 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.280;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.18;MQ0=1;MQRankSum=-0.168;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.168;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:66:564,66,0 chrI 27099 . T C 650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.51;MQ0=1;MQRankSum=0.674;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.578;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:81:683,81,0 chrI 27105 . A G 655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.51;MQ0=1;QD=17.70;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:37:81:688,81,0 chrI 27126 . T C 1375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.45;MQ0=0;QD=21.48;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1408,162,0 chrI 27129 . C G 1418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.34;MQ0=0;QD=20.55;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1451,171,0 chrI 27141 . G T 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.126;DP=82;Dels=0.00;FS=31.921;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.89;MQ0=0;MQRankSum=-3.106;QD=0.73;ReadPosRankSum=0.252;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:90:90,0,1341 chrI 27151 . A G 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.399;DP=87;Dels=0.00;FS=36.032;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.759;QD=0.48;ReadPosRankSum=-1.534;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,15:87:72:72,0,1491 chrI 27183 . G A 87.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.691;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.330;QD=0.72;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:117,0,2049 chrI 27186 . T C 91.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.958;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.870;QD=0.75;ReadPosRankSum=-1.352;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:121,0,2205 chrI 27188 . G A 128.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.213;DP=119;Dels=0.00;FS=0.872;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.673;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.571;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:158,0,2071 chrI 27195 . T G 147.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;DP=123;Dels=0.00;FS=1.843;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.33;MQ0=0;MQRankSum=-3.220;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,24:123:99:177,0,2119 chrI 27210 . A G 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.36;MQ0=0;QD=20.64;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3088,354,0 chrI 27290 . C A 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.60;MQ0=0;QD=22.43;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3410,345,0 chrI 27318 . T C 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.378;DP=117;Dels=0.00;FS=2.505;HaplotypeScore=35.4112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.55;MQ0=0;MQRankSum=3.529;QD=7.13;ReadPosRankSum=2.839;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:864,0,1072 chrI 27356 . T C 628 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.04;MQ0=0;QD=11.63;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:78:661,78,0 chrI 27357 . A G 663 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.04;MQ0=0;QD=12.28;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:81:696,81,0 chrI 27365 . C G 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;DP=54;Dels=0.00;FS=1.105;HaplotypeScore=9.3222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.902;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:62:62,0,435 chrI 27370 . G A 475 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.3222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.99;MQ0=1;QD=9.13;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:57:508,57,0 chrI 27374 . T A 113.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.806;DP=59;Dels=0.00;FS=5.675;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.44;MQ0=1;MQRankSum=1.382;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:143,0,339 chrI 27380 . T G 535 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.18;MQ0=1;QD=9.73;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:66:568,66,0 chrI 27468 . G A 47.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.601;DP=26;Dels=0.00;FS=4.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.86;MQ0=1;MQRankSum=0.091;QD=1.81;ReadPosRankSum=1.120;SB=-2.990e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:77:77,0,137 chrI 27471 . T C 55.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.126;DP=26;Dels=0.00;FS=4.043;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.91;MQ0=1;MQRankSum=0.262;QD=2.12;ReadPosRankSum=1.427;SB=-4.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:85:85,0,143 chrI 27476 . G A 202.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.11;MQ0=1;QD=11.88;SB=-1.028e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:27:235,27,0 chrI 27483 . A G 87.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.964;DP=18;Dels=0.00;FS=5.193;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.77;MQ0=2;MQRankSum=2.011;QD=4.83;ReadPosRankSum=1.270;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:70:117,0,70 chrI 27486 . G A 199.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=1;QD=11.06;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:27:232,27,0 chrI 27489 . G A 196.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.21;MQ0=1;QD=9.33;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:27:229,27,0 chrI 27492 . A T 166.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.78;MQ0=1;QD=8.30;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:20:24:199,24,0 chrI 27498 . A T 146.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.36;MQ0=5;QD=7.69;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,14:19:21:179,21,0 chrI 27504 . C A 145.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.36;MQ0=5;QD=7.63;SB=-1.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,14:19:21:178,21,0 chrI 27505 . T G 140.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.36;MQ0=5;QD=7.37;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,14:19:21:173,21,0 chrI 27506 . T A 146.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.36;MQ0=5;QD=7.69;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,14:19:21:179,21,0 chrI 27507 . G A 147.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.36;MQ0=5;QD=7.74;SB=-1.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,14:19:21:180,21,0 chrI 27510 . T C 136.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.79;MQ0=5;QD=5.23;SB=-1.461e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,21:26:21:169,21,0 chrI 27522 . C T 306.54 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.572;DP=38;Dels=0.00;FS=2.734;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.01;MQ0=7;MQRankSum=0.702;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.771;SB=-2.504e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,28:38:2:336,2,0 chrI 27540 . A G 365.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.592;DP=43;Dels=0.00;FS=5.370;HaplotypeScore=5.4350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.18;MQ0=7;MQRankSum=1.988;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.982;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,32:43:17:395,0,17 chrI 27549 . C T 157.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.28;MQ0=7;MQRankSum=0.073;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:46:99:187,0,271 chrI 27557 . G A 201.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.901;DP=47;Dels=0.00;FS=5.012;HaplotypeScore=12.4109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.39;MQ0=7;MQRankSum=2.243;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:231,0,254 chrI 27561 . T G 416.34 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;DP=45;Dels=0.00;FS=2.548;HaplotypeScore=7.7164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.16;MQ0=7;MQRankSum=1.070;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-2.547e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,34:45:8:446,0,8 chrI 27563 . C T 421.64 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.211;DP=45;Dels=0.00;FS=2.548;HaplotypeScore=11.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.16;MQ0=7;MQRankSum=0.785;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-2.565e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,34:45:5:451,0,5 chrI 27573 . G A 187.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.012;DP=48;Dels=0.00;FS=3.151;HaplotypeScore=11.5918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.47;MQ0=7;MQRankSum=-0.561;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:217,0,261 chrI 27576 . A G 412.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;DP=47;Dels=0.00;FS=2.551;HaplotypeScore=11.6066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.36;MQ0=7;MQRankSum=0.879;QD=8.77;ReadPosRankSum=-2.547;SB=-2.575e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,36:47:11:442,0,11 chrI 27582 . G A 395.05 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;DP=44;Dels=0.00;FS=2.548;HaplotypeScore=15.4689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.41;MQ0=6;MQRankSum=0.975;QD=8.98;ReadPosRankSum=-2.354;SB=-2.699e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:17:425,0,17 chrI 27585 . A G 364.05 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;DP=38;Dels=0.00;FS=2.599;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.90;MQ0=6;MQRankSum=-0.142;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.194;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:17:394,0,17 chrI 27591 . T C 372.09 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;DP=36;Dels=0.00;FS=2.599;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.08;MQ0=5;MQRankSum=1.444;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.679;SB=-1.821e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:14:402,0,14 chrI 27593 . A G 350.02 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.08;MQ0=5;MQRankSum=1.047;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.477;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:22:380,0,22 chrI 27597 . A T 424.18 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;DP=44;Dels=0.00;FS=5.111;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.65;MQ0=2;MQRankSum=0.921;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.992;SB=-3.138e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,38:44:11:454,0,11 chrI 27611 . C A 415.09 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.087;DP=39;Dels=0.00;FS=2.690;HaplotypeScore=8.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.14;MQ0=2;MQRankSum=-0.028;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.862;SB=-3.531e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,34:39:14:445,0,14 chrI 27614 . T C 51.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;DP=19;Dels=0.00;FS=5.798;HaplotypeScore=9.9193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.99;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=2.68;ReadPosRankSum=2.404;SB=-1.509e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:59:81,0,59 chrI 27616 . A C,G 98.03 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=26.99;MQ0=0;QD=5.16;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,3,16:19:51:158,95,86,63,0,51 chrI 27617 . T C 98.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=0;QD=5.78;SB=-1.812e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:15:131,15,0 chrI 27619 . G T 102.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=0;QD=6.02;SB=-1.882e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:15:135,15,0 chrI 27622 . T C 94.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=0;QD=5.54;SB=-1.762e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:15:127,15,0 chrI 27624 . A G 60.14 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.74;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.531;SB=-1.582e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:12:90,0,12 chrI 27627 . A G 58.14 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.74;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.531;SB=-1.571e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:12:88,0,12 chrI 27630 . A G 60.14 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.74;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.531;SB=-1.631e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:12:90,0,12 chrI 27646 . T C 60.34 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.386;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.11;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=1.59;ReadPosRankSum=1.013;SB=-3.483e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,36:38:8:90,0,8 chrI 27667 . A G 320 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.22;MQ0=0;QD=7.27;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:42:353,42,0 chrI 27668 . A C 236.98 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;DP=44;Dels=0.00;FS=8.967;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.22;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.873;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,42:44:3:266,0,3 chrI 27681 . A G 278.02 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;DP=48;Dels=0.00;FS=2.618;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.85;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,45:48:22:308,0,22 chrI 27684 . A C 249.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;DP=46;Dels=0.00;FS=9.427;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.56;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.487;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,42:46:25:279,0,25 chrI 27685 . G T 258.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;DP=47;Dels=0.00;FS=4.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.08;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.983;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,42:47:49:288,0,49 chrI 27688 . A T 343.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;DP=55;Dels=0.00;FS=8.510;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.03;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,50:55:37:373,0,37 chrI 27693 . G C 317.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;DP=51;Dels=0.00;FS=11.608;HaplotypeScore=42.9132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.161;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,45:51:39:347,0,39 chrI 27699 . T G 149.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;DP=58;Dels=0.00;FS=30.745;HaplotypeScore=69.3145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.48;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=2.57;ReadPosRankSum=3.384;SB=-1.238e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:58:99:179,0,211 chrI 27701 . A T 307.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=58;Dels=0.00;FS=41.513;HaplotypeScore=69.3145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=5.29;ReadPosRankSum=3.366;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,42:58:99:337,0,194 chrI 27702 . A T 315.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;DP=58;Dels=0.00;FS=41.513;HaplotypeScore=69.3145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=5.43;ReadPosRankSum=3.071;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,42:58:99:345,0,194 chrI 27703 . C G 301.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.149;DP=58;Dels=0.00;FS=41.513;HaplotypeScore=69.3145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=5.19;ReadPosRankSum=2.844;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,42:58:99:331,0,186 chrI 27716 . T G 343.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;DP=67;Dels=0.00;FS=50.661;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,50:67:99:373,0,183 chrI 27723 . A G 367.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.264;DP=68;Dels=0.00;FS=53.789;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.63;MQ0=1;MQRankSum=-0.065;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,50:68:99:397,0,184 chrI 27725 . C T 383.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;DP=68;Dels=0.00;FS=53.789;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.63;MQ0=1;MQRankSum=-0.079;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.419;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,50:68:99:413,0,184 chrI 27726 . A G 372.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.396;DP=68;Dels=0.00;FS=56.054;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.63;MQ0=1;MQRankSum=-0.088;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,49:68:99:402,0,188 chrI 27729 . C A 361.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.959;DP=70;Dels=0.00;FS=55.846;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.59;MQ0=1;MQRankSum=-0.063;QD=5.16;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,52:70:99:391,0,175 chrI 27732 . G T 371.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;DP=72;Dels=0.00;FS=57.841;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.29;MQ0=1;MQRankSum=-0.195;QD=5.15;ReadPosRankSum=-4.076;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,54:72:99:401,0,183 chrI 27738 . A C 354.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.575;DP=67;Dels=0.00;FS=62.289;HaplotypeScore=82.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.52;MQ0=1;MQRankSum=-0.172;QD=5.28;ReadPosRankSum=-3.829;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,48:67:99:384,0,183 chrI 27744 . T C 367.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.461;DP=68;Dels=0.00;FS=59.590;HaplotypeScore=78.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.37;MQ0=1;MQRankSum=-0.205;QD=5.40;ReadPosRankSum=-3.299;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,49:68:99:397,0,187 chrI 27747 . T A 202.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.263;DP=65;Dels=0.00;FS=25.582;HaplotypeScore=88.7769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.014;QD=3.11;ReadPosRankSum=-3.613;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:65:99:232,0,194 chrI 27749 . C T 368.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.452;DP=65;Dels=0.00;FS=52.151;HaplotypeScore=87.9379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.079;QD=5.66;ReadPosRankSum=-3.915;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:99:398,0,153 chrI 27750 . G A 372.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=65;Dels=0.00;FS=52.151;HaplotypeScore=87.9379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.095;QD=5.72;ReadPosRankSum=-3.455;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:99:402,0,163 chrI 27756 . A G 299.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.546;DP=64;Dels=0.00;FS=48.316;HaplotypeScore=127.5677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.01;MQ0=1;MQRankSum=-0.322;QD=4.67;ReadPosRankSum=-2.786;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,49:64:99:329,0,152 chrI 27759 . C T 124.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;DP=62;Dels=0.00;FS=49.767;HaplotypeScore=31.6595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.04;MQ0=1;MQRankSum=0.386;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.964;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:154,0,282 chrI 27761 . G A 205.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.588;DP=59;Dels=0.00;FS=46.978;HaplotypeScore=31.6595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.40;MQ0=1;MQRankSum=-0.336;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.608;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,44:59:99:235,0,162 chrI 27781 . C T 208.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.064;DP=53;Dels=0.00;FS=59.968;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.33;MQ0=1;MQRankSum=0.106;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.796;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,39:53:99:238,0,151 chrI 27782 . C G 196.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=53;Dels=0.00;FS=59.968;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.33;MQ0=1;MQRankSum=0.042;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.754;SB=-9.502e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,39:53:99:226,0,150 chrI 27783 . A G 195.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.166;DP=52;Dels=0.00;FS=55.703;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.55;MQ0=1;MQRankSum=-0.322;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.543;SB=-9.502e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:225,0,150 chrI 27804 . C A,G 959.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;DP=72;Dels=0.00;FS=14.914;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=27.54;MQ0=1;MQRankSum=1.683;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.049;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,40,30:72:99:1019,359,272,660,0,612 chrI 27810 . T C 1078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=70;Dels=0.00;FS=9.938;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=1;MQRankSum=1.682;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.682;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,68:70:99:1111,132,0 chrI 27816 . G A 1262 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.19;MQ0=1;QD=17.77;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:71:99:1295,147,0 chrI 27822 . T C 1169 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.31;MQ0=0;QD=17.45;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1202,144,0 chrI 27823 . C A 1202 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.31;MQ0=0;QD=17.94;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1235,144,0 chrI 27825 . C T 659.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.029;DP=73;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.45;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.460;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,40:73:99:689,0,428 chrI 27843 . G A 513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.864;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.17;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.174;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,37:86:99:543,0,875 chrI 27914 . T C 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.05;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2842,327,0 chrI 27917 . A G 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.759;DP=114;Dels=0.00;FS=2.412;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.196;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:865,0,1300 chrI 27941 . G A 834.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.605;DP=109;Dels=0.00;FS=2.534;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.990;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:864,0,1178 chrI 27948 . A G 903.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=104;Dels=0.00;FS=5.200;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.93;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.902;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:933,0,997 chrI 27951 . A G 890.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.682;DP=105;Dels=0.00;FS=3.894;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.883;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:920,0,941 chrI 27970 . T G 1891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.28;MQ0=0;QD=21.25;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1924,222,0 chrI 27983 . T A 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;DP=91;Dels=0.00;FS=0.846;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:871,0,691 chrI 27997 . T C 1809 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.32;MQ0=0;QD=21.54;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1842,216,0 chrI 27998 . T C 508.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.857;DP=95;Dels=0.00;FS=5.679;HaplotypeScore=80.1775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=5.35;ReadPosRankSum=1.347;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:538,0,1053 chrI 28007 . G C 912.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;DP=95;Dels=0.01;FS=6.851;HaplotypeScore=87.1143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.341;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.752;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,55:94:99:942,0,714 chrI 28051 . G T 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.116;DP=108;Dels=0.00;FS=4.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.48;MQ0=0;MQRankSum=1.469;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.083;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:784,0,1323 chrI 28057 . A G 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;DP=104;Dels=0.00;FS=9.592;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.41;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.934;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:732,0,1259 chrI 28083 . T C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;DP=101;Dels=0.00;FS=2.594;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.18;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.712;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1073,0,852 chrI 28117 . G C 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.64;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3111,336,0 chrI 28127 . T C 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.630;DP=136;Dels=0.00;FS=2.160;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.89;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.842;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1410,0,1248 chrI 28148 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.18;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1285,0,1379 chrI 28168 . T A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;DP=119;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=9.38;ReadPosRankSum=3.394;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1146,0,1294 chrI 28259 . C T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.335;DP=113;Dels=0.00;FS=8.723;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQ0=0;MQRankSum=2.960;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.578;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1059,0,1186 chrI 28321 . G A 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.22;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3697,408,0 chrI 28352 . C T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.57;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3405,369,0 chrI 28384 . G C 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=23.02;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3048,348,0 chrI 28385 . A G 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3027,339,0 chrI 28433 . G A 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.37;MQ0=0;QD=26.04;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3158,336,0 chrI 28458 . C T 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.66;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3372,351,0 chrI 28517 . A G 2265 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=84.0862;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.17;MQ0=0;QD=23.11;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2298,258,0 chrI 28560 . A G 170.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.501;DP=68;Dels=0.00;FS=19.543;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.29;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=2.50;ReadPosRankSum=-5.357;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:200,0,518 chrI 28650 . G T 2232 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.294;DP=87;Dels=0.00;FS=3.267;HaplotypeScore=6.7786;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=25.66;ReadPosRankSum=1.294;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:2265,240,0 chrI 28666 . A G 2112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.17;MQ0=0;QD=23.73;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2145,240,0 chrI 28684 . A G 2108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=22.91;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2141,240,0 chrI 28696 . G T 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.26;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2623,285,0 chrI 28844 . C T 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.30;MQ0=1;QD=23.68;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2733,294,0 chrI 28926 . A T 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.501;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=24.37;ReadPosRankSum=1.299;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:2957,290,0 chrI 28949 . T G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.912;DP=125;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.78;MQ0=0;MQRankSum=3.213;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1445,0,1039 chrI 28975 . G A 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.205;DP=138;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=6.65;ReadPosRankSum=-3.131;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,55:138:99:948,0,1652 chrI 29079 . A G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.312;DP=113;Dels=0.00;FS=2.585;HaplotypeScore=5.7723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.33;MQ0=0;MQRankSum=4.954;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,69:113:99:1373,0,699 chrI 29093 . A T 2527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.463;DP=109;Dels=0.00;FS=8.560;HaplotypeScore=5.6894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.237;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:109:99:2560,288,0 chrI 29095 . A C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.614;DP=114;Dels=0.00;FS=1.551;HaplotypeScore=5.6560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.94;MQ0=0;MQRankSum=5.048;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1304,0,785 chrI 29109 . G C 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;DP=122;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.86;MQ0=0;MQRankSum=-4.829;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.014;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:821,0,1499 chrI 29118 . C T 720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.463;DP=109;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.50;MQ0=0;MQRankSum=-5.271;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.794;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:750,0,1283 chrI 29126 . T C 585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.522;DP=102;Dels=0.00;FS=2.613;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.85;MQ0=0;MQRankSum=-4.870;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.778;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:102:99:615,0,1305 chrI 29131 . A G 2260 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.813;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2293,267,0 chrI 29154 . G A 375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;DP=68;Dels=0.00;FS=4.903;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.925;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:405,0,785 chrI 29180 . T C 1666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.01;MQ0=0;QD=22.82;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1699,195,0 chrI 29209 . C T 1344 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.89;MQ0=0;QD=22.03;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1377,156,0 chrI 29226 . C T 1307 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.61;MQ0=0;QD=21.08;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1340,150,0 chrI 29227 . A G 1212 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.61;MQ0=0;QD=19.55;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1245,144,0 chrI 29245 . G A 1178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.35;MQ0=0;QD=20.67;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1211,141,0 chrI 29282 . C T 863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=55.8015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.02;MQ0=0;QD=13.28;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:896,99,0 chrI 29322 . G C 609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.28;MQ0=0;QD=9.37;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:72:642,72,0 chrI 29352 . T C 497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.51;MQ0=0;QD=14.62;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:63:530,63,0 chrI 29354 . T A 522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.51;MQ0=0;QD=15.35;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:63:555,63,0 chrI 29374 . C T 468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.78;MQ0=0;QD=13.00;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:57:501,57,0 chrI 29397 . T C 661 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.53;MQ0=0;QD=16.12;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:81:694,81,0 chrI 29400 . C T 617 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.74;MQ0=0;QD=16.68;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:75:650,75,0 chrI 29402 . A T 647 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.74;MQ0=0;QD=17.49;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:75:680,75,0 chrI 29440 . G T 594 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.3637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.21;MQ0=0;QD=15.63;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:69:627,69,0 chrI 29441 . C T 592 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.21;MQ0=0;QD=15.58;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:69:625,69,0 chrI 29449 . A G 586 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.98;MQ0=0;QD=15.03;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:72:619,72,0 chrI 29459 . C T 581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=88.6691;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.06;MQ0=0;QD=18.16;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:69:614,69,0 chrI 29476 . A G 564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.82;MQ0=0;QD=16.59;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:72:597,72,0 chrI 29508 . T C 858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.12;MQ0=0;QD=19.95;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:891,105,0 chrI 29522 . T A 892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=18.98;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:925,105,0 chrI 29530 . C T 895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.4486;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.68;MQ0=0;QD=19.89;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:928,105,0 chrI 29564 . T C 1277 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.55;MQ0=0;QD=22.02;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1310,153,0 chrI 29666 . C A 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.11;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3705,384,0 chrI 29693 . G A 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.34;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2885,309,0 chrI 29713 . T A 2173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.35;MQ0=0;QD=24.98;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2206,252,0 chrI 29746 . T C 1096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.5830;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.76;MQ0=0;QD=22.83;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1129,132,0 chrI 29778 . G A 575 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=20.54;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:69:608,69,0 chrI 29782 . A T 609 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.0622;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.70;MQ0=0;QD=20.30;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:72:642,72,0 chrI 29787 . G A 618 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=28.0287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.74;MQ0=0;QD=19.94;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:75:651,75,0 chrI 29817 . G A 582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=23.28;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:69:615,69,0 chrI 29849 . C T 380 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.8075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.11;MQ0=0;QD=16.52;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:51:413,51,0 chrI 29875 . T G 349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.07;MQ0=0;QD=15.86;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:45:382,45,0 chrI 29883 . T C 328 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=38.6430;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.07;MQ0=0;QD=14.91;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:42:361,42,0 chrI 29908 . C T 468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.30;MQ0=0;QD=16.14;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:57:501,57,0 chrI 29911 . A G 407 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.24;MQ0=0;QD=15.07;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:51:440,51,0 chrI 29927 . G A 63.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.093;DP=25;Dels=0.00;FS=1.799;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.192;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:93:93,0,190 chrI 29929 . A G 301 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.15;MQ0=0;QD=12.54;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:39:334,39,0 chrI 29931 . A C 288 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.15;MQ0=0;QD=12.00;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:36:321,36,0 chrI 29996 . T C 258 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.60;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:33:291,33,0 chrI 30004 . T C 238 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.93;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:33:271,33,0 chrI 30006 . T C 369 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;QD=10.54;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:48:402,48,0 chrI 30051 . C T 480 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.04;MQ0=0;QD=13.33;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:63:513,63,0 chrI 30066 . T A 659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.58;MQ0=0;QD=15.69;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:84:692,84,0 chrI 30071 . G A 687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.84;MQ0=0;QD=18.08;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:84:720,84,0 chrI 30091 . A G 669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=25.5259;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.58;MQ0=0;QD=15.93;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:84:702,84,0 chrI 30153 . G A 1375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.9818;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=22.18;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1408,153,0 chrI 30204 . A G 1167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=23.82;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1200,141,0 chrI 30209 . T A 1136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.19;MQ0=0;QD=24.70;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1169,132,0 chrI 30220 . G A 627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.30;MQ0=0;QD=19.59;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:75:660,75,0 chrI 30239 . A G 350 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.43;MQ0=0;QD=15.91;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:45:383,45,0 chrI 30265 . T G 446 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.84;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:57:479,57,0 chrI 30268 . C G 399 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=16.62;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:51:432,51,0 chrI 30274 . G A 405 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.7889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=16.87;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:51:438,51,0 chrI 30275 . A G 375 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.7889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=15.62;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:48:408,48,0 chrI 30277 . A G 382 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.6660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=15.92;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:48:415,48,0 chrI 30290 . C A 383 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.8200;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=15.96;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:48:416,48,0 chrI 30300 . C A 281 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.86;MQ0=0;QD=16.53;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:39:314,39,0 chrI 30307 . T C 285 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8331;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=17.81;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:39:318,39,0 chrI 30313 . A G 296 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8331;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=18.50;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:39:329,39,0 chrI 30335 . C T 231 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.16;MQ0=0;QD=14.44;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:30:264,30,0 chrI 30351 . A G 46.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=5.87;SB=-5.385e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:79,9,0 chrI 30352 . C A 49.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=6.25;SB=-5.585e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:82,9,0 chrI 30356 . C G 45.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=5.11;SB=-5.291e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:78,9,0 chrI 30361 . A T 78.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=8.72;SB=-8.339e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:111,12,0 chrI 30371 . C A 177.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=14.75;SB=-7.802e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:210,24,0 chrI 30381 . T C 177.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=14.75;SB=-7.702e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:210,24,0 chrI 30413 . G A 182.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=15.17;SB=-7.702e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:215,24,0 chrI 30422 . G A 183.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=20.34;SB=-8.291e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:216,24,0 chrI 30427 . G C 170.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=18.89;SB=-7.891e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:203,24,0 chrI 30432 . G T 156.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.51;SB=-8.081e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:189,21,0 chrI 30434 . C T 155.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.38;SB=-8.081e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:188,21,0 chrI 30458 . C T 33.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.406;SB=-1.725e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:60:63,0,60 chrI 30468 . G A 69.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=17.38;SB=-2.155e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:102,12,0 chrI 30478 . C T 72.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=18.13;SB=-2.155e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:105,12,0 chrI 30493 . G A 96.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=19.25;SB=-2.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:129,15,0 chrI 30516 . G A 240 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=21.82;SB=-4.499e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:273,33,0 chrI 30522 . A G 220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=20.00;SB=-4.398e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:30:253,30,0 chrI 30548 . A G 296 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=21.14;SB=-1.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:39:329,39,0 chrI 30551 . G A 296 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=21.14;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:39:329,39,0 chrI 30558 . G A 299 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=21.36;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:39:332,39,0 chrI 30583 . A G 235 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=18.08;SB=-1.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:33:268,33,0 chrI 30601 . C T 274 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=21.08;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:36:307,36,0 chrI 30602 . G A 274 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=21.08;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:36:307,36,0 chrI 30613 . C T 195.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.99;MQ0=0;QD=19.50;SB=-1.099e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:27:228,27,0 chrI 30614 . T C 192.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.99;MQ0=0;QD=19.20;SB=-1.069e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:27:225,27,0 chrI 30624 . T A 278 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;QD=21.38;SB=-8.000e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:36:311,36,0 chrI 30646 . A G 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;DP=17;Dels=0.00;FS=6.597;HaplotypeScore=8.8879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.321;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:35:74,0,35 chrI 30662 . T G 485 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.38;MQ0=0;QD=20.21;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:63:518,63,0 chrI 30669 . T C 481 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.49;MQ0=0;QD=19.24;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:25:63:514,63,0 chrI 30670 . T C 479 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.49;MQ0=0;QD=19.16;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:63:512,63,0 chrI 30713 . T G 651 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.69;MQ0=0;QD=17.59;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:81:684,81,0 chrI 30747 . A C 948 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.80;MQ0=0;QD=20.17;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:981,114,0 chrI 30749 . G A 946 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.33;MQ0=0;QD=21.02;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:979,108,0 chrI 30755 . C G 830 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.24;MQ0=0;QD=18.04;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:46:99:863,99,0 chrI 30787 . T C 900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.075;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.4976;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.42;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.419;SB=-4.300e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,43:50:45:933,45,0 chrI 30817 . T C 1353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.55;MQ0=0;QD=21.48;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1386,159,0 chrI 30840 . G A 1437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.28;MQ0=0;QD=23.18;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1470,168,0 chrI 30852 . T C 1281 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.075;DP=64;Dels=0.00;FS=4.906;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.90;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-3.958e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,58:64:72:1314,72,0 chrI 30980 . G A 1184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;DP=60;Dels=0.00;FS=8.308;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.30;MQ0=0;MQRankSum=2.300;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.802;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,55:60:73:1217,73,0 chrI 30987 . T G 1274 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.73;MQ0=0;QD=21.59;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1307,147,0 chrI 31018 . G A 1381 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3107;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.26;MQ0=0;QD=21.25;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1414,162,0 chrI 31026 . G C 1547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.75;MQ0=0;QD=21.79;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1580,177,0 chrI 31058 . G A 2013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.20;MQ0=0;QD=22.37;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2046,216,0 chrI 31143 . A G 355.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.812;DP=87;Dels=0.00;FS=20.511;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.40;MQ0=0;MQRankSum=-4.014;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.159;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:385,0,682 chrI 31152 . C T 1648 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.28;MQ0=0;QD=17.17;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:1681,186,0 chrI 31154 . G A 1623 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.55;MQ0=0;QD=16.73;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:1656,189,0 chrI 31161 . A G 500.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.421;DP=107;Dels=0.00;FS=26.654;HaplotypeScore=3.5104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.64;MQ0=0;MQRankSum=-5.084;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.679;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:107:99:530,0,946 chrI 31168 . A G 465.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.600;DP=109;Dels=0.00;FS=26.563;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.83;MQ0=0;MQRankSum=-5.577;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.306;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:495,0,1024 chrI 31191 . C T 478.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.357;DP=111;Dels=0.00;FS=37.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.59;MQ0=0;MQRankSum=-6.357;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.528;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,44:111:99:508,0,1175 chrI 31240 . T C 305.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.113;DP=104;Dels=0.00;FS=58.151;HaplotypeScore=11.8903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQ0=0;MQRankSum=-4.748;QD=2.93;ReadPosRankSum=-4.223;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:335,0,1776 chrI 31246 . A G 180.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.251;DP=99;Dels=0.00;FS=32.254;HaplotypeScore=15.8452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-4.594;QD=1.82;ReadPosRankSum=-4.089;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:210,0,1758 chrI 31260 . G A 190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.825;DP=90;Dels=0.00;FS=12.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.949;QD=2.11;ReadPosRankSum=-1.831;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:220,0,1545 chrI 31265 . G T 257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.591;DP=93;Dels=0.00;FS=19.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.862;QD=2.76;ReadPosRankSum=-2.155;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:287,0,1566 chrI 31383 . T A 1939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;DP=196;Dels=0.00;FS=2.476;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.02;MQ0=0;MQRankSum=-3.631;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.210;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,100:196:99:1969,0,1894 chrI 31391 . A G 4294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.68;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:178:99:4294,459,0 chrI 31403 . T A 1772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.984;DP=181;Dels=0.00;FS=3.827;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.87;MQ0=0;MQRankSum=-4.638;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.211;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,92:181:99:1802,0,1678 chrI 31500 . C T 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;DP=179;Dels=0.00;FS=45.974;HaplotypeScore=205.6512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=0.22;ReadPosRankSum=3.291;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,24:179:69:69,0,1438 chrI 31529 . A G 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.882;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.7365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,95:196:99:1663,0,1687 chrI 31608 . C T 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.094;DP=136;Dels=0.00;FS=7.847;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.442;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1092,0,1543 chrI 31635 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.213;DP=109;Dels=0.00;FS=8.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1233,0,956 chrI 31755 . C T 4251.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.987e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4251,471,0 chrI 31821 . C T 4195.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4195,426,0 chrI 31848 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.914;DP=157;Dels=0.00;FS=3.750;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.656;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,71:157:99:1309,0,1811 chrI 31917 . C T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.481;DP=160;Dels=0.00;FS=3.796;HaplotypeScore=2.4383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.838;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1553,0,1579 chrI 31975 . C T 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.019;DP=192;Dels=0.00;FS=0.539;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.947;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,91:192:99:1739,0,2013 chrI 31989 . T C 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.115;DP=187;Dels=0.00;FS=1.145;HaplotypeScore=9.9051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.352;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,89:187:99:1668,0,1961 chrI 32145 . C T 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.192;DP=150;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.228;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1531,0,1426 chrI 32158 . T C 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.874;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.994;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,86:161:99:1644,0,1543 chrI 32178 . A G 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.909;DP=160;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,80:160:99:1557,0,1594 chrI 32271 . G A 3948.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.269;DP=161;Dels=0.00;FS=4.215;HaplotypeScore=3.9391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=24.52;ReadPosRankSum=1.323;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,160:161:99:3948,417,0 chrI 32280 . C T 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.552;DP=141;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=6.7495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1414,0,1311 chrI 32511 . C T 4338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.991;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8341;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=25.08;ReadPosRankSum=1.151;SB=-1.991e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:4338,449,0 chrI 32574 . T G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.695;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.651;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,66:168:99:1226,0,2066 chrI 32595 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.714;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.540;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,73:177:99:1330,0,2037 chrI 32652 . A C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.912;DP=128;Dels=0.00;FS=3.208;HaplotypeScore=3.7922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.896;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1235,0,1265 chrI 32766 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.653;DP=174;Dels=0.00;FS=3.670;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,81:174:99:1475,0,1751 chrI 32776 . C T 1778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.281;DP=175;Dels=0.00;FS=2.007;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.594;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,93:175:99:1808,0,1504 chrI 32883 . C T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.573;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.068;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1642,0,1272 chrI 32954 . T C 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.952;DP=160;Dels=0.00;FS=2.003;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1560,0,1583 chrI 32989 . G A 4376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=68.0873;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4376,459,0 chrI 33040 . A G 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.492;DP=156;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=3.3787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.549;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1598,0,1563 chrI 33048 . A C 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.901;DP=162;Dels=0.00;FS=1.234;HaplotypeScore=2.5900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.412;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1598,0,1591 chrI 33070 . A T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.672;DP=170;Dels=0.00;FS=2.644;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.687;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,86:170:99:1651,0,1707 chrI 33077 . G A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.685;DP=163;Dels=0.00;FS=5.654;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.027;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1623,0,1618 chrI 33113 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.598;DP=150;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.277;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1332,0,1659 chrI 33140 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.708;DP=144;Dels=0.00;FS=2.998;HaplotypeScore=5.6975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:144:99:1378,0,1423 chrI 33147 . G T 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.485;DP=140;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=7.6469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3563,371,0 chrI 33152 . T C 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.167;DP=142;Dels=0.00;FS=3.009;HaplotypeScore=5.6638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.895;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.463;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1268,0,1515 chrI 33190 . G T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.468;DP=163;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=5.3469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.519;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,68:163:99:1228,0,1887 chrI 33200 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.025;DP=160;Dels=0.00;FS=6.988;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.215;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,66:160:99:1124,0,1907 chrI 33222 . C A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.139;DP=163;Dels=0.00;FS=1.975;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,67:163:99:1249,0,1960 chrI 33237 . G A 2276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.609;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,108:173:99:2306,0,1093 chrI 33240 . A G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.066;DP=179;Dels=0.00;FS=1.201;HaplotypeScore=4.2400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.477;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,68:179:99:1125,0,2350 chrI 33268 . G A 1989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.160;DP=172;Dels=0.00;FS=6.628;HaplotypeScore=3.5118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.691;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,99:172:99:2019,0,1297 chrI 33296 . A T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.541;DP=163;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=2.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.195;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1446,0,1795 chrI 33328 . C A 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3912,420,0 chrI 33347 . T A 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3749,411,0 chrI 33348 . G T 3825.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3825,414,0 chrI 33511 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=1;MQRankSum=2.848;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.960;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,89:175:99:1619,0,1688 chrI 33548 . A C 4226.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=1;QD=24.43;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4226,459,0 chrI 33612 . A G 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3592,405,0 chrI 33690 . G A 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.258;DP=156;Dels=0.00;FS=1.260;HaplotypeScore=7.2847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.612;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,86:156:99:1714,0,1341 chrI 33771 . T C 1768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.746;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=12.45;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,86:142:99:1798,0,1075 chrI 33926 . T C 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;DP=162;Dels=0.00;FS=15.600;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.996;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1695,0,1482 chrI 34182 . C A 2070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.228;DP=166;Dels=0.00;FS=19.360;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,97:166:99:2100,0,1216 chrI 34308 . C T 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.595;DP=191;Dels=0.00;FS=7.490;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,91:191:99:1835,0,1796 chrI 34515 . T C 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.512;DP=194;Dels=0.00;FS=1.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.046;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,89:194:99:1644,0,2135 chrI 34548 . G A 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.256;DP=174;Dels=0.00;FS=1.213;HaplotypeScore=3.8438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.361;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,92:174:99:1882,0,1528 chrI 34695 . C T 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.862;DP=153;Dels=0.00;FS=2.078;HaplotypeScore=3.6788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1705,0,1308 chrI 34794 . T C 2041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.978;DP=206;Dels=0.00;FS=6.965;HaplotypeScore=9.4406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,110:206:99:2071,0,1892 chrI 34948 . T C 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=14.7139;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3637,399,0 chrI 35000 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.297;DP=146;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=13.5346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.803;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:146:99:1219,0,1348 chrI 35044 . A G 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.585;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.246;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:745,0,1226 chrI 35059 . G A,C 2172.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=55.54;MQ0=0;QD=20.30;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,62,45:107:99:2232,796,619,1436,0,1337 chrI 35070 . C T 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.63;MQ0=0;QD=24.06;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2704,303,0 chrI 35145 . T C 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.403;DP=154;Dels=0.00;FS=2.916;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:925,0,936 chrI 35421 . G A 1892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.967;DP=159;Dels=0.00;FS=14.368;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,92:159:99:1922,0,1225 chrI 35466 . G A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.891;DP=140;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1219,0,1365 chrI 35508 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.991;DP=161;Dels=0.00;FS=4.639;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.938;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1477,0,1547 chrI 35565 . A G 3556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=22.94;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3556,390,0 chrI 35568 . A G 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=22.62;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3529,387,0 chrI 35631 . G C 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3233,372,0 chrI 35641 . G C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;DP=138;Dels=0.00;FS=7.838;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.558;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1424,0,1300 chrI 35697 . T G 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.321;DP=166;Dels=0.00;FS=1.215;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.522;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1541,0,1651 chrI 35736 . G A 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;DP=147;Dels=0.00;FS=6.641;HaplotypeScore=2.8139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.024;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1543,0,1245 chrI 35751 . T C 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=22.26;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3295,357,0 chrI 35796 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.686;DP=147;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1322,0,1571 chrI 35818 . A G 4158.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.46;SB=-2.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4158,441,0 chrI 35820 . T C 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.925;DP=168;Dels=0.00;FS=3.571;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.71;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,86:168:99:1662,0,1627 chrI 35970 . T C 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.966;DP=167;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,86:167:99:1721,0,1639 chrI 36005 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.334;DP=159;Dels=0.00;FS=4.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,75:159:99:1269,0,1824 chrI 36048 . C G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;DP=134;Dels=0.00;FS=3.058;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.234;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1270,0,1363 chrI 36123 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.810;DP=135;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=2.6904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.896;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1395,0,1185 chrI 36160 . G A 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.728;DP=136;Dels=0.00;FS=12.439;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1467,0,1103 chrI 36524 . C T 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2764,300,0 chrI 36547 . G A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.229;DP=136;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1606,0,1125 chrI 36552 . T C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;DP=144;Dels=0.00;FS=2.128;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.482;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1586,0,1264 chrI 36574 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.379;DP=172;Dels=0.00;FS=5.410;HaplotypeScore=4.6955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.197;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.284;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,82:172:99:1588,0,1858 chrI 36637 . A G 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.227;DP=155;Dels=0.00;FS=2.873;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1504,0,1634 chrI 36898 . C T 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=1;QD=24.39;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3464,375,0 chrI 37001 . G A 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;DP=177;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=3.3285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,86:177:99:1664,0,1708 chrI 37019 . A G 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.577;DP=184;Dels=0.00;FS=2.795;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.641;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,97:184:99:1777,0,1700 chrI 37148 . A G 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.618;DP=156;Dels=0.00;FS=2.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,89:156:99:1801,0,1305 chrI 37255 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.095;DP=143;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=3.5455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1356,0,1504 chrI 37294 . T C 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3841,414,0 chrI 37315 . T A 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.294;DP=166;Dels=0.00;FS=4.565;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,81:166:99:1586,0,1752 chrI 37330 . A G 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;DP=150;Dels=0.00;FS=2.895;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.464;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1446,0,1504 chrI 37369 . C T 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.492;DP=187;Dels=0.00;FS=1.822;HaplotypeScore=4.8294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.237;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,89:187:99:1778,0,1932 chrI 37409 . A C 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.309;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.491;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1474,0,1309 chrI 37460 . T C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;DP=159;Dels=0.00;FS=3.797;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.302;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:1397,0,1784 chrI 37478 . G C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.943;DP=129;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.592;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1283,0,1174 chrI 37521 . A G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.384;DP=142;Dels=0.00;FS=10.333;HaplotypeScore=2.8996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.777;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1427,0,1371 chrI 37553 . A G 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3476,390,0 chrI 37595 . G A 4135.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4135,432,0 chrI 37682 . T C 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.109;DP=183;Dels=0.00;FS=4.251;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,98:183:99:1692,0,1709 chrI 37885 . C T 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.577;DP=158;Dels=0.00;FS=4.801;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.515;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1541,0,1527 chrI 37922 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.071;DP=164;Dels=0.00;FS=8.051;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.296;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,73:164:99:1451,0,1774 chrI 37976 . C A 4253.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4253,438,0 chrI 38120 . A T 4164.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.86;SB=-2.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4164,435,0 chrI 38236 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.029;DP=165;Dels=0.00;FS=6.806;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=8.62;ReadPosRankSum=-2.202;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1452,0,1763 chrI 38290 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.886;DP=147;Dels=0.00;FS=12.381;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1548,0,1256 chrI 38361 . C T 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3445,369,0 chrI 38490 . C G 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.73;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3047,345,0 chrI 38504 . T G 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2756,306,0 chrI 38508 . G T 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.41;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3067,321,0 chrI 38524 . C A 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.84;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3320,345,0 chrI 38533 . T C 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.67;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3119,336,0 chrI 38657 . G A 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3294,351,0 chrI 38689 . G C 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3534,369,0 chrI 38888 . A C 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3418,369,0 chrI 38980 . G A 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.46;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2707,282,0 chrI 39009 . T C 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=22.10;ReadPosRankSum=0.888;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,135:137:99:3061,292,0 chrI 39105 . A G 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3560,378,0 chrI 39123 . C T 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3686,393,0 chrI 39162 . C G 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2934,315,0 chrI 39301 . C G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.915;DP=135;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=3.5461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.778;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1257,0,1266 chrI 39795 . G A 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8852;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3410,366,0 chrI 39901 . T C 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2726,294,0 chrI 39919 . T C 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2869,312,0 chrI 39920 . T C 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2834,312,0 chrI 39963 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3268,342,0 chrI 40064 . C T 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.900;DP=138;Dels=0.00;FS=1.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.189;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1622,0,1125 chrI 40237 . C T 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3364,348,0 chrI 40380 . G A 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4046,432,0 chrI 40860 . A G 3817.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3817,405,0 chrI 40866 . T C 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3283,357,0 chrI 40914 . C G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3358,363,0 chrI 41259 . G A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.433;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.123;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1442,0,1433 chrI 41278 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.421;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1534,0,1323 chrI 41438 . A C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.397;DP=148;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.610;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1295,0,1620 chrI 41481 . A G 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=17.7424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=22.90;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2918,303,0 chrI 41497 . A C 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.430;DP=105;Dels=0.00;FS=6.308;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=7.84;ReadPosRankSum=2.219;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:853,0,1119 chrI 41499 . A G 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.224;DP=106;Dels=0.00;FS=4.983;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=8.29;ReadPosRankSum=2.192;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:909,0,1161 chrI 41587 . C T 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3385,339,0 chrI 41736 . T C 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3196,333,0 chrI 41739 . A G 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3132,339,0 chrI 41802 . G A 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3085,309,0 chrI 41883 . C T 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3053,327,0 chrI 41906 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.662;DP=128;Dels=0.00;FS=4.338;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.264;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1355,0,1275 chrI 41987 . C T 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3499,375,0 chrI 42048 . T G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;DP=129;Dels=0.00;FS=4.293;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.906;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1347,0,1097 chrI 42115 . T C 2416 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2883;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=21.19;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2449,273,0 chrI 42120 . C T 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.440;DP=109;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=3.2883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:839,0,1035 chrI 42159 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.614;DP=152;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.2393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1424,0,1373 chrI 42257 . G A 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3225,336,0 chrI 42484 . G A 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=19.56;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:2674,285,0 chrI 42527 . T C 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=20.40;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:2665,291,0 chrI 42554 . A T 2403 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=22.89;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2436,255,0 chrI 42562 . G A 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2491,264,0 chrI 42590 . G A 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.70;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2594,273,0 chrI 42629 . A G 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3194,357,0 chrI 42635 . C T 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3537,369,0 chrI 42684 . G A 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3743,414,0 chrI 43004 . G A 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2772,297,0 chrI 43137 . C T 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.749;DP=110;Dels=0.00;FS=4.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=8.54;ReadPosRankSum=-2.170;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:969,0,1191 chrI 43478 . G A 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3765,405,0 chrI 43565 . A G 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3509,378,0 chrI 43691 . C T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.814;DP=110;Dels=0.00;FS=3.532;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:979,0,1165 chrI 43784 . C G 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2723,306,0 chrI 43838 . G A 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.724;DP=168;Dels=0.00;FS=3.832;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,92:168:99:1843,0,1379 chrI 43850 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.430;DP=165;Dels=0.00;FS=6.306;HaplotypeScore=5.7057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.156;QD=8.45;ReadPosRankSum=-2.156;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1424,0,1694 chrI 44276 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.862;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:156:99:1408,0,1586 chrI 44384 . A G 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.262;DP=188;Dels=0.00;FS=4.291;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=1;MQRankSum=0.091;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,83:188:99:1503,0,2098 chrI 44585 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.844;DP=149;Dels=0.00;FS=2.048;HaplotypeScore=3.9526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.264;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1408,0,1434 chrI 44588 . A G 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9526;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3524,390,0 chrI 44666 . G T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.420;DP=146;Dels=0.00;FS=3.866;HaplotypeScore=3.8086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.578;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1486,0,1328 chrI 44675 . G A 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;DP=160;Dels=0.00;FS=2.751;HaplotypeScore=3.8086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=9.94;ReadPosRankSum=-2.288;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,83:160:99:1620,0,1465 chrI 44891 . A G 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.24;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3008,330,0 chrI 44935 . C A 4212.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.22;SB=-2.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4212,414,0 chrI 45024 . G A 4213.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=58.4915;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4213,450,0 chrI 45198 . G A 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3127,348,0 chrI 45431 . G A 1360.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.080;DP=158;Dels=0.00;FS=2.085;HaplotypeScore=2.1188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQ0=0;MQRankSum=2.089;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,91:158:99:1390,0,1033 chrI 45434 . A G 987.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.761;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1017,0,1406 chrI 45435 . C T 1415.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.839;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.150;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,82:147:99:1445,0,947 chrI 45546 . A T 3638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=25.44;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3638,402,0 chrI 45831 . G C 4605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4605,492,0 chrI 46030 . G A 4154.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4154,438,0 chrI 46375 . A T 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3598,369,0 chrI 46447 . C G 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;DP=134;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=2.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1377,0,1192 chrI 46669 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.312;DP=156;Dels=0.00;FS=4.734;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:1268,0,1843 chrI 46723 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.593;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1286,0,1484 chrI 46837 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;DP=172;Dels=0.00;FS=9.080;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.806;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,70:172:99:1259,0,2128 chrI 46846 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.477;DP=163;Dels=0.00;FS=3.795;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,64:163:99:1132,0,2119 chrI 46894 . A G 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3529,390,0 chrI 46912 . T G 3658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3658,414,0 chrI 46966 . T C 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8197;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.323;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3598,390,0 chrI 47015 . C T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.115;DP=126;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=8.57;ReadPosRankSum=2.325;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1110,0,1362 chrI 47044 . A C 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3173,336,0 chrI 47206 . A G 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3244,357,0 chrI 47518 . A G 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=23.91;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2567,306,0 chrI 47660 . T C 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.281;DP=151;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.267;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:151:99:1615,0,1355 chrI 47690 . T C 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.280;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,80:172:99:1504,0,1897 chrI 47845 . A G 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.647;DP=106;Dels=0.00;FS=9.554;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.266;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:964,0,1172 chrI 47896 . C T 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3292,357,0 chrI 47908 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;DP=141;Dels=0.00;FS=6.448;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1295,0,1476 chrI 48115 . G C 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8902;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=23.03;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2843,312,0 chrI 48238 . C A 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.034;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1078,0,1060 chrI 48266 . C T 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=106;Dels=0.00;FS=2.599;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:889,0,1168 chrI 48751 . T C 2192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2225,228,0 chrI 48815 . T C 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.676;DP=96;Dels=0.00;FS=1.665;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.466;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:846,0,1118 chrI 48890 . C T 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2574,264,0 chrI 49103 . C T 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3122,336,0 chrI 49114 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.802;DP=130;Dels=0.00;FS=2.300;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1246,0,1329 chrI 49247 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.666;DP=118;Dels=0.00;FS=3.306;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1331,0,1089 chrI 49403 . C T 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3033,327,0 chrI 49589 . T C 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2932,318,0 chrI 49871 . C T 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3689,393,0 chrI 50024 . C T 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3091,321,0 chrI 50204 . A G 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=22.89;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3365,366,0 chrI 50255 . T G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=122;Dels=0.00;FS=4.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.558;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1180,0,1209 chrI 50343 . A G 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3428,354,0 chrI 50354 . C T 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=142;Dels=0.00;FS=3.198;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=24.61;ReadPosRankSum=-1.391;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3495,360,0 chrI 50384 . G A 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2602,276,0 chrI 50432 . T C 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=1;QD=23.94;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2954,309,0 chrI 50456 . G A 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=1;QD=24.99;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3032,306,0 chrI 50498 . A G 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=1;QD=24.60;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3083,333,0 chrI 50660 . T A 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.32;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2565,279,0 chrI 50663 . C T 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2629,291,0 chrI 50840 . A G 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2998,333,0 chrI 51095 . G A 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3864,399,0 chrI 51287 . T C 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3317,357,0 chrI 51321 . T C 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.27;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3105,342,0 chrI 51371 . A C 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3189,348,0 chrI 51434 . A G 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2895,327,0 chrI 51825 . A G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;DP=131;Dels=0.00;FS=5.832;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.559;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1337,0,1282 chrI 51951 . T G 2329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=22.83;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2362,270,0 chrI 52164 . C T 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.225;DP=115;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=6.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.926;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1098,0,1131 chrI 52310 . A G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.721;DP=120;Dels=0.00;FS=7.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.120;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.439;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1105,0,1283 chrI 52603 . A T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.816;DP=126;Dels=0.00;FS=6.853;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1277,0,1209 chrI 52613 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;DP=132;Dels=0.00;FS=7.989;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.148;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1352,0,1180 chrI 52632 . T C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.474;DP=117;Dels=0.00;FS=5.703;HaplotypeScore=5.7892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.477;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1265,0,1056 chrI 52733 . A G 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.830;DP=113;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:865,0,1237 chrI 52846 . G A 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.623;DP=118;Dels=0.00;FS=7.128;HaplotypeScore=2.5677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:942,0,1238 chrI 52849 . A G 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.293;DP=123;Dels=0.00;FS=2.311;HaplotypeScore=4.5509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1080,0,1299 chrI 52858 . T C 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=113;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=3.8086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQ0=0;MQRankSum=-4.225;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:987,0,1150 chrI 52939 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.809;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.851;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1264,0,1241 chrI 52951 . G T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.306;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.198;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1187,0,1074 chrI 52984 . A G 2330 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.79;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2363,264,0 chrI 52996 . A G 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.043;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=7.60;ReadPosRankSum=2.063;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,38:90:99:714,0,1087 chrI 53146 . T G 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3325,363,0 chrI 53167 . A G 3833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:3833,417,0 chrI 53266 . C T 3773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=23.88;ReadPosRankSum=1.403;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:3773,390,0 chrI 53542 . C T 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3752,402,0 chrI 53836 . A G 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3073,348,0 chrI 53843 . C T 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3321,357,0 chrI 53851 . G A 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3273,351,0 chrI 53935 . A T 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3733,402,0 chrI 53937 . C T 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.539;DP=153;Dels=0.00;FS=5.954;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1744,0,1260 chrI 54009 . T G 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.988;DP=147;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,85:147:99:1708,0,1200 chrI 54136 . G A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.839;DP=132;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.961;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.261;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:132:99:1362,0,1194 chrI 54175 . A G 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=22.63;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3440,375,0 chrI 54198 . G A 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.126;DP=166;Dels=0.00;FS=3.781;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.626;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,88:166:99:1792,0,1429 chrI 54244 . A G 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.85;SB=-2.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4051,453,0 chrI 54319 . T C 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.232;DP=160;Dels=0.00;FS=12.447;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.118;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1725,0,1494 chrI 54427 . T A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.326;DP=118;Dels=0.00;FS=2.362;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.813;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1397,0,986 chrI 54478 . G A 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=22.89;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3215,336,0 chrI 54481 . T C 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=22.90;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3010,321,0 chrI 54508 . A G 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=22.51;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3162,351,0 chrI 54661 . G T 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.995e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4061,441,0 chrI 54679 . C T 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3367,366,0 chrI 54742 . A C 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.64;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3035,336,0 chrI 54784 . A G 2422 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2455,279,0 chrI 54806 . T C 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2862,312,0 chrI 54935 . C T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=116;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.414;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1190,0,1219 chrI 55145 . C T 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3492,372,0 chrI 55171 . A G 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3735,411,0 chrI 55213 . A C 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3329,357,0 chrI 55256 . A G 3827.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3827,441,0 chrI 55327 . C A 4198.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=1;QD=24.55;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4198,429,0 chrI 55508 . T C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3176,348,0 chrI 55525 . A G 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.490;DP=143;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1385,0,1366 chrI 55583 . A T 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.100;DP=111;Dels=0.00;FS=4.616;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.033;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1013,0,1213 chrI 55688 . T C 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3317,351,0 chrI 55721 . C T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.504;DP=126;Dels=0.00;FS=1.442;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.832;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:126:99:1435,0,987 chrI 55793 . T C 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=1;QD=24.45;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3350,372,0 chrI 55841 . T C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;DP=122;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=4.7507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=0.952;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.843;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1161,0,1141 chrI 56007 . A G 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3610,378,0 chrI 56058 . A C 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=159;Dels=0.00;FS=3.696;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1563,0,1571 chrI 56107 . T C 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2738;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=25.00;ReadPosRankSum=0.609;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3625,405,0 chrI 56129 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.327;DP=139;Dels=0.00;FS=5.095;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.249;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1190,0,1453 chrI 56144 . T G 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3403,396,0 chrI 56195 . A G 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3742,420,0 chrI 56351 . G A 2929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2962,315,0 chrI 56786 . G A 4029.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9058;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:99:4029,417,0 chrI 56871 . C T 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3471;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3546,366,0 chrI 56878 . T C 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.131;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=132.0634;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=22.68;ReadPosRankSum=0.681;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3288,341,0 chrI 56904 . G C 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3428,375,0 chrI 57041 . C T 4707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.547;DP=187;Dels=0.00;FS=3.225;HaplotypeScore=8.8925;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=25.17;ReadPosRankSum=0.954;SB=-2.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,186:187:99:4707,473,0 chrI 57155 . G A 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.04;SB=-2.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3956,408,0 chrI 57320 . C T 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3661,399,0 chrI 57455 . C T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.796;DP=161;Dels=0.00;FS=1.960;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.191;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,75:161:99:1460,0,1744 chrI 57669 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.755;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.621;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1388,0,1530 chrI 57853 . T G 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.875;DP=174;Dels=0.00;FS=2.016;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.880;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.272;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,88:174:99:1694,0,1745 chrI 58073 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.436;DP=135;Dels=0.00;FS=6.442;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.456;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1243,0,1258 chrI 58166 . C T 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.577;DP=115;Dels=0.00;FS=3.536;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.011;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:933,0,1278 chrI 59229 . G T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.393;DP=142;Dels=0.00;FS=2.147;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.703;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,56:142:99:990,0,1749 chrI 59349 . A C 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2950,324,0 chrI 59659 . C G 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=23.17;SB=-2.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3823,399,0 chrI 59757 . G A 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.793;DP=165;Dels=0.00;FS=1.239;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.314;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,83:165:99:1660,0,1596 chrI 59823 . T C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.181;DP=157;Dels=0.00;FS=2.852;HaplotypeScore=3.7068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,66:157:99:1195,0,1842 chrI 60036 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.501;DP=159;Dels=0.00;FS=1.256;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,70:159:99:1387,0,1822 chrI 60133 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.618;DP=159;Dels=0.00;FS=2.883;HaplotypeScore=3.6358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.084;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.491;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,70:159:99:1293,0,1863 chrI 60198 . C T 4445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.692;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=25.40;ReadPosRankSum=1.495;SB=-2.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:4445,443,0 chrI 60244 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.952;DP=131;Dels=0.00;FS=6.535;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1362,0,1288 chrI 60267 . G C 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3163,348,0 chrI 60387 . A G 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.721;DP=161;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.747;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1655,0,1512 chrI 60417 . C T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.942;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.622;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:147:99:1347,0,1534 chrI 60774 . T C 4191.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.65;SB=-2.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4191,465,0 chrI 60912 . A G 1940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.469;DP=206;Dels=0.00;FS=0.512;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.281;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,106:206:99:1970,0,1985 chrI 60915 . C T 1851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.261;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,99:207:99:1881,0,2063 chrI 61451 . G A 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.202;DP=182;Dels=0.00;FS=1.833;HaplotypeScore=3.1399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,84:182:99:1564,0,1956 chrI 61585 . C T 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.568;DP=167;Dels=0.00;FS=2.701;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.152;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:1751,0,1578 chrI 61744 . T C 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.183;DP=201;Dels=0.00;FS=2.423;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,91:201:99:1639,0,2220 chrI 61768 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.821;DP=177;Dels=0.00;FS=1.182;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.546;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,81:177:99:1535,0,1930 chrI 61990 . T C 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.579;DP=157;Dels=0.00;FS=1.254;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.367;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1454,0,1575 chrI 62053 . G T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.539;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1515,0,1488 chrI 62131 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.808;DP=141;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.553;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1350,0,1323 chrI 62134 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;DP=132;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1230,0,1306 chrI 62146 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.213;DP=130;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=4.3540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1305,0,1217 chrI 62308 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.602;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.300;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1455,0,1445 chrI 62361 . T C 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.934;DP=166;Dels=0.00;FS=1.229;HaplotypeScore=7.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,81:166:99:1535,0,1757 chrI 62565 . G A 1904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.867;DP=173;Dels=0.00;FS=1.927;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.939;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,100:173:99:1934,0,1326 chrI 62654 . C T 1931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.793;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,92:145:99:1961,0,939 chrI 62695 . G A 2009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.327;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.755;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,101:178:99:2039,0,1440 chrI 62950 . C T 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;DP=176;Dels=0.00;FS=8.843;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.203;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,94:176:99:1892,0,1441 chrI 63012 . C G 1786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.624;DP=204;Dels=0.00;FS=9.503;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,99:204:99:1816,0,1876 chrI 63025 . T C 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.453;DP=173;Dels=0.00;FS=9.110;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=2.380;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.193;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,81:173:99:1534,0,1865 chrI 63385 . T C 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.617;DP=177;Dels=0.00;FS=1.918;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,94:177:99:1829,0,1622 chrI 63520 . T A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.342;DP=129;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.470;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1465,0,1102 chrI 63658 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.678;DP=127;Dels=0.00;FS=1.524;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=-0.318;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.086;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1317,0,1190 chrI 64094 . C T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.760;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=9.60;ReadPosRankSum=2.091;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1460,0,1455 chrI 64315 . C T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.458;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.726;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.940;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1477,0,1147 chrI 64477 . C T 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=143;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1572,0,1191 chrI 64663 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.458;DP=164;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.351;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,65:164:99:1176,0,2140 chrI 64676 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.040;DP=173;Dels=0.00;FS=3.644;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,72:173:99:1428,0,2047 chrI 64781 . T C 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.461;DP=133;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.913;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1079,0,1584 chrI 64907 . G A 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.463;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.710;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1528,0,1568 chrI 65036 . C T 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.669;DP=166;Dels=0.00;FS=1.241;HaplotypeScore=6.0387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,93:166:99:1871,0,1380 chrI 65365 . G A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.798;DP=126;Dels=0.00;FS=5.491;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1394,0,1105 chrI 65414 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.046;DP=162;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.824;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.402;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1654,0,1598 chrI 65453 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.641;DP=153;Dels=0.00;FS=6.227;HaplotypeScore=5.0564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1426,0,1547 chrI 65462 . A T 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;DP=156;Dels=0.00;FS=7.297;HaplotypeScore=5.8324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.836;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:156:99:1557,0,1604 chrI 65506 . T C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.046;DP=144;Dels=0.00;FS=5.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.347;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1178,0,1570 chrI 65514 . A T 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.859;DP=147;Dels=0.00;FS=3.065;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.701;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1235,0,1565 chrI 65570 . A G 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.179;DP=123;Dels=0.00;FS=11.009;HaplotypeScore=3.8906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:948,0,1342 chrI 65590 . T C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;DP=121;Dels=0.00;FS=8.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.589;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:964,0,1166 chrI 65627 . T G 789.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.856;DP=121;Dels=0.00;FS=1.454;HaplotypeScore=62.3803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=6.52;ReadPosRankSum=3.465;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:819,0,473 chrI 65628 . G T 102.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.842;DP=123;Dels=0.00;FS=101.039;HaplotypeScore=61.3870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=0.83;ReadPosRankSum=-5.212;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,24:123:99:132,0,1370 chrI 65630 . A T 75.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;DP=122;Dels=0.00;FS=79.734;HaplotypeScore=58.4127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=0.61;ReadPosRankSum=-6.332;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,18:122:99:105,0,1433 chrI 65631 . A T 51.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;DP=124;Dels=0.00;FS=66.597;HaplotypeScore=54.4463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=0.41;ReadPosRankSum=-5.590;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,16:124:81:81,0,1613 chrI 65871 . G A 1778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.693;DP=180;Dels=0.00;FS=3.418;HaplotypeScore=3.4348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,92:180:99:1808,0,1744 chrI 65892 . A C 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3928,426,0 chrI 65910 . T C 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8898;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.993;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3733,389,0 chrI 65991 . G A 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3647,387,0 chrI 66003 . T C 4037.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4037,453,0 chrI 66033 . A G 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3789,414,0 chrI 66413 . T G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.959;DP=149;Dels=0.00;FS=2.071;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.612;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1392,0,1619 chrI 66488 . T C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;DP=146;Dels=0.00;FS=4.972;HaplotypeScore=4.8539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.122;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1343,0,1506 chrI 66690 . C T 2239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.751;DP=198;Dels=0.00;FS=1.768;HaplotypeScore=4.3826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.787;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,111:198:99:2269,0,1695 chrI 66731 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.375;DP=152;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1377,0,1680 chrI 66841 . G A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.608;DP=133;Dels=0.00;FS=2.189;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1327,0,1234 chrI 66984 . G A 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.832;DP=153;Dels=0.00;FS=3.803;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=2.253;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.449;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1626,0,1343 chrI 67269 . A G 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3157,354,0 chrI 67275 . G A 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3214,339,0 chrI 67421 . A C 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8529;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3099,348,0 chrI 67441 . G A 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7732;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3279,351,0 chrI 67476 . C G 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3642,402,0 chrI 68074 . A G 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=22.69;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3141,363,0 chrI 68178 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.367;DP=134;Dels=0.00;FS=2.572;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.454;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1224,0,1164 chrI 68650 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.239;DP=157;Dels=0.00;FS=1.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.027;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1518,0,1554 chrI 68785 . A C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.538;DP=173;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=5.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.952;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,79:173:99:1331,0,1891 chrI 68791 . G A 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.714;DP=193;Dels=0.00;FS=6.152;HaplotypeScore=2.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.923;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,91:193:99:1614,0,2061 chrI 69403 . C T 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.239;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=11.03;ReadPosRankSum=2.157;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,87:155:99:1740,0,1285 chrI 69585 . A G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;DP=138;Dels=0.00;FS=7.500;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:138:99:1524,0,1165 chrI 69603 . T C 3623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=25.34;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3623,408,0 chrI 69675 . G A 1776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.933;DP=132;Dels=0.00;FS=27.147;HaplotypeScore=2.5584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.73;MQ0=0;MQRankSum=2.887;QD=13.45;ReadPosRankSum=4.300;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,119:132:99:1809,161,0 chrI 69759 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.227;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.012;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,76:122:99:1484,0,691 chrI 69767 . G A 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.214;DP=125;Dels=0.00;FS=3.009;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.796;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,46:125:99:733,0,1584 chrI 69951 . A T 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;DP=180;Dels=0.00;FS=7.936;HaplotypeScore=5.8059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,90:180:99:1806,0,1775 chrI 69981 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.462;DP=176;Dels=0.00;FS=8.996;HaplotypeScore=5.6883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.196;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,80:176:99:1475,0,1906 chrI 69998 . T A 1885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;DP=168;Dels=0.00;FS=8.111;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,96:168:99:1915,0,1410 chrI 70015 . A G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.205;DP=180;Dels=0.00;FS=2.832;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.961;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,78:180:99:1449,0,2017 chrI 70024 . T C 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;DP=195;Dels=0.00;FS=6.378;HaplotypeScore=2.8963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.987;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,83:195:99:1543,0,2222 chrI 70045 . A G 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4012,438,0 chrI 70071 . C T 4209.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.51;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4209,438,0 chrI 70228 . T C 539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.378;DP=133;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=13.4667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.942;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:569,0,1439 chrI 70280 . A G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.500;DP=147;Dels=0.00;FS=2.916;HaplotypeScore=2.7200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.440;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1422,0,1215 chrI 70345 . G T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.741;DP=116;Dels=0.00;FS=2.507;HaplotypeScore=4.5438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.293;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:116:99:1294,0,1013 chrI 70497 . A G 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.213;DP=101;Dels=0.00;FS=2.552;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.818;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:851,0,1063 chrI 71287 . C T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;DP=182;Dels=0.00;FS=3.524;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,81:182:99:1540,0,2034 chrI 71601 . G A 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.01;MQ0=0;QD=22.97;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3249,348,0 chrI 72928 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.421;DP=118;Dels=0.00;FS=3.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.930;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1217,0,1030 chrI 73490 . T C 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.472;DP=116;Dels=0.00;FS=20.373;HaplotypeScore=2.7094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1115,0,1147 chrI 73976 . A T 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=8.42;ReadPosRankSum=2.830;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1284,0,1761 chrI 73999 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.756;DP=131;Dels=0.00;FS=2.204;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=2.487;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1169,0,1466 chrI 74047 . C T 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.169;DP=193;Dels=0.00;FS=3.295;HaplotypeScore=5.3259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=8.95;ReadPosRankSum=2.272;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,90:193:99:1758,0,2084 chrI 74050 . A G 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.195;DP=192;Dels=0.00;FS=5.077;HaplotypeScore=5.3259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=8.42;ReadPosRankSum=2.354;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,90:192:99:1647,0,2126 chrI 74363 . C A 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.065;DP=188;Dels=0.00;FS=1.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.446;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,91:188:99:1653,0,1888 chrI 74580 . C T 1754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.101;DP=174;Dels=0.00;FS=3.615;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.452;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,86:174:99:1784,0,1699 chrI 74674 . G A 1780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;DP=160;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=3.7603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,92:160:99:1810,0,1331 chrI 75211 . T C 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.008;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=1;MQRankSum=2.860;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.121;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,84:176:99:1531,0,1916 chrI 75220 . C T 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;DP=167;Dels=0.00;FS=1.217;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=1;MQRankSum=-0.425;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.458;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,89:167:99:1751,0,1483 chrI 76368 . G C 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=23.30;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2526,291,0 chrI 76386 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.937;DP=116;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.135;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1184,0,1084 chrI 76417 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.130;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1245,0,1085 chrI 76456 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.981;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=10.41;ReadPosRankSum=2.163;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1290,0,1103 chrI 76496 . A G 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.740;DP=119;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=11.16;ReadPosRankSum=-2.902;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,70:119:99:1358,0,1008 chrI 76497 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.580;DP=123;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.979;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,73:123:99:1452,0,997 chrI 76762 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.626;DP=144;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.012;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1326,0,1537 chrI 77073 . A G 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.762;DP=121;Dels=0.00;FS=8.381;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1319,0,1065 chrI 77115 . G T 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2853,306,0 chrI 77152 . A G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.293;DP=112;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1100,0,1121 chrI 77226 . C T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.805;DP=126;Dels=0.00;FS=18.987;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.798;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1300,0,1255 chrI 77737 . C T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1103,0,1129 chrI 81442 . G A 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;DP=139;Dels=0.00;FS=4.443;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,80:139:99:1656,0,1114 chrI 81691 . A G 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.131;DP=146;Dels=0.00;FS=7.364;HaplotypeScore=2.5009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.562;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1624,0,1238 chrI 81731 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.665;DP=123;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.417;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.058;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1231,0,1214 chrI 81922 . C A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.107;DP=148;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1525,0,1381 chrI 81961 . A G 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.897;DP=154;Dels=0.00;FS=2.971;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.816;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,88:154:99:1737,0,1237 chrI 82099 . C T 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.703;DP=175;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,86:175:99:1734,0,1787 chrI 82106 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.061;DP=149;Dels=0.00;FS=2.073;HaplotypeScore=6.2058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:149:99:1423,0,1496 chrI 82136 . G A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.542;DP=137;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.270;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1225,0,1471 chrI 82379 . G A 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3649,381,0 chrI 82464 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.655;DP=127;Dels=0.00;FS=4.296;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.036;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1032,0,1461 chrI 82599 . C T 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.802;DP=150;Dels=0.00;FS=4.882;HaplotypeScore=4.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1336,0,1475 chrI 82662 . A G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.708;DP=146;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.409;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1509,0,1408 chrI 82711 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;DP=117;Dels=0.00;FS=5.689;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.163;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1206,0,1094 chrI 83452 . G T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.321;DP=128;Dels=0.00;FS=4.268;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.122;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1449,0,1015 chrI 83613 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.244;DP=131;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.630;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1192,0,1454 chrI 84076 . C T 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.966;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=10.39;ReadPosRankSum=2.759;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:138:99:1464,0,1140 chrI 84108 . A G 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.666;DP=155;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.632;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,87:155:99:1660,0,1215 chrI 84578 . C G 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;DP=119;Dels=0.00;FS=3.347;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.903;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:119:99:1019,0,1306 chrI 84810 . A C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.908;DP=123;Dels=0.00;FS=3.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.995;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1166,0,1310 chrI 85480 . C T 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2743,294,0 chrI 85751 . C T 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;QD=24.62;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2864,300,0 chrI 87859 . T G 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.403;DP=162;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.596;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1602,0,1662 chrI 88008 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.780;DP=107;Dels=0.00;FS=6.039;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.315;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1174,0,1004 chrI 88173 . C A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.994;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.324;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1054,0,1060 chrI 88212 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;DP=113;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.878;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1226,0,1066 chrI 88270 . T C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.637;DP=153;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=6.7564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=9.20;ReadPosRankSum=-2.436;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1438,0,1562 chrI 88393 . A C 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.313;DP=105;Dels=0.00;FS=1.641;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:105:99:870,0,1241 chrI 88638 . A G 2140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=23.26;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2173,243,0 chrI 88645 . G C 2366 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2399,258,0 chrI 88782 . G A 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.832;DP=133;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=2.375;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1167,0,1502 chrI 88812 . A G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.312;DP=126;Dels=0.00;FS=2.262;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:126:99:1059,0,1371 chrI 89010 . T C 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.055;DP=120;Dels=0.00;FS=8.435;HaplotypeScore=4.6776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.221;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:120:99:1098,0,1273 chrI 89060 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1009,0,1141 chrI 89266 . A C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.360;DP=121;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=2.7468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.764;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:121:99:1080,0,1198 chrI 89268 . T C 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.143;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1064,0,1240 chrI 89334 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.758;DP=127;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=5.2025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1198,0,1345 chrI 89430 . C T 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=122;Dels=0.00;FS=1.483;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.145;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:958,0,1447 chrI 89433 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;DP=121;Dels=0.00;FS=2.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:977,0,1427 chrI 89472 . A G 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.466;DP=128;Dels=0.00;FS=11.850;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.641;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,46:128:99:774,0,1707 chrI 89484 . C G 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.185;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,49:125:99:826,0,1579 chrI 89494 . A G 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.737;DP=119;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.417;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,48:119:99:846,0,1481 chrI 89561 . T C 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.234;DP=124;Dels=0.00;FS=2.384;HaplotypeScore=3.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:958,0,1440 chrI 89679 . T A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.524;DP=121;Dels=0.00;FS=2.422;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:956,0,1380 chrI 89705 . T C 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.982;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:115:99:973,0,1260 chrI 89805 . C T 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=1;QD=24.50;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3749,390,0 chrI 89979 . A G 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.319;DP=106;Dels=0.00;FS=9.255;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1042,0,1094 chrI 90064 . G T 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.749;DP=89;Dels=0.00;FS=2.799;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.325;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:852,0,991 chrI 90253 . G C 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.761;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.952;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:871,0,1165 chrI 90330 . G T 1934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.12;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1967,219,0 chrI 90516 . G A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.482;DP=120;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.488;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1436,0,925 chrI 90665 . C T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.373;DP=138;Dels=0.00;FS=5.135;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1459,0,1300 chrI 91110 . G A 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.471;DP=101;Dels=0.00;FS=18.124;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=1;MQRankSum=0.822;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.518;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:928,0,1031 chrI 91173 . G A 695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.415;DP=98;Dels=0.00;FS=1.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=1;MQRankSum=0.685;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.994;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,37:98:99:725,0,1202 chrI 91209 . G A 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.645;DP=116;Dels=0.00;FS=9.325;HaplotypeScore=3.9526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.929;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,44:116:99:827,0,1466 chrI 91614 . A G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;DP=115;Dels=0.00;FS=4.507;HaplotypeScore=3.9526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.518;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1201,0,1067 chrI 91665 . G A 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.255;DP=122;Dels=0.00;FS=8.937;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.077;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1306,0,1117 chrI 91791 . A C 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.550;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=8.70;ReadPosRankSum=1.366;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1379,0,1671 chrI 91812 . G C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1402,0,1521 chrI 91938 . A T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.009;DP=116;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.006;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1060,0,1251 chrI 92115 . G C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.275;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.312;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1117,0,1069 chrI 92310 . G T 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.683;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.563;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1074,0,1061 chrI 92368 . A T 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.000;DP=96;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,55:96:99:1122,0,795 chrI 92532 . C T 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.507;DP=90;Dels=0.00;FS=1.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.206;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:751,0,975 chrI 92703 . G T 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.897;DP=107;Dels=0.00;FS=2.490;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.340;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1005,0,1116 chrI 92722 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;DP=129;Dels=0.00;FS=3.158;HaplotypeScore=7.6847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.583;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1337,0,1110 chrI 92724 . T G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.207;DP=122;Dels=0.02;FS=8.437;HaplotypeScore=7.6847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.754;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1245,0,1144 chrI 92769 . T C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.206;DP=108;Dels=0.00;FS=1.625;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=8.27;ReadPosRankSum=-2.124;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:923,0,1208 chrI 92841 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.351;DP=117;Dels=0.00;FS=12.410;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=9.11;ReadPosRankSum=-2.272;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1096,0,1245 chrI 92891 . C T 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3379,357,0 chrI 92913 . A T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.281;DP=121;Dels=0.00;FS=3.308;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.806;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1147,0,1245 chrI 93281 . C T 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.046;DP=155;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1589,0,1492 chrI 93341 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.842;DP=131;Dels=0.00;FS=4.246;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.811;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1268,0,1278 chrI 93563 . G A 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=22.76;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2946,315,0 chrI 93674 . A G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;DP=137;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=3.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.852;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1247,0,1476 chrI 93789 . T A 2328 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.03;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2361,252,0 chrI 94034 . A C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.596;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.598;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1003,0,1014 chrI 94267 . T A 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;DP=99;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:988,0,878 chrI 94285 . T C 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.486;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.249;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:102:99:887,0,1089 chrI 94472 . G A 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.82;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2976,312,0 chrI 94488 . A G 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.936;DP=105;Dels=0.00;FS=1.875;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:892,0,1207 chrI 94682 . G A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.651;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:978,0,1119 chrI 94767 . C G 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;DP=119;Dels=0.00;FS=4.415;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=8.11;ReadPosRankSum=-2.130;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:995,0,1409 chrI 94863 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.555;DP=112;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.841;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:112:99:1171,0,1061 chrI 94915 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.612;DP=107;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=4.2366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.658;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1014,0,1146 chrI 95018 . T C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.995;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.358;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1004,0,1390 chrI 95043 . A T 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;DP=114;Dels=0.00;FS=5.823;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1001,0,1193 chrI 95055 . G A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.206;DP=117;Dels=0.00;FS=2.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1021,0,1213 chrI 95073 . T A 658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.258;DP=103;Dels=0.00;FS=3.868;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=6.39;ReadPosRankSum=2.291;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,40:103:99:688,0,1329 chrI 95116 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.073;DP=113;Dels=0.00;FS=2.414;HaplotypeScore=3.5838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=8.59;ReadPosRankSum=-2.038;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1001,0,1211 chrI 95139 . G A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.090;DP=111;Dels=0.00;FS=5.933;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=8.71;ReadPosRankSum=1.600;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:997,0,1236 chrI 95169 . G A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.070;DP=117;Dels=0.00;FS=2.368;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.279;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:117:99:1158,0,1185 chrI 95190 . T C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.344;DP=108;Dels=0.00;FS=2.496;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1073,0,1136 chrI 95238 . A T 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;DP=101;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=3.4953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.248;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1053,0,992 chrI 96049 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.291;DP=135;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=3.8925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.463;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1350,0,1272 chrI 96673 . A T 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.597;DP=126;Dels=0.00;FS=5.485;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=10.95;ReadPosRankSum=-2.024;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1410,0,1184 chrI 99471 . A G 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3813,396,0 chrI 99522 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.694;DP=132;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1277,0,1341 chrI 99929 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.326;DP=109;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.312;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1067,0,1084 chrI 100048 . G T 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.409;DP=94;Dels=0.00;FS=3.328;HaplotypeScore=5.8398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=1;MQRankSum=-0.543;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.574;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:805,0,814 chrI 101173 . T A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;DP=143;Dels=0.00;FS=10.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.137;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1481,0,1491 chrI 101583 . A T 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;DP=147;Dels=0.01;FS=3.977;HaplotypeScore=7.3563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.267;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:912,0,1880 chrI 101793 . G A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.317;DP=135;Dels=0.00;FS=3.072;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.733;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1261,0,1338 chrI 102345 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.795;DP=120;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1374,0,983 chrI 102348 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.125;DP=120;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1303,0,1061 chrI 102425 . C T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.834;DP=155;Dels=0.00;FS=3.755;HaplotypeScore=4.9543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1443,0,1653 chrI 102486 . G A 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.913;DP=151;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.370;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,86:151:99:1736,0,1251 chrI 102626 . C T 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.271;DP=121;Dels=0.00;FS=4.429;HaplotypeScore=2.8542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1129,0,1232 chrI 103146 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.693;DP=125;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1037,0,1360 chrI 103433 . C T 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.981;DP=157;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,91:157:99:1840,0,1234 chrI 103866 . G A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;DP=151;Dels=0.00;FS=5.919;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.702;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1461,0,1499 chrI 104691 . T A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;DP=140;Dels=0.00;FS=3.072;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.675;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1446,0,1356 chrI 104763 . A C 1846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.626;DP=182;Dels=0.00;FS=1.237;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.230;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,97:182:99:1876,0,1709 chrI 105258 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.199;DP=137;Dels=0.00;FS=3.042;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1529,0,1142 chrI 105600 . A G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.092;DP=152;Dels=0.00;FS=1.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=1;MQRankSum=1.827;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1323,0,1615 chrI 105800 . C A 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.047;DP=140;Dels=0.00;FS=5.667;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.284;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1550,0,1259 chrI 106141 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.926;DP=116;Dels=0.00;FS=2.685;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1194,0,1199 chrI 106240 . T C 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.748;DP=152;Dels=0.00;FS=6.047;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.041;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1579,0,1543 chrI 107087 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.244;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1565,0,1495 chrI 107538 . G A 4349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9067;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=1;QD=25.43;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4349,444,0 chrI 107970 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;DP=142;Dels=0.00;FS=3.033;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,61:142:99:1190,0,1598 chrI 108718 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.088;DP=159;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.392;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,67:159:99:1280,0,1774 chrI 108810 . A C 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;DP=123;Dels=0.00;FS=2.592;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.636;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:930,0,1487 chrI 108812 . T C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.678;DP=119;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.010;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,71:119:99:1375,0,927 chrI 108830 . C T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.204;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQ0=0;MQRankSum=-3.025;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.188;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1060,0,1437 chrI 108928 . G A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.463;DP=168;Dels=0.00;FS=6.133;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,80:168:99:1538,0,1762 chrI 109283 . G A 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.173;DP=175;Dels=0.00;FS=6.663;HaplotypeScore=3.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=9.69;ReadPosRankSum=-2.118;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,85:175:99:1725,0,1632 chrI 109735 . A G 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3826,414,0 chrI 110101 . G A 4207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4207,441,0 chrI 110131 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.752;DP=132;Dels=0.00;FS=6.539;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1213,0,1433 chrI 110146 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.915;DP=155;Dels=0.00;FS=7.009;HaplotypeScore=4.9361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.177;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1397,0,1647 chrI 110595 . A G 2349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=24.73;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2382,273,0 chrI 110728 . A G 1588.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.594;DP=163;Dels=0.00;FS=3.232;HaplotypeScore=4.2534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=11;MQRankSum=0.827;QD=9.74;ReadPosRankSum=-2.402;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:163:99:1618,0,1103 chrI 110856 . T C 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3919,432,0 chrI 110975 . C A 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.314;DP=160;Dels=0.00;FS=6.093;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=0.067;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.987;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1646,0,1516 chrI 111180 . T C 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.198;DP=134;Dels=0.00;FS=9.892;HaplotypeScore=5.9459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=1;MQRankSum=1.370;QD=12.54;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,85:134:99:1711,0,845 chrI 111245 . T C 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.457;DP=150;Dels=0.00;FS=2.932;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=2;MQRankSum=0.816;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:150:99:1418,0,1480 chrI 111362 . C T 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.010;DP=195;Dels=0.01;FS=2.603;HaplotypeScore=5.1466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=1;MQRankSum=0.374;QD=7.66;ReadPosRankSum=-1.446;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,83:194:99:1524,0,2254 chrI 111401 . A G 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.614;DP=173;Dels=0.00;FS=4.441;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=1;MQRankSum=0.796;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.181;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,87:173:99:1607,0,1806 chrI 111581 . G A 2370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.493;DP=202;Dels=0.00;FS=3.889;HaplotypeScore=7.4227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.494;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,116:202:99:2400,0,1453 chrI 111655 . G A 2008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.146;DP=183;Dels=0.00;FS=0.547;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,103:183:99:2038,0,1496 chrI 111731 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.530;DP=164;Dels=0.00;FS=1.940;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.668;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1470,0,1509 chrI 111881 . A G 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.682;DP=209;Dels=0.00;FS=1.065;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.532;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,102:209:99:1730,0,2155 chrI 111956 . C T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.710;DP=136;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.213;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1467,0,1249 chrI 111983 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.080;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.97;ReadPosRankSum=2.247;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1375,0,1558 chrI 111986 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.848;DP=149;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=9.03;ReadPosRankSum=2.157;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1376,0,1588 chrI 112117 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.216;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1439,0,1650 chrI 112136 . G T 4113.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.988e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4113,435,0 chrI 112184 . T C 1802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.466;DP=177;Dels=0.00;FS=1.852;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=2.848;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,90:177:99:1832,0,1776 chrI 112207 . A G 1885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.371;DP=154;Dels=0.00;FS=3.843;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,91:154:99:1915,0,1246 chrI 112232 . G A 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;DP=144;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.354;QD=11.56;ReadPosRankSum=2.442;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1694,0,1260 chrI 112237 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.293;DP=136;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,56:136:99:1133,0,1669 chrI 112339 . A G 1782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.863;DP=180;Dels=0.00;FS=0.565;HaplotypeScore=2.4317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.047;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,97:180:99:1812,0,1709 chrI 112373 . C G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.505;DP=152;Dels=0.00;FS=8.500;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1378,0,1500 chrI 112578 . T C 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.116;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.458;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,85:152:99:1663,0,1317 chrI 112808 . C T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.534;DP=138;Dels=0.00;FS=5.298;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:1666,0,1121 chrI 113132 . A G 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.063;DP=159;Dels=0.00;FS=1.993;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=-0.644;QD=9.49;ReadPosRankSum=3.372;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1539,0,1407 chrI 113207 . T C 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3566,402,0 chrI 113326 . C G 4655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:4655,489,0 chrI 113416 . G A 2162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.864;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,108:189:99:2192,0,1482 chrI 113440 . T C 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.703;DP=131;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=2.8555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.809;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,79:131:99:1446,0,977 chrI 113665 . A G 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.531;DP=197;Dels=0.00;FS=0.524;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,99:197:99:1744,0,1961 chrI 113789 . G A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.897;DP=161;Dels=0.00;FS=1.965;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.623;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1492,0,1631 chrI 113857 . G C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.102;DP=146;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.998;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,64:146:99:1132,0,1533 chrI 113890 . T C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;DP=145;Dels=0.00;FS=3.969;HaplotypeScore=2.2301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.177;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.825;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1067,0,1544 chrI 113907 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.991;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1218,0,1331 chrI 114102 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.520;DP=167;Dels=0.00;FS=5.057;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.842;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,75:167:99:1461,0,1749 chrI 114112 . C T 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.962;DP=171;Dels=0.00;FS=5.016;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.190;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,79:171:99:1559,0,1729 chrI 114133 . T C 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.353;DP=173;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=3.1104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.038;QD=8.74;ReadPosRankSum=-1.008;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,82:173:99:1542,0,1693 chrI 114148 . T G 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.273;DP=161;Dels=0.00;FS=1.979;HaplotypeScore=4.0922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.865;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.463;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1488,0,1494 chrI 114227 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.862;DP=181;Dels=0.00;FS=1.217;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,67:181:99:1214,0,2260 chrI 114258 . G C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.641;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,74:191:99:1301,0,2411 chrI 114589 . A G 1836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;DP=201;Dels=0.00;FS=16.582;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.352;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,99:201:99:1866,0,1961 chrI 114628 . G T 2162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.154;DP=194;Dels=0.00;FS=17.592;HaplotypeScore=3.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.917;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,105:194:99:2192,0,1636 chrI 114652 . C T 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8436;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3509,369,0 chrI 114814 . C A 1847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.350;DP=181;Dels=0.00;FS=7.397;HaplotypeScore=16.0690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.268;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,94:181:99:1877,0,1704 chrI 114824 . C T 4027.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.688;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6306;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=25.65;ReadPosRankSum=1.247;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:4027,410,0 chrI 115629 . A G 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;DP=171;Dels=0.00;FS=1.916;HaplotypeScore=5.3506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,79:171:99:1520,0,1837 chrI 115665 . C T 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.990;DP=196;Dels=0.00;FS=6.943;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,95:196:99:1754,0,2026 chrI 115977 . G A 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;DP=131;Dels=0.00;FS=6.540;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.183;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1026,0,1387 chrI 115998 . T C 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.279;DP=171;Dels=0.00;FS=3.526;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.089;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,83:171:99:1501,0,1650 chrI 116037 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.627;DP=154;Dels=0.00;FS=2.008;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.016;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1407,0,1555 chrI 116327 . T C 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3456,384,0 chrI 116334 . C T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;DP=155;Dels=0.00;FS=5.986;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.787;QD=7.53;ReadPosRankSum=2.487;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,67:155:99:1197,0,1766 chrI 116340 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.321;DP=157;Dels=0.00;FS=3.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.035;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.750;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,70:157:99:1276,0,1769 chrI 116511 . C T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.771;DP=169;Dels=0.00;FS=1.962;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,76:169:99:1477,0,1792 chrI 116548 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.176;DP=139;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.360;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1143,0,1648 chrI 116850 . T A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;DP=116;Dels=0.00;FS=6.243;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.029;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1271,0,1098 chrI 117063 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.538;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.846;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1075,0,1058 chrI 117504 . A C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.698;DP=124;Dels=0.00;FS=6.852;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=10.73;ReadPosRankSum=-2.086;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1361,0,1158 chrI 117510 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.526;DP=127;Dels=0.00;FS=12.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1356,0,1201 chrI 117669 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.951;DP=153;Dels=0.00;FS=1.282;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.340;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1275,0,1753 chrI 117678 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.889;DP=153;Dels=0.00;FS=2.983;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=7.67;ReadPosRankSum=2.240;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,63:153:99:1204,0,1723 chrI 117940 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.482;DP=149;Dels=0.00;FS=1.283;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1377,0,1530 chrI 118143 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;DP=99;Dels=0.00;FS=3.729;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.907;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1037,0,903 chrI 118332 . A G 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;DP=91;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1001,0,814 chrI 118723 . A G 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.754;DP=127;Dels=0.00;FS=2.293;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1450,0,1067 chrI 118822 . T C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.289;DP=115;Dels=0.00;FS=8.837;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=10.25;ReadPosRankSum=-3.020;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1209,0,947 chrI 118997 . G A 2068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;DP=182;Dels=0.00;FS=18.179;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,104:182:99:2098,0,1459 chrI 119050 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.547;DP=146;Dels=0.00;FS=14.642;HaplotypeScore=3.6937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1456,0,1522 chrI 119167 . C G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;DP=134;Dels=0.00;FS=2.275;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=-0.082;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.506;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:134:99:1230,0,1359 chrI 119242 . C T 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;DP=153;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1546,0,1500 chrI 119344 . G A 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;DP=167;Dels=0.00;FS=5.605;HaplotypeScore=2.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.560;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,83:167:99:1666,0,1684 chrI 119350 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.208;DP=161;Dels=0.00;FS=6.880;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1529,0,1622 chrI 119387 . C T 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.533;DP=150;Dels=0.00;FS=8.591;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.038;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1476,0,1540 chrI 119404 . G C 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;DP=149;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1581,0,1318 chrI 119460 . G A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.544;DP=137;Dels=0.00;FS=3.071;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1393,0,1366 chrI 119605 . C T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.046;DP=139;Dels=0.00;FS=2.250;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.187;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1299,0,1384 chrI 119659 . T G 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.401;DP=158;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=2.997;QD=10.83;ReadPosRankSum=-2.046;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1741,0,1322 chrI 119951 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.462;DP=132;Dels=0.00;FS=6.398;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1286,0,1355 chrI 120274 . T G 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.099;DP=142;Dels=0.00;FS=5.149;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.094;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,58:142:99:1034,0,1772 chrI 120281 . A G 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.743;DP=140;Dels=0.00;FS=3.139;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.643;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1662,0,1086 chrI 120347 . C T 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.760;DP=107;Dels=0.00;FS=1.584;HaplotypeScore=2.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1137,0,878 chrI 120378 . G A 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.331;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1490,0,1061 chrI 120473 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.781;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.161;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1222,0,1130 chrI 121534 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=131;Dels=0.00;FS=6.766;HaplotypeScore=6.4419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.039;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1218,0,1355 chrI 121957 . C T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.726;DP=139;Dels=0.00;FS=3.531;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.465;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1412,0,1394 chrI 122690 . T C 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.532;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.050;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:989,0,1401 chrI 122882 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.740;DP=106;Dels=0.00;FS=11.593;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.922;QD=9.61;ReadPosRankSum=2.643;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1049,0,1061 chrI 122940 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.526;DP=117;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1050,0,1369 chrI 123855 . T C 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.438;DP=157;Dels=0.00;FS=1.987;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1445,0,1709 chrI 124719 . A C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.172;DP=135;Dels=0.00;FS=1.451;HaplotypeScore=2.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.038;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,55:135:99:990,0,1697 chrI 124775 . G A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.691;DP=143;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=5.2684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.006;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1319,0,1434 chrI 124950 . G A 53.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.852;DP=130;Dels=0.00;FS=7.223;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-4.540;QD=0.41;ReadPosRankSum=-5.378;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,15:130:83:83,0,1748 chrI 125133 . A G 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.601;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.137;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:925,0,1480 chrI 125548 . T C 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.403;DP=141;Dels=0.00;FS=4.812;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1344,0,1481 chrI 125610 . G A 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.538;DP=93;Dels=0.00;FS=0.856;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:1153,0,778 chrI 125674 . T C 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.814;DP=114;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.663;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1042,0,1249 chrI 125793 . A T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.687;DP=157;Dels=0.00;FS=4.696;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1577,0,1558 chrI 126258 . G A 1786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.442;DP=186;Dels=0.00;FS=5.119;HaplotypeScore=5.9193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.318;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,100:186:99:1816,0,1419 chrI 126462 . A G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;DP=133;Dels=0.00;FS=8.208;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1060,0,1543 chrI 126468 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.232;DP=136;Dels=0.00;FS=8.026;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1092,0,1634 chrI 126483 . G A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.583;DP=139;Dels=0.00;FS=9.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.375;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1126,0,1594 chrI 126501 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.007;DP=141;Dels=0.00;FS=5.094;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.716;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1272,0,1524 chrI 126600 . G A 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.873;DP=142;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.87;ReadPosRankSum=-2.032;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1574,0,1223 chrI 126902 . C G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.286;DP=123;Dels=0.00;FS=5.677;HaplotypeScore=5.5869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.061;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:950,0,370 chrI 127011 . T C 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.268;DP=120;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.269;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:909,0,1444 chrI 127038 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.803;DP=126;Dels=0.00;FS=7.159;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.118;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1044,0,1453 chrI 127227 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.858;DP=144;Dels=0.00;FS=6.142;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.449;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1401,0,1409 chrI 127274 . C G 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;DP=164;Dels=0.00;FS=4.783;HaplotypeScore=4.9518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.880;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:1539,0,1592 chrI 127396 . C T 1873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.219;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.154;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,93:171:99:1903,0,1500 chrI 127533 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.366;DP=153;Dels=0.00;FS=5.459;HaplotypeScore=3.5868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:153:99:1541,0,1413 chrI 127572 . G A 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.786;DP=158;Dels=0.00;FS=6.099;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.532;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1639,0,1367 chrI 127881 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.201;DP=151;Dels=0.00;FS=11.706;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1411,0,1602 chrI 127902 . T C 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.373;DP=147;Dels=0.00;FS=7.679;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=2.144;QD=10.01;ReadPosRankSum=-2.703;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1502,0,1442 chrI 128001 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.822;DP=152;Dels=0.00;FS=18.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.158;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,61:152:99:1217,0,1836 chrI 128423 . G A 4305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4305,462,0 chrI 128435 . G A 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.695;DP=165;Dels=0.00;FS=3.687;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.319;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:1652,0,1524 chrI 128455 . G T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.522;DP=139;Dels=0.00;FS=3.353;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.692;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1381,0,1357 chrI 128589 . T A 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=166;Dels=0.00;FS=3.677;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.588;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,79:166:99:1547,0,1766 chrI 128608 . G T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.723;DP=152;Dels=0.00;FS=7.184;HaplotypeScore=2.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1507,0,1537 chrI 128648 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.954;DP=151;Dels=0.00;FS=11.984;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.785;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.676;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1449,0,1496 chrI 128756 . T G 5306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=23.17;SB=-2.854e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,228:228:99:5306,561,0 chrI 128843 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;DP=172;Dels=0.00;FS=10.679;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.519;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,75:172:99:1371,0,1980 chrI 128864 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.106;DP=161;Dels=0.00;FS=9.893;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.930;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,66:161:99:1155,0,1906 chrI 128930 . G A 2070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.299;DP=189;Dels=0.00;FS=2.663;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.041;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,103:189:99:2100,0,1478 chrI 129067 . T G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.966;DP=172;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=8.09;ReadPosRankSum=2.222;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,78:172:99:1422,0,1971 chrI 129075 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.851;DP=156;Dels=0.00;FS=2.506;HaplotypeScore=3.8657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.737;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1414,0,1793 chrI 129407 . C T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;DP=135;Dels=0.00;FS=2.225;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.290;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1521,0,1060 chrI 129476 . A G 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2812,309,0 chrI 129517 . T C 1695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.22;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1728,186,0 chrI 129537 . C T 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.309;DP=71;Dels=0.00;FS=1.960;HaplotypeScore=6.8153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.950;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:714,0,611 chrI 129731 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;DP=149;Dels=0.00;FS=13.292;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.575;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1191,0,1624 chrI 129785 . C A 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.753;DP=148;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=7.0318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.051;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,82:148:99:1654,0,1224 chrI 129816 . C T 2008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.460;DP=163;Dels=0.00;FS=2.864;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.817;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,97:163:99:2038,0,1223 chrI 130254 . T C 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=1;QD=23.80;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3951,432,0 chrI 130292 . C T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.223;DP=170;Dels=0.00;FS=1.954;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=2.148;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,72:170:99:1299,0,1839 chrI 130362 . C T 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.069;DP=177;Dels=0.00;FS=1.165;HaplotypeScore=4.6740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.285;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,84:177:99:1613,0,1845 chrI 130776 . C G 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.159;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,98:191:99:1887,0,1837 chrI 130885 . C T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;DP=136;Dels=0.00;FS=1.359;HaplotypeScore=2.7766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.763;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1281,0,1366 chrI 130975 . G A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.343;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.575;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1446,0,1399 chrI 131494 . A G 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.191;DP=171;Dels=0.00;FS=7.944;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=1.365;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,86:171:99:1543,0,1650 chrI 131539 . C T 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.246;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=-0.889;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1670,0,1544 chrI 131635 . T C 4800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:4800,525,0 chrI 131980 . C T 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.085;DP=163;Dels=0.00;FS=10.192;HaplotypeScore=5.5906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:163:99:1673,0,1311 chrI 132189 . A C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.905;DP=164;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=4.4813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.479;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,75:164:99:1436,0,1858 chrI 132423 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.767;DP=149;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=1;MQRankSum=0.021;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.793;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1305,0,1626 chrI 132468 . T C 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.706;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.471;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,86:169:99:1647,0,1615 chrI 132618 . A G 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.888;DP=178;Dels=0.00;FS=7.520;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.601;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,98:178:99:1899,0,1627 chrI 132680 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.666;DP=149;Dels=0.00;FS=6.227;HaplotypeScore=7.4861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1414,0,1553 chrI 132723 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.697;DP=147;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.025;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1449,0,1528 chrI 132831 . A G 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.690;DP=127;Dels=0.00;FS=2.293;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.122;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1029,0,1470 chrI 132928 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.858;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1381,0,1118 chrI 132978 . A G 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.242;DP=145;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=3.8069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,84:145:99:1748,0,1208 chrI 132994 . C T 1934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.488;DP=157;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=6.0845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.276;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,92:157:99:1964,0,1248 chrI 133080 . A G 4117.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.924e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4117,450,0 chrI 133083 . C T 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.784;DP=169;Dels=0.00;FS=4.461;HaplotypeScore=4.9398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.392;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,89:169:99:1820,0,1471 chrI 133134 . C T 4143.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4143,441,0 chrI 133174 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.757;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.607;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,71:171:99:1381,0,1977 chrI 133346 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.258;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1042,0,1277 chrI 133347 . C T 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1004,0,1248 chrI 133360 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.445;DP=128;Dels=0.00;FS=8.347;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=1.850;QD=10.09;ReadPosRankSum=2.583;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:128:99:1321,0,1002 chrI 133374 . G A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=124;Dels=0.00;FS=15.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.993;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:966,0,1278 chrI 133425 . G C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.321;DP=141;Dels=0.00;FS=4.067;HaplotypeScore=4.1802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.223;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1266,0,1334 chrI 133429 . T G 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1886;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=23.15;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3287,354,0 chrI 133615 . G A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.602;DP=119;Dels=0.00;FS=13.969;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.246;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:119:99:967,0,1425 chrI 133640 . A G 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3119,345,0 chrI 133749 . G A 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.530;DP=154;Dels=0.00;FS=3.882;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.495;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:3739,374,0 chrI 133857 . G A 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.373;DP=135;Dels=0.00;FS=5.506;HaplotypeScore=2.9388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=23.63;ReadPosRankSum=-1.501;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3223,325,0 chrI 134190 . G A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;DP=149;Dels=0.00;FS=8.747;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1597,0,1338 chrI 134219 . C T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.797;DP=117;Dels=0.00;FS=1.519;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.651;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1194,0,1089 chrI 134475 . T C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.986;DP=150;Dels=0.00;FS=7.694;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.432;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1307,0,1610 chrI 134587 . G A 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:146:99:1632,0,1252 chrI 134604 . A G 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.121;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:1621,0,1401 chrI 134639 . G A 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.799;DP=158;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.473;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,78:158:99:1645,0,1593 chrI 134661 . G A 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.826;DP=108;Dels=0.00;FS=9.959;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.858;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1165,0,906 chrI 135181 . C T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.676;DP=120;Dels=0.00;FS=7.013;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1109,0,1246 chrI 135222 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.074;DP=146;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1204,0,1659 chrI 135325 . G C 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=1;QD=22.41;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3171,348,0 chrI 135417 . T A 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:105:99:703,0,1289 chrI 135714 . T A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.352;DP=132;Dels=0.00;FS=3.006;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1311,0,1363 chrI 135827 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.457;DP=116;Dels=0.00;FS=2.859;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.459;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1092,0,1202 chrI 135952 . C T 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3559,384,0 chrI 136041 . G A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.276;DP=126;Dels=0.00;FS=3.212;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1405,0,1102 chrI 136057 . A G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.166;DP=127;Dels=0.00;FS=4.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.619;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1341,0,1210 chrI 136153 . C G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;DP=123;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1265,0,1202 chrI 136160 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3048,318,0 chrI 136195 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.314;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,70:117:99:1452,0,883 chrI 136667 . G A 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.038;DP=115;Dels=0.00;FS=2.974;HaplotypeScore=5.8885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=23.79;ReadPosRankSum=1.936;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,113:115:99:2769,282,0 chrI 136814 . T C 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3093,327,0 chrI 136961 . T C 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=22.94;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3130,333,0 chrI 137074 . G C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;DP=145;Dels=0.00;FS=1.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.158;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:145:99:1184,0,1717 chrI 137076 . G A 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.860;DP=142;Dels=0.00;FS=4.438;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1630,0,1177 chrI 137148 . C G 2420 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2453,273,0 chrI 137167 . C A 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2803,294,0 chrI 137237 . G A 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3255,348,0 chrI 137264 . A G 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=22.22;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2944,315,0 chrI 137336 . A G 2477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2510,279,0 chrI 138257 . G A 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;DP=135;Dels=0.00;FS=2.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.376;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1283,0,1381 chrI 138499 . G A 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3188,321,0 chrI 138591 . A G 1888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.72;MQ0=0;QD=23.60;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1921,213,0 chrI 138650 . A G 1110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.67;MQ0=0;QD=19.14;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1143,129,0 chrI 138655 . G A 1097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.88;MQ0=0;QD=19.25;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1130,120,0 chrI 138667 . A G 45.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=36.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.24;MQ0=0;QD=0.96;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:9:78,9,0 chrI 138668 . T G 46.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=36.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.24;MQ0=0;QD=0.98;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:9:79,9,0 chrI 138669 . T C 47.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=36.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.24;MQ0=0;QD=1.00;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:48:9:80,9,0 chrI 138770 . A G 1205 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.79;MQ0=0;QD=21.91;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1238,141,0 chrI 138780 . C T 1016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.64;MQ0=0;QD=20.32;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1049,120,0 chrI 138785 . C T 996 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.58;MQ0=0;QD=19.15;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1029,117,0 chrI 138791 . T C 792 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.76;MQ0=0;QD=17.60;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:96:825,96,0 chrI 138793 . T C 780 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.76;MQ0=0;QD=17.33;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:93:813,93,0 chrI 138806 . A T 836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.91;MQ0=0;QD=16.72;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:869,99,0 chrI 138807 . G A 828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.91;MQ0=0;QD=16.56;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:861,99,0 chrI 138823 . A G 253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;DP=58;Dels=0.00;FS=24.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.93;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.984;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,28:58:99:283,0,494 chrI 138824 . T C 905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.22;MQ0=0;QD=16.45;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:938,108,0 chrI 139045 . C G 1971 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.37;MQ0=0;QD=24.04;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2004,228,0 chrI 139049 . T G 513.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.952;DP=79;Dels=0.00;FS=14.362;HaplotypeScore=3.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=6.49;ReadPosRankSum=2.647;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:79:99:543,0,947 chrI 139055 . G A 649.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.058;DP=74;Dels=0.00;FS=7.730;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.05;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.157;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:679,0,659 chrI 139073 . G A 741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.194;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.489;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:771,0,826 chrI 139107 . T A 102.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.986;DP=91;Dels=0.00;FS=12.680;HaplotypeScore=56.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=1.12;ReadPosRankSum=-5.030;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,16:91:99:132,0,999 chrI 139123 . T C 2242 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.20;MQ0=0;QD=20.38;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2275,255,0 chrI 139132 . A T 2380 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.66;MQ0=0;QD=21.64;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2413,264,0 chrI 139199 . T A 2803 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.43;MQ0=0;QD=23.75;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2836,303,0 chrI 139277 . T C 1766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=23.86;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1799,201,0 chrI 139311 . T C 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.80;MQ0=0;QD=22.77;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2652,294,0 chrI 139692 . G A 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.68;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3671,393,0 chrI 140286 . A G 54.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;DP=174;Dels=0.00;FS=101.434;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.63;MQ0=82;MQRankSum=-4.409;QD=0.31;ReadPosRankSum=1.019;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,60:174:84:84,0,1149 chrI 140346 . T A 126.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;DP=157;Dels=0.00;FS=65.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.63;MQ0=72;MQRankSum=-3.178;QD=0.80;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,63:157:99:156,0,964 chrI 140397 . T C 1077.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.265;DP=206;Dels=0.00;FS=3.790;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.52;MQ0=50;MQRankSum=0.356;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,98:206:99:1107,0,1589 chrI 140418 . G A 1341.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;DP=237;Dels=0.00;FS=2.478;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.27;MQ0=36;MQRankSum=-0.760;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.405;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,104:237:99:1371,0,2155 chrI 140451 . T C 3539.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.933;DP=251;Dels=0.00;FS=5.459;HaplotypeScore=3.3888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.62;MQ0=10;MQRankSum=-1.297;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.816;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,186:251:99:3539,0,901 chrI 140526 . C T 208.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;DP=150;Dels=0.00;FS=0.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.67;MQ0=55;MQRankSum=-2.100;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.562;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,36:150:99:238,0,1337 chrI 140646 . G A 229 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.55;MQ0=12;QD=10.41;SB=-1.337e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:30:262,30,0 chrI 141030 . T A 1177 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.18;MQ0=2;QD=24.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1210,135,0 chrI 141135 . A T 1546 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=71;Dels=0.00;FS=8.325;HaplotypeScore=5.4274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.59;MQ0=3;MQRankSum=1.376;QD=21.77;ReadPosRankSum=1.528;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:71:99:1579,174,0 chrI 141180 . G A 2517 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.71;MQ0=3;QD=23.97;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2550,285,0 chrI 141184 . G C 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.38;MQ0=3;QD=24.04;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2726,303,0 chrI 141342 . A G 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.01;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3976,423,0 chrI 141723 . T C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;DP=103;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=2.5769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.199;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1003,0,907 chrI 141802 . C T 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3850,429,0 chrI 141835 . A G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3393,384,0 chrI 141913 . C T 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.501;DP=165;Dels=0.00;FS=4.113;HaplotypeScore=2.7077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=23.35;ReadPosRankSum=-1.207;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:3853,394,0 chrI 141984 . T C 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.51;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2827,306,0 chrI 142162 . T C 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;DP=170;Dels=0.00;FS=1.200;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,90:170:99:1653,0,1473 chrI 142568 . A T 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.197;DP=156;Dels=0.00;FS=7.060;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1400,0,1774 chrI 143085 . T C 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2642,288,0 chrI 143622 . A G 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=21.38;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:2812,312,0 chrI 143638 . C A 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=21.21;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3066,330,0 chrI 143679 . G A 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3676,408,0 chrI 143806 . T C 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3238,351,0 chrI 143852 . T C 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=22.83;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3229,357,0 chrI 143945 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.516;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:135:99:1208,0,1393 chrI 144684 . T C 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.760;DP=122;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=3.0746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.255;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1066,0,957 chrI 144826 . C G 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2748,297,0 chrI 145429 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.981;DP=109;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=2.561;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.826;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1250,0,848 chrI 145634 . T C 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3325,363,0 chrI 145720 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=144;Dels=0.00;FS=4.486;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.609;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.230;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1342,0,1479 chrI 146021 . C G 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.889;DP=140;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.192;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1281,0,1337 chrI 146535 . G T 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.964;DP=80;Dels=0.00;FS=1.838;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:738,0,861 chrI 146659 . A G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.846;DP=128;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.098;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1160,0,1286 chrI 146738 . A G 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.063;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=3.6372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.154;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1432,0,1172 chrI 146820 . T C 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2838,312,0 chrI 147414 . T C 495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.779;DP=68;Dels=0.00;FS=6.174;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.880;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:525,0,856 chrI 147507 . G T 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.787;DP=83;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=3.7532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.844;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:888,0,746 chrI 147598 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;DP=116;Dels=0.00;FS=10.330;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1316,0,975 chrI 147607 . T A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.311;DP=111;Dels=0.00;FS=9.025;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.026;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1171,0,1116 chrI 147655 . G C 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.550;DP=112;Dels=0.00;FS=9.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.601;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:959,0,1264 chrI 147717 . T A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.225;DP=124;Dels=0.00;FS=2.284;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.759;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1187,0,1321 chrI 147726 . A G 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2879,300,0 chrI 147759 . T A 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;DP=100;Dels=0.00;FS=6.412;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1131,0,914 chrI 147785 . C G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;DP=111;Dels=0.00;FS=8.872;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1023,0,1194 chrI 148146 . A T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.781;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.651;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1304,0,1542 chrI 148886 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.890;DP=137;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.544;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.235;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1231,0,1508 chrI 149268 . T C 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3222,345,0 chrI 149307 . T C 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2747,300,0 chrI 149594 . T C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3558,375,0 chrI 149773 . C T 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3229,339,0 chrI 149796 . C T 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=25.34;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2896,315,0 chrI 149803 . G A 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=24.86;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2743,303,0 chrI 149913 . C A 2551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=21.26;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2584,282,0 chrI 149973 . A G 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3000,318,0 chrI 150303 . G A 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3675,393,0 chrI 150921 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.958;DP=128;Dels=0.00;FS=8.318;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=2.582;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.077;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1115,0,1317 chrI 151010 . C T 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;DP=116;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.462;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.399;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:873,0,1454 chrI 151332 . A C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.179;DP=113;Dels=0.00;FS=0.822;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.173;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1107,0,1162 chrI 151450 . A T 735.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;DP=77;Dels=0.00;FS=0.908;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.76;MQ0=0;MQRankSum=-6.785;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.342;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:765,0,827 chrI 151453 . G A 704.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.043;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.43;MQ0=0;MQRankSum=-7.134;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.522;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:734,0,901 chrI 151460 . G C 680.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;DP=81;Dels=0.00;FS=0.929;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.08;MQ0=0;MQRankSum=-7.457;QD=8.40;ReadPosRankSum=1.190;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:710,0,907 chrI 151465 . G A 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.027;DP=78;Dels=0.00;FS=1.031;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.44;MQ0=0;MQRankSum=-7.605;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:755,0,799 chrI 151475 . A G 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.574;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQ0=0;MQRankSum=-7.779;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.525;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:660,0,940 chrI 151478 . A G 643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.395;DP=82;Dels=0.00;FS=1.172;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.90;MQ0=0;MQRankSum=-7.762;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.643;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,37:82:99:673,0,977 chrI 151501 . A T 216.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.618;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-4.988;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.172;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:246,0,495 chrI 151502 . A T 218.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-4.909;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.198;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:248,0,536 chrI 151503 . A T 215.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-4.803;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.013;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:245,0,531 chrI 151511 . T A 222.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.200;DP=46;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.27;MQ0=0;MQRankSum=-4.519;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:252,0,531 chrI 151521 . T C 344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.592;DP=46;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.27;MQ0=0;MQRankSum=-3.208;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.472;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:374,0,494 chrI 151526 . A G 490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.950;DP=49;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.38;MQ0=0;MQRankSum=4.290;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.990;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:520,0,385 chrI 151658 . G C 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;DP=96;Dels=0.00;FS=1.812;HaplotypeScore=3.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQ0=0;MQRankSum=-4.086;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.355;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:96:99:831,0,1011 chrI 151834 . C A 2418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.18;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2451,270,0 chrI 151963 . T A 2225 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=24.72;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:90:99:2258,240,0 chrI 152004 . A G 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;DP=125;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=4.7061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.656;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,51:125:99:914,0,1485 chrI 152125 . G T 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.194;DP=110;Dels=0.01;FS=230.055;HaplotypeScore=30.8139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=0.35;ReadPosRankSum=-5.035;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,33:109:69:69,0,629 chrI 152155 . A G 1432 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=14.46;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:1465,171,0 chrI 152233 . A G 1194.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.078;DP=137;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=2.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.902;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1224,0,1444 chrI 152235 . G A 1435.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.729;DP=138;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=2.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1465,0,1295 chrI 152239 . T C 1306.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.246;DP=138;Dels=0.00;FS=4.038;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1336,0,1302 chrI 152274 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;DP=145;Dels=0.00;FS=2.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.516;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1376,0,1476 chrI 152291 . C T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.338;DP=139;Dels=0.00;FS=1.366;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1291,0,1436 chrI 152336 . A G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3113,336,0 chrI 152709 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.565;DP=117;Dels=0.00;FS=5.972;HaplotypeScore=3.6381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.092;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:117:99:1155,0,1183 chrI 152728 . G A 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2891,306,0 chrI 152932 . A G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3466,372,0 chrI 152970 . C T 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.646;DP=135;Dels=0.00;FS=3.118;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.425;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1414,0,1168 chrI 153156 . A T 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1636,0,1407 chrI 153742 . T C 614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.111;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.992;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,37:100:99:644,0,1369 chrI 153762 . A G 554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.719;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,35:96:99:584,0,1286 chrI 154086 . A G 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.761;DP=119;Dels=0.00;FS=4.440;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.637;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:976,0,1267 chrI 154332 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;DP=125;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=2.9544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:125:99:1160,0,1184 chrI 154746 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.655;DP=113;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.281;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,64:113:99:1322,0,927 chrI 155069 . C T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.276;DP=141;Dels=0.00;FS=2.148;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1363,0,1387 chrI 155562 . T G 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3374,375,0 chrI 156174 . T G 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=147;Dels=0.00;FS=3.100;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=24.22;ReadPosRankSum=0.766;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3560,384,0 chrI 156314 . T C 2437 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=22.36;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2470,288,0 chrI 156315 . A G 2428 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=22.28;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2461,288,0 chrI 156316 . G A 753.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.336;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.301;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:783,0,1247 chrI 156383 . T G 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.47;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2854,318,0 chrI 156393 . G T 2872 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.46;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2905,315,0 chrI 156394 . G A 2821 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.46;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2854,312,0 chrI 156403 . T C 2953 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.17;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2986,336,0 chrI 156479 . G A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.851;DP=115;Dels=0.00;FS=7.702;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.987;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1281,0,992 chrI 156494 . G A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;DP=127;Dels=0.00;FS=7.395;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=-3.689;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.821;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1470,0,1041 chrI 156518 . T C 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3477,369,0 chrI 156538 . T C 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.45;MQ0=0;QD=23.17;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3184,351,0 chrI 156554 . C A 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3173,339,0 chrI 156584 . T C 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3030,339,0 chrI 156651 . A G 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2997,342,0 chrI 156666 . G A 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=23.77;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:125:99:3004,324,0 chrI 156835 . G A 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3293,351,0 chrI 156949 . T C 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3158,336,0 chrI 157114 . A G 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3027,342,0 chrI 157134 . G A 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3055,318,0 chrI 157339 . C T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.720;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=24.32;ReadPosRankSum=1.784;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,137:140:99:3405,319,0 chrI 157428 . G A 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.579;DP=113;Dels=0.00;FS=3.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.456;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2811,266,0 chrI 157759 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.664;DP=156;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1356,0,1566 chrI 157912 . C G 2687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2720,315,0 chrI 157927 . T A 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3220,351,0 chrI 158089 . A G 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2752,303,0 chrI 158141 . G A 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.22;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2681,294,0 chrI 158200 . A G 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.50;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2630,306,0 chrI 158870 . T C 2929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2962,330,0 chrI 159623 . C T 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2518,264,0 chrI 159724 . C T 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2725,291,0 chrI 159757 . T G 2321 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2354,264,0 chrI 159894 . G A 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2488,273,0 chrI 160056 . A T 1939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=25.18;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1972,219,0 chrI 160234 . G A 892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.93;MQ0=0;QD=21.76;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:925,105,0 chrI 160239 . G T 351 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.25;MQ0=0;QD=19.50;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:45:384,45,0 chrI 160249 . T A 366 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=2;MQRankSum=0.285;QD=11.81;ReadPosRankSum=4.539;SB=3.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,16:31:45:399,45,0 chrI 160256 . T G 206 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.583;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=2;MQRankSum=-0.066;QD=6.65;ReadPosRankSum=4.539;SB=3.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,16:31:30:239,30,0 chrI 160413 . T A 102.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.33;MQ0=9;QD=7.30;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,5:14:15:135,15,0 chrI 160531 . T C 91.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=15.21;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:124,15,0 chrI 160564 . C T 50.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.19;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:83,9,0 chrI 160686 . T C 39.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.56;MQ0=13;QD=2.50;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,4:16:9:72,9,0 chrI 165714 . G A 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.50;MQ0=6;QD=2.72;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:53,6,0 chrI 166001 . T A 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=3;QD=3.96;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:51,6,0 chrI 166119 . T C 1128 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.73;MQ0=0;QD=24.52;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1161,135,0 chrI 166152 . C T 1509 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.80;MQ0=0;QD=24.74;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1542,168,0 chrI 166221 . T C 1702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.05;MQ0=0;QD=23.97;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1735,189,0 chrI 166245 . A T 1858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.45;MQ0=0;QD=24.77;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1891,201,0 chrI 166248 . T C 1959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;QD=24.19;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1992,219,0 chrI 166369 . T C 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.56;MQ0=0;QD=22.42;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3239,345,0 chrI 166429 . A G 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2818,315,0 chrI 166443 . G C 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.19;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3044,345,0 chrI 166458 . C T 2774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2807,306,0 chrI 166491 . T C 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.28;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3218,360,0 chrI 166571 . G A 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3509,372,0 chrI 166733 . A G 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.01;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2955,327,0 chrI 166820 . C T 3409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3409,372,0 chrI 166931 . A G 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3138,339,0 chrI 167064 . C T 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3172,348,0 chrI 167179 . T C 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.16;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2835,324,0 chrI 168203 . A T 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;DP=109;Dels=0.00;FS=8.039;HaplotypeScore=5.9442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.168;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1282,0,920 chrI 168686 . G A 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.595;DP=125;Dels=0.00;FS=6.771;HaplotypeScore=2.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.149;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1246,0,1194 chrI 168767 . G T 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;DP=124;Dels=0.00;FS=6.854;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.661;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1325,0,1029 chrI 168772 . G A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.423;DP=129;Dels=0.00;FS=5.340;HaplotypeScore=4.5941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=3.418;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1353,0,1126 chrI 168787 . C A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.727;DP=140;Dels=0.00;FS=2.103;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.734;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1338,0,1318 chrI 168836 . G A 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.813;DP=115;Dels=0.00;FS=7.359;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1094,0,1053 chrI 169205 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.948;DP=117;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1200,0,1083 chrI 169217 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;DP=117;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=35.0324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.882;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1081,0,1122 chrI 169227 . C T 636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;DP=122;Dels=0.02;FS=7.106;HaplotypeScore=40.2729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.612;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:666,0,1096 chrI 169243 . C T 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;DP=107;Dels=0.01;FS=3.665;HaplotypeScore=5.7918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1036,0,874 chrI 169269 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.142;DP=119;Dels=0.00;FS=2.624;HaplotypeScore=3.9582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1225,0,1059 chrI 169422 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;DP=119;Dels=0.00;FS=11.729;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.223;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1256,0,1046 chrI 169476 . T C 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3650,396,0 chrI 169638 . T C 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2723,297,0 chrI 169689 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.541;DP=120;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1396,0,997 chrI 169830 . A G 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3206,357,0 chrI 169887 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.974;DP=127;Dels=0.00;FS=5.378;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.280;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1168,0,1348 chrI 169992 . T C 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.139;DP=118;Dels=0.00;FS=4.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:840,0,1422 chrI 170022 . T C 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;DP=114;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=2.8048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:947,0,1209 chrI 170389 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.317;DP=143;Dels=0.00;FS=2.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.587;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1419,0,1489 chrI 170564 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.688;DP=134;Dels=0.00;FS=2.427;HaplotypeScore=2.9413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.744;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1444,0,1166 chrI 171110 . G A 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.990;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,74:125:99:1520,0,895 chrI 171389 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.264;DP=120;Dels=0.00;FS=1.475;HaplotypeScore=2.8569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1389,0,968 chrI 171685 . A G 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.594;DP=109;Dels=0.00;FS=6.309;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.004;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:109:99:1177,0,918 chrI 171975 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.900;DP=143;Dels=0.01;FS=3.081;HaplotypeScore=7.7490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.302;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:141:99:1067,0,1543 chrI 172113 . C A 4757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3017;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4757,507,0 chrI 172129 . A T 4733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4733,507,0 chrI 172431 . A T 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;DP=93;Dels=0.00;FS=2.725;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.012;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:852,0,1001 chrI 172585 . A T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.324;DP=115;Dels=0.00;FS=5.066;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1244,0,1101 chrI 173222 . A C 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2959,327,0 chrI 173339 . G A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.321;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=1;MQRankSum=-0.838;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.491;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1154,0,735 chrI 173831 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.811;DP=133;Dels=0.00;FS=4.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1246,0,1351 chrI 174118 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.772;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1339,0,1204 chrI 174371 . T C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.360;DP=125;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1359,0,1194 chrI 174544 . G A 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.355;DP=117;Dels=0.00;FS=7.047;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.925;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1099,0,1269 chrI 174746 . T G 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.412;DP=153;Dels=0.01;FS=0.601;HaplotypeScore=8.8895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.238;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:1576,0,1387 chrI 174919 . A G 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7669;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3378,357,0 chrI 174938 . G A 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3500,363,0 chrI 175281 . G A 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.931;DP=130;Dels=0.00;FS=2.535;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.369;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1396,0,1246 chrI 175307 . T A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.033;DP=128;Dels=0.00;FS=4.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.990;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1269,0,1334 chrI 175315 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.253;DP=136;Dels=0.00;FS=10.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.269;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1331,0,1431 chrI 175318 . C G 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;DP=146;Dels=0.00;FS=13.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1505,0,1423 chrI 175573 . G A 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.160;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1098,0,1065 chrI 175644 . A G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=106;Dels=0.00;FS=3.769;HaplotypeScore=3.5605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.616;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:106:99:1185,0,899 chrI 175849 . T C 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.686;DP=106;Dels=0.00;FS=1.629;HaplotypeScore=4.1430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:842,0,1110 chrI 175876 . C T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.330;DP=126;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.664;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1187,0,1263 chrI 175963 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;DP=135;Dels=0.00;FS=9.173;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=2.454;QD=9.47;ReadPosRankSum=2.115;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1308,0,1340 chrI 176001 . T C 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.288;DP=107;Dels=0.00;FS=15.187;HaplotypeScore=4.4205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=7.67;ReadPosRankSum=-1.748;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:851,0,1244 chrI 176015 . T C 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.088;DP=96;Dels=0.00;FS=9.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=7.58;ReadPosRankSum=-3.007;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:758,0,1203 chrI 176220 . T C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.863;DP=111;Dels=0.00;FS=6.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.728;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1097,0,1129 chrI 176230 . T C 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.275;DP=109;Dels=0.00;FS=2.566;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.744;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1089,0,1018 chrI 176263 . T C 1132.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.361;DP=119;Dels=0.00;FS=6.972;HaplotypeScore=10.5442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1162,0,1168 chrI 176266 . A T 2751 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.046;DP=122;Dels=0.00;FS=2.989;HaplotypeScore=10.4489;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.474;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,120:122:99:2784,259,0 chrI 176273 . A G 1203.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=122;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=6.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1233,0,1208 chrI 176368 . C T 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;DP=104;Dels=0.00;FS=6.120;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:936,0,1100 chrI 176512 . T A 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.001;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=1;MQRankSum=0.187;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.608;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:908,0,902 chrI 176650 . G A 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.318;DP=122;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1131,0,933 chrI 176694 . A G 2425 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.97;MQ0=3;QD=23.54;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2458,279,0 chrI 176721 . G A 845.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;DP=95;Dels=0.00;FS=3.962;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.21;MQ0=4;MQRankSum=-0.853;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:875,0,896 chrI 176847 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.484;DP=100;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.463;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1055,0,908 chrI 176858 . A G 1095.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=4;MQRankSum=-3.909;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.407;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1125,0,1067 chrI 176948 . A G 2178 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=4;QD=22.93;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2211,249,0 chrI 177285 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.320;DP=140;Dels=0.00;FS=1.383;HaplotypeScore=7.1063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.811;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:140:99:1186,0,1581 chrI 177545 . G A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.784;DP=116;Dels=0.00;FS=16.901;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1083,0,1210 chrI 177572 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;DP=126;Dels=0.00;FS=20.125;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.193;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1329,0,1177 chrI 177667 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;DP=114;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.937;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1219,0,1031 chrI 178191 . A T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.138;DP=129;Dels=0.00;FS=9.430;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=9.40;ReadPosRankSum=-2.278;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1242,0,1398 chrI 178602 . G C 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3178,345,0 chrI 178654 . G A 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3082,321,0 chrI 178674 . G A 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2767,303,0 chrI 178682 . C T 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2663,294,0 chrI 178802 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.808;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=1;MQRankSum=0.173;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1318,0,1470 chrI 178875 . G C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;DP=129;Dels=0.01;FS=1.436;HaplotypeScore=17.7140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.815;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1437,0,1111 chrI 178905 . G A 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.403;DP=135;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=3.2791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,79:135:99:1674,0,1054 chrI 178989 . A G 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3639,402,0 chrI 179014 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.921;DP=137;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.360;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1151,0,1509 chrI 179051 . A G 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=23.48;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3357,369,0 chrI 179052 . A G 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3351,363,0 chrI 179149 . G C 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.875;DP=115;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.913;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:887,0,1162 chrI 179221 . A G 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=67.4953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=1;QD=21.17;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:2637,297,0 chrI 179355 . C T 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.319;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1595,0,1450 chrI 179372 . C A 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.893;DP=181;Dels=0.00;FS=1.154;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,89:181:99:1722,0,1792 chrI 179397 . A G 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.230;DP=159;Dels=0.00;FS=6.903;HaplotypeScore=3.8037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.081;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,87:159:99:1750,0,1471 chrI 179578 . G A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.653;DP=112;Dels=0.00;FS=21.390;HaplotypeScore=5.9398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.426;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:992,0,1264 chrI 179619 . G A 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.486;DP=136;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=12.27;ReadPosRankSum=2.222;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,80:136:99:1699,0,1042 chrI 179706 . C G 987.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.626;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.750;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1017,0,1516 chrI 179708 . A C 984.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.170;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.847;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.569;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1014,0,1552 chrI 179709 . T C 977.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.584;DP=132;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.530;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.492;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1007,0,1513 chrI 179761 . A C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.914;DP=135;Dels=0.00;FS=2.292;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1021,0,1613 chrI 179772 . T C 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.547;DP=149;Dels=0.00;FS=2.979;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=2.474;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.483;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1661,0,1232 chrI 179796 . A C 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3310,363,0 chrI 179942 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6815;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2718,291,0 chrI 179951 . A G 670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.303;DP=107;Dels=0.00;FS=2.546;HaplotypeScore=4.8239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.960;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:700,0,1375 chrI 179996 . A G 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3076,333,0 chrI 180069 . A G 732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.960;DP=102;Dels=0.00;FS=4.952;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:762,0,1294 chrI 180103 . T C 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.687;DP=121;Dels=0.00;FS=2.411;HaplotypeScore=4.1261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.716;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:886,0,1451 chrI 180105 . A C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.258;DP=126;Dels=0.00;FS=3.317;HaplotypeScore=4.1261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1385,0,1068 chrI 180123 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.756;DP=131;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=2.847;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1479,0,1058 chrI 180134 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.764;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=77.1342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,50:122:99:911,0,1375 chrI 180286 . A G 243.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;DP=111;Dels=0.00;FS=4.354;HaplotypeScore=5.6302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.700;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:111:12:276,12,0 chrI 180328 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.627;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1199,0,1136 chrI 180356 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.213;DP=136;Dels=0.00;FS=4.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.851;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1484,0,1196 chrI 180592 . A G 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2467,273,0 chrI 180646 . C T 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.333;DP=120;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.656;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1178,0,1163 chrI 180652 . A C 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.362;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.413;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1130,0,1326 chrI 180697 . A G 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.024;DP=126;Dels=0.00;FS=6.683;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.123;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1080,0,1412 chrI 180747 . A G 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.52;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2729,288,0 chrI 181013 . T C 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=1;QD=24.82;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3012,321,0 chrI 181117 . G A 2647 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.98;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2680,291,0 chrI 181118 . T C 2611 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.79;MQ0=0;QD=23.52;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2644,288,0 chrI 181119 . G A 2727 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.94;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2760,294,0 chrI 181197 . G T 2584 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.88;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2617,291,0 chrI 181370 . C T 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.757;DP=156;Dels=0.00;FS=3.183;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,86:156:99:1756,0,1372 chrI 181589 . G A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.519;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=1.740;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.524;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:933,0,975 chrI 181595 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.299;DP=116;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=4.7278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.591;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1233,0,1056 chrI 181647 . T A 2112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=174;Dels=0.00;FS=7.848;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.769;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,103:174:99:2142,0,1381 chrI 181662 . G T 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.790;DP=166;Dels=0.02;FS=2.780;HaplotypeScore=3.8889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=10.51;ReadPosRankSum=2.471;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:163:99:1775,0,1344 chrI 181663 . T A 1807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.806;DP=165;Dels=0.00;FS=1.958;HaplotypeScore=3.8889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=10.95;ReadPosRankSum=3.032;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:1837,0,1356 chrI 181700 . C T 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.930;DP=160;Dels=0.00;FS=2.142;HaplotypeScore=3.6655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.982;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,89:160:99:1787,0,1310 chrI 181746 . C T 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.232;DP=114;Dels=0.00;FS=7.477;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1365,0,953 chrI 181752 . G C 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=122;Dels=0.00;FS=4.473;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.444;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:918,0,1407 chrI 181772 . T C 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3297,363,0 chrI 181823 . A C 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.718;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1442,0,1227 chrI 182040 . C T 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.66;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2960,309,0 chrI 182045 . A G 2637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.69;MQ0=0;QD=22.35;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2670,291,0 chrI 182141 . G T 2406 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2439,258,0 chrI 182201 . C T 764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;DP=78;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.720;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:794,0,794 chrI 182210 . T A 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.016;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:75:99:764,0,748 chrI 182213 . T C 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.922;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.111;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:75:99:738,0,752 chrI 182240 . T C 706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.701;DP=87;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.557;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:736,0,983 chrI 182251 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.924;DP=107;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1009,0,1037 chrI 182605 . A T 211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.864;DP=71;Dels=0.00;FS=8.292;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.275;QD=2.97;ReadPosRankSum=-3.883;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:71:99:241,0,1172 chrI 183032 . T A 602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;DP=62;Dels=0.00;FS=1.027;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.508;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,33:62:99:632,0,566 chrI 183083 . A G 560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.163;DP=62;Dels=0.00;FS=1.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.63;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.894;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,30:62:99:590,0,677 chrI 183223 . G A 867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.87;MQ0=1;QD=20.64;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:900,99,0 chrI 183270 . T C 998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.77;MQ0=1;QD=17.82;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1031,111,0 chrI 183331 . G T 439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.96;MQ0=0;QD=13.72;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:54:472,54,0 chrI 183353 . C T 317 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.10;MQ0=0;QD=12.19;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:39:350,39,0 chrI 183541 . C T 1597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.48;MQ0=0;QD=23.49;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1630,183,0 chrI 183545 . C T 1606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.60;MQ0=0;QD=23.97;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1639,189,0 chrI 183590 . A G 935 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.61;MQ0=0;QD=18.70;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:968,111,0 chrI 183591 . C G 887 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.16;MQ0=0;QD=18.48;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:920,105,0 chrI 183596 . C T 780 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.30;MQ0=0;QD=16.60;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:90:813,90,0 chrI 183650 . G A 831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.14;MQ0=2;QD=15.98;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:864,99,0 chrI 183799 . C T 1944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.70;MQ0=0;QD=24.00;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1977,216,0 chrI 183803 . T A 1927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.84;MQ0=0;QD=24.39;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1960,210,0 chrI 183835 . A G 325 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.63;MQ0=0;QD=20.31;SB=-9.600e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:42:358,42,0 chrI 183841 . G A 92.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.98;MQ0=0;QD=13.18;SB=-5.430e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:125,15,0 chrI 183844 . A G 85.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.98;MQ0=0;QD=12.18;SB=-5.130e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:118,15,0 chrI 183850 . G A 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.25;MQ0=0;QD=3.01;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:43,6,0 chrI 184874 . G A 100.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.18;MQ0=0;QD=12.53;SB=-2.384e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15:133,15,0 chrI 184888 . G C 206.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.57;MQ0=0;QD=13.73;SB=-4.702e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:239,27,0 chrI 184890 . C A 216.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.57;MQ0=0;QD=14.40;SB=-5.402e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:249,27,0 chrI 184900 . A C 566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.86;MQ0=0;QD=18.87;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:69:599,69,0 chrI 184921 . A T 1095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.21;MQ0=0;QD=22.81;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1128,123,0 chrI 184957 . A G 2180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.78;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2213,243,0 chrI 185159 . A G 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.52;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3020,324,0 chrI 185480 . T G 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.185;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.342;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3736,373,0 chrI 185728 . T C 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.321;DP=135;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=3.8962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.987;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.376;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1268,0,1394 chrI 186446 . C T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.446;DP=112;Dels=0.00;FS=3.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.490;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1253,0,914 chrI 186605 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3268,372,0 chrI 186648 . C T 3740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3740,402,0 chrI 186807 . C A 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3421,360,0 chrI 188136 . C A 1543.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;DP=141;Dels=0.01;FS=0.686;HaplotypeScore=17.9954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.61;MQ0=6;MQRankSum=3.381;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.483;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,83:140:99:1573,0,885 chrI 188151 . T C 737.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.166;DP=121;Dels=0.00;FS=1.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.08;MQ0=6;MQRankSum=-3.155;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:121:99:767,0,1421 chrI 188190 . T C 730.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.856;DP=121;Dels=0.00;FS=6.166;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.74;MQ0=8;MQRankSum=-3.100;QD=6.03;ReadPosRankSum=-1.956;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:760,0,1397 chrI 188466 . G A 661 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.38;MQ0=13;QD=15.74;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:78:694,78,0 chrI 188470 . G A 278.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.386;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.52;MQ0=12;MQRankSum=-0.065;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:308,0,240 chrI 188881 . G C 4090.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=2;QD=23.64;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4090,444,0 chrI 188939 . A G 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.95;MQ0=2;QD=23.34;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3758,411,0 chrI 189006 . T G 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.13;MQ0=1;QD=23.08;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2826,306,0 chrI 189066 . T C 2360 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.09;MQ0=4;QD=20.70;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2393,264,0 chrI 189582 . A G 3288.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.449;DP=184;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=2.8104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=5;MQRankSum=4.468;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,175:184:99:3288,336,0 chrI 189586 . T A 3508.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.404;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.90;MQ0=6;MQRankSum=3.784;QD=24.03;ReadPosRankSum=-1.437;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,139:146:99:3508,363,0 chrI 189669 . A G 2645 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.10;MQ0=7;QD=21.50;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2678,297,0 chrI 189706 . C T 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.062;DP=141;Dels=0.00;FS=4.270;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.14;MQ0=2;MQRankSum=1.607;QD=24.03;ReadPosRankSum=-1.308;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3388,369,0 chrI 189746 . C A 2459 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;DP=113;Dels=0.00;FS=6.012;HaplotypeScore=219.3262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.78;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=21.76;ReadPosRankSum=1.581;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,110:113:99:2492,294,0 chrI 189817 . T A 105.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=155.6391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.89;MQ0=0;QD=0.65;SB=-2.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:15:138,15,0 chrI 189825 . G T 127.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.41;MQ0=0;QD=0.78;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:18:160,18,0 chrI 190017 . G A 1946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.553;DP=181;Dels=0.00;FS=4.314;HaplotypeScore=4.6731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,98:181:99:1976,0,1555 chrI 190429 . G A 4290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.79;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4290,459,0 chrI 190433 . T C 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.900;DP=193;Dels=0.00;FS=2.545;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,94:193:99:1477,0,2010 chrI 190443 . A G 1777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.094;DP=201;Dels=0.00;FS=5.114;HaplotypeScore=6.8981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,97:201:99:1807,0,2074 chrI 190558 . T A 5503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.46;SB=-2.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,225:225:99:5503,624,0 chrI 190621 . A G 5451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9682;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=22.25;SB=-2.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,245:245:99:5451,600,0 chrI 190636 . T C 5491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=236;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=23.27;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,236:236:99:5491,597,0 chrI 191617 . T C 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=21.96;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:172:99:3777,396,0 chrI 191697 . G C 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=19.23;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3091,336,0 chrI 191704 . G C 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=20.37;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3320,360,0 chrI 191755 . A G 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=133;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=22.80;ReadPosRankSum=-1.472;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3065,317,0 chrI 191818 . G T 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.102;DP=154;Dels=0.00;FS=3.994;HaplotypeScore=3.6929;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=24.12;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:154:99:3714,370,0 chrI 192139 . G A 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.307;DP=164;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1809,0,1416 chrI 192169 . G A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.478;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.930;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.548;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1327,0,1293 chrI 192170 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.129;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.409;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1270,0,1348 chrI 192196 . A G 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.19;MQ0=0;QD=22.59;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3128,360,0 chrI 192328 . T C 364.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.776;DP=275;Dels=0.01;FS=193.795;HaplotypeScore=247.1004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.63;MQ0=0;MQRankSum=-5.193;QD=1.32;ReadPosRankSum=-7.895;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,82:271:99:394,0,3420 chrI 192340 . A C 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.813;DP=237;Dels=0.00;FS=46.510;HaplotypeScore=165.4709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.032;QD=0.18;ReadPosRankSum=-6.545;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,19:237:72:72,0,1953 chrI 192429 . G C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;DP=156;Dels=0.00;FS=6.968;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1356,0,1712 chrI 192469 . G A 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:3874,408,0 chrI 192531 . C T 1508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.47;MQ0=0;QD=20.66;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:72:99:1541,171,0 chrI 192551 . C A 126.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=38.2724;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.07;MQ0=0;QD=0.59;SB=-9.301e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,214:214:18:159,18,0 chrI 192618 . C T 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4345;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=15.96;SB=-2.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:3447,396,0 chrI 192693 . C T 2222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.713;DP=216;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.928;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,119:216:99:2252,0,1720 chrI 192804 . C T 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.118;DP=165;Dels=0.00;FS=2.769;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.037;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:1726,0,1337 chrI 192945 . C T 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.257;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.244;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,94:197:99:1760,0,1817 chrI 192954 . C A 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.951;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.530;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,96:203:99:1756,0,1934 chrI 193131 . C T 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.889;DP=180;Dels=0.00;FS=7.496;HaplotypeScore=2.7741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,98:180:99:1880,0,1488 chrI 193260 . T C 4199.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4199,459,0 chrI 193452 . G A 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;DP=157;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=-0.059;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1639,0,1422 chrI 193500 . C T 1911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.673;DP=192;Dels=0.00;FS=1.148;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=1;MQRankSum=0.918;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.258;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,97:192:99:1941,0,1822 chrI 193716 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.315;DP=145;Dels=0.00;FS=3.125;HaplotypeScore=5.0558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.573;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1484,0,1283 chrI 193725 . A G 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.896;DP=150;Dels=0.00;FS=5.382;HaplotypeScore=3.2851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=9.13;ReadPosRankSum=-2.019;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1399,0,1407 chrI 193731 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.796;DP=148;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=4.4379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.450;QD=9.04;ReadPosRankSum=-2.222;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1368,0,1454 chrI 193807 . C T 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.309;DP=155;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1714,0,1440 chrI 194101 . A G 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=21.87;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3161,351,0 chrI 194104 . C T 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3474,360,0 chrI 194166 . T C 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3415;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:3591,411,0 chrI 194169 . T C 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8473;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3446,393,0 chrI 194241 . C T 4102.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4102,432,0 chrI 194290 . C A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.890;DP=159;Dels=0.00;FS=0.589;HaplotypeScore=2.4533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.329;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:1333,0,1733 chrI 194457 . A G 4374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4374,465,0 chrI 194475 . C T 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3462,387,0 chrI 194499 . T C 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2972,339,0 chrI 194736 . G A 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3566,378,0 chrI 194803 . G A 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3506,369,0 chrI 194818 . G A 4058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3320;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4058,417,0 chrI 194831 . A G 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7537;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:3889,426,0 chrI 195087 . G A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.616;DP=137;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=4.2919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.182;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1393,0,1310 chrI 195126 . G A 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.242;DP=151;Dels=0.00;FS=2.883;HaplotypeScore=3.7988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.598;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1598,0,1328 chrI 195138 . T C 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.474;DP=161;Dels=0.00;FS=1.968;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.847;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1597,0,1508 chrI 195204 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.266;DP=155;Dels=0.00;FS=6.985;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.163;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1393,0,1590 chrI 195277 . G T 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.704;DP=171;Dels=0.00;FS=1.295;HaplotypeScore=5.5398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,87:171:99:1813,0,1614 chrI 195303 . C T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.689;DP=155;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1345,0,1534 chrI 195309 . C A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.074;DP=151;Dels=0.00;FS=2.883;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.921;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1289,0,1447 chrI 195324 . C T 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3362,351,0 chrI 195459 . T C 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.874;DP=133;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.363;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1118,0,1432 chrI 195482 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.703;DP=136;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.849;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1343,0,1385 chrI 195585 . C T 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;DP=143;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.662;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1516,0,1261 chrI 195677 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.599;DP=97;Dels=0.00;FS=0.829;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.037;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,57:97:99:1151,0,803 chrI 195790 . A G 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.324;DP=87;Dels=0.00;FS=5.934;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:764,0,913 chrI 195910 . A G 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3183,339,0 chrI 196198 . A G 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.017;DP=145;Dels=0.00;FS=2.220;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=2.535;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,85:145:99:1690,0,1165 chrI 196248 . G C 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3692,408,0 chrI 196284 . G A 3909.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.31;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3909,426,0 chrI 196285 . A C 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.477;DP=155;Dels=0.00;FS=2.915;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=1.743;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.111;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,91:155:99:1818,0,1286 chrI 196305 . G C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.232;DP=116;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQ0=0;MQRankSum=-3.209;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.842;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1222,0,1057 chrI 196423 . C T 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=22.03;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2941,315,0 chrI 196452 . C T 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=22.57;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2696,288,0 chrI 196500 . C T 2370 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.59;MQ0=0;QD=18.96;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2403,267,0 chrI 196523 . T A 2542 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=20.02;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2575,288,0 chrI 196564 . G A 2358 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.33;MQ0=0;QD=24.31;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2391,252,0 chrI 196587 . C T 2332 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.55;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2365,246,0 chrI 196623 . C T 1785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.153;DP=84;Dels=0.00;FS=7.084;HaplotypeScore=3.3797;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=21.25;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:1818,210,0 chrI 196647 . T C 620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.433;DP=89;Dels=0.00;FS=2.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.910;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:650,0,995 chrI 196696 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=126;Dels=0.00;FS=14.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.325;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1217,0,1272 chrI 196805 . C T 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2738,297,0 chrI 196861 . C T 2029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.84;MQ0=0;QD=20.70;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2062,231,0 chrI 196864 . C A 1785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=79.9993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.92;MQ0=0;QD=19.62;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:1818,204,0 chrI 196884 . C T 1837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.80;MQ0=0;QD=19.14;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:1870,213,0 chrI 196891 . G T 2269 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.62;MQ0=0;QD=21.21;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2302,255,0 chrI 196926 . A C 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.584;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.999;QD=0.31;ReadPosRankSum=-3.158;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,6:138:73:73,0,300 chrI 196929 . A G 456.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.42;MQ0=0;MQRankSum=1.636;QD=3.12;ReadPosRankSum=3.788;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,141:146:27:486,0,27 chrI 196932 . C T 3390.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.23;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3390,390,0 chrI 197024 . A G 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=22.82;SB=-1.973e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3446,360,0 chrI 197120 . G A 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=25.75;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2943,312,0 chrI 197123 . G A 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.07;MQ0=0;QD=25.58;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2796,303,0 chrI 197225 . G A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;DP=111;Dels=0.00;FS=2.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.627;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1189,0,990 chrI 197236 . G T 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3199,333,0 chrI 197266 . G T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;DP=118;Dels=0.00;FS=3.526;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.134;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1242,0,1102 chrI 197292 . G A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.531;DP=114;Dels=0.00;FS=4.104;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.306;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1209,0,1049 chrI 197344 . C T 2314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.88;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:93:99:2347,252,0 chrI 197350 . G A 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.137;DP=95;Dels=0.00;FS=6.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.07;MQ0=0;MQRankSum=2.520;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.287;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:986,0,918 chrI 197428 . A T 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.058;DP=93;Dels=0.00;FS=3.952;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=9.31;ReadPosRankSum=-2.171;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:896,0,973 chrI 197442 . A G 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.025;DP=108;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.147;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:972,0,1124 chrI 197459 . T C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;DP=110;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.591;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1029,0,1147 chrI 197484 . T C 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.939;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.196;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1085,0,863 chrI 197497 . G A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;DP=90;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:973,0,833 chrI 197559 . C T 580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.283;DP=65;Dels=0.00;FS=2.052;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.704;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:65:99:610,0,672 chrI 197560 . A G 602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.757;DP=65;Dels=0.00;FS=2.052;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQ0=0;MQRankSum=1.717;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.559;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:632,0,611 chrI 197587 . G A 1954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.11;MQ0=0;QD=25.71;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1987,219,0 chrI 197606 . T C 495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;DP=80;Dels=0.00;FS=0.868;HaplotypeScore=65.3245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.607;QD=6.19;ReadPosRankSum=-2.232;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:525,0,1069 chrI 197629 . C T 1262 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.8149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.53;MQ0=0;QD=18.29;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1295,147,0 chrI 197646 . T G 2018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.16;MQ0=0;QD=24.91;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2051,237,0 chrI 197656 . A G 2190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.87;MQ0=0;QD=24.61;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2223,249,0 chrI 197694 . G T 2262 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.33;MQ0=0;QD=25.13;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2295,255,0 chrI 197695 . A G 2187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.33;MQ0=0;QD=24.30;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2220,255,0 chrI 197741 . C A 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.280;DP=94;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.026;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:904,0,835 chrI 197758 . A G 2171 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.79;MQ0=0;QD=22.15;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2204,258,0 chrI 197760 . G C 2061 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.40;MQ0=0;QD=21.93;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2094,249,0 chrI 197765 . C G 2151 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.90;MQ0=0;QD=22.18;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2184,249,0 chrI 197770 . A G 2045 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.142;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.516;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:2078,240,0 chrI 197772 . A G 2060 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.91;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2093,240,0 chrI 197783 . G A 1766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.79;MQ0=0;QD=18.99;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:1799,201,0 chrI 197791 . A G 1867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.71;MQ0=0;QD=19.05;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:1900,216,0 chrI 197811 . G A 1685 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.10;MQ0=0;QD=17.74;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:95:99:1718,198,0 chrI 197813 . T C 1684 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.06;MQ0=0;QD=17.36;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:1717,201,0 chrI 197819 . A G 2098 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.15;MQ0=0;QD=18.73;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2131,246,0 chrI 197825 . G A 1776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.88;MQ0=0;QD=18.31;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:1809,204,0 chrI 197873 . G A 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.44;MQ0=0;QD=23.13;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2947,321,0 chrI 197890 . C T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.792;DP=115;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.76;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=8.65;ReadPosRankSum=2.321;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1025,0,1118 chrI 197908 . C T 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.99;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3023,327,0 chrI 197983 . T A 2388 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.82;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2421,255,0 chrI 198013 . T A 2571 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.60;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=24.03;ReadPosRankSum=1.603;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2604,273,0 chrI 198022 . A G 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=110.8877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.53;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2744,300,0 chrI 198027 . C T 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=117.8179;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.74;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3055,315,0 chrI 198118 . G A 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.43;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3446,348,0 chrI 198168 . G T 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.19;MQ0=0;QD=25.43;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3085,333,0 chrI 198190 . T C 2467 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.01;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2500,279,0 chrI 198215 . C A 2070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.28;MQ0=0;QD=23.52;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2103,234,0 chrI 198232 . C G 2230 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.90;MQ0=0;QD=22.76;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2263,267,0 chrI 198244 . G T 1534 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.09;MQ0=0;QD=20.73;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1567,174,0 chrI 198252 . C G 1420 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.72;MQ0=0;QD=20.88;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1453,168,0 chrI 198253 . T C,G 1250.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=28.72;MQ0=0;QD=18.38;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,35,33:68:99:1310,660,576,650,0,566 chrI 198259 . T C 1458 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.58;MQ0=0;QD=21.13;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1491,171,0 chrI 198267 . A G 1465 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.14;MQ0=0;QD=22.20;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1498,174,0 chrI 198279 . A G 1187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=21.20;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1220,141,0 chrI 198287 . A G 1173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.73;MQ0=0;QD=20.95;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1206,141,0 chrI 198331 . G T 2372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7971;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=24.20;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2405,261,0 chrI 198351 . G A 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.82;MQ0=0;QD=25.54;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2945,309,0 chrI 198398 . C T 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.96;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2953,300,0 chrI 198456 . T A 1750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.06;MQ0=0;QD=25.00;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1783,198,0 chrI 198490 . G C 1271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.37;MQ0=0;QD=24.44;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1304,153,0 chrI 198502 . G A 345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.665;DP=50;Dels=0.00;FS=19.912;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=6.90;ReadPosRankSum=2.687;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:375,0,563 chrI 198533 . C T 1095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.65;MQ0=0;QD=24.33;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1128,129,0 chrI 198536 . C T 1089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.15;MQ0=0;QD=25.33;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1122,129,0 chrI 198560 . T C 553 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.39;MQ0=0;QD=23.04;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:69:586,69,0 chrI 198562 . G A 537 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.43;MQ0=0;QD=24.41;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:570,66,0 chrI 198568 . G C 531 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.83;MQ0=0;QD=21.24;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:66:564,66,0 chrI 198584 . C A 150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;DP=30;Dels=0.00;FS=4.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.36;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=5.00;ReadPosRankSum=2.547;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:180,0,351 chrI 198586 . A G 533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=20.50;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:26:66:566,66,0 chrI 198601 . T A 131.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=29;Dels=0.00;FS=7.890;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.332;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:161,0,320 chrI 198603 . T C 131.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.494;DP=29;Dels=0.00;FS=7.890;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.155;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:161,0,318 chrI 198605 . C T 251.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.407;DP=29;Dels=0.00;FS=7.164;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:281,0,174 chrI 198619 . C T 415 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.16;MQ0=0;QD=18.04;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:51:448,51,0 chrI 198620 . T G 414 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.16;MQ0=0;QD=18.00;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:51:447,51,0 chrI 198623 . A T 430 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.16;MQ0=0;QD=18.70;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:51:463,51,0 chrI 198628 . C G 402 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.16;MQ0=0;QD=17.48;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:51:435,51,0 chrI 198642 . T C 554 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.87;MQ0=0;QD=12.88;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:69:587,69,0 chrI 198648 . C T 620 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=13.78;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:75:653,75,0 chrI 198652 . A G 611 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=13.28;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:75:644,75,0 chrI 198657 . C T 641 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.70;MQ0=0;QD=14.24;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:75:674,75,0 chrI 198664 . A G 506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=12.65;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:63:539,63,0 chrI 198675 . T C 316 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.32;MQ0=0;QD=9.03;SB=-1.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:42:349,42,0 chrI 198676 . C T 331 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.32;MQ0=0;QD=9.46;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:42:364,42,0 chrI 198677 . A G 325 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.32;MQ0=0;QD=9.29;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:42:358,42,0 chrI 198707 . C T 530 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.657;DP=46;Dels=0.00;FS=8.177;HaplotypeScore=41.4874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.88;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.431;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:63:563,63,0 chrI 198713 . C T 593 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.431;DP=46;Dels=0.00;FS=7.597;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.431;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:72:626,72,0 chrI 198851 . G C 479 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.05;MQ0=0;QD=15.45;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:63:512,63,0 chrI 198856 . T C 308 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.82;MQ0=0;QD=12.32;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:42:341,42,0 chrI 198861 . G C 160.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.67;MQ0=0;QD=9.41;SB=-9.204e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:24:193,24,0 chrI 198863 . T C 147.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=9.19;SB=-6.507e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:21:180,21,0 chrI 198864 . T C 149.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=9.32;SB=-6.507e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:21:182,21,0 chrI 198865 . T A 149.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=11.47;SB=-7.388e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:21:182,21,0 chrI 198867 . T C 143.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=11.00;SB=-7.388e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:21:176,21,0 chrI 198874 . G A 197.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.88;MQ0=0;QD=7.58;SB=-2.382e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:26:27:230,27,0 chrI 198877 . T C 193.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=7.15;SB=-2.382e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:27:226,27,0 chrI 198880 . T G 167.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=5.76;SB=-4.096e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:24:200,24,0 chrI 198883 . A G 194.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=6.69;SB=-2.382e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:27:227,27,0 chrI 198887 . C T 203.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=7.52;SB=-2.382e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:27:236,27,0 chrI 198889 . C G 193.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=7.15;SB=-2.382e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:27:226,27,0 chrI 198895 . T A 148.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=6.44;SB=-7.497e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:21:181,21,0 chrI 198896 . G A 149.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=6.48;SB=-7.497e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:21:182,21,0 chrI 198897 . G A 149.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=6.48;SB=-7.497e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:21:182,21,0 chrI 198902 . A G 139.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=6.05;SB=-7.497e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:21:172,21,0 chrI 198904 . G A 148.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=6.44;SB=-7.497e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:21:181,21,0 chrI 198906 . G A 145.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=6.31;SB=-7.497e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:21:178,21,0 chrI 198909 . A G 143.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.239;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=5.11;ReadPosRankSum=3.419;SB=2.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,23:28:21:176,21,0 chrI 198913 . A G 141.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQ0=0;MQRankSum=2.339;QD=5.04;ReadPosRankSum=3.419;SB=2.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,23:28:21:174,21,0 chrI 198916 . A G 143.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=5.11;ReadPosRankSum=3.419;SB=2.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,23:28:21:176,21,0 chrI 198918 . G C 136.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=4.86;ReadPosRankSum=3.119;SB=3.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,23:28:21:169,21,0 chrI 198921 . T C 141.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6456;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=4.70;SB=-7.497e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:21:174,21,0 chrI 198932 . A C 157.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.18;MQ0=0;QD=5.82;SB=-4.096e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:24:190,24,0 chrI 198938 . G A 164.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.605;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.18;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.476;SB=-4.096e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:24:197,24,0 chrI 198946 . G A 200.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.55;MQ0=0;QD=7.41;SB=-2.382e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:27:233,27,0 chrI 198961 . G A 226 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.29;MQ0=0;QD=9.83;SB=-1.520e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:30:259,30,0 chrI 198964 . C T 173.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=14.42;SB=-3.878e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:206,24,0 chrI 198965 . G A 75.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.843;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.813;SB=-6.528e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:54:105,0,54 chrI 198966 . C T 134.98 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.000;SB=-3.013e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3:164,0,3 chrI 198971 . C T 180.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=20.00;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:213,24,0 chrI 198972 . C T 170.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=18.89;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:203,24,0 chrI 198973 . G A 175.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=19.45;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:208,24,0 chrI 198976 . T C 174.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=19.34;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:207,24,0 chrI 198980 . G A 180.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=20.00;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:213,24,0 chrI 198981 . G A 175.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=19.45;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:208,24,0 chrI 198983 . G A 182.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=20.23;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:215,24,0 chrI 198986 . C G 175.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=19.45;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:208,24,0 chrI 198988 . G A 173.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=19.23;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:206,24,0 chrI 198989 . G C 175.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=19.45;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:208,24,0 chrI 198990 . C T 181.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=20.11;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:214,24,0 chrI 198994 . G A 175.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=14.59;SB=-3.878e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:208,24,0 chrI 199012 . C G 143.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.401;SB=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:21:176,21,0 chrI 199132 . T C 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=4.36;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:53,6,0 chrI 199133 . C A 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=4.36;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:53,6,0 chrI 199138 . C T 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=4.36;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:53,6,0 chrI 199141 . A G 13.94 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=2.79;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:45,6,0 chrI 202258 . C G 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.90;MQ0=0;QD=3.37;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:48,6,0 chrI 202261 . G A 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.90;MQ0=0;QD=3.37;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:48,6,0 chrI 202264 . T C 15.88 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.77;MQ0=0;QD=3.97;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:47,6,0 chrI 202267 . C G 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.77;MQ0=0;QD=4.21;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:48,6,0 chrI 202270 . C T 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=5.95;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 chrI 202273 . T G 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=5.62;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:48,6,0 chrI 202282 . A C 15.88 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=5.29;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:47,6,0 chrI 202284 . A G 15.88 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=5.29;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:47,6,0 chrI 202298 . A T 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=4.46;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:49,6,0 chrI 202300 . A T 16.85 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=4.21;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:6:48,6,0 chrI 202310 . C A 74.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQ0=0;QD=6.77;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:107,12,0 chrI 202311 . T C 67.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQ0=0;QD=6.14;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:100,12,0 chrI 202315 . C T 72.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQ0=0;QD=6.59;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:105,12,0 chrI 202323 . G A 72.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQ0=0;QD=6.59;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:105,12,0 chrI 202339 . C A 100.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=8.36;SB=-2.707e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:15:133,15,0 chrI 202346 . A C 70.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=6.41;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:103,12,0 chrI 202353 . G A 45.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=3.54;SB=-9.807e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:78,9,0 chrI 202357 . A T 50.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=3.92;SB=-9.807e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:83,9,0 chrI 202358 . G A 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=3.46;SB=-9.807e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:77,9,0 chrI 202363 . T A 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=0;QD=2.50;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:9:77,9,0 chrI 202364 . A C 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=0;QD=2.50;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:9:77,9,0 chrI 202370 . C A 70.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=3.53;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:12:103,12,0 chrI 202380 . A G 67.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=3.21;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:12:100,12,0 chrI 202381 . C T 75.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=3.60;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:12:108,12,0 chrI 202389 . C G 72.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=3.63;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:12:105,12,0 chrI 202390 . A C 74.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=3.73;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:12:107,12,0 chrI 202441 . A G 71.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.58;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:12:104,12,0 chrI 202447 . G C 71.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=4.21;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:104,12,0 chrI 202452 . T C 73.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.25;SB=-5.221e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:12:106,12,0 chrI 202455 . C G 73.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.65;SB=-5.215e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:12:106,12,0 chrI 202480 . C T 47.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.33;SB=-9.645e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:80,9,0 chrI 202481 . C T 50.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.66;SB=-9.645e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:83,9,0 chrI 202483 . C T 47.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.33;SB=-9.645e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:80,9,0 chrI 202485 . G A 50.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.66;SB=-9.645e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:83,9,0 chrI 202491 . A G 72.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=3.63;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:12:105,12,0 chrI 202500 . A G 67.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=3.55;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:100,12,0 chrI 202502 . T C 74.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=3.92;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:107,12,0 chrI 202504 . A G 67.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=3.55;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:100,12,0 chrI 202510 . G T 74.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=3.92;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:107,12,0 chrI 202514 . A G 75.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.43;MQ0=0;QD=4.44;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:108,12,0 chrI 202516 . A G 71.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.43;MQ0=0;QD=4.21;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:104,12,0 chrI 202519 . G A 71.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.43;MQ0=0;QD=4.21;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:104,12,0 chrI 202520 . T C 73.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.43;MQ0=0;QD=4.32;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:106,12,0 chrI 202563 . A G 42.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=2.15;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:9:75,9,0 chrI 202564 . T G 14.20 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.03;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=0.71;ReadPosRankSum=0.684;SB=-3.377e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:19:44,0,19 chrI 202567 . G A 50.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=2.55;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:9:83,9,0 chrI 202571 . A C 46.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=2.47;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:79,9,0 chrI 202572 . G A 48.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=2.58;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:81,9,0 chrI 202575 . G T 50.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=2.68;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:83,9,0 chrI 202579 . A G 41.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=2.21;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:74,9,0 chrI 202581 . T C 46.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=2.47;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:79,9,0 chrI 202589 . G A 96.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.67;MQ0=0;QD=3.32;SB=-2.729e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:15:129,15,0 chrI 202600 . C T 57.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.035;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.69;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.831;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:81:87,0,81 chrI 202616 . C G 178.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=0;QD=6.59;SB=-4.096e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:24:211,24,0 chrI 202618 . T C 172.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=0;QD=6.37;SB=-4.096e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:24:205,24,0 chrI 202626 . A T 188.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.62;MQ0=0;QD=7.52;SB=-4.096e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:24:221,24,0 chrI 202631 . G A 188.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.95;SB=-4.096e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:24:221,24,0 chrI 202633 . G A 182.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.67;SB=-4.096e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:24:215,24,0 chrI 202636 . C T 357 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;QD=10.82;SB=-6.794e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:45:390,45,0 chrI 202663 . C T 556 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=35.5153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.72;MQ0=0;QD=14.26;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:66:589,66,0 chrI 202664 . T C 533 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=35.5153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.72;MQ0=0;QD=13.67;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:66:566,66,0 chrI 202692 . G T 501 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.53;MQ0=0;QD=14.74;SB=-6.528e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:60:534,60,0 chrI 202718 . A T 540 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.15;MQ0=0;QD=15.88;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:66:573,66,0 chrI 202720 . G A 179.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.224;DP=41;Dels=0.00;FS=8.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.08;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.648;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:209,0,341 chrI 202724 . A G 652 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.08;MQ0=0;QD=15.90;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:81:685,81,0 chrI 202727 . T C 340.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.887;DP=43;Dels=0.00;FS=14.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.10;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:370,0,193 chrI 202732 . G A 624 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.82;MQ0=0;QD=18.91;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:78:657,78,0 chrI 202740 . T A 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.420;DP=40;Dels=0.00;FS=21.261;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.984;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:86:86,0,555 chrI 202761 . C T 27.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.331;DP=41;Dels=0.00;FS=21.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.66;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.866;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,9:41:57:57,0,618 chrI 202762 . T A 16.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.764;DP=41;Dels=0.00;FS=22.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.66;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.614;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,9:41:46:46,0,660 chrI 202763 . C G 917 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.32;MQ0=0;QD=21.83;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:950,111,0 chrI 202801 . G A 1481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.10;MQ0=0;QD=23.14;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1514,168,0 chrI 202825 . G A 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.07;MQ0=0;QD=25.87;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2568,282,0 chrI 202966 . G C 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.95;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2964,333,0 chrI 203074 . A G 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.40;MQ0=0;QD=24.40;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3010,333,0 chrI 203105 . A G 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.13;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2600,294,0 chrI 203111 . C T 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.06;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2925,315,0 chrI 203174 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;DP=115;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.665;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1037,0,1169 chrI 203180 . T C 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.77;MQ0=0;QD=22.82;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2749,321,0 chrI 203214 . G C 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=22.37;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2762,318,0 chrI 203215 . C T 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2809,318,0 chrI 203238 . T A 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.14;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3162,351,0 chrI 203283 . A T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;DP=138;Dels=0.00;FS=3.238;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1143,0,1567 chrI 203300 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.431;DP=133;Dels=0.00;FS=3.273;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.117;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,78:133:99:1451,0,1054 chrI 203313 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.969;DP=115;Dels=0.00;FS=1.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.663;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:972,0,1262 chrI 203349 . C T 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.098;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.47;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.977;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:978,0,1001 chrI 203364 . A G 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.20;MQ0=0;MQRankSum=3.093;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.834;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:907,0,952 chrI 203458 . C T 2223 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.24;MQ0=0;QD=24.16;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2256,246,0 chrI 203461 . G A 2198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.08;MQ0=0;QD=23.63;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2231,246,0 chrI 203494 . C T 992.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;DP=114;Dels=0.00;FS=9.279;HaplotypeScore=17.8362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.65;MQ0=17;MQRankSum=-0.106;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.062;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1022,0,674 chrI 203606 . C T 288.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;DP=43;Dels=0.00;FS=3.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.35;MQ0=8;MQRankSum=-1.370;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:318,0,303 chrI 203639 . C T 383.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.675;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.6009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.96;MQ0=8;MQRankSum=0.845;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.717;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:413,0,373 chrI 203660 . C T 290.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.312;DP=53;Dels=0.00;FS=4.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.57;MQ0=16;MQRankSum=-1.387;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.777;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:320,0,330 chrI 203677 . G A 374.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.75;MQ0=20;MQRankSum=2.105;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.797;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:404,0,325 chrI 203798 . C T 108.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.631;DP=72;Dels=0.00;FS=32.050;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.35;MQ0=25;MQRankSum=-2.265;QD=1.50;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:138,0,503 chrI 203804 . A T 109.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;DP=71;Dels=0.00;FS=28.809;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.58;MQ0=23;MQRankSum=-1.961;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:139,0,528 chrI 203807 . C T 110.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.594;DP=73;Dels=0.00;FS=36.655;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.41;MQ0=23;MQRankSum=-1.693;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:140,0,507 chrI 203813 . C T 122.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;DP=73;Dels=0.00;FS=18.766;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.35;MQ0=23;MQRankSum=-1.506;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:152,0,582 chrI 203814 . C G 140.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.782;DP=74;Dels=0.00;FS=14.599;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.64;MQ0=22;MQRankSum=-1.653;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:170,0,595 chrI 203816 . A G 276.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;DP=81;Dels=0.00;FS=2.233;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.36;MQ0=22;MQRankSum=-2.283;QD=3.41;ReadPosRankSum=-2.496;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,26:81:99:306,0,599 chrI 203828 . T G 363.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.274;DP=79;Dels=0.00;FS=3.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.20;MQ0=19;MQRankSum=-1.860;QD=4.60;ReadPosRankSum=-3.771;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,28:79:99:393,0,582 chrI 203831 . T C 472.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.136;DP=86;Dels=0.00;FS=4.790;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.90;MQ0=19;MQRankSum=-0.959;QD=5.49;ReadPosRankSum=-4.308;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:502,0,572 chrI 203860 . C T 442.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;DP=106;Dels=0.00;FS=18.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.62;MQ0=9;MQRankSum=1.249;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.845;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,31:106:99:472,0,1281 chrI 203912 . A T 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.27;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3062,345,0 chrI 203922 . A G 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.39;MQ0=0;QD=22.99;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2769,318,0 chrI 203973 . G A 1704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8355;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.18;MQ0=0;QD=18.93;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1737,195,0 chrI 203984 . G A 1487 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.472;DP=81;Dels=0.00;FS=3.048;HaplotypeScore=6.8394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.27;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=18.36;ReadPosRankSum=-1.720;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:1520,168,0 chrI 204012 . A G 700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;DP=53;Dels=0.00;FS=2.540;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.51;MQ0=0;MQRankSum=1.597;QD=13.21;ReadPosRankSum=-1.212;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:87:733,87,0 chrI 204023 . C T 609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=13.24;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:75:642,75,0 chrI 204029 . T C 469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.88;MQ0=0;QD=10.91;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:60:502,60,0 chrI 204035 . C T 339 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=10.94;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:42:372,42,0 chrI 204041 . C A 314 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.893;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8313;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.40;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=9.81;ReadPosRankSum=3.040;SB=3.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,23:32:39:347,39,0 chrI 204043 . A T 328 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.823;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6200;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.40;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.25;ReadPosRankSum=3.966;SB=3.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,25:32:39:361,39,0 chrI 204047 . T C 308 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.58;MQ0=0;MQRankSum=2.165;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.433;SB=-7.612e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:39:341,39,0 chrI 204050 . T C 283 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-8.699e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:36:316,36,0 chrI 204071 . G A 377 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.23;MQ0=0;QD=13.00;SB=-6.794e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:45:410,45,0 chrI 204074 . C T 368 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7044;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.23;MQ0=0;QD=12.69;SB=-6.794e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:45:401,45,0 chrI 204113 . T G 330 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.68;MQ0=0;QD=14.35;SB=-7.063e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:42:363,42,0 chrI 204116 . A T 339 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=0;QD=13.56;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:42:372,42,0 chrI 204125 . C A 174.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.62;MQ0=0;QD=11.60;SB=-3.661e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:15:24:207,24,0 chrI 204126 . A G 198.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.62;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.104;SB=3.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:15:27:231,27,0 chrI 204129 . G A 202.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.783;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.934;SB=3.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:15:27:235,27,0 chrI 204131 . A C 203.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.62;MQ0=0;QD=13.53;SB=-1.946e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:15:27:236,27,0 chrI 204146 . A G 250.17 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.739;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.46;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.839;SB=2.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,16:19:17:283,17,0 chrI 204149 . G A 261.17 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.178;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.632;SB=1.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:17:294,17,0 chrI 204155 . C G 274 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=13.05;SB=-8.666e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:20:36:307,36,0 chrI 204167 . C T 246 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.46;MQ0=0;QD=12.95;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:33:279,33,0 chrI 204173 . C T 257 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;MQ0=0;QD=13.53;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:33:290,33,0 chrI 204174 . C T 259 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;MQ0=0;QD=13.63;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:33:292,33,0 chrI 204176 . A G 250 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;MQ0=0;QD=13.16;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:33:283,33,0 chrI 204178 . G C 248 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;MQ0=0;QD=13.05;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:33:281,33,0 chrI 204186 . A G 227 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=11.35;SB=-1.519e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:30:260,30,0 chrI 204188 . C T 231 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=11.55;SB=-1.519e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:30:264,30,0 chrI 204194 . T C 149.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.16;MQ0=0;QD=9.32;SB=-7.483e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:21:182,21,0 chrI 204195 . G A 149.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.16;MQ0=0;QD=9.32;SB=-7.483e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:21:182,21,0 chrI 204197 . C T 155.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.16;MQ0=0;QD=9.69;SB=-7.483e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:21:188,21,0 chrI 204200 . T A 148.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=8.23;SB=-7.494e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:21:181,21,0 chrI 204203 . C T 155.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=8.61;SB=-7.494e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:21:188,21,0 chrI 204212 . T C 103.69 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.27;MQ0=0;QD=6.10;SB=23.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:17:15:134,15,0 chrI 204216 . G A 146.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.27;MQ0=0;QD=8.59;SB=-7.490e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:21:179,21,0 chrI 204219 . G A 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=3.11;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:53,6,0 chrI 204224 . T G 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=3.11;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:53,6,0 chrI 204225 . A C 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=3.11;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:53,6,0 chrI 204227 . C T 19.81 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=2.83;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:51,6,0 chrI 204229 . C A 19.81 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=2.83;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:51,6,0 chrI 204233 . A C 20.80 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=2.97;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:52,6,0 chrI 204236 . T C 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=2.72;SB=-1.740e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:53,6,0 chrI 204239 . A C 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=2.42;SB=-1.757e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:53,6,0 chrI 204242 . G T 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=2.64;SB=-1.757e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:55,6,0 chrI 204281 . 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G A 42.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.727;SB=2.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:75,9,0 chrI 204296 . C T 43.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.727;SB=2.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:76,9,0 chrI 204308 . C T 41.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=10.49;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:74,9,0 chrI 204309 . G C 40.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=10.24;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:73,9,0 chrI 204310 . 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A C 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.77;MQ0=0;QD=8.43;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 chrI 205739 . T C 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.204;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.16;MQ0=19;MQRankSum=2.202;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:50:50,0,133 chrI 205742 . T C 77.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.37;MQ0=20;MQRankSum=-1.215;QD=2.20;ReadPosRankSum=1.794;SB=-6.524e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:57:107,0,57 chrI 205751 . C T 48.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.13;MQ0=21;MQRankSum=0.429;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.796;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:78:78,0,101 chrI 205766 . G A 48.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.355;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.6632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.16;MQ0=20;MQRankSum=1.943;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.795;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:78:78,0,146 chrI 205767 . A G 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.331;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.6632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.40;MQ0=19;MQRankSum=-1.827;QD=0.41;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,4:37:45:45,0,163 chrI 205769 . G T 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.6716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.40;MQ0=19;MQRankSum=-1.896;QD=0.38;ReadPosRankSum=-0.948;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,4:37:44:44,0,179 chrI 205771 . C T 20.05 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.056;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.6839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.66;MQ0=18;MQRankSum=0.493;QD=0.56;ReadPosRankSum=0.591;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:50:50,0,147 chrI 205772 . C T 16.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.6839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.66;MQ0=18;MQRankSum=0.578;QD=0.45;ReadPosRankSum=0.222;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,8:36:46:46,0,169 chrI 205775 . C A 16.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.621;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.6973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.92;MQ0=17;MQRankSum=0.666;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.489;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:46:46,0,168 chrI 205776 . G A 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.606;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.6973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.92;MQ0=17;MQRankSum=-1.896;QD=0.41;ReadPosRankSum=-0.948;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:44:44,0,168 chrI 205781 . C T 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.20;MQ0=16;MQRankSum=0.489;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,8:34:44:44,0,166 chrI 205787 . T C 117.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.11;MQ0=15;MQRankSum=1.701;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.441;SB=-2.257e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:45:147,0,45 chrI 205790 . C T 45.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.71;MQ0=15;MQRankSum=-1.395;QD=1.45;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:75:75,0,99 chrI 205841 . A G 15.88 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.20;MQ0=1;QD=3.97;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:47,6,0 chrI 205848 . G A 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.77;MQ0=0;QD=9.41;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 chrI 205856 . C T 14.31 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.03;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.727;SB=5.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:5:13:44,0,13 chrI 205862 . T C 44.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.99;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:77,9,0 chrI 205877 . T C 34.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.684;SB=-6.859e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:38:64,0,38 chrI 205883 . T C 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.000;SB=-5.012e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:40:66,0,40 chrI 205886 . T A 39.08 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:8:15:69,0,15 chrI 205895 . T C 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.289;SB=-6.863e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:38:62,0,38 chrI 205901 . A G 31.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.849;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:61:61,0,65 chrI 205907 . C T 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.451;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=2.46;ReadPosRankSum=-1.606;SB=-6.178e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:59:62,0,59 chrI 205910 . C T 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.451;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=2.46;ReadPosRankSum=-1.775;SB=-5.978e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:57:62,0,57 chrI 205911 . A G 54.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.256;SB=-7.607e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:33:84,0,33 chrI 205913 . T C 125.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9007;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=9.63;SB=-1.410e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:18:158,18,0 chrI 205919 . A C 30.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:14:60:60,0,65 chrI 205925 . C T 55.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.800;SB=-6.524e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:57:85,0,57 chrI 205928 . C T 57.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=4.39;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-6.522e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:59:87,0,59 chrI 205929 . G T 56.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.533;SB=-6.524e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:57:86,0,57 chrI 205931 . T A,G 102.01 SnpCluster;filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.85;SB=-1.141e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,8,5:13:57:162,93,84,69,0,57 chrI 205940 . C T 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.23;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.071;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:60:62,0,60 chrI 205946 . C T 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.10;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.000;SB=-7.065e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:36:62,0,36 chrI 205955 . C T 49.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=0;QD=5.55;SB=-9.474e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:82,9,0 chrI 205956 . A G 45.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=0;QD=5.11;SB=-9.474e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:78,9,0 chrI 205960 . G A 48.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=0;QD=5.44;SB=-9.474e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:81,9,0 chrI 206030 . T C 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.79;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.731;SB=1.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:51,6,0 chrI 206046 . A G 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.727;SB=1.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:50,6,0 chrI 206048 . T C 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.45;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:53,6,0 chrI 206156 . T A 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.10;MQ0=0;QD=1.82;SB=-1.639e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:12:6:53,6,0 chrI 206165 . T C 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.365;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,4:10:6:51,6,0 chrI 206186 . C T 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.08;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.731;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:53,6,0 chrI 206189 . T A 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9952;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.08;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:5:6:55,6,0 chrI 206195 . C T 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.589;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:53,6,0 chrI 206199 . G T 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9952;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.94;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.380;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:7:6:53,6,0 chrI 206201 . T G 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=0;QD=3.63;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:6:6:53,6,0 chrI 206210 . C T 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.720;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:53,6,0 chrI 206216 . C T 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.380;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:50,6,0 chrI 206225 . C T 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=0;QD=3.80;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:54,6,0 chrI 206226 . A G 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:6:50,6,0 chrI 206230 . G A 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:6:53,6,0 chrI 206278 . C A 180.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.137;DP=20;Dels=0.00;FS=6.767;HaplotypeScore=8.2726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.154;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.323;SB=-7.345e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,10:20:7:212,7,0 chrI 206288 . C T 177.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.025;DP=17;Dels=0.00;FS=6.422;HaplotypeScore=4.9536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.98;MQ0=0;MQRankSum=-2.293;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.244;SB=-7.276e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,10:17:6:209,6,0 chrI 206307 . G A 261 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.98;MQ0=0;QD=15.35;SB=-7.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:36:294,36,0 chrI 206315 . C A 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;DP=26;Dels=0.00;FS=9.223;HaplotypeScore=27.6184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.58;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=1.58;ReadPosRankSum=-2.919;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:26:71:71,0,254 chrI 206316 . A G 61.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.663;DP=26;Dels=0.00;FS=4.328;HaplotypeScore=26.6268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.58;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=2.35;ReadPosRankSum=-3.979;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:91:91,0,237 chrI 206351 . T C 497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.806;DP=48;Dels=0.00;FS=5.017;HaplotypeScore=16.7487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.37;MQ0=2;MQRankSum=1.098;QD=10.35;ReadPosRankSum=2.513;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:527,0,175 chrI 206360 . T C 130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;DP=52;Dels=0.00;FS=2.924;HaplotypeScore=26.2555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.36;MQ0=2;MQRankSum=-2.646;QD=2.50;ReadPosRankSum=-3.828;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:160,0,651 chrI 206375 . C T 369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.740;DP=43;Dels=0.00;FS=2.886;HaplotypeScore=38.7628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.53;MQ0=2;MQRankSum=-0.042;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.278;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:43:99:399,0,231 chrI 206381 . A G 301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.967;DP=47;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=67.8503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.18;MQ0=3;MQRankSum=-0.531;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.390;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:331,0,337 chrI 206414 . T C 343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.802;DP=72;Dels=0.00;FS=6.285;HaplotypeScore=15.7760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.80;MQ0=3;MQRankSum=-1.039;QD=4.76;ReadPosRankSum=2.522;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:373,0,523 chrI 206417 . T C 140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;DP=73;Dels=0.00;FS=3.405;HaplotypeScore=38.4117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.80;MQ0=3;MQRankSum=0.521;QD=1.92;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:170,0,743 chrI 206426 . T C 175.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.904;DP=69;Dels=0.00;FS=48.170;HaplotypeScore=26.6085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.95;MQ0=1;MQRankSum=1.500;QD=2.54;ReadPosRankSum=3.046;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,30:69:99:205,0,662 chrI 206435 . T C 446.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.842;DP=65;Dels=0.00;FS=3.108;HaplotypeScore=32.5830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.58;MQ0=2;MQRankSum=1.514;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.879;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,46:65:99:476,0,216 chrI 206441 . A G 820 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.026;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=36.0561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=2;MQRankSum=-0.019;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.794;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:66:77:853,77,0 chrI 206445 . A G 76.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.972;DP=68;Dels=0.00;FS=16.197;HaplotypeScore=36.0578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.64;MQ0=2;MQRankSum=-0.687;QD=1.12;ReadPosRankSum=2.537;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,22:68:99:106,0,625 chrI 206456 . C T 50.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.708;DP=68;Dels=0.00;FS=3.600;HaplotypeScore=37.8593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.93;MQ0=2;MQRankSum=0.532;QD=0.74;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:80:80,0,586 chrI 206462 . T C 308.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.827;DP=68;Dels=0.00;FS=15.676;HaplotypeScore=22.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.02;MQ0=2;MQRankSum=-0.174;QD=4.53;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,38:68:99:338,0,301 chrI 206465 . C T 248.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.678;DP=67;Dels=0.00;FS=18.286;HaplotypeScore=22.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.99;MQ0=2;MQRankSum=2.073;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.915;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,30:67:99:278,0,360 chrI 206469 . C T 178.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.463;DP=64;Dels=0.00;FS=15.069;HaplotypeScore=9.7302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.73;MQ0=2;MQRankSum=1.995;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.177;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:208,0,444 chrI 206470 . A T 179.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;DP=64;Dels=0.00;FS=15.069;HaplotypeScore=10.8827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.73;MQ0=2;MQRankSum=1.679;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.847;SB=-1.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:209,0,438 chrI 206471 . A G 165.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;DP=65;Dels=0.00;FS=12.247;HaplotypeScore=10.8827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.59;MQ0=2;MQRankSum=1.776;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.729;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:195,0,468 chrI 206480 . C T 31.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.689;DP=62;Dels=0.00;FS=22.352;HaplotypeScore=49.6183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.79;MQ0=1;MQRankSum=1.336;QD=0.50;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:61:61,0,586 chrI 206486 . C T 339.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.579;DP=55;Dels=0.00;FS=1.208;HaplotypeScore=61.3825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.76;MQ0=1;MQRankSum=-1.053;QD=6.16;ReadPosRankSum=-1.924;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:369,0,257 chrI 206489 . G T 249.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;DP=54;Dels=0.00;FS=12.809;HaplotypeScore=65.2804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.96;MQ0=1;MQRankSum=0.137;QD=4.61;ReadPosRankSum=-2.545;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:54:99:279,0,210 chrI 206495 . T C 162.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.664;DP=53;Dels=0.00;FS=9.671;HaplotypeScore=64.4832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.73;MQ0=1;MQRankSum=0.144;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.375;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:192,0,467 chrI 206496 . A G 27.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=52;Dels=0.00;FS=19.784;HaplotypeScore=62.5000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.68;MQ0=1;MQRankSum=1.033;QD=0.52;ReadPosRankSum=-2.298;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:57:57,0,614 chrI 206500 . G A 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.018;DP=47;Dels=0.00;FS=16.737;HaplotypeScore=40.0857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.42;MQ0=1;MQRankSum=-0.249;QD=0.92;ReadPosRankSum=-1.800;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,9:47:73:73,0,491 chrI 206510 . C T 159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;DP=27;Dels=0.00;FS=19.253;HaplotypeScore=27.0297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.24;MQ0=1;MQRankSum=-0.250;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.416;SB=-7.655e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:27:42:189,0,42 chrI 206523 . G A 169.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;DP=24;Dels=0.00;FS=1.643;HaplotypeScore=56.6800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.72;MQ0=1;MQRankSum=2.614;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:53:199,0,53 chrI 206525 . T C 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;DP=24;Dels=0.00;FS=12.879;HaplotypeScore=50.7712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.72;MQ0=1;MQRankSum=0.665;QD=1.38;ReadPosRankSum=2.135;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:63:63,0,189 chrI 206528 . A T 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;DP=26;Dels=0.00;FS=9.132;HaplotypeScore=51.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.55;MQ0=1;MQRankSum=0.708;QD=1.23;ReadPosRankSum=-2.050;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:26:62:62,0,159 chrI 206531 . C T 17.09 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=47.1141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.92;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=0.71;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:24:47:47,0,116 chrI 206549 . T C 76.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.307;DP=23;Dels=0.00;FS=1.824;HaplotypeScore=15.5993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.78;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-7.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:106,0,156 chrI 206558 . T C 273.34 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.704;DP=25;Dels=0.00;FS=8.625;HaplotypeScore=26.4496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.05;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-1.673e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:8:303,0,8 chrI 206561 . T C 87.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;DP=24;Dels=0.00;FS=1.987;HaplotypeScore=19.6049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.92;MQ0=0;MQRankSum=1.790;QD=3.63;ReadPosRankSum=-2.766;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:24:99:117,0,110 chrI 206564 . G T 186.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;DP=29;Dels=0.00;FS=8.010;HaplotypeScore=18.6803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.48;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.391;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:69:216,0,69 chrI 206567 . T A 144.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;DP=28;Dels=0.00;FS=8.606;HaplotypeScore=27.6225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.16;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:28:79:174,0,79 chrI 206576 . A G 165.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.460;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=41.1996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:195,0,215 chrI 206580 . T A,G 420.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.6336;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=31.23;MQ0=0;QD=12.00;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,26,9:35:73:480,118,73,362,0,347 chrI 206582 . T C 201.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.043;DP=39;Dels=0.00;FS=3.789;HaplotypeScore=39.2318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.634;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:231,0,250 chrI 206585 . T C 217.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.539;DP=45;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=47.0141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.580;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:247,0,270 chrI 206586 . G A 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;DP=46;Dels=0.00;FS=1.778;HaplotypeScore=43.0997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=0.31;ReadPosRankSum=0.759;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,10:46:44:44,0,489 chrI 206594 . A T 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.779;DP=65;Dels=0.00;FS=5.055;HaplotypeScore=38.1513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=0.49;ReadPosRankSum=3.451;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:65:62:62,0,777 chrI 206597 . C T 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.646;DP=77;Dels=0.00;FS=11.295;HaplotypeScore=26.3801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.370;QD=0.47;ReadPosRankSum=0.500;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,24:77:66:66,0,907 chrI 206603 . C T 74.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.003;DP=92;Dels=0.00;FS=23.403;HaplotypeScore=22.6128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.445;QD=0.80;ReadPosRankSum=2.328;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:104,0,1151 chrI 206624 . C T 573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.992;DP=116;Dels=0.00;FS=7.618;HaplotypeScore=12.7106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=4.94;ReadPosRankSum=-4.297;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:603,0,1175 chrI 206671 . C T 210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;DP=125;Dels=0.00;FS=6.753;HaplotypeScore=170.4237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.85;MQ0=3;MQRankSum=-0.169;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.723;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,20:125:99:240,0,1002 chrI 206762 . T C 264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.512;DP=118;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.14;MQ0=3;MQRankSum=-2.039;QD=2.24;ReadPosRankSum=1.900;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,29:117:99:294,0,1749 chrI 206780 . C T 484.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.147;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=25.4768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.34;MQ0=4;MQRankSum=-3.111;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.349;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,38:122:99:514,0,1609 chrI 206785 . T A 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.5064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.26;MQ0=4;MQRankSum=-3.012;QD=0.20;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,20:134:57:57,0,2372 chrI 206828 . A G 836.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.683;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.4873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.82;MQ0=4;MQRankSum=-4.417;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.300;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:122:99:866,0,1178 chrI 207179 . T C 2005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.51;MQ0=2;QD=16.99;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2038,222,0 chrI 207257 . A G 852 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.37;MQ0=6;QD=16.38;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:885,102,0 chrI 207299 . G A 592 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.55;MQ0=5;QD=15.18;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:72:625,72,0 chrI 207330 . G A 178.04 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.870;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.04;MQ0=6;MQRankSum=0.410;QD=6.14;ReadPosRankSum=-2.050;SB=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:18:208,0,18 chrI 207362 . A G 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.25;MQ0=6;QD=0.99;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:6:51,6,0 chrI 207376 . C T 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.34;MQ0=7;MQRankSum=2.018;QD=0.57;ReadPosRankSum=-1.883;SB=-7.602e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:33:43,0,33 chrI 207388 . G A 13.94 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.66;MQ0=5;QD=0.73;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:6:45,6,0 chrI 207395 . T C 35.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.53;MQ0=5;QD=1.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:68,9,0 chrI 207439 . G A 58.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.00;MQ0=7;QD=3.25;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:12:91,12,0 chrI 207449 . A T 58.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.39;MQ0=7;QD=3.08;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:91,12,0 chrI 207579 . G A 98.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.60;MQ0=5;QD=6.14;SB=-5.214e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:15:131,15,0 chrI 207588 . G C 99.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.03;MQ0=3;QD=7.64;SB=-5.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:15:132,15,0 chrI 207710 . G A 130.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.57;MQ0=3;QD=8.13;SB=-7.963e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:18:163,18,0 chrI 207718 . T C 181.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.71;MQ0=3;QD=10.06;SB=-7.977e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:24:214,24,0 chrI 207771 . G T 416.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.959;DP=36;Dels=0.00;FS=7.077;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.10;MQ0=2;MQRankSum=1.875;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.694;SB=-1.922e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,30:36:4:447,4,0 chrI 208038 . G A 133.46 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;DP=16;Dels=0.00;FS=11.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.42;MQ0=3;MQRankSum=-0.401;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.737;SB=-4.461e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:1:162,0,1 chrI 210350 . T C 117.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.13;MQ0=0;QD=19.54;SB=-5.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:150,15,0 chrI 210407 . G T 134.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.37;MQ0=2;QD=14.92;SB=-7.976e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:15:167,15,0 chrI 210415 . T C 108.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.10;MQ0=2;QD=13.56;SB=-7.655e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:12:141,12,0 chrI 212153 . G C 410.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.441;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.10;MQ0=19;MQRankSum=0.105;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.584;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:440,0,852 chrI 219596 . T A 651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;DP=268;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.78;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.684;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,58:268:99:681,0,4595 chrI 220328 . C G 1867.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;DP=168;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=2.9599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.86;MQ0=29;MQRankSum=-1.141;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.666;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,125:168:99:1897,0,470 chrI 220382 . C A 81.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=51;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.33;MQ0=41;MQRankSum=-1.733;QD=1.59;ReadPosRankSum=0.898;SB=-2.050e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,49:51:29:111,0,29 chrI 220518 . C T 1140.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.184;DP=158;Dels=0.00;FS=9.866;HaplotypeScore=3.5118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.78;MQ0=37;MQRankSum=0.600;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.563;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,60:158:99:1170,0,1219 chrI 220529 . G A 1065.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.994;DP=174;Dels=0.00;FS=6.581;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.15;MQ0=45;MQRankSum=0.469;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.068;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,65:174:99:1095,0,1180 chrI 221198 . T C 216.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;DP=150;Dels=0.00;FS=4.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.55;MQ0=127;MQRankSum=2.173;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,45:150:13:246,0,13 chrI 221658 . T C 235.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;DP=265;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.22;MQ0=222;MQRankSum=-0.726;QD=0.89;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-1.792e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,128:265:58:265,0,58 chrI 221681 . C T 114.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;DP=280;Dels=0.00;FS=4.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.94;MQ0=235;MQRankSum=-1.138;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.609;SB=-1.200e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,130:280:99:144,0,119 chrI 221690 . T C 126.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;DP=290;Dels=0.00;FS=2.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.46;MQ0=239;MQRankSum=-0.066;QD=0.43;ReadPosRankSum=0.594;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,132:290:99:156,0,207 chrI 221775 . G A 209.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.544;DP=266;Dels=0.00;FS=15.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.00;MQ0=207;MQRankSum=-1.495;QD=0.79;ReadPosRankSum=2.102;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,103:266:99:239,0,382 chrI 221844 . C G 783.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.693;DP=304;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.10;MQ0=188;MQRankSum=2.123;QD=2.58;ReadPosRankSum=-2.986;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,127:304:99:813,0,745 chrI 221857 . C G 1078.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.903;DP=310;Dels=0.00;FS=7.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.39;MQ0=165;MQRankSum=1.921;QD=3.48;ReadPosRankSum=-2.313;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,135:310:99:1108,0,874 chrI 222313 . C T 2817.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.496;DP=460;Dels=0.00;FS=10.209;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.23;MQ0=135;MQRankSum=-0.021;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,235:460:99:2847,0,2289 chrI 222743 . C G 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;DP=376;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.3588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.71;MQ0=213;MQRankSum=1.549;QD=0.14;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:327,49:376:81:81,0,2016 chrI 222940 . T C 68.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.920;DP=447;Dels=0.00;FS=1.567;HaplotypeScore=32.4307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.40;MQ0=157;MQRankSum=1.698;QD=0.15;ReadPosRankSum=-1.546;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:397,50:447:98:98,0,4552 chrI 223297 . G A 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;DP=382;Dels=0.00;FS=2.266;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.69;MQ0=288;MQRankSum=-0.625;QD=0.06;ReadPosRankSum=-1.553;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:327,54:382:51:51,0,1011 chrI 223359 . A G 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.720;DP=348;Dels=0.00;FS=7.069;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.74;MQ0=273;MQRankSum=-0.569;QD=0.03;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:311,37:348:40:40,0,1104 chrI 224014 . T A 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.58;MQ0=229;QD=0.22;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,211:232:9:83,9,0 chrI 225098 . A G 58.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.803;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.1562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.41;MQ0=36;MQRankSum=3.905;QD=0.46;ReadPosRankSum=1.580;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,27:126:88:88,0,774 chrI 225099 . G A 195.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.461;DP=119;Dels=0.00;FS=62.125;HaplotypeScore=37.1562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.11;MQ0=29;MQRankSum=-3.839;QD=1.64;ReadPosRankSum=-4.790;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,43:119:99:225,0,251 chrI 225103 . T A 210.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.071;DP=85;Dels=0.00;FS=1.107;HaplotypeScore=15.7908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.21;MQ0=29;MQRankSum=-2.122;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,56:85:99:240,0,99 chrI 225610 . C A 254.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.587;DP=311;Dels=0.00;FS=1.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.83;MQ0=244;MQRankSum=0.159;QD=0.82;ReadPosRankSum=0.540;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,129:311:99:284,0,323 chrI 226095 . C T 516.05 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.164;DP=307;Dels=0.00;FS=5.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.86;MQ0=263;MQRankSum=0.184;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-2.604e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:64,243:307:22:549,22,0 chrI 226869 . T C 35.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.98;MQ0=4;QD=5.14;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,4:7:9:68,9,0 chrI 227620 . C T 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.42;MQ0=6;QD=2.28;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:54,6,0 chrI 227665 . G A 66.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.83;MQ0=7;QD=5.58;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:99,9,0 chrI 227697 . C T 38.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.26;MQ0=4;QD=5.54;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:70,6,0 chrI 227707 . A C 38.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.26;MQ0=4;QD=5.54;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:70,6,0 chrI 228232 . C T 554 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.650;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.45;MQ0=30;MQRankSum=-1.733;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,71:72:66:587,66,0 chrI 228234 . A G 498 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.192;DP=72;Dels=0.00;FS=1.969;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.45;MQ0=30;MQRankSum=0.450;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,62:72:41:531,41,0 chrI 228268 . A G 277.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.971;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.29;MQ0=34;MQRankSum=0.033;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-1.265e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,53:65:15:310,15,0 chrI 228446 . G C 305 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.26;MQ0=20;QD=5.87;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:39:338,39,0 chrI 228756 . A G 227 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;DP=61;Dels=0.00;FS=8.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.86;MQ0=38;MQRankSum=-1.261;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.576;SB=-5.200e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:30:260,30,0 chrI 229086 . C T 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.73;MQ0=2;QD=1.52;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:54,6,0 chrI 229092 . A G 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.28;MQ0=1;QD=1.49;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:52,6,0 chrI 229098 . C T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.90;MQ0=0;QD=1.83;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:55,6,0 chrI 229104 . C A 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.90;MQ0=0;QD=1.75;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:54,6,0 chrII 64 . G C 1614.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.931;DP=111;Dels=0.00;FS=16.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.07;MQ0=6;MQRankSum=1.184;QD=14.54;ReadPosRankSum=-1.793;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,82:111:99:1644,0,225 chrII 102 . G A 2631.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.179;DP=156;Dels=0.00;FS=6.438;HaplotypeScore=6.5327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.00;MQ0=6;MQRankSum=-2.818;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.271;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,126:156:99:2661,0,253 chrII 103 . T C 2460.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.180;DP=156;Dels=0.00;FS=9.837;HaplotypeScore=6.5327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.07;MQ0=5;MQRankSum=-1.615;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.762;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,121:156:99:2490,0,385 chrII 139 . G A 855.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.934;DP=184;Dels=0.00;FS=51.424;HaplotypeScore=7.7210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.91;MQ0=1;MQRankSum=-3.615;QD=4.65;ReadPosRankSum=7.292;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,56:184:99:885,0,2533 chrII 155 . A G 545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.500;DP=181;Dels=0.00;FS=15.622;HaplotypeScore=2.9401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.64;MQ0=1;MQRankSum=-1.394;QD=3.01;ReadPosRankSum=-2.660;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,42:181:99:575,0,2794 chrII 173 . A G 169.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.701;DP=155;Dels=0.00;FS=17.199;HaplotypeScore=135.9515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.40;MQ0=1;MQRankSum=-2.949;QD=1.09;ReadPosRankSum=-2.049;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,29:155:99:199,0,2749 chrII 196 . G A 82.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.623;DP=136;Dels=0.00;FS=21.880;HaplotypeScore=19.7428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.49;MQ0=3;MQRankSum=-2.839;QD=0.60;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,19:136:99:112,0,2139 chrII 200 . T A 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.849;DP=136;Dels=0.00;FS=9.302;HaplotypeScore=21.4387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.46;MQ0=3;MQRankSum=-7.676;QD=6.18;ReadPosRankSum=-3.425;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:870,0,1531 chrII 279 . T A 165.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;DP=105;Dels=0.00;FS=29.551;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.33;MQ0=31;MQRankSum=1.319;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,14:104:99:195,0,702 chrII 307 . T C 166.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.745;DP=129;Dels=0.00;FS=30.614;HaplotypeScore=75.0058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.48;MQ0=40;MQRankSum=3.317;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.540;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,17:129:99:196,0,786 chrII 394 . T C 172.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.699;DP=159;Dels=0.00;FS=69.442;HaplotypeScore=9.8074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.97;MQ0=27;MQRankSum=1.825;QD=1.08;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,23:159:99:202,0,922 chrII 408 . T C 123.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.139;DP=131;Dels=0.00;FS=19.127;HaplotypeScore=10.4516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.16;MQ0=21;MQRankSum=-5.675;QD=0.94;ReadPosRankSum=1.160;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:153,0,848 chrII 490 . T C 80.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.485;DP=79;Dels=0.00;FS=10.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.39;MQ0=16;MQRankSum=-2.553;QD=1.01;ReadPosRankSum=-2.224;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:110,0,564 chrII 620 . A C 147.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.381;DP=184;Dels=0.00;FS=6.934;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.59;MQ0=114;MQRankSum=-0.331;QD=0.80;ReadPosRankSum=-2.819;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,77:184:99:177,0,349 chrII 796 . T C 456.02 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;DP=121;Dels=0.00;FS=3.168;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.76;MQ0=68;MQRankSum=-1.120;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.501;SB=-1.190e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:22:486,0,22 chrII 1187 . C T 199.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.36;MQ0=69;QD=1.99;SB=-6.689e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,88:100:27:232,27,0 chrII 1231 . T C 155.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.346;DP=89;Dels=0.00;FS=19.340;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.79;MQ0=54;MQRankSum=1.755;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.886;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:185,0,140 chrII 1254 . T C 201.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.175;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.72;MQ0=76;MQRankSum=1.581;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.032;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,22:123:99:231,0,324 chrII 1372 . G C 130.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.37;MQ0=23;QD=4.34;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:18:163,18,0 chrII 1507 . G A 218.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;DP=177;Dels=0.00;FS=29.841;HaplotypeScore=7.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.15;MQ0=105;MQRankSum=-1.221;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.116;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,38:177:99:248,0,565 chrII 1528 . G A 222.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;DP=146;Dels=0.00;FS=10.312;HaplotypeScore=2.6984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.35;MQ0=86;MQRankSum=3.560;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,21:146:99:252,0,375 chrII 1531 . A T 189.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;DP=143;Dels=0.00;FS=9.528;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.75;MQ0=88;MQRankSum=3.120;QD=1.32;ReadPosRankSum=0.842;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,17:143:99:219,0,364 chrII 1532 . G T 188.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.357;DP=147;Dels=0.00;FS=9.442;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.66;MQ0=90;MQRankSum=3.471;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.922;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,17:147:99:218,0,363 chrII 1548 . T C 192.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=25.8180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.22;MQ0=66;MQRankSum=3.159;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-7.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,18:151:99:222,0,684 chrII 1596 . C T 84.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.962;DP=157;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=18.4823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.55;MQ0=35;MQRankSum=-3.994;QD=0.54;ReadPosRankSum=0.951;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,38:157:99:114,0,1510 chrII 1614 . T C 326.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.629;DP=153;Dels=0.00;FS=6.047;HaplotypeScore=40.7910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.98;MQ0=31;MQRankSum=2.592;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.807;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,26:153:99:356,0,1371 chrII 1616 . G C 304.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;DP=149;Dels=0.00;FS=8.034;HaplotypeScore=47.1633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.21;MQ0=27;MQRankSum=2.795;QD=2.04;ReadPosRankSum=-1.623;SB=-6.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,25:149:99:334,0,1356 chrII 1670 . A G 299.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.883;DP=53;Dels=0.00;FS=4.908;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.00;MQ0=14;MQRankSum=2.988;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-1.059e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:86:329,0,86 chrII 1675 . A G 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;DP=50;Dels=0.00;FS=14.224;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.31;MQ0=9;MQRankSum=-2.794;QD=0.50;ReadPosRankSum=1.504;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:55:55,0,392 chrII 1691 . T C 343.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;DP=43;Dels=0.00;FS=11.854;HaplotypeScore=2.5725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.53;MQ0=8;MQRankSum=2.896;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.977;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:42:373,0,42 chrII 1697 . T C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.053;DP=45;Dels=0.00;FS=16.301;HaplotypeScore=5.4605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.19;MQ0=8;MQRankSum=-2.685;QD=0.25;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:41:41,0,388 chrII 1704 . C T 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.615;DP=46;Dels=0.00;FS=13.729;HaplotypeScore=7.1584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.18;MQ0=8;MQRankSum=-2.981;QD=1.28;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:89:89,0,326 chrII 1740 . T C 29.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.568;DP=46;Dels=0.00;FS=4.838;HaplotypeScore=10.0772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.20;MQ0=10;MQRankSum=2.104;QD=0.63;ReadPosRankSum=-1.875;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,5:46:59:59,0,270 chrII 1785 . C T 1413 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.190;DP=85;Dels=0.00;FS=18.499;HaplotypeScore=34.0607;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.61;MQ0=5;MQRankSum=4.062;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.350;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,63:85:40:1446,40,0 chrII 1799 . C T 68.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.792;DP=121;Dels=0.00;FS=3.321;HaplotypeScore=10.1023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.01;MQ0=5;MQRankSum=-1.890;QD=0.56;ReadPosRankSum=-4.522;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,24:121:98:98,0,1758 chrII 1813 . G A 107.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;DP=131;Dels=0.00;FS=0.871;HaplotypeScore=24.7232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.21;MQ0=6;MQRankSum=-2.521;QD=0.82;ReadPosRankSum=-4.486;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,27:131:99:137,0,1887 chrII 1831 . A C 401.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;DP=132;Dels=0.00;FS=2.725;HaplotypeScore=23.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.14;MQ0=6;MQRankSum=-1.959;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.721;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,40:132:99:431,0,1586 chrII 1850 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.936;DP=105;Dels=0.00;FS=11.002;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.96;MQ0=2;MQRankSum=3.765;QD=14.53;ReadPosRankSum=-3.934;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,75:105:99:1556,0,204 chrII 1871 . C T 245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.909;DP=74;Dels=0.00;FS=3.891;HaplotypeScore=14.3071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.73;MQ0=2;MQRankSum=-2.605;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.221;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:275,0,831 chrII 1886 . G A 474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.308;DP=55;Dels=0.00;FS=4.835;HaplotypeScore=6.6947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.43;MQ0=1;MQRankSum=-2.624;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.242;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,34:55:99:504,0,304 chrII 1888 . G A 193.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=55;Dels=0.00;FS=8.362;HaplotypeScore=6.6947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.43;MQ0=1;MQRankSum=2.872;QD=3.51;ReadPosRankSum=-2.675;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:223,0,583 chrII 1925 . G C 76.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;DP=13;Dels=0.00;FS=14.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.113;QD=5.85;ReadPosRankSum=-2.620;SB=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:53:106,0,53 chrII 1927 . C T 81.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;DP=13;Dels=0.00;FS=14.150;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.113;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.944;SB=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:54:111,0,54 chrII 1928 . G T 80.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.451;DP=13;Dels=0.00;FS=14.150;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.113;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.268;SB=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:52:110,0,52 chrII 1931 . T G 77.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=13;Dels=0.00;FS=14.150;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.113;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.930;SB=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:60:107,0,60 chrII 1939 . A C 80.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;DP=13;Dels=0.00;FS=18.195;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=6.15;ReadPosRankSum=-2.256;SB=-2.883e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:13:32:110,0,32 chrII 2035 . T G 34.04 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.3549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.29;MQ0=47;MQRankSum=0.922;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.922;SB=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,4:56:18:64,0,18 chrII 2036 . T G 34.04 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=56;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=11.4272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.29;MQ0=47;MQRankSum=1.683;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.001;SB=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:18:64,0,18 chrII 2047 . C A 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.933;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.60;MQ0=62;MQRankSum=0.533;QD=0.46;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-6.524e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:57:65,0,57 chrII 2083 . A C 84.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.000;DP=177;Dels=0.00;FS=4.630;HaplotypeScore=17.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.02;MQ0=150;MQRankSum=-0.359;QD=0.47;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-8.244e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,67:177:31:114,0,31 chrII 2087 . T C 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=191;Dels=0.00;FS=5.444;HaplotypeScore=17.6928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.75;MQ0=164;MQRankSum=1.726;QD=0.29;ReadPosRankSum=1.673;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,45:191:86:86,0,88 chrII 2097 . A C 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;DP=202;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=13.8647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.57;MQ0=175;MQRankSum=2.829;QD=0.19;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,6:202:68:68,0,98 chrII 2119 . C A 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;DP=219;Dels=0.00;FS=2.049;HaplotypeScore=18.1214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.06;MQ0=191;MQRankSum=-0.765;QD=0.20;ReadPosRankSum=0.025;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,24:219:71:74,0,71 chrII 2123 . C T 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.233;DP=224;Dels=0.00;FS=2.625;HaplotypeScore=13.6482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.24;MQ0=200;MQRankSum=2.300;QD=0.23;ReadPosRankSum=0.500;SB=-6.547e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,7:224:49:81,0,49 chrII 2138 . A G 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.739;DP=215;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=4.48;MQ0=196;MQRankSum=1.733;QD=0.11;ReadPosRankSum=0.056;SB=-6.533e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,8:215:52:53,0,52 chrII 2140 . G A 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=4.53;MQ0=192;MQRankSum=1.621;QD=0.11;ReadPosRankSum=0.056;SB=-6.533e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,3:211:52:54,0,52 chrII 2231 . T C 14.26 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=3.66;MQ0=158;MQRankSum=1.231;QD=0.09;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,4:163:14:44,0,14 chrII 2237 . C T 19.15 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=3.74;MQ0=151;MQRankSum=1.231;QD=0.12;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,3:156:14:49,0,14 chrII 2244 . T C 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=4.87;MQ0=133;MQRankSum=1.754;QD=0.07;ReadPosRankSum=1.300;SB=-5.156e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,3:140:32:40,0,32 chrII 2254 . A G 57.34 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.27;MQ0=120;MQRankSum=2.383;QD=0.44;ReadPosRankSum=1.447;SB=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,6:130:8:87,0,8 chrII 2267 . T C 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.79;MQ0=111;MQRankSum=0.365;QD=0.22;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,29:121:57:57,0,68 chrII 2273 . T C 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.22;MQ0=112;MQRankSum=-0.597;QD=0.49;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.526e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,12:123:55:90,0,55 chrII 2299 . C A 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.281;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.33;MQ0=101;MQRankSum=-3.387;QD=0.48;ReadPosRankSum=0.212;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,26:117:86:86,0,99 chrII 2335 . C A 222.64 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.022;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.52;MQ0=115;MQRankSum=2.256;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.128;SB=-5.608e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:115,22:137:11:255,11,0 chrII 2354 . A G 132.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.674;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.97;MQ0=130;MQRankSum=0.206;QD=0.89;ReadPosRankSum=1.940;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,22:149:99:162,0,101 chrII 2375 . T C 95.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.18;MQ0=133;MQRankSum=1.426;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,12:153:99:125,0,149 chrII 2380 . G C 91.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.3977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.15;MQ0=134;MQRankSum=1.733;QD=0.59;ReadPosRankSum=0.887;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,7:154:99:121,0,142 chrII 2384 . G A 98.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.4053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.19;MQ0=129;MQRankSum=1.395;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.803;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,7:148:99:128,0,123 chrII 2385 . A C 78.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.566;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=16.4053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.69;MQ0=130;MQRankSum=1.189;QD=0.52;ReadPosRankSum=1.585;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,7:150:99:108,0,176 chrII 2431 . C T 210.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.042;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.83;MQ0=120;MQRankSum=3.557;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-6.412e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,38:146:61:240,0,61 chrII 2452 . G A 125.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.554;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.39;MQ0=98;MQRankSum=2.000;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.215;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,17:121:99:155,0,151 chrII 2468 . C T 263.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.82;MQ0=89;MQRankSum=2.015;QD=2.39;ReadPosRankSum=-1.030;SB=1.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:110:13:293,0,13 chrII 2539 . A T 430 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.771;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.48;MQ0=73;MQRankSum=1.542;QD=4.73;ReadPosRankSum=1.349;SB=-6.588e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:36,55:91:48:463,48,0 chrII 2789 . G A 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.09;MQ0=63;QD=0.76;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:51,16:67:9:83,9,0 chrII 5927 . T C 15.88 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.60;MQ0=1;MQRankSum=0.358;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.231;SB=1.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:6:47,6,0 chrII 5933 . T C 236 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.59;MQ0=1;QD=13.11;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:36:269,36,0 chrII 5943 . T A 320.06 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;DP=28;Dels=0.00;FS=4.357;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.27;MQ0=2;MQRankSum=-2.548;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.238;SB=-2.206e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:28:16:350,0,16 chrII 5980 . C T 451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.72;MQ0=2;QD=17.35;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:63:484,63,0 chrII 6000 . T G 387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7294;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.37;MQ0=2;MQRankSum=-0.788;QD=14.33;ReadPosRankSum=1.576;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:27:38:420,38,0 chrII 6002 . A C 429 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6873;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.37;MQ0=2;QD=15.89;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:27:60:462,60,0 chrII 6034 . G C 213 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.02;MQ0=1;QD=14.20;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:33:246,33,0 chrII 6041 . T C 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.62;MQ0=0;QD=2.41;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:43,6,0 chrII 6069 . T C 75.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.40;MQ0=3;MQRankSum=1.678;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.521;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,7:18:15:108,15,0 chrII 6070 . A T 75.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.910;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.40;MQ0=3;MQRankSum=0.405;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.521;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,7:18:15:108,15,0 chrII 6071 . C T 97.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.067;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.40;MQ0=3;MQRankSum=-1.331;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.521;SB=2.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,7:18:18:130,18,0 chrII 6116 . T A 265.52 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;DP=29;Dels=0.00;FS=17.337;HaplotypeScore=10.6454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.49;MQ0=3;MQRankSum=-1.395;QD=9.16;ReadPosRankSum=2.069;SB=-4.853e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:6:295,0,6 chrII 6130 . T C 155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;DP=32;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=3.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.19;MQ0=3;MQRankSum=-0.642;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.705;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:185,0,166 chrII 6142 . C G 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;DP=31;Dels=0.00;FS=9.467;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.29;MQ0=3;MQRankSum=-1.509;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:57:57,0,284 chrII 6175 . T C 297 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.06;MQ0=0;QD=16.50;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:39:330,39,0 chrII 6190 . T C 138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;DP=15;Dels=0.00;FS=21.553;HaplotypeScore=14.7182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.898;SB=-3.898e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:53:168,0,53 chrII 6228 . C G 141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;DP=24;Dels=0.00;FS=2.318;HaplotypeScore=5.8976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.824;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:24:99:171,0,209 chrII 6233 . C T 127.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.042;DP=27;Dels=0.00;FS=12.442;HaplotypeScore=6.9346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.887;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:157,0,325 chrII 6258 . C T 45.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.98;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=0.58;ReadPosRankSum=4.092;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,11:78:75:75,0,1318 chrII 6302 . A G 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.494;DP=105;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=8.7379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=15.39;ReadPosRankSum=4.675;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,90:105:99:1646,0,105 chrII 6335 . C T 1508.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.311;DP=97;Dels=0.00;FS=1.567;HaplotypeScore=15.5075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;MQ0=1;MQRankSum=-0.338;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-9.418e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,90:97:6:1540,6,0 chrII 6379 . A T 461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;DP=41;Dels=0.00;FS=42.677;HaplotypeScore=5.8239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.22;MQ0=2;MQRankSum=-2.850;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.050;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,31:41:99:491,0,139 chrII 6422 . C T 231.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;DP=57;Dels=0.00;FS=40.132;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.67;MQ0=5;MQRankSum=-3.414;QD=4.05;ReadPosRankSum=2.191;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:261,0,634 chrII 6430 . C T 204.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;DP=60;Dels=0.00;FS=34.606;HaplotypeScore=8.8765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.44;MQ0=5;MQRankSum=-3.298;QD=3.40;ReadPosRankSum=2.826;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:234,0,692 chrII 6434 . C T 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.221;DP=61;Dels=0.00;FS=7.665;HaplotypeScore=7.8832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.67;MQ0=5;MQRankSum=1.437;QD=0.64;ReadPosRankSum=1.313;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,7:61:69:69,0,845 chrII 6440 . G C,T 978.01 SnpCluster;filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=26.82;MQ0=5;QD=15.77;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,41,21:62:99:1038,315,234,723,0,678 chrII 6457 . C A 110.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.238;DP=77;Dels=0.00;FS=55.389;HaplotypeScore=6.9397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.10;MQ0=6;MQRankSum=-3.604;QD=1.43;ReadPosRankSum=1.678;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:140,0,1172 chrII 6461 . T C 263.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;DP=78;Dels=0.00;FS=96.276;HaplotypeScore=6.9397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.35;MQ0=7;MQRankSum=-3.408;QD=3.37;ReadPosRankSum=2.186;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:293,0,1041 chrII 6465 . A G 90.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.728;DP=83;Dels=0.00;FS=67.008;HaplotypeScore=7.9229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.61;MQ0=7;MQRankSum=-3.824;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.483;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,15:83:99:120,0,1339 chrII 6603 . C T 488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.215;DP=37;Dels=0.00;FS=2.908;HaplotypeScore=13.9182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.67;MQ0=0;MQRankSum=4.152;QD=13.19;ReadPosRankSum=2.816;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:89:518,0,89 chrII 6619 . T A 122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.9137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.775;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:152,0,286 chrII 6642 . G T 208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.241;DP=36;Dels=0.00;FS=10.665;HaplotypeScore=14.6251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.01;MQ0=1;MQRankSum=0.149;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.700;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:238,0,140 chrII 6647 . A T 209.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;DP=35;Dels=0.00;FS=15.289;HaplotypeScore=7.8091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.69;MQ0=1;MQRankSum=0.500;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.777;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:71:239,0,71 chrII 6674 . A C 190.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;DP=46;Dels=0.00;FS=19.371;HaplotypeScore=20.6195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.62;MQ0=1;MQRankSum=2.002;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.744;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:220,0,264 chrII 6675 . C T 188.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.530;DP=46;Dels=0.00;FS=19.371;HaplotypeScore=20.6195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.62;MQ0=1;MQRankSum=1.065;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.838;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:218,0,236 chrII 6680 . A G 570 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.619;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6035;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.84;MQ0=1;MQRankSum=1.481;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.135;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,44:47:50:603,50,0 chrII 6684 . T C 205.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.507;DP=49;Dels=0.00;FS=6.794;HaplotypeScore=18.2847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.42;MQ0=2;MQRankSum=2.287;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.076;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:235,0,297 chrII 6689 . G A 543.05 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.245;DP=48;Dels=0.00;FS=15.360;HaplotypeScore=31.8279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.28;MQ0=2;MQRankSum=1.437;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-8.805e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,39:48:22:576,22,0 chrII 6690 . A G 175.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.232;DP=48;Dels=0.00;FS=21.350;HaplotypeScore=31.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.28;MQ0=2;MQRankSum=2.894;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:205,0,324 chrII 6698 . T G 319.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.744;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=25.2374;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.25;MQ0=3;MQRankSum=0.382;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-1.011e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,23:42:1:348,1,0 chrII 6699 . A T 339.77 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;DP=43;Dels=0.00;FS=11.226;HaplotypeScore=25.2374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.96;MQ0=4;MQRankSum=1.372;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.640;SB=-1.165e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,34:43:0:368,0,0 chrII 6704 . T A 546 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.2908;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.05;MQ0=4;MQRankSum=0.626;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.125;SB=-2.127e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,41:45:39:579,39,0 chrII 6705 . C T 40.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;DP=47;Dels=0.00;FS=5.100;HaplotypeScore=20.2908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.28;MQ0=4;MQRankSum=1.016;QD=0.85;ReadPosRankSum=0.459;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:70:70,0,424 chrII 6706 . A G 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.832;DP=47;Dels=0.00;FS=5.246;HaplotypeScore=20.2908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.28;MQ0=4;MQRankSum=-0.200;QD=0.83;ReadPosRankSum=0.315;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:47:69:69,0,428 chrII 6713 . A T 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;DP=63;Dels=0.00;FS=11.512;HaplotypeScore=12.3386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.88;MQ0=4;MQRankSum=-0.134;QD=0.19;ReadPosRankSum=1.274;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:42:42,0,706 chrII 6724 . T G 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;DP=74;Dels=0.00;FS=10.436;HaplotypeScore=7.9548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.64;MQ0=4;MQRankSum=1.893;QD=0.37;ReadPosRankSum=-0.277;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,8:74:57:57,0,812 chrII 6735 . C A 962 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.831;DP=71;Dels=0.00;FS=11.707;HaplotypeScore=36.8687;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.38;MQ0=4;MQRankSum=1.934;QD=13.55;ReadPosRankSum=2.272;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,53:71:41:995,41,0 chrII 6741 . G C 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;DP=77;Dels=0.00;FS=10.889;HaplotypeScore=32.9278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.26;MQ0=4;MQRankSum=3.024;QD=1.52;ReadPosRankSum=2.495;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,10:77:99:147,0,849 chrII 6754 . A C 643.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;DP=75;Dels=0.00;FS=6.801;HaplotypeScore=43.1612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.94;MQ0=3;MQRankSum=4.157;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,33:75:99:673,0,176 chrII 6755 . T C 613.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.611;DP=75;Dels=0.00;FS=5.246;HaplotypeScore=43.1612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.94;MQ0=3;MQRankSum=4.747;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.305;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:643,0,369 chrII 6762 . C T 475.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.670;DP=63;Dels=0.00;FS=12.101;HaplotypeScore=71.1975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.42;MQ0=5;MQRankSum=2.784;QD=7.54;ReadPosRankSum=2.488;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:505,0,259 chrII 6764 . A T 208.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=80.8380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.30;MQ0=5;MQRankSum=3.691;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.185;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:238,0,551 chrII 6766 . A C 453.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.653;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=71.3042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.30;MQ0=5;MQRankSum=2.714;QD=7.08;ReadPosRankSum=-1.418;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,35:64:99:483,0,197 chrII 6767 . A T 483.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.313;DP=65;Dels=0.00;FS=12.406;HaplotypeScore=71.3042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.11;MQ0=6;MQRankSum=3.874;QD=7.43;ReadPosRankSum=2.236;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:513,0,266 chrII 6769 . C T 552.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.891;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=82.9773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.25;MQ0=7;MQRankSum=2.312;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,40:66:99:582,0,214 chrII 6774 . C T 578.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.028;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=113.3460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.02;MQ0=7;MQRankSum=1.984;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,44:70:99:608,0,206 chrII 6779 . G C 188.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.755;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=102.5287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.01;MQ0=7;MQRankSum=3.845;QD=2.69;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:218,0,573 chrII 6783 . C T 179.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.688;DP=69;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=74.8798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.70;MQ0=6;MQRankSum=4.026;QD=2.59;ReadPosRankSum=-1.686;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:209,0,546 chrII 6787 . A C 325.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.552;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=54.5195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.71;MQ0=9;MQRankSum=0.797;QD=4.11;ReadPosRankSum=-4.562;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,44:79:99:355,0,414 chrII 6796 . C G 547.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.188;DP=84;Dels=0.00;FS=6.976;HaplotypeScore=22.1609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.45;MQ0=9;MQRankSum=1.568;QD=6.51;ReadPosRankSum=-2.740;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,55:84:99:577,0,240 chrII 6814 . G A 250.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.526;DP=92;Dels=0.00;FS=6.504;HaplotypeScore=22.4544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.15;MQ0=12;MQRankSum=2.438;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.575;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:280,0,713 chrII 6819 . C T 389.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;DP=103;Dels=0.00;FS=27.086;HaplotypeScore=28.2785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.84;MQ0=12;MQRankSum=1.944;QD=3.78;ReadPosRankSum=-3.975;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,35:103:99:419,0,671 chrII 6831 . T C 859.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.423;DP=120;Dels=0.00;FS=54.349;HaplotypeScore=3.8474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.07;MQ0=14;MQRankSum=-1.745;QD=7.16;ReadPosRankSum=3.587;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,76:120:99:889,0,518 chrII 6841 . T A 936.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;DP=130;Dels=0.00;FS=54.678;HaplotypeScore=7.5202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.50;MQ0=16;MQRankSum=-1.900;QD=7.20;ReadPosRankSum=2.064;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,83:130:99:966,0,544 chrII 6859 . C G 445.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;DP=164;Dels=0.00;FS=13.957;HaplotypeScore=3.1300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.90;MQ0=15;MQRankSum=-0.913;QD=2.71;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,43:164:99:475,0,1677 chrII 6939 . T G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.238;DP=270;Dels=0.00;FS=14.296;HaplotypeScore=167.9507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.13;MQ0=3;MQRankSum=-3.499;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.435;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,83:270:99:1136,0,4173 chrII 6944 . G A 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.191;DP=265;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=148.7147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.57;MQ0=1;MQRankSum=1.015;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,58:265:99:858,0,4034 chrII 7024 . G A 608.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.421;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.4844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.91;MQ0=13;MQRankSum=-0.761;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,50:225:99:638,0,3213 chrII 7044 . C T 1053.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.105;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.18;MQ0=13;MQRankSum=3.115;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,59:170:99:1083,0,1858 chrII 7125 . C G 932 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;DP=62;Dels=0.00;FS=4.068;HaplotypeScore=12.3177;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.12;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.562;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,53:62:86:965,86,0 chrII 7129 . A C 1077 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.54;MQ0=0;QD=17.66;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1110,120,0 chrII 7133 . T G 1108 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8018;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.46;MQ0=0;QD=17.31;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:64:99:1141,123,0 chrII 7138 . C T 1187 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=0;QD=17.72;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:67:99:1220,126,0 chrII 7141 . A G 1118 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;DP=72;Dels=0.00;FS=44.659;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.21;MQ0=0;MQRankSum=3.022;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.855;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,65:72:99:1151,101,0 chrII 7150 . G C 1132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.6277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.18;MQ0=0;QD=15.09;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1165,135,0 chrII 7156 . A G 1096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;DP=80;Dels=0.00;FS=65.971;HaplotypeScore=7.1388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.37;MQ0=0;MQRankSum=3.963;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,64:80:53:1129,53,0 chrII 7167 . A G 1496 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9452;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.09;MQ0=0;QD=14.67;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:1529,168,0 chrII 7168 . T C 1454 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;DP=102;Dels=0.00;FS=29.431;HaplotypeScore=8.9452;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.09;MQ0=0;MQRankSum=2.560;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.336;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,98:102:99:1487,140,0 chrII 7172 . C T 1644 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6177;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:1677,177,0 chrII 7181 . G A 1437 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.576;DP=107;Dels=0.00;FS=16.022;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.217;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,104:107:99:1470,132,0 chrII 7183 . T C 1458 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=0;QD=13.63;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:1491,159,0 chrII 7186 . G A 1489 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.03;MQ0=0;QD=12.84;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:1522,159,0 chrII 7209 . A G 1129 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.37;MQ0=0;QD=10.96;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:1162,126,0 chrII 7211 . C T 1202 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.877;DP=106;Dels=0.00;FS=14.317;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.45;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.981;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,103:106:99:1235,129,0 chrII 7217 . C A 1365 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.112;DP=118;Dels=0.00;FS=6.017;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.16;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.560;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,114:118:99:1398,147,0 chrII 7273 . A G 5451.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.878;DP=301;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.95;MQ0=6;MQRankSum=3.471;QD=18.11;ReadPosRankSum=4.563;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,273:301:99:5451,307,0 chrII 7366 . T C 2124.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.281;DP=178;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=11.7593;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.57;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=11.93;ReadPosRankSum=2.245;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,157:178:28:2157,28,0 chrII 7387 . G A 2263 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.14;MQ0=0;QD=19.18;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2296,243,0 chrII 7393 . G T 2244 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.99;MQ0=0;QD=18.86;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2277,243,0 chrII 7396 . T C 2293 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.18;MQ0=0;QD=19.77;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2326,246,0 chrII 7402 . A G 2017 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.73;MQ0=0;QD=22.41;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2050,219,0 chrII 7403 . C G 1985 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.73;MQ0=0;QD=22.06;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2018,219,0 chrII 7404 . A G 1899 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.73;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.832;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,87:90:99:1932,189,0 chrII 7405 . A G 1974 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.73;MQ0=0;QD=21.93;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2007,219,0 chrII 7409 . T C 1871 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.473;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.069;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,113:118:99:1904,190,0 chrII 7432 . C T 1832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.13;MQ0=0;QD=15.02;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:1865,192,0 chrII 7436 . G A 1618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.12;MQ0=0;QD=14.07;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:1651,174,0 chrII 7481 . T C 990 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.90;MQ0=25;QD=8.05;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:1023,120,0 chrII 7510 . G T 5259.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=262;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.49;MQ0=26;QD=20.07;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,262:262:99:5259,558,0 chrII 7549 . T C 2682.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.429;DP=416;Dels=0.00;FS=5.054;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.59;MQ0=95;MQRankSum=1.281;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.206;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,220:416:99:2712,0,3250 chrII 7645 . C T 416.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.051;DP=416;Dels=0.00;FS=4.737;HaplotypeScore=97.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.74;MQ0=85;MQRankSum=-2.689;QD=1.00;ReadPosRankSum=2.397;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:342,74:416:99:446,0,5194 chrII 7647 . G A 906.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.519;DP=423;Dels=0.00;FS=6.100;HaplotypeScore=99.9196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.52;MQ0=88;MQRankSum=-0.589;QD=2.14;ReadPosRankSum=-3.923;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:320,103:423:99:936,0,4440 chrII 7669 . C G 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.926;DP=362;Dels=0.00;FS=4.093;HaplotypeScore=22.1802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.44;MQ0=102;MQRankSum=-1.033;QD=0.09;ReadPosRankSum=-2.225;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:300,26:362:61:61,0,3510 chrII 7797 . G A 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.703;DP=289;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=9.1212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.86;MQ0=176;MQRankSum=1.447;QD=0.04;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,11:289:42:42,0,1213 chrII 7839 . G T 76.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.702;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.9926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.69;MQ0=121;MQRankSum=1.992;QD=0.36;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-3.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,18:209:99:106,0,974 chrII 7866 . C A 347.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.964;DP=151;Dels=0.00;FS=35.706;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.89;MQ0=90;MQRankSum=2.134;QD=2.30;ReadPosRankSum=-3.424;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,28:151:99:377,0,399 chrII 8072 . C T 79.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;DP=129;Dels=0.00;FS=37.044;HaplotypeScore=22.6641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.58;MQ0=79;MQRankSum=1.394;QD=0.61;ReadPosRankSum=-2.829;SB=-3.000e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,12:129:99:109,0,255 chrII 8073 . G A 100.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.340;DP=131;Dels=0.00;FS=9.236;HaplotypeScore=28.3189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.47;MQ0=81;MQRankSum=0.708;QD=0.76;ReadPosRankSum=-3.191;SB=-3.492e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,25:131:99:130,0,328 chrII 8079 . C T 74.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.213;DP=135;Dels=0.00;FS=9.261;HaplotypeScore=36.6985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.60;MQ0=84;MQRankSum=1.035;QD=0.55;ReadPosRankSum=-0.286;SB=-2.592e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,23:135:99:104,0,402 chrII 8083 . C T 45.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.190;DP=154;Dels=0.00;FS=27.837;HaplotypeScore=30.2188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.71;MQ0=99;MQRankSum=1.613;QD=0.29;ReadPosRankSum=1.456;SB=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,11:154:75:75,0,437 chrII 8084 . T G 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;DP=154;Dels=0.00;FS=17.621;HaplotypeScore=33.0091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.71;MQ0=99;MQRankSum=1.442;QD=0.25;ReadPosRankSum=1.543;SB=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,14:154:69:69,0,434 chrII 8103 . A T 68.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;DP=145;Dels=0.00;FS=14.988;HaplotypeScore=14.2149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.97;MQ0=98;MQRankSum=1.808;QD=0.47;ReadPosRankSum=0.314;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,31:145:98:98,0,391 chrII 8139 . T C 123.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.216;DP=169;Dels=0.00;FS=26.422;HaplotypeScore=14.1178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.86;MQ0=87;MQRankSum=1.705;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.618;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,18:169:99:153,0,868 chrII 8161 . C G 221.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;DP=191;Dels=0.00;FS=41.329;HaplotypeScore=14.5534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.86;MQ0=106;MQRankSum=3.162;QD=1.16;ReadPosRankSum=-2.316;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,19:191:99:251,0,846 chrII 8174 . T A 208.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;DP=174;Dels=0.00;FS=11.295;HaplotypeScore=6.2886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.12;MQ0=88;MQRankSum=0.754;QD=1.20;ReadPosRankSum=-2.795;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,39:174:99:238,0,841 chrII 8221 . G A 141.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.745;DP=136;Dels=0.00;FS=33.376;HaplotypeScore=5.9407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.31;MQ0=70;MQRankSum=-1.184;QD=1.04;ReadPosRankSum=1.748;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,28:136:99:171,0,469 chrII 8222 . T C 140.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.986;DP=131;Dels=0.00;FS=30.100;HaplotypeScore=7.9207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.75;MQ0=70;MQRankSum=-1.009;QD=1.07;ReadPosRankSum=1.419;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,28:131:99:170,0,427 chrII 8242 . T A 382.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.856;DP=109;Dels=0.00;FS=67.200;HaplotypeScore=7.8732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.71;MQ0=63;MQRankSum=2.856;QD=3.50;ReadPosRankSum=-1.695;SB=-8.593e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,29:109:99:412,0,128 chrII 8592 . C T 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.235;DP=111;Dels=0.00;FS=13.901;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.227;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,38:111:99:689,0,1528 chrII 8616 . G A 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;DP=99;Dels=0.00;FS=16.761;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=7.37;ReadPosRankSum=-1.414;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,38:99:99:760,0,1293 chrII 8647 . G A 577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.251;DP=86;Dels=0.00;FS=11.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.279;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,31:86:99:607,0,1174 chrII 8963 . T G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.893;DP=108;Dels=0.00;FS=1.680;HaplotypeScore=4.6778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=2.592;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1048,0,1250 chrII 9266 . C T 139.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.847;DP=90;Dels=0.00;FS=38.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.48;MQ0=60;MQRankSum=-1.222;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.448;SB=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,9:90:99:169,0,429 chrII 9332 . G C 114.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.550;DP=128;Dels=0.00;FS=41.931;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.70;MQ0=89;MQRankSum=-2.083;QD=0.89;ReadPosRankSum=2.983;SB=-6.506e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,12:128:99:144,0,659 chrII 9427 . A T 104.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;DP=49;Dels=0.00;FS=14.098;HaplotypeScore=14.8734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.97;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.041;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,8:49:99:134,0,353 chrII 9432 . C T 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;DP=51;Dels=0.00;FS=1.101;HaplotypeScore=12.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.157;QD=0.73;ReadPosRankSum=-2.723;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:67:67,0,385 chrII 10621 . C T 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2764,273,0 chrII 10859 . A T 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;DP=131;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.727;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.520;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1571,0,1153 chrII 12359 . T G 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.429;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.343;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1383,0,1605 chrII 14472 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.924;DP=115;Dels=0.00;FS=2.381;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1312,0,1045 chrII 15222 . T A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.146;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.459;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.335;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1281,0,1163 chrII 15234 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.528;DP=120;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.883;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1267,0,1210 chrII 15510 . G T 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2989,303,0 chrII 15518 . A G 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.753;DP=127;Dels=0.00;FS=5.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1438,0,1304 chrII 15736 . T C 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.966;DP=110;Dels=0.00;FS=1.539;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.075;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1007,0,1348 chrII 15830 . A G 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.850;DP=114;Dels=0.00;FS=3.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.351;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:874,0,1426 chrII 15835 . C T 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.719;DP=119;Dels=0.00;FS=3.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.874;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:863,0,1432 chrII 15842 . C T 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.561;DP=121;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.750;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.182;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:867,0,1497 chrII 15880 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.767;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=7.66;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:911,0,1393 chrII 16293 . A T 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.345;DP=135;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.948;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1551,0,1443 chrII 16380 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.122;DP=159;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.000;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,69:159:99:1427,0,1922 chrII 16392 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.700;DP=162;Dels=0.00;FS=2.895;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,70:162:99:1387,0,2090 chrII 16530 . C T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.020;DP=146;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.942;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,58:146:99:1212,0,1980 chrII 16749 . G A 1867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.762;DP=161;Dels=0.00;FS=1.953;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.688;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1897,0,1508 chrII 16956 . G A 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.733;DP=135;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.773;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,53:135:99:1059,0,1719 chrII 17470 . T G 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.744;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:911,0,1314 chrII 17502 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.308;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.458;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1127,0,1329 chrII 17571 . C T 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.435;DP=97;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:996,0,1037 chrII 17715 . A G 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.208;DP=172;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=5.5433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=8.77;ReadPosRankSum=2.545;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,78:172:99:1539,0,2106 chrII 18082 . A T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;DP=123;Dels=0.00;FS=2.500;HaplotypeScore=2.6414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.997;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1399,0,1188 chrII 18175 . T C 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.025;DP=171;Dels=0.00;FS=7.710;HaplotypeScore=5.8507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.715;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,83:171:99:1708,0,1949 chrII 18513 . A G 1814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.988;DP=154;Dels=0.00;FS=8.358;HaplotypeScore=3.4535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.013;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,87:154:99:1844,0,1407 chrII 19056 . T G 146.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.002;DP=99;Dels=0.00;FS=84.105;HaplotypeScore=20.7502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=1;MQRankSum=1.065;QD=1.47;ReadPosRankSum=-2.548;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:176,0,1059 chrII 19770 . A G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.618;DP=148;Dels=0.00;FS=4.943;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.720;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1314,0,1711 chrII 19967 . T C 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2957,309,0 chrII 21532 . C T 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.764;DP=149;Dels=0.01;FS=7.726;HaplotypeScore=3.9453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.646;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1511,0,1627 chrII 21958 . T C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.547;DP=106;Dels=0.00;FS=3.518;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1033,0,1167 chrII 23537 . T C 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.528;DP=114;Dels=0.00;FS=1.593;HaplotypeScore=2.8751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.369;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:839,0,1548 chrII 23787 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.454;DP=139;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=8.2564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1413,0,1403 chrII 24096 . A G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.081;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=7.36;ReadPosRankSum=-2.619;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,84:141:99:1068,0,934 chrII 24209 . T C 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2971,306,0 chrII 24838 . A G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.158;DP=125;Dels=0.00;FS=8.106;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=-1.020;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1322,0,1339 chrII 24859 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.279;DP=114;Dels=0.00;FS=10.325;HaplotypeScore=6.0352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1257,0,1097 chrII 24972 . C T 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.690;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=13.11;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,80:132:99:1761,0,1039 chrII 25059 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.672;DP=127;Dels=0.00;FS=19.644;HaplotypeScore=3.5081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.074;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1470,0,1268 chrII 25345 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.766;DP=140;Dels=0.00;FS=2.151;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.255;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1351,0,1470 chrII 25639 . A T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.767;DP=165;Dels=0.00;FS=2.834;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=9.47;ReadPosRankSum=-2.381;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1592,0,1794 chrII 25680 . C G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.921;DP=152;Dels=0.00;FS=14.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.581;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,67:152:99:1318,0,1842 chrII 25978 . G A 1858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.529;DP=165;Dels=0.00;FS=3.361;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,89:165:99:1888,0,1485 chrII 26029 . G A 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.473;DP=146;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.684;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1643,0,1430 chrII 26040 . C T 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.538;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.616;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1548,0,1630 chrII 26161 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1173,0,1261 chrII 26500 . A C 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3042,318,0 chrII 26767 . T A 2098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.471;DP=166;Dels=0.00;FS=10.792;HaplotypeScore=6.8646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.920;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,95:166:99:2128,0,1497 chrII 26815 . A G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.378;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=8.80;ReadPosRankSum=2.062;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:163:99:1465,0,1942 chrII 26950 . T A 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.742;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.359;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1648,0,1479 chrII 27032 . G T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.314;DP=129;Dels=0.00;FS=11.244;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.619;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1249,0,1560 chrII 27157 . G A 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.126;DP=132;Dels=0.00;FS=7.983;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.031;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1293,0,1529 chrII 27577 . G A 1943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.418;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.885;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,94:188:99:1973,0,1869 chrII 27850 . T C 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.116;DP=113;Dels=0.00;FS=16.282;HaplotypeScore=2.1500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:113:99:960,0,1322 chrII 27855 . C T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;DP=129;Dels=0.00;FS=10.254;HaplotypeScore=4.1381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.534;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1192,0,1366 chrII 27998 . G A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.562;DP=113;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.709;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1157,0,1155 chrII 28250 . A G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.396;DP=91;Dels=0.00;FS=4.126;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,52:91:99:1148,0,796 chrII 28485 . G C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.133;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1243,0,1137 chrII 29052 . T A 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.923;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2765,273,0 chrII 29064 . T C 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.04;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2975,312,0 chrII 29190 . A G 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3600,375,0 chrII 29269 . A G 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3441,345,0 chrII 29361 . T C 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.53;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3387,351,0 chrII 29377 . A C 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.21;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3194,333,0 chrII 29496 . C T 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.810;DP=148;Dels=0.00;FS=5.966;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1735,0,1351 chrII 30012 . C T 602 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.310;DP=61;Dels=0.00;FS=4.988;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.93;MQ0=20;MQRankSum=1.648;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.296;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,40:61:69:635,69,0 chrII 30050 . A G 306 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.54;MQ0=52;QD=3.64;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:49,35:84:39:339,39,0 chrII 31097 . G A 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=148;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.10;MQ0=142;MQRankSum=0.406;QD=0.12;ReadPosRankSum=-1.537;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:135,13:148:6:49,6,0 chrII 31193 . C T 84.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.368;DP=88;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.47;MQ0=80;MQRankSum=2.017;QD=0.96;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:81,6:88:12:117,12,0 chrII 31198 . T C 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=85;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.79;MQ0=78;MQRankSum=1.754;QD=0.59;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:80,5:85:9:82,9,0 chrII 31236 . A G 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=71;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.21;MQ0=66;MQRankSum=1.231;QD=0.28;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:69,2:71:6:51,6,0 chrII 31242 . A G 51.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=75;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.07;MQ0=69;MQRankSum=1.537;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.988;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:72,3:75:9:84,9,0 chrII 31253 . C A 54.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=97;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.34;MQ0=91;MQRankSum=1.537;QD=0.57;ReadPosRankSum=-0.988;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:94,3:97:9:87,9,0 chrII 31260 . A G 67.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=100;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.01;MQ0=93;MQRankSum=1.754;QD=0.68;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:96,4:100:12:100,12,0 chrII 31264 . A G 96.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=107;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.45;MQ0=99;MQRankSum=1.920;QD=0.90;ReadPosRankSum=-0.956;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:102,5:107:15:129,15,0 chrII 31318 . G A 141.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.80;MQ0=103;QD=1.29;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:100,9:109:18:174,18,0 chrII 31324 . G A 139.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.03;MQ0=96;QD=1.36;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:93,9:102:18:172,18,0 chrII 31330 . C T 141.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.01;MQ0=96;QD=1.37;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:93,10:103:18:174,18,0 chrII 31480 . A G 685 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.71;MQ0=15;QD=11.61;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,46:59:78:718,78,0 chrII 31486 . C T 721 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.33;MQ0=37;QD=9.13;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,47:79:78:754,78,0 chrII 31525 . T C 310 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.94;MQ0=86;QD=3.04;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:81,20:102:30:343,30,0 chrII 31561 . A G 283.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.78;MQ0=108;QD=2.30;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:106,17:123:27:316,27,0 chrII 31582 . A C 52.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.53;MQ0=120;QD=0.43;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:115,7:123:9:85,9,0 chrII 31686 . A G 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.84;MQ0=104;QD=0.46;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:101,8:109:9:82,9,0 chrII 31742 . T G 75.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.03;MQ0=129;QD=0.57;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:123,10:133:12:108,12,0 chrII 31795 . A G 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.73;MQ0=119;QD=0.19;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:107,14:121:6:54,6,0 chrII 32690 . C A 78.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.749;DP=87;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.27;MQ0=76;MQRankSum=2.637;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.143;SB=-3.871e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:53,33:86:12:111,12,0 chrII 32719 . A G 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.714;DP=157;Dels=0.00;FS=7.519;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.62;MQ0=102;MQRankSum=0.915;QD=0.09;ReadPosRankSum=0.494;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,32:157:44:44,0,189 chrII 32850 . T C 74.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.03;MQ0=53;QD=1.15;SB=-5.175e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:12:107,12,0 chrII 32897 . C A 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;DP=139;Dels=0.00;FS=15.128;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.05;MQ0=119;MQRankSum=2.329;QD=0.25;ReadPosRankSum=-1.270;SB=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,3:139:37:65,0,37 chrII 32900 . G A 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.627;DP=139;Dels=0.00;FS=14.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.94;MQ0=120;MQRankSum=2.292;QD=0.30;ReadPosRankSum=-0.727;SB=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,3:139:39:71,0,39 chrII 33016 . G C 235.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;DP=106;Dels=0.00;FS=25.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.14;MQ0=78;MQRankSum=1.310;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,14:106:99:265,0,142 chrII 33029 . C A 265.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.597;DP=98;Dels=0.00;FS=17.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.51;MQ0=69;MQRankSum=1.331;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.502;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,14:98:99:295,0,183 chrII 33037 . T G 263.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;DP=91;Dels=0.00;FS=17.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.35;MQ0=61;MQRankSum=1.742;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.332;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,15:91:99:293,0,194 chrII 33075 . A G 511 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.52;MQ0=0;QD=21.29;SB=-6.524e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:60:544,60,0 chrII 33097 . C A 81.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;DP=33;Dels=0.00;FS=5.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.31;MQ0=1;MQRankSum=1.328;QD=2.45;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:111,0,327 chrII 33250 . C T 1056.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.411;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.30;MQ0=9;MQRankSum=-2.950;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.801;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,65:111:99:1086,0,494 chrII 33391 . T C 289.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.300;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.66;MQ0=12;MQRankSum=-0.305;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.250;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:319,0,162 chrII 33392 . A C 302.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.101;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.49;MQ0=12;MQRankSum=-0.954;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:332,0,143 chrII 33616 . T C 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;DP=15;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.02;MQ0=3;MQRankSum=-1.849;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:66:66,0,67 chrII 33623 . C T 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=14;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.72;MQ0=2;MQRankSum=-1.664;QD=2.57;ReadPosRankSum=-1.294;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:66:66,0,67 chrII 33631 . A T 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;DP=12;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.38;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.109;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:64:68,0,64 chrII 33646 . A G 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=18;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.95;MQ0=7;MQRankSum=-2.262;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:40:40,0,74 chrII 35353 . A G 12.29 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.311;DP=65;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.05;MQ0=48;MQRankSum=2.012;QD=0.19;ReadPosRankSum=1.565;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,2:65:20:42,0,20 chrII 35631 . C T 77.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.367;DP=39;Dels=0.00;FS=1.847;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.906;QD=1.97;ReadPosRankSum=2.815;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:107,0,265 chrII 35660 . T C 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.324;DP=59;Dels=0.00;FS=6.834;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.98;MQ0=0;MQRankSum=-4.209;QD=0.44;ReadPosRankSum=2.796;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:56:56,0,925 chrII 35688 . T G 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.304;DP=75;Dels=0.00;FS=8.918;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.01;MQ0=0;MQRankSum=-4.122;QD=0.41;ReadPosRankSum=-2.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,13:75:61:61,0,1407 chrII 35736 . T C 169.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.735;DP=92;Dels=0.00;FS=46.972;HaplotypeScore=3.5566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.65;MQ0=0;MQRankSum=-5.591;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:199,0,1626 chrII 35737 . A C 168.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.436;DP=93;Dels=0.00;FS=43.354;HaplotypeScore=3.5566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.20;MQ0=0;MQRankSum=-5.338;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.022;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:198,0,1656 chrII 35816 . A T 269.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=80;Dels=0.00;FS=25.341;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.31;MQ0=0;MQRankSum=-3.950;QD=3.36;ReadPosRankSum=-2.676;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:299,0,1086 chrII 35839 . G A 617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;DP=53;Dels=0.00;FS=13.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.70;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=11.64;ReadPosRankSum=5.099;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:647,0,129 chrII 36220 . C G 87.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;DP=19;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=10.8809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.40;MQ0=9;MQRankSum=1.393;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-4.820e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,9:19:15:120,15,0 chrII 36221 . A T 94.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;DP=17;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=10.8809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.43;MQ0=7;MQRankSum=1.393;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.348;SB=-4.820e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,9:17:15:127,15,0 chrII 36362 . A G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.197;DP=138;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=4.7588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.270;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1437,0,1393 chrII 36366 . A T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.698;DP=117;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.154;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1214,0,1165 chrII 36389 . T C 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.37;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2934,294,0 chrII 36492 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.198;DP=136;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=9.15;ReadPosRankSum=-2.370;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1274,0,1382 chrII 37424 . G A 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;DP=139;Dels=0.00;FS=3.649;HaplotypeScore=4.5558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=25.84;ReadPosRankSum=1.707;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3592,363,0 chrII 37454 . C T 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3173,316,0 chrII 37628 . C T 2522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.520;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6902;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.555;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2555,261,0 chrII 38273 . C T 2268 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=17.72;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2301,237,0 chrII 38779 . C A 1599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9082;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.04;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1632,162,0 chrII 38800 . G A 2056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.338;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:2089,213,0 chrII 38825 . A G 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.140;DP=88;Dels=0.00;FS=0.885;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.921;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:88:99:849,0,954 chrII 39234 . A T 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.97;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3412,337,0 chrII 39405 . C T 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.603;DP=119;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:909,0,1540 chrII 40179 . A G 633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.676;DP=91;Dels=0.00;FS=3.062;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.489;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,37:91:99:663,0,1173 chrII 40260 . G A 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3097,295,0 chrII 40329 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.913;DP=128;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.478;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1313,0,1364 chrII 40479 . T C 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;DP=95;Dels=0.00;FS=8.255;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:890,0,946 chrII 40554 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.634;DP=112;Dels=0.00;FS=4.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.84;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.933;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1244,0,1020 chrII 40598 . T C 196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.348;DP=102;Dels=0.00;FS=14.301;HaplotypeScore=32.1494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;MQ0=0;MQRankSum=2.852;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,60:102:99:226,0,569 chrII 40699 . G A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;DP=121;Dels=0.00;FS=3.583;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.153;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1219,0,1338 chrII 40720 . C T 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.880;DP=86;Dels=0.00;FS=1.920;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,36:86:99:721,0,1116 chrII 40882 . T C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.819;DP=109;Dels=0.00;FS=1.655;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.310;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.009;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1332,0,985 chrII 40983 . C T 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.234;DP=101;Dels=0.00;FS=1.595;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.725;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1115,0,941 chrII 40992 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.218;DP=99;Dels=0.00;FS=2.735;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.265;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1307,0,820 chrII 41046 . T C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.320;DP=107;Dels=0.00;FS=1.750;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.011;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.293;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1195,0,984 chrII 41484 . C T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.433;DP=130;Dels=0.00;FS=3.150;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.530;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1292,0,1433 chrII 41506 . C A 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.304;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.720;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1544,0,1738 chrII 41781 . C T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.311;DP=138;Dels=0.00;FS=9.412;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.071;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1352,0,1558 chrII 41802 . C T 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.255;DP=164;Dels=0.00;FS=10.311;HaplotypeScore=2.6015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.149;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,75:164:99:1545,0,1894 chrII 41913 . A G 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.924;DP=168;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.660;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,83:168:99:1632,0,1836 chrII 41932 . A T 1915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.149;DP=169;Dels=0.00;FS=2.790;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.187;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,86:169:99:1945,0,1813 chrII 41973 . C T 1885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.775;DP=168;Dels=0.00;FS=6.270;HaplotypeScore=4.6118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.935;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1915,0,1620 chrII 42009 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.100;DP=109;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.342;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1219,0,1158 chrII 42018 . A G 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.801;DP=112;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.639;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1177,0,1293 chrII 42177 . G T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.631;DP=150;Dels=0.00;FS=2.195;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1505,0,1563 chrII 42187 . C A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.219;DP=152;Dels=0.00;FS=10.583;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1555,0,1652 chrII 42921 . G A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=-0.812;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.374;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1281,0,1831 chrII 42991 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.033;DP=149;Dels=0.00;FS=3.016;HaplotypeScore=4.7546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=7.60;ReadPosRankSum=2.432;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,56:149:99:1163,0,2061 chrII 43330 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.227;DP=133;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=2.208;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1198,0,1606 chrII 43348 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.559;DP=142;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=3.3618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.902;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:1069,0,1828 chrII 43588 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.376;DP=150;Dels=0.00;FS=5.878;HaplotypeScore=5.7685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1352,0,1693 chrII 43654 . T C 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.293;DP=168;Dels=0.00;FS=4.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.450;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,75:168:99:1481,0,2041 chrII 43688 . T C 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.730;DP=160;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1545,0,1796 chrII 43708 . T C 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.420;DP=143;Dels=0.00;FS=2.159;HaplotypeScore=3.8924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.369;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1390,0,1581 chrII 44047 . G A 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.025;DP=150;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1452,0,1735 chrII 44098 . G T 1969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.208;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.395;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,88:156:99:1999,0,1349 chrII 44904 . C T 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;DP=162;Dels=0.00;FS=6.824;HaplotypeScore=6.1076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1766,0,1531 chrII 44974 . T C 1836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.499;DP=182;Dels=0.00;FS=1.888;HaplotypeScore=4.8003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.653;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,101:182:99:1866,0,1685 chrII 45009 . G A 1819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.816;DP=162;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.078;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,87:162:99:1849,0,1537 chrII 45075 . C T 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=151;Dels=0.00;FS=4.068;HaplotypeScore=10.3186;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.655;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3785,379,0 chrII 45269 . T C 601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.199;DP=113;Dels=0.00;FS=15.375;HaplotypeScore=5.8712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:631,0,656 chrII 45299 . A G 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.156;DP=97;Dels=0.00;FS=6.265;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.465;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,57:97:99:855,0,634 chrII 45699 . G T 1872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.439;DP=163;Dels=0.00;FS=18.040;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,87:163:99:1902,0,1560 chrII 45824 . T C 4361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.886;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=25.21;ReadPosRankSum=1.329;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:173:99:4361,447,0 chrII 46720 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.631;DP=130;Dels=0.00;FS=21.173;HaplotypeScore=3.4742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1302,0,1341 chrII 47062 . A G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.477;DP=139;Dels=0.00;FS=18.058;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:139:99:1170,0,1856 chrII 47244 . A T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.678;DP=176;Dels=0.00;FS=5.287;HaplotypeScore=10.5542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=1;MQRankSum=0.339;QD=8.70;ReadPosRankSum=1.262;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,82:176:99:1562,0,1884 chrII 49603 . A G 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3501,360,0 chrII 49999 . A G 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3430,351,0 chrII 50068 . C G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.620;DP=143;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.352;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1325,0,1546 chrII 50539 . A G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.280;DP=107;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.485;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,69:107:99:1425,0,771 chrII 50569 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;DP=104;Dels=0.00;FS=7.976;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,64:104:99:1378,0,823 chrII 50601 . C A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.226;DP=133;Dels=0.00;FS=11.217;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.527;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:133:99:1606,0,1065 chrII 50626 . G A 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.980;DP=143;Dels=0.00;FS=17.418;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.105;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1738,0,1271 chrII 50820 . C T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.712;DP=127;Dels=0.00;FS=1.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=0.362;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.225;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1437,0,1155 chrII 50893 . G A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.903;DP=102;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.282;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1083,0,1046 chrII 50947 . A G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.925;DP=113;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.377;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1245,0,1148 chrII 50954 . G C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.505;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1451,0,1319 chrII 50996 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.830;DP=127;Dels=0.00;FS=2.458;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1279,0,1276 chrII 51538 . T C 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.246;DP=146;Dels=0.00;FS=7.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.167;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,85:146:99:1818,0,1293 chrII 51589 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.827;DP=134;Dels=0.00;FS=1.872;HaplotypeScore=5.6967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1316,0,1390 chrII 51976 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.541;DP=110;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.051;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1361,0,875 chrII 52083 . T C 677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.463;DP=98;Dels=0.00;FS=1.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,40:98:99:707,0,1291 chrII 52107 . C A 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.903;DP=108;Dels=0.00;FS=5.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=1.933;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.020;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,38:108:99:732,0,1470 chrII 52217 . C T 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.586;DP=111;Dels=0.00;FS=2.455;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.098;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:849,0,1268 chrII 52301 . T C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.442;DP=115;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:931,0,1353 chrII 53315 . G A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.673;DP=132;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=8.6790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.066;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1222,0,1582 chrII 53512 . A C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.327;DP=138;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=2.8529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.022;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1255,0,1530 chrII 53554 . G C 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.921;DP=144;Dels=0.00;FS=2.171;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.482;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1548,0,1340 chrII 53802 . A C 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.961;DP=122;Dels=0.00;FS=2.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,78:122:99:1627,0,929 chrII 53815 . G A 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.800;DP=122;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=2.9669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,77:122:99:1726,0,916 chrII 54034 . G A 1867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.153;DP=136;Dels=0.00;FS=2.300;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.786;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,82:136:99:1897,0,1061 chrII 54042 . G A 1816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.690;DP=135;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=13.45;ReadPosRankSum=2.423;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,81:135:99:1846,0,1091 chrII 54156 . T C 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6431;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2718,279,0 chrII 54267 . A G 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.621;DP=109;Dels=0.00;FS=2.465;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.798;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1199,0,1127 chrII 54607 . G A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.010;DP=157;Dels=0.00;FS=1.269;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,74:157:99:1565,0,1771 chrII 54682 . T C 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.529;DP=162;Dels=0.00;FS=1.969;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=9.15;ReadPosRankSum=2.522;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1512,0,1754 chrII 54813 . G A 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.885;DP=133;Dels=0.00;FS=6.563;HaplotypeScore=5.1909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.372;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1593,0,1199 chrII 54988 . A G 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.805;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1703,0,1170 chrII 55191 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.587;DP=124;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.235;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1249,0,1438 chrII 55192 . A T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.251;DP=123;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.956;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1253,0,1441 chrII 55537 . G C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.915;DP=117;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.406;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1228,0,1225 chrII 55693 . A C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.309;DP=131;Dels=0.00;FS=5.446;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1196,0,1550 chrII 56575 . A T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.050;DP=111;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.499;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1202,0,1181 chrII 56837 . C G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.100;DP=132;Dels=0.00;FS=5.335;HaplotypeScore=5.6372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1253,0,1423 chrII 56942 . A T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;DP=113;Dels=0.00;FS=2.429;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1035,0,1398 chrII 56974 . C A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.469;DP=122;Dels=0.00;FS=8.657;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1274,0,1293 chrII 57088 . C T 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.893;DP=97;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1034,0,1036 chrII 57316 . T C 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.176;DP=101;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1002,0,1134 chrII 57742 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.479;DP=128;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.701;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1338,0,1310 chrII 58180 . C T 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.157;DP=122;Dels=0.00;FS=5.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.662;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1128,0,1474 chrII 58381 . A C 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.394;DP=147;Dels=0.00;FS=3.183;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.607;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,86:147:99:1828,0,1279 chrII 58496 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.419;DP=143;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=3.9477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.423;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1365,0,1694 chrII 58629 . C T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.612;DP=122;Dels=0.00;FS=4.610;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.713;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:122:99:1342,0,1263 chrII 58654 . A T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.716;DP=122;Dels=0.00;FS=1.616;HaplotypeScore=4.3351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.806;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1354,0,1212 chrII 58773 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.202;DP=112;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.167;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1320,0,1038 chrII 58787 . A T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.758;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:1412,0,1073 chrII 58900 . A G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.558;DP=127;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=0.693;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.585;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1173,0,1471 chrII 59001 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.145;DP=129;Dels=0.00;FS=7.951;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1353,0,1426 chrII 59164 . G C 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3010,321,0 chrII 59191 . G C 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3213,333,0 chrII 59525 . T C 623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.493;DP=94;Dels=0.00;FS=8.427;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:94:99:653,0,1226 chrII 59755 . T C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.061;DP=106;Dels=0.00;FS=3.595;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1059,0,1077 chrII 59864 . A G 529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.847;DP=88;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQ0=1;MQRankSum=-0.558;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.463;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:559,0,1194 chrII 59894 . G A 262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.980;DP=86;Dels=0.00;FS=1.839;HaplotypeScore=5.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.40;MQ0=1;MQRankSum=-2.552;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.805;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,31:86:99:292,0,1277 chrII 59900 . G A 186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.257;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=1;MQRankSum=-4.680;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.210;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,31:82:99:216,0,1116 chrII 59948 . T C 326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;DP=87;Dels=0.00;FS=1.818;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.14;MQ0=0;MQRankSum=-7.106;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:356,0,1168 chrII 60329 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.447;DP=101;Dels=0.00;FS=0.859;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.260;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,61:101:99:1226,0,867 chrII 60330 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;DP=102;Dels=0.00;FS=0.862;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.622;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,60:102:99:1241,0,888 chrII 60470 . A G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.795;DP=122;Dels=0.00;FS=17.659;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1392,0,1167 chrII 60478 . G A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.528;DP=122;Dels=0.00;FS=12.233;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1486,0,1104 chrII 60545 . C T 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.490;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.554;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1378,0,1148 chrII 60551 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=123;Dels=0.00;FS=7.052;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.560;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1263,0,1193 chrII 60786 . T C 1781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;DP=163;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,85:163:99:1811,0,1664 chrII 60829 . C A 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.809;DP=155;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.477;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1732,0,1614 chrII 60917 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.939;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.348;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1183,0,1083 chrII 61024 . C A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.952;DP=140;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.13;MQ0=0;MQRankSum=-9.548;QD=8.16;ReadPosRankSum=-1.215;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:140:99:1172,0,1593 chrII 61031 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.412;DP=138;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=65.3382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.94;MQ0=0;MQRankSum=-9.267;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.928;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1094,0,1568 chrII 61067 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.192;DP=153;Dels=0.00;FS=5.789;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-7.342;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1303,0,1740 chrII 61071 . G A 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.846;DP=151;Dels=0.00;FS=7.214;HaplotypeScore=5.5407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.32;MQ0=0;MQRankSum=-7.657;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.524;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,65:151:99:1179,0,1815 chrII 61089 . T A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;DP=139;Dels=0.00;FS=12.619;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-4.477;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.070;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1119,0,1740 chrII 61103 . T C 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.377;DP=142;Dels=0.00;FS=6.122;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.762;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.870;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1145,0,1693 chrII 61199 . A T 1172.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.105;DP=147;Dels=0.00;FS=2.118;HaplotypeScore=4.1802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=7.97;ReadPosRankSum=2.206;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,60:147:99:1202,0,1872 chrII 61202 . C T 1197.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.413;DP=145;Dels=0.00;FS=2.117;HaplotypeScore=3.3916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=8.26;ReadPosRankSum=2.117;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,61:145:99:1227,0,1788 chrII 61208 . C T 1148.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.010;DP=140;Dels=0.00;FS=5.094;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=8.20;ReadPosRankSum=2.245;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1178,0,1597 chrII 61287 . G A 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.252;DP=139;Dels=0.00;FS=5.079;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=12.24;ReadPosRankSum=3.270;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1732,0,1263 chrII 61304 . G A 1837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.730;DP=145;Dels=0.00;FS=7.583;HaplotypeScore=2.7066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.273;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,87:145:99:1867,0,1043 chrII 61376 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.277;DP=142;Dels=0.00;FS=4.064;HaplotypeScore=3.2350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.287;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1448,0,1507 chrII 61447 . T C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.791;DP=143;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=2.3459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1256,0,1670 chrII 61810 . C T 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.013;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,87:150:99:1840,0,1180 chrII 61835 . A T 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.500;DP=173;Dels=0.00;FS=1.983;HaplotypeScore=3.6097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=10.40;ReadPosRankSum=3.356;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,89:173:99:1829,0,1653 chrII 62000 . T C 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.825;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.460;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1603,0,1239 chrII 62381 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.938;DP=161;Dels=0.00;FS=2.861;HaplotypeScore=8.8592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.307;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1473,0,1714 chrII 62709 . G T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.905;DP=135;Dels=0.00;FS=4.196;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.040;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1239,0,1559 chrII 62879 . G C 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;DP=84;Dels=0.00;FS=0.851;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.502;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:944,0,808 chrII 62891 . C T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.445;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1239,0,951 chrII 62971 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.231;DP=120;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=5.1199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.299;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1381,0,1044 chrII 63113 . T C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.362;DP=141;Dels=0.00;FS=3.141;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1215,0,1700 chrII 63115 . A T 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;DP=142;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1278,0,1648 chrII 63144 . T C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.303;DP=133;Dels=0.00;FS=12.492;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1143,0,1597 chrII 63295 . G T 1028.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.870;DP=110;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.392;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1058,0,1182 chrII 63304 . T A 1126.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.831;DP=108;Dels=0.00;FS=1.566;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1156,0,1077 chrII 63305 . G C 1007.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.438;DP=105;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.016;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1037,0,1017 chrII 63428 . C G 1784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.530;DP=163;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.470;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,85:163:99:1814,0,1619 chrII 63732 . A G 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.169;DP=88;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:863,0,1017 chrII 63857 . T C 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3550,366,0 chrII 63955 . G A 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.978;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=2.5900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=12.05;ReadPosRankSum=-2.226;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1596,0,1156 chrII 64139 . C T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.194;DP=146;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=5.6204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,84:146:99:1737,0,1219 chrII 64291 . G A 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.839;DP=160;Dels=0.00;FS=17.984;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.103;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,69:160:99:1367,0,1976 chrII 64716 . C G 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.076;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:865,0,1196 chrII 64820 . A C 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.416;DP=106;Dels=0.00;FS=1.565;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.801;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:774,0,1358 chrII 64864 . A C 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.075;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.228;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:937,0,1170 chrII 65171 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.458;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.761;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1193,0,1607 chrII 65480 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.062;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1090,0,1175 chrII 65527 . C T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.866;DP=92;Dels=0.00;FS=2.721;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.435;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:1134,0,762 chrII 65606 . C T 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;DP=103;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.652;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,43:103:99:836,0,1294 chrII 65975 . C T 1867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.389;DP=172;Dels=0.00;FS=7.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=3.080;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,88:172:99:1897,0,1719 chrII 66052 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.545;DP=119;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.673;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1366,0,1175 chrII 66467 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.295;DP=126;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.109;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1231,0,1416 chrII 66479 . A G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.452;DP=133;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.881;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.827;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1247,0,1516 chrII 66566 . T C 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.384;DP=121;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=2.6279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=1;MQRankSum=-1.011;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.406;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1297,0,1067 chrII 66975 . G T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.657;DP=157;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1701,0,1563 chrII 67175 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.355;DP=113;Dels=0.00;FS=2.446;HaplotypeScore=3.0995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.257;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1301,0,1094 chrII 68245 . G A 586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.818;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.250;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:616,0,853 chrII 68282 . G A 220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.860;DP=53;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=226.1629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.522;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:250,0,676 chrII 68312 . A G 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.888;DP=44;Dels=0.05;FS=1.921;HaplotypeScore=84.5011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.250;QD=1.34;ReadPosRankSum=-3.172;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:42:89:89,0,294 chrII 68834 . C T 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3538,352,0 chrII 68867 . C T 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.454;DP=122;Dels=0.00;FS=10.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.185;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1114,0,1421 chrII 69128 . C G 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;DP=109;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=6.20;ReadPosRankSum=2.350;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,38:109:99:706,0,1563 chrII 69229 . A G 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.615;DP=165;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1717,0,1847 chrII 69278 . T C 2137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.429;DP=195;Dels=0.00;FS=15.131;HaplotypeScore=7.4187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.611;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,101:195:99:2167,0,1883 chrII 69727 . T C 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.698;DP=147;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=9.42;ReadPosRankSum=-2.189;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1415,0,1698 chrII 69772 . A G 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;DP=177;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=2.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=10.73;ReadPosRankSum=2.465;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,92:177:99:1929,0,1784 chrII 70169 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.977;DP=134;Dels=0.01;FS=7.800;HaplotypeScore=14.8620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1346,0,1384 chrII 70215 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.784;DP=161;Dels=0.00;FS=3.055;HaplotypeScore=6.3266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.647;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,69:161:99:1369,0,1982 chrII 70420 . G C 2088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.246;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,103:197:99:2118,0,1881 chrII 70525 . T C 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.928;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.622;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:163:99:1505,0,2025 chrII 70638 . A G 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.310;DP=174;Dels=0.00;FS=7.696;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.331;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,85:174:99:1740,0,1917 chrII 70767 . C G 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.150;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,80:170:99:1611,0,1804 chrII 70939 . C T 1754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.749;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.077;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,80:164:99:1784,0,1802 chrII 71276 . C G 1907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.454;DP=174;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.958;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,95:174:99:1937,0,1578 chrII 71383 . G C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.650;DP=128;Dels=0.00;FS=7.267;HaplotypeScore=2.6069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1097,0,1445 chrII 71420 . T C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.794;DP=131;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,52:131:99:1021,0,1721 chrII 71431 . G A 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.285;DP=128;Dels=0.00;FS=4.632;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.030;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1648,0,993 chrII 71634 . A T 1949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.869;DP=186;Dels=0.00;FS=7.106;HaplotypeScore=2.6537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.872;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,95:186:99:1979,0,1935 chrII 71636 . T A 2059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.890;DP=187;Dels=0.00;FS=5.918;HaplotypeScore=2.6537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.361;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,95:187:99:2089,0,1932 chrII 72018 . C G 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;DP=156;Dels=0.00;FS=18.155;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1466,0,1520 chrII 72096 . A T 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.464;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,86:170:99:1803,0,1779 chrII 72117 . A G 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.241;DP=177;Dels=0.00;FS=3.433;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,87:177:99:1720,0,1954 chrII 72209 . A G 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.932;DP=167;Dels=0.00;FS=6.779;HaplotypeScore=6.6159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.901;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,85:167:99:1648,0,1730 chrII 72365 . G A 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.859;DP=192;Dels=0.00;FS=9.447;HaplotypeScore=37.5065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=1;MQRankSum=-2.972;QD=5.66;ReadPosRankSum=-1.837;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,88:192:99:1117,0,2026 chrII 72371 . A G 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.593;DP=179;Dels=0.00;FS=2.295;HaplotypeScore=39.2855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=1;MQRankSum=-3.093;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.264;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,48:179:99:703,0,2017 chrII 72663 . T C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.317;DP=165;Dels=0.00;FS=5.625;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:1463,0,1484 chrII 72833 . T C 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.579;DP=174;Dels=0.00;FS=1.900;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.488;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,80:174:99:1442,0,1925 chrII 72882 . G A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.794;DP=152;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1244,0,1870 chrII 73337 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.188;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,72:169:99:1341,0,1989 chrII 73354 . C T 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3675,370,0 chrII 73448 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.087;DP=102;Dels=0.00;FS=1.643;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,64:102:99:1384,0,708 chrII 73470 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.454;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.978;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,63:102:99:1319,0,804 chrII 73697 . A C 2031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.212;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=1;MQRankSum=-0.378;QD=13.02;ReadPosRankSum=-1.277;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,93:156:99:2061,0,1207 chrII 73758 . G T 1875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.363;DP=153;Dels=0.00;FS=3.842;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1905,0,1367 chrII 73871 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;DP=114;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.032;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.458;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:946,0,1372 chrII 73943 . G A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.438;DP=137;Dels=0.00;FS=2.151;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.782;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1408,0,1498 chrII 74102 . C T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.642;DP=122;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.870;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1277,0,1205 chrII 74189 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.371;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.301;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1479,0,1640 chrII 74263 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=174;Dels=0.00;FS=6.519;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.711;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,73:174:99:1415,0,2071 chrII 74291 . C A 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.604;DP=189;Dels=0.00;FS=2.534;HaplotypeScore=6.3491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,85:189:99:1672,0,2169 chrII 74441 . A G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.871;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=1.219;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.332;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,71:169:99:1287,0,2136 chrII 74528 . T C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.108;DP=144;Dels=0.00;FS=3.980;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.497;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1269,0,1731 chrII 74585 . C A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.060;DP=160;Dels=0.00;FS=2.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,69:160:99:1400,0,1815 chrII 74688 . C T 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.702;DP=169;Dels=0.00;FS=9.110;HaplotypeScore=7.2674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,87:169:99:1899,0,1034 chrII 74713 . G A 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.273;DP=172;Dels=0.00;FS=5.460;HaplotypeScore=4.3751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,92:172:99:1544,0,1659 chrII 74767 . G A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.908;DP=150;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.882;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1609,0,1451 chrII 74853 . A T 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.665;DP=130;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1213,0,1579 chrII 74920 . C T 638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.375;DP=90;Dels=0.01;FS=10.942;HaplotypeScore=8.8878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.917;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:668,0,1083 chrII 75097 . T A 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.501;DP=135;Dels=0.00;FS=12.705;HaplotypeScore=123.7948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1294,0,1683 chrII 75564 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=146;Dels=0.00;FS=3.836;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.308;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1314,0,1596 chrII 76187 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.480;DP=128;Dels=0.00;FS=4.271;HaplotypeScore=2.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.189;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1445,0,1221 chrII 76203 . A G 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.606;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.062;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1451,0,1239 chrII 76212 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.578;DP=131;Dels=0.01;FS=0.670;HaplotypeScore=4.9130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.988;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1484,0,1179 chrII 76314 . T G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.193;DP=113;Dels=0.00;FS=14.413;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.061;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.788;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1265,0,1104 chrII 76824 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.530;DP=109;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.003;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1074,0,1181 chrII 76869 . G A 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3663,361,0 chrII 76947 . A G 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.165;DP=140;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=3.5372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=12.31;ReadPosRankSum=-2.659;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,87:140:99:1753,0,1036 chrII 77223 . T C 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.256;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.338;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1681,0,1604 chrII 77239 . G A 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.526;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.994;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1759,0,1438 chrII 77259 . G T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.151;DP=106;Dels=0.00;FS=6.190;HaplotypeScore=5.7974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=2.063;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.582;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1252,0,984 chrII 77577 . T C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.613;DP=109;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=4.1111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=11.14;ReadPosRankSum=3.652;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1244,0,1050 chrII 77651 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.335;DP=128;Dels=0.00;FS=4.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.343;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:128:99:1376,0,1177 chrII 77699 . T A 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;DP=137;Dels=0.00;FS=10.555;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1615,0,1265 chrII 77714 . G C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=120;Dels=0.00;FS=9.946;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.924;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.428;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1377,0,1087 chrII 77748 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.892;DP=112;Dels=0.00;FS=5.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.050;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1266,0,1076 chrII 77835 . A C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.589;DP=121;Dels=0.00;FS=4.345;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.169;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1304,0,1223 chrII 78183 . C T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.699;DP=117;Dels=0.00;FS=1.999;HaplotypeScore=5.8797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.253;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1253,0,1252 chrII 78288 . T C 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.815;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.278;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,75:173:99:1530,0,2186 chrII 78537 . T C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.885;DP=112;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=6.8541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.035;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:112:99:1146,0,1177 chrII 78701 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.429;DP=123;Dels=0.00;FS=7.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1280,0,1300 chrII 78705 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.848;DP=131;Dels=0.00;FS=8.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1286,0,1394 chrII 79464 . A T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.765;DP=118;Dels=0.00;FS=5.049;HaplotypeScore=5.9434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.568;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:118:99:1274,0,1247 chrII 79470 . G A 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;DP=129;Dels=0.00;FS=11.893;HaplotypeScore=6.9378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.725;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.816;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1213,0,1394 chrII 79692 . A C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.016;DP=108;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1219,0,1090 chrII 79837 . C T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.576;DP=127;Dels=0.00;FS=9.656;HaplotypeScore=7.2130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.051;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:127:99:1363,0,1324 chrII 80393 . A G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.242;DP=136;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.271;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1085,0,1716 chrII 80423 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.422;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.115;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1055,0,1404 chrII 80748 . T C 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.516;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.506;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:796,0,958 chrII 80838 . A T 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;DP=105;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.868;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1054,0,1163 chrII 80848 . A C 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.243;DP=107;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.259;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1035,0,1186 chrII 80873 . C A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.209;DP=125;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.773;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1303,0,1206 chrII 81388 . G A 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.669;DP=129;Dels=0.00;FS=6.650;HaplotypeScore=3.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.573;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1570,0,1125 chrII 81418 . A G 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.639;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.86;MQ0=0;MQRankSum=-4.945;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.010;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1084,0,995 chrII 81427 . T A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;DP=101;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.42;MQ0=0;MQRankSum=-4.190;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1072,0,1021 chrII 81448 . G A 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.563;DP=96;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.37;MQ0=0;MQRankSum=-7.350;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1039,0,878 chrII 81451 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.482;DP=99;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.97;MQ0=0;MQRankSum=-7.362;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:968,0,979 chrII 81460 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.009;DP=119;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.40;MQ0=0;MQRankSum=-7.794;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.369;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1088,0,1236 chrII 81478 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.951;DP=123;Dels=0.00;FS=11.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.235;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1148,0,1346 chrII 81655 . T C 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.269;DP=144;Dels=0.00;FS=19.620;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=1.821;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1249,0,1775 chrII 81997 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.781;DP=101;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=-1.802;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.017;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1164,0,960 chrII 82363 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.320;DP=124;Dels=0.00;FS=2.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.217;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:1351,0,1089 chrII 82573 . C T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.835;DP=162;Dels=0.00;FS=7.566;HaplotypeScore=7.9608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.536;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,74:162:99:1599,0,1785 chrII 83659 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.246;DP=130;Dels=0.00;FS=9.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.484;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1342,0,1362 chrII 83662 . A G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.568;DP=129;Dels=0.00;FS=9.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1381,0,1430 chrII 83698 . C T 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3508,361,0 chrII 83713 . G C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;DP=153;Dels=0.00;FS=2.867;HaplotypeScore=3.8376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.138;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:153:99:1402,0,1649 chrII 83944 . G A 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.930;DP=114;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1183,0,1172 chrII 84294 . G T 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.713;DP=103;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=13.76;ReadPosRankSum=-1.208;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,63:103:99:1447,0,787 chrII 84352 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;DP=113;Dels=0.01;FS=0.747;HaplotypeScore=3.7440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:112:99:1143,0,1084 chrII 84413 . T A 198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;DP=139;Dels=0.00;FS=9.605;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.238;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:139:99:228,0,1185 chrII 84553 . C T 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.814;DP=109;Dels=0.00;FS=2.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.545;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1037,0,1147 chrII 84589 . C G 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.683;DP=110;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.094;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:863,0,1182 chrII 84590 . C G 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.339;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:894,0,1186 chrII 84631 . C G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.205;DP=120;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.162;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1201,0,1079 chrII 84823 . C T 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.198;DP=114;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.212;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1085,0,1217 chrII 84862 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.459;DP=106;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1094,0,1047 chrII 84976 . C T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;DP=114;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.146;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1380,0,1022 chrII 85144 . A G 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.635;DP=145;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1513,0,1507 chrII 85339 . A G 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.156;DP=127;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.925;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:127:99:1150,0,1400 chrII 85504 . T C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.768;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.227;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1346,0,1609 chrII 85528 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.784;DP=139;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.735;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1283,0,1550 chrII 85816 . A G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.991;DP=146;Dels=0.00;FS=4.955;HaplotypeScore=2.3770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.787;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1417,0,1547 chrII 85822 . T C 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.763;DP=148;Dels=0.00;FS=7.273;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=9.47;ReadPosRankSum=-2.451;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:148:99:1431,0,1546 chrII 85903 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.255;DP=152;Dels=0.00;FS=2.093;HaplotypeScore=3.2275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.150;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,61:152:99:1199,0,1691 chrII 86390 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.502;DP=140;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1257,0,1544 chrII 86416 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.806;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.047;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1261,0,1662 chrII 86465 . T G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.332;DP=155;Dels=0.00;FS=2.011;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.095;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.893;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1509,0,1702 chrII 86473 . A G 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.574;DP=162;Dels=0.00;FS=6.734;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.985;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,87:162:99:1652,0,1614 chrII 86518 . G A 1812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.680;DP=168;Dels=0.00;FS=6.814;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.049;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:168:99:1842,0,1636 chrII 86533 . C T 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.998;DP=160;Dels=0.00;FS=9.803;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.700;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1751,0,1573 chrII 86699 . A G 1830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.699;DP=149;Dels=0.00;FS=7.401;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.250;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,88:149:99:1860,0,1196 chrII 87000 . A G 1889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.907;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,87:140:99:1919,0,1082 chrII 87264 . A G 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.007;DP=151;Dels=0.00;FS=6.337;HaplotypeScore=3.9718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.870;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.014;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1559,0,1627 chrII 87294 . C T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.205;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.644;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:138:99:1564,0,1397 chrII 87772 . A G 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.664;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1751,0,1496 chrII 87809 . A G 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.726;DP=163;Dels=0.00;FS=2.102;HaplotypeScore=8.0251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.144;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:1742,0,1686 chrII 87929 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.984;DP=129;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.507;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1339,0,1397 chrII 88046 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.448;DP=108;Dels=0.00;FS=2.594;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1034,0,1286 chrII 88087 . T G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.738;DP=145;Dels=0.00;FS=4.163;HaplotypeScore=10.8150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.643;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1299,0,1455 chrII 88289 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.019;DP=124;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1187,0,1464 chrII 89325 . T C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.128;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.573;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1293,0,1497 chrII 89335 . C A 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.534;DP=146;Dels=0.00;FS=3.021;HaplotypeScore=1.9367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1473,0,1487 chrII 89547 . A G 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3950,408,0 chrII 89612 . C T 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.607;DP=171;Dels=0.00;FS=1.968;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=1;MQRankSum=-0.496;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.488;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,81:171:99:1724,0,1864 chrII 89621 . A C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.445;DP=165;Dels=0.00;FS=2.821;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=1;MQRankSum=0.082;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.944;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1488,0,1879 chrII 89628 . A G 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.441;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=1;MQRankSum=0.052;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.863;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,84:163:99:1520,0,1690 chrII 89733 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.116;DP=141;Dels=0.00;FS=1.382;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.932;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1440,0,1504 chrII 89751 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.371;DP=129;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1330,0,1391 chrII 89785 . T C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;DP=120;Dels=0.00;FS=0.884;HaplotypeScore=4.7577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.525;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1269,0,1256 chrII 89926 . A T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.693;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1327,0,1559 chrII 90014 . A G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.865;DP=169;Dels=0.00;FS=2.803;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.274;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,79:169:99:1565,0,1876 chrII 90193 . C A 947.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.966;DP=123;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.572;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:977,0,1553 chrII 90196 . C A 857.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.707;DP=125;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.763;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.767;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:887,0,1616 chrII 90202 . T G 854.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.492;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.290;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.754;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:884,0,1502 chrII 90237 . C T 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.003;DP=102;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.159;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:877,0,1270 chrII 90273 . T C 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.101;DP=101;Dels=0.00;FS=1.658;HaplotypeScore=29.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.938;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.436;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:101:99:729,0,1407 chrII 90326 . C T 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.259;DP=139;Dels=0.00;FS=4.570;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.092;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1048,0,1709 chrII 90695 . G A 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.609;DP=105;Dels=0.00;FS=4.966;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.149;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:786,0,1426 chrII 90715 . G C 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;DP=118;Dels=0.00;FS=3.474;HaplotypeScore=2.7508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:939,0,1510 chrII 91043 . G A 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.480;DP=143;Dels=0.00;FS=5.563;HaplotypeScore=2.7844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,83:143:99:1871,0,1099 chrII 91126 . A C 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.642;DP=145;Dels=0.00;FS=2.989;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.083;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,84:145:99:1710,0,1265 chrII 91278 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;DP=130;Dels=0.01;FS=1.414;HaplotypeScore=10.8647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.394;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1279,0,1445 chrII 91811 . C T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.730;DP=110;Dels=0.00;FS=16.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.313;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1003,0,1275 chrII 91895 . C T 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.701;DP=140;Dels=0.00;FS=4.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.656;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1631,0,1233 chrII 92047 . A T 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.918;DP=113;Dels=0.00;FS=4.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.422;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,44:113:99:809,0,1537 chrII 92128 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.223;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.672;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1124,0,1372 chrII 92362 . C T 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.504;DP=158;Dels=0.00;FS=1.993;HaplotypeScore=6.6851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.343;QD=11.01;ReadPosRankSum=-2.180;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:158:99:1770,0,1492 chrII 92393 . C A 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.851;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1723,0,1412 chrII 92395 . C A 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.430;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1741,0,1387 chrII 92890 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.844;DP=147;Dels=0.00;FS=4.911;HaplotypeScore=4.8662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.895;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1212,0,1728 chrII 92992 . T C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.960;DP=128;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.050;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1258,0,1412 chrII 93100 . A G 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.239;DP=147;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:147:99:1681,0,1406 chrII 93235 . T C 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.126;DP=151;Dels=0.00;FS=7.234;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=1.045;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.812;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,85:151:99:1795,0,1296 chrII 93469 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.939;DP=98;Dels=0.00;FS=4.117;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.854;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1047,0,945 chrII 93522 . T A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.070;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1075,0,1111 chrII 93526 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.229;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.140;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1076,0,1188 chrII 93696 . G A 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.272;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.384;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1583,0,1622 chrII 93758 . T G 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.846;DP=133;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=3.6289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=12.86;ReadPosRankSum=-2.034;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,82:133:99:1741,0,1069 chrII 93772 . C T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.066;DP=140;Dels=0.00;FS=5.335;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.313;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,52:140:99:1058,0,1902 chrII 93811 . T C 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3542,375,0 chrII 95085 . G A 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=117;Dels=0.00;FS=2.409;HaplotypeScore=2.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1183,0,1223 chrII 95093 . T G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.730;DP=123;Dels=0.00;FS=5.712;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.856;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.404;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1074,0,1501 chrII 95270 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.309;DP=113;Dels=0.00;FS=21.374;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.955;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1180,0,1147 chrII 95275 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.885;DP=111;Dels=0.00;FS=15.015;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.223;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1093,0,1295 chrII 95343 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.847;DP=127;Dels=0.00;FS=5.467;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.290;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1263,0,1357 chrII 95358 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.677;DP=116;Dels=0.00;FS=7.333;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.914;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1112,0,1291 chrII 95360 . A G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.704;DP=115;Dels=0.00;FS=8.843;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.579;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1089,0,1258 chrII 95376 . C T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.563;DP=108;Dels=0.00;FS=4.968;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1059,0,1200 chrII 95739 . G A 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.975;DP=96;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.695;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:806,0,1199 chrII 95759 . G A 764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.968;DP=96;Dels=0.00;FS=2.737;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.962;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:794,0,1268 chrII 96328 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.945;DP=134;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.870;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.806;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1309,0,1376 chrII 96610 . A G 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.779;DP=119;Dels=0.00;FS=5.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.854;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1282,0,1177 chrII 96664 . A G 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.975;DP=143;Dels=0.00;FS=2.966;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.904;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1436,0,1544 chrII 96723 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.295;DP=130;Dels=0.00;FS=3.215;HaplotypeScore=2.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1350,0,1350 chrII 96789 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.385;DP=123;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=2.6392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1233,0,1403 chrII 97068 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.065;DP=166;Dels=0.00;FS=1.908;HaplotypeScore=4.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.691;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,82:166:99:1605,0,1821 chrII 97117 . T C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.440;DP=135;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=2.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.245;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,57:135:99:1104,0,1740 chrII 97341 . T C 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.058;DP=170;Dels=0.00;FS=2.847;HaplotypeScore=3.7800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=5.28;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,58:170:99:928,0,2425 chrII 97345 . T C 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.160;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.605;QD=5.23;ReadPosRankSum=-2.540;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,67:175:99:945,0,2353 chrII 97530 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;DP=135;Dels=0.00;FS=2.278;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.808;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1345,0,1460 chrII 97590 . T C 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.846;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.440;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1327,0,1478 chrII 97608 . T C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.347;DP=147;Dels=0.00;FS=2.957;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1509,0,1613 chrII 97707 . T C 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.686;DP=161;Dels=0.01;FS=5.078;HaplotypeScore=16.7398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=-0.028;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.266;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1671,0,1685 chrII 97805 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.024;DP=131;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=7.4810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=-0.178;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.847;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1216,0,1550 chrII 97956 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.918;DP=124;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=4.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.323;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1424,0,1228 chrII 98271 . A C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.415;DP=115;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=2.7171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.834;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1161,0,1119 chrII 99188 . C T 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.080;DP=149;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=10.4472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.189;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,58:149:99:1216,0,1927 chrII 99197 . T C 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.646;DP=135;Dels=0.00;FS=3.245;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.456;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,81:135:99:1747,0,1111 chrII 99228 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.721;DP=135;Dels=0.00;FS=2.197;HaplotypeScore=3.5039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.014;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:135:99:1173,0,1549 chrII 99333 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.857;DP=137;Dels=0.00;FS=9.352;HaplotypeScore=6.7429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1409,0,1424 chrII 99464 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.421;DP=137;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=2.8596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.690;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1400,0,1484 chrII 99756 . G C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;DP=128;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.860;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,74:128:99:1397,0,1077 chrII 99759 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.811;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.033;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1471,0,1132 chrII 99849 . G A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.500;DP=123;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.190;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1219,0,1264 chrII 100174 . G T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.777;DP=130;Dels=0.00;FS=13.106;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.314;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1449,0,1289 chrII 100367 . A T 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.797;DP=148;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=1;MQRankSum=1.126;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.999;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,61:148:99:1262,0,1955 chrII 100413 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.338;DP=159;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=1;MQRankSum=2.336;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.454;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,67:159:99:1362,0,2047 chrII 102053 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.960;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1364,0,1233 chrII 102068 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.464;DP=114;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=2.4573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.707;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1250,0,1036 chrII 102242 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.234;DP=129;Dels=0.00;FS=3.563;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.300;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1334,0,1315 chrII 102968 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.291;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=9.67;ReadPosRankSum=-3.132;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1384,0,1492 chrII 103646 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.039;DP=111;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.384;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1229,0,1102 chrII 103652 . C T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.843;DP=104;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.092;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1194,0,902 chrII 104641 . T C 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2534,264,0 chrII 104669 . G A 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.560;DP=99;Dels=0.00;FS=3.881;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.161;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:864,0,1231 chrII 105289 . A G 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;DP=147;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=4.9236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.051;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1621,0,1445 chrII 105374 . C T 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.305;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.3238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.309;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:131:99:1024,0,1448 chrII 105449 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.302;DP=116;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=2.9669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1074,0,1278 chrII 105799 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.952;DP=124;Dels=0.00;FS=3.276;HaplotypeScore=4.6999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.849;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1219,0,1350 chrII 106149 . T G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.703;DP=131;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.040;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1270,0,1296 chrII 106263 . T A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;DP=137;Dels=0.00;FS=3.121;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.579;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1480,0,1500 chrII 106356 . G A 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.896;DP=103;Dels=0.00;FS=9.365;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.637;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:1041,0,1119 chrII 106694 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.052;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1270,0,1417 chrII 107123 . A T 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3305,336,0 chrII 107124 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.288;DP=120;Dels=0.00;FS=2.593;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.729;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1249,0,1235 chrII 107402 . G A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.283;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.510;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.869;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1108,0,1484 chrII 107418 . T C 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.879;DP=127;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=0.265;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.349;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:1052,0,1639 chrII 107903 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.436;DP=136;Dels=0.00;FS=12.399;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.668;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1192,0,1637 chrII 107990 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.465;DP=134;Dels=0.00;FS=3.113;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.305;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1427,0,1288 chrII 108452 . T A 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.269;DP=148;Dels=0.00;FS=3.839;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=11.06;ReadPosRankSum=2.450;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1667,0,1486 chrII 108764 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.838;DP=118;Dels=0.00;FS=5.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=1;MQRankSum=0.843;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.346;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1148,0,1346 chrII 109094 . T C 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.450;DP=98;Dels=0.00;FS=1.726;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:853,0,1204 chrII 109115 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.573;DP=99;Dels=0.00;FS=1.786;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.884;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.933;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1201,0,889 chrII 109165 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.631;DP=96;Dels=0.00;FS=1.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.938;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1075,0,901 chrII 109482 . A T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.454;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1183,0,1416 chrII 109500 . A C 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.380;DP=114;Dels=0.00;FS=4.794;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.727;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1049,0,1373 chrII 109506 . T A 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.914;DP=110;Dels=0.00;FS=6.253;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.516;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1012,0,1258 chrII 110028 . C G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.810;DP=117;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.608;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1268,0,1217 chrII 110746 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.872;DP=120;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.646;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1357,0,1170 chrII 110806 . A G 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.487;DP=154;Dels=0.00;FS=1.264;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.327;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1504,0,1572 chrII 111049 . G C 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.367;DP=116;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.483;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:968,0,1353 chrII 111306 . A C 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;DP=139;Dels=0.00;FS=4.381;HaplotypeScore=5.9530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.877;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.800;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,59:139:99:1156,0,1805 chrII 111639 . A G 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.095;DP=112;Dels=0.00;FS=16.401;HaplotypeScore=49.7693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.552;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1088,0,1281 chrII 111699 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.830;DP=125;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=4.9617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1277,0,1312 chrII 111739 . G A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.056;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.289;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1327,0,1256 chrII 111751 . T G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.249;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.694;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1275,0,1385 chrII 111931 . T G 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.316;DP=106;Dels=0.00;FS=5.219;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.117;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:944,0,1241 chrII 111970 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.339;DP=119;Dels=0.00;FS=3.363;HaplotypeScore=3.7111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1176,0,1220 chrII 111999 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.850;DP=129;Dels=0.00;FS=4.228;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.521;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1250,0,1376 chrII 112018 . T G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.348;DP=127;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.109;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1325,0,1328 chrII 112335 . C A 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3207,324,0 chrII 112372 . A G 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.720;DP=127;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1310,0,1245 chrII 112378 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.816;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.760;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1212,0,1273 chrII 112399 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.424;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,72:121:99:1519,0,930 chrII 112452 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.025;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=11.71;ReadPosRankSum=2.857;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:1388,0,985 chrII 112454 . C T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.691;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=12.47;ReadPosRankSum=2.818;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:1489,0,957 chrII 112527 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.391;DP=115;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.322;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1138,0,1175 chrII 112544 . A T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;DP=106;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.250;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1214,0,1056 chrII 112618 . T C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.539;DP=113;Dels=0.00;FS=5.842;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1160,0,1175 chrII 112684 . C A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.309;DP=128;Dels=0.00;FS=5.436;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.633;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1180,0,1435 chrII 113236 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.247;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,66:112:99:1330,0,926 chrII 113452 . C T 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=143;Dels=0.00;FS=6.144;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.008;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,81:143:99:1740,0,1170 chrII 114074 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.045;DP=117;Dels=0.00;FS=4.539;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.341;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1296,0,1222 chrII 114766 . T C 2084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2117,228,0 chrII 114919 . T C 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.347;DP=147;Dels=0.00;FS=9.346;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,83:147:99:1823,0,1389 chrII 115238 . C A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;DP=109;Dels=0.00;FS=16.261;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.694;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,69:109:99:1504,0,796 chrII 115774 . G A 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=1;QD=26.17;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3016,295,0 chrII 116084 . C T 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6625;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=26.82;ReadPosRankSum=1.550;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:3090,324,0 chrII 116102 . G A 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.41;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2536,261,0 chrII 116106 . T C 2484 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.55;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2517,270,0 chrII 116518 . C T 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3307,322,0 chrII 116701 . C T 3548.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.89;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.992e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3548,346,0 chrII 116704 . T C 3423.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.15;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3423,354,0 chrII 116707 . A T 3152 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=22.35;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3185,321,0 chrII 116832 . A G 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3517,363,0 chrII 116848 . G T 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=102.4894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.75;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3282,331,0 chrII 116850 . G A 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.221;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=102.4894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.75;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=23.65;ReadPosRankSum=0.951;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3178,309,0 chrII 116939 . G A 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.94;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3506,372,0 chrII 116947 . T G 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.74;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3112,330,0 chrII 117148 . C A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.267;DP=149;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.228;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1488,0,1594 chrII 117298 . A G 29.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.019;DP=111;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=53.1579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=0.26;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-5.101e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:16:59,0,16 chrII 117547 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.918;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:130:99:1369,0,1396 chrII 117595 . T C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.325;DP=111;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.452;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:111:99:997,0,1301 chrII 117726 . G A 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.139;DP=123;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=3.3999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1420,0,1062 chrII 117972 . G A 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3276,319,0 chrII 118370 . A G 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3218,327,0 chrII 118457 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.001;DP=113;Dels=0.00;FS=1.537;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=1;MQRankSum=0.911;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.684;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1272,0,1185 chrII 118818 . C A 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3147,316,0 chrII 118921 . C T 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3467,346,0 chrII 118953 . C T 3974.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3974,400,0 chrII 118959 . C T 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5615;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3776,382,0 chrII 119103 . T G 2401 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2434,261,0 chrII 119247 . A C 3617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3617,381,0 chrII 119442 . G A 1866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.415;DP=170;Dels=0.00;FS=4.562;HaplotypeScore=3.5720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.028;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,89:170:99:1896,0,1634 chrII 119499 . A G 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3002,327,0 chrII 119604 . A G 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3035,309,0 chrII 119739 . A G 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2482,258,0 chrII 120170 . G A 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=27.00;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3030,309,0 chrII 120369 . G C 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3507,360,0 chrII 120427 . C T 3601.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.47;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3601,367,0 chrII 120430 . G A 3458.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.28;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3458,360,0 chrII 120437 . C A 2951 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.17;MQ0=0;QD=26.83;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2984,312,0 chrII 120585 . A G 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=24.93;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2551,273,0 chrII 120630 . G A 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=1;QD=27.03;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3168,313,0 chrII 120701 . A G 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3240;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=1;QD=24.58;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3007,309,0 chrII 120888 . G C 2417 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=23.24;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2450,255,0 chrII 121101 . C T 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3384,331,0 chrII 121194 . G A 1921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1954,198,0 chrII 121223 . T C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.548;DP=110;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1215,0,1104 chrII 121421 . G A 2615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2648,261,0 chrII 121589 . T C 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7906;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2524,270,0 chrII 121809 . C T 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2835,283,0 chrII 121848 . C T 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2746,276,0 chrII 121908 . G A 2260 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.28;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2293,228,0 chrII 122151 . G T 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.969;DP=115;Dels=0.00;FS=3.444;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=2;MQRankSum=-1.388;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.468;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1161,0,1194 chrII 122327 . T A 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;DP=123;Dels=0.00;FS=3.481;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.135;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1113,0,1526 chrII 122705 . T G 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;DP=98;Dels=0.00;FS=3.860;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.906;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:816,0,1270 chrII 122981 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.801;DP=143;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.445;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1286,0,1702 chrII 122996 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.127;DP=151;Dels=0.00;FS=2.042;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,66:151:99:1292,0,1753 chrII 123008 . G A 4191.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:162:99:4191,415,0 chrII 123103 . T A 4048.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4048,426,0 chrII 123195 . G A 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.699;DP=104;Dels=0.00;FS=3.666;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:782,0,1297 chrII 123301 . G C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.288;DP=137;Dels=0.00;FS=2.182;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.080;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1424,0,1417 chrII 123311 . C T 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.52;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3545,369,0 chrII 123320 . T C 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.95;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2942,333,0 chrII 123339 . C T 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2835,291,0 chrII 123675 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.234;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=1;MQRankSum=0.271;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1193,0,1518 chrII 123764 . G A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3263,345,0 chrII 123800 . C T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=1;QD=25.03;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3354,331,0 chrII 123940 . C T 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.592;DP=124;Dels=0.00;FS=3.859;HaplotypeScore=2.3056;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=26.60;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3298,309,0 chrII 123944 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.064;DP=129;Dels=0.00;FS=3.263;HaplotypeScore=3.2722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1178,0,1547 chrII 124174 . C G 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3637,372,0 chrII 124193 . C A 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3099,321,0 chrII 124286 . C A 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2840,282,0 chrII 124505 . A G 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3410,375,0 chrII 124574 . T C 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3098,315,0 chrII 124616 . C T 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.470;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=3.7097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1296,0,1449 chrII 124617 . A G 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3377,333,0 chrII 124932 . T C 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3597,363,0 chrII 124959 . A C 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3919;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3824,393,0 chrII 124966 . A T 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3382,340,0 chrII 124982 . A G 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.825;DP=123;Dels=0.00;FS=13.188;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.456;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:1008,0,1665 chrII 125022 . A G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3393,348,0 chrII 125552 . T C 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2735,279,0 chrII 125660 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.728;DP=139;Dels=0.00;FS=5.283;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1163,0,1841 chrII 126130 . C T 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.97;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3796,388,0 chrII 126263 . T C 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3212,339,0 chrII 126335 . G A 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3628,361,0 chrII 126398 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.650;DP=143;Dels=0.00;FS=12.299;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.931;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1402,0,1485 chrII 126692 . G T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.124;DP=177;Dels=0.00;FS=1.223;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,72:177:99:1433,0,2166 chrII 126813 . T C 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;DP=143;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=2.5233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.588;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:143:99:1427,0,1462 chrII 126836 . G A 4116.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.22;SB=-2.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4116,426,0 chrII 127523 . T C 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.981;DP=110;Dels=0.00;FS=11.073;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=1;MQRankSum=0.216;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1254,0,1059 chrII 127903 . T A 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.192;DP=158;Dels=0.00;FS=2.167;HaplotypeScore=6.6312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1760,0,1599 chrII 127964 . C T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.295;DP=137;Dels=0.00;FS=7.638;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.010;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1363,0,1419 chrII 128257 . A G 4022.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.30;SB=-2.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4022,417,0 chrII 128282 . G A 1867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.053;DP=162;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1897,0,1425 chrII 128423 . G A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=148;Dels=0.00;FS=3.043;HaplotypeScore=4.4954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.572;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1502,0,1511 chrII 128479 . T G 4292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=23.71;SB=-2.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4292,430,0 chrII 128480 . T A 4270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=23.46;SB=-2.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4270,427,0 chrII 128547 . A G 3833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.478;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5270;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=0.531;QD=25.22;ReadPosRankSum=1.663;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3833,385,0 chrII 128669 . A G 4591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.82;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:185:99:4591,480,0 chrII 129254 . C T 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3441,340,0 chrII 129308 . T A 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3550,366,0 chrII 129347 . G A 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3213,327,0 chrII 129386 . T C 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3380,351,0 chrII 129437 . G A 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3342,345,0 chrII 129668 . C T 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3067,324,0 chrII 129692 . C T 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3280,331,0 chrII 129755 . G A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.826;DP=125;Dels=0.00;FS=5.530;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.851;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1151,0,1473 chrII 129791 . T A 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3193,327,0 chrII 130349 . G A 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.388;DP=131;Dels=0.00;FS=3.614;HaplotypeScore=5.8287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.256;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3386,348,0 chrII 130370 . G T 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3429,340,0 chrII 130407 . A G 1858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0422;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=19.77;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:1891,207,0 chrII 130769 . C T 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3622,349,0 chrII 130988 . T C 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:131:99:3293,345,0 chrII 131020 . A G 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=23.82;ReadPosRankSum=1.189;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3225,336,0 chrII 131051 . G A 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3365,337,0 chrII 131705 . G A 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3305,342,0 chrII 131783 . G A 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3309,339,0 chrII 132280 . T C 4347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4347,435,0 chrII 132482 . G A 4108.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4108,421,0 chrII 132564 . T C 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2893,309,0 chrII 132576 . G A 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2789,294,0 chrII 132654 . T C 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3654,366,0 chrII 132945 . A G 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3438,357,0 chrII 132975 . T A 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.21;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3503,361,0 chrII 133163 . G C 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.90;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.989e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3597,369,0 chrII 133239 . C T 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.09;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3569,364,0 chrII 133355 . T C 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.901;DP=110;Dels=0.00;FS=8.194;HaplotypeScore=22.7618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.158;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,53:110:99:849,0,739 chrII 133595 . A G 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=23.69;SB=-2.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4051,414,0 chrII 133612 . A G 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3795,390,0 chrII 133718 . T C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.845;DP=128;Dels=0.00;FS=4.420;HaplotypeScore=4.8788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=2.331;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1282,0,1388 chrII 133742 . C T 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=27.87;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2931,298,0 chrII 133779 . C T 2469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=22.04;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2502,249,0 chrII 133938 . A C 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=136.4635;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3524,369,0 chrII 134090 . A G 4147.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5368;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4147,426,0 chrII 135183 . A C 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.401;DP=113;Dels=0.00;FS=2.459;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=2.158;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.206;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:961,0,1478 chrII 135214 . G A 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3235,331,0 chrII 135402 . C T 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.474;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.553;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1736,0,1719 chrII 135469 . C T 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.598;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.573;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,83:172:99:1759,0,1835 chrII 135630 . T A 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3209,316,0 chrII 135667 . A C 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3598,363,0 chrII 135827 . G A 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.62;SB=-2.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4046,397,0 chrII 135919 . T C 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.502;DP=157;Dels=0.00;FS=2.009;HaplotypeScore=3.9723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,85:157:99:1632,0,1449 chrII 135923 . C T 4080.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4080,420,0 chrII 136000 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.650;DP=149;Dels=0.00;FS=2.084;HaplotypeScore=5.1136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:149:99:1464,0,1303 chrII 136582 . C G 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3228,354,0 chrII 136632 . T G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.244;DP=162;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=2.026;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.273;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,61:162:99:1197,0,2336 chrII 136840 . A T 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3314,336,0 chrII 136884 . G A 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.948;DP=126;Dels=0.00;FS=8.269;HaplotypeScore=5.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=2.422;QD=13.07;ReadPosRankSum=2.481;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1677,0,1048 chrII 137272 . T C 2295 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=14.25;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:2328,252,0 chrII 137341 . C T 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8759;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3432,334,0 chrII 137745 . A G 2605 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.37;MQ0=0;QD=23.05;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2638,288,0 chrII 137801 . T C 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3774,384,0 chrII 137859 . T G 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4030,417,0 chrII 137868 . A G 3943.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3943,397,0 chrII 137948 . A G 4119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.33;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4119,427,0 chrII 138346 . T C 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.65;MQ0=0;QD=18.90;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2490,261,0 chrII 138529 . G T 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3043,321,0 chrII 138734 . C T 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2503;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3353,348,0 chrII 138818 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.008;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.481;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1313,0,1127 chrII 138835 . A G 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3454,354,0 chrII 139079 . T G 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2722,297,0 chrII 139895 . T C 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.985;DP=135;Dels=0.00;FS=4.094;HaplotypeScore=5.7663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1537,0,1256 chrII 140021 . C T 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3478,349,0 chrII 140061 . T C 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3191,330,0 chrII 140131 . T C 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=1;QD=24.80;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2935,303,0 chrII 140254 . C T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.653;DP=139;Dels=0.00;FS=12.647;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1568,0,1264 chrII 140383 . A G 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3100,339,0 chrII 140643 . C A 2461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2494,252,0 chrII 140863 . G T 4498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4498,439,0 chrII 140993 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.292;DP=122;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.167;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1236,0,1319 chrII 141015 . G A 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3507,357,0 chrII 141175 . C T 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.95;MQ0=0;QD=25.72;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3421,357,0 chrII 141191 . G A 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3042,309,0 chrII 141207 . A G 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.35;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:2880,306,0 chrII 141215 . C T 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.89;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3241,336,0 chrII 141553 . C T 2428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.11;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:93:99:2461,246,0 chrII 141579 . C T 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.71;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2964,300,0 chrII 141987 . A T 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=1;QD=25.16;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:3976,385,0 chrII 142133 . C T 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2862,294,0 chrII 142181 . C T 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2930,297,0 chrII 142186 . G A 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3058,301,0 chrII 142208 . G A 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=1;QD=25.63;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3434,334,0 chrII 142364 . A G 3828.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3828,387,0 chrII 142625 . C T 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.47;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2706,285,0 chrII 142804 . C G 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3545,357,0 chrII 142980 . G A 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2630,258,0 chrII 143272 . A G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.377;DP=115;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1170,0,1101 chrII 143298 . A T 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3461,360,0 chrII 143327 . C T 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.90;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3571,361,0 chrII 143335 . C G 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3276,342,0 chrII 143491 . T C 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=121;Dels=0.00;FS=3.346;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=25.30;ReadPosRankSum=1.389;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3094,315,0 chrII 143613 . A G 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3100,318,0 chrII 143759 . A T 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=1;MQRankSum=-0.750;QD=26.12;ReadPosRankSum=0.968;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3343,313,0 chrII 144151 . G A 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=26.34;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3220,324,0 chrII 144211 . C G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;DP=147;Dels=0.00;FS=8.943;HaplotypeScore=3.5841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1427,0,1656 chrII 144214 . C T 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.276;DP=144;Dels=0.00;FS=5.791;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1398,0,1620 chrII 144820 . T G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.189;DP=113;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.837;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1016,0,1246 chrII 144853 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.926;DP=110;Dels=0.00;FS=9.065;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.791;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1341,0,1006 chrII 144937 . T C 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.685;DP=140;Dels=0.00;FS=3.317;HaplotypeScore=5.8878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:140:99:1755,0,1213 chrII 144991 . A G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.684;DP=152;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=4.9241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.078;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:152:99:1562,0,1589 chrII 145108 . T C 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.943;DP=136;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=0.799;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.389;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1338,0,1499 chrII 145474 . A G 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3195,339,0 chrII 145486 . A G 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3339,342,0 chrII 145735 . T C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.567;DP=136;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=2.058;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.883;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1244,0,1738 chrII 145924 . A T 88.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.186;DP=111;Dels=0.00;FS=40.443;HaplotypeScore=50.3672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.34;MQ0=1;MQRankSum=4.229;QD=0.79;ReadPosRankSum=2.583;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,27:111:99:118,0,253 chrII 145980 . G T 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;DP=106;Dels=0.00;FS=5.726;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.047;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:887,0,854 chrII 146004 . C T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1095,0,1358 chrII 146008 . T C 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.513;DP=112;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:969,0,1413 chrII 146027 . G T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;DP=127;Dels=0.00;FS=2.301;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1207,0,1554 chrII 146099 . C T 2679 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.49;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2712,282,0 chrII 146102 . A G 1148.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.075;DP=104;Dels=0.00;FS=2.562;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQ0=0;MQRankSum=1.972;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.229;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1178,0,902 chrII 146107 . C A 2694 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.88;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2727,279,0 chrII 146113 . A T 880.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:910,0,1228 chrII 146114 . C T 2620 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.67;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2653,273,0 chrII 146129 . T A 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.850;DP=105;Dels=0.00;FS=3.622;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.402;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:874,0,1243 chrII 146169 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;DP=112;Dels=0.00;FS=4.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=9.02;ReadPosRankSum=2.119;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1040,0,1191 chrII 146217 . T G 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.892e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3569,363,0 chrII 146248 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.789;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1163,0,1508 chrII 146312 . C G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.361;DP=119;Dels=0.00;FS=2.369;HaplotypeScore=15.8062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.325;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:118:99:1216,0,1087 chrII 146333 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.055;DP=113;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=5.9302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.230;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:113:99:1288,0,1077 chrII 146444 . C T 3881.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3881,399,0 chrII 146609 . G A 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2949,309,0 chrII 146672 . G T 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3160,318,0 chrII 146699 . G A 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2873,291,0 chrII 146992 . C T 4359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7466;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4359,427,0 chrII 147040 . T G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.685;DP=137;Dels=0.00;FS=2.188;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.695;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1213,0,1607 chrII 147106 . T C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.009;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.412;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1170,0,1261 chrII 147112 . A C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.774;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.655;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1105,0,1292 chrII 147197 . A T 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3585,361,0 chrII 147484 . A G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.070;DP=127;Dels=0.00;FS=10.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1390,0,1284 chrII 148075 . G T 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.442;DP=106;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=-0.645;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.845;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:749,0,1361 chrII 148172 . C T 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.144;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:145:99:3946,379,0 chrII 148240 . A G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.590;DP=133;Dels=0.00;FS=10.749;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.790;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:133:99:1427,0,1319 chrII 148307 . A G 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.382;DP=122;Dels=0.00;FS=19.141;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.459;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.297;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1227,0,1331 chrII 148327 . A T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.776;DP=133;Dels=0.00;FS=9.258;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.461;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.146;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1335,0,1433 chrII 148429 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.852;DP=128;Dels=0.00;FS=6.798;HaplotypeScore=8.9304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1383,0,1312 chrII 148600 . T A 4224.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4224,427,0 chrII 149026 . C T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.228;DP=114;Dels=0.00;FS=5.906;HaplotypeScore=2.9150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:114:99:1345,0,1171 chrII 149285 . A T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.340;DP=127;Dels=0.00;FS=11.323;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.136;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1553,0,1050 chrII 149400 . T C 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.44;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2994,312,0 chrII 149696 . A C 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3745,385,0 chrII 149872 . T C 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3073,324,0 chrII 149934 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.092;DP=115;Dels=0.00;FS=16.178;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.151;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1449,0,1073 chrII 150200 . A T 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6826;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3402,340,0 chrII 150349 . C T 488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.409;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=90.3473;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=65.49;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:63:521,63,0 chrII 150422 . A T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.084;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=6.135;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.168;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1299,0,910 chrII 150513 . C T 2387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2420,255,0 chrII 150781 . T C 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3304,366,0 chrII 150817 . T A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;DP=158;Dels=0.00;FS=2.868;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.068;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1503,0,1858 chrII 151212 . A T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;DP=114;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=10.39;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:114:99:1214,0,1156 chrII 151397 . T C 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=144;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=70.3834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.351;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:144:99:3497,357,0 chrII 151407 . G T 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3113,321,0 chrII 151574 . T C 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3856,405,0 chrII 151682 . A G 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=23.78;ReadPosRankSum=1.588;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3424,342,0 chrII 151709 . G A 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3995,405,0 chrII 151724 . G A 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-2.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3950,400,0 chrII 151854 . T C 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.795;DP=151;Dels=0.00;FS=3.822;HaplotypeScore=4.2881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1570,0,1560 chrII 151946 . A G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.894;DP=161;Dels=0.00;FS=3.701;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.452;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,70:161:99:1373,0,2016 chrII 151976 . G A 4439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.74;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4439,445,0 chrII 152073 . C T 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=1;QD=25.11;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3290,331,0 chrII 152204 . A G 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.308;DP=144;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=8.5228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1535,0,1406 chrII 152451 . T C 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3282,339,0 chrII 152612 . A G 4044.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4044,432,0 chrII 152624 . C T 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.588;DP=144;Dels=0.00;FS=3.133;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=22.98;ReadPosRankSum=1.034;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3309,342,0 chrII 152750 . A C 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2639,279,0 chrII 152795 . A G 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=110;Dels=0.00;FS=3.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,67:110:99:1488,0,900 chrII 152894 . A G 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=1;QD=26.01;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3563,372,0 chrII 152949 . A G 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3103,318,0 chrII 153007 . C T 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2991,288,0 chrII 153547 . T C 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.093;DP=104;Dels=0.00;FS=5.650;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:910,0,1305 chrII 153636 . C T 410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.025;DP=90;Dels=0.00;FS=11.686;HaplotypeScore=4.2355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=4.56;ReadPosRankSum=-2.635;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,37:90:99:440,0,964 chrII 153732 . T A 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3491,360,0 chrII 153787 . T A 4035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.279;DP=154;Dels=0.00;FS=4.523;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4035,375,0 chrII 154001 . A C 5139.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.13;SB=-2.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:213:99:5139,552,0 chrII 154142 . G A 4358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4358,445,0 chrII 154160 . A G 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3666,387,0 chrII 154235 . C T 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.635;DP=131;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=1;MQRankSum=-0.243;QD=7.01;ReadPosRankSum=1.302;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,51:131:99:948,0,1762 chrII 154506 . T C 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.820;DP=105;Dels=0.00;FS=1.581;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=0.416;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1047,0,1167 chrII 154740 . A G 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4175;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=23.04;ReadPosRankSum=1.072;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:2936,303,0 chrII 154799 . G A 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3474,352,0 chrII 155015 . C G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;DP=122;Dels=0.00;FS=11.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=10.43;ReadPosRankSum=2.009;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1303,0,1291 chrII 155317 . T G 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.075;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.089;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1095,0,1073 chrII 155354 . A G 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2821,300,0 chrII 155399 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;DP=116;Dels=0.00;FS=5.920;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,67:116:99:1433,0,1015 chrII 155418 . T C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;DP=116;Dels=0.00;FS=3.498;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.341;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1282,0,1067 chrII 155527 . T A 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;DP=98;Dels=0.00;FS=1.716;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.118;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,39:98:99:783,0,1278 chrII 155591 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.025;DP=118;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.881;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1298,0,1214 chrII 155707 . T G 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.215;DP=122;Dels=0.00;FS=2.333;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=2.397;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.244;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1131,0,1263 chrII 155739 . T G 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3541,372,0 chrII 155780 . G A 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.108;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.052;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1539,0,1597 chrII 155783 . A G 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=24.63;ReadPosRankSum=1.078;SB=-2.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:3916,411,0 chrII 155846 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.742;DP=125;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.062;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1171,0,1439 chrII 155972 . C T 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.846;DP=117;Dels=0.00;FS=3.514;HaplotypeScore=3.8698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.259;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:1063,0,1454 chrII 156194 . C T 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3036,313,0 chrII 156203 . C A 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4619;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3077,324,0 chrII 156261 . T G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.803;DP=111;Dels=0.00;FS=4.662;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.835;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:111:99:1307,0,955 chrII 156652 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;DP=117;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=2.5625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1093,0,1275 chrII 156761 . G A 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.978;DP=114;Dels=0.00;FS=8.810;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=12.19;ReadPosRankSum=-2.498;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1420,0,981 chrII 156776 . A G 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.784;DP=129;Dels=0.00;FS=4.247;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.094;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1399,0,1348 chrII 157474 . G A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.301;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.519;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1299,0,1437 chrII 158114 . A G 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.159;DP=170;Dels=0.00;FS=2.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,81:170:99:1517,0,1994 chrII 158591 . C T 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3987,418,0 chrII 158739 . G C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.722;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1509,0,1434 chrII 158800 . G T 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3874,394,0 chrII 158803 . A G 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3715,390,0 chrII 158953 . G A 4138.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.39;SB=-2.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4138,394,0 chrII 159079 . C T 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3677,364,0 chrII 159139 . T G 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3592,369,0 chrII 159797 . C T 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.530;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=26.83;ReadPosRankSum=1.588;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3253,313,0 chrII 159857 . C G 4071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.29;SB=-2.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4071,408,0 chrII 159891 . A C 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3565,372,0 chrII 159926 . C A 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=61.8565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3166,327,0 chrII 160143 . T G 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3133,315,0 chrII 160403 . G T 1833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.919;DP=178;Dels=0.00;FS=11.400;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.543;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,88:178:99:1863,0,1741 chrII 160810 . T G 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6640;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=1;QD=23.40;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3369,357,0 chrII 161065 . G A 1764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;DP=147;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.808;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1794,0,1343 chrII 161257 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.865;DP=173;Dels=0.00;FS=2.157;HaplotypeScore=4.6372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.988;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,75:173:99:1405,0,2036 chrII 161297 . G A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.204;DP=164;Dels=0.00;FS=3.291;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.000;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1676,0,1694 chrII 161484 . T G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3466,360,0 chrII 161687 . T C 4274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.997e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4274,441,0 chrII 161757 . G A 3969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3969,397,0 chrII 161840 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8007;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3267,339,0 chrII 162251 . A G 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3676,402,0 chrII 162420 . T C 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.50;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3068,324,0 chrII 162773 . T C 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3181,339,0 chrII 163080 . G A 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.465;DP=166;Dels=0.00;FS=4.114;HaplotypeScore=2.5785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.758;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,89:166:99:1824,0,1521 chrII 163180 . C T 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.713;DP=150;Dels=0.00;FS=7.263;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.180;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:150:99:1600,0,1338 chrII 163284 . A G 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;DP=133;Dels=0.00;FS=2.243;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1293,0,1430 chrII 163349 . G T 1827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;DP=167;Dels=0.00;FS=3.549;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.047;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,89:167:99:1857,0,1601 chrII 163497 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.986;DP=125;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=3.7597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1313,0,1269 chrII 163787 . A C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.693;DP=131;Dels=0.00;FS=6.112;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.310;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1348,0,1416 chrII 163854 . T C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3076,321,0 chrII 163892 . C T 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.621;DP=105;Dels=0.00;FS=11.376;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:969,0,1251 chrII 163967 . A G 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3496,360,0 chrII 163989 . G A 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3526,357,0 chrII 164157 . T A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1254,0,1257 chrII 164378 . T C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.404;DP=143;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1395,0,1607 chrII 164419 . T C 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3072,348,0 chrII 164828 . C T 4145.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4145,412,0 chrII 164914 . A G 3556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3556,363,0 chrII 164957 . C A 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.408;DP=115;Dels=0.00;FS=2.400;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.326;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:974,0,1372 chrII 164995 . T G 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.15;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3345,348,0 chrII 165048 . C T 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2911,291,0 chrII 165107 . A G 1989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.12;MQ0=0;QD=22.35;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2022,225,0 chrII 165259 . G A 4679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5898;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.20;SB=-2.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4679,478,0 chrII 165358 . A G 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.282;DP=128;Dels=0.00;FS=1.704;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.100;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1123,0,1435 chrII 165525 . G A 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3039,300,0 chrII 165680 . A C 33.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.60;MQ0=0;QD=0.33;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:9:66,9,0 chrII 165729 . T C 2349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2382,261,0 chrII 165754 . T G 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.744;DP=95;Dels=0.00;FS=0.787;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:753,0,1189 chrII 165877 . T C 2015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.811;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8275;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.557;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:2048,228,0 chrII 165925 . T C 45.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;DP=105;Dels=0.00;FS=48.286;HaplotypeScore=13.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=2.041;QD=0.43;ReadPosRankSum=2.206;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,30:105:75:75,0,880 chrII 166019 . T C 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=56.8928;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.81;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2809,312,0 chrII 166061 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.438;DP=110;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=4.7773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=10.96;ReadPosRankSum=2.000;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1236,0,1136 chrII 166311 . C T 2479 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=26.66;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2512,255,0 chrII 166399 . A G 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.792;DP=109;Dels=0.00;FS=21.309;HaplotypeScore=91.9061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=0.17;ReadPosRankSum=-3.238;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,14:109:49:49,0,2068 chrII 166400 . A T 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=110;Dels=0.00;FS=12.704;HaplotypeScore=113.2463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=0.34;ReadPosRankSum=-3.599;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,16:110:67:67,0,2046 chrII 166544 . G A 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=25.24;ReadPosRankSum=-1.463;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:117:99:2986,303,0 chrII 166572 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=106;Dels=0.00;FS=4.021;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=25.33;ReadPosRankSum=0.131;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2718,250,0 chrII 166703 . G A 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2843,282,0 chrII 166816 . C T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.814;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=1;MQRankSum=-0.908;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.285;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:122:99:1517,0,969 chrII 166909 . C G 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3076,342,0 chrII 167174 . A G 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=111;Dels=0.00;FS=3.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=24.71;ReadPosRankSum=1.264;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2776,288,0 chrII 167373 . C T 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3553,352,0 chrII 167426 . G A 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3303,334,0 chrII 167527 . G A 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2943,303,0 chrII 167897 . A G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.848;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.617;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1213,0,1447 chrII 167998 . G A 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.03;MQ0=0;QD=0.31;SB=-1.268e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:6:51,6,0 chrII 168012 . T A 156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.167;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.019;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.811;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:186,0,150 chrII 168021 . A G 437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.302;DP=93;Dels=0.00;FS=2.789;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.35;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:467,0,437 chrII 168036 . A C 569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.630;DP=99;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=2.3924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.917;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:599,0,962 chrII 168065 . T C 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3415,345,0 chrII 168150 . C G 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2951,321,0 chrII 168194 . G A 3755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3755,376,0 chrII 168448 . T C 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.192;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=24.39;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2692,260,0 chrII 168467 . T G 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;DP=107;Dels=0.00;FS=3.218;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=25.43;ReadPosRankSum=-1.085;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2754,272,0 chrII 168536 . A G 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;DP=111;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.671;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2750,272,0 chrII 168653 . G A 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3096,321,0 chrII 168711 . C T 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=91;Dels=0.00;FS=5.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=26.97;ReadPosRankSum=1.009;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2487,240,0 chrII 168731 . A G 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.919;DP=115;Dels=0.00;FS=5.693;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.828;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:3014,301,0 chrII 168747 . A G 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;DP=108;Dels=0.00;FS=5.019;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=26.50;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2895,285,0 chrII 168775 . A T 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.597;DP=119;Dels=0.00;FS=3.766;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=27.67;ReadPosRankSum=0.160;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3293,308,0 chrII 168802 . T C 2658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2691,279,0 chrII 168980 . C T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.210;DP=126;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1478,0,1237 chrII 169483 . A G 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2853,306,0 chrII 169496 . G C 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3147,333,0 chrII 169566 . G T 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3276,330,0 chrII 169589 . A G 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3392,360,0 chrII 169601 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.954;DP=131;Dels=0.00;FS=2.217;HaplotypeScore=3.8109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.831;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1387,0,1441 chrII 169621 . C T 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3515,364,0 chrII 169820 . G T 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2942,298,0 chrII 169875 . T C 2766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.54;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2799,318,0 chrII 169947 . C A 339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;DP=91;Dels=0.00;FS=1.193;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.26;MQ0=0;MQRankSum=3.236;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.758;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:369,0,485 chrII 170086 . A G 764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.443;DP=107;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=3.0421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.025;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:794,0,1398 chrII 170167 . C G 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.90;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2783,303,0 chrII 170206 . G T 2861 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.60;MQ0=0;QD=26.74;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2894,300,0 chrII 170207 . C T 2850 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.60;MQ0=0;QD=26.64;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2883,300,0 chrII 170208 . C T 2789 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.60;MQ0=0;QD=26.07;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2822,294,0 chrII 170235 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.597;DP=131;Dels=0.00;FS=3.446;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.46;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1577,0,1184 chrII 170320 . A C 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3240,324,0 chrII 170442 . T C 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=24.98;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2831,297,0 chrII 170692 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.070;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.063;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1328,0,1316 chrII 170790 . T C 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3116,336,0 chrII 171183 . G T 4310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4310,427,0 chrII 171433 . A G 2554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2587,276,0 chrII 171454 . T C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.395;DP=131;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.727;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1280,0,1497 chrII 171570 . A G 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2967,306,0 chrII 171612 . G C 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3428,348,0 chrII 171906 . A G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.314;DP=123;Dels=0.00;FS=5.507;HaplotypeScore=4.9073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.462;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1233,0,1228 chrII 172028 . G C 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3351,360,0 chrII 172038 . T A 4059.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4059,406,0 chrII 172113 . T C 4278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.77;SB=-2.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4278,447,0 chrII 172223 . A G 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2946,306,0 chrII 172245 . C T 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.6092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=22.14;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3133,312,0 chrII 172262 . A G 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3158,318,0 chrII 172315 . G A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.506;DP=111;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.795;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1174,0,1209 chrII 172346 . A T 2699 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.82;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2732,279,0 chrII 172488 . A G 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3183,336,0 chrII 172596 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.380;DP=138;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=9.70;ReadPosRankSum=-2.652;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1368,0,1544 chrII 172995 . A C 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.416;DP=122;Dels=0.00;FS=3.999;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:1068,0,1524 chrII 173028 . T C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.88;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3558,375,0 chrII 173043 . A G 3969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3969,429,0 chrII 173340 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.662;DP=115;Dels=0.00;FS=2.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1202,0,1106 chrII 173488 . G T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.853;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1413,0,1400 chrII 173659 . T C 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8221;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3599,372,0 chrII 173811 . C T 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.076;DP=120;Dels=0.00;FS=18.122;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=10.24;ReadPosRankSum=2.903;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1259,0,1248 chrII 173864 . T G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.737;DP=119;Dels=0.00;FS=4.426;HaplotypeScore=2.4476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.742;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1206,0,1218 chrII 174030 . G A 4321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.48;SB=-2.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4321,465,0 chrII 174060 . T C 4218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4218,450,0 chrII 174535 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.541;DP=154;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=5.6992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:1224,0,1880 chrII 174555 . A C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.079;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.981;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1106,0,1483 chrII 174597 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.098;DP=121;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1155,0,1410 chrII 174599 . G C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;DP=123;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1243,0,1405 chrII 174685 . A G 1002.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;DP=108;Dels=0.00;FS=15.069;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.757;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:108:99:1032,0,1069 chrII 174688 . C T 1111.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.811;DP=107;Dels=0.00;FS=13.209;HaplotypeScore=3.6302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.616;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1141,0,1027 chrII 174690 . G A 1003.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.802;DP=105;Dels=0.00;FS=9.300;HaplotypeScore=3.6302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.068;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1033,0,1030 chrII 174758 . A G 589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.501;DP=73;Dels=0.00;FS=1.013;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,45:73:99:619,0,446 chrII 174801 . A T 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.178;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.6660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.06;MQ0=0;MQRankSum=1.882;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:916,0,1418 chrII 174853 . C T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.970;DP=99;Dels=0.00;FS=3.812;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,57:99:99:1312,0,827 chrII 174871 . A T 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;DP=87;Dels=0.00;FS=1.743;HaplotypeScore=73.6287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.191;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:966,0,887 chrII 175054 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.629;DP=107;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.172;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1092,0,1129 chrII 175109 . T A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;DP=130;Dels=0.00;FS=3.328;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.030;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1391,0,1352 chrII 175316 . C T 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.736;DP=115;Dels=0.00;FS=2.399;HaplotypeScore=8.9340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.246;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.159;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1051,0,1229 chrII 175409 . A G 2098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=1;QD=24.40;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2131,228,0 chrII 175439 . G A 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;DP=104;Dels=0.00;FS=1.627;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=1.150;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.257;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:837,0,1180 chrII 175505 . C A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.937;DP=144;Dels=0.00;FS=2.233;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.397;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1411,0,1503 chrII 175526 . A G 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.492;DP=145;Dels=0.00;FS=15.630;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.669;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:145:99:1237,0,1770 chrII 175714 . A G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.572;DP=96;Dels=0.00;FS=3.827;HaplotypeScore=3.0150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=1;MQRankSum=-0.510;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.465;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:943,0,1011 chrII 175784 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.635;DP=123;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1094,0,1483 chrII 175964 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.674;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1494,0,1537 chrII 176009 . A G 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.791;DP=116;Dels=0.00;FS=1.501;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.513;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:116:99:1019,0,1402 chrII 176084 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.280;DP=134;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.081;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1171,0,1697 chrII 176261 . T C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.762;DP=123;Dels=0.00;FS=2.425;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.112;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1365,0,1199 chrII 177092 . C T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;DP=137;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1634,0,1269 chrII 177622 . G A 4910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4910,496,0 chrII 177793 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3268,336,0 chrII 178351 . C T 4437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4437,439,0 chrII 179248 . A G 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.991;DP=110;Dels=0.00;FS=1.555;HaplotypeScore=4.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,45:110:99:844,0,1357 chrII 179257 . C T 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.581;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:1038,0,1429 chrII 179290 . C G 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=117;Dels=0.00;FS=1.519;HaplotypeScore=3.6591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.483;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,44:117:99:729,0,1518 chrII 179410 . T C 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.480;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:921,0,1229 chrII 179872 . T C 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.227;DP=134;Dels=0.00;FS=2.203;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.127;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1499,0,1387 chrII 180070 . T G 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;DP=106;Dels=0.00;FS=5.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1237,0,995 chrII 180255 . G T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.574;DP=160;Dels=0.00;FS=2.819;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=2;MQRankSum=0.944;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.230;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,71:160:99:1435,0,1810 chrII 180379 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.562;DP=159;Dels=0.00;FS=2.948;HaplotypeScore=5.6786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.758;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:159:99:1433,0,1786 chrII 180607 . G A 1928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.031;DP=157;Dels=0.00;FS=2.834;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,91:157:99:1958,0,1269 chrII 180832 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.446;DP=128;Dels=0.00;FS=6.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.251;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1201,0,1381 chrII 181033 . T C 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.931;DP=144;Dels=0.00;FS=15.307;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.184;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1450,0,1491 chrII 181034 . G T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.741;DP=141;Dels=0.00;FS=15.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.858;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1483,0,1442 chrII 181279 . C T 2332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.432;DP=197;Dels=0.00;FS=1.204;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.275;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,108:197:99:2362,0,1798 chrII 181425 . A C 4656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=23.52;SB=-2.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:4656,460,0 chrII 181635 . C T 4161.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34;SB=-2.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4161,415,0 chrII 181646 . C T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.377;DP=145;Dels=0.00;FS=2.952;HaplotypeScore=3.3533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.394;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1478,0,1497 chrII 181647 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.497;DP=146;Dels=0.00;FS=2.904;HaplotypeScore=3.3533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.049;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1440,0,1558 chrII 181705 . C G 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.075;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1681,0,1484 chrII 181873 . A G 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.693;DP=170;Dels=0.00;FS=2.189;HaplotypeScore=4.6126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.965;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,82:170:99:1669,0,1880 chrII 182128 . T C 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3378,363,0 chrII 182137 . G T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.667;DP=138;Dels=0.00;FS=2.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.430;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1399,0,1491 chrII 182323 . C G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.906;DP=126;Dels=0.00;FS=3.247;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=9.70;ReadPosRankSum=-2.477;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1252,0,1280 chrII 182436 . T C 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3352,357,0 chrII 182499 . C G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.496;DP=146;Dels=0.00;FS=2.107;HaplotypeScore=2.6221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:146:99:1318,0,1616 chrII 182892 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.558;DP=120;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.644;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1499,0,788 chrII 182901 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.237;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1471,0,947 chrII 183084 . A C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.024;DP=150;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1541,0,1615 chrII 183117 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.960;DP=130;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=2.7474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.054;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1384,0,1288 chrII 183198 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.317;DP=121;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.060;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1213,0,1274 chrII 183369 . T C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.430;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.174;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1362,0,1533 chrII 183456 . A G 1856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.845;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.244;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,91:152:99:1886,0,1221 chrII 183459 . C T 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.347;DP=144;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.217;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,87:144:99:1899,0,1092 chrII 183619 . T C 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.070;DP=151;Dels=0.00;FS=7.413;HaplotypeScore=7.0489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.408;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:151:99:1623,0,1498 chrII 183726 . T C 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.159;DP=151;Dels=0.00;FS=6.573;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.075;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,55:151:99:873,0,2195 chrII 183810 . C T 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3601,370,0 chrII 183889 . C T 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3831,376,0 chrII 184144 . C A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.029;DP=134;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=3.6376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1345,0,1423 chrII 184146 . T C 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.173;DP=133;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.8489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.808;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.763;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1411,0,1351 chrII 184218 . T A 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.916;DP=148;Dels=0.00;FS=11.413;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.411;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1543,0,1456 chrII 184236 . G C 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.68;SB=-2.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3628,375,0 chrII 184249 . T C 3963.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3963,411,0 chrII 184343 . T C 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3540,360,0 chrII 184372 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.294;DP=112;Dels=0.00;FS=6.347;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.798;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1271,0,1066 chrII 184388 . G A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.721;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1083,0,1143 chrII 184606 . C A 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.242;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=11.13;ReadPosRankSum=2.430;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1733,0,1425 chrII 184932 . A C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3279,339,0 chrII 184941 . T A 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3383,337,0 chrII 185376 . G A 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.126;DP=127;Dels=0.00;FS=1.560;HaplotypeScore=6.7366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.159;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:1046,0,1567 chrII 185442 . C G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;DP=147;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.501;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1305,0,1781 chrII 185468 . G T 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.258;DP=150;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:1778,0,1346 chrII 185478 . C G 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3884,394,0 chrII 185492 . C T 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.095;DP=155;Dels=0.00;FS=7.828;HaplotypeScore=8.9141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1574,0,1649 chrII 185526 . A G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.501;DP=111;Dels=0.00;FS=11.033;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.694;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1016,0,1354 chrII 185579 . A G 652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.164;DP=78;Dels=0.00;FS=11.653;HaplotypeScore=2.8529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.587;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,34:78:99:682,0,989 chrII 185762 . T C 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.200;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.183;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:891,0,1656 chrII 185891 . T A 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;DP=103;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.200;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:103:99:959,0,1226 chrII 185922 . A G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3177,324,0 chrII 185954 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.086;DP=117;Dels=0.00;FS=2.415;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.280;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:117:99:1015,0,1445 chrII 185979 . T A 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.467;DP=92;Dels=0.00;FS=0.830;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.939;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:929,0,1111 chrII 186008 . T G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.074;DP=113;Dels=0.00;FS=3.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1255,0,1180 chrII 186049 . T A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.908;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.615;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1478,0,1177 chrII 186067 . A G 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.232;DP=148;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.677;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1590,0,1489 chrII 186185 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.754;DP=155;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=8.95;ReadPosRankSum=2.140;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,67:155:99:1418,0,1769 chrII 186210 . G C 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.184;DP=177;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.659;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,80:177:99:1627,0,2062 chrII 186253 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.224;DP=142;Dels=0.00;FS=3.035;HaplotypeScore=4.9324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:1137,0,1850 chrII 186322 . T C 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.153;DP=142;Dels=0.00;FS=7.591;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.641;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,84:142:99:1648,0,1157 chrII 186366 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.692;DP=137;Dels=0.00;FS=2.453;HaplotypeScore=2.8043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.510;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1219,0,1721 chrII 186379 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.285;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.161;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1221,0,1758 chrII 186397 . T C 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.718;DP=135;Dels=0.00;FS=9.116;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=2.748;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1411,0,1516 chrII 186424 . A G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.456;DP=144;Dels=0.00;FS=5.214;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.115;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:144:99:1252,0,1728 chrII 186525 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.010;DP=128;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.844;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.558;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1155,0,1476 chrII 186555 . A G 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.177;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1683,0,1473 chrII 186623 . C T 4066.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4066,403,0 chrII 186648 . C G 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3962,414,0 chrII 186709 . A T 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3686,370,0 chrII 186753 . G A 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.536;DP=159;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=9.5844;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.970;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:4033,394,0 chrII 186759 . G A 4040.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;DP=160;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=12.3496;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.882;SB=-2.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:160:99:4040,388,0 chrII 186778 . A G 4388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=25.66;SB=-2.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4388,445,0 chrII 186915 . T C 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4179,409,0 chrII 186935 . G A 1784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.674;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:154:99:1814,0,1238 chrII 187153 . G A 4167.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.60;SB=-2.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4167,418,0 chrII 187157 . G A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.152;DP=155;Dels=0.00;FS=5.829;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.524;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,69:155:99:1436,0,1866 chrII 187552 . T A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;DP=146;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.716;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1409,0,1693 chrII 187714 . C T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.259;DP=114;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.422;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1453,0,929 chrII 187744 . T C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;DP=114;Dels=0.00;FS=1.660;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1436,0,936 chrII 187788 . C T 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.941;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.202;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1016,0,1324 chrII 187873 . T C 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=24.86;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3854,390,0 chrII 188032 . G A 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.139;DP=166;Dels=0.00;FS=10.483;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.770;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1841,0,1697 chrII 188476 . A G 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.177;DP=128;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1446,0,1242 chrII 188701 . G A 2024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.091;DP=164;Dels=0.00;FS=1.253;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.081;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,94:164:99:2054,0,1294 chrII 188734 . T C 1812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.215;DP=159;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,90:159:99:1842,0,1421 chrII 188743 . G A 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.038;DP=141;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.023;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1506,0,1242 chrII 189163 . A C 1921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;DP=188;Dels=0.00;FS=4.528;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.194;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,96:188:99:1951,0,1945 chrII 189209 . T A 1922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.462;DP=184;Dels=0.00;FS=2.544;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.454;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,89:184:99:1952,0,2093 chrII 189263 . T C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.331;DP=149;Dels=0.00;FS=3.919;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.387;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1437,0,1808 chrII 189376 . A G 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.795;DP=133;Dels=0.00;FS=3.191;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.892;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1568,0,1191 chrII 189424 . T A 1699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.307;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.238;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,79:131:99:1729,0,1064 chrII 189673 . A G 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.754;DP=152;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.113;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1576,0,1675 chrII 189739 . G C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;DP=135;Dels=0.00;FS=2.169;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1382,0,1418 chrII 190246 . C T 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3684,367,0 chrII 190255 . A G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.971;DP=133;Dels=0.00;FS=3.181;HaplotypeScore=3.2231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.925;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1361,0,1353 chrII 190308 . T C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.875;DP=122;Dels=0.00;FS=20.272;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=9.55;ReadPosRankSum=-2.652;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1195,0,1326 chrII 190351 . C T 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.393;DP=142;Dels=0.00;FS=4.173;HaplotypeScore=4.0357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.708;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,60:142:99:1091,0,1679 chrII 190355 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.165;DP=148;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=4.0357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=8.24;ReadPosRankSum=2.111;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,60:148:99:1249,0,1825 chrII 190452 . A G 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3368,345,0 chrII 190737 . A T 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;DP=163;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=4.6325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.948;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.344;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,84:163:99:1783,0,1667 chrII 190816 . G A 1927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.821;DP=171;Dels=0.00;FS=9.071;HaplotypeScore=2.8491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:171:99:1957,0,1586 chrII 190944 . T C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.711;DP=133;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.838;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.342;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1209,0,1483 chrII 190980 . G C 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;DP=149;Dels=0.00;FS=6.212;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1279,0,1772 chrII 191066 . C T 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.200;DP=115;Dels=0.00;FS=22.493;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1011,0,1236 chrII 191084 . T A 507.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.556;DP=85;Dels=0.00;FS=27.521;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=-6.806;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:537,0,1301 chrII 191087 . A G 293.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.003;DP=74;Dels=0.00;FS=10.990;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQ0=0;MQRankSum=-6.771;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.609;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:323,0,1207 chrII 191088 . A G 279.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.658;DP=75;Dels=0.00;FS=11.064;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.48;MQ0=0;MQRankSum=-6.509;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.304;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:309,0,1237 chrII 191090 . T G 289.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.149;DP=73;Dels=0.00;FS=10.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.26;MQ0=0;MQRankSum=-6.171;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:319,0,1172 chrII 191091 . G C 347.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;DP=80;Dels=0.00;FS=9.930;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=-5.830;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:377,0,1206 chrII 191207 . T C 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.56;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3104,324,0 chrII 191214 . G A 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.173;DP=120;Dels=0.00;FS=3.582;HaplotypeScore=3.7006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQ0=0;MQRankSum=-8.626;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,40:120:99:738,0,1757 chrII 191222 . C T 626.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.797;DP=122;Dels=0.00;FS=5.973;HaplotypeScore=2.6834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=0;MQRankSum=-8.942;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.273;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,40:122:99:656,0,1833 chrII 191226 . C T 662.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.182;DP=124;Dels=0.00;FS=7.435;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=-8.843;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.880;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,41:124:99:692,0,1890 chrII 191228 . C T 644.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.205;DP=130;Dels=0.00;FS=4.663;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.71;MQ0=0;MQRankSum=-9.144;QD=4.95;ReadPosRankSum=2.515;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,41:130:99:674,0,2014 chrII 191242 . C A 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.42;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3675,372,0 chrII 191281 . A G 725.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.127;DP=150;Dels=0.00;FS=10.897;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.45;MQ0=0;MQRankSum=-9.902;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,49:150:99:755,0,2231 chrII 191288 . T C 472.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.367;DP=140;Dels=0.00;FS=10.339;HaplotypeScore=2.2243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-8.898;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.293;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,41:140:99:502,0,2207 chrII 191289 . A G 457.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.812;DP=140;Dels=0.00;FS=8.743;HaplotypeScore=2.2243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-9.149;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.593;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,40:140:99:487,0,2218 chrII 191294 . C T 527.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.060;DP=135;Dels=0.00;FS=14.115;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.00;MQ0=0;MQRankSum=-9.031;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,41:135:99:557,0,2072 chrII 191298 . T A 478.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.520;DP=132;Dels=0.00;FS=17.900;HaplotypeScore=2.2460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQ0=0;MQRankSum=-8.852;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,43:132:99:508,0,2091 chrII 191304 . C A 408.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.686;DP=129;Dels=0.00;FS=26.577;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.81;MQ0=0;MQRankSum=-9.021;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,42:129:99:438,0,1949 chrII 191311 . A C 454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.302;DP=134;Dels=0.00;FS=33.634;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=-8.362;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,45:134:99:484,0,2088 chrII 191363 . C T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.032;DP=154;Dels=0.00;FS=13.824;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1348,0,1826 chrII 191377 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.457;DP=154;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.975;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.366;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1151,0,1873 chrII 191422 . G A 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.791;DP=153;Dels=0.00;FS=17.253;HaplotypeScore=3.3760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1684,0,1536 chrII 191424 . T C 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.353;DP=150;Dels=0.00;FS=15.647;HaplotypeScore=4.3676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.189;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.314;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:150:99:1564,0,1443 chrII 191470 . A T 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.692;DP=144;Dels=0.00;FS=6.182;HaplotypeScore=2.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.739;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1447,0,1649 chrII 191521 . G C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.591;DP=152;Dels=0.00;FS=3.194;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.832;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.000;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1342,0,1641 chrII 191528 . G A 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.346;DP=158;Dels=0.00;FS=3.074;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:158:99:1592,0,1710 chrII 191599 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.731;DP=141;Dels=0.00;FS=17.768;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.604;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1339,0,1765 chrII 191751 . C T 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=110;Dels=0.00;FS=9.149;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:887,0,1365 chrII 192038 . G A 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.037;DP=144;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.971;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1741,0,1315 chrII 192085 . A G 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.673;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1783,0,1382 chrII 192122 . C T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.438;DP=157;Dels=0.00;FS=3.889;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.472;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1602,0,1687 chrII 192148 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.121;DP=115;Dels=0.00;FS=8.942;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.388;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1090,0,1240 chrII 192289 . G C 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=22.67;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:2980,333,0 chrII 192390 . C T 1918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.437;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.690;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,85:142:99:1948,0,1193 chrII 192591 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.752;DP=152;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.839;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:1484,0,1706 chrII 192948 . C T 1969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.645;DP=167;Dels=0.00;FS=3.987;HaplotypeScore=3.7404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.879;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,94:167:99:1999,0,1360 chrII 193380 . A G 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3708,375,0 chrII 193383 . A G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.297;DP=156;Dels=0.00;FS=4.675;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=8.24;ReadPosRankSum=-2.728;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1315,0,1666 chrII 193398 . C T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.774;DP=145;Dels=0.00;FS=8.779;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=8.66;ReadPosRankSum=-2.191;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1285,0,1475 chrII 193450 . T C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.837;DP=115;Dels=0.00;FS=12.282;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.714;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1058,0,1203 chrII 193664 . T C 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.872;DP=158;Dels=0.00;FS=9.243;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.245;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.750;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1622,0,1630 chrII 193708 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.394;DP=135;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=121.8380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.852;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1231,0,1274 chrII 193867 . C T 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.863;DP=144;Dels=0.00;FS=5.101;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.859;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1557,0,1214 chrII 194057 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.199;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=1;MQRankSum=0.185;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.161;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1429,0,1704 chrII 194226 . C T 1859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.944;DP=177;Dels=0.00;FS=4.388;HaplotypeScore=2.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,89:177:99:1889,0,1840 chrII 195009 . C T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.892;DP=141;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.421;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.449;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1517,0,1475 chrII 195168 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.849;DP=113;Dels=0.00;FS=5.833;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.313;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1171,0,1150 chrII 195177 . T A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.045;DP=108;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.751;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.367;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1172,0,1091 chrII 195180 . C G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.975;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.969;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1017,0,1126 chrII 195594 . G A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.145;DP=140;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1327,0,1617 chrII 195603 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.579;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=1;MQRankSum=0.340;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.204;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1335,0,1640 chrII 195718 . C G 564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.502;DP=100;Dels=0.00;FS=8.408;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.101;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,35:100:99:594,0,1443 chrII 195719 . G A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.691;DP=99;Dels=0.00;FS=8.586;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=13.91;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,64:99:99:1407,0,665 chrII 195960 . A T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;DP=143;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.888;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,59:143:99:1218,0,1834 chrII 196145 . C A 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.240;DP=122;Dels=0.00;FS=4.604;HaplotypeScore=4.9526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.909;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.880;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1148,0,1445 chrII 196155 . A G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.997;DP=120;Dels=0.00;FS=2.410;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1062,0,1463 chrII 196206 . G A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.714;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1194,0,1307 chrII 196241 . C T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.844;DP=130;Dels=0.00;FS=4.645;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1483,0,1265 chrII 196417 . A G 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.711;DP=108;Dels=0.00;FS=7.886;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.639;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:108:99:1118,0,1145 chrII 196581 . G A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.444;DP=128;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1425,0,1188 chrII 196633 . G A 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.924;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1156,0,908 chrII 196657 . T A 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.966;DP=113;Dels=0.00;FS=18.420;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.893;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1152,0,1282 chrII 196681 . A G 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2757,285,0 chrII 196706 . T C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.979;DP=112;Dels=0.00;FS=9.407;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.106;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1041,0,1236 chrII 196868 . T C 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.994;DP=106;Dels=0.00;FS=4.848;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:932,0,1357 chrII 196964 . A T 637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;DP=96;Dels=0.01;FS=8.507;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.664;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,36:95:99:667,0,1304 chrII 197035 . A G 534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.095;DP=85;Dels=0.00;FS=25.316;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQ0=0;MQRankSum=-4.232;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.675;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:564,0,1276 chrII 197076 . A C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;DP=100;Dels=0.00;FS=16.121;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.00;MQ0=0;MQRankSum=7.749;QD=9.67;ReadPosRankSum=6.271;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:997,0,713 chrII 197246 . G T 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.016;DP=108;Dels=0.00;FS=8.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.52;MQ0=0;MQRankSum=3.828;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.487;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,75:108:99:1733,0,586 chrII 197250 . C A 541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.051;DP=108;Dels=0.00;FS=8.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.847;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,32:108:99:571,0,1743 chrII 197460 . T C 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.536;DP=117;Dels=0.00;FS=3.367;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:984,0,1420 chrII 197464 . T C 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.670;DP=110;Dels=0.00;FS=3.532;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:888,0,1404 chrII 197474 . G C 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;DP=99;Dels=0.00;FS=4.992;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.907;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:938,0,1121 chrII 197588 . C G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.985;DP=107;Dels=0.00;FS=1.724;HaplotypeScore=39.7133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:890,0,1190 chrII 197703 . T A 828 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.904;DP=69;Dels=0.00;FS=17.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-7.996e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,45:69:90:861,90,0 chrII 197706 . C A 795 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.310;DP=64;Dels=0.00;FS=16.113;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-6.996e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,40:64:67:828,67,0 chrII 197712 . A C 580 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.096;DP=58;Dels=0.00;FS=22.974;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=10.00;ReadPosRankSum=2.310;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,33:58:78:613,78,0 chrII 197713 . G T 604 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.97;MQ0=0;QD=10.41;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:58:78:637,78,0 chrII 197715 . G T 535.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.457;DP=64;Dels=0.00;FS=13.296;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.83;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.989;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,33:64:99:565,0,482 chrII 197731 . A G 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;DP=78;Dels=0.00;FS=1.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.110;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.346;SB=-3.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:609,0,734 chrII 197761 . G A 1560 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.13;MQ0=4;QD=22.94;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,65:68:99:1593,165,0 chrII 197816 . T C 1456 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;DP=93;Dels=0.00;FS=24.265;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.11;MQ0=29;MQRankSum=3.314;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.929;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,64:93:99:1489,162,0 chrII 197825 . G T 1479 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.325;DP=98;Dels=0.00;FS=21.866;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.27;MQ0=35;MQRankSum=3.312;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,59:98:99:1512,162,0 chrII 197969 . C T 1469 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.203;DP=74;Dels=0.00;FS=24.265;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.80;MQ0=10;MQRankSum=3.314;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.208;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,60:74:99:1502,165,0 chrII 198003 . C T 1700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.892;DP=66;Dels=0.00;FS=6.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.39;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.157;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,65:66:99:1733,180,0 chrII 198029 . A G 1734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.16;MQ0=0;QD=24.42;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1767,195,0 chrII 198051 . A T 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.767;DP=82;Dels=0.00;FS=0.966;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.395;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.419;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,48:82:99:977,0,633 chrII 198085 . G C 2088 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.07;MQ0=0;QD=24.00;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2121,231,0 chrII 198086 . T C 2084 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.69;MQ0=0;QD=23.42;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2117,237,0 chrII 198093 . A G 1848 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.12;MQ0=0;QD=23.10;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1881,201,0 chrII 198095 . A G 1934 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.24;MQ0=0;QD=23.59;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1967,216,0 chrII 198168 . C T 2697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.82;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2730,282,0 chrII 198180 . C T 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.97;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2666,267,0 chrII 198368 . A C 2404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6927;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:97:99:2437,255,0 chrII 198399 . A G 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.792;DP=93;Dels=0.00;FS=5.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.142;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:937,0,1020 chrII 198512 . A G 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3206,333,0 chrII 198526 . A G 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.84;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3186,354,0 chrII 198605 . C T 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3358,331,0 chrII 198672 . C T 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3139,313,0 chrII 198751 . T C 2044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=24.05;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2077,222,0 chrII 198778 . T G 2262 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=22.40;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2295,246,0 chrII 198782 . C T 2388 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2421,246,0 chrII 198826 . A G 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=23.10;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2828,303,0 chrII 198891 . G A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.270;DP=110;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=3.4954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.981;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1138,0,1180 chrII 199139 . T C 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=24.15;ReadPosRankSum=1.415;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:143:99:3454,357,0 chrII 199390 . T C 2556 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=21.85;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2589,267,0 chrII 199391 . A C 2435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=20.81;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2468,267,0 chrII 199514 . C T 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3083,309,0 chrII 199762 . A C 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3187,330,0 chrII 199961 . A G 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.868;DP=119;Dels=0.00;FS=3.496;HaplotypeScore=3.7732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.329;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1056,0,1438 chrII 200008 . C T 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.361;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.706;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1154,0,1216 chrII 200267 . G A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.374;DP=156;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=2.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.970;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,67:156:99:1362,0,1876 chrII 200298 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.132;DP=162;Dels=0.00;FS=5.698;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=9.12;ReadPosRankSum=-2.677;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,75:162:99:1507,0,1854 chrII 200483 . G A 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.456;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=1.544;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.446;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1809,0,1399 chrII 200522 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.297;DP=104;Dels=0.00;FS=14.969;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.476;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1073,0,1106 chrII 200530 . G T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.662;DP=117;Dels=0.00;FS=10.182;HaplotypeScore=2.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1256,0,1168 chrII 200854 . C T 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.450;DP=152;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=9.7413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:152:99:1828,0,1288 chrII 200968 . C T 4369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4369,433,0 chrII 201063 . C T 4635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.582;DP=171;Dels=0.00;FS=6.519;HaplotypeScore=7.8373;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=2.392;QD=27.11;ReadPosRankSum=2.421;SB=-2.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,169:171:99:4635,460,0 chrII 201476 . G A 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3845,391,0 chrII 201611 . T C 4202.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4202,435,0 chrII 201647 . C T 4559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.98;SB=-2.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4559,451,0 chrII 201779 . C G 4213.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4213,438,0 chrII 201831 . G A 4204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4204,424,0 chrII 201879 . C T 4554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.73;SB=-2.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4554,468,0 chrII 202001 . G C 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3332,369,0 chrII 202108 . A T 4199.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.92;SB=-2.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4199,424,0 chrII 202227 . T A 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4033,417,0 chrII 202411 . G A 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3099,304,0 chrII 202509 . T C 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.952;DP=156;Dels=0.00;FS=3.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.571;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1609,0,1674 chrII 202580 . C G 3924.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.620;DP=155;Dels=0.00;FS=3.095;HaplotypeScore=6.9207;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=25.32;ReadPosRankSum=1.687;SB=-2.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:3924,417,0 chrII 202724 . T C 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.58;SB=-2.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3884,402,0 chrII 202739 . G T 4086.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.858e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4086,409,0 chrII 203114 . C T 4480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.99;SB=-2.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4480,448,0 chrII 203566 . T C 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3733,375,0 chrII 203783 . G C 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=22.03;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3304,354,0 chrII 203910 . C G 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5186;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=17.23;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:2755,318,0 chrII 204179 . T C 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.734;DP=141;Dels=0.00;FS=3.157;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,83:141:99:1589,0,1203 chrII 204182 . T C 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;DP=138;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.987;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,83:138:99:1689,0,1138 chrII 204215 . T C 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.547;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.607;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:141:99:1726,0,1234 chrII 204404 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.103;DP=126;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=3.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.449;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1359,0,1228 chrII 204458 . C T 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.709;DP=159;Dels=0.00;FS=3.692;HaplotypeScore=5.5350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:159:99:1780,0,1512 chrII 204536 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.500;DP=138;Dels=0.00;FS=2.179;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.700;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1289,0,1507 chrII 204923 . A T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.165;DP=132;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.797;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1203,0,1532 chrII 204924 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;DP=128;Dels=0.00;FS=5.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.854;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.382;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1192,0,1439 chrII 204995 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.236;DP=149;Dels=0.00;FS=1.292;HaplotypeScore=4.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.349;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:1287,0,1675 chrII 205151 . G A 2069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.172;DP=151;Dels=0.00;FS=8.797;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,91:151:99:2099,0,1037 chrII 205157 . C A 1920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.669;DP=143;Dels=0.00;FS=7.742;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.482;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,87:143:99:1950,0,943 chrII 205343 . A C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;DP=99;Dels=0.00;FS=6.992;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,64:99:99:1385,0,700 chrII 205834 . G A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.748;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=1;MQRankSum=1.236;QD=10.68;ReadPosRankSum=2.329;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1461,0,1271 chrII 205854 . A T 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;DP=153;Dels=0.00;FS=2.253;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=1;MQRankSum=-0.516;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1622,0,1648 chrII 205891 . T C 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3371,369,0 chrII 206076 . C G 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3406,345,0 chrII 206280 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.829;DP=130;Dels=0.00;FS=5.346;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1306,0,1421 chrII 206369 . T C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.845;DP=121;Dels=0.00;FS=11.766;HaplotypeScore=2.8807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.680;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1346,0,1195 chrII 206394 . G A 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.855;DP=145;Dels=0.00;FS=2.190;HaplotypeScore=2.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.050;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1691,0,1292 chrII 207171 . C T 4124.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=27.13;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-2.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:4124,402,0 chrII 207220 . A G 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7714;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3589,369,0 chrII 207727 . C T 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2919,291,0 chrII 207923 . C T 562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.240;DP=70;Dels=0.00;FS=1.995;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:592,0,758 chrII 208189 . C T 2637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2670,270,0 chrII 208213 . C T 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3448,337,0 chrII 208351 . T A 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3439,343,0 chrII 208417 . G A 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3383,348,0 chrII 208471 . A G 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=25.41;ReadPosRankSum=1.315;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3380,357,0 chrII 208543 . A G 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3326,345,0 chrII 208574 . A G 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3188,327,0 chrII 208735 . C T 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12;SB=-2.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4150,424,0 chrII 208745 . T C 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.614;DP=151;Dels=0.00;FS=2.072;HaplotypeScore=2.9453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=11.70;ReadPosRankSum=-2.640;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1797,0,1480 chrII 208870 . C T 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3733,382,0 chrII 208879 . G A 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.987e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3786,394,0 chrII 208915 . C T 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2983,298,0 chrII 208916 . C G 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2889,297,0 chrII 208963 . C A 3725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3725,364,0 chrII 209169 . T A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;DP=123;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=-0.372;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1189,0,1428 chrII 209225 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.924;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1289,0,1012 chrII 209245 . G A 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.819;DP=129;Dels=0.00;FS=3.044;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3451,339,0 chrII 209373 . C T 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3484,360,0 chrII 209754 . A G 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=1;QD=24.54;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3288,360,0 chrII 210006 . T C 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3263,351,0 chrII 210387 . A G 3762.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.59;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3762,387,0 chrII 210531 . A G 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.672;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.371;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1358,0,1549 chrII 210582 . G A 4167.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4167,429,0 chrII 210974 . T C 2191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=23.82;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2224,228,0 chrII 210990 . G A 2259 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2292,228,0 chrII 211106 . A G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.082;DP=104;Dels=0.00;FS=2.554;HaplotypeScore=6.3547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.27;ReadPosRankSum=-2.090;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1098,0,1171 chrII 211332 . G A 2097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.40;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2130,216,0 chrII 211581 . C T 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:3036,309,0 chrII 212351 . G A 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=26.39;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2276,237,0 chrII 212495 . G T 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2699,273,0 chrII 212638 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.234;DP=121;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=2.6496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=9.59;ReadPosRankSum=-2.016;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1190,0,1306 chrII 212810 . T C 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.85;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3777,378,0 chrII 212882 . A G 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3639,372,0 chrII 212886 . C G 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3771,390,0 chrII 213058 . C T 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9419;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3210,318,0 chrII 213466 . A G 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;DP=138;Dels=0.00;FS=3.172;HaplotypeScore=5.9641;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=25.83;ReadPosRankSum=1.631;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:3565,353,0 chrII 213545 . G C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.131;DP=136;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=3.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,54:136:99:931,0,1763 chrII 213628 . T A 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1227,0,1431 chrII 213728 . T G 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3695,393,0 chrII 213729 . C T 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.261;DP=151;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.351;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1631,0,1320 chrII 214190 . G C 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=23.27;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2826,294,0 chrII 214439 . G A 2441 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2474,252,0 chrII 214468 . G T 717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.551;DP=72;Dels=0.00;FS=0.939;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.427;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,34:72:99:747,0,772 chrII 214711 . G A 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2980,298,0 chrII 214801 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.187;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1368,0,904 chrII 214810 . C T 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.347;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.662;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2780,263,0 chrII 214891 . G A 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2683,273,0 chrII 215181 . G A 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3374,337,0 chrII 215629 . A G 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.736;DP=134;Dels=0.00;FS=4.186;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1501,0,1200 chrII 215946 . G C 2047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2080,219,0 chrII 215962 . G A 2465 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2498,264,0 chrII 215982 . G T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.695;DP=106;Dels=0.00;FS=14.256;HaplotypeScore=3.4831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.860;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,68:106:99:1399,0,632 chrII 216520 . A G 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3704,375,0 chrII 216541 . A C 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3650,369,0 chrII 216631 . A G 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3338,345,0 chrII 216685 . T C 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.539;DP=139;Dels=0.00;FS=2.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.824;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1561,0,1485 chrII 216794 . T C 4102.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4102,417,0 chrII 217015 . G C 3773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3773,385,0 chrII 217070 . C T 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3868,379,0 chrII 217109 . T C 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3465,369,0 chrII 217360 . T A 1833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;DP=150;Dels=0.00;FS=5.277;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1863,0,1440 chrII 217412 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.628;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.611;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,65:148:99:1342,0,1795 chrII 217636 . A G 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3875,399,0 chrII 217676 . C T 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3751,381,0 chrII 218039 . A G 1084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.09;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1117,117,0 chrII 218057 . T C 500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.482;DP=51;Dels=0.00;FS=2.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.293;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:530,0,520 chrII 218507 . T C 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3034,309,0 chrII 218618 . A G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.930;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.045;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1148,0,1447 chrII 218630 . C T 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3706,364,0 chrII 218666 . G A 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3849,382,0 chrII 218957 . G A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.772;DP=102;Dels=0.00;FS=2.650;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.274;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1102,0,1095 chrII 219000 . C T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.468;DP=98;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.268;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:905,0,1192 chrII 219410 . C T 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3322,334,0 chrII 219506 . A G 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3723,381,0 chrII 220055 . C T 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.79;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3102,309,0 chrII 220122 . G A 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.596;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=26.19;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4007,394,0 chrII 220136 . C T 3989.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3989,403,0 chrII 220216 . A G 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3190,321,0 chrII 220331 . C T 4284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=27.46;SB=-2.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4284,430,0 chrII 220403 . A G 4128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4128,415,0 chrII 220405 . G A 4222.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4222,418,0 chrII 220424 . A C 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=24.58;SB=-2.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3932,405,0 chrII 220451 . T G 4056.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4056,426,0 chrII 220776 . C T 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.18;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3205,316,0 chrII 220790 . C T 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.06;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3345,339,0 chrII 220911 . G T 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.16;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3503,355,0 chrII 220914 . C T 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3648,370,0 chrII 221037 . T C 13.94 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.14;MQ0=3;QD=1.74;SB=-5.580e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,5:8:6:45,6,0 chrII 221305 . C T 138.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.85;MQ0=1;QD=19.73;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:18:171,18,0 chrII 221318 . C T 167.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.87;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:200,21,0 chrII 221321 . T C 165.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.58;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:198,21,0 chrII 221324 . T A 196.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.82;SB=-3.661e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:24:229,24,0 chrII 221330 . A G 263 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.53;SB=-1.032e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:33:296,33,0 chrII 221349 . C G 276 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.71;SB=-1.032e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:33:309,33,0 chrII 221350 . T A 283 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=20.21;SB=-1.032e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:33:316,33,0 chrII 221354 . C A 291 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=20.79;SB=-1.032e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:33:324,33,0 chrII 222192 . C A 306.03 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;DP=51;Dels=0.00;FS=1.850;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.16;MQ0=26;MQRankSum=2.831;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.159;SB=-1.274e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,38:51:19:336,0,19 chrII 226848 . C T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.37;MQ0=79;QD=0.29;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:79,4:83:6:55,6,0 chrII 226856 . C T 103.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.23;MQ0=71;QD=1.31;SB=-2.384e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:71,8:79:15:136,15,0 chrII 226860 . A G 101.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.47;MQ0=67;QD=1.35;SB=-2.384e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:67,8:75:15:134,15,0 chrII 226862 . G T 110.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.60;MQ0=65;QD=1.51;SB=-2.384e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:59,8:73:15:143,15,0 chrII 226864 . G T 110.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.95;MQ0=60;QD=1.62;SB=-2.384e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:60,8:68:15:143,15,0 chrII 226865 . A G 108.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.95;MQ0=60;QD=1.59;SB=-2.384e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:59,9:68:15:141,15,0 chrII 226877 . A T 228 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.50;MQ0=54;QD=3.17;SB=-1.516e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:54,18:72:30:261,30,0 chrII 226878 . T A 227 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.50;MQ0=54;QD=3.15;SB=-1.516e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:52,18:70:30:260,30,0 chrII 226887 . C T 282 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=47;QD=4.27;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:46,19:65:33:315,33,0 chrII 226900 . C T 307 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.99;MQ0=20;QD=7.31;SB=-8.698e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,22:42:36:340,36,0 chrII 226903 . T C 308 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.27;MQ0=16;QD=7.90;SB=-8.699e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,23:39:36:341,36,0 chrII 226906 . T A 314 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.56;MQ0=15;QD=8.26;SB=-8.699e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,23:38:36:347,36,0 chrII 226912 . A G 306 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=12;QD=8.74;SB=-8.699e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,23:35:36:339,36,0 chrII 226931 . C G 304 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.13;MQ0=3;QD=12.67;SB=-8.696e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:24:36:337,36,0 chrII 226932 . T A 312 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.13;MQ0=3;QD=13.00;SB=-8.696e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:24:36:345,36,0 chrII 226936 . C A 318 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.33;MQ0=1;QD=14.45;SB=-8.696e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:36:351,36,0 chrII 226965 . G A 592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.80;MQ0=0;QD=9.11;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:66:625,66,0 chrII 226979 . T C 946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.31;MQ0=0;QD=12.13;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:979,105,0 chrII 227201 . C T 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.59;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3449,346,0 chrII 227302 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.614;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:131:99:1299,0,1473 chrII 227328 . G A 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3511,360,0 chrII 227387 . A T 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3383,339,0 chrII 227881 . T C 2861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=20.58;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:2894,312,0 chrII 227900 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.866;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1272,0,953 chrII 228106 . T C 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3028,318,0 chrII 228251 . T C 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2973,312,0 chrII 228551 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.271;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=10.72;ReadPosRankSum=3.064;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1402,0,1303 chrII 228581 . A G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.637;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.119;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1323,0,1155 chrII 228645 . C T 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.593;DP=129;Dels=0.00;FS=6.613;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.623;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1594,0,1184 chrII 229154 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.604;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.433;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,74:122:99:1578,0,919 chrII 229777 . T C 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.680;DP=157;Dels=0.00;FS=10.674;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,88:157:99:1840,0,1449 chrII 230037 . A T 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.00;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2679,270,0 chrII 230255 . C T 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.133;DP=104;Dels=0.00;FS=5.247;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.502;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:977,0,1176 chrII 230576 . A G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.371;DP=109;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.823;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1173,0,1039 chrII 230849 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.978;DP=111;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1305,0,1034 chrII 231252 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.486;DP=112;Dels=0.00;FS=2.446;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1270,0,1077 chrII 231614 . A G 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.617;DP=110;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.531;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1186,0,1150 chrII 231704 . A G 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3515,352,0 chrII 231837 . A G 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.098;DP=137;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.083;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1414,0,1437 chrII 232618 . C T 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.179;DP=116;Dels=0.00;FS=4.412;HaplotypeScore=5.7392;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=25.97;ReadPosRankSum=1.672;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:3046,284,0 chrII 233405 . C T 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2875,285,0 chrII 234340 . T C 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.894;DP=146;Dels=0.00;FS=7.372;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.496;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1439,0,1729 chrII 234385 . G A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.106;DP=107;Dels=0.00;FS=5.225;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1119,0,1073 chrII 234604 . T C 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.577;DP=127;Dels=0.00;FS=6.770;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.445;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1410,0,1146 chrII 234613 . T A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;DP=127;Dels=0.00;FS=4.349;HaplotypeScore=2.8271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=12.43;ReadPosRankSum=-1.451;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1609,0,1121 chrII 234673 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.791;DP=130;Dels=0.00;FS=4.194;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.422;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1457,0,1211 chrII 234856 . C G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.095;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1588,0,1503 chrII 235113 . C T 2718 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.13;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2751,282,0 chrII 235634 . T C 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3295,330,0 chrII 235845 . A G 92.27 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;DP=98;Dels=0.00;FS=4.002;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=0.94;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,97:98:9:122,0,9 chrII 236156 . C T 2498 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.86;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2531,264,0 chrII 236256 . T A 2376 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2409,243,0 chrII 236313 . C T 2336 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2369,246,0 chrII 236383 . G A 2365 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.32;MQ0=0;QD=26.57;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2398,255,0 chrII 236390 . G A 2459 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.11;MQ0=0;QD=26.16;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2492,264,0 chrII 236391 . G A 2399 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.79;MQ0=0;QD=26.36;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2432,255,0 chrII 236441 . T A 2074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.80;MQ0=0;QD=24.12;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2107,219,0 chrII 236489 . C A 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2798,294,0 chrII 236626 . T C 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3159,330,0 chrII 237151 . A G 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2810,300,0 chrII 237541 . C T 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2966,291,0 chrII 237656 . C T 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2855,282,0 chrII 237660 . T C 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2731,282,0 chrII 237729 . A G 2309 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2342,258,0 chrII 237971 . A T 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.99;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3431,351,0 chrII 238080 . G C 2197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=24.97;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2230,237,0 chrII 238111 . A G 2308 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2341,240,0 chrII 238137 . T C 1636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=24.42;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1669,174,0 chrII 238155 . C A 352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.737;DP=51;Dels=0.00;FS=2.418;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.25;MQ0=0;MQRankSum=-3.186;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.219;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:382,0,622 chrII 238163 . A T 1225 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.73;MQ0=0;QD=25.52;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1258,126,0 chrII 238186 . G A 1167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.54;MQ0=0;QD=24.83;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1200,123,0 chrII 238189 . C T 1119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.73;MQ0=0;QD=24.87;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1152,120,0 chrII 238224 . T A 1226 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.75;MQ0=0;QD=25.02;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1259,126,0 chrII 238239 . G A 1155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.27;MQ0=0;QD=26.25;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1188,114,0 chrII 238287 . A C 1283 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.98;MQ0=0;QD=25.16;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1316,126,0 chrII 238291 . T C 1263 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.98;MQ0=0;QD=24.76;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:51:99:1296,126,0 chrII 238346 . T G 1394 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.30;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1427,147,0 chrII 238452 . A G 2231 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.94;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2264,222,0 chrII 238608 . A C 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3200,327,0 chrII 238611 . C T 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3191,327,0 chrII 238675 . C T 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.48;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3298,331,0 chrII 238737 . G A 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.226;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:878,0,1276 chrII 238925 . C T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.862;DP=123;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=9.9307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:123:99:1405,0,1141 chrII 238944 . T A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;DP=128;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.322;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1379,0,1424 chrII 239405 . A G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.183;DP=123;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.211;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1106,0,1453 chrII 239434 . T A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.764;DP=103;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.116;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1182,0,1062 chrII 239525 . A C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.896;DP=112;Dels=0.00;FS=5.916;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1205,0,1224 chrII 239528 . A C 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2932,309,0 chrII 239597 . C T 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2624,261,0 chrII 239625 . T C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.343;DP=109;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1215,0,1083 chrII 239864 . G A 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.315;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.406;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1159,0,1267 chrII 239951 . A G 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3147,321,0 chrII 240048 . C A 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2853,279,0 chrII 240157 . G T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.033;DP=155;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1629,0,1677 chrII 240542 . C T 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3448,345,0 chrII 240840 . G A 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3407,343,0 chrII 240963 . C T 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3096,312,0 chrII 241143 . A G 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4706;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2763,297,0 chrII 241196 . C T 2069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3093;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2102,216,0 chrII 241422 . T C 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.17;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2912,309,0 chrII 241482 . C T 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3440,355,0 chrII 241509 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.276;DP=123;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.109;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1216,0,1392 chrII 241599 . C T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.769;DP=115;Dels=0.00;FS=11.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1014,0,1389 chrII 242012 . T C 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2754,285,0 chrII 242038 . A G 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2859,291,0 chrII 242053 . C G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;DP=110;Dels=0.00;FS=1.575;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.523;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1012,0,1301 chrII 242434 . G A 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3462,346,0 chrII 242746 . C G 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:3782,402,0 chrII 243436 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.161;DP=135;Dels=0.00;FS=8.182;HaplotypeScore=3.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1312,0,1482 chrII 243470 . G A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.653;DP=102;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=2.3264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.356;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1130,0,986 chrII 243486 . G A 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2845,291,0 chrII 243507 . A G 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.101;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:969,0,1126 chrII 243576 . C T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.763;DP=113;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.084;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1072,0,1375 chrII 243609 . T C 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2866,303,0 chrII 243768 . C T 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2951,300,0 chrII 243846 . C T 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=22.18;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3072,301,0 chrII 244011 . A G 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2949,324,0 chrII 244215 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.533;DP=117;Dels=0.00;FS=7.176;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=1;MQRankSum=-0.591;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.608;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1408,0,1058 chrII 244779 . A G 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2854,294,0 chrII 245034 . C T 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3099,315,0 chrII 245073 . A G 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3275,339,0 chrII 245305 . C T 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2967,300,0 chrII 245537 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.205;DP=106;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.294;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1236,0,1051 chrII 245747 . T C 2167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.695;DP=94;Dels=0.00;FS=4.818;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=23.05;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:2200,237,0 chrII 245877 . G A 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.635;DP=107;Dels=0.00;FS=3.304;HaplotypeScore=6.5912;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=25.83;ReadPosRankSum=1.408;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2797,253,0 chrII 246027 . T G 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2722,285,0 chrII 246059 . G A 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3295,337,0 chrII 246172 . G A 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3770,379,0 chrII 246333 . G A 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.284;DP=125;Dels=0.00;FS=5.607;HaplotypeScore=5.7892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.543;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:842,0,1272 chrII 246575 . T C 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2778,294,0 chrII 246579 . A C 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.50;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2630,285,0 chrII 246816 . G A 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3796,384,0 chrII 246960 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.510;DP=136;Dels=0.00;FS=5.408;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.327;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:136:99:1433,0,1344 chrII 247040 . C T 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3143,316,0 chrII 247234 . A G 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2785,309,0 chrII 247522 . G A 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2986,286,0 chrII 247531 . C T 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2735,264,0 chrII 247603 . A T 2392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2425,243,0 chrII 247759 . G A 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3294,319,0 chrII 247789 . A G 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.93;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3049,318,0 chrII 247813 . C T 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3283,339,0 chrII 247993 . C T 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2893,297,0 chrII 248152 . A T 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3221,313,0 chrII 248212 . A G 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3124,318,0 chrII 248555 . G T 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3386,337,0 chrII 248659 . G A 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3359,322,0 chrII 248671 . C G 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.67;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3134,321,0 chrII 248728 . A G 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3109,327,0 chrII 248918 . C T 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3577,358,0 chrII 249073 . G A 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3710,381,0 chrII 249307 . C A 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.381;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1677,0,1582 chrII 249400 . G C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.168;DP=129;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1365,0,1328 chrII 249533 . T C 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3210,345,0 chrII 249570 . G A 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=26.85;ReadPosRankSum=1.128;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2960,297,0 chrII 249967 . A G 3881.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=23.10;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:3881,402,0 chrII 250250 . G A 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3995,397,0 chrII 250316 . G A 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3610,369,0 chrII 250466 . A G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.688;DP=108;Dels=0.00;FS=6.212;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:108:99:1271,0,925 chrII 250482 . C A 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3026,298,0 chrII 251004 . A T 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3729,373,0 chrII 251105 . T G 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3237,345,0 chrII 251109 . G A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.229;DP=131;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1116,0,1565 chrII 251134 . G T 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3937;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.909e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3668,373,0 chrII 251548 . G A 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3851,391,0 chrII 251790 . C T 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2480,264,0 chrII 251800 . C T 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.366;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2599,239,0 chrII 251820 . G C 2631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2664,273,0 chrII 251882 . A G 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3485,378,0 chrII 252013 . G A 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.12;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3068,301,0 chrII 252027 . C T 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2851,288,0 chrII 252036 . C T 2588 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.55;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2621,258,0 chrII 252044 . C T 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.30;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2739,276,0 chrII 252161 . C G 4353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=27.21;SB=-2.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4353,457,0 chrII 252193 . A G 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3985,403,0 chrII 252572 . T G 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.38;MQ0=0;QD=23.45;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2472,270,0 chrII 252578 . C T 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.24;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2857,294,0 chrII 252589 . T C 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.95;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2649,282,0 chrII 252599 . T C 2464 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.55;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2497,276,0 chrII 252680 . A G 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2863,321,0 chrII 252704 . G T 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3420,346,0 chrII 252792 . T G 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2524,279,0 chrII 253219 . G A 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3629,346,0 chrII 253479 . A T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1521,0,1326 chrII 253709 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.873;DP=152;Dels=0.00;FS=20.458;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=2;MQRankSum=-0.224;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.747;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1478,0,1724 chrII 254030 . C T 4228.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8427;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4228,418,0 chrII 254096 . T A 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;DP=146;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=4.5049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.778;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.495;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:146:99:1585,0,1363 chrII 254124 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.774;DP=166;Dels=0.00;FS=3.596;HaplotypeScore=4.3502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.877;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,76:166:99:1484,0,1949 chrII 254349 . C T 3888.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3888,388,0 chrII 254368 . C T 3931.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3931,399,0 chrII 254409 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3269,337,0 chrII 254436 . T C 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.36;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:126:99:3102,339,0 chrII 254493 . T G 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.021;DP=127;Dels=0.00;FS=8.104;HaplotypeScore=3.7381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:864,0,1459 chrII 254671 . A G 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.490;DP=132;Dels=0.00;FS=7.444;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1410,0,1261 chrII 254728 . C T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.823;DP=128;Dels=0.00;FS=5.580;HaplotypeScore=4.6255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.889;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1453,0,1292 chrII 254742 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.755;DP=127;Dels=0.00;FS=6.919;HaplotypeScore=3.6347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.971;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1416,0,1266 chrII 254834 . A G 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3592,384,0 chrII 254899 . T A 2655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2688,270,0 chrII 254908 . T C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.475;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.220;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.178;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:1004,0,996 chrII 255033 . C T 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.601;DP=78;Dels=0.00;FS=0.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.121;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:779,0,952 chrII 255047 . A G 648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.717;DP=80;Dels=0.00;FS=3.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.593;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,33:80:99:678,0,1055 chrII 255127 . A G 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2702,285,0 chrII 255469 . G A 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3890,403,0 chrII 255688 . T A 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.147;DP=151;Dels=0.00;FS=6.264;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=7.44;ReadPosRankSum=-4.789;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,57:151:99:1153,0,2085 chrII 255740 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.149;DP=135;Dels=0.00;FS=26.589;HaplotypeScore=6.9439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.545;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1173,0,1651 chrII 255743 . C T 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.440;DP=134;Dels=0.00;FS=19.913;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=9.17;ReadPosRankSum=2.232;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1259,0,1579 chrII 255828 . T C 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.200;DP=109;Dels=0.00;FS=5.015;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.064;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:882,0,1367 chrII 256267 . C A 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2935,306,0 chrII 256925 . T C 2045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=85;Dels=0.00;FS=3.731;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2078,225,0 chrII 256941 . A T 1897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1930,204,0 chrII 257162 . G A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.630;DP=117;Dels=0.00;FS=4.660;HaplotypeScore=3.0888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,72:117:99:1471,0,882 chrII 257430 . C T 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3410,343,0 chrII 257913 . T C 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3477,360,0 chrII 257980 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.864;DP=117;Dels=0.00;FS=7.083;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.156;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1321,0,1241 chrII 258153 . T C 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=21.79;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3084,330,0 chrII 258208 . A C 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7971;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3236,324,0 chrII 258211 . A G 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3270,327,0 chrII 258297 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.293;DP=124;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1239,0,1265 chrII 258313 . G C 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.48;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3156,312,0 chrII 258385 . A C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.482;DP=96;Dels=0.00;FS=1.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.176;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1101,0,934 chrII 258409 . C A 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3514,361,0 chrII 258662 . C T 2451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2484,246,0 chrII 258851 . T C 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3203,318,0 chrII 258852 . G A 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=22.81;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3181,312,0 chrII 258896 . A G 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=25.17;ReadPosRankSum=0.742;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3028,315,0 chrII 258961 . A G 3182 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.98;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3215,321,0 chrII 258965 . T A 3039 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.05;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3072,306,0 chrII 258971 . C T 2996 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.74;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3029,295,0 chrII 259158 . A G 3953.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.29;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3953,406,0 chrII 259235 . T C 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.45;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3771,387,0 chrII 259410 . A C 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.55;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3358,339,0 chrII 259419 . T C 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.40;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3320,336,0 chrII 259438 . A T 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.96;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3360,328,0 chrII 259451 . T A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.491;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.241;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3297,333,0 chrII 259521 . C T 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.62;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2576,264,0 chrII 259561 . A G 1864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.82;MQ0=0;QD=23.01;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1897,207,0 chrII 262767 . C T 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.30;MQ0=89;QD=0.21;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:80,11:91:6:50,6,0 chrII 263153 . C T 140.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.12;MQ0=0;QD=14.01;SB=-1.079e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:18:173,18,0 chrII 265294 . G A 126.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.895;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.60;MQ0=33;MQRankSum=2.166;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.818;SB=-5.588e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:35,7:43:18:159,18,0 chrII 265306 . T A 223.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.113;DP=37;Dels=0.00;FS=2.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.12;MQ0=24;MQRankSum=2.451;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-8.896e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,10:37:27:256,27,0 chrII 265334 . A G 250.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.74;MQ0=12;MQRankSum=1.042;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.042;SB=-1.469e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,15:27:27:283,27,0 chrII 265343 . T C 250.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;DP=30;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=14;MQRankSum=-0.079;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.350;SB=-1.259e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,17:30:27:283,27,0 chrII 265351 . A C 246.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;DP=31;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.35;MQ0=15;MQRankSum=-0.079;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.826;SB=-1.249e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,19:31:27:279,27,0 chrII 265394 . T G 138.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;DP=25;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.83;MQ0=15;MQRankSum=1.393;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.000;SB=-4.788e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,14:25:18:171,18,0 chrII 265775 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.190;DP=139;Dels=0.00;FS=9.231;HaplotypeScore=5.9511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=9.65;ReadPosRankSum=2.322;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1371,0,1533 chrII 265831 . A G 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.49;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3812,393,0 chrII 265907 . C G 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;DP=165;Dels=0.00;FS=1.962;HaplotypeScore=3.8877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=2.849;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:1821,0,1556 chrII 266107 . G A 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3742,355,0 chrII 266250 . A T 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3235,313,0 chrII 266324 . T C 2266 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2299,231,0 chrII 266339 . T G 2502 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2535,255,0 chrII 266358 . C T 2336 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2369,237,0 chrII 266478 . G A 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3603,352,0 chrII 266551 . C G 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2818,297,0 chrII 266622 . T C 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3193,333,0 chrII 266791 . G A 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3185,315,0 chrII 266952 . A G 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2743,285,0 chrII 267510 . C T 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2748,282,0 chrII 267525 . T A 2527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2560,258,0 chrII 267594 . A G 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3022,306,0 chrII 268895 . G A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.818;DP=165;Dels=0.00;FS=3.637;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.759;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,72:165:99:1524,0,2014 chrII 268913 . G A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.636;DP=161;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.912;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,70:161:99:1389,0,1905 chrII 268925 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.982;DP=149;Dels=0.00;FS=2.981;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,61:149:99:1231,0,1888 chrII 268930 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.168;DP=151;Dels=0.00;FS=4.972;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.772;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,63:151:99:1069,0,1956 chrII 268949 . T C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.184;DP=157;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.678;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,69:157:99:1256,0,1881 chrII 269396 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.798;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.117;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1286,0,1369 chrII 269402 . G A 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.524;DP=142;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=7.8461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.264;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1637,0,1327 chrII 269527 . C T 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.320;DP=158;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=0.889;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.153;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:158:99:1772,0,1515 chrII 269532 . T C 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.560;DP=165;Dels=0.00;FS=1.950;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=1;MQRankSum=-0.081;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.312;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,88:165:99:1756,0,1630 chrII 269578 . G A 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.980;DP=141;Dels=0.00;FS=8.229;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=0.420;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.215;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1617,0,1383 chrII 269653 . C T 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3714,358,0 chrII 269824 . T C 3991.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=21.69;SB=-2.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:3991,417,0 chrII 270284 . A C 4034.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;DP=168;Dels=0.00;FS=4.124;HaplotypeScore=3.9430;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=24.01;ReadPosRankSum=1.629;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:4034,408,0 chrII 270456 . A G 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;DP=95;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,54:95:99:910,0,537 chrII 270459 . G C 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.659;DP=96;Dels=0.00;FS=1.654;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.244;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:882,0,707 chrII 270474 . C A 378.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.277;DP=99;Dels=0.00;FS=0.826;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-4.596;QD=3.82;ReadPosRankSum=-3.057;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,28:99:99:408,0,1419 chrII 270477 . C T 289.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.346;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.54;MQ0=0;MQRankSum=-5.742;QD=2.89;ReadPosRankSum=-3.773;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:319,0,1548 chrII 270480 . T C 113.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.030;DP=91;Dels=0.00;FS=5.682;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.561;QD=1.24;ReadPosRankSum=-3.373;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,16:91:99:143,0,1626 chrII 272240 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.635;DP=114;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1020,0,1318 chrII 273772 . T C 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.997;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.983;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1412,0,1386 chrII 273781 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.477;DP=110;Dels=0.00;FS=7.851;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.048;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1102,0,1170 chrII 273923 . A G 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.446;DP=84;Dels=0.00;FS=0.823;HaplotypeScore=2.5031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:843,0,917 chrII 274068 . G A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.885;DP=104;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.399;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,61:104:99:1344,0,851 chrII 274120 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.903;DP=98;Dels=0.00;FS=2.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1179,0,869 chrII 274140 . C A 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.254;DP=87;Dels=0.00;FS=1.836;HaplotypeScore=67.6556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQ0=0;MQRankSum=3.623;QD=7.74;ReadPosRankSum=3.198;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:703,0,1086 chrII 274152 . T C 688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.355;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.14;MQ0=0;MQRankSum=-3.372;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,40:82:99:718,0,921 chrII 274197 . T G 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.465;DP=83;Dels=0.00;FS=0.829;HaplotypeScore=5.5558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=4.876;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.635;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,45:83:99:751,0,525 chrII 274206 . T G 646.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.807;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.0759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-5.068;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.404;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:676,0,882 chrII 274209 . C T 641.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.353;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.8966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-6.066;QD=6.82;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:671,0,795 chrII 274212 . A T 569.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.093;DP=92;Dels=0.00;FS=1.706;HaplotypeScore=17.4415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=-5.082;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:599,0,807 chrII 274298 . T A 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;DP=104;Dels=0.00;FS=11.266;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=-4.683;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.392;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:840,0,1173 chrII 274303 . T A 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;DP=95;Dels=0.00;FS=10.056;HaplotypeScore=86.9133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-4.414;QD=7.01;ReadPosRankSum=1.724;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:696,0,1157 chrII 274372 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.724;DP=124;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=1;MQRankSum=-0.951;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1314,0,1024 chrII 274384 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.406;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=1;MQRankSum=-1.115;QD=9.13;ReadPosRankSum=3.064;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1125,0,1163 chrII 274439 . T C 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.746;DP=85;Dels=0.00;FS=0.822;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:945,0,823 chrII 274460 . T C 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=86;Dels=0.00;FS=4.131;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.043;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:973,0,845 chrII 274509 . G T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.306;DP=123;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.003;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1355,0,1202 chrII 274643 . A G 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.640;DP=129;Dels=0.00;FS=3.267;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=1;MQRankSum=-0.479;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1319,0,1431 chrII 275600 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.613;DP=145;Dels=0.00;FS=9.217;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.647;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1529,0,1566 chrII 275968 . T C 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.905;DP=118;Dels=0.00;FS=4.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.332;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:983,0,1371 chrII 276052 . T C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.394;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1072,0,1570 chrII 276131 . T C 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.506;DP=120;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.871;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1077,0,1591 chrII 276137 . T C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.345;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:1004,0,1551 chrII 276150 . T A 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.062;DP=131;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1079,0,1777 chrII 276249 . C T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.976;DP=128;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.643;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1412,0,1313 chrII 276361 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.801;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.779;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1234,0,1749 chrII 276526 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.511;DP=112;Dels=0.00;FS=3.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1189,0,1129 chrII 276676 . T C 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.804;DP=128;Dels=0.00;FS=8.461;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.046;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,52:128:99:937,0,1733 chrII 276799 . C G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;DP=165;Dels=0.00;FS=3.991;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.485;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1553,0,1801 chrII 276816 . G T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.280;DP=149;Dels=0.00;FS=3.651;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.568;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1517,0,1530 chrII 277566 . G T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.734;DP=134;Dels=0.00;FS=5.243;HaplotypeScore=5.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.409;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:134:99:1280,0,1517 chrII 277912 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.818;DP=162;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,70:162:99:1412,0,1980 chrII 278176 . G A 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.249;DP=148;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=3.3809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=3.978;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:148:99:1550,0,1489 chrII 278501 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;DP=153;Dels=0.00;FS=3.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.885;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1494,0,1762 chrII 278796 . T C 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.972;DP=110;Dels=0.00;FS=2.474;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:886,0,1355 chrII 278884 . G C 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;DP=87;Dels=0.00;FS=0.801;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,47:87:99:950,0,835 chrII 278927 . A G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.280;DP=119;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=2.7920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.885;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1221,0,1232 chrII 278934 . A G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.748;DP=131;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=2.9531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1373,0,1373 chrII 279504 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.133;DP=150;Dels=0.00;FS=4.829;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.317;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1427,0,1651 chrII 279623 . T C 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.488;DP=176;Dels=0.00;FS=1.186;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,83:176:99:1704,0,2033 chrII 279743 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.450;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1259,0,1883 chrII 279910 . T C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.578;DP=130;Dels=0.00;FS=8.000;HaplotypeScore=2.7254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.697;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1165,0,1513 chrII 280053 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.639;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.804;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,63:152:99:1346,0,1932 chrII 280259 . A C 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.500;DP=111;Dels=0.00;FS=3.625;HaplotypeScore=6.3337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.802;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:921,0,1314 chrII 280418 . C T 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.000;DP=114;Dels=0.00;FS=1.653;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1227,0,1138 chrII 280496 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.362;DP=110;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.752;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1138,0,1163 chrII 280639 . A G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.397;DP=132;Dels=0.00;FS=2.225;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.232;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1532,0,1207 chrII 280684 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.525;DP=114;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1265,0,1080 chrII 280810 . A C 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.653;DP=148;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.222;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,86:148:99:1803,0,1345 chrII 280848 . C T 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.549;DP=136;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.147;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,80:136:99:1714,0,1106 chrII 280915 . G A 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;DP=114;Dels=0.00;FS=0.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1340,0,1059 chrII 280916 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.252;DP=114;Dels=0.00;FS=0.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1305,0,1051 chrII 281105 . A G 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.654;DP=128;Dels=0.00;FS=0.840;HaplotypeScore=4.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1399,0,1324 chrII 281251 . A G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.223;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=1;MQRankSum=-0.489;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.065;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1465,0,1534 chrII 281281 . C T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.855;DP=136;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=2.5486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=1;MQRankSum=-1.199;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.926;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1435,0,1415 chrII 281826 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.118;DP=106;Dels=0.00;FS=6.378;HaplotypeScore=7.4569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:106:99:1353,0,839 chrII 282024 . C T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.876;DP=151;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=8.97;ReadPosRankSum=-2.396;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1385,0,1649 chrII 282128 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.746;DP=140;Dels=0.00;FS=2.278;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=-0.150;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.978;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1367,0,1677 chrII 282212 . T G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.370;DP=117;Dels=0.00;FS=8.661;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.558;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1094,0,1373 chrII 282492 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.018;DP=135;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=1.167;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.359;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1174,0,1564 chrII 282738 . T C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=118;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:118:99:1140,0,1435 chrII 283092 . A T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;DP=130;Dels=0.00;FS=11.564;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.151;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1322,0,1268 chrII 283424 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.020;DP=131;Dels=0.00;FS=3.192;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.919;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1279,0,1538 chrII 283573 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.065;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1149,0,1402 chrII 283654 . C G 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.408;DP=101;Dels=0.00;FS=1.595;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.161;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:885,0,1103 chrII 283729 . G C 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;DP=117;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.146;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:987,0,1413 chrII 283800 . C T 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.328;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.057;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.308;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:1227,0,1740 chrII 283860 . G A 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.141;DP=120;Dels=0.00;FS=2.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1043,0,1382 chrII 283935 . A G 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.038;DP=123;Dels=0.00;FS=3.421;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:999,0,1644 chrII 284108 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.560;DP=121;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.049;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1088,0,1420 chrII 284207 . A G 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.655;DP=132;Dels=0.00;FS=5.628;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:132:99:876,0,1908 chrII 284437 . G T 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.519;DP=149;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.320;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1628,0,1355 chrII 284893 . T C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.710;DP=136;Dels=0.00;FS=11.177;HaplotypeScore=6.9010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1179,0,1659 chrII 285109 . A G 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.974;DP=129;Dels=0.00;FS=4.306;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.512;QD=7.67;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1019,0,1690 chrII 285666 . T C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.864;DP=147;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1351,0,1710 chrII 285829 . G A 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;DP=119;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,68:119:99:1430,0,1043 chrII 286002 . G A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.433;DP=133;Dels=0.00;FS=12.445;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.597;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1482,0,1284 chrII 286036 . C T 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.282;DP=136;Dels=0.00;FS=14.261;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1578,0,1225 chrII 286327 . G A 1781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.466;DP=147;Dels=0.00;FS=1.307;HaplotypeScore=5.8969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.014;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:147:99:1811,0,1253 chrII 286738 . G T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.930;DP=127;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.390;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1256,0,1359 chrII 286762 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.687;DP=135;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.588;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1369,0,1460 chrII 286855 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.359;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.696;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1384,0,1521 chrII 286863 . C T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.294;DP=140;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=4.9238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=10.53;ReadPosRankSum=-2.280;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1504,0,1401 chrII 286894 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.623;DP=149;Dels=0.00;FS=1.283;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1490,0,1726 chrII 286939 . C T 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.995;DP=140;Dels=0.00;FS=2.132;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.011;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1561,0,1362 chrII 287113 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1248,0,1780 chrII 287260 . A C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.499;DP=118;Dels=0.00;FS=3.363;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1204,0,1182 chrII 287483 . G A 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3858,391,0 chrII 287551 . A G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.192;DP=97;Dels=0.00;FS=3.854;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=1;MQRankSum=0.659;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,56:97:99:1071,0,855 chrII 287818 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.375;DP=129;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=2.7833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.841;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1303,0,1425 chrII 288039 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.813;DP=118;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=5.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=11.84;ReadPosRankSum=-1.796;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1427,0,1134 chrII 288081 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.198;DP=114;Dels=0.00;FS=4.796;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.206;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1246,0,1184 chrII 288197 . T C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.111;DP=135;Dels=0.00;FS=4.453;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1402,0,1300 chrII 288273 . G T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.598;DP=151;Dels=0.00;FS=10.582;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=1;MQRankSum=0.277;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1629,0,1376 chrII 288339 . A C 1958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.975;DP=170;Dels=0.00;FS=1.202;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,94:170:99:1988,0,1643 chrII 288379 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.139;DP=153;Dels=0.00;FS=2.098;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,62:153:99:1205,0,1974 chrII 288498 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.254;DP=120;Dels=0.00;FS=2.341;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=10.86;ReadPosRankSum=2.071;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:120:99:1333,0,1101 chrII 288671 . T A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.942;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.084;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1336,0,1359 chrII 288717 . C T 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.253;DP=109;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.090;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1068,0,1122 chrII 288768 . C T 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;DP=104;Dels=0.00;FS=3.721;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.940;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.775;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:943,0,1098 chrII 288773 . T A 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.034;DP=108;Dels=0.00;FS=6.315;HaplotypeScore=3.5243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQ0=0;MQRankSum=-3.296;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.728;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:108:99:857,0,1146 chrII 288780 . A G 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.503;DP=97;Dels=0.00;FS=10.130;HaplotypeScore=3.5243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQ0=0;MQRankSum=-3.826;QD=8.08;ReadPosRankSum=2.016;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:97:99:814,0,1069 chrII 288800 . T C 2520 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2553,267,0 chrII 288809 . A C 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.375;DP=97;Dels=0.00;FS=6.621;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:790,0,1126 chrII 288880 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.614;DP=114;Dels=0.00;FS=5.739;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.915;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.377;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1292,0,1112 chrII 288893 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.633;DP=115;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.318;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1402,0,1020 chrII 288970 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.055;DP=116;Dels=0.00;FS=7.149;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.494;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1114,0,1202 chrII 288985 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.360;DP=118;Dels=0.00;FS=2.379;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=-3.095;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1085,0,1197 chrII 288986 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.652;DP=119;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1034,0,1264 chrII 289069 . G C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.430;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1034,0,1443 chrII 289101 . G T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.413;DP=110;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.341;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1084,0,1141 chrII 289328 . A G 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;DP=119;Dels=0.00;FS=13.356;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.546;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,45:119:99:861,0,1618 chrII 289342 . T C 668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;DP=104;Dels=0.00;FS=4.182;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.401;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,37:104:99:698,0,1500 chrII 289364 . A C 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.831;DP=125;Dels=0.00;FS=5.729;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.541;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,48:125:99:773,0,1781 chrII 289391 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.578;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.557;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1117,0,1225 chrII 289601 . C A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.499;DP=134;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.180;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,52:134:99:1021,0,1836 chrII 289642 . A G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.271;DP=159;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1524,0,1884 chrII 289723 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.211;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.608;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1253,0,1427 chrII 289906 . C T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.549;DP=141;Dels=0.00;FS=5.018;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.046;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1363,0,1547 chrII 289966 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.194;DP=139;Dels=0.00;FS=3.027;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.030;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1274,0,1673 chrII 290047 . A G 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.312;DP=147;Dels=0.00;FS=6.037;HaplotypeScore=3.3631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.343;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1476,0,1657 chrII 290619 . C T 4038.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4038,394,0 chrII 292193 . C T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.866;DP=116;Dels=0.00;FS=12.072;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.208;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1352,0,1105 chrII 292201 . G C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.124;DP=118;Dels=0.00;FS=5.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1161,0,1147 chrII 292212 . A T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.726;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=10.80;ReadPosRankSum=-3.046;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1380,0,1233 chrII 292257 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.917;DP=114;Dels=0.00;FS=7.353;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=10.12;ReadPosRankSum=2.018;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1184,0,1235 chrII 292285 . T C 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.799;DP=100;Dels=0.00;FS=1.621;HaplotypeScore=5.7019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.448;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:969,0,1118 chrII 292578 . C T 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.872;DP=137;Dels=0.00;FS=8.043;HaplotypeScore=4.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=10.64;ReadPosRankSum=-2.066;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1487,0,1337 chrII 292600 . A G 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.958;DP=120;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=47.6438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.644;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1042,0,1434 chrII 292618 . T C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.599;DP=135;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=55.5627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.923;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1159,0,1633 chrII 292676 . C T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.607;DP=127;Dels=0.00;FS=5.555;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:988,0,1656 chrII 292748 . C G 1015.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.721;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.288;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1045,0,1307 chrII 292752 . T C 1001.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.291;DP=121;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.723;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1031,0,1395 chrII 292755 . A G 977.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.967;DP=121;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.992;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1007,0,1430 chrII 292835 . C T 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3389,343,0 chrII 292860 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.281;DP=143;Dels=0.00;FS=4.083;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1456,0,1528 chrII 292870 . A G 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.315;DP=158;Dels=0.00;FS=2.048;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1666,0,1712 chrII 292991 . T C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.486;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.742;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,58:99:99:1252,0,826 chrII 293020 . A C 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.571;DP=118;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,69:118:99:1522,0,1040 chrII 293099 . C T 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.219;DP=127;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.407;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,77:127:99:1723,0,968 chrII 293501 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.291;DP=110;Dels=0.00;FS=4.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1244,0,1041 chrII 293504 . G A 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.216;DP=111;Dels=0.00;FS=4.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1300,0,1016 chrII 293630 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.250;DP=145;Dels=0.00;FS=3.932;HaplotypeScore=3.9366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.813;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1495,0,1611 chrII 294026 . A G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.129;DP=129;Dels=0.00;FS=4.197;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.855;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1295,0,1388 chrII 294064 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.034;DP=143;Dels=0.00;FS=4.058;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.449;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1357,0,1551 chrII 294067 . C T 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.126;DP=141;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1591,0,1340 chrII 294216 . G A 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.876;DP=106;Dels=0.00;FS=4.809;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1078,0,1016 chrII 294230 . C T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.494;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1062,0,1018 chrII 294937 . A G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.484;DP=123;Dels=0.00;FS=4.321;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.700;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1338,0,1258 chrII 295631 . G A 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.458;DP=162;Dels=0.00;FS=1.230;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1736,0,1694 chrII 295710 . C G 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2748,285,0 chrII 295870 . C G 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;DP=136;Dels=0.00;FS=4.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=9.01;ReadPosRankSum=2.420;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1256,0,1644 chrII 295912 . T C 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=26.39;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3536,363,0 chrII 295988 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.940;DP=131;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=2.215;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1207,0,1506 chrII 296073 . G C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.725;DP=98;Dels=0.00;FS=8.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.657;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:1043,0,1031 chrII 296198 . C G 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.690;DP=104;Dels=0.00;FS=1.779;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.139;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.079;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,61:104:99:916,0,701 chrII 296774 . A G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.028;DP=92;Dels=0.00;FS=8.562;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.071;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1098,0,913 chrII 297226 . G A 3940.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.937e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3940,388,0 chrII 297266 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.823;DP=161;Dels=0.00;FS=1.231;HaplotypeScore=3.4786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.612;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1612,0,1842 chrII 297515 . G A 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.414;DP=177;Dels=0.00;FS=3.728;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.075;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,81:177:99:1693,0,2124 chrII 298141 . C T 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3199,316,0 chrII 298438 . T A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;DP=106;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=2.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.398;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:106:99:1287,0,913 chrII 298678 . A G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.409;DP=101;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.684;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1140,0,965 chrII 298717 . G A 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.393;DP=83;Dels=0.00;FS=0.962;HaplotypeScore=3.2321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.198;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:862,0,840 chrII 298721 . G A 2255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=25.92;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2288,237,0 chrII 298732 . A G 735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.761;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.286;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:765,0,1060 chrII 298785 . A G 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.209;DP=89;Dels=0.00;FS=4.071;HaplotypeScore=3.4435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.120;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:896,0,904 chrII 298966 . T C 4089.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4089,411,0 chrII 298990 . G A 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3805,388,0 chrII 299034 . A G 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3834,402,0 chrII 299056 . A T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;DP=118;Dels=0.00;FS=2.578;HaplotypeScore=3.4948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.442;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1242,0,1305 chrII 299092 . T C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.571;DP=139;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.263;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1404,0,1471 chrII 299174 . T C 2386 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.394;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2419,258,0 chrII 299182 . T C 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.555;DP=119;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=7.2858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.826;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1006,0,1258 chrII 299196 . T C 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2709,279,0 chrII 299230 . C T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.081;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.842;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1059,0,1289 chrII 299389 . A G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.224;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=1;MQRankSum=-0.135;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.202;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:131:99:1062,0,1734 chrII 299524 . C T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.800;DP=142;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=7.01;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,53:142:99:1025,0,1948 chrII 299581 . T C 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.083;DP=128;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.90;MQ0=0;MQRankSum=7.013;QD=13.20;ReadPosRankSum=-1.874;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,74:128:99:1720,0,182 chrII 299803 . C A 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3770,367,0 chrII 299876 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.018;DP=145;Dels=0.00;FS=7.130;HaplotypeScore=2.7724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=2.588;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.504;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1384,0,1525 chrII 299935 . C G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;DP=147;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=2.156;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1562,0,1531 chrII 300001 . A T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.553;DP=125;Dels=0.00;FS=17.910;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.538;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1356,0,1356 chrII 300017 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;DP=155;Dels=0.00;FS=37.754;HaplotypeScore=14.8513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=7.28;ReadPosRankSum=2.683;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,58:155:99:1158,0,1382 chrII 300111 . G A 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.851;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,55:96:99:1044,0,664 chrII 300849 . C T 292.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;DP=135;Dels=0.00;FS=11.978;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.93;MQ0=65;MQRankSum=1.107;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.724;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,38:135:99:322,0,694 chrII 301002 . T C 254.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.103;DP=109;Dels=0.00;FS=7.161;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.06;MQ0=14;MQRankSum=-3.636;QD=2.33;ReadPosRankSum=1.785;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,36:109:99:284,0,1583 chrII 301044 . C T 1912 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.84;MQ0=15;QD=19.12;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:1945,207,0 chrII 301140 . G A 762.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.29;MQ0=7;MQRankSum=-0.665;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:792,0,1259 chrII 301314 . A T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.304;DP=113;Dels=0.00;FS=4.579;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=2.789;QD=11.25;ReadPosRankSum=2.530;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1301,0,1031 chrII 301324 . C T 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.870;DP=116;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=3.9422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=8.29;ReadPosRankSum=-2.351;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:992,0,1223 chrII 301399 . T C 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=22.68;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3140,330,0 chrII 301406 . T A 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.83;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3043,315,0 chrII 301455 . G A 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3771,378,0 chrII 301505 . A G 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.253;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.174;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1399,0,1524 chrII 301530 . A G 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.471;DP=153;Dels=0.00;FS=3.929;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1726,0,1363 chrII 301549 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.036;DP=169;Dels=0.00;FS=4.615;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.768;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,74:169:99:1452,0,2003 chrII 301569 . T C 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3897,399,0 chrII 301570 . T C 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;DP=154;Dels=0.00;FS=6.016;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1399,0,1766 chrII 301589 . G C 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.152;DP=151;Dels=0.00;FS=2.918;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=2.618;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.599;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1614,0,1476 chrII 301683 . T C 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.953;DP=154;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.124;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1720,0,1470 chrII 301937 . T A 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=131;Dels=0.00;FS=3.538;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=26.46;ReadPosRankSum=0.965;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3466,333,0 chrII 301999 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.634;DP=145;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.034;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1419,0,1542 chrII 302104 . A G 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3028,318,0 chrII 302192 . A G 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.953;DP=129;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=3.3338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.333;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1358,0,1230 chrII 302245 . G C 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3692,387,0 chrII 302254 . T C 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.912;DP=179;Dels=0.00;FS=1.874;HaplotypeScore=5.5843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.799;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,84:179:99:1664,0,1976 chrII 302260 . T A 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3932,397,0 chrII 302285 . T C 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.997e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3885,414,0 chrII 302360 . G A 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.762;DP=161;Dels=0.00;FS=7.313;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=2.579;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.800;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,97:161:99:1929,0,1303 chrII 302473 . T C 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3932,405,0 chrII 302822 . C T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3491,343,0 chrII 302839 . T G 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3650,363,0 chrII 303121 . A G 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.265;DP=135;Dels=0.00;FS=7.756;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.159;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1537,0,1382 chrII 303125 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.157;DP=133;Dels=0.00;FS=9.411;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=9.37;ReadPosRankSum=2.104;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1276,0,1589 chrII 303237 . T C 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.436;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.184;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1549,0,1414 chrII 303295 . T G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.962;DP=133;Dels=0.00;FS=3.171;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.631;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1374,0,1350 chrII 303435 . T C 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.235;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.344;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1126,0,941 chrII 303446 . C T 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.807;DP=84;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=2.994;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,35:84:99:689,0,1018 chrII 303452 . G A 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.108;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.714;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,46:87:99:1004,0,807 chrII 303465 . T C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.246;DP=93;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1043,0,885 chrII 303520 . T G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.585;DP=126;Dels=0.00;FS=4.385;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.084;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1090,0,1389 chrII 303528 . C G 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6812;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3011,300,0 chrII 303540 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.140;DP=132;Dels=0.00;FS=3.362;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.212;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1319,0,1343 chrII 303588 . G A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.041;DP=142;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=1.996;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1391,0,1597 chrII 303826 . A C 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.152;DP=132;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.086;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1379,0,1507 chrII 304001 . T C 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.893;DP=151;Dels=0.00;FS=2.061;HaplotypeScore=2.8334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.367;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1662,0,1539 chrII 304221 . G C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;DP=132;Dels=0.00;FS=2.212;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.504;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1452,0,1294 chrII 304314 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.542;DP=109;Dels=0.00;FS=15.541;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=7.95;ReadPosRankSum=2.554;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,48:109:99:897,0,1334 chrII 304737 . A T 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=133;Dels=0.00;FS=6.591;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=11.66;ReadPosRankSum=-2.233;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1581,0,1402 chrII 306136 . T C 686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.730;DP=125;Dels=0.00;FS=1.925;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:716,0,929 chrII 306242 . T G 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.87;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3142,342,0 chrII 306376 . G A 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.699;DP=89;Dels=0.00;FS=5.653;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:89:99:1049,0,729 chrII 306460 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.329;DP=105;Dels=0.00;FS=6.287;HaplotypeScore=5.9202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=10.47;ReadPosRankSum=-2.650;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1129,0,1096 chrII 306605 . C T 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.786;DP=136;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=4.8700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.846;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,56:136:99:1076,0,1648 chrII 306737 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.344;DP=119;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=2.6939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.887;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1427,0,1137 chrII 306976 . G C 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;DP=169;Dels=0.00;FS=0.571;HaplotypeScore=2.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,93:169:99:1561,0,1603 chrII 306980 . A G 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.293;DP=156;Dels=0.00;FS=2.830;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1663,0,1604 chrII 307360 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.527;DP=105;Dels=0.00;FS=2.555;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.433;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1191,0,1061 chrII 307459 . G A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;DP=121;Dels=0.00;FS=9.970;HaplotypeScore=3.2764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=8.21;ReadPosRankSum=-2.249;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1023,0,1086 chrII 307512 . G A 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=43.5771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.292;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:871,0,752 chrII 307537 . C T 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;DP=83;Dels=0.00;FS=16.492;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.637;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,46:83:99:948,0,765 chrII 307575 . T A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.015;DP=94;Dels=0.00;FS=10.126;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.404;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1126,0,881 chrII 307597 . G A 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.231;DP=99;Dels=0.00;FS=9.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.340;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1046,0,1008 chrII 307613 . C A 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.859;DP=113;Dels=0.00;FS=18.982;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.49;ReadPosRankSum=2.465;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:989,0,1290 chrII 307634 . T C 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.775;DP=106;Dels=0.00;FS=6.576;HaplotypeScore=3.8065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.385;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:106:99:801,0,1223 chrII 307713 . C T 482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.031;DP=91;Dels=0.00;FS=4.750;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.019;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,36:91:99:512,0,903 chrII 307734 . G A 514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.789;DP=86;Dels=0.00;FS=3.355;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,37:86:99:544,0,873 chrII 307808 . C T 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.870;DP=113;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:907,0,1305 chrII 307810 . A G 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.540;DP=111;Dels=0.00;FS=3.616;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:835,0,1323 chrII 307858 . A G 517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.535;DP=83;Dels=0.00;FS=3.314;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.257;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:547,0,1168 chrII 307944 . T C 678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.982;DP=98;Dels=0.00;FS=2.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.432;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,41:98:99:708,0,1261 chrII 307989 . T C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.738;DP=116;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=2.9583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1104,0,1338 chrII 307994 . C A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.822;DP=113;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1129,0,1194 chrII 308006 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.211;DP=113;Dels=0.00;FS=7.224;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1162,0,1090 chrII 308083 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.162;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=1;MQRankSum=-1.278;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1308,0,1349 chrII 308205 . A G 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.258;DP=111;Dels=0.00;FS=3.631;HaplotypeScore=6.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:821,0,1508 chrII 308477 . T C 681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.017;DP=115;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.513;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,45:115:99:711,0,1618 chrII 308593 . T C 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.270;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.034;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1039,0,1293 chrII 308634 . T A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.812;DP=124;Dels=0.00;FS=5.558;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=11.97;ReadPosRankSum=-2.138;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1514,0,1219 chrII 308690 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.039;DP=98;Dels=0.00;FS=12.020;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=13.74;ReadPosRankSum=2.700;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,59:98:99:1377,0,727 chrII 308805 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.664;DP=136;Dels=0.00;FS=5.352;HaplotypeScore=4.3905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.517;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1283,0,1602 chrII 308890 . A G 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3365,342,0 chrII 309001 . G A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.122;DP=113;Dels=0.00;FS=1.633;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.238;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1185,0,1158 chrII 309178 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.185;DP=117;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.704;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1466,0,976 chrII 309264 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.580;DP=134;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1539,0,1290 chrII 309603 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.869;DP=139;Dels=0.00;FS=10.338;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.216;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1445,0,1454 chrII 309822 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.137;DP=158;Dels=0.00;FS=4.872;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=1;MQRankSum=-0.630;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.827;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1619,0,1617 chrII 310030 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.251;DP=118;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.612;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1272,0,1166 chrII 310032 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.877;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1032,0,1409 chrII 310088 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.169;DP=130;Dels=0.00;FS=2.193;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.969;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1318,0,1215 chrII 310113 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.718;DP=137;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=4.3343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1216,0,1560 chrII 310393 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.730;DP=144;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=2.6775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.033;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1351,0,1629 chrII 310571 . G A 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.961;DP=132;Dels=0.00;FS=3.184;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=1;MQRankSum=0.621;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1642,0,1207 chrII 310706 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;DP=136;Dels=0.00;FS=4.085;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.667;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1194,0,1627 chrII 310972 . G C 4174.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4174,435,0 chrII 311038 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.796;DP=151;Dels=0.00;FS=1.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1482,0,1643 chrII 311155 . T C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.659;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1185,0,1660 chrII 311366 . A C 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.115;DP=147;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=4.4880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.165;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1556,0,1480 chrII 311676 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.427;DP=132;Dels=0.00;FS=3.149;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1152,0,1681 chrII 312029 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;DP=107;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=3.6354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1140,0,1044 chrII 312167 . G A 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.020;DP=131;Dels=0.00;FS=2.231;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1463,0,1242 chrII 312596 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.638;DP=142;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:142:99:1325,0,1664 chrII 312686 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.436;DP=127;Dels=0.00;FS=3.213;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1369,0,1255 chrII 312995 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.974;DP=114;Dels=0.00;FS=4.572;HaplotypeScore=4.7980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.983;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1181,0,1212 chrII 313154 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.036;DP=130;Dels=0.00;FS=4.225;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.230;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.039;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1403,0,1187 chrII 313283 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.647;DP=129;Dels=0.00;FS=3.190;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1073,0,1632 chrII 313313 . G A 536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.559;DP=97;Dels=0.00;FS=2.873;HaplotypeScore=6.6453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.166;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,36:97:99:566,0,1338 chrII 313334 . A G 573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.366;DP=94;Dels=0.00;FS=5.395;HaplotypeScore=4.5724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,36:94:99:603,0,1271 chrII 313427 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.816;DP=119;Dels=0.00;FS=5.173;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.919;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1082,0,1421 chrII 313448 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.964;DP=113;Dels=0.00;FS=10.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.630;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1162,0,1206 chrII 313673 . C T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.361;DP=107;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=3.8433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:1408,0,815 chrII 313835 . G A 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.376;DP=97;Dels=0.00;FS=1.640;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1022,0,974 chrII 314087 . T C 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.033;DP=149;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=2.5688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.340;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1559,0,1589 chrII 314198 . A G 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3206,336,0 chrII 314258 . G A 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.500;DP=140;Dels=0.00;FS=3.099;HaplotypeScore=3.7118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1641,0,1238 chrII 314330 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.500;DP=118;Dels=0.00;FS=1.535;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.684;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1286,0,1224 chrII 314492 . G A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.600;DP=110;Dels=0.00;FS=2.052;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.288;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1121,0,1300 chrII 314932 . A G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.348;DP=123;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=6.9594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.100;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1233,0,1253 chrII 315206 . G T 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.822;DP=153;Dels=0.00;FS=3.995;HaplotypeScore=3.2937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1601,0,1568 chrII 315267 . G T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.796;DP=141;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.947;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.334;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1324,0,1572 chrII 315296 . G A 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.346;DP=140;Dels=0.00;FS=2.161;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.424;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1657,0,1420 chrII 315318 . T A 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3285,328,0 chrII 315453 . C T 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.020;DP=138;Dels=0.00;FS=5.360;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.177;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1614,0,1377 chrII 315469 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.439;DP=135;Dels=0.00;FS=5.520;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1356,0,1468 chrII 315559 . A T 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;DP=152;Dels=0.00;FS=2.180;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1731,0,1500 chrII 315655 . T C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;DP=128;Dels=0.00;FS=2.355;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.060;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1350,0,1389 chrII 315835 . C T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.547;DP=135;Dels=0.00;FS=2.346;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1453,0,1317 chrII 315988 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.709;DP=131;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.645;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1465,0,1121 chrII 316012 . A G 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.315;DP=113;Dels=0.00;FS=6.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1496,0,958 chrII 316711 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.887;DP=101;Dels=0.00;FS=4.947;HaplotypeScore=4.3621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.350;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1094,0,952 chrII 316739 . A T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;DP=118;Dels=0.00;FS=12.218;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.210;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1158,0,1299 chrII 316804 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.303;DP=107;Dels=0.00;FS=2.671;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.131;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1168,0,1137 chrII 316890 . T C 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.113;DP=110;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=7.32;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,45:110:99:835,0,1493 chrII 316923 . T C 700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.160;DP=95;Dels=0.00;FS=2.913;HaplotypeScore=2.7765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:730,0,1295 chrII 317339 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.852;DP=109;Dels=0.00;FS=5.098;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.131;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1030,0,1219 chrII 317648 . A G 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.996;DP=110;Dels=0.00;FS=3.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1018,0,1201 chrII 317666 . C T 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.133;DP=118;Dels=0.00;FS=2.454;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.288;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1091,0,1347 chrII 317789 . T C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.963;DP=133;Dels=0.00;FS=3.188;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.902;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1351,0,1502 chrII 317878 . T A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.234;DP=121;Dels=0.00;FS=4.481;HaplotypeScore=4.8635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.811;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:121:99:1175,0,1404 chrII 317942 . T A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.035;DP=114;Dels=0.00;FS=9.797;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.297;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1196,0,1218 chrII 318192 . G C 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.747;DP=113;Dels=0.00;FS=4.759;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1447,0,885 chrII 318225 . T C 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.579;DP=109;Dels=0.01;FS=9.872;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=11.65;ReadPosRankSum=-2.617;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,65:108:99:1300,0,930 chrII 318380 . A G 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.639;DP=126;Dels=0.00;FS=5.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.535;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1512,0,1153 chrII 318590 . C A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.627;DP=100;Dels=0.00;FS=2.629;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:966,0,1087 chrII 318982 . C T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.907;DP=101;Dels=0.00;FS=12.834;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.877;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,62:100:99:1405,0,675 chrII 319000 . C T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.902;DP=98;Dels=0.00;FS=5.324;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,61:98:99:1110,0,786 chrII 319018 . C T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;DP=74;Dels=0.00;FS=4.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.343;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,45:74:99:990,0,600 chrII 319087 . C T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.455;DP=108;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.177;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:108:99:1330,0,863 chrII 319525 . T C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.471;DP=109;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1128,0,1134 chrII 319547 . T C 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.617;DP=87;Dels=0.00;FS=5.500;HaplotypeScore=4.5052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.519;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,49:87:99:1079,0,853 chrII 319717 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.906;DP=117;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.614;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1289,0,1059 chrII 319900 . G A 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.726;DP=105;Dels=0.00;FS=3.595;HaplotypeScore=5.9576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.529;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1125,0,1017 chrII 320188 . T C 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;DP=80;Dels=0.00;FS=0.862;HaplotypeScore=6.4937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.076;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:622,0,1092 chrII 320415 . T A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;DP=123;Dels=0.01;FS=8.490;HaplotypeScore=5.6161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=11.34;ReadPosRankSum=-2.389;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1425,0,1164 chrII 320539 . A G 2412 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2445,276,0 chrII 320583 . G A 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2983,306,0 chrII 320597 . C T 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.509;DP=101;Dels=0.00;FS=8.020;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQ0=0;MQRankSum=-3.188;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1159,0,948 chrII 320632 . C T 2338 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.26;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2371,240,0 chrII 320638 . C G 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.602;DP=115;Dels=0.00;FS=5.862;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.963;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.530;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1019,0,1162 chrII 320644 . T G 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.95;MQ0=0;QD=22.07;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2681,285,0 chrII 320656 . A G 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2706,282,0 chrII 320788 . A T 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2764,279,0 chrII 320830 . T C 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.363;DP=96;Dels=0.00;FS=3.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.141;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:810,0,1220 chrII 320836 . T C 597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.362;DP=92;Dels=0.00;FS=7.315;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:627,0,1209 chrII 320851 . T C 2446 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=26.30;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2479,261,0 chrII 320886 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;DP=90;Dels=0.00;FS=5.454;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.738;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,53:90:99:1145,0,770 chrII 320890 . A G 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.993;DP=90;Dels=0.00;FS=4.052;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:770,0,1101 chrII 320918 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.945;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.971;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1140,0,1274 chrII 320988 . C A 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.669;DP=112;Dels=0.00;FS=1.595;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.245;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:964,0,1409 chrII 321385 . C A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.134;DP=124;Dels=0.00;FS=4.363;HaplotypeScore=3.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.745;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1511,0,1079 chrII 321438 . A G 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.938;DP=125;Dels=0.00;FS=4.450;HaplotypeScore=2.8385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.582;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1410,0,1216 chrII 321553 . G A 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3270,324,0 chrII 321773 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.676;DP=116;Dels=0.00;FS=6.360;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=9.83;ReadPosRankSum=-2.422;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1170,0,1303 chrII 321857 . G C,T 2645.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=44.7382;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.46;MQ0=0;QD=21.86;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,69,52:121:99:2705,1090,904,1615,0,1486 chrII 321867 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.948;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=41.7426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=8.34;ReadPosRankSum=-3.250;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1123,0,1477 chrII 321906 . A G 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3018,318,0 chrII 321960 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.336;DP=120;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,74:120:99:1569,0,867 chrII 322041 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.570;DP=111;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=4.4887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1242,0,1080 chrII 322122 . T C 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.285;DP=94;Dels=0.00;FS=0.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=7.78;ReadPosRankSum=-1.926;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:761,0,1082 chrII 322182 . A T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.793;DP=134;Dels=0.00;FS=7.748;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1288,0,1490 chrII 322479 . T C 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.590;DP=144;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.750;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1563,0,1369 chrII 322610 . G C 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2915,303,0 chrII 322620 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.770;DP=107;Dels=0.00;FS=1.584;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.321;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1166,0,1080 chrII 322797 . A G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.476;DP=142;Dels=0.00;FS=1.339;HaplotypeScore=5.5192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=10.06;ReadPosRankSum=-2.620;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:142:99:1458,0,1457 chrII 322869 . A G 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;DP=138;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=2.288;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.538;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1508,0,1412 chrII 322968 . T C 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.662;DP=120;Dels=0.00;FS=6.047;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,74:120:99:1560,0,904 chrII 323106 . C T 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2872,300,0 chrII 323173 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.455;DP=102;Dels=0.00;FS=4.931;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=2.761;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1160,0,1015 chrII 323184 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.797;DP=115;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.711;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1163,0,1271 chrII 323214 . C G 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.319;DP=126;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=22.66;ReadPosRankSum=0.651;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:2888,285,0 chrII 323577 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.205;DP=118;Dels=0.00;FS=12.930;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1401,0,1075 chrII 324106 . A C 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;DP=137;Dels=0.00;FS=4.062;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.110;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1620,0,1212 chrII 324220 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.447;DP=116;Dels=0.00;FS=2.379;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.457;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1286,0,1126 chrII 324455 . T A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=123;Dels=0.00;FS=3.572;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.043;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1312,0,1335 chrII 324525 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.964;DP=129;Dels=0.00;FS=2.384;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1234,0,1466 chrII 324887 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.210;DP=103;Dels=0.00;FS=0.790;HaplotypeScore=2.6478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.377;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1190,0,924 chrII 324926 . T C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.024;DP=148;Dels=0.00;FS=1.327;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=3.421;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1396,0,1504 chrII 325007 . G A 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.361;DP=151;Dels=0.00;FS=5.049;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.932;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1549,0,1681 chrII 325175 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.796;DP=132;Dels=0.00;FS=3.145;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.981;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1406,0,1291 chrII 325202 . A G 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3485,366,0 chrII 325275 . T A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.543;DP=124;Dels=0.00;FS=10.674;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.888;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1366,0,1302 chrII 325550 . A G 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.753;DP=120;Dels=0.00;FS=7.013;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1317,0,1107 chrII 325595 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.338;DP=152;Dels=0.00;FS=4.826;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.447;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1452,0,1502 chrII 325634 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.037;DP=118;Dels=0.00;FS=4.515;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1310,0,1055 chrII 325701 . T C 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3083,324,0 chrII 326112 . A T 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;DP=94;Dels=0.00;FS=12.126;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.157;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:1023,0,1051 chrII 326136 . G A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.627;DP=97;Dels=0.00;FS=2.745;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.841;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1021,0,1048 chrII 326154 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.028;DP=101;Dels=0.00;FS=5.336;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.214;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1166,0,938 chrII 326179 . A G 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2853,303,0 chrII 326249 . A G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.870;DP=122;Dels=0.00;FS=4.594;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1106,0,1382 chrII 326297 . T C 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.34;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3200,336,0 chrII 326357 . C T 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3256,328,0 chrII 326372 . C T 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3028,315,0 chrII 326394 . A G 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.32;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2912,291,0 chrII 326404 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.986;DP=124;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=2.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQ0=0;MQRankSum=-3.279;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1274,0,1193 chrII 326408 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.360;DP=121;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=2.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.19;MQ0=0;MQRankSum=-3.027;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1206,0,1183 chrII 326572 . T G 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.994;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1646,0,1321 chrII 326660 . C T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.901;DP=130;Dels=0.00;FS=3.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.921;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1437,0,1078 chrII 326680 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.369;DP=111;Dels=0.00;FS=2.879;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.297;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.477;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1155,0,1070 chrII 326693 . C T 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.295;DP=110;Dels=0.00;FS=0.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.84;MQ0=0;MQRankSum=2.706;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1092,0,1114 chrII 326704 . G A 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.351;DP=117;Dels=0.00;FS=1.723;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.979;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1089,0,1206 chrII 326734 . T A 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.990;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.53;MQ0=0;MQRankSum=-3.664;QD=7.49;ReadPosRankSum=-3.131;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:816,0,1117 chrII 326744 . G A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.595;DP=113;Dels=0.00;FS=4.861;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.25;MQ0=0;MQRankSum=-6.590;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.818;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:992,0,1192 chrII 326754 . A G 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;DP=105;Dels=0.00;FS=6.205;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.86;MQ0=0;MQRankSum=-6.240;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.710;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:900,0,1187 chrII 326757 . A T 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;DP=112;Dels=0.00;FS=4.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.428;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:989,0,1307 chrII 326765 . G T 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.576;DP=116;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=50.7306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-4.605;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.136;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1052,0,1335 chrII 326899 . G A 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.12;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3225,333,0 chrII 326919 . A T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.654;DP=117;Dels=0.00;FS=5.819;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.823;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1366,0,1140 chrII 327051 . G A 637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.592;DP=87;Dels=0.00;FS=11.034;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-5.163;QD=7.32;ReadPosRankSum=-2.722;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:667,0,1138 chrII 327078 . G A 498.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.522;DP=85;Dels=0.00;FS=16.417;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.87;MQ0=0;MQRankSum=-5.844;QD=5.86;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:85:99:528,0,1244 chrII 327079 . G A 504.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.493;DP=85;Dels=0.00;FS=14.471;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.87;MQ0=0;MQRankSum=-5.830;QD=5.93;ReadPosRankSum=-1.340;SB=-1.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:85:99:534,0,1233 chrII 327083 . T C 1223.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.133;DP=88;Dels=0.00;FS=13.996;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQ0=0;MQRankSum=5.902;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.858;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,58:88:99:1253,0,503 chrII 327085 . A C 331.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.035;DP=85;Dels=0.00;FS=14.917;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.50;MQ0=0;MQRankSum=-5.690;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,28:85:99:361,0,1353 chrII 327095 . C T 290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;DP=77;Dels=0.00;FS=17.696;HaplotypeScore=19.5535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.89;MQ0=0;MQRankSum=-6.472;QD=3.77;ReadPosRankSum=-1.270;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,24:77:99:320,0,1248 chrII 327098 . C A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.179;DP=77;Dels=0.00;FS=17.723;HaplotypeScore=19.8831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQ0=0;MQRankSum=6.338;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.818;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,54:77:99:1326,0,316 chrII 327112 . C T 211.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.132;DP=69;Dels=0.00;FS=20.427;HaplotypeScore=13.6597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.46;MQ0=0;MQRankSum=-5.730;QD=3.06;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:241,0,1180 chrII 327156 . T A 1411 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;DP=55;Dels=0.00;FS=9.387;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=2.226;QD=25.65;ReadPosRankSum=1.281;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,53:55:99:1444,125,0 chrII 327179 . A G 1925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.15;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1958,198,0 chrII 327214 . T G 140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;DP=90;Dels=0.00;FS=0.944;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.45;MQ0=0;MQRankSum=-5.314;QD=1.56;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:170,0,1631 chrII 327215 . G A 160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.474;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=0;MQRankSum=-4.944;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:190,0,1570 chrII 327228 . T A 420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQ0=0;MQRankSum=-4.093;QD=4.33;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,32:97:99:450,0,1552 chrII 327243 . G A 492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.223;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.124;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,36:99:99:522,0,1457 chrII 327300 . C A 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.172;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:767,0,882 chrII 327325 . T C 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.072;DP=94;Dels=0.00;FS=0.790;HaplotypeScore=2.6775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.588;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:936,0,943 chrII 327327 . C T 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.109;DP=94;Dels=0.00;FS=0.771;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=10.07;ReadPosRankSum=-2.212;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:977,0,978 chrII 327363 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.663;DP=145;Dels=0.00;FS=8.706;HaplotypeScore=13.6701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.064;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:145:99:1471,0,1456 chrII 327403 . C T 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.33;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3348,322,0 chrII 327511 . A T 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.504;DP=149;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.761;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1548,0,1635 chrII 327596 . A G 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2685,276,0 chrII 327608 . C G 584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.186;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,32:98:99:614,0,1475 chrII 327647 . T C 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.943;DP=129;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=5.8802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.570;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1487,0,1242 chrII 327685 . C A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.605;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.372;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1109,0,1275 chrII 327736 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.365;DP=137;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.567;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:137:99:1272,0,1637 chrII 327972 . T C 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2984,309,0 chrII 327989 . T C 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2782,300,0 chrII 328001 . T C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.287;DP=128;Dels=0.00;FS=15.168;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.014;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1351,0,1363 chrII 328068 . C T 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2838,282,0 chrII 328093 . G A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.915;DP=133;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1144,0,1540 chrII 328179 . A G 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=25.39;SB=-2.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4012,396,0 chrII 328278 . A C 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3356,339,0 chrII 328525 . A G 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.10;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3288,360,0 chrII 328531 . G A 3820.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3820,376,0 chrII 328557 . A G 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3698,393,0 chrII 328647 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.519;DP=102;Dels=0.00;FS=2.544;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1112,0,1042 chrII 328908 . A G 602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.372;DP=104;Dels=0.00;FS=10.363;HaplotypeScore=2.7989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.500;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,34:104:99:632,0,1513 chrII 329472 . T C 624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.624;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=6.86;ReadPosRankSum=2.460;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,37:91:99:654,0,1181 chrII 329496 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.175;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.843;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1289,0,1043 chrII 329529 . A T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.432;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.738;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1244,0,839 chrII 329583 . C A 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2925,297,0 chrII 329654 . C T 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3422,343,0 chrII 329730 . T C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.330;DP=121;Dels=0.00;FS=2.483;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=7.38;ReadPosRankSum=-2.732;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:923,0,1592 chrII 329757 . C A 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.504;DP=116;Dels=0.00;FS=2.614;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.920;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,43:116:99:860,0,1585 chrII 329976 . T C 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.880;DP=130;Dels=0.00;FS=14.575;HaplotypeScore=3.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1077,0,1642 chrII 330203 . T A 2298 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.98;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2331,237,0 chrII 330435 . T G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.575;DP=112;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1209,0,1172 chrII 330495 . C A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.189;DP=109;Dels=0.00;FS=5.034;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.967;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.680;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:1015,0,1334 chrII 330647 . C T 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.490;DP=109;Dels=0.00;FS=1.548;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.712;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1283,0,1065 chrII 330690 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.792;DP=114;Dels=0.00;FS=5.755;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1226,0,1135 chrII 331253 . C T 4358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4358,430,0 chrII 331286 . C A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.169;DP=149;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1508,0,1630 chrII 331350 . A G 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3339,342,0 chrII 331446 . T A 3773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3773,379,0 chrII 331485 . T C 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.635;DP=158;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=3.3785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1671,0,1680 chrII 331527 . A G 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.701;DP=151;Dels=0.00;FS=2.879;HaplotypeScore=3.8639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.281;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1533,0,1564 chrII 331557 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.801;DP=122;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=3.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1248,0,1218 chrII 331580 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1210,0,1550 chrII 331783 . G A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;DP=127;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.302;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1428,0,1189 chrII 331804 . A G 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=52.1914;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3355,348,0 chrII 331827 . T A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.193;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1174,0,1551 chrII 331937 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.905;DP=138;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1192,0,1700 chrII 331973 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;DP=140;Dels=0.00;FS=5.080;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.077;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1494,0,1487 chrII 332399 . A G 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.17;MQ0=0;QD=23.17;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3022,321,0 chrII 332412 . T C 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.31;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2840,300,0 chrII 332422 . G T 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.77;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3080,318,0 chrII 332452 . C T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.225;DP=150;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.87;MQ0=1;MQRankSum=-4.889;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.469;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,62:150:99:1080,0,1804 chrII 332471 . G A 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.12;MQ0=1;QD=25.79;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3791,379,0 chrII 332582 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.578;DP=127;Dels=0.00;FS=9.564;HaplotypeScore=3.9230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.835;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1350,0,1293 chrII 332630 . G A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.072;DP=148;Dels=0.00;FS=6.190;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.943;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1394,0,1671 chrII 332654 . T C 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3503,387,0 chrII 332772 . A G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.138;DP=134;Dels=0.00;FS=7.800;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.310;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1350,0,1410 chrII 332940 . C G 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3099,321,0 chrII 332992 . C G 4096.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.745e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4096,429,0 chrII 333015 . A G 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.870;DP=125;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=12.58;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,75:125:99:1603,0,1014 chrII 333043 . C T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.919;DP=137;Dels=0.00;FS=16.006;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.498;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,82:137:99:1593,0,1116 chrII 333044 . C T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.112;DP=135;Dels=0.00;FS=18.466;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.264;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,82:135:99:1599,0,1095 chrII 333194 . G A 2269 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2302,228,0 chrII 333196 . A G 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.898;DP=88;Dels=0.00;FS=1.716;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.970;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:925,0,869 chrII 333214 . A G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.635;DP=100;Dels=0.00;FS=1.585;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=2.030;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.478;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:986,0,1101 chrII 333270 . A T 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3017,306,0 chrII 333321 . G A 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.643;DP=116;Dels=0.00;FS=10.501;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1078,0,1317 chrII 333347 . T A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.383;DP=108;Dels=0.00;FS=2.514;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:807,0,1425 chrII 333382 . T A 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2744,276,0 chrII 334051 . G A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.592;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=8.22;ReadPosRankSum=2.060;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,59:139:99:1172,0,1669 chrII 334070 . T C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;DP=104;Dels=0.00;FS=4.906;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.391;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:956,0,1183 chrII 334452 . G A 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.463;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.884;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:1016,0,1075 chrII 334911 . A C 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.642;DP=119;Dels=0.00;FS=3.661;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=2.518;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1425,0,1030 chrII 334938 . G T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.565;DP=110;Dels=0.00;FS=0.790;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=2.133;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.353;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1390,0,956 chrII 335049 . T A 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;DP=113;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.425;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:113:99:1340,0,1040 chrII 335310 . A G 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3513,363,0 chrII 336060 . C T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.194;DP=143;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.021;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1277,0,1757 chrII 336358 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.237;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.456;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1172,0,1568 chrII 336720 . G A 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.541;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=12.33;ReadPosRankSum=-1.445;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1670,0,1118 chrII 336747 . A G 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.194;DP=149;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.170;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1606,0,1340 chrII 337030 . T C 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.469;DP=162;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=5.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.374;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1575,0,1631 chrII 337074 . G A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;DP=107;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=3.7362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1123,0,1147 chrII 337088 . A C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.835;DP=105;Dels=0.00;FS=4.852;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1037,0,1172 chrII 337181 . A G 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.142;DP=156;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,88:156:99:1839,0,1431 chrII 337320 . C A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.428;DP=109;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.649;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1353,0,922 chrII 337526 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.053;DP=131;Dels=0.00;FS=5.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.500;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1325,0,1493 chrII 337567 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.876;DP=121;Dels=0.00;FS=3.299;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.446;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1351,0,1170 chrII 337611 . T C 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.177;DP=133;Dels=0.00;FS=1.422;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.530;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:133:99:1599,0,1166 chrII 337658 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.465;DP=152;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=2.7499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.951;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,61:152:99:1201,0,1927 chrII 337897 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;DP=84;Dels=0.00;FS=1.982;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,51:84:99:1173,0,670 chrII 338656 . A T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.022;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.029;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1256,0,1461 chrII 338664 . A T 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3283,339,0 chrII 339083 . T G 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2765,294,0 chrII 339200 . C T 2483 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2516,255,0 chrII 339326 . A G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.827;DP=149;Dels=0.00;FS=6.569;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.857;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1461,0,1643 chrII 339413 . C T 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.140;DP=130;Dels=0.00;FS=6.770;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1698,0,1147 chrII 339511 . G A 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2904,303,0 chrII 339542 . G A 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.169;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:114:99:1041,0,1320 chrII 339674 . C T 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.819;DP=153;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.351;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,87:153:99:1880,0,1311 chrII 339739 . T C 4131.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4131,420,0 chrII 339813 . G A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.674;DP=125;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=1.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.304;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1426,0,1207 chrII 339902 . A G 2455 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=25.31;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2488,267,0 chrII 339903 . A G 2454 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=25.04;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2487,270,0 chrII 339905 . C T 1051.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.681;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=10.41;ReadPosRankSum=2.144;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1081,0,998 chrII 339966 . G A 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.640;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1246,0,960 chrII 340242 . T C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.573;DP=125;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=3.4724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.569;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:125:99:1365,0,1191 chrII 340305 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.479;DP=121;Dels=0.00;FS=10.097;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1171,0,1320 chrII 340434 . G A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.992;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.651;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1486,0,1023 chrII 340466 . G A 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.856;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.812;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:782,0,1415 chrII 340644 . G A 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.205;DP=113;Dels=0.00;FS=16.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.568;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1059,0,1245 chrII 340743 . A C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.160;DP=134;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:1104,0,1699 chrII 340757 . G A 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.996;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.144;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,77:123:99:1674,0,911 chrII 340824 . G A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.681;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1126,0,1043 chrII 340842 . A T 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;DP=112;Dels=0.00;FS=2.500;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1115,0,1266 chrII 340843 . G A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.804;DP=117;Dels=0.00;FS=2.446;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.772;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1151,0,1311 chrII 341038 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.483;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,67:116:99:1549,0,1033 chrII 341186 . T C 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3416,357,0 chrII 341216 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.677;DP=133;Dels=0.00;FS=4.161;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.758;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1501,0,1225 chrII 341233 . A G 3828.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3828,429,0 chrII 341309 . A G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.586;DP=122;Dels=0.00;FS=8.427;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=9.84;ReadPosRankSum=-2.144;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1230,0,1257 chrII 341391 . T A 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3097;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=25.49;ReadPosRankSum=1.206;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:126:99:3245,327,0 chrII 341451 . A G 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2941,312,0 chrII 341567 . A C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.536;DP=135;Dels=0.00;FS=7.670;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.452;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1372,0,1351 chrII 341715 . T C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.345;DP=104;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.809;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,62:104:99:1324,0,877 chrII 341837 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.237;DP=120;Dels=0.00;FS=1.751;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1419,0,1046 chrII 341985 . C T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.342;DP=109;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.960;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1014,0,1032 chrII 342004 . A G 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;DP=99;Dels=0.00;FS=5.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.50;MQ0=0;MQRankSum=-4.798;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.445;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:875,0,1018 chrII 342023 . G A 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.929;DP=107;Dels=0.00;FS=0.838;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=-4.987;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.922;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:837,0,1311 chrII 342025 . G C 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.393;DP=107;Dels=0.00;FS=0.829;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=-5.433;QD=7.78;ReadPosRankSum=1.604;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:862,0,1266 chrII 342041 . A G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.032;DP=113;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQ0=0;MQRankSum=-4.113;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.935;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1012,0,1301 chrII 342048 . A C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.341;DP=117;Dels=0.00;FS=1.667;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.545;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.869;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1033,0,1446 chrII 342308 . G A 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.578;DP=112;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=2.6238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.307;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:1007,0,1335 chrII 342383 . G T 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.017;DP=80;Dels=0.00;FS=1.895;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.332;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:876,0,809 chrII 342510 . T C 738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.389;DP=95;Dels=0.00;FS=1.711;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:768,0,1036 chrII 342642 . G A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.845;DP=126;Dels=0.00;FS=2.391;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=2.322;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.672;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1267,0,1440 chrII 342650 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.023;DP=124;Dels=0.00;FS=2.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1406,0,1191 chrII 342723 . C T 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=25.59;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2771,260,0 chrII 342862 . T G 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.477;DP=88;Dels=0.00;FS=3.987;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.076;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,49:88:99:1027,0,818 chrII 343086 . A T 479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;DP=83;Dels=0.00;FS=3.211;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:509,0,1162 chrII 343142 . A G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;DP=86;Dels=0.00;FS=5.432;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=10.17;ReadPosRankSum=2.190;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:905,0,865 chrII 343406 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.930;DP=98;Dels=0.00;FS=1.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.945;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1096,0,886 chrII 343713 . A G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.167;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1262,0,1519 chrII 343730 . C T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.167;DP=128;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1489,0,1284 chrII 343838 . G A 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.200;DP=109;Dels=0.00;FS=3.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.874;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:948,0,1395 chrII 343845 . C T 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2958,303,0 chrII 343970 . T C 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.268;DP=121;Dels=0.00;FS=12.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.525;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:121:99:917,0,1601 chrII 344093 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.049;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=1;MQRankSum=-0.714;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1249,0,1170 chrII 344211 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.782;DP=130;Dels=0.00;FS=3.181;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1424,0,1224 chrII 344225 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.205;DP=121;Dels=0.00;FS=2.409;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.195;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1295,0,1186 chrII 344282 . C T 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.879;DP=118;Dels=0.00;FS=7.188;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.519;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1434,0,1102 chrII 344668 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.605;DP=128;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.637;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1508,0,1054 chrII 344938 . C T 2718 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2751,273,0 chrII 344946 . T C 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.679;DP=103;Dels=0.00;FS=1.609;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:823,0,1287 chrII 345050 . C T 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.167;DP=124;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.026;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,49:124:99:1023,0,1637 chrII 345172 . C T 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3485,346,0 chrII 345288 . A G 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3713,381,0 chrII 345609 . C A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.414;DP=137;Dels=0.00;FS=1.361;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.130;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1474,0,1408 chrII 345769 . A G 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.970;DP=110;Dels=0.00;FS=7.462;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.474;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:859,0,1399 chrII 345781 . C T 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3336,334,0 chrII 345849 . C A 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.969;DP=133;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.569;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1430,0,1375 chrII 345853 . A C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;DP=135;Dels=0.00;FS=4.271;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=9.76;ReadPosRankSum=2.242;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1347,0,1491 chrII 345955 . C A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.108;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=2.444;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1565,0,1326 chrII 346082 . A C 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.831;DP=122;Dels=0.00;FS=5.799;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.371;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1145,0,1417 chrII 346270 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.617;DP=143;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1168,0,1719 chrII 346363 . A G 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.042;DP=146;Dels=0.00;FS=5.010;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.780;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1656,0,1421 chrII 346437 . C T 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5582;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2707,282,0 chrII 346636 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.777;DP=135;Dels=0.00;FS=9.332;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.751;QD=11.10;ReadPosRankSum=2.013;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1529,0,1258 chrII 346663 . A G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.147;DP=158;Dels=0.00;FS=2.024;HaplotypeScore=3.9444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.406;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,82:158:99:1593,0,1598 chrII 346741 . G A 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.318;DP=150;Dels=0.00;FS=2.127;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=10.61;ReadPosRankSum=2.142;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1621,0,1570 chrII 347227 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.396;DP=125;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.457;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1125,0,1386 chrII 347231 . G A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.651;DP=130;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.331;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1209,0,1399 chrII 347317 . C T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.501;DP=124;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.478;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1130,0,1269 chrII 347455 . C A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.468;DP=117;Dels=0.00;FS=3.541;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1517,0,933 chrII 347559 . A T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.901;DP=102;Dels=0.00;FS=5.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1153,0,1053 chrII 347560 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.390;DP=107;Dels=0.00;FS=2.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1163,0,1074 chrII 347587 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.605;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1122,0,1020 chrII 347777 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.773;DP=98;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=4.9570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.208;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:990,0,1075 chrII 347803 . T A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=111;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.630;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1200,0,1092 chrII 347856 . T G 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.155;DP=97;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1009,0,978 chrII 347935 . T C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.018;DP=116;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.398;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1395,0,1049 chrII 348625 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.506;DP=106;Dels=0.00;FS=5.978;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1086,0,1073 chrII 348820 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.543;DP=105;Dels=0.00;FS=13.142;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.840;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:105:99:1200,0,1018 chrII 349371 . T A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.524;DP=106;Dels=0.00;FS=7.523;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.834;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1171,0,1164 chrII 349415 . A T 4335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=28.15;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4335,433,0 chrII 349446 . A C 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.386;DP=152;Dels=0.00;FS=3.260;HaplotypeScore=75.0803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.279;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.312;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1687,0,1520 chrII 349467 . G A 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;DP=144;Dels=0.00;FS=4.525;HaplotypeScore=2.4889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.623;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1596,0,1399 chrII 349482 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.490;DP=141;Dels=0.00;FS=2.188;HaplotypeScore=3.7819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1496,0,1344 chrII 349506 . A G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.688;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1028,0,1049 chrII 349712 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.588;DP=119;Dels=0.00;FS=1.463;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.051;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1218,0,1295 chrII 349989 . C T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;DP=102;Dels=0.00;FS=1.600;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1111,0,992 chrII 350030 . G A 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.353;DP=94;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.839;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:887,0,1020 chrII 350081 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.895;DP=106;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.864;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1060,0,1131 chrII 350135 . C T 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.578;DP=126;Dels=0.00;FS=22.034;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.931;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.265;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1017,0,1453 chrII 350166 . A G 739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.292;DP=109;Dels=0.00;FS=10.992;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.89;MQ0=0;MQRankSum=-5.961;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.316;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:769,0,1414 chrII 350168 . A G 764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.714;DP=108;Dels=0.00;FS=12.861;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQ0=0;MQRankSum=-6.263;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.069;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:794,0,1413 chrII 350178 . C T 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.990;DP=110;Dels=0.00;FS=16.780;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-6.935;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:806,0,1347 chrII 350197 . G A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.139;DP=107;Dels=0.00;FS=18.454;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=-6.755;QD=7.66;ReadPosRankSum=-2.234;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,44:107:99:850,0,1207 chrII 350219 . A G 384.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;DP=103;Dels=0.00;FS=1.862;HaplotypeScore=37.5832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=-7.290;QD=3.73;ReadPosRankSum=3.113;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,33:103:99:414,0,1499 chrII 350220 . T A 367.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;DP=114;Dels=0.00;FS=4.203;HaplotypeScore=37.5832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQ0=0;MQRankSum=-7.355;QD=3.22;ReadPosRankSum=3.509;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,34:114:99:397,0,1817 chrII 350225 . T G 501.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.754;DP=133;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=37.5832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.37;MQ0=0;MQRankSum=-8.135;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.857;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:531,0,1744 chrII 350246 . C T 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.749;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQ0=0;MQRankSum=-7.180;QD=6.16;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:782,0,1347 chrII 350323 . C G 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.156;DP=104;Dels=0.00;FS=2.631;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=9.68;ReadPosRankSum=-2.532;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1037,0,1071 chrII 350376 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.928;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=56.9433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.343;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1094,0,1170 chrII 350491 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.549;DP=102;Dels=0.00;FS=3.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,61:102:99:1349,0,789 chrII 350563 . G A 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.994;DP=95;Dels=0.00;FS=10.253;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:819,0,1147 chrII 350580 . G A 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.937;DP=99;Dels=0.00;FS=9.907;HaplotypeScore=2.6694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.343;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:873,0,1229 chrII 350657 . G A 626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.187;DP=70;Dels=0.00;FS=0.915;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:656,0,738 chrII 350675 . C T 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.744;DP=80;Dels=0.00;FS=0.846;HaplotypeScore=8.5819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.821;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:80:99:751,0,888 chrII 350683 . T C 607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.467;DP=77;Dels=0.00;FS=3.064;HaplotypeScore=3.8025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.487;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,36:77:99:637,0,930 chrII 350686 . A C 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.794;DP=78;Dels=0.00;FS=2.993;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.704;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:704,0,884 chrII 350727 . T C 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.993;DP=85;Dels=0.00;FS=3.166;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.392;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,51:85:99:1120,0,683 chrII 350764 . A T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.351;DP=112;Dels=0.00;FS=2.451;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.461;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1413,0,1001 chrII 350792 . A G 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.505;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.727;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,52:85:99:1127,0,645 chrII 350797 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.566;DP=87;Dels=0.00;FS=0.855;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,52:87:99:1135,0,678 chrII 350931 . C A 1109.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.274;DP=120;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.365;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1139,0,1288 chrII 350936 . T A 776.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.515;DP=119;Dels=0.00;FS=3.402;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=6.52;ReadPosRankSum=2.709;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:806,0,1530 chrII 350937 . T G 755.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.190;DP=108;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=6.99;ReadPosRankSum=2.408;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:785,0,1406 chrII 350939 . G A 759.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.068;DP=105;Dels=0.00;FS=3.829;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=7.23;ReadPosRankSum=2.924;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:789,0,1318 chrII 351436 . G A 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.591;DP=89;Dels=0.00;FS=1.761;HaplotypeScore=3.7107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:795,0,1105 chrII 351623 . A G 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.598;DP=104;Dels=0.00;FS=2.579;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1147,0,1092 chrII 351893 . T G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;DP=101;Dels=0.00;FS=7.817;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.24;MQ0=0;MQRankSum=3.631;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.538;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1078,0,1106 chrII 351999 . G A 448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.065;DP=83;Dels=0.00;FS=5.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.021;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:478,0,928 chrII 352513 . C A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.690;DP=114;Dels=0.00;FS=16.209;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.300;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1266,0,1200 chrII 352655 . C T 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.293;DP=103;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.149;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:971,0,1233 chrII 353774 . G T 595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.998;DP=75;Dels=0.00;FS=4.491;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:625,0,947 chrII 353810 . A G 628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.674;DP=80;Dels=0.00;FS=4.341;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.378;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:658,0,992 chrII 353932 . A G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.492;DP=97;Dels=0.00;FS=5.188;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.061;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1023,0,958 chrII 354093 . A T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1309,0,1300 chrII 354332 . T A 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.019;DP=132;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.104;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1665,0,1130 chrII 354452 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.370;DP=102;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.449;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1082,0,989 chrII 354704 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.800;DP=133;Dels=0.00;FS=8.171;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:908,0,1712 chrII 355034 . C T 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;DP=91;Dels=0.00;FS=5.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.570;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,35:91:99:704,0,1235 chrII 355151 . T C 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=100;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=4.8895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:821,0,1334 chrII 355349 . C T 4149.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3696;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4149,424,0 chrII 355406 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.619;DP=135;Dels=0.00;FS=1.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1611,0,1275 chrII 355622 . C T 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.937;DP=107;Dels=0.00;FS=3.618;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=2.055;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.368;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:929,0,1313 chrII 355626 . G A 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2749,282,0 chrII 355748 . T G 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.509;DP=124;Dels=0.00;FS=1.469;HaplotypeScore=6.1234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.182;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1008,0,1462 chrII 355836 . A G 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=22.77;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3392,366,0 chrII 355918 . G C 1823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.099;DP=163;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.405;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:163:99:1853,0,1450 chrII 356462 . C G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;DP=118;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1169,0,1294 chrII 356546 . C T 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.618;DP=145;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.193;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1806,0,1347 chrII 356648 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.271;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1253,0,1593 chrII 356897 . C T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.666;DP=153;Dels=0.00;FS=2.941;HaplotypeScore=3.6036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1609,0,1645 chrII 356920 . T C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.659;DP=151;Dels=0.00;FS=4.903;HaplotypeScore=8.5305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.508;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1243,0,1903 chrII 357199 . A G 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3893,405,0 chrII 357454 . C T 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.341;DP=158;Dels=0.00;FS=2.028;HaplotypeScore=7.6864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=8.76;ReadPosRankSum=-2.392;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,70:158:99:1414,0,1898 chrII 357536 . G T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.758;DP=127;Dels=0.00;FS=3.330;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.761;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1326,0,1443 chrII 357752 . G C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;DP=133;Dels=0.00;FS=6.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.403;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:1131,0,1667 chrII 358049 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.284;DP=107;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=2.6565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1171,0,1111 chrII 358277 . G A 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.558;DP=149;Dels=0.00;FS=29.914;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.686;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1642,0,1466 chrII 359006 . G A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.273;DP=121;Dels=0.00;FS=1.462;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.531;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,72:121:99:1542,0,962 chrII 359116 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.843;DP=115;Dels=0.00;FS=2.389;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.810;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1242,0,1247 chrII 359197 . A G 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.711;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.334;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1438,0,1600 chrII 359471 . A G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.374;DP=165;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=6.3112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=1.505;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.670;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1593,0,1754 chrII 359576 . C T 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.459;DP=171;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=4.4198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.240;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,77:171:99:1687,0,1981 chrII 359654 . G A 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.996;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.221;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:895,0,1121 chrII 359662 . A G 2372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9312;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=22.59;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2405,258,0 chrII 359957 . C T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.569;DP=152;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=6.7420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.049;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1419,0,1743 chrII 359978 . C T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.998;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.764;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:116:99:1119,0,1286 chrII 360477 . A C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.027;DP=113;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=3.3511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:998,0,1237 chrII 360862 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.182;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=6.92;ReadPosRankSum=-2.081;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,61:156:99:1109,0,2143 chrII 361468 . T C 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.205;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.712;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:1002,0,1530 chrII 361480 . A G 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.460;DP=144;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.612;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1541,0,1375 chrII 361648 . G T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.299;DP=135;Dels=0.00;FS=2.167;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.530;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1350,0,1475 chrII 361669 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.207;DP=120;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1273,0,1177 chrII 362055 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.820;DP=120;Dels=0.00;FS=5.735;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1399,0,1062 chrII 362081 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.982;DP=124;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:971,0,1571 chrII 362082 . C T 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.911;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.037;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1610,0,1051 chrII 362354 . C T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.440;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1184,0,1135 chrII 362377 . C T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.930;DP=99;Dels=0.00;FS=1.625;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1059,0,1018 chrII 362638 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.899;DP=123;Dels=0.00;FS=3.253;HaplotypeScore=3.6854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.063;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1373,0,1192 chrII 362688 . T G 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.021;DP=142;Dels=0.00;FS=2.089;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.104;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1376,0,1508 chrII 362702 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.516;DP=144;Dels=0.00;FS=2.966;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.042;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.281;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:144:99:1384,0,1549 chrII 362748 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.535;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1032,0,1492 chrII 362789 . T G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.527;DP=131;Dels=0.00;FS=2.237;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=8.11;ReadPosRankSum=-2.213;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1092,0,1656 chrII 362800 . G C 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3353,333,0 chrII 362833 . C T 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.576;DP=133;Dels=0.00;FS=4.123;HaplotypeScore=2.6297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.002;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1308,0,1421 chrII 362997 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.392;DP=117;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1137,0,1221 chrII 363144 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.055;DP=113;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=1;MQRankSum=-1.450;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1492,0,954 chrII 363224 . C T 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.364;DP=124;Dels=0.00;FS=2.361;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.742;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,76:124:99:1686,0,932 chrII 363228 . T C 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.424;DP=126;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.600;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,78:126:99:1681,0,973 chrII 363277 . C G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.531;DP=104;Dels=0.00;FS=3.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.594;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,64:104:99:1416,0,773 chrII 363362 . A G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.769;DP=118;Dels=0.00;FS=1.626;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.000;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1077,0,1297 chrII 363386 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.333;DP=136;Dels=0.00;FS=14.800;HaplotypeScore=5.3199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1135,0,1583 chrII 363408 . A G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.470;DP=128;Dels=0.00;FS=15.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1089,0,1618 chrII 363414 . A G 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.730;DP=119;Dels=0.00;FS=19.074;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1009,0,1520 chrII 363574 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.435;DP=115;Dels=0.00;FS=7.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1191,0,1272 chrII 363616 . T C 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.669;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.095;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1016,0,1643 chrII 363700 . T G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.488;DP=132;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1057,0,1628 chrII 363721 . C T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.417;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,48:109:99:988,0,1276 chrII 363749 . A C 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;DP=119;Dels=0.00;FS=3.499;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.408;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.372;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:940,0,1487 chrII 363765 . T A 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.064;DP=109;Dels=0.00;FS=6.305;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.034;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,48:109:99:953,0,1340 chrII 364073 . C T 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2539,258,0 chrII 364161 . T C 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3310,336,0 chrII 364175 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.253;DP=127;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=9.71;ReadPosRankSum=3.263;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1263,0,1312 chrII 364205 . C T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.453;DP=137;Dels=0.00;FS=7.636;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.348;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1321,0,1578 chrII 364214 . T C 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.620;DP=136;Dels=0.00;FS=6.288;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1538,0,1368 chrII 364373 . C T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.211;DP=139;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.342;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:139:99:1642,0,1256 chrII 364408 . A G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3113,327,0 chrII 364419 . C T 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3120,321,0 chrII 364469 . A G 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.842;DP=108;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=3.5875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1083,0,1163 chrII 364642 . A G 2374 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2407,264,0 chrII 364725 . G A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.463;DP=114;Dels=0.00;FS=1.571;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.649;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,70:114:99:1587,0,835 chrII 364895 . C T 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.011;DP=77;Dels=0.00;FS=7.920;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:879,0,653 chrII 365120 . A C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.036;DP=119;Dels=0.00;FS=3.415;HaplotypeScore=3.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1170,0,1316 chrII 365126 . C T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.803;DP=128;Dels=0.00;FS=11.128;HaplotypeScore=2.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1435,0,1317 chrII 365306 . G A 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2954,297,0 chrII 365326 . A G 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3216,339,0 chrII 365525 . C T 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3171,319,0 chrII 365666 . C T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.206;DP=137;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.369;QD=11.67;ReadPosRankSum=-2.239;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1629,0,1356 chrII 365830 . G A 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3659,349,0 chrII 366120 . C T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.194;DP=123;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.529;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:1540,0,1094 chrII 366264 . C T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.090;DP=115;Dels=0.00;FS=5.766;HaplotypeScore=2.9600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1174,0,1157 chrII 366323 . T A 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0023;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3816,379,0 chrII 366409 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.714;DP=124;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=1;MQRankSum=0.640;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1284,0,1339 chrII 366754 . C T 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.754;DP=108;Dels=0.00;FS=6.275;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1120,0,1110 chrII 366921 . C T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.926;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=7.46;ReadPosRankSum=-2.051;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,45:116:99:895,0,1539 chrII 366946 . G C 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;DP=107;Dels=0.00;FS=3.735;HaplotypeScore=3.8016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.295;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,39:107:99:729,0,1485 chrII 367200 . C T 668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;DP=67;Dels=0.00;FS=3.715;HaplotypeScore=4.8878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.959;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:698,0,757 chrII 367429 . T C 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7759;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3584,357,0 chrII 367444 . G C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.745;DP=128;Dels=0.00;FS=4.316;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.834;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.357;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1137,0,1420 chrII 367502 . T C 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3352,339,0 chrII 367503 . T C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3279,330,0 chrII 367531 . C T 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2816,282,0 chrII 367587 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.623;DP=134;Dels=0.00;FS=4.455;HaplotypeScore=4.7089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.476;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:134:99:1218,0,1468 chrII 367601 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.793;DP=108;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.661;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1073,0,1109 chrII 367614 . T G 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.516;DP=104;Dels=0.00;FS=1.588;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.237;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:992,0,1165 chrII 367774 . A T 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2863,280,0 chrII 367802 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.268;DP=116;Dels=0.00;FS=8.939;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.815;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1002,0,1448 chrII 367884 . A G 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.427;DP=118;Dels=0.00;FS=10.150;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1096,0,1420 chrII 367900 . C A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.665;DP=123;Dels=0.00;FS=9.954;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1361,0,1180 chrII 367965 . A G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.987;DP=110;Dels=0.00;FS=4.682;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.612;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.142;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1211,0,1027 chrII 368051 . G A 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.460;DP=130;Dels=0.00;FS=5.422;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1237,0,1423 chrII 368084 . G T 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.199;DP=117;Dels=0.00;FS=5.745;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.530;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1177,0,1289 chrII 368093 . C T 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3107,312,0 chrII 368247 . T C 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.417;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.222;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:968,0,1234 chrII 368496 . C T 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.036;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:940,0,1353 chrII 368536 . T C 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.071;DP=103;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:103:99:845,0,1296 chrII 368563 . A G 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.545;DP=92;Dels=0.00;FS=4.015;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.539;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:775,0,972 chrII 368565 . G A 2215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2248,231,0 chrII 368583 . T C 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.693;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.995;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:815,0,1071 chrII 368630 . T G 2440 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=25.42;ReadPosRankSum=0.974;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2473,238,0 chrII 368716 . C T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.206;DP=95;Dels=0.00;FS=2.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.372;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,52:95:99:1156,0,888 chrII 368722 . A G 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.380;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.562;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:948,0,1005 chrII 369040 . C T 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.701;DP=89;Dels=0.00;FS=8.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.103;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:838,0,1044 chrII 369044 . G A 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.693;DP=88;Dels=0.00;FS=8.454;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:826,0,1005 chrII 369085 . T C 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.039;DP=89;Dels=0.00;FS=8.185;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:854,0,1079 chrII 369657 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.641;DP=146;Dels=0.00;FS=3.098;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.407;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1602,0,1505 chrII 369692 . C T 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.296;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1697,0,1515 chrII 369831 . G C 403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;DP=93;Dels=0.00;FS=1.892;HaplotypeScore=3.7432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.76;MQ0=1;MQRankSum=-0.513;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:433,0,531 chrII 369847 . A C 655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.089;DP=81;Dels=0.00;FS=1.821;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:685,0,714 chrII 370007 . T G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.898;DP=151;Dels=0.00;FS=3.810;HaplotypeScore=4.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1561,0,1653 chrII 370707 . T C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.463;DP=138;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1280,0,1552 chrII 370780 . T G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.909;DP=126;Dels=0.00;FS=3.337;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1212,0,1458 chrII 370967 . C T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.198;DP=145;Dels=0.00;FS=5.084;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1390,0,1698 chrII 371029 . A G 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.649;DP=128;Dels=0.00;FS=6.863;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.488;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1031,0,1612 chrII 371139 . T G 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.541;DP=145;Dels=0.00;FS=2.146;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.777;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,60:145:99:1004,0,1847 chrII 371146 . C T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.363;DP=168;Dels=0.00;FS=2.709;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.235;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,77:168:99:1538,0,1857 chrII 371555 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.912;DP=130;Dels=0.00;FS=2.230;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=3.657;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1413,0,1267 chrII 371707 . C G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.634;DP=136;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1248,0,1451 chrII 371746 . A C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.620;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1205,0,1452 chrII 371941 . C T 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.811;DP=84;Dels=0.00;FS=4.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.828;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:807,0,904 chrII 372481 . A G 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.771;DP=143;Dels=0.00;FS=5.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=1.922;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.568;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1600,0,1468 chrII 372547 . A G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.280;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=2.677;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1316,0,1438 chrII 372730 . G A 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.836;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1572,0,1343 chrII 372845 . G A 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.188;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.037;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,89:175:99:1845,0,1640 chrII 372954 . C T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.570;DP=112;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.816;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1187,0,1250 chrII 372958 . T C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.606;DP=111;Dels=0.00;FS=7.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.859;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1084,0,1283 chrII 373440 . C A 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.918;DP=113;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:983,0,1254 chrII 373487 . C G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.656;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.913;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:134:99:1262,0,1190 chrII 373488 . A C 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.404;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1315,0,1273 chrII 373603 . T C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.478;DP=145;Dels=0.00;FS=8.856;HaplotypeScore=3.4559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=7.09;ReadPosRankSum=-2.940;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,59:145:99:1058,0,1911 chrII 373731 . G A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.758;DP=152;Dels=0.00;FS=11.608;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=9.34;ReadPosRankSum=2.206;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:1450,0,1651 chrII 373782 . A G 4303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4303,438,0 chrII 374149 . G C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.024;DP=159;Dels=0.00;FS=2.891;HaplotypeScore=3.8382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,71:159:99:1381,0,1930 chrII 375157 . T C 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.803;DP=134;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.244;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1585,0,1298 chrII 375303 . T C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.688;DP=129;Dels=0.00;FS=3.763;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1346,0,1403 chrII 375370 . T A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;DP=116;Dels=0.00;FS=12.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.714;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1166,0,1314 chrII 375505 . C T 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;DP=130;Dels=0.00;FS=3.382;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.522;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,76:130:99:1698,0,1053 chrII 375801 . T C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.224;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1078,0,1663 chrII 375942 . T C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.099;DP=105;Dels=0.00;FS=4.890;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.894;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1127,0,1090 chrII 375972 . G A 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2953,286,0 chrII 376093 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.352;DP=112;Dels=0.00;FS=7.421;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.103;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1413,0,893 chrII 376186 . C T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.883;DP=144;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1567,0,1463 chrII 376298 . T C 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.061;DP=140;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.411;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1516,0,1471 chrII 376375 . G A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.639;DP=123;Dels=0.00;FS=6.968;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.813;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1123,0,1431 chrII 376428 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.650;DP=133;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=4.8020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.847;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1384,0,1453 chrII 376441 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.819;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1290,0,1234 chrII 376523 . A G 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.708;DP=104;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=8.87;ReadPosRankSum=2.036;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:952,0,1142 chrII 376667 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.521;DP=121;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.531;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1022,0,1571 chrII 376703 . C T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.091;DP=148;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1505,0,1600 chrII 376898 . C T 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.825;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.513;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:908,0,1219 chrII 376916 . G T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.379;DP=120;Dels=0.00;FS=3.329;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1143,0,1357 chrII 376970 . T A 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;DP=134;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1293,0,1570 chrII 377588 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.307;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1002,0,1372 chrII 377622 . T C 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.868;DP=131;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=3.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:131:99:1083,0,1634 chrII 377657 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.394;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.424;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.674;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1167,0,1570 chrII 377735 . C T 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.668;DP=100;Dels=0.00;FS=3.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.259;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:951,0,1065 chrII 377765 . T G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;DP=108;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.878;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1172,0,979 chrII 377771 . A G 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.430;DP=107;Dels=0.00;FS=3.557;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.818;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.215;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1096,0,1077 chrII 377776 . T C 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.212;DP=105;Dels=0.00;FS=1.568;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.602;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1091,0,1018 chrII 377807 . G T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.088;DP=138;Dels=0.00;FS=3.186;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.75;MQ0=0;MQRankSum=-3.889;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.302;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1382,0,1523 chrII 377820 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.570;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.834;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.390;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1263,0,1602 chrII 377867 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.082;DP=142;Dels=0.00;FS=2.142;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.357;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1338,0,1569 chrII 378164 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.119;DP=157;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=5.7666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.254;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,71:157:99:1423,0,1854 chrII 378523 . G A 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.030;DP=144;Dels=0.00;FS=6.730;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.987;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1787,0,1363 chrII 378868 . C G 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.876;DP=127;Dels=0.00;FS=3.408;HaplotypeScore=1.8218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:1010,0,1491 chrII 379311 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.367;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1440,0,1310 chrII 379421 . A G 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.425;DP=162;Dels=0.00;FS=9.263;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.911;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,76:162:99:1517,0,1860 chrII 379464 . A G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.319;DP=147;Dels=0.00;FS=3.926;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.997;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1532,0,1619 chrII 379470 . G A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.176;DP=137;Dels=0.00;FS=4.050;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.902;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1470,0,1399 chrII 379598 . T C 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.912;DP=138;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.408;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1581,0,1424 chrII 379969 . C T 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.349;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=1;MQRankSum=0.037;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1657,0,1535 chrII 380911 . T C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.633;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.355;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1468,0,1500 chrII 380932 . C T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.449;DP=145;Dels=0.00;FS=2.106;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.771;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1454,0,1548 chrII 380971 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.424;DP=140;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1324,0,1495 chrII 381431 . A T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.979;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.328;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,72:161:99:1412,0,1855 chrII 381433 . C G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;DP=163;Dels=0.00;FS=0.582;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.252;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,73:163:99:1305,0,1887 chrII 381522 . T C 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.834;DP=141;Dels=0.00;FS=13.549;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.816;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.247;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,48:141:99:868,0,2033 chrII 382146 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;DP=129;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=3.3861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1187,0,1453 chrII 382450 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.534;DP=133;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1400,0,1411 chrII 382571 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.447;DP=124;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=4.1140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=1;MQRankSum=1.049;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.775;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1067,0,1555 chrII 382581 . G A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.568;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=0.067;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.932;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1031,0,1508 chrII 382644 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;DP=142;Dels=0.00;FS=5.245;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.809;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1358,0,1552 chrII 382778 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.136;DP=138;Dels=0.00;FS=1.499;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:138:99:1114,0,1853 chrII 382823 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.953;DP=103;Dels=0.00;FS=14.691;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.000;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:1069,0,1184 chrII 382880 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.686;DP=140;Dels=0.00;FS=1.343;HaplotypeScore=8.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1468,0,1549 chrII 382911 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.067;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1415,0,1373 chrII 383124 . A T 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.622;DP=108;Dels=0.00;FS=0.820;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.465;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:992,0,1165 chrII 383351 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.649;DP=134;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.505;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1439,0,1338 chrII 383390 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;DP=136;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.921;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1261,0,1538 chrII 383768 . C T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.495;DP=137;Dels=0.00;FS=12.451;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.180;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1252,0,1575 chrII 383866 . C T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.969;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.184;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1479,0,1660 chrII 384458 . C T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.895;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.475;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1368,0,957 chrII 384578 . G A 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.454;DP=108;Dels=0.00;FS=2.764;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=0.685;QD=8.44;ReadPosRankSum=2.700;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:941,0,1280 chrII 384692 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.285;DP=128;Dels=0.00;FS=5.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.761;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1460,0,1010 chrII 384884 . C T 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.247;DP=66;Dels=0.00;FS=5.826;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=11.62;ReadPosRankSum=2.183;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:797,0,660 chrII 385265 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.977;DP=123;Dels=0.00;FS=4.339;HaplotypeScore=3.0703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.985;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1182,0,1267 chrII 385445 . T C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.876;DP=108;Dels=0.00;FS=4.867;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:941,0,1330 chrII 385559 . G A 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.764;DP=142;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1782,0,1160 chrII 385759 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.802;DP=150;Dels=0.00;FS=2.924;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1499,0,1642 chrII 385766 . A T 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.928;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.723;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,74:157:99:1496,0,1801 chrII 385829 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.729;DP=139;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.592;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1349,0,1511 chrII 385925 . A C 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.710;DP=152;Dels=0.00;FS=8.530;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1602,0,1561 chrII 386474 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.881;DP=108;Dels=0.00;FS=4.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.873;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1374,0,932 chrII 386919 . G A 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.222;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.022;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:145:99:1701,0,1366 chrII 386954 . A T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1354,0,1157 chrII 386957 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.724;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1366,0,1205 chrII 387022 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.511;DP=145;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.475;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1522,0,1452 chrII 387453 . T C 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.710;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.984;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.687;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:945,0,978 chrII 387602 . A T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.923;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1174,0,1047 chrII 387923 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.985;DP=111;Dels=0.00;FS=6.144;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1034,0,1303 chrII 387935 . G A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;DP=122;Dels=0.00;FS=5.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=3.183;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1104,0,1444 chrII 387954 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.321;DP=132;Dels=0.00;FS=6.589;HaplotypeScore=5.7976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.023;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:1020,0,1659 chrII 388325 . C G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.259;DP=144;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.301;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:144:99:1226,0,1707 chrII 388901 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.503;DP=115;Dels=0.00;FS=2.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1182,0,1283 chrII 389007 . G T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.646;DP=111;Dels=0.00;FS=11.830;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.844;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1352,0,1013 chrII 389242 . T C 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.665;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.012;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,45:72:99:935,0,547 chrII 389243 . T C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.904;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,44:71:99:931,0,546 chrII 389341 . G A 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.954;DP=122;Dels=0.00;FS=4.525;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.936;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1430,0,1106 chrII 389411 . A C 679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;DP=96;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=3.2416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.92;MQ0=0;MQRankSum=-4.118;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,37:96:99:709,0,1294 chrII 389492 . T C 640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.027;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.300;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:670,0,1032 chrII 389557 . G A 641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.003;DP=91;Dels=0.00;FS=5.586;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.20;MQ0=0;MQRankSum=-6.179;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.171;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,35:91:99:671,0,1160 chrII 389570 . C T 500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.339;DP=86;Dels=0.00;FS=1.829;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.241;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,32:86:99:530,0,1184 chrII 389571 . C T 505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.320;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.61;MQ0=0;MQRankSum=-6.245;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.331;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,35:89:99:535,0,1180 chrII 389585 . C T 648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.987;DP=89;Dels=0.00;FS=2.839;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.87;MQ0=0;MQRankSum=-4.815;QD=7.28;ReadPosRankSum=-2.891;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:678,0,1085 chrII 389614 . A G 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.782;DP=106;Dels=0.00;FS=2.582;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.32;MQ0=0;MQRankSum=-3.417;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,43:106:99:728,0,1442 chrII 389620 . G A 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.446;DP=112;Dels=0.00;FS=3.564;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.919;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:816,0,1447 chrII 389683 . G A 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.699;DP=107;Dels=0.00;FS=2.748;HaplotypeScore=5.9253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=8.41;ReadPosRankSum=2.597;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:930,0,1327 chrII 389687 . T C 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.400;DP=101;Dels=0.00;FS=2.789;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=7.88;ReadPosRankSum=2.291;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:826,0,1295 chrII 389867 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.536;DP=138;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1374,0,1522 chrII 389875 . T C 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.943;DP=144;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=2.6618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1279,0,1729 chrII 389912 . G A 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.614;DP=169;Dels=0.00;FS=2.046;HaplotypeScore=3.8402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.064;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,82:169:99:1753,0,1675 chrII 389935 . C A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.373;DP=145;Dels=0.00;FS=3.074;HaplotypeScore=3.5357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.989;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:145:99:1509,0,1548 chrII 390214 . T C 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.137;DP=162;Dels=0.00;FS=13.951;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1865,0,1534 chrII 390252 . C T 1980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.071;DP=174;Dels=0.00;FS=4.409;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.319;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,92:174:99:2010,0,1676 chrII 390461 . A T 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.892;DP=138;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1606,0,1400 chrII 390676 . C T 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.819;DP=148;Dels=0.00;FS=2.217;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=1.153;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,84:148:99:1880,0,1139 chrII 390823 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.384;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.717;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,59:99:99:1265,0,772 chrII 390895 . A T 1998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.114;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.254;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,90:149:99:2028,0,1234 chrII 391457 . C T 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.157;DP=120;Dels=0.00;FS=2.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,41:120:99:788,0,1746 chrII 391835 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.846;DP=134;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1495,0,1377 chrII 391895 . C T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.866;DP=134;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1387,0,1340 chrII 392090 . G A 1827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.727;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.499;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,87:179:99:1857,0,1896 chrII 392135 . G A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.736;DP=150;Dels=0.00;FS=1.687;HaplotypeScore=6.5052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.667;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1503,0,1625 chrII 392182 . T A 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.539;DP=101;Dels=0.00;FS=13.605;HaplotypeScore=2.6917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.063;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:960,0,1122 chrII 392785 . T G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.238;DP=122;Dels=0.00;FS=5.633;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.209;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1221,0,1282 chrII 393191 . A T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;DP=140;Dels=0.00;FS=4.492;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.815;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1417,0,1607 chrII 393269 . T C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.636;DP=120;Dels=0.01;FS=2.375;HaplotypeScore=4.8875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1155,0,1301 chrII 393489 . C T 1863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.705;DP=169;Dels=0.00;FS=5.516;HaplotypeScore=5.4278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,87:169:99:1893,0,1699 chrII 393507 . G A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.145;DP=151;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.859;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1717,0,1485 chrII 393519 . A T 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;DP=160;Dels=0.00;FS=2.818;HaplotypeScore=3.5636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.232;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1675,0,1676 chrII 393698 . C T 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.590;DP=138;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:138:99:1531,0,1271 chrII 393708 . T C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.609;DP=127;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.259;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1482,0,1233 chrII 393947 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.503;DP=128;Dels=0.00;FS=4.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1270,0,1473 chrII 394376 . G A 4078.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.83;SB=-2.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4078,421,0 chrII 394415 . C A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.011;DP=147;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=6.1251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.496;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:147:99:1474,0,1499 chrII 394430 . C T 3927.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5819;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.67;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3927,391,0 chrII 394461 . T A 1808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.039;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,86:153:99:1838,0,1372 chrII 394726 . G C 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2966,315,0 chrII 394873 . G A 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.572;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=9.54;ReadPosRankSum=2.026;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:936,0,1048 chrII 395030 . A G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.115;DP=102;Dels=0.00;FS=2.888;HaplotypeScore=6.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.309;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1140,0,796 chrII 395115 . C T 1660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.14;MQ0=0;QD=24.41;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1693,180,0 chrII 395218 . G A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.420;DP=79;Dels=0.00;FS=3.053;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:807,0,864 chrII 395228 . T C 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.634;DP=88;Dels=0.00;FS=2.959;HaplotypeScore=4.8105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:863,0,1035 chrII 395258 . C A 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.962;DP=110;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1124,0,1250 chrII 395280 . A T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.525;DP=103;Dels=0.00;FS=3.770;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.268;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1194,0,1058 chrII 395349 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.273;DP=115;Dels=0.00;FS=9.418;HaplotypeScore=2.6287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1352,0,994 chrII 395756 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.892;DP=119;Dels=0.00;FS=2.393;HaplotypeScore=4.6949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1234,0,1294 chrII 396556 . T C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.940;DP=150;Dels=0.00;FS=7.368;HaplotypeScore=4.4719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.070;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1296,0,1736 chrII 396588 . G T 1860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.397;DP=153;Dels=0.00;FS=2.853;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=12.16;ReadPosRankSum=2.264;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1890,0,1334 chrII 396761 . T C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.255;DP=124;Dels=0.00;FS=3.268;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.010;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1244,0,1311 chrII 396779 . G A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.751;DP=118;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1441,0,1080 chrII 396793 . T C 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.080;DP=113;Dels=0.00;FS=1.537;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.113;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:886,0,1485 chrII 396967 . A G 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4179,441,0 chrII 396972 . C T 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;DP=160;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=3.7567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=9.84;ReadPosRankSum=2.285;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,80:160:99:1605,0,1640 chrII 397114 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.815;DP=127;Dels=0.00;FS=6.699;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.839;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1265,0,1338 chrII 397162 . T C 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.024;DP=132;Dels=0.00;FS=4.231;HaplotypeScore=4.8048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1505,0,1226 chrII 397435 . A G 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.151;DP=146;Dels=0.00;FS=2.073;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1687,0,1389 chrII 397534 . G T 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.003;DP=145;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.359;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1441,0,1692 chrII 397579 . C T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.933;DP=165;Dels=0.00;FS=4.596;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=1;MQRankSum=0.554;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:1652,0,1749 chrII 397645 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.382;DP=152;Dels=0.00;FS=8.254;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1321,0,1760 chrII 397782 . A T 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.957;DP=145;Dels=0.00;FS=6.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=10.56;ReadPosRankSum=2.122;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1561,0,1606 chrII 397813 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.449;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.513;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,64:113:99:1441,0,1044 chrII 397849 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;DP=107;Dels=0.00;FS=2.614;HaplotypeScore=2.7815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.663;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.690;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1260,0,1020 chrII 397984 . A G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.976;DP=118;Dels=0.00;FS=4.523;HaplotypeScore=2.9453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1380,0,1111 chrII 398292 . G A 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2888,303,0 chrII 398314 . G A 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.925;DP=107;Dels=0.00;FS=14.854;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1293,0,1053 chrII 398319 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.806;DP=108;Dels=0.00;FS=16.999;HaplotypeScore=4.8904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.570;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:108:99:1035,0,1208 chrII 398848 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.436;DP=135;Dels=0.00;FS=2.169;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.495;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1332,0,1438 chrII 399535 . C T 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2994,306,0 chrII 399687 . T C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.136;DP=124;Dels=0.00;FS=3.940;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.491;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1116,0,1410 chrII 399739 . T C 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.824;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=11.32;ReadPosRankSum=-2.099;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,87:154:99:1774,0,1370 chrII 399796 . G A 4126.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2506;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.79;SB=-2.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4126,427,0 chrII 399952 . A G 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.204;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:148:99:1398,0,1708 chrII 399991 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;DP=139;Dels=0.00;FS=5.130;HaplotypeScore=3.3989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1496,0,1381 chrII 400386 . A G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;DP=116;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:1016,0,1513 chrII 400426 . G A 1878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.723;DP=148;Dels=0.00;FS=7.450;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,89:148:99:1908,0,1163 chrII 400486 . A G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.156;DP=148;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1314,0,1795 chrII 400504 . C G 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.633;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.274;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1591,0,1175 chrII 400827 . T C 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=24.94;ReadPosRankSum=1.374;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2926,296,0 chrII 400907 . C T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.776;DP=108;Dels=0.00;FS=2.558;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1303,0,1014 chrII 401143 . A G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.448;DP=145;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=3.2039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.639;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1434,0,1574 chrII 401413 . G A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.780;DP=133;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.808;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1416,0,1406 chrII 401588 . T G 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.663;DP=156;Dels=0.00;FS=5.126;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1772,0,1549 chrII 401604 . C G 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3718,381,0 chrII 401612 . T C 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3593,363,0 chrII 401823 . A G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;DP=121;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=6.6271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=9.63;ReadPosRankSum=2.014;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1195,0,1306 chrII 401901 . G A 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.154;DP=106;Dels=0.00;FS=9.753;HaplotypeScore=2.7374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=8.46;ReadPosRankSum=2.336;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:927,0,1332 chrII 401915 . A G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.983;DP=105;Dels=0.00;FS=4.966;HaplotypeScore=4.7524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1160,0,1030 chrII 402150 . T C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.958;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1178,0,1454 chrII 402249 . T C 736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.458;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:766,0,1503 chrII 403146 . C T 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.509;DP=123;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.771;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1074,0,1436 chrII 403244 . C T 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.262;DP=101;Dels=0.00;FS=6.354;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:976,0,1158 chrII 403281 . T C 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.995;DP=109;Dels=0.00;FS=7.878;HaplotypeScore=3.5690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1279,0,977 chrII 403324 . T C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.710;DP=111;Dels=0.00;FS=12.491;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1265,0,1002 chrII 403354 . T C 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.054;DP=137;Dels=0.00;FS=7.775;HaplotypeScore=5.6647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.210;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.315;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1133,0,1760 chrII 403369 . T C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.323;DP=129;Dels=0.00;FS=5.351;HaplotypeScore=3.2144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.959;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1067,0,1511 chrII 403621 . C G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3265,345,0 chrII 403763 . T C 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;DP=125;Dels=0.00;FS=5.430;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1188,0,1433 chrII 403944 . C T 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3544,369,0 chrII 404004 . T A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;DP=129;Dels=0.00;FS=13.096;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1431,0,1339 chrII 404067 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.796;DP=119;Dels=0.00;FS=4.731;HaplotypeScore=5.7395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.447;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:119:99:1231,0,1269 chrII 404090 . A G 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.411;DP=117;Dels=0.00;FS=11.356;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.008;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1406,0,1135 chrII 404101 . C T 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3039,309,0 chrII 404406 . G A 726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.518;DP=90;Dels=0.00;FS=2.902;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.827;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:756,0,1019 chrII 404468 . G C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.158;DP=106;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.736;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1116,0,1059 chrII 404586 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.270;DP=142;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=2.3569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=1.255;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.085;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1377,0,1576 chrII 404589 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.642;DP=150;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=2.9352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=0.321;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1392,0,1545 chrII 404662 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.437;DP=125;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.015;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1426,0,1188 chrII 405275 . G A 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.562;DP=110;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.639;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1208,0,1061 chrII 405577 . T A 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.097;DP=110;Dels=0.00;FS=7.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.096;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:110:99:939,0,1418 chrII 405578 . A C 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.958;DP=110;Dels=0.00;FS=7.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.609;QD=7.90;ReadPosRankSum=-1.242;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:110:99:899,0,1453 chrII 405615 . C A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.643;DP=88;Dels=0.00;FS=4.300;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=3.197;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.978;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,57:88:99:1222,0,609 chrII 405625 . G A 380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.496;DP=86;Dels=0.00;FS=0.913;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.102;QD=4.42;ReadPosRankSum=2.517;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:86:99:410,0,1416 chrII 405666 . C A 63.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.050;DP=82;Dels=0.00;FS=6.881;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.313;QD=0.77;ReadPosRankSum=-2.079;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,12:82:93:93,0,1515 chrII 405695 . A C 338.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;DP=94;Dels=0.00;FS=17.893;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQ0=0;MQRankSum=-7.169;QD=3.60;ReadPosRankSum=-4.491;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:94:99:368,0,1589 chrII 405713 . T C 339.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;DP=112;Dels=0.00;FS=39.474;HaplotypeScore=2.6040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQ0=0;MQRankSum=-8.078;QD=3.03;ReadPosRankSum=-2.999;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,30:112:99:369,0,1896 chrII 405716 . A T 357.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.038;DP=111;Dels=0.00;FS=39.144;HaplotypeScore=2.6040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQ0=0;MQRankSum=-7.779;QD=3.22;ReadPosRankSum=-3.569;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:387,0,1860 chrII 405749 . A G 282.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.239;DP=100;Dels=0.00;FS=50.320;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQ0=0;MQRankSum=-4.655;QD=2.82;ReadPosRankSum=-2.170;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,37:100:99:312,0,1467 chrII 405752 . T C 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.435;DP=106;Dels=0.00;FS=48.846;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.76;MQ0=0;MQRankSum=4.416;QD=13.76;ReadPosRankSum=2.378;SB=-7.399e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,67:106:99:1489,0,465 chrII 405787 . A C 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.074;DP=105;Dels=0.00;FS=21.471;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.06;MQ0=0;MQRankSum=3.863;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,65:105:99:1453,0,728 chrII 405790 . A C 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.427;DP=106;Dels=0.00;FS=15.958;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.095;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.333;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:696,0,1573 chrII 405803 . G A 722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.005;DP=119;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.075;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.745;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,43:119:99:752,0,1734 chrII 405845 . T A 735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.990;DP=107;Dels=0.00;FS=5.298;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.562;QD=6.87;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,38:107:99:765,0,1631 chrII 406051 . C T 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.62;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3654,372,0 chrII 406057 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.877;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1189,0,1663 chrII 406089 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.663;DP=137;Dels=0.00;FS=4.986;HaplotypeScore=2.4696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=2.378;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1565,0,1302 chrII 406111 . G C 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.256;DP=151;Dels=0.00;FS=5.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=10.72;ReadPosRankSum=2.176;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1649,0,1511 chrII 406115 . C T 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.565;DP=143;Dels=0.00;FS=3.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=11.25;ReadPosRankSum=2.241;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1639,0,1389 chrII 406182 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.260;DP=125;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1535,0,1100 chrII 406266 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.096;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,57:142:99:1200,0,1741 chrII 406281 . A C 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.387;DP=133;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=2.234;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,79:133:99:1572,0,1186 chrII 406300 . A T 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;DP=124;Dels=0.00;FS=2.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=12.30;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,78:124:99:1555,0,988 chrII 406615 . T G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.785;DP=124;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=2.7932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:124:99:1086,0,1431 chrII 406787 . T G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2974,330,0 chrII 407113 . T G 4166.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.65;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4166,429,0 chrII 407115 . A T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.065;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.955;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,64:165:99:1233,0,2233 chrII 407146 . A G 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2917,300,0 chrII 407353 . A C 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.958;DP=124;Dels=0.00;FS=8.906;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=2.990;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.710;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,75:124:99:1615,0,1059 chrII 407450 . T C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.786;DP=117;Dels=0.00;FS=2.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.869;QD=9.31;ReadPosRankSum=2.005;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1119,0,1283 chrII 407559 . T C 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.136;DP=130;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.49;MQ0=0;MQRankSum=-9.697;QD=7.32;ReadPosRankSum=-1.306;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:982,0,1610 chrII 407570 . C T 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.314;DP=158;Dels=0.00;FS=5.794;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.97;MQ0=0;MQRankSum=-9.208;QD=7.05;ReadPosRankSum=-2.124;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:158:99:1144,0,1761 chrII 407571 . A G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.382;DP=156;Dels=0.00;FS=4.821;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.10;MQ0=0;MQRankSum=-9.092;QD=6.61;ReadPosRankSum=-2.217;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1061,0,1771 chrII 407645 . G A 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.248;DP=123;Dels=0.00;FS=9.747;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.434;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.671;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1051,0,1396 chrII 407754 . C T 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.884;DP=132;Dels=0.00;FS=8.509;HaplotypeScore=5.7158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=12.44;ReadPosRankSum=2.387;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,80:132:99:1672,0,970 chrII 407778 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.580;DP=110;Dels=0.00;FS=2.476;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.181;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1313,0,1004 chrII 407830 . G A 785.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.542;DP=105;Dels=0.00;FS=2.561;HaplotypeScore=3.6723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.463;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:815,0,1256 chrII 407831 . A T 789.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.500;DP=105;Dels=0.00;FS=2.561;HaplotypeScore=2.7254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=7.51;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:819,0,1387 chrII 407836 . A G 710.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.499;DP=101;Dels=0.00;FS=8.025;HaplotypeScore=3.3275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.675;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.700;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:740,0,1280 chrII 408073 . G A 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.327;DP=166;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=2.7145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.060;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,85:166:99:1834,0,1668 chrII 408107 . A G 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.195;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=9.60;ReadPosRankSum=-3.259;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,83:166:99:1624,0,1749 chrII 408294 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.394;DP=134;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=2.624;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1353,0,1399 chrII 408433 . A G 1823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.687;DP=164;Dels=0.00;FS=3.690;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1853,0,1687 chrII 408643 . C T 1092.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.131;DP=121;Dels=0.00;FS=2.294;HaplotypeScore=6.9542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:121:99:1122,0,1321 chrII 408644 . T G 1005.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.697;DP=122;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=6.9542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=-3.361;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1035,0,1354 chrII 408652 . G C 2718 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2751,285,0 chrII 408801 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.649;DP=142;Dels=0.00;FS=2.681;HaplotypeScore=2.6421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1414,0,1442 chrII 408987 . C T 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.430;DP=94;Dels=0.00;FS=2.883;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.346;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.042;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:829,0,1073 chrII 409101 . C T 700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.075;DP=94;Dels=0.00;FS=2.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.170;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,37:94:99:730,0,1224 chrII 409116 . A C 565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;DP=86;Dels=0.00;FS=0.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,32:86:99:595,0,1234 chrII 409149 . A G 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.206;DP=91;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.862;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:758,0,1158 chrII 409264 . G A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.327;DP=109;Dels=0.00;FS=5.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=10.38;ReadPosRankSum=4.235;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1161,0,1057 chrII 409364 . A G 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2744,294,0 chrII 409999 . T C 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.611;DP=101;Dels=0.00;FS=10.184;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.345;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:861,0,1196 chrII 410209 . G T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.188;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1477,0,1559 chrII 410546 . T C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.210;DP=119;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=3.8109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1157,0,1327 chrII 410850 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.147;DP=145;Dels=0.00;FS=17.355;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.075;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,57:145:99:1149,0,1931 chrII 410961 . G A 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.883;DP=114;Dels=0.00;FS=1.701;HaplotypeScore=19.5084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1003,0,817 chrII 410985 . A G 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.83;MQ0=0;QD=19.48;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2526,276,0 chrII 410998 . C T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.803;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.453;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1212,0,1200 chrII 411003 . C T 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=21.38;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3154,319,0 chrII 411152 . T A 3882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3882,397,0 chrII 411167 . T C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.806;DP=131;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1500,0,1171 chrII 411224 . C A 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.836;DP=131;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.913;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1547,0,956 chrII 411233 . T C 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.055;DP=133;Dels=0.00;FS=2.231;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=10.64;ReadPosRankSum=2.511;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1445,0,1184 chrII 412233 . A C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.494;DP=117;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=2.7706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1282,0,1018 chrII 412403 . T C 1876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.052;DP=151;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,90:151:99:1906,0,1158 chrII 412642 . A G 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3510,354,0 chrII 413099 . A G 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.998;DP=154;Dels=0.00;FS=2.859;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.152;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,67:154:99:1340,0,1922 chrII 413111 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.976;DP=151;Dels=0.00;FS=7.233;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.507;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:1323,0,1782 chrII 413117 . T A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.030;DP=158;Dels=0.00;FS=5.799;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.224;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:1408,0,1870 chrII 413148 . A T 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.195;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1464,0,1647 chrII 413264 . C A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.378;DP=135;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=3.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.871;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1427,0,1383 chrII 413270 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.476;DP=119;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=5.8424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.200;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1242,0,1213 chrII 413321 . C A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.655;DP=114;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=3.5789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=10.66;ReadPosRankSum=-2.145;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:114:99:1245,0,1067 chrII 413777 . A G 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.712;DP=142;Dels=0.00;FS=4.793;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,85:142:99:1755,0,1166 chrII 414161 . T G 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.466;DP=143;Dels=0.00;FS=4.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=-0.745;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.353;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1451,0,1590 chrII 414544 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.441;DP=151;Dels=0.00;FS=1.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1512,0,1594 chrII 414756 . G A 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.980;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1050,0,1351 chrII 414849 . C T 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.290;DP=147;Dels=0.00;FS=6.160;HaplotypeScore=4.7602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:147:99:1601,0,1470 chrII 414987 . C G 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;DP=104;Dels=0.00;FS=6.382;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.300;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:975,0,1165 chrII 415314 . T A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.771;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=2.276;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:1317,0,1735 chrII 415534 . G A 694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.030;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=7.15;ReadPosRankSum=2.236;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,36:97:99:724,0,1265 chrII 415547 . T C 2360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2393,267,0 chrII 415575 . G A 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;DP=101;Dels=0.00;FS=2.874;HaplotypeScore=4.9648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.527;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:775,0,1327 chrII 415599 . C A 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.111;DP=106;Dels=0.00;FS=0.932;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:779,0,1320 chrII 415607 . T C 584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.172;DP=82;Dels=0.00;FS=1.024;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.602;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.883;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:614,0,1041 chrII 415620 . C A 660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.984;DP=80;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:690,0,950 chrII 415649 . T G 710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.451;DP=94;Dels=0.00;FS=5.452;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.793;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,41:94:99:740,0,1192 chrII 415722 . A T 126.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.959;DP=67;Dels=0.00;FS=67.150;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.37;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=1.88;ReadPosRankSum=-6.245;SB=2.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:49,18:67:18:159,18,0 chrII 415782 . C T 355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;DP=105;Dels=0.02;FS=242.992;HaplotypeScore=9.1553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=3.38;ReadPosRankSum=-4.524;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:385,0,600 chrII 415846 . C T 2250 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.98;MQ0=0;QD=26.16;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2283,237,0 chrII 415863 . G C 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;DP=93;Dels=0.00;FS=5.459;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.700;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:784,0,1193 chrII 415869 . A C 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.05;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3468,381,0 chrII 415997 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.109;DP=161;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.740;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,67:161:99:1322,0,2050 chrII 416243 . T C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.424;DP=122;Dels=0.00;FS=6.920;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1073,0,1407 chrII 416328 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.612;DP=101;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1142,0,979 chrII 416376 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.089;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.0807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.181;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1261,0,1347 chrII 416426 . A C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.996;DP=140;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.674;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1244,0,1631 chrII 416559 . A C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.698;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1282,0,1157 chrII 416935 . C A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.976;DP=97;Dels=0.00;FS=5.180;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.089;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,56:97:99:1230,0,785 chrII 416990 . G A 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.499;DP=113;Dels=0.00;FS=1.773;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=-1.672;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.804;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:917,0,1334 chrII 417205 . T G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.048;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=50.2496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.671;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1064,0,1330 chrII 417239 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.887;DP=91;Dels=0.00;FS=7.294;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.060;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:977,0,971 chrII 417346 . G A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.132;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.040;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1320,0,1199 chrII 417468 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.131;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.329;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,62:144:99:1246,0,1855 chrII 417503 . A G 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.545;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.252;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,54:147:99:994,0,2021 chrII 417588 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.931;DP=126;Dels=0.00;FS=1.666;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=11.66;ReadPosRankSum=2.304;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1499,0,1155 chrII 417692 . T C 1352.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.780;DP=111;Dels=0.00;FS=3.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=12.18;ReadPosRankSum=2.313;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:111:99:1382,0,982 chrII 417694 . T C 1341.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.935;DP=113;Dels=0.00;FS=3.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=11.87;ReadPosRankSum=2.065;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1371,0,985 chrII 417699 . G A 1298.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.837;DP=114;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=11.39;ReadPosRankSum=2.295;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1328,0,982 chrII 417729 . C G 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;DP=94;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.592;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:857,0,1127 chrII 417736 . A C 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.881;DP=103;Dels=0.00;FS=0.858;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.722;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:897,0,1199 chrII 417744 . C T 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.009;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=9.97;ReadPosRankSum=2.537;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1047,0,1131 chrII 417762 . A C 695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.580;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,38:92:99:725,0,1244 chrII 417795 . A G 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.523;DP=114;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.611;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:911,0,1504 chrII 417797 . T C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.715;DP=114;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.697;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:964,0,1536 chrII 417889 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.510;DP=124;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.033;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.065;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1199,0,1437 chrII 417917 . G C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.849;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.21;MQ0=0;MQRankSum=-6.831;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.814;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:990,0,1329 chrII 417944 . T A 986.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;DP=115;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=2.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.19;MQ0=0;MQRankSum=-8.291;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1016,0,1398 chrII 417950 . C T 1012.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.697;DP=111;Dels=0.00;FS=1.535;HaplotypeScore=2.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.40;MQ0=0;MQRankSum=-8.578;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.352;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:111:99:1042,0,1264 chrII 417952 . T G 972.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.81;MQ0=0;MQRankSum=-8.698;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1002,0,1368 chrII 417959 . C T 1000.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.416;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.94;MQ0=0;MQRankSum=-8.773;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1030,0,1317 chrII 417968 . T C 947.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.850;DP=121;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQ0=0;MQRankSum=-9.054;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:977,0,1527 chrII 417969 . T A 1004.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.798;DP=121;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQ0=0;MQRankSum=-9.252;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.738;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1034,0,1523 chrII 417980 . T C 644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.693;DP=125;Dels=0.00;FS=16.551;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.42;MQ0=0;MQRankSum=-9.308;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.157;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:674,0,1544 chrII 418007 . G A 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.594;DP=110;Dels=0.00;FS=7.515;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.706;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:696,0,1170 chrII 418023 . C T 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.015;DP=101;Dels=0.00;FS=6.025;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.63;MQ0=0;MQRankSum=-5.961;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.248;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:669,0,1056 chrII 418042 . G C 480.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;DP=100;Dels=0.00;FS=10.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.54;MQ0=0;MQRankSum=-5.406;QD=4.80;ReadPosRankSum=2.149;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:510,0,1160 chrII 418045 . T C 505.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.446;DP=106;Dels=0.00;FS=8.081;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.05;MQ0=0;MQRankSum=-4.414;QD=4.76;ReadPosRankSum=2.104;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:535,0,1281 chrII 418050 . T A 1242.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.837;DP=114;Dels=0.00;FS=2.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.42;MQ0=0;MQRankSum=5.389;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1272,0,740 chrII 418065 . G A 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.653;DP=114;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-3.400;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:745,0,1233 chrII 418148 . A C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.712;DP=112;Dels=0.00;FS=1.635;HaplotypeScore=5.8852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.479;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1108,0,1197 chrII 418150 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.364;DP=109;Dels=0.00;FS=1.733;HaplotypeScore=4.8919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.14;MQ0=0;MQRankSum=-4.083;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:109:99:1181,0,1080 chrII 418169 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.609;DP=135;Dels=0.00;FS=3.308;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.72;MQ0=0;MQRankSum=4.452;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.215;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1376,0,1538 chrII 418183 . A T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;DP=120;Dels=0.00;FS=12.077;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.85;MQ0=1;MQRankSum=-3.516;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:120:99:1345,0,1223 chrII 418255 . G A 1741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.711;DP=131;Dels=0.00;FS=6.970;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.95;MQ0=1;MQRankSum=-3.020;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.278;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,78:131:99:1771,0,960 chrII 418348 . T C 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.193;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.012;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.979;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1087,0,1227 chrII 418383 . C A 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.24;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2904,294,0 chrII 418399 . A T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.269;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.73;MQ0=0;MQRankSum=-5.389;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.176;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1101,0,1413 chrII 418404 . T G 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.51;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2690,279,0 chrII 418420 . C T 2275 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2308,237,0 chrII 418450 . A G 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.06;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2559,279,0 chrII 418451 . C T 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.355;DP=110;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.056;QD=8.20;ReadPosRankSum=2.416;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:932,0,1256 chrII 418484 . T C 3409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3409,363,0 chrII 418505 . T A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3263,334,0 chrII 418524 . G A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.243;DP=128;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=9.48;ReadPosRankSum=2.256;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1244,0,1467 chrII 418557 . A G 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3206,336,0 chrII 418629 . T A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.283;DP=118;Dels=0.00;FS=3.472;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1196,0,1210 chrII 418649 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.150;DP=113;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.409;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1106,0,1200 chrII 419086 . G A 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.775;DP=127;Dels=0.00;FS=2.421;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.440;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1490,0,1133 chrII 419139 . C T 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.18;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3131,324,0 chrII 419197 . A G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.545;DP=117;Dels=0.00;FS=4.476;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.341;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1258,0,1250 chrII 419204 . G A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;DP=132;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1403,0,1378 chrII 419913 . C G 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3482,363,0 chrII 419931 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.050;DP=141;Dels=0.00;FS=2.421;HaplotypeScore=7.3609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1430,0,1435 chrII 419943 . C A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.125;DP=130;Dels=0.00;FS=2.392;HaplotypeScore=3.3786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.567;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1196,0,1518 chrII 420047 . A G 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.520;DP=153;Dels=0.00;FS=7.324;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.762;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,88:153:99:1620,0,1331 chrII 420057 . G C 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;DP=142;Dels=0.00;FS=6.143;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.715;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1722,0,1280 chrII 420134 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.189;DP=137;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=2.580;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1265,0,1670 chrII 420351 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.901;DP=126;Dels=0.00;FS=5.118;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1280,0,1125 chrII 420379 . G C 260.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;DP=135;Dels=0.00;FS=43.418;HaplotypeScore=135.7559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQ0=0;MQRankSum=2.772;QD=1.93;ReadPosRankSum=-4.283;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,20:135:99:290,0,752 chrII 420402 . A G 380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;DP=116;Dels=0.00;FS=4.208;HaplotypeScore=10.4813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQ0=0;MQRankSum=-5.066;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.576;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:410,0,1331 chrII 420411 . C T 572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.517;DP=124;Dels=0.00;FS=0.828;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=0;MQRankSum=-4.703;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:602,0,1381 chrII 420483 . T C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.429;DP=109;Dels=0.00;FS=2.462;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=3.073;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.344;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1155,0,1009 chrII 420516 . G A 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.252;DP=109;Dels=0.00;FS=7.958;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=2.912;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.227;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1076,0,1046 chrII 420567 . G T 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2872,285,0 chrII 420692 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.886;DP=120;Dels=0.00;FS=12.022;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1242,0,1229 chrII 420720 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.335;DP=118;Dels=0.00;FS=5.703;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.917;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1309,0,1152 chrII 420748 . G C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.532;DP=113;Dels=0.00;FS=4.758;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1105,0,1274 chrII 420843 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.057;DP=118;Dels=0.00;FS=9.973;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.056;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1346,0,1042 chrII 421082 . A G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.913;DP=134;Dels=0.00;FS=3.773;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1445,0,1394 chrII 421116 . C A 3523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.96;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3523,358,0 chrII 421574 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.143;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.609;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:140:99:1318,0,1498 chrII 421673 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.914;DP=110;Dels=0.00;FS=7.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.383;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1295,0,1088 chrII 421692 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.792;DP=111;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=12.58;ReadPosRankSum=-1.207;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,69:111:99:1426,0,871 chrII 421695 . C G 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.804;DP=108;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=12.87;ReadPosRankSum=-1.291;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,67:108:99:1420,0,815 chrII 422076 . C G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;DP=116;Dels=0.00;FS=12.235;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.457;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1485,0,949 chrII 422148 . T C 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3032,315,0 chrII 422164 . T C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.620;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=9.34;ReadPosRankSum=-2.980;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1244,0,1425 chrII 422415 . C T 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.302;DP=147;Dels=0.00;FS=4.892;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.142;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1464,0,1515 chrII 422475 . T A 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.379;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1213,0,1524 chrII 422583 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.935;DP=138;Dels=0.00;FS=3.165;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.386;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:138:99:1430,0,1342 chrII 422622 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.345;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1351,0,1593 chrII 422634 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.871;DP=148;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1373,0,1565 chrII 422762 . T G 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:150:99:1480,0,1720 chrII 422913 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.409;DP=137;Dels=0.00;FS=6.556;HaplotypeScore=4.9216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.557;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1402,0,1444 chrII 423054 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.559;DP=118;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.396;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1295,0,1109 chrII 423264 . A G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3113,324,0 chrII 423351 . G A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.780;DP=134;Dels=0.00;FS=3.396;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1587,0,1337 chrII 423506 . A G 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.677;DP=91;Dels=0.00;FS=0.901;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=8.33;ReadPosRankSum=-2.345;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:788,0,1031 chrII 423518 . A G 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.095;DP=115;Dels=0.00;FS=4.754;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:904,0,1450 chrII 423550 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.263;DP=167;Dels=0.00;FS=3.819;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.134;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,72:167:99:1456,0,2079 chrII 423698 . G T 2069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.557;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,97:194:99:2099,0,2002 chrII 423800 . C T 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.635;DP=144;Dels=0.00;FS=5.008;HaplotypeScore=3.4838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.231;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1333,0,1662 chrII 423950 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.495;DP=136;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.613;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1090,0,1713 chrII 424031 . C T 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.355;DP=127;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,47:127:99:923,0,1769 chrII 424193 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.672;DP=122;Dels=0.00;FS=3.290;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1355,0,1251 chrII 424199 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.616;DP=124;Dels=0.00;FS=6.701;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.290;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1285,0,1303 chrII 424346 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.859;DP=114;Dels=0.00;FS=4.868;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=9.15;ReadPosRankSum=2.341;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1073,0,1289 chrII 424367 . C T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.848;DP=108;Dels=0.00;FS=3.640;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.501;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1104,0,1242 chrII 424421 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.843;DP=118;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.822;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1067,0,1451 chrII 424448 . A G 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.705;DP=121;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1082,0,1209 chrII 424451 . C T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.537;DP=121;Dels=0.00;FS=1.673;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.154;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1108,0,1158 chrII 424490 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.824;DP=115;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.653;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,71:115:99:1611,0,860 chrII 424607 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.659;DP=144;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=3.5862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:144:99:1506,0,1365 chrII 424811 . T C 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.319;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=1;MQRankSum=0.898;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.758;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,77:128:99:1714,0,999 chrII 424906 . G A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.049;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=2.244;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.424;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:121:99:1240,0,1315 chrII 425500 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.638;DP=154;Dels=0.00;FS=1.282;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.173;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1405,0,1707 chrII 425596 . G A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.415;DP=120;Dels=0.00;FS=5.814;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.340;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1446,0,1209 chrII 425780 . T C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.902;DP=112;Dels=0.00;FS=7.189;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.249;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1195,0,1195 chrII 425844 . T A 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.111;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:90:99:852,0,1048 chrII 425855 . A G 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.529;DP=92;Dels=0.00;FS=4.090;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:844,0,1056 chrII 425891 . T A 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.450;DP=79;Dels=0.00;FS=0.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=8.70;ReadPosRankSum=1.235;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:717,0,974 chrII 425926 . C T 727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.058;DP=81;Dels=0.00;FS=4.592;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.628;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:757,0,814 chrII 425982 . A T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.114;DP=86;Dels=0.00;FS=0.889;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.119;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:895,0,751 chrII 425995 . A C 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;DP=92;Dels=0.00;FS=3.064;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.770;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:926,0,808 chrII 426165 . A G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.348;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.175;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,77:123:99:1409,0,908 chrII 426299 . C T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;DP=112;Dels=0.00;FS=1.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1110,0,1180 chrII 426361 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.853;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.609;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1216,0,1462 chrII 426388 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.812;DP=129;Dels=0.00;FS=11.140;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1067,0,1604 chrII 426608 . A G 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.618;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.304;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1385,0,1665 chrII 426669 . C A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.417;DP=145;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1373,0,1616 chrII 426865 . C T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.638;DP=139;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=5.9504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.360;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1385,0,1386 chrII 426936 . G C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;DP=112;Dels=0.00;FS=2.618;HaplotypeScore=3.6520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1230,0,1006 chrII 427377 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.008;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1210,0,1629 chrII 427525 . T A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;DP=97;Dels=0.00;FS=8.452;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.566;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:850,0,1201 chrII 427545 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.005;DP=122;Dels=0.00;FS=5.697;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1036,0,1470 chrII 427719 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.314;DP=150;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=5.0885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=9.86;ReadPosRankSum=-2.353;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1509,0,1506 chrII 427812 . A G 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.71;MQ0=2;QD=22.62;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2861,306,0 chrII 427869 . G A 861.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.852;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.74;MQ0=6;MQRankSum=-6.122;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:891,0,1269 chrII 427872 . G A 2634 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.73;MQ0=4;QD=23.95;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2667,276,0 chrII 427998 . G A 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.63;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3137,330,0 chrII 428040 . T C 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.13;MQ0=0;QD=24.97;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2805,297,0 chrII 428055 . A T 3011 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3044,307,0 chrII 428058 . A G 2397 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.51;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2430,273,0 chrII 428059 . G A 2596 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.51;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2629,273,0 chrII 428060 . C T 2594 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.27;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2627,273,0 chrII 428064 . G T 2784 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.69;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2817,288,0 chrII 428261 . C T 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.814;DP=153;Dels=0.00;FS=4.802;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1594,0,1508 chrII 428433 . G A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.815;DP=131;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.799;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1429,0,1275 chrII 428478 . A G 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.162;DP=162;Dels=0.00;FS=1.978;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=2.795;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.317;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:1525,0,1711 chrII 428484 . T G 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.369;DP=157;Dels=0.00;FS=2.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.594;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1584,0,1623 chrII 428694 . C T 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.426;DP=106;Dels=0.00;FS=2.611;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.869;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:982,0,1322 chrII 428751 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.168;DP=129;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=3.3282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQ0=1;MQRankSum=-1.879;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.984;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1257,0,1424 chrII 428805 . T G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.334;DP=104;Dels=0.00;FS=10.144;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.840;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.927;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1094,0,1045 chrII 428862 . T A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.252;DP=105;Dels=0.00;FS=1.564;HaplotypeScore=2.3937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1097,0,1122 chrII 428886 . A G 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.453;DP=118;Dels=0.00;FS=2.369;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1147,0,1255 chrII 428982 . G A 1913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1946,192,0 chrII 429006 . G A 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.036;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,38:70:99:758,0,676 chrII 429084 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.360;DP=102;Dels=0.00;FS=2.794;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.014;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1264,0,888 chrII 429095 . T C 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.819;DP=102;Dels=0.00;FS=4.197;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,39:102:99:714,0,1489 chrII 429107 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.732;DP=120;Dels=0.00;FS=3.474;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.954;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,75:120:99:1588,0,838 chrII 429123 . T G 909.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.858;DP=137;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=6.64;ReadPosRankSum=-2.230;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,53:137:99:939,0,1873 chrII 429124 . C A 907.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.555;DP=138;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=6.57;ReadPosRankSum=-2.318;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,52:138:99:937,0,1832 chrII 429131 . G A 1779.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.715;DP=136;Dels=0.00;FS=4.228;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.852;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,84:136:99:1809,0,995 chrII 429183 . T A 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.418;DP=108;Dels=0.00;FS=2.544;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.713;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:940,0,1396 chrII 429199 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.381;DP=129;Dels=0.00;FS=8.565;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.369;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1501,0,1250 chrII 429360 . G A 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.213;DP=107;Dels=0.00;FS=6.282;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1202,0,1067 chrII 429396 . G T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.176;DP=147;Dels=0.00;FS=2.205;HaplotypeScore=6.9176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=9.48;ReadPosRankSum=2.054;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1424,0,1768 chrII 429746 . A G 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.29;MQ0=2;QD=24.01;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3505,369,0 chrII 430040 . G A 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.51;MQ0=0;QD=25.28;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3168,327,0 chrII 430055 . C T 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=0;QD=23.94;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3169,327,0 chrII 430067 . A G 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3299,351,0 chrII 430145 . A G 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=1;QD=26.31;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3216,342,0 chrII 430301 . A G 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3554,366,0 chrII 430514 . C A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.041;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.588;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:115:99:1146,0,1221 chrII 430642 . C T 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.88;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3602,378,0 chrII 430846 . C A 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2994,306,0 chrII 431229 . A G 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2860,321,0 chrII 431273 . T C 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=25.17;ReadPosRankSum=0.369;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3104,321,0 chrII 431479 . A G 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3202,330,0 chrII 431663 . G A 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3501,343,0 chrII 431703 . C T 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=1;QD=26.61;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3779,385,0 chrII 431781 . A G 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=1;QD=24.51;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3170,315,0 chrII 431851 . C G 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2744,282,0 chrII 431912 . A T 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2833,294,0 chrII 431999 . C T 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3114,312,0 chrII 432022 . A T 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3348,328,0 chrII 432025 . T C 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3174,324,0 chrII 432185 . G A 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3677,370,0 chrII 432284 . T C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2931,297,0 chrII 432329 . T C 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=22.82;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3045,318,0 chrII 432356 . A G 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3533,357,0 chrII 432415 . C A 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3352,345,0 chrII 432497 . C T 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=24.03;ReadPosRankSum=0.090;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2821,294,0 chrII 432974 . G C 4711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.17;SB=-2.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4711,466,0 chrII 433187 . C T 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.06;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2717,276,0 chrII 433196 . C T 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2881,288,0 chrII 433213 . A G 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.714;DP=120;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=2.8466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.018;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1084,0,1434 chrII 433232 . C A 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3641,358,0 chrII 433640 . C T 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3233,324,0 chrII 434976 . G T 2359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.577;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=25.37;ReadPosRankSum=1.434;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:2392,249,0 chrII 435201 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.556;DP=112;Dels=0.00;FS=11.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1172,0,1223 chrII 435236 . C T 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3299,328,0 chrII 435261 . C T 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3657,367,0 chrII 435279 . G C 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.468;DP=127;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1600,0,945 chrII 435391 . G C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.731;DP=114;Dels=0.00;FS=9.782;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.808;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:114:99:1275,0,1059 chrII 435405 . A G 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.315;DP=106;Dels=0.00;FS=5.170;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=8.23;ReadPosRankSum=2.604;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:902,0,1363 chrII 435637 . T C 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2797,285,0 chrII 435843 . G A 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2882,300,0 chrII 436119 . T C 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2806,297,0 chrII 437154 . T C 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2767,291,0 chrII 437187 . G A 2701 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2734,285,0 chrII 437295 . G A 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3083,304,0 chrII 437307 . A G 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3007,303,0 chrII 437440 . A T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3405,342,0 chrII 437604 . T C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;DP=98;Dels=0.00;FS=1.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1155,0,918 chrII 437754 . C T 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.482;DP=111;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.451;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2928,300,0 chrII 438061 . G A 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2782,294,0 chrII 438126 . A C 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2993,318,0 chrII 438190 . A G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=124;Dels=0.00;FS=4.143;HaplotypeScore=3.2215;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=2;MQRankSum=1.647;QD=24.94;ReadPosRankSum=1.533;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3126,327,0 chrII 438300 . A C 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3059,318,0 chrII 438386 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.851;DP=128;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.812;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1506,0,1177 chrII 438523 . A G 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3138,312,0 chrII 438582 . T C 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3402,354,0 chrII 438870 . T C 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3282,336,0 chrII 438919 . C G 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3276,333,0 chrII 438954 . T G 2507 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2540,273,0 chrII 439191 . A G 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2859,291,0 chrII 439486 . T C 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2491,258,0 chrII 440220 . A T 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2630,267,0 chrII 440349 . G A 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2746,273,0 chrII 441419 . A C 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3528,354,0 chrII 441722 . G A 4125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4125,406,0 chrII 441772 . T C 2517 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2550,264,0 chrII 441927 . A G 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3062,315,0 chrII 442031 . G C 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3894,420,0 chrII 442040 . A G 4019.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.29;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4019,409,0 chrII 442059 . G C 3933.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.55;MQ0=0;QD=25.37;SB=-2.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3933,399,0 chrII 442063 . T C 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3703,378,0 chrII 442127 . C A 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.208;DP=104;Dels=0.00;FS=0.822;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.770;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1152,0,1086 chrII 442233 . C A 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2854,286,0 chrII 442249 . G A 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3052,315,0 chrII 442309 . A G 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3853,402,0 chrII 442819 . G A 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2750,285,0 chrII 444780 . A G 662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;DP=93;Dels=0.00;FS=9.009;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.140;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:692,0,1299 chrII 445027 . T C 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.002;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.242;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:1730,0,1840 chrII 447158 . G A 3863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3863,379,0 chrII 447264 . T C 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2875,300,0 chrII 447300 . C T 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3165,318,0 chrII 447536 . G T 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3677,376,0 chrII 447579 . A G 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3439,369,0 chrII 447685 . T C 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3029,312,0 chrII 447707 . A G 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3567,360,0 chrII 447726 . A G 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3349,342,0 chrII 447876 . G A 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3637,373,0 chrII 448135 . G A 4313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4313,424,0 chrII 448470 . G A 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4289;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3586,352,0 chrII 448507 . G T 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3705,376,0 chrII 448634 . T C 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3148,333,0 chrII 449152 . T A 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3564,358,0 chrII 449241 . T C 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.152;DP=167;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.770;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1682,0,1870 chrII 449253 . C T 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.622;DP=157;Dels=0.00;FS=4.325;HaplotypeScore=5.9395;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.313;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:4054,382,0 chrII 449416 . T C 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2748,288,0 chrII 449588 . G A 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.066;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=25.30;ReadPosRankSum=0.666;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3289,309,0 chrII 449616 . G T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;DP=118;Dels=0.00;FS=3.527;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.564;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:118:99:1431,0,1057 chrII 449860 . C T 1854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.867;DP=142;Dels=0.01;FS=4.193;HaplotypeScore=5.9267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=13.06;ReadPosRankSum=-1.855;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,84:141:99:1884,0,1119 chrII 450377 . T C 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3604,366,0 chrII 450742 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.490;DP=139;Dels=0.00;FS=2.174;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.637;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1264,0,1673 chrII 450938 . T C 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3168,327,0 chrII 451124 . G A 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.99;SB=-2.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4076,403,0 chrII 451343 . G A 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3196,327,0 chrII 451344 . A T 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3218,330,0 chrII 451373 . G A 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3421,352,0 chrII 451442 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.520;DP=125;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=3.4814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1260,0,1328 chrII 451454 . G T 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3671,367,0 chrII 451599 . C T 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4011,397,0 chrII 452080 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.703;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.399;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,71:113:99:1490,0,800 chrII 452218 . A G 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3536,381,0 chrII 452365 . T C 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9198;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.69;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2843,312,0 chrII 452375 . A T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;DP=129;Dels=0.00;FS=11.897;HaplotypeScore=2.8494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.847;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1380,0,1331 chrII 452408 . C T 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.29;MQ0=0;QD=24.97;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3421,358,0 chrII 452891 . G A 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3804,379,0 chrII 453044 . C T 4201.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:4201,424,0 chrII 453048 . T C 4129.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4129,418,0 chrII 453192 . A C 1753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;QD=19.26;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:90:99:1786,198,0 chrII 453417 . G A 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3089,313,0 chrII 453556 . A T 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.85;SB=-2.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4054,412,0 chrII 453581 . G A 4424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=27.14;SB=-2.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4424,442,0 chrII 453718 . G A 4228.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.76;SB=-2.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4228,424,0 chrII 454021 . A G 4097.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=25.14;ReadPosRankSum=0.032;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:4097,433,0 chrII 454027 . T C 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.346;DP=166;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=4.5526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.612;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1779,0,1810 chrII 454122 . T C 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3700,393,0 chrII 454135 . T C 3927.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8840;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3927,408,0 chrII 454261 . G A 4828.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.622;DP=189;Dels=0.00;FS=3.900;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-2.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,188:189:99:4828,469,0 chrII 454272 . A G 4833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.695;DP=185;Dels=0.00;FS=4.818;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=26.12;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,184:185:99:4833,472,0 chrII 454336 . T C 4260.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.21;SB=-2.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4260,436,0 chrII 454371 . T A 4056.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4056,397,0 chrII 454467 . T G 4793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=23.85;SB=-2.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:4793,501,0 chrII 454488 . A G 4706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.72;SB=-2.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4706,472,0 chrII 454587 . A G 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3586,378,0 chrII 454598 . C T 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3587,372,0 chrII 454753 . T C 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3730,390,0 chrII 454872 . C T 2066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.481;DP=176;Dels=0.00;FS=4.390;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.790;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,98:176:99:2096,0,1503 chrII 454884 . T C 4263.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4263,459,0 chrII 455010 . T A 5108.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=26.74;SB=-2.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:5108,505,0 chrII 455029 . T C 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=153;Dels=0.00;FS=3.813;HaplotypeScore=3.6403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.403;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1610,0,1579 chrII 455204 . C T 4502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4502,463,0 chrII 455407 . A T 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.08;MQ0=0;QD=26.34;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3767,376,0 chrII 455916 . C T 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=23.62;SB=-2.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3732,390,0 chrII 455991 . A G 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.236;DP=152;Dels=0.00;FS=8.504;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.741;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,89:152:99:1691,0,866 chrII 456000 . G A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.024;DP=169;Dels=0.00;FS=3.589;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=2.313;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,72:169:99:1014,0,1884 chrII 456029 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.779;DP=159;Dels=0.00;FS=1.250;HaplotypeScore=2.3460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,78:159:99:1362,0,1534 chrII 456055 . G A 4183.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.20;SB=-2.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4183,426,0 chrII 456132 . T G 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4030,423,0 chrII 456187 . G C 4365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.83;SB=-2.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4365,448,0 chrII 456231 . A G 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3656,399,0 chrII 456240 . G A 3658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3658,369,0 chrII 456336 . G T 4086.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4086,412,0 chrII 456431 . C G 4034.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4034,420,0 chrII 456442 . C T 4461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=27.20;SB=-2.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4461,457,0 chrII 456535 . C T 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1636;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3734,382,0 chrII 456657 . G T 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2936,294,0 chrII 456662 . G A 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2963,303,0 chrII 456718 . G C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3389,366,0 chrII 456733 . C T 718 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.776;DP=123;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=177.6906;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=5.84;ReadPosRankSum=-7.445;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:89,34:123:57:751,57,0 chrII 456771 . G A 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3823,379,0 chrII 457002 . G A 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:141:99:3628,361,0 chrII 457014 . G A 3724.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3724,372,0 chrII 457048 . A G 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3769,399,0 chrII 457101 . A G 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3165,339,0 chrII 457208 . A G 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.671;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.264;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1088,0,1265 chrII 457215 . G A 2655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2688,273,0 chrII 457395 . G A 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3366,351,0 chrII 457684 . T A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2997,303,0 chrII 457818 . C T 3891.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3891,402,0 chrII 457994 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.313;DP=142;Dels=0.00;FS=12.175;HaplotypeScore=2.9586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.094;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1326,0,1579 chrII 458104 . G A 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3494,355,0 chrII 458399 . T C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.367;DP=119;Dels=0.00;FS=3.394;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.092;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1129,0,1389 chrII 458570 . T C 2470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.70;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2503,261,0 chrII 458604 . A C 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2690,285,0 chrII 458640 . G C 2495 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2528,261,0 chrII 458748 . T C 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3011,315,0 chrII 458800 . C T 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2574,258,0 chrII 458813 . G C 2395 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2428,252,0 chrII 458841 . G A 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.050;DP=91;Dels=0.00;FS=2.728;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1106,0,787 chrII 458919 . C T 2461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2494,255,0 chrII 459048 . T C 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.11;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3062,321,0 chrII 459093 . T C 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.73;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3314,345,0 chrII 459628 . A G 4025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.69;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4025,411,0 chrII 459672 . T C 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3208,327,0 chrII 460202 . A G 2011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.95;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2044,222,0 chrII 460203 . T C 1956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.95;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1989,213,0 chrII 460337 . A G 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3386,348,0 chrII 460385 . G A 4160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.26;MQ0=0;QD=26.00;SB=-2.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4160,406,0 chrII 460418 . A T 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.92;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3231,327,0 chrII 460459 . G A 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3581,369,0 chrII 460520 . G A 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3181,321,0 chrII 460561 . A G 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3207,321,0 chrII 460566 . A G 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3204,327,0 chrII 460668 . T C 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7327;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2985,312,0 chrII 460748 . A G 2709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=97.2438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2742,279,0 chrII 460876 . G C 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3183,336,0 chrII 461012 . T C 2166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2199,246,0 chrII 461079 . T A 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2998,306,0 chrII 461088 . A T 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3545,367,0 chrII 461298 . A G 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2583,270,0 chrII 461718 . G A 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3810,379,0 chrII 461771 . C T 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5886;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3368,339,0 chrII 461817 . A G 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2718,294,0 chrII 461852 . C G 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3682,393,0 chrII 461887 . G C 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.96;SB=-2.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4168,444,0 chrII 462116 . T C 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3163,327,0 chrII 462229 . G A 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3748,384,0 chrII 462458 . T C 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.904;DP=109;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.736;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,42:109:99:780,0,1501 chrII 462560 . A G 2580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.05;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2613,279,0 chrII 462587 . G A 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2913,294,0 chrII 462765 . T C 2522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=23.35;ReadPosRankSum=1.347;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2555,270,0 chrII 462876 . G A 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3113,309,0 chrII 462933 . C T 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3088,310,0 chrII 463266 . A C 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2760,297,0 chrII 463354 . G A 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3434,340,0 chrII 463357 . C T 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3629,358,0 chrII 463509 . A G 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1936;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2988,315,0 chrII 463791 . G A 3938.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3938,396,0 chrII 464001 . G A 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.11;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3975,406,0 chrII 464055 . T C 301.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.867;DP=88;Dels=0.00;FS=10.372;HaplotypeScore=41.8232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.46;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:331,0,1025 chrII 464058 . T C 723.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;DP=86;Dels=0.00;FS=6.725;HaplotypeScore=41.8232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.51;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:753,0,591 chrII 464061 . T C 207.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;DP=89;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=39.9379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.59;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=2.33;ReadPosRankSum=-1.226;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,17:88:99:237,0,1153 chrII 464079 . T C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.188;DP=94;Dels=0.00;FS=2.829;HaplotypeScore=4.8564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=10.53;ReadPosRankSum=4.865;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,73:94:99:1020,0,305 chrII 464148 . T A 335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;DP=144;Dels=0.00;FS=3.719;HaplotypeScore=10.0480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=2.33;ReadPosRankSum=-6.061;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,34:144:99:365,0,2338 chrII 464151 . C T 343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.011;DP=145;Dels=0.00;FS=17.735;HaplotypeScore=11.4899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=2.37;ReadPosRankSum=-5.708;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,43:145:99:373,0,1936 chrII 464160 . A T 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.891;DP=149;Dels=0.00;FS=12.384;HaplotypeScore=7.5698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=5.36;ReadPosRankSum=-4.417;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,55:149:99:828,0,1910 chrII 464184 . C T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.277;DP=146;Dels=0.00;FS=6.082;HaplotypeScore=11.6468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=1;MQRankSum=-2.292;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.583;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,64:146:99:1102,0,1446 chrII 464193 . C T 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.505;DP=156;Dels=0.00;FS=7.895;HaplotypeScore=36.6857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQ0=2;MQRankSum=-2.408;QD=5.67;ReadPosRankSum=-4.820;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,53:156:99:915,0,1367 chrII 464205 . T A,C 2704.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7259;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=53.02;MQ0=2;MQRankSum=1.469;QD=18.39;ReadPosRankSum=1.445;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,87,59:147:99:2764,1024,814,1594,0,1447 chrII 464208 . T C 283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.029;DP=148;Dels=0.00;FS=3.782;HaplotypeScore=60.6845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQ0=2;MQRankSum=-2.015;QD=1.91;ReadPosRankSum=-5.254;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,31:148:99:313,0,2084 chrII 464217 . C T 428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.882;DP=161;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=46.5686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=2;MQRankSum=-1.263;QD=2.66;ReadPosRankSum=-6.873;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,54:161:99:458,0,1545 chrII 464259 . A T 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.111;DP=154;Dels=0.00;FS=8.231;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.32;MQ0=2;MQRankSum=-1.346;QD=17.05;ReadPosRankSum=7.421;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:45,109:154:99:2659,270,0 chrII 464478 . G A 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=1;QD=25.53;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2816,285,0 chrII 464655 . A G 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3663,378,0 chrII 464667 . G A 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.75;SB=-2.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3759,373,0 chrII 464940 . G T 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3721,376,0 chrII 465103 . T C 4277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4277,444,0 chrII 465156 . T C 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3789,402,0 chrII 465458 . T C 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.193;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.147;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,81:172:99:1709,0,1939 chrII 465493 . C T 4298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=160;Dels=0.00;FS=3.441;HaplotypeScore=7.8458;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=26.86;ReadPosRankSum=1.536;SB=-2.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:160:99:4298,408,0 chrII 465618 . G A 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.45;SB=-2.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3667,372,0 chrII 465657 . G C 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3808,396,0 chrII 465688 . T C 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.366;DP=118;Dels=0.00;FS=7.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.766;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1409,0,1094 chrII 465694 . T C 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2875,309,0 chrII 465853 . C T 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2829,291,0 chrII 465979 . G A 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.88;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3124,318,0 chrII 466295 . A G 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=22.63;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2794,303,0 chrII 466414 . A G 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3001,321,0 chrII 466676 . T C 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3368,357,0 chrII 466718 . T C 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2739,291,0 chrII 466724 . T C 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3233,339,0 chrII 466848 . A G 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.591;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5625;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.422;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3121,321,0 chrII 466961 . T A 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8062;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=22.70;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2598,276,0 chrII 466995 . T A 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.77;MQ0=0;QD=24.35;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2760,285,0 chrII 467369 . G A 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3855,388,0 chrII 467538 . C T 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3429,346,0 chrII 467580 . C T 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3846,388,0 chrII 467631 . A G 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3490,354,0 chrII 467964 . C T 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3702,393,0 chrII 468345 . A G 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=25.16;ReadPosRankSum=1.360;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3749,399,0 chrII 468566 . A G 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3088,330,0 chrII 468804 . A G 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3518,363,0 chrII 468870 . C T 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2487,261,0 chrII 468915 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.906;DP=129;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=-1.918;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1416,0,1358 chrII 469086 . C T 3966.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3966,405,0 chrII 469119 . T C 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.23;SB=-2.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4046,420,0 chrII 469122 . G A 4219.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.999e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4219,424,0 chrII 469152 . G A 4241.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.36;SB=-2.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4241,415,0 chrII 469344 . C T 2767 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=126;Dels=0.00;FS=3.460;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.540;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:126:99:2800,288,0 chrII 469374 . G A 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3089,309,0 chrII 469491 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.588;DP=146;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=5.6330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.619;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,64:146:99:1253,0,1779 chrII 469512 . T C 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3376,354,0 chrII 469575 . T C 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3620,366,0 chrII 469648 . C T 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3239,313,0 chrII 469663 . T C 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3522,366,0 chrII 469766 . T C 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3533,363,0 chrII 469816 . G A 4710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.05;SB=-2.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4710,466,0 chrII 470009 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.976;DP=146;Dels=0.00;FS=4.972;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.229;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1532,0,1592 chrII 470054 . C T 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3314,345,0 chrII 470150 . T C 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2718,288,0 chrII 470377 . C T 4095.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.12;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4095,427,0 chrII 470537 . C T 4310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4310,436,0 chrII 470582 . A T 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2987,312,0 chrII 470609 . A G 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2634,285,0 chrII 470873 . T C 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2812,288,0 chrII 471002 . A G 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3691,381,0 chrII 471887 . C G 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.412;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=25.34;ReadPosRankSum=-1.492;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3294,354,0 chrII 472319 . A C 4213.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4213,429,0 chrII 472718 . G A 4318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.33;SB=-2.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4318,445,0 chrII 472731 . T A 4387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4387,451,0 chrII 472853 . T C 4212.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;QD=25.68;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4212,435,0 chrII 473376 . T A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;DP=143;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.028;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1385,0,1649 chrII 473429 . G A 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.212;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.345;QD=26.01;ReadPosRankSum=1.142;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,139:141:99:3667,390,0 chrII 473605 . T G 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7228;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=24.81;ReadPosRankSum=-1.360;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3035,297,0 chrII 473948 . C T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.986;DP=125;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=3.9826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.662;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1190,0,1488 chrII 473996 . A G 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.476;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1368,0,1427 chrII 474031 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.599;DP=114;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=4.4366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=9.47;ReadPosRankSum=2.009;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1110,0,1206 chrII 474179 . C T 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.191;DP=91;Dels=0.00;FS=0.801;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.100;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:954,0,971 chrII 474261 . T A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;DP=128;Dels=0.00;FS=2.422;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.870;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1344,0,1335 chrII 474281 . G A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.701;DP=126;Dels=0.00;FS=5.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1403,0,1229 chrII 474308 . T A 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;DP=123;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=87.1789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.918;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1148,0,1442 chrII 474348 . A G 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.387;DP=136;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=5.6052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.874;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1602,0,1228 chrII 475550 . A G 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.814;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3414;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=24.85;ReadPosRankSum=1.227;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3753,370,0 chrII 475721 . G A 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.046;DP=144;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.541;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1571,0,1495 chrII 475856 . T C 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3206,333,0 chrII 475859 . A T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.032;DP=129;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.097;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1181,0,1530 chrII 475985 . C T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.385;DP=129;Dels=0.00;FS=1.396;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.072;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:1134,0,1496 chrII 475994 . G A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.023;DP=130;Dels=0.00;FS=2.237;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.211;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1261,0,1481 chrII 476201 . A G 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.603;DP=150;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=4.3852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.748;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1515,0,1585 chrII 476335 . G A 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.059;DP=143;Dels=0.00;FS=2.203;HaplotypeScore=2.7038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.190;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,53:143:99:909,0,2013 chrII 476506 . T G 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.754;DP=140;Dels=0.00;FS=3.088;HaplotypeScore=4.3817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.391;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1193,0,1543 chrII 476602 . T G 2003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.166;DP=173;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=2.9639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,99:173:99:2033,0,1528 chrII 476678 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.862;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.578;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1328,0,1502 chrII 476730 . C T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.355;DP=145;Dels=0.00;FS=3.945;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1405,0,1537 chrII 476894 . G A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.144;DP=132;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.139;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1287,0,1467 chrII 476910 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.068;DP=112;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:112:99:1124,0,1146 chrII 476950 . A C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.727;DP=123;Dels=0.00;FS=11.579;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1380,0,1241 chrII 476954 . C T 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3206,333,0 chrII 477006 . T A 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=72.5100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.088;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1530,0,1402 chrII 477171 . G C 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.573;DP=145;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.116;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1516,0,1310 chrII 477246 . T G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.691;DP=138;Dels=0.01;FS=7.620;HaplotypeScore=5.6992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1263,0,1512 chrII 477249 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.194;DP=149;Dels=0.01;FS=2.960;HaplotypeScore=8.6735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.816;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:148:99:1194,0,1465 chrII 477263 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.922;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.827;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1224,0,1250 chrII 477343 . A G 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=144;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.545;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,142:144:99:3151,315,0 chrII 477407 . G C 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;DP=121;Dels=0.00;FS=13.588;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQ0=0;MQRankSum=2.412;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1009,0,1080 chrII 477576 . C T 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.826;DP=99;Dels=0.00;FS=3.870;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.79;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:1034,0,1045 chrII 478039 . C T 150.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;DP=108;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.61;MQ0=92;MQRankSum=0.271;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.766;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,27:108:89:180,0,89 chrII 478987 . T C 1989 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.98;MQ0=33;QD=17.76;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,99:112:99:2022,213,0 chrII 479201 . G A 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.50;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2603,264,0 chrII 479219 . G A 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;DP=93;Dels=0.00;FS=5.631;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=0.29;ReadPosRankSum=-2.729;SB=-8.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,3:93:57:57,0,124 chrII 479220 . T A 87.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;DP=92;Dels=0.00;FS=2.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=0.95;ReadPosRankSum=2.396;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,90:92:34:117,0,34 chrII 479684 . A G 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2583,273,0 chrII 479752 . G A 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2883,285,0 chrII 480069 . G A 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.655;DP=135;Dels=0.00;FS=4.869;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=26.21;ReadPosRankSum=-0.244;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3539,347,0 chrII 480074 . A G 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3593,387,0 chrII 480137 . C T 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.47;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3782,393,0 chrII 480143 . C T 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.016;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.21;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.670;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3627,355,0 chrII 480150 . T C 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.56;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3173,333,0 chrII 480237 . G A 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2570,264,0 chrII 480324 . A G 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3134,318,0 chrII 480674 . A G 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3069,318,0 chrII 483620 . G C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.043;DP=124;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=3.3818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.023;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1216,0,1248 chrII 483785 . A G 3994.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3994,396,0 chrII 483944 . A G 4249.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4249,409,0 chrII 484231 . A G 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3463,375,0 chrII 484506 . G A 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3320,339,0 chrII 484558 . C T 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3082,321,0 chrII 484574 . G A 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3485,346,0 chrII 484617 . G A 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3443,346,0 chrII 485107 . T C 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.263;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=24.11;ReadPosRankSum=0.251;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,130:132:99:3216,304,0 chrII 485257 . T G 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3413,372,0 chrII 485396 . T C 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=26.27;ReadPosRankSum=1.427;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3284,342,0 chrII 485585 . A G 4132.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:164:99:4132,417,0 chrII 485633 . C T 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3715,373,0 chrII 485764 . T C 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.82;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3260,336,0 chrII 486033 . A G 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3543,372,0 chrII 486404 . G C 4155.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4155,438,0 chrII 486737 . T C 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2639,282,0 chrII 486878 . G A 4035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=27.45;SB=-2.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4035,406,0 chrII 487047 . G A 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.3964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:3566,337,0 chrII 487454 . G A 2651 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2684,276,0 chrII 487661 . C G 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=1;QD=25.74;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3912,420,0 chrII 487980 . G A 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.77;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3801,382,0 chrII 488565 . C A 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3043,324,0 chrII 488579 . A G 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2379;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3219,345,0 chrII 488707 . G A 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.23;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3135,336,0 chrII 488755 . C G 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3568,372,0 chrII 488875 . T A 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3203,319,0 chrII 488899 . G A 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3175,330,0 chrII 489223 . G A 4035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.13;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4035,405,0 chrII 489238 . A G 4136.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4136,423,0 chrII 489241 . A G 3886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=24.91;ReadPosRankSum=1.173;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,154:156:99:3886,388,0 chrII 489688 . G A 4912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.139;DP=187;Dels=0.00;FS=3.910;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=26.27;ReadPosRankSum=1.028;SB=-2.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,186:187:99:4912,505,0 chrII 489703 . T C 4537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;DP=177;Dels=0.00;FS=4.698;HaplotypeScore=4.4099;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.186;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,176:177:99:4537,486,0 chrII 489712 . G A 4566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.692;DP=173;Dels=0.00;FS=4.899;HaplotypeScore=3.9313;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=26.39;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:4566,480,0 chrII 489778 . C T 4250.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.40;SB=-2.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4250,430,0 chrII 489805 . G A 4017.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.544;QD=27.33;ReadPosRankSum=1.402;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:4017,368,0 chrII 490264 . C T 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3829,391,0 chrII 492025 . A C 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3045,321,0 chrII 493122 . T C 4133.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;DP=165;Dels=0.00;FS=3.037;HaplotypeScore=2.5220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=25.05;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-2.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:4133,401,0 chrII 493123 . T C 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.75;SB=-2.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4109,432,0 chrII 493536 . T C 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3220,333,0 chrII 493755 . A G 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2821,303,0 chrII 493841 . C T 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3437,351,0 chrII 493879 . T C 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3520,342,0 chrII 493930 . G A 2178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2211,225,0 chrII 493942 . G A 1842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.684;DP=72;Dels=0.00;FS=3.388;HaplotypeScore=5.6009;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=25.58;ReadPosRankSum=1.347;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,71:72:99:1875,195,0 chrII 493999 . C T 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3846,361,0 chrII 494992 . A G 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=19.75;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:2758,270,0 chrII 495085 . A G 4530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4530,451,0 chrII 495347 . A G 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2977,306,0 chrII 495627 . C T 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3765,381,0 chrII 495979 . C G 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3525,390,0 chrII 496048 . T C 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3177,330,0 chrII 496540 . T C 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.35;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2984,318,0 chrII 496664 . T C 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3010,318,0 chrII 496814 . T C 4320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4320,445,0 chrII 496879 . A T 4314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.30;SB=-2.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4314,451,0 chrII 497022 . A G 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3286,342,0 chrII 497477 . A T 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3876,391,0 chrII 498205 . C T 3857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=1;QD=26.97;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3857,382,0 chrII 498428 . G A 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3627,381,0 chrII 498697 . T C 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3459,354,0 chrII 498905 . A G 2784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.37;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2817,291,0 chrII 498911 . G A 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2958,303,0 chrII 498923 . G C 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=22.07;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2659,282,0 chrII 498935 . C T 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.77;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2861,285,0 chrII 498959 . G A 2028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.82;MQ0=0;QD=20.48;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2061,213,0 chrII 499010 . G A 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.31;MQ0=0;QD=26.38;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2697,270,0 chrII 499017 . A G 2578 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.06;MQ0=0;QD=25.52;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2611,273,0 chrII 499037 . G A 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.90;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3002,298,0 chrII 499049 . T A 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3144,316,0 chrII 499401 . A C 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3323,360,0 chrII 499475 . A G 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2877,306,0 chrII 499488 . C T 2478 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.13;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2511,264,0 chrII 499985 . G A 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3449,348,0 chrII 500363 . T C 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2988,315,0 chrII 500417 . A C 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3383,345,0 chrII 500498 . T C 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3679,384,0 chrII 500795 . G T 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3669,373,0 chrII 500843 . T A 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3055,318,0 chrII 500915 . A T 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.49;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3015,306,0 chrII 500990 . G A 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3516,360,0 chrII 501201 . A G 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3546,360,0 chrII 501286 . G A 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3872,382,0 chrII 501487 . G A 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3097,324,0 chrII 501490 . A G 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3027,318,0 chrII 501576 . A T 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3493,360,0 chrII 501696 . T C 4062.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4062,405,0 chrII 501800 . G T 4565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4565,463,0 chrII 501831 . A G 4220.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4220,459,0 chrII 501974 . T C 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3414,351,0 chrII 501990 . C T 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3379,339,0 chrII 502029 . G A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3152,327,0 chrII 502038 . A G 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2680,279,0 chrII 502058 . G A 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3056,309,0 chrII 502305 . A T 4143.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.993e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4143,412,0 chrII 503196 . C T 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3601,375,0 chrII 504587 . C T 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2927,303,0 chrII 504617 . G A 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3160,321,0 chrII 504865 . C T 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3780,379,0 chrII 504973 . G A 3939.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3939,397,0 chrII 504994 . T C 4127.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.16;SB=-2.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4127,432,0 chrII 505129 . G A 4345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4345,442,0 chrII 505396 . T A 3613.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.952;DP=147;Dels=0.00;FS=27.196;HaplotypeScore=26.1467;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=2.235;QD=24.58;ReadPosRankSum=2.483;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,144:147:99:3613,379,0 chrII 505399 . A T 3507.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.924;DP=148;Dels=0.00;FS=135.526;HaplotypeScore=43.2673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=2.976;QD=23.70;ReadPosRankSum=4.007;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,131:148:99:3507,331,0 chrII 505431 . G A 1577 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.11;MQ0=0;QD=16.09;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:1610,180,0 chrII 517042 . A G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.242;DP=135;Dels=0.00;FS=7.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.254;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1300,0,1569 chrII 517735 . A G 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.387;DP=141;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=2.410;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1377,0,1539 chrII 519590 . C T 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.772;DP=131;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.88;ReadPosRankSum=-2.862;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1455,0,1354 chrII 521399 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.643;DP=122;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.175;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1218,0,1179 chrII 521441 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.726;DP=111;Dels=0.00;FS=4.737;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.697;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:111:99:1303,0,854 chrII 521820 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.042;DP=108;Dels=0.00;FS=6.535;HaplotypeScore=4.5530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,69:108:99:1458,0,704 chrII 521946 . C T 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.135;DP=126;Dels=0.00;FS=2.325;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.940;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:973,0,1623 chrII 522687 . T C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=10.26;ReadPosRankSum=2.079;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1097,0,1006 chrII 522696 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.286;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.255;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1109,0,995 chrII 522774 . C T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.887;DP=91;Dels=0.00;FS=0.799;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.397;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1097,0,857 chrII 522921 . A G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.965;DP=95;Dels=0.00;FS=2.854;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=12.16;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:95:99:1185,0,856 chrII 523000 . C T 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.355;DP=128;Dels=0.00;FS=5.104;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.501;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1525,0,1138 chrII 523035 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.107;DP=104;Dels=0.00;FS=2.573;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.515;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.679;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1334,0,985 chrII 523127 . A G 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.966;DP=88;Dels=0.00;FS=0.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.859;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.422;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:982,0,880 chrII 523206 . C T 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.082;DP=131;Dels=0.00;FS=2.205;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.191;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1255,0,1439 chrII 523217 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.768;DP=134;Dels=0.00;FS=3.127;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1277,0,1442 chrII 523386 . G A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.167;DP=119;Dels=0.00;FS=6.035;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.378;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:966,0,1659 chrII 523695 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.605;DP=142;Dels=0.00;FS=5.205;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.112;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1360,0,1552 chrII 523878 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.189;DP=130;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1346,0,1389 chrII 523893 . C A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.732;DP=129;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.535;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1352,0,1311 chrII 523926 . G C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.757;DP=132;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=2.146;QD=8.55;ReadPosRankSum=2.132;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1159,0,1527 chrII 523940 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.750;DP=137;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1192,0,1588 chrII 524097 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.392;DP=121;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=2.4495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1358,0,1132 chrII 524475 . A G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.573;DP=137;Dels=0.00;FS=4.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.222;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1156,0,1714 chrII 524592 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.070;DP=122;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.684;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1115,0,1506 chrII 524656 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.871;DP=126;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1036,0,1582 chrII 524659 . C T 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3316,319,0 chrII 524698 . C T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.420;DP=124;Dels=0.00;FS=3.306;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:1103,0,1509 chrII 524735 . G A 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.982;DP=94;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.635;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:939,0,1035 chrII 524751 . G A 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.316;DP=75;Dels=0.00;FS=1.901;HaplotypeScore=3.9439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.357;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,34:75:99:753,0,883 chrII 524916 . T A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.702;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.420;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1410,0,1459 chrII 525072 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.378;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.507;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1162,0,1175 chrII 525210 . A G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.666;DP=141;Dels=0.00;FS=7.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.462;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1364,0,1552 chrII 525342 . T C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.122;DP=132;Dels=0.00;FS=5.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1111,0,1641 chrII 525363 . C A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.541;DP=129;Dels=0.00;FS=15.224;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:129:99:1090,0,1540 chrII 525483 . T A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.622;DP=119;Dels=0.00;FS=3.394;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.884;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1226,0,1278 chrII 525492 . T A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;DP=127;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.851;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1335,0,1308 chrII 525674 . G A 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3511,355,0 chrII 526366 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.640;DP=138;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.045;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1467,0,1408 chrII 526374 . A G 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3763,381,0 chrII 526512 . T C 2929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2962,327,0 chrII 526527 . T C 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3103,330,0 chrII 526551 . C A 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.055;DP=114;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.739;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1131,0,1251 chrII 526594 . A G 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3256,339,0 chrII 526612 . G A 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3325,339,0 chrII 526673 . G A 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2441,240,0 chrII 526690 . C T 2413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2446,243,0 chrII 526739 . A T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.782;DP=135;Dels=0.00;FS=5.318;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.270;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1554,0,1327 chrII 526922 . C A 3561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3561,364,0 chrII 527211 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.567;DP=123;Dels=0.00;FS=7.200;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.816;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1187,0,1342 chrII 527412 . A G 1841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.93;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1874,198,0 chrII 527451 . A C 2018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=26.55;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2051,219,0 chrII 527493 . C T 2477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2510,249,0 chrII 527516 . C T 2291 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.31;MQ0=0;QD=26.64;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2324,237,0 chrII 527518 . G A 2129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.23;MQ0=0;QD=25.05;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2162,225,0 chrII 527528 . A G 1991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.91;MQ0=0;QD=24.28;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2024,225,0 chrII 527601 . G A 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3206,321,0 chrII 528069 . T C 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.988e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3836,402,0 chrII 528108 . T C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3732,402,0 chrII 528286 . G T 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.168;DP=107;Dels=0.00;FS=7.503;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1031,0,1198 chrII 528511 . C G 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.914;DP=91;Dels=0.00;FS=8.582;HaplotypeScore=5.1855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.428;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:932,0,840 chrII 528775 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.721;DP=137;Dels=0.00;FS=9.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.43;MQ0=0;MQRankSum=-5.482;QD=9.52;ReadPosRankSum=-2.238;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1334,0,1325 chrII 528793 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.922;DP=147;Dels=0.00;FS=21.621;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.44;MQ0=0;MQRankSum=-5.176;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.080;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1224,0,1776 chrII 529032 . A G 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.110;DP=145;Dels=0.00;FS=7.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1481,0,1456 chrII 529081 . G A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.786;DP=128;Dels=0.00;FS=3.154;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.649;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1422,0,1280 chrII 529129 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;DP=131;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.980;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1234,0,1529 chrII 529298 . A G 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3423,345,0 chrII 529327 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.664;DP=112;Dels=0.00;FS=7.316;HaplotypeScore=2.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=10.30;ReadPosRankSum=-2.142;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1184,0,1168 chrII 529459 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.371;DP=108;Dels=0.00;FS=8.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1246,0,1061 chrII 529507 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.515;DP=127;Dels=0.00;FS=4.530;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.508;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1241,0,1405 chrII 529552 . A G 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.377;DP=139;Dels=0.00;FS=4.033;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1505,0,1445 chrII 529567 . A G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.043;DP=132;Dels=0.00;FS=9.335;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.826;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1485,0,1402 chrII 529840 . G A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.963;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.365;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.025;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1123,0,1077 chrII 529864 . G A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.374;DP=105;Dels=0.00;FS=3.817;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.683;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1181,0,1090 chrII 530040 . C G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.667;DP=144;Dels=0.00;FS=2.979;HaplotypeScore=4.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.979;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1313,0,1650 chrII 530080 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;DP=141;Dels=0.00;FS=8.827;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=9.16;ReadPosRankSum=2.079;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1321,0,1575 chrII 530098 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.281;DP=145;Dels=0.00;FS=2.239;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=10.21;ReadPosRankSum=2.748;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1511,0,1579 chrII 530153 . T C 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.748;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.688;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1188,0,1374 chrII 530377 . T C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.892;DP=104;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1177,0,1037 chrII 530473 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;DP=113;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.909;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1224,0,1160 chrII 530521 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.689;DP=119;Dels=0.00;FS=9.097;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.959;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.566;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1221,0,1268 chrII 530672 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.218;DP=137;Dels=0.00;FS=6.241;HaplotypeScore=1.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1309,0,1486 chrII 531175 . A G 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2727,285,0 chrII 531256 . C T 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3134,324,0 chrII 531481 . A T 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3259,328,0 chrII 531496 . A G 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3262,339,0 chrII 531664 . C A 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3228,322,0 chrII 532114 . T C 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3165,333,0 chrII 532216 . C T 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2902,286,0 chrII 532452 . T C 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3455,354,0 chrII 532473 . C T 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3208,333,0 chrII 532578 . C T 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.79;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3292,336,0 chrII 532597 . T C 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.79;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3242,345,0 chrII 532609 . T C 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.64;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3109,330,0 chrII 532643 . G A 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.89;MQ0=0;QD=21.66;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2654,279,0 chrII 532654 . G A 2415 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.67;MQ0=0;QD=21.18;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2448,264,0 chrII 532658 . A G 2226 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.70;MQ0=0;QD=20.05;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2259,243,0 chrII 532659 . A G 2217 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.91;MQ0=0;QD=19.79;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2250,246,0 chrII 532705 . A T 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=53.6240;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;QD=27.34;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3390,340,0 chrII 532782 . G A 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3193,321,0 chrII 532827 . T G 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3543,363,0 chrII 532850 . C T 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3209,330,0 chrII 532864 . A C 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=26.37;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3118,321,0 chrII 532899 . T C 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3131,321,0 chrII 532929 . G A 3817.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3817,382,0 chrII 533002 . A G 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3822,396,0 chrII 533078 . A G 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.812;DP=99;Dels=0.00;FS=6.546;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1042,0,1012 chrII 533095 . A C 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.31;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2831,303,0 chrII 533102 . G A 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.10;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2786,288,0 chrII 533146 . G A 1969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=72.5576;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.73;MQ0=0;QD=26.25;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2002,201,0 chrII 533246 . A G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3231,327,0 chrII 533310 . G A 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.09;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3092,315,0 chrII 533325 . T C 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.48;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3068,330,0 chrII 533657 . C T 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3092,324,0 chrII 533723 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;DP=107;Dels=0.00;FS=0.839;HaplotypeScore=2.5838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.957;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1035,0,1181 chrII 533727 . A G 2446 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=26.02;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2479,255,0 chrII 533745 . T A 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.400;DP=96;Dels=0.00;FS=1.806;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.665;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.415;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,52:96:99:1049,0,931 chrII 533760 . T A 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;DP=101;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=3.6231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.248;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:989,0,1135 chrII 533767 . T C 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.000;DP=98;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=4.4950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.573;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.979;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:880,0,1174 chrII 534460 . T C 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.929;DP=133;Dels=0.00;FS=2.339;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.463;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1098,0,1554 chrII 534637 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.163;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1402,0,1478 chrII 534745 . T C 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2707,294,0 chrII 534922 . T C 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.884;DP=89;Dels=0.00;FS=5.426;HaplotypeScore=3.5076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:834,0,1032 chrII 535096 . A T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.320;DP=116;Dels=0.00;FS=6.272;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.327;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1350,0,1193 chrII 535193 . G A 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.035;DP=96;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.066;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1034,0,1034 chrII 535517 . C T 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3837,370,0 chrII 535535 . C T 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3408,331,0 chrII 535549 . A G 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3288,339,0 chrII 535736 . A G 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3247,336,0 chrII 535775 . T C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;DP=140;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.763;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1365,0,1418 chrII 535883 . G A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.103;DP=125;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.569;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1014,0,1514 chrII 535991 . C G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.453;DP=120;Dels=0.00;FS=1.469;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.323;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1098,0,1354 chrII 535995 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.744;DP=132;Dels=0.00;FS=3.143;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.768;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1319,0,1470 chrII 536426 . C A 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=104;Dels=0.00;FS=4.488;HaplotypeScore=5.9544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=26.36;ReadPosRankSum=1.599;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2774,268,0 chrII 536475 . G A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.548;DP=118;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=6.9433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.504;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1144,0,1269 chrII 536637 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.043;DP=127;Dels=0.00;FS=4.241;HaplotypeScore=5.6202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.297;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1232,0,1354 chrII 536661 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.224;DP=120;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.011;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1204,0,1273 chrII 536673 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.476;DP=119;Dels=0.00;FS=5.739;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.748;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:119:99:1301,0,1151 chrII 536700 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.898;DP=113;Dels=0.00;FS=8.851;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.020;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1226,0,1022 chrII 536726 . T C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.025;DP=121;Dels=0.00;FS=4.379;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.869;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.823;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1127,0,1371 chrII 536751 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.257;DP=125;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1208,0,1483 chrII 536808 . T A 3778.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3778,378,0 chrII 536917 . C T 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3247,330,0 chrII 537038 . C G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.905;DP=139;Dels=0.00;FS=2.135;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=2.336;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.672;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1509,0,1405 chrII 537174 . G A 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.46;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3672,370,0 chrII 537210 . G A 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4033,400,0 chrII 537282 . C T 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.37;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3254,330,0 chrII 537351 . C T 1532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.132;DP=73;Dels=0.00;FS=4.092;HaplotypeScore=5.9620;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.995;QD=20.99;ReadPosRankSum=-4.041;SB=-7.859e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,65:73:99:1565,162,0 chrII 537387 . G A 502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.309;DP=96;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=4.6485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.93;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.544;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:532,0,648 chrII 537535 . G A 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3169,313,0 chrII 537793 . G T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.284;DP=139;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.461;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1499,0,1376 chrII 537796 . A G 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3608,349,0 chrII 537821 . G A 4009.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4009,382,0 chrII 537829 . T C 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=23.95;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3473,369,0 chrII 537888 . G A 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.93;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3459,352,0 chrII 537962 . T A 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.49;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3672,379,0 chrII 537981 . T C 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.945;DP=142;Dels=0.00;FS=21.391;HaplotypeScore=4.2890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:142:99:1583,0,1380 chrII 538014 . C T 2697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.63;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2730,282,0 chrII 538023 . A G 2469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=24.94;ReadPosRankSum=1.137;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2502,245,0 chrII 538047 . G A 2362 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=25.67;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2395,255,0 chrII 538048 . A G 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.96;MQ0=0;QD=25.89;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2493,270,0 chrII 538328 . C G 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.172;DP=101;Dels=0.00;FS=3.184;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.109;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:798,0,1308 chrII 538427 . A C 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3399,345,0 chrII 538428 . C T 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3433,348,0 chrII 538483 . A G 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.871;DP=126;Dels=0.00;FS=6.854;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.152;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1334,0,1284 chrII 538507 . A G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.830;DP=126;Dels=0.00;FS=11.477;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.713;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1391,0,1264 chrII 538781 . A C 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.417;DP=158;Dels=0.00;FS=3.737;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=10.33;ReadPosRankSum=-3.190;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1662,0,1572 chrII 538836 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;DP=145;Dels=0.00;FS=4.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=7.61;ReadPosRankSum=-3.279;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,58:145:99:1134,0,1948 chrII 538837 . A G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.024;DP=148;Dels=0.00;FS=3.610;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=7.28;ReadPosRankSum=-3.431;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,60:148:99:1107,0,2041 chrII 538897 . A T 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3080,315,0 chrII 538919 . A C 2031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=23.62;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2064,222,0 chrII 538926 . G A 2214 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=22.82;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2247,231,0 chrII 538968 . T A 2748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2781,282,0 chrII 539105 . T C 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2762,288,0 chrII 539253 . G A 2056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=15.01;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:2089,216,0 chrII 539561 . C T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.531;DP=117;Dels=0.00;FS=3.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.611;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1033,0,1240 chrII 539637 . T C 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3280,336,0 chrII 539810 . A T 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3335,331,0 chrII 539825 . G T 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3260,324,0 chrII 539861 . A G 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2902,321,0 chrII 539908 . G A 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.250;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.528;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1612,0,1176 chrII 539971 . T A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.551;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.717;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1472,0,1615 chrII 540238 . A G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.694;DP=143;Dels=0.00;FS=5.037;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.264;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1485,0,1516 chrII 540296 . G A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.649;DP=131;Dels=0.00;FS=3.172;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.207;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:131:99:1362,0,1333 chrII 540405 . A G 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.241;DP=121;Dels=0.00;FS=2.456;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1505,0,1052 chrII 540838 . G A 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.96;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3089,309,0 chrII 541093 . C T 596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.477;DP=90;Dels=0.00;FS=1.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.010;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:626,0,875 chrII 541103 . A G 697.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.312;DP=88;Dels=0.00;FS=8.744;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.94;MQ0=0;MQRankSum=-4.828;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.715;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:727,0,916 chrII 541108 . A T 852.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.168;DP=100;Dels=0.00;FS=11.595;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQ0=0;MQRankSum=-3.692;QD=8.52;ReadPosRankSum=2.272;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:882,0,1045 chrII 541110 . G A 895.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.325;DP=100;Dels=0.00;FS=13.213;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQ0=0;MQRankSum=3.967;QD=8.95;ReadPosRankSum=-2.458;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:925,0,859 chrII 541111 . T A 888.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;DP=101;Dels=0.00;FS=13.412;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQ0=0;MQRankSum=4.738;QD=8.79;ReadPosRankSum=-2.544;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:918,0,885 chrII 541139 . G A 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.886;DP=100;Dels=0.00;FS=5.333;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.92;MQ0=0;MQRankSum=-5.171;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.228;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:100:99:856,0,1043 chrII 541145 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.213;DP=98;Dels=0.00;FS=4.144;HaplotypeScore=5.6733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.63;MQ0=0;MQRankSum=4.135;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.350;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1077,0,878 chrII 541156 . G A 636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.152;DP=94;Dels=0.00;FS=1.745;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=-3.461;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,41:94:99:666,0,1109 chrII 541186 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=95;Dels=0.00;FS=1.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:888,0,1152 chrII 541344 . T C 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.059;DP=107;Dels=0.00;FS=10.558;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQ0=0;MQRankSum=3.212;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.495;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1005,0,1177 chrII 541358 . C T 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.648;DP=111;Dels=0.00;FS=2.486;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:986,0,1272 chrII 541386 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.735;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.748;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1244,0,953 chrII 541425 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.642;DP=81;Dels=0.00;FS=1.857;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.130;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,49:81:99:1032,0,643 chrII 541490 . C A 76.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.284;DP=36;Dels=0.00;FS=25.388;HaplotypeScore=22.8665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.73;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.809;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:36:99:106,0,120 chrII 541493 . C T 87.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.262;DP=37;Dels=0.00;FS=32.622;HaplotypeScore=18.8955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:37:99:117,0,127 chrII 541494 . A G 87.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.142;DP=37;Dels=0.00;FS=34.771;HaplotypeScore=18.8969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.01;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:117,0,127 chrII 541502 . C T 245.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;DP=45;Dels=0.00;FS=37.223;HaplotypeScore=7.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.29;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:275,0,160 chrII 541503 . A G 245.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.265;DP=45;Dels=0.00;FS=37.223;HaplotypeScore=7.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.29;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.428;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:275,0,162 chrII 541521 . A T 123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;DP=47;Dels=0.00;FS=44.476;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.455;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:153,0,379 chrII 541524 . A G 123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.406;DP=48;Dels=0.00;FS=48.501;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=2.56;ReadPosRankSum=0.949;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:153,0,389 chrII 541574 . T A 94.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;DP=44;Dels=0.00;FS=21.908;HaplotypeScore=50.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.085;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.735;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:124,0,406 chrII 541579 . T G 115.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.601;DP=44;Dels=0.00;FS=16.893;HaplotypeScore=24.4633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.488;QD=2.61;ReadPosRankSum=-2.369;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:145,0,408 chrII 541582 . A G,T 573.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;DP=41;Dels=0.00;FS=18.865;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=39.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,19,20:41:99:633,433,409,200,0,149 chrII 541588 . C G 137.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;DP=44;Dels=0.00;FS=49.491;HaplotypeScore=10.8520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.597;QD=3.11;ReadPosRankSum=-2.720;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:44:99:167,0,396 chrII 541608 . T A 375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;DP=45;Dels=0.00;FS=4.246;HaplotypeScore=50.4969;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=8.33;ReadPosRankSum=-2.532;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,23:45:45:408,45,0 chrII 542052 . T G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.540;DP=137;Dels=0.00;FS=7.806;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,59:137:99:1176,0,1541 chrII 542121 . C T 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;DP=132;Dels=0.00;FS=9.443;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=1;MQRankSum=0.620;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.741;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,54:132:99:959,0,1662 chrII 542175 . A G 1846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.489;DP=167;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=1;MQRankSum=3.009;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.105;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,90:167:99:1876,0,1685 chrII 542283 . T C 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2981,309,0 chrII 542367 . G A 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.234;DP=175;Dels=0.00;FS=7.171;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.466;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,81:175:99:1638,0,1921 chrII 542402 . G A 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3676,381,0 chrII 542430 . G A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.517;DP=144;Dels=0.00;FS=2.972;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.703;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1364,0,1545 chrII 542433 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.623;DP=139;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.929;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1360,0,1544 chrII 542481 . A C 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.703;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.616;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3122,324,0 chrII 542486 . A G 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.408;DP=119;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.598;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1191,0,1361 chrII 542535 . G A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.031;DP=111;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=1;MQRankSum=-0.036;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1282,0,967 chrII 542592 . G A 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.652;DP=135;Dels=0.00;FS=10.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1689,0,1192 chrII 542664 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.746;DP=135;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=2.7171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=9.22;ReadPosRankSum=-2.414;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1275,0,1371 chrII 542895 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.504;DP=129;Dels=0.00;FS=7.264;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1350,0,1426 chrII 543006 . T C 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3681,375,0 chrII 543054 . T C 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.598;DP=162;Dels=0.00;FS=10.921;HaplotypeScore=3.9235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.281;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:1688,0,1704 chrII 543063 . A G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.522;DP=152;Dels=0.00;FS=11.470;HaplotypeScore=4.9129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.964;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1474,0,1703 chrII 543092 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.700;DP=142;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=2.6865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1333,0,1664 chrII 543129 . G A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.471;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1394,0,1495 chrII 543246 . T C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.544;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=9.83;ReadPosRankSum=-2.051;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1131,0,1243 chrII 543264 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.801;DP=135;Dels=0.00;FS=4.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.786;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1398,0,1473 chrII 543299 . A G 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=1;QD=24.57;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3636,381,0 chrII 543307 . C A 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;DP=139;Dels=0.00;FS=8.109;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=-0.314;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1588,0,1360 chrII 543363 . C T 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.749;DP=135;Dels=0.00;FS=14.930;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.819;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.364;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1558,0,1203 chrII 543393 . A G 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.722;DP=136;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=2.7761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.581;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1471,0,1371 chrII 543495 . C T 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.118;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.453;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1336,0,1443 chrII 543588 . T C 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.016;DP=134;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=6.5284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.494;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1394,0,1389 chrII 543997 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.222;DP=137;Dels=0.00;FS=4.050;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.890;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1512,0,1336 chrII 544134 . G A 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.505;DP=101;Dels=0.00;FS=13.289;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.153;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:998,0,1065 chrII 544218 . C G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;DP=130;Dels=0.00;FS=8.696;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.280;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1234,0,1473 chrII 544278 . C G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;DP=121;Dels=0.00;FS=2.338;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.512;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1074,0,1319 chrII 544298 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.511;DP=129;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.975;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1275,0,1441 chrII 544299 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.968;DP=128;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.166;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1248,0,1396 chrII 544459 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.113;DP=111;Dels=0.00;FS=3.501;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1112,0,1212 chrII 544475 . T A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.579;DP=106;Dels=0.00;FS=3.665;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.612;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.688;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1054,0,1167 chrII 544499 . C A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.219;DP=111;Dels=0.00;FS=7.421;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.418;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1242,0,1173 chrII 544514 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;DP=116;Dels=0.00;FS=10.144;HaplotypeScore=3.9723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1320,0,1132 chrII 544676 . T A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.122;DP=99;Dels=0.00;FS=2.060;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.493;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,54:99:99:1177,0,1014 chrII 544692 . G A 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;DP=91;Dels=0.00;FS=8.165;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.188;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1058,0,886 chrII 544772 . A G 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.667;DP=102;Dels=0.00;FS=1.729;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=-1.044;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:854,0,1274 chrII 544773 . G A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.517;DP=102;Dels=0.00;FS=1.729;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.243;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.853;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1267,0,895 chrII 544904 . C G 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=159;Dels=0.00;FS=2.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1707,0,1467 chrII 544912 . A G 1855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.516;DP=183;Dels=0.00;FS=3.400;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.237;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,97:183:99:1885,0,1796 chrII 544962 . C T 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.730;DP=146;Dels=0.01;FS=3.984;HaplotypeScore=5.1927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.874;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.777;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:145:99:1685,0,1371 chrII 544991 . C T 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.161;DP=140;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=3.4491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,81:140:99:1743,0,1141 chrII 545201 . C T 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.755;DP=104;Dels=0.00;FS=7.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.227;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:955,0,1228 chrII 545438 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.333;DP=145;Dels=0.00;FS=2.942;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.018;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1560,0,1534 chrII 545558 . C T 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.228;DP=122;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=4.3683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.267;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:122:99:861,0,1596 chrII 545774 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.144;DP=107;Dels=0.00;FS=1.983;HaplotypeScore=3.2505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.205;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1321,0,974 chrII 545985 . G A 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.55;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3081,309,0 chrII 545996 . A C 2746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2779,294,0 chrII 545997 . C A 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.301;DP=108;Dels=0.00;FS=15.246;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.071;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1043,0,1162 chrII 546010 . C T 2757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2790,288,0 chrII 546015 . A C 2680 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2713,285,0 chrII 546118 . C A 3820.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.61;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3820,397,0 chrII 546124 . T C 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.02;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3745,405,0 chrII 546140 . A T 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3739,390,0 chrII 546224 . T C 2598 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2631,273,0 chrII 546316 . A G 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2947,321,0 chrII 546732 . C G 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.892;DP=148;Dels=0.00;FS=3.002;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.849;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1512,0,1417 chrII 546739 . G A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;DP=147;Dels=0.00;FS=2.234;HaplotypeScore=2.7547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.657;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1582,0,1506 chrII 546889 . T A 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.259;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:1795,0,1189 chrII 546933 . A G 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7084;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3568,372,0 chrII 547137 . A G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;DP=135;Dels=0.00;FS=4.160;HaplotypeScore=9.4895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1213,0,1526 chrII 547559 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.272;DP=127;Dels=0.00;FS=3.279;HaplotypeScore=4.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.580;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1260,0,1376 chrII 547596 . G A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.981;DP=146;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1542,0,1437 chrII 547617 . C T 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.792;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1788,0,1379 chrII 547630 . C T 1484.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.797;DP=160;Dels=0.00;FS=1.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1514,0,1642 chrII 547633 . G T 1703.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.665;DP=160;Dels=0.00;FS=1.230;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.533;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,83:160:99:1733,0,1551 chrII 547636 . C T 1694.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.368;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1724,0,1457 chrII 547945 . G A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.228;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1440,0,1673 chrII 547966 . A G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.866;DP=155;Dels=0.00;FS=2.024;HaplotypeScore=2.7413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.109;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1444,0,1772 chrII 548011 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.803;DP=130;Dels=0.00;FS=3.173;HaplotypeScore=5.6334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.002;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1216,0,1493 chrII 548044 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.651;DP=137;Dels=0.00;FS=4.045;HaplotypeScore=2.9470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.081;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1152,0,1747 chrII 548176 . G A 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.907;DP=142;Dels=0.00;FS=3.156;HaplotypeScore=3.6327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.118;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1703,0,1298 chrII 548206 . C T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.952;DP=126;Dels=0.00;FS=7.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1292,0,1361 chrII 548239 . G A 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.043;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.881;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1354,0,1201 chrII 548249 . C T 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3179,321,0 chrII 548258 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.323;DP=121;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.709;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1328,0,1242 chrII 548289 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.915;DP=124;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=4.0280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.495;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1092,0,1350 chrII 548425 . T C 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3166,336,0 chrII 548443 . T C 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3146,333,0 chrII 549084 . T A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;DP=119;Dels=0.00;FS=8.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.172;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1285,0,1334 chrII 549229 . G A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;DP=129;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.353;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1203,0,1454 chrII 549310 . A T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;DP=125;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1327,0,1275 chrII 549465 . G T 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.386;DP=176;Dels=0.00;FS=2.636;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.64;MQ0=0;MQRankSum=-4.060;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.391;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,80:176:99:1523,0,2010 chrII 549466 . C A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.668;DP=167;Dels=0.00;FS=1.918;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.28;MQ0=0;MQRankSum=-6.292;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.870;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,75:167:99:1523,0,1953 chrII 549489 . C T 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.564;DP=158;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.50;MQ0=0;MQRankSum=-7.027;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.110;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1410,0,1571 chrII 549494 . G A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.555;DP=159;Dels=0.00;FS=3.700;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.22;MQ0=0;MQRankSum=-6.095;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,82:159:99:1428,0,1660 chrII 549503 . T C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.571;DP=152;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.19;MQ0=0;MQRankSum=-6.788;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.286;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1355,0,1630 chrII 549535 . A C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.573;DP=126;Dels=0.00;FS=8.043;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-5.294;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1204,0,1300 chrII 549576 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;DP=139;Dels=0.00;FS=13.206;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1477,0,1488 chrII 549769 . G A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.006;DP=130;Dels=0.00;FS=9.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.255;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1429,0,1385 chrII 549815 . A G 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.875;DP=140;Dels=0.00;FS=3.099;HaplotypeScore=5.4185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=10.82;ReadPosRankSum=-2.131;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1545,0,1450 chrII 550110 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.815;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.784;QD=8.10;ReadPosRankSum=-2.705;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1164,0,1442 chrII 550124 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.107;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1324,0,1731 chrII 550133 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.057;DP=154;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:154:99:1484,0,1518 chrII 550142 . T C 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.288;DP=182;Dels=0.00;FS=1.160;HaplotypeScore=3.5089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.017;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,90:182:99:1629,0,1943 chrII 550241 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.696;DP=129;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=3.6453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:129:99:1376,0,1341 chrII 550268 . C T 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.472;DP=116;Dels=0.00;FS=1.651;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.964;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1333,0,1206 chrII 550330 . C A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.386;DP=119;Dels=0.00;FS=8.721;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=10.20;ReadPosRankSum=-2.453;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1244,0,1220 chrII 550736 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.329;DP=114;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.030;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1430,0,941 chrII 550847 . A C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.127;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.279;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1166,0,1525 chrII 550907 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.347;DP=129;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=6.8539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.391;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:129:99:1238,0,1413 chrII 550916 . A T 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.439;DP=124;Dels=0.00;FS=5.538;HaplotypeScore=5.8645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.610;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1216,0,1454 chrII 551016 . C T 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.006;DP=173;Dels=0.00;FS=1.218;HaplotypeScore=9.3570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,91:173:99:1901,0,1583 chrII 551109 . A G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.160;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1315,0,1559 chrII 551302 . A G 727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.737;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.325;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:757,0,748 chrII 551347 . G A 696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.243;DP=85;Dels=0.00;FS=0.836;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=8.19;ReadPosRankSum=2.344;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:726,0,994 chrII 551377 . A G 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.200;DP=77;Dels=0.00;FS=0.884;HaplotypeScore=7.7148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,35:77:99:701,0,882 chrII 551397 . A G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.251;DP=128;Dels=0.00;FS=4.329;HaplotypeScore=5.0784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=9.88;ReadPosRankSum=-2.729;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1295,0,1242 chrII 551704 . C T 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.337;DP=77;Dels=0.00;FS=4.380;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.913;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:801,0,852 chrII 551855 . G C 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.605;DP=144;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.881;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,85:144:99:1673,0,1165 chrII 552046 . C T 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.827;DP=145;Dels=0.00;FS=1.343;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,83:145:99:1872,0,1244 chrII 552407 . A G 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.142;DP=164;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=7.6110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.270;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,62:164:99:1205,0,2249 chrII 552503 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.292;DP=136;Dels=0.00;FS=10.503;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1217,0,1496 chrII 552671 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.942;DP=116;Dels=0.00;FS=13.554;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1249,0,1269 chrII 552681 . G A 1215.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.901;DP=119;Dels=0.00;FS=6.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1245,0,1264 chrII 552684 . C T 1199.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.817;DP=112;Dels=0.00;FS=7.483;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.049;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1229,0,1124 chrII 552685 . C T 1129.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;DP=112;Dels=0.00;FS=7.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.437;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1159,0,1215 chrII 552703 . T C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.031;DP=137;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.270;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:137:99:1407,0,1413 chrII 552727 . T G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.752;DP=137;Dels=0.00;FS=4.564;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1371,0,1516 chrII 552811 . G A 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.651;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.578;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1564,0,1401 chrII 552889 . G A 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.941;DP=122;Dels=0.00;FS=3.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.106;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:122:99:1588,0,943 chrII 553211 . T G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.539;DP=117;Dels=0.00;FS=2.540;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.739;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1357,0,1065 chrII 553227 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.764;DP=121;Dels=0.00;FS=4.779;HaplotypeScore=4.7851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=11.16;ReadPosRankSum=2.046;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1380,0,1171 chrII 553255 . C T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.545;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.844;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:1184,0,723 chrII 553403 . A G 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.130;DP=128;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=2.071;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1359,0,1389 chrII 553479 . C G 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;DP=129;Dels=0.00;FS=7.142;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=11.59;ReadPosRankSum=-2.364;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1525,0,1141 chrII 553663 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.429;DP=143;Dels=0.00;FS=9.131;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=9.20;ReadPosRankSum=2.541;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1346,0,1623 chrII 553726 . G A 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.699;DP=112;Dels=0.00;FS=1.640;HaplotypeScore=2.8026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.547;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:977,0,1363 chrII 553780 . G A 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.028;DP=155;Dels=0.00;FS=1.298;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=0.944;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.075;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1515,0,1785 chrII 553783 . A G 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=0.535;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.768;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1518,0,1733 chrII 553854 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.271;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=1;MQRankSum=0.089;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1214,0,1528 chrII 553921 . A G 1870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.490;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.130;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,99:161:99:1900,0,1313 chrII 554133 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.681;DP=149;Dels=0.00;FS=2.055;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1378,0,1778 chrII 554441 . T C 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3685,393,0 chrII 554460 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.231;DP=121;Dels=0.00;FS=8.589;HaplotypeScore=4.9505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=1;MQRankSum=-1.333;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.378;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1246,0,1284 chrII 554537 . G A 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=1;QD=27.10;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3550,366,0 chrII 554599 . T C 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3007,318,0 chrII 554815 . T C 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3391,357,0 chrII 554862 . T C 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3199,339,0 chrII 555375 . A C 1107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=16.7722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=11.07;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:1140,123,0 chrII 555518 . G A 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.41;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3215,324,0 chrII 555562 . G A 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=100.4170;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;QD=25.21;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3058,318,0 chrII 555569 . A G 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=98.2063;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=24.10;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3022,336,0 chrII 555623 . C G 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3712,393,0 chrII 555624 . A G 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3659,393,0 chrII 555819 . C T 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2674,270,0 chrII 555881 . G T 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3546,346,0 chrII 555964 . G A 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.137;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:105:99:787,0,1403 chrII 556105 . G A 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.343;DP=143;Dels=0.00;FS=2.256;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.334;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1625,0,1337 chrII 556110 . G A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.331;DP=142;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.592;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1408,0,1487 chrII 556141 . C G 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.603;DP=151;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=4.7410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=2.703;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1668,0,1364 chrII 556201 . A G 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.071;DP=144;Dels=0.00;FS=2.231;HaplotypeScore=79.0302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.222;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.112;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,61:144:99:1121,0,1741 chrII 556272 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.118;DP=136;Dels=0.00;FS=9.400;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.003;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,54:136:99:1093,0,1953 chrII 556275 . A G 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;DP=136;Dels=0.00;FS=9.454;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=7.74;ReadPosRankSum=1.102;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,53:136:99:1083,0,1924 chrII 556310 . C A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.822;DP=145;Dels=0.00;FS=3.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=8.29;ReadPosRankSum=-2.331;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1232,0,1734 chrII 556539 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.016;DP=162;Dels=0.00;FS=11.221;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.447;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,75:162:99:1494,0,1862 chrII 556857 . T C 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3392;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3345,348,0 chrII 556887 . T C 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2907,309,0 chrII 557204 . G T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.527;DP=134;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.439;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.547;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1506,0,1241 chrII 557225 . G A 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3840,373,0 chrII 557246 . A G 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3342,345,0 chrII 557317 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.630;DP=135;Dels=0.00;FS=6.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1495,0,1265 chrII 557352 . C T 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3458,334,0 chrII 557651 . T A 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3306,339,0 chrII 557658 . A G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.492;DP=119;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.822;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1111,0,1369 chrII 557763 . G C 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3281,339,0 chrII 558378 . C T 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.116;DP=91;Dels=0.00;FS=5.413;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.708;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:91:99:790,0,1104 chrII 558380 . G C 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.899;DP=92;Dels=0.00;FS=5.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:787,0,1047 chrII 558397 . T C 722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;DP=86;Dels=0.00;FS=10.670;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.178;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:752,0,1064 chrII 558401 . C T 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.312;DP=92;Dels=0.00;FS=12.448;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.059;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,40:92:99:804,0,1131 chrII 558471 . A G 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.790;DP=94;Dels=0.00;FS=8.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.492;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:894,0,1072 chrII 558499 . T C 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.735;DP=114;Dels=0.00;FS=5.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.846;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.097;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1038,0,1450 chrII 558504 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.100;DP=106;Dels=0.00;FS=5.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:1005,0,1286 chrII 558576 . T C 2599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.031;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.575;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:111:99:2632,273,0 chrII 558582 . G A 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.158;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:98:99:964,0,922 chrII 558597 . A C 1919 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.26;MQ0=0;QD=22.31;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1952,213,0 chrII 558866 . C G 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=23.42;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2703,279,0 chrII 558881 . C T 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2945,303,0 chrII 559000 . C T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3019,298,0 chrII 559131 . T C 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3345,342,0 chrII 559186 . A G 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3026,318,0 chrII 559359 . T C 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.823;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.827;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1415,0,1070 chrII 559378 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;DP=118;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=2.0234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=9.66;ReadPosRankSum=2.713;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:118:99:1170,0,1315 chrII 559515 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.623;DP=110;Dels=0.00;FS=1.803;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1349,0,1005 chrII 559650 . C T 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.640;DP=84;Dels=0.00;FS=2.948;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.617;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:870,0,882 chrII 559695 . A G 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.143;DP=97;Dels=0.00;FS=0.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:895,0,1073 chrII 559732 . T C 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.088;DP=94;Dels=0.00;FS=2.053;HaplotypeScore=7.7267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.374;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:760,0,1005 chrII 559922 . C G 2031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.303;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=34.1150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.126;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:81:99:2064,195,0 chrII 559960 . C T 406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.714;DP=49;Dels=0.00;FS=10.441;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.673;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:436,0,451 chrII 560022 . C A 597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.831;DP=69;Dels=0.00;FS=8.746;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.502;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:627,0,732 chrII 560167 . T A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.737;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1345,0,1361 chrII 560494 . G C 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.483;DP=122;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=10.74;ReadPosRankSum=-2.351;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1340,0,1149 chrII 560960 . T C 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.126;DP=138;Dels=0.00;FS=7.919;HaplotypeScore=5.8112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.339;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1315,0,1466 chrII 560987 . A G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.907;DP=127;Dels=0.00;FS=8.170;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1222,0,1442 chrII 561284 . T A 444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.862;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQ0=0;MQRankSum=3.686;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.460;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:474,0,602 chrII 561879 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.676;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.304;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1175,0,1422 chrII 562338 . A C 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.879;DP=174;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,78:174:99:1594,0,2021 chrII 562452 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.764;DP=110;Dels=0.00;FS=10.768;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.964;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1256,0,1140 chrII 562617 . T C 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.906;DP=150;Dels=0.01;FS=2.911;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.350;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1394,0,1748 chrII 562763 . G A 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.593;DP=165;Dels=0.00;FS=3.205;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.341;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1657,0,1936 chrII 562894 . A G 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.713;DP=125;Dels=0.00;FS=4.343;HaplotypeScore=3.8698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=12.00;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:125:99:1530,0,1080 chrII 562936 . C T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.881;DP=102;Dels=0.00;FS=2.591;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.207;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1252,0,942 chrII 562937 . C T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.399;DP=100;Dels=0.00;FS=1.621;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.746;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1250,0,912 chrII 562975 . G A 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;DP=101;Dels=0.00;FS=4.254;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:917,0,1070 chrII 562976 . A G 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.032;DP=97;Dels=0.00;FS=5.666;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:913,0,1044 chrII 563013 . T A 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.311;DP=123;Dels=0.00;FS=21.960;HaplotypeScore=51.2676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.241;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:939,0,1038 chrII 563175 . A T 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;DP=122;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1178,0,1367 chrII 563201 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.063;DP=104;Dels=0.00;FS=1.865;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.802;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:104:99:1074,0,1103 chrII 563203 . C T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.535;DP=110;Dels=0.00;FS=2.777;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=2.007;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1102,0,1199 chrII 563317 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.815;DP=122;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.599;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1175,0,1278 chrII 563527 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.167;DP=121;Dels=0.00;FS=4.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=9.90;ReadPosRankSum=-2.533;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1228,0,1355 chrII 563969 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.067;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1473,0,1546 chrII 564550 . C G 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;DP=138;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=4.7582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.054;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:1651,0,1246 chrII 564636 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.410;DP=99;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.096;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:99:99:1034,0,943 chrII 564639 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.822;DP=97;Dels=0.00;FS=2.773;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.054;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1140,0,963 chrII 564727 . G C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;DP=93;Dels=0.00;FS=5.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.366;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1127,0,852 chrII 564882 . G C 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.476;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:807,0,994 chrII 564925 . G A 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.638;DP=94;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=2.7772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.004;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:94:99:913,0,1035 chrII 565037 . C T 563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.340;DP=94;Dels=0.00;FS=10.535;HaplotypeScore=2.8139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.846;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,31:94:99:593,0,1286 chrII 565040 . A C 523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.450;DP=94;Dels=0.00;FS=8.536;HaplotypeScore=2.8139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.986;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,31:94:99:553,0,1367 chrII 565153 . A G 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.245;DP=139;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=3.322;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1282,0,1576 chrII 565250 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.254;DP=131;Dels=0.00;FS=1.558;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.934;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:1147,0,1719 chrII 565493 . C T 2791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2824,270,0 chrII 565566 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.769;DP=110;Dels=0.00;FS=6.207;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.416;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1254,0,1087 chrII 565627 . G A 678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.544;DP=97;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=5.5659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:708,0,1104 chrII 565630 . G A 642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.338;DP=90;Dels=0.00;FS=1.754;HaplotypeScore=3.3255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.236;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:672,0,1155 chrII 565711 . T C 617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.093;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=1;MQRankSum=0.919;QD=5.93;ReadPosRankSum=2.027;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,38:104:99:647,0,1481 chrII 565735 . G A 735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.880;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.603;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:765,0,1260 chrII 565750 . T C 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.570;DP=96;Dels=0.00;FS=3.870;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:786,0,1244 chrII 565856 . C T 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.933;DP=106;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.796;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:907,0,1340 chrII 566056 . T C 3936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3936,402,0 chrII 566061 . G A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.908;DP=150;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.478;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:1221,0,1904 chrII 568766 . A T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;DP=128;Dels=0.00;FS=7.405;HaplotypeScore=6.7705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.004;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1252,0,1536 chrII 569064 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.511;DP=105;Dels=0.00;FS=2.770;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.363;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1053,0,1192 chrII 569301 . T A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;DP=112;Dels=0.00;FS=10.537;HaplotypeScore=2.5212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.543;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:112:99:956,0,1167 chrII 569302 . T C 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.842;DP=122;Dels=0.00;FS=8.393;HaplotypeScore=2.5212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=7.43;ReadPosRankSum=-1.602;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:936,0,1324 chrII 569460 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.178;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.686;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1302,0,1372 chrII 569582 . T C 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.481;DP=118;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1010,0,1418 chrII 569811 . C T 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.975;DP=103;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:992,0,1186 chrII 569856 . T G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.653;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.979;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1215,0,1194 chrII 569872 . G C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1154,0,1213 chrII 570247 . C T 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.249;DP=120;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.624;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:120:99:926,0,1539 chrII 570256 . G A 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3041,312,0 chrII 570264 . T C 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.13;MQ0=0;QD=22.02;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3006,318,0 chrII 570267 . C T 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.32;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3426,360,0 chrII 570301 . A G 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3331,351,0 chrII 570508 . G T 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3312,328,0 chrII 570582 . A G 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.172;DP=115;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.581;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1131,0,1290 chrII 571034 . G A 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.788;DP=177;Dels=0.00;FS=4.349;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.351;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,88:177:99:1803,0,1733 chrII 571050 . G A 1912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.865;DP=178;Dels=0.00;FS=4.419;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,94:178:99:1942,0,1647 chrII 571089 . C T 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;DP=131;Dels=0.00;FS=3.391;HaplotypeScore=7.9084;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=25.73;ReadPosRankSum=1.494;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3370,345,0 chrII 571411 . A G 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3527,372,0 chrII 571717 . T G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.554;DP=130;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=2.3620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1404,0,1202 chrII 571870 . T G 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.072;DP=141;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.769;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1536,0,1416 chrII 571949 . T C 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.572;DP=108;Dels=0.00;FS=6.078;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:966,0,1241 chrII 571983 . A G 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.076;DP=137;Dels=0.00;FS=9.837;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1654,0,1278 chrII 572114 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.096;DP=111;Dels=0.00;FS=4.657;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.015;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1217,0,1159 chrII 572123 . T C 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.807;DP=123;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1367,0,1268 chrII 572340 . G T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.162;DP=93;Dels=0.00;FS=1.861;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.288;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:990,0,1065 chrII 572944 . A G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.467;DP=115;Dels=0.01;FS=0.711;HaplotypeScore=3.7804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.378;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1195,0,1154 chrII 572996 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.110;DP=118;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1232,0,1249 chrII 573399 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.924;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1063,0,934 chrII 573446 . G A 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3339,337,0 chrII 573536 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.828;DP=129;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1228,0,1486 chrII 573554 . G A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.289;DP=151;Dels=0.00;FS=3.850;HaplotypeScore=6.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1579,0,1611 chrII 573621 . C A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.065;DP=135;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=7.7095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.202;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.202;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1162,0,1669 chrII 573669 . G T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.918;DP=107;Dels=0.00;FS=3.544;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.078;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1272,0,1048 chrII 573743 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.931;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.857;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1458,0,1402 chrII 573792 . A T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;DP=138;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.716;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1460,0,1447 chrII 573799 . T G 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.969;DP=135;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.461;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1450,0,1398 chrII 573826 . G A 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8723;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3256,342,0 chrII 573868 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.629;DP=110;Dels=0.00;FS=1.582;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.789;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1109,0,1266 chrII 573886 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.481;DP=118;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.959;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1060,0,1328 chrII 573907 . A G 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.693;DP=115;Dels=0.00;FS=4.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.919;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:949,0,1557 chrII 573913 . G T 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.782;DP=114;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1441,0,958 chrII 573927 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.686;DP=116;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1360,0,1012 chrII 574371 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1205,0,1188 chrII 574556 . T G 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.167;DP=135;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.760;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.658;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1574,0,1262 chrII 574593 . C A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.795;DP=145;Dels=0.00;FS=2.121;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=-1.594;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.090;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1351,0,1653 chrII 574678 . C T 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.591;DP=126;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.267;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1457,0,1290 chrII 574683 . A G 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.760;DP=137;Dels=0.00;FS=4.035;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.062;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1356,0,1537 chrII 574755 . G A 1926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.793;DP=164;Dels=0.00;FS=6.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.544;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,90:164:99:1956,0,1450 chrII 574962 . G T 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3920,402,0 chrII 574996 . T C 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.747;DP=162;Dels=0.00;FS=3.778;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=11.54;ReadPosRankSum=-2.180;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,94:162:99:1899,0,1474 chrII 575422 . G A 1127.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.673;DP=142;Dels=0.00;FS=33.173;HaplotypeScore=3.2923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-3.134;QD=7.94;ReadPosRankSum=-2.107;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:1157,0,1824 chrII 575423 . G A 1136.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.555;DP=131;Dels=0.00;FS=32.238;HaplotypeScore=4.0810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.199;QD=8.67;ReadPosRankSum=-2.409;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1166,0,1612 chrII 575427 . T A 989.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;DP=124;Dels=0.00;FS=28.476;HaplotypeScore=6.0822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.402;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.427;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,51:124:99:1019,0,1605 chrII 575460 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.536;DP=138;Dels=0.00;FS=18.115;HaplotypeScore=5.4519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.966;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,55:138:99:1055,0,1712 chrII 575523 . G A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.570;DP=114;Dels=0.00;FS=2.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:850,0,1433 chrII 575601 . C T 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.890;DP=134;Dels=0.00;FS=14.384;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.385;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1604,0,1156 chrII 575685 . C G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.133;DP=118;Dels=0.00;FS=15.299;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.572;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,70:118:99:1461,0,939 chrII 575784 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.656;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.554;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1150,0,1111 chrII 575877 . G C 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;DP=126;Dels=0.00;FS=3.405;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1249,0,1330 chrII 575882 . A C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.986;DP=131;Dels=0.00;FS=4.781;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1107,0,1442 chrII 575949 . T C 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.939;DP=152;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.981;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.475;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,54:152:99:961,0,2109 chrII 576022 . G A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.332;DP=124;Dels=0.00;FS=8.230;HaplotypeScore=111.1484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.525;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.640;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1104,0,1450 chrII 576057 . A G 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;DP=130;Dels=0.00;FS=28.523;HaplotypeScore=5.2373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.979;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1029,0,1227 chrII 576135 . G A 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.761;DP=114;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.274;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1094,0,1349 chrII 576166 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.607;DP=114;Dels=0.00;FS=10.448;HaplotypeScore=4.9377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:114:99:1286,0,1110 chrII 576434 . A G 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.809;DP=110;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.306;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1005,0,1177 chrII 576971 . G A 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=109;Dels=0.00;FS=13.030;HaplotypeScore=4.6327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.723;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.500;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:109:99:994,0,1218 chrII 576997 . T C 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.106;DP=121;Dels=0.00;FS=7.171;HaplotypeScore=3.8754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:121:99:901,0,1490 chrII 577235 . T A 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.132;DP=153;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.880;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1589,0,1690 chrII 577418 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.636;DP=140;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=2.9156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1401,0,1470 chrII 577738 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.200;DP=146;Dels=0.00;FS=2.136;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.946;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:146:99:1328,0,1605 chrII 578174 . A C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;DP=114;Dels=0.00;FS=2.604;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.796;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1180,0,1232 chrII 578954 . A G 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.031;DP=138;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1354,0,1646 chrII 579038 . A C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;DP=101;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1117,0,1049 chrII 579082 . G A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.277;DP=138;Dels=0.00;FS=3.187;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.923;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,54:138:99:1080,0,1805 chrII 579131 . A G 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.118;DP=124;Dels=0.00;FS=5.730;HaplotypeScore=8.9425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,76:124:99:1696,0,994 chrII 579408 . G T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.825;DP=137;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.785;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1180,0,1628 chrII 579996 . G A 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.587;DP=137;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.923;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1557,0,1292 chrII 580772 . G A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.472;DP=147;Dels=0.00;FS=2.975;HaplotypeScore=2.8112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.170;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1284,0,1709 chrII 580868 . T C 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4109,429,0 chrII 581091 . A C 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3844,423,0 chrII 581460 . A G 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3877,396,0 chrII 581465 . A G 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3696,384,0 chrII 581942 . G T 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.532;DP=182;Dels=0.00;FS=7.481;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.563;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,87:182:99:1775,0,1935 chrII 582285 . T C 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3805,408,0 chrII 582334 . T G 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3547,366,0 chrII 582375 . T A 2672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2705,282,0 chrII 582406 . A G 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.909;DP=100;Dels=0.00;FS=2.683;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1058,0,1074 chrII 582433 . G A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.743;DP=110;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.398;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1172,0,1157 chrII 582458 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.288;DP=113;Dels=0.00;FS=7.210;HaplotypeScore=6.6906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1234,0,1087 chrII 582470 . A T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.283;DP=114;Dels=0.00;FS=4.513;HaplotypeScore=4.8831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1366,0,1098 chrII 582806 . A G 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.029;DP=129;Dels=0.00;FS=4.408;HaplotypeScore=4.7785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=1;MQRankSum=1.491;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.184;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1475,0,1257 chrII 583100 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.670;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=7.74;ReadPosRankSum=-2.356;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,71:162:99:1284,0,1982 chrII 583262 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.359;DP=132;Dels=0.00;FS=2.435;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=0.474;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:132:99:1279,0,1472 chrII 583267 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.256;DP=132;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=0.607;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.377;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1334,0,1461 chrII 583514 . T C 608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.242;DP=116;Dels=0.00;FS=2.553;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-5.310;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.920;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,43:116:99:638,0,1590 chrII 583576 . T A 717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;DP=127;Dels=0.00;FS=7.362;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-5.327;QD=5.65;ReadPosRankSum=-2.935;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:747,0,1430 chrII 583619 . A T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.439;DP=119;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=2.3039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQ0=0;MQRankSum=5.238;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.580;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1130,0,1043 chrII 583825 . T G 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3720,390,0 chrII 583826 . T G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.290;DP=151;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=7.2720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.874;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1433,0,1618 chrII 583912 . G A 1834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.181;DP=200;Dels=0.00;FS=10.619;HaplotypeScore=3.3326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.991;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,87:200:99:1864,0,2342 chrII 583984 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.489;DP=174;Dels=0.00;FS=1.922;HaplotypeScore=3.4771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.379;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,70:174:99:1312,0,2277 chrII 584093 . A G 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.676;DP=153;Dels=0.00;FS=6.377;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.956;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,87:153:99:1727,0,1468 chrII 584397 . C T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.488;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=-0.477;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.394;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1624,0,1285 chrII 584634 . C T 1766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.650;DP=156;Dels=0.00;FS=4.172;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.267;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:156:99:1796,0,1560 chrII 584764 . G A 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.459;DP=114;Dels=0.00;FS=4.545;HaplotypeScore=3.6538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.735;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1167,0,1306 chrII 585012 . C T 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.413;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.076;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:1774,0,1571 chrII 585092 . G A 2114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.360;DP=197;Dels=0.00;FS=11.034;HaplotypeScore=9.2448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.349;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,102:197:99:2144,0,1934 chrII 585569 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.080;DP=131;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=2;MQRankSum=-0.831;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.580;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1168,0,1485 chrII 585769 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=1;QD=25.34;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2922,297,0 chrII 585814 . C T 2571 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2604,261,0 chrII 585983 . T C 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.563;DP=93;Dels=0.00;FS=3.917;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:937,0,970 chrII 586072 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.831;DP=110;Dels=0.00;FS=3.541;HaplotypeScore=2.4905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.329;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.027;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1228,0,953 chrII 586133 . G A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.791;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.736;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1304,0,1251 chrII 586153 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.992;DP=126;Dels=0.00;FS=5.491;HaplotypeScore=4.9670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.952;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1162,0,1445 chrII 586221 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.173;DP=120;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.665;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1305,0,1199 chrII 586315 . G C 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;DP=92;Dels=0.00;FS=9.364;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:981,0,839 chrII 586488 . A T 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.017;DP=136;Dels=0.00;FS=5.206;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.480;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1520,0,1237 chrII 586853 . A G 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.701;DP=124;Dels=0.00;FS=5.693;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.609;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,75:124:99:1581,0,1030 chrII 586961 . C T 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.239;DP=175;Dels=0.00;FS=1.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,87:175:99:1730,0,1819 chrII 586964 . A T 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.512;DP=171;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,85:171:99:1736,0,1860 chrII 587130 . G T 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.927;DP=120;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,43:120:99:849,0,1712 chrII 587279 . A G 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.544;DP=106;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:919,0,1273 chrII 587405 . C T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.277;DP=134;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=4.6341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1310,0,1352 chrII 587432 . A T 1780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.151;DP=176;Dels=0.00;FS=4.469;HaplotypeScore=4.0782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,91:176:99:1810,0,1759 chrII 587830 . G C 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2681,294,0 chrII 588089 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.766;DP=123;Dels=0.00;FS=4.338;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.045;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1286,0,1301 chrII 588182 . T C 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.914;DP=147;Dels=0.00;FS=5.067;HaplotypeScore=6.6329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.515;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:147:99:1743,0,1324 chrII 588254 . C T 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.020;DP=132;Dels=0.00;FS=3.303;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1222,0,1532 chrII 588326 . C T 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.502;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.623;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1692,0,1085 chrII 588329 . G C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.591;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.513;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1413,0,1065 chrII 588368 . A C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.812;DP=125;Dels=0.00;FS=5.839;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1172,0,1277 chrII 588727 . G C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.652;DP=127;Dels=0.00;FS=2.326;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.142;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1362,0,1178 chrII 588752 . C T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.835;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.933;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1527,0,1404 chrII 588763 . T C 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.406;DP=145;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1626,0,1495 chrII 588892 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.970;DP=146;Dels=0.00;FS=6.253;HaplotypeScore=3.6589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=1;MQRankSum=0.156;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1511,0,1510 chrII 588941 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.259;DP=128;Dels=0.00;FS=4.282;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=-1.218;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.538;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1302,0,1286 chrII 589117 . T C 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.544;DP=156;Dels=0.00;FS=4.660;HaplotypeScore=5.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.699;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1637,0,1631 chrII 589145 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.033;DP=139;Dels=0.00;FS=2.166;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.044;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1474,0,1475 chrII 589164 . T C 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2987,315,0 chrII 589328 . T C 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.010;DP=157;Dels=0.00;FS=5.058;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=9.03;ReadPosRankSum=-2.294;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,78:157:99:1447,0,1666 chrII 589354 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.653;DP=158;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.542;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,67:158:99:1264,0,2016 chrII 589381 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.435;DP=138;Dels=0.01;FS=3.277;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.133;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:137:99:1148,0,1750 chrII 589394 . G A 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3040,315,0 chrII 589399 . A G 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.568;DP=116;Dels=0.00;FS=9.127;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.264;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:939,0,1487 chrII 589436 . A G 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.797;DP=149;Dels=0.00;FS=4.210;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.591;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1402,0,1779 chrII 589450 . T C 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.046;DP=156;Dels=0.00;FS=1.557;HaplotypeScore=2.6014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.829;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1544,0,1680 chrII 589471 . A G 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.690;DP=154;Dels=0.00;FS=2.545;HaplotypeScore=3.6326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1665,0,1611 chrII 589487 . C T 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.706;DP=160;Dels=0.00;FS=5.415;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.814;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1898,0,1505 chrII 589532 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.259;DP=136;Dels=0.00;FS=5.630;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1481,0,1156 chrII 589590 . G T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.429;DP=125;Dels=0.00;FS=5.481;HaplotypeScore=3.1989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.331;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1287,0,1170 chrII 589593 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.784;DP=124;Dels=0.00;FS=5.554;HaplotypeScore=2.4649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.014;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1277,0,1104 chrII 589671 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.445;DP=110;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1330,0,1073 chrII 589837 . C T 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.607;DP=111;Dels=0.00;FS=2.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.310;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1154,0,1195 chrII 589871 . A G 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.37;MQ0=0;QD=24.65;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2745,309,0 chrII 589872 . G T 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.37;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2935,309,0 chrII 589895 . T C 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.55;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3008,324,0 chrII 589941 . G A 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3945,394,0 chrII 590112 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.371;DP=134;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1366,0,1377 chrII 590223 . T C 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.491;DP=161;Dels=0.00;FS=1.241;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.750;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1538,0,1813 chrII 590242 . G T 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.881;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.450;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,81:144:99:1767,0,1192 chrII 590654 . A G 3941.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;DP=153;Dels=0.00;FS=5.315;HaplotypeScore=3.9503;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=25.76;ReadPosRankSum=1.438;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3941,414,0 chrII 590742 . C T 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3114,316,0 chrII 590853 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.250;DP=128;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1103,0,1487 chrII 590898 . C T 4824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.65;SB=-2.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4824,469,0 chrII 590982 . T C 3911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3911,414,0 chrII 591204 . T C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.751;DP=157;Dels=0.00;FS=8.261;HaplotypeScore=4.0681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.054;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1586,0,1698 chrII 591250 . T C 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.852;DP=116;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=3.7065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:116:99:1251,0,1222 chrII 591285 . T C 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.508;DP=160;Dels=0.00;FS=3.723;HaplotypeScore=3.5763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:160:99:1453,0,1785 chrII 591323 . C T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.223;DP=165;Dels=0.00;FS=5.201;HaplotypeScore=2.3913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.777;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.044;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,67:165:99:1357,0,2106 chrII 591378 . C A 3755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.564;DP=144;Dels=0.00;FS=3.323;HaplotypeScore=6.5274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.708;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3755,370,0 chrII 591478 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.894;DP=136;Dels=0.00;FS=1.359;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=3.465;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.755;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1275,0,1595 chrII 591710 . A G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.843;DP=137;Dels=0.00;FS=5.324;HaplotypeScore=6.9196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=1;MQRankSum=1.052;QD=7.85;ReadPosRankSum=-2.525;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,56:137:99:1106,0,1752 chrII 592177 . A G 735.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.489;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.42;MQ0=36;MQRankSum=1.184;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.316;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,54:136:99:765,0,922 chrII 592447 . G A 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;DP=123;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=2.268;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1125,0,1438 chrII 592495 . T C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.669;DP=111;Dels=0.00;FS=5.397;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.315;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1015,0,1392 chrII 592600 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.088;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1371,0,1389 chrII 592634 . T A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.458;DP=126;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1297,0,1522 chrII 592643 . G C 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.778;DP=130;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1386,0,1324 chrII 592744 . T A 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=53.1579;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3481,343,0 chrII 592815 . A T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;DP=141;Dels=0.00;FS=8.275;HaplotypeScore=4.8379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=2.507;QD=10.74;ReadPosRankSum=3.014;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1544,0,1439 chrII 592905 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.498;DP=144;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=7.8375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.932;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1346,0,1212 chrII 592938 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.117;DP=156;Dels=0.00;FS=2.025;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,90:156:99:1455,0,1197 chrII 592973 . G A 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;DP=157;Dels=0.00;FS=11.503;HaplotypeScore=4.2241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.833;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.264;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,89:157:99:1649,0,1267 chrII 593029 . G A 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.372;DP=154;Dels=0.00;FS=9.896;HaplotypeScore=2.3779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.214;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1613,0,1601 chrII 593091 . T C 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;DP=127;Dels=0.00;FS=3.045;HaplotypeScore=10.7981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=2.411;QD=23.82;ReadPosRankSum=1.675;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,125:127:99:3058,297,0 chrII 593396 . T C 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.689;DP=139;Dels=0.00;FS=5.164;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.705;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1220,0,1619 chrII 593459 . T G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.476;DP=142;Dels=0.00;FS=5.744;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=9.56;ReadPosRankSum=-2.658;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1387,0,1620 chrII 593464 . C G 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.542;DP=137;Dels=0.00;FS=2.536;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:137:99:1570,0,1190 chrII 593719 . C T 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.117;DP=135;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=3.4318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.257;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:135:99:1490,0,1355 chrII 593800 . G A 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.857;DP=99;Dels=0.00;FS=2.954;HaplotypeScore=4.4140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.627;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:954,0,977 chrII 593927 . A G 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.091;DP=117;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=2.4558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.003;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:923,0,1436 chrII 593968 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.298;DP=139;Dels=0.00;FS=2.320;HaplotypeScore=2.6478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1178,0,1766 chrII 594007 . C T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.261;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.054;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1563,0,1840 chrII 594022 . C G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;DP=156;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.197;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1474,0,1731 chrII 594148 . C T 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.711;DP=126;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.700;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1050,0,1497 chrII 594298 . A T 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.143;DP=183;Dels=0.00;FS=0.548;HaplotypeScore=15.1240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,84:183:99:1704,0,2124 chrII 594303 . T A 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;DP=177;Dels=0.00;FS=1.872;HaplotypeScore=14.1346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.846;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.736;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,82:177:99:1682,0,1887 chrII 594416 . G C 1923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.292;DP=173;Dels=0.00;FS=4.409;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.288;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,92:173:99:1953,0,1636 chrII 594492 . A G 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3274,345,0 chrII 594526 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.682;DP=112;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.526;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1127,0,1208 chrII 594781 . T C 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.155;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3576,387,0 chrII 594784 . T G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.767;DP=143;Dels=0.00;FS=7.344;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.097;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1327,0,1704 chrII 595083 . G A 1964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.076;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.133;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,93:184:99:1994,0,1889 chrII 595191 . A C 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.583;DP=121;Dels=0.00;FS=11.712;HaplotypeScore=2.6263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.289;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:984,0,1499 chrII 595222 . C T 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;DP=112;Dels=0.00;FS=6.349;HaplotypeScore=6.5781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=2.689;QD=8.92;ReadPosRankSum=-2.183;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1029,0,1122 chrII 595246 . C T 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2940,306,0 chrII 595346 . G C,T 3801.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;DP=166;Dels=0.00;FS=3.904;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.72;MQ0=1;MQRankSum=-1.627;QD=22.90;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,79,86:166:99:3801,1989,1797,1793,0,1583 chrII 595497 . A G 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3323,354,0 chrII 595508 . A G 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=105.9348;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=23.49;ReadPosRankSum=1.528;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2828,303,0 chrII 595530 . A G 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.960;DP=164;Dels=0.00;FS=2.760;HaplotypeScore=4.7030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.413;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.741;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1359,0,1753 chrII 595808 . C T 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.316;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.911;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1667,0,1419 chrII 595927 . T C 4497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=1;QD=24.31;SB=-2.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4497,448,0 chrII 596041 . T C 1911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.850;DP=146;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=5.6664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,87:146:99:1941,0,1253 chrII 596047 . G A 2131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.789;DP=160;Dels=0.00;FS=2.272;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,96:160:99:2161,0,1278 chrII 596219 . C T 4104.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=25.81;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:4104,423,0 chrII 596258 . A T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.790;DP=161;Dels=0.00;FS=7.668;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=8.37;ReadPosRankSum=3.470;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,66:161:99:1377,0,2102 chrII 596654 . G A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.006;DP=131;Dels=0.00;FS=5.284;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.720;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1446,0,1298 chrII 596681 . T A 1863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.541;DP=163;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.983;QD=11.43;ReadPosRankSum=-2.111;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,89:163:99:1893,0,1553 chrII 596684 . C T 1812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.247;DP=161;Dels=0.00;FS=1.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=-0.087;QD=11.25;ReadPosRankSum=-1.360;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,86:161:99:1842,0,1519 chrII 596798 . T C 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.608;DP=146;Dels=0.00;FS=3.991;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=1;MQRankSum=1.225;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:146:99:1605,0,1404 chrII 596828 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.064;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=1.056;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.040;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1302,0,1612 chrII 597100 . G A 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3595,364,0 chrII 597341 . A G 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.386;DP=91;Dels=0.00;FS=7.546;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=8.82;ReadPosRankSum=-2.018;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:833,0,1149 chrII 597634 . A C 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.348;DP=113;Dels=0.00;FS=2.476;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.111;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.595;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:972,0,1397 chrII 597806 . C T 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2666,261,0 chrII 598025 . T G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.477;DP=119;Dels=0.00;FS=10.842;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=7.35;ReadPosRankSum=-2.017;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:119:99:905,0,1518 chrII 598062 . G A 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.206;DP=113;Dels=0.00;FS=2.412;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.762;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:1066,0,1359 chrII 598133 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.757;DP=119;Dels=0.00;FS=1.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1302,0,1316 chrII 598137 . C T 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.63;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3202,325,0 chrII 598243 . T C 1993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.110;DP=164;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.715;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,95:164:99:2023,0,1428 chrII 598254 . T G 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3984,411,0 chrII 598272 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.662;DP=149;Dels=0.00;FS=4.531;HaplotypeScore=2.4573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.243;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.720;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:1346,0,1826 chrII 598514 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.468;DP=125;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=4.6624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.542;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1250,0,1420 chrII 598635 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.016;DP=128;Dels=0.00;FS=5.301;HaplotypeScore=5.2195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.439;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1335,0,1319 chrII 598753 . G T 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.270;DP=137;Dels=0.00;FS=5.667;HaplotypeScore=3.1925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,81:137:99:1825,0,1001 chrII 598781 . C T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.410;DP=141;Dels=0.00;FS=3.120;HaplotypeScore=3.6063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.210;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,54:141:99:988,0,1963 chrII 598928 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.378;DP=130;Dels=0.00;FS=5.574;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=2.190;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.592;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1430,0,1288 chrII 599085 . G A 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.157;DP=158;Dels=0.00;FS=7.133;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.333;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,70:158:99:1559,0,1913 chrII 599098 . T C 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3868,400,0 chrII 599150 . A T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.894;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.243;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1477,0,1319 chrII 599573 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.981;DP=126;Dels=0.00;FS=1.422;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.335;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1352,0,1219 chrII 599687 . C T 4057.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52;SB=-2.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4057,420,0 chrII 599732 . A G 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.739;DP=132;Dels=0.00;FS=4.443;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1406,0,1303 chrII 599869 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.100;DP=131;Dels=0.00;FS=8.517;HaplotypeScore=3.5493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1270,0,1484 chrII 599903 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.238;DP=135;Dels=0.00;FS=11.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1181,0,1619 chrII 599979 . G T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.211;DP=126;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=3.5558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=11.71;ReadPosRankSum=2.254;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1505,0,1286 chrII 600505 . T A 4493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4658;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.38;SB=-2.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4493,430,0 chrII 600570 . C T 4159.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.73;SB=-2.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4159,424,0 chrII 600991 . T C 1983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.389;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,94:154:99:2013,0,1101 chrII 601074 . G A 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.391;DP=159;Dels=0.00;FS=1.978;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.308;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.342;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,85:159:99:1775,0,1405 chrII 601087 . A G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.340;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.88;MQ0=0;MQRankSum=-4.863;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1245,0,1534 chrII 601097 . T C 1030.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.327;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.01;MQ0=0;MQRankSum=-6.938;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.521;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1060,0,1505 chrII 601100 . A G 980.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.627;DP=131;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-7.530;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.242;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1010,0,1573 chrII 601104 . G A 1046.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.552;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.79;MQ0=0;MQRankSum=-7.465;QD=7.53;ReadPosRankSum=1.485;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1076,0,1630 chrII 601142 . A G 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.66;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2932,315,0 chrII 601251 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.046;DP=131;Dels=0.00;FS=7.876;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.721;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1339,0,1273 chrII 601320 . C A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.142;DP=133;Dels=0.00;FS=12.698;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.159;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1375,0,1391 chrII 601329 . C T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.039;DP=126;Dels=0.00;FS=11.221;HaplotypeScore=3.5556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1342,0,1197 chrII 601775 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.352;DP=114;Dels=0.00;FS=4.912;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1392,0,990 chrII 601941 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.079;DP=130;Dels=0.00;FS=20.371;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.280;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1325,0,1442 chrII 601945 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.111;DP=136;Dels=0.00;FS=15.326;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.455;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1397,0,1463 chrII 602036 . G C 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.641;DP=141;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.019;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1543,0,1334 chrII 602041 . A C 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.269;DP=151;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:151:99:1582,0,1386 chrII 602047 . G A 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.062;DP=149;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.414;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1663,0,1441 chrII 602171 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.490;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:124:99:1271,0,1310 chrII 602182 . T C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.751;DP=126;Dels=0.00;FS=1.987;HaplotypeScore=3.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.994;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1063,0,1395 chrII 602361 . C T 3725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3725,382,0 chrII 602682 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.427;DP=135;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.988;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1320,0,1468 chrII 602687 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.386;DP=137;Dels=0.00;FS=1.361;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1273,0,1355 chrII 602697 . G A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.592;DP=135;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=3.8905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=9.52;ReadPosRankSum=-2.364;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:135:99:1315,0,1221 chrII 602847 . G C 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.217;DP=130;Dels=0.00;FS=4.994;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.502;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,77:130:99:1623,0,1050 chrII 602855 . G A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.506;DP=132;Dels=0.00;FS=4.878;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1623,0,1121 chrII 603595 . A T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;DP=134;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=61.4896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.549;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1402,0,1424 chrII 603825 . C T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.342;DP=143;Dels=0.00;FS=7.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.947;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1348,0,1593 chrII 603837 . A T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;DP=142;Dels=0.00;FS=11.388;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.461;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1305,0,1669 chrII 603865 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.487;DP=159;Dels=0.00;FS=13.715;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1393,0,1892 chrII 603916 . T C 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.522;DP=158;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=3.5015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.336;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1524,0,1770 chrII 603980 . T C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.279;DP=142;Dels=0.00;FS=5.949;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.928;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1562,0,1480 chrII 603992 . A G 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.979;DP=138;Dels=0.00;FS=7.392;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.835;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1586,0,1478 chrII 604017 . C T 1764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.015;DP=153;Dels=0.00;FS=3.015;HaplotypeScore=2.4383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1794,0,1504 chrII 604051 . A T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;DP=129;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1354,0,1424 chrII 604155 . T C 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.100;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1528,0,1341 chrII 604449 . A G 1822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.492;DP=173;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=10.9141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,88:173:99:1852,0,1833 chrII 605039 . G A 4653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.21;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4653,463,0 chrII 605067 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.009;DP=146;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.244;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1343,0,1680 chrII 605709 . C A 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.612;DP=148;Dels=0.00;FS=3.172;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1455,0,1625 chrII 605773 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.782;DP=141;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1201,0,1589 chrII 605775 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.038;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:130:99:1187,0,1473 chrII 605930 . T C 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3575,363,0 chrII 605969 . A C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.645;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=8.51;ReadPosRankSum=2.188;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1221,0,1382 chrII 605997 . C T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.149;DP=124;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=2.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.652;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1195,0,1124 chrII 606200 . A G 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;DP=126;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=5.6927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=2.729;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.041;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,50:126:99:985,0,1667 chrII 606236 . A G 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.480;DP=143;Dels=0.00;FS=5.077;HaplotypeScore=2.6566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.529;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1669,0,1294 chrII 606435 . C A 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.719;DP=146;Dels=0.00;FS=3.910;HaplotypeScore=4.8695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.299;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1540,0,1536 chrII 606458 . C T 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.689;DP=137;Dels=0.00;FS=4.103;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.931;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:137:99:1476,0,1362 chrII 606494 . T A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;DP=129;Dels=0.00;FS=3.207;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1365,0,1392 chrII 606499 . T C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.815;DP=135;Dels=0.00;FS=2.180;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1488,0,1382 chrII 606590 . C G 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.230;DP=129;Dels=0.00;FS=9.654;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.463;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:129:99:1440,0,1271 chrII 606638 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.875;DP=124;Dels=0.00;FS=6.096;HaplotypeScore=3.4361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.041;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1334,0,1343 chrII 606658 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.982;DP=128;Dels=0.00;FS=5.950;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.304;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1385,0,1310 chrII 607035 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.999;DP=116;Dels=0.00;FS=3.458;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.194;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1076,0,1423 chrII 607269 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.822;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1117,0,1382 chrII 607487 . G A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.764;DP=102;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1109,0,1044 chrII 607539 . A C 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.824;DP=137;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.239;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1340,0,1582 chrII 607542 . A T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.285;DP=132;Dels=0.00;FS=4.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.456;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1312,0,1547 chrII 607558 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.303;DP=128;Dels=0.00;FS=8.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.976;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1190,0,1548 chrII 607602 . C T 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.073;DP=118;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.016;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1052,0,1410 chrII 607669 . T A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.493;DP=125;Dels=0.00;FS=1.422;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.735;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1141,0,1535 chrII 607705 . A G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.607;DP=110;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.015;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1072,0,1216 chrII 607867 . C A 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;DP=89;Dels=0.00;FS=5.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:821,0,1079 chrII 608320 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.325;DP=119;Dels=0.00;FS=3.533;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.368;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.779;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1047,0,1448 chrII 608350 . T C 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.651;DP=127;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=3.4146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=2.484;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1158,0,1399 chrII 608432 . A C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.325;DP=126;Dels=0.00;FS=4.598;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.918;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1154,0,1517 chrII 608984 . T C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;DP=107;Dels=0.00;FS=11.148;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.008;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1176,0,1070 chrII 609073 . A G 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.967;DP=117;Dels=0.00;FS=7.062;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1127,0,1334 chrII 609102 . A G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.373;DP=131;Dels=0.00;FS=4.211;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1197,0,1580 chrII 609255 . A T 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.201;DP=109;Dels=0.00;FS=2.465;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.265;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1091,0,1202 chrII 609397 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.898;DP=131;Dels=0.00;FS=2.260;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.569;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1291,0,1435 chrII 609547 . C T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.428;DP=130;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.747;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1202,0,1557 chrII 609798 . G T 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.648;DP=114;Dels=0.00;FS=2.845;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.759;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1283,0,1035 chrII 610045 . A G 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.350;DP=126;Dels=0.00;FS=7.221;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.618;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1186,0,1471 chrII 610094 . C T 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.459;DP=151;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.494;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1792,0,1470 chrII 610295 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;DP=130;Dels=0.00;FS=5.308;HaplotypeScore=4.8488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.460;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1473,0,1108 chrII 610376 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.446;DP=115;Dels=0.00;FS=2.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1187,0,1041 chrII 610437 . A T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;DP=120;Dels=0.00;FS=5.817;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.746;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1249,0,1352 chrII 610492 . T G 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.800;DP=146;Dels=0.00;FS=2.079;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.177;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1718,0,1399 chrII 610603 . G T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.749;DP=132;Dels=0.00;FS=21.282;HaplotypeScore=6.5109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=8.13;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1103,0,1584 chrII 610797 . T C 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.492;DP=116;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=4.2572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=2.254;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.841;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:943,0,1389 chrII 611052 . G T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.606;DP=145;Dels=0.00;FS=8.704;HaplotypeScore=2.3924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.078;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1465,0,1513 chrII 611232 . A C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.634;DP=143;Dels=0.00;FS=2.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1372,0,1621 chrII 611442 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.379;DP=145;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1350,0,1576 chrII 611711 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.075;DP=134;Dels=0.00;FS=5.373;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:134:99:1234,0,1537 chrII 611905 . T C 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.394;DP=125;Dels=0.00;FS=6.792;HaplotypeScore=2.6566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1502,0,1111 chrII 612275 . A G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.545;DP=130;Dels=0.00;FS=3.183;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.334;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1322,0,1323 chrII 612287 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.393;DP=130;Dels=0.00;FS=3.183;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.921;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.421;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1350,0,1287 chrII 612323 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.920;DP=105;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.959;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1253,0,1035 chrII 612575 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.531;DP=157;Dels=0.00;FS=4.949;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.149;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,63:157:99:1167,0,2029 chrII 612968 . G A 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3482,363,0 chrII 613112 . G T 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.714;DP=167;Dels=0.00;FS=3.581;HaplotypeScore=4.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,76:167:99:1480,0,1860 chrII 613145 . G A 4379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.956e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4379,442,0 chrII 613202 . G A 3773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3773,399,0 chrII 613370 . A G 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.985;DP=145;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.506;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1564,0,1404 chrII 613388 . C T 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8844;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3779,387,0 chrII 613415 . A G 4089.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9118;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4089,418,0 chrII 613517 . A G 4132.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4132,426,0 chrII 614131 . A G 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.49;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3921,403,0 chrII 614154 . T A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.582;DP=149;Dels=0.00;FS=8.615;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=9.08;ReadPosRankSum=2.015;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:1383,0,1928 chrII 614308 . G T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.612;DP=133;Dels=0.00;FS=7.801;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1650,0,1108 chrII 614359 . T C 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.868;DP=154;Dels=0.00;FS=3.818;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.026;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1732,0,1431 chrII 614485 . G C 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.558;DP=136;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,84:136:99:1700,0,922 chrII 614507 . C T 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.17;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3251,328,0 chrII 614520 . A G 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.18;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2939,318,0 chrII 614550 . G A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.022;DP=144;Dels=0.00;FS=2.106;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.594;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1587,0,1335 chrII 614683 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.591;DP=146;Dels=0.00;FS=3.160;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1352,0,1559 chrII 614824 . A G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.776;DP=137;Dels=0.00;FS=11.433;HaplotypeScore=2.8121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.857;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.426;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1379,0,1416 chrII 614924 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.272;DP=146;Dels=0.00;FS=2.089;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.642;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1285,0,1669 chrII 615097 . T A 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;DP=116;Dels=0.00;FS=5.040;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.765;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,44:116:99:849,0,1625 chrII 615157 . A G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.766;DP=123;Dels=0.00;FS=2.284;HaplotypeScore=2.4052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=1;MQRankSum=2.047;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1055,0,1489 chrII 615204 . C A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.036;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1400,0,1722 chrII 615317 . G A 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;DP=145;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1775,0,1286 chrII 615346 . G A 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.221;DP=117;Dels=0.00;FS=8.814;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.935;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1027,0,1365 chrII 615566 . T C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.249;DP=144;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=2.2301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=2.406;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.870;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1348,0,1494 chrII 615644 . T C 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.463;DP=154;Dels=0.00;FS=3.234;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.281;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1584,0,1592 chrII 615654 . G C 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;DP=155;Dels=0.00;FS=5.391;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:155:99:1594,0,1486 chrII 615698 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.570;DP=145;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=4.2151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=8.70;ReadPosRankSum=1.906;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1292,0,1666 chrII 615775 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.675;DP=142;Dels=0.00;FS=4.145;HaplotypeScore=4.8818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.682;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1373,0,1590 chrII 615881 . A G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;DP=126;Dels=0.00;FS=3.322;HaplotypeScore=4.3442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.673;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1241,0,1313 chrII 615887 . A G 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.953;DP=116;Dels=0.00;FS=4.859;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.102;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1034,0,1257 chrII 615970 . C G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.868;DP=120;Dels=0.00;FS=3.496;HaplotypeScore=2.7920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.429;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:998,0,1212 chrII 616193 . C G 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.600;DP=116;Dels=0.00;FS=1.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:907,0,1316 chrII 616310 . G A 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.838;DP=137;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=-0.105;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.991;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1652,0,1187 chrII 616376 . A G 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.764;DP=135;Dels=0.00;FS=5.508;HaplotypeScore=5.6692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.368;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:135:99:1501,0,1329 chrII 616532 . C T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.784;DP=138;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=4.5579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.584;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:138:99:1203,0,1616 chrII 616646 . C T 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.68;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3678,372,0 chrII 616805 . A C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3624,369,0 chrII 616838 . G A 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3552,364,0 chrII 617504 . A G 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3461,375,0 chrII 617606 . A C 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2746,291,0 chrII 617783 . A T 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3318,331,0 chrII 617810 . T C 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2968,312,0 chrII 618086 . G A 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.491;DP=135;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1740,0,1072 chrII 618167 . T C 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3693,378,0 chrII 618353 . C T 1922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.554;DP=172;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.185;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,90:172:99:1952,0,1606 chrII 618506 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;DP=134;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=3.5587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.466;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1257,0,1516 chrII 618525 . C T 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.316;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.056;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1457,0,1476 chrII 618597 . T C 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2915,321,0 chrII 618600 . C T 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.914;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.755;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:974,0,1262 chrII 618674 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.320;DP=149;Dels=0.00;FS=3.971;HaplotypeScore=4.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-4.268;QD=9.80;ReadPosRankSum=2.213;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1490,0,1520 chrII 618736 . T G 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.11;MQ0=0;QD=25.02;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3236,345,0 chrII 618746 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.865;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=63.3676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.566;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.153;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,67:158:99:1378,0,1823 chrII 618793 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.851;DP=150;Dels=0.01;FS=8.668;HaplotypeScore=6.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.59;MQ0=0;MQRankSum=-5.235;QD=7.39;ReadPosRankSum=-2.130;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,65:149:99:1138,0,1748 chrII 618834 . A T 1114.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.918;DP=151;Dels=0.00;FS=8.562;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-7.883;QD=7.38;ReadPosRankSum=3.068;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,65:151:99:1144,0,1957 chrII 618841 . A T 997.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.078;DP=138;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.32;MQ0=0;MQRankSum=-8.150;QD=7.22;ReadPosRankSum=3.565;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:138:99:1027,0,1834 chrII 618844 . A T 3408.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.61;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3408,352,0 chrII 618861 . A G 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.156;DP=106;Dels=0.00;FS=17.245;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.118;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.547;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:835,0,1397 chrII 618892 . G A 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.62;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3459,357,0 chrII 618901 . G A 1552.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.006;DP=129;Dels=0.00;FS=8.987;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.47;MQ0=0;MQRankSum=3.283;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.364;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1582,0,1112 chrII 618907 . A G 3233.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.10;MQ0=0;QD=26.07;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3268,348,0 chrII 618908 . T C 3280.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.10;MQ0=0;QD=26.45;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3280,348,0 chrII 618941 . T G 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.52;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2842,312,0 chrII 619028 . C A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.565;DP=127;Dels=0.00;FS=8.051;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=3.017;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1342,0,1410 chrII 619100 . C T 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.429;DP=166;Dels=0.00;FS=1.948;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.010;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,81:166:99:1777,0,1665 chrII 619125 . G A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.846;DP=159;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1644,0,1718 chrII 619205 . T C 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.643;DP=135;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=5.9296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1608,0,1293 chrII 619256 . G A 688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.689;DP=92;Dels=0.00;FS=7.101;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,35:92:99:718,0,1286 chrII 619415 . C T 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.239;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:1083,0,1701 chrII 619502 . T C 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;DP=143;Dels=0.00;FS=2.947;HaplotypeScore=6.9113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=2.312;QD=25.49;ReadPosRankSum=2.415;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,141:143:99:3645,375,0 chrII 619507 . G A 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2901,294,0 chrII 619532 . T C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.788;DP=124;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.083;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1215,0,1338 chrII 619534 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.545;DP=128;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1253,0,1414 chrII 619575 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.859;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.182;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.342;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1168,0,1380 chrII 619746 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.956;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.237;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1291,0,1429 chrII 619747 . A G 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3407,348,0 chrII 620102 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.474;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.691;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1377,0,1654 chrII 620302 . G A 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.546;DP=161;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.225;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1738,0,1727 chrII 620443 . G T 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3260,316,0 chrII 620453 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.804;DP=120;Dels=0.00;FS=5.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.083;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1135,0,1423 chrII 620472 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.701;DP=133;Dels=0.00;FS=7.986;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.776;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:133:99:1182,0,1577 chrII 620480 . C T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.824;DP=130;Dels=0.00;FS=4.196;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.051;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1527,0,1249 chrII 620498 . G A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.057;DP=113;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=3.5580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1142,0,1236 chrII 620513 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.015;DP=115;Dels=0.00;FS=2.392;HaplotypeScore=48.3883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.227;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1308,0,1049 chrII 620530 . C T 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.925;DP=105;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=2.9737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.818;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:966,0,1204 chrII 620577 . T C 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.528;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.191;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1469,0,1278 chrII 620677 . T A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;DP=127;Dels=0.00;FS=3.394;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1258,0,1434 chrII 620680 . A G 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=131;Dels=0.00;FS=5.608;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.681;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1453,0,1357 chrII 620975 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.078;DP=142;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.863;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.112;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1460,0,1538 chrII 621057 . A G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.343;DP=131;Dels=0.00;FS=2.263;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1388,0,1373 chrII 621176 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.577;DP=125;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.390;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1369,0,1275 chrII 621285 . G A 4087.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.25;SB=-2.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4087,403,0 chrII 621351 . C T 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=151;Dels=0.00;FS=2.029;HaplotypeScore=7.8365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.860;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1645,0,1486 chrII 621546 . C T 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.627;DP=129;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.178;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,81:129:99:1747,0,827 chrII 621963 . C T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.596;DP=150;Dels=0.00;FS=2.101;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.478;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1419,0,1689 chrII 622305 . T A 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.529;DP=113;Dels=0.00;FS=3.472;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.338;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1041,0,1348 chrII 622533 . G A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.736;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.468;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1177,0,1325 chrII 622655 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.808;DP=117;Dels=0.00;FS=4.490;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.644;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1085,0,1256 chrII 622784 . A C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.182;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.544;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1206,0,1140 chrII 622789 . G T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.077;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.571;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1254,0,1362 chrII 622812 . T G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.292;DP=114;Dels=0.00;FS=3.437;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1064,0,1211 chrII 622849 . A T 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2744,273,0 chrII 622858 . C A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.592;DP=105;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.260;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1067,0,1003 chrII 622888 . C A 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3472,346,0 chrII 622971 . T C 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.050;DP=139;Dels=0.00;FS=4.141;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,54:139:99:1083,0,1922 chrII 622981 . A C 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.05;SB=-2.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3631,378,0 chrII 623027 . T C 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=113;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=4.6336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.399;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1126,0,1245 chrII 623061 . G A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.207;DP=123;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1448,0,1076 chrII 623199 . G A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.937;DP=137;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=3.2952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.264;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.829;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1459,0,1446 chrII 623272 . C A 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=43.5384;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.37;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3404,357,0 chrII 623409 . C T 1281.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.596;DP=114;Dels=0.00;FS=2.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.428;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1311,0,879 chrII 623413 . A T 2737 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.98;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2770,285,0 chrII 623418 . A T 2722 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2755,285,0 chrII 623423 . G C 1247.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;DP=108;Dels=0.00;FS=2.514;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.103;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1277,0,864 chrII 623427 . A G 813.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.027;DP=108;Dels=0.00;FS=3.555;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=0;MQRankSum=1.921;QD=7.53;ReadPosRankSum=-1.617;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:843,0,1350 chrII 623484 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.239;DP=126;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1440,0,1263 chrII 623785 . C T 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.278;DP=131;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=4.8357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.477;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,79:131:99:1722,0,992 chrII 623818 . A G 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3473,351,0 chrII 623968 . G T 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.678;DP=159;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=3.6434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:159:99:1823,0,1506 chrII 624009 . C T 4533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.61;SB=-2.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4533,457,0 chrII 624023 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.366;DP=159;Dels=0.00;FS=3.747;HaplotypeScore=2.7547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1451,0,1732 chrII 624052 . A T 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;DP=142;Dels=0.00;FS=7.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1683,0,1295 chrII 624076 . T C 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.455;DP=143;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.132;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1697,0,1342 chrII 624174 . C A 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;DP=113;Dels=0.00;FS=3.610;HaplotypeScore=6.3527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.407;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:923,0,1483 chrII 624215 . A G 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.224;DP=145;Dels=0.00;FS=8.458;HaplotypeScore=3.0888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1726,0,1285 chrII 624493 . C T 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.988;DP=149;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.940;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1558,0,1671 chrII 624540 . A T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.984;DP=174;Dels=0.00;FS=2.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=8.98;ReadPosRankSum=3.167;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,78:174:99:1593,0,2090 chrII 624736 . C T 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.624;DP=103;Dels=0.00;FS=1.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:887,0,1229 chrII 624740 . A G 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.734;DP=107;Dels=0.00;FS=3.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:878,0,1346 chrII 624762 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.954;DP=136;Dels=0.00;FS=1.647;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1230,0,1579 chrII 624798 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.074;DP=126;Dels=0.00;FS=1.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.639;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1198,0,1340 chrII 624805 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.164;DP=125;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.595;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1303,0,1286 chrII 624836 . C A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.120;DP=121;Dels=0.00;FS=3.917;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1297,0,1283 chrII 625077 . T C 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.349;DP=113;Dels=0.00;FS=5.221;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.162;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,69:113:99:1506,0,954 chrII 625150 . C G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;DP=105;Dels=0.00;FS=4.846;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.453;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1183,0,1023 chrII 625203 . C A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.660;DP=110;Dels=0.00;FS=10.766;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1216,0,1094 chrII 625210 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.702;DP=107;Dels=0.00;FS=6.094;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.240;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1143,0,1185 chrII 625234 . T G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.413;DP=107;Dels=0.00;FS=6.118;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.271;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1107,0,1205 chrII 625298 . A G 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3029,324,0 chrII 625628 . A C 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.389;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1120,0,1433 chrII 625690 . C A 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.000;DP=131;Dels=0.00;FS=4.152;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.422;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1547,0,1271 chrII 625721 . C T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;DP=151;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1701,0,1489 chrII 625733 . G C 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;DP=139;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.556;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1605,0,1373 chrII 625761 . T C 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.490;DP=123;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1333,0,1275 chrII 625843 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.783;DP=128;Dels=0.00;FS=6.921;HaplotypeScore=2.7902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1475,0,1265 chrII 625876 . T C 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.044;DP=98;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=3.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.012;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1010,0,961 chrII 626092 . A G 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.729;DP=100;Dels=0.00;FS=1.674;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.347;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:100:99:1103,0,1059 chrII 626278 . C T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;DP=147;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1695,0,1364 chrII 626455 . G A 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3027,318,0 chrII 626470 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.432;DP=111;Dels=0.00;FS=7.313;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1172,0,1184 chrII 626578 . T A 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.118;DP=116;Dels=0.00;FS=2.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=7.92;ReadPosRankSum=-2.058;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:949,0,1575 chrII 626608 . T C 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.630;DP=125;Dels=0.00;FS=1.463;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.284;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,79:125:99:1576,0,920 chrII 626656 . G A 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=128;Dels=0.00;FS=8.406;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.128;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1453,0,1165 chrII 626680 . A T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.784;DP=124;Dels=0.00;FS=5.501;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.095;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1383,0,1289 chrII 626886 . C T 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.088;DP=142;Dels=0.00;FS=7.958;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=12.20;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1763,0,1195 chrII 627001 . T A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.623;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=1;MQRankSum=2.724;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.906;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:129:99:1435,0,1151 chrII 627055 . A T 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3016,295,0 chrII 628267 . T C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.924;DP=140;Dels=0.00;FS=5.922;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.842;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1402,0,1501 chrII 628269 . T C 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.39;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3554,375,0 chrII 628345 . T C 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.764;DP=100;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=4.6985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:753,0,1062 chrII 628662 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.311;DP=110;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:888,0,1400 chrII 628674 . T C 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.015;DP=132;Dels=0.00;FS=4.380;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.904;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1487,0,1314 chrII 628807 . T C 2239 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.08;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2272,231,0 chrII 628898 . T C 436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.479;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=74.6825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.206;QD=3.69;ReadPosRankSum=-2.042;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,25:118:99:466,0,529 chrII 628943 . C G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.579;DP=108;Dels=0.00;FS=16.156;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.786;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1081,0,1093 chrII 629013 . G A 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3983,376,0 chrII 629035 . T C 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.316;DP=120;Dels=0.00;FS=4.693;HaplotypeScore=2.8522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.332;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1009,0,1496 chrII 629133 . A G 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3057,321,0 chrII 629145 . A G 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2958,324,0 chrII 629197 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.523;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.975;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.074;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1231,0,1074 chrII 629259 . G A 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3148,318,0 chrII 629636 . C T 2627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2660,261,0 chrII 629641 . G A 2682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2715,267,0 chrII 629782 . T C 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3885,402,0 chrII 630052 . C T 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7616;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3328,336,0 chrII 630091 . T C 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.760;DP=124;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=4.5203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,49:124:99:886,0,1613 chrII 630094 . A G 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.770;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.731;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,46:121:99:823,0,1635 chrII 630671 . T A 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3585,358,0 chrII 630784 . C T 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3628,367,0 chrII 630833 . C T 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3956,409,0 chrII 631243 . C T 4521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.924e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4521,448,0 chrII 631321 . T C 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3605,384,0 chrII 631353 . G A 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=26.18;ReadPosRankSum=-0.709;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:133:99:3482,342,0 chrII 631540 . T C 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.443;DP=102;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.050;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:854,0,1318 chrII 631572 . A T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.585;DP=120;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1443,0,1162 chrII 631668 . T C 2451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.27;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2484,261,0 chrII 631864 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.100;DP=137;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.072;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:1113,0,1843 chrII 631870 . A G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.727;DP=138;Dels=0.00;FS=1.382;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.826;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,55:138:99:1115,0,1971 chrII 632170 . G A 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.883;DP=137;Dels=0.00;FS=7.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.580;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,78:137:99:1767,0,1195 chrII 632747 . T C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.605;DP=121;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1182,0,1274 chrII 632812 . G A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.345;DP=134;Dels=0.00;FS=4.140;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.506;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1553,0,1212 chrII 632857 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.388;DP=102;Dels=0.00;FS=9.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.752;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1183,0,959 chrII 632896 . G A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.725;DP=115;Dels=0.00;FS=10.528;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1394,0,951 chrII 632908 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.664;DP=110;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=2.7789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1339,0,976 chrII 632938 . G A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.106;DP=122;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.387;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1482,0,1006 chrII 632980 . G A 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;DP=122;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,73:122:99:1600,0,978 chrII 633052 . G T 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.703;DP=144;Dels=0.00;FS=5.039;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.644;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1644,0,1339 chrII 633129 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.238;DP=142;Dels=0.00;FS=10.324;HaplotypeScore=3.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.404;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1420,0,1500 chrII 633176 . T G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.461;DP=127;Dels=0.00;FS=2.520;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=1;MQRankSum=1.315;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.279;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1113,0,1505 chrII 633308 . T A 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.535;DP=112;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=3.4999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.749;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:976,0,1371 chrII 633318 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.497;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.173;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1060,0,1412 chrII 633358 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.875;DP=139;Dels=0.00;FS=6.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.697;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.426;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1247,0,1632 chrII 633402 . G C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;DP=142;Dels=0.00;FS=7.484;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1341,0,1372 chrII 633409 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.012;DP=148;Dels=0.00;FS=5.925;HaplotypeScore=2.4533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=2.285;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.091;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1439,0,1488 chrII 633468 . T G 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.782;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.043;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1539,0,1430 chrII 633618 . A C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.129;DP=108;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.126;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1099,0,1192 chrII 633636 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.433;DP=134;Dels=0.00;FS=10.602;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1440,0,1329 chrII 633855 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.340;DP=139;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1353,0,1439 chrII 633876 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1184,0,1198 chrII 633957 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.958;DP=120;Dels=0.00;FS=7.061;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.118;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1178,0,1303 chrII 633960 . C T 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.959;DP=122;Dels=0.00;FS=8.445;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.675;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1213,0,1353 chrII 634225 . C T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.101;DP=135;Dels=0.00;FS=4.084;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.132;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.242;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1543,0,1338 chrII 634599 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.392;DP=127;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1163,0,1441 chrII 635127 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.124;DP=115;Dels=0.00;FS=3.480;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1095,0,1293 chrII 635323 . A G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.511;DP=113;Dels=0.00;FS=3.506;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:991,0,1383 chrII 635445 . A G 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.352;DP=143;Dels=0.00;FS=3.033;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-0.157;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1576,0,1304 chrII 635478 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.398;DP=112;Dels=0.00;FS=7.444;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.347;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:112:99:1381,0,880 chrII 635928 . C A 1849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.220;DP=174;Dels=0.00;FS=0.557;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,89:174:99:1879,0,1706 chrII 635959 . G T 1699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.866;DP=169;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=4.9146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=2.680;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.467;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,79:169:99:1729,0,1882 chrII 636168 . C T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.533;DP=134;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=9.2646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1540,0,1213 chrII 636267 . C T 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.126;DP=126;Dels=0.00;FS=1.549;HaplotypeScore=7.5429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1473,0,958 chrII 636372 . T C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.551;DP=126;Dels=0.00;FS=1.492;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.340;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1324,0,1415 chrII 636537 . A G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=143;Dels=0.00;FS=3.954;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.168;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1316,0,1676 chrII 636709 . C G 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.374;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.889;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,55:136:99:1027,0,1674 chrII 636994 . T C 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.107;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.797;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1655,0,1295 chrII 637063 . T A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;DP=120;Dels=0.00;FS=1.433;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.494;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1393,0,1253 chrII 637264 . T C 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.474;DP=162;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.299;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:162:99:1481,0,1768 chrII 637366 . T C 1915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.568;DP=178;Dels=0.00;FS=2.075;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,96:178:99:1945,0,1711 chrII 637651 . C G 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=0.043;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.157;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1395,0,1181 chrII 637785 . T C 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.448;DP=133;Dels=0.00;FS=5.425;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.200;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1425,0,1387 chrII 637795 . C A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;DP=137;Dels=0.00;FS=5.291;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.058;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1403,0,1527 chrII 637928 . T G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.421;DP=130;Dels=0.00;FS=12.725;HaplotypeScore=2.7119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=8.77;ReadPosRankSum=-2.022;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1170,0,1492 chrII 637990 . C T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.410;DP=146;Dels=0.00;FS=9.956;HaplotypeScore=7.8174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.254;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1479,0,1590 chrII 638086 . A G 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.655;DP=154;Dels=0.00;FS=2.861;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.609;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1455,0,1813 chrII 638716 . A G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.885;DP=161;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:1262,0,1949 chrII 639220 . C G 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.228;DP=134;Dels=0.00;FS=18.477;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.913;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:134:99:1517,0,1206 chrII 639314 . A G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.636;DP=132;Dels=0.00;FS=5.533;HaplotypeScore=4.7054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.918;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1284,0,1333 chrII 639337 . C T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.724;DP=125;Dels=0.00;FS=2.344;HaplotypeScore=5.6913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.654;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1095,0,1297 chrII 639427 . A G 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.781;DP=159;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:1334,0,1896 chrII 639700 . C T 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.712;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1637,0,1319 chrII 639745 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.267;DP=143;Dels=0.00;FS=5.139;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.963;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1276,0,1670 chrII 639793 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.782;DP=139;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=3.4220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1451,0,1365 chrII 639832 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.500;DP=150;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=5.4828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.509;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1535,0,1363 chrII 640153 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.021;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,72:167:99:1415,0,1991 chrII 640834 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.971;DP=142;Dels=0.00;FS=5.067;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.577;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1218,0,1739 chrII 641071 . T G 4177.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.32;SB=-2.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4177,415,0 chrII 641302 . C T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.480;DP=131;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1634,0,1168 chrII 641433 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.488;DP=131;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.899;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.246;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1305,0,1503 chrII 641467 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;DP=140;Dels=0.00;FS=2.130;HaplotypeScore=2.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1272,0,1490 chrII 641842 . C T 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.755;DP=132;Dels=0.00;FS=3.214;HaplotypeScore=2.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.469;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.612;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1608,0,1158 chrII 642049 . C T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.274;DP=129;Dels=0.00;FS=4.233;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.821;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1528,0,1078 chrII 642483 . G A 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3848;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3014,297,0 chrII 642492 . A G 2784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.341;DP=117;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=23.79;ReadPosRankSum=-1.614;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2817,265,0 chrII 642773 . G A 2397 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2430,246,0 chrII 642806 . A G 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.920;DP=108;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.421;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:922,0,1371 chrII 642969 . A G 1327.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.416;DP=131;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=3.6123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1357,0,1348 chrII 642976 . A C 1196.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.225;DP=131;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.507;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1226,0,1260 chrII 642978 . G A 1242.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.267;DP=129;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=3.2437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1272,0,1187 chrII 643098 . G T 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;DP=135;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=3.7520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.287;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1600,0,1165 chrII 643122 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.489;DP=123;Dels=0.00;FS=3.560;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.883;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1076,0,1542 chrII 643134 . G A 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.73;MQ0=0;QD=27.45;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3459,352,0 chrII 643176 . G A 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.56;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3641,364,0 chrII 643432 . G A 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2557,270,0 chrII 643489 . G T 1122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.98;MQ0=0;QD=25.50;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1155,120,0 chrII 643492 . G T 1048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.22;MQ0=0;QD=24.95;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1081,114,0 chrII 643866 . A T 139.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.89;MQ0=0;QD=3.16;SB=-4.151e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:18:172,18,0 chrII 643914 . G A 1130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.44;MQ0=0;QD=15.48;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1163,120,0 chrII 643915 . T A 1130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.44;MQ0=0;QD=15.48;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1163,120,0 chrII 643931 . T C 1870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.03;MQ0=0;QD=19.48;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:1903,201,0 chrII 643991 . A C 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2972,306,0 chrII 644145 . G A 1622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.605;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.79;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:83:99:1655,177,0 chrII 644246 . T G 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.405;DP=97;Dels=0.00;FS=3.904;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,39:97:99:728,0,1252 chrII 644333 . G T 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.477;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.20;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=27.29;ReadPosRankSum=1.274;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3712,367,0 chrII 644482 . G C 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3655,375,0 chrII 644529 . C T 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3374,324,0 chrII 644646 . C T 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=25.09;ReadPosRankSum=0.799;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2642,241,0 chrII 644790 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.120;DP=111;Dels=0.00;FS=6.165;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=3.315;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.379;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1200,0,1124 chrII 645021 . C T 2363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=24.11;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2396,237,0 chrII 645058 . C A 2209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.20;MQ0=0;QD=26.30;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2242,225,0 chrII 645081 . T C 2381 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2414,249,0 chrII 645084 . C T 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=23.02;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2657,270,0 chrII 645127 . C A 2422 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;QD=26.04;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2455,246,0 chrII 645132 . A G 2314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.37;MQ0=0;QD=25.15;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2347,243,0 chrII 645158 . A G 2427 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.96;MQ0=0;QD=26.10;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2460,258,0 chrII 645289 . G A 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.201;DP=105;Dels=0.00;FS=17.444;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.901;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:990,0,1193 chrII 645341 . A G 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.284;DP=93;Dels=0.00;FS=2.794;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:864,0,1034 chrII 645457 . A G 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.558;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.426;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:899,0,999 chrII 645592 . C T 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.515;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=11.13;ReadPosRankSum=2.718;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1610,0,1300 chrII 645738 . A G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.670;DP=136;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=1;MQRankSum=0.327;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.740;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1562,0,1240 chrII 645753 . C T 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.431;DP=134;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=1;MQRankSum=-1.490;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.890;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1245,0,1524 chrII 645807 . T C 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.448;DP=86;Dels=0.00;FS=2.915;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.335;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1079,0,805 chrII 646115 . T C 114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.057;DP=72;Dels=0.03;FS=1.587;HaplotypeScore=208.8828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.91;MQ0=0;MQRankSum=2.106;QD=1.58;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,11:70:99:144,0,128 chrII 646209 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.449;DP=111;Dels=0.00;FS=2.597;HaplotypeScore=4.1898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.401;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1201,0,1029 chrII 646524 . G A 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3314,337,0 chrII 646843 . A G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3231,330,0 chrII 646863 . G A 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3210,322,0 chrII 646935 . A T 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3402,343,0 chrII 646965 . A T 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.103;DP=128;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,49:128:99:950,0,1783 chrII 647284 . C T 2718 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2751,267,0 chrII 647363 . G T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.643;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1335,0,1102 chrII 647422 . C G 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3071,306,0 chrII 647496 . A C 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3551,357,0 chrII 647502 . G A 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3516,357,0 chrII 647924 . A G 2791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.70;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2824,288,0 chrII 648275 . C T 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3587,370,0 chrII 648361 . C A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.394;DP=129;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.186;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1427,0,1324 chrII 648554 . C T 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3178,330,0 chrII 648668 . A G 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3818,391,0 chrII 649200 . A G 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.634;DP=121;Dels=0.00;FS=8.512;HaplotypeScore=6.3242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.679;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:944,0,1199 chrII 649517 . A T 4112.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.03;SB=-2.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4112,421,0 chrII 649520 . G A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.329;DP=159;Dels=0.00;FS=2.793;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.438;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1695,0,1628 chrII 649588 . C A 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3814,379,0 chrII 649638 . C T 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.316;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1398,0,1384 chrII 649931 . T C 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5186;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3180,324,0 chrII 650411 . A G 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9257;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3789,370,0 chrII 650466 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.971;DP=105;Dels=0.00;FS=9.226;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.958;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1064,0,1114 chrII 650502 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.131;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1364,0,942 chrII 650526 . G A 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.160;DP=97;Dels=0.00;FS=5.020;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.091;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,54:97:99:1164,0,873 chrII 650548 . G A 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2964,295,0 chrII 650605 . C T 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.458;DP=150;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.409;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,87:150:99:1817,0,1143 chrII 650619 . A G 4070.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:166:99:4070,408,0 chrII 650631 . C T 2118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.430;DP=173;Dels=0.00;FS=1.245;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,100:173:99:2148,0,1323 chrII 650671 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.781;DP=138;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=3.7910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=7.28;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:138:99:1035,0,1792 chrII 650976 . G A 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.355;DP=155;Dels=0.00;FS=2.910;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.020;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1570,0,1788 chrII 651310 . C A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.714;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.811;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1207,0,1437 chrII 651616 . T A 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3163,324,0 chrII 651951 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.821;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.428;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,59:98:99:1265,0,783 chrII 652021 . C T 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.568;DP=98;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.325;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:981,0,1117 chrII 652086 . C T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.936;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=11.99;ReadPosRankSum=2.164;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1445,0,1024 chrII 652113 . G A 1833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.100;DP=146;Dels=0.00;FS=5.044;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,86:146:99:1863,0,1157 chrII 652362 . C T 4049.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.31;SB=-2.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4049,385,0 chrII 652373 . G A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.300;DP=150;Dels=0.00;FS=4.855;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=9.35;ReadPosRankSum=2.078;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1433,0,1743 chrII 652467 . T C 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.882;DP=169;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.667;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,78:169:99:1701,0,1999 chrII 652587 . T C 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.739;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=23.79;ReadPosRankSum=0.133;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3402,339,0 chrII 652686 . T C 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.386;DP=153;Dels=0.00;FS=4.828;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.968;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1641,0,1466 chrII 652830 . T C 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3592,363,0 chrII 653007 . G A 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2702,279,0 chrII 653133 . C T 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2951,301,0 chrII 653239 . G A 80.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.95;MQ0=0;QD=0.60;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:12:113,12,0 chrII 653275 . A G 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.56;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3630,381,0 chrII 653427 . T C 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.89;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2887,300,0 chrII 653429 . G C 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3008,315,0 chrII 653440 . C A 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.67;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2903,297,0 chrII 653517 . G A 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.670;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.188;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:880,0,1189 chrII 653730 . A G 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.00;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3058,333,0 chrII 653876 . G A 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3243,325,0 chrII 654127 . C T 4537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=27.01;SB=-2.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4537,439,0 chrII 654312 . C T 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.66;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2994,312,0 chrII 654339 . C G 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.31;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2526,276,0 chrII 654351 . T C 2443 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.13;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2476,267,0 chrII 654360 . T C 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.80;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2557,270,0 chrII 654388 . A G 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.62;MQ0=0;QD=25.84;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2488,258,0 chrII 654468 . C A 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.124;DP=89;Dels=0.00;FS=4.007;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.65;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1019,0,813 chrII 654500 . G A 2128 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7133;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.78;MQ0=0;QD=22.17;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:96:99:2161,222,0 chrII 654506 . C G 767.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;DP=92;Dels=0.00;FS=0.809;HaplotypeScore=2.7218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:797,0,823 chrII 654507 . T C 1927 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.92;MQ0=0;QD=20.95;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:1960,210,0 chrII 654523 . G T 2230 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.95;MQ0=0;QD=20.09;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2263,234,0 chrII 654525 . C T 2263 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.85;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2296,234,0 chrII 655451 . G A 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3814,376,0 chrII 655511 . G A 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2651,264,0 chrII 655893 . T C 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.226;DP=113;Dels=0.00;FS=1.584;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.314;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1028,0,1429 chrII 655999 . T C 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.502;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.540;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:1288,0,941 chrII 656068 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.217;DP=121;Dels=0.00;FS=4.436;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.369;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1053,0,1560 chrII 656242 . A G 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=23.27;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2826,294,0 chrII 656467 . G A 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3507,343,0 chrII 656530 . G A 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2827,300,0 chrII 656574 . T C 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2986,309,0 chrII 656619 . A C 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.230;DP=123;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:992,0,1620 chrII 656770 . C T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.633;DP=119;Dels=0.00;FS=4.449;HaplotypeScore=3.8250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1143,0,1366 chrII 656779 . T C 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7537;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2979,309,0 chrII 657120 . G T 2223 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=1;QD=26.78;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2256,231,0 chrII 657562 . A G 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2860,309,0 chrII 657582 . T A 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2783,279,0 chrII 657722 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.537;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.877;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:144:99:1329,0,1544 chrII 658596 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.365;DP=143;Dels=0.00;FS=4.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.423;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1585,0,1516 chrII 658786 . T C 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2683,282,0 chrII 658797 . G A 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.85;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:93:99:2530,258,0 chrII 659685 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.333;DP=136;Dels=0.00;FS=5.204;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.020;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1472,0,1297 chrII 660105 . G A 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.093;DP=146;Dels=0.00;FS=5.109;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=12.16;ReadPosRankSum=2.015;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1806,0,1254 chrII 660237 . A G 4263.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4263,424,0 chrII 660369 . A G 1366.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.080;DP=154;Dels=0.00;FS=21.562;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=4;MQRankSum=1.366;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1396,0,1720 chrII 660402 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.225;DP=159;Dels=0.00;FS=11.325;HaplotypeScore=3.6378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=3;MQRankSum=1.406;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,65:159:99:1261,0,1982 chrII 660728 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.531;DP=150;Dels=0.00;FS=8.845;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=1;MQRankSum=-0.212;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.590;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1339,0,1664 chrII 660819 . C T 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.263;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.545;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1365,0,1664 chrII 660870 . T A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;DP=157;Dels=0.00;FS=0.589;HaplotypeScore=4.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.824;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,70:157:99:1407,0,1988 chrII 661314 . T C 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.434;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.706;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1110,0,1380 chrII 661542 . A T 954.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;DP=132;Dels=0.00;FS=15.854;HaplotypeScore=6.5926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.69;MQ0=4;MQRankSum=-1.150;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.208;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,54:132:99:984,0,1685 chrII 661659 . G A 905.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.140;DP=128;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.98;MQ0=13;MQRankSum=-0.801;QD=7.07;ReadPosRankSum=2.942;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:935,0,1229 chrII 661818 . T A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;DP=146;Dels=0.00;FS=3.026;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.503;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1508,0,1593 chrII 661854 . G T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.218;DP=146;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQ0=2;MQRankSum=1.720;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.149;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:146:99:1315,0,1719 chrII 661878 . G A 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.37;MQ0=3;QD=21.57;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3031,298,0 chrII 662073 . G A 4191.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4191,427,0 chrII 662094 . A G 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3861,423,0 chrII 662112 . G A 4387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4387,462,0 chrII 662256 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.316;DP=122;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1352,0,1233 chrII 662272 . C T 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3272,345,0 chrII 662354 . G A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.812;DP=141;Dels=0.00;FS=2.147;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=10.89;ReadPosRankSum=2.398;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1565,0,1442 chrII 662444 . G A 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6689;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3539,346,0 chrII 662749 . G A 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3875,399,0 chrII 662807 . A G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.440;DP=122;Dels=0.00;FS=6.888;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1101,0,1400 chrII 662833 . A G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.964;DP=116;Dels=0.00;FS=4.688;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=11.59;ReadPosRankSum=-3.523;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1375,0,1108 chrII 662914 . A G 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.723;DP=136;Dels=0.00;FS=9.217;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=8.35;ReadPosRankSum=2.118;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1166,0,1700 chrII 662924 . C T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.161;DP=142;Dels=0.00;FS=4.006;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=9.37;ReadPosRankSum=2.573;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1361,0,1706 chrII 662962 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.117;DP=133;Dels=0.00;FS=5.333;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=10.35;ReadPosRankSum=-2.344;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1407,0,1382 chrII 663226 . G A 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.317;DP=150;Dels=0.00;FS=1.283;HaplotypeScore=4.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.721;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,84:150:99:1868,0,1228 chrII 663297 . A G 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.085;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.290;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,93:176:99:1824,0,1751 chrII 663370 . A G 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.561;DP=174;Dels=0.00;FS=0.566;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,84:174:99:1635,0,1840 chrII 663448 . G A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.043;DP=142;Dels=0.00;FS=2.134;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.827;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1344,0,1534 chrII 663478 . C T 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2979,303,0 chrII 663508 . C T 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.193;DP=110;Dels=0.00;FS=4.834;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1013,0,1220 chrII 663562 . G A 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1454,0,944 chrII 663901 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.380;DP=138;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.538;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1430,0,1409 chrII 663909 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.739;DP=147;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=2.5105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1451,0,1510 chrII 664018 . T C 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.075;DP=102;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:102:99:826,0,1325 chrII 664165 . T C 2823 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2856,315,0 chrII 664354 . T A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.667;DP=122;Dels=0.00;FS=6.902;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1349,0,1369 chrII 664500 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.753;DP=129;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.365;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1248,0,1434 chrII 664761 . G T 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.392;DP=135;Dels=0.00;FS=3.618;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1780,0,1184 chrII 665011 . C T 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.090;DP=208;Dels=0.00;FS=0.559;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.723;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,92:208:99:1868,0,2491 chrII 665118 . C A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.616;DP=131;Dels=0.00;FS=4.215;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1428,0,1332 chrII 665139 . G C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;DP=124;Dels=0.00;FS=9.812;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1197,0,1415 chrII 665576 . C A 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5186;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3470,355,0 chrII 665795 . A G 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.369;DP=166;Dels=0.00;FS=2.790;HaplotypeScore=7.7450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=0.433;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,89:166:99:1809,0,1643 chrII 666366 . A T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.522;DP=176;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=3.6938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=7.89;ReadPosRankSum=-1.835;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,76:176:99:1418,0,2335 chrII 666416 . T C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.605;DP=177;Dels=0.00;FS=0.557;HaplotypeScore=2.6451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.961;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,81:177:99:1465,0,2174 chrII 666708 . A G 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3961,411,0 chrII 666849 . T A 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2899,291,0 chrII 666875 . G A 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2973,297,0 chrII 666885 . G A 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2785,282,0 chrII 667131 . G A 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2854,294,0 chrII 667170 . C T 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3036,309,0 chrII 667779 . A G 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3107,327,0 chrII 668585 . A G 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4076,415,0 chrII 668596 . G A 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3958,394,0 chrII 668651 . C T 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.99;SB=-2.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4075,415,0 chrII 668968 . C T 4345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.33;SB=-2.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4345,448,0 chrII 668984 . A G 4420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;DP=175;Dels=0.00;FS=5.082;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=25.26;ReadPosRankSum=1.374;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:4420,474,0 chrII 669257 . C T 4834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4834,487,0 chrII 669262 . C T 4752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4752,490,0 chrII 669668 . G A 4512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.23;SB=-2.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4512,451,0 chrII 670083 . T C 3740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3740,378,0 chrII 670150 . C T 4004.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4004,406,0 chrII 670277 . G C 3971.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3971,405,0 chrII 670302 . G A 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3571,361,0 chrII 670480 . A T 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6324;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3450,354,0 chrII 670710 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.655;DP=139;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1423,0,1522 chrII 670742 . T C 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3673,393,0 chrII 670867 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.105;DP=141;Dels=0.00;FS=6.293;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=8.60;ReadPosRankSum=-2.054;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1243,0,1680 chrII 671022 . T A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;DP=147;Dels=0.00;FS=7.397;HaplotypeScore=3.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=10.29;ReadPosRankSum=-2.115;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1542,0,1644 chrII 671153 . G C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;DP=134;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=4.1051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.137;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1421,0,1341 chrII 671233 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.110;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1501,0,1663 chrII 671376 . T C 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2816,288,0 chrII 671544 . A T 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.112;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1150,0,1162 chrII 671577 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.457;DP=113;Dels=0.00;FS=2.506;HaplotypeScore=2.7113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.506;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1261,0,1160 chrII 671745 . T C 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.405;DP=153;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=6.7239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=6.20;ReadPosRankSum=2.531;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,54:153:99:978,0,2093 chrII 672003 . A G 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3103,312,0 chrII 672013 . T C 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3420,339,0 chrII 672019 . C G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.901;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.353;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1353,0,1140 chrII 672147 . T G 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.117;DP=148;Dels=0.00;FS=5.093;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.212;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1700,0,1360 chrII 672200 . A C 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3118,324,0 chrII 672318 . G A 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=1;QD=25.36;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3474,349,0 chrII 672507 . G A 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.287;DP=122;Dels=0.00;FS=3.039;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=1;MQRankSum=1.352;QD=25.92;ReadPosRankSum=1.149;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,120:122:99:3195,294,0 chrII 673311 . G A 2093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2126,219,0 chrII 673342 . T A 2340 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2373,231,0 chrII 673355 . T C 2336 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=22.90;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2369,234,0 chrII 673390 . G T 2334 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.31;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2367,237,0 chrII 673524 . T A 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3252,316,0 chrII 673645 . A G 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3642,372,0 chrII 673832 . G A 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3383,343,0 chrII 674295 . T A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3152,324,0 chrII 674848 . C T 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3091,318,0 chrII 674974 . T C 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3221,339,0 chrII 675146 . G A 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3700,373,0 chrII 675204 . T A 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2686,288,0 chrII 675206 . A G 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.180;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.935;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2758,279,0 chrII 675236 . C T 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3504,348,0 chrII 675293 . A G 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3329,336,0 chrII 675612 . T C 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2702,288,0 chrII 675714 . G C 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3055,324,0 chrII 675777 . A G 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.989;DP=119;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,68:119:99:1435,0,1066 chrII 675804 . A G 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3884,391,0 chrII 675879 . G A 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3606,378,0 chrII 676050 . T C 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2993,327,0 chrII 676055 . G C 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.509;DP=116;Dels=0.00;FS=7.726;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.725;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1442,0,1018 chrII 676110 . G A 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3479,366,0 chrII 676125 . T C 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3103,330,0 chrII 676163 . T C 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2818,312,0 chrII 676305 . C A 694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.548;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=7.63;ReadPosRankSum=1.165;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,36:91:99:724,0,1226 chrII 676310 . T C 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.782;DP=109;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.681;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,48:109:99:920,0,1371 chrII 676339 . T C 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2936,297,0 chrII 676341 . A C 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2957,297,0 chrII 676353 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.788;DP=117;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.314;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1306,0,1108 chrII 676380 . C T 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.175;DP=97;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.047;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1019,0,1041 chrII 676447 . C T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.487;DP=121;Dels=0.00;FS=3.297;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.744;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.210;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1250,0,1247 chrII 676481 . A G 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3780,387,0 chrII 676577 . G A 2313 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.21;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2346,240,0 chrII 676587 . C T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.926;DP=80;Dels=0.00;FS=1.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=13.49;ReadPosRankSum=2.297;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1109,0,669 chrII 676632 . T C 2378 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2411,255,0 chrII 676645 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1378,0,1074 chrII 676924 . G A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.233;DP=137;Dels=0.00;FS=9.094;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=10.19;ReadPosRankSum=2.589;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1426,0,1403 chrII 677014 . A G 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2893,300,0 chrII 677110 . T C 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3918,394,0 chrII 677653 . C T 1866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.761;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,92:173:99:1896,0,1698 chrII 677719 . A G 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3463,351,0 chrII 678377 . C T 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.451;DP=173;Dels=0.00;FS=1.192;HaplotypeScore=4.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.703;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,80:173:99:1669,0,1988 chrII 678410 . A G 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.275;DP=178;Dels=0.00;FS=0.552;HaplotypeScore=3.2286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,83:178:99:1769,0,2056 chrII 678648 . C T 3613.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3613,364,0 chrII 678984 . A G 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3840,390,0 chrII 679024 . C T 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3080,313,0 chrII 679063 . G A 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3782,388,0 chrII 679168 . C G 2084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=22.41;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2117,225,0 chrII 679276 . A C 2416 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=21.77;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2449,252,0 chrII 679332 . G T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.501;DP=127;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1383,0,1274 chrII 679502 . G A 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4379;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3787,391,0 chrII 679642 . A G 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.529;DP=138;Dels=0.00;FS=5.174;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.513;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1536,0,1248 chrII 679643 . G T 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.259;DP=140;Dels=0.00;FS=6.306;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1551,0,1300 chrII 679814 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.958;DP=129;Dels=0.00;FS=5.458;HaplotypeScore=3.4229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=2.000;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1451,0,1262 chrII 680168 . G A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.707;DP=135;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=3.6510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.130;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1446,0,1368 chrII 680372 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.814;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,87:185:99:1330,0,1874 chrII 680373 . A C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.744;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,87:185:99:1356,0,1828 chrII 680436 . G A 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.490;DP=150;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=1;MQRankSum=0.040;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1577,0,1433 chrII 680448 . C G 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.543;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-0.169;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.864;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,75:161:99:1504,0,1709 chrII 680550 . T C 3881.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3881,417,0 chrII 680703 . G A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.953;DP=149;Dels=0.00;FS=2.045;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.135;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1252,0,1573 chrII 680726 . A G 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=22.33;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2735,294,0 chrII 681025 . A G 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;DP=111;Dels=0.00;FS=21.673;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=8.32;ReadPosRankSum=2.021;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:954,0,1448 chrII 681127 . T A 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.611;DP=151;Dels=0.00;FS=4.382;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.896;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1495,0,1641 chrII 681206 . A T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.914;DP=129;Dels=0.00;FS=9.183;HaplotypeScore=2.7670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.078;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1322,0,1425 chrII 681344 . T G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.918;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.036;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:123:99:1153,0,1432 chrII 681398 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.518;DP=132;Dels=0.00;FS=5.287;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1507,0,1296 chrII 681414 . A G 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.738;DP=150;Dels=0.00;FS=3.188;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.972;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.021;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1512,0,1571 chrII 681488 . T A 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.832;DP=153;Dels=0.00;FS=2.468;HaplotypeScore=4.3360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=2.321;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.014;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,80:153:99:1681,0,1333 chrII 681492 . A G 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.322;DP=146;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=3.5039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.394;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1484,0,1594 chrII 681557 . G A 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.886;DP=116;Dels=0.00;FS=2.585;HaplotypeScore=12.3825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=2.939;QD=24.84;ReadPosRankSum=1.781;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,112:116:99:2915,286,0 chrII 682145 . G T 4443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4443,436,0 chrII 682149 . A T 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;DP=173;Dels=0.00;FS=4.554;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,78:173:99:1569,0,2079 chrII 682192 . C T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.692;DP=140;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.657;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1568,0,1264 chrII 682449 . T C 2342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=23.90;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2375,258,0 chrII 682462 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.040;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1362,0,1066 chrII 682491 . T A 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;DP=145;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=3.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=1;MQRankSum=1.589;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.625;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:145:99:1586,0,1453 chrII 682551 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.167;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=0.583;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1093,0,1575 chrII 682583 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.578;DP=118;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1349,0,1073 chrII 682751 . C T 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3744,379,0 chrII 682968 . G A 4211.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4211,412,0 chrII 683268 . A G 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3822,399,0 chrII 683415 . C T 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3685,364,0 chrII 683586 . T C 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3366,357,0 chrII 684585 . G T 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3958,397,0 chrII 684795 . A G 1824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.49;MQ0=0;QD=23.09;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1857,195,0 chrII 684797 . G A 1846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.60;MQ0=0;QD=23.07;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1879,195,0 chrII 685165 . A G 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2902,303,0 chrII 685306 . T C 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;QD=26.13;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3606,378,0 chrII 685510 . C T 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=26.29;ReadPosRankSum=1.492;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3418,351,0 chrII 685662 . T C 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.068;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=26.62;ReadPosRankSum=1.126;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3228,333,0 chrII 686539 . G A 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2939,288,0 chrII 686563 . G A 2539 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2572,264,0 chrII 686624 . C T 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3098,310,0 chrII 686767 . A G 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.80;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2900,309,0 chrII 686783 . G A 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.87;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2958,303,0 chrII 687029 . C T 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2830,288,0 chrII 687350 . T C 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3193,318,0 chrII 687626 . A T 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3118,310,0 chrII 687872 . T A 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3698,378,0 chrII 687980 . G A 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.975e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3739,370,0 chrII 688355 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3048,321,0 chrII 688364 . G A 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3167,321,0 chrII 688475 . G A 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;DP=109;Dels=0.00;FS=4.934;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=25.02;ReadPosRankSum=1.700;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2760,250,0 chrII 688487 . C T 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=113;Dels=0.00;FS=4.364;HaplotypeScore=2.5939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=25.39;ReadPosRankSum=0.866;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2902,267,0 chrII 688640 . G A 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.123;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,138:140:99:3654,329,0 chrII 688700 . A T 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3181,321,0 chrII 688949 . T A 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.937e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3799,373,0 chrII 689085 . A C 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3299,357,0 chrII 689156 . C T 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3707,376,0 chrII 689867 . G C 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3354,351,0 chrII 689912 . G A 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2953,292,0 chrII 689996 . A C 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4068,409,0 chrII 690123 . T C 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3679,363,0 chrII 690313 . T C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3279,342,0 chrII 690330 . G A 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3366,342,0 chrII 691208 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3266,345,0 chrII 691367 . C T 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3551,355,0 chrII 691485 . G T 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=28.17;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3521,358,0 chrII 691521 . A G 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3238,342,0 chrII 691649 . G A 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3080,306,0 chrII 691707 . G C 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2567,264,0 chrII 691742 . T C 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=26.59;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2559,270,0 chrII 691776 . G T 2409 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2442,249,0 chrII 691838 . G A 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3422,337,0 chrII 691869 . G A 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3275,342,0 chrII 691880 . A G 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.26;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3370,354,0 chrII 691893 . T C 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3018,321,0 chrII 691937 . C T 3940.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=28.76;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3940,400,0 chrII 691950 . C T 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3772,388,0 chrII 692083 . C A 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3100,307,0 chrII 692126 . G C 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2441,264,0 chrII 692195 . A G 2409 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2442,246,0 chrII 692366 . A T 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3511,346,0 chrII 692680 . C T 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3615,358,0 chrII 692883 . C T 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3649,364,0 chrII 692889 . C T 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3594,363,0 chrII 693069 . A T 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3461,360,0 chrII 693391 . G A 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3772,382,0 chrII 693469 . C T 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3548,366,0 chrII 693612 . T G 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.526;DP=142;Dels=0.00;FS=4.109;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.979;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1599,0,1348 chrII 693651 . T C 3936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3936,408,0 chrII 693825 . T A 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3140,316,0 chrII 693923 . T C 4229.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.19;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4229,418,0 chrII 693925 . G A 4336.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.19;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4336,421,0 chrII 693928 . C T 4155.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4155,415,0 chrII 694124 . G A 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6855;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.46;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3745,382,0 chrII 694133 . G A 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.78;MQ0=0;QD=25.79;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3610,370,0 chrII 694151 . T A 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.367;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.576;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3303,342,0 chrII 694153 . T C 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=24.26;ReadPosRankSum=1.477;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3299,348,0 chrII 694443 . A T 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2885,283,0 chrII 694512 . A G 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3105,324,0 chrII 694669 . G A 2427 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2460,252,0 chrII 694728 . G A 2417 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=26.27;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:99:2450,258,0 chrII 695368 . T C 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3330,366,0 chrII 695575 . T C 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3632,390,0 chrII 695857 . A T 4151.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4151,424,0 chrII 696541 . T C 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2810,300,0 chrII 696652 . T C 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3683,378,0 chrII 696781 . A G 4084.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4084,418,0 chrII 697043 . T C 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3116,339,0 chrII 697455 . C T 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3669,372,0 chrII 697695 . C T 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3910,385,0 chrII 697855 . C A 4254.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4254,421,0 chrII 697900 . T G 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3757,390,0 chrII 697912 . C T 4299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.958e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4299,447,0 chrII 697933 . C A 3806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3806,390,0 chrII 698208 . C T 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=146;Dels=0.00;FS=4.240;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=25.64;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3743,356,0 chrII 698648 . A T 4014.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.33;SB=-2.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4014,394,0 chrII 698958 . T C 4117.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4117,435,0 chrII 699308 . T C 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3492,351,0 chrII 699380 . G A 4178.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:165:99:4178,421,0 chrII 699560 . T C 4388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.22;SB=-2.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4388,459,0 chrII 699675 . T C 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3100,327,0 chrII 699878 . A G 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8664;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:2943,300,0 chrII 700005 . A G 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2722,279,0 chrII 700064 . G C 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2544,270,0 chrII 700097 . T C 1728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.69;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1761,183,0 chrII 700199 . A T 1423 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=13.30;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:1456,156,0 chrII 700223 . G C 1740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=17.06;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:1773,183,0 chrII 700246 . T C 1782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.10;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1815,180,0 chrII 700349 . C T 784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9318;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=15.37;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:96:817,96,0 chrII 700423 . T C 1713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=23.79;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1746,162,0 chrII 700682 . G A 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3241,316,0 chrII 700715 . C T 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3028,315,0 chrII 700736 . G A 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3339,340,0 chrII 705072 . G A 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3367,334,0 chrII 707207 . A G 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2893,309,0 chrII 707436 . G A 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.15;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3087,321,0 chrII 707452 . G T 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.56;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2686,282,0 chrII 707848 . C T 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3166,316,0 chrII 708909 . A G 2343 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9511;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.41;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:96:99:2376,255,0 chrII 708952 . T C 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3460,360,0 chrII 710109 . A G 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5395;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3551,366,0 chrII 712303 . A G 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.47;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2987,318,0 chrII 712962 . G A 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2778,279,0 chrII 713996 . T G 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3380,375,0 chrII 715254 . G A 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3210,327,0 chrII 715566 . A G 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;DP=132;Dels=0.00;FS=3.044;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=25.14;ReadPosRankSum=-1.388;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3318,323,0 chrII 716467 . C T 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3417,343,0 chrII 716483 . G A 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3457,354,0 chrII 716927 . T C 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.964e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3894,385,0 chrII 718117 . G A 2643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2676,276,0 chrII 718330 . A G 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=23.34;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3337,357,0 chrII 720010 . G T 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.96;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3635,379,0 chrII 720938 . T C 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5311;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3277,321,0 chrII 721881 . G A 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2798,279,0 chrII 722533 . C T 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.07;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3011,298,0 chrII 722589 . C T 4435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4435,463,0 chrII 723175 . G C 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3114,318,0 chrII 723360 . G T 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9423;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3397,334,0 chrII 724613 . T G 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3028,303,0 chrII 724660 . T C 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2995,318,0 chrII 724784 . A G 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3531,375,0 chrII 724948 . A G 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2989,336,0 chrII 725168 . A G 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3242,342,0 chrII 728499 . C A 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3120,310,0 chrII 728914 . C A 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.69;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2755,276,0 chrII 729640 . G A 4084.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4084,403,0 chrII 730031 . T C 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=2;QD=25.29;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3718,369,0 chrII 730059 . T C 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3717,396,0 chrII 730165 . T C 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3069,303,0 chrII 730195 . T C 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3659,399,0 chrII 730234 . T C 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3232,330,0 chrII 730392 . C G 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3670,375,0 chrII 730662 . A G 2786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2819,288,0 chrII 730763 . T C 2370 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.43;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2403,246,0 chrII 730861 . A G 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=1;QD=25.06;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2815,291,0 chrII 730949 . T C 2070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2103,225,0 chrII 731155 . G A 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3603,370,0 chrII 731212 . G A 2636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2669,270,0 chrII 731292 . T C 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3448,357,0 chrII 731394 . A T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3048,309,0 chrII 731473 . A G 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2738,294,0 chrII 731475 . A T 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3083,315,0 chrII 731541 . C T 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3132,312,0 chrII 731564 . A G 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2982,315,0 chrII 731596 . A G 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3647,378,0 chrII 731934 . C T 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=28.16;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2905,294,0 chrII 731970 . A T 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2776,291,0 chrII 732110 . A G 2470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2503,279,0 chrII 732123 . C T 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.842;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=26.27;ReadPosRankSum=1.033;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2896,291,0 chrII 732408 . G T 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2925,292,0 chrII 732496 . T C 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3314,345,0 chrII 732591 . A G 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.06;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3300,354,0 chrII 732631 . T C 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3115,339,0 chrII 732633 . C G 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3160,333,0 chrII 732678 . T C 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3185,339,0 chrII 732837 . C G 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7231;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=1;QD=24.38;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3608,384,0 chrII 732930 . C T 4327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4327,418,0 chrII 733059 . G A 2496 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2529,267,0 chrII 733077 . C T 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3146,318,0 chrII 733152 . A G 2861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.77;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2894,300,0 chrII 733320 . C T 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3548,360,0 chrII 733332 . A G 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3380,354,0 chrII 733473 . C T 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3673,370,0 chrII 733476 . C T 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3570,361,0 chrII 733543 . C T 4680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:171:99:4680,469,0 chrII 733629 . G A 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.560;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9529;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.380;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.979;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,139:141:99:3639,361,0 chrII 733707 . T C 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2597,267,0 chrII 733809 . C T 4412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4412,453,0 chrII 733887 . C T 4801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.5070;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.12;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4801,481,0 chrII 733953 . G A 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3571,361,0 chrII 734046 . C T 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3002,300,0 chrII 734409 . A G 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3325,345,0 chrII 734508 . T C 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3241,348,0 chrII 734775 . G A 4195.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4195,426,0 chrII 734889 . G A 4086.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4086,418,0 chrII 735096 . C T 4376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6776;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.74;SB=-2.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4376,445,0 chrII 735240 . A T 4573.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.995e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:178:99:4573,454,0 chrII 735363 . C T 5309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.40;SB=-2.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5309,508,0 chrII 735399 . C T 5036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.96;SB=-2.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:194:99:5036,508,0 chrII 735582 . T C 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3889,414,0 chrII 735848 . T C 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3883,393,0 chrII 735882 . C T 4043.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4043,402,0 chrII 737614 . C T 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2729,282,0 chrII 737963 . G A 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3553,355,0 chrII 738015 . T G 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3478,343,0 chrII 738941 . T C 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3625,399,0 chrII 739892 . T G 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3866,402,0 chrII 740580 . A T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.682;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3405,342,0 chrII 740827 . G A 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3985,394,0 chrII 741344 . A G 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3545,372,0 chrII 741349 . A G 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3353,351,0 chrII 742394 . C T 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3427,351,0 chrII 742721 . C G 4207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4207,447,0 chrII 743243 . T C 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.62;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2518,270,0 chrII 743714 . G A 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3679,370,0 chrII 744063 . G A 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3628,366,0 chrII 744342 . C T 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3805,376,0 chrII 744356 . A C 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.25;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.970e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3672,399,0 chrII 744368 . C T 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.98;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3553,366,0 chrII 744516 . A G 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3390,345,0 chrII 744519 . A G 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3479,357,0 chrII 744640 . A T 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3313,339,0 chrII 744816 . C T 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2991,300,0 chrII 744823 . G A 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3190,319,0 chrII 745190 . G A 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3771,373,0 chrII 745192 . C G 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3671,378,0 chrII 745280 . C A 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3550,346,0 chrII 745349 . G C 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3593,381,0 chrII 745793 . G A 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2707,267,0 chrII 746171 . G A 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3121,315,0 chrII 746288 . T C 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3185,318,0 chrII 746478 . G A 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3114,312,0 chrII 746514 . C T 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.426;DP=113;Dels=0.00;FS=3.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=25.59;ReadPosRankSum=1.180;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2925,300,0 chrII 746583 . C T 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3438,337,0 chrII 746619 . C T 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3622,352,0 chrII 747177 . A T 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3324,339,0 chrII 748042 . A G 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2851,300,0 chrII 748066 . T C 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.479;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6176;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=26.14;ReadPosRankSum=0.721;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3581,369,0 chrII 748373 . T C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3624,369,0 chrII 748404 . T C 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2902,306,0 chrII 748514 . A C 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2949,312,0 chrII 748583 . A T 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3540,366,0 chrII 748630 . C G 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3453,366,0 chrII 749056 . C T 4272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4272,430,0 chrII 749314 . C G 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3746,396,0 chrII 749547 . C A 3969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.76;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3969,391,0 chrII 749992 . T C 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3143,333,0 chrII 750088 . T C 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4068,406,0 chrII 750157 . T C 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;DP=133;Dels=0.00;FS=4.078;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=25.14;ReadPosRankSum=1.550;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3343,360,0 chrII 750649 . A C 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=1;QD=23.70;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2758,297,0 chrII 750709 . A C 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=1;QD=25.41;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2981,303,0 chrII 750714 . G T 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=1;QD=25.39;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3301,328,0 chrII 750883 . G A 2202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.21;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2235,228,0 chrII 750970 . T C 2120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:2153,225,0 chrII 751317 . T C 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2958,312,0 chrII 751319 . A C 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2973,318,0 chrII 751854 . A G 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2741,291,0 chrII 751983 . T G 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2960,324,0 chrII 752039 . G T 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.313;DP=133;Dels=0.00;FS=13.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,82:133:99:1825,0,932 chrII 752106 . G A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.559;DP=140;Dels=0.00;FS=3.266;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.59;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3723,355,0 chrII 752136 . A G 2781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2814,294,0 chrII 752153 . C T 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.45;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3167,318,0 chrII 752266 . A G 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.55;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2708,291,0 chrII 752292 . A G 2707 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.05;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2740,309,0 chrII 752329 . T C 1731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.99;MQ0=0;QD=18.41;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:1764,192,0 chrII 752333 . C T 1739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.471;DP=93;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=2.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.130;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:1772,170,0 chrII 752344 . C T 1521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.17;MQ0=0;QD=17.69;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1554,165,0 chrII 752361 . G A 1584 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.84;MQ0=0;QD=18.42;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1617,174,0 chrII 752372 . C G 1816 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=19.32;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:1849,201,0 chrII 752501 . G C 2469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.55;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2502,267,0 chrII 752538 . A G 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3575,360,0 chrII 752597 . T C 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3307;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=26.27;ReadPosRankSum=1.708;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3809,405,0 chrII 752672 . T C 3750.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6416;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3750,384,0 chrII 752718 . T C 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3080,321,0 chrII 752744 . C T 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.91;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3332,345,0 chrII 752777 . T C 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3195,348,0 chrII 752810 . T C 3450.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.86;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3450,357,0 chrII 752814 . G A 3669.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.54;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3669,367,0 chrII 752817 . A G 3485.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.16;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3485,360,0 chrII 752901 . T C 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3326,348,0 chrII 752916 . G A 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3685,370,0 chrII 752933 . C T 3825.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3825,385,0 chrII 753131 . T A 2444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2477,255,0 chrII 753144 . C G 2349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2382,258,0 chrII 753196 . C A 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2928,294,0 chrII 753198 . C T 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3055,304,0 chrII 753285 . G A 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3369,343,0 chrII 753573 . T C 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3323,345,0 chrII 753610 . T C 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2882,300,0 chrII 753721 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2922,312,0 chrII 753723 . A G 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2839,300,0 chrII 753759 . C T 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3535,364,0 chrII 753909 . G A 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2797,282,0 chrII 753942 . C T 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3258,324,0 chrII 753990 . T C 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.66;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3087,321,0 chrII 754103 . A T 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.54;SB=-2.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3626,358,0 chrII 754139 . G A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3263,325,0 chrII 754188 . G A 2578 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:96:99:2611,261,0 chrII 754197 . T C 2442 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2475,255,0 chrII 754355 . G A 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2960,297,0 chrII 754404 . A G 2599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2632,276,0 chrII 754416 . A G 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2772,285,0 chrII 754436 . T C 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2678,279,0 chrII 754776 . G A 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2996,300,0 chrII 754911 . A G 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2709,288,0 chrII 755157 . G T 2751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2784,279,0 chrII 755817 . T C 2148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=25.27;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2181,225,0 chrII 756042 . T C 2253 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.31;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2286,243,0 chrII 756063 . G A 2259 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.651;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=26.58;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2292,237,0 chrII 756114 . T A 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3110,304,0 chrII 756213 . G A 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2703,270,0 chrII 756267 . T C 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3042,321,0 chrII 756533 . C A 2379 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7044;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2412,246,0 chrII 757005 . A G 2232 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2265,237,0 chrII 757411 . T C 2098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2131,216,0 chrII 757437 . G C 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2680,282,0 chrII 757513 . C T 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3813,370,0 chrII 757931 . C T 1937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.83;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1970,195,0 chrII 758975 . T G 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3495,360,0 chrII 759402 . C A 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2892,286,0 chrII 759424 . C T 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2794,285,0 chrII 759735 . G A 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3139,321,0 chrII 760323 . T C 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3421,354,0 chrII 760624 . G A 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3219,336,0 chrII 762665 . A G 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3154,324,0 chrII 764397 . C A 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2796,282,0 chrII 764652 . A G 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3376,333,0 chrII 764667 . G A 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3224,310,0 chrII 765684 . C G 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3399,363,0 chrII 767663 . T C 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9506;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2658,261,0 chrII 767690 . A T 2373 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2406,237,0 chrII 767691 . T C 2364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2397,243,0 chrII 767731 . T C 2431 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:99:2464,261,0 chrII 767899 . G A 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3188,325,0 chrII 767991 . A G 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:3018,321,0 chrII 768165 . T A 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.13;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2704,273,0 chrII 768196 . G A 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2941,300,0 chrII 768210 . C G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.17;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3264,336,0 chrII 768214 . G A 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3505,343,0 chrII 768260 . T G 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=1;QD=24.40;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3083,339,0 chrII 768374 . G A 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3299,325,0 chrII 768981 . C T 2249 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=21.42;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2282,237,0 chrII 769003 . G A 2275 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=20.50;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2308,240,0 chrII 769150 . G A 3532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3532,355,0 chrII 769258 . C T 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3036,309,0 chrII 769303 . G C 2468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2501,273,0 chrII 769903 . G A 4124.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.13;SB=-2.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4124,412,0 chrII 770543 . G T 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3013,303,0 chrII 770771 . T C 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2994,312,0 chrII 771164 . A T 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3412,343,0 chrII 771838 . T A 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3149,313,0 chrII 772129 . T C 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3391,345,0 chrII 772302 . T C 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;DP=122;Dels=0.00;FS=3.585;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=24.30;ReadPosRankSum=1.560;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:2998,315,0 chrII 772498 . C T 4436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.40;SB=-2.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4436,448,0 chrII 772534 . C T 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2974,312,0 chrII 772685 . C T 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3471,349,0 chrII 772699 . A G 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3519,381,0 chrII 773042 . G A 3727.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3727,379,0 chrII 773188 . G C 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=24.17;ReadPosRankSum=-1.329;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3151,330,0 chrII 773200 . G A 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3212,324,0 chrII 773420 . A C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=1;QD=24.94;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2976,315,0 chrII 773550 . G C 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=22.73;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2738,282,0 chrII 773821 . T A 2559 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=1;QD=22.85;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2592,261,0 chrII 774509 . T C 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3016,321,0 chrII 774954 . T C 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3877,405,0 chrII 775070 . T C 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2524,258,0 chrII 775411 . A G 2092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.48;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2125,216,0 chrII 776502 . T C 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3337,372,0 chrII 777303 . A G 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3147,339,0 chrII 779836 . G T 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3362,339,0 chrII 779883 . C T 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.672;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=24.46;ReadPosRankSum=0.538;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2895,294,0 chrII 780425 . A G 2548 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.09;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=21.78;ReadPosRankSum=-1.463;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:117:99:2581,273,0 chrII 784284 . T A 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3087,303,0 chrII 784600 . C T 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.15;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2700,273,0 chrII 785002 . A G 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3278,339,0 chrII 785761 . G A 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2544,267,0 chrII 785852 . G A 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=114;Dels=0.00;FS=3.757;HaplotypeScore=6.6740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=22.25;ReadPosRankSum=1.519;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2569,261,0 chrII 785908 . G T 2041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=20.01;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2074,213,0 chrII 786053 . T C 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3031,327,0 chrII 787277 . T C 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.994e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3848,384,0 chrII 788140 . G A 3917.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3917,411,0 chrII 788369 . C T 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3719,376,0 chrII 788663 . A G 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.58;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2386,252,0 chrII 789016 . A G 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5433;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3659,375,0 chrII 789183 . G A 2755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2788,285,0 chrII 792237 . A G 2363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2396,252,0 chrII 795756 . C G 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=23.56;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3167,339,0 chrII 796648 . C T 2229 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=1;QD=23.22;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2262,234,0 chrII 797599 . C G 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2748,285,0 chrII 798415 . C A 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.960;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.283;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,135:137:99:3102,291,0 chrII 800655 . T C 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2544,270,0 chrII 800746 . T C 2159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2192,219,0 chrII 800911 . A C 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5067;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3610,378,0 chrII 801428 . A T 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.132;DP=158;Dels=0.00;FS=58.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.46;MQ0=0;MQRankSum=-7.438;QD=0.21;ReadPosRankSum=-2.648;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,28:158:63:63,0,3103 chrII 801431 . G A 29.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.466;DP=156;Dels=0.00;FS=57.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=0;MQRankSum=-7.142;QD=0.19;ReadPosRankSum=-2.214;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,28:156:59:59,0,3012 chrII 801436 . A G 28.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.069;DP=156;Dels=0.00;FS=55.605;HaplotypeScore=6.9574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=-7.547;QD=0.18;ReadPosRankSum=-1.724;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,27:156:58:58,0,3027 chrII 801437 . A G 18.07 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.209;DP=156;Dels=0.00;FS=55.605;HaplotypeScore=6.9574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=-6.774;QD=0.12;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,27:156:48:48,0,3023 chrII 801455 . C T 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.708;DP=142;Dels=0.00;FS=65.613;HaplotypeScore=6.7451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.57;MQ0=0;MQRankSum=-7.257;QD=0.11;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,27:142:45:45,0,2627 chrII 801470 . A T 90.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=186;Dels=0.00;FS=39.652;HaplotypeScore=8.9144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.92;MQ0=0;MQRankSum=-8.205;QD=0.48;ReadPosRankSum=-4.508;SB=-4.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,54:186:99:120,0,3165 chrII 801476 . A G 536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.193;DP=193;Dels=0.00;FS=46.332;HaplotypeScore=4.6501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.77;MQ0=0;MQRankSum=-8.517;QD=2.78;ReadPosRankSum=-4.783;SB=-4.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,64:193:99:566,0,3051 chrII 801599 . A T 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.473;DP=204;Dels=0.00;FS=85.435;HaplotypeScore=6.7426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.523;QD=4.73;ReadPosRankSum=-3.086;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,69:204:99:994,0,3133 chrII 801614 . A T 671.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.903;DP=248;Dels=0.00;FS=224.845;HaplotypeScore=2.5450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.30;MQ0=0;MQRankSum=-6.765;QD=2.71;ReadPosRankSum=-6.388;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,121:248:99:701,0,2998 chrII 801616 . A G 245.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.646;DP=242;Dels=0.00;FS=225.329;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.09;MQ0=0;MQRankSum=-6.873;QD=1.01;ReadPosRankSum=-5.483;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,115:242:99:275,0,2952 chrII 801617 . G A 213.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.482;DP=250;Dels=0.00;FS=215.186;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.59;MQ0=0;MQRankSum=-6.832;QD=0.85;ReadPosRankSum=-4.340;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,114:250:99:243,0,3136 chrII 801620 . T C 250.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.154;DP=256;Dels=0.00;FS=206.608;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.835;QD=0.98;ReadPosRankSum=-4.211;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,119:256:99:280,0,3278 chrII 801624 . C T 346.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.740;DP=249;Dels=0.00;FS=182.148;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.58;MQ0=0;MQRankSum=-6.961;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.210;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,111:249:99:376,0,3210 chrII 801628 . A G 241.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.590;DP=229;Dels=0.00;FS=160.881;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.80;MQ0=0;MQRankSum=-4.525;QD=1.05;ReadPosRankSum=-2.931;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,104:229:99:271,0,2992 chrII 801629 . C A 270.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.434;DP=229;Dels=0.00;FS=163.566;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.80;MQ0=0;MQRankSum=-5.959;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.579;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,104:229:99:300,0,2645 chrII 801634 . T C 95.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.034;DP=219;Dels=0.00;FS=164.944;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.78;MQ0=0;MQRankSum=-5.252;QD=0.43;ReadPosRankSum=0.664;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,95:219:99:125,0,2869 chrII 801635 . A G 88.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.213;DP=219;Dels=0.00;FS=159.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.61;MQ0=0;MQRankSum=-5.845;QD=0.40;ReadPosRankSum=0.470;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,95:219:99:118,0,2852 chrII 801638 . C T 143.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.070;DP=228;Dels=0.00;FS=166.359;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.14;MQ0=0;MQRankSum=-6.282;QD=0.63;ReadPosRankSum=0.331;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,103:228:99:173,0,2864 chrII 801647 . A G 291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.747;DP=222;Dels=0.00;FS=129.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.02;MQ0=0;MQRankSum=-4.247;QD=1.31;ReadPosRankSum=3.011;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,101:222:99:321,0,2782 chrII 801650 . C A 329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.793;DP=236;Dels=0.00;FS=106.359;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.66;MQ0=0;MQRankSum=-3.921;QD=1.39;ReadPosRankSum=2.940;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,107:236:99:359,0,2836 chrII 801661 . A T 2339.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.710;DP=277;Dels=0.00;FS=104.038;HaplotypeScore=3.7292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.058;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,131:277:99:2369,0,1659 chrII 801662 . T A 2265.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.427;DP=264;Dels=0.00;FS=85.401;HaplotypeScore=3.7292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.122;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.614;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,116:264:99:2295,0,1645 chrII 801665 . A C 2184.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;DP=273;Dels=0.00;FS=77.001;HaplotypeScore=2.3249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.514;QD=8.00;ReadPosRankSum=2.158;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,114:273:99:2214,0,1899 chrII 801676 . G T 1755.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.242;DP=308;Dels=0.00;FS=38.081;HaplotypeScore=57.7524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.09;MQ0=0;MQRankSum=-3.451;QD=5.70;ReadPosRankSum=4.909;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,102:308:99:1785,0,3123 chrII 801677 . A G 1779.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.169;DP=309;Dels=0.00;FS=33.528;HaplotypeScore=57.7524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.07;MQ0=0;MQRankSum=-4.133;QD=5.76;ReadPosRankSum=4.627;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,104:309:99:1809,0,3281 chrII 801683 . A G 462.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.641;DP=314;Dels=0.00;FS=3.617;HaplotypeScore=173.6396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.54;MQ0=0;MQRankSum=-3.253;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.348;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,59:314:99:492,0,4678 chrII 801689 . A G 2649.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.508;DP=309;Dels=0.00;FS=15.120;HaplotypeScore=181.7921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.28;MQ0=0;MQRankSum=-7.858;QD=8.57;ReadPosRankSum=4.275;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,156:309:99:2679,0,2515 chrII 801690 . T G 2569.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.292;DP=308;Dels=0.00;FS=15.117;HaplotypeScore=181.7830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.32;MQ0=0;MQRankSum=-6.580;QD=8.34;ReadPosRankSum=3.933;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,156:308:99:2599,0,2512 chrII 801693 . T C 1293.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.691;DP=296;Dels=0.00;FS=10.405;HaplotypeScore=180.7942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.828;QD=4.37;ReadPosRankSum=2.711;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,93:296:99:1323,0,4077 chrII 801695 . G A 537.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.741;DP=295;Dels=0.00;FS=0.541;HaplotypeScore=124.5414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.82;MQ0=0;MQRankSum=-4.217;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.024;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,62:295:99:567,0,4840 chrII 801699 . G A 2978.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.917;DP=306;Dels=0.00;FS=4.724;HaplotypeScore=120.5660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.64;MQ0=0;MQRankSum=-7.543;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.138;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,166:306:99:3008,0,2695 chrII 801782 . C T 8413.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=321;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.54;MQ0=4;QD=26.21;SB=-3.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,321:321:99:8413,865,0 chrII 802153 . T C 2171.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.466;DP=429;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=13.6195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.575;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,126:429:99:2201,0,7117 chrII 802257 . C T 12476.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=496;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.26;MQ0=0;QD=25.15;SB=-6.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,496:496:99:12476,1241,0 chrII 802259 . G T 13127.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=498;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=26.36;SB=-6.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,498:498:99:13127,1310,0 chrII 802322 . G C 2422.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.142;DP=406;Dels=0.00;FS=1.722;HaplotypeScore=3.5256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=5.97;ReadPosRankSum=-1.336;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,154:406:99:2452,0,5227 chrII 802344 . A G 1739.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.154;DP=447;Dels=0.00;FS=6.944;HaplotypeScore=30.6372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=2.230;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:324,122:446:99:1769,0,7704 chrII 802651 . A G 4883.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.540;DP=415;Dels=0.00;FS=7.259;HaplotypeScore=15.5532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.230;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-2.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,234:414:99:4883,0,3754 chrII 802656 . T C 10419.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=403;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.92;MQ0=0;QD=25.85;SB=-4.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,403:403:99:10419,1093,0 chrII 802719 . G A 1613.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.248;DP=371;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=3.400;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.165;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,100:371:99:1643,0,6071 chrII 802840 . A G 148.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.691;DP=276;Dels=0.00;FS=71.827;HaplotypeScore=2.8508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=-9.949;QD=0.54;ReadPosRankSum=0.821;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,41:275:99:178,0,5593 chrII 802841 . A G 97.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.947;DP=282;Dels=0.00;FS=84.666;HaplotypeScore=2.8508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-9.615;QD=0.34;ReadPosRankSum=1.320;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,40:282:99:127,0,5732 chrII 802844 . G A 124.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.824;DP=289;Dels=0.00;FS=90.785;HaplotypeScore=2.6935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-9.932;QD=0.43;ReadPosRankSum=1.778;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,38:288:99:154,0,5479 chrII 802846 . C T 80.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.656;DP=293;Dels=0.00;FS=94.584;HaplotypeScore=2.6935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-9.928;QD=0.27;ReadPosRankSum=1.427;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,38:293:99:110,0,5817 chrII 802847 . A T 74.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.201;DP=293;Dels=0.00;FS=90.914;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-9.918;QD=0.25;ReadPosRankSum=1.148;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,38:293:99:104,0,6028 chrII 802850 . A G 67.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.634;DP=297;Dels=0.00;FS=98.663;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=-10.303;QD=0.23;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,42:297:97:97,0,5844 chrII 802857 . G A 64.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.345;DP=321;Dels=0.00;FS=115.493;HaplotypeScore=9.5084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-10.552;QD=0.20;ReadPosRankSum=-1.702;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:277,44:321:94:94,0,6376 chrII 802861 . A G 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.076;DP=309;Dels=0.00;FS=111.495;HaplotypeScore=10.1717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQ0=0;MQRankSum=-10.190;QD=0.03;ReadPosRankSum=-2.759;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,41:309:40:40,0,6469 chrII 802960 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.267;DP=250;Dels=0.04;FS=0.504;HaplotypeScore=84.4020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.865;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,80:241:99:1502,0,3534 chrII 803024 . T C 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.002;DP=323;Dels=0.00;FS=0.941;HaplotypeScore=63.7418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.551;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,102:323:99:1800,0,4626 chrII 803353 . A T 2406.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;DP=358;Dels=0.00;FS=9.864;HaplotypeScore=34.7622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-3.727;QD=6.72;ReadPosRankSum=4.259;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,138:358:99:2436,0,4866 chrII 803355 . C G 2358.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.697;DP=353;Dels=0.00;FS=8.940;HaplotypeScore=13.2792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-4.410;QD=6.68;ReadPosRankSum=3.668;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,141:353:99:2388,0,4574 chrII 803356 . A T 2551.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.238;DP=352;Dels=0.00;FS=8.904;HaplotypeScore=13.2792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=7.25;ReadPosRankSum=3.359;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,140:351:99:2581,0,4691 chrII 803661 . T C 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.072;DP=338;Dels=0.00;FS=1.942;HaplotypeScore=9.0946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=-7.397;QD=0.08;ReadPosRankSum=-1.117;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,48:338:58:58,0,6969 chrII 803690 . G A 45.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.468;DP=312;Dels=0.00;FS=6.104;HaplotypeScore=3.2682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQ0=0;MQRankSum=-10.004;QD=0.14;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,49:312:75:75,0,6281 chrII 803693 . C T 79.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.703;DP=310;Dels=0.00;FS=4.871;HaplotypeScore=3.2682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=-9.930;QD=0.25;ReadPosRankSum=-1.957;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,51:310:99:109,0,6313 chrII 803699 . A G 137.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.855;DP=310;Dels=0.00;FS=9.397;HaplotypeScore=5.6717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQ0=0;MQRankSum=-10.103;QD=0.44;ReadPosRankSum=-2.978;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,54:310:99:167,0,6281 chrII 803782 . A T 1994.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.114;DP=409;Dels=0.00;FS=4.476;HaplotypeScore=7.5548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.18;MQ0=0;MQRankSum=5.389;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.127;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:291,118:409:99:2024,0,6866 chrII 803812 . T C 1782.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-13.660;DP=424;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQ0=0;MQRankSum=2.860;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.441;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:309,115:424:99:1812,0,7189 chrII 803861 . G A 2029.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=13.695;DP=445;Dels=0.00;FS=3.434;HaplotypeScore=8.6086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.887;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:322,123:445:99:2059,0,6600 chrII 803935 . G A 4163.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.250;DP=463;Dels=0.00;FS=6.521;HaplotypeScore=108.7797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.03;MQ0=0;MQRankSum=-9.620;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-2.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,216:463:99:4163,0,4942 chrII 803936 . A T 1464.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.370;DP=464;Dels=0.00;FS=0.826;HaplotypeScore=109.9742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.94;MQ0=0;MQRankSum=-8.214;QD=3.16;ReadPosRankSum=-2.561;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:353,111:464:99:1494,0,7581 chrII 803945 . G A 966.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.858;DP=385;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=475.2358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-11.478;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,84:385:99:996,0,6262 chrII 803948 . G A 1299.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.998;DP=358;Dels=0.00;FS=9.206;HaplotypeScore=404.1964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.45;MQ0=0;MQRankSum=-7.655;QD=3.63;ReadPosRankSum=-2.190;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,89:358:99:1329,0,3986 chrII 803954 . G A 1408.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.711;DP=340;Dels=0.00;FS=28.301;HaplotypeScore=478.3580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.81;MQ0=0;MQRankSum=-7.146;QD=4.14;ReadPosRankSum=-3.462;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,93:340:99:1438,0,4067 chrII 803960 . T C 461.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.906;DP=367;Dels=0.00;FS=12.782;HaplotypeScore=467.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.42;MQ0=0;MQRankSum=-11.297;QD=1.26;ReadPosRankSum=1.310;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:291,76:367:99:491,0,6412 chrII 803963 . A G 402.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.227;DP=374;Dels=0.00;FS=14.079;HaplotypeScore=480.9763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.47;MQ0=0;MQRankSum=-10.900;QD=1.07;ReadPosRankSum=2.131;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,76:374:99:432,0,6609 chrII 803964 . G A 1186.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.760;DP=370;Dels=0.00;FS=35.077;HaplotypeScore=418.4675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.56;MQ0=0;MQRankSum=-7.797;QD=3.21;ReadPosRankSum=-1.772;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,93:370:99:1216,0,5723 chrII 803966 . A G 489.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.748;DP=361;Dels=0.00;FS=11.515;HaplotypeScore=423.5740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.71;MQ0=0;MQRankSum=-10.561;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.432;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:285,76:361:99:519,0,6286 chrII 803972 . A C 421.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.380;DP=349;Dels=0.00;FS=10.428;HaplotypeScore=475.5733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQ0=0;MQRankSum=-10.250;QD=1.21;ReadPosRankSum=1.211;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,75:349:99:451,0,5963 chrII 803975 . C T 298.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.800;DP=354;Dels=0.00;FS=4.810;HaplotypeScore=8.4935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.71;MQ0=0;MQRankSum=-10.035;QD=0.84;ReadPosRankSum=4.481;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:291,63:354:99:328,0,6333 chrII 803977 . T G 275.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.179;DP=349;Dels=0.00;FS=5.728;HaplotypeScore=507.7503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.61;MQ0=0;MQRankSum=-9.011;QD=0.79;ReadPosRankSum=4.187;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,63:349:99:305,0,6421 chrII 803978 . T C 277.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.032;DP=348;Dels=0.00;FS=5.708;HaplotypeScore=508.2125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.57;MQ0=0;MQRankSum=-8.953;QD=0.80;ReadPosRankSum=3.962;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:285,63:348:99:307,0,6486 chrII 803981 . C T 309.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.437;DP=350;Dels=0.00;FS=4.822;HaplotypeScore=507.2192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.64;MQ0=0;MQRankSum=-9.097;QD=0.88;ReadPosRankSum=3.091;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,63:350:99:339,0,6132 chrII 803983 . A G 293.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.738;DP=343;Dels=0.00;FS=5.769;HaplotypeScore=505.1601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.63;MQ0=0;MQRankSum=-9.400;QD=0.85;ReadPosRankSum=2.438;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,63:343:99:323,0,6273 chrII 803984 . A C 280.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.256;DP=343;Dels=0.00;FS=7.732;HaplotypeScore=505.1601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.47;MQ0=0;MQRankSum=-9.995;QD=0.82;ReadPosRankSum=1.963;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,65:343:99:310,0,6135 chrII 803987 . G T 1199.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.825;DP=363;Dels=0.00;FS=18.192;HaplotypeScore=488.3497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.36;MQ0=0;MQRankSum=-12.847;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,91:363:99:1229,0,3956 chrII 803990 . A C 1006.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.481;DP=365;Dels=0.00;FS=19.902;HaplotypeScore=347.1979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQ0=0;MQRankSum=-10.306;QD=2.76;ReadPosRankSum=1.108;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:277,88:365:99:1036,0,5535 chrII 803993 . C T 2452.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.934;DP=371;Dels=0.00;FS=10.119;HaplotypeScore=346.3722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.51;MQ0=0;MQRankSum=-15.787;QD=6.61;ReadPosRankSum=-2.448;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,181:371:99:2482,0,4056 chrII 803999 . T A 1016.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=361;Dels=0.00;FS=23.015;HaplotypeScore=89.5451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.66;MQ0=0;MQRankSum=-11.506;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.836;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,90:361:99:1046,0,5249 chrII 804006 . T C 1046.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.511;DP=405;Dels=0.00;FS=18.894;HaplotypeScore=87.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.53;MQ0=0;MQRankSum=-11.793;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.452;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:307,98:405:99:1076,0,6237 chrII 804023 . G A 750.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.519;DP=420;Dels=0.00;FS=16.942;HaplotypeScore=4.7390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-12.927;QD=1.79;ReadPosRankSum=-1.048;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:322,98:420:99:780,0,6325 chrII 804036 . A G 710.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.567;DP=429;Dels=0.00;FS=4.543;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=-11.102;QD=1.66;ReadPosRankSum=-4.120;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:330,99:429:99:740,0,7180 chrII 804095 . A G 991.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.929;DP=445;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.4699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=-5.843;QD=2.23;ReadPosRankSum=3.300;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:339,106:445:99:1021,0,7846 chrII 804104 . A G 1045.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.012;DP=438;Dels=0.00;FS=9.123;HaplotypeScore=280.0024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.692;QD=2.39;ReadPosRankSum=5.601;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:346,92:438:99:1075,0,8228 chrII 804105 . T A 1183.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.737;DP=439;Dels=0.00;FS=8.079;HaplotypeScore=280.9971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.434;QD=2.69;ReadPosRankSum=5.388;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:346,93:439:99:1213,0,8196 chrII 804112 . C A 2527.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.487;DP=414;Dels=0.00;FS=0.386;HaplotypeScore=187.4767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=3.550;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,133:414:99:2557,0,6233 chrII 804209 . G A 2478.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.647;DP=491;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=15.8248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=1;MQRankSum=2.179;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.288;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:343,148:491:99:2508,0,7723 chrII 804298 . T C 2292.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.471;DP=481;Dels=0.00;FS=1.175;HaplotypeScore=125.9648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.372;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:341,140:481:99:2322,0,7928 chrII 804303 . A G 5509.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.186;DP=496;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=124.6378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.934;SB=-2.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,274:496:99:5509,0,4585 chrII 804327 . A T 2618.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;DP=496;Dels=0.00;FS=2.598;HaplotypeScore=4.7463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.022;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.917;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:346,150:496:99:2648,0,8052 chrII 804467 . T G 2360.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.379;DP=526;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=16.5743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.598;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:375,150:526:99:2390,0,8676 chrII 804507 . T C 2648.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.915;DP=575;Dels=0.00;FS=4.489;HaplotypeScore=6.3399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:413,162:575:99:2678,0,9595 chrII 804522 . C T 2501.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=15.821;DP=545;Dels=0.00;FS=3.841;HaplotypeScore=8.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:395,150:545:99:2531,0,8373 chrII 804560 . T C 2128.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-13.939;DP=478;Dels=0.00;FS=14.818;HaplotypeScore=4.2122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.343;QD=4.45;ReadPosRankSum=1.223;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,134:478:99:2158,0,8063 chrII 804646 . T C 2574.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-14.055;DP=546;Dels=0.00;FS=0.340;HaplotypeScore=3.3269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:388,158:546:99:2604,0,8765 chrII 804664 . G A 2232.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.774;DP=474;Dels=0.00;FS=2.708;HaplotypeScore=12.1322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.345;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,130:474:99:2262,0,7657 chrII 804707 . A G 12060.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;DP=466;Dels=0.00;FS=3.220;HaplotypeScore=7.4008;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=25.88;ReadPosRankSum=1.695;SB=-6.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,465:466:99:12060,1214,0 chrII 804775 . G C 2716.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.652;DP=500;Dels=0.00;FS=1.608;HaplotypeScore=14.6660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.717;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.356;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:342,157:500:99:2746,0,7617 chrII 804823 . A G 695.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-17.683;DP=727;Dels=0.00;FS=22.779;HaplotypeScore=7.2933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQ0=0;MQRankSum=-5.317;QD=0.96;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:582,145:727:99:725,0,12516 chrII 804827 . C T 1050.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.668;DP=785;Dels=0.00;FS=11.092;HaplotypeScore=9.4126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.87;MQ0=0;MQRankSum=-6.546;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:620,165:785:99:1080,0,13163 chrII 804854 . C T 983.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.057;DP=807;Dels=0.00;FS=38.128;HaplotypeScore=5.2579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.988;QD=1.22;ReadPosRankSum=4.602;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:650,155:807:99:1013,0,13801 chrII 804874 . G A 463.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.256;DP=805;Dels=0.00;FS=2.807;HaplotypeScore=113.5659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.788;QD=0.58;ReadPosRankSum=-1.568;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:699,106:805:99:493,0,15634 chrII 804879 . C T 1291.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.262;DP=780;Dels=0.00;FS=18.526;HaplotypeScore=110.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=1.66;ReadPosRankSum=1.513;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:629,151:780:99:1321,0,13862 chrII 805115 . C T 7318.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=301;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8452;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.44;MQ0=19;QD=24.31;SB=-2.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,301:301:99:7318,763,0 chrII 805314 . C G 1561.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.464;DP=369;Dels=0.00;FS=1.976;HaplotypeScore=6.4395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.50;MQ0=9;MQRankSum=0.550;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.130;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,104:369:99:1591,0,5935 chrII 805343 . A T 6282.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.12;MQ0=15;QD=25.13;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,250:250:99:6282,655,0 chrII 805905 . T C 2137.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.832;DP=303;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.48;MQ0=102;MQRankSum=1.501;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,221:303:99:2167,0,465 chrII 806263 . C G 606 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.42;MQ0=20;QD=13.77;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:69:639,69,0 chrII 806862 . A G 680.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.963;DP=328;Dels=0.00;FS=3.759;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.70;MQ0=126;MQRankSum=0.308;QD=2.07;ReadPosRankSum=-3.815;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,93:328:99:710,0,2779 chrII 807174 . T A 1056.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;DP=345;Dels=0.00;FS=0.477;HaplotypeScore=6.6890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.54;MQ0=40;MQRankSum=0.853;QD=3.06;ReadPosRankSum=-2.360;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,95:345:99:1086,0,4695 chrII 807206 . A G 5714.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=355;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.48;MQ0=67;QD=16.10;SB=-2.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,355:355:99:5714,633,0 chrII 807331 . A G 4236.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.014;DP=524;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=12.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.01;MQ0=0;MQRankSum=5.232;QD=8.08;ReadPosRankSum=-2.031;SB=-2.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,221:524:99:4236,0,6515 chrII 807957 . C G 3535.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.964;DP=454;Dels=0.00;FS=3.549;HaplotypeScore=11.2171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.224;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,188:454:99:3535,0,5852 chrII 808186 . G A 2148.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=13.161;DP=489;Dels=0.00;FS=1.187;HaplotypeScore=11.1818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:354,135:489:99:2178,0,7954 chrII 808211 . T C 2125.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.151;DP=485;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.5735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.926;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:348,137:485:99:2155,0,8021 chrII 808371 . T C 1614.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.962;DP=362;Dels=0.00;FS=5.422;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,98:362:99:1644,0,6197 chrII 808450 . G A 2513.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.620;DP=493;Dels=0.00;FS=1.715;HaplotypeScore=2.9426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.482;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:347,146:493:99:2543,0,7772 chrII 809024 . C A 393.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.389;DP=261;Dels=0.00;FS=4.632;HaplotypeScore=9.6561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.04;MQ0=88;MQRankSum=-1.091;QD=1.51;ReadPosRankSum=1.294;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,60:261:99:423,0,2254 chrII 809040 . A C 464.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.235;DP=287;Dels=0.00;FS=25.485;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.77;MQ0=100;MQRankSum=-2.256;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.299;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,72:287:99:494,0,2467 chrII 809061 . T C 358.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.534;DP=244;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=11.1387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.46;MQ0=74;MQRankSum=-0.911;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,51:244:99:388,0,2173 chrII 809066 . C T 486.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.882;DP=255;Dels=0.00;FS=30.836;HaplotypeScore=11.1822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.29;MQ0=80;MQRankSum=-0.502;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.531;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,61:255:99:516,0,2098 chrII 809220 . T C 2112 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=48;QD=13.63;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:155:99:2145,237,0 chrII 809355 . G C 236.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.570;DP=364;Dels=0.00;FS=35.384;HaplotypeScore=2.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.73;MQ0=13;MQRankSum=-7.381;QD=0.65;ReadPosRankSum=3.596;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:291,73:364:99:266,0,6265 chrII 809379 . G A 1721.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.995;DP=355;Dels=0.00;FS=2.437;HaplotypeScore=84.2303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.06;MQ0=13;MQRankSum=-5.967;QD=4.85;ReadPosRankSum=-1.586;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,123:355:99:1751,0,4552 chrII 809420 . A G 1652.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.810;DP=259;Dels=0.00;FS=19.879;HaplotypeScore=7.7977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.57;MQ0=12;MQRankSum=-8.186;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.420;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,130:258:99:1682,0,2785 chrII 809423 . C G 1684.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.630;DP=262;Dels=0.00;FS=23.219;HaplotypeScore=9.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.62;MQ0=12;MQRankSum=-7.751;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.674;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,129:261:99:1714,0,2737 chrII 809444 . T A 1859.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.593;DP=227;Dels=0.00;FS=3.297;HaplotypeScore=16.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQ0=4;MQRankSum=-6.490;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.819;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,123:227:99:1889,0,1984 chrII 809483 . G A 66.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.014;DP=275;Dels=0.00;FS=13.874;HaplotypeScore=242.1100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=1;MQRankSum=-2.954;QD=0.24;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,49:275:96:96,0,1266 chrII 809513 . T A 159.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.902;DP=236;Dels=0.00;FS=92.892;HaplotypeScore=6.5407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.06;MQ0=0;MQRankSum=-5.703;QD=0.67;ReadPosRankSum=-1.514;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,44:236:99:189,0,1725 chrII 809526 . G A 370.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.154;DP=290;Dels=0.00;FS=84.349;HaplotypeScore=94.5878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.84;MQ0=14;MQRankSum=-6.059;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.965;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,65:290:99:400,0,2440 chrII 809800 . T C 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.175;DP=311;Dels=0.00;FS=20.992;HaplotypeScore=136.6450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.55;MQ0=47;MQRankSum=-3.411;QD=0.16;ReadPosRankSum=-4.730;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,23:311:80:80,0,1871 chrII 810032 . C T 831.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.586;DP=440;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.57;MQ0=56;MQRankSum=-1.608;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.114;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:353,87:440:99:861,0,6574 chrII 810159 . C T 506.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.623;DP=454;Dels=0.00;FS=17.849;HaplotypeScore=33.0635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.45;MQ0=7;MQRankSum=-4.302;QD=1.11;ReadPosRankSum=1.011;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:386,68:454:99:536,0,8226 chrII 810163 . G A 510.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.051;DP=455;Dels=0.00;FS=13.664;HaplotypeScore=39.0211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.60;MQ0=6;MQRankSum=-3.683;QD=1.12;ReadPosRankSum=2.792;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:390,65:455:99:540,0,8272 chrII 810165 . G A 544.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.404;DP=440;Dels=0.00;FS=13.825;HaplotypeScore=34.8926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.36;MQ0=6;MQRankSum=-3.850;QD=1.24;ReadPosRankSum=2.984;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:375,65:440:99:574,0,7959 chrII 810319 . T A 1305.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.304;DP=200;Dels=0.00;FS=15.657;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.01;MQ0=16;MQRankSum=-0.577;QD=6.53;ReadPosRankSum=3.851;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,77:200:99:1335,0,2207 chrII 810340 . C T 2485 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.70;MQ0=21;QD=20.54;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,103:121:99:2518,273,0 chrII 810344 . A G 2192 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.74;MQ0=24;QD=19.06;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,94:115:99:2225,246,0 chrII 810350 . A G 1493 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.21;MQ0=22;QD=17.99;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,61:83:99:1526,171,0 chrII 810351 . G A 1488 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.10;MQ0=23;QD=17.71;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,61:84:99:1521,171,0 chrII 810353 . A T 1500 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.10;MQ0=23;QD=17.86;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,61:84:99:1533,171,0 chrII 810363 . G A 1177 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.94;MQ0=28;QD=13.37;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,60:88:99:1210,135,0 chrII 810385 . G A 64.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.02;MQ0=41;MQRankSum=4.818;QD=0.55;ReadPosRankSum=4.622;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,9:116:94:94,0,852 chrII 810416 . G A 267 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.928;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.5106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.60;MQ0=44;MQRankSum=3.161;QD=2.93;ReadPosRankSum=-3.321;SB=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:76,15:91:33:300,33,0 chrII 810433 . C T 167.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.885;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.18;MQ0=40;MQRankSum=2.213;QD=2.01;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-4.053e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:72,11:83:21:200,21,0 chrII 810442 . A G 207.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.772;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.06;MQ0=46;MQRankSum=2.221;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,26:101:99:237,0,148 chrII 810444 . C G 196.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.373;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.61;MQ0=45;MQRankSum=1.948;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:226,0,171 chrII 810461 . T C 674 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.14;MQ0=45;QD=7.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,73:96:78:707,78,0 chrII 810487 . G A 177.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.214;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.45;MQ0=55;MQRankSum=-2.536;QD=1.49;ReadPosRankSum=1.474;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,16:119:99:207,0,895 chrII 810490 . G A 123.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.739;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.37;MQ0=56;MQRankSum=-2.485;QD=1.03;ReadPosRankSum=1.075;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,12:120:99:153,0,967 chrII 810508 . C A 102.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.738;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.22;MQ0=56;MQRankSum=-1.585;QD=0.73;ReadPosRankSum=0.157;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,15:139:99:132,0,1386 chrII 810515 . G A 2070 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.70;MQ0=57;QD=14.28;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,118:145:99:2103,231,0 chrII 810548 . C T 308.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.251;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.15;MQ0=69;MQRankSum=-0.610;QD=1.81;ReadPosRankSum=1.129;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,39:170:99:338,0,1534 chrII 810883 . T C 188.56 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.06;MQ0=132;QD=1.31;SB=23.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:144:24:219,24,0 chrII 810917 . C T 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.23;MQ0=92;MQRankSum=-0.573;QD=0.28;ReadPosRankSum=0.248;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,27:101:58:58,0,110 chrIII 131 . A C 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;DP=63;Dels=0.03;FS=1.502;HaplotypeScore=99.0745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.39;MQ0=6;MQRankSum=0.724;QD=0.21;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,12:61:43:43,0,349 chrIII 388 . T C 33.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.898;DP=55;Dels=0.00;FS=4.513;HaplotypeScore=11.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.922;QD=0.60;ReadPosRankSum=0.531;SB=-4.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:63:63,0,761 chrIII 414 . C A 44.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.526;DP=57;Dels=0.00;FS=1.753;HaplotypeScore=19.1492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.66;MQ0=0;MQRankSum=-3.271;QD=0.77;ReadPosRankSum=-2.375;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:57:74:74,0,762 chrIII 418 . T C 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=59;Dels=0.00;FS=1.741;HaplotypeScore=20.1450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.583;QD=0.24;ReadPosRankSum=-2.435;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,9:59:44:44,0,930 chrIII 422 . T C 37.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.207;DP=58;Dels=0.00;FS=3.108;HaplotypeScore=15.1887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.53;MQ0=0;MQRankSum=-3.970;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.552;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:67:67,0,909 chrIII 467 . C T 61.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.300;DP=83;Dels=0.00;FS=39.402;HaplotypeScore=51.1817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQ0=3;MQRankSum=-4.517;QD=0.74;ReadPosRankSum=3.109;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:91:91,0,1364 chrIII 468 . G A 121.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.901;DP=82;Dels=0.00;FS=39.433;HaplotypeScore=48.2258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.27;MQ0=3;MQRankSum=-5.878;QD=1.48;ReadPosRankSum=2.549;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:82:99:151,0,1246 chrIII 686 . T C 71.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;DP=70;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=31.4178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.03;MQ0=5;MQRankSum=-3.438;QD=1.01;ReadPosRankSum=-1.786;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:101,0,1006 chrIII 776 . T C 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.531;DP=82;Dels=0.00;FS=20.683;HaplotypeScore=40.0238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.24;MQ0=0;MQRankSum=-5.831;QD=0.18;ReadPosRankSum=2.106;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:82:45:45,0,1313 chrIII 780 . T C 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.345;DP=83;Dels=0.00;FS=44.437;HaplotypeScore=44.8570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.864;QD=0.23;ReadPosRankSum=0.710;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:49:49,0,1307 chrIII 816 . C T 70.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.141;DP=83;Dels=0.05;FS=24.805;HaplotypeScore=54.9199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.41;MQ0=0;MQRankSum=-3.995;QD=0.84;ReadPosRankSum=-3.239;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:100,0,1229 chrIII 859 . C T 144.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;DP=145;Dels=0.00;FS=18.696;HaplotypeScore=3.9348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.04;MQ0=7;MQRankSum=-5.045;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.037;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,28:145:99:174,0,2303 chrIII 879 . G C 408.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.230;DP=153;Dels=0.00;FS=0.835;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.75;MQ0=9;MQRankSum=-1.432;QD=2.67;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,35:153:99:438,0,2045 chrIII 892 . C G 680.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;DP=189;Dels=0.00;FS=6.421;HaplotypeScore=6.5055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.05;MQ0=15;MQRankSum=-3.386;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.076;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,53:189:99:710,0,2367 chrIII 924 . C T 328.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.325;DP=199;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=49.1142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.08;MQ0=18;MQRankSum=-4.728;QD=1.65;ReadPosRankSum=1.903;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,48:199:99:358,0,2818 chrIII 929 . A G 804.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.551;DP=194;Dels=0.00;FS=11.982;HaplotypeScore=51.1005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.21;MQ0=18;MQRankSum=-5.583;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.347;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,83:194:99:834,0,2313 chrIII 931 . A C 1127.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.342;DP=187;Dels=0.00;FS=7.702;HaplotypeScore=49.1138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.23;MQ0=17;MQRankSum=-8.202;QD=6.03;ReadPosRankSum=2.450;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,102:187:99:1157,0,1741 chrIII 951 . C T 647.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.034;DP=173;Dels=0.00;FS=2.201;HaplotypeScore=9.3761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.53;MQ0=13;MQRankSum=-4.522;QD=3.74;ReadPosRankSum=2.452;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,55:173:99:677,0,2230 chrIII 978 . A G 105.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.472;DP=136;Dels=0.00;FS=2.141;HaplotypeScore=37.0273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.42;MQ0=10;MQRankSum=-1.053;QD=0.77;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,19:136:99:135,0,2324 chrIII 980 . A G 368.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.924;DP=136;Dels=0.00;FS=112.224;HaplotypeScore=37.3102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.24;MQ0=10;MQRankSum=-6.686;QD=2.71;ReadPosRankSum=-3.679;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,38:136:99:398,0,2144 chrIII 982 . C T 100.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;DP=137;Dels=0.00;FS=71.138;HaplotypeScore=58.6424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.38;MQ0=9;MQRankSum=-5.096;QD=0.73;ReadPosRankSum=-3.350;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,22:137:99:130,0,2396 chrIII 1006 . C T 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;DP=160;Dels=0.00;FS=25.500;HaplotypeScore=14.6041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.27;MQ0=4;MQRankSum=-6.167;QD=0.18;ReadPosRankSum=-2.046;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,25:160:58:58,0,2992 chrIII 1023 . A T 65.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;DP=193;Dels=0.00;FS=36.949;HaplotypeScore=62.4246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.76;MQ0=5;MQRankSum=-6.498;QD=0.34;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,31:193:95:95,0,3525 chrIII 1028 . C A 338.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.738;DP=196;Dels=0.00;FS=35.476;HaplotypeScore=91.8854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.78;MQ0=6;MQRankSum=-7.940;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.802;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,55:196:99:368,0,3010 chrIII 1034 . C T 255.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;DP=196;Dels=0.00;FS=27.951;HaplotypeScore=122.8109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.21;MQ0=6;MQRankSum=-4.373;QD=1.30;ReadPosRankSum=-1.034;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,32:196:99:285,0,3401 chrIII 1040 . T C 192.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.215;DP=199;Dels=0.00;FS=11.388;HaplotypeScore=35.0956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.24;MQ0=6;MQRankSum=-3.085;QD=0.96;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,32:199:99:222,0,3471 chrIII 1109 . T A 54.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.529;DP=108;Dels=0.00;FS=9.693;HaplotypeScore=43.5113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQ0=5;MQRankSum=-3.754;QD=0.50;ReadPosRankSum=1.575;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,16:108:84:84,0,1868 chrIII 1171 . C A 97.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.524;DP=79;Dels=0.00;FS=9.901;HaplotypeScore=9.6842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.03;MQ0=0;MQRankSum=-4.988;QD=1.23;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:127,0,1234 chrIII 1218 . C T 202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.382;DP=77;Dels=0.00;FS=11.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.30;MQ0=0;MQRankSum=-5.630;QD=2.62;ReadPosRankSum=3.468;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:232,0,1403 chrIII 1258 . C T 66.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.983;DP=65;Dels=0.00;FS=13.569;HaplotypeScore=15.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQ0=0;MQRankSum=-4.243;QD=1.02;ReadPosRankSum=2.248;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,11:65:96:96,0,1338 chrIII 1261 . G A 262.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.640;DP=65;Dels=0.00;FS=9.813;HaplotypeScore=11.7948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=-6.209;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.213;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:292,0,1153 chrIII 1264 . G A 259.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.010;DP=68;Dels=0.00;FS=7.807;HaplotypeScore=6.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.84;MQ0=0;MQRankSum=-6.262;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.229;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:289,0,1243 chrIII 2521 . C T 1941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=28.13;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1974,198,0 chrIII 3939 . C T 1363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.82;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1396,138,0 chrIII 4090 . T C 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.116;DP=84;Dels=0.00;FS=7.155;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-4.415;QD=0.12;ReadPosRankSum=-2.625;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,11:84:40:40,0,1752 chrIII 4178 . G T 403.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.417;DP=95;Dels=0.00;FS=16.669;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQ0=0;MQRankSum=-6.312;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,23:95:99:433,0,1647 chrIII 4184 . A C 244.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.953;DP=91;Dels=0.00;FS=18.824;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.983;QD=2.68;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,18:91:99:274,0,1713 chrIII 4489 . T C 1255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=24.13;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1288,126,0 chrIII 4490 . T C 1237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=24.74;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1270,126,0 chrIII 6041 . A C 2240 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.87;MQ0=0;QD=21.75;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2273,231,0 chrIII 6190 . C T 708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=2;QD=22.84;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:75:741,75,0 chrIII 6260 . G C 53.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.59;MQ0=0;QD=6.00;SB=-2.985e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:86,9,0 chrIII 6268 . C T 431 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.95;MQ0=0;QD=18.74;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:48:464,48,0 chrIII 8528 . T C 1183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.27;MQ0=0;QD=24.65;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1216,126,0 chrIII 8530 . T C 1237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.27;MQ0=0;QD=25.77;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1270,129,0 chrIII 8572 . T C 553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=26.0697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.82;MQ0=3;QD=21.27;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:63:586,63,0 chrIII 8584 . A T 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;DP=16;Dels=0.00;FS=11.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.61;MQ0=3;MQRankSum=-0.296;QD=0.75;ReadPosRankSum=-2.073;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,2:16:6:43,6,0 chrIII 8685 . C T 1138 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.03;MQ0=9;QD=17.78;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1171,123,0 chrIII 8696 . G A 1290 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.85;MQ0=10;QD=18.43;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1323,138,0 chrIII 8743 . C T 1195 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.30;MQ0=4;QD=23.43;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1228,126,0 chrIII 9461 . G T 360 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.07;MQ0=4;QD=15.00;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:42:393,42,0 chrIII 9739 . A G 995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.650;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;MQ0=2;MQRankSum=-0.578;QD=22.61;ReadPosRankSum=1.320;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:99:1028,105,0 chrIII 10348 . A G 53.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.50;MQ0=12;QD=2.84;SB=-2.985e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:86,9,0 chrIII 10703 . C T 228.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.66;MQ0=18;QD=6.16;SB=-8.296e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:27:261,27,0 chrIII 11056 . C T 2038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.99;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2071,195,0 chrIII 11126 . T C 1703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=2;QD=25.42;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1736,180,0 chrIII 11578 . C T 499 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.86;MQ0=27;QD=10.85;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,24:46:54:532,54,0 chrIII 11775 . G T 442 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.11;MQ0=1;QD=21.05;SB=-6.640e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:48:475,48,0 chrIII 14139 . G T 1367 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.95;MQ0=0;QD=27.34;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1400,138,0 chrIII 14191 . G A 1638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.85;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1671,156,0 chrIII 14356 . A T 1709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.559;DP=94;Dels=0.00;FS=2.581;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;MQ0=0;MQRankSum=2.065;QD=18.18;ReadPosRankSum=2.667;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,91:94:99:1742,177,0 chrIII 14631 . T A 2279 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=26.81;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2312,222,0 chrIII 15312 . A G 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;DP=123;Dels=0.00;FS=3.290;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.043;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1395,0,1186 chrIII 15688 . G T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.623;DP=128;Dels=0.00;FS=5.417;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1305,0,1471 chrIII 16356 . G A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;DP=121;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.451;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.624;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1207,0,1491 chrIII 17510 . G A 2109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.191;DP=158;Dels=0.00;FS=5.973;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,96:158:99:2139,0,1326 chrIII 17635 . C T 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.15;SB=-2.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4054,385,0 chrIII 17787 . C T 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.752;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.316;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,79:172:99:1766,0,1852 chrIII 17917 . A G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.549;DP=133;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.791;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1427,0,1371 chrIII 17925 . G A 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.089;DP=135;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.870;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1638,0,1322 chrIII 18052 . A C 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.626;DP=177;Dels=0.00;FS=2.602;HaplotypeScore=6.5286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.339;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,93:177:99:1929,0,1868 chrIII 18173 . G A 4162.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4162,397,0 chrIII 18277 . T C 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.555;DP=138;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.906;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1470,0,1416 chrIII 18342 . C T 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.670;DP=137;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.057;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:137:99:1598,0,1365 chrIII 18531 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.508;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.690;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1187,0,1600 chrIII 18583 . C T 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.291;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.808;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:98:99:1053,0,1103 chrIII 18613 . T G 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.393;DP=100;Dels=0.00;FS=2.719;HaplotypeScore=35.2726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.776;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:997,0,247 chrIII 18676 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.683;DP=115;Dels=0.00;FS=1.701;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.437;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1185,0,1216 chrIII 18742 . C T 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;DP=86;Dels=0.00;FS=12.909;HaplotypeScore=4.8430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.959;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.886;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:950,0,812 chrIII 18757 . G C 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;DP=84;Dels=0.00;FS=11.098;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.641;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:969,0,774 chrIII 18759 . C T 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.092;DP=87;Dels=0.00;FS=12.636;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.368;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.450;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1005,0,816 chrIII 18804 . G T 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;DP=74;Dels=0.00;FS=14.878;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.120;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.786;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:901,0,713 chrIII 18813 . C G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;DP=88;Dels=0.00;FS=15.817;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.982;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,49:88:99:980,0,810 chrIII 18828 . G A 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.417;DP=76;Dels=0.00;FS=0.869;HaplotypeScore=2.7196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.902;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:732,0,791 chrIII 18860 . A T 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.271;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:99:767,0,751 chrIII 19327 . T A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.401;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.674;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:126:99:1435,0,1351 chrIII 19599 . A G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.517;DP=128;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.710;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1258,0,1472 chrIII 19946 . T C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.009;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.216;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1119,0,1449 chrIII 20735 . T C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.806;DP=120;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=2.6320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.577;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1182,0,1347 chrIII 21015 . C T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.118;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.092;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1521,0,1379 chrIII 21165 . T C 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.208;DP=125;Dels=0.00;FS=3.283;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1006,0,1724 chrIII 21556 . C T 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.901;DP=143;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.467;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1754,0,1480 chrIII 21786 . T G 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.488;DP=141;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.147;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1679,0,1357 chrIII 22127 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.177;DP=105;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.112;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1210,0,1141 chrIII 22203 . G A 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.725;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1643,0,1355 chrIII 23149 . T C 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3814,379,0 chrIII 23567 . C A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.852;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.344;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1381,0,1094 chrIII 23619 . C T 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;DP=130;Dels=0.00;FS=2.279;HaplotypeScore=3.3227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=12.45;ReadPosRankSum=-1.783;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,76:130:99:1648,0,1060 chrIII 24833 . C G 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;DP=133;Dels=0.00;FS=9.354;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:133:99:1560,0,1241 chrIII 24904 . C T 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.302;DP=180;Dels=0.00;FS=4.803;HaplotypeScore=5.3479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.766;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,86:180:99:1773,0,1993 chrIII 24905 . T A 1929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.076;DP=169;Dels=0.00;FS=6.013;HaplotypeScore=4.3546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,89:169:99:1959,0,1811 chrIII 24942 . A G 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.507;DP=128;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.160;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1358,0,1435 chrIII 25125 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.212;DP=115;Dels=0.00;FS=2.427;HaplotypeScore=2.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.594;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1116,0,1426 chrIII 25319 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;DP=145;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.497;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1514,0,1711 chrIII 25355 . G T 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;DP=134;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.182;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,51:134:99:1028,0,1825 chrIII 25463 . T G 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;DP=139;Dels=0.00;FS=3.035;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.209;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1616,0,1471 chrIII 25467 . A G 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.832;DP=144;Dels=0.00;FS=3.887;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.491;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1594,0,1601 chrIII 25689 . G A 4586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.98;SB=-2.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4586,445,0 chrIII 25808 . C T 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=28.68;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3528,352,0 chrIII 26192 . G A 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.338;DP=134;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=7.7106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.876;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:134:99:1521,0,1268 chrIII 26583 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.258;DP=138;Dels=0.00;FS=2.155;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.748;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1508,0,1521 chrIII 26807 . T C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.036;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.211;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1256,0,1076 chrIII 27037 . A G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.753;DP=163;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.941;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,68:163:99:1380,0,2226 chrIII 27185 . T C 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.887;DP=129;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.082;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,82:129:99:1791,0,956 chrIII 27682 . G A 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;DP=88;Dels=0.01;FS=166.672;HaplotypeScore=8.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=0.13;ReadPosRankSum=-6.222;SB=-3.012e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:41:41,0,304 chrIII 27840 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.741;DP=121;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.348;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1081,0,1583 chrIII 28362 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=105;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=11.62;ReadPosRankSum=3.176;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1250,0,1046 chrIII 28900 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.560;DP=135;Dels=0.00;FS=6.536;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.370;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1268,0,1642 chrIII 29261 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;DP=84;Dels=0.00;FS=1.828;HaplotypeScore=3.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,48:84:99:1090,0,735 chrIII 29326 . T A 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;DP=97;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=3.8135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=-4.910;QD=7.96;ReadPosRankSum=-4.852;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:802,0,1054 chrIII 29340 . G A 133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.6240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.565;QD=1.60;ReadPosRankSum=-5.068;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,13:83:99:163,0,1307 chrIII 29342 . T C 211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.252;DP=81;Dels=0.00;FS=0.880;HaplotypeScore=13.6293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.69;MQ0=0;MQRankSum=-3.535;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:241,0,1248 chrIII 29373 . T G 472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;DP=70;Dels=0.00;FS=3.273;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=6.74;ReadPosRankSum=3.038;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:502,0,797 chrIII 29388 . G A 618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.603;DP=71;Dels=0.00;FS=6.278;HaplotypeScore=2.8135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.98;MQ0=0;MQRankSum=-2.473;QD=8.70;ReadPosRankSum=2.081;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,38:71:99:648,0,675 chrIII 29478 . A G 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.402;DP=69;Dels=0.00;FS=29.003;HaplotypeScore=55.0755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=0.54;ReadPosRankSum=-2.202;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,8:69:67:67,0,1195 chrIII 29511 . A C 439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=73;Dels=0.00;FS=3.322;HaplotypeScore=7.4464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.543;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,30:73:99:469,0,883 chrIII 29668 . G A 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.298;DP=83;Dels=0.00;FS=0.836;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.47;MQ0=0;MQRankSum=-5.868;QD=10.67;ReadPosRankSum=-2.201;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:83:99:916,0,781 chrIII 29675 . T A 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;DP=89;Dels=0.00;FS=1.718;HaplotypeScore=3.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQ0=0;MQRankSum=-6.626;QD=7.74;ReadPosRankSum=-1.194;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:719,0,992 chrIII 29700 . A G 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.841;DP=91;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQ0=0;MQRankSum=-6.651;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:838,0,938 chrIII 29722 . A G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.028;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-4.261;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,63:105:99:1240,0,900 chrIII 29724 . A T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;DP=103;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,63:103:99:1274,0,845 chrIII 29747 . A G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.001;DP=118;Dels=0.00;FS=3.479;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.486;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.333;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1474,0,992 chrIII 29774 . C T 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.596;DP=111;Dels=0.00;FS=5.228;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,73:111:99:1662,0,773 chrIII 29830 . T A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;DP=112;Dels=0.00;FS=1.535;HaplotypeScore=5.9070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1459,0,1083 chrIII 29840 . C T 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.032;DP=115;Dels=0.00;FS=3.484;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=12.61;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1480,0,1025 chrIII 29922 . A G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=1;MQRankSum=-0.352;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.968;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1222,0,1308 chrIII 30013 . C T 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.239;DP=151;Dels=0.00;FS=0.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.951;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1557,0,1908 chrIII 30246 . C A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.473;DP=128;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.549;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1414,0,1446 chrIII 30435 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.381;DP=120;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1197,0,1435 chrIII 30649 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.600;DP=118;Dels=0.00;FS=2.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1184,0,1446 chrIII 30662 . A G 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.406;DP=123;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:123:99:1103,0,1541 chrIII 30903 . T C 519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.208;DP=139;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=15.9269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=3.73;ReadPosRankSum=3.470;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,42:139:99:549,0,2391 chrIII 30932 . T C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.529;DP=108;Dels=0.00;FS=1.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.247;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:948,0,1361 chrIII 30957 . T C 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.943;DP=102;Dels=0.00;FS=6.294;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.674;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1047,0,1201 chrIII 30991 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.502;DP=142;Dels=0.00;FS=13.635;HaplotypeScore=3.8148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=2.126;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1429,0,1617 chrIII 31027 . T A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.998;DP=112;Dels=0.00;FS=3.510;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.633;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1180,0,1387 chrIII 31129 . A G 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.522;DP=149;Dels=0.00;FS=1.327;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.423;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1563,0,1560 chrIII 31156 . A C 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.185;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=40.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=-3.136;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.159;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1491,0,1490 chrIII 31227 . T A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.270;DP=130;Dels=0.00;FS=1.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=1;MQRankSum=0.704;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.648;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1465,0,1452 chrIII 31319 . A T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;DP=107;Dels=0.00;FS=1.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.428;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1172,0,1151 chrIII 31414 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.857;DP=132;Dels=0.00;FS=5.558;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.648;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1424,0,1436 chrIII 31646 . A G 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.567;DP=131;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=3.3906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.343;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1421,0,1347 chrIII 32243 . G C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;DP=127;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.181;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1212,0,1433 chrIII 32816 . C T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.212;DP=140;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.203;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1258,0,1746 chrIII 33211 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.748;DP=112;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=8.6297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.598;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,69:112:99:1489,0,921 chrIII 33329 . T C 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.020;DP=142;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=4.8576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.556;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1597,0,1436 chrIII 33368 . G A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.120;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=1;MQRankSum=0.785;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.101;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1497,0,1629 chrIII 33566 . T C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.143;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1166,0,1206 chrIII 33569 . A C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.536;DP=119;Dels=0.00;FS=5.712;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.296;QD=9.55;ReadPosRankSum=-2.008;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1166,0,1245 chrIII 33587 . T C 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.974;DP=129;Dels=0.00;FS=4.202;HaplotypeScore=4.7086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.540;QD=7.85;ReadPosRankSum=1.352;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1042,0,1588 chrIII 33692 . A G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.695;DP=107;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.009;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1059,0,1276 chrIII 33845 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.361;DP=156;Dels=0.00;FS=3.997;HaplotypeScore=3.9533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=0.755;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1511,0,1851 chrIII 34008 . T C 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;DP=141;Dels=0.00;FS=12.156;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.197;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1523,0,1410 chrIII 34434 . T C 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=2.433;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.260;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:1824,0,1433 chrIII 34592 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.359;DP=119;Dels=0.00;FS=3.337;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1333,0,1299 chrIII 34635 . C T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.554;DP=114;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.73;ReadPosRankSum=-2.183;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1253,0,1221 chrIII 34667 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.978;DP=140;Dels=0.00;FS=7.544;HaplotypeScore=4.6035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.338;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1477,0,1538 chrIII 34749 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.499;DP=135;Dels=0.00;FS=3.076;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1423,0,1471 chrIII 34755 . G A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.498;DP=140;Dels=0.00;FS=4.013;HaplotypeScore=2.6204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.021;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1524,0,1498 chrIII 34905 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.087;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1335,0,1613 chrIII 35584 . C T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.209;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1252,0,1744 chrIII 35700 . T C 1864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.610;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.317;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,85:159:99:1894,0,1664 chrIII 35964 . C T 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.619;DP=113;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.190;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:1028,0,1479 chrIII 36186 . C G 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.732;DP=109;Dels=0.00;FS=7.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1029,0,1320 chrIII 36388 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.606;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.244;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1231,0,1225 chrIII 36506 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.328;DP=142;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=3.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.959;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1334,0,1676 chrIII 36579 . G C 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.675;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.579;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1604,0,1097 chrIII 36653 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.842;DP=116;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.843;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:116:99:1445,0,1119 chrIII 36701 . A G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.990;DP=142;Dels=0.00;FS=3.035;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.697;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.125;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1553,0,1517 chrIII 36813 . A G 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.395;DP=139;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.321;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1459,0,1540 chrIII 36914 . T C 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;DP=133;Dels=0.00;FS=21.407;HaplotypeScore=6.4483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.524;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1471,0,1441 chrIII 37159 . T C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.064;DP=132;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=1;MQRankSum=-0.189;QD=8.05;ReadPosRankSum=-2.153;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1092,0,1795 chrIII 37250 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;DP=105;Dels=0.00;FS=1.568;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.087;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1167,0,1051 chrIII 37484 . C T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.684;DP=108;Dels=0.00;FS=7.426;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1247,0,1066 chrIII 37525 . A G 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.348;DP=114;Dels=0.00;FS=2.458;HaplotypeScore=2.7792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1281,0,1251 chrIII 37664 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.542;DP=107;Dels=0.00;FS=2.630;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.175;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1187,0,1208 chrIII 37731 . C T 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.128;DP=145;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=5.4636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=10.25;ReadPosRankSum=-2.443;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1516,0,1706 chrIII 38022 . G A 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.978;DP=126;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.535;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1515,0,1230 chrIII 38157 . G A 1904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.298;DP=148;Dels=0.00;FS=3.893;HaplotypeScore=3.3597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.524;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,84:148:99:1934,0,1279 chrIII 38664 . A G 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.106;DP=149;Dels=0.00;FS=2.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.706;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1731,0,1589 chrIII 38814 . T G 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.273;DP=117;Dels=0.00;FS=13.961;HaplotypeScore=6.9246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.061;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:969,0,1589 chrIII 39123 . A T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;DP=147;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=0.582;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.123;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1543,0,1746 chrIII 39240 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.531;DP=147;Dels=0.00;FS=2.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.401;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1506,0,1675 chrIII 39265 . T C 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.989;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.831;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1446,0,1773 chrIII 39326 . T G 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.966;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.171;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1615,0,1445 chrIII 39512 . A G 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.453;DP=117;Dels=0.00;FS=3.503;HaplotypeScore=2.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.311;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:777,0,1592 chrIII 39524 . G C 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;DP=111;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.72;MQ0=0;MQRankSum=-5.893;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,43:111:99:773,0,1496 chrIII 39525 . A C 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.347;DP=111;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.72;MQ0=0;MQRankSum=-5.451;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,43:111:99:758,0,1563 chrIII 39539 . T A 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.824;DP=113;Dels=0.00;FS=2.520;HaplotypeScore=4.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQ0=0;MQRankSum=-4.772;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.175;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,44:113:99:696,0,1609 chrIII 39540 . C A 678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.349;DP=118;Dels=0.00;FS=5.792;HaplotypeScore=4.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.18;MQ0=0;MQRankSum=-4.348;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.589;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:708,0,1598 chrIII 39552 . T C 575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.333;DP=102;Dels=0.00;FS=12.149;HaplotypeScore=3.9359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQ0=0;MQRankSum=-4.935;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.289;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:102:99:605,0,1448 chrIII 39570 . A G 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.608;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQ0=0;MQRankSum=-3.148;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:719,0,1364 chrIII 40089 . G A 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.044;DP=151;Dels=0.00;FS=2.919;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1690,0,1605 chrIII 41566 . A G 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.494;DP=133;Dels=0.00;FS=5.352;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.004;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1463,0,1346 chrIII 41675 . C T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.119;DP=110;Dels=0.00;FS=2.802;HaplotypeScore=2.7267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,68:110:99:1493,0,813 chrIII 43107 . T G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.118;DP=126;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1428,0,1363 chrIII 43835 . T G 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2599,267,0 chrIII 43874 . G A 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3234,325,0 chrIII 43877 . G A 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3307,328,0 chrIII 44267 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.632;DP=126;Dels=0.00;FS=6.845;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=9.29;ReadPosRankSum=3.045;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1200,0,1566 chrIII 45109 . A G 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.476;DP=109;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.589;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1010,0,1277 chrIII 45785 . G T 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;DP=82;Dels=0.00;FS=6.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:812,0,1077 chrIII 46250 . A G 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.259;DP=150;Dels=0.00;FS=2.894;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=1;MQRankSum=0.036;QD=9.97;ReadPosRankSum=2.160;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1526,0,1764 chrIII 46258 . C T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;DP=140;Dels=0.00;FS=8.975;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=1;MQRankSum=-0.613;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.949;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1564,0,1591 chrIII 46282 . G A 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.675;DP=147;Dels=0.00;FS=3.975;HaplotypeScore=2.7145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=1.202;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1682,0,1516 chrIII 46493 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.049;DP=122;Dels=0.00;FS=6.812;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1273,0,1317 chrIII 46562 . T A 5017.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.87;SB=-2.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:5017,475,0 chrIII 47690 . A T 1950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;DP=157;Dels=0.00;FS=5.934;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=2.471;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.046;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:157:99:1980,0,1508 chrIII 48299 . G A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.540;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.257;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1389,0,1322 chrIII 48963 . G A 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.670;DP=144;Dels=0.00;FS=4.108;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1841,0,1436 chrIII 49187 . C T 4376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1706;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.36;SB=-2.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4376,424,0 chrIII 49193 . C T 1907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.306;DP=161;Dels=0.00;FS=3.682;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,88:161:99:1937,0,1518 chrIII 49400 . C T 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=28.20;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3271,331,0 chrIII 49436 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3266,342,0 chrIII 49571 . G A 4445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.69;SB=-2.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4445,454,0 chrIII 49655 . G A 4362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4362,430,0 chrIII 50099 . G A 4175.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.77;SB=-2.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4175,397,0 chrIII 50129 . G A 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.490;DP=143;Dels=0.00;FS=3.960;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.404;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1790,0,1305 chrIII 50269 . A G 3938.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3938,382,0 chrIII 50543 . T A 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;DP=130;Dels=0.02;FS=3.614;HaplotypeScore=84.7353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.112;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.072;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,50:127:99:838,0,1533 chrIII 50560 . C T 493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;DP=137;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=94.6344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:137:99:523,0,1641 chrIII 50599 . A T 291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;DP=128;Dels=0.00;FS=14.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=2.27;ReadPosRankSum=-1.530;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:321,0,1414 chrIII 50613 . G A 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.082;DP=133;Dels=0.00;FS=3.855;HaplotypeScore=1.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.578;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:827,0,1343 chrIII 50675 . T C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;DP=126;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.633;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.020;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1084,0,1376 chrIII 50770 . C T 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.914;DP=158;Dels=0.00;FS=1.987;HaplotypeScore=11.2114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=11.61;ReadPosRankSum=2.633;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1865,0,1428 chrIII 50897 . G T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.648;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1251,0,1530 chrIII 51119 . T C 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.409;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1590,0,1441 chrIII 51491 . C T 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.427;DP=141;Dels=0.00;FS=2.215;HaplotypeScore=2.2424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=12.01;ReadPosRankSum=2.101;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1724,0,1303 chrIII 51650 . G A 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.486;DP=178;Dels=0.00;FS=3.467;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.739;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,85:178:99:1843,0,2025 chrIII 51674 . G T 2039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.397;DP=186;Dels=0.00;FS=1.795;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.347;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,94:186:99:2069,0,1927 chrIII 52238 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.000;DP=144;Dels=0.00;FS=3.946;HaplotypeScore=3.9720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1269,0,1702 chrIII 52334 . A G 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.071;DP=181;Dels=0.00;FS=7.677;HaplotypeScore=7.9584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=9.21;ReadPosRankSum=2.544;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,89:181:99:1697,0,1966 chrIII 52365 . G C 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.361;DP=182;Dels=0.00;FS=5.192;HaplotypeScore=4.9968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.134;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,91:182:99:1715,0,1828 chrIII 52383 . T C 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.835;DP=181;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.762;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,90:180:99:1721,0,1841 chrIII 52596 . T C 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.266;DP=121;Dels=0.00;FS=4.706;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=6.96;ReadPosRankSum=2.239;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,44:121:99:872,0,1815 chrIII 52699 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.390;DP=147;Dels=0.00;FS=7.324;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=1;MQRankSum=1.575;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1484,0,1593 chrIII 52716 . T C 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.563;DP=155;Dels=0.00;FS=5.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=1;MQRankSum=0.392;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.137;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1570,0,1733 chrIII 52747 . T C 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.757;DP=160;Dels=0.00;FS=4.776;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=1;MQRankSum=-0.140;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.278;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1791,0,1666 chrIII 52762 . C T 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.060;DP=160;Dels=0.00;FS=19.636;HaplotypeScore=8.7373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=1;MQRankSum=1.076;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.672;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:160:99:1605,0,1902 chrIII 52792 . A G 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;DP=139;Dels=0.00;FS=4.012;HaplotypeScore=2.8894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1368,0,1756 chrIII 52803 . G A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=9.86;ReadPosRankSum=-2.663;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:1597,0,1854 chrIII 52919 . C T 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.363;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=11.51;ReadPosRankSum=-1.450;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1803,0,1502 chrIII 53295 . T C 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.922;DP=137;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=2.991;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1188,0,1722 chrIII 53316 . A G 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.569;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=9.84;ReadPosRankSum=-2.230;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1487,0,1711 chrIII 53820 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.542;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1539,0,1437 chrIII 53891 . T C 4469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.39;SB=-2.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4469,454,0 chrIII 54072 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.495;DP=141;Dels=0.00;FS=3.029;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.799;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1236,0,1814 chrIII 54357 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.262;DP=128;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=3.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1257,0,1641 chrIII 54426 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.255;DP=135;Dels=0.00;FS=4.112;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.789;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1546,0,1470 chrIII 54441 . C T 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3651,370,0 chrIII 54482 . C A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.036;DP=140;Dels=0.00;FS=2.192;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1474,0,1581 chrIII 54535 . T C 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3566,355,0 chrIII 54588 . T C 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3327,331,0 chrIII 54609 . A C 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3000,306,0 chrIII 54721 . C T 4025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4025,394,0 chrIII 55716 . A G 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4630;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3445,360,0 chrIII 56210 . T C 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3213,327,0 chrIII 56873 . G A 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.809;DP=102;Dels=0.00;FS=7.840;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:995,0,1113 chrIII 56968 . G A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.065;DP=130;Dels=0.00;FS=15.309;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1244,0,1596 chrIII 56979 . G A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.201;DP=117;Dels=0.00;FS=6.363;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.953;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:1118,0,1568 chrIII 57071 . C A 33.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.321;DP=128;Dels=0.02;FS=7.208;HaplotypeScore=26.8801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=0.26;ReadPosRankSum=-4.053;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:63:63,0,445 chrIII 57239 . C A 51.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;DP=74;Dels=0.01;FS=88.643;HaplotypeScore=20.0810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=0.69;ReadPosRankSum=-5.347;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:79:81,0,79 chrIII 57303 . A G 1933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.12;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1966,201,0 chrIII 57639 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.691;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.694;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:977,0,1117 chrIII 59775 . G A 4502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.12;SB=-2.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4502,442,0 chrIII 59925 . G A 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3956,385,0 chrIII 60024 . C T 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.563;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=27.74;ReadPosRankSum=1.366;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3412,312,0 chrIII 60058 . T C 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3415,346,0 chrIII 60260 . A G 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.071;DP=156;Dels=0.00;FS=10.922;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.875;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1647,0,1768 chrIII 60354 . C G 4142.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4142,400,0 chrIII 60463 . G A 4178.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4178,406,0 chrIII 61224 . T A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.817;DP=130;Dels=0.00;FS=5.369;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.733;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1150,0,1595 chrIII 61231 . A G 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.228;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.967;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1414,0,1390 chrIII 61242 . T C 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.514;DP=108;Dels=0.00;FS=6.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.722;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1297,0,1108 chrIII 61327 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.533;DP=121;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.104;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1396,0,1229 chrIII 61358 . G T 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3518,351,0 chrIII 61630 . A G 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3273,328,0 chrIII 62729 . A G 4252.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9133;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4252,430,0 chrIII 63611 . T C 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3675,376,0 chrIII 63878 . C G 4326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.60;SB=-2.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4326,427,0 chrIII 64304 . C T 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3458,343,0 chrIII 67416 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.617;DP=162;Dels=0.00;FS=2.013;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.880;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.630;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,71:162:99:1430,0,2119 chrIII 67820 . T C 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.285;DP=175;Dels=0.00;FS=8.419;HaplotypeScore=2.5973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.411;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,79:175:99:1634,0,2151 chrIII 68070 . T G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.689;DP=150;Dels=0.00;FS=7.240;HaplotypeScore=2.7711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.395;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1675,0,1589 chrIII 70158 . G T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.286;DP=146;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.060;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1702,0,1400 chrIII 70425 . A T 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.827;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,74:177:99:1511,0,2314 chrIII 71079 . T C 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.78;SB=-2.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:3792,373,0 chrIII 72786 . T C 4246.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4246,415,0 chrIII 72790 . A G 1801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.516;DP=175;Dels=0.00;FS=1.174;HaplotypeScore=3.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.464;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,87:175:99:1831,0,1860 chrIII 73403 . C T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.840;DP=151;Dels=0.00;FS=4.929;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1540,0,1781 chrIII 73471 . G A 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.004;DP=158;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.362;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1625,0,1769 chrIII 74074 . T C 4313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4313,445,0 chrIII 74146 . C G 4128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4128,406,0 chrIII 74327 . C A 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3744,367,0 chrIII 74346 . A G 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4114,421,0 chrIII 74505 . C T 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3029,301,0 chrIII 74562 . G T 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3402,334,0 chrIII 74673 . A G 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3194,342,0 chrIII 74692 . C T 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3734,367,0 chrIII 74872 . T A 1872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.664;DP=171;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=3.2327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.986;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.126;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,87:171:99:1902,0,1902 chrIII 75025 . T C 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3650,379,0 chrIII 75053 . T C 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3718,376,0 chrIII 75088 . T A 4377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.88;SB=-2.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4377,421,0 chrIII 75130 . C T 4093.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.970e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4093,406,0 chrIII 75202 . G A 4474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=28.32;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4474,445,0 chrIII 75288 . C T 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3655,349,0 chrIII 75503 . C T 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=27.03;ReadPosRankSum=1.411;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:152:99:4109,406,0 chrIII 76131 . C T 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7714;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3691,355,0 chrIII 76147 . T G 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3425,351,0 chrIII 76973 . G A 4467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4467,430,0 chrIII 77505 . A G 5287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5624;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.17;SB=-2.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:5287,514,0 chrIII 78354 . C T 4052.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.56;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4052,391,0 chrIII 79096 . G T 4784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.92;SB=-2.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:4784,472,0 chrIII 79507 . A G 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.821;DP=147;Dels=0.00;FS=6.037;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.796;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1570,0,1686 chrIII 80327 . G A 2007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.419;DP=173;Dels=0.00;FS=6.666;HaplotypeScore=5.4564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.280;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,98:173:99:2037,0,1578 chrIII 80444 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.266;DP=136;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1232,0,1704 chrIII 82353 . T G 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.274;DP=98;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.716;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:903,0,1304 chrIII 82365 . G A 2480 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.13;MQ0=0;QD=27.56;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2513,255,0 chrIII 82590 . C T 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=17.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.97;MQ0=0;QD=27.97;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2690,264,0 chrIII 82701 . G A 155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.450;DP=58;Dels=0.00;FS=26.105;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.79;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=2.67;ReadPosRankSum=-4.755;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:185,0,948 chrIII 82710 . G A 1118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=24.84;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1151,114,0 chrIII 82716 . A C 1004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=22.82;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:44:99:1037,108,0 chrIII 82723 . A G 923 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=22.51;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:956,102,0 chrIII 82728 . C T 884 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.56;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:917,99,0 chrIII 82729 . T C 862 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.55;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:96:895,96,0 chrIII 82735 . G A 880 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.16;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:93:913,93,0 chrIII 82738 . T G 730 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.47;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:81:763,81,0 chrIII 82742 . C T 739 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.74;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:81:772,81,0 chrIII 82747 . C T 541 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.44;MQ0=1;QD=20.81;SB=-6.523e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:63:574,63,0 chrIII 82748 . T C 507 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.44;MQ0=1;QD=19.50;SB=-6.527e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:60:540,60,0 chrIII 82750 . G A 588 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.44;MQ0=1;QD=22.62;SB=-6.523e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:63:621,63,0 chrIII 82805 . T G 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=2;QD=5.45;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:53,6,0 chrIII 82807 . A T 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=2;QD=5.45;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:53,6,0 chrIII 82808 . A G 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=2;QD=5.45;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:53,6,0 chrIII 82813 . T A 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=2;QD=3.63;SB=-3.180e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:6:53,6,0 chrIII 83031 . T A 207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;DP=27;Dels=0.00;FS=33.740;HaplotypeScore=25.8471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.11;MQ0=0;MQRankSum=-4.392;QD=7.67;ReadPosRankSum=4.198;SB=-1.500e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:237,0,125 chrIII 83118 . T G 2416 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.31;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2449,246,0 chrIII 83195 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;DP=134;Dels=0.00;FS=9.293;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=2.244;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.623;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1374,0,1541 chrIII 83421 . C T 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3212,310,0 chrIII 83576 . A G 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.32;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3442,354,0 chrIII 83594 . A G 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.36;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2993,309,0 chrIII 83597 . G T 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2984,297,0 chrIII 83607 . T A 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.23;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2956,294,0 chrIII 83631 . C T 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.27;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3149,318,0 chrIII 84048 . C T 2527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.42;MQ0=0;QD=24.53;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2560,267,0 chrIII 84070 . G A 1356 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.671;DP=87;Dels=0.00;FS=31.077;HaplotypeScore=38.2806;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.48;MQ0=3;MQRankSum=1.519;QD=15.59;ReadPosRankSum=-6.208;SB=-9.996e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,63:87:85:1389,85,0 chrIII 84097 . C T 330.02 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.167;DP=84;Dels=0.00;FS=30.916;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.13;MQ0=60;MQRankSum=2.233;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-2.103e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:23:360,0,23 chrIII 84099 . A G 325.02 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.700;DP=84;Dels=0.00;FS=30.916;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.13;MQ0=60;MQRankSum=2.233;QD=3.87;ReadPosRankSum=-1.233;SB=-2.103e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:23:355,0,23 chrIII 84103 . A G 311.02 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;DP=87;Dels=0.00;FS=23.468;HaplotypeScore=5.9737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.56;MQ0=61;MQRankSum=1.806;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-1.683e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:22:341,0,22 chrIII 84109 . T C 323.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;DP=88;Dels=0.00;FS=23.468;HaplotypeScore=7.9653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.48;MQ0=62;MQRankSum=2.194;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-1.625e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,18:88:25:353,0,25 chrIII 84111 . C T 336.02 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;DP=88;Dels=0.00;FS=30.916;HaplotypeScore=7.9653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.48;MQ0=62;MQRankSum=2.233;QD=3.82;ReadPosRankSum=-2.233;SB=-2.103e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:88:23:366,0,23 chrIII 84112 . G C 324.02 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.639;DP=88;Dels=0.00;FS=23.468;HaplotypeScore=7.9653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.48;MQ0=62;MQRankSum=0.972;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-1.590e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,18:88:22:354,0,22 chrIII 84114 . T C 324.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;DP=88;Dels=0.00;FS=23.468;HaplotypeScore=7.9653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.48;MQ0=62;MQRankSum=2.194;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-1.682e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,18:88:25:354,0,25 chrIII 84116 . C G 313.02 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;DP=88;Dels=0.00;FS=23.468;HaplotypeScore=5.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.48;MQ0=62;MQRankSum=2.139;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-1.656e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,18:88:23:343,0,23 chrIII 84117 . T C 318.02 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;DP=88;Dels=0.00;FS=23.468;HaplotypeScore=3.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.48;MQ0=62;MQRankSum=1.306;QD=3.61;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-1.556e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,18:88:24:348,0,24 chrIII 84133 . A G 304.02 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.488;DP=86;Dels=0.00;FS=26.462;HaplotypeScore=7.7904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.28;MQ0=62;MQRankSum=1.848;QD=3.54;ReadPosRankSum=-3.128;SB=-2.003e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:23:334,0,23 chrIII 84140 . T A 252.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;DP=87;Dels=0.02;FS=31.652;HaplotypeScore=35.6534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.19;MQ0=63;MQRankSum=1.802;QD=2.90;ReadPosRankSum=-3.055;SB=-3.018e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:34:282,0,34 chrIII 84146 . A G 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.30;MQ0=63;MQRankSum=1.271;QD=0.16;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,2:73:41:41,0,61 chrIII 84387 . A G 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.724;DP=134;Dels=0.00;FS=74.657;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.01;MQ0=79;MQRankSum=4.899;QD=0.25;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,10:134:63:63,0,80 chrIII 84391 . A G 34.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.521;DP=139;Dels=0.00;FS=76.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.89;MQ0=82;MQRankSum=4.920;QD=0.24;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,10:139:64:64,0,80 chrIII 84392 . T C 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;DP=139;Dels=0.00;FS=76.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.89;MQ0=82;MQRankSum=4.920;QD=0.26;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,10:139:66:66,0,80 chrIII 84407 . G A 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;DP=141;Dels=0.00;FS=88.859;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.44;MQ0=81;MQRankSum=5.313;QD=0.27;ReadPosRankSum=-2.338;SB=-6.508e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,12:141:68:68,0,80 chrIII 84416 . G A 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.623;DP=138;Dels=0.00;FS=94.407;HaplotypeScore=4.1607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.84;MQ0=77;MQRankSum=5.486;QD=0.49;ReadPosRankSum=-2.474;SB=-6.498e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,13:138:77:97,0,77 chrIII 84420 . C T 64.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.239;DP=138;Dels=0.00;FS=94.407;HaplotypeScore=7.4893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.84;MQ0=77;MQRankSum=5.486;QD=0.46;ReadPosRankSum=-2.492;SB=-6.498e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,13:138:77:94,0,77 chrIII 84430 . G A 64.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.376;DP=125;Dels=0.00;FS=72.896;HaplotypeScore=10.8179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.34;MQ0=71;MQRankSum=4.876;QD=0.51;ReadPosRankSum=-2.216;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,10:125:77:94,0,77 chrIII 84431 . A G 60.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.785;DP=123;Dels=0.00;FS=72.896;HaplotypeScore=9.9857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.39;MQ0=70;MQRankSum=4.876;QD=0.49;ReadPosRankSum=-2.103;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,10:123:77:90,0,77 chrIII 84434 . A G 67.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.527;DP=121;Dels=0.00;FS=76.501;HaplotypeScore=18.3072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.35;MQ0=69;MQRankSum=4.852;QD=0.55;ReadPosRankSum=-2.432;SB=-6.250e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,10:121:57:97,0,57 chrIII 84435 . T A 66.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.815;DP=118;Dels=0.00;FS=76.501;HaplotypeScore=23.3000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.48;MQ0=66;MQRankSum=4.852;QD=0.56;ReadPosRankSum=-2.479;SB=-6.250e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,10:118:57:96,0,57 chrIII 84442 . G A 67.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.500;DP=113;Dels=0.00;FS=63.593;HaplotypeScore=34.1179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.91;MQ0=65;MQRankSum=4.412;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.923;SB=-6.455e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,9:113:57:97,0,57 chrIII 84617 . G A 56.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.89;MQ0=0;QD=18.99;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 chrIII 84622 . T C 55.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.89;MQ0=0;QD=18.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:88,9,0 chrIII 84735 . C T 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=13.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 chrIII 87679 . G A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.28;MQ0=142;MQRankSum=0.326;QD=0.07;ReadPosRankSum=-2.024;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,10:157:40:40,0,92 chrIII 87868 . G A 74.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.91;MQ0=99;MQRankSum=-1.443;QD=0.62;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,8:119:99:104,0,252 chrIII 87891 . C A 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.993;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.73;MQ0=95;MQRankSum=-0.846;QD=0.30;ReadPosRankSum=0.195;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,7:121:66:66,0,402 chrIII 87968 . A T 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.50;MQ0=63;MQRankSum=1.031;QD=0.45;ReadPosRankSum=1.569;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,9:110:80:80,0,419 chrIII 87970 . A G 382.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;DP=120;Dels=0.00;FS=4.277;HaplotypeScore=28.9359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.92;MQ0=62;MQRankSum=-2.478;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.892;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,71:120:99:412,0,260 chrIII 88006 . A G 261.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.712;DP=230;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.38;MQ0=74;MQRankSum=-6.327;QD=1.13;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,60:230:99:291,0,2253 chrIII 88124 . G A 223 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.464;DP=64;Dels=0.00;FS=90.268;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.71;MQ0=23;MQRankSum=0.065;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,33:64:30:256,30,0 chrIII 90716 . T C 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.53;MQ0=12;MQRankSum=1.026;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,2:16:6:55,6,0 chrIII 90724 . T A 29.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.12;MQ0=9;MQRankSum=1.026;QD=2.29;ReadPosRankSum=1.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,5:13:6:61,6,0 chrIII 91026 . C T 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.618;DP=91;Dels=0.00;FS=0.923;HaplotypeScore=2.7510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.907;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:91:99:892,0,1142 chrIII 91321 . C G 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3296,342,0 chrIII 91728 . C T 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=23.77;SB=-2.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3946,373,0 chrIII 91977 . G A 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3311,322,0 chrIII 92106 . T C 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3046,306,0 chrIII 92187 . C T 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3058,298,0 chrIII 92193 . T C 2575 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2608,270,0 chrIII 92292 . G A 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.44;SB=-2.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3952,376,0 chrIII 92556 . G C 2607 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2640,273,0 chrIII 92671 . C T 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=28.32;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3370,334,0 chrIII 92716 . C T 2438 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.32;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2471,240,0 chrIII 93230 . T C 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9506;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=23.13;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3202,313,0 chrIII 93275 . C T 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3987,388,0 chrIII 93455 . A G 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3270,342,0 chrIII 93512 . A G 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4397;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3872,385,0 chrIII 93620 . T C 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=1;QD=25.95;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3685,367,0 chrIII 93824 . A G 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55;SB=-2.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3982,397,0 chrIII 94248 . C T 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3592,346,0 chrIII 94340 . A G 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.879;DP=135;Dels=0.00;FS=2.531;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1498,0,1423 chrIII 94374 . T C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.249;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.245;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1488,0,1330 chrIII 94376 . T C 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;DP=113;Dels=0.00;FS=3.541;HaplotypeScore=3.3564;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.701;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:3009,290,0 chrIII 94470 . T G 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3594,361,0 chrIII 94554 . G A 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3822,367,0 chrIII 94573 . G A 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4168,394,0 chrIII 94591 . C G 4130.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4130,403,0 chrIII 95029 . A G 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3708,376,0 chrIII 95071 . A G 4223.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=26.23;ReadPosRankSum=-1.668;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,160:161:99:4223,412,0 chrIII 95149 . A G 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3579,358,0 chrIII 95527 . T C 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.04;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3822,388,0 chrIII 95697 . C T 4438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4438,421,0 chrIII 95776 . T C 4943.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.676;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.941;SB=-2.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,184:185:99:4943,479,0 chrIII 95815 . C T 4550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=0;QD=25.28;SB=-2.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:180:99:4550,424,0 chrIII 95935 . A C 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3834,388,0 chrIII 95946 . C G 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.976e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3916,397,0 chrIII 95967 . G T 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3912,382,0 chrIII 96019 . A G 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3396,343,0 chrIII 96055 . A G 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3117,315,0 chrIII 96248 . T A 1887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;DP=145;Dels=0.00;FS=3.949;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.895;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1917,0,1388 chrIII 96799 . G A 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3198,307,0 chrIII 96805 . A T 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3236,310,0 chrIII 96988 . A G 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3047,324,0 chrIII 97369 . A G 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2598,261,0 chrIII 97696 . A G 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3374,334,0 chrIII 98308 . T C 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3481,360,0 chrIII 98535 . C G 4066.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4066,409,0 chrIII 98578 . C T 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2994,297,0 chrIII 98617 . T C 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3583,363,0 chrIII 99163 . T C 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3134,324,0 chrIII 99195 . C A 4461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9639;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4461,442,0 chrIII 99209 . A G 4487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4487,454,0 chrIII 99392 . C T 4252.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=149;Dels=0.00;FS=4.742;HaplotypeScore=3.0776;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=28.54;ReadPosRankSum=0.267;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:4252,412,0 chrIII 99481 . T C 3892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3892,402,0 chrIII 99547 . C T 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.28;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3956,385,0 chrIII 99700 . T C 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3374,354,0 chrIII 100212 . A G 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3422,349,0 chrIII 100244 . T C 3833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3833,391,0 chrIII 100272 . A G 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3707,373,0 chrIII 100295 . A G 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3453,352,0 chrIII 100583 . G A 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.33;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3159,354,0 chrIII 100585 . A G 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3138,354,0 chrIII 100644 . A G 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3848,394,0 chrIII 100653 . T C 3941.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3941,403,0 chrIII 100869 . A G 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3259,328,0 chrIII 100927 . C T 4002.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=27.60;SB=-2.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4002,379,0 chrIII 101152 . C T 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2922,292,0 chrIII 101155 . C T 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3011,301,0 chrIII 101368 . G A 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3354,325,0 chrIII 101527 . C A 2580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2613,255,0 chrIII 101597 . A G 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2993,300,0 chrIII 101813 . T G 3949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;QD=27.23;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3949,402,0 chrIII 101894 . T C 284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;DP=91;Dels=0.00;FS=48.998;HaplotypeScore=8.9560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=3.12;ReadPosRankSum=2.625;SB=-4.602e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,70:91:99:314,0,129 chrIII 102669 . C T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3405,340,0 chrIII 105047 . G A 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.288;DP=142;Dels=0.00;FS=22.233;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.559;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1646,0,1518 chrIII 105155 . C T 4467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.91;SB=-2.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4467,430,0 chrIII 105854 . G T 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.917;DP=166;Dels=0.00;FS=3.588;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,82:166:99:1830,0,1851 chrIII 106308 . T C 1919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.798;DP=153;Dels=0.00;FS=10.729;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.268;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,94:153:99:1949,0,1279 chrIII 106362 . G C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.844;DP=153;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1488,0,1648 chrIII 106731 . A T 1977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;DP=181;Dels=0.00;FS=2.114;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,94:181:99:2007,0,1988 chrIII 106776 . G T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.449;DP=142;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:142:99:1418,0,1674 chrIII 106818 . C T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.019;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.108;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1095,0,1405 chrIII 106895 . C G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;DP=125;Dels=0.00;FS=4.450;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.141;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1485,0,1244 chrIII 106955 . A G 1826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.468;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,82:148:99:1856,0,1384 chrIII 107060 . C T 1990.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.481;DP=182;Dels=0.00;FS=1.900;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,96:182:99:2020,0,1810 chrIII 107061 . T C 1935.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.757;DP=183;Dels=0.00;FS=2.645;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.151;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,97:183:99:1965,0,1881 chrIII 107067 . T C 2127.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.986;DP=201;Dels=0.00;FS=1.145;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,105:201:99:2157,0,2122 chrIII 108225 . G A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.473;DP=157;Dels=0.00;FS=6.935;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.294;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1563,0,1755 chrIII 108227 . T A 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.122;DP=158;Dels=0.00;FS=5.791;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.239;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:158:99:1577,0,1833 chrIII 108293 . A G 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.011;DP=160;Dels=0.00;FS=1.269;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.463;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:160:99:1690,0,1734 chrIII 108503 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.460;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.464;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.567;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1264,0,1610 chrIII 108790 . G A 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;DP=107;Dels=0.00;FS=6.166;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.242;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:987,0,1375 chrIII 108793 . A G 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;DP=108;Dels=0.00;FS=7.479;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.426;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:979,0,1435 chrIII 109046 . A G 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3720,384,0 chrIII 109290 . A C 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.723;DP=100;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.862;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1052,0,1100 chrIII 109596 . T G 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.061;DP=121;Dels=0.00;FS=3.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.182;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1010,0,1574 chrIII 109704 . G C 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;DP=106;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1019,0,1214 chrIII 109923 . A G 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.549;DP=115;Dels=0.00;FS=12.141;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1329,0,1178 chrIII 110538 . A T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.680;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,64:148:99:1298,0,1878 chrIII 110997 . A G 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.249;DP=126;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=4.2457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=13.17;ReadPosRankSum=-1.024;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:1690,0,1053 chrIII 111026 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.013;DP=130;Dels=0.00;FS=8.067;HaplotypeScore=7.8685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=-1.527;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.271;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1588,0,1252 chrIII 111330 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;DP=126;Dels=0.00;FS=5.455;HaplotypeScore=2.5577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1369,0,1456 chrIII 111404 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.711;DP=132;Dels=0.00;FS=5.324;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.967;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1360,0,1431 chrIII 111594 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;DP=116;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=4.3947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=2.413;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.127;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1214,0,1273 chrIII 111618 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.115;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.587;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1264,0,1170 chrIII 111695 . T G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;DP=99;Dels=0.00;FS=6.786;HaplotypeScore=3.4338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.508;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1059,0,1097 chrIII 111960 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.377;DP=140;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=3.7818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.889;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1456,0,1626 chrIII 112101 . C A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.081;DP=130;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=1;MQRankSum=0.300;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.895;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1541,0,1288 chrIII 112707 . A C 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.579;DP=82;Dels=0.00;FS=7.643;HaplotypeScore=3.9583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=2.441;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,37:82:99:797,0,1055 chrIII 112760 . A G 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.705;DP=104;Dels=0.00;FS=9.077;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.769;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:952,0,1345 chrIII 112762 . C A 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.658;DP=104;Dels=0.00;FS=9.014;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.371;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:946,0,1329 chrIII 112940 . A C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.639;DP=105;Dels=0.00;FS=5.466;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1206,0,1104 chrIII 112965 . C A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.746;DP=126;Dels=0.00;FS=8.650;HaplotypeScore=3.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.833;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1474,0,1211 chrIII 113059 . C A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.129;DP=96;Dels=0.00;FS=5.121;HaplotypeScore=7.9518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=1;MQRankSum=0.879;QD=12.40;ReadPosRankSum=-2.120;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1220,0,840 chrIII 113166 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.776;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1192,0,949 chrIII 113279 . T A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;DP=112;Dels=0.00;FS=2.647;HaplotypeScore=3.3564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.192;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1160,0,1323 chrIII 113543 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.215;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1081,0,1128 chrIII 113605 . A G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;DP=99;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.467;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1170,0,918 chrIII 113636 . A C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.279;DP=126;Dels=0.00;FS=6.776;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.181;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1135,0,1495 chrIII 113781 . C T 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.509;DP=112;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.017;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1056,0,1398 chrIII 113902 . G A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.168;DP=99;Dels=0.01;FS=3.867;HaplotypeScore=5.8259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.434;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1194,0,1017 chrIII 113907 . G A 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;DP=98;Dels=0.01;FS=5.235;HaplotypeScore=7.8163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.025;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1042,0,1017 chrIII 113921 . A T 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.826;DP=84;Dels=0.00;FS=7.223;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.993;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:986,0,961 chrIII 113952 . C G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;DP=109;Dels=0.00;FS=21.351;HaplotypeScore=2.4558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.064;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1151,0,1215 chrIII 114025 . G C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=112;Dels=0.00;FS=7.189;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.874;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1141,0,1326 chrIII 114062 . A T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;DP=113;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1149,0,1380 chrIII 114169 . G A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.238;DP=94;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.933;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.435;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:1020,0,1014 chrIII 114184 . C T 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.047;DP=93;Dels=0.00;FS=5.235;HaplotypeScore=43.3930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:885,0,1042 chrIII 114243 . T C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;DP=137;Dels=0.00;FS=10.918;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.205;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1372,0,1538 chrIII 114262 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.435;DP=126;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1368,0,1318 chrIII 114298 . A T 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.666;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.845;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:1015,0,1115 chrIII 114307 . A G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;DP=80;Dels=0.00;FS=7.754;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.217;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:943,0,842 chrIII 114354 . A G 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.824;DP=72;Dels=0.00;FS=12.260;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=9.32;ReadPosRankSum=-2.540;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,36:72:99:701,0,835 chrIII 114365 . T A 537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.539;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.943;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.320;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:567,0,853 chrIII 114366 . G A 564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.146;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.356;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:594,0,876 chrIII 114395 . G A 468.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;DP=56;Dels=0.00;FS=13.235;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.76;MQ0=0;MQRankSum=-5.742;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.093;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:498,0,678 chrIII 114397 . T A 490.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;DP=55;Dels=0.00;FS=13.145;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQ0=0;MQRankSum=-5.319;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.290;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:520,0,668 chrIII 114400 . T C 473.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.350;DP=54;Dels=0.00;FS=17.505;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.10;MQ0=0;MQRankSum=-5.046;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.082;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:503,0,689 chrIII 114401 . T A 477.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;DP=54;Dels=0.00;FS=17.505;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.10;MQ0=0;MQRankSum=-5.237;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.117;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:507,0,679 chrIII 114452 . T C 764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;DP=66;Dels=0.00;FS=14.186;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.499;QD=11.58;ReadPosRankSum=2.726;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:794,0,531 chrIII 114454 . A G 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.548;DP=66;Dels=0.00;FS=11.690;HaplotypeScore=5.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.933;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:845,0,519 chrIII 114465 . T G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.852;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.8623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.011;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.469;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,41:63:99:888,0,319 chrIII 114485 . A T 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.746;DP=69;Dels=0.00;FS=1.055;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.182;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,37:69:99:876,0,633 chrIII 114620 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.705;DP=98;Dels=0.00;FS=11.469;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.973;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.178;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1125,0,983 chrIII 114644 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.106;DP=85;Dels=0.00;FS=20.876;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.760;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.079;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:968,0,911 chrIII 114679 . G C 582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;DP=69;Dels=0.00;FS=25.126;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQ0=0;MQRankSum=-4.530;QD=8.43;ReadPosRankSum=-2.081;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,31:69:99:612,0,869 chrIII 114694 . C A 634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.387;DP=81;Dels=0.00;FS=11.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQ0=0;MQRankSum=-5.964;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,33:81:99:664,0,1134 chrIII 114698 . A C 663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;DP=84;Dels=0.00;FS=13.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.94;MQ0=0;MQRankSum=-5.870;QD=7.89;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,35:84:99:693,0,1162 chrIII 114714 . C T 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.837;DP=100;Dels=0.00;FS=5.389;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.02;MQ0=0;MQRankSum=-3.831;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:824,0,1395 chrIII 114728 . C T 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.828;DP=101;Dels=0.00;FS=2.902;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQ0=0;MQRankSum=-4.820;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.465;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:885,0,1346 chrIII 114762 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.929;DP=121;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-3.432;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1080,0,1533 chrIII 114986 . G A 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3392,340,0 chrIII 115127 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.511;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.868;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1248,0,936 chrIII 115183 . T C 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.175;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.861;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1533,0,1167 chrIII 115351 . T C 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.317;DP=118;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.634;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1487,0,1102 chrIII 115547 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;DP=97;Dels=0.00;FS=3.812;HaplotypeScore=3.7782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1162,0,918 chrIII 115623 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.546;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=12.59;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1264,0,886 chrIII 115736 . A T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.341;DP=112;Dels=0.00;FS=2.431;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1362,0,1119 chrIII 115829 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.264;DP=109;Dels=0.00;FS=6.139;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1415,0,936 chrIII 116011 . G T 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.507;DP=129;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.478;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1409,0,1339 chrIII 116224 . T G 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.458;DP=107;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=3.7160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,68:107:99:1563,0,799 chrIII 116294 . T A 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.574;DP=111;Dels=0.00;FS=5.052;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.572;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,74:111:99:1735,0,692 chrIII 116382 . C T 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.896;DP=101;Dels=0.00;FS=8.580;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.018;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,65:101:99:1490,0,724 chrIII 116479 . A C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.113;DP=118;Dels=0.00;FS=2.486;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.488;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1263,0,1186 chrIII 116641 . G A 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.844;DP=96;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:943,0,1140 chrIII 116795 . T G 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;DP=128;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=4.8925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.988;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1521,0,1216 chrIII 116887 . G A 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.366;DP=93;Dels=0.00;FS=11.056;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.788;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:1045,0,1029 chrIII 116946 . A G 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;DP=121;Dels=0.00;FS=2.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.252;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1117,0,1489 chrIII 117035 . G C 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;DP=93;Dels=0.00;FS=10.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.776;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:786,0,1135 chrIII 117295 . G A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.742;DP=97;Dels=0.00;FS=16.146;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.285;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1030,0,1136 chrIII 117476 . A G 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.049;DP=129;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=7.7447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1579,0,1190 chrIII 117992 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.277;DP=124;Dels=0.00;FS=9.654;HaplotypeScore=3.6113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.186;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1123,0,1445 chrIII 118196 . C T 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.525;DP=101;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.617;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1131,0,1091 chrIII 118342 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.188;DP=119;Dels=0.00;FS=3.394;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=9.34;ReadPosRankSum=2.129;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1141,0,1572 chrIII 118354 . T A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.930;DP=131;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.878;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1177,0,1700 chrIII 118412 . C G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.579;DP=130;Dels=0.00;FS=6.870;HaplotypeScore=8.6090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1218,0,1537 chrIII 118631 . G A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;DP=129;Dels=0.00;FS=7.972;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1488,0,1358 chrIII 118719 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.254;DP=109;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.385;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1219,0,1142 chrIII 119105 . T C 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.375;DP=93;Dels=0.00;FS=3.915;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.466;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:897,0,1067 chrIII 119131 . A G 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.868;DP=111;Dels=0.00;FS=3.463;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.033;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:951,0,1427 chrIII 119474 . A C 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2907,297,0 chrIII 119587 . A G 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3673,373,0 chrIII 119638 . T A 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.207;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1065,0,1304 chrIII 119779 . T A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;DP=132;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1517,0,1436 chrIII 119805 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.814;DP=129;Dels=0.00;FS=1.790;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=10.05;ReadPosRankSum=2.418;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1326,0,1525 chrIII 120121 . C T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.992;DP=124;Dels=0.00;FS=10.808;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.280;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1041,0,1447 chrIII 120133 . G A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.945;DP=117;Dels=0.00;FS=8.371;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.873;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:1021,0,1397 chrIII 120341 . C T 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.851;DP=94;Dels=0.00;FS=3.105;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.900;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.113;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:921,0,1102 chrIII 120342 . T C 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;DP=95;Dels=0.00;FS=1.903;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.219;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:904,0,1149 chrIII 120708 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.696;DP=109;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1159,0,1310 chrIII 121150 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.785;DP=119;Dels=0.00;FS=3.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.950;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1360,0,1219 chrIII 121210 . G A 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.434;DP=143;Dels=0.00;FS=2.096;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1600,0,1514 chrIII 122182 . G T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.063;DP=113;Dels=0.00;FS=1.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1176,0,1300 chrIII 122194 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.210;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1189,0,1328 chrIII 122386 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.679;DP=117;Dels=0.00;FS=9.532;HaplotypeScore=3.5167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=12.86;ReadPosRankSum=-1.257;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1535,0,1127 chrIII 122393 . T C 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.321;DP=105;Dels=0.00;FS=8.583;HaplotypeScore=2.5233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=8.96;ReadPosRankSum=-2.014;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:971,0,1098 chrIII 122472 . G A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.714;DP=116;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=9.08;ReadPosRankSum=-3.656;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1083,0,1388 chrIII 122563 . C G 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2743,276,0 chrIII 122778 . G C 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.705;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1095,0,1297 chrIII 122867 . G C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.002;DP=111;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1076,0,1049 chrIII 123212 . A T 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.300;DP=154;Dels=0.00;FS=3.778;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1756,0,1498 chrIII 123248 . T C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.573;DP=138;Dels=0.00;FS=5.202;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.319;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1500,0,1451 chrIII 123295 . A T 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1520,0,1719 chrIII 123494 . C T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.245;DP=118;Dels=0.00;FS=3.438;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.926;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1158,0,1225 chrIII 123733 . A G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;DP=115;Dels=0.00;FS=9.052;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.076;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1204,0,1309 chrIII 123908 . G T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;DP=108;Dels=0.00;FS=4.130;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=13.08;ReadPosRankSum=2.404;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:108:99:1443,0,906 chrIII 123967 . A G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.695;DP=89;Dels=0.00;FS=1.844;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:89:99:940,0,939 chrIII 124665 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.175;DP=116;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1333,0,1279 chrIII 124677 . T C 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.458;DP=144;Dels=0.00;FS=3.930;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1489,0,1596 chrIII 124902 . T G 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;DP=160;Dels=0.00;FS=2.874;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=9.33;ReadPosRankSum=2.189;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,73:160:99:1522,0,1939 chrIII 125023 . G A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.326;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.169;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.187;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1328,0,1417 chrIII 125090 . A T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;DP=109;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.871;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1117,0,1340 chrIII 125120 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.524;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1222,0,1334 chrIII 125134 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.111;DP=111;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.163;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:980,0,1411 chrIII 125341 . T C 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.367;DP=119;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.543;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1387,0,1224 chrIII 125835 . T C 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.368;DP=153;Dels=0.00;FS=4.830;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.325;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1868,0,1445 chrIII 126323 . C A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;DP=100;Dels=0.00;FS=4.989;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.823;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1178,0,1038 chrIII 126606 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.068;DP=94;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:977,0,1106 chrIII 126802 . G A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.717;DP=133;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=3.8117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1301,0,1692 chrIII 126856 . T C 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;DP=144;Dels=0.00;FS=3.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.674;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1411,0,1697 chrIII 126871 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.829;DP=120;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.541;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1298,0,1246 chrIII 126876 . T C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.520;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.102;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1294,0,1326 chrIII 126934 . C T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;DP=128;Dels=0.00;FS=2.279;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=1;MQRankSum=0.127;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.000;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:128:99:1544,0,1236 chrIII 127045 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.013;DP=111;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=12.16;ReadPosRankSum=-1.723;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1380,0,1063 chrIII 127056 . G C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;DP=109;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.106;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1233,0,1161 chrIII 127083 . G A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;DP=123;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.245;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1359,0,1248 chrIII 127084 . A T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;DP=127;Dels=0.00;FS=4.238;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.952;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1362,0,1390 chrIII 127139 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.181;DP=105;Dels=0.00;FS=3.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.398;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1302,0,915 chrIII 127464 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.366;DP=136;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=8.7429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.295;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1264,0,1625 chrIII 127692 . T A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;DP=112;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.210;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1350,0,1147 chrIII 127715 . T C 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.748;DP=99;Dels=0.00;FS=2.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:934,0,1085 chrIII 128021 . G C 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.875;DP=144;Dels=0.00;FS=17.702;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1623,0,1466 chrIII 128224 . T C 2474 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2507,255,0 chrIII 128266 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.513;DP=119;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.725;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1298,0,1300 chrIII 128376 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;DP=117;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.123;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1336,0,1142 chrIII 128401 . C T 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.924;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.375;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1761,0,1432 chrIII 128538 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.367;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.123;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1173,0,1554 chrIII 128667 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.870;DP=140;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.466;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1330,0,1644 chrIII 128694 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.031;DP=137;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1342,0,1532 chrIII 128766 . G C 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;DP=122;Dels=0.00;FS=4.594;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=9.16;ReadPosRankSum=2.945;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1147,0,1430 chrIII 128979 . C T 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.154;DP=124;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.974;QD=7.47;ReadPosRankSum=-3.028;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,50:124:99:956,0,1655 chrIII 129036 . T C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.254;DP=135;Dels=0.00;FS=4.360;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.750;QD=7.16;ReadPosRankSum=2.426;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,50:135:99:997,0,1963 chrIII 129054 . T C 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.223;DP=125;Dels=0.00;FS=3.343;HaplotypeScore=2.9114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.403;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1055,0,1646 chrIII 129196 . A T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;DP=142;Dels=0.00;FS=2.998;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.556;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1461,0,1645 chrIII 129310 . T G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.868;DP=131;Dels=0.00;FS=8.616;HaplotypeScore=3.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.008;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1206,0,1648 chrIII 129336 . A T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;DP=144;Dels=0.00;FS=4.390;HaplotypeScore=4.7258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1468,0,1704 chrIII 129603 . T C 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.281;DP=156;Dels=0.00;FS=5.049;HaplotypeScore=2.8246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:1868,0,1607 chrIII 130242 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.095;DP=107;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=3.8086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=11.52;ReadPosRankSum=-2.305;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1263,0,1081 chrIII 130263 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.497;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.891;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1328,0,1432 chrIII 130268 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.651;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.159;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1312,0,1280 chrIII 130317 . G A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.224;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.660;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1225,0,1679 chrIII 130325 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.339;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.592;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1295,0,1612 chrIII 130372 . G A 2527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2560,255,0 chrIII 130406 . T C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.626;DP=94;Dels=0.00;FS=13.834;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:1021,0,1083 chrIII 130462 . T C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;DP=89;Dels=0.00;FS=3.065;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:931,0,1022 chrIII 130594 . G A 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;DP=113;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=7.96;ReadPosRankSum=-2.135;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:113:99:929,0,1314 chrIII 130829 . A G 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.710;DP=168;Dels=0.00;FS=1.930;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.897;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:168:99:1880,0,1799 chrIII 130940 . A G 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=27.17;ReadPosRankSum=0.312;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3315,322,0 chrIII 130997 . A G 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;DP=139;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.730;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1340,0,1712 chrIII 131027 . C T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1404,0,1718 chrIII 131280 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.009;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.396;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,63:152:99:1216,0,2032 chrIII 131371 . A G 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.152;DP=161;Dels=0.00;FS=10.839;HaplotypeScore=2.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1756,0,1760 chrIII 131513 . G A 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;DP=164;Dels=0.00;FS=1.229;HaplotypeScore=4.6433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,84:164:99:1727,0,1778 chrIII 131519 . T C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.783;DP=146;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1482,0,1588 chrIII 131572 . A T 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.020;DP=117;Dels=0.00;FS=13.101;HaplotypeScore=55.8796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.007;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1488,0,1161 chrIII 131585 . T A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.842;DP=122;Dels=0.00;FS=22.194;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.722;QD=10.75;ReadPosRankSum=2.346;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1342,0,1241 chrIII 131983 . T C 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.444;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3035,289,0 chrIII 132020 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.244;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=2.599;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.721;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1448,0,1326 chrIII 132065 . G C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;DP=128;Dels=0.00;FS=4.355;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.663;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1252,0,1546 chrIII 132170 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.077;DP=103;Dels=0.00;FS=1.615;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.870;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1276,0,911 chrIII 132915 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.361;DP=150;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=2.9093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.244;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,60:150:99:1220,0,2043 chrIII 133141 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.036;DP=125;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=4.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1271,0,1395 chrIII 133383 . G A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.762;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.773;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.693;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1385,0,1135 chrIII 133467 . C T 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2955,289,0 chrIII 133715 . G A 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3422,343,0 chrIII 133716 . A G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.063;DP=127;Dels=0.00;FS=2.288;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.483;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1485,0,1241 chrIII 133913 . G A 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;DP=145;Dels=0.00;FS=10.113;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1592,0,1531 chrIII 134374 . G A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.754;DP=141;Dels=0.00;FS=5.445;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.819;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1525,0,1600 chrIII 135665 . T C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.309;DP=168;Dels=0.00;FS=4.555;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.518;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,77:168:99:1619,0,2056 chrIII 135905 . C T 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.411;DP=122;Dels=0.00;FS=4.522;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.312;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1432,0,1102 chrIII 136010 . A G 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.548;DP=136;Dels=0.00;FS=2.159;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.497;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1502,0,1388 chrIII 136159 . C T 1914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.403;DP=167;Dels=0.00;FS=1.222;HaplotypeScore=6.9120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.617;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,88:167:99:1944,0,1685 chrIII 136457 . C G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.786;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.576;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,80:170:99:1461,0,1996 chrIII 136789 . T C 4395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4395,430,0 chrIII 137256 . A G 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.775;DP=117;Dels=0.00;FS=4.531;HaplotypeScore=3.4332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.940;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1164,0,1387 chrIII 137311 . G T 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.660;DP=102;Dels=0.00;FS=8.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.685;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:898,0,1168 chrIII 138018 . T C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.338;DP=116;Dels=0.00;FS=5.810;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.146;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:1021,0,1444 chrIII 138345 . G A 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.108;DP=174;Dels=0.00;FS=0.560;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.006;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,91:174:99:1750,0,1823 chrIII 139189 . G C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.593;DP=113;Dels=0.00;FS=2.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.384;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1081,0,1442 chrIII 139934 . T C 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.457;DP=149;Dels=0.00;FS=4.871;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.039;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1522,0,1627 chrIII 139959 . G A 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3569,352,0 chrIII 140025 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.184;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.210;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1217,0,1602 chrIII 140121 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;DP=131;Dels=0.00;FS=5.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.771;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1422,0,1413 chrIII 140403 . G C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.129;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,59:139:99:1109,0,1815 chrIII 140422 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.840;DP=139;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1313,0,1796 chrIII 140656 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.711;DP=108;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.414;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1228,0,1102 chrIII 141153 . C T 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.825;DP=166;Dels=0.00;FS=1.915;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.603;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,86:166:99:1880,0,1698 chrIII 141617 . C T 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.704;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1693,0,1109 chrIII 141799 . T A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.198;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,69:109:99:1525,0,841 chrIII 141860 . T C 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.601;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:1139,0,793 chrIII 142192 . G A 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.254;DP=115;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:1003,0,1452 chrIII 142487 . C T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;DP=108;Dels=0.00;FS=9.312;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.545;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1372,0,1010 chrIII 142576 . G A 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.945;DP=123;Dels=0.00;FS=4.440;HaplotypeScore=4.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.148;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.788;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1065,0,1435 chrIII 142587 . T C 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=116;Dels=0.00;FS=3.439;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.029;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:912,0,1319 chrIII 142793 . C T 528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.376;DP=107;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.87;MQ0=0;MQRankSum=-6.306;QD=4.93;ReadPosRankSum=-5.528;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,31:106:99:558,0,1662 chrIII 142794 . G A 526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.052;DP=146;Dels=0.00;FS=6.067;HaplotypeScore=6.9274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQ0=0;MQRankSum=-5.263;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,29:146:99:556,0,1867 chrIII 142805 . C A 248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.726;DP=166;Dels=0.00;FS=1.858;HaplotypeScore=54.7835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.41;MQ0=1;MQRankSum=-7.395;QD=1.49;ReadPosRankSum=-5.225;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,27:166:99:278,0,2143 chrIII 142828 . C A 341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.613;DP=145;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=6.8783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.87;MQ0=1;MQRankSum=-5.562;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,48:145:99:371,0,2285 chrIII 142902 . C T 355.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.986;DP=97;Dels=0.00;FS=9.952;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.248;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.027;SB=-7.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:385,0,1699 chrIII 142906 . T C 312.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.017;DP=83;Dels=0.00;FS=8.756;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.132;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.917;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:342,0,1519 chrIII 142907 . C A 311.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;DP=83;Dels=0.00;FS=8.756;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.880;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.812;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:341,0,1462 chrIII 142911 . T C 311.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.720;DP=78;Dels=0.00;FS=7.171;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.535;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:341,0,1361 chrIII 142912 . A G 320.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.588;DP=81;Dels=0.00;FS=8.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.581;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:350,0,1390 chrIII 143059 . A G 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.173;DP=127;Dels=0.00;FS=2.394;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=1;MQRankSum=0.469;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,47:127:99:954,0,1805 chrIII 143070 . C T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.966;DP=133;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=6.2747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1136,0,1761 chrIII 143131 . T C 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2848,294,0 chrIII 143396 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.593;DP=128;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.633;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1494,0,1355 chrIII 143575 . C G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;DP=114;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1143,0,1175 chrIII 143576 . A G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.039;DP=114;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1154,0,1209 chrIII 143625 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;DP=108;Dels=0.00;FS=11.055;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.320;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1375,0,1004 chrIII 143858 . A G 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.642;DP=87;Dels=0.00;FS=0.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.735;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:879,0,1030 chrIII 144125 . C T 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.806;DP=145;Dels=0.00;FS=2.075;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.017;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.618;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1659,0,1497 chrIII 144180 . T C 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.178;DP=124;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1574,0,1056 chrIII 144315 . G A 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.808;DP=114;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=8.96;ReadPosRankSum=-2.084;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:114:99:1052,0,1322 chrIII 144316 . G C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.535;DP=119;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=8.64;ReadPosRankSum=-2.444;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1058,0,1369 chrIII 144359 . A T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.724;DP=113;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=1;MQRankSum=0.160;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.823;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1391,0,1188 chrIII 144591 . G A 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.901;DP=124;Dels=0.00;FS=2.690;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.349;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,43:124:99:916,0,1866 chrIII 144921 . G A 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.598;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.046;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:140:99:1773,0,1249 chrIII 145017 . C T 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=1;QD=24.35;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3028,304,0 chrIII 145055 . A G 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.616;DP=149;Dels=0.00;FS=4.128;HaplotypeScore=4.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=0.959;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1751,0,1470 chrIII 145633 . T A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.321;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.704;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1268,0,1542 chrIII 145634 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.503;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.795;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1286,0,1475 chrIII 145673 . C T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.387;DP=119;Dels=0.00;FS=2.542;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1497,0,1024 chrIII 145735 . T C 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2968,303,0 chrIII 145988 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.010;DP=125;Dels=0.00;FS=6.786;HaplotypeScore=3.7980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:125:99:1602,0,1137 chrIII 146420 . A G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.270;DP=124;Dels=0.00;FS=5.439;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.263;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1312,0,1325 chrIII 146470 . A G 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.900;DP=137;Dels=0.00;FS=2.215;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.130;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1721,0,1309 chrIII 146949 . C T 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.105;DP=80;Dels=0.00;FS=2.936;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:842,0,960 chrIII 147587 . A G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.775;DP=108;Dels=0.00;FS=9.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.315;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.844;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1314,0,1064 chrIII 148041 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;DP=112;Dels=0.00;FS=5.965;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=2.315;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.166;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1224,0,1224 chrIII 148049 . T C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.069;DP=116;Dels=0.00;FS=10.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1176,0,1252 chrIII 148271 . T C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.865;DP=113;Dels=0.00;FS=3.474;HaplotypeScore=3.4470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1159,0,1237 chrIII 148618 . T G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.372;DP=110;Dels=0.00;FS=4.835;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.499;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1208,0,1041 chrIII 148649 . T C 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.348;DP=95;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=10.86;ReadPosRankSum=-2.687;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:1062,0,966 chrIII 148694 . A T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.459;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=10.85;ReadPosRankSum=2.279;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1126,0,1085 chrIII 148832 . C T 1252.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.959;DP=112;Dels=0.00;FS=4.715;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.767;QD=11.18;ReadPosRankSum=2.227;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:112:99:1282,0,1016 chrIII 148833 . T C 878.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.925;DP=118;Dels=0.00;FS=5.892;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.603;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:908,0,1436 chrIII 148835 . C T 871.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;DP=115;Dels=0.00;FS=7.446;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:901,0,1403 chrIII 148974 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.382;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.982;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1247,0,1162 chrIII 148991 . G A 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.44;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2862,279,0 chrIII 149131 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.595;DP=109;Dels=0.00;FS=1.669;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:109:99:1353,0,1001 chrIII 149289 . G T 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;DP=121;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.398;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:967,0,1538 chrIII 149433 . G A 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.051;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.857;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:813,0,1054 chrIII 149504 . G C 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;DP=91;Dels=0.00;FS=10.623;HaplotypeScore=35.8277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.418;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:862,0,1064 chrIII 149508 . T C 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.467;DP=92;Dels=0.00;FS=10.669;HaplotypeScore=37.6532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.325;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:804,0,1149 chrIII 149594 . T A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;DP=105;Dels=0.00;FS=13.174;HaplotypeScore=5.8686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1018,0,1282 chrIII 149686 . C T 438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;DP=91;Dels=0.00;FS=3.496;HaplotypeScore=10.2628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,31:91:99:468,0,1336 chrIII 149687 . C A 448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.048;DP=86;Dels=0.00;FS=3.537;HaplotypeScore=10.2628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.368;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,29:86:99:478,0,1249 chrIII 149702 . A G 316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.618;DP=75;Dels=0.00;FS=2.534;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.028;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:346,0,1276 chrIII 149831 . C T 604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;DP=81;Dels=0.00;FS=22.445;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.178;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:81:99:634,0,1133 chrIII 149847 . A G 644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;DP=84;Dels=0.00;FS=13.460;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=7.67;ReadPosRankSum=2.180;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,33:84:99:674,0,1183 chrIII 149901 . A G 713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.488;DP=80;Dels=0.00;FS=7.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,39:80:99:743,0,933 chrIII 150045 . C T 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.352;DP=86;Dels=0.00;FS=1.912;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,39:86:99:845,0,1015 chrIII 150117 . T A 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.352;DP=80;Dels=0.00;FS=3.016;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.972;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,39:80:99:840,0,947 chrIII 150129 . T C 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.806;DP=82;Dels=0.00;FS=0.856;HaplotypeScore=1.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:928,0,893 chrIII 150161 . G T 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.682;DP=76;Dels=0.00;FS=0.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.114;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:775,0,862 chrIII 150179 . T A 2062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=26.78;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2095,201,0 chrIII 150203 . C T 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;DP=93;Dels=0.00;FS=4.190;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.926;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1056,0,982 chrIII 150321 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.092;DP=89;Dels=0.00;FS=0.964;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,59:89:99:1380,0,652 chrIII 150478 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.622;DP=108;Dels=0.00;FS=3.572;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.442;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1343,0,1046 chrIII 150498 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.882;DP=113;Dels=0.00;FS=7.257;HaplotypeScore=4.4579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.789;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1345,0,1115 chrIII 150520 . C A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.763;DP=108;Dels=0.00;FS=4.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.117;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1287,0,1045 chrIII 150586 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.027;DP=92;Dels=0.00;FS=6.750;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1040,0,971 chrIII 150592 . C G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.550;DP=88;Dels=0.00;FS=6.574;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,47:88:99:1017,0,873 chrIII 150619 . G T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.033;DP=109;Dels=0.00;FS=8.122;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.774;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1272,0,1131 chrIII 150717 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.459;DP=91;Dels=0.00;FS=1.969;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1074,0,911 chrIII 150721 . C T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.841;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1143,0,913 chrIII 150823 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.870;DP=114;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.148;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1230,0,1302 chrIII 150868 . T A 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;DP=104;Dels=0.00;FS=4.906;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.085;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:1047,0,1261 chrIII 151152 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.851;DP=101;Dels=0.00;FS=19.120;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.716;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:101:99:1378,0,886 chrIII 151161 . T G 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=99;Dels=0.00;FS=9.995;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=13.11;ReadPosRankSum=-1.686;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,59:99:99:1328,0,843 chrIII 151377 . C T 1005.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.696;DP=89;Dels=0.00;FS=2.799;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.457;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.650;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:1035,0,853 chrIII 151378 . G C 982.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.183;DP=88;Dels=0.00;FS=3.993;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.879;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.638;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,48:88:99:1012,0,822 chrIII 151385 . A C 945.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;DP=87;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=10.86;ReadPosRankSum=2.875;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:975,0,904 chrIII 151663 . T C 273.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.103;DP=109;Dels=0.00;FS=30.545;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.02;MQ0=31;MQRankSum=-1.638;QD=2.50;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:303,0,1240 chrIII 151757 . C T 196.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.004;DP=87;Dels=0.00;FS=20.537;HaplotypeScore=10.7134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.13;MQ0=9;MQRankSum=-1.256;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,14:87:99:226,0,1172 chrIII 151761 . G A 189.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.585;DP=87;Dels=0.00;FS=18.960;HaplotypeScore=19.4765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.22;MQ0=9;MQRankSum=-1.301;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.067;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,13:87:99:219,0,1193 chrIII 151793 . T C 427.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.779;DP=103;Dels=0.00;FS=39.826;HaplotypeScore=29.5599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.54;MQ0=0;MQRankSum=-4.983;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,29:103:99:457,0,1656 chrIII 151796 . C T 559.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.482;DP=89;Dels=0.00;FS=12.171;HaplotypeScore=25.7050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.42;MQ0=0;MQRankSum=-7.608;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.667;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:589,0,1373 chrIII 151797 . T A 541.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.955;DP=89;Dels=0.00;FS=12.171;HaplotypeScore=26.6179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.42;MQ0=0;MQRankSum=-7.126;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.659;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:571,0,1422 chrIII 151803 . T G 455.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.043;DP=95;Dels=0.00;FS=54.926;HaplotypeScore=18.7135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQ0=0;MQRankSum=-7.131;QD=4.79;ReadPosRankSum=-1.303;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,33:95:99:485,0,1437 chrIII 151809 . T C 493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.196;DP=94;Dels=0.00;FS=14.592;HaplotypeScore=11.8050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.45;MQ0=0;MQRankSum=-8.026;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.908;SB=-6.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,40:94:99:523,0,1308 chrIII 151817 . T C 455.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=98;Dels=0.00;FS=58.369;HaplotypeScore=8.8196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.56;MQ0=0;MQRankSum=-6.835;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,36:98:99:485,0,1495 chrIII 151826 . C T 577.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.417;DP=99;Dels=0.00;FS=28.072;HaplotypeScore=11.9437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.21;MQ0=0;MQRankSum=-8.230;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:607,0,1358 chrIII 151832 . G C 591.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.339;DP=101;Dels=0.00;FS=7.338;HaplotypeScore=15.7127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.29;MQ0=0;MQRankSum=-7.645;QD=5.85;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:621,0,1406 chrIII 151834 . A C 546.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.724;DP=103;Dels=0.00;FS=15.604;HaplotypeScore=21.5117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.875;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,41:103:99:576,0,1501 chrIII 151925 . G A 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.156;DP=132;Dels=0.00;FS=4.259;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=13.07;ReadPosRankSum=-1.982;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1755,0,1106 chrIII 152069 . G T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.403;DP=100;Dels=0.00;FS=1.626;HaplotypeScore=5.4973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=12.27;ReadPosRankSum=2.931;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:100:99:1257,0,848 chrIII 152240 . A C 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:917,0,905 chrIII 152257 . G A 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;DP=75;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.552;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:793,0,846 chrIII 152269 . T C 2236 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=1;QD=23.79;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2269,231,0 chrIII 152334 . A G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;DP=109;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=1;MQRankSum=0.222;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1105,0,1265 chrIII 152439 . T G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.860;DP=108;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1211,0,1024 chrIII 152466 . G A 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.477;DP=100;Dels=0.00;FS=3.729;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.431;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1070,0,1024 chrIII 152546 . A G 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2719,276,0 chrIII 152773 . A T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;DP=119;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=6.5920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1219,0,1331 chrIII 152950 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.125;DP=127;Dels=0.00;FS=5.434;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.924;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.567;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1220,0,1508 chrIII 152956 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;DP=121;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.968;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1124,0,1353 chrIII 152962 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.402;DP=120;Dels=0.00;FS=2.345;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.308;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.475;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1276,0,1360 chrIII 153418 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.796;DP=107;Dels=0.00;FS=13.036;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.079;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,63:107:99:1337,0,922 chrIII 153706 . C T 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.463;DP=87;Dels=0.00;FS=1.971;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:87:99:702,0,987 chrIII 153719 . T G 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.448;DP=90;Dels=0.00;FS=3.135;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=2.324;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.033;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:868,0,1040 chrIII 153893 . A G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;DP=113;Dels=0.00;FS=8.862;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.767;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1209,0,1281 chrIII 153901 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.859;DP=115;Dels=0.00;FS=10.591;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.307;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1431,0,1058 chrIII 154081 . T C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.965;DP=118;Dels=0.00;FS=6.126;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.783;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1292,0,1254 chrIII 154234 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.092;DP=108;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1074,0,1324 chrIII 154278 . C A 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.807;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.351;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1778,0,1255 chrIII 154645 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.808;DP=129;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.005;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1196,0,1622 chrIII 154683 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;DP=133;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=5.7023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1276,0,1724 chrIII 154902 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.066;DP=134;Dels=0.00;FS=6.604;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.792;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1444,0,1537 chrIII 154911 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.201;DP=128;Dels=0.00;FS=4.198;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.193;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1352,0,1403 chrIII 155093 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.746;DP=120;Dels=0.00;FS=1.577;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.497;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1218,0,1364 chrIII 155166 . A G 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.440;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:970,0,1248 chrIII 155502 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.809;DP=118;Dels=0.00;FS=2.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1328,0,1340 chrIII 155616 . A G 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.153;DP=99;Dels=0.00;FS=6.977;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.351;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1127,0,1012 chrIII 155801 . G C 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.372;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1459,0,1429 chrIII 155846 . T C 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.569;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.279;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1548,0,1279 chrIII 155855 . C T 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.944;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.717;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1438,0,1327 chrIII 156289 . A G 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.232;DP=108;Dels=0.00;FS=1.559;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.310;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:108:99:994,0,1321 chrIII 156517 . G C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.313;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1119,0,1262 chrIII 156868 . A G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.202;DP=137;Dels=0.00;FS=9.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.136;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1561,0,1462 chrIII 156960 . C T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;DP=154;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.951;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:1355,0,1941 chrIII 157250 . G A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.225;DP=105;Dels=0.00;FS=10.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.493;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1232,0,1121 chrIII 157443 . C T 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.291;DP=155;Dels=0.00;FS=4.793;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1491,0,1840 chrIII 157485 . T C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.618;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.222;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1144,0,1774 chrIII 157807 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.759;DP=120;Dels=0.01;FS=2.337;HaplotypeScore=2.7474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=-1.337;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1224,0,1277 chrIII 157881 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.758;DP=141;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=1.642;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1335,0,1676 chrIII 157998 . C T 3623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3623,358,0 chrIII 158053 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;DP=119;Dels=0.00;FS=3.550;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1234,0,1354 chrIII 158141 . C T 3750.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=28.41;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3750,361,0 chrIII 158329 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;DP=115;Dels=0.00;FS=7.795;HaplotypeScore=2.7460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.165;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1329,0,1196 chrIII 158345 . T C 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2745,282,0 chrIII 158378 . T C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.269;DP=115;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1256,0,1330 chrIII 158627 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;DP=136;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.259;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1416,0,1580 chrIII 158635 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.337;DP=155;Dels=0.00;FS=1.255;HaplotypeScore=7.9520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=3.008;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.020;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1592,0,1824 chrIII 158956 . T C 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3191,330,0 chrIII 159547 . A T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;DP=133;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1108,0,1832 chrIII 159689 . C T 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2539,241,0 chrIII 159720 . C T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;DP=110;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:928,0,1396 chrIII 159774 . C A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.892;DP=108;Dels=0.00;FS=3.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.673;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1270,0,1100 chrIII 159894 . A T 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;DP=105;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.849;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,64:105:99:1457,0,875 chrIII 160045 . C T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.289;DP=100;Dels=0.00;FS=9.819;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.756;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1203,0,974 chrIII 160119 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.278;DP=128;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=2.368;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1163,0,1688 chrIII 160421 . T G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.419;DP=115;Dels=0.00;FS=2.391;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:115:99:1139,0,1353 chrIII 160427 . C T 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.651;DP=106;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1175,0,1155 chrIII 160583 . G A 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.768;DP=81;Dels=0.00;FS=3.055;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.036;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:813,0,928 chrIII 161749 . G T 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3339,334,0 chrIII 162279 . G A 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.032;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,70:114:99:1559,0,929 chrIII 162396 . G C 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2696,282,0 chrIII 162640 . T G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.000;DP=126;Dels=0.00;FS=7.480;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.543;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.284;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1397,0,1320 chrIII 162941 . C A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;DP=146;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=4.2348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.463;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1633,0,1376 chrIII 163319 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.827;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.506;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1176,0,1191 chrIII 163548 . A G 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.390;DP=90;Dels=0.00;FS=1.716;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.004;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:90:99:907,0,1020 chrIII 163699 . T G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.928;DP=122;Dels=0.00;FS=11.968;HaplotypeScore=2.7700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.581;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1333,0,1275 chrIII 163757 . T G 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5251;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3296,319,0 chrIII 163810 . A G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;DP=98;Dels=0.00;FS=2.655;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.432;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1125,0,902 chrIII 163816 . G A 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.385;DP=100;Dels=0.00;FS=1.624;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:881,0,1177 chrIII 164093 . G A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.742;DP=123;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.147;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1488,0,1176 chrIII 164249 . G T 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=28.62;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3721,361,0 chrIII 164277 . A G 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1968;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3649,378,0 chrIII 164600 . A G 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.852;DP=145;Dels=0.00;FS=5.122;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.814;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.498;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,87:145:99:1872,0,1208 chrIII 165025 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.980;DP=143;Dels=0.00;FS=7.783;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.898;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1462,0,1657 chrIII 165034 . C T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.154;DP=139;Dels=0.00;FS=6.547;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.575;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1543,0,1535 chrIII 165283 . G A 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=139;Dels=0.00;FS=4.053;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1574,0,1510 chrIII 165407 . A C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.479;DP=147;Dels=0.00;FS=4.722;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=1;MQRankSum=-0.536;QD=9.35;ReadPosRankSum=-2.614;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1404,0,1650 chrIII 165593 . C T 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.747;DP=144;Dels=0.00;FS=3.942;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.473;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1681,0,1434 chrIII 165706 . C T 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.372;DP=135;Dels=0.00;FS=3.150;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.497;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.178;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1691,0,1179 chrIII 165982 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.202;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1274,0,1413 chrIII 166020 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.707;DP=107;Dels=0.00;FS=7.849;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1036,0,1176 chrIII 166247 . A G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.360;DP=123;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.390;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1373,0,1115 chrIII 166414 . G A 1954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;DP=168;Dels=0.00;FS=7.546;HaplotypeScore=3.4661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.856;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1984,0,1676 chrIII 166581 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.761;DP=109;Dels=0.00;FS=1.734;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.623;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:109:99:1401,0,941 chrIII 166648 . A G 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.644;DP=126;Dels=0.00;FS=5.390;HaplotypeScore=2.9822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.286;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1319,0,1417 chrIII 166713 . A G 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.214;DP=93;Dels=0.00;FS=4.213;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.589;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:928,0,1127 chrIII 166738 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;DP=105;Dels=0.00;FS=8.073;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.490;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1080,0,1194 chrIII 167066 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.008;DP=128;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1310,0,1391 chrIII 167724 . T C 4152.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4152,418,0 chrIII 168099 . A G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.310;DP=144;Dels=0.00;FS=17.154;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1405,0,1689 chrIII 168244 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.250;DP=104;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1173,0,1071 chrIII 168386 . A G 241.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.414;DP=67;Dels=0.00;FS=29.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=0;MQRankSum=-5.160;QD=3.60;ReadPosRankSum=-5.921;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:271,0,1125 chrIII 168408 . G A 1250 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.48;MQ0=2;QD=25.00;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1283,120,0 chrIII 168627 . T G 44.04 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.02;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=4.00;ReadPosRankSum=-2.239;SB=1.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:18:74,0,18 chrIII 168633 . G A 50.04 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.02;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=4.55;ReadPosRankSum=-2.239;SB=1.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:18:80,0,18 chrIII 168635 . T A 47.04 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.02;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=4.28;ReadPosRankSum=-2.239;SB=1.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:18:77,0,18 chrIII 168638 . C T 44.04 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.02;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=4.00;ReadPosRankSum=-2.239;SB=1.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:18:74,0,18 chrIII 168642 . G C 47.05 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.02;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=4.28;ReadPosRankSum=-2.239;SB=1.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:17:77,0,17 chrIII 168644 . T C 38.04 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.02;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=3.46;ReadPosRankSum=-2.239;SB=1.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:18:68,0,18 chrIII 168646 . A G 44.04 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.02;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=4.00;ReadPosRankSum=-2.239;SB=1.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:18:74,0,18 chrIII 168653 . C T 48.04 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.62;MQ0=1;MQRankSum=1.733;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.733;SB=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:18:78,0,18 chrIII 168662 . T C 46.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.49;MQ0=2;MQRankSum=0.633;QD=3.84;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-4.963e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:17:76,0,17 chrIII 169091 . G A 135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.769;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.23;MQ0=0;MQRankSum=-4.704;QD=1.85;ReadPosRankSum=-2.885;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,31:73:99:165,0,971 chrIII 169123 . A T 301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.716;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.625;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:331,0,1102 chrIII 169162 . A G 330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.005;DP=55;Dels=0.00;FS=1.140;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.296;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:360,0,800 chrIII 169196 . A G 74.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;DP=29;Dels=0.00;FS=1.786;HaplotypeScore=5.8565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=2.55;ReadPosRankSum=-2.019;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,6:29:99:104,0,426 chrIII 169210 . T C 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.46;MQ0=3;QD=3.63;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:6:53,6,0 chrIII 169570 . T C 336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.43;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.461;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:366,0,444 chrIII 169677 . A C 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.341;DP=160;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.536;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1718,0,1801 chrIII 169751 . G T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;DP=142;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=6.3337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,60:142:99:1214,0,1907 chrIII 169774 . G C 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,49:133:99:926,0,1870 chrIII 169850 . G C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;DP=145;Dels=0.00;FS=3.168;HaplotypeScore=2.5721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.386;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:145:99:1294,0,1874 chrIII 169991 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.323;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.490;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1619,0,1594 chrIII 169994 . C T 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.096;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.276;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1670,0,1518 chrIII 170096 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.965;DP=135;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=2;MQRankSum=-0.926;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.302;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1275,0,1642 chrIII 170190 . T C 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.355;DP=138;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=4.2198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.430;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1288,0,1594 chrIII 170277 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.150;DP=139;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=0.602;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.843;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,59:139:99:1183,0,1888 chrIII 170381 . A G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.367;DP=148;Dels=0.00;FS=10.287;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=1;MQRankSum=-2.058;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,61:148:99:1250,0,1976 chrIII 170451 . G T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.269;DP=129;Dels=0.00;FS=4.526;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.132;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1293,0,1611 chrIII 170561 . A G 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.426;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.023;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1504,0,1461 chrIII 170570 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.859;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.603;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1436,0,1328 chrIII 170648 . C G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.395;DP=130;Dels=0.00;FS=5.466;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1198,0,1572 chrIII 170765 . A G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.335;DP=139;Dels=0.00;FS=9.932;HaplotypeScore=11.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.277;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1287,0,1755 chrIII 170886 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.647;DP=107;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.864;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1251,0,1124 chrIII 170997 . T C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.161;DP=126;Dels=0.00;FS=7.358;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.066;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1242,0,1500 chrIII 171207 . G T 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.407;DP=138;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.161;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:1755,0,1187 chrIII 171564 . G A 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.201;DP=129;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=4.5033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.175;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,53:129:99:1084,0,1754 chrIII 171620 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.829;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1443,0,1615 chrIII 171878 . T C 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.702;DP=116;Dels=0.00;FS=7.158;HaplotypeScore=2.7700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.947;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1077,0,1178 chrIII 172092 . A G 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.026;DP=111;Dels=0.00;FS=2.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.499;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.045;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,44:111:99:901,0,1611 chrIII 172122 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.075;DP=151;Dels=0.00;FS=2.922;HaplotypeScore=3.7072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1419,0,1896 chrIII 172125 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.245;DP=152;Dels=0.00;FS=3.883;HaplotypeScore=3.7072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:152:99:1465,0,1825 chrIII 172242 . G C 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.228;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1601,0,1243 chrIII 172362 . C T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.825;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1537,0,1355 chrIII 172626 . C T 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.570;DP=119;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1114,0,1524 chrIII 172675 . G C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;DP=99;Dels=0.00;FS=4.984;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.328;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1129,0,1022 chrIII 172988 . C T 394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.090;DP=147;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.061;QD=2.68;ReadPosRankSum=-7.436;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,29:146:99:424,0,2069 chrIII 173130 . G T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.846;DP=131;Dels=0.00;FS=4.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.44;ReadPosRankSum=-2.063;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1267,0,1584 chrIII 173446 . T A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;DP=109;Dels=0.00;FS=4.726;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.780;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1235,0,1179 chrIII 173565 . T C 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.168;DP=111;Dels=0.00;FS=14.425;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.159;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1100,0,1101 chrIII 173641 . T A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;DP=130;Dels=0.00;FS=10.815;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.603;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1170,0,1723 chrIII 173853 . G A 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.930;DP=93;Dels=0.00;FS=8.355;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:974,0,1015 chrIII 173968 . A G 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.482;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1301,0,1116 chrIII 174943 . A T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;DP=132;Dels=0.00;FS=2.254;HaplotypeScore=3.7164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1288,0,1586 chrIII 175328 . A G 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3756;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3272,330,0 chrIII 175359 . T C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2931,300,0 chrIII 175569 . T C 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.475;DP=148;Dels=0.00;FS=2.073;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.058;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1432,0,1807 chrIII 177258 . T C 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.390;DP=104;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.040;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,63:104:99:1481,0,902 chrIII 177291 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.227;DP=102;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,60:102:99:1369,0,922 chrIII 177325 . A G 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2874,291,0 chrIII 177399 . G A 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.97;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3524,343,0 chrIII 177761 . G A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;DP=129;Dels=0.00;FS=3.463;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.698;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1410,0,1419 chrIII 178367 . G A 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=28.11;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3209,319,0 chrIII 179122 . C T 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3703,361,0 chrIII 180127 . G A 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3352,331,0 chrIII 180840 . G C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.860;DP=109;Dels=0.00;FS=3.631;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=1;MQRankSum=-0.580;QD=12.16;ReadPosRankSum=-1.390;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1355,0,919 chrIII 180860 . G A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.872;DP=122;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=0.478;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.640;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1597,0,1096 chrIII 180893 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.453;DP=131;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=2.238;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.222;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1440,0,1381 chrIII 180969 . A G 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.313;DP=96;Dels=0.00;FS=1.664;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.197;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:1070,0,999 chrIII 180983 . T C 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;DP=95;Dels=0.00;FS=2.684;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.718;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:954,0,1092 chrIII 181211 . T C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.673;DP=111;Dels=0.00;FS=3.500;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.124;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1144,0,1320 chrIII 181373 . C T 792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;DP=77;Dels=0.00;FS=1.905;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.659;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,36:77:99:822,0,894 chrIII 181465 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.391;DP=112;Dels=0.00;FS=4.706;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1135,0,1376 chrIII 181524 . C A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.878;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.366;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1177,0,1120 chrIII 181556 . T C 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;DP=106;Dels=0.00;FS=3.533;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1052,0,1311 chrIII 181625 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.675;DP=117;Dels=0.00;FS=2.369;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.880;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1264,0,1255 chrIII 181637 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.889;DP=118;Dels=0.00;FS=2.361;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1221,0,1315 chrIII 181685 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.192;DP=138;Dels=0.00;FS=6.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.123;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1299,0,1786 chrIII 182326 . G A 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.499;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.957;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,75:164:99:1590,0,1943 chrIII 182576 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.872;DP=130;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=6.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.538;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1236,0,1616 chrIII 182668 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.731;DP=135;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.195;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1400,0,1547 chrIII 183385 . C T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.139;DP=103;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=14.30;ReadPosRankSum=1.587;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,63:103:99:1503,0,806 chrIII 183635 . C T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.687;DP=119;Dels=0.00;FS=3.337;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1460,0,1166 chrIII 183893 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.717;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.202;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1189,0,995 chrIII 184637 . C T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.161;DP=118;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=13.32;ReadPosRankSum=-1.765;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,71:118:99:1602,0,986 chrIII 184700 . C G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;DP=135;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=4.2983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.749;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1370,0,1449 chrIII 184706 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.373;DP=134;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=3.3036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:134:99:1309,0,1579 chrIII 184874 . C A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.114;DP=151;Dels=0.00;FS=3.822;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1658,0,1563 chrIII 185117 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.070;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1616,0,1601 chrIII 185848 . A G 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.543;DP=123;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.548;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:1621,0,1129 chrIII 185887 . A G 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.326;DP=138;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1642,0,1371 chrIII 186028 . C G 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;DP=148;Dels=0.00;FS=10.530;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1779,0,1522 chrIII 186237 . T A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=109;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.367;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1158,0,1214 chrIII 186911 . C A 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.008;DP=145;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1629,0,1480 chrIII 186984 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.758;DP=127;Dels=0.00;FS=3.212;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.152;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1376,0,1273 chrIII 187010 . G A 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.847;DP=138;Dels=0.00;FS=2.126;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.833;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1557,0,1353 chrIII 187273 . C A 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=108;Dels=0.00;FS=2.496;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.022;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1043,0,1230 chrIII 187328 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.680;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1225,0,1058 chrIII 187459 . C T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.424;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.773;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:990,0,1219 chrIII 187612 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.071;DP=118;Dels=0.00;FS=2.422;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=2.391;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.178;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1317,0,1361 chrIII 187655 . G A 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2922,283,0 chrIII 187736 . C T 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.500;DP=104;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:104:99:1186,0,1025 chrIII 187803 . A T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;DP=117;Dels=0.00;FS=14.763;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.874;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1254,0,1419 chrIII 187853 . G A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.357;DP=101;Dels=0.00;FS=3.709;HaplotypeScore=2.5655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.198;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:933,0,1178 chrIII 187932 . G A 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3240,316,0 chrIII 188102 . C T 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.271;DP=91;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.012;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:919,0,1073 chrIII 188202 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.785;DP=136;Dels=0.00;FS=1.382;HaplotypeScore=6.9010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=10.37;ReadPosRankSum=2.380;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1440,0,1612 chrIII 188418 . C T 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2827,282,0 chrIII 188758 . G A 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.375;DP=116;Dels=0.00;FS=4.701;HaplotypeScore=4.8379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.781;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1247,0,1224 chrIII 188786 . G T 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.834e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3494,346,0 chrIII 188904 . C A 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3317,325,0 chrIII 188954 . C T 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3792,370,0 chrIII 188979 . G A 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3421,337,0 chrIII 189025 . G A 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3747,367,0 chrIII 189040 . A T 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.431;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1534,0,1299 chrIII 189052 . C G 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3514,358,0 chrIII 189331 . T C 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=2;MQRankSum=-0.156;QD=11.52;ReadPosRankSum=2.239;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1712,0,1392 chrIII 189555 . A G 706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.641;DP=84;Dels=0.00;FS=1.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.939;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:736,0,1024 chrIII 189875 . A G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.950;DP=100;Dels=0.00;FS=3.679;HaplotypeScore=4.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.363;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1062,0,1150 chrIII 190810 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.346;DP=148;Dels=0.00;FS=7.493;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.185;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.798;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,59:148:99:1055,0,1988 chrIII 191536 . C T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.418;DP=91;Dels=0.00;FS=1.723;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:91:99:1119,0,866 chrIII 191932 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.365;DP=136;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1495,0,1359 chrIII 192005 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.555;DP=127;Dels=0.00;FS=4.233;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.959;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1466,0,1241 chrIII 192293 . C T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.103;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.791;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1418,0,1112 chrIII 192371 . T C 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.739;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1419,0,1676 chrIII 192710 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1365,0,1050 chrIII 192715 . C A 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3017,292,0 chrIII 192830 . C T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.834;DP=126;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=5.2899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:126:99:1198,0,1472 chrIII 192868 . C T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.779;DP=111;Dels=0.00;FS=8.869;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1230,0,1282 chrIII 193023 . A G 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.814;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.529;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1119,0,1565 chrIII 193063 . G A 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.459;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.292;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1164,0,1377 chrIII 193066 . A G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.310;DP=127;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.197;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1456,0,1273 chrIII 193107 . C A 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3415,343,0 chrIII 193109 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;DP=120;Dels=0.00;FS=7.486;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.042;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1378,0,1237 chrIII 193294 . A G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.088;DP=145;Dels=0.00;FS=6.629;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1562,0,1589 chrIII 193320 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.767;DP=129;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=4.6433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.412;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1494,0,1371 chrIII 193503 . A G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.559;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1213,0,1502 chrIII 193536 . T C 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.614;DP=109;Dels=0.00;FS=11.220;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1340,0,1014 chrIII 193600 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.156;DP=101;Dels=0.00;FS=32.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=0.619;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1189,0,965 chrIII 193675 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=124;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.779;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1257,0,1458 chrIII 193815 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.921;DP=115;Dels=0.00;FS=5.766;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.025;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1162,0,1318 chrIII 193828 . G A 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.905;DP=119;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=13.00;ReadPosRankSum=-1.484;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1577,0,1099 chrIII 194107 . C G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;DP=110;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1314,0,1032 chrIII 194217 . A T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;DP=142;Dels=0.01;FS=2.132;HaplotypeScore=6.4743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.772;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.789;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1362,0,1728 chrIII 194218 . T C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.954;DP=142;Dels=0.00;FS=2.977;HaplotypeScore=6.4743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=9.35;ReadPosRankSum=2.171;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1358,0,1714 chrIII 194344 . C G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;DP=124;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.858;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1369,0,1262 chrIII 194465 . T C 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.592;DP=140;Dels=0.00;FS=2.165;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.273;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1469,0,1628 chrIII 194544 . T C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.609;DP=105;Dels=0.00;FS=1.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:1003,0,1368 chrIII 194732 . C T 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.130;DP=120;Dels=0.00;FS=18.167;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1278,0,1383 chrIII 195020 . A G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.750;DP=108;Dels=0.00;FS=3.735;HaplotypeScore=4.5478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.083;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1160,0,1210 chrIII 195038 . G A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;DP=120;Dels=0.00;FS=1.492;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.709;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1322,0,1297 chrIII 195050 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.356;DP=116;Dels=0.00;FS=3.457;HaplotypeScore=2.6511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.646;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1241,0,1283 chrIII 195140 . G A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.683;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1258,0,1393 chrIII 195587 . A T 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;DP=133;Dels=0.00;FS=3.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=11.11;ReadPosRankSum=-2.200;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1508,0,1296 chrIII 195980 . G A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.991;DP=117;Dels=0.00;FS=3.482;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.753;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.613;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1261,0,1265 chrIII 196331 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.598;DP=112;Dels=0.00;FS=4.634;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.297;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1305,0,1133 chrIII 196646 . C T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.546;DP=116;Dels=0.00;FS=2.442;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=12.06;ReadPosRankSum=2.737;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1429,0,1144 chrIII 196733 . C T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.794;DP=116;Dels=0.00;FS=4.528;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=11.13;ReadPosRankSum=-3.152;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1321,0,1156 chrIII 196742 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.958;DP=124;Dels=0.00;FS=6.821;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.789;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1373,0,1387 chrIII 196835 . G T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.895;DP=121;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.205;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1323,0,1211 chrIII 197217 . A C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.019;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1328,0,1274 chrIII 197280 . A T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.688;DP=116;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.406;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1301,0,1325 chrIII 197459 . T G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.349;DP=96;Dels=0.00;FS=3.860;HaplotypeScore=76.6132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1057,0,992 chrIII 197559 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.595;DP=135;Dels=0.00;FS=2.180;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1364,0,1588 chrIII 198348 . A G 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3245,325,0 chrIII 198707 . G T 808.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.232;DP=120;Dels=0.00;FS=4.853;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQ0=10;MQRankSum=1.599;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.623;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,47:120:99:838,0,1365 chrIII 199307 . A G 1504.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.838;DP=157;Dels=0.00;FS=2.257;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.65;MQ0=25;MQRankSum=-0.942;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.062;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,90:157:99:1534,0,1190 chrIII 200606 . T A 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.59;MQ0=43;QD=0.51;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,24:45:6:54,6,0 chrIII 200630 . A G 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.49;MQ0=34;QD=0.69;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,20:36:6:56,6,0 chrIII 200659 . G C 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.54;MQ0=48;QD=0.50;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,33:50:6:56,6,0 chrIII 201041 . C A 471.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.823;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.96;MQ0=60;MQRankSum=0.304;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.203;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,37:103:99:501,0,485 chrIII 201081 . C T 459.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.565;DP=99;Dels=0.00;FS=6.307;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.45;MQ0=52;MQRankSum=0.458;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-8.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,38:99:99:489,0,521 chrIII 201125 . G C 718.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;DP=116;Dels=0.00;FS=7.304;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQ0=16;MQRankSum=-0.248;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,40:116:99:748,0,1526 chrIII 201173 . A T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;DP=161;Dels=0.00;FS=6.837;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=1.822;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.042;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,68:161:99:1429,0,2225 chrIII 201189 . A C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.435;DP=155;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQ0=0;MQRankSum=1.941;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.381;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,67:155:99:1404,0,2022 chrIII 201258 . C T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.009;DP=141;Dels=0.00;FS=3.040;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1385,0,1634 chrIII 201587 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.873;DP=132;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.287;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1331,0,1493 chrIII 201595 . C T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.875;DP=134;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.705;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.574;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1477,0,1467 chrIII 201639 . A G 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.729;DP=147;Dels=0.00;FS=3.867;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1639,0,1610 chrIII 201813 . A G 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.220;DP=138;Dels=0.00;FS=4.147;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.822;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1719,0,1289 chrIII 201965 . T A 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;DP=120;Dels=0.00;FS=2.482;HaplotypeScore=11.3540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,70:120:99:1620,0,1019 chrIII 201978 . A G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;DP=111;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=3.5320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.556;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,66:111:99:1434,0,967 chrIII 202065 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;DP=127;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.118;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.225;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1449,0,1302 chrIII 202104 . A C 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.034;DP=136;Dels=0.01;FS=2.689;HaplotypeScore=14.7203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1582,0,1295 chrIII 202304 . T C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.807;DP=111;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=-0.852;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1097,0,1285 chrIII 202497 . G A 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.483;DP=77;Dels=0.00;FS=0.933;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.733;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,34:77:99:776,0,1014 chrIII 202551 . T A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.948;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.955;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1219,0,1271 chrIII 202704 . A G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.213;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:109:99:1108,0,1086 chrIII 202851 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.022;DP=106;Dels=0.00;FS=4.971;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.563;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1149,0,1132 chrIII 202932 . C A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.386;DP=146;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.536;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1444,0,1637 chrIII 202939 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.563;DP=147;Dels=0.00;FS=1.327;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.904;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.231;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1433,0,1712 chrIII 203124 . T C 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.867;DP=125;Dels=0.00;FS=8.962;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1383,0,1287 chrIII 203412 . A G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;DP=113;Dels=0.00;FS=2.765;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.237;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1235,0,1180 chrIII 203463 . C G 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;DP=121;Dels=0.00;FS=4.375;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.710;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1103,0,1406 chrIII 203567 . T C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.446;DP=126;Dels=0.01;FS=0.674;HaplotypeScore=6.8742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.475;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.047;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1488,0,1081 chrIII 203646 . C T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.199;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1448,0,1240 chrIII 203691 . A G 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.110;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:1727,0,1209 chrIII 203979 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.463;DP=143;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.208;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1495,0,1499 chrIII 204006 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.274;DP=113;Dels=0.00;FS=7.260;HaplotypeScore=4.7932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.624;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1201,0,1282 chrIII 204067 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.031;DP=118;Dels=0.00;FS=1.501;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1415,0,1149 chrIII 204133 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.946;DP=125;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=5.4138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.912;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1383,0,1264 chrIII 204174 . T C 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3256,327,0 chrIII 204382 . C T 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.441;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.387;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,39:88:99:831,0,1097 chrIII 204507 . T A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;DP=112;Dels=0.00;FS=1.589;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.148;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1418,0,951 chrIII 204525 . G A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.268;DP=109;Dels=0.00;FS=1.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=11.69;ReadPosRankSum=2.879;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1304,0,925 chrIII 204530 . A T 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.931;DP=121;Dels=0.00;FS=6.178;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.544;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,72:121:99:1485,0,999 chrIII 204543 . G T 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.709;DP=112;Dels=0.00;FS=9.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.730;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1529,0,814 chrIII 204670 . C T 1854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.673;DP=118;Dels=0.00;FS=5.240;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.704;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,82:118:99:1884,0,677 chrIII 204750 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.161;DP=101;Dels=0.00;FS=8.010;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1338,0,862 chrIII 204792 . C T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.056;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:1080,0,919 chrIII 205065 . A G 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.694;DP=89;Dels=0.00;FS=2.835;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.550;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:818,0,1186 chrIII 205197 . A G 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.609;DP=113;Dels=0.00;FS=1.607;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,43:113:99:808,0,1639 chrIII 205338 . C T 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3876,382,0 chrIII 205454 . A T 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.396;DP=103;Dels=0.00;FS=3.596;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=25.79;ReadPosRankSum=1.698;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2689,267,0 chrIII 205472 . C A 2640 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2673,270,0 chrIII 205536 . G A 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.900;DP=92;Dels=0.00;FS=3.968;HaplotypeScore=44.7091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.696;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:780,0,1106 chrIII 205549 . A T 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.795;DP=99;Dels=0.00;FS=9.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.495;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:784,0,1227 chrIII 205553 . A G 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;DP=96;Dels=0.00;FS=11.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.606;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.242;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:847,0,1197 chrIII 205619 . A G 641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.732;DP=82;Dels=0.00;FS=15.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.089;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:671,0,1104 chrIII 205637 . C T 701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.889;DP=88;Dels=0.00;FS=10.739;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.273;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,35:88:99:731,0,1207 chrIII 205673 . G C 2007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=163.5145;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.39;MQ0=1;QD=24.18;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:83:99:2040,210,0 chrIII 205742 . A T 2097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.54;MQ0=1;QD=25.89;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2130,222,0 chrIII 205779 . T A 1881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.69;MQ0=0;QD=27.26;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1914,192,0 chrIII 205780 . G A 1893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.69;MQ0=0;QD=27.43;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1926,192,0 chrIII 205806 . A G 570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.403;DP=70;Dels=0.00;FS=6.257;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=-4.753;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.136;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,30:70:99:600,0,932 chrIII 205811 . T C 635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.472;DP=71;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-4.779;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:665,0,905 chrIII 205824 . A C 644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.295;DP=81;Dels=0.00;FS=9.163;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.57;MQ0=0;MQRankSum=-3.257;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:674,0,1002 chrIII 205857 . G C 724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.897;DP=86;Dels=0.00;FS=11.194;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.602;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.893;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,39:86:99:754,0,1040 chrIII 205870 . A T 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.512;DP=80;Dels=0.00;FS=14.857;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.849;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,39:80:99:758,0,948 chrIII 205883 . C T 742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.143;DP=82;Dels=0.00;FS=11.941;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.446;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.128;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:772,0,988 chrIII 205886 . T G 724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.041;DP=87;Dels=0.00;FS=11.050;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.057;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.583;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:754,0,1090 chrIII 206021 . A G 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;DP=74;Dels=0.00;FS=7.958;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.642;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:868,0,739 chrIII 206081 . A T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.638;DP=115;Dels=0.00;FS=10.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1221,0,1310 chrIII 206083 . A T 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;DP=115;Dels=0.00;FS=10.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.267;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1265,0,1289 chrIII 206117 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.206;DP=105;Dels=0.00;FS=5.402;HaplotypeScore=5.7497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=2.752;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.391;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1183,0,1082 chrIII 206233 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.020;DP=143;Dels=0.00;FS=3.957;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.317;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1393,0,1582 chrIII 206913 . C T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.543;DP=118;Dels=0.00;FS=10.122;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.654;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1340,0,1305 chrIII 207086 . G C 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2862,294,0 chrIII 207093 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.333;DP=108;Dels=0.00;FS=3.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1100,0,1311 chrIII 207237 . G C 1847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.104;DP=170;Dels=0.00;FS=7.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,87:170:99:1877,0,1785 chrIII 207459 . C G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=11.15;ReadPosRankSum=2.810;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1323,0,471 chrIII 207528 . G A 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.908;DP=174;Dels=0.00;FS=3.530;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.400;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,79:174:99:1788,0,1837 chrIII 207534 . G A 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.634;DP=173;Dels=0.00;FS=5.475;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.444;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,78:173:99:1750,0,1923 chrIII 207705 . T C 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.015;DP=119;Dels=0.00;FS=10.400;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.529;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:119:99:886,0,1645 chrIII 208072 . C G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.663;DP=152;Dels=0.00;FS=9.543;HaplotypeScore=2.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.048;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.080;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:152:99:1444,0,1815 chrIII 208234 . A G 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.190;DP=160;Dels=0.00;FS=1.272;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,85:160:99:1724,0,1677 chrIII 208432 . C T 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.170;DP=159;Dels=0.00;FS=16.058;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.822;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1638,0,1795 chrIII 208480 . G T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;DP=146;Dels=0.00;FS=4.944;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1460,0,1634 chrIII 208489 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.029;DP=140;Dels=0.00;FS=4.026;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.957;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1367,0,1659 chrIII 208702 . G A 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.545;DP=165;Dels=0.00;FS=0.576;HaplotypeScore=4.3200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=1.043;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,83:165:99:1820,0,1595 chrIII 208795 . C T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.459;DP=158;Dels=0.00;FS=1.272;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.629;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1544,0,1775 chrIII 208885 . G A 1936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.175;DP=168;Dels=0.00;FS=1.237;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.653;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,91:168:99:1966,0,1649 chrIII 208954 . T A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;DP=168;Dels=0.00;FS=9.373;HaplotypeScore=4.6260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.018;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.621;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,80:168:99:1555,0,1793 chrIII 209056 . T C 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.328;DP=154;Dels=0.00;FS=2.016;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.328;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1569,0,1778 chrIII 209248 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.847;DP=149;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.359;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1343,0,1681 chrIII 209260 . C G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.030;DP=143;Dels=0.00;FS=1.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.026;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1207,0,1596 chrIII 209265 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.730;DP=144;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1337,0,1611 chrIII 209380 . T A 1967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;DP=155;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,89:155:99:1997,0,1433 chrIII 209464 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.284;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=9.15;ReadPosRankSum=-2.798;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1384,0,1747 chrIII 209617 . T G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.430;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.247;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,74:162:99:1506,0,1865 chrIII 209634 . T C 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.284;DP=157;Dels=0.00;FS=2.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=1.999;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.854;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1469,0,1943 chrIII 209648 . A G 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.488;DP=164;Dels=0.00;FS=1.223;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.926;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,77:164:99:1615,0,1896 chrIII 209687 . G A 2124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=193;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=2.6548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.723;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,98:193:99:2154,0,2003 chrIII 209716 . A G 1777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.700;DP=165;Dels=0.00;FS=4.488;HaplotypeScore=5.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.653;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,82:165:99:1807,0,1913 chrIII 209758 . C T 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.381;DP=162;Dels=0.00;FS=12.062;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.787;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,74:162:99:1670,0,1896 chrIII 209805 . A G 224.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;DP=152;Dels=0.00;FS=65.528;HaplotypeScore=41.4310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:254,0,861 chrIII 209836 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.543;DP=156;Dels=0.00;FS=6.936;HaplotypeScore=3.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.792;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1087,0,1151 chrIII 209856 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;DP=133;Dels=0.02;FS=8.381;HaplotypeScore=13.5861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.889;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.524;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1253,0,1117 chrIII 209941 . G C 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3440,340,0 chrIII 210036 . T C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.390;DP=130;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.555;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1184,0,1468 chrIII 210192 . T C 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.139;DP=173;Dels=0.00;FS=4.464;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.093;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,79:173:99:1640,0,2077 chrIII 210245 . T C 1836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.955;DP=190;Dels=0.00;FS=2.529;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,91:190:99:1866,0,2079 chrIII 210262 . G A 1919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.994;DP=185;Dels=0.00;FS=9.878;HaplotypeScore=6.5147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.419;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,88:185:99:1949,0,1922 chrIII 210436 . C A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;DP=132;Dels=0.00;FS=1.532;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.429;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1303,0,1530 chrIII 210441 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.755;DP=126;Dels=0.04;FS=1.602;HaplotypeScore=10.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.093;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1185,0,1412 chrIII 210469 . T C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.845;DP=154;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=144.0647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.783;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.586;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1518,0,1805 chrIII 210599 . T C 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;DP=145;Dels=0.00;FS=3.069;HaplotypeScore=5.8666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.356;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1786,0,1425 chrIII 210635 . A G 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.421;DP=180;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=3.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,82:180:99:1664,0,2299 chrIII 210757 . G A 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.354;DP=163;Dels=0.00;FS=6.048;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.350;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,79:163:99:1742,0,1854 chrIII 211159 . T G 2120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.331;DP=204;Dels=0.00;FS=1.744;HaplotypeScore=3.0466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.325;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.991;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,106:204:99:2150,0,2220 chrIII 211348 . C T 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=28.22;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3273,325,0 chrIII 211772 . G A 2244 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=18.24;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2277,222,0 chrIII 211997 . A G 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.958;DP=160;Dels=0.00;FS=7.731;HaplotypeScore=3.8759;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.636;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,158:160:99:3420,369,0 chrIII 211998 . G C 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.173;DP=162;Dels=0.00;FS=3.939;HaplotypeScore=3.8759;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.893;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,160:162:99:3481,375,0 chrIII 212063 . G T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.286;DP=161;Dels=0.00;FS=5.680;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.97;MQ0=0;MQRankSum=-3.130;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1412,0,1588 chrIII 212264 . G T 1801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.459;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.649;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.524;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,92:175:99:1831,0,1636 chrIII 212321 . C T 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.874;DP=154;Dels=0.00;FS=5.867;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.038;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1632,0,1616 chrIII 212336 . G A 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.691;DP=162;Dels=0.00;FS=3.647;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:162:99:1655,0,1771 chrIII 212415 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.847;DP=171;Dels=0.00;FS=1.190;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,77:171:99:1612,0,2177 chrIII 212528 . A T 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.457;DP=181;Dels=0.00;FS=4.051;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.941;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.187;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,82:181:99:1829,0,2200 chrIII 212637 . T C 2622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.255;DP=230;Dels=0.00;FS=5.846;HaplotypeScore=3.8335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.022;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,129:230:99:2652,0,2167 chrIII 212942 . T C 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.543;DP=170;Dels=0.00;FS=4.533;HaplotypeScore=2.7938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.379;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,89:170:99:1872,0,1770 chrIII 213069 . T C 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.578;DP=159;Dels=0.00;FS=3.138;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.366;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1522,0,1919 chrIII 213185 . G C 1837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;DP=167;Dels=0.00;FS=1.208;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,93:167:99:1867,0,1528 chrIII 213542 . T C 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.724;DP=171;Dels=0.00;FS=2.661;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,77:171:99:1584,0,2216 chrIII 213768 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.919;DP=172;Dels=0.00;FS=5.617;HaplotypeScore=1.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=0.367;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.261;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,82:172:99:1330,0,1946 chrIII 213823 . C T 1989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.660;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=2.638;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,91:166:99:2019,0,1404 chrIII 213859 . G A 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=39.7695;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3968,376,0 chrIII 213865 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.178;DP=155;Dels=0.00;FS=7.126;HaplotypeScore=42.7533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=8.12;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1289,0,1825 chrIII 213895 . A G 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;DP=147;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=3.6416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.576;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1432,0,1743 chrIII 214135 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.787;DP=133;Dels=0.00;FS=12.621;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.452;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1451,0,1474 chrIII 214145 . A C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.287;DP=138;Dels=0.00;FS=9.197;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1494,0,1511 chrIII 214358 . T C 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.194;DP=166;Dels=0.00;FS=1.972;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.005;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,82:166:99:1644,0,1890 chrIII 214369 . T C 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.018;DP=155;Dels=0.00;FS=2.050;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1584,0,1762 chrIII 214460 . T A 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;DP=146;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=2.7747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1683,0,1578 chrIII 214574 . T C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.182;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.526;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,80:175:99:1513,0,1965 chrIII 214577 . G C 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.023;DP=176;Dels=0.00;FS=1.176;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,96:176:99:1805,0,1541 chrIII 214661 . T C 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.377;DP=154;Dels=0.00;FS=3.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.228;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1769,0,1578 chrIII 214762 . C T 4542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.826;SB=-2.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,172:174:99:4542,409,0 chrIII 215005 . G A 5011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.109;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=26.51;ReadPosRankSum=1.036;SB=-2.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,188:189:99:5011,467,0 chrIII 215029 . T C 1916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.914;DP=195;Dels=0.00;FS=5.256;HaplotypeScore=2.3002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=3.676;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,99:195:99:1946,0,2235 chrIII 215332 . C T 1483.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.721;DP=151;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=9.82;ReadPosRankSum=-3.759;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1513,0,1606 chrIII 215336 . A G 1147.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.814;DP=143;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=8.02;ReadPosRankSum=-2.910;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1177,0,1709 chrIII 215341 . A G 972.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.472;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.257;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1002,0,1803 chrIII 215344 . G A 963.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.685;DP=139;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.649;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:993,0,1793 chrIII 215487 . G T 4663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.92;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4663,460,0 chrIII 215506 . C T 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;DP=154;Dels=0.00;FS=2.053;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.527;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1748,0,1605 chrIII 215671 . T C 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.405;DP=153;Dels=0.00;FS=3.840;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:153:99:1692,0,1401 chrIII 215848 . C T 4418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.79;SB=-2.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4418,430,0 chrIII 215870 . G A 1926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.129;DP=147;Dels=0.00;FS=6.149;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:146:99:1956,0,1272 chrIII 215935 . G A 1877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.810;DP=157;Dels=0.00;FS=5.764;HaplotypeScore=2.5275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.196;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:157:99:1907,0,1450 chrIII 216042 . T C 2185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.323;DP=204;Dels=0.00;FS=1.105;HaplotypeScore=3.3884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=1;MQRankSum=-0.506;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,113:204:99:2215,0,1858 chrIII 216197 . A T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.669;DP=130;Dels=0.00;FS=5.308;HaplotypeScore=3.5597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=2.596;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1156,0,1449 chrIII 216257 . C T 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3434,331,0 chrIII 216268 . T C 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.408;DP=133;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,77:133:99:1508,0,1263 chrIII 216352 . T C 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.801;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.421;QD=10.40;ReadPosRankSum=-2.061;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1726,0,1755 chrIII 216363 . C T 1851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.583;DP=173;Dels=0.00;FS=1.330;HaplotypeScore=2.9410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.286;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,87:173:99:1881,0,1815 chrIII 216424 . G C 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.921;DP=158;Dels=0.00;FS=1.999;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.953;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1708,0,1743 chrIII 216488 . T G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.262;DP=116;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.209;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1184,0,1347 chrIII 216750 . A C 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.001;DP=112;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.233;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1083,0,1269 chrIII 216898 . C T 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.795;DP=173;Dels=0.00;FS=5.457;HaplotypeScore=7.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.317;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,86:173:99:1804,0,1653 chrIII 217031 . T G 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.921;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.873;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1442,0,1451 chrIII 217266 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.377;DP=121;Dels=0.00;FS=8.377;HaplotypeScore=2.4383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.623;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1375,0,1236 chrIII 217443 . C T 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.682;DP=130;Dels=0.00;FS=3.165;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.720;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1222,0,1534 chrIII 217455 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.645;DP=139;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.112;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1352,0,1652 chrIII 217467 . A C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;DP=125;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1280,0,1384 chrIII 218143 . C T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.460;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:1014,0,1073 chrIII 218372 . A C 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3486,346,0 chrIII 218655 . T C 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3241,331,0 chrIII 218906 . A G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.340;DP=147;Dels=0.00;FS=2.943;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.924;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1516,0,1706 chrIII 218949 . T C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.996;DP=118;Dels=0.00;FS=10.244;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1180,0,1402 chrIII 219276 . T C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.185;DP=128;Dels=0.00;FS=4.263;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.099;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1170,0,1565 chrIII 219318 . A G 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.871;DP=117;Dels=0.00;FS=2.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1146,0,1395 chrIII 219339 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.709;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.699;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1224,0,1639 chrIII 219412 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.583;DP=114;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1255,0,1284 chrIII 219477 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;DP=123;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.122;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1132,0,1497 chrIII 219561 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.667;DP=152;Dels=0.00;FS=2.192;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.322;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,66:152:99:1352,0,1915 chrIII 219723 . G C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;DP=152;Dels=0.00;FS=4.917;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=1;MQRankSum=-1.532;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.034;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1443,0,1784 chrIII 220054 . T G 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.674;DP=168;Dels=0.00;FS=10.738;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.971;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.158;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:168:99:1697,0,1744 chrIII 220080 . A G 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.874;DP=162;Dels=0.00;FS=2.806;HaplotypeScore=4.7604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.199;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,91:162:99:1840,0,1505 chrIII 220083 . T C 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.348;DP=158;Dels=0.00;FS=1.250;HaplotypeScore=7.7393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.440;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1805,0,1528 chrIII 220106 . T A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.426;DP=134;Dels=0.00;FS=5.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.565;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.756;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,77:134:99:1644,0,1267 chrIII 220112 . A G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.233;DP=131;Dels=0.00;FS=12.840;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.907;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1551,0,1197 chrIII 220158 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.015;DP=128;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.806;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1507,0,1230 chrIII 220477 . T C 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.075;DP=174;Dels=0.00;FS=1.344;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,83:174:99:1820,0,2109 chrIII 220494 . G A 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.612;DP=159;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.455;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1780,0,1726 chrIII 220550 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.106;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1330,0,1322 chrIII 220575 . A G 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.012;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.819;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1540,0,1623 chrIII 220640 . A G 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.543;DP=160;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1530,0,1818 chrIII 220866 . T C 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.560;DP=144;Dels=0.00;FS=8.770;HaplotypeScore=5.7574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.275;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1496,0,1673 chrIII 221162 . C T 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.885;DP=136;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=10.48;ReadPosRankSum=-2.043;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1455,0,1505 chrIII 221240 . C A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.265;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.209;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1133,0,1226 chrIII 221705 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.987;DP=153;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.310;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1328,0,1965 chrIII 222056 . A G 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.545;DP=166;Dels=0.00;FS=4.546;HaplotypeScore=3.4028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,87:166:99:1829,0,1732 chrIII 222227 . C G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;DP=141;Dels=0.00;FS=7.874;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.352;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:141:99:1434,0,1376 chrIII 222347 . C T 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;DP=128;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=2.7508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.597;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1677,0,1152 chrIII 222524 . G T 3960.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3960,379,0 chrIII 222776 . A G 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.815;DP=159;Dels=0.00;FS=2.013;HaplotypeScore=6.0182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,75:159:99:1611,0,1865 chrIII 223280 . A G 2023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.343;DP=161;Dels=0.00;FS=5.828;HaplotypeScore=4.9530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.391;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,99:161:99:2053,0,1334 chrIII 223523 . A T 5046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=28.19;SB=-2.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:5046,508,0 chrIII 223676 . T C 4534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=25.62;SB=-2.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4534,448,0 chrIII 224009 . A G 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3837,376,0 chrIII 224025 . G A 1889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.633;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.050;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,87:156:99:1919,0,1394 chrIII 224038 . C T 4209.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4209,421,0 chrIII 224288 . A G 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.938;DP=154;Dels=0.00;FS=4.041;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.713;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1124,0,1687 chrIII 224437 . T C 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.741;DP=137;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.410;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1314,0,1647 chrIII 224491 . T C 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.925;DP=160;Dels=0.00;FS=8.119;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.915;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1663,0,1794 chrIII 224492 . A G 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.140;DP=160;Dels=0.00;FS=6.875;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.70;ReadPosRankSum=2.094;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1582,0,1814 chrIII 224594 . C T 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.021;DP=151;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=12.2220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=1;MQRankSum=0.090;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.289;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1635,0,1581 chrIII 224619 . T C 1636.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.343;DP=160;Dels=0.00;FS=4.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=1;MQRankSum=-0.632;QD=10.23;ReadPosRankSum=3.083;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1666,0,1611 chrIII 224620 . A G 1652.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.458;DP=160;Dels=0.00;FS=4.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=1;MQRankSum=0.174;QD=10.33;ReadPosRankSum=3.083;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1682,0,1608 chrIII 224623 . T C 1712.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;DP=155;Dels=0.00;FS=9.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=1;MQRankSum=0.625;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.645;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1742,0,1527 chrIII 224674 . T G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.047;DP=135;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=4.3804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=1;MQRankSum=-1.366;QD=9.47;ReadPosRankSum=-2.167;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:135:99:1308,0,1462 chrIII 224795 . A G 505.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=131;Dels=0.00;FS=40.217;HaplotypeScore=89.4589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQ0=0;MQRankSum=3.264;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.797;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:535,0,1824 chrIII 224821 . T C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.256;DP=146;Dels=0.00;FS=4.383;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.07;MQ0=0;MQRankSum=-3.835;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1201,0,1815 chrIII 224846 . T C 2188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.676;DP=195;Dels=0.00;FS=6.298;HaplotypeScore=2.3883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=5.563;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.877;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,103:195:99:2218,0,1871 chrIII 224861 . T G 5112.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7418;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.521;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,196:198:99:5112,502,0 chrIII 224874 . T A 1893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.010;DP=201;Dels=0.00;FS=6.022;HaplotypeScore=6.3872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.220;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,95:201:99:1923,0,2404 chrIII 224924 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.421;DP=149;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=1;MQRankSum=-1.108;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1616,0,1671 chrIII 224961 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.287;DP=121;Dels=0.00;FS=2.345;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=1;MQRankSum=-1.301;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.570;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1248,0,1420 chrIII 224994 . C T 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.878;DP=160;Dels=0.00;FS=6.959;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=1;MQRankSum=0.505;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1721,0,1721 chrIII 225006 . T C 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.951;DP=167;Dels=0.00;FS=11.934;HaplotypeScore=8.7922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=1;MQRankSum=-2.074;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.177;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,81:167:99:1746,0,1872 chrIII 225042 . C T 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.008;DP=122;Dels=0.00;FS=3.307;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.870;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.646;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1482,0,1262 chrIII 225051 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.476;DP=132;Dels=0.00;FS=4.213;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1473,0,1482 chrIII 225088 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.270;DP=140;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.147;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1353,0,1789 chrIII 225116 . G C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.918;DP=155;Dels=0.00;FS=5.940;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.342;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,62:155:99:1336,0,2074 chrIII 225143 . G C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.312;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=7.64;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,68:163:99:1276,0,2105 chrIII 225150 . A T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;DP=158;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,63:158:99:1302,0,2248 chrIII 225173 . G C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.993;DP=134;Dels=0.00;FS=2.280;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-3.933;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,52:134:99:952,0,1921 chrIII 225180 . G C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.505;DP=135;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-3.539;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.876;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,49:135:99:892,0,1981 chrIII 225200 . G T 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.014;DP=137;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.715;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.424;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,50:137:99:1027,0,1936 chrIII 225234 . A G 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;DP=119;Dels=0.00;FS=1.653;HaplotypeScore=5.5127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.267;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:119:99:1054,0,1596 chrIII 225256 . C G 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.705;DP=129;Dels=0.00;FS=1.557;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.795;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:129:99:1050,0,1703 chrIII 225343 . T A 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.6314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3360,322,0 chrIII 225558 . G C 1967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;DP=186;Dels=0.00;FS=2.555;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.792;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,98:186:99:1997,0,1871 chrIII 225710 . T C 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.764;DP=177;Dels=0.00;FS=1.183;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,93:177:99:1797,0,1823 chrIII 225718 . T C 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.037;DP=181;Dels=0.00;FS=1.842;HaplotypeScore=3.3884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.328;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,91:181:99:1824,0,1983 chrIII 226057 . T C 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;DP=140;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.774;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1573,0,1396 chrIII 226510 . C T 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.553;DP=188;Dels=0.00;FS=0.543;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.707;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,85:188:99:1751,0,2152 chrIII 226628 . T C 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.476;DP=166;Dels=0.00;FS=3.634;HaplotypeScore=4.7680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,74:166:99:1442,0,2014 chrIII 226701 . C G 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;DP=147;Dels=0.00;FS=13.188;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.584;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1678,0,1514 chrIII 226744 . T C 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.656;DP=148;Dels=0.00;FS=9.459;HaplotypeScore=3.3098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.426;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1681,0,1491 chrIII 226753 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.410;DP=145;Dels=0.00;FS=8.192;HaplotypeScore=2.6912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1477,0,1469 chrIII 226774 . T C 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.438;DP=150;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.453;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1646,0,1582 chrIII 227113 . G A 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.148;DP=150;Dels=0.00;FS=2.070;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.906;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1632,0,1595 chrIII 227116 . C T 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.975;DP=144;Dels=0.00;FS=4.027;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.696;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1621,0,1453 chrIII 227463 . C A 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.065;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=8.22;ReadPosRankSum=2.378;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,40:101:99:860,0,879 chrIII 227570 . G A 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3099,307,0 chrIII 227581 . A T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;DP=118;Dels=0.00;FS=3.433;HaplotypeScore=5.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.261;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1495,0,1130 chrIII 227763 . C A 4680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=1;QD=28.02;SB=-2.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4680,448,0 chrIII 227830 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.947;DP=149;Dels=0.00;FS=15.130;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=8.51;ReadPosRankSum=-3.471;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1298,0,1850 chrIII 227862 . C A 120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;DP=163;Dels=0.00;FS=2.128;HaplotypeScore=12.9186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.45;MQ0=0;MQRankSum=-4.584;QD=0.74;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:163:99:150,0,1853 chrIII 227873 . G A 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.103;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=-5.121;QD=9.32;ReadPosRankSum=3.053;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:170:99:1614,0,1985 chrIII 227897 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.033;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.53;MQ0=0;MQRankSum=-5.209;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1495,0,1153 chrIII 228130 . C T 4712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=28.56;SB=-2.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4712,472,0 chrIII 228291 . C A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.728;DP=142;Dels=0.00;FS=3.005;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=2.101;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.636;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1508,0,1543 chrIII 228338 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.972;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=9.80;ReadPosRankSum=-2.678;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1578,0,1778 chrIII 228554 . T C 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.573;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,87:197:99:1747,0,2534 chrIII 228632 . T C 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.724;DP=153;Dels=0.00;FS=4.943;HaplotypeScore=5.6427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.740;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1490,0,1869 chrIII 228849 . T C 1994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.639;DP=173;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=3.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.538;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,89:173:99:2024,0,1906 chrIII 229023 . C T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.903;DP=129;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=1.821;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1079,0,1099 chrIII 229345 . T G 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=118;Dels=0.00;FS=3.661;HaplotypeScore=5.5191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.016;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,69:118:99:1521,0,785 chrIII 229627 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.936;DP=122;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=-0.936;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.806;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1260,0,1353 chrIII 230047 . C T 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.636;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,82:165:99:1682,0,1731 chrIII 230267 . A G 4559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.51;SB=-2.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4559,439,0 chrIII 230329 . T C 1792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.685;DP=145;Dels=0.00;FS=5.021;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1822,0,1395 chrIII 230467 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.120;DP=137;Dels=0.01;FS=0.640;HaplotypeScore=16.3820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=10.45;ReadPosRankSum=-2.519;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1461,0,1437 chrIII 230560 . A G 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.664;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:139:99:1586,0,1137 chrIII 230773 . G A 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.424;DP=149;Dels=0.00;FS=4.337;HaplotypeScore=4.6161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.018;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.345;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1778,0,1441 chrIII 231858 . G T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=28.08;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3285,325,0 chrIII 231898 . T C 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.857;DP=151;Dels=0.00;FS=9.873;HaplotypeScore=5.9654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.251;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1550,0,1669 chrIII 232177 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.442;DP=125;Dels=0.00;FS=4.471;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.164;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1168,0,1507 chrIII 232201 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.006;DP=112;Dels=0.00;FS=7.524;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.059;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.921;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1396,0,1080 chrIII 232215 . G A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.195;DP=135;Dels=0.00;FS=2.283;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=11.33;ReadPosRankSum=2.234;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1560,0,1390 chrIII 232537 . C T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.682;DP=118;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.316;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1187,0,1376 chrIII 232820 . G A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.644;DP=128;Dels=0.00;FS=2.244;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1142,0,1709 chrIII 232890 . C T 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.195;DP=159;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.191;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1575,0,1847 chrIII 232933 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.992;DP=141;Dels=0.00;FS=3.306;HaplotypeScore=3.1000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.497;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1412,0,1601 chrIII 233158 . G T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.970;DP=127;Dels=0.00;FS=11.604;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.403;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1368,0,1419 chrIII 233164 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.539;DP=123;Dels=0.00;FS=17.956;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.554;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.776;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:123:99:1216,0,1455 chrIII 233360 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.210;DP=126;Dels=0.00;FS=3.264;HaplotypeScore=3.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=9.57;ReadPosRankSum=-2.078;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1236,0,1548 chrIII 233380 . A T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;DP=125;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1071,0,1683 chrIII 233404 . C A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.647;DP=132;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=2.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.628;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1060,0,1680 chrIII 233654 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.091;DP=157;Dels=0.00;FS=12.496;HaplotypeScore=3.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1469,0,1912 chrIII 233678 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.772;DP=151;Dels=0.00;FS=8.552;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,63:151:99:1332,0,1978 chrIII 233773 . A G 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.230;DP=179;Dels=0.00;FS=8.089;HaplotypeScore=22.8633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQ0=0;MQRankSum=-6.577;QD=0.27;ReadPosRankSum=-2.118;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,20:179:79:79,0,3808 chrIII 233783 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.174;DP=177;Dels=0.00;FS=9.114;HaplotypeScore=46.7733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=7.84;ReadPosRankSum=2.146;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,69:177:99:1417,0,2370 chrIII 233793 . C T 337.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.621;DP=179;Dels=0.00;FS=20.560;HaplotypeScore=85.4259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=0;MQRankSum=-5.158;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.295;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,30:179:99:367,0,3429 chrIII 233797 . A C 257.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.266;DP=183;Dels=0.00;FS=12.720;HaplotypeScore=95.5268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQ0=0;MQRankSum=-5.564;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.039;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,32:183:99:287,0,3644 chrIII 233803 . A G 2108.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.703;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=146.2049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.010;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.273;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,104:193:99:2138,0,1878 chrIII 233807 . G T 442.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;DP=189;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=115.3258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQ0=0;MQRankSum=-7.396;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.037;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,41:189:99:472,0,3423 chrIII 233808 . G A 488.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.276;DP=184;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=88.4846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.06;MQ0=0;MQRankSum=-7.156;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.772;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,42:184:99:518,0,3208 chrIII 233813 . A G 1956.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.976;DP=181;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=135.0121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.03;MQ0=0;MQRankSum=-4.991;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,100:181:99:1986,0,1738 chrIII 233823 . C T 681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.249;DP=176;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=51.3686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=3.87;ReadPosRankSum=-3.400;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,42:176:99:711,0,2824 chrIII 233910 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.683;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.876;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1278,0,1745 chrIII 233911 . C T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.655;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.710;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1294,0,1640 chrIII 233941 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.014;DP=136;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.259;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1452,0,1496 chrIII 234004 . T A 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.259;DP=134;Dels=0.00;FS=2.194;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1452,0,1523 chrIII 234551 . A G 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3371,334,0 chrIII 234608 . G A 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.434;DP=113;Dels=0.00;FS=7.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.716;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1159,0,1300 chrIII 234617 . G C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;DP=119;Dels=0.00;FS=7.055;HaplotypeScore=3.8092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.432;QD=9.81;ReadPosRankSum=-2.671;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1197,0,1255 chrIII 234626 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.124;DP=112;Dels=0.00;FS=5.908;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=10.01;ReadPosRankSum=-3.219;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1151,0,1257 chrIII 234679 . T A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.401;DP=132;Dels=0.00;FS=7.903;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.958;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.750;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1361,0,1534 chrIII 234688 . G A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.020;DP=118;Dels=0.00;FS=10.302;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQ0=0;MQRankSum=-3.075;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.269;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1181,0,1355 chrIII 234696 . T G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.246;DP=106;Dels=0.00;FS=6.062;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.779;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1137,0,1167 chrIII 234792 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.562;DP=117;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=1;MQRankSum=-0.450;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.085;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1331,0,1251 chrIII 234883 . C A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;DP=104;Dels=0.00;FS=2.743;HaplotypeScore=18.9261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=-4.601;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,62:104:99:1407,0,896 chrIII 234928 . T C 667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.354;DP=116;Dels=0.01;FS=7.244;HaplotypeScore=4.8886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQ0=0;MQRankSum=-4.958;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:697,0,1176 chrIII 235062 . C T 1475.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.222;DP=130;Dels=0.00;FS=4.328;HaplotypeScore=5.1281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.527;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.489;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1505,0,1207 chrIII 235065 . C T 1388.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.729;DP=138;Dels=0.00;FS=7.807;HaplotypeScore=6.1070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.740;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.870;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1418,0,1319 chrIII 235070 . G T 1381.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.106;DP=127;Dels=0.00;FS=2.288;HaplotypeScore=2.6616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.134;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1411,0,1277 chrIII 235153 . G A 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.547;DP=168;Dels=0.00;FS=3.555;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,88:168:99:1714,0,1702 chrIII 235155 . T C 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=172;Dels=0.00;FS=3.505;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.328;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,90:172:99:1713,0,1806 chrIII 235472 . A G 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3105,321,0 chrIII 235561 . T A 1941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.729;DP=133;Dels=0.00;FS=6.870;HaplotypeScore=4.1684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.255;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,85:133:99:1971,0,970 chrIII 235639 . T A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;DP=113;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.549;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1461,0,1038 chrIII 235645 . T C 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.883;DP=140;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=7.4575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=11.92;ReadPosRankSum=-2.205;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1699,0,1337 chrIII 235669 . C T 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.991;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1581,0,1063 chrIII 236284 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.787;DP=138;Dels=0.00;FS=6.425;HaplotypeScore=2.9458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.301;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1220,0,1703 chrIII 236387 . G A 4477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4477,418,0 chrIII 236451 . G A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.318;DP=149;Dels=0.00;FS=2.116;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:1465,0,1806 chrIII 236702 . C A 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.246;DP=149;Dels=0.00;FS=3.837;HaplotypeScore=6.9426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.401;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1650,0,1559 chrIII 236789 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.893;DP=129;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=22.0586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.789;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1227,0,213 chrIII 236969 . A G 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.758;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=10.69;ReadPosRankSum=-2.002;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,87:162:99:1761,0,1674 chrIII 237018 . A G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=125;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.914;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,76:125:99:1675,0,1040 chrIII 237321 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.668;DP=120;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.972;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1534,0,1040 chrIII 237610 . T A 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;DP=153;Dels=0.00;FS=4.894;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.652;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1782,0,1649 chrIII 237645 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1592,0,1313 chrIII 237732 . T C 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;DP=141;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:141:99:1620,0,1452 chrIII 237960 . G A 1979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.001;DP=153;Dels=0.00;FS=7.332;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.565;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,89:152:99:2009,0,1270 chrIII 238082 . T C 4265.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=24.80;SB=-2.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:172:99:4265,427,0 chrIII 238260 . G A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.965;DP=145;Dels=0.00;FS=3.998;HaplotypeScore=5.7588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.344;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,61:145:99:1168,0,1785 chrIII 238350 . C T 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.610;DP=159;Dels=0.00;FS=1.970;HaplotypeScore=7.5010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.877;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1797,0,1662 chrIII 238359 . C T 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.386;DP=149;Dels=0.00;FS=3.831;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.556;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1660,0,1532 chrIII 238562 . A G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.272;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:1341,0,1813 chrIII 238725 . T C 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.730;DP=152;Dels=0.00;FS=3.804;HaplotypeScore=2.7244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.595;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1327,0,1810 chrIII 238947 . T C 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.694;DP=139;Dels=0.00;FS=2.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=12.78;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,79:139:99:1806,0,1314 chrIII 238995 . C T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.654;DP=162;Dels=0.00;FS=1.250;HaplotypeScore=2.8736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,74:162:99:1562,0,2002 chrIII 239394 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.265;DP=141;Dels=0.00;FS=2.113;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.656;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1489,0,1578 chrIII 239437 . C T 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.130;DP=149;Dels=0.00;FS=2.968;HaplotypeScore=2.8535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=11.52;ReadPosRankSum=-2.336;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1746,0,1513 chrIII 239515 . A G 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3479,355,0 chrIII 239924 . G A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.398;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=2.447;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.842;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1372,0,1419 chrIII 239957 . T C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.447;DP=135;Dels=0.00;FS=3.105;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.446;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1396,0,1564 chrIII 240075 . C A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.700;DP=124;Dels=0.00;FS=5.565;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.325;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1251,0,1425 chrIII 240280 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.865;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.974;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1350,0,1056 chrIII 240337 . C T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.877;DP=103;Dels=0.00;FS=7.707;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1247,0,1115 chrIII 240607 . G A 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.264;DP=149;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.118;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1737,0,1443 chrIII 240608 . T A 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;DP=149;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1693,0,1498 chrIII 240903 . C T 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.446;DP=142;Dels=0.00;FS=5.127;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1325,0,1617 chrIII 240922 . T C 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3819,382,0 chrIII 241007 . T C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.767;DP=129;Dels=0.00;FS=6.699;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.611;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1293,0,1541 chrIII 241156 . G A 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3741,373,0 chrIII 241573 . A G 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;DP=155;Dels=0.00;FS=4.841;HaplotypeScore=6.3543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.356;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1513,0,1859 chrIII 241753 . T C 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.983;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.824;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1725,0,1723 chrIII 241804 . C A 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.029;DP=168;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=3.9555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.420;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,77:168:99:1641,0,2046 chrIII 241930 . A T 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;DP=179;Dels=0.00;FS=2.647;HaplotypeScore=7.7969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.607;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,86:179:99:1769,0,2102 chrIII 241995 . G A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.291;DP=141;Dels=0.00;FS=7.642;HaplotypeScore=6.5999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=10.60;ReadPosRankSum=-2.540;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1525,0,1516 chrIII 242071 . C T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.604;DP=133;Dels=0.00;FS=7.823;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=2.258;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.349;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1651,0,1362 chrIII 242088 . T A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;DP=134;Dels=0.00;FS=7.797;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.545;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1352,0,1612 chrIII 242137 . G A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.956;DP=109;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.212;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1144,0,1231 chrIII 242143 . A G 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.539;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1144,0,1390 chrIII 242230 . A T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;DP=95;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.210;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1251,0,894 chrIII 242239 . A G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.493;DP=103;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.138;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:103:99:1390,0,902 chrIII 242251 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.026;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:107:99:1303,0,973 chrIII 242407 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.690;DP=119;Dels=0.00;FS=4.854;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1228,0,1459 chrIII 242483 . G A 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.954;DP=83;Dels=0.00;FS=2.531;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:795,0,529 chrIII 242723 . C T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.878;DP=141;Dels=0.00;FS=10.418;HaplotypeScore=2.3249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.666;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1504,0,1562 chrIII 242777 . T A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.231;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.650;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1408,0,1780 chrIII 242882 . A G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.310;DP=147;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=2.137;QD=9.15;ReadPosRankSum=2.067;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1375,0,1812 chrIII 242917 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.644;DP=128;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.760;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.534;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1481,0,1281 chrIII 243218 . C G 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.087;DP=169;Dels=0.00;FS=1.951;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.770;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:169:99:1672,0,1808 chrIII 243219 . G A 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.903;DP=171;Dels=0.00;FS=2.728;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.450;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,82:171:99:1701,0,1867 chrIII 243289 . A G 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.719;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.703;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1526,0,1402 chrIII 243734 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.348;DP=137;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=20.1750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.123;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1290,0,1524 chrIII 243779 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.785;DP=138;Dels=0.00;FS=13.949;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.133;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1512,0,1638 chrIII 243794 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.284;DP=133;Dels=0.00;FS=14.266;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.466;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1285,0,1641 chrIII 243914 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.095;DP=132;Dels=0.00;FS=3.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1321,0,1632 chrIII 243928 . T A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.953;DP=123;Dels=0.00;FS=5.639;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1249,0,1561 chrIII 243959 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;DP=120;Dels=0.00;FS=8.972;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=9.61;ReadPosRankSum=2.531;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1183,0,1545 chrIII 244093 . A G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.836;DP=134;Dels=0.00;FS=17.202;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.560;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1230,0,1662 chrIII 244604 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.936;DP=112;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=12.78;ReadPosRankSum=1.363;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1461,0,1004 chrIII 244643 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;DP=104;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,62:104:99:1333,0,919 chrIII 244888 . T C 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.461;DP=91;Dels=0.00;FS=0.881;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.160;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:996,0,1024 chrIII 245054 . G A 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.012;DP=106;Dels=0.00;FS=2.141;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.716;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1179,0,1098 chrIII 245066 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.338;DP=133;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1419,0,1482 chrIII 245276 . T C 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.568;DP=116;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.532;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1277,0,1254 chrIII 245396 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.662;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=3.4053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1302,0,1186 chrIII 245631 . C A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.654;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.218;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1399,0,1370 chrIII 245687 . C T 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.347;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=0.212;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.093;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1719,0,1431 chrIII 245888 . T C 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.967;DP=137;Dels=0.00;FS=1.358;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.032;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1638,0,1336 chrIII 246171 . G A 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1693,0,1402 chrIII 246183 . C A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.187;DP=130;Dels=0.00;FS=5.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1476,0,1357 chrIII 246581 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=1;MQRankSum=-0.415;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.285;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1318,0,1227 chrIII 246789 . C A 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;DP=91;Dels=0.00;FS=10.634;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:801,0,1158 chrIII 246813 . T G 2443 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2476,246,0 chrIII 246818 . T A 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2739,268,0 chrIII 246853 . G A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3261,307,0 chrIII 247156 . C A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.056;DP=141;Dels=0.00;FS=2.990;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.600;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1286,0,1703 chrIII 247183 . G A 1985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.502;DP=166;Dels=0.00;FS=1.212;HaplotypeScore=4.3995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.273;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,91:166:99:2015,0,1519 chrIII 247418 . A G 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.749;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=0.678;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.871;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1617,0,1685 chrIII 247472 . C T 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.608;DP=136;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=1.543;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1508,0,1381 chrIII 248057 . A G 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.07;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3005,309,0 chrIII 248549 . C T 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;DP=125;Dels=0.00;FS=3.252;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.067;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1222,0,1511 chrIII 249146 . G A 1995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.568;DP=190;Dels=0.00;FS=6.613;HaplotypeScore=4.9718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,88:190:99:2025,0,2144 chrIII 249285 . A C 935.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.838;DP=129;Dels=0.00;FS=12.791;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.238;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:965,0,1649 chrIII 249286 . C T 927.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.648;DP=123;Dels=0.00;FS=9.254;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.281;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.953;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:123:99:957,0,1573 chrIII 249290 . C A 985.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.987;DP=121;Dels=0.00;FS=4.954;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.526;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.312;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1015,0,1602 chrIII 249499 . C G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;DP=117;Dels=0.00;FS=5.896;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.730;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:117:99:1148,0,1344 chrIII 249541 . C G 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3170,321,0 chrIII 249797 . C A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.423;DP=149;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=4.8145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.744;QD=9.30;ReadPosRankSum=2.235;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1415,0,1656 chrIII 249887 . A T 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;DP=146;Dels=0.00;FS=5.052;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1545,0,1653 chrIII 249898 . A G 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.601;DP=147;Dels=0.00;FS=10.050;HaplotypeScore=2.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1583,0,1496 chrIII 249971 . G A 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.416;DP=144;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.879;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1564,0,1575 chrIII 249994 . C A 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.361;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.149;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1452,0,1482 chrIII 250185 . T A 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=107;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=9.8985;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.052;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2690,259,0 chrIII 250253 . T A 2378 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2411,231,0 chrIII 250855 . A G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.782;DP=144;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=8.78;ReadPosRankSum=-2.079;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1295,0,1854 chrIII 250886 . C T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;DP=128;Dels=0.00;FS=2.284;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1737,0,1185 chrIII 251092 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.762;DP=120;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.667;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1167,0,1295 chrIII 251323 . A G 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.129;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.357;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,88:179:99:1843,0,2051 chrIII 251657 . T C 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.048;DP=157;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1575,0,1815 chrIII 251939 . A G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.186;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1262,0,1867 chrIII 251945 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.552;DP=153;Dels=0.00;FS=2.015;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1466,0,1924 chrIII 252079 . C T 1933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.211;DP=180;Dels=0.00;FS=8.690;HaplotypeScore=4.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.552;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,90:180:99:1963,0,1871 chrIII 252128 . T C 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.152;DP=177;Dels=0.00;FS=1.878;HaplotypeScore=5.1279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=9.47;ReadPosRankSum=2.286;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,85:177:99:1707,0,2072 chrIII 252239 . A C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.902;DP=134;Dels=0.00;FS=3.277;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1500,0,1262 chrIII 252242 . A C 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.584;DP=133;Dels=0.00;FS=2.292;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1538,0,1237 chrIII 252269 . A G 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.629;DP=150;Dels=0.00;FS=4.020;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.106;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,85:150:99:1769,0,1379 chrIII 252345 . G A 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.162;DP=138;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1589,0,1349 chrIII 252377 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.802;DP=122;Dels=0.00;FS=4.555;HaplotypeScore=4.2148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.110;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1260,0,1404 chrIII 252425 . A G 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.584;DP=142;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1429,0,1593 chrIII 252633 . A G 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.580;DP=148;Dels=0.00;FS=6.207;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1686,0,1579 chrIII 252801 . C T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.436;DP=129;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=3.8016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.885;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.666;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1478,0,1199 chrIII 253015 . G T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.483;DP=173;Dels=0.00;FS=1.902;HaplotypeScore=6.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,69:173:99:1415,0,2277 chrIII 253084 . G A 2091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.594;DP=187;Dels=0.00;FS=10.950;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.656;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,100:187:99:2121,0,1902 chrIII 253152 . A G 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.417;DP=143;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=2.5640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.324;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1681,0,1502 chrIII 253483 . G C 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.057;DP=144;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.463;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1705,0,1253 chrIII 253504 . C T 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;DP=164;Dels=0.00;FS=1.958;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:1742,0,1799 chrIII 253507 . T A 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.406;DP=165;Dels=0.00;FS=1.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,82:165:99:1821,0,1826 chrIII 253696 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.229;DP=160;Dels=0.00;FS=1.243;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,71:160:99:1498,0,1948 chrIII 253903 . C T 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.752;DP=144;Dels=0.00;FS=2.993;HaplotypeScore=2.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.777;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1620,0,1515 chrIII 253963 . C T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.959;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.240;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,73:182:99:1477,0,2517 chrIII 254180 . C T 1982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.363;DP=182;Dels=0.00;FS=1.183;HaplotypeScore=2.3135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=2.441;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.480;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,92:182:99:2012,0,1941 chrIII 254370 . G A 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.372;DP=122;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1528,0,1163 chrIII 254374 . A G 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.697;DP=131;Dels=0.00;FS=3.346;HaplotypeScore=3.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1682,0,1234 chrIII 254715 . G A 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.921;DP=149;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.631;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1685,0,1563 chrIII 254941 . T A 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=153;Dels=0.00;FS=5.221;HaplotypeScore=4.5435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1652,0,1681 chrIII 254947 . G T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.927;DP=146;Dels=0.00;FS=2.326;HaplotypeScore=4.8043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.131;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1370,0,1599 chrIII 254961 . T C 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.204;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1315,0,1518 chrIII 255126 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.374;DP=115;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=8.35;ReadPosRankSum=2.958;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,48:115:99:990,0,1607 chrIII 255150 . C T 705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.483;DP=92;Dels=0.00;FS=1.906;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.446;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:735,0,1278 chrIII 255168 . A G 522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;DP=82;Dels=0.00;FS=10.220;HaplotypeScore=4.0352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=6.37;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,29:82:99:552,0,962 chrIII 255246 . C T 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.325;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=13.26;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1621,0,1078 chrIII 255699 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.782;DP=154;Dels=0.00;FS=3.017;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.409;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1654,0,1745 chrIII 255891 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.624;DP=141;Dels=0.00;FS=11.138;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=10.01;ReadPosRankSum=2.487;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1442,0,1589 chrIII 256521 . G A 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.005;DP=152;Dels=0.00;FS=3.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1621,0,1649 chrIII 257049 . T C 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2859,288,0 chrIII 257205 . A C 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3580,367,0 chrIII 257455 . T C 4269.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4269,424,0 chrIII 257484 . C T 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.412;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=27.00;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,127:129:99:3483,302,0 chrIII 257531 . C G 3898.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3898,400,0 chrIII 257592 . T G 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3379,346,0 chrIII 257960 . T C 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3563,372,0 chrIII 258066 . T C 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3553,343,0 chrIII 258276 . C T 3778.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=141;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3778,376,0 chrIII 258306 . G C 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3742,379,0 chrIII 258334 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.886;DP=129;Dels=0.00;FS=6.453;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.194;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1381,0,1509 chrIII 258477 . G A 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3860,364,0 chrIII 258579 . T C 4020.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4020,409,0 chrIII 258780 . T G 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3990,400,0 chrIII 258781 . T C 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:3877,385,0 chrIII 258847 . A G 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3338,351,0 chrIII 258915 . G A 5108.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:5108,508,0 chrIII 259351 . G A 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2905,280,0 chrIII 259489 . A G 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.15;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3053,304,0 chrIII 259496 . T C 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.33;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3257,327,0 chrIII 259724 . T C 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3503,351,0 chrIII 259975 . G A 2583 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1428;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.78;MQ0=0;QD=21.71;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2616,261,0 chrIII 260010 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.492;DP=169;Dels=0.00;FS=6.788;HaplotypeScore=22.1681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,96:169:99:1308,0,800 chrIII 260698 . A C 3871.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.07;SB=-2.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3871,399,0 chrIII 261281 . C T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.270;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.017;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1386,0,1519 chrIII 261312 . G A 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2199;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3535,343,0 chrIII 261331 . A G 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3282,342,0 chrIII 262105 . C T 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.064;DP=136;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.91;MQ0=0;MQRankSum=4.379;QD=22.98;ReadPosRankSum=5.095;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,122:136:99:3158,220,0 chrIII 262154 . C T 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.0584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;QD=22.83;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2796,282,0 chrIII 262264 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.750;DP=128;Dels=0.00;FS=5.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1360,0,1447 chrIII 262377 . C A 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.130;DP=144;Dels=0.00;FS=23.222;HaplotypeScore=2.8424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.762;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1809,0,1331 chrIII 262717 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.943;DP=125;Dels=0.00;FS=15.112;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.191;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1200,0,1427 chrIII 262823 . G A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.302;DP=100;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.331;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1110,0,1093 chrIII 262830 . T G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.599;DP=100;Dels=0.00;FS=4.055;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.135;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1060,0,1160 chrIII 263029 . A G 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3495,337,0 chrIII 263282 . C T 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;DP=116;Dels=0.00;FS=2.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.532;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1400,0,1086 chrIII 263356 . A G 1509.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-7.468;DP=142;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=69.5679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-5.351e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:78,64:142:19:1542,19,0 chrIII 263484 . A G 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.604;DP=122;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=2.5525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:122:99:976,0,1636 chrIII 263790 . A C 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7588;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3089,306,0 chrIII 263883 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.565;DP=110;Dels=0.00;FS=3.662;HaplotypeScore=4.7647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=1.458;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.691;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1287,0,1122 chrIII 264135 . A T 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.92;MQ0=0;QD=28.76;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2823,277,0 chrIII 264244 . T G 769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.078;DP=109;Dels=0.00;FS=2.506;HaplotypeScore=104.6818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.17;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=7.06;ReadPosRankSum=4.135;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:78:799,0,78 chrIII 264282 . C T 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.77;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3585,361,0 chrIII 264441 . A G 5148.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.3073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=24.63;SB=-2.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5148,505,0 chrIII 264462 . A T 1904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.851;DP=197;Dels=0.00;FS=2.737;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,89:197:99:1934,0,2347 chrIII 264610 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.353;DP=136;Dels=0.00;FS=6.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.063;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,59:136:99:1278,0,1712 chrIII 264634 . G A 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.74;MQ0=0;QD=29.16;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3383,331,0 chrIII 264642 . T C 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=0;QD=27.47;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3137,321,0 chrIII 264655 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.888;DP=123;Dels=0.00;FS=0.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.883;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1189,0,1461 chrIII 264887 . T C 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3348,339,0 chrIII 265045 . C T 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.636;DP=169;Dels=0.00;FS=0.565;HaplotypeScore=5.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.832;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,85:169:99:1774,0,1770 chrIII 265091 . T C 4279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4279,430,0 chrIII 265240 . T C 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3325,345,0 chrIII 265458 . C T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.547;DP=152;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=3.4758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.423;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1676,0,1600 chrIII 265550 . G C 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.184;DP=148;Dels=0.00;FS=2.095;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=1.240;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.236;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1789,0,1387 chrIII 265580 . T C 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.256;DP=158;Dels=0.00;FS=4.983;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=1;MQRankSum=0.785;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.244;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1580,0,1790 chrIII 265650 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;DP=132;Dels=0.00;FS=11.225;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.974;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1136,0,1690 chrIII 266048 . C T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.481;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1021,0,1074 chrIII 266282 . C T 2401 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=16.67;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:2434,243,0 chrIII 266283 . G C 2419 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=16.80;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:2452,249,0 chrIII 266399 . C G 4192.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=26.87;SB=-2.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4192,415,0 chrIII 266967 . T G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.062;DP=150;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.316;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1276,0,1822 chrIII 267154 . C G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;DP=165;Dels=0.00;FS=3.614;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.175;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1448,0,1969 chrIII 267157 . A G 4251.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.15;SB=-2.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4251,424,0 chrIII 267200 . A G 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.799;DP=187;Dels=0.00;FS=5.293;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,89:187:99:1817,0,2201 chrIII 267523 . T C 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.385;DP=179;Dels=0.00;FS=2.610;HaplotypeScore=4.6380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.299;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,88:179:99:1850,0,2069 chrIII 267542 . C T 4978.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34;SB=-2.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4978,478,0 chrIII 267603 . A G 1911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.789;DP=167;Dels=0.00;FS=10.469;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.015;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,92:167:99:1941,0,1640 chrIII 267682 . T C 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.999;DP=149;Dels=0.00;FS=7.883;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.766;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1592,0,1600 chrIII 267793 . C G 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3702,381,0 chrIII 267909 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.949;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.094;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.263;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,76:175:99:1529,0,2132 chrIII 268066 . C A 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.055;DP=127;Dels=0.00;FS=2.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.948;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1562,0,1212 chrIII 269056 . G A 604.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.132;DP=193;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=3.3286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.13;MQ0=48;MQRankSum=-0.430;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.486;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,79:193:99:634,0,864 chrIII 269298 . A T 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;DP=153;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1608,0,1745 chrIII 269319 . C T 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;DP=146;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.606;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1735,0,1498 chrIII 269359 . T C 1864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.689;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.369;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:163:99:1894,0,1594 chrIII 269369 . T A 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.252;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1732,0,1464 chrIII 269637 . T C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.935;DP=150;Dels=0.00;FS=3.107;HaplotypeScore=5.7367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.492;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,57:150:99:997,0,2110 chrIII 269640 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.539;DP=148;Dels=0.00;FS=4.169;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.465;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,57:148:99:1093,0,1939 chrIII 269744 . T A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;DP=161;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.509;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1717,0,1871 chrIII 269932 . C T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.178;DP=140;Dels=0.00;FS=4.321;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1254,0,1751 chrIII 270052 . C T 142.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.359;DP=147;Dels=0.00;FS=17.503;HaplotypeScore=3.5956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.67;MQ0=0;MQRankSum=-4.785;QD=0.97;ReadPosRankSum=-1.658;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,26:147:99:172,0,2697 chrIII 270055 . G A 120.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.655;DP=151;Dels=0.00;FS=18.201;HaplotypeScore=3.5956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=-4.248;QD=0.79;ReadPosRankSum=-1.950;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,25:151:99:150,0,2880 chrIII 270591 . T C 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1521,0,1637 chrIII 270772 . T C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.988;DP=125;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=-1.230;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.115;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1232,0,1448 chrIII 271415 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.869;DP=143;Dels=0.00;FS=5.250;HaplotypeScore=3.9780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=1;MQRankSum=2.784;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.916;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1363,0,1870 chrIII 271756 . G C 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.488;DP=142;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.771;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1519,0,1499 chrIII 271948 . G C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;DP=133;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=2.038;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1371,0,1451 chrIII 272072 . G A 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.640;DP=92;Dels=0.00;FS=0.787;HaplotypeScore=5.9432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.756;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:896,0,1098 chrIII 272125 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.771;DP=111;Dels=0.00;FS=2.449;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:1103,0,1405 chrIII 272348 . A G 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.636;DP=155;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=1.192;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.863;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1376,0,1808 chrIII 272975 . A C 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.995;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.660;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.991;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,45:78:99:974,0,663 chrIII 272988 . A G 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.839;DP=84;Dels=0.00;FS=2.909;HaplotypeScore=9.9446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.879;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:875,0,682 chrIII 273011 . G A 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.905;DP=86;Dels=0.00;FS=0.820;HaplotypeScore=10.0842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.832;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:901,0,539 chrIII 273072 . T C 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.045;DP=109;Dels=0.00;FS=3.231;HaplotypeScore=3.7700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:783,0,713 chrIII 273250 . A G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.059;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.454;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:890,0,1246 chrIII 273260 . C T 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.808;DP=100;Dels=0.00;FS=3.830;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.171;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:1026,0,1228 chrIII 273312 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.028;DP=97;Dels=0.00;FS=1.693;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.509;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1047,0,1070 chrIII 273348 . A T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;DP=113;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=45.0282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1111,0,1264 chrIII 273439 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.255;DP=106;Dels=0.00;FS=2.638;HaplotypeScore=2.6946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.549;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.497;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:106:99:1112,0,1114 chrIII 273446 . A G 983.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.233;DP=107;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=3.6893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.84;MQ0=0;MQRankSum=-4.478;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1013,0,1191 chrIII 273450 . A T 868.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.566;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.456;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.271;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:898,0,1160 chrIII 273452 . T G 880.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.628;DP=95;Dels=0.00;FS=0.799;HaplotypeScore=2.8846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.09;MQ0=0;MQRankSum=-3.601;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:910,0,1049 chrIII 273474 . T C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.015;DP=113;Dels=0.00;FS=5.268;HaplotypeScore=11.8794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.789;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.307;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1143,0,1249 chrIII 273518 . T C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.358;DP=107;Dels=0.00;FS=7.617;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.156;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1144,0,1164 chrIII 273523 . T G 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.798;DP=105;Dels=0.00;FS=6.219;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.837;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1157,0,1094 chrIII 273723 . T G 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3211,319,0 chrIII 273881 . G A 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;DP=133;Dels=0.00;FS=3.446;HaplotypeScore=6.5755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.831;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:133:99:1300,0,1592 chrIII 273911 . C G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;DP=128;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=6.0413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.151;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:128:99:1265,0,1511 chrIII 273985 . A G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.412;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=0.555;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1267,0,1627 chrIII 274039 . C T 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.365;DP=133;Dels=0.00;FS=3.393;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=1;MQRankSum=-0.999;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.900;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1508,0,1501 chrIII 274091 . G A 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;DP=149;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:149:99:1506,0,1694 chrIII 274100 . T A 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;DP=146;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1356,0,1880 chrIII 274122 . A G 1827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.337;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.757;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,85:149:99:1857,0,1343 chrIII 274124 . T A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=8.99;ReadPosRankSum=-2.307;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1369,0,1902 chrIII 274137 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.950;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.881;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,64:146:99:1349,0,1887 chrIII 274173 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.853;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1273,0,1336 chrIII 274250 . C T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;DP=114;Dels=0.00;FS=5.889;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.223;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1355,0,1068 chrIII 274321 . A G 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;DP=145;Dels=0.00;FS=2.976;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:145:99:1580,0,1570 chrIII 274530 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.413;DP=107;Dels=0.00;FS=3.717;HaplotypeScore=3.9381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.347;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1192,0,1087 chrIII 275117 . C T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;DP=109;Dels=0.00;FS=5.038;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,67:109:99:1567,0,823 chrIII 275254 . A G 2035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;DP=161;Dels=0.00;FS=1.331;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,90:161:99:2065,0,1441 chrIII 275765 . C T 3981.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.36;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3981,388,0 chrIII 276586 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.648;DP=108;Dels=0.00;FS=3.861;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.207;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1171,0,1276 chrIII 276617 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;DP=82;Dels=0.00;FS=19.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.519;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,46:82:99:1035,0,797 chrIII 277187 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.673;DP=118;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=10.35;ReadPosRankSum=-2.228;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:118:99:1251,0,1283 chrIII 277277 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.693;DP=129;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1107,0,1577 chrIII 277310 . G A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.987;DP=150;Dels=0.00;FS=1.290;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.720;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1313,0,1806 chrIII 277511 . A G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.475;DP=114;Dels=0.00;FS=7.705;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:114:99:1060,0,1361 chrIII 277564 . G T 134.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.224;DP=108;Dels=0.00;FS=129.015;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=1.24;ReadPosRankSum=-6.180;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,25:108:99:164,0,1692 chrIII 277895 . A T 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;DP=118;Dels=0.00;FS=11.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.022;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1031,0,1457 chrIII 278281 . T C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.769;DP=127;Dels=0.00;FS=34.382;HaplotypeScore=2.4930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.721;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1165,0,1681 chrIII 278428 . C T 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.448;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.693;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1125,0,1154 chrIII 278462 . T A 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;DP=128;Dels=0.00;FS=6.557;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.466;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1348,0,1307 chrIII 278483 . A G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.254;DP=139;Dels=0.00;FS=15.807;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=2.212;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.770;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1379,0,1429 chrIII 278525 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.090;DP=121;Dels=0.00;FS=19.670;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.200;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1390,0,1230 chrIII 278558 . A G 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.040;DP=162;Dels=0.00;FS=5.936;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.023;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,92:162:99:1688,0,1481 chrIII 278585 . G A 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.468;DP=123;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.820;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:1679,0,1111 chrIII 278826 . A G 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.218;DP=92;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=2.9531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:913,0,1137 chrIII 278873 . A G 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.834;DP=76;Dels=0.00;FS=1.912;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.011;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,45:76:99:978,0,659 chrIII 278927 . G A 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:820,0,1286 chrIII 279149 . T C 2164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=1;QD=25.16;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2197,228,0 chrIII 279350 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;DP=125;Dels=0.00;FS=4.399;HaplotypeScore=5.9603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=2.235;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.373;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1444,0,1322 chrIII 279627 . C T 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.436;DP=116;Dels=0.00;FS=3.617;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1520,0,1134 chrIII 279772 . A C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.239;DP=126;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=5.1232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1160,0,1224 chrIII 279891 . T G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.751;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.403;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1280,0,914 chrIII 280381 . C T 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.645;DP=110;Dels=0.00;FS=2.741;HaplotypeScore=2.8271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.979;QD=8.44;ReadPosRankSum=2.348;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:958,0,1459 chrIII 280971 . G A 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.477;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1632,0,1649 chrIII 281752 . C T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.987;DP=135;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.579;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1666,0,1376 chrIII 282816 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;DP=124;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=3.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.205;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1384,0,1347 chrIII 283946 . T G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.424;DP=110;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.729;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1062,0,1399 chrIII 284830 . C T 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.944;DP=99;Dels=0.00;FS=3.738;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.487;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1154,0,1044 chrIII 284917 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.107;DP=90;Dels=0.00;FS=7.235;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.952;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:1040,0,963 chrIII 285429 . T G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.715;DP=136;Dels=0.00;FS=6.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.282;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1422,0,1578 chrIII 286180 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.015;DP=105;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1132,0,1217 chrIII 286623 . T C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.096;DP=107;Dels=0.00;FS=4.844;HaplotypeScore=2.3999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.961;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:990,0,1355 chrIII 287526 . T C 1897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.962;DP=142;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.101;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,87:142:99:1927,0,1063 chrIII 287544 . T C 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.097;DP=119;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,73:119:99:1654,0,920 chrIII 287614 . A G 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.056;DP=110;Dels=0.00;FS=1.763;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1104,0,1373 chrIII 288008 . G C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;DP=105;Dels=0.00;FS=6.152;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1134,0,1062 chrIII 288098 . A G 618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;DP=88;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.785;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:88:99:648,0,961 chrIII 288099 . G A 648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.843;DP=88;Dels=0.00;FS=1.782;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.454;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,44:88:99:678,0,898 chrIII 288246 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.725;DP=100;Dels=0.00;FS=1.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.906;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1228,0,909 chrIII 288380 . T A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.632;DP=81;Dels=0.00;FS=0.863;HaplotypeScore=3.0979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,43:81:99:972,0,833 chrIII 288455 . G A 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;DP=82;Dels=0.00;FS=4.343;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,49:82:99:990,0,670 chrIII 288978 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;DP=99;Dels=0.00;FS=10.069;HaplotypeScore=2.4780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.554;QD=13.53;ReadPosRankSum=-1.398;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,57:99:99:1369,0,868 chrIII 289803 . T A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;DP=102;Dels=0.00;FS=4.035;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1067,0,1145 chrIII 289856 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.022;DP=123;Dels=0.00;FS=8.227;HaplotypeScore=3.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.498;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1343,0,1350 chrIII 289942 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.881;DP=115;Dels=0.00;FS=6.189;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1426,0,1077 chrIII 290208 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.969;DP=137;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.951;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.366;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:137:99:1273,0,1663 chrIII 290265 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.383;DP=134;Dels=0.00;FS=5.381;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.862;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1357,0,1599 chrIII 290295 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.294;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=61.1889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:130:99:1200,0,1495 chrIII 290562 . C G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.049;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1020,0,1366 chrIII 290645 . C T 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.932;DP=129;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.584;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1573,0,1237 chrIII 290657 . T C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;DP=110;Dels=0.00;FS=1.651;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1342,0,1097 chrIII 290826 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.653;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.632;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1285,0,1231 chrIII 290917 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;DP=115;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1129,0,1445 chrIII 291044 . G A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.007;DP=106;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.537;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1108,0,1225 chrIII 291045 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.719;DP=106;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.335;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1081,0,1238 chrIII 291099 . G A 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.830;DP=143;Dels=0.00;FS=3.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.504;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1712,0,1329 chrIII 291194 . A G 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.417;DP=83;Dels=0.00;FS=0.830;HaplotypeScore=11.7350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.29;MQ0=0;MQRankSum=-4.691;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.087;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:820,0,780 chrIII 291211 . T A 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;DP=91;Dels=0.00;FS=3.961;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.55;MQ0=0;MQRankSum=-7.136;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:780,0,1054 chrIII 291220 . A G 650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;DP=77;Dels=0.00;FS=1.891;HaplotypeScore=30.2549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQ0=0;MQRankSum=-5.456;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:680,0,787 chrIII 291282 . G A 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.122;DP=96;Dels=0.00;FS=1.664;HaplotypeScore=4.4389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.327;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.026;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:998,0,959 chrIII 291321 . C T 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;DP=108;Dels=0.00;FS=4.142;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.581;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1278,0,1063 chrIII 291695 . A T 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;DP=102;Dels=0.00;FS=8.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.402;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:102:99:836,0,1434 chrIII 292177 . C A 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.730;DP=98;Dels=0.00;FS=0.910;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.790;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1279,0,905 chrIII 292183 . G A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.684;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1284,0,934 chrIII 292432 . C T 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;DP=65;Dels=0.00;FS=8.638;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,38:65:99:893,0,530 chrIII 292449 . C T 397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.176;DP=49;Dels=0.00;FS=14.036;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.307;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:49:99:427,0,598 chrIII 292484 . T A 611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.391;DP=79;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=5.8786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=2.391;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.787;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,34:79:99:641,0,958 chrIII 292728 . A T 413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.954;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:443,0,328 chrIII 292890 . C T 718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.579;DP=90;Dels=0.00;FS=0.946;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=7.98;ReadPosRankSum=2.261;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:748,0,822 chrIII 292937 . C T 1922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.80;MQ0=0;QD=22.35;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1955,189,0 chrIII 293013 . A G 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.668;DP=96;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1046,0,933 chrIII 293366 . G A 273.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.67;MQ0=72;MQRankSum=-2.475;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.571;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,26:97:99:303,0,271 chrIII 293855 . G A 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.87;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:4041,415,0 chrIII 293907 . G T 1862.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.932;DP=134;Dels=0.00;FS=6.823;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.602;QD=13.90;ReadPosRankSum=2.261;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,84:134:99:1892,0,1081 chrIII 293908 . A T 1883.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;DP=131;Dels=0.00;FS=5.664;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.396;QD=14.37;ReadPosRankSum=2.257;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,83:131:99:1913,0,1082 chrIII 293909 . A C 1854.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.739;DP=127;Dels=0.00;FS=7.306;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.506;QD=14.60;ReadPosRankSum=2.220;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,81:127:99:1884,0,1017 chrIII 293920 . A G 2259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.407;DP=150;Dels=0.00;FS=12.456;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.297;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.364;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,106:150:99:2289,0,888 chrIII 294256 . T A 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.576;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,48:157:99:976,0,2660 chrIII 294389 . A T 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.98;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3345,337,0 chrIII 294522 . T A 787.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;DP=118;Dels=0.00;FS=9.952;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.14;MQ0=20;MQRankSum=-0.163;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.430;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,42:118:99:817,0,1388 chrIII 294583 . G C 1173.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.395;DP=131;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=8.4620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.23;MQ0=7;MQRankSum=-0.771;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.183;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:131:99:1203,0,1469 chrIII 294636 . T A 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.133;DP=123;Dels=0.00;FS=3.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.958;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:1045,0,1706 chrIII 294655 . G T 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.956;DP=103;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.173;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,36:103:99:749,0,1515 chrIII 294758 . T C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.477;DP=90;Dels=0.00;FS=4.010;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.815;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:1020,0,933 chrIII 294842 . T A 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.863;DP=71;Dels=0.00;FS=4.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=1.907;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,40:71:99:878,0,693 chrIII 294936 . T C 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.990;DP=68;Dels=0.00;FS=0.920;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,36:68:99:789,0,728 chrIII 295219 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.563;DP=74;Dels=0.00;FS=35.749;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=12.59;ReadPosRankSum=2.218;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,44:74:99:962,0,585 chrIII 295252 . G C 251.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;DP=113;Dels=0.00;FS=42.616;HaplotypeScore=47.5144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:281,0,1208 chrIII 295257 . T C 327.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.620;DP=114;Dels=0.01;FS=4.350;HaplotypeScore=80.2302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.980;QD=2.87;ReadPosRankSum=2.214;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,30:113:99:357,0,816 chrIII 295259 . C T 300.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.045;DP=119;Dels=0.00;FS=3.190;HaplotypeScore=89.1835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=2.52;ReadPosRankSum=2.787;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,28:119:99:330,0,1013 chrIII 295260 . T G 565.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.205;DP=118;Dels=0.00;FS=45.165;HaplotypeScore=89.1835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.204;QD=4.79;ReadPosRankSum=2.063;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,41:118:99:595,0,728 chrIII 295261 . A G 627.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=114;Dels=0.00;FS=37.082;HaplotypeScore=89.2293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.773;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.007;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:114:99:657,0,653 chrIII 295264 . T C 84.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.399;DP=106;Dels=0.00;FS=3.171;HaplotypeScore=93.1565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=0.79;ReadPosRankSum=1.146;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,32:106:99:114,0,1335 chrIII 295267 . C A 674.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.860;DP=108;Dels=0.00;FS=37.624;HaplotypeScore=97.2098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.38;MQ0=0;MQRankSum=-4.071;QD=6.24;ReadPosRankSum=-3.136;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:704,0,816 chrIII 295277 . T A 288.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.217;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=70.3529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.93;MQ0=0;MQRankSum=-5.335;QD=3.03;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,33:95:99:318,0,1102 chrIII 295278 . A G 311.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=65.5868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.16;MQ0=0;MQRankSum=-4.945;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,33:96:99:341,0,1079 chrIII 295280 . T C 566.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.991;DP=98;Dels=0.00;FS=5.318;HaplotypeScore=125.7473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.26;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.777;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:596,0,902 chrIII 295285 . T C 562.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.301;DP=101;Dels=0.00;FS=7.371;HaplotypeScore=151.2854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.85;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.628;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,40:101:99:592,0,1021 chrIII 295287 . T A 175.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;DP=105;Dels=0.04;FS=1.110;HaplotypeScore=196.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.57;MQ0=0;MQRankSum=-4.627;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:101:99:205,0,1437 chrIII 295289 . C T 100.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.694;DP=106;Dels=0.00;FS=7.192;HaplotypeScore=133.6231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.74;MQ0=0;MQRankSum=-4.203;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.311;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:130,0,1531 chrIII 295294 . C A 74.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.940;DP=103;Dels=0.00;FS=4.087;HaplotypeScore=142.5523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.41;MQ0=0;MQRankSum=-5.026;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,24:103:99:104,0,1448 chrIII 295306 . A T 109.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.277;DP=103;Dels=0.00;FS=2.540;HaplotypeScore=11.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.86;MQ0=0;MQRankSum=-5.159;QD=1.06;ReadPosRankSum=-2.744;SB=-8.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,23:103:99:139,0,1657 chrIII 295309 . A C 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.550;DP=103;Dels=0.00;FS=2.839;HaplotypeScore=106.0388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQ0=0;MQRankSum=-4.876;QD=0.35;ReadPosRankSum=-2.436;SB=-6.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,19:103:66:66,0,1748 chrIII 295311 . A C 88.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.204;DP=104;Dels=0.00;FS=1.146;HaplotypeScore=85.2022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.29;MQ0=0;MQRankSum=-5.186;QD=0.85;ReadPosRankSum=-3.864;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,22:104:99:118,0,1699 chrIII 295314 . A C 20.05 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.172;DP=108;Dels=0.00;FS=1.154;HaplotypeScore=102.0539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.28;MQ0=0;MQRankSum=-5.656;QD=0.19;ReadPosRankSum=-2.856;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:50:50,0,1936 chrIII 295317 . T C 1225.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.045;DP=107;Dels=0.00;FS=0.861;HaplotypeScore=79.0378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQ0=0;MQRankSum=-3.247;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.082;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,71:107:99:1255,0,724 chrIII 295322 . A T 27.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.8554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.21;MQ0=0;MQRankSum=-5.239;QD=0.26;ReadPosRankSum=-4.325;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,17:104:57:57,0,1944 chrIII 295415 . G T 660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.329;DP=59;Dels=0.00;FS=2.212;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.17;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=11.19;ReadPosRankSum=-2.130;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:690,0,646 chrIII 295426 . A G 616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.139;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=9.33;ReadPosRankSum=-2.521;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:646,0,800 chrIII 295441 . C T 613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.753;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:643,0,856 chrIII 295646 . T C 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.707;DP=87;Dels=0.00;FS=1.845;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.737;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,47:87:99:959,0,882 chrIII 295703 . T A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.980;DP=79;Dels=0.00;FS=6.143;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=11.94;ReadPosRankSum=-2.532;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:973,0,709 chrIII 295923 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.883;DP=108;Dels=0.00;FS=3.473;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=2.606;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.192;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1214,0,1150 chrIII 295937 . T G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.665;DP=108;Dels=0.00;FS=2.449;HaplotypeScore=8.0733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1304,0,1089 chrIII 296050 . A T 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.874;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,37:84:99:780,0,1053 chrIII 296219 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.306;DP=104;Dels=0.00;FS=11.871;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.761;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1185,0,1131 chrIII 296281 . C T 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;DP=90;Dels=0.00;FS=5.337;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.222;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1008,0,941 chrIII 296384 . C A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.704;DP=83;Dels=0.00;FS=7.368;HaplotypeScore=1.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=13.77;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,50:83:99:1173,0,618 chrIII 296406 . C T 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.557;DP=70;Dels=0.00;FS=2.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:873,0,668 chrIII 296447 . C A 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.783;DP=72;Dels=0.01;FS=4.611;HaplotypeScore=12.8984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:773,0,759 chrIII 296505 . C A 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.023;DP=99;Dels=0.00;FS=3.729;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.025;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1076,0,960 chrIII 296603 . C A 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.157;DP=96;Dels=0.00;FS=0.787;HaplotypeScore=5.1291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:1029,0,975 chrIII 296655 . C G 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;DP=77;Dels=0.00;FS=0.869;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.800;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:851,0,731 chrIII 296676 . A T 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.477;DP=76;Dels=0.00;FS=1.962;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.670;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:918,0,792 chrIII 296689 . C A 2180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2213,225,0 chrIII 296732 . A T 656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.615;DP=83;Dels=0.00;FS=3.127;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:686,0,1145 chrIII 296738 . C T 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.591;DP=81;Dels=0.00;FS=5.919;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,35:81:99:677,0,1013 chrIII 296757 . A G 720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.529;DP=79;Dels=0.00;FS=1.918;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.854;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,35:79:99:750,0,1059 chrIII 296914 . G A 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.826;DP=73;Dels=0.00;FS=0.884;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,35:73:99:732,0,753 chrIII 296948 . A G 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.652;DP=86;Dels=0.00;FS=4.104;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.938;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:86:99:835,0,997 chrIII 297016 . G A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.978;DP=86;Dels=0.00;FS=0.818;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.952;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.822;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:969,0,825 chrIII 297026 . G A 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.154;DP=84;Dels=0.00;FS=0.829;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.883;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.270;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,47:84:99:993,0,796 chrIII 297027 . G A 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.109;DP=84;Dels=0.00;FS=0.829;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.640;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.324;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,47:84:99:1013,0,814 chrIII 297038 . C A 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.251;DP=84;Dels=0.00;FS=2.908;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.615;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,50:84:99:1050,0,707 chrIII 297070 . G A 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;DP=70;Dels=0.00;FS=1.058;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=-3.677;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:789,0,693 chrIII 297325 . C T 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;DP=65;Dels=0.00;FS=0.985;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.964;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,38:64:99:855,0,544 chrIII 297334 . C T 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.727;DP=70;Dels=0.00;FS=0.911;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.555;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,39:70:99:952,0,630 chrIII 297834 . A T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.558;DP=140;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=4.9680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.926;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.554;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1273,0,1819 chrIII 297919 . G A 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8654;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=28.76;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3279,322,0 chrIII 297933 . C T 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.163;DP=105;Dels=0.00;FS=28.718;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=7.78;ReadPosRankSum=-2.227;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:847,0,1421 chrIII 298117 . G A 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5551;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3568,349,0 chrIII 298120 . A G 677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.804;DP=137;Dels=0.00;FS=4.564;HaplotypeScore=2.5688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,47:137:99:707,0,2163 chrIII 298326 . G A 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;DP=113;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.996;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:3051,301,0 chrIII 298402 . T C 2348 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2381,234,0 chrIII 298408 . A G 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.918;DP=87;Dels=0.00;FS=10.615;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:879,0,996 chrIII 298441 . C T 2891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2924,286,0 chrIII 298456 . C T 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.242;DP=105;Dels=0.00;FS=12.888;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.991;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1118,0,1118 chrIII 298548 . G A 2354 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2387,234,0 chrIII 298597 . G A 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.88;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2802,279,0 chrIII 298764 . C T 2637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2670,259,0 chrIII 298822 . A T 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.974;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1135,0,1307 chrIII 298878 . C G 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3074,321,0 chrIII 298949 . A C 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2778,253,0 chrIII 298990 . C T 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.467;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:1043,0,1330 chrIII 298992 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.205;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.860;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1411,0,1008 chrIII 299098 . C T 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3577,328,0 chrIII 299155 . C G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.231;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1033,0,1180 chrIII 299165 . G T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.007;DP=104;Dels=0.00;FS=6.061;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1057,0,1084 chrIII 299184 . C A 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.817;DP=98;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:925,0,1055 chrIII 299220 . T C 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2559,246,0 chrIII 299262 . A G 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3009,292,0 chrIII 299288 . A G 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2833,279,0 chrIII 299395 . G A 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=124;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=27.25;ReadPosRankSum=1.676;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3379,331,0 chrIII 299645 . T C 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.06;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3173,321,0 chrIII 299687 . C T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.794;DP=113;Dels=0.00;FS=7.633;HaplotypeScore=3.5136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.053;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:113:99:1445,0,1099 chrIII 299972 . G A 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.221;DP=97;Dels=0.00;FS=2.713;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.033;QD=9.70;ReadPosRankSum=-2.843;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,56:97:99:971,0,438 chrIII 300168 . G T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.003;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.609;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1149,0,1390 chrIII 300273 . A G 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.852;DP=95;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:841,0,1235 chrIII 300466 . A C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.852;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1238,0,1502 chrIII 300695 . G A 4103.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4103,406,0 chrIII 300759 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.658;DP=122;Dels=0.00;FS=2.371;HaplotypeScore=5.3469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.931;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:1398,0,1071 chrIII 300866 . G A 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.540;DP=82;Dels=0.00;FS=12.895;HaplotypeScore=6.8050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.631;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:925,0,867 chrIII 300877 . A G 1972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2005,204,0 chrIII 300878 . C T 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.473;DP=78;Dels=0.00;FS=7.438;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,40:78:99:865,0,824 chrIII 301176 . G C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.925;DP=86;Dels=0.00;FS=21.200;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,51:86:99:1140,0,728 chrIII 301255 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.006;DP=130;Dels=0.00;FS=5.390;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=2.315;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.033;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1405,0,1411 chrIII 301448 . G A 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2873,289,0 chrIII 301452 . A G 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3178,324,0 chrIII 301627 . T G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.394;DP=141;Dels=0.00;FS=3.536;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1553,0,1452 chrIII 301748 . T C 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.490;DP=104;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.947;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:104:99:1088,0,1202 chrIII 301864 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.519;DP=106;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.398;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1112,0,1174 chrIII 302119 . C T 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.553;DP=91;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,37:91:99:779,0,1192 chrIII 302316 . T C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.661;DP=136;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.467;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1586,0,1468 chrIII 302475 . T G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.754;DP=108;Dels=0.00;FS=0.756;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1219,0,1096 chrIII 302683 . T C 1907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;DP=170;Dels=0.00;FS=5.464;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.878;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,92:170:99:1937,0,1589 chrIII 302979 . G A 4439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=28.64;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4439,433,0 chrIII 303175 . G A 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.824;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=1;MQRankSum=-0.594;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.015;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:866,0,1043 chrIII 303499 . C T 2814 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2847,274,0 chrIII 303677 . A T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.331;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.733;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1357,0,1214 chrIII 303775 . A G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.930;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1396,0,1324 chrIII 303796 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.891;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1535,0,1395 chrIII 303967 . G A 970.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.830;DP=134;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.13;MQ0=6;MQRankSum=-4.071;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.650;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1000,0,1238 chrIII 304019 . T C 1418.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.939;DP=151;Dels=0.00;FS=75.612;HaplotypeScore=2.6786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.43;MQ0=8;MQRankSum=-2.025;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.615;SB=-6.639e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,95:151:99:1448,0,960 chrIII 304035 . T A 123.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.834;DP=167;Dels=0.00;FS=23.819;HaplotypeScore=5.8697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.85;MQ0=5;MQRankSum=-3.110;QD=0.74;ReadPosRankSum=-1.682;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,39:167:99:153,0,2857 chrIII 304106 . G A 1231.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.737;DP=236;Dels=0.00;FS=0.532;HaplotypeScore=5.5477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=6;MQRankSum=0.997;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.409;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,70:236:99:1261,0,3691 chrIII 304426 . G A 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.086;DP=223;Dels=0.00;FS=1.879;HaplotypeScore=2.5608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.029;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,60:223:99:993,0,3677 chrIII 304775 . C T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.125;DP=228;Dels=0.00;FS=0.540;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.751;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,63:228:99:1080,0,3830 chrIII 304825 . G C 5598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=26.91;SB=-2.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:208:99:5598,568,0 chrIII 304929 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.200;DP=257;Dels=0.00;FS=10.986;HaplotypeScore=4.4334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=4.51;ReadPosRankSum=1.077;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,69:257:99:1189,0,3920 chrIII 305038 . T C 1768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.983;DP=194;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=3.7514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,87:194:99:1798,0,2313 chrIII 305105 . T C 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.810;DP=201;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=4.6488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;MQ0=1;MQRankSum=-3.661;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.768;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,55:201:99:850,0,3400 chrIII 305167 . A G 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.789;DP=183;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.09;MQ0=3;MQRankSum=2.716;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.244;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,49:183:99:851,0,2968 chrIII 305458 . C G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.133;DP=244;Dels=0.00;FS=3.990;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=3.670;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,72:244:99:1241,0,3999 chrIII 305551 . A G 606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.729;DP=206;Dels=0.01;FS=5.150;HaplotypeScore=10.7453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,45:204:99:636,0,3884 chrIII 305655 . G C 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.579;DP=258;Dels=0.00;FS=5.510;HaplotypeScore=14.6257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=2.251;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,55:258:99:749,0,4690 chrIII 305785 . G T 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.804;DP=222;Dels=0.00;FS=1.244;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,58:222:99:955,0,3825 chrIII 306397 . C G 3215.99 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;DP=279;Dels=0.00;FS=2.638;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.095;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,150:279:99:3246,0,2732 chrIII 306552 . A G 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.188;DP=196;Dels=0.00;FS=2.986;HaplotypeScore=50.5148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=1;MQRankSum=1.205;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,51:196:99:827,0,3592 chrIII 306561 . T C 2548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.222;DP=194;Dels=0.00;FS=10.481;HaplotypeScore=45.5454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.50;MQ0=3;MQRankSum=-3.850;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.205;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,119:194:99:2578,0,1656 chrIII 306575 . C T 2264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.816;DP=206;Dels=0.00;FS=5.430;HaplotypeScore=4.3115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.20;MQ0=2;MQRankSum=-4.288;QD=10.99;ReadPosRankSum=2.033;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,110:206:99:2294,0,2118 chrIII 306783 . G A 2448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;DP=261;Dels=0.00;FS=0.974;HaplotypeScore=4.0423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=2.627;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.169;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,114:261:99:2478,0,3251 chrIII 306942 . C T 459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.615;DP=273;Dels=0.00;FS=10.609;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=-6.694;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,50:273:99:489,0,5164 chrIII 306967 . T A 348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;DP=253;Dels=0.00;FS=3.112;HaplotypeScore=5.4735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQ0=0;MQRankSum=-8.640;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,45:253:99:378,0,5071 chrIII 306974 . C T 381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.630;DP=235;Dels=0.00;FS=3.101;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=1;MQRankSum=-8.867;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,43:235:99:411,0,4522 chrIII 306978 . C T 268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.839;DP=246;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.76;MQ0=1;MQRankSum=-8.178;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.252;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,41:245:99:298,0,4886 chrIII 306992 . C T 152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.045;DP=248;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.69;MQ0=2;MQRankSum=-8.574;QD=0.61;ReadPosRankSum=0.525;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,39:248:99:182,0,5097 chrIII 307016 . G A 82.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.614;DP=222;Dels=0.00;FS=6.799;HaplotypeScore=4.9397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.30;MQ0=2;MQRankSum=-8.113;QD=0.37;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,38:222:99:112,0,4529 chrIII 307039 . A T 7588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=295;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.57;MQ0=2;QD=25.72;SB=-3.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,295:295:99:7588,784,0 chrIII 307095 . G C 2232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.088;DP=250;Dels=0.00;FS=10.097;HaplotypeScore=2.4706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,111:250:99:2262,0,2855 chrIII 307149 . A T 679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.155;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQ0=1;MQRankSum=1.144;QD=3.38;ReadPosRankSum=1.167;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,47:201:99:709,0,3491 chrIII 307185 . C T 208.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.702;DP=234;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.69;MQ0=6;MQRankSum=-1.695;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.229;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,42:234:99:238,0,4072 chrIII 307255 . C T 119.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.857;DP=259;Dels=0.00;FS=3.419;HaplotypeScore=2.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.10;MQ0=13;MQRankSum=-3.612;QD=0.46;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,35:259:99:149,0,4608 chrIII 307293 . G C 53.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.201;DP=282;Dels=0.00;FS=18.665;HaplotypeScore=6.6938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.60;MQ0=11;MQRankSum=-7.553;QD=0.19;ReadPosRankSum=0.007;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,43:282:83:83,0,5218 chrIII 307310 . G A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.576;DP=272;Dels=0.00;FS=11.593;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.68;MQ0=8;MQRankSum=-7.672;QD=0.04;ReadPosRankSum=3.070;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,41:272:40:40,0,5160 chrIII 307379 . G A 54.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.352;DP=183;Dels=0.00;FS=30.602;HaplotypeScore=24.2594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=2;MQRankSum=-2.682;QD=0.30;ReadPosRankSum=0.035;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,19:183:84:84,0,3541 chrIII 307595 . A T 169.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;DP=244;Dels=0.00;FS=29.801;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.99;MQ0=35;MQRankSum=-6.126;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.961;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,54:244:99:199,0,3680 chrIII 307628 . A G 460.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.055;DP=267;Dels=0.00;FS=5.086;HaplotypeScore=37.4873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.64;MQ0=16;MQRankSum=-7.428;QD=1.72;ReadPosRankSum=2.348;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,79:267:99:490,0,4085 chrIII 307630 . G A 161.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.888;DP=269;Dels=0.00;FS=80.939;HaplotypeScore=40.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.51;MQ0=12;MQRankSum=-1.157;QD=0.60;ReadPosRankSum=-1.365;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,42:269:99:191,0,4473 chrIII 307632 . T C 393.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.759;DP=272;Dels=0.00;FS=16.619;HaplotypeScore=42.2266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.25;MQ0=11;MQRankSum=-7.267;QD=1.44;ReadPosRankSum=4.039;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,73:272:99:423,0,4234 chrIII 307675 . T A 336.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.520;DP=244;Dels=0.00;FS=13.355;HaplotypeScore=13.8757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.85;MQ0=18;MQRankSum=-5.281;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.938;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,59:244:99:366,0,3507 chrIII 307683 . A G 327.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.010;DP=237;Dels=0.00;FS=21.021;HaplotypeScore=5.1100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.14;MQ0=19;MQRankSum=-5.408;QD=1.38;ReadPosRankSum=-3.384;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,58:237:99:357,0,3426 chrIII 315884 . A G 92.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.025;DP=93;Dels=0.00;FS=20.291;HaplotypeScore=13.7619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQ0=0;MQRankSum=-6.588;QD=0.99;ReadPosRankSum=-1.688;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:122,0,1782 chrIII 316056 . G A 53.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.500;DP=204;Dels=0.00;FS=15.217;HaplotypeScore=21.1756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.92;MQ0=7;MQRankSum=-7.008;QD=0.26;ReadPosRankSum=3.740;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,44:204:83:83,0,3171 chrIII 316065 . G A 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;DP=205;Dels=0.02;FS=15.836;HaplotypeScore=39.7641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.16;MQ0=7;MQRankSum=-5.817;QD=0.25;ReadPosRankSum=3.383;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,40:201:81:81,0,3107 chrIII 316156 . C A 495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.757;DP=210;Dels=0.00;FS=2.091;HaplotypeScore=52.1154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.58;MQ0=3;MQRankSum=-4.346;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,47:209:99:525,0,3252 chrIII 316159 . C G 415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.724;DP=209;Dels=0.00;FS=7.088;HaplotypeScore=55.0575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.01;MQ0=3;MQRankSum=-2.890;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,39:209:99:445,0,3342 chrIII 316167 . T C 604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.373;DP=225;Dels=0.00;FS=1.201;HaplotypeScore=185.0173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.89;MQ0=3;MQRankSum=-5.251;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.480;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,59:225:99:634,0,3569 chrIII 316174 . A C 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.868;DP=223;Dels=0.00;FS=4.548;HaplotypeScore=82.8747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.29;MQ0=3;MQRankSum=-1.106;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,56:223:99:832,0,3380 chrIII 316221 . G A 594.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.936;DP=298;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.1822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.29;MQ0=4;MQRankSum=-3.067;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.817;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,62:298:99:624,0,5022 chrIII 316223 . A G 529.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.095;DP=293;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.1984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.97;MQ0=4;MQRankSum=-3.062;QD=1.81;ReadPosRankSum=1.494;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,61:293:99:559,0,5066 chrIII 316311 . A G 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;DP=193;Dels=0.00;FS=7.127;HaplotypeScore=28.2651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.76;MQ0=1;MQRankSum=3.813;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.086;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,97:193:99:1649,0,1524 chrIII 316313 . T C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;DP=188;Dels=0.00;FS=6.168;HaplotypeScore=28.5821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.62;MQ0=1;MQRankSum=3.700;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.433;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,91:188:99:1520,0,1508 chrIII 316325 . T A,C 2401.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;DP=158;Dels=0.00;FS=15.985;HaplotypeScore=26.0224;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=38.03;MQ0=2;MQRankSum=2.166;QD=15.20;ReadPosRankSum=2.615;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:13,76,68:158:99:2461,1063,1009,1305,0,1284 chrIII 316326 . G A 1075.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.059;DP=159;Dels=0.00;FS=12.655;HaplotypeScore=26.9731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.26;MQ0=2;MQRankSum=-3.272;QD=6.76;ReadPosRankSum=2.438;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:159:99:1105,0,1321 chrIII 316331 . A G 970.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.313;DP=168;Dels=0.00;FS=14.196;HaplotypeScore=23.2445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.08;MQ0=2;MQRankSum=-3.361;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.907;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,78:168:99:1000,0,1480 chrIII 316371 . C T 1268.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.505;DP=164;Dels=0.00;FS=9.077;HaplotypeScore=26.3568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.47;MQ0=4;MQRankSum=2.760;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.884;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,76:164:99:1298,0,1313 chrIII 316382 . G A 720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.229;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=23.9035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.04;MQ0=3;MQRankSum=-1.922;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.802;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,59:158:99:750,0,1778 chrIII 316428 . G A 1008.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.526;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=112.8230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.63;MQ0=3;MQRankSum=0.958;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1038,0,948 chrIII 316431 . G A 1186.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.104;DP=107;Dels=0.00;FS=8.659;HaplotypeScore=184.0624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.21;MQ0=3;MQRankSum=2.143;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.176;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:1216,0,677 chrIII 316433 . G A 1207.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.725;DP=105;Dels=0.00;FS=6.954;HaplotypeScore=235.5392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.18;MQ0=3;MQRankSum=1.642;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,63:105:99:1237,0,622 chrIII 316499 . A G 336.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.219;DP=95;Dels=0.00;FS=30.038;HaplotypeScore=8.6868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.92;MQ0=1;MQRankSum=0.111;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.556;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:366,0,793 chrIII 316502 . A G 363.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.396;DP=95;Dels=0.00;FS=29.788;HaplotypeScore=8.6383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.10;MQ0=1;MQRankSum=1.491;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.639;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:95:99:393,0,805 chrIII 316553 . T G 50.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.055;DP=62;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=99.3289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.36;MQ0=3;MQRankSum=0.677;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.396;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,6:61:80:80,0,314 chrIII 316617 . T G 95.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.488;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.86;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.752;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:125,0,139 chrIV 207 . A T 46.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.11;MQ0=2;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:17:76,0,17 chrIV 224 . C T 165.77 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.83;MQ0=2;MQRankSum=0.537;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-9.725e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:0:194,0,0 chrIV 294 . T C 71.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;DP=31;Dels=0.00;FS=17.975;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.87;MQ0=4;MQRankSum=-1.371;QD=2.29;ReadPosRankSum=2.012;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:101,0,381 chrIV 326 . A C 139.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.489;DP=24;Dels=0.00;FS=18.176;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.41;MQ0=7;MQRankSum=0.146;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-3.498e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:169,0,137 chrIV 342 . T C 105.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.843;DP=18;Dels=0.00;FS=12.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.65;MQ0=6;MQRankSum=-0.259;QD=5.83;ReadPosRankSum=-1.073;SB=-5.833e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:77:135,0,77 chrIV 348 . A G 85.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;DP=17;Dels=0.00;FS=18.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.63;MQ0=6;MQRankSum=-0.143;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.932;SB=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:62:115,0,62 chrIV 383 . G C 35.06 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.54;MQ0=6;MQRankSum=-1.537;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.537;SB=-6.072e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:16:65,0,16 chrIV 385 . C G 34.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.54;MQ0=6;MQRankSum=-1.537;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.988;SB=-9.212e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:14:64,0,14 chrIV 438 . C G 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.12;MQ0=5;MQRankSum=1.231;QD=1.13;ReadPosRankSum=1.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:41:41,0,59 chrIV 451 . T C 60.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.10;MQ0=4;MQRankSum=0.731;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.731;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:14:90,0,14 chrIV 453 . C T 61.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.10;MQ0=4;MQRankSum=-0.731;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:13:91,0,13 chrIV 1196 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=89;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.55;MQ0=85;MQRankSum=1.026;QD=0.24;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:87,2:89:6:53,6,0 chrIV 1206 . T C 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=87;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.60;MQ0=83;MQRankSum=1.026;QD=0.28;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:85,2:87:6:56,6,0 chrIV 1208 . C T 28.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=91;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.50;MQ0=87;MQRankSum=1.026;QD=0.32;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:89,2:91:6:60,6,0 chrIV 1217 . C T 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=77;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.89;MQ0=73;MQRankSum=1.026;QD=0.36;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:75,2:77:6:59,6,0 chrIV 1222 . G T 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=73;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.03;MQ0=69;MQRankSum=1.026;QD=0.38;ReadPosRankSum=1.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:71,2:73:6:59,6,0 chrIV 1230 . T C 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=73;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.91;MQ0=70;MQRankSum=0.736;QD=0.37;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:71,2:73:6:58,6,0 chrIV 1237 . C A 29.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=73;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.91;MQ0=70;MQRankSum=0.736;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:71,2:73:6:61,6,0 chrIV 1238 . G A 27.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=80;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.69;MQ0=77;MQRankSum=0.736;QD=0.35;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:78,2:80:6:59,6,0 chrIV 1244 . C T 28.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=77;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.78;MQ0=74;MQRankSum=0.736;QD=0.37;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:75,2:77:6:60,6,0 chrIV 1254 . G A 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=80;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.69;MQ0=77;MQRankSum=0.736;QD=0.35;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:78,2:80:6:59,6,0 chrIV 1264 . G A 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.32;MQ0=88;QD=0.31;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:88,2:90:6:59,6,0 chrIV 1359 . T C 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.97;MQ0=69;QD=0.36;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:69,3:72:6:57,6,0 chrIV 1368 . A G 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.98;MQ0=72;QD=0.35;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:72,4:76:6:58,6,0 chrIV 1379 . C T 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.08;MQ0=69;QD=0.35;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:69,4:73:6:57,6,0 chrIV 1422 . G C 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.91;MQ0=74;QD=0.30;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:74,4:78:6:55,6,0 chrIV 1423 . A C 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.85;MQ0=76;QD=0.31;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:76,4:80:6:56,6,0 chrIV 1444 . A G 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.76;MQ0=79;QD=0.29;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:53,30:83:6:55,6,0 chrIV 1504 . A G 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.51;MQ0=39;QD=0.61;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,25:42:6:57,6,0 chrIV 1511 . C A 28.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.94;MQ0=34;QD=0.78;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,18:37:6:60,6,0 chrIV 1525 . G C 102.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.09;MQ0=29;QD=2.92;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,6:35:15:135,15,0 chrIV 1531 . T C 106.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.18;MQ0=23;QD=3.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,12:29:15:139,15,0 chrIV 1534 . C T 115.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.39;MQ0=18;QD=4.80;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,6:24:15:148,15,0 chrIV 1554 . T A 117.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.40;MQ0=10;QD=7.33;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,6:16:15:150,15,0 chrIV 1555 . T G 109.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.94;MQ0=9;QD=7.28;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,8:15:15:142,15,0 chrIV 1567 . T C 105.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.87;MQ0=3;QD=11.70;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:15:138,15,0 chrIV 1571 . T C 114.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.80;MQ0=1;QD=16.32;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:147,15,0 chrIV 1669 . A G 333 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.64;MQ0=3;QD=15.14;SB=-8.500e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:39:366,39,0 chrIV 1850 . T G 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.37;MQ0=9;QD=2.07;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,2:11:6:54,6,0 chrIV 1875 . T C 54.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.61;MQ0=31;QD=1.62;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,4:34:9:87,9,0 chrIV 1876 . T C 47.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.26;MQ0=34;QD=1.30;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,3:37:9:80,9,0 chrIV 1885 . T C 53.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.84;MQ0=38;QD=1.32;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:38,3:41:9:86,9,0 chrIV 1892 . C G 51.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.66;MQ0=40;QD=1.21;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:40,3:43:9:84,9,0 chrIV 1898 . A C 47.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.57;MQ0=41;QD=1.09;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:41,3:44:9:80,9,0 chrIV 1902 . G A 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.18;MQ0=42;QD=0.61;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:42,2:44:6:58,6,0 chrIV 1904 . A G 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.11;MQ0=43;QD=0.37;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,2:45:6:48,6,0 chrIV 1905 . G A 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.05;MQ0=44;QD=0.37;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:44,2:46:6:48,6,0 chrIV 1906 . C A 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.05;MQ0=44;QD=0.41;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:44,2:46:6:50,6,0 chrIV 1909 . T G 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.98;MQ0=45;QD=0.57;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:45,2:47:6:58,6,0 chrIV 1924 . T C 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.29;MQ0=58;QD=0.38;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:58,2:60:6:54,6,0 chrIV 1930 . T G 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.21;MQ0=60;QD=0.40;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:60,2:62:6:56,6,0 chrIV 1932 . A C 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.17;MQ0=61;QD=0.41;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:60,3:63:6:57,6,0 chrIV 1939 . C T 28.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.16;MQ0=64;QD=0.43;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:57,10:67:6:60,6,0 chrIV 2573 . G C 256 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.04;MQ0=0;QD=16.00;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:30:289,30,0 chrIV 2589 . G A 366 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;QD=18.30;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:42:399,42,0 chrIV 2617 . G A 252 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.08;MQ0=0;QD=21.00;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:33:285,33,0 chrIV 2618 . T A 219 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.08;MQ0=0;QD=18.25;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:33:252,33,0 chrIV 2619 . G A 120.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.08;MQ0=0;QD=10.01;SB=-7.062e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:21:153,21,0 chrIV 2621 . C G 120.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.08;MQ0=0;QD=10.01;SB=-7.062e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:21:153,21,0 chrIV 2622 . T A 213 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.08;MQ0=0;QD=17.75;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:33:246,33,0 chrIV 2651 . C G 102.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.97;MQ0=1;QD=10.23;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:15:135,15,0 chrIV 2713 . T C 14.91 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.14;MQ0=13;QD=0.78;SB=-2.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,14:19:6:46,6,0 chrIV 2739 . G A 46.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.87;MQ0=18;QD=1.57;SB=-8.463e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,22:30:9:79,9,0 chrIV 2842 . C T 176.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.20;MQ0=17;QD=6.07;SB=-2.794e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,12:29:21:209,21,0 chrIV 2845 . T C 166.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.49;MQ0=16;QD=6.15;SB=-2.694e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,19:27:21:199,21,0 chrIV 2846 . C A 168.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.49;MQ0=16;QD=6.22;SB=-2.794e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,11:27:21:201,21,0 chrIV 2854 . A G 149.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.80;MQ0=16;QD=5.14;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,14:29:18:182,18,0 chrIV 2865 . T C 130.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.06;MQ0=15;QD=4.82;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,12:27:18:163,18,0 chrIV 2871 . T C 139.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.66;MQ0=13;QD=5.57;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,12:25:18:172,18,0 chrIV 12469 . C A 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.26;MQ0=27;MQRankSum=-1.026;QD=0.52;ReadPosRankSum=0.000;SB=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:35:46,0,35 chrIV 12497 . C T 67.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.20;MQ0=21;QD=2.72;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:9:100,9,0 chrIV 12510 . C T 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.14;MQ0=16;QD=2.68;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:83,9,0 chrIV 16713 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=10.90;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 chrIV 16722 . T C 45.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=11.49;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:78,9,0 chrIV 16731 . T C 103.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.88;MQ0=1;QD=14.75;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:136,15,0 chrIV 16752 . A G 190.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.80;MQ0=2;QD=17.28;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:24:223,24,0 chrIV 16794 . T C 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.75;MQ0=2;MQRankSum=0.382;QD=1.47;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:49:49,0,192 chrIV 16804 . G A 72.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.40;MQ0=6;MQRankSum=1.473;QD=3.43;ReadPosRankSum=-2.416;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:102,0,175 chrIV 16839 . G A 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.35;MQ0=9;MQRankSum=-3.281;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:76:76,0,190 chrIV 16977 . T C 387.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.579;DP=75;Dels=0.00;FS=42.215;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.51;MQ0=3;MQRankSum=1.685;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.198;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:417,0,808 chrIV 17067 . T C 775.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.503;DP=88;Dels=0.00;FS=57.213;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.39;MQ0=7;MQRankSum=2.125;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.320;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:805,0,499 chrIV 17068 . C T 778.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;DP=87;Dels=0.00;FS=56.324;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.37;MQ0=7;MQRankSum=1.893;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:808,0,486 chrIV 17107 . C T 1110.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.350;DP=99;Dels=0.00;FS=67.548;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.38;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.857;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1140,0,880 chrIV 17151 . C T 1051.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.466;DP=96;Dels=0.00;FS=72.115;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.52;MQ0=1;MQRankSum=-0.541;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.238;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:96:99:1081,0,796 chrIV 17251 . T A 1967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.232;DP=80;Dels=0.00;FS=16.523;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.88;MQ0=1;MQRankSum=3.272;QD=24.59;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,75:80:99:2000,150,0 chrIV 17352 . A G 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.17;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3055,306,0 chrIV 17357 . T C 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.103;DP=124;Dels=0.00;FS=15.528;HaplotypeScore=1.9298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.99;MQ0=0;MQRankSum=3.685;QD=22.67;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,118:124:99:2844,265,0 chrIV 17374 . T C 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;DP=109;Dels=0.00;FS=14.871;HaplotypeScore=2.5776;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.46;MQ0=0;MQRankSum=3.655;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,102:109:99:2765,233,0 chrIV 17421 . A G 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.79;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3510,351,0 chrIV 17461 . T C 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.83;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:135:99:3424,349,0 chrIV 17772 . A T 2581 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.88;MQ0=6;QD=23.46;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2614,255,0 chrIV 17799 . C T 2441 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.51;MQ0=6;QD=23.47;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2474,246,0 chrIV 17823 . A G 1978 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.63;MQ0=6;MQRankSum=2.132;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.355;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,86:90:99:2011,161,0 chrIV 17886 . A G 1398 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=18.1569;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.27;MQ0=0;QD=21.51;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1431,150,0 chrIV 17888 . C T 1452 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.27;MQ0=0;QD=22.34;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1485,150,0 chrIV 17889 . C T 1460 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.08;MQ0=0;QD=23.17;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1493,150,0 chrIV 17893 . T G 1386 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;DP=63;Dels=0.00;FS=3.071;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.08;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=22.00;ReadPosRankSum=1.117;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,61:63:99:1419,150,0 chrIV 17894 . T C 1375 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.411;DP=63;Dels=0.00;FS=3.071;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.08;MQ0=0;MQRankSum=1.901;QD=21.83;ReadPosRankSum=1.039;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,61:63:99:1408,150,0 chrIV 17898 . C T 1453 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.372;DP=63;Dels=0.00;FS=3.071;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.08;MQ0=0;MQRankSum=2.058;QD=23.06;ReadPosRankSum=0.843;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,61:63:99:1486,150,0 chrIV 17906 . T C 907 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=42;Dels=0.00;FS=2.955;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.41;MQ0=0;MQRankSum=2.038;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.207;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:940,102,0 chrIV 17907 . A G 856 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=10.5362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.64;MQ0=0;QD=20.88;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:889,102,0 chrIV 17909 . A G 750 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.64;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=18.29;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:783,99,0 chrIV 17910 . A G 714 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.64;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=17.41;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:96:747,96,0 chrIV 17911 . G C 737 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.5362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.64;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.056;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:770,99,0 chrIV 17912 . T C 838 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.5362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.64;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:871,102,0 chrIV 17917 . G A 943 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.582;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.93;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:976,102,0 chrIV 17918 . A C 899 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6205;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.93;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:932,102,0 chrIV 17921 . C A 947 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=20.1146;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.95;MQ0=2;QD=16.05;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:980,102,0 chrIV 17955 . C T 1240 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.66;MQ0=5;QD=19.37;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1273,129,0 chrIV 17973 . C T 1031.05 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.140;DP=62;Dels=0.00;FS=14.220;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.55;MQ0=5;MQRankSum=1.171;QD=16.63;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-5.391e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,53:62:22:1064,22,0 chrIV 18120 . G A 2955.64 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;DP=152;Dels=0.00;FS=70.609;HaplotypeScore=18.3643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.53;MQ0=0;MQRankSum=5.308;QD=19.45;ReadPosRankSum=-1.574;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,128:152:5:2985,0,5 chrIV 18129 . G A 75.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.177;DP=148;Dels=0.00;FS=68.158;HaplotypeScore=13.3034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.16;MQ0=0;MQRankSum=-4.626;QD=0.51;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,25:148:99:105,0,2779 chrIV 18141 . A C 2432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.677;DP=137;Dels=0.00;FS=64.900;HaplotypeScore=11.3301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=4.627;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.630;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,112:137:90:2462,0,90 chrIV 18194 . G A 762.03 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.735;DP=65;Dels=0.00;FS=33.655;HaplotypeScore=9.3391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.65;MQ0=5;MQRankSum=2.543;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.708;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,46:65:19:792,0,19 chrIV 18195 . A C 753.12 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-5.004;DP=62;Dels=0.00;FS=29.167;HaplotypeScore=8.3475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.68;MQ0=5;MQRankSum=2.255;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.074;SB=-2.781e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,43:62:5:784,5,0 chrIV 18200 . A G 662.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.892;DP=61;Dels=0.00;FS=28.501;HaplotypeScore=8.6444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.31;MQ0=5;MQRankSum=2.232;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.203;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,43:61:30:692,0,30 chrIV 18218 . T C 358.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.413;DP=72;Dels=0.00;FS=41.593;HaplotypeScore=4.7595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.96;MQ0=5;MQRankSum=-0.985;QD=4.97;ReadPosRankSum=3.057;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:388,0,593 chrIV 18219 . A G 389.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;DP=72;Dels=0.00;FS=41.593;HaplotypeScore=4.7595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.96;MQ0=5;MQRankSum=-1.138;QD=5.40;ReadPosRankSum=2.879;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:419,0,574 chrIV 18231 . T A 486.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.602;DP=83;Dels=0.00;FS=38.181;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.86;MQ0=7;MQRankSum=-1.971;QD=5.86;ReadPosRankSum=-1.534;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:83:99:516,0,679 chrIV 18264 . T A 246.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.229;DP=118;Dels=0.00;FS=23.247;HaplotypeScore=4.4408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.81;MQ0=8;MQRankSum=-5.169;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.269;SB=-1.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,32:118:99:276,0,1614 chrIV 18303 . C T 489.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.990;DP=139;Dels=0.00;FS=106.718;HaplotypeScore=32.4090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.18;MQ0=7;MQRankSum=-7.811;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,46:139:99:519,0,1917 chrIV 18325 . T C 727.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.984;DP=157;Dels=0.00;FS=68.236;HaplotypeScore=27.3439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.66;MQ0=5;MQRankSum=-9.653;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.357;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,61:157:99:757,0,2221 chrIV 18333 . A G 306.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.696;DP=156;Dels=0.00;FS=18.644;HaplotypeScore=26.1460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.79;MQ0=5;MQRankSum=-5.357;QD=1.96;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,34:156:99:336,0,2624 chrIV 18342 . A G 318.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.324;DP=153;Dels=0.00;FS=15.491;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.29;MQ0=5;MQRankSum=-5.690;QD=2.08;ReadPosRankSum=-2.310;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,35:153:99:348,0,2518 chrIV 18345 . G A 322.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.014;DP=143;Dels=0.00;FS=10.221;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.57;MQ0=4;MQRankSum=-5.169;QD=2.25;ReadPosRankSum=-1.925;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,31:143:99:352,0,2274 chrIV 18351 . A G 234.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.971;DP=140;Dels=0.00;FS=8.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.17;MQ0=2;MQRankSum=-5.190;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.789;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,30:140:99:264,0,2336 chrIV 18369 . T A 68.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;DP=143;Dels=0.00;FS=0.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.10;MQ0=3;MQRankSum=-4.847;QD=0.48;ReadPosRankSum=-3.390;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,30:143:98:98,0,2382 chrIV 18375 . C G 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;DP=143;Dels=0.00;FS=0.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.10;MQ0=3;MQRankSum=-4.609;QD=0.30;ReadPosRankSum=-2.694;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,30:143:73:73,0,2234 chrIV 18376 . T C 34.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.03;MQ0=2;MQRankSum=-5.451;QD=0.25;ReadPosRankSum=-3.152;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,30:135:64:64,0,2236 chrIV 18377 . T C 61.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.536;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.31;MQ0=1;MQRankSum=-5.602;QD=0.45;ReadPosRankSum=-3.066;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,30:135:91:91,0,2292 chrIV 18381 . A G 151.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.489;DP=149;Dels=0.00;FS=5.997;HaplotypeScore=27.5923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.99;MQ0=1;MQRankSum=-6.475;QD=1.01;ReadPosRankSum=-5.703;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,44:149:99:181,0,2251 chrIV 18384 . A G 147.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.643;DP=152;Dels=0.00;FS=5.964;HaplotypeScore=27.5923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.30;MQ0=1;MQRankSum=-6.599;QD=0.97;ReadPosRankSum=-4.711;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,44:152:99:177,0,2378 chrIV 18388 . C G 435.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.606;DP=146;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=27.5921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.90;MQ0=1;MQRankSum=-9.472;QD=2.98;ReadPosRankSum=-4.176;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:465,0,2014 chrIV 18389 . C T 448.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.939;DP=146;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=28.4862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.90;MQ0=1;MQRankSum=-9.597;QD=3.07;ReadPosRankSum=-3.777;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:478,0,1906 chrIV 18426 . C T 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.572;DP=128;Dels=0.00;FS=24.838;HaplotypeScore=8.8041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.74;MQ0=1;MQRankSum=-6.684;QD=0.27;ReadPosRankSum=0.610;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,47:128:65:65,0,1647 chrIV 18456 . A G 199.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.216;DP=111;Dels=0.00;FS=66.869;HaplotypeScore=5.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.87;MQ0=0;MQRankSum=-6.061;QD=1.79;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,33:111:99:229,0,1690 chrIV 18457 . A G 203.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.252;DP=111;Dels=0.00;FS=57.040;HaplotypeScore=5.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.87;MQ0=0;MQRankSum=-6.337;QD=1.83;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,35:111:99:233,0,1665 chrIV 18459 . C T 212.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.305;DP=117;Dels=0.00;FS=56.756;HaplotypeScore=5.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.85;MQ0=1;MQRankSum=-6.526;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,35:117:99:242,0,1724 chrIV 18467 . C G 209.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=113;Dels=0.00;FS=60.373;HaplotypeScore=8.8021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.07;MQ0=1;MQRankSum=-6.658;QD=1.85;ReadPosRankSum=-2.719;SB=-1.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,38:113:99:239,0,1573 chrIV 18477 . G A 177.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.695;DP=113;Dels=0.00;FS=50.384;HaplotypeScore=15.7187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQ0=1;MQRankSum=-6.018;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,29:113:99:207,0,1705 chrIV 18483 . G A 242.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.919;DP=117;Dels=0.00;FS=44.077;HaplotypeScore=8.8376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.05;MQ0=2;MQRankSum=-6.600;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.869;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,33:117:99:272,0,1745 chrIV 18486 . T C 201.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.013;DP=121;Dels=0.00;FS=60.295;HaplotypeScore=7.8879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQ0=2;MQRankSum=-6.518;QD=1.66;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,32:121:99:231,0,1916 chrIV 18495 . A G 58.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.755;DP=109;Dels=0.00;FS=35.158;HaplotypeScore=5.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.68;MQ0=2;MQRankSum=-6.195;QD=0.53;ReadPosRankSum=2.256;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,25:109:88:88,0,1880 chrIV 18504 . A G 166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;DP=112;Dels=0.00;FS=22.298;HaplotypeScore=12.8682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.27;MQ0=2;MQRankSum=-6.673;QD=1.48;ReadPosRankSum=1.540;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:196,0,1778 chrIV 18513 . T C 209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.546;DP=107;Dels=0.00;FS=26.784;HaplotypeScore=9.8828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.58;MQ0=2;MQRankSum=-7.485;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,31:107:99:239,0,1711 chrIV 18516 . A G 242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.016;DP=107;Dels=0.00;FS=17.600;HaplotypeScore=10.8744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.58;MQ0=2;MQRankSum=-7.947;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,34:107:99:272,0,1650 chrIV 18531 . A T 463.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.848;DP=120;Dels=0.00;FS=25.195;HaplotypeScore=22.4601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.72;MQ0=4;MQRankSum=-8.734;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.909;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,44:120:99:493,0,1716 chrIV 18540 . A G 478.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.221;DP=122;Dels=0.00;FS=32.892;HaplotypeScore=25.4459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.86;MQ0=4;MQRankSum=-6.359;QD=3.92;ReadPosRankSum=-3.567;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,47:122:99:508,0,1642 chrIV 18571 . C G 1270.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;DP=174;Dels=0.00;FS=21.596;HaplotypeScore=12.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.57;MQ0=5;MQRankSum=-7.628;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.817;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,78:174:99:1300,0,1930 chrIV 18588 . G A 1520.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.310;DP=167;Dels=0.00;FS=34.357;HaplotypeScore=12.5937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.65;MQ0=4;MQRankSum=-7.472;QD=9.10;ReadPosRankSum=2.687;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,80:167:99:1550,0,1683 chrIV 18590 . T G 1401.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.351;DP=166;Dels=0.00;FS=39.527;HaplotypeScore=10.6110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.56;MQ0=4;MQRankSum=-7.107;QD=8.44;ReadPosRankSum=2.807;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1431,0,1783 chrIV 18624 . T G 1448.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;DP=162;Dels=0.00;FS=75.282;HaplotypeScore=7.2401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.46;MQ0=5;MQRankSum=-6.512;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:162:99:1478,0,1550 chrIV 18651 . G A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;DP=140;Dels=0.00;FS=105.857;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.88;MQ0=3;MQRankSum=-8.091;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.872;SB=-3.888e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1291,0,1253 chrIV 18663 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.057;DP=100;Dels=0.00;FS=115.792;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.03;MQ0=2;MQRankSum=-6.286;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1066,0,801 chrIV 18671 . G C 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;DP=84;Dels=0.00;FS=118.531;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.67;MQ0=2;MQRankSum=-5.832;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.927;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,50:84:99:883,0,581 chrIV 18675 . T C 925.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.525;DP=81;Dels=0.00;FS=95.631;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.74;MQ0=2;MQRankSum=-5.009;QD=11.42;ReadPosRankSum=2.243;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,50:81:99:955,0,547 chrIV 18682 . A G 970.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.191;DP=79;Dels=0.00;FS=83.061;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.93;MQ0=2;MQRankSum=-4.006;QD=12.28;ReadPosRankSum=3.760;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,52:79:99:1000,0,430 chrIV 18683 . G C 953.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.761;DP=78;Dels=0.00;FS=83.061;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.57;MQ0=2;MQRankSum=-4.028;QD=12.22;ReadPosRankSum=3.704;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,52:78:99:983,0,394 chrIV 18853 . T G 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.90;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2909,297,0 chrIV 19144 . T C 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3391,342,0 chrIV 19277 . C T 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3522,355,0 chrIV 19413 . C G 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3361,345,0 chrIV 19609 . T C 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.83;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3592,372,0 chrIV 19790 . A G 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.47;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3441,337,0 chrIV 19934 . C T 3725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9488;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3725,358,0 chrIV 20081 . G A 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.17;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3233,322,0 chrIV 20112 . T G 3989.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.40;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3989,399,0 chrIV 20160 . C G 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3103,312,0 chrIV 20223 . C T 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:3011,292,0 chrIV 20319 . T C 2375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=13.6984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:97:99:2408,240,0 chrIV 20444 . A C 3694.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.13;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3694,361,0 chrIV 20473 . G A 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.63;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3353,334,0 chrIV 20538 . T C 1063.42 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.073;DP=85;Dels=0.00;FS=46.890;HaplotypeScore=283.0107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.65;MQ0=0;MQRankSum=2.006;QD=12.51;ReadPosRankSum=-5.545;SB=-3.164e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,49:85:7:1093,0,7 chrIV 20550 . T C 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.835;DP=89;Dels=0.00;FS=17.833;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.96;MQ0=0;MQRankSum=1.742;QD=9.67;ReadPosRankSum=3.795;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,71:89:99:891,0,297 chrIV 20578 . C T 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.81;MQ0=0;QD=26.89;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3018,295,0 chrIV 20642 . T C 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.49;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3249,318,0 chrIV 20659 . T C 2166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.22;MQ0=0;QD=26.41;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2199,225,0 chrIV 20742 . G C 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=25.67;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2780,288,0 chrIV 20779 . T G 2465 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2498,258,0 chrIV 20785 . G A 2124 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.46;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2157,216,0 chrIV 20789 . C A 2113 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.22;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2146,210,0 chrIV 20969 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.89;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2718,265,0 chrIV 20979 . C G 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3053,309,0 chrIV 20989 . T G 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.85;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3014,309,0 chrIV 21079 . A C 206.02 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.737;DP=103;Dels=0.00;FS=9.771;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.55;MQ0=0;MQRankSum=3.613;QD=2.00;ReadPosRankSum=-4.579;SB=-1.739e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,12:103:23:236,0,23 chrIV 21083 . G T 110.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.85;MQ0=0;QD=1.17;SB=-9.283e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:15:143,15,0 chrIV 21086 . A T 2077 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.85;MQ0=0;QD=22.10;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2110,216,0 chrIV 21113 . G T 1845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.65;MQ0=0;QD=21.21;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1878,192,0 chrIV 21119 . A T 1720 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.09;MQ0=0;QD=21.23;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1753,183,0 chrIV 21165 . G A 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.11;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3122,301,0 chrIV 21268 . T C 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3173,316,0 chrIV 21431 . C T 4642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4642,442,0 chrIV 21510 . A G 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3315,342,0 chrIV 21677 . A G 2549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.01;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2582,273,0 chrIV 21692 . T G 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2760,291,0 chrIV 21759 . A G 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2569,270,0 chrIV 21781 . A G 2319 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2352,246,0 chrIV 21807 . T C 2370 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9035;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2403,252,0 chrIV 21893 . T A 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3111,307,0 chrIV 21929 . A G 4100.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4526;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4100,435,0 chrIV 21964 . A G 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3984,406,0 chrIV 22006 . A G 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.892e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3596,363,0 chrIV 22049 . G T 2521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.82;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2554,261,0 chrIV 22139 . C G 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2628,273,0 chrIV 22166 . A G 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3026,312,0 chrIV 22312 . T C 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3184,313,0 chrIV 22379 . C T 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3559,331,0 chrIV 22481 . G A 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3621,349,0 chrIV 22513 . A G 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3807,385,0 chrIV 22594 . A G 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3022,303,0 chrIV 22713 . C T 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3193,313,0 chrIV 22728 . T A 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=28.05;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3478,355,0 chrIV 22889 . A C 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=25.44;ReadPosRankSum=-0.930;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2780,279,0 chrIV 23062 . T C 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3728,387,0 chrIV 23097 . G A 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3423,331,0 chrIV 23647 . T C 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3295,339,0 chrIV 24379 . C T 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=1;QD=27.26;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3626,367,0 chrIV 25365 . G A 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3748,376,0 chrIV 25927 . C T 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3059,300,0 chrIV 26205 . A T 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.963e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3729,369,0 chrIV 26924 . T G 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3099,327,0 chrIV 26950 . C A 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.661;DP=98;Dels=0.00;FS=3.892;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=27.44;ReadPosRankSum=1.308;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2722,246,0 chrIV 27078 . C G 2445 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2478,261,0 chrIV 27235 . T C 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2741,282,0 chrIV 27477 . G A 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3004,306,0 chrIV 27879 . G T 4363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.27;SB=-2.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4363,442,0 chrIV 27985 . A G 2755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2788,282,0 chrIV 28488 . G A 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3499,346,0 chrIV 28639 . T C 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3159,324,0 chrIV 29380 . T C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3732,399,0 chrIV 29908 . G A 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3598,340,0 chrIV 30404 . C T 3871.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.88;SB=-2.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3871,364,0 chrIV 30468 . G T 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3293,342,0 chrIV 30545 . T C 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3340,331,0 chrIV 31202 . G A 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=28.14;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3884,385,0 chrIV 31224 . G T 4174.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4174,397,0 chrIV 31253 . C T 4346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4346,406,0 chrIV 31492 . G A 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=137;Dels=0.00;FS=3.172;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.429;SB=-1.928e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3524,337,0 chrIV 31511 . A G 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3442,351,0 chrIV 31685 . C T 4321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=28.24;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4321,421,0 chrIV 32605 . C T 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.09;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3508,340,0 chrIV 33153 . G A 2679 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2712,256,0 chrIV 33219 . C T 2196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.40;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2229,222,0 chrIV 33230 . T A 1922 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.33;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1955,195,0 chrIV 33236 . G A 1767 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.77;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1800,180,0 chrIV 33239 . G C 1734 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.87;MQ0=0;QD=21.95;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1767,183,0 chrIV 33253 . A T 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.67;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3017,300,0 chrIV 34063 . C T 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3258,325,0 chrIV 34077 . A G 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4041,405,0 chrIV 34338 . T C 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=1;QD=26.09;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3112,321,0 chrIV 35164 . A G 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3540,357,0 chrIV 36417 . C T 4705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;DP=172;Dels=0.00;FS=3.270;HaplotypeScore=1.8218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=27.35;ReadPosRankSum=1.712;SB=-2.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:172:99:4705,445,0 chrIV 36708 . C T 4329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.40;SB=-2.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4329,403,0 chrIV 36896 . C T 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3982,379,0 chrIV 37123 . C T 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3146,315,0 chrIV 38200 . C T 5110.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=28.23;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:5110,499,0 chrIV 39021 . G T 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=28.05;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3366,331,0 chrIV 40439 . T C 3972.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3972,411,0 chrIV 40965 . G C 4053.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.32;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4053,411,0 chrIV 41590 . T C 3660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3660,384,0 chrIV 41978 . A G 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3012,318,0 chrIV 42278 . C T 4336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4336,430,0 chrIV 42343 . G A 4783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4783,463,0 chrIV 42356 . G C 4732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4732,466,0 chrIV 42471 . C A 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3850,373,0 chrIV 42484 . G A 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2880,288,0 chrIV 43611 . G A 4131.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4131,406,0 chrIV 43892 . A G 738.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.952;DP=118;Dels=0.00;FS=89.281;HaplotypeScore=134.8847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.51;MQ0=0;MQRankSum=2.609;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.773;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,84:118:9:771,9,0 chrIV 43901 . G A 1410 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=48.2921;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;QD=14.24;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:1443,156,0 chrIV 44367 . T C 3839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.83;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3839,393,0 chrIV 45363 . T C 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3850,399,0 chrIV 45804 . T C 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3212,330,0 chrIV 46068 . G C 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3361,339,0 chrIV 46090 . C G 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3161,330,0 chrIV 46115 . G A 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=28.44;ReadPosRankSum=-1.466;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:118:99:3356,340,0 chrIV 46164 . T A 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.84;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3341,345,0 chrIV 46179 . T G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.66;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3268,345,0 chrIV 46259 . A T 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2902,291,0 chrIV 46818 . G A 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3312,325,0 chrIV 46848 . T C 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3569,369,0 chrIV 47364 . C T 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=22.26;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2571,270,0 chrIV 47365 . T C 2463 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=21.61;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2496,273,0 chrIV 48046 . A G 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2789,285,0 chrIV 48149 . A C 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3568,372,0 chrIV 48241 . T C 4181.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97;SB=-2.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4181,424,0 chrIV 48267 . G T 4916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4916,478,0 chrIV 48349 . G A 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.622;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=27.98;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3526,336,0 chrIV 48549 . G A 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3080,315,0 chrIV 48826 . G A 4196.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.90;SB=-2.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4196,412,0 chrIV 49108 . C T 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3804,367,0 chrIV 49143 . C T 4131.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4131,415,0 chrIV 49229 . T C 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3133,312,0 chrIV 49754 . A T 2560 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2593,253,0 chrIV 50294 . C T 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.49;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2276,222,0 chrIV 50502 . C T 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3098,301,0 chrIV 51529 . T A 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.49;SB=-2.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3920,400,0 chrIV 51859 . T C 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;DP=120;Dels=0.00;FS=3.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=26.30;ReadPosRankSum=1.443;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3189,330,0 chrIV 51985 . T C 4101.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=27.34;SB=-2.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4101,409,0 chrIV 52093 . C T 4180.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4180,418,0 chrIV 52421 . T C 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.610;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6686;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.254;QD=24.70;ReadPosRankSum=0.968;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,149:151:99:3730,349,0 chrIV 52423 . C T 4042.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4042,397,0 chrIV 52556 . G A 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3772,379,0 chrIV 53283 . G T 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1028;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3846,388,0 chrIV 53471 . G A 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.44;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3179,325,0 chrIV 53787 . C A 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2992,292,0 chrIV 53890 . A G 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5855;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3346,336,0 chrIV 54379 . A G 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=123;Dels=0.00;FS=4.988;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=27.15;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3339,330,0 chrIV 54490 . C T 3658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3658,361,0 chrIV 55290 . A G 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;DP=127;Dels=0.00;FS=3.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=24.91;ReadPosRankSum=0.368;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3197,308,0 chrIV 56817 . C T 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3112,304,0 chrIV 56962 . T A 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0418;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.95;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3069,298,0 chrIV 57037 . C A 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.88;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3184,313,0 chrIV 57157 . T G 2030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=63.17;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2063,213,0 chrIV 58177 . G A 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3129,312,0 chrIV 58661 . A G 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.896;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=25.59;ReadPosRankSum=1.159;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3711,348,0 chrIV 58765 . T A 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.643;DP=117;Dels=0.00;FS=3.869;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=27.13;ReadPosRankSum=-0.755;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3207,305,0 chrIV 59062 . T A 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=28.06;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3035,301,0 chrIV 59068 . T C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2931,303,0 chrIV 59114 . C T 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2993,295,0 chrIV 62021 . C T 4043.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4043,409,0 chrIV 62075 . A G 4059.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4059,415,0 chrIV 62157 . A G 4201.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=1;QD=23.73;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:177:99:4201,427,0 chrIV 62726 . T C 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=22.07;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:3685,381,0 chrIV 62804 . A G 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=22.10;SB=-2.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:3801,396,0 chrIV 62811 . A G 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=20.36;SB=-2.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:3584,375,0 chrIV 62951 . C T 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6776;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=27.31;ReadPosRankSum=1.460;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3824,368,0 chrIV 63385 . C G 4206.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.96;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4206,418,0 chrIV 63606 . A G 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3357,337,0 chrIV 63839 . G C 4349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.68;SB=-2.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4349,459,0 chrIV 63945 . T A 4010.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:4010,400,0 chrIV 64151 . T C 4330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4330,454,0 chrIV 65250 . T C 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3312,339,0 chrIV 65350 . T C 4216.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4216,427,0 chrIV 65456 . G A 4570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4570,433,0 chrIV 65822 . C A 4337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.62;SB=-2.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4337,421,0 chrIV 66230 . T C 4222.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4222,421,0 chrIV 66345 . G C 3970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3970,405,0 chrIV 66381 . G A 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3256,325,0 chrIV 66478 . T C 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=1;QD=24.22;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3415,366,0 chrIV 66552 . G T 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21;SB=-2.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3918,379,0 chrIV 66688 . C T 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3322,334,0 chrIV 66945 . A G 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3661,370,0 chrIV 67121 . C T 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3676,355,0 chrIV 67354 . T C 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3114,318,0 chrIV 67529 . A C 2338 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2371,237,0 chrIV 67659 . T C 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.131;DP=119;Dels=0.00;FS=3.197;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=24.39;ReadPosRankSum=1.528;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2935,279,0 chrIV 67718 . A G 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3636,367,0 chrIV 67805 . A C 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3055,315,0 chrIV 67840 . T C 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=112.1252;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.27;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3124,312,0 chrIV 67845 . G C 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=118.2836;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3119,321,0 chrIV 67866 . G A 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3675,352,0 chrIV 68082 . G A 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.391;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.254;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.747;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,124:126:99:3290,308,0 chrIV 68235 . A G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.60;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3302,325,0 chrIV 68451 . T C 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3085,324,0 chrIV 68677 . T C 4097.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4097,426,0 chrIV 68840 . T C 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3575,355,0 chrIV 69465 . T G 2733 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2766,276,0 chrIV 69621 . G T 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3546,346,0 chrIV 69675 . T A 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.94;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3078,298,0 chrIV 69815 . A G 3709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3709,370,0 chrIV 69920 . C A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3723,364,0 chrIV 69990 . A G 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3494,360,0 chrIV 70457 . A G 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3424,354,0 chrIV 70481 . C T 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=28.39;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3804,373,0 chrIV 70718 . C T 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2980,292,0 chrIV 70900 . G A 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2989,301,0 chrIV 71168 . T G 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3655,366,0 chrIV 71207 . C T 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3598,358,0 chrIV 71264 . A G 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3865,391,0 chrIV 71523 . T G 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3525,360,0 chrIV 71645 . C T 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3641,352,0 chrIV 71962 . T C 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3264,324,0 chrIV 72290 . T C 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3305,336,0 chrIV 72338 . C T 2791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2824,271,0 chrIV 72373 . G A 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2629,249,0 chrIV 72485 . C T 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3281,325,0 chrIV 72869 . G A 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3860,379,0 chrIV 72872 . A G 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3662,364,0 chrIV 72956 . T C 3948.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3948,403,0 chrIV 73193 . C A 4965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.43;SB=-2.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4965,493,0 chrIV 73466 . G T 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3707,367,0 chrIV 73760 . C T 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3239,304,0 chrIV 74637 . A T 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3376,331,0 chrIV 74684 . C T 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3527,334,0 chrIV 74731 . G A 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3188,310,0 chrIV 74965 . G C 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2801,291,0 chrIV 75082 . G A 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3529,355,0 chrIV 75776 . C A 4813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=27.66;SB=-2.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4813,475,0 chrIV 76252 . T A 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4011,394,0 chrIV 76353 . G A 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3350,325,0 chrIV 76974 . A G 2176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2209,219,0 chrIV 77029 . T C 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.58;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3051,306,0 chrIV 77295 . A G 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8656;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3699,376,0 chrIV 77418 . T C 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2771,291,0 chrIV 77733 . A G 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9427;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3044,309,0 chrIV 78196 . C T 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=28.71;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3531,358,0 chrIV 78270 . T C 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2523,261,0 chrIV 78578 . G A 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=28.17;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3437,343,0 chrIV 78587 . C T 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.84;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3307,328,0 chrIV 78590 . A G 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3132,315,0 chrIV 78617 . G C 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3165,312,0 chrIV 78644 . T A 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3337,316,0 chrIV 78728 . C T 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3376,331,0 chrIV 78945 . C G 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2840,282,0 chrIV 79219 . A G 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3125,321,0 chrIV 79367 . G C 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=1;QD=26.95;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3051,309,0 chrIV 80046 . G A 4827.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.12;SB=-2.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4827,463,0 chrIV 80602 . G A 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3761,379,0 chrIV 80612 . A G 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3331,354,0 chrIV 81776 . T C 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3553,352,0 chrIV 81868 . A G 4145.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.74;SB=-2.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4145,415,0 chrIV 82474 . G A 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2588,258,0 chrIV 82548 . T C 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5911;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=1;QD=25.94;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3295,345,0 chrIV 82687 . A G 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3452,345,0 chrIV 82754 . A T 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3849,385,0 chrIV 82818 . A G 4228.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.93;SB=-2.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4228,438,0 chrIV 83386 . C T 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=3.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=27.71;ReadPosRankSum=-1.341;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3713,349,0 chrIV 83723 . G A 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.93;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3296,325,0 chrIV 83830 . C T 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.924e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3897,388,0 chrIV 84159 . T C 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3743,370,0 chrIV 84201 . T C 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3140,324,0 chrIV 84392 . T C 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2671,279,0 chrIV 84899 . G A 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3705,379,0 chrIV 85442 . T C 2474 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2507,255,0 chrIV 87227 . C T 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3769,355,0 chrIV 87483 . G A 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=28.60;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3746,370,0 chrIV 87993 . C T 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7453;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.01;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3902,385,0 chrIV 88145 . A G 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3361,345,0 chrIV 88160 . A T 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3654,349,0 chrIV 88301 . T C 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3231,330,0 chrIV 88514 . G C 2544 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2577,264,0 chrIV 88736 . A G 2476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2509,255,0 chrIV 88760 . G A 2397 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2430,234,0 chrIV 89333 . C T 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2950,286,0 chrIV 89420 . A C 1913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.85;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1946,210,0 chrIV 89537 . A G 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2755,282,0 chrIV 89546 . A G 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2752,282,0 chrIV 89588 . C T 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2717,262,0 chrIV 90575 . G A 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3379,334,0 chrIV 90577 . C T 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3422,340,0 chrIV 90638 . A C 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3202,327,0 chrIV 90975 . G A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3540,340,0 chrIV 91201 . T C 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3117,318,0 chrIV 91318 . T C 2395 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2428,249,0 chrIV 91325 . G T 2398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2431,237,0 chrIV 91537 . A G 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3876,387,0 chrIV 91555 . T C 3969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.61;SB=-2.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3969,385,0 chrIV 91807 . A G 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.71;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2913,303,0 chrIV 94411 . G A 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.618;DP=121;Dels=0.00;FS=4.015;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.129;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3284,319,0 chrIV 94538 . T G 3886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3886,399,0 chrIV 94715 . T G 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3656,381,0 chrIV 95016 . T G 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3568,363,0 chrIV 95033 . C T 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3444,337,0 chrIV 95036 . C A 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.611;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.587;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3582,352,0 chrIV 95230 . C T 4501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=27.28;SB=-2.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4501,451,0 chrIV 95871 . A G 2571 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2604,273,0 chrIV 96072 . T G 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2827,279,0 chrIV 96121 . G A 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2786,268,0 chrIV 96124 . T A 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2820,276,0 chrIV 96160 . C T 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2747,264,0 chrIV 96217 . T C 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2960,303,0 chrIV 96268 . G A 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=111;Dels=0.00;FS=3.732;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=27.00;ReadPosRankSum=1.451;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:3030,273,0 chrIV 96364 . C T 2315 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.309;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:90:99:2348,215,0 chrIV 96663 . G A 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3609,349,0 chrIV 96799 . T C 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3162,324,0 chrIV 97285 . T C 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2838,285,0 chrIV 98294 . G A 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3339,331,0 chrIV 98297 . T A 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=29.00;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3335,328,0 chrIV 98345 . T C 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3482,357,0 chrIV 98435 . C T 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2707,262,0 chrIV 98507 . C T 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3513,340,0 chrIV 98744 . A G 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2910,303,0 chrIV 98807 . G A 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2946,309,0 chrIV 99245 . G A 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9085;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3514,334,0 chrIV 99689 . A G 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3365,342,0 chrIV 99908 . C A 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3087,300,0 chrIV 99917 . A G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3113,315,0 chrIV 100715 . A G 3390.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3390,354,0 chrIV 100717 . G A 3490.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=27.27;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3490,331,0 chrIV 100723 . G A 2986 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.45;MQ0=0;QD=27.91;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3019,306,0 chrIV 100815 . G A 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=1;QD=27.20;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3052,307,0 chrIV 100993 . A G 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2982,297,0 chrIV 101275 . T G 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3646,378,0 chrIV 101584 . T G 2514 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2547,264,0 chrIV 101608 . G A 2707 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.91;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2740,273,0 chrIV 101707 . C T 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3384,337,0 chrIV 101871 . G A 4508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=1;QD=26.99;SB=-2.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4508,427,0 chrIV 102008 . G A 4103.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4103,415,0 chrIV 102763 . G A 4630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4630,463,0 chrIV 102841 . C T 4424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.14;SB=-2.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4424,436,0 chrIV 103051 . C T 4056.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4056,394,0 chrIV 103054 . T C 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4061,411,0 chrIV 103171 . T C 3588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3588,381,0 chrIV 103365 . A T 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3510,337,0 chrIV 103456 . T C 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.994e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3920,394,0 chrIV 103585 . A T 4096.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.04;MQ0=0;QD=28.25;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4096,394,0 chrIV 103700 . A G 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=1;QD=25.40;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2573,270,0 chrIV 104093 . A G 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3134,310,0 chrIV 104219 . A G 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3343,321,0 chrIV 104599 . T A 3980.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3980,379,0 chrIV 104780 . G A 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.23;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2859,285,0 chrIV 104854 . C T 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3982,397,0 chrIV 105189 . T C 4005.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4573;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=24.88;SB=-2.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4005,420,0 chrIV 105197 . T C 4553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=178;Dels=0.00;FS=3.261;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=25.58;ReadPosRankSum=0.564;SB=-2.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,177:178:99:4553,469,0 chrIV 105294 . G C 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5023;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=22.17;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3226,348,0 chrIV 105308 . C G 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3266;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.66;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:118:99:2780,297,0 chrIV 105345 . T C 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3197,342,0 chrIV 105366 . C T 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.06;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3370,337,0 chrIV 105373 . G A 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=25.20;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3579,352,0 chrIV 105391 . T C 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2905,309,0 chrIV 105636 . C T 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3437,334,0 chrIV 105673 . T C 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3355,354,0 chrIV 105784 . A G 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3851,391,0 chrIV 105853 . G A 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9615;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3648,346,0 chrIV 106053 . C T 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3585,349,0 chrIV 106123 . A T 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3299,322,0 chrIV 106143 . C A 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3414,328,0 chrIV 106440 . T A 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.86;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3734,364,0 chrIV 106513 . T C 4209.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4209,427,0 chrIV 106620 . A T 4106.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.665;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=26.49;ReadPosRankSum=0.637;SB=-2.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:4106,381,0 chrIV 106727 . A G 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.59;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3015,318,0 chrIV 106754 . C G 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3703,382,0 chrIV 106767 . G A 4352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=147.1271;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.18;MQ0=0;QD=26.70;SB=-2.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:99:4352,430,0 chrIV 106842 . C T 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3630,361,0 chrIV 106846 . T C 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3370,360,0 chrIV 107282 . T C 3623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3623,381,0 chrIV 107346 . T C 4756.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28;SB=-2.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4756,495,0 chrIV 107546 . G C 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3535,375,0 chrIV 107750 . G A 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.38;SB=-2.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3746,364,0 chrIV 108611 . C T 4219.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4219,412,0 chrIV 108917 . G A 3895.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=28.43;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3895,382,0 chrIV 109021 . C A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.779;DP=117;Dels=0.00;FS=5.739;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1160,0,1415 chrIV 109279 . G A 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2774,279,0 chrIV 109468 . C T 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3271,322,0 chrIV 109530 . C T 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3500,346,0 chrIV 109836 . A G 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.92;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3143,327,0 chrIV 110285 . C T 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3689,346,0 chrIV 110696 . T C 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3758,370,0 chrIV 110881 . A G 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3060,318,0 chrIV 111349 . A G 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3052,312,0 chrIV 111521 . T C 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2852,288,0 chrIV 111716 . C T 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=27.98;ReadPosRankSum=1.700;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:3027,278,0 chrIV 112605 . T C 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3154,330,0 chrIV 112809 . T C 3613.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3613,360,0 chrIV 113334 . A G 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2844,291,0 chrIV 113346 . C T 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3135,307,0 chrIV 113458 . G A 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.68;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3075,301,0 chrIV 113472 . A T 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3416,340,0 chrIV 113547 . G A 3110 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.51;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3143,322,0 chrIV 113548 . T A 3088 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=23.04;ReadPosRankSum=1.241;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3121,319,0 chrIV 113554 . T C 3052 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.24;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3085,315,0 chrIV 114010 . T G 4062.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.590;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=25.39;ReadPosRankSum=1.390;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,158:160:99:4062,401,0 chrIV 114147 . C T 3556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3556,352,0 chrIV 114170 . T G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3358,345,0 chrIV 114468 . C T 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3244,316,0 chrIV 114542 . T A 2451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:94:99:2484,249,0 chrIV 114797 . T C 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3203,321,0 chrIV 115328 . T C 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3631,372,0 chrIV 115385 . C T 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.91;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3545,358,0 chrIV 115568 . C T 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:133:99:3516,346,0 chrIV 115939 . A G 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2987,300,0 chrIV 116482 . A G 4153.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4153,427,0 chrIV 116794 . G A 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3135,310,0 chrIV 117135 . T C 2179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.74;MQ0=0;QD=22.23;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2212,231,0 chrIV 117352 . G A 4108.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4108,394,0 chrIV 117353 . G A 4125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.92;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.966e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4125,394,0 chrIV 117535 . G A 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3032,295,0 chrIV 117536 . G A 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3043,295,0 chrIV 117622 . T C 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3339,351,0 chrIV 117799 . C T 4013.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.33;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:4013,388,0 chrIV 117891 . T C 2370 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2403,246,0 chrIV 117913 . A G 1986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=27.21;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2019,201,0 chrIV 117959 . C T 2219 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.18;MQ0=0;QD=28.09;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2252,228,0 chrIV 118023 . A G 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.43;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3379,340,0 chrIV 118053 . G A 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.38;MQ0=0;QD=27.83;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3122,307,0 chrIV 118130 . A G 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.19;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3289,336,0 chrIV 118971 . T C 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.28;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2714,282,0 chrIV 119301 . G A 3768.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3768,370,0 chrIV 119568 . C T 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:3022,292,0 chrIV 119603 . A G 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2880,297,0 chrIV 120852 . G T 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.407;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=27.00;ReadPosRankSum=0.650;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3456,324,0 chrIV 121089 . C T 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.04;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2637,261,0 chrIV 121098 . A G 2472 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.22;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2505,258,0 chrIV 121296 . G A 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3084,298,0 chrIV 121593 . G A 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3136,319,0 chrIV 121624 . T C 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2809,288,0 chrIV 121990 . C T 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3374,331,0 chrIV 122142 . T C 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3109,304,0 chrIV 122163 . C T 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3076,301,0 chrIV 122524 . G A 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3343,322,0 chrIV 122546 . G A 3532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3532,360,0 chrIV 122569 . A G 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3319,342,0 chrIV 122596 . A G 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3151,316,0 chrIV 122629 . C T 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3374,345,0 chrIV 122656 . T C 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2570,264,0 chrIV 122724 . G A 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3609,349,0 chrIV 123113 . C A 4029.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4029,388,0 chrIV 123193 . C A 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3805,358,0 chrIV 123559 . A G 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3438,348,0 chrIV 123695 . G T 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3229,319,0 chrIV 123745 . A G 2441 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2474,261,0 chrIV 124321 . C T 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3373,334,0 chrIV 124630 . A G 3092.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.617;DP=169;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=6.4186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.89;MQ0=6;MQRankSum=0.710;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.507;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,139:169:99:3122,0,168 chrIV 124666 . C T 4131.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.97;MQ0=17;QD=24.74;SB=-2.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,160:167:99:4131,409,0 chrIV 125130 . T C 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3209,339,0 chrIV 126981 . C T 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.369;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3915;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=26.94;ReadPosRankSum=0.875;SB=-2.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,151:153:99:4122,362,0 chrIV 127476 . T C 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3607,369,0 chrIV 129270 . G A 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2984,292,0 chrIV 130086 . T G 4042.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4042,397,0 chrIV 130517 . G T 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=28.20;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3248,316,0 chrIV 130640 . G A 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3440,334,0 chrIV 130711 . G A 4442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.09;SB=-2.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4442,424,0 chrIV 130869 . C A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.00;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2997,292,0 chrIV 130934 . T G 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2905,294,0 chrIV 130967 . C A 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3403,337,0 chrIV 131075 . C T 4595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.19;SB=-2.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4595,448,0 chrIV 131512 . A G 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3433,360,0 chrIV 131626 . T C 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3165,327,0 chrIV 131677 . C T 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=28.44;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3754,370,0 chrIV 131889 . C T 5282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.09;SB=-2.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:5282,496,0 chrIV 132259 . G A 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3414,328,0 chrIV 132280 . G A 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3411,334,0 chrIV 132292 . A G 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3093,304,0 chrIV 132560 . G A 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4383;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2948,292,0 chrIV 132709 . C A 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3233,316,0 chrIV 132747 . T A 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=28.70;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3789,382,0 chrIV 133024 . C A 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.60;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2665,267,0 chrIV 133127 . A G 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3494,354,0 chrIV 133571 . A G 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.53;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3031,306,0 chrIV 134051 . T C 3623.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.68;MQ0=6;QD=25.34;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3623,375,0 chrIV 134762 . C T 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3320,331,0 chrIV 135397 . T C 2232 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.66;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2265,231,0 chrIV 136940 . A G 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3877,402,0 chrIV 136987 . G A 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3809,382,0 chrIV 137047 . G A 3764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3764,379,0 chrIV 137158 . C T 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3736,370,0 chrIV 137357 . T C 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3626,364,0 chrIV 137498 . C T 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.24;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3103,310,0 chrIV 137867 . G T 116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=3.31;ReadPosRankSum=-3.329;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:146,0,228 chrIV 138066 . A C 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=24.65;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2818,291,0 chrIV 139681 . C A 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.55;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3334,337,0 chrIV 140094 . G A 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3845,367,0 chrIV 140397 . A G 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:104:99:2628,273,0 chrIV 140808 . T C 2321 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=22.53;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2354,243,0 chrIV 140835 . A C 2359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=21.45;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2392,246,0 chrIV 140862 . C T 2593 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2626,258,0 chrIV 140967 . T C 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2559,264,0 chrIV 141831 . G T 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3604,340,0 chrIV 142408 . A G 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2972,300,0 chrIV 143626 . C T 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2984,283,0 chrIV 143902 . C G 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2941,300,0 chrIV 145686 . A G 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.192;DP=141;Dels=0.00;FS=4.168;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=22.84;ReadPosRankSum=1.241;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3254,311,0 chrIV 145687 . T G 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;DP=136;Dels=0.00;FS=4.011;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=24.72;ReadPosRankSum=1.375;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3362,314,0 chrIV 145805 . T A 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=120.2944;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:134:99:3663,367,0 chrIV 146231 . T A 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3718,367,0 chrIV 146675 . A C 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.933e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3717,373,0 chrIV 146729 . A G 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3812,393,0 chrIV 147362 . C T 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3667,361,0 chrIV 147377 . T C 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3453,354,0 chrIV 147467 . G A 4174.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:4174,406,0 chrIV 147548 . A G 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3576,366,0 chrIV 147986 . T C 4872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4872,478,0 chrIV 148010 . T G 4450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.57;SB=-2.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4450,450,0 chrIV 148141 . C G 4131.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.940;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=27.00;ReadPosRankSum=1.619;SB=-2.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4131,384,0 chrIV 148274 . T C 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3797,402,0 chrIV 148598 . A T 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3704,378,0 chrIV 148745 . C T 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0703;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3538,364,0 chrIV 148986 . T C 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2774,291,0 chrIV 149003 . C T 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=28.12;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2873,283,0 chrIV 149500 . A G 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3504,349,0 chrIV 149608 . G A 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=23.64;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3404,343,0 chrIV 149689 . T C 4589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.93;SB=-2.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4589,463,0 chrIV 150172 . A G 4725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1611;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.27;SB=-2.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:187:99:4725,486,0 chrIV 150223 . A G 4581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.74;SB=-2.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4581,454,0 chrIV 150307 . A G 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3812,381,0 chrIV 150382 . G C 4706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9453;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4706,478,0 chrIV 150553 . A G 4178.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4178,427,0 chrIV 150658 . A G 4177.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4177,409,0 chrIV 150838 . T C 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3606,361,0 chrIV 154611 . A G 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3404,343,0 chrIV 155343 . G T 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3387,328,0 chrIV 155368 . C A 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3590,358,0 chrIV 155835 . T C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.30;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3136,339,0 chrIV 155900 . G A 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3684,367,0 chrIV 156473 . T C 2774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.566;DP=105;Dels=0.00;FS=3.181;HaplotypeScore=7.8634;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.699;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:105:99:2807,285,0 chrIV 156591 . G A 4105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.93;SB=-1.966e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4105,412,0 chrIV 156943 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.647;DP=129;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=5.8509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1412,0,1422 chrIV 157038 . A G 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.522;DP=148;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=0.870;QD=10.08;ReadPosRankSum=2.367;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1522,0,1669 chrIV 157244 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.924;DP=107;Dels=0.00;FS=1.571;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1402,0,1079 chrIV 157266 . T C 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.469;DP=107;Dels=0.00;FS=3.603;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.611;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:107:99:1100,0,1251 chrIV 157424 . T C 2481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.12;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2514,264,0 chrIV 157757 . C T 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.304;DP=108;Dels=0.00;FS=7.531;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1450,0,879 chrIV 157918 . T C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.716;DP=114;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.979;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1178,0,1238 chrIV 157927 . G A 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.380;DP=117;Dels=0.00;FS=10.318;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:117:99:1190,0,1189 chrIV 157945 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.354;DP=135;Dels=0.00;FS=14.407;HaplotypeScore=3.8289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.352;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1366,0,1338 chrIV 157969 . A G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.376;DP=130;Dels=0.00;FS=21.486;HaplotypeScore=51.0332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:130:99:1226,0,1222 chrIV 158013 . C A 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.195;DP=110;Dels=0.00;FS=13.243;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=9.29;ReadPosRankSum=2.374;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1052,0,951 chrIV 158023 . C G 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=128;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=3.4948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=7.10;ReadPosRankSum=3.193;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:939,0,1332 chrIV 158032 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.381;DP=119;Dels=0.00;FS=7.047;HaplotypeScore=4.2828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.237;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1103,0,1207 chrIV 158137 . G A 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3340,325,0 chrIV 158154 . G A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.115;DP=127;Dels=0.00;FS=7.035;HaplotypeScore=4.3766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:127:99:1258,0,1386 chrIV 158331 . T G 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.212;DP=151;Dels=0.00;FS=2.074;HaplotypeScore=5.7561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1376,0,1877 chrIV 158474 . T C 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3342,339,0 chrIV 158505 . T A 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3777,361,0 chrIV 158510 . T C 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3661,364,0 chrIV 158749 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=28.36;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3268,328,0 chrIV 158929 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.545;DP=136;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=2.5562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1401,0,1442 chrIV 158966 . T C 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.576;DP=124;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1392,0,1264 chrIV 158981 . A C 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3678,376,0 chrIV 159017 . A G 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3228,319,0 chrIV 159085 . A C 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.141;DP=114;Dels=0.00;FS=7.265;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1083,0,1430 chrIV 159133 . C T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.214;DP=128;Dels=0.00;FS=5.415;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.263;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:128:99:1437,0,1208 chrIV 159190 . A G 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3101,324,0 chrIV 159238 . C A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.497;DP=118;Dels=0.00;FS=3.428;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.740;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.051;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1251,0,1367 chrIV 159284 . A C 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.520;DP=151;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=7.8140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=1;MQRankSum=-1.083;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.884;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1603,0,1628 chrIV 159315 . G A 1446.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;DP=132;Dels=0.00;FS=6.673;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.381;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1476,0,1469 chrIV 159318 . T C 1289.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.467;DP=136;Dels=0.00;FS=9.369;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.597;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1319,0,1566 chrIV 159320 . G C 1320.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;DP=140;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1350,0,1509 chrIV 159428 . T C 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3490,343,0 chrIV 159505 . T C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.691;DP=116;Dels=0.00;FS=5.689;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.202;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1280,0,1170 chrIV 159513 . T C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.050;DP=120;Dels=0.00;FS=15.197;HaplotypeScore=4.3852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.667;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1242,0,1358 chrIV 159602 . C G 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3399,342,0 chrIV 159777 . C T 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.790;DP=126;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=4.9718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.792;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,49:126:99:1024,0,1706 chrIV 159954 . T C 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3258,330,0 chrIV 160071 . G A 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.724;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.065;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:789,0,846 chrIV 160218 . C T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.927;DP=109;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=3.9276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.361;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1277,0,1021 chrIV 160520 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.732;DP=113;Dels=0.00;FS=2.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.500;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1366,0,1042 chrIV 160523 . A G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;DP=111;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.040;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1072,0,1358 chrIV 160552 . G A 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.003;DP=100;Dels=0.00;FS=2.663;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:1084,0,1051 chrIV 160615 . G A 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.981;DP=98;Dels=0.00;FS=0.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:1013,0,1091 chrIV 160643 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.462;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.363;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1335,0,1123 chrIV 160731 . A G 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:906,0,1191 chrIV 161006 . T C 2386 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2419,249,0 chrIV 161007 . T C 2329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.32;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2362,249,0 chrIV 161194 . T C 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.644;DP=99;Dels=0.00;FS=5.033;HaplotypeScore=2.1514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.180;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:865,0,1191 chrIV 161220 . A G 601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.602;DP=89;Dels=0.00;FS=5.436;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.429;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,37:89:99:631,0,1127 chrIV 161421 . C T 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.50;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3392,328,0 chrIV 161584 . T C 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.323;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.424;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1042,0,967 chrIV 162498 . C A 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.703;DP=117;Dels=0.00;FS=2.360;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1237,0,1029 chrIV 162718 . A T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;DP=101;Dels=0.00;FS=5.066;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1261,0,1000 chrIV 162819 . T C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.663;DP=129;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.707;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1210,0,1531 chrIV 162933 . G A 1938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.842;DP=149;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.999;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,87:149:99:1968,0,1239 chrIV 163031 . T C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.385;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1292,0,1388 chrIV 163217 . G A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;DP=148;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,58:148:99:1212,0,2043 chrIV 163327 . C A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.912;DP=130;Dels=0.00;FS=12.252;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.019;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1290,0,1567 chrIV 163443 . G C 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.358;DP=145;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=6.9349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1410,0,1683 chrIV 163644 . G A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;DP=139;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1609,0,1351 chrIV 163695 . A G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.178;DP=130;Dels=0.00;FS=6.633;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.322;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1461,0,1311 chrIV 163734 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.005;DP=114;Dels=0.00;FS=4.587;HaplotypeScore=2.5221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.307;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1363,0,1088 chrIV 163737 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.332;DP=115;Dels=0.00;FS=5.793;HaplotypeScore=2.5221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1163,0,1275 chrIV 163809 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.666;DP=142;Dels=0.00;FS=1.329;HaplotypeScore=2.7732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-3.183;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1224,0,1624 chrIV 163842 . C A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.592;DP=131;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.09;MQ0=0;MQRankSum=-4.553;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1114,0,1552 chrIV 163851 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.014;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.730;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1170,0,1654 chrIV 163864 . A G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.181;DP=135;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.94;MQ0=0;MQRankSum=-4.224;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.802;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1108,0,1738 chrIV 163869 . C T 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.354;DP=137;Dels=0.00;FS=5.130;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.28;MQ0=0;MQRankSum=-5.089;QD=8.12;ReadPosRankSum=-2.392;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1142,0,1552 chrIV 163896 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.003;DP=118;Dels=0.00;FS=7.393;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1132,0,1331 chrIV 163902 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.155;DP=125;Dels=0.00;FS=3.236;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.461;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.830;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1204,0,1473 chrIV 163967 . A G 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.290;DP=145;Dels=0.00;FS=2.155;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.524;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1586,0,1515 chrIV 164013 . G A 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;DP=145;Dels=0.00;FS=3.014;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=1.815;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.453;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1787,0,1394 chrIV 164045 . T C 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.518;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=2.526;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.213;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,85:141:99:1765,0,1232 chrIV 164089 . C T 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.120;DP=132;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=13.45;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:132:99:1806,0,1083 chrIV 164200 . A G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;DP=105;Dels=0.00;FS=8.232;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.453;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1087,0,1236 chrIV 164238 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;DP=86;Dels=0.00;FS=13.888;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.190;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:911,0,952 chrIV 164256 . G A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.149;DP=87;Dels=0.00;FS=7.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:956,0,1005 chrIV 164281 . C G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.852;DP=134;Dels=0.00;FS=3.283;HaplotypeScore=5.7782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1184,0,1649 chrIV 164439 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.817;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.608;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1579,0,1493 chrIV 164580 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.364;DP=132;Dels=0.00;FS=5.498;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.458;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1513,0,1401 chrIV 164987 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.015;DP=123;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=4.3028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=1;MQRankSum=-3.110;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1166,0,834 chrIV 165233 . G A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;DP=90;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=3.2018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.341;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,55:90:99:1174,0,671 chrIV 165265 . A G 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2618,285,0 chrIV 165290 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.854;DP=113;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.549;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.348;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1141,0,1303 chrIV 165386 . T C 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2782,285,0 chrIV 165509 . T C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.237;DP=138;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.975;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1520,0,1300 chrIV 165538 . A G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.657;DP=120;Dels=0.00;FS=8.437;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1207,0,1471 chrIV 165740 . T C 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3459,351,0 chrIV 165899 . A T 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=13.76;ReadPosRankSum=-1.775;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1571,0,948 chrIV 166025 . T C 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3092,312,0 chrIV 166634 . T C 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3381,348,0 chrIV 169703 . G T 2095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.142;DP=80;Dels=0.00;FS=10.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=26.19;ReadPosRankSum=0.200;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,78:80:99:2128,158,0 chrIV 169833 . G A 2085 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.098;DP=112;Dels=0.00;FS=12.816;HaplotypeScore=41.2429;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=1.922;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.165;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,110:112:99:2118,213,0 chrIV 169837 . A G 161.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.752;DP=109;Dels=0.00;FS=76.420;HaplotypeScore=39.5143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=1.48;ReadPosRankSum=-4.345;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,22:109:99:191,0,1484 chrIV 169839 . A G 275.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.577;DP=108;Dels=0.00;FS=49.462;HaplotypeScore=39.5143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=2.55;ReadPosRankSum=-5.069;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:305,0,1046 chrIV 170698 . G A 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3290,325,0 chrIV 170878 . G T 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3607,346,0 chrIV 172151 . A T 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3320,336,0 chrIV 172218 . T C 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2763,285,0 chrIV 172282 . T C 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=126;Dels=0.00;FS=3.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=24.72;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3148,315,0 chrIV 172513 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.873;DP=130;Dels=0.00;FS=6.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.314;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1374,0,1441 chrIV 172558 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.623;DP=140;Dels=0.00;FS=12.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1259,0,1744 chrIV 172570 . G A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.523;DP=111;Dels=0.00;FS=3.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:969,0,1460 chrIV 172805 . T A 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;DP=142;Dels=0.00;FS=3.005;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1823,0,1333 chrIV 172927 . A G 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.612;DP=142;Dels=0.00;FS=5.407;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.210;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1431,0,1568 chrIV 172966 . G A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.087;DP=140;Dels=0.00;FS=1.344;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:1258,0,1687 chrIV 173380 . C T 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3246,310,0 chrIV 173416 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.142;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.870;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1363,0,1484 chrIV 173461 . C A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;DP=107;Dels=0.00;FS=4.704;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1264,0,1077 chrIV 173563 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.773;DP=108;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.449;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:108:99:1105,0,1226 chrIV 173776 . C T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.939;DP=119;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=2.4637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.407;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1223,0,1303 chrIV 174089 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.358;DP=124;Dels=0.00;FS=4.371;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.353;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1242,0,1387 chrIV 174272 . T G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;DP=120;Dels=0.00;FS=10.161;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.274;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1477,0,1129 chrIV 174369 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.503;DP=97;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1208,0,810 chrIV 174831 . C T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.869;DP=105;Dels=0.00;FS=3.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.369;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1136,0,1184 chrIV 174887 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.814;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1208,0,1035 chrIV 174905 . T C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.449;DP=102;Dels=0.00;FS=0.810;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.395;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1182,0,1116 chrIV 174995 . T C 2119 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.71;MQ0=0;QD=21.19;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2152,231,0 chrIV 174996 . T C 2006 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.71;MQ0=0;QD=20.06;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2039,225,0 chrIV 174998 . G T 2083 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9422;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.58;MQ0=0;QD=19.84;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2116,231,0 chrIV 175067 . G A 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.493;DP=115;Dels=0.01;FS=9.319;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=7.30;ReadPosRankSum=-1.091;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:869,0,1242 chrIV 175307 . C G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.198;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1139,0,1064 chrIV 175406 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.590;DP=126;Dels=0.00;FS=6.787;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1381,0,1243 chrIV 175412 . G T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.006;DP=119;Dels=0.00;FS=5.701;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.170;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1334,0,1282 chrIV 175529 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.950;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1110,0,1302 chrIV 175731 . A C 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.168;DP=123;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=2.716;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.738;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1483,0,1233 chrIV 175847 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.881;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1152,0,1612 chrIV 175931 . T C 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.362;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=1;MQRankSum=-0.329;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1610,0,1237 chrIV 175946 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;DP=128;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=-1.894;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.321;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1271,0,1444 chrIV 175994 . A G 1858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.495;DP=148;Dels=0.00;FS=2.102;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,85:148:99:1888,0,1358 chrIV 176019 . A G 3764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3764,373,0 chrIV 176064 . A G 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.300;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1282,0,1982 chrIV 176273 . C T 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.530;DP=145;Dels=0.00;FS=3.036;HaplotypeScore=8.4687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.586;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1681,0,1311 chrIV 176423 . T C 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3260,333,0 chrIV 176496 . A G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.602;DP=115;Dels=0.00;FS=6.353;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.256;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1142,0,1285 chrIV 176513 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.723;DP=137;Dels=0.00;FS=4.487;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1452,0,1402 chrIV 176519 . T C 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3499,348,0 chrIV 176628 . C T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=28.82;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3285,328,0 chrIV 176919 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.535;DP=131;Dels=0.00;FS=6.758;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1298,0,1459 chrIV 177157 . C G 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.946;DP=173;Dels=0.00;FS=2.815;HaplotypeScore=5.7044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,85:173:99:1667,0,1868 chrIV 177160 . T C 4180.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7044;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4180,421,0 chrIV 177363 . A G 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3420,343,0 chrIV 177633 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=147;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.189;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1337,0,1760 chrIV 177780 . T C 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3336,336,0 chrIV 177807 . C T 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.81;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3504,337,0 chrIV 178267 . A C 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.788;DP=150;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.886;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,65:150:99:1300,0,1907 chrIV 178389 . G A 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3657,352,0 chrIV 178453 . T G 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.370;DP=101;Dels=0.00;FS=2.570;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.365;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:984,0,1250 chrIV 178489 . C G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.384;DP=115;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.771;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1224,0,1126 chrIV 178580 . A C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.410;DP=127;Dels=0.00;FS=4.326;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1322,0,1520 chrIV 178909 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.347;DP=131;Dels=0.00;FS=8.014;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1224,0,1583 chrIV 178930 . G A 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3779,372,0 chrIV 179020 . T C 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.515;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.843;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1548,0,1588 chrIV 179105 . C A 4826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.90;SB=-2.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4826,457,0 chrIV 179134 . C T 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.568;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.525;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,81:173:99:1671,0,2001 chrIV 179240 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.575;DP=117;Dels=0.00;FS=2.387;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.780;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1136,0,1481 chrIV 179245 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.223;DP=116;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.830;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.156;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1389,0,1176 chrIV 179328 . G C 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3529,366,0 chrIV 179480 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.021;DP=130;Dels=0.00;FS=3.131;HaplotypeScore=3.5488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=11.84;ReadPosRankSum=2.174;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1569,0,1288 chrIV 179487 . C G 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3674,370,0 chrIV 179632 . C T 4248.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=27.76;SB=-2.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4248,418,0 chrIV 179651 . A G 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.252;DP=150;Dels=0.00;FS=4.868;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.145;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1517,0,1757 chrIV 179674 . G T 1777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.962;DP=155;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.424;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1807,0,1654 chrIV 179696 . A C 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.128;DP=136;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1607,0,1365 chrIV 179714 . A C 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.288;DP=156;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=1.5750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.197;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1723,0,1604 chrIV 179755 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.589;DP=137;Dels=0.00;FS=3.083;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.009;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1533,0,1335 chrIV 179843 . C T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.749;DP=138;Dels=0.00;FS=2.175;HaplotypeScore=3.3361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1421,0,1651 chrIV 179995 . A G 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.116;DP=143;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1699,0,1412 chrIV 180067 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.322;DP=150;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=2.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1602,0,1600 chrIV 180071 . G A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.316;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1606,0,1637 chrIV 180086 . G A 4988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=27.11;SB=-2.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4988,499,0 chrIV 180121 . G A 4020.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:4020,406,0 chrIV 180183 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.455;DP=130;Dels=0.00;FS=3.171;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.238;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1311,0,1514 chrIV 180228 . A C 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.409;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.047;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1600,0,1712 chrIV 180234 . A G 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.361;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1571,0,1730 chrIV 180355 . G A 1786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.551;DP=150;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.390;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1816,0,1453 chrIV 180382 . A G 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=26.90;ReadPosRankSum=0.948;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3685,378,0 chrIV 180628 . A G 1778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.358;DP=171;Dels=0.00;FS=4.488;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.612;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.377;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,83:171:99:1808,0,2011 chrIV 180644 . A C 4469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:167:99:4469,460,0 chrIV 180937 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.781;DP=101;Dels=0.00;FS=4.332;HaplotypeScore=3.3056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,60:101:99:1481,0,835 chrIV 181049 . G A 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.748;DP=99;Dels=0.00;FS=5.623;HaplotypeScore=5.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=1;MQRankSum=0.135;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.492;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:1049,0,1183 chrIV 181978 . T G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.709;DP=131;Dels=0.00;FS=8.018;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=1;MQRankSum=1.276;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.666;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1202,0,1687 chrIV 181988 . C T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.685;DP=129;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=1.163;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1292,0,1507 chrIV 182019 . G C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.625;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=1.470;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.284;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1031,0,1279 chrIV 182498 . A G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.225;DP=118;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1079,0,1476 chrIV 182600 . G C 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;DP=145;Dels=0.00;FS=4.146;HaplotypeScore=2.7227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1537,0,1454 chrIV 182859 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.495;DP=126;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.063;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1325,0,1536 chrIV 183011 . C T 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.872;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1614,0,1449 chrIV 183645 . C T 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3147,310,0 chrIV 183720 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.780;DP=126;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1357,0,1425 chrIV 183726 . G A 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3673,373,0 chrIV 183756 . T C 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.308;DP=152;Dels=0.00;FS=8.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.739;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1412,0,1694 chrIV 183759 . G T 4037.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.966e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4037,400,0 chrIV 183887 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.629;DP=144;Dels=0.00;FS=7.758;HaplotypeScore=4.3084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=2.947;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.723;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1392,0,1652 chrIV 183912 . A G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.427;DP=135;Dels=0.00;FS=4.119;HaplotypeScore=2.8466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=3.416;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.960;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1215,0,1640 chrIV 183975 . C T 4071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.96;SB=-2.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4071,406,0 chrIV 184169 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.039;DP=126;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.046;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1436,0,1204 chrIV 184221 . A G 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2857,303,0 chrIV 184320 . A G 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3094,318,0 chrIV 184697 . A T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.176;DP=113;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=2;MQRankSum=0.015;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.622;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1191,0,1290 chrIV 184893 . C T 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3362,334,0 chrIV 185023 . T C 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.200;DP=152;Dels=0.00;FS=10.071;HaplotypeScore=2.5664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=0.531;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1631,0,1640 chrIV 185188 . G A 1866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.301;DP=139;Dels=0.00;FS=2.232;HaplotypeScore=1.9900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,82:139:99:1896,0,1203 chrIV 185256 . C T 1908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.734;DP=142;Dels=0.00;FS=4.750;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1938,0,1204 chrIV 185428 . C T 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=1;MQRankSum=5.098;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.029;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1711,0,1292 chrIV 185449 . T C 1450.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.854;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=1;MQRankSum=-1.311;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1480,0,1732 chrIV 185452 . G A 1565.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.351;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=1;MQRankSum=-2.095;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.299;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,79:162:99:1595,0,1769 chrIV 185458 . C G 1465.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;DP=159;Dels=0.01;FS=1.432;HaplotypeScore=15.8495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=1;MQRankSum=-1.695;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.760;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1495,0,1777 chrIV 185528 . G A 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.819;DP=157;Dels=0.00;FS=1.991;HaplotypeScore=1.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1825,0,1612 chrIV 185548 . T C 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.147;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,82:158:99:1672,0,1635 chrIV 185567 . C T 4056.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6868;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4056,400,0 chrIV 185597 . C T 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.350;DP=155;Dels=0.00;FS=2.029;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.064;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1623,0,1711 chrIV 185668 . C T 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.056;DP=136;Dels=0.00;FS=6.581;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1566,0,1368 chrIV 185683 . T C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3624,369,0 chrIV 185704 . A G 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.336;DP=146;Dels=0.00;FS=6.171;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.899;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1558,0,1617 chrIV 185746 . C T 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3476,343,0 chrIV 185783 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.671;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1096,0,1347 chrIV 185908 . G A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;DP=100;Dels=0.00;FS=12.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,60:100:99:1412,0,862 chrIV 186151 . T C 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.583;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.658;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,40:67:99:857,0,573 chrIV 186274 . T C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.444;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.932;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1057,0,1161 chrIV 186841 . C T 4304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4304,415,0 chrIV 187060 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;DP=129;Dels=0.00;FS=4.229;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1577,0,1321 chrIV 187198 . G T 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.433;DP=152;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1604,0,1623 chrIV 187216 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.195;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1585,0,1592 chrIV 187293 . A G 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.350;DP=158;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.570;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1615,0,1958 chrIV 187299 . G A 1845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.786;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.828;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1875,0,1544 chrIV 187556 . C G 1941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.426;DP=173;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.986;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,99:173:99:1971,0,1534 chrIV 187696 . G T 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.978;DP=142;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=10.32;ReadPosRankSum=-2.175;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1496,0,1617 chrIV 187789 . C T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.909;DP=158;Dels=0.00;FS=1.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.332;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,82:158:99:1676,0,1634 chrIV 188103 . C G 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;DP=108;Dels=0.00;FS=11.668;HaplotypeScore=3.8476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1053,0,1251 chrIV 188150 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.786;DP=122;Dels=0.00;FS=4.415;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1060,0,1541 chrIV 188469 . T C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.484;DP=137;Dels=0.00;FS=11.515;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.754;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,59:137:99:1163,0,1777 chrIV 188774 . C T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.622;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:122:99:1624,0,1108 chrIV 189502 . C T 3994.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=28.33;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3994,400,0 chrIV 189732 . G A 4464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4464,433,0 chrIV 190116 . G C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.882;DP=121;Dels=0.00;FS=2.805;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1092,0,1485 chrIV 190140 . G A 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3529,352,0 chrIV 190212 . C A 2637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2670,264,0 chrIV 190248 . G A 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.439;DP=145;Dels=0.00;FS=5.162;HaplotypeScore=3.1248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:145:99:1679,0,1461 chrIV 190497 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.405;DP=130;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=1.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1176,0,1385 chrIV 190604 . T G 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.989;DP=145;Dels=0.00;FS=9.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.988;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1641,0,1493 chrIV 190764 . T C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.722;DP=149;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=6.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=0.469;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,63:149:99:1313,0,1833 chrIV 190810 . C T 4072.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4072,400,0 chrIV 190888 . C G 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.634;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=26.59;ReadPosRankSum=0.577;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3271,312,0 chrIV 191044 . G C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;DP=111;Dels=0.00;FS=29.192;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.277;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1178,0,1189 chrIV 191112 . A G 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3570,358,0 chrIV 191355 . G A 3917.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3917,385,0 chrIV 192247 . T C 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0746;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2940,306,0 chrIV 192278 . G C 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3207,333,0 chrIV 192319 . T C 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;DP=130;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1419,0,1423 chrIV 192451 . G A 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.50;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2868,285,0 chrIV 192473 . T C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.163;DP=107;Dels=0.00;FS=7.642;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.678;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1030,0,1274 chrIV 192839 . C T 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3287,313,0 chrIV 193043 . A G 2197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.34;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2230,237,0 chrIV 193103 . C T 2266 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.90;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2299,231,0 chrIV 193107 . T C 2116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.40;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2149,228,0 chrIV 193118 . A G 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.57;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2530,264,0 chrIV 193121 . C T 2507 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.32;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:94:99:2540,258,0 chrIV 193154 . T C 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.35;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2854,288,0 chrIV 193178 . C T 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3370,328,0 chrIV 193214 . T A 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3138,309,0 chrIV 193229 . C T 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.43;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3175,315,0 chrIV 193242 . T C 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.46;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2936,300,0 chrIV 193254 . A G 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.59;MQ0=0;QD=26.67;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3047,321,0 chrIV 193364 . G A 2861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2894,280,0 chrIV 193567 . G A 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3253,322,0 chrIV 193568 . G A 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.20;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3241,322,0 chrIV 193583 . T C 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.78;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3228,330,0 chrIV 193595 . A G 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3858,390,0 chrIV 193645 . T C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.273;DP=132;Dels=0.00;FS=3.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.190;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1144,0,1657 chrIV 193723 . G A 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3237,316,0 chrIV 194241 . T C 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2729,273,0 chrIV 194352 . A C 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.041;DP=102;Dels=0.00;FS=9.388;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.759;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:864,0,1244 chrIV 194353 . G A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.572;DP=102;Dels=0.00;FS=9.388;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.712;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:966,0,1213 chrIV 195095 . C T 1975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.238;DP=142;Dels=0.00;FS=5.334;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.893;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.347;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,88:142:99:2005,0,1062 chrIV 195098 . C T 2056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.044;DP=143;Dels=0.00;FS=4.136;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=14.38;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,88:143:99:2086,0,1105 chrIV 195160 . G A 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3335,337,0 chrIV 195231 . A T 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;DP=135;Dels=0.00;FS=4.421;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.063;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1491,0,1511 chrIV 195366 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.310;DP=153;Dels=0.00;FS=3.020;HaplotypeScore=3.4101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.057;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,57:153:99:1165,0,2123 chrIV 195463 . A G 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.686;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1623,0,1603 chrIV 195859 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.807;DP=155;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=2.4131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.426;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:154:99:1481,0,1649 chrIV 195920 . A G 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.544;DP=139;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=11.15;ReadPosRankSum=-2.027;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1580,0,1481 chrIV 196014 . A G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.413;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.875;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1211,0,1544 chrIV 196443 . C T 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.894;DP=131;Dels=0.00;FS=3.243;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.928;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,51:131:99:1113,0,1833 chrIV 196482 . A G 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=119;Dels=0.00;FS=8.875;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1600,0,1122 chrIV 196790 . C A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.331;DP=108;Dels=0.00;FS=7.500;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.475;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1104,0,1229 chrIV 196806 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;DP=120;Dels=0.00;FS=7.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.410;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1207,0,1372 chrIV 196851 . A G 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2904,294,0 chrIV 197342 . C T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.135;DP=148;Dels=0.00;FS=4.954;HaplotypeScore=7.8272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1397,0,1713 chrIV 197472 . T C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.612;DP=150;Dels=0.00;FS=2.056;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1348,0,1846 chrIV 197574 . G A 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.235;DP=145;Dels=0.00;FS=2.946;HaplotypeScore=3.6009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1622,0,1308 chrIV 197883 . G C 1786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;DP=153;Dels=0.00;FS=4.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.209;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1816,0,1403 chrIV 198420 . A G 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.384;DP=125;Dels=0.00;FS=5.690;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.463;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1652,0,1166 chrIV 198533 . C G 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.146;DP=183;Dels=0.00;FS=3.528;HaplotypeScore=2.6113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,84:183:99:1617,0,2007 chrIV 198571 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.018;DP=129;Dels=0.00;FS=5.774;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.623;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:129:99:1022,0,1713 chrIV 198656 . T C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.709;DP=159;Dels=0.00;FS=1.978;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.284;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,71:159:99:1428,0,1960 chrIV 198659 . G A 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.533;DP=162;Dels=0.00;FS=3.669;HaplotypeScore=3.3303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.946;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1789,0,1602 chrIV 198734 . T C 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.851;DP=149;Dels=0.00;FS=3.902;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.337;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.067;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1666,0,1540 chrIV 198797 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.592;DP=143;Dels=0.00;FS=4.000;HaplotypeScore=2.3999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,59:143:99:1286,0,1763 chrIV 198950 . A T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.428;DP=122;Dels=0.00;FS=7.159;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.144;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,46:122:99:895,0,1767 chrIV 199259 . G A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.315;DP=123;Dels=0.00;FS=8.420;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=10.74;ReadPosRankSum=2.201;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1351,0,1324 chrIV 199393 . G A 3409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3409,334,0 chrIV 199455 . A G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.749;DP=139;Dels=0.00;FS=4.204;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.104;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.461;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:139:99:1507,0,1491 chrIV 199642 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.379;DP=122;Dels=0.00;FS=10.155;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:122:99:1218,0,1348 chrIV 199779 . A T 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;DP=98;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:1010,0,1164 chrIV 199794 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.065;DP=99;Dels=0.00;FS=1.625;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.096;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,58:99:99:1204,0,902 chrIV 199937 . A G 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3398,343,0 chrIV 200220 . C T 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3423,334,0 chrIV 200331 . C T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.149;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:129:99:1393,0,1416 chrIV 200337 . C T 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3217,336,0 chrIV 200994 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.852;DP=124;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1275,0,1424 chrIV 201039 . T C 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.562;DP=129;Dels=0.00;FS=3.236;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.714;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1516,0,1223 chrIV 201393 . C T 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3822,367,0 chrIV 202117 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.981;DP=139;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.405;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1218,0,1704 chrIV 202127 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.462;DP=138;Dels=0.00;FS=4.119;HaplotypeScore=5.7646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1268,0,1564 chrIV 202229 . T G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.173;DP=158;Dels=0.00;FS=1.270;HaplotypeScore=4.5161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=7.70;ReadPosRankSum=2.226;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,65:158:99:1246,0,2014 chrIV 202448 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.397;DP=117;Dels=0.00;FS=3.498;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=2.505;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.419;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1078,0,1462 chrIV 202579 . T G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.669;DP=140;Dels=0.00;FS=5.000;HaplotypeScore=5.6996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1308,0,1644 chrIV 202591 . A G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.102;DP=148;Dels=0.00;FS=4.917;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1514,0,1634 chrIV 202790 . A T 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;DP=130;Dels=0.00;FS=3.183;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.431;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1680,0,1254 chrIV 203446 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.761;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1171,0,1547 chrIV 203647 . G T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.451;DP=132;Dels=0.00;FS=1.492;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.645;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1407,0,1453 chrIV 203795 . G A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.419;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1221,0,1397 chrIV 204077 . G A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.360;DP=134;Dels=0.00;FS=2.243;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.109;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1624,0,1177 chrIV 204271 . T C 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.455;DP=136;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=2.6971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.309;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:136:99:1618,0,1274 chrIV 204319 . T C 1090.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.585;DP=109;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1120,0,1181 chrIV 204322 . C T 1074.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.445;DP=111;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.506;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1104,0,1292 chrIV 204324 . C T 1136.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.125;DP=108;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=5.9580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.402;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1166,0,1124 chrIV 204349 . C T 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.465;DP=108;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1044,0,1235 chrIV 204361 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.561;DP=121;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=1.9621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.200;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1078,0,1435 chrIV 204469 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.085;DP=114;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.723;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1226,0,1335 chrIV 204557 . A C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.187;DP=114;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1161,0,1309 chrIV 204805 . G A 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3343,325,0 chrIV 204898 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.034;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,58:145:99:1134,0,1847 chrIV 205310 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.988;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=9.40;ReadPosRankSum=-3.401;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1290,0,1600 chrIV 205528 . T C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.006;DP=123;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.766;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1184,0,1521 chrIV 205765 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.088;DP=128;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=5.8611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1257,0,1201 chrIV 205771 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.282;DP=141;Dels=0.00;FS=1.352;HaplotypeScore=6.8303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.730;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1278,0,1447 chrIV 205915 . G A 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.159;DP=177;Dels=0.00;FS=3.740;HaplotypeScore=5.8281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.063;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,82:177:99:1641,0,2017 chrIV 206764 . T C 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.261;DP=137;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=5.6427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.440;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:137:99:1828,0,1302 chrIV 209791 . T C 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.986;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=11.76;ReadPosRankSum=-2.108;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1711,0,1260 chrIV 210091 . A G 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.272;DP=162;Dels=0.00;FS=2.896;HaplotypeScore=6.0454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:162:99:1872,0,1585 chrIV 210594 . G A 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1632,0,1508 chrIV 210686 . A T 711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;DP=115;Dels=0.00;FS=3.399;HaplotypeScore=51.9629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=6.18;ReadPosRankSum=-2.082;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:741,0,1268 chrIV 210836 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.079;DP=114;Dels=0.00;FS=4.512;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.119;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1343,0,1127 chrIV 211126 . C T 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.130;DP=123;Dels=0.00;FS=8.373;HaplotypeScore=2.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1182,0,1515 chrIV 211275 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.227;DP=137;Dels=0.00;FS=3.068;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1286,0,1194 chrIV 211301 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.660;DP=110;Dels=0.00;FS=5.135;HaplotypeScore=2.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.041;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1214,0,1009 chrIV 211370 . G A 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.989;DP=115;Dels=0.00;FS=8.462;HaplotypeScore=3.4870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=4.048;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.793;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,71:115:99:1645,0,778 chrIV 211536 . C T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;DP=114;Dels=0.00;FS=3.448;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.538;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1393,0,1099 chrIV 211684 . T C 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.555;DP=121;Dels=0.00;FS=5.780;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=6.54;ReadPosRankSum=-2.146;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,47:121:99:821,0,1758 chrIV 211831 . A G 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.236;DP=148;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1500,0,1676 chrIV 211876 . G T 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.106;DP=153;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.534;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1601,0,1657 chrIV 211916 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.412;DP=144;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=2.5699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.371;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:144:99:1296,0,1622 chrIV 211933 . A G 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.436;DP=92;Dels=0.00;FS=1.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.848;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:975,0,963 chrIV 211978 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.745;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,60:100:99:1248,0,865 chrIV 212036 . T C 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.604;DP=103;Dels=0.00;FS=2.658;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.709;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1251,0,985 chrIV 212222 . A G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.398;DP=106;Dels=0.00;FS=2.541;HaplotypeScore=190.2045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.076;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1140,0,1104 chrIV 212251 . A G 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.701;DP=115;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.594;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1010,0,1288 chrIV 212267 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.666;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.62;MQ0=0;MQRankSum=-3.247;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1114,0,1397 chrIV 212303 . C T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.915;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1156,0,1316 chrIV 212370 . A T 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;DP=104;Dels=0.00;FS=0.756;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:1011,0,1269 chrIV 212428 . T A 575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.182;DP=92;Dels=0.00;FS=8.595;HaplotypeScore=16.1779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.295;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:605,0,843 chrIV 212442 . T A 86.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.075;DP=104;Dels=0.00;FS=67.310;HaplotypeScore=30.7936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQ0=0;MQRankSum=3.065;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:116,0,199 chrIV 212458 . G T 116.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=111;Dels=0.00;FS=278.321;HaplotypeScore=69.0476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.94;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=1.05;ReadPosRankSum=-8.338;SB=-1.420e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:72,39:111:18:149,18,0 chrIV 212479 . G C 259.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;DP=92;Dels=0.00;FS=3.020;HaplotypeScore=3.0889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.79;MQ0=0;MQRankSum=-7.167;QD=2.82;ReadPosRankSum=3.344;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:289,0,445 chrIV 212482 . T G 297.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.89;MQ0=0;MQRankSum=-6.636;QD=3.23;ReadPosRankSum=2.238;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:327,0,445 chrIV 212488 . A G 419.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.724;DP=106;Dels=0.00;FS=11.128;HaplotypeScore=2.7113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-5.218;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.820;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:449,0,935 chrIV 212616 . T C 1220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.8734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=20.68;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1253,126,0 chrIV 212681 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.225;DP=116;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=80.5483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.772;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1036,0,1293 chrIV 212682 . T A 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.887;DP=116;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=76.7721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.419;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1038,0,1310 chrIV 213112 . A G 2510 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2543,264,0 chrIV 213530 . C T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.455;DP=111;Dels=0.00;FS=2.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1126,0,1271 chrIV 213539 . C T 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3420,325,0 chrIV 213698 . C T 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3607,358,0 chrIV 214436 . C T 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.423;DP=141;Dels=0.00;FS=5.184;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=2.085;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1511,0,1562 chrIV 214858 . C T 4435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0063;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.20;SB=-2.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4435,415,0 chrIV 214965 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.175;DP=103;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.545;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1214,0,975 chrIV 215003 . T C 2637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=22.73;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2670,279,0 chrIV 215004 . T C 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.60;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2641,279,0 chrIV 215138 . C G 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.395;DP=117;Dels=0.00;FS=5.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.118;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1457,0,1027 chrIV 215204 . G A 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;DP=131;Dels=0.00;FS=8.090;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1562,0,1311 chrIV 215207 . T G 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.758;DP=134;Dels=0.00;FS=7.867;HaplotypeScore=3.4174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1471,0,1414 chrIV 215266 . G A 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3284,319,0 chrIV 215523 . T C 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=1;QD=25.78;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2972,303,0 chrIV 215739 . C A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.913;DP=128;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.803;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1343,0,1494 chrIV 215967 . G C 4201.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3175;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=25.31;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4201,418,0 chrIV 216140 . A G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.905;DP=158;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=1.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.945;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1593,0,1641 chrIV 216293 . G T 2008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.022;DP=172;Dels=0.00;FS=2.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=0.308;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.206;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,91:172:99:2038,0,1544 chrIV 216340 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.186;DP=137;Dels=0.00;FS=6.486;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:137:99:1160,0,1776 chrIV 216341 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.742;DP=137;Dels=0.00;FS=7.807;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.111;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1239,0,1772 chrIV 216405 . A T 1898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;DP=160;Dels=0.00;FS=4.671;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.244;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,89:160:99:1928,0,1595 chrIV 216465 . A G 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.546;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3653,375,0 chrIV 216541 . G A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.764;DP=139;Dels=0.00;FS=5.399;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.176;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1075,0,1739 chrIV 217137 . A G 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.211;DP=135;Dels=0.00;FS=4.378;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1459,0,1492 chrIV 217351 . G A 641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.759;DP=79;Dels=0.00;FS=0.937;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.833;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,32:79:99:671,0,1100 chrIV 217405 . C T 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2837,271,0 chrIV 217435 . A T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;DP=117;Dels=0.00;FS=4.539;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=2.130;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1527,0,885 chrIV 217557 . G A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.817;DP=126;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=41.0948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=2;MQRankSum=1.534;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1619,0,1042 chrIV 217696 . T C 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.190;DP=133;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1383,0,1508 chrIV 217745 . A G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.973;DP=101;Dels=0.00;FS=10.149;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.407;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:101:99:1017,0,1245 chrIV 217775 . T A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;DP=104;Dels=0.00;FS=22.474;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.453;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:104:99:1290,0,1016 chrIV 217841 . T C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.714;DP=154;Dels=0.00;FS=3.143;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=9.34;ReadPosRankSum=-2.240;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1468,0,1864 chrIV 217904 . A G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.110;DP=150;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.59;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:934,0,1973 chrIV 217905 . G A 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.951;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,73:164:99:1017,0,2048 chrIV 217975 . T C 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.862;DP=152;Dels=0.00;FS=6.808;HaplotypeScore=2.7157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.287;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1620,0,1819 chrIV 218065 . T C 704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.575;DP=107;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.02;MQ0=3;MQRankSum=0.686;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,43:107:99:734,0,1470 chrIV 218512 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;DP=113;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.97;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1214,0,1222 chrIV 218569 . T A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.90;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.035;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1358,0,1672 chrIV 218572 . A T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.097;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1568,0,1346 chrIV 218669 . T C 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=136;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.440;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1545,0,1473 chrIV 218767 . A G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1230,0,1548 chrIV 218923 . T C 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2963,309,0 chrIV 219175 . G A 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3372,331,0 chrIV 219303 . C G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;DP=111;Dels=0.00;FS=4.640;HaplotypeScore=2.6386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1115,0,1264 chrIV 219340 . C A 2563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2596,250,0 chrIV 219761 . T C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.250;DP=152;Dels=0.00;FS=3.814;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.079;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1541,0,1742 chrIV 220433 . G A 660.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;DP=98;Dels=0.00;FS=6.733;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.34;MQ0=8;MQRankSum=-5.307;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.488;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:690,0,998 chrIV 220445 . G A 939.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.396;DP=114;Dels=0.00;FS=7.706;HaplotypeScore=4.1802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.69;MQ0=10;MQRankSum=-5.134;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.234;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:114:99:969,0,993 chrIV 220463 . C T 1228.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.648;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.67;MQ0=15;MQRankSum=-2.479;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,68:112:99:1258,0,765 chrIV 221090 . C A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.720;DP=117;Dels=0.00;FS=1.501;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=9.39;ReadPosRankSum=2.109;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1129,0,1406 chrIV 221175 . G A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.536;DP=119;Dels=0.00;FS=19.917;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.029;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1347,0,1202 chrIV 221471 . A G 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.367;DP=117;Dels=0.00;FS=7.703;HaplotypeScore=2.7233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.340;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:851,0,1552 chrIV 221511 . C T 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.287;DP=124;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=7.95;ReadPosRankSum=2.280;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,48:124:99:1016,0,1654 chrIV 221893 . C T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.514;DP=126;Dels=0.00;FS=5.530;HaplotypeScore=6.1226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.363;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1212,0,1472 chrIV 221899 . T A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;DP=126;Dels=0.00;FS=4.385;HaplotypeScore=8.2390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1177,0,1450 chrIV 221995 . G A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.879;DP=91;Dels=0.00;FS=1.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.939;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1138,0,855 chrIV 222025 . C A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.360;DP=105;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,62:105:99:1445,0,845 chrIV 222073 . A G 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;DP=116;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.635;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:1515,0,1022 chrIV 222082 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=114;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.754;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,68:114:99:1506,0,1011 chrIV 222257 . G A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.952;DP=101;Dels=0.00;FS=15.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.856;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:1036,0,1224 chrIV 222481 . G A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.421;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1033,0,1181 chrIV 222741 . C A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.651;DP=129;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1381,0,1238 chrIV 222906 . A G 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.796;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.980;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1504,0,1207 chrIV 223242 . G A 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3094,313,0 chrIV 223377 . C T 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=28.54;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3511,349,0 chrIV 223821 . A C 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.341;DP=138;Dels=0.00;FS=5.285;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.235;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1508,0,1508 chrIV 223847 . C G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.559;DP=126;Dels=0.00;FS=10.616;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=9.95;ReadPosRankSum=2.495;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1284,0,1551 chrIV 223943 . G A 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3569,352,0 chrIV 224112 . C T 4066.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4066,391,0 chrIV 224747 . G A 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.594;DP=94;Dels=0.00;FS=2.710;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.840;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:959,0,1084 chrIV 224809 . G A 4136.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=28.52;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4136,403,0 chrIV 224854 . G A 4319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4319,406,0 chrIV 225248 . C T 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3245,319,0 chrIV 225458 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.143;DP=120;Dels=0.00;FS=7.012;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1347,0,1111 chrIV 225510 . C A 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.656;DP=112;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=6.79;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,45:112:99:791,0,1551 chrIV 225743 . T C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.617;DP=123;Dels=0.00;FS=2.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1359,0,1354 chrIV 225919 . C T 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.704;DP=146;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=2;MQRankSum=4.810;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.241;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:146:99:1779,0,1374 chrIV 226059 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.757;DP=114;Dels=0.00;FS=1.622;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.675;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1213,0,1293 chrIV 226148 . A G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.291;DP=127;Dels=0.00;FS=3.186;HaplotypeScore=6.7452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.090;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1514,0,1237 chrIV 226209 . C T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.076;DP=134;Dels=0.00;FS=3.265;HaplotypeScore=4.8308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.930;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1394,0,1464 chrIV 226314 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.008;DP=138;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:1226,0,1775 chrIV 226839 . A G 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.594;DP=76;Dels=0.04;FS=30.955;HaplotypeScore=81.7770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=0.41;ReadPosRankSum=-4.011;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,12:73:61:61,0,253 chrIV 227035 . A G 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3055,318,0 chrIV 227115 . A G 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.403;DP=88;Dels=0.00;FS=1.735;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQ0=0;MQRankSum=-4.006;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.642;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:807,0,902 chrIV 227127 . A G 2005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.29;MQ0=0;QD=23.87;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2038,213,0 chrIV 227133 . C T 949.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.727;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-5.179;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.022;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:979,0,884 chrIV 227138 . G A 1033.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.196;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=-4.626;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1063,0,932 chrIV 227141 . G A 1113.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.046;DP=98;Dels=0.00;FS=1.836;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.02;MQ0=0;MQRankSum=-3.161;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1143,0,903 chrIV 227151 . G C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;DP=86;Dels=0.00;FS=0.998;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.936;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.503;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,51:86:99:1003,0,726 chrIV 227175 . G A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=4.617;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,51:126:99:1023,0,1537 chrIV 227285 . T A 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;DP=146;Dels=0.00;FS=1.558;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1632,0,1727 chrIV 227289 . A G 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.276;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.255;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1526,0,1777 chrIV 227299 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.948;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.510;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1506,0,1776 chrIV 227300 . A G 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.285;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.011;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.694;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1497,0,1788 chrIV 227375 . T A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.524;DP=127;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1439,0,1412 chrIV 227641 . C T 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.461;DP=130;Dels=0.00;FS=3.231;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.292;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1718,0,1124 chrIV 228112 . T G 3493.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.788;DP=158;Dels=0.00;FS=9.393;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.23;MQ0=10;MQRankSum=2.856;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.486;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,147:158:99:3493,283,0 chrIV 228430 . A G 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.26;MQ0=2;QD=25.88;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3139,324,0 chrIV 228436 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.159;DP=116;Dels=0.00;FS=4.908;HaplotypeScore=3.8720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=2;MQRankSum=0.619;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.227;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1112,0,1418 chrIV 228508 . G C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.482;DP=131;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=0;MQRankSum=2.455;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1258,0,1439 chrIV 228626 . C T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.780;DP=116;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,70:116:99:1650,0,884 chrIV 228856 . C T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.895;DP=151;Dels=0.00;FS=3.995;HaplotypeScore=4.7951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1446,0,1794 chrIV 228893 . T C 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3513,354,0 chrIV 229033 . C T 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3702,358,0 chrIV 229042 . T C 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=139;Dels=0.00;FS=3.235;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.561;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3715,358,0 chrIV 229226 . C T 626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.438;DP=75;Dels=0.00;FS=8.011;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:656,0,978 chrIV 229260 . T C 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.002;DP=81;Dels=0.00;FS=4.354;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.69;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.214;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,45:81:99:911,0,748 chrIV 229467 . G A 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.35;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2853,285,0 chrIV 229690 . A C 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.16;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3395,348,0 chrIV 229702 . T C 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.88;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3494,343,0 chrIV 229828 . G C 2615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2648,270,0 chrIV 229843 . A C 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.006;DP=100;Dels=0.00;FS=1.683;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=2.004;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:834,0,1441 chrIV 229868 . T A 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3190,322,0 chrIV 230132 . C T 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;DP=99;Dels=0.00;FS=3.973;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.540;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:914,0,1193 chrIV 230153 . A C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.843;DP=108;Dels=0.00;FS=2.562;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.695;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1131,0,1171 chrIV 230620 . T A 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;DP=94;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:832,0,1089 chrIV 230677 . T C 2237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2270,231,0 chrIV 230893 . C T 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.324;DP=90;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.156;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:851,0,1167 chrIV 231253 . C T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;DP=134;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.978;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1370,0,1448 chrIV 231260 . G A 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7911;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=26.54;ReadPosRankSum=1.704;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3317,319,0 chrIV 231317 . A G 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.183;DP=141;Dels=0.00;FS=13.753;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.080;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1292,0,1681 chrIV 231400 . A T 3862.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=28.82;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3862,385,0 chrIV 231525 . A G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.756;DP=132;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=5.3347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1113,0,1689 chrIV 231562 . T C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;DP=120;Dels=0.00;FS=2.663;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.588;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1243,0,1370 chrIV 231593 . G A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.446;DP=123;Dels=0.00;FS=2.364;HaplotypeScore=3.6342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:123:99:1514,0,1056 chrIV 231629 . A G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.468;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.788;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1048,0,1468 chrIV 231806 . A G 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.297;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.426;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:851,0,1264 chrIV 231960 . A G 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.542;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.213;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:706,0,1249 chrIV 232043 . A T 1847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;DP=149;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.440;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,85:149:99:1877,0,1372 chrIV 232127 . A G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.132;DP=134;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1170,0,1690 chrIV 232181 . C T 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3637,340,0 chrIV 232245 . C T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.468;DP=96;Dels=0.00;FS=0.819;HaplotypeScore=5.4746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.764;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,52:96:99:1184,0,928 chrIV 232386 . C G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;DP=117;Dels=0.00;FS=1.750;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:991,0,1475 chrIV 232673 . T C 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.461;DP=167;Dels=0.00;FS=15.134;HaplotypeScore=5.2206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=3.284;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.697;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,88:167:99:1718,0,1769 chrIV 232777 . C T 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3543,340,0 chrIV 232783 . G A 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3527,352,0 chrIV 232831 . T C 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3519,372,0 chrIV 232918 . T A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;DP=135;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.769;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1392,0,1519 chrIV 232936 . A G 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=22.63;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2930,303,0 chrIV 232994 . A G 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3070,310,0 chrIV 233071 . A C 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2890,297,0 chrIV 233134 . A G 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3287,342,0 chrIV 233173 . G A 4227.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.42;SB=-2.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4227,421,0 chrIV 233198 . C T 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3992,400,0 chrIV 233389 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.528;DP=138;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.197;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.102;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1298,0,1701 chrIV 233551 . C A 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3006,298,0 chrIV 233563 . C A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;DP=118;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.877;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1324,0,1161 chrIV 233636 . G A 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2797,268,0 chrIV 233727 . C T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.545;DP=96;Dels=0.00;FS=2.834;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.660;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1095,0,978 chrIV 233865 . A C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.056;DP=103;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=2.2064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.833;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:103:99:1194,0,1014 chrIV 233915 . A C 2360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=39.1765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2393,243,0 chrIV 234088 . A C 1296 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.118;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.9084;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.584;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,53:90:99:1329,132,0 chrIV 234097 . A T 2125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2158,210,0 chrIV 234231 . C A 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3442,343,0 chrIV 234289 . G A 4013.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4013,394,0 chrIV 234361 . T C 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2928,297,0 chrIV 234488 . T A 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.119;DP=87;Dels=0.00;FS=6.951;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,39:87:99:839,0,1117 chrIV 234547 . C G 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2678,282,0 chrIV 234690 . G C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.675;DP=128;Dels=0.00;FS=4.177;HaplotypeScore=6.7729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.248;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1417,0,1256 chrIV 234821 . C A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.336;DP=120;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.491;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1443,0,1257 chrIV 234968 . T C 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.73;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3339,345,0 chrIV 235223 . C T 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.841;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1595,0,1330 chrIV 235466 . T A 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;DP=110;Dels=0.00;FS=9.277;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.045;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.118;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:926,0,1499 chrIV 235604 . T C 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3634,375,0 chrIV 235676 . A G 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3087,307,0 chrIV 235902 . C G 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.11;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2820,294,0 chrIV 236074 . A G 3142 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3175,327,0 chrIV 236080 . T C 2662 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=24.88;ReadPosRankSum=1.569;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:107:99:2695,276,0 chrIV 236082 . A T 2731 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.12;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2764,276,0 chrIV 236289 . A G 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.73;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3540,352,0 chrIV 236460 . T A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;DP=134;Dels=0.00;FS=4.205;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.948;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.731;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1634,0,1384 chrIV 236604 . C T 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;QD=28.70;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3358,340,0 chrIV 236610 . A G 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;QD=26.10;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3087,330,0 chrIV 236619 . T C 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.81;MQ0=0;QD=28.03;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3336,337,0 chrIV 236627 . G A 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=28.47;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3815,379,0 chrIV 236928 . A G 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2821,297,0 chrIV 237186 . A C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.400;DP=146;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,61:146:99:1292,0,1924 chrIV 237219 . G A 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3757,367,0 chrIV 237312 . C T 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3353,339,0 chrIV 237441 . T G 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2986,300,0 chrIV 237522 . G A 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3253,319,0 chrIV 237570 . G A 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3444,337,0 chrIV 237588 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.787;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:118:99:1290,0,1179 chrIV 237897 . G A 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3155,321,0 chrIV 238476 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.866;DP=129;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=4.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1259,0,1468 chrIV 238826 . G T 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3478,340,0 chrIV 239361 . G A 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.970;DP=178;Dels=0.00;FS=1.224;HaplotypeScore=4.5907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,77:178:99:1636,0,2149 chrIV 239639 . A C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.298;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1513,0,1510 chrIV 239853 . T C 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.208;DP=117;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.260;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1392,0,1160 chrIV 239899 . A G 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3045,309,0 chrIV 239984 . C T 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.02;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3850,376,0 chrIV 240090 . T C 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3134,312,0 chrIV 240232 . G A 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;QD=28.25;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3447,340,0 chrIV 240258 . G A 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.874;DP=129;Dels=0.00;FS=4.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.733;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,81:129:99:1871,0,955 chrIV 240375 . G C 3788.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3788,388,0 chrIV 240480 . T C 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3589,349,0 chrIV 240564 . T G 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3449,351,0 chrIV 240647 . T C 4054.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4054,412,0 chrIV 240655 . T C 1307.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.691;DP=147;Dels=0.00;FS=2.109;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.397;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1337,0,1820 chrIV 240657 . A C 1350.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.525;DP=147;Dels=0.00;FS=2.109;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1380,0,1879 chrIV 240868 . G C 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3527,357,0 chrIV 241044 . T C 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.177;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:860,0,1076 chrIV 241166 . G A 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=28.38;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3406,340,0 chrIV 241179 . C T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.506;DP=137;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.343;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:137:99:1602,0,1378 chrIV 241206 . T C 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3162,330,0 chrIV 241313 . A G 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.462;DP=148;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=2.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.358;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:871,0,1104 chrIV 241739 . A G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.088;DP=135;Dels=0.00;FS=4.178;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.219;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1221,0,1639 chrIV 241816 . G A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.435;DP=155;Dels=0.00;FS=2.899;HaplotypeScore=7.3976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:155:99:1347,0,1882 chrIV 241861 . T A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;DP=154;Dels=0.00;FS=1.298;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.061;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:154:99:1464,0,2006 chrIV 241900 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.547;DP=132;Dels=0.00;FS=3.165;HaplotypeScore=2.9403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:132:99:1345,0,1516 chrIV 241923 . A G 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.502;DP=104;Dels=0.00;FS=4.907;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-3.524;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.514;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:879,0,1331 chrIV 241930 . T C 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.968;DP=88;Dels=0.00;FS=8.731;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.821;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.192;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,37:88:99:704,0,1114 chrIV 241945 . A G 632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.820;DP=95;Dels=0.00;FS=2.745;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQ0=0;MQRankSum=-4.690;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.729;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:662,0,1277 chrIV 241962 . G A 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.474;DP=94;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=0;MQRankSum=-4.133;QD=8.30;ReadPosRankSum=-2.125;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:810,0,1054 chrIV 241990 . C T 614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.931;DP=97;Dels=0.00;FS=3.867;HaplotypeScore=11.9574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.26;MQ0=0;MQRankSum=-6.266;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.552;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,40:97:99:644,0,1129 chrIV 242001 . G C 2310 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=49.1868;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.32;MQ0=0;QD=20.62;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2343,240,0 chrIV 242036 . C T 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.690;DP=119;Dels=0.00;FS=5.722;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.83;MQ0=0;MQRankSum=-5.647;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.773;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:927,0,1266 chrIV 242056 . C A 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;DP=132;Dels=0.00;FS=3.261;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.01;MQ0=0;MQRankSum=-5.524;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.197;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:991,0,1524 chrIV 242073 . A T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;DP=140;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=0;MQRankSum=-4.462;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1149,0,1677 chrIV 242081 . A C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.103;DP=163;Dels=0.00;FS=5.891;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQ0=0;MQRankSum=-3.750;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.052;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,70:163:99:1199,0,2117 chrIV 242141 . T C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;DP=151;Dels=0.00;FS=3.021;HaplotypeScore=3.7710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,58:151:99:1134,0,2150 chrIV 242142 . A T 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.205;DP=151;Dels=0.00;FS=2.132;HaplotypeScore=3.7710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,59:151:99:1186,0,2137 chrIV 242179 . C A 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=13.85;ReadPosRankSum=-1.480;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,86:133:99:1872,0,994 chrIV 242306 . A G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;DP=103;Dels=0.00;FS=2.746;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.771;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:1017,0,1281 chrIV 242486 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.944;DP=104;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=1;MQRankSum=0.397;QD=11.37;ReadPosRankSum=2.363;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1212,0,929 chrIV 242941 . C G 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.784;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.733;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:137:99:1441,0,1498 chrIV 242997 . G A 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3499,334,0 chrIV 243004 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.738;DP=129;Dels=0.00;FS=2.298;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:129:99:1103,0,1566 chrIV 243234 . A G 4172.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4172,418,0 chrIV 243367 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.314;DP=140;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1539,0,1449 chrIV 243379 . G A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.576;DP=139;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.482;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1142,0,1708 chrIV 243421 . C T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.867;DP=159;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,68:159:99:1387,0,2063 chrIV 243568 . G A 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.750;DP=137;Dels=0.00;FS=3.435;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.587;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1662,0,1336 chrIV 243616 . C T 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.170;DP=145;Dels=0.00;FS=2.940;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.474;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1678,0,1457 chrIV 243919 . T C 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;DP=150;Dels=0.00;FS=9.939;HaplotypeScore=2.8718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=1;MQRankSum=-1.924;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.150;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1686,0,1571 chrIV 243935 . T C 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.675;DP=142;Dels=0.00;FS=5.035;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=1;MQRankSum=0.886;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.922;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1667,0,1501 chrIV 243985 . A G 2098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.830;DP=175;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=0.174;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.726;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,94:175:99:2128,0,1664 chrIV 244033 . G A 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.352;DP=152;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=7.7660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.073;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:152:99:1835,0,1498 chrIV 244138 . T G 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3771,387,0 chrIV 244150 . T C 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3194,342,0 chrIV 244177 . G T 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=1;QD=28.17;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3465,357,0 chrIV 244397 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=126;Dels=0.00;FS=3.260;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.169;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1276,0,1416 chrIV 244864 . G A 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.876;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.442;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:1012,0,1012 chrIV 245359 . C T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.699;DP=140;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=12.4535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=7.41;ReadPosRankSum=2.374;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1067,0,1758 chrIV 246213 . T C 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.623;DP=149;Dels=0.00;FS=2.074;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.397;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1825,0,1497 chrIV 246316 . T C 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.829;DP=119;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.829;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,70:119:99:1453,0,1060 chrIV 246448 . G C 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.011;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:835,0,1137 chrIV 246449 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.064;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.821;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,56:96:99:1086,0,911 chrIV 246646 . T C 1856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.575;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.118;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,88:169:99:1886,0,1780 chrIV 246658 . G A 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.709;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,88:171:99:1854,0,1738 chrIV 246664 . T G 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.139;DP=156;Dels=0.00;FS=3.746;HaplotypeScore=6.3216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.938;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1613,0,1718 chrIV 246743 . G C 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3365,340,0 chrIV 246839 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.621;DP=114;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1353,0,1109 chrIV 246965 . T C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.083;DP=135;Dels=0.00;FS=3.115;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1176,0,1553 chrIV 248088 . G A 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2678,264,0 chrIV 248500 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.766;DP=107;Dels=0.00;FS=3.660;HaplotypeScore=5.3160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:107:99:1042,0,1278 chrIV 248513 . G C 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2855,294,0 chrIV 248568 . T A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.164;DP=120;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.428;QD=11.22;ReadPosRankSum=-2.107;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1376,0,1249 chrIV 248573 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.454;DP=108;Dels=0.00;FS=1.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.252;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.611;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1181,0,1122 chrIV 248586 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;DP=112;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.418;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.773;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1274,0,1128 chrIV 248600 . C G 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.757;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=10.65;ReadPosRankSum=2.435;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1372,0,1314 chrIV 248899 . G A 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.510;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2925,286,0 chrIV 249264 . C T 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2741,262,0 chrIV 249432 . C T 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3501,331,0 chrIV 249508 . A G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.698;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,54:96:99:1165,0,961 chrIV 249541 . G A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;DP=115;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1406,0,1064 chrIV 249574 . C A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=114;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1236,0,1265 chrIV 249579 . G A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.139;DP=108;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1284,0,1140 chrIV 249627 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.643;DP=105;Dels=0.00;FS=3.592;HaplotypeScore=2.9517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.022;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1032,0,1175 chrIV 249679 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.730;DP=125;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=3.4894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=1;MQRankSum=0.963;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1216,0,1571 chrIV 249699 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.648;DP=146;Dels=0.00;FS=2.077;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=1.617;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1507,0,1600 chrIV 249783 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.952;DP=147;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=4.8863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.004;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1329,0,1888 chrIV 249966 . T C 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.798;DP=110;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=1.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.039;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1049,0,1352 chrIV 250434 . G A 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=1;QD=25.78;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3352,340,0 chrIV 250440 . G A 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.102;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=-1.211;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:1045,0,1555 chrIV 250548 . T C 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=26.45;ReadPosRankSum=0.541;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3386,351,0 chrIV 250746 . A G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.038;DP=149;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=4.6063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1427,0,1704 chrIV 251017 . G A 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=20.16;SB=-2.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:3608,361,0 chrIV 251082 . A G 3643.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3643,378,0 chrIV 251097 . G A 4112.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4112,397,0 chrIV 251115 . C T 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.73;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3823,379,0 chrIV 251292 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.179;DP=149;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.108;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1331,0,1767 chrIV 251443 . C T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.154;DP=113;Dels=0.00;FS=3.421;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.544;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1371,0,1083 chrIV 251500 . T A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.877;DP=103;Dels=0.00;FS=9.950;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.103;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:1068,0,1261 chrIV 251506 . C T 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.316;DP=100;Dels=0.00;FS=11.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.260;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:949,0,1228 chrIV 251534 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.883;DP=121;Dels=0.00;FS=5.746;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.864;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1481,0,1103 chrIV 251630 . T A 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3119,313,0 chrIV 251673 . T C 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3469,343,0 chrIV 251943 . C G 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;DP=112;Dels=0.00;FS=5.995;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.683;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,44:112:99:924,0,1627 chrIV 252063 . T C 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3138,315,0 chrIV 252202 . T A 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.868;DP=139;Dels=0.00;FS=1.373;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.374;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1741,0,1429 chrIV 252231 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.367;DP=119;Dels=0.00;FS=4.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1577,0,1046 chrIV 252312 . C T 2374 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2407,243,0 chrIV 252376 . A G 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.47;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2865,300,0 chrIV 252749 . G T 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:112:99:3037,295,0 chrIV 252925 . G A 1792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.228;DP=148;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=1;MQRankSum=0.088;QD=12.11;ReadPosRankSum=2.277;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1822,0,1358 chrIV 253388 . G A 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2873,288,0 chrIV 253390 . T C 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.089;DP=107;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1062,0,1247 chrIV 253602 . G A 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.267;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.039;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,37:126:99:753,0,1992 chrIV 253830 . A G 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.71;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2971,309,0 chrIV 253832 . T A 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3106,315,0 chrIV 253859 . G A 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;DP=95;Dels=0.00;FS=1.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:1000,0,1062 chrIV 254130 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.862;DP=100;Dels=0.00;FS=0.756;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.707;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1192,0,970 chrIV 254813 . T G 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3356,345,0 chrIV 254856 . A G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2995,306,0 chrIV 254990 . T C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.497;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1023,0,1258 chrIV 255055 . C A,T 3021.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,65,56:121:99:3081,1421,1244,1659,0,1500 chrIV 255135 . T C 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.121;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.545;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1559,0,1855 chrIV 255235 . A G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.965;DP=134;Dels=0.00;FS=4.332;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.942;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1461,0,1468 chrIV 255292 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.047;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.695;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1145,0,1043 chrIV 255364 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;DP=114;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=2.9669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1234,0,1221 chrIV 255481 . G A 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3253,310,0 chrIV 255558 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.129;DP=106;Dels=0.00;FS=6.193;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.288;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1182,0,1143 chrIV 255562 . A T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=109;Dels=0.00;FS=3.544;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.149;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1119,0,1329 chrIV 255722 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.466;DP=105;Dels=0.00;FS=1.722;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=1.051;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.096;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1273,0,1081 chrIV 255870 . C T 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3535,346,0 chrIV 255933 . C T 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.007;DP=147;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.480;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,50:147:99:1032,0,2187 chrIV 256111 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.371;DP=134;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.923;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1226,0,1628 chrIV 256213 . T C 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3591,355,0 chrIV 256413 . A G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;DP=120;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=2;MQRankSum=0.868;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:1044,0,1611 chrIV 256515 . G A 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.507;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.319;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1561,0,1131 chrIV 256985 . T G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.641;DP=132;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=2.7569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.133;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1182,0,1715 chrIV 257200 . A G 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.176;DP=99;Dels=0.00;FS=2.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.508;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1045,0,1128 chrIV 257223 . G A 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3275,322,0 chrIV 257251 . C A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;DP=122;Dels=0.00;FS=2.295;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1315,0,1356 chrIV 257386 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.738;DP=123;Dels=0.00;FS=11.833;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1465,0,1269 chrIV 257501 . T C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.935;DP=139;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.056;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1101,0,1938 chrIV 257569 . G A 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.873;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.220;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:971,0,1309 chrIV 257584 . T C 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.833;DP=109;Dels=0.00;FS=1.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.489;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:908,0,1340 chrIV 257586 . G A,T 2585.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=56.32;MQ0=0;QD=23.50;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,52,58:110:99:2645,1499,1373,1147,0,984 chrIV 257704 . G T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1315,0,1310 chrIV 257828 . C T 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.932;DP=156;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.369;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1720,0,1752 chrIV 257974 . G A 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.636;DP=105;Dels=0.00;FS=5.051;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:1012,0,1167 chrIV 257984 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.272;DP=105;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.804;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1309,0,965 chrIV 258190 . T C 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3053,315,0 chrIV 258250 . G C 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2923,306,0 chrIV 258286 . T C 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.356;DP=127;Dels=0.00;FS=4.318;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=2.496;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.848;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:989,0,1579 chrIV 258728 . G T 4352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.54;SB=-2.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4352,418,0 chrIV 258793 . G A 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;DP=143;Dels=0.00;FS=8.462;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.128;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1754,0,1321 chrIV 258800 . C T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;DP=145;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=6.3638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.491;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1695,0,1300 chrIV 258830 . C A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.294;DP=128;Dels=0.00;FS=3.195;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.794;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.778;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1335,0,1409 chrIV 258881 . G A 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.850;DP=147;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=3.2711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1547,0,1620 chrIV 259049 . G A 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3339,325,0 chrIV 259211 . A G 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.554;DP=122;Dels=0.00;FS=2.377;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.539;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1503,0,1112 chrIV 259359 . C A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.000;DP=123;Dels=0.00;FS=1.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.276;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1419,0,1313 chrIV 259559 . C T 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3087,316,0 chrIV 259624 . C G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;DP=118;Dels=0.00;FS=1.483;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1391,0,1153 chrIV 259676 . T C 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3861,388,0 chrIV 259808 . A C 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3152,321,0 chrIV 259889 . G T 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3111,304,0 chrIV 259996 . A T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;DP=133;Dels=0.00;FS=5.238;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1370,0,1648 chrIV 260003 . A G 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3711,381,0 chrIV 260036 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.974;DP=101;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.513;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1178,0,1058 chrIV 260180 . T C 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2689,288,0 chrIV 260233 . A G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.638;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:118:99:1173,0,1354 chrIV 260778 . T C 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=1;QD=25.79;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3128,315,0 chrIV 260870 . A C 2339 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.582;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=25.42;ReadPosRankSum=0.979;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:2372,249,0 chrIV 260923 . C T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.814;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.463;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1247,0,966 chrIV 261002 . T C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3176,330,0 chrIV 261099 . A T 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3516,340,0 chrIV 261140 . G C 4088.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4088,394,0 chrIV 261167 . T C 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.55;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4075,417,0 chrIV 261197 . A G 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3461,351,0 chrIV 261207 . T C 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.295;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.406;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1344,0,1752 chrIV 261254 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.654;DP=131;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.679;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1495,0,1309 chrIV 261458 . C T 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3585,343,0 chrIV 261620 . A G 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2728,276,0 chrIV 261627 . A G 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.490;DP=93;Dels=0.00;FS=2.713;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:903,0,1114 chrIV 261828 . T C 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3031,303,0 chrIV 262117 . A G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.968;DP=134;Dels=0.00;FS=4.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.328;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1332,0,1604 chrIV 262128 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.626;DP=143;Dels=0.00;FS=7.579;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.275;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1321,0,1729 chrIV 262380 . C T 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.479;DP=146;Dels=0.00;FS=3.850;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.687;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1668,0,1504 chrIV 262660 . A G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.290;DP=136;Dels=0.00;FS=4.144;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=7.76;ReadPosRankSum=-3.594;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:136:99:1085,0,1591 chrIV 262662 . G T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.590;DP=141;Dels=0.00;FS=4.031;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=8.93;ReadPosRankSum=-3.867;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:141:99:1289,0,1395 chrIV 262793 . T C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.083;DP=134;Dels=0.00;FS=6.762;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1296,0,1476 chrIV 262975 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.176;DP=113;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1136,0,1259 chrIV 263532 . T A 2051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.462;DP=148;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=2.8068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.954;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,87:148:99:2081,0,1237 chrIV 263773 . T A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;DP=128;Dels=0.00;FS=5.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.491;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1413,0,1399 chrIV 264134 . C G 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3786,376,0 chrIV 264197 . G A 4145.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9251;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4145,418,0 chrIV 264290 . G A 4151.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.710;SB=-2.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:159:99:4151,382,0 chrIV 264370 . C T 1913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.014;DP=152;Dels=0.00;FS=3.944;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.808;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,87:152:99:1943,0,1344 chrIV 264828 . T G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.161;DP=139;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.572;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1403,0,1580 chrIV 265178 . C T 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.194;DP=136;Dels=0.00;FS=6.452;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.734;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1647,0,1157 chrIV 265445 . G A 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3053,304,0 chrIV 265452 . T G 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2925,300,0 chrIV 265606 . G T 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2485,246,0 chrIV 265841 . G A 2226 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2259,219,0 chrIV 266053 . G A 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3149,313,0 chrIV 266248 . G A 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3216,327,0 chrIV 266302 . T C 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3536,363,0 chrIV 266398 . A G 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2845,288,0 chrIV 266407 . A T 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3186,318,0 chrIV 266671 . G A 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2871,285,0 chrIV 266733 . A C 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3423,354,0 chrIV 266739 . T C 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3346,331,0 chrIV 266824 . T C 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3432,343,0 chrIV 266920 . A G 4040.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4040,400,0 chrIV 267183 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.703;DP=149;Dels=0.00;FS=2.380;HaplotypeScore=8.6797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:1327,0,1857 chrIV 267316 . C T 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.768;DP=104;Dels=0.00;FS=3.617;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.857;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1052,0,1197 chrIV 267359 . A T 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=28.29;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2834,283,0 chrIV 268132 . T C 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9151;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.45;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3665,384,0 chrIV 268432 . C T 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4945;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3382,334,0 chrIV 268580 . T C 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.190;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:978,0,910 chrIV 268701 . A T 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3106,301,0 chrIV 268714 . A G 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2689,276,0 chrIV 268735 . G T 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5769;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2682,270,0 chrIV 268855 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.898;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.695;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1306,0,1353 chrIV 268919 . A G 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3035,327,0 chrIV 269089 . G C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3389,339,0 chrIV 269283 . C T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.666;DP=123;Dels=0.00;FS=5.847;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.823;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1515,0,1158 chrIV 269350 . G A 3658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=14.8346;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3658,355,0 chrIV 269406 . G A 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2901,291,0 chrIV 269517 . G T 2471 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.15;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2504,252,0 chrIV 269544 . T G 2774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.12;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2807,303,0 chrIV 269772 . C T 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2532,246,0 chrIV 269891 . A G 741.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.733;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:771,0,1121 chrIV 269895 . T C 2270 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.45;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2303,237,0 chrIV 269898 . A C 708.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.779;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.150;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:738,0,1145 chrIV 270080 . T C 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3388,354,0 chrIV 270158 . C T 641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.153;DP=81;Dels=0.00;FS=0.880;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.769;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,35:81:99:671,0,1022 chrIV 270174 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=10.96;ReadPosRankSum=-2.263;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1060,0,734 chrIV 270285 . G A 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2760,265,0 chrIV 270858 . A C 1819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.697;DP=160;Dels=0.00;FS=3.975;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.484;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,89:160:99:1849,0,1534 chrIV 270951 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.659;DP=118;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=4.9645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.027;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1002,0,1596 chrIV 271119 . G A 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.916;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:836,0,1085 chrIV 271340 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.070;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.628;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1341,0,1217 chrIV 271431 . A T 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;DP=107;Dels=0.00;FS=1.585;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=8.61;ReadPosRankSum=-2.187;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,44:107:99:951,0,1450 chrIV 271505 . T G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.478;DP=112;Dels=0.00;FS=5.138;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.040;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1251,0,1099 chrIV 271629 . C G 3794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.35;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3794,391,0 chrIV 271671 . T C 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.430;DP=132;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.516;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1483,0,1513 chrIV 271787 . T G 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.637;DP=95;Dels=0.00;FS=6.264;HaplotypeScore=34.7943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.53;MQ0=0;MQRankSum=4.606;QD=13.96;ReadPosRankSum=2.118;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,58:95:99:1356,0,787 chrIV 271797 . A G 482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.973;DP=92;Dels=0.04;FS=5.246;HaplotypeScore=75.4395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQ0=0;MQRankSum=-3.781;QD=5.24;ReadPosRankSum=-4.758;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:512,0,1437 chrIV 272291 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.143;DP=120;Dels=0.00;FS=2.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.236;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1238,0,1310 chrIV 272385 . A C 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.65;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2880,312,0 chrIV 272421 . A G 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3517,360,0 chrIV 272848 . G T 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3111,301,0 chrIV 272994 . G A 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3629,361,0 chrIV 273139 . C A 4240.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4240,406,0 chrIV 273171 . C T 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3845,376,0 chrIV 273273 . G A 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=28.04;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:3061,283,0 chrIV 273339 . A G 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3116,324,0 chrIV 273764 . G A 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;DP=125;Dels=0.00;FS=3.261;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=24.39;ReadPosRankSum=-1.372;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3082,277,0 chrIV 273848 . C T 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3241,301,0 chrIV 274059 . T C 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.639;DP=95;Dels=0.00;FS=0.785;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.862;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,53:95:99:1110,0,921 chrIV 274409 . A T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.723;DP=141;Dels=0.00;FS=7.698;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=-0.498;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.722;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:1310,0,1839 chrIV 274589 . T C 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3448,340,0 chrIV 274595 . G A 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3552,343,0 chrIV 274672 . A G 3722.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3722,379,0 chrIV 274809 . A G 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;DP=109;Dels=0.00;FS=3.613;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=26.66;ReadPosRankSum=0.802;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2939,300,0 chrIV 274840 . C A 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=14.4976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=12.48;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1640,0,1150 chrIV 274870 . A C 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3345,342,0 chrIV 274998 . T C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.776;DP=109;Dels=0.00;FS=3.559;HaplotypeScore=86.5481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:109:99:1135,0,1192 chrIV 275038 . G A 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.651;DP=94;Dels=0.00;FS=6.921;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:984,0,1036 chrIV 275070 . T A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.483;DP=112;Dels=0.02;FS=2.562;HaplotypeScore=4.8607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1215,0,1151 chrIV 275118 . T C 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.555;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=51.4532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.158;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1156,0,1547 chrIV 275205 . A G 3740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3740,384,0 chrIV 275289 . G C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;DP=106;Dels=0.00;FS=2.594;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.883;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1154,0,1044 chrIV 275448 . T C 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3403,337,0 chrIV 275508 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.929;DP=142;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=1;MQRankSum=1.613;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1228,0,1754 chrIV 275637 . A G 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3189,312,0 chrIV 275645 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.848;DP=115;Dels=0.00;FS=10.289;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.059;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1172,0,1274 chrIV 275721 . T C 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3010,318,0 chrIV 275730 . C T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.581;DP=119;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.019;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1417,0,1099 chrIV 275859 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.457;DP=122;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.751;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1253,0,1444 chrIV 275865 . A G 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.705;DP=122;Dels=0.00;FS=3.382;HaplotypeScore=2.8741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1301,0,1399 chrIV 275877 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.204;DP=123;Dels=0.00;FS=5.811;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1443,0,1225 chrIV 276015 . A G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.443;DP=126;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1427,0,1314 chrIV 276057 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.263;DP=126;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=4.8588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.939;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1201,0,1488 chrIV 276066 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.107;DP=126;Dels=0.00;FS=2.293;HaplotypeScore=2.8800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.497;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:126:99:1363,0,1355 chrIV 276194 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.944;DP=108;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1180,0,1133 chrIV 276204 . G A 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2756,274,0 chrIV 276375 . T G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.833;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.002;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1218,0,1159 chrIV 276645 . G A 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.308;DP=136;Dels=0.00;FS=2.208;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=12.79;ReadPosRankSum=2.198;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1770,0,1145 chrIV 276677 . C A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.654;DP=144;Dels=0.00;FS=6.247;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.682;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,62:144:99:1313,0,1786 chrIV 276806 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1214,0,1254 chrIV 276820 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.077;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.377;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1285,0,1334 chrIV 276934 . G A 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.014;DP=142;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.191;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,57:142:99:1202,0,1727 chrIV 277129 . G A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.056;DP=119;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=2.3656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1462,0,1132 chrIV 277276 . C T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.420;DP=133;Dels=0.00;FS=9.499;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.484;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1590,0,1333 chrIV 277603 . C T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.145;DP=127;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.801;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1368,0,1325 chrIV 277642 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.355;DP=118;Dels=0.00;FS=5.896;HaplotypeScore=2.5628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.103;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1457,0,1091 chrIV 277971 . C A 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.082;DP=132;Dels=0.00;FS=6.715;HaplotypeScore=14.6235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.462;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:132:99:925,0,1820 chrIV 278280 . G A 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.705;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.031;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:132:99:1613,0,1269 chrIV 278671 . C T 4127.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.15;SB=-2.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4127,385,0 chrIV 278692 . G A 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.586;DP=142;Dels=0.00;FS=3.461;HaplotypeScore=5.9070;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=26.78;ReadPosRankSum=1.513;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3803,355,0 chrIV 278971 . G A 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2923,286,0 chrIV 279031 . T C 2357 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2390,252,0 chrIV 279220 . C G 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=103;Dels=0.00;FS=6.328;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.225;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:1010,0,1112 chrIV 279238 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.107;DP=119;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1204,0,1321 chrIV 279796 . C T 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.007;DP=91;Dels=0.00;FS=5.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:920,0,1071 chrIV 280191 . T C 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3323,340,0 chrIV 280295 . T C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.160;DP=95;Dels=0.00;FS=1.686;HaplotypeScore=2.9339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.024;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1185,0,880 chrIV 280298 . T A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.590;DP=94;Dels=0.00;FS=2.698;HaplotypeScore=2.9339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1230,0,944 chrIV 280697 . C T 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=26.00;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3127,318,0 chrIV 280802 . A T 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.09;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2694,264,0 chrIV 280844 . T C 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=105;Dels=0.00;FS=1.682;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:839,0,1386 chrIV 280847 . G A 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2778,262,0 chrIV 280931 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.420;DP=105;Dels=0.00;FS=8.372;HaplotypeScore=2.4052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.237;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,61:105:99:1259,0,955 chrIV 280934 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;DP=104;Dels=0.00;FS=3.932;HaplotypeScore=2.3972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:104:99:1297,0,898 chrIV 280976 . A G 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.928;DP=110;Dels=0.00;FS=4.970;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=2.029;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.156;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:110:99:809,0,1507 chrIV 281045 . T C 701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.142;DP=78;Dels=0.00;FS=9.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:731,0,960 chrIV 281207 . C T 2835 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.06;MQ0=0;QD=25.09;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2868,294,0 chrIV 281210 . C T 2683 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.86;MQ0=0;QD=24.17;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2716,282,0 chrIV 281213 . G A 2611 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.85;MQ0=0;QD=26.11;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2644,265,0 chrIV 281246 . T G 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;DP=112;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.319;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,70:112:99:1624,0,821 chrIV 281306 . C A 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3006,300,0 chrIV 281314 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.632;DP=121;Dels=0.00;FS=2.613;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.647;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1112,0,1213 chrIV 281327 . T C 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.43;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2627,267,0 chrIV 281392 . T C 2053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.44;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2086,219,0 chrIV 281405 . G C 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.116;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:983,0,943 chrIV 281474 . A G 2476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2509,264,0 chrIV 281643 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.056;DP=130;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.457;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1298,0,1515 chrIV 281647 . A G 4097.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9421;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.14;SB=-2.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4097,450,0 chrIV 281915 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.022;DP=105;Dels=0.00;FS=7.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.074;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:1087,0,1262 chrIV 281966 . T A 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=1;QD=25.74;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3372,331,0 chrIV 282024 . T A 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.20;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3183,310,0 chrIV 282129 . A G 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.966e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3845,393,0 chrIV 282145 . G A 3764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3764,379,0 chrIV 282844 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3266,316,0 chrIV 282856 . A G 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=25.07;ReadPosRankSum=0.296;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3116,318,0 chrIV 283024 . G A 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3312,325,0 chrIV 283309 . C T 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.079;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:787,0,1069 chrIV 283404 . T A 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;DP=140;Dels=0.00;FS=5.158;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.768;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,81:140:99:1854,0,1245 chrIV 283730 . A G 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3514,357,0 chrIV 283742 . G A 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3417,334,0 chrIV 283794 . A C 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3253,321,0 chrIV 283814 . A G 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=23.42;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2914,291,0 chrIV 283830 . A G 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2890,294,0 chrIV 283896 . A G 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3184,324,0 chrIV 284033 . G A 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.818;DP=80;Dels=0.00;FS=11.500;HaplotypeScore=3.8122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.475;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,45:80:99:1037,0,693 chrIV 284069 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.651;DP=97;Dels=0.00;FS=14.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1231,0,902 chrIV 284072 . A G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.953;DP=98;Dels=0.00;FS=12.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1213,0,939 chrIV 284171 . C T 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2601,252,0 chrIV 284322 . A G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.323;DP=144;Dels=0.00;FS=7.797;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=10.43;ReadPosRankSum=2.015;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1532,0,1521 chrIV 284371 . A G 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.079;DP=99;Dels=0.00;FS=1.694;HaplotypeScore=2.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:839,0,1338 chrIV 284463 . A G 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.212;DP=114;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=7.63;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,45:114:99:900,0,1580 chrIV 284500 . T C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=126;Dels=0.00;FS=4.353;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.894;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,51:126:99:1030,0,1746 chrIV 284539 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.423;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:112:99:1330,0,1125 chrIV 284746 . C T 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.122;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,43:106:99:930,0,1425 chrIV 285079 . A C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.601;DP=127;Dels=0.00;FS=5.438;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.189;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1356,0,1429 chrIV 285215 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.435;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:107:99:1239,0,1022 chrIV 285457 . C T 1924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.987;DP=175;Dels=0.00;FS=1.187;HaplotypeScore=4.9645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.181;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,94:175:99:1954,0,1633 chrIV 285472 . C T 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.202;DP=151;Dels=0.00;FS=2.033;HaplotypeScore=4.9670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=10.60;ReadPosRankSum=2.804;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1631,0,1533 chrIV 285505 . A G 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2863,297,0 chrIV 285562 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.848;DP=129;Dels=0.00;FS=8.752;HaplotypeScore=2.5986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1308,0,1484 chrIV 285568 . C T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.787;DP=122;Dels=0.00;FS=9.025;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.827;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:122:99:1104,0,1428 chrIV 285994 . A C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.749;DP=146;Dels=0.00;FS=14.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.504;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1286,0,1908 chrIV 286258 . A G 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3850,402,0 chrIV 286630 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.512;DP=124;Dels=0.00;FS=2.392;HaplotypeScore=3.1461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1204,0,1475 chrIV 286925 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.943;DP=143;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=2.7574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.403;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1242,0,1087 chrIV 287409 . T C 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3689,378,0 chrIV 287439 . C T 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.81;SB=-2.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3914,382,0 chrIV 287535 . T C 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3264,339,0 chrIV 287634 . G A 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3845,367,0 chrIV 288063 . G A 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3014,300,0 chrIV 288140 . G T 2814 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2847,280,0 chrIV 288549 . C T 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.854e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3983,382,0 chrIV 288597 . C T 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3499,349,0 chrIV 288618 . A G 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.910;DP=128;Dels=0.00;FS=5.649;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.024;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1431,0,1292 chrIV 288636 . T G 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.456;DP=131;Dels=0.00;FS=6.971;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1493,0,1339 chrIV 288667 . T G 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.717;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.372;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1552,0,1471 chrIV 288760 . C T 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=28.44;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3583,355,0 chrIV 288918 . C T 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3533,343,0 chrIV 288945 . G A 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3217,310,0 chrIV 289365 . G A 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3738,370,0 chrIV 289515 . T A 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.399;DP=97;Dels=0.00;FS=2.637;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1012,0,1187 chrIV 289558 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.299;DP=122;Dels=0.00;FS=8.599;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.784;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:122:99:1441,0,1172 chrIV 289917 . A T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.530;DP=103;Dels=0.00;FS=2.603;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=1;MQRankSum=-0.483;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.949;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1342,0,953 chrIV 290077 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.286;DP=123;Dels=0.00;FS=3.406;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1534,0,1148 chrIV 290079 . C T 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3308,334,0 chrIV 290715 . G C 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;DP=167;Dels=0.00;FS=2.730;HaplotypeScore=3.7688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.164;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,81:167:99:1638,0,1811 chrIV 291018 . T C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.675;DP=127;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.437;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1326,0,1489 chrIV 291204 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.059;DP=133;Dels=0.00;FS=14.219;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.192;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1184,0,1584 chrIV 291246 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.944;DP=112;Dels=0.00;FS=10.623;HaplotypeScore=3.3381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.240;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1357,0,1082 chrIV 291309 . G A 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.970e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3737,364,0 chrIV 291351 . G A 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3870,376,0 chrIV 291369 . C T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.886;DP=127;Dels=0.00;FS=13.195;HaplotypeScore=8.3603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.224;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1650,0,1160 chrIV 291387 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.652;DP=109;Dels=0.00;FS=27.384;HaplotypeScore=6.7857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:109:99:1427,0,990 chrIV 291408 . A G 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.896;DP=99;Dels=0.00;FS=11.832;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.116;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1051,0,1181 chrIV 291582 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.059;DP=148;Dels=0.00;FS=4.908;HaplotypeScore=6.5025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.440;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1485,0,1744 chrIV 291726 . T A 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3407,337,0 chrIV 291738 . T C 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.720;DP=123;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.390;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:123:99:899,0,1588 chrIV 291748 . C T 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.820;DP=126;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=6.6164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.174;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,49:126:99:941,0,1701 chrIV 291765 . C T 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;DP=123;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,42:123:99:783,0,1878 chrIV 291846 . G A 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.523;DP=136;Dels=0.00;FS=10.133;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.333;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,46:136:99:861,0,2033 chrIV 291889 . C T 2117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.913;DP=161;Dels=0.00;FS=7.120;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=1.874;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.785;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,90:161:99:2147,0,1416 chrIV 291961 . G A 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.392;DP=163;Dels=0.00;FS=4.721;HaplotypeScore=4.8772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=1;MQRankSum=2.260;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.436;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,77:163:99:1693,0,1896 chrIV 292005 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.478;DP=132;Dels=0.00;FS=6.603;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.147;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1418,0,1438 chrIV 292017 . T G 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3674,369,0 chrIV 292036 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.025;DP=133;Dels=0.01;FS=0.647;HaplotypeScore=3.6854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.756;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1368,0,1499 chrIV 292139 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.741;DP=131;Dels=0.01;FS=3.161;HaplotypeScore=6.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=2.377;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1346,0,1372 chrIV 292210 . G A 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.726;DP=101;Dels=0.00;FS=2.590;HaplotypeScore=2.7490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1061,0,1093 chrIV 292219 . A G 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.782;DP=108;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=2.7490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:108:99:1103,0,1266 chrIV 292273 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.953;DP=101;Dels=0.00;FS=5.085;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=-3.448;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.665;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:1060,0,1083 chrIV 292277 . A G 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.281;DP=106;Dels=0.00;FS=7.731;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.042;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.958;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:978,0,1251 chrIV 292317 . C T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.839;DP=132;Dels=0.00;FS=8.073;HaplotypeScore=55.1985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.82;MQ0=0;MQRankSum=-4.920;QD=10.33;ReadPosRankSum=-2.730;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1394,0,1322 chrIV 292351 . C T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.561;DP=129;Dels=0.00;FS=9.470;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.63;MQ0=0;MQRankSum=-5.556;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1070,0,1251 chrIV 292352 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.287;DP=140;Dels=0.00;FS=6.828;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.62;MQ0=0;MQRankSum=-4.903;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1092,0,1431 chrIV 292402 . A G 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;DP=116;Dels=0.00;FS=11.067;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.031;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1141,0,1328 chrIV 292426 . G A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.478;DP=122;Dels=0.00;FS=13.069;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.752;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.747;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1209,0,1415 chrIV 292428 . A G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.879;DP=121;Dels=0.00;FS=14.963;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.695;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1154,0,1495 chrIV 292499 . G A 810.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.537;DP=97;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQ0=0;MQRankSum=-6.536;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.769;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:840,0,1120 chrIV 292500 . G A 803.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.641;DP=97;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQ0=0;MQRankSum=-6.118;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.884;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:833,0,1101 chrIV 292505 . T G 810.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.562;DP=103;Dels=0.00;FS=2.554;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.43;MQ0=0;MQRankSum=-6.652;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.465;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:840,0,1221 chrIV 292517 . G A 2579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.31;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2612,261,0 chrIV 292555 . A G 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.932;DP=99;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=5.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.59;MQ0=0;MQRankSum=-7.228;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.079;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:721,0,1229 chrIV 292574 . T A 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;DP=100;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.62;MQ0=0;MQRankSum=-7.839;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:920,0,1212 chrIV 292582 . T C 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.275;DP=95;Dels=0.00;FS=1.672;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.75;MQ0=0;MQRankSum=-7.780;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.118;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:811,0,1158 chrIV 292597 . C T 636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;DP=80;Dels=0.00;FS=2.924;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.87;MQ0=0;MQRankSum=-6.876;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:666,0,984 chrIV 292605 . G A 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.175;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.623;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:732,0,923 chrIV 292611 . T C 607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.522;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.61;MQ0=0;MQRankSum=-6.353;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.207;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,34:78:99:637,0,1006 chrIV 292625 . T G 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.252;DP=77;Dels=0.00;FS=3.034;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.55;MQ0=0;MQRankSum=-4.518;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,36:77:99:706,0,918 chrIV 292644 . C T 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.203;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.184;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.560;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:994,0,1035 chrIV 292751 . A G 2786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.48;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2819,279,0 chrIV 292776 . A G 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3569,355,0 chrIV 293191 . A T 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2488,246,0 chrIV 293951 . G A 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.675;DP=91;Dels=0.00;FS=0.815;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=2.448;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:906,0,1055 chrIV 294427 . A G 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.343;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.779;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1670,0,1507 chrIV 294429 . T G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.241;DP=150;Dels=0.00;FS=0.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.366;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1409,0,1779 chrIV 294517 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;DP=113;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.806;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1094,0,1512 chrIV 294791 . C T 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.202;DP=117;Dels=0.00;FS=4.621;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.103;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.573;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1482,0,1021 chrIV 295157 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.763;DP=110;Dels=0.00;FS=3.535;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1109,0,1293 chrIV 295338 . T C 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.491;DP=151;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=3.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.271;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1725,0,1564 chrIV 295469 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.683;DP=147;Dels=0.00;FS=5.699;HaplotypeScore=2.9740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.064;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1482,0,1721 chrIV 295520 . T A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.583;DP=123;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1555,0,1251 chrIV 295526 . A G 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.265;DP=123;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.453;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1435,0,1260 chrIV 295789 . C T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.931;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.876;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1203,0,1546 chrIV 295928 . T C 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:120:99:3027,297,0 chrIV 295966 . T C 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.112;DP=120;Dels=0.00;FS=3.387;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.373;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1156,0,1322 chrIV 296009 . C T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.145;DP=106;Dels=0.00;FS=6.158;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.961;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1041,0,1133 chrIV 296063 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.589;DP=143;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1311,0,1724 chrIV 296415 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.783;DP=131;Dels=0.00;FS=3.221;HaplotypeScore=5.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.279;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1383,0,1473 chrIV 296527 . A G 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.819;DP=96;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.154;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:1024,0,1093 chrIV 296567 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.739;DP=120;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1142,0,1425 chrIV 296793 . A G 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3049,306,0 chrIV 296817 . A G 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2823,282,0 chrIV 296942 . G A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=114;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1122,0,1380 chrIV 297184 . A G 2210 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2243,237,0 chrIV 297848 . A G 718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.303;DP=82;Dels=0.00;FS=6.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.135;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:748,0,1109 chrIV 297971 . T C 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.952;DP=98;Dels=0.00;FS=2.686;HaplotypeScore=3.0979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.594;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,40:98:99:783,0,1360 chrIV 297975 . C A 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.534;DP=100;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=3.0979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=7.96;ReadPosRankSum=2.051;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:826,0,1392 chrIV 298099 . A T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.152;DP=112;Dels=0.00;FS=2.455;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.149;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1103,0,1334 chrIV 298148 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.283;DP=102;Dels=0.00;FS=3.708;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1243,0,1060 chrIV 298304 . G A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.251;DP=127;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=53.7324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.818;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:127:99:1523,0,1327 chrIV 298579 . T C 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3132,312,0 chrIV 298866 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.097;DP=126;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1109,0,1596 chrIV 298871 . C T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.625;DP=121;Dels=0.00;FS=4.450;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.194;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1568,0,1039 chrIV 299070 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.868;DP=129;Dels=0.00;FS=2.253;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=8.81;ReadPosRankSum=2.079;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1167,0,1558 chrIV 299200 . C T 4060.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.81;SB=-1.961e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4060,394,0 chrIV 299385 . T A 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3084,295,0 chrIV 299725 . A G 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.018;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.604;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,85:187:99:1684,0,2396 chrIV 299792 . G A 4178.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=15.7540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=28.04;SB=-2.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4178,412,0 chrIV 300204 . A T 4050.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.956e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4050,391,0 chrIV 300254 . C T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.346;DP=137;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.321;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1501,0,1388 chrIV 300482 . A G 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.205;DP=178;Dels=0.00;FS=1.984;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.482;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,85:178:99:1687,0,2151 chrIV 300487 . T C 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.933;DP=162;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.534;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,78:162:99:1618,0,1923 chrIV 300521 . C G 4440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.993e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4440,462,0 chrIV 300736 . T C 4269.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4269,418,0 chrIV 300807 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.297;DP=124;Dels=0.00;FS=9.928;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.163;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1235,0,1402 chrIV 300814 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.828;DP=125;Dels=0.00;FS=9.688;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1356,0,1334 chrIV 300862 . C T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.188;DP=134;Dels=0.00;FS=3.102;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1492,0,1386 chrIV 300880 . G A 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.883;DP=156;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=3.9627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1698,0,1613 chrIV 300983 . G T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.019;DP=120;Dels=0.00;FS=2.388;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1286,0,1198 chrIV 301024 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.886;DP=112;Dels=0.00;FS=1.544;HaplotypeScore=6.0707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.047;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1128,0,1212 chrIV 301033 . G A 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3101,312,0 chrIV 301039 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.869;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.997;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:106:99:946,0,1193 chrIV 301246 . C T 4271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=28.28;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4271,421,0 chrIV 301279 . C A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.446;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.387;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1465,0,1660 chrIV 301365 . A G 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.263;DP=134;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.511;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1599,0,1356 chrIV 301396 . A G 1958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.934;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.500;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,91:162:99:1988,0,1514 chrIV 301553 . G A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.947;DP=149;Dels=0.00;FS=2.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1440,0,1630 chrIV 301751 . T C 4265.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;DP=168;Dels=0.00;FS=4.329;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=25.39;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:4265,426,0 chrIV 301845 . G A 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.385;DP=151;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=-1.015;QD=11.45;ReadPosRankSum=2.166;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1759,0,1508 chrIV 301888 . G A 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.653;DP=157;Dels=0.00;FS=2.835;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=1.335;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.367;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,73:157:99:1495,0,1900 chrIV 302207 . C T 4914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4914,490,0 chrIV 302250 . C T 5162.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;DP=189;Dels=0.00;FS=3.956;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=27.31;ReadPosRankSum=1.714;SB=-2.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,188:189:99:5162,505,0 chrIV 302259 . T C 1996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.050;DP=157;Dels=0.00;FS=10.321;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.739;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,94:157:99:2026,0,1351 chrIV 302333 . A T 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.992;DP=171;Dels=0.00;FS=19.519;HaplotypeScore=358.1548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=2.272;QD=0.08;ReadPosRankSum=-2.089;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,85:171:44:44,0,95 chrIV 302423 . C A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.618;DP=116;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.532;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1560,0,951 chrIV 302429 . T G 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.574;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.328;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:801,0,1635 chrIV 302474 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.702;DP=132;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,52:132:99:1103,0,1738 chrIV 302581 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.184;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.389;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,63:105:99:1249,0,860 chrIV 302711 . G T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.475;DP=159;Dels=0.00;FS=8.158;HaplotypeScore=7.6148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.693;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1328,0,1767 chrIV 302719 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.603;DP=170;Dels=0.00;FS=15.379;HaplotypeScore=2.8751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.820;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,73:170:99:1331,0,2132 chrIV 302749 . C T 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;DP=191;Dels=0.00;FS=23.805;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,85:191:99:1716,0,2376 chrIV 302868 . G T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.967;DP=155;Dels=0.00;FS=2.911;HaplotypeScore=6.5393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=0.446;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,68:155:99:1512,0,1806 chrIV 302927 . C A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.443;DP=145;Dels=0.00;FS=10.375;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=1;MQRankSum=2.165;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.543;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:145:99:1184,0,1860 chrIV 303051 . C A 4244.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4244,415,0 chrIV 303088 . T A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.724;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.99;MQ0=0;MQRankSum=-4.139;QD=9.68;ReadPosRankSum=-2.138;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:123:99:1221,0,1291 chrIV 303098 . A G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.546;DP=137;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=2.3656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-3.240;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:137:99:1342,0,1477 chrIV 303104 . G C 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.245;DP=144;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.338;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.984;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1529,0,1333 chrIV 303140 . C T 1934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.789;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.563;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.284;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,85:148:99:1964,0,1284 chrIV 303396 . C G 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.222;DP=138;Dels=0.00;FS=4.092;HaplotypeScore=4.2023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1497,0,1515 chrIV 303471 . A G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.378;DP=130;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.391;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.105;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1375,0,1471 chrIV 303534 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.367;DP=134;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.388;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1338,0,1358 chrIV 303967 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.259;DP=110;Dels=0.00;FS=2.588;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.580;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:110:99:1155,0,1213 chrIV 304248 . C T 4347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4347,445,0 chrIV 304662 . C T 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.904;DP=126;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=1;MQRankSum=1.852;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.769;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,51:126:99:1046,0,1708 chrIV 304677 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.003;DP=114;Dels=0.00;FS=2.482;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=1;MQRankSum=0.636;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,68:114:99:1654,0,848 chrIV 304849 . T A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;DP=146;Dels=0.00;FS=4.924;HaplotypeScore=6.9801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:146:99:1432,0,1752 chrIV 305375 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.844;DP=128;Dels=0.00;FS=3.218;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.080;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1180,0,1331 chrIV 305411 . A G 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.772;DP=136;Dels=0.00;FS=2.274;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.133;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1382,0,1371 chrIV 305599 . G T 4278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4278,415,0 chrIV 306214 . A C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.750;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1195,0,1119 chrIV 306463 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.955;DP=127;Dels=0.00;FS=9.582;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=9.51;ReadPosRankSum=-2.120;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1238,0,1558 chrIV 306752 . T C 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.937;DP=148;Dels=0.00;FS=1.366;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.284;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1477,0,1747 chrIV 307571 . C T 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2990,283,0 chrIV 307596 . G A 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.787;DP=117;Dels=0.00;FS=4.477;HaplotypeScore=1.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.739;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1279,0,1175 chrIV 307671 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.238;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.435;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1400,0,1690 chrIV 307685 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.036;DP=136;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.5380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.970;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.189;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1498,0,1473 chrIV 307974 . C T 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.944;DP=153;Dels=0.00;FS=11.844;HaplotypeScore=4.1142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=11.10;ReadPosRankSum=-2.653;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1728,0,1356 chrIV 307984 . T C 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6629;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=24.66;ReadPosRankSum=1.662;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3674,355,0 chrIV 308096 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.070;DP=128;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=11.44;ReadPosRankSum=2.018;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:128:99:1494,0,1304 chrIV 308170 . A G 1276.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.630;DP=129;Dels=0.00;FS=2.670;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.587;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.729;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:129:99:1306,0,1372 chrIV 308173 . C T 843.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.693;DP=137;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=6.15;ReadPosRankSum=3.428;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:873,0,1690 chrIV 308174 . T C 843.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.792;DP=137;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=6.15;ReadPosRankSum=3.255;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:873,0,1755 chrIV 308212 . A C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.162;DP=130;Dels=0.00;FS=5.397;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.703;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1246,0,1623 chrIV 308238 . A G 3389.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3389,348,0 chrIV 308241 . C T 3325.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.97;MQ0=0;QD=27.25;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3325,340,0 chrIV 308248 . T C 1242.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.271;DP=130;Dels=0.00;FS=10.354;HaplotypeScore=3.8885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.202;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.120;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1272,0,1582 chrIV 308257 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.112;DP=132;Dels=0.00;FS=10.028;HaplotypeScore=2.8938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.752;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1371,0,1523 chrIV 308440 . T C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.529;DP=146;Dels=0.00;FS=2.055;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1438,0,1697 chrIV 308457 . C T 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.084;DP=142;Dels=0.00;FS=3.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1719,0,1402 chrIV 308552 . G A 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.883;DP=144;Dels=0.00;FS=5.057;HaplotypeScore=2.5657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.342;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1490,0,1742 chrIV 308657 . C T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.185;DP=116;Dels=0.00;FS=5.779;HaplotypeScore=3.8953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.107;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.022;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1156,0,1296 chrIV 308658 . T G 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.397;DP=119;Dels=0.00;FS=8.423;HaplotypeScore=3.8953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1199,0,1336 chrIV 308700 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.990;DP=129;Dels=0.00;FS=2.506;HaplotypeScore=2.6187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=11.13;ReadPosRankSum=2.057;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1466,0,1447 chrIV 308773 . T C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.260;DP=111;Dels=0.00;FS=7.312;HaplotypeScore=5.3976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.048;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1127,0,1295 chrIV 308968 . C T 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.657;DP=151;Dels=0.00;FS=4.817;HaplotypeScore=4.9679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.922;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1707,0,1545 chrIV 309554 . G T 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.34;MQ0=0;QD=28.99;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:3164,319,0 chrIV 309607 . T C 2448 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=90.3101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.99;MQ0=0;QD=22.05;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2481,261,0 chrIV 309630 . G A 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.27;MQ0=0;QD=22.67;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2685,273,0 chrIV 309716 . T A 4842.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=26.90;SB=-2.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4842,460,0 chrIV 310132 . T C 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3251,339,0 chrIV 310329 . A T 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2235;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3456,343,0 chrIV 310698 . T C 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3774,387,0 chrIV 311386 . A G 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;DP=149;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1455,0,1755 chrIV 311442 . T G 4183.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.997e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4183,409,0 chrIV 311476 . A G 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.461;DP=151;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.848;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1519,0,1709 chrIV 311500 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.743;DP=133;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.348;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1351,0,1509 chrIV 311602 . G A 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3809,376,0 chrIV 311685 . C G 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;DP=142;Dels=0.00;FS=6.352;HaplotypeScore=4.6870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.739;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1767,0,1236 chrIV 311752 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.894;DP=142;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.775;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1440,0,1581 chrIV 311890 . T G 1831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.307;DP=192;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=6.2472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,91:192:99:1861,0,2251 chrIV 312028 . T C 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.577;DP=168;Dels=0.00;FS=2.702;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.567;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:168:99:1682,0,1822 chrIV 312184 . C T 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.072;DP=165;Dels=0.00;FS=2.778;HaplotypeScore=8.8472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1836,0,1708 chrIV 312250 . T C 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.80;SB=-2.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4179,418,0 chrIV 312391 . C T 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.693;DP=150;Dels=0.00;FS=11.667;HaplotypeScore=3.8972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.583;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1724,0,1595 chrIV 312431 . C T 4335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.27;MQ0=0;QD=26.76;SB=-2.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4335,445,0 chrIV 313108 . G A 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=28.75;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3278,319,0 chrIV 314015 . T C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.544;DP=117;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.093;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1143,0,1285 chrIV 317492 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.943;DP=135;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,57:135:99:1212,0,1888 chrIV 317652 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.573;DP=132;Dels=0.00;FS=3.126;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.327;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1309,0,1497 chrIV 317822 . T A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.180;DP=138;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.141;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:138:99:1296,0,1660 chrIV 317913 . G T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.878;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.341;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1449,0,1451 chrIV 317937 . C T 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.080;DP=117;Dels=0.00;FS=5.823;HaplotypeScore=3.5645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:117:99:1278,0,1134 chrIV 318023 . A G 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.322;DP=95;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.026;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,52:95:99:1157,0,911 chrIV 318193 . A G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.585;DP=111;Dels=0.00;FS=10.446;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.896;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1057,0,1273 chrIV 318317 . G A 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.820;DP=143;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=8.6426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=1;MQRankSum=1.000;QD=10.47;ReadPosRankSum=-2.069;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1527,0,1549 chrIV 318398 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.252;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=0.350;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.862;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:111:99:1380,0,1004 chrIV 318563 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.202;DP=135;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.089;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1480,0,1380 chrIV 318565 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.099;DP=140;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=6.0002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.369;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1441,0,1541 chrIV 318609 . A G 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.841;DP=112;Dels=0.00;FS=4.890;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:948,0,1448 chrIV 320548 . T C 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3100,310,0 chrIV 320650 . C T 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.188;DP=98;Dels=0.00;FS=8.037;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=1;MQRankSum=0.589;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:1001,0,1070 chrIV 320917 . A G 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;DP=109;Dels=0.00;FS=10.732;HaplotypeScore=7.6564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.160;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1281,0,1072 chrIV 321142 . A G 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3371,342,0 chrIV 322167 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.411;DP=114;Dels=0.00;FS=1.600;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=2.943;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.270;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1129,0,1392 chrIV 322563 . A T 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.280;DP=130;Dels=0.00;FS=5.467;HaplotypeScore=3.9394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=13.20;ReadPosRankSum=-2.512;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1746,0,1154 chrIV 323989 . T C 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.578;DP=139;Dels=0.00;FS=2.287;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,54:139:99:1014,0,2063 chrIV 324593 . C T 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.469;DP=99;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.118;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:944,0,1142 chrIV 324892 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.838;DP=85;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.501;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1009,0,871 chrIV 325079 . C A 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5383;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2783,276,0 chrIV 325302 . T C 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2943,294,0 chrIV 326534 . A C 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3546,360,0 chrIV 327242 . G A 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3808,367,0 chrIV 327540 . G A 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=28.28;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3620,346,0 chrIV 328816 . A G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.804;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.235;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1068,0,1524 chrIV 328957 . A C 4280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4280,439,0 chrIV 329270 . G A 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;DP=105;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=4.9626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:909,0,1260 chrIV 329711 . G A 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3110,291,0 chrIV 330288 . C T 5314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:5314,511,0 chrIV 331393 . G C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;DP=145;Dels=0.00;FS=2.962;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1063,0,1615 chrIV 333019 . G A 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.057;DP=82;Dels=0.00;FS=1.780;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.626;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,40:82:99:816,0,896 chrIV 333169 . T C 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;DP=121;Dels=0.00;FS=12.216;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.677;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1379,0,1356 chrIV 333204 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;DP=119;Dels=0.00;FS=5.635;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=9.93;ReadPosRankSum=2.023;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1212,0,1463 chrIV 333208 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.535;DP=118;Dels=0.00;FS=5.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.807;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1400,0,1266 chrIV 333466 . T C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.947;DP=125;Dels=0.00;FS=8.623;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=9.78;ReadPosRankSum=2.033;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1252,0,1465 chrIV 333580 . T C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1269,0,1759 chrIV 333642 . T A 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;DP=129;Dels=0.00;FS=4.362;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.061;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1558,0,1260 chrIV 333664 . G A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.567;DP=130;Dels=0.00;FS=5.830;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.472;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1606,0,1183 chrIV 333682 . G C 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.317;DP=135;Dels=0.00;FS=5.906;HaplotypeScore=4.7132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=3.375;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.306;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1491,0,1412 chrIV 333747 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.972;DP=129;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.973;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,51:129:99:1040,0,1763 chrIV 333753 . A T 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.493;DP=127;Dels=0.00;FS=3.448;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.680;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,50:127:99:1001,0,1684 chrIV 333802 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.829;DP=126;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.956;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.130;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:126:99:1420,0,1250 chrIV 333847 . C T 1883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.357;DP=156;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=5.1202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.416;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.449;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,87:156:99:1913,0,1358 chrIV 334393 . T C 4393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4393,454,0 chrIV 334761 . G C 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.567;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1533,0,1684 chrIV 334805 . A G 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.110;DP=138;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=2.5239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:1673,0,1328 chrIV 334888 . T C 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.461;DP=135;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.294;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1527,0,1313 chrIV 334894 . T C 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;DP=146;Dels=0.00;FS=2.086;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.030;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1661,0,1480 chrIV 335332 . A C 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3220,330,0 chrIV 335392 . A G 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3612,361,0 chrIV 335410 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;DP=140;Dels=0.00;FS=2.246;HaplotypeScore=3.7432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1375,0,1539 chrIV 335428 . C A 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=28.39;ReadPosRankSum=1.707;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3861,361,0 chrIV 335476 . C T 4300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=28.10;ReadPosRankSum=1.504;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:153:99:4300,421,0 chrIV 335524 . C T 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3707,364,0 chrIV 335650 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.620;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1426,0,1533 chrIV 335956 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.971;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.004;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1357,0,1873 chrIV 336327 . T C 1956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.668;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.280;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,96:179:99:1986,0,1819 chrIV 336444 . T C 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.410;DP=154;Dels=0.00;FS=2.972;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1579,0,1780 chrIV 336447 . C T 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.940;DP=154;Dels=0.00;FS=2.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.562;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1598,0,1714 chrIV 336657 . C T 1741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.598;DP=143;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=4.9518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.342;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1771,0,1365 chrIV 336671 . G A 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.853;DP=139;Dels=0.00;FS=2.145;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1688,0,1359 chrIV 336884 . C G 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3811,379,0 chrIV 336922 . C G 3892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3892,391,0 chrIV 336930 . C G 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;DP=148;Dels=0.00;FS=2.121;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,84:148:99:1728,0,1283 chrIV 336943 . T C 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3317,354,0 chrIV 337041 . G A 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.646;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.025;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1709,0,1608 chrIV 337188 . A G 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.682;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=11.72;ReadPosRankSum=2.353;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,86:147:99:1753,0,1354 chrIV 337582 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.499;DP=114;Dels=0.00;FS=10.986;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1183,0,1395 chrIV 337604 . A C 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.491;DP=108;Dels=0.00;FS=1.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1035,0,1398 chrIV 337809 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.321;DP=120;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=1.5750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:120:99:1196,0,1368 chrIV 338341 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.695;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.164;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,60:153:99:1226,0,2094 chrIV 338368 . G A 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.648;DP=120;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.851;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,45:120:99:909,0,1682 chrIV 338428 . A G 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.570;DP=100;Dels=0.00;FS=7.985;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:882,0,1283 chrIV 338718 . C T 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.004;DP=107;Dels=0.00;FS=4.814;HaplotypeScore=7.1790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:107:99:1131,0,1101 chrIV 338980 . T C 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.735;DP=144;Dels=0.00;FS=8.940;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,81:144:99:1711,0,1290 chrIV 339115 . T C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;DP=126;Dels=0.00;FS=3.235;HaplotypeScore=10.6955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.172;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1210,0,1480 chrIV 339391 . A G 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3636,378,0 chrIV 339421 . G A 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.517;DP=142;Dels=0.00;FS=5.056;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.286;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1572,0,1558 chrIV 339528 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.929;DP=130;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.745;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1324,0,1494 chrIV 339556 . T C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.972;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1351,0,1505 chrIV 339743 . C T 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=28.25;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3475,340,0 chrIV 339880 . C T 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3555,355,0 chrIV 339988 . A T 3838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3838,361,0 chrIV 340208 . C T 4099.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=28.66;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:4099,403,0 chrIV 340351 . C T 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.44;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4083,397,0 chrIV 340395 . A T 2803 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.127;DP=129;Dels=0.00;FS=16.834;HaplotypeScore=167.9719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=21.73;ReadPosRankSum=3.122;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,113:129:99:2836,217,0 chrIV 340555 . G T 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=26.60;SB=-2.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3883,379,0 chrIV 340874 . T G 57.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=0.57;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:12:90,12,0 chrIV 340916 . T C 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2818,282,0 chrIV 340965 . A T 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3693,364,0 chrIV 341033 . G A 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.6767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3875,382,0 chrIV 341077 . C T 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.995;DP=134;Dels=0.00;FS=3.301;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1379,0,1452 chrIV 341171 . T C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.939;DP=131;Dels=0.00;FS=4.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1343,0,1323 chrIV 341261 . A G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.055;DP=154;Dels=0.00;FS=4.694;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1474,0,1744 chrIV 341381 . A G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.773;DP=139;Dels=0.00;FS=12.352;HaplotypeScore=3.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.455;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1585,0,1360 chrIV 341423 . T A 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.904;DP=137;Dels=0.00;FS=7.647;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.386;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1557,0,1540 chrIV 341464 . A G 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.830;DP=152;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1637,0,1712 chrIV 341565 . A C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.512;DP=111;Dels=0.00;FS=3.481;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.710;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1059,0,1408 chrIV 341570 . A T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;DP=106;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.993;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1339,0,1064 chrIV 341596 . G A 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.357;DP=127;Dels=0.00;FS=3.380;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=9.08;ReadPosRankSum=2.085;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1183,0,1545 chrIV 341782 . A G 2393 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2426,255,0 chrIV 341812 . G A 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2759,270,0 chrIV 341953 . G A 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=28.33;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:4051,388,0 chrIV 341978 . A C 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=25.29;ReadPosRankSum=-1.188;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3540,333,0 chrIV 342221 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.699;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1478,0,1217 chrIV 342417 . G A 1965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.655;DP=158;Dels=0.00;FS=2.001;HaplotypeScore=2.7051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,90:158:99:1995,0,1309 chrIV 342428 . T C 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.752;DP=152;Dels=0.00;FS=8.457;HaplotypeScore=2.7051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.143;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1719,0,1453 chrIV 342525 . C T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.736;DP=149;Dels=0.00;FS=7.970;HaplotypeScore=7.6832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.320;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:149:99:1563,0,1624 chrIV 342597 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.973;DP=132;Dels=0.00;FS=3.139;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.788;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1324,0,1547 chrIV 342600 . A G 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3421,351,0 chrIV 342623 . A C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.981;DP=134;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.018;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1341,0,1556 chrIV 342650 . T C 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3621,384,0 chrIV 342869 . A G 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.914;DP=147;Dels=0.00;FS=3.980;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=9.99;ReadPosRankSum=2.218;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1498,0,1739 chrIV 343292 . G A 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3410,334,0 chrIV 343448 . T C 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4122,412,0 chrIV 343523 . T C 1944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.654;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.058;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,95:193:99:1974,0,2270 chrIV 343580 . C T 1801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;DP=145;Dels=0.00;FS=3.201;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.142;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,83:145:99:1831,0,1302 chrIV 344176 . T C 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.787;DP=142;Dels=0.00;FS=3.633;HaplotypeScore=2.7209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.260;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1645,0,1564 chrIV 344181 . C G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.571;DP=129;Dels=0.00;FS=3.716;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.761;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1465,0,1312 chrIV 344235 . T C 1297 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.351;DP=111;Dels=0.00;FS=3.502;HaplotypeScore=54.0853;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:57,54:111:60:1330,60,0 chrIV 344321 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.696;DP=117;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.498;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1276,0,1298 chrIV 344363 . G A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.737;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1174,0,1558 chrIV 344480 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.638;DP=141;Dels=0.00;FS=3.297;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.491;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:141:99:1394,0,1357 chrIV 344899 . C T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.099;DP=148;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:99:1453,0,1713 chrIV 345017 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.658;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1322,0,1508 chrIV 345134 . T C 3561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3561,357,0 chrIV 345195 . A G 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3492,366,0 chrIV 345209 . A G 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3515,369,0 chrIV 345304 . G T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.553;DP=154;Dels=0.00;FS=9.814;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,67:154:99:1493,0,1897 chrIV 345360 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.945;DP=121;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1036,0,1605 chrIV 345524 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.642;DP=155;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=4.6467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.416;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,69:155:99:1484,0,1900 chrIV 345541 . A T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.277;DP=149;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=2.8832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1527,0,1746 chrIV 345543 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.057;DP=145;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.105;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1518,0,1674 chrIV 345566 . A G 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;DP=151;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=2.9111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1728,0,1631 chrIV 345627 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.057;DP=137;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1235,0,1760 chrIV 345639 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.607;DP=144;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=3.7175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.198;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1301,0,1761 chrIV 345766 . C T 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.162;DP=123;Dels=0.00;FS=7.078;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=1;MQRankSum=-0.879;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.111;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1175,0,1421 chrIV 345769 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.746;DP=124;Dels=0.00;FS=4.500;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=-1.462;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.130;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1168,0,1514 chrIV 346111 . T C 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;DP=131;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,51:131:99:967,0,1751 chrIV 346360 . C A 3878.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3878,376,0 chrIV 346366 . C T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3378,334,0 chrIV 346477 . G A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.443;DP=151;Dels=0.00;FS=9.902;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1597,0,1707 chrIV 346531 . T C 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3932,405,0 chrIV 346536 . T C 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3884,396,0 chrIV 346558 . G A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.489;DP=139;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=2.5939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1471,0,1693 chrIV 346745 . G A 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3612,355,0 chrIV 346843 . A G 4327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.728;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.609;SB=-2.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,168:169:99:4327,430,0 chrIV 346886 . C T 1886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.938;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.942;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,88:156:99:1916,0,1382 chrIV 346939 . A G 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3992,420,0 chrIV 347059 . T C 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3226,330,0 chrIV 347078 . A G 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.300;DP=127;Dels=0.00;FS=2.289;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.007;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1191,0,1654 chrIV 347326 . A C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.525;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1500,0,1300 chrIV 347619 . C G 4429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.36;SB=-2.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4429,445,0 chrIV 347623 . G A 4609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.11;SB=-2.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4609,451,0 chrIV 347851 . C T 4073.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4073,388,0 chrIV 347958 . T C 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7605;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=25.94;ReadPosRankSum=0.429;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2861,279,0 chrIV 348204 . G A 4904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.55;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4904,466,0 chrIV 348352 . C T 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.798;DP=124;Dels=0.00;FS=5.033;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1438,0,1293 chrIV 348434 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.246;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.489;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1087,0,1315 chrIV 348490 . A G 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.421;DP=109;Dels=0.00;FS=4.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.312;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1175,0,1197 chrIV 348778 . G A 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2935,289,0 chrIV 348793 . A T 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2961,300,0 chrIV 349114 . A G 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2956,297,0 chrIV 349421 . G A 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9427;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3091,316,0 chrIV 349537 . T C 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0620;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3355,348,0 chrIV 349619 . A G 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3206,333,0 chrIV 349654 . A G 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2798,294,0 chrIV 350046 . A G 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2809,300,0 chrIV 350077 . A G 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=107;Dels=0.00;FS=3.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=25.06;ReadPosRankSum=1.340;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2714,285,0 chrIV 350405 . G A 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3580,358,0 chrIV 350462 . A G 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3714,385,0 chrIV 350645 . C A 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3695,367,0 chrIV 350782 . A C 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8231;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=27.23;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3975,406,0 chrIV 350863 . A G 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3640,372,0 chrIV 351013 . C T 583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.284;DP=108;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=3.5131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.01;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:108:99:613,0,483 chrIV 351028 . A G 1716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.75;MQ0=0;QD=14.18;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:1749,177,0 chrIV 351097 . G A 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3516,346,0 chrIV 351207 . G T 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3448,328,0 chrIV 351214 . C A 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3452,328,0 chrIV 351250 . T C 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6971;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2815,294,0 chrIV 351451 . C T 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3946,391,0 chrIV 351529 . A G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.703;DP=133;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.443;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1391,0,1426 chrIV 351730 . A T 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.50;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2728,267,0 chrIV 351862 . G A 4004.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4004,409,0 chrIV 351963 . A G 4370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.98;SB=-2.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4370,436,0 chrIV 351988 . C T 4198.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.44;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4198,412,0 chrIV 351997 . T C 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3593,378,0 chrIV 352048 . G A 4044.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4044,388,0 chrIV 352525 . G T 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.214;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1633,0,1605 chrIV 352550 . T C 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3555,372,0 chrIV 352697 . T C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3369,345,0 chrIV 352902 . G A 4139.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9223;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=27.05;SB=-2.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4139,394,0 chrIV 353125 . G A 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3705,355,0 chrIV 353156 . G A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.803;DP=145;Dels=0.00;FS=5.028;HaplotypeScore=3.9666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.256;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1472,0,1602 chrIV 353410 . T C 2431 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2464,261,0 chrIV 353682 . T G 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.54;SB=-2.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3985,400,0 chrIV 353837 . C A 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;DP=124;Dels=0.00;FS=2.324;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.968;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:1591,0,1040 chrIV 354052 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.045;DP=135;Dels=0.00;FS=2.275;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.809;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1259,0,1588 chrIV 354130 . A G 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.020;DP=174;Dels=0.00;FS=3.766;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.008;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,92:174:99:1799,0,1768 chrIV 354238 . G A 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.920;DP=111;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:984,0,1335 chrIV 354286 . C T 4317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4317,424,0 chrIV 354574 . A G 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;DP=123;Dels=0.00;FS=3.417;HaplotypeScore=3.5981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.859;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3161,298,0 chrIV 354889 . G A 3901.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.1587;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3901,382,0 chrIV 354974 . A G 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;DP=135;Dels=0.00;FS=3.379;HaplotypeScore=4.9785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=26.47;ReadPosRankSum=1.501;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3574,358,0 chrIV 355467 . A G 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=1;QD=24.96;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3769,381,0 chrIV 355605 . G A 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:124:99:3361,310,0 chrIV 355986 . G A 4202.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4202,415,0 chrIV 356226 . A G 3806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3806,390,0 chrIV 356546 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.525;DP=141;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=1.977;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.251;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1377,0,1676 chrIV 356562 . C T 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=1;QD=28.04;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3589,349,0 chrIV 356766 . A G 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3602,372,0 chrIV 356951 . T G 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.96;MQ0=0;QD=17.04;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:2470,258,0 chrIV 356965 . A G 2043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.06;MQ0=0;QD=13.99;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:2076,210,0 chrIV 357038 . G C 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3511,375,0 chrIV 357070 . C T 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3552,360,0 chrIV 357312 . T C 2043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=18.57;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2076,228,0 chrIV 357529 . C T 4631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2931;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4631,436,0 chrIV 357632 . A C 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7398;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3774,375,0 chrIV 357664 . C T 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.104;DP=144;Dels=0.00;FS=2.976;HaplotypeScore=4.3912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.965;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1533,0,1488 chrIV 357787 . A G 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2796,285,0 chrIV 357802 . C T 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.276;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=24.81;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2861,254,0 chrIV 358050 . G A 4272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.981e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4272,412,0 chrIV 358197 . C T 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5359;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=27.12;ReadPosRankSum=1.183;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3932,382,0 chrIV 358230 . T A 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.67;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3921,391,0 chrIV 358243 . T C 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.82;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3796,394,0 chrIV 358273 . A G 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.267;DP=149;Dels=0.00;FS=3.808;HaplotypeScore=12.9386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=24.54;ReadPosRankSum=1.523;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3656,381,0 chrIV 358299 . T C 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.71;SB=-2.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3628,381,0 chrIV 358380 . C A 4454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.16;SB=-2.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4454,445,0 chrIV 358389 . C T 4769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.10;SB=-2.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4769,484,0 chrIV 358431 . G A 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3714,355,0 chrIV 358561 . A T 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3813,379,0 chrIV 358643 . G T 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3579,352,0 chrIV 358690 . G T 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3448,340,0 chrIV 358707 . T G 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2958,303,0 chrIV 358755 . A G 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3018,324,0 chrIV 358884 . A C 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3456,354,0 chrIV 358932 . A G 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3288,342,0 chrIV 358989 . T A 4569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.88;SB=-2.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4569,442,0 chrIV 359007 . C T 4260.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.30;SB=-2.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4260,406,0 chrIV 359028 . A G 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.997e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3950,379,0 chrIV 359069 . T C 4202.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4202,441,0 chrIV 359293 . T G 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3145,321,0 chrIV 359402 . C T 4213.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=27.90;SB=-2.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4213,418,0 chrIV 359411 . A T 4357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.79;MQ0=0;QD=25.93;SB=-2.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4357,433,0 chrIV 359427 . A G 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.27;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.965e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3735,387,0 chrIV 359534 . A T 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3391,325,0 chrIV 359556 . C A 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3122,339,0 chrIV 359557 . A G 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=22.68;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3050,336,0 chrIV 359718 . G A 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.03;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3233,316,0 chrIV 359736 . T G 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9205;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.87;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3175,324,0 chrIV 359743 . A G 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3428,357,0 chrIV 359793 . A T 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3325,319,0 chrIV 359869 . C T 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.84;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3536,343,0 chrIV 360257 . G A 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2724,262,0 chrIV 360665 . T C 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3243,328,0 chrIV 361157 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.133;DP=117;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.193;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1060,0,1420 chrIV 361162 . T C 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3047,306,0 chrIV 361183 . A C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.433;DP=115;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,48:115:99:941,0,1472 chrIV 361672 . G A 2144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=28.21;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2177,213,0 chrIV 361711 . T C 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.093;DP=123;Dels=0.00;FS=4.788;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1415,0,1294 chrIV 361844 . A G 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3426,354,0 chrIV 361942 . A G 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.874;DP=128;Dels=0.00;FS=14.792;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1568,0,1286 chrIV 362381 . A G 1053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.202;DP=113;Dels=0.00;FS=6.050;HaplotypeScore=14.8530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=9.32;ReadPosRankSum=-2.026;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:68,45:113:99:1086,117,0 chrIV 362486 . A T 2008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.429;DP=155;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=3.7136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.618;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,87:155:99:2038,0,1419 chrIV 362677 . G A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.449;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.437;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1385,0,1095 chrIV 362834 . G A 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:3037,306,0 chrIV 362993 . T C 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3224,324,0 chrIV 363404 . G A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.223;DP=145;Dels=0.00;FS=5.070;HaplotypeScore=2.9882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.137;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1487,0,1587 chrIV 363607 . A G 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.134;DP=115;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1306,0,1163 chrIV 363784 . G A 1892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.794;DP=159;Dels=0.00;FS=4.792;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.848;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,89:159:99:1922,0,1384 chrIV 363821 . A C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.280;DP=121;Dels=0.00;FS=7.846;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.672;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1269,0,1380 chrIV 364119 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.905;DP=164;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,69:164:99:1383,0,2008 chrIV 364251 . G A 3936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3936,379,0 chrIV 364735 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.999;DP=109;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.680;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1456,0,982 chrIV 364913 . G T 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.286;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.369;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1532,0,1768 chrIV 365027 . G A 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3096,298,0 chrIV 365106 . G A 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.174;DP=160;Dels=0.00;FS=2.396;HaplotypeScore=4.8434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.799;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.471;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1681,0,1725 chrIV 365740 . T C 4438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4438,436,0 chrIV 365821 . A G 4295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4295,438,0 chrIV 365897 . T A 3939.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.17;SB=-2.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3939,385,0 chrIV 366206 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.323;DP=96;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1085,0,876 chrIV 366283 . G A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.255;DP=121;Dels=0.00;FS=10.065;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1221,0,1100 chrIV 366354 . C A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.385;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:135:99:1425,0,1478 chrIV 366413 . C T 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.441;DP=151;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.490;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1746,0,1587 chrIV 366464 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.396;DP=135;Dels=0.00;FS=4.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1383,0,1482 chrIV 366543 . C T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.689;DP=102;Dels=0.00;FS=1.606;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.177;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1007,0,1101 chrIV 366862 . C T 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;DP=106;Dels=0.00;FS=5.008;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.636;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:863,0,1425 chrIV 367162 . G A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.123;DP=134;Dels=0.00;FS=11.004;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.646;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1472,0,1491 chrIV 367213 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.802;DP=159;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.789;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:159:99:1354,0,1973 chrIV 367336 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.604;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.527;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1404,0,1449 chrIV 367564 . G C 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.374;DP=160;Dels=0.00;FS=6.996;HaplotypeScore=4.3821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.797;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,80:160:99:1557,0,1681 chrIV 367618 . G A 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.518;DP=158;Dels=0.00;FS=3.711;HaplotypeScore=5.7629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.909;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:158:99:1528,0,1693 chrIV 368193 . A C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.245;DP=140;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1500,0,1684 chrIV 368207 . A G 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.937;DP=147;Dels=0.00;FS=3.887;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1453,0,1782 chrIV 368276 . C T 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.200;DP=160;Dels=0.00;FS=2.797;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=10.23;ReadPosRankSum=-2.076;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1667,0,1810 chrIV 368402 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.361;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.290;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1371,0,1250 chrIV 368735 . G A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.629;DP=117;Dels=0.00;FS=7.608;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1093,0,1380 chrIV 368972 . G A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.563;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.821;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1405,0,1252 chrIV 369194 . C T 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.335;DP=103;Dels=0.00;FS=6.580;HaplotypeScore=4.9661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:986,0,736 chrIV 369366 . C A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.403;DP=102;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=2.9453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.130;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.938;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1126,0,1128 chrIV 369451 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.442;DP=152;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=6.5711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1387,0,1472 chrIV 369971 . G T 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.552;DP=128;Dels=0.00;FS=2.300;HaplotypeScore=8.2200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.298;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1620,0,1116 chrIV 370142 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.625;DP=88;Dels=0.00;FS=1.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,51:88:99:1204,0,725 chrIV 370148 . C T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.604;DP=92;Dels=0.00;FS=2.844;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.436;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,56:92:99:1310,0,729 chrIV 370499 . G A 2030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.157;DP=152;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.561;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,93:152:99:2060,0,1141 chrIV 370634 . G C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;DP=130;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1404,0,1267 chrIV 370771 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.092;DP=125;Dels=0.00;FS=16.549;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1081,0,1524 chrIV 370914 . T C 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.906;DP=116;Dels=0.00;FS=1.763;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,76:116:99:1585,0,719 chrIV 370982 . A G 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;DP=108;Dels=0.00;FS=1.221;HaplotypeScore=61.3651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=0.22;ReadPosRankSum=-4.779;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,15:108:54:54,0,976 chrIV 370986 . A G 235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.884;DP=98;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=14.8227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.900;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,57:98:99:265,0,696 chrIV 371085 . T C 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.835;DP=115;Dels=0.00;FS=1.825;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.038;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1434,0,1004 chrIV 371088 . A G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.165;DP=112;Dels=0.00;FS=2.946;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.373;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1350,0,1033 chrIV 371142 . A G 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;DP=69;Dels=0.00;FS=3.490;HaplotypeScore=3.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.655;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:69:99:865,0,544 chrIV 371204 . T C 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.538;DP=87;Dels=0.00;FS=17.982;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.073;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.944;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,51:87:99:1042,0,799 chrIV 371211 . T C 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.663;DP=88;Dels=0.00;FS=17.390;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.584;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.250;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:1070,0,798 chrIV 371220 . A T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.883;DP=101;Dels=0.00;FS=7.995;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,59:101:99:1256,0,927 chrIV 371249 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.245;DP=96;Dels=0.00;FS=16.196;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.751;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,50:96:99:1022,0,1020 chrIV 371263 . A G 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.444;DP=91;Dels=0.00;FS=16.602;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=-4.144;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1000,0,903 chrIV 371266 . C T 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.650;DP=90;Dels=0.00;FS=14.749;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.969;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:1047,0,867 chrIV 371437 . T C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.179;DP=123;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.131;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:1063,0,1575 chrIV 371461 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.334;DP=127;Dels=0.00;FS=5.632;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.196;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1234,0,1499 chrIV 371620 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.192;DP=132;Dels=0.00;FS=6.864;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:132:99:1173,0,1590 chrIV 371744 . A G 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.309;DP=106;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=2.593;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:819,0,1385 chrIV 371907 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.758;DP=112;Dels=0.00;FS=4.665;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=2.225;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.949;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1462,0,1000 chrIV 371914 . T A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;DP=114;Dels=0.00;FS=4.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.892;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1040,0,1463 chrIV 372011 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.711;DP=113;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.134;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1290,0,1066 chrIV 372053 . C T 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.119;DP=102;Dels=0.00;FS=8.083;HaplotypeScore=3.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=-4.481;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:960,0,1172 chrIV 372060 . G A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.197;DP=115;Dels=0.00;FS=4.664;HaplotypeScore=3.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.74;MQ0=0;MQRankSum=-7.629;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1009,0,1202 chrIV 372075 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.514;DP=127;Dels=0.00;FS=4.255;HaplotypeScore=2.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.64;MQ0=0;MQRankSum=-8.068;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:962,0,1595 chrIV 372084 . A T 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.384;DP=132;Dels=0.00;FS=6.495;HaplotypeScore=4.8298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.527;QD=6.70;ReadPosRankSum=-1.785;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:914,0,1594 chrIV 372093 . T C 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.181;DP=123;Dels=0.00;FS=4.298;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-6.547;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.686;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:830,0,1424 chrIV 372119 . C T 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.754;DP=139;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=2.6665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=0;MQRankSum=-5.063;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1196,0,1431 chrIV 372125 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;DP=131;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.892;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.983;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1091,0,1435 chrIV 372201 . C T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.511;DP=124;Dels=0.00;FS=5.439;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1443,0,1215 chrIV 372238 . G T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.334;DP=115;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.011;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1361,0,1126 chrIV 372390 . G A 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=27.82;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2871,292,0 chrIV 372433 . T A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;DP=133;Dels=0.00;FS=4.191;HaplotypeScore=2.6984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.332;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1334,0,1556 chrIV 372434 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.379;DP=140;Dels=0.00;FS=5.100;HaplotypeScore=2.6984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.194;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1299,0,1648 chrIV 372540 . A T 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3804,364,0 chrIV 372546 . A C 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3710,370,0 chrIV 372671 . C T 4439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.74;SB=-2.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4439,424,0 chrIV 372729 . C T 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.94;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3883,379,0 chrIV 372821 . C T 3943.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3943,373,0 chrIV 372855 . T C 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3181,321,0 chrIV 373089 . C T 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3280,316,0 chrIV 373281 . C G 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.22;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3136,321,0 chrIV 373453 . C T 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3757,367,0 chrIV 373661 . G C 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.991e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3754,373,0 chrIV 373723 . T C 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.42;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3350,342,0 chrIV 373728 . T C 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.38;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3466,352,0 chrIV 374694 . T G 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.350;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3407,330,0 chrIV 374879 . A T 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2727,268,0 chrIV 374903 . G C 2474 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=22.91;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2507,258,0 chrIV 374909 . G A 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2948,294,0 chrIV 374960 . C T 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3321,319,0 chrIV 375032 . T A 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=28.34;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3429,340,0 chrIV 375077 . C T 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=28.30;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3594,367,0 chrIV 375103 . C T 4005.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:4005,397,0 chrIV 375171 . A G 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3564,363,0 chrIV 375199 . C T 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.52;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3395,328,0 chrIV 375239 . A G 4108.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4108,438,0 chrIV 375282 . C T 4053.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=28.95;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:4053,397,0 chrIV 375354 . G A 4699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.85;SB=-2.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4699,445,0 chrIV 375384 . T A 4906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=179.7902;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4906,457,0 chrIV 375530 . T C 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9453;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.83;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3541,349,0 chrIV 375533 . A C 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3206,315,0 chrIV 375542 . G T 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.81;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3369,325,0 chrIV 375611 . G A 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3982,397,0 chrIV 375673 . A G 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.973e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3962,403,0 chrIV 375690 . G C 3839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.619;DP=153;Dels=0.00;FS=4.288;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=25.09;ReadPosRankSum=1.483;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3839,393,0 chrIV 375773 . T C 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3423,348,0 chrIV 375776 . T C 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3585,369,0 chrIV 375826 . A T 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3028,292,0 chrIV 375932 . T G 3931.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3931,388,0 chrIV 375947 . A G 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3772,379,0 chrIV 376457 . C T 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4626;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3437,340,0 chrIV 376537 . A G 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.93;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3055,315,0 chrIV 376661 . T A 2704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.19;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2737,268,0 chrIV 377123 . A G 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.04;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3490,360,0 chrIV 377176 . T C 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3354,354,0 chrIV 377486 . T G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3267,336,0 chrIV 379556 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.826;DP=115;Dels=0.00;FS=1.636;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.761;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1479,0,1018 chrIV 379725 . G T 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.760;DP=131;Dels=0.00;FS=6.261;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1516,0,1417 chrIV 380035 . G A 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.537;DP=133;Dels=0.00;FS=9.219;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1354,0,1492 chrIV 380086 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.803;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.377;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1249,0,1559 chrIV 380427 . C T 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.811;DP=115;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=4.8064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1235,0,1333 chrIV 380668 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.820;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=-0.578;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1256,0,1667 chrIV 380743 . A G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.911;DP=139;Dels=0.00;FS=2.249;HaplotypeScore=6.7944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=0.465;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:139:99:1116,0,1837 chrIV 380808 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.858;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=1;MQRankSum=-0.810;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.011;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1082,0,1338 chrIV 380824 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.854;DP=120;Dels=0.00;FS=2.341;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=1;MQRankSum=1.753;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1186,0,1416 chrIV 380924 . T C 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.394;DP=129;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.879;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1516,0,1159 chrIV 381444 . G C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.047;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1255,0,1063 chrIV 381458 . C G 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1053,0,1042 chrIV 381481 . A G 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.259;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.456;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,74:161:99:1573,0,1946 chrIV 381576 . T C 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.330;DP=175;Dels=0.01;FS=4.504;HaplotypeScore=2.9556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=1.916;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.388;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,94:174:99:1677,0,1874 chrIV 381770 . C T 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3731,355,0 chrIV 382153 . G T 1949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.623;DP=193;Dels=0.00;FS=3.253;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.347;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,95:193:99:1979,0,2132 chrIV 382330 . C T 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.314;DP=159;Dels=0.00;FS=0.587;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:1546,0,1919 chrIV 382372 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.047;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1513,0,1568 chrIV 382655 . T C 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.766;DP=166;Dels=0.00;FS=4.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.029;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,77:166:99:1552,0,2004 chrIV 382829 . C T 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.943;DP=161;Dels=0.00;FS=9.881;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1696,0,1841 chrIV 382830 . C T 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.265;DP=158;Dels=0.00;FS=8.631;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1687,0,1685 chrIV 383033 . A G 1896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.729;DP=182;Dels=0.00;FS=2.582;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,91:182:99:1926,0,2018 chrIV 383065 . G A 4756.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=27.02;SB=-2.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4756,475,0 chrIV 383227 . C T 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.566;DP=151;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=8.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.455;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.207;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1597,0,1523 chrIV 383229 . C T 4055.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.593;DP=152;Dels=0.00;FS=3.895;HaplotypeScore=10.9200;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.094;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:4055,400,0 chrIV 383380 . G C 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;DP=203;Dels=0.00;FS=26.928;HaplotypeScore=249.9971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.60;MQ0=0;MQRankSum=-5.208;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,50:203:99:925,0,1960 chrIV 383389 . A G 656.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;DP=215;Dels=0.00;FS=45.477;HaplotypeScore=306.5966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.53;MQ0=0;MQRankSum=-4.640;QD=3.05;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,49:215:99:686,0,2782 chrIV 383394 . A C 413.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;DP=191;Dels=0.00;FS=11.472;HaplotypeScore=161.2884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.39;MQ0=0;MQRankSum=-6.251;QD=2.16;ReadPosRankSum=2.792;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,33:191:99:443,0,2261 chrIV 383395 . G A 569.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.949;DP=190;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=209.8099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.29;MQ0=0;MQRankSum=-6.785;QD=2.99;ReadPosRankSum=1.715;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,56:185:99:599,0,2370 chrIV 383399 . G A 204.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.622;DP=179;Dels=0.00;FS=60.565;HaplotypeScore=124.6788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.32;MQ0=0;MQRankSum=-5.533;QD=1.14;ReadPosRankSum=2.615;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,39:179:99:234,0,2021 chrIV 383405 . G C 397.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;DP=194;Dels=0.00;FS=53.586;HaplotypeScore=101.7810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.555;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.064;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,43:194:99:427,0,2508 chrIV 383416 . T A 278.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;DP=172;Dels=0.02;FS=80.945;HaplotypeScore=76.8837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.97;MQ0=0;MQRankSum=-6.924;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.749;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,47:168:99:308,0,2534 chrIV 383417 . G A 222.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.665;DP=175;Dels=0.02;FS=76.545;HaplotypeScore=79.7550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.30;MQ0=0;MQRankSum=-7.003;QD=1.27;ReadPosRankSum=-3.081;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,46:171:99:252,0,2557 chrIV 383443 . G A 725.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=93.7020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.75;MQ0=0;MQRankSum=-9.632;QD=5.45;ReadPosRankSum=-2.481;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:755,0,1665 chrIV 383446 . T A 166.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;DP=126;Dels=0.00;FS=17.698;HaplotypeScore=60.2637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.44;MQ0=0;MQRankSum=-6.120;QD=1.32;ReadPosRankSum=2.008;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,30:126:99:196,0,2184 chrIV 383448 . G A 267.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.398;DP=125;Dels=0.00;FS=9.933;HaplotypeScore=41.5617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.34;MQ0=0;MQRankSum=-6.590;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.861;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,35:125:99:297,0,1998 chrIV 383449 . G A 229.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.056;DP=120;Dels=0.00;FS=10.471;HaplotypeScore=39.4120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.270;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.715;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,32:120:99:259,0,1927 chrIV 383454 . C T 196.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.779;DP=120;Dels=0.00;FS=12.873;HaplotypeScore=14.6249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.83;MQ0=0;MQRankSum=-6.306;QD=1.63;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,30:120:99:226,0,1921 chrIV 383457 . A T 106.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;DP=121;Dels=0.00;FS=11.002;HaplotypeScore=16.5275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-6.116;QD=0.88;ReadPosRankSum=1.037;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,27:121:99:136,0,2104 chrIV 383458 . A G 99.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.827;DP=120;Dels=0.00;FS=11.216;HaplotypeScore=16.5275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-6.171;QD=0.83;ReadPosRankSum=0.830;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,27:120:99:129,0,2080 chrIV 383483 . T G 62.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.788;DP=103;Dels=0.00;FS=1.874;HaplotypeScore=11.4792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQ0=0;MQRankSum=-6.952;QD=0.60;ReadPosRankSum=-5.725;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:103:92:92,0,1788 chrIV 383586 . T C 355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.860;DP=170;Dels=0.00;FS=8.387;HaplotypeScore=16.8580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.899;QD=2.09;ReadPosRankSum=-6.220;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,42:170:99:385,0,2465 chrIV 383596 . T G 450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.097;DP=172;Dels=0.00;FS=10.926;HaplotypeScore=8.4977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=2.62;ReadPosRankSum=-3.917;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,46:172:99:480,0,2369 chrIV 383684 . T G 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.106;DP=161;Dels=0.00;FS=24.220;HaplotypeScore=12.4593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1611,0,1803 chrIV 383859 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.828;DP=135;Dels=0.00;FS=3.122;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.77;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1369,0,1607 chrIV 383874 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.818;DP=124;Dels=0.00;FS=3.261;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.583;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1180,0,1468 chrIV 383933 . G A 643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.082;DP=109;Dels=0.00;FS=7.845;HaplotypeScore=149.6725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.006;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:673,0,801 chrIV 383938 . G A 1684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=6.204;DP=121;Dels=0.00;FS=20.955;HaplotypeScore=213.2334;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.773;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,93:121:63:1717,63,0 chrIV 383946 . A G 135.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;DP=113;Dels=0.00;FS=51.133;HaplotypeScore=136.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.75;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=1.19;ReadPosRankSum=-6.079;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,37:113:60:165,0,60 chrIV 383957 . G C 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;DP=121;Dels=0.02;FS=141.123;HaplotypeScore=322.9237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.76;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.415;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1038,0,213 chrIV 384000 . G A 53.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.780;DP=124;Dels=0.00;FS=0.873;HaplotypeScore=81.4232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=0.43;ReadPosRankSum=5.207;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,25:124:83:83,0,1065 chrIV 384001 . G A 227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.900;DP=123;Dels=0.00;FS=21.104;HaplotypeScore=78.4624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=1.85;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,23:123:99:257,0,889 chrIV 384021 . C T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.772;DP=114;Dels=0.00;FS=8.052;HaplotypeScore=27.3385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.62;MQ0=0;MQRankSum=4.271;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.492;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,80:114:99:1317,0,175 chrIV 384035 . A G 619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.709;DP=175;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=22.2953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.70;MQ0=1;MQRankSum=-5.915;QD=3.54;ReadPosRankSum=-3.012;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,63:175:99:649,0,2020 chrIV 384083 . G C 1790.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;DP=267;Dels=0.00;FS=5.027;HaplotypeScore=2.6175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.62;MQ0=1;MQRankSum=-7.376;QD=6.70;ReadPosRankSum=2.955;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,107:267:99:1820,0,3382 chrIV 384085 . C A 1887.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.372;DP=262;Dels=0.00;FS=9.929;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.72;MQ0=1;MQRankSum=-7.518;QD=7.20;ReadPosRankSum=2.808;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,107:262:99:1917,0,3268 chrIV 384088 . T A 1969.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.860;DP=262;Dels=0.00;FS=7.861;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.72;MQ0=1;MQRankSum=-7.015;QD=7.52;ReadPosRankSum=2.808;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,108:262:99:1999,0,3459 chrIV 384090 . A C 1941.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.011;DP=267;Dels=0.00;FS=4.978;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.96;MQ0=1;MQRankSum=-6.829;QD=7.27;ReadPosRankSum=2.417;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,112:267:99:1971,0,3580 chrIV 384189 . G A 1856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.708;DP=277;Dels=0.00;FS=12.010;HaplotypeScore=83.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQ0=0;MQRankSum=-7.125;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,97:277:99:1886,0,3990 chrIV 384191 . C G 3887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;DP=272;Dels=0.00;FS=7.374;HaplotypeScore=83.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.03;MQ0=0;MQRankSum=-6.909;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,176:272:99:3887,0,1805 chrIV 384204 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.513;DP=249;Dels=0.00;FS=24.948;HaplotypeScore=9.3554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.06;MQ0=0;MQRankSum=-7.577;QD=5.11;ReadPosRankSum=-3.975;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,72:249:99:1302,0,3905 chrIV 384225 . G A 96.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.420;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=28.5034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.85;MQ0=0;MQRankSum=-5.669;QD=0.45;ReadPosRankSum=-3.834;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,27:213:99:126,0,4429 chrIV 384240 . T C 127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=194;Dels=0.00;FS=7.717;HaplotypeScore=5.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.78;MQ0=0;MQRankSum=-4.942;QD=0.65;ReadPosRankSum=-5.517;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,31:194:99:157,0,4016 chrIV 384256 . A G 464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.941;DP=206;Dels=0.00;FS=8.525;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=0;MQRankSum=-4.702;QD=2.25;ReadPosRankSum=-3.980;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,49:206:99:494,0,3751 chrIV 384257 . T C 5118.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.27;MQ0=0;QD=24.97;SB=-2.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:5118,529,0 chrIV 384310 . A T 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;DP=253;Dels=0.00;FS=6.540;HaplotypeScore=58.9034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.49;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=6.35;ReadPosRankSum=-2.069;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,82:253:99:1637,0,3575 chrIV 384359 . T G 55.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.920;DP=285;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=156.4013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.32;MQ0=0;MQRankSum=-5.441;QD=0.19;ReadPosRankSum=-5.220;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,55:280:85:85,0,4543 chrIV 384370 . G A 522.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.636;DP=319;Dels=0.02;FS=7.502;HaplotypeScore=204.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.40;MQ0=0;MQRankSum=-7.513;QD=1.64;ReadPosRankSum=-7.581;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,102:314:99:552,0,4308 chrIV 384378 . G A 273.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.750;DP=321;Dels=0.01;FS=39.462;HaplotypeScore=124.7924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.62;MQ0=0;MQRankSum=-6.996;QD=0.85;ReadPosRankSum=3.709;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,48:319:99:303,0,4708 chrIV 384379 . G A 808.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.291;DP=318;Dels=0.01;FS=18.874;HaplotypeScore=118.9641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.73;MQ0=0;MQRankSum=-7.300;QD=2.54;ReadPosRankSum=-5.944;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,117:316:99:838,0,4004 chrIV 384383 . G A 1027.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.162;DP=336;Dels=0.00;FS=3.687;HaplotypeScore=110.3659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.59;MQ0=0;MQRankSum=-6.817;QD=3.06;ReadPosRankSum=-5.694;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,131:336:99:1057,0,4075 chrIV 384415 . A G 1917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.305;DP=360;Dels=0.00;FS=2.431;HaplotypeScore=84.4615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.18;MQ0=0;MQRankSum=-6.824;QD=5.33;ReadPosRankSum=-2.685;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,116:360:99:1947,0,3671 chrIV 384419 . A G 227.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.785;DP=362;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=469.2805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.04;MQ0=0;MQRankSum=-4.473;QD=0.63;ReadPosRankSum=3.195;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:299,63:362:99:257,0,5456 chrIV 384475 . A T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;DP=293;Dels=0.00;FS=32.775;HaplotypeScore=146.8328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.20;MQ0=0;MQRankSum=-3.170;QD=5.51;ReadPosRankSum=-7.553;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,131:293:99:1643,0,3886 chrIV 384496 . G A 1231.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.566;DP=214;Dels=0.01;FS=7.050;HaplotypeScore=391.2300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.84;MQ0=0;MQRankSum=-5.597;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.133;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,87:211:99:1261,0,2558 chrIV 384504 . G A 2023.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.757;DP=201;Dels=0.00;FS=1.129;HaplotypeScore=214.7630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.20;MQ0=0;MQRankSum=5.810;QD=10.06;ReadPosRankSum=3.206;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,107:201:99:2053,0,1520 chrIV 384505 . A G 1314.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.875;DP=205;Dels=0.00;FS=18.768;HaplotypeScore=212.8557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.29;MQ0=0;MQRankSum=7.986;QD=6.41;ReadPosRankSum=2.062;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,70:205:99:1344,0,2347 chrIV 384509 . G A 232.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.604;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=210.1718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.12;MQ0=0;MQRankSum=-4.881;QD=1.16;ReadPosRankSum=-1.810;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,35:200:99:262,0,3213 chrIV 384518 . T G 2487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.942;DP=195;Dels=0.00;FS=73.892;HaplotypeScore=192.8567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.43;MQ0=0;MQRankSum=3.799;QD=12.75;ReadPosRankSum=-3.006;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,131:195:99:2517,0,519 chrIV 384581 . T G 130.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.232;DP=171;Dels=0.00;FS=46.801;HaplotypeScore=26.7332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.969;QD=0.76;ReadPosRankSum=-3.521;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,29:171:99:160,0,3160 chrIV 384602 . T G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.8724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.572;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.583;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1160,0,1757 chrIV 384607 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.218;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.7077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.928;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.770;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1214,0,1700 chrIV 384804 . T C 2019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.413;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=3.781;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.896;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,100:197:99:2049,0,2131 chrIV 384915 . A T 334.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.729;DP=57;Dels=0.00;FS=11.439;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.65;MQ0=15;MQRankSum=0.657;QD=5.86;ReadPosRankSum=-1.643;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:364,0,406 chrIV 384916 . G T 316.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;DP=57;Dels=0.00;FS=14.373;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.65;MQ0=15;MQRankSum=0.113;QD=5.54;ReadPosRankSum=-2.078;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:346,0,413 chrIV 384930 . A T 101.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.40;MQ0=17;MQRankSum=0.234;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.047;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:35:99:131,0,195 chrIV 385035 . T A 469.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.467;DP=113;Dels=0.00;FS=4.155;HaplotypeScore=8.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=9;MQRankSum=1.191;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,37:113:99:499,0,1432 chrIV 385051 . G T 757.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.814;DP=125;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.64;MQ0=9;MQRankSum=2.412;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.892;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,47:125:99:787,0,1472 chrIV 385740 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.796;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.047;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:108:99:1357,0,939 chrIV 385750 . T C 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;DP=102;Dels=0.00;FS=2.650;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.030;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:910,0,1346 chrIV 385938 . A G 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.317;DP=139;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.414;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1552,0,1353 chrIV 385961 . G A 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=56.0916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.24;MQ0=0;QD=21.42;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:2925,297,0 chrIV 385972 . C T 1592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=60.3832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.17;MQ0=0;QD=11.54;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:1625,156,0 chrIV 385986 . A G 462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.681;DP=108;Dels=0.00;FS=3.705;HaplotypeScore=15.4304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.721;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:492,0,1115 chrIV 386094 . T A 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0669;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3483,352,0 chrIV 386095 . T C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.767;DP=136;Dels=0.00;FS=4.056;HaplotypeScore=4.0669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1176,0,1608 chrIV 386111 . G A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.362;DP=126;Dels=0.00;FS=3.212;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.706;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1174,0,1440 chrIV 386657 . G A 2823 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2856,283,0 chrIV 386845 . A G 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.098;DP=81;Dels=0.00;FS=1.938;HaplotypeScore=41.8324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.36;MQ0=1;MQRankSum=-0.766;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.332;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:909,0,807 chrIV 386858 . T C 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.469;DP=80;Dels=0.00;FS=4.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQ0=1;MQRankSum=-0.407;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.417;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,41:80:99:862,0,869 chrIV 386966 . C A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.522;DP=106;Dels=0.00;FS=10.269;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1072,0,1179 chrIV 387713 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.453;DP=140;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=2.5946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1230,0,1051 chrIV 388038 . A T 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.257;DP=114;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=4.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.309;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:1028,0,1506 chrIV 388147 . T C 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3120,318,0 chrIV 388221 . G T 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3679,364,0 chrIV 388305 . A G 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3732,370,0 chrIV 388440 . A G 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.817;DP=136;Dels=0.00;FS=3.073;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=26.21;ReadPosRankSum=0.009;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,134:136:99:3564,322,0 chrIV 388926 . C T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.551;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.299;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1143,0,1219 chrIV 389086 . A T 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7658;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3540,352,0 chrIV 389477 . G A 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.572;DP=126;Dels=0.00;FS=5.584;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.473;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1473,0,1140 chrIV 389583 . C T 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.638;DP=135;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=3.6512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.907;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:1724,0,1090 chrIV 390311 . T C 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.697;DP=139;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=2.9230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.537;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1444,0,1583 chrIV 390517 . C T 604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.045;DP=141;Dels=0.00;FS=1.513;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=4.28;ReadPosRankSum=-2.971;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,41:141:99:634,0,2166 chrIV 390525 . G A 282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.010;DP=144;Dels=0.00;FS=2.719;HaplotypeScore=14.6863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=1.96;ReadPosRankSum=-3.432;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,29:144:99:312,0,2509 chrIV 390530 . C T 180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.968;DP=139;Dels=0.00;FS=2.995;HaplotypeScore=16.6754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.176;QD=1.30;ReadPosRankSum=-5.570;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,24:139:99:210,0,2637 chrIV 391042 . G A 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.913;DP=148;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=12.20;ReadPosRankSum=-3.312;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,82:148:99:1836,0,1342 chrIV 391149 . G C 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.455;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:980,0,809 chrIV 391407 . G C 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;DP=143;Dels=0.00;FS=1.373;HaplotypeScore=2.3565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.812;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1557,0,1343 chrIV 391712 . T C 4117.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4117,417,0 chrIV 392020 . A G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.604;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1197,0,1309 chrIV 392128 . C G 476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;DP=125;Dels=0.00;FS=1.827;HaplotypeScore=14.8604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=3.81;ReadPosRankSum=-3.632;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,48:125:99:506,0,1482 chrIV 392287 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.510;DP=112;Dels=0.00;FS=8.855;HaplotypeScore=2.9237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1225,0,1300 chrIV 392478 . T C 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.296;DP=136;Dels=0.00;FS=4.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=-3.675;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.518;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1138,0,1677 chrIV 392938 . C A 4164.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4164,409,0 chrIV 392959 . C G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.310;DP=148;Dels=0.00;FS=5.316;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,65:148:99:1320,0,1803 chrIV 393421 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.872;DP=144;Dels=0.00;FS=2.986;HaplotypeScore=3.3673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1265,0,1637 chrIV 393423 . T C 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.893;DP=144;Dels=0.00;FS=3.959;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1399,0,1650 chrIV 393509 . T A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,86:145:99:1337,0,943 chrIV 393651 . T C 4446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,173:174:99:4446,427,0 chrIV 394097 . A T 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;DP=135;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1159,0,1626 chrIV 394249 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.851;DP=150;Dels=0.00;FS=1.298;HaplotypeScore=3.0888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.850;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,65:150:99:1374,0,1763 chrIV 394339 . T C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=10.63;ReadPosRankSum=2.430;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:140:99:1518,0,1461 chrIV 394385 . G A 1830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.154;DP=151;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1860,0,1477 chrIV 394555 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.007;DP=107;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.396;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1172,0,1146 chrIV 394798 . A C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.930;DP=144;Dels=0.00;FS=2.275;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.716;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1404,0,1779 chrIV 394876 . C T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.880;DP=136;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=2.209;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,59:136:99:1230,0,1649 chrIV 395086 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.112;DP=151;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=3.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1250,0,1877 chrIV 395248 . G A 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.485;DP=144;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.667;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1612,0,1381 chrIV 395367 . A C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.743;DP=115;Dels=0.00;FS=7.392;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.710;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1310,0,1206 chrIV 395381 . C T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.397;DP=114;Dels=0.00;FS=3.555;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.648;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1156,0,1312 chrIV 395470 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.605;DP=116;Dels=0.00;FS=5.857;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.725;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1106,0,1484 chrIV 395530 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.235;DP=119;Dels=0.00;FS=1.796;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.386;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1377,0,1139 chrIV 395767 . A T 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2903,280,0 chrIV 395957 . C A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.238;DP=137;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1440,0,1474 chrIV 396610 . C A 2450 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.53;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2483,237,0 chrIV 396862 . T C 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.803;DP=138;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.830;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1485,0,1400 chrIV 397012 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.160;DP=153;Dels=0.00;FS=3.869;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,61:153:99:1220,0,2000 chrIV 397272 . T G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.864;DP=104;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=4.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=2;MQRankSum=1.642;QD=13.02;ReadPosRankSum=-1.219;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:104:99:1384,0,886 chrIV 397512 . A G 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.05;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3078,318,0 chrIV 397673 . C T 4418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.67;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4418,436,0 chrIV 397687 . T C 4172.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.03;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4172,433,0 chrIV 397688 . C T 4284.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.03;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4284,433,0 chrIV 397695 . G A 4174.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.39;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4174,418,0 chrIV 397749 . G A 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.64;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3431,340,0 chrIV 397803 . A G 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3371,339,0 chrIV 397864 . C T 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2928,292,0 chrIV 397888 . C T 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.662;DP=117;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=6.9032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.889;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:117:99:1584,0,951 chrIV 397902 . A G 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2758,288,0 chrIV 398236 . C G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.972;DP=90;Dels=0.00;FS=8.966;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.400;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1026,0,890 chrIV 398297 . C A 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.136;DP=132;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.396;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1629,0,1167 chrIV 398518 . T C 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.594;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1422,0,1196 chrIV 398523 . T G 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3390,351,0 chrIV 398655 . G C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.654;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.768;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1164,0,1387 chrIV 398669 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.844;DP=155;Dels=0.00;FS=6.046;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.763;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1374,0,1872 chrIV 398697 . A G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.871;DP=161;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,71:161:99:1422,0,2037 chrIV 398734 . T C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.137;DP=150;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=4.9219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.442;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,59:150:99:1159,0,2112 chrIV 398799 . T C 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.075;DP=146;Dels=0.00;FS=3.519;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,85:146:99:1783,0,1353 chrIV 398862 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.124;DP=129;Dels=0.00;FS=12.739;HaplotypeScore=2.6935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.535;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1309,0,1397 chrIV 398875 . A C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.218;DP=126;Dels=0.00;FS=11.290;HaplotypeScore=3.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.232;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1236,0,1439 chrIV 398907 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.855;DP=112;Dels=0.00;FS=2.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1032,0,1359 chrIV 399007 . C T 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.397;DP=136;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=7.6479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1640,0,1241 chrIV 399193 . A G 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.506;DP=121;Dels=0.00;FS=2.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.162;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1413,0,1247 chrIV 399202 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.388;DP=123;Dels=0.00;FS=2.425;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.740;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.669;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1313,0,1286 chrIV 399395 . C T 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;DP=141;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.261;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:141:99:1378,0,1582 chrIV 399900 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.187;DP=124;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=3.5724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.093;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:124:99:1246,0,1382 chrIV 400242 . A T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.231;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.146;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1391,0,1438 chrIV 400395 . G A 1947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.391;DP=153;Dels=0.00;FS=2.237;HaplotypeScore=4.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.395;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1977,0,1446 chrIV 400404 . G C 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.944;DP=146;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.898;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:146:99:1721,0,1378 chrIV 400491 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.847;DP=103;Dels=0.00;FS=3.807;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1137,0,1045 chrIV 400709 . T A 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=28.92;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3442,337,0 chrIV 400864 . A G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.097;DP=124;Dels=0.00;FS=5.545;HaplotypeScore=4.9670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1315,0,1369 chrIV 401199 . T A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=122;Dels=0.00;FS=3.453;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.038;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1253,0,1401 chrIV 402202 . T C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=86;Dels=0.00;FS=2.015;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.759;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1040,0,807 chrIV 402371 . A G 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2929,309,0 chrIV 402856 . C A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.407;DP=122;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=3.6253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=10.88;ReadPosRankSum=-3.342;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:122:99:1357,0,1254 chrIV 403061 . G A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.015;DP=122;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=2.4694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.544;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:122:99:1374,0,1221 chrIV 403952 . T C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.717;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.792;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1157,0,1122 chrIV 404127 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.184;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1278,0,1130 chrIV 404304 . C T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.354;DP=110;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.660;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1355,0,1083 chrIV 404459 . A T 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2767,270,0 chrIV 404478 . A G 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.158;DP=91;Dels=0.00;FS=6.869;HaplotypeScore=3.6113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:850,0,1087 chrIV 404598 . C T 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.464;DP=121;Dels=0.00;FS=13.566;HaplotypeScore=2.8969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1215,0,1386 chrIV 404690 . A G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.919;DP=117;Dels=0.00;FS=7.039;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.670;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1077,0,1399 chrIV 404730 . A C 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.914;DP=109;Dels=0.00;FS=3.505;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.928;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1006,0,1325 chrIV 404818 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.475;DP=123;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.091;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1231,0,1372 chrIV 404883 . A G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.260;DP=132;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.124;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1427,0,1389 chrIV 404981 . T C 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.516;DP=148;Dels=0.00;FS=0.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.048;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1471,0,1670 chrIV 405116 . C A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.464;DP=137;Dels=0.00;FS=3.214;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1282,0,1551 chrIV 405143 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.952;DP=118;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=5.9088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1036,0,1388 chrIV 405160 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.587;DP=132;Dels=0.00;FS=5.307;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1278,0,1400 chrIV 405303 . A T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.249;DP=121;Dels=0.00;FS=2.463;HaplotypeScore=3.4207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.232;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1258,0,1417 chrIV 405482 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.868;DP=133;Dels=0.00;FS=5.284;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.150;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:133:99:1219,0,1504 chrIV 405794 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.223;DP=148;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=3.9732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.554;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:99:1260,0,1751 chrIV 406099 . C T 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3865,376,0 chrIV 406118 . C T 1954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.945;DP=153;Dels=0.00;FS=4.991;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=12.77;ReadPosRankSum=-2.385;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1984,0,1376 chrIV 406262 . T C 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.022;DP=114;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=1;MQRankSum=0.044;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:926,0,1555 chrIV 406267 . C T 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.461;DP=119;Dels=0.00;FS=2.376;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=1;MQRankSum=0.257;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:119:99:1040,0,1485 chrIV 406301 . A G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.194;DP=120;Dels=0.00;FS=4.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=2.276;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1116,0,1451 chrIV 406385 . C T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;DP=126;Dels=0.00;FS=13.089;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1418,0,1439 chrIV 406814 . T C 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.296;DP=139;Dels=0.01;FS=12.491;HaplotypeScore=9.5722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.363;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1605,0,1246 chrIV 406847 . G C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.508;DP=127;Dels=0.00;FS=5.753;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.265;QD=11.57;ReadPosRankSum=2.527;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1500,0,1211 chrIV 406901 . A T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.155;DP=121;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.992;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1538,0,1120 chrIV 406981 . A G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.153;DP=118;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.82;ReadPosRankSum=-2.383;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1425,0,1071 chrIV 407051 . T C 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.667;DP=109;Dels=0.00;FS=5.122;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.242;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,69:109:99:1471,0,866 chrIV 407060 . A G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.008;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1388,0,1009 chrIV 407064 . C T 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.034;DP=110;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.082;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,45:110:99:947,0,1432 chrIV 407223 . G C 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.541;DP=153;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.900;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1741,0,1438 chrIV 407286 . C G 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;DP=156;Dels=0.00;FS=2.846;HaplotypeScore=4.9533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1783,0,1486 chrIV 407982 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;DP=127;Dels=0.00;FS=6.660;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1485,0,1328 chrIV 408038 . C T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.602;DP=112;Dels=0.00;FS=4.814;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:112:99:1311,0,1070 chrIV 408128 . T A 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.734;DP=92;Dels=0.00;FS=3.911;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:958,0,942 chrIV 408131 . C T 738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.394;DP=85;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.012;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.180;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:99:768,0,892 chrIV 408225 . G A 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.174;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.52;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:904,0,995 chrIV 408416 . T A 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3815,370,0 chrIV 408443 . T C 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.192;DP=138;Dels=0.00;FS=4.049;HaplotypeScore=3.6253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.339;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1446,0,1455 chrIV 408455 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.364;DP=131;Dels=0.00;FS=9.316;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.003;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1190,0,1684 chrIV 408706 . T C 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.153;DP=151;Dels=0.00;FS=4.823;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.138;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1630,0,1512 chrIV 408811 . A T 1872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.922;DP=194;Dels=0.00;FS=5.046;HaplotypeScore=6.4546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.852;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,95:194:99:1902,0,2178 chrIV 408812 . G A 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.159;DP=193;Dels=0.00;FS=5.046;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.599;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,95:193:99:1929,0,2045 chrIV 408877 . G A 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.510;DP=148;Dels=0.00;FS=2.064;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1749,0,1438 chrIV 408894 . T G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.781;DP=145;Dels=0.00;FS=3.917;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.773;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.836;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1675,0,1490 chrIV 409009 . T C 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.457;DP=115;Dels=0.00;FS=3.446;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.184;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1454,0,989 chrIV 409324 . G A 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.928;DP=135;Dels=0.00;FS=4.357;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.966;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:135:99:1489,0,1306 chrIV 409414 . T C 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.003;DP=127;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.596;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,77:127:99:1662,0,1092 chrIV 409441 . C T 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.582;DP=125;Dels=0.00;FS=2.519;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.530;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1631,0,1161 chrIV 409523 . T C 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.743;DP=147;Dels=0.00;FS=7.338;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1596,0,1529 chrIV 409621 . C T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.629;DP=147;Dels=0.00;FS=2.065;HaplotypeScore=3.8074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.703;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1655,0,1569 chrIV 409681 . A G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.755;DP=115;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.166;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1200,0,1350 chrIV 409788 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.705;DP=147;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=1;MQRankSum=0.992;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.602;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1227,0,1817 chrIV 409894 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.304;DP=153;Dels=0.00;FS=7.137;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1495,0,1699 chrIV 409954 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.895;DP=145;Dels=0.00;FS=2.937;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.459;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.420;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1314,0,1619 chrIV 410087 . T G 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.178;DP=156;Dels=0.00;FS=13.685;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQ0=0;MQRankSum=-3.196;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:1829,0,1610 chrIV 410122 . G A 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.644;DP=160;Dels=0.00;FS=8.155;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.291;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1829,0,1579 chrIV 410282 . G T 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.700;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.11;MQ0=0;MQRankSum=-5.132;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.070;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1154,0,1451 chrIV 410322 . T C 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.028;DP=125;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.94;MQ0=0;MQRankSum=-7.348;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.287;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,48:125:99:737,0,1768 chrIV 410348 . A T 736.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.958;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.16;MQ0=0;MQRankSum=-8.866;QD=6.13;ReadPosRankSum=-4.283;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:766,0,1373 chrIV 410352 . A C 665.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.141;DP=116;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.13;MQ0=0;MQRankSum=-8.953;QD=5.73;ReadPosRankSum=-3.345;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:695,0,1345 chrIV 410358 . G A 747.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.583;DP=116;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.39;MQ0=0;MQRankSum=-8.677;QD=6.44;ReadPosRankSum=-2.417;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:777,0,1236 chrIV 410363 . C A 626.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.667;DP=109;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=5.7535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.29;MQ0=0;MQRankSum=-8.497;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.058;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:656,0,1247 chrIV 410364 . G A 616.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.030;DP=111;Dels=0.00;FS=2.435;HaplotypeScore=5.7535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.28;MQ0=0;MQRankSum=-8.617;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.434;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:646,0,1296 chrIV 410375 . T C 650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.847;DP=117;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=4.1683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.48;MQ0=0;MQRankSum=-7.779;QD=5.56;ReadPosRankSum=2.249;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:680,0,1383 chrIV 410477 . C G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;DP=119;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.215;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:986,0,1379 chrIV 410485 . A G 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.964;DP=132;Dels=0.00;FS=4.171;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.375;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1099,0,1625 chrIV 410499 . G C 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;DP=129;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1126,0,1570 chrIV 410549 . C T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.882;DP=158;Dels=0.00;FS=2.320;HaplotypeScore=65.5708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.508;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:158:99:1602,0,1673 chrIV 410728 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=148;Dels=0.00;FS=1.322;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1530,0,1665 chrIV 411047 . A C 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;DP=157;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.230;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,78:157:99:1627,0,1678 chrIV 411287 . C T 1789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.779;DP=173;Dels=0.00;FS=4.635;HaplotypeScore=3.7581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.700;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,87:173:99:1819,0,1790 chrIV 411544 . T C 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.536;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.031;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1696,0,1481 chrIV 411666 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;DP=138;Dels=0.00;FS=5.386;HaplotypeScore=2.7289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.132;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1467,0,1564 chrIV 412127 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.213;DP=130;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=5.2135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1122,0,1550 chrIV 412190 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.301;DP=139;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=7.8678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1221,0,1786 chrIV 412382 . C T 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.392;DP=155;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.163;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1731,0,1656 chrIV 413173 . A G 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.016;DP=88;Dels=0.00;FS=0.807;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.685;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,51:88:99:1104,0,772 chrIV 413236 . T G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;DP=111;Dels=0.00;FS=2.891;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.320;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:111:99:1529,0,942 chrIV 413241 . G A 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.821;DP=131;Dels=0.00;FS=5.907;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,79:131:99:1748,0,985 chrIV 413252 . C A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;DP=119;Dels=0.00;FS=7.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.099;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,68:119:99:1438,0,988 chrIV 413288 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;DP=132;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.016;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1322,0,1462 chrIV 413313 . T C 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.967;DP=126;Dels=0.00;FS=3.259;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1091,0,1434 chrIV 413443 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.255;DP=105;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=2.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.121;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:105:99:1296,0,1048 chrIV 413544 . T A 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;DP=148;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=10.43;ReadPosRankSum=2.604;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1574,0,1616 chrIV 413545 . A G 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.306;DP=149;Dels=0.00;FS=2.055;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=10.17;ReadPosRankSum=2.444;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1546,0,1603 chrIV 413595 . T C 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.247;DP=128;Dels=0.00;FS=3.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1223,0,1582 chrIV 414183 . C T 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;DP=128;Dels=0.00;FS=3.188;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1432,0,1350 chrIV 414243 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;DP=122;Dels=0.00;FS=5.607;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.091;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:122:99:1276,0,1308 chrIV 414546 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.771;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=11.25;ReadPosRankSum=-1.025;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1402,0,1278 chrIV 414564 . A G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.790;DP=131;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=9.37;ReadPosRankSum=2.261;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1258,0,1622 chrIV 414726 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.278;DP=105;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=2.6511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1227,0,1056 chrIV 415078 . T C 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.688;DP=105;Dels=0.00;FS=1.675;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=13.86;ReadPosRankSum=3.340;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,64:105:99:1485,0,895 chrIV 415090 . T C 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.389;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=7.57;ReadPosRankSum=-2.332;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:855,0,1635 chrIV 415353 . G A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.927;DP=112;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1393,0,997 chrIV 415413 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.181;DP=108;Dels=0.00;FS=6.144;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.368;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:108:99:1349,0,885 chrIV 415430 . T C 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3017,306,0 chrIV 415728 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.353;DP=138;Dels=0.00;FS=11.449;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1374,0,1585 chrIV 415755 . G A 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.934;DP=130;Dels=0.00;FS=4.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.274;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1500,0,1412 chrIV 415969 . A G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.101;DP=136;Dels=0.00;FS=3.081;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.222;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1341,0,1518 chrIV 416043 . A G 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.659;DP=133;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=3.5838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:133:99:1205,0,1627 chrIV 416109 . G A 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.246;DP=125;Dels=0.00;FS=3.496;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.042;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1306,0,1362 chrIV 416301 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;DP=116;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=2.8832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1112,0,1406 chrIV 416304 . A G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.693;DP=122;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=4.8681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.581;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1200,0,1446 chrIV 416389 . G A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.410;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=12.65;ReadPosRankSum=-1.319;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1624,0,1121 chrIV 416488 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.818;DP=107;Dels=0.00;FS=3.720;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=12.26;ReadPosRankSum=-2.390;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1342,0,1000 chrIV 416544 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.778;DP=113;Dels=0.00;FS=6.505;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.679;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1035,0,1371 chrIV 416574 . T C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.018;DP=135;Dels=0.00;FS=8.326;HaplotypeScore=3.2778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1067,0,1650 chrIV 416628 . G A 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.570;DP=105;Dels=0.00;FS=9.364;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.668;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:1041,0,1251 chrIV 416675 . A G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.676;DP=130;Dels=0.00;FS=5.653;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1061,0,1596 chrIV 416754 . C T 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.716;DP=117;Dels=0.00;FS=7.874;HaplotypeScore=7.9477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.108;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.964;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1227,0,1303 chrIV 416856 . G A 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.373;DP=124;Dels=0.00;FS=6.819;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1027,0,1484 chrIV 416872 . A C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.621;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.293;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:914,0,1453 chrIV 417015 . T C 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.392;DP=95;Dels=0.00;FS=6.709;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=8.65;ReadPosRankSum=2.198;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:852,0,1252 chrIV 417206 . G A 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;DP=109;Dels=0.00;FS=4.874;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.628;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:918,0,1430 chrIV 418485 . T C 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.624;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,92:167:99:1880,0,1684 chrIV 418963 . C T 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.003;DP=157;Dels=0.00;FS=2.043;HaplotypeScore=9.1421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.934;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1661,0,1801 chrIV 419490 . G T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.613;DP=120;Dels=0.00;FS=4.444;HaplotypeScore=1.8633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.500;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1615,0,1017 chrIV 419688 . T G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.679;DP=142;Dels=0.00;FS=3.225;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.253;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1403,0,1548 chrIV 419703 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1495,0,1410 chrIV 420417 . T C 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;DP=137;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.534;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1736,0,1332 chrIV 420453 . C T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.021;DP=167;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=10.01;ReadPosRankSum=-2.383;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1702,0,1731 chrIV 420492 . G A 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.706;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.030;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:1006,0,1300 chrIV 420571 . C G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;DP=119;Dels=0.00;FS=4.389;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.253;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1225,0,1298 chrIV 420755 . C T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.152;DP=126;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=1.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.657;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1397,0,1259 chrIV 420945 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.008;DP=120;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=1.9664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.708;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1110,0,1512 chrIV 421109 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.904;DP=112;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:112:99:1229,0,1216 chrIV 421556 . C T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.370;DP=104;Dels=0.00;FS=4.888;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:1025,0,1205 chrIV 421602 . T C 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.043;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.047;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:815,0,1172 chrIV 421989 . C G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;DP=106;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1151,0,1059 chrIV 422005 . A T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.891;DP=136;Dels=0.00;FS=6.436;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.201;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1472,0,1451 chrIV 422276 . C A 940.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.422;DP=102;Dels=0.00;FS=6.411;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.193;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:970,0,1330 chrIV 422278 . G A 911.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.234;DP=101;Dels=0.00;FS=5.114;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.546;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:941,0,1301 chrIV 422280 . C G 872.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;DP=98;Dels=0.00;FS=2.655;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:902,0,1203 chrIV 422318 . G T 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.629;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:948,0,1317 chrIV 422574 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.493;DP=128;Dels=0.00;FS=8.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.22;MQ0=0;MQRankSum=-4.194;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.100;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1512,0,1328 chrIV 422595 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.470;DP=122;Dels=0.00;FS=12.706;HaplotypeScore=58.6962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQ0=0;MQRankSum=-4.591;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.141;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1452,0,1131 chrIV 422672 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.888;DP=117;Dels=0.02;FS=1.006;HaplotypeScore=24.5417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.592;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.099;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1171,0,1361 chrIV 422737 . C T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.795;DP=118;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.15;MQ0=0;MQRankSum=-6.317;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1301,0,1316 chrIV 422745 . G C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.346;DP=121;Dels=0.00;FS=4.383;HaplotypeScore=49.6453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.72;MQ0=0;MQRankSum=-7.656;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.630;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1075,0,1530 chrIV 422794 . C T 567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.242;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=-5.922;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:597,0,1562 chrIV 422812 . G A 458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.891;DP=100;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=-4.062;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.371;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,37:100:99:488,0,1380 chrIV 423046 . A G 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;DP=154;Dels=0.00;FS=4.061;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.764;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1684,0,1695 chrIV 423061 . G A 1877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.061;DP=177;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,91:177:99:1907,0,1858 chrIV 423118 . G C 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.004;DP=168;Dels=0.00;FS=3.586;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=10.17;ReadPosRankSum=2.405;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,83:168:99:1739,0,1811 chrIV 423202 . A G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.238;DP=116;Dels=0.00;FS=4.839;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=9.50;ReadPosRankSum=3.024;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1132,0,1415 chrIV 423322 . A G 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;DP=151;Dels=0.00;FS=4.888;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.993;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1431,0,1713 chrIV 423383 . A G 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.069;DP=125;Dels=0.00;FS=3.252;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.890;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1181,0,1551 chrIV 423385 . T G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.762;DP=121;Dels=0.00;FS=6.884;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1216,0,1555 chrIV 423430 . T C 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.768;DP=127;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.800;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1066,0,1699 chrIV 423515 . G A 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;DP=108;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.336;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:911,0,1075 chrIV 423595 . C G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.492;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=1;MQRankSum=1.599;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.364;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1274,0,1116 chrIV 423680 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.177;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=9.86;ReadPosRankSum=2.847;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1341,0,1553 chrIV 423847 . G T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.399;DP=107;Dels=0.00;FS=17.589;HaplotypeScore=2.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.095;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1166,0,967 chrIV 423869 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.977;DP=107;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=1;MQRankSum=-0.932;QD=10.71;ReadPosRankSum=2.417;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1176,0,1156 chrIV 423908 . T C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.198;DP=112;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=0.134;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:998,0,1376 chrIV 423912 . A G 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.662;DP=121;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=0.893;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.138;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:121:99:1117,0,1512 chrIV 424075 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.073;DP=109;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.545;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1321,0,986 chrIV 424226 . G A 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.431;DP=116;Dels=0.00;FS=5.107;HaplotypeScore=3.2145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.616;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1530,0,1137 chrIV 424517 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.771;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=1.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.363;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1296,0,1302 chrIV 424905 . C A 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3373,351,0 chrIV 425036 . T C 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.746;DP=148;Dels=0.00;FS=5.985;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1608,0,1622 chrIV 425098 . G C 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;DP=106;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.793;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1254,0,1035 chrIV 426326 . C T 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3683,361,0 chrIV 426362 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.568;DP=135;Dels=0.00;FS=12.585;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1193,0,1475 chrIV 426545 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.313;DP=149;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1385,0,1819 chrIV 426781 . A T 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.79;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3146,319,0 chrIV 426788 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.039;DP=115;Dels=0.00;FS=6.675;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.193;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1303,0,1206 chrIV 426944 . A G 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;DP=118;Dels=0.00;FS=1.700;HaplotypeScore=3.7452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=1;MQRankSum=-0.263;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,40:118:99:815,0,1880 chrIV 427330 . C T 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.73;SB=-2.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3808,355,0 chrIV 427996 . A T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.352;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=2.131;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1666,0,1503 chrIV 428020 . A C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.202;DP=155;Dels=0.00;FS=11.163;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.469;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,68:155:99:1362,0,2036 chrIV 428068 . T C 1766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;DP=163;Dels=0.00;FS=17.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.157;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1796,0,1674 chrIV 428383 . G A 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.223;DP=140;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=4.1520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1583,0,1387 chrIV 428558 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.098;DP=112;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=8.2752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=10.01;ReadPosRankSum=2.846;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:112:99:1151,0,1165 chrIV 428676 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=147;Dels=0.01;FS=8.647;HaplotypeScore=4.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1414,0,1801 chrIV 428861 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.112;DP=132;Dels=0.00;FS=2.281;HaplotypeScore=5.8929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.344;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1039,0,1102 chrIV 428925 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.376;DP=145;Dels=0.00;FS=6.214;HaplotypeScore=4.9666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,62:145:99:1273,0,1885 chrIV 429057 . A G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.588;DP=133;Dels=0.01;FS=0.655;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1115,0,1691 chrIV 429337 . G A 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.837;DP=147;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1571,0,1611 chrIV 429579 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.393;DP=118;Dels=0.00;FS=3.431;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=10.79;ReadPosRankSum=2.107;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1303,0,1312 chrIV 429588 . G A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.127;DP=136;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=4.4316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.991;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1492,0,1412 chrIV 430281 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.002;DP=109;Dels=0.00;FS=9.722;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=0.322;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.140;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1304,0,1048 chrIV 430309 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;DP=117;Dels=0.00;FS=4.950;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=1.198;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.163;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1371,0,1162 chrIV 430599 . A T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=121;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=5.2961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.910;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1269,0,1333 chrIV 430665 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.110;DP=127;Dels=0.00;FS=5.667;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.960;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1470,0,1350 chrIV 430932 . G T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.947;DP=107;Dels=0.00;FS=2.518;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.450;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1080,0,1245 chrIV 431267 . T C 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3059,315,0 chrIV 431674 . G C 4481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7634;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:177:99:4481,451,0 chrIV 431960 . G A 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.81;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3365,328,0 chrIV 432174 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.426;DP=112;Dels=0.00;FS=2.450;HaplotypeScore=2.7244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1456,0,860 chrIV 432463 . G A 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.606;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=10.69;ReadPosRankSum=2.079;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1570,0,1640 chrIV 432487 . G C 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3242,345,0 chrIV 432803 . T C 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;DP=143;Dels=0.00;FS=2.117;HaplotypeScore=2.6478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.545;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1629,0,1547 chrIV 432926 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.127;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.578;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1407,0,1062 chrIV 432992 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.420;DP=106;Dels=0.00;FS=17.362;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.511;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:106:99:1269,0,1009 chrIV 433044 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.838;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.5026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.705;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.171;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1365,0,1085 chrIV 433099 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.360;DP=102;Dels=0.00;FS=8.046;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.101;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1253,0,935 chrIV 433146 . G A 654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.114;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.100;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,39:107:99:684,0,1463 chrIV 433160 . A C 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3143,321,0 chrIV 433175 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.623;DP=128;Dels=0.00;FS=9.503;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.099;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1164,0,1488 chrIV 433233 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.529;DP=109;Dels=0.00;FS=5.346;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.950;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1165,0,1205 chrIV 433257 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.097;DP=128;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.355;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:128:99:1243,0,1539 chrIV 433297 . C T 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3482,343,0 chrIV 433317 . C A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;DP=125;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.696;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1429,0,1363 chrIV 433376 . G A 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2844,277,0 chrIV 433396 . A G 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2548,258,0 chrIV 433401 . C T 2507 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2540,243,0 chrIV 433434 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.256;DP=91;Dels=0.00;FS=4.256;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,58:91:99:1272,0,639 chrIV 433470 . C G 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.133;DP=120;Dels=0.01;FS=1.593;HaplotypeScore=5.1489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1310,0,1289 chrIV 433489 . A T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.301;DP=127;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.209;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1274,0,1573 chrIV 433591 . T A 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3415,322,0 chrIV 433703 . T C 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3736,379,0 chrIV 433742 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.486;DP=126;Dels=0.00;FS=11.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.315;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1369,0,1445 chrIV 433889 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.664;DP=132;Dels=0.00;FS=4.165;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.312;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1231,0,1532 chrIV 434021 . C T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.788;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.525;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1371,0,1398 chrIV 434124 . A G 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4007,408,0 chrIV 434129 . T C 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3988,402,0 chrIV 434153 . T C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.425;DP=147;Dels=0.00;FS=3.465;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.771;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1342,0,1763 chrIV 434166 . A C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.907;DP=111;Dels=0.00;FS=9.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.421;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1175,0,1276 chrIV 434178 . G A 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=28.54;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3087,315,0 chrIV 434351 . C T 582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;DP=72;Dels=0.00;FS=8.169;HaplotypeScore=25.4675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.964;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,30:72:99:612,0,997 chrIV 434368 . G C 489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;DP=94;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.956;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.656;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,32:94:99:519,0,1442 chrIV 434371 . T A 503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.442;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.514;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.993;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,31:93:99:533,0,1420 chrIV 434379 . G A 495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.702;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.51;MQ0=0;MQRankSum=-3.561;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.995;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:525,0,1380 chrIV 434468 . G A 218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.41;MQ0=0;QD=14.53;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:251,27,0 chrIV 434492 . C T 310 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.06;MQ0=1;QD=14.09;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:36:343,36,0 chrIV 434516 . G C 335 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.11;MQ0=2;QD=15.23;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:39:368,39,0 chrIV 434559 . A G 661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.28;MQ0=3;QD=19.44;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:78:694,78,0 chrIV 434582 . C T 546 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.53;MQ0=2;QD=21.00;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:63:579,63,0 chrIV 434589 . G A 688 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.13;MQ0=2;QD=20.24;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:72:721,72,0 chrIV 434590 . C T 689 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.13;MQ0=2;QD=20.26;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:72:722,72,0 chrIV 434648 . C T 671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.725;DP=37;Dels=0.00;FS=7.202;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.41;MQ0=1;MQRankSum=-1.692;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:75:704,75,0 chrIV 434679 . T C 304 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.33;MQ0=1;QD=12.16;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:39:337,39,0 chrIV 434684 . A G 296 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.33;MQ0=1;QD=11.84;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:39:329,39,0 chrIV 434693 . G A 60.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.17;MQ0=0;QD=4.32;SB=-4.949e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:12:93,12,0 chrIV 434695 . G T 60.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.50;MQ0=0;QD=5.04;SB=-4.949e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:12:93,12,0 chrIV 434704 . A C 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=1.72;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:43,6,0 chrIV 434726 . G A 54.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.73;MQ0=0;QD=7.79;SB=-3.871e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:87,12,0 chrIV 434729 . C T 32.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.68;MQ0=0;QD=5.50;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:65,9,0 chrIV 434730 . A C 32.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.68;MQ0=0;QD=5.50;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:65,9,0 chrIV 434776 . T A 602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.39;MQ0=0;QD=14.00;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:66:635,66,0 chrIV 434834 . C T 1623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=27.98;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1656,162,0 chrIV 434864 . A T 1508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.00;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1541,153,0 chrIV 434921 . C T 211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.332;DP=90;Dels=0.00;FS=5.190;HaplotypeScore=12.5539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.64;MQ0=0;MQRankSum=-4.291;QD=2.34;ReadPosRankSum=-3.224;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:241,0,1130 chrIV 434947 . A G 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.562;DP=105;Dels=0.00;FS=2.006;HaplotypeScore=3.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.446;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:811,0,1109 chrIV 435004 . T C 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.260;DP=126;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=2.6000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1593,0,1219 chrIV 435072 . T C 4163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.55;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4163,403,0 chrIV 435113 . C T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.668;DP=132;Dels=0.00;FS=2.345;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1459,0,1438 chrIV 435139 . C T 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.948;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:906,0,1123 chrIV 435200 . G T 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.983;DP=89;Dels=0.00;FS=6.900;HaplotypeScore=2.9860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=2.427;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,50:89:99:1129,0,731 chrIV 435202 . A C 2196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;DP=89;Dels=0.00;FS=3.159;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.304;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:2229,228,0 chrIV 435213 . T A 718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.583;DP=93;Dels=0.00;FS=7.163;HaplotypeScore=5.6558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.927;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:748,0,1124 chrIV 435214 . T C 688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.234;DP=92;Dels=0.00;FS=8.911;HaplotypeScore=5.6558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.327;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.886;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,40:92:99:718,0,1083 chrIV 435238 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.934;DP=113;Dels=0.00;FS=12.055;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.46;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.887;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1343,0,965 chrIV 435246 . T C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.526;DP=107;Dels=0.00;FS=13.831;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.94;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=10.79;ReadPosRankSum=3.044;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1185,0,1074 chrIV 435275 . G A 70.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;DP=83;Dels=0.00;FS=16.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=0.84;ReadPosRankSum=2.575;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:100,0,948 chrIV 435323 . A T 1111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.76;MQ0=0;QD=24.69;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1144,114,0 chrIV 435397 . G A 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.136;DP=85;Dels=0.00;FS=7.538;HaplotypeScore=15.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=2.361;QD=18.15;ReadPosRankSum=3.437;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,67:85:78:1573,0,78 chrIV 435518 . A T 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2859,277,0 chrIV 435532 . T C 2462 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2495,252,0 chrIV 435564 . T C 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.133;DP=104;Dels=0.00;FS=4.856;HaplotypeScore=2.7291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=25.12;ReadPosRankSum=1.199;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2646,264,0 chrIV 435606 . A G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.887;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1300,0,1647 chrIV 435820 . A G 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2808,288,0 chrIV 435908 . G A 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2646,256,0 chrIV 436026 . T C 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=25.78;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2663,279,0 chrIV 436092 . G A 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;DP=101;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=3.5153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=1.960;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.567;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1057,0,1142 chrIV 436162 . A G 1690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.38;MQ0=0;QD=24.85;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1723,183,0 chrIV 436237 . C T 254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=1;MQRankSum=-3.383;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.599;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:284,0,320 chrIV 436257 . G A 1691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=1;QD=18.38;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:1724,174,0 chrIV 436270 . G C 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;DP=83;Dels=0.00;FS=1.791;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.451;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:785,0,834 chrIV 436482 . T A 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3142,298,0 chrIV 436525 . C T 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.243;DP=148;Dels=0.00;FS=1.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1496,0,1707 chrIV 436543 . C T 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;DP=150;Dels=0.00;FS=5.711;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.660;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1716,0,1614 chrIV 436565 . T C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.898;DP=130;Dels=0.00;FS=8.538;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.907;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1307,0,1449 chrIV 436884 . C T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;DP=131;Dels=0.00;FS=39.027;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.492;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,49:131:99:1002,0,1864 chrIV 436994 . T C 2158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.71;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2191,228,0 chrIV 437035 . C A 1537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.298;DP=83;Dels=0.00;FS=49.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.16;MQ0=0;MQRankSum=2.883;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.709;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,66:83:99:1570,153,0 chrIV 437054 . G T 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.865;DP=71;Dels=0.00;FS=47.277;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.43;MQ0=0;MQRankSum=-4.516;QD=0.51;ReadPosRankSum=-1.647;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,24:71:66:66,0,1079 chrIV 437065 . A T 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;DP=64;Dels=0.00;FS=48.323;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.35;MQ0=0;MQRankSum=-4.926;QD=1.14;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:103,0,1029 chrIV 437081 . T C 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.758;DP=66;Dels=0.00;FS=48.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.960;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.878;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:73:73,0,1145 chrIV 437130 . A G 1224 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.25;MQ0=0;QD=24.00;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:51:99:1257,132,0 chrIV 437637 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.38;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3268,319,0 chrIV 437695 . T G 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2692,270,0 chrIV 437717 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.380;DP=107;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.171;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.536;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1050,0,1163 chrIV 437759 . T C 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.080;DP=85;Dels=0.00;FS=0.839;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.093;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:764,0,1113 chrIV 437881 . C T 2222 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2255,219,0 chrIV 437890 . T C 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.195;DP=86;Dels=0.00;FS=2.797;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.117;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:86:99:852,0,983 chrIV 437896 . G A 2333 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2366,225,0 chrIV 437955 . A G 1856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=26.90;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1889,189,0 chrIV 438856 . A G 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;DP=112;Dels=0.00;FS=4.824;HaplotypeScore=11.5834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=8.36;ReadPosRankSum=-2.513;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:966,0,1453 chrIV 438868 . T C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;DP=102;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=14.7644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.624;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.919;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,64:102:99:1326,0,492 chrIV 439479 . A G 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3331,342,0 chrIV 439746 . A T 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3858,379,0 chrIV 439768 . T C 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3353,336,0 chrIV 439851 . C G 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3434,337,0 chrIV 439906 . A G 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.968;DP=160;Dels=0.00;FS=1.238;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=1;MQRankSum=1.053;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1645,0,1786 chrIV 440205 . C G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.386;DP=137;Dels=0.00;FS=6.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=9.32;ReadPosRankSum=-2.002;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1307,0,1598 chrIV 440496 . A G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.198;DP=128;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=4.7827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.805;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1267,0,1448 chrIV 440778 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.627;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.491;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:107:99:1073,0,1263 chrIV 440866 . C G 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.080;DP=133;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.965;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1429,0,1418 chrIV 440889 . T C 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3792,358,0 chrIV 440913 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;DP=115;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.765;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1245,0,1131 chrIV 440916 . A C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.666;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.686;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1242,0,1125 chrIV 441071 . A G 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2576,258,0 chrIV 441158 . G A 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.593;DP=88;Dels=0.00;FS=1.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.213;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,35:88:99:779,0,1151 chrIV 441238 . T G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.452;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:1055,0,999 chrIV 441323 . A G 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;DP=85;Dels=0.00;FS=5.651;HaplotypeScore=68.5222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=0.66;ReadPosRankSum=-4.372;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,8:85:86:86,0,267 chrIV 441348 . T C 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.575;DP=93;Dels=0.00;FS=10.066;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.797;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.127;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:963,0,951 chrIV 441367 . C T 2242 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=27.01;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2275,222,0 chrIV 441465 . A G 1761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.46;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:72:99:1794,180,0 chrIV 441629 . G A 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3587,343,0 chrIV 441636 . A G 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3446,337,0 chrIV 441738 . C T 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2595,258,0 chrIV 441813 . G C 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;DP=85;Dels=0.00;FS=0.835;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.368;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:749,0,1106 chrIV 441971 . C T 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8663;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2725,265,0 chrIV 442273 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.158;DP=100;Dels=0.00;FS=1.656;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.769;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1060,0,1062 chrIV 442292 . G A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.400;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1221,0,1313 chrIV 442638 . G T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;DP=128;Dels=0.00;FS=5.326;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=9.97;ReadPosRankSum=-2.104;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1306,0,1517 chrIV 442746 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.740;DP=122;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.320;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1374,0,1208 chrIV 442782 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.229;DP=100;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=2.8480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1081,0,1093 chrIV 442788 . T C 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.397;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.500;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1153,0,1216 chrIV 442843 . T C 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.484;DP=109;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=4.6787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.603;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1052,0,1230 chrIV 443218 . T C 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3040,321,0 chrIV 443491 . C T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.860;DP=111;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:928,0,1251 chrIV 443547 . A G 2151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2184,231,0 chrIV 443786 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3268,325,0 chrIV 444063 . C G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.125;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1167,0,1375 chrIV 444228 . T A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.395;DP=105;Dels=0.00;FS=2.517;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1097,0,1236 chrIV 444518 . T C 3959.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4414;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.75;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3959,417,0 chrIV 445208 . C A 2030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.242;DP=157;Dels=0.00;FS=6.195;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=1.220;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:157:99:2060,0,1427 chrIV 445249 . A G 2687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=1;QD=25.84;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2720,279,0 chrIV 445581 . T C 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.30;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2968,312,0 chrIV 445817 . C T 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=28.27;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3307,319,0 chrIV 445993 . A G 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3344,351,0 chrIV 446016 . G A 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3257,327,0 chrIV 446066 . A G 2766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2799,285,0 chrIV 446126 . T C 2132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2165,216,0 chrIV 446188 . A G 2215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2248,225,0 chrIV 446498 . G A 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.664;DP=92;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.752;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:945,0,1048 chrIV 446573 . T C 652.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.576;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.792;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.904;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,37:88:99:682,0,1104 chrIV 446580 . G A 1089.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.848;DP=92;Dels=0.00;FS=2.968;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:1119,0,804 chrIV 446581 . T C 1015.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;DP=92;Dels=0.00;FS=2.968;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:1045,0,822 chrIV 446658 . C T 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.029;DP=119;Dels=0.00;FS=4.423;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.434;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1222,0,1221 chrIV 446812 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;DP=104;Dels=0.00;FS=7.919;HaplotypeScore=2.9441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.900;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1086,0,1144 chrIV 446850 . A G 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.866;DP=82;Dels=0.00;FS=0.838;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.830;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,42:82:99:761,0,927 chrIV 446874 . C T 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.685;DP=77;Dels=0.00;FS=0.892;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.534;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:910,0,803 chrIV 446913 . A G 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;DP=92;Dels=0.00;FS=2.929;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=10.03;ReadPosRankSum=-2.445;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:953,0,1054 chrIV 446954 . G A 2120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.476;DP=83;Dels=0.00;FS=3.770;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.518;QD=25.54;ReadPosRankSum=0.492;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:83:99:2153,184,0 chrIV 447357 . C T 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3291,319,0 chrIV 447589 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.358;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.540;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1283,0,1431 chrIV 447952 . G C 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3026,306,0 chrIV 448175 . A G 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3624,361,0 chrIV 448388 . T C 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3292,348,0 chrIV 448634 . G C 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3049,318,0 chrIV 449024 . A G 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3403,357,0 chrIV 449411 . A C 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.324;DP=118;Dels=0.00;FS=0.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=13.50;ReadPosRankSum=1.706;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,73:118:99:1623,0,976 chrIV 449471 . G A 3045 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3078,301,0 chrIV 449473 . A G 1078.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.859;DP=113;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=9.54;ReadPosRankSum=2.483;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1108,0,1344 chrIV 449477 . C G 3410.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3410,342,0 chrIV 449521 . A G 2791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.41;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2824,274,0 chrIV 449562 . G A 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.63;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2895,282,0 chrIV 449566 . G C 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.31;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2711,270,0 chrIV 449578 . T C 2137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.50;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2170,207,0 chrIV 449579 . T C 2093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.50;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2126,207,0 chrIV 449650 . G T 2580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.02;MQ0=0;QD=26.33;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2613,264,0 chrIV 449654 . C T 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.080;DP=100;Dels=0.00;FS=4.299;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.427;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.177;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:933,0,1183 chrIV 449709 . A G 2273 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.68;MQ0=0;QD=26.43;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2306,243,0 chrIV 449722 . A T 1563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.01;MQ0=0;QD=19.06;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1596,215,0 chrIV 449727 . C A 1946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.49;MQ0=0;QD=25.61;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1979,207,0 chrIV 449742 . T C 1272 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.80;MQ0=0;QD=23.56;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1305,138,0 chrIV 449745 . A G 580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;DP=56;Dels=0.00;FS=3.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.12;MQ0=0;MQRankSum=-2.778;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.959;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:610,0,498 chrIV 449770 . T C 731.64 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;DP=45;Dels=0.00;FS=17.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.86;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=16.26;ReadPosRankSum=4.379;SB=-3.437e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,37:45:5:761,0,5 chrIV 449788 . T G 657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.716;DP=70;Dels=0.00;FS=2.713;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.36;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.593;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:687,0,809 chrIV 449988 . G A 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.56;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2675,264,0 chrIV 450139 . C T 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3987,373,0 chrIV 450232 . G A 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3846;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3536,340,0 chrIV 451246 . G T 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3361,328,0 chrIV 451471 . A G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.275;DP=144;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.306;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:144:99:1396,0,1775 chrIV 451837 . G C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.730;DP=128;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=9.88;ReadPosRankSum=-2.262;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1294,0,1385 chrIV 452236 . T C 2668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=22.61;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2701,282,0 chrIV 452771 . C T 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3567,355,0 chrIV 452803 . T C 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.98;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3441,355,0 chrIV 452897 . A G 2271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=77.3364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.92;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=23.41;ReadPosRankSum=0.830;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,95:97:99:2304,252,0 chrIV 452966 . A G 631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.139;DP=86;Dels=0.00;FS=3.127;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:661,0,675 chrIV 453755 . T C 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3651,355,0 chrIV 453843 . C T 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3670,373,0 chrIV 453852 . A T 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3670,361,0 chrIV 453908 . G A 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3455,343,0 chrIV 454502 . C T 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.61;SB=-2.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4045,406,0 chrIV 454817 . T C 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3282,342,0 chrIV 455170 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.572;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1377,0,1519 chrIV 455311 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.352;DP=123;Dels=0.00;FS=6.851;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.028;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1139,0,1492 chrIV 455316 . G A 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3352,334,0 chrIV 455506 . T C 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3398,348,0 chrIV 455545 . A T 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=28.02;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3811,364,0 chrIV 455618 . T C 2680 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2713,282,0 chrIV 456230 . A C 2040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.672;DP=171;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=11.93;ReadPosRankSum=-2.464;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,96:171:99:2070,0,1679 chrIV 456343 . T C 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.207;DP=86;Dels=0.00;FS=1.789;HaplotypeScore=3.9833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.730;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:905,0,954 chrIV 456352 . T C 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.823;DP=91;Dels=0.00;FS=0.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:898,0,1018 chrIV 456445 . T G 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.064;DP=120;Dels=0.00;FS=7.299;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=2.777;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1395,0,1175 chrIV 456683 . G T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.350;DP=135;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=2.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,51:135:99:1002,0,1888 chrIV 456852 . T C 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.138;DP=147;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=5.7301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.091;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1502,0,1600 chrIV 457671 . C T 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=28.22;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3274,325,0 chrIV 458036 . G A 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.626;DP=104;Dels=0.00;FS=9.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1057,0,1203 chrIV 458135 . T C 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.191;DP=112;Dels=0.00;FS=3.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.300;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1220,0,1169 chrIV 458153 . A T 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3449,348,0 chrIV 458209 . C T 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2958,298,0 chrIV 458379 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.789;DP=90;Dels=0.00;FS=32.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:1139,0,853 chrIV 458401 . G A 2441 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2474,246,0 chrIV 458653 . T C 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2912,300,0 chrIV 458851 . G A 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.808;DP=155;Dels=0.00;FS=3.738;HaplotypeScore=2.6660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1669,0,1549 chrIV 459304 . G A 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2769,265,0 chrIV 459332 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.373;DP=124;Dels=0.00;FS=2.628;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1401,0,1221 chrIV 459391 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.076;DP=118;Dels=0.00;FS=4.408;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.867;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1166,0,1417 chrIV 459458 . T A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.585;DP=129;Dels=0.00;FS=2.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1418,0,1425 chrIV 459514 . G T 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.03;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3271,334,0 chrIV 459567 . G A 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3212,310,0 chrIV 459811 . A G 4039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.24;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4039,388,0 chrIV 460219 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.279;DP=108;Dels=0.00;FS=7.545;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1287,0,1074 chrIV 460279 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.249;DP=119;Dels=0.00;FS=5.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.301;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1216,0,1288 chrIV 460660 . C G 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.378;DP=114;Dels=0.00;FS=1.551;HaplotypeScore=2.9237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.282;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,44:114:99:816,0,1498 chrIV 460852 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.167;DP=114;Dels=0.00;FS=20.017;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.711;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1181,0,1293 chrIV 460993 . A G 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.918;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:879,0,1564 chrIV 461027 . C T 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.159;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,53:139:99:1087,0,1889 chrIV 461088 . G A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.906;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1244,0,1537 chrIV 461168 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.421;DP=138;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1498,0,1353 chrIV 461311 . C A 2019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.284;DP=175;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,95:175:99:2049,0,1623 chrIV 461425 . C T 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=21.41;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:148:99:3202,324,0 chrIV 461469 . G C 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3890,385,0 chrIV 461615 . T C 4096.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4096,444,0 chrIV 461656 . A G 4126.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.97;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4126,427,0 chrIV 461758 . A G 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.336;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.632;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3688,361,0 chrIV 462097 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.533;DP=120;Dels=0.00;FS=14.058;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.378;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.042;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1228,0,1391 chrIV 462476 . C T 1764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.865;DP=141;Dels=0.00;FS=3.119;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.254;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1794,0,1380 chrIV 462658 . T C 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.876;DP=105;Dels=0.00;FS=2.687;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.914;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,40:105:99:797,0,1505 chrIV 462910 . T C 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.295;DP=161;Dels=0.00;FS=3.697;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.127;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,89:161:99:1834,0,1584 chrIV 463263 . C A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.253;DP=116;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.101;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1504,0,1043 chrIV 464012 . C T 4454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=1;QD=24.21;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4454,439,0 chrIV 464078 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.648;DP=139;Dels=0.00;FS=8.978;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.036;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1246,0,1703 chrIV 464138 . C T 4095.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4095,394,0 chrIV 464336 . T C 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.555;DP=156;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,71:156:99:1412,0,1923 chrIV 464487 . C G 4130.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4130,418,0 chrIV 464538 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.127;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.477;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1421,0,1541 chrIV 464571 . T C 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3707,384,0 chrIV 464945 . C A 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.522;DP=99;Dels=0.00;FS=2.610;HaplotypeScore=5.9590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.431;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1153,0,919 chrIV 465051 . T A 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.80;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3371,348,0 chrIV 465056 . C G 2680 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.44;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2713,294,0 chrIV 465343 . T A 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3169,307,0 chrIV 465360 . C T 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.84;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3655,352,0 chrIV 465487 . G A 1833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.827;DP=143;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.855;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1863,0,1272 chrIV 465495 . G A 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.203;DP=141;Dels=0.00;FS=3.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQ0=0;MQRankSum=1.813;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,84:141:99:1882,0,1117 chrIV 465541 . C G 3857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.89;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3857,396,0 chrIV 465563 . T A 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3602,361,0 chrIV 465662 . G A 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.413;DP=135;Dels=0.00;FS=6.118;HaplotypeScore=164.9715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.97;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=24.55;ReadPosRankSum=1.357;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,133:135:99:3314,319,0 chrIV 465690 . G A 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.38;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3362,337,0 chrIV 465718 . C G 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.646;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,85:154:99:1768,0,1381 chrIV 465882 . G A 4350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.52;SB=-2.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4350,409,0 chrIV 466062 . A G 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3092,307,0 chrIV 466170 . A G 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3602,381,0 chrIV 466356 . A G 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=22.59;SB=-2.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3615,361,0 chrIV 466362 . T C 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3731,378,0 chrIV 466410 . T C 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3497,352,0 chrIV 466737 . C T 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3790,367,0 chrIV 467306 . C T 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3054,295,0 chrIV 467442 . C T 4445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.78;SB=-2.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4445,439,0 chrIV 467595 . T C 3895.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=1;QD=25.63;SB=-1.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3895,393,0 chrIV 467790 . C T 4274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4274,424,0 chrIV 467803 . T A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.323;DP=132;Dels=0.00;FS=3.150;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.342;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1522,0,1419 chrIV 468822 . T C 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.282;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1557,0,1456 chrIV 469108 . T C 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.065;DP=125;Dels=0.00;FS=12.043;HaplotypeScore=4.4308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.044;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,80:125:99:1707,0,943 chrIV 469111 . C T 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.149;DP=120;Dels=0.00;FS=8.962;HaplotypeScore=4.4308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.367;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,77:120:99:1765,0,852 chrIV 469194 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.511;DP=135;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.726;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1331,0,1674 chrIV 469707 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.884;DP=122;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=8.9759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=11.20;ReadPosRankSum=-2.432;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1397,0,1148 chrIV 469779 . A T 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.869;DP=147;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1733,0,1421 chrIV 470435 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.569;DP=141;Dels=0.00;FS=6.237;HaplotypeScore=3.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.691;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1448,0,1613 chrIV 470731 . A T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.219;DP=83;Dels=0.00;FS=1.835;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.373;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,48:83:99:1151,0,764 chrIV 470848 . C T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.725;DP=124;Dels=0.00;FS=1.618;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=13.43;ReadPosRankSum=1.923;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1695,0,1015 chrIV 471249 . T C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;DP=97;Dels=0.00;FS=6.480;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:997,0,1144 chrIV 471530 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;DP=150;Dels=0.00;FS=4.991;HaplotypeScore=5.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.89;ReadPosRankSum=2.041;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1363,0,1801 chrIV 472458 . A G 153.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.527;DP=112;Dels=0.00;FS=11.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.30;MQ0=66;MQRankSum=1.144;QD=1.37;ReadPosRankSum=-1.481;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,27:112:99:183,0,497 chrIV 472549 . T C 433.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.134;DP=127;Dels=0.00;FS=6.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.44;MQ0=61;MQRankSum=0.336;QD=3.41;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:463,0,658 chrIV 472671 . T C 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.083;DP=118;Dels=0.00;FS=3.760;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.49;MQ0=4;MQRankSum=-3.251;QD=0.51;ReadPosRankSum=1.073;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,20:118:90:90,0,2278 chrIV 472918 . G A 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.70;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3093,312,0 chrIV 473912 . A G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.249;DP=120;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.490;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1016,0,1554 chrIV 474265 . G A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.794;DP=142;Dels=0.00;FS=23.291;HaplotypeScore=3.8571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1080,0,1713 chrIV 474320 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.866;DP=140;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1162,0,1865 chrIV 474321 . A G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.156;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.399;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1213,0,1860 chrIV 474455 . C A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.309;DP=105;Dels=0.00;FS=11.343;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.035;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1157,0,1072 chrIV 474625 . T G 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2714,294,0 chrIV 474628 . A G 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3078,330,0 chrIV 475191 . A C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.504;DP=108;Dels=0.00;FS=2.641;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1073,0,1284 chrIV 475206 . A G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;DP=100;Dels=0.00;FS=6.861;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.052;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1066,0,1189 chrIV 475233 . T C 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.762;DP=98;Dels=0.00;FS=2.767;HaplotypeScore=7.7526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.202;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:1009,0,1089 chrIV 475394 . C A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.118;DP=126;Dels=0.00;FS=3.193;HaplotypeScore=2.7059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.657;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1273,0,1419 chrIV 475405 . T C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.985;DP=115;Dels=0.00;FS=2.425;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.381;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1069,0,1391 chrIV 475608 . T C 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.544;DP=152;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.408;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1530,0,1610 chrIV 475850 . G C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.031;DP=99;Dels=0.00;FS=2.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.301;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:964,0,1159 chrIV 476220 . A G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.133;DP=109;Dels=0.00;FS=12.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=1;MQRankSum=-2.594;QD=8.74;ReadPosRankSum=-1.376;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:983,0,1386 chrIV 476334 . G A 416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;DP=118;Dels=0.00;FS=2.972;HaplotypeScore=52.4857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.40;MQ0=0;MQRankSum=-5.874;QD=3.53;ReadPosRankSum=-6.368;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,25:118:99:446,0,1636 chrIV 476358 . T C 157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.877;DP=103;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.44;MQ0=0;MQRankSum=-4.458;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:187,0,1579 chrIV 476502 . A T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;DP=109;Dels=0.00;FS=3.842;HaplotypeScore=4.4801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.076;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1191,0,1144 chrIV 476684 . G A 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.539;DP=144;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.539;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1638,0,1496 chrIV 476833 . C A 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.547;DP=102;Dels=0.00;FS=4.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.606;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:879,0,1230 chrIV 476875 . G C 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;DP=91;Dels=0.02;FS=1.894;HaplotypeScore=19.7872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.870;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:810,0,1033 chrIV 477034 . A G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.336;DP=120;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1417,0,1175 chrIV 477069 . T G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.173;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.710;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1367,0,1190 chrIV 477077 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.943;DP=112;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.292;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1361,0,1070 chrIV 477210 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.344;DP=137;Dels=0.00;FS=13.962;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.402;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1304,0,1656 chrIV 477220 . C T 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.157;DP=133;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.992;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1414,0,1507 chrIV 477309 . G A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.720;DP=110;Dels=0.00;FS=6.016;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.201;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1093,0,1274 chrIV 477415 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.731;DP=104;Dels=0.00;FS=2.524;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.185;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:1106,0,1128 chrIV 477445 . A G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.960;DP=122;Dels=0.00;FS=6.992;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.243;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1195,0,1353 chrIV 477475 . A T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;DP=124;Dels=0.00;FS=3.341;HaplotypeScore=8.6418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.273;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:1136,0,1541 chrIV 477857 . G A 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.027;DP=145;Dels=0.00;FS=3.059;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=-1.220;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1607,0,1474 chrIV 478019 . G A 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.287;DP=124;Dels=0.00;FS=3.565;HaplotypeScore=4.6333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,47:124:99:879,0,1598 chrIV 478092 . G C 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.184;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=8.12;ReadPosRankSum=2.418;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:866,0,1088 chrIV 478327 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.952;DP=133;Dels=0.00;FS=4.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1353,0,1350 chrIV 478496 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.115;DP=101;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:101:99:1270,0,898 chrIV 478585 . T C 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.336;DP=148;Dels=0.00;FS=3.353;HaplotypeScore=3.5088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1567,0,1588 chrIV 479106 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.236;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.989;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1395,0,1210 chrIV 479557 . T C 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.048;DP=93;Dels=0.00;FS=2.699;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,43:93:99:954,0,1082 chrIV 479694 . G A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;DP=141;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=2.7822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.446;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1545,0,1599 chrIV 479946 . T C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.740;DP=106;Dels=0.00;FS=13.705;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:106:99:1022,0,1236 chrIV 480076 . G C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.258;DP=100;Dels=0.00;FS=3.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.180;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:892,0,1132 chrIV 480096 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.691;DP=110;Dels=0.00;FS=6.062;HaplotypeScore=2.5251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.273;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:980,0,1360 chrIV 480135 . A G 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.349;DP=113;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.604;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1011,0,1321 chrIV 480222 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.288;DP=107;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.237;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:107:99:1249,0,1000 chrIV 480231 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.307;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1298,0,1276 chrIV 480345 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;DP=112;Dels=0.00;FS=2.464;HaplotypeScore=6.9517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.707;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1096,0,1316 chrIV 480624 . G A 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.580;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.550;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1550,0,1370 chrIV 480726 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.859;DP=117;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1199,0,1159 chrIV 480846 . G A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.020;DP=116;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.737;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1230,0,1239 chrIV 480887 . A G 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.833;DP=156;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=3.7594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.534;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.562;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:1830,0,1480 chrIV 480972 . C A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.966;DP=116;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=3.7403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.775;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1233,0,1231 chrIV 482148 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.117;DP=111;Dels=0.00;FS=7.503;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.149;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:968,0,1358 chrIV 482388 . G A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.920;DP=86;Dels=0.00;FS=2.858;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.445;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:1015,0,864 chrIV 482540 . A G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;DP=105;Dels=0.00;FS=8.580;HaplotypeScore=2.1188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.543;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1086,0,1107 chrIV 482955 . T C 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2907,297,0 chrIV 483136 . T C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.828;DP=137;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.287;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,52:137:99:1012,0,1926 chrIV 483171 . C T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.918;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.211;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:1067,0,1383 chrIV 483341 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3265,325,0 chrIV 483420 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.953;DP=124;Dels=0.00;FS=6.846;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.632;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1168,0,1458 chrIV 483422 . G A 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3215,316,0 chrIV 483501 . A G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.019;DP=149;Dels=0.00;FS=5.107;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=1;MQRankSum=0.401;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.471;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1514,0,1546 chrIV 483504 . C T 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.531;DP=146;Dels=0.00;FS=3.101;HaplotypeScore=3.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=1.081;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.793;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:146:99:1591,0,1511 chrIV 483545 . T G 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.605;DP=100;Dels=0.00;FS=2.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.410;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.320;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1070,0,1035 chrIV 483591 . T A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;DP=86;Dels=0.00;FS=0.816;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.744;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:1095,0,872 chrIV 483735 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.285;DP=110;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1182,0,1283 chrIV 483836 . T G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.559;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.304;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1048,0,1093 chrIV 483939 . A T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.022;DP=121;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.301;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1090,0,1487 chrIV 484026 . A G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.990;DP=120;Dels=0.00;FS=1.760;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:998,0,1604 chrIV 484028 . A G 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.82;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3198,330,0 chrIV 484050 . T A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.464;DP=118;Dels=0.00;FS=3.704;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1141,0,1487 chrIV 484429 . C T 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.239;DP=116;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.402;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:1013,0,1488 chrIV 484952 . G A 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.203;DP=156;Dels=0.00;FS=2.828;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1608,0,1709 chrIV 485150 . C T 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.492;DP=145;Dels=0.00;FS=8.748;HaplotypeScore=5.4178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.109;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1753,0,1358 chrIV 485454 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.009;DP=123;Dels=0.00;FS=17.289;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.945;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1227,0,1472 chrIV 485593 . A G 2060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2093,196,0 chrIV 485604 . C T 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.488;DP=78;Dels=0.00;FS=7.632;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.198;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,42:78:99:901,0,760 chrIV 485672 . G A 1892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=23.36;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1925,186,0 chrIV 485723 . C T 1610 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.633;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=23.00;ReadPosRankSum=0.000;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:1643,145,0 chrIV 486009 . A G 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.915;DP=124;Dels=0.00;FS=11.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1527,0,1277 chrIV 486079 . A G 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.204;DP=144;Dels=0.00;FS=2.130;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.115;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1721,0,1251 chrIV 486303 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.602;DP=127;Dels=0.00;FS=3.227;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.268;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1418,0,1376 chrIV 487279 . A G 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3352,334,0 chrIV 487532 . C G 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.599;DP=135;Dels=0.00;FS=8.394;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,77:135:99:1697,0,1129 chrIV 488021 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.629;DP=139;Dels=0.00;FS=2.155;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.731;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1499,0,1450 chrIV 488048 . A G 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.700;DP=152;Dels=0.00;FS=1.325;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=2.226;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.372;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1541,0,1705 chrIV 488094 . T C 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.407;DP=157;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=4.408;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,84:157:99:1776,0,1636 chrIV 488205 . G A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.406;DP=98;Dels=0.00;FS=13.289;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1256,0,960 chrIV 488584 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.638;DP=121;Dels=0.00;FS=5.595;HaplotypeScore=6.7724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.793;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1231,0,1251 chrIV 488654 . A G 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.260;DP=132;Dels=0.00;FS=5.409;HaplotypeScore=2.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,78:132:99:1680,0,1092 chrIV 489433 . C T 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.687;DP=85;Dels=0.00;FS=4.916;HaplotypeScore=47.2426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1011,0,730 chrIV 489543 . T C 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.909;DP=113;Dels=0.00;FS=5.287;HaplotypeScore=3.9463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.808;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:113:99:965,0,1335 chrIV 489556 . C T 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.471;DP=88;Dels=0.00;FS=3.163;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.339;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:862,0,1025 chrIV 491016 . A C 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;DP=136;Dels=0.00;FS=1.383;HaplotypeScore=2.6851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.598;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1640,0,1275 chrIV 491144 . C T 1400.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.057;DP=125;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=11.20;ReadPosRankSum=2.134;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,75:125:99:1430,0,1056 chrIV 491145 . A T 1321.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;DP=123;Dels=0.00;FS=3.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.688;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,75:123:99:1351,0,1020 chrIV 491146 . G A 1321.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.415;DP=123;Dels=0.00;FS=3.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.599;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,75:123:99:1351,0,966 chrIV 491787 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.817;DP=106;Dels=0.00;FS=7.496;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.876;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1318,0,1030 chrIV 491804 . T A 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=28.78;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2652,265,0 chrIV 491805 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.759;DP=93;Dels=0.00;FS=3.995;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.971;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.148;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1115,0,974 chrIV 492120 . T C 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.802;DP=109;Dels=0.00;FS=10.029;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1095,0,1221 chrIV 492626 . T C 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.277;DP=146;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.000;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,64:146:99:1240,0,1770 chrIV 492686 . T G 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7062;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3109,316,0 chrIV 492702 . T C 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=1;QD=25.86;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3853,382,0 chrIV 493794 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.774;DP=120;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.291;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1399,0,1195 chrIV 494419 . A G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.182;DP=150;Dels=0.00;FS=8.360;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1499,0,1724 chrIV 494981 . C T 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.484;DP=184;Dels=0.00;FS=1.857;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.229;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.498;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,86:184:99:1823,0,2106 chrIV 495483 . T C 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;DP=162;Dels=0.00;FS=1.240;HaplotypeScore=4.2161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.349;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:1476,0,2022 chrIV 495642 . G T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.068;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=1;MQRankSum=0.102;QD=10.42;ReadPosRankSum=-2.452;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1416,0,1468 chrIV 496104 . A T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1181,0,1103 chrIV 497387 . C A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.252;DP=145;Dels=0.00;FS=2.939;HaplotypeScore=3.6057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.609;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1523,0,1598 chrIV 497463 . T A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.332;DP=135;Dels=0.00;FS=5.166;HaplotypeScore=5.7585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.646;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1347,0,1593 chrIV 497525 . C T 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.676;DP=145;Dels=0.00;FS=2.973;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.121;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1697,0,1442 chrIV 497940 . G C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;DP=108;Dels=0.00;FS=4.753;HaplotypeScore=2.6263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1185,0,1081 chrIV 498016 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.731;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1298,0,942 chrIV 498305 . C T 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3104,307,0 chrIV 499386 . A T 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.028;DP=158;Dels=0.00;FS=2.007;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.362;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,67:158:99:1410,0,2054 chrIV 499704 . G A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.716;DP=122;Dels=0.00;FS=9.913;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.385;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1274,0,1415 chrIV 499794 . G A 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4109,400,0 chrIV 500512 . C T 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3442,337,0 chrIV 500594 . A G 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3463,360,0 chrIV 500673 . G A 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.158;DP=136;Dels=0.00;FS=9.475;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.534;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1817,0,1149 chrIV 501531 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.937;DP=106;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=12.38;ReadPosRankSum=2.536;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1342,0,1020 chrIV 501667 . A C 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=140;Dels=0.00;FS=3.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=26.09;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3653,345,0 chrIV 502097 . G T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.529;DP=113;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=12.22;ReadPosRankSum=1.223;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1411,0,991 chrIV 502181 . T C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.135;DP=120;Dels=0.00;FS=4.484;HaplotypeScore=3.7121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.373;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1210,0,1423 chrIV 502981 . T A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;DP=133;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1476,0,1484 chrIV 503212 . G C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;DP=112;Dels=0.00;FS=5.980;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.534;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.481;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1396,0,1006 chrIV 503249 . C A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.033;DP=112;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=5.5711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1394,0,1023 chrIV 503375 . T C 660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.877;DP=109;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=28.9189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.979;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.386;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:690,0,1367 chrIV 503628 . T C 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.240;DP=116;Dels=0.00;FS=3.439;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.844;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:1539,0,1019 chrIV 503809 . T C 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.218;DP=96;Dels=0.00;FS=6.867;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:867,0,1233 chrIV 503927 . C T 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.451;DP=142;Dels=0.00;FS=3.003;HaplotypeScore=3.7707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1268,0,1716 chrIV 504046 . C T 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.919;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,39:87:99:865,0,1089 chrIV 504071 . G A 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.501;DP=97;Dels=0.00;FS=3.879;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.438;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:932,0,1217 chrIV 504159 . C T 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;DP=103;Dels=0.00;FS=8.500;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.167;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:103:99:915,0,1344 chrIV 504183 . G A 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.743;DP=93;Dels=0.00;FS=1.811;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:882,0,1187 chrIV 504204 . C T 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.292;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:916,0,1213 chrIV 504609 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.555;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=1;MQRankSum=0.343;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.060;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1158,0,1600 chrIV 504869 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;DP=107;Dels=0.00;FS=6.424;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.471;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.022;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:918,0,1328 chrIV 504877 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.333;DP=109;Dels=0.00;FS=2.550;HaplotypeScore=5.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1087,0,1239 chrIV 505206 . C T 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;DP=97;Dels=0.00;FS=13.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.996;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:913,0,1127 chrIV 505225 . T C 349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;DP=84;Dels=0.00;FS=10.070;HaplotypeScore=57.2127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:379,0,1252 chrIV 505262 . T A 520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;DP=85;Dels=0.00;FS=1.853;HaplotypeScore=9.5806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.844;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:550,0,1067 chrIV 505264 . T G 473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.048;DP=85;Dels=0.00;FS=0.877;HaplotypeScore=9.5979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:85:99:503,0,1079 chrIV 505274 . T A 628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.389;DP=92;Dels=0.00;FS=2.965;HaplotypeScore=4.8548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.943;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.233;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,35:92:99:658,0,1179 chrIV 505380 . T A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;DP=116;Dels=0.00;FS=0.920;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.097;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.975;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1289,0,1404 chrIV 505429 . C G 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.301;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.314;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1009,0,872 chrIV 505529 . C A 720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.084;DP=79;Dels=0.00;FS=4.305;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:750,0,846 chrIV 505841 . G A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.332;DP=131;Dels=0.00;FS=11.184;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1225,0,1537 chrIV 506222 . A G 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.255;DP=94;Dels=0.00;FS=9.092;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.724;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:835,0,1136 chrIV 506283 . C T 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.217;DP=89;Dels=0.00;FS=0.891;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.112;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,51:89:99:816,0,778 chrIV 506367 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.505;DP=129;Dels=0.00;FS=10.417;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.552;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1442,0,1249 chrIV 506641 . T A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;DP=124;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.982;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1069,0,1601 chrIV 506998 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;DP=103;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.503;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1054,0,727 chrIV 507180 . C T 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3238,313,0 chrIV 507490 . G A 2426 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.25;MQ0=0;QD=27.57;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2459,249,0 chrIV 507578 . G A 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.869;DP=75;Dels=0.00;FS=0.996;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.026;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:797,0,843 chrIV 507718 . A T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.786;DP=119;Dels=0.00;FS=2.341;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.780;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1197,0,1422 chrIV 507786 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.793;DP=104;Dels=0.00;FS=6.265;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1247,0,1017 chrIV 507791 . A T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;DP=104;Dels=0.00;FS=4.887;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.105;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1281,0,1018 chrIV 507975 . A G 886.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.739;DP=76;Dels=0.00;FS=4.447;HaplotypeScore=37.7282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=11.66;ReadPosRankSum=-2.338;SB=-2.841e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,37:76:22:919,22,0 chrIV 508741 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.296;DP=132;Dels=0.00;FS=4.339;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1480,0,1332 chrIV 508764 . T C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.623;DP=122;Dels=0.00;FS=3.388;HaplotypeScore=2.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.492;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1359,0,1365 chrIV 509004 . A T 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;DP=93;Dels=0.00;FS=2.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.342;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1069,0,1012 chrIV 509186 . A T 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2796,274,0 chrIV 509322 . T C 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.454;DP=87;Dels=0.00;FS=1.773;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.924;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:787,0,1071 chrIV 509407 . G T 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.91;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2778,271,0 chrIV 509488 . G A 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=126;Dels=0.00;FS=4.472;HaplotypeScore=4.2534;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=27.21;ReadPosRankSum=1.402;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3428,352,0 chrIV 509559 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.856;DP=121;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.289;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1171,0,1460 chrIV 509676 . C T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;DP=104;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.373;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:104:99:1025,0,1188 chrIV 509797 . C T 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.427;DP=90;Dels=0.00;FS=7.048;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.441;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:844,0,1117 chrIV 509821 . T C 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.311;DP=97;Dels=0.00;FS=6.503;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.011;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1005,0,1050 chrIV 509831 . T C 2498 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2531,249,0 chrIV 510079 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.909;DP=107;Dels=0.00;FS=2.489;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.153;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1142,0,1236 chrIV 510085 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.491;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.246;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1218,0,1349 chrIV 510199 . G A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.556;DP=113;Dels=0.00;FS=5.142;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.370;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1228,0,1245 chrIV 510253 . C G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.626;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1068,0,1473 chrIV 511129 . C T 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3042,295,0 chrIV 511850 . C T 626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.157;DP=94;Dels=0.00;FS=4.263;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.442;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,33:94:99:656,0,1324 chrIV 512368 . C A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;DP=116;Dels=0.00;FS=5.806;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1313,0,1060 chrIV 512370 . T C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.001;DP=116;Dels=0.00;FS=3.397;HaplotypeScore=3.4639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.446;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:986,0,1418 chrIV 512392 . T C 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;DP=113;Dels=0.00;FS=10.762;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:842,0,1333 chrIV 512393 . G A 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2578,252,0 chrIV 512419 . G A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.803;DP=116;Dels=0.00;FS=11.170;HaplotypeScore=2.4404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.471;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,46:116:99:933,0,1523 chrIV 512478 . A C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.959;DP=116;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.690;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1181,0,1266 chrIV 512519 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.122;DP=124;Dels=0.00;FS=8.775;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.616;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1507,0,1040 chrIV 512522 . T C 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;DP=125;Dels=0.00;FS=7.078;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.193;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1531,0,1106 chrIV 512720 . T C 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.424;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.974;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.141;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1445,0,1586 chrIV 513405 . A C 792.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.965;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.94;MQ0=5;MQRankSum=-2.881;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.423;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:822,0,961 chrIV 513524 . C T 1018.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.295;DP=98;Dels=0.00;FS=2.752;HaplotypeScore=2.8265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.12;MQ0=7;MQRankSum=-0.520;QD=10.39;ReadPosRankSum=-2.426;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1048,0,720 chrIV 513586 . T C 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.50;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3599,352,0 chrIV 513763 . A G 108.34 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=35;Dels=0.00;FS=3.802;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.04;MQ0=26;MQRankSum=-1.179;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.179;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:8:138,0,8 chrIV 515535 . T C 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.273;DP=119;Dels=0.00;FS=33.790;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.07;MQ0=70;MQRankSum=1.097;QD=0.14;ReadPosRankSum=-0.374;SB=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,36:119:47:47,0,180 chrIV 516407 . A G 52.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.29;MQ0=96;MQRankSum=1.807;QD=0.39;ReadPosRankSum=1.276;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,17:134:82:82,0,176 chrIV 516410 . G A 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.56;MQ0=92;MQRankSum=2.107;QD=0.37;ReadPosRankSum=1.496;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,17:131:79:79,0,198 chrIV 516452 . T C 70.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.55;MQ0=73;MQRankSum=-1.651;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.103;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,38:121:99:100,0,199 chrIV 516488 . T C 218.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.9786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.85;MQ0=86;MQRankSum=1.625;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.127;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:51:248,0,51 chrIV 516489 . A G 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.191;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.9786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.89;MQ0=85;MQRankSum=0.922;QD=0.17;ReadPosRankSum=0.435;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,14:124:51:51,0,248 chrIV 516654 . G A 106.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.441;DP=353;Dels=0.00;FS=2.536;HaplotypeScore=7.4452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.09;MQ0=121;MQRankSum=-0.876;QD=0.30;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:311,42:353:99:136,0,3718 chrIV 519063 . G A 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.65;MQ0=107;MQRankSum=0.071;QD=0.23;ReadPosRankSum=1.344;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,9:121:58:58,0,138 chrIV 519197 . G C 48.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.344;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.06;MQ0=117;MQRankSum=0.645;QD=0.34;ReadPosRankSum=0.510;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,10:142:78:78,0,239 chrIV 519318 . A T 138.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.778;DP=178;Dels=0.00;FS=8.641;HaplotypeScore=78.8457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.06;MQ0=74;MQRankSum=-4.829;QD=0.78;ReadPosRankSum=2.949;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,20:178:99:168,0,1942 chrIV 519320 . G A 128.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.139;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=78.8457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.13;MQ0=73;MQRankSum=-0.244;QD=0.72;ReadPosRankSum=-1.497;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,54:177:99:158,0,1907 chrIV 519322 . T G 280.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.762;DP=164;Dels=0.00;FS=2.040;HaplotypeScore=76.8879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.03;MQ0=61;MQRankSum=1.904;QD=1.71;ReadPosRankSum=-2.192;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,48:164:99:310,0,1393 chrIV 519323 . T G 145.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.477;DP=163;Dels=0.00;FS=8.658;HaplotypeScore=76.8879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.07;MQ0=61;MQRankSum=-4.724;QD=0.89;ReadPosRankSum=3.283;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,20:163:99:175,0,1844 chrIV 519324 . G T 1250.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.142;DP=163;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=76.8879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.90;MQ0=62;MQRankSum=3.042;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,94:163:99:1280,0,704 chrIV 519361 . A T 293.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;DP=157;Dels=0.00;FS=4.836;HaplotypeScore=20.4338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.65;MQ0=63;MQRankSum=2.934;QD=1.87;ReadPosRankSum=3.693;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,37:157:99:323,0,1463 chrIV 519369 . A G 345.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.587;DP=167;Dels=0.00;FS=2.138;HaplotypeScore=24.4064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.89;MQ0=73;MQRankSum=2.343;QD=2.07;ReadPosRankSum=4.092;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,43:167:99:375,0,1012 chrIV 519389 . T A 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;DP=97;Dels=0.00;FS=5.770;HaplotypeScore=6.9155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.60;MQ0=38;MQRankSum=0.299;QD=0.17;ReadPosRankSum=0.255;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,15:97:46:46,0,907 chrIV 519408 . C G 33.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;DP=85;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.41;MQ0=51;MQRankSum=0.511;QD=0.39;ReadPosRankSum=-2.641;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,11:85:63:63,0,236 chrIV 519474 . A G 86.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.757;DP=79;Dels=0.00;FS=9.278;HaplotypeScore=2.5655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.26;MQ0=55;MQRankSum=2.027;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.656;SB=-6.177e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,19:79:38:116,0,38 chrIV 519856 . A G 668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.593;DP=84;Dels=0.00;FS=1.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=-4.226;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.258;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:698,0,1029 chrIV 519895 . T C 187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;DP=37;Dels=0.00;FS=13.878;HaplotypeScore=64.6737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.104;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-9.247e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:37:99:217,0,377 chrIV 519954 . A G 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.785;DP=93;Dels=0.00;FS=0.928;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.233;QD=7.27;ReadPosRankSum=-2.077;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,43:93:99:706,0,752 chrIV 519960 . A G 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.981;DP=94;Dels=0.00;FS=1.946;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.48;MQ0=0;MQRankSum=-3.423;QD=7.95;ReadPosRankSum=-2.409;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:777,0,790 chrIV 519970 . C T 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.382;DP=105;Dels=0.00;FS=5.334;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-3.125;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:899,0,919 chrIV 520004 . G A 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.655;DP=108;Dels=0.00;FS=6.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.298;QD=7.38;ReadPosRankSum=2.560;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:827,0,1517 chrIV 520031 . A G 642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.114;DP=93;Dels=0.00;FS=3.897;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=6.90;ReadPosRankSum=-2.161;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,38:93:99:672,0,1294 chrIV 520061 . C A 599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;DP=91;Dels=0.00;FS=5.629;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQ0=0;MQRankSum=-6.028;QD=6.58;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:91:99:629,0,1323 chrIV 520078 . A G 472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.981;DP=78;Dels=0.00;FS=1.928;HaplotypeScore=29.3594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.48;MQ0=0;MQRankSum=-6.549;QD=6.05;ReadPosRankSum=1.085;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:78:99:502,0,1166 chrIV 520108 . A G 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.177;DP=96;Dels=0.00;FS=5.565;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.47;MQ0=0;MQRankSum=-7.422;QD=6.47;ReadPosRankSum=-1.622;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:651,0,1317 chrIV 520115 . T C 640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.648;DP=100;Dels=0.00;FS=6.974;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.38;MQ0=0;MQRankSum=-7.302;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.903;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:670,0,1417 chrIV 520121 . A G 587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.259;DP=94;Dels=0.00;FS=2.903;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.09;MQ0=0;MQRankSum=-6.466;QD=6.24;ReadPosRankSum=-2.482;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,40:94:99:617,0,1292 chrIV 520152 . C T 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.842;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.12;MQ0=0;MQRankSum=-4.252;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.124;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:883,0,1367 chrIV 520210 . C A 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;DP=84;Dels=0.00;FS=9.057;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.973;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:938,0,871 chrIV 520212 . A G 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.395;DP=83;Dels=0.00;FS=7.415;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.505;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.315;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:868,0,907 chrIV 520246 . G A 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.348;DP=77;Dels=0.00;FS=11.792;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.85;MQ0=0;MQRankSum=-4.552;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.291;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:811,0,856 chrIV 520247 . G A 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.764;DP=78;Dels=0.00;FS=11.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-4.933;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.330;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:805,0,866 chrIV 520268 . A G 503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;DP=68;Dels=0.00;FS=4.732;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.84;MQ0=0;MQRankSum=-6.330;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.340;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:533,0,857 chrIV 520309 . G A 466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.269;DP=78;Dels=0.00;FS=7.084;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-7.205;QD=5.97;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:496,0,1153 chrIV 520315 . G A 543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;DP=86;Dels=0.00;FS=4.566;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-7.518;QD=6.31;ReadPosRankSum=-2.703;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,32:86:99:573,0,1215 chrIV 520322 . T A 468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;DP=81;Dels=0.00;FS=0.986;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQ0=0;MQRankSum=-6.317;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.949;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:498,0,1297 chrIV 520334 . T C 379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;DP=86;Dels=0.00;FS=1.891;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQ0=0;MQRankSum=-4.243;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.535;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:409,0,1391 chrIV 520710 . C T 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.089;DP=115;Dels=0.00;FS=4.532;HaplotypeScore=3.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.317;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1056,0,1406 chrIV 520815 . A G 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3496,354,0 chrIV 521406 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.573;DP=122;Dels=0.00;FS=2.284;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.206;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1274,0,1319 chrIV 521623 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;DP=116;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.637;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1383,0,1145 chrIV 521753 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.671;DP=117;Dels=0.00;FS=2.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1176,0,1297 chrIV 521776 . C G 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;DP=99;Dels=0.00;FS=3.834;HaplotypeScore=4.8368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.165;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:921,0,1123 chrIV 521778 . A G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.603;DP=98;Dels=0.00;FS=1.672;HaplotypeScore=5.8284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.967;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:1016,0,1043 chrIV 521976 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.850;DP=126;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.581;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1219,0,1471 chrIV 523042 . T C 488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.542;DP=60;Dels=0.00;FS=1.049;HaplotypeScore=61.5725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.79;MQ0=0;MQRankSum=-6.571;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.962;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:518,0,713 chrIV 523048 . A T 361.05 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.214;DP=58;Dels=0.00;FS=1.093;HaplotypeScore=38.6422;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.84;MQ0=0;MQRankSum=-6.406;QD=6.23;ReadPosRankSum=-2.151;SB=-1.501e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,25:58:22:394,22,0 chrIV 523054 . A T 360.05 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.949;DP=56;Dels=0.00;FS=1.153;HaplotypeScore=33.8576;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.40;MQ0=0;MQRankSum=-6.366;QD=6.43;ReadPosRankSum=-2.227;SB=-1.261e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,24:56:22:393,22,0 chrIV 523058 . C T 206.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;DP=49;Dels=0.02;FS=11.285;HaplotypeScore=4.8916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.12;MQ0=0;MQRankSum=-5.691;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.013;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:236,0,617 chrIV 523059 . T A 175.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;DP=49;Dels=0.02;FS=8.787;HaplotypeScore=4.8916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.12;MQ0=0;MQRankSum=-5.610;QD=3.57;ReadPosRankSum=-1.017;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:205,0,691 chrIV 523083 . A T 213.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.812;DP=57;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQ0=0;MQRankSum=-6.465;QD=3.74;ReadPosRankSum=-2.203;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:243,0,689 chrIV 523087 . T C 261.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.472;DP=62;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.81;MQ0=0;MQRankSum=-6.768;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.810;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,30:62:99:291,0,716 chrIV 523092 . T G 296.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;DP=65;Dels=0.00;FS=15.487;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.00;MQ0=0;MQRankSum=-6.928;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,31:65:99:326,0,743 chrIV 523113 . C T 271.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.388;DP=65;Dels=0.00;FS=36.408;HaplotypeScore=3.6885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQ0=0;MQRankSum=-6.915;QD=4.17;ReadPosRankSum=2.507;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:65:99:301,0,792 chrIV 523139 . T G 127.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;DP=59;Dels=0.00;FS=61.227;HaplotypeScore=3.3269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-6.210;QD=2.15;ReadPosRankSum=2.139;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:157,0,838 chrIV 523141 . C T 141.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.142;DP=60;Dels=0.00;FS=69.909;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-6.477;QD=2.35;ReadPosRankSum=1.961;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:171,0,804 chrIV 523161 . A G 105.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.595;DP=71;Dels=0.00;FS=78.272;HaplotypeScore=4.7581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=-6.570;QD=1.48;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,24:71:99:135,0,1021 chrIV 523166 . T G 109.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;DP=60;Dels=0.00;FS=57.113;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.625;QD=1.82;ReadPosRankSum=-1.546;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:139,0,923 chrIV 523174 . A C 70.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.360;DP=61;Dels=0.00;FS=51.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=-5.411;QD=1.15;ReadPosRankSum=-2.050;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:100,0,1061 chrIV 523176 . A G 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.068;DP=61;Dels=0.00;FS=51.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=-5.411;QD=0.23;ReadPosRankSum=-2.187;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:44:44,0,1037 chrIV 523256 . A G 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.454;DP=64;Dels=0.00;FS=46.029;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQ0=0;MQRankSum=-6.080;QD=0.66;ReadPosRankSum=1.824;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:72:72,0,1108 chrIV 523286 . C T 93.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;DP=63;Dels=0.00;FS=41.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQ0=0;MQRankSum=-6.062;QD=1.48;ReadPosRankSum=0.054;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:123,0,1074 chrIV 523292 . C A 137.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;DP=59;Dels=0.00;FS=36.816;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.24;MQ0=0;MQRankSum=-5.983;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:167,0,968 chrIV 523304 . A G 79.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.855;DP=52;Dels=0.00;FS=23.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.64;MQ0=0;MQRankSum=-5.223;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:109,0,993 chrIV 523307 . A G 83.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;DP=53;Dels=0.00;FS=19.842;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-5.077;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:113,0,1063 chrIV 523309 . T C 84.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.764;DP=52;Dels=0.00;FS=19.358;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=-5.064;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:114,0,1033 chrIV 523316 . G A 22.03 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;DP=57;Dels=0.00;FS=7.319;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=0;MQRankSum=-5.126;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.152;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:52:52,0,1079 chrIV 523322 . G A 37.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.549;DP=54;Dels=0.00;FS=3.390;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=-4.712;QD=0.69;ReadPosRankSum=0.975;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,9:54:67:67,0,1026 chrIV 523328 . T A 29.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;DP=58;Dels=0.00;FS=5.307;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=-4.746;QD=0.50;ReadPosRankSum=1.374;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,9:58:59:59,0,1169 chrIV 523330 . G T 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.196;DP=62;Dels=0.00;FS=5.505;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.776;QD=0.24;ReadPosRankSum=1.559;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,9:62:45:45,0,1218 chrIV 523370 . C T 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.345;DP=78;Dels=0.00;FS=9.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=-5.491;QD=0.21;ReadPosRankSum=-2.721;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,12:78:46:46,0,1526 chrIV 523401 . T C 60.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.252;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQ0=0;MQRankSum=-5.901;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.883;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,14:86:90:90,0,1708 chrIV 523418 . G A 138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.773;DP=85;Dels=0.00;FS=1.105;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.09;MQ0=0;MQRankSum=-6.211;QD=1.62;ReadPosRankSum=2.029;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:168,0,1574 chrIV 523433 . G C 96.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.118;DP=87;Dels=0.00;FS=1.100;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.073;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.388;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,15:87:99:126,0,1682 chrIV 523459 . A C 70.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.677;DP=87;Dels=0.00;FS=2.495;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=-5.839;QD=0.80;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,14:87:99:100,0,1785 chrIV 523471 . G A 45.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.506;DP=74;Dels=0.00;FS=3.042;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=-4.973;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.969;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,10:74:75:75,0,1462 chrIV 524808 . T C 1537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.79;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1570,159,0 chrIV 525250 . G T 1093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.7654;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.11;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=16.31;ReadPosRankSum=1.262;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,64:67:91:1126,91,0 chrIV 525488 . C T 133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.844;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=-6.397;QD=1.71;ReadPosRankSum=2.172;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:163,0,1400 chrIV 525499 . C T 135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.228;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.74;MQ0=0;MQRankSum=-6.530;QD=1.73;ReadPosRankSum=3.597;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:165,0,1371 chrIV 525504 . C T 140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.874;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-6.516;QD=1.82;ReadPosRankSum=3.811;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:170,0,1336 chrIV 525511 . G A 122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.459;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.74;MQ0=0;MQRankSum=-6.519;QD=1.56;ReadPosRankSum=3.562;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:152,0,1356 chrIV 525523 . C T 132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQ0=0;MQRankSum=-6.516;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.266;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:162,0,1330 chrIV 525682 . T C 1241 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.54;MQ0=0;QD=23.87;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1274,132,0 chrIV 525758 . T G 1485.02 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.596;DP=72;Dels=0.00;FS=3.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=4.578;QD=20.63;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,64:72:21:1515,0,21 chrIV 525967 . G A 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;DP=99;Dels=0.00;FS=3.978;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.085;QD=0.22;ReadPosRankSum=-3.167;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,15:99:52:52,0,1905 chrIV 525976 . C T 204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.648;DP=108;Dels=0.00;FS=2.078;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQ0=0;MQRankSum=-5.229;QD=1.89;ReadPosRankSum=-2.929;SB=-4.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:99:234,0,1936 chrIV 525988 . G A 356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.654;DP=106;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.06;MQ0=0;MQRankSum=-6.128;QD=3.36;ReadPosRankSum=-2.603;SB=-1.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,26:106:99:386,0,1782 chrIV 526042 . C T 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.532;DP=92;Dels=0.00;FS=10.514;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-6.132;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.676;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,36:92:99:699,0,1241 chrIV 526063 . A G 654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.843;DP=96;Dels=0.00;FS=11.029;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=-6.395;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.747;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:684,0,1337 chrIV 526072 . A T 611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.352;DP=81;Dels=0.00;FS=9.176;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.48;MQ0=0;MQRankSum=-6.090;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.377;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:641,0,1035 chrIV 526087 . A G 382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;DP=72;Dels=0.00;FS=17.208;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQ0=0;MQRankSum=-6.544;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.433;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:412,0,1057 chrIV 526090 . T A 354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;DP=67;Dels=0.00;FS=11.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-6.633;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.045;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:384,0,1028 chrIV 526099 . C T 279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.962;DP=67;Dels=0.00;FS=4.573;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=-6.688;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.420;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:309,0,1043 chrIV 526102 . T C 274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;DP=67;Dels=0.00;FS=4.573;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=-6.688;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.314;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:304,0,1124 chrIV 526111 . A G 321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.646;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-6.813;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:351,0,1048 chrIV 526117 . G A 389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;DP=68;Dels=0.00;FS=1.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-6.455;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.291;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:419,0,959 chrIV 526135 . G A 480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.568;DP=77;Dels=0.00;FS=1.008;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-6.881;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:77:99:510,0,1115 chrIV 526183 . T C 314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;DP=63;Dels=0.00;FS=5.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQ0=0;MQRankSum=-5.579;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.894;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:344,0,1054 chrIV 526186 . C T 333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.877;DP=60;Dels=0.00;FS=5.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.57;MQ0=0;MQRankSum=-4.942;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.144;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:363,0,958 chrIV 526215 . G A 337.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.775;DP=67;Dels=0.00;FS=15.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.46;MQ0=0;MQRankSum=-6.200;QD=5.03;ReadPosRankSum=-1.898;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:367,0,1106 chrIV 526219 . T C 307.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.816;DP=68;Dels=0.00;FS=12.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQ0=0;MQRankSum=-5.821;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.581;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:337,0,1169 chrIV 526222 . G A 267.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.089;DP=68;Dels=0.00;FS=10.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.713;QD=3.93;ReadPosRankSum=-1.394;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:297,0,1136 chrIV 526246 . A G 247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;DP=82;Dels=0.00;FS=29.856;HaplotypeScore=3.6198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQ0=0;MQRankSum=-6.810;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.285;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:277,0,1470 chrIV 526267 . T C 296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;DP=78;Dels=0.00;FS=47.505;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.38;MQ0=0;MQRankSum=-6.845;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.361;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:326,0,1367 chrIV 526282 . T C 351.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;DP=71;Dels=0.00;FS=35.568;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-6.928;QD=4.94;ReadPosRankSum=-1.824;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:381,0,1066 chrIV 526285 . C T 330.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.525;DP=73;Dels=0.00;FS=26.577;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQ0=0;MQRankSum=-6.911;QD=4.52;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-7.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:360,0,1071 chrIV 526288 . T C 362.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;DP=76;Dels=0.00;FS=22.489;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-7.185;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.856;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:392,0,1147 chrIV 526297 . T C 341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;DP=79;Dels=0.00;FS=15.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.01;MQ0=0;MQRankSum=-6.004;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:371,0,1267 chrIV 526303 . C A 319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;DP=78;Dels=0.00;FS=18.502;HaplotypeScore=4.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.03;MQ0=0;MQRankSum=-5.428;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.236;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,25:78:99:349,0,1248 chrIV 526727 . A G 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.469;DP=128;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1454,0,1318 chrIV 527319 . C G 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3390,351,0 chrIV 527586 . T C 1163.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.810;DP=161;Dels=0.00;FS=46.176;HaplotypeScore=6.9070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.20;MQ0=21;MQRankSum=3.479;QD=7.22;ReadPosRankSum=2.410;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,60:161:99:1193,0,1510 chrIV 527743 . A G 220.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.677;DP=107;Dels=0.00;FS=78.849;HaplotypeScore=3.8388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.98;MQ0=13;MQRankSum=-1.344;QD=2.06;ReadPosRankSum=1.658;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,21:107:99:250,0,1592 chrIV 528042 . C T 3416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.706;DP=317;Dels=0.00;FS=4.507;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.27;MQ0=1;MQRankSum=-1.436;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,166:317:99:3416,0,3143 chrIV 528490 . C A 89.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.040;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.12;MQ0=89;MQRankSum=0.033;QD=0.79;ReadPosRankSum=1.036;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,33:112:99:119,0,226 chrIV 535615 . C T 115.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.01;MQ0=30;QD=2.95;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,25:39:18:148,18,0 chrIV 535653 . C T 94.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.81;MQ0=52;QD=1.55;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,31:61:15:127,15,0 chrIV 537709 . C T 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.28;MQ0=60;MQRankSum=0.322;QD=0.47;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,3:68:62:62,0,111 chrIV 537713 . C T 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.20;MQ0=61;MQRankSum=-0.322;QD=0.51;ReadPosRankSum=0.322;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,3:69:65:65,0,114 chrIV 537715 . A G 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.52;MQ0=58;MQRankSum=1.300;QD=0.51;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,3:65:63:63,0,94 chrIV 537724 . G C 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.10;MQ0=55;MQRankSum=0.406;QD=0.20;ReadPosRankSum=-1.537;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,3:61:42:42,0,73 chrIV 537730 . G A 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.33;MQ0=52;MQRankSum=0.406;QD=0.64;ReadPosRankSum=-1.537;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,3:58:67:67,0,69 chrIV 537738 . A C 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.91;MQ0=48;MQRankSum=0.358;QD=0.20;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,2:53:40:40,0,75 chrIV 537750 . G A 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.95;MQ0=45;MQRankSum=-0.720;QD=0.24;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,2:51:42:42,0,96 chrIV 537778 . A G 140.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.59;MQ0=39;QD=3.11;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,12:45:18:173,18,0 chrIV 537808 . G C 137.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.11;MQ0=29;QD=3.61;SB=-1.247e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,10:38:18:170,18,0 chrIV 537811 . T C 106.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.32;MQ0=31;QD=2.59;SB=-2.556e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,11:41:15:139,15,0 chrIV 537817 . C T 196.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.95;MQ0=30;QD=4.56;SB=-3.987e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,13:43:24:229,24,0 chrIV 537828 . C T 213.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.95;MQ0=30;QD=4.95;SB=-2.272e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:27:246,27,0 chrIV 537829 . G A 217.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.95;MQ0=30;QD=5.05;SB=-2.272e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,13:43:27:250,27,0 chrIV 537832 . T C 244 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.36;MQ0=30;QD=5.55;SB=-1.465e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,14:44:30:277,30,0 chrIV 537838 . A G 240 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.83;MQ0=33;QD=5.11;SB=-1.465e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,14:47:30:273,30,0 chrIV 537865 . G A 253 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.85;MQ0=44;QD=4.44;SB=-1.410e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,18:57:30:286,30,0 chrIV 537889 . C T 264 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.88;MQ0=37;QD=5.50;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,16:48:30:297,30,0 chrIV 537892 . T C 243 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.03;MQ0=36;QD=5.17;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,16:47:30:276,30,0 chrIV 537897 . T C 196.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.97;MQ0=36;QD=4.36;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,14:45:24:229,24,0 chrIV 537913 . A T 152.52 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.59;MQ0=32;MQRankSum=1.179;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-5.193e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,8:41:6:182,0,6 chrIV 537934 . T C 243 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.34;MQ0=41;QD=4.67;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,20:52:30:276,30,0 chrIV 537961 . A G 48.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.66;MQ0=34;MQRankSum=-1.226;QD=1.00;ReadPosRankSum=-1.872;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,6:48:78:78,0,192 chrIV 537970 . T C 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.98;MQ0=33;MQRankSum=0.825;QD=0.58;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,4:45:56:56,0,203 chrIV 537976 . C T 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.700;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.94;MQ0=36;MQRankSum=0.386;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.540;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,4:49:50:50,0,213 chrIV 537994 . A G 132.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.65;MQ0=46;MQRankSum=0.178;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.320;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,9:67:99:162,0,279 chrIV 538009 . C T 150.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.05;MQ0=41;MQRankSum=-2.230;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.567;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,10:61:99:180,0,228 chrIV 538030 . C G 157.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.36;MQ0=31;MQRankSum=-2.209;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:187,0,195 chrIV 538039 . T G 544 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.60;MQ0=34;QD=9.89;SB=-6.524e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,26:55:60:577,60,0 chrIV 538042 . G A 562 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.96;MQ0=38;QD=9.53;SB=-6.524e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,26:59:60:595,60,0 chrIV 538051 . C T 415 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.52;MQ0=34;QD=8.14;SB=-6.725e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,22:51:45:448,45,0 chrIV 538054 . A G 340 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.22;MQ0=34;QD=6.80;SB=-6.930e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,20:50:42:373,42,0 chrIV 538057 . T C 370 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.88;MQ0=36;QD=7.12;SB=-6.930e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,20:52:42:403,42,0 chrIV 538066 . C T 135.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.646;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.35;MQ0=35;MQRankSum=-2.069;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,9:52:99:165,0,180 chrIV 538069 . A G 129.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.05;MQ0=35;MQRankSum=-2.223;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,9:51:99:159,0,159 chrIV 538120 . G T 676 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.07;MQ0=22;QD=14.08;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,27:48:72:709,72,0 chrIV 538141 . T A 791 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.65;MQ0=11;QD=18.83;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,31:42:84:824,84,0 chrIV 538156 . A G 391 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.15;MQ0=7;QD=15.64;SB=-6.622e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,18:25:48:424,48,0 chrIV 538159 . G A 422 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.15;MQ0=7;QD=16.88;SB=-6.622e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,18:25:48:455,48,0 chrIV 538162 . C A 354 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.15;MQ0=7;QD=14.16;SB=-6.622e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,18:25:48:387,48,0 chrIV 538163 . G C 354 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.15;MQ0=7;QD=14.16;SB=-6.622e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,18:25:48:387,48,0 chrIV 538165 . G C 357 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.65;MQ0=6;QD=14.87;SB=-6.622e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,18:24:48:390,48,0 chrIV 538167 . T C 371 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.69;MQ0=6;QD=13.25;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,22:28:48:404,48,0 chrIV 538168 . A G 409 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.26;MQ0=6;QD=13.63;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,24:30:54:442,54,0 chrIV 538174 . A G 616 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.52;MQ0=6;QD=12.57;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,43:49:72:649,72,0 chrIV 538183 . G A 802 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.25;MQ0=4;QD=16.04;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,46:50:87:835,87,0 chrIV 538369 . T C 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.962;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:913,0,1288 chrIV 538384 . G A 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.276;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:91:99:845,0,1171 chrIV 538433 . G T 492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.914;DP=86;Dels=0.00;FS=11.405;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.936;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.228;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:522,0,1321 chrIV 538447 . C T 316.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.308;DP=86;Dels=0.00;FS=9.280;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.42;MQ0=0;MQRankSum=-5.893;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.015;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:346,0,1424 chrIV 538450 . A G 188.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;DP=79;Dels=0.00;FS=10.267;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQ0=0;MQRankSum=-6.165;QD=2.38;ReadPosRankSum=2.203;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:218,0,1422 chrIV 538451 . G A 188.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.803;DP=79;Dels=0.00;FS=10.267;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQ0=0;MQRankSum=-5.780;QD=2.38;ReadPosRankSum=2.180;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:218,0,1391 chrIV 538452 . T C 247.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;DP=82;Dels=0.00;FS=12.510;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-5.473;QD=3.01;ReadPosRankSum=2.414;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:277,0,1473 chrIV 538459 . T C 476.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.425;DP=95;Dels=0.00;FS=0.822;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-6.092;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:506,0,1464 chrIV 538464 . C T 546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.123;DP=93;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.78;MQ0=0;MQRankSum=-5.793;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.337;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:576,0,1367 chrIV 538483 . C A 654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;DP=101;Dels=0.00;FS=5.240;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-5.565;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.942;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,37:101:99:684,0,1482 chrIV 538491 . G A 710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.340;DP=110;Dels=0.00;FS=6.286;HaplotypeScore=2.6953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.05;MQ0=0;MQRankSum=-5.329;QD=6.45;ReadPosRankSum=-1.471;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:740,0,1557 chrIV 538827 . T C 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.401;DP=136;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=6.3048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1288,0,1413 chrIV 538966 . A C 1802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.648;DP=141;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.111;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,82:141:99:1832,0,1288 chrIV 539017 . C T 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.280;DP=126;Dels=0.00;FS=2.427;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=12.11;ReadPosRankSum=-1.215;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1556,0,1116 chrIV 539024 . C A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.873;DP=137;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=6.9064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=2.093;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.172;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:137:99:1695,0,1215 chrIV 539137 . C T 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.593;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=13.06;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,85:141:99:1872,0,1064 chrIV 539196 . C A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=140;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=6.8467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.257;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1332,0,1763 chrIV 539207 . T C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.708;DP=120;Dels=0.00;FS=6.422;HaplotypeScore=3.6800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.531;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1195,0,1446 chrIV 539475 . G A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.303;DP=132;Dels=0.00;FS=3.156;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.809;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1230,0,1572 chrIV 539551 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.032;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1400,0,1188 chrIV 540228 . C T 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.857;DP=142;Dels=0.00;FS=2.300;HaplotypeScore=12.7136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.496;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1581,0,1323 chrIV 540249 . G C 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.582;DP=138;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=4.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.350;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1556,0,1153 chrIV 540514 . A T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.755;DP=132;Dels=0.00;FS=8.025;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=1;MQRankSum=-0.251;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1423,0,1482 chrIV 540564 . T A 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.433;DP=126;Dels=0.00;FS=10.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=-0.862;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1384,0,1365 chrIV 540619 . C T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.513;DP=126;Dels=0.00;FS=6.760;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:126:99:1515,0,1159 chrIV 540965 . G A 1925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.796;DP=175;Dels=0.00;FS=8.943;HaplotypeScore=4.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.040;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,90:175:99:1955,0,1730 chrIV 540969 . C T 1876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.620;DP=173;Dels=0.00;FS=8.994;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.081;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,90:173:99:1906,0,1700 chrIV 541985 . T A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.751;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.853;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1189,0,1415 chrIV 542266 . G C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;DP=118;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=2.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.729;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1287,0,1312 chrIV 542914 . C T 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.166;DP=120;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1473,0,1204 chrIV 543029 . C T 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.598;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.458;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1410,0,1520 chrIV 543049 . A G 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.163;DP=139;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=2.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1492,0,1518 chrIV 543598 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.010;DP=95;Dels=0.00;FS=2.707;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.333;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:95:99:1035,0,1029 chrIV 544220 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.115;DP=103;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.505;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1094,0,971 chrIV 544361 . G A 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=12.53;ReadPosRankSum=-3.234;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,76:129:99:1646,0,1054 chrIV 544682 . A C 93.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.951;DP=44;Dels=0.00;FS=37.538;HaplotypeScore=3.7725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=2.11;ReadPosRankSum=-4.926;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:123,0,730 chrIV 545047 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.080;DP=105;Dels=0.00;FS=1.581;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=12.46;ReadPosRankSum=2.284;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1338,0,1010 chrIV 545374 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.378;DP=126;Dels=0.00;FS=4.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.039;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1484,0,1254 chrIV 546556 . C T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.279;DP=125;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=0;MQRankSum=-4.423;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:922,0,1311 chrIV 547875 . C A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.042;DP=100;Dels=0.00;FS=5.019;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.018;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1225,0,929 chrIV 547876 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.489;DP=100;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.566;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1198,0,937 chrIV 548352 . C T 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.873;DP=112;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=1;MQRankSum=-1.049;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.690;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:848,0,1640 chrIV 549071 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.115;DP=102;Dels=0.00;FS=3.746;HaplotypeScore=4.6929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.739;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1249,0,924 chrIV 550672 . G A 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.720;DP=142;Dels=0.00;FS=2.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.354;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1716,0,1381 chrIV 550727 . A T 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;DP=124;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.629;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1128,0,1430 chrIV 550868 . G A 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.339;DP=139;Dels=0.00;FS=6.374;HaplotypeScore=4.9626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.603;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:139:99:1584,0,1264 chrIV 550889 . C G 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;DP=149;Dels=0.00;FS=5.988;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.795;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1555,0,1617 chrIV 550893 . C G 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.401;DP=153;Dels=0.00;FS=3.763;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.393;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1570,0,1727 chrIV 551003 . G A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.426;DP=135;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=2.8230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=7.99;ReadPosRankSum=2.129;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,55:135:99:1109,0,1673 chrIV 551004 . G A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.468;DP=133;Dels=0.00;FS=2.243;HaplotypeScore=2.8230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.925;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1112,0,1655 chrIV 551018 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;DP=124;Dels=0.00;FS=8.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.436;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,52:124:99:1022,0,1570 chrIV 551063 . C G 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.146;DP=122;Dels=0.00;FS=5.756;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.431;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,47:122:99:883,0,1667 chrIV 551099 . G A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.857;DP=123;Dels=0.00;FS=6.033;HaplotypeScore=2.9392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.214;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,49:123:99:1021,0,1666 chrIV 551214 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.064;DP=156;Dels=0.00;FS=6.241;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,61:156:99:1189,0,2148 chrIV 551387 . C A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;DP=176;Dels=0.00;FS=4.733;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.967;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,73:176:99:1526,0,2224 chrIV 551587 . T C 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.703;DP=149;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.904;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1642,0,1684 chrIV 551702 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.364;DP=133;Dels=0.00;FS=1.705;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.501;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1439,0,1333 chrIV 551843 . G T 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.142;DP=131;Dels=0.00;FS=7.480;HaplotypeScore=8.3688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.960;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:131:99:959,0,566 chrIV 552354 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.836;DP=140;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.830;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1213,0,1806 chrIV 552943 . A C 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.039;DP=143;Dels=0.00;FS=7.403;HaplotypeScore=2.6912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.523;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1470,0,1616 chrIV 553031 . G A 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=12.08;ReadPosRankSum=2.357;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1745,0,1202 chrIV 553189 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.953;DP=123;Dels=0.00;FS=11.889;HaplotypeScore=5.6727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.465;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,47:123:99:908,0,1706 chrIV 553651 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.288;DP=124;Dels=0.00;FS=8.790;HaplotypeScore=3.5565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.513;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1238,0,1438 chrIV 553753 . A G 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.380;DP=112;Dels=0.00;FS=7.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1065,0,1399 chrIV 554794 . A G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.253;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,58:146:99:1089,0,2007 chrIV 554837 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.829;DP=149;Dels=0.00;FS=6.634;HaplotypeScore=7.0089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.444;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,55:149:99:1081,0,2147 chrIV 555214 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.817;DP=102;Dels=0.01;FS=6.789;HaplotypeScore=4.7807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.704;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1110,0,1094 chrIV 555283 . C T 769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:799,0,1263 chrIV 555327 . A G 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.501;DP=97;Dels=0.00;FS=15.015;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.770;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1117,0,971 chrIV 555346 . G A 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.190;DP=117;Dels=0.00;FS=12.420;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQ0=0;MQRankSum=-4.301;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1148,0,1378 chrIV 555362 . C T 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.993;DP=117;Dels=0.00;FS=4.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQ0=0;MQRankSum=-5.781;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1027,0,1419 chrIV 555365 . C A 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.904;DP=114;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQ0=0;MQRankSum=-5.853;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.496;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:982,0,1313 chrIV 555379 . C T 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.256;DP=117;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQ0=0;MQRankSum=-4.964;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1034,0,1452 chrIV 555381 . C G 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.384;DP=116;Dels=0.00;FS=4.228;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.84;MQ0=0;MQRankSum=-4.678;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:965,0,1449 chrIV 555425 . A C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.011;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.507;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.017;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1287,0,1857 chrIV 555524 . C A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1328,0,1556 chrIV 555588 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.406;DP=111;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=1;MQRankSum=-0.132;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1101,0,1261 chrIV 556326 . G A 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.427;DP=117;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.541;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.479;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:998,0,1472 chrIV 556732 . T C 1937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.854;DP=168;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.194;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,90:168:99:1967,0,1623 chrIV 556859 . T G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.716;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1361,0,1508 chrIV 556934 . A C 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3509,363,0 chrIV 556996 . A G 1781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.842;DP=161;Dels=0.00;FS=2.768;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.932;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1811,0,1661 chrIV 557054 . C T 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.971;DP=155;Dels=0.00;FS=2.979;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,83:155:99:1820,0,1477 chrIV 557161 . A G 1825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=1;MQRankSum=-0.576;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.576;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1855,0,1451 chrIV 557710 . A G 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.908;DP=162;Dels=0.00;FS=2.784;HaplotypeScore=2.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:1470,0,2043 chrIV 557749 . G C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:1309,0,1921 chrIV 557899 . T C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2967,303,0 chrIV 557923 . A G 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.120;DP=123;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.418;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:965,0,1608 chrIV 558249 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.660;DP=147;Dels=0.00;FS=1.591;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.334;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1366,0,1651 chrIV 558325 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.247;DP=131;Dels=0.00;FS=14.572;HaplotypeScore=56.5918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.486;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.894;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1244,0,261 chrIV 558895 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.872;DP=129;Dels=0.00;FS=4.327;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1178,0,1439 chrIV 558963 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;DP=124;Dels=0.00;FS=4.340;HaplotypeScore=2.8173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.353;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1224,0,1355 chrIV 559020 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.675;DP=151;Dels=0.00;FS=2.905;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.848;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1498,0,1718 chrIV 559132 . T A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.760;DP=144;Dels=0.00;FS=4.203;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.696;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1468,0,1521 chrIV 559236 . C T 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.533;DP=115;Dels=0.00;FS=3.453;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=12.27;ReadPosRankSum=2.953;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1441,0,1077 chrIV 559461 . A T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=135;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.116;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1577,0,1262 chrIV 559582 . G T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.746;DP=122;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.523;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1384,0,1306 chrIV 559897 . T C 1887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.138;DP=160;Dels=0.00;FS=9.628;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=0.582;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.813;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1917,0,1635 chrIV 559935 . C T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.309;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.863;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:144:99:1505,0,1647 chrIV 560449 . A G 1955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.103;DP=147;Dels=0.00;FS=3.992;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,91:147:99:1985,0,1142 chrIV 560536 . T A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.532;DP=112;Dels=0.00;FS=5.825;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.499;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1250,0,1248 chrIV 560715 . G A 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.899;DP=157;Dels=0.00;FS=2.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:1835,0,1508 chrIV 560858 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.954;DP=87;Dels=0.00;FS=1.733;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.176;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,50:87:99:1075,0,764 chrIV 561251 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.836;DP=134;Dels=0.00;FS=3.831;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.009;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,54:134:99:1109,0,1949 chrIV 561417 . G A 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.561;DP=125;Dels=0.00;FS=15.317;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.199;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,75:125:99:1662,0,1023 chrIV 561566 . T C 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.430;DP=164;Dels=0.00;FS=5.100;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.788;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.413;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,80:164:99:1547,0,1875 chrIV 562925 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.269;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1069,0,1048 chrIV 562970 . G T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.712;DP=108;Dels=0.00;FS=6.087;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.71;MQ0=0;MQRankSum=-4.118;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.926;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:108:99:922,0,1303 chrIV 562989 . G C 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.704;DP=123;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQ0=0;MQRankSum=-5.050;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.434;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:755,0,1726 chrIV 563010 . C T 353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.444;DP=123;Dels=0.02;FS=1.498;HaplotypeScore=51.2769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=0;MQRankSum=-6.893;QD=2.87;ReadPosRankSum=-2.347;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:121:99:383,0,1637 chrIV 563017 . A T 511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.764;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=41.0958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.06;MQ0=0;MQRankSum=-5.891;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,36:107:99:541,0,1693 chrIV 563021 . G A 537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;DP=116;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=40.1224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.49;MQ0=0;MQRankSum=-5.276;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.083;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,41:116:99:567,0,1709 chrIV 563080 . C A 625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.422;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,36:86:99:655,0,1174 chrIV 563081 . T C 554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.217;DP=91;Dels=0.00;FS=1.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.564;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:91:99:584,0,1245 chrIV 563188 . A G 683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.611;DP=117;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=5.9019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,40:117:99:713,0,1832 chrIV 563209 . G C 576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;DP=123;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.714;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,40:123:99:606,0,1909 chrIV 563218 . G T 568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.332;DP=110;Dels=0.00;FS=2.930;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,33:110:99:598,0,1786 chrIV 563438 . A G 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.076;DP=163;Dels=0.00;FS=2.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.572;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,84:163:99:1739,0,1792 chrIV 563468 . G A 1932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.901;DP=171;Dels=0.00;FS=5.782;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,90:171:99:1962,0,1654 chrIV 563790 . C T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.719;DP=120;Dels=0.00;FS=3.380;HaplotypeScore=4.7555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.839;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,70:120:99:1503,0,1078 chrIV 564360 . T C 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.188;DP=135;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.926;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:135:99:1554,0,1334 chrIV 564366 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.526;DP=137;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=3.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.225;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1539,0,1382 chrIV 564745 . G A 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.91;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2852,285,0 chrIV 564873 . A G 356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.524;DP=83;Dels=0.00;FS=3.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.320;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:99:386,0,1196 chrIV 564879 . C T 588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.318;DP=83;Dels=0.00;FS=3.599;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.671;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.725;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:618,0,1221 chrIV 565245 . G A 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.277;DP=150;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=8.4879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.503;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:150:99:1690,0,1515 chrIV 565254 . T C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.693;DP=142;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=6.4068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.263;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1413,0,1538 chrIV 565313 . C T 3218.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3251,325,0 chrIV 565317 . T G 1042.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.793;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1072,0,1433 chrIV 565322 . A G 2589 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2622,270,0 chrIV 565468 . A G 1877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.234;DP=143;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.011;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,87:143:99:1907,0,1104 chrIV 565653 . G T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.290;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:1093,0,1438 chrIV 565863 . A G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.322;DP=129;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.026;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1375,0,1383 chrIV 566376 . A G 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.631;DP=129;Dels=0.00;FS=6.829;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,76:129:99:1736,0,1086 chrIV 566726 . G A 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3014,292,0 chrIV 566734 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.035;DP=107;Dels=0.00;FS=3.551;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1208,0,1141 chrIV 566816 . G A 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.606;DP=97;Dels=0.00;FS=5.288;HaplotypeScore=2.4607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.942;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1094,0,1016 chrIV 567068 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.856;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.033;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,67:111:99:1495,0,936 chrIV 567111 . C T 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.967;DP=136;Dels=0.00;FS=4.019;HaplotypeScore=4.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1571,0,1383 chrIV 567155 . C A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.883;DP=133;Dels=0.00;FS=3.388;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.556;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1542,0,1252 chrIV 568017 . C T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.987;DP=124;Dels=0.00;FS=3.323;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1526,0,1185 chrIV 568131 . A G 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3651,381,0 chrIV 568436 . T C 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.365;DP=144;Dels=0.00;FS=2.120;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.714;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.686;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:144:99:1505,0,1631 chrIV 568569 . A G 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.184;DP=166;Dels=0.00;FS=7.802;HaplotypeScore=8.6180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.788;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1549,0,1913 chrIV 568816 . G A 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.17;MQ0=0;QD=28.22;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3641,355,0 chrIV 568863 . G A 3328.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.15;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3328,331,0 chrIV 568871 . G A 3233.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.56;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3268,322,0 chrIV 568873 . C T 1314.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.483;DP=124;Dels=0.00;FS=8.284;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.715;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.103;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1344,0,1224 chrIV 569056 . A G 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;DP=113;Dels=0.00;FS=3.629;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=23.08;ReadPosRankSum=1.334;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2641,261,0 chrIV 569057 . G A 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;DP=115;Dels=0.00;FS=3.705;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.34;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=23.66;ReadPosRankSum=1.341;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2754,270,0 chrIV 569081 . A G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.026;DP=111;Dels=0.00;FS=7.421;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:998,0,1188 chrIV 569606 . T A,G 3553.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=146;Dels=0.00;FS=5.963;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=24.34;ReadPosRankSum=1.020;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,71,74:146:99:3553,1741,1533,1812,0,1611 chrIV 569915 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.859;DP=121;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1301,0,1260 chrIV 570044 . G A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.636;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.027;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1429,0,1378 chrIV 570168 . T C 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.899;DP=139;Dels=0.00;FS=4.023;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1574,0,1555 chrIV 570290 . A T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=122;Dels=0.00;FS=7.012;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.068;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1303,0,1455 chrIV 570369 . A G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.488;DP=138;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=8.53;ReadPosRankSum=-2.619;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1207,0,1702 chrIV 570373 . C T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.196;DP=138;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.955;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1702,0,1236 chrIV 570480 . T A 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;DP=172;Dels=0.00;FS=1.227;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=2.881;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,80:172:99:1791,0,2047 chrIV 570653 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.174;DP=105;Dels=0.00;FS=2.870;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1235,0,1054 chrIV 570745 . A G 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.468;DP=125;Dels=0.00;FS=1.560;HaplotypeScore=3.0818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:125:99:1293,0,1318 chrIV 570926 . A G 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.879;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.228;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1037,0,1516 chrIV 571144 . C A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.963;DP=105;Dels=0.00;FS=11.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.402;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:992,0,1232 chrIV 571473 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.319;DP=133;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.247;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1263,0,1574 chrIV 571718 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.063;DP=109;Dels=0.00;FS=6.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.792;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1174,0,1246 chrIV 571806 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.348;DP=105;Dels=0.00;FS=3.678;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.464;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:888,0,1403 chrIV 572100 . C T 1931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.283;DP=165;Dels=0.00;FS=1.944;HaplotypeScore=2.5130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,89:165:99:1961,0,1513 chrIV 572145 . A G 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;DP=142;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.605;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1762,0,1340 chrIV 572184 . C T 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.473;DP=124;Dels=0.00;FS=11.434;HaplotypeScore=2.5130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1388,0,1232 chrIV 572190 . T C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;DP=131;Dels=0.00;FS=11.053;HaplotypeScore=3.0914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.029;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1437,0,1506 chrIV 572208 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.080;DP=115;Dels=0.00;FS=9.571;HaplotypeScore=2.2282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.266;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1270,0,1227 chrIV 572492 . G A 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.658;DP=134;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.476;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:134:99:1578,0,1375 chrIV 572610 . C T 3835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3835,370,0 chrIV 572797 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.659;DP=128;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=2.4397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=11.01;ReadPosRankSum=2.428;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1439,0,1265 chrIV 572826 . C T 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.689;DP=126;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1658,0,1087 chrIV 572934 . C T 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.821;DP=147;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.525;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1726,0,1491 chrIV 573174 . A G 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.413;DP=129;Dels=0.00;FS=6.866;HaplotypeScore=2.8807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1423,0,1464 chrIV 573177 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.943;DP=130;Dels=0.00;FS=11.634;HaplotypeScore=3.8754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1381,0,1480 chrIV 573595 . G A 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.312;DP=106;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.323;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:976,0,1282 chrIV 573702 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.044;DP=115;Dels=0.00;FS=12.019;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.548;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1178,0,1288 chrIV 573826 . C T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.120;DP=97;Dels=0.00;FS=5.054;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,54:97:99:1151,0,883 chrIV 573896 . G C 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;DP=97;Dels=0.00;FS=1.755;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1009,0,989 chrIV 573928 . A G 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2699,270,0 chrIV 573980 . G A 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.216;DP=109;Dels=0.00;FS=4.807;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:808,0,1409 chrIV 573991 . C T 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.163;DP=102;Dels=0.00;FS=3.746;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,39:102:99:809,0,1402 chrIV 574093 . G A 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;DP=111;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=27.30;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:3063,284,0 chrIV 574753 . T C 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=23.82;SB=-2.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3692,372,0 chrIV 575468 . A C 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3284,333,0 chrIV 575774 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.485;DP=144;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.164;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:144:99:1346,0,1762 chrIV 575873 . A G 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.148;DP=145;Dels=0.00;FS=3.899;HaplotypeScore=6.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=2.761;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1421,0,1731 chrIV 575960 . T G 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.054;DP=159;Dels=0.00;FS=1.237;HaplotypeScore=5.5446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.886;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1432,0,1830 chrIV 576025 . C A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.629;DP=161;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=3.9550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=8.50;ReadPosRankSum=-2.388;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1398,0,1726 chrIV 576258 . C T 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.83;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3125,313,0 chrIV 576298 . A C 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.139;DP=106;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=4.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.262;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:996,0,972 chrIV 576445 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.824;DP=142;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.300;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1473,0,1636 chrIV 576524 . G T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.022;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.068;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,52:129:99:1106,0,1694 chrIV 576577 . G A 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.974;DP=125;Dels=0.00;FS=7.313;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,45:125:99:939,0,1752 chrIV 578168 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.240;DP=113;Dels=0.00;FS=9.608;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1114,0,1383 chrIV 578566 . T A 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=28.25;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2886,289,0 chrIV 578638 . T C 2220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.73;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:2253,231,0 chrIV 578647 . C T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.851;DP=102;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=2.364;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.507;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1014,0,726 chrIV 578649 . T C 2113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.99;MQ0=0;QD=21.13;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2146,216,0 chrIV 578722 . A G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.305;DP=118;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=2.343;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.968;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1409,0,878 chrIV 578728 . A G 2758 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2791,294,0 chrIV 578841 . G A 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3560,343,0 chrIV 578941 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.105;DP=173;Dels=0.00;FS=1.906;HaplotypeScore=2.6461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=7.53;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,73:173:99:1333,0,2327 chrIV 579199 . C A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.351;DP=134;Dels=0.00;FS=8.785;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.259;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1387,0,1607 chrIV 579222 . A T 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.048;DP=139;Dels=0.00;FS=8.187;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=11.64;ReadPosRankSum=-2.623;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1648,0,1566 chrIV 579531 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.020;DP=130;Dels=0.00;FS=2.254;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.603;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1443,0,1438 chrIV 579755 . A G 3410.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3410,351,0 chrIV 579762 . A C 3184 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3217,319,0 chrIV 579764 . G A 1019.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.126;DP=122;Dels=0.00;FS=3.350;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:122:99:1049,0,1361 chrIV 579809 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.621;DP=140;Dels=0.00;FS=8.004;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.101;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1159,0,1701 chrIV 579813 . A G 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6797;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3403,342,0 chrIV 579869 . C T 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3575,352,0 chrIV 579879 . A G 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3570,364,0 chrIV 579940 . G A 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3624,337,0 chrIV 580006 . T C 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3741,376,0 chrIV 580011 . T C 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3650,369,0 chrIV 580119 . G C 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3791,385,0 chrIV 580191 . T C 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3650,370,0 chrIV 580230 . T C 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3464,354,0 chrIV 580374 . C T 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3686,373,0 chrIV 580561 . C T 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.271;DP=81;Dels=0.00;FS=4.336;HaplotypeScore=5.9586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.215;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:1013,0,824 chrIV 580820 . T A 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6421;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3821,364,0 chrIV 580899 . T C 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.29;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2598,273,0 chrIV 580972 . A G 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.91;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3656,367,0 chrIV 581004 . A C 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3527,366,0 chrIV 581058 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;DP=124;Dels=0.00;FS=3.213;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.570;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1394,0,1411 chrIV 581091 . C T 3974.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.901e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3974,403,0 chrIV 581181 . T C 3725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.909e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3725,378,0 chrIV 581218 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.501;DP=125;Dels=0.00;FS=1.431;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.557;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:125:99:1400,0,1356 chrIV 581388 . A G 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2699,285,0 chrIV 581421 . G A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.020;DP=96;Dels=0.00;FS=1.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.750;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,54:96:99:1262,0,843 chrIV 581521 . G A 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3382,325,0 chrIV 581857 . A G 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3682,390,0 chrIV 581897 . A C 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3741,385,0 chrIV 582132 . G T 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3683,361,0 chrIV 582144 . G A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.770;DP=117;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.856;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1474,0,1190 chrIV 582182 . C A 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.581;DP=148;Dels=0.00;FS=7.260;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=10.14;ReadPosRankSum=2.936;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1530,0,1569 chrIV 582217 . G A 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3149,304,0 chrIV 582238 . A T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;DP=120;Dels=0.00;FS=7.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.809;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1392,0,1171 chrIV 582466 . T G 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3069,321,0 chrIV 582525 . T A 606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;DP=86;Dels=0.00;FS=1.771;HaplotypeScore=5.7107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.153;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:86:99:636,0,1065 chrIV 582555 . A G 2316 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2349,240,0 chrIV 582571 . T C 2386 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2419,249,0 chrIV 582739 . A G 2522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2555,261,0 chrIV 583013 . A G 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3299,336,0 chrIV 583094 . T C 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3761,379,0 chrIV 583433 . A G 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3506,357,0 chrIV 583657 . A G 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.181;DP=128;Dels=0.00;FS=4.637;HaplotypeScore=3.7329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1123,0,1799 chrIV 583733 . A G 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3567,363,0 chrIV 583765 . G A 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3386,334,0 chrIV 583767 . A G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3231,336,0 chrIV 583846 . A G 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2797,288,0 chrIV 583925 . G A 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3283,316,0 chrIV 583943 . A G 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3790,379,0 chrIV 584012 . T C 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3689,387,0 chrIV 584144 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.608;DP=92;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:1063,0,1067 chrIV 584270 . T C 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.177;DP=131;Dels=0.00;FS=4.291;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.828;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:996,0,1816 chrIV 584489 . A T 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=26.87;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:98:99:2666,261,0 chrIV 584515 . C T 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=26.50;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2816,274,0 chrIV 584534 . G A 2470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=25.73;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2503,249,0 chrIV 584634 . G A 206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.628;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:236,0,177 chrIV 584913 . G C 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2918,309,0 chrIV 584993 . A T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;DP=127;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=3.8065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1448,0,1335 chrIV 585389 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.732;DP=120;Dels=0.00;FS=5.720;HaplotypeScore=3.7528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.016;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1046,0,1475 chrIV 585467 . A G 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.572;DP=141;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.363;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1317,0,1626 chrIV 585476 . C G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=138;Dels=0.00;FS=5.440;HaplotypeScore=2.6953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.884;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1331,0,1554 chrIV 585554 . A G 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.427;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.962;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1488,0,1502 chrIV 585872 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.691;DP=106;Dels=0.00;FS=6.146;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1112,0,1225 chrIV 586061 . A G 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.367;DP=149;Dels=0.00;FS=4.910;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.175;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1493,0,1670 chrIV 586326 . T G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.116;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.778;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1212,0,1611 chrIV 586361 . T C 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.388;DP=114;Dels=0.00;FS=2.645;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1110,0,1332 chrIV 586700 . A G 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.001;DP=121;Dels=0.00;FS=2.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.279;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1013,0,1590 chrIV 586725 . A G 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.717;DP=98;Dels=0.00;FS=4.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,41:98:99:815,0,1339 chrIV 586742 . C G 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.634;DP=103;Dels=0.00;FS=5.950;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:872,0,1333 chrIV 586820 . T C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.539;DP=134;Dels=0.00;FS=8.845;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.246;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,56:134:99:1129,0,1840 chrIV 586838 . C T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=118;Dels=0.00;FS=4.099;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1082,0,1491 chrIV 587113 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;DP=135;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.055;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1313,0,1551 chrIV 587237 . G A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;DP=121;Dels=0.00;FS=3.353;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:121:99:1189,0,1424 chrIV 587347 . C T 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;DP=132;Dels=0.00;FS=2.220;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.451;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.200;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1524,0,1410 chrIV 588134 . T C 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.926;DP=154;Dels=0.00;FS=11.204;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.380;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1677,0,1742 chrIV 588140 . G A 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.797;DP=146;Dels=0.00;FS=9.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1568,0,1493 chrIV 588182 . A G 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.869;DP=95;Dels=0.00;FS=10.155;HaplotypeScore=4.9341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.724;QD=9.31;ReadPosRankSum=2.209;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:95:99:914,0,1153 chrIV 588263 . T C 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.721;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.321;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.953;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1641,0,1494 chrIV 588300 . C T 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.485;DP=141;Dels=0.00;FS=3.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=11.51;ReadPosRankSum=-2.287;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1653,0,1310 chrIV 588381 . A T 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3457,334,0 chrIV 588386 . A G 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.341;DP=125;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:125:99:1534,0,1131 chrIV 588450 . A G 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;DP=141;Dels=0.00;FS=6.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.423;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:141:99:1637,0,1318 chrIV 588465 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.528;DP=150;Dels=0.00;FS=2.908;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.819;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:1189,0,1913 chrIV 588509 . A G 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3505,340,0 chrIV 588560 . A G 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.730;DP=134;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1508,0,1389 chrIV 588583 . G A 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=139;Dels=0.00;FS=3.577;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=26.63;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3702,338,0 chrIV 588705 . G T 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2855,283,0 chrIV 588711 . G T 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=109;Dels=0.00;FS=4.706;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1087,0,1263 chrIV 589025 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.333;DP=111;Dels=0.00;FS=1.640;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.245;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:111:99:1325,0,1101 chrIV 589061 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.607;DP=107;Dels=0.00;FS=2.085;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1335,0,1010 chrIV 589136 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.900;DP=116;Dels=0.00;FS=3.400;HaplotypeScore=4.6355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1226,0,1359 chrIV 589186 . G A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.780;DP=116;Dels=0.00;FS=6.089;HaplotypeScore=2.6670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1582,0,989 chrIV 589256 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.618;DP=122;Dels=0.00;FS=4.166;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.244;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1187,0,1495 chrIV 589421 . C A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;DP=99;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.290;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1127,0,1075 chrIV 589440 . T C 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3530,360,0 chrIV 589449 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.480;DP=133;Dels=0.00;FS=2.401;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:133:99:1206,0,1576 chrIV 589456 . G C 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;DP=137;Dels=0.00;FS=2.352;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=2.208;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.459;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1601,0,1291 chrIV 589460 . T C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=133;Dels=0.00;FS=3.286;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.991;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1232,0,1739 chrIV 589498 . T C 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.204;DP=123;Dels=0.00;FS=2.376;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=4.129;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.494;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1434,0,1201 chrIV 589510 . A T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.968;DP=118;Dels=0.00;FS=2.421;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.802;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1197,0,1432 chrIV 589546 . T A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=90;Dels=0.00;FS=2.805;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.122;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,51:90:99:1134,0,863 chrIV 589613 . C T 600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.3464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.279;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,37:89:99:630,0,803 chrIV 589643 . T G 1469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=50.8386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.19;MQ0=0;QD=19.33;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1502,159,0 chrIV 589699 . A T 28.10 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;DP=95;Dels=0.00;FS=1.887;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=0.30;ReadPosRankSum=-0.656;SB=-3.701e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,53:95:14:58,0,14 chrIV 589702 . C G 2267 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=23.86;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:2300,237,0 chrIV 589875 . C T 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2999,292,0 chrIV 589956 . G A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.947;DP=129;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=2.9799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:129:99:1565,0,1163 chrIV 590018 . T C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.906;DP=122;Dels=0.00;FS=5.143;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.02;ReadPosRankSum=2.388;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,77:122:99:1619,0,963 chrIV 590019 . A G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.261;DP=111;Dels=0.00;FS=3.319;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.581;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,76:111:99:1618,0,672 chrIV 590058 . A G 2013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.887;DP=155;Dels=0.00;FS=5.521;HaplotypeScore=3.5647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.829;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,92:155:99:2043,0,1311 chrIV 590081 . T C 1822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.994;DP=141;Dels=0.00;FS=2.339;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,85:141:99:1852,0,1234 chrIV 590120 . T G 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.839;DP=112;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=3.2854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=12.33;ReadPosRankSum=1.594;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1411,0,990 chrIV 590175 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.952;DP=113;Dels=0.00;FS=1.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,69:113:99:1426,0,874 chrIV 590328 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3201,336,0 chrIV 590529 . A C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.712;DP=167;Dels=0.00;FS=10.677;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.066;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,73:167:99:1520,0,2064 chrIV 590870 . A G 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3351,342,0 chrIV 590898 . T C 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3297,330,0 chrIV 590927 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.511;DP=139;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.339;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:139:99:1141,0,1830 chrIV 591021 . A G 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3647,381,0 chrIV 591031 . A G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.038;DP=139;Dels=0.00;FS=4.194;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1551,0,1554 chrIV 591092 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.734;DP=139;Dels=0.00;FS=21.954;HaplotypeScore=3.9679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1499,0,1542 chrIV 591104 . C A 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.154;DP=149;Dels=0.00;FS=14.917;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.610;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1739,0,1527 chrIV 591129 . A G 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3779,381,0 chrIV 591187 . A G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.552;DP=141;Dels=0.00;FS=5.032;HaplotypeScore=3.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1593,0,1464 chrIV 591205 . C T 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=28.23;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3614,367,0 chrIV 591255 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.532;DP=134;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,54:134:99:1147,0,1831 chrIV 591382 . G A 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.018;DP=137;Dels=0.00;FS=2.197;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1705,0,1271 chrIV 591500 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.397;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.972;QD=11.75;ReadPosRankSum=-2.348;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1452,0,1131 chrIV 591514 . T A 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.904;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:128:99:1707,0,1188 chrIV 591605 . A T 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.111;DP=122;Dels=0.00;FS=7.353;HaplotypeScore=44.7448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=0.11;ReadPosRankSum=-3.971;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:43:43,0,1752 chrIV 591737 . T C 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=22.83;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2704,279,0 chrIV 591926 . A C 4442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4442,465,0 chrIV 591986 . A G 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.604;DP=152;Dels=0.00;FS=4.918;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.112;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1601,0,1561 chrIV 592009 . G A 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.928;DP=177;Dels=0.00;FS=8.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.673;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,83:177:99:1786,0,1815 chrIV 592050 . T C 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3753,378,0 chrIV 592072 . T C 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3695,387,0 chrIV 592090 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.476;DP=156;Dels=0.00;FS=11.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.477;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:1356,0,1908 chrIV 592124 . G A 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.225;DP=130;Dels=0.00;FS=8.300;HaplotypeScore=5.3131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.256;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:130:99:1647,0,1213 chrIV 592160 . G A 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.660;DP=138;Dels=0.00;FS=5.936;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.007;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1779,0,1248 chrIV 592179 . A G 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.796;DP=156;Dels=0.00;FS=2.208;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=10.60;ReadPosRankSum=-2.037;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,89:156:99:1683,0,1396 chrIV 592191 . C T 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.687;DP=174;Dels=0.00;FS=0.568;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=9.21;ReadPosRankSum=2.069;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,77:174:99:1632,0,2125 chrIV 592224 . A G 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3995,402,0 chrIV 592368 . C G 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.634;DP=159;Dels=0.00;FS=6.949;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.438;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,78:159:99:1648,0,1737 chrIV 592380 . G T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;DP=139;Dels=0.00;FS=4.617;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.011;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1458,0,1500 chrIV 592385 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.194;DP=136;Dels=0.00;FS=3.430;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.406;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1451,0,1451 chrIV 592479 . C T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.433;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:905,0,923 chrIV 592486 . C A 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.133;DP=78;Dels=0.00;FS=1.832;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.865;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:811,0,782 chrIV 592490 . A G 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.661;DP=75;Dels=0.00;FS=0.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.07;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.175;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:796,0,793 chrIV 592535 . G A 79.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.652;DP=101;Dels=0.00;FS=39.627;HaplotypeScore=33.5887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.95;MQ0=0;MQRankSum=3.285;QD=0.78;ReadPosRankSum=-5.612;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,20:101:99:109,0,1756 chrIV 592536 . C T 79.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;DP=102;Dels=0.00;FS=1.061;HaplotypeScore=50.9859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=0.77;ReadPosRankSum=-4.495;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,16:102:99:109,0,1816 chrIV 592541 . G A 206.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;DP=108;Dels=0.00;FS=0.984;HaplotypeScore=154.2824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.44;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=1.91;ReadPosRankSum=-3.880;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,20:108:99:236,0,1541 chrIV 592609 . G A 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.475;DP=130;Dels=0.00;FS=14.409;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.45;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.349;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1384,0,1271 chrIV 592618 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.705;DP=131;Dels=0.00;FS=7.827;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1534,0,1211 chrIV 592795 . C A 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.468;DP=165;Dels=0.00;FS=1.213;HaplotypeScore=5.4153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,83:165:99:1753,0,1788 chrIV 593008 . T A 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.042;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1024,0,1366 chrIV 593018 . T C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.609;DP=119;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1161,0,1014 chrIV 593022 . G A 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.367;DP=126;Dels=0.00;FS=2.283;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.494;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1022,0,1285 chrIV 593084 . A G 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.736;DP=151;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.904;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,86:151:99:1830,0,1407 chrIV 593085 . A G 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.079;DP=151;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.035;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,86:151:99:1865,0,1410 chrIV 593192 . T C 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.915;DP=160;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1559,0,1892 chrIV 593211 . A C 4515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.25;SB=-2.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4515,448,0 chrIV 593254 . T A 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=65.7226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3438,334,0 chrIV 593313 . G A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.808;DP=121;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.409;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1517,0,1114 chrIV 593316 . A G 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3138,324,0 chrIV 593463 . A G 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3673,384,0 chrIV 593517 . T G 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3785,370,0 chrIV 593642 . T C 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3647,370,0 chrIV 593721 . A G 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.888;DP=143;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.346;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1590,0,1469 chrIV 593751 . C T 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3867,373,0 chrIV 593816 . T A 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3700,370,0 chrIV 593881 . T C 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.111;DP=144;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=3.6836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.744;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1471,0,1671 chrIV 594013 . A T 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.557;DP=156;Dels=0.00;FS=5.103;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.907;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1742,0,1655 chrIV 594035 . T A 4169.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6488;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:164:99:4169,418,0 chrIV 594137 . G A 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.827;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.179;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,82:168:99:1669,0,1946 chrIV 594249 . G C 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.071;DP=152;Dels=0.00;FS=5.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1426,0,1784 chrIV 594326 . G A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.659;DP=130;Dels=0.00;FS=4.252;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.357;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1459,0,1337 chrIV 595029 . A G 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9177;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2940,300,0 chrIV 595059 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.431;DP=120;Dels=0.00;FS=6.999;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.718;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1615,0,1022 chrIV 595292 . T C 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.409;DP=156;Dels=0.00;FS=5.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.690;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1701,0,1778 chrIV 595528 . A G 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3362,336,0 chrIV 595641 . C T 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.510;DP=138;Dels=0.00;FS=4.053;HaplotypeScore=2.5683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.283;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1700,0,1341 chrIV 596055 . T C 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=1;QD=25.13;SB=-1.858e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3569,363,0 chrIV 596097 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.575;DP=128;Dels=0.00;FS=4.346;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.954;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1203,0,1537 chrIV 596391 . A G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.970;DP=141;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=9.9228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.836;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:141:99:1675,0,1376 chrIV 596624 . C T 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.085;DP=167;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.155;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1720,0,1779 chrIV 596731 . T G 3888.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3888,385,0 chrIV 596770 . C T 4146.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4146,394,0 chrIV 596817 . T C 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.84;MQ0=1;QD=27.11;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3470,363,0 chrIV 596843 . A T 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.579;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=1;MQRankSum=2.047;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1570,0,1194 chrIV 596913 . G A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.176;DP=112;Dels=0.00;FS=4.827;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=10.16;ReadPosRankSum=2.209;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1168,0,1258 chrIV 596914 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.234;DP=112;Dels=0.00;FS=4.827;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=9.63;ReadPosRankSum=2.413;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1109,0,1323 chrIV 597058 . C T 193.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=79.1296;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.62;MQ0=0;QD=1.97;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:24:226,24,0 chrIV 597096 . C T 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=148.8536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3088,313,0 chrIV 597114 . T C 2413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.27;MQ0=0;QD=22.76;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2446,267,0 chrIV 597115 . A T 572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.593;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.27;MQ0=0;MQRankSum=-5.649;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:602,0,1435 chrIV 597218 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.591;DP=120;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.950;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1164,0,1398 chrIV 597245 . G A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.189;DP=139;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.521;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1524,0,1457 chrIV 597383 . C T 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.571;DP=147;Dels=0.01;FS=5.509;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=1;MQRankSum=0.837;QD=12.06;ReadPosRankSum=2.764;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1803,0,1443 chrIV 597485 . C T 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.598;DP=130;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1570,0,1286 chrIV 597488 . T C 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.255;DP=131;Dels=0.00;FS=2.212;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.372;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1540,0,1348 chrIV 597668 . T C 3762.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3762,396,0 chrIV 597689 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.146;DP=152;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=6.4342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=2.303;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:152:99:1468,0,1809 chrIV 597800 . T C 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3632,363,0 chrIV 597833 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.229;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.820;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1341,0,1200 chrIV 598134 . A T 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.11;MQ0=0;QD=27.15;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2775,279,0 chrIV 598184 . T G 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.11;MQ0=0;QD=25.85;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2566,276,0 chrIV 598232 . C T 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=102;Dels=0.00;FS=3.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=1;MQRankSum=-1.526;QD=28.19;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2908,289,0 chrIV 598369 . A G 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2913,285,0 chrIV 598426 . A C 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2470,258,0 chrIV 598569 . G A 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3495,337,0 chrIV 598655 . G A 2430 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2463,240,0 chrIV 598656 . C T 2381 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=22.68;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2414,240,0 chrIV 598729 . C T 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=28.40;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3323,331,0 chrIV 598737 . A G 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.565;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1083,0,1071 chrIV 598956 . A G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.297;DP=119;Dels=0.00;FS=2.341;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.982;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1188,0,1384 chrIV 599013 . G A 738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.166;DP=87;Dels=0.00;FS=0.806;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,36:87:99:768,0,1112 chrIV 599029 . G C 2191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.08;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2224,231,0 chrIV 599091 . C T 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.563;DP=108;Dels=0.00;FS=1.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=1.158;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.540;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1414,0,954 chrIV 599181 . C T 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3167,307,0 chrIV 599229 . T C 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.793;DP=105;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:971,0,1321 chrIV 599314 . T C 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2932,303,0 chrIV 599370 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.464;DP=115;Dels=0.00;FS=2.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1248,0,1280 chrIV 599388 . G A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;DP=131;Dels=0.00;FS=3.151;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=9.97;ReadPosRankSum=2.033;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1336,0,1510 chrIV 599393 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.943;DP=136;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=10.43;ReadPosRankSum=-2.117;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1448,0,1440 chrIV 599409 . T C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.281;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1372,0,1371 chrIV 599571 . A G 1289.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.061;DP=125;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1319,0,1314 chrIV 599573 . C A 1019.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.183;DP=122;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1049,0,1222 chrIV 599574 . A T 1063.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;DP=123;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.286;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1093,0,1298 chrIV 599654 . G A 2557 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2590,255,0 chrIV 599733 . A G 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.897;DP=91;Dels=0.00;FS=6.733;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.819;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:875,0,1108 chrIV 599820 . G A 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.64;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3621,349,0 chrIV 599964 . C G 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3119,309,0 chrIV 600005 . A G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.977;DP=106;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1072,0,1201 chrIV 600037 . T C 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2835,279,0 chrIV 600120 . T C 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.00;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2983,303,0 chrIV 600127 . T A 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.04;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2683,262,0 chrIV 600177 . C T 2317 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.94;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2350,228,0 chrIV 600312 . G T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.816;DP=122;Dels=0.00;FS=2.391;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1386,0,1151 chrIV 600466 . T C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.458;DP=88;Dels=0.00;FS=10.244;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1101,0,845 chrIV 600473 . G A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;DP=91;Dels=0.00;FS=20.120;HaplotypeScore=75.6915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.044;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1122,0,834 chrIV 600479 . G A 2477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=87.6168;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2510,240,0 chrIV 600632 . A G 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3123,307,0 chrIV 600705 . C T 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.355;DP=146;Dels=0.00;FS=1.609;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=2.103;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1711,0,1603 chrIV 600722 . T C 4116.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4116,397,0 chrIV 600764 . G A 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2896,277,0 chrIV 600792 . G T 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;DP=106;Dels=0.00;FS=9.279;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:1039,0,1230 chrIV 600858 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.017;DP=105;Dels=0.00;FS=4.873;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=11.96;ReadPosRankSum=2.716;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1286,0,996 chrIV 600978 . A T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;DP=124;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=3.7418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.894;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:124:99:1347,0,1413 chrIV 601035 . T A 81.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.263;DP=69;Dels=0.00;FS=10.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.05;MQ0=0;MQRankSum=-3.350;QD=1.17;ReadPosRankSum=-4.266;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:111,0,997 chrIV 601038 . T A 154.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;DP=67;Dels=0.00;FS=13.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.816;QD=2.30;ReadPosRankSum=-3.413;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:184,0,920 chrIV 601041 . A G 163.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.896;DP=64;Dels=0.00;FS=20.334;HaplotypeScore=13.9086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.700;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.873;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:193,0,809 chrIV 601074 . C T 79.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.062;DP=96;Dels=0.00;FS=5.422;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=0.82;ReadPosRankSum=-2.342;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:109,0,1441 chrIV 601251 . T A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.013;DP=154;Dels=0.00;FS=5.459;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1488,0,1845 chrIV 601302 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.075;DP=152;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1368,0,1828 chrIV 601371 . C T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.878;DP=156;Dels=0.00;FS=2.889;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1538,0,1589 chrIV 601422 . A G 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.111;DP=146;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.049;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1556,0,1430 chrIV 601524 . C T 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.098;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=1;MQRankSum=-0.504;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.144;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,46:134:99:838,0,1854 chrIV 601644 . T C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.233;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.447;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1355,0,1537 chrIV 601683 . C T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=127;Dels=0.00;FS=11.138;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.263;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1303,0,1358 chrIV 601708 . T C 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.558;DP=125;Dels=0.00;FS=16.953;HaplotypeScore=3.9627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.828;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1379,0,1283 chrIV 602033 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.430;DP=133;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.869;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1220,0,1637 chrIV 602153 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.438;DP=153;Dels=0.00;FS=3.813;HaplotypeScore=3.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,66:153:99:1320,0,1958 chrIV 602488 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.603;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.828;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1452,0,1479 chrIV 602876 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.768;DP=110;Dels=0.00;FS=2.558;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1234,0,1161 chrIV 603005 . G A 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.053;DP=98;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=2.7255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.868;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:904,0,1160 chrIV 603579 . T A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1361,0,1377 chrIV 603587 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=3.7305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.816;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:120:99:1287,0,1235 chrIV 603685 . T C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.233;DP=130;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.260;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1350,0,1496 chrIV 603743 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.372;DP=103;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=2.5193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.346;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,61:103:99:1343,0,950 chrIV 603991 . C A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.883;DP=146;Dels=0.00;FS=13.540;HaplotypeScore=8.7730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.560;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.364;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1232,0,1717 chrIV 604105 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.095;DP=124;Dels=0.00;FS=3.284;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.485;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1237,0,1344 chrIV 604397 . A G 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.214;DP=110;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1141,0,1278 chrIV 604439 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.375;DP=109;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.726;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.156;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1317,0,1090 chrIV 604670 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.342;DP=129;Dels=0.00;FS=2.249;HaplotypeScore=3.7164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.092;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1462,0,1279 chrIV 604674 . C T 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.301;DP=144;Dels=0.00;FS=6.159;HaplotypeScore=7.6840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.043;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1850,0,1229 chrIV 604841 . T C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.543;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1520,0,1952 chrIV 605187 . A G 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.701;DP=124;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.834;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,76:124:99:1694,0,940 chrIV 605254 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.595;DP=112;Dels=0.00;FS=1.672;HaplotypeScore=2.9097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1333,0,1135 chrIV 605312 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.260;DP=87;Dels=0.00;FS=3.052;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=11.91;ReadPosRankSum=3.095;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:87:99:1066,0,849 chrIV 605381 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.366;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1125,0,992 chrIV 605558 . T C 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.663;DP=127;Dels=0.00;FS=12.978;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.259;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1483,0,1239 chrIV 605615 . G C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.042;DP=131;Dels=0.00;FS=6.800;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.849;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1403,0,1470 chrIV 605641 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.973;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1324,0,1561 chrIV 605972 . G A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.869;DP=127;Dels=0.00;FS=9.890;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1406,0,1337 chrIV 605973 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.523;DP=128;Dels=0.00;FS=9.747;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1368,0,1382 chrIV 606300 . A T 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;DP=80;Dels=0.00;FS=0.877;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.650;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:885,0,960 chrIV 606458 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.269;DP=118;Dels=0.00;FS=9.335;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.396;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:118:99:1176,0,1345 chrIV 606896 . T C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.729;DP=115;Dels=0.00;FS=4.498;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.994;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1342,0,1074 chrIV 606952 . T G 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.806;DP=132;Dels=0.00;FS=6.322;HaplotypeScore=3.3519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.183;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1525,0,1320 chrIV 607060 . G A 72.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.037;DP=160;Dels=0.03;FS=137.742;HaplotypeScore=270.6123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=0.45;ReadPosRankSum=-7.097;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,47:156:99:102,0,176 chrIV 607313 . G A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.130;DP=90;Dels=0.00;FS=4.644;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.391;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:978,0,931 chrIV 607474 . C T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.256;DP=90;Dels=0.00;FS=12.169;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=11.67;ReadPosRankSum=-1.400;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:1080,0,968 chrIV 607916 . C T 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;DP=100;Dels=0.00;FS=2.745;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:984,0,1181 chrIV 607973 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.519;DP=95;Dels=0.00;FS=0.789;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.519;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:95:99:1166,0,887 chrIV 608233 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.808;DP=115;Dels=0.00;FS=10.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.014;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1312,0,1233 chrIV 608333 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.911;DP=102;Dels=0.00;FS=0.928;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.546;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,61:102:99:1406,0,851 chrIV 608354 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.511;DP=98;Dels=0.00;FS=3.168;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.755;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,60:98:99:1458,0,741 chrIV 608390 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.307;DP=86;Dels=0.00;FS=1.769;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.556;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,50:86:99:1173,0,820 chrIV 608495 . A G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;DP=98;Dels=0.00;FS=1.669;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.283;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1055,0,1010 chrIV 608624 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.982;DP=96;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.188;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:918,0,1220 chrIV 608921 . G A 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;DP=133;Dels=0.00;FS=2.264;HaplotypeScore=6.9338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:133:99:1693,0,1167 chrIV 609152 . T A 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.183;DP=145;Dels=0.00;FS=1.359;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1647,0,1548 chrIV 609926 . T C 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.914;DP=90;Dels=0.00;FS=6.993;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.494;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:1027,0,909 chrIV 609953 . T G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.519;DP=111;Dels=0.00;FS=4.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1163,0,1198 chrIV 610214 . T G 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.723;DP=101;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=3.7360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=1;MQRankSum=1.748;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.629;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:797,0,1288 chrIV 610966 . A G 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.373;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1689,0,1424 chrIV 611056 . A G 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.513;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2821,268,0 chrIV 611095 . A T 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2602,253,0 chrIV 611157 . A G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.26;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3263,330,0 chrIV 611625 . A G 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3958,399,0 chrIV 611859 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.831;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=10.56;ReadPosRankSum=2.132;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1139,0,1217 chrIV 611871 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.742;DP=113;Dels=0.00;FS=1.550;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.571;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1206,0,1264 chrIV 611969 . G C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.141;DP=143;Dels=0.00;FS=4.337;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.468;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1241,0,1631 chrIV 612020 . A G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.870;DP=113;Dels=0.00;FS=1.559;HaplotypeScore=2.8858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:113:99:1020,0,1435 chrIV 612078 . C T 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.607;DP=114;Dels=0.00;FS=2.899;HaplotypeScore=2.9513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.209;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:1015,0,1496 chrIV 612171 . T G 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.706;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,52:133:99:898,0,1542 chrIV 612253 . C G 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.771;DP=99;Dels=0.00;FS=1.640;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.349;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:884,0,1253 chrIV 612294 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.505;DP=115;Dels=0.01;FS=1.527;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.278;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1341,0,1111 chrIV 612323 . G A 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.768;DP=117;Dels=0.00;FS=3.378;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.904;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1384,0,1083 chrIV 612358 . A C 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.191;DP=132;Dels=0.00;FS=10.816;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1418,0,1367 chrIV 612573 . G A 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3280,322,0 chrIV 612828 . G T 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.801;DP=135;Dels=0.00;FS=0.865;HaplotypeScore=5.3659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1496,0,1466 chrIV 613325 . T C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.236;DP=128;Dels=0.02;FS=4.354;HaplotypeScore=24.4046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.220;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1402,0,1333 chrIV 613362 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.556;DP=102;Dels=0.00;FS=3.599;HaplotypeScore=3.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1121,0,1129 chrIV 613386 . T G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.139;DP=116;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.343;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:1002,0,1596 chrIV 613520 . T C 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.914;DP=129;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.650;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1432,0,1276 chrIV 613630 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.946;DP=120;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=1;MQRankSum=0.077;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.969;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1328,0,1257 chrIV 613738 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.465;DP=131;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.202;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1217,0,1512 chrIV 613744 . A G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.024;DP=128;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1094,0,1517 chrIV 613810 . T C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.324;DP=106;Dels=0.00;FS=4.848;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.549;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1011,0,1257 chrIV 613813 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.862;DP=106;Dels=0.00;FS=4.824;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.035;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:106:99:1135,0,1189 chrIV 613864 . G A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.616;DP=131;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.210;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1497,0,1350 chrIV 613945 . T A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.259;DP=106;Dels=0.00;FS=7.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.212;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1085,0,1245 chrIV 613999 . G A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.608;DP=116;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=2.6492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.094;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1225,0,1269 chrIV 614005 . G C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;DP=118;Dels=0.00;FS=3.447;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1206,0,1239 chrIV 614045 . G T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.844;DP=103;Dels=0.00;FS=4.986;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.737;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:911,0,1259 chrIV 614064 . T C 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.781;DP=102;Dels=0.00;FS=3.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.573;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:866,0,1304 chrIV 614065 . T C 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.972;DP=103;Dels=0.00;FS=2.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:867,0,1279 chrIV 614093 . T C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;DP=109;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=4.7994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.186;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1067,0,1389 chrIV 614186 . G A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.614;DP=115;Dels=0.00;FS=12.420;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1086,0,1459 chrIV 614205 . G T 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.361;DP=107;Dels=0.00;FS=9.378;HaplotypeScore=3.8212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.828;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:1001,0,1382 chrIV 614223 . G T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.529;DP=115;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=3.7741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:1067,0,1502 chrIV 614280 . T C 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.327;DP=123;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=4.8370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.784;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:1502,0,1067 chrIV 614321 . C T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.834;DP=151;Dels=0.00;FS=7.271;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=9.60;ReadPosRankSum=2.721;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1479,0,1846 chrIV 614483 . G A 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.969;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.591;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:1078,0,848 chrIV 614504 . T C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.741;DP=84;Dels=0.00;FS=4.257;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.577;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,46:84:99:1015,0,861 chrIV 614534 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.955;DP=100;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.097;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1107,0,1053 chrIV 614618 . C T 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;DP=104;Dels=0.00;FS=2.869;HaplotypeScore=4.3082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:1016,0,1222 chrIV 614729 . A G 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.787;DP=90;Dels=0.00;FS=1.716;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.590;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.755;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:849,0,1071 chrIV 614789 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.126;DP=119;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1236,0,1289 chrIV 614940 . A G 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.681;DP=89;Dels=0.00;FS=1.776;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:813,0,1082 chrIV 615060 . T C 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.647;DP=136;Dels=0.00;FS=2.352;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,55:136:99:1115,0,1907 chrIV 615092 . A G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.058;DP=141;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.437;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1338,0,1762 chrIV 615095 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.750;DP=142;Dels=0.00;FS=2.184;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.826;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1322,0,1757 chrIV 615103 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.733;DP=127;Dels=0.00;FS=5.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.406;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1232,0,1550 chrIV 615114 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.646;DP=127;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=9.12;ReadPosRankSum=2.122;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:127:99:1188,0,1569 chrIV 615161 . T A 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;DP=130;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1193,0,1671 chrIV 615243 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.689;DP=112;Dels=0.00;FS=3.548;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.009;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1047,0,1380 chrIV 615258 . T C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.833;DP=100;Dels=0.00;FS=1.785;HaplotypeScore=4.0326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.935;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1029,0,1206 chrIV 615413 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.866;DP=102;Dels=0.00;FS=5.043;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:918,0,1199 chrIV 615437 . C T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;DP=131;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=4.7378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1454,0,1287 chrIV 615449 . A T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;DP=135;Dels=0.00;FS=5.245;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=9.70;ReadPosRankSum=2.652;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1340,0,1547 chrIV 615581 . C T 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.036;DP=159;Dels=0.00;FS=6.008;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1792,0,1660 chrIV 615641 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.699;DP=150;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.944;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:1383,0,1855 chrIV 615694 . G T 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.887;DP=127;Dels=0.00;FS=1.543;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.127;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,49:127:99:954,0,1685 chrIV 615735 . C G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;DP=139;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1298,0,1590 chrIV 615758 . T C 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.304;DP=163;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.130;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,73:163:99:1480,0,2015 chrIV 615816 . C T 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3558,352,0 chrIV 615959 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.697;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.184;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,67:157:99:1305,0,2027 chrIV 615973 . C T 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.037;DP=137;Dels=0.00;FS=1.366;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.316;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.105;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1296,0,1634 chrIV 615975 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.356;DP=149;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.778;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1332,0,1835 chrIV 616169 . G A 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.742;DP=158;Dels=0.00;FS=3.706;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.453;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:158:99:1935,0,1432 chrIV 616214 . C T 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.411;DP=154;Dels=0.00;FS=2.032;HaplotypeScore=2.9011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.329;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1823,0,1478 chrIV 616411 . A C 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.598;DP=108;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=97.6087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:861,0,1524 chrIV 616559 . G A 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3119,307,0 chrIV 616624 . G T 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3427,340,0 chrIV 617681 . G A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.082;DP=115;Dels=0.00;FS=4.739;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1252,0,1125 chrIV 617842 . C T 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.263;DP=158;Dels=0.00;FS=1.260;HaplotypeScore=2.9625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.610;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1557,0,1659 chrIV 618121 . C T 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.721;DP=158;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=2.9441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.514;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1935,0,1414 chrIV 618461 . C T 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.585;DP=150;Dels=0.00;FS=5.999;HaplotypeScore=6.6403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=12.13;ReadPosRankSum=2.080;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,84:150:99:1850,0,1300 chrIV 619185 . T G 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3690,373,0 chrIV 619315 . T C 1864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.806;DP=157;Dels=0.00;FS=7.220;HaplotypeScore=4.5656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.004;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,89:157:99:1894,0,1497 chrIV 619433 . G A 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.300;DP=175;Dels=0.00;FS=0.570;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=9.66;ReadPosRankSum=2.213;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,88:175:99:1721,0,1789 chrIV 619442 . T C 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=173;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.934;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,90:172:99:1634,0,1803 chrIV 619456 . C T 1780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.820;DP=175;Dels=0.00;FS=3.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,95:175:99:1810,0,1707 chrIV 619470 . T C 1789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.990;DP=158;Dels=0.00;FS=2.007;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.314;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,88:158:99:1819,0,1601 chrIV 619532 . T C 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.039;DP=141;Dels=0.00;FS=2.382;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.478;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1480,0,1600 chrIV 619600 . T G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.357;DP=156;Dels=0.00;FS=3.815;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,64:156:99:1067,0,2163 chrIV 619621 . C T 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3635,355,0 chrIV 619697 . G A 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.507;DP=174;Dels=0.00;FS=5.707;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.452;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,74:174:99:1580,0,2082 chrIV 619698 . C T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.202;DP=174;Dels=0.00;FS=5.707;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.349;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,74:174:99:1593,0,2085 chrIV 619787 . C G 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,63:147:99:1124,0,1859 chrIV 619809 . G A 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.412;DP=107;Dels=0.00;FS=4.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.209;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1283,0,1029 chrIV 619843 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.089;DP=114;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1401,0,1106 chrIV 619883 . A G 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;DP=100;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.613;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1056,0,1027 chrIV 619900 . C T 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;DP=91;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.131;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:1015,0,957 chrIV 619930 . G A 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.745;DP=82;Dels=0.00;FS=1.832;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.922;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.569;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:824,0,836 chrIV 619942 . A T 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;DP=89;Dels=0.00;FS=4.099;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:981,0,891 chrIV 619943 . A C 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.924;DP=89;Dels=0.00;FS=4.099;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:959,0,899 chrIV 620056 . G A 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.601;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:959,0,1043 chrIV 620061 . T A 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:928,0,1347 chrIV 620075 . T G 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.450;DP=106;Dels=0.00;FS=2.804;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:893,0,1389 chrIV 620079 . G A 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;DP=104;Dels=0.00;FS=9.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:862,0,1336 chrIV 620090 . T C 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;DP=90;Dels=0.00;FS=13.058;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=2.264;QD=12.53;ReadPosRankSum=1.099;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,51:90:99:1158,0,724 chrIV 620108 . T C 2472 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2505,261,0 chrIV 620254 . G A 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.959;DP=126;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=2.4495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.518;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,76:126:99:1792,0,1011 chrIV 620359 . A G 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.615;DP=132;Dels=0.00;FS=2.233;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=8.46;ReadPosRankSum=2.922;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:132:99:1147,0,1630 chrIV 620379 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.052;DP=133;Dels=0.00;FS=4.172;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.409;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1158,0,1638 chrIV 620546 . C T 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.002;DP=126;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1215,0,1494 chrIV 620822 . T A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;DP=128;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1174,0,1664 chrIV 620832 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.176;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.132;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1185,0,1582 chrIV 620943 . G C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1109,0,1018 chrIV 620963 . A G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.127;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1098,0,1094 chrIV 621009 . T C 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.250;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.513;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:844,0,1357 chrIV 621343 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.556;DP=127;Dels=0.00;FS=5.390;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=-1.335;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.725;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1430,0,1320 chrIV 621542 . G A 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.721;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.144;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:990,0,1358 chrIV 621550 . G A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.116;DP=109;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.307;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1083,0,1197 chrIV 621579 . T C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.921;DP=144;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=2.6279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1482,0,1604 chrIV 621781 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.151;DP=125;Dels=0.00;FS=2.399;HaplotypeScore=2.6653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1518,0,1069 chrIV 621798 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.738;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1350,0,1110 chrIV 621887 . A G 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.377;DP=126;Dels=0.00;FS=17.710;HaplotypeScore=85.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=0.15;ReadPosRankSum=-3.461;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,7:126:49:49,0,575 chrIV 621980 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.231;DP=117;Dels=0.00;FS=5.166;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1151,0,1358 chrIV 622375 . T C 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.566;DP=94;Dels=0.00;FS=9.956;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.253;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:966,0,1031 chrIV 622651 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.295;DP=126;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=-0.329;QD=9.38;ReadPosRankSum=-2.019;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1212,0,1534 chrIV 622741 . G A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1278,0,1362 chrIV 622798 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.739;DP=114;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1263,0,1271 chrIV 622891 . C T 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.760;DP=136;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=2.6318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=11.99;ReadPosRankSum=-2.584;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1660,0,1184 chrIV 622923 . T G 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;DP=132;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=5.9437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.552;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1175,0,1638 chrIV 622941 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.278;DP=128;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=5.0313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.126;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1138,0,1561 chrIV 622991 . A G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.011;DP=121;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=5.1124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.180;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,45:121:99:890,0,1745 chrIV 623053 . T C 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;DP=145;Dels=0.00;FS=5.002;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.856;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1620,0,1586 chrIV 623197 . T C 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.799;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:1717,0,1777 chrIV 623422 . C G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;DP=125;Dels=0.00;FS=4.375;HaplotypeScore=2.7995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.763;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1061,0,1515 chrIV 623653 . G A 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.501;DP=146;Dels=0.00;FS=4.916;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1697,0,1495 chrIV 623798 . T C 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.245;DP=122;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=3.5836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:122:99:1590,0,1103 chrIV 623886 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.605;DP=123;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.307;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1206,0,1402 chrIV 623966 . C A 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.475;DP=135;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=26.85;ReadPosRankSum=1.424;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3625,330,0 chrIV 624036 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.254;DP=137;Dels=0.00;FS=5.257;HaplotypeScore=3.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.528;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1469,0,1518 chrIV 624319 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.076;DP=134;Dels=0.00;FS=2.272;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.535;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1264,0,1659 chrIV 624397 . C T 1898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.971;DP=147;Dels=0.00;FS=4.984;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.071;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,82:147:99:1928,0,1325 chrIV 624521 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.011;DP=137;Dels=0.00;FS=2.193;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1495,0,1494 chrIV 624547 . C T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;DP=114;Dels=0.00;FS=7.125;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.000;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.792;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1382,0,1156 chrIV 624565 . T A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.411;DP=128;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1487,0,1412 chrIV 624583 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;DP=116;Dels=0.00;FS=3.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.760;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1322,0,1258 chrIV 624733 . G T 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3876,388,0 chrIV 624782 . G C 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.829;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.577;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,45:121:99:884,0,1753 chrIV 624847 . G C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;DP=148;Dels=0.00;FS=6.126;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=8.28;ReadPosRankSum=3.570;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:148:99:1255,0,1820 chrIV 624920 . T G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.063;DP=168;Dels=0.00;FS=7.649;HaplotypeScore=70.1695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.915;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.414;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,74:168:99:1248,0,2129 chrIV 624930 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.257;DP=174;Dels=0.00;FS=7.222;HaplotypeScore=72.1123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.648;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,77:174:99:1301,0,2154 chrIV 624969 . T G 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3095,324,0 chrIV 625030 . G A 1937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.911;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.320;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,89:162:99:1967,0,1513 chrIV 625043 . T A 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.860;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,85:152:99:1935,0,1411 chrIV 625056 . C T 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.174;DP=167;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=4.8130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,73:167:99:1583,0,2018 chrIV 625164 . T C 2184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.572;DP=185;Dels=0.00;FS=1.873;HaplotypeScore=2.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.063;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,107:185:99:2214,0,1610 chrIV 625173 . A G 4190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4190,418,0 chrIV 625219 . A G 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.101;DP=126;Dels=0.00;FS=10.345;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.681;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,78:126:99:1653,0,1026 chrIV 625250 . C T 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3206,316,0 chrIV 625283 . T C 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.554;DP=94;Dels=0.00;FS=0.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.387;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:927,0,1140 chrIV 625468 . T C 1812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.352;DP=163;Dels=0.00;FS=3.156;HaplotypeScore=2.6077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.720;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.531;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,84:163:99:1842,0,1764 chrIV 625525 . A G 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.046;DP=145;Dels=0.00;FS=2.272;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.968;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1572,0,1553 chrIV 625639 . C T 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.583;DP=146;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=2.6457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.928;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:146:99:1823,0,1122 chrIV 625681 . C T 1940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.330;DP=147;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.458;QD=13.20;ReadPosRankSum=3.165;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:147:99:1970,0,1024 chrIV 625729 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;DP=138;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=4.0447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=9.38;ReadPosRankSum=2.146;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1325,0,1574 chrIV 625756 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.817;DP=116;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:116:99:1068,0,1315 chrIV 625778 . A G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.636;DP=124;Dels=0.00;FS=6.862;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.164;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.707;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:124:99:934,0,1679 chrIV 625832 . T A 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.894;DP=124;Dels=0.00;FS=2.387;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1506,0,1309 chrIV 625867 . G A 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.666;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=11.08;ReadPosRankSum=1.382;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1515,0,1494 chrIV 626028 . T C 1293.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.551;DP=137;Dels=0.00;FS=9.092;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1323,0,1469 chrIV 626035 . A G 968.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.954;DP=121;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.95;MQ0=0;MQRankSum=-3.740;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.685;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:998,0,1470 chrIV 626036 . T C 953.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.609;DP=119;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.858;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.841;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:983,0,1507 chrIV 626057 . G C 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;DP=143;Dels=0.00;FS=10.994;HaplotypeScore=2.4805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=4.291;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,84:143:99:1778,0,1032 chrIV 626103 . G C 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.629;DP=161;Dels=0.00;FS=27.115;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.195;QD=6.65;ReadPosRankSum=-2.527;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,65:161:99:1100,0,2076 chrIV 626127 . C T 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.822;DP=145;Dels=0.00;FS=27.261;HaplotypeScore=48.9809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,55:145:99:975,0,1957 chrIV 626150 . C A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.151;DP=138;Dels=0.00;FS=12.296;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.873;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:138:99:1198,0,1826 chrIV 626244 . G A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.698;DP=136;Dels=0.00;FS=6.403;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.018;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1391,0,1518 chrIV 626394 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.384;DP=133;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1430,0,1391 chrIV 626706 . G A 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.331;DP=94;Dels=0.00;FS=8.490;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:986,0,1083 chrIV 627107 . G A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.903;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.929;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1393,0,1417 chrIV 627332 . A G 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.167;DP=93;Dels=0.00;FS=1.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.204;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:810,0,1147 chrIV 627941 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.553;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.849;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:133:99:1163,0,1451 chrIV 628076 . T C 1766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.747;DP=147;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,82:147:99:1796,0,1488 chrIV 628502 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;DP=150;Dels=0.00;FS=5.998;HaplotypeScore=2.8427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=1.825;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.194;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1393,0,1825 chrIV 628602 . A G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.745;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=1.981;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.532;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:123:99:1261,0,1183 chrIV 628689 . G A 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.212;DP=101;Dels=0.00;FS=1.593;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=6.009;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.821;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:885,0,1019 chrIV 628833 . T C 1870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=23.37;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1903,192,0 chrIV 628955 . A G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;DP=130;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.315;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1111,0,1548 chrIV 629029 . T G 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.415;DP=108;Dels=0.00;FS=1.591;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.100;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,66:108:99:1411,0,861 chrIV 629044 . G T 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.754;DP=99;Dels=0.00;FS=5.277;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.640;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,63:99:99:1336,0,727 chrIV 629055 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.363;DP=100;Dels=0.00;FS=2.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.485;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,63:100:99:1327,0,775 chrIV 629111 . C T 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;DP=103;Dels=0.00;FS=5.543;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1135,0,1092 chrIV 629128 . T C 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.319;DP=110;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1035,0,1322 chrIV 629176 . A G 1202.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.391;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=49.6785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.815;SB=-4.423e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:49,50:99:15:1235,15,0 chrIV 629226 . A G 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.179;DP=80;Dels=0.00;FS=0.896;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,43:80:99:931,0,838 chrIV 629315 . T G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.305;DP=132;Dels=0.00;FS=6.454;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.638;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1325,0,1443 chrIV 629352 . T C 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.541;DP=105;Dels=0.00;FS=13.007;HaplotypeScore=3.8720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1156,0,1201 chrIV 629383 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.454;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.032;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1068,0,1268 chrIV 629395 . C A 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.732;DP=109;Dels=0.00;FS=2.599;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.259;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:109:99:1088,0,1253 chrIV 629422 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.766;DP=98;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:897,0,1174 chrIV 629477 . A G 642.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;DP=85;Dels=0.00;FS=1.840;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.963;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:672,0,1051 chrIV 629481 . A G 653.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:683,0,926 chrIV 629487 . G A 843.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.580;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.879;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:873,0,779 chrIV 629492 . A G 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.068;DP=90;Dels=0.00;FS=1.820;HaplotypeScore=5.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.892;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:90:99:830,0,1011 chrIV 629523 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.471;DP=102;Dels=0.00;FS=17.937;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.187;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1216,0,914 chrIV 629532 . G C 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;DP=106;Dels=0.00;FS=19.631;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.478;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:971,0,1155 chrIV 629595 . T A 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;DP=97;Dels=0.00;FS=5.507;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=2.587;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.314;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1038,0,1126 chrIV 629614 . C T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.825;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQ0=0;MQRankSum=-3.075;QD=11.09;ReadPosRankSum=-2.051;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:116:99:1316,0,1205 chrIV 629639 . T C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.194;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.37;MQ0=0;MQRankSum=-5.033;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:964,0,1078 chrIV 629643 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.879;DP=91;Dels=0.00;FS=1.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.53;MQ0=0;MQRankSum=-5.131;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:888,0,1069 chrIV 629651 . G A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.772;DP=95;Dels=0.00;FS=3.827;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.52;MQ0=0;MQRankSum=-6.162;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1030,0,1022 chrIV 629687 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=86;Dels=0.00;FS=1.789;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQ0=0;MQRankSum=-6.380;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:963,0,932 chrIV 629700 . C T 841.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.075;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.93;MQ0=0;MQRankSum=-4.196;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.481;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:871,0,992 chrIV 629701 . C T 821.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.871;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.28;MQ0=0;MQRankSum=-4.781;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.991;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:851,0,1006 chrIV 629702 . G A 808.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.176;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.594;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.368;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:838,0,1027 chrIV 629724 . T A 784.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:814,0,701 chrIV 629725 . G A 677.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.445;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.26;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.913;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,37:82:99:707,0,787 chrIV 629726 . T C 686.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.607;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.45;MQ0=0;MQRankSum=1.988;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.562;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,38:83:99:716,0,838 chrIV 629788 . T C 68.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.045;DP=95;Dels=0.02;FS=5.274;HaplotypeScore=40.9395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:98:98,0,930 chrIV 629797 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.369;DP=121;Dels=0.00;FS=13.505;HaplotypeScore=4.6000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.070;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1155,0,1250 chrIV 629864 . A C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.957;DP=152;Dels=0.00;FS=6.370;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1562,0,1545 chrIV 630050 . T C 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.404;DP=141;Dels=0.00;FS=3.023;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.294;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1554,0,1494 chrIV 630103 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;DP=126;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1354,0,1294 chrIV 630138 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.999;DP=143;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.180;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1477,0,1634 chrIV 630449 . A G 1782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.368;DP=165;Dels=0.00;FS=1.931;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1812,0,1741 chrIV 630492 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.755;DP=150;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=2.9583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.895;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1592,0,1642 chrIV 630548 . T C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.441;DP=120;Dels=0.00;FS=10.178;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=8.56;ReadPosRankSum=-1.696;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1057,0,1407 chrIV 630621 . T C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.422;DP=125;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1256,0,1366 chrIV 630888 . C T 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.291;DP=130;Dels=0.00;FS=4.123;HaplotypeScore=3.1461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=1;MQRankSum=1.745;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,78:130:99:815,0,595 chrIV 630905 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.209;DP=137;Dels=0.00;FS=6.497;HaplotypeScore=3.8424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.029;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,55:137:99:1036,0,1471 chrIV 631508 . T C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.178;DP=107;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1170,0,1126 chrIV 631537 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1069,0,1546 chrIV 631576 . A G 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.178;DP=143;Dels=0.00;FS=5.043;HaplotypeScore=5.9564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.245;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.895;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1574,0,1396 chrIV 631794 . A G 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3435,366,0 chrIV 631828 . A G 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.374;DP=151;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1707,0,1599 chrIV 632423 . T C 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.388;DP=114;Dels=0.00;FS=5.130;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=13.66;ReadPosRankSum=-2.028;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,70:114:99:1587,0,912 chrIV 632499 . T C 1380.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.477;DP=141;Dels=0.00;FS=6.216;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=9.79;ReadPosRankSum=3.140;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1410,0,1537 chrIV 632502 . G A 1563.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.180;DP=139;Dels=0.00;FS=6.375;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.540;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1593,0,1397 chrIV 632508 . G A 1517.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.702;DP=135;Dels=0.00;FS=7.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.670;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1547,0,1359 chrIV 632573 . A C 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.271;DP=129;Dels=0.00;FS=4.325;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.903;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.804;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1536,0,1253 chrIV 632607 . C T 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.593;DP=135;Dels=0.00;FS=2.218;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1265,0,1632 chrIV 632746 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.589;DP=110;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=2.7213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=12.38;ReadPosRankSum=2.912;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1392,0,986 chrIV 632937 . G A 3800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3800,364,0 chrIV 632958 . C T 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6127;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.94;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3493,349,0 chrIV 633060 . G A 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.875;DP=141;Dels=0.00;FS=13.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.569;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1493,0,1498 chrIV 633094 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.173;DP=149;Dels=0.00;FS=4.955;HaplotypeScore=6.8365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.543;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1349,0,1784 chrIV 633231 . G A 3784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3784,370,0 chrIV 633513 . C T 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.181;DP=144;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,62:144:99:1282,0,1791 chrIV 633552 . T C 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.009;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.731;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,85:182:99:1742,0,2033 chrIV 633614 . T G 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.437;DP=134;Dels=0.00;FS=3.108;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.087;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1430,0,1495 chrIV 633784 . A C 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.025;DP=123;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:979,0,1765 chrIV 633804 . T C 3996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.928e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3996,403,0 chrIV 633852 . G A 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.797;DP=149;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1561,0,1654 chrIV 633882 . A T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.037;DP=131;Dels=0.00;FS=5.302;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1394,0,1578 chrIV 633933 . A T 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.221;DP=155;Dels=0.00;FS=8.389;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1788,0,1621 chrIV 633960 . G A 3891.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3891,370,0 chrIV 633999 . G C 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2946,318,0 chrIV 634044 . T C 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3858,379,0 chrIV 634116 . A G 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.057;DP=169;Dels=0.00;FS=7.897;HaplotypeScore=3.4220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,76:169:99:1543,0,2048 chrIV 634140 . A C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.967;DP=159;Dels=0.00;FS=17.969;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1414,0,1953 chrIV 634632 . C T 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.813;DP=128;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.687;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1730,0,1025 chrIV 634755 . G A 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.091;DP=165;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=4.5973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:165:99:1607,0,2016 chrIV 634905 . G A 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.493;DP=171;Dels=0.00;FS=4.544;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.698;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,87:171:99:1880,0,1702 chrIV 635008 . C T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.022;DP=161;Dels=0.00;FS=5.756;HaplotypeScore=4.7524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.806;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,67:161:99:1361,0,1966 chrIV 635025 . T C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.964;DP=150;Dels=0.00;FS=2.949;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.187;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,63:150:99:1206,0,1985 chrIV 635043 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.329;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.703;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1246,0,1670 chrIV 635124 . A T 1837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;DP=151;Dels=0.00;FS=5.995;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.078;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1867,0,1509 chrIV 635301 . T C 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.920;DP=155;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:155:99:1664,0,1777 chrIV 635526 . A G 1932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.991;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,100:187:99:1962,0,1732 chrIV 635712 . G A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.845;DP=157;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=4.8902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=9.38;ReadPosRankSum=-2.951;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,73:157:99:1502,0,1779 chrIV 635784 . T C 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.897;DP=162;Dels=0.00;FS=9.667;HaplotypeScore=2.9058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.253;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1521,0,1778 chrIV 636201 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;DP=127;Dels=0.00;FS=9.645;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=1;MQRankSum=-1.154;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:127:99:1239,0,1416 chrIV 636237 . G A 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=1;QD=25.43;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3992,403,0 chrIV 636391 . A T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;DP=120;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=2.8105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=10.73;ReadPosRankSum=2.269;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:120:99:1317,0,1168 chrIV 636465 . A C 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3771,393,0 chrIV 636564 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.712;DP=127;Dels=0.00;FS=4.467;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.319;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1176,0,1545 chrIV 636737 . A T 3863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3863,385,0 chrIV 636971 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.925;DP=114;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=5.7332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:114:99:1272,0,1053 chrIV 637011 . A C 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.349;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1056,0,1242 chrIV 637466 . C G 2024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.240;DP=175;Dels=0.00;FS=2.036;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,93:175:99:2054,0,1753 chrIV 637715 . C G 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;DP=147;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1609,0,1511 chrIV 637865 . C A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.012;DP=138;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.320;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1619,0,1421 chrIV 638458 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;DP=109;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.807;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1224,0,1111 chrIV 639152 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.619;DP=121;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.244;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1199,0,1382 chrIV 639439 . T G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.409;DP=123;Dels=0.00;FS=9.826;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.041;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1339,0,1297 chrIV 639565 . G A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.960;DP=139;Dels=0.00;FS=2.131;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.048;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1432,0,1471 chrIV 639832 . A G 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.626;DP=82;Dels=0.00;FS=0.852;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.716;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.907;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:931,0,836 chrIV 639896 . C T 1266 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=45.3191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=13.61;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:1299,123,0 chrIV 639970 . C T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.240;DP=107;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=4.7875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1198,0,1163 chrIV 640048 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;DP=110;Dels=0.00;FS=2.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.308;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1149,0,1225 chrIV 640089 . T A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.417;DP=112;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.657;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1268,0,1186 chrIV 640113 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.407;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1127,0,1171 chrIV 640224 . T G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=109;Dels=0.00;FS=9.112;HaplotypeScore=2.6015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1098,0,1192 chrIV 640481 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.305;DP=121;Dels=0.00;FS=4.407;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.366;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1392,0,1233 chrIV 640565 . A G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.127;DP=102;Dels=0.00;FS=6.365;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1287,0,912 chrIV 640931 . T C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.296;DP=118;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.771;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1463,0,1120 chrIV 640973 . G C 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.480;DP=127;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=4.3963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.327;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,76:127:99:1645,0,1026 chrIV 641285 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.896;DP=133;Dels=0.00;FS=12.526;HaplotypeScore=3.7981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1406,0,1517 chrIV 641340 . G C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.938;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.580;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1371,0,1385 chrIV 641507 . T G 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.958;DP=135;Dels=0.00;FS=8.019;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:1722,0,1209 chrIV 641786 . T A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;DP=131;Dels=0.00;FS=4.218;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.268;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1486,0,1518 chrIV 642149 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.454;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1169,0,1170 chrIV 642326 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.710;DP=125;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=7.3561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.264;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1278,0,1414 chrIV 642569 . T C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;DP=129;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.973;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1359,0,1491 chrIV 642572 . C T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.011;DP=134;Dels=0.00;FS=3.256;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.191;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1526,0,1383 chrIV 642692 . G A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.489;DP=79;Dels=0.00;FS=14.595;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.967;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:850,0,864 chrIV 642698 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.408;DP=83;Dels=0.00;FS=14.027;HaplotypeScore=3.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.332;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:946,0,851 chrIV 642755 . G A 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.174;DP=91;Dels=0.00;FS=6.860;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.652;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:886,0,951 chrIV 643058 . T C 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.474;DP=144;Dels=0.00;FS=3.933;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1458,0,1590 chrIV 643077 . T G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.097;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.044;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:130:99:1400,0,1380 chrIV 643082 . C T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.032;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.606;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1505,0,1275 chrIV 643127 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.802;DP=111;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1341,0,1122 chrIV 643129 . C T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.525;DP=111;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1372,0,1155 chrIV 643177 . A T 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.834;DP=130;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:130:99:1594,0,1249 chrIV 643210 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.639;DP=117;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.795;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1379,0,1208 chrIV 643256 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.433;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.079;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1250,0,1611 chrIV 643436 . C T 1945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.045;DP=161;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=3.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.396;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,91:161:99:1975,0,1466 chrIV 643559 . T A 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.705;DP=150;Dels=0.00;FS=3.119;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.079;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:1817,0,1558 chrIV 643602 . A G 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;DP=163;Dels=0.00;FS=7.136;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=2.284;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.477;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1568,0,1795 chrIV 643715 . G A 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.276;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.533;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1620,0,1190 chrIV 643760 . C T 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.514;DP=127;Dels=0.00;FS=2.258;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.391;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1677,0,1085 chrIV 643772 . T C 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.734;DP=122;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.832;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1529,0,1139 chrIV 643795 . C T 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3355,328,0 chrIV 643844 . G A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.643;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.063;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1114,0,1096 chrIV 643929 . T G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.790;DP=110;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.063;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1365,0,1057 chrIV 643973 . G A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.063;DP=113;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1438,0,1092 chrIV 644081 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.046;DP=113;Dels=0.00;FS=12.320;HaplotypeScore=2.6803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:980,0,1446 chrIV 644532 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.604;DP=117;Dels=0.00;FS=5.891;HaplotypeScore=8.9304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1347,0,1017 chrIV 644541 . C T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.322;DP=121;Dels=0.00;FS=3.320;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.912;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1347,0,1215 chrIV 644629 . T A 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:3170,316,0 chrIV 645268 . C G 2346 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.87;MQ0=1;QD=25.23;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2379,243,0 chrIV 645352 . C T 764 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.98;MQ0=0;QD=19.10;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:84:797,84,0 chrIV 645433 . A G 103.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.65;MQ0=2;QD=9.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:11:15:136,15,0 chrIV 651528 . A G 516.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=74;Dels=0.00;FS=21.722;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:546,0,1068 chrIV 651534 . T A 551.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;DP=73;Dels=0.00;FS=19.680;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.714;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,27:73:99:581,0,1061 chrIV 651540 . C A 461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.631;DP=73;Dels=0.00;FS=13.836;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.23;MQ0=0;MQRankSum=-3.118;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:491,0,1101 chrIV 651580 . C T 670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.069;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-5.225;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.247;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,34:85:99:700,0,1132 chrIV 651590 . C T 693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-5.244;QD=7.53;ReadPosRankSum=1.196;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,36:92:99:723,0,1224 chrIV 651672 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.795;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.37;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.684;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1140,0,1358 chrIV 651714 . G C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;DP=125;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1331,0,1420 chrIV 651778 . C A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;DP=149;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=3.5228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:1406,0,1828 chrIV 651813 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.603;DP=137;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.443;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1274,0,1681 chrIV 651881 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.383;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=10.69;ReadPosRankSum=2.108;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1356,0,1300 chrIV 651974 . G A 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.951;DP=148;Dels=0.00;FS=3.886;HaplotypeScore=3.6079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,65:148:99:1306,0,1801 chrIV 652069 . A T 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;DP=163;Dels=0.00;FS=3.658;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=9.33;ReadPosRankSum=2.398;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,73:163:99:1550,0,2031 chrIV 652106 . C A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;DP=116;Dels=0.00;FS=14.017;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.084;QD=9.86;ReadPosRankSum=-2.239;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1174,0,1345 chrIV 652118 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.431;DP=117;Dels=0.00;FS=13.667;HaplotypeScore=5.8904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=9.64;ReadPosRankSum=-2.583;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1158,0,1399 chrIV 652176 . A C 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.551;DP=101;Dels=0.00;FS=11.326;HaplotypeScore=1.9048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.91;MQ0=0;MQRankSum=-4.731;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.980;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1006,0,1131 chrIV 652186 . G C 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;DP=113;Dels=0.00;FS=8.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.925;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.976;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:977,0,1211 chrIV 652203 . A T 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.240;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.083;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1206,0,1455 chrIV 652205 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.039;DP=126;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.948;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1228,0,1493 chrIV 652594 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.901;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.307;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1106,0,1171 chrIV 652990 . T C 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;DP=126;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=12.64;ReadPosRankSum=2.715;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1623,0,1196 chrIV 653143 . C T 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.784;DP=135;Dels=0.00;FS=4.137;HaplotypeScore=5.6884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1534,0,1295 chrIV 653150 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.230;DP=122;Dels=0.00;FS=6.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.216;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1442,0,1168 chrIV 653208 . C T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.379;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1363,0,1194 chrIV 653246 . T C 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3029,309,0 chrIV 653323 . T G 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.256;DP=107;Dels=0.00;FS=3.660;HaplotypeScore=4.2253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:107:99:906,0,1283 chrIV 653336 . C T 1252 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=23.5094;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=14.23;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1285,126,0 chrIV 653344 . T C 1192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.411;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=34.4273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=13.86;ReadPosRankSum=4.771;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,47:86:99:1225,129,0 chrIV 654775 . C A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.931;DP=127;Dels=0.00;FS=9.785;HaplotypeScore=2.5320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=10.17;ReadPosRankSum=-3.071;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1321,0,1380 chrIV 654780 . C T 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.156;DP=114;Dels=0.00;FS=2.550;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.867;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:114:99:992,0,1442 chrIV 654798 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.179;DP=133;Dels=0.00;FS=10.407;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.476;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1112,0,1680 chrIV 654890 . T G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.123;DP=143;Dels=0.00;FS=7.391;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:143:99:1467,0,1515 chrIV 654900 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.134;DP=128;Dels=0.00;FS=4.282;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1346,0,1335 chrIV 655011 . G A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.252;DP=113;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.188;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:1018,0,1433 chrIV 655491 . G A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.810;DP=112;Dels=0.00;FS=7.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1102,0,1237 chrIV 655804 . T A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.744;DP=131;Dels=0.00;FS=5.304;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.315;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1395,0,1471 chrIV 655820 . C T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.064;DP=142;Dels=0.00;FS=6.220;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:142:99:1454,0,1500 chrIV 656349 . T C 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3126,324,0 chrIV 656658 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.225;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.998;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1302,0,1357 chrIV 656959 . A G 1898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.423;DP=174;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=8.9118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.723;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,93:174:99:1928,0,1760 chrIV 657111 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.899;DP=123;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1332,0,1270 chrIV 657366 . G A 4267.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4267,406,0 chrIV 657595 . C A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.773;DP=90;Dels=0.00;FS=6.949;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.443;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.024;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,51:90:99:1210,0,806 chrIV 657674 . T A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.946;DP=131;Dels=0.00;FS=12.695;HaplotypeScore=69.6762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.544;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1451,0,1193 chrIV 657792 . A G 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.394;DP=150;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.325;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1754,0,1555 chrIV 658108 . C T 2552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=77.0952;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.75;MQ0=0;QD=20.75;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2585,261,0 chrIV 658436 . T G 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3579,369,0 chrIV 658469 . T C 4060.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4060,417,0 chrIV 658478 . C T 3775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3775,376,0 chrIV 658643 . C T 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3240,316,0 chrIV 658682 . G A 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3696;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3191,319,0 chrIV 658775 . C T 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3645,367,0 chrIV 659198 . G T 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2946,292,0 chrIV 659338 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.699;DP=137;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=4.4265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1530,0,1321 chrIV 659402 . G A 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3491,343,0 chrIV 659467 . C T 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3181,307,0 chrIV 659689 . T C 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3865,385,0 chrIV 659864 . A T 3762.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3762,370,0 chrIV 659912 . G C 3925.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3925,400,0 chrIV 659970 . C T 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;DP=139;Dels=0.00;FS=2.153;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1659,0,1337 chrIV 660025 . G C 4166.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4166,421,0 chrIV 660107 . C T 4217.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=28.69;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:4217,418,0 chrIV 660131 . C T 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7307;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:147:99:3860,391,0 chrIV 660153 . C T 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.284;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.657;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:669,0,1708 chrIV 660155 . T A 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9290;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=21.11;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3010,330,0 chrIV 660197 . C T 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3433,337,0 chrIV 660200 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.653;DP=122;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.087;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1121,0,1509 chrIV 660237 . G A 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2966,303,0 chrIV 660248 . T C 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3406,345,0 chrIV 660411 . T C 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3851,390,0 chrIV 660498 . A G 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2937,312,0 chrIV 660681 . C G 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3361,331,0 chrIV 660748 . C T 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3418,346,0 chrIV 660773 . T C 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3851,400,0 chrIV 660788 . T C 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3632,372,0 chrIV 660950 . A G 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3342,339,0 chrIV 661137 . A G 3980.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3980,400,0 chrIV 661159 . G T 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3780,364,0 chrIV 661166 . C T 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3815,370,0 chrIV 661181 . T C 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3830,387,0 chrIV 661358 . A T 3617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3617,358,0 chrIV 662378 . T C 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3274,345,0 chrIV 662769 . A G 4171.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4171,409,0 chrIV 662835 . T C 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5510;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=28.16;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3689,373,0 chrIV 663117 . A G 4028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4028,420,0 chrIV 663138 . G A 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.54;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3801,361,0 chrIV 663384 . C T 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=28.36;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3346,322,0 chrIV 663492 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.640;DP=129;Dels=0.00;FS=11.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.375;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1368,0,1339 chrIV 663521 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.146;DP=116;Dels=0.00;FS=7.102;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.579;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1392,0,1198 chrIV 663559 . T C 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.389;DP=81;Dels=0.00;FS=4.295;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.091;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:834,0,976 chrIV 663566 . C T 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.992;DP=89;Dels=0.00;FS=1.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.678;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:810,0,1013 chrIV 663819 . T C 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.427;DP=105;Dels=0.00;FS=2.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,65:105:99:1422,0,847 chrIV 663861 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.450;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.943;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,58:82:99:1314,0,451 chrIV 663915 . T C 2610 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2643,270,0 chrIV 664139 . C T 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.136;DP=86;Dels=0.00;FS=5.680;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:941,0,971 chrIV 664186 . T C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.420;DP=99;Dels=0.00;FS=0.806;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1124,0,1026 chrIV 664257 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.607;DP=117;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=6.9396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.593;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1396,0,1127 chrIV 664347 . T G 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3059,312,0 chrIV 664395 . G A 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3426,322,0 chrIV 664456 . A G 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3436,345,0 chrIV 664477 . T C 4165.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4165,415,0 chrIV 665204 . A G 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.298;DP=102;Dels=0.00;FS=2.590;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:952,0,1277 chrIV 665593 . G A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.092;DP=142;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=5.6656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1436,0,1645 chrIV 665718 . C T 1860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.380;DP=165;Dels=0.00;FS=1.214;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.499;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1890,0,1648 chrIV 665841 . A G 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.464;DP=161;Dels=0.00;FS=3.797;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.178;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1596,0,1894 chrIV 666159 . G A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.897;DP=116;Dels=0.00;FS=1.543;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.822;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1503,0,1003 chrIV 666663 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.597;DP=123;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1216,0,1361 chrIV 666947 . C G 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.556;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,41:113:99:825,0,1571 chrIV 666968 . G A 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.335;DP=110;Dels=0.00;FS=3.574;HaplotypeScore=4.6635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.997;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.003;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:110:99:979,0,1428 chrIV 666977 . A T 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.024;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.324;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1018,0,1669 chrIV 666994 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.598;DP=126;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.211;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1148,0,1577 chrIV 667014 . C A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.855;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=-4.472;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.940;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:1055,0,1627 chrIV 667027 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.368;DP=121;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.272;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1179,0,1483 chrIV 667031 . T A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.341;DP=119;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-5.071;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1215,0,1474 chrIV 667151 . C T 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.677;DP=85;Dels=0.00;FS=7.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:913,0,892 chrIV 667309 . G A 4048.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5731;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:4048,412,0 chrIV 667343 . G A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.914;DP=120;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.249;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1440,0,1193 chrIV 667439 . C G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;DP=118;Dels=0.01;FS=2.525;HaplotypeScore=4.3715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=10.72;ReadPosRankSum=-2.160;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1295,0,1128 chrIV 667469 . A T 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.498;DP=83;Dels=0.00;FS=0.845;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.871;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:770,0,1053 chrIV 667473 . T C 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.939;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:890,0,1127 chrIV 667729 . G A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.595;DP=131;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.025;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1382,0,1470 chrIV 667994 . G A 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2871,283,0 chrIV 668232 . C A 1871 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.01;MQ0=6;QD=25.63;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,72:73:99:1904,195,0 chrIV 668243 . T C 1625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.31;MQ0=3;QD=25.39;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:64:99:1658,177,0 chrIV 668582 . T C 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2675,282,0 chrIV 668687 . A T 2308 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=28.15;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2341,228,0 chrIV 668861 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.058;DP=125;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1276,0,1443 chrIV 668949 . T A 705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.1072;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=5.92;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:81:738,81,0 chrIV 668967 . T A 280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.069;DP=122;Dels=0.00;FS=242.746;HaplotypeScore=2.1036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=2.30;ReadPosRankSum=-8.186;SB=-2.989e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:310,0,599 chrIV 669064 . A G 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.990;DP=111;Dels=0.00;FS=3.635;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.092;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:922,0,1408 chrIV 669850 . G A 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.332;DP=115;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.915;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1367,0,1120 chrIV 670000 . T C 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2741,267,0 chrIV 670255 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.511;DP=122;Dels=0.00;FS=5.658;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1236,0,1400 chrIV 670324 . T A 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3549,349,0 chrIV 670418 . A T 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3047,295,0 chrIV 670636 . G C 2505 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2538,267,0 chrIV 670663 . C G 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;DP=114;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.550;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1001,0,1157 chrIV 670771 . A C 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3609,369,0 chrIV 670957 . G A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.487;DP=120;Dels=0.00;FS=24.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1389,0,1195 chrIV 671025 . C T 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3014,292,0 chrIV 671041 . T A 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3446,331,0 chrIV 671079 . A G 2610 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2643,270,0 chrIV 671086 . G C 2557 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2590,261,0 chrIV 671207 . G A 3935.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3935,382,0 chrIV 671226 . C G 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.52;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3136,333,0 chrIV 671379 . T C 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2778;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3636,366,0 chrIV 671460 . G A 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2939,297,0 chrIV 671508 . G A 2823 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2856,286,0 chrIV 671547 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.206;DP=139;Dels=0.00;FS=4.391;HaplotypeScore=6.5060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1212,0,1642 chrIV 671559 . T A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;DP=135;Dels=0.00;FS=6.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1323,0,1635 chrIV 671820 . A G 2063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2096,213,0 chrIV 671958 . T C 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3401,351,0 chrIV 672124 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.716;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.292;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1343,0,1771 chrIV 672136 . T C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.894;DP=146;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1269,0,1865 chrIV 672138 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.413;DP=142;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.667;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1290,0,1818 chrIV 672351 . C T 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2789,268,0 chrIV 672752 . G A 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3686,358,0 chrIV 672815 . A T 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.638;DP=146;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=2.5200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.805;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1836,0,1410 chrIV 672849 . G A 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.113;DP=127;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.287;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1463,0,1240 chrIV 672865 . A G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3126,315,0 chrIV 672972 . C T 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.639;DP=146;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.859;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1569,0,1593 chrIV 673035 . T A 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3958,382,0 chrIV 673237 . A G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.607;DP=113;Dels=0.00;FS=3.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=2.802;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.095;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1132,0,1341 chrIV 673272 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.727;DP=91;Dels=0.00;FS=1.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.496;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:950,0,1034 chrIV 673716 . C G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.365;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.029;QD=9.85;ReadPosRankSum=-2.084;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1320,0,1307 chrIV 673838 . C T 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.342;DP=113;Dels=0.00;FS=5.053;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.349;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:113:99:1074,0,1135 chrIV 673951 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.627;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1114,0,871 chrIV 673957 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.213;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.631;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:95:99:1086,0,920 chrIV 673965 . G A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.416;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.025;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,54:98:99:1221,0,816 chrIV 673982 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.762;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.313;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1263,0,897 chrIV 674236 . A G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.213;DP=126;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.925;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1059,0,1684 chrIV 674321 . T C 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.495;DP=140;Dels=0.00;FS=3.341;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.270;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,80:140:99:1753,0,1294 chrIV 674365 . A G 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.352;DP=132;Dels=0.00;FS=3.408;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=10.73;ReadPosRankSum=2.311;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1447,0,1348 chrIV 674440 . C A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.787;DP=130;Dels=0.00;FS=3.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1242,0,1491 chrIV 674458 . T G 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.921;DP=125;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=3.8159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.410;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1034,0,1579 chrIV 674459 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.503;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.002;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1074,0,1593 chrIV 674486 . C A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.984;DP=132;Dels=0.00;FS=4.582;HaplotypeScore=3.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.429;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1422,0,1354 chrIV 674519 . A G 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3135,318,0 chrIV 674711 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.715;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.792;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.054;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1320,0,1348 chrIV 674716 . C G 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.058;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1283,0,1260 chrIV 674810 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.526;DP=123;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.098;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1198,0,1439 chrIV 675008 . A G 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.004;DP=104;Dels=0.00;FS=6.505;HaplotypeScore=6.1448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.886;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:809,0,1360 chrIV 675634 . T C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.134;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.895;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1196,0,1122 chrIV 675790 . C A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;DP=111;Dels=0.00;FS=4.715;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.310;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1249,0,1142 chrIV 675810 . T A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.905;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1497,0,1238 chrIV 675833 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.184;DP=119;Dels=0.00;FS=3.368;HaplotypeScore=7.3283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.664;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:119:99:1305,0,1145 chrIV 675841 . C G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;DP=111;Dels=0.00;FS=4.656;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.098;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1344,0,945 chrIV 675985 . A G 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.078;DP=123;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=3.7769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.816;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,76:123:99:1670,0,982 chrIV 676644 . T C 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.372;DP=152;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=5.2748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=9.55;ReadPosRankSum=2.616;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:152:99:1481,0,1878 chrIV 677241 . G A 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.811;DP=101;Dels=0.00;FS=2.667;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.417;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:926,0,1339 chrIV 677543 . A G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.114;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.854;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1213,0,1510 chrIV 677658 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.424;DP=118;Dels=0.00;FS=7.545;HaplotypeScore=5.9486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.720;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1039,0,1506 chrIV 677713 . C T 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.061;DP=100;Dels=0.00;FS=2.679;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.519;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:913,0,1353 chrIV 677729 . C T 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.336;DP=112;Dels=0.00;FS=1.557;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.285;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:1012,0,1454 chrIV 677962 . C A 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;DP=124;Dels=0.00;FS=1.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=14.19;ReadPosRankSum=-1.451;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,78:124:99:1789,0,963 chrIV 678076 . T C 1755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=17.73;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:1788,189,0 chrIV 678110 . G A 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2914,295,0 chrIV 678128 . C T 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=28.95;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3705,370,0 chrIV 678156 . T C 3898.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3898,429,0 chrIV 678238 . C T 169.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.168;DP=135;Dels=0.01;FS=96.873;HaplotypeScore=4.1460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=2;MQRankSum=-1.345;QD=1.25;ReadPosRankSum=-6.323;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,30:134:99:199,0,1403 chrIV 678239 . A T 177.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=136;Dels=0.01;FS=100.894;HaplotypeScore=4.1460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=2;MQRankSum=-1.198;QD=1.30;ReadPosRankSum=-6.969;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,31:135:99:207,0,1359 chrIV 678344 . G A 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.623;DP=132;Dels=0.00;FS=5.341;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.574;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1673,0,1265 chrIV 678436 . G A 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3661,352,0 chrIV 678481 . G A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.469;DP=109;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.197;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1229,0,1118 chrIV 678613 . G A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.877;DP=123;Dels=0.00;FS=5.860;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1344,0,1195 chrIV 678773 . T C 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2605,267,0 chrIV 679260 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.523;DP=105;Dels=0.00;FS=3.620;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.741;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1078,0,1247 chrIV 679286 . T A 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.169;DP=107;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.202;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:991,0,1320 chrIV 679438 . A T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.030;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1472,0,1747 chrIV 679489 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;DP=131;Dels=0.00;FS=10.912;HaplotypeScore=3.6194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.690;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1565,0,1320 chrIV 679624 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.663;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.4659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.124;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1199,0,1589 chrIV 679781 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.870;DP=137;Dels=0.00;FS=2.324;HaplotypeScore=4.0303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:137:99:1380,0,1577 chrIV 679834 . T G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.671;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:125:99:1350,0,1274 chrIV 679949 . C G 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.551;DP=155;Dels=0.00;FS=2.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.156;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1632,0,1724 chrIV 679996 . A G 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.638;DP=141;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=4.5005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.316;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1665,0,1450 chrIV 680091 . C A 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;DP=139;Dels=0.00;FS=6.634;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.312;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1745,0,1259 chrIV 680123 . T C 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.364;DP=99;Dels=0.00;FS=3.744;HaplotypeScore=50.5140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:99:99:1000,0,988 chrIV 680244 . G A 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.220;DP=156;Dels=0.00;FS=3.065;HaplotypeScore=3.7567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=2.065;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.292;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1850,0,1609 chrIV 680288 . C T 1797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.888;DP=157;Dels=0.00;FS=1.251;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.771;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,80:157:99:1827,0,1596 chrIV 680316 . C A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.960;DP=138;Dels=0.00;FS=9.406;HaplotypeScore=2.7865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.956;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:138:99:1235,0,1734 chrIV 680401 . G T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.850;DP=166;Dels=0.00;FS=8.765;HaplotypeScore=2.5051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.360;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,65:166:99:1334,0,2067 chrIV 680423 . A G 3980.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3980,403,0 chrIV 680490 . G C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=1;QD=26.26;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3624,361,0 chrIV 680614 . C T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.534;DP=141;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1521,0,1372 chrIV 680639 . A G 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3338,360,0 chrIV 680727 . G A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.189;DP=123;Dels=0.00;FS=7.094;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1497,0,1105 chrIV 680751 . C T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.051;DP=151;Dels=0.00;FS=6.104;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.989;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1655,0,1448 chrIV 680772 . A T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;DP=145;Dels=0.00;FS=3.031;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1626,0,1479 chrIV 680813 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.206;DP=142;Dels=0.00;FS=2.115;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.273;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1365,0,1519 chrIV 681125 . A G 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.000;DP=121;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1146,0,1529 chrIV 681246 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.844;DP=124;Dels=0.00;FS=1.433;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1337,0,1333 chrIV 681251 . G A 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.793;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.056;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:132:99:1354,0,1415 chrIV 681282 . G A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.678;DP=123;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.055;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1136,0,1549 chrIV 681304 . G A 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=28.23;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3387,328,0 chrIV 681417 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.678;DP=132;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=3.9529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.333;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1513,0,1440 chrIV 681664 . G A 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.774;DP=180;Dels=0.00;FS=15.754;HaplotypeScore=8.1858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.802;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,85:180:99:1780,0,1997 chrIV 681734 . G T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.704;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.068;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1443,0,1342 chrIV 681886 . C T 576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.222;DP=120;Dels=0.00;FS=5.764;HaplotypeScore=34.8748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.41;MQ0=0;MQRankSum=-5.866;QD=4.80;ReadPosRankSum=2.023;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,39:120:99:606,0,1743 chrIV 681918 . C T 695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.718;DP=154;Dels=0.00;FS=3.479;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.87;MQ0=0;MQRankSum=-8.464;QD=4.51;ReadPosRankSum=-3.009;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,61:154:99:725,0,2097 chrIV 681935 . A G 552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.368;DP=149;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=7.2961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.42;MQ0=0;MQRankSum=-8.989;QD=3.70;ReadPosRankSum=-2.123;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,60:149:99:582,0,2044 chrIV 681939 . G T 497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.600;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.08;MQ0=0;MQRankSum=-9.601;QD=3.52;ReadPosRankSum=-2.357;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,58:141:99:527,0,1851 chrIV 681959 . T A 237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;DP=143;Dels=0.00;FS=5.803;HaplotypeScore=2.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQ0=0;MQRankSum=-8.748;QD=1.66;ReadPosRankSum=1.767;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,50:143:99:267,0,2283 chrIV 681960 . T G 199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;DP=143;Dels=0.00;FS=5.803;HaplotypeScore=2.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQ0=0;MQRankSum=-9.028;QD=1.39;ReadPosRankSum=1.539;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,50:143:99:229,0,2285 chrIV 682085 . G A 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.887;DP=112;Dels=0.00;FS=4.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:999,0,1276 chrIV 682093 . T C 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.982;DP=100;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:742,0,1251 chrIV 682121 . A C 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.788;DP=89;Dels=0.00;FS=4.182;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.127;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:881,0,951 chrIV 682165 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.717;DP=101;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=4.9341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.331;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1216,0,862 chrIV 682178 . C T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.755;DP=103;Dels=0.00;FS=1.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=12.50;ReadPosRankSum=-1.741;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,61:103:99:1317,0,822 chrIV 682303 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.671;DP=117;Dels=0.00;FS=4.490;HaplotypeScore=6.4569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1137,0,1354 chrIV 682420 . G A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.888;DP=98;Dels=0.00;FS=2.705;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.942;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:1086,0,1070 chrIV 682509 . C G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.301;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1412,0,1326 chrIV 682954 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.504;DP=135;Dels=0.00;FS=9.263;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1366,0,1497 chrIV 682960 . T C 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.400;DP=148;Dels=0.00;FS=10.389;HaplotypeScore=8.3987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.666;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1489,0,1673 chrIV 683501 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.181;DP=125;Dels=0.00;FS=3.294;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.245;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1406,0,1235 chrIV 683520 . A G 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.732;DP=128;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=5.5478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.717;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.454;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:128:99:1484,0,1192 chrIV 683610 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.810;DP=103;Dels=0.00;FS=18.138;HaplotypeScore=3.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=11.49;ReadPosRankSum=-2.496;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1213,0,1129 chrIV 683639 . T A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.595;DP=96;Dels=0.00;FS=0.908;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.825;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:1020,0,1137 chrIV 683768 . T C 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.451;DP=140;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=3.7474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1558,0,1394 chrIV 683805 . C T 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.117;DP=126;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.617;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1532,0,1205 chrIV 683812 . G A 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.970;DP=128;Dels=0.00;FS=4.274;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1677,0,1100 chrIV 683834 . G C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;DP=115;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.265;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:115:99:1287,0,997 chrIV 683860 . T G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.829;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=-3.241;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.163;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1215,0,1227 chrIV 683886 . A G 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.578;DP=100;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-4.454;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.514;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:945,0,1035 chrIV 683890 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.559;DP=103;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=3.8928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-3.441;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1022,0,1078 chrIV 683918 . C T 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3017,295,0 chrIV 684013 . T G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.315;DP=115;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.962;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1253,0,1233 chrIV 684395 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.215;DP=126;Dels=0.00;FS=4.710;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.343;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1090,0,1502 chrIV 685013 . C T 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;DP=132;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=12.58;ReadPosRankSum=-1.506;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1690,0,1211 chrIV 685091 . A T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;DP=111;Dels=0.00;FS=4.826;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.062;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1220,0,1294 chrIV 685095 . A T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.626;DP=113;Dels=0.00;FS=6.088;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1289,0,1249 chrIV 685142 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;DP=125;Dels=0.00;FS=8.227;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.709;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1332,0,1379 chrIV 685189 . A T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.676;DP=109;Dels=0.00;FS=4.861;HaplotypeScore=7.3724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1090,0,1251 chrIV 685290 . A G 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.088;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:992,0,1197 chrIV 685473 . G A 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.644;DP=136;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.601;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1730,0,1242 chrIV 685531 . C G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.046;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1394,0,1074 chrIV 685659 . G A 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3618,381,0 chrIV 685708 . T G 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.872;DP=137;Dels=0.00;FS=6.194;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.453;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1462,0,1619 chrIV 685822 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.063;DP=123;Dels=0.00;FS=3.459;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=2.230;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.888;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1399,0,1246 chrIV 685839 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.340;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.464;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1419,0,1355 chrIV 686038 . G A 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.231;DP=108;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=2.2337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.822;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1101,0,1201 chrIV 686344 . A T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.517;DP=127;Dels=0.00;FS=13.135;HaplotypeScore=4.8381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.071;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:127:99:1375,0,1448 chrIV 686709 . C A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.714;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.252;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1194,0,1107 chrIV 686865 . A G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.198;DP=129;Dels=0.00;FS=8.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:129:99:1675,0,1224 chrIV 686871 . T C 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.013;DP=128;Dels=0.00;FS=10.293;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1549,0,1257 chrIV 687105 . G C 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=0.667;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.161;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:783,0,999 chrIV 687255 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.775;DP=93;Dels=0.00;FS=1.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:1030,0,972 chrIV 687261 . G A 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.341;DP=87;Dels=0.00;FS=2.821;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,44:87:99:944,0,952 chrIV 687279 . T G 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;DP=82;Dels=0.00;FS=2.940;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.251;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:885,0,974 chrIV 687424 . C G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.147;DP=112;Dels=0.00;FS=2.911;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.157;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.389;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:990,0,1270 chrIV 687427 . A G 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.158;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.162;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:840,0,1332 chrIV 687440 . A T 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.171;DP=112;Dels=0.00;FS=7.561;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:969,0,1355 chrIV 687498 . T A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.498;DP=126;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.986;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1499,0,1283 chrIV 687533 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.832;DP=126;Dels=0.00;FS=5.429;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1289,0,1306 chrIV 687534 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.312;DP=126;Dels=0.00;FS=5.429;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.436;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.064;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1309,0,1241 chrIV 687589 . A C 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.003;DP=128;Dels=0.00;FS=4.255;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.611;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1297,0,1517 chrIV 687632 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.822;DP=115;Dels=0.00;FS=1.608;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.329;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1360,0,1223 chrIV 687643 . A G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.214;DP=124;Dels=0.00;FS=2.470;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.627;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:124:99:1388,0,1275 chrIV 687691 . G A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;DP=112;Dels=0.00;FS=10.790;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.120;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1180,0,1253 chrIV 687745 . A G 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.197;DP=118;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:920,0,1346 chrIV 687746 . G A 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.133;DP=118;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=2.8290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:118:99:954,0,1305 chrIV 687830 . A G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.753;DP=108;Dels=0.00;FS=6.101;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.974;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1213,0,1077 chrIV 688177 . G A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.031;DP=139;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=74.9099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1394,0,1459 chrIV 688353 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.410;DP=99;Dels=0.00;FS=20.578;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.657;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,54:99:99:1217,0,967 chrIV 688415 . A G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.608;DP=109;Dels=0.00;FS=4.859;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1043,0,1334 chrIV 688432 . G A 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.976;DP=105;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.529;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1039,0,1180 chrIV 688437 . C A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.456;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.654;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1014,0,1213 chrIV 688474 . A G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.494;DP=116;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=3.7599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1140,0,1294 chrIV 688518 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;DP=126;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=1;MQRankSum=0.368;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.520;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1417,0,1250 chrIV 688530 . G A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.600;DP=123;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=1;MQRankSum=-0.387;QD=11.31;ReadPosRankSum=3.060;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1421,0,1271 chrIV 688602 . C A 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.763;DP=154;Dels=0.00;FS=3.782;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.688;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.439;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1757,0,1582 chrIV 688608 . G A 1863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.129;DP=160;Dels=0.00;FS=3.705;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.074;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1893,0,1533 chrIV 688643 . A T 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;DP=145;Dels=0.00;FS=6.389;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:145:99:1800,0,1436 chrIV 688689 . T G 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.031;DP=128;Dels=0.00;FS=4.438;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.467;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,77:128:99:1616,0,1114 chrIV 688821 . T C 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.213;DP=129;Dels=0.00;FS=4.248;HaplotypeScore=2.2350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=0.933;QD=10.60;ReadPosRankSum=-2.313;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1398,0,1427 chrIV 688841 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.966;DP=134;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=1;MQRankSum=-2.043;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.378;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1244,0,1571 chrIV 689214 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.916;DP=132;Dels=0.00;FS=14.122;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1320,0,1519 chrIV 689315 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.016;DP=120;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1107,0,1500 chrIV 689403 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.824;DP=97;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1032,0,1093 chrIV 689526 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.465;DP=154;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=5.8500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.358;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,62:154:99:1247,0,2069 chrIV 689532 . C G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.653;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=2.333;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.538;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1151,0,1701 chrIV 689618 . A G 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.491;DP=147;Dels=0.00;FS=5.162;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.684;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1497,0,1626 chrIV 689810 . A C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.379;DP=126;Dels=0.00;FS=6.776;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.095;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1322,0,1386 chrIV 690128 . G A 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.109;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1530,0,1309 chrIV 690152 . C T 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.713;DP=147;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=10.51;ReadPosRankSum=2.593;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1575,0,1588 chrIV 690212 . G A 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.591;DP=129;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=6.82;ReadPosRankSum=-2.259;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,53:129:99:910,0,1654 chrIV 690267 . C A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.868;DP=121;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=6.7449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.585;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1196,0,1424 chrIV 690503 . T A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;DP=109;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1140,0,1222 chrIV 690684 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.139;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1424,0,1129 chrIV 690691 . G T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.390;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:113:99:1428,0,1001 chrIV 690751 . G A 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.345;DP=132;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.425;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,77:132:99:1707,0,1129 chrIV 690855 . C T 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.409;DP=75;Dels=0.00;FS=1.900;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,40:75:99:900,0,753 chrIV 690909 . C G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.663;DP=107;Dels=0.00;FS=2.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:107:99:1325,0,980 chrIV 690968 . C G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;DP=109;Dels=0.00;FS=8.959;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.944;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1198,0,1078 chrIV 691366 . C G 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;DP=107;Dels=0.00;FS=8.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=14.36;ReadPosRankSum=2.217;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,70:107:99:1567,0,635 chrIV 691370 . T G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.858;DP=108;Dels=0.00;FS=8.029;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=14.19;ReadPosRankSum=3.265;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,70:108:99:1562,0,725 chrIV 691402 . T A 1931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.826;DP=105;Dels=0.02;FS=5.451;HaplotypeScore=38.6934;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=18.39;ReadPosRankSum=-2.696;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,86:103:99:1964,195,0 chrIV 691713 . C T 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=28.34;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3372,337,0 chrIV 691930 . T A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;DP=137;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.076;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:137:99:1097,0,1780 chrIV 691936 . T C 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.749;DP=145;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.613;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1534,0,1457 chrIV 691984 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.845;DP=119;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.746;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1229,0,1355 chrIV 692033 . T C 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.193;DP=162;Dels=0.00;FS=14.028;HaplotypeScore=1.9799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.246;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,79:162:99:1507,0,1830 chrIV 692140 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.716;DP=123;Dels=0.00;FS=13.908;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.393;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1530,0,1239 chrIV 692149 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.576;DP=136;Dels=0.00;FS=15.869;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.735;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1592,0,1373 chrIV 692170 . A G 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.406;DP=152;Dels=0.00;FS=18.227;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.567;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,85:152:99:1865,0,1421 chrIV 692212 . C T 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.393;DP=165;Dels=0.00;FS=6.762;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.842;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:1777,0,1529 chrIV 692241 . G T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;DP=140;Dels=0.00;FS=2.147;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.690;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1479,0,1536 chrIV 692320 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;DP=107;Dels=0.00;FS=14.824;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.885;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1328,0,1077 chrIV 692518 . G A 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.086;DP=151;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=2.3617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1821,0,1373 chrIV 692575 . A G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.432;DP=149;Dels=0.00;FS=6.005;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.803;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1618,0,1509 chrIV 692593 . A G 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3447,348,0 chrIV 692602 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.820;DP=143;Dels=0.00;FS=8.821;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1477,0,1497 chrIV 692655 . T A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;DP=150;Dels=0.00;FS=2.916;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.381;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1496,0,1697 chrIV 692797 . G A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.126;DP=120;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.023;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1228,0,1397 chrIV 692839 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.645;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.127;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1308,0,1242 chrIV 693070 . G C 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.188;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,80:134:99:1805,0,1132 chrIV 693184 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.501;DP=112;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.237;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1172,0,1218 chrIV 693255 . C T 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.074;DP=144;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1541,0,1578 chrIV 693728 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.311;DP=126;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.829;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1033,0,1703 chrIV 693982 . G A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.539;DP=141;Dels=0.00;FS=8.966;HaplotypeScore=3.6310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=9.74;ReadPosRankSum=-2.209;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1403,0,1640 chrIV 694033 . T C 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.38;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3038,324,0 chrIV 694079 . C T 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.739;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1476,0,1462 chrIV 694241 . C T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.522;DP=122;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=108.2551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1174,0,1406 chrIV 694457 . A G 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.602;DP=161;Dels=0.00;FS=1.248;HaplotypeScore=3.6943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,86:161:99:1839,0,1683 chrIV 694473 . T G 1797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;DP=161;Dels=0.00;FS=2.801;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.814;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1827,0,1760 chrIV 694503 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.737;DP=148;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.159;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1565,0,1673 chrIV 694556 . A G 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.655;DP=141;Dels=0.00;FS=6.525;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1523,0,1547 chrIV 694587 . C T 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.357;DP=161;Dels=0.00;FS=1.964;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.992;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1774,0,1579 chrIV 694789 . A C 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.678;DP=164;Dels=0.00;FS=1.217;HaplotypeScore=5.9084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.844;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:164:99:1609,0,2030 chrIV 694831 . A C 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.754;DP=154;Dels=0.00;FS=2.934;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1516,0,1870 chrIV 695272 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;DP=125;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.664;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1261,0,1325 chrIV 695335 . G A 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.523;DP=142;Dels=0.00;FS=2.953;HaplotypeScore=3.5510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.480;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1656,0,1356 chrIV 695576 . A C 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.694;DP=134;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,79:134:99:1753,0,1222 chrIV 695620 . G A 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3227,328,0 chrIV 695635 . C T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.114;DP=118;Dels=0.00;FS=2.381;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1501,0,1120 chrIV 695803 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.679;DP=143;Dels=0.00;FS=7.579;HaplotypeScore=5.8966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.228;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1267,0,1696 chrIV 695821 . G A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=159;Dels=0.00;FS=4.725;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.513;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,75:159:99:1587,0,1829 chrIV 696046 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;DP=145;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-3.671;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1495,0,1723 chrIV 696052 . T C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.398;DP=124;Dels=0.00;FS=6.789;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1020,0,1596 chrIV 696062 . G T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.479;DP=130;Dels=0.00;FS=5.286;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1341,0,1449 chrIV 696106 . C G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.371;DP=129;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.492;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1198,0,1436 chrIV 696130 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.668;DP=126;Dels=0.00;FS=1.442;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.005;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1304,0,1349 chrIV 696145 . A G 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.302;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.547;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1050,0,1474 chrIV 696199 . C T 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.355;DP=96;Dels=0.00;FS=3.904;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.646;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:970,0,1146 chrIV 696549 . G A 600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.674;DP=88;Dels=0.00;FS=12.835;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.900;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:630,0,1322 chrIV 696637 . A G 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.103;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=1;MQRankSum=-0.583;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.400;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,84:164:99:1668,0,1727 chrIV 696745 . T C 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.955;DP=173;Dels=0.00;FS=1.246;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.997;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,84:173:99:1756,0,1947 chrIV 696847 . G C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;DP=135;Dels=0.00;FS=7.824;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.947;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:135:99:1245,0,1470 chrIV 696886 . A G 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.934;DP=134;Dels=0.00;FS=4.152;HaplotypeScore=3.7631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1662,0,1273 chrIV 696979 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.432;DP=135;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=2.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1341,0,1556 chrIV 697096 . A G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.640;DP=146;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.282;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1381,0,1709 chrIV 697105 . T C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.233;DP=157;Dels=0.00;FS=3.808;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.214;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1438,0,1958 chrIV 697118 . A G 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3563,366,0 chrIV 697144 . A G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.617;DP=128;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.546;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1113,0,1712 chrIV 697201 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;DP=151;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.461;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1324,0,1942 chrIV 697575 . A G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.779;DP=134;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.6159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1486,0,1396 chrIV 697612 . T C 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.866;DP=143;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.039;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1607,0,1386 chrIV 697648 . A G 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.563;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=12.59;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1679,0,1196 chrIV 697693 . A G 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.180;DP=141;Dels=0.00;FS=4.306;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.040;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1715,0,1232 chrIV 697699 . T G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.581;DP=120;Dels=0.00;FS=5.656;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.483;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1458,0,1042 chrIV 697705 . G A 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.976;DP=120;Dels=0.00;FS=7.030;HaplotypeScore=2.6511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.569;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1557,0,1074 chrIV 697759 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.836;DP=130;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1634,0,1196 chrIV 697891 . G A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.136;DP=122;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.822;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1319,0,1319 chrIV 697912 . A T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.127;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.118;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1136,0,1466 chrIV 698225 . T A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:130:99:1401,0,1474 chrIV 698243 . T A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;DP=130;Dels=0.00;FS=4.710;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.086;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1464,0,1504 chrIV 698270 . T C 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.433;DP=137;Dels=0.00;FS=2.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1602,0,1446 chrIV 698272 . T G 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;DP=136;Dels=0.00;FS=3.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1542,0,1360 chrIV 698347 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.378;DP=114;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.152;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1404,0,1041 chrIV 698417 . T C 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.151;DP=119;Dels=0.00;FS=4.437;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,68:119:99:1445,0,1172 chrIV 698508 . T C 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.208;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1416,0,1495 chrIV 698668 . C T 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.106;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.185;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1692,0,1606 chrIV 698670 . G A 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.365;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.642;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1627,0,1544 chrIV 699022 . T A 4747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4747,451,0 chrIV 699153 . C T 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3767,367,0 chrIV 699202 . T A 4897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.98;SB=-2.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4897,490,0 chrIV 699280 . T C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3136,327,0 chrIV 699810 . C G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.031;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.244;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:152:99:1392,0,1713 chrIV 699872 . A G 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.384;DP=159;Dels=0.00;FS=1.238;HaplotypeScore=5.1981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.095;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1484,0,1795 chrIV 699938 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.758;DP=129;Dels=0.00;FS=4.195;HaplotypeScore=9.6240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1361,0,1429 chrIV 700036 . A C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.539;DP=136;Dels=0.00;FS=4.112;HaplotypeScore=4.5466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.894;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1479,0,1345 chrIV 700210 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.736;DP=130;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.525;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1311,0,1508 chrIV 700250 . G A 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.506;DP=161;Dels=0.00;FS=2.031;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.069;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1678,0,1707 chrIV 700377 . G A 1925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.273;DP=154;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=2.8402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.924;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.875;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,87:154:99:1955,0,1336 chrIV 700440 . C T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.793;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.629;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1385,0,1405 chrIV 700614 . A G 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.659;DP=132;Dels=0.00;FS=3.108;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.045;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1502,0,1436 chrIV 700773 . T C 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.534;DP=106;Dels=0.00;FS=10.914;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:961,0,1295 chrIV 700855 . G A 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.628;DP=146;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=4.7177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.439;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:1000,0,1926 chrIV 701064 . A G 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.353;DP=104;Dels=0.00;FS=4.906;HaplotypeScore=2.9247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:919,0,1334 chrIV 701178 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.084;DP=113;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.40;MQ0=0;MQRankSum=-5.853;QD=9.35;ReadPosRankSum=-3.292;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1087,0,1268 chrIV 701238 . C G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;DP=107;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.014;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:980,0,1262 chrIV 701262 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.915;DP=118;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=2.8047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.511;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.374;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1203,0,1317 chrIV 701279 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.541;DP=111;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1047,0,1277 chrIV 701448 . T C 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.579;DP=148;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.234;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:148:99:1490,0,1690 chrIV 701457 . G A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.292;DP=141;Dels=0.00;FS=2.992;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.394;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1565,0,1529 chrIV 701669 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.493;DP=131;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.758;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1231,0,1479 chrIV 701674 . G C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.980;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.130;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1293,0,1451 chrIV 702278 . T A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;DP=135;Dels=0.00;FS=3.106;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.825;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1485,0,1528 chrIV 702480 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;DP=125;Dels=0.00;FS=9.664;HaplotypeScore=3.9680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.773;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1452,0,1265 chrIV 702555 . T C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.661;DP=115;Dels=0.00;FS=2.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1165,0,1233 chrIV 702706 . A G 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.301;DP=141;Dels=0.00;FS=6.199;HaplotypeScore=2.9269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.282;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1497,0,1538 chrIV 702757 . A T 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;DP=159;Dels=0.00;FS=3.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1606,0,1913 chrIV 702817 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.677;DP=120;Dels=0.00;FS=4.379;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.309;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1187,0,1417 chrIV 702967 . A G 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.751;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:958,0,686 chrIV 703275 . A G 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;DP=125;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.321;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1494,0,1145 chrIV 703309 . A G 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.340;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.883;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1317,0,1273 chrIV 703359 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.692;DP=143;Dels=0.00;FS=3.355;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.565;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1449,0,1499 chrIV 703386 . G C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.36;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3558,355,0 chrIV 703521 . G A 4349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4349,409,0 chrIV 703740 . C T 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.776;DP=104;Dels=0.00;FS=2.595;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:907,0,1309 chrIV 703850 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.136;DP=130;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=2.6938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.872;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1316,0,1417 chrIV 703854 . G C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.918;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.162;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1350,0,1318 chrIV 703905 . C T 1875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;DP=171;Dels=0.00;FS=4.438;HaplotypeScore=7.9131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,88:171:99:1905,0,1764 chrIV 704286 . T C 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.976;DP=110;Dels=0.00;FS=17.256;HaplotypeScore=2.8566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:973,0,1434 chrIV 704345 . T A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;DP=131;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1565,0,1316 chrIV 704410 . A T 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;DP=146;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=7.6556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=11.35;ReadPosRankSum=-2.471;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1687,0,1567 chrIV 705119 . C T 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.857;DP=107;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.900;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:983,0,1158 chrIV 705383 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.408;DP=122;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=4.9003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1428,0,1254 chrIV 705884 . G A 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.397;DP=141;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1730,0,1357 chrIV 706032 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.834;DP=139;Dels=0.00;FS=13.191;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=2.252;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.018;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1325,0,1555 chrIV 706217 . A T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;DP=121;Dels=0.00;FS=15.012;HaplotypeScore=3.7073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=9.73;ReadPosRankSum=-2.123;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1207,0,1461 chrIV 707014 . A C 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.247;DP=144;Dels=0.00;FS=1.341;HaplotypeScore=2.6742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=-0.948;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.490;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:144:99:1592,0,1456 chrIV 707342 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.058;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1496,0,1178 chrIV 707384 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.965;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1238,0,1661 chrIV 707654 . T C 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.153;DP=129;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:1123,0,1640 chrIV 707900 . A T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.916;DP=130;Dels=0.00;FS=10.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=1;MQRankSum=-0.159;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1189,0,1636 chrIV 707905 . T A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=126;Dels=0.00;FS=9.653;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=1;MQRankSum=0.379;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1198,0,1582 chrIV 708086 . A G 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.873;DP=101;Dels=0.00;FS=8.025;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:850,0,1332 chrIV 708341 . T C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.025;DP=124;Dels=0.00;FS=10.006;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=11.44;ReadPosRankSum=2.224;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1449,0,1139 chrIV 708639 . G A 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.876;DP=157;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=3.8522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=1;MQRankSum=0.571;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.981;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,80:157:99:1804,0,1592 chrIV 709011 . T C 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.853;DP=154;Dels=0.00;FS=2.009;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.103;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1570,0,1828 chrIV 709040 . A G 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.293;DP=132;Dels=0.00;FS=7.761;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=8.90;ReadPosRankSum=-3.057;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1205,0,1636 chrIV 709210 . G C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.685;DP=136;Dels=0.00;FS=12.356;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.824;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1216,0,1527 chrIV 709257 . A G 1672.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.749;DP=164;Dels=0.00;FS=1.222;HaplotypeScore=4.8020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.345;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,83:164:99:1702,0,1829 chrIV 709260 . T C 1521.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.540;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.097;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.005;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1551,0,1825 chrIV 709261 . A C 1500.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.171;DP=154;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.301;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1530,0,1723 chrIV 709611 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;DP=140;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.330;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1444,0,1648 chrIV 709623 . T C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.077;DP=141;Dels=0.00;FS=5.166;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.543;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1424,0,1496 chrIV 709686 . T C 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.635;DP=151;Dels=0.00;FS=1.296;HaplotypeScore=5.5701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.663;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:151:99:1641,0,1621 chrIV 709887 . C T 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.844;DP=172;Dels=0.00;FS=4.750;HaplotypeScore=4.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.058;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,89:172:99:1910,0,1767 chrIV 709938 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=156;Dels=0.00;FS=5.607;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1495,0,1780 chrIV 710100 . G A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.239;DP=136;Dels=0.00;FS=9.128;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.386;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1516,0,1413 chrIV 710109 . G A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;DP=139;Dels=0.00;FS=7.569;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.915;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.081;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1504,0,1553 chrIV 710130 . C T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.036;DP=135;Dels=0.00;FS=7.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1300,0,1679 chrIV 710277 . A G 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.181;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.697;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1768,0,1542 chrIV 710371 . A G 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3192,333,0 chrIV 710478 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.437;DP=114;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=2.7541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.903;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.164;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:114:99:1277,0,1037 chrIV 710492 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.762;DP=115;Dels=0.00;FS=2.399;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.700;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1352,0,1055 chrIV 710715 . C T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.671;DP=123;Dels=0.00;FS=9.961;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1211,0,1479 chrIV 710850 . A G 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.235;DP=144;Dels=0.00;FS=5.003;HaplotypeScore=6.3613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1541,0,1533 chrIV 710853 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.963;DP=138;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=7.1500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.264;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1466,0,1389 chrIV 710996 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.698;DP=112;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=8.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1053,0,1415 chrIV 711174 . C T 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.692;DP=124;Dels=0.00;FS=9.977;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.316;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.906;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,48:124:99:1006,0,1683 chrIV 711312 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.828;DP=132;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=9.51;ReadPosRankSum=2.223;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1285,0,1611 chrIV 711314 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.538;DP=132;Dels=0.00;FS=1.442;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=9.17;ReadPosRankSum=2.063;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:132:99:1241,0,1590 chrIV 711352 . T A 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.385;DP=105;Dels=0.00;FS=9.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1049,0,1233 chrIV 711426 . T C 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.929;DP=102;Dels=0.00;FS=5.151;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:848,0,1364 chrIV 711528 . A C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.524;DP=130;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=2.158;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.725;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1106,0,1693 chrIV 711759 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.480;DP=141;Dels=0.00;FS=3.106;HaplotypeScore=3.8966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.820;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,56:141:99:1148,0,1961 chrIV 711909 . C G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;DP=119;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1243,0,1374 chrIV 711924 . A G 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.007;DP=101;Dels=0.00;FS=5.085;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:999,0,1252 chrIV 711956 . G A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.745;DP=127;Dels=0.00;FS=3.191;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.031;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1313,0,1439 chrIV 712092 . C T 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.717;DP=141;Dels=0.00;FS=6.220;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.188;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1646,0,1397 chrIV 712122 . G A 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.818;DP=143;Dels=0.00;FS=2.133;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.363;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1762,0,1295 chrIV 712473 . G A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.400;DP=137;Dels=0.00;FS=1.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1560,0,1369 chrIV 712698 . A T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;DP=135;Dels=0.00;FS=2.209;HaplotypeScore=4.6007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1242,0,1682 chrIV 712818 . A G 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.353;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.665;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:135:99:1053,0,1811 chrIV 712857 . A G 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.220;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.099;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1293,0,1856 chrIV 713009 . A G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.017;DP=142;Dels=0.00;FS=3.976;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1449,0,1573 chrIV 713011 . G C 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.950;DP=137;Dels=0.00;FS=4.042;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1431,0,1423 chrIV 713074 . G T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.425;DP=119;Dels=0.00;FS=10.002;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.46;MQ0=0;MQRankSum=-4.203;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.348;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1192,0,1293 chrIV 713084 . G T 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.291;DP=99;Dels=0.00;FS=8.076;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQ0=0;MQRankSum=-3.819;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.662;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:1024,0,1078 chrIV 713108 . C T 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.718;DP=87;Dels=0.00;FS=1.761;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.76;MQ0=0;MQRankSum=-5.642;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.021;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:904,0,983 chrIV 713109 . C T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.957;DP=87;Dels=0.00;FS=1.751;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.160;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:87:99:894,0,977 chrIV 713130 . C T 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.310;DP=95;Dels=0.00;FS=6.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=-4.050;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:935,0,1101 chrIV 713166 . C T 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.006;DP=130;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1113,0,1508 chrIV 713335 . T C 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.057;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.509;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:147:99:1646,0,1471 chrIV 713336 . T A 3936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3936,385,0 chrIV 713505 . G A 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.208;DP=131;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.537;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:131:99:1754,0,1187 chrIV 713520 . A G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.903;DP=119;Dels=0.00;FS=3.402;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1461,0,1224 chrIV 713623 . G A 1894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.620;DP=162;Dels=0.00;FS=2.760;HaplotypeScore=8.3939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:1924,0,1604 chrIV 713871 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.296;DP=121;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=8.5340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.023;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1514,0,1026 chrIV 714483 . T C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.948;DP=133;Dels=0.00;FS=2.204;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=-0.846;QD=11.54;ReadPosRankSum=-2.266;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1565,0,1405 chrIV 714663 . A T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.454;DP=140;Dels=0.00;FS=5.390;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.557;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,57:140:99:1218,0,1817 chrIV 714714 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.522;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1389,0,1333 chrIV 714933 . T C 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6837;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2963,303,0 chrIV 715349 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.192;DP=119;Dels=0.00;FS=5.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.567;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1414,0,1126 chrIV 715352 . T C 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.264;DP=124;Dels=0.00;FS=6.842;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.725;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1491,0,1257 chrIV 715627 . C T 1830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;DP=149;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=12.28;ReadPosRankSum=-2.161;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,86:149:99:1860,0,1324 chrIV 715629 . A G 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.728;DP=146;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.644;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:146:99:1755,0,1362 chrIV 715691 . G A 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.070;DP=137;Dels=0.00;FS=6.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1670,0,1335 chrIV 715715 . T A 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;DP=152;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.386;QD=11.47;ReadPosRankSum=-2.836;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1773,0,1617 chrIV 715773 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.070;DP=122;Dels=0.00;FS=2.608;HaplotypeScore=2.7031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.716;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1368,0,1317 chrIV 715933 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.483;DP=120;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.485;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1121,0,1544 chrIV 716020 . C T 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.696;DP=140;Dels=0.00;FS=4.137;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.551;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1627,0,1354 chrIV 716118 . T C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.855;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.881;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1417,0,1413 chrIV 716179 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.719;DP=138;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1380,0,1530 chrIV 716374 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.578;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.434;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1172,0,1638 chrIV 716407 . A T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.381;DP=112;Dels=0.00;FS=6.228;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.971;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.299;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1102,0,1478 chrIV 716464 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.433;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.731;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1284,0,1851 chrIV 716510 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.119;DP=164;Dels=0.00;FS=8.104;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,70:164:99:1370,0,2155 chrIV 716521 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.608;DP=163;Dels=0.00;FS=12.182;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.630;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,73:163:99:1448,0,1968 chrIV 716641 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.103;DP=121;Dels=0.00;FS=2.415;HaplotypeScore=3.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.964;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1163,0,1288 chrIV 716654 . G T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.939;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=8.50;ReadPosRankSum=2.042;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:129:99:1127,0,1518 chrIV 716660 . C T 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;DP=128;Dels=0.00;FS=2.400;HaplotypeScore=4.7880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.966;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1196,0,1440 chrIV 716832 . G A 1983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.026;DP=179;Dels=0.00;FS=1.864;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.427;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,98:179:99:2013,0,1566 chrIV 716915 . C T 1988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.364;DP=148;Dels=0.00;FS=5.051;HaplotypeScore=4.5537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.261;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,87:148:99:2018,0,1185 chrIV 717247 . T C 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.644;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.089;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.052;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:944,0,1145 chrIV 717264 . T C 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.928;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:836,0,873 chrIV 717285 . A G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.888;DP=85;Dels=0.00;FS=1.870;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:943,0,916 chrIV 717372 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;DP=110;Dels=0.00;FS=11.521;HaplotypeScore=2.9664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1151,0,1238 chrIV 717377 . G C 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8331;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2786,294,0 chrIV 717532 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.715;DP=94;Dels=0.00;FS=5.552;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.076;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1133,0,907 chrIV 717546 . C T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.901;DP=96;Dels=0.00;FS=5.253;HaplotypeScore=3.3957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.866;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1119,0,910 chrIV 717634 . C A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.640;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.398;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1121,0,1201 chrIV 717729 . G C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;DP=106;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.272;QD=10.10;ReadPosRankSum=2.157;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1101,0,1148 chrIV 717736 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.704;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=10.01;ReadPosRankSum=2.055;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1081,0,1175 chrIV 717744 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.003;DP=118;Dels=0.00;FS=5.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=9.92;ReadPosRankSum=2.386;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1200,0,1273 chrIV 717791 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.359;DP=124;Dels=0.00;FS=3.341;HaplotypeScore=3.3882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:1076,0,1650 chrIV 717813 . C T 769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.179;DP=106;Dels=0.00;FS=4.206;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.635;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:799,0,1476 chrIV 717834 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.437;DP=112;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:1022,0,1443 chrIV 717840 . G A 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3739,358,0 chrIV 717936 . G A 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.804;DP=150;Dels=0.00;FS=11.620;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=1;MQRankSum=0.185;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.849;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1780,0,1503 chrIV 717987 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.958;DP=119;Dels=0.00;FS=6.345;HaplotypeScore=6.9455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=1;MQRankSum=-0.097;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1380,0,1234 chrIV 718146 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.250;DP=129;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.072;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1475,0,1350 chrIV 718187 . C A 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.652;DP=161;Dels=0.00;FS=8.140;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.456;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1782,0,1640 chrIV 718242 . T A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.304;DP=139;Dels=0.00;FS=3.152;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.616;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1391,0,1682 chrIV 718259 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.218;DP=147;Dels=0.00;FS=16.018;HaplotypeScore=2.3565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.354;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1373,0,1805 chrIV 718296 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.669;DP=142;Dels=0.00;FS=5.160;HaplotypeScore=5.5110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.53;MQ0=0;MQRankSum=-3.124;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1249,0,1773 chrIV 718303 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.941;DP=148;Dels=0.00;FS=5.106;HaplotypeScore=4.7275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:148:99:1272,0,1927 chrIV 718331 . A C 1147.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.859;DP=125;Dels=0.00;FS=3.603;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.295;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.884;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1177,0,1551 chrIV 718335 . C T 1208.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.582;DP=121;Dels=0.00;FS=1.541;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.872;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.756;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1238,0,1451 chrIV 718341 . G A 1156.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.543;DP=114;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=3.6173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.493;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.638;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1186,0,1308 chrIV 718416 . C A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.970;DP=98;Dels=0.00;FS=3.778;HaplotypeScore=4.7160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1154,0,1026 chrIV 718455 . A T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.027;DP=101;Dels=0.00;FS=3.666;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1212,0,973 chrIV 718506 . T C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.053;DP=119;Dels=0.00;FS=7.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1497,0,1053 chrIV 718640 . T G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.817;DP=122;Dels=0.00;FS=4.445;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.389;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.760;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1129,0,1502 chrIV 718760 . G A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.375;DP=124;Dels=0.00;FS=8.591;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.495;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1516,0,1188 chrIV 718867 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;DP=130;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.079;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1248,0,1528 chrIV 718958 . C T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.282;DP=125;Dels=0.00;FS=11.841;HaplotypeScore=5.8318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=8.26;ReadPosRankSum=2.277;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1062,0,1678 chrIV 719116 . C T 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.549;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.367;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,45:117:99:949,0,1542 chrIV 719380 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.301;DP=94;Dels=0.00;FS=5.263;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-3.370;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.374;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1178,0,936 chrIV 719391 . T C 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2654,270,0 chrIV 719554 . C T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.917;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.757;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:1143,0,969 chrIV 719695 . C T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;DP=128;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=11.83;ReadPosRankSum=-2.111;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1544,0,1163 chrIV 719745 . A G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3466,357,0 chrIV 719860 . C G 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3187,315,0 chrIV 719959 . G A 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.519;DP=145;Dels=0.00;FS=3.228;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1552,0,1635 chrIV 720029 . T G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.071;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.984;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1262,0,1689 chrIV 720061 . A G 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3313,325,0 chrIV 720086 . G C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.210;DP=113;Dels=0.00;FS=4.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.399;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1063,0,1262 chrIV 720284 . A G 727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.761;DP=74;Dels=0.00;FS=0.890;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.620;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.942;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:757,0,861 chrIV 720439 . T A 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=28.13;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3488,352,0 chrIV 720440 . C T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=28.15;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3491,349,0 chrIV 720596 . T G 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.584;DP=86;Dels=0.00;FS=4.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=2.593;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.826;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,33:86:99:721,0,923 chrIV 720637 . A T 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;DP=108;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.965;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,37:108:99:755,0,1717 chrIV 720645 . A G 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.848;DP=110;Dels=0.00;FS=3.890;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.968;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,71:110:99:1614,0,823 chrIV 720763 . G T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.672;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.375;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1390,0,1241 chrIV 720993 . C G 692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.464;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.167;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:722,0,1097 chrIV 721110 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.650;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.962;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1257,0,1128 chrIV 721119 . C T 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.260;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1265,0,1017 chrIV 721283 . A G 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3646,376,0 chrIV 722011 . C T 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.007;DP=127;Dels=0.00;FS=9.574;HaplotypeScore=6.7289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1157,0,1509 chrIV 722058 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.136;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=8.99;ReadPosRankSum=2.351;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1270,0,1623 chrIV 722085 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.059;DP=146;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.344;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1298,0,1796 chrIV 722265 . A G 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.698;DP=169;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=20.7978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=2.228;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,71:169:99:1082,0,1926 chrIV 722306 . G A 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.698;DP=130;Dels=0.00;FS=1.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.343;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1356,0,1444 chrIV 722348 . A G 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.669;DP=156;Dels=0.00;FS=3.797;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.972;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:156:99:1738,0,1616 chrIV 722407 . A G 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.633;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=2.208;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.263;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:154:99:1533,0,1788 chrIV 722460 . G A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.482;DP=119;Dels=0.00;FS=5.635;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.246;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1301,0,1271 chrIV 722585 . C T 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.166;DP=131;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1235,0,1448 chrIV 722672 . T C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.474;DP=129;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.840;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.610;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1307,0,1408 chrIV 722772 . T C 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.452;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1555,0,1625 chrIV 722776 . A G 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3656,387,0 chrIV 722840 . A C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.369;DP=156;Dels=0.00;FS=2.073;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.257;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.126;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1586,0,1745 chrIV 722940 . C T 157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.409;DP=88;Dels=0.00;FS=1.870;HaplotypeScore=37.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,47:88:99:187,0,821 chrIV 723133 . G A 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.856;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,78:176:99:1612,0,2157 chrIV 723157 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.644;DP=188;Dels=0.00;FS=3.493;HaplotypeScore=4.9641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.851;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,85:188:99:1615,0,2207 chrIV 723163 . G A 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.091;DP=188;Dels=0.00;FS=1.261;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.554;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,87:188:99:1627,0,2205 chrIV 723345 . G A 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.495;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.823;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1708,0,1596 chrIV 723783 . C T 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.233;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=2.490;QD=11.30;ReadPosRankSum=2.826;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1578,0,1419 chrIV 723847 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.456;DP=123;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.192;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1117,0,1501 chrIV 723895 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.343;DP=95;Dels=0.00;FS=4.040;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.748;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.572;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1217,0,736 chrIV 723901 . T C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.987;DP=101;Dels=0.00;FS=3.849;HaplotypeScore=3.3213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=10.56;ReadPosRankSum=2.089;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:101:99:1097,0,765 chrIV 723910 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.739;DP=101;Dels=0.00;FS=5.189;HaplotypeScore=4.3229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.489;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1196,0,732 chrIV 723916 . T C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.995;DP=103;Dels=0.00;FS=5.172;HaplotypeScore=10.7605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.948;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1040,0,880 chrIV 724081 . G A 4163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=28.13;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4163,418,0 chrIV 724549 . A C 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.599;DP=141;Dels=0.00;FS=7.582;HaplotypeScore=6.5445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.383;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:141:99:1510,0,1340 chrIV 724570 . A G 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.177;DP=149;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=4.8444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1751,0,1410 chrIV 724610 . C T 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.918;DP=149;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.176;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1657,0,1455 chrIV 725095 . G A 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.986;DP=153;Dels=0.00;FS=3.773;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1817,0,1398 chrIV 725197 . T C 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.202;DP=134;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=2.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1536,0,1275 chrIV 725245 . C T 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3681,369,0 chrIV 725461 . T C 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.40;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3157,348,0 chrIV 725814 . T C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.235;DP=134;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=6.6012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1282,0,1550 chrIV 726400 . T C 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;DP=131;Dels=0.00;FS=10.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1560,0,1306 chrIV 726762 . C G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.093;DP=116;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.254;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1269,0,1260 chrIV 727008 . T C 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.204;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.934;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:966,0,1270 chrIV 727318 . T A 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3320,313,0 chrIV 727392 . C T 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.429;DP=145;Dels=0.00;FS=2.946;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.157;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1598,0,1548 chrIV 727810 . T C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.341;DP=145;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=2.7565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.821;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1372,0,1799 chrIV 727987 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.886;DP=112;Dels=0.01;FS=4.679;HaplotypeScore=11.8704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.841;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.209;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1217,0,1132 chrIV 728215 . C T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.489;DP=100;Dels=0.00;FS=5.033;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1080,0,1088 chrIV 728250 . G A 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.317;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.101;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1159,0,1011 chrIV 728296 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.347;DP=112;Dels=0.00;FS=3.507;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=11.25;ReadPosRankSum=-2.243;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1290,0,1068 chrIV 728391 . C A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.244;DP=130;Dels=0.00;FS=2.224;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.215;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.352;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1329,0,1509 chrIV 728470 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.557;DP=145;Dels=0.00;FS=3.080;HaplotypeScore=4.5359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.103;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,55:145:99:1037,0,1964 chrIV 728918 . C T 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3454,343,0 chrIV 728966 . A C 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.99;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3401,348,0 chrIV 729030 . G A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.148;DP=141;Dels=0.00;FS=3.117;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1386,0,1502 chrIV 729266 . T C 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.275;DP=158;Dels=0.00;FS=3.734;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=1;MQRankSum=-1.740;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1727,0,1728 chrIV 729398 . T C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.138;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.039;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1280,0,1490 chrIV 729422 . G A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;DP=136;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1442,0,1513 chrIV 729752 . T C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;DP=125;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.266;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1165,0,1488 chrIV 730077 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.477;DP=117;Dels=0.00;FS=2.360;HaplotypeScore=5.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1040,0,1405 chrIV 730085 . A G 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;DP=105;Dels=0.00;FS=1.560;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.981;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:974,0,1284 chrIV 730340 . G A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.926;DP=131;Dels=0.00;FS=1.438;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.403;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1281,0,1541 chrIV 730611 . A C 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.827;DP=138;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=4.4334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.567;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1483,0,1554 chrIV 730704 . G A 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.938;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=26.76;ReadPosRankSum=1.001;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2950,295,0 chrIV 730734 . A G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.737;DP=119;Dels=0.00;FS=3.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1055,0,1587 chrIV 731928 . T C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9118;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.78;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3389,351,0 chrIV 732134 . G A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.142;DP=125;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.165;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1320,0,1249 chrIV 732272 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.180;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.328;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1053,0,1320 chrIV 732683 . C T 1855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.486;DP=143;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.220;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,85:143:99:1885,0,1138 chrIV 732994 . C G 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.749;DP=138;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=4.8061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.571;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:138:99:1096,0,1771 chrIV 733047 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.354;DP=115;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=11.64;ReadPosRankSum=-2.163;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1369,0,1186 chrIV 733147 . G T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.269;DP=113;Dels=0.00;FS=5.977;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.567;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1348,0,1101 chrIV 733522 . C T 369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;DP=76;Dels=0.00;FS=2.046;HaplotypeScore=8.0968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:76:99:399,0,632 chrIV 733614 . G C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.848;DP=143;Dels=0.00;FS=4.430;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1366,0,1614 chrIV 733663 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.589;DP=125;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.556;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1238,0,1430 chrIV 734411 . T C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.278;DP=137;Dels=0.00;FS=2.140;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=-1.491;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.969;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1365,0,1542 chrIV 734832 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.680;DP=117;Dels=0.00;FS=3.590;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.153;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,78:117:99:1529,0,821 chrIV 734833 . A T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;DP=116;Dels=0.00;FS=4.867;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=13.01;ReadPosRankSum=1.548;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,76:116:99:1539,0,861 chrIV 735306 . T C 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.286;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.763;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:873,0,1281 chrIV 735360 . A G 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2960,303,0 chrIV 735402 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.991;DP=109;Dels=0.00;FS=3.554;HaplotypeScore=2.4476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1362,0,1045 chrIV 735567 . A T 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;DP=93;Dels=0.00;FS=3.882;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=10.43;ReadPosRankSum=-3.147;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:1000,0,1113 chrIV 735825 . A G 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.208;DP=86;Dels=0.00;FS=20.691;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.169;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,46:86:99:995,0,909 chrIV 736175 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.551;DP=101;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=2.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=12.70;ReadPosRankSum=-2.976;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1313,0,952 chrIV 736692 . C T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.067;DP=128;Dels=0.00;FS=3.354;HaplotypeScore=1.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.329;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1458,0,1385 chrIV 736713 . G A 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;DP=130;Dels=0.00;FS=5.653;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.343;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1279,0,1528 chrIV 736769 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.246;DP=128;Dels=0.00;FS=3.322;HaplotypeScore=2.2337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=0.914;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1236,0,1472 chrIV 736908 . T C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.827;DP=101;Dels=0.00;FS=6.417;HaplotypeScore=2.8663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:101:99:1031,0,1018 chrIV 738672 . A G 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3733,373,0 chrIV 738708 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.838;DP=126;Dels=0.00;FS=1.431;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1191,0,1498 chrIV 739050 . C T 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;DP=134;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1692,0,1288 chrIV 739056 . G A 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3695,367,0 chrIV 740178 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=9.59;ReadPosRankSum=-2.080;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1200,0,1368 chrIV 740249 . T A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;DP=115;Dels=0.00;FS=5.873;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:1069,0,1485 chrIV 740275 . T A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;DP=118;Dels=0.00;FS=8.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1268,0,1452 chrIV 740635 . T G 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.586;DP=133;Dels=0.00;FS=6.833;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=6.69;ReadPosRankSum=2.022;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,49:133:99:920,0,1979 chrIV 740795 . A G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.540;DP=110;Dels=0.00;FS=4.727;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1048,0,1266 chrIV 741444 . C G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.058;DP=126;Dels=0.00;FS=1.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=11.58;ReadPosRankSum=-2.811;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1489,0,1145 chrIV 741499 . C T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.652;DP=147;Dels=0.00;FS=3.063;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=9.93;ReadPosRankSum=-2.377;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1489,0,1579 chrIV 741656 . T A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;DP=101;Dels=0.00;FS=4.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.841;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1182,0,1078 chrIV 741803 . G C 663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.696;DP=63;Dels=0.00;FS=3.442;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:693,0,578 chrIV 741894 . A G 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.980;DP=103;Dels=0.00;FS=5.207;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.485;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1096,0,1126 chrIV 742242 . T A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;DP=134;Dels=0.00;FS=6.596;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=3.037;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.502;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1378,0,1639 chrIV 742728 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.648;DP=128;Dels=0.00;FS=15.319;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.796;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.042;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:128:99:1512,0,1152 chrIV 743645 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.052;DP=131;Dels=0.00;FS=3.150;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1415,0,1345 chrIV 743773 . A G 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.883;DP=132;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.335;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1481,0,1309 chrIV 743850 . T C 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2978,306,0 chrIV 744041 . C T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.225;DP=126;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=3.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.672;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1357,0,1544 chrIV 744157 . G A 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.237;DP=133;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.145;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,53:133:99:1026,0,1739 chrIV 744159 . T C 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.348;DP=122;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,50:122:99:967,0,1616 chrIV 744174 . T C 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.417;DP=107;Dels=0.00;FS=1.658;HaplotypeScore=3.5605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.950;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:916,0,1381 chrIV 744206 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.917;DP=132;Dels=0.00;FS=6.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.999;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1401,0,1334 chrIV 744218 . G A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.729;DP=128;Dels=0.00;FS=3.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1406,0,1256 chrIV 744290 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.712;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.412;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1306,0,1526 chrIV 744306 . A C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.938;DP=123;Dels=0.00;FS=0.779;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1071,0,1380 chrIV 744309 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.923;DP=125;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.811;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1194,0,1450 chrIV 744329 . A T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.426;DP=130;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=2.114;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.020;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1528,0,1257 chrIV 744344 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.036;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1072,0,1252 chrIV 744456 . G T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.568;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.100;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1042,0,1179 chrIV 744457 . A G 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.190;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.103;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.956;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:108:99:979,0,1225 chrIV 744475 . T A 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;DP=101;Dels=0.00;FS=2.646;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.648;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1061,0,1130 chrIV 744524 . C T 1399.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.502;DP=133;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=3.184;QD=10.52;ReadPosRankSum=2.395;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1429,0,1304 chrIV 744529 . A G 1292.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.454;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1322,0,1474 chrIV 744534 . A G 1344.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.765;DP=136;Dels=0.00;FS=4.415;HaplotypeScore=4.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=9.88;ReadPosRankSum=-2.143;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1374,0,1433 chrIV 745067 . G A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.459;DP=133;Dels=0.00;FS=2.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.156;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1525,0,1255 chrIV 745106 . A G 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.902;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1720,0,1371 chrIV 745512 . G A 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.438;DP=150;Dels=0.00;FS=6.834;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.934;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1566,0,1531 chrIV 745766 . G A 4128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4128,400,0 chrIV 745886 . C T 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;DP=125;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=11.47;ReadPosRankSum=-2.033;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1464,0,1264 chrIV 745916 . C T 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3281,322,0 chrIV 745998 . A T 3899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3899,376,0 chrIV 746034 . C T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.235;DP=146;Dels=0.01;FS=0.627;HaplotypeScore=9.6144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.687;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1702,0,1486 chrIV 746064 . A G 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=133;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=9.85;ReadPosRankSum=2.533;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1340,0,1579 chrIV 746167 . C T 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3304,322,0 chrIV 746186 . C T 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3160,309,0 chrIV 746245 . T A 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1169,0,1028 chrIV 746280 . T C 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.754;DP=77;Dels=0.00;FS=3.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:903,0,846 chrIV 746550 . A C 4013.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.24;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4013,391,0 chrIV 746705 . G T 2099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.672;DP=175;Dels=0.00;FS=4.648;HaplotypeScore=6.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.445;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,95:175:99:2129,0,1590 chrIV 746896 . A G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.179;DP=143;Dels=0.00;FS=19.875;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.269;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1390,0,1620 chrIV 747029 . T C 4120.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4120,397,0 chrIV 747123 . G A 63.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.144;DP=104;Dels=0.00;FS=5.612;HaplotypeScore=20.3999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.97;MQ0=0;MQRankSum=-5.265;QD=0.61;ReadPosRankSum=-4.691;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,15:104:93:93,0,1620 chrIV 747124 . T C 59.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=102;Dels=0.00;FS=5.604;HaplotypeScore=20.3999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=-5.526;QD=0.58;ReadPosRankSum=-5.526;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,16:102:89:89,0,1653 chrIV 747300 . C G 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;DP=119;Dels=0.00;FS=1.454;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=2.710;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.168;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1123,0,1352 chrIV 747352 . G T 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.061;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1548,0,1466 chrIV 747541 . A G 210.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.332;DP=103;Dels=0.01;FS=3.649;HaplotypeScore=215.0882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.79;MQ0=0;MQRankSum=2.035;QD=2.04;ReadPosRankSum=2.665;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:240,0,396 chrIV 747544 . G A 349.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.828;DP=107;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=94.2656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.352;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.110;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:379,0,814 chrIV 747550 . G A 663.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.721;DP=103;Dels=0.00;FS=3.656;HaplotypeScore=7.8934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.544;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:693,0,821 chrIV 747674 . A C 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3135,321,0 chrIV 747733 . T C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.901;DP=127;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=5.0635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.863;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1500,0,1136 chrIV 747916 . C A 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.827;DP=133;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1685,0,1200 chrIV 748054 . C T 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.86;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2875,283,0 chrIV 748297 . T C 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.563;DP=116;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1027,0,1531 chrIV 748461 . G A 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;DP=88;Dels=0.00;FS=0.810;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.556;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:744,0,1207 chrIV 748463 . T A 732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.384;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,36:87:99:762,0,1208 chrIV 748485 . A G 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.213;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.630;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:786,0,972 chrIV 748518 . C T 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.789;DP=93;Dels=0.00;FS=5.857;HaplotypeScore=148.8423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.010;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:1018,0,1016 chrIV 748734 . A G 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.649;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.320;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1293,0,1221 chrIV 749258 . A G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;DP=120;Dels=0.00;FS=5.808;HaplotypeScore=2.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.627;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1312,0,1299 chrIV 749263 . C T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.242;DP=122;Dels=0.00;FS=4.497;HaplotypeScore=2.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.677;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1330,0,1280 chrIV 749441 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;DP=146;Dels=0.00;FS=5.338;HaplotypeScore=6.6949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.775;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1439,0,1662 chrIV 749663 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.348;DP=128;Dels=0.00;FS=6.687;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.577;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1514,0,1314 chrIV 749759 . A G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;DP=94;Dels=0.00;FS=3.920;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.305;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:943,0,1146 chrIV 749852 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.548;DP=119;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.770;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.148;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:1096,0,1394 chrIV 749897 . T A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.370;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.568;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:142:99:1548,0,1627 chrIV 750047 . A G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.393;DP=127;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=2.8529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.239;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1233,0,1445 chrIV 750050 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.634;DP=128;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1346,0,1422 chrIV 750110 . T C 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.745;DP=126;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=11.18;ReadPosRankSum=-2.127;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1439,0,1142 chrIV 750688 . C T 1432.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.998;DP=119;Dels=0.00;FS=3.493;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.498;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1462,0,1219 chrIV 750696 . A T 1182.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.810;DP=121;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.175;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1212,0,1481 chrIV 750698 . G A 1168.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.086;DP=126;Dels=0.00;FS=2.344;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.580;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1198,0,1540 chrIV 750778 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.044;DP=135;Dels=0.00;FS=10.828;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.635;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1334,0,1602 chrIV 751203 . C A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.206;DP=130;Dels=0.00;FS=3.158;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=-0.134;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.314;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1553,0,1297 chrIV 751285 . A G 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.680;DP=178;Dels=0.00;FS=0.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,82:178:99:1674,0,2145 chrIV 751326 . A G 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.942;DP=157;Dels=0.00;FS=1.267;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.483;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,68:157:99:1345,0,1971 chrIV 751490 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.899;DP=130;Dels=0.00;FS=5.484;HaplotypeScore=8.2886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=0.348;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:130:99:1499,0,1178 chrIV 751663 . C T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.465;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1493,0,1593 chrIV 751891 . A G 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.710;DP=114;Dels=0.00;FS=8.812;HaplotypeScore=3.5242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1157,0,1263 chrIV 752043 . C T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.556;DP=142;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1497,0,1582 chrIV 752433 . T C 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.135;DP=116;Dels=0.00;FS=5.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=1;MQRankSum=-0.609;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1297,0,1106 chrIV 753137 . T A 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;DP=79;Dels=0.00;FS=1.843;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:838,0,967 chrIV 753275 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.424;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1326,0,1083 chrIV 753357 . A G 2103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2136,225,0 chrIV 753375 . G T 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.366;DP=74;Dels=0.00;FS=2.026;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.054;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:813,0,864 chrIV 753551 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.224;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1323,0,1141 chrIV 753577 . A T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;DP=89;Dels=0.00;FS=4.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.777;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:1060,0,978 chrIV 753858 . G A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.801;DP=117;Dels=0.00;FS=5.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.374;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1284,0,1107 chrIV 754044 . G T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.863;DP=108;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=5.8786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1108,0,1202 chrIV 754071 . C G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;DP=130;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.692;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:1063,0,1610 chrIV 754425 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.078;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.128;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1215,0,1250 chrIV 755101 . T C 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3521,354,0 chrIV 755117 . G A 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.362;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.196;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1688,0,1278 chrIV 755182 . A C 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;DP=135;Dels=0.00;FS=11.319;HaplotypeScore=2.2282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.934;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1426,0,1511 chrIV 755458 . C G 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;DP=140;Dels=0.00;FS=14.202;HaplotypeScore=2.4993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.539;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1609,0,1265 chrIV 755654 . G A 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3527,325,0 chrIV 755785 . A G 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2727,282,0 chrIV 755819 . A G 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3034,309,0 chrIV 756074 . C T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.257;DP=114;Dels=0.00;FS=7.622;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1174,0,1242 chrIV 756751 . A G 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.734;DP=80;Dels=0.00;FS=1.838;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,43:80:99:915,0,809 chrIV 756842 . T C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.991;DP=104;Dels=0.00;FS=5.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.329;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:1004,0,1285 chrIV 756915 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.002;DP=117;Dels=0.00;FS=4.568;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.036;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1096,0,1463 chrIV 757187 . C A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.990;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=2.436;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:1095,0,1490 chrIV 757202 . A G 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;DP=113;Dels=0.00;FS=4.803;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.341;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1537,0,992 chrIV 757409 . A T 908.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.721;DP=133;Dels=0.00;FS=11.695;HaplotypeScore=7.6057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.75;MQ0=0;MQRankSum=-6.390;QD=6.83;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:938,0,1680 chrIV 757412 . G A 660.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.676;DP=137;Dels=0.00;FS=21.861;HaplotypeScore=7.6057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.98;MQ0=0;MQRankSum=-4.410;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.543;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,46:137:99:690,0,1715 chrIV 757414 . A C 608.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.161;DP=133;Dels=0.00;FS=17.763;HaplotypeScore=12.9641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.68;MQ0=0;MQRankSum=-4.824;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.339;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,45:133:99:638,0,1724 chrIV 757430 . T C 495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.321;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.35;MQ0=1;MQRankSum=-5.084;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:525,0,1449 chrIV 757452 . T C 583.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.630;DP=127;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=5.3743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.60;MQ0=8;MQRankSum=-3.890;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:127:99:613,0,1214 chrIV 757454 . A G 564.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.443;DP=129;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.33;MQ0=8;MQRankSum=-4.110;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.767;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:594,0,1191 chrIV 757478 . C A 597.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.917;DP=154;Dels=0.00;FS=24.822;HaplotypeScore=24.8305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.23;MQ0=24;MQRankSum=0.465;QD=3.88;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,49:154:99:627,0,979 chrIV 757506 . A G 1181 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.63;MQ0=29;QD=9.08;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:1214,138,0 chrIV 757508 . G T 798.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.145;DP=129;Dels=0.00;FS=2.885;HaplotypeScore=8.1825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.59;MQ0=29;MQRankSum=0.440;QD=6.19;ReadPosRankSum=3.999;SB=-2.186e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,93:129:96:828,0,96 chrIV 757538 . A G 763.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;DP=104;Dels=0.00;FS=4.695;HaplotypeScore=6.5493;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.86;MQ0=29;MQRankSum=1.814;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.585;SB=-1.653e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,91:104:21:796,21,0 chrIV 757564 . C A 964 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.980;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.05;MQ0=23;MQRankSum=-0.960;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.119;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,109:113:50:997,50,0 chrIV 757601 . A T 200.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.19;MQ0=18;MQRankSum=-2.474;QD=2.35;ReadPosRankSum=2.284;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,42:85:99:230,0,388 chrIV 757602 . C A 329.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;DP=84;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=4.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.29;MQ0=18;MQRankSum=3.235;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.686;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:359,0,258 chrIV 757604 . G A 221.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.27;MQ0=18;MQRankSum=-2.895;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.839;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:251,0,346 chrIV 757606 . A C 210.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.351;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.2771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.38;MQ0=17;MQRankSum=-2.256;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.695;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:240,0,362 chrIV 757616 . T C 347.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.952;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.3613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.61;MQ0=15;MQRankSum=1.150;QD=4.28;ReadPosRankSum=-2.393;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,53:81:99:377,0,216 chrIV 757622 . T C 624 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.921;DP=77;Dels=0.00;FS=10.283;HaplotypeScore=8.5163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.77;MQ0=14;MQRankSum=0.533;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.307;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,74:77:54:657,54,0 chrIV 757631 . G C,T 498.01 filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=18.93;MQ0=11;QD=7.22;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,32,37:69:99:558,297,261,261,0,225 chrIV 757635 . A G 214.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.251;DP=67;Dels=0.00;FS=3.067;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.07;MQ0=11;MQRankSum=0.140;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.501;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:244,0,241 chrIV 757644 . T C 66.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.32;MQ0=13;MQRankSum=-0.339;QD=1.25;ReadPosRankSum=4.176;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:96:96,0,286 chrIV 757646 . A G 65.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.50;MQ0=13;MQRankSum=-0.298;QD=1.27;ReadPosRankSum=4.098;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:95:95,0,277 chrIV 757698 . A G 1562 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5174;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.18;MQ0=10;QD=18.16;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1595,165,0 chrIV 757700 . G A 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.729;DP=87;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.02;MQ0=10;MQRankSum=-4.307;QD=0.40;ReadPosRankSum=1.472;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,22:87:65:65,0,1208 chrIV 757724 . C T 1661.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.301;DP=131;Dels=0.00;FS=2.850;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.93;MQ0=12;MQRankSum=3.781;QD=12.68;ReadPosRankSum=3.133;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,89:131:99:1691,0,470 chrIV 757730 . A G 405.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;DP=144;Dels=0.00;FS=2.771;HaplotypeScore=7.9107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.66;MQ0=13;MQRankSum=-4.076;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.792;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,42:144:99:435,0,1958 chrIV 757742 . G T 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.758;DP=181;Dels=0.00;FS=8.050;HaplotypeScore=37.8558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.22;MQ0=18;MQRankSum=-1.810;QD=0.07;ReadPosRankSum=2.456;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,16:181:42:42,0,2893 chrIV 757750 . A G 132.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.648;DP=192;Dels=0.00;FS=8.360;HaplotypeScore=23.5076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.52;MQ0=17;MQRankSum=-2.781;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.881;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,44:192:99:162,0,3083 chrIV 757756 . C A 234.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.305;DP=200;Dels=0.00;FS=4.784;HaplotypeScore=6.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.94;MQ0=14;MQRankSum=-3.555;QD=1.17;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,49:200:99:264,0,3054 chrIV 757793 . G A 140.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.545;DP=285;Dels=0.00;FS=26.357;HaplotypeScore=12.5807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.55;MQ0=19;MQRankSum=0.397;QD=0.49;ReadPosRankSum=-1.847;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,39:285:99:170,0,4672 chrIV 757824 . T C 3227.04 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.589;DP=381;Dels=0.00;FS=1.721;HaplotypeScore=23.7633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.58;MQ0=24;MQRankSum=-5.922;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.575;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,203:381:99:3257,0,3308 chrIV 757913 . G T 2860.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.937;DP=401;Dels=0.00;FS=20.459;HaplotypeScore=91.4980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.12;MQ0=31;MQRankSum=-4.979;QD=7.13;ReadPosRankSum=-2.904;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,180:401:99:2890,0,1686 chrIV 757937 . T C 1090.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.881;DP=302;Dels=0.00;FS=19.723;HaplotypeScore=138.2129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.87;MQ0=27;MQRankSum=-1.405;QD=3.61;ReadPosRankSum=3.706;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,86:302:99:1120,0,3181 chrIV 757938 . A G 918.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.122;DP=307;Dels=0.00;FS=0.993;HaplotypeScore=84.3372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.66;MQ0=28;MQRankSum=-4.232;QD=2.99;ReadPosRankSum=-4.138;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,98:307:99:948,0,3534 chrIV 757943 . A G 998.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.110;DP=282;Dels=0.00;FS=10.131;HaplotypeScore=145.5331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.17;MQ0=28;MQRankSum=-1.219;QD=3.54;ReadPosRankSum=4.782;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,83:282:99:1028,0,3011 chrIV 757949 . T C 761.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.356;DP=265;Dels=0.00;FS=13.989;HaplotypeScore=81.3433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.83;MQ0=27;MQRankSum=-5.233;QD=2.87;ReadPosRankSum=-4.788;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,92:265:99:791,0,2889 chrIV 757961 . T C 1396.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.420;DP=178;Dels=0.00;FS=8.665;HaplotypeScore=36.7705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.99;MQ0=19;MQRankSum=-3.188;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.201;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,118:178:99:1426,0,860 chrIV 758006 . G A 391.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.007;DP=140;Dels=0.00;FS=10.307;HaplotypeScore=3.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.94;MQ0=21;MQRankSum=2.244;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.969;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,30:140:99:421,0,1416 chrIV 758024 . A G 491.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.471;DP=135;Dels=0.00;FS=8.710;HaplotypeScore=7.5595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.45;MQ0=27;MQRankSum=3.085;QD=3.64;ReadPosRankSum=3.015;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,29:135:99:521,0,1062 chrIV 758025 . T A 505.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.792;DP=135;Dels=0.00;FS=8.768;HaplotypeScore=7.5595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.45;MQ0=27;MQRankSum=3.090;QD=3.74;ReadPosRankSum=3.069;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,29:135:99:535,0,1052 chrIV 758027 . A T 986.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.750;DP=135;Dels=0.00;FS=10.651;HaplotypeScore=34.4616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.45;MQ0=27;MQRankSum=-2.744;QD=7.30;ReadPosRankSum=-2.934;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,104:135:99:1016,0,554 chrIV 758030 . A G 548.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.933;DP=142;Dels=0.00;FS=7.245;HaplotypeScore=35.0400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.38;MQ0=27;MQRankSum=3.103;QD=3.86;ReadPosRankSum=2.459;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,35:142:99:578,0,1078 chrIV 758032 . C A 599.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.093;DP=139;Dels=0.00;FS=7.422;HaplotypeScore=43.3929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.20;MQ0=27;MQRankSum=2.975;QD=4.31;ReadPosRankSum=2.737;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,35:139:99:629,0,990 chrIV 758042 . C T 475.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.795;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=32.2648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.44;MQ0=24;MQRankSum=-2.756;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.317;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,75:124:99:505,0,904 chrIV 758070 . T C 89.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.009;DP=105;Dels=0.00;FS=24.959;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.27;MQ0=18;MQRankSum=-0.399;QD=0.85;ReadPosRankSum=0.780;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,17:105:99:119,0,999 chrIV 758072 . A G 92.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;DP=109;Dels=0.00;FS=21.852;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.82;MQ0=20;MQRankSum=-1.213;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:122,0,964 chrIV 758124 . A G 1695 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.33;MQ0=26;QD=10.27;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:1728,195,0 chrIV 758126 . G T 1381.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.856;DP=178;Dels=0.00;FS=11.052;HaplotypeScore=10.4166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.40;MQ0=26;MQRankSum=-1.879;QD=7.76;ReadPosRankSum=2.473;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,140:178:39:1411,0,39 chrIV 758150 . C T 88.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.749;DP=258;Dels=0.00;FS=9.606;HaplotypeScore=2.2064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.38;MQ0=27;MQRankSum=0.122;QD=0.34;ReadPosRankSum=-2.690;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,37:258:99:118,0,3099 chrIV 758151 . A G 133.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.771;DP=265;Dels=0.00;FS=3.598;HaplotypeScore=2.2064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.41;MQ0=27;MQRankSum=0.388;QD=0.50;ReadPosRankSum=-2.436;SB=-4.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,37:265:99:163,0,3326 chrIV 758156 . A G 3286.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.760;DP=280;Dels=0.00;FS=2.297;HaplotypeScore=5.2181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.39;MQ0=28;MQRankSum=-0.354;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.132;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,235:280:99:3286,0,252 chrIV 758182 . C A 6070.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=286;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.59;MQ0=24;QD=21.22;SB=-2.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,286:286:99:6070,639,0 chrIV 758203 . A G 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.506;DP=274;Dels=0.00;FS=35.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.21;MQ0=32;MQRankSum=-1.689;QD=0.10;ReadPosRankSum=-2.535;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,37:274:57:57,0,4339 chrIV 758219 . A T 5254.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.400;DP=256;Dels=0.00;FS=9.284;HaplotypeScore=8.8538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.11;MQ0=20;MQRankSum=4.720;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-2.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,235:256:99:5254,461,0 chrIV 758234 . C T 1277.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.901;DP=192;Dels=0.00;FS=0.562;HaplotypeScore=11.9555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.68;MQ0=18;MQRankSum=3.613;QD=6.65;ReadPosRankSum=-3.829;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,84:192:99:1307,0,1610 chrIV 758240 . T C 2948 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-5.635;DP=164;Dels=0.00;FS=39.407;HaplotypeScore=15.3431;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.23;MQ0=17;MQRankSum=5.309;QD=17.98;ReadPosRankSum=-5.005;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,150:164:99:2981,336,0 chrIV 758249 . T C 1056.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.456;DP=148;Dels=0.00;FS=14.122;HaplotypeScore=6.9702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.10;MQ0=16;MQRankSum=-1.084;QD=7.14;ReadPosRankSum=2.159;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1086,0,973 chrIV 758253 . G A 1069.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.823;DP=139;Dels=0.00;FS=11.607;HaplotypeScore=9.9158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.90;MQ0=16;MQRankSum=-1.149;QD=7.69;ReadPosRankSum=2.735;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:139:99:1099,0,861 chrIV 758289 . C T 106.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.540;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.49;MQ0=10;MQRankSum=1.080;QD=2.87;ReadPosRankSum=2.033;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:136,0,103 chrIV 758294 . C A 110.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.964;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.48;MQ0=10;MQRankSum=1.082;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.317;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:140,0,107 chrIV 758310 . T C 268 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.17;MQ0=4;QD=11.65;SB=-8.689e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:33:301,33,0 chrIV 758342 . T C 262.07 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.44;MQ0=5;MQRankSum=-0.167;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.057;SB=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:36:15:292,0,15 chrIV 758348 . A G 306.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.485;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.37;MQ0=6;MQRankSum=0.025;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.628;SB=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:10:336,0,10 chrIV 758372 . A G 167.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.460;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.81;MQ0=6;MQRankSum=0.225;QD=3.98;ReadPosRankSum=-3.818;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:197,0,230 chrIV 758374 . C A 146.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.799;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.81;MQ0=6;MQRankSum=0.296;QD=3.48;ReadPosRankSum=-2.734;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:176,0,255 chrIV 758411 . A T 227.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.208;DP=70;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.73;MQ0=35;MQRankSum=0.413;QD=3.24;ReadPosRankSum=2.030;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,48:70:99:257,0,141 chrIV 758426 . C T 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.795;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.69;MQ0=36;MQRankSum=-1.061;QD=0.54;ReadPosRankSum=1.673;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:65:65,0,271 chrIV 758432 . T C 219.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.231;DP=65;Dels=0.00;FS=4.929;HaplotypeScore=16.7159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.68;MQ0=37;MQRankSum=-0.492;QD=3.37;ReadPosRankSum=2.066;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,51:65:98:249,0,98 chrIV 758441 . T C 86.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.09;MQ0=40;MQRankSum=0.970;QD=1.30;ReadPosRankSum=2.749;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:116,0,210 chrIV 758445 . G A 115.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.95;MQ0=43;MQRankSum=0.282;QD=1.62;ReadPosRankSum=2.305;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:145,0,212 chrIV 758473 . A T 97.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.160;DP=165;Dels=0.00;FS=5.019;HaplotypeScore=9.7702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.16;MQ0=111;MQRankSum=0.279;QD=0.59;ReadPosRankSum=1.732;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,60:165:99:127,0,301 chrIV 758480 . C A 241.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.038;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.07;MQ0=112;MQRankSum=2.170;QD=1.40;ReadPosRankSum=3.224;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,53:172:99:271,0,153 chrIV 758508 . A G 482 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.49;MQ0=123;QD=2.61;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:60:515,60,0 chrIV 758510 . G T 468 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.378;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.49;MQ0=123;MQRankSum=0.333;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.620;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,169:185:57:501,57,0 chrIV 758540 . A G 488.02 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.295;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.2894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.89;MQ0=136;MQRankSum=0.047;QD=2.17;ReadPosRankSum=-4.034;SB=4.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,191:225:25:521,25,0 chrIV 758566 . C A 152.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.962;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.53;MQ0=88;MQRankSum=0.059;QD=1.06;ReadPosRankSum=3.571;SB=-5.768e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,136:144:21:185,21,0 chrIV 758604 . C A 82.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.463;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.80;MQ0=43;MQRankSum=-1.781;QD=1.01;ReadPosRankSum=1.061;SB=-7.202e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,72:81:35:112,0,35 chrIV 758618 . T C 123.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.275;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.93;MQ0=36;MQRankSum=0.223;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.491;SB=-1.076e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,60:64:18:156,18,0 chrIV 758624 . T C 74.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.39;MQ0=35;MQRankSum=-1.387;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.561;SB=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,52:55:13:104,0,13 chrIV 758700 . A G 272 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.49;MQ0=100;QD=2.41;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:33:305,33,0 chrIV 758702 . G A,T 231.01 filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=8.38;MQ0=103;MQRankSum=1.470;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.203;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,9,102:116:82:291,187,175,104,0,82 chrIV 758726 . C T 85.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.034;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.66;MQ0=125;MQRankSum=-0.581;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.872;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,38:139:99:115,0,140 chrIV 758727 . A G 86.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.63;MQ0=126;MQRankSum=0.323;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.614;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,36:140:99:116,0,147 chrIV 758732 . A G 112.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.60;MQ0=127;MQRankSum=0.225;QD=0.79;ReadPosRankSum=2.007;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,103:141:99:142,0,114 chrIV 758738 . C T 47.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.73;MQ0=143;MQRankSum=-0.306;QD=0.30;ReadPosRankSum=1.164;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,7:158:77:77,0,185 chrIV 758758 . C A 225.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.08;MQ0=136;QD=1.52;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:27:258,27,0 chrIV 758796 . C A 227.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;DP=134;Dels=0.00;FS=13.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.11;MQ0=112;MQRankSum=-0.158;QD=1.69;ReadPosRankSum=1.261;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,123:134:27:260,27,0 chrIV 758810 . T C 262 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.49;MQ0=89;QD=2.28;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:33:295,33,0 chrIV 758816 . T C 262 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.57;MQ0=90;QD=2.22;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:33:295,33,0 chrIV 758882 . A G 11.36 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;DP=34;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.88;MQ0=23;MQRankSum=-1.423;QD=0.33;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:20:41,0,20 chrIV 758894 . A T 14.21 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;DP=35;Dels=0.00;FS=3.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.95;MQ0=23;MQRankSum=-1.448;QD=0.41;ReadPosRankSum=-1.738;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:18:44,0,18 chrIV 758973 . C G 47.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.91;MQ0=8;MQRankSum=0.727;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.727;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,3:12:9:80,9,0 chrIV 758984 . A G 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=8;MQRankSum=1.231;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,3:13:9:82,9,0 chrIV 758985 . T A 57.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=8;MQRankSum=1.231;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,3:13:9:90,9,0 chrIV 759002 . T C 78.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.88;MQ0=23;MQRankSum=0.751;QD=2.45;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-4.542e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,28:32:12:111,12,0 chrIV 759008 . T C 72.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.10;MQ0=44;QD=1.29;SB=-4.542e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:12:105,12,0 chrIV 759017 . C T 48.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.86;MQ0=64;MQRankSum=1.944;QD=0.63;ReadPosRankSum=2.451;SB=-2.184e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,3:77:10:78,0,10 chrIV 759021 . A G 38.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.57;MQ0=68;MQRankSum=2.287;QD=0.45;ReadPosRankSum=2.422;SB=-2.184e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,3:84:10:68,0,10 chrIV 759030 . C T 45.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.57;MQ0=68;MQRankSum=2.556;QD=0.54;ReadPosRankSum=1.076;SB=-2.184e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,3:84:10:75,0,10 chrIV 759032 . G A 44.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.57;MQ0=68;MQRankSum=2.556;QD=0.53;ReadPosRankSum=0.538;SB=-2.184e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,3:84:10:74,0,10 chrIV 759110 . T C 107.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.92;MQ0=33;MQRankSum=-0.401;QD=2.33;ReadPosRankSum=1.470;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:46:15:140,15,0 chrIV 759116 . A G 110.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.32;MQ0=17;QD=3.80;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:15:143,15,0 chrIV 759128 . G T 93.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.66;MQ0=15;MQRankSum=2.793;QD=2.91;ReadPosRankSum=2.583;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:47:123,0,47 chrIV 759140 . A G 156.46 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.89;MQ0=15;MQRankSum=1.614;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.404;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:1:185,0,1 chrIV 759142 . C A 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.308;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.66;MQ0=16;MQRankSum=-1.313;QD=0.53;ReadPosRankSum=1.838;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:47:47,0,138 chrIV 759156 . G C 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.71;MQ0=36;MQRankSum=3.004;QD=1.38;ReadPosRankSum=-3.215;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,5:53:99:103,0,99 chrIV 759179 . A T 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.66;MQ0=35;MQRankSum=-1.693;QD=0.23;ReadPosRankSum=3.096;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:42:42,0,157 chrIV 759200 . T C 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.899;DP=66;Dels=0.00;FS=2.846;HaplotypeScore=8.4336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.45;MQ0=31;MQRankSum=-1.451;QD=0.56;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:67:67,0,312 chrIV 759222 . C T 18.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;DP=72;Dels=0.00;FS=7.466;HaplotypeScore=3.7434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.74;MQ0=27;MQRankSum=-0.809;QD=0.25;ReadPosRankSum=-1.461;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:48:48,0,510 chrIV 759224 . G A 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;DP=72;Dels=0.00;FS=7.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.84;MQ0=26;MQRankSum=-0.775;QD=0.20;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:44:44,0,527 chrIV 759249 . C T 584.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.826;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.64;MQ0=13;MQRankSum=0.402;QD=7.04;ReadPosRankSum=3.914;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:614,0,372 chrIV 759254 . C A 578.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.093;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.47;MQ0=13;MQRankSum=0.650;QD=6.96;ReadPosRankSum=2.353;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:608,0,355 chrIV 759302 . T C 728 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;DP=67;Dels=0.00;FS=7.724;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.20;MQ0=17;MQRankSum=1.510;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.447;SB=-2.869e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,52:67:31:761,31,0 chrIV 759308 . A G 668.02 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.814;DP=65;Dels=0.00;FS=7.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.23;MQ0=16;MQRankSum=1.157;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.214;SB=-2.329e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,50:65:25:701,25,0 chrIV 759320 . G T 106.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;DP=59;Dels=0.00;FS=7.954;HaplotypeScore=2.7165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.38;MQ0=20;MQRankSum=0.852;QD=1.80;ReadPosRankSum=-1.861;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,8:59:99:136,0,323 chrIV 759350 . A G 16.13 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.11;MQ0=15;MQRankSum=1.614;QD=0.52;ReadPosRankSum=-2.018;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,3:31:22:46,0,22 chrIV 759354 . A G 17.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.87;MQ0=17;MQRankSum=1.660;QD=0.53;ReadPosRankSum=-2.093;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,3:32:22:47,0,22 chrIV 759357 . C G 18.10 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.69;MQ0=19;MQRankSum=1.701;QD=0.50;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,3:36:20:48,0,20 chrIV 759369 . T A 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.17;MQ0=18;MQRankSum=1.376;QD=0.40;ReadPosRankSum=0.635;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,3:38:45:45,0,73 chrIV 759371 . A T 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;DP=35;Dels=0.00;FS=6.107;HaplotypeScore=15.2455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.46;MQ0=17;MQRankSum=0.265;QD=0.35;ReadPosRankSum=-2.071;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:42:42,0,75 chrIV 759374 . A G 44.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.2455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.46;MQ0=17;MQRankSum=1.858;QD=1.26;ReadPosRankSum=1.221;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:41:74,0,41 chrIV 759376 . C A 44.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.283;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.46;MQ0=17;MQRankSum=1.858;QD=1.26;ReadPosRankSum=1.115;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:40:74,0,40 chrIV 759392 . T C 129.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.408;DP=39;Dels=0.00;FS=12.270;HaplotypeScore=2.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.20;MQ0=14;MQRankSum=1.602;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-2.207e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,21:39:18:162,18,0 chrIV 759414 . C T 111.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.45;MQ0=32;MQRankSum=0.419;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.765;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:141,0,121 chrIV 759416 . G A 99.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.35;MQ0=39;MQRankSum=-0.061;QD=1.21;ReadPosRankSum=1.993;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:129,0,189 chrIV 759440 . C A 198.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.914;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.3359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.45;MQ0=55;MQRankSum=-1.701;QD=1.51;ReadPosRankSum=4.739;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:228,0,502 chrIV 759468 . A G 1117 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.1737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.51;MQ0=59;QD=8.04;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:1150,129,0 chrIV 759470 . G T 983 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.117;DP=140;Dels=0.00;FS=19.746;HaplotypeScore=10.5144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.46;MQ0=60;MQRankSum=2.078;QD=7.02;ReadPosRankSum=4.249;SB=2.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,117:140:59:1016,59,0 chrIV 759494 . C T 658.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.079;DP=150;Dels=0.00;FS=25.275;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.46;MQ0=70;MQRankSum=4.236;QD=4.39;ReadPosRankSum=2.982;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,40:150:99:688,0,385 chrIV 759495 . A G 642.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.821;DP=152;Dels=0.00;FS=28.221;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.40;MQ0=71;MQRankSum=4.101;QD=4.22;ReadPosRankSum=3.152;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,40:152:99:672,0,389 chrIV 759500 . A G 376.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;DP=152;Dels=0.00;FS=22.198;HaplotypeScore=8.3482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.74;MQ0=71;MQRankSum=-3.970;QD=2.47;ReadPosRankSum=-2.749;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,111:152:99:406,0,688 chrIV 759526 . C A 1258 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.448;DP=127;Dels=0.00;FS=71.184;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.69;MQ0=44;MQRankSum=0.857;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.128;SB=3.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,113:127:55:1291,55,0 chrIV 759564 . C A 2017 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.852;DP=148;Dels=0.00;FS=7.278;HaplotypeScore=5.9556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.59;MQ0=36;MQRankSum=-1.423;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.658;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,138:148:99:2050,197,0 chrIV 759578 . T C 2375 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.60;MQ0=21;QD=16.05;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:2408,258,0 chrIV 759584 . T C 2329 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.538;DP=152;Dels=0.00;FS=10.493;HaplotypeScore=6.8036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.17;MQ0=19;MQRankSum=-1.720;QD=15.32;ReadPosRankSum=2.644;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,149:152:99:2362,192,0 chrIV 759625 . A T 2089.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.297;DP=151;Dels=0.00;FS=18.945;HaplotypeScore=8.5219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.35;MQ0=11;MQRankSum=-0.710;QD=13.83;ReadPosRankSum=5.784;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,124:151:99:2119,0,107 chrIV 759632 . C A 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.945;DP=150;Dels=0.00;FS=31.405;HaplotypeScore=13.0495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.77;MQ0=10;MQRankSum=2.534;QD=0.45;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,20:150:97:97,0,2163 chrIV 759660 . A G 1801 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6103;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.54;MQ0=13;QD=17.15;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:1834,186,0 chrIV 759662 . G T 880.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.585;DP=100;Dels=0.00;FS=9.646;HaplotypeScore=3.7212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.93;MQ0=14;MQRankSum=-3.328;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,63:100:99:910,0,509 chrIV 759686 . T C 1334 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.050;DP=85;Dels=0.00;FS=2.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.11;MQ0=15;MQRankSum=0.519;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.986;SB=-6.737e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,81:85:76:1367,76,0 chrIV 759698 . T C 316.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.665;DP=112;Dels=0.00;FS=2.918;HaplotypeScore=12.6626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.78;MQ0=15;MQRankSum=-2.114;QD=2.82;ReadPosRankSum=-4.497;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:112:99:346,0,1314 chrIV 759714 . A G 637.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.529;DP=106;Dels=0.00;FS=1.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.41;MQ0=5;MQRankSum=-1.633;QD=6.01;ReadPosRankSum=-3.502;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:667,0,1250 chrIV 759756 . C A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.917;DP=136;Dels=0.00;FS=12.788;HaplotypeScore=11.1055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=2;MQRankSum=-0.855;QD=8.15;ReadPosRankSum=2.987;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1138,0,1438 chrIV 759794 . A T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.763;DP=121;Dels=0.00;FS=8.567;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.32;MQ0=0;MQRankSum=1.337;QD=11.49;ReadPosRankSum=-2.234;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1420,0,1151 chrIV 759809 . C T 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.053;DP=109;Dels=0.00;FS=3.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.82;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.221;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1128,0,1110 chrIV 759818 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.756;DP=117;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.325;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.701;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1199,0,1159 chrIV 759888 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.471;DP=143;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.88;MQ0=1;MQRankSum=0.926;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1429,0,1440 chrIV 760206 . G C 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3303,327,0 chrIV 760217 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;DP=115;Dels=0.00;FS=1.519;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=12.20;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1433,0,1033 chrIV 760275 . G C 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;DP=130;Dels=0.00;FS=5.653;HaplotypeScore=2.7902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=11.67;ReadPosRankSum=-2.267;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1547,0,1187 chrIV 760350 . A G 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3285,330,0 chrIV 760456 . G A 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.703;DP=116;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.734;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1340,0,1120 chrIV 760775 . T C 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2932,294,0 chrIV 761335 . T C 4193.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4193,444,0 chrIV 761363 . A G 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.083;DP=122;Dels=0.00;FS=3.297;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.712;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1329,0,1372 chrIV 761375 . T C 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3345,357,0 chrIV 761455 . A G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.374;DP=113;Dels=0.00;FS=12.188;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1304,0,1114 chrIV 761459 . C A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.039;DP=111;Dels=0.00;FS=10.405;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1102,0,1246 chrIV 761482 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.850;DP=115;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=2.9063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1188,0,1264 chrIV 761715 . C T 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.493;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,65:109:99:1401,0,892 chrIV 762595 . A G 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.187;DP=158;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,86:158:99:1776,0,1552 chrIV 762834 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.537;DP=151;Dels=0.00;FS=3.833;HaplotypeScore=2.2990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1522,0,1748 chrIV 762896 . T A 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.702;DP=155;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.622;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1580,0,1893 chrIV 763036 . T C 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.625;DP=132;Dels=0.00;FS=8.272;HaplotypeScore=4.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.830;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1379,0,1512 chrIV 763076 . A T 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;DP=156;Dels=0.01;FS=3.752;HaplotypeScore=4.9112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,83:155:99:1778,0,1648 chrIV 763207 . A G 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3659,384,0 chrIV 763658 . A C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.763;DP=120;Dels=0.00;FS=6.893;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1331,0,1247 chrIV 764003 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=103;Dels=0.00;FS=1.595;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.996;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1234,0,1086 chrIV 764292 . C T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.930;DP=150;Dels=0.00;FS=3.876;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.290;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1737,0,1534 chrIV 764691 . G A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.959;DP=130;Dels=0.00;FS=2.234;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1416,0,1341 chrIV 764844 . T A 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.419;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1672,0,1270 chrIV 764930 . C T 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1545,0,1317 chrIV 764994 . A G 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.730;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.899;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1464,0,1233 chrIV 765216 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.237;DP=127;Dels=0.00;FS=4.292;HaplotypeScore=2.5664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:127:99:1458,0,1182 chrIV 765331 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.468;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=10.94;ReadPosRankSum=2.829;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1452,0,1287 chrIV 765398 . T A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.257;DP=136;Dels=0.00;FS=3.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=-1.079;QD=10.60;ReadPosRankSum=-2.187;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1471,0,1492 chrIV 765617 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.824;DP=135;Dels=0.00;FS=3.314;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1398,0,1470 chrIV 765670 . C G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;DP=103;Dels=0.00;FS=5.634;HaplotypeScore=2.7577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1023,0,1082 chrIV 766047 . A C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.350;DP=128;Dels=0.00;FS=4.484;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.462;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1355,0,1393 chrIV 766080 . A T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;DP=138;Dels=0.00;FS=2.173;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.258;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1393,0,1708 chrIV 766600 . G A 522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.202;DP=146;Dels=0.01;FS=20.233;HaplotypeScore=3.9864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=3.58;ReadPosRankSum=-4.941;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:145:99:552,0,1893 chrIV 766886 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.245;DP=104;Dels=0.00;FS=9.213;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.892;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1229,0,1091 chrIV 767007 . C T 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3739;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3122,307,0 chrIV 767076 . C T 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.248;DP=144;Dels=0.00;FS=7.418;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.724;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1508,0,1612 chrIV 767342 . C G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.517;DP=116;Dels=0.00;FS=4.592;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1142,0,1268 chrIV 767443 . A G 2919 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2952,306,0 chrIV 767552 . G A 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.470;DP=117;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.662;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1396,0,1196 chrIV 767675 . C T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.065;DP=123;Dels=0.00;FS=13.252;HaplotypeScore=4.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.139;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1405,0,1145 chrIV 767888 . G A 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.393;DP=143;Dels=0.00;FS=5.212;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.650;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,81:143:99:1667,0,1320 chrIV 768037 . T C 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3361,357,0 chrIV 768366 . C A 1864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.522;DP=176;Dels=0.00;FS=2.927;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,90:176:99:1894,0,1762 chrIV 768390 . T A 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.680;DP=170;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.331;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,79:170:99:1671,0,2032 chrIV 769198 . G C 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.130;DP=154;Dels=0.00;FS=7.146;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.798;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1698,0,1515 chrIV 770352 . C T 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3308,319,0 chrIV 773527 . A C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.729;DP=125;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=2.3294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1283,0,1305 chrIV 773623 . T C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.888;DP=115;Dels=0.00;FS=10.656;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1358,0,1023 chrIV 774079 . G A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.003;DP=120;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.625;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,71:120:99:1658,0,1010 chrIV 774592 . A G 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.828;DP=93;Dels=0.00;FS=5.309;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.343;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:933,0,1153 chrIV 774849 . T C 612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.275;DP=87;Dels=0.00;FS=0.820;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:642,0,1223 chrIV 776256 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.225;DP=138;Dels=0.00;FS=3.065;HaplotypeScore=4.8003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.394;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1472,0,1467 chrIV 776259 . C A 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.747;DP=139;Dels=0.00;FS=2.169;HaplotypeScore=4.9640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.773;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1586,0,1450 chrIV 776609 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.736;DP=116;Dels=0.00;FS=10.677;HaplotypeScore=2.7176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.372;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:116:99:1166,0,1313 chrIV 776795 . T A 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.243;DP=136;Dels=0.00;FS=5.181;HaplotypeScore=3.6161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.799;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:136:99:1573,0,1426 chrIV 777116 . G A 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.974;DP=158;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.364;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1574,0,1612 chrIV 777334 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.608;DP=124;Dels=0.00;FS=8.342;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1250,0,1397 chrIV 778228 . T C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.877;DP=120;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=3.8441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1307,0,1221 chrIV 778271 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.402;DP=107;Dels=0.00;FS=3.549;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1257,0,1007 chrIV 778694 . G A 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;DP=73;Dels=0.00;FS=15.851;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.418;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,43:73:99:925,0,632 chrIV 778709 . C T 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.588;DP=68;Dels=0.00;FS=17.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=10.96;ReadPosRankSum=2.069;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,38:68:99:775,0,650 chrIV 778721 . G A 571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.645;DP=63;Dels=0.00;FS=16.025;HaplotypeScore=4.9668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=9.06;ReadPosRankSum=3.324;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,33:63:99:601,0,648 chrIV 778722 . G A 573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.627;DP=62;Dels=0.00;FS=13.722;HaplotypeScore=4.9668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=9.24;ReadPosRankSum=3.571;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:603,0,652 chrIV 778774 . A G 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.257;DP=25;Dels=0.00;FS=6.825;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=1.44;ReadPosRankSum=-2.217;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:66:66,0,242 chrIV 778778 . T G 82.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.487;DP=26;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQ0=0;MQRankSum=1.795;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.897;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:112,0,191 chrIV 779220 . A G 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=121;Dels=0.00;FS=2.460;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.504;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:121:99:1054,0,1509 chrIV 779524 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.748;DP=97;Dels=0.00;FS=14.155;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1091,0,1130 chrIV 779717 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.443;DP=108;Dels=0.00;FS=6.400;HaplotypeScore=5.7053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,68:108:99:1529,0,766 chrIV 780587 . C G 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.107;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1466,0,1634 chrIV 781103 . T C 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2918,297,0 chrIV 781139 . G A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.719;DP=132;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.335;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1470,0,1346 chrIV 781241 . G C 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.059;DP=170;Dels=0.00;FS=2.819;HaplotypeScore=7.9337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.670;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,88:170:99:1918,0,1757 chrIV 781371 . G T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.047;DP=115;Dels=0.00;FS=1.694;HaplotypeScore=1.9411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1205,0,1307 chrIV 781395 . G A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.166;DP=133;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.755;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1393,0,1511 chrIV 781404 . T C 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.446;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.113;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1453,0,1555 chrIV 781421 . C T 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.537;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.695;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1491,0,1629 chrIV 781568 . G A 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.843;DP=145;Dels=0.00;FS=2.146;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.500;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,57:145:99:1213,0,1968 chrIV 781624 . A G 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.761;DP=123;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.357;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,45:123:99:807,0,1895 chrIV 781717 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.830;DP=127;Dels=0.00;FS=1.447;HaplotypeScore=1.9882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.862;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1264,0,1497 chrIV 781779 . A T 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;DP=111;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=4.1401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:997,0,1435 chrIV 782125 . A G 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.281;DP=121;Dels=0.00;FS=8.327;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1205,0,1463 chrIV 782410 . A G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.361;DP=106;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.032;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,63:106:99:1405,0,832 chrIV 782863 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.063;DP=107;Dels=0.00;FS=2.541;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.249;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1060,0,1210 chrIV 783691 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.886;DP=147;Dels=0.00;FS=4.922;HaplotypeScore=3.9145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1364,0,1708 chrIV 784060 . G A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=-0.024;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1118,0,1370 chrIV 784102 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.545;DP=137;Dels=0.00;FS=3.083;HaplotypeScore=6.9319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=0.385;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1513,0,1514 chrIV 784297 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.468;DP=151;Dels=0.00;FS=7.121;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.123;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1457,0,1807 chrIV 784305 . G C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;DP=146;Dels=0.00;FS=2.081;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.750;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1463,0,1667 chrIV 784774 . A G 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.544;DP=123;Dels=0.00;FS=1.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.142;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1463,0,1190 chrIV 785156 . C A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;DP=121;Dels=0.00;FS=13.509;HaplotypeScore=4.8692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.831;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1335,0,1037 chrIV 785712 . A G 2417 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2450,249,0 chrIV 785881 . G T 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.973;DP=80;Dels=0.00;FS=11.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.608;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:793,0,945 chrIV 786128 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.988;DP=132;Dels=0.00;FS=2.336;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.048;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:132:99:1301,0,1537 chrIV 786426 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.721;DP=110;Dels=0.00;FS=8.766;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.613;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1224,0,1136 chrIV 787046 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.232;DP=123;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1443,0,1202 chrIV 787750 . T C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.839;DP=87;Dels=0.00;FS=4.276;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.004;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,54:87:99:1128,0,680 chrIV 788247 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.735;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.812;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1160,0,1486 chrIV 788528 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.912;DP=105;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=2.259;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.900;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1162,0,1148 chrIV 788607 . T C 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.954;DP=67;Dels=0.00;FS=0.930;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.284;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,38:67:99:832,0,673 chrIV 788889 . G A 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;DP=156;Dels=0.00;FS=5.109;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.252;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1709,0,1522 chrIV 789368 . T A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;DP=111;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.716;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1459,0,1073 chrIV 789392 . C A 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.257;DP=121;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.419;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:121:99:1528,0,1197 chrIV 789767 . G T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.378;DP=144;Dels=0.00;FS=8.049;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.068;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1501,0,1673 chrIV 790182 . C T 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.944;DP=143;Dels=0.00;FS=4.883;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.029;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1764,0,1234 chrIV 790216 . G T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=104;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=13.00;ReadPosRankSum=-1.509;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1382,0,871 chrIV 790489 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.231;DP=138;Dels=0.00;FS=3.069;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=2.987;QD=8.62;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1220,0,1746 chrIV 791482 . A G 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.480;DP=121;Dels=0.00;FS=3.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1368,0,1287 chrIV 791869 . C T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.067;DP=117;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.723;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1210,0,1293 chrIV 792022 . T A 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;DP=102;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:898,0,1421 chrIV 792772 . T G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.530;DP=145;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.821;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1407,0,1604 chrIV 793254 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.196;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1309,0,1471 chrIV 793726 . A T 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1671,0,1481 chrIV 793822 . C T 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.018;DP=122;Dels=0.00;FS=1.438;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.113;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1284,0,1381 chrIV 794057 . T C 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.011;DP=97;Dels=0.00;FS=3.044;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:969,0,1159 chrIV 794820 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.030;DP=114;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1216,0,1291 chrIV 795041 . G C 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.233;DP=154;Dels=0.00;FS=2.022;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.747;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1726,0,1433 chrIV 795391 . A G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.949;DP=129;Dels=0.00;FS=9.452;HaplotypeScore=2.8932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=10.81;ReadPosRankSum=2.190;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1425,0,1350 chrIV 795459 . C T 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.447;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.123;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1761,0,1340 chrIV 795537 . C G 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3173,330,0 chrIV 795883 . G A 4023.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4023,394,0 chrIV 795893 . G A 4029.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:4029,397,0 chrIV 795956 . G A 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.304;DP=148;Dels=0.00;FS=2.059;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=10.39;ReadPosRankSum=-2.658;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1567,0,1602 chrIV 795988 . A G 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.107;DP=133;Dels=0.00;FS=7.888;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.904;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1549,0,1398 chrIV 796092 . C T 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3302,322,0 chrIV 796104 . T A 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3552,349,0 chrIV 796175 . G T 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=28.39;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3463,337,0 chrIV 797276 . A T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.570;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.259;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1090,0,1501 chrIV 797669 . T C 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.951;DP=153;Dels=0.00;FS=7.618;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=1.295;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.760;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1700,0,1737 chrIV 798512 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.820;DP=94;Dels=0.00;FS=5.531;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1246,0,870 chrIV 798575 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.925;DP=114;Dels=0.00;FS=5.950;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1060,0,1310 chrIV 799705 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.236;DP=102;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.605;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1136,0,1083 chrIV 799997 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.050;DP=150;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=1;MQRankSum=2.118;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.644;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:150:99:1441,0,1797 chrIV 800015 . T C 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.222;DP=159;Dels=0.00;FS=3.215;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.815;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1592,0,1750 chrIV 800045 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.318;DP=116;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.666;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1264,0,1257 chrIV 800065 . C G 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;DP=121;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:121:99:1377,0,1145 chrIV 800174 . C T 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.152;DP=119;Dels=0.00;FS=8.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.779;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,71:119:99:1632,0,992 chrIV 800342 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.033;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1055,0,1057 chrIV 800772 . T C 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.705;DP=115;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=13.44;ReadPosRankSum=1.991;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,70:115:99:1576,0,912 chrIV 800855 . T G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.519;DP=131;Dels=0.00;FS=11.081;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.441;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1190,0,1618 chrIV 800862 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.549;DP=141;Dels=0.00;FS=7.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1383,0,1536 chrIV 800990 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.463;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.621;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1235,0,1605 chrIV 801463 . A G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.586;DP=97;Dels=0.00;FS=3.906;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.262;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:934,0,1151 chrIV 801527 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.126;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.332;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1530,0,1238 chrIV 801804 . G A 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.694;DP=147;Dels=0.00;FS=8.820;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.813;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1693,0,1485 chrIV 801845 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.103;DP=125;Dels=0.00;FS=4.340;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=0.563;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1498,0,1207 chrIV 801982 . C T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.666;DP=112;Dels=0.00;FS=3.707;HaplotypeScore=3.9591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.415;QD=8.02;ReadPosRankSum=-3.887;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:928,0,1246 chrIV 802100 . A G 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=107;Dels=0.01;FS=1.660;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.655;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:921,0,1319 chrIV 802112 . A T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1042,0,1273 chrIV 802129 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.396;DP=108;Dels=0.00;FS=2.565;HaplotypeScore=3.3502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=4.003;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.960;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:108:99:1125,0,1187 chrIV 802553 . A C 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.511;DP=129;Dels=0.00;FS=3.637;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.400;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:1652,0,1151 chrIV 802606 . C A 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;DP=126;Dels=0.00;FS=8.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.086;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1156,0,1603 chrIV 802610 . C T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.369;DP=121;Dels=0.00;FS=5.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.458;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1079,0,1552 chrIV 802627 . A C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.742;DP=117;Dels=0.00;FS=6.079;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:914,0,1648 chrIV 802666 . T C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.757;DP=103;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:915,0,1340 chrIV 802711 . G A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.531;DP=129;Dels=0.00;FS=4.309;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.339;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.459;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1408,0,1273 chrIV 802822 . T A 393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.828;DP=92;Dels=0.00;FS=9.942;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.65;MQ0=0;MQRankSum=-5.892;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.317;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,26:92:99:423,0,1548 chrIV 802824 . C T 391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.678;DP=92;Dels=0.00;FS=8.071;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.65;MQ0=0;MQRankSum=-6.057;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,26:92:99:421,0,1460 chrIV 802878 . T A 167.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;DP=81;Dels=0.00;FS=26.929;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQ0=0;MQRankSum=-6.515;QD=2.06;ReadPosRankSum=-1.900;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,19:81:99:197,0,1476 chrIV 802905 . T C 68.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.324;DP=65;Dels=0.00;FS=22.770;HaplotypeScore=10.6085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=1;MQRankSum=-5.169;QD=1.05;ReadPosRankSum=-1.402;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,12:65:98:98,0,1208 chrIV 802914 . A T 74.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;DP=64;Dels=0.00;FS=22.705;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.90;MQ0=2;MQRankSum=-4.828;QD=1.16;ReadPosRankSum=-4.772;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,11:64:99:104,0,1243 chrIV 802915 . A G 67.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.354;DP=64;Dels=0.00;FS=22.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.90;MQ0=2;MQRankSum=-4.772;QD=1.05;ReadPosRankSum=-4.772;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,11:64:97:97,0,1256 chrIV 803989 . G A 127.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.207;DP=73;Dels=0.00;FS=23.919;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.29;MQ0=4;MQRankSum=-5.314;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.948;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:157,0,988 chrIV 804011 . G A 127.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.601;DP=75;Dels=0.00;FS=30.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.88;MQ0=7;MQRankSum=-6.128;QD=1.69;ReadPosRankSum=2.804;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:157,0,987 chrIV 804752 . T C 400 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;DP=63;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.60;MQ0=24;MQRankSum=0.666;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.466;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,46:63:45:433,45,0 chrIV 805589 . T G 656.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.838;DP=103;Dels=0.00;FS=18.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.72;MQ0=6;MQRankSum=2.100;QD=6.37;ReadPosRankSum=1.787;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:686,0,1195 chrIV 805615 . G A 943.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.308;DP=105;Dels=0.00;FS=15.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.90;MQ0=6;MQRankSum=2.487;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.200;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:973,0,1147 chrIV 805620 . T C 985.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.282;DP=108;Dels=0.00;FS=17.688;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.03;MQ0=6;MQRankSum=2.029;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1015,0,1163 chrIV 805658 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.311;DP=91;Dels=0.00;FS=20.778;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQ0=0;MQRankSum=2.349;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.339;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:911,0,1017 chrIV 805735 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.163;DP=116;Dels=0.00;FS=7.588;HaplotypeScore=3.4286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.977;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1260,0,1296 chrIV 805798 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.562;DP=131;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=2.8480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=9.66;ReadPosRankSum=-2.718;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1296,0,1465 chrIV 805830 . T C 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.934;DP=143;Dels=0.00;FS=6.138;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.375;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1427,0,1664 chrIV 806046 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.487;DP=121;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1401,0,1201 chrIV 806121 . C G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.131;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=11.53;ReadPosRankSum=2.009;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1379,0,1107 chrIV 806142 . G T 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.876;DP=129;Dels=0.00;FS=4.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.480;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1645,0,1253 chrIV 806174 . A C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.654;DP=148;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=2.8809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1497,0,1681 chrIV 806233 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.961;DP=126;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=2.8558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.603;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1531,0,1241 chrIV 806292 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.803;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.894;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:110:99:1275,0,1102 chrIV 806407 . T C 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.578;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:1017,0,1266 chrIV 806486 . G C 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.310;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1054,0,1170 chrIV 806513 . T C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.470;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:988,0,1457 chrIV 806514 . T C 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.630;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:967,0,1458 chrIV 806584 . T C 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=1;QD=25.49;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2786,282,0 chrIV 806752 . A G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.532;DP=133;Dels=0.00;FS=3.221;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=1;MQRankSum=0.672;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1108,0,1597 chrIV 807025 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.173;DP=131;Dels=0.00;FS=6.557;HaplotypeScore=2.2702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.334;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1498,0,1364 chrIV 807121 . A G 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.972;DP=124;Dels=0.00;FS=4.352;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.453;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1099,0,1491 chrIV 807222 . T C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.072;DP=127;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=7.8029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.403;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1316,0,1280 chrIV 807376 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.674;DP=145;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=3.0659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.067;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.533;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1611,0,1533 chrIV 807529 . A G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.960;DP=139;Dels=0.00;FS=1.383;HaplotypeScore=3.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1250,0,1734 chrIV 807559 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.374;DP=122;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=3.8348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.528;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1124,0,1483 chrIV 807761 . T A 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.810;DP=146;Dels=0.00;FS=7.519;HaplotypeScore=9.1799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.276;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.607;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:146:99:1636,0,1630 chrIV 807839 . C A 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;DP=158;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=5.4368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1770,0,1627 chrIV 808031 . G A 2170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.483;DP=181;Dels=0.00;FS=2.747;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=1;MQRankSum=2.143;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.790;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,96:181:99:2200,0,1704 chrIV 808521 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.066;DP=143;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.9125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=9.55;ReadPosRankSum=2.064;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1396,0,1704 chrIV 808649 . A G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.838;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=9.16;ReadPosRankSum=-3.295;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1211,0,1486 chrIV 808808 . G A 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2615,264,0 chrIV 808830 . T A 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.631;DP=108;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=3.5630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.960;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1165,0,1181 chrIV 808940 . C A 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.188;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.014;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1195,0,1202 chrIV 808977 . T C 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.111;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1054,0,1400 chrIV 808996 . C G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;DP=116;Dels=0.00;FS=1.544;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.249;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1114,0,1379 chrIV 809670 . C T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.153;DP=135;Dels=0.00;FS=9.243;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.971;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.188;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1634,0,1312 chrIV 810372 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.002;DP=93;Dels=0.00;FS=20.853;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1171,0,877 chrIV 810443 . A C 2374 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.290;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=25.26;ReadPosRankSum=1.511;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:2407,249,0 chrIV 810702 . C T 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.527;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1177,0,1313 chrIV 810771 . C T 508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.98;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.404;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:538,0,718 chrIV 810988 . A G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.754;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.765;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1133,0,1649 chrIV 811032 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.825;DP=122;Dels=0.00;FS=11.532;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=8.70;ReadPosRankSum=-3.156;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1092,0,1485 chrIV 811697 . T C 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.092;DP=154;Dels=0.00;FS=3.763;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.338;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1600,0,1728 chrIV 811762 . T A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;DP=147;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=3.7705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=7.90;ReadPosRankSum=-1.122;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1191,0,1804 chrIV 811787 . G A 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;DP=133;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.981;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1659,0,1339 chrIV 811992 . C T 1994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.132;DP=174;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,95:174:99:2024,0,1641 chrIV 812567 . G C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=112;Dels=0.00;FS=3.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1144,0,1258 chrIV 812928 . G A 1874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.111;DP=168;Dels=0.00;FS=5.723;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.15;ReadPosRankSum=-2.568;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,90:168:99:1904,0,1506 chrIV 812940 . T C 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.297;DP=157;Dels=0.00;FS=5.716;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.476;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,78:157:99:1487,0,1729 chrIV 812947 . C T 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.060;DP=164;Dels=0.00;FS=6.891;HaplotypeScore=2.8529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.760;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.713;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,78:164:99:1641,0,1750 chrIV 812975 . A G 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.108;DP=130;Dels=0.00;FS=6.697;HaplotypeScore=169.6046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=0.35;ReadPosRankSum=-4.752;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,11:130:76:76,0,906 chrIV 813125 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.751;DP=147;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.850;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1489,0,1604 chrIV 813568 . G A 4320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4320,430,0 chrIV 814094 . T C 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.993;DP=167;Dels=0.00;FS=8.031;HaplotypeScore=2.6963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.772;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1570,0,1921 chrIV 814114 . A G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;DP=144;Dels=0.00;FS=3.918;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.094;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:144:99:1361,0,1594 chrIV 814135 . C T 1778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.100;DP=162;Dels=0.00;FS=9.365;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.087;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:162:99:1808,0,1662 chrIV 814278 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.880;DP=125;Dels=0.00;FS=8.137;HaplotypeScore=4.8890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.776;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1392,0,1311 chrIV 814586 . T C 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.166;DP=155;Dels=0.00;FS=6.123;HaplotypeScore=3.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.728;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1498,0,1789 chrIV 815156 . T A 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.731;DP=116;Dels=0.00;FS=0.841;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.752;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.938;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1061,0,1454 chrIV 815194 . G A 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.835;DP=115;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=4.8939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=1;MQRankSum=-0.459;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.250;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1073,0,1263 chrIV 815495 . A G 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3619,363,0 chrIV 815632 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.485;DP=105;Dels=0.00;FS=4.467;HaplotypeScore=4.3469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1250,0,978 chrIV 815666 . G A 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.691;DP=86;Dels=0.00;FS=5.566;HaplotypeScore=4.8335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:814,0,1062 chrIV 815797 . C G 501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;DP=72;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.946;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:531,0,872 chrIV 815851 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.152;DP=105;Dels=0.00;FS=1.819;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1238,0,1064 chrIV 815880 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.302;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.032;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1370,0,1024 chrIV 816386 . C G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.895;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.501;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.099;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1289,0,1375 chrIV 816398 . A G 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.874;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1508,0,1552 chrIV 816494 . A G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.294;DP=104;Dels=0.00;FS=1.588;HaplotypeScore=2.5900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1079,0,1177 chrIV 816619 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.934;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.548;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:117:99:1434,0,1065 chrIV 816662 . C T 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.116;DP=93;Dels=0.00;FS=6.697;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:985,0,746 chrIV 817315 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.262;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.659;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:1343,0,1896 chrIV 817438 . G C 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.988;DP=149;Dels=0.00;FS=1.301;HaplotypeScore=5.6944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.710;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,65:149:99:1318,0,1803 chrIV 817489 . C T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.266;DP=139;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.908;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1467,0,1557 chrIV 817539 . A G 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.102;DP=129;Dels=0.00;FS=3.308;HaplotypeScore=4.7743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.628;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,80:129:99:1728,0,949 chrIV 817854 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.535;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.734;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1341,0,1450 chrIV 818317 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.346;DP=105;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.504;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1260,0,1035 chrIV 818363 . C A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.406;DP=127;Dels=0.00;FS=1.442;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.770;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1448,0,1276 chrIV 818486 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.108;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1407,0,1420 chrIV 818791 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;DP=119;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.545;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1354,0,1183 chrIV 818821 . A G 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:994,0,1415 chrIV 819242 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.109;DP=114;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.351;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1277,0,1260 chrIV 819541 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.833;DP=106;Dels=0.00;FS=12.396;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.922;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1327,0,1023 chrIV 819584 . G A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.041;DP=110;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1307,0,1150 chrIV 819656 . G A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.668;DP=124;Dels=0.00;FS=7.551;HaplotypeScore=2.8004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.188;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1223,0,1424 chrIV 819998 . A T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.578;DP=116;Dels=0.00;FS=2.416;HaplotypeScore=3.6636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.031;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1446,0,1134 chrIV 820028 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.562;DP=114;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1334,0,1156 chrIV 820419 . G A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3540,334,0 chrIV 820472 . T C 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3055,307,0 chrIV 820541 . T G 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.455;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:959,0,967 chrIV 820638 . T C 2329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2362,240,0 chrIV 820678 . G A 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.454;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=26.42;ReadPosRankSum=0.252;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2754,239,0 chrIV 820777 . C T 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.640;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.518;QD=27.00;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:3084,276,0 chrIV 820879 . C T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.224;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.309;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1429,0,1357 chrIV 820898 . C A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.489;DP=120;Dels=0.00;FS=4.682;HaplotypeScore=2.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.644;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1266,0,1396 chrIV 820921 . G A 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3380,325,0 chrIV 821052 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.336;DP=117;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=12.40;ReadPosRankSum=2.031;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1481,0,999 chrIV 821234 . G A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.721;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.62;ReadPosRankSum=-2.037;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:992,0,1124 chrIV 821264 . A T 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.220;DP=107;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.482;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:1056,0,1306 chrIV 821309 . G A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.969;DP=114;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1021,0,1410 chrIV 821327 . T C 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.153;DP=111;Dels=0.00;FS=1.555;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:920,0,1444 chrIV 821485 . T C 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.910;DP=114;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,45:114:99:852,0,1617 chrIV 821498 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.802;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1036,0,1690 chrIV 821555 . A G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.572;DP=135;Dels=0.00;FS=4.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.536;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1331,0,1588 chrIV 821579 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.754;DP=141;Dels=0.00;FS=6.240;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.287;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1393,0,1605 chrIV 821605 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.274;DP=105;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1183,0,1218 chrIV 821822 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.387;DP=112;Dels=0.00;FS=8.977;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:908,0,1400 chrIV 822225 . G C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;DP=126;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.060;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1252,0,1426 chrIV 822347 . C T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.552;DP=101;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1202,0,1032 chrIV 822353 . T A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.929;DP=102;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1232,0,1142 chrIV 822483 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;DP=118;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.505;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1401,0,1268 chrIV 822554 . T C 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.575;DP=119;Dels=0.00;FS=3.627;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=0.858;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:917,0,1677 chrIV 822572 . T A 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;DP=117;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=1;MQRankSum=-1.192;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.399;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:970,0,1641 chrIV 822719 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.769;DP=119;Dels=0.00;FS=11.787;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1323,0,1315 chrIV 823181 . G A 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.046;DP=104;Dels=0.00;FS=5.120;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.065;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1113,0,1030 chrIV 823188 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.021;DP=114;Dels=0.00;FS=2.518;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1143,0,1229 chrIV 823198 . T G 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3102,309,0 chrIV 823234 . T C 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3464,369,0 chrIV 824228 . C T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.289;DP=121;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.744;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1105,0,1442 chrIV 824938 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.553;DP=98;Dels=0.00;FS=5.124;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=12.12;ReadPosRankSum=-2.405;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,57:98:99:1218,0,927 chrIV 825050 . T C 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.453;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.787;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1153,0,961 chrIV 825422 . T C 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.647;DP=135;Dels=0.00;FS=9.261;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=1;MQRankSum=-0.676;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.609;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1524,0,1432 chrIV 825834 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.851;DP=127;Dels=0.00;FS=4.280;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.533;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1367,0,1433 chrIV 826114 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.620;DP=118;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.126;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1164,0,1345 chrIV 826151 . T A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;DP=123;Dels=0.00;FS=2.336;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1104,0,1683 chrIV 826369 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;DP=110;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=2.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1143,0,1220 chrIV 828748 . T C 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3604,375,0 chrIV 829122 . T C 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3491,355,0 chrIV 829221 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.270;DP=145;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.430;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1442,0,1719 chrIV 829291 . A G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;DP=110;Dels=0.00;FS=7.249;HaplotypeScore=2.6412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.076;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1077,0,1278 chrIV 829373 . T C 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3274,327,0 chrIV 830274 . A T 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5513;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=28.74;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3708,355,0 chrIV 830619 . A G 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2825,282,0 chrIV 830754 . A T 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3154,313,0 chrIV 830962 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.641;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1380,0,1350 chrIV 831133 . A G 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2978,306,0 chrIV 831279 . A G 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3473,355,0 chrIV 831397 . A G 3905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3905,399,0 chrIV 831575 . C A 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.851;DP=119;Dels=0.00;FS=4.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.443;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:951,0,1705 chrIV 831797 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.717;DP=130;Dels=0.00;FS=9.446;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=11.74;ReadPosRankSum=2.011;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1556,0,1324 chrIV 831877 . T C 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.947;DP=98;Dels=0.00;FS=8.987;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.305;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,39:98:99:767,0,1415 chrIV 832831 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.254;DP=110;Dels=0.00;FS=6.440;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:110:99:1141,0,1235 chrIV 832844 . T G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.518;DP=105;Dels=0.00;FS=3.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.221;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1078,0,1201 chrIV 833173 . G T 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3651,367,0 chrIV 833261 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.786;DP=125;Dels=0.00;FS=2.292;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.016;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1449,0,1141 chrIV 833314 . T G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.306;DP=114;Dels=0.00;FS=5.819;HaplotypeScore=4.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.344;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1276,0,1242 chrIV 834683 . G A 2033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.690;DP=177;Dels=0.00;FS=1.178;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.280;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,91:177:99:2063,0,1720 chrIV 834790 . C T 1930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.980;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.957;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,89:170:99:1960,0,1617 chrIV 836028 . G A 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3814,376,0 chrIV 836148 . A G 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3659,370,0 chrIV 836255 . A T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;DP=173;Dels=0.00;FS=1.287;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,80:173:99:1462,0,2110 chrIV 836436 . T C 2205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.298;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,107:214:99:2235,0,2348 chrIV 836888 . G C 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.264;DP=135;Dels=0.00;FS=4.217;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.217;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1491,0,1370 chrIV 837158 . A G 1863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.333;DP=178;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=2.7586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,94:178:99:1893,0,1866 chrIV 837953 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.243;DP=116;Dels=0.00;FS=4.577;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.278;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1272,0,1129 chrIV 838092 . A T 229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.838;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:259,0,333 chrIV 838114 . T C 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.091;DP=93;Dels=0.00;FS=1.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.780;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:991,0,559 chrIV 838649 . T C 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.714;DP=153;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=4.6107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1747,0,1599 chrIV 838745 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.976;DP=115;Dels=0.00;FS=7.328;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.305;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1176,0,1236 chrIV 838835 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;DP=107;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=11.94;ReadPosRankSum=2.056;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:107:99:1308,0,992 chrIV 839020 . T C 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.645;DP=141;Dels=0.00;FS=5.130;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.917;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1489,0,1639 chrIV 839045 . A T 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;DP=148;Dels=0.00;FS=1.295;HaplotypeScore=6.8443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1664,0,1630 chrIV 839087 . T C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.997;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.090;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1463,0,1673 chrIV 839141 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.800;DP=143;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.515;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1536,0,1477 chrIV 839157 . C T 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.330;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.044;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1531,0,1190 chrIV 839339 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.962;DP=142;Dels=0.00;FS=6.228;HaplotypeScore=3.4488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.117;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1268,0,1659 chrIV 839342 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.086;DP=144;Dels=0.00;FS=2.121;HaplotypeScore=4.4434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1311,0,1819 chrIV 839558 . G A 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.194;DP=120;Dels=0.00;FS=8.234;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1354,0,1273 chrIV 839672 . A T 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.799;DP=130;Dels=0.00;FS=3.176;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.673;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1558,0,1323 chrIV 840230 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.465;DP=125;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=1.096;QD=10.78;ReadPosRankSum=-2.106;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1377,0,1102 chrIV 840362 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.619;DP=129;Dels=0.00;FS=14.287;HaplotypeScore=3.8120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.891;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1579,0,1089 chrIV 840549 . G C 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;DP=89;Dels=0.00;FS=4.007;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:984,0,879 chrIV 840598 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.546;DP=102;Dels=0.00;FS=9.248;HaplotypeScore=6.9191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.013;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1076,0,1133 chrIV 840697 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.948;DP=98;Dels=0.00;FS=0.844;HaplotypeScore=2.4839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1117,0,1081 chrIV 841000 . G A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.899;DP=135;Dels=0.00;FS=1.420;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.279;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1545,0,1442 chrIV 841009 . T C 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.579;DP=156;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.519;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1504,0,1799 chrIV 841276 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;DP=109;Dels=0.00;FS=9.187;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1151,0,1304 chrIV 841648 . T C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.939;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1299,0,1286 chrIV 841738 . T C 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.235;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,88:160:99:1725,0,1600 chrIV 841756 . A G 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.176;DP=167;Dels=0.00;FS=1.206;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,83:167:99:1468,0,1887 chrIV 842028 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;DP=139;Dels=0.00;FS=2.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.856;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.967;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1264,0,1793 chrIV 842068 . T A 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=147;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.34;ReadPosRankSum=2.907;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1550,0,1743 chrIV 842070 . A T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.343;DP=133;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=11.02;ReadPosRankSum=2.023;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1495,0,1445 chrIV 842326 . A G 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2758,303,0 chrIV 842336 . A G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.644;DP=112;Dels=0.00;FS=14.457;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1142,0,1404 chrIV 842380 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.870;DP=106;Dels=0.00;FS=2.800;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.355;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1094,0,1212 chrIV 842450 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.453;DP=122;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1276,0,1330 chrIV 842455 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.423;DP=126;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=2.7510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.323;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1192,0,1480 chrIV 842465 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;DP=125;Dels=0.00;FS=7.100;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.694;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1262,0,1388 chrIV 842576 . C T 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.457;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.078;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1723,0,1475 chrIV 842680 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.104;DP=124;Dels=0.00;FS=4.375;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.560;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1316,0,1457 chrIV 842936 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.998;DP=148;Dels=0.00;FS=5.270;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:148:99:1199,0,1834 chrIV 842964 . G A 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.660;DP=148;Dels=0.00;FS=2.957;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.995;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1647,0,1478 chrIV 843125 . G T 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3061,292,0 chrIV 843506 . A G 558.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.223;DP=158;Dels=0.00;FS=47.061;HaplotypeScore=24.6221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.303;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,46:158:99:588,0,1939 chrIV 843524 . A G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.686;DP=127;Dels=0.00;FS=16.982;HaplotypeScore=35.5351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.22;MQ0=0;MQRankSum=9.013;QD=11.57;ReadPosRankSum=2.431;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:127:99:1499,0,302 chrIV 843581 . T C 513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.214;DP=110;Dels=0.00;FS=6.139;HaplotypeScore=8.1847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.81;MQ0=0;MQRankSum=-7.039;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:110:99:543,0,1416 chrIV 843608 . A G 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.942;DP=116;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.921;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:948,0,1467 chrIV 843647 . T C 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.852;DP=112;Dels=0.00;FS=6.203;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.523;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:898,0,1497 chrIV 843659 . G A 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.965;DP=129;Dels=0.00;FS=9.749;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.807;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:129:99:1699,0,1048 chrIV 843818 . C A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;DP=130;Dels=0.00;FS=11.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.973;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1536,0,1262 chrIV 843832 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.041;DP=142;Dels=0.00;FS=15.231;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.372;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1383,0,1638 chrIV 843857 . C A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;DP=114;Dels=0.00;FS=4.687;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1268,0,1216 chrIV 843911 . T G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.100;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1138,0,1584 chrIV 844040 . C T 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.971;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1113,0,1579 chrIV 844178 . C T 4026.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.64;SB=-2.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4026,388,0 chrIV 844368 . C G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;DP=134;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=2.5184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.492;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1458,0,1371 chrIV 844392 . A T 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;DP=125;Dels=0.00;FS=3.297;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1367,0,1470 chrIV 844646 . A T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;DP=108;Dels=0.00;FS=1.539;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1303,0,1076 chrIV 844694 . G C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;DP=116;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.428;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.782;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1283,0,1149 chrIV 845065 . G A 1751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.447;DP=137;Dels=0.01;FS=1.415;HaplotypeScore=6.7710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=12.78;ReadPosRankSum=1.609;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,84:135:99:1781,0,1013 chrIV 845136 . C T 4147.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;DP=157;Dels=0.00;FS=3.966;HaplotypeScore=94.7430;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=26.41;ReadPosRankSum=1.644;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:4147,403,0 chrIV 845187 . A G 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.615;DP=148;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=2.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.543;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1395,0,1740 chrIV 845277 . G T 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.953;DP=148;Dels=0.00;FS=4.898;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.769;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1706,0,1522 chrIV 845309 . T A 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.281;DP=114;Dels=0.00;FS=4.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.298;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:1076,0,1552 chrIV 845391 . G C 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.65;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3303,330,0 chrIV 845494 . T G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.435;DP=123;Dels=0.00;FS=4.509;HaplotypeScore=6.4874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1203,0,1472 chrIV 845513 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.050;DP=123;Dels=0.00;FS=10.196;HaplotypeScore=2.9058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.649;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1137,0,1620 chrIV 845567 . T C 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.006;DP=91;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.624;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:1055,0,898 chrIV 845568 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.654;DP=90;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:1044,0,926 chrIV 845613 . G T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.742;DP=76;Dels=0.00;FS=15.336;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=12.80;ReadPosRankSum=-1.342;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,42:76:99:1003,0,723 chrIV 845739 . G A 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.469;DP=89;Dels=0.00;FS=2.903;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1038,0,872 chrIV 845818 . T G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.345;DP=101;Dels=0.00;FS=1.669;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,60:101:99:1379,0,850 chrIV 845959 . A C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;DP=117;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.571;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1146,0,1423 chrIV 846137 . T C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;DP=115;Dels=0.00;FS=7.301;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.144;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1361,0,1164 chrIV 846477 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.275;DP=111;Dels=0.00;FS=7.289;HaplotypeScore=3.7644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=9.69;ReadPosRankSum=2.429;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1106,0,1263 chrIV 846900 . T G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.221;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.123;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1168,0,1352 chrIV 846996 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.147;DP=122;Dels=0.00;FS=5.590;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.252;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1297,0,1452 chrIV 847053 . A G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.039;DP=122;Dels=0.00;FS=3.553;HaplotypeScore=5.8281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.460;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1221,0,1318 chrIV 847524 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.151;DP=121;Dels=0.00;FS=13.503;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.233;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1199,0,1467 chrIV 847527 . T G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;DP=124;Dels=0.00;FS=13.165;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.651;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1280,0,1483 chrIV 847680 . T C 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.533;DP=148;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.765;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,83:148:99:1805,0,1370 chrIV 847796 . T A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.469;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=9.44;ReadPosRankSum=-2.901;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:1522,0,1974 chrIV 847822 . T C 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.539;DP=152;Dels=0.00;FS=8.436;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1755,0,1510 chrIV 847853 . C T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.262;DP=153;Dels=0.00;FS=1.279;HaplotypeScore=4.6904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.639;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:153:99:1544,0,1752 chrIV 848136 . T C 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.658;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.683;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3590,366,0 chrIV 848316 . A G 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.779;DP=145;Dels=0.00;FS=10.804;HaplotypeScore=2.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.873;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,60:145:99:1175,0,1738 chrIV 848940 . C A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.866;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.140;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1375,0,1539 chrIV 848977 . C G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.819;DP=165;Dels=0.00;FS=1.250;HaplotypeScore=1.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.082;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,73:165:99:1409,0,1995 chrIV 849395 . C T 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.523;DP=135;Dels=0.00;FS=2.213;HaplotypeScore=70.5473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,79:135:99:1745,0,1102 chrIV 849478 . A G 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.273;DP=155;Dels=0.00;FS=6.307;HaplotypeScore=4.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.763;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1732,0,1637 chrIV 849539 . C G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.460;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.305;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1418,0,1516 chrIV 849555 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.004;DP=145;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.253;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1364,0,1736 chrIV 849735 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.860;DP=131;Dels=0.00;FS=2.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1234,0,1638 chrIV 849796 . T C 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2839,288,0 chrIV 849849 . G A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.438;DP=142;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=1;MQRankSum=0.658;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.554;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1407,0,1519 chrIV 849999 . T C 1839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.510;DP=143;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=12.86;ReadPosRankSum=1.450;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,87:143:99:1869,0,1213 chrIV 850164 . A G 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;DP=133;Dels=0.00;FS=9.138;HaplotypeScore=5.6923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.530;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1460,0,1362 chrIV 850221 . A C 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.277;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,75:127:99:1582,0,1122 chrIV 850484 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.139;DP=121;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1261,0,1474 chrIV 850495 . T C 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.664;DP=119;Dels=0.00;FS=2.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:954,0,1550 chrIV 850508 . A T 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.929;DP=123;Dels=0.00;FS=3.314;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1255,0,1430 chrIV 850697 . T C 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.951;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,78:133:99:1813,0,1164 chrIV 850922 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.670;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1183,0,1551 chrIV 850955 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;DP=123;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.930;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1270,0,1418 chrIV 851004 . T C 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.020;DP=158;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=3.7164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.444;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,82:158:99:1740,0,1664 chrIV 851043 . T C 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.331;DP=136;Dels=0.00;FS=3.080;HaplotypeScore=2.5721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1649,0,1333 chrIV 851114 . T A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;DP=134;Dels=0.01;FS=0.656;HaplotypeScore=23.2622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.342;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1155,0,1214 chrIV 851221 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.052;DP=128;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.277;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1380,0,1390 chrIV 851413 . C T 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.194;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=10.54;ReadPosRankSum=2.464;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1379,0,1400 chrIV 851427 . C T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.130;DP=120;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=11.06;ReadPosRankSum=2.291;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1357,0,1288 chrIV 851792 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.319;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.197;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1426,0,1612 chrIV 851816 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.889;DP=128;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=6.5329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.960;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1257,0,1575 chrIV 851855 . G A 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.108;DP=119;Dels=0.00;FS=2.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.833;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:999,0,1521 chrIV 851875 . A G 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.278;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:957,0,1578 chrIV 851927 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.510;DP=133;Dels=0.00;FS=2.525;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.380;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1436,0,1425 chrIV 852118 . G C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.994;DP=130;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.407;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1436,0,1256 chrIV 852542 . C G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.300;DP=139;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.450;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,55:139:99:1063,0,1869 chrIV 852619 . T C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.652;DP=123;Dels=0.00;FS=2.488;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1296,0,1475 chrIV 852794 . C T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;DP=116;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=2.9297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.249;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1320,0,1187 chrIV 852904 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.456;DP=143;Dels=0.00;FS=2.155;HaplotypeScore=3.9714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.554;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:143:99:1485,0,1590 chrIV 853192 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.240;DP=139;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.057;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1381,0,1611 chrIV 853448 . A C 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=161;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.888;SB=-2.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:161:99:3986,412,0 chrIV 853808 . C G 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;DP=97;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=8.65;ReadPosRankSum=-2.312;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:869,0,1163 chrIV 853958 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.924;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:990,0,1502 chrIV 853984 . T C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.370;DP=122;Dels=0.00;FS=7.090;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.015;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1029,0,1537 chrIV 853985 . A C 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.186;DP=123;Dels=0.00;FS=8.387;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.483;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1027,0,1518 chrIV 853996 . T C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.906;DP=121;Dels=0.00;FS=5.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.801;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1029,0,1554 chrIV 854017 . C T 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.785;DP=81;Dels=0.00;FS=4.383;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.839;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.185;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:742,0,1025 chrIV 854335 . C T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.776;DP=116;Dels=0.00;FS=8.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.130;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1152,0,1392 chrIV 854367 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.064;DP=116;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.815;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1264,0,1324 chrIV 854519 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.521;DP=122;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.764;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1260,0,1222 chrIV 855322 . G C 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.665;DP=131;Dels=0.00;FS=2.352;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1601,0,1141 chrIV 855709 . C T 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9290;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3539,346,0 chrIV 855748 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.981;DP=112;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=3.8954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.152;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1166,0,1131 chrIV 855817 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.324;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.314;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,81:171:99:1461,0,1997 chrIV 855848 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.051;DP=150;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.225;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,66:150:99:1311,0,1895 chrIV 856201 . G A 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.228;DP=122;Dels=0.00;FS=4.716;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1208,0,1350 chrIV 856278 . A T 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;DP=164;Dels=0.00;FS=1.945;HaplotypeScore=2.3948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.643;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,78:164:99:1731,0,1881 chrIV 856679 . A G 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.088;DP=133;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=4.9088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.897;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1574,0,1349 chrIV 857522 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.792;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=3.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.192;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1248,0,1405 chrIV 857609 . C A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.640;DP=151;Dels=0.01;FS=24.891;HaplotypeScore=5.6929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1458,0,1681 chrIV 857627 . A C 4309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4309,436,0 chrIV 857630 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.138;DP=160;Dels=0.00;FS=16.623;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,69:160:99:1368,0,2101 chrIV 858371 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.650;DP=115;Dels=0.00;FS=3.408;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.725;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1273,0,1195 chrIV 858496 . T A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;DP=98;Dels=0.00;FS=2.781;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.645;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,63:98:99:1443,0,695 chrIV 858787 . C G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.595;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.196;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1311,0,1077 chrIV 858828 . C T 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.466;DP=106;Dels=0.00;FS=7.756;HaplotypeScore=4.7047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:106:99:1053,0,1120 chrIV 858862 . C T 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.595;DP=93;Dels=0.00;FS=3.913;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:941,0,1049 chrIV 859191 . T G 623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;DP=109;Dels=0.00;FS=1.852;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.885;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.855;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:653,0,748 chrIV 859510 . A G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.344;DP=126;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.582;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1087,0,1600 chrIV 859605 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.775;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.900;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.647;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1443,0,1385 chrIV 859708 . G A 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.570;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.148;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:854,0,1125 chrIV 859980 . A G 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.608;DP=134;Dels=0.00;FS=2.348;HaplotypeScore=2.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.279;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1537,0,1300 chrIV 860353 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=139;Dels=0.00;FS=4.222;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1322,0,1654 chrIV 860382 . C G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.364;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.415;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1081,0,1345 chrIV 860602 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.898;DP=97;Dels=0.00;FS=2.750;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1155,0,903 chrIV 860620 . C T 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.217;DP=94;Dels=0.00;FS=5.221;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:1122,0,918 chrIV 860671 . A G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.172;DP=139;Dels=0.00;FS=9.008;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1275,0,1648 chrIV 860689 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.015;DP=131;Dels=0.00;FS=5.290;HaplotypeScore=5.6173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1324,0,1510 chrIV 860711 . T G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.673;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.298;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1390,0,1250 chrIV 860755 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.290;DP=119;Dels=0.00;FS=5.687;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.885;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1440,0,1060 chrIV 860764 . T C 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2988,306,0 chrIV 861013 . T A 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.235;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=8.64;ReadPosRankSum=-2.486;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:989,0,1434 chrIV 861202 . G C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.452;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1406,0,1375 chrIV 861257 . A G 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.89;SB=-2.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:4168,397,0 chrIV 861292 . C T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.320;DP=132;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.351;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1386,0,1499 chrIV 861707 . G A 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.758;DP=107;Dels=0.00;FS=19.570;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.363;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:870,0,1359 chrIV 861716 . G A 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.302;DP=103;Dels=0.00;FS=13.547;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=13.76;ReadPosRankSum=-1.034;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:103:99:1447,0,744 chrIV 862580 . T G 3828.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9799;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3828,399,0 chrIV 862602 . T C 1859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.146;DP=155;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,89:155:99:1889,0,1452 chrIV 862854 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;DP=118;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.469;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1241,0,1318 chrIV 863028 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.461;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.678;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1295,0,1699 chrIV 863397 . T C 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.377;DP=175;Dels=0.00;FS=5.387;HaplotypeScore=2.8793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,79:175:99:1595,0,2160 chrIV 863455 . G A 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.645;DP=160;Dels=0.00;FS=14.119;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1767,0,1665 chrIV 863555 . A G 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.142;DP=129;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.168;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1450,0,1271 chrIV 863664 . T C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.632;DP=107;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1011,0,1244 chrIV 863685 . G A 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.861;DP=102;Dels=0.00;FS=0.807;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.302;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:1062,0,1183 chrIV 863835 . T C 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;DP=107;Dels=0.00;FS=6.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:839,0,1555 chrIV 863843 . G A 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.776;DP=113;Dels=0.00;FS=6.025;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.324;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:970,0,1463 chrIV 863931 . G A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.225;DP=129;Dels=0.00;FS=1.465;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=0.443;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.773;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1272,0,1458 chrIV 864201 . C G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.502;DP=114;Dels=0.00;FS=2.412;HaplotypeScore=3.9039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=10.27;ReadPosRankSum=2.120;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1201,0,1205 chrIV 864225 . G A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.267;DP=130;Dels=0.00;FS=4.283;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.653;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1144,0,1529 chrIV 864550 . T C 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3208,330,0 chrIV 864611 . C A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.332;DP=107;Dels=0.00;FS=3.720;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.265;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1292,0,1033 chrIV 864669 . G T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.248;DP=98;Dels=0.00;FS=8.037;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.221;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1205,0,958 chrIV 864686 . A G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.120;DP=97;Dels=0.00;FS=8.226;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=10.68;ReadPosRankSum=2.089;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1066,0,1038 chrIV 864727 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.613;DP=109;Dels=0.00;FS=4.807;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=12.45;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,65:109:99:1387,0,913 chrIV 864765 . T C 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.704;DP=127;Dels=0.00;FS=2.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,48:127:99:879,0,1836 chrIV 864978 . G A 2451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3974;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=17.26;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:2484,249,0 chrIV 865291 . C T 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=1;QD=28.22;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3697,358,0 chrIV 865399 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.671;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.450;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1265,0,1520 chrIV 865489 . A G 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.051;DP=161;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=3.9482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.324;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1759,0,1712 chrIV 865525 . T C 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.120;DP=152;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.061;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,86:152:99:1722,0,1405 chrIV 865546 . T C 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.477;DP=158;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=2.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,88:158:99:1910,0,1467 chrIV 865573 . T C 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.910;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,85:154:99:1841,0,1399 chrIV 865865 . G C 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.414;DP=185;Dels=0.00;FS=0.545;HaplotypeScore=2.9441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=1;MQRankSum=0.976;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.086;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,87:185:99:1735,0,1934 chrIV 865993 . T C 2286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.475;DP=214;Dels=0.00;FS=3.876;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.590;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,113:214:99:2316,0,2091 chrIV 866129 . C T 2062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.727;DP=174;Dels=0.00;FS=8.856;HaplotypeScore=2.7438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,97:174:99:2092,0,1608 chrIV 866146 . A G 4724.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.96;SB=-2.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4724,481,0 chrIV 866195 . T G 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.459;DP=144;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.726;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1608,0,1408 chrIV 866436 . T C 4681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.01;SB=-2.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4681,478,0 chrIV 866723 . G T 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.444;DP=137;Dels=0.00;FS=3.059;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.871;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1480,0,1479 chrIV 866949 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.282;DP=146;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.497;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:146:99:1512,0,1343 chrIV 866998 . T C 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.11;SB=-2.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3816,384,0 chrIV 867546 . G A 1908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.799;DP=190;Dels=0.00;FS=6.199;HaplotypeScore=4.3571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=1;MQRankSum=0.345;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,91:190:99:1938,0,2103 chrIV 867677 . G A 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.290;DP=161;Dels=0.00;FS=3.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.974;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1763,0,1665 chrIV 867821 . C A 1345.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.507;DP=152;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQ0=0;MQRankSum=-8.551;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.756;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1375,0,1896 chrIV 867828 . T C 1096.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.529;DP=144;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=-8.398;QD=7.61;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,60:144:99:1126,0,1908 chrIV 867831 . A C 1179.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.056;DP=148;Dels=0.00;FS=4.266;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQ0=0;MQRankSum=-8.257;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.801;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:148:99:1209,0,1902 chrIV 867837 . A G 1162.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.086;DP=144;Dels=0.00;FS=4.239;HaplotypeScore=2.8212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=-8.215;QD=8.07;ReadPosRankSum=-2.549;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:144:99:1192,0,1879 chrIV 867841 . C T 1096.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.748;DP=136;Dels=0.00;FS=9.053;HaplotypeScore=1.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=-8.874;QD=8.06;ReadPosRankSum=-1.945;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1126,0,1771 chrIV 867847 . T C 1001.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.658;DP=137;Dels=0.00;FS=14.417;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.00;MQ0=0;MQRankSum=-8.253;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:137:99:1031,0,1833 chrIV 868027 . G A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;DP=108;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1086,0,1145 chrIV 868086 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.448;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.007;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1274,0,1302 chrIV 868348 . G T 3972.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3972,385,0 chrIV 868576 . A G 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.533;DP=144;Dels=0.00;FS=7.431;HaplotypeScore=2.7914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1328,0,1770 chrIV 868578 . G A 3892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7914;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.901e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3892,385,0 chrIV 868817 . C T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.797;DP=138;Dels=0.00;FS=6.397;HaplotypeScore=2.3906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.924;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1528,0,1391 chrIV 868916 . C A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.897;DP=117;Dels=0.00;FS=2.359;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1379,0,1253 chrIV 869149 . G T 1488.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.513;DP=172;Dels=0.00;FS=9.213;HaplotypeScore=13.2544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.015;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,74:172:99:1518,0,2031 chrIV 869151 . C A 1485.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.839;DP=174;Dels=0.01;FS=10.497;HaplotypeScore=13.2544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.102;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,77:173:99:1515,0,1970 chrIV 869159 . C T 1348.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;DP=156;Dels=0.00;FS=3.770;HaplotypeScore=4.6599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.584;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1378,0,1636 chrIV 869237 . A G 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.496;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,88:157:99:1871,0,1419 chrIV 869369 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.077;DP=141;Dels=0.00;FS=5.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.330;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1392,0,1576 chrIV 869558 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.817;DP=142;Dels=0.00;FS=7.571;HaplotypeScore=14.2592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.238;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:142:99:1439,0,1508 chrIV 869651 . C T 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.008;DP=142;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.283;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1583,0,1417 chrIV 869984 . G A 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=28.51;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3877,385,0 chrIV 870200 . G C 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3650,384,0 chrIV 870583 . C A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.806;DP=144;Dels=0.00;FS=3.876;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.473;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1546,0,1642 chrIV 870699 . A T 2406 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=35.3504;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=21.11;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2439,234,0 chrIV 870717 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.327;DP=107;Dels=0.00;FS=7.537;HaplotypeScore=39.6996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:63:1263,0,63 chrIV 870727 . A C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.340;DP=119;Dels=0.00;FS=5.619;HaplotypeScore=3.9388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.331;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:119:99:1041,0,1336 chrIV 870749 . T C 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.372;DP=134;Dels=0.00;FS=2.202;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1434,0,1276 chrIV 870787 . T C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.350;DP=116;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.025;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,70:116:99:1509,0,953 chrIV 870917 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.394;DP=125;Dels=0.00;FS=2.266;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=9.10;ReadPosRankSum=2.283;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1168,0,1429 chrIV 871042 . G T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.796;DP=115;Dels=0.00;FS=2.411;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.049;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1300,0,1136 chrIV 871373 . G A 2328 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=25.87;ReadPosRankSum=1.193;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:90:99:2361,217,0 chrIV 871483 . G T 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.767;DP=105;Dels=0.00;FS=22.736;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.168;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:900,0,1276 chrIV 871540 . C T 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.315;DP=97;Dels=0.00;FS=6.882;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.576;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:940,0,1220 chrIV 871554 . G C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.319;DP=104;Dels=0.00;FS=2.767;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.202;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1069,0,1083 chrIV 871619 . A G 697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.184;DP=94;Dels=0.00;FS=0.809;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.767;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:94:99:727,0,1350 chrIV 871622 . T A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.559;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,53:91:99:1207,0,791 chrIV 871635 . A G 678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.544;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.526;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,37:86:99:708,0,1201 chrIV 871656 . G A 481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.202;DP=97;Dels=0.00;FS=3.084;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=1.829;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:511,0,1316 chrIV 871657 . A T 496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;DP=89;Dels=0.00;FS=3.178;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.082;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:526,0,1224 chrIV 871688 . C T 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.689;DP=86;Dels=0.00;FS=3.336;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.755;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,39:86:99:816,0,1041 chrIV 871796 . C T 305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;DP=58;Dels=0.00;FS=1.533;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.48;MQ0=2;MQRankSum=-0.798;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.535;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:335,0,834 chrIV 871806 . G A 260.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.829;DP=51;Dels=0.00;FS=5.253;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.95;MQ0=2;MQRankSum=-0.835;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:290,0,760 chrIV 871816 . G A 151.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.233;DP=35;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=5.9193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.19;MQ0=3;MQRankSum=-2.179;QD=4.31;ReadPosRankSum=-3.982;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:181,0,492 chrIV 877687 . T A 34.77 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.70;MQ0=30;QD=1.05;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,15:33:6:66,6,0 chrIV 877864 . G A 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;DP=58;Dels=0.00;FS=13.155;HaplotypeScore=3.6622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.65;MQ0=0;MQRankSum=-3.506;QD=0.71;ReadPosRankSum=-0.958;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,8:58:71:71,0,1022 chrIV 878016 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.609;DP=117;Dels=0.00;FS=8.202;HaplotypeScore=62.4460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.96;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.628;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1063,0,1542 chrIV 878048 . A T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.668;DP=124;Dels=0.00;FS=10.825;HaplotypeScore=2.9548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.82;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.780;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1218,0,1582 chrIV 878186 . A T 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;DP=90;Dels=0.00;FS=0.820;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.76;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.586;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:962,0,1018 chrIV 878246 . C A 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.123;DP=94;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.26;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.325;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1117,0,968 chrIV 878261 . C T 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.750;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.38;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:827,0,770 chrIV 878287 . A T 466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.446;DP=48;Dels=0.00;FS=2.811;HaplotypeScore=3.9688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.86;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:496,0,551 chrIV 884217 . A T 24.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.84;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-2.802e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:54,0,18 chrIV 884220 . A T 140.52 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-3.053e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,59:60:6:170,0,6 chrIV 884248 . C G 266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.336;DP=84;Dels=0.00;FS=7.474;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.700;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:296,0,476 chrIV 884268 . G C 352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;DP=85;Dels=0.00;FS=5.376;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.836;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.682;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:382,0,477 chrIV 884283 . G A 622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.666;DP=90;Dels=0.00;FS=5.664;HaplotypeScore=89.8305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.02;MQ0=0;MQRankSum=2.638;QD=6.91;ReadPosRankSum=2.027;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:652,0,552 chrIV 884320 . C T 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.606;DP=84;Dels=0.00;FS=2.981;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.49;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.065;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:876,0,753 chrIV 884517 . G A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.455;DP=90;Dels=0.00;FS=8.966;HaplotypeScore=2.8960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=10.69;ReadPosRankSum=-2.172;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:992,0,870 chrIV 884597 . G A 226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.901;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,43:73:99:256,0,141 chrIV 884657 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.177;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,51:87:99:1072,0,656 chrIV 884761 . T A 2643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2676,259,0 chrIV 884974 . C G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=118;Dels=0.00;FS=5.731;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.354;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1391,0,1056 chrIV 885302 . T C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.826;DP=127;Dels=0.00;FS=11.154;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.562;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1346,0,1380 chrIV 885407 . G A 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.158;DP=98;Dels=0.00;FS=1.632;HaplotypeScore=3.8937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:98:99:1106,0,982 chrIV 885734 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.964;DP=111;Dels=0.00;FS=9.186;HaplotypeScore=3.8228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.101;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1145,0,1275 chrIV 885908 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.987;DP=113;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.726;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.324;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1218,0,1287 chrIV 886178 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.637;DP=129;Dels=0.00;FS=2.250;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1327,0,1368 chrIV 886289 . A G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.015;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1026,0,1063 chrIV 887044 . A G 2154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=40.6620;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.48;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:88:99:2187,240,0 chrIV 887192 . A C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.049;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1332,0,1273 chrIV 887448 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.096;DP=131;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:131:99:1286,0,1538 chrIV 887943 . G A 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.955;DP=127;Dels=0.00;FS=6.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.408;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1550,0,1161 chrIV 889122 . T C 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3090,312,0 chrIV 889739 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.127;DP=140;Dels=0.00;FS=7.006;HaplotypeScore=2.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1314,0,1803 chrIV 890069 . T C 4429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.493;DP=174;Dels=0.00;FS=3.772;HaplotypeScore=2.7569;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=25.45;ReadPosRankSum=0.259;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,173:174:99:4429,451,0 chrIV 890632 . T C 2114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.468;DP=190;Dels=0.00;FS=14.281;HaplotypeScore=4.3330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,104:190:99:2144,0,1983 chrIV 890651 . C A 1955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.257;DP=191;Dels=0.00;FS=4.273;HaplotypeScore=3.6284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,90:191:99:1985,0,2168 chrIV 891174 . A T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;DP=155;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=-0.487;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1537,0,1829 chrIV 892147 . T C 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.597;DP=171;Dels=0.00;FS=1.202;HaplotypeScore=2.9097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,82:171:99:1611,0,2034 chrIV 892194 . A G 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.981;DP=172;Dels=0.00;FS=1.193;HaplotypeScore=8.1495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.473;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,87:172:99:1608,0,1838 chrIV 892662 . G C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;DP=117;Dels=0.00;FS=17.382;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.562;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1291,0,1328 chrIV 892764 . C T 448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;DP=88;Dels=0.00;FS=6.230;HaplotypeScore=4.9173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:88:99:478,0,805 chrIV 893039 . A G 1937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.397;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.197;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,95:173:99:1967,0,1741 chrIV 893390 . T C 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.671;DP=156;Dels=0.00;FS=2.022;HaplotypeScore=5.2414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:156:99:1683,0,1608 chrIV 893393 . C T 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.377;DP=153;Dels=0.00;FS=1.267;HaplotypeScore=5.2414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1725,0,1607 chrIV 893441 . T C 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.131;DP=158;Dels=0.00;FS=3.836;HaplotypeScore=3.9128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.966;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,85:158:99:1646,0,1528 chrIV 893442 . C T 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.996;DP=158;Dels=0.00;FS=4.816;HaplotypeScore=4.7449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.840;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,85:158:99:1662,0,1506 chrIV 893751 . C G 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3152,336,0 chrIV 893888 . T C 1918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.900;DP=187;Dels=0.00;FS=0.555;HaplotypeScore=2.8582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=10.26;ReadPosRankSum=-2.181;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,98:187:99:1948,0,1918 chrIV 893934 . T C 5545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.09;SB=-2.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5545,574,0 chrIV 893952 . A G 2153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.030;DP=179;Dels=0.00;FS=0.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.092;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,96:179:99:2183,0,1875 chrIV 893982 . A G 4833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.46;SB=-2.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4833,499,0 chrIV 894453 . A T 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.882;DP=169;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=8.5829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.559;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:169:99:1777,0,1965 chrIV 894589 . A G 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.066;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.786;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1519,0,1554 chrIV 894714 . C A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=2.9133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.137;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1158,0,1475 chrIV 895397 . A G 1875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.413;DP=155;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=3.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.728;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,88:155:99:1905,0,1452 chrIV 895472 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;DP=120;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=7.7555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.569;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.680;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1265,0,1326 chrIV 895550 . T A 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.680;DP=135;Dels=0.00;FS=4.124;HaplotypeScore=3.6644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1255,0,1677 chrIV 895556 . T C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.971;DP=133;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=5.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.594;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.730;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1232,0,1549 chrIV 895577 . A T 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;DP=111;Dels=0.00;FS=1.602;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.534;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:111:99:918,0,1487 chrIV 895607 . T C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.100;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.783;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:988,0,1526 chrIV 897167 . T C 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.390;DP=154;Dels=0.00;FS=5.871;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.224;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,85:154:99:1918,0,1467 chrIV 897260 . A G 1972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.252;DP=158;Dels=0.00;FS=3.835;HaplotypeScore=3.8513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,90:158:99:2002,0,1388 chrIV 897287 . G A 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.944;DP=151;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.360;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,83:151:99:1824,0,1396 chrIV 897434 . A T 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.248;DP=143;Dels=0.00;FS=10.442;HaplotypeScore=7.0534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.379;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,87:143:99:1935,0,1167 chrIV 897959 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.860;DP=137;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.174;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:137:99:1301,0,1633 chrIV 898087 . T C 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2920,303,0 chrIV 898114 . C T 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.569;DP=114;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.656;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,42:112:99:874,0,1642 chrIV 898400 . C A 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.603;DP=106;Dels=0.00;FS=3.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:795,0,1337 chrIV 898406 . T G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.393;DP=108;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=8.80;ReadPosRankSum=-2.320;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:980,0,1282 chrIV 898436 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.335;DP=127;Dels=0.00;FS=3.307;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1369,0,1322 chrIV 898456 . C T 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.461;DP=138;Dels=0.00;FS=1.365;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.753;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1572,0,1312 chrIV 898763 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.588;DP=127;Dels=0.00;FS=2.463;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=9.71;ReadPosRankSum=2.313;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1263,0,1487 chrIV 898787 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.313;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1236,0,1296 chrIV 898970 . C T 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3677,352,0 chrIV 899129 . G A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.549;DP=160;Dels=0.00;FS=10.983;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.577;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1676,0,1663 chrIV 899142 . T C 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.354;DP=147;Dels=0.00;FS=4.942;HaplotypeScore=4.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.213;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:147:99:1512,0,1613 chrIV 899304 . G A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.602;DP=97;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1023,0,1020 chrIV 899488 . C T 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.349;DP=161;Dels=0.00;FS=5.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.055;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1656,0,1806 chrIV 899489 . T G 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.621;DP=164;Dels=0.00;FS=3.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.915;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.550;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1572,0,1834 chrIV 899581 . A G 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.887;DP=160;Dels=0.00;FS=5.679;HaplotypeScore=9.5854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.589;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1696,0,1780 chrIV 899680 . C T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.281;DP=140;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.886;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1649,0,1508 chrIV 900294 . C T 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3058,307,0 chrIV 900880 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.373;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.337;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:971,0,1586 chrIV 901041 . T C 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.658;DP=136;Dels=0.00;FS=6.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1487,0,1424 chrIV 901107 . T A 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3334,328,0 chrIV 901288 . C G 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.723;DP=151;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=3.4540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.363;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1630,0,1463 chrIV 901517 . T C 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.558;DP=140;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1813,0,1211 chrIV 901599 . T G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.856;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1240,0,1545 chrIV 901669 . T C 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.818;DP=134;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.871;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:134:99:1677,0,1244 chrIV 901798 . A G 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.398;DP=139;Dels=0.00;FS=6.289;HaplotypeScore=2.7759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1559,0,1528 chrIV 902051 . G T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.052;DP=126;Dels=0.00;FS=1.462;HaplotypeScore=4.5175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1489,0,1239 chrIV 902065 . A C 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.214;DP=145;Dels=0.00;FS=7.319;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1606,0,1461 chrIV 902156 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.406;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.293;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1253,0,1598 chrIV 902257 . G A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.625;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.765;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1609,0,1464 chrIV 902350 . G A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.985;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1336,0,1578 chrIV 902361 . T C 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3770,385,0 chrIV 902688 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.298;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.683;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1182,0,1029 chrIV 902746 . T C 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.938;DP=123;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.276;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1240,0,1379 chrIV 902824 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.024;DP=138;Dels=0.00;FS=9.572;HaplotypeScore=5.4591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.812;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1265,0,1571 chrIV 902880 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.174;DP=121;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1137,0,1418 chrIV 902950 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.458;DP=135;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=2.8690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.016;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1362,0,1468 chrIV 903517 . T C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.351;DP=133;Dels=0.00;FS=9.212;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1180,0,1741 chrIV 903611 . C G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;DP=148;Dels=0.00;FS=2.937;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.043;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1510,0,1667 chrIV 903899 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.055;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.796;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.603;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1181,0,1259 chrIV 903976 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.116;DP=120;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.543;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1298,0,1344 chrIV 904395 . C T 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.972;DP=140;Dels=0.00;FS=21.564;HaplotypeScore=2.8004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.435;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1706,0,1420 chrIV 904531 . C A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=124;Dels=0.00;FS=5.664;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=13.27;ReadPosRankSum=1.689;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:1676,0,1091 chrIV 904648 . A T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;DP=131;Dels=0.00;FS=6.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1472,0,1372 chrIV 904826 . G A 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.136;DP=132;Dels=0.00;FS=10.896;HaplotypeScore=3.2524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1575,0,1306 chrIV 904871 . C T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.226;DP=135;Dels=0.00;FS=17.972;HaplotypeScore=2.4839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.356;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1397,0,1522 chrIV 904915 . C T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.943;DP=152;Dels=0.00;FS=3.940;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1306,0,1889 chrIV 905063 . A G 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.143;DP=150;Dels=0.00;FS=2.986;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.959;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1628,0,1571 chrIV 905128 . A T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.265;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.738;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1110,0,1570 chrIV 905409 . T C 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.742;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,78:131:99:1639,0,1127 chrIV 905602 . T C 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.501;DP=168;Dels=0.00;FS=5.654;HaplotypeScore=3.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=10.57;ReadPosRankSum=-2.788;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,86:168:99:1806,0,1795 chrIV 905609 . A G 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.934;DP=155;Dels=0.00;FS=3.897;HaplotypeScore=4.7585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=9.92;ReadPosRankSum=-2.821;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:155:99:1567,0,1727 chrIV 906063 . T C 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.718;DP=120;Dels=0.00;FS=10.292;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.229;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1025,0,1536 chrIV 906101 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.864;DP=115;Dels=0.00;FS=18.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1039,0,1409 chrIV 906310 . A G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.595;DP=132;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.251;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1287,0,1698 chrIV 907064 . T G 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.718;DP=133;Dels=0.00;FS=9.671;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1166,0,1731 chrIV 907102 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.287;DP=149;Dels=0.00;FS=2.936;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.759;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,63:149:99:1277,0,1890 chrIV 907206 . C T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;DP=138;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=8.82;ReadPosRankSum=-2.124;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1247,0,1708 chrIV 907227 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.489;DP=136;Dels=0.00;FS=1.383;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1243,0,1653 chrIV 907286 . A G 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.639;DP=120;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.105;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1494,0,1173 chrIV 907521 . T A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;DP=128;Dels=0.00;FS=7.982;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1303,0,1546 chrIV 907628 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=124;Dels=0.00;FS=9.723;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1206,0,1430 chrIV 907707 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.169;DP=132;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.862;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.584;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1530,0,1388 chrIV 907779 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.729;DP=114;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.397;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1145,0,1358 chrIV 907782 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.327;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1251,0,1202 chrIV 907830 . T G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;DP=105;Dels=0.00;FS=3.595;HaplotypeScore=2.6939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.740;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1142,0,1063 chrIV 907845 . A G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.589;DP=116;Dels=0.00;FS=3.325;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.878;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.530;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1215,0,1315 chrIV 907920 . A G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.606;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.023;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1098,0,1323 chrIV 908078 . C T 1921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.981;DP=189;Dels=0.00;FS=1.787;HaplotypeScore=7.9394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,90:189:99:1951,0,2073 chrIV 908478 . T C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.359;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.544;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.081;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,54:137:99:1127,0,1858 chrIV 908567 . C T 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.473;DP=125;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.524;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1432,0,1220 chrIV 908649 . A G 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2926,315,0 chrIV 909033 . G C 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.980;DP=180;Dels=0.00;FS=8.985;HaplotypeScore=5.9595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=2.347;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.082;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,90:180:99:1801,0,1980 chrIV 909366 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.198;DP=118;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.246;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1415,0,1118 chrIV 909447 . T A 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3122,307,0 chrIV 909834 . A C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.806;DP=135;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.681;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1384,0,1626 chrIV 909908 . C A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.914;DP=136;Dels=0.00;FS=2.201;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1443,0,1574 chrIV 910025 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.157;DP=128;Dels=0.00;FS=2.274;HaplotypeScore=6.5575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:128:99:1212,0,1494 chrIV 910427 . A T 1883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.453;DP=142;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1913,0,1309 chrIV 910506 . T C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.148;DP=119;Dels=0.00;FS=3.327;HaplotypeScore=5.2034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1266,0,1375 chrIV 910601 . T C 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.558;DP=77;Dels=0.00;FS=5.924;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:77:99:728,0,1047 chrIV 910688 . T C 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2594,282,0 chrIV 910761 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.065;DP=106;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=4.6596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=2.437;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.978;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,63:106:99:1368,0,873 chrIV 910905 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.049;DP=110;Dels=0.00;FS=4.782;HaplotypeScore=2.6882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.988;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1310,0,1149 chrIV 910968 . C T 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.249;DP=116;Dels=0.00;FS=6.055;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1358,0,1104 chrIV 911274 . T C 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.607;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.888;QD=10.42;ReadPosRankSum=2.001;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:91:99:978,0,1045 chrIV 911317 . C T 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.023;DP=100;Dels=0.00;FS=3.410;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.984;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:984,0,1210 chrIV 911326 . G A 781.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;DP=93;Dels=0.00;FS=3.970;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.150;QD=8.40;ReadPosRankSum=-2.104;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:811,0,1138 chrIV 911330 . T C 713.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.432;DP=85;Dels=0.00;FS=7.806;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.999;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:743,0,1136 chrIV 911333 . G A 699.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.336;DP=83;Dels=0.00;FS=1.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.369;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:729,0,1025 chrIV 911343 . C T 613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.222;DP=86;Dels=0.00;FS=2.958;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:643,0,1132 chrIV 911472 . A C 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.954;DP=108;Dels=0.00;FS=3.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=1;MQRankSum=-1.966;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.094;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1002,0,1038 chrIV 911858 . C T 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.391;DP=138;Dels=0.00;FS=1.690;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=12.32;ReadPosRankSum=2.043;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1730,0,1313 chrIV 911925 . G T 4079.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.84;SB=-2.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4079,403,0 chrIV 912021 . G A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.434;DP=124;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1461,0,1236 chrIV 912072 . T G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.669;DP=131;Dels=0.00;FS=2.206;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=9.62;ReadPosRankSum=2.129;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1290,0,1629 chrIV 912148 . G A 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.662;DP=122;Dels=0.00;FS=7.857;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.688;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.024;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:958,0,1276 chrIV 912340 . A G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.204;DP=148;Dels=0.02;FS=0.644;HaplotypeScore=8.8643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.700;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1507,0,1360 chrIV 912471 . A C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.742;DP=122;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=1;MQRankSum=-0.371;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1176,0,1413 chrIV 912557 . T C 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.341;DP=148;Dels=0.00;FS=23.109;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1220,0,1749 chrIV 912700 . A C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.977;DP=140;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=4.9557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1443,0,1639 chrIV 912778 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.885;DP=142;Dels=0.00;FS=5.121;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.389;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:142:99:1354,0,1546 chrIV 912782 . A G 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.498;DP=142;Dels=0.00;FS=4.071;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1406,0,1646 chrIV 912884 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.527;DP=114;Dels=0.00;FS=3.441;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.376;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1154,0,1183 chrIV 912902 . C T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.253;DP=122;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=3.7694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.660;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1366,0,1184 chrIV 912983 . C T 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.746;DP=124;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.829;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1569,0,1127 chrIV 913034 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.121;DP=145;Dels=0.00;FS=17.106;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.675;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1433,0,1681 chrIV 913112 . T G 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.462;DP=132;Dels=0.00;FS=3.462;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.244;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1460,0,1462 chrIV 913116 . G A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.988;DP=132;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.192;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1524,0,1343 chrIV 913396 . G A 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.489;DP=148;Dels=0.00;FS=5.071;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.343;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1712,0,1423 chrIV 913596 . T G 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;DP=106;Dels=0.00;FS=1.577;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.646;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:996,0,1240 chrIV 913633 . A G 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.416;DP=136;Dels=0.00;FS=4.191;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.855;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1479,0,1469 chrIV 913716 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.793;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.838;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1246,0,1563 chrIV 913736 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.123;DP=118;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1163,0,1311 chrIV 913863 . T C 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.196;DP=110;Dels=0.00;FS=4.732;HaplotypeScore=5.2164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.839;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:949,0,1433 chrIV 913903 . G A 549.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;DP=101;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.911;QD=5.44;ReadPosRankSum=-2.979;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:579,0,1238 chrIV 913904 . A G 548.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.751;DP=108;Dels=0.00;FS=1.571;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.768;QD=5.07;ReadPosRankSum=-3.788;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:578,0,1271 chrIV 913905 . A T 672.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.215;DP=107;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.097;QD=6.28;ReadPosRankSum=-3.256;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:702,0,1234 chrIV 913973 . G C 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.908;DP=111;Dels=0.00;FS=12.395;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.152;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.866;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:1008,0,1377 chrIV 914065 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.782;DP=127;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=10.40;ReadPosRankSum=2.298;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1351,0,1394 chrIV 914155 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.562;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.920;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1136,0,1399 chrIV 914554 . G A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.934;DP=110;Dels=0.00;FS=6.135;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.727;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:1023,0,1386 chrIV 914816 . G A 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=136;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=27.09;ReadPosRankSum=1.121;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3684,358,0 chrIV 914902 . A G 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3204,336,0 chrIV 914952 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.452;DP=127;Dels=0.00;FS=2.388;HaplotypeScore=3.6337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.471;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1234,0,1612 chrIV 915199 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.279;DP=129;Dels=0.00;FS=6.740;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.689;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1484,0,1342 chrIV 915370 . T A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.844;DP=116;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=3.2445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.149;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1211,0,1244 chrIV 915378 . A T 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2774,267,0 chrIV 915388 . T A 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;DP=99;Dels=0.00;FS=2.668;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1017,0,1085 chrIV 915430 . G A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.729;DP=109;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.282;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1304,0,1076 chrIV 915455 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.809;DP=119;Dels=0.00;FS=2.452;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.773;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1040,0,1498 chrIV 915507 . A C 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.398;DP=132;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=4.9141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.610;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1507,0,1338 chrIV 916130 . T C 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.541;DP=158;Dels=0.00;FS=1.233;HaplotypeScore=3.9268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1653,0,1887 chrIV 916142 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.454;DP=134;Dels=0.00;FS=3.131;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.120;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1358,0,1559 chrIV 916169 . A T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;DP=128;Dels=0.00;FS=5.541;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.123;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1251,0,1465 chrIV 916285 . C T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.647;DP=126;Dels=0.00;FS=4.247;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1323,0,1217 chrIV 916446 . T C 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.846;DP=156;Dels=0.00;FS=3.983;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.188;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1695,0,1674 chrIV 917034 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.328;DP=117;Dels=0.00;FS=4.495;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.141;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1364,0,1084 chrIV 917149 . G A 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2827,274,0 chrIV 917487 . T C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.420;DP=104;Dels=0.00;FS=0.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.392;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1238,0,1012 chrIV 917577 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.860;DP=103;Dels=0.00;FS=3.807;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.093;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1092,0,839 chrIV 917683 . A G 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.728;DP=135;Dels=0.00;FS=5.431;HaplotypeScore=13.5161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,52:135:99:1005,0,1874 chrIV 917833 . A G 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3583,346,0 chrIV 918196 . A C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.485;DP=114;Dels=0.00;FS=2.627;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1335,0,1162 chrIV 918363 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.622;DP=126;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.946;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1443,0,1273 chrIV 918400 . T A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;DP=110;Dels=0.00;FS=3.478;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.667;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1154,0,1220 chrIV 918495 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.458;DP=113;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=4.8029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.365;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1234,0,1229 chrIV 918501 . G A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;DP=115;Dels=0.01;FS=1.508;HaplotypeScore=6.2351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1412,0,1166 chrIV 918524 . C T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.254;DP=110;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.482;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1370,0,1112 chrIV 918560 . G A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.829;DP=114;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,68:114:99:1488,0,890 chrIV 918606 . G T 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3113,292,0 chrIV 918617 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.029;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:113:99:1105,0,1125 chrIV 918797 . T C 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.088;DP=120;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:120:99:1223,0,1416 chrIV 918920 . G A 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.545;DP=112;Dels=0.00;FS=2.502;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.298;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:989,0,1513 chrIV 919021 . T G 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;DP=155;Dels=0.00;FS=10.173;HaplotypeScore=6.5216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.663;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:155:99:1700,0,1511 chrIV 919343 . T C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.123;DP=100;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.906;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.112;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1157,0,1029 chrIV 920392 . T A 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.751;DP=132;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=5.9184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.621;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1603,0,1332 chrIV 920565 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.275;DP=96;Dels=0.00;FS=6.466;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1277,0,864 chrIV 920628 . C T 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3146,307,0 chrIV 920977 . C T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.293;DP=130;Dels=0.00;FS=4.345;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.352;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1506,0,1336 chrIV 921045 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.131;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.403;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1324,0,1389 chrIV 921130 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.961;DP=103;Dels=0.00;FS=2.615;HaplotypeScore=2.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.389;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:103:99:1162,0,969 chrIV 921790 . A T 634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.765;DP=64;Dels=0.00;FS=0.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.699;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:664,0,842 chrIV 922174 . C T 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2953,286,0 chrIV 922223 . G A 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.819;DP=106;Dels=0.00;FS=12.983;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.959;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:958,0,1307 chrIV 922344 . T C 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.219;DP=127;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=4.1476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:869,0,1954 chrIV 922382 . T C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.793;DP=139;Dels=0.00;FS=3.148;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=7.00;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,51:139:99:1003,0,2068 chrIV 922571 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.494;DP=129;Dels=0.00;FS=11.054;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1287,0,1527 chrIV 922733 . C T 1944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.859;DP=163;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.466;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,95:163:99:1974,0,1400 chrIV 922757 . A G 2050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.562;DP=181;Dels=0.00;FS=2.733;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,99:181:99:2080,0,1762 chrIV 922835 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.119;DP=142;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=5.8572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1328,0,1698 chrIV 922979 . T G 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.576;DP=94;Dels=0.00;FS=2.941;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.844;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,36:94:99:689,0,1403 chrIV 923087 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.869;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQ0=0;MQRankSum=2.705;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.503;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1121,0,1430 chrIV 923102 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.250;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQ0=0;MQRankSum=2.520;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.429;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1338,0,1386 chrIV 923277 . G T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.828;DP=134;Dels=0.00;FS=1.447;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.554;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1643,0,1304 chrIV 923336 . G T 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;DP=143;Dels=0.00;FS=11.809;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=11.50;ReadPosRankSum=2.765;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1675,0,1322 chrIV 923384 . G T 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1646,0,1661 chrIV 923675 . A G 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3574,375,0 chrIV 924174 . C A 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.061;DP=131;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.527;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1665,0,1286 chrIV 924181 . C T 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.710;DP=141;Dels=0.00;FS=4.141;HaplotypeScore=2.9482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.925;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.094;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1839,0,1223 chrIV 924234 . C A 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;DP=154;Dels=0.00;FS=13.158;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.274;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1540,0,1743 chrIV 924283 . A G 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.096;DP=155;Dels=0.01;FS=4.777;HaplotypeScore=7.8787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.954;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1521,0,1643 chrIV 924617 . T C 1989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.475;DP=168;Dels=0.00;FS=3.571;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.440;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.149;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,95:168:99:2019,0,1530 chrIV 924619 . G T 4489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-2.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4489,418,0 chrIV 925130 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.330;DP=154;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=2.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.911;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1643,0,1647 chrIV 925318 . C T 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;DP=155;Dels=0.00;FS=7.055;HaplotypeScore=3.8183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.406;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1684,0,1719 chrIV 925484 . A G 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.545;DP=140;Dels=0.00;FS=3.270;HaplotypeScore=10.1181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,83:140:99:1739,0,1241 chrIV 925675 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.650;DP=142;Dels=0.00;FS=1.352;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1210,0,1824 chrIV 925783 . C T 2230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.703;DP=174;Dels=0.00;FS=1.927;HaplotypeScore=8.7308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.913;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,99:174:99:2260,0,1513 chrIV 925829 . C T 2040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.189;DP=170;Dels=0.00;FS=5.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.772;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.844;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:170:99:2070,0,1641 chrIV 925876 . C T 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;DP=146;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1646,0,1396 chrIV 925956 . G A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.487;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.812;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1555,0,1340 chrIV 926246 . A G 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.008;DP=141;Dels=0.00;FS=7.626;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.369;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1696,0,1378 chrIV 926285 . C G 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;DP=131;Dels=0.00;FS=6.753;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.096;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1660,0,1164 chrIV 926303 . T C 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.051;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.697;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1564,0,1588 chrIV 926437 . T G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.314;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1091,0,1474 chrIV 926551 . C T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.654;DP=137;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=3.7197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1486,0,1499 chrIV 926737 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.407;DP=118;Dels=0.00;FS=11.954;HaplotypeScore=2.8402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.005;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1117,0,1392 chrIV 926855 . G A 2005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.901;DP=182;Dels=0.00;FS=11.411;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.611;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,95:182:99:2035,0,1747 chrIV 926869 . C A 2112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.364;DP=188;Dels=0.00;FS=6.310;HaplotypeScore=5.5122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.304;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,96:188:99:2142,0,1841 chrIV 926907 . G C 2398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.313;DP=200;Dels=0.00;FS=2.760;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.999;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,111:200:99:2428,0,1726 chrIV 926953 . A G 2360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.576;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.166;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.358;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,110:214:99:2390,0,2126 chrIV 926985 . T C 2061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.247;DP=184;Dels=0.00;FS=1.826;HaplotypeScore=3.7125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,98:184:99:2091,0,1835 chrIV 927028 . G T 1873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.433;DP=180;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.432;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,89:180:99:1903,0,1868 chrIV 927195 . G A 2144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.432;DP=178;Dels=0.00;FS=1.941;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=2.196;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,94:178:99:2174,0,1615 chrIV 927589 . T C 270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.729;DP=160;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.36;MQ0=0;MQRankSum=-4.221;QD=1.69;ReadPosRankSum=-7.052;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,29:160:99:300,0,2275 chrIV 927592 . C T 276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;DP=171;Dels=0.00;FS=1.654;HaplotypeScore=2.4694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.76;MQ0=0;MQRankSum=-5.032;QD=1.61;ReadPosRankSum=-7.172;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,29:171:99:306,0,2418 chrIV 927608 . C A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.571;DP=129;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=2.5027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=2.706;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.957;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1108,0,912 chrIV 927625 . A T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;DP=121;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:946,0,1183 chrIV 927628 . C T 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.967;DP=126;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1008,0,1143 chrIV 928114 . A T 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;DP=168;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.690;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,82:168:99:1606,0,1820 chrIV 928579 . C G 97.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;DP=75;Dels=0.00;FS=99.125;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=1.29;ReadPosRankSum=-5.458;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:127,0,1184 chrIV 928756 . C T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.671;DP=157;Dels=0.00;FS=4.705;HaplotypeScore=2.4397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.723;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,74:157:99:1695,0,1728 chrIV 928925 . G A 2125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.539;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.810;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,95:174:99:2155,0,1575 chrIV 928988 . T C 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.633;DP=163;Dels=0.00;FS=1.944;HaplotypeScore=3.8424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.685;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,82:163:99:1686,0,1817 chrIV 929038 . C T 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.029;DP=162;Dels=0.00;FS=1.224;HaplotypeScore=3.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.200;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.211;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,77:162:99:1709,0,1756 chrIV 929658 . A T 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.489;DP=148;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.317;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1668,0,1618 chrIV 929662 . G A 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.077;DP=144;Dels=0.00;FS=2.101;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.326;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1660,0,1443 chrIV 929900 . G C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;DP=131;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=4.2750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1263,0,1468 chrIV 929923 . A G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;DP=149;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=11.7242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:149:99:1499,0,1618 chrIV 930059 . T C 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.193;DP=135;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.196;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1344,0,1575 chrIV 930409 . A G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.964;DP=123;Dels=0.00;FS=2.196;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.897;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.320;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1258,0,1503 chrIV 930719 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.555;DP=116;Dels=0.00;FS=2.391;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1248,0,1235 chrIV 930822 . A T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;DP=148;Dels=0.00;FS=2.202;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=1;MQRankSum=0.069;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.472;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,59:148:99:1079,0,1915 chrIV 930823 . A T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;DP=151;Dels=0.00;FS=2.164;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.773;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.237;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,61:151:99:1081,0,1923 chrIV 931013 . G C 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;DP=157;Dels=0.00;FS=4.808;HaplotypeScore=5.5815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=10.48;ReadPosRankSum=-3.068;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1675,0,1496 chrIV 931376 . C A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.101;DP=163;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=2.7794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.430;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1556,0,1734 chrIV 931447 . G T 1867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.345;DP=166;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,86:166:99:1897,0,1673 chrIV 931764 . T C 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.967;DP=162;Dels=0.00;FS=2.833;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,92:162:99:1687,0,1538 chrIV 931770 . C G 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.898;DP=146;Dels=0.00;FS=5.025;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.063;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.492;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1689,0,1355 chrIV 931988 . C T 1891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.590;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.026;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,87:159:99:1921,0,1468 chrIV 932859 . C T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.203;DP=120;Dels=0.00;FS=10.045;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1197,0,1435 chrIV 933755 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;DP=130;Dels=0.00;FS=4.413;HaplotypeScore=5.7057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1349,0,1415 chrIV 933821 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=113;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=6.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.204;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1268,0,1168 chrIV 933861 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.839;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.061;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.337;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1183,0,1423 chrIV 933867 . C A 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.965;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.922;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1120,0,1311 chrIV 933896 . A G 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.300;DP=102;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.600;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:102:99:860,0,1447 chrIV 934007 . G A 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.495;DP=144;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=3.5654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=11.90;ReadPosRankSum=2.303;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1743,0,1461 chrIV 934175 . G A 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.942;DP=144;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.468;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1528,0,1605 chrIV 934184 . G A 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.152;DP=131;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=2.3924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.430;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1424,0,1535 chrIV 934256 . C A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;DP=115;Dels=0.00;FS=4.723;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.865;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1329,0,1208 chrIV 934358 . T C 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.339;DP=122;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1074,0,1586 chrIV 934364 . C T 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;DP=118;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1177,0,1461 chrIV 934508 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.883;DP=135;Dels=0.00;FS=16.045;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1605,0,1365 chrIV 934903 . T C 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3415,339,0 chrIV 934913 . G A 1927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.043;DP=143;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=13.48;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,85:143:99:1957,0,1156 chrIV 935012 . A G 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3513,346,0 chrIV 935079 . G C 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6232;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:117:99:3125,315,0 chrIV 935138 . G A 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=26.90;ReadPosRankSum=1.701;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:3073,307,0 chrIV 935192 . T G 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.129;DP=121;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.411;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1440,0,1120 chrIV 935384 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.666;DP=116;Dels=0.00;FS=5.069;HaplotypeScore=4.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.602;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1261,0,1277 chrIV 935575 . T C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.704;DP=104;Dels=0.00;FS=9.521;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.175;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:104:99:988,0,1217 chrIV 935955 . A T 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=12.53;ReadPosRankSum=-1.898;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,70:120:99:1534,0,1089 chrIV 935963 . G T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.757;DP=127;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.949;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1203,0,1507 chrIV 936016 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;DP=109;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=1.233;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.251;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1146,0,1242 chrIV 936056 . C T 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.923;DP=122;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=7.8570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=1;MQRankSum=-0.005;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:122:99:1196,0,1351 chrIV 936158 . C A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;DP=141;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1480,0,1602 chrIV 936221 . A G 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3815,379,0 chrIV 936290 . A T 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=1;QD=26.74;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3663,361,0 chrIV 936485 . T A 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=49.2919;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3290,328,0 chrIV 936486 . G C 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=51.2249;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3234,327,0 chrIV 936663 . G A 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.488;DP=144;Dels=0.00;FS=2.975;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1797,0,1327 chrIV 936728 . A G 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.476;DP=137;Dels=0.00;FS=2.203;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.123;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:1088,0,1841 chrIV 937029 . A G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.914;DP=111;Dels=0.00;FS=6.195;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.164;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:1023,0,1438 chrIV 937139 . T C 2125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2158,216,0 chrIV 937167 . C T 2384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2417,237,0 chrIV 937186 . T A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;DP=118;Dels=0.00;FS=3.403;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1428,0,1149 chrIV 937515 . G A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.441;DP=141;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1658,0,1315 chrIV 937517 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;DP=139;Dels=0.00;FS=4.362;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1530,0,1339 chrIV 937744 . G A 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;DP=113;Dels=0.00;FS=5.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:932,0,1509 chrIV 937875 . T C 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.12;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3526,369,0 chrIV 937878 . C A 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.801;DP=128;Dels=0.00;FS=6.474;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.574;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1738,0,1149 chrIV 938009 . A T 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3914,382,0 chrIV 938147 . A G 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.362;DP=148;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.602;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1500,0,1680 chrIV 938500 . G A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.785;DP=109;Dels=0.00;FS=7.422;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.718;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1212,0,1163 chrIV 938510 . T C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.543;DP=106;Dels=0.00;FS=6.158;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.986;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1134,0,1146 chrIV 938591 . T C 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3174,324,0 chrIV 939008 . T A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.524;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1512,0,1786 chrIV 939122 . G A 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.794;DP=128;Dels=0.00;FS=4.268;HaplotypeScore=5.9491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1576,0,1009 chrIV 939227 . G A 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.667;DP=123;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.832;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:123:99:1120,0,1402 chrIV 939749 . A G 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3487,363,0 chrIV 939974 . C T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.656;DP=126;Dels=0.00;FS=2.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.596;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1300,0,1424 chrIV 940069 . A G 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.646;DP=130;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=3.8784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.135;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1607,0,1106 chrIV 940202 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.696;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.471;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1389,0,1479 chrIV 940217 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.153;DP=129;Dels=0.00;FS=2.282;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1370,0,1388 chrIV 940972 . G C 1746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6366;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=13.13;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:133:99:1779,183,0 chrIV 940995 . T A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3268,333,0 chrIV 941063 . T C 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3296,336,0 chrIV 941099 . C T 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3387,340,0 chrIV 941151 . T C 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3661,367,0 chrIV 941404 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.407;DP=144;Dels=0.00;FS=3.220;HaplotypeScore=4.2173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.016;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,61:144:99:1273,0,1972 chrIV 941528 . C G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;DP=121;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.200;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1139,0,1342 chrIV 942067 . T G 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3397,357,0 chrIV 942069 . G A 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3704,387,0 chrIV 942296 . T G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.108;DP=126;Dels=0.00;FS=6.747;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1315,0,1352 chrIV 942582 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=119;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=3.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1326,0,1258 chrIV 942593 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.748;DP=111;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=7.2778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:111:99:1190,0,1127 chrIV 942662 . G A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;DP=112;Dels=0.00;FS=2.447;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1112,0,1284 chrIV 942724 . T A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.810;DP=107;Dels=0.00;FS=4.836;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1199,0,1204 chrIV 942748 . G A 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3053,301,0 chrIV 942772 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.970;DP=129;Dels=0.00;FS=5.350;HaplotypeScore=4.8601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1343,0,1435 chrIV 942812 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.776;DP=148;Dels=0.00;FS=5.074;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.363;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1465,0,1618 chrIV 942881 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.484;DP=106;Dels=0.00;FS=2.618;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:963,0,1234 chrIV 942914 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;DP=116;Dels=0.00;FS=5.807;HaplotypeScore=3.5018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.453;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1246,0,1246 chrIV 943103 . G C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.411;DP=141;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=6.5146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.799;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1329,0,1579 chrIV 943132 . A G 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.648;DP=155;Dels=0.00;FS=14.672;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.715;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1441,0,1864 chrIV 943157 . A G 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.376;DP=138;Dels=0.00;FS=6.468;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.699;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1589,0,1494 chrIV 943539 . T C 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.823;DP=84;Dels=0.00;FS=17.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=10.45;ReadPosRankSum=2.506;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:908,0,973 chrIV 943601 . A T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.180;DP=131;Dels=0.00;FS=1.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1320,0,1628 chrIV 943622 . T C 1041.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;DP=119;Dels=0.00;FS=2.080;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.550;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1071,0,1490 chrIV 943625 . C T 1102.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.668;DP=119;Dels=0.00;FS=0.967;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.115;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.994;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1132,0,1471 chrIV 943632 . G T 1083.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.900;DP=123;Dels=0.00;FS=0.962;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1113,0,1493 chrIV 944277 . G A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.583;DP=83;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.753;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:967,0,875 chrIV 944304 . T C 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.326;DP=76;Dels=0.00;FS=6.053;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.987;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,42:76:99:912,0,783 chrIV 944433 . G C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;DP=119;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1182,0,1311 chrIV 944564 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.554;DP=106;Dels=0.00;FS=5.279;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=10.95;ReadPosRankSum=2.281;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1191,0,1107 chrIV 945227 . A T 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;DP=91;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=6.7938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.195;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,35:91:99:622,0,1341 chrIV 945419 . G A 688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.627;DP=76;Dels=0.00;FS=2.083;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.792;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,35:76:99:718,0,913 chrIV 945604 . T G 572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.239;DP=65;Dels=0.00;FS=2.074;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:602,0,767 chrIV 945665 . C A 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=96;Dels=0.00;FS=2.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.982;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:957,0,1065 chrIV 945712 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.033;DP=113;Dels=0.00;FS=8.827;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.297;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1266,0,1142 chrIV 946425 . T C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.447;DP=117;Dels=0.00;FS=2.970;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQ0=1;MQRankSum=1.913;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1135,0,1300 chrIV 946459 . C A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.561;DP=122;Dels=0.00;FS=0.829;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.53;MQ0=0;MQRankSum=3.147;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.042;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1345,0,1168 chrIV 946858 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.553;DP=128;Dels=0.01;FS=3.353;HaplotypeScore=6.5877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.444;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1232,0,1541 chrIV 947412 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;DP=114;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=12.62;ReadPosRankSum=2.430;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1469,0,1058 chrIV 947433 . T A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;DP=112;Dels=0.00;FS=1.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.916;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,72:112:99:1623,0,818 chrIV 947968 . G A 2033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.394;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.358;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,96:175:99:2063,0,1601 chrIV 947971 . A G 1923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.905;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.833;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,93:170:99:1953,0,1664 chrIV 947998 . T C 2091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.142;DP=159;Dels=0.00;FS=2.205;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,95:159:99:2121,0,1307 chrIV 948028 . C A 2031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;DP=164;Dels=0.00;FS=9.385;HaplotypeScore=2.4558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.146;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,95:164:99:2061,0,1373 chrIV 948289 . A C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;DP=137;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.206;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1272,0,1662 chrIV 948465 . T G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.264;DP=129;Dels=0.00;FS=5.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.915;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1151,0,1597 chrIV 948494 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.131;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.003;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1249,0,1407 chrIV 948548 . G A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.264;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.856;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:133:99:1432,0,1383 chrIV 948551 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.025;DP=116;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.721;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1325,0,1189 chrIV 948656 . G A 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.211;DP=137;Dels=0.00;FS=4.117;HaplotypeScore=6.0782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:136:99:1620,0,1324 chrIV 948676 . C T 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.966;DP=142;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.105;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1786,0,1322 chrIV 948761 . C T 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;DP=112;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.257;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.299;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1531,0,864 chrIV 948815 . G T 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;DP=101;Dels=0.00;FS=1.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.251;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,65:101:99:1551,0,704 chrIV 948920 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.356;DP=108;Dels=0.00;FS=2.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.620;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:1042,0,1358 chrIV 949385 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;DP=111;Dels=0.00;FS=7.438;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=1;MQRankSum=1.718;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.946;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1304,0,1025 chrIV 949454 . A T 773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;DP=87;Dels=0.00;FS=2.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.350;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:803,0,1110 chrIV 949737 . T C 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.508;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.337;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1103,0,1170 chrIV 949739 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.597;DP=106;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.341;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1168,0,1096 chrIV 949789 . T C 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3040,309,0 chrIV 949825 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.125;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1132,0,1320 chrIV 949927 . A G 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3000,321,0 chrIV 949961 . A G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.875;DP=132;Dels=0.00;FS=4.445;HaplotypeScore=4.9527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.259;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1125,0,1518 chrIV 950109 . C A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.259;DP=122;Dels=0.00;FS=13.400;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.527;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1161,0,1423 chrIV 950289 . C G 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.036;DP=103;Dels=0.00;FS=3.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.165;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1099,0,1137 chrIV 950307 . G C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;DP=103;Dels=0.00;FS=4.879;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.604;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1108,0,1007 chrIV 950317 . G C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;DP=114;Dels=0.00;FS=3.455;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1382,0,1126 chrIV 950368 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.843;DP=119;Dels=0.00;FS=4.420;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.497;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1178,0,1348 chrIV 950411 . A G 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.341;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.602;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:837,0,1060 chrIV 950587 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;DP=103;Dels=0.01;FS=0.745;HaplotypeScore=14.2631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=1;MQRankSum=0.581;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1035,0,1147 chrIV 950760 . G A 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.503;DP=118;Dels=0.00;FS=2.543;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.138;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:1049,0,1551 chrIV 950907 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.377;DP=124;Dels=0.00;FS=8.212;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.310;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1381,0,1276 chrIV 950937 . A G 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.536;DP=102;Dels=0.00;FS=5.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.382;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:904,0,1304 chrIV 950965 . G A 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.045;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.884;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:124:99:1356,0,1265 chrIV 951096 . C G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.165;DP=135;Dels=0.00;FS=12.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.152;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1332,0,1575 chrIV 951132 . T A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;DP=142;Dels=0.00;FS=10.204;HaplotypeScore=2.4889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1516,0,1628 chrIV 951420 . C T 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.734;DP=110;Dels=0.00;FS=3.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.998;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:110:99:977,0,1396 chrIV 951624 . T C 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.316;DP=125;Dels=0.00;FS=6.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.472;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1251,0,1409 chrIV 951669 . C T 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.999;DP=127;Dels=0.00;FS=2.448;HaplotypeScore=3.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.314;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1699,0,1068 chrIV 952329 . T C 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2898,300,0 chrIV 952433 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.647;DP=136;Dels=0.00;FS=7.410;HaplotypeScore=5.4671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1375,0,1587 chrIV 952563 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.175;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=8.57;ReadPosRankSum=-2.914;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,75:166:99:1452,0,2071 chrIV 952568 . C T 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.827;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=9.02;ReadPosRankSum=-2.297;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:1491,0,1964 chrIV 952622 . T G 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.617;DP=101;Dels=0.00;FS=8.889;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=6.66;ReadPosRankSum=2.043;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,38:101:99:703,0,1494 chrIV 952698 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1172,0,1027 chrIV 952701 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.326;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1248,0,1170 chrIV 952937 . G A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.687;DP=118;Dels=0.00;FS=13.752;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.536;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1525,0,1008 chrIV 953287 . C G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.977;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1370,0,1710 chrIV 953288 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.886;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.608;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1415,0,1678 chrIV 953474 . A G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.667;DP=158;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=4.4345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,63:158:99:1201,0,2219 chrIV 953613 . C T 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.447;DP=147;Dels=0.00;FS=10.438;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.374;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,63:147:99:1365,0,1854 chrIV 953693 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.263;DP=114;Dels=0.00;FS=7.323;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1234,0,1316 chrIV 953940 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.207;DP=104;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1198,0,1171 chrIV 954146 . T A 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;DP=116;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.572;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1241,0,1423 chrIV 954283 . T C 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.533;DP=85;Dels=0.00;FS=1.798;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.382;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,42:85:99:883,0,987 chrIV 954475 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.213;DP=138;Dels=0.00;FS=6.323;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=0.321;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.918;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1421,0,1456 chrIV 954530 . T C 770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.367;DP=104;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.940;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,41:104:99:800,0,1506 chrIV 954791 . C A 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.407;DP=105;Dels=0.00;FS=2.515;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:952,0,1117 chrIV 954939 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.038;DP=128;Dels=0.00;FS=2.362;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.345;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1267,0,1420 chrIV 954954 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.990;DP=129;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=2.7678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1378,0,1307 chrIV 954963 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.151;DP=130;Dels=0.00;FS=1.424;HaplotypeScore=5.8419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.478;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1311,0,1466 chrIV 954985 . A C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.726;DP=116;Dels=0.00;FS=8.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.011;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1181,0,1298 chrIV 955099 . C A 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.899;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,40:103:99:753,0,1287 chrIV 955111 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.390;DP=107;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.527;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:1234,0,915 chrIV 955293 . A G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.019;DP=152;Dels=0.00;FS=3.851;HaplotypeScore=3.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1316,0,1680 chrIV 955574 . T G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.418;DP=126;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.892;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1122,0,1478 chrIV 955620 . A C 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=27.14;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2937,297,0 chrIV 955643 . C T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.335;DP=110;Dels=0.00;FS=11.630;HaplotypeScore=3.8114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.021;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:1049,0,1319 chrIV 955755 . T A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;DP=105;Dels=0.00;FS=2.719;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.632;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1251,0,1158 chrIV 955831 . C T 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.64;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2769,268,0 chrIV 955880 . T G 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.128;DP=103;Dels=0.00;FS=19.808;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.275;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:973,0,1151 chrIV 955955 . G A 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;DP=79;Dels=0.00;FS=24.741;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,43:79:99:843,0,737 chrIV 956155 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.230;DP=124;Dels=0.00;FS=10.142;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.641;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1331,0,1401 chrIV 956810 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.953;DP=129;Dels=0.00;FS=6.638;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1262,0,1606 chrIV 956957 . G A 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:1011,0,1280 chrIV 957311 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.064;DP=95;Dels=0.00;FS=1.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.89;ReadPosRankSum=2.389;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,57:95:99:1350,0,711 chrIV 957317 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.634;DP=96;Dels=0.00;FS=4.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.937;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,58:96:99:1276,0,805 chrIV 957329 . C T 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.405;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1146,0,813 chrIV 957342 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.864;DP=113;Dels=0.00;FS=2.456;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1272,0,998 chrIV 957424 . T C 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1066,0,1056 chrIV 957637 . T C 1554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.095;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=180.0383;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=13.75;ReadPosRankSum=-3.065;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:48,62:113:99:1587,138,0 chrIV 957741 . T A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.534;DP=120;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=1.863;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1228,0,1354 chrIV 958319 . A C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.310;DP=119;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=-2.381;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.000;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,70:119:99:1136,0,849 chrIV 958391 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.784;DP=115;Dels=0.00;FS=11.451;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1163,0,1361 chrIV 958762 . T C 651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;DP=115;Dels=0.00;FS=1.577;HaplotypeScore=4.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=1;MQRankSum=-0.191;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.247;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:681,0,1329 chrIV 959248 . C T 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.897;DP=134;Dels=0.01;FS=1.374;HaplotypeScore=3.8928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.003;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1511,0,1317 chrIV 959287 . A G 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.685;DP=163;Dels=0.00;FS=2.727;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:163:99:1772,0,1782 chrIV 959371 . C T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.185;DP=110;Dels=0.00;FS=9.005;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:110:99:1192,0,1174 chrIV 959478 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.931;DP=131;Dels=0.00;FS=16.882;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.834;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1452,0,1344 chrIV 959837 . A T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.608;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1145,0,1372 chrIV 960058 . A G 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.843;DP=141;Dels=0.00;FS=4.095;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=1;MQRankSum=-0.636;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.156;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1611,0,1343 chrIV 960101 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.207;DP=93;Dels=0.00;FS=1.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=10.32;ReadPosRankSum=-2.328;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:990,0,1056 chrIV 960128 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.170;DP=109;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1209,0,1118 chrIV 960374 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.985;DP=115;Dels=0.00;FS=2.458;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.244;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1077,0,1236 chrIV 960833 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;DP=118;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1170,0,1330 chrIV 960835 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.827;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.116;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1065,0,1429 chrIV 961077 . C A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.397;DP=119;Dels=0.01;FS=7.037;HaplotypeScore=5.4984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.930;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1409,0,1070 chrIV 961189 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.608;DP=115;Dels=0.00;FS=3.389;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1339,0,1134 chrIV 961222 . C T 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2795,276,0 chrIV 961234 . C G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=105;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.106;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1067,0,1068 chrIV 961561 . A T 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.878;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.355;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:976,0,1214 chrIV 961848 . G A 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=27.36;ReadPosRankSum=1.532;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2878,280,0 chrIV 962131 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.711;DP=135;Dels=0.00;FS=6.643;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.151;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1456,0,1381 chrIV 962150 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.537;DP=127;Dels=0.00;FS=5.741;HaplotypeScore=5.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.121;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1163,0,1340 chrIV 962280 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.528;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=1;MQRankSum=0.305;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.100;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1212,0,1498 chrIV 962400 . G A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.967;DP=152;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=7.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.719;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1644,0,1625 chrIV 962481 . G A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.258;DP=146;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1440,0,1687 chrIV 962545 . G A 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3801,355,0 chrIV 962572 . C A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.453;DP=141;Dels=0.00;FS=3.107;HaplotypeScore=2.6979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.702;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1416,0,1548 chrIV 962580 . G A 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.721;DP=136;Dels=0.00;FS=1.424;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.596;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1612,0,1278 chrIV 962700 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.074;DP=112;Dels=0.00;FS=7.870;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1067,0,1414 chrIV 962922 . A G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.214;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.081;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.438;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1194,0,1264 chrIV 962979 . C T 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.386;DP=112;Dels=0.00;FS=4.614;HaplotypeScore=2.6542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.082;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.348;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1113,0,1206 chrIV 962980 . T C 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.115;DP=112;Dels=0.00;FS=4.614;HaplotypeScore=3.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.418;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1083,0,1224 chrIV 963042 . G A 655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.160;DP=82;Dels=0.00;FS=1.880;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:685,0,1015 chrIV 963291 . G A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;DP=120;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=0.441;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.083;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1126,0,1443 chrIV 963747 . C T 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2876,282,0 chrIV 963777 . T C 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2686,264,0 chrIV 963941 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.509;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1219,0,1165 chrIV 964326 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.378;DP=95;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1020,0,1024 chrIV 964950 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.788;DP=111;Dels=0.00;FS=2.418;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:111:99:1172,0,1273 chrIV 965157 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.321;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=11.09;ReadPosRankSum=2.026;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1327,0,1066 chrIV 965160 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.854;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1166,0,1285 chrIV 965565 . T A 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;DP=135;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1614,0,1410 chrIV 965626 . C T 1921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.390;DP=146;Dels=0.00;FS=5.220;HaplotypeScore=2.6263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,84:146:99:1951,0,1250 chrIV 965755 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=121;Dels=0.00;FS=4.432;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.428;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:121:99:1140,0,1434 chrIV 965951 . G A 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.797;DP=119;Dels=0.00;FS=6.356;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.328;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:119:99:1043,0,1454 chrIV 966228 . C T 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.665;DP=112;Dels=0.00;FS=3.616;HaplotypeScore=4.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.883;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,44:112:99:920,0,1519 chrIV 966497 . C T 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.935;DP=84;Dels=0.00;FS=4.500;HaplotypeScore=3.0662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.83;MQ0=0;MQRankSum=-4.341;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.960;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,33:84:99:705,0,1075 chrIV 966504 . C T 445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.633;DP=104;Dels=0.00;FS=1.977;HaplotypeScore=32.5994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.66;MQ0=1;MQRankSum=-3.580;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:475,0,1234 chrIV 966514 . T C 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.628;DP=76;Dels=0.00;FS=9.185;HaplotypeScore=19.4408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.99;MQ0=1;MQRankSum=-6.321;QD=0.30;ReadPosRankSum=-2.006;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,30:76:53:53,0,1015 chrIV 966524 . A T 68.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;DP=97;Dels=0.00;FS=7.217;HaplotypeScore=25.5965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.92;MQ0=1;MQRankSum=-6.970;QD=0.70;ReadPosRankSum=3.123;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,29:97:98:98,0,626 chrIV 966525 . A T 60.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;DP=97;Dels=0.00;FS=7.217;HaplotypeScore=24.6007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.92;MQ0=1;MQRankSum=-7.075;QD=0.62;ReadPosRankSum=3.188;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,29:97:90:90,0,624 chrIV 966526 . A T 57.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;DP=98;Dels=0.00;FS=7.311;HaplotypeScore=24.6007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=1;MQRankSum=-7.237;QD=0.58;ReadPosRankSum=3.248;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,29:98:87:87,0,641 chrIV 966527 . A C 57.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.436;DP=98;Dels=0.00;FS=7.311;HaplotypeScore=23.6060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=1;MQRankSum=-7.118;QD=0.58;ReadPosRankSum=3.830;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,29:98:87:87,0,638 chrIV 966528 . A T 57.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;DP=98;Dels=0.00;FS=7.311;HaplotypeScore=24.6007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=1;MQRankSum=-7.309;QD=0.58;ReadPosRankSum=4.397;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,29:98:87:87,0,638 chrIV 966529 . A T 59.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;DP=98;Dels=0.00;FS=7.357;HaplotypeScore=22.7424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=1;MQRankSum=-7.120;QD=0.60;ReadPosRankSum=4.677;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,29:98:89:89,0,636 chrIV 966614 . G A 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.192;DP=108;Dels=0.00;FS=9.117;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.265;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.743;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:916,0,1254 chrIV 966626 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.975;DP=103;Dels=0.00;FS=17.531;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.760;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:1141,0,1243 chrIV 966662 . C T 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.950;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1283,0,1330 chrIV 966686 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.902;DP=117;Dels=0.00;FS=2.381;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.705;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.465;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1369,0,1227 chrIV 966952 . A G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.742;DP=128;Dels=0.00;FS=6.678;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.144;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1262,0,1534 chrIV 966953 . C G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.844;DP=128;Dels=0.00;FS=6.678;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.702;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1231,0,1392 chrIV 966980 . T C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.308;DP=141;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.633;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1255,0,1749 chrIV 967004 . A T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.399;DP=144;Dels=0.00;FS=2.264;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.713;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1411,0,1710 chrIV 967019 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.159;DP=143;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1433,0,1520 chrIV 967037 . T C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.632;DP=126;Dels=0.00;FS=3.394;HaplotypeScore=4.1339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.344;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1031,0,1589 chrIV 967248 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.810;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.588;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1508,0,1034 chrIV 967640 . C A 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.049;DP=147;Dels=0.00;FS=3.905;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=10.51;ReadPosRankSum=-2.408;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1575,0,1554 chrIV 967787 . A G 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.072;DP=155;Dels=0.00;FS=5.421;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.582;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1651,0,1773 chrIV 967934 . G A 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.812;DP=153;Dels=0.00;FS=1.344;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.235;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,65:153:99:1348,0,1891 chrIV 968331 . G A 2000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.104;DP=151;Dels=0.00;FS=2.970;HaplotypeScore=5.4232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.360;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,88:151:99:2030,0,1273 chrIV 968466 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.353;DP=127;Dels=0.00;FS=2.433;HaplotypeScore=2.4468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:127:99:1444,0,1243 chrIV 968773 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.394;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.349;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:148:99:1171,0,1900 chrIV 969384 . C A 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.417;DP=96;Dels=0.00;FS=5.309;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.714;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.033;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:96:99:786,0,1182 chrIV 969630 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.034;DP=116;Dels=0.00;FS=3.351;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1247,0,1175 chrIV 969643 . T G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;DP=114;Dels=0.00;FS=8.802;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.418;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1023,0,1359 chrIV 970293 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.453;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1115,0,1306 chrIV 970348 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.378;DP=143;Dels=0.00;FS=2.441;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.160;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1499,0,1595 chrIV 970434 . C T 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:944,0,1471 chrIV 970494 . G T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;DP=106;Dels=0.00;FS=6.138;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.998;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1079,0,1279 chrIV 970658 . G A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.356;DP=145;Dels=0.00;FS=5.076;HaplotypeScore=6.8354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=9.79;ReadPosRankSum=2.498;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1450,0,1623 chrIV 970880 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.179;DP=119;Dels=0.00;FS=4.472;HaplotypeScore=3.7644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.044;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1226,0,1235 chrIV 971073 . T C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;DP=94;Dels=0.00;FS=6.601;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.278;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1177,0,878 chrIV 971172 . C T 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.987;DP=134;Dels=0.00;FS=3.314;HaplotypeScore=4.9543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.669;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,80:134:99:1823,0,1091 chrIV 971579 . C A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.459;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.702;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:101:99:1229,0,995 chrIV 971728 . C T 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.789;DP=137;Dels=0.00;FS=12.486;HaplotypeScore=4.8569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.970;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1663,0,1359 chrIV 971787 . A T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.138;DP=107;Dels=0.00;FS=3.557;HaplotypeScore=2.9223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1067,0,1295 chrIV 971873 . T C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.724;DP=117;Dels=0.00;FS=7.328;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=2;MQRankSum=1.156;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.384;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1179,0,1247 chrIV 971904 . G A 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.853;DP=156;Dels=0.00;FS=4.811;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=2;MQRankSum=0.703;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.168;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1724,0,1486 chrIV 972096 . A G 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.485;DP=124;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.773;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:989,0,1619 chrIV 972240 . A G 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.801;DP=149;Dels=0.00;FS=2.045;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.112;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1590,0,1422 chrIV 972369 . T C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.667;DP=132;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.329;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1244,0,1534 chrIV 972414 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.800;DP=141;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.651;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1490,0,1495 chrIV 972465 . T C 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.590;DP=106;Dels=0.00;FS=3.844;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.153;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:920,0,1295 chrIV 972540 . A G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.242;DP=149;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.427;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1510,0,1667 chrIV 973372 . C A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.920;DP=166;Dels=0.00;FS=3.927;HaplotypeScore=6.8515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.347;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,65:166:99:1413,0,2235 chrIV 973718 . C T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.336;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.820;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.623;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1320,0,1418 chrIV 973960 . T A 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.621;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1703,0,1416 chrIV 974505 . T C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.225;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.887;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:990,0,1252 chrIV 974630 . A G 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3016,309,0 chrIV 974632 . T C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.502;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1090,0,1401 chrIV 974689 . T A 4320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=25.71;ReadPosRankSum=1.588;SB=-2.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:4320,412,0 chrIV 974731 . T C 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.004;DP=141;Dels=0.00;FS=2.113;HaplotypeScore=6.1822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1711,0,1238 chrIV 974814 . T C 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.378;DP=151;Dels=0.00;FS=8.589;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.894;QD=9.06;ReadPosRankSum=-2.420;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1398,0,1826 chrIV 974820 . C T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.689;DP=156;Dels=0.00;FS=9.652;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=9.85;ReadPosRankSum=-2.682;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1567,0,1769 chrIV 974882 . A T 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.545;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1571,0,1540 chrIV 974883 . G A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.006;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1579,0,1488 chrIV 974990 . T A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.930;DP=127;Dels=0.00;FS=3.933;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.744;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1350,0,1447 chrIV 975039 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.094;DP=115;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.661;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.351;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1073,0,1395 chrIV 975090 . A G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.281;DP=129;Dels=0.00;FS=4.632;HaplotypeScore=2.6979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.929;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:129:99:1275,0,1522 chrIV 975108 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.582;DP=126;Dels=0.00;FS=4.390;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.307;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1243,0,1491 chrIV 975126 . G T 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3075,301,0 chrIV 975149 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.733;DP=127;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=3.5876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.924;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1175,0,1428 chrIV 975156 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.687;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.802;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1311,0,1473 chrIV 975252 . A G 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.266;DP=127;Dels=0.00;FS=4.415;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.361;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1439,0,1346 chrIV 975354 . G A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.646;DP=128;Dels=0.00;FS=4.361;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.827;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1404,0,1367 chrIV 975573 . A G 2008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.417;DP=184;Dels=0.00;FS=1.820;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.235;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,99:184:99:2038,0,1796 chrIV 975612 . C A 4283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.390;DP=165;Dels=0.00;FS=7.610;HaplotypeScore=3.8146;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.914;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.288;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,163:165:99:4283,405,0 chrIV 975702 . C T 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.856;DP=130;Dels=0.00;FS=2.284;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.314;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1659,0,1223 chrIV 975747 . A G 1898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.276;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.823;QD=12.41;ReadPosRankSum=2.165;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,90:153:99:1928,0,1271 chrIV 976174 . G A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.194;DP=116;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.176;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1009,0,1410 chrIV 976264 . A G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.824;DP=136;Dels=0.00;FS=7.825;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1565,0,1339 chrIV 976554 . C T 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.228;DP=120;Dels=0.00;FS=1.610;HaplotypeScore=2.6938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=2;MQRankSum=-1.000;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.220;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1024,0,1344 chrIV 976663 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.811;DP=140;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.94;MQ0=0;MQRankSum=6.894;QD=10.34;ReadPosRankSum=2.517;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1477,0,1435 chrIV 976894 . C G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.756;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1015,0,1371 chrIV 977045 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.373;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.435;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1495,0,1071 chrIV 977181 . G A 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.297;DP=162;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.432;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,74:162:99:1581,0,1963 chrIV 977306 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.799;DP=122;Dels=0.00;FS=13.221;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1141,0,1386 chrIV 977428 . C T 1864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.811;DP=187;Dels=0.00;FS=10.062;HaplotypeScore=7.6594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,86:187:99:1894,0,2167 chrIV 977509 . T C 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.026;DP=164;Dels=0.00;FS=12.585;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.717;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,78:164:99:1659,0,1927 chrIV 977767 . G A 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=151;Dels=0.00;FS=3.833;HaplotypeScore=4.7992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.333;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1768,0,1582 chrIV 978274 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.145;DP=138;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.828;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1592,0,1372 chrIV 978369 . T C 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.859;DP=140;Dels=0.00;FS=6.272;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.872;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1563,0,1488 chrIV 978384 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.755;DP=128;Dels=0.00;FS=8.215;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1331,0,1363 chrIV 978469 . C G 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;DP=128;Dels=0.00;FS=4.353;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.769;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,52:128:99:996,0,1656 chrIV 978570 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.035;DP=128;Dels=0.00;FS=4.532;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=2.152;QD=10.13;ReadPosRankSum=-2.214;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1326,0,1379 chrIV 978598 . A G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2974,294,0 chrIV 978636 . G A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.069;DP=135;Dels=0.00;FS=6.417;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.489;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1256,0,1638 chrIV 978778 . C T 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.746;DP=89;Dels=0.00;FS=1.759;HaplotypeScore=3.5478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.112;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,37:89:99:820,0,1112 chrIV 979217 . C T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.158;DP=96;Dels=0.00;FS=9.772;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.285;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1002,0,861 chrIV 979237 . C T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.952;DP=110;Dels=0.00;FS=21.549;HaplotypeScore=1.7306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.386;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1057,0,1142 chrIV 979392 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;DP=111;Dels=0.00;FS=2.479;HaplotypeScore=9.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=1;MQRankSum=2.408;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1411,0,984 chrIV 979492 . T C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.900;DP=113;Dels=0.00;FS=5.020;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.189;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:948,0,1562 chrIV 979813 . T C 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.802;DP=127;Dels=0.00;FS=12.254;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.117;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,49:127:99:1024,0,1798 chrIV 979873 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.250;DP=121;Dels=0.00;FS=1.492;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQ0=0;MQRankSum=-8.095;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.186;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1068,0,1392 chrIV 979879 . G A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.046;DP=120;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=2.9799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.18;MQ0=0;MQRankSum=-7.483;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1118,0,1286 chrIV 979891 . T G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.097;DP=116;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=2.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.58;MQ0=0;MQRankSum=-7.230;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.366;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:116:99:940,0,1393 chrIV 979901 . T C 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-6.457;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1025,0,1487 chrIV 979931 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.871;DP=139;Dels=0.00;FS=1.330;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.906;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.747;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1180,0,1763 chrIV 979973 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.952;DP=136;Dels=0.00;FS=6.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.129;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,53:136:99:1155,0,1805 chrIV 979983 . A G 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3715,370,0 chrIV 980016 . A T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.855;DP=131;Dels=0.00;FS=1.425;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,52:131:99:1022,0,1730 chrIV 980072 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.018;DP=128;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=2.276;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.692;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1303,0,1469 chrIV 980090 . T C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.095;DP=150;Dels=0.00;FS=5.977;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.303;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1541,0,1759 chrIV 980269 . G A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.030;DP=121;Dels=0.00;FS=5.604;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.335;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1315,0,1281 chrIV 980341 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.773;DP=125;Dels=0.00;FS=7.808;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.348;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1191,0,1482 chrIV 980364 . C T 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.515;DP=129;Dels=0.00;FS=5.061;HaplotypeScore=3.7386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1283,0,1609 chrIV 980428 . T C 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.300;DP=110;Dels=0.00;FS=4.842;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:110:99:896,0,1499 chrIV 980461 . T G 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.136;DP=93;Dels=0.00;FS=13.418;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:969,0,1064 chrIV 980521 . T A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;DP=108;Dels=0.00;FS=6.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.213;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1263,0,1144 chrIV 980614 . T G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.353;DP=104;Dels=0.00;FS=2.558;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1219,0,1017 chrIV 980617 . C G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;DP=98;Dels=0.00;FS=1.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1134,0,896 chrIV 980652 . A C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.271;DP=117;Dels=0.00;FS=6.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.444;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.096;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1310,0,1196 chrIV 980689 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;DP=109;Dels=0.00;FS=6.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1182,0,1130 chrIV 980706 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.785;DP=114;Dels=0.00;FS=1.578;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.964;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1204,0,1177 chrIV 980763 . C T 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.043;DP=105;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.337;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1262,0,1054 chrIV 980779 . G C 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3075,315,0 chrIV 980816 . G A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.358;DP=104;Dels=0.00;FS=7.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=9.50;ReadPosRankSum=2.515;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1018,0,1159 chrIV 980844 . A G 736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.609;DP=95;Dels=0.00;FS=6.568;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.661;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:766,0,1222 chrIV 980857 . C T 593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.885;DP=83;Dels=0.00;FS=11.194;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQ0=0;MQRankSum=-4.431;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.838;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:99:623,0,1057 chrIV 980873 . T G 409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.837;DP=78;Dels=0.00;FS=20.472;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.22;MQ0=0;MQRankSum=-5.083;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.376;SB=-1.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:439,0,1256 chrIV 980906 . T C 216.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.124;DP=71;Dels=0.00;FS=57.928;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQ0=0;MQRankSum=-5.033;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:246,0,1294 chrIV 980907 . T C 221.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.647;DP=69;Dels=0.00;FS=55.942;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQ0=0;MQRankSum=-5.295;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:251,0,1244 chrIV 980919 . A G 245.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.362;DP=66;Dels=0.00;FS=49.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.41;MQ0=0;MQRankSum=-5.396;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:275,0,1155 chrIV 980920 . T G 235.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.613;DP=67;Dels=0.00;FS=54.517;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.18;MQ0=0;MQRankSum=-6.044;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.981;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:265,0,1200 chrIV 980934 . A G 164.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.248;DP=60;Dels=0.00;FS=19.893;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.660;QD=2.73;ReadPosRankSum=1.956;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:194,0,1164 chrIV 980935 . A G 166.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.301;DP=59;Dels=0.00;FS=19.893;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-3.575;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.966;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:196,0,1127 chrIV 981066 . A T 582.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;DP=82;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.74;MQ0=0;MQRankSum=-6.589;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,31:82:99:612,0,1198 chrIV 981071 . T C 442.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.757;DP=83;Dels=0.00;FS=2.209;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.90;MQ0=0;MQRankSum=-6.773;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,31:83:99:472,0,1262 chrIV 981074 . G T 416.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;DP=83;Dels=0.00;FS=1.021;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.20;MQ0=0;MQRankSum=-7.006;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,29:83:99:446,0,1291 chrIV 981075 . A T 439.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.160;DP=83;Dels=0.00;FS=1.021;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.20;MQ0=0;MQRankSum=-6.939;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,29:83:99:469,0,1296 chrIV 981087 . T C 364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.84;MQ0=0;MQRankSum=-6.383;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.442;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:394,0,1258 chrIV 981096 . G C 233.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;DP=59;Dels=0.00;FS=8.121;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.786;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.403;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:263,0,978 chrIV 981112 . C T 316.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=54;Dels=0.00;FS=8.329;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.04;MQ0=0;MQRankSum=-4.609;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:54:99:346,0,773 chrIV 981139 . C T 257.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.823;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.875;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:287,0,647 chrIV 981146 . T C 182.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.591;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:43:99:212,0,658 chrIV 981149 . G A 189.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.112;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:219,0,653 chrIV 981157 . A T 611.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.54;MQ0=0;MQRankSum=1.957;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.531;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:641,0,224 chrIV 981159 . C T 191.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.589;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.308;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:221,0,603 chrIV 981160 . C T 184.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.108;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.588;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:43:99:214,0,608 chrIV 981167 . G A 194.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.165;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:224,0,569 chrIV 981218 . C T 133.64 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.366;DP=30;Dels=0.00;FS=19.956;HaplotypeScore=2.4101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.65;MQ0=14;MQRankSum=1.555;QD=4.45;ReadPosRankSum=-2.727;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:5:163,0,5 chrIV 981219 . T C 160.20 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;DP=30;Dels=0.00;FS=20.584;HaplotypeScore=2.4101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.65;MQ0=14;MQRankSum=1.799;QD=5.34;ReadPosRankSum=-2.964;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:2:189,0,2 chrIV 981221 . G A 182.46 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.123;DP=34;Dels=0.00;FS=19.590;HaplotypeScore=16.0425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.58;MQ0=18;MQRankSum=1.473;QD=5.37;ReadPosRankSum=-2.887;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:1:211,0,1 chrIV 981371 . A G 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.43;MQ0=20;QD=0.59;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,16:30:6:49,6,0 chrIV 981500 . A T 132.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;DP=63;Dels=0.00;FS=14.913;HaplotypeScore=15.9313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.36;MQ0=25;MQRankSum=-1.112;QD=2.10;ReadPosRankSum=-1.630;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:63:99:162,0,210 chrIV 981911 . A G 227 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.914;DP=76;Dels=0.00;FS=18.575;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.33;MQ0=27;MQRankSum=4.648;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.215;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:52,24:76:30:260,30,0 chrIV 981965 . A G 230.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.105;DP=131;Dels=0.00;FS=23.801;HaplotypeScore=2.6550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.32;MQ0=40;MQRankSum=3.036;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,26:131:99:260,0,451 chrIV 982103 . G T 156.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.030;DP=114;Dels=0.00;FS=1.221;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.48;MQ0=18;MQRankSum=0.429;QD=1.37;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:186,0,467 chrIV 983632 . G A 43.06 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;DP=166;Dels=0.00;FS=7.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.31;MQ0=109;MQRankSum=-0.599;QD=0.26;ReadPosRankSum=-0.871;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,35:166:16:73,0,16 chrIV 986051 . A T 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.98;MQ0=104;QD=0.24;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:103,3:106:6:57,6,0 chrIV 986103 . A G 85.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.51;MQ0=107;QD=0.77;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:107,4:111:12:118,12,0 chrIV 986106 . G A 81.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.34;MQ0=114;QD=0.69;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:108,10:118:12:114,12,0 chrIV 986229 . C T 559 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.19;MQ0=9;QD=17.47;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,23:32:54:592,54,0 chrIV 986340 . A C 51.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.20;MQ0=5;QD=5.77;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,4:9:9:84,9,0 chrIV 986349 . T C 51.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.97;MQ0=3;QD=5.77;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:9:84,9,0 chrIV 986406 . G A 55.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.99;MQ0=1;QD=11.19;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:9:88,9,0 chrIV 986421 . G C 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.04;MQ0=5;QD=2.72;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:6:53,6,0 chrIV 992013 . T G 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.34;MQ0=57;QD=0.45;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:57,2:59:6:58,6,0 chrIV 992020 . A C 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.77;MQ0=52;QD=0.41;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:52,3:55:6:54,6,0 chrIV 992023 . C T 29.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.84;MQ0=51;QD=0.55;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:50,4:54:6:61,6,0 chrIV 992025 . T A 28.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.97;MQ0=49;QD=0.55;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:48,4:52:6:60,6,0 chrIV 992032 . G T 28.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.18;MQ0=46;QD=0.59;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:46,3:49:6:60,6,0 chrIV 992035 . T C 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.25;MQ0=45;QD=0.52;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:45,3:48:6:56,6,0 chrIV 992056 . T A 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.74;MQ0=50;QD=0.31;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:50,5:55:6:48,6,0 chrIV 992057 . G A 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.74;MQ0=50;QD=0.31;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:50,5:55:6:48,6,0 chrIV 992058 . G T 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.74;MQ0=50;QD=0.31;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:50,5:55:6:48,6,0 chrIV 992065 . T G 19.81 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.99;MQ0=47;QD=0.38;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:47,5:52:6:51,6,0 chrIV 992094 . G A 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.42;MQ0=49;QD=0.48;SB=-1.757e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:49,9:58:6:59,6,0 chrIV 992098 . C T 55.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.72;MQ0=42;QD=1.08;SB=-9.731e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:42,10:52:9:88,9,0 chrIV 992106 . T C 15.88 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.63;MQ0=47;QD=0.28;SB=-1.757e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:47,9:56:6:47,6,0 chrIV 992107 . C T 15.88 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.52;MQ0=48;QD=0.28;SB=-1.757e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:48,9:57:6:47,6,0 chrIV 992115 . G A 12.99 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.07;MQ0=41;QD=0.27;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:41,7:48:6:44,6,0 chrIV 992121 . C G 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.31;MQ0=39;QD=0.56;SB=-1.639e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,7:46:6:57,6,0 chrIV 992123 . G T 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.19;MQ0=40;QD=0.38;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:40,7:47:6:49,6,0 chrIV 992124 . A G 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.19;MQ0=40;QD=0.38;SB=-1.639e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:40,7:47:6:49,6,0 chrIV 992130 . G C 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.74;MQ0=44;QD=0.49;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:44,7:51:6:56,6,0 chrIV 992150 . G T 139.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.23;MQ0=37;QD=3.09;SB=-1.076e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:37,8:45:18:172,18,0 chrIV 992160 . G A 206.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.52;MQ0=36;QD=4.48;SB=-3.228e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:36,10:46:24:239,24,0 chrIV 992167 . T A 206.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.42;MQ0=33;QD=4.91;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,9:42:24:239,24,0 chrIV 992170 . T C 189.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.59;MQ0=32;QD=4.61;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,9:41:24:222,24,0 chrIV 992173 . A G 194.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.76;MQ0=31;QD=4.85;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,9:40:24:227,24,0 chrIV 992175 . C G 197.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.93;MQ0=30;QD=5.05;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,9:39:24:230,24,0 chrIV 992183 . G A 366 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.90;MQ0=26;QD=8.71;SB=-6.930e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,16:42:42:399,42,0 chrIV 992187 . T G 345 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.33;MQ0=27;QD=8.21;SB=-7.338e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,15:42:39:378,39,0 chrIV 992192 . T C 346 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.60;MQ0=24;QD=9.11;SB=-7.065e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,14:38:39:379,39,0 chrIV 992197 . G A 290 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.67;MQ0=22;MQRankSum=0.401;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.935;SB=-8.689e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,13:35:33:323,33,0 chrIV 992200 . A G 311 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.78;MQ0=18;QD=10.03;SB=-7.607e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,13:31:36:344,36,0 chrIV 992213 . G A 380 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.23;MQ0=13;QD=13.57;SB=-6.793e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,15:28:42:413,42,0 chrIV 992247 . C T 285 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.95;MQ0=11;QD=12.39;SB=-8.689e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,12:23:33:318,33,0 chrIV 992251 . T C 265 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=12;QD=11.04;SB=-8.689e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,12:24:33:298,33,0 chrIV 992254 . C T 236.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.55;MQ0=12;QD=10.73;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,10:22:27:269,27,0 chrIV 992256 . G T 222.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.55;MQ0=12;QD=10.09;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,10:22:27:255,27,0 chrIV 992269 . G T 298 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.18;MQ0=17;QD=10.64;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,11:28:33:331,33,0 chrIV 992278 . C T 125.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.93;MQ0=20;QD=4.81;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,6:26:18:158,18,0 chrIV 992279 . T C 125.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.67;MQ0=21;QD=4.63;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,6:27:18:158,18,0 chrIV 992285 . G C 136.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.78;MQ0=24;QD=4.39;SB=-7.359e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,7:31:18:169,18,0 chrIV 992300 . G T 225.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.50;MQ0=25;QD=6.43;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,10:35:27:258,27,0 chrIV 992316 . T C 189.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.08;MQ0=27;QD=5.11;SB=-3.228e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,10:37:24:222,24,0 chrIV 992317 . G A 207.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.08;MQ0=27;QD=5.60;SB=-3.228e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,10:37:24:240,24,0 chrIV 992325 . G T 210.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.23;MQ0=26;QD=4.88;SB=-4.089e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,17:43:24:243,24,0 chrIV 992342 . G A 173.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.011;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=24;MQRankSum=-0.847;QD=4.33;ReadPosRankSum=-2.223;SB=2.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,9:40:21:206,21,0 chrIV 992403 . A G 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.70;MQ0=3;QD=2.53;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:6:54,6,0 chrIV 992449 . C G 171.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.58;MQ0=13;MQRankSum=1.159;QD=6.84;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-5.768e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,11:25:21:204,21,0 chrIV 992469 . G A 205.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.54;MQ0=15;QD=7.59;SB=-3.661e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,13:27:24:238,24,0 chrIV 992706 . A G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;DP=122;Dels=0.00;FS=16.647;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=11.70;ReadPosRankSum=-2.839;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1458,0,1109 chrIV 992797 . G C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;DP=100;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=3.9224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.547;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1179,0,839 chrIV 992912 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.636;DP=109;Dels=0.00;FS=2.660;HaplotypeScore=2.6525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1276,0,1058 chrIV 992964 . T A 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;DP=94;Dels=0.00;FS=1.725;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.48;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:784,0,1231 chrIV 992975 . C A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;DP=100;Dels=0.00;FS=1.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.060;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:100:99:1276,0,871 chrIV 993037 . C T 594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.474;DP=82;Dels=0.00;FS=5.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.37;MQ0=0;MQRankSum=-5.014;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.524;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,40:82:99:624,0,895 chrIV 993060 . T A 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.291;DP=97;Dels=0.00;FS=8.147;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.281;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:916,0,1089 chrIV 993078 . T C 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.438;DP=96;Dels=0.00;FS=3.875;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.571;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:955,0,1106 chrIV 993128 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.521;DP=116;Dels=0.00;FS=3.461;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.224;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1353,0,1129 chrIV 993235 . T C 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.805;DP=116;Dels=0.00;FS=5.833;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.161;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,70:116:99:1478,0,947 chrIV 993303 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.190;DP=123;Dels=0.00;FS=4.628;HaplotypeScore=5.5694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.188;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:1393,0,1127 chrIV 993336 . A T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;DP=120;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1593,0,1125 chrIV 993391 . A T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;DP=85;Dels=0.00;FS=9.166;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=13.52;ReadPosRankSum=-2.960;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,50:85:99:1179,0,755 chrIV 993416 . T A 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.677;DP=79;Dels=0.00;FS=4.346;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,43:79:99:1007,0,825 chrIV 993435 . T C 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;DP=74;Dels=0.00;FS=4.438;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=11.08;ReadPosRankSum=2.071;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:850,0,804 chrIV 993571 . T C 657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.763;DP=66;Dels=0.00;FS=3.305;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=2;MQRankSum=0.094;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,33:66:99:687,0,677 chrIV 993715 . T C 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.078;DP=100;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.702;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:833,0,1337 chrIV 993763 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;DP=118;Dels=0.00;FS=16.568;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,69:118:99:1546,0,1025 chrIV 993979 . C T 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.512;DP=103;Dels=0.00;FS=6.358;HaplotypeScore=3.4062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=8.75;ReadPosRankSum=2.572;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:931,0,1309 chrIV 994023 . A G 437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.726;DP=113;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=3.87;ReadPosRankSum=-2.922;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:467,0,1479 chrIV 994124 . A G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.285;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=2.488;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.299;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1396,0,1193 chrIV 994230 . T C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.394;DP=126;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.821;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1099,0,1564 chrIV 994342 . A G 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.154;DP=123;Dels=0.00;FS=4.327;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.792;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1199,0,1364 chrIV 994514 . C T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.066;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.525;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1370,0,901 chrIV 994605 . A T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;DP=97;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1249,0,953 chrIV 994719 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.512;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.183;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.517;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1236,0,1021 chrIV 995637 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.381;DP=112;Dels=0.00;FS=2.678;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.934;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1273,0,1082 chrIV 995837 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.778;DP=129;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.361;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1321,0,1333 chrIV 995898 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.472;DP=121;Dels=0.00;FS=3.271;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=8.36;ReadPosRankSum=3.724;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1042,0,1458 chrIV 996015 . A G 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.203;DP=112;Dels=0.00;FS=4.803;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=2.593;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.234;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:112:99:987,0,1399 chrIV 996022 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.055;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1109,0,1486 chrIV 996542 . G A 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.648;DP=108;Dels=0.00;FS=2.496;HaplotypeScore=2.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.388;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:983,0,1331 chrIV 996692 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.968;DP=90;Dels=0.00;FS=1.721;HaplotypeScore=2.5922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1060,0,892 chrIV 996740 . T G 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.273;DP=72;Dels=0.00;FS=6.413;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.645;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:791,0,757 chrIV 997121 . G A 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.317;DP=147;Dels=0.00;FS=2.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1651,0,1427 chrIV 997472 . A G 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.321;DP=146;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.506;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1431,0,1773 chrIV 997511 . T A 1917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.933;DP=168;Dels=0.00;FS=1.917;HaplotypeScore=7.4170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,87:168:99:1947,0,1684 chrIV 997571 . C T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;DP=142;Dels=0.00;FS=2.132;HaplotypeScore=1.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1505,0,1526 chrIV 998004 . G T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.378;DP=138;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=3.8928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.126;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1258,0,1685 chrIV 998303 . A G 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.173;DP=105;Dels=0.00;FS=4.856;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.554;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:105:99:910,0,1179 chrIV 998350 . G T 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.670;DP=118;Dels=0.00;FS=5.889;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.956;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:978,0,1376 chrIV 998484 . T C 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3712,378,0 chrIV 998627 . A T 904.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;DP=120;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.86;MQ0=0;MQRankSum=-3.572;QD=7.53;ReadPosRankSum=-1.714;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:934,0,1368 chrIV 998628 . A T 2855 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.91;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2888,300,0 chrIV 998630 . T C 773.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.769;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQ0=0;MQRankSum=-3.613;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:803,0,1323 chrIV 998631 . T A 782.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.997;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:812,0,1341 chrIV 998635 . A G 958.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.814;DP=121;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.19;MQ0=0;MQRankSum=-4.445;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:988,0,1384 chrIV 998658 . A G 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.896;DP=111;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.851;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1052,0,1170 chrIV 998676 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.826;DP=125;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=3.6007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.460;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.623;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1048,0,1418 chrIV 998712 . A C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.548;DP=125;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.077;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1295,0,1359 chrIV 998725 . C G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1288,0,1189 chrIV 998786 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.969;DP=109;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=2.7412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1277,0,1152 chrIV 998825 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.599;DP=125;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.926;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1334,0,1368 chrIV 998904 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.809;DP=126;Dels=0.00;FS=3.291;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=1;MQRankSum=0.368;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.242;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1411,0,1318 chrIV 999271 . A G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.737;DP=118;Dels=0.00;FS=4.486;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1185,0,1464 chrIV 999384 . C T 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.638;DP=131;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.394;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:873,0,1770 chrIV 999432 . A G 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.044;DP=155;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.387;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1544,0,1813 chrIV 999505 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.498;DP=111;Dels=0.00;FS=7.650;HaplotypeScore=6.2943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.022;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1213,0,1097 chrIV 999625 . A T 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;DP=93;Dels=0.00;FS=7.102;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.043;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:896,0,1151 chrIV 999724 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.741;DP=137;Dels=0.00;FS=5.488;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=2.431;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.618;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1475,0,1452 chrIV 999930 . T C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.153;DP=108;Dels=0.00;FS=3.743;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.740;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1209,0,1134 chrIV 1000380 . G A 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.618;DP=98;Dels=0.00;FS=1.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.212;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:996,0,1131 chrIV 1000466 . G A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.143;DP=126;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=11.08;ReadPosRankSum=2.893;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1426,0,1350 chrIV 1000829 . C T 700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.036;DP=109;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=5.8323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=1;MQRankSum=-0.602;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.679;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:730,0,1482 chrIV 1001844 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.586;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1230,0,1577 chrIV 1001864 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.338;DP=144;Dels=0.00;FS=3.757;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.297;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1436,0,1647 chrIV 1001889 . A T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;DP=135;Dels=0.00;FS=3.698;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.669;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1317,0,1632 chrIV 1001907 . C T 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.901;DP=100;Dels=0.02;FS=2.807;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.580;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:945,0,1166 chrIV 1002119 . C A 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.670;DP=112;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.168;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.525;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1190,0,1196 chrIV 1002178 . A G 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;DP=113;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1360,0,1188 chrIV 1002382 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.087;DP=124;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.940;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,49:124:99:971,0,1655 chrIV 1002467 . C T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.388;DP=124;Dels=0.00;FS=3.277;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1247,0,1519 chrIV 1002837 . A G 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.291;DP=151;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.461;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1447,0,1623 chrIV 1003167 . A G 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.902;DP=159;Dels=0.00;FS=1.243;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.150;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1607,0,1652 chrIV 1003263 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.014;DP=120;Dels=0.00;FS=13.571;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:120:99:1163,0,1169 chrIV 1003272 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.388;DP=120;Dels=0.00;FS=5.661;HaplotypeScore=2.2633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1112,0,1292 chrIV 1003376 . A C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;DP=133;Dels=0.00;FS=5.295;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1257,0,1658 chrIV 1003380 . C T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.257;DP=130;Dels=0.00;FS=6.542;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1316,0,1601 chrIV 1003479 . C T 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.427;DP=126;Dels=0.00;FS=1.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.096;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1690,0,1134 chrIV 1003693 . C A 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.916;DP=164;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.997;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:1836,0,1566 chrIV 1003809 . T C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.077;DP=134;Dels=0.00;FS=10.592;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1437,0,1452 chrIV 1003812 . T C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.358;DP=136;Dels=0.00;FS=8.903;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1424,0,1548 chrIV 1003824 . C T 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3436,346,0 chrIV 1003826 . C A 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.536;DP=130;Dels=0.00;FS=7.161;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1003,0,1503 chrIV 1003934 . T C 1145.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.149;DP=103;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.257;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:103:99:1175,0,1091 chrIV 1003939 . G A 1218.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.452;DP=107;Dels=0.01;FS=1.592;HaplotypeScore=4.7427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1248,0,1062 chrIV 1003940 . G A 1219.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.730;DP=106;Dels=0.01;FS=1.611;HaplotypeScore=5.6368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.136;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1249,0,1058 chrIV 1004069 . C T 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.852;DP=132;Dels=0.00;FS=5.436;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.271;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,78:132:99:1825,0,1023 chrIV 1004080 . T G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.043;DP=134;Dels=0.00;FS=5.310;HaplotypeScore=4.5369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.090;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1071,0,1754 chrIV 1004468 . A C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.690;DP=127;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.562;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1195,0,1575 chrIV 1004480 . T A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.922;DP=120;Dels=0.00;FS=1.454;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1032,0,1610 chrIV 1004646 . A C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.550;DP=131;Dels=0.01;FS=6.498;HaplotypeScore=6.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=1.306;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.212;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1186,0,1426 chrIV 1004996 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.758;DP=129;Dels=0.00;FS=3.159;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.549;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1460,0,1401 chrIV 1005047 . G A 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.993;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.412;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1520,0,1185 chrIV 1005151 . C T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.825;DP=143;Dels=0.00;FS=2.181;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=9.16;ReadPosRankSum=2.643;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1340,0,1650 chrIV 1005358 . C G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;DP=138;Dels=0.00;FS=4.064;HaplotypeScore=1.9799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.400;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1412,0,1431 chrIV 1005381 . T A 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;DP=165;Dels=0.00;FS=7.034;HaplotypeScore=4.5482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.693;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,74:165:99:1573,0,2047 chrIV 1005614 . A G 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.732;DP=137;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=2.7920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1535,0,1344 chrIV 1005656 . G A 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3988,385,0 chrIV 1005728 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.803;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.747;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,67:152:99:1380,0,1834 chrIV 1005839 . T C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1335,0,1545 chrIV 1006074 . G A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.012;DP=120;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.311;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1161,0,1381 chrIV 1006075 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.886;DP=119;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.836;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.309;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1181,0,1409 chrIV 1006085 . G A 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3182,313,0 chrIV 1006268 . T A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.317;DP=130;Dels=0.00;FS=4.935;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=2.456;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1487,0,1434 chrIV 1006388 . T C 1786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.634;DP=149;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.829;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:1816,0,1346 chrIV 1006510 . G C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=125;Dels=0.00;FS=2.410;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.862;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.224;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1565,0,1165 chrIV 1006661 . A C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.085;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.826;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1628,0,1727 chrIV 1006922 . T A 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;DP=143;Dels=0.00;FS=4.083;HaplotypeScore=3.6820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:143:99:1420,0,1775 chrIV 1006998 . G A 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.222;DP=122;Dels=0.00;FS=4.746;HaplotypeScore=2.6204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1125,0,1520 chrIV 1007012 . T G 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.246;DP=114;Dels=0.00;FS=4.814;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.120;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:921,0,1498 chrIV 1007414 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.114;DP=142;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=2.7569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.784;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1422,0,1496 chrIV 1007597 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.607;DP=85;Dels=0.00;FS=0.832;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.305;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,47:85:99:1111,0,801 chrIV 1007834 . G T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.124;DP=132;Dels=0.00;FS=4.168;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.359;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1579,0,1246 chrIV 1008485 . A G 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.387;DP=156;Dels=0.00;FS=6.076;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.211;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,67:156:99:1352,0,1995 chrIV 1008496 . T C 1764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.245;DP=145;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=4.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.165;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,83:145:99:1794,0,1305 chrIV 1008697 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.507;DP=134;Dels=0.00;FS=6.632;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.514;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1216,0,1675 chrIV 1008803 . C T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.618;DP=118;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=3.4814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=10.66;ReadPosRankSum=3.751;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1288,0,1350 chrIV 1008843 . G A 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3110,310,0 chrIV 1008848 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3265,325,0 chrIV 1008896 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.465;DP=142;Dels=0.00;FS=2.114;HaplotypeScore=5.5348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.535;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1530,0,1475 chrIV 1009126 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.540;DP=165;Dels=0.00;FS=1.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.786;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,68:165:99:1399,0,2113 chrIV 1009135 . A T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;DP=159;Dels=0.00;FS=2.823;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.850;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,65:159:99:1344,0,2124 chrIV 1009143 . C A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.720;DP=161;Dels=0.00;FS=4.704;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.434;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,67:161:99:1482,0,2017 chrIV 1009163 . G A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.912;DP=134;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.5221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1256,0,1675 chrIV 1009315 . T C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.653;DP=124;Dels=0.00;FS=4.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1282,0,1479 chrIV 1009366 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.997;DP=129;Dels=0.00;FS=9.507;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=9.43;ReadPosRankSum=2.418;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1246,0,1440 chrIV 1009558 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.887;DP=134;Dels=0.00;FS=3.058;HaplotypeScore=3.6724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1449,0,1434 chrIV 1009761 . C T 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.024;DP=150;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1646,0,1553 chrIV 1009914 . C T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.225;DP=137;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.545;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1563,0,1384 chrIV 1009977 . A G 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.297;DP=101;Dels=0.00;FS=3.854;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=8.72;ReadPosRankSum=-2.404;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:911,0,1180 chrIV 1010028 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.193;DP=116;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.538;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1216,0,1217 chrIV 1010069 . A T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;DP=121;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.075;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1306,0,1330 chrIV 1010115 . G A 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.665;DP=115;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1131,0,1362 chrIV 1010124 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.186;DP=115;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.333;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1076,0,1413 chrIV 1010221 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.028;DP=125;Dels=0.00;FS=3.337;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:125:99:1349,0,1291 chrIV 1010256 . T C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;DP=117;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=10.08;ReadPosRankSum=2.042;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1209,0,1234 chrIV 1010478 . A G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.406;DP=129;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.773;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1240,0,1507 chrIV 1010565 . T C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.481;DP=123;Dels=0.00;FS=6.889;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1059,0,1467 chrIV 1010668 . T G 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.595;DP=137;Dels=0.00;FS=4.103;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.132;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1603,0,1372 chrIV 1010750 . A G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.416;DP=122;Dels=0.00;FS=2.482;HaplotypeScore=6.3112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=2.824;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.052;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:1379,0,1150 chrIV 1011237 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.810;DP=122;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.716;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:1135,0,1555 chrIV 1011299 . C G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.394;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1378,0,1250 chrIV 1011319 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.814;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.682;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1532,0,1280 chrIV 1011332 . C A 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.901;DP=156;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=11.27;ReadPosRankSum=3.023;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1788,0,1587 chrIV 1011421 . C T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.195;DP=120;Dels=0.00;FS=1.509;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.813;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1521,0,1016 chrIV 1011449 . C T 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.609;DP=119;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=1;MQRankSum=0.345;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,72:119:99:1617,0,880 chrIV 1011562 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.609;DP=108;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.032;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1204,0,1198 chrIV 1011655 . C A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.561;DP=104;Dels=0.00;FS=1.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.735;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1373,0,908 chrIV 1011699 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.484;DP=106;Dels=0.00;FS=9.271;HaplotypeScore=5.9533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1256,0,1048 chrIV 1011753 . C G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;DP=111;Dels=0.00;FS=4.719;HaplotypeScore=3.2126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.839;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:111:99:1337,0,926 chrIV 1011936 . A T 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3559,363,0 chrIV 1011970 . A G 3687.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3687,364,0 chrIV 1011981 . G A 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.861;DP=143;Dels=0.00;FS=1.339;HaplotypeScore=4.1303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:143:99:1766,0,1195 chrIV 1012073 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.890;DP=156;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=12.4984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.822;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1399,0,1847 chrIV 1012657 . G A 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.859;DP=150;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.342;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,83:150:99:1901,0,1360 chrIV 1013236 . A T 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=28.42;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3865,382,0 chrIV 1013349 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.874;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.312;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.835;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1069,0,1052 chrIV 1013385 . T G 2379 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=21.63;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2412,249,0 chrIV 1013673 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.237;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.000;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1263,0,1785 chrIV 1013882 . G C 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;DP=98;Dels=0.00;FS=1.685;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=4.098;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,57:98:99:1268,0,561 chrIV 1013924 . A G 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9118;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3496,354,0 chrIV 1014073 . A G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.636;DP=134;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1449,0,1375 chrIV 1014136 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.008;DP=119;Dels=0.00;FS=11.908;HaplotypeScore=7.6624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=1;MQRankSum=0.436;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.156;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1384,0,1086 chrIV 1014400 . T A 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=135;Dels=0.00;FS=3.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.744;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,79:135:99:1778,0,1190 chrIV 1014713 . G T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.348;DP=113;Dels=0.00;FS=7.343;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1351,0,1081 chrIV 1014863 . C A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.068;DP=121;Dels=0.00;FS=3.481;HaplotypeScore=1.9125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.159;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1285,0,1262 chrIV 1015219 . G A 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.651;DP=152;Dels=0.00;FS=7.359;HaplotypeScore=3.6394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.072;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1718,0,1490 chrIV 1015301 . G A 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.413;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.935;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.879;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1479,0,1669 chrIV 1015598 . G A 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.864;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.025;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1169,0,1378 chrIV 1015740 . T G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.818;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,74:126:99:1578,0,1123 chrIV 1015754 . C T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.914;DP=138;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.378;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:138:99:1652,0,1293 chrIV 1015807 . A G 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.306;DP=156;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.345;QD=10.24;ReadPosRankSum=-2.452;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1628,0,1663 chrIV 1015826 . T A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.086;DP=115;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=10.85;ReadPosRankSum=-2.151;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1278,0,1326 chrIV 1015888 . T A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;DP=110;Dels=0.00;FS=3.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.272;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,66:110:99:1548,0,909 chrIV 1015897 . C T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.644;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.019;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.767;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,58:95:99:1317,0,749 chrIV 1015946 . T G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.025;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,59:96:99:1057,0,674 chrIV 1016028 . G A 477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.386;DP=84;Dels=0.00;FS=3.202;HaplotypeScore=3.3480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.498;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:507,0,580 chrIV 1016050 . T C 1772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=20.37;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1805,189,0 chrIV 1016056 . C T 598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:83:99:628,0,954 chrIV 1016202 . T A 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;DP=109;Dels=0.00;FS=6.125;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=1;MQRankSum=2.156;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.527;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:931,0,1434 chrIV 1016282 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.999;DP=93;Dels=0.00;FS=5.174;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.159;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:1208,0,842 chrIV 1016376 . G C 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;DP=97;Dels=0.00;FS=3.842;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.714;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:918,0,1035 chrIV 1016426 . C A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.581;DP=101;Dels=0.00;FS=8.004;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=1.882;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.917;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:1015,0,1195 chrIV 1016489 . T C 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.847;DP=116;Dels=0.00;FS=15.979;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1008,0,1487 chrIV 1016597 . A G 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.878;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:1001,0,941 chrIV 1016644 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.772;DP=121;Dels=0.00;FS=2.389;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.88;MQ0=0;MQRankSum=1.893;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.158;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1244,0,1435 chrIV 1016685 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.131;DP=113;Dels=0.00;FS=2.412;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.26;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1076,0,1364 chrIV 1016821 . A T 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.27;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2873,280,0 chrIV 1016830 . T C 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;DP=121;Dels=0.00;FS=7.049;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.44;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.453;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:957,0,1457 chrIV 1016858 . T A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.823;DP=112;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=13.38;ReadPosRankSum=2.229;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1529,0,957 chrIV 1017015 . G T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.717;DP=132;Dels=0.00;FS=3.181;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=10.27;ReadPosRankSum=2.141;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1386,0,1560 chrIV 1017026 . T G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.061;DP=125;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1302,0,1354 chrIV 1017181 . A G 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.020;DP=128;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.338;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1385,0,1357 chrIV 1017216 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.816;DP=142;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=2.4993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1480,0,1464 chrIV 1017553 . G C 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.802;DP=124;Dels=0.00;FS=2.307;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:859,0,1464 chrIV 1017610 . A C 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3432,354,0 chrIV 1017759 . G T 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;DP=122;Dels=0.00;FS=17.650;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.951;QD=9.25;ReadPosRankSum=-2.368;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1159,0,1545 chrIV 1017776 . G A 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.743;DP=119;Dels=0.00;FS=14.330;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,72:119:99:1629,0,942 chrIV 1017855 . T A 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.433;DP=111;Dels=0.00;FS=12.675;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.471;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:953,0,1484 chrIV 1017915 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.477;DP=107;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1065,0,1270 chrIV 1018014 . A T 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;DP=127;Dels=0.00;FS=10.552;HaplotypeScore=3.6341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.596;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,51:127:99:1005,0,1852 chrIV 1018111 . C G 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;DP=119;Dels=0.00;FS=7.497;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.932;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:1008,0,1621 chrIV 1018128 . C G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.593;DP=124;Dels=0.00;FS=12.033;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:124:99:1509,0,1054 chrIV 1018236 . T C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.493;DP=124;Dels=0.00;FS=3.268;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1269,0,1420 chrIV 1018321 . C A 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:1029,0,1286 chrIV 1018330 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.246;DP=100;Dels=0.00;FS=0.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1247,0,940 chrIV 1018564 . C A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.877;DP=132;Dels=0.00;FS=5.217;HaplotypeScore=4.6183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=10.94;ReadPosRankSum=-2.775;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1474,0,1314 chrIV 1018753 . A G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;DP=135;Dels=0.00;FS=4.541;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=10.88;ReadPosRankSum=-2.429;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1499,0,1352 chrIV 1018804 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.432;DP=118;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.159;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1440,0,1184 chrIV 1018931 . T G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.572;DP=100;Dels=0.00;FS=4.995;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.576;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1026,0,1222 chrIV 1019082 . T C 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.895;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.094;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:982,0,1447 chrIV 1019235 . C A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.918;DP=112;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=2.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.913;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:112:99:1180,0,1232 chrIV 1019310 . T C 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.036;DP=80;Dels=0.00;FS=0.852;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,41:80:99:865,0,879 chrIV 1019506 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.755;DP=115;Dels=0.00;FS=10.264;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.743;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1138,0,1395 chrIV 1019535 . A G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.615;DP=124;Dels=0.00;FS=8.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.976;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1111,0,1603 chrIV 1019829 . G A 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.291;DP=122;Dels=0.00;FS=2.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.968;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.889;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:1001,0,1615 chrIV 1019915 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.410;DP=122;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.486;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1135,0,1447 chrIV 1019958 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.778;DP=118;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.382;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1295,0,1135 chrIV 1020075 . A T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.355;DP=98;Dels=0.00;FS=2.850;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=11.84;ReadPosRankSum=-1.575;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1190,0,913 chrIV 1020081 . A T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.989;DP=100;Dels=0.00;FS=3.033;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=12.16;ReadPosRankSum=-1.233;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1246,0,921 chrIV 1020194 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.300;DP=114;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.737;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1289,0,1213 chrIV 1020305 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.493;DP=95;Dels=0.00;FS=1.980;HaplotypeScore=2.9669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.076;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1171,0,941 chrIV 1020315 . G C 2089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.48;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2122,225,0 chrIV 1020456 . A T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.223;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1081,0,1584 chrIV 1020493 . C A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.029;DP=128;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.519;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,51:128:99:1077,0,1712 chrIV 1020625 . G A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.936;DP=131;Dels=0.00;FS=12.882;HaplotypeScore=2.8982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.647;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1351,0,1497 chrIV 1020636 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.579;DP=120;Dels=0.00;FS=9.977;HaplotypeScore=3.8173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.197;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1114,0,1449 chrIV 1021040 . G A 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.611;DP=145;Dels=0.00;FS=3.228;HaplotypeScore=3.4571;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=1;MQRankSum=-1.344;QD=24.08;ReadPosRankSum=-1.417;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,143:145:99:3492,351,0 chrIV 1021208 . C T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.175;DP=143;Dels=0.00;FS=3.030;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.978;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1394,0,1649 chrIV 1022417 . A G 2111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.162;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2144,211,0 chrIV 1022660 . T A 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.955;DP=119;Dels=0.00;FS=3.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.878;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,72:119:99:1595,0,931 chrIV 1022834 . T C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.097;DP=123;Dels=0.00;FS=5.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1497,0,1239 chrIV 1022874 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.581;DP=115;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.072;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1137,0,1341 chrIV 1023018 . A G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.923;DP=122;Dels=0.00;FS=5.482;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.041;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1416,0,1323 chrIV 1023058 . C G 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;DP=143;Dels=0.00;FS=21.283;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1535,0,1603 chrIV 1023353 . C T 980 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.75;MQ0=7;QD=21.30;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1013,105,0 chrIV 1023589 . A G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.689;DP=112;Dels=0.00;FS=3.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.926;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1445,0,1018 chrIV 1023657 . A G 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.976;DP=131;Dels=0.00;FS=4.352;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=11.64;ReadPosRankSum=-2.150;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1555,0,1378 chrIV 1024035 . C A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.278;DP=76;Dels=0.00;FS=30.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,47:76:99:1075,0,544 chrIV 1024375 . C A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.386;DP=104;Dels=0.00;FS=12.991;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.659;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1345,0,931 chrIV 1024582 . A C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.624;DP=132;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=3.9422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.335;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1351,0,1483 chrIV 1024632 . G T 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.759;DP=114;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.060;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1268,0,1292 chrIV 1024779 . T C 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.678;DP=105;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=3.8452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:920,0,1398 chrIV 1024985 . A G 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.496;DP=127;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.220;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,50:127:99:1011,0,1766 chrIV 1025085 . G A 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.541;DP=152;Dels=0.00;FS=5.942;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.026;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1642,0,1630 chrIV 1025323 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.180;DP=124;Dels=0.00;FS=3.261;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.631;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1259,0,1376 chrIV 1025949 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.429;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.723;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1377,0,1048 chrIV 1026600 . T A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.761;DP=83;Dels=0.00;FS=0.832;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:1036,0,795 chrIV 1026759 . A T 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.456;DP=148;Dels=0.00;FS=2.118;HaplotypeScore=4.7281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=2.019;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.435;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1595,0,1665 chrIV 1026927 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.569;DP=121;Dels=0.00;FS=2.310;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1411,0,1180 chrIV 1026933 . G C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1198,0,1056 chrIV 1027140 . A T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;DP=99;Dels=0.00;FS=3.821;HaplotypeScore=5.3898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.014;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:99:99:1057,0,1105 chrIV 1027623 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.893;DP=124;Dels=0.00;FS=12.616;HaplotypeScore=4.7327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.963;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.438;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1196,0,1442 chrIV 1027653 . C T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.078;DP=127;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.919;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1469,0,1231 chrIV 1027767 . A G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=124;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=5.7038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:124:99:1235,0,1390 chrIV 1028486 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.296;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.575;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:1040,0,1241 chrIV 1028509 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.826;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:1246,0,883 chrIV 1028937 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;DP=136;Dels=0.00;FS=4.252;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=-0.042;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.163;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,56:136:99:1112,0,1723 chrIV 1029103 . G A 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.792;DP=109;Dels=0.00;FS=9.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=14.10;ReadPosRankSum=1.565;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,66:109:99:1567,0,858 chrIV 1029246 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.529;DP=110;Dels=0.00;FS=5.204;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.147;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1203,0,1178 chrIV 1029540 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.492;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.093;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:946,0,1226 chrIV 1030124 . C T 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.611;DP=146;Dels=0.00;FS=2.301;HaplotypeScore=5.1459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.661;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1558,0,1495 chrIV 1030215 . G A 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.830;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.113;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:1058,0,1077 chrIV 1030251 . C T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.559;DP=112;Dels=0.00;FS=6.760;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.152;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1291,0,1208 chrIV 1030287 . T C 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.728;DP=115;Dels=0.00;FS=6.001;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1008,0,1505 chrIV 1030401 . C T 1228.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;DP=122;Dels=0.00;FS=15.142;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-3.269;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1258,0,1402 chrIV 1030402 . C A 1213.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.000;DP=126;Dels=0.00;FS=16.789;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1243,0,1347 chrIV 1030406 . G A 1280.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.527;DP=122;Dels=0.00;FS=13.254;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.246;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1310,0,1362 chrIV 1030407 . A T 1265.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.997;DP=123;Dels=0.00;FS=11.601;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=-3.135;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1295,0,1431 chrIV 1030428 . A C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.429;DP=137;Dels=0.00;FS=5.252;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=1;MQRankSum=0.542;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.722;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1093,0,1679 chrIV 1030607 . G C 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1398,0,1300 chrIV 1030683 . A G 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.628;DP=152;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=4.0644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1662,0,1648 chrIV 1030955 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.528;DP=124;Dels=0.00;FS=4.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.493;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1310,0,1363 chrIV 1031168 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1311,0,1231 chrIV 1031318 . T G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.289;DP=124;Dels=0.00;FS=4.568;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.114;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:124:99:1325,0,1393 chrIV 1031350 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.927;DP=131;Dels=0.00;FS=3.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.289;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1384,0,1522 chrIV 1031473 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.379;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1181,0,1251 chrIV 1031550 . T A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;DP=145;Dels=0.00;FS=7.456;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.487;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.470;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1432,0,1811 chrIV 1031637 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.533;DP=125;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.613;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1168,0,1525 chrIV 1031723 . G A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.748;DP=117;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.013;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1353,0,1198 chrIV 1031974 . G A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.438;DP=142;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,57:142:99:1069,0,2003 chrIV 1031976 . A G 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.675;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.319;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,55:141:99:1024,0,2111 chrIV 1032015 . T C 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,69:155:99:1412,0,1911 chrIV 1032245 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.196;DP=128;Dels=0.00;FS=2.261;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1229,0,1623 chrIV 1032798 . A G 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.436;DP=102;Dels=0.00;FS=6.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,41:102:99:819,0,1432 chrIV 1033176 . G A 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.830;DP=103;Dels=0.00;FS=1.595;HaplotypeScore=19.7276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.465;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:660,0,491 chrIV 1033297 . A C 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.366;DP=141;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.284;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,84:141:99:1779,0,1237 chrIV 1033434 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.527;DP=127;Dels=0.00;FS=8.419;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=12.27;ReadPosRankSum=-2.902;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1588,0,1172 chrIV 1033545 . A C 2066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.629;DP=171;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.038;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,95:171:99:2096,0,1597 chrIV 1033569 . G T 2189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.374;DP=167;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=4.3133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=13.11;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,94:167:99:2219,0,1423 chrIV 1033590 . A G 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.791;DP=145;Dels=0.00;FS=2.431;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.071;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1716,0,1359 chrIV 1033631 . A T 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.685;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=14.3626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1682,0,1208 chrIV 1033712 . A C 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.063;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.880;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1581,0,1360 chrIV 1033864 . A C 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.017;DP=144;Dels=0.00;FS=2.972;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.535;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1700,0,1475 chrIV 1033877 . G A 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.850;DP=138;Dels=0.00;FS=3.057;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.952;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1782,0,1237 chrIV 1033891 . G C 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;DP=135;Dels=0.00;FS=3.134;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.816;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1726,0,1162 chrIV 1033951 . T C 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.436;DP=112;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=14.54;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,71:112:99:1658,0,791 chrIV 1034115 . A G 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.440;DP=85;Dels=0.00;FS=7.098;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.071;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:842,0,1000 chrIV 1034116 . A G 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.689;DP=83;Dels=0.00;FS=9.196;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.046;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:821,0,1012 chrIV 1034253 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.931;DP=100;Dels=0.00;FS=3.999;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.497;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1228,0,937 chrIV 1034463 . A G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.222;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=12.8086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.596;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1028,0,1651 chrIV 1034538 . T C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.914;DP=95;Dels=0.00;FS=5.512;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1023,0,1032 chrIV 1034709 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;DP=123;Dels=0.00;FS=2.346;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.107;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1137,0,1373 chrIV 1034904 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.335;DP=120;Dels=0.00;FS=1.465;HaplotypeScore=16.7718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.981;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1311,0,1368 chrIV 1035084 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.459;DP=128;Dels=0.00;FS=7.029;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.881;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1274,0,1537 chrIV 1035309 . A G 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;DP=114;Dels=0.00;FS=2.442;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=12.14;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,67:114:99:1414,0,983 chrIV 1035606 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.557;DP=147;Dels=0.00;FS=2.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=-4.904;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.006;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,57:147:99:1232,0,1967 chrIV 1035627 . T C 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.941;DP=140;Dels=0.00;FS=2.219;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.98;MQ0=0;MQRankSum=-5.941;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,52:140:99:976,0,1979 chrIV 1035668 . T C 510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.886;DP=112;Dels=0.00;FS=6.301;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=-8.589;QD=4.55;ReadPosRankSum=-1.794;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,41:112:99:540,0,1657 chrIV 1035697 . A C 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.393;DP=100;Dels=0.00;FS=8.134;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.20;MQ0=0;MQRankSum=-5.414;QD=5.92;ReadPosRankSum=-4.879;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:622,0,1397 chrIV 1035801 . T C 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.012;DP=149;Dels=0.00;FS=2.903;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1620,0,1616 chrIV 1035891 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.172;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.228;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1442,0,1063 chrIV 1035987 . T C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.344;DP=124;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=4.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.842;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1269,0,1422 chrIV 1036063 . A C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.772;DP=113;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.597;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1061,0,1449 chrIV 1036179 . A C 2599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2632,267,0 chrIV 1036216 . A G 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.433;DP=91;Dels=0.00;FS=10.699;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.163;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:962,0,996 chrIV 1036257 . G A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.860;DP=122;Dels=0.00;FS=3.872;HaplotypeScore=4.6552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:122:99:1403,0,1101 chrIV 1036312 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.953;DP=124;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=5.9634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1373,0,1287 chrIV 1036351 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.226;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.163;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1417,0,1378 chrIV 1036384 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.418;DP=128;Dels=0.00;FS=2.871;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.532;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1364,0,1407 chrIV 1036669 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.993;DP=110;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1060,0,1248 chrIV 1036886 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.943;DP=132;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=3.3130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.877;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1476,0,1328 chrIV 1036952 . T C 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.007;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1655,0,1196 chrIV 1037080 . G A 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.483;DP=145;Dels=0.00;FS=2.109;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1758,0,1201 chrIV 1037205 . T C 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3301,345,0 chrIV 1037262 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.790;DP=145;Dels=0.00;FS=3.020;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.480;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1353,0,1784 chrIV 1037347 . A G 4406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=26.07;ReadPosRankSum=0.420;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,168:169:99:4406,425,0 chrIV 1037511 . G A 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.632;DP=160;Dels=0.00;FS=2.253;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.712;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1841,0,1594 chrIV 1037652 . C A 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.384;DP=131;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.220;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,80:131:99:1899,0,1008 chrIV 1037705 . A G 2094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.688;DP=151;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.555;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,96:151:99:2124,0,1187 chrIV 1037710 . G A 2370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.360;DP=156;Dels=0.00;FS=2.142;HaplotypeScore=2.6566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.249;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,100:155:99:2400,0,1099 chrIV 1037923 . G A 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.095;DP=151;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.665;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1621,0,1669 chrIV 1037990 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.979;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.023;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1106,0,1482 chrIV 1038058 . T C 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.764;DP=147;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.655;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1444,0,1695 chrIV 1038059 . T C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.503;DP=148;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.822;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1436,0,1772 chrIV 1038316 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.608;DP=152;Dels=0.00;FS=1.272;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1343,0,1769 chrIV 1038463 . G A 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.998;DP=147;Dels=0.00;FS=8.597;HaplotypeScore=2.8467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.246;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1708,0,1429 chrIV 1038536 . G A 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.245;DP=146;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=2.4706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.768;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1469,0,1769 chrIV 1038620 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.467;DP=117;Dels=0.00;FS=7.053;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.291;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.233;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1188,0,1389 chrIV 1039385 . A G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3302,357,0 chrIV 1040424 . T G 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.776;DP=158;Dels=0.00;FS=7.128;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.409;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,69:158:99:1493,0,1972 chrIV 1040438 . G A 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;DP=155;Dels=0.00;FS=11.249;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.088;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:155:99:1578,0,1819 chrIV 1040522 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.372;DP=119;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.380;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1136,0,1463 chrIV 1040595 . A C 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.429;DP=132;Dels=0.00;FS=5.473;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=1;MQRankSum=-0.030;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1423,0,1388 chrIV 1040627 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.292;DP=139;Dels=0.00;FS=6.467;HaplotypeScore=2.3683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=1;MQRankSum=1.210;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.196;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1530,0,1466 chrIV 1040643 . G A 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.123;DP=123;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.248;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1384,0,1263 chrIV 1040939 . A G 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3183,324,0 chrIV 1041086 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.959;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.992;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.444;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:1475,0,1982 chrIV 1041278 . G A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.065;DP=141;Dels=0.00;FS=3.088;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.908;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,56:141:99:1210,0,1865 chrIV 1041560 . G A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;DP=139;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1448,0,1628 chrIV 1041581 . A T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.518;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.72;ReadPosRankSum=-2.812;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1471,0,1306 chrIV 1041853 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.036;DP=120;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1167,0,1404 chrIV 1041863 . T A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.868;DP=122;Dels=0.00;FS=5.581;HaplotypeScore=3.7747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1346,0,1300 chrIV 1042427 . G T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.574;DP=105;Dels=0.00;FS=13.160;HaplotypeScore=5.9563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=2.840;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.042;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:1105,0,1102 chrIV 1042457 . A G 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.564;DP=91;Dels=0.00;FS=12.497;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.365;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:829,0,1118 chrIV 1042469 . G A 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.659;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.7927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=8.22;ReadPosRankSum=3.224;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:770,0,996 chrIV 1042736 . A G 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.369;DP=148;Dels=0.00;FS=2.926;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.280;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1411,0,1719 chrIV 1042840 . T C 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1074,0,1437 chrIV 1042968 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.518;DP=111;Dels=0.00;FS=1.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:993,0,1411 chrIV 1043012 . T C 622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.179;DP=102;Dels=0.01;FS=2.631;HaplotypeScore=10.3180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.674;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:652,0,1386 chrIV 1043069 . A G 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.551;DP=122;Dels=0.00;FS=5.039;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=6.96;ReadPosRankSum=3.863;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,45:122:99:879,0,1642 chrIV 1043113 . G A 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.013;DP=107;Dels=0.01;FS=1.990;HaplotypeScore=34.6845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.557;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.946;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:893,0,1242 chrIV 1043299 . G A 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3225,307,0 chrIV 1043662 . A G 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.426;DP=117;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1025,0,1474 chrIV 1043842 . A C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.934;DP=121;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.698;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1365,0,1394 chrIV 1043887 . G A 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.079;DP=170;Dels=0.00;FS=0.565;HaplotypeScore=2.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.359;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,81:170:99:1745,0,1817 chrIV 1043992 . T A 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1725,0,1512 chrIV 1044052 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.748;DP=119;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=9.4039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.394;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1360,0,1229 chrIV 1044571 . G A 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3028,298,0 chrIV 1044635 . C A 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3426,340,0 chrIV 1044637 . A T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.163;DP=127;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=8.68;ReadPosRankSum=2.484;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1132,0,1594 chrIV 1044721 . C T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.751;DP=117;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1391,0,1220 chrIV 1044751 . G A 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.994;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.035;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:1048,0,1282 chrIV 1045062 . A T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;DP=127;Dels=0.00;FS=5.549;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1565,0,1245 chrIV 1045288 . T C 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.646;DP=110;Dels=0.00;FS=3.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.320;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,66:110:99:1519,0,954 chrIV 1045311 . G C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.175;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,56:93:99:1109,0,753 chrIV 1045364 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.587;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1298,0,1233 chrIV 1045482 . C G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.238;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1092,0,1563 chrIV 1045644 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;DP=127;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.166;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1278,0,1412 chrIV 1045735 . A G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.007;DP=125;Dels=0.00;FS=0.809;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1392,0,1355 chrIV 1045804 . A G 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.635;DP=130;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.485;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1429,0,1343 chrIV 1045807 . C G 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;DP=129;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.225;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1377,0,1220 chrIV 1045817 . G T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.295;DP=114;Dels=0.00;FS=2.380;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.125;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1274,0,1120 chrIV 1045825 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.667;DP=123;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.327;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1162,0,1359 chrIV 1045889 . A G 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.468;DP=92;Dels=0.00;FS=2.697;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.074;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:895,0,1123 chrIV 1045961 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.272;DP=117;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.063;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1449,0,1051 chrIV 1046027 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.630;DP=113;Dels=0.00;FS=2.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.355;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1296,0,1088 chrIV 1046447 . C T 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.696;DP=160;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=11.1873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.531;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1710,0,1727 chrIV 1046579 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.026;DP=122;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.945;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1204,0,1202 chrIV 1046663 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.672;DP=98;Dels=0.00;FS=14.070;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1274,0,853 chrIV 1046702 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;DP=97;Dels=0.00;FS=21.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.884;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.519;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,54:97:99:1187,0,997 chrIV 1046876 . T G 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.468;DP=136;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1470,0,1476 chrIV 1046913 . G C 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;DP=137;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=4.9006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.132;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1561,0,1257 chrIV 1046957 . C T 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.775;DP=152;Dels=0.00;FS=2.030;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1733,0,1552 chrIV 1046963 . G A 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.973;DP=154;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=2.7989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:154:99:1698,0,1612 chrIV 1046969 . G A 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.657;DP=152;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1662,0,1642 chrIV 1047029 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.825;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1443,0,1330 chrIV 1047046 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.938;DP=108;Dels=0.00;FS=3.598;HaplotypeScore=3.7567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.724;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1321,0,1017 chrIV 1047081 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.776;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.239;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1467,0,1345 chrIV 1047131 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;DP=135;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=10.51;ReadPosRankSum=-2.190;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1449,0,1378 chrIV 1047137 . A G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.150;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.897;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1287,0,1425 chrIV 1047263 . A G 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.830;DP=169;Dels=0.00;FS=1.216;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.615;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,94:169:99:1747,0,1649 chrIV 1047306 . T C 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.858;DP=154;Dels=0.00;FS=7.800;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.138;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1717,0,1652 chrIV 1047620 . C G 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.241;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.260;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1576,0,1498 chrIV 1048043 . A G 1877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.225;DP=167;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=2.8832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.453;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,85:167:99:1907,0,1791 chrIV 1048142 . C T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.835;DP=135;Dels=0.00;FS=2.198;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.230;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1651,0,1294 chrIV 1048193 . A T 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;DP=154;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=3.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,88:154:99:1840,0,1353 chrIV 1048271 . G A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.020;DP=137;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.040;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1450,0,1450 chrIV 1048403 . A G 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.501;DP=153;Dels=0.00;FS=2.908;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.988;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.712;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,89:153:99:1841,0,1348 chrIV 1048839 . C T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.057;DP=145;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=3.8799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.329;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.056;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1486,0,1672 chrIV 1048865 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.505;DP=150;Dels=0.00;FS=3.842;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1393,0,1737 chrIV 1048868 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.515;DP=153;Dels=0.00;FS=3.766;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:153:99:1565,0,1586 chrIV 1048988 . G A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.909;DP=143;Dels=0.00;FS=12.200;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=1;MQRankSum=-0.923;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.614;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1322,0,1790 chrIV 1049075 . A G 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=-0.222;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,61:147:99:1237,0,1861 chrIV 1049195 . T C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=107;Dels=0.00;FS=2.577;HaplotypeScore=4.4224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1041,0,1312 chrIV 1049568 . G C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;DP=104;Dels=0.00;FS=9.496;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.743;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1179,0,1044 chrIV 1049727 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.062;DP=112;Dels=0.00;FS=3.510;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.085;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1206,0,1237 chrIV 1050425 . C T 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.416;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=2;MQRankSum=-1.464;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1159,0,1246 chrIV 1051307 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.234;DP=140;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=2.5608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.155;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1200,0,1761 chrIV 1051766 . A T 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;DP=128;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=4.4738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1485,0,1327 chrIV 1051775 . G A 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3356,331,0 chrIV 1051797 . A G 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3491,357,0 chrIV 1052169 . A G 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.790;DP=136;Dels=0.00;FS=5.271;HaplotypeScore=4.7034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.476;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1150,0,1756 chrIV 1052196 . A T 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3299,331,0 chrIV 1052308 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.627;DP=136;Dels=0.00;FS=5.205;HaplotypeScore=4.8521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.085;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1296,0,1708 chrIV 1052478 . G C 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2994,297,0 chrIV 1052615 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.551;DP=112;Dels=0.00;FS=1.584;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1314,0,1097 chrIV 1052743 . G A 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3012,300,0 chrIV 1052765 . C T 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.530;DP=85;Dels=0.00;FS=5.494;HaplotypeScore=3.8169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=2.497;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.295;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:797,0,1034 chrIV 1052815 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.329;DP=103;Dels=0.00;FS=9.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.624;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1201,0,1048 chrIV 1052882 . T C 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.497;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.202;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:1016,0,1014 chrIV 1052914 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.128;DP=96;Dels=0.00;FS=2.705;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.658;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1215,0,866 chrIV 1052996 . T C 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.366;DP=111;Dels=0.00;FS=10.707;HaplotypeScore=3.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=1;MQRankSum=-1.837;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.311;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:872,0,1442 chrIV 1053051 . C T 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.852;DP=101;Dels=0.00;FS=3.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1336,0,853 chrIV 1053054 . A C 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.113;DP=101;Dels=0.00;FS=2.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.483;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:830,0,1380 chrIV 1053089 . A G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.770;DP=110;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=4.7456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.270;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,67:110:99:1516,0,902 chrIV 1053134 . T A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,59:91:99:1449,0,655 chrIV 1053228 . C T 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.344;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=26.40;ReadPosRankSum=0.761;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2858,274,0 chrIV 1053274 . G A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.786;DP=123;Dels=0.00;FS=18.295;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.858;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:123:99:1472,0,1079 chrIV 1053283 . G A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.566;DP=127;Dels=0.00;FS=12.918;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.651;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1579,0,1098 chrIV 1053286 . C T 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3386,328,0 chrIV 1053397 . G A 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3964,382,0 chrIV 1053747 . A G 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3032,312,0 chrIV 1053796 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.014;DP=133;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.931;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1172,0,1576 chrIV 1053820 . C T 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=28.20;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:4033,400,0 chrIV 1053840 . C T 1827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.950;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=12.87;ReadPosRankSum=1.979;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1857,0,1313 chrIV 1053946 . C T 4962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=191;Dels=0.00;FS=3.220;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=25.98;ReadPosRankSum=1.605;SB=-2.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,190:191:99:4962,445,0 chrIV 1054003 . A C 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.838;DP=166;Dels=0.00;FS=2.777;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.709;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,80:166:99:1647,0,1819 chrIV 1054018 . A G 1903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.404;DP=168;Dels=0.00;FS=7.866;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,91:168:99:1933,0,1614 chrIV 1054225 . A G 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.100;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1439,0,1365 chrIV 1054503 . C T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.359;DP=134;Dels=0.00;FS=4.172;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=2;MQRankSum=1.712;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.744;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1517,0,1326 chrIV 1054527 . T G 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3673,375,0 chrIV 1054662 . A C 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=116;Dels=0.00;FS=3.163;HaplotypeScore=3.7213;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=26.48;ReadPosRankSum=1.553;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:3105,310,0 chrIV 1054717 . T C 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;DP=108;Dels=0.00;FS=2.550;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.60;MQ0=0;MQRankSum=-4.789;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.638;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,43:108:99:845,0,1470 chrIV 1054827 . T G 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.976;DP=121;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=2.747;QD=6.62;ReadPosRankSum=-2.133;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,46:121:99:831,0,1637 chrIV 1054871 . G A 1839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.978;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,91:151:99:1869,0,772 chrIV 1054894 . C A 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.846;DP=157;Dels=0.00;FS=4.941;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=6.68;ReadPosRankSum=1.360;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,65:157:99:1078,0,1911 chrIV 1055184 . G A 1321 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.764;DP=96;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=46.6964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.674;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:47,49:96:99:1354,132,0 chrIV 1055202 . G C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;DP=117;Dels=0.00;FS=2.389;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.855;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1020,0,1339 chrIV 1055204 . G A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.643;DP=119;Dels=0.00;FS=3.364;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1416,0,1090 chrIV 1055277 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.101;DP=134;Dels=0.00;FS=2.365;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.423;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1337,0,1534 chrIV 1055412 . A G 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3890,382,0 chrIV 1055562 . G A 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3622,358,0 chrIV 1055660 . C A 4482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4482,427,0 chrIV 1055678 . T C 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=15.7826;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=22.62;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:3890,399,0 chrIV 1055826 . T G 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3072;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3580,355,0 chrIV 1055999 . A C 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.047;DP=130;Dels=0.00;FS=6.190;HaplotypeScore=2.5114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=25.53;ReadPosRankSum=1.428;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,128:130:99:3319,333,0 chrIV 1056052 . A G 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2754,288,0 chrIV 1056091 . G A 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5002;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2863,282,0 chrIV 1056097 . A G 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3052,306,0 chrIV 1056135 . C T 3863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.01;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3863,364,0 chrIV 1056271 . T C 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2793,288,0 chrIV 1056272 . T C 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2763,291,0 chrIV 1056299 . C A 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3685,352,0 chrIV 1056324 . C T 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=26.64;ReadPosRankSum=1.606;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2963,286,0 chrIV 1056332 . T C 2873 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2906,291,0 chrIV 1056448 . T C 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.19;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3001,312,0 chrIV 1056784 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.362;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.100;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1464,0,1490 chrIV 1057123 . T C 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3738,402,0 chrIV 1057366 . C T 4452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=28.72;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4452,433,0 chrIV 1057426 . C T 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3182,316,0 chrIV 1057517 . G A 2579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2612,252,0 chrIV 1057526 . T C 2442 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2475,252,0 chrIV 1057573 . T C 2737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2770,294,0 chrIV 1057601 . C T 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=25.90;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3419,334,0 chrIV 1057603 . C T 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=26.26;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3440,337,0 chrIV 1057627 . G A 4452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4452,448,0 chrIV 1057712 . G A 4025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.47;SB=-2.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4025,400,0 chrIV 1057776 . G A 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3188,322,0 chrIV 1057799 . T C 2118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=26.15;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2151,228,0 chrIV 1057818 . T A 1701 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;QD=23.96;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:71:99:1734,180,0 chrIV 1057855 . T C 2066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:84:99:2099,219,0 chrIV 1057856 . G A 2175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2208,219,0 chrIV 1057925 . T A 1908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=85.2413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.37;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:1941,201,0 chrIV 1057928 . A G 1595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;DP=92;Dels=0.00;FS=4.010;HaplotypeScore=83.9822;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=17.34;ReadPosRankSum=-2.129;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,84:92:99:1628,177,0 chrIV 1057986 . A G 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.65;MQ0=0;QD=24.91;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2948,312,0 chrIV 1058083 . A G 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2921,294,0 chrIV 1058179 . A G 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9758;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3568,363,0 chrIV 1058335 . G A 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3363,325,0 chrIV 1058545 . G T 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3066,292,0 chrIV 1058617 . C T 4532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=1;QD=27.63;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4532,439,0 chrIV 1058864 . C T 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3691,361,0 chrIV 1059080 . G A 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2813,280,0 chrIV 1059094 . C T 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.93;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2780,279,0 chrIV 1059143 . G A 2189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2222,216,0 chrIV 1059399 . G C 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=28.08;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2813,285,0 chrIV 1059459 . A C 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3275,324,0 chrIV 1059662 . C T 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3024,298,0 chrIV 1059836 . A G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;DP=120;Dels=0.00;FS=5.663;HaplotypeScore=1.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=11.78;ReadPosRankSum=-1.813;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1444,0,1191 chrIV 1059944 . G A 587.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.008;DP=121;Dels=0.02;FS=10.292;HaplotypeScore=43.3786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.59;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=4.85;ReadPosRankSum=-3.329;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:617,0,480 chrIV 1059947 . A G 447.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.266;DP=116;Dels=0.00;FS=13.886;HaplotypeScore=41.6537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.25;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=3.85;ReadPosRankSum=-2.311;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:477,0,551 chrIV 1059954 . A G 418.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.601;DP=115;Dels=0.00;FS=18.639;HaplotypeScore=3.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=3.63;ReadPosRankSum=-4.529;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:448,0,767 chrIV 1059955 . A G 462.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.569;DP=116;Dels=0.00;FS=18.906;HaplotypeScore=2.9565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=3.98;ReadPosRankSum=-5.127;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:492,0,772 chrIV 1059983 . A T 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;DP=97;Dels=0.00;FS=9.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.427;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:826,0,827 chrIV 1060010 . T C 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.91;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2714,279,0 chrIV 1060244 . C T 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.745;DP=105;Dels=0.00;FS=2.837;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:952,0,1293 chrIV 1060533 . T C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.259;DP=120;Dels=0.00;FS=3.450;HaplotypeScore=2.9499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.718;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1269,0,1438 chrIV 1061183 . C T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.480;DP=90;Dels=0.00;FS=2.800;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.050;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:1072,0,867 chrIV 1061386 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.603;DP=113;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.808;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.510;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:113:99:1183,0,1211 chrIV 1061571 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.177;DP=113;Dels=0.00;FS=4.645;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1426,0,1022 chrIV 1061631 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.477;DP=99;Dels=0.00;FS=5.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,54:99:99:1171,0,941 chrIV 1061634 . T C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.818;DP=107;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.715;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1252,0,1013 chrIV 1065086 . A G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.284;DP=150;Dels=0.00;FS=7.198;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.383;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1561,0,1701 chrIV 1066882 . A G 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2724,279,0 chrIV 1067784 . C T 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3357,331,0 chrIV 1069346 . A G 664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.852;DP=73;Dels=0.00;FS=0.962;HaplotypeScore=4.9713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.928;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:694,0,946 chrIV 1071558 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.810;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=2.822;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.918;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,74:166:99:1472,0,2058 chrIV 1071771 . G A 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3692,367,0 chrIV 1072384 . G C 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3946,408,0 chrIV 1072576 . G A 2404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.85;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2437,249,0 chrIV 1072962 . G A 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3580,334,0 chrIV 1073936 . G A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.483;DP=126;Dels=0.00;FS=1.438;HaplotypeScore=3.6419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.400;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:126:99:1644,0,1124 chrIV 1074630 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.251;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:114:99:1073,0,1305 chrIV 1074638 . A G 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.219;DP=111;Dels=0.00;FS=2.637;HaplotypeScore=3.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.609;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1024,0,1411 chrIV 1074698 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;DP=98;Dels=0.00;FS=3.821;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.018;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,58:98:99:1309,0,828 chrIV 1074737 . A G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.108;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1562,0,1228 chrIV 1074754 . C T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.872;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1521,0,1190 chrIV 1074776 . T G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.906;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1364,0,1216 chrIV 1074842 . T C 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.733;DP=121;Dels=0.00;FS=4.409;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.856;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1391,0,1217 chrIV 1074879 . A G 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.193;DP=149;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=6.8494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1643,0,1564 chrIV 1074890 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.424;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1349,0,1352 chrIV 1074897 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.579;DP=128;Dels=0.00;FS=1.499;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.724;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.926;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1452,0,1292 chrIV 1074927 . G A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.408;DP=135;Dels=0.00;FS=1.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.007;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1523,0,1334 chrIV 1075079 . C T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.968;DP=138;Dels=0.00;FS=4.225;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.426;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1500,0,1336 chrIV 1075290 . A G 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.313;DP=145;Dels=0.00;FS=5.018;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.232;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1564,0,1550 chrIV 1075328 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.902;DP=135;Dels=0.00;FS=4.206;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1399,0,1379 chrIV 1075347 . A G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.212;DP=132;Dels=0.00;FS=8.130;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1467,0,1361 chrIV 1075360 . A T 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.581;DP=149;Dels=0.00;FS=5.004;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.495;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1605,0,1664 chrIV 1075561 . G A 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.064;DP=112;Dels=0.00;FS=7.384;HaplotypeScore=2.9758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.972;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1101,0,1330 chrIV 1075570 . T G 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.358;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.885;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1008,0,1430 chrIV 1075577 . G A 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.317;DP=113;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=2.7570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.422;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1098,0,1363 chrIV 1075592 . T A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.129;DP=110;Dels=0.00;FS=7.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.172;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.981;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1149,0,1286 chrIV 1075596 . A G 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.292;DP=119;Dels=0.00;FS=7.011;HaplotypeScore=2.8043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.778;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.422;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1177,0,1386 chrIV 1075670 . C G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.109;DP=116;Dels=0.00;FS=1.542;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.089;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:991,0,1428 chrIV 1075724 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.994;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1113,0,1317 chrIV 1075812 . G A 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.354;DP=130;Dels=0.00;FS=4.245;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.479;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1650,0,1119 chrIV 1075857 . T C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.280;DP=114;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.993;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1073,0,1415 chrIV 1075948 . G T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.643;DP=124;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.085;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1309,0,1417 chrIV 1076035 . A G 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.203;DP=116;Dels=0.00;FS=1.570;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.499;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:844,0,1590 chrIV 1076140 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.776;DP=124;Dels=0.00;FS=2.728;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.227;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:124:99:1176,0,1507 chrIV 1076725 . A T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.248;DP=134;Dels=0.00;FS=6.501;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1456,0,1434 chrIV 1076910 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.078;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.207;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:115:99:1239,0,1310 chrIV 1077082 . A G 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.243;DP=143;Dels=0.00;FS=2.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.365;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1440,0,1734 chrIV 1077155 . G T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;DP=144;Dels=0.00;FS=6.273;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=1;MQRankSum=-0.039;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1386,0,1763 chrIV 1077589 . A T 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;DP=170;Dels=0.00;FS=10.410;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.086;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,82:170:99:1767,0,1947 chrIV 1078302 . C T 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.353;DP=152;Dels=0.00;FS=29.954;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1734,0,1573 chrIV 1078809 . G A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.101;DP=129;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.282;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1606,0,1166 chrIV 1079189 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.349;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:108:99:1458,0,940 chrIV 1079222 . G A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.456;DP=122;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.498;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1487,0,1207 chrIV 1079273 . C T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.751;DP=128;Dels=0.00;FS=7.893;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1425,0,1391 chrIV 1079646 . T C 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.318;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.342;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1391,0,1307 chrIV 1079855 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.598;DP=157;Dels=0.00;FS=2.058;HaplotypeScore=6.8775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.191;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:157:99:1407,0,1979 chrIV 1080184 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.287;DP=143;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=4.4740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:143:99:1371,0,1641 chrIV 1080523 . C T 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3283,319,0 chrIV 1081029 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.315;DP=120;Dels=0.00;FS=4.495;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.24;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.911;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:962,0,1250 chrIV 1081972 . C T 1684.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.499;DP=165;Dels=0.00;FS=0.573;HaplotypeScore=3.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.918;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1714,0,1894 chrIV 1081973 . C T 1688.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.709;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.326;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1718,0,1773 chrIV 1081977 . G A 1598.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.187;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.138;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1628,0,1815 chrIV 1082031 . G A 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.769;DP=164;Dels=0.00;FS=7.975;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.937;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,72:164:99:1585,0,1909 chrIV 1082390 . G T 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.581;DP=146;Dels=0.00;FS=2.145;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=11.25;ReadPosRankSum=2.101;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1673,0,1382 chrIV 1082404 . A G 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.678;DP=141;Dels=0.00;FS=6.304;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1748,0,1317 chrIV 1084457 . A G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.520;DP=153;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1396,0,1926 chrIV 1085928 . C G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.758;DP=138;Dels=0.00;FS=4.053;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.128;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1373,0,1684 chrIV 1086372 . T C 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.026;DP=116;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=5.9509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:885,0,1496 chrIV 1087865 . G A 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.036;DP=160;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=30.7862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=3;MQRankSum=1.573;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:160:99:1543,0,1479 chrIV 1087952 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.092;DP=133;Dels=0.00;FS=2.217;HaplotypeScore=4.4404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQ0=1;MQRankSum=-4.392;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.478;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1373,0,1388 chrIV 1087970 . A G 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;DP=146;Dels=0.00;FS=2.903;HaplotypeScore=2.6927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.161;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1584,0,1544 chrIV 1088026 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.032;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.860;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.720;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1375,0,1180 chrIV 1088057 . A G 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.309;DP=127;Dels=0.00;FS=3.189;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=12.20;ReadPosRankSum=-1.681;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1580,0,1214 chrIV 1088864 . A G 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.632;DP=161;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.296;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1539,0,1879 chrIV 1088898 . G A 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.943;DP=159;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.133;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,87:159:99:1851,0,1482 chrIV 1088912 . G A 1836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.522;DP=160;Dels=0.00;FS=2.943;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.050;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,86:160:99:1866,0,1506 chrIV 1088958 . T C 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.215;DP=186;Dels=0.00;FS=1.141;HaplotypeScore=4.7599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.631;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,88:186:99:1593,0,2211 chrIV 1088972 . G A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.283;DP=158;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.340;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:158:99:1616,0,1756 chrIV 1089304 . C T 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.663;DP=95;Dels=0.00;FS=2.814;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.403;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,36:95:99:775,0,1314 chrIV 1089625 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.776;DP=128;Dels=0.00;FS=6.920;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:128:99:1204,0,1539 chrIV 1089672 . G A 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.935;DP=127;Dels=0.00;FS=5.460;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1622,0,1083 chrIV 1090085 . T C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.816;DP=103;Dels=0.00;FS=5.036;HaplotypeScore=3.7426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.700;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.854;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:956,0,1136 chrIV 1090107 . C G 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;DP=102;Dels=0.01;FS=10.293;HaplotypeScore=156.8776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.877;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.259;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:101:99:859,0,844 chrIV 1090145 . A G 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.009;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.1125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=5.50;ReadPosRankSum=2.430;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:729,0,877 chrIV 1090269 . C T 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.681;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.952;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,55:150:99:1040,0,2154 chrIV 1090281 . G A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=154;Dels=0.00;FS=7.303;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,63:154:99:1267,0,1856 chrIV 1090306 . A G 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.609;DP=136;Dels=0.00;FS=4.213;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:958,0,1803 chrIV 1090321 . G T 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;DP=137;Dels=0.00;FS=5.384;HaplotypeScore=4.9255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.662;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1054,0,1736 chrIV 1090559 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.825;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.086;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:1088,0,1758 chrIV 1090578 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.072;DP=164;Dels=0.00;FS=2.818;HaplotypeScore=12.2036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,68:164:99:1085,0,2157 chrIV 1091087 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.928;DP=148;Dels=0.00;FS=2.108;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.735;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1421,0,1742 chrIV 1091102 . A G 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.640;DP=158;Dels=0.00;FS=8.292;HaplotypeScore=7.4157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:158:99:1665,0,1709 chrIV 1091480 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.707;DP=157;Dels=0.00;FS=5.820;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.259;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1549,0,1780 chrIV 1091512 . C T 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.572;DP=146;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.953;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1657,0,1584 chrIV 1091514 . C T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.712;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.010;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1599,0,1536 chrIV 1091591 . A G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.959;DP=109;Dels=0.00;FS=10.735;HaplotypeScore=3.9173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1048,0,1203 chrIV 1092275 . C A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.820;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.259;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.449;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1123,0,1161 chrIV 1092317 . G T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1123,0,1071 chrIV 1092548 . C T 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.328;DP=93;Dels=0.00;FS=5.197;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.735;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:1144,0,969 chrIV 1093040 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.795;DP=144;Dels=0.00;FS=13.826;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.727;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.022;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1498,0,1661 chrIV 1093101 . G T 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.058;DP=147;Dels=0.00;FS=12.800;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.042;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.797;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1710,0,1445 chrIV 1093107 . T C 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.278;DP=153;Dels=0.00;FS=14.076;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.630;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1554,0,1683 chrIV 1093319 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.804;DP=104;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.637;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1112,0,1225 chrIV 1093491 . T C 1966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.086;DP=151;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=3.3937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.739;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,91:151:99:1996,0,1210 chrIV 1093601 . A G 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.225;DP=100;Dels=0.00;FS=5.410;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.892;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:919,0,1262 chrIV 1093742 . G T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.139;DP=109;Dels=0.00;FS=1.581;HaplotypeScore=2.8415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=11.74;ReadPosRankSum=-2.437;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:109:99:1310,0,1042 chrIV 1093818 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.277;DP=106;Dels=0.00;FS=6.184;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.413;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1229,0,935 chrIV 1093879 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.261;DP=113;Dels=0.00;FS=3.470;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.675;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:113:99:1081,0,1201 chrIV 1093912 . A G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.488;DP=111;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1251,0,1142 chrIV 1094122 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.690;DP=127;Dels=0.00;FS=1.463;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.793;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1357,0,1381 chrIV 1094292 . A G 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.935;DP=107;Dels=0.00;FS=3.844;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:806,0,1601 chrIV 1095022 . A G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.732;DP=109;Dels=0.00;FS=12.634;HaplotypeScore=4.5245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=10.76;ReadPosRankSum=2.078;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1203,0,1201 chrIV 1095230 . T G 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2996,315,0 chrIV 1095542 . T G 2331 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.62;MQ0=0;QD=25.34;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2364,246,0 chrIV 1101687 . T A 35.04 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.76;MQ0=1;MQRankSum=1.537;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.988;SB=-2.904e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:18:65,0,18 chrIV 1102257 . T C 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9520;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3185,330,0 chrIV 1102674 . G A 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3327,334,0 chrIV 1102795 . T G 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.649;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.125;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3223,324,0 chrIV 1102958 . T C 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.016;DP=95;Dels=0.00;FS=8.736;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.597;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:806,0,1257 chrIV 1103168 . A T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.608;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1211,0,1024 chrIV 1103400 . G A 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.034;DP=95;Dels=0.00;FS=5.105;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.071;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:929,0,1078 chrIV 1103455 . G A 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.726;DP=104;Dels=0.00;FS=3.554;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1120,0,1152 chrIV 1103480 . C T 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2566,252,0 chrIV 1103488 . T A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.709;DP=94;Dels=0.00;FS=6.733;HaplotypeScore=2.5608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.166;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:94:99:1086,0,992 chrIV 1103531 . A G 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3441,351,0 chrIV 1104014 . G A 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3952,379,0 chrIV 1104203 . T C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.609;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:120:99:1030,0,1267 chrIV 1104401 . G A 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=28.20;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3497,337,0 chrIV 1104470 . C T 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3136,298,0 chrIV 1104782 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.836;DP=100;Dels=0.00;FS=11.595;HaplotypeScore=8.5247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=10.72;ReadPosRankSum=-2.658;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1102,0,1108 chrIV 1104914 . A G 2468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2501,261,0 chrIV 1104929 . C T 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3162,304,0 chrIV 1104966 . T G 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.30;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3094,321,0 chrIV 1105164 . C T 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.444;DP=117;Dels=0.00;FS=3.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=8.16;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:985,0,1434 chrIV 1105249 . A T 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6770;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3195,328,0 chrIV 1105360 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.794;DP=102;Dels=0.00;FS=6.919;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.163;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1319,0,954 chrIV 1105780 . G A 4117.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.45;SB=-2.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4117,403,0 chrIV 1106241 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3268,333,0 chrIV 1106617 . C G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3126,318,0 chrIV 1107083 . C T 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3663,349,0 chrIV 1107118 . G A 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3412,337,0 chrIV 1107137 . T C 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2802,291,0 chrIV 1107272 . T C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.885;DP=127;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=6.7120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1242,0,1446 chrIV 1107444 . C T 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3608,364,0 chrIV 1107805 . G A 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.349;DP=160;Dels=0.00;FS=1.943;HaplotypeScore=6.3023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.623;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1697,0,1714 chrIV 1107815 . T G 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.011;DP=158;Dels=0.00;FS=1.248;HaplotypeScore=6.3019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.623;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1651,0,1813 chrIV 1108111 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.180;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.841;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1096,0,1546 chrIV 1108114 . T C 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2995,306,0 chrIV 1108484 . A G 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.16;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3611,375,0 chrIV 1108662 . G A 2124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=20.04;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2157,213,0 chrIV 1108673 . C G 2263 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.09;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2296,237,0 chrIV 1108696 . C G 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3204,324,0 chrIV 1109217 . C T 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.801;DP=130;Dels=0.00;FS=5.511;HaplotypeScore=6.2742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.572;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1227,0,1539 chrIV 1109334 . C T 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.874;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1336,0,1471 chrIV 1109358 . T C 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3092,318,0 chrIV 1109568 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=1;QD=24.13;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3265,351,0 chrIV 1109736 . A C 2450 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2483,246,0 chrIV 1109781 . A G 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.217;DP=110;Dels=0.00;FS=4.731;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=2.134;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1141,0,1192 chrIV 1109890 . T G 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.615;DP=115;Dels=0.00;FS=2.630;HaplotypeScore=3.5078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.917;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,112:115:99:2782,253,0 chrIV 1110097 . A T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.200;DP=87;Dels=0.00;FS=1.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.751;QD=15.00;ReadPosRankSum=-2.490;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,58:87:99:1335,0,571 chrIV 1110323 . T C 635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.702;DP=60;Dels=0.00;FS=1.007;HaplotypeScore=3.7686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:60:99:665,0,567 chrIV 1110376 . A C 675.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.153;DP=64;Dels=0.00;FS=3.328;HaplotypeScore=28.0287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.17;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,33:64:25:708,25,0 chrIV 1110379 . A T 668.79 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=28.0287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-3.408e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:4:698,0,4 chrIV 1110572 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.511;DP=115;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=1.221;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.875;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1109,0,1415 chrIV 1110624 . C T 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.206;DP=92;Dels=0.00;FS=11.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.073;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.870;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,46:92:99:1048,0,1042 chrIV 1110668 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.105;DP=105;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=10.65;ReadPosRankSum=-2.202;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1148,0,1133 chrIV 1111002 . G A 3971.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3971,403,0 chrIV 1111210 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.708;DP=123;Dels=0.00;FS=1.431;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1162,0,1402 chrIV 1111246 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.956;DP=114;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=2.5049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1204,0,1235 chrIV 1111414 . T A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;DP=135;Dels=0.00;FS=5.174;HaplotypeScore=2.6587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.531;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1358,0,1671 chrIV 1111479 . C A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.808;DP=120;Dels=0.00;FS=2.339;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.976;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1311,0,1294 chrIV 1111575 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.417;DP=120;Dels=0.00;FS=11.508;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.119;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1179,0,1440 chrIV 1111626 . A C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.515;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1175,0,1575 chrIV 1111638 . C T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.942;DP=128;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1281,0,1426 chrIV 1111780 . G A 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.787;DP=168;Dels=0.00;FS=3.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,83:168:99:1700,0,1847 chrIV 1112115 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.475;DP=132;Dels=0.00;FS=11.132;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.323;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1318,0,1440 chrIV 1112180 . C A 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.655;DP=134;Dels=0.00;FS=12.883;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=11.70;ReadPosRankSum=2.131;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1598,0,1357 chrIV 1112508 . G A 1768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.564;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=13.71;ReadPosRankSum=-2.192;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:1798,0,1028 chrIV 1112991 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.863;DP=130;Dels=0.00;FS=10.075;HaplotypeScore=2.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.658;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1378,0,1320 chrIV 1113023 . T A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;DP=105;Dels=0.00;FS=6.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=10.92;ReadPosRankSum=-2.634;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1177,0,1107 chrIV 1113060 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.753;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=9.53;ReadPosRankSum=2.438;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1212,0,1427 chrIV 1113068 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.582;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1362,0,1259 chrIV 1113112 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.732;DP=128;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=4.8051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1507,0,1162 chrIV 1113224 . C T 2247 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2280,222,0 chrIV 1113239 . A C 456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.996;DP=83;Dels=0.00;FS=6.097;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.120;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,28:83:99:486,0,1277 chrIV 1113545 . C A 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.275;DP=115;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.682;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,44:115:99:877,0,1581 chrIV 1113548 . T C 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3006,288,0 chrIV 1113753 . A G 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3497,360,0 chrIV 1113766 . T C 3873.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3873,393,0 chrIV 1113867 . C T 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2920,283,0 chrIV 1114059 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.251;DP=110;Dels=0.00;FS=9.420;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1384,0,1014 chrIV 1116982 . A T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;DP=144;Dels=0.01;FS=2.182;HaplotypeScore=11.7519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:143:99:1402,0,1692 chrIV 1117736 . T A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.767;DP=130;Dels=0.00;FS=2.272;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.586;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1579,0,1340 chrIV 1118027 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.741;DP=133;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1257,0,1557 chrIV 1119109 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.119;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:132:99:1380,0,1499 chrIV 1119147 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.266;DP=139;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=9.9184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:139:99:1358,0,1581 chrIV 1120112 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.073;DP=126;Dels=0.00;FS=2.278;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.387;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1451,0,1153 chrIV 1120245 . G A 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.542;DP=94;Dels=0.00;FS=1.690;HaplotypeScore=2.9419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.740;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1283,0,839 chrIV 1123442 . G C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3279,336,0 chrIV 1123519 . G C 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;DP=123;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.706;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1483,0,1091 chrIV 1123610 . T G 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.588;DP=91;Dels=0.00;FS=10.405;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:896,0,1056 chrIV 1124047 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.067;DP=121;Dels=0.00;FS=2.377;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.489;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1142,0,1430 chrIV 1124465 . G A 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3822,373,0 chrIV 1125071 . A G 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.633;DP=155;Dels=0.00;FS=4.728;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.116;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1674,0,1706 chrIV 1125098 . A T 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.873;DP=138;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.720;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1557,0,1585 chrIV 1125103 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.014;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1451,0,1478 chrIV 1125139 . T C 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.357;DP=112;Dels=0.00;FS=3.492;HaplotypeScore=2.6989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.957;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1019,0,1418 chrIV 1125356 . C A 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.875;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=1;MQRankSum=1.740;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.503;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:1585,0,1796 chrIV 1126889 . T C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.644;DP=127;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.798;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1058,0,1720 chrIV 1126921 . A G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.470;DP=118;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=2.9625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1373,0,1221 chrIV 1127082 . A G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.199;DP=150;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=2.8135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=1;MQRankSum=1.679;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1428,0,1758 chrIV 1127449 . C T 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;DP=177;Dels=0.00;FS=1.922;HaplotypeScore=7.9873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.197;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,79:177:99:1574,0,2150 chrIV 1127544 . C G 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.420;DP=133;Dels=0.00;FS=4.904;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=26.19;ReadPosRankSum=1.315;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3483,360,0 chrIV 1127826 . C A 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.656;DP=143;Dels=0.00;FS=3.916;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.990;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1724,0,1374 chrIV 1127922 . C T 1892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.631;DP=128;Dels=0.00;FS=15.834;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=14.78;ReadPosRankSum=-2.481;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,81:128:99:1922,0,828 chrIV 1127928 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;DP=138;Dels=0.00;FS=18.443;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.605;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,55:138:99:1044,0,1852 chrIV 1128060 . G A 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.242;DP=163;Dels=0.00;FS=1.974;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.345;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.521;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,77:163:99:1637,0,1821 chrIV 1128108 . G A 4304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4304,430,0 chrIV 1128135 . G A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.951;DP=123;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.158;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.225;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1205,0,1430 chrIV 1128562 . G T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.905;DP=135;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1185,0,1653 chrIV 1128837 . A G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:127:99:3181,330,0 chrIV 1129980 . A G 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.538;DP=165;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.664;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,82:165:99:1716,0,1847 chrIV 1130061 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.984;DP=137;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=10.61;ReadPosRankSum=2.173;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:137:99:1484,0,1409 chrIV 1130324 . G A 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.592;DP=126;Dels=0.00;FS=5.456;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.097;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1629,0,1105 chrIV 1130680 . G A 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3337,322,0 chrIV 1131916 . G A 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.512;DP=160;Dels=0.00;FS=8.567;HaplotypeScore=4.8203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=10.47;ReadPosRankSum=2.391;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:160:99:1705,0,1728 chrIV 1132333 . A G 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.147;DP=111;Dels=0.00;FS=4.631;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1097,0,1330 chrIV 1132357 . A G 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.887;DP=137;Dels=0.00;FS=6.499;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1356,0,1553 chrIV 1132452 . T C 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.400;DP=125;Dels=0.00;FS=8.261;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:125:99:992,0,1724 chrIV 1132734 . A G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.821;DP=109;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1148,0,1269 chrIV 1132828 . C A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.348;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1441,0,1288 chrIV 1132875 . A G 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.068;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1223,0,1685 chrIV 1132989 . C T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=12.62;ReadPosRankSum=-1.989;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1014,0,766 chrIV 1133095 . T C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.651;DP=135;Dels=0.00;FS=2.531;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1266,0,1640 chrIV 1133213 . C T 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.459;DP=154;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.749;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1692,0,1524 chrIV 1133503 . A T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:1152,0,1850 chrIV 1133593 . A T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;DP=151;Dels=0.00;FS=3.809;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.564;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1498,0,1767 chrIV 1133634 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.011;DP=132;Dels=0.00;FS=2.287;HaplotypeScore=8.3287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:132:99:1444,0,1298 chrIV 1133710 . A T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;DP=133;Dels=0.00;FS=4.115;HaplotypeScore=2.6386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1364,0,1527 chrIV 1133759 . G A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.542;DP=130;Dels=0.00;FS=4.232;HaplotypeScore=1.9203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.935;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1382,0,1469 chrIV 1133767 . A G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.486;DP=140;Dels=0.00;FS=4.023;HaplotypeScore=2.8672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.626;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:140:99:1364,0,1578 chrIV 1133923 . G C 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.007;DP=149;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=2.9008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:149:99:1478,0,1550 chrIV 1135584 . C T 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=28.29;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3847,376,0 chrIV 1136363 . A G 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.232;DP=157;Dels=0.00;FS=5.801;HaplotypeScore=5.7517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.445;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1751,0,1681 chrIV 1136387 . A G 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.300;DP=155;Dels=0.00;FS=6.973;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=2.508;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.256;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1739,0,1571 chrIV 1136466 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.987;DP=129;Dels=0.00;FS=4.611;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1233,0,1470 chrIV 1136470 . T A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.914;DP=130;Dels=0.00;FS=5.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.730;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.005;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1258,0,1557 chrIV 1136725 . G A 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.503;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:944,0,1133 chrIV 1137089 . A G 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.237;DP=115;Dels=0.00;FS=4.932;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1056,0,1434 chrIV 1137173 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.514;DP=118;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.040;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1199,0,1318 chrIV 1137447 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.756;DP=132;Dels=0.00;FS=3.126;HaplotypeScore=5.6999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=10.22;ReadPosRankSum=-3.017;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1379,0,1432 chrIV 1137538 . G A 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.588;DP=120;Dels=0.00;FS=3.549;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=25.56;ReadPosRankSum=1.472;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3100,301,0 chrIV 1137761 . G A 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2883,283,0 chrIV 1138271 . C T 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.125;DP=146;Dels=0.00;FS=10.185;HaplotypeScore=6.7878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.384;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1613,0,1442 chrIV 1138398 . C T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.221;DP=131;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.086;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1152,0,1678 chrIV 1138406 . A G 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.506;DP=120;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=5.8756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.443;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:895,0,1636 chrIV 1138886 . T C 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.074;DP=130;Dels=0.00;FS=2.327;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=12.86;ReadPosRankSum=-2.185;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,83:130:99:1702,0,929 chrIV 1138945 . T C 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;DP=145;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.248;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1696,0,1474 chrIV 1138987 . A C 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:144:99:3654,393,0 chrIV 1139004 . C G 4043.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4043,423,0 chrIV 1139381 . T A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;DP=132;Dels=0.00;FS=6.973;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.610;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.744;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1428,0,1419 chrIV 1139520 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.375;DP=147;Dels=0.00;FS=3.940;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.317;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1616,0,1433 chrIV 1139550 . G A 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.392;DP=132;Dels=0.00;FS=3.191;HaplotypeScore=2.8569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.881;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1527,0,1258 chrIV 1139792 . T C 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.560;DP=152;Dels=0.00;FS=4.016;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1668,0,1687 chrIV 1139987 . A G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.590;DP=123;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.859;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1331,0,1320 chrIV 1140038 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.797;DP=114;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.242;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.346;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1260,0,1261 chrIV 1140095 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.838;DP=121;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.828;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1357,0,1264 chrIV 1140165 . T C 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3450,343,0 chrIV 1140266 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.736;DP=97;Dels=0.00;FS=2.815;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1217,0,1033 chrIV 1141061 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.489;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.432;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1233,0,839 chrIV 1141130 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.072;DP=103;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1035,0,1016 chrIV 1141245 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.726;DP=112;Dels=0.00;FS=4.660;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1312,0,1045 chrIV 1141283 . G C 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;DP=141;Dels=0.00;FS=5.475;HaplotypeScore=3.8200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.932;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1493,0,1338 chrIV 1141284 . C T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.357;DP=140;Dels=0.00;FS=5.538;HaplotypeScore=4.5540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=10.95;ReadPosRankSum=2.202;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1563,0,1339 chrIV 1141710 . A G 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.957;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:86:99:782,0,1106 chrIV 1141725 . T C 711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.557;DP=98;Dels=0.00;FS=4.148;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.066;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,40:98:99:741,0,1418 chrIV 1142034 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.039;DP=128;Dels=0.00;FS=2.225;HaplotypeScore=4.9703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.744;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1369,0,1479 chrIV 1142250 . A G 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.911;DP=160;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=3.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1632,0,1786 chrIV 1142868 . T C 572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.951;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=6.81;ReadPosRankSum=1.624;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,31:83:99:602,0,1241 chrIV 1143051 . C T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.124;DP=119;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=2.655;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.395;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1156,0,1483 chrIV 1143075 . A G 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.649;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.723;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1470,0,1396 chrIV 1143493 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.790;DP=120;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=4.9645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.248;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:120:99:1407,0,1200 chrIV 1143838 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.569;DP=151;Dels=0.00;FS=2.029;HaplotypeScore=4.1017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=9.63;ReadPosRankSum=2.655;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1484,0,1649 chrIV 1143894 . A C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.844;DP=129;Dels=0.00;FS=3.196;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,53:129:99:998,0,1756 chrIV 1144305 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.638;DP=113;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.938;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1337,0,1113 chrIV 1144484 . C T 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=1;QD=26.67;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3574,349,0 chrIV 1145144 . A G 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.571;DP=97;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1041,0,1043 chrIV 1145465 . G A 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.774;DP=119;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.867;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.673;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1454,0,1154 chrIV 1145628 . C T 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.679;DP=141;Dels=0.00;FS=4.107;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1259,0,1791 chrIV 1146161 . G T 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.756;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1206,0,806 chrIV 1146376 . T C 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.054;DP=117;Dels=0.00;FS=4.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.811;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1251,0,1229 chrIV 1146414 . C T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.956;DP=107;Dels=0.00;FS=5.259;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,69:107:99:1515,0,762 chrIV 1146468 . T C 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;DP=90;Dels=0.00;FS=9.816;HaplotypeScore=75.6906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.760;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,55:90:99:930,0,383 chrIV 1146477 . A G 709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.185;DP=86;Dels=0.00;FS=33.740;HaplotypeScore=59.2346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=8.24;ReadPosRankSum=3.443;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:739,0,276 chrIV 1146894 . T C 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.324;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.840;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:992,0,1323 chrIV 1147285 . A T 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:929,0,1035 chrIV 1147320 . G A 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.327;DP=110;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=1.9861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=9.21;ReadPosRankSum=2.080;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1043,0,1052 chrIV 1147469 . C T 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.056;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1623,0,1279 chrIV 1147489 . T A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.282;DP=125;Dels=0.00;FS=6.734;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.178;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1422,0,1296 chrIV 1147847 . C A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.030;DP=98;Dels=0.00;FS=2.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,62:98:99:1476,0,647 chrIV 1147951 . T C 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.651;DP=145;Dels=0.00;FS=5.901;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1442,0,1680 chrIV 1148075 . C T 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.179;DP=108;Dels=0.00;FS=2.535;HaplotypeScore=3.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.040;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:977,0,1191 chrIV 1148777 . T A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;DP=110;Dels=0.00;FS=6.157;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.502;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1387,0,1022 chrIV 1149047 . A C 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.243;DP=112;Dels=0.00;FS=3.687;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.021;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1410,0,990 chrIV 1149318 . C T 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.995;DP=117;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:1083,0,1455 chrIV 1149565 . G A 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=146;Dels=0.00;FS=3.582;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.783;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3958,391,0 chrIV 1149762 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.633;DP=116;Dels=0.00;FS=2.394;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.083;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1337,0,1103 chrIV 1149773 . C G 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2826,288,0 chrIV 1150691 . A G 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2762;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2981,306,0 chrIV 1150695 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.343;DP=119;Dels=0.00;FS=8.423;HaplotypeScore=4.2340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.391;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1402,0,1191 chrIV 1150962 . G T 2071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=26.90;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2104,207,0 chrIV 1150994 . G A 2137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2170,219,0 chrIV 1151028 . A G 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3420,351,0 chrIV 1151234 . G A 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.999;DP=71;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=-4.727;QD=0.55;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,9:71:69:69,0,1471 chrIV 1151236 . A G 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.932;DP=71;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=-4.727;QD=0.35;ReadPosRankSum=-1.875;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,9:71:55:55,0,1532 chrIV 1151301 . T C 349.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.704;DP=106;Dels=0.00;FS=33.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.67;MQ0=0;MQRankSum=-7.349;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:379,0,1919 chrIV 1151324 . G A 934.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.578;DP=125;Dels=0.00;FS=31.848;HaplotypeScore=4.4911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.65;MQ0=0;MQRankSum=-9.000;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.148;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,51:125:99:964,0,1577 chrIV 1151451 . T A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.399;DP=113;Dels=0.00;FS=2.442;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.728;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.896;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1015,0,1439 chrIV 1152100 . T G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.878;DP=120;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1231,0,1327 chrIV 1152431 . T A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;DP=102;Dels=0.00;FS=2.600;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.325;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1192,0,1181 chrIV 1152671 . T C 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.209;DP=164;Dels=0.00;FS=0.576;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,78:164:99:1510,0,2021 chrIV 1153559 . T C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.709;DP=110;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=2.4671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.968;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1343,0,1084 chrIV 1154048 . T C 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.013;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,69:112:99:1425,0,968 chrIV 1154148 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=10.51;ReadPosRankSum=-2.246;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1281,0,1338 chrIV 1154600 . T A 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.18;MQ0=92;MQRankSum=-1.721;QD=0.12;ReadPosRankSum=0.815;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,25:110:43:43,0,239 chrIV 1154603 . A G 33.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.01;MQ0=91;MQRankSum=-1.386;QD=0.29;ReadPosRankSum=0.604;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,29:112:63:63,0,262 chrIV 1154783 . C A 21.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.77;MQ0=107;MQRankSum=-0.720;QD=0.19;ReadPosRankSum=0.720;SB=-3.368e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,45:113:19:51,0,19 chrIV 1157271 . A G 2105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.67;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2138,207,0 chrIV 1159971 . G A 271 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.58;MQ0=71;QD=3.27;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:36,47:83:30:304,30,0 chrIV 1159979 . G C 228.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.14;MQ0=72;QD=2.75;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:37,46:83:27:261,27,0 chrIV 1160110 . T A 54.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.00;MQ0=102;QD=0.52;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:62,43:105:9:87,9,0 chrIV 1161053 . T C 174.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.241;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.69;MQ0=86;MQRankSum=-0.059;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.648;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,29:101:99:204,0,134 chrIV 1161132 . G A 311.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.30;MQ0=50;MQRankSum=-0.498;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.581;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,33:80:99:341,0,335 chrIV 1161206 . T G 525.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.559;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.46;MQ0=40;MQRankSum=-2.801;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.502;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:555,0,328 chrIV 1161213 . T A 418.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.59;MQ0=36;MQRankSum=-2.942;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.981;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:448,0,294 chrIV 1161214 . C T 419.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.68;MQ0=36;MQRankSum=-2.235;QD=5.51;ReadPosRankSum=1.006;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,26:76:99:449,0,321 chrIV 1161225 . G A 342.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.76;MQ0=33;MQRankSum=-1.976;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.517;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:372,0,229 chrIV 1161228 . T A 300.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.41;MQ0=32;MQRankSum=-1.779;QD=5.26;ReadPosRankSum=1.670;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:330,0,247 chrIV 1161230 . A T 301.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.21;MQ0=31;MQRankSum=-2.313;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.142;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:331,0,218 chrIV 1161242 . A G 366.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.561;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.07;MQ0=26;MQRankSum=-3.445;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.755;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:396,0,290 chrIV 1161243 . A C 356.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.261;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.07;MQ0=26;MQRankSum=-3.003;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.903;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:386,0,288 chrIV 1161246 . C T 390.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.776;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.68;MQ0=23;MQRankSum=-3.813;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.050;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:420,0,276 chrIV 1161249 . G A 386.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.972;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.99;MQ0=22;MQRankSum=-3.832;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.347;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:416,0,295 chrIV 1161251 . G T 388.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.007;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.21;MQ0=21;MQRankSum=-3.657;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.997;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:418,0,275 chrIV 1161252 . G A 371.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.21;MQ0=21;MQRankSum=-1.977;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.137;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:401,0,300 chrIV 1161258 . T C 356.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.942;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.49;MQ0=21;MQRankSum=-2.332;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,34:71:99:386,0,340 chrIV 1161261 . G A 408.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.345;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.42;MQ0=21;MQRankSum=-2.816;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,35:72:99:438,0,303 chrIV 1161264 . A G 343.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.247;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.31;MQ0=23;MQRankSum=-3.745;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.312;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,35:76:99:373,0,395 chrIV 1161267 . A C 302.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.37;MQ0=24;MQRankSum=-2.762;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.807;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:77:99:332,0,473 chrIV 1161269 . C G 312.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.166;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.59;MQ0=24;MQRankSum=-3.960;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.967;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:79:99:342,0,499 chrIV 1161276 . A G 340.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.260;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.30;MQ0=27;MQRankSum=-2.467;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.721;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:370,0,511 chrIV 1161283 . A T 293.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.67;MQ0=23;MQRankSum=-3.748;QD=3.15;ReadPosRankSum=2.258;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:323,0,762 chrIV 1161289 . G T 329.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.397;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.68;MQ0=22;MQRankSum=-3.066;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.687;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:359,0,745 chrIV 1161302 . T C 309.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.582;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.53;MQ0=25;MQRankSum=-3.894;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.065;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:339,0,918 chrIV 1161321 . T C 184.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.50;MQ0=20;MQRankSum=-3.655;QD=2.09;ReadPosRankSum=-1.874;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:214,0,924 chrIV 1161322 . T C 173.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.831;DP=89;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.63;MQ0=20;MQRankSum=-3.183;QD=1.94;ReadPosRankSum=-1.715;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:203,0,924 chrIV 1161325 . T A 170.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.903;DP=89;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.63;MQ0=20;MQRankSum=-3.339;QD=1.91;ReadPosRankSum=-2.268;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:200,0,944 chrIV 1161326 . G A 191.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.300;DP=88;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.78;MQ0=19;MQRankSum=-4.037;QD=2.17;ReadPosRankSum=-2.364;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:221,0,875 chrIV 1161328 . T G 170.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.072;DP=88;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.78;MQ0=19;MQRankSum=-3.183;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.208;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:200,0,943 chrIV 1161337 . A G 119.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.406;DP=81;Dels=0.00;FS=3.026;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.76;MQ0=18;MQRankSum=-3.064;QD=1.47;ReadPosRankSum=-1.930;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:149,0,884 chrIV 1161338 . A G 88.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.618;DP=78;Dels=0.00;FS=3.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.99;MQ0=16;MQRankSum=-1.959;QD=1.13;ReadPosRankSum=-2.115;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:118,0,864 chrIV 1161346 . T C 140.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;DP=68;Dels=0.00;FS=2.781;HaplotypeScore=16.9341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.72;MQ0=16;MQRankSum=-2.660;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:170,0,811 chrIV 1161357 . G T 155.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.087;DP=73;Dels=0.00;FS=11.886;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.65;MQ0=16;MQRankSum=-1.834;QD=2.12;ReadPosRankSum=-1.963;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:185,0,714 chrIV 1161361 . A G 127.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;DP=75;Dels=0.00;FS=4.790;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.17;MQ0=15;MQRankSum=-1.992;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:157,0,815 chrIV 1161556 . G A 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3793,373,0 chrIV 1161568 . C T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.076;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.809;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1599,0,1367 chrIV 1162471 . T C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.149;DP=91;Dels=0.00;FS=1.706;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.198;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1020,0,900 chrIV 1162637 . T A 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.983;DP=156;Dels=0.00;FS=4.858;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=11.44;ReadPosRankSum=-2.185;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1815,0,1560 chrIV 1163316 . T C 104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.645;DP=163;Dels=0.00;FS=1.869;HaplotypeScore=2.9669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.076;QD=0.64;ReadPosRankSum=1.566;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,22:163:99:134,0,3471 chrIV 1163407 . T A 636.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;DP=106;Dels=0.00;FS=3.151;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-7.403;QD=6.00;ReadPosRankSum=-1.458;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,35:106:99:666,0,1649 chrIV 1163410 . A T 220.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.737;DP=90;Dels=0.00;FS=1.053;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.73;MQ0=0;MQRankSum=-6.943;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.742;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:250,0,1585 chrIV 1163411 . C G 184.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;DP=91;Dels=0.00;FS=1.036;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.83;MQ0=0;MQRankSum=-6.994;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.951;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:99:214,0,1574 chrIV 1163412 . C G 40.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.470;DP=91;Dels=0.00;FS=1.036;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.83;MQ0=0;MQRankSum=-6.985;QD=0.44;ReadPosRankSum=2.174;SB=-1.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:70:70,0,1573 chrIV 1163416 . A G 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.42;MQ0=0;MQRankSum=-6.236;QD=0.13;ReadPosRankSum=2.278;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,23:95:42:42,0,1658 chrIV 1163417 . C T 191.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.545;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.172;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.481;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:221,0,1662 chrIV 1163421 . C G 353.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;DP=103;Dels=0.00;FS=0.860;HaplotypeScore=6.6359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-7.686;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,33:103:99:383,0,1625 chrIV 1163557 . G A 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.681;DP=117;Dels=0.00;FS=9.481;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.768;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,41:117:99:820,0,1644 chrIV 1163614 . G C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;DP=119;Dels=0.00;FS=3.319;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1051,0,1326 chrIV 1163658 . T A 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;DP=105;Dels=0.00;FS=2.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:893,0,1440 chrIV 1163731 . C T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.035;DP=135;Dels=0.00;FS=6.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.878;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1590,0,1326 chrIV 1163878 . A T 1807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.135;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=1.807;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.524;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:1837,0,1561 chrIV 1163953 . T C 646.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.451;DP=204;Dels=0.00;FS=16.561;HaplotypeScore=3.1930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=1;MQRankSum=-7.825;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.120;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,47:204:99:676,0,3624 chrIV 1163959 . A G 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.753;DP=194;Dels=0.00;FS=18.737;HaplotypeScore=3.2666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.36;MQ0=1;MQRankSum=-6.791;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.690;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,45:194:99:712,0,3599 chrIV 1164160 . A G 692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.255;DP=137;Dels=0.00;FS=3.518;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.11;MQ0=1;MQRankSum=-6.594;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,48:137:99:722,0,2078 chrIV 1164217 . A G 427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;DP=109;Dels=0.00;FS=17.234;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=1;MQRankSum=-8.325;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.155;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,35:109:99:457,0,1753 chrIV 1164241 . T C 235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.389;DP=93;Dels=0.00;FS=8.774;HaplotypeScore=3.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.17;MQ0=0;MQRankSum=-6.951;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.557;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:265,0,1741 chrIV 1164439 . G A 338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.198;DP=96;Dels=0.00;FS=0.907;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.230;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.018;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:368,0,1567 chrIV 1164451 . G A 362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.816;DP=96;Dels=0.00;FS=0.908;HaplotypeScore=3.7634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.934;QD=3.77;ReadPosRankSum=2.771;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:392,0,1551 chrIV 1164852 . T A 2019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.676;DP=175;Dels=0.00;FS=2.914;HaplotypeScore=5.7983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,98:175:99:2049,0,1649 chrIV 1165262 . T A 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=29.38;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3614,361,0 chrIV 1165439 . A G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.322;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.212;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1261,0,1608 chrIV 1165501 . C A 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.785;DP=143;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.971;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1707,0,1465 chrIV 1166801 . T C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.857;DP=144;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=4.6358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1562,0,1519 chrIV 1166853 . C T 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;DP=145;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=3.4141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1720,0,1481 chrIV 1167232 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.723;DP=131;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=4.8666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=10.33;ReadPosRankSum=2.375;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1383,0,1490 chrIV 1167511 . A T 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;DP=144;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=37.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=2.773;QD=11.94;ReadPosRankSum=5.834;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1750,0,561 chrIV 1168316 . T C 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.711;DP=138;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1539,0,1387 chrIV 1170434 . G A 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.078;DP=131;Dels=0.00;FS=8.025;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=13.20;ReadPosRankSum=-2.130;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:131:99:1759,0,1095 chrIV 1170752 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.071;DP=102;Dels=0.00;FS=6.599;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.775;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:102:99:1307,0,838 chrIV 1171385 . C T 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.726;DP=116;Dels=0.00;FS=10.241;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1447,0,1055 chrIV 1171430 . G C 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2871,285,0 chrIV 1171863 . T A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;DP=125;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.831;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1344,0,1396 chrIV 1172380 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.898;DP=127;Dels=0.00;FS=11.154;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1346,0,1433 chrIV 1172576 . G C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;DP=126;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=2.650;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.120;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1193,0,1391 chrIV 1172908 . T C 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3246,322,0 chrIV 1172914 . G A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.557;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.215;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1189,0,1535 chrIV 1173007 . G A 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.276;DP=131;Dels=0.01;FS=3.472;HaplotypeScore=7.8372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.276;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:130:99:3439,340,0 chrIV 1173622 . G A 4290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=28.22;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4290,421,0 chrIV 1173661 . G C 2293 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=25.48;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2326,249,0 chrIV 1173670 . C T 2234 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.27;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2267,222,0 chrIV 1173678 . T C 2029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.99;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2062,210,0 chrIV 1173839 . G A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.590;DP=140;Dels=0.00;FS=11.504;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.687;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,58:140:99:1282,0,1863 chrIV 1173894 . C T 4110.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=28.54;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:4110,409,0 chrIV 1174054 . C A 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2958,295,0 chrIV 1174213 . T C 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=26.51;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3029,312,0 chrIV 1174270 . T C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.221;DP=110;Dels=0.00;FS=3.678;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.451;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1282,0,1097 chrIV 1174282 . G A 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2914,295,0 chrIV 1174395 . G A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;DP=135;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1512,0,1346 chrIV 1174496 . C G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.847;DP=105;Dels=0.00;FS=4.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQ0=0;MQRankSum=2.184;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.207;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,64:105:99:1424,0,794 chrIV 1174544 . C T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.521;DP=84;Dels=0.00;FS=1.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.411;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,48:84:99:1067,0,688 chrIV 1174551 . C T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.260;DP=100;Dels=0.00;FS=0.756;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1210,0,891 chrIV 1174575 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.689;DP=102;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.418;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1109,0,1048 chrIV 1174611 . A G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.872;DP=128;Dels=0.00;FS=1.532;HaplotypeScore=2.6511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.582;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1562,0,1202 chrIV 1174695 . C T 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.415;DP=109;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1017,0,1350 chrIV 1174702 . C T 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=28.25;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3141,313,0 chrIV 1174722 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.873;DP=114;Dels=0.00;FS=7.173;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.168;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1075,0,1518 chrIV 1174749 . T C 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.340;DP=116;Dels=0.00;FS=5.800;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.518;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1318,0,1196 chrIV 1175004 . G A 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.358;DP=96;Dels=0.00;FS=4.244;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.142;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:944,0,1088 chrIV 1175016 . C T 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;DP=90;Dels=0.00;FS=3.020;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.140;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:872,0,1045 chrIV 1175302 . C T 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3316,310,0 chrIV 1175327 . G A 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.327;DP=124;Dels=0.00;FS=8.773;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.204;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,78:124:99:1757,0,947 chrIV 1175430 . A G 1085.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.566;DP=136;Dels=0.00;FS=5.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.98;MQ0=21;MQRankSum=-3.313;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.368;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1115,0,1186 chrIV 1176138 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.406;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1035,0,1226 chrIV 1176513 . C T 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.763;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=2;MQRankSum=0.747;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.105;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1227,0,1226 chrIV 1176852 . T C 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.354;DP=111;Dels=0.00;FS=2.484;HaplotypeScore=6.7889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:843,0,1462 chrIV 1176969 . A G 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.534;DP=98;Dels=0.00;FS=1.655;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,39:98:99:755,0,1315 chrIV 1177256 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.932;DP=103;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1186,0,1060 chrIV 1177557 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.239;DP=118;Dels=0.00;FS=3.343;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1353,0,1151 chrIV 1177824 . A C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;DP=97;Dels=0.00;FS=2.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1034,0,1100 chrIV 1177862 . A T 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.400;DP=81;Dels=0.00;FS=5.752;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=10.27;ReadPosRankSum=2.198;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,39:81:99:862,0,944 chrIV 1178350 . C A 1953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=15.62;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:1986,210,0 chrIV 1178975 . C T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.968;DP=142;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1448,0,1474 chrIV 1179516 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.605;DP=116;Dels=0.00;FS=4.551;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.599;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1181,0,1300 chrIV 1180249 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.444;DP=111;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1163,0,1248 chrIV 1180472 . A G 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.589;DP=115;Dels=0.00;FS=7.492;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=0.379;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.708;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,42:115:99:807,0,1695 chrIV 1180484 . A T 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.636;DP=123;Dels=0.00;FS=10.049;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,47:123:99:892,0,1760 chrIV 1180885 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.471;DP=124;Dels=0.00;FS=10.418;HaplotypeScore=2.8239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1135,0,1466 chrIV 1181165 . T C 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.585;DP=123;Dels=0.00;FS=14.194;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.384;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,41:123:99:805,0,1931 chrIV 1181208 . T A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;DP=143;Dels=0.00;FS=8.996;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=10.60;ReadPosRankSum=-2.050;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1546,0,1634 chrIV 1181379 . T C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.459;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.882;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1165,0,1756 chrIV 1181427 . A T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;DP=124;Dels=0.00;FS=3.339;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1423,0,1369 chrIV 1181542 . G A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.325;DP=138;Dels=0.00;FS=1.366;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.292;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1389,0,1621 chrIV 1181621 . A G 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.360;DP=137;Dels=0.00;FS=9.713;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.241;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1572,0,1338 chrIV 1181697 . G T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.962;DP=126;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.630;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1310,0,1469 chrIV 1181805 . C G 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.053;DP=134;Dels=0.00;FS=3.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.236;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1411,0,1393 chrIV 1181944 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.589;DP=121;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1140,0,1440 chrIV 1182010 . T C 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.650;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3160;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=27.01;ReadPosRankSum=1.353;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3457,343,0 chrIV 1182098 . T C 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.644;DP=149;Dels=0.00;FS=1.309;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.616;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:149:99:1390,0,1802 chrIV 1183454 . C T 4196.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=2;QD=27.25;SB=-2.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4196,409,0 chrIV 1184604 . T A 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3230,318,0 chrIV 1184776 . C T 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=26.32;ReadPosRankSum=1.707;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3659,352,0 chrIV 1184872 . T C 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.247;DP=151;Dels=0.00;FS=9.804;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:151:99:1517,0,1798 chrIV 1185094 . T C 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.107;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.329;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1074,0,1623 chrIV 1185509 . G A 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.132;DP=128;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,78:128:99:1813,0,964 chrIV 1185640 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.354;DP=138;Dels=0.00;FS=11.999;HaplotypeScore=6.0380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1334,0,1518 chrIV 1186629 . T C 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;DP=115;Dels=0.00;FS=3.886;HaplotypeScore=6.5312;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=25.42;ReadPosRankSum=1.491;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2956,303,0 chrIV 1187297 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.241;DP=106;Dels=0.00;FS=7.652;HaplotypeScore=3.9160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1137,0,1203 chrIV 1187416 . T C 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;DP=111;Dels=0.00;FS=3.464;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.952;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2783,294,0 chrIV 1187870 . A G 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.601;DP=116;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=7.08;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,45:116:99:851,0,1585 chrIV 1188416 . T C 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.910;DP=133;Dels=0.00;FS=14.271;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.493;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1311,0,1567 chrIV 1188878 . C T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.377;DP=120;Dels=0.00;FS=22.877;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1294,0,1266 chrIV 1189030 . A T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.548;DP=119;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=3.7274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1399,0,1178 chrIV 1189130 . C T 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.609;DP=108;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,43:108:99:940,0,1544 chrIV 1189463 . C T 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3627,355,0 chrIV 1189499 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.693;DP=149;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=3.7577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1257,0,1832 chrIV 1189652 . T C 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3262,327,0 chrIV 1190196 . T C 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2600,267,0 chrIV 1190854 . G A 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2877,283,0 chrIV 1191194 . C T 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.598;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.341;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:1032,0,1037 chrIV 1191476 . A T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.747;DP=122;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.432;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1220,0,1489 chrIV 1191567 . C T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;DP=131;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1437,0,1410 chrIV 1191935 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.336;DP=126;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.545;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,47:126:99:1005,0,1347 chrIV 1193260 . G A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.625;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.327;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,67:159:99:1372,0,1987 chrIV 1193348 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.575;DP=102;Dels=0.00;FS=7.869;HaplotypeScore=2.6377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.127;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1076,0,1183 chrIV 1193452 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.614;DP=123;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1267,0,1425 chrIV 1194510 . T G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.690;DP=118;Dels=0.00;FS=3.379;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1215,0,1396 chrIV 1195901 . A G 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.776;DP=97;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:868,0,1123 chrIV 1196291 . A G 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.961;DP=99;Dels=0.00;FS=1.670;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=8.68;ReadPosRankSum=2.384;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:889,0,1308 chrIV 1196388 . T C 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.280;DP=143;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=3.8919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1435,0,1739 chrIV 1196619 . A G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.023;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.448;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1375,0,1305 chrIV 1197080 . A G 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3730,393,0 chrIV 1198189 . A T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;DP=125;Dels=0.00;FS=1.548;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1405,0,1405 chrIV 1198463 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.835;DP=141;Dels=0.00;FS=1.343;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1244,0,1652 chrIV 1198548 . G C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.662;DP=130;Dels=0.00;FS=4.218;HaplotypeScore=3.5562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.477;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1509,0,1134 chrIV 1198799 . A G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.305;DP=138;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=6.9441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=11.04;ReadPosRankSum=-2.186;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1553,0,1346 chrIV 1199588 . T C 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.448;DP=127;Dels=0.01;FS=1.545;HaplotypeScore=11.8277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.802;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,74:126:99:1614,0,1107 chrIV 1199943 . A G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.740;DP=121;Dels=0.00;FS=5.639;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.804;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:121:99:1241,0,1459 chrIV 1200168 . A G 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.157;DP=84;Dels=0.00;FS=2.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:861,0,914 chrIV 1201621 . C T 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.837;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3260,334,0 chrIV 1202719 . C T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.506;DP=99;Dels=0.00;FS=2.721;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1141,0,985 chrIV 1202749 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.485;DP=102;Dels=0.00;FS=2.590;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=1;MQRankSum=0.343;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.846;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1117,0,1097 chrIV 1202939 . T C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.419;DP=126;Dels=0.00;FS=11.159;HaplotypeScore=2.5642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.623;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1397,0,1120 chrIV 1203594 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.751;DP=130;Dels=0.00;FS=5.433;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=8.76;ReadPosRankSum=2.497;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1169,0,1632 chrIV 1203603 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.075;DP=117;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.795;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.254;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1151,0,1333 chrIV 1203676 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.850;DP=125;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.185;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1231,0,1418 chrIV 1203709 . G A 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.052;DP=127;Dels=0.00;FS=4.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.937;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1197,0,1527 chrIV 1203716 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.713;DP=126;Dels=0.00;FS=5.483;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1206,0,1481 chrIV 1206028 . G A 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.528;DP=120;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.460;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:994,0,1594 chrIV 1206705 . G A 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.77;MQ0=0;QD=1.51;SB=-9.051e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:43,6,0 chrIV 1214903 . T C 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.978;DP=105;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.698;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:861,0,1483 chrIV 1216318 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.340;DP=126;Dels=0.00;FS=7.367;HaplotypeScore=6.4120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.880;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1409,0,1137 chrIV 1217031 . T C 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3459,349,0 chrIV 1217821 . A T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;DP=125;Dels=0.00;FS=3.226;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1634,0,1187 chrIV 1218917 . C T 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.873;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.620;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1142,0,931 chrIV 1218963 . A G 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.577;DP=121;Dels=0.00;FS=4.671;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:1056,0,1637 chrIV 1219431 . C A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;DP=136;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1358,0,1635 chrIV 1219509 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.305;DP=132;Dels=0.00;FS=3.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.101;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1323,0,1607 chrIV 1219871 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.800;DP=142;Dels=0.00;FS=6.272;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,58:142:99:1188,0,1859 chrIV 1223971 . C A 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.099;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.148;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,43:80:99:1028,0,761 chrIV 1225730 . G A 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.090;DP=104;Dels=0.00;FS=4.015;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.273;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:1026,0,1171 chrIV 1225837 . T C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.411;DP=147;Dels=0.00;FS=6.382;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.836;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,59:147:99:1063,0,1994 chrIV 1226784 . C T 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.383;DP=101;Dels=0.00;FS=4.920;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=11.51;ReadPosRankSum=2.185;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1193,0,1029 chrIV 1229224 . C T 1466 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.188;DP=139;Dels=0.00;FS=3.100;HaplotypeScore=16.2599;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=1;MQRankSum=2.055;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.996;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,135:139:99:1499,138,0 chrIV 1229881 . C G 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;DP=136;Dels=0.00;FS=14.075;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,52:136:99:1018,0,1897 chrIV 1232362 . T C 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.575;DP=134;Dels=0.00;FS=6.441;HaplotypeScore=5.1596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.735;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1418,0,1462 chrIV 1235582 . G A 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.90;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2907,292,0 chrIV 1235594 . A G 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2838,297,0 chrIV 1236269 . C T 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.335;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.216;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,50:122:99:1013,0,1624 chrIV 1237546 . T A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;DP=114;Dels=0.00;FS=11.272;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.000;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1402,0,1109 chrIV 1238608 . C T 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3801,379,0 chrIV 1238647 . G A 4022.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.36;SB=-2.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4022,397,0 chrIV 1238648 . G A 4098.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.88;SB=-2.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4098,400,0 chrIV 1239039 . T C 1094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.884;DP=104;Dels=0.01;FS=8.712;HaplotypeScore=204.0917;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.20;MQ0=0;MQRankSum=-4.512;QD=10.52;ReadPosRankSum=-7.097;SB=-1.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:55,48:103:45:1127,45,0 chrIV 1239043 . T C 62.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;DP=98;Dels=0.01;FS=16.061;HaplotypeScore=157.7490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQ0=0;MQRankSum=1.792;QD=0.63;ReadPosRankSum=5.522;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,58:97:92:92,0,842 chrIV 1239087 . T C 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.08;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2666,264,0 chrIV 1239354 . C A 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.76;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3137,307,0 chrIV 1239990 . T A 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3440,343,0 chrIV 1240134 . A G 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2930,294,0 chrIV 1240175 . G A 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2983,289,0 chrIV 1240227 . T C 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2605,261,0 chrIV 1240251 . C T 2578 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=28.02;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2611,256,0 chrIV 1240320 . C T 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3558,349,0 chrIV 1240455 . T C 4154.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.987e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4154,409,0 chrIV 1240551 . T C 4049.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.29;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4049,414,0 chrIV 1240855 . A G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.380;DP=145;Dels=0.00;FS=3.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:145:99:1323,0,1959 chrIV 1240919 . C T 2382 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7249;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2415,243,0 chrIV 1241008 . C G 2153 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=20.90;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2186,234,0 chrIV 1241013 . C T 1211.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;DP=106;Dels=0.00;FS=14.411;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=11.42;ReadPosRankSum=-2.030;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,66:106:99:1241,0,622 chrIV 1241016 . C T 2496 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.99;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2529,255,0 chrIV 1241303 . T C 4406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=26.07;SB=-2.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4406,424,0 chrIV 1242241 . T A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;DP=143;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.421;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1175,0,1805 chrIV 1243174 . G T 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.99;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3352,325,0 chrIV 1244360 . T C 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.946;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.17;MQ0=163;MQRankSum=0.365;QD=0.22;ReadPosRankSum=0.365;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,36:199:73:73,0,340 chrIV 1244612 . A G 14.21 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=141;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=4.66;MQ0=132;MQRankSum=0.573;QD=0.10;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-2.076e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:18:44,0,18 chrIV 1245092 . C T 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.645;DP=138;Dels=0.00;FS=3.226;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.74;MQ0=106;MQRankSum=0.507;QD=0.12;ReadPosRankSum=-1.955;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,32:138:47:47,0,368 chrIV 1247494 . A C 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3450,351,0 chrIV 1253397 . T C 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.901e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3721,379,0 chrIV 1259876 . A G 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3082,312,0 chrIV 1259970 . G C 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3011,297,0 chrIV 1259982 . A G 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3136,324,0 chrIV 1261102 . A G 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9430;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.05;SB=-2.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4041,391,0 chrIV 1261386 . A G 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3208,327,0 chrIV 1263265 . T G 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.528;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3476,325,0 chrIV 1267740 . A G 4302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.56;SB=-2.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4302,436,0 chrIV 1271005 . C T 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.029;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1593;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=25.77;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3125,304,0 chrIV 1271701 . T A 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3471,352,0 chrIV 1271755 . G C 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3379,348,0 chrIV 1271758 . G A 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3489,346,0 chrIV 1271812 . C T 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=28.44;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3498,352,0 chrIV 1271941 . C T 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=28.73;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3821,373,0 chrIV 1271979 . A G 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8146;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3986,408,0 chrIV 1271999 . A G 4255.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.18;SB=-2.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4255,441,0 chrIV 1272164 . G A 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.03;MQ0=0;QD=27.52;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3880,376,0 chrIV 1272748 . T C 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3300,327,0 chrIV 1273219 . A T 2560 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2593,252,0 chrIV 1273337 . A G 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.63;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3434,354,0 chrIV 1273367 . C T 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3456,343,0 chrIV 1273683 . C A 2740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2773,271,0 chrIV 1273940 . A G 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2929,300,0 chrIV 1274047 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3268,328,0 chrIV 1274092 . C T 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.05;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3096,310,0 chrIV 1274124 . G C 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.23;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3120,327,0 chrIV 1274423 . C T 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3785,387,0 chrIV 1274484 . G A 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=135;Dels=0.00;FS=4.869;HaplotypeScore=2.6766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.245;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3710,361,0 chrIV 1274509 . T A 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2995,303,0 chrIV 1274626 . T C 2482 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=24.57;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2515,249,0 chrIV 1274677 . A G 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2907,288,0 chrIV 1274715 . G A 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.22;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3154,313,0 chrIV 1274773 . G A 3338.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.04;MQ0=0;QD=27.82;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3338,337,0 chrIV 1274775 . C T 3368.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.04;MQ0=0;QD=28.07;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3368,337,0 chrIV 1274778 . T C 3130 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3696;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.69;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3163,330,0 chrIV 1274808 . T C 2287 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.75;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2320,243,0 chrIV 1274844 . T C 1940 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.97;MQ0=0;QD=23.10;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1973,213,0 chrIV 1274848 . C T 2023 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.87;MQ0=0;QD=20.43;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2056,210,0 chrIV 1274852 . A G 1755 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.93;MQ0=0;QD=19.50;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1788,195,0 chrIV 1274867 . A G 1608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.35;MQ0=0;QD=19.14;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1641,168,0 chrIV 1274975 . A G 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.92;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2598,264,0 chrIV 1274988 . G A 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2945,289,0 chrIV 1275009 . A T 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3125,316,0 chrIV 1275068 . A G 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3229,348,0 chrIV 1275069 . A G 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3327,345,0 chrIV 1275540 . T C 4984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4984,505,0 chrIV 1275780 . G A 4442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4442,427,0 chrIV 1276281 . T C 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=1;QD=26.81;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3324,330,0 chrIV 1276339 . C A 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3236,313,0 chrIV 1276486 . A G 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.58;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3735,367,0 chrIV 1276608 . A G 3970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7186;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3970,406,0 chrIV 1276635 . G A 3832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9288;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3832,376,0 chrIV 1277231 . C A 4678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.40;MQ0=0;QD=28.01;SB=-2.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4678,451,0 chrIV 1277282 . G T 4198.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.81;MQ0=0;QD=26.07;SB=-2.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4198,426,0 chrIV 1277377 . A T 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3526,349,0 chrIV 1277378 . T C 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3564,363,0 chrIV 1277726 . G A 4562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.65;SB=-2.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4562,451,0 chrIV 1278481 . C G 4071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.77;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4071,432,0 chrIV 1279875 . G A 3965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3965,385,0 chrIV 1280606 . G A 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3893,385,0 chrIV 1280622 . C T 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3864,385,0 chrIV 1280715 . A G 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:3928,414,0 chrIV 1282163 . A G 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3153,321,0 chrIV 1282523 . C T 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3228,313,0 chrIV 1283387 . T C 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:175:99:4114,423,0 chrIV 1283766 . G T 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3039,301,0 chrIV 1284111 . T A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3540,355,0 chrIV 1285878 . T C 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3053,315,0 chrIV 1286166 . G A 4279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8357;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4279,415,0 chrIV 1290073 . A C 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3313,336,0 chrIV 1290378 . C G 4205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4205,427,0 chrIV 1291676 . C T 4006.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=28.21;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:4006,397,0 chrIV 1292354 . C T 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6985;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3673,352,0 chrIV 1292358 . C T 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6985;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3443,340,0 chrIV 1292515 . G C 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2600,273,0 chrIV 1297616 . A G 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3686,364,0 chrIV 1298144 . A G 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=137;Dels=0.00;FS=3.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.226;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3770,388,0 chrIV 1298262 . A G 2539 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2572,273,0 chrIV 1299595 . A G 2754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7094;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.54;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2787,279,0 chrIV 1301046 . A G 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;DP=129;Dels=0.00;FS=3.702;HaplotypeScore=5.8008;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=24.88;ReadPosRankSum=1.195;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3243,330,0 chrIV 1301255 . A T 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=1;QD=26.21;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3257,319,0 chrIV 1301379 . C A 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3221,324,0 chrIV 1301552 . T C 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4303;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2961,291,0 chrIV 1302786 . G A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3261,330,0 chrIV 1305496 . A G 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3305,345,0 chrIV 1305938 . A T 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=28.56;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3542,349,0 chrIV 1307724 . A G 1731.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.198;DP=348;Dels=0.00;FS=0.425;HaplotypeScore=4.4473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.32;MQ0=24;MQRankSum=-0.317;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.451;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,111:348:99:1761,0,3986 chrIV 1307843 . C T 101.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.667;DP=104;Dels=0.00;FS=5.416;HaplotypeScore=16.0141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.08;MQ0=13;MQRankSum=-2.663;QD=0.97;ReadPosRankSum=-1.940;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,29:104:99:131,0,1340 chrIV 1307848 . A G 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.987;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.6142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.23;MQ0=13;MQRankSum=-2.308;QD=0.79;ReadPosRankSum=1.382;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:103,0,1269 chrIV 1307856 . A G 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.081;DP=79;Dels=0.00;FS=2.698;HaplotypeScore=12.6459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.74;MQ0=13;MQRankSum=-2.122;QD=0.39;ReadPosRankSum=2.528;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:79:61:61,0,1085 chrIV 1307883 . T C 85.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=24;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.73;MQ0=13;MQRankSum=-0.480;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.898;SB=-2.962e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:24:10:115,0,10 chrIV 1308003 . A G 213.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.54;MQ0=15;QD=6.27;SB=-1.069e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:27:246,27,0 chrIV 1308006 . A T 27.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.03;MQ0=15;MQRankSum=0.087;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.786;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:35:57:57,0,167 chrIV 1308007 . C T 17.09 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.85;MQ0=15;MQRankSum=0.112;QD=0.45;ReadPosRankSum=1.230;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:47:47,0,245 chrIV 1308009 . T C 48.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.407;DP=44;Dels=0.00;FS=15.678;HaplotypeScore=18.7470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.33;MQ0=15;MQRankSum=-2.653;QD=1.09;ReadPosRankSum=2.258;SB=-9.006e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:78:78,0,321 chrIV 1308016 . A G 416.02 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;DP=39;Dels=0.00;FS=10.647;HaplotypeScore=24.8520;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.05;MQ0=13;MQRankSum=0.625;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.241;SB=-4.303e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:26:449,26,0 chrIV 1308024 . A G,T 354.52 filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=24.94;MQ0=12;MQRankSum=-0.248;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.908;SB=-6.462e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,29,3:33:36:414,78,36,336,0,327 chrIV 1308047 . T C 272.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.425;DP=16;Dels=0.00;FS=8.751;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.76;MQ0=1;MQRankSum=0.255;QD=17.05;ReadPosRankSum=2.123;SB=-7.962e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,14:16:10:305,10,0 chrIV 1308051 . T C 305 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.27;MQ0=1;QD=21.79;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:36:338,36,0 chrIV 1308135 . C T 198.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.320;DP=103;Dels=0.00;FS=4.315;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.04;MQ0=42;MQRankSum=3.173;QD=1.92;ReadPosRankSum=-3.287;SB=-6.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:228,0,628 chrIV 1308171 . A G 190.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.248;DP=197;Dels=0.00;FS=11.508;HaplotypeScore=2.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.34;MQ0=90;MQRankSum=0.041;QD=0.96;ReadPosRankSum=-1.890;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,73:197:99:220,0,707 chrIV 1308228 . A G 458.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.733;DP=270;Dels=0.00;FS=52.155;HaplotypeScore=10.0778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.31;MQ0=121;MQRankSum=5.738;QD=1.70;ReadPosRankSum=-2.662;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,45:270:99:488,0,181 chrIV 1308387 . C T 109.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.274;DP=39;Dels=0.00;FS=7.830;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.06;MQ0=25;MQRankSum=2.100;QD=2.80;ReadPosRankSum=-2.282;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,26:39:15:142,15,0 chrIV 1309620 . C T 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3664,361,0 chrIV 1310395 . G A 5017.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87;SB=-2.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:5017,502,0 chrIV 1312365 . T C 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3706,372,0 chrIV 1312462 . A C 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3416,348,0 chrIV 1316641 . A G 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.88;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2880,288,0 chrIV 1316659 . T C 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.45;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3036,306,0 chrIV 1317763 . C T 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3386,328,0 chrIV 1317903 . G C 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=22.56;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3192,333,0 chrIV 1318030 . A C 4183.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.47;SB=-2.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4183,424,0 chrIV 1318086 . G T 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.538;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=27.71;ReadPosRankSum=-1.659;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3962,360,0 chrIV 1318331 . C T 3869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3869,379,0 chrIV 1318378 . G A 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3708,361,0 chrIV 1318845 . T C 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3277,336,0 chrIV 1320900 . C T 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2767,274,0 chrIV 1321633 . A G 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2918,288,0 chrIV 1321800 . C G 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.956;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2965,265,0 chrIV 1323775 . C T 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3114,307,0 chrIV 1324081 . T G 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3446,354,0 chrIV 1331502 . G A 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3034,298,0 chrIV 1334424 . C T 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3318,339,0 chrIV 1335398 . C A 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3544,361,0 chrIV 1337684 . C G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3266,324,0 chrIV 1337715 . T C 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3297,327,0 chrIV 1338262 . G T 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=1;QD=27.48;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3166,304,0 chrIV 1338321 . T G 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=1;QD=25.99;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3457,346,0 chrIV 1338585 . A T 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.261;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=27.16;ReadPosRankSum=1.701;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:3102,287,0 chrIV 1340128 . T C 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3671,378,0 chrIV 1340784 . T C 35.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.43;MQ0=0;QD=0.36;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:9:68,9,0 chrIV 1341095 . C T 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3559,340,0 chrIV 1341293 . T C 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2882,297,0 chrIV 1341693 . C T 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3294,331,0 chrIV 1341826 . G C 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2599,270,0 chrIV 1342306 . G T 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3095,301,0 chrIV 1342433 . G A 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3635,355,0 chrIV 1342986 . G A 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3741,355,0 chrIV 1343249 . G A 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3657,352,0 chrIV 1344556 . C T 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.67;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3403,331,0 chrIV 1344681 . C T 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3669,358,0 chrIV 1344727 . A G 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3373,330,0 chrIV 1345064 . A G 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3666,381,0 chrIV 1345632 . T A 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3078,301,0 chrIV 1346089 . A C 3980.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3980,394,0 chrIV 1346336 . G C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3176,324,0 chrIV 1347437 . G A 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3615,355,0 chrIV 1349687 . T C 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.69;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3340,351,0 chrIV 1352461 . A C 2269 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.24;MQ0=0;QD=25.78;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2302,237,0 chrIV 1352644 . T A 1866 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.90;MQ0=0;QD=23.92;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1899,192,0 chrIV 1353994 . T C 2563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2596,267,0 chrIV 1354278 . G C 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3466,348,0 chrIV 1354322 . T A 4226.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=156;Dels=0.00;FS=3.419;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=27.09;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:4226,408,0 chrIV 1354359 . C T 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4109,400,0 chrIV 1355395 . G A 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=28.41;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3295,325,0 chrIV 1357207 . A G 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3625,346,0 chrIV 1359514 . C T 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2950,288,0 chrIV 1361345 . T G 83.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.213;DP=116;Dels=0.00;FS=190.006;HaplotypeScore=13.6506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=0.72;ReadPosRankSum=-1.966;SB=-6.175e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,33:116:99:113,0,1873 chrIV 1362063 . T A 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3414,334,0 chrIV 1362190 . T A 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.896;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=26.21;ReadPosRankSum=1.583;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3099,301,0 chrIV 1362620 . G A 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=28.27;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3647,370,0 chrIV 1362669 . C G 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3474,351,0 chrIV 1363282 . G A 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2793,265,0 chrIV 1364136 . T C 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3860,391,0 chrIV 1364702 . G A 4183.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8554;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.99;SB=-2.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4183,391,0 chrIV 1364750 . A G 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3344,357,0 chrIV 1366750 . G A 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3238,307,0 chrIV 1367576 . T C 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3393,336,0 chrIV 1368022 . C T 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=28.05;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3338,325,0 chrIV 1368624 . T C 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3005,306,0 chrIV 1371004 . T C 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2997,303,0 chrIV 1371121 . C T 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3510,334,0 chrIV 1371136 . C T 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3179,304,0 chrIV 1371862 . A G 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2875,291,0 chrIV 1372366 . C T 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.07;SB=-2.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3676,361,0 chrIV 1372422 . G A 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3916,370,0 chrIV 1372812 . C T 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3139,307,0 chrIV 1373275 . C T 4845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9732;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.84;SB=-2.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4845,495,0 chrIV 1373320 . C T 4205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.5311;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:4205,418,0 chrIV 1373769 . G A 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3631,355,0 chrIV 1374217 . G T 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=28.71;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3790,373,0 chrIV 1374352 . T C 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3278,345,0 chrIV 1374505 . T G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2974,300,0 chrIV 1374590 . A G 2341 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.51;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2374,249,0 chrIV 1374919 . C T 4184.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4184,412,0 chrIV 1375261 . C T 4265.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.69;SB=-2.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4265,436,0 chrIV 1379791 . A C 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3011,315,0 chrIV 1379888 . C T 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3729,373,0 chrIV 1379910 . T C 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3677,375,0 chrIV 1380625 . A G 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3204,327,0 chrIV 1384186 . G T 4226.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=28.17;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4226,409,0 chrIV 1385256 . C A 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3118,310,0 chrIV 1385323 . C T 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2600,250,0 chrIV 1385712 . G C 2272 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2305,252,0 chrIV 1386851 . T C 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3323,330,0 chrIV 1387061 . G C 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3590,367,0 chrIV 1387160 . G A 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3733,361,0 chrIV 1387313 . C T 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3714,370,0 chrIV 1387436 . T C 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2923,303,0 chrIV 1389010 . T A 3957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3957,379,0 chrIV 1390794 . T A 2342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.226;DP=89;Dels=0.00;FS=3.583;HaplotypeScore=3.9472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.460;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:2375,240,0 chrIV 1391355 . T C 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3559,357,0 chrIV 1391478 . G A 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3034,295,0 chrIV 1391636 . A G 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3237,312,0 chrIV 1392190 . G A 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=23.46;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3308,337,0 chrIV 1394087 . C T 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3555,354,0 chrIV 1396254 . T C 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3444,360,0 chrIV 1397565 . A G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.53;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2995,321,0 chrIV 1398006 . G A 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3108;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3593,355,0 chrIV 1398909 . C T 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.51;MQ0=0;QD=28.61;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3633,355,0 chrIV 1400042 . G A 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=28.71;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3503,343,0 chrIV 1400971 . C T 2697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2730,273,0 chrIV 1401432 . T G 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.15;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3000,297,0 chrIV 1401497 . T C 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=130;Dels=0.00;FS=3.216;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=24.70;ReadPosRankSum=1.306;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3244,342,0 chrIV 1401563 . T C 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2727,276,0 chrIV 1401828 . C A 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3551,346,0 chrIV 1401839 . A T 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=28.15;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3547,340,0 chrIV 1401877 . A G 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3544,352,0 chrIV 1402134 . A G 2398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.07;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2431,237,0 chrIV 1402144 . G C 2319 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.94;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2352,234,0 chrIV 1402305 . C T 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.01;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2897,289,0 chrIV 1402695 . T C 1712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.61;MQ0=0;QD=24.11;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1745,180,0 chrIV 1402714 . G C 454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.85;MQ0=0;QD=5.97;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:51:487,51,0 chrIV 1402760 . A G 1792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.98;MQ0=0;QD=23.58;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1825,189,0 chrIV 1402811 . G T 2255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.15;MQ0=0;QD=25.34;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2288,222,0 chrIV 1402890 . C G 1801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.34;MQ0=0;QD=25.37;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1834,186,0 chrIV 1402910 . T C 1392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.18;MQ0=0;QD=20.78;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1425,147,0 chrIV 1402911 . A T 1399 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.44;MQ0=0;QD=21.20;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1432,147,0 chrIV 1403082 . C T 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.41;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2786,288,0 chrIV 1403147 . T G 2337 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=24.09;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2370,237,0 chrIV 1403669 . A C 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3142,321,0 chrIV 1403689 . A G 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2968,306,0 chrIV 1403771 . C T 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2748,279,0 chrIV 1404228 . G A 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3308,331,0 chrIV 1404335 . C G 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3098,306,0 chrIV 1404745 . G A 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2869,286,0 chrIV 1404826 . C T 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3718,358,0 chrIV 1404973 . T C 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2490,261,0 chrIV 1405144 . C T 4449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4449,430,0 chrIV 1405366 . A G 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3387,351,0 chrIV 1405690 . C T 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3300,319,0 chrIV 1405860 . C T 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2594,252,0 chrIV 1405995 . G A 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3311,325,0 chrIV 1406105 . C G 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.31;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2689,282,0 chrIV 1406179 . T C 2665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4513;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.82;MQ0=0;QD=24.68;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2698,285,0 chrIV 1406350 . T C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3318,345,0 chrIV 1406418 . A C 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3443,351,0 chrIV 1406432 . C T 4365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=1;QD=27.28;SB=-2.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4365,430,0 chrIV 1406526 . A G 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2921,303,0 chrIV 1406566 . A G 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3033,312,0 chrIV 1406875 . G A 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3663,343,0 chrIV 1406893 . C A 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.85;SB=-2.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3893,376,0 chrIV 1406925 . C T 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3362,331,0 chrIV 1406984 . G A 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.901e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3636,352,0 chrIV 1407015 . T G 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3560,366,0 chrIV 1407144 . A G 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3284,342,0 chrIV 1407493 . C T 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3754,376,0 chrIV 1407535 . A G 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3840,385,0 chrIV 1407605 . T C 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3126,321,0 chrIV 1407845 . C T 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.601;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=27.72;ReadPosRankSum=1.391;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3659,373,0 chrIV 1407899 . C T 4017.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4017,385,0 chrIV 1408247 . C T 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2568,246,0 chrIV 1408334 . C T 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3212,310,0 chrIV 1408568 . T C 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3088,324,0 chrIV 1408733 . G A 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3242,316,0 chrIV 1408760 . T C 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3297,342,0 chrIV 1408799 . A G 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;DP=134;Dels=0.00;FS=3.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=24.69;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3309,327,0 chrIV 1408802 . T C 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3589,366,0 chrIV 1409023 . C T 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3553,355,0 chrIV 1409059 . A T 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.82;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2759,282,0 chrIV 1409126 . A T 3973.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=27.03;SB=-2.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3973,385,0 chrIV 1409468 . T C 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.344;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.510;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:126:99:3197,310,0 chrIV 1409602 . T C 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3805,372,0 chrIV 1409794 . A G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3181,327,0 chrIV 1409803 . C T 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3344,328,0 chrIV 1409847 . C T 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3375,319,0 chrIV 1411239 . G A 4676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4676,448,0 chrIV 1412047 . A G 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3518,360,0 chrIV 1412121 . A G 4731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6663;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4731,487,0 chrIV 1412132 . T G 4525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:172:99:4525,466,0 chrIV 1412438 . T C 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6688;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=17.04;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:2777,291,0 chrIV 1412444 . C T 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.0417;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=17.54;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:2822,276,0 chrIV 1412922 . C T 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3031,298,0 chrIV 1412942 . T C 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3130,330,0 chrIV 1413131 . C T 4084.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4084,391,0 chrIV 1413176 . T G 4800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.13;SB=-2.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:191:99:4800,495,0 chrIV 1413182 . C G 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:3992,423,0 chrIV 1413377 . T C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3136,318,0 chrIV 1413485 . A G 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3467,357,0 chrIV 1413914 . T C 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4404;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3274,339,0 chrIV 1414565 . G C 4243.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:164:99:4243,409,0 chrIV 1414748 . G A 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3299,313,0 chrIV 1414935 . T C 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3277,327,0 chrIV 1415193 . A T 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3921,394,0 chrIV 1416353 . A G 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3525,354,0 chrIV 1416401 . G A 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3630,358,0 chrIV 1416431 . G A 3643.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.679;DP=131;Dels=0.00;FS=5.342;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=27.81;ReadPosRankSum=0.906;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:131:99:3643,334,0 chrIV 1416716 . T C 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3098,333,0 chrIV 1416927 . A G 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3530,363,0 chrIV 1416976 . G A 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3684,361,0 chrIV 1417161 . C T 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3916,385,0 chrIV 1417489 . C T 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2645,267,0 chrIV 1417509 . T C 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3296,339,0 chrIV 1417646 . C T 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2844,277,0 chrIV 1417872 . G A 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3339,328,0 chrIV 1425361 . T C 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2758,279,0 chrIV 1429122 . T C 4937.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.45;SB=-2.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:4937,481,0 chrIV 1429245 . A G 4496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.17;SB=-2.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4496,448,0 chrIV 1433710 . A T 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3093,298,0 chrIV 1434754 . C G 4595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4551;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:173:99:4595,448,0 chrIV 1435866 . C T 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3088,315,0 chrIV 1437335 . G A 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=28.34;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2980,292,0 chrIV 1438464 . A G 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2985,297,0 chrIV 1438494 . T C 2249 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2282,234,0 chrIV 1438524 . G C 2248 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2281,246,0 chrIV 1438565 . G C 2104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:2137,202,0 chrIV 1441011 . G C 4117.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6901;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4117,424,0 chrIV 1441031 . T C 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3253,339,0 chrIV 1441482 . G A 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3326,331,0 chrIV 1441483 . T C 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3150,333,0 chrIV 1441919 . C T 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3412,334,0 chrIV 1441973 . T C 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3563,375,0 chrIV 1442315 . A G 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3621,366,0 chrIV 1442725 . T C 4403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7313;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.68;SB=-2.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4403,442,0 chrIV 1442972 . C T 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=28.54;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3710,358,0 chrIV 1443134 . T C 2429 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2462,252,0 chrIV 1443307 . C T 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=28.22;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3415,337,0 chrIV 1443488 . G A 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.09;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3281,325,0 chrIV 1443515 . A T 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.246;DP=145;Dels=0.00;FS=7.420;HaplotypeScore=3.8652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=22.59;ReadPosRankSum=1.890;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,143:145:99:3275,294,0 chrIV 1443800 . T C 4258.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4258,421,0 chrIV 1443836 . A G 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2981,306,0 chrIV 1443906 . C A 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.99;SB=-2.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3887,373,0 chrIV 1443911 . C T 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3758,373,0 chrIV 1444256 . C T 4091.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:4091,409,0 chrIV 1444337 . G A 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3472,340,0 chrIV 1444364 . A G 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3114,315,0 chrIV 1444544 . C T 4315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.880e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4315,415,0 chrIV 1444709 . T C 4447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4447,442,0 chrIV 1444711 . G A 4473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.78;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4473,433,0 chrIV 1444817 . A G 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5562;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3067,324,0 chrIV 1444847 . A G 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=22.87;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2823,306,0 chrIV 1444985 . A T 3694.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.98;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3694,361,0 chrIV 1445015 . G A 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3666,358,0 chrIV 1445114 . C T 4049.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4049,412,0 chrIV 1445129 . C T 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3418,340,0 chrIV 1445249 . C T 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3811,376,0 chrIV 1445459 . T A 5184.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=27.14;SB=-2.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:5184,484,0 chrIV 1445462 . T G 4748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.09;SB=-2.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4748,463,0 chrIV 1445609 . T C 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.58;SB=-2.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3811,384,0 chrIV 1445641 . T C 4091.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.837;DP=174;Dels=0.00;FS=15.546;HaplotypeScore=5.8394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=23.51;ReadPosRankSum=1.280;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,170:174:99:4091,413,0 chrIV 1445712 . C T 4445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4445,439,0 chrIV 1445739 . T C 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=23.01;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4003,412,0 chrIV 1446020 . T C 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=1;QD=25.07;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3736,393,0 chrIV 1446136 . C T 4111.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.991e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4111,403,0 chrIV 1446425 . G A 3483.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3483,355,0 chrIV 1446428 . C T 3598.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3598,358,0 chrIV 1446434 . G A 3343.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3343,334,0 chrIV 1446482 . G A 3901.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=28.27;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3901,388,0 chrIV 1446792 . C T 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3022,298,0 chrIV 1446878 . A G 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3012,315,0 chrIV 1446950 . T C 2682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=107;Dels=0.00;FS=3.392;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=25.07;ReadPosRankSum=0.502;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2715,260,0 chrIV 1447014 . G A 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2690,264,0 chrIV 1447053 . G A 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2744,279,0 chrIV 1447054 . T C 2735 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2768,288,0 chrIV 1447111 . T C 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3609,366,0 chrIV 1447149 . C T 4080.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.02;SB=-2.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4080,406,0 chrIV 1447231 . G A 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=1;QD=26.05;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2690,259,0 chrIV 1447296 . A G 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2576,267,0 chrIV 1447297 . T A 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2665,267,0 chrIV 1447313 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2718,268,0 chrIV 1447378 . G A 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=28.21;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3221,322,0 chrIV 1447428 . G C 2786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2819,303,0 chrIV 1447474 . C G 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.75;MQ0=0;QD=25.72;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3119,318,0 chrIV 1447558 . C A 2634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.237;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6896;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=25.09;ReadPosRankSum=1.699;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2667,264,0 chrIV 1447682 . G A 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6626;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=22.08;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2683,279,0 chrIV 1447808 . C A 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2880,288,0 chrIV 1447837 . G A 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2327;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3515,331,0 chrIV 1447962 . A G 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3291,342,0 chrIV 1447991 . C T 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3855,382,0 chrIV 1448237 . G A 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=28.54;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2916,289,0 chrIV 1448315 . G A 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=104;Dels=0.00;FS=3.736;HaplotypeScore=5.9539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=28.30;ReadPosRankSum=1.599;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2976,298,0 chrIV 1448483 . T A 4326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4326,430,0 chrIV 1448600 . A G 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3017,309,0 chrIV 1448696 . A T 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7470;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3632,364,0 chrIV 1448726 . C G 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3380,346,0 chrIV 1448735 . G A 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.33;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3670,370,0 chrIV 1448745 . A G 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3621,369,0 chrIV 1448987 . T A 3974.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.41;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3974,385,0 chrIV 1449089 . T C 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3315,351,0 chrIV 1449123 . A G 4467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4467,462,0 chrIV 1449406 . G A 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3170,313,0 chrIV 1449611 . G A 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3708,361,0 chrIV 1450091 . G A 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=1;QD=26.40;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3069,295,0 chrIV 1450513 . T A 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3258,307,0 chrIV 1450588 . C A 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.09;MQ0=0;QD=27.96;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3025,304,0 chrIV 1450638 . G A 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.06;SB=-2.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3870,373,0 chrIV 1450681 . T A 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=90.4065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=28.07;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2980,300,0 chrIV 1450720 . G A 4121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.84;SB=-2.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4121,403,0 chrIV 1450764 . A G 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3325,342,0 chrIV 1450894 . C T 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3490,346,0 chrIV 1450897 . A G 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3258,342,0 chrIV 1450914 . T C 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3127,318,0 chrIV 1450998 . G A 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3323,331,0 chrIV 1451009 . A T 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.687;SB=-2.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3870,360,0 chrIV 1451028 . G A 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7902;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.74;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3401,343,0 chrIV 1451042 . C G 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.05;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2680,288,0 chrIV 1451054 . C T 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3049,312,0 chrIV 1451129 . A T 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=85.2381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=0.30;SB=-8.588e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:6:59,6,0 chrIV 1451166 . A G 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6008;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3098,318,0 chrIV 1451277 . C T 2398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2431,249,0 chrIV 1451427 . G A 4187.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4187,409,0 chrIV 1451517 . C T 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=28.78;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3742,370,0 chrIV 1451576 . C G 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3019,300,0 chrIV 1451577 . C T 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3130,304,0 chrIV 1451724 . G A 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.978e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3712,373,0 chrIV 1451955 . G A 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8634;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3459,345,0 chrIV 1452195 . A G 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.33;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2693,288,0 chrIV 1452222 . A G 2125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2158,234,0 chrIV 1452255 . C T 2159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.70;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2192,216,0 chrIV 1452420 . G C 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3075,324,0 chrIV 1452434 . A T 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=28.49;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3390,334,0 chrIV 1452539 . T G 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3136,324,0 chrIV 1452589 . G A 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3175,307,0 chrIV 1452642 . G C 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=21.29;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:2865,291,0 chrIV 1452762 . G A 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3047,312,0 chrIV 1452807 . C A 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=23.85;ReadPosRankSum=1.187;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3062,298,0 chrIV 1452825 . A G 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=23.52;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2997,303,0 chrIV 1452837 . T C 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=22.62;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2566,258,0 chrIV 1452974 . G A 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3855,379,0 chrIV 1453212 . T G 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=65.87;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3335,345,0 chrIV 1453261 . G A 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3438,337,0 chrIV 1453296 . T A 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3403,328,0 chrIV 1453300 . G A 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3393,328,0 chrIV 1454822 . G A 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3430,325,0 chrIV 1454951 . A G 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4046,420,0 chrIV 1455133 . A G 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3446,357,0 chrIV 1455507 . A G 4742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.05;SB=-2.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4742,478,0 chrIV 1455570 . T C 4167.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4304;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4167,427,0 chrIV 1455713 . G A 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3321,322,0 chrIV 1455714 . G A 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3308,322,0 chrIV 1455920 . C G 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3270,342,0 chrIV 1455937 . C T 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=28.27;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2888,289,0 chrIV 1456074 . T G 3638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.99;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3638,390,0 chrIV 1456144 . A G 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.77;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3319,342,0 chrIV 1456284 . G C 2192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.49;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2225,237,0 chrIV 1456713 . A G 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.84;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2798,282,0 chrIV 1456746 . G A 2574 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2607,264,0 chrIV 1456749 . G T 2488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2521,255,0 chrIV 1456794 . C G 2376 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:99:2409,252,0 chrIV 1456812 . C A 2465 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2498,240,0 chrIV 1457142 . T C 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2467,246,0 chrIV 1457335 . T C 2614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.38;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2647,270,0 chrIV 1457379 . G A 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2469,243,0 chrIV 1457633 . C A 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3213,313,0 chrIV 1457664 . G A 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=27.70;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2775,271,0 chrIV 1457763 . C T 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3401,334,0 chrIV 1457829 . G A 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=28.65;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2898,289,0 chrIV 1457981 . C T 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;QD=29.21;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3680,361,0 chrIV 1458101 . C T 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3329,328,0 chrIV 1458159 . T C 148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.974;DP=165;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=3.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.23;MQ0=0;MQRankSum=-6.889;QD=0.90;ReadPosRankSum=-6.817;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,70:165:99:178,0,2151 chrIV 1458160 . G T 186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.447;DP=164;Dels=0.00;FS=1.236;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.11;MQ0=0;MQRankSum=-6.757;QD=1.13;ReadPosRankSum=3.852;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,70:164:99:216,0,2047 chrIV 1458188 . G A 1435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.96;MQ0=0;QD=14.21;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:1468,150,0 chrIV 1458243 . T C 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.89;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3570,384,0 chrIV 1458332 . C T 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.559;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=26.52;ReadPosRankSum=1.287;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3713,359,0 chrIV 1458347 . C T 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3314,325,0 chrIV 1458387 . G A 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2909,300,0 chrIV 1458423 . T C 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2794,282,0 chrIV 1458432 . T C 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2789,276,0 chrIV 1458576 . G A 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3597,355,0 chrIV 1458625 . C T 4038.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4038,391,0 chrIV 1458636 . G T 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3811,370,0 chrIV 1458898 . C T 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.69;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2944,286,0 chrIV 1458903 . C T 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.67;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3013,286,0 chrIV 1458915 . C T 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2971,288,0 chrIV 1458931 . T C 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2963,303,0 chrIV 1458951 . C T 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2879,288,0 chrIV 1459011 . C T 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3209,313,0 chrIV 1459382 . G A 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.90;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4046,406,0 chrIV 1459584 . G A 3908.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.24;MQ0=0;QD=28.32;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3908,385,0 chrIV 1459601 . C G 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.05;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3472,355,0 chrIV 1459669 . C G 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.27;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3139,330,0 chrIV 1459800 . C T 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3672,355,0 chrIV 1459840 . G A 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3424,311,0 chrIV 1460367 . G A 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3729,346,0 chrIV 1460373 . T C 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3545,351,0 chrIV 1460401 . T C 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3736,384,0 chrIV 1460431 . T A 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3697,367,0 chrIV 1460433 . G A 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3745,373,0 chrIV 1460475 . G C 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3469,354,0 chrIV 1460534 . A G 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2908,300,0 chrIV 1460585 . T C 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3405,348,0 chrIV 1460694 . A G 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3822,382,0 chrIV 1460721 . A G 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3403,346,0 chrIV 1460763 . A T 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.21;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3196,325,0 chrIV 1460774 . C T 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2861,289,0 chrIV 1460798 . T C 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2646,282,0 chrIV 1460813 . A G 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.921;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8624;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=23.87;ReadPosRankSum=1.358;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2683,263,0 chrIV 1460832 . T C 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.26;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2576,267,0 chrIV 1460859 . G A 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.13;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2534,252,0 chrIV 1460877 . G A 2905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=28.48;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2938,298,0 chrIV 1460907 . A G 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2970,312,0 chrIV 1460919 . C T 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.49;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3514,355,0 chrIV 1460932 . C T 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=28.49;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3333,328,0 chrIV 1460968 . T C 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.55;MQ0=0;QD=25.33;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2642,285,0 chrIV 1461071 . C T 4432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=26.70;SB=-2.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4432,421,0 chrIV 1461391 . C T 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3375,328,0 chrIV 1461432 . G A 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3507,340,0 chrIV 1461557 . T C 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.21;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2868,288,0 chrIV 1461567 . G C 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2875,288,0 chrIV 1461591 . C T 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3915,370,0 chrIV 1461847 . T G 1334 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-9.063;DP=123;Dels=0.00;FS=189.148;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.65;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=10.85;ReadPosRankSum=8.394;SB=3.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:70,53:123:77:1367,77,0 chrIV 1461955 . T C 2615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.85;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2648,264,0 chrIV 1462035 . A C 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=25.91;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2805,288,0 chrIV 1462081 . T C 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.89;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2898,291,0 chrIV 1462089 . C A 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3003,292,0 chrIV 1462110 . A G 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.95;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2654,267,0 chrIV 1462394 . C T 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3446,322,0 chrIV 1462526 . A G 4247.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.58;SB=-2.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:166:99:4247,450,0 chrIV 1462655 . C T 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3338,325,0 chrIV 1462703 . A G 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2979,297,0 chrIV 1462739 . C T 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=28.02;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2947,295,0 chrIV 1462835 . A C 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2842,300,0 chrIV 1462865 . C T 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3155,310,0 chrIV 1463461 . C T 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3486,352,0 chrIV 1463528 . A G 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3531,372,0 chrIV 1463543 . C A 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=28.13;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3600,349,0 chrIV 1463657 . A G 4186.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.62;SB=-2.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4186,423,0 chrIV 1463798 . G A 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3498,355,0 chrIV 1463897 . T G 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3140,324,0 chrIV 1463912 . T C 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3103,327,0 chrIV 1464119 . G A 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3055,301,0 chrIV 1464206 . G A 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2978,301,0 chrIV 1464362 . C T 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3451,337,0 chrIV 1464424 . T C 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3583,375,0 chrIV 1464464 . G A 3756.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=27.42;ReadPosRankSum=0.822;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3756,376,0 chrIV 1464656 . A G 4718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4718,460,0 chrIV 1464658 . C T 4740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4740,454,0 chrIV 1464680 . T C 4174.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4174,430,0 chrIV 1465190 . T C 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=1;QD=25.12;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3844,390,0 chrIV 1465247 . C T 4022.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4022,397,0 chrIV 1465349 . G A 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=1;QD=27.96;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3467,343,0 chrIV 1465397 . C T 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=1;QD=26.95;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2998,298,0 chrIV 1465643 . C T 4307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.989e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4307,418,0 chrIV 1465769 . G A 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3428,351,0 chrIV 1465791 . A G 3658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;DP=147;Dels=0.00;FS=3.318;HaplotypeScore=4.3154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3658,340,0 chrIV 1465800 . A G 3949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7818;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.988e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:3949,417,0 chrIV 1465952 . G A 4425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=28.55;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4425,430,0 chrIV 1466217 . T C 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.59;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3377,346,0 chrIV 1466338 . G A 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3761,382,0 chrIV 1466344 . A T 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.377;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=25.65;ReadPosRankSum=1.654;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,134:137:99:3514,351,0 chrIV 1466364 . G A 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=26.65;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3438,343,0 chrIV 1466633 . T C 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2927,297,0 chrIV 1466643 . C A 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2871,277,0 chrIV 1466759 . G T 4048.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;DP=155;Dels=0.00;FS=3.578;HaplotypeScore=5.7611;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=26.12;ReadPosRankSum=1.084;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:4048,412,0 chrIV 1466914 . A G 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=1;QD=25.91;SB=-2.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3912,388,0 chrIV 1466994 . G A 4434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=28.06;SB=-2.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4434,439,0 chrIV 1467056 . C T 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=28.32;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3767,379,0 chrIV 1467059 . C T 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4083,406,0 chrIV 1467118 . A G 4062.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4062,414,0 chrIV 1467130 . C A 4232.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.13;SB=-2.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4232,412,0 chrIV 1467260 . C T 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3684,361,0 chrIV 1467392 . T A 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3792,367,0 chrIV 1467544 . C T 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3564,355,0 chrIV 1467545 . T A 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3585,358,0 chrIV 1467660 . T C 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3048,309,0 chrIV 1467713 . A G 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4365;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3336,330,0 chrIV 1467761 . G T 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=27.03;ReadPosRankSum=1.471;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3946,373,0 chrIV 1467803 . T C 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3614,369,0 chrIV 1467833 . T C 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3340,336,0 chrIV 1467965 . C T 3957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.53;SB=-2.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3957,385,0 chrIV 1468015 . T C 4044.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:4044,397,0 chrIV 1468017 . T C 4079.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.02;SB=-2.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4079,400,0 chrIV 1468145 . A G 4245.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.124;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=25.27;ReadPosRankSum=-1.196;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:4245,396,0 chrIV 1468191 . C T 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3810,367,0 chrIV 1468321 . G C 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2970,300,0 chrIV 1468372 . G C 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3690,393,0 chrIV 1468381 . G C 4035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4035,403,0 chrIV 1468406 . C T 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3539,346,0 chrIV 1468562 . G A 2311 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=22.44;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2344,228,0 chrIV 1468720 . C A 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=26.68;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3048,300,0 chrIV 1468785 . G A 2166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2199,222,0 chrIV 1468817 . C A 2473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2506,249,0 chrIV 1468900 . C T 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.30;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3399,345,0 chrIV 1468935 . A G 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.85;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3429,366,0 chrIV 1469141 . T C 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2776,294,0 chrIV 1469161 . A G 2575 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQ0=0;QD=25.75;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2608,267,0 chrIV 1469271 . A G 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3712,378,0 chrIV 1469289 . T A 3917.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3917,391,0 chrIV 1469311 . T A 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3782,373,0 chrIV 1469501 . G A 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3164,304,0 chrIV 1469510 . C T 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3074,301,0 chrIV 1469751 . C T 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3427,325,0 chrIV 1469888 . C T 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.86;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3384,334,0 chrIV 1469963 . T C 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3110,312,0 chrIV 1470079 . T G 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3518,361,0 chrIV 1470784 . G A 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3490,349,0 chrIV 1470869 . A G 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.62;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2602,279,0 chrIV 1471220 . G A 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3653,367,0 chrIV 1471232 . C T 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3179,310,0 chrIV 1471256 . C T 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9815;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=27.03;ReadPosRankSum=1.612;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:3141,313,0 chrIV 1471461 . T C 2205 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=25.64;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2238,234,0 chrIV 1471524 . T C 2034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=21.87;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2067,219,0 chrIV 1471549 . C T 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2717,265,0 chrIV 1471573 . G A 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;QD=26.31;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3190,322,0 chrIV 1471657 . A G 2598 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2631,279,0 chrIV 1471830 . G A 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3582,343,0 chrIV 1471977 . T C 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3109,310,0 chrIV 1471999 . G A 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3786,373,0 chrIV 1472290 . A G 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3650,367,0 chrIV 1472336 . C A 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3975,397,0 chrIV 1472819 . G A 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2823,277,0 chrIV 1473027 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3201,348,0 chrIV 1473079 . C A 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=29.05;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3719,367,0 chrIV 1473233 . C T 2754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2787,271,0 chrIV 1473269 . A G 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3152,309,0 chrIV 1473316 . A G 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2932,294,0 chrIV 1473634 . G C 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3759,376,0 chrIV 1473635 . G C 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3826,379,0 chrIV 1473860 . C A 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3088,298,0 chrIV 1473918 . A G 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2518,264,0 chrIV 1473919 . A G 2505 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2538,258,0 chrIV 1474139 . A C 3766.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3766,382,0 chrIV 1474394 . T A 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2778,282,0 chrIV 1474416 . T C 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3145,315,0 chrIV 1474441 . A G 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3377,342,0 chrIV 1474473 . C T 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3454,334,0 chrIV 1474481 . C T 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.73;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3822,385,0 chrIV 1474567 . C T 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3824,376,0 chrIV 1474570 . T C 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3734,387,0 chrIV 1474679 . C T 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=28.94;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3159,313,0 chrIV 1474686 . A G 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2929,312,0 chrIV 1474811 . A T 1084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5182;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=12.75;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1117,111,0 chrIV 1474885 . A G 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3460,343,0 chrIV 1475249 . G A 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3078,307,0 chrIV 1475397 . G A 4794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.71;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4794,469,0 chrIV 1475652 . T C 4992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=1;QD=26.00;SB=-1.980e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4992,511,0 chrIV 1476051 . C T 4366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.63;SB=-2.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4366,433,0 chrIV 1476401 . G C 4182.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.81;SB=-2.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4182,412,0 chrIV 1476502 . T C 4194.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.54;SB=-2.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4194,429,0 chrIV 1476572 . A G 4517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.05;MQ0=0;QD=26.42;SB=-2.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4517,454,0 chrIV 1477131 . G C 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6336;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.97;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3077,321,0 chrIV 1483478 . C T 2428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2461,249,0 chrIV 1483867 . C T 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2576,250,0 chrIV 1484273 . G A 2465 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.51;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2498,243,0 chrIV 1484422 . A G 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2808,279,0 chrIV 1484599 . G A 2637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.36;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2670,255,0 chrIV 1484729 . T C 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3106,315,0 chrIV 1484733 . A G 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2926,294,0 chrIV 1484812 . G A 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2923,283,0 chrIV 1484977 . A G 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2709,279,0 chrIV 1485012 . G T 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3035,292,0 chrIV 1485210 . C T 2814 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2847,274,0 chrIV 1485375 . A T 2037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=21.00;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2070,216,0 chrIV 1485403 . G A 53.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=83.6409;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=1;QD=0.48;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:9:86,9,0 chrIV 1485510 . G A 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;QD=28.86;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3406,337,0 chrIV 1485530 . T A 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=28.03;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3336,339,0 chrIV 1485542 . C T 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=27.98;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3274,331,0 chrIV 1485724 . T G 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2831,291,0 chrIV 1485812 . A G 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3188,324,0 chrIV 1486110 . T C 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.013;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=26.55;ReadPosRankSum=1.492;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3451,324,0 chrIV 1486166 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3268,319,0 chrIV 1486178 . A G 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3310,328,0 chrIV 1486808 . T C 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=1;QD=24.83;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3262,333,0 chrIV 1487095 . T A 2284 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2317,222,0 chrIV 1487442 . C G 1951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;DP=89;Dels=0.00;FS=5.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=21.92;ReadPosRankSum=1.693;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:1984,219,0 chrIV 1487490 . G A 2588 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2621,285,0 chrIV 1487491 . A G 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2601,285,0 chrIV 1487875 . A G 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2829,288,0 chrIV 1487917 . C A 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2821,274,0 chrIV 1487920 . T C 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2686,267,0 chrIV 1487967 . A G 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2972,297,0 chrIV 1488034 . G A 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3612,343,0 chrIV 1488040 . T C 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3457,351,0 chrIV 1488084 . A T 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3185,325,0 chrIV 1488306 . G A 3838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3838,370,0 chrIV 1488682 . C T 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2811,279,0 chrIV 1488754 . C A 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2685,264,0 chrIV 1488904 . C T 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2942,289,0 chrIV 1489122 . T C 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.13;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2983,309,0 chrIV 1489245 . C T 2033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.18;MQ0=0;QD=26.06;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2066,204,0 chrIV 1489545 . A T 2261 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:90:99:2294,216,0 chrIV 1489546 . A T 2271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.617;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:90:99:2304,216,0 chrIV 1489717 . G C 2654 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2687,276,0 chrIV 1490059 . G T 4035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4035,403,0 chrIV 1490249 . C T 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3534,355,0 chrIV 1490594 . C T 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3697,364,0 chrIV 1490862 . C T 3857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.32;MQ0=0;QD=28.15;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3857,391,0 chrIV 1490977 . G A 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.93;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2823,280,0 chrIV 1491114 . A C 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3611,381,0 chrIV 1491138 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3267,342,0 chrIV 1491321 . C G 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3692,378,0 chrIV 1491446 . A T 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3520,346,0 chrIV 1491519 . C T 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.603;DP=134;Dels=0.00;FS=4.369;HaplotypeScore=4.7132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=27.13;ReadPosRankSum=0.465;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3636,334,0 chrIV 1491574 . G A 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=27.90;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3241,319,0 chrIV 1491605 . T A 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=27.93;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3715,367,0 chrIV 1491619 . G A 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.68;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3681,373,0 chrIV 1491666 . A G 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3102,321,0 chrIV 1491852 . A G 2181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9514;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2214,225,0 chrIV 1491879 . C T 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2571,258,0 chrIV 1491889 . G A 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2566,249,0 chrIV 1491939 . C T 4176.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4176,409,0 chrIV 1491981 . C T 4002.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.209;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.008;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,151:153:99:4002,346,0 chrIV 1492309 . T G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3264,333,0 chrIV 1492576 . C T 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3106,315,0 chrIV 1492828 . C T 3948.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3948,373,0 chrIV 1492922 . G A 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.970e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3922,399,0 chrIV 1493045 . A G 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4179,427,0 chrIV 1493055 . T C 4185.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4185,436,0 chrIV 1493088 . C T 3617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3617,352,0 chrIV 1493150 . T C 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3521,357,0 chrIV 1493251 . A G 2259 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.95;MQ0=0;QD=23.29;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2292,240,0 chrIV 1493255 . C T 2201 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=23.17;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2234,222,0 chrIV 1493260 . G T 1890 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=22.50;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1923,201,0 chrIV 1493304 . G A 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3173,319,0 chrIV 1493468 . G T 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=28.78;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3367,328,0 chrIV 1493474 . G A 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3445,340,0 chrIV 1493509 . T A 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2615,249,0 chrIV 1493527 . C T 2488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2521,243,0 chrIV 1493685 . C A 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3195,304,0 chrIV 1493732 . T G 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2979,300,0 chrIV 1493806 . A G 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=26.65;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3384,327,0 chrIV 1493820 . A G 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=23.89;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3234,307,0 chrIV 1493831 . G A 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.611;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.230;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3792,367,0 chrIV 1493869 . G A 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3419,334,0 chrIV 1493916 . T C 4195.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4195,421,0 chrIV 1493956 . C T 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.478;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=26.89;ReadPosRankSum=1.085;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:4033,390,0 chrIV 1493975 . C T 4877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.433;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=27.87;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-2.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:4877,471,0 chrIV 1494542 . T G 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2772,279,0 chrIV 1494612 . T C 2665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2698,273,0 chrIV 1494779 . G A 2628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2661,267,0 chrIV 1495218 . G A 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3077,307,0 chrIV 1495512 . A C 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3710,375,0 chrIV 1495521 . T C 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3605,361,0 chrIV 1495550 . G A 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3162,327,0 chrIV 1495580 . C A 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2758,279,0 chrIV 1495680 . C T 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=12.2590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.02;SB=-2.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3864,391,0 chrIV 1495814 . G A 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3834,367,0 chrIV 1496077 . T C 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;QD=25.50;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2813,306,0 chrIV 1496312 . A G 4302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56;SB=-2.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4302,433,0 chrIV 1496498 . C T 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3235,316,0 chrIV 1496691 . C A 4342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4342,427,0 chrIV 1496788 . A G 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3612,375,0 chrIV 1497133 . A T 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2467,240,0 chrIV 1497214 . G A 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2868,277,0 chrIV 1497679 . G C 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.36;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3222,324,0 chrIV 1497793 . C T 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2767,276,0 chrIV 1497881 . T C 3768.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3768,393,0 chrIV 1497922 . T A 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3719,367,0 chrIV 1498015 . A T 1600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=14.81;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:1633,165,0 chrIV 1498087 . C G 2004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=22.77;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2037,222,0 chrIV 1498175 . A T 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3033,303,0 chrIV 1498558 . A G 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3004,297,0 chrIV 1498564 . C G 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2858,294,0 chrIV 1498915 . T C 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.45;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3233,333,0 chrIV 1498969 . G C 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3355,334,0 chrIV 1499290 . C T 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3460,328,0 chrIV 1499328 . G A 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3179,307,0 chrIV 1499382 . T C 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2795,288,0 chrIV 1499487 . C T 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2825,280,0 chrIV 1500051 . C T 2118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2151,207,0 chrIV 1500134 . C T 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2823,274,0 chrIV 1500757 . A G 4036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.520;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=27.46;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:4036,394,0 chrIV 1500841 . G T 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.969;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3260,328,0 chrIV 1500945 . G A 3888.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3888,376,0 chrIV 1501006 . A C 2611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.51;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2644,279,0 chrIV 1501020 . T C 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.32;MQ0=0;QD=22.85;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2866,294,0 chrIV 1501077 . T A 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=19.84;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:2771,279,0 chrIV 1501080 . T C 2599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.52;MQ0=0;QD=19.25;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:2632,273,0 chrIV 1501132 . G C 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3106,318,0 chrIV 1501182 . G C 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4003,409,0 chrIV 1501183 . C T 4028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=27.40;SB=-2.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4028,409,0 chrIV 1501212 . C T 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.65;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3349,342,0 chrIV 1501236 . T A 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.31;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3453,340,0 chrIV 1501238 . T C 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.31;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3332,339,0 chrIV 1501321 . T A 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3915,382,0 chrIV 1501322 . T C 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:3944,388,0 chrIV 1501359 . G A 4009.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4009,388,0 chrIV 1501372 . T C 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3493,351,0 chrIV 1501404 . C T 3802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.22;SB=-2.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3802,361,0 chrIV 1501453 . T C 4199.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.24;SB=-2.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4199,420,0 chrIV 1501555 . A G 2529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.62;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2562,273,0 chrIV 1501681 . T C 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2868,300,0 chrIV 1501840 . G A 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.96;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3607,367,0 chrIV 1501879 . C T 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3418,337,0 chrIV 1501882 . C T 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3262,325,0 chrIV 1501936 . T C 2551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2584,264,0 chrIV 1502106 . T C 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7936;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=25.23;ReadPosRankSum=-0.608;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2909,306,0 chrIV 1502303 . C G 3966.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3966,391,0 chrIV 1502377 . G A 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3920,397,0 chrIV 1502494 . T C 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3293,333,0 chrIV 1502550 . A G 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3203,315,0 chrIV 1502666 . T C 3778.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.42;SB=-2.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3778,387,0 chrIV 1502742 . T A 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3645,355,0 chrIV 1502817 . C T 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3471,340,0 chrIV 1502831 . T G 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2919,291,0 chrIV 1502849 . C T 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=112;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=26.27;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2975,270,0 chrIV 1502908 . C A 2413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.37;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2446,252,0 chrIV 1503023 . T C 2228 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.52;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2261,231,0 chrIV 1503107 . T C 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.684;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=26.03;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3749,366,0 chrIV 1503206 . T C 4058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4058,409,0 chrIV 1503301 . T C 2307 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.76;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2340,237,0 chrIV 1503303 . G A 2327 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.42;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2360,228,0 chrIV 1503306 . A T 2305 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.88;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2338,225,0 chrIV 1503329 . G A 2539 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.73;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2572,255,0 chrIV 1503576 . A G 2658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.23;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2691,285,0 chrIV 1503587 . A G 2254 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.81;MQ0=0;QD=22.10;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2287,240,0 chrIV 1503593 . A G 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.22;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2565,276,0 chrIV 1503632 . T A 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.02;MQ0=0;QD=26.94;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3131,313,0 chrIV 1503648 . G A 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.98;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2933,289,0 chrIV 1503693 . G C 2654 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.95;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2687,270,0 chrIV 1503776 . A G 2371 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.46;MQ0=0;QD=26.34;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2404,252,0 chrIV 1503861 . A G 318 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.86;MQ0=0;QD=7.76;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:36:351,36,0 chrIV 1503887 . G A 322 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.221;DP=61;Dels=0.00;FS=2.811;HaplotypeScore=17.2959;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.18;MQ0=0;MQRankSum=2.636;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.058;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,29:61:36:355,36,0 chrIV 1503903 . G A 317 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.07;MQ0=0;MQRankSum=2.929;QD=13.78;ReadPosRankSum=-4.000;SB=-6.900e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,14:23:36:350,36,0 chrIV 1503921 . G A 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.770;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8811;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=2;MQRankSum=-0.766;QD=1.63;ReadPosRankSum=-1.002;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,8:17:6:59,6,0 chrIV 1503947 . G A 727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.64;MQ0=2;MQRankSum=0.919;QD=15.80;ReadPosRankSum=-1.082;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,42:46:64:760,64,0 chrIV 1503965 . G A 955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.132;DP=49;Dels=0.00;FS=6.896;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.39;MQ0=2;MQRankSum=1.674;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.450;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,41:49:64:988,64,0 chrIV 1503993 . G A 1797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.122;DP=87;Dels=0.00;FS=2.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.36;MQ0=2;MQRankSum=2.827;QD=20.66;ReadPosRankSum=1.838;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,74:87:99:1830,195,0 chrIV 1504019 . A G 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.841;DP=117;Dels=0.00;FS=2.365;HaplotypeScore=9.8933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.72;MQ0=0;MQRankSum=2.980;QD=21.50;ReadPosRankSum=3.893;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,102:117:99:2548,249,0 chrIV 1504024 . C T 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.348;DP=128;Dels=0.00;FS=3.870;HaplotypeScore=8.9545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.64;MQ0=0;MQRankSum=3.445;QD=22.62;ReadPosRankSum=4.719;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,113:128:99:2928,281,0 chrIV 1504046 . A G 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.88;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3449,351,0 chrIV 1504103 . G A 3754.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.38;MQ0=4;QD=25.19;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3754,373,0 chrIV 1504175 . G A 48.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.865;DP=123;Dels=0.00;FS=5.665;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.72;MQ0=9;MQRankSum=-2.112;QD=0.39;ReadPosRankSum=1.294;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,25:123:78:78,0,2016 chrIV 1504193 . A G 2622.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.873;DP=156;Dels=0.00;FS=2.424;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.97;MQ0=6;MQRankSum=4.181;QD=16.81;ReadPosRankSum=2.238;SB=-6.321e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,129:156:10:2652,0,10 chrIV 1504222 . T C 3948.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;DP=173;Dels=0.00;FS=5.825;HaplotypeScore=15.6972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.91;MQ0=0;MQRankSum=3.545;QD=22.82;ReadPosRankSum=-1.073;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,165:173:99:3948,402,0 chrIV 1504234 . G A 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=6.659;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=5.832;QD=19.94;ReadPosRankSum=5.321;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:37,146:183:99:3649,101,0 chrIV 1504290 . A G 5008.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9436;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.95;MQ0=3;QD=22.76;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:5008,502,0 chrIV 1504297 . C T 959.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;DP=231;Dels=0.00;FS=3.417;HaplotypeScore=5.0592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.75;MQ0=6;MQRankSum=-0.593;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.146;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,87:231:99:989,0,2748 chrIV 1504301 . T C 1168.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.605;DP=231;Dels=0.00;FS=4.247;HaplotypeScore=5.8913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQ0=6;MQRankSum=-0.208;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.651;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,91:231:99:1198,0,2815 chrIV 1504322 . G A 1629.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.552;DP=250;Dels=0.00;FS=8.778;HaplotypeScore=2.8800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.65;MQ0=7;MQRankSum=2.302;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.650;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,106:250:99:1659,0,2361 chrIV 1504370 . G A 1361.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.747;DP=206;Dels=0.00;FS=5.080;HaplotypeScore=34.6772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.45;MQ0=9;MQRankSum=-0.597;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.933;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,91:206:99:1391,0,1715 chrIV 1504373 . G A 1179.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.046;DP=202;Dels=0.00;FS=0.545;HaplotypeScore=34.6772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.45;MQ0=9;MQRankSum=2.959;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,78:202:99:1209,0,1895 chrIV 1504388 . G A 1070.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.992;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.09;MQ0=7;MQRankSum=-1.401;QD=6.11;ReadPosRankSum=6.146;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,80:175:99:1100,0,1365 chrIV 1504438 . T C 1364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;DP=68;Dels=0.00;FS=3.014;HaplotypeScore=7.3261;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.31;MQ0=0;MQRankSum=1.906;QD=20.06;ReadPosRankSum=2.305;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,66:68:99:1397,127,0 chrIV 1504461 . T A 527.42 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=41;Dels=0.00;FS=13.697;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.75;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=12.86;ReadPosRankSum=1.977;SB=-3.014e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,38:41:7:557,0,7 chrIV 1504463 . A T 513.22 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;DP=40;Dels=0.00;FS=13.367;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.45;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=12.83;ReadPosRankSum=2.259;SB=-3.102e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:10:543,0,10 chrIV 1504465 . C G 493.52 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;DP=40;Dels=0.00;FS=13.367;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.45;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=12.34;ReadPosRankSum=2.465;SB=-2.985e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:6:523,0,6 chrIV 1504466 . G A 506.79 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.773;DP=40;Dels=0.00;FS=13.367;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.45;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=12.67;ReadPosRankSum=2.824;SB=-3.128e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:4:536,0,4 chrIV 1504468 . C A 504.52 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;DP=40;Dels=0.00;FS=13.367;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.45;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=12.61;ReadPosRankSum=2.824;SB=-3.095e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:6:534,0,6 chrIV 1504470 . A G 504.33 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;DP=40;Dels=0.00;FS=8.709;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=12.61;ReadPosRankSum=2.203;SB=-3.073e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:14:537,14,0 chrIV 1504474 . A C 490.27 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;DP=40;Dels=0.00;FS=13.367;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.45;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=12.26;ReadPosRankSum=2.824;SB=-2.913e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:9:520,0,9 chrIV 1504493 . A G 356 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.90;MQ0=0;QD=11.87;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:42:389,42,0 chrIV 1504507 . C T 109.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.62;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=5.20;ReadPosRankSum=-1.073;SB=-2.295e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:15:142,15,0 chrIV 1504511 . T C 78.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-3.527e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:12:111,12,0 chrIV 1504541 . A G 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.69;MQ0=0;QD=3.26;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:54,6,0 chrIV 1504583 . G A 1055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.649;DP=51;Dels=0.00;FS=8.181;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.63;MQ0=1;MQRankSum=3.460;QD=20.69;ReadPosRankSum=-3.331;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,45:51:99:1088,114,0 chrIV 1504663 . T C 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4940;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.12;MQ0=0;QD=20.82;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2386,252,0 chrIV 1504680 . A G 97.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.802;DP=114;Dels=0.00;FS=26.502;HaplotypeScore=23.6865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.64;MQ0=0;MQRankSum=-4.101;QD=0.85;ReadPosRankSum=-2.878;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:127,0,1809 chrIV 1504685 . T C 76.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.200;DP=116;Dels=0.00;FS=25.752;HaplotypeScore=16.9236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.839;QD=0.66;ReadPosRankSum=-1.756;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,33:116:99:106,0,1835 chrIV 1504689 . T G 177.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.207;DP=105;Dels=0.00;FS=19.068;HaplotypeScore=7.9570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.154;QD=1.69;ReadPosRankSum=-1.743;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,34:105:99:207,0,1538 chrIV 1504713 . A G 563.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.830;DP=105;Dels=0.00;FS=29.480;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=5.36;ReadPosRankSum=-3.078;SB=-6.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:593,0,956 chrIV 1504717 . T C 468.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;DP=103;Dels=0.00;FS=24.775;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=4.54;ReadPosRankSum=-6.223;SB=-7.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:498,0,963 chrIV 1504723 . C T 182.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.374;DP=101;Dels=0.00;FS=9.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.593;QD=1.80;ReadPosRankSum=-6.256;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,29:101:99:212,0,1186 chrIV 1504725 . T G 197.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.430;DP=98;Dels=0.00;FS=4.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.10;MQ0=0;MQRankSum=-4.075;QD=2.01;ReadPosRankSum=-6.634;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:227,0,1305 chrIV 1504938 . G A 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7232;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.17;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:96:99:2570,252,0 chrIV 1504947 . A G 2522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.47;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2555,261,0 chrIV 1504951 . C G 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.72;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2792,285,0 chrIV 1504971 . C A 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3258,319,0 chrIV 1505138 . T A 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3418,340,0 chrIV 1505243 . A G 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3003,303,0 chrIV 1505437 . A G 4307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:158:99:4307,454,0 chrIV 1505562 . A G 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3106,318,0 chrIV 1505642 . C T 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.24;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2690,267,0 chrIV 1505691 . G C 1549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.81;MQ0=0;QD=25.39;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1582,165,0 chrIV 1505703 . A G 1067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.10;MQ0=0;QD=20.92;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1100,117,0 chrIV 1505716 . T C 911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.93;MQ0=0;QD=25.31;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:944,99,0 chrIV 1505722 . C T 731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.03;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:78:764,78,0 chrIV 1505728 . G A 543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:60:576,60,0 chrIV 1505809 . C G 1698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.64;MQ0=0;QD=19.52;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1731,180,0 chrIV 1505850 . G A 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.32;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3566,349,0 chrIV 1505869 . C T 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3744,370,0 chrIV 1505904 . T C 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3574;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.73;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3867,388,0 chrIV 1505951 . A G 4035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4035,417,0 chrIV 1506008 . C T 4570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=27.53;SB=-2.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4570,451,0 chrIV 1506371 . G A 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=1;QD=25.91;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3887,382,0 chrIV 1506542 . G A 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.183;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=27.04;ReadPosRankSum=0.370;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3921,368,0 chrIV 1506740 . A G 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=25.75;ReadPosRankSum=-1.553;SB=-2.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:3992,397,0 chrIV 1506853 . C T 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3668,355,0 chrIV 1506970 . G A 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2733,265,0 chrIV 1506992 . G C 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2724,279,0 chrIV 1507078 . A G 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3695,378,0 chrIV 1507082 . C G 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3685,384,0 chrIV 1507540 . T G 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.961e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3805,387,0 chrIV 1507780 . G A 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3242,304,0 chrIV 1507981 . A G 4434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4434,447,0 chrIV 1508454 . G A 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3439,343,0 chrIV 1508550 . T C 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3405,354,0 chrIV 1508583 . G T 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3442,334,0 chrIV 1508644 . C T 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=28.92;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3818,373,0 chrIV 1508840 . G A 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3549,354,0 chrIV 1509009 . C G 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6812;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:145:99:3422,339,0 chrIV 1509300 . T C 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3737,384,0 chrIV 1509719 . C T 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3414,340,0 chrIV 1510214 . C T 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3432,325,0 chrIV 1510368 . C T 3755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.79;MQ0=0;QD=27.81;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3755,379,0 chrIV 1510383 . A C 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.62;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3697,393,0 chrIV 1510411 . A G 3228.29 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.74;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3261,348,0 chrIV 1510417 . G A 3109 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.05;MQ0=0;QD=22.69;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3142,330,0 chrIV 1510421 . G T 3089 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.16;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3122,327,0 chrIV 1510422 . G A 3107 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.29;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3140,330,0 chrIV 1510501 . G A 4411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.30;MQ0=0;QD=27.57;SB=-2.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4411,439,0 chrIV 1510510 . C A 4321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.84;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4321,430,0 chrIV 1510552 . T C 4720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4720,487,0 chrIV 1510882 . G A 3409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=1;QD=27.72;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3409,346,0 chrIV 1511013 . C T 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2951,297,0 chrIV 1511041 . C T 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2922,297,0 chrIV 1511078 . C T 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=28.11;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2900,286,0 chrIV 1511153 . C A 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2618,255,0 chrIV 1511255 . T C 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2904,303,0 chrIV 1511348 . C T 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2905,283,0 chrIV 1511510 . G T 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=28.46;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3529,349,0 chrIV 1511659 . C T 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=28.34;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3457,334,0 chrIV 1511886 . A G 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3089,330,0 chrIV 1512312 . G A 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3430,340,0 chrIV 1513649 . T C 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.090;DP=124;Dels=0.00;FS=5.024;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=25.77;ReadPosRankSum=1.620;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3228,318,0 chrIV 1513839 . G T 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2848,285,0 chrIV 1514173 . G C 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2892,297,0 chrIV 1514235 . A G 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3090,315,0 chrIV 1514258 . T C 3886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3886,394,0 chrIV 1514370 . C T 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3229,328,0 chrIV 1514403 . A G 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3298,339,0 chrIV 1514528 . T C 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2789,285,0 chrIV 1514569 . A T 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2864,283,0 chrIV 1514712 . T C 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3126,315,0 chrIV 1514773 . A C 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3013,300,0 chrIV 1514828 . A T 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2714,265,0 chrIV 1514885 . C T 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2441,228,0 chrIV 1515083 . C T 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2723,258,0 chrIV 1515183 . T C 2180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.77;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2213,228,0 chrIV 1515216 . A G 2498 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:94:99:2531,255,0 chrIV 1515303 . A T 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2851,277,0 chrIV 1515420 . T C 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=25.27;ReadPosRankSum=0.346;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2686,258,0 chrIV 1515455 . C T 2636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=26.36;ReadPosRankSum=1.524;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2669,256,0 chrIV 1515582 . T C 2407 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2440,249,0 chrIV 1515661 . A G 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3383,354,0 chrIV 1515708 . T C 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=26.18;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3018,312,0 chrIV 1515864 . G C 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2876,291,0 chrIV 1515946 . G A 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.21;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3204,327,0 chrIV 1515956 . G A 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3282,328,0 chrIV 1515965 . G T 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.53;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3286,331,0 chrIV 1516038 . T G 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3432,345,0 chrIV 1516083 . C T 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3735,367,0 chrIV 1516137 . G A 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=28.02;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3199,324,0 chrIV 1516250 . T G 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3087,309,0 chrIV 1516301 . G A 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=28.48;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3361,331,0 chrIV 1516312 . G A 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=28.08;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3482,358,0 chrIV 1516441 . A G 2414 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2447,264,0 chrIV 1516642 . A G 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;QD=0.17;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:122:6:52,6,0 chrIV 1516658 . T C 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3168,312,0 chrIV 1516666 . G A 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3244,313,0 chrIV 1516703 . C T 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3152,307,0 chrIV 1516810 . T C 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3325,322,0 chrIV 1516853 . T G 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3282,318,0 chrIV 1516976 . G C 2531 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2564,258,0 chrIV 1517088 . T A 2210 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.09;MQ0=0;QD=26.31;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2243,228,0 chrIV 1517095 . C A 1961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.689;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=24.51;ReadPosRankSum=1.386;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:80:99:1994,204,0 chrIV 1517115 . C G 1476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.52;MQ0=0;QD=23.81;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1509,153,0 chrIV 1517124 . A G 1596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.678;DP=64;Dels=0.00;FS=3.291;HaplotypeScore=4.2741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.41;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.920;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:1629,168,0 chrIV 1517334 . A G 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3559,355,0 chrIV 1517708 . A C 1824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.51;MQ0=0;QD=24.00;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1857,201,0 chrIV 1517709 . A G 1845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=23.96;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1878,204,0 chrIV 1517744 . T C 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.27;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2707,294,0 chrIV 1517745 . C T 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.17;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2776,294,0 chrIV 1517758 . T C 2662 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.47;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2695,285,0 chrIV 1517833 . A G 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.57;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2672,285,0 chrIV 1517934 . C A 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.75;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2620,264,0 chrIV 1517966 . A G 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2622,267,0 chrIV 1518137 . A G 3832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.928e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3832,402,0 chrIV 1518269 . A G 4141.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4141,421,0 chrIV 1518332 . T C 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.46;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3581,372,0 chrIV 1518334 . C A 3828.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=26.22;SB=-2.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3828,385,0 chrIV 1518445 . A C 986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.52;MQ0=0;QD=19.33;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1019,111,0 chrIV 1518448 . G T 85.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.25;SB=-3.871e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:118,12,0 chrIV 1518694 . C T 2688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=28.00;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2721,262,0 chrIV 1518926 . T A 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3608,370,0 chrIV 1518997 . C G 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=23.48;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3039,318,0 chrIV 1519082 . G A 2919 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.74;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2952,312,0 chrIV 1519083 . A G 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.79;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2903,312,0 chrIV 1519105 . G A 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.12;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3099,307,0 chrIV 1519177 . C A 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2586,264,0 chrIV 1519267 . T C 2367 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;QD=25.18;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2400,246,0 chrIV 1519279 . C T 2376 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2409,249,0 chrIV 1519310 . T G 2330 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.29;MQ0=0;QD=24.27;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2363,252,0 chrIV 1519313 . C G 2511 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.33;MQ0=0;QD=25.36;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2544,258,0 chrIV 1519316 . C A 2524 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.78;MQ0=0;QD=25.49;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2557,255,0 chrIV 1519393 . G A 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3015,301,0 chrIV 1519398 . G A 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.23;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2946,292,0 chrIV 1519407 . T C 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.35;MQ0=0;QD=26.39;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3068,310,0 chrIV 1519429 . G A 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.67;MQ0=0;QD=27.56;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3335,331,0 chrIV 1519461 . A G 2307 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.15;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2340,240,0 chrIV 1519463 . A G 2286 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.17;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2319,243,0 chrIV 1519512 . T C 2372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2405,240,0 chrIV 1519563 . G A 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2707,264,0 chrIV 1519598 . T A 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=28.47;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3388,325,0 chrIV 1519615 . C T 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3188,313,0 chrIV 1519618 . G A 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.78;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3270,319,0 chrIV 1519850 . T C 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3230,327,0 chrIV 1520098 . G C 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3073,306,0 chrIV 1520273 . G A 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.23;MQ0=0;QD=26.65;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3438,343,0 chrIV 1520281 . C T 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.55;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3087,298,0 chrIV 1520285 . C T 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.61;MQ0=0;QD=26.80;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3088,298,0 chrIV 1520501 . G A 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.88;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2855,283,0 chrIV 1520813 . C T 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=28.34;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3712,361,0 chrIV 1520843 . G A 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3739,364,0 chrIV 1520921 . A G 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=145;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=26.04;ReadPosRankSum=1.278;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3776,381,0 chrIV 1521015 . T C 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3308,336,0 chrIV 1521081 . G A 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3250,319,0 chrIV 1521084 . T A 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3164,316,0 chrIV 1521171 . C T 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3262,301,0 chrIV 1521256 . C T 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=28.45;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3699,361,0 chrIV 1521296 . A G 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3505,349,0 chrIV 1521369 . A C 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2926,292,0 chrIV 1521435 . A T 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3514,337,0 chrIV 1521557 . T C 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=118.9838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.41;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3395,339,0 chrIV 1521594 . T C 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.96;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2973,300,0 chrIV 1521638 . C T 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.32;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3434,349,0 chrIV 1521711 . T C 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.33;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:3987,400,0 chrIV 1521834 . A G 1256 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.56;MQ0=0;QD=18.47;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1289,138,0 chrIV 1521941 . A G 2071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.53;MQ0=1;QD=22.51;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2104,213,0 chrIV 1522055 . T C 2507 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2540,255,0 chrIV 1522245 . A G 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3109,303,0 chrIV 1522332 . T C 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.84;MQ0=0;QD=26.30;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2663,282,0 chrIV 1522334 . A G 2701 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.73;MQ0=0;QD=27.56;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2734,282,0 chrIV 1522398 . G A 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.52;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2544,255,0 chrIV 1522415 . G A 2362 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.55;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2395,237,0 chrIV 1522423 . C T 2197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=79.5434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.50;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=23.88;ReadPosRankSum=1.657;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:2230,228,0 chrIV 1522501 . C T 1392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.543;DP=55;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=5.6618;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=25.31;ReadPosRankSum=1.669;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,54:55:99:1425,144,0 chrIV 1522527 . T G 120.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;DP=62;Dels=0.00;FS=7.648;HaplotypeScore=50.7568;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.03;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.538;SB=-6.286e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,60:62:2:150,2,0 chrIV 1522539 . T C 1625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.95;MQ0=0;QD=25.00;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1658,183,0 chrIV 1522544 . C T 1810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.70;MQ0=0;QD=26.62;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1843,186,0 chrIV 1522592 . A T 1734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.12;MQ0=0;QD=24.08;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1767,189,0 chrIV 1522616 . C T 1958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.34;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1991,207,0 chrIV 1522631 . G C 1911 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.18;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1944,210,0 chrIV 1522634 . C T 1746 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.92;MQ0=0;QD=24.25;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1779,192,0 chrIV 1522636 . G A 1759 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.92;MQ0=0;QD=24.43;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1792,192,0 chrIV 1522649 . A G 1677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.79;MQ0=0;QD=23.62;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1710,186,0 chrIV 1522700 . G A 1805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.66;MQ0=0;QD=24.07;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:75:99:1838,192,0 chrIV 1522713 . T G 1939 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.22;MQ0=0;QD=22.55;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1972,204,0 chrIV 1522718 . G A 2005 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.81;MQ0=0;QD=23.05;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2038,207,0 chrIV 1522722 . T C 1848 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.90;MQ0=0;QD=21.74;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1881,195,0 chrIV 1522755 . T C 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.41;MQ0=0;QD=24.63;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2619,276,0 chrIV 1522807 . C T 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.58;MQ0=0;QD=28.03;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2724,270,0 chrIV 1522830 . T C 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.27;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2832,291,0 chrIV 1522920 . G A 1941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=84;Dels=0.00;FS=8.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.94;MQ0=0;MQRankSum=2.264;QD=23.11;ReadPosRankSum=3.221;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,79:84:99:1974,201,0 chrIV 1522934 . G T 2023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.82;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2056,207,0 chrIV 1522967 . G A 2364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.61;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2397,237,0 chrIV 1522973 . C T 2344 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.22;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2377,237,0 chrIV 1522982 . T C 2496 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.57;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2529,255,0 chrIV 1522984 . T C 2463 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.882;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.74;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=23.24;ReadPosRankSum=0.065;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2496,231,0 chrIV 1523060 . G C 2377 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.77;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2410,246,0 chrIV 1523071 . A G 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.44;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2711,273,0 chrIV 1523096 . A G 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.97;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2747,273,0 chrIV 1523171 . G C 1961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.24;MQ0=0;QD=23.63;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:83:99:1994,201,0 chrIV 1523192 . G C 1829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.71;MQ0=0;QD=24.07;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:76:99:1862,189,0 chrIV 1523232 . A C 1748 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.303;DP=99;Dels=0.00;FS=3.764;HaplotypeScore=4.7233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.88;MQ0=16;MQRankSum=3.470;QD=17.66;ReadPosRankSum=2.933;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,83:99:99:1781,146,0 chrIV 1523281 . C T 1106.27 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;DP=114;Dels=0.00;FS=42.113;HaplotypeScore=5.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.05;MQ0=31;MQRankSum=6.146;QD=9.70;ReadPosRankSum=-5.306;SB=-2.703e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:114:9:1136,0,9 chrIV 1523284 . T C 1061.98 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.130;DP=115;Dels=0.00;FS=48.526;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.97;MQ0=32;MQRankSum=6.242;QD=9.23;ReadPosRankSum=-5.793;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:3:1091,0,3 chrIV 1523350 . T G 1197.34 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.414;DP=154;Dels=0.00;FS=32.335;HaplotypeScore=5.5283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.78;MQ0=64;MQRankSum=3.566;QD=7.77;ReadPosRankSum=2.295;SB=-3.348e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,91:154:8:1227,0,8 chrIV 1523440 . T C 703 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-5.639;DP=105;Dels=0.00;FS=11.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.54;MQ0=51;MQRankSum=4.847;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:42,63:105:84:736,84,0 chrIV 1523482 . C T 602 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;DP=105;Dels=0.00;FS=4.168;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.21;MQ0=58;MQRankSum=4.869;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.368;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:67,38:105:66:635,66,0 chrIV 1523820 . T C 15.88 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.36;MQ0=0;QD=1.06;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:47,6,0 chrIV 1523888 . A G 50.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.15;MQ0=2;QD=4.25;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:83,9,0 chrIV 1523913 . T C 51.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.03;MQ0=3;QD=4.72;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:9:84,9,0 chrIV 1523932 . C T 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.83;MQ0=3;MQRankSum=1.186;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.387;SB=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:31:97,0,31 chrIV 1523934 . G C 64.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.83;MQ0=3;MQRankSum=0.825;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.387;SB=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:34:94,0,34 chrIV 1523971 . G A 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;DP=21;Dels=0.00;FS=35.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.46;MQ0=2;MQRankSum=0.450;QD=1.00;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:51:51,0,163 chrIV 1523978 . A G 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;DP=21;Dels=0.00;FS=41.904;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.62;MQ0=1;MQRankSum=-0.175;QD=1.10;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:53:53,0,173 chrIV 1524001 . G A 88.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;DP=15;Dels=0.00;FS=34.776;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.24;MQ0=1;MQRankSum=0.193;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.109;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:87:118,0,87 chrIV 1524003 . C T 224.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.24;MQ0=1;QD=14.93;SB=-1.138e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:257,27,0 chrIV 1524008 . G T 58.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;DP=14;Dels=0.00;FS=34.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.02;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=4.14;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:88:88,0,113 chrIV 1524014 . G A 57.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;DP=13;Dels=0.00;FS=31.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.66;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.256;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:87:87,0,109 chrIV 1524025 . T C 60.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;DP=11;Dels=0.00;FS=25.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=5.46;ReadPosRankSum=-2.520;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:65:90,0,65 chrIV 1524027 . A G 60.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;DP=11;Dels=0.00;FS=25.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=5.46;ReadPosRankSum=-2.520;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:67:90,0,67 chrIV 1524040 . C T 174.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.75;MQ0=0;QD=17.41;SB=-8.956e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:207,21,0 chrIV 1524043 . A G 166.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.75;MQ0=0;QD=16.61;SB=-8.456e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:199,21,0 chrIV 1524045 . C T 37.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;DP=11;Dels=0.00;FS=25.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=3.36;ReadPosRankSum=1.398;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:67:67,0,92 chrIV 1524052 . T A 40.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:70:70,0,73 chrIV 1524054 . G A 143.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.63;MQ0=0;QD=17.89;SB=-8.763e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18:176,18,0 chrIV 1524058 . A G 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.23;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:42:69,0,42 chrIV 1524059 . T C 107.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.23;MQ0=0;QD=15.32;SB=-8.130e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:140,15,0 chrIV 1524076 . C G 51.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.99;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:84,9,0 chrIV 1524311 . T C 15.25 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.44;MQ0=3;MQRankSum=-0.742;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-2.211e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:13:45,0,13 chrIV 1524351 . G T 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;DP=48;Dels=0.00;FS=10.428;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.44;MQ0=7;MQRankSum=-0.490;QD=0.88;ReadPosRankSum=3.264;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:72:72,0,325 chrIV 1524367 . G T 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.627;DP=53;Dels=0.00;FS=7.319;HaplotypeScore=10.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.78;MQ0=9;MQRankSum=-0.334;QD=0.79;ReadPosRankSum=2.624;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:72:72,0,343 chrIV 1524372 . C G 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=53;Dels=0.00;FS=20.121;HaplotypeScore=10.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.78;MQ0=9;MQRankSum=-1.510;QD=0.79;ReadPosRankSum=1.981;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:72:72,0,344 chrIV 1524416 . G A 207.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;DP=38;Dels=0.00;FS=7.319;HaplotypeScore=5.8548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.75;MQ0=4;MQRankSum=2.220;QD=5.45;ReadPosRankSum=3.989;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:93:237,0,93 chrIV 1524418 . C A 210.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.821;DP=38;Dels=0.00;FS=7.319;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.75;MQ0=4;MQRankSum=2.185;QD=5.53;ReadPosRankSum=4.093;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:93:240,0,93 chrIV 1524478 . G A 32.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.69;MQ0=2;QD=4.71;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:9:65,9,0 chrIV 1524506 . G T 208.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.46;MQ0=5;QD=9.91;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:27:241,27,0 chrIV 1524526 . T G 83.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;DP=27;Dels=0.00;FS=13.554;HaplotypeScore=16.7396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.02;MQ0=5;MQRankSum=0.537;QD=3.07;ReadPosRankSum=3.172;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:27:99:113,0,117 chrIV 1524533 . A T 65.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;DP=28;Dels=0.00;FS=1.804;HaplotypeScore=16.7396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.66;MQ0=5;MQRankSum=-0.403;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-7.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:95:95,0,136 chrIV 1524542 . C T 271 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;DP=28;Dels=0.00;FS=5.836;HaplotypeScore=11.2802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.66;MQ0=5;MQRankSum=0.678;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.131;SB=-7.300e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:36:304,36,0 chrIV 1524543 . C T 107.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;DP=28;Dels=0.00;FS=1.804;HaplotypeScore=11.2802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.66;MQ0=5;MQRankSum=1.023;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.961;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:95:137,0,95 chrIV 1524548 . A G 65.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.327;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.3490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.55;MQ0=5;MQRankSum=-0.849;QD=2.17;ReadPosRankSum=2.053;SB=-7.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:95:95,0,139 chrIV 1524552 . C T 65.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.906;DP=30;Dels=0.00;FS=1.941;HaplotypeScore=9.3490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.55;MQ0=5;MQRankSum=0.878;QD=2.17;ReadPosRankSum=3.298;SB=-4.104e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:95:95,0,133 chrIV 1524600 . A G 32.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.1383;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.71;MQ0=0;QD=1.94;SB=-8.772e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:17:9:65,9,0 chrIV 1524636 . A G 76.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;DP=38;Dels=0.00;FS=6.709;HaplotypeScore=24.2724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.28;MQ0=6;MQRankSum=-0.084;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.718;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:106,0,231 chrIV 1524652 . G A 194.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=63;Dels=0.00;FS=4.191;HaplotypeScore=39.0316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.23;MQ0=12;MQRankSum=2.048;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:224,0,427 chrIV 1524653 . G A 157.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.121;DP=64;Dels=0.00;FS=7.971;HaplotypeScore=29.3162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.12;MQ0=12;MQRankSum=-2.760;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.298;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:187,0,471 chrIV 1524683 . G A 239.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;DP=76;Dels=0.00;FS=7.266;HaplotypeScore=37.5766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.40;MQ0=13;MQRankSum=1.016;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:269,0,526 chrIV 1524685 . T A 338.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;DP=76;Dels=0.00;FS=14.431;HaplotypeScore=38.5344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.40;MQ0=13;MQRankSum=1.680;QD=4.45;ReadPosRankSum=-1.737;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:368,0,432 chrIV 1524689 . G A 152.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.209;DP=75;Dels=0.00;FS=13.953;HaplotypeScore=63.0956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.48;MQ0=13;MQRankSum=0.668;QD=2.03;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-4.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:182,0,609 chrIV 1524698 . G A 60.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.416;DP=74;Dels=0.00;FS=2.442;HaplotypeScore=46.3271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.39;MQ0=13;MQRankSum=-2.308;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,21:74:90:90,0,696 chrIV 1524700 . A G 330.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.748;DP=74;Dels=0.00;FS=12.438;HaplotypeScore=47.6713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.39;MQ0=13;MQRankSum=1.578;QD=4.46;ReadPosRankSum=2.764;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:74:99:360,0,433 chrIV 1524707 . G A 638.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.022;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=36.4482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.61;MQ0=13;MQRankSum=2.010;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.438;SB=-3.785e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,51:75:99:668,0,143 chrIV 1524717 . A G 91.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.233;DP=79;Dels=0.00;FS=8.306;HaplotypeScore=12.7778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.11;MQ0=15;MQRankSum=-0.287;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-4.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:121,0,759 chrIV 1524751 . C T 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.119;DP=51;Dels=0.00;FS=2.868;HaplotypeScore=7.0938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.52;MQ0=6;MQRankSum=-1.299;QD=2.29;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:147,0,350 chrIV 1524761 . T C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.944;DP=54;Dels=0.00;FS=3.853;HaplotypeScore=5.4158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.41;MQ0=11;MQRankSum=-1.036;QD=0.21;ReadPosRankSum=-3.964;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,7:54:41:41,0,481 chrIV 1524772 . A G 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.8363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.46;MQ0=21;MQRankSum=0.017;QD=0.18;ReadPosRankSum=0.397;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,5:68:42:42,0,467 chrIV 1524779 . T A 629 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.3393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.98;MQ0=24;QD=8.50;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:66:662,66,0 chrIV 1524780 . T C 315.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.604;DP=74;Dels=0.00;FS=10.731;HaplotypeScore=11.3393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.98;MQ0=24;MQRankSum=1.297;QD=4.26;ReadPosRankSum=4.565;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:345,0,182 chrIV 1524794 . C T 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.436;DP=93;Dels=0.00;FS=13.384;HaplotypeScore=23.3479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.09;MQ0=30;MQRankSum=-0.580;QD=0.60;ReadPosRankSum=-4.210;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,13:93:86:86,0,520 chrIV 1524796 . G A 90.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.858;DP=96;Dels=0.00;FS=12.435;HaplotypeScore=24.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.11;MQ0=30;MQRankSum=-0.836;QD=0.94;ReadPosRankSum=-4.688;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:120,0,538 chrIV 1524824 . G A 80.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;DP=94;Dels=0.00;FS=12.626;HaplotypeScore=7.6728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.52;MQ0=29;MQRankSum=-0.700;QD=0.85;ReadPosRankSum=2.863;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:110,0,489 chrIV 1524838 . G T 159.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;DP=84;Dels=0.00;FS=3.717;HaplotypeScore=12.4621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.73;MQ0=27;MQRankSum=-0.713;QD=1.89;ReadPosRankSum=-4.110;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,37:84:99:189,0,294 chrIV 1524864 . G A 131.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.244;DP=64;Dels=0.00;FS=4.461;HaplotypeScore=9.4701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.49;MQ0=21;MQRankSum=0.304;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:161,0,162 chrIV 1524886 . T A,C 96.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=16.44;MQ0=3;MQRankSum=0.217;QD=5.05;ReadPosRankSum=1.302;SB=-6.681e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,3,15:19:68:156,77,68,79,0,70 chrIV 1524898 . A G 16.13 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;DP=14;Dels=0.00;FS=6.154;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.44;MQ0=2;MQRankSum=1.517;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.259;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:21:46,0,21 chrIV 1524905 . T A 17.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=13;Dels=0.00;FS=6.154;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.06;MQ0=2;MQRankSum=1.408;QD=1.32;ReadPosRankSum=1.532;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:21:47,0,21 chrIV 1524907 . G T 21.07 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;DP=11;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.03;MQ0=2;MQRankSum=1.159;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.159;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:19:51,0,19 chrIV 1524974 . A G 555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=21.8080;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.09;MQ0=3;QD=15.00;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:63:588,63,0 chrIV 1525003 . G A 547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.805;DP=31;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.37;MQ0=3;MQRankSum=1.342;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.417;SB=-2.907e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:31:41:580,41,0 chrIV 1525062 . A G 79.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.666;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:12:112,12,0 chrIV 1525071 . G A 77.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.06;MQ0=0;QD=11.07;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:110,12,0 chrIV 1525152 . G A 53.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=3.8936;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:86,9,0 chrIV 1525216 . C G 217.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.66;MQ0=0;QD=21.70;SB=-5.396e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:27:250,27,0 chrIV 1525218 . G C 220.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;DP=10;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.66;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=22.00;ReadPosRankSum=0.000;SB=-5.896e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:27:253,27,0 chrIV 1525263 . A G 47.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.25;MQ0=0;QD=9.59;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:80,9,0 chrIV 1525284 . G A 19.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.06;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.495;SB=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:19:49,0,19 chrIV 1525289 . G A 16.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.06;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.495;SB=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:20:46,0,20 chrIV 1525335 . C G 51.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.73;MQ0=0;QD=8.66;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:84,9,0 chrIV 1525340 . C A 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.94;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:59,6,0 chrIV 1525472 . A C 167.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.84;MQ0=5;QD=12.85;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,10:13:21:200,21,0 chrIV 1525481 . T C 164.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.99;MQ0=7;QD=10.94;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,12:15:21:197,21,0 chrIV 1525482 . G T 167.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.20;MQ0=8;QD=10.44;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,12:16:21:200,21,0 chrIV 1525823 . C T 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.34;MQ0=73;MQRankSum=0.358;QD=0.19;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.574e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,11:78:45:45,0,46 chrIV 1525890 . A G 41.04 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.08;MQ0=103;MQRankSum=-0.358;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.358;SB=-4.066e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,9:108:18:71,0,18 chrIX 8262 . C T 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.48;MQ0=43;MQRankSum=1.470;QD=0.32;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,42:56:6:49,6,0 chrIX 19312 . A G 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.000;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.70;MQ0=62;MQRankSum=0.582;QD=0.14;ReadPosRankSum=0.672;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,14:83:41:41,0,381 chrIX 19415 . T A 1725 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.13;MQ0=63;QD=12.97;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:1758,201,0 chrIX 19456 . T C 343.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.545;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.09;MQ0=53;MQRankSum=-1.118;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:373,0,649 chrIX 19607 . G A 696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.284;DP=127;Dels=0.00;FS=7.257;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQ0=1;MQRankSum=-3.914;QD=5.48;ReadPosRankSum=3.499;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,47:127:99:726,0,1664 chrIX 19619 . C T 727.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.500;DP=124;Dels=0.00;FS=4.494;HaplotypeScore=2.1232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.80;MQ0=1;MQRankSum=-4.081;QD=5.86;ReadPosRankSum=2.098;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,51:124:99:757,0,1441 chrIX 19623 . G A 752.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.281;DP=120;Dels=0.00;FS=4.501;HaplotypeScore=2.1232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.956;QD=6.27;ReadPosRankSum=2.092;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:120:99:782,0,1425 chrIX 19625 . C T 726.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.292;DP=117;Dels=0.00;FS=4.589;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.95;MQ0=0;MQRankSum=-4.220;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.455;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:756,0,1382 chrIX 19631 . C T 729.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.523;DP=120;Dels=0.00;FS=3.354;HaplotypeScore=3.2276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.821;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.182;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:759,0,1444 chrIX 19685 . A G 555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.667;DP=216;Dels=0.00;FS=5.720;HaplotypeScore=10.8928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQ0=1;MQRankSum=-2.248;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.690;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,55:216:99:585,0,3442 chrIX 19858 . T C 472.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.303;DP=237;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=2.7692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQ0=4;MQRankSum=-2.305;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.347;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,50:237:99:502,0,4041 chrIX 19891 . C A 286.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.199;DP=208;Dels=0.00;FS=11.483;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.53;MQ0=4;MQRankSum=-2.602;QD=1.38;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,34:208:99:316,0,3366 chrIX 19924 . T C 369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.238;DP=224;Dels=0.00;FS=12.252;HaplotypeScore=7.8703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.25;MQ0=1;MQRankSum=0.205;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,47:223:99:399,0,3793 chrIX 19966 . T C 66.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.687;DP=177;Dels=0.00;FS=10.552;HaplotypeScore=25.4448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.65;MQ0=2;MQRankSum=-0.459;QD=0.37;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,26:177:96:96,0,3117 chrIX 19968 . T G 374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;DP=178;Dels=0.00;FS=9.527;HaplotypeScore=25.4448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.67;MQ0=3;MQRankSum=-2.542;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.259;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,42:178:99:404,0,2817 chrIX 19993 . C A 401.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.690;DP=198;Dels=0.00;FS=7.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.26;MQ0=5;MQRankSum=-2.333;QD=2.03;ReadPosRankSum=0.590;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,48:198:99:431,0,3040 chrIX 19997 . A G 389.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.848;DP=196;Dels=0.00;FS=4.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.99;MQ0=7;MQRankSum=-2.160;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.689;SB=-1.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,45:196:99:419,0,3245 chrIX 20039 . A C 3463.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.39;MQ0=17;QD=19.68;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:3463,375,0 chrIX 20053 . A T 86.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.181;DP=172;Dels=0.00;FS=0.826;HaplotypeScore=15.2622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.09;MQ0=17;MQRankSum=-4.484;QD=0.50;ReadPosRankSum=-1.928;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,37:172:99:116,0,2399 chrIX 20104 . C T 138.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.206;DP=173;Dels=0.00;FS=0.789;HaplotypeScore=68.5446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.77;MQ0=13;MQRankSum=-3.854;QD=0.80;ReadPosRankSum=0.332;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,35:173:99:168,0,2726 chrIX 20107 . G A 372.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.289;DP=176;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=69.4898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.60;MQ0=11;MQRankSum=-5.562;QD=2.11;ReadPosRankSum=1.668;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,45:176:99:402,0,2532 chrIX 20112 . C T 1042.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.154;DP=187;Dels=0.00;FS=3.797;HaplotypeScore=68.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.80;MQ0=11;MQRankSum=4.025;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,61:187:99:1072,0,2157 chrIX 20167 . T C 492.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.357;DP=201;Dels=0.00;FS=9.776;HaplotypeScore=9.9049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.27;MQ0=11;MQRankSum=1.982;QD=2.45;ReadPosRankSum=1.521;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,42:201:99:522,0,3148 chrIX 20196 . A C 609.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.800;DP=188;Dels=0.00;FS=20.426;HaplotypeScore=54.6890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.68;MQ0=13;MQRankSum=0.992;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,49:188:99:639,0,2710 chrIX 20198 . G A 1309.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.088;DP=192;Dels=0.00;FS=33.300;HaplotypeScore=53.6956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.49;MQ0=13;MQRankSum=-0.140;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.789;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,78:192:99:1339,0,2013 chrIX 20218 . C T 1231.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.382;DP=171;Dels=0.00;FS=4.863;HaplotypeScore=5.9353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.84;MQ0=13;MQRankSum=2.431;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.033;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,71:171:99:1261,0,1623 chrIX 20247 . T C 825.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.647;DP=147;Dels=0.00;FS=22.047;HaplotypeScore=4.2817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.00;MQ0=11;MQRankSum=5.314;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.085;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,46:146:99:855,0,1415 chrIX 20260 . G A 457.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.200;DP=128;Dels=0.00;FS=5.880;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.23;MQ0=12;MQRankSum=-7.003;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.164;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:487,0,1349 chrIX 20287 . T C 934.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.675;DP=104;Dels=0.00;FS=7.020;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.37;MQ0=9;MQRankSum=7.547;QD=8.98;ReadPosRankSum=2.312;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:964,0,394 chrIX 20296 . C T 246.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.524;DP=104;Dels=0.00;FS=1.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.48;MQ0=9;MQRankSum=-7.383;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:276,0,1063 chrIX 20299 . A G 171.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.649;DP=101;Dels=0.00;FS=1.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.28;MQ0=10;MQRankSum=-6.984;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:201,0,1084 chrIX 20325 . A G 1256 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.16;MQ0=10;QD=16.10;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:78:99:1289,147,0 chrIX 20332 . A T 591.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.80;MQ0=10;MQRankSum=2.063;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:76:99:621,0,469 chrIX 20356 . T C 227.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.337;DP=79;Dels=0.00;FS=3.599;HaplotypeScore=2.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.32;MQ0=12;MQRankSum=-1.130;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.445;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,28:79:99:257,0,873 chrIX 20382 . A G 1181.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.50;MQ0=14;MQRankSum=4.134;QD=13.12;ReadPosRankSum=2.177;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,63:90:27:1211,0,27 chrIX 20437 . G A 1487.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.288;DP=114;Dels=0.00;FS=19.642;HaplotypeScore=11.8655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.86;MQ0=14;MQRankSum=5.095;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.011;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,77:114:99:1517,0,163 chrIX 20494 . A G 1929 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.01;MQ0=19;QD=18.37;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:1962,222,0 chrIX 20548 . C G 1094.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.821;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.78;MQ0=16;MQRankSum=1.625;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,66:156:99:1124,0,1297 chrIX 20664 . G A 1614.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.480;DP=193;Dels=0.00;FS=12.540;HaplotypeScore=4.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.44;MQ0=5;MQRankSum=4.241;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,86:193:99:1644,0,1874 chrIX 20698 . G A 696.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.236;DP=194;Dels=0.00;FS=12.207;HaplotypeScore=2.7635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.36;MQ0=8;MQRankSum=-0.610;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,54:194:99:726,0,2872 chrIX 20726 . G T 946.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.186;DP=204;Dels=0.00;FS=5.543;HaplotypeScore=11.8032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.25;MQ0=10;MQRankSum=-2.086;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.234;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,68:203:99:976,0,2573 chrIX 20791 . C T 1097.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.829;DP=182;Dels=0.00;FS=1.205;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.14;MQ0=9;MQRankSum=-3.641;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.416;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,76:182:99:1127,0,2041 chrIX 20845 . G A 257.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.072;DP=168;Dels=0.00;FS=8.257;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.53;MQ0=7;MQRankSum=-3.239;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,38:168:99:287,0,2534 chrIX 20856 . T A 161.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.807;DP=157;Dels=0.00;FS=13.140;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.03;MQ0=6;MQRankSum=-3.709;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.274;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,32:157:99:191,0,2676 chrIX 20866 . G C 243.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;DP=151;Dels=0.00;FS=13.076;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.19;MQ0=6;MQRankSum=-4.507;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-1.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,30:151:99:273,0,2422 chrIX 20888 . G A 883.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.868;DP=136;Dels=0.00;FS=2.301;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.56;MQ0=12;MQRankSum=-0.033;QD=6.49;ReadPosRankSum=2.281;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,59:136:99:913,0,1350 chrIX 20889 . C T 2676 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.37;MQ0=12;QD=20.27;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2709,273,0 chrIX 20950 . T C 499.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.687;DP=100;Dels=0.00;FS=19.334;HaplotypeScore=20.7570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.44;MQ0=17;MQRankSum=1.768;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.242;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,35:100:99:529,0,1159 chrIX 20953 . C T 635.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.961;DP=104;Dels=0.00;FS=35.664;HaplotypeScore=20.7570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.33;MQ0=22;MQRankSum=-2.748;QD=6.11;ReadPosRankSum=2.063;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:665,0,987 chrIX 20962 . A G 280.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.921;DP=98;Dels=0.00;FS=10.446;HaplotypeScore=14.8066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.07;MQ0=27;MQRankSum=-0.167;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,32:98:99:310,0,1093 chrIX 20988 . A T 218.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.151;DP=105;Dels=0.00;FS=7.544;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.55;MQ0=20;MQRankSum=-3.339;QD=2.08;ReadPosRankSum=2.168;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:248,0,1416 chrIX 21065 . T C 76.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;DP=88;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=10.1458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.70;MQ0=9;MQRankSum=-6.966;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.176;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,33:88:99:106,0,1266 chrIX 21076 . A G 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.862;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.1542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.67;MQ0=11;MQRankSum=-6.272;QD=0.31;ReadPosRankSum=0.734;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,29:82:55:55,0,1221 chrIX 21121 . G A 799 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.815;DP=68;Dels=0.00;FS=7.336;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.11;MQ0=24;MQRankSum=4.306;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.198;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,45:68:56:832,56,0 chrIX 21234 . G A 343 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.79;MQ0=30;QD=6.86;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,26:50:42:376,42,0 chrIX 21239 . A G 288 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;DP=49;Dels=0.00;FS=7.858;HaplotypeScore=15.3298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.32;MQ0=30;MQRankSum=0.066;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.661;SB=-8.400e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,23:49:36:321,36,0 chrIX 21253 . A T 98.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;DP=50;Dels=0.00;FS=25.092;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.89;MQ0=31;MQRankSum=0.296;QD=1.96;ReadPosRankSum=-0.887;SB=2.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,7:50:18:131,18,0 chrIX 21264 . T A 74.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.81;MQ0=28;QD=1.86;SB=-5.451e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,25:40:12:107,12,0 chrIX 21273 . C T 105.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.22;MQ0=26;QD=2.77;SB=-5.526e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,19:38:15:138,15,0 chrIX 21279 . C T 70.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;DP=37;Dels=0.00;FS=8.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.44;MQ0=25;MQRankSum=-0.831;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.244;SB=-5.711e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:13:100,0,13 chrIX 21289 . C T 212.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.73;MQ0=33;QD=4.61;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:27:245,27,0 chrIX 21314 . T A 124.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;DP=60;Dels=0.00;FS=13.919;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.51;MQ0=45;MQRankSum=-1.682;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.220;SB=-3.059e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,10:60:99:154,0,128 chrIX 21342 . C T 145.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;DP=61;Dels=0.00;FS=13.919;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.38;MQ0=46;MQRankSum=-2.431;QD=2.38;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-2.949e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,10:61:99:175,0,122 chrIX 21373 . C T 180.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.780;DP=73;Dels=0.00;FS=10.922;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.30;MQ0=47;MQRankSum=-2.186;QD=2.47;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,12:73:99:210,0,294 chrIX 21380 . C A 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.666;DP=69;Dels=0.00;FS=4.558;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.33;MQ0=47;MQRankSum=-2.044;QD=0.71;ReadPosRankSum=1.269;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,7:69:79:79,0,335 chrIX 21381 . A T 48.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;DP=69;Dels=0.00;FS=4.558;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.33;MQ0=47;MQRankSum=-1.551;QD=0.70;ReadPosRankSum=1.903;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,7:69:78:78,0,354 chrIX 21384 . C T 50.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.641;DP=70;Dels=0.00;FS=4.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.31;MQ0=44;MQRankSum=-1.940;QD=0.71;ReadPosRankSum=1.078;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,9:70:80:80,0,372 chrIX 21397 . T G 80.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;DP=67;Dels=0.00;FS=4.314;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.05;MQ0=35;MQRankSum=-1.032;QD=1.19;ReadPosRankSum=1.187;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,12:67:99:110,0,421 chrIX 21401 . G A 127.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.509;DP=75;Dels=0.00;FS=2.007;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.67;MQ0=40;MQRankSum=-1.041;QD=1.69;ReadPosRankSum=0.563;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:157,0,402 chrIX 21419 . C T 436.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.096;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.24;MQ0=32;MQRankSum=0.648;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.259;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,55:75:99:466,0,288 chrIX 21741 . A G 1907 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7963;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.01;MQ0=9;MQRankSum=-0.834;QD=20.96;ReadPosRankSum=1.604;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:91:99:1940,186,0 chrIX 21742 . A G 48.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.850;DP=91;Dels=0.00;FS=1.270;HaplotypeScore=7.7963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.01;MQ0=9;MQRankSum=1.510;QD=0.53;ReadPosRankSum=1.129;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,14:91:78:78,0,1509 chrIX 21951 . T C 804.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.907;DP=111;Dels=0.00;FS=12.828;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.61;MQ0=47;MQRankSum=1.434;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,74:111:99:834,0,155 chrIX 22039 . C G 52.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;DP=69;Dels=0.00;FS=8.066;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.91;MQ0=33;MQRankSum=0.037;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:82:82,0,464 chrIX 22109 . T A 419.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;DP=100;Dels=0.00;FS=11.971;HaplotypeScore=42.1033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.18;MQ0=17;MQRankSum=0.939;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.583;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,34:100:99:449,0,805 chrIX 22321 . G A 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.950;DP=55;Dels=0.00;FS=5.927;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.46;MQ0=36;MQRankSum=0.850;QD=0.26;ReadPosRankSum=1.050;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:44:44,0,215 chrIX 22531 . A T 389.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.54;MQ0=26;MQRankSum=-0.830;QD=5.48;ReadPosRankSum=-1.376;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,30:71:99:419,0,441 chrIX 22614 . T C 1409 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.357;DP=78;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.76;MQ0=5;MQRankSum=-1.879;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.206;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,69:78:63:1442,63,0 chrIX 22632 . A G 1031.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.46;MQ0=9;MQRankSum=-0.976;QD=14.73;ReadPosRankSum=1.122;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,58:70:29:1064,29,0 chrIX 22647 . A T 998.20 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;DP=78;Dels=0.00;FS=4.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.78;MQ0=19;MQRankSum=-1.837;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.830;SB=-5.012e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,62:78:2:1027,0,2 chrIX 22700 . C T 280.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.950;DP=88;Dels=0.00;FS=12.257;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.68;MQ0=39;MQRankSum=-3.991;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.303;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:310,0,319 chrIX 22702 . A T 199.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;DP=90;Dels=0.00;FS=17.374;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.56;MQ0=39;MQRankSum=-4.137;QD=2.21;ReadPosRankSum=2.006;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,52:90:99:229,0,428 chrIX 22708 . C T 175.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.212;DP=88;Dels=0.00;FS=25.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.38;MQ0=38;MQRankSum=-4.243;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.258;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:205,0,448 chrIX 22749 . G A 314.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.764;DP=86;Dels=0.00;FS=20.316;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.09;MQ0=24;MQRankSum=-2.511;QD=3.65;ReadPosRankSum=-3.359;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:344,0,637 chrIX 22769 . C G 570.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.903;DP=106;Dels=0.00;FS=3.335;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.84;MQ0=14;MQRankSum=0.483;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,43:106:99:600,0,1159 chrIX 22790 . G T 769.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;DP=118;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=2.7156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.59;MQ0=14;MQRankSum=-1.109;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.155;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:799,0,1244 chrIX 22872 . A G 635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.213;DP=58;Dels=0.00;FS=1.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.66;MQ0=3;MQRankSum=0.555;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:665,0,489 chrIX 22928 . T C 345.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.499;DP=66;Dels=0.00;FS=4.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.06;MQ0=19;MQRankSum=0.802;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.481;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:375,0,428 chrIX 22938 . G A 405.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.131;DP=68;Dels=0.00;FS=4.589;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.11;MQ0=19;MQRankSum=0.613;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.211;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:435,0,407 chrIX 23371 . G A 2011.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.815;DP=138;Dels=0.00;FS=14.774;HaplotypeScore=2.6968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.49;MQ0=10;MQRankSum=0.788;QD=14.57;ReadPosRankSum=-2.216;SB=-4.876e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,111:138:99:2041,0,165 chrIX 23525 . G T 929.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.183;DP=339;Dels=0.00;FS=5.339;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.37;MQ0=28;MQRankSum=1.912;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.347;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,80:339:99:959,0,4146 chrIX 23605 . G A 144.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.675;DP=114;Dels=0.00;FS=4.442;HaplotypeScore=13.8734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.16;MQ0=11;MQRankSum=1.537;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.005;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,21:114:99:174,0,1213 chrIX 23647 . A G 199.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.50;MQ0=9;QD=5.69;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:27:232,27,0 chrIX 23650 . T C 158.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.81;MQ0=7;QD=5.45;SB=-4.053e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:21:191,21,0 chrIX 23656 . A G 69.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.74;MQ0=7;QD=3.16;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:12:102,12,0 chrIX 23671 . C G 74.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=10.64;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:107,12,0 chrIX 23677 . T G 74.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=10.64;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:107,12,0 chrIX 23685 . C T 74.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=10.64;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:107,12,0 chrIX 23686 . A G 73.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=10.50;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:106,12,0 chrIX 23704 . G A 52.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 chrIX 23705 . G A 48.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.32;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:81,9,0 chrIX 23780 . T C 14.20 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.49;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=2.37;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-1.276e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:19:44,0,19 chrIX 23785 . G T 16.15 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.49;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=2.69;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-1.283e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:18:46,0,18 chrIX 23791 . G A 16.15 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.18;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-1.283e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:18:46,0,18 chrIX 23803 . G A 16.17 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=3.8316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.18;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.000;SB=-1.730e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:16:46,0,16 chrIX 23809 . G A 15.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=4.7943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.18;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=2.17;ReadPosRankSum=1.495;SB=-1.292e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:17:45,0,17 chrIX 23813 . A G 16.15 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=4.7943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.18;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.922;SB=-1.283e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:18:46,0,18 chrIX 23818 . G T 18.13 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=8;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=2.9410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.69;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=2.27;ReadPosRankSum=1.380;SB=-3.044e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:8:17:48,0,17 chrIX 23830 . T G 14.20 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.79;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=2.03;ReadPosRankSum=0.000;SB=-1.828e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:19:44,0,19 chrIX 23832 . G A 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=9.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.21;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-1.825e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:41:42,0,41 chrIX 23837 . G A 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=9.700;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.21;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=1.65;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-1.725e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:41:43,0,41 chrIX 23838 . C T 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=9.700;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=1.65;ReadPosRankSum=1.920;SB=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:39:43,0,39 chrIX 23842 . T A 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;DP=9;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=1.36;ReadPosRankSum=2.054;SB=-1.896e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:42:42,0,44 chrIX 23846 . G T 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.21;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-2.773e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:6:55,6,0 chrIX 23851 . T A 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.21;MQ0=0;QD=3.96;SB=-2.780e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:55,6,0 chrIX 23859 . T C 46.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.49;MQ0=0;QD=5.87;SB=-5.547e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:79,9,0 chrIX 23860 . G A 49.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.49;MQ0=0;QD=6.25;SB=-5.447e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:82,9,0 chrIX 23862 . A G 49.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.17;MQ0=0;QD=4.54;SB=-5.491e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:82,9,0 chrIX 23888 . T C 820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.24;MQ0=0;QD=22.16;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:96:853,96,0 chrIX 23893 . G T 925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.12;MQ0=0;QD=23.12;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:958,102,0 chrIX 24157 . G T 1895 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.594;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.52;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=25.27;ReadPosRankSum=1.547;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,74:75:99:1928,207,0 chrIX 24160 . A C 1939 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=24.24;ReadPosRankSum=1.169;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:80:99:1972,216,0 chrIX 24163 . G A 2037 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.650;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.949;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,83:84:99:2070,222,0 chrIX 24340 . G A 1627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1660,177,0 chrIX 24646 . A G 2244 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2277,237,0 chrIX 24792 . C T 2273 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.578;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9526;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=25.26;ReadPosRankSum=1.347;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:90:99:2306,227,0 chrIX 25066 . A G 1717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=22.01;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1750,189,0 chrIX 25228 . G A 2255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.39;MQ0=0;QD=25.62;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2288,246,0 chrIX 25306 . G A 2244 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.541;DP=128;Dels=0.00;FS=9.234;HaplotypeScore=45.4418;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.71;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=17.53;ReadPosRankSum=2.102;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,124:128:99:2277,234,0 chrIX 25308 . T C 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.343;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=49.2071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.71;MQ0=0;MQRankSum=-4.753;QD=0.11;ReadPosRankSum=-5.948;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,51:128:44:44,0,1686 chrIX 25376 . C T 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.010;DP=177;Dels=0.00;FS=14.919;HaplotypeScore=47.6022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.36;MQ0=1;MQRankSum=-3.697;QD=0.07;ReadPosRankSum=-4.296;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,34:177:42:42,0,2441 chrIX 25397 . T G 91.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.110;DP=150;Dels=0.01;FS=5.387;HaplotypeScore=145.4158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.56;MQ0=1;MQRankSum=-2.900;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.519;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,26:149:99:121,0,2203 chrIX 25400 . C G 523.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.087;DP=147;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=141.1252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.58;MQ0=2;MQRankSum=-0.660;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.509;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,51:147:99:553,0,1534 chrIX 25401 . T G 509.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.991;DP=145;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=140.9972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.20;MQ0=2;MQRankSum=1.144;QD=3.51;ReadPosRankSum=-2.459;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,44:145:99:539,0,1070 chrIX 25403 . A C 617.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.243;DP=144;Dels=0.00;FS=10.120;HaplotypeScore=143.1540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.14;MQ0=2;MQRankSum=1.455;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.092;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,42:144:99:647,0,1417 chrIX 25404 . C A 350.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.761;DP=144;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=141.1873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.14;MQ0=2;MQRankSum=-0.060;QD=2.43;ReadPosRankSum=-1.686;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,39:144:99:380,0,1521 chrIX 25405 . A T 335.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;DP=143;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=150.0759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.14;MQ0=2;MQRankSum=0.513;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,38:143:99:365,0,1676 chrIX 25415 . A C 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;DP=127;Dels=0.00;FS=22.261;HaplotypeScore=81.8906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.92;MQ0=4;MQRankSum=0.712;QD=0.39;ReadPosRankSum=-1.246;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,13:127:79:79,0,1702 chrIX 25416 . C T 47.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.807;DP=127;Dels=0.00;FS=17.000;HaplotypeScore=65.2254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.92;MQ0=4;MQRankSum=1.406;QD=0.37;ReadPosRankSum=-1.724;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,14:127:77:77,0,1642 chrIX 25418 . T C 727.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.282;DP=120;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=65.2254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.51;MQ0=4;MQRankSum=1.794;QD=6.06;ReadPosRankSum=-4.011;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:120:99:757,0,675 chrIX 25425 . T C 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.313;DP=104;Dels=0.00;FS=1.228;HaplotypeScore=67.9272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.68;MQ0=4;MQRankSum=1.645;QD=0.31;ReadPosRankSum=0.253;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,11:104:62:62,0,1175 chrIX 25426 . A G 484.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.358;DP=104;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=60.9740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.68;MQ0=4;MQRankSum=1.720;QD=4.65;ReadPosRankSum=-3.114;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,34:104:99:514,0,695 chrIX 25429 . G T 452.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.138;DP=103;Dels=0.00;FS=2.788;HaplotypeScore=81.6332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.68;MQ0=4;MQRankSum=3.026;QD=4.39;ReadPosRankSum=-3.490;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:482,0,748 chrIX 25439 . T G 417.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.341;DP=95;Dels=0.04;FS=5.638;HaplotypeScore=119.1564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.40;MQ0=4;MQRankSum=0.132;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.512;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:447,0,635 chrIX 25442 . C G 59.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.958;DP=87;Dels=0.00;FS=5.972;HaplotypeScore=95.3943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.47;MQ0=4;MQRankSum=1.903;QD=0.68;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,14:87:89:89,0,910 chrIX 25443 . T C 429.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.550;DP=86;Dels=0.00;FS=7.799;HaplotypeScore=87.5693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.46;MQ0=4;MQRankSum=0.295;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,44:86:99:459,0,426 chrIX 25460 . T C 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.253;DP=74;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=19.5760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.77;MQ0=2;MQRankSum=2.003;QD=0.23;ReadPosRankSum=-3.520;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,10:74:47:47,0,882 chrIX 25498 . T G 150.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;DP=26;Dels=0.00;FS=2.706;HaplotypeScore=9.7959;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.62;MQ0=2;MQRankSum=-1.097;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-7.606e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:21:183,21,0 chrIX 25508 . G A 89.79 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=13;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=5.7657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.59;MQ0=2;MQRankSum=1.532;QD=6.91;ReadPosRankSum=2.181;SB=-5.679e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:4:119,0,4 chrIX 25510 . T G 79.79 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.6042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.73;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.531;SB=-5.077e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:4:109,0,4 chrIX 25513 . A T 128.14 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.14;MQ0=0;QD=9.15;SB=-5.408e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:14:18:161,18,0 chrIX 25519 . A G 198.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.8413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.46;MQ0=0;QD=10.42;SB=-7.896e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:19:27:231,27,0 chrIX 25523 . T G 183.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.343;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.8288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.58;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.558;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:63:213,0,63 chrIX 25527 . T C 198.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.633;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.89;MQ0=1;MQRankSum=0.621;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.718;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:40:99:228,0,272 chrIX 25544 . T C 189.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;DP=80;Dels=0.00;FS=23.520;HaplotypeScore=19.6027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.89;MQ0=1;MQRankSum=1.048;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:219,0,996 chrIX 25555 . G T 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;DP=90;Dels=0.00;FS=5.661;HaplotypeScore=29.5272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.76;MQ0=1;MQRankSum=0.695;QD=0.15;ReadPosRankSum=0.708;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,10:90:43:43,0,1305 chrIX 25565 . T G 380.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.392;DP=90;Dels=0.00;FS=6.133;HaplotypeScore=80.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.76;MQ0=1;MQRankSum=-0.820;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.720;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:410,0,958 chrIX 25568 . C G 106.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.631;DP=90;Dels=0.00;FS=20.401;HaplotypeScore=75.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.76;MQ0=1;MQRankSum=1.374;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.097;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:136,0,1217 chrIX 25569 . T C 418.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.677;DP=90;Dels=0.00;FS=0.924;HaplotypeScore=75.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.76;MQ0=1;MQRankSum=0.848;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.783;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:90:99:448,0,677 chrIX 25572 . C A 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.883;DP=90;Dels=0.00;FS=15.343;HaplotypeScore=79.0251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.76;MQ0=1;MQRankSum=0.681;QD=0.54;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,14:90:79:79,0,1231 chrIX 25586 . T C 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;DP=87;Dels=0.00;FS=24.494;HaplotypeScore=40.4609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.78;MQ0=1;MQRankSum=1.857;QD=0.12;ReadPosRankSum=1.157;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,13:87:40:40,0,1390 chrIX 25635 . C T 422.11 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;DP=29;Dels=0.00;FS=2.515;HaplotypeScore=4.7560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.62;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:29:13:452,0,13 chrIX 25636 . T A 445.18 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;DP=27;Dels=0.00;FS=5.316;HaplotypeScore=4.7560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.80;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-1.609e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:11:475,0,11 chrIX 25644 . A C 110.34 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.07;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-4.883e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:8:140,0,8 chrIX 25645 . A T 126.79 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.07;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-4.954e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:4:156,0,4 chrIX 25666 . T G 130.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=1;QD=14.46;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:163,18,0 chrIX 25676 . G A 11.34 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.05;MQ0=1;MQRankSum=0.729;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.876;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:41:41,0,41 chrIX 25678 . T G 25.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.66;MQ0=1;MQRankSum=0.851;QD=2.27;ReadPosRankSum=1.098;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:55:55,0,65 chrIX 25681 . A G,T 52.52 SnpCluster;filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=22.87;MQ0=1;QD=4.38;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,4:11:37:112,46,37,66,0,60 chrIX 25686 . A C 34.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.87;MQ0=1;MQRankSum=-1.186;QD=2.83;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:63:64,0,63 chrIX 25687 . A G,T 79.01 SnpCluster;filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=22.87;MQ0=1;QD=6.58;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,4,8:12:57:139,73,64,66,0,57 chrIX 25691 . T G 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.843;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.40;MQ0=1;MQRankSum=-0.259;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.073;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:79:79,0,88 chrIX 25695 . T C 45.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.843;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.40;MQ0=1;MQRankSum=1.517;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.073;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:75:75,0,85 chrIX 25733 . T G 312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.960;DP=50;Dels=0.00;FS=23.537;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.92;MQ0=3;MQRankSum=1.388;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.850;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:342,0,444 chrIX 25737 . T C 295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.615;DP=51;Dels=0.00;FS=23.983;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.66;MQ0=3;MQRankSum=1.579;QD=5.78;ReadPosRankSum=2.227;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:325,0,464 chrIX 25765 . A G 934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.27;MQ0=2;QD=19.06;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:967,114,0 chrIX 25792 . T G 966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.46;MQ0=2;QD=20.55;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:999,111,0 chrIX 25817 . T G 170.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.136;DP=26;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=6.9129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:91:200,0,91 chrIX 25819 . G A 355 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.81;MQ0=0;QD=13.65;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:45:388,45,0 chrIX 25820 . C G 25.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.513;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.85;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=0.93;ReadPosRankSum=3.403;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,7:27:55:55,0,261 chrIX 25821 . T C 150.80 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;DP=27;Dels=0.00;FS=3.493;HaplotypeScore=7.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=5.59;ReadPosRankSum=2.095;SB=6.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:27:41:180,0,41 chrIX 25824 . C A 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.845;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.85;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=1.22;ReadPosRankSum=3.624;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,7:27:63:63,0,253 chrIX 25825 . A T 31.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.85;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=1.15;ReadPosRankSum=3.624;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,7:27:61:61,0,264 chrIX 25838 . A T 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.946;DP=23;Dels=0.00;FS=3.617;HaplotypeScore=11.8518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.07;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:79:79,0,106 chrIX 25867 . C T 198.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.05;MQ0=0;QD=9.90;SB=-2.381e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:27:231,27,0 chrIX 25874 . C T 69.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.05;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=3.45;ReadPosRankSum=-1.444;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:82:99,0,82 chrIX 25881 . T C 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=2.17;ReadPosRankSum=-2.443;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:60:69,0,60 chrIX 25885 . T G 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.874;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=1.32;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:51:51,0,63 chrIX 25897 . T A 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=4.36;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:53,6,0 chrIX 25906 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=4.36;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:53,6,0 chrIX 29565 . G A 447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=6.12;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:51:480,51,0 chrIX 29619 . T G 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.98;MQ0=0;QD=23.49;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3063,333,0 chrIX 29628 . G C 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=24.60;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3157,348,0 chrIX 29750 . C G 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.592;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.16;MQ0=1;MQRankSum=0.983;QD=21.57;ReadPosRankSum=1.287;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3247,327,0 chrIX 29855 . C A 4593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4593,471,0 chrIX 29986 . G A 5630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.83;SB=-2.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,218:218:99:5630,583,0 chrIX 30282 . C G 5098.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=24.39;SB=-2.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5098,534,0 chrIX 30416 . A G 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3779,423,0 chrIX 30537 . G A 5077.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.06;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:5077,529,0 chrIX 30598 . G A 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.07;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3476,372,0 chrIX 30599 . G A 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.07;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3468,375,0 chrIX 30609 . A C 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.72;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2878,336,0 chrIX 30639 . T G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.389;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.8593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.31;MQ0=0;MQRankSum=-3.461;QD=6.06;ReadPosRankSum=-9.876;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,55:171:99:1067,0,562 chrIX 30672 . C G 2385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.11;MQ0=0;QD=14.54;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:2418,285,0 chrIX 30688 . A C 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.24;MQ0=0;QD=17.77;SB=-2.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:3213,348,0 chrIX 30792 . A G 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.855;DP=157;Dels=0.00;FS=52.508;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.71;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=17.04;ReadPosRankSum=9.233;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,117:157:99:2709,193,0 chrIX 30821 . A T 208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.708;DP=151;Dels=0.00;FS=8.059;HaplotypeScore=150.5190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.16;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.437;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,49:151:99:238,0,140 chrIX 30845 . C T 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.37;MQ0=0;QD=18.66;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:2870,315,0 chrIX 31001 . G T 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.009;DP=161;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=2.5343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,56:161:99:986,0,2233 chrIX 31283 . A G 6293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;DP=258;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=24.39;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-2.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,256:258:99:6293,634,0 chrIX 31766 . C T 4309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=168;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=3.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=25.65;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-2.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:4309,438,0 chrIX 31904 . G A 5401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=25.60;SB=-2.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5401,550,0 chrIX 31909 . A G 5353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=25.49;SB=-2.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:210:99:5353,547,0 chrIX 31948 . G A 5623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:219:99:5623,562,0 chrIX 32095 . C G 4344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4344,459,0 chrIX 32147 . G C 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3494,384,0 chrIX 32156 . A G 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3819,405,0 chrIX 32295 . A T 4157.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14;SB=-2.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4157,432,0 chrIX 32483 . C T 4927.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.35;SB=-2.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4927,502,0 chrIX 32809 . C T 4878.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4878,502,0 chrIX 32963 . C G 5054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=24.77;ReadPosRankSum=1.476;SB=-2.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,202:203:99:5054,519,0 chrIX 33147 . T C 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3626,393,0 chrIX 33348 . A T 3561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.64;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3561,366,0 chrIX 33441 . T C 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.88;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3111,351,0 chrIX 33484 . A G 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.74;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2871,321,0 chrIX 33485 . T C 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.91;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2798,312,0 chrIX 33510 . A G 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.21;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2940,330,0 chrIX 33515 . C A 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.94;MQ0=0;QD=23.27;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2826,303,0 chrIX 33529 . T G 2195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.83;MQ0=0;QD=19.42;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2228,261,0 chrIX 33531 . A G 2342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.83;MQ0=0;QD=20.73;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2375,267,0 chrIX 33548 . T G 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;QD=20.37;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2559,288,0 chrIX 33549 . G T 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;QD=20.73;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2603,288,0 chrIX 33562 . G T 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.32;MQ0=0;QD=20.30;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:2936,318,0 chrIX 33599 . A T 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.10;MQ0=0;QD=21.01;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3227,354,0 chrIX 34168 . C T 5556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6682;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5556,559,0 chrIX 34666 . A C 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3743,429,0 chrIX 34677 . G A 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.892e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4081,435,0 chrIX 34809 . G A 4356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4356,450,0 chrIX 34826 . G T 4590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4590,463,0 chrIX 34975 . C A 4300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4300,451,0 chrIX 35111 . C T 5303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,206:206:99:5303,555,0 chrIX 35118 . C G 4905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.36;SB=-2.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,210:210:99:4905,540,0 chrIX 35226 . C T 4242.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.68;SB=-2.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4242,447,0 chrIX 35247 . T C 4437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.50;SB=-2.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4437,477,0 chrIX 35312 . G A 4666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.36;SB=-2.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4666,504,0 chrIX 35674 . T C 4398.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.56;MQ0=0;QD=22.79;SB=-2.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4398,471,0 chrIX 35677 . G A 4539.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.26;MQ0=0;QD=24.54;SB=-2.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4539,471,0 chrIX 35680 . G A 4458.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.40;MQ0=0;QD=23.97;SB=-2.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4458,459,0 chrIX 35685 . G A 4405.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.78;MQ0=0;QD=23.81;SB=-2.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,184:185:99:4405,459,0 chrIX 35691 . T C 4343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.16;MQ0=0;QD=22.74;SB=-2.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4343,483,0 chrIX 35770 . T C 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3789,429,0 chrIX 35773 . T G 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3875,426,0 chrIX 35804 . C T 4606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=24.90;SB=-2.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4606,469,0 chrIX 35871 . C T 4744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4744,484,0 chrIX 35894 . A G 4388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.38;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4388,471,0 chrIX 35903 . G T 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3968,420,0 chrIX 35910 . T G 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.01;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3714,405,0 chrIX 35983 . C T 4975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.554;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.312;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,199:200:99:4975,514,0 chrIX 36103 . G A 5508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4347;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=24.81;SB=-2.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,222:222:99:5508,538,0 chrIX 36218 . C T 4256.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4256,465,0 chrIX 36317 . A G 5300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3644;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=25.36;SB=-2.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5300,558,0 chrIX 36359 . T C 4287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4287,480,0 chrIX 36369 . G A 4646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.67;SB=-2.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4646,489,0 chrIX 36456 . C A 5368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5368,547,0 chrIX 36580 . A C 4977.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=25.26;SB=-2.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:4977,525,0 chrIX 36599 . C T 4438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4438,474,0 chrIX 36609 . C T 4679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.29;SB=-2.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4679,481,0 chrIX 36687 . A G 4339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.51;SB=-2.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4339,492,0 chrIX 36782 . G T 5379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.86;SB=-2.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:208:99:5379,553,0 chrIX 36846 . C T 4539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4539,486,0 chrIX 37089 . C T 5200.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.53;SB=-2.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:5200,561,0 chrIX 37213 . G T 162.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.547;DP=198;Dels=0.00;FS=158.982;HaplotypeScore=35.9524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQ0=0;MQRankSum=3.483;QD=0.82;ReadPosRankSum=-8.812;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,38:198:99:192,0,963 chrIX 37214 . G T 168.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.406;DP=197;Dels=0.00;FS=166.706;HaplotypeScore=38.9306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQ0=0;MQRankSum=2.787;QD=0.85;ReadPosRankSum=-8.856;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,36:197:99:198,0,914 chrIX 37215 . A T 239.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;DP=194;Dels=0.02;FS=262.783;HaplotypeScore=44.9458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=2.396;QD=1.23;ReadPosRankSum=-9.624;SB=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,53:191:99:269,0,585 chrIX 37220 . G A 1421 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.690;DP=148;Dels=0.00;FS=29.074;HaplotypeScore=5.2380;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;MQRankSum=2.702;QD=9.60;ReadPosRankSum=2.158;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,144:148:99:1454,142,0 chrIX 37252 . T C 2126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;DP=169;Dels=0.00;FS=24.016;HaplotypeScore=8.0479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=3.921;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.346;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,159:169:99:2159,227,0 chrIX 37367 . T C 108.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.701;DP=133;Dels=0.00;FS=13.908;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-7.071;QD=0.81;ReadPosRankSum=1.524;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,24:133:99:138,0,2384 chrIX 37403 . C A 75.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.877;DP=168;Dels=0.00;FS=9.078;HaplotypeScore=2.7196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=-7.513;QD=0.45;ReadPosRankSum=0.524;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,24:168:99:105,0,3110 chrIX 37420 . T C 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.225;DP=169;Dels=0.00;FS=18.230;HaplotypeScore=3.3853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=-7.367;QD=0.27;ReadPosRankSum=-3.218;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,25:169:76:76,0,3306 chrIX 37424 . G A 3213.02 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.699;DP=168;Dels=0.00;FS=26.493;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=7.576;QD=19.13;ReadPosRankSum=3.844;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,142:168:62:3243,0,62 chrIX 37533 . A C 81.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.601;DP=253;Dels=0.00;FS=93.704;HaplotypeScore=3.4808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-9.602;QD=0.32;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,36:253:99:111,0,5087 chrIX 37540 . T A 132.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.268;DP=248;Dels=0.00;FS=97.616;HaplotypeScore=8.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-9.198;QD=0.53;ReadPosRankSum=-1.538;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,37:248:99:162,0,4753 chrIX 37542 . C G 107.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;DP=250;Dels=0.00;FS=94.168;HaplotypeScore=8.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-9.521;QD=0.43;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,36:250:99:137,0,4714 chrIX 37543 . C T 64.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.672;DP=250;Dels=0.00;FS=93.764;HaplotypeScore=7.4426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-9.336;QD=0.26;ReadPosRankSum=-1.127;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,35:250:94:94,0,4602 chrIX 37555 . G C 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.946;DP=274;Dels=0.00;FS=110.275;HaplotypeScore=7.3032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=-10.009;QD=0.22;ReadPosRankSum=0.176;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,40:274:90:90,0,5117 chrIX 37564 . A G 141.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.290;DP=271;Dels=0.00;FS=121.183;HaplotypeScore=8.5410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.24;MQ0=0;MQRankSum=-10.385;QD=0.52;ReadPosRankSum=0.848;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,44:271:99:171,0,5249 chrIX 37570 . C T 107.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.995;DP=269;Dels=0.00;FS=118.485;HaplotypeScore=13.2914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.22;MQ0=0;MQRankSum=-10.580;QD=0.40;ReadPosRankSum=1.534;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,45:269:99:137,0,5056 chrIX 37582 . C T 154.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.291;DP=241;Dels=0.00;FS=158.953;HaplotypeScore=10.1268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.33;MQ0=0;MQRankSum=-10.969;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.861;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,52:241:99:184,0,4005 chrIX 37585 . A T 257.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.650;DP=274;Dels=0.00;FS=165.933;HaplotypeScore=5.2745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-11.756;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.623;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,61:274:99:287,0,4895 chrIX 37592 . A T 153.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.356;DP=245;Dels=0.00;FS=117.937;HaplotypeScore=4.8278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-11.061;QD=0.62;ReadPosRankSum=1.898;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,55:245:99:183,0,4235 chrIX 37593 . C T 135.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.576;DP=248;Dels=0.00;FS=117.887;HaplotypeScore=5.4929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQ0=0;MQRankSum=-10.945;QD=0.54;ReadPosRankSum=2.203;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,55:248:99:165,0,4125 chrIX 37598 . T C 120.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.854;DP=246;Dels=0.00;FS=94.772;HaplotypeScore=15.4718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=-11.280;QD=0.49;ReadPosRankSum=1.588;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,58:246:99:150,0,4336 chrIX 37600 . G C 93.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.279;DP=261;Dels=0.00;FS=86.387;HaplotypeScore=16.9255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQ0=0;MQRankSum=-11.428;QD=0.36;ReadPosRankSum=1.991;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,59:261:99:123,0,4487 chrIX 37603 . T C 124.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.700;DP=279;Dels=0.00;FS=124.488;HaplotypeScore=20.1424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQ0=0;MQRankSum=-12.393;QD=0.44;ReadPosRankSum=-0.863;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,77:279:99:154,0,4702 chrIX 37609 . C T 122.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;DP=275;Dels=0.00;FS=114.104;HaplotypeScore=18.3713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.28;MQ0=0;MQRankSum=-12.600;QD=0.44;ReadPosRankSum=-1.202;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,77:275:99:152,0,4299 chrIX 37622 . G A 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.274;DP=287;Dels=0.00;FS=118.084;HaplotypeScore=3.1726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.89;MQ0=0;MQRankSum=-12.643;QD=0.18;ReadPosRankSum=0.504;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,76:287:81:81,0,4411 chrIX 37634 . A C 5981.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.303;DP=289;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.0145;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.10;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.734;SB=-2.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,287:289:99:5981,625,0 chrIX 37640 . G C 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.777;DP=294;Dels=0.00;FS=106.492;HaplotypeScore=7.0925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=0;MQRankSum=-12.682;QD=0.05;ReadPosRankSum=0.139;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,76:294:45:45,0,4767 chrIX 37646 . C G 6406.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=304;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4389;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.38;MQ0=0;QD=21.07;SB=-2.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,304:304:99:6406,696,0 chrIX 37651 . C T 184.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.295;DP=315;Dels=0.00;FS=127.667;HaplotypeScore=7.6453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.82;MQ0=0;MQRankSum=-13.129;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.980;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,81:315:99:214,0,5037 chrIX 37652 . A G 191.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.611;DP=307;Dels=0.00;FS=117.892;HaplotypeScore=7.6453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.71;MQ0=0;MQRankSum=-12.980;QD=0.62;ReadPosRankSum=0.428;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,81:307:99:221,0,5118 chrIX 37663 . T G 95.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.960;DP=303;Dels=0.00;FS=107.934;HaplotypeScore=3.4101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.69;MQ0=0;MQRankSum=-12.909;QD=0.31;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,79:303:99:125,0,4988 chrIX 37678 . T C 555.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.091;DP=297;Dels=0.00;FS=119.001;HaplotypeScore=9.0131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.98;MQ0=0;MQRankSum=-12.970;QD=1.87;ReadPosRankSum=-1.899;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,85:297:99:585,0,4777 chrIX 37681 . A T 532.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;DP=300;Dels=0.00;FS=125.792;HaplotypeScore=8.1190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.91;MQ0=0;MQRankSum=-13.113;QD=1.77;ReadPosRankSum=-1.694;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,86:300:99:562,0,4712 chrIX 37689 . T A 766.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.720;DP=275;Dels=0.00;FS=178.240;HaplotypeScore=7.0435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.05;MQ0=0;MQRankSum=-13.061;QD=2.79;ReadPosRankSum=-1.698;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,89:275:99:796,0,4233 chrIX 37690 . C T 770.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.006;DP=282;Dels=0.00;FS=168.627;HaplotypeScore=7.0435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQ0=0;MQRankSum=-13.171;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,89:282:99:800,0,4286 chrIX 37696 . C T 786.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;DP=273;Dels=0.00;FS=179.162;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-13.098;QD=2.88;ReadPosRankSum=-1.676;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,91:273:99:816,0,4027 chrIX 37699 . C G 654.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.941;DP=256;Dels=0.00;FS=143.181;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.64;MQ0=0;MQRankSum=-12.425;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.552;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,77:256:99:684,0,3836 chrIX 37706 . G A 879.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.299;DP=247;Dels=0.00;FS=153.185;HaplotypeScore=5.1268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-12.383;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.129;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,79:247:99:909,0,3722 chrIX 37711 . T C 720.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.341;DP=257;Dels=0.00;FS=138.360;HaplotypeScore=7.8722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.46;MQ0=0;MQRankSum=-12.404;QD=2.80;ReadPosRankSum=3.157;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,77:257:99:750,0,4122 chrIX 37712 . T C 659.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.119;DP=265;Dels=0.00;FS=149.990;HaplotypeScore=7.8722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.74;MQ0=0;MQRankSum=-12.236;QD=2.49;ReadPosRankSum=3.753;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,77:265:99:689,0,4305 chrIX 37723 . G C,T 6340.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=306;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5960;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.12;MQ0=0;QD=20.72;SB=-2.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,196,110:306:99:6340,1952,1412,4388,0,4139 chrIX 37745 . A G 1558.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.637;DP=334;Dels=0.00;FS=263.126;HaplotypeScore=6.3409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-14.553;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.571;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,125:334:99:1588,0,4706 chrIX 37768 . T G 1613.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.724;DP=316;Dels=0.00;FS=263.870;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.82;MQ0=0;MQRankSum=-14.619;QD=5.10;ReadPosRankSum=-2.845;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,122:316:99:1643,0,4364 chrIX 37771 . G A 7639.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=311;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6812;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.14;MQ0=0;QD=24.56;SB=-2.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,311:311:99:7639,817,0 chrIX 37774 . T C 1713.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.399;DP=328;Dels=0.00;FS=187.514;HaplotypeScore=3.5971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.46;MQ0=0;MQRankSum=-15.099;QD=5.22;ReadPosRankSum=-3.813;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,130:328:99:1743,0,4558 chrIX 37786 . C T 2163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.061;DP=355;Dels=0.00;FS=88.308;HaplotypeScore=18.4135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.40;MQ0=0;MQRankSum=-15.753;QD=6.09;ReadPosRankSum=-3.295;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,141:355:99:2193,0,4540 chrIX 37792 . T A 2439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;DP=351;Dels=0.00;FS=63.246;HaplotypeScore=15.6486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.38;MQ0=0;MQRankSum=-15.544;QD=6.95;ReadPosRankSum=-5.518;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,156:351:99:2469,0,4175 chrIX 37797 . G T 4330.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.283;DP=379;Dels=0.00;FS=58.037;HaplotypeScore=14.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.36;MQ0=0;MQRankSum=16.173;QD=11.42;ReadPosRankSum=5.712;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,200:379:99:4330,0,3036 chrIX 37804 . G A 3767.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.926;DP=425;Dels=0.00;FS=33.466;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.43;MQ0=0;MQRankSum=-14.420;QD=8.86;ReadPosRankSum=-4.089;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,211:425:99:3767,0,4387 chrIX 37822 . T C 12779.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=527;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8980;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.47;MQ0=0;QD=24.25;SB=-6.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,527:527:99:12779,1437,0 chrIX 37942 . G A 5435.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=16.193;DP=436;Dels=0.00;FS=28.973;HaplotypeScore=4.2505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.57;MQ0=0;MQRankSum=-9.157;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,270:436:99:5435,0,2775 chrIX 37960 . C T 4896.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.063;DP=438;Dels=0.00;FS=56.723;HaplotypeScore=5.0911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-9.017;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.075;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,247:438:99:4896,0,3622 chrIX 37984 . T G 9039.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=404;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.93;MQ0=0;QD=22.37;SB=-4.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,404:404:99:9039,1048,0 chrIX 37987 . T C 3464.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.869;DP=380;Dels=0.00;FS=51.668;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.71;MQ0=0;MQRankSum=-10.735;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.592;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,204:380:99:3464,0,3520 chrIX 37991 . T C 3444.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.158;DP=399;Dels=0.00;FS=46.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.21;MQ0=0;MQRankSum=-11.909;QD=8.63;ReadPosRankSum=-2.071;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,216:399:99:3444,0,3726 chrIX 38006 . C T 3466.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.605;DP=375;Dels=0.00;FS=35.427;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.04;MQ0=0;MQRankSum=14.092;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.574;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,174:375:99:3466,0,3197 chrIX 38035 . C T 2694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.680;DP=347;Dels=0.00;FS=32.643;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.66;MQ0=0;MQRankSum=-16.043;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.175;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,173:347:99:2724,0,3667 chrIX 38041 . C T 2665.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.579;DP=369;Dels=0.00;FS=23.225;HaplotypeScore=4.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.45;MQ0=0;MQRankSum=-16.463;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.988;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,184:369:99:2695,0,3916 chrIX 38050 . C T 9668.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=408;Dels=0.00;FS=3.651;HaplotypeScore=4.5683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.52;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=23.70;ReadPosRankSum=1.061;SB=-4.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,407:408:99:9668,1034,0 chrIX 38053 . A G 3532.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.914;DP=389;Dels=0.00;FS=56.188;HaplotypeScore=4.5683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.39;MQ0=0;MQRankSum=-16.687;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.816;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,209:389:99:3532,0,3801 chrIX 38059 . A C 3429.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-16.475;DP=399;Dels=0.00;FS=47.136;HaplotypeScore=32.3076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.80;MQ0=0;MQRankSum=-15.680;QD=8.59;ReadPosRankSum=-2.399;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,221:399:99:3429,0,3603 chrIX 38068 . T C 3388.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.359;DP=398;Dels=0.00;FS=33.335;HaplotypeScore=30.2108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.09;MQ0=0;MQRankSum=-12.163;QD=8.51;ReadPosRankSum=-3.976;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,201:398:99:3388,0,4101 chrIX 38095 . C T 5999.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=15.683;DP=487;Dels=0.00;FS=0.336;HaplotypeScore=5.6960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQ0=0;MQRankSum=-14.425;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-2.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,294:487:99:5999,0,3529 chrIX 38101 . T C,G 10366.01 SnpCluster;filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=503;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9304;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=47.58;MQ0=0;QD=20.61;SB=-4.995e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,195,308:503:99:10366,6155,5648,4211,0,3405 chrIX 38102 . T C 5888.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.081;DP=503;Dels=0.00;FS=0.331;HaplotypeScore=7.9237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.51;MQ0=0;MQRankSum=-12.948;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.308;SB=-3.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,310:503:99:5888,0,3539 chrIX 38251 . G A 4083.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.715;DP=650;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=5.4990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=10.700;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:425,224:650:99:4083,0,8806 chrIX 38269 . T A 7534.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;DP=668;Dels=0.00;FS=0.894;HaplotypeScore=10.4215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQ0=0;MQRankSum=-8.482;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.568;SB=-3.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,365:668:99:7534,0,5880 chrIX 38278 . C G 7000.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.801;DP=659;Dels=0.00;FS=0.901;HaplotypeScore=16.2903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.44;MQ0=0;MQRankSum=-7.185;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.497;SB=-3.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,362:659:99:7000,0,5661 chrIX 38437 . C T 5998.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=16.253;DP=477;Dels=0.00;FS=1.963;HaplotypeScore=4.3496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.23;MQ0=0;MQRankSum=-11.824;QD=12.57;ReadPosRankSum=-4.050;SB=-3.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,295:477:99:5998,0,3043 chrIX 38447 . T C 5794.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.951;DP=481;Dels=0.00;FS=1.961;HaplotypeScore=5.4427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQ0=0;MQRankSum=-12.238;QD=12.05;ReadPosRankSum=-6.730;SB=-3.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,302:481:99:5794,0,3466 chrIX 38464 . T C 4038.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-15.909;DP=407;Dels=0.00;FS=11.528;HaplotypeScore=3.7313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.94;MQ0=0;MQRankSum=-16.887;QD=9.92;ReadPosRankSum=-4.721;SB=-2.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,237:407:99:4038,0,3391 chrIX 38467 . T C 3201.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.660;DP=435;Dels=0.00;FS=12.930;HaplotypeScore=42.3766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.53;MQ0=0;MQRankSum=17.401;QD=7.36;ReadPosRankSum=5.531;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,175:435:99:3231,0,4892 chrIX 38470 . C A 4804.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.591;DP=426;Dels=0.00;FS=12.152;HaplotypeScore=42.3766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.58;MQ0=0;MQRankSum=-17.339;QD=11.28;ReadPosRankSum=-4.918;SB=-2.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,254:426:99:4804,0,3270 chrIX 38475 . C T 3280.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.235;DP=358;Dels=0.00;FS=20.885;HaplotypeScore=41.3900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQ0=0;MQRankSum=-16.261;QD=9.16;ReadPosRankSum=4.303;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,171:358:99:3280,0,3869 chrIX 38476 . T G 2165.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.632;DP=355;Dels=0.00;FS=15.340;HaplotypeScore=43.3500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.03;MQ0=0;MQRankSum=-14.882;QD=6.10;ReadPosRankSum=3.764;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,130:355:99:2195,0,3971 chrIX 38478 . G A 3036.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.517;DP=352;Dels=0.00;FS=19.779;HaplotypeScore=43.3500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.90;MQ0=0;MQRankSum=-15.979;QD=8.63;ReadPosRankSum=5.472;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,171:352:99:3066,0,3532 chrIX 38479 . T C 3091.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.519;DP=352;Dels=0.00;FS=19.779;HaplotypeScore=43.3500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.90;MQ0=0;MQRankSum=-15.977;QD=8.78;ReadPosRankSum=6.078;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,171:352:99:3121,0,3807 chrIX 38485 . T C 3294.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.512;DP=423;Dels=0.00;FS=19.518;HaplotypeScore=43.5192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.55;MQ0=0;MQRankSum=-17.601;QD=7.79;ReadPosRankSum=3.583;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,226:423:99:3294,0,4142 chrIX 38487 . C G 3426.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;DP=424;Dels=0.00;FS=19.399;HaplotypeScore=2.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.59;MQ0=0;MQRankSum=-17.612;QD=8.08;ReadPosRankSum=4.295;SB=-2.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,226:424:99:3426,0,4025 chrIX 38488 . T C 3363.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.267;DP=427;Dels=0.00;FS=18.157;HaplotypeScore=2.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.71;MQ0=0;MQRankSum=-17.729;QD=7.88;ReadPosRankSum=4.776;SB=-2.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,226:427:99:3363,0,4207 chrIX 38492 . A T 3546.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.647;DP=480;Dels=0.00;FS=13.641;HaplotypeScore=2.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.43;MQ0=0;MQRankSum=-18.678;QD=7.39;ReadPosRankSum=4.681;SB=-2.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,259:480:99:3546,0,4547 chrIX 38494 . A C 3295.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-15.412;DP=476;Dels=0.00;FS=13.737;HaplotypeScore=2.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.29;MQ0=0;MQRankSum=-18.634;QD=6.92;ReadPosRankSum=4.600;SB=-2.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,259:476:99:3295,0,4611 chrIX 38498 . C T 3691.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=15.537;DP=513;Dels=0.00;FS=8.051;HaplotypeScore=4.7549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.64;MQ0=0;MQRankSum=-19.246;QD=7.19;ReadPosRankSum=5.176;SB=-2.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,272:513:99:3691,0,4995 chrIX 38500 . A G 3464.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-14.731;DP=516;Dels=0.00;FS=5.380;HaplotypeScore=7.7288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.64;MQ0=0;MQRankSum=-19.310;QD=6.71;ReadPosRankSum=5.436;SB=-2.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,272:516:99:3464,0,5259 chrIX 38503 . T G 3334.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.721;DP=521;Dels=0.00;FS=11.059;HaplotypeScore=6.7421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.39;MQ0=0;MQRankSum=-19.382;QD=6.40;ReadPosRankSum=4.320;SB=-2.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,279:521:99:3334,0,5147 chrIX 38506 . G A 3633.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.751;DP=504;Dels=0.00;FS=3.766;HaplotypeScore=4.7976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.88;MQ0=0;MQRankSum=-19.134;QD=7.21;ReadPosRankSum=2.521;SB=-2.933e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,279:504:99:3633,0,4514 chrIX 38515 . T G 2879.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-16.734;DP=472;Dels=0.00;FS=0.331;HaplotypeScore=2.7413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQ0=0;MQRankSum=-18.517;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.787;SB=-2.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,254:472:99:2909,0,4675 chrIX 38517 . A T 3136.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.977;DP=472;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQ0=0;MQRankSum=-18.519;QD=6.64;ReadPosRankSum=1.339;SB=-2.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,253:472:99:3166,0,4598 chrIX 38520 . A G 3015.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-14.074;DP=470;Dels=0.00;FS=0.332;HaplotypeScore=2.7759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.23;MQ0=0;MQRankSum=-18.459;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.285;SB=-2.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,254:470:99:3045,0,4648 chrIX 38521 . T C 2824.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-14.302;DP=473;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=2.7759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.34;MQ0=0;MQRankSum=-18.549;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.680;SB=-2.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,254:473:99:2854,0,4616 chrIX 38524 . C A 3124.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.336;DP=504;Dels=0.00;FS=4.331;HaplotypeScore=2.7759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.47;MQ0=0;MQRankSum=-19.083;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.999;SB=-2.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,286:504:99:3154,0,4327 chrIX 38533 . C T 2659.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.526;DP=484;Dels=0.00;FS=14.518;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.01;MQ0=0;MQRankSum=-18.779;QD=5.49;ReadPosRankSum=-3.215;SB=-2.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,266:484:99:2689,0,4491 chrIX 38536 . C T 2713.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.212;DP=489;Dels=0.00;FS=13.381;HaplotypeScore=3.4373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQ0=0;MQRankSum=-18.915;QD=5.55;ReadPosRankSum=-3.722;SB=-2.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,264:489:99:2743,0,4698 chrIX 38539 . G T 2045.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.462;DP=463;Dels=0.00;FS=6.433;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.17;MQ0=0;MQRankSum=-18.422;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.469;SB=-2.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,236:463:99:2075,0,4658 chrIX 38542 . T C 1593.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-17.971;DP=460;Dels=0.00;FS=9.485;HaplotypeScore=3.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.65;MQ0=0;MQRankSum=-18.299;QD=3.46;ReadPosRankSum=-2.351;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,226:460:99:1623,0,5033 chrIX 38545 . T C 1615.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.971;DP=450;Dels=0.00;FS=5.237;HaplotypeScore=6.2807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.90;MQ0=0;MQRankSum=-18.196;QD=3.59;ReadPosRankSum=-2.498;SB=-2.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,218:450:99:1645,0,4876 chrIX 38548 . C A 1190.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=13.140;DP=434;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=6.4585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.89;MQ0=0;MQRankSum=-17.795;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-1.987e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,196:434:99:1220,0,5016 chrIX 38549 . C T 1213.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=13.334;DP=432;Dels=0.00;FS=0.348;HaplotypeScore=6.4585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-17.688;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,196:432:99:1243,0,5009 chrIX 38588 . A T 2190.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;DP=406;Dels=0.00;FS=13.588;HaplotypeScore=17.5676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQ0=0;MQRankSum=-16.931;QD=5.39;ReadPosRankSum=5.272;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,177:405:99:2220,0,4913 chrIX 38590 . C T 2184.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.412;DP=404;Dels=0.00;FS=12.633;HaplotypeScore=16.6489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.15;MQ0=0;MQRankSum=-16.737;QD=5.41;ReadPosRankSum=5.906;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,177:403:99:2214,0,4561 chrIX 38591 . A G 2120.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.948;DP=383;Dels=0.00;FS=6.515;HaplotypeScore=11.7012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.49;MQ0=0;MQRankSum=-16.551;QD=5.54;ReadPosRankSum=4.563;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,177:383:99:2150,0,4364 chrIX 38593 . A T 2336.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.716;DP=383;Dels=0.00;FS=6.486;HaplotypeScore=11.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.57;MQ0=0;MQRankSum=-16.639;QD=6.10;ReadPosRankSum=5.165;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,177:383:99:2366,0,4413 chrIX 38596 . C T 2294.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=14.022;DP=363;Dels=0.00;FS=10.334;HaplotypeScore=9.8177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.79;MQ0=0;MQRankSum=-16.247;QD=6.32;ReadPosRankSum=3.671;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,177:363:99:2324,0,3698 chrIX 38600 . T A 2334.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;DP=353;Dels=0.00;FS=7.719;HaplotypeScore=5.8589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.58;MQ0=0;MQRankSum=-16.225;QD=6.61;ReadPosRankSum=3.040;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,177:353:99:2364,0,3778 chrIX 38601 . C G 2251.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.263;DP=356;Dels=0.00;FS=12.598;HaplotypeScore=5.8589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.71;MQ0=0;MQRankSum=-16.180;QD=6.32;ReadPosRankSum=3.152;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,177:356:99:2281,0,3788 chrIX 38602 . C T 2263.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=14.055;DP=348;Dels=0.00;FS=10.715;HaplotypeScore=4.8656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.36;MQ0=0;MQRankSum=-16.025;QD=6.50;ReadPosRankSum=2.565;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,179:348:99:2293,0,3292 chrIX 38609 . G C,T 6851.01 SnpCluster;filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=390;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=44.80;MQ0=0;QD=17.57;SB=-3.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,170,220:390:99:6851,2938,2472,3913,0,3559 chrIX 38611 . C A 2330.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=16.043;DP=393;Dels=0.00;FS=6.283;HaplotypeScore=3.5478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.93;MQ0=0;MQRankSum=-16.747;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,220:393:99:2360,0,3372 chrIX 38620 . A T 3595.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.470;DP=465;Dels=0.00;FS=3.427;HaplotypeScore=3.6404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.29;MQ0=0;MQRankSum=-16.590;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-2.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,257:465:99:3595,0,4164 chrIX 38629 . C T 3775.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=13.174;DP=464;Dels=0.00;FS=9.589;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.27;MQ0=0;MQRankSum=-15.979;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-2.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,261:464:99:3775,0,4098 chrIX 38632 . G A 3719.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.560;DP=463;Dels=0.00;FS=13.172;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.23;MQ0=0;MQRankSum=-15.929;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.668;SB=-2.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,263:463:99:3719,0,3945 chrIX 38659 . G A 5328.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.284;DP=495;Dels=0.00;FS=12.700;HaplotypeScore=2.7214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.56;MQ0=0;MQRankSum=-12.854;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-3.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,295:495:99:5328,0,3880 chrIX 38676 . T C 4477.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.711;DP=443;Dels=0.00;FS=11.953;HaplotypeScore=5.2247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=2;MQRankSum=-10.083;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.753;SB=-2.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,264:443:99:4477,0,3492 chrIX 38719 . C G 5161.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;DP=554;Dels=0.00;FS=4.621;HaplotypeScore=5.3798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.12;MQ0=2;MQRankSum=-4.802;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.542;SB=-2.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,258:554:99:5161,0,6013 chrIX 38929 . T C 2918.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-16.831;DP=448;Dels=0.00;FS=26.057;HaplotypeScore=4.2172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQ0=0;MQRankSum=8.809;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.701;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,170:448:99:2948,0,5934 chrIX 38988 . T C 4673.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.706;DP=454;Dels=0.00;FS=4.712;HaplotypeScore=5.1790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQ0=0;MQRankSum=-6.359;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.334;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,233:454:99:4673,0,4559 chrIX 39041 . A T 4117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;DP=386;Dels=0.00;FS=17.226;HaplotypeScore=166.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.29;MQ0=0;MQRankSum=-5.318;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.482;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,203:386:99:4117,0,3754 chrIX 39104 . G T 264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=14.595;DP=326;Dels=0.00;FS=128.655;HaplotypeScore=187.8976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.986;QD=0.81;ReadPosRankSum=3.037;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,149:325:99:294,0,3607 chrIX 39175 . A G 2088.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.528;DP=342;Dels=0.00;FS=195.271;HaplotypeScore=4.7620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-12.351;QD=6.11;ReadPosRankSum=-14.357;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,133:342:99:2118,0,4598 chrIX 39258 . C T 4981.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=25.54;SB=-2.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:4981,531,0 chrIX 39286 . A C 5152.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.25;SB=-2.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,204:204:99:5152,540,0 chrIX 39289 . T C 4769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=23.38;SB=-2.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,204:204:99:4769,537,0 chrIX 39328 . G A 5925.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=25.76;SB=-3.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:5925,625,0 chrIX 39386 . C T 2699 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.22;MQ0=0;QD=15.34;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:176:99:2732,318,0 chrIX 39393 . T G 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.09;MQ0=0;QD=19.50;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:3374,393,0 chrIX 39427 . A G 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.22;MQ0=0;QD=21.95;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:3951,444,0 chrIX 39470 . C T 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3753,390,0 chrIX 39475 . G A 3833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3833,408,0 chrIX 39962 . T A 4194.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.981e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4194,435,0 chrIX 40145 . G A 5013.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=1;QD=26.25;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:191:99:5013,511,0 chrIX 40190 . A G 5136.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=1;QD=25.68;SB=-2.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:5136,543,0 chrIX 40512 . G A 4444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4444,474,0 chrIX 40681 . G A 5168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,203:203:99:5168,541,0 chrIX 40928 . G A 4874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.93;SB=-2.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4874,502,0 chrIX 40953 . G A 5482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5482,568,0 chrIX 41223 . A G 5474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.77;SB=-2.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5474,582,0 chrIX 41415 . A G 6028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=239;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.22;SB=-2.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,238:238:99:6028,651,0 chrIX 41439 . A T 5388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1599;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.28;SB=-2.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:5388,579,0 chrIX 41532 . A G 6200.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3431;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.80;SB=-2.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,250:250:99:6200,636,0 chrIX 41810 . G A 4599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8175;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4599,486,0 chrIX 41898 . T C 5457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.04;SB=-2.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,227:227:99:5457,570,0 chrIX 41905 . A G 5260.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.13;SB=-2.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,218:218:99:5260,546,0 chrIX 42365 . A G 5223.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,206:206:99:5223,558,0 chrIX 42679 . T C 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3897,438,0 chrIX 42862 . A T 5176.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=26.14;ReadPosRankSum=1.591;SB=-2.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,196:198:99:5176,523,0 chrIX 43318 . G A 4857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.25;SB=-2.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4857,513,0 chrIX 43434 . C G 3726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.51;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3726,387,0 chrIX 43493 . T C 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3470,369,0 chrIX 43753 . C A 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3615,370,0 chrIX 44120 . C T 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3082,327,0 chrIX 44230 . A T 3948.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.71;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:3948,423,0 chrIX 44331 . G A 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.76;MQ0=0;QD=21.47;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:146:99:3168,345,0 chrIX 44632 . C T 4444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4444,468,0 chrIX 44674 . G A 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.904;DP=140;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=26.36;ReadPosRankSum=1.730;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,138:140:99:3690,399,0 chrIX 44800 . C T 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3646,378,0 chrIX 44854 . A T 2640 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.827;DP=141;Dels=0.00;FS=28.871;HaplotypeScore=25.1090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=2.587;QD=18.72;ReadPosRankSum=-3.182;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,128:141:99:2673,291,0 chrIX 44890 . G A 2300 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.274;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.493;SB=-2.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,173:174:99:2333,249,0 chrIX 44979 . C T 4375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4375,456,0 chrIX 45115 . C T 4512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4512,463,0 chrIX 45203 . A G 4883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4883,534,0 chrIX 45259 . T C 4368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=1;QD=24.68;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4368,477,0 chrIX 45367 . G A 4334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.43;SB=-2.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4334,456,0 chrIX 45530 . C T 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3312,348,0 chrIX 45559 . A C 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3290,366,0 chrIX 45691 . T G 4884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.18;SB=-2.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:4884,513,0 chrIX 45705 . G A 5142.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.37;SB=-2.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:195:99:5142,535,0 chrIX 45746 . A G 5144.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5144,543,0 chrIX 45805 . T C 4365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7152;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.39;SB=-2.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4365,465,0 chrIX 45859 . C T 5359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.14;SB=-2.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:5359,550,0 chrIX 45886 . A G 4723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=25.39;ReadPosRankSum=1.713;SB=-2.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,184:186:99:4723,492,0 chrIX 45981 . G A 5269.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5269,559,0 chrIX 45992 . A G 5383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5383,582,0 chrIX 46057 . C G 4325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4325,471,0 chrIX 46102 . C A 3939.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.26;SB=-2.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3939,400,0 chrIX 46189 . T C 4691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4691,510,0 chrIX 46556 . C T 5701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6744;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,222:222:99:5701,615,0 chrIX 46584 . A G 4508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4508,489,0 chrIX 47054 . G T 4404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.44;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4404,474,0 chrIX 47108 . A G 4570.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.50;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:188:99:4570,489,0 chrIX 47114 . A G 4704.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.62;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4704,504,0 chrIX 47117 . C T 5079.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=25.52;SB=-2.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:5079,532,0 chrIX 47222 . A G 6605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=254;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.00;SB=-2.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,254:254:99:6605,729,0 chrIX 47766 . G A 3997.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3997,412,0 chrIX 47916 . T C 4658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.39;SB=-2.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4658,510,0 chrIX 48813 . A G 5307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5307,576,0 chrIX 48876 . A C 5596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=224;Dels=0.00;FS=3.249;HaplotypeScore=2.7156;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=24.98;ReadPosRankSum=1.345;SB=-2.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,223:224:99:5596,588,0 chrIX 48879 . C T 5974.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=236;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.31;SB=-2.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,236:236:99:5974,622,0 chrIX 49422 . T C 4110.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4110,453,0 chrIX 49521 . G A 1288 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.571;DP=172;Dels=0.00;FS=4.721;HaplotypeScore=132.8755;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=7.49;ReadPosRankSum=1.430;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:172:99:1321,150,0 chrIX 49550 . T C 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:3475,390,0 chrIX 49641 . T G 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3135;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=20.79;ReadPosRankSum=-1.347;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,170:171:99:3555,389,0 chrIX 49836 . A G 4512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4512,471,0 chrIX 51147 . G A 4926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4926,514,0 chrIX 51226 . A G 4534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7547;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4534,495,0 chrIX 51375 . T C 5519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;QD=25.09;SB=-2.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:5519,594,0 chrIX 51702 . C T 3999.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.993e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3999,423,0 chrIX 51730 . C T 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2419;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3958,412,0 chrIX 51756 . G C 4544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4544,504,0 chrIX 52260 . G A 5652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.57;SB=-2.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5652,580,0 chrIX 53091 . G C 4844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4844,537,0 chrIX 53103 . A G 5250.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=23.76;SB=-2.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5250,564,0 chrIX 53238 . T C 5412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5412,635,0 chrIX 53717 . A G 6103.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=253;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.12;SB=-3.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,253:253:99:6103,648,0 chrIX 53800 . A G 5898.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,233:233:99:5898,627,0 chrIX 54404 . G C 4968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=236;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=21.05;SB=-2.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,236:236:99:4968,555,0 chrIX 54480 . T C 4839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.82;SB=-2.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:4839,507,0 chrIX 54551 . G A 717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.557;DP=191;Dels=0.00;FS=7.505;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,49:191:99:747,0,2977 chrIX 55054 . T C 5442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7347;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=1;QD=25.67;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5442,588,0 chrIX 55071 . C A 5662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:219:99:5662,601,0 chrIX 55251 . G A 6033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.508;DP=248;Dels=0.00;FS=3.927;HaplotypeScore=7.1072;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=24.33;ReadPosRankSum=1.283;SB=-2.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,246:248:99:6033,628,0 chrIX 55428 . G T 6925.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=275;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.18;SB=-3.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,275:275:99:6925,721,0 chrIX 55461 . A T 5054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=1;QD=25.14;SB=-2.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:5054,531,0 chrIX 55663 . G A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.602;DP=248;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=3.4174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,86:248:99:1512,0,3326 chrIX 55666 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.463;DP=245;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,85:245:99:1377,0,3094 chrIX 55678 . A C 6311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=267;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=23.64;SB=-3.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,267:267:99:6311,672,0 chrIX 55716 . T C 7399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=297;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.91;SB=-3.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,297:297:99:7399,795,0 chrIX 55756 . C T 8264.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=331;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.97;SB=-3.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,331:331:99:8264,847,0 chrIX 55837 . T C 6954.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=297;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2640;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=23.41;SB=-3.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,296:297:99:6954,750,0 chrIX 56028 . T A 5882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.91;SB=-2.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,226:227:99:5882,636,0 chrIX 56300 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.037;DP=278;Dels=0.00;FS=1.581;HaplotypeScore=2.3696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.046;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,82:278:99:1270,0,4338 chrIX 56518 . T G 3820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.204;DP=249;Dels=0.00;FS=2.536;HaplotypeScore=4.7235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.226;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,181:249:99:3820,0,1045 chrIX 56622 . A G 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.825;DP=246;Dels=0.00;FS=2.471;HaplotypeScore=13.7862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.742;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.812;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,66:246:99:989,0,4060 chrIX 56679 . C T 3994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.243;DP=274;Dels=0.00;FS=1.078;HaplotypeScore=3.5261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.661;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,186:274:99:3994,0,1449 chrIX 56841 . G A 2842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;DP=222;Dels=0.00;FS=2.513;HaplotypeScore=5.5962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=12.80;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,147:222:99:2872,0,1188 chrIX 56947 . T G 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.610;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.077;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,64:200:99:1051,0,2791 chrIX 57063 . C T 6409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=253;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.33;SB=-3.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,253:253:99:6409,655,0 chrIX 57096 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.739;DP=222;Dels=0.00;FS=2.572;HaplotypeScore=5.7782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.045;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,73:222:99:1383,0,3086 chrIX 57153 . C T 5633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.49;SB=-2.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5633,592,0 chrIX 57170 . G A 3300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.347;DP=215;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.641;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,146:215:99:3300,0,1127 chrIX 57683 . A G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.996;DP=184;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,59:184:99:1017,0,2796 chrIX 57890 . T C 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.001;DP=234;Dels=0.00;FS=4.647;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.117;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,88:234:99:1548,0,3146 chrIX 57911 . G A 1863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.039;DP=262;Dels=0.00;FS=1.002;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.051;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,100:262:99:1893,0,3282 chrIX 57929 . C T 3095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.347;DP=243;Dels=0.00;FS=1.803;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,151:243:99:3125,0,1603 chrIX 58130 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.179;DP=192;Dels=0.00;FS=1.149;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.399;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,74:192:99:1298,0,2383 chrIX 58256 . C G 4292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4292,468,0 chrIX 58382 . C T 6264.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=27.12;SB=-2.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,231:231:99:6264,667,0 chrIX 58436 . A G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.703;DP=223;Dels=0.00;FS=10.529;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.447;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,74:223:99:1215,0,3318 chrIX 58508 . A G 4303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.45;SB=-2.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4303,477,0 chrIX 58511 . G A 4570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.82;SB=-2.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4570,483,0 chrIX 58961 . G A 2599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.626;DP=193;Dels=0.00;FS=1.156;HaplotypeScore=3.3655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.333;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,120:193:99:2629,0,1303 chrIX 59054 . C T 2590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.328;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.320;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,119:189:99:2620,0,1298 chrIX 59333 . T C 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.979;DP=221;Dels=0.00;FS=2.583;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.817;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,70:221:99:1223,0,3503 chrIX 59546 . T C 3113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.176;DP=213;Dels=0.00;FS=2.689;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.086;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,148:212:99:3143,0,1140 chrIX 59552 . T G 4873.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.51;SB=-2.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4873,540,0 chrIX 59639 . T A 5255.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.14;SB=-2.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:5255,514,0 chrIX 59981 . T C 4695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4695,531,0 chrIX 60280 . T C 4708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3822;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4708,498,0 chrIX 60838 . G A 2315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.079;DP=173;Dels=0.00;FS=3.666;HaplotypeScore=3.9666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,113:173:99:2345,0,1083 chrIX 60844 . T C 4210.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;QD=24.06;SB=-2.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4210,474,0 chrIX 60857 . A G 2316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=174;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=1.9367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,114:174:99:2346,0,1106 chrIX 60879 . A C 5045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.37;SB=-2.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5045,552,0 chrIX 61274 . G A 5039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:5039,523,0 chrIX 61323 . C T 4658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.999e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4658,478,0 chrIX 61466 . C A 3869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3869,399,0 chrIX 61826 . A G 3280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;DP=225;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.274;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,153:225:99:3280,0,1236 chrIX 62027 . G A 2860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.724;DP=193;Dels=0.00;FS=1.226;HaplotypeScore=2.8891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.823;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,130:193:99:2890,0,1081 chrIX 62057 . A C 4332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4332,486,0 chrIX 62211 . T C 2418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.389;DP=190;Dels=0.00;FS=15.557;HaplotypeScore=2.8293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=1;MQRankSum=-0.278;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,123:190:99:2448,0,1216 chrIX 62276 . C T 2571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.478;DP=202;Dels=0.00;FS=5.261;HaplotypeScore=4.3397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.205;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,128:202:99:2601,0,1228 chrIX 62364 . T A 2508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;DP=199;Dels=0.00;FS=12.349;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.831;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,122:199:99:2538,0,1499 chrIX 62438 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.205;DP=196;Dels=0.00;FS=5.287;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.711;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,69:196:99:1145,0,2805 chrIX 62815 . A G 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.950;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=4.39;ReadPosRankSum=-2.840;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,58:179:99:815,0,2793 chrIX 62861 . C G 2312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.008;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,115:185:99:2342,0,1180 chrIX 62971 . G A 2553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.060;DP=179;Dels=0.00;FS=1.955;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,118:179:99:2583,0,1056 chrIX 63495 . C T 3999.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.690;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.691;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:164:99:3999,403,0 chrIX 63566 . C T 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.551;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.502;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,55:162:99:934,0,2328 chrIX 63655 . A G 3977.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3977,426,0 chrIX 63770 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.185;DP=172;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.014;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,66:172:99:1250,0,2328 chrIX 63799 . T C 1817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.854;DP=169;Dels=0.00;FS=2.723;HaplotypeScore=3.3282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.241;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,97:169:99:1847,0,1405 chrIX 63838 . T C 1902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.127;DP=170;Dels=0.00;FS=5.877;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.390;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,99:170:99:1932,0,1434 chrIX 64041 . C T 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.311;DP=153;Dels=0.00;FS=4.469;HaplotypeScore=4.4603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.644;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,49:153:99:809,0,2277 chrIX 64048 . T C 657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.799;DP=152;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,48:152:99:687,0,2346 chrIX 64057 . C A 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3990,420,0 chrIX 64177 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.760;DP=150;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.247;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,56:150:99:1078,0,1852 chrIX 64231 . G A 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3816,396,0 chrIX 64245 . C A 1972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.275;DP=149;Dels=0.00;FS=12.015;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,91:149:99:2002,0,1030 chrIX 64310 . G A 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.679;DP=131;Dels=0.00;FS=5.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=24.50;ReadPosRankSum=1.309;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3242,351,0 chrIX 64321 . T C 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;DP=136;Dels=0.00;FS=7.614;HaplotypeScore=4.4154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.771;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,49:136:99:834,0,1833 chrIX 64334 . T G 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.832;DP=163;Dels=0.00;FS=6.302;HaplotypeScore=2.4404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=5.07;ReadPosRankSum=1.372;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,52:163:99:856,0,2367 chrIX 64552 . T C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.126;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,65:173:99:1180,0,2371 chrIX 64705 . A G 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4045,438,0 chrIX 64944 . C T 5787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6405;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.790;SB=-2.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,227:231:99:5787,624,0 chrIX 65121 . T A 5336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5336,558,0 chrIX 65290 . C T 4741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4741,484,0 chrIX 65299 . G A 5154.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=26.03;SB=-2.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5154,531,0 chrIX 65341 . T C 4890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.964e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:4890,510,0 chrIX 65359 . T A 4749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4749,501,0 chrIX 65368 . T C 4633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4633,498,0 chrIX 65406 . A G 5130.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:5130,552,0 chrIX 65518 . C A 5103.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.44;SB=-2.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:5103,543,0 chrIX 65522 . T C 4892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.83;SB=-2.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:4892,537,0 chrIX 65551 . C T 4776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4776,493,0 chrIX 65571 . A T 2796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;DP=188;Dels=0.00;FS=2.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,125:188:99:2826,0,1109 chrIX 65711 . T C 4844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.36;SB=-2.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4844,516,0 chrIX 65714 . T A 4968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.88;SB=-2.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4968,516,0 chrIX 65758 . G A 4066.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4066,438,0 chrIX 66115 . T A 4197.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.023;DP=163;Dels=0.00;FS=9.489;HaplotypeScore=8.2494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.952;QD=25.75;ReadPosRankSum=1.967;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,161:163:99:4197,441,0 chrIX 66117 . T C 4019.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.031;DP=164;Dels=0.00;FS=14.156;HaplotypeScore=9.2410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=24.51;ReadPosRankSum=1.153;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,161:164:99:4019,435,0 chrIX 66143 . A C 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.256;DP=137;Dels=0.00;FS=4.399;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.342;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,91:137:99:1835,0,801 chrIX 66647 . G A 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.668;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.353;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.720;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,61:196:99:1062,0,2680 chrIX 66681 . G A 2565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.212;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.394;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,123:184:99:2595,0,990 chrIX 66808 . T G 2487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.491;DP=183;Dels=0.00;FS=5.816;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,127:183:99:2517,0,1007 chrIX 66906 . G T 3161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.565;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=2.727;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.995;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,138:185:99:3191,0,703 chrIX 66928 . C T 3233.06 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.767;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=17.38;ReadPosRankSum=2.066;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,140:186:99:3264,0,675 chrIX 66948 . A G 3315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.176;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,150:197:99:3315,0,699 chrIX 66963 . C T 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.233;DP=229;Dels=0.00;FS=4.605;HaplotypeScore=3.8025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.774;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,59:229:99:909,0,3700 chrIX 67128 . C T 3831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.839;DP=237;Dels=0.00;FS=1.761;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.804;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,168:237:99:3831,0,1105 chrIX 67219 . T C 3203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.175;DP=198;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=2.145;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.947;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,152:198:99:3233,0,693 chrIX 67222 . C T 5098.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9082;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:5098,540,0 chrIX 67321 . T C 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3865,429,0 chrIX 67390 . G A,C 3444.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=51.42;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,102,48:150:99:3444,1075,793,2369,0,2234 chrIX 67392 . T C 3622.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.35;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3622,408,0 chrIX 67395 . A T 3890.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.30;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3890,423,0 chrIX 67430 . A G 2142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.174;DP=155;Dels=0.00;FS=11.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.74;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,106:155:99:2172,0,878 chrIX 67456 . T C 4736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.03;MQ0=0;QD=24.04;SB=-2.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:4736,522,0 chrIX 67458 . T C 4956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=24.90;SB=-2.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:4956,528,0 chrIX 67690 . G C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.567;DP=185;Dels=0.00;FS=6.808;HaplotypeScore=8.6587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,64:184:99:1165,0,2557 chrIX 67705 . A G 2467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.473;DP=184;Dels=0.00;FS=6.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.096;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,119:184:99:2497,0,1226 chrIX 67842 . C T 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.424;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.839;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,73:204:99:1182,0,2397 chrIX 67951 . C T 4912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.85;SB=-2.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4912,505,0 chrIX 68072 . G T 4752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4752,501,0 chrIX 68113 . T C 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3984,432,0 chrIX 68156 . G T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.322;DP=208;Dels=0.00;FS=0.548;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,70:208:99:1250,0,2740 chrIX 68186 . C T 4549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4549,466,0 chrIX 68384 . A T 4928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4928,496,0 chrIX 68461 . A G 5121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.39;MQ0=0;QD=23.28;SB=-2.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:5121,567,0 chrIX 68548 . A G 2936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.702;DP=212;Dels=0.00;FS=2.657;HaplotypeScore=9.8694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=13.85;ReadPosRankSum=-1.632;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,147:211:99:2966,0,1187 chrIX 68567 . C T 2875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.208;DP=205;Dels=0.00;FS=1.196;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,142:205:99:2905,0,1058 chrIX 68595 . A G 2447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.303;DP=192;Dels=0.00;FS=3.451;HaplotypeScore=8.3317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=12.74;ReadPosRankSum=1.949;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,124:192:99:2477,0,1247 chrIX 68663 . T C 2359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.246;DP=193;Dels=0.00;FS=5.202;HaplotypeScore=7.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.425;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,116:193:99:2389,0,1474 chrIX 68857 . A G 4402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4402,453,0 chrIX 68879 . G A 2293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.621;DP=176;Dels=0.00;FS=8.271;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.582;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,110:176:99:2323,0,1280 chrIX 68891 . C T 2361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.380;DP=182;Dels=0.00;FS=5.682;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.119;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,113:182:99:2391,0,1318 chrIX 68901 . T C 2576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.020;DP=198;Dels=0.00;FS=1.183;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=13.01;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,126:198:99:2606,0,1370 chrIX 69033 . C T 4378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.981e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4378,471,0 chrIX 69138 . T C 2103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.725;DP=150;Dels=0.00;FS=12.697;HaplotypeScore=3.4523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,99:150:99:2133,0,919 chrIX 69429 . C T 2246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.171;DP=161;Dels=0.00;FS=3.924;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=-0.144;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,106:161:99:2276,0,950 chrIX 69624 . C A 4524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.64;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4524,478,0 chrIX 69636 . T C 2348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.589;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.176;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,118:175:99:2378,0,1036 chrIX 69651 . A G 4191.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=24.23;ReadPosRankSum=0.471;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:4191,453,0 chrIX 69658 . T C 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3864,417,0 chrIX 69770 . T G 4698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4698,522,0 chrIX 69789 . G A 4984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4984,534,0 chrIX 69950 . A G 4067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4067,462,0 chrIX 70239 . C T 2729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.747;DP=190;Dels=0.00;FS=2.029;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,127:190:99:2759,0,1103 chrIX 70241 . T C 4577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4577,507,0 chrIX 70339 . G T 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.153;DP=163;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.135;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,50:163:99:920,0,2311 chrIX 70598 . G A 5591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.88;SB=-2.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:5591,583,0 chrIX 70698 . T C 2501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.488;DP=176;Dels=0.00;FS=3.875;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=14.21;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,118:176:99:2531,0,1006 chrIX 70904 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.619;DP=228;Dels=0.00;FS=0.527;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.337;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,69:228:99:1181,0,3309 chrIX 70913 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.632;DP=230;Dels=0.00;FS=1.105;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,72:230:99:1217,0,3407 chrIX 70962 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.206;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.813;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,67:209:99:1146,0,2885 chrIX 71000 . A G 2554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.344;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.792;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,133:200:99:2584,0,1237 chrIX 71060 . G C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.075;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,72:195:99:1239,0,2631 chrIX 71177 . G A 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.76;SB=-2.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4045,426,0 chrIX 71236 . T C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.844;DP=175;Dels=0.00;FS=5.897;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,55:175:99:941,0,2757 chrIX 71252 . C A 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;DP=181;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.307;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,57:181:99:790,0,2687 chrIX 71255 . T C 640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.384;DP=200;Dels=0.00;FS=1.227;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.795;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,64:200:99:670,0,3043 chrIX 71393 . T C 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.596;DP=205;Dels=0.00;FS=1.786;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.711;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,81:205:99:1458,0,2785 chrIX 71501 . C T 770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.101;DP=134;Dels=0.00;FS=6.421;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,43:134:99:800,0,1975 chrIX 71504 . T C 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3520,378,0 chrIX 71693 . A G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=186;Dels=0.00;FS=5.759;HaplotypeScore=6.3540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.258;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,59:186:99:988,0,2757 chrIX 71714 . C T 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.943;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.565;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,53:152:99:901,0,1990 chrIX 71726 . G A 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.609;DP=166;Dels=0.00;FS=3.868;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.803;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,55:166:99:943,0,2276 chrIX 71768 . G A 5160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.46;SB=-2.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5160,528,0 chrIX 71830 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.984;DP=182;Dels=0.00;FS=6.049;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.094;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,60:182:99:1090,0,2624 chrIX 72015 . C G 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.315;DP=142;Dels=0.00;FS=11.399;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,49:142:99:821,0,2029 chrIX 72065 . G A 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.870;DP=194;Dels=0.00;FS=2.848;HaplotypeScore=4.4855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=4.42;ReadPosRankSum=-1.611;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,54:194:99:888,0,3020 chrIX 72176 . G A 604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.126;DP=172;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.958;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,48:172:99:634,0,2747 chrIX 72177 . C G 574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.412;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,49:169:99:604,0,2676 chrIX 72223 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;DP=181;Dels=0.00;FS=7.959;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=1.821;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.755;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,63:181:99:1084,0,2514 chrIX 72260 . T C 2679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.209;DP=205;Dels=0.00;FS=12.383;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=13.07;ReadPosRankSum=-2.130;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,132:205:99:2709,0,1340 chrIX 72311 . G A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.191;DP=215;Dels=0.00;FS=0.558;HaplotypeScore=3.9398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=5.85;ReadPosRankSum=-3.166;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,77:215:99:1287,0,2876 chrIX 72464 . T C 5333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.69;SB=-2.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:5333,537,0 chrIX 72564 . C T 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.137;DP=159;Dels=0.00;FS=5.720;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.253;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.769;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,46:159:99:702,0,2299 chrIX 72570 . G T 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.358;DP=163;Dels=0.00;FS=3.405;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.072;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.672;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,47:163:99:715,0,2561 chrIX 72581 . G A 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.541;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.088;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.498;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,50:170:99:779,0,2568 chrIX 72621 . C T 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.349;DP=174;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.599;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.343;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,46:174:99:764,0,2721 chrIX 72642 . T C 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.711;DP=210;Dels=0.00;FS=3.538;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.170;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,59:210:99:978,0,3378 chrIX 72672 . G A 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.914;DP=176;Dels=0.00;FS=5.436;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,50:176:99:770,0,2786 chrIX 72684 . T G 611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;DP=164;Dels=0.00;FS=17.912;HaplotypeScore=2.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=3.73;ReadPosRankSum=2.564;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,42:164:99:641,0,2771 chrIX 72697 . C T 577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.226;DP=155;Dels=0.00;FS=12.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=3.72;ReadPosRankSum=2.996;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,39:155:99:607,0,2565 chrIX 72757 . T A 535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.399;DP=194;Dels=0.00;FS=2.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=2.76;ReadPosRankSum=1.337;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,41:194:99:565,0,3423 chrIX 72762 . T C 482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.815;DP=198;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.530;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.686;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,41:198:99:512,0,3549 chrIX 72784 . T C 657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.284;DP=184;Dels=0.00;FS=5.314;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,47:184:99:687,0,3159 chrIX 72792 . C A 3224.03 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.586;DP=194;Dels=0.00;FS=6.133;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.529;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,142:194:99:3254,0,790 chrIX 72796 . T C 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.045;DP=209;Dels=0.00;FS=8.032;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.627;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,59:209:99:907,0,3426 chrIX 72950 . T A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.913;DP=188;Dels=0.00;FS=1.937;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.746;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,62:188:99:1090,0,2794 chrIX 72971 . G A 3283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.252;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=15.41;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,146:213:99:3283,0,1014 chrIX 72998 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.982;DP=226;Dels=0.00;FS=1.852;HaplotypeScore=4.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,70:226:99:1163,0,3552 chrIX 73076 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.879;DP=193;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.146;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,67:193:99:1128,0,2795 chrIX 73100 . G A 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.842;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.908;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,62:191:99:1070,0,2756 chrIX 73117 . T C 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.090;DP=201;Dels=0.00;FS=2.014;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,64:201:99:1017,0,3076 chrIX 73733 . G A 697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.817;DP=150;Dels=0.00;FS=4.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.712;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,43:150:99:727,0,2255 chrIX 73905 . G C 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.416;DP=174;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,61:174:99:1095,0,2469 chrIX 73950 . T C 2170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.528;DP=158;Dels=0.00;FS=5.103;HaplotypeScore=5.4554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.519;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,104:158:99:2200,0,997 chrIX 73989 . A G 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.810;DP=140;Dels=0.00;FS=8.069;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=1;MQRankSum=0.902;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.941;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,50:140:99:873,0,2015 chrIX 74340 . A G 4138.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4138,441,0 chrIX 74541 . G A 4000.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4000,426,0 chrIX 74562 . T C 2264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.483;DP=161;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=14.06;ReadPosRankSum=-2.040;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,116:161:99:2294,0,792 chrIX 74610 . C T 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.62;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3591,373,0 chrIX 74646 . A G 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.357;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.793;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,52:163:99:915,0,2390 chrIX 74670 . T C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.968;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.632;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,61:155:99:1104,0,1988 chrIX 74736 . A G 683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.490;DP=159;Dels=0.00;FS=6.505;HaplotypeScore=3.6868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.791;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,47:159:99:713,0,2501 chrIX 74754 . T C 713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.073;DP=143;Dels=0.00;FS=4.498;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.735;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,47:143:99:743,0,2121 chrIX 74780 . G T 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.057;DP=162;Dels=0.00;FS=8.438;HaplotypeScore=6.7373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.497;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,52:162:99:945,0,2350 chrIX 74808 . T C 2010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.127;DP=143;Dels=0.00;FS=5.602;HaplotypeScore=3.7568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=14.06;ReadPosRankSum=-2.241;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,98:143:99:2040,0,789 chrIX 74922 . T C 770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.609;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.308;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,56:210:99:800,0,3507 chrIX 74967 . T A 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.024;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.361;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,52:178:99:862,0,2794 chrIX 75045 . T C 2779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.198;DP=185;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.812;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,135:185:99:2809,0,738 chrIX 75152 . G A 2781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.727;DP=190;Dels=0.00;FS=1.909;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.263;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,128:190:99:2811,0,1077 chrIX 75437 . G A 2348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.844;DP=167;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=4.3831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=14.06;ReadPosRankSum=2.460;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,112:167:99:2378,0,975 chrIX 75750 . C T 2497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.002;DP=179;Dels=0.00;FS=5.622;HaplotypeScore=4.0793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,114:179:99:2527,0,1113 chrIX 75847 . T C 4227.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4227,459,0 chrIX 75941 . A G 1972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.405;DP=152;Dels=0.00;FS=2.089;HaplotypeScore=9.3240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.598;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,95:152:99:2002,0,1058 chrIX 76283 . A G 5804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,250:250:99:5804,639,0 chrIX 76340 . C T 5232.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.264;SB=-2.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,209:211:99:5232,534,0 chrIX 76381 . G A 5888.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.71;SB=-2.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,229:229:99:5888,577,0 chrIX 76556 . G A 696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.360;DP=145;Dels=0.00;FS=11.626;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.586;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,42:145:99:726,0,2275 chrIX 76624 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.003;DP=209;Dels=0.00;FS=7.346;HaplotypeScore=4.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.374;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,67:209:99:1231,0,2919 chrIX 76900 . C T 4503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.33;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4503,454,0 chrIX 76912 . A G 2315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.302;DP=198;Dels=0.00;FS=4.407;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,127:198:99:2345,0,1256 chrIX 76959 . C T 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.618;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.710;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,55:177:99:1015,0,2530 chrIX 77020 . C T 4583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=177;Dels=0.00;FS=3.559;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=25.89;ReadPosRankSum=1.184;SB=-2.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,176:177:99:4583,469,0 chrIX 77092 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.761;DP=161;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.499;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,62:161:99:1181,0,2097 chrIX 77152 . G A 2739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=165;Dels=0.00;FS=1.499;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=16.60;ReadPosRankSum=1.179;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,119:165:99:2769,0,681 chrIX 77257 . T C 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.961;DP=198;Dels=0.00;FS=5.182;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.326;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,73:198:99:1100,0,2772 chrIX 77291 . A G 3117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.470;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.384;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,146:217:99:3147,0,1193 chrIX 77307 . T C 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.089;DP=205;Dels=0.00;FS=3.501;HaplotypeScore=3.7055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.989;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,62:205:99:968,0,3221 chrIX 77331 . G A 5563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.62;SB=-2.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5563,586,0 chrIX 77387 . T A 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.789;DP=222;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=2.7881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.636;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,57:222:99:892,0,3677 chrIX 77427 . A T 5076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.714;SB=-2.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,195:196:99:5076,492,0 chrIX 77497 . C A 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.959;DP=175;Dels=0.00;FS=9.455;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=4.81;ReadPosRankSum=2.724;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,51:175:99:872,0,2625 chrIX 77531 . A G 2709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.684;DP=179;Dels=0.00;FS=11.220;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=15.13;ReadPosRankSum=2.428;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,124:179:99:2739,0,915 chrIX 77546 . T C 4335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4335,468,0 chrIX 77585 . G T 2803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.950;DP=173;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.682;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,127:173:99:2833,0,674 chrIX 77594 . T G 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.694;DP=184;Dels=0.01;FS=7.086;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,56:183:99:899,0,2851 chrIX 77604 . C T 2618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.351;DP=178;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.693;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,115:177:99:2648,0,1087 chrIX 77663 . C T 3661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.935;DP=251;Dels=0.00;FS=2.988;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=14.59;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,166:251:99:3661,0,1504 chrIX 77692 . G T 3514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.386;DP=224;Dels=0.00;FS=3.553;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.166;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,158:224:99:3514,0,1075 chrIX 77697 . A G 3380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.777;DP=231;Dels=0.00;FS=7.231;HaplotypeScore=2.7381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=14.63;ReadPosRankSum=2.612;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,158:231:99:3380,0,1315 chrIX 77788 . G A 3137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.019;DP=237;Dels=0.00;FS=5.408;HaplotypeScore=2.3999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.287;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,145:237:99:3167,0,1738 chrIX 78087 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.414;DP=220;Dels=0.00;FS=6.982;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,77:220:99:1430,0,2947 chrIX 78274 . A G 4955.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.94;SB=-2.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4955,525,0 chrIX 78328 . T C 5447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.21;SB=-2.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,225:225:99:5447,597,0 chrIX 78415 . A G 4236.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=21.72;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:195:99:4236,465,0 chrIX 78442 . C T 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3918,408,0 chrIX 78571 . C T 2699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.477;DP=158;Dels=0.00;FS=1.631;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.530;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,121:158:99:2729,0,526 chrIX 78597 . C A 2689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.178;DP=153;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=9.4991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,118:153:99:2719,0,464 chrIX 78622 . C G 2611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;DP=172;Dels=0.00;FS=12.586;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.872;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.654;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,124:172:99:2641,0,747 chrIX 79417 . G A 4407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.981e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4407,459,0 chrIX 79502 . A G 4564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=1;QD=24.94;SB=-2.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4564,513,0 chrIX 79550 . T C 4337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.23;SB=-2.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4337,468,0 chrIX 79636 . T C 3929.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3929,429,0 chrIX 79682 . A G 2446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.914;DP=169;Dels=0.00;FS=4.882;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,113:169:99:2476,0,1038 chrIX 79786 . G A 4500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.47;SB=-2.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4500,477,0 chrIX 79822 . G A 3965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3965,423,0 chrIX 79846 . G C 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.46;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3448,390,0 chrIX 79900 . G A 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.296;DP=171;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.081;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,54:171:99:951,0,2474 chrIX 79996 . A G 3873.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3873,432,0 chrIX 80086 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.061;DP=200;Dels=0.00;FS=1.154;HaplotypeScore=2.6414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=1;MQRankSum=0.053;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,71:200:99:1171,0,2784 chrIX 80297 . G T 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.064;DP=158;Dels=0.00;FS=9.255;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=6.66;ReadPosRankSum=-2.613;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,59:158:99:1083,0,2127 chrIX 80335 . G A 2289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.824;DP=174;Dels=0.00;FS=1.420;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=1.922;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.197;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,105:174:99:2319,0,1219 chrIX 80414 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.409;DP=175;Dels=0.00;FS=1.237;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.911;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,72:175:99:1224,0,2196 chrIX 80696 . A G 4704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=23.76;SB=-2.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:4704,519,0 chrIX 80882 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.893;DP=217;Dels=0.00;FS=7.232;HaplotypeScore=3.8545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.564;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,74:217:99:1253,0,3191 chrIX 81014 . G A 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.948;DP=224;Dels=0.00;FS=5.309;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=4.69;ReadPosRankSum=2.545;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,63:224:99:1081,0,3502 chrIX 81401 . T C 5061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.22;SB=-2.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5061,546,0 chrIX 81995 . G A 4625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.43;SB=-2.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4625,484,0 chrIX 82157 . T C 5117.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7569;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.47;SB=-2.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,218:218:99:5117,585,0 chrIX 82232 . C T 5866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.65;SB=-3.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,238:238:99:5866,598,0 chrIX 82237 . G A 6402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=252;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.40;SB=-3.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,252:252:99:6402,646,0 chrIX 82457 . T C 5950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6134;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=1;QD=23.99;SB=-2.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,248:248:99:5950,654,0 chrIX 82610 . C T 5761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=26.55;SB=-2.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:217:99:5761,583,0 chrIX 82619 . G A 5568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.63;MQ0=0;QD=26.26;SB=-2.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5568,568,0 chrIX 82622 . C T 5517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=26.40;SB=-2.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:208:99:5517,556,0 chrIX 82673 . T C 5269.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=25.70;SB=-2.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:5269,552,0 chrIX 82694 . A G 4637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=24.41;SB=-2.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4637,516,0 chrIX 82733 . A G 5865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5912;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=24.64;SB=-3.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,238:238:99:5865,615,0 chrIX 82899 . G A 6151.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=265;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;QD=23.21;SB=-3.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,265:265:99:6151,643,0 chrIX 82900 . A C 6125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=267;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=22.94;SB=-3.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,266:267:99:6125,642,0 chrIX 83061 . C T 3948.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.31;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:172:99:3948,423,0 chrIX 83067 . T C 3878.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=136.4581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.59;MQ0=0;QD=21.31;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:3878,432,0 chrIX 83087 . T C 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.26;MQ0=0;QD=17.61;SB=-1.958e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:3150,363,0 chrIX 83104 . A C 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.40;MQ0=0;QD=19.36;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:3310,384,0 chrIX 83517 . C G 5014.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=23.54;SB=-2.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5014,540,0 chrIX 83571 . T C 4790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=23.83;SB=-2.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:4790,537,0 chrIX 83625 . G A 4569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4569,478,0 chrIX 83676 . A G 4562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=23.04;SB=-2.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:4562,477,0 chrIX 83721 . T G 4818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:4818,537,0 chrIX 84138 . T C 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4168,465,0 chrIX 84510 . C T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.598;DP=205;Dels=0.00;FS=12.836;HaplotypeScore=1.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=5.50;ReadPosRankSum=-1.898;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,68:205:99:1158,0,2822 chrIX 85177 . C T 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.791;DP=269;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=6.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.143;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,92:269:99:1685,0,3494 chrIX 85300 . T C 4959.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.83;SB=-2.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4959,528,0 chrIX 85309 . C T 5160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.19;SB=-2.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:5160,523,0 chrIX 85444 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.164;DP=238;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=9.8402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=3.229;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.828;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,86:238:99:1399,0,3273 chrIX 85680 . C T 5872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,224:224:99:5872,616,0 chrIX 85688 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.273;DP=241;Dels=0.00;FS=2.328;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=5.90;ReadPosRankSum=-2.614;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,81:241:99:1451,0,3258 chrIX 85716 . C A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.165;DP=243;Dels=0.00;FS=8.051;HaplotypeScore=5.5520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=4.48;ReadPosRankSum=2.792;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,71:243:99:1118,0,3745 chrIX 85758 . G A 5814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.39;SB=-2.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,229:229:99:5814,618,0 chrIX 85764 . G A 3367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.496;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.998;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,156:229:99:3367,0,1090 chrIX 85821 . C T 5075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:5075,528,0 chrIX 85860 . T C 5474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5474,597,0 chrIX 86294 . C T 2839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.682;DP=184;Dels=0.00;FS=2.936;HaplotypeScore=3.7873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=15.43;ReadPosRankSum=-1.169;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,126:184:99:2869,0,1001 chrIX 86303 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.150;DP=194;Dels=0.00;FS=2.860;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.190;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,61:194:99:1049,0,3013 chrIX 86586 . T G 4800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=21.43;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,224:224:99:4800,537,0 chrIX 86720 . C T 4987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.31;SB=-2.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:4987,534,0 chrIX 86751 . C T 4818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.679;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=24.71;ReadPosRankSum=-1.341;SB=-2.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,194:195:99:4818,487,0 chrIX 86925 . A G 5084.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=1;QD=22.40;SB=-2.892e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,226:227:99:5084,546,0 chrIX 87121 . G A 4357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4357,453,0 chrIX 87180 . C T 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.688;DP=167;Dels=0.00;FS=11.484;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.336;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,57:167:99:967,0,2233 chrIX 87283 . C T 6182.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=239;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.87;SB=-3.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,239:239:99:6182,619,0 chrIX 87642 . C T 5380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.79;SB=-2.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,217:217:99:5380,538,0 chrIX 88151 . T C 4689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.68;SB=-2.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4689,498,0 chrIX 88444 . G A 4697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=25.53;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-2.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,183:184:99:4697,489,0 chrIX 88448 . T C 5224.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.00;SB=-2.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5224,552,0 chrIX 88522 . A G 5427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=215;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,214:215:99:5427,570,0 chrIX 89503 . A C 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.144;DP=178;Dels=0.00;FS=1.983;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.063;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,58:178:99:927,0,2690 chrIX 89552 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.806;DP=217;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.588;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,80:217:99:1499,0,2897 chrIX 90515 . C T 6259.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;DP=263;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=1.679;QD=23.80;ReadPosRankSum=1.706;SB=-3.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,262:263:99:6259,625,0 chrIX 90617 . A G 5489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5489,594,0 chrIX 90752 . G A 2556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.891;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.594;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,116:169:99:2586,0,794 chrIX 90765 . T A 2818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.839;DP=181;Dels=0.00;FS=2.035;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,129:181:99:2848,0,885 chrIX 90986 . A G 6073.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=242;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.10;SB=-2.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,242:242:99:6073,631,0 chrIX 91112 . G C 6514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=277;Dels=0.00;FS=3.491;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.78;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=23.52;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-3.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,276:277:99:6514,690,0 chrIX 91116 . T G 6451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=266;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.70;MQ0=0;QD=24.25;SB=-3.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,266:266:99:6451,696,0 chrIX 91130 . C T 6679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=261;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,261:261:99:6679,685,0 chrIX 91187 . T C 5063.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.62;MQ0=0;QD=25.96;SB=-2.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:5063,552,0 chrIX 91226 . A G 2625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.920;DP=200;Dels=0.00;FS=4.638;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.613;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,132:200:99:2655,0,1201 chrIX 91232 . T C 5248.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,203:203:99:5248,570,0 chrIX 91277 . C T 4669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4669,472,0 chrIX 91316 . G A 4190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.86;SB=-2.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4190,447,0 chrIX 91343 . A G 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3584,399,0 chrIX 91352 . A G 3937.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3937,423,0 chrIX 91451 . C G 2774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;DP=214;Dels=0.00;FS=4.498;HaplotypeScore=4.3836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,136:214:99:2804,0,1336 chrIX 91579 . C A 6186.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.35;SB=-3.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,244:244:99:6186,610,0 chrIX 91661 . C T 4237.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=25.52;SB=-2.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4237,456,0 chrIX 91709 . A T 4550.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.77;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4550,483,0 chrIX 91712 . T C 4275.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.80;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4275,477,0 chrIX 91718 . A G 4317.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.73;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4317,465,0 chrIX 91814 . C T 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.334;DP=185;Dels=0.00;FS=2.851;HaplotypeScore=5.7075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=4.24;ReadPosRankSum=-1.401;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,53:185:99:815,0,2876 chrIX 91834 . T A 4479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=25.74;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-2.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,173:174:99:4479,457,0 chrIX 91967 . T C 5641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,225:225:99:5641,582,0 chrIX 91970 . A G 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.301;DP=229;Dels=0.00;FS=1.690;HaplotypeScore=4.4878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.865;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,80:229:99:1453,0,3248 chrIX 92024 . T G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.786;DP=216;Dels=0.00;FS=3.306;HaplotypeScore=2.4203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=5.26;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,74:215:99:1167,0,3079 chrIX 92242 . C A 5987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.37;SB=-2.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,227:227:99:5987,625,0 chrIX 92420 . T C 5586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.39;SB=-2.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:5586,606,0 chrIX 92793 . G A 2391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.787;DP=188;Dels=0.00;FS=3.474;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.173;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,115:188:99:2421,0,1378 chrIX 92809 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.636;DP=178;Dels=0.00;FS=3.576;HaplotypeScore=3.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.960;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,66:178:99:1244,0,2301 chrIX 92857 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.108;DP=191;Dels=0.00;FS=4.332;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=2.606;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.132;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,70:191:99:1273,0,2503 chrIX 92905 . T C 2809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.433;DP=221;Dels=0.00;FS=10.579;HaplotypeScore=3.2707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.591;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,140:221:99:2839,0,1524 chrIX 92944 . A G 1634.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.215;DP=156;Dels=0.00;FS=7.735;HaplotypeScore=12.8879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.862;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,97:156:99:1664,0,1092 chrIX 92947 . G A 3364.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=12.8879;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.31;MQ0=0;QD=22.58;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:148:99:3364,366,0 chrIX 92948 . A T 3372.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=148;Dels=0.00;FS=5.078;HaplotypeScore=12.8879;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=22.78;ReadPosRankSum=3.352;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,144:148:99:3372,369,0 chrIX 92966 . C T 2022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.895;DP=170;Dels=0.00;FS=20.103;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.69;MQ0=0;MQRankSum=-3.410;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,113:170:99:2052,0,1020 chrIX 92997 . G A 3646.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.41;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3646,399,0 chrIX 92998 . A C 3615.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.50;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3615,402,0 chrIX 92999 . A C,T 3044.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=47.41;MQ0=0;QD=20.71;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,102,45:147:99:3104,1077,807,2027,0,1895 chrIX 93013 . G T 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.216;DP=157;Dels=0.00;FS=8.186;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.20;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,48:157:99:821,0,2055 chrIX 93053 . C A 5012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=215;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;QD=23.31;SB=-2.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,214:215:99:5012,531,0 chrIX 93433 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.117;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.612;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,71:229:99:1201,0,3274 chrIX 93546 . G A 3467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.303;DP=227;Dels=0.00;FS=1.153;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.851;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,158:227:99:3467,0,1168 chrIX 93577 . T C 5029.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.15;SB=-2.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:5029,558,0 chrIX 93686 . G A 3173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.096;DP=220;Dels=0.00;FS=1.160;HaplotypeScore=4.3980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=14.42;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,148:220:99:3203,0,1239 chrIX 93723 . C T 3300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.763;DP=225;Dels=0.00;FS=0.518;HaplotypeScore=6.8328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.264;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,149:225:99:3300,0,1250 chrIX 93762 . A G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.722;DP=218;Dels=0.00;FS=6.991;HaplotypeScore=6.2026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,74:218:99:1195,0,3210 chrIX 93786 . A G 2969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.116;DP=228;Dels=0.00;FS=11.301;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.198;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,143:228:99:2999,0,1657 chrIX 93804 . C T 3185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.991;DP=239;Dels=0.00;FS=15.738;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,153:239:99:3215,0,1549 chrIX 93903 . G A 2718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.561;DP=204;Dels=0.00;FS=1.165;HaplotypeScore=3.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.865;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,135:204:99:2748,0,1156 chrIX 94089 . G C 2138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.924;DP=183;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=2.6899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.314;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,116:183:99:2168,0,1193 chrIX 94207 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.764;DP=257;Dels=0.00;FS=3.686;HaplotypeScore=5.6191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,90:257:99:1605,0,3552 chrIX 94443 . A G 2494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.796;DP=215;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.652;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,124:215:99:2524,0,1768 chrIX 94563 . T C 5516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.85;SB=-2.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,222:222:99:5516,576,0 chrIX 94593 . A G 2601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.333;DP=190;Dels=0.00;FS=1.872;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.697;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,124:190:99:2631,0,1137 chrIX 94596 . T C 2418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.265;DP=184;Dels=0.00;FS=0.571;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=13.14;ReadPosRankSum=1.782;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,121:184:99:2448,0,1105 chrIX 94805 . A T 2227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=12.30;ReadPosRankSum=2.226;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,105:181:99:2257,0,1500 chrIX 94832 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.376;DP=169;Dels=0.00;FS=2.021;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.453;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,69:169:99:1297,0,2049 chrIX 94863 . C T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.074;DP=160;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=1.9301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.363;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,53:160:99:1002,0,2253 chrIX 94886 . T C 5039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=24.95;SB=-2.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:5039,531,0 chrIX 94907 . A G 4539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=24.14;SB=-2.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:188:99:4539,471,0 chrIX 94908 . T A 4621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.19;MQ0=0;QD=24.84;SB=-2.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4621,474,0 chrIX 94919 . A C 2617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.956;DP=190;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.468;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,132:190:99:2647,0,955 chrIX 94942 . G A 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.874;DP=179;Dels=0.00;FS=2.049;HaplotypeScore=2.7893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.848;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,53:179:99:863,0,2769 chrIX 95013 . G A 2644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.031;DP=195;Dels=0.00;FS=13.043;HaplotypeScore=5.8415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.242;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,117:195:99:2674,0,1403 chrIX 95057 . A G 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.289;DP=151;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.047;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,88:151:99:1745,0,1190 chrIX 95059 . T A 1839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.255;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,89:151:99:1869,0,1128 chrIX 95162 . T A 2432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.956;DP=166;Dels=0.00;FS=4.876;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,111:166:99:2462,0,981 chrIX 95216 . A C 2649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.455;DP=205;Dels=0.00;FS=0.542;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,134:205:99:2679,0,1340 chrIX 95293 . A G 2745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.254;DP=182;Dels=0.00;FS=11.179;HaplotypeScore=2.8840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,128:182:99:2775,0,864 chrIX 95341 . C G 4407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=24.48;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-2.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,179:180:99:4407,492,0 chrIX 95346 . G C 2420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;DP=176;Dels=0.00;FS=7.042;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.815;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,119:176:99:2450,0,913 chrIX 95505 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.029;DP=227;Dels=0.00;FS=1.078;HaplotypeScore=4.6161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.512;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,79:227:99:1415,0,3087 chrIX 95527 . A G 2723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.807;DP=207;Dels=0.00;FS=1.140;HaplotypeScore=8.8440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=13.15;ReadPosRankSum=1.456;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,135:207:99:2753,0,1314 chrIX 95590 . C T 4885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=25.31;ReadPosRankSum=1.409;SB=-2.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,192:193:99:4885,492,0 chrIX 95596 . T C 2388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.168;DP=185;Dels=0.00;FS=2.746;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,119:185:99:2418,0,1181 chrIX 95625 . G A 2692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.331;DP=203;Dels=0.00;FS=7.266;HaplotypeScore=2.5633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.137;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,132:203:99:2722,0,1242 chrIX 95670 . G A 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.643;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.9371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,56:191:99:907,0,2647 chrIX 95875 . T C 5085.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.43;SB=-2.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,217:217:99:5085,561,0 chrIX 96275 . C T 5437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.65;SB=-2.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,204:204:99:5437,568,0 chrIX 96860 . G A 4101.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4101,414,0 chrIX 96868 . C T 4650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.467;DP=183;Dels=0.00;FS=3.760;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=25.41;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-2.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,182:183:99:4650,445,0 chrIX 96985 . T C 4302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4302,474,0 chrIX 97075 . T A 4308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=23.54;SB=-2.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4308,436,0 chrIX 97283 . A G 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=173;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=12.9031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.480;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:3754,385,0 chrIX 97409 . G A 5574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.17;SB=-2.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,213:213:99:5574,577,0 chrIX 97592 . A G 2435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.907;DP=170;Dels=0.00;FS=6.129;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.271;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,118:170:99:2465,0,837 chrIX 97661 . A T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.500;DP=210;Dels=0.00;FS=4.244;HaplotypeScore=3.1723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.982;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,71:210:99:1095,0,3033 chrIX 97931 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.177;DP=224;Dels=0.00;FS=0.543;HaplotypeScore=7.7578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,64:224:99:1078,0,3414 chrIX 98050 . G A 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.644;DP=164;Dels=0.00;FS=6.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.665;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,49:164:99:844,0,2410 chrIX 98109 . G A 452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.010;DP=119;Dels=0.00;FS=3.938;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.530;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,31:119:99:482,0,1924 chrIX 98144 . G A 551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.439;DP=108;Dels=0.00;FS=1.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.243;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,35:108:99:581,0,1622 chrIX 98294 . C A 4544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.97;SB=-2.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4544,486,0 chrIX 98414 . T C 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;DP=145;Dels=0.00;FS=2.225;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.989;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,49:145:99:838,0,1928 chrIX 98923 . A G 2325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.027;DP=178;Dels=0.00;FS=14.534;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=13.06;ReadPosRankSum=1.959;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,118:178:99:2355,0,1077 chrIX 98932 . A G 4716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4716,513,0 chrIX 99159 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.831;DP=256;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=10.6435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=4.77;ReadPosRankSum=-2.019;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,77:256:99:1250,0,3854 chrIX 99281 . T A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;DP=204;Dels=0.00;FS=7.704;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.501;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,70:204:99:1217,0,2954 chrIX 99644 . G A 2150.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.688;DP=176;Dels=0.00;FS=4.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.740;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,109:176:99:2180,0,1216 chrIX 99647 . T C 2053.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;DP=171;Dels=0.00;FS=3.905;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.158;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,107:171:99:2083,0,1162 chrIX 99653 . T C 2098.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.456;DP=182;Dels=0.00;FS=2.786;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.485;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,110:182:99:2128,0,1348 chrIX 99686 . C T 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;DP=179;Dels=0.00;FS=5.928;HaplotypeScore=2.2282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQ0=0;MQRankSum=4.179;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.955;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,75:179:99:1398,0,2114 chrIX 99731 . C T 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.037;DP=122;Dels=0.00;FS=4.620;HaplotypeScore=17.7505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.12;MQ0=0;MQRankSum=-3.341;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.577;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,65:122:99:1075,0,552 chrIX 99734 . A G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.968;DP=130;Dels=0.00;FS=3.945;HaplotypeScore=17.7505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.75;MQ0=0;MQRankSum=-5.539;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.224;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,91:130:99:1252,0,538 chrIX 99748 . G A 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;DP=173;Dels=0.00;FS=4.189;HaplotypeScore=4.2125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.64;MQ0=0;MQRankSum=7.717;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.793;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,52:173:99:874,0,2081 chrIX 99772 . C T 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.159;DP=161;Dels=0.00;FS=6.812;HaplotypeScore=2.6119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.92;MQ0=0;MQRankSum=-6.332;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.621;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,107:161:99:1789,0,1025 chrIX 99794 . T C 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.454;DP=166;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=4.2975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.58;MQ0=0;MQRankSum=-7.430;QD=9.28;ReadPosRankSum=-2.029;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,106:166:99:1570,0,1199 chrIX 99807 . A G 1840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.265;DP=173;Dels=0.00;FS=4.492;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-5.139;QD=10.64;ReadPosRankSum=-3.808;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,112:173:99:1870,0,1212 chrIX 99846 . T A 1960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;DP=170;Dels=0.00;FS=2.730;HaplotypeScore=3.7436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=2.467;QD=11.53;ReadPosRankSum=2.483;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,102:170:99:1990,0,1372 chrIX 99972 . T C 2614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.763;DP=185;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=15.6680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.957;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,121:185:99:2644,0,1044 chrIX 100199 . G A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.316;DP=167;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=3.6982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,59:167:99:1075,0,2242 chrIX 100355 . A G 4344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.11;SB=-2.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4344,462,0 chrIX 100367 . T C 642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.377;DP=172;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=7.1448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.958;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,49:172:99:672,0,2715 chrIX 100415 . T C 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3865,426,0 chrIX 100423 . T C 544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.478;DP=149;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.432;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.304;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,43:149:99:574,0,2478 chrIX 100449 . T G 453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.130;DP=152;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,41:152:99:483,0,2501 chrIX 100450 . T C 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.956e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3814,411,0 chrIX 100465 . G A 543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.462;DP=146;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,41:146:99:573,0,2322 chrIX 100595 . A G 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=21.86;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3323,372,0 chrIX 100673 . G A 2982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.865;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,133:196:99:3012,0,971 chrIX 100882 . C T 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;DP=151;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=3.7731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.181;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,49:151:99:787,0,2087 chrIX 100888 . C T 2281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.427;DP=157;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=3.7731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=2.097;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.103;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,106:157:99:2311,0,858 chrIX 101006 . T C 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.67;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3952,432,0 chrIX 101012 . C T 3725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.79;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3725,396,0 chrIX 101027 . G A 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.74;MQ0=0;QD=24.51;SB=-2.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3897,414,0 chrIX 101030 . G A 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.30;MQ0=0;QD=23.27;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:3654,402,0 chrIX 101046 . C T 642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.535;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.394;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,46:155:99:672,0,2315 chrIX 101207 . A G 2672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.733;DP=189;Dels=0.00;FS=3.883;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.581;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,130:189:99:2702,0,1099 chrIX 101270 . A T 5401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=25.72;SB=-2.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:210:99:5401,562,0 chrIX 101294 . T C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.067;DP=184;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=9.6228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.574;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,64:184:99:1069,0,2661 chrIX 101315 . C A 4745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.77;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4745,501,0 chrIX 101321 . T C 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.57;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3799,426,0 chrIX 101379 . G C 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.327;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.796;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,57:188:99:853,0,2710 chrIX 101388 . C T 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.272;DP=191;Dels=0.00;FS=1.960;HaplotypeScore=2.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.159;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,56:191:99:897,0,2912 chrIX 101395 . T G 625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.361;DP=173;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=2.417;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.588;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,49:173:99:655,0,2712 chrIX 101559 . T C 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9843;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=18.77;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:3303,375,0 chrIX 101723 . C T 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.125;DP=215;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.245;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,62:215:99:1069,0,3044 chrIX 101771 . A C 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.295;DP=204;Dels=0.00;FS=1.152;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.329;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.692;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,69:204:99:1098,0,2953 chrIX 101828 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.741;DP=215;Dels=0.00;FS=12.179;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=5.35;ReadPosRankSum=1.573;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,70:215:99:1180,0,3015 chrIX 101954 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.728;DP=192;Dels=0.00;FS=1.853;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,70:192:99:1314,0,2547 chrIX 102011 . T C 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.425;DP=217;Dels=0.00;FS=6.344;HaplotypeScore=3.6510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,65:217:99:1038,0,3337 chrIX 102098 . A G 3501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.448;DP=244;Dels=0.00;FS=0.521;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=1;MQRankSum=-0.637;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,168:244:99:3501,0,1272 chrIX 102310 . C T 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.458;DP=199;Dels=0.00;FS=20.886;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,74:199:99:1432,0,2609 chrIX 102483 . A T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=101.0515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=6.21;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,71:190:99:1210,0,2737 chrIX 102495 . A C 5071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=25.36;SB=-2.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:5071,537,0 chrIX 102496 . T A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;DP=200;Dels=0.00;FS=1.147;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,71:200:99:1178,0,2881 chrIX 102597 . C T 4119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.54;SB=-2.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4119,426,0 chrIX 102974 . C T 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.978;DP=238;Dels=0.00;FS=0.512;HaplotypeScore=6.7289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.234;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,75:238:99:1358,0,3552 chrIX 102994 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.971;DP=229;Dels=0.00;FS=5.360;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.850;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,70:229:99:1114,0,3569 chrIX 103132 . A G 2987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.153;DP=195;Dels=0.00;FS=1.937;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.436;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,137:195:99:3017,0,955 chrIX 103157 . T C 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.776;DP=238;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=4.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=0.376;QD=4.43;ReadPosRankSum=1.536;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,69:238:99:1085,0,3733 chrIX 103177 . G A 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.169;DP=233;Dels=0.00;FS=1.773;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=0.920;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,69:233:99:1193,0,3575 chrIX 103303 . G A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.602;DP=162;Dels=0.00;FS=7.608;HaplotypeScore=4.5945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,55:162:99:1020,0,2312 chrIX 103318 . A G 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.951;DP=133;Dels=0.00;FS=16.745;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.675;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,42:133:99:732,0,2079 chrIX 103339 . T G 769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.507;DP=139;Dels=0.00;FS=5.543;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,47:139:99:799,0,1934 chrIX 103404 . T C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.047;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.836;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,70:201:99:1129,0,2798 chrIX 103474 . C G 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;DP=174;Dels=0.00;FS=6.415;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.074;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,58:174:99:858,0,2399 chrIX 103838 . A T 4115.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=1;QD=25.88;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4115,426,0 chrIX 103873 . G C 1939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.877;DP=133;Dels=0.00;FS=3.567;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=-0.143;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,95:133:99:1969,0,595 chrIX 103927 . T C 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3668,378,0 chrIX 104128 . G A 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.409;DP=121;Dels=0.00;FS=3.145;HaplotypeScore=6.7236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.335;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,119:121:99:3095,303,0 chrIX 104428 . A C 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.847;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,48:174:99:729,0,2709 chrIX 104728 . C T 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.182;DP=193;Dels=0.00;FS=1.966;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.105;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,72:193:99:1283,0,2530 chrIX 104822 . G T 591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.677;DP=150;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,40:150:99:621,0,2409 chrIX 104826 . T C 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.67;SB=-2.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4030,426,0 chrIX 104962 . T G 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.889;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.923;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.926;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,45:157:99:677,0,2599 chrIX 105090 . T C 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3962,417,0 chrIX 105326 . A G 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.030;DP=121;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=13.7018;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=21.40;ReadPosRankSum=3.927;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,112:121:99:2623,231,0 chrIX 105349 . C T 362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.526;DP=108;Dels=0.00;FS=4.213;HaplotypeScore=44.1151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=3.35;ReadPosRankSum=-3.145;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:392,0,624 chrIX 105352 . T C 389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.027;DP=106;Dels=0.00;FS=3.981;HaplotypeScore=44.1876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=3.67;ReadPosRankSum=-4.085;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,34:106:99:419,0,702 chrIX 105420 . A G 198.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;DP=93;Dels=0.00;FS=17.262;HaplotypeScore=8.7040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.872;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:228,0,1671 chrIX 105476 . T C 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;DP=105;Dels=0.00;FS=8.379;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.914;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,80:105:99:1693,0,327 chrIX 105709 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.905;DP=105;Dels=0.00;FS=12.735;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,69:105:99:1470,0,597 chrIX 105866 . C G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.909;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.008;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1016,0,658 chrIX 105910 . C T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.310;DP=112;Dels=0.00;FS=3.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=14.23;ReadPosRankSum=-2.383;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,72:112:99:1624,0,731 chrIX 105923 . A T 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.699;DP=115;Dels=0.00;FS=2.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,69:115:99:1588,0,889 chrIX 105959 . A G 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.172;DP=126;Dels=0.00;FS=3.443;HaplotypeScore=2.7523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.246;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,77:126:99:1547,0,974 chrIX 105961 . G A 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.226;DP=131;Dels=0.00;FS=8.217;HaplotypeScore=2.7523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.597;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:131:99:1666,0,1082 chrIX 106629 . G A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.417;DP=203;Dels=0.00;FS=5.086;HaplotypeScore=2.4993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.689;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,78:203:99:1465,0,2566 chrIX 106806 . A G 4717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.36;SB=-2.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4717,507,0 chrIX 106841 . G A 2303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.248;DP=155;Dels=0.00;FS=8.167;HaplotypeScore=4.9148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.946;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,109:155:99:2333,0,793 chrIX 107346 . T G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.253;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,63:201:99:1012,0,2891 chrIX 107451 . A G 2664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.808;DP=197;Dels=0.00;FS=7.657;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.555;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,127:197:99:2694,0,1201 chrIX 107538 . G A 1933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.880;DP=158;Dels=0.00;FS=2.848;HaplotypeScore=5.4590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.774;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,92:158:99:1963,0,1207 chrIX 107661 . A C 2654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.887;DP=209;Dels=0.00;FS=1.786;HaplotypeScore=3.5812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=12.70;ReadPosRankSum=-2.319;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,139:209:99:2684,0,1298 chrIX 107705 . T C 2116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.708;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,109:171:99:2146,0,1162 chrIX 108018 . G A 2237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.892;DP=156;Dels=0.00;FS=3.955;HaplotypeScore=3.8906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,103:156:99:2267,0,897 chrIX 108051 . C T 2151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.578;DP=150;Dels=0.00;FS=7.490;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,95:150:99:2181,0,974 chrIX 108375 . C T 2982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.522;DP=214;Dels=0.00;FS=0.528;HaplotypeScore=4.9426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=1.988;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,140:214:99:3012,0,1198 chrIX 108602 . T C 1921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.813;DP=151;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=5.8316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,94:151:99:1951,0,1078 chrIX 108660 . G A 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.083;DP=145;Dels=0.00;FS=13.873;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.038;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,86:145:99:1843,0,1115 chrIX 109487 . T C 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.385;DP=195;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=2.4612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=-1.704;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,63:195:99:902,0,3046 chrIX 109578 . A G 2541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.300;DP=170;Dels=0.00;FS=3.082;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.493;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,120:170:99:2571,0,822 chrIX 109716 . A G 3512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.882;DP=245;Dels=0.00;FS=8.008;HaplotypeScore=5.6900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,164:245:99:3512,0,1427 chrIX 109941 . G A 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.660;DP=216;Dels=0.00;FS=0.564;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.781;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,61:216:99:924,0,3289 chrIX 110073 . A G 5131.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6961;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=22.60;SB=-2.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,227:227:99:5131,531,0 chrIX 110174 . T C 3564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;DP=243;Dels=0.00;FS=1.705;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.522;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,169:243:99:3564,0,1203 chrIX 110376 . T C 3139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.298;DP=189;Dels=0.00;FS=3.120;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.430;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,146:189:99:3169,0,669 chrIX 110559 . G A 5481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9664;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5481,571,0 chrIX 111173 . G A 2799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.086;DP=194;Dels=0.00;FS=6.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.444;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,129:194:99:2829,0,1124 chrIX 111519 . A G 2553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.806;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.925;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,120:174:99:2583,0,969 chrIX 111569 . G A 2943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.312;DP=207;Dels=0.00;FS=10.733;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.584;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,138:207:99:2973,0,1192 chrIX 111631 . C T 5652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3742;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.54;SB=-2.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,213:213:99:5652,601,0 chrIX 111894 . A G 1923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.341;DP=157;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.772;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,98:157:99:1953,0,1078 chrIX 112032 . A G 2255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.519;DP=145;Dels=0.00;FS=10.296;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,105:145:99:2285,0,670 chrIX 112038 . A G 2163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.678;DP=152;Dels=0.00;FS=6.761;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.171;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,108:152:99:2193,0,728 chrIX 112043 . T A 2229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;DP=152;Dels=0.00;FS=5.445;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=14.66;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,109:152:99:2259,0,724 chrIX 112143 . A G 2817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.468;DP=199;Dels=0.00;FS=8.366;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.226;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,136:199:99:2847,0,1124 chrIX 112228 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=218;Dels=0.00;FS=0.525;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.788;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,73:218:99:1308,0,3189 chrIX 112302 . A G 2334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.625;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=14.41;ReadPosRankSum=1.081;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,115:162:99:2364,0,794 chrIX 112368 . A G 2465.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.382;DP=175;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=2.9426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=14.09;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,118:175:99:2495,0,1009 chrIX 112372 . G A 1012.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.070;DP=166;Dels=0.00;FS=2.074;HaplotypeScore=3.9391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.367;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,57:166:99:1042,0,2266 chrIX 112374 . A G 2185.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.996;DP=162;Dels=0.00;FS=2.128;HaplotypeScore=3.9391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,106:162:99:2215,0,1033 chrIX 112832 . C G 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.050;DP=170;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.195;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,57:170:99:1001,0,2477 chrIX 112854 . T A 2366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.715;DP=170;Dels=0.00;FS=18.390;HaplotypeScore=7.9098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,111:170:99:2396,0,1120 chrIX 112855 . C A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.693;DP=173;Dels=0.00;FS=16.470;HaplotypeScore=7.9098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.706;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,59:173:99:1103,0,2423 chrIX 113159 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.083;DP=116;Dels=0.00;FS=5.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.102;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1179,0,1165 chrIX 113517 . G A 4863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4863,505,0 chrIX 113518 . G A 4816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4816,505,0 chrIX 113561 . A T 2726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.321;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.318;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,127:204:99:2756,0,1534 chrIX 113679 . G A 2344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.795;DP=186;Dels=0.00;FS=1.199;HaplotypeScore=4.9526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.480;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,112:186:99:2374,0,1413 chrIX 113681 . G A 2359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.691;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.464;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.588;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,109:182:99:2389,0,1401 chrIX 113749 . G T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.428;DP=175;Dels=0.00;FS=12.608;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.244;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,60:175:99:1156,0,2434 chrIX 113799 . C A 5205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.77;SB=-2.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:5205,537,0 chrIX 113838 . C T 5457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5457,574,0 chrIX 113871 . G T 2746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.753;DP=181;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=15.17;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,123:181:99:2776,0,918 chrIX 114027 . A G 2075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.944;DP=135;Dels=0.00;FS=2.517;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,95:135:99:2105,0,720 chrIX 114177 . C T 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.663;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.2445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=4.39;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,52:179:99:815,0,2670 chrIX 114240 . G T 677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.347;DP=161;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=4.21;ReadPosRankSum=2.509;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,44:161:99:707,0,2574 chrIX 114270 . T C 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.617;DP=158;Dels=0.00;FS=1.533;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.900;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,45:158:99:715,0,2594 chrIX 114355 . A G 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.169;DP=112;Dels=0.00;FS=1.557;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=6.28;ReadPosRankSum=2.888;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,42:112:99:733,0,1538 chrIX 114394 . G A 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.186;DP=129;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.144;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,51:129:99:945,0,1561 chrIX 114408 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.189;DP=133;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.997;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,82:133:99:1616,0,957 chrIX 114549 . A G 2437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.840;DP=168;Dels=0.00;FS=6.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.000;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,119:168:99:2467,0,805 chrIX 114791 . A G 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9448;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3809,426,0 chrIX 114808 . G A 4374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.14;SB=-2.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4374,474,0 chrIX 115136 . C T 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3581,363,0 chrIX 115317 . G A 2494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.833;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,121:179:99:2524,0,955 chrIX 115321 . G A 2501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.130;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.210;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,119:171:99:2531,0,877 chrIX 115936 . A T 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.690;DP=134;Dels=0.00;FS=4.896;HaplotypeScore=4.3676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=5.65;ReadPosRankSum=1.768;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,43:134:99:787,0,2031 chrIX 115941 . G A 2351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.039;DP=153;Dels=0.00;FS=7.100;HaplotypeScore=3.3760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=15.37;ReadPosRankSum=-2.187;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,107:153:99:2381,0,684 chrIX 116245 . G T 2202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.437;DP=156;Dels=0.00;FS=8.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.671;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,100:156:99:2232,0,1011 chrIX 116290 . C T 2681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.852;DP=191;Dels=0.00;FS=9.478;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,126:191:99:2711,0,1196 chrIX 116329 . A G 2076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.433;DP=164;Dels=0.00;FS=6.273;HaplotypeScore=2.8415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.552;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,109:164:99:2106,0,972 chrIX 116385 . C T 2358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.656;DP=167;Dels=0.00;FS=7.200;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,111:167:99:2388,0,978 chrIX 116428 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.593;DP=184;Dels=0.00;FS=7.845;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.698;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,65:184:99:1169,0,2705 chrIX 116694 . C A 3134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.309;DP=224;Dels=0.00;FS=0.518;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=1.588;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.896;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,146:224:99:3164,0,1369 chrIX 116742 . A G 3099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.495;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=15.27;ReadPosRankSum=-2.012;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,144:203:99:3129,0,1028 chrIX 116968 . G C 3410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;DP=240;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,159:240:99:3410,0,1363 chrIX 117012 . T A 5857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.69;SB=-3.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,228:228:99:5857,592,0 chrIX 117336 . A T 4644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4644,498,0 chrIX 117383 . G T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.781;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.103;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,64:184:99:1208,0,2554 chrIX 117411 . T C 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7436;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-2.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,179:182:99:3759,417,0 chrIX 117413 . T G 2103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.659;DP=176;Dels=0.00;FS=10.886;HaplotypeScore=11.3219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,117:176:99:2133,0,827 chrIX 117717 . G A 3274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.974;DP=241;Dels=0.00;FS=1.776;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,151:241:99:3274,0,1673 chrIX 117809 . T G 2899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.245;DP=221;Dels=0.00;FS=1.905;HaplotypeScore=5.2855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.756;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,138:221:99:2929,0,1621 chrIX 117852 . C T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;DP=199;Dels=0.00;FS=7.900;HaplotypeScore=5.1975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,78:199:99:1390,0,2506 chrIX 118307 . A G 3214.03 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.788;DP=230;Dels=0.00;FS=6.740;HaplotypeScore=3.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=13.97;ReadPosRankSum=2.617;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,151:229:99:3244,0,1441 chrIX 118413 . C A 2650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.639;DP=185;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.309;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,122:185:99:2680,0,1034 chrIX 118634 . A G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.915;DP=215;Dels=0.00;FS=0.544;HaplotypeScore=10.5742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=4.80;ReadPosRankSum=2.053;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,65:215:99:1062,0,3201 chrIX 118726 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.248;DP=230;Dels=0.00;FS=21.623;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.370;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,75:230:99:1387,0,3263 chrIX 118750 . A G 2676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.159;DP=200;Dels=0.00;FS=14.023;HaplotypeScore=2.9669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,129:200:99:2706,0,1298 chrIX 118855 . T C 2357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.176;DP=173;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.990;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,118:173:99:2387,0,986 chrIX 119092 . G A 2441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.208;DP=172;Dels=0.00;FS=2.848;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=14.19;ReadPosRankSum=1.210;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,114:172:99:2471,0,1030 chrIX 119272 . A G 2728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.137;DP=194;Dels=0.00;FS=10.450;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,128:194:99:2758,0,1243 chrIX 119687 . G A 5265.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5265,550,0 chrIX 120214 . T A 5037.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:5037,531,0 chrIX 120514 . T C 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.611;DP=194;Dels=0.00;FS=2.825;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=2;MQRankSum=-0.636;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.634;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,66:194:99:1115,0,2857 chrIX 120883 . T G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.673;DP=188;Dels=0.00;FS=2.765;HaplotypeScore=3.7752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,62:188:99:1036,0,2670 chrIX 121009 . A G 2847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.389;DP=229;Dels=0.00;FS=11.130;HaplotypeScore=3.6975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,151:229:99:2877,0,1536 chrIX 121087 . C T 2970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.413;DP=221;Dels=0.00;FS=1.678;HaplotypeScore=4.2714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=2.566;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.144;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,136:221:99:3000,0,1577 chrIX 121460 . A G 4677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=23.74;SB=-2.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:4677,519,0 chrIX 121652 . G A 3613.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3613,384,0 chrIX 121990 . T C 2514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.632;DP=176;Dels=0.00;FS=8.534;HaplotypeScore=3.6527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.108;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,122:176:99:2544,0,856 chrIX 122127 . T C 2624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.961;DP=184;Dels=0.00;FS=1.283;HaplotypeScore=3.3418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.843;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,131:184:99:2654,0,836 chrIX 122272 . A T 2171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.246;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.052;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,110:192:99:2201,0,1633 chrIX 122282 . G T 4252.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.48;MQ0=0;QD=24.58;SB=-2.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4252,432,0 chrIX 122284 . C G 1894.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;DP=179;Dels=0.00;FS=3.503;HaplotypeScore=3.4808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.789;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,105:179:99:1924,0,1354 chrIX 122286 . A G 1886.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.118;DP=179;Dels=0.00;FS=3.503;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.827;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,105:179:99:1916,0,1462 chrIX 122620 . A T 5356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=203;Dels=0.00;FS=4.442;HaplotypeScore=5.5034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=26.38;ReadPosRankSum=1.101;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,202:203:99:5356,556,0 chrIX 122931 . A G 2881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.708;DP=218;Dels=0.00;FS=2.513;HaplotypeScore=5.8615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.215;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,145:218:99:2911,0,1299 chrIX 122940 . A T 5545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.20;SB=-2.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:5545,577,0 chrIX 122985 . C T 3366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.706;DP=223;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.3331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,156:223:99:3366,0,1063 chrIX 123753 . G A 3107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.147;DP=211;Dels=0.00;FS=0.543;HaplotypeScore=9.2668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.744;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,146:211:99:3137,0,996 chrIX 124278 . T C 643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.152;DP=159;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,45:159:99:673,0,2496 chrIX 124308 . A C 2564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.163;DP=171;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=2.3770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=14.99;ReadPosRankSum=-2.095;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,123:171:99:2594,0,835 chrIX 124830 . A G 5397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.87;SB=-2.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,217:217:99:5397,576,0 chrIX 125289 . T G 1889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.682;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.851;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,97:155:99:1919,0,1112 chrIX 125295 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.281;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,78:207:99:1462,0,2529 chrIX 125455 . C G 5363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:208:99:5363,567,0 chrIX 125593 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.092;DP=186;Dels=0.00;FS=15.136;HaplotypeScore=3.3787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=6.48;ReadPosRankSum=2.081;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,69:186:99:1235,0,2550 chrIX 126032 . T C 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.315;DP=183;Dels=0.00;FS=1.962;HaplotypeScore=5.8230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.617;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,60:183:99:970,0,2726 chrIX 126041 . C T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.207;DP=194;Dels=0.00;FS=1.857;HaplotypeScore=10.1382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.734;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,65:194:99:1132,0,2777 chrIX 126263 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.731;DP=230;Dels=0.00;FS=1.063;HaplotypeScore=2.7359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.616;QD=6.08;ReadPosRankSum=2.364;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,82:230:99:1429,0,3145 chrIX 126375 . A G 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.732;DP=195;Dels=0.00;FS=2.052;HaplotypeScore=7.8556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,52:195:99:815,0,3239 chrIX 126566 . T C 5896.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=255;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=23.12;SB=-2.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,255:255:99:5896,630,0 chrIX 127022 . A G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.589;DP=234;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.274;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,73:234:99:1165,0,3554 chrIX 127117 . G C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,75:207:99:1144,0,2888 chrIX 127393 . T C 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.131;DP=194;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.108;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,70:194:99:1077,0,2615 chrIX 127496 . A G 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.830;DP=182;Dels=0.00;FS=10.114;HaplotypeScore=4.5961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,79:182:99:1620,0,2233 chrIX 127636 . T C 4773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=24.99;SB=-2.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4773,498,0 chrIX 127637 . T C 4529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=23.96;SB=-2.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4529,486,0 chrIX 127743 . G A 899.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.618;DP=176;Dels=0.00;FS=6.016;HaplotypeScore=4.5931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=-4.007;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.285;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,57:176:99:929,0,2593 chrIX 127746 . G T 973.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.082;DP=190;Dels=0.00;FS=0.582;HaplotypeScore=3.6772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-4.546;QD=5.12;ReadPosRankSum=1.270;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,61:190:99:1003,0,2781 chrIX 127749 . C T 4947.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4947,511,0 chrIX 127774 . G A 4534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4534,480,0 chrIX 127868 . C T 678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.062;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=1;MQRankSum=0.660;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,45:146:99:708,0,2044 chrIX 127885 . C G 640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.779;DP=152;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=4.9197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=1;MQRankSum=-0.090;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.389;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,47:152:99:670,0,2036 chrIX 128216 . C G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.380;DP=202;Dels=0.00;FS=1.135;HaplotypeScore=6.9397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=1;MQRankSum=0.425;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.311;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,73:202:99:1224,0,2627 chrIX 128572 . G A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.133;DP=196;Dels=0.00;FS=1.155;HaplotypeScore=7.1109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=2.147;QD=6.27;ReadPosRankSum=2.959;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,70:196:99:1258,0,2594 chrIX 129649 . A G 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.410;DP=241;Dels=0.00;FS=17.855;HaplotypeScore=8.8221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,64:241:99:903,0,3461 chrIX 129784 . A G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.324;DP=195;Dels=0.00;FS=1.805;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,77:195:99:1381,0,2547 chrIX 129806 . T C 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.070;DP=224;Dels=0.00;FS=3.935;HaplotypeScore=8.8603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.354;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,81:224:99:1458,0,3108 chrIX 129937 . T A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,70:212:99:1278,0,3099 chrIX 130004 . T A 5779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,217:217:99:5779,598,0 chrIX 130011 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.165;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=5.53;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,75:228:99:1290,0,3403 chrIX 130049 . G T 5584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.50;SB=-2.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:219:99:5584,580,0 chrIX 130122 . A G 547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.456;DP=146;Dels=0.00;FS=19.958;HaplotypeScore=4.0174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.604;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,41:146:99:577,0,2111 chrIX 130167 . T C 2052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.976;DP=163;Dels=0.00;FS=9.093;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=12.59;ReadPosRankSum=-2.296;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,105:163:99:2082,0,1080 chrIX 130259 . T C 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.483;DP=176;Dels=0.00;FS=3.844;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,73:176:99:1383,0,2345 chrIX 130270 . T C 4571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4571,498,0 chrIX 130336 . C T 5058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.93;MQ0=0;QD=26.48;SB=-2.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:5058,543,0 chrIX 130430 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.294;DP=243;Dels=0.00;FS=0.516;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.801;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,71:243:99:1191,0,3652 chrIX 130461 . T C 5899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7341;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,227:227:99:5899,639,0 chrIX 130480 . G A 5399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=25.47;SB=-2.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5399,565,0 chrIX 130537 . C T 4670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.43;MQ0=0;QD=23.47;SB=-2.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:4670,486,0 chrIX 130538 . A C 4556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.715;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=23.01;ReadPosRankSum=1.155;SB=-2.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,197:198:99:4556,483,0 chrIX 130586 . G A 4094.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9529;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.31;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:171:99:4094,424,0 chrIX 130592 . C T 2053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.736;DP=186;Dels=0.00;FS=3.863;HaplotypeScore=10.0518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.07;MQ0=0;MQRankSum=-4.221;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,110:186:99:2083,0,1351 chrIX 130684 . G T 7244.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=292;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.81;SB=-3.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,292:292:99:7244,769,0 chrIX 130712 . G A 6703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=262;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.58;SB=-3.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,261:262:99:6703,721,0 chrIX 130771 . A T 5703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.40;SB=-2.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:5703,598,0 chrIX 130852 . T C 4008.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=1;QD=24.00;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:167:99:4008,459,0 chrIX 130859 . G T 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.376;DP=178;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=-0.742;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.721;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,61:178:99:1137,0,2527 chrIX 130876 . C T 4825.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=1;QD=25.94;SB=-2.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4825,513,0 chrIX 131485 . C T 4522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4522,477,0 chrIX 131490 . T C 4227.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4227,483,0 chrIX 131557 . T C 4062.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4062,426,0 chrIX 131563 . C A 2101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.655;DP=166;Dels=0.00;FS=2.067;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,106:166:99:2131,0,1058 chrIX 131617 . G A 4371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:174:99:4371,462,0 chrIX 131703 . A G 2870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.366;DP=220;Dels=0.00;FS=1.208;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.471;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,142:220:99:2900,0,1453 chrIX 131737 . C T 5401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0746;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=1;QD=25.84;SB=-2.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5401,553,0 chrIX 131742 . C G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;DP=209;Dels=0.00;FS=3.529;HaplotypeScore=3.0746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=0.045;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.173;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,68:209:99:1128,0,2791 chrIX 131883 . C A 4750.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4750,490,0 chrIX 131893 . A G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.205;DP=183;Dels=0.00;FS=3.619;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.910;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,67:183:99:1201,0,2533 chrIX 131911 . C G 2628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;DP=182;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=3.0311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.485;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.392;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,135:182:99:2658,0,640 chrIX 131983 . A G 5366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,218:218:99:5366,570,0 chrIX 132007 . C A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.144;DP=193;Dels=0.00;FS=3.642;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.124;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,65:193:99:1150,0,2687 chrIX 132018 . G A 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.923;DP=180;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=2.5220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,54:180:99:872,0,2703 chrIX 132095 . A C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.078;DP=206;Dels=0.00;FS=2.522;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.823;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,73:206:99:1217,0,2836 chrIX 132151 . T A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;DP=191;Dels=0.00;FS=6.749;HaplotypeScore=57.7659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=6.14;ReadPosRankSum=2.765;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,66:191:99:1203,0,2780 chrIX 132156 . G A 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.287;DP=189;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=60.0024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=5.65;ReadPosRankSum=-1.254;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,63:189:99:1098,0,2644 chrIX 132182 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.767;DP=192;Dels=0.01;FS=3.581;HaplotypeScore=7.5550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,66:191:99:1209,0,2656 chrIX 132304 . A C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.939;DP=219;Dels=0.00;FS=3.966;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.586;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,83:219:99:1384,0,3017 chrIX 132429 . T G 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.957;DP=252;Dels=0.00;FS=1.023;HaplotypeScore=2.5183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=5.25;ReadPosRankSum=-3.575;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,86:252:99:1354,0,3629 chrIX 132543 . T C 5378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.01;SB=-2.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,224:224:99:5378,579,0 chrIX 132581 . C T 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.685;DP=193;Dels=0.00;FS=3.384;HaplotypeScore=4.4358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.228;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,75:193:99:1379,0,2440 chrIX 132615 . G A 5266.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.69;SB=-2.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:5266,543,0 chrIX 132907 . T C 4774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4774,531,0 chrIX 133074 . T A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;DP=195;Dels=0.00;FS=1.170;HaplotypeScore=2.5981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.958;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,68:195:99:1072,0,2808 chrIX 133353 . C T 5320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.60;SB=-2.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:5320,547,0 chrIX 133368 . C T 3389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.573;DP=222;Dels=0.00;FS=1.791;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.951;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,154:222:99:3389,0,1140 chrIX 133668 . G A 4452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4452,474,0 chrIX 133698 . A G 2737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.376;DP=170;Dels=0.00;FS=6.798;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.292;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,128:170:99:2767,0,675 chrIX 133869 . T C 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;DP=143;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=24.01;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3433,345,0 chrIX 133870 . T C 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3347,363,0 chrIX 133892 . C G 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;DP=117;Dels=0.00;FS=1.656;HaplotypeScore=2.8402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.539;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,79:117:99:1594,0,651 chrIX 134077 . T C 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.901;DP=163;Dels=0.00;FS=4.658;HaplotypeScore=6.6398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.333;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,54:163:99:940,0,2409 chrIX 134277 . A G 1882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.055;DP=158;Dels=0.00;FS=1.268;HaplotypeScore=3.1246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,95:158:99:1912,0,1235 chrIX 134280 . A G 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;DP=157;Dels=0.00;FS=2.045;HaplotypeScore=2.3906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.113;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,63:157:99:1214,0,1968 chrIX 134472 . G A 4887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.42;SB=-2.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:185:99:4887,519,0 chrIX 134641 . T C 2417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.116;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.846;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,132:214:99:2447,0,1508 chrIX 134773 . G A 2638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.806;DP=201;Dels=0.00;FS=2.523;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=2.628;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.208;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,124:201:99:2668,0,1366 chrIX 134779 . T C 2178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.955;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.116;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,117:186:99:2208,0,1307 chrIX 134788 . T C 2407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.355;DP=178;Dels=0.00;FS=3.626;HaplotypeScore=5.5135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.429;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,114:178:99:2437,0,1196 chrIX 134885 . A G 2761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.779;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.287;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,133:189:99:2791,0,963 chrIX 134890 . C T 2805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.756;DP=190;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=5.7788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.296;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,132:190:99:2835,0,940 chrIX 134917 . A G 2820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.061;DP=202;Dels=0.00;FS=1.976;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.407;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,137:202:99:2850,0,1146 chrIX 134920 . G A 2915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.324;DP=204;Dels=0.00;FS=2.728;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.282;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,138:204:99:2945,0,1139 chrIX 134985 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.377;DP=204;Dels=0.00;FS=5.467;HaplotypeScore=4.3474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.391;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,63:204:99:1081,0,3011 chrIX 135055 . T C 2679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.643;DP=183;Dels=0.00;FS=3.748;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,127:183:99:2709,0,1030 chrIX 135075 . A G 4957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4957,537,0 chrIX 135142 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.496;DP=183;Dels=0.00;FS=3.642;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.906;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.009;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,58:183:99:1030,0,2594 chrIX 135273 . C T 2914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.649;DP=208;Dels=0.00;FS=8.538;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=14.01;ReadPosRankSum=0.369;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,134:208:99:2944,0,1245 chrIX 135274 . T A 2943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;DP=206;Dels=0.00;FS=7.417;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.286;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,133:206:99:2973,0,1325 chrIX 135361 . T C 5584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.49;SB=-2.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,228:228:99:5584,588,0 chrIX 135454 . C T 2635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.908;DP=207;Dels=0.00;FS=0.533;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.807;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,126:207:99:2665,0,1477 chrIX 135647 . G A 5027.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:5027,525,0 chrIX 135991 . G C 5025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7860;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.00;SB=-2.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:5025,540,0 chrIX 136028 . C T 2169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.048;DP=170;Dels=0.00;FS=5.785;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.013;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,101:170:99:2199,0,1337 chrIX 136044 . T A 2230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;DP=176;Dels=0.00;FS=4.829;HaplotypeScore=3.9576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.083;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,104:176:99:2260,0,1411 chrIX 136075 . A G 4048.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4048,438,0 chrIX 136100 . T C 2214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.348;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,109:171:99:2244,0,1125 chrIX 136134 . G A 2326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.599;DP=166;Dels=0.00;FS=8.632;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=14.01;ReadPosRankSum=2.200;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,108:166:99:2356,0,1000 chrIX 136172 . T C 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.681;DP=126;Dels=0.00;FS=1.675;HaplotypeScore=2.6744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=3.811;QD=14.68;ReadPosRankSum=-3.121;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,92:126:99:1880,0,540 chrIX 136210 . A T 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.351;DP=106;Dels=0.00;FS=3.496;HaplotypeScore=77.5010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.28;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.336;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,84:106:99:1845,0,276 chrIX 136233 . A T 40.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;DP=104;Dels=0.00;FS=12.875;HaplotypeScore=2.4637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-3.652;QD=0.38;ReadPosRankSum=-5.167;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,14:104:70:70,0,2077 chrIX 136356 . T A 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.047;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:767,0,1299 chrIX 136423 . T C 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.039;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.282;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,45:111:99:821,0,1413 chrIX 136426 . A C 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.361;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=2.481;QD=6.97;ReadPosRankSum=1.369;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,43:107:99:776,0,1382 chrIX 136527 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.791;DP=165;Dels=0.00;FS=7.255;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=3.053;QD=6.92;ReadPosRankSum=-3.390;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,62:165:99:1171,0,1664 chrIX 136579 . G C 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.328;DP=154;Dels=0.00;FS=3.277;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.673;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,50:154:99:805,0,2075 chrIX 136584 . A G 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.987;DP=154;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=2.250;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.718;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,49:154:99:841,0,2325 chrIX 136619 . A G 4065.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4065,453,0 chrIX 136762 . G A 4714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4714,475,0 chrIX 136845 . T C 4500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:176:99:4500,489,0 chrIX 136846 . T C 4498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.05;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4498,495,0 chrIX 136891 . C T 4609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4609,471,0 chrIX 136938 . G C 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=155;Dels=0.00;FS=3.252;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=3.985;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,49:155:99:821,0,2360 chrIX 136968 . G A 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.434;DP=171;Dels=0.00;FS=7.441;HaplotypeScore=3.6836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.009;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,49:171:99:808,0,2593 chrIX 137062 . A G 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.556;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=25.76;ReadPosRankSum=1.600;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:4045,444,0 chrIX 137125 . G A 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.420;DP=168;Dels=0.00;FS=31.681;HaplotypeScore=281.3720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.25;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=9.96;ReadPosRankSum=-3.418;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,84:168:99:1704,0,303 chrIX 137138 . A C 1183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.106;DP=153;Dels=0.00;FS=10.105;HaplotypeScore=299.9185;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=7.73;ReadPosRankSum=-5.467;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:67,54:153:99:1216,138,0 chrIX 137143 . A G 377.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.945;DP=159;Dels=0.00;FS=11.191;HaplotypeScore=236.1622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=2.37;ReadPosRankSum=-4.213;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,25:159:99:407,0,798 chrIX 137155 . G A 82.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.977;DP=152;Dels=0.00;FS=9.828;HaplotypeScore=46.5476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=0.54;ReadPosRankSum=-6.277;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,16:152:99:112,0,1574 chrIX 137160 . A T 1976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8427;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.88;MQ0=0;QD=14.75;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:2009,216,0 chrIX 137334 . C T 4361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.92;MQ0=1;QD=25.35;SB=-2.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4361,442,0 chrIX 137403 . T C 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.247;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.62;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,51:139:99:873,0,1854 chrIX 137599 . C A 1957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.559;DP=162;Dels=0.00;FS=2.812;HaplotypeScore=3.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=2.645;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.525;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,93:162:99:1987,0,1376 chrIX 137624 . T C 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=164;Dels=0.00;FS=16.458;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,48:164:99:767,0,2593 chrIX 137636 . A T 4216.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.78;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4216,447,0 chrIX 137742 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.235;DP=161;Dels=0.00;FS=6.089;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.445;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,58:161:99:950,0,2057 chrIX 137929 . A G 518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.981;DP=156;Dels=0.00;FS=1.513;HaplotypeScore=6.2144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=1.995;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.601;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,48:156:99:548,0,1763 chrIX 138125 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.517;DP=188;Dels=0.00;FS=4.572;HaplotypeScore=2.7272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.534;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,63:188:99:962,0,2589 chrIX 138305 . T C 5028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.65;SB=-2.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,204:204:99:5028,549,0 chrIX 138346 . T C 4943.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:4943,537,0 chrIX 138437 . C A 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=137;Dels=0.00;FS=10.704;HaplotypeScore=475.6161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=0.27;ReadPosRankSum=-4.043;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,6:137:67:67,0,85 chrIX 138455 . A C 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3706,402,0 chrIX 138495 . C T 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.961e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3946,408,0 chrIX 138636 . T A 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.277;DP=188;Dels=0.00;FS=11.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.066;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,53:188:99:856,0,2839 chrIX 138740 . C T 5082.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.47;SB=-2.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:5082,549,0 chrIX 138792 . T A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.079;DP=212;Dels=0.00;FS=12.956;HaplotypeScore=5.2108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.441;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,72:212:99:1287,0,3140 chrIX 138848 . C A 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.089;DP=212;Dels=0.00;FS=4.348;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.088;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,63:212:99:1084,0,3155 chrIX 139216 . C G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;DP=168;Dels=0.00;FS=10.058;HaplotypeScore=4.7941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=5.16;ReadPosRankSum=-2.238;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,55:168:99:897,0,2312 chrIX 139233 . G T 4420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.23;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.980e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4420,468,0 chrIX 139242 . A T 4182.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.31;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4182,444,0 chrIX 139314 . G C 2103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.88;MQ0=0;QD=20.03;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2136,246,0 chrIX 139367 . A G 2588 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.94;MQ0=0;QD=20.54;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2621,294,0 chrIX 139370 . A G 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.82;MQ0=0;QD=20.17;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2594,291,0 chrIX 139397 . G C 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.62;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3449,396,0 chrIX 139404 . G T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.672;DP=147;Dels=0.00;FS=3.892;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.56;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.012;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3405,351,0 chrIX 139442 . A G 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.45;MQ0=0;QD=18.94;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:2855,321,0 chrIX 139448 . C A 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.74;MQ0=0;QD=19.73;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:2854,312,0 chrIX 139458 . T C 2901 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.30;MQ0=0;QD=20.29;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:2934,330,0 chrIX 139461 . T C 2833 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.30;MQ0=0;QD=19.81;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:2866,333,0 chrIX 139466 . T A 2996 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.93;MQ0=0;QD=21.10;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3029,333,0 chrIX 139513 . T A 4719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.87;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4719,510,0 chrIX 139519 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.335;DP=188;Dels=0.00;FS=14.812;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.57;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.151;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,76:188:99:1541,0,2294 chrIX 139556 . T C 629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.425;DP=193;Dels=0.00;FS=11.828;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.054;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,50:193:99:659,0,3190 chrIX 139629 . T C 451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.439;DP=122;Dels=0.00;FS=12.332;HaplotypeScore=3.4528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.649;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,32:122:99:481,0,2042 chrIX 141013 . G A 4615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07;SB=-2.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4615,492,0 chrIX 141022 . A G 4662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.54;SB=-2.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4662,504,0 chrIX 141321 . T G 4544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=23.67;SB=-2.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:192:99:4544,471,0 chrIX 141911 . A G 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=23.17;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3776,429,0 chrIX 141933 . C G 652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=5.17;ReadPosRankSum=-2.898;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,44:126:99:682,0,1677 chrIX 142070 . A G 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.429;DP=194;Dels=0.00;FS=2.737;HaplotypeScore=8.8786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.930;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,61:194:99:955,0,2340 chrIX 142215 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.751;DP=185;Dels=0.00;FS=7.813;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,65:185:99:1168,0,2486 chrIX 142344 . C T 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.588;DP=165;Dels=0.00;FS=2.274;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,54:165:99:901,0,2325 chrIX 142456 . A T 472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.735;DP=174;Dels=0.00;FS=5.916;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=-9.155;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.807;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,44:174:99:502,0,2916 chrIX 142469 . T G 418.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.765;DP=196;Dels=0.00;FS=6.960;HaplotypeScore=4.4958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=-8.711;QD=2.13;ReadPosRankSum=3.847;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,42:196:99:448,0,3472 chrIX 142470 . A G 430.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.573;DP=197;Dels=0.00;FS=6.862;HaplotypeScore=3.5024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=-8.554;QD=2.18;ReadPosRankSum=3.968;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,42:197:99:460,0,3507 chrIX 142478 . C A 473.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.746;DP=180;Dels=0.00;FS=4.225;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=-8.676;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.653;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,44:180:99:503,0,2989 chrIX 142488 . C G 488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.465;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=35.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQ0=0;MQRankSum=-8.484;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.038;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,46:200:99:518,0,3392 chrIX 142542 . T C 2727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.257;DP=195;Dels=0.00;FS=1.237;HaplotypeScore=46.6271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,132:195:99:2757,0,1113 chrIX 142544 . C A 611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.352;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=46.6271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.353;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,46:196:99:641,0,3268 chrIX 142556 . G T 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.998;DP=210;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.202;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.677;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,56:210:99:796,0,3470 chrIX 142618 . G T 738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.052;DP=173;Dels=0.00;FS=1.343;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,49:173:99:768,0,2626 chrIX 142890 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.250;DP=210;Dels=0.00;FS=0.541;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=6.11;ReadPosRankSum=-1.473;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,72:210:99:1314,0,2820 chrIX 142906 . C T 6011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=235;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.58;SB=-2.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,234:235:99:6011,622,0 chrIX 143092 . G A 5121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5525;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.13;SB=-2.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:5121,531,0 chrIX 143221 . G A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.276;DP=224;Dels=0.00;FS=1.806;HaplotypeScore=6.7208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.028;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,66:224:99:1151,0,3456 chrIX 143302 . C T 6119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.4633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.82;SB=-2.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,235:236:99:6119,631,0 chrIX 143352 . C T 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.439;DP=189;Dels=0.00;FS=7.223;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,57:189:99:974,0,2886 chrIX 143414 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.230;DP=176;Dels=0.00;FS=2.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.520;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,59:176:99:1032,0,2577 chrIX 143458 . C A 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.943;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.752;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,50:157:99:891,0,2162 chrIX 143620 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.844;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.235;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,65:164:99:1152,0,2132 chrIX 143995 . A G 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.953;DP=186;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=3.44;ReadPosRankSum=-1.138;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,46:186:99:669,0,3100 chrIX 144130 . T C 123.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.976;DP=156;Dels=0.00;FS=14.799;HaplotypeScore=788.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=0.79;ReadPosRankSum=-1.975;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,13:156:99:153,0,417 chrIX 144276 . G A 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.226;DP=146;Dels=0.00;FS=4.239;HaplotypeScore=3.7045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.010;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,48:146:99:886,0,2091 chrIX 144792 . T C 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.806;DP=164;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,50:164:99:879,0,2524 chrIX 144930 . A C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.024;DP=236;Dels=0.00;FS=3.174;HaplotypeScore=4.8094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.337;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,85:235:99:1321,0,3379 chrIX 145032 . A G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.244;DP=194;Dels=0.00;FS=1.227;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.143;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,76:194:99:1258,0,2601 chrIX 145248 . T A 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.3383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.102;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,68:197:99:1237,0,2755 chrIX 145407 . C T 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.531;DP=213;Dels=0.00;FS=1.203;HaplotypeScore=4.3716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=1;MQRankSum=1.275;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.626;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,83:213:99:1534,0,2641 chrIX 145805 . T A 4497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.70;SB=-2.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4497,471,0 chrIX 146023 . G T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.587;DP=224;Dels=0.00;FS=5.326;HaplotypeScore=3.0224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=1.787;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,62:224:99:1061,0,3488 chrIX 146113 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.216;DP=200;Dels=0.00;FS=2.081;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,70:200:99:1249,0,2736 chrIX 146193 . T C 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.721;DP=165;Dels=0.00;FS=3.998;HaplotypeScore=2.4888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,49:165:99:737,0,2524 chrIX 146276 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.109;DP=202;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=2.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.094;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,70:202:99:1267,0,2787 chrIX 146460 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.219;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.758;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,68:197:99:1297,0,2760 chrIX 146901 . A G 3905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.503;DP=193;Dels=0.00;FS=9.229;HaplotypeScore=8.7305;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.55;MQ0=1;MQRankSum=5.519;QD=20.23;ReadPosRankSum=5.663;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,170:193:99:3905,270,0 chrIX 146913 . T C 3121.22 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.772;DP=206;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=8.5895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.18;MQ0=1;MQRankSum=3.604;QD=15.15;ReadPosRankSum=4.117;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,172:206:10:3151,0,10 chrIX 146919 . A G 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5094;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.08;MQ0=1;QD=20.78;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:3990,441,0 chrIX 146928 . C T 2863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;DP=193;Dels=0.00;FS=2.316;HaplotypeScore=5.5095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.71;MQ0=1;MQRankSum=2.560;QD=14.83;ReadPosRankSum=2.069;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,154:193:99:2893,0,169 chrIX 146932 . G A 4094.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.84;MQ0=1;QD=21.43;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4094,435,0 chrIX 146985 . T G 651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.237;DP=261;Dels=0.00;FS=3.789;HaplotypeScore=41.5802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=1;MQRankSum=-1.037;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.406;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,77:261:99:681,0,3409 chrIX 147006 . C T 292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.181;DP=290;Dels=0.00;FS=5.301;HaplotypeScore=10.7610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=-3.124;QD=1.01;ReadPosRankSum=-2.655;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,55:290:99:322,0,4809 chrIX 147036 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.119;DP=300;Dels=0.00;FS=7.979;HaplotypeScore=6.5469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=2.481;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.778;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,86:300:99:1298,0,4277 chrIX 147051 . G T 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.487;DP=294;Dels=0.00;FS=5.015;HaplotypeScore=37.4355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.16;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.122;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,92:294:99:1557,0,3751 chrIX 147057 . A G 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.766;DP=283;Dels=0.00;FS=3.135;HaplotypeScore=79.9906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=0.09;ReadPosRankSum=0.926;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,38:283:55:55,0,5073 chrIX 147063 . G T 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.703;DP=260;Dels=0.00;FS=3.257;HaplotypeScore=43.4837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=2.49;ReadPosRankSum=1.276;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,64:260:99:677,0,3932 chrIX 147092 . A G 466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.072;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.7927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=1.905;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.704;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,43:180:99:496,0,3003 chrIX 147145 . T G 4604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=25.16;SB=-2.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4604,486,0 chrIX 147273 . T C 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.680;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,70:210:99:1149,0,3027 chrIX 147411 . A G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.894;DP=199;Dels=0.00;FS=21.735;HaplotypeScore=3.3326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,66:199:99:1068,0,2939 chrIX 147414 . C T 2963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.932;DP=199;Dels=0.00;FS=14.848;HaplotypeScore=3.3326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.361;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,136:199:99:2993,0,1101 chrIX 147476 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.278;DP=184;Dels=0.00;FS=4.329;HaplotypeScore=3.6063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,74:184:99:1323,0,2454 chrIX 147523 . G C 2874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;DP=209;Dels=0.00;FS=1.174;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.178;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,143:209:99:2904,0,1173 chrIX 147684 . G A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.649;DP=216;Dels=0.00;FS=1.880;HaplotypeScore=3.7470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=4.29;ReadPosRankSum=1.122;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,60:216:99:956,0,3260 chrIX 147732 . G A 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.510;DP=262;Dels=0.00;FS=0.494;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,76:262:99:1247,0,3980 chrIX 147738 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.754;DP=269;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,79:269:99:1269,0,4006 chrIX 147906 . T G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.163;DP=185;Dels=0.00;FS=1.200;HaplotypeScore=4.3487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.291;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,66:185:99:1132,0,2644 chrIX 148037 . C T 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.047;DP=202;Dels=0.00;FS=1.909;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.981;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,60:202:99:952,0,3182 chrIX 148204 . A G 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.316;DP=144;Dels=0.00;FS=7.958;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.659;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,48:144:99:793,0,2145 chrIX 148268 . A T 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.035;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,61:162:99:1125,0,2240 chrIX 148596 . A G 2265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.504;DP=181;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=3.5902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.201;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,113:181:99:2295,0,1301 chrIX 148727 . A G 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.443;DP=188;Dels=0.00;FS=1.218;HaplotypeScore=186.5274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,62:188:99:1065,0,2781 chrIX 148798 . T A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;DP=237;Dels=0.00;FS=1.038;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=6.38;ReadPosRankSum=-1.345;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,86:237:99:1542,0,3283 chrIX 148834 . A C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.934;DP=210;Dels=0.00;FS=1.808;HaplotypeScore=5.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.681;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,73:210:99:1239,0,2953 chrIX 148892 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.814;DP=172;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,52:172:99:911,0,2499 chrIX 148925 . C T 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.450;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.519;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,62:186:99:1074,0,2633 chrIX 149011 . T C 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.396;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,57:185:99:853,0,2898 chrIX 149158 . T C 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.058;DP=176;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=3.3519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=4.58;ReadPosRankSum=-2.222;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,54:176:99:836,0,2624 chrIX 149536 . G T 5545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.79;SB=-2.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5545,565,0 chrIX 149564 . C G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,74:208:99:1291,0,2858 chrIX 149761 . C T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.987;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=2.090;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.488;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,64:195:99:1132,0,2716 chrIX 149769 . T C 2977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.549;DP=209;Dels=0.00;FS=1.178;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=14.24;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,141:209:99:3007,0,1190 chrIX 149978 . C G 4855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5898;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4855,519,0 chrIX 149985 . C T 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.912;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.243;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,72:190:99:1367,0,2493 chrIX 150030 . C T 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.571;DP=179;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=3.6278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,57:179:99:972,0,2692 chrIX 150043 . A G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.331;DP=187;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=49.2247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,85:187:99:1593,0,2249 chrIX 150052 . G C 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;DP=188;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=47.3688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,54:188:99:798,0,2877 chrIX 150163 . A G 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.415;DP=147;Dels=0.00;FS=3.192;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.035;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,47:147:99:761,0,2230 chrIX 150261 . T C 4780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7910;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:4780,548,0 chrIX 150475 . T G 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;DP=239;Dels=0.00;FS=6.575;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,85:239:99:1518,0,3261 chrIX 150521 . T C 1884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.561;DP=272;Dels=0.00;FS=9.794;HaplotypeScore=5.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.344;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,105:272:99:1914,0,3569 chrIX 150557 . G C 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.796;DP=219;Dels=0.00;FS=2.835;HaplotypeScore=2.8233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,61:219:99:911,0,3296 chrIX 150599 . C T 5189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=24.95;SB=-2.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:208:99:5189,552,0 chrIX 150611 . G A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.186;DP=207;Dels=0.00;FS=9.267;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=1.624;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.827;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,82:207:99:1516,0,2536 chrIX 150694 . C T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.713;DP=227;Dels=0.00;FS=7.798;HaplotypeScore=2.7232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.694;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,89:227:99:1655,0,2873 chrIX 150780 . C T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.026;DP=182;Dels=0.00;FS=8.037;HaplotypeScore=7.7878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.191;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,62:182:99:1126,0,2454 chrIX 150789 . A G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.766;DP=202;Dels=0.00;FS=21.770;HaplotypeScore=8.8711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.820;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,66:201:99:1101,0,2947 chrIX 150814 . A G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.719;DP=189;Dels=0.00;FS=20.562;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.432;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,62:189:99:934,0,2791 chrIX 150939 . C T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.127;DP=214;Dels=0.00;FS=18.723;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.679;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,72:214:99:1317,0,2918 chrIX 151006 . C T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.178;DP=253;Dels=0.00;FS=9.415;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,89:253:99:1652,0,3497 chrIX 151170 . T G 727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;DP=210;Dels=0.00;FS=5.468;HaplotypeScore=3.7117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,61:210:99:757,0,3074 chrIX 151326 . C T 2387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.614;DP=176;Dels=0.00;FS=6.664;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.462;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.832;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,110:176:99:2417,0,1253 chrIX 151377 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.873;DP=238;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=4.3358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=6.62;ReadPosRankSum=-2.124;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,101:238:99:1605,0,3036 chrIX 151394 . T C 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.232;DP=221;Dels=0.00;FS=1.060;HaplotypeScore=3.9558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=2.202;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.516;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,87:221:99:1629,0,2985 chrIX 151658 . G C 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.406;DP=208;Dels=0.00;FS=3.543;HaplotypeScore=3.4369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=1;MQRankSum=0.889;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.176;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,66:208:99:1074,0,2929 chrIX 151727 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.469;DP=207;Dels=0.00;FS=0.546;HaplotypeScore=5.6146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQ0=0;MQRankSum=-6.832;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,70:207:99:1214,0,2723 chrIX 151731 . A G 4873.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.49;MQ0=0;QD=23.43;SB=-2.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:208:99:4873,537,0 chrIX 151743 . G A 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.042;DP=200;Dels=0.00;FS=1.180;HaplotypeScore=7.2639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=-7.920;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.701;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,67:200:99:977,0,2726 chrIX 151767 . G A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.956;DP=205;Dels=0.00;FS=1.861;HaplotypeScore=2.8048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.09;MQ0=0;MQRankSum=-7.541;QD=5.06;ReadPosRankSum=2.131;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,66:205:99:1067,0,2942 chrIX 151775 . T C 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.373;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQ0=0;MQRankSum=-7.547;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.906;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,67:203:99:1056,0,2952 chrIX 151788 . T G 5355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.41;MQ0=0;QD=24.79;SB=-2.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:5355,585,0 chrIX 151869 . C T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.108;DP=199;Dels=0.00;FS=6.495;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.220;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,64:199:99:1141,0,2886 chrIX 151882 . T C 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.144;DP=186;Dels=0.00;FS=6.890;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=4.47;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,61:186:99:862,0,2799 chrIX 151917 . G A 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.923;DP=190;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQ0=0;MQRankSum=-6.859;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.858;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,56:190:99:815,0,2982 chrIX 151918 . C T 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.345;DP=192;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=-5.057;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.677;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,57:192:99:812,0,2959 chrIX 151933 . T C 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.462;DP=193;Dels=0.00;FS=1.255;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=-6.702;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.041;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,57:193:99:764,0,3109 chrIX 151935 . C T 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.034;DP=200;Dels=0.00;FS=0.571;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.69;MQ0=0;MQRankSum=-7.029;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,61:200:99:793,0,2975 chrIX 152033 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.971;DP=185;Dels=0.00;FS=3.478;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.477;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,69:185:99:1295,0,2479 chrIX 152184 . T A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.922;DP=220;Dels=0.00;FS=11.117;HaplotypeScore=2.8121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.278;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,67:220:99:1132,0,3367 chrIX 152419 . A T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,63:199:99:1049,0,2977 chrIX 152949 . A C 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.759;DP=207;Dels=0.00;FS=1.296;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=4.29;ReadPosRankSum=1.263;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,59:207:99:918,0,3365 chrIX 153385 . T A 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;DP=233;Dels=0.00;FS=4.267;HaplotypeScore=2.4511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.181;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,74:233:99:1298,0,3472 chrIX 153400 . A T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;DP=248;Dels=0.00;FS=7.524;HaplotypeScore=8.7156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,75:248:99:1298,0,3679 chrIX 153463 . A G 4352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0376;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.04;SB=-2.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4352,483,0 chrIX 153608 . G A 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=169;Dels=0.00;FS=3.025;HaplotypeScore=96.1678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,50:169:99:819,0,2333 chrIX 153611 . G A 720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.287;DP=164;Dels=0.00;FS=5.155;HaplotypeScore=94.1876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=4.39;ReadPosRankSum=-1.144;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,48:164:99:750,0,2367 chrIX 153725 . A G 4345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=22.51;SB=-2.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4345,483,0 chrIX 154095 . G A 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.752;DP=114;Dels=0.00;FS=5.122;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,78:114:99:1683,0,633 chrIX 154314 . A G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.259;DP=180;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=4.2952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.571;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,61:180:99:1060,0,2691 chrIX 154387 . C T 2822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.512;DP=190;Dels=0.00;FS=3.655;HaplotypeScore=2.3696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.485;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,133:190:99:2852,0,957 chrIX 154405 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.382;DP=165;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.978;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,64:165:99:1127,0,2216 chrIX 154430 . A G 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;DP=180;Dels=0.00;FS=3.574;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.764;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,64:180:99:1037,0,2543 chrIX 154476 . G A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.790;DP=173;Dels=0.00;FS=1.266;HaplotypeScore=1.9048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.722;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,60:173:99:1129,0,2354 chrIX 154834 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.268;DP=199;Dels=0.00;FS=0.549;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.762;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,69:199:99:1232,0,2681 chrIX 154893 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.484;DP=181;Dels=0.00;FS=2.722;HaplotypeScore=2.7468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=5.81;ReadPosRankSum=-1.223;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,61:181:99:1082,0,2551 chrIX 154922 . A G 4257.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.75;SB=-2.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4257,489,0 chrIX 155033 . A T 3942.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.956e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3942,420,0 chrIX 155162 . A T 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;DP=158;Dels=0.00;FS=2.163;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.279;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,50:158:99:910,0,2462 chrIX 155480 . A C 5067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:5067,537,0 chrIX 155570 . C A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.007;DP=194;Dels=0.00;FS=4.209;HaplotypeScore=5.0897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.533;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,77:194:99:1498,0,2374 chrIX 155631 . G A 2620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.843;DP=198;Dels=0.00;FS=11.040;HaplotypeScore=2.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.272;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,122:197:99:2650,0,1305 chrIX 155654 . T C 2240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.745;DP=184;Dels=0.00;FS=3.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.000;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,115:184:99:2270,0,1349 chrIX 155702 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.437;DP=204;Dels=0.00;FS=3.531;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=7.07;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,77:204:99:1472,0,2663 chrIX 155792 . G A 5783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.29;SB=-2.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:5783,601,0 chrIX 156015 . A G 3943.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3943,438,0 chrIX 156029 . G A 4361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4361,465,0 chrIX 156304 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.043;DP=228;Dels=0.00;FS=4.758;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.126;QD=6.11;ReadPosRankSum=-2.603;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,87:228:99:1424,0,3072 chrIX 156711 . G T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.035;DP=199;Dels=0.00;FS=4.281;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=6.62;ReadPosRankSum=-1.753;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,73:199:99:1348,0,2585 chrIX 156724 . A C 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.071;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.095;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,57:180:99:989,0,2682 chrIX 156752 . T C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.750;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.628;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,60:177:99:1022,0,2502 chrIX 156976 . A G 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.225;DP=189;Dels=0.00;FS=3.551;HaplotypeScore=2.4905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=5.76;ReadPosRankSum=-2.507;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,65:189:99:1119,0,2780 chrIX 156990 . G A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.175;DP=153;Dels=0.00;FS=12.419;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=5.36;ReadPosRankSum=-2.094;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,49:153:99:850,0,2140 chrIX 157619 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.015;DP=211;Dels=0.00;FS=0.543;HaplotypeScore=3.2443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.975;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,73:211:99:1254,0,3063 chrIX 157805 . G A 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.245;DP=235;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.973;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,96:235:99:1772,0,2910 chrIX 157808 . T G 2695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.968;DP=237;Dels=0.00;FS=0.486;HaplotypeScore=7.0977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.761;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,142:237:99:2725,0,1816 chrIX 157961 . C G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;DP=209;Dels=0.00;FS=1.170;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.667;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,66:209:99:1032,0,2814 chrIX 157967 . G A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.405;DP=211;Dels=0.00;FS=1.813;HaplotypeScore=6.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,69:211:99:1223,0,2843 chrIX 158276 . T G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.073;DP=208;Dels=0.00;FS=4.126;HaplotypeScore=2.6387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=5.94;ReadPosRankSum=-1.089;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,74:208:99:1265,0,2884 chrIX 158408 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.110;DP=226;Dels=0.00;FS=3.128;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=1;MQRankSum=0.066;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,78:226:99:1400,0,3106 chrIX 158843 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.474;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.198;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,78:177:99:1494,0,2187 chrIX 159008 . C T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.788;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=7.42;ReadPosRankSum=-2.345;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,79:197:99:1492,0,2400 chrIX 159058 . C T 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.760;DP=223;Dels=0.00;FS=11.636;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,88:223:99:1714,0,2668 chrIX 159221 . G A 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.432;DP=195;Dels=0.00;FS=2.744;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.587;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,61:195:99:976,0,2840 chrIX 159305 . C G 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;DP=226;Dels=0.00;FS=4.241;HaplotypeScore=4.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.530;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,69:226:99:1080,0,3433 chrIX 159542 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;DP=210;Dels=0.00;FS=8.598;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=4.90;ReadPosRankSum=-1.295;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,65:210:99:1060,0,3222 chrIX 159842 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.854;DP=248;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,77:248:99:1174,0,3553 chrIX 160022 . C T 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.476;DP=233;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.781;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,88:233:99:1522,0,2980 chrIX 160034 . C T 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.152;DP=236;Dels=0.00;FS=2.992;HaplotypeScore=7.9142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.915;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,86:236:99:1637,0,3205 chrIX 160170 . C T 5757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.70;SB=-2.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,224:224:99:5757,600,0 chrIX 160245 . T G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.070;DP=193;Dels=0.00;FS=0.555;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,68:193:99:1176,0,2847 chrIX 160280 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.318;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.040;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,63:178:99:1169,0,2535 chrIX 160453 . G A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.402;DP=238;Dels=0.00;FS=1.178;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,68:238:99:1136,0,3705 chrIX 160457 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.779;DP=239;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.030;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,67:239:99:1111,0,3698 chrIX 160514 . T C 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.690;DP=216;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.736;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,58:216:99:836,0,3625 chrIX 161067 . G T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.150;DP=264;Dels=0.00;FS=4.831;HaplotypeScore=3.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=5.14;ReadPosRankSum=1.306;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,80:264:99:1386,0,3912 chrIX 161147 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.166;DP=235;Dels=0.00;FS=3.158;HaplotypeScore=3.8472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=4.94;ReadPosRankSum=2.309;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,74:235:99:1190,0,3396 chrIX 161738 . T C 5310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=1;QD=24.47;SB=-2.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,217:217:99:5310,540,0 chrIX 161795 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;DP=232;Dels=0.00;FS=0.523;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,72:232:99:1203,0,3528 chrIX 161894 . A G 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.144;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=-2.617;QD=4.30;ReadPosRankSum=-2.261;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,65:206:99:916,0,3121 chrIX 162177 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.338;DP=195;Dels=0.00;FS=11.246;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=1;MQRankSum=0.730;QD=6.14;ReadPosRankSum=-2.012;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,71:195:99:1228,0,2721 chrIX 162266 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.615;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.784;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,66:194:99:1162,0,2852 chrIX 163001 . C T 567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.890;DP=157;Dels=0.02;FS=7.905;HaplotypeScore=18.2657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=3.61;ReadPosRankSum=-2.675;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,53:154:99:597,0,1951 chrIX 163145 . C A 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.464;DP=165;Dels=0.00;FS=19.047;HaplotypeScore=2.8135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=6.32;ReadPosRankSum=3.278;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,56:165:99:1073,0,2362 chrIX 163161 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.244;DP=163;Dels=0.00;FS=24.500;HaplotypeScore=3.5088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.660;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,61:163:99:1165,0,2111 chrIX 163176 . A G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.777;DP=143;Dels=0.00;FS=7.277;HaplotypeScore=5.1620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.343;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.523;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,50:143:99:890,0,2070 chrIX 163185 . A G 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.583;DP=141;Dels=0.00;FS=6.116;HaplotypeScore=2.5894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,50:141:99:880,0,2037 chrIX 163200 . T A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.119;DP=146;Dels=0.00;FS=1.524;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=7.38;ReadPosRankSum=-2.603;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,57:146:99:1107,0,2018 chrIX 163353 . A G 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.785;DP=153;Dels=0.00;FS=2.993;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=5.99;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,56:153:99:946,0,2204 chrIX 163686 . G A 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.064;DP=192;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=10.9173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,58:192:99:939,0,2871 chrIX 163812 . C T 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.845;DP=178;Dels=0.00;FS=2.828;HaplotypeScore=2.8322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=1;MQRankSum=0.560;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.301;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,61:178:99:1089,0,2335 chrIX 164017 . C T 3155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.352;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.814;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,145:212:99:3185,0,1195 chrIX 164332 . C T 3272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.729;DP=221;Dels=0.00;FS=16.699;HaplotypeScore=4.4991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=14.81;ReadPosRankSum=2.213;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,148:221:99:3272,0,1231 chrIX 164475 . A G 433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.488;DP=142;Dels=0.00;FS=3.775;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.946;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,38:142:99:463,0,2285 chrIX 164504 . G T 507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.263;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=4.19;ReadPosRankSum=-2.292;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,35:121:99:537,0,1758 chrIX 164522 . G A 629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.918;DP=159;Dels=0.00;FS=2.253;HaplotypeScore=3.6236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,44:159:99:659,0,2340 chrIX 164732 . G C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.143;DP=172;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.096;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,61:172:99:1015,0,2355 chrIX 164883 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.428;DP=167;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.477;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,71:167:99:1398,0,2027 chrIX 165018 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.130;DP=195;Dels=0.00;FS=8.832;HaplotypeScore=4.5996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.579;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,70:195:99:1169,0,2730 chrIX 165039 . C G 2826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;DP=208;Dels=0.00;FS=0.537;HaplotypeScore=10.3157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.412;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,137:208:99:2856,0,1144 chrIX 165870 . C T 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.992;DP=201;Dels=0.00;FS=5.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.769;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,60:200:99:1053,0,3052 chrIX 166083 . T G 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.721;DP=214;Dels=0.00;FS=21.955;HaplotypeScore=5.7168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,62:214:99:919,0,3433 chrIX 166116 . G C 644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;DP=157;Dels=0.00;FS=16.507;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,45:157:99:674,0,2342 chrIX 166141 . T A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.835;DP=166;Dels=0.00;FS=7.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=4.68;ReadPosRankSum=2.932;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,47:166:99:807,0,2721 chrIX 166157 . T C 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.976;DP=148;Dels=0.00;FS=5.285;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,51:148:99:910,0,2224 chrIX 166175 . C T 2200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.878;DP=162;Dels=0.00;FS=5.912;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.832;QD=13.58;ReadPosRankSum=3.052;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,101:162:99:2230,0,1106 chrIX 166203 . C T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.723;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,57:177:99:1041,0,2586 chrIX 166264 . T C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.440;DP=196;Dels=0.00;FS=6.289;HaplotypeScore=4.6978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=6.39;ReadPosRankSum=-1.929;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,71:196:99:1282,0,2716 chrIX 166274 . G A 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.056;DP=173;Dels=0.00;FS=10.868;HaplotypeScore=3.7062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=6.30;ReadPosRankSum=-1.850;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,61:173:99:1120,0,2436 chrIX 166298 . C A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.379;DP=173;Dels=0.00;FS=24.893;HaplotypeScore=7.5479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.366;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,59:173:99:1085,0,2400 chrIX 166383 . A G 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.720;DP=167;Dels=0.00;FS=3.058;HaplotypeScore=3.8393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,56:167:99:975,0,2469 chrIX 166442 . G A 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.803;DP=155;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=2.8751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=2.343;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.398;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,55:155:99:970,0,2142 chrIX 166463 . A C 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.969;DP=180;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.173;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,62:180:99:951,0,2620 chrIX 166510 . T C 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.560;DP=186;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,57:186:99:904,0,2872 chrIX 166640 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.301;DP=186;Dels=0.00;FS=1.952;HaplotypeScore=295.4752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.295;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,64:186:99:1132,0,2769 chrIX 166805 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.862;DP=196;Dels=0.00;FS=0.537;HaplotypeScore=2.2329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=7.01;ReadPosRankSum=2.076;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,77:196:99:1403,0,2570 chrIX 166889 . T C 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.660;DP=188;Dels=0.00;FS=5.768;HaplotypeScore=3.5064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.808;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,57:188:99:940,0,2620 chrIX 166931 . T C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.845;DP=208;Dels=0.00;FS=0.527;HaplotypeScore=4.3627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.065;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,80:208:99:1347,0,2757 chrIX 167048 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.537;DP=215;Dels=0.00;FS=0.536;HaplotypeScore=3.8698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.499;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,69:215:99:1129,0,3104 chrIX 167454 . T C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.695;DP=186;Dels=0.00;FS=0.570;HaplotypeScore=3.3271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,63:186:99:990,0,2713 chrIX 167496 . G C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.886;DP=204;Dels=0.00;FS=1.220;HaplotypeScore=3.6057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.143;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,69:204:99:1207,0,2921 chrIX 167769 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.906;DP=179;Dels=0.00;FS=10.260;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.393;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,74:179:99:1388,0,2257 chrIX 167860 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.440;DP=205;Dels=0.00;FS=5.461;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,70:205:99:1189,0,3092 chrIX 168053 . C A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.174;DP=190;Dels=0.00;FS=3.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.661;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,56:190:99:980,0,2889 chrIX 168127 . T C 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.174;DP=171;Dels=0.00;FS=1.309;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=4.78;ReadPosRankSum=1.052;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,51:171:99:847,0,2658 chrIX 168175 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.240;DP=227;Dels=0.00;FS=0.533;HaplotypeScore=13.0972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,72:227:99:1206,0,3328 chrIX 168187 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.240;DP=184;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.952;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,59:184:99:1002,0,2681 chrIX 168217 . T C 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.756;DP=181;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=2.3391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.649;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,57:181:99:949,0,2643 chrIX 168244 . C T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.696;DP=177;Dels=0.00;FS=1.256;HaplotypeScore=3.2489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.533;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,58:177:99:1072,0,2545 chrIX 168373 . A G 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.622;DP=199;Dels=0.00;FS=6.533;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.647;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,62:199:99:981,0,3049 chrIX 168381 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.032;DP=202;Dels=0.00;FS=5.361;HaplotypeScore=4.8590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.206;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,64:202:99:1078,0,3114 chrIX 168511 . A G 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.023;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.690;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,59:166:99:989,0,2341 chrIX 168871 . C T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;DP=192;Dels=0.00;FS=2.764;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.137;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,62:192:99:1109,0,2614 chrIX 168934 . A G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.467;DP=172;Dels=0.00;FS=7.040;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,61:172:99:1125,0,2446 chrIX 169225 . C A 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.381;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.940;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,61:174:99:1051,0,2405 chrIX 169256 . A G 2192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.981;DP=171;Dels=0.00;FS=5.730;HaplotypeScore=3.3486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=12.82;ReadPosRankSum=-2.630;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,110:171:99:2222,0,1116 chrIX 169445 . C G 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;DP=132;Dels=0.00;FS=4.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.414;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.039;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,46:132:99:787,0,1793 chrIX 169544 . C T 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.604;DP=177;Dels=0.00;FS=4.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.789;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.965;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,61:177:99:1037,0,2486 chrIX 169666 . C G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;DP=214;Dels=0.00;FS=1.108;HaplotypeScore=7.1277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.771;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.146;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,76:214:99:1267,0,2839 chrIX 169671 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.339;DP=207;Dels=0.00;FS=0.532;HaplotypeScore=7.1277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.023;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,74:207:99:1212,0,2848 chrIX 169745 . G A 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.131;DP=205;Dels=0.00;FS=6.285;HaplotypeScore=6.3940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.520;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,67:204:99:1167,0,2923 chrIX 169795 . C A 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.546;DP=212;Dels=0.00;FS=1.189;HaplotypeScore=218.1814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=6.79;ReadPosRankSum=4.167;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,65:212:94:1469,0,94 chrIX 170146 . T C 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.856;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.245;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,52:172:99:863,0,2715 chrIX 170156 . C A 690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.370;DP=168;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.848;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,45:168:99:720,0,2644 chrIX 170201 . A G 499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.405;DP=133;Dels=0.00;FS=5.899;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,38:133:99:529,0,2146 chrIX 170432 . A T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.846;DP=223;Dels=0.00;FS=1.164;HaplotypeScore=5.0597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.547;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,73:223:99:1375,0,3358 chrIX 170567 . C T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;DP=188;Dels=0.00;FS=4.276;HaplotypeScore=4.5520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=7.85;ReadPosRankSum=1.872;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,76:188:99:1505,0,2374 chrIX 170576 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.224;DP=204;Dels=0.00;FS=0.530;HaplotypeScore=2.8052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=7.01;ReadPosRankSum=3.107;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,77:204:99:1461,0,2705 chrIX 170885 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.386;DP=231;Dels=0.00;FS=0.533;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,77:231:99:1352,0,3446 chrIX 170921 . A T 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.414;DP=240;Dels=0.00;FS=1.045;HaplotypeScore=4.9562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,83:240:99:1463,0,3503 chrIX 171065 . C T 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.343;DP=179;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=3.6146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,58:179:99:954,0,2485 chrIX 171154 . T C 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.458;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,60:171:99:1070,0,2421 chrIX 171278 . T C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.256;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=5.02;ReadPosRankSum=2.941;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,72:222:99:1144,0,3279 chrIX 171281 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.795;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=4.90;ReadPosRankSum=2.877;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,73:224:99:1128,0,3269 chrIX 171404 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.990;DP=217;Dels=0.00;FS=0.542;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,75:217:99:1373,0,3014 chrIX 171517 . A G 914.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.081;DP=215;Dels=0.00;FS=4.236;HaplotypeScore=3.3816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=-7.089;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,66:215:99:944,0,3370 chrIX 171518 . G C 907.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;DP=214;Dels=0.00;FS=3.400;HaplotypeScore=3.3816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.935;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,65:214:99:937,0,3310 chrIX 171525 . T C 803.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.551;DP=194;Dels=0.00;FS=4.533;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.51;MQ0=0;MQRankSum=-8.758;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,59:194:99:833,0,3035 chrIX 171535 . C T 4677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.79;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:184:99:4677,507,0 chrIX 171556 . T A 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;DP=197;Dels=0.00;FS=7.200;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQ0=0;MQRankSum=-7.627;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,57:197:99:703,0,3262 chrIX 171558 . T C 603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.412;DP=199;Dels=0.00;FS=7.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.46;MQ0=0;MQRankSum=-8.536;QD=3.03;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,58:199:99:633,0,3293 chrIX 171616 . T A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;DP=196;Dels=0.00;FS=1.921;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.331;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,74:196:99:1445,0,2654 chrIX 171632 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.883;DP=190;Dels=0.00;FS=0.551;HaplotypeScore=99.4883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,78:190:99:1518,0,2310 chrIX 171655 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.517;DP=201;Dels=0.00;FS=6.065;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.835;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.154;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,80:201:99:1356,0,2463 chrIX 171701 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.433;DP=168;Dels=0.00;FS=2.015;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.815;QD=6.13;ReadPosRankSum=-2.137;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,60:168:99:1060,0,2297 chrIX 171711 . T A 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.252;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.209;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,55:164:99:944,0,2478 chrIX 171806 . A G 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.418;DP=194;Dels=0.00;FS=8.386;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.457;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,82:194:99:1600,0,2515 chrIX 171999 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.637;DP=193;Dels=0.00;FS=1.840;HaplotypeScore=6.2790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.257;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,71:193:99:1207,0,2601 chrIX 172044 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.837;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,71:196:99:1198,0,2730 chrIX 172050 . T A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;DP=180;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.995;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,62:180:99:1136,0,2584 chrIX 172074 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.594;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.135;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,74:198:99:1435,0,2650 chrIX 172231 . G A 5116.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6616;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.966e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5116,528,0 chrIX 172693 . T C 617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.870;DP=178;Dels=0.00;FS=2.129;HaplotypeScore=6.5044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.533;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,46:178:99:647,0,2989 chrIX 172731 . A G 596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.771;DP=141;Dels=0.00;FS=6.191;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=4.23;ReadPosRankSum=-1.214;SB=-1.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,40:141:99:626,0,2320 chrIX 172920 . T C 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.131;DP=246;Dels=0.00;FS=6.495;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.136;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.018;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,63:246:99:885,0,4019 chrIX 173151 . T C 2811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.801;DP=246;Dels=0.00;FS=3.665;HaplotypeScore=7.3126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,139:246:99:2841,0,2065 chrIX 173286 . C T 2486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.246;DP=176;Dels=0.00;FS=9.373;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=1.950;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.031;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,113:176:99:2516,0,1136 chrIX 173584 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.266;DP=227;Dels=0.00;FS=0.523;HaplotypeScore=4.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,77:227:99:1263,0,3249 chrIX 173613 . T C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.223;DP=220;Dels=0.00;FS=4.492;HaplotypeScore=14.2440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.270;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,58:219:99:892,0,3445 chrIX 173732 . G A 5869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.85;SB=-3.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,227:227:99:5869,583,0 chrIX 174307 . C T 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.928;DP=214;Dels=0.00;FS=4.292;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.190;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,66:214:99:1074,0,3174 chrIX 174345 . T A 5618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.54;SB=-2.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:5618,582,0 chrIX 174391 . T A 5130.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.04;SB=-2.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:5130,520,0 chrIX 174779 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.186;DP=231;Dels=0.00;FS=1.131;HaplotypeScore=5.4359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQ0=0;MQRankSum=3.118;QD=5.03;ReadPosRankSum=-1.024;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,74:231:99:1193,0,3433 chrIX 175006 . A G 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.205;DP=213;Dels=0.00;FS=3.180;HaplotypeScore=4.2612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=6.365;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.658;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,84:213:99:1608,0,1630 chrIX 175120 . C A 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=144.9354;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.22;MQ0=0;QD=22.92;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3484,381,0 chrIX 175126 . A C 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.19;MQ0=0;QD=21.41;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3180,360,0 chrIX 175220 . A G 360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.350;DP=170;Dels=0.00;FS=3.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=2.12;ReadPosRankSum=3.427;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,49:170:99:390,0,2730 chrIX 175368 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.848;DP=173;Dels=0.00;FS=15.670;HaplotypeScore=3.6513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=3.509;QD=6.38;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,63:173:99:1134,0,2531 chrIX 175374 . G C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;DP=176;Dels=0.00;FS=20.944;HaplotypeScore=3.9090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=2.767;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.010;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,66:176:99:1159,0,2376 chrIX 175438 . C T 490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.661;DP=209;Dels=0.00;FS=4.165;HaplotypeScore=5.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=2.196;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.192;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,45:209:99:520,0,3423 chrIX 175484 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.796;DP=209;Dels=0.00;FS=1.145;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.115;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,78:209:99:1260,0,2772 chrIX 175568 . G A 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.317;DP=196;Dels=0.00;FS=2.604;HaplotypeScore=2.7487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=3.488;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.280;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,67:196:99:1195,0,2722 chrIX 175751 . A G,T 4303.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.61;MQ0=0;QD=22.89;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,66,122:188:99:4303,2850,2667,1453,0,1116 chrIX 175755 . T G 4850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.74;SB=-2.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4850,537,0 chrIX 175785 . T C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.104;DP=181;Dels=0.00;FS=2.906;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=5.03;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,57:181:99:941,0,2849 chrIX 175811 . G A 2979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.363;DP=199;Dels=0.00;FS=4.498;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,138:199:99:3009,0,981 chrIX 175864 . C T 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.397;DP=190;Dels=0.00;FS=7.745;HaplotypeScore=3.9017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.578;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.737;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,54:190:99:913,0,2729 chrIX 175887 . G A 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.062;DP=189;Dels=0.00;FS=8.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=1.691;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.187;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,57:189:99:975,0,2744 chrIX 175942 . G C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.167;DP=235;Dels=0.00;FS=5.758;HaplotypeScore=2.5677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=4.32;ReadPosRankSum=-2.696;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,78:235:99:1046,0,3363 chrIX 175960 . C T 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.177;DP=220;Dels=0.00;FS=2.710;HaplotypeScore=4.6118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.617;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,58:220:99:918,0,3515 chrIX 176017 . C A 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.678;DP=207;Dels=0.00;FS=1.818;HaplotypeScore=6.6422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.165;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,81:207:99:1566,0,2620 chrIX 176261 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.474;DP=189;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,63:189:99:1039,0,2724 chrIX 176379 . G A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.049;DP=207;Dels=0.00;FS=7.460;HaplotypeScore=4.2725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=5.45;ReadPosRankSum=-1.804;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,66:207:99:1158,0,3022 chrIX 176412 . C T 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.681;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,54:193:99:816,0,2924 chrIX 176421 . G T 4241.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.40;SB=-2.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4241,442,0 chrIX 176578 . C T 4660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=1;QD=24.79;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4660,478,0 chrIX 176678 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.504;DP=222;Dels=0.00;FS=0.558;HaplotypeScore=9.9147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.586;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,68:222:99:1182,0,3327 chrIX 177411 . A G 358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.100;DP=138;Dels=0.00;FS=9.970;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=2;MQRankSum=1.572;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.550;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,31:138:99:388,0,2310 chrIX 177448 . T C 582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.354;DP=154;Dels=0.00;FS=14.143;HaplotypeScore=11.3282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=1;MQRankSum=-0.496;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.093;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,40:154:99:612,0,2420 chrIX 177586 . G A 2715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.211;DP=196;Dels=0.00;FS=1.912;HaplotypeScore=5.6603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,126:196:99:2745,0,1186 chrIX 177598 . G A 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.779;DP=211;Dels=0.00;FS=1.944;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.553;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,62:211:99:1099,0,3220 chrIX 177853 . T C 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.037;DP=261;Dels=0.00;FS=3.563;HaplotypeScore=2.8494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.150;QD=6.34;ReadPosRankSum=1.174;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,96:261:99:1684,0,3631 chrIX 178160 . C T 6807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=269;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.30;SB=-2.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,269:269:99:6807,682,0 chrIX 178552 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.569;DP=198;Dels=0.00;FS=1.854;HaplotypeScore=5.7814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=1;MQRankSum=1.248;QD=6.07;ReadPosRankSum=-2.391;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,71:198:99:1232,0,2756 chrIX 179020 . C A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.928;DP=220;Dels=0.00;FS=10.980;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.527;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,69:220:99:1229,0,2867 chrIX 179065 . T C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.002;DP=267;Dels=0.00;FS=0.481;HaplotypeScore=4.5561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,85:267:99:1395,0,3716 chrIX 179188 . G T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.539;DP=249;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.611;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,66:249:99:988,0,3507 chrIX 179273 . A G 6552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=259;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.30;SB=-2.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,259:259:99:6552,699,0 chrIX 179275 . C T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.560;DP=259;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,82:259:99:1380,0,3620 chrIX 179398 . G A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.742;DP=230;Dels=0.00;FS=1.066;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.549;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,82:230:99:1525,0,3053 chrIX 179673 . G A 3559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.145;DP=252;Dels=0.00;FS=9.786;HaplotypeScore=7.6805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.831;SB=-1.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,172:252:99:3559,0,744 chrIX 179763 . G A 2819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.931;DP=192;Dels=0.00;FS=2.752;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.146;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,130:192:99:2849,0,1044 chrIX 179764 . A G 2856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.294;DP=199;Dels=0.00;FS=3.554;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.199;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,135:199:99:2886,0,1136 chrIX 180009 . T A 2794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.956;DP=183;Dels=0.00;FS=6.955;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,128:183:99:2824,0,902 chrIX 180087 . C T 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.690;DP=185;Dels=0.00;FS=12.833;HaplotypeScore=63.4814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=7.75;ReadPosRankSum=-3.028;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:185:99:1463,0,1114 chrIX 180128 . T C 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.951;DP=240;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=3.88;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,63:239:99:961,0,3936 chrIX 180248 . C A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.835;DP=211;Dels=0.00;FS=1.279;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.991;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,70:211:99:1253,0,3007 chrIX 180349 . A T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.946;DP=193;Dels=0.00;FS=1.174;HaplotypeScore=9.5086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.825;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,69:193:99:1192,0,2736 chrIX 180360 . G A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.746;DP=175;Dels=0.00;FS=2.775;HaplotypeScore=10.2509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=6.00;ReadPosRankSum=2.555;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,61:175:99:1080,0,2393 chrIX 180372 . A G 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.209;DP=170;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=51.1780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,57:170:99:989,0,2511 chrIX 180379 . A G 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.300;DP=170;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=53.3749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.356;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,54:170:99:920,0,2587 chrIX 180412 . G A 2291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.444;DP=163;Dels=0.00;FS=2.907;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=14.06;ReadPosRankSum=2.938;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,105:163:99:2321,0,1094 chrIX 180565 . T A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;DP=194;Dels=0.00;FS=2.764;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,64:194:99:1151,0,2940 chrIX 180792 . A T 4882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4882,519,0 chrIX 180798 . C T 5078.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:5078,538,0 chrIX 180891 . C G 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;DP=222;Dels=0.00;FS=2.527;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,65:222:99:1084,0,3316 chrIX 181236 . A G 5612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.05;SB=-2.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,223:223:99:5612,588,0 chrIX 181676 . A G 2821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.632;DP=227;Dels=0.00;FS=1.691;HaplotypeScore=4.1406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,147:227:99:2851,0,1447 chrIX 181677 . A G 5369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=23.76;SB=-2.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,226:226:99:5369,576,0 chrIX 182483 . C T 4806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4806,478,0 chrIX 182837 . G A 5171.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.47;SB=-2.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,203:203:99:5171,535,0 chrIX 182841 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.743;DP=195;Dels=0.00;FS=1.206;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=5.46;ReadPosRankSum=2.894;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,61:195:99:1094,0,2834 chrIX 182939 . C T 4678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4678,487,0 chrIX 183036 . A T 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;DP=167;Dels=0.00;FS=7.031;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.968;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,53:167:99:959,0,2572 chrIX 183064 . T G 4266.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4266,471,0 chrIX 183089 . G A 4541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.95;SB=-2.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4541,486,0 chrIX 183268 . T C 245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.699;DP=160;Dels=0.01;FS=7.687;HaplotypeScore=15.1812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,109:158:99:275,0,646 chrIX 183280 . A G 2201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=14.29;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:2234,249,0 chrIX 183332 . A G 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=21.89;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:3459,387,0 chrIX 183373 . T C 4460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.11;SB=-2.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4460,480,0 chrIX 183480 . A T 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.959;DP=160;Dels=0.00;FS=2.262;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.307;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,47:160:99:719,0,2538 chrIX 183552 . G T 5440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.66;SB=-2.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5440,547,0 chrIX 183567 . T C 4805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.29;SB=-2.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4805,501,0 chrIX 183619 . C G 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.400;DP=195;Dels=0.00;FS=7.853;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.669;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,61:195:99:984,0,2849 chrIX 183795 . A C 2321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.883;DP=167;Dels=0.00;FS=2.108;HaplotypeScore=7.8673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,112:167:99:2351,0,980 chrIX 183943 . A G 2754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;DP=204;Dels=0.00;FS=2.964;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=13.50;ReadPosRankSum=1.098;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,133:204:99:2784,0,1155 chrIX 184053 . C T 2761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.850;DP=190;Dels=0.00;FS=2.736;HaplotypeScore=5.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.833;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,127:190:99:2791,0,1004 chrIX 184317 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.753;DP=215;Dels=0.00;FS=0.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=5.52;ReadPosRankSum=-1.218;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,70:215:99:1217,0,3205 chrIX 184448 . T C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.573;DP=210;Dels=0.00;FS=2.607;HaplotypeScore=8.3074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,63:210:99:1011,0,3166 chrIX 184585 . T A 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.284;DP=235;Dels=0.00;FS=1.794;HaplotypeScore=10.5436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=4.78;ReadPosRankSum=2.209;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,68:235:99:1153,0,3693 chrIX 184665 . G A 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.794;DP=203;Dels=0.00;FS=0.563;HaplotypeScore=4.5366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,61:203:99:1046,0,2929 chrIX 184857 . T C 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.373;DP=184;Dels=0.00;FS=1.292;HaplotypeScore=2.7776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,54:184:99:925,0,2893 chrIX 184925 . C A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.871;DP=225;Dels=0.00;FS=1.751;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.259;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,74:225:99:1259,0,3273 chrIX 184947 . T A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.037;DP=210;Dels=0.00;FS=1.937;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.317;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,72:210:99:1272,0,3061 chrIX 185013 . T G 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;DP=207;Dels=0.00;FS=5.658;HaplotypeScore=8.6667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,57:207:99:874,0,3311 chrIX 185152 . T A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.182;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.523;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,70:196:99:1252,0,2783 chrIX 185367 . T C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.698;DP=187;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.416;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,63:187:99:998,0,2753 chrIX 185961 . A G 2866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.763;DP=209;Dels=0.00;FS=14.917;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=3.629;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,139:209:99:2896,0,1285 chrIX 186053 . G A 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.709;DP=204;Dels=0.00;FS=9.623;HaplotypeScore=3.4599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.745;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,83:204:99:1574,0,2564 chrIX 186072 . A G 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;DP=186;Dels=0.00;FS=1.186;HaplotypeScore=5.9202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.801;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,82:186:99:1545,0,2203 chrIX 186216 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.276;DP=169;Dels=0.00;FS=7.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.245;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,63:169:99:1095,0,2308 chrIX 186225 . T C 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.959;DP=150;Dels=0.00;FS=6.225;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.000;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,59:150:99:1068,0,2037 chrIX 186277 . A C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.486;DP=152;Dels=0.00;FS=4.989;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.265;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,59:152:99:1023,0,2089 chrIX 186691 . G A 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.885;DP=218;Dels=0.00;FS=1.924;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=3.70;ReadPosRankSum=-2.588;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,57:218:99:837,0,3440 chrIX 186967 . C T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=205;Dels=0.00;FS=8.089;HaplotypeScore=5.6762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=7.70;ReadPosRankSum=2.309;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,83:205:99:1609,0,2520 chrIX 187126 . G A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.110;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.489;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,69:198:99:1180,0,2711 chrIX 187360 . A G 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.800;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.168;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,57:172:99:949,0,2558 chrIX 187543 . G A 633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.003;DP=179;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.649;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,43:179:99:663,0,2811 chrIX 187624 . T C 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.564;DP=214;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=6.5557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=1;MQRankSum=3.066;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.348;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,85:214:99:1554,0,2699 chrIX 187644 . C G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.833;DP=225;Dels=0.00;FS=2.432;HaplotypeScore=2.8930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=3.795;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,75:225:99:1219,0,3021 chrIX 187747 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.534;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.163;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,67:206:99:1263,0,3117 chrIX 187849 . G C 616.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.541;DP=147;Dels=0.02;FS=2.681;HaplotypeScore=68.2693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=1;MQRankSum=-0.603;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.788;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,42:144:99:646,0,466 chrIX 187968 . T C 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.890;DP=203;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=67.5864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.916;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,57:203:99:876,0,3255 chrIX 187970 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.405;DP=203;Dels=0.00;FS=4.237;HaplotypeScore=68.5758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,72:203:99:1226,0,2685 chrIX 188629 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.789;DP=210;Dels=0.00;FS=4.119;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,72:210:99:1357,0,2742 chrIX 188822 . C G 3076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.824;DP=210;Dels=0.00;FS=3.745;HaplotypeScore=7.3429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.637;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,152:210:99:3106,0,862 chrIX 188845 . G A 2888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.582;DP=190;Dels=0.00;FS=6.236;HaplotypeScore=3.6954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=15.20;ReadPosRankSum=2.638;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,138:190:99:2918,0,777 chrIX 188870 . A T 2770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;DP=183;Dels=0.00;FS=6.126;HaplotypeScore=3.5088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,131:183:99:2800,0,830 chrIX 188877 . T C 2421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.852;DP=178;Dels=0.00;FS=5.964;HaplotypeScore=3.6854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.900;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,124:178:99:2451,0,898 chrIX 188919 . A T 1976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.432;DP=149;Dels=0.00;FS=3.341;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.301;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,90:149:99:2006,0,1112 chrIX 189024 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.513;DP=211;Dels=0.00;FS=1.151;HaplotypeScore=5.9160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,76:211:99:1337,0,2901 chrIX 189195 . G A 2299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.802;DP=175;Dels=0.00;FS=3.715;HaplotypeScore=45.6105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.163;QD=13.14;ReadPosRankSum=-1.908;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,108:175:99:2329,0,1128 chrIX 189202 . T C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.032;DP=179;Dels=0.00;FS=4.960;HaplotypeScore=45.6356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.118;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,59:179:99:1030,0,2628 chrIX 189228 . G C 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.494;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,45:166:99:712,0,2553 chrIX 189322 . A G 2646.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.331;DP=223;Dels=0.00;FS=0.546;HaplotypeScore=64.5042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.066;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,135:223:99:2676,0,1657 chrIX 189329 . A G 804.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.105;DP=231;Dels=0.00;FS=1.901;HaplotypeScore=70.2439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.190;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,63:231:99:834,0,3673 chrIX 189332 . C T 2681.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.695;DP=211;Dels=0.00;FS=2.570;HaplotypeScore=62.3086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.536;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.093;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,134:211:99:2711,0,1311 chrIX 189347 . T C 2519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.708;DP=223;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.057;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,138:223:99:2549,0,1621 chrIX 189367 . T C 5743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4799;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=25.19;SB=-2.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,227:228:99:5743,630,0 chrIX 189470 . C T 2771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.007;DP=179;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=3.9533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.405;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,124:179:99:2801,0,957 chrIX 189692 . A G 2350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.319;DP=189;Dels=0.00;FS=0.556;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.544;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,121:189:99:2380,0,1242 chrIX 189696 . T C 2464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.255;DP=189;Dels=0.01;FS=0.558;HaplotypeScore=6.4601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.803;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,121:188:99:2494,0,1251 chrIX 189725 . C T 2593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.234;DP=193;Dels=0.00;FS=4.419;HaplotypeScore=2.6050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.040;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,128:193:99:2623,0,1144 chrIX 189741 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.144;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=6.48;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,67:176:99:1171,0,2397 chrIX 189777 . A G 2952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.961;DP=195;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=6.7707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.291;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,139:195:99:2982,0,922 chrIX 189843 . A G 2669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.301;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=13.08;ReadPosRankSum=-3.155;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,133:204:99:2699,0,1267 chrIX 189896 . G A 2669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.004;DP=191;Dels=0.00;FS=1.179;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=13.97;ReadPosRankSum=1.394;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,126:191:99:2699,0,1177 chrIX 190035 . A C 2411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.614;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.096;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,117:180:99:2441,0,1208 chrIX 190120 . G A 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.728;DP=164;Dels=0.00;FS=7.483;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.534;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,50:164:99:898,0,2479 chrIX 190142 . G A 2810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.964;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.1388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.501;QD=15.11;ReadPosRankSum=-2.043;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,133:186:99:2840,0,858 chrIX 190151 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.388;DP=193;Dels=0.00;FS=6.978;HaplotypeScore=50.5086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.850;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,58:193:99:888,0,3014 chrIX 190174 . T C 2589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.698;DP=183;Dels=0.00;FS=9.581;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.831;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,128:183:99:2619,0,981 chrIX 190259 . G A 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.954;DP=173;Dels=0.00;FS=1.974;HaplotypeScore=2.5486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=6.40;ReadPosRankSum=-2.569;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,60:173:99:1137,0,2284 chrIX 190296 . G A 2743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.896;DP=200;Dels=0.00;FS=4.395;HaplotypeScore=5.5750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.116;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,133:200:99:2773,0,1147 chrIX 190373 . C T 3823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.647;DP=250;Dels=0.00;FS=0.514;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.198;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,172:250:99:3823,0,1246 chrIX 190526 . C T 2876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.190;DP=197;Dels=0.00;FS=1.177;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.048;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,130:197:99:2906,0,1186 chrIX 190574 . A T 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.016;DP=202;Dels=0.00;FS=1.821;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,70:202:99:1282,0,2903 chrIX 190788 . C A 6015.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.04;SB=-2.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,231:231:99:6015,628,0 chrIX 190795 . C G 2794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.252;DP=223;Dels=0.00;FS=1.708;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.351;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,142:223:99:2824,0,1471 chrIX 190867 . G T 4903.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4903,513,0 chrIX 190898 . G A 3098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.143;DP=210;Dels=0.00;FS=0.571;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=14.75;ReadPosRankSum=-1.944;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,143:210:99:3128,0,1174 chrIX 191063 . C T 3368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.443;DP=258;Dels=0.00;FS=0.488;HaplotypeScore=6.6314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.897;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,169:257:99:3368,0,1586 chrIX 191204 . A G 5908.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=243;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.31;SB=-2.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,243:243:99:5908,615,0 chrIX 191319 . C G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.816;DP=218;Dels=0.00;FS=1.133;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,69:218:99:1061,0,3134 chrIX 191432 . A G 4627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5974;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.35;SB=-2.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,188:190:99:4627,489,0 chrIX 191501 . G A 4591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4591,483,0 chrIX 191573 . T C 4386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4386,465,0 chrIX 191635 . C T 2367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.724;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.548;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,109:166:99:2397,0,925 chrIX 192113 . G A 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4083,429,0 chrIX 192137 . C T 4998.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4998,517,0 chrIX 192374 . G A 4100.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4100,441,0 chrIX 192411 . T C 2291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.410;DP=179;Dels=0.00;FS=6.277;HaplotypeScore=4.8729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=-1.779;QD=12.80;ReadPosRankSum=-2.962;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,111:179:99:2321,0,1290 chrIX 192413 . A G 4773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=1;QD=24.86;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4773,522,0 chrIX 192482 . T C 2984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.982;DP=205;Dels=0.00;FS=6.553;HaplotypeScore=2.3459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=1;MQRankSum=-1.694;QD=14.56;ReadPosRankSum=2.513;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,143:205:99:3014,0,1056 chrIX 192491 . C A 3105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.318;DP=203;Dels=0.00;FS=8.947;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=1;MQRankSum=-0.140;QD=15.30;ReadPosRankSum=2.457;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,140:203:99:3135,0,1055 chrIX 192530 . T C 2509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.305;DP=196;Dels=0.00;FS=8.782;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.007;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,128:196:99:2539,0,1247 chrIX 192621 . T C 2187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.109;DP=188;Dels=0.00;FS=2.083;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.663;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,124:188:99:2217,0,1233 chrIX 192670 . T C 5533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.62;SB=-2.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:5533,579,0 chrIX 192753 . C T 5052.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.26;SB=-2.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:5052,511,0 chrIX 193203 . T C 4777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;DP=198;Dels=0.01;FS=4.024;HaplotypeScore=20.4211;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=24.13;ReadPosRankSum=1.468;SB=-2.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,196:197:99:4777,534,0 chrIX 193214 . C T 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.866;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.593;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,63:197:99:1085,0,2857 chrIX 193298 . T C 4325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.21;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4325,468,0 chrIX 193442 . G C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;DP=218;Dels=0.00;FS=0.546;HaplotypeScore=6.8439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.317;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,67:218:99:1080,0,3202 chrIX 193744 . A G 5212.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.58;SB=-2.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5212,549,0 chrIX 193784 . C T 668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.373;DP=203;Dels=0.00;FS=4.788;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.216;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,51:203:99:698,0,3214 chrIX 193815 . A G 5121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.39;SB=-2.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,210:210:99:5121,537,0 chrIX 193939 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.799;DP=180;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,70:180:99:1387,0,2261 chrIX 193952 . A T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.285;DP=191;Dels=0.00;FS=1.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,74:191:99:1374,0,2612 chrIX 194026 . A G 4428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8379;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.02;SB=-2.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:177:99:4428,477,0 chrIX 194170 . C T 4732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4732,495,0 chrIX 194267 . C T 5547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.12;SB=-2.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:5547,565,0 chrIX 194587 . C T 5538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.40;SB=-2.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,218:218:99:5538,588,0 chrIX 194686 . T C 4015.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=23.48;SB=-2.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4015,438,0 chrIX 195072 . G A 4716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5093;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.06;SB=-2.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4716,487,0 chrIX 195082 . T C 5060.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.68;SB=-2.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:5060,528,0 chrIX 195274 . C G 5153.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=1;QD=24.66;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5153,561,0 chrIX 195521 . T A 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.21;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3359,354,0 chrIX 195532 . C T 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.55;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3168,330,0 chrIX 195634 . A G 4743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.965e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4743,513,0 chrIX 195661 . T C 4522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4522,492,0 chrIX 195787 . G T 4537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4537,468,0 chrIX 195861 . A G 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3528,375,0 chrIX 195899 . T C 619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.840;DP=172;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,48:172:99:649,0,2684 chrIX 195922 . C T 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.779;DP=179;Dels=0.00;FS=2.113;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.072;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,50:179:99:830,0,2780 chrIX 195961 . C T 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3810,396,0 chrIX 196033 . T C 4451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4451,480,0 chrIX 196067 . T A 5178.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=26.42;SB=-2.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:5178,544,0 chrIX 196201 . C T 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.75;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3450,369,0 chrIX 196221 . T C 646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.944;DP=168;Dels=0.00;FS=3.072;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQ0=0;MQRankSum=-3.898;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.816;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,50:168:99:676,0,2559 chrIX 196228 . T G 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.17;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3884,414,0 chrIX 196240 . T C 600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.247;DP=169;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=12.3868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.31;MQ0=0;MQRankSum=-5.363;QD=3.55;ReadPosRankSum=-1.764;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,49:169:99:630,0,2636 chrIX 196248 . C G 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=25.2908;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=22.05;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3484,375,0 chrIX 196321 . C G 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=155.7136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3841,426,0 chrIX 196366 . G A 4591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=25.51;SB=-2.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4591,480,0 chrIX 196407 . T C 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=119.5536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.11;MQ0=0;QD=22.81;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3067,339,0 chrIX 196459 . C G 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.45;MQ0=0;QD=25.52;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3368,366,0 chrIX 197092 . G A 2522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.43;MQ0=0;QD=19.86;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2555,276,0 chrIX 197177 . C T 4558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.396;DP=187;Dels=0.00;FS=5.573;HaplotypeScore=2.5633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.36;MQ0=0;MQRankSum=2.787;QD=24.37;ReadPosRankSum=1.786;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,179:187:99:4558,345,0 chrIX 197241 . T A 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:151:99:3757,396,0 chrIX 197287 . A C 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.840;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,55:174:99:929,0,2652 chrIX 197377 . C T 4672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.213;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.491;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,186:187:99:4672,451,0 chrIX 197410 . A C 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,45:160:99:702,0,2417 chrIX 197446 . G A 4343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.378;DP=176;Dels=0.00;FS=4.602;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.181;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,175:176:99:4343,433,0 chrIX 197448 . A G 4317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=181;Dels=0.00;FS=4.653;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=23.85;ReadPosRankSum=1.254;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,180:181:99:4317,440,0 chrIX 197490 . G A 4605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4605,472,0 chrIX 197558 . A G 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.88;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3431,372,0 chrIX 197560 . C T 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.95;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3459,366,0 chrIX 197573 . T A 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.71;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.892e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3499,375,0 chrIX 197671 . T C 585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.993;DP=163;Dels=0.00;FS=3.262;HaplotypeScore=173.1501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,42:163:99:615,0,2687 chrIX 197782 . G T 4282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.04;SB=-2.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:171:99:4282,468,0 chrIX 197823 . C T 4934.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=24.92;SB=-2.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:4934,502,0 chrIX 197949 . G A 4505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4505,471,0 chrIX 198073 . A G 4388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;DP=179;Dels=0.00;FS=6.599;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=2.422;QD=24.51;ReadPosRankSum=1.599;SB=-1.963e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,177:179:99:4388,468,0 chrIX 198256 . T A 2905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.389;DP=179;Dels=0.00;FS=9.350;HaplotypeScore=2.5677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=2.005;QD=16.23;ReadPosRankSum=-1.603;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,135:179:99:2935,0,700 chrIX 198411 . C G 2540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.645;DP=190;Dels=0.00;FS=1.920;HaplotypeScore=3.6640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=13.37;ReadPosRankSum=2.738;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,127:190:99:2570,0,1058 chrIX 198924 . A G 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3872,411,0 chrIX 199233 . C T 4384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.06;SB=-2.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4384,451,0 chrIX 199368 . C T 2224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.595;DP=154;Dels=0.00;FS=2.190;HaplotypeScore=2.8026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,105:154:99:2254,0,795 chrIX 199422 . T C 226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.203;DP=123;Dels=0.00;FS=1.947;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=1.84;ReadPosRankSum=1.158;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,24:123:99:256,0,2205 chrIX 199445 . T C 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3526,369,0 chrIX 199577 . G T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.909;DP=185;Dels=0.00;FS=6.764;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=6.93;ReadPosRankSum=1.343;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,72:185:99:1312,0,2329 chrIX 199623 . T A 4658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.17;SB=-2.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4658,481,0 chrIX 199628 . C T 4875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.93;SB=-2.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4875,513,0 chrIX 200213 . C T 4343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.81;SB=-2.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4343,460,0 chrIX 200298 . G A 4429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.45;SB=-2.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4429,454,0 chrIX 200326 . C T 5229.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5229,538,0 chrIX 200335 . C T 5053.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:5053,526,0 chrIX 200457 . T C 4534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62;SB=-2.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4534,486,0 chrIX 201008 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.361;DP=187;Dels=0.00;FS=1.325;HaplotypeScore=2.5450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,63:187:99:1068,0,2637 chrIX 201027 . T C 2125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.198;DP=162;Dels=0.00;FS=2.072;HaplotypeScore=3.3353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,104:162:99:2155,0,1116 chrIX 201057 . T C 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4041,459,0 chrIX 201167 . C G 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;DP=119;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,77:119:99:1629,0,723 chrIX 201431 . A G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.467;DP=203;Dels=0.00;FS=1.158;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.119;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,69:203:99:1240,0,3003 chrIX 201525 . T C 5232.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=24.80;SB=-2.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5232,570,0 chrIX 201537 . A G 3063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.083;DP=218;Dels=0.00;FS=7.157;HaplotypeScore=3.5683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.475;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,148:218:99:3093,0,1289 chrIX 201555 . A G 2947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.646;DP=223;Dels=0.00;FS=1.789;HaplotypeScore=3.3382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,152:223:99:2977,0,1344 chrIX 201561 . A G 3492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.419;DP=245;Dels=0.00;FS=2.399;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=14.25;ReadPosRankSum=-1.655;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,172:245:99:3492,0,1323 chrIX 201607 . G C 2719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;DP=191;Dels=0.00;FS=16.740;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=14.24;ReadPosRankSum=2.315;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,128:191:99:2749,0,1106 chrIX 201645 . A G 2818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.428;DP=213;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=13.23;ReadPosRankSum=-2.186;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,133:212:99:2848,0,1488 chrIX 201647 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.513;DP=216;Dels=0.00;FS=3.990;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=6.55;ReadPosRankSum=2.170;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,80:216:99:1444,0,2985 chrIX 201729 . C T 3137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.744;DP=205;Dels=0.00;FS=4.408;HaplotypeScore=4.7959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,140:205:99:3167,0,1083 chrIX 201814 . T C 2713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.200;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.019;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,131:189:99:2743,0,1039 chrIX 201914 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.692;DP=186;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=5.0113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.158;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,67:186:99:1200,0,2303 chrIX 201950 . C A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.542;DP=194;Dels=0.00;FS=2.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.854;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,62:194:99:1107,0,2697 chrIX 202086 . G A 4972.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-2.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4972,531,0 chrIX 202271 . A G 5590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.24;SB=-2.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,213:213:99:5590,609,0 chrIX 202393 . G A 5208.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:5208,546,0 chrIX 202633 . A T 4847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.78;SB=-2.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4847,510,0 chrIX 202695 . T G 4163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=170;Dels=0.00;FS=3.166;HaplotypeScore=5.8547;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=24.49;ReadPosRankSum=1.630;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:4163,453,0 chrIX 202707 . C T 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.363;DP=167;Dels=0.00;FS=2.129;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,50:167:99:796,0,2569 chrIX 202817 . C T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.349;DP=251;Dels=0.00;FS=8.833;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.050;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,79:251:99:1347,0,3694 chrIX 202909 . C G 6385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=251;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.44;SB=-2.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,251:251:99:6385,678,0 chrIX 202963 . A G 2548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.699;DP=189;Dels=0.00;FS=20.883;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=13.48;ReadPosRankSum=2.035;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,128:189:99:2578,0,1136 chrIX 203308 . T G 2782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.401;DP=212;Dels=0.00;FS=1.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,140:212:99:2812,0,1327 chrIX 203415 . A G 2039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.133;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=112.8795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,94:136:99:2069,0,743 chrIX 203744 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.542;DP=181;Dels=0.00;FS=3.741;HaplotypeScore=4.4184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.241;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,65:181:99:1231,0,2445 chrIX 203850 . C T 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.082;DP=223;Dels=0.00;FS=3.121;HaplotypeScore=2.7920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=1;MQRankSum=1.813;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.861;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,82:223:99:1509,0,2821 chrIX 204156 . A T 4763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.4425;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.999e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:182:99:4763,501,0 chrIX 204369 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.615;DP=217;Dels=0.00;FS=19.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=6.92;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,80:217:99:1532,0,2692 chrIX 204609 . A T 5082.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5082,525,0 chrIX 204746 . C T 2288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.416;DP=183;Dels=0.00;FS=20.710;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.954;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,116:183:99:2318,0,1217 chrIX 204891 . A G 2732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.962;DP=180;Dels=0.00;FS=5.398;HaplotypeScore=4.2372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,129:180:99:2762,0,798 chrIX 204908 . T C 4143.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4143,441,0 chrIX 204976 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.169;DP=159;Dels=0.00;FS=16.595;HaplotypeScore=2.7094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.088;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,65:159:99:1253,0,2018 chrIX 204990 . C T 2620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.323;DP=136;Dels=0.00;FS=10.314;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.03;MQ0=0;MQRankSum=3.303;QD=19.26;ReadPosRankSum=1.105;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,119:136:75:2650,0,75 chrIX 205055 . T G 2659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.485;DP=156;Dels=0.00;FS=46.880;HaplotypeScore=3.6456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.70;MQ0=0;MQRankSum=7.021;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.730;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,131:156:99:2689,0,125 chrIX 205061 . G A 230.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.483;DP=152;Dels=0.00;FS=50.391;HaplotypeScore=7.3589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.57;MQ0=0;MQRankSum=-7.678;QD=1.51;ReadPosRankSum=-2.289;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,28:152:99:260,0,2525 chrIX 205156 . A C 1951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.46;MQ0=0;QD=24.39;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1984,219,0 chrIX 205159 . A G 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.340;DP=86;Dels=0.00;FS=13.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.25;MQ0=0;MQRankSum=1.869;QD=18.01;ReadPosRankSum=-2.170;SB=-4.074e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,73:86:99:1579,0,117 chrIX 205192 . G A 1623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.36;MQ0=0;QD=23.52;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1656,180,0 chrIX 205198 . C T 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.293;DP=67;Dels=0.00;FS=18.293;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=0.21;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,9:67:44:44,0,1021 chrIX 205209 . A T 666 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.487;DP=38;Dels=0.00;FS=23.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.14;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.433;SB=-1.087e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:33:699,33,0 chrIX 205211 . C T 663 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.274;DP=38;Dels=0.00;FS=23.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-8.252e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:37:696,37,0 chrIX 205213 . T A 646 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.920;DP=38;Dels=0.00;FS=23.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.14;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-1.087e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:33:679,33,0 chrIX 205217 . A C 673 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.474;DP=39;Dels=0.00;FS=23.464;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.30;MQ0=0;MQRankSum=2.365;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-6.536e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:39:57:706,57,0 chrIX 205658 . A C 351 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.41;MQ0=12;QD=9.75;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:45:384,45,0 chrIX 206018 . G A 580 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.36;MQ0=15;QD=12.08;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:66:613,66,0 chrIX 206286 . T C 466 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.95;MQ0=11;QD=13.31;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:51:499,51,0 chrIX 206333 . C T 70.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.63;MQ0=11;QD=4.41;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:12:103,12,0 chrIX 206430 . C T 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.14;MQ0=16;QD=2.63;SB=-2.721e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:82,9,0 chrIX 207537 . T C 74.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=5;QD=7.45;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:107,12,0 chrIX 207669 . C T 614 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.75;MQ0=6;QD=20.47;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:69:647,69,0 chrIX 207672 . C T 577 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.71;MQ0=6;QD=19.90;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:66:610,66,0 chrIX 207786 . C T 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.00;MQ0=6;QD=2.23;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:49,6,0 chrIX 210410 . C T 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.95;MQ0=15;QD=1.34;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,2:17:6:54,6,0 chrIX 210419 . A G 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.59;MQ0=13;QD=1.52;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,2:15:6:54,6,0 chrIX 210650 . A C 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.915;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.73;MQ0=3;MQRankSum=0.173;QD=0.39;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:61:54:54,0,61 chrIX 210751 . C G 441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.586;DP=146;Dels=0.00;FS=15.085;HaplotypeScore=42.4533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=4.345;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.984;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,34:146:99:471,0,2443 chrIX 210848 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.926;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.314;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,57:169:99:1022,0,2504 chrIX 210861 . A T 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.998;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,54:159:99:947,0,2389 chrIX 210942 . T C 583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.610;DP=167;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=3.49;ReadPosRankSum=-2.509;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,43:167:99:613,0,2726 chrIX 210959 . T A 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;DP=176;Dels=0.00;FS=6.347;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=2.106;QD=3.86;ReadPosRankSum=-2.170;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,45:176:99:710,0,2861 chrIX 211064 . A G 2923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.419;DP=217;Dels=0.00;FS=5.937;HaplotypeScore=9.6742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=13.47;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,141:217:99:2953,0,1412 chrIX 211150 . T C 2133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.829;DP=172;Dels=0.00;FS=5.909;HaplotypeScore=3.5565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.517;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,108:172:99:2163,0,1125 chrIX 211179 . T C 2299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.260;DP=166;Dels=0.00;FS=24.510;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=13.85;ReadPosRankSum=-1.393;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,106:166:99:2329,0,1101 chrIX 211211 . T C 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.936;DP=138;Dels=0.00;FS=12.573;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.309;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,83:138:99:1707,0,1115 chrIX 211502 . G A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.481;DP=187;Dels=0.00;FS=1.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=0.055;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,62:187:99:1083,0,2627 chrIX 211519 . C T 2604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.181;DP=200;Dels=0.00;FS=2.534;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=0.157;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.478;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,125:200:99:2634,0,1355 chrIX 211652 . A G 2753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.549;DP=207;Dels=0.00;FS=1.155;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.566;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,136:207:99:2783,0,1292 chrIX 211982 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.398;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.087;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,62:198:99:1032,0,2977 chrIX 212110 . A G 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.882;DP=171;Dels=0.00;FS=4.996;HaplotypeScore=2.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.616;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,51:171:99:782,0,2685 chrIX 212171 . A G 4429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4429,498,0 chrIX 212200 . A G 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.741;DP=179;Dels=0.00;FS=2.049;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,53:179:99:808,0,2904 chrIX 212310 . G A 4906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6591;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4906,523,0 chrIX 212456 . A G 451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.714;DP=116;Dels=0.00;FS=2.844;HaplotypeScore=2.7933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=0.409;QD=3.89;ReadPosRankSum=1.014;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,32:116:99:481,0,1977 chrIX 212523 . A G 4273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.14;SB=-2.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4273,483,0 chrIX 212552 . G C 4347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.28;SB=-2.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4347,495,0 chrIX 212838 . G A 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.191;DP=199;Dels=0.00;FS=5.426;HaplotypeScore=7.5193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.047;QD=5.05;ReadPosRankSum=1.348;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,63:199:99:1034,0,2896 chrIX 213122 . G A 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.516;DP=128;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.552;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,82:128:99:1748,0,813 chrIX 213251 . A G 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.086;DP=186;Dels=0.00;FS=2.792;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=5.25;ReadPosRankSum=3.825;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,65:186:99:1007,0,2573 chrIX 213299 . A T 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.620;DP=195;Dels=0.00;FS=2.005;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.531;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,52:195:99:849,0,3212 chrIX 213605 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.892;DP=197;Dels=0.00;FS=6.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.772;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.095;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,70:197:99:1208,0,2516 chrIX 213938 . G A 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.092;DP=179;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=4.9258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.228;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,57:179:99:1029,0,2717 chrIX 213953 . T C 4558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4558,483,0 chrIX 214397 . G A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.131;DP=204;Dels=0.00;FS=6.813;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.783;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,70:204:99:1254,0,2721 chrIX 214484 . C T 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.802;DP=222;Dels=0.00;FS=3.913;HaplotypeScore=6.0160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.070;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,66:222:99:1068,0,3225 chrIX 214643 . A G 2297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.269;DP=167;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=4.9504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,114:167:99:2327,0,941 chrIX 214671 . G A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.689;DP=193;Dels=0.00;FS=1.194;HaplotypeScore=2.9318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.173;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,67:193:99:1272,0,2736 chrIX 214800 . C T 219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.551;DP=172;Dels=0.02;FS=2.154;HaplotypeScore=123.7566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=1.27;ReadPosRankSum=-3.542;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,55:168:99:249,0,1984 chrIX 214803 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.745;DP=175;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=124.7499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=7.44;ReadPosRankSum=-2.998;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,118:170:99:1332,0,963 chrIX 214842 . T G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.975;DP=161;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=3.6713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,105:161:99:1394,0,1027 chrIX 214856 . T A 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.532;DP=201;Dels=0.00;FS=4.832;HaplotypeScore=8.8119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=3.74;ReadPosRankSum=-2.113;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,69:201:99:782,0,2642 chrIX 214890 . A T 4864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4864,508,0 chrIX 214988 . C T 2227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.034;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,101:157:99:2257,0,953 chrIX 215033 . C T 3024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.050;DP=201;Dels=0.00;FS=4.066;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,139:201:99:3054,0,1024 chrIX 215186 . A G 2432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.519;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,116:169:99:2462,0,916 chrIX 215257 . G A 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.521;DP=164;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.509;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,50:164:99:815,0,2443 chrIX 215372 . G A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.014;DP=252;Dels=0.00;FS=3.647;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.999;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,95:252:99:1497,0,2646 chrIX 215380 . A G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.611;DP=253;Dels=0.00;FS=4.413;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.873;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,101:253:99:1565,0,2677 chrIX 215732 . T C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.977;DP=171;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,66:171:99:1116,0,2301 chrIX 215993 . C T 6055.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.55;SB=-3.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,236:237:99:6055,627,0 chrIX 215997 . A G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.817;DP=227;Dels=0.00;FS=1.808;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=4.66;ReadPosRankSum=-1.152;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,65:227:99:1087,0,3701 chrIX 216106 . A G 2390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.503;DP=158;Dels=0.00;FS=4.374;HaplotypeScore=3.1987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.187;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,111:158:99:2420,0,814 chrIX 216122 . T C 2773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.565;DP=204;Dels=0.00;FS=2.577;HaplotypeScore=5.3333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.269;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,138:204:99:2803,0,1163 chrIX 216129 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.772;DP=207;Dels=0.00;FS=3.359;HaplotypeScore=2.7130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=5.70;ReadPosRankSum=-1.682;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,70:207:99:1210,0,3021 chrIX 216326 . A G 4772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.85;SB=-2.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4772,480,0 chrIX 216335 . C T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.467;DP=197;Dels=0.00;FS=5.146;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.804;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,81:197:99:1568,0,2455 chrIX 216395 . A G 2655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.256;DP=214;Dels=0.00;FS=3.582;HaplotypeScore=2.7105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=12.41;ReadPosRankSum=2.231;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,136:214:99:2685,0,1464 chrIX 216408 . A T 2425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;DP=178;Dels=0.00;FS=1.959;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=13.62;ReadPosRankSum=2.693;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,114:178:99:2455,0,1181 chrIX 216471 . G C 2133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.390;DP=158;Dels=0.00;FS=3.473;HaplotypeScore=4.5714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,98:158:99:2163,0,1079 chrIX 216864 . A G 2757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.568;DP=194;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=14.21;ReadPosRankSum=-2.096;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,134:194:99:2787,0,1007 chrIX 217264 . T C 3061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.856;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.235;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.696;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,144:203:99:3091,0,1024 chrIX 217335 . C T 3398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.203;DP=244;Dels=0.00;FS=5.577;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.145;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,162:244:99:3398,0,1421 chrIX 217389 . A G 6440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=255;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.25;SB=-2.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,255:255:99:6440,690,0 chrIX 217459 . T C 2925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.497;DP=186;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,134:186:99:2955,0,881 chrIX 217612 . T A 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.158;DP=214;Dels=0.00;FS=3.503;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.485;QD=5.69;ReadPosRankSum=2.354;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,67:214:99:1247,0,3322 chrIX 217641 . A G 2782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.945;DP=211;Dels=0.00;FS=4.072;HaplotypeScore=4.8326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.772;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,135:211:99:2812,0,1490 chrIX 217682 . A G 2435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.204;DP=181;Dels=0.00;FS=1.969;HaplotypeScore=4.7294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=13.45;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,119:181:99:2465,0,1195 chrIX 217875 . G A 2838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.860;DP=218;Dels=0.00;FS=5.915;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.923;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,142:218:99:2868,0,1369 chrIX 218196 . T C 2610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.515;DP=175;Dels=0.00;FS=2.107;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=14.91;ReadPosRankSum=-1.839;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,126:175:99:2640,0,779 chrIX 218229 . A G 2114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.789;DP=161;Dels=0.00;FS=5.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=13.13;ReadPosRankSum=2.408;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,105:161:99:2144,0,1022 chrIX 218274 . T C 2259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.571;DP=169;Dels=0.00;FS=8.003;HaplotypeScore=5.6721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=13.37;ReadPosRankSum=-2.485;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,114:169:99:2289,0,983 chrIX 218344 . C T 3012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.759;DP=199;Dels=0.00;FS=3.545;HaplotypeScore=3.8280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,137:199:99:3042,0,1014 chrIX 218409 . G A 3110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.900;DP=221;Dels=0.00;FS=2.457;HaplotypeScore=3.0889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=14.07;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,147:221:99:3140,0,1156 chrIX 218556 . A G 3016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.622;DP=201;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=15.01;ReadPosRankSum=-1.496;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,145:201:99:3046,0,952 chrIX 218754 . T C 2560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.349;DP=172;Dels=0.00;FS=6.838;HaplotypeScore=3.2601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,121:172:99:2590,0,876 chrIX 218780 . A G 2913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.601;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=15.02;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,137:194:99:2943,0,979 chrIX 218801 . A G 3323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.564;DP=224;Dels=0.00;FS=2.640;HaplotypeScore=2.6711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.442;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,157:224:99:3323,0,1124 chrIX 219135 . T G 2649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.255;DP=207;Dels=0.00;FS=6.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,129:207:99:2679,0,1467 chrIX 219186 . G A 2316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.823;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.425;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,110:186:99:2346,0,1339 chrIX 219192 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.403;DP=187;Dels=0.00;FS=1.191;HaplotypeScore=2.6162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.098;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,74:187:99:1225,0,2418 chrIX 219459 . G T 2896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.458;DP=230;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,139:230:99:2926,0,1622 chrIX 219851 . G A 2470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.943;DP=182;Dels=0.00;FS=6.517;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.109;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,114:182:99:2500,0,1299 chrIX 220677 . A T 2257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.813;DP=148;Dels=0.00;FS=4.549;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=3.642;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,108:148:99:2287,0,687 chrIX 220939 . G C 2207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;DP=167;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,105:167:99:2237,0,1143 chrIX 220962 . G A 2155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.605;DP=162;Dels=0.00;FS=1.290;HaplotypeScore=2.7233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.936;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,100:162:99:2185,0,1152 chrIX 221031 . G A 2253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.531;DP=178;Dels=0.00;FS=3.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,108:178:99:2283,0,1352 chrIX 221064 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.569;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,68:175:99:1287,0,2424 chrIX 221256 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.056;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.884;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,70:206:99:1208,0,2963 chrIX 222278 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.702;DP=183;Dels=0.00;FS=2.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.688;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,73:183:99:1302,0,2464 chrIX 222311 . A T 5804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.35;SB=-3.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,228:229:99:5804,592,0 chrIX 222583 . A G 2733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.486;DP=187;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=13.2806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=14.62;ReadPosRankSum=-2.007;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,134:187:99:2763,0,878 chrIX 223114 . A G 2885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.688;DP=210;Dels=0.00;FS=1.156;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.803;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,138:210:99:2915,0,1322 chrIX 223281 . G T 2344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.010;DP=176;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=4.7055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.544;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,113:176:99:2374,0,1101 chrIX 223286 . C T 2276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.017;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,108:166:99:2306,0,878 chrIX 223322 . A G 2221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.148;DP=163;Dels=0.00;FS=2.246;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.772;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,107:163:99:2251,0,951 chrIX 223465 . C G 3069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;DP=189;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=11.8651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,140:189:99:3099,0,722 chrIX 223474 . A G 2588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.590;DP=173;Dels=0.00;FS=3.079;HaplotypeScore=10.9012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=14.96;ReadPosRankSum=1.605;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,125:173:99:2618,0,749 chrIX 223504 . G A 2628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.063;DP=174;Dels=0.00;FS=4.104;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.063;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,128:174:99:2658,0,772 chrIX 223691 . C T 1764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.742;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.765;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:147:99:1794,0,1181 chrIX 224410 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.801;DP=205;Dels=0.00;FS=4.620;HaplotypeScore=3.6431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.542;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,75:205:99:1397,0,2563 chrIX 224455 . T C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.977;DP=177;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=6.24;ReadPosRankSum=-1.867;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,63:177:99:1134,0,2543 chrIX 224632 . T C 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.942;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,54:157:99:902,0,2253 chrIX 224666 . C T 2570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.739;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=14.94;ReadPosRankSum=1.326;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,129:172:99:2600,0,703 chrIX 224705 . A G 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.575;DP=174;Dels=0.00;FS=2.192;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,56:174:99:895,0,2681 chrIX 224745 . T C 2681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.847;DP=164;Dels=0.00;FS=5.577;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=16.35;ReadPosRankSum=-1.177;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,123:164:99:2711,0,651 chrIX 224827 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.906;DP=208;Dels=0.00;FS=0.525;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,79:208:99:1260,0,2764 chrIX 224875 . T C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.964;DP=175;Dels=0.00;FS=5.857;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.689;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,62:175:99:1040,0,2418 chrIX 224905 . T C 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.708;DP=170;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.367;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,54:170:99:825,0,2579 chrIX 224914 . A G 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.613;DP=160;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=5.20;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,53:160:99:862,0,2328 chrIX 224926 . C T 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.154;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=5.16;ReadPosRankSum=-2.192;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,47:150:99:804,0,2178 chrIX 224976 . G A 4770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.523;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=26.21;ReadPosRankSum=1.332;SB=-2.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,181:182:99:4770,496,0 chrIX 225363 . T G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.555;DP=136;Dels=0.00;FS=3.525;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.695;QD=7.32;ReadPosRankSum=-1.364;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,55:136:99:1026,0,1765 chrIX 225676 . A T 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;DP=174;Dels=0.00;FS=4.753;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.104;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,58:174:99:1019,0,2576 chrIX 225885 . C T 4644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4644,486,0 chrIX 226043 . C T 709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.021;DP=153;Dels=0.00;FS=7.981;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.151;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,44:153:99:739,0,2422 chrIX 226086 . G T 718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.189;DP=158;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=7.8578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.552;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,47:158:99:748,0,2463 chrIX 226144 . A G 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.785;DP=180;Dels=0.00;FS=2.038;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,59:180:99:1000,0,2682 chrIX 226226 . A G 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.345;DP=184;Dels=0.00;FS=2.950;HaplotypeScore=2.7648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=4.94;ReadPosRankSum=2.968;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,65:184:99:939,0,2617 chrIX 226283 . G T 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;DP=184;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=5.17;ReadPosRankSum=-2.341;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,57:184:99:982,0,2703 chrIX 226398 . T G 544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.920;DP=150;Dels=0.00;FS=3.607;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.671;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.829;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,49:150:99:574,0,1952 chrIX 226476 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.373;DP=186;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.386;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,60:186:99:972,0,2638 chrIX 226523 . C T 605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.328;DP=160;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,42:160:99:635,0,2627 chrIX 226583 . C T 4454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4454,454,0 chrIX 226591 . A G 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.854;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,49:173:99:737,0,2838 chrIX 226674 . C T 496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.982;DP=152;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=0.045;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.309;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,37:152:99:526,0,2450 chrIX 226854 . G A 2455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.086;DP=177;Dels=0.00;FS=12.706;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.477;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,117:177:99:2485,0,1085 chrIX 227051 . G A 1560.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.564;DP=115;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=72.3064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.499;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,79:115:99:1590,0,653 chrIX 227053 . G A 1525.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;DP=112;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=71.3131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.783;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,77:112:99:1555,0,630 chrIX 227061 . G A 696.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;DP=120;Dels=0.00;FS=8.862;HaplotypeScore=70.9266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,45:120:99:726,0,1567 chrIX 227151 . C T 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.745;DP=130;Dels=0.00;FS=7.294;HaplotypeScore=3.3542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.506;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,89:130:99:1892,0,636 chrIX 227301 . A T 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3150,327,0 chrIX 227309 . C T 2271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.793;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=15.66;ReadPosRankSum=-1.692;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,101:145:99:2301,0,706 chrIX 227464 . T C 2041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.357;DP=158;Dels=0.00;FS=1.301;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.931;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,99:158:99:2071,0,1127 chrIX 227732 . A T 2075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;DP=147;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.082;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,97:147:99:2105,0,898 chrIX 228015 . G A 2747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.279;DP=180;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,125:180:99:2777,0,941 chrIX 228090 . G T 2181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.000;DP=180;Dels=0.00;FS=1.180;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,104:180:99:2211,0,1476 chrIX 228239 . T C 2509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.498;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.484;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,123:194:99:2539,0,1251 chrIX 228423 . A T 2267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.040;DP=157;Dels=0.00;FS=12.421;HaplotypeScore=3.4019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=14.44;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,105:157:99:2297,0,971 chrIX 228430 . A C 2552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;DP=176;Dels=0.00;FS=20.176;HaplotypeScore=3.7292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.111;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,121:176:99:2582,0,990 chrIX 228699 . A G 2965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.701;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=1;MQRankSum=0.653;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.576;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,146:204:99:2995,0,904 chrIX 228759 . C T 3008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.250;DP=200;Dels=0.00;FS=4.435;HaplotypeScore=4.6788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=15.04;ReadPosRankSum=-2.019;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,138:200:99:3038,0,934 chrIX 228786 . T C 2807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.988;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,139:208:99:2837,0,1242 chrIX 228791 . G A 2429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.833;DP=181;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,118:181:99:2459,0,1150 chrIX 228903 . A G 2444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.961;DP=176;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=5.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.749;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,120:176:99:2474,0,971 chrIX 229345 . T C 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.635;DP=149;Dels=0.00;FS=6.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=5.18;ReadPosRankSum=-1.326;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,51:149:99:802,0,2202 chrIX 229455 . G C 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.323;DP=152;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,56:152:99:1010,0,2077 chrIX 229515 . A G 1893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.108;DP=159;Dels=0.00;FS=9.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.423;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,95:159:99:1923,0,1244 chrIX 230147 . T C 1917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;DP=140;Dels=0.00;FS=2.339;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,90:140:99:1947,0,898 chrIX 230680 . G A 2092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.452;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=14.94;ReadPosRankSum=1.990;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,94:140:99:2122,0,713 chrIX 230953 . T C 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.213;DP=153;Dels=0.00;FS=3.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.290;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,97:153:99:1871,0,1022 chrIX 230993 . C A 2207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.678;DP=159;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=13.88;ReadPosRankSum=1.780;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,103:159:99:2237,0,957 chrIX 231138 . A G 2065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.556;DP=160;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.393;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,99:160:99:2095,0,1183 chrIX 231300 . T C 2042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.355;DP=138;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.471;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,97:138:99:2072,0,670 chrIX 231324 . A G 2010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.885;DP=145;Dels=0.00;FS=4.325;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.716;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,102:145:99:2040,0,676 chrIX 231377 . G A 3083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.166;DP=205;Dels=0.00;FS=1.183;HaplotypeScore=3.5098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.375;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,144:205:99:3113,0,888 chrIX 231757 . T C 2135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.329;DP=180;Dels=0.00;FS=1.238;HaplotypeScore=3.1667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.85;MQ0=2;MQRankSum=-10.698;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.673;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,108:180:99:2165,0,1396 chrIX 232253 . A C 2858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.096;DP=205;Dels=0.00;FS=1.287;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.377;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,139:205:99:2888,0,1171 chrIX 232425 . G A 2532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.855;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.036;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,116:175:99:2562,0,1002 chrIX 232438 . A G 2536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.574;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,125:185:99:2566,0,1053 chrIX 232454 . T C 3135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.893;DP=230;Dels=0.00;FS=1.776;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,160:230:99:3165,0,1227 chrIX 232621 . G C 3273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;DP=266;Dels=0.00;FS=1.646;HaplotypeScore=4.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.790;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,172:266:99:3273,0,1633 chrIX 232759 . A G 3455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.469;DP=231;Dels=0.00;FS=24.482;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.702;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,161:231:99:3455,0,1199 chrIX 232800 . C T 2733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.163;DP=186;Dels=0.00;FS=3.681;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,128:186:99:2763,0,874 chrIX 233049 . G A 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3576;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;QD=22.14;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:169:99:3742,399,0 chrIX 233111 . C T 2996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.191;DP=198;Dels=0.00;FS=3.602;HaplotypeScore=2.7419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=15.13;ReadPosRankSum=3.159;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,139:198:99:3026,0,267 chrIX 234136 . C T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.361;DP=183;Dels=0.00;FS=5.518;HaplotypeScore=43.2914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=0.796;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.534;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,68:183:99:1130,0,2165 chrIX 234371 . A G 3287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.363;DP=218;Dels=0.00;FS=8.930;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,153:218:99:3287,0,1072 chrIX 234893 . G T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.959;DP=162;Dels=0.00;FS=4.743;HaplotypeScore=22.9217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,63:162:99:1205,0,2072 chrIX 234965 . T C 2227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.845;DP=173;Dels=0.00;FS=2.050;HaplotypeScore=6.1412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=12.87;ReadPosRankSum=-1.796;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,115:173:99:2257,0,1064 chrIX 235235 . A G 650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.701;DP=145;Dels=0.00;FS=5.468;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,46:145:99:680,0,2197 chrIX 235694 . C G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.350;DP=195;Dels=0.00;FS=1.175;HaplotypeScore=7.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.177;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,72:195:99:1165,0,2499 chrIX 235730 . T C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.205;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.924;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,70:213:99:1119,0,3005 chrIX 235944 . T C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.328;DP=229;Dels=0.00;FS=2.410;HaplotypeScore=2.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,76:229:99:1209,0,3384 chrIX 236044 . G A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.252;DP=232;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.734;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,79:232:99:1512,0,3195 chrIX 236267 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.151;DP=188;Dels=0.00;FS=3.231;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=6.12;ReadPosRankSum=-1.056;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,62:188:99:1181,0,2770 chrIX 236624 . T C 2914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.655;DP=231;Dels=0.00;FS=3.925;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,144:231:99:2944,0,1595 chrIX 236678 . C T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.972;DP=210;Dels=0.00;FS=3.529;HaplotypeScore=7.8983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=4.52;ReadPosRankSum=-2.482;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,61:210:99:979,0,3013 chrIX 236759 . A G 3147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.495;DP=274;Dels=0.00;FS=2.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=1;MQRankSum=0.645;QD=11.49;ReadPosRankSum=2.117;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,162:274:99:3177,0,2132 chrIX 237295 . T C 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.786;DP=200;Dels=0.00;FS=1.946;HaplotypeScore=2.4115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=4.65;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,64:200:99:960,0,2948 chrIX 237441 . G C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.870;DP=208;Dels=0.00;FS=3.449;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.867;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,64:208:99:998,0,3128 chrIX 237506 . G A 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.884;DP=174;Dels=0.00;FS=4.574;HaplotypeScore=3.6056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,68:174:99:1306,0,2089 chrIX 237595 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.727;DP=246;Dels=0.00;FS=6.853;HaplotypeScore=4.5430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.386;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,84:246:99:1330,0,3504 chrIX 237799 . A C 2828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.612;DP=222;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=3.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.373;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.959;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,133:222:99:2858,0,1756 chrIX 237829 . T C 2493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.669;DP=207;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.710;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,119:207:99:2523,0,1745 chrIX 238349 . G A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.233;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,62:193:99:1102,0,2723 chrIX 238662 . A G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.231;DP=220;Dels=0.00;FS=5.029;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.414;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,72:220:99:1250,0,3250 chrIX 238849 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.924;DP=219;Dels=0.00;FS=1.708;HaplotypeScore=2.5343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=6.97;ReadPosRankSum=1.291;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,81:219:99:1556,0,2820 chrIX 239129 . T A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.828;DP=214;Dels=0.00;FS=9.894;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,73:214:99:1307,0,3130 chrIX 239299 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.411;DP=203;Dels=0.00;FS=4.306;HaplotypeScore=3.4391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.120;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,68:203:99:1192,0,3000 chrIX 239431 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.437;DP=214;Dels=0.00;FS=0.529;HaplotypeScore=5.8261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,77:214:99:1296,0,3075 chrIX 239653 . C T 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.803;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.931;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,72:226:99:1173,0,3140 chrIX 239659 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.790;DP=224;Dels=0.00;FS=1.132;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,70:224:99:1214,0,3320 chrIX 240221 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.491;DP=234;Dels=0.00;FS=1.724;HaplotypeScore=2.3346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.331;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,73:234:99:1122,0,3480 chrIX 240673 . G T 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.115;DP=209;Dels=0.00;FS=4.216;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,80:209:99:1508,0,2480 chrIX 241041 . A C 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.442;DP=178;Dels=0.00;FS=22.846;HaplotypeScore=106.3680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=1;MQRankSum=1.436;QD=7.12;ReadPosRankSum=4.378;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,95:178:99:1297,0,224 chrIX 241093 . A G 402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.500;DP=196;Dels=0.00;FS=2.107;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=0.566;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.713;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,46:196:99:432,0,2723 chrIX 241170 . C G 2410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;DP=193;Dels=0.00;FS=2.746;HaplotypeScore=4.3488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.561;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,124:193:99:2440,0,1129 chrIX 241892 . A G 4851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=21.85;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,222:222:99:4851,546,0 chrIX 241991 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.577;DP=215;Dels=0.00;FS=0.533;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.868;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,71:215:99:1139,0,3146 chrIX 242419 . G C 2655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;DP=201;Dels=0.00;FS=6.328;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,129:201:99:2685,0,1262 chrIX 242535 . G A 2907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.982;DP=215;Dels=0.00;FS=9.478;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=1;MQRankSum=1.788;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.882;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,132:215:99:2937,0,1447 chrIX 242543 . A G 2559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.008;DP=199;Dels=0.00;FS=8.525;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=1;MQRankSum=-0.391;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.509;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,124:199:99:2589,0,1394 chrIX 242713 . C T 3219.08 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.649;DP=225;Dels=0.00;FS=9.778;HaplotypeScore=5.5907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=1.676;QD=14.31;ReadPosRankSum=-2.362;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,151:225:99:3249,0,1297 chrIX 242863 . T C 2599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.397;DP=216;Dels=0.00;FS=2.598;HaplotypeScore=5.9297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.012;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,131:216:99:2629,0,1561 chrIX 242937 . G A 3496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.197;DP=234;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=14.94;ReadPosRankSum=1.137;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,154:234:99:3496,0,1438 chrIX 243202 . A G 2398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.380;DP=187;Dels=0.00;FS=1.213;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,123:187:99:2428,0,1132 chrIX 243230 . A G 2541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.442;DP=171;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,119:170:99:2571,0,877 chrIX 243264 . T C 2703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.721;DP=180;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=9.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.789;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,124:180:99:2733,0,957 chrIX 243482 . A C 3500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.583;DP=211;Dels=0.00;FS=2.941;HaplotypeScore=11.4392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=16.59;ReadPosRankSum=-1.725;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,163:210:99:3500,0,688 chrIX 243813 . T G 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.531;DP=193;Dels=0.00;FS=0.587;HaplotypeScore=13.3927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,55:193:99:839,0,3040 chrIX 243933 . C T 3482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.746;DP=240;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=3.5438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.680;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,162:240:99:3482,0,1195 chrIX 244502 . G A 2914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.357;DP=221;Dels=0.00;FS=4.785;HaplotypeScore=3.1780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.609;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,135:221:99:2944,0,1546 chrIX 244618 . C T 2623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.195;DP=183;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=6.4752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.691;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,123:183:99:2653,0,1005 chrIX 244765 . T G 2603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.492;DP=206;Dels=0.00;FS=4.130;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,131:206:99:2633,0,1318 chrIX 244863 . C T 2888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;DP=203;Dels=0.00;FS=1.188;HaplotypeScore=8.7106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=14.23;ReadPosRankSum=-1.348;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,141:203:99:2918,0,1025 chrIX 244871 . C T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.147;DP=198;Dels=0.00;FS=1.898;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.613;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,63:198:99:1107,0,2853 chrIX 244901 . G A 2821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.774;DP=188;Dels=0.00;FS=3.691;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=2.856;QD=15.01;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,132:188:99:2851,0,883 chrIX 245022 . T C 3617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.314;DP=225;Dels=0.00;FS=3.585;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=16.08;ReadPosRankSum=-2.320;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,170:225:99:3617,0,843 chrIX 245220 . G A 2588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.071;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,129:201:99:2618,0,1311 chrIX 245431 . G A 2937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.706;DP=217;Dels=0.00;FS=5.116;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=1;MQRankSum=0.282;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.639;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,140:217:99:2967,0,1284 chrIX 245567 . G C 2529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;DP=195;Dels=0.00;FS=1.152;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.976;QD=12.97;ReadPosRankSum=-1.121;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,123:195:99:2559,0,1316 chrIX 245601 . A T 2806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;DP=208;Dels=0.00;FS=4.186;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,132:208:99:2836,0,1358 chrIX 245693 . G A 3173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.692;DP=215;Dels=0.00;FS=5.090;HaplotypeScore=3.1083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,142:215:99:3203,0,1301 chrIX 245762 . T C 2422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.911;DP=200;Dels=0.00;FS=1.792;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,126:200:99:2452,0,1483 chrIX 245765 . C T 2411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.519;DP=201;Dels=0.00;FS=2.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.475;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,124:201:99:2441,0,1468 chrIX 245832 . C T 2597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.714;DP=192;Dels=0.00;FS=6.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=13.53;ReadPosRankSum=2.225;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,123:192:99:2627,0,1249 chrIX 245890 . G C 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.124;DP=164;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,49:164:99:776,0,2343 chrIX 245930 . G A 1197.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.766;DP=95;Dels=0.00;FS=1.772;HaplotypeScore=3.1291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.75;MQ0=0;MQRankSum=-6.251;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.512;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,64:95:99:1227,0,525 chrIX 245931 . G A 1202.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.544;DP=95;Dels=0.00;FS=2.930;HaplotypeScore=3.1291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.75;MQ0=0;MQRankSum=-5.881;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.205;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,65:95:99:1232,0,499 chrIX 245932 . G A 1193.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.398;DP=95;Dels=0.00;FS=2.930;HaplotypeScore=3.1291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.75;MQ0=0;MQRankSum=-6.449;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.549;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,65:95:99:1223,0,515 chrIX 245946 . G A 438.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.970;DP=119;Dels=0.00;FS=16.772;HaplotypeScore=4.9209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.98;MQ0=0;MQRankSum=5.357;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.086;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:468,0,1480 chrIX 245951 . A G 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.118;DP=118;Dels=0.00;FS=11.682;HaplotypeScore=10.2319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.13;MQ0=0;MQRankSum=-4.415;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,87:118:99:1494,0,493 chrIX 245966 . T C 409.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.967;DP=149;Dels=0.01;FS=75.620;HaplotypeScore=174.6516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.928;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,27:148:99:439,0,254 chrIX 246055 . T G 390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;DP=129;Dels=0.00;FS=3.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.22;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.526;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,31:129:99:420,0,2005 chrIX 246074 . A G 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.343;DP=123;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=13.49;ReadPosRankSum=-2.297;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,78:123:99:1689,0,865 chrIX 246094 . G T 2074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.486;DP=147;Dels=0.00;FS=6.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,94:147:99:2104,0,972 chrIX 246179 . T A 1897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.357;DP=147;Dels=0.00;FS=14.339;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=12.90;ReadPosRankSum=1.108;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,88:147:99:1927,0,1159 chrIX 246552 . A C 73.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.416;DP=127;Dels=0.00;FS=17.235;HaplotypeScore=2.9389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.37;MQ0=0;MQRankSum=-5.432;QD=0.57;ReadPosRankSum=-8.865;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:103,0,1434 chrIX 246592 . A G 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.926;DP=165;Dels=0.00;FS=29.122;HaplotypeScore=2.5946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.909;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.450;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,106:165:99:1281,0,1163 chrIX 246605 . G A 499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.761;DP=172;Dels=0.00;FS=11.420;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.61;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.133;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,55:172:99:529,0,2082 chrIX 246643 . A C 2495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.432;DP=197;Dels=0.00;FS=11.427;HaplotypeScore=2.8918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=3.726;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,129:197:99:2525,0,1194 chrIX 246729 . C T 2567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.499;DP=186;Dels=0.00;FS=8.111;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.188;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,126:186:99:2597,0,1024 chrIX 246806 . G T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;DP=209;Dels=0.00;FS=1.192;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.308;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,72:209:99:1234,0,2962 chrIX 246817 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.938;DP=205;Dels=0.00;FS=0.576;HaplotypeScore=2.6515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.556;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,66:205:99:1123,0,3049 chrIX 246868 . T G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.089;DP=225;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.960;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,73:225:99:1198,0,3360 chrIX 246894 . G C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;DP=199;Dels=0.00;FS=1.888;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.986;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,65:199:99:1134,0,2775 chrIX 246958 . T C 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.099;DP=252;Dels=0.00;FS=8.195;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=2.164;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.205;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,67:252:99:976,0,4067 chrIX 247009 . T C 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.538;DP=219;Dels=0.00;FS=7.484;HaplotypeScore=2.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.695;QD=4.52;ReadPosRankSum=2.385;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,63:219:99:1019,0,3406 chrIX 247021 . C A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.012;DP=215;Dels=0.00;FS=4.506;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,61:215:99:978,0,3300 chrIX 247032 . T C 4832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:4832,528,0 chrIX 247049 . T C 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;DP=211;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=6.2152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.401;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,60:211:99:787,0,3209 chrIX 247058 . G C 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;DP=203;Dels=0.00;FS=3.805;HaplotypeScore=6.2289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.970;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,62:203:99:908,0,3036 chrIX 247121 . A G 2918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.924;DP=208;Dels=0.00;FS=1.201;HaplotypeScore=12.4922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQ0=0;MQRankSum=-3.470;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.617;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,136:207:99:2948,0,1322 chrIX 247126 . G C 5133.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5257;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.53;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:5133,546,0 chrIX 247167 . G C 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.660;DP=208;Dels=0.00;FS=6.086;HaplotypeScore=3.5836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.271;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,79:208:99:1432,0,2703 chrIX 247172 . G A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.797;DP=203;Dels=0.00;FS=8.420;HaplotypeScore=5.5636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.996;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.206;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,77:203:99:1436,0,2534 chrIX 247194 . A G 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.775;DP=174;Dels=0.00;FS=6.620;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.078;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,72:174:99:1294,0,2206 chrIX 247255 . G A 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.954;DP=169;Dels=0.00;FS=2.248;HaplotypeScore=5.6603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.104;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,48:169:99:705,0,2538 chrIX 247296 . C T 556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.805;DP=178;Dels=0.00;FS=4.404;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.98;MQ0=0;MQRankSum=-5.823;QD=3.12;ReadPosRankSum=-2.373;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,45:178:99:586,0,2790 chrIX 247307 . C T 505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.765;DP=183;Dels=0.00;FS=11.417;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.19;MQ0=0;MQRankSum=-5.731;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.479;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,45:183:99:535,0,3061 chrIX 247315 . G A 435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.837;DP=183;Dels=0.00;FS=13.183;HaplotypeScore=38.6291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=-7.868;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,43:183:99:465,0,3069 chrIX 247361 . G A 2713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.539;DP=212;Dels=0.00;FS=4.296;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=1;MQRankSum=-6.105;QD=12.80;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,137:212:99:2743,0,1382 chrIX 247384 . G C 2034.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.330;DP=188;Dels=0.00;FS=10.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=1;MQRankSum=-6.752;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,118:188:99:2064,0,1213 chrIX 247387 . T C 2055.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.391;DP=183;Dels=0.00;FS=9.079;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=1;MQRankSum=-6.842;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.086;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,114:183:99:2085,0,1358 chrIX 247394 . A C 2318.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;DP=194;Dels=0.00;FS=10.014;HaplotypeScore=2.8681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQ0=1;MQRankSum=-6.599;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.020;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,122:194:99:2348,0,1365 chrIX 247434 . G A 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.969;DP=155;Dels=0.00;FS=31.192;HaplotypeScore=9.7620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.871;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.539;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,87:155:99:1648,0,1209 chrIX 247451 . C T 113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.568;DP=140;Dels=0.00;FS=10.170;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.85;MQ0=0;MQRankSum=-5.223;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.060;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,25:140:99:143,0,2304 chrIX 247477 . T G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.134;DP=175;Dels=0.00;FS=13.073;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.01;MQ0=0;MQRankSum=-9.676;QD=7.09;ReadPosRankSum=-3.548;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,80:175:99:1271,0,2026 chrIX 247481 . C G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;DP=177;Dels=0.00;FS=14.528;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.14;MQ0=0;MQRankSum=-9.952;QD=6.95;ReadPosRankSum=-4.337;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,80:177:99:1261,0,1999 chrIX 247491 . A G 821.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.943;DP=167;Dels=0.00;FS=9.502;HaplotypeScore=22.2297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.46;MQ0=0;MQRankSum=-10.912;QD=4.92;ReadPosRankSum=-3.452;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,66:167:99:851,0,2219 chrIX 247492 . A T 845.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;DP=165;Dels=0.00;FS=10.904;HaplotypeScore=22.2297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.53;MQ0=0;MQRankSum=-10.840;QD=5.12;ReadPosRankSum=-3.460;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,65:165:99:875,0,2191 chrIX 247495 . C T 842.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.887;DP=169;Dels=0.00;FS=12.236;HaplotypeScore=46.1800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.80;MQ0=0;MQRankSum=-10.924;QD=4.98;ReadPosRankSum=-3.081;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,65:169:99:872,0,2106 chrIX 247508 . T A 270.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.062;DP=156;Dels=0.00;FS=48.265;HaplotypeScore=101.5754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-6.950;QD=1.73;ReadPosRankSum=4.057;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,35:156:99:300,0,2438 chrIX 247509 . T C 285.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.900;DP=143;Dels=0.00;FS=41.743;HaplotypeScore=66.7811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.56;MQ0=0;MQRankSum=-8.074;QD=1.99;ReadPosRankSum=3.529;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,35:143:99:315,0,2220 chrIX 247510 . C A 294.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.966;DP=141;Dels=0.00;FS=41.540;HaplotypeScore=66.7811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=-7.901;QD=2.09;ReadPosRankSum=3.787;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,35:141:99:324,0,1981 chrIX 247514 . T C 275.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.888;DP=160;Dels=0.00;FS=40.560;HaplotypeScore=54.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.67;MQ0=0;MQRankSum=-7.017;QD=1.72;ReadPosRankSum=4.850;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,35:160:99:305,0,2083 chrIX 247516 . C T 278.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.790;DP=158;Dels=0.00;FS=40.437;HaplotypeScore=76.7516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.51;MQ0=0;MQRankSum=-7.264;QD=1.76;ReadPosRankSum=5.054;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,35:158:99:308,0,1959 chrIX 247522 . T C 271.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.959;DP=155;Dels=0.00;FS=39.214;HaplotypeScore=77.6029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.89;MQ0=0;MQRankSum=-6.886;QD=1.75;ReadPosRankSum=4.586;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,37:155:99:301,0,1930 chrIX 247530 . T C 356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.787;DP=138;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=23.2589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.13;MQ0=0;MQRankSum=-10.087;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:386,0,1635 chrIX 247539 . A T 513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.840;DP=144;Dels=0.00;FS=2.266;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQ0=0;MQRankSum=-10.122;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:543,0,1670 chrIX 247598 . A C 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.999;DP=165;Dels=0.00;FS=2.971;HaplotypeScore=3.6264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.13;MQ0=0;MQRankSum=-3.889;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.582;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,103:165:99:1780,0,1210 chrIX 247608 . G A 1986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.455;DP=170;Dels=0.00;FS=6.970;HaplotypeScore=2.9580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.47;MQ0=0;MQRankSum=-3.563;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.994;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,105:170:99:2016,0,1117 chrIX 247613 . C T 2045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.232;DP=171;Dels=0.00;FS=5.704;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQ0=0;MQRankSum=-5.131;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.422;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,104:171:99:2075,0,1188 chrIX 247623 . G A 2251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.333;DP=184;Dels=0.00;FS=4.507;HaplotypeScore=6.6364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQ0=0;MQRankSum=-3.540;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,113:184:99:2281,0,1269 chrIX 247635 . T A 2571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;DP=205;Dels=0.00;FS=3.391;HaplotypeScore=8.4465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,124:205:99:2601,0,1553 chrIX 247681 . T C 2181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.325;DP=164;Dels=0.00;FS=2.089;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=-3.919;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.959;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,108:164:99:2211,0,994 chrIX 247784 . T C 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.546;DP=234;Dels=0.00;FS=1.048;HaplotypeScore=49.6262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=7.17;ReadPosRankSum=4.309;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,94:234:99:1708,0,3042 chrIX 247791 . C A 2987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.105;DP=203;Dels=0.00;FS=21.664;HaplotypeScore=48.6235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.061;QD=14.71;ReadPosRankSum=2.788;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,137:203:99:3017,0,1120 chrIX 247822 . C T 2425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.565;DP=179;Dels=0.00;FS=28.234;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.116;QD=13.55;ReadPosRankSum=-3.270;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,116:179:99:2455,0,1147 chrIX 247828 . A T 2330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.155;DP=180;Dels=0.00;FS=21.554;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=12.94;ReadPosRankSum=-4.223;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,115:180:99:2360,0,1305 chrIX 247879 . T A 2852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;DP=216;Dels=0.00;FS=0.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.916;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,138:216:99:2882,0,1532 chrIX 247894 . C G 2666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.942;DP=207;Dels=0.00;FS=2.555;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.198;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,138:207:99:2696,0,1286 chrIX 247899 . A C 2803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.689;DP=220;Dels=0.00;FS=6.109;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.082;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,151:220:99:2833,0,1345 chrIX 247930 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.967;DP=221;Dels=0.00;FS=12.237;HaplotypeScore=4.6801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,70:221:99:993,0,3414 chrIX 248292 . T C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.279;DP=241;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=3.8325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,71:241:99:1111,0,3811 chrIX 248343 . T C 3333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.537;DP=240;Dels=0.00;FS=1.840;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.446;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,163:240:99:3333,0,1405 chrIX 248675 . T A 5576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.89;SB=-2.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,224:224:99:5576,603,0 chrIX 248721 . C G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.030;DP=231;Dels=0.00;FS=1.776;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,71:231:99:1148,0,3343 chrIX 248948 . A C 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;DP=196;Dels=0.01;FS=21.510;HaplotypeScore=482.3352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=3.59;ReadPosRankSum=3.948;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,50:195:99:733,0,1540 chrIX 248949 . T C 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.919;DP=199;Dels=0.00;FS=7.189;HaplotypeScore=445.4659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=4.40;ReadPosRankSum=5.144;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,50:199:99:905,0,502 chrIX 249005 . G A 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.976;DP=184;Dels=0.00;FS=3.914;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.912;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,56:184:99:841,0,2480 chrIX 249346 . G T 706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.636;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.194;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,46:171:99:736,0,2573 chrIX 249546 . T C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.838;DP=225;Dels=0.00;FS=5.260;HaplotypeScore=4.5096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.257;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,80:225:99:1438,0,3325 chrIX 249665 . A T 4176.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.0777;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=1;QD=18.16;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:4176,438,0 chrIX 250194 . T C 2987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.698;DP=231;Dels=0.00;FS=5.990;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=1;MQRankSum=1.888;QD=12.93;ReadPosRankSum=2.542;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,147:231:99:3017,0,1574 chrIX 250317 . C G 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.497;DP=237;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=4.9531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=6.90;ReadPosRankSum=-1.979;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,89:237:99:1666,0,3096 chrIX 250337 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.802;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,65:186:99:1235,0,2604 chrIX 250521 . C T 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.984;DP=234;Dels=0.00;FS=4.567;HaplotypeScore=12.5151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.092;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,94:234:99:1746,0,2777 chrIX 250530 . C T 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.470;DP=228;Dels=0.00;FS=1.065;HaplotypeScore=11.5755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.508;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,90:228:99:1742,0,2812 chrIX 250581 . T C 3909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.516;DP=293;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.903;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,185:293:99:3909,0,2000 chrIX 250597 . G A 1803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.362;DP=279;Dels=0.00;FS=0.991;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.451;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,99:279:99:1833,0,3820 chrIX 250668 . C T 7023.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=267;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.30;SB=-2.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,267:267:99:7023,739,0 chrIX 250683 . T C 5957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,245:245:99:5957,660,0 chrIX 250698 . C T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;DP=242;Dels=0.00;FS=1.767;HaplotypeScore=5.8853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.125;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,88:242:99:1528,0,3324 chrIX 250881 . T C 5372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.53;SB=-2.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:219:99:5372,588,0 chrIX 251208 . T A 5848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;DP=239;Dels=0.00;FS=3.370;HaplotypeScore=4.6022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=24.47;ReadPosRankSum=1.268;SB=-2.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,238:239:99:5848,581,0 chrIX 251499 . C T 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;DP=144;Dels=0.00;FS=3.133;HaplotypeScore=4.3895;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.612;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3758,381,0 chrIX 251544 . G A 4829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4829,481,0 chrIX 251549 . A G 4602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4602,489,0 chrIX 251559 . T C 5238.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5238,558,0 chrIX 251784 . T C 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.505;DP=158;Dels=0.00;FS=1.330;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=2.099;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.077;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,53:158:99:847,0,2332 chrIX 251795 . C T 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.758;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.005;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,58:177:99:1031,0,2575 chrIX 251868 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.582;DP=215;Dels=0.00;FS=1.801;HaplotypeScore=2.9046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.957;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,73:215:99:1261,0,3141 chrIX 251878 . A C 2603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.040;DP=208;Dels=0.00;FS=0.528;HaplotypeScore=2.6912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,134:208:99:2633,0,1357 chrIX 251980 . T C 5091.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.38;SB=-2.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:5091,549,0 chrIX 252102 . A C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.037;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,76:214:99:1309,0,3001 chrIX 252259 . C T 2970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.462;DP=229;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=3.4528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.202;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,143:229:99:3000,0,1563 chrIX 252323 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.151;DP=186;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,72:185:99:1350,0,2299 chrIX 252351 . A G 4614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.28;SB=-2.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4614,504,0 chrIX 252405 . T C 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.561;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.362;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,56:202:99:908,0,3209 chrIX 252448 . T C 3326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.755;DP=224;Dels=0.00;FS=4.168;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.216;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,156:224:99:3326,0,1121 chrIX 253139 . C T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.481;DP=213;Dels=0.00;FS=19.949;HaplotypeScore=9.7582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=5.03;ReadPosRankSum=-1.291;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,64:213:99:1102,0,3064 chrIX 253199 . C G 5944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;DP=238;Dels=0.00;FS=3.989;HaplotypeScore=10.6126;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.179;SB=-2.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,237:238:99:5944,598,0 chrIX 253318 . T C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.787;DP=224;Dels=0.00;FS=12.003;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.216;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,84:224:99:1436,0,2960 chrIX 253488 . G A 5784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.94;SB=-2.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,223:223:99:5784,580,0 chrIX 253527 . C A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.619;DP=196;Dels=0.00;FS=5.462;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,73:196:99:1349,0,2511 chrIX 253992 . C T 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.015;DP=250;Dels=0.00;FS=1.238;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.921;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.196;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,95:250:99:1586,0,2783 chrIX 254025 . A G 431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.938;DP=178;Dels=0.00;FS=10.070;HaplotypeScore=76.1993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,58:178:99:461,0,1703 chrIX 254034 . T A 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=206;Dels=0.00;FS=21.125;HaplotypeScore=64.9374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.753;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,67:206:99:795,0,1729 chrIX 254108 . C T 3233.06 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.079;DP=232;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.025;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,148:232:99:3263,0,1537 chrIX 254153 . A G 2569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.621;DP=211;Dels=0.00;FS=1.724;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.742;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,130:211:99:2599,0,1581 chrIX 254261 . T C 6245.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=24.98;SB=-2.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,250:250:99:6245,645,0 chrIX 254311 . C A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.175;DP=246;Dels=0.00;FS=6.929;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.202;QD=4.99;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,82:246:99:1258,0,3512 chrIX 254336 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.317;DP=258;Dels=0.00;FS=7.209;HaplotypeScore=4.6660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,88:258:99:1476,0,3497 chrIX 254355 . T C 2960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.251;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.111;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,146:225:99:2990,0,1456 chrIX 254748 . T A 4594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4594,489,0 chrIX 254764 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;DP=180;Dels=0.00;FS=6.772;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=6.81;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,67:180:99:1255,0,2406 chrIX 254765 . A C 2358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.061;DP=185;Dels=0.00;FS=8.946;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.571;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,114:185:99:2388,0,1383 chrIX 254905 . T C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.338;DP=193;Dels=0.00;FS=5.548;HaplotypeScore=5.4986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.781;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,64:193:99:1146,0,2775 chrIX 254916 . T C 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.633;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.057;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,57:195:99:820,0,3176 chrIX 255654 . A C 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.60;SB=-2.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:173:99:4083,441,0 chrIX 255998 . A T 622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;DP=146;Dels=0.00;FS=2.418;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.106;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,42:146:99:652,0,2349 chrIX 256045 . C T 2727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.593;DP=174;Dels=0.00;FS=3.287;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.520;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,124:174:99:2757,0,812 chrIX 256089 . G A 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3798,402,0 chrIX 256094 . T A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.636;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.453;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,59:156:99:1173,0,2022 chrIX 256304 . T C 2438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.871;DP=191;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=1;MQRankSum=0.576;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,121:191:99:2468,0,1330 chrIX 256581 . C T 4726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4726,498,0 chrIX 256673 . T C 4685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4685,510,0 chrIX 256715 . T C 5504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.46;SB=-2.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,225:225:99:5504,579,0 chrIX 256728 . G T 5560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=24.39;SB=-2.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,228:228:99:5560,577,0 chrIX 256751 . A G 4788.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4788,522,0 chrIX 256752 . G A 4875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.487;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=24.62;ReadPosRankSum=1.540;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,197:198:99:4875,523,0 chrIX 256796 . T C 4825.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=24.37;SB=-2.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:4825,519,0 chrIX 256885 . C G 2686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;DP=175;Dels=0.00;FS=5.285;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.108;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,131:175:99:2716,0,659 chrIX 256921 . G A 4113.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4113,447,0 chrIX 256951 . G A 4622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.35;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4622,489,0 chrIX 256984 . A G 2632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.581;DP=186;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=14.15;ReadPosRankSum=-3.774;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,126:186:99:2662,0,1072 chrIX 257003 . C A 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.483;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=89.9405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.151;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,110:175:99:819,0,1363 chrIX 257011 . T C 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.131;DP=148;Dels=0.00;FS=5.298;HaplotypeScore=85.3879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQ0=0;MQRankSum=-4.131;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.579;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,93:148:99:827,0,1150 chrIX 257018 . G A 1984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.191;DP=161;Dels=0.00;FS=1.301;HaplotypeScore=3.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.640;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.099;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,100:161:99:2014,0,1133 chrIX 257077 . C G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.585;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=2.013;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.774;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,72:211:99:1109,0,2680 chrIX 257135 . G A 2780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.212;DP=185;Dels=0.00;FS=4.240;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.682;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,128:185:99:2810,0,899 chrIX 257350 . A G 2801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.192;DP=218;Dels=0.00;FS=9.510;HaplotypeScore=6.7971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=12.85;ReadPosRankSum=2.193;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,140:218:99:2831,0,1408 chrIX 257381 . T A 4134.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.65;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4134,444,0 chrIX 257418 . G C 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;DP=146;Dels=0.00;FS=2.353;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,51:146:99:872,0,2019 chrIX 257434 . G A 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.831;DP=155;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.60;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,52:155:99:870,0,1987 chrIX 257456 . A C 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.101;DP=157;Dels=0.00;FS=6.133;HaplotypeScore=4.7017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.66;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.064;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,58:157:99:982,0,1763 chrIX 257464 . T A 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.068;DP=153;Dels=0.00;FS=3.938;HaplotypeScore=4.7017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.10;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,95:153:99:1628,0,936 chrIX 257516 . A G 2412 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.80;MQ0=0;QD=16.75;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:2445,276,0 chrIX 257521 . C T 2376 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=16.97;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:2409,264,0 chrIX 257522 . G T 2305 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.77;MQ0=0;QD=16.70;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:2338,255,0 chrIX 257531 . C T 1284.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.432;DP=148;Dels=0.00;FS=5.242;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.163;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.691;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,97:148:99:1314,0,567 chrIX 257534 . C A 2498 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.94;MQ0=0;QD=15.71;SB=-2.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:2531,270,0 chrIX 257575 . T G 4359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.09;MQ0=0;QD=23.06;SB=-2.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4359,477,0 chrIX 257638 . C T 2512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.887;DP=180;Dels=0.00;FS=0.582;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=1;MQRankSum=-0.202;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.701;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,119:180:99:2542,0,1082 chrIX 257646 . T C 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.340;DP=158;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=1;MQRankSum=0.377;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.725;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,49:158:99:812,0,2474 chrIX 257809 . A G 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.725;DP=139;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=2.9199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,89:139:99:1841,0,947 chrIX 257823 . A G 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3793,423,0 chrIX 257834 . T C 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.334;DP=192;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.552;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,69:192:99:1156,0,2747 chrIX 257945 . T C 4331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7685;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4331,474,0 chrIX 258179 . G A 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.911;DP=161;Dels=0.00;FS=3.832;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.269;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,56:161:99:989,0,2261 chrIX 258263 . G A 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.785;DP=192;Dels=0.00;FS=2.780;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.433;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,56:192:99:940,0,2683 chrIX 258417 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.038;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=5.63;ReadPosRankSum=-2.301;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,64:195:99:1128,0,2590 chrIX 258510 . A G 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.187;DP=202;Dels=0.00;FS=1.797;HaplotypeScore=7.7564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,71:202:99:1186,0,2905 chrIX 258854 . T A 2501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;DP=173;Dels=0.00;FS=8.666;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.176;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,116:173:99:2531,0,1010 chrIX 259266 . C T 6393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=236;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.09;SB=-2.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,236:236:99:6393,649,0 chrIX 259323 . T A 6058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.11;SB=-2.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,232:232:99:6058,616,0 chrIX 259400 . A G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.873;DP=192;Dels=0.00;FS=5.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=5.14;ReadPosRankSum=2.887;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,62:192:99:1016,0,2839 chrIX 259413 . T C 656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.237;DP=188;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.120;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,47:188:99:686,0,3242 chrIX 259533 . C T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.847;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,52:160:99:979,0,2289 chrIX 259701 . G A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.707;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.773;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,64:187:99:1114,0,2644 chrIX 259784 . A G 2547.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.651;DP=176;Dels=0.00;FS=8.982;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=14.47;ReadPosRankSum=1.863;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,124:176:99:2577,0,873 chrIX 259788 . T C 2571.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.727;DP=164;Dels=0.00;FS=9.834;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.050;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,120:164:99:2601,0,742 chrIX 259794 . T C 571.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.987;DP=159;Dels=0.00;FS=13.088;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.631;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,42:159:99:601,0,2606 chrIX 259858 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.409;DP=174;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=3.6394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.333;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,71:174:99:1227,0,2247 chrIX 259859 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.009;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.934;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,65:168:99:1234,0,2120 chrIX 259913 . G A 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.230;DP=118;Dels=0.00;FS=12.600;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.903;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,45:118:99:859,0,1468 chrIX 259923 . T C 690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.599;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=6.45;ReadPosRankSum=2.263;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,40:107:99:720,0,1369 chrIX 260018 . T A 491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.323;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,31:124:99:521,0,1887 chrIX 260022 . C T 509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.617;DP=137;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=5.7285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.989;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,33:137:99:539,0,2124 chrIX 260067 . G A 2198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.219;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.332;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,101:138:99:2228,0,541 chrIX 260120 . G A 4361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4361,450,0 chrIX 260123 . C T 2539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.966;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,118:171:99:2569,0,932 chrIX 260167 . G A 4001.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4001,423,0 chrIX 260168 . A G 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.468;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.115;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,57:151:99:973,0,2154 chrIX 260232 . C T 4519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4519,477,0 chrIX 260247 . A C 4230.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4230,465,0 chrIX 260291 . G A 2023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.885;DP=145;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=2.273;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,95:145:99:2053,0,856 chrIX 260320 . A G 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.443;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=5.20;ReadPosRankSum=-1.865;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,44:137:99:742,0,2083 chrIX 260331 . A G 3726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3726,396,0 chrIX 260350 . C T 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.966e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3921,403,0 chrIX 260376 . C T 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4003,412,0 chrIX 260388 . C T 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.624;DP=150;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.771;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.465;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,49:150:99:782,0,2087 chrIX 260414 . T A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.218;DP=153;Dels=0.00;FS=2.146;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.261;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,58:153:99:1035,0,2041 chrIX 260478 . G C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.251;DP=179;Dels=0.00;FS=5.871;HaplotypeScore=52.5005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,66:179:99:1051,0,2259 chrIX 260488 . C T 2698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.054;DP=192;Dels=0.00;FS=1.960;HaplotypeScore=54.4108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.347;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,125:192:99:2728,0,1107 chrIX 260769 . T C 602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.647;DP=135;Dels=0.00;FS=3.457;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.347;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,40:135:99:632,0,2172 chrIX 260930 . A G 641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.554;DP=164;Dels=0.00;FS=4.464;HaplotypeScore=52.2506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.372;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,46:164:99:671,0,2590 chrIX 260934 . G A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.227;DP=171;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=47.9258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,65:171:99:1240,0,2166 chrIX 261061 . C T 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.14;SB=-2.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3983,411,0 chrIX 261156 . A T 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;DP=138;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.354;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,52:138:99:1000,0,1896 chrIX 261197 . T A 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;DP=136;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,90:136:99:1834,0,859 chrIX 261221 . T C 738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.013;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=4.99;ReadPosRankSum=-1.303;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,50:148:99:768,0,2165 chrIX 261261 . G A 4416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4416,471,0 chrIX 261499 . A G 4189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.23;SB=-2.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4189,438,0 chrIX 261520 . T C 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.616;DP=157;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,56:157:99:937,0,2174 chrIX 261805 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.001;DP=181;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=3.129;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,63:181:99:1173,0,2521 chrIX 262330 . C G 2373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.583;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.091;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,117:161:99:2403,0,619 chrIX 262342 . C A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.234;DP=155;Dels=0.00;FS=5.011;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=6.24;ReadPosRankSum=1.443;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,56:155:99:997,0,2049 chrIX 262414 . T G 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.518;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,48:158:99:696,0,2403 chrIX 262441 . T C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.990;DP=198;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=5.6284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,63:198:99:1051,0,2934 chrIX 262483 . A G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.988;DP=188;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=2.5221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=5.15;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,62:188:99:998,0,2764 chrIX 262504 . T C 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.700;DP=166;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=4.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.055;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,55:166:99:943,0,2466 chrIX 262630 . T A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;DP=184;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.5311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.352;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.513;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,69:183:99:1251,0,2456 chrIX 262672 . C T 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.689;DP=147;Dels=0.00;FS=2.536;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,44:147:99:703,0,2302 chrIX 262771 . G A 764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.784;DP=167;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,51:167:99:794,0,2552 chrIX 263059 . G A 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.282;DP=209;Dels=0.00;FS=1.255;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,62:209:99:1070,0,3173 chrIX 263188 . G A 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.985;DP=140;Dels=0.00;FS=5.511;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,46:140:99:791,0,1994 chrIX 263203 . A G 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.551;DP=153;Dels=0.00;FS=7.722;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.064;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,51:153:99:865,0,2249 chrIX 263455 . T C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.541;DP=178;Dels=0.00;FS=1.972;HaplotypeScore=9.7624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.752;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,62:178:99:1029,0,2537 chrIX 263502 . G C 88.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.849;DP=102;Dels=0.00;FS=114.071;HaplotypeScore=6.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.768;QD=0.86;ReadPosRankSum=-2.081;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:118,0,1470 chrIX 263590 . T A 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.590;DP=165;Dels=0.00;FS=5.586;HaplotypeScore=6.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.384;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,50:165:99:839,0,2602 chrIX 263605 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.998;DP=171;Dels=0.00;FS=1.992;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=7.27;ReadPosRankSum=-2.059;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,74:171:99:1273,0,2140 chrIX 263632 . C T 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.088;DP=164;Dels=0.00;FS=2.977;HaplotypeScore=3.5472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.870;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.453;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,55:164:99:1008,0,2400 chrIX 263668 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.140;DP=178;Dels=0.00;FS=9.530;HaplotypeScore=4.5761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.466;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,62:178:99:1065,0,2526 chrIX 263719 . G A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.649;DP=197;Dels=0.00;FS=2.108;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.994;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,62:196:99:1121,0,2965 chrIX 263753 . C T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.295;DP=203;Dels=0.00;FS=2.650;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.431;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,74:203:99:1371,0,2753 chrIX 263911 . A G 2452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.944;DP=184;Dels=0.00;FS=2.675;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.556;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,118:184:99:2482,0,1261 chrIX 264166 . T A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;DP=196;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=3.7073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.787;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,62:196:99:1080,0,2903 chrIX 264361 . C T 2637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.355;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=1;MQRankSum=0.884;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.041;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,119:176:99:2667,0,937 chrIX 264571 . A G 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.452;DP=177;Dels=0.00;FS=1.981;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.429;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,62:177:99:1054,0,2564 chrIX 264604 . C T 2349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.637;DP=180;Dels=0.00;FS=5.460;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.653;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,110:180:99:2379,0,1262 chrIX 265508 . C T 5347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.71;SB=-2.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:208:99:5347,544,0 chrIX 265532 . C T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.408;DP=226;Dels=0.00;FS=1.082;HaplotypeScore=61.9856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.608;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.135;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,77:226:99:1357,0,3008 chrIX 265537 . C A 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.329;DP=220;Dels=0.00;FS=6.478;HaplotypeScore=64.9696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=4.23;ReadPosRankSum=2.144;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,60:220:99:960,0,3482 chrIX 265732 . A C 6103.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=251;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.31;SB=-2.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,251:251:99:6103,669,0 chrIX 265793 . G T 4304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.276;DP=301;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=7.2224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.350;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,202:301:99:4304,0,1667 chrIX 265961 . T C 3024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.267;DP=221;Dels=0.00;FS=5.275;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.110;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,146:221:99:3054,0,1325 chrIX 266255 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.640;DP=235;Dels=0.00;FS=3.960;HaplotypeScore=5.7391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.409;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,75:235:99:1276,0,3304 chrIX 266696 . G A 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.001;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=-0.172;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.275;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,57:216:99:842,0,3401 chrIX 266717 . A G 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.925;DP=226;Dels=0.00;FS=2.637;HaplotypeScore=6.9242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=1;MQRankSum=1.820;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.455;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,59:226:99:749,0,3698 chrIX 266720 . C T 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.427;DP=216;Dels=0.00;FS=0.571;HaplotypeScore=7.5025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=1;MQRankSum=-0.378;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.573;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,56:216:99:824,0,3337 chrIX 266797 . C G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=231;Dels=0.00;FS=4.255;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=2.355;QD=4.45;ReadPosRankSum=-1.538;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,70:231:99:1059,0,3386 chrIX 266869 . C T 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.228;DP=221;Dels=0.00;FS=1.729;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,81:221:99:1455,0,2786 chrIX 266933 . C T 3834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.312;DP=257;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=3.7004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,174:257:99:3834,0,1444 chrIX 267253 . C T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.288;DP=274;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=3.2101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,91:274:99:1489,0,3768 chrIX 267269 . C A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.126;DP=303;Dels=0.00;FS=2.784;HaplotypeScore=2.7570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=5.50;ReadPosRankSum=2.915;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,98:303:99:1695,0,4355 chrIX 267287 . A G 6942.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=293;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3068;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=23.69;SB=-3.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,292:293:99:6942,776,0 chrIX 267291 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.978;DP=286;Dels=0.00;FS=0.472;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,85:286:99:1353,0,4118 chrIX 267404 . C T 3548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.764;DP=242;Dels=0.00;FS=1.708;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,166:242:99:3548,0,1304 chrIX 267441 . G A 1796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.178;DP=258;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.741;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,95:258:99:1826,0,3299 chrIX 267668 . A T 3135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;DP=230;Dels=0.00;FS=3.062;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.547;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,148:230:99:3165,0,1497 chrIX 267764 . A G 6635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=270;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7669;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=24.57;SB=-2.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,270:270:99:6635,723,0 chrIX 267767 . A G 1817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.051;DP=264;Dels=0.00;FS=6.952;HaplotypeScore=3.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.534;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,103:264:99:1847,0,3487 chrIX 267785 . C T 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.412;DP=237;Dels=0.00;FS=16.442;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.068;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,92:237:99:1693,0,2866 chrIX 268100 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.618;DP=209;Dels=0.00;FS=2.531;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.140;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,75:209:99:1376,0,2620 chrIX 268176 . G A 3227.04 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.907;DP=245;Dels=0.00;FS=1.615;HaplotypeScore=6.4569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.17;ReadPosRankSum=-1.502;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,156:245:99:3257,0,1570 chrIX 268188 . T A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.257;DP=258;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,76:258:99:1209,0,4028 chrIX 268262 . G T 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.990;DP=218;Dels=0.00;FS=1.178;HaplotypeScore=5.5860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.709;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,68:218:99:1255,0,3113 chrIX 268278 . C G 6348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.719;DP=265;Dels=0.00;FS=4.130;HaplotypeScore=12.3363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=23.95;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-2.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,263:264:99:6348,684,0 chrIX 268399 . A G 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.217;DP=235;Dels=0.00;FS=1.112;HaplotypeScore=7.1200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.356;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,70:235:99:989,0,3533 chrIX 268466 . G T 7694.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;DP=303;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4702;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=25.39;ReadPosRankSum=1.652;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,302:303:99:7694,799,0 chrIX 268483 . G C 3810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.632;DP=289;Dels=0.00;FS=3.198;HaplotypeScore=3.2270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,193:289:99:3810,0,1553 chrIX 268526 . A G 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.585;DP=256;Dels=0.00;FS=3.744;HaplotypeScore=3.8198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=1.808;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.120;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,81:256:99:1334,0,3709 chrIX 268542 . A G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.218;DP=214;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.664;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,67:214:99:1153,0,3192 chrIX 268579 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.946;DP=225;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=6.4808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,73:225:99:1255,0,3413 chrIX 268690 . A G 6222.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;DP=254;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=3.7796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=1.705;QD=24.50;ReadPosRankSum=1.486;SB=-3.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,253:254:99:6222,687,0 chrIX 268813 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.938;DP=241;Dels=0.00;FS=2.392;HaplotypeScore=6.4367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.689;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,72:241:99:1164,0,3711 chrIX 268864 . C T 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.214;DP=186;Dels=0.00;FS=2.671;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.792;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,73:186:99:1400,0,2198 chrIX 268909 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.349;DP=215;Dels=0.00;FS=10.939;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=6.33;ReadPosRankSum=2.258;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,77:215:99:1392,0,2864 chrIX 269136 . G A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.031;DP=225;Dels=0.00;FS=2.435;HaplotypeScore=7.8298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=0.777;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.211;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,74:224:99:1304,0,3105 chrIX 269349 . C T 3732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.577;DP=272;Dels=0.00;FS=5.010;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=13.72;ReadPosRankSum=2.297;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,171:272:99:3732,0,1766 chrIX 269376 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;DP=246;Dels=0.00;FS=9.536;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.191;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,87:246:99:1569,0,3311 chrIX 269523 . C T 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;DP=219;Dels=0.00;FS=1.865;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.439;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,59:219:99:893,0,3481 chrIX 269580 . T C 3300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.251;DP=254;Dels=0.01;FS=0.998;HaplotypeScore=15.3721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.986;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,158:252:99:3300,0,1848 chrIX 269763 . C G 4355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=20.94;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:208:99:4355,498,0 chrIX 269793 . C T 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.073;DP=236;Dels=0.00;FS=4.626;HaplotypeScore=5.9392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.299;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,58:236:99:848,0,3700 chrIX 269835 . C T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.045;DP=247;Dels=0.00;FS=7.438;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.811;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,69:247:99:1110,0,3658 chrIX 269976 . T C 5875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=235;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.00;SB=-2.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,235:235:99:5875,615,0 chrIX 270121 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.485;DP=262;Dels=0.00;FS=6.868;HaplotypeScore=2.7932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.399;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,70:262:99:1112,0,4048 chrIX 270435 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.857;DP=240;Dels=0.00;FS=4.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.334;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,83:240:99:1357,0,3358 chrIX 270588 . C A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.784;DP=176;Dels=0.00;FS=0.566;HaplotypeScore=3.5593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=7.06;ReadPosRankSum=-1.022;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,68:176:99:1273,0,2323 chrIX 270694 . T A 651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.663;DP=163;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.423;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,60:163:99:681,0,2276 chrIX 270915 . C A 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.991;DP=181;Dels=0.00;FS=21.876;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.356;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,62:181:99:1113,0,2538 chrIX 270968 . T A 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.556;DP=166;Dels=0.00;FS=17.035;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.119;QD=5.31;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,58:166:99:911,0,2362 chrIX 270969 . A C 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.828;DP=165;Dels=0.00;FS=17.012;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.834;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,58:165:99:973,0,2308 chrIX 271009 . T C 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.495;DP=186;Dels=0.00;FS=4.475;HaplotypeScore=6.5330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.837;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,67:186:99:1133,0,2627 chrIX 271273 . T C 5362.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6855;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=25.29;SB=-2.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5362,555,0 chrIX 271274 . T C 1024.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.586;DP=222;Dels=0.00;FS=3.246;HaplotypeScore=5.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.088;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,72:222:99:1054,0,3326 chrIX 271280 . T C 1155.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.549;DP=229;Dels=0.00;FS=3.215;HaplotypeScore=5.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.571;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,75:229:99:1185,0,3423 chrIX 271484 . T C 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.556;DP=174;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.231;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.945;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,60:174:99:919,0,2562 chrIX 271556 . T C 2376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.459;DP=181;Dels=0.00;FS=5.534;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.961;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,115:181:99:2406,0,1201 chrIX 271960 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.027;DP=189;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=2.3924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=1;MQRankSum=0.143;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,65:188:99:1092,0,2670 chrIX 272006 . T C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.665;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,67:183:99:1210,0,2467 chrIX 272078 . C T 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.221;DP=137;Dels=0.00;FS=4.453;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,44:137:99:784,0,1940 chrIX 272261 . T C 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.910;DP=146;Dels=0.00;FS=2.141;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.163;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,56:146:99:1019,0,2046 chrIX 272280 . A G 2015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.608;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=12.59;ReadPosRankSum=-1.829;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,105:160:99:2045,0,1098 chrIX 272369 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.818;DP=179;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.022;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,70:179:99:1298,0,2363 chrIX 272672 . C T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.115;DP=188;Dels=0.00;FS=4.617;HaplotypeScore=6.2813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.120;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,59:188:99:1025,0,2770 chrIX 273029 . T G 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.989;DP=187;Dels=0.00;FS=4.514;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.850;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.332;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,66:187:99:1095,0,2689 chrIX 273060 . G T 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.951;DP=189;Dels=0.00;FS=3.503;HaplotypeScore=6.3249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,67:189:99:1120,0,2566 chrIX 273183 . A C 4341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4341,465,0 chrIX 273224 . A G 2751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.732;DP=187;Dels=0.00;FS=4.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.357;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,129:187:99:2781,0,1015 chrIX 273263 . G A 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.959;DP=209;Dels=0.00;FS=10.270;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.746;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,61:209:99:1044,0,3261 chrIX 273420 . G A 1249.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.166;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.630;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,71:203:99:1279,0,2788 chrIX 273421 . C T 5235.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:5235,550,0 chrIX 273430 . A G 2560.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.240;DP=191;Dels=0.01;FS=2.698;HaplotypeScore=7.7171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=13.40;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,123:190:99:2590,0,1294 chrIX 273469 . G C 4854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4854,549,0 chrIX 273538 . G A 5653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.81;SB=-2.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:219:99:5653,577,0 chrIX 273547 . C T 5750.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.90;SB=-2.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,222:222:99:5750,571,0 chrIX 273624 . C T 4839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.44;SB=-2.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4839,507,0 chrIX 273676 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.895;DP=199;Dels=0.00;FS=0.554;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.360;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,72:199:99:1330,0,2690 chrIX 273888 . T G 4406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=24.89;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4406,477,0 chrIX 274009 . G A 4159.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.28;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:169:99:4159,438,0 chrIX 274203 . T C 5503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.24;SB=-2.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,218:218:99:5503,591,0 chrIX 274263 . T C 4847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.24;SB=-2.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:4847,519,0 chrIX 274306 . A G 3047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.004;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,146:221:99:3077,0,1424 chrIX 274413 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.674;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.535;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,67:194:99:1257,0,2658 chrIX 274516 . C T 4821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4821,478,0 chrIX 274816 . C T 2774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.366;DP=195;Dels=0.00;FS=4.316;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,127:195:99:2804,0,1247 chrIX 274830 . G A 2949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.550;DP=210;Dels=0.00;FS=6.041;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,135:210:99:2979,0,1364 chrIX 274972 . A G 4690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.81;SB=-2.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4690,501,0 chrIX 275112 . T C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.694;DP=233;Dels=0.00;FS=5.996;HaplotypeScore=2.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=4.26;ReadPosRankSum=-1.420;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,70:232:99:1022,0,3643 chrIX 275129 . A G 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.472;DP=240;Dels=0.00;FS=7.817;HaplotypeScore=3.8863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.037;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,76:240:99:1050,0,3677 chrIX 275131 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.244;DP=257;Dels=0.00;FS=7.452;HaplotypeScore=2.8969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.507;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,81:257:99:1197,0,3917 chrIX 275192 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.091;DP=201;Dels=0.00;FS=5.032;HaplotypeScore=4.9283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,79:201:99:1443,0,2434 chrIX 275372 . A G 4393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4393,489,0 chrIX 275399 . C A 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.384;DP=203;Dels=0.00;FS=1.230;HaplotypeScore=6.3184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.153;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,57:203:99:889,0,3125 chrIX 275507 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.411;DP=201;Dels=0.00;FS=3.465;HaplotypeScore=6.4101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.365;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,65:201:99:1191,0,2906 chrIX 275789 . C T 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.922;DP=186;Dels=0.00;FS=6.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,61:186:99:830,0,2692 chrIX 275972 . A G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.089;DP=210;Dels=0.00;FS=5.372;HaplotypeScore=6.4748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.878;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.001;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,62:210:99:986,0,3192 chrIX 276080 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.382;DP=225;Dels=0.00;FS=6.917;HaplotypeScore=4.9388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.928;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.919;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,73:225:99:1261,0,3103 chrIX 276104 . T C 3398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.520;DP=227;Dels=0.00;FS=14.607;HaplotypeScore=10.6424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=0.436;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,162:227:99:3398,0,1083 chrIX 276321 . T A 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;DP=212;Dels=0.00;FS=2.607;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.920;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,70:212:99:1247,0,3013 chrIX 276447 . A G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.529;DP=206;Dels=0.00;FS=1.175;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,68:206:99:1148,0,3190 chrIX 276483 . T C 2519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.891;DP=173;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,125:173:99:2549,0,830 chrIX 276611 . C T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.525;DP=199;Dels=0.00;FS=5.493;HaplotypeScore=4.6970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.124;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,74:199:99:1366,0,2540 chrIX 276744 . T C 2873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.266;DP=201;Dels=0.00;FS=6.695;HaplotypeScore=4.4433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,138:201:99:2903,0,1080 chrIX 276826 . G A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.214;DP=195;Dels=0.00;FS=4.633;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.622;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.573;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,61:195:99:997,0,2900 chrIX 276932 . C T 3156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.380;DP=209;Dels=0.00;FS=1.170;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,144:209:99:3186,0,1029 chrIX 277223 . G A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.604;DP=218;Dels=0.00;FS=1.095;HaplotypeScore=68.2033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=6.71;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,79:218:99:1492,0,2930 chrIX 277232 . C T 3476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.983;DP=229;Dels=0.00;FS=9.309;HaplotypeScore=68.1782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=15.18;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,156:229:99:3476,0,1247 chrIX 277347 . T C 2492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.105;DP=178;Dels=0.00;FS=4.628;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.088;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,116:178:99:2522,0,1100 chrIX 277526 . T C 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.315;DP=196;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=7.1766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=3.44;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,54:196:99:704,0,3280 chrIX 277591 . A T 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.117;DP=201;Dels=0.00;FS=0.815;HaplotypeScore=3.2003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQ0=0;MQRankSum=2.293;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.024;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,62:201:99:891,0,3209 chrIX 277596 . T C 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.246;DP=206;Dels=0.00;FS=1.717;HaplotypeScore=2.5352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,64:206:99:921,0,3348 chrIX 277669 . C G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;DP=175;Dels=0.00;FS=1.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.755;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,63:175:99:1171,0,2321 chrIX 277716 . C A 1933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,96:152:99:1963,0,1013 chrIX 277761 . A C 4339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.67;SB=-2.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4339,477,0 chrIX 277905 . C A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.943;DP=228;Dels=0.00;FS=4.154;HaplotypeScore=2.6420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.765;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.391;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,75:228:99:1275,0,3207 chrIX 278148 . G C 4418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:185:99:4418,495,0 chrIX 278157 . T A 4698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4698,493,0 chrIX 278242 . C T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.686;DP=168;Dels=0.00;FS=2.070;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.236;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,53:168:99:905,0,2480 chrIX 278276 . G A 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.479;DP=147;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,42:147:99:651,0,2285 chrIX 278371 . G A 4242.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4242,447,0 chrIX 278374 . G C 651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.222;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,45:161:99:681,0,2499 chrIX 278518 . T C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.070;DP=208;Dels=0.00;FS=1.122;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.627;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,75:208:99:1293,0,2963 chrIX 278568 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.618;DP=214;Dels=0.00;FS=1.925;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.674;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,70:214:99:1255,0,3187 chrIX 278878 . G A 5042.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.34;SB=-2.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:5042,528,0 chrIX 278890 . A G 4883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.91;SB=-2.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4883,504,0 chrIX 278998 . G A 2176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.316;DP=155;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=3.9447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.642;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.874;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,98:155:99:2206,0,1004 chrIX 279154 . T C 2595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.081;DP=184;Dels=0.00;FS=1.235;HaplotypeScore=6.1969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,124:184:99:2625,0,1041 chrIX 279163 . T C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.996;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.3812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=4.89;ReadPosRankSum=1.175;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,62:201:99:1012,0,3129 chrIX 279199 . C T 4623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.26;SB=-2.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4623,475,0 chrIX 279277 . C T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.259;DP=197;Dels=0.00;FS=3.430;HaplotypeScore=3.3705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.035;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,68:197:99:1240,0,2625 chrIX 279316 . T C 3219.08 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.884;DP=236;Dels=0.00;FS=3.869;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=13.64;ReadPosRankSum=-1.645;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,155:236:99:3249,0,1544 chrIX 279526 . T C 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3774,411,0 chrIX 279602 . A G 4472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4472,480,0 chrIX 279700 . T A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;DP=172;Dels=0.00;FS=10.580;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.537;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,57:172:99:1031,0,2539 chrIX 280080 . T G 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.789;DP=147;Dels=0.00;FS=3.271;HaplotypeScore=3.8897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.126;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,56:147:99:954,0,1977 chrIX 280264 . C T 2462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.159;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.834;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,116:189:99:2492,0,1371 chrIX 280331 . T C 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.753;DP=162;Dels=0.00;FS=2.428;HaplotypeScore=3.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.325;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,51:162:99:875,0,2563 chrIX 280479 . T C 1970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.578;DP=143;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=2.4694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,94:143:99:2000,0,898 chrIX 280761 . T C 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.347;DP=208;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,59:208:99:864,0,3336 chrIX 280877 . A G 4730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.38;SB=-2.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4730,516,0 chrIX 280907 . C T 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.628;DP=168;Dels=0.00;FS=2.145;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,49:168:99:820,0,2398 chrIX 281033 . C T 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.200;DP=166;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,50:166:99:862,0,2489 chrIX 281171 . C T 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.369;DP=133;Dels=0.00;FS=11.405;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.422;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,48:133:99:857,0,1711 chrIX 281282 . T G 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;DP=198;Dels=0.00;FS=2.783;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=1;MQRankSum=-1.707;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,62:197:99:974,0,2938 chrIX 281719 . C T 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.022;DP=216;Dels=0.00;FS=6.761;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.361;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,85:216:99:1645,0,2610 chrIX 281795 . T C 4968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.09;SB=-2.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:4968,510,0 chrIX 281888 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.967;DP=194;Dels=0.00;FS=2.733;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=5.25;ReadPosRankSum=2.830;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,64:194:99:1049,0,2908 chrIX 281969 . G A 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.814;DP=212;Dels=0.00;FS=1.172;HaplotypeScore=7.8061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.544;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,65:212:99:1091,0,3076 chrIX 282020 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.218;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=6.16;ReadPosRankSum=-1.484;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,62:186:99:1176,0,2566 chrIX 282224 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.186;DP=188;Dels=0.00;FS=2.818;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=6.68;ReadPosRankSum=1.454;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,71:188:99:1286,0,2557 chrIX 282436 . C T 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.348;DP=187;Dels=0.00;FS=2.971;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.108;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,57:187:99:826,0,2903 chrIX 282578 . A G 2296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.930;DP=184;Dels=0.00;FS=1.177;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=12.48;ReadPosRankSum=-1.042;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,112:184:99:2326,0,1400 chrIX 282798 . A G 2726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.949;DP=197;Dels=0.00;FS=4.473;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.516;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,133:197:99:2756,0,1183 chrIX 283114 . T C 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.471;DP=173;Dels=0.00;FS=0.813;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=0.855;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.237;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,48:173:99:749,0,2809 chrIX 283346 . C T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.457;DP=201;Dels=0.00;FS=7.140;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=7.45;ReadPosRankSum=2.411;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,77:201:99:1527,0,2675 chrIX 283369 . C T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.005;DP=187;Dels=0.00;FS=3.555;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.442;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,70:187:99:1368,0,2485 chrIX 283390 . A T 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.239;DP=208;Dels=0.00;FS=7.115;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=6.98;ReadPosRankSum=-2.678;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,78:208:99:1482,0,2862 chrIX 283475 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.226;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.643;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,70:185:99:1189,0,2578 chrIX 283496 . T C 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.019;DP=180;Dels=0.00;FS=1.990;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.524;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,64:180:99:1026,0,2586 chrIX 283497 . C T 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.118;DP=175;Dels=0.00;FS=3.816;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,61:175:99:1038,0,2423 chrIX 283758 . T A 2304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.748;DP=165;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.297;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,106:165:99:2334,0,1159 chrIX 283770 . T C 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.689;DP=169;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=51.5927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,55:169:99:820,0,2570 chrIX 283774 . T C 2151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.506;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=103.2045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,108:170:99:2181,0,1229 chrIX 283803 . A C 2449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.949;DP=186;Dels=0.00;FS=1.224;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,125:186:99:2479,0,1158 chrIX 283818 . G T 2330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.169;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.068;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,113:161:99:2360,0,850 chrIX 283856 . T C 2203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.059;DP=146;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=2.8771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.240;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,109:146:99:2233,0,591 chrIX 283914 . G A 2455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.687;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.456;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,111:160:99:2485,0,733 chrIX 284092 . A G 2326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.600;DP=179;Dels=0.00;FS=1.199;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.688;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.141;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,113:179:99:2356,0,1155 chrIX 284112 . T C 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.863;DP=174;Dels=0.00;FS=7.178;HaplotypeScore=6.6995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.776;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.010;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,57:174:99:938,0,2643 chrIX 284253 . C T 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.305;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=2.547;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.044;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,50:166:99:773,0,2468 chrIX 284273 . T C 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.752;DP=163;Dels=0.00;FS=6.291;HaplotypeScore=8.9040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.106;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,50:163:99:827,0,2472 chrIX 284292 . G A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.205;DP=177;Dels=0.00;FS=5.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,59:177:99:1031,0,2622 chrIX 284368 . G C 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.306;DP=163;Dels=0.00;FS=3.902;HaplotypeScore=3.4307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.616;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,54:163:99:955,0,2287 chrIX 284579 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.029;DP=190;Dels=0.00;FS=0.545;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=6.87;ReadPosRankSum=2.368;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,73:190:99:1335,0,2474 chrIX 284643 . C T 5146.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5146,520,0 chrIX 284715 . A G 572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.008;DP=199;Dels=0.00;FS=4.882;HaplotypeScore=2.9077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,51:199:99:602,0,3239 chrIX 284725 . G T 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.506;DP=207;Dels=0.00;FS=3.824;HaplotypeScore=4.2187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,52:207:99:696,0,3340 chrIX 284729 . G T 548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.549;DP=199;Dels=0.00;FS=2.151;HaplotypeScore=14.3513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.767;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,45:199:99:578,0,3333 chrIX 284868 . G T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.958;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.547;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,66:209:99:1179,0,3038 chrIX 285060 . T A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;DP=168;Dels=0.00;FS=8.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=7.51;ReadPosRankSum=-1.889;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,68:168:99:1291,0,2187 chrIX 285202 . A G 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.446;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=51.1525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.315;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,55:161:99:914,0,2430 chrIX 285218 . C T 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.464;DP=158;Dels=0.00;FS=2.153;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,58:158:99:1074,0,2027 chrIX 285229 . A C 988.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;DP=154;Dels=0.00;FS=2.251;HaplotypeScore=47.3423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,55:154:99:1018,0,2186 chrIX 285231 . C T 920.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.049;DP=154;Dels=0.00;FS=2.281;HaplotypeScore=47.3423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.465;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,52:154:99:950,0,2162 chrIX 285235 . G A 904.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.597;DP=154;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=46.3529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.900;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,51:154:99:934,0,2272 chrIX 285236 . T A 905.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;DP=153;Dels=0.00;FS=3.275;HaplotypeScore=45.3613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=5.92;ReadPosRankSum=2.076;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,51:153:99:935,0,2328 chrIX 285322 . G A 2569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.133;DP=174;Dels=0.00;FS=11.531;HaplotypeScore=52.4852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.968;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,116:174:99:2599,0,1052 chrIX 285324 . A G 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.016;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=53.4799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.261;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,53:175:99:784,0,2810 chrIX 285376 . C T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.376;DP=184;Dels=0.00;FS=3.767;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,65:184:99:1184,0,2567 chrIX 285394 . C G 2534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;DP=162;Dels=0.00;FS=1.465;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.211;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,115:162:99:2564,0,745 chrIX 285457 . C G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;DP=209;Dels=0.00;FS=8.086;HaplotypeScore=6.3529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=1;MQRankSum=2.203;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.383;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,59:209:99:929,0,3214 chrIX 285492 . C T 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.705;DP=169;Dels=0.00;FS=2.212;HaplotypeScore=3.4540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=0.030;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,56:169:99:921,0,2494 chrIX 285554 . A G 4318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4318,462,0 chrIX 285572 . T C 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.810;DP=190;Dels=0.00;FS=9.555;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,63:190:99:1074,0,2904 chrIX 285709 . A G 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.614;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.212;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,56:197:99:879,0,3167 chrIX 285783 . G A 4595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4595,492,0 chrIX 285848 . C T 506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.523;DP=163;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=2.8706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.690;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,43:163:99:536,0,2544 chrIX 285874 . G A 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.681;DP=165;Dels=0.00;FS=3.017;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.174;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,52:165:99:838,0,2457 chrIX 285890 . T G 18.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.155;DP=128;Dels=0.00;FS=128.429;HaplotypeScore=2.5238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=0.14;ReadPosRankSum=-3.957;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,41:128:48:48,0,1705 chrIX 285902 . A G 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.531;DP=124;Dels=0.00;FS=3.467;HaplotypeScore=4.2471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.603;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,44:124:99:701,0,1814 chrIX 285920 . T C 1885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.447;DP=148;Dels=0.00;FS=5.305;HaplotypeScore=6.5106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=2.112;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,95:148:99:1915,0,921 chrIX 285923 . C G 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;DP=143;Dels=0.00;FS=5.434;HaplotypeScore=6.5106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,90:143:99:1749,0,887 chrIX 286108 . G A 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.122;DP=197;Dels=0.00;FS=1.218;HaplotypeScore=2.2368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.191;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,61:197:99:1050,0,2924 chrIX 286125 . T C 2545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.310;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.475;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,123:194:99:2575,0,1390 chrIX 286132 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.642;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,73:194:99:1270,0,2607 chrIX 286178 . C T 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.649;DP=183;Dels=0.00;FS=2.004;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,58:183:99:934,0,2712 chrIX 286189 . C A 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.635;DP=195;Dels=0.00;FS=2.551;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.873;QD=8.12;ReadPosRankSum=-2.025;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,81:195:99:1613,0,2293 chrIX 286316 . C T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.099;DP=179;Dels=0.00;FS=3.881;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=4.89;ReadPosRankSum=-1.327;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,55:179:99:905,0,2553 chrIX 286346 . G A 2343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.388;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.926;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,108:166:99:2373,0,1041 chrIX 286569 . C T 534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.379;DP=153;Dels=0.00;FS=5.498;HaplotypeScore=6.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.873;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,44:153:99:564,0,1982 chrIX 286680 . G A 2524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.654;DP=199;Dels=0.00;FS=3.475;HaplotypeScore=3.6381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,133:199:99:2554,0,946 chrIX 286696 . G A 2424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.463;DP=178;Dels=0.00;FS=2.789;HaplotypeScore=2.7741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,115:178:99:2454,0,1151 chrIX 286810 . G A 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.209;DP=124;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.5186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.013;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.018;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,76:124:99:1607,0,910 chrIX 286869 . C T 2201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.733;DP=155;Dels=0.00;FS=5.101;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.725;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,102:155:99:2231,0,957 chrIX 287126 . T C 1932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=130;Dels=0.00;FS=4.124;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,89:130:99:1962,0,722 chrIX 287156 . A G 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.040;DP=121;Dels=0.00;FS=4.832;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,86:121:99:1707,0,626 chrIX 287429 . A G 2714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.092;DP=206;Dels=0.00;FS=7.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=1;MQRankSum=1.465;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.412;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,130:206:99:2744,0,1355 chrIX 287904 . T C 3163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.641;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,146:210:99:3193,0,1106 chrIX 287980 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.181;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=5.65;ReadPosRankSum=-2.040;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,74:202:99:1172,0,2906 chrIX 288084 . C T 2020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.980;DP=195;Dels=0.00;FS=1.780;HaplotypeScore=3.6638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.091;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,113:195:99:2050,0,1529 chrIX 288099 . T A 2074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.723;DP=199;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,116:199:99:2104,0,1561 chrIX 288210 . C G 2352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;DP=179;Dels=0.00;FS=1.948;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.135;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,115:179:99:2382,0,1090 chrIX 288567 . A G 3006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.630;DP=198;Dels=0.00;FS=2.126;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,137:198:99:3036,0,1104 chrIX 288825 . A G 4229.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=22.14;ReadPosRankSum=-1.331;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,189:191:99:4229,459,0 chrIX 289127 . C T 4589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.970e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4589,457,0 chrIX 289162 . T A 2756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;DP=184;Dels=0.00;FS=6.079;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.560;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,127:184:99:2786,0,1014 chrIX 289409 . G A 2984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.311;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=2.060;QD=15.30;ReadPosRankSum=-2.453;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,134:194:99:3014,0,1023 chrIX 289540 . G A 3783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.821;DP=242;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.178;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.212;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,171:242:99:3783,0,1187 chrIX 289593 . G T 2732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.814;DP=189;Dels=0.00;FS=0.559;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,123:189:99:2762,0,1182 chrIX 289643 . G A 3088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.191;DP=220;Dels=0.00;FS=5.913;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,145:220:99:3118,0,1333 chrIX 289999 . A C 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.558;DP=241;Dels=0.00;FS=3.971;HaplotypeScore=4.7734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,72:241:99:1150,0,3791 chrIX 290108 . G C 2877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;DP=191;Dels=0.00;FS=1.267;HaplotypeScore=3.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.389;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,133:191:99:2907,0,946 chrIX 290288 . G A 2972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.177;DP=205;Dels=0.00;FS=8.488;HaplotypeScore=3.8086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.108;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,134:205:99:3002,0,1261 chrIX 290346 . G T 3057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.105;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=13.96;ReadPosRankSum=-1.362;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,141:219:99:3087,0,1444 chrIX 290536 . C T 2922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.877;DP=224;Dels=0.00;FS=4.960;HaplotypeScore=9.3272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=13.04;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,148:224:99:2952,0,1305 chrIX 290668 . A G 2630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.353;DP=196;Dels=0.00;FS=1.841;HaplotypeScore=5.0538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,128:196:99:2660,0,1289 chrIX 290902 . G A 2661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.608;DP=194;Dels=0.00;FS=8.841;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.569;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,126:194:99:2691,0,1146 chrIX 290956 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.242;DP=201;Dels=0.00;FS=1.143;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=3.122;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.751;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,72:201:99:1380,0,2725 chrIX 291694 . G A 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.557;DP=205;Dels=0.00;FS=5.313;HaplotypeScore=5.0635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.162;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,64:205:99:1047,0,2993 chrIX 291981 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.628;DP=211;Dels=0.00;FS=2.058;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.147;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,66:211:99:1176,0,2967 chrIX 292353 . A C 4533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=200;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=22.67;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:4533,507,0 chrIX 292835 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.649;DP=213;Dels=0.00;FS=2.487;HaplotypeScore=5.6142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,73:213:99:1168,0,3140 chrIX 293849 . C G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;DP=192;Dels=0.00;FS=0.553;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.860;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,72:192:99:1286,0,2460 chrIX 294956 . A G 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.788;DP=159;Dels=0.00;FS=7.679;HaplotypeScore=8.5934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.362;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,56:159:99:923,0,2212 chrIX 295261 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.025;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.3742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.734;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,68:218:99:1123,0,3238 chrIX 296453 . T A 4293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.40;SB=-2.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4293,427,0 chrIX 296620 . C T 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.829;DP=191;Dels=0.00;FS=3.682;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,59:191:99:1043,0,2698 chrIX 296757 . T C 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.694;DP=210;Dels=0.00;FS=1.189;HaplotypeScore=2.7165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=1;MQRankSum=1.611;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,61:210:99:977,0,3288 chrIX 297683 . G A 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.140;DP=166;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.399;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,51:166:99:825,0,2469 chrIX 297783 . C T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.297;DP=173;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.098;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,59:173:99:1033,0,2389 chrIX 298465 . C A 2574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.065;DP=176;Dels=0.00;FS=5.860;HaplotypeScore=3.7538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.316;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,120:176:99:2604,0,973 chrIX 298747 . G A 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.457;DP=160;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,61:160:99:1056,0,2061 chrIX 298798 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.577;DP=179;Dels=0.00;FS=4.558;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,66:179:99:1257,0,2409 chrIX 298867 . G A 2799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.742;DP=193;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=2.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,129:193:99:2829,0,1091 chrIX 299044 . T C 2186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.502;DP=178;Dels=0.00;FS=4.467;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,108:178:99:2216,0,1246 chrIX 299047 . G A 2306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.233;DP=178;Dels=0.00;FS=4.446;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,108:178:99:2336,0,1192 chrIX 299287 . T A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.700;DP=207;Dels=0.00;FS=11.940;HaplotypeScore=7.8073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.065;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,69:207:99:1226,0,3084 chrIX 299898 . T G 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.763;DP=152;Dels=0.00;FS=423.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=5.73;ReadPosRankSum=-10.096;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:901,0,1287 chrIX 299901 . C G 102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;DP=113;Dels=0.00;FS=223.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=0.90;ReadPosRankSum=-7.673;SB=-3.008e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,34:113:99:132,0,1418 chrIX 300209 . T A 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.351;DP=162;Dels=0.00;FS=5.181;HaplotypeScore=3.6315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.082;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,55:162:99:1046,0,2261 chrIX 300210 . T A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;DP=162;Dels=0.00;FS=5.181;HaplotypeScore=3.6315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.877;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,55:162:99:1014,0,2258 chrIX 300325 . T A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.723;DP=187;Dels=0.00;FS=0.568;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.620;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,63:187:99:1110,0,2704 chrIX 300371 . T C 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.513;DP=135;Dels=0.00;FS=3.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.345;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,44:135:99:733,0,2039 chrIX 300482 . G A 76.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.669;DP=184;Dels=0.00;FS=70.641;HaplotypeScore=86.6533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.97;MQ0=1;MQRankSum=-7.493;QD=0.41;ReadPosRankSum=-3.487;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,53:184:99:106,0,2343 chrIX 300510 . T C 24.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.343;DP=161;Dels=0.00;FS=33.569;HaplotypeScore=45.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.401;QD=0.15;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,21:161:54:54,0,2377 chrIX 300511 . C A 576.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.652;DP=162;Dels=0.00;FS=43.946;HaplotypeScore=45.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.18;MQ0=1;MQRankSum=-6.712;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,74:162:99:606,0,1821 chrIX 300519 . C T 227.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.630;DP=150;Dels=0.00;FS=120.996;HaplotypeScore=21.6028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.12;MQ0=1;MQRankSum=-5.565;QD=1.51;ReadPosRankSum=1.500;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,52:150:99:257,0,1968 chrIX 300524 . T A 385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;DP=150;Dels=0.00;FS=44.146;HaplotypeScore=24.1150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.38;MQ0=1;MQRankSum=-7.584;QD=2.57;ReadPosRankSum=2.680;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,61:150:99:415,0,1886 chrIX 300532 . T A 299.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;DP=149;Dels=0.00;FS=100.919;HaplotypeScore=31.8246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.83;MQ0=1;MQRankSum=-5.607;QD=2.01;ReadPosRankSum=2.442;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,51:149:99:329,0,1938 chrIX 300536 . T C 297.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.180;DP=165;Dels=0.00;FS=101.059;HaplotypeScore=31.8448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.84;MQ0=1;MQRankSum=-6.097;QD=1.80;ReadPosRankSum=2.189;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,54:165:99:327,0,2368 chrIX 300538 . T C 338.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.213;DP=167;Dels=0.00;FS=104.608;HaplotypeScore=31.8448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.07;MQ0=1;MQRankSum=-6.327;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.668;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,56:167:99:368,0,2376 chrIX 300544 . T C 627.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.027;DP=179;Dels=0.00;FS=32.134;HaplotypeScore=23.2110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.26;MQ0=0;MQRankSum=-7.426;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.621;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,71:179:99:657,0,2295 chrIX 300591 . C A 558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.487;DP=180;Dels=0.00;FS=16.369;HaplotypeScore=21.9571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.35;MQ0=0;MQRankSum=-4.662;QD=3.10;ReadPosRankSum=-3.909;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,44:180:99:588,0,2886 chrIX 300610 . T C 126.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.219;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.318;QD=0.69;ReadPosRankSum=-1.754;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,27:182:99:156,0,3396 chrIX 300611 . T C 109.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.629;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.512;QD=0.60;ReadPosRankSum=-1.900;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,27:182:99:139,0,3390 chrIX 300615 . T C 157.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.598;DP=184;Dels=0.00;FS=0.785;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.29;MQ0=0;MQRankSum=-6.568;QD=0.85;ReadPosRankSum=-1.083;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,29:184:99:187,0,3291 chrIX 300617 . T C 159.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.587;DP=185;Dels=0.00;FS=0.788;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQ0=0;MQRankSum=-6.267;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,29:185:99:189,0,3383 chrIX 300655 . T C 1996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.446;DP=175;Dels=0.00;FS=14.104;HaplotypeScore=4.2334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.68;MQ0=0;MQRankSum=4.180;QD=11.41;ReadPosRankSum=-2.421;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,103:175:99:2026,0,1324 chrIX 301525 . C T 575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.659;DP=143;Dels=0.00;FS=3.421;HaplotypeScore=2.5476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=4.02;ReadPosRankSum=-1.364;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,38:143:99:605,0,2280 chrIX 301548 . T A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;DP=154;Dels=0.00;FS=3.824;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.771;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,64:154:99:1219,0,1900 chrIX 301652 . T C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.495;DP=175;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=6.9213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.060;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,56:175:99:986,0,2638 chrIX 301883 . A G 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.422;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,92:136:99:1824,0,803 chrIX 301893 . T C 1975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.501;DP=143;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,98:143:99:2005,0,805 chrIX 301894 . C T 1998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.462;DP=143;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.758;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,98:143:99:2028,0,714 chrIX 301970 . T A 2196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;DP=145;Dels=0.00;FS=2.486;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.724;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,98:145:99:2226,0,858 chrIX 301993 . T G 2472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.525;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=14.89;ReadPosRankSum=-2.114;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,114:166:99:2502,0,911 chrIX 302007 . C G 2436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;DP=178;Dels=0.00;FS=9.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=13.69;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,120:178:99:2466,0,973 chrIX 302019 . A G 2396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.893;DP=176;Dels=0.00;FS=9.839;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,119:176:99:2426,0,1030 chrIX 302126 . C T 2741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.937;DP=184;Dels=0.00;FS=1.349;HaplotypeScore=3.0169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,131:184:99:2771,0,815 chrIX 302140 . C T 2850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.315;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,130:188:99:2880,0,892 chrIX 302223 . C T 2238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.943;DP=170;Dels=0.00;FS=2.768;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=3.058;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,104:170:99:2268,0,1228 chrIX 302272 . G C 2203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;DP=177;Dels=0.00;FS=2.003;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.186;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,112:177:99:2233,0,1136 chrIX 302275 . C T 2474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.373;DP=184;Dels=0.00;FS=1.224;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.340;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,117:184:99:2504,0,1211 chrIX 302298 . A C 2338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.556;DP=173;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=6.9344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.718;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,117:173:99:2368,0,1037 chrIX 302411 . A T 2543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.811;DP=196;Dels=0.00;FS=14.552;HaplotypeScore=3.3760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.982;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,129:196:99:2573,0,1209 chrIX 302472 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.434;DP=168;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=8.6338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=6.44;ReadPosRankSum=-3.445;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,114:168:99:1112,0,1016 chrIX 302650 . G C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;DP=212;Dels=0.00;FS=1.216;HaplotypeScore=2.9615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,73:212:99:1238,0,2940 chrIX 302670 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.659;DP=209;Dels=0.00;FS=2.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=0.976;QD=6.77;ReadPosRankSum=1.702;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,79:209:99:1445,0,2792 chrIX 302871 . T G 2503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.711;DP=196;Dels=0.00;FS=10.557;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.638;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,122:196:99:2533,0,1425 chrIX 303220 . C T 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.715;DP=204;Dels=0.00;FS=6.553;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=4.57;ReadPosRankSum=2.261;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,61:204:99:962,0,3168 chrIX 303266 . T C 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.237;DP=194;Dels=0.00;FS=3.972;HaplotypeScore=3.5345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.218;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,54:194:99:804,0,3057 chrIX 303276 . C T 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.612;DP=185;Dels=0.00;FS=2.157;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.731;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,56:185:99:980,0,2872 chrIX 303292 . A G 2863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.754;DP=193;Dels=0.00;FS=7.141;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=14.83;ReadPosRankSum=-1.677;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,133:193:99:2893,0,1015 chrIX 303361 . A G 2628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.735;DP=186;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=4.4889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,131:186:99:2658,0,844 chrIX 303435 . A G 2941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;DP=189;Dels=0.00;FS=3.767;HaplotypeScore=2.6779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,135:189:99:2971,0,841 chrIX 303507 . G C 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,56:181:99:935,0,2732 chrIX 303690 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.852;DP=191;Dels=0.00;FS=0.554;HaplotypeScore=2.6871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,69:191:99:1260,0,2770 chrIX 304133 . G C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;DP=141;Dels=0.00;FS=2.201;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1230,0,1554 chrIX 304231 . C G 3768.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3768,387,0 chrIX 304371 . C G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;DP=186;Dels=0.00;FS=1.930;HaplotypeScore=4.4334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=5.81;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,63:186:99:1111,0,2564 chrIX 304393 . G A 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.841;DP=212;Dels=0.00;FS=5.135;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.00;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,71:212:99:1302,0,2978 chrIX 304473 . T C 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.922;DP=192;Dels=0.00;FS=4.985;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,51:192:99:828,0,3280 chrIX 304586 . A G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.045;DP=190;Dels=0.00;FS=2.701;HaplotypeScore=3.5227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.645;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,63:189:99:1115,0,2660 chrIX 305089 . T C 2458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.788;DP=162;Dels=0.00;FS=4.052;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.252;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,111:162:99:2488,0,864 chrIX 305101 . T G 2533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;DP=166;Dels=0.00;FS=5.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,113:166:99:2563,0,886 chrIX 305143 . T A 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;DP=206;Dels=0.00;FS=1.124;HaplotypeScore=6.6040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.087;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,77:206:99:1430,0,2676 chrIX 305568 . T C 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.063;DP=167;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=5.11;ReadPosRankSum=2.315;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,50:167:99:884,0,2656 chrIX 305620 . A G 1984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.315;DP=136;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.473;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,93:136:99:2014,0,820 chrIX 305776 . T C 3014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.371;DP=233;Dels=0.00;FS=1.753;HaplotypeScore=4.1821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.421;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,152:233:99:3044,0,1471 chrIX 305977 . A T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;DP=204;Dels=0.00;FS=6.738;HaplotypeScore=4.4272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.934;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,62:204:99:1014,0,3145 chrIX 306037 . C A 5299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=25.60;SB=-2.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5299,535,0 chrIX 306076 . T C 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.816;DP=194;Dels=0.00;FS=8.114;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.108;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,57:194:99:881,0,3145 chrIX 306387 . G A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.909;DP=171;Dels=0.00;FS=1.248;HaplotypeScore=3.4448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.369;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,61:171:99:1136,0,2328 chrIX 306403 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.896;DP=172;Dels=0.00;FS=1.260;HaplotypeScore=4.6087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,63:172:99:1134,0,2293 chrIX 306481 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.136;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=2;MQRankSum=0.497;QD=5.79;ReadPosRankSum=2.087;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,64:187:99:1113,0,2609 chrIX 306523 . A G 4400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.72;SB=-2.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4400,486,0 chrIX 306994 . T C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.573;DP=174;Dels=0.00;FS=2.802;HaplotypeScore=2.3665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.743;QD=5.32;ReadPosRankSum=-2.155;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,60:174:99:956,0,2528 chrIX 307120 . A G 3432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.498;DP=214;Dels=0.00;FS=1.208;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.637;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,159:214:99:3432,0,845 chrIX 307231 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=162;Dels=0.00;FS=2.962;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.467;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,61:162:99:1175,0,2046 chrIX 307321 . A G 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.131;DP=152;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.730;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,51:152:99:871,0,2203 chrIX 307366 . G A 2368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.170;DP=157;Dels=0.00;FS=9.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.126;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,112:157:99:2398,0,662 chrIX 307639 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.380;DP=200;Dels=0.00;FS=1.137;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.370;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,73:200:99:1442,0,2667 chrIX 307735 . G A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.594;DP=185;Dels=0.00;FS=0.564;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,68:185:99:1291,0,2501 chrIX 307741 . A G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.936;DP=192;Dels=0.00;FS=1.202;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.443;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,67:192:99:1107,0,2727 chrIX 307779 . T G 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;DP=219;Dels=0.00;FS=6.459;HaplotypeScore=6.7060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.817;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,62:218:99:1042,0,3383 chrIX 307880 . A G 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.907;DP=179;Dels=0.00;FS=4.590;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=6.24;ReadPosRankSum=1.905;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,62:179:99:1147,0,2529 chrIX 307943 . G A 2815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.131;DP=188;Dels=0.00;FS=3.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.343;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,129:188:99:2845,0,955 chrIX 307976 . A C 2920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;DP=193;Dels=0.00;FS=2.728;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.762;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,134:193:99:2950,0,1030 chrIX 308091 . T C 3342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.716;DP=235;Dels=0.00;FS=3.304;HaplotypeScore=3.8211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.701;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,159:235:99:3342,0,1369 chrIX 308167 . G A 3553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.916;DP=240;Dels=0.00;FS=0.537;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.143;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,158:240:99:3553,0,1410 chrIX 308369 . C T 2804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.232;DP=188;Dels=0.00;FS=1.244;HaplotypeScore=8.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,128:188:99:2834,0,969 chrIX 308383 . C T 3140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.009;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,146:210:99:3170,0,1037 chrIX 308815 . C A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.900;DP=233;Dels=0.00;FS=0.501;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.947;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,84:233:99:1482,0,2956 chrIX 308852 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.972;DP=218;Dels=0.00;FS=0.531;HaplotypeScore=2.2019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.142;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,71:218:99:1204,0,3125 chrIX 308908 . G A 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.170;DP=245;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=1;MQRankSum=0.996;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.293;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,83:245:99:1577,0,3364 chrIX 309123 . A T 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;DP=265;Dels=0.00;FS=4.406;HaplotypeScore=6.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,89:265:99:1610,0,3711 chrIX 309998 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.845;DP=204;Dels=0.00;FS=3.313;HaplotypeScore=3.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=6.65;ReadPosRankSum=2.759;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,74:204:99:1387,0,2630 chrIX 310160 . T C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.642;DP=238;Dels=0.00;FS=0.510;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,76:238:99:1266,0,3621 chrIX 310171 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.480;DP=225;Dels=0.00;FS=1.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=3.269;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.104;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,74:225:99:1263,0,3339 chrIX 310223 . A G 4800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8911;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:4800,546,0 chrIX 310226 . G A 5295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,203:203:99:5295,567,0 chrIX 310286 . G T 3766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.136;DP=254;Dels=0.00;FS=4.715;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=0.537;QD=14.83;ReadPosRankSum=-1.402;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,174:254:99:3766,0,1304 chrIX 310383 . G T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;DP=227;Dels=0.00;FS=3.343;HaplotypeScore=2.7922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=5.09;ReadPosRankSum=2.662;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,74:227:99:1185,0,3260 chrIX 310412 . G C 5882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.62;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5882,636,0 chrIX 310533 . G A 518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.620;DP=156;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=2.4607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.340;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,49:156:99:548,0,1952 chrIX 310545 . T C 578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.577;DP=158;Dels=0.01;FS=3.218;HaplotypeScore=76.5515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=3.66;ReadPosRankSum=-1.438;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,47:156:99:608,0,2134 chrIX 310546 . A G 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.718;DP=158;Dels=0.01;FS=6.376;HaplotypeScore=76.5515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.376;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,56:156:99:976,0,1747 chrIX 310570 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.232;DP=168;Dels=0.00;FS=9.650;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.733;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,60:168:99:1176,0,2084 chrIX 310623 . G T 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.171;DP=185;Dels=0.00;FS=4.877;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.656;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,56:185:99:980,0,2703 chrIX 310671 . A G 2300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.653;DP=159;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,113:159:99:2330,0,814 chrIX 310732 . T G 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=23.72;ReadPosRankSum=1.124;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3534,384,0 chrIX 310769 . G A 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:155:99:3845,411,0 chrIX 310807 . C T 2408.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.347;DP=151;Dels=0.00;FS=0.926;HaplotypeScore=84.1637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.999;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,109:151:99:2438,0,588 chrIX 310815 . G C 590.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.385;DP=161;Dels=0.00;FS=1.946;HaplotypeScore=87.1485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=3.66;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,45:161:99:620,0,2574 chrIX 310816 . A T 1012.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.822;DP=166;Dels=0.00;FS=4.201;HaplotypeScore=87.1485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.881;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,57:166:99:1042,0,2354 chrIX 310874 . A G 4300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.75;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4300,465,0 chrIX 310895 . A G 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.703;DP=200;Dels=0.00;FS=13.848;HaplotypeScore=6.2225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=6.27;ReadPosRankSum=-1.078;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,78:200:99:1283,0,2575 chrIX 310945 . G T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.485;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,74:206:99:1306,0,2558 chrIX 311139 . T C 4960.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=74.3472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=22.96;SB=-2.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:4960,516,0 chrIX 311141 . C T 1180.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.190;DP=219;Dels=0.00;FS=0.525;HaplotypeScore=73.4461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,73:219:99:1210,0,2962 chrIX 311143 . G A 2854.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.594;DP=218;Dels=0.00;FS=0.525;HaplotypeScore=71.5855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.357;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,143:217:99:2884,0,1209 chrIX 311178 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.971;DP=245;Dels=0.00;FS=1.057;HaplotypeScore=5.8251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.915;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,84:245:99:1462,0,3252 chrIX 311272 . C T 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.032;DP=254;Dels=0.00;FS=3.165;HaplotypeScore=3.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=0.038;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,85:254:99:1533,0,3409 chrIX 311461 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.717;DP=239;Dels=0.00;FS=9.506;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.966;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,66:239:99:1128,0,3831 chrIX 311489 . C T 3341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.539;DP=211;Dels=0.00;FS=7.498;HaplotypeScore=4.7796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=15.83;ReadPosRankSum=1.250;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,147:211:99:3341,0,1092 chrIX 311518 . T C 3096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.407;DP=223;Dels=0.00;FS=3.234;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.456;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,152:223:99:3126,0,1214 chrIX 311545 . A G 5375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5375,585,0 chrIX 311839 . C T 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=208;Dels=0.00;FS=2.014;HaplotypeScore=5.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,51:208:99:715,0,3370 chrIX 311953 . T G 2554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;DP=192;Dels=0.00;FS=6.389;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.250;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,124:192:99:2584,0,1194 chrIX 312013 . C T 2488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.556;DP=170;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=14.64;ReadPosRankSum=1.047;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,119:170:99:2518,0,764 chrIX 312025 . A G 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.718;DP=168;Dels=0.00;FS=2.127;HaplotypeScore=47.0079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.838;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,57:168:99:984,0,2413 chrIX 312034 . C T 2867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.468;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=55.6982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.072;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,133:185:99:2897,0,737 chrIX 312474 . A G 2257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.921;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=1;MQRankSum=0.505;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.274;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,110:180:99:2287,0,1331 chrIX 312591 . A T 3775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.696;DP=263;Dels=0.00;FS=13.975;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.837;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,171:263:99:3775,0,1713 chrIX 312613 . A T 3318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;DP=242;Dels=0.00;FS=6.439;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.194;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,155:242:99:3318,0,1629 chrIX 313552 . T C 2979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.526;DP=216;Dels=0.00;FS=2.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.268;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,148:216:99:3009,0,1176 chrIX 313841 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.739;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,62:197:99:980,0,2927 chrIX 313898 . G A 3919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.117;DP=245;Dels=0.00;FS=2.494;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,178:245:99:3919,0,1018 chrIX 314131 . T C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.800;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.645;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,75:229:99:1310,0,3475 chrIX 314695 . T C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.150;DP=256;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=3.5036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.093;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,80:256:99:1291,0,3843 chrIX 314742 . T C 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.479;DP=255;Dels=0.00;FS=3.931;HaplotypeScore=2.8082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,85:255:99:1431,0,3760 chrIX 314767 . A T 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.515;DP=248;Dels=0.00;FS=4.041;HaplotypeScore=3.7336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=7.06;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,95:248:99:1782,0,3419 chrIX 314838 . C T 2556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.939;DP=320;Dels=0.00;FS=5.101;HaplotypeScore=7.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.234;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,133:320:99:2586,0,3826 chrIX 315075 . C G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;DP=215;Dels=0.00;FS=3.463;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=5.49;ReadPosRankSum=-2.384;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,72:215:99:1210,0,3091 chrIX 315079 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.180;DP=212;Dels=0.00;FS=4.462;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.714;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,68:212:99:1138,0,3246 chrIX 315261 . C G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;DP=228;Dels=0.00;FS=11.917;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=1;MQRankSum=0.417;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,73:228:99:1247,0,3336 chrIX 315279 . G A 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.290;DP=211;Dels=0.00;FS=11.324;HaplotypeScore=7.1762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.304;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.420;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,67:211:99:1037,0,3197 chrIX 315641 . T C 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.076;DP=240;Dels=0.00;FS=4.006;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.503;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,91:240:99:1603,0,3105 chrIX 315783 . C T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.896;DP=180;Dels=0.00;FS=7.994;HaplotypeScore=3.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=7.17;ReadPosRankSum=-1.398;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,69:180:99:1321,0,2388 chrIX 315806 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.571;DP=218;Dels=0.00;FS=9.253;HaplotypeScore=4.4263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.651;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.640;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,80:218:99:1455,0,3038 chrIX 315831 . G C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.731;DP=208;Dels=0.00;FS=3.409;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.948;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,74:208:99:1274,0,2698 chrIX 315884 . A G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.477;DP=219;Dels=0.00;FS=1.109;HaplotypeScore=2.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.833;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,72:219:99:1160,0,3254 chrIX 315923 . T C 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.629;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.053;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,51:183:99:760,0,2937 chrIX 315969 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.474;DP=240;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.565;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,75:240:99:1288,0,3511 chrIX 316019 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.146;DP=234;Dels=0.00;FS=9.124;HaplotypeScore=6.3564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=2.375;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.644;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,78:234:99:1317,0,3457 chrIX 316046 . A G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.388;DP=242;Dels=0.00;FS=5.620;HaplotypeScore=4.8118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=5.63;ReadPosRankSum=2.133;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,81:242:99:1392,0,3497 chrIX 316055 . A C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.063;DP=240;Dels=0.00;FS=13.476;HaplotypeScore=7.5801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.985;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,77:240:99:1291,0,3631 chrIX 316151 . G A 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.387;DP=183;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=-1.085;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,55:183:99:961,0,2794 chrIX 316207 . C T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.240;DP=191;Dels=0.00;FS=5.396;HaplotypeScore=6.7440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.756;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,64:191:99:1158,0,2677 chrIX 316244 . A T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.724;DP=244;Dels=0.00;FS=15.127;HaplotypeScore=2.9257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.080;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,70:244:99:1202,0,3881 chrIX 316351 . A T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.166;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,81:213:99:1553,0,2879 chrIX 316369 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.338;DP=194;Dels=0.00;FS=1.166;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.347;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,70:194:99:1259,0,2812 chrIX 316450 . C T 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.813;DP=247;Dels=0.00;FS=1.601;HaplotypeScore=6.4004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=6.29;ReadPosRankSum=-2.779;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,88:247:99:1584,0,3282 chrIX 316577 . G C 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;DP=274;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=4.9654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.170;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,82:274:99:1379,0,4139 chrIX 316645 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.159;DP=253;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=4.5411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=5.92;ReadPosRankSum=2.767;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,88:253:99:1529,0,3650 chrIX 316715 . A T 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;DP=215;Dels=0.00;FS=5.280;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=1;MQRankSum=0.606;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.057;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,64:215:99:1065,0,3420 chrIX 316929 . G C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;DP=215;Dels=0.00;FS=1.157;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.940;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.201;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,64:215:99:1059,0,3135 chrIX 316998 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.285;DP=224;Dels=0.00;FS=5.934;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.669;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,75:224:99:1418,0,3255 chrIX 317012 . A C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;DP=216;Dels=0.00;FS=10.586;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.246;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,77:216:99:1402,0,3070 chrIX 317056 . C T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.816;DP=199;Dels=0.00;FS=10.468;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.128;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,80:199:99:1526,0,2520 chrIX 317065 . T G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.459;DP=176;Dels=0.00;FS=3.099;HaplotypeScore=3.5549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.092;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.210;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,68:176:99:1188,0,2491 chrIX 317145 . C T 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.910;DP=223;Dels=0.00;FS=8.135;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=6.85;ReadPosRankSum=-2.101;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,83:223:99:1557,0,2842 chrIX 317443 . A G 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.953;DP=215;Dels=0.00;FS=2.503;HaplotypeScore=4.6332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.82;MQ0=3;MQRankSum=-2.225;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.632;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,73:215:99:1229,0,3094 chrIX 318063 . A G 428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.180;DP=118;Dels=0.00;FS=2.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.869;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,32:118:99:458,0,1950 chrIX 318065 . A T 467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;DP=115;Dels=0.00;FS=2.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.796;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,32:115:99:497,0,1912 chrIX 318078 . T C 459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.168;DP=133;Dels=0.00;FS=4.711;HaplotypeScore=4.9242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=3.45;ReadPosRankSum=1.172;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,37:133:99:489,0,2153 chrIX 318129 . C T 515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.312;DP=152;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.566;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,45:152:99:545,0,2458 chrIX 318185 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.628;DP=197;Dels=0.00;FS=4.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=6.29;ReadPosRankSum=2.890;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,72:197:99:1269,0,2685 chrIX 318254 . C T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.464;DP=209;Dels=0.00;FS=5.164;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,71:209:99:1252,0,2829 chrIX 318288 . C T 2869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.712;DP=204;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,133:204:99:2899,0,1246 chrIX 318344 . A C 591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.957;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=1;MQRankSum=-1.461;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.474;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,49:183:99:621,0,2870 chrIX 318368 . A G 518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=188;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=1;MQRankSum=0.350;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,46:188:99:548,0,3114 chrIX 318383 . C G 460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;DP=186;Dels=0.00;FS=2.230;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=1;MQRankSum=-1.701;QD=2.47;ReadPosRankSum=-2.661;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,45:186:99:490,0,2937 chrIX 318392 . A G 530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.273;DP=195;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=3.3920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.292;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.577;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,48:195:99:560,0,3347 chrIX 318395 . G A 611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.009;DP=192;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=3.3920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=1;MQRankSum=-0.846;QD=3.18;ReadPosRankSum=-2.220;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,47:192:99:641,0,2976 chrIX 318650 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.552;DP=193;Dels=0.00;FS=6.725;HaplotypeScore=5.3290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,59:193:99:1095,0,2910 chrIX 318694 . T A 4983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4983,511,0 chrIX 319106 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.647;DP=239;Dels=0.00;FS=4.921;HaplotypeScore=4.6452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=4.97;ReadPosRankSum=2.164;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,73:239:99:1217,0,3568 chrIX 319127 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.932;DP=225;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.916;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,75:225:99:1310,0,3150 chrIX 319209 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.580;DP=226;Dels=0.00;FS=0.529;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.067;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,73:226:99:1245,0,3358 chrIX 319670 . C T 2016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.218;DP=142;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.099;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,93:142:99:2046,0,884 chrIX 320609 . T C 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3554,384,0 chrIX 320712 . T C 6640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=257;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,257:257:99:6640,729,0 chrIX 320919 . G A 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.164;DP=172;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=3.5869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.150;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,57:172:99:879,0,2530 chrIX 321421 . A G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.178;DP=170;Dels=0.00;FS=2.818;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.771;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,61:170:99:1156,0,2352 chrIX 322035 . G A 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.824;DP=133;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.453;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:1094,0,1510 chrIX 322077 . G C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;DP=212;Dels=0.00;FS=10.562;HaplotypeScore=3.8645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.341;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,80:212:99:1303,0,2759 chrIX 322202 . T C 2723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.214;DP=191;Dels=0.00;FS=4.364;HaplotypeScore=61.6745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,128:191:99:2753,0,1095 chrIX 322207 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.132;DP=226;Dels=0.00;FS=8.683;HaplotypeScore=61.6745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.197;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,77:226:99:1435,0,3227 chrIX 322347 . T A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;DP=164;Dels=0.00;FS=1.263;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.777;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,65:164:99:1285,0,2131 chrIX 322437 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.363;DP=190;Dels=0.00;FS=2.103;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.501;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,64:190:99:1180,0,2740 chrIX 322476 . C T 2741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.809;DP=196;Dels=0.00;FS=2.692;HaplotypeScore=9.4047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.574;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,127:196:99:2771,0,1109 chrIX 322503 . G A 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.597;DP=183;Dels=0.00;FS=7.203;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.927;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,59:183:99:1047,0,2524 chrIX 322620 . T C 2178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.355;DP=163;Dels=0.00;FS=3.099;HaplotypeScore=6.8985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.458;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,106:163:99:2208,0,1037 chrIX 322623 . T C 2005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.212;DP=160;Dels=0.00;FS=3.165;HaplotypeScore=6.8985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.122;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,105:160:99:2035,0,958 chrIX 322665 . T C 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.649;DP=151;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,51:151:99:893,0,2147 chrIX 323343 . T C 2174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.854;DP=159;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=2.4805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.328;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,106:159:99:2204,0,1005 chrIX 323487 . A C 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.737;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.334;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,48:166:99:801,0,2639 chrIX 323727 . C A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.486;DP=190;Dels=0.00;FS=1.232;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.521;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,62:190:99:1102,0,2671 chrIX 323807 . G A 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.174;DP=202;Dels=0.00;FS=14.858;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.518;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.944;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,67:202:99:1190,0,2959 chrIX 323829 . C T 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.122;DP=203;Dels=0.00;FS=9.849;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=1;MQRankSum=-0.076;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.278;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,68:203:99:1213,0,2762 chrIX 323883 . A G 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.692;DP=198;Dels=0.00;FS=3.726;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.599;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,65:198:99:1096,0,2815 chrIX 323885 . A G 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;DP=199;Dels=0.00;FS=6.896;HaplotypeScore=6.8905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.249;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,67:199:99:1242,0,2785 chrIX 323976 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.677;DP=196;Dels=0.00;FS=2.060;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,63:196:99:1022,0,2925 chrIX 324268 . T C 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.278;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=2.167;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.247;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,50:126:99:898,0,1604 chrIX 324378 . T C 553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.667;DP=134;Dels=0.00;FS=25.872;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.72;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=4.13;ReadPosRankSum=3.208;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,39:134:99:583,0,2001 chrIX 324390 . T C 1649.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.522;DP=121;Dels=0.00;FS=16.483;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=13.63;ReadPosRankSum=-4.931;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,84:121:99:1679,0,573 chrIX 324395 . G T 577.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.157;DP=121;Dels=0.00;FS=10.977;HaplotypeScore=4.9400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.11;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=4.77;ReadPosRankSum=4.129;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,39:121:99:607,0,1593 chrIX 324400 . T A 717.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.711;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:747,0,872 chrIX 324408 . C G 1829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.62;MQ0=0;QD=21.02;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:87:99:1862,204,0 chrIX 324424 . C A 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.749;DP=92;Dels=0.00;FS=1.707;HaplotypeScore=4.9531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQ0=0;MQRankSum=2.247;QD=8.78;ReadPosRankSum=3.232;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:838,0,923 chrIX 324521 . A C 518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.782;DP=83;Dels=0.00;FS=15.132;HaplotypeScore=4.9487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=1;MQRankSum=-2.134;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.290;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:548,0,1021 chrIX 324536 . G A 328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;DP=65;Dels=0.00;FS=7.226;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.52;MQ0=1;MQRankSum=-3.484;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:358,0,833 chrIX 324559 . A G 1358 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.48;MQ0=0;QD=23.02;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1391,147,0 chrIX 324573 . T C 352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.867;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.822;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:382,0,802 chrIX 324597 . C T 1665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;DP=70;Dels=0.00;FS=5.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=23.79;ReadPosRankSum=1.386;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:1698,177,0 chrIX 324627 . G T 521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.755;DP=61;Dels=0.00;FS=2.154;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.97;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.394;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:551,0,604 chrIX 325047 . C T 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.02;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2789,279,0 chrIX 325080 . T C 627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.002;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQ0=0;MQRankSum=-3.492;QD=6.03;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:657,0,1418 chrIX 325081 . C T 631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.634;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQ0=0;MQRankSum=-3.399;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.402;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,41:105:99:661,0,1369 chrIX 325112 . A C 612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.686;DP=98;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.023;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,37:98:99:642,0,1328 chrIX 325145 . C T 637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.376;DP=98;Dels=0.00;FS=4.125;HaplotypeScore=3.9477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.260;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,35:98:99:667,0,1331 chrIX 325265 . A C 274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.327;DP=79;Dels=0.00;FS=16.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:304,0,1291 chrIX 325450 . C T 2605 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4778;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=25.29;ReadPosRankSum=1.429;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2638,282,0 chrIX 325723 . T A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.080;DP=107;Dels=0.00;FS=2.489;HaplotypeScore=6.7656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.577;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1214,0,1030 chrIX 325738 . T G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;DP=132;Dels=0.00;FS=22.216;HaplotypeScore=23.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=1.946;QD=8.73;ReadPosRankSum=2.386;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1182,0,1021 chrIX 325886 . A G 312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.015;DP=137;Dels=0.00;FS=5.243;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=2.28;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,28:137:99:342,0,2536 chrIX 326005 . G T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.857;DP=158;Dels=0.00;FS=9.048;HaplotypeScore=2.7200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.947;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.416;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,56:158:99:1072,0,2079 chrIX 326195 . C G 2083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;DP=151;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=1;MQRankSum=2.020;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.534;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,103:151:99:2113,0,775 chrIX 326249 . A G 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.44;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3540,405,0 chrIX 326294 . C A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.461;DP=177;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.736;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,65:177:99:1126,0,2314 chrIX 326329 . C T 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.907;DP=157;Dels=0.00;FS=4.062;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=5.08;ReadPosRankSum=1.385;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,48:157:99:827,0,2350 chrIX 326411 . G T 2912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.286;DP=203;Dels=0.00;FS=19.987;HaplotypeScore=3.7024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.740;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,133:203:99:2942,0,1169 chrIX 326540 . A G 2474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.829;DP=176;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,117:176:99:2504,0,1106 chrIX 326570 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.957;DP=168;Dels=0.00;FS=6.967;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,63:168:99:1134,0,2340 chrIX 326595 . A C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.810;DP=196;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,71:196:99:1306,0,2805 chrIX 326669 . G A 2093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.438;DP=160;Dels=0.00;FS=1.322;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,101:160:99:2123,0,1074 chrIX 326760 . T C 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.334;DP=172;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=4.95;ReadPosRankSum=-1.770;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,58:172:99:881,0,2530 chrIX 326778 . T C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.581;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,57:170:99:915,0,2429 chrIX 326875 . T C 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.595;DP=149;Dels=0.00;FS=1.358;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,51:149:99:898,0,2179 chrIX 327148 . C T 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.113;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.712;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,66:205:99:952,0,2953 chrIX 327164 . C A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.073;DP=215;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.571;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,85:215:99:1624,0,2634 chrIX 327320 . C T 2659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.519;DP=180;Dels=0.00;FS=4.747;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=14.77;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,124:180:99:2689,0,875 chrIX 327359 . A G 620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.413;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,42:152:99:650,0,2460 chrIX 327407 . T G 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.059;DP=202;Dels=0.00;FS=9.136;HaplotypeScore=2.4809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.583;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,62:202:99:926,0,3126 chrIX 327518 . C T 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.749;DP=181;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=4.6000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=4.98;ReadPosRankSum=-1.093;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,55:181:99:932,0,2715 chrIX 327797 . C T 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.609;DP=272;Dels=0.00;FS=0.470;HaplotypeScore=5.7509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,90:272:99:1635,0,3724 chrIX 328162 . T C 2379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.311;DP=194;Dels=0.00;FS=1.873;HaplotypeScore=1.9621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.942;QD=12.26;ReadPosRankSum=3.472;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,116:194:99:2409,0,1536 chrIX 328167 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.403;DP=204;Dels=0.00;FS=0.551;HaplotypeScore=2.5151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=6.94;ReadPosRankSum=-2.035;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,76:204:99:1445,0,2594 chrIX 328196 . C T 3101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.478;DP=222;Dels=0.00;FS=1.178;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.568;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,144:222:99:3131,0,1407 chrIX 328390 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.684;DP=243;Dels=0.00;FS=0.540;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.694;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,85:243:99:1529,0,3353 chrIX 328453 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.363;DP=216;Dels=0.00;FS=9.791;HaplotypeScore=7.4646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=5.81;ReadPosRankSum=-1.787;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,71:216:99:1286,0,3013 chrIX 328585 . T C 2262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.524;DP=194;Dels=0.00;FS=2.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.830;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,114:194:99:2292,0,1544 chrIX 329074 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.617;DP=197;Dels=0.00;FS=1.804;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,72:197:99:1308,0,2680 chrIX 329134 . T A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;DP=223;Dels=0.00;FS=10.297;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.082;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,78:223:99:1444,0,3095 chrIX 329523 . C T 683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.295;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,46:178:99:713,0,2684 chrIX 329599 . G A 5035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3495;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.36;SB=-2.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:5035,508,0 chrIX 329647 . A G 5196.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.47;SB=-2.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,204:204:99:5196,585,0 chrIX 329898 . C T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.709;DP=210;Dels=0.00;FS=3.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=1;MQRankSum=0.087;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.205;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,68:210:99:1202,0,2919 chrIX 330361 . G A 2773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.642;DP=190;Dels=0.00;FS=1.977;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=14.59;ReadPosRankSum=-2.945;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,128:190:99:2803,0,1016 chrIX 330697 . A G 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.107;DP=220;Dels=0.00;FS=0.499;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,93:220:99:1738,0,2707 chrIX 331384 . A G 2873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.703;DP=205;Dels=0.00;FS=16.540;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,137:205:99:2903,0,1190 chrIX 331437 . C T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.271;DP=170;Dels=0.00;FS=3.817;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,60:170:99:1082,0,2389 chrIX 331927 . A G 2608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.786;DP=185;Dels=0.00;FS=2.772;HaplotypeScore=2.5566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,126:185:99:2638,0,1104 chrIX 332173 . A G 3046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.502;DP=220;Dels=0.00;FS=7.366;HaplotypeScore=4.7265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.576;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,150:220:99:3076,0,1168 chrIX 332248 . C T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.498;DP=198;Dels=0.00;FS=4.600;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.592;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,68:198:99:1281,0,2680 chrIX 332459 . C T 4031.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4031,424,0 chrIX 332503 . C G 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.360;DP=181;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.269;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,56:181:99:928,0,2606 chrIX 332541 . A G 3226.07 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.281;DP=230;Dels=0.00;FS=1.279;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,154:230:99:3256,0,1370 chrIX 332714 . G A 2913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.288;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.369;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,139:202:99:2943,0,995 chrIX 332795 . G A 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.725;DP=155;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.551;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,47:155:99:787,0,2361 chrIX 332947 . C A 2467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.647;DP=168;Dels=0.00;FS=13.670;HaplotypeScore=2.7570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.904;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,116:168:99:2497,0,841 chrIX 333073 . A C 1912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.024;DP=147;Dels=0.00;FS=3.101;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.699;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,95:147:99:1942,0,1016 chrIX 333088 . G A 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.665;DP=139;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,48:139:99:908,0,1871 chrIX 333345 . T C 5037.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=23.76;SB=-2.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5037,528,0 chrIX 333452 . G A 2445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.669;DP=175;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,116:175:99:2475,0,954 chrIX 333801 . A G 2619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.831;DP=196;Dels=0.00;FS=1.206;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,127:196:99:2649,0,1207 chrIX 333924 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.833;DP=202;Dels=0.00;FS=1.152;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.787;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,70:202:99:1328,0,2816 chrIX 333942 . T C 5383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=24.92;SB=-2.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,215:216:99:5383,570,0 chrIX 334061 . A G 2263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.771;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.970;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,116:180:99:2293,0,1180 chrIX 334096 . A T 3275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;DP=218;Dels=0.00;FS=6.092;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,146:218:99:3275,0,1254 chrIX 334155 . T A 2307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.360;DP=182;Dels=0.00;FS=17.168;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.157;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,109:182:99:2337,0,1289 chrIX 334173 . T C 444.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.929;DP=164;Dels=0.00;FS=14.657;HaplotypeScore=77.1852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.657;QD=2.71;ReadPosRankSum=-3.376;SB=-4.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,39:164:99:474,0,2650 chrIX 334176 . T C 108.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.846;DP=166;Dels=0.00;FS=23.611;HaplotypeScore=72.2238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=0.65;ReadPosRankSum=-2.897;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,33:166:99:138,0,2714 chrIX 334179 . T C 463.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.269;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=67.3948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,36:137:99:493,0,1928 chrIX 334188 . T A 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;DP=112;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=37.6573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=-5.543;QD=5.29;ReadPosRankSum=-4.082;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:622,0,1330 chrIX 334194 . C T 98.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.138;DP=120;Dels=0.00;FS=2.224;HaplotypeScore=37.5066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-4.576;QD=0.82;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,17:120:99:128,0,1903 chrIX 334200 . A T 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=31.3069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=4.469;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.992;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,82:114:99:1759,0,194 chrIX 334221 . T A 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;DP=143;Dels=0.00;FS=6.260;HaplotypeScore=3.9212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.124;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:892,0,1710 chrIX 334383 . T C 314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.909;DP=194;Dels=0.00;FS=3.466;HaplotypeScore=145.3162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.03;MQ0=0;MQRankSum=-3.250;QD=1.62;ReadPosRankSum=-3.986;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,39:194:99:344,0,2057 chrIX 334640 . T C 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.955;DP=159;Dels=0.00;FS=3.154;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.829;QD=4.75;ReadPosRankSum=2.754;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,47:159:99:786,0,2513 chrIX 334696 . T C 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.978;DP=186;Dels=0.00;FS=7.178;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,59:186:99:935,0,2902 chrIX 334734 . C A 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.278;DP=142;Dels=0.00;FS=3.238;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.355;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,45:142:99:856,0,2084 chrIX 334764 . G A 3016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.433;DP=209;Dels=0.00;FS=3.383;HaplotypeScore=13.8328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=14.43;ReadPosRankSum=2.226;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,141:208:99:3046,0,1193 chrIX 334815 . T C 2807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.803;DP=203;Dels=0.00;FS=5.584;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,135:203:99:2837,0,1214 chrIX 334877 . A G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.239;DP=190;Dels=0.00;FS=0.564;HaplotypeScore=6.1497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=2.324;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,64:190:99:1142,0,2838 chrIX 334906 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.185;DP=197;Dels=0.00;FS=7.480;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.174;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,65:197:99:1152,0,2976 chrIX 334919 . T C 5221.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:210:99:5221,537,0 chrIX 334989 . G A 2475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.258;DP=182;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.569;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,121:182:99:2505,0,1074 chrIX 335001 . G A 4505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4505,474,0 chrIX 335022 . T A 4516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.81;SB=-2.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4516,480,0 chrIX 335035 . C A 5422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.45;SB=-2.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:5422,565,0 chrIX 335052 . A G 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.302;DP=191;Dels=0.00;FS=1.221;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.418;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,59:191:99:864,0,3004 chrIX 335079 . C G 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.395;DP=202;Dels=0.00;FS=1.193;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=4.26;ReadPosRankSum=-1.704;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,63:202:99:891,0,2958 chrIX 335322 . G T 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.573;DP=174;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.116;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,58:174:99:1028,0,2546 chrIX 335344 . C T 2743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.394;DP=184;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,125:184:99:2773,0,1047 chrIX 335376 . C T 2367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.768;DP=156;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,106:156:99:2397,0,802 chrIX 335541 . C T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.133;DP=184;Dels=0.00;FS=2.904;HaplotypeScore=2.4441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.907;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,60:184:99:1095,0,2544 chrIX 335555 . T A 2480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.449;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.143;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,119:189:99:2510,0,1323 chrIX 335581 . A T 2089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;DP=156;Dels=0.00;FS=2.132;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.517;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,96:156:99:2119,0,1201 chrIX 335743 . C T 3067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.967;DP=199;Dels=0.00;FS=1.924;HaplotypeScore=2.7635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,137:199:99:3097,0,1030 chrIX 335815 . A G 2507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.165;DP=184;Dels=0.00;FS=1.207;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,120:184:99:2537,0,1196 chrIX 335817 . T C 2437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.008;DP=188;Dels=0.00;FS=1.200;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,124:188:99:2467,0,1187 chrIX 336040 . G T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.389;DP=185;Dels=0.00;FS=2.873;HaplotypeScore=3.6445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=2.100;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.250;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,60:185:99:1007,0,2612 chrIX 336156 . T C 5334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.40;SB=-2.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,210:210:99:5334,573,0 chrIX 336197 . G A 2675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.462;DP=187;Dels=0.00;FS=5.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=14.30;ReadPosRankSum=1.292;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,122:187:99:2705,0,1144 chrIX 336223 . T C 3869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7656;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3869,420,0 chrIX 336248 . A G 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.139;DP=138;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.150;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,48:138:99:838,0,1935 chrIX 336289 . A G 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.144;DP=119;Dels=0.00;FS=2.716;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.060;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,86:119:99:1761,0,540 chrIX 336424 . G A 1919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.232;DP=141;Dels=0.00;FS=3.139;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.152;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,89:141:99:1949,0,927 chrIX 336464 . T A 1963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.004;DP=140;Dels=0.00;FS=15.237;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=14.02;ReadPosRankSum=-1.259;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,90:140:99:1993,0,977 chrIX 336486 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.971;DP=156;Dels=0.00;FS=15.189;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.014;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,56:156:99:1035,0,2091 chrIX 336519 . C G 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=22.78;SB=-2.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3782,405,0 chrIX 336595 . T G 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.080;DP=164;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,51:164:99:809,0,2661 chrIX 336672 . A G 2076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.200;DP=169;Dels=0.00;FS=1.999;HaplotypeScore=100.9600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQ0=0;MQRankSum=-3.570;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,108:169:99:2106,0,1093 chrIX 336673 . A C,G 3656.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=96.9868;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=54.08;MQ0=0;QD=22.02;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,58,105:166:99:3656,2337,2178,1320,0,1043 chrIX 336702 . C T 711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.826;DP=176;Dels=0.00;FS=2.084;HaplotypeScore=3.6036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQ0=0;MQRankSum=-4.231;QD=4.04;ReadPosRankSum=-1.519;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,51:176:99:741,0,2620 chrIX 336731 . T C 2309 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;DP=154;Dels=0.00;FS=3.959;HaplotypeScore=55.9400;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.955;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:154:99:2342,255,0 chrIX 336770 . G A 2745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.801;DP=193;Dels=0.00;FS=6.691;HaplotypeScore=3.4953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.493;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,130:192:99:2775,0,1007 chrIX 336869 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.336;DP=178;Dels=0.00;FS=8.515;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.174;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,64:178:99:1178,0,2547 chrIX 336989 . C T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.714;DP=188;Dels=0.00;FS=6.961;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.642;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,65:188:99:1147,0,2671 chrIX 337002 . G A 2641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.859;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.532;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,122:188:99:2671,0,1098 chrIX 337034 . G A 2613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.159;DP=178;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=5.5425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,118:178:99:2643,0,1060 chrIX 337083 . A T 5554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:208:99:5554,583,0 chrIX 337098 . A G 2702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.755;DP=189;Dels=0.00;FS=4.718;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,127:189:99:2732,0,1133 chrIX 337127 . C G 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;DP=182;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=2.7381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,58:182:99:956,0,2580 chrIX 337182 . G A 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.016;DP=147;Dels=0.00;FS=3.211;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,47:147:99:839,0,2127 chrIX 337219 . T G 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=133.3781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3754,411,0 chrIX 337321 . C A 4391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.38;SB=-2.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4391,462,0 chrIX 337390 . G A 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.158;DP=174;Dels=0.01;FS=4.089;HaplotypeScore=20.2632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.206;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,62:172:99:1078,0,2319 chrIX 337425 . G C 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;DP=170;Dels=0.00;FS=2.012;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=1;MQRankSum=-1.166;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.480;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,60:170:99:921,0,2357 chrIX 337478 . G A 2952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.311;DP=220;Dels=0.00;FS=2.388;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=0.405;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.338;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,138:220:99:2982,0,1434 chrIX 337519 . C T 2552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.211;DP=207;Dels=0.00;FS=4.204;HaplotypeScore=4.5510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=2;MQRankSum=0.136;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,127:207:99:2582,0,1466 chrIX 337589 . C A 2789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.308;DP=183;Dels=0.00;FS=10.066;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,124:183:99:2819,0,945 chrIX 337621 . C T 2779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.962;DP=192;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=8.1717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=14.47;ReadPosRankSum=1.560;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,129:192:99:2809,0,1039 chrIX 337721 . A G 2518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.373;DP=175;Dels=0.00;FS=10.097;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=14.39;ReadPosRankSum=2.268;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,115:175:99:2548,0,1149 chrIX 337799 . C G 5511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,229:229:99:5511,600,0 chrIX 337905 . T A 1356.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.242;DP=173;Dels=0.00;FS=1.941;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=0.177;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.054;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,71:173:99:1386,0,2199 chrIX 337914 . A T 1960.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;DP=162;Dels=0.00;FS=2.845;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=-1.521;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,96:162:99:1990,0,1325 chrIX 337915 . A T 1219.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.206;DP=157;Dels=0.00;FS=2.920;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=1.014;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.625;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,64:157:99:1249,0,2021 chrIX 337948 . T C 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3433,393,0 chrIX 337953 . A G 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.942;DP=142;Dels=0.00;FS=4.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=5.60;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,50:142:99:825,0,1983 chrIX 338032 . A G 2729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.046;DP=226;Dels=0.00;FS=1.177;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,140:226:99:2759,0,1630 chrIX 338050 . A G 5496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=134.9289;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,233:233:99:5496,582,0 chrIX 338323 . G A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.103;DP=171;Dels=0.00;FS=4.840;HaplotypeScore=3.7207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=5.54;ReadPosRankSum=-1.944;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,56:171:99:978,0,2360 chrIX 338491 . C T 2120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.458;DP=160;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.978;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,99:160:99:2150,0,1126 chrIX 338777 . C T 5439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2322;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.95;SB=-2.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,218:218:99:5439,550,0 chrIX 338798 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.853;DP=222;Dels=0.00;FS=8.327;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.089;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,73:222:99:1296,0,3188 chrIX 339251 . G T 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.804;DP=205;Dels=0.02;FS=448.993;HaplotypeScore=12.2059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=3;MQRankSum=0.281;QD=0.19;ReadPosRankSum=-8.957;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,57:201:69:69,0,872 chrIX 339383 . A G 3151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.269;DP=236;Dels=0.00;FS=4.744;HaplotypeScore=3.2880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,156:236:99:3181,0,1454 chrIX 339502 . T C 4589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:187:99:4589,513,0 chrIX 339595 . T C 5692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.75;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:5692,603,0 chrIX 340156 . G A 6035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:6035,640,0 chrIX 340345 . G A 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.163;DP=196;Dels=0.00;FS=3.086;HaplotypeScore=9.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=0.200;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.314;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,43:196:99:651,0,3286 chrIX 340540 . G A 2597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.050;DP=198;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=5.2942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=13.12;ReadPosRankSum=2.146;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,133:198:99:2627,0,1188 chrIX 340669 . T C 2247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.587;DP=161;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.299;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,111:161:99:2277,0,811 chrIX 340684 . T C 2557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.522;DP=188;Dels=0.00;FS=2.756;HaplotypeScore=3.3436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=13.60;ReadPosRankSum=2.774;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,127:188:99:2587,0,988 chrIX 340768 . T A 2740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.367;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,128:191:99:2770,0,1068 chrIX 340799 . G A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.855;DP=191;Dels=0.00;FS=2.024;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.229;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,56:191:99:978,0,2910 chrIX 340813 . C T 2894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.013;DP=186;Dels=0.00;FS=2.055;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.341;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,134:186:99:2924,0,867 chrIX 340927 . A C 4464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.22;SB=-2.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4464,471,0 chrIX 341117 . G T 2487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.337;DP=199;Dels=0.00;FS=12.365;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.726;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,117:199:99:2517,0,1510 chrIX 341215 . C A 2855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.885;DP=203;Dels=0.00;FS=0.538;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.186;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,132:203:99:2885,0,1262 chrIX 341299 . T C 2134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.087;DP=173;Dels=0.00;FS=5.664;HaplotypeScore=4.9056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,104:173:99:2164,0,1245 chrIX 341340 . T A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.081;DP=165;Dels=0.00;FS=3.878;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=6.62;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,61:165:99:1123,0,2401 chrIX 341341 . T A 2561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;DP=182;Dels=0.00;FS=5.865;HaplotypeScore=3.8037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.793;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.105;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,118:182:99:2591,0,1158 chrIX 341514 . T G 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;DP=168;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,62:168:99:938,0,2292 chrIX 341515 . G C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;DP=168;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,62:168:99:923,0,2261 chrIX 341595 . C A 4639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4639,480,0 chrIX 341662 . C T 4586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=21.43;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,214:214:99:4586,468,0 chrIX 341674 . C T 2883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.368;DP=188;Dels=0.00;FS=5.728;HaplotypeScore=2.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,133:188:99:2913,0,911 chrIX 341686 . T C 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.992;DP=216;Dels=0.00;FS=3.044;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.854;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,55:216:99:831,0,3581 chrIX 341700 . G A 5137.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:198:99:5137,532,0 chrIX 341777 . A C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.302;DP=203;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.242;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,65:203:99:1159,0,3149 chrIX 341828 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.394;DP=200;Dels=0.00;FS=2.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.125;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,75:200:99:1350,0,2715 chrIX 341838 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.370;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.044;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,75:193:99:1366,0,2668 chrIX 341987 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.142;DP=153;Dels=0.00;FS=3.947;HaplotypeScore=7.7612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.876;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,59:153:99:1171,0,1908 chrIX 342151 . C T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.199;DP=163;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=2.9664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.381;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,57:163:99:988,0,2302 chrIX 342194 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.215;DP=202;Dels=0.00;FS=8.789;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.640;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,69:202:99:1244,0,2814 chrIX 342312 . T A 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;DP=188;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=4.73;ReadPosRankSum=1.573;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,53:188:99:920,0,3036 chrIX 342470 . T A 867.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=144.8665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.653;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,52:159:99:897,0,2475 chrIX 342473 . C T 841.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.535;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=145.8532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.263;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,50:158:99:871,0,2310 chrIX 342478 . G A 790.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=160;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=138.8896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.942;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.037;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,48:160:99:820,0,2520 chrIX 342479 . C A 1051.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.904;DP=160;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=138.8896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,56:160:99:1081,0,2248 chrIX 343172 . T C 2922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.420;DP=196;Dels=0.00;FS=2.770;HaplotypeScore=69.3285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=14.91;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,137:196:99:2952,0,988 chrIX 343174 . A G 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.317;DP=206;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=73.0451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.59;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,69:206:99:1181,0,2897 chrIX 343482 . T C 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.938;DP=202;Dels=0.00;FS=3.594;HaplotypeScore=4.7435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.002;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,58:202:99:872,0,3218 chrIX 343776 . G A 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;DP=196;Dels=0.00;FS=7.352;HaplotypeScore=3.5956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,51:196:99:745,0,3191 chrIX 343874 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.726;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=4.94;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,70:216:99:1096,0,3165 chrIX 344094 . C T 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.879;DP=173;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.149;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,54:173:99:932,0,2461 chrIX 344344 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.505;DP=192;Dels=0.00;FS=4.469;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,66:192:99:1147,0,2703 chrIX 344740 . C A 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.670;DP=187;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=4.73;ReadPosRankSum=-2.062;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,55:187:99:914,0,2855 chrIX 345129 . G C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.206;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.548;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,72:210:99:1295,0,2915 chrIX 345192 . A C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.315;DP=205;Dels=0.00;FS=2.516;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.023;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,76:205:99:1402,0,2842 chrIX 345247 . A C 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.001;DP=159;Dels=0.00;FS=15.080;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.912;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,45:159:99:721,0,2471 chrIX 345363 . T A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;DP=228;Dels=0.00;FS=4.153;HaplotypeScore=2.6392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.960;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,71:228:99:1232,0,3477 chrIX 345656 . A C 2913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.856;DP=211;Dels=0.00;FS=0.560;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=13.81;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,142:211:99:2943,0,1206 chrIX 345705 . T C 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.461;DP=140;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.604;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,97:140:99:1657,0,628 chrIX 345745 . T C 2254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.692;DP=176;Dels=0.00;FS=3.072;HaplotypeScore=7.0841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,124:176:99:2284,0,714 chrIX 345871 . T C 2987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.823;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.127;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,144:213:99:3017,0,1206 chrIX 345893 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.794;DP=200;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,67:200:99:1220,0,2829 chrIX 346096 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.933;DP=179;Dels=0.00;FS=3.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.635;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,56:179:99:918,0,2767 chrIX 346366 . C T 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.497;DP=158;Dels=0.00;FS=2.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,48:158:99:831,0,2397 chrIX 346531 . G T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.685;DP=183;Dels=0.00;FS=2.134;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.327;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,61:183:99:1134,0,2610 chrIX 346599 . G A 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.762;DP=165;Dels=0.00;FS=3.208;HaplotypeScore=14.1783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=2.942;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.991;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,52:165:99:928,0,2412 chrIX 346836 . A G 557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.732;DP=156;Dels=0.00;FS=3.218;HaplotypeScore=5.7401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,49:156:99:587,0,2394 chrIX 347270 . A T 1894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;DP=130;Dels=0.00;FS=5.925;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.673;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,90:130:99:1924,0,709 chrIX 348305 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;DP=180;Dels=0.00;FS=4.474;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.317;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,67:180:99:1188,0,2363 chrIX 348722 . T C 2787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.837;DP=207;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=2.8863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,150:207:99:2817,0,1026 chrIX 349310 . G A 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.400;DP=183;Dels=0.00;FS=9.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,52:183:99:885,0,2846 chrIX 350044 . T C 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.568;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.70;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.018;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,145:149:99:2576,282,0 chrIX 350262 . C A 1884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.676;DP=137;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.761;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,86:137:99:1914,0,931 chrIX 350660 . C G 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;DP=129;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.133;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,40:129:99:651,0,1926 chrIX 351996 . G C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;DP=232;Dels=0.00;FS=1.072;HaplotypeScore=9.1958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=1;MQRankSum=0.676;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.079;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,77:232:99:1184,0,3332 chrIX 353322 . C T 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=146;Dels=0.00;FS=8.270;HaplotypeScore=2.6912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.086;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,46:146:99:786,0,2049 chrIX 354832 . G A 2800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.206;DP=195;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=3.6677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,133:195:99:2830,0,1087 chrIX 354862 . C G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.772;DP=183;Dels=0.00;FS=2.845;HaplotypeScore=5.5098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,60:183:99:1072,0,2461 chrIX 354867 . A G 2405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.418;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.743;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.945;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,122:181:99:2435,0,1067 chrIX 354945 . T C 2640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.292;DP=211;Dels=0.00;FS=1.726;HaplotypeScore=5.9271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.808;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,128:211:99:2670,0,1608 chrIX 355385 . C G 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;DP=194;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,64:194:99:1038,0,2673 chrIX 355519 . C A 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.460;DP=129;Dels=0.00;FS=5.621;HaplotypeScore=4.3696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.067;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,46:129:99:870,0,1689 chrIX 355580 . A T 2631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2664,273,0 chrIX 355620 . T G 391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;DP=100;Dels=0.00;FS=3.015;HaplotypeScore=2.9318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.390;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:100:99:421,0,1616 chrIX 355716 . A G 573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.533;DP=102;Dels=0.00;FS=3.978;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.750;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,34:102:99:603,0,1497 chrIX 356037 . C T 3623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3623,369,0 chrIX 356207 . T G 2145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.357;DP=179;Dels=0.00;FS=1.899;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.262;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,111:179:99:2175,0,1342 chrIX 356503 . G A 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;DP=168;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,44:168:99:669,0,2585 chrIX 357029 . C T 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.800;DP=211;Dels=0.00;FS=1.204;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.516;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,60:211:99:851,0,3351 chrIX 357150 . T C 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.904;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=3.44;ReadPosRankSum=1.866;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,51:196:99:705,0,3273 chrIX 357800 . C T 5240.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:5240,564,0 chrIX 358140 . T A 564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;DP=165;Dels=0.00;FS=2.301;HaplotypeScore=9.5764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=3.42;ReadPosRankSum=-3.213;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,43:165:99:594,0,2420 chrIX 359933 . C T 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.709;DP=145;Dels=0.01;FS=0.685;HaplotypeScore=5.6430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=4.34;ReadPosRankSum=2.426;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,40:144:99:660,0,2286 chrIX 360067 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.605;DP=228;Dels=0.00;FS=4.945;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.488;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,77:228:99:1259,0,3253 chrIX 360413 . C A 2985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.430;DP=229;Dels=0.00;FS=1.728;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=13.03;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,138:229:99:3015,0,1687 chrIX 360493 . C T 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.881;DP=191;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=5.9199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,61:191:99:1044,0,2601 chrIX 361370 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.247;DP=187;Dels=0.00;FS=4.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.703;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,71:187:99:1154,0,2340 chrIX 361596 . T C 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.611;DP=209;Dels=0.00;FS=8.314;HaplotypeScore=3.4055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.193;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,53:209:99:837,0,3478 chrIX 362255 . G A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.938;DP=186;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=4.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=6.76;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,69:186:99:1287,0,2363 chrIX 362358 . G A 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.608;DP=167;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,52:167:99:884,0,2457 chrIX 362714 . G A 4809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3459;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.85;SB=-2.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4809,496,0 chrIX 362718 . G A 4638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4638,495,0 chrIX 362824 . A G 468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.163;DP=155;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=3.5663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.104;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,40:155:99:498,0,2544 chrIX 363069 . G A 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=111.3939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.36;MQ0=0;QD=20.99;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3014,330,0 chrIX 363379 . A G 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.043;DP=219;Dels=0.00;FS=6.825;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,81:219:99:1468,0,2902 chrIX 363624 . C T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.557;DP=197;Dels=0.00;FS=1.873;HaplotypeScore=5.5035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.471;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,69:197:99:1225,0,2686 chrIX 363644 . A G 2584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.245;DP=192;Dels=0.00;FS=0.563;HaplotypeScore=6.1955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,126:192:99:2614,0,1146 chrIX 363854 . T C 4911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4911,531,0 chrIX 364352 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.350;DP=184;Dels=0.00;FS=4.580;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.097;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,69:184:99:1307,0,2446 chrIX 364389 . G A 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.834;DP=177;Dels=0.00;FS=12.523;HaplotypeScore=2.8930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.802;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,57:177:99:985,0,2646 chrIX 364447 . A G 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.968;DP=195;Dels=0.00;FS=5.813;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,58:195:99:903,0,3069 chrIX 364558 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.776;DP=199;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=1;MQRankSum=1.224;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.414;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,73:199:99:1308,0,2795 chrIX 364597 . G A 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.005;DP=203;Dels=0.00;FS=1.969;HaplotypeScore=52.2512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=1;MQRankSum=-1.251;QD=4.55;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,62:203:99:954,0,3071 chrIX 364631 . T C 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.707;DP=169;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=3.6347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.318;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,49:169:99:828,0,2747 chrIX 364849 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.657;DP=140;Dels=0.00;FS=5.417;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,53:140:99:990,0,1924 chrIX 365116 . T C 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.475;DP=172;Dels=0.00;FS=22.299;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.343;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,68:172:99:1249,0,2376 chrIX 365623 . C T 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,54:181:99:882,0,2779 chrIX 366229 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.322;DP=223;Dels=0.00;FS=2.511;HaplotypeScore=2.2455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.041;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,81:223:99:1531,0,3063 chrIX 366567 . C T 454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.881;DP=147;Dels=0.00;FS=3.448;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.189;QD=3.09;ReadPosRankSum=-3.720;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,37:147:99:484,0,2357 chrIX 366579 . A T 89.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;DP=143;Dels=0.00;FS=0.916;HaplotypeScore=2.1483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.584;QD=0.62;ReadPosRankSum=-2.566;SB=-4.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,19:143:99:119,0,2804 chrIX 366584 . G A 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.938;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-4.185;QD=0.10;ReadPosRankSum=-2.794;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,15:136:44:44,0,2650 chrIX 366585 . C T 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.042;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.07;MQ0=0;MQRankSum=-3.383;QD=0.09;ReadPosRankSum=-2.173;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,16:151:44:44,0,2679 chrIX 366603 . C T 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.289;DP=157;Dels=0.00;FS=15.335;HaplotypeScore=5.9088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.730;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,60:157:99:689,0,1961 chrIX 367155 . A G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.198;DP=189;Dels=0.00;FS=1.227;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.763;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,66:189:99:1116,0,2703 chrIX 367284 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.750;DP=166;Dels=0.00;FS=10.977;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.524;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,69:166:99:1194,0,2128 chrIX 367547 . T C 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.926;DP=233;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,81:233:99:1453,0,3395 chrIX 367896 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.203;DP=210;Dels=0.00;FS=0.533;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.100;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,72:210:99:1339,0,2954 chrIX 367929 . T A 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=4.29;ReadPosRankSum=2.053;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,58:205:99:910,0,3317 chrIX 368031 . C T 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.826;DP=142;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=1;MQRankSum=0.011;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.106;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,50:142:99:875,0,2034 chrIX 368158 . T C 597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.669;DP=145;Dels=0.00;FS=3.533;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.842;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,43:145:99:627,0,2305 chrIX 368159 . T C 570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.187;DP=146;Dels=0.00;FS=3.540;HaplotypeScore=3.7454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.017;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,43:146:99:600,0,2316 chrIX 368366 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.218;DP=198;Dels=0.00;FS=4.161;HaplotypeScore=4.6275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.545;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,79:198:99:1403,0,2390 chrIX 368784 . G A 2831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.811;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=13.48;ReadPosRankSum=-1.378;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,131:210:99:2861,0,1378 chrIX 369045 . A G 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.370;DP=182;Dels=0.00;FS=2.902;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.376;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,56:182:99:867,0,2812 chrIX 369078 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.964;DP=189;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=4.5621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-3.854;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,71:189:99:1271,0,2658 chrIX 369090 . T C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.318;DP=169;Dels=0.00;FS=8.343;HaplotypeScore=4.4862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.971;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,62:169:99:1104,0,2403 chrIX 369093 . T C 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.721;DP=165;Dels=0.00;FS=5.949;HaplotypeScore=3.5284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=-3.084;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,62:165:99:1098,0,2342 chrIX 369135 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.468;DP=192;Dels=0.00;FS=5.343;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,71:192:99:1271,0,2589 chrIX 369375 . A G 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.485;DP=215;Dels=0.00;FS=0.518;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=7.82;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,93:215:99:1712,0,2586 chrIX 369452 . C A 3429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.985;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=15.31;ReadPosRankSum=1.860;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,157:224:99:3429,0,1138 chrIX 369511 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.874;DP=211;Dels=0.00;FS=1.136;HaplotypeScore=9.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=5.63;ReadPosRankSum=-2.845;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,71:211:99:1218,0,2974 chrIX 369589 . G A 4346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.42;SB=-2.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4346,456,0 chrIX 370336 . C G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;DP=149;Dels=0.00;FS=2.151;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,54:149:99:991,0,1942 chrIX 370356 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.174;DP=161;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=5.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.449;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,55:161:99:950,0,2258 chrIX 370388 . G A 2708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.335;DP=173;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=50.2847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=3.456;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.829;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,125:173:99:2738,0,799 chrIX 370396 . T G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;DP=176;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=48.3959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,64:176:99:1100,0,2417 chrIX 370566 . C T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.309;DP=158;Dels=0.00;FS=4.236;HaplotypeScore=4.9320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,62:158:99:1184,0,2062 chrIX 370657 . T C 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.155;DP=165;Dels=0.00;FS=4.914;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,58:165:99:972,0,2317 chrIX 370829 . C G 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;DP=173;Dels=0.00;FS=8.596;HaplotypeScore=2.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=2.269;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,54:173:99:859,0,2487 chrIX 370919 . G A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;DP=237;Dels=0.00;FS=5.073;HaplotypeScore=2.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.248;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,75:237:99:1266,0,3345 chrIX 371225 . C A 2766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.641;DP=218;Dels=0.00;FS=3.489;HaplotypeScore=5.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.570;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,135:218:99:2796,0,1489 chrIX 371341 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.449;DP=213;Dels=0.00;FS=1.787;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.138;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,71:213:99:1217,0,3193 chrIX 371441 . A G 568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.323;DP=188;Dels=0.00;FS=5.200;HaplotypeScore=3.5333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.601;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,43:188:99:598,0,3318 chrIX 371627 . T C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.969;DP=204;Dels=0.00;FS=0.556;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.316;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,63:204:99:1057,0,3190 chrIX 371714 . G A 471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.034;DP=192;Dels=0.00;FS=16.128;HaplotypeScore=3.8605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=2.45;ReadPosRankSum=1.020;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,43:192:99:501,0,3286 chrIX 371792 . C A 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.977;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.220;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,55:170:99:985,0,2384 chrIX 371807 . G A 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.111;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=5.37;ReadPosRankSum=1.555;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,55:178:99:986,0,2645 chrIX 371957 . C T 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.141;DP=174;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=8.5694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.395;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,50:174:99:887,0,2589 chrIX 371963 . G A 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.577;DP=182;Dels=0.00;FS=2.030;HaplotypeScore=3.6655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.129;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,54:182:99:941,0,2536 chrIX 372143 . G A 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.017;DP=243;Dels=0.00;FS=4.190;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.931;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,81:243:99:1452,0,3502 chrIX 372359 . T G 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.380;DP=218;Dels=0.00;FS=2.401;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=2;MQRankSum=1.478;QD=6.44;ReadPosRankSum=-2.208;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,80:218:99:1435,0,3014 chrIX 372446 . G A 2776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.114;DP=200;Dels=0.00;FS=5.195;HaplotypeScore=3.2002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=3.282;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.062;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,128:200:99:2806,0,1147 chrIX 372481 . A G 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.798;DP=167;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=7.2104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.570;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,58:167:99:995,0,2398 chrIX 372491 . T G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.182;DP=168;Dels=0.00;FS=2.041;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=5.12;ReadPosRankSum=1.634;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,56:168:99:890,0,2370 chrIX 372506 . A G 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.853;DP=159;Dels=0.00;FS=1.296;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.055;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,56:159:99:857,0,2178 chrIX 372590 . T A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.373;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,71:170:99:1268,0,2156 chrIX 372678 . C A 2579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.034;DP=167;Dels=0.00;FS=2.180;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=15.44;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,117:167:99:2609,0,790 chrIX 373034 . T C 236.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.333;DP=184;Dels=0.00;FS=49.389;HaplotypeScore=119.8987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.755;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,27:184:99:266,0,1229 chrIX 373063 . A G 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.80;MQ0=0;QD=18.11;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:2568,276,0 chrIX 373113 . A G 307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.161;DP=158;Dels=0.00;FS=3.641;HaplotypeScore=3.4446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=-4.548;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,42:158:99:337,0,2383 chrIX 373284 . A G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.253;DP=157;Dels=0.01;FS=7.283;HaplotypeScore=6.5533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.073;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,60:156:99:940,0,2102 chrIX 373459 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.996;DP=199;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.130;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,65:199:99:1201,0,2687 chrIX 373695 . A C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.645;DP=170;Dels=0.00;FS=5.832;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.416;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,57:170:99:941,0,2495 chrIX 373728 . C G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;DP=174;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,63:174:99:1047,0,2399 chrIX 373876 . G A 4798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4798,492,0 chrIX 373971 . A G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.170;DP=205;Dels=0.00;FS=1.798;HaplotypeScore=2.3604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,78:205:99:1361,0,2751 chrIX 374268 . T C 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.653;DP=228;Dels=0.00;FS=1.844;HaplotypeScore=9.4374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.001;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,70:228:99:1026,0,3516 chrIX 374347 . T C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.423;DP=165;Dels=0.00;FS=3.270;HaplotypeScore=2.7145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,56:165:99:1003,0,2473 chrIX 374496 . C G 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.630;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.839;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,53:183:99:869,0,2797 chrIX 374542 . G A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=213;Dels=0.00;FS=2.627;HaplotypeScore=3.3011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,63:213:99:1110,0,3231 chrIX 374562 . G A 3185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.430;DP=212;Dels=0.00;FS=0.546;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.959;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,146:212:99:3215,0,938 chrIX 374576 . A G 3060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.075;DP=218;Dels=0.00;FS=1.191;HaplotypeScore=5.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.932;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,153:218:99:3090,0,1059 chrIX 374674 . G A 2505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;DP=174;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=3.6097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.116;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,124:174:99:2535,0,693 chrIX 374861 . C T 3138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.515;DP=204;Dels=0.00;FS=2.194;HaplotypeScore=3.5644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.202;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,143:204:99:3168,0,995 chrIX 374922 . A G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.571;DP=219;Dels=0.00;FS=0.549;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,67:219:99:1012,0,3303 chrIX 374943 . C G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;DP=280;Dels=0.00;FS=0.468;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,88:280:99:1388,0,4018 chrIX 374992 . C A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.043;DP=196;Dels=0.00;FS=1.146;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.651;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,73:196:99:1311,0,2510 chrIX 375017 . G A 2644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.064;DP=199;Dels=0.00;FS=2.575;HaplotypeScore=4.9359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.514;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,129:199:99:2674,0,1253 chrIX 375181 . T C 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=178;Dels=0.00;FS=2.003;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=1;MQRankSum=-0.368;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,64:178:99:1100,0,2473 chrIX 375200 . T C 2446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.629;DP=181;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=1;MQRankSum=0.118;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.502;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,119:181:99:2476,0,1183 chrIX 375219 . T C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.603;DP=170;Dels=0.00;FS=3.686;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=1;MQRankSum=0.082;QD=6.13;ReadPosRankSum=2.024;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,65:170:99:1072,0,2319 chrIX 375220 . G C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.042;DP=166;Dels=0.00;FS=4.744;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=1;MQRankSum=-1.051;QD=6.10;ReadPosRankSum=2.061;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,63:166:99:1043,0,2216 chrIX 375279 . C A 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.828;DP=170;Dels=0.00;FS=3.254;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,54:170:99:955,0,2509 chrIX 375595 . G A 563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.113;DP=157;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.014;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,39:157:99:593,0,2470 chrIX 375913 . T C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.011;DP=189;Dels=0.00;FS=3.504;HaplotypeScore=2.8066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.034;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,65:189:99:1059,0,2700 chrIX 375934 . T C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.912;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.375;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,73:193:99:1178,0,2558 chrIX 376391 . A G 4044.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.96;SB=-2.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4044,429,0 chrIX 376556 . A G 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.622;DP=172;Dels=0.00;FS=4.719;HaplotypeScore=7.2065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=3.297;QD=6.83;ReadPosRankSum=-2.509;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,67:172:99:1205,0,2180 chrIX 376567 . T C 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.669;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=2.942;QD=5.70;ReadPosRankSum=-1.335;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,60:173:99:1016,0,2266 chrIX 376672 . A G 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.773;DP=155;Dels=0.00;FS=3.349;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.701;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,52:155:99:899,0,2180 chrIX 376792 . C T 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.869;DP=171;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.381;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,50:171:99:877,0,2586 chrIX 377168 . A T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;DP=275;Dels=0.00;FS=9.607;HaplotypeScore=11.7348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,87:275:99:1585,0,3876 chrIX 377238 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.517;DP=240;Dels=0.00;FS=5.491;HaplotypeScore=3.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,85:240:99:1191,0,3504 chrIX 377405 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=220;Dels=0.00;FS=8.260;HaplotypeScore=4.2405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,73:220:99:1268,0,3163 chrIX 377556 . C T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.927;DP=216;Dels=0.00;FS=4.240;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,67:216:99:1194,0,3011 chrIX 377838 . G C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;DP=196;Dels=0.00;FS=1.195;HaplotypeScore=5.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=5.16;ReadPosRankSum=1.556;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,63:196:99:1041,0,2748 chrIX 378064 . G A 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.993;DP=182;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=6.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=4.20;ReadPosRankSum=-2.105;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,49:182:99:795,0,2726 chrIX 378238 . C T 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.503;DP=193;Dels=0.00;FS=11.132;HaplotypeScore=6.8142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=4.36;ReadPosRankSum=2.157;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,54:193:99:872,0,3094 chrIX 378389 . A T 403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.760;DP=158;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=2.55;ReadPosRankSum=-1.623;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,44:158:99:433,0,1644 chrIX 379276 . A C 3937.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3937,429,0 chrIX 379413 . T C 2569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.244;DP=207;Dels=0.00;FS=0.528;HaplotypeScore=6.8359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=2.642;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,129:207:99:2599,0,1466 chrIX 379472 . C T 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.537;DP=205;Dels=0.00;FS=0.525;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,85:205:99:1614,0,2443 chrIX 379476 . G A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.518;DP=187;Dels=0.00;FS=0.548;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=7.95;ReadPosRankSum=-2.196;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,81:187:99:1516,0,2125 chrIX 379493 . C G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;DP=208;Dels=0.00;FS=2.491;HaplotypeScore=2.9257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=6.05;ReadPosRankSum=1.507;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,75:208:99:1288,0,2793 chrIX 379574 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.408;DP=214;Dels=0.00;FS=2.492;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.852;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,72:214:99:1239,0,3069 chrIX 379771 . T C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;DP=212;Dels=0.00;FS=0.544;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.106;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,78:212:99:1464,0,2659 chrIX 379942 . A C 453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;DP=178;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.507;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,44:178:99:483,0,2643 chrIX 379944 . G C 463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.542;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,44:176:99:493,0,2473 chrIX 380031 . A T 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.977;DP=204;Dels=0.00;FS=6.352;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,67:204:99:1139,0,3015 chrIX 380306 . C T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.891;DP=238;Dels=0.00;FS=2.338;HaplotypeScore=3.4078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,86:238:99:1593,0,3074 chrIX 380325 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.247;DP=241;Dels=0.00;FS=8.962;HaplotypeScore=3.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.639;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,80:241:99:1254,0,3592 chrIX 380666 . A G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.495;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.195;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,63:165:99:1077,0,2184 chrIX 380678 . A G 2219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.731;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,113:175:99:2249,0,1026 chrIX 380757 . C T 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.692;DP=208;Dels=0.00;FS=1.934;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=5.59;ReadPosRankSum=-2.641;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,71:208:99:1193,0,2756 chrIX 380768 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.288;DP=218;Dels=0.00;FS=1.226;HaplotypeScore=3.8796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.805;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,69:218:99:1163,0,3047 chrIX 380934 . A G 1114.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.889;DP=212;Dels=0.00;FS=20.660;HaplotypeScore=43.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=5.25;ReadPosRankSum=-2.115;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,68:212:99:1144,0,2936 chrIX 380951 . C A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.459;DP=267;Dels=0.04;FS=16.043;HaplotypeScore=86.7583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=4.40;ReadPosRankSum=-6.761;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,188:255:99:1205,0,463 chrIX 380958 . T C 280.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.413;DP=233;Dels=0.00;FS=14.973;HaplotypeScore=96.6779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.160;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.749;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,57:233:99:310,0,2408 chrIX 380973 . A G 301.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.635;DP=214;Dels=0.00;FS=9.621;HaplotypeScore=14.3521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=1.41;ReadPosRankSum=0.686;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,52:214:99:331,0,2479 chrIX 380999 . G A 530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.391;DP=211;Dels=0.00;FS=28.165;HaplotypeScore=6.7198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.688;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,56:211:99:560,0,2891 chrIX 381073 . G A 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;DP=214;Dels=0.00;FS=3.408;HaplotypeScore=4.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.883;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,65:214:99:1073,0,3271 chrIX 381084 . A C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.113;DP=205;Dels=0.00;FS=1.859;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.574;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,64:205:99:1078,0,3216 chrIX 381270 . A T 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,59:176:99:972,0,2615 chrIX 381277 . T C 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.689;DP=180;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=4.8400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,58:180:99:960,0,2729 chrIX 381398 . C T 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.829;DP=174;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=2.991;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.770;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,51:174:99:745,0,2605 chrIX 381521 . A G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.485;DP=262;Dels=0.00;FS=0.494;HaplotypeScore=3.5522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.012;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,89:262:99:1486,0,3785 chrIX 381525 . C G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.840;DP=244;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.196;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,84:244:99:1456,0,3361 chrIX 381591 . T C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.552;DP=205;Dels=0.00;FS=7.795;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,60:205:99:1004,0,3260 chrIX 381607 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.964;DP=209;Dels=0.00;FS=2.595;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.426;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,65:209:99:1171,0,3137 chrIX 381696 . A G 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.532;DP=263;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=4.7089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.955;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,91:263:99:1566,0,3662 chrIX 381841 . T C 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.014;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,61:226:99:835,0,3689 chrIX 382512 . A G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.794;DP=199;Dels=0.00;FS=0.562;HaplotypeScore=3.5996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,67:199:99:1107,0,2961 chrIX 382710 . G T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=224;Dels=0.00;FS=13.909;HaplotypeScore=4.5270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,74:224:99:1152,0,3176 chrIX 382781 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.789;DP=256;Dels=0.00;FS=5.619;HaplotypeScore=4.4553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.59;MQ0=0;MQRankSum=4.039;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.319;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,84:256:99:1362,0,3687 chrIX 382792 . T C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.442;DP=250;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=5.8097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.01;MQ0=0;MQRankSum=4.857;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,77:250:99:1092,0,3900 chrIX 382915 . A T 329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;DP=90;Dels=0.00;FS=10.187;HaplotypeScore=154.4975;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=1.907;QD=3.66;ReadPosRankSum=-5.855;SB=-2.600e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:73,17:90:39:362,39,0 chrIX 382918 . C A,T 256.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=145.9894;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.39;MQ0=0;QD=2.84;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,83,7:90:99:316,145,124,171,0,153 chrIX 383179 . G A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.071;DP=178;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.406;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,63:178:99:1108,0,2389 chrIX 383251 . A G 6190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=257;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=24.09;SB=-2.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,257:257:99:6190,630,0 chrIX 383339 . G A 2788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.574;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,129:202:99:2818,0,1288 chrIX 383395 . G A 3451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.538;DP=262;Dels=0.00;FS=3.600;HaplotypeScore=3.4630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.255;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,166:262:99:3451,0,1576 chrIX 383416 . C T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;DP=240;Dels=0.00;FS=7.617;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=6.54;ReadPosRankSum=2.271;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,89:240:99:1599,0,3214 chrIX 383530 . G A 6461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.16;SB=-2.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,247:247:99:6461,628,0 chrIX 384118 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.706;DP=256;Dels=0.00;FS=4.970;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.876;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,72:256:99:1112,0,4045 chrIX 384159 . G A 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.212;DP=246;Dels=0.00;FS=6.423;HaplotypeScore=2.3537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,93:246:99:1750,0,3230 chrIX 384189 . T C 3064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.003;DP=216;Dels=0.00;FS=3.581;HaplotypeScore=3.0498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.942;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,154:216:99:3094,0,994 chrIX 384344 . A G 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.612;DP=197;Dels=0.00;FS=7.414;HaplotypeScore=12.7160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.876;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.678;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,55:197:99:721,0,2343 chrIX 384366 . A C 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.907;DP=187;Dels=0.00;FS=1.959;HaplotypeScore=61.1409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,60:187:99:857,0,2376 chrIX 384418 . T C 3636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.456;DP=240;Dels=0.00;FS=0.529;HaplotypeScore=2.6711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=2.305;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.314;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,171:239:99:3636,0,1128 chrIX 384590 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.884;DP=270;Dels=0.00;FS=1.632;HaplotypeScore=4.6347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.771;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,78:270:99:1264,0,4233 chrIX 384629 . A G 2140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.500;DP=293;Dels=0.00;FS=4.219;HaplotypeScore=13.3910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=7.30;ReadPosRankSum=-2.025;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,117:293:99:2170,0,3808 chrIX 384665 . G A 2027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.775;DP=268;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=4.6391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.279;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,105:268:99:2057,0,3450 chrIX 384715 . A G 637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.489;DP=209;Dels=0.00;FS=11.234;HaplotypeScore=4.9354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.255;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,53:209:99:667,0,3557 chrIX 384962 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.522;DP=264;Dels=0.00;FS=1.649;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=4.91;ReadPosRankSum=-2.036;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,81:264:99:1325,0,3960 chrIX 385125 . C T 1836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.719;DP=255;Dels=0.00;FS=5.155;HaplotypeScore=9.2618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.023;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,100:255:99:1866,0,3150 chrIX 385422 . G C 3541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;DP=248;Dels=0.00;FS=5.435;HaplotypeScore=7.9239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,163:248:99:3541,0,1523 chrIX 385599 . T C 1255.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.691;DP=162;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=5.8708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.51;MQ0=0;MQRankSum=-8.608;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.976;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,111:162:99:1285,0,902 chrIX 385600 . T C 1193.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.915;DP=162;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=5.7586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.51;MQ0=0;MQRankSum=-8.987;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.987;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,111:162:99:1223,0,905 chrIX 385607 . A G 1252.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.078;DP=173;Dels=0.00;FS=10.127;HaplotypeScore=6.5377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.95;MQ0=0;MQRankSum=-7.791;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.509;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,123:173:99:1282,0,889 chrIX 385724 . G A 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.894;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.960;QD=4.74;ReadPosRankSum=-2.235;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,67:204:99:996,0,2650 chrIX 385830 . T G 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.607;DP=260;Dels=0.00;FS=1.003;HaplotypeScore=3.4553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,86:260:99:1545,0,3756 chrIX 385892 . A C 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.148;DP=199;Dels=0.00;FS=7.904;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.81;MQ0=0;MQRankSum=-5.676;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.843;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,61:199:99:858,0,3178 chrIX 385951 . C T 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.711;DP=205;Dels=0.00;FS=6.728;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=-9.062;QD=3.07;ReadPosRankSum=-5.320;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,62:205:99:660,0,2975 chrIX 385961 . A G 503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.991;DP=203;Dels=0.00;FS=13.641;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQ0=0;MQRankSum=-7.705;QD=2.48;ReadPosRankSum=-5.981;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,58:203:99:533,0,3268 chrIX 386028 . T G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.800;DP=218;Dels=0.00;FS=5.748;HaplotypeScore=2.3838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.792;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,61:218:99:890,0,3525 chrIX 386051 . A G 5501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8909;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,233:233:99:5501,624,0 chrIX 386125 . A T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;DP=217;Dels=0.00;FS=1.146;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,66:217:99:1078,0,3358 chrIX 386244 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.548;DP=215;Dels=0.00;FS=4.394;HaplotypeScore=69.9114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.515;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,68:215:99:963,0,3077 chrIX 386249 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.757;DP=215;Dels=0.00;FS=2.687;HaplotypeScore=68.8974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=2.293;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,64:215:99:968,0,3103 chrIX 386266 . C T 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.838;DP=200;Dels=0.00;FS=4.549;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.729;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,60:200:99:977,0,2999 chrIX 386321 . C T 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.388;DP=232;Dels=0.00;FS=13.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,63:232:99:999,0,3758 chrIX 386334 . A T 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.659;DP=255;Dels=0.00;FS=5.234;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.976;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,67:255:99:1005,0,4264 chrIX 386360 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.005;DP=253;Dels=0.00;FS=4.027;HaplotypeScore=4.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.361;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,76:253:99:1257,0,3993 chrIX 386386 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.071;DP=295;Dels=0.00;FS=4.955;HaplotypeScore=3.6605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,93:295:99:1484,0,4502 chrIX 386399 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=295;Dels=0.00;FS=6.752;HaplotypeScore=5.7457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,96:295:99:1634,0,4081 chrIX 386447 . T G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.934;DP=220;Dels=0.00;FS=3.494;HaplotypeScore=2.8814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,75:220:99:1320,0,3178 chrIX 386492 . G C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;DP=229;Dels=0.00;FS=5.166;HaplotypeScore=3.4926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-3.830;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,73:229:99:1173,0,3440 chrIX 386511 . C T 6343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.0294;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.67;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,244:244:99:6343,676,0 chrIX 386561 . G C 565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;DP=257;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.29;MQ0=0;MQRankSum=-10.755;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.823;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,64:257:99:595,0,4263 chrIX 386566 . G A 632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;DP=267;Dels=0.00;FS=1.109;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=-10.343;QD=2.37;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,64:267:99:662,0,4439 chrIX 386589 . A G 544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.298;DP=228;Dels=0.00;FS=3.537;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-7.265;QD=2.39;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,58:228:99:574,0,3811 chrIX 386592 . G A 595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.952;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQ0=0;MQRankSum=-7.869;QD=2.62;ReadPosRankSum=-2.175;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,63:227:99:625,0,3440 chrIX 386665 . G T 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.439;DP=237;Dels=0.00;FS=0.508;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.111;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,85:237:99:1414,0,3287 chrIX 386682 . C T 2981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.006;DP=233;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,146:232:99:3011,0,1468 chrIX 386758 . G A 2943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.822;DP=216;Dels=0.00;FS=5.641;HaplotypeScore=4.2749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=13.63;ReadPosRankSum=-2.292;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,140:216:99:2973,0,1285 chrIX 386815 . G A 3352.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.435;DP=247;Dels=0.00;FS=0.484;HaplotypeScore=75.9952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.299;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,159:247:99:3352,0,1508 chrIX 386817 . C T 3470.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.015;DP=239;Dels=0.00;FS=1.654;HaplotypeScore=75.9952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=1.821;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.891;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,156:239:99:3470,0,1387 chrIX 386823 . G A 1188.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.346;DP=239;Dels=0.00;FS=1.072;HaplotypeScore=78.9504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.934;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,77:239:99:1218,0,3381 chrIX 386922 . G A 2797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.992;DP=220;Dels=0.00;FS=4.757;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,135:220:99:2827,0,1512 chrIX 386957 . C T 3079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=233;Dels=0.00;FS=6.502;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.262;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,145:233:99:3109,0,1625 chrIX 386979 . C T 2946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.128;DP=219;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=3.3251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.186;QD=13.45;ReadPosRankSum=1.520;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,139:219:99:2976,0,1506 chrIX 386988 . G A 2722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.120;DP=204;Dels=0.00;FS=1.138;HaplotypeScore=2.5365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.613;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,131:204:99:2752,0,1383 chrIX 386994 . G A 2753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.132;DP=203;Dels=0.00;FS=0.542;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.986;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.958;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,131:203:99:2783,0,1327 chrIX 387056 . G A 4832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=25.70;SB=-2.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4832,522,0 chrIX 387090 . C T 2050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.010;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,102:165:99:2080,0,1186 chrIX 387107 . A T 2086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.075;DP=177;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQ0=0;MQRankSum=-4.106;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.124;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,107:177:99:2116,0,1419 chrIX 387109 . C T 2165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.602;DP=175;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.218;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.232;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,106:175:99:2195,0,1323 chrIX 387142 . A G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.138;DP=128;Dels=0.02;FS=1.861;HaplotypeScore=61.6995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.32;MQ0=1;MQRankSum=-2.849;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.334;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,79:125:99:1510,0,856 chrIX 387176 . G A 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.961;DP=171;Dels=0.00;FS=7.154;HaplotypeScore=6.0727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.48;MQ0=1;MQRankSum=-4.010;QD=3.95;ReadPosRankSum=-4.772;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,123:171:99:705,0,138 chrIX 387186 . C A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.672;DP=200;Dels=0.00;FS=4.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.56;MQ0=1;MQRankSum=-4.521;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.291;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,139:200:99:1177,0,434 chrIX 387190 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.487;DP=200;Dels=0.00;FS=4.020;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=1;MQRankSum=-4.268;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.096;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,136:200:99:1358,0,444 chrIX 387201 . A T 337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.624;DP=180;Dels=0.00;FS=5.279;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.73;MQ0=1;MQRankSum=-3.798;QD=1.87;ReadPosRankSum=1.098;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,51:180:99:367,0,1684 chrIX 387229 . T A 2273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;DP=205;Dels=0.00;FS=15.433;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.702;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.588;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,146:205:99:2303,0,962 chrIX 387314 . T C 3081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.509;DP=225;Dels=0.00;FS=2.414;HaplotypeScore=2.8858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.689;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,149:225:99:3111,0,1415 chrIX 387325 . A C 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.541;DP=234;Dels=0.00;FS=1.671;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=2.904;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.698;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,84:234:99:1493,0,3297 chrIX 387368 . A G 2693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,129:201:99:2723,0,1271 chrIX 387393 . T C 3157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.780;DP=234;Dels=0.00;FS=0.510;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,154:234:99:3187,0,1480 chrIX 387419 . A C 3564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.888;DP=257;Dels=0.00;FS=1.005;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.136;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,169:257:99:3564,0,1674 chrIX 387502 . T C 3225.28 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.100;DP=265;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=12.17;ReadPosRankSum=1.192;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,160:265:99:3255,0,1957 chrIX 387531 . T C 3715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.332;DP=286;Dels=0.00;FS=4.104;HaplotypeScore=8.0533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.232;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.519;SB=-1.882e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,184:286:99:3715,0,1851 chrIX 387587 . T C 2382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.020;DP=199;Dels=0.00;FS=1.781;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.915;QD=11.97;ReadPosRankSum=2.901;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,121:199:99:2412,0,1443 chrIX 387630 . T C 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.683;DP=172;Dels=0.00;FS=25.714;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.73;MQ0=0;MQRankSum=9.340;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.077;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,77:172:99:1481,0,1895 chrIX 387640 . G A 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.409;DP=165;Dels=0.00;FS=20.231;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.37;MQ0=0;MQRankSum=-9.073;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.633;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1621,0,1492 chrIX 387779 . G A 2744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.257;DP=213;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=2.4673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=0;MQRankSum=-4.419;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,136:213:99:2774,0,1312 chrIX 387795 . A T 202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.818;DP=246;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.358;QD=0.82;ReadPosRankSum=-0.928;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,159:246:99:232,0,1977 chrIX 387804 . G A 3543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.399;DP=256;Dels=0.00;FS=1.014;HaplotypeScore=4.2730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=-3.678;QD=13.84;ReadPosRankSum=-1.367;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,167:256:99:3543,0,1538 chrIX 387808 . T C 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.207;DP=280;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQ0=0;MQRankSum=4.839;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.148;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,92:280:99:1551,0,4030 chrIX 387870 . G T 3288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.316;DP=213;Dels=0.00;FS=2.603;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.362;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,150:213:99:3288,0,903 chrIX 387908 . A G 1936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.834;DP=167;Dels=0.00;FS=6.889;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.673;QD=11.59;ReadPosRankSum=2.162;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,100:167:99:1966,0,1308 chrIX 387914 . C T 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;DP=167;Dels=0.00;FS=4.673;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.504;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.167;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,102:167:99:1841,0,1242 chrIX 387959 . T C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.815;DP=160;Dels=0.00;FS=19.722;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQ0=0;MQRankSum=-7.866;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,91:160:99:1525,0,1386 chrIX 388008 . T C 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.122;DP=173;Dels=0.00;FS=1.923;HaplotypeScore=211.2558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.73;MQ0=1;MQRankSum=-10.766;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.723;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,85:173:99:706,0,1773 chrIX 388015 . T C 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.908;DP=171;Dels=0.00;FS=1.931;HaplotypeScore=20.1977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.38;MQ0=1;MQRankSum=-10.676;QD=4.67;ReadPosRankSum=-3.851;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,87:171:99:829,0,1700 chrIX 388037 . T C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.175;DP=145;Dels=0.00;FS=8.764;HaplotypeScore=1.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.33;MQ0=1;MQRankSum=-8.760;QD=6.33;ReadPosRankSum=-5.946;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:948,0,1281 chrIX 388144 . A T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;DP=236;Dels=0.00;FS=0.541;HaplotypeScore=7.5589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.315;QD=4.17;ReadPosRankSum=2.468;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,63:236:99:1014,0,3775 chrIX 388158 . C A 2431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.001;DP=208;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQ0=0;MQRankSum=-5.935;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,119:208:99:2461,0,1733 chrIX 388181 . G C 4531.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=44.4860;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.20;MQ0=0;QD=23.97;SB=-2.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4531,516,0 chrIX 388183 . G C 1592.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.482;DP=180;Dels=0.00;FS=5.385;HaplotypeScore=47.2595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.53;MQ0=0;MQRankSum=-10.268;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.046;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,93:180:99:1622,0,1800 chrIX 388189 . C T 647.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;DP=184;Dels=0.00;FS=6.314;HaplotypeScore=49.2962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.47;MQ0=0;MQRankSum=-8.016;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.434;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,52:184:99:677,0,2644 chrIX 388217 . T G 1710.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.226;DP=196;Dels=0.00;FS=8.955;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.92;MQ0=0;MQRankSum=-11.733;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.040;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,105:196:99:1740,0,1872 chrIX 388220 . A G 4257.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.54;MQ0=0;QD=22.64;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4257,492,0 chrIX 388227 . C T 1787.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.795;DP=186;Dels=0.00;FS=10.936;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.16;MQ0=0;MQRankSum=-10.448;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.216;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,97:186:99:1817,0,1755 chrIX 388256 . G A 2079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.258;DP=186;Dels=0.00;FS=1.817;HaplotypeScore=3.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.62;MQ0=0;MQRankSum=-8.242;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,100:186:99:2109,0,1532 chrIX 388279 . T C 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.137;DP=151;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=4.6253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=-5.852;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,84:151:99:1764,0,1292 chrIX 388304 . C T 1828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.177;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=85.2495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=0;MQRankSum=-5.290;QD=10.69;ReadPosRankSum=2.588;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,88:171:99:1858,0,1622 chrIX 388426 . A G 2060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.093;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.233;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.235;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,107:177:99:2090,0,1363 chrIX 388444 . C T 2133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.846;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.777;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.910;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,107:191:99:2163,0,1615 chrIX 388455 . C T 1977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.744;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQ0=0;MQRankSum=-3.261;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,103:176:99:2007,0,1382 chrIX 388464 . G A 2251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.783;DP=192;Dels=0.00;FS=1.173;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.929;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.474;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,119:192:99:2281,0,1393 chrIX 388520 . A C 1870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.225;DP=168;Dels=0.00;FS=2.869;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.59;MQ0=0;MQRankSum=-4.117;QD=11.13;ReadPosRankSum=2.918;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,104:168:99:1900,0,1172 chrIX 388551 . A C 2151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.268;DP=163;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.93;MQ0=0;MQRankSum=-3.331;QD=13.20;ReadPosRankSum=-2.353;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,104:163:99:2181,0,1054 chrIX 388703 . G A 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3956,417,0 chrIX 388882 . C A 2679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.252;DP=188;Dels=0.00;FS=4.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.535;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,121:188:99:2709,0,1178 chrIX 388886 . G T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.981;DP=194;Dels=0.00;FS=2.749;HaplotypeScore=2.9426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.87;MQ0=0;MQRankSum=3.883;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.329;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,70:194:99:1257,0,2668 chrIX 388951 . G A 1998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.642;DP=196;Dels=0.00;FS=2.465;HaplotypeScore=93.5007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.48;MQ0=0;MQRankSum=-8.499;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.179;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,106:196:99:2028,0,1778 chrIX 388964 . C T 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.960;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.66;MQ0=0;MQRankSum=-8.972;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.656;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,102:184:99:1709,0,1493 chrIX 388981 . A G 1831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.131;DP=194;Dels=0.00;FS=1.189;HaplotypeScore=2.7569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.85;MQ0=0;MQRankSum=-6.464;QD=9.44;ReadPosRankSum=-2.156;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,103:194:99:1861,0,1754 chrIX 388987 . G A 2006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.21;MQ0=0;MQRankSum=-6.658;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.646;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,105:203:99:2036,0,1877 chrIX 389030 . C T 1910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.098;DP=204;Dels=0.00;FS=1.091;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQ0=0;MQRankSum=6.492;QD=9.36;ReadPosRankSum=-2.283;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,100:204:99:1940,0,2084 chrIX 389094 . G T 5173.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:5173,552,0 chrIX 389156 . C T 4783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.45;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4783,487,0 chrIX 389168 . T A 4439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.17;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4439,460,0 chrIX 389212 . T C 4232.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.14;MQ0=0;QD=24.32;SB=-2.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4232,465,0 chrIX 389244 . C A 2116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.344;DP=171;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=50.3420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.93;MQ0=0;MQRankSum=-6.884;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.127;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,106:171:99:2146,0,948 chrIX 389250 . G A 690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;DP=170;Dels=0.01;FS=3.998;HaplotypeScore=371.2252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.87;MQ0=0;MQRankSum=-5.480;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.045;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,49:169:99:720,0,2241 chrIX 389291 . G A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.964;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.626;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.588;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,91:152:99:1623,0,700 chrIX 389295 . C T 3927.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2957;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.22;MQ0=0;QD=21.11;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:3927,432,0 chrIX 389404 . C A 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.167;DP=208;Dels=0.00;FS=3.975;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,45:208:99:622,0,3566 chrIX 389433 . T C 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.981;DP=179;Dels=0.00;FS=2.055;HaplotypeScore=51.4607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=4.51;ReadPosRankSum=1.123;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,52:179:99:837,0,2787 chrIX 389434 . A G 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.811;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=51.4607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.084;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,68:180:99:1205,0,2443 chrIX 389444 . T C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.177;DP=163;Dels=0.00;FS=2.822;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=7.75;ReadPosRankSum=-2.221;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,71:163:99:1294,0,2069 chrIX 389512 . T A 4713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=1;QD=25.20;SB=-2.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4713,490,0 chrIX 389745 . C T 5992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.02;MQ0=0;QD=25.83;SB=-2.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,232:232:99:5992,619,0 chrIX 389949 . T C 5346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;DP=211;Dels=0.00;FS=3.466;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.66;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=25.34;ReadPosRankSum=1.190;SB=-2.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,210:211:99:5346,579,0 chrIX 389968 . C T 4668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.52;MQ0=0;QD=24.96;SB=-2.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4668,510,0 chrIX 389969 . G A 538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.442;DP=191;Dels=0.00;FS=5.170;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.487;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.605;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,43:191:99:568,0,3123 chrIX 390114 . C T 2962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.529;DP=226;Dels=0.00;FS=11.735;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=3.000;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.255;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,140:226:99:2992,0,1551 chrIX 390119 . T C 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.161;DP=229;Dels=0.00;FS=10.407;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.987;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,89:229:99:1652,0,3059 chrIX 390169 . G A 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.775;DP=226;Dels=0.00;FS=2.374;HaplotypeScore=7.4769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.173;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,85:226:99:1600,0,2818 chrIX 390192 . A G 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.521;DP=223;Dels=0.00;FS=1.128;HaplotypeScore=4.8145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=1.793;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.666;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,68:223:99:1035,0,3408 chrIX 390207 . T C 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.727;DP=238;Dels=0.00;FS=2.249;HaplotypeScore=7.6882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.251;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,93:238:99:1718,0,3086 chrIX 390275 . A G 5443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=233;Dels=0.00;FS=3.970;HaplotypeScore=8.5882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.941;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.090;SB=-2.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,232:233:99:5443,588,0 chrIX 390679 . G A 7341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.558;DP=294;Dels=0.00;FS=6.058;HaplotypeScore=4.3480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=1;MQRankSum=2.962;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.558;SB=-3.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,291:294:99:7341,744,0 chrIX 390703 . T A 1947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.109;DP=270;Dels=0.00;FS=14.500;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=1;MQRankSum=0.565;QD=7.21;ReadPosRankSum=-6.686;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,113:270:99:1977,0,3399 chrIX 390718 . T C 1768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.063;DP=248;Dels=0.00;FS=2.830;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=1;MQRankSum=-1.223;QD=7.13;ReadPosRankSum=-3.414;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,107:248:99:1798,0,2971 chrIX 390814 . A T 2206 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.15;MQ0=2;MQRankSum=1.371;QD=22.51;ReadPosRankSum=-1.047;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,96:98:99:2239,216,0 chrIX 390850 . C T 317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.251;DP=105;Dels=0.00;FS=5.993;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQ0=2;MQRankSum=0.043;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:347,0,1469 chrIX 390856 . G A 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.91;MQ0=1;QD=23.44;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3103,342,0 chrIX 390876 . G A 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.968;DP=164;Dels=0.00;FS=3.665;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.01;MQ0=1;MQRankSum=2.076;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.274;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:1641,0,1503 chrIX 390899 . T G 4551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.66;MQ0=1;QD=23.83;SB=-2.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4551,486,0 chrIX 391028 . A G 4806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0978;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.24;MQ0=0;QD=23.11;SB=-2.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:4806,522,0 chrIX 391102 . G A 162.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.603;DP=309;Dels=0.00;FS=19.946;HaplotypeScore=4.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.407;QD=0.52;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,46:309:99:192,0,5327 chrIX 391105 . G A 81.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.250;DP=312;Dels=0.00;FS=18.872;HaplotypeScore=89.1103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.949;QD=0.26;ReadPosRankSum=0.286;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,43:312:99:111,0,5492 chrIX 391113 . A T 605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.790;DP=318;Dels=0.00;FS=20.628;HaplotypeScore=114.8803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.21;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.434;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,59:318:99:635,0,5301 chrIX 391117 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.541;DP=309;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=130.9419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.07;MQ0=0;MQRankSum=4.198;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.054;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,91:309:99:1440,0,4257 chrIX 391126 . A G 2362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.568;DP=296;Dels=0.00;FS=11.183;HaplotypeScore=74.5122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.31;MQ0=1;MQRankSum=-1.321;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.328;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,144:296:99:2392,0,3043 chrIX 391147 . T G 2169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.876;DP=267;Dels=0.00;FS=2.126;HaplotypeScore=29.2416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.96;MQ0=1;MQRankSum=-2.521;QD=8.12;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,141:267:99:2199,0,2631 chrIX 391153 . G A 3124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.404;DP=265;Dels=0.00;FS=11.905;HaplotypeScore=46.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.64;MQ0=1;MQRankSum=-2.133;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,166:265:99:3154,0,1763 chrIX 391166 . A G 97.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.866;DP=258;Dels=0.00;FS=30.241;HaplotypeScore=19.8356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.864;QD=0.38;ReadPosRankSum=-3.461;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,37:258:99:127,0,4624 chrIX 391198 . G A 4333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.329;DP=205;Dels=0.00;FS=28.413;HaplotypeScore=4.7022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.80;MQ0=2;MQRankSum=3.675;QD=21.14;ReadPosRankSum=6.234;SB=-2.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,190:204:99:4333,456,0 chrIX 391213 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.173;DP=184;Dels=0.00;FS=6.291;HaplotypeScore=56.4282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.07;MQ0=2;MQRankSum=0.259;QD=6.67;ReadPosRankSum=-2.576;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:184:99:1257,0,819 chrIX 391255 . T A 509.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;DP=106;Dels=0.00;FS=19.560;HaplotypeScore=5.8467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.12;MQ0=2;MQRankSum=-1.956;QD=4.80;ReadPosRankSum=3.878;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:539,0,917 chrIX 391258 . T A 393.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;DP=90;Dels=0.00;FS=11.120;HaplotypeScore=4.9526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.84;MQ0=2;MQRankSum=-2.599;QD=4.37;ReadPosRankSum=4.056;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,38:90:99:423,0,747 chrIX 391259 . A G 401.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;DP=85;Dels=0.00;FS=9.837;HaplotypeScore=4.9526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.02;MQ0=2;MQRankSum=-1.563;QD=4.72;ReadPosRankSum=4.698;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,35:85:99:431,0,703 chrIX 391260 . C A 417.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.139;DP=84;Dels=0.00;FS=8.069;HaplotypeScore=5.9381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.17;MQ0=2;MQRankSum=-1.021;QD=4.96;ReadPosRankSum=4.899;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,34:84:99:447,0,673 chrIX 391273 . A G 24.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.776;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.16;MQ0=1;MQRankSum=-1.758;QD=0.44;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:54:54,0,647 chrIX 391276 . A G 24.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.003;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.1359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.866;QD=0.44;ReadPosRankSum=0.296;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:54:54,0,647 chrIX 391282 . T G 621 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=42.3455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.66;MQ0=1;QD=13.50;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:78:654,78,0 chrIX 391294 . T A 314.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;DP=63;Dels=0.00;FS=23.332;HaplotypeScore=79.4962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.61;MQ0=2;MQRankSum=-0.226;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.145;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,36:63:99:344,0,136 chrIX 391295 . A G 315.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;DP=63;Dels=0.00;FS=27.219;HaplotypeScore=78.6021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.61;MQ0=2;MQRankSum=-0.066;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.535;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:345,0,249 chrIX 391300 . A T 284.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.232;DP=76;Dels=0.00;FS=19.709;HaplotypeScore=44.1972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.48;MQ0=3;MQRankSum=0.130;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.547;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:76:99:314,0,392 chrIX 391315 . G A 272.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.668;DP=95;Dels=0.00;FS=7.030;HaplotypeScore=8.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.94;MQ0=3;MQRankSum=-1.860;QD=2.86;ReadPosRankSum=4.348;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:302,0,673 chrIX 391339 . C A 1734 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=36.9433;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.97;MQ0=28;QD=9.69;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:177:99:1767,201,0 chrIX 391340 . A G 1619 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.543;DP=182;Dels=0.00;FS=6.359;HaplotypeScore=39.7318;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.95;MQ0=29;MQRankSum=1.629;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.089;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,164:182:91:1652,91,0 chrIX 391345 . A T 872.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.756;DP=197;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=40.1150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.54;MQ0=34;MQRankSum=0.876;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.475;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,103:197:99:902,0,635 chrIX 391360 . A G 968.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.984;DP=235;Dels=0.00;FS=1.285;HaplotypeScore=18.0864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.44;MQ0=49;MQRankSum=3.452;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.052;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,110:235:99:998,0,677 chrIX 391372 . G T 1008.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.724;DP=270;Dels=0.00;FS=35.434;HaplotypeScore=26.7466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.45;MQ0=58;MQRankSum=-0.658;QD=3.73;ReadPosRankSum=7.124;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,126:270:99:1038,0,1018 chrIX 391411 . A G 2139.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.079;DP=405;Dels=0.00;FS=26.443;HaplotypeScore=48.9206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.92;MQ0=122;MQRankSum=0.318;QD=5.28;ReadPosRankSum=4.174;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,248:405:99:2169,0,625 chrIX 391421 . A G 103.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;DP=434;Dels=0.00;FS=9.155;HaplotypeScore=97.7419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.26;MQ0=134;MQRankSum=-0.040;QD=0.24;ReadPosRankSum=-2.652;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:376,57:434:99:133,0,2972 chrIX 391428 . C T 926.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;DP=440;Dels=0.00;FS=175.937;HaplotypeScore=98.8181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.02;MQ0=135;MQRankSum=-0.597;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,147:440:99:956,0,2129 chrIX 391432 . A G 387.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.784;DP=454;Dels=0.00;FS=63.939;HaplotypeScore=135.9365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.76;MQ0=145;MQRankSum=2.725;QD=0.85;ReadPosRankSum=2.757;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:391,63:454:99:417,0,2765 chrIX 391441 . A G 1032.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-14.095;DP=516;Dels=0.00;FS=11.021;HaplotypeScore=93.7870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.60;MQ0=143;MQRankSum=0.678;QD=2.00;ReadPosRankSum=5.319;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:375,141:516:99:1062,0,2970 chrIX 391448 . G C 75.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.877;DP=577;Dels=0.00;FS=23.684;HaplotypeScore=170.0589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.03;MQ0=145;MQRankSum=3.179;QD=0.13;ReadPosRankSum=-6.328;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:528,49:577:99:105,0,4559 chrIX 391453 . G T 1877.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=15.464;DP=627;Dels=0.00;FS=11.004;HaplotypeScore=87.7092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.62;MQ0=147;MQRankSum=-1.877;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:374,252:627:99:1907,0,3304 chrIX 391465 . T A 988.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.563;DP=748;Dels=0.00;FS=6.949;HaplotypeScore=91.1693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.04;MQ0=138;MQRankSum=-1.625;QD=1.32;ReadPosRankSum=5.983;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:534,212:746:99:1018,0,6145 chrIX 391466 . A G 983.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.734;DP=748;Dels=0.00;FS=10.060;HaplotypeScore=91.7477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.04;MQ0=138;MQRankSum=-1.762;QD=1.31;ReadPosRankSum=5.434;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:531,214:746:99:1013,0,6151 chrIX 391493 . G C 747.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.095;DP=779;Dels=0.00;FS=6.195;HaplotypeScore=200.0543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.19;MQ0=169;MQRankSum=1.259;QD=0.96;ReadPosRankSum=3.379;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:637,142:779:99:777,0,6455 chrIX 391498 . G T 238.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.558;DP=772;Dels=0.00;FS=2.930;HaplotypeScore=184.6171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.53;MQ0=162;MQRankSum=-1.233;QD=0.31;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:631,141:772:99:268,0,7092 chrIX 391499 . G C 161.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.236;DP=770;Dels=0.00;FS=18.500;HaplotypeScore=198.6193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.62;MQ0=160;MQRankSum=2.275;QD=0.21;ReadPosRankSum=-7.156;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:686,82:770:99:191,0,7447 chrIX 391510 . T A 2880.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.235;DP=726;Dels=0.00;FS=26.138;HaplotypeScore=105.6426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.51;MQ0=145;MQRankSum=-0.810;QD=3.97;ReadPosRankSum=4.337;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:390,332:723:99:2910,0,3697 chrIX 391511 . A G 2791.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;DP=726;Dels=0.00;FS=23.846;HaplotypeScore=106.5092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.51;MQ0=145;MQRankSum=-0.577;QD=3.84;ReadPosRankSum=3.987;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:391,331:723:99:2821,0,3831 chrIX 391516 . A T 2041.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.744;DP=679;Dels=0.00;FS=21.330;HaplotypeScore=124.6012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.32;MQ0=137;MQRankSum=1.091;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.950;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:482,195:679:99:2071,0,4303 chrIX 391531 . A G 876.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-14.690;DP=620;Dels=0.00;FS=31.280;HaplotypeScore=98.0228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.72;MQ0=123;MQRankSum=3.853;QD=1.41;ReadPosRankSum=-1.562;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:506,114:620:99:906,0,5290 chrIX 391534 . A G 114.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.422;DP=621;Dels=0.00;FS=10.290;HaplotypeScore=186.5753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.78;MQ0=120;MQRankSum=2.409;QD=0.18;ReadPosRankSum=6.502;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:568,53:621:99:144,0,6146 chrIX 391543 . G T 922.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.378;DP=527;Dels=0.00;FS=14.971;HaplotypeScore=124.3684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.04;MQ0=128;MQRankSum=-0.225;QD=1.75;ReadPosRankSum=-2.884;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:401,126:527:99:952,0,3864 chrIX 391555 . T A 582.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.452;DP=423;Dels=0.00;FS=5.113;HaplotypeScore=26.2922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.42;MQ0=131;MQRankSum=0.988;QD=1.38;ReadPosRankSum=-4.935;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,133:423:99:612,0,2785 chrIX 391556 . A G 548.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;DP=422;Dels=0.00;FS=5.129;HaplotypeScore=26.2922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.44;MQ0=131;MQRankSum=0.971;QD=1.30;ReadPosRankSum=-5.146;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,133:422:99:578,0,2848 chrIX 391635 . C T 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;DP=200;Dels=0.00;FS=2.370;HaplotypeScore=9.0548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.99;MQ0=131;MQRankSum=-1.019;QD=0.13;ReadPosRankSum=2.494;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,26:200:55:55,0,416 chrIX 391651 . A G 147.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.393;DP=207;Dels=0.00;FS=5.157;HaplotypeScore=36.4897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.00;MQ0=122;MQRankSum=2.790;QD=0.71;ReadPosRankSum=-1.429;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,75:207:99:177,0,317 chrIX 391652 . G C 25.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;DP=207;Dels=0.00;FS=12.522;HaplotypeScore=36.4897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.00;MQ0=122;MQRankSum=3.240;QD=0.12;ReadPosRankSum=-1.541;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,5:207:55:55,0,442 chrIX 391660 . G T 121.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.512;DP=208;Dels=0.00;FS=13.439;HaplotypeScore=33.4527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.36;MQ0=120;MQRankSum=-1.852;QD=0.58;ReadPosRankSum=1.314;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,60:208:99:151,0,415 chrIX 391661 . G A 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.730;DP=204;Dels=0.00;FS=12.511;HaplotypeScore=39.5166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.59;MQ0=116;MQRankSum=3.182;QD=0.13;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,5:204:56:56,0,511 chrIX 391671 . G A 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.731;DP=195;Dels=0.00;FS=12.344;HaplotypeScore=31.6779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.50;MQ0=107;MQRankSum=3.281;QD=0.06;ReadPosRankSum=0.523;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,5:195:42:42,0,465 chrIX 391672 . T A 171.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;DP=195;Dels=0.00;FS=25.937;HaplotypeScore=27.6623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.31;MQ0=108;MQRankSum=3.013;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.552;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,81:195:99:201,0,302 chrIX 391673 . A G 172.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.747;DP=195;Dels=0.00;FS=29.006;HaplotypeScore=27.6623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.31;MQ0=108;MQRankSum=2.902;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.197;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,82:195:99:202,0,306 chrIX 391674 . C A 16.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;DP=193;Dels=0.00;FS=12.412;HaplotypeScore=34.5286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.37;MQ0=106;MQRankSum=3.438;QD=0.08;ReadPosRankSum=1.067;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,5:193:46:46,0,468 chrIX 391703 . C G 30.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;DP=138;Dels=0.00;FS=11.488;HaplotypeScore=41.1427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.67;MQ0=66;MQRankSum=3.234;QD=0.22;ReadPosRankSum=0.111;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,5:138:60:60,0,407 chrIX 391704 . T A 37.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.301;DP=133;Dels=0.00;FS=11.488;HaplotypeScore=36.1779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.91;MQ0=61;MQRankSum=3.301;QD=0.28;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,5:133:67:67,0,407 chrIX 391705 . G A 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.489;DP=133;Dels=0.00;FS=11.443;HaplotypeScore=36.1779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.91;MQ0=61;MQRankSum=3.284;QD=0.29;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,5:133:69:69,0,358 chrIX 391711 . G A 178.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.943;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.4215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.52;MQ0=45;MQRankSum=-4.587;QD=1.58;ReadPosRankSum=2.405;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,101:113:99:208,0,123 chrIX 391717 . T A 99.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;DP=114;Dels=0.00;FS=6.623;HaplotypeScore=10.9955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.30;MQ0=45;MQRankSum=-0.502;QD=0.87;ReadPosRankSum=1.785;SB=-6.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:129,0,228 chrIX 391718 . A G 75.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;DP=114;Dels=0.00;FS=6.623;HaplotypeScore=10.9955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.30;MQ0=45;MQRankSum=-0.297;QD=0.66;ReadPosRankSum=1.640;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:105,0,235 chrIX 391723 . A T 53.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.118;DP=123;Dels=0.00;FS=27.930;HaplotypeScore=4.4868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.66;MQ0=54;MQRankSum=0.786;QD=0.43;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,44:123:83:83,0,234 chrIX 391750 . G T 417.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.983;DP=133;Dels=0.00;FS=5.693;HaplotypeScore=4.9869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.60;MQ0=49;MQRankSum=1.414;QD=3.14;ReadPosRankSum=-2.215;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,33:133:99:447,0,506 chrIX 391786 . G A 167.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.352;DP=244;Dels=0.00;FS=10.405;HaplotypeScore=26.1160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.53;MQ0=76;MQRankSum=-0.454;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.414;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,27:244:99:197,0,2184 chrIX 391789 . A G 1779.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.483;DP=245;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=30.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.50;MQ0=77;MQRankSum=3.898;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.684;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,127:245:99:1809,0,617 chrIX 391806 . C T 2253.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;DP=349;Dels=0.00;FS=3.323;HaplotypeScore=61.5837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.93;MQ0=78;MQRankSum=6.299;QD=6.46;ReadPosRankSum=4.503;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,148:349:99:2283,0,1518 chrIX 391819 . A G 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.237;DP=435;Dels=0.00;FS=10.788;HaplotypeScore=43.0555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.35;MQ0=81;MQRankSum=-5.890;QD=0.07;ReadPosRankSum=1.587;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:348,87:435:61:61,0,5155 chrIX 391831 . T G 1476.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-13.549;DP=455;Dels=0.00;FS=35.461;HaplotypeScore=14.4493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.26;MQ0=70;MQRankSum=-7.408;QD=3.24;ReadPosRankSum=1.014;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,224:455:99:1506,0,3897 chrIX 391837 . G A 7180.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.986;DP=476;Dels=0.00;FS=20.132;HaplotypeScore=13.3996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.06;MQ0=72;MQRankSum=-1.708;QD=15.08;ReadPosRankSum=3.772;SB=-3.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,466:476:99:7180,637,0 chrIX 391849 . A T 4138.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.136;DP=482;Dels=0.00;FS=7.052;HaplotypeScore=19.2905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.45;MQ0=72;MQRankSum=3.513;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.734;SB=-2.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,295:482:99:4138,0,1449 chrIX 391894 . A T 122.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;DP=387;Dels=0.00;FS=3.906;HaplotypeScore=32.0124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.00;MQ0=33;MQRankSum=-2.653;QD=0.32;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:321,66:387:99:152,0,4349 chrIX 391909 . A G 923.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-13.101;DP=403;Dels=0.00;FS=12.977;HaplotypeScore=63.2489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.16;MQ0=40;MQRankSum=2.447;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.343;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:299,104:403:99:953,0,3671 chrIX 391921 . T G 637.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.162;DP=395;Dels=0.00;FS=2.004;HaplotypeScore=38.0042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.01;MQ0=49;MQRankSum=-7.273;QD=1.61;ReadPosRankSum=-3.730;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,137:395:99:667,0,4148 chrIX 391933 . C A,T 5415.01 filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=404;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=80.2068;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=32.74;MQ0=44;QD=13.40;SB=-2.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,59,332:391:99:5415,4564,4450,851,0,290 chrIX 391934 . A G 254.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.539;DP=406;Dels=0.03;FS=15.999;HaplotypeScore=96.4244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.74;MQ0=44;MQRankSum=-0.865;QD=0.63;ReadPosRankSum=-2.985;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:333,60:393:99:284,0,4462 chrIX 391990 . A G 1601.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-16.571;DP=527;Dels=0.00;FS=5.705;HaplotypeScore=26.9668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.58;MQ0=51;MQRankSum=-1.578;QD=3.04;ReadPosRankSum=4.557;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:354,173:527:99:1631,0,5005 chrIX 392002 . G T 3346.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.460;DP=424;Dels=0.00;FS=4.734;HaplotypeScore=20.2768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.26;MQ0=42;MQRankSum=-0.496;QD=7.89;ReadPosRankSum=-6.166;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,253:424:99:3346,0,1750 chrIX 392038 . G A 186.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.388;DP=222;Dels=0.00;FS=32.576;HaplotypeScore=30.4189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.03;MQ0=36;MQRankSum=-0.823;QD=0.84;ReadPosRankSum=-3.301;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,48:222:99:216,0,2058 chrIX 392041 . A G 1652.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.756;DP=204;Dels=0.00;FS=24.654;HaplotypeScore=32.3656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.05;MQ0=35;MQRankSum=1.189;QD=8.10;ReadPosRankSum=5.179;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,125:204:99:1682,0,398 chrIX 392058 . C T 410.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;DP=173;Dels=0.00;FS=16.399;HaplotypeScore=30.4913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.74;MQ0=46;MQRankSum=0.196;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,52:173:99:440,0,678 chrIX 392074 . G A 765.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.713;DP=151;Dels=0.00;FS=26.448;HaplotypeScore=27.7223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.94;MQ0=47;MQRankSum=1.742;QD=5.07;ReadPosRankSum=-4.344;SB=-1.045e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,85:151:99:795,0,111 chrIX 392077 . G A 1228 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.619;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.6690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.49;MQ0=46;MQRankSum=0.186;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.670;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:1261,128,0 chrIX 392083 . T G 643.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.618;DP=208;Dels=0.00;FS=10.764;HaplotypeScore=31.1943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.41;MQ0=62;MQRankSum=-2.516;QD=3.09;ReadPosRankSum=2.904;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,140:208:99:673,0,737 chrIX 392089 . G A 2407 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=255;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.9228;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.18;MQ0=63;QD=9.44;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,252:255:99:2440,288,0 chrIX 392095 . A T 166.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.007;DP=300;Dels=0.00;FS=54.285;HaplotypeScore=88.4101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.29;MQ0=65;MQRankSum=-1.707;QD=0.55;ReadPosRankSum=5.794;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,49:300:99:196,0,2345 chrIX 392096 . G A 141.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;DP=300;Dels=0.00;FS=65.954;HaplotypeScore=88.4101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.29;MQ0=65;MQRankSum=-1.625;QD=0.47;ReadPosRankSum=6.069;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,46:300:99:171,0,2305 chrIX 392101 . A T 887.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;DP=307;Dels=0.00;FS=1.176;HaplotypeScore=89.2877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.09;MQ0=71;MQRankSum=2.266;QD=2.89;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,106:307:99:917,0,1643 chrIX 392128 . G T 301.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.832;DP=358;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=34.3416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.61;MQ0=107;MQRankSum=-1.606;QD=0.84;ReadPosRankSum=1.726;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,95:358:99:331,0,2225 chrIX 392140 . T A 1097.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.722;DP=356;Dels=0.00;FS=0.536;HaplotypeScore=52.3032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.58;MQ0=109;MQRankSum=-0.391;QD=3.08;ReadPosRankSum=-3.957;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,140:356:99:1127,0,1456 chrIX 392141 . A G 1066.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.945;DP=356;Dels=0.00;FS=0.536;HaplotypeScore=53.2948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.58;MQ0=109;MQRankSum=-0.330;QD=2.99;ReadPosRankSum=-4.150;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,140:356:99:1096,0,1482 chrIX 392146 . A T 386.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.854;DP=346;Dels=0.00;FS=23.575;HaplotypeScore=49.6276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.81;MQ0=108;MQRankSum=0.397;QD=1.12;ReadPosRankSum=-6.878;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,63:346:99:416,0,2207 chrIX 392164 . G A 366.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.805;DP=286;Dels=0.00;FS=18.743;HaplotypeScore=60.8316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.31;MQ0=99;MQRankSum=-0.553;QD=1.28;ReadPosRankSum=-8.648;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,57:286:99:396,0,1751 chrIX 392167 . A G 604.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.430;DP=282;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=77.0478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.33;MQ0=97;MQRankSum=0.631;QD=2.14;ReadPosRankSum=4.233;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,110:282:99:634,0,1549 chrIX 392184 . C T 319.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.858;DP=199;Dels=0.00;FS=4.021;HaplotypeScore=38.3732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.42;MQ0=93;MQRankSum=-0.490;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.757;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,63:199:99:349,0,923 chrIX 392197 . A G 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.211;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.2985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.00;MQ0=105;MQRankSum=0.555;QD=0.31;ReadPosRankSum=-2.250;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:79:79,0,212 chrIX 392209 . G T 105.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.920;DP=166;Dels=0.00;FS=8.539;HaplotypeScore=15.2465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.07;MQ0=105;MQRankSum=2.095;QD=0.63;ReadPosRankSum=3.216;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,37:166:99:135,0,176 chrIX 392221 . T A 88.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;DP=165;Dels=0.01;FS=1.158;HaplotypeScore=10.7733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.07;MQ0=106;MQRankSum=2.251;QD=0.53;ReadPosRankSum=2.803;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,39:163:99:118,0,186 chrIX 392222 . A G 86.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.231;DP=165;Dels=0.01;FS=2.478;HaplotypeScore=11.6399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.07;MQ0=106;MQRankSum=2.181;QD=0.52;ReadPosRankSum=2.412;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,40:163:99:116,0,185 chrIX 392233 . A G 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.790;DP=141;Dels=0.00;FS=8.601;HaplotypeScore=2.6492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.84;MQ0=91;MQRankSum=2.316;QD=0.27;ReadPosRankSum=0.327;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,11:141:68:68,0,180 chrIX 392245 . G A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.388;DP=123;Dels=0.00;FS=1.907;HaplotypeScore=8.2467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.41;MQ0=77;MQRankSum=1.623;QD=0.08;ReadPosRankSum=-1.412;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,8:123:40:40,0,195 chrIX 392248 . A G 114.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.322;DP=122;Dels=0.00;FS=1.271;HaplotypeScore=16.2880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.11;MQ0=77;MQRankSum=-1.866;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:93:144,0,93 chrIX 392302 . T A 68.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;DP=126;Dels=0.02;FS=1.585;HaplotypeScore=4.8796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.97;MQ0=97;MQRankSum=2.271;QD=0.54;ReadPosRankSum=0.803;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,45:124:95:98,0,95 chrIX 392303 . A G 66.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;DP=126;Dels=0.02;FS=1.585;HaplotypeScore=5.8663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.97;MQ0=97;MQRankSum=2.455;QD=0.52;ReadPosRankSum=1.032;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,45:124:93:96,0,93 chrIX 392491 . T A 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;DP=87;Dels=0.00;FS=17.433;HaplotypeScore=3.6882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.50;MQ0=68;MQRankSum=0.124;QD=0.41;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:39:66,0,39 chrIX 392492 . A G 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;DP=87;Dels=0.00;FS=17.433;HaplotypeScore=3.6882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.50;MQ0=68;MQRankSum=0.041;QD=0.41;ReadPosRankSum=-1.280;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:40:66,0,40 chrIX 392554 . A G 122.02 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.118;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.36;MQ0=31;MQRankSum=3.307;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.598;SB=-1.039e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:23:152,0,23 chrIX 392575 . A G 150.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;DP=41;Dels=0.00;FS=1.808;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.49;MQ0=20;MQRankSum=0.398;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.760;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:25:180,0,25 chrIX 392616 . C T 194.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;DP=35;Dels=0.00;FS=1.810;HaplotypeScore=5.5011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.94;MQ0=10;MQRankSum=3.056;QD=5.54;ReadPosRankSum=-2.875;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:17:224,0,17 chrIX 392619 . A T 156.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.61;MQ0=10;MQRankSum=2.419;QD=4.59;ReadPosRankSum=-3.337;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:25:186,0,25 chrIX 392635 . A G 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.777;DP=23;Dels=0.00;FS=15.355;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.47;MQ0=10;MQRankSum=-0.312;QD=1.17;ReadPosRankSum=1.369;SB=-1.297e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:57:57,0,63 chrIX 392652 . C T 63.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;DP=57;Dels=0.00;FS=1.322;HaplotypeScore=12.1000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.96;MQ0=14;MQRankSum=-0.988;QD=1.11;ReadPosRankSum=3.100;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:93:93,0,217 chrIX 392668 . A G 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.966;DP=68;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=27.9473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.67;MQ0=13;MQRankSum=1.589;QD=0.40;ReadPosRankSum=1.273;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:57:57,0,424 chrIX 392677 . G T 268.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.813;DP=67;Dels=0.00;FS=1.027;HaplotypeScore=36.4438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.13;MQ0=11;MQRankSum=1.351;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:298,0,214 chrIX 392689 . T A 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=53.2372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.49;MQ0=5;MQRankSum=0.363;QD=0.19;ReadPosRankSum=2.218;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:42:42,0,402 chrIX 392690 . A G 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=52.2975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.56;MQ0=5;MQRankSum=0.577;QD=0.20;ReadPosRankSum=2.412;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:43:43,0,573 chrIX 392697 . C T 73.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=58.7648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.68;MQ0=4;MQRankSum=3.271;QD=1.12;ReadPosRankSum=-3.167;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,9:65:99:103,0,482 chrIX 392704 . A G 471.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;DP=75;Dels=0.00;FS=12.055;HaplotypeScore=28.7461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.05;MQ0=4;MQRankSum=-3.552;QD=6.28;ReadPosRankSum=4.124;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,56:75:99:501,0,331 chrIX 392722 . T G 248.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.935;DP=96;Dels=0.00;FS=5.581;HaplotypeScore=12.5300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.21;MQ0=4;MQRankSum=-3.462;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.491;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:96:99:278,0,995 chrIX 392728 . G A 202.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.641;DP=110;Dels=0.00;FS=6.884;HaplotypeScore=21.9311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.04;MQ0=4;MQRankSum=-5.909;QD=1.84;ReadPosRankSum=-3.315;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,43:110:99:232,0,1206 chrIX 392771 . G C 632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.061;DP=123;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.267;QD=5.14;ReadPosRankSum=1.033;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,47:123:99:662,0,1604 chrIX 392776 . A G 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.28;MQ0=0;QD=22.77;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2834,321,0 chrIX 392788 . T A 670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;DP=120;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.842;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.297;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:120:99:700,0,1601 chrIX 392791 . A G 646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.247;DP=120;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.824;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:120:99:676,0,1563 chrIX 392833 . T A 1324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.550;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=23.23;ReadPosRankSum=1.185;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:1357,153,0 chrIX 392834 . G C 1123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=22.46;ReadPosRankSum=1.663;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:1156,113,0 chrIX 392873 . G C 308 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.10;MQ0=0;QD=9.06;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:39:341,39,0 chrIX 392929 . C T 1947 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.937;DP=95;Dels=0.00;FS=5.312;HaplotypeScore=4.4996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=20.49;ReadPosRankSum=1.436;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,91:95:99:1980,173,0 chrIX 392932 . G T 1907 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.285;DP=93;Dels=0.00;FS=5.329;HaplotypeScore=80.4974;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.37;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=20.51;ReadPosRankSum=1.202;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,89:93:99:1940,176,0 chrIX 392939 . C G 1868 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.070;DP=88;Dels=0.00;FS=5.346;HaplotypeScore=91.4277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=21.23;ReadPosRankSum=0.310;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,84:88:99:1901,172,0 chrIX 392998 . G A 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.050;DP=71;Dels=0.00;FS=1.499;HaplotypeScore=18.8671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.843;QD=0.69;ReadPosRankSum=-2.134;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,9:71:79:79,0,1129 chrIX 393028 . G A 2090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.407;DP=94;Dels=0.00;FS=9.483;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.34;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=22.23;ReadPosRankSum=1.452;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,90:94:99:2123,225,0 chrIX 393067 . A G 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.35;MQ0=0;QD=22.79;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:3829,417,0 chrIX 393074 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.728;DP=176;Dels=0.00;FS=2.839;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.36;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=8.52;ReadPosRankSum=2.286;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,77:176:99:1530,0,1715 chrIX 393106 . C T 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.26;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3696,399,0 chrIX 393138 . T C 139.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.548;DP=169;Dels=0.00;FS=30.724;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.61;MQ0=0;MQRankSum=-3.634;QD=0.82;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,29:169:99:169,0,3303 chrIX 393156 . C T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.288;DP=157;Dels=0.00;FS=2.284;HaplotypeScore=31.6417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.626;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:157:99:1303,0,1331 chrIX 393177 . G C,T 3814.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=47.18;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,31,133:165:99:3814,3180,3099,634,0,262 chrIX 393181 . G A 4304.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.72;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:4304,462,0 chrIX 393186 . T A 373.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;DP=181;Dels=0.00;FS=2.432;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.63;MQ0=0;MQRankSum=-6.688;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.901;SB=-1.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,37:181:99:403,0,3363 chrIX 393195 . G C 576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.561;DP=204;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQ0=0;MQRankSum=-6.386;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.052;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,47:204:99:606,0,3562 chrIX 393220 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.601;DP=194;Dels=0.00;FS=1.847;HaplotypeScore=3.9438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQ0=0;MQRankSum=4.898;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,70:194:99:1323,0,2598 chrIX 393280 . A G 5579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.30;MQ0=0;QD=25.24;SB=-2.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5579,588,0 chrIX 393336 . T C 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.274;DP=177;Dels=0.00;FS=23.896;HaplotypeScore=44.6252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.60;MQ0=0;MQRankSum=-7.599;QD=0.21;ReadPosRankSum=-4.644;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,41:177:68:68,0,3101 chrIX 393338 . T C 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.059;DP=178;Dels=0.00;FS=4.387;HaplotypeScore=44.0468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.68;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=9.00;ReadPosRankSum=-2.108;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,82:178:99:1632,0,1450 chrIX 393359 . C T 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.163;DP=164;Dels=0.00;FS=4.765;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.918;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,101:164:99:1777,0,1188 chrIX 393395 . C G 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;DP=146;Dels=0.00;FS=3.213;HaplotypeScore=32.4016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.291;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,100:146:99:1918,0,680 chrIX 393403 . C A,T 3582.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;DP=169;Dels=0.00;FS=3.026;HaplotypeScore=4.6759;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=49.49;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=21.20;ReadPosRankSum=0.007;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,71,96:169:99:3582,2015,1876,1529,0,1324 chrIX 393406 . C T 4251.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6692;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=24.29;ReadPosRankSum=0.663;SB=-2.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:4251,450,0 chrIX 393415 . A G 4292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8198;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.384;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,184:185:99:4292,449,0 chrIX 393423 . T C 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.366;DP=188;Dels=0.00;FS=2.805;HaplotypeScore=6.0795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.92;MQ0=0;MQRankSum=-6.874;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.009;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,59:188:99:850,0,2758 chrIX 393506 . T G 1308.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.322;DP=228;Dels=0.00;FS=9.179;HaplotypeScore=3.5043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.089;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,76:228:99:1338,0,3300 chrIX 393511 . C T 5326.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.0567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=23.99;SB=-2.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:222:99:5326,558,0 chrIX 393516 . C T 5458.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.59;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,210:210:99:5458,556,0 chrIX 393592 . T A 5406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.75;MQ0=0;QD=25.03;SB=-2.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:5406,573,0 chrIX 393622 . C T 5072.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.69;MQ0=0;QD=25.49;SB=-2.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:199:99:5072,534,0 chrIX 393627 . T A 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;DP=211;Dels=0.00;FS=1.145;HaplotypeScore=3.4282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.865;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,67:211:99:1148,0,3162 chrIX 393657 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.163;DP=196;Dels=0.00;FS=3.505;HaplotypeScore=8.5134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.010;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,68:196:99:1201,0,2678 chrIX 393659 . A G 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.167;DP=194;Dels=0.00;FS=3.544;HaplotypeScore=8.5134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.618;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.916;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,69:194:99:1121,0,2726 chrIX 393711 . T G 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.624;DP=162;Dels=0.00;FS=5.397;HaplotypeScore=8.7807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.31;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=4.46;ReadPosRankSum=2.507;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,45:162:99:753,0,2341 chrIX 393738 . C T 3924.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.64;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3924,426,0 chrIX 393745 . T G 3862.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.6938;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.46;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3862,426,0 chrIX 393746 . A T 3699.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.6938;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=22.55;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,163:164:99:3699,411,0 chrIX 393794 . G A 5011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=201.7093;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=22.88;SB=-2.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:219:99:5011,529,0 chrIX 393829 . T C 5673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=245;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.72;MQ0=0;QD=23.16;SB=-2.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,245:245:99:5673,606,0 chrIX 393886 . G C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.404;DP=235;Dels=0.00;FS=1.128;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,69:235:99:1015,0,3430 chrIX 393889 . A C 5903.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=25.44;SB=-2.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,232:232:99:5903,648,0 chrIX 393931 . T A 5461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,213:213:99:5461,571,0 chrIX 393945 . C T 4918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.95;MQ0=0;QD=26.44;SB=-2.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4918,514,0 chrIX 393995 . A G 716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.761;DP=184;Dels=0.00;FS=2.942;HaplotypeScore=4.7020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.616;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,50:184:99:746,0,2979 chrIX 394019 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.648;DP=192;Dels=0.00;FS=2.598;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.017;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,75:192:99:1401,0,2712 chrIX 394030 . A G 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.000;DP=218;Dels=0.00;FS=1.082;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.731;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,81:218:99:1352,0,3084 chrIX 394094 . T C 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.968;DP=220;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=3.7373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.312;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,72:220:99:1249,0,3242 chrIX 394156 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.390;DP=246;Dels=0.00;FS=3.947;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.875;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,73:246:99:1146,0,3706 chrIX 394211 . T G 4929.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=25.28;SB=-2.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:4929,546,0 chrIX 394214 . G A 5073.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=25.75;SB=-2.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:5073,537,0 chrIX 394234 . G A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.803;DP=194;Dels=0.00;FS=15.317;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=5.54;ReadPosRankSum=-1.088;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,61:194:99:1104,0,2867 chrIX 394293 . A G 2458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.712;DP=190;Dels=0.00;FS=11.993;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,122:190:99:2488,0,1332 chrIX 394357 . T A 590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;DP=211;Dels=0.00;FS=4.041;HaplotypeScore=2.9132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.649;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,47:211:99:620,0,3634 chrIX 394371 . C G 5412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.83;MQ0=0;QD=24.94;SB=-2.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,217:217:99:5412,588,0 chrIX 394423 . T C 7540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=300;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=25.13;SB=-3.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,300:300:99:7540,807,0 chrIX 394427 . C T 3320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.814;DP=295;Dels=0.00;FS=3.847;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=11.25;ReadPosRankSum=-1.869;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,162:295:99:3320,0,2402 chrIX 394650 . T C 4974.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4974,543,0 chrIX 394651 . C T 5189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;DP=198;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=26.21;ReadPosRankSum=1.714;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,195:196:99:5189,558,0 chrIX 394680 . A G 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.651;DP=257;Dels=0.00;FS=1.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.412;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.258;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,66:257:99:896,0,4285 chrIX 394739 . A G 3519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.457;DP=218;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=4.5256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.255;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,168:218:99:3519,0,690 chrIX 394808 . A G 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.307;DP=215;Dels=0.00;FS=4.637;HaplotypeScore=180.3009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=0;MQRankSum=-3.891;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,57:215:99:881,0,2587 chrIX 394846 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.995;DP=233;Dels=0.00;FS=1.693;HaplotypeScore=5.8629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=0;MQRankSum=3.136;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,78:233:99:1429,0,2531 chrIX 394847 . T C 4661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=21.19;SB=-2.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:4661,504,0 chrIX 394906 . A T 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.634;DP=177;Dels=0.00;FS=2.666;HaplotypeScore=28.8171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=0.14;ReadPosRankSum=2.075;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,29:177:54:54,0,3496 chrIX 394916 . A G 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.077;DP=165;Dels=0.00;FS=8.835;HaplotypeScore=27.4168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQ0=0;MQRankSum=2.724;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.467;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,51:165:99:833,0,2468 chrIX 394975 . G A 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.821;DP=218;Dels=0.00;FS=21.556;HaplotypeScore=6.7679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQ0=0;MQRankSum=2.176;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.064;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,61:217:99:893,0,2805 chrIX 394992 . A G 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;DP=194;Dels=0.00;FS=35.244;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,66:194:99:877,0,2513 chrIX 395011 . T C 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3473,369,0 chrIX 395026 . T G 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.508;DP=155;Dels=0.00;FS=2.891;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.573;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,55:155:99:858,0,1994 chrIX 395062 . G A 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.898;DP=167;Dels=0.00;FS=6.503;HaplotypeScore=2.3346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.146;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,51:167:99:888,0,2390 chrIX 395073 . C A 2407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.019;DP=168;Dels=0.00;FS=2.916;HaplotypeScore=4.5890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=2.435;QD=14.33;ReadPosRankSum=1.402;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,108:168:99:2437,0,1067 chrIX 395123 . T C 2921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.296;DP=203;Dels=0.00;FS=1.883;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,140:203:99:2951,0,1129 chrIX 395125 . A G 5287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7047;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5287,573,0 chrIX 395136 . A G 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.467;DP=195;Dels=0.00;FS=3.649;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.814;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,58:195:99:878,0,2859 chrIX 395274 . C T 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.750;DP=153;Dels=0.00;FS=5.665;HaplotypeScore=46.4741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.069;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,49:153:99:846,0,2251 chrIX 395275 . C T 2221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.608;DP=148;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=47.4688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=15.01;ReadPosRankSum=1.976;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,100:148:99:2251,0,784 chrIX 395303 . G A 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.152;DP=123;Dels=0.00;FS=1.614;HaplotypeScore=2.5894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=6.11;ReadPosRankSum=1.923;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,44:123:99:782,0,1689 chrIX 395356 . C T 3138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.765;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.790;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,147:198:99:3168,0,753 chrIX 395422 . T A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;DP=218;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.672;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,69:218:99:1155,0,3304 chrIX 395439 . T G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.740;DP=203;Dels=0.00;FS=2.557;HaplotypeScore=4.3173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.510;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,67:203:99:1172,0,2923 chrIX 395469 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.850;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,72:206:99:1246,0,2977 chrIX 395561 . T C 1893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.928;DP=174;Dels=0.00;FS=7.702;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=10.88;ReadPosRankSum=-2.383;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,99:174:99:1923,0,1459 chrIX 395574 . T C 1938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.851;DP=181;Dels=0.00;FS=11.255;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.127;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,101:181:99:1968,0,1597 chrIX 395693 . T C 2600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.938;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.257;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.818;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,131:208:99:2630,0,1354 chrIX 395873 . A G 3161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.422;DP=222;Dels=0.00;FS=1.774;HaplotypeScore=16.8119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,151:221:99:3191,0,1241 chrIX 395890 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.161;DP=212;Dels=0.00;FS=3.504;HaplotypeScore=3.9558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=4.60;ReadPosRankSum=2.992;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,61:212:99:1005,0,3323 chrIX 395904 . G A 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.392;DP=214;Dels=0.00;FS=6.627;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.229;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,57:214:99:919,0,3417 chrIX 395916 . C T 5665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.024;DP=219;Dels=0.00;FS=3.234;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=25.87;ReadPosRankSum=1.178;SB=-2.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,218:219:99:5665,552,0 chrIX 395990 . G A 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.450;DP=201;Dels=0.00;FS=1.133;HaplotypeScore=3.6658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.190;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,80:201:99:1584,0,2571 chrIX 396021 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.519;DP=169;Dels=0.00;FS=1.213;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.205;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,71:169:99:1270,0,2121 chrIX 396038 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.766;DP=173;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,74:173:99:1384,0,2028 chrIX 396045 . T G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.860;DP=162;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,67:162:99:1176,0,2006 chrIX 396080 . T A 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;DP=146;Dels=0.00;FS=7.484;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,37:146:99:609,0,2358 chrIX 396138 . C T 2849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.440;DP=203;Dels=0.00;FS=1.171;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.197;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,128:203:99:2879,0,1337 chrIX 396186 . A G 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.148;DP=213;Dels=0.00;FS=7.574;HaplotypeScore=4.9547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=4.19;ReadPosRankSum=-1.819;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,73:213:99:923,0,3122 chrIX 396227 . A T 711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;DP=183;Dels=0.00;FS=6.973;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=3.89;ReadPosRankSum=2.313;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,61:183:99:741,0,2769 chrIX 396307 . C A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.770;DP=221;Dels=0.00;FS=1.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.743;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,68:221:99:1196,0,3308 chrIX 396434 . C G 4769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.61;MQ0=0;QD=24.21;SB=-2.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:4769,557,0 chrIX 396463 . G A 2471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.651;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.898;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.241;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,124:209:99:2501,0,1574 chrIX 396464 . T C 2559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.968;DP=215;Dels=0.00;FS=0.510;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.965;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,130:215:99:2589,0,1664 chrIX 396489 . C T 2344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.620;DP=183;Dels=0.00;FS=8.984;HaplotypeScore=3.8267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.140;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.215;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,116:183:99:2374,0,1248 chrIX 396504 . G A 2061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.625;DP=161;Dels=0.00;FS=5.980;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-6.413;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.731;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,100:160:99:2091,0,1079 chrIX 396505 . C T 2105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.969;DP=170;Dels=0.00;FS=5.741;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=-5.940;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.752;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,107:170:99:2135,0,1082 chrIX 396557 . A G 2457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.526;DP=185;Dels=0.00;FS=0.560;HaplotypeScore=1.9664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=13.28;ReadPosRankSum=-1.658;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,118:185:99:2487,0,1228 chrIX 396639 . A G 3083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.699;DP=213;Dels=0.00;FS=0.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=14.47;ReadPosRankSum=2.161;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,150:213:99:3113,0,1055 chrIX 396649 . G C 3046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;DP=223;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=13.66;ReadPosRankSum=3.653;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,152:223:99:3076,0,1121 chrIX 396683 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.324;DP=230;Dels=0.00;FS=6.807;HaplotypeScore=3.4997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,77:230:99:1298,0,3252 chrIX 396692 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.263;DP=229;Dels=0.00;FS=1.697;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=2.290;QD=6.17;ReadPosRankSum=-2.572;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,80:229:99:1443,0,2963 chrIX 396734 . G C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;DP=188;Dels=0.00;FS=9.327;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=2.394;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.851;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,63:188:99:1121,0,2679 chrIX 396753 . C T 2811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.740;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.7275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=1;MQRankSum=0.366;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.928;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,131:211:99:2841,0,1415 chrIX 396773 . T A 2885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=1;MQRankSum=-0.524;QD=14.50;ReadPosRankSum=-1.035;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,134:199:99:2915,0,1103 chrIX 396834 . C T 3332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.087;DP=221;Dels=0.00;FS=5.273;HaplotypeScore=6.6387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=1;MQRankSum=0.992;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,158:221:99:3332,0,921 chrIX 396851 . T C 2823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.546;DP=195;Dels=0.00;FS=9.630;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.111;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,139:195:99:2853,0,937 chrIX 396889 . C T 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.108;DP=267;Dels=0.00;FS=1.015;HaplotypeScore=9.4042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=2.080;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.607;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,84:267:99:1473,0,3954 chrIX 396902 . C T 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.624;DP=230;Dels=0.00;FS=1.757;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.712;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,71:230:99:1222,0,3251 chrIX 396906 . A G 5792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6855;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=25.29;SB=-2.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,229:229:99:5792,618,0 chrIX 396988 . T A 2484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.065;DP=201;Dels=0.00;FS=12.373;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.619;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,116:201:99:2514,0,1714 chrIX 397058 . A G 2367.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.393;DP=187;Dels=0.00;FS=1.842;HaplotypeScore=1.9411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=12.66;ReadPosRankSum=-2.031;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,116:187:99:2397,0,1347 chrIX 397061 . C T 1163.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.933;DP=180;Dels=0.00;FS=4.498;HaplotypeScore=2.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=6.46;ReadPosRankSum=2.234;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,67:180:99:1193,0,2398 chrIX 397063 . T C 4501.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4501,483,0 chrIX 397090 . C T 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.859;DP=138;Dels=0.00;FS=10.843;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=13.49;ReadPosRankSum=3.575;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,84:138:99:1892,0,1001 chrIX 397113 . T A 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.621;DP=142;Dels=0.00;FS=7.922;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.81;MQ0=0;MQRankSum=2.398;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,51:142:99:922,0,2068 chrIX 397230 . T A 3090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.014;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.96;MQ0=0;MQRankSum=-4.956;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.052;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,137:217:99:3120,0,1519 chrIX 397285 . A C 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;DP=186;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,50:186:99:760,0,2979 chrIX 397305 . G A 2453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.101;DP=219;Dels=0.00;FS=5.650;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=11.20;ReadPosRankSum=2.218;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,125:219:99:2483,0,1864 chrIX 397309 . A T 2592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.657;DP=223;Dels=0.00;FS=1.670;HaplotypeScore=2.7474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=11.62;ReadPosRankSum=2.358;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,126:223:99:2622,0,1994 chrIX 397426 . G A 2093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.813;DP=178;Dels=0.00;FS=1.877;HaplotypeScore=3.3954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.407;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,100:178:99:2123,0,1452 chrIX 397439 . C A 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.061;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,86:158:99:1708,0,1412 chrIX 397547 . T A 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.743;DP=170;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=4.94;ReadPosRankSum=2.000;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,52:170:99:869,0,2624 chrIX 397575 . C T 2622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.335;DP=182;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.420;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,121:182:99:2652,0,1047 chrIX 397626 . A C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.557;DP=183;Dels=0.00;FS=2.593;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.182;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,75:183:99:1326,0,2338 chrIX 397647 . C T 2667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.502;DP=202;Dels=0.00;FS=9.436;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.760;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,124:202:99:2697,0,1444 chrIX 397671 . G T 2409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.210;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=11.93;ReadPosRankSum=2.056;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,122:202:99:2439,0,1555 chrIX 397755 . C T 2634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.512;DP=214;Dels=0.00;FS=1.079;HaplotypeScore=4.8607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=12.31;ReadPosRankSum=2.144;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,123:214:99:2664,0,1732 chrIX 397837 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.667;DP=190;Dels=0.00;FS=3.486;HaplotypeScore=4.4801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,68:190:99:1173,0,2770 chrIX 397968 . T C 2525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.600;DP=218;Dels=0.00;FS=6.665;HaplotypeScore=9.6138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=1;MQRankSum=-0.261;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.208;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,131:218:99:2555,0,1626 chrIX 397974 . G A 2717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.387;DP=216;Dels=0.00;FS=5.796;HaplotypeScore=9.8587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=1;MQRankSum=1.786;QD=12.58;ReadPosRankSum=-1.858;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,131:216:99:2747,0,1493 chrIX 398084 . G A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.589;DP=223;Dels=0.00;FS=1.743;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,73:223:99:1258,0,3082 chrIX 398092 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.833;DP=221;Dels=0.00;FS=1.809;HaplotypeScore=4.7680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.560;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,69:221:99:1201,0,3129 chrIX 398246 . T C 2996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.584;DP=225;Dels=0.00;FS=3.962;HaplotypeScore=5.8915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=13.32;ReadPosRankSum=-1.941;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,144:225:99:3026,0,1444 chrIX 398250 . C T 3025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.845;DP=221;Dels=0.00;FS=3.163;HaplotypeScore=5.8048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=13.69;ReadPosRankSum=-1.363;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,141:221:99:3055,0,1379 chrIX 398376 . A C 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.491;DP=180;Dels=0.00;FS=25.222;HaplotypeScore=2.8840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,54:180:99:791,0,2869 chrIX 398401 . T C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.736;DP=163;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.967;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,61:163:99:1108,0,2220 chrIX 398416 . C T 2545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.586;DP=165;Dels=0.00;FS=9.105;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,114:165:99:2575,0,772 chrIX 398448 . C A 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.584;DP=169;Dels=0.00;FS=6.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.228;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.567;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,51:169:99:805,0,2459 chrIX 398457 . G C 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.834e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:3985,450,0 chrIX 398466 . T A 4295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=25.72;SB=-2.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4295,444,0 chrIX 398482 . T G 4351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=24.58;SB=-2.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4351,456,0 chrIX 398494 . T C 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.319;DP=157;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=3.1706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.275;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,58:157:99:984,0,2116 chrIX 398533 . G C 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.360;DP=186;Dels=0.00;FS=1.973;HaplotypeScore=60.1954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.895;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,57:186:99:934,0,2743 chrIX 398541 . C T 2678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.976;DP=189;Dels=0.00;FS=1.908;HaplotypeScore=55.1606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,126:189:99:2708,0,1151 chrIX 398583 . G C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;DP=191;Dels=0.00;FS=1.211;HaplotypeScore=8.4985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=6.26;ReadPosRankSum=-2.145;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,69:190:99:1225,0,2419 chrIX 398957 . A G 2715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.959;DP=192;Dels=0.00;FS=4.663;HaplotypeScore=5.7954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=0.638;QD=14.14;ReadPosRankSum=-1.387;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,135:192:99:2745,0,940 chrIX 399062 . C T 3289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.661;DP=237;Dels=0.00;FS=13.844;HaplotypeScore=6.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.404;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,151:237:99:3289,0,1545 chrIX 399239 . C T 4929.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=198;Dels=0.00;FS=3.238;HaplotypeScore=129.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.972;SB=-2.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,195:198:99:4929,505,0 chrIX 399252 . T A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,58:189:99:966,0,2766 chrIX 399281 . T C 2897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.536;DP=207;Dels=0.00;FS=4.426;HaplotypeScore=9.7650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,147:207:99:2927,0,903 chrIX 399357 . G A 2571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.375;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.04;MQ0=0;MQRankSum=-5.937;QD=13.60;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,120:189:99:2601,0,1117 chrIX 399370 . A C 2161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.877;DP=178;Dels=0.00;FS=1.991;HaplotypeScore=2.8082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.28;MQ0=0;MQRankSum=-7.561;QD=12.14;ReadPosRankSum=-2.345;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,117:178:99:2191,0,977 chrIX 399384 . G A 1954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.234;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.05;MQ0=0;MQRankSum=-9.217;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,103:161:99:1984,0,897 chrIX 399393 . C T 2016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.017;DP=170;Dels=0.00;FS=2.824;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.46;MQ0=0;MQRankSum=-9.872;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,110:170:99:2046,0,967 chrIX 399396 . T A 2051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.300;DP=165;Dels=0.00;FS=2.842;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.16;MQ0=0;MQRankSum=-9.727;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.222;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,105:165:99:2081,0,993 chrIX 399404 . G A 2217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;DP=179;Dels=0.00;FS=2.716;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.57;MQ0=0;MQRankSum=-8.510;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.238;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,115:179:99:2247,0,1042 chrIX 399414 . A G 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.08;MQ0=0;QD=21.33;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:3328,381,0 chrIX 399456 . C T 2524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.989;DP=171;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.983;QD=14.76;ReadPosRankSum=-2.105;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,115:171:99:2554,0,883 chrIX 399532 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.213;DP=249;Dels=0.00;FS=2.604;HaplotypeScore=4.7858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,87:249:99:1634,0,3218 chrIX 399545 . A T 3196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.240;DP=250;Dels=0.00;FS=1.189;HaplotypeScore=6.8421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.47;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=12.78;ReadPosRankSum=1.778;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,158:250:99:3226,0,1859 chrIX 399624 . T C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.746;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=6.01;ReadPosRankSum=-2.188;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,80:211:99:1299,0,2856 chrIX 399657 . A C 5317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:5317,558,0 chrIX 399998 . A G 2238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.544;DP=172;Dels=0.00;FS=1.422;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQ0=3;MQRankSum=-0.367;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,120:172:99:2268,0,870 chrIX 400007 . T A 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=154.8432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.95;MQ0=3;QD=19.75;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:175:99:3457,378,0 chrIX 400121 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.862;DP=216;Dels=0.00;FS=8.109;HaplotypeScore=4.1638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.234;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,76:216:99:1354,0,3032 chrIX 400141 . A G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.716;DP=239;Dels=0.00;FS=4.878;HaplotypeScore=5.1864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,76:239:99:1325,0,3613 chrIX 400481 . G A 3124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.287;DP=228;Dels=0.00;FS=3.146;HaplotypeScore=6.9791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.595;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,149:228:99:3154,0,1247 chrIX 400508 . C T 3276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.440;DP=244;Dels=0.00;FS=1.693;HaplotypeScore=3.2560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.931;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,150:244:99:3276,0,1576 chrIX 400841 . G C 2635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;DP=211;Dels=0.00;FS=1.102;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,133:211:99:2665,0,1378 chrIX 400889 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.249;DP=194;Dels=0.00;FS=3.449;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,67:194:99:1033,0,2665 chrIX 401170 . A G 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.637;DP=196;Dels=0.00;FS=14.964;HaplotypeScore=2.9286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.751;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,62:196:99:1030,0,3086 chrIX 401177 . T C,G 3758.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.15;MQ0=0;QD=22.24;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,57,112:169:99:3758,2527,2365,1231,0,922 chrIX 401181 . T C 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.023;DP=174;Dels=0.00;FS=5.814;HaplotypeScore=2.7442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,59:174:99:1062,0,2543 chrIX 401259 . C T 2794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.498;DP=189;Dels=0.00;FS=10.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=2.261;QD=14.78;ReadPosRankSum=1.053;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,129:189:99:2824,0,1065 chrIX 401266 . C T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.755;DP=191;Dels=0.00;FS=12.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.090;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,57:191:99:1002,0,2789 chrIX 401270 . C A 4624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4624,469,0 chrIX 401296 . A G 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;DP=184;Dels=0.00;FS=21.906;HaplotypeScore=5.5143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.130;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,59:184:99:1008,0,2653 chrIX 401375 . C T 4527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4527,483,0 chrIX 402055 . A G 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.569;DP=225;Dels=0.00;FS=4.277;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.771;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.318;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,63:225:99:958,0,3598 chrIX 402165 . T C 4798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=24.48;SB=-2.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4798,513,0 chrIX 402236 . C T 3177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.941;DP=205;Dels=0.00;FS=1.206;HaplotypeScore=6.3053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=15.50;ReadPosRankSum=1.556;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,146:205:99:3207,0,929 chrIX 402302 . T C 3056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.938;DP=219;Dels=0.00;FS=5.127;HaplotypeScore=3.8082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,151:219:99:3086,0,1182 chrIX 402516 . G A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.385;DP=174;Dels=0.00;FS=4.049;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=5.75;ReadPosRankSum=-2.502;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,59:174:99:1031,0,2316 chrIX 402533 . A T 2464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,116:177:99:2494,0,1114 chrIX 402823 . C T 5548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=228;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.33;SB=-2.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,228:228:99:5548,568,0 chrIX 402833 . A G 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.184;DP=221;Dels=0.00;FS=2.657;HaplotypeScore=2.6301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.693;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,61:221:99:932,0,3554 chrIX 403138 . T C 2887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.429;DP=207;Dels=0.00;FS=1.869;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,139:207:99:2917,0,1249 chrIX 403232 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.904;DP=205;Dels=0.00;FS=0.556;HaplotypeScore=4.7625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,68:205:99:1219,0,2688 chrIX 403261 . T C 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.920;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.584;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,62:198:99:983,0,3057 chrIX 403289 . A G 5093.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.91;SB=-2.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,213:213:99:5093,546,0 chrIX 403447 . C T 4368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.54;SB=-2.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4368,451,0 chrIX 403510 . C T 6357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3062;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.53;SB=-2.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,249:249:99:6357,661,0 chrIX 403621 . C T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.698;DP=216;Dels=0.00;FS=7.200;HaplotypeScore=4.6781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,70:216:99:1252,0,3176 chrIX 403622 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.489;DP=211;Dels=0.00;FS=9.675;HaplotypeScore=4.6781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.888;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,70:211:99:1274,0,2840 chrIX 403638 . C A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.273;DP=212;Dels=0.00;FS=2.637;HaplotypeScore=69.4883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.583;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.911;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,67:211:99:1175,0,2989 chrIX 403645 . G T 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.667;DP=235;Dels=0.00;FS=1.686;HaplotypeScore=67.5083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=6.39;ReadPosRankSum=-1.400;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,83:235:99:1531,0,3146 chrIX 403748 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.194;DP=211;Dels=0.00;FS=3.536;HaplotypeScore=3.4236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=2.540;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.333;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,73:211:99:1414,0,2967 chrIX 403760 . A G 5123.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,213:213:99:5123,534,0 chrIX 403814 . T C 5939.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.34;SB=-3.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,244:244:99:5939,627,0 chrIX 403850 . G A 5799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.48;SB=-2.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:219:99:5799,601,0 chrIX 403943 . C T 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.383;DP=230;Dels=0.00;FS=4.307;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=3.94;ReadPosRankSum=2.533;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,60:230:99:937,0,3328 chrIX 403997 . G A 4851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.43;SB=-2.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:4851,504,0 chrIX 404058 . C T 3123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.119;DP=204;Dels=0.00;FS=4.430;HaplotypeScore=4.7541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.040;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,142:204:99:3153,0,1022 chrIX 404267 . G A 3495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.232;DP=252;Dels=0.00;FS=5.921;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,170:252:99:3495,0,1344 chrIX 404297 . G A 3355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.542;DP=240;Dels=0.00;FS=9.836;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,152:240:99:3355,0,1591 chrIX 404489 . T C 3223.06 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.976;DP=229;Dels=0.00;FS=0.531;HaplotypeScore=3.8829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.404;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,152:229:99:3253,0,1391 chrIX 404578 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.938;DP=198;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.839;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,67:198:99:1093,0,2943 chrIX 404597 . C G 2519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.629;DP=189;Dels=0.00;FS=1.221;HaplotypeScore=4.4657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,128:189:99:2549,0,978 chrIX 404738 . A T 3599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.165;DP=246;Dels=0.00;FS=13.851;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.301;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,165:246:99:3599,0,1459 chrIX 404792 . T C 3028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.561;DP=222;Dels=0.00;FS=7.299;HaplotypeScore=5.2989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,145:222:99:3058,0,1474 chrIX 404802 . A G 2914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.682;DP=217;Dels=0.00;FS=8.412;HaplotypeScore=5.2122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.308;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,140:217:99:2944,0,1488 chrIX 405160 . T C 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.306;DP=196;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.843;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,62:196:99:980,0,2962 chrIX 405278 . C G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;DP=217;Dels=0.00;FS=1.159;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.116;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,74:217:99:1330,0,3042 chrIX 405428 . T G 2343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.129;DP=175;Dels=0.00;FS=2.968;HaplotypeScore=17.2147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=13.39;ReadPosRankSum=2.091;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,120:175:99:2373,0,948 chrIX 405473 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.313;DP=238;Dels=0.00;FS=1.693;HaplotypeScore=6.6228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=5.53;ReadPosRankSum=-1.764;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,82:238:99:1346,0,3360 chrIX 405539 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.884;DP=233;Dels=0.00;FS=1.188;HaplotypeScore=6.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.460;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.560;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,78:233:99:1257,0,3346 chrIX 405590 . G T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.758;DP=251;Dels=0.00;FS=14.531;HaplotypeScore=4.2321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=-1.025;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,76:251:99:1217,0,3785 chrIX 405665 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.602;DP=253;Dels=0.00;FS=3.098;HaplotypeScore=2.9388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=1.257;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.828;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,75:253:99:1200,0,3875 chrIX 405749 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.867;DP=224;Dels=0.00;FS=1.785;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.824;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,68:224:99:1015,0,3468 chrIX 405812 . T G 735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.129;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=58.9509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.781;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,59:214:99:765,0,3454 chrIX 405821 . C T 3344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.735;DP=224;Dels=0.00;FS=4.047;HaplotypeScore=60.7722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.207;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,150:224:99:3344,0,1258 chrIX 405854 . G A 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.600;DP=241;Dels=0.00;FS=2.351;HaplotypeScore=4.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.586;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,81:241:99:1454,0,3358 chrIX 405945 . A G 3022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.648;DP=236;Dels=0.00;FS=1.054;HaplotypeScore=3.6314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,150:236:99:3052,0,1636 chrIX 405973 . C T 2652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.510;DP=194;Dels=0.00;FS=4.335;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,124:194:99:2682,0,1245 chrIX 406065 . G T 311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;DP=216;Dels=0.00;FS=1.215;HaplotypeScore=61.8718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.217;QD=1.44;ReadPosRankSum=-4.323;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,57:216:99:341,0,3221 chrIX 406173 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.986;DP=185;Dels=0.00;FS=18.348;HaplotypeScore=6.8319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=5.94;ReadPosRankSum=2.405;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,68:185:99:1129,0,2608 chrIX 406184 . G T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.551;DP=182;Dels=0.00;FS=2.114;HaplotypeScore=5.5079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=6.70;ReadPosRankSum=3.530;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,67:182:99:1250,0,2419 chrIX 406186 . G C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.075;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.725;QD=6.75;ReadPosRankSum=2.807;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,68:179:99:1239,0,2305 chrIX 406436 . T C 3152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.513;DP=209;Dels=0.00;FS=3.557;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,150:209:99:3182,0,1015 chrIX 406590 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.373;DP=247;Dels=0.00;FS=14.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,79:247:99:1218,0,3739 chrIX 406596 . G A 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.345;DP=236;Dels=0.00;FS=16.888;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,76:236:99:1348,0,3295 chrIX 406941 . T C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.076;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,65:190:99:1177,0,2751 chrIX 407041 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.006;DP=208;Dels=0.00;FS=2.155;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=0.427;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.943;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,66:208:99:1060,0,2897 chrIX 407154 . A C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.125;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,83:227:99:1396,0,3071 chrIX 407232 . C A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.234;DP=205;Dels=0.00;FS=5.125;HaplotypeScore=7.3843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.946;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,73:205:99:1330,0,2758 chrIX 407301 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.737;DP=198;Dels=0.00;FS=1.207;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,68:198:99:1149,0,2778 chrIX 407554 . G T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.205;DP=218;Dels=0.00;FS=7.128;HaplotypeScore=2.4706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.268;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,70:218:99:1210,0,3054 chrIX 407727 . A G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.299;DP=188;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.121;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,59:188:99:1026,0,2738 chrIX 407939 . C T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.408;DP=179;Dels=0.00;FS=5.457;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.443;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,69:179:99:1330,0,2164 chrIX 407953 . C T 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.097;DP=191;Dels=0.00;FS=3.486;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.013;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,67:191:99:1178,0,2641 chrIX 408091 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.714;DP=183;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.116;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,60:183:99:1071,0,2591 chrIX 408110 . T G 2018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.415;DP=149;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,98:149:99:2048,0,883 chrIX 408244 . A T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.179;DP=188;Dels=0.00;FS=10.334;HaplotypeScore=5.2396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.680;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,72:188:99:1376,0,2532 chrIX 408521 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.838;DP=203;Dels=0.00;FS=2.743;HaplotypeScore=6.4758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.194;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,71:203:99:1185,0,2701 chrIX 408614 . C T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.557;DP=233;Dels=0.00;FS=15.542;HaplotypeScore=3.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=3.098;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,82:233:99:1503,0,3264 chrIX 408637 . C G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.519;DP=233;Dels=0.00;FS=10.816;HaplotypeScore=5.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.314;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,77:233:99:1321,0,3446 chrIX 408665 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.701;DP=210;Dels=0.00;FS=2.003;HaplotypeScore=2.7468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.515;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,78:210:99:1423,0,2734 chrIX 409106 . A T 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;DP=186;Dels=0.00;FS=11.440;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,63:186:99:1137,0,2700 chrIX 409125 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.903;DP=175;Dels=0.00;FS=6.146;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.978;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,58:175:99:1055,0,2491 chrIX 409294 . C T 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.196;DP=202;Dels=0.00;FS=7.773;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.853;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,57:202:99:862,0,3203 chrIX 409388 . T C 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.205;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,50:163:99:737,0,2502 chrIX 409496 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.287;DP=189;Dels=0.00;FS=1.882;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.019;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,66:189:99:1086,0,2754 chrIX 409514 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;DP=222;Dels=0.00;FS=5.063;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,75:222:99:1317,0,3106 chrIX 409532 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.420;DP=223;Dels=0.00;FS=3.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.041;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,73:223:99:1260,0,3181 chrIX 409601 . G T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.915;DP=195;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.100;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,74:195:99:1329,0,2379 chrIX 409607 . C T 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.630;DP=208;Dels=0.00;FS=3.264;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=6.94;ReadPosRankSum=2.243;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,76:208:99:1473,0,2779 chrIX 409769 . G A 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.217;DP=217;Dels=0.00;FS=3.949;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=7.85;ReadPosRankSum=-2.252;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,88:217:99:1734,0,2664 chrIX 409838 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.856;DP=213;Dels=0.00;FS=4.818;HaplotypeScore=3.5088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.632;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,67:213:99:1039,0,3263 chrIX 409916 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.520;DP=225;Dels=0.00;FS=4.095;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.221;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,77:224:99:1325,0,3131 chrIX 410027 . T C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.523;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.508;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,54:166:99:915,0,2515 chrIX 410111 . G A 2692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.614;DP=194;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,126:194:99:2722,0,1088 chrIX 410260 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.237;DP=259;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.019;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.910;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,78:259:99:1263,0,3914 chrIX 410318 . C T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.508;DP=190;Dels=0.00;FS=7.273;HaplotypeScore=5.4624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=7.95;ReadPosRankSum=2.059;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,82:190:99:1540,0,2237 chrIX 410510 . C A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.543;DP=192;Dels=0.00;FS=12.098;HaplotypeScore=50.7852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.531;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,80:192:99:1579,0,2198 chrIX 410511 . C G 593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;DP=200;Dels=0.00;FS=5.892;HaplotypeScore=102.1239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.745;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,56:200:99:623,0,2964 chrIX 410521 . A G 3303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.287;DP=228;Dels=0.00;FS=9.535;HaplotypeScore=52.2229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=14.49;ReadPosRankSum=-2.136;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,160:228:99:3303,0,1218 chrIX 410703 . A G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.738;DP=186;Dels=0.00;FS=4.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.895;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,63:186:99:1012,0,2680 chrIX 410784 . T C 2434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.602;DP=180;Dels=0.00;FS=4.979;HaplotypeScore=2.5239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.323;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,127:180:99:2464,0,957 chrIX 410842 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.006;DP=196;Dels=0.00;FS=8.154;HaplotypeScore=3.6277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,68:196:99:1168,0,2836 chrIX 411094 . T C 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.449;DP=212;Dels=0.00;FS=1.123;HaplotypeScore=2.8643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,73:212:99:1229,0,3046 chrIX 411193 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.384;DP=204;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=4.7149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.635;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,75:204:99:1366,0,2898 chrIX 411211 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.639;DP=207;Dels=0.00;FS=7.397;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,70:207:99:1219,0,3075 chrIX 411310 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.404;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.532;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,76:216:99:1317,0,2955 chrIX 411442 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.499;DP=204;Dels=0.00;FS=4.217;HaplotypeScore=3.5858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.652;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,71:204:99:1271,0,2874 chrIX 411481 . T A 3403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=2.727;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,155:212:99:3403,0,907 chrIX 411499 . G A 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.294;DP=221;Dels=0.00;FS=3.080;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.737;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,87:221:99:1596,0,2646 chrIX 411520 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.681;DP=236;Dels=0.00;FS=1.737;HaplotypeScore=3.2896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=2.422;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.274;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,70:236:99:1128,0,3689 chrIX 411643 . G C 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.782;DP=210;Dels=0.00;FS=3.451;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,63:210:99:932,0,3097 chrIX 411868 . C T 2462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.791;DP=174;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.951;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,111:174:99:2492,0,1104 chrIX 411882 . C T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.191;DP=196;Dels=0.00;FS=1.832;HaplotypeScore=2.4673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.382;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,77:196:99:1478,0,2474 chrIX 411905 . T C 3013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.920;DP=208;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=5.7927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.078;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,145:208:99:3043,0,1115 chrIX 412003 . T A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;DP=149;Dels=0.00;FS=12.139;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.732;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,59:149:99:1077,0,1985 chrIX 412084 . A G 2664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.633;DP=198;Dels=0.00;FS=1.844;HaplotypeScore=3.9095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.318;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,127:198:99:2694,0,1305 chrIX 412153 . A T 2774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.233;DP=194;Dels=0.00;FS=1.204;HaplotypeScore=2.9697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.866;QD=14.30;ReadPosRankSum=1.010;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,132:194:99:2804,0,1012 chrIX 412186 . G A 3103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.572;DP=217;Dels=0.00;FS=1.108;HaplotypeScore=5.4552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.419;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,144:217:99:3133,0,1260 chrIX 412202 . T C 2893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.249;DP=213;Dels=0.00;FS=5.996;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,137:213:99:2923,0,1426 chrIX 412218 . A G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.688;DP=212;Dels=0.00;FS=1.848;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=4.50;ReadPosRankSum=-2.038;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,63:212:99:983,0,3316 chrIX 412260 . G A 3296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.345;DP=235;Dels=0.00;FS=1.053;HaplotypeScore=5.6176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.376;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,150:235:99:3296,0,1484 chrIX 412271 . T G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.612;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.388;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,70:218:99:968,0,3293 chrIX 412306 . T C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.567;DP=188;Dels=0.00;FS=6.491;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,67:188:99:1210,0,2799 chrIX 412312 . A G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.008;DP=191;Dels=0.00;FS=4.383;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=2.432;QD=6.06;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,68:191:99:1188,0,2805 chrIX 412381 . A G 2357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.444;DP=182;Dels=0.00;FS=10.744;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,119:182:99:2387,0,1133 chrIX 412585 . A G 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.659;DP=178;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=55.5523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,53:178:99:838,0,2828 chrIX 412588 . A G 2681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;DP=185;Dels=0.00;FS=18.036;HaplotypeScore=52.5825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,129:185:99:2711,0,965 chrIX 412622 . C T 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.755;DP=179;Dels=0.00;FS=13.797;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=5.02;ReadPosRankSum=-1.076;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,54:179:99:929,0,2633 chrIX 412645 . G T 3072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.597;DP=208;Dels=0.00;FS=1.898;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.401;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,145:208:99:3102,0,1112 chrIX 412802 . T C 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.596;DP=192;Dels=0.00;FS=2.857;HaplotypeScore=4.2366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,53:192:99:816,0,3090 chrIX 412962 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.729;DP=189;Dels=0.00;FS=1.183;HaplotypeScore=2.9318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,67:189:99:1145,0,2724 chrIX 413129 . G T 739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.171;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.485;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,49:156:99:769,0,2259 chrIX 414362 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.212;DP=182;Dels=0.00;FS=1.947;HaplotypeScore=4.1810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,68:182:99:1204,0,2361 chrIX 414641 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.891;DP=235;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=1.023;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.280;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,79:235:99:1234,0,3324 chrIX 414735 . C T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.680;DP=205;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.766;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,80:205:99:1562,0,2651 chrIX 414918 . G A 2624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.454;DP=180;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,120:180:99:2654,0,947 chrIX 415204 . A G 2588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.459;DP=172;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=2.4876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,123:172:99:2618,0,809 chrIX 415315 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.469;DP=234;Dels=0.00;FS=2.488;HaplotypeScore=5.3097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.343;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,69:234:99:1188,0,3396 chrIX 415367 . G C 2521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.154;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=12.48;ReadPosRankSum=-1.674;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,129:202:99:2551,0,1212 chrIX 415528 . C T 2274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.629;DP=169;Dels=0.00;FS=2.897;HaplotypeScore=2.6878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=13.46;ReadPosRankSum=-2.219;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,109:169:99:2304,0,1085 chrIX 415609 . G T 2323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.967;DP=166;Dels=0.00;FS=2.983;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.345;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,109:166:99:2353,0,864 chrIX 415643 . C T 2745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.638;DP=202;Dels=0.00;FS=1.227;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.707;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,132:202:99:2775,0,1246 chrIX 415662 . A C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.086;DP=212;Dels=0.00;FS=1.813;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.336;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,80:212:99:1299,0,2864 chrIX 415702 . A G 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.955;DP=218;Dels=0.00;FS=0.498;HaplotypeScore=3.7585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,96:218:99:1638,0,2615 chrIX 415811 . A C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.183;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,66:209:99:1146,0,3203 chrIX 415829 . A T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.134;DP=195;Dels=0.00;FS=2.811;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.046;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,63:195:99:1147,0,2963 chrIX 415834 . C T 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.704;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=5.67;ReadPosRankSum=1.059;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,61:187:99:1091,0,2672 chrIX 416010 . G A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.230;DP=195;Dels=0.00;FS=5.656;HaplotypeScore=7.7060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.651;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,80:195:99:1488,0,2168 chrIX 416052 . C G 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.064;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,56:206:99:847,0,3256 chrIX 416240 . G A 2858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.362;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.667;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,127:186:99:2888,0,940 chrIX 416282 . T A 3016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.695;DP=210;Dels=0.00;FS=1.165;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.616;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,139:210:99:3046,0,1298 chrIX 416335 . C T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.105;DP=189;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=3.1886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,63:189:99:1132,0,2607 chrIX 416339 . C T 5108.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:197:99:5108,520,0 chrIX 416380 . A G 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.052;DP=150;Dels=0.00;FS=6.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.011;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,50:150:99:837,0,2271 chrIX 416543 . T C 2871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.317;DP=208;Dels=0.00;FS=1.155;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=1;MQRankSum=1.771;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,136:208:99:2901,0,1353 chrIX 416627 . T C 2794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.981;DP=213;Dels=0.00;FS=4.397;HaplotypeScore=3.0199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.873;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,144:213:99:2824,0,1256 chrIX 416694 . C G 2237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;DP=156;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.495;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,105:156:99:2267,0,855 chrIX 417395 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.430;DP=229;Dels=0.00;FS=2.412;HaplotypeScore=7.9114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,76:229:99:1377,0,3254 chrIX 417719 . T C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.750;DP=184;Dels=0.00;FS=9.881;HaplotypeScore=3.9242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,55:184:99:923,0,2986 chrIX 417992 . C T 4583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.19;SB=-2.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4583,486,0 chrIX 418028 . G A 4452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.19;SB=-2.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4452,465,0 chrIX 418265 . C T 5646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9103;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,222:222:99:5646,571,0 chrIX 418524 . A G 4448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:175:99:4448,471,0 chrIX 418530 . A G 4454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=25.45;SB=-2.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4454,477,0 chrIX 418547 . T A 5071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:5071,520,0 chrIX 418607 . G A 4911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=26.26;SB=-2.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4911,522,0 chrIX 418859 . G T 5610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=225;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=24.93;ReadPosRankSum=1.239;SB=-2.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,224:225:99:5610,566,0 chrIX 418899 . G A 3157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.054;DP=249;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,154:249:99:3187,0,1721 chrIX 418993 . A G 5843.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.08;SB=-2.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,224:224:99:5843,636,0 chrIX 419095 . G A 4713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8926;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-2.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,182:183:99:4713,477,0 chrIX 419141 . G A 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3920,420,0 chrIX 419420 . A G 2890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.226;DP=233;Dels=0.00;FS=3.534;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.31;MQ0=0;MQRankSum=3.806;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,147:233:99:2920,0,1599 chrIX 419495 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.473;DP=282;Dels=0.00;FS=56.065;HaplotypeScore=99.7364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQ0=0;MQRankSum=-4.107;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,106:282:99:1333,0,1876 chrIX 419510 . A G 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.783;DP=214;Dels=0.00;FS=13.852;HaplotypeScore=10.6165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=7.50;ReadPosRankSum=-2.280;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,85:214:99:1635,0,2596 chrIX 419726 . G A 2821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.575;DP=192;Dels=0.00;FS=13.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.451;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,130:192:99:2851,0,1133 chrIX 419811 . G A 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.588;DP=210;Dels=0.00;FS=5.628;HaplotypeScore=3.9109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,61:210:99:959,0,3160 chrIX 419999 . A G 2481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.040;DP=179;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,118:179:99:2511,0,1118 chrIX 420044 . A G 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.488;DP=183;Dels=0.00;FS=8.097;HaplotypeScore=6.5345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.717;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,63:183:99:1018,0,2693 chrIX 420080 . T A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.659;DP=184;Dels=0.00;FS=10.914;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.082;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,59:184:99:1075,0,2650 chrIX 420167 . T G 3143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.223;DP=218;Dels=0.00;FS=2.560;HaplotypeScore=3.3492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=14.42;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,154:218:99:3173,0,1072 chrIX 420215 . T C 3628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.017;DP=246;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.928;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,175:246:99:3628,0,1178 chrIX 420376 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.832;DP=233;Dels=0.00;FS=8.494;HaplotypeScore=3.5724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,66:233:99:1075,0,3688 chrIX 420518 . A G 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.600;DP=223;Dels=0.00;FS=1.052;HaplotypeScore=5.2119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.525;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,89:223:99:1676,0,2880 chrIX 420530 . G A 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.220;DP=250;Dels=0.00;FS=4.381;HaplotypeScore=2.5838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.513;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,99:250:99:1840,0,2998 chrIX 420788 . C G 2207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;DP=175;Dels=0.00;FS=2.043;HaplotypeScore=47.2441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,117:175:99:2237,0,1040 chrIX 420791 . C T 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.564;DP=157;Dels=0.00;FS=9.344;HaplotypeScore=49.2334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.232;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,47:157:99:789,0,2401 chrIX 420815 . G A 589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.918;DP=150;Dels=0.00;FS=5.594;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=3.93;ReadPosRankSum=1.422;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,43:150:99:619,0,2365 chrIX 421122 . T A 3397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;DP=231;Dels=0.00;FS=1.741;HaplotypeScore=4.4639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.149;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,158:231:99:3397,0,1242 chrIX 421228 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.544;DP=244;Dels=0.00;FS=6.762;HaplotypeScore=7.4683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.852;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,83:244:99:1455,0,3416 chrIX 421278 . C T 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.497;DP=257;Dels=0.00;FS=10.810;HaplotypeScore=3.9543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.606;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,90:257:99:1582,0,3520 chrIX 421475 . G A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.796;DP=226;Dels=0.00;FS=2.491;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=2;MQRankSum=-1.312;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.802;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,71:226:99:1172,0,3337 chrIX 421490 . T G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.383;DP=239;Dels=0.00;FS=1.073;HaplotypeScore=5.4607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=2;MQRankSum=0.925;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,80:239:99:1341,0,3496 chrIX 421593 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;DP=228;Dels=0.00;FS=2.426;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=4.29;ReadPosRankSum=-1.543;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,72:228:99:1009,0,3358 chrIX 421841 . A G 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.856;DP=243;Dels=0.00;FS=6.418;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=0.619;QD=6.00;ReadPosRankSum=-1.060;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,88:243:99:1487,0,3341 chrIX 421865 . T C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.666;DP=196;Dels=0.00;FS=5.550;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=1;MQRankSum=1.195;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,61:196:99:1043,0,3053 chrIX 422134 . G A 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.837;DP=241;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.354;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,61:241:99:954,0,3899 chrIX 422239 . G A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.209;DP=241;Dels=0.00;FS=1.043;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,90:241:99:1563,0,3034 chrIX 422341 . C T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.412;DP=223;Dels=0.00;FS=7.048;HaplotypeScore=3.5167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.196;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.696;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,72:223:99:1243,0,3022 chrIX 422374 . T G 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.954;DP=206;Dels=0.00;FS=1.769;HaplotypeScore=3.3072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=6.43;ReadPosRankSum=2.230;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,76:206:99:1354,0,2710 chrIX 422694 . G A 2751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.103;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=0.714;QD=15.46;ReadPosRankSum=1.493;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,132:178:99:2781,0,600 chrIX 422857 . C T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.805;DP=205;Dels=0.00;FS=9.292;HaplotypeScore=6.7710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=2.049;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,82:205:99:1554,0,2511 chrIX 422867 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.807;DP=214;Dels=0.00;FS=9.163;HaplotypeScore=3.7880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=5.83;ReadPosRankSum=-1.679;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,88:214:99:1278,0,2754 chrIX 422955 . A G 2664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.437;DP=183;Dels=0.00;FS=2.812;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.173;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,125:183:99:2694,0,1056 chrIX 423054 . T C 2766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.247;DP=179;Dels=0.00;FS=3.179;HaplotypeScore=3.4396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.124;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,133:179:99:2796,0,662 chrIX 423451 . G A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.262;DP=176;Dels=0.00;FS=4.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.070;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,64:176:99:1189,0,2453 chrIX 423556 . T C 643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.114;DP=157;Dels=0.00;FS=3.171;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.670;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,46:156:99:673,0,2527 chrIX 423571 . T C 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.432;DP=165;Dels=0.01;FS=0.615;HaplotypeScore=5.6933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=2.923;QD=4.65;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,54:164:99:798,0,2483 chrIX 424069 . G C 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;DP=184;Dels=0.00;FS=4.708;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.283;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,56:184:99:904,0,2736 chrIX 424169 . T C 2339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.811;DP=174;Dels=0.00;FS=4.614;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.069;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,111:174:99:2369,0,1106 chrIX 424253 . A G 4962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.06;SB=-2.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:4962,519,0 chrIX 424322 . T C 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8645;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3984,444,0 chrIX 424438 . A G 2271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.016;DP=165;Dels=0.00;FS=4.113;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.780;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,106:165:99:2301,0,1080 chrIX 424518 . C A 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.081;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=4.99;ReadPosRankSum=2.360;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,62:202:99:1037,0,3068 chrIX 424571 . C T 2362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.903;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,109:163:99:2392,0,866 chrIX 424605 . T A 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=144;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=6.74;ReadPosRankSum=-2.241;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,53:144:99:1000,0,2022 chrIX 424619 . A G 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.195;DP=133;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=3.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.872;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,51:133:99:921,0,1710 chrIX 424642 . C T 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.135;DP=180;Dels=0.00;FS=2.964;HaplotypeScore=8.3962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.961;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,52:180:99:819,0,2805 chrIX 424776 . A G 5166.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=25.45;SB=-2.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,203:203:99:5166,540,0 chrIX 424793 . T C 2825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.408;DP=212;Dels=0.00;FS=1.825;HaplotypeScore=2.5114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=13.33;ReadPosRankSum=-1.746;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,140:212:99:2855,0,1261 chrIX 424866 . T C 5012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.10;MQ0=0;QD=24.69;SB=-2.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:203:99:5012,540,0 chrIX 424960 . G C 2394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=23.1316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=5.205;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.642;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,111:148:99:2424,0,410 chrIX 424980 . C T 2898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.685;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.33;MQ0=0;MQRankSum=4.702;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,135:164:99:2928,0,109 chrIX 425023 . G T 599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.340;DP=169;Dels=0.00;FS=2.204;HaplotypeScore=2.7341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.698;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,45:169:99:629,0,2728 chrIX 425056 . T C 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.710;DP=199;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.29;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.256;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,58:199:99:877,0,3153 chrIX 425064 . A G 2632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.006;DP=189;Dels=0.00;FS=5.736;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,132:189:99:2662,0,981 chrIX 425130 . A T 1653.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;DP=153;Dels=0.00;FS=8.807;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.18;MQ0=0;MQRankSum=-3.739;QD=10.80;ReadPosRankSum=2.230;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,92:153:99:1683,0,1195 chrIX 425132 . G A 3654.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.643;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.29;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.466;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3654,386,0 chrIX 425135 . C T 1577.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.438;DP=162;Dels=0.00;FS=16.146;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.23;MQ0=0;MQRankSum=-4.322;QD=9.73;ReadPosRankSum=2.567;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,93:162:99:1607,0,1348 chrIX 425137 . G T 4084.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.41;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4084,435,0 chrIX 425156 . C T 616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.667;DP=157;Dels=0.00;FS=13.040;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.53;MQ0=0;MQRankSum=-4.162;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,48:157:99:646,0,2252 chrIX 425170 . T C 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.32;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3327,372,0 chrIX 425281 . G A 2087 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.426;DP=147;Dels=0.00;FS=3.892;HaplotypeScore=2.9575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.544;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:2120,204,0 chrIX 425284 . T G 2010 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;DP=146;Dels=0.00;FS=3.905;HaplotypeScore=2.9575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.278;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:146:99:2043,203,0 chrIX 425287 . G A 2049 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.338;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.773;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,147:149:99:2082,204,0 chrIX 425311 . T C 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=20.63;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3190,338,0 chrIX 425407 . G A 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=21.42;ReadPosRankSum=0.701;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,177:178:99:3813,396,0 chrIX 425460 . A G 4484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.79;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4484,483,0 chrIX 425513 . G A 4612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7007;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=0;QD=25.62;SB=-2.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4612,468,0 chrIX 425546 . A G 2714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.129;DP=198;Dels=0.00;FS=2.539;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=13.71;ReadPosRankSum=2.683;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,126:198:99:2744,0,1267 chrIX 425620 . G A 2992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.903;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.921;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,141:207:99:3022,0,1037 chrIX 425655 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.335;DP=191;Dels=0.00;FS=9.070;HaplotypeScore=50.4018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.497;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,70:191:99:1224,0,2417 chrIX 425664 . C A 2843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.817;DP=207;Dels=0.00;FS=3.410;HaplotypeScore=51.1804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.035;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,135:207:99:2873,0,1240 chrIX 425707 . T A 5590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=24.73;SB=-2.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,226:226:99:5590,547,0 chrIX 425741 . A G 4909.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:4909,528,0 chrIX 425781 . A G 4483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.33;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.958e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4483,492,0 chrIX 425799 . T A 4769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.64;MQ0=0;QD=24.84;SB=-2.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4769,525,0 chrIX 425817 . A G 3931.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.06;MQ0=0;QD=23.26;SB=-2.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:3931,447,0 chrIX 425822 . G A 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.302;DP=178;Dels=0.00;FS=3.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.66;MQ0=0;MQRankSum=-6.466;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,58:178:99:937,0,2352 chrIX 425829 . C T 4157.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=0;QD=23.89;SB=-2.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4157,459,0 chrIX 425839 . C T 4589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.14;MQ0=0;QD=24.54;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4589,495,0 chrIX 425875 . T C 4739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.93;MQ0=0;QD=24.43;SB=-2.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:4739,525,0 chrIX 425933 . G A 5361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.02;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,203:203:99:5361,541,0 chrIX 425941 . C T 5182.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.83;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:5182,540,0 chrIX 425954 . G A 4785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4785,495,0 chrIX 426001 . A G 4453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9312;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=24.33;SB=-2.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4453,492,0 chrIX 426032 . T C 4752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4752,519,0 chrIX 426148 . G A 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.041;DP=185;Dels=0.00;FS=1.993;HaplotypeScore=7.8231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.13;MQ0=0;MQRankSum=2.589;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.097;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,57:185:99:938,0,2794 chrIX 426151 . T A 4561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6352;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.15;MQ0=0;QD=25.48;SB=-2.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4561,463,0 chrIX 426346 . T C 3379.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.113;DP=178;Dels=0.00;FS=2.494;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.193;QD=18.98;ReadPosRankSum=2.439;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,174:178:99:3379,313,0 chrIX 426348 . G A 3168 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.382;QD=19.92;ReadPosRankSum=2.956;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,155:159:99:3201,286,0 chrIX 426350 . T C 2820 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;DP=175;Dels=0.00;FS=5.270;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=16.11;ReadPosRankSum=1.178;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:2853,319,0 chrIX 426351 . C G 2952 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.911;DP=173;Dels=0.00;FS=5.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.211;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:2985,322,0 chrIX 426391 . C T 4538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.59;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4538,483,0 chrIX 426410 . G C 4970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.52;MQ0=0;QD=23.44;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:4970,552,0 chrIX 426423 . A C 5085.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.73;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,210:210:99:5085,546,0 chrIX 426461 . C T 3640.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=22.20;SB=-1.978e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:3640,396,0 chrIX 426462 . A G 3625.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.66;MQ0=0;QD=21.97;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3625,399,0 chrIX 426471 . T C 3605.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.64;MQ0=0;QD=22.53;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3605,393,0 chrIX 426627 . C A 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;QD=24.31;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3574,372,0 chrIX 426830 . G A 4427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.22;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4427,477,0 chrIX 426856 . T A 4151.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4151,438,0 chrIX 426859 . T A 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.80;MQ0=0;QD=23.34;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4061,438,0 chrIX 426874 . A G 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;DP=166;Dels=0.00;FS=4.851;HaplotypeScore=3.9034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=24.37;ReadPosRankSum=1.480;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:4046,453,0 chrIX 427016 . A C 4967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,206:206:99:4967,552,0 chrIX 427026 . C T 5837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.988e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:5837,607,0 chrIX 427189 . A G 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:3777,405,0 chrIX 427341 . A T 2334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.043;DP=196;Dels=0.00;FS=4.251;HaplotypeScore=11.9921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.898;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,120:196:99:2364,0,1443 chrIX 427441 . G A 4351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4351,462,0 chrIX 427464 . T C 2789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.795;DP=193;Dels=0.00;FS=2.778;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,131:193:99:2819,0,1092 chrIX 427584 . A C 2763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.817;DP=217;Dels=0.00;FS=2.464;HaplotypeScore=3.7016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=1;MQRankSum=1.694;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,140:217:99:2793,0,1340 chrIX 427600 . T C 2902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.980;DP=223;Dels=0.00;FS=2.415;HaplotypeScore=14.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=1;MQRankSum=1.270;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,141:223:99:2932,0,1427 chrIX 427665 . A T 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.419;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=3.799;QD=5.27;ReadPosRankSum=-2.154;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,65:207:99:1120,0,3072 chrIX 427692 . G A 2785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.702;DP=183;Dels=0.00;FS=1.279;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.374;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,130:183:99:2815,0,843 chrIX 427825 . T A 148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;DP=121;Dels=0.00;FS=4.415;HaplotypeScore=11.8892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.57;MQ0=0;MQRankSum=-6.587;QD=1.22;ReadPosRankSum=-2.505;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,72:121:99:178,0,1115 chrIX 427863 . T C 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.850;DP=140;Dels=0.00;FS=4.266;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=1;MQRankSum=-4.132;QD=6.78;ReadPosRankSum=-3.324;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,88:140:99:979,0,1120 chrIX 427930 . C T 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.427;DP=156;Dels=0.00;FS=1.341;HaplotypeScore=5.9260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.284;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,52:156:99:909,0,2241 chrIX 427997 . A T 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.402;DP=180;Dels=0.00;FS=2.043;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.79;MQ0=0;MQRankSum=2.175;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,58:180:99:964,0,2714 chrIX 428035 . T A 2223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.648;DP=149;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.540;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,104:149:99:2253,0,775 chrIX 428126 . G A 2424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;DP=181;Dels=0.00;FS=5.756;HaplotypeScore=2.4404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,119:181:99:2454,0,1063 chrIX 428138 . G A 2596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.331;DP=188;Dels=0.00;FS=8.066;HaplotypeScore=2.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.840;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,121:188:99:2626,0,1163 chrIX 428190 . A G 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.297;DP=154;Dels=0.00;FS=5.097;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.64;MQ0=0;MQRankSum=-6.391;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,99:154:99:1737,0,1052 chrIX 428193 . T A 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;DP=157;Dels=0.00;FS=3.978;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.63;MQ0=0;MQRankSum=-5.100;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.554;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,100:157:99:1803,0,1082 chrIX 428213 . A G 3940.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4591;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.30;MQ0=0;QD=22.64;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:3940,429,0 chrIX 428221 . A T 2030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.71;MQ0=0;MQRankSum=-7.291;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,116:194:99:2060,0,1536 chrIX 428225 . G T 2013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.91;MQ0=0;MQRankSum=-7.084;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.710;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,114:190:99:2043,0,1464 chrIX 428248 . G A 2412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.613;DP=191;Dels=0.00;FS=1.575;HaplotypeScore=2.5384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.22;MQ0=0;MQRankSum=-3.854;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.877;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,117:191:99:2442,0,1363 chrIX 428267 . T C 2036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.498;DP=167;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.438;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,104:167:99:2066,0,1268 chrIX 428297 . G A 2552.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.743;DP=180;Dels=0.00;FS=13.946;HaplotypeScore=3.9433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.854;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,120:180:99:2582,0,1064 chrIX 428303 . A G 2488.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.833;DP=186;Dels=0.00;FS=6.223;HaplotypeScore=2.4983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.58;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.247;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,125:186:99:2518,0,1141 chrIX 428304 . G C 1027.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;DP=189;Dels=0.00;FS=6.195;HaplotypeScore=2.4983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.61;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,61:189:99:1057,0,2719 chrIX 428359 . A G 2294 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7920;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.34;MQ0=0;QD=19.44;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:118:99:2327,264,0 chrIX 428394 . G A 2035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.44;MQ0=0;QD=25.12;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2068,213,0 chrIX 428399 . C T 2150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.07;MQ0=0;QD=24.16;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2183,219,0 chrIX 428461 . C G 102.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;DP=185;Dels=0.00;FS=28.355;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=0.55;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,40:185:99:132,0,3190 chrIX 428473 . T G 2627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.793;DP=165;Dels=0.00;FS=29.221;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.994;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,125:165:99:2657,0,188 chrIX 428479 . T C 2606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.089;DP=159;Dels=0.00;FS=29.225;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,118:159:99:2636,0,234 chrIX 428519 . A C 2562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.088;DP=173;Dels=0.00;FS=9.865;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.78;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.313;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,119:173:99:2592,0,770 chrIX 428537 . G A 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.664;DP=173;Dels=0.00;FS=24.397;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,51:173:99:877,0,2495 chrIX 428597 . A T 354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;DP=132;Dels=0.00;FS=1.887;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.19;MQ0=0;MQRankSum=-3.520;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.985;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,34:132:99:384,0,1347 chrIX 428607 . G A 413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.929;DP=123;Dels=0.00;FS=10.568;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.676;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,38:123:99:443,0,1542 chrIX 428609 . G A 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.03;MQ0=0;QD=22.33;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3025,333,0 chrIX 428656 . C G 2560 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=117;Dels=0.00;FS=3.692;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=21.88;ReadPosRankSum=1.436;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2593,277,0 chrIX 428720 . T G 4285.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.05;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:165:99:4285,477,0 chrIX 428722 . A G 3862.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.10;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3862,456,0 chrIX 428729 . C T 4030.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.41;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4030,424,0 chrIX 428764 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.472;DP=185;Dels=0.00;FS=3.944;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.638;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,67:185:99:1132,0,2521 chrIX 428776 . A C 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.702;DP=166;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.334;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,57:166:99:875,0,2344 chrIX 428868 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.511;DP=191;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.21;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,79:191:99:1546,0,2322 chrIX 428891 . C T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.744;DP=197;Dels=0.00;FS=2.201;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.401;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,80:197:99:1543,0,2528 chrIX 428913 . T C 2504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.328;DP=202;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=3.2880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.88;MQ0=0;MQRankSum=2.211;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.702;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,124:202:99:2534,0,1487 chrIX 428948 . C T 4537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.92;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4537,480,0 chrIX 428983 . A C 4930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=24.41;SB=-2.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:4930,531,0 chrIX 429037 . T C 5280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;QD=24.44;SB=-2.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:5280,543,0 chrIX 429066 . A G 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.153;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=2.543;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.563;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,61:205:99:944,0,3038 chrIX 429127 . T C 2933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.426;DP=185;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.659;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,139:185:99:2963,0,741 chrIX 429153 . A G 2826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.052;DP=176;Dels=0.00;FS=1.414;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.975;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,130:176:99:2856,0,750 chrIX 429213 . C T 793.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.728;DP=144;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=4.9341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,45:144:99:823,0,2136 chrIX 429218 . G A 736.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.830;DP=140;Dels=0.00;FS=2.387;HaplotypeScore=7.5062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.390;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.207;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,43:140:99:766,0,2075 chrIX 429223 . G A 3757.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.350;DP=145;Dels=0.00;FS=3.690;HaplotypeScore=6.5168;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.517;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3757,414,0 chrIX 429241 . T G 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3651,426,0 chrIX 429315 . C T 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.590;DP=182;Dels=0.00;FS=10.680;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.025;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,46:182:99:758,0,2941 chrIX 429333 . C T 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.444;DP=196;Dels=0.00;FS=11.992;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,48:196:99:719,0,3286 chrIX 429337 . T G 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;DP=193;Dels=0.00;FS=7.681;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,48:193:99:704,0,3227 chrIX 429385 . C G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;DP=169;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=5.38;ReadPosRankSum=-2.127;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,57:169:99:940,0,2302 chrIX 429417 . C T 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.389;DP=152;Dels=0.00;FS=1.325;HaplotypeScore=2.7648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=2.187;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,56:152:99:1050,0,1939 chrIX 429451 . A G 583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.719;DP=139;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=3.5587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,39:139:99:613,0,2232 chrIX 429462 . T A 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.53;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3601,387,0 chrIX 429465 . G A 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.59;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3443,366,0 chrIX 429503 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.898;DP=165;Dels=0.00;FS=5.637;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=1;MQRankSum=-1.672;QD=6.33;ReadPosRankSum=-2.289;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,59:165:99:1074,0,2276 chrIX 429512 . T C 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.063;DP=168;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=3.4278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=1;MQRankSum=-0.466;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.202;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,56:168:99:907,0,2499 chrIX 429534 . C T 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.237;DP=180;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=1;MQRankSum=-0.969;QD=5.07;ReadPosRankSum=2.053;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,61:180:99:943,0,2595 chrIX 429541 . T C 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.468;DP=183;Dels=0.00;FS=5.115;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=1;MQRankSum=-1.562;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.920;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,61:183:99:881,0,2684 chrIX 429623 . G A 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,56:197:99:891,0,3057 chrIX 429664 . A G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.374;DP=174;Dels=0.00;FS=1.993;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.217;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,60:174:99:1113,0,2464 chrIX 429743 . A G 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.654;DP=185;Dels=0.00;FS=2.133;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=1;MQRankSum=-1.500;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,55:185:99:783,0,2862 chrIX 429951 . C T 431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.785;DP=126;Dels=0.00;FS=5.082;HaplotypeScore=49.1047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.94;MQ0=1;MQRankSum=-4.574;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.481;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,33:126:99:461,0,1881 chrIX 429953 . A G 567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.810;DP=131;Dels=0.01;FS=36.578;HaplotypeScore=61.7636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQ0=1;MQRankSum=-3.962;QD=4.33;ReadPosRankSum=-1.671;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,48:130:99:597,0,958 chrIX 430005 . C T 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.038;DP=175;Dels=0.00;FS=2.651;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=2.927;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.752;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,53:175:99:886,0,1911 chrIX 430024 . C A 395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.859;DP=175;Dels=0.00;FS=8.232;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.925;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,54:175:99:425,0,2595 chrIX 430092 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.584;DP=178;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=70.1630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.566;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,63:178:99:1176,0,2544 chrIX 430093 . G T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.426;DP=178;Dels=0.00;FS=6.977;HaplotypeScore=70.1630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.876;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,58:178:99:1057,0,2625 chrIX 430199 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.610;DP=172;Dels=0.00;FS=7.193;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.687;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,68:172:99:1246,0,2217 chrIX 430215 . T C 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.278;DP=195;Dels=0.00;FS=8.918;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=2.729;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.114;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,60:195:99:873,0,2909 chrIX 430247 . G C 4255.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4255,462,0 chrIX 430295 . G C 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.153;DP=177;Dels=0.00;FS=2.037;HaplotypeScore=3.6300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.512;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,56:177:99:968,0,2569 chrIX 430308 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.165;DP=184;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,63:184:99:1165,0,2441 chrIX 430403 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.789;DP=209;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.796;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.602;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,72:208:99:1234,0,2911 chrIX 430418 . G T 2886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.737;DP=185;Dels=0.00;FS=7.326;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.405;QD=15.60;ReadPosRankSum=-1.403;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,132:185:99:2916,0,813 chrIX 430457 . C T 2376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.578;DP=162;Dels=0.00;FS=2.609;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.559;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,109:162:99:2406,0,879 chrIX 430460 . A G 2176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.650;DP=166;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=2.041;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.572;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,110:166:99:2206,0,997 chrIX 430567 . A G 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.500;DP=139;Dels=0.00;FS=13.582;HaplotypeScore=5.0287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.138;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,88:139:99:1669,0,808 chrIX 430585 . G A 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=19.61;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:2681,297,0 chrIX 430586 . C G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.187;DP=136;Dels=0.00;FS=8.191;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,86:136:99:1433,0,734 chrIX 430797 . C T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.186;DP=205;Dels=0.00;FS=4.710;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,60:205:99:988,0,3165 chrIX 430825 . G A 3035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.893;DP=225;Dels=0.00;FS=4.043;HaplotypeScore=2.8362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.013;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,145:225:99:3065,0,1378 chrIX 430869 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.581;DP=206;Dels=0.00;FS=1.135;HaplotypeScore=4.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.679;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,71:206:99:1209,0,2902 chrIX 430912 . G A 2813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.295;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.302;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,125:173:99:2843,0,745 chrIX 431143 . C T 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.501;DP=187;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.760;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,53:187:99:900,0,2745 chrIX 431296 . C T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.155;DP=211;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=61.0204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.878;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,64:211:99:1108,0,3247 chrIX 431302 . T A 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.057;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.7118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=2.781;QD=7.29;ReadPosRankSum=-2.342;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,84:210:99:1561,0,2878 chrIX 431389 . C T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.304;DP=188;Dels=0.00;FS=11.713;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=6.38;ReadPosRankSum=-2.099;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,68:188:99:1230,0,2475 chrIX 431611 . A C 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;DP=218;Dels=0.00;FS=8.898;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.396;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,60:218:99:913,0,3430 chrIX 431680 . T A 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;DP=218;Dels=0.00;FS=1.203;HaplotypeScore=3.4720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,56:217:99:699,0,3579 chrIX 431747 . A G 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.182;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.69;MQ0=1;MQRankSum=-0.800;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,52:169:99:717,0,2594 chrIX 431755 . T C 4013.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.25;MQ0=2;QD=22.80;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4013,447,0 chrIX 431874 . A C 186.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;DP=165;Dels=0.00;FS=41.346;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.74;MQ0=1;MQRankSum=-3.713;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.323;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,32:165:99:216,0,2999 chrIX 431988 . A C 1682 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.24;MQ0=24;QD=15.15;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:1715,195,0 chrIX 432102 . T A 1280 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.20;MQ0=13;QD=18.29;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1313,144,0 chrIX 432363 . G A 144.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.984;DP=55;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.85;MQ0=11;MQRankSum=-1.775;QD=2.62;ReadPosRankSum=-3.318;SB=-3.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:174,0,585 chrIX 432374 . C T 215.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.631;DP=61;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=2.9577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.28;MQ0=9;MQRankSum=-0.856;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.908;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:245,0,704 chrIX 432527 . A T 839 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=13;QD=16.45;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:96:872,96,0 chrIX 432529 . T C 718 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.87;MQ0=13;MQRankSum=0.093;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.955;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,49:53:49:751,49,0 chrIX 432723 . T C 929.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.388;DP=88;Dels=0.00;FS=20.987;HaplotypeScore=18.7377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.86;MQ0=23;MQRankSum=-1.091;QD=10.56;ReadPosRankSum=2.832;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,74:88:47:959,0,47 chrIX 432859 . G A 557 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.41;MQ0=14;QD=12.95;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:66:590,66,0 chrIX 432980 . G A 472.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.858;DP=53;Dels=0.00;FS=4.033;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.00;MQ0=12;MQRankSum=-0.047;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,44:53:32:502,0,32 chrIX 432981 . G A 658 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=12;QD=12.42;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:75:691,75,0 chrIX 433039 . A G 55.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.027;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.5985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.19;MQ0=6;MQRankSum=1.202;QD=0.97;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-1.140e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:13:85,0,13 chrIX 433072 . G A 1212 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.23;MQ0=4;QD=17.31;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1245,129,0 chrIX 433180 . A G 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;DP=85;Dels=0.00;FS=19.487;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.54;MQ0=2;MQRankSum=-1.392;QD=0.17;ReadPosRankSum=2.259;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,10:85:44:44,0,1427 chrIX 433182 . T C 1145.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;DP=86;Dels=0.00;FS=25.312;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.45;MQ0=2;MQRankSum=1.758;QD=13.31;ReadPosRankSum=-2.218;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,74:86:90:1175,0,90 chrIX 433184 . A G 40.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.760;DP=72;Dels=0.00;FS=23.199;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.39;MQ0=2;MQRankSum=-0.871;QD=0.56;ReadPosRankSum=1.033;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,11:72:70:70,0,1129 chrIX 433189 . G T 138.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.950;DP=67;Dels=0.00;FS=12.634;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.06;MQ0=1;MQRankSum=1.112;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,13:67:99:168,0,853 chrIX 433191 . A G 126.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;DP=66;Dels=0.00;FS=12.597;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.96;MQ0=1;MQRankSum=1.861;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:156,0,849 chrIX 433196 . T C 63.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.056;DP=61;Dels=0.00;FS=7.261;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.43;MQ0=1;MQRankSum=1.210;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.730;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,12:61:93:93,0,824 chrIX 433197 . C T 66.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;DP=60;Dels=0.00;FS=9.805;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.69;MQ0=1;MQRankSum=1.761;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.537;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,12:60:96:96,0,760 chrIX 433202 . T C 464.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.509;DP=56;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.29;MQ0=2;MQRankSum=-1.881;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.285;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:494,0,247 chrIX 433213 . G A 1399 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.22;MQ0=3;QD=17.06;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1432,156,0 chrIX 433253 . G A 2941 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.96;MQ0=4;QD=21.47;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:2974,309,0 chrIX 433284 . T C 1552.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.648;DP=169;Dels=0.00;FS=23.088;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.00;MQ0=4;MQRankSum=4.916;QD=9.18;ReadPosRankSum=-4.103;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,102:169:99:1582,0,1292 chrIX 433359 . C A 155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.131;DP=158;Dels=0.00;FS=6.540;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=0.98;ReadPosRankSum=-1.087;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,22:158:99:185,0,2200 chrIX 433584 . T C 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.504;DP=73;Dels=0.00;FS=28.559;HaplotypeScore=4.7678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.40;MQ0=30;MQRankSum=1.706;QD=0.77;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-1.504e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:86:86,0,247 chrIX 433618 . C T 34.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.387;DP=52;Dels=0.00;FS=30.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.67;MQ0=9;MQRankSum=-2.678;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:64:64,0,171 chrIX 433645 . G A 251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.563;DP=48;Dels=0.00;FS=2.967;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.34;MQ0=1;MQRankSum=3.777;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.808;SB=-6.882e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:40:281,0,40 chrIX 433712 . T A 152.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.0314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.70;MQ0=5;MQRankSum=-0.619;QD=4.90;ReadPosRankSum=-2.518;SB=-4.600e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:31:50:182,0,50 chrIX 433724 . A T 232 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.15;MQ0=6;MQRankSum=1.156;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.156;SB=-8.098e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:30:265,30,0 chrIX 433755 . G A 141.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.100;DP=44;Dels=0.00;FS=1.786;HaplotypeScore=15.2583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.39;MQ0=15;MQRankSum=0.022;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.258;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:171,0,150 chrIX 433765 . T C 75.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.511;DP=52;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=16.1250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.85;MQ0=13;MQRankSum=0.983;QD=1.44;ReadPosRankSum=3.667;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:105,0,314 chrIX 433783 . C T 79.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;DP=62;Dels=0.00;FS=15.431;HaplotypeScore=5.4388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.20;MQ0=11;MQRankSum=-0.699;QD=1.27;ReadPosRankSum=2.265;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:62:99:109,0,402 chrIX 433814 . T A 97.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.471;DP=72;Dels=0.00;FS=6.898;HaplotypeScore=16.0838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.46;MQ0=15;MQRankSum=1.360;QD=1.35;ReadPosRankSum=-2.006;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,13:72:99:127,0,449 chrIX 435933 . A G 37.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.75;MQ0=0;QD=12.66;SB=-2.121e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:70,9,0 chrIX 435945 . A C 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-2.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrIX 435951 . A G 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-2.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrIX 435954 . T C 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-2.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrIX 435967 . A T 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-2.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrIX 437271 . G A 93.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.38;MQ0=6;QD=7.79;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:12:126,12,0 chrIX 437345 . C T 53.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.14;MQ0=2;QD=9.00;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:86,9,0 chrIX 437346 . C T 50.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.14;MQ0=2;QD=8.50;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:83,9,0 chrIX 437459 . C G 101.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.47;MQ0=1;QD=16.88;SB=-2.676e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:134,15,0 chrIX 437461 . T G 97.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.47;MQ0=1;QD=16.21;SB=-2.676e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:130,15,0 chrIX 437471 . G A 156.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.85;MQ0=1;QD=17.34;SB=-8.156e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:21:189,21,0 chrIX 437475 . C G 205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.02;MQ0=1;QD=18.64;SB=-1.078e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27:238,27,0 chrIX 437639 . A G 71.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.20;MQ0=14;QD=2.98;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:12:104,12,0 chrIX 437705 . G C 30.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=40;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.01;MQ0=31;MQRankSum=1.683;QD=0.75;ReadPosRankSum=2.054;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,8:40:40:60,0,40 chrIX 437706 . G A 61.11 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.01;MQ0=31;MQRankSum=1.881;QD=1.53;ReadPosRankSum=2.219;SB=-2.415e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:13:91,0,13 chrIX 437707 . G C 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=40;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.01;MQ0=31;MQRankSum=1.422;QD=0.83;ReadPosRankSum=2.054;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,8:40:37:63,0,37 chrIX 437755 . C T 99.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=37;Dels=0.00;FS=11.181;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.33;MQ0=27;MQRankSum=1.866;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.741;SB=-4.350e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:29:129,0,29 chrIX 437825 . T G 46.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.89;MQ0=0;QD=15.66;SB=-2.621e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 chrIX 437830 . A G 43.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.89;MQ0=0;QD=14.66;SB=-2.721e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:76,9,0 chrIX 438093 . C T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.93;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 chrIX 438101 . A G 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.93;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 chrIX 438105 . A G 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.27;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:50,6,0 chrIX 438131 . A C 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.60;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 chrIX 438138 . C T 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.26;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:56,6,0 chrIX 438330 . A G 208.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.38;MQ0=1;QD=17.33;SB=-5.299e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:27:241,27,0 chrIX 438358 . C T 206.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.38;MQ0=1;QD=17.17;SB=-5.499e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:27:239,27,0 chrIX 438374 . G T 207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=12;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.38;MQ0=1;MQRankSum=1.423;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.158;SB=-5.299e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:27:240,27,0 chrIX 438410 . A G 66.79 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.27;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-2.838e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:4:96,0,4 chrIX 438482 . G A 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.27;MQ0=0;QD=1.51;SB=-9.226e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:43,6,0 chrIX 438499 . C T 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=2.55;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-3.780e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:6:49,6,0 chrIX 438546 . C G 77.22 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.742;SB=-4.271e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:10:107,0,10 chrIX 438553 . G C 117.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.59;MQ0=0;QD=16.73;SB=-7.463e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:150,18,0 chrIX 438558 . C A 29.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.59;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=4.14;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:59:59,0,59 chrIX 438567 . C T 121.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=1;QD=15.14;SB=-7.663e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18:154,18,0 chrIX 438570 . A C 194.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.78;MQ0=1;QD=17.64;SB=-9.889e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27:227,27,0 chrIX 438573 . G A 106.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;DP=11;Dels=0.00;FS=23.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.78;MQ0=1;MQRankSum=1.568;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:48:136,0,48 chrIX 438609 . G A 440.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.706;DP=25;Dels=0.00;FS=33.062;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.81;MQ0=1;MQRankSum=0.611;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.571;SB=-2.194e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:16:473,16,0 chrIX 438621 . G A 713 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.740;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=1;MQRankSum=1.031;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.326;SB=-4.425e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,32:36:50:746,50,0 chrIX 438622 . G T 799 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=1;QD=22.19;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:93:832,93,0 chrIX 438630 . G A 921 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.592;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=1;MQRankSum=2.878;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.796;SB=4.401e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,40:45:69:954,69,0 chrIX 438634 . C A 927 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.470;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=1;MQRankSum=2.388;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.469;SB=4.400e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,40:45:68:960,68,0 chrIX 438636 . T G 893 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.286;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=1;MQRankSum=2.552;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.306;SB=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,40:45:67:926,67,0 chrIX 438638 . C G 924 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.347;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=1;MQRankSum=1.449;QD=20.53;ReadPosRankSum=-0.102;SB=2.157e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,40:45:69:957,69,0 chrIX 438644 . G T 902 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.690;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.11;MQ0=1;MQRankSum=-0.615;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-5.654e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,44:49:65:935,65,0 chrIX 438653 . A G 887 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.614;QD=13.44;ReadPosRankSum=-2.034;SB=-6.522e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,61:66:65:920,65,0 chrIX 438663 . T C 951 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.56;MQ0=0;QD=14.63;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:984,114,0 chrIX 438666 . C G 605.41 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.674;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-4.170e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,50:55:13:638,13,0 chrIX 438668 . C G 560.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-1.414e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,50:55:18:593,18,0 chrIX 438669 . T A 790 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=0;QD=14.36;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:90:823,90,0 chrIX 438672 . A G 607.33 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.385;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-2.234e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,51:56:14:640,14,0 chrIX 438674 . T G 647.17 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.681;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-4.717e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,52:57:17:680,17,0 chrIX 438677 . T C 681.05 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.652;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.69;MQ0=0;MQRankSum=2.076;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-7.606e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,59:64:22:714,22,0 chrIX 438686 . G A 1044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.373;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.83;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,71:76:64:1077,64,0 chrIX 438694 . T C 1439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.687;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,87:92:99:1472,107,0 chrIX 438951 . A G 4112.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.21;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4112,441,0 chrIX 438975 . G T 1692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.13;MQ0=0;QD=18.39;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:1725,189,0 chrIX 438993 . A G 1259 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.99;MQ0=0;QD=16.57;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1292,147,0 chrIX 439001 . C T 762 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.58;MQ0=0;QD=14.11;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:90:795,90,0 chrIX 439006 . T A 500 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=11.63;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:63:533,63,0 chrIX 439011 . C T 279 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.69;MQ0=0;QD=9.96;SB=-8.700e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:36:312,36,0 chrIX 439033 . C A 214.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.69;MQ0=2;QD=9.30;SB=-2.802e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:27:247,27,0 chrIX 439034 . A G 208.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.69;MQ0=2;QD=9.04;SB=-2.902e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:27:241,27,0 chrIX 439044 . T C 215.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.822;DP=21;Dels=0.00;FS=12.788;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.46;MQ0=2;MQRankSum=-1.369;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.552;SB=-2.375e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,18:21:27:248,27,0 chrIX 439054 . G A 181.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;DP=17;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.83;MQ0=2;MQRankSum=1.273;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.273;SB=-3.987e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,14:17:24:214,24,0 chrIX 439063 . T C 163.46 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;DP=17;Dels=0.00;FS=20.212;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.40;MQ0=2;MQRankSum=2.123;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.764;SB=-4.468e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:1:192,0,1 chrIX 439072 . A T 216.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.54;MQ0=2;QD=16.62;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,11:13:27:249,27,0 chrIX 439073 . G A 217.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.54;MQ0=2;QD=16.69;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,11:13:27:250,27,0 chrIX 439081 . T G 82.18 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=9;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.10;MQ0=2;MQRankSum=0.742;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.742;SB=-3.050e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:11:112,0,11 chrIX 439083 . C A 90.22 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=9;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.10;MQ0=2;MQRankSum=0.742;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-3.093e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:10:120,0,10 chrIX 439084 . G T 91.42 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=9;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.10;MQ0=2;MQRankSum=0.742;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-3.294e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:7:121,0,7 chrIX 439087 . A T 92.18 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=9;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.10;MQ0=2;MQRankSum=0.742;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-3.050e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:11:122,0,11 chrIX 439088 . A T 85.18 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=9;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.10;MQ0=2;MQRankSum=0.742;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-3.050e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:11:115,0,11 chrIX 439095 . A G 55.11 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=10;Dels=0.00;FS=9.031;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.52;MQ0=2;MQRankSum=0.747;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-3.056e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:13:85,0,13 chrIX 439096 . G A 56.14 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=10;Dels=0.00;FS=9.031;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.52;MQ0=2;MQRankSum=0.747;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-3.083e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:12:86,0,12 chrIX 439097 . G A 99.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.52;MQ0=2;QD=9.93;SB=-2.820e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,8:10:15:132,15,0 chrIX 439100 . A G 65.09 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=11;Dels=0.00;FS=9.542;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.85;MQ0=2;MQRankSum=0.751;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-3.068e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:14:95,0,14 chrIX 439132 . A G 158.06 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;DP=16;Dels=0.00;FS=9.031;HaplotypeScore=3.9295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.94;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-2.985e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:16:188,0,16 chrIX 439141 . G A 194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.453;DP=19;Dels=0.00;FS=3.299;HaplotypeScore=5.9183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.45;MQ0=0;MQRankSum=3.009;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-1.899e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:54:224,0,54 chrIX 439150 . A G 163.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.694;DP=20;Dels=0.00;FS=15.128;HaplotypeScore=6.9077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.58;MQ0=0;MQRankSum=2.298;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.475;SB=7.160e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:82:193,0,82 chrIX 439158 . T G 325 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4901;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.94;MQ0=0;QD=15.48;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:42:358,42,0 chrIX 439163 . A T 335 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.94;MQ0=0;QD=15.95;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:42:368,42,0 chrIX 439184 . G A 217.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.572;DP=24;Dels=0.00;FS=17.042;HaplotypeScore=8.8979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.67;MQ0=1;MQRankSum=0.902;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.033;SB=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:74:247,0,74 chrIX 439186 . C T 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.300;DP=25;Dels=0.00;FS=8.438;HaplotypeScore=9.8138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.54;MQ0=1;MQRankSum=-0.300;QD=0.64;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-1.297e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:46:46,0,270 chrIX 439202 . T C 391 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8458;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.79;MQ0=1;QD=19.55;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:51:424,51,0 chrIX 439208 . C T 450 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.62;MQ0=1;QD=21.43;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:54:483,54,0 chrIX 439235 . A G 506 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.19;MQ0=1;QD=20.24;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:63:539,63,0 chrIX 439237 . C T 238.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;DP=26;Dels=0.00;FS=11.442;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.04;MQ0=1;MQRankSum=1.451;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.356;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:268,0,195 chrIX 439241 . T C 483 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.41;MQ0=1;QD=19.32;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:63:516,63,0 chrIX 439275 . G A 456 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.254;DP=25;Dels=0.00;FS=24.771;HaplotypeScore=4.1078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=18.24;ReadPosRankSum=2.154;SB=-9.967e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:34:489,34,0 chrIX 439278 . A G 425 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.84;MQ0=0;QD=18.48;SB=-6.537e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:54:458,54,0 chrIX 439280 . C A 191.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.488;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.84;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:221,0,157 chrIX 439323 . A G 92.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.98;MQ0=0;QD=6.15;SB=-7.130e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:15:125,15,0 chrIX 439331 . C T 225.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.44;MQ0=0;QD=10.71;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:27:258,27,0 chrIX 439358 . T G 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.139;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.3868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.603;QD=1.77;ReadPosRankSum=2.137;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:69:69,0,243 chrIX 439359 . T A 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.4201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.337;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.870;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:74:74,0,240 chrIX 439388 . G C 230.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;DP=25;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=13.6370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.68;MQ0=1;MQRankSum=1.457;QD=9.20;ReadPosRankSum=3.442;SB=-1.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:260,0,111 chrIX 439394 . G T 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;DP=23;Dels=0.00;FS=14.018;HaplotypeScore=33.3945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.97;MQ0=1;MQRankSum=-0.392;QD=1.70;ReadPosRankSum=-1.802;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:69:69,0,270 chrIX 439396 . G T 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;DP=23;Dels=0.00;FS=13.457;HaplotypeScore=33.3945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.97;MQ0=1;MQRankSum=-1.362;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.858;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:23:63:63,0,296 chrIX 439397 . A G 27.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.369;DP=23;Dels=0.00;FS=14.018;HaplotypeScore=32.4367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.97;MQ0=1;MQRankSum=-0.940;QD=1.17;ReadPosRankSum=-1.802;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:57:57,0,298 chrIX 439399 . T C 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;DP=23;Dels=0.00;FS=14.018;HaplotypeScore=9.7965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.97;MQ0=1;MQRankSum=-1.254;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.880;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:63:63,0,287 chrIX 439442 . G A 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;DP=16;Dels=0.00;FS=5.021;HaplotypeScore=8.7788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.85;MQ0=1;MQRankSum=-1.555;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.209;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:74:74,0,104 chrIX 439463 . T G 18.07 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;DP=14;Dels=0.00;FS=6.113;HaplotypeScore=18.4527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.386;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:48:48,0,103 chrIX 439464 . T C 16.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.5197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.79;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:46:46,0,102 chrIX 439473 . G A 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.9318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.49;MQ0=1;MQRankSum=0.047;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.047;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:66:66,0,100 chrIX 439492 . G T 57.34 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;DP=18;Dels=0.00;FS=12.884;HaplotypeScore=9.2080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.31;MQ0=1;MQRankSum=2.586;QD=3.19;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-7.637e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:8:87,0,8 chrIX 439515 . G A 321.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;DP=27;Dels=0.00;FS=6.198;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.77;MQ0=2;MQRankSum=0.069;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.347;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:23:354,23,0 chrIX 439533 . C T 69.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.153;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.98;MQ0=2;MQRankSum=-0.450;QD=1.97;ReadPosRankSum=-2.448;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:99,0,323 chrIX 439551 . T C 212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.889;DP=40;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=17.7865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.31;MQ0=2;MQRankSum=1.498;QD=5.30;ReadPosRankSum=2.345;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:242,0,273 chrIX 439556 . T A 218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.8972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.96;MQ0=2;MQRankSum=0.492;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.888;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:43:99:248,0,325 chrIX 439562 . G A 225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.488;DP=52;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=16.8706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.76;MQ0=2;MQRankSum=1.228;QD=4.33;ReadPosRankSum=2.392;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:255,0,457 chrIX 439590 . T G 84.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.9898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.02;MQ0=2;MQRankSum=0.768;QD=1.02;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,11:82:99:114,0,955 chrIX 439608 . T C 1190.03 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;DP=88;Dels=0.00;FS=8.048;HaplotypeScore=35.7140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.73;MQ0=1;MQRankSum=2.109;QD=13.52;ReadPosRankSum=3.520;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,78:88:19:1220,0,19 chrIX 439668 . G A 373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.837;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.0728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.46;MQ0=2;MQRankSum=1.127;QD=5.11;ReadPosRankSum=-6.223;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:403,0,532 chrIX 439672 . G C 429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;DP=72;Dels=0.00;FS=8.570;HaplotypeScore=13.6195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.68;MQ0=1;MQRankSum=0.121;QD=5.96;ReadPosRankSum=5.807;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:459,0,451 chrIX 439685 . C A 832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.79;MQ0=1;QD=13.64;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:865,99,0 chrIX 439700 . T G 624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.36;MQ0=1;QD=12.24;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:78:657,78,0 chrIX 439724 . A G 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.778;DP=29;Dels=0.00;FS=2.538;HaplotypeScore=20.3708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.962;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.911;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:57:57,0,133 chrIX 439728 . A G 135.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.4043;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.58;MQ0=0;QD=5.63;SB=-7.490e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:21:168,21,0 chrIX 439739 . A G 137.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4973;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.81;MQ0=0;QD=5.08;SB=-7.496e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:21:170,21,0 chrIX 439745 . G A 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.914;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.301;SB=-9.959e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:28:62,0,28 chrIX 439750 . A T 144.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7249;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.94;MQ0=0;QD=5.76;SB=-7.495e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:21:177,21,0 chrIX 439767 . A G 67.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.424;SB=-6.530e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:53:97,0,53 chrIX 439771 . G T 146.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.31;MQ0=0;QD=7.69;SB=-7.470e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:19:21:179,21,0 chrIX 439772 . A G 139.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5638;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.31;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-7.470e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:21:172,21,0 chrIX 439786 . T C 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.3804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.65;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:61:81,0,61 chrIX 439886 . T G 35.06 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.19;MQ0=1;MQRankSum=1.231;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-2.603e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:16:65,0,16 chrM 92 . C A 1675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=25.00;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1708,162,0 chrM 116 . G C 1433 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.58;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.022;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,77:78:99:1466,162,0 chrM 125 . T C 1738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=17.3971;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=23.17;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1771,180,0 chrM 172 . C T 2256 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=22.56;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2289,177,0 chrM 453 . C T 1618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.533;DP=87;Dels=0.00;FS=3.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:1651,180,0 chrM 474 . C T 1333 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.787;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9448;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.89;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.922;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:77:99:1366,147,0 chrM 625 . T A 115.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.083;DP=59;Dels=0.00;FS=26.024;HaplotypeScore=11.7677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.18;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=1.95;ReadPosRankSum=-6.083;SB=2.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:41,18:59:18:148,18,0 chrM 630 . T A 457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.391;DP=72;Dels=0.00;FS=2.106;HaplotypeScore=117.6394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.42;MQ0=0;MQRankSum=2.695;QD=6.35;ReadPosRankSum=-7.233;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:41,31:72:57:490,57,0 chrM 818 . C A 6123.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.26;MQ0=0;QD=24.89;SB=-2.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,246:246:99:6123,615,0 chrM 831 . G A 5041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.73;MQ0=0;QD=22.21;SB=-3.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,227:227:99:5041,505,0 chrM 877 . G A 2397 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.587;DP=154;Dels=0.04;FS=13.626;HaplotypeScore=142.3585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.066;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,141:148:99:2430,270,0 chrM 880 . C T 2357 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;DP=148;Dels=0.00;FS=15.655;HaplotypeScore=133.4098;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.656;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,144:148:99:2390,221,0 chrM 1058 . C T 4903.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7858;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=23.35;ReadPosRankSum=1.301;SB=-2.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,208:209:99:4903,436,0 chrM 1117 . A G 4775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.416;DP=233;Dels=0.00;FS=8.513;HaplotypeScore=120.9373;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=6.607;QD=20.49;ReadPosRankSum=5.158;SB=-2.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,214:233:99:4775,375,0 chrM 1228 . G A 6884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=285;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.41;MQ0=0;QD=24.15;SB=-2.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,285:285:99:6884,619,0 chrM 1409 . T C 1292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;DP=73;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=9.9343;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=17.70;ReadPosRankSum=1.684;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,71:73:99:1325,134,0 chrM 1489 . A G 1099 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.86;MQ0=0;QD=12.63;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1132,126,0 chrM 1492 . T G 976 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.15;MQ0=0;QD=12.20;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1009,114,0 chrM 1493 . A G 1085 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.428;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:1118,126,0 chrM 1498 . C T 2205 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9335;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.75;MQ0=0;QD=19.17;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2238,261,0 chrM 1503 . A T 2455 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.21;MQ0=0;QD=19.64;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2488,288,0 chrM 1506 . T C 2411 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.98;MQ0=0;QD=19.29;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2444,282,0 chrM 1679 . A G 5182.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.383;DP=236;Dels=0.00;FS=5.982;HaplotypeScore=187.3102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.78;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.885;SB=-2.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,233:236:99:5182,469,0 chrM 1789 . A T 753.02 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;DP=68;Dels=0.00;FS=82.101;HaplotypeScore=87.0636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQ0=0;MQRankSum=5.801;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.776;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,46:68:24:783,0,24 chrM 1825 . T A 208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;DP=35;Dels=0.00;FS=3.110;HaplotypeScore=40.1652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.59;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.290;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:238,0,198 chrM 1846 . A T 496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=28.6322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.42;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:526,0,139 chrM 1867 . A T 54.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;DP=50;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=21.8092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.38;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=1.08;ReadPosRankSum=-2.247;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,9:50:84:84,0,790 chrM 1886 . C T 901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.22;MQ0=0;QD=25.03;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:96:934,96,0 chrM 1902 . C T 844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.56;MQ0=0;QD=24.11;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:90:877,90,0 chrM 1953 . A G 2262 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;DP=123;Dels=0.02;FS=17.782;HaplotypeScore=176.5643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=18.39;ReadPosRankSum=2.274;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,109:120:99:2295,240,0 chrM 2621 . A G 103.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;DP=132;Dels=0.01;FS=88.305;HaplotypeScore=12.4768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.56;MQ0=0;MQRankSum=2.143;QD=0.78;ReadPosRankSum=-3.042;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,13:131:99:133,0,1105 chrM 3027 . T A 5408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.527;DP=238;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3699;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=22.72;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-2.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,236:238:99:5408,523,0 chrM 3028 . T A 5401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=240;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=22.50;ReadPosRankSum=1.718;SB=-2.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,239:240:99:5401,504,0 chrM 3094 . G A 4245.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=2;QD=24.40;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4245,388,0 chrM 3443 . G A 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.11;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3566,351,0 chrM 3498 . T A 5843.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=24.55;SB=-2.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,238:238:99:5843,517,0 chrM 3630 . T A 5638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.6736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=24.95;ReadPosRankSum=1.717;SB=-2.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,224:225:99:5638,529,0 chrM 3673 . T G 5598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;DP=240;Dels=0.00;FS=3.028;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=2.316;QD=23.33;ReadPosRankSum=1.381;SB=-3.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,237:240:99:5598,490,0 chrM 3675 . C A 5694.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.584;DP=246;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=2.669;QD=23.15;ReadPosRankSum=1.698;SB=-3.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,243:246:99:5694,490,0 chrM 3950 . A T 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.139;DP=116;Dels=0.00;FS=7.080;HaplotypeScore=26.6394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.67;MQ0=0;MQRankSum=3.130;QD=21.84;ReadPosRankSum=0.070;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,109:116:99:2567,204,0 chrM 3966 . A C 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-5.969;DP=177;Dels=0.01;FS=3.887;HaplotypeScore=47.1637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;MQ0=1;MQRankSum=6.086;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.974;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,155:176:99:3425,243,0 chrM 4081 . A T 257.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.119;DP=311;Dels=0.00;FS=39.567;HaplotypeScore=7.6321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.39;MQ0=0;MQRankSum=-8.769;QD=0.83;ReadPosRankSum=6.294;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,49:311:99:287,0,5921 chrM 4082 . T A 183.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;DP=311;Dels=0.00;FS=41.898;HaplotypeScore=6.7931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.29;MQ0=0;MQRankSum=-8.636;QD=0.59;ReadPosRankSum=5.948;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,49:311:99:213,0,5849 chrM 4090 . T A 271.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.735;DP=309;Dels=0.00;FS=41.395;HaplotypeScore=13.5800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.68;MQ0=0;MQRankSum=-8.749;QD=0.88;ReadPosRankSum=2.556;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,50:309:99:301,0,5763 chrM 4096 . A T 263.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;DP=312;Dels=0.01;FS=45.266;HaplotypeScore=13.5913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.46;MQ0=0;MQRankSum=-8.558;QD=0.84;ReadPosRankSum=0.182;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,49:310:99:293,0,5839 chrM 4114 . A T 220.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.409;DP=265;Dels=0.00;FS=67.910;HaplotypeScore=11.8656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.48;MQ0=0;MQRankSum=-7.386;QD=0.83;ReadPosRankSum=-5.939;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,46:265:99:250,0,4653 chrM 4361 . T G 4443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.215;DP=228;Dels=0.00;FS=2.272;HaplotypeScore=17.6204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.78;MQ0=2;MQRankSum=2.395;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.785;SB=-2.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,225:228:99:4443,366,0 chrM 4432 . C T 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;DP=117;Dels=0.03;FS=5.254;HaplotypeScore=21.6380;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=23.59;ReadPosRankSum=0.638;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2793,267,0 chrM 4705 . T C 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.973;DP=82;Dels=0.00;FS=4.839;HaplotypeScore=67.6195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.98;MQ0=1;MQRankSum=-0.521;QD=0.54;ReadPosRankSum=-4.028;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,6:82:31:74,0,31 chrM 4706 . T C 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;DP=85;Dels=0.00;FS=14.303;HaplotypeScore=76.6412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.23;MQ0=1;MQRankSum=2.731;QD=0.52;ReadPosRankSum=4.903;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,70:85:73:74,0,73 chrM 4831 . C T 5036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.7604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:5036,499,0 chrM 4835 . T A 5119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.358;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.5669;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=2.145;QD=24.61;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,205:208:99:5119,499,0 chrM 5169 . C T 314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=74.0824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.86;MQ0=0;QD=4.08;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:39:347,39,0 chrM 5182 . T G 1275 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.186;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=81.5181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.73;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.804;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,120:127:99:1308,134,0 chrM 5534 . T C 2202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.379;DP=100;Dels=0.01;FS=3.100;HaplotypeScore=11.7154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=22.02;ReadPosRankSum=1.697;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,97:99:99:2235,219,0 chrM 5558 . A C 2159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.746;DP=114;Dels=0.00;FS=42.297;HaplotypeScore=105.1341;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=6.323;QD=18.94;ReadPosRankSum=5.683;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,96:114:99:2192,210,0 chrM 5639 . T A 2191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2224,207,0 chrM 5932 . G A 1738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=75;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=11.7209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.637;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,72:73:99:1771,150,0 chrM 6013 . A C 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.23;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3453,357,0 chrM 6118 . A T 4535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.62;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4535,472,0 chrM 6164 . G T 227.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.653;DP=115;Dels=0.00;FS=41.586;HaplotypeScore=90.0248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.77;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=1.97;ReadPosRankSum=-7.007;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,20:115:99:257,0,1121 chrM 6187 . T C 443 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.124;DP=68;Dels=0.00;FS=25.234;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.58;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=6.51;ReadPosRankSum=-4.032;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,62:68:63:476,63,0 chrM 6432 . T A 45.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;DP=24;Dels=0.00;FS=16.510;HaplotypeScore=49.1597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=1.88;ReadPosRankSum=1.016;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:75:75,0,150 chrM 6518 . T A 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.097;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=42.1527;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=1.931;QD=20.83;ReadPosRankSum=-3.929;SB=-4.578e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,162:180:99:3749,352,0 chrM 6553 . A T 7458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.128;DP=299;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=24.94;ReadPosRankSum=1.686;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,297:299:99:7458,688,0 chrM 6994 . A T 6969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.214;DP=293;Dels=0.00;FS=20.313;HaplotypeScore=19.5205;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=3.382;QD=23.79;ReadPosRankSum=1.501;SB=-2.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,284:293:99:6969,586,0 chrM 8231 . T G 311.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.118;DP=255;Dels=0.00;FS=13.697;HaplotypeScore=1052.6735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=1.22;ReadPosRankSum=-8.779;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,32:255:99:341,0,716 chrM 9939 . C A 6323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.99;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,246:246:99:6323,610,0 chrM 9953 . G A 6158.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.98;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,246:248:99:6158,613,0 chrM 9954 . A G 6077.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.718;DP=248;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7732;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=24.50;ReadPosRankSum=1.718;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,247:248:99:6077,615,0 chrM 10102 . T A 1338 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=72;Dels=0.00;FS=7.165;HaplotypeScore=20.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.03;MQ0=1;MQRankSum=1.803;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.453;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,65:72:99:1371,124,0 chrM 10124 . G T 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;DP=54;Dels=0.04;FS=30.560;HaplotypeScore=44.2218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.98;MQ0=1;MQRankSum=-0.756;QD=0.76;ReadPosRankSum=-2.174;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:52:71:71,0,256 chrM 10128 . G T 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;DP=56;Dels=0.02;FS=20.011;HaplotypeScore=62.0234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.49;MQ0=1;MQRankSum=-1.080;QD=0.66;ReadPosRankSum=-1.776;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:55:67:67,0,306 chrM 10211 . A T 38.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;DP=67;Dels=0.00;FS=5.479;HaplotypeScore=315.2106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.678;QD=0.57;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-4.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,3:67:40:68,0,40 chrM 10212 . A C 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.541;DP=68;Dels=0.00;FS=5.378;HaplotypeScore=313.2439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.802;QD=0.63;ReadPosRankSum=0.195;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,4:68:73:73,0,157 chrM 10217 . A T 42.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.994;DP=67;Dels=0.00;FS=1.930;HaplotypeScore=232.8607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.161;QD=0.63;ReadPosRankSum=0.441;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,5:67:72:72,0,242 chrM 10404 . C G 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.551;DP=209;Dels=0.00;FS=45.835;HaplotypeScore=176.2608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=14.87;ReadPosRankSum=7.348;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,178:209:99:3140,306,0 chrM 10813 . A T 9032.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=364;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=1;QD=24.81;SB=-4.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,364:364:99:9032,880,0 chrM 10836 . T C 9301.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=378;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7213;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.32;MQ0=1;QD=24.61;SB=-4.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,377:377:99:9301,910,0 chrM 11170 . A T 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;DP=39;Dels=0.00;FS=5.058;HaplotypeScore=19.6716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.42;MQ0=0;MQRankSum=-3.743;QD=0.62;ReadPosRankSum=-2.129;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:39:54:54,0,580 chrM 11181 . A G 47.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;DP=32;Dels=0.00;FS=5.411;HaplotypeScore=20.6790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.88;MQ0=0;MQRankSum=-3.269;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.006;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:77:77,0,431 chrM 11183 . T G 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.085;DP=26;Dels=0.00;FS=5.528;HaplotypeScore=17.7537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.576;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.104;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:26:80:80,0,314 chrM 11225 . A T 84.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;DP=15;Dels=0.00;FS=13.570;HaplotypeScore=10.9307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-6.435e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:61:114,0,61 chrM 11230 . A T 89.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;DP=14;Dels=0.00;FS=9.590;HaplotypeScore=7.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.22;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-6.487e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:60:119,0,60 chrM 11386 . A G 4123.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;DP=179;Dels=0.01;FS=9.251;HaplotypeScore=18.4719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=2.268;QD=23.03;ReadPosRankSum=0.105;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,174:178:99:4123,364,0 chrM 11713 . T A 6586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=262;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.14;SB=-3.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,262:262:99:6586,616,0 chrM 11749 . T C 7412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.936;DP=297;Dels=0.00;FS=2.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.963;QD=24.96;ReadPosRankSum=1.922;SB=-2.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,294:297:99:7412,744,0 chrM 11783 . C T 8176.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.948;DP=325;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=2.719;QD=25.16;ReadPosRankSum=2.559;SB=-2.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,322:325:99:8176,738,0 chrM 11791 . G A 8948.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=361;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.79;SB=-3.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,361:361:99:8948,838,0 chrM 12059 . A T 1756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;DP=77;Dels=0.00;FS=9.381;HaplotypeScore=5.9065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=3.317;QD=22.81;ReadPosRankSum=0.677;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,73:77:99:1789,156,0 chrM 12878 . A G 5864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;DP=259;Dels=0.00;FS=19.597;HaplotypeScore=8.8300;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=3.698;QD=22.64;ReadPosRankSum=2.059;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,254:259:99:5864,584,0 chrM 13333 . T A 5436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.278;DP=214;Dels=0.00;FS=5.240;HaplotypeScore=4.9388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=3.371;QD=25.40;ReadPosRankSum=1.479;SB=-2.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,210:214:99:5436,523,0 chrM 13706 . G A 5955.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.780;DP=256;Dels=0.00;FS=131.200;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.98;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=23.26;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,244:256:99:5955,646,0 chrM 13740 . A T 362.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.663;DP=276;Dels=0.00;FS=32.270;HaplotypeScore=71.2406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.79;MQ0=0;MQRankSum=2.712;QD=1.31;ReadPosRankSum=-6.618;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,37:276:99:392,0,1445 chrM 13976 . A G 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.18;MQ0=0;QD=18.57;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3097,342,0 chrM 13987 . G T 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.58;MQ0=0;QD=1.19;SB=-1.398e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:49,6,0 chrM 20504 . G T 92.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.03;MQ0=0;QD=18.45;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:125,15,0 chrM 20525 . A G 4493.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.724;DP=413;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7599;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,412:413:99:4493,504,0 chrM 20537 . A T 7641.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=485;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.81;MQ0=0;QD=15.75;SB=-2.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,485:485:99:7641,831,0 chrM 20570 . T C 14613.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=643;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.36;MQ0=0;QD=22.73;SB=-6.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,643:643:99:14613,1504,0 chrM 20642 . G A 23442.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=889;Dels=0.00;FS=3.634;HaplotypeScore=7.4446;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=26.37;ReadPosRankSum=1.362;SB=-1.089e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,888:889:99:23442,2445,0 chrM 20651 . C A 26631.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=993;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.7370;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.64;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.081e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,993:993:99:26631,2697,0 chrM 20934 . T G 21428.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=987;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.2295;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=21.71;SB=-1.082e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,985:986:99:21428,2298,0 chrM 24565 . T C 1402 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;DP=100;Dels=0.00;FS=9.895;HaplotypeScore=35.4075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.88;MQ0=1;MQRankSum=3.901;QD=14.02;ReadPosRankSum=-4.675;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,90:98:99:1435,185,0 chrM 24614 . A G 6434.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;DP=458;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.3614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.96;MQ0=1;MQRankSum=0.959;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.588;SB=-4.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,457:458:99:6434,717,0 chrM 24671 . T C 15406.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;DP=630;Dels=0.00;FS=3.515;HaplotypeScore=19.4015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.19;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=24.45;ReadPosRankSum=0.983;SB=-7.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,628:630:99:15406,1603,0 chrM 24934 . T A 16568.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.601;DP=675;Dels=0.00;FS=56.156;HaplotypeScore=9.1517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=6.023;QD=24.55;ReadPosRankSum=6.116;SB=-8.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,656:675:99:16568,1747,0 chrM 25150 . A G 14267.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;DP=604;Dels=0.00;FS=30.621;HaplotypeScore=12.8377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.47;MQ0=0;MQRankSum=3.157;QD=23.62;ReadPosRankSum=4.089;SB=-7.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,589:604:99:14267,1608,0 chrM 25185 . A T 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;DP=439;Dels=0.00;FS=3.077;HaplotypeScore=5.7648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.18;MQ0=0;MQRankSum=3.772;QD=0.03;ReadPosRankSum=-4.431;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:429,10:439:42:42,0,933 chrM 25344 . T C 16025.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=720;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2769;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.93;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=22.26;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-5.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,719:720:99:16025,1732,0 chrM 26386 . T C 17593.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.727;DP=702;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8927;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=1;MQRankSum=1.559;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-6.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,701:702:99:17593,1905,0 chrM 26539 . C T 18061.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=677;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7607;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.18;MQ0=0;QD=26.68;SB=-9.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,676:677:99:18061,1838,0 chrM 26570 . A G 13607.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=604;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.26;MQ0=0;QD=22.53;SB=-6.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,604:604:99:13607,1452,0 chrM 26571 . A C 15556.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=656;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6595;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.79;MQ0=0;QD=23.71;SB=-6.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,656:656:99:15556,1647,0 chrM 26581 . T C 14228.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.721;DP=611;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.590;QD=23.29;ReadPosRankSum=-1.630;SB=-5.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,610:611:99:14228,1503,0 chrM 26709 . A T 5047.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.77;MQ0=0;QD=21.94;SB=-2.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:5047,543,0 chrM 26738 . G A 1075.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;DP=188;Dels=0.00;FS=464.064;HaplotypeScore=82.0616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.20;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=5.72;ReadPosRankSum=-8.035;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,56:188:99:1105,0,538 chrM 26739 . T A 1040.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.628;DP=188;Dels=0.00;FS=481.546;HaplotypeScore=75.7522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.20;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=5.53;ReadPosRankSum=-9.327;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,55:188:99:1070,0,582 chrM 26743 . T A 30.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.732;DP=167;Dels=0.00;FS=145.067;HaplotypeScore=120.0250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.17;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=0.18;ReadPosRankSum=-4.307;SB=-4.732e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,10:167:60:60,0,833 chrM 26832 . C T 81.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=73.2669;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.74;MQ0=0;QD=1.10;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:12:114,12,0 chrM 26939 . A T 194.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=42.6034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.50;MQ0=0;MQRankSum=2.608;QD=9.70;ReadPosRankSum=2.079;SB=-6.806e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,10:20:21:227,21,0 chrM 26987 . A T 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;DP=40;Dels=0.00;FS=7.904;HaplotypeScore=18.6724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.142;QD=0.50;ReadPosRankSum=0.152;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,8:40:50:50,0,693 chrM 27098 . C T 4362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4362,406,0 chrM 27184 . C G 4954.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9047;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.12;MQ0=0;QD=23.48;SB=-2.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,210:211:99:4954,483,0 chrM 27463 . G A 4468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.09;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:180:99:4468,415,0 chrM 28023 . G A 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.059;DP=126;Dels=0.00;FS=3.035;HaplotypeScore=17.5459;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.17;MQ0=0;MQRankSum=1.962;QD=24.32;ReadPosRankSum=2.235;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,124:126:99:3097,283,0 chrM 28333 . C T 1981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=43.5484;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.09;MQ0=0;QD=21.53;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2014,213,0 chrM 28367 . T A 1372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.51;MQ0=0;QD=13.58;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:1405,162,0 chrM 28390 . T A 1189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.331;DP=177;Dels=0.00;FS=70.187;HaplotypeScore=121.2642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=6.72;ReadPosRankSum=-9.689;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,134:177:99:1222,132,0 chrM 28837 . C T 22458.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=864;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.094e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,864:864:99:22458,2253,0 chrM 29015 . T A 21406.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.672;DP=833;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.88;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.435;SB=-1.147e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,830:833:99:21406,2147,0 chrM 29017 . C T 21003.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.719;DP=811;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6506;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.60;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.505;SB=-1.136e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,808:810:99:21003,2065,0 chrM 29170 . C T 13638.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;DP=562;Dels=0.00;FS=9.172;HaplotypeScore=5.6660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=24.27;ReadPosRankSum=1.442;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,561:562:99:13638,1444,0 chrM 29179 . G T 11638.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=515;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.88;MQ0=0;QD=22.60;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,515:515:99:11638,1258,0 chrM 29200 . C T 9908.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=432;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.89;MQ0=0;QD=22.94;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,432:432:99:9908,1048,0 chrM 29203 . T C 7799.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.529;DP=359;Dels=0.00;FS=17.769;HaplotypeScore=3.6989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.87;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=21.72;ReadPosRankSum=1.722;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,358:359:99:7799,876,0 chrM 29206 . G A 5177.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.78;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:216:99:5177,564,0 chrM 29207 . G T 4959.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6963;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.50;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:4959,552,0 chrM 29208 . G C 4865.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6474;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.06;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:4865,549,0 chrM 29209 . A T 4996.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.68;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:4996,552,0 chrM 29215 . C T 5142.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;QD=20.82;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,245:245:99:5142,561,0 chrM 29218 . G A 5120.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.138;DP=247;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.840;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,245:247:99:5120,556,0 chrM 29219 . G C 4945.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;QD=20.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,246:247:99:4945,561,0 chrM 29220 . C T 5101.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.718;DP=247;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.680;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,246:247:99:5101,561,0 chrM 29224 . T C 5013.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=266;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.86;MQ0=0;QD=18.85;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,266:266:99:5013,564,0 chrM 29239 . T C 3457.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;QD=17.82;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:3457,390,0 chrM 29249 . G A 3276.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.84;MQ0=0;QD=18.72;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:3276,345,0 chrM 29252 . G T 3015 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.83;MQ0=0;QD=18.05;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:3048,333,0 chrM 29289 . T A 126.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.789;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=68.2016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.60;MQ0=1;MQRankSum=0.375;QD=2.10;ReadPosRankSum=-4.325;SB=2.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,47:60:21:159,21,0 chrM 29366 . T C 13.24 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.355;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.203;QD=0.66;ReadPosRankSum=2.431;SB=-3.377e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:19:43,0,19 chrM 29369 . C A 17.12 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;DP=20;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=14.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-3.033e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:19:47,0,19 chrM 29371 . A C 15.17 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.039;DP=29;Dels=0.00;FS=28.597;HaplotypeScore=41.4462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.28;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=0.52;ReadPosRankSum=3.039;SB=-3.360e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:29:19:45,0,19 chrM 29381 . T C 38.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.049;DP=35;Dels=0.00;FS=15.009;HaplotypeScore=82.3482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=1.09;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-4.963e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:17:68,0,17 chrM 29410 . C A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.77;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:56,6,0 chrM 29413 . G A 107.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.66;SB=-2.723e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:15:140,15,0 chrM 29469 . C T 335.10 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.238;DP=37;Dels=0.00;FS=7.112;HaplotypeScore=49.7151;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.17;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.519;SB=2.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,29:37:19:368,19,0 chrM 29489 . C T 312.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.085;DP=16;Dels=0.00;FS=12.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=19.51;ReadPosRankSum=-1.735;SB=-1.759e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:17:345,17,0 chrM 29555 . G A 34.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.123;DP=17;Dels=0.00;FS=9.294;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=2.06;ReadPosRankSum=1.531;SB=-1.898e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:9:67,9,0 chrM 29562 . T G 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;DP=31;Dels=0.00;FS=40.030;HaplotypeScore=10.6708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=0.34;ReadPosRankSum=-3.373;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:40:40,0,134 chrM 29594 . A T 1401 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.367;DP=78;Dels=0.00;FS=3.859;HaplotypeScore=32.4078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.51;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.804;SB=-7.159e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,71:78:99:1434,137,0 chrM 30217 . C A 4967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.808;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7624;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.96;MQ0=2;MQRankSum=0.208;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.808;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,226:229:99:4967,494,0 chrM 30258 . C A 4380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.32;MQ0=2;QD=22.01;SB=-2.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:4380,474,0 chrM 30308 . A T 2165 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.676;DP=111;Dels=0.00;FS=23.071;HaplotypeScore=20.5457;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.67;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=19.50;ReadPosRankSum=2.255;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,99:111:99:2198,260,0 chrM 30314 . A T 480 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;DP=82;Dels=0.00;FS=13.273;HaplotypeScore=20.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.515;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.778;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,66:82:69:513,69,0 chrM 30315 . A T 368 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;DP=81;Dels=0.00;FS=17.294;HaplotypeScore=17.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.571;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.395;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,66:81:54:401,54,0 chrM 30316 . T A 368 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;DP=77;Dels=0.00;FS=16.737;HaplotypeScore=17.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.987;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.264;SB=-4.519e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,62:77:54:401,54,0 chrM 31158 . T C 8537.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=365;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=23.39;SB=-2.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,363:364:99:8537,862,0 chrM 33467 . T C 6992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;DP=313;Dels=0.00;FS=4.838;HaplotypeScore=6.6573;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=3.719;QD=22.34;ReadPosRankSum=2.553;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,308:313:99:6992,735,0 chrM 35840 . G A 427 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8956;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.08;MQ0=0;QD=16.42;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:48:460,48,0 chrM 35841 . A C 413 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8956;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.57;MQ0=0;QD=16.52;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:48:446,48,0 chrM 35849 . A T 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=11;Dels=0.00;FS=6.264;HaplotypeScore=13.8956;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=2.07;ReadPosRankSum=-2.520;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,4:11:6:54,6,0 chrM 35859 . A T 132.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.747;SB=-6.963e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:18:165,18,0 chrM 35862 . A T 128.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.02;SB=-1.106e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18:161,18,0 chrM 35940 . A T 35.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.4013;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.66;MQ0=0;MQRankSum=2.192;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.306;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,20:29:9:68,9,0 chrM 39517 . G T 14913.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=591;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.4468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=25.23;SB=-5.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,590:591:99:14913,1466,0 chrM 39759 . G A 11839.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;DP=449;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=5.7266;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=2.671;QD=26.37;ReadPosRankSum=2.188;SB=-3.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,445:449:99:11839,1225,0 chrM 39945 . G A 12882.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.182;DP=504;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.4685;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.65;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.674;SB=-5.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,503:504:99:12882,1294,0 chrM 40011 . C A 7482.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=331;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.29;MQ0=0;QD=22.60;SB=-2.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,331:331:99:7482,784,0 chrM 40012 . A T 7340.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=330;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.22;MQ0=0;QD=22.24;SB=-2.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,330:330:99:7340,763,0 chrM 40021 . G A 6564.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=294;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.15;MQ0=0;QD=22.33;SB=-2.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,294:294:99:6564,697,0 chrM 40063 . C A 4842.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.374;DP=213;Dels=0.00;FS=4.093;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=22.73;ReadPosRankSum=1.033;SB=-2.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,212:213:99:4842,520,0 chrM 40065 . C A 4816.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.358;DP=213;Dels=0.00;FS=4.093;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=22.61;ReadPosRankSum=0.594;SB=-2.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,212:213:99:4816,517,0 chrM 40067 . A T 4930.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.133;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=23.15;ReadPosRankSum=1.643;SB=-2.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,211:213:99:4930,517,0 chrM 40078 . C T 4956.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.64;SB=-2.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,229:229:99:4956,517,0 chrM 40080 . G A 4762.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.70;MQ0=0;QD=19.52;SB=-2.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,228:244:99:4762,514,0 chrM 40083 . A G 4775.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.198;DP=261;Dels=0.00;FS=25.158;HaplotypeScore=3.9732;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.78;MQ0=0;MQRankSum=-3.967;QD=18.30;ReadPosRankSum=5.440;SB=-2.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,245:261:99:4775,537,0 chrM 40099 . G A 5426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=263;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.21;MQ0=0;QD=20.63;SB=-2.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,263:263:99:5426,583,0 chrM 40123 . G A 6518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.517;DP=268;Dels=0.00;FS=4.281;HaplotypeScore=5.5140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=24.32;ReadPosRankSum=1.125;SB=-2.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,267:268:99:6518,663,0 chrM 40157 . C T 7611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;DP=305;Dels=0.00;FS=3.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.44;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=24.95;ReadPosRankSum=-1.039;SB=-3.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,304:305:99:7611,738,0 chrM 40254 . C T 5498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.713;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.478;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,220:221:99:5498,520,0 chrM 40387 . G A 2467 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.741;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.7137;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.46;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=15.52;ReadPosRankSum=2.339;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,157:159:99:2500,297,0 chrM 40416 . C T 538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.833;DP=357;Dels=0.00;FS=35.160;HaplotypeScore=1143.3634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=1.51;ReadPosRankSum=0.393;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,282:356:99:568,0,550 chrM 40430 . A T 194.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.677;DP=390;Dels=0.00;FS=18.631;HaplotypeScore=29.8989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=0.50;ReadPosRankSum=-7.224;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:323,58:390:99:224,0,2627 chrM 41631 . G A 22261.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.728;DP=886;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=9.5372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=25.13;ReadPosRankSum=1.501;SB=-1.158e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,884:886:99:22261,2199,0 chrM 41727 . C A 19183.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=736;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5963;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.06;SB=-9.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,736:736:99:19183,1964,0 chrM 41882 . G A 19674.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=743;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8028;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.48;SB=-9.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,743:743:99:19674,2021,0 chrM 44872 . T G 6369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;DP=283;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=8.4519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.03;MQ0=1;MQRankSum=2.242;QD=22.51;ReadPosRankSum=2.256;SB=-3.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,280:283:99:6369,610,0 chrM 44923 . C A 6009.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.174;DP=271;Dels=0.00;FS=5.090;HaplotypeScore=14.0137;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.61;MQ0=11;MQRankSum=2.536;QD=22.17;ReadPosRankSum=1.310;SB=-2.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,260:271:99:6009,562,0 chrM 45046 . T A 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.506;DP=122;Dels=0.00;FS=11.071;HaplotypeScore=68.9040;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.44;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=20.58;ReadPosRankSum=4.711;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,113:122:99:2544,276,0 chrM 45126 . T A 5399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.23;MQ0=1;QD=22.78;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,237:237:99:5399,553,0 chrM 45127 . T G 5314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=239;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.15;MQ0=1;QD=22.23;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,239:239:99:5314,558,0 chrM 45157 . A T 7733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.547;DP=320;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.88;MQ0=1;MQRankSum=1.699;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.581;SB=-4.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,319:320:99:7733,724,0 chrM 45162 . A T 7673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.596;DP=315;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.10;MQ0=1;MQRankSum=1.710;QD=24.36;ReadPosRankSum=1.258;SB=-4.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,314:315:99:7673,724,0 chrM 45224 . T C 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.08;MQ0=0;QD=18.99;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:3627,408,0 chrM 45244 . A C 440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.156;DP=51;Dels=0.00;FS=10.030;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.83;MQ0=0;MQRankSum=2.986;QD=8.63;ReadPosRankSum=-5.662;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:40:470,0,40 chrM 45381 . T A 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.94;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=24.97;ReadPosRankSum=2.135;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,108:115:99:2905,297,0 chrM 45401 . C A 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8329;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.23;MQ0=0;QD=24.63;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:113:99:2816,285,0 chrM 45442 . A C 35.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.53;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=2.00;ReadPosRankSum=-2.725;SB=-3.972e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,3:18:9:68,9,0 chrM 45459 . T A 491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.026;DP=151;Dels=0.00;FS=8.771;HaplotypeScore=4.9480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.15;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=3.25;ReadPosRankSum=-6.865;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,133:151:57:524,57,0 chrM 45481 . T A 1836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.48;MQ0=0;QD=10.14;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:1869,192,0 chrM 45925 . T A 333.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.994;DP=267;Dels=0.00;FS=56.237;HaplotypeScore=516.9023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.73;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=1.25;ReadPosRankSum=-7.652;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,49:267:99:363,0,1067 chrM 45927 . T A 319.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;DP=258;Dels=0.00;FS=33.946;HaplotypeScore=354.3441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.06;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=1.24;ReadPosRankSum=-6.140;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,31:258:99:349,0,1197 chrM 46017 . C T 8064.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=311;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9257;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.08;MQ0=0;QD=25.93;SB=-3.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,311:311:99:8064,790,0 chrM 46234 . A T 399 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=425;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=373.6309;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=0.94;SB=-4.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,425:425:48:432,48,0 chrM 46443 . A G 1711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.162;DP=100;Dels=0.01;FS=71.522;HaplotypeScore=73.0500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.46;MQ0=1;MQRankSum=0.296;QD=17.11;ReadPosRankSum=-3.877;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,74:99:99:1744,195,0 chrM 46496 . G A 597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;DP=47;Dels=0.04;FS=4.491;HaplotypeScore=19.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.424;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,44:45:69:630,69,0 chrM 46538 . A G 2041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.831;DP=111;Dels=0.00;FS=11.851;HaplotypeScore=5.8282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.52;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=18.39;ReadPosRankSum=1.574;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,107:111:99:2074,182,0 chrM 46611 . G A 1364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.65;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:56:99:1397,138,0 chrM 47147 . T A 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;DP=126;Dels=0.00;FS=8.322;HaplotypeScore=50.1243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=5.347;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.928;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,114:126:99:2821,273,0 chrM 47150 . A T 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.505;DP=135;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=42.2924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;MQRankSum=4.975;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.122;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,124:135:99:2674,196,0 chrM 47208 . T C 4792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.034;DP=210;Dels=0.00;FS=13.246;HaplotypeScore=9.8697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=4.301;QD=22.82;ReadPosRankSum=4.288;SB=-2.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,202:210:99:4792,376,0 chrM 47295 . A T 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.398;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=1;MQRankSum=1.655;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.808;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3566,358,0 chrM 47433 . T G 6867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.352;DP=284;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7504;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=2.268;QD=24.18;ReadPosRankSum=2.121;SB=-3.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,282:284:99:6867,667,0 chrM 47639 . C A 410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.776;DP=87;Dels=0.02;FS=27.529;HaplotypeScore=372.7919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=4.71;ReadPosRankSum=-5.387;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,25:85:93:440,0,93 chrM 48163 . T A 346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;DP=317;Dels=0.00;FS=26.888;HaplotypeScore=144.8517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=1;MQRankSum=-0.101;QD=1.09;ReadPosRankSum=-11.068;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,60:317:99:376,0,5030 chrM 48169 . A T 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;DP=341;Dels=0.00;FS=28.390;HaplotypeScore=154.4417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=1;MQRankSum=2.361;QD=1.98;ReadPosRankSum=-9.272;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,83:341:99:704,0,4843 chrM 49500 . A T 5123.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.431;DP=207;Dels=0.00;FS=4.835;HaplotypeScore=5.6949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=24.75;ReadPosRankSum=1.448;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,206:207:99:5123,445,0 chrM 49754 . T A 79.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;DP=50;Dels=0.00;FS=31.527;HaplotypeScore=34.2439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.32;MQ0=1;MQRankSum=0.166;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.100;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:109,0,590 chrM 51128 . T C 719.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.728;DP=428;Dels=0.00;FS=56.554;HaplotypeScore=8.5612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=1.68;ReadPosRankSum=-7.479;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:320,107:428:99:749,0,7348 chrM 51394 . A T 9681.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;DP=393;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=1;MQRankSum=1.679;QD=24.63;ReadPosRankSum=1.138;SB=-4.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,391:393:99:9681,952,0 chrM 52363 . G C 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7758;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=2.350;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.492;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,195:198:99:3712,333,0 chrM 52663 . G A 1243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.06;MQ0=0;QD=23.02;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1276,126,0 chrM 52708 . T A 186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.762;QD=3.00;ReadPosRankSum=-2.115;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:216,0,589 chrM 52715 . T A 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.6073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.725;QD=0.30;ReadPosRankSum=-2.630;SB=-4.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,11:71:51:51,0,887 chrM 52740 . T A 1666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;DP=84;Dels=0.00;FS=11.253;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.97;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=19.83;ReadPosRankSum=2.724;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,81:84:99:1699,165,0 chrM 52761 . C T 2094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=69.3512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.77;MQ0=0;QD=21.59;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2127,207,0 chrM 52824 . A T 302.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.705;DP=133;Dels=0.00;FS=270.286;HaplotypeScore=7.7508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.36;MQ0=1;MQRankSum=-5.445;QD=2.27;ReadPosRankSum=-7.273;SB=-4.348e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,54:132:99:332,0,1587 chrM 52834 . A C 344.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.294;DP=121;Dels=0.00;FS=215.034;HaplotypeScore=5.9627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.58;MQ0=1;MQRankSum=-3.708;QD=2.84;ReadPosRankSum=-8.175;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,45:121:99:374,0,1489 chrM 53031 . T G 5443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.194;DP=223;Dels=0.00;FS=2.705;HaplotypeScore=11.6436;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=2.361;QD=24.41;ReadPosRankSum=1.426;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,221:223:99:5443,540,0 chrM 53314 . T A 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.820;DP=22;Dels=0.00;FS=11.290;HaplotypeScore=4.8740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.64;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=0.55;ReadPosRankSum=-3.736;SB=-1.192e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,15:22:6:43,6,0 chrM 53327 . A G 60.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;DP=28;Dels=0.00;FS=20.769;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.91;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=2.16;ReadPosRankSum=-3.585;SB=-1.375e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,20:28:12:93,12,0 chrM 53394 . A T 787.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;DP=287;Dels=0.00;FS=114.309;HaplotypeScore=197.8146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.54;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=2.74;ReadPosRankSum=-12.065;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,87:287:99:817,0,3643 chrM 53422 . A G 7391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.930;DP=305;Dels=0.00;FS=38.193;HaplotypeScore=10.5463;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.43;MQ0=0;MQRankSum=2.664;QD=24.23;ReadPosRankSum=2.096;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,298:305:99:7391,676,0 chrM 53520 . T A 2455 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.620;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.75;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.695;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:2488,247,0 chrM 53527 . A C 2306 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=114.0480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.33;MQ0=0;QD=25.07;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2339,264,0 chrM 53529 . G A 2510 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=228.0959;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.33;MQ0=0;QD=27.28;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2543,267,0 chrM 53568 . A G 4231.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6400;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.79;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=22.87;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,184:185:99:4231,474,0 chrM 53648 . T C 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.49;MQ0=0;QD=16.60;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:3502,399,0 chrM 53658 . G C 1604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9459;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.18;MQ0=0;QD=9.38;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:1637,198,0 chrM 53674 . C A 1974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.72;MQ0=0;QD=16.87;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2007,237,0 chrM 54050 . G T 4309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6038;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.49;MQ0=0;QD=25.20;SB=-2.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4309,415,0 chrM 54291 . T G 2070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.83;MQ0=0;QD=18.99;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2103,231,0 chrM 54321 . A T 287 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;DP=46;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=87.8544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.75;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=6.24;ReadPosRankSum=1.956;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:33:320,33,0 chrM 54322 . T A 279 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;DP=46;Dels=0.02;FS=3.488;HaplotypeScore=77.9432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.75;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.695;SB=-8.800e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,41:45:33:312,33,0 chrM 54768 . T A 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.526;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=2.301;QD=23.95;ReadPosRankSum=2.122;SB=-2.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,163:165:99:3952,352,0 chrM 54983 . A G 1716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.98;MQ0=3;QD=22.00;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1749,153,0 chrM 55001 . A G 2469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=3;QD=21.47;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2502,186,0 chrM 55125 . G A 5071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5910;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.48;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:5071,508,0 chrM 55264 . C T 5962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,237:237:99:5962,589,0 chrM 55745 . T A 2600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.533;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=2.762;QD=24.53;ReadPosRankSum=1.315;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,103:106:99:2633,252,0 chrM 56102 . A T 8839.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=380;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=23.26;SB=-3.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,380:380:99:8839,793,0 chrM 56188 . G T 8001.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.721;DP=310;Dels=0.00;FS=4.914;HaplotypeScore=5.7514;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=25.81;ReadPosRankSum=0.726;SB=-2.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,309:310:99:8001,784,0 chrM 56215 . C T 7205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.029;DP=294;Dels=0.00;FS=8.300;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=2.257;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.892;SB=-3.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,292:294:99:7205,651,0 chrM 56230 . T C 6735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;DP=286;Dels=0.00;FS=5.721;HaplotypeScore=1.8991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;MQRankSum=2.426;QD=23.55;ReadPosRankSum=2.391;SB=-3.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,282:286:99:6735,649,0 chrM 56287 . G A 5831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;DP=249;Dels=0.00;FS=6.813;HaplotypeScore=237.9145;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.29;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=23.42;ReadPosRankSum=2.122;SB=-3.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,245:248:99:5831,549,0 chrM 56332 . A T 4018.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;DP=153;Dels=0.00;FS=4.288;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=26.26;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4018,406,0 chrM 56410 . T C 223 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=25.6992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.59;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=11.74;ReadPosRankSum=-3.266;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,11:19:33:256,33,0 chrM 56412 . A C 62.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;DP=21;Dels=0.00;FS=14.270;HaplotypeScore=22.6981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=2.98;ReadPosRankSum=-3.505;SB=-1.051e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,6:21:12:95,12,0 chrM 56520 . G A 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8688;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.65;MQ0=0;QD=25.12;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3316,309,0 chrM 56645 . A T 7011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=293;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9221;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.67;MQ0=0;QD=23.93;SB=-2.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,293:293:99:7011,658,0 chrM 56835 . T G 4128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.4511;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.02;MQ0=1;MQRankSum=3.083;QD=20.74;ReadPosRankSum=0.577;SB=-2.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,193:199:99:4128,334,0 chrM 56885 . T A 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=19.93;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:2743,252,0 chrM 56961 . A T 2382 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.193;DP=108;Dels=0.00;FS=13.963;HaplotypeScore=37.9889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.48;MQ0=0;MQRankSum=3.740;QD=22.06;ReadPosRankSum=1.794;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,99:108:99:2415,206,0 chrM 57073 . T A 3879.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.614;DP=200;Dels=0.01;FS=97.023;HaplotypeScore=81.5999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.59;MQ0=0;MQRankSum=6.385;QD=19.40;ReadPosRankSum=5.577;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,167:199:99:3879,384,0 chrM 57160 . G T 6073.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.538;DP=233;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.7218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.941;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,231:232:99:6073,557,0 chrM 57283 . A C 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.471;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,183:184:99:3126,327,0 chrM 57781 . T A 1398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.642;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9085;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=25.42;ReadPosRankSum=1.283;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:55:99:1431,150,0 chrM 57824 . G A 712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.05;MQ0=0;QD=20.34;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:87:745,87,0 chrM 57971 . T A 536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;DP=82;Dels=0.00;FS=4.265;HaplotypeScore=47.3083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.63;MQ0=0;MQRankSum=3.641;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.005;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,42:82:99:566,0,492 chrM 58159 . A G 12206.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.410;DP=528;Dels=0.00;FS=5.043;HaplotypeScore=19.1228;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=23.12;ReadPosRankSum=1.476;SB=-4.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,526:528:99:12206,1264,0 chrM 58197 . T A 14876.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.316;DP=576;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.3029;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=25.83;ReadPosRankSum=1.521;SB=-6.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,573:576:99:14876,1463,0 chrM 60355 . A T 228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.961;DP=297;Dels=0.00;FS=15.181;HaplotypeScore=526.6294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=2.586;QD=0.77;ReadPosRankSum=-9.338;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,51:297:99:258,0,478 chrM 60486 . C T 56.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.61;MQ0=0;QD=2.97;SB=-5.226e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:89,12,0 chrM 60726 . T C 447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;DP=37;Dels=0.00;FS=15.113;HaplotypeScore=5.9030;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.11;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=12.08;ReadPosRankSum=-2.862;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,33:37:29:480,29,0 chrM 60727 . T A 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9030;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.38;MQ0=0;QD=0.93;SB=-2.977e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:13:6:43,6,0 chrM 61866 . G T 161.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.97;MQ0=0;QD=17.89;SB=-4.897e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:194,24,0 chrM 61881 . G A 3431.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;DP=511;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7764;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.532;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,510:511:99:3431,372,0 chrM 61903 . C T 7580.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=559;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.80;MQ0=0;QD=13.56;SB=-2.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,559:559:99:7580,816,0 chrM 62951 . T G 2672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=119;Dels=0.00;FS=3.395;HaplotypeScore=110.0587;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=1;MQRankSum=1.644;QD=22.45;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2705,261,0 chrM 63226 . G A 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3198,262,0 chrM 63401 . C A 14.18 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;DP=211;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=197.9661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=0.07;ReadPosRankSum=-4.528;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:202,9:211:3:44,3,0 chrM 63404 . C T 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=199.0844;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=0.09;ReadPosRankSum=1.062;SB=-2.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,216:217:6:51,6,0 chrM 64322 . G T 34.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.993;DP=56;Dels=0.00;FS=23.178;HaplotypeScore=24.1718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.22;MQ0=0;MQRankSum=3.146;QD=0.61;ReadPosRankSum=1.249;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,9:56:64:64,0,641 chrM 65062 . C T 900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=84.0986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.96;MQ0=0;QD=10.00;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:90:99:933,111,0 chrM 65171 . A G 7456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=296;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.53;MQ0=0;QD=25.19;SB=-2.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,295:296:99:7456,733,0 chrM 65916 . G C 4418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.853;DP=267;Dels=0.00;FS=11.540;HaplotypeScore=684.8853;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.92;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=16.55;ReadPosRankSum=3.100;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,260:267:99:4418,494,0 chrM 65943 . T C 288 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.492;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9257;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.87;MQ0=0;MQRankSum=1.837;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,59:62:36:321,36,0 chrM 66594 . A T 4347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.364;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=24.28;ReadPosRankSum=1.539;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,178:179:99:4347,433,0 chrM 66797 . T A 6617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;DP=268;Dels=0.00;FS=7.726;HaplotypeScore=12.7129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=2.376;QD=24.69;ReadPosRankSum=1.815;SB=-3.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,265:268:99:6617,625,0 chrM 66837 . C G 5557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;DP=274;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.439;SB=-2.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,271:274:99:5557,542,0 chrM 66960 . A T 2320 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6980;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=24.17;ReadPosRankSum=1.696;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2353,201,0 chrM 67033 . G T 112.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.660;DP=13;Dels=0.00;FS=23.314;HaplotypeScore=7.8860;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.94;MQ0=0;MQRankSum=3.016;QD=8.63;ReadPosRankSum=-3.016;SB=-5.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,7:13:18:145,18,0 chrM 67420 . A T 9518.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.235;DP=397;Dels=0.00;FS=4.085;HaplotypeScore=6.7531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=23.97;ReadPosRankSum=1.680;SB=-4.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,396:397:99:9518,913,0 chrM 67421 . A T 9593.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=399;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;QD=24.04;SB=-4.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,399:399:99:9593,913,0 chrM 67614 . T A 1156 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.389;DP=128;Dels=0.00;FS=34.127;HaplotypeScore=23.8475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=9.03;ReadPosRankSum=-9.213;SB=3.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:55,73:128:99:1189,104,0 chrM 67618 . A T 654 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.706;DP=92;Dels=0.00;FS=25.511;HaplotypeScore=46.4838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=2.689;QD=7.11;ReadPosRankSum=-5.496;SB=3.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:63,29:92:50:687,50,0 chrM 67642 . A T 58.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.187;DP=62;Dels=0.00;FS=20.178;HaplotypeScore=69.4783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.531;QD=0.94;ReadPosRankSum=-2.364;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,10:62:88:88,0,823 chrM 67645 . A T 29.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;DP=63;Dels=0.00;FS=16.301;HaplotypeScore=68.2696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.49;MQ0=0;MQRankSum=-3.790;QD=0.46;ReadPosRankSum=-1.815;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,10:63:59:59,0,853 chrM 67652 . T A 59.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.875;DP=62;Dels=0.00;FS=9.893;HaplotypeScore=74.8421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.819;QD=0.95;ReadPosRankSum=-1.400;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,11:62:89:89,0,755 chrM 67702 . C A 18.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.382;DP=84;Dels=0.00;FS=29.988;HaplotypeScore=32.7460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.83;MQ0=0;MQRankSum=-6.075;QD=0.22;ReadPosRankSum=-6.138;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:48:48,0,1319 chrM 67882 . A T 226.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.063;DP=105;Dels=0.00;FS=8.297;HaplotypeScore=9.9181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=2.16;ReadPosRankSum=2.570;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,101:105:14:259,14,0 chrM 67887 . A T 563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.716;DP=117;Dels=0.00;FS=5.792;HaplotypeScore=6.9321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.750;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,114:117:69:596,69,0 chrM 67968 . C T 3972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;DP=216;Dels=0.02;FS=49.034;HaplotypeScore=18.2592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.30;MQ0=0;MQRankSum=4.919;QD=18.39;ReadPosRankSum=5.751;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,184:211:99:3972,0,143 chrM 67973 . G A 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.838;DP=212;Dels=0.00;FS=39.542;HaplotypeScore=18.5001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.58;MQ0=0;MQRankSum=-4.469;QD=0.15;ReadPosRankSum=-6.032;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,21:212:62:62,0,3762 chrM 68050 . G C 1905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.012;DP=146;Dels=0.00;FS=3.040;HaplotypeScore=6.9324;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.613;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:1938,200,0 chrM 68133 . T A 2697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.192;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=24.74;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2730,261,0 chrM 68400 . T A 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.184;DP=139;Dels=0.01;FS=23.452;HaplotypeScore=6.8426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.94;MQ0=0;MQRankSum=2.847;QD=17.70;ReadPosRankSum=7.110;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,116:138:99:2493,237,0 chrM 68977 . T C 4742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.6357;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=3.174;QD=23.02;ReadPosRankSum=3.103;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,199:206:99:4742,427,0 chrM 69095 . A G 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.50;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=23.73;ReadPosRankSum=1.379;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:158:99:3749,405,0 chrM 69105 . A T 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.117;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.6804;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.38;MQ0=0;MQRankSum=2.541;QD=22.60;ReadPosRankSum=1.514;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,144:147:99:3322,345,0 chrM 69114 . T A 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5839;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.21;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.902;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,141:144:99:3328,339,0 chrM 69151 . A T 4319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=183;Dels=0.00;FS=5.516;HaplotypeScore=18.7209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.88;MQ0=0;MQRankSum=3.882;QD=23.60;ReadPosRankSum=0.707;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,174:183:99:4319,394,0 chrM 69565 . A G 2205 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.092;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7089;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=23.71;ReadPosRankSum=0.904;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:93:99:2238,222,0 chrM 69665 . C A 4438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=24.38;SB=-2.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4438,385,0 chrM 70692 . G A 162.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;DP=156;Dels=0.01;FS=43.829;HaplotypeScore=408.9375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=1.04;ReadPosRankSum=-4.896;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,11:155:65:192,0,65 chrM 70693 . A T 157.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.556;DP=157;Dels=0.00;FS=43.671;HaplotypeScore=408.9375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=2.954;QD=1.00;ReadPosRankSum=-4.817;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,11:157:99:187,0,117 chrM 70695 . A G 114.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.640;DP=157;Dels=0.00;FS=35.972;HaplotypeScore=409.9242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=0.73;ReadPosRankSum=-4.323;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,9:157:99:144,0,166 chrM 70745 . G A 1348 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=24.51;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1381,138,0 chrM 70942 . A C 189.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-5.629;DP=164;Dels=0.00;FS=62.792;HaplotypeScore=417.5315;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=1.15;ReadPosRankSum=-5.314;SB=2.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:152,12:164:27:222,27,0 chrM 70944 . A T 181.19 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.522;DP=161;Dels=0.00;FS=72.022;HaplotypeScore=417.5315;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=1.13;ReadPosRankSum=-4.772;SB=1.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:152,9:161:8:213,8,0 chrM 70946 . C G 159.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.235;DP=161;Dels=0.00;FS=72.022;HaplotypeScore=417.5315;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=0.99;ReadPosRankSum=-5.037;SB=-1.167e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:152,9:161:3:189,3,0 chrM 71002 . A G 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.70;MQ0=0;QD=24.48;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3451,357,0 chrM 71074 . A T 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.6356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=1.14;ReadPosRankSum=-1.674;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:54:54,0,89 chrM 71092 . A T 95.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;DP=26;Dels=0.00;FS=24.849;HaplotypeScore=13.6801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.73;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.830;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:125,0,159 chrM 71199 . C T 920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.73;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:953,102,0 chrM 71310 . T A 920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=58;Dels=0.00;FS=19.338;HaplotypeScore=2.7865;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=15.86;ReadPosRankSum=5.202;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,44:57:83:953,83,0 chrM 71357 . T C 78.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.900;DP=84;Dels=0.00;FS=45.591;HaplotypeScore=34.4931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.41;MQ0=0;MQRankSum=2.634;QD=0.93;ReadPosRankSum=-6.685;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,27:84:99:108,0,1077 chrM 71967 . T A 336.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;DP=52;Dels=0.04;FS=2.888;HaplotypeScore=42.2007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=6.46;ReadPosRankSum=-3.747;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:366,0,167 chrM 71999 . A G 2475 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.33;MQ0=0;QD=21.71;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2508,258,0 chrM 72061 . G A 4402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.412;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8502;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.48;MQ0=0;MQRankSum=2.557;QD=24.46;ReadPosRankSum=3.411;SB=-2.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,176:180:99:4402,391,0 chrM 72240 . T G 2563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;DP=112;Dels=0.00;FS=2.676;HaplotypeScore=13.8015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.87;MQ0=0;MQRankSum=2.095;QD=22.88;ReadPosRankSum=0.388;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,109:112:99:2596,227,0 chrM 72732 . T A 289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;DP=296;Dels=0.01;FS=40.230;HaplotypeScore=67.3774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.88;MQ0=0;MQRankSum=2.801;QD=0.98;ReadPosRankSum=5.061;SB=-3.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,275:293:99:319,0,158 chrM 73080 . C A 386 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=52.1914;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.79;MQ0=0;QD=7.57;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:45:419,45,0 chrM 73155 . G C 91.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.939;DP=39;Dels=0.00;FS=2.496;HaplotypeScore=22.6726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.34;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.017;SB=-4.726e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,31:39:15:124,15,0 chrM 73367 . A T 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.469;DP=114;Dels=0.00;FS=5.896;HaplotypeScore=5.8992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.61;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=24.73;ReadPosRankSum=2.195;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,111:114:99:2852,257,0 chrM 73448 . T C 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.17;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:169:99:3952,375,0 chrM 73462 . C T 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8914;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=22.43;ReadPosRankSum=1.413;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:3656,354,0 chrM 73498 . A G 652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=25.7664;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.18;MQ0=0;QD=13.04;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:78:685,78,0 chrM 73619 . G T 107.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.388;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=85.0553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.069;QD=1.09;ReadPosRankSum=3.492;SB=-2.017e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,88:98:15:140,15,0 chrM 73629 . A G 1030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=27.4917;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.51;MQ0=0;QD=10.96;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:1063,129,0 chrM 73649 . T A 70.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.481;DP=125;Dels=0.00;FS=96.149;HaplotypeScore=721.8266;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=0.56;ReadPosRankSum=-4.661;SB=2.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:110,15:125:12:103,12,0 chrM 74051 . T C 19917.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.150;DP=801;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.690;SB=-1.051e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,799:801:99:19917,2067,0 chrM 74225 . T A 19515.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=733;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1375;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;QD=26.62;SB=-5.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,733:733:99:19515,2069,0 chrM 74327 . T C 24169.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=999;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.146e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,999:999:99:24169,2484,0 chrM 74384 . T A 20961.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=783;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7682;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.77;SB=-3.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,783:783:99:20961,2109,0 chrM 74414 . A G 17865.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=712;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=1;QD=25.09;SB=-4.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,712:712:99:17865,1918,0 chrM 74462 . G A 14240.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=547;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=1;QD=26.03;SB=-7.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,547:547:99:14240,1439,0 chrM 74716 . T A 14465.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=582;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.7814;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.85;SB=-5.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,582:582:99:14465,1433,0 chrM 75121 . T A 13680.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.524;DP=533;Dels=0.00;FS=5.357;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.028;QD=25.67;ReadPosRankSum=2.754;SB=-5.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,530:533:99:13680,1364,0 chrM 75124 . A T 14149.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=555;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.26;MQ0=0;QD=25.49;SB=-6.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,552:552:99:14149,1424,0 chrM 75125 . C T 14075.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=555;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.30;MQ0=0;QD=25.36;SB=-6.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,552:552:99:14075,1426,0 chrM 75997 . C T 6142.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=240;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,239:240:99:6142,607,0 chrM 76299 . C G 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.3953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=18.26;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:3688,369,0 chrM 76313 . G A 4736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.9792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=23.45;SB=-2.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:4736,430,0 chrM 76800 . A G 6814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=291;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=0;QD=23.42;SB=-3.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,291:291:99:6814,595,0 chrM 76818 . G A 7406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=326;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9664;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=22.72;SB=-4.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,326:326:99:7406,634,0 chrM 76830 . A G 6513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.955;DP=293;Dels=0.00;FS=5.946;HaplotypeScore=2.7949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=2.818;QD=22.23;ReadPosRankSum=2.117;SB=-3.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,289:293:99:6513,609,0 chrM 76959 . T A 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.018;DP=148;Dels=0.01;FS=24.828;HaplotypeScore=23.3462;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.75;MQ0=0;MQRankSum=4.787;QD=22.92;ReadPosRankSum=2.695;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,138:147:99:3392,304,0 chrM 77159 . T A 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;DP=28;Dels=0.00;FS=17.258;HaplotypeScore=19.7110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.73;MQ0=1;MQRankSum=-1.604;QD=0.96;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:57:57,0,373 chrM 77582 . A T 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.78;MQ0=0;QD=25.68;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2627,264,0 chrM 77832 . T A 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;DP=95;Dels=0.03;FS=62.922;HaplotypeScore=309.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=0.29;ReadPosRankSum=-2.040;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:58:58,0,309 chrM 77877 . T C 1405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.61;MQ0=0;QD=18.01;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1438,171,0 chrM 78180 . A T 1828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=2;QD=22.85;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1861,171,0 chrM 78260 . T A 97.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;DP=14;Dels=0.00;FS=19.792;HaplotypeScore=31.4202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.79;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.933;SB=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,5:14:15:130,15,0 chrM 79131 . A T 2154 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;DP=126;Dels=0.00;FS=4.953;HaplotypeScore=12.9019;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.37;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.057;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:126:99:2187,243,0 chrM 79132 . A G 2002 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;DP=124;Dels=0.00;FS=24.227;HaplotypeScore=9.9377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.43;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=16.15;ReadPosRankSum=2.236;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,119:124:99:2035,239,0 chrM 79133 . G A 1987 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.708;DP=123;Dels=0.00;FS=14.646;HaplotypeScore=8.9430;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=16.15;ReadPosRankSum=2.925;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,118:123:99:2020,239,0 chrM 79281 . T A 21748.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=833;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=25.7467;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.178;SB=-6.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,830:833:99:21748,2041,0 chrM 79713 . C T 24742.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=962;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.4637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=1;QD=25.72;SB=-1.231e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,962:962:99:24742,2531,0 chrM 79999 . G C 8815.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=395;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.33;MQ0=0;QD=22.32;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,395:395:99:8815,996,0 chrM 80001 . C A 9179.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=391;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=23.48;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,391:391:99:9179,991,0 chrM 80004 . C T 8741.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=387;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.95;MQ0=0;QD=22.59;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,387:387:99:8741,961,0 chrM 80007 . C T 8599.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=380;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.95;MQ0=0;QD=22.63;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,380:380:99:8599,949,0 chrM 80016 . A T 7673.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=292;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.97;MQ0=0;QD=26.28;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,292:292:99:7673,772,0 chrM 80019 . C T 7128.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=289;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.97;MQ0=0;QD=24.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,289:289:99:7128,772,0 chrM 80030 . G A 48.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.30;MQ0=0;QD=3.06;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:9:81,9,0 chrM 80161 . C T 4350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.624;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4551;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=1.777;QD=24.30;ReadPosRankSum=2.230;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,177:179:99:4350,397,0 chrM 80174 . A T 5280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=24.11;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:219:99:5280,499,0 chrM 80281 . A T 46.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;DP=283;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=307.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.09;MQ0=0;MQRankSum=-4.643;QD=0.16;ReadPosRankSum=1.169;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,31:283:76:76,0,276 chrM 80283 . A T 25.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.630;DP=278;Dels=0.00;FS=26.990;HaplotypeScore=304.9382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.65;MQ0=0;MQRankSum=-3.117;QD=0.09;ReadPosRankSum=3.188;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,8:278:55:55,0,455 chrM 80284 . A T 25.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;DP=272;Dels=0.00;FS=33.976;HaplotypeScore=320.2346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.473;QD=0.09;ReadPosRankSum=3.081;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,7:272:55:55,0,470 chrM 80474 . T A 116.98 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.104;DP=194;Dels=0.00;FS=229.826;HaplotypeScore=108.8363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.211;QD=0.60;ReadPosRankSum=-10.662;SB=-9.777e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,115:194:3:146,0,3 chrM 80475 . T C 137.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-9.575;DP=193;Dels=0.00;FS=215.226;HaplotypeScore=109.8046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=0.71;ReadPosRankSum=-9.845;SB=2.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:76,115:193:21:170,21,0 chrM 80476 . T C 134.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-10.507;DP=193;Dels=0.00;FS=206.456;HaplotypeScore=111.7909;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=0.69;ReadPosRankSum=-8.980;SB=2.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:77,115:193:21:167,21,0 chrM 80508 . C T 305 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=258.5372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.86;MQ0=1;QD=1.78;SB=-7.613e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,163:164:39:338,39,0 chrM 80538 . A T 878 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=48.3483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=1;QD=5.74;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:96:911,96,0 chrM 80551 . T A 566.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.671;DP=145;Dels=0.00;FS=225.537;HaplotypeScore=96.6454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.921;QD=3.90;ReadPosRankSum=5.943;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,85:145:99:596,0,749 chrM 80552 . A C 544.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.550;DP=145;Dels=0.00;FS=225.537;HaplotypeScore=88.8966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.571;QD=3.75;ReadPosRankSum=4.173;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,85:145:99:574,0,744 chrM 80559 . T A 532.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;DP=151;Dels=0.00;FS=225.771;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.53;MQ0=0;MQRankSum=-4.065;QD=3.52;ReadPosRankSum=-3.532;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,66:151:99:562,0,1312 chrM 80653 . G A 6892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=273;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7971;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;QD=25.25;SB=-3.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,273:273:99:6892,646,0 chrM 80843 . A T 5135.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=24.93;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,206:206:99:5135,522,0 chrM 81186 . A T 34.77 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;DP=15;Dels=0.00;FS=2.158;HaplotypeScore=32.5761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.32;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=2.32;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-3.676e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,8:15:6:66,6,0 chrM 81529 . G T 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;DP=43;Dels=0.00;FS=2.411;HaplotypeScore=36.4499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.87;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=1.02;ReadPosRankSum=-3.908;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,6:43:74:74,0,309 chrM 81541 . A T 203.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.118;DP=89;Dels=0.00;FS=105.876;HaplotypeScore=139.5748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.22;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=2.28;ReadPosRankSum=-6.663;SB=2.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:70,19:89:27:236,27,0 chrM 81589 . G A 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=153;Dels=0.01;FS=3.965;HaplotypeScore=10.5974;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=23.27;ReadPosRankSum=1.709;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3560,387,0 chrM 81639 . T G 4838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.585;DP=194;Dels=0.00;FS=28.755;HaplotypeScore=20.5673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=24.94;ReadPosRankSum=1.280;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,187:194:99:4838,531,0 chrM 81744 . T G 7029.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=287;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.21;MQ0=0;QD=24.49;SB=-2.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,287:287:99:7029,753,0 chrM 81824 . T C 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;DP=47;Dels=0.00;FS=2.289;HaplotypeScore=51.2235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=0.22;ReadPosRankSum=-3.088;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:47:40:40,0,143 chrM 81839 . A G 749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=40.3463;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.05;MQ0=0;QD=10.55;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:93:782,93,0 chrM 81908 . T A 2360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.966;DP=128;Dels=0.02;FS=0.756;HaplotypeScore=84.1116;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=18.44;ReadPosRankSum=7.637;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,92:126:99:2393,238,0 chrM 81944 . A G 162.14 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.002;DP=72;Dels=0.01;FS=17.047;HaplotypeScore=9.8231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.08;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=2.25;ReadPosRankSum=5.267;SB=-1.201e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:12:192,0,12 chrM 81946 . A G 88.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;DP=70;Dels=0.00;FS=10.043;HaplotypeScore=9.8231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=1.26;ReadPosRankSum=-1.814;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:69:118,0,69 chrM 81947 . G T 87.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;DP=60;Dels=0.00;FS=10.101;HaplotypeScore=9.8231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.29;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=1.45;ReadPosRankSum=-3.560;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,10:60:90:117,0,90 chrM 81981 . G A 1276 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.91;MQ0=0;QD=15.75;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1309,138,0 chrM 81991 . A G 1638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.247;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.797;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:1671,177,0 chrM 82041 . A T 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9171;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=25.41;ReadPosRankSum=1.584;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3006,303,0 chrM 82184 . T A 2160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.852;DP=94;Dels=0.00;FS=18.823;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.92;MQ0=1;MQRankSum=0.590;QD=22.98;ReadPosRankSum=3.866;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,87:94:99:2193,222,0 chrM 82308 . A T 1087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.42;MQ0=0;QD=21.31;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1120,123,0 chrM 82389 . T A 5089.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.42;MQ0=0;QD=24.58;SB=-2.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5089,493,0 chrM 82450 . G A 5260.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.80;MQ0=0;QD=24.24;SB=-2.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,213:213:99:5260,523,0 chrM 82462 . A T 6364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.882;DP=252;Dels=0.00;FS=17.121;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=3.011;QD=25.25;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-2.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,248:252:99:6364,622,0 chrM 82507 . T A 5969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.412;DP=250;Dels=0.00;FS=3.207;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=23.88;ReadPosRankSum=1.537;SB=-3.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,248:249:99:5969,571,0 chrM 82511 . C T 5996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.870;DP=250;Dels=0.00;FS=3.207;HaplotypeScore=4.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=23.98;ReadPosRankSum=1.287;SB=-3.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,248:250:99:5996,574,0 chrM 82744 . A T 1149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.871;DP=67;Dels=0.00;FS=48.801;HaplotypeScore=32.3771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.01;MQ0=0;MQRankSum=2.631;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,57:67:99:1182,129,0 chrM 82901 . A C 16.85 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.751;SB=-2.871e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:6:48,6,0 chrM 83031 . T C 7085.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.300;DP=308;Dels=0.00;FS=2.923;HaplotypeScore=13.1645;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.20;MQ0=1;MQRankSum=2.130;QD=23.00;ReadPosRankSum=2.378;SB=-3.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,306:308:99:7085,619,0 chrM 83149 . A T 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;DP=122;Dels=0.00;FS=5.301;HaplotypeScore=3.8737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=23.30;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:2876,282,0 chrM 83292 . T A 2338 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;DP=122;Dels=0.00;FS=8.476;HaplotypeScore=6.2413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.23;MQ0=0;MQRankSum=2.643;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.605;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,114:122:99:2371,187,0 chrM 83353 . A G 102.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.2403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=4.45;SB=-5.027e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:15:135,15,0 chrM 83456 . A T 1042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.59;MQ0=0;QD=17.37;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1075,108,0 chrM 83629 . T G 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.70;MQ0=0;QD=23.10;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2759,255,0 chrM 83762 . T C 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4689;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.86;MQ0=2;QD=21.97;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2757,273,0 chrM 84020 . T A 655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.544;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=51.4537;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.94;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.284;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,44:47:72:688,72,0 chrM 84029 . T A 740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.394;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8133;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=14.23;ReadPosRankSum=2.159;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,49:52:84:773,84,0 chrM 84066 . T A 2261 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.49;MQ0=0;QD=26.29;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2294,243,0 chrM 84185 . C A 231.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.7160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.09;MQ0=1;MQRankSum=0.264;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.580;SB=-7.889e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:26:32:261,0,32 chrM 84274 . C T 215.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.97;MQ0=0;QD=2.50;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:27:248,27,0 chrM 84335 . G A 1591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=164.3064;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=13.37;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:1624,177,0 chrM 84348 . T A 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.64;MQ0=0;QD=0.18;SB=-7.278e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:6:50,6,0 chrM 84353 . A T 1909 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=119;Dels=0.00;FS=5.842;HaplotypeScore=5.7972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.674;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:1942,186,0 chrM 84358 . A T 2145 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.88;MQ0=0;QD=16.37;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:2178,234,0 chrM 84361 . C T 2558 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.88;MQ0=0;QD=17.52;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:2591,282,0 chrM 84483 . T G 371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=421.9413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=1.67;ReadPosRankSum=-8.893;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,31:221:99:401,0,732 chrM 84523 . G A 6538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=261;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.21;MQ0=1;QD=25.05;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,261:261:99:6538,646,0 chrM 84637 . T G 5264.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.12;MQ0=3;MQRankSum=1.134;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.655;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,228:229:99:5264,450,0 chrM 84748 . C T 48.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.77;MQ0=0;QD=16.32;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:81,9,0 chrM 84858 . A T 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=26;Dels=0.00;FS=10.193;HaplotypeScore=12.9091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.096;QD=0.77;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:50:50,0,213 chrM 84996 . G A 4548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.212;DP=207;Dels=0.04;FS=3.991;HaplotypeScore=25.3607;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.30;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=21.97;ReadPosRankSum=1.283;SB=-2.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,192:198:99:4548,421,0 chrM 85127 . T C 271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=242;Dels=0.00;FS=14.146;HaplotypeScore=62.1733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=1.12;ReadPosRankSum=-6.337;SB=-5.700e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:225,16:242:36:304,36,0 chrM 85129 . A C 81.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.832;DP=236;Dels=0.00;FS=36.793;HaplotypeScore=51.1408;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.80;MQ0=0;MQRankSum=3.360;QD=0.34;ReadPosRankSum=4.146;SB=-1.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,223:236:15:114,15,0 chrM 85260 . A C 169.09 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.788;DP=31;Dels=0.00;FS=28.263;HaplotypeScore=33.6339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.30;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=5.45;ReadPosRankSum=-1.536;SB=-1.813e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:31:14:199,0,14 chrM 85601 . C G 16.85 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.155;DP=72;Dels=0.00;FS=3.853;HaplotypeScore=25.9122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=0.23;ReadPosRankSum=-4.220;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:65,7:72:6:48,6,0 chrM 85611 . G A 29.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.664;DP=64;Dels=0.00;FS=13.678;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.80;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=0.45;ReadPosRankSum=-4.557;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,8:64:59:59,0,766 chrM 85621 . A C 265 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.63;MQ0=0;QD=5.10;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:52:39:298,39,0 chrM 85671 . A C 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.07;MQ0=1;QD=2.97;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:6:49,6,0 chrM 85673 . A C 14.91 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.19;MQ0=1;QD=2.13;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:7:6:46,6,0 chrV 305 . T A 17.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.46;MQ0=55;MQRankSum=-1.558;QD=0.23;ReadPosRankSum=-1.558;SB=-2.302e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:20:47,0,20 chrV 542 . G C 954.20 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;DP=181;Dels=0.00;FS=19.668;HaplotypeScore=2.5243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.30;MQ0=82;MQRankSum=-0.980;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.310;SB=-1.193e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,156:181:2:983,0,2 chrV 575 . T G 62.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.824;DP=86;Dels=0.00;FS=13.692;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.58;MQ0=21;MQRankSum=2.466;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,8:86:92:92,0,643 chrV 600 . G A 844 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.86;MQ0=9;QD=12.23;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:93:877,93,0 chrV 769 . T C 394 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.473;DP=86;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.57;MQ0=50;MQRankSum=4.010;QD=4.58;ReadPosRankSum=-2.030;SB=-6.588e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:58,28:86:48:427,48,0 chrV 780 . T C 136.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.938;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.49;MQ0=37;MQRankSum=-2.477;QD=1.74;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,50:78:99:166,0,233 chrV 1083 . G A 162.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.556;DP=41;Dels=0.00;FS=4.559;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.33;MQ0=25;MQRankSum=-1.667;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.079;SB=-2.294e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,29:41:1:191,1,0 chrV 1125 . C T 170.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.00;MQ0=13;MQRankSum=-1.466;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:68:200,0,68 chrV 1133 . T G 171.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.17;MQ0=9;MQRankSum=-2.239;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.768;SB=-2.804e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:17:201,0,17 chrV 1215 . T C 523.42 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.56;MQ0=10;MQRankSum=0.000;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-2.621e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:7:553,0,7 chrV 1218 . G T 653 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=10;QD=16.74;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,31:39:72:686,72,0 chrV 1491 . A G 87.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=340;Dels=0.00;FS=2.567;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.51;MQ0=137;MQRankSum=-1.282;QD=0.26;ReadPosRankSum=1.576;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:307,33:340:99:117,0,3404 chrV 1544 . T C 298.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.988;DP=227;Dels=0.00;FS=11.470;HaplotypeScore=3.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.93;MQ0=22;MQRankSum=-2.225;QD=1.31;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,41:227:99:328,0,3359 chrV 1567 . C T 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.569;DP=149;Dels=0.00;FS=2.064;HaplotypeScore=54.4825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.09;MQ0=5;MQRankSum=-0.649;QD=0.10;ReadPosRankSum=1.287;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,20:149:44:44,0,2466 chrV 1570 . G C 196.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;DP=127;Dels=0.00;FS=15.929;HaplotypeScore=55.4540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.74;MQ0=5;MQRankSum=0.735;QD=1.54;ReadPosRankSum=-1.423;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,26:127:99:226,0,1688 chrV 1603 . C T 228.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.576;DP=26;Dels=0.00;FS=25.420;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.95;MQ0=1;MQRankSum=0.198;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:58:258,0,58 chrV 1608 . T G 356 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8276;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.95;MQ0=1;QD=13.69;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:48:389,48,0 chrV 1609 . T C 199.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.855;DP=26;Dels=0.00;FS=36.027;HaplotypeScore=3.9118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.48;MQ0=1;MQRankSum=0.749;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.969;SB=-3.015e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:68:229,0,68 chrV 1616 . T C 189.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;DP=28;Dels=0.00;FS=28.609;HaplotypeScore=5.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.74;MQ0=1;MQRankSum=0.073;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.512;SB=-5.684e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:219,0,158 chrV 1656 . G A 241.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.758;DP=41;Dels=0.00;FS=18.265;HaplotypeScore=4.8078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.84;MQ0=9;MQRankSum=2.115;QD=5.88;ReadPosRankSum=3.512;SB=-6.514e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:58:271,0,58 chrV 1659 . A T 246.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.580;DP=47;Dels=0.00;FS=12.768;HaplotypeScore=4.8078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.84;MQ0=9;MQRankSum=2.495;QD=5.23;ReadPosRankSum=4.257;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:85:276,0,85 chrV 1660 . G T 245.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.050;DP=47;Dels=0.00;FS=12.768;HaplotypeScore=6.7590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.84;MQ0=9;MQRankSum=2.701;QD=5.21;ReadPosRankSum=3.963;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:80:275,0,80 chrV 1662 . A G 170.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.875;DP=49;Dels=0.00;FS=8.275;HaplotypeScore=11.4817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.72;MQ0=10;MQRankSum=1.743;QD=3.47;ReadPosRankSum=3.322;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:200,0,141 chrV 1680 . T G 390 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.654;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.1724;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.85;MQ0=12;MQRankSum=-0.079;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.654;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:48:423,48,0 chrV 1688 . T C 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;DP=60;Dels=0.00;FS=51.066;HaplotypeScore=11.8890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.74;MQ0=13;MQRankSum=-0.430;QD=0.22;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,8:60:43:43,0,336 chrV 1738 . A G 364 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.71;MQ0=13;QD=7.43;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:48:397,48,0 chrV 1755 . G A 150.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.458;DP=43;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=21.5089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.84;MQ0=6;MQRankSum=-1.018;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.300;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:180,0,166 chrV 1762 . A G 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.491;DP=35;Dels=0.00;FS=11.798;HaplotypeScore=12.6525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.09;MQ0=6;MQRankSum=0.025;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:67:67,0,257 chrV 1769 . T C 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;DP=34;Dels=0.00;FS=11.798;HaplotypeScore=11.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.72;MQ0=5;MQRankSum=0.684;QD=0.68;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:53:53,0,191 chrV 1815 . C A,T 274.01 filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;DP=87;Dels=0.00;FS=11.491;HaplotypeScore=8.9486;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=12.30;MQ0=38;MQRankSum=1.876;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-6.503e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:26,34,27:87:96:334,109,96,208,0,212 chrV 1819 . T C 177.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=89;Dels=0.00;FS=21.320;HaplotypeScore=18.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.77;MQ0=41;MQRankSum=1.012;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:89:94:207,0,94 chrV 1851 . A C 30.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.873;DP=102;Dels=0.02;FS=5.105;HaplotypeScore=26.7616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.67;MQ0=57;MQRankSum=2.436;QD=0.29;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,13:100:60:60,0,167 chrV 1887 . A C 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.580;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.0759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.05;MQ0=53;MQRankSum=1.050;QD=0.43;ReadPosRankSum=1.696;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:65:65,0,155 chrV 1906 . G A 57.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.951;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.2142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.78;MQ0=36;MQRankSum=0.984;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.637;SB=-6.524e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:57:87,0,57 chrV 1999 . T C 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.80;MQ0=0;QD=3.80;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:54,6,0 chrV 2014 . G A 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.47;MQ0=2;MQRankSum=-0.736;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.736;SB=1.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:6:58,6,0 chrV 2016 . A G 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.47;MQ0=2;MQRankSum=0.736;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.736;SB=1.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:6:53,6,0 chrV 2019 . A G 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.25;MQ0=3;QD=2.64;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:9:6:55,6,0 chrV 2029 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.73;MQ0=5;QD=1.56;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:53,6,0 chrV 2031 . C A 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8576;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.73;MQ0=5;MQRankSum=-0.751;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.751;SB=1.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:6:57,6,0 chrV 4482 . C A 99.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.21;MQ0=160;MQRankSum=0.747;QD=0.59;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-5.430e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:157,11:168:15:132,15,0 chrV 4513 . C T 99.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.87;MQ0=120;MQRankSum=0.751;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.751;SB=-5.430e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:102,26:129:15:132,15,0 chrV 4516 . T C 98.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.87;MQ0=116;QD=0.79;SB=-5.430e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:99,25:124:15:131,15,0 chrV 5856 . T A 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;DP=93;Dels=0.00;FS=6.154;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.76;MQ0=82;MQRankSum=0.000;QD=0.22;ReadPosRankSum=2.228;SB=-8.249e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,16:93:50:50,0,109 chrV 6011 . G T 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.68;MQ0=143;MQRankSum=1.377;QD=0.20;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,8:154:61:61,0,104 chrV 6102 . G T 81.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.34;MQ0=13;MQRankSum=-0.717;QD=3.24;ReadPosRankSum=1.186;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:111,0,107 chrV 6110 . G C 214.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.40;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:27:247,27,0 chrV 6125 . C T 172.46 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:1:201,0,1 chrV 6219 . A G 57.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.218;DP=77;Dels=0.00;FS=17.321;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.58;MQ0=32;MQRankSum=-2.334;QD=0.74;ReadPosRankSum=-1.979;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,11:77:87:87,0,761 chrV 6259 . A C 1777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.54;MQ0=2;QD=21.15;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1810,174,0 chrV 6271 . T C 442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.668;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.12;MQ0=2;MQRankSum=-2.863;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,32:107:99:472,0,1425 chrV 6303 . G A 2060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.74;MQ0=1;QD=20.81;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2093,195,0 chrV 6304 . C T 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.911;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.58;MQ0=1;MQRankSum=-1.489;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.447;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,38:98:99:622,0,1033 chrV 6407 . A G 437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.687;DP=91;Dels=0.00;FS=0.987;HaplotypeScore=15.9107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.153;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.008;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:467,0,419 chrV 6486 . A G 85.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.742;DP=128;Dels=0.00;FS=5.135;HaplotypeScore=8.8158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.48;MQ0=1;MQRankSum=-2.781;QD=0.66;ReadPosRankSum=-4.674;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,19:128:99:115,0,2471 chrV 6611 . G C 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.63;MQ0=1;QD=24.51;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3897,393,0 chrV 6782 . C A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.207;DP=120;Dels=0.00;FS=1.547;HaplotypeScore=4.7709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQ0=1;MQRankSum=1.589;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.935;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1415,0,1045 chrV 6807 . G T 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.724;DP=105;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1039,0,905 chrV 6808 . T A 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.531;DP=107;Dels=0.00;FS=1.550;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:1058,0,964 chrV 6921 . G A 565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.543;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQ0=0;MQRankSum=-5.957;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.451;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,33:99:99:595,0,1449 chrV 7021 . A G 54.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.127;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-3.179;QD=0.74;ReadPosRankSum=0.180;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,13:73:84:84,0,1394 chrV 7036 . C T 184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.856;DP=63;Dels=0.00;FS=5.894;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.908;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:214,0,1084 chrV 7047 . C T 310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.802;DP=70;Dels=0.00;FS=5.181;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.435;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.221;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:340,0,1101 chrV 7063 . A G 551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.974;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQ0=0;MQRankSum=-3.324;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,32:80:99:581,0,1072 chrV 7069 . T A 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.640;DP=85;Dels=0.00;FS=1.793;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.415;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:703,0,1081 chrV 7205 . C T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.292;DP=115;Dels=0.00;FS=3.440;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.820;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1207,0,1172 chrV 7235 . C A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.033;DP=118;Dels=0.00;FS=7.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.029;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1274,0,1302 chrV 7376 . G C 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.551;DP=76;Dels=0.00;FS=0.887;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=9.87;ReadPosRankSum=-2.013;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:780,0,717 chrV 7546 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.518;DP=122;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=2.4676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.117;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1213,0,1350 chrV 7581 . T C 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.224;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.190;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1288,0,1245 chrV 7660 . C T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.731;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1205,0,1232 chrV 7846 . A C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.514;DP=129;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=3.9068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.795;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:129:99:1076,0,1653 chrV 7941 . A G 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.091;DP=126;Dels=0.00;FS=1.652;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1058,0,1657 chrV 8258 . T C 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.966;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1211,0,1048 chrV 8344 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.671;DP=113;Dels=0.00;FS=9.212;HaplotypeScore=6.0558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.493;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1466,0,834 chrV 8647 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.912;DP=116;Dels=0.00;FS=2.770;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.246;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1081,0,1198 chrV 8932 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.044;DP=113;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=2.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1037,0,1353 chrV 8946 . C T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.678;DP=111;Dels=0.00;FS=2.529;HaplotypeScore=3.8413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.802;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1072,0,1295 chrV 9297 . G A 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.037;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.179;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1049,0,860 chrV 9542 . T C 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.59;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3270,348,0 chrV 9596 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;DP=127;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.741;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1292,0,1385 chrV 9699 . T G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.943;DP=107;Dels=0.00;FS=1.949;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1260,0,1045 chrV 9733 . G C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1030,0,1316 chrV 9859 . G A 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3536,351,0 chrV 9894 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.690;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.007;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1343,0,1410 chrV 10058 . G A 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.789;DP=103;Dels=0.00;FS=4.857;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.544;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1179,0,1028 chrV 10202 . A T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.961;DP=94;Dels=0.00;FS=10.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,56:94:99:1208,0,790 chrV 10389 . C T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.312;DP=101;Dels=0.00;FS=2.650;HaplotypeScore=2.5633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.846;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1102,0,1044 chrV 10476 . T C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.366;DP=97;Dels=0.00;FS=5.054;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1022,0,1011 chrV 10492 . A G 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.140;DP=92;Dels=0.00;FS=5.299;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.450;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:937,0,1060 chrV 10561 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.140;DP=116;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1110,0,1295 chrV 10568 . C T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.218;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1300,0,1375 chrV 10621 . T C 2757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2790,291,0 chrV 10640 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.721;DP=112;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.776;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1233,0,1144 chrV 10653 . T A 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;DP=118;Dels=0.00;FS=2.332;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1153,0,1354 chrV 10700 . T A 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3490,346,0 chrV 10731 . C T 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3477,352,0 chrV 10779 . T C 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2951,318,0 chrV 10946 . T C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.809;DP=98;Dels=0.00;FS=3.817;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.039;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:952,0,1086 chrV 10979 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.834;DP=117;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.281;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1353,0,1212 chrV 11032 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.193;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.288;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1295,0,1202 chrV 11049 . T C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.292;DP=105;Dels=0.00;FS=1.655;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1135,0,1114 chrV 11100 . A G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.748;DP=104;Dels=0.00;FS=2.730;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.036;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1194,0,1041 chrV 11186 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.325;DP=104;Dels=0.00;FS=3.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1267,0,958 chrV 11195 . T G 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2947,306,0 chrV 11261 . T C 614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.310;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=6.27;ReadPosRankSum=-2.132;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:644,0,1273 chrV 11331 . A T 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;DP=88;Dels=0.00;FS=14.019;HaplotypeScore=3.5775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:1135,0,748 chrV 11349 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.496;DP=85;Dels=0.00;FS=4.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.888;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,50:85:99:1037,0,737 chrV 11351 . T C 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.754;DP=86;Dels=0.00;FS=4.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=7.91;ReadPosRankSum=-1.134;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,36:86:99:710,0,1096 chrV 11370 . C A 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;DP=106;Dels=0.00;FS=0.799;HaplotypeScore=3.5900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,39:106:99:751,0,1472 chrV 11439 . C G 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2943,294,0 chrV 11496 . C T 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;DP=87;Dels=0.00;FS=2.837;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.880;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:770,0,1068 chrV 11548 . A G 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.245;DP=101;Dels=0.00;FS=2.582;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=9.85;ReadPosRankSum=2.438;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1025,0,1013 chrV 11716 . G T 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.349;DP=86;Dels=0.00;FS=5.883;HaplotypeScore=4.3710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.735;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:974,0,830 chrV 11741 . G A 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.629;DP=87;Dels=0.00;FS=4.380;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,39:87:99:819,0,1089 chrV 11744 . G A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.841;DP=87;Dels=0.00;FS=4.380;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.003;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,48:87:99:1104,0,735 chrV 11756 . C T 2285 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.53;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2318,240,0 chrV 11785 . G T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.944;DP=138;Dels=0.00;FS=6.358;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1294,0,1626 chrV 11847 . T G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.225;DP=141;Dels=0.00;FS=10.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1452,0,1490 chrV 12024 . G A 2517 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2550,246,0 chrV 12028 . A C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.578;DP=96;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:900,0,1085 chrV 12036 . C A 2445 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=21.45;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2478,243,0 chrV 12071 . A C 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2887,297,0 chrV 12186 . G A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.915;DP=120;Dels=0.00;FS=10.478;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1406,0,1135 chrV 12215 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.651;DP=128;Dels=0.00;FS=7.977;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.577;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1400,0,1259 chrV 12258 . A C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1217,0,1120 chrV 12309 . T C 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.757;DP=78;Dels=0.00;FS=0.895;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.929;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:784,0,877 chrV 12413 . A T 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=6.917;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=25.27;ReadPosRankSum=0.910;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3015,321,0 chrV 12467 . G A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.515;DP=98;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1069,0,998 chrV 12511 . T A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.973;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.449;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1296,0,891 chrV 12532 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.587;DP=108;Dels=0.00;FS=4.182;HaplotypeScore=4.9544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.429;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1220,0,921 chrV 12571 . C T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.755;DP=92;Dels=0.00;FS=3.962;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQ0=0;MQRankSum=-4.391;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1136,0,807 chrV 12600 . C T 2301 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.32;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2334,240,0 chrV 12612 . C T 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.252;DP=91;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=32.6623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-7.107;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:880,0,942 chrV 12625 . G A 658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.367;DP=74;Dels=0.00;FS=4.562;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.99;MQ0=0;MQRankSum=-4.897;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:688,0,782 chrV 12629 . G A 704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.885;DP=78;Dels=0.00;FS=7.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.26;MQ0=0;MQRankSum=-4.443;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:734,0,796 chrV 12766 . T C 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.729;DP=97;Dels=0.00;FS=2.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.416;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,35:97:99:660,0,1404 chrV 12869 . C T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.771;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.949;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1281,0,1151 chrV 12937 . C T 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3121,310,0 chrV 13004 . A C 514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.862;DP=99;Dels=0.00;FS=2.967;HaplotypeScore=3.6674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,31:99:99:544,0,1582 chrV 13167 . T G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.911;DP=106;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=8.48;ReadPosRankSum=2.537;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:929,0,1344 chrV 13215 . G A 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.938;DP=112;Dels=0.00;FS=4.922;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=10.05;ReadPosRankSum=-2.175;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1156,0,1199 chrV 13307 . A G 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.556;DP=122;Dels=0.00;FS=3.355;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=9.63;ReadPosRankSum=-2.077;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1205,0,1392 chrV 13446 . T A 1101.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=99;Dels=0.00;FS=7.980;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.04;MQ0=0;MQRankSum=-4.113;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.530;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1131,0,973 chrV 13447 . C T 1090.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.498;DP=99;Dels=0.00;FS=7.980;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.04;MQ0=0;MQRankSum=-4.316;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.131;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1120,0,968 chrV 13449 . G T 1083.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;DP=98;Dels=0.00;FS=7.937;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQ0=0;MQRankSum=-4.936;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.970;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1113,0,978 chrV 13454 . C T 1076.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.013;DP=104;Dels=0.00;FS=5.692;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.571;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.365;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1106,0,992 chrV 13502 . T C 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.201;DP=91;Dels=0.00;FS=0.820;HaplotypeScore=2.5343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=-4.495;QD=9.25;ReadPosRankSum=-2.330;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,52:91:99:872,0,835 chrV 13681 . A T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;DP=125;Dels=0.00;FS=4.448;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1291,0,1436 chrV 13773 . T G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.199;DP=108;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.132;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1087,0,1238 chrV 13805 . C G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.550;DP=122;Dels=0.00;FS=4.412;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=7.79;ReadPosRankSum=-2.265;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:980,0,1536 chrV 14025 . A G 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3149,321,0 chrV 14061 . A G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3113,321,0 chrV 14175 . A T 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9630;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3371,331,0 chrV 14277 . G A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.083;DP=120;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.708;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1158,0,1432 chrV 14370 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.719;DP=129;Dels=0.00;FS=2.419;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=8.62;ReadPosRankSum=-1.586;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1142,0,1677 chrV 14408 . G A 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.439;DP=139;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=3.4630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1737,0,1270 chrV 14425 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.048;DP=168;Dels=0.00;FS=1.932;HaplotypeScore=6.3809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.639;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,81:168:99:1359,0,1936 chrV 14438 . T A 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.53;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3463,354,0 chrV 14476 . G A 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3692,384,0 chrV 14482 . A G 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.22;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3611,375,0 chrV 14512 . C G 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3524,372,0 chrV 14579 . T A 2313 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.12;MQ0=0;QD=22.46;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2346,240,0 chrV 14582 . T C 682.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.537;DP=107;Dels=0.00;FS=6.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.360;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.766;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:712,0,1171 chrV 14585 . A G 577.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.893;DP=108;Dels=0.00;FS=4.978;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.043;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.055;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:607,0,1212 chrV 14592 . A G 1020.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.212;DP=105;Dels=0.00;FS=6.501;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.54;MQ0=0;MQRankSum=2.714;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1050,0,792 chrV 14610 . A G 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.190;DP=97;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.787;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1004,0,953 chrV 14659 . A T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.507;DP=93;Dels=0.00;FS=8.577;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQ0=0;MQRankSum=4.317;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.681;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1243,0,779 chrV 14660 . T A 729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;DP=92;Dels=0.00;FS=8.456;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.795;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,38:92:99:759,0,1247 chrV 14676 . A G 556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.031;DP=90;Dels=0.00;FS=8.972;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQ0=0;MQRankSum=-3.807;QD=6.18;ReadPosRankSum=-6.237;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,34:90:99:586,0,1286 chrV 14785 . T A 1569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;QD=27.05;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1602,165,0 chrV 14798 . C T 1602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=26.70;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1635,165,0 chrV 14808 . A T 1626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.62;MQ0=0;QD=27.56;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1659,165,0 chrV 14875 . C T 1648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=96.6508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.30;MQ0=0;QD=27.02;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1681,177,0 chrV 14921 . T A 1527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.46;MQ0=0;QD=25.88;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:59:99:1560,162,0 chrV 14947 . T A 1221 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6335;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.96;MQ0=0;QD=22.20;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1254,129,0 chrV 15022 . A C 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.740;DP=75;Dels=0.00;FS=2.071;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.59;MQ0=0;MQRankSum=3.926;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.901;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:814,0,185 chrV 15032 . T C 143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.639;DP=81;Dels=0.00;FS=1.975;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.237;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,35:81:99:173,0,1136 chrV 15052 . G A 575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.345;DP=102;Dels=0.00;FS=3.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.724;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:605,0,1147 chrV 15054 . A T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.935;DP=103;Dels=0.00;FS=3.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.66;MQ0=0;MQRankSum=2.293;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.468;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1226,0,638 chrV 15173 . C G 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.739;DP=105;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=67.4022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=0.11;ReadPosRankSum=-5.330;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,12:105:41:41,0,41 chrV 15174 . C T 100.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.015;DP=105;Dels=0.00;FS=10.857;HaplotypeScore=65.4131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=0.95;ReadPosRankSum=3.983;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,99:105:15:133,15,0 chrV 15198 . C G 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=94;Dels=0.00;FS=5.585;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.499;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:849,0,1002 chrV 15229 . A G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.124;DP=91;Dels=0.00;FS=1.778;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.266;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:905,0,951 chrV 15479 . T C 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2619,282,0 chrV 15541 . A G 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.705;DP=130;Dels=0.01;FS=14.898;HaplotypeScore=4.9024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.64;MQ0=0;MQRankSum=-6.522;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.592;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:979,0,1583 chrV 15562 . C T 1010.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.528;DP=130;Dels=0.00;FS=11.199;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=-6.885;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1040,0,1588 chrV 15565 . T C 823.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.664;DP=120;Dels=0.00;FS=10.166;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.429;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:853,0,1518 chrV 15567 . G A 1351.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.077;DP=117;Dels=0.00;FS=8.589;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=6.942;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.347;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1381,0,849 chrV 15568 . G A 713.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.336;DP=116;Dels=0.00;FS=10.210;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.77;MQ0=0;MQRankSum=-7.468;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:743,0,1344 chrV 15593 . C T 477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.075;DP=97;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=35.7959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.04;MQ0=0;MQRankSum=-8.141;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,39:97:99:507,0,1290 chrV 15594 . G T 514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.859;DP=96;Dels=0.00;FS=1.702;HaplotypeScore=35.7959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.92;MQ0=0;MQRankSum=-8.320;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:544,0,1239 chrV 15608 . C T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.061;DP=99;Dels=0.00;FS=0.767;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.94;MQ0=0;MQRankSum=6.977;QD=12.03;ReadPosRankSum=2.452;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1221,0,630 chrV 15621 . C T 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.056;DP=107;Dels=0.00;FS=6.118;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQ0=0;MQRankSum=-4.999;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.756;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:831,0,1172 chrV 15655 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;DP=106;Dels=0.00;FS=2.852;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.038;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1182,0,975 chrV 15662 . T C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.094;DP=112;Dels=0.00;FS=2.698;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.686;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1293,0,1068 chrV 15698 . T A 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;DP=130;Dels=0.00;FS=4.308;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1152,0,1611 chrV 15826 . T C 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.519;DP=119;Dels=0.00;FS=5.640;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1327,0,1131 chrV 15966 . G A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.929;DP=119;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1291,0,1211 chrV 17065 . C T 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.597;DP=151;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=4.9171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.024;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1603,0,1560 chrV 17311 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.788;DP=124;Dels=0.00;FS=5.558;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1295,0,1211 chrV 17320 . G A 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3413,334,0 chrV 17400 . T A 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3742,381,0 chrV 17824 . A G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.116;DP=140;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.536;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1507,0,1422 chrV 17871 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.753;DP=104;Dels=0.00;FS=2.962;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1155,0,1060 chrV 17918 . T A 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7769;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3176,333,0 chrV 18011 . A G 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.599;DP=104;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=4.8389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.716;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:104:99:957,0,1174 chrV 18031 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.940;DP=106;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.142;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1231,0,1025 chrV 18035 . C T 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2885,282,0 chrV 18138 . G A 608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.367;DP=93;Dels=0.00;FS=1.754;HaplotypeScore=7.4823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.890;QD=6.54;ReadPosRankSum=-1.480;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,35:93:99:638,0,1198 chrV 18162 . T A 521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.010;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-5.793;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.499;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,30:89:99:551,0,1301 chrV 18174 . A T 2347 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.84;MQ0=0;QD=26.08;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2380,249,0 chrV 18178 . A C 501.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.700;DP=93;Dels=0.00;FS=0.851;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQ0=0;MQRankSum=-7.897;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.514;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,32:93:99:531,0,1450 chrV 18182 . T C 589.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.298;DP=102;Dels=0.00;FS=1.687;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQ0=0;MQRankSum=-8.005;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,38:102:99:619,0,1481 chrV 18193 . T A 704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.832;DP=118;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=3.8867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.45;MQ0=0;MQRankSum=-7.193;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,44:118:99:734,0,1689 chrV 18224 . C T 762.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.645;DP=112;Dels=0.00;FS=2.497;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.12;MQ0=0;MQRankSum=-5.937;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.533;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,44:112:99:792,0,1514 chrV 18229 . C T 786.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.652;DP=118;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.925;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.698;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,46:118:99:816,0,1593 chrV 18232 . G A 796.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.013;DP=118;Dels=0.00;FS=2.405;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.49;MQ0=0;MQRankSum=-5.827;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.330;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:826,0,1539 chrV 18285 . A T 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2965,303,0 chrV 18339 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.756;DP=131;Dels=0.00;FS=5.571;HaplotypeScore=2.4888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=2.473;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.155;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1343,0,1443 chrV 18343 . G A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.170;DP=130;Dels=0.00;FS=6.868;HaplotypeScore=2.6904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.042;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1347,0,1379 chrV 18400 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.130;DP=123;Dels=0.00;FS=2.305;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.327;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1276,0,1308 chrV 18487 . T C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.379;DP=131;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1402,0,1280 chrV 18502 . C A 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.482;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.114;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1363,0,1433 chrV 18516 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.379;DP=121;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1212,0,1268 chrV 18609 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.286;DP=122;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.510;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1321,0,1287 chrV 18636 . C A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.719;DP=135;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.258;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1553,0,1352 chrV 18812 . T C 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.048;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.442;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1229,0,1237 chrV 18885 . C T 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.194;DP=72;Dels=0.00;FS=4.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=1.848;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.687;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:788,0,782 chrV 18949 . T C 154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.214;DP=50;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.65;MQ0=0;MQRankSum=-3.578;QD=3.08;ReadPosRankSum=-3.260;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:184,0,834 chrV 18960 . T C 70.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.402;DP=49;Dels=0.00;FS=5.391;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-4.299;QD=1.43;ReadPosRankSum=-2.672;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,9:49:99:100,0,855 chrV 18961 . T G 70.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.066;DP=50;Dels=0.00;FS=3.340;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.268;QD=1.40;ReadPosRankSum=-2.550;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,9:50:99:100,0,883 chrV 18962 . T C 56.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.410;DP=54;Dels=0.00;FS=3.275;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.62;MQ0=0;MQRankSum=-4.294;QD=1.04;ReadPosRankSum=-1.973;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,9:54:86:86,0,992 chrV 18963 . G A 71.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;DP=54;Dels=0.00;FS=3.275;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.62;MQ0=0;MQRankSum=-4.410;QD=1.31;ReadPosRankSum=-2.043;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,9:54:99:101,0,954 chrV 18965 . G T 87.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;DP=55;Dels=0.00;FS=3.290;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.471;QD=1.58;ReadPosRankSum=-2.264;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,9:55:99:117,0,981 chrV 18979 . G A 71.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.634;DP=73;Dels=0.00;FS=5.138;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=1;MQRankSum=-5.666;QD=0.97;ReadPosRankSum=-3.307;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:101,0,1106 chrV 18986 . A C 58.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.653;DP=75;Dels=0.00;FS=6.888;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.06;MQ0=1;MQRankSum=-4.204;QD=0.77;ReadPosRankSum=-2.149;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:88:88,0,1170 chrV 18988 . C T 95.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.394;DP=76;Dels=0.01;FS=5.088;HaplotypeScore=5.8756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQ0=1;MQRankSum=-4.451;QD=1.25;ReadPosRankSum=-1.876;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:125,0,1089 chrV 18994 . G A 128.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.688;DP=79;Dels=0.01;FS=2.042;HaplotypeScore=5.8756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQ0=1;MQRankSum=-3.592;QD=1.62;ReadPosRankSum=-1.244;SB=-1.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:158,0,1087 chrV 19144 . T C 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=21.14;ReadPosRankSum=1.195;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:2760,264,0 chrV 19236 . C A 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.075;DP=138;Dels=0.00;FS=8.516;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.37;MQ0=1;MQRankSum=2.857;QD=24.43;ReadPosRankSum=1.489;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,134:138:99:3371,334,0 chrV 19305 . G A 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.421;DP=155;Dels=0.00;FS=11.252;HaplotypeScore=110.5293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=1;MQRankSum=1.790;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,56:155:99:889,0,1707 chrV 19307 . G A 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.087;DP=147;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=95.9720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=1;MQRankSum=3.501;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1640,0,941 chrV 19431 . C T 2275 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.467;DP=97;Dels=0.00;FS=14.270;HaplotypeScore=9.7640;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=3.272;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.385;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,91:97:99:2308,228,0 chrV 19504 . T C 573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.171;DP=69;Dels=0.00;FS=10.607;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.76;MQ0=0;MQRankSum=2.156;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.592;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,36:69:99:603,0,505 chrV 19513 . C T 520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.222;DP=64;Dels=0.00;FS=3.159;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.58;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.218;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,34:64:99:550,0,488 chrV 19517 . A T 474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.28;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.810;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:504,0,472 chrV 19529 . T A 435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.002;DP=66;Dels=0.00;FS=2.475;HaplotypeScore=22.7579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=6.59;ReadPosRankSum=-1.680;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,33:66:99:465,0,509 chrV 19630 . T C 531.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.516;DP=87;Dels=0.00;FS=15.730;HaplotypeScore=5.1936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.44;MQ0=4;MQRankSum=-2.405;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.486;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:87:99:561,0,761 chrV 19654 . A C 1710 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.89;MQ0=5;QD=19.21;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1743,192,0 chrV 19675 . C T 638.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;DP=93;Dels=0.00;FS=13.764;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.25;MQ0=6;MQRankSum=-2.838;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.890;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:668,0,1024 chrV 19717 . C A 724.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.411;DP=135;Dels=0.00;FS=43.934;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.86;MQ0=5;MQRankSum=2.234;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.446;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,38:135:99:754,0,1434 chrV 19893 . C T 554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.403;DP=188;Dels=0.00;FS=4.564;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.55;MQ0=2;MQRankSum=-2.345;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,42:188:99:584,0,3127 chrV 20125 . A G 721.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.183;DP=174;Dels=0.00;FS=6.295;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.53;MQ0=53;MQRankSum=-9.093;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.826;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,129:174:99:751,0,1019 chrV 20192 . C T 575.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.502;DP=165;Dels=0.00;FS=18.382;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.69;MQ0=82;MQRankSum=-5.387;QD=3.48;ReadPosRankSum=-2.030;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,129:165:99:605,0,357 chrV 20609 . C T 285.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.750;DP=147;Dels=0.00;FS=48.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.45;MQ0=72;MQRankSum=-1.063;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:315,0,790 chrV 20638 . A G 148.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.311;DP=160;Dels=0.00;FS=1.012;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.55;MQ0=69;MQRankSum=-0.407;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-8.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,31:160:99:178,0,1381 chrV 20659 . T C 61.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.867;DP=160;Dels=0.00;FS=2.191;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.39;MQ0=61;MQRankSum=-2.508;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.086;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,55:160:91:91,0,1672 chrV 20762 . C T 875.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.697;DP=139;Dels=0.00;FS=3.330;HaplotypeScore=4.8343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.54;MQ0=15;MQRankSum=-3.798;QD=6.30;ReadPosRankSum=3.895;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:905,0,1577 chrV 20785 . T C 1037.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.006;DP=156;Dels=0.00;FS=12.550;HaplotypeScore=6.8433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.77;MQ0=23;MQRankSum=-6.188;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.702;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1067,0,1641 chrV 20807 . G A 1018.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.093;DP=143;Dels=0.00;FS=11.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.02;MQ0=24;MQRankSum=-7.323;QD=7.12;ReadPosRankSum=-3.192;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1048,0,1412 chrV 20824 . G A 520.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;DP=134;Dels=0.00;FS=16.165;HaplotypeScore=4.9237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.19;MQ0=24;MQRankSum=-6.795;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.456;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:550,0,1639 chrV 20858 . C T 380.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.350;DP=122;Dels=0.00;FS=22.176;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.22;MQ0=25;MQRankSum=-3.685;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:410,0,1560 chrV 20912 . C G 232.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;DP=133;Dels=0.00;FS=12.711;HaplotypeScore=5.5867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.29;MQ0=29;MQRankSum=-4.598;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.097;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,50:133:99:262,0,1724 chrV 20941 . C T 177.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;DP=121;Dels=0.00;FS=0.907;HaplotypeScore=3.5870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.10;MQ0=23;MQRankSum=-6.646;QD=1.46;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:121:99:207,0,1539 chrV 21001 . C T 741.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.570;DP=104;Dels=0.00;FS=0.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.65;MQ0=18;MQRankSum=-6.057;QD=7.13;ReadPosRankSum=2.317;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:771,0,983 chrV 21022 . A G 783.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.198;DP=109;Dels=0.00;FS=4.251;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.24;MQ0=16;MQRankSum=-5.645;QD=7.18;ReadPosRankSum=1.281;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:813,0,1188 chrV 21110 . A T 2128 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.35;MQ0=17;QD=21.28;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2161,225,0 chrV 21153 . T C 1125.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.324;DP=120;Dels=0.00;FS=28.579;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.71;MQ0=13;MQRankSum=2.838;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1155,0,999 chrV 21290 . C G 746.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.814;DP=175;Dels=0.00;FS=7.747;HaplotypeScore=5.4490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.62;MQ0=8;MQRankSum=0.703;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,54:175:99:776,0,2272 chrV 21300 . T G 622.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.417;DP=155;Dels=0.00;FS=16.281;HaplotypeScore=13.0209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=11;MQRankSum=0.268;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.015;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,56:155:99:652,0,2108 chrV 21301 . T C 512.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.066;DP=156;Dels=0.00;FS=12.202;HaplotypeScore=9.1237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.07;MQ0=12;MQRankSum=1.213;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,47:156:99:542,0,2187 chrV 21312 . C T 1501.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.066;DP=139;Dels=0.00;FS=8.594;HaplotypeScore=8.0635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.84;MQ0=14;MQRankSum=-0.675;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.858;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,79:139:99:1531,0,568 chrV 21333 . A C 739.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.474;DP=155;Dels=0.00;FS=15.871;HaplotypeScore=160.6853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.44;MQ0=15;MQRankSum=-3.430;QD=4.77;ReadPosRankSum=4.643;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:155:99:769,0,495 chrV 21355 . G T 1558.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;DP=144;Dels=0.00;FS=0.892;HaplotypeScore=24.5480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.87;MQ0=7;MQRankSum=-2.867;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,117:144:99:1588,0,132 chrV 21359 . T C 1068.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.043;DP=142;Dels=0.00;FS=22.498;HaplotypeScore=24.5480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.05;MQ0=6;MQRankSum=-5.420;QD=7.52;ReadPosRankSum=-2.069;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1098,0,648 chrV 21381 . A G 2536 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.83;MQ0=7;QD=17.25;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:2569,276,0 chrV 21406 . C T 197.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.353;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.70;MQ0=15;MQRankSum=0.002;QD=0.88;ReadPosRankSum=2.394;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,44:224:99:227,0,3496 chrV 21440 . T G 6651.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=270;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.11;MQ0=16;QD=24.63;SB=-2.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,270:270:99:6651,667,0 chrV 21521 . C A 286.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.025;DP=198;Dels=0.00;FS=17.109;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.46;MQ0=11;MQRankSum=-5.048;QD=1.44;ReadPosRankSum=2.029;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,36:198:99:316,0,3551 chrV 21547 . T C 248.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.048;DP=201;Dels=0.00;FS=3.731;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.69;MQ0=15;MQRankSum=-5.968;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.688;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,38:201:99:278,0,3625 chrV 21548 . T C 272.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.312;DP=202;Dels=0.00;FS=3.736;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.49;MQ0=15;MQRankSum=-6.142;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.180;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,39:202:99:302,0,3728 chrV 21734 . A G 558.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.905;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.18;MQ0=30;MQRankSum=-0.826;QD=5.37;ReadPosRankSum=-3.208;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,62:104:99:588,0,714 chrV 21741 . A T 1726 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.599;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.68;MQ0=30;MQRankSum=-0.799;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.311;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:1759,183,0 chrV 21762 . C A 1695 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.09;MQ0=24;QD=17.66;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:1728,177,0 chrV 21768 . A G 507.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.089;DP=98;Dels=0.00;FS=3.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.68;MQ0=24;MQRankSum=-3.129;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.931;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,36:98:99:537,0,835 chrV 21771 . A G 530.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.743;DP=132;Dels=0.00;FS=16.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.55;MQ0=26;MQRankSum=-4.064;QD=4.02;ReadPosRankSum=2.082;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,42:132:99:560,0,1482 chrV 21849 . T C 4087.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.831;DP=253;Dels=0.00;FS=1.208;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.38;MQ0=12;MQRankSum=2.040;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-2.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,198:253:99:4087,0,782 chrV 21876 . C T 4125.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.432;DP=256;Dels=0.00;FS=3.338;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.49;MQ0=12;MQRankSum=2.426;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.155;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,194:256:99:4125,0,946 chrV 21951 . A G 3549.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.10;MQ0=7;QD=22.04;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3549,384,0 chrV 21954 . A T 142.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.26;MQ0=6;MQRankSum=-0.702;QD=0.97;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,27:146:99:172,0,2611 chrV 21990 . A G 2168 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.70;MQ0=14;QD=19.36;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2201,249,0 chrV 21993 . A T 2160 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.56;MQ0=14;QD=20.38;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2193,243,0 chrV 21999 . G A 2170 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.42;MQ0=15;QD=20.87;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2203,246,0 chrV 22026 . C T 160.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;DP=99;Dels=0.00;FS=5.606;HaplotypeScore=3.4236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.95;MQ0=16;MQRankSum=1.281;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.103;SB=-6.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:190,0,1256 chrV 22082 . A G 2220.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.681;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.39;MQ0=11;MQRankSum=-2.019;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,120:166:99:2250,0,654 chrV 22083 . C T 2211.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.674;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.39;MQ0=11;MQRankSum=-1.834;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,120:166:99:2241,0,615 chrV 22101 . A T 673.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.704;DP=179;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.56;MQ0=8;MQRankSum=0.434;QD=3.76;ReadPosRankSum=-1.244;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,51:179:99:703,0,2603 chrV 22296 . A T 267.07 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.67;MQ0=8;MQRankSum=-0.050;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-7.454e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:15:297,0,15 chrV 22302 . T G 219.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.11;MQ0=7;QD=9.52;SB=-8.196e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:27:252,27,0 chrV 22305 . A G 210.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.91;MQ0=7;QD=9.55;SB=-5.199e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:27:243,27,0 chrV 22326 . A G 234.18 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;DP=28;Dels=0.00;FS=4.545;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.76;MQ0=6;MQRankSum=2.101;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.037;SB=-1.007e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:11:264,0,11 chrV 22332 . T C 215.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;DP=28;Dels=0.00;FS=7.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.23;MQ0=5;MQRankSum=2.205;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-1.273e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:13:245,0,13 chrV 22341 . C T 371 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=7;QD=10.60;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:45:404,45,0 chrV 22349 . C A 210.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.226;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.74;MQ0=6;MQRankSum=0.690;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:240,0,174 chrV 22377 . C T 950.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.068;DP=72;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.50;MQ0=6;MQRankSum=2.586;QD=13.20;ReadPosRankSum=-1.048;SB=-4.061e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,60:71:21:983,21,0 chrV 22390 . C T 1573.20 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.024;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.74;MQ0=6;MQRankSum=2.786;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.452;SB=-8.182e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,93:109:2:1602,0,2 chrV 22422 . G A 1598.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.378;DP=140;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=13.3787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.70;MQ0=6;MQRankSum=0.736;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,88:140:99:1628,0,762 chrV 22432 . G A 2616 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.407;DP=144;Dels=0.00;FS=6.404;HaplotypeScore=12.3829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.34;MQ0=6;MQRankSum=2.973;QD=18.17;ReadPosRankSum=-1.397;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,129:144:51:2649,51,0 chrV 22464 . C A 224.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.079;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.79;MQ0=6;MQRankSum=-3.995;QD=1.07;ReadPosRankSum=-2.075;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,38:209:99:254,0,3523 chrV 22499 . C T 1955.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.686;DP=200;Dels=0.00;FS=1.201;HaplotypeScore=45.9537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.25;MQ0=9;MQRankSum=2.163;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,102:200:99:1985,0,1710 chrV 22506 . G A 784.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.905;DP=200;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=44.9604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQ0=11;MQRankSum=-3.213;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.885;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,59:200:99:814,0,2967 chrV 22542 . G C 4625.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=11;QD=22.56;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:4625,480,0 chrV 22614 . C G 1649 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.84;MQ0=6;QD=20.11;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1682,183,0 chrV 22641 . C A 1130 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.45;MQ0=9;QD=18.83;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1163,120,0 chrV 22644 . T A 1078 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.04;MQ0=7;QD=19.25;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1111,120,0 chrV 22665 . G A 850 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;MQ0=7;QD=18.48;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:93:883,93,0 chrV 22671 . T C 587.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.351;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.07;MQ0=7;MQRankSum=1.619;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.226;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:57:617,0,57 chrV 22692 . C T 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.981;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.52;MQ0=7;MQRankSum=-0.752;QD=0.44;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:46:46,0,454 chrV 22716 . A G 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=15;Dels=0.00;FS=18.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.01;MQ0=4;MQRankSum=0.717;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.408;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:41:68,0,41 chrV 22722 . G A 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.02;MQ0=3;QD=3.68;SB=-2.776e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:57,6,0 chrV 22746 . C T 52.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.44;MQ0=2;QD=7.57;SB=-2.821e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:85,9,0 chrV 22764 . T C 107.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.52;MQ0=2;QD=13.41;SB=-2.776e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15:140,15,0 chrV 22854 . A G 293.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.007;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.19;MQ0=17;MQRankSum=1.351;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.908;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:323,0,135 chrV 22863 . G A 713 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.87;MQ0=18;QD=13.98;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:78:746,78,0 chrV 22917 . G A 436.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.803;DP=92;Dels=0.00;FS=4.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.64;MQ0=19;MQRankSum=-1.133;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.783;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,32:92:99:466,0,855 chrV 23118 . G A 2050.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.446;DP=197;Dels=0.00;FS=14.133;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.79;MQ0=4;MQRankSum=-0.910;QD=10.41;ReadPosRankSum=-2.767;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,115:197:99:2080,0,1597 chrV 23151 . T C 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.063;DP=154;Dels=0.00;FS=7.243;HaplotypeScore=16.5488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQ0=2;MQRankSum=-1.204;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.310;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,94:154:99:1634,0,1207 chrV 23160 . G A 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.563;DP=147;Dels=0.00;FS=6.209;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.76;MQ0=1;MQRankSum=-1.681;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.508;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,90:147:99:1640,0,1067 chrV 23192 . C T 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.357;DP=126;Dels=0.00;FS=51.331;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.96;MQ0=0;MQRankSum=5.640;QD=22.95;ReadPosRankSum=5.430;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,112:126:99:2925,266,0 chrV 23309 . A G 2314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=22.04;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2347,243,0 chrV 23494 . C T 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3771,379,0 chrV 23825 . C T 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.661;DP=97;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.29;MQ0=0;MQRankSum=-6.002;QD=7.36;ReadPosRankSum=-3.228;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:744,0,1129 chrV 23976 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.193;DP=120;Dels=0.00;FS=10.217;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1158,0,1422 chrV 24002 . G T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.736;DP=151;Dels=0.00;FS=0.605;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.514;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1466,0,1753 chrV 24025 . G C 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4021,409,0 chrV 24122 . C T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.512;DP=137;Dels=0.00;FS=1.358;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=12.20;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1701,0,1258 chrV 24135 . T C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.595;DP=149;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=1.714;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1565,0,1608 chrV 24163 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.833;DP=140;Dels=0.00;FS=2.155;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.612;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1287,0,1580 chrV 24165 . C G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.062;DP=137;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.907;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1176,0,1527 chrV 24222 . A T 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.760;DP=120;Dels=0.00;FS=2.376;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.375;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1076,0,1561 chrV 24232 . C T 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.86;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3041,315,0 chrV 24259 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.466;DP=110;Dels=0.00;FS=6.032;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=1;MQRankSum=0.288;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1117,0,1172 chrV 24354 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.406;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.981;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,56:96:99:1180,0,870 chrV 24380 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.117;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.230;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1033,0,1048 chrV 24388 . A G 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.434;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.755;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1021,0,1063 chrV 24392 . A T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.269;DP=110;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.414;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1127,0,1099 chrV 24419 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.623;DP=132;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1338,0,1360 chrV 24444 . G A 1308.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;DP=126;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1338,0,1254 chrV 24445 . A G 1322.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.043;DP=130;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1352,0,1297 chrV 24446 . T C 1194.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.795;DP=130;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.098;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1224,0,1370 chrV 24575 . T C 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.041;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:141:99:1758,0,1277 chrV 24581 . C A 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.827;DP=143;Dels=0.00;FS=2.126;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.716;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.284;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1773,0,1239 chrV 24596 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.179;DP=114;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-3.052;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,71:114:99:1238,0,869 chrV 24650 . T G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.835;DP=114;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.455;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1207,0,987 chrV 24661 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.312;DP=123;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.854;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1341,0,1124 chrV 24670 . C T 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3395,345,0 chrV 24749 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;DP=135;Dels=0.00;FS=2.193;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1434,0,1344 chrV 24754 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.711;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.242;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:149:99:1477,0,1563 chrV 24870 . G A 3588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3588,355,0 chrV 24902 . G A 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3145,313,0 chrV 24966 . G A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.107;DP=156;Dels=0.00;FS=8.208;HaplotypeScore=4.9607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.630;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,71:156:99:1516,0,1710 chrV 25051 . C T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.391;DP=141;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.863;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1563,0,1428 chrV 25057 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.685;DP=144;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=2.588;QD=10.26;ReadPosRankSum=-2.076;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1507,0,1466 chrV 25095 . G A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.069;DP=128;Dels=0.00;FS=2.512;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.441;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.070;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:128:99:1422,0,1275 chrV 25103 . A T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.658;DP=122;Dels=0.00;FS=4.700;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1198,0,1335 chrV 25106 . A G 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2905,312,0 chrV 25120 . T A 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.37;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2868,300,0 chrV 25188 . G T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.481;DP=128;Dels=0.00;FS=3.265;HaplotypeScore=3.2327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.025;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:128:99:1105,0,1388 chrV 25194 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.388;DP=119;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1074,0,1378 chrV 25237 . C T 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3160,321,0 chrV 25332 . C T 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4109,424,0 chrV 25369 . C T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.294;DP=148;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=4.3977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.354;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1404,0,1699 chrV 25407 . G A 167.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=95.9040;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.17;MQ0=0;QD=1.28;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:21:200,21,0 chrV 25422 . T A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.062;DP=119;Dels=0.00;FS=4.656;HaplotypeScore=5.2388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=9.05;ReadPosRankSum=2.962;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:119:99:1107,0,1218 chrV 25565 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.912;DP=122;Dels=0.00;FS=9.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.354;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1215,0,1293 chrV 25571 . A T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.93;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3285,328,0 chrV 25590 . A G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.764;DP=146;Dels=0.00;FS=9.228;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1474,0,1581 chrV 25685 . G A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.607;DP=153;Dels=0.00;FS=2.839;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.371;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1676,0,1410 chrV 25874 . A C 1943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.561;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=12.30;ReadPosRankSum=-2.625;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,90:158:99:1973,0,1412 chrV 25914 . G A 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.998;DP=133;Dels=0.00;FS=14.922;HaplotypeScore=2.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.046;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,80:133:99:1761,0,988 chrV 25974 . T G 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.483;DP=132;Dels=0.00;FS=4.196;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.511;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,79:132:99:1661,0,1086 chrV 26021 . C T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.270;DP=133;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1301,0,1510 chrV 26265 . A C 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.270;DP=162;Dels=0.00;FS=2.768;HaplotypeScore=2.8480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.852;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.065;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1679,0,1780 chrV 26313 . G T 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.824;DP=164;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,84:164:99:1778,0,1614 chrV 26322 . C G 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;DP=165;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:165:99:1742,0,1550 chrV 26413 . A G 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.539;DP=176;Dels=0.00;FS=0.555;HaplotypeScore=2.7579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.977;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,96:176:99:1935,0,1628 chrV 26422 . T C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.120;DP=175;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=2.4272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.574;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,80:175:99:1565,0,1896 chrV 26594 . G A 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=23.65;SB=-2.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3831,379,0 chrV 26678 . C T 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3097,315,0 chrV 26685 . C T 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3174,321,0 chrV 27044 . C T 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3338,342,0 chrV 27119 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.392;DP=155;Dels=0.00;FS=4.058;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=8.10;ReadPosRankSum=-2.933;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,68:155:99:1286,0,1969 chrV 27260 . G A 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.317;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.005;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1657,0,1475 chrV 27272 . A G 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.357;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1682,0,1542 chrV 27604 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.371;DP=149;Dels=0.00;FS=1.309;HaplotypeScore=4.5485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1626,0,1569 chrV 27636 . C A 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3850,391,0 chrV 27912 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.880;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.875;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1384,0,1434 chrV 27980 . A T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.101;DP=123;Dels=0.00;FS=3.250;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.327;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1469,0,1217 chrV 28151 . T C 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.765;DP=102;Dels=0.00;FS=15.155;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.549;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:955,0,1104 chrV 28167 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.794;DP=108;Dels=0.00;FS=9.316;HaplotypeScore=7.2031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:108:99:1214,0,997 chrV 28312 . A G 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3411,360,0 chrV 28427 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.743;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.572;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1457,0,1367 chrV 28622 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;DP=136;Dels=0.00;FS=18.251;HaplotypeScore=4.8011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1415,0,1391 chrV 29722 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.493;DP=136;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=10.7506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.486;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:136:99:1303,0,1604 chrV 29909 . C T 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2714,264,0 chrV 29921 . C A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.061;DP=112;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1100,0,1252 chrV 30664 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.233;DP=131;Dels=0.00;FS=5.384;HaplotypeScore=3.3614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1387,0,1358 chrV 30760 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.207;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1073,0,1344 chrV 31093 . A C 2467 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2500,270,0 chrV 31263 . G A 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2950,292,0 chrV 31273 . G A 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2802,276,0 chrV 31294 . G A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.705;DP=130;Dels=0.00;FS=5.419;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.424;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1432,0,1353 chrV 31336 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.421;DP=121;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1337,0,1227 chrV 31408 . A C 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.738;DP=128;Dels=0.00;FS=17.541;HaplotypeScore=2.8863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1049,0,1539 chrV 31663 . A G 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2798,282,0 chrV 31867 . T C 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2598,273,0 chrV 31965 . T G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.679;DP=126;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=3.7114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.805;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1213,0,1400 chrV 32214 . G C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;DP=121;Dels=0.00;FS=3.509;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.372;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1125,0,1440 chrV 32941 . A C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.038;DP=129;Dels=0.00;FS=4.587;HaplotypeScore=2.6884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:129:99:1041,0,1617 chrV 33002 . A C 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.916;DP=124;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=3.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.624;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.977;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1100,0,1526 chrV 33344 . C T 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3701,349,0 chrV 33440 . G A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;DP=138;Dels=0.00;FS=3.543;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.784;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:1619,0,1144 chrV 33455 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.719;DP=117;Dels=0.00;FS=2.778;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.755;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1349,0,985 chrV 33469 . C T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.722;DP=115;Dels=0.00;FS=2.713;HaplotypeScore=11.4533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=12.72;ReadPosRankSum=2.198;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1493,0,847 chrV 33483 . T C 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.441;DP=138;Dels=0.00;FS=6.392;HaplotypeScore=18.7858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.901;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:1571,0,653 chrV 33656 . T A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.327;DP=124;Dels=0.00;FS=5.605;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.086;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.384;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1394,0,1180 chrV 33782 . C A 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9294;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3128,307,0 chrV 34197 . A T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;DP=157;Dels=0.00;FS=3.737;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.068;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,70:157:99:1448,0,1931 chrV 34622 . T C 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.126;DP=154;Dels=0.01;FS=1.349;HaplotypeScore=11.6437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.119;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1474,0,1756 chrV 34703 . T C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.666;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.263;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1332,0,1557 chrV 36835 . A G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.141;DP=123;Dels=0.00;FS=4.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.802;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1307,0,1259 chrV 37747 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.836;DP=112;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.218;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1215,0,1072 chrV 38716 . C T 4166.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4166,415,0 chrV 39166 . T G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.703;DP=141;Dels=0.00;FS=4.547;HaplotypeScore=4.3543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1437,0,1528 chrV 39651 . T A 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2998,304,0 chrV 39664 . C T 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.776;DP=132;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.248;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1482,0,1160 chrV 39794 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.349;DP=162;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=3.9197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,71:162:99:1255,0,2033 chrV 39820 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.903;DP=128;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.544;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.972;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1460,0,1111 chrV 40307 . A G 4023.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7687;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4023,420,0 chrV 40517 . G A 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3295,336,0 chrV 40623 . A G 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3526,372,0 chrV 40835 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.234;DP=153;Dels=0.00;FS=8.660;HaplotypeScore=5.0583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.540;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,64:153:99:1162,0,1976 chrV 41273 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.027;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1377,0,1006 chrV 41275 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.850;DP=109;Dels=0.00;FS=0.756;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1305,0,899 chrV 41432 . C G 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3282,345,0 chrV 41545 . T C 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=23.98;SB=-2.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4076,406,0 chrV 41566 . T C 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.691;DP=171;Dels=0.00;FS=3.645;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,87:171:99:1728,0,1866 chrV 41687 . A C 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2867,303,0 chrV 41711 . C G 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3169,333,0 chrV 41761 . G C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.331;DP=122;Dels=0.00;FS=3.302;HaplotypeScore=2.3869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.257;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1202,0,1271 chrV 41973 . G T 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.763;DP=148;Dels=0.00;FS=4.077;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.265;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1555,0,1461 chrV 42215 . T C 1870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.672;DP=185;Dels=0.00;FS=5.188;HaplotypeScore=7.5316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.847;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,101:185:99:1900,0,1746 chrV 42238 . A T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;DP=165;Dels=0.00;FS=2.774;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.799;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,72:165:99:1437,0,1867 chrV 42418 . G A 4658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4658,490,0 chrV 42490 . G A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.539;DP=155;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=2.4390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.806;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:155:99:1695,0,1606 chrV 42502 . G A 1946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.274;DP=183;Dels=0.00;FS=1.920;HaplotypeScore=2.4115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=-1.034;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,96:182:99:1976,0,1675 chrV 42517 . G A 2004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.164;DP=186;Dels=0.00;FS=2.577;HaplotypeScore=2.7565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=0.232;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.843;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,98:186:99:2034,0,1842 chrV 42557 . T C 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.581;DP=168;Dels=0.00;FS=1.205;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=1;MQRankSum=0.319;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.601;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1805,0,1635 chrV 42586 . C T 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.343;DP=157;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.313;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1587,0,1522 chrV 42780 . C G 2120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.127;DP=234;Dels=0.00;FS=3.007;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=2.244;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.182;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,112:234:99:2150,0,2460 chrV 43007 . G A 1772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.673;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.466;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1802,0,1399 chrV 43057 . A T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.129;DP=165;Dels=0.00;FS=2.759;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.465;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:1355,0,2141 chrV 43074 . T C 4280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4280,450,0 chrV 43103 . G A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.574;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.699;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.971;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1266,0,1653 chrV 43104 . C T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.688;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=8.45;ReadPosRankSum=-2.172;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:139:99:1205,0,1601 chrV 43204 . A G 4725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4725,492,0 chrV 43259 . T C 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.958;DP=157;Dels=0.00;FS=14.342;HaplotypeScore=8.9919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,88:157:99:1887,0,1447 chrV 43295 . C T 1766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.447;DP=182;Dels=0.00;FS=14.209;HaplotypeScore=9.2529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.172;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,83:182:99:1796,0,2017 chrV 43485 . C T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.903;DP=142;Dels=0.00;FS=2.231;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.170;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1650,0,1271 chrV 43494 . A G 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3814,414,0 chrV 43578 . A G 4173.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.92;SB=-2.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4173,420,0 chrV 43817 . C T 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.640;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:1738,0,1303 chrV 43838 . A G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.404;DP=156;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,64:156:99:1173,0,2038 chrV 43959 . G A 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3428,340,0 chrV 44010 . T G 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.507;DP=166;Dels=0.00;FS=3.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.505;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,89:166:99:1801,0,1606 chrV 44019 . C T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.576;DP=162;Dels=0.00;FS=1.959;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.649;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,75:162:99:1503,0,1878 chrV 44468 . A G 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.237;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.881;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,88:161:99:1865,0,1594 chrV 44529 . A G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.131;DP=138;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=3.6381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.970;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,51:138:99:988,0,1954 chrV 44568 . T C 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.223;DP=142;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=12.23;ReadPosRankSum=2.114;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,85:142:99:1766,0,1215 chrV 44601 . T G 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.963e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3711,393,0 chrV 44613 . T C 3828.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3828,393,0 chrV 44641 . A G 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.195;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.422;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1442,0,1691 chrV 44763 . A G 4104.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4104,420,0 chrV 44860 . A G 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.318;DP=186;Dels=0.00;FS=8.696;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=0.174;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,91:186:99:1817,0,2026 chrV 44999 . C G 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.64;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3783,402,0 chrV 45023 . G A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.147;DP=142;Dels=0.00;FS=8.319;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=10.07;ReadPosRankSum=2.150;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1460,0,1649 chrV 45208 . T C 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.334;DP=112;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.599;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1188,0,1238 chrV 45606 . C T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.185;DP=136;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:136:99:1567,0,1249 chrV 45816 . A G 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.519;DP=124;Dels=0.00;FS=4.069;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.003;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,76:124:99:1681,0,923 chrV 45866 . A G 1784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.162;DP=131;Dels=0.00;FS=4.307;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,82:131:99:1814,0,1004 chrV 45963 . T C 3881.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3881,408,0 chrV 46022 . C T 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3119,327,0 chrV 46030 . C G 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2911,309,0 chrV 46142 . T C 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.391;DP=148;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1444,0,1567 chrV 46313 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.807;DP=145;Dels=0.02;FS=7.492;HaplotypeScore=6.5877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.756;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1347,0,1540 chrV 46329 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;DP=131;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.251;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1248,0,1441 chrV 46348 . C T 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3442,349,0 chrV 46731 . A C 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.890;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=104.3829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.131;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1318,0,1355 chrV 46749 . T C 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.010;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=110.9001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.730;QD=23.67;ReadPosRankSum=0.790;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,121:123:99:2944,309,0 chrV 46866 . T C 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3469,351,0 chrV 46910 . A G 4207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.975e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4207,441,0 chrV 46984 . C T 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3599,375,0 chrV 47064 . A G 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.673;DP=152;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.150;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1528,0,1686 chrV 47089 . T C 4088.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8241;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4088,432,0 chrV 47165 . A G 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3633,387,0 chrV 47412 . A C 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.033;DP=144;Dels=0.00;FS=3.042;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.638;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1523,0,1323 chrV 47483 . A G 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.973;DP=137;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1556,0,1282 chrV 47764 . A G 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.743;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.844;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1402,0,1649 chrV 47863 . C T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.272;DP=135;Dels=0.00;FS=5.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.658;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1526,0,1250 chrV 48081 . C G 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1534;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=23.03;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3363,348,0 chrV 48099 . T C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.087;DP=167;Dels=0.00;FS=27.284;HaplotypeScore=4.4437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.464;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,78:167:99:1347,0,1786 chrV 48112 . G A 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3327,334,0 chrV 48124 . A G 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.607;DP=148;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,55:148:99:862,0,2015 chrV 48175 . C T 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.127;DP=143;Dels=0.00;FS=2.184;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,55:143:99:1026,0,1855 chrV 48289 . A G 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.915;DP=161;Dels=0.00;FS=19.599;HaplotypeScore=3.9723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.816;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1601,0,1894 chrV 48384 . T C 4189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=158;Dels=0.00;FS=4.352;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=26.51;ReadPosRankSum=1.513;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:4189,423,0 chrV 48555 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.728;DP=127;Dels=0.00;FS=8.256;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.741;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1309,0,1431 chrV 48609 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.282;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.968;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.886;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1507,0,1560 chrV 48636 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.937;DP=157;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.474;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,71:157:99:1535,0,1732 chrV 48663 . G A 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.400;DP=164;Dels=0.00;FS=5.644;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.855;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,77:164:99:1662,0,1709 chrV 48831 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.618;DP=127;Dels=0.00;FS=16.954;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.603;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1234,0,1451 chrV 48849 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.214;DP=141;Dels=0.00;FS=5.037;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1360,0,1622 chrV 48856 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.154;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.727;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1259,0,1445 chrV 48897 . T C 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.355;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.270;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1547,0,1585 chrV 48972 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.038;DP=122;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.205;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.892;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1239,0,1319 chrV 49043 . T G 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.945;DP=138;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.948;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,83:138:99:1696,0,1176 chrV 49056 . A G 1925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.880;DP=156;Dels=0.00;FS=3.804;HaplotypeScore=3.6832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,95:156:99:1955,0,1257 chrV 49185 . G A 1789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.415;DP=156;Dels=0.00;FS=2.828;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=1;MQRankSum=-0.631;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:1819,0,1408 chrV 49341 . C T 1890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.001;DP=137;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=62.1001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=13.80;ReadPosRankSum=-1.865;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,83:137:99:1920,0,1030 chrV 49343 . C T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.418;DP=134;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=51.3369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.994;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1695,0,599 chrV 49397 . T C 2658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2691,279,0 chrV 49411 . T G 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.592;DP=95;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:984,0,1014 chrV 49751 . C T 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.775;DP=150;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=4.9446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.002;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1511,0,1718 chrV 49908 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.405;DP=131;Dels=0.00;FS=14.529;HaplotypeScore=3.5016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.094;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1320,0,1459 chrV 50125 . A T 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3734,382,0 chrV 50151 . A C 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3108,327,0 chrV 50218 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.223;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.674;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1189,0,1206 chrV 50409 . A G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.794;DP=131;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.048;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1307,0,1447 chrV 50649 . C T 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.385;DP=100;Dels=0.00;FS=1.748;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.972;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1085,0,1027 chrV 50703 . T C 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.641;DP=110;Dels=0.00;FS=5.921;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.192;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1068,0,1330 chrV 50835 . C T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.079;DP=152;Dels=0.00;FS=2.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.135;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1666,0,1527 chrV 50838 . C T 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.404;DP=154;Dels=0.00;FS=2.015;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.235;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1566,0,1658 chrV 50918 . C T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.759;DP=128;Dels=0.00;FS=6.664;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1397,0,1271 chrV 51006 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.637;DP=99;Dels=0.00;FS=3.878;HaplotypeScore=5.7535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.342;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,57:99:99:1198,0,938 chrV 51087 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.647;DP=124;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.929;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.215;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1189,0,1451 chrV 51120 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.608;DP=120;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.081;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1268,0,1305 chrV 51366 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.362;DP=153;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=2.7748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1602,0,1550 chrV 51423 . G A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.097;DP=123;Dels=0.00;FS=5.632;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1393,0,1124 chrV 51661 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.768;DP=122;Dels=0.00;FS=6.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.873;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1381,0,1258 chrV 51743 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.636;DP=106;Dels=0.00;FS=4.826;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.219;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1278,0,1044 chrV 51780 . A G 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5285;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.64;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3456,372,0 chrV 51785 . A G 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.494;DP=134;Dels=0.00;FS=14.518;HaplotypeScore=3.6612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.900;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1603,0,1197 chrV 51822 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3266,339,0 chrV 51919 . T C 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.652;DP=120;Dels=0.00;FS=2.405;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1027,0,1507 chrV 51959 . C T 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3238,327,0 chrV 52075 . T C 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.223;DP=152;Dels=0.00;FS=4.133;HaplotypeScore=3.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=8.62;ReadPosRankSum=-2.597;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1340,0,1633 chrV 52448 . A T 78.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;DP=113;Dels=0.00;FS=5.430;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=0.69;ReadPosRankSum=0.465;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:108,0,275 chrV 52570 . G A 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.562;DP=109;Dels=0.00;FS=7.143;HaplotypeScore=14.7877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.034;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:965,0,1403 chrV 52700 . G T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.094;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.848;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.220;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:979,0,816 chrV 53433 . G A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.249;DP=101;Dels=0.00;FS=5.358;HaplotypeScore=3.1258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:101:99:1102,0,1002 chrV 53456 . G A 2132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5009;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=24.23;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:88:99:2165,228,0 chrV 53463 . A G 2050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:84:99:2083,225,0 chrV 53537 . G T 2395 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=20.13;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2428,249,0 chrV 53618 . T G 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3161,315,0 chrV 53637 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.434;DP=140;Dels=0.00;FS=12.287;HaplotypeScore=4.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.663;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1260,0,1477 chrV 53657 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.436;DP=121;Dels=0.00;FS=3.306;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.034;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1037,0,1378 chrV 53704 . T C 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3485,351,0 chrV 54177 . A T 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.058;DP=132;Dels=0.00;FS=19.166;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.195;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1556,0,1230 chrV 55152 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.077;DP=121;Dels=0.00;FS=8.465;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=2.413;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1271,0,1273 chrV 55530 . T C 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.610;DP=120;Dels=0.00;FS=3.647;HaplotypeScore=6.7960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=1;MQRankSum=1.065;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:120:99:958,0,1454 chrV 55841 . C T 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.042;DP=152;Dels=0.00;FS=1.624;HaplotypeScore=4.8639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.710;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1580,0,1703 chrV 56093 . C G 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;DP=158;Dels=0.00;FS=4.664;HaplotypeScore=2.3906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1770,0,1560 chrV 56129 . A C 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3739,399,0 chrV 56149 . A C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.673;DP=128;Dels=0.00;FS=5.901;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.457;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1146,0,1595 chrV 56166 . G A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.773;DP=133;Dels=0.00;FS=14.852;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1307,0,1558 chrV 56171 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.273;DP=136;Dels=0.00;FS=12.833;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.501;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.535;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1202,0,1623 chrV 56315 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.394;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1283,0,1731 chrV 56577 . G A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.168;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1328,0,1145 chrV 57203 . C T 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.929;DP=134;Dels=0.00;FS=4.733;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.714;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,80:134:99:1780,0,1045 chrV 57448 . A G 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3142,312,0 chrV 57449 . T A 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3244,313,0 chrV 57614 . G A 4115.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.55;SB=-2.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4115,400,0 chrV 57806 . T C 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2749,291,0 chrV 57836 . T C 567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;DP=96;Dels=0.00;FS=5.580;HaplotypeScore=11.8549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.855;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,35:96:99:597,0,1242 chrV 57855 . T A 2575 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=22.79;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2608,273,0 chrV 57861 . T C 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2681,282,0 chrV 57900 . T C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.740;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.499;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:111:99:1324,0,895 chrV 57938 . T C 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.942;DP=92;Dels=0.01;FS=0.783;HaplotypeScore=11.7499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.909;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:897,0,981 chrV 58022 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.009;DP=114;Dels=0.00;FS=3.624;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1139,0,1308 chrV 58103 . C A 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.932;DP=138;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=2.746;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.349;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1711,0,1152 chrV 58114 . A G 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.031;DP=138;Dels=0.00;FS=4.301;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=12.28;ReadPosRankSum=-2.010;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,82:138:99:1725,0,1175 chrV 58183 . A G 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.105;DP=119;Dels=0.00;FS=5.914;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.408;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1464,0,1001 chrV 58245 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.746;DP=108;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.901;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:108:99:1329,0,895 chrV 58398 . A G 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.392;DP=165;Dels=0.00;FS=5.714;HaplotypeScore=4.6314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.477;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:165:99:1283,0,2084 chrV 59312 . G A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;DP=104;Dels=0.00;FS=8.500;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.049;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1212,0,968 chrV 59461 . T C 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.895;DP=95;Dels=0.00;FS=2.697;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.682;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.750;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,53:95:99:1089,0,856 chrV 59504 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.306;DP=140;Dels=0.00;FS=6.568;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.309;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1481,0,1395 chrV 59555 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.551;DP=138;Dels=0.00;FS=2.622;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=9.14;ReadPosRankSum=2.023;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:138:99:1292,0,1548 chrV 59952 . C T 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.477;DP=115;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1140,0,1262 chrV 60003 . C G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.002;DP=120;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1113,0,1413 chrV 60057 . A G 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3086,306,0 chrV 60147 . G C 2256 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.64;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2289,252,0 chrV 60162 . C T 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3006,309,0 chrV 60891 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.941;DP=123;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.685;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1147,0,1493 chrV 60924 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.810;DP=111;Dels=0.00;FS=2.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.107;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.418;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:990,0,1334 chrV 60995 . T C 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.752;DP=100;Dels=0.00;FS=6.379;HaplotypeScore=3.3068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.013;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:882,0,1081 chrV 61123 . G A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.458;DP=105;Dels=0.00;FS=7.993;HaplotypeScore=28.7721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=-4.937;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1069,0,1156 chrV 61194 . A G 599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.432;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=47.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQ0=0;MQRankSum=-4.586;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:629,0,1186 chrV 61280 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.825;DP=95;Dels=0.00;FS=8.146;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.355;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:95:99:1116,0,928 chrV 61449 . C A 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.892;DP=101;Dels=0.00;FS=3.681;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.593;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:977,0,1087 chrV 61456 . A G 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.199;DP=80;Dels=0.00;FS=5.797;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.145;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,41:80:99:873,0,870 chrV 61507 . C T 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.374;DP=97;Dels=0.00;FS=6.825;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:944,0,1190 chrV 61565 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.581;DP=105;Dels=0.00;FS=2.736;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=2;MQRankSum=1.054;QD=10.11;ReadPosRankSum=-2.166;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1092,0,990 chrV 61667 . A G 1311 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2099;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.13;MQ0=0;QD=18.21;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:72:99:1344,147,0 chrV 61799 . G A 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3149,304,0 chrV 62004 . T A 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.782;DP=108;Dels=0.00;FS=1.621;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.753;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1106,0,1211 chrV 62009 . T G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;DP=105;Dels=0.00;FS=1.614;HaplotypeScore=2.8787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.698;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:1016,0,1153 chrV 62086 . G T 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;DP=115;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1017,0,1325 chrV 62117 . T C 677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.866;DP=92;Dels=0.00;FS=0.846;HaplotypeScore=4.7619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.431;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:707,0,1072 chrV 62511 . C T 1500 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.86;MQ0=0;QD=15.96;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:1533,153,0 chrV 62630 . T G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.253;DP=133;Dels=0.00;FS=2.201;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.644;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1215,0,1571 chrV 63006 . T A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.688;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.052;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1333,0,1579 chrV 63059 . C A 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3427,351,0 chrV 63233 . G A 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.222;DP=168;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=2.270;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,84:168:99:1718,0,1833 chrV 63253 . A C 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.793;DP=141;Dels=0.00;FS=6.667;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.936;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.089;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1434,0,1539 chrV 63369 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.605;DP=121;Dels=0.00;FS=6.884;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.138;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1474,0,1095 chrV 63440 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.408;DP=143;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=4.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.999;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1322,0,1674 chrV 63695 . T C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.993;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=2.675;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,62:101:99:1436,0,787 chrV 63829 . T G 203.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.946;DP=100;Dels=0.00;FS=12.618;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.34;MQ0=1;MQRankSum=-4.474;QD=2.03;ReadPosRankSum=2.187;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,25:100:99:233,0,1772 chrV 63847 . A C 2121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.90;MQ0=0;QD=22.81;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2154,222,0 chrV 63865 . T C 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;DP=82;Dels=0.00;FS=14.039;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.55;MQ0=0;MQRankSum=-5.601;QD=0.23;ReadPosRankSum=-2.267;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:49:49,0,1617 chrV 64150 . A C 498.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.550;DP=170;Dels=0.00;FS=83.601;HaplotypeScore=231.1425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=3;MQRankSum=-2.368;QD=2.93;ReadPosRankSum=-3.215;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,47:170:99:528,0,1112 chrV 64152 . C A 497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.225;DP=172;Dels=0.00;FS=22.623;HaplotypeScore=233.7040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQ0=3;MQRankSum=-2.380;QD=2.89;ReadPosRankSum=-5.601;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,60:172:99:527,0,1070 chrV 64237 . C T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.037;DP=124;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=1;MQRankSum=0.674;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1563,0,902 chrV 64421 . A T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.067;DP=124;Dels=0.00;FS=6.773;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.154;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1421,0,1161 chrV 64760 . G A 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.033;DP=82;Dels=0.00;FS=0.888;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,40:82:99:846,0,897 chrV 64919 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.436;DP=110;Dels=0.00;FS=1.547;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.941;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1317,0,1023 chrV 65190 . A G 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.067;DP=104;Dels=0.00;FS=1.784;HaplotypeScore=2.8066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:787,0,1422 chrV 65210 . A G 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.562;DP=96;Dels=0.00;FS=0.838;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,38:96:99:755,0,1278 chrV 65315 . T A 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.008;DP=92;Dels=0.04;FS=25.665;HaplotypeScore=32.4815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=0.34;ReadPosRankSum=-3.288;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,63:88:61:61,0,109 chrV 65418 . G A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.006;DP=145;Dels=0.00;FS=8.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.259;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1468,0,1507 chrV 65424 . C T 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.847;DP=156;Dels=0.00;FS=3.738;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.788;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1509,0,1653 chrV 65622 . A G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.112;DP=128;Dels=0.00;FS=4.257;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.286;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1241,0,1276 chrV 65697 . G C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.150;DP=135;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1332,0,1452 chrV 65944 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.617;DP=127;Dels=0.00;FS=11.153;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.895;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1431,0,1297 chrV 66105 . C T 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.909;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.370;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1019,0,1309 chrV 66141 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.938;DP=116;Dels=0.00;FS=2.417;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=9.05;ReadPosRankSum=2.006;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1080,0,1393 chrV 66168 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.619;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1312,0,1170 chrV 66258 . G A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.870;DP=150;Dels=0.00;FS=9.905;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.475;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,66:150:99:1372,0,1769 chrV 66738 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.808;DP=151;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.611;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1217,0,1763 chrV 66817 . G T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.736;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.463;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1194,0,1708 chrV 67018 . G C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.291;DP=132;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=66.1841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.369;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.163;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1075,0,1565 chrV 67131 . A G 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.571;DP=139;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.614;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1166,0,1742 chrV 67159 . A G 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.227;DP=157;Dels=0.00;FS=7.073;HaplotypeScore=4.1777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,85:157:99:1689,0,1474 chrV 67341 . T C 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.233;DP=133;Dels=0.00;FS=2.237;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.034;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1383,0,1442 chrV 68268 . A G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.008;DP=147;Dels=0.00;FS=4.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=2.268;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,60:147:99:1156,0,1873 chrV 68346 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.490;DP=153;Dels=0.00;FS=2.041;HaplotypeScore=2.8494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,65:153:99:1311,0,1930 chrV 68379 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.654;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,60:144:99:1273,0,1698 chrV 68442 . C G 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.064;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.766;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,77:169:99:1503,0,1978 chrV 68457 . C T 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.638;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.616;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1536,0,1874 chrV 68472 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.751;DP=156;Dels=0.00;FS=3.773;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1461,0,1726 chrV 68475 . C T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.969;DP=159;Dels=0.00;FS=4.694;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1469,0,1765 chrV 68547 . G A 4002.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4002,403,0 chrV 68643 . A G 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.28;MQ0=0;QD=23.36;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3187,330,0 chrV 68702 . C G 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.74;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3399,360,0 chrV 68713 . G C 973.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.031;DP=145;Dels=0.00;FS=5.025;HaplotypeScore=8.9861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.50;MQ0=0;MQRankSum=-5.111;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1003,0,1721 chrV 68714 . C G 3418.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9861;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.54;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3418,354,0 chrV 68718 . T G 1031.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.527;DP=143;Dels=0.00;FS=6.137;HaplotypeScore=8.4630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.22;MQ0=0;MQRankSum=-4.343;QD=7.21;ReadPosRankSum=-2.318;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1061,0,1648 chrV 68794 . G A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.407;DP=150;Dels=0.00;FS=4.999;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.316;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1429,0,1578 chrV 68798 . T G 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3805,396,0 chrV 68910 . T C 3927.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3927,402,0 chrV 68945 . G T 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3630,358,0 chrV 68996 . G A 4786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5732;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=26.74;ReadPosRankSum=-1.382;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,177:179:99:4786,502,0 chrV 69083 . T C 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.474;DP=132;Dels=0.00;FS=6.641;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.361;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,80:132:99:1639,0,1037 chrV 69184 . T C 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.683;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,70:120:99:1515,0,888 chrV 69208 . C T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.664;DP=138;Dels=0.01;FS=1.389;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.183;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1554,0,1173 chrV 69209 . A C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=131;Dels=0.01;FS=0.680;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.247;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1364,0,1185 chrV 69229 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.805;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.821;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1474,0,1014 chrV 69726 . T C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.438;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:163:99:1497,0,2005 chrV 70335 . A C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.508;DP=148;Dels=0.00;FS=2.344;HaplotypeScore=3.7236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=1;MQRankSum=-0.319;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,63:148:99:1276,0,1901 chrV 70531 . G A 4870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4870,487,0 chrV 70702 . C T 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3729,382,0 chrV 70833 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.078;DP=144;Dels=0.00;FS=2.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1472,0,1448 chrV 70852 . T C 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.120;DP=159;Dels=0.00;FS=3.563;HaplotypeScore=4.9651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.623;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:3983,397,0 chrV 70969 . A C 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:3796,387,0 chrV 72306 . C G 1975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.313;DP=164;Dels=0.00;FS=5.928;HaplotypeScore=7.7125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=12.04;ReadPosRankSum=2.194;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,93:164:99:2005,0,1389 chrV 72403 . A T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;DP=156;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=4.9654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1517,0,1769 chrV 72694 . T G 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.02;SB=-2.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3747,393,0 chrV 72800 . C G 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3339,339,0 chrV 72942 . C T 4095.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=1;QD=27.67;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4095,421,0 chrV 72990 . T G 4298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4298,447,0 chrV 73003 . T A 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;DP=165;Dels=0.00;FS=6.921;HaplotypeScore=2.7515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.334;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,83:165:99:1762,0,1809 chrV 73131 . G A 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3747,379,0 chrV 73422 . T C 1751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.353;DP=157;Dels=0.00;FS=3.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.586;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,84:157:99:1781,0,1578 chrV 73467 . A T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;DP=157;Dels=0.01;FS=5.123;HaplotypeScore=64.2110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.117;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1626,0,1564 chrV 73592 . C T 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.234;DP=102;Dels=0.00;FS=9.479;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.105;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:938,0,1121 chrV 73600 . G C 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;DP=101;Dels=0.00;FS=6.352;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.309;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:930,0,1150 chrV 73670 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.934;DP=124;Dels=0.00;FS=5.941;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.384;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1243,0,1434 chrV 73686 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.312;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1295,0,1207 chrV 74271 . T G 1844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.616;DP=149;Dels=0.00;FS=6.118;HaplotypeScore=5.2897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,90:149:99:1874,0,1224 chrV 75225 . A G 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.240;DP=123;Dels=0.00;FS=2.332;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:1503,0,1148 chrV 75516 . A C 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.246;DP=106;Dels=0.00;FS=7.764;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.708;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:995,0,1023 chrV 75539 . T C 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.898;DP=125;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1091,0,1277 chrV 75589 . G A 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.254;DP=122;Dels=0.00;FS=5.620;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.552;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1167,0,1312 chrV 75594 . C T 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3210,307,0 chrV 75731 . T G 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3049,318,0 chrV 75745 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.857;DP=118;Dels=0.00;FS=5.719;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1326,0,1189 chrV 75860 . A C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.891;DP=94;Dels=0.00;FS=14.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.921;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:948,0,1088 chrV 76029 . A G 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.582;DP=132;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=2.371;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1559,0,1295 chrV 76078 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.690;DP=133;Dels=0.00;FS=7.943;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1389,0,1304 chrV 76107 . G C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;DP=136;Dels=0.00;FS=6.498;HaplotypeScore=7.0613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.681;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1466,0,1273 chrV 76232 . C A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:1145,0,782 chrV 76273 . A C 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.578;DP=126;Dels=0.00;FS=5.390;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.318;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1472,0,1175 chrV 76357 . A G 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.597;DP=128;Dels=0.00;FS=6.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.881;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,52:128:99:1008,0,1712 chrV 76382 . A G 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.713;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.528;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3115,321,0 chrV 76472 . A G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.133;DP=110;Dels=0.00;FS=9.223;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1379,0,1015 chrV 76636 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.753;DP=112;Dels=0.00;FS=4.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.276;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1296,0,1035 chrV 76912 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.354;DP=164;Dels=0.00;FS=4.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=2.269;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,70:164:99:1346,0,1995 chrV 77032 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.060;DP=135;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=2.7523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1378,0,1388 chrV 77098 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.730;DP=115;Dels=0.00;FS=7.140;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1217,0,1135 chrV 77310 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.740;DP=135;Dels=0.00;FS=5.261;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.672;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1264,0,1659 chrV 77423 . G T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.277;DP=126;Dels=0.00;FS=4.631;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1302,0,1420 chrV 77444 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.526;DP=129;Dels=0.00;FS=3.524;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.971;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.985;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1081,0,1431 chrV 77459 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.419;DP=117;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=9.44;ReadPosRankSum=2.231;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1135,0,1271 chrV 77500 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.495;DP=159;Dels=0.00;FS=5.713;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.908;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.363;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1499,0,1729 chrV 77529 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.283;DP=152;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=3.3269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=9.76;ReadPosRankSum=2.073;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1514,0,1699 chrV 77544 . G A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.009;DP=135;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.516;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1425,0,1427 chrV 77558 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.537;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.028;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1343,0,1565 chrV 77697 . A G 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.590;DP=104;Dels=0.00;FS=9.369;HaplotypeScore=2.4805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1095,0,1105 chrV 77902 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.970;DP=110;Dels=0.00;FS=5.581;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.396;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1194,0,1180 chrV 77918 . C T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.663;DP=106;Dels=0.00;FS=7.106;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:979,0,1256 chrV 78092 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.677;DP=121;Dels=0.00;FS=11.633;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.619;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1290,0,1223 chrV 78410 . G A 1979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.903;DP=152;Dels=0.00;FS=1.296;HaplotypeScore=2.9506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.038;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,89:152:99:2009,0,1211 chrV 78595 . C G 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2935,303,0 chrV 78787 . C T 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.001;DP=150;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.384;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1519,0,1606 chrV 78893 . T G 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.893;DP=129;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.221;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.197;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1439,0,1228 chrV 78895 . C G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;DP=128;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.290;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1355,0,1070 chrV 79059 . T C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.600;DP=134;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.933;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1463,0,1298 chrV 79285 . A G 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3377,363,0 chrV 79309 . C T 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3486,349,0 chrV 79396 . C T 4539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4539,469,0 chrV 79416 . G A 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=27.01;ReadPosRankSum=0.878;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:4051,412,0 chrV 79508 . T A 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=25.89;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3417,346,0 chrV 79544 . T C 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=25.41;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3031,330,0 chrV 79549 . C T 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=25.70;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2809,285,0 chrV 79607 . G A 1857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.84;MQ0=0;QD=25.44;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1890,201,0 chrV 79621 . C G 1949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.51;MQ0=0;QD=23.77;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1982,222,0 chrV 79626 . A G 2070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.35;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2103,228,0 chrV 79648 . C T 2393 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2426,246,0 chrV 80081 . C T 4171.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4171,403,0 chrV 80083 . C T 4044.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4044,400,0 chrV 80096 . A G 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3922,402,0 chrV 80182 . T C 4485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4485,450,0 chrV 80244 . A T 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.384;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=2.540;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.701;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,78:158:99:1681,0,1683 chrV 80303 . T A 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4179,427,0 chrV 80437 . G C 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3536,378,0 chrV 80485 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.649;DP=146;Dels=0.00;FS=1.291;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.602;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.196;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1424,0,1688 chrV 80509 . G A 1766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.606;DP=161;Dels=0.00;FS=8.109;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:161:99:1796,0,1513 chrV 80557 . T G 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=148;Dels=0.00;FS=2.108;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.723;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1654,0,1450 chrV 80633 . A G 4344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.70;SB=-2.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4344,447,0 chrV 80671 . G A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.571;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,74:182:99:1395,0,2240 chrV 80717 . G A 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.116;DP=159;Dels=0.00;FS=3.900;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=8.96;ReadPosRankSum=-2.535;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1454,0,1838 chrV 80728 . C G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.079;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=7.88;ReadPosRankSum=-2.314;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1244,0,1816 chrV 80737 . A G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.822;DP=156;Dels=0.00;FS=3.739;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,71:156:99:1336,0,1917 chrV 81049 . C T 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.044;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.578;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1582,0,1403 chrV 81181 . A G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.927;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.82;MQ0=0;MQRankSum=-3.329;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.251;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1142,0,1186 chrV 81197 . A G 628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.940;DP=98;Dels=0.01;FS=2.712;HaplotypeScore=173.9534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.38;MQ0=1;MQRankSum=-3.509;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.580;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:97:99:658,0,1024 chrV 81200 . A G 603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;DP=102;Dels=0.01;FS=1.644;HaplotypeScore=301.5821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQ0=3;MQRankSum=-3.335;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:633,0,1111 chrV 81300 . A C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.517;DP=124;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.769;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1364,0,1332 chrV 81333 . T A 1596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.4681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=12.18;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:131:99:1629,171,0 chrV 81356 . A G 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=22.90;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2873,306,0 chrV 81369 . T A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.582;DP=121;Dels=0.00;FS=8.987;HaplotypeScore=10.1859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,71:121:99:1438,0,825 chrV 81713 . G A 4749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.67;SB=-2.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:185:99:4749,463,0 chrV 82262 . T A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;DP=118;Dels=0.00;FS=3.370;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:992,0,1519 chrV 82641 . T A 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3206,333,0 chrV 82782 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4696;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3269,354,0 chrV 82869 . A C 620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.294;DP=155;Dels=0.00;FS=4.935;HaplotypeScore=3.9627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.23;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.341;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,68:155:99:650,0,893 chrV 82875 . T G 1834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4352;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.26;MQ0=0;QD=12.07;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:1867,195,0 chrV 82885 . T C 506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.705;DP=159;Dels=0.00;FS=7.442;HaplotypeScore=7.3083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.056;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.349;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,69:159:99:536,0,940 chrV 82923 . A T 3415.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.78;MQ0=0;QD=20.82;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:3415,346,0 chrV 82928 . G A 3672.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=21.73;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:3672,381,0 chrV 82932 . T C 1457.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.561;DP=183;Dels=0.00;FS=1.163;HaplotypeScore=2.5539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.400;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,85:183:99:1487,0,1912 chrV 82970 . A G 4173.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=25.45;SB=-2.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4173,441,0 chrV 83036 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.373;DP=140;Dels=0.00;FS=3.479;HaplotypeScore=3.1438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,58:140:99:1167,0,1803 chrV 83038 . A C 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;DP=140;Dels=0.00;FS=3.479;HaplotypeScore=4.0105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.243;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1859,0,1107 chrV 83138 . G A 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3325,336,0 chrV 83167 . C T 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3624,370,0 chrV 83329 . G T 4577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4577,463,0 chrV 83473 . G A 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=22.38;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3122,324,0 chrV 83548 . C T 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.555;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9668;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.437;SB=-2.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,176:177:99:3218,330,0 chrV 83617 . T C 4555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4555,483,0 chrV 83692 . G A 4486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.86;SB=-2.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4486,457,0 chrV 83783 . T C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.420;DP=155;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=7.2814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1316,0,1775 chrV 83919 . T C 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.270;DP=150;Dels=0.00;FS=1.287;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.360;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1533,0,1503 chrV 84238 . G C 2313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.610;DP=212;Dels=0.00;FS=4.748;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=10.91;ReadPosRankSum=2.566;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,114:212:99:2343,0,2041 chrV 84562 . A G 1751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.785;DP=194;Dels=0.00;FS=0.529;HaplotypeScore=3.7665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.820;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,87:194:99:1781,0,2350 chrV 84797 . G A 3857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3857,400,0 chrV 84810 . A C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.225;DP=144;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-2.624;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.117;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1213,0,1694 chrV 85009 . G A 5509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=27.68;SB=-2.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:5509,541,0 chrV 85103 . A C 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.162;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,87:183:99:1649,0,2116 chrV 85219 . A G 2110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.501;DP=200;Dels=0.00;FS=0.546;HaplotypeScore=7.7617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=10.55;ReadPosRankSum=3.523;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,104:200:99:2140,0,2040 chrV 85317 . T C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.233;DP=190;Dels=0.00;FS=1.177;HaplotypeScore=4.9187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.699;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,79:190:99:1509,0,2479 chrV 85340 . G C 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;DP=153;Dels=0.00;FS=2.159;HaplotypeScore=5.0691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1713,0,1479 chrV 85578 . C T 2039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.525;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.427;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,103:225:99:2069,0,2605 chrV 85693 . T C 4500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=25.00;SB=-2.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4500,465,0 chrV 85780 . G A 1581.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.082;DP=159;Dels=0.01;FS=0.590;HaplotypeScore=5.5082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=1;MQRankSum=-2.320;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.203;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,86:158:99:1611,0,1498 chrV 85781 . A G 1560.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.831;DP=156;Dels=0.00;FS=1.261;HaplotypeScore=5.5082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=1;MQRankSum=-0.712;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.551;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1590,0,1593 chrV 85782 . G A 1577.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.410;DP=159;Dels=0.00;FS=3.675;HaplotypeScore=5.5082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=1;MQRankSum=2.810;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1607,0,1733 chrV 85978 . T C 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.291;DP=139;Dels=0.00;FS=4.151;HaplotypeScore=4.2780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.978;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1019,0,1690 chrV 85986 . A C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.501;DP=142;Dels=0.00;FS=1.352;HaplotypeScore=2.5493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=7.06;ReadPosRankSum=-1.798;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1033,0,1744 chrV 85999 . C A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.064;DP=159;Dels=0.00;FS=2.858;HaplotypeScore=4.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.334;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.638;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,69:159:99:1181,0,1938 chrV 86381 . C T 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.564;DP=159;Dels=0.02;FS=2.040;HaplotypeScore=8.7695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.232;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,92:156:99:1800,0,1382 chrV 86451 . A T 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;DP=103;Dels=0.00;FS=9.789;HaplotypeScore=8.3651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=-3.159;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.564;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:884,0,1235 chrV 86452 . A T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;DP=102;Dels=0.00;FS=10.557;HaplotypeScore=6.3757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-3.729;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.469;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:905,0,1326 chrV 86770 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.049;DP=110;Dels=0.00;FS=6.084;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,67:110:99:1389,0,829 chrV 86861 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.386;DP=128;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.953;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1319,0,1322 chrV 87182 . A G 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.167;DP=173;Dels=0.00;FS=10.736;HaplotypeScore=5.9523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=1;MQRankSum=0.686;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.483;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,97:173:99:1868,0,1564 chrV 87323 . T C 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.963;DP=148;Dels=0.00;FS=2.108;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.509;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1605,0,1362 chrV 87554 . T C 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.495;DP=176;Dels=0.00;FS=7.652;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.486;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,91:176:99:1809,0,1792 chrV 87617 . G T 2300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.334;DP=201;Dels=0.00;FS=0.520;HaplotypeScore=3.7774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,112:201:99:2330,0,1598 chrV 87749 . C G 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;DP=172;Dels=0.00;FS=5.486;HaplotypeScore=4.2888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.891;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,79:172:99:1526,0,1898 chrV 88286 . G A 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.732;DP=138;Dels=0.00;FS=4.049;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.230;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1574,0,1337 chrV 88595 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.840;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,63:155:99:1270,0,1867 chrV 89263 . C T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.447;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1097,0,1218 chrV 89480 . T C 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.498;DP=165;Dels=0.00;FS=4.539;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.873;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1749,0,1675 chrV 89642 . A G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.071;DP=128;Dels=0.00;FS=9.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.370;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1307,0,1441 chrV 89944 . T G 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.350;DP=161;Dels=0.00;FS=11.146;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1654,0,1692 chrV 89953 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.523;DP=139;Dels=0.00;FS=3.544;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.439;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:139:99:1464,0,1466 chrV 90719 . C T 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.63;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2796,282,0 chrV 90720 . C T 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.97;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2830,283,0 chrV 90830 . A G 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3758,384,0 chrV 91322 . G A 3726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=1;QD=26.06;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3726,373,0 chrV 91637 . C T 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3518,352,0 chrV 91715 . C T 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3639,355,0 chrV 91751 . G A 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3242,321,0 chrV 92201 . G A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.255;DP=128;Dels=0.00;FS=9.756;HaplotypeScore=2.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.334;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1033,0,1618 chrV 92765 . T C 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.824;DP=156;Dels=0.00;FS=3.004;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=3.050;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1656,0,1504 chrV 93797 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.619;DP=120;Dels=0.00;FS=8.675;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.287;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1092,0,1359 chrV 93914 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.291;DP=133;Dels=0.00;FS=12.580;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.282;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1492,0,1283 chrV 94126 . C T 577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.221;DP=90;Dels=0.00;FS=6.795;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=-4.788;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.832;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:607,0,1134 chrV 94157 . G A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.634;DP=101;Dels=0.00;FS=1.610;HaplotypeScore=2.9031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=3.351;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1284,0,747 chrV 94351 . G A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.596;DP=116;Dels=0.00;FS=7.102;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=8.62;ReadPosRankSum=-1.204;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1030,0,1169 chrV 94535 . T C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.731;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.482;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1182,0,1303 chrV 94674 . C T 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.364;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1617,0,1322 chrV 95043 . A G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.221;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.344;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1225,0,1001 chrV 95227 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.596;DP=105;Dels=0.00;FS=3.716;HaplotypeScore=4.7611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.880;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1220,0,1027 chrV 95480 . C T 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.768;DP=113;Dels=0.00;FS=1.630;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:987,0,1229 chrV 96109 . C T 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,104:106:99:2598,261,0 chrV 96439 . G T 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3173,319,0 chrV 96763 . A G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.517;DP=113;Dels=0.00;FS=3.441;HaplotypeScore=2.9403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1200,0,1195 chrV 96835 . A T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.156;DP=121;Dels=0.00;FS=6.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1305,0,1324 chrV 96904 . T G 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.447;DP=117;Dels=0.00;FS=3.482;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.269;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:117:99:1372,0,1133 chrV 97322 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.411;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1579,0,1482 chrV 97416 . G A 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.542;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=26.95;ReadPosRankSum=0.198;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3531,338,0 chrV 97801 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.906;DP=141;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=7.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.305;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1475,0,1563 chrV 98574 . G A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.573;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=2.391;QD=7.78;ReadPosRankSum=1.457;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1010,0,1447 chrV 98966 . T C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.556;DP=139;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.705;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1265,0,1614 chrV 98997 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.392;DP=139;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.929;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1560,0,1268 chrV 99283 . G A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.992;DP=127;Dels=0.00;FS=12.890;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1245,0,1465 chrV 99314 . G A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.114;DP=117;Dels=0.00;FS=5.689;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.723;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.980;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1185,0,1339 chrV 99441 . T G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.155;DP=126;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=5.7956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.639;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:126:99:1380,0,1220 chrV 99489 . T C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.683;DP=105;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.847;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:988,0,1263 chrV 99519 . A G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.301;DP=130;Dels=0.00;FS=23.461;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.247;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1355,0,1261 chrV 99522 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.389;DP=126;Dels=0.00;FS=21.628;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.335;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1361,0,1182 chrV 100596 . C A 66.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.759;DP=133;Dels=0.01;FS=262.155;HaplotypeScore=23.7594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=0.50;ReadPosRankSum=-8.661;SB=-3.008e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,46:132:96:96,0,289 chrV 100635 . T G 583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.992;DP=84;Dels=0.00;FS=0.850;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=6.94;ReadPosRankSum=-2.224;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,52:84:99:613,0,417 chrV 101643 . T A 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.887;DP=124;Dels=0.00;FS=2.658;HaplotypeScore=3.5635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.459;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1513,0,1193 chrV 103136 . A G 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3459,354,0 chrV 103362 . A G 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.464;DP=100;Dels=0.00;FS=13.755;HaplotypeScore=4.8862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.055;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:896,0,1205 chrV 103569 . T C 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.392;DP=123;Dels=0.00;FS=2.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1418,0,1212 chrV 103660 . A T 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.521;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.020;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:880,0,1116 chrV 103918 . C T 1840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.770;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.867;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1870,0,1348 chrV 103937 . A G 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.048;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=8.04;ReadPosRankSum=-2.019;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:938,0,1475 chrV 103985 . G A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.020;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.654;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1240,0,1443 chrV 104015 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.593;DP=101;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.926;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1152,0,1053 chrV 104404 . C T 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2886,300,0 chrV 104442 . T C 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3363,351,0 chrV 105054 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.195;DP=131;Dels=0.00;FS=3.388;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.56;ReadPosRankSum=2.006;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1152,0,1554 chrV 105743 . G A 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9568;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=26.61;ReadPosRankSum=1.323;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2960,298,0 chrV 106481 . A G 1083.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.638;DP=135;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=5.7267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.299;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1113,0,1710 chrV 106489 . G C 926.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.870;DP=132;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=5.7267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.403;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:956,0,1637 chrV 106491 . T A 967.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;DP=133;Dels=0.00;FS=2.260;HaplotypeScore=5.7267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.379;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:997,0,1738 chrV 106493 . G C 928.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.731;DP=138;Dels=0.00;FS=5.175;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.578;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:958,0,1726 chrV 106501 . C T 1182.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.420;DP=136;Dels=0.00;FS=4.006;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.211;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1212,0,1528 chrV 107341 . C G 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2782,276,0 chrV 107580 . G T 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3110,307,0 chrV 107830 . A G 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2843,297,0 chrV 109103 . A G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.111;DP=94;Dels=0.00;FS=8.622;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1107,0,897 chrV 109146 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.342;DP=101;Dels=0.00;FS=2.820;HaplotypeScore=2.9479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=12.74;ReadPosRankSum=2.216;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,60:101:99:1317,0,874 chrV 109271 . C T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.392;DP=122;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:122:99:1386,0,1134 chrV 109342 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.831;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.130;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1270,0,987 chrV 109476 . G A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.414;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1563,0,1283 chrV 109956 . G A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.062;DP=118;Dels=0.00;FS=8.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.808;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1223,0,1300 chrV 111431 . G A 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3500,352,0 chrV 112974 . A G 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.462;DP=118;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.123;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:118:99:1095,0,1351 chrV 113148 . G A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.607;DP=113;Dels=0.00;FS=2.428;HaplotypeScore=5.5828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1133,0,1281 chrV 113863 . C G 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.013;DP=147;Dels=0.00;FS=2.174;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.499;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1584,0,1481 chrV 114633 . C T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.253;DP=103;Dels=0.00;FS=4.876;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.440;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1212,0,968 chrV 115406 . A G 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.276;DP=139;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=11.35;ReadPosRankSum=-2.446;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1607,0,1344 chrV 116053 . C T 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;DP=154;Dels=0.00;FS=3.321;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.159;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1569,0,1376 chrV 117072 . C T 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=36.3806;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=22.43;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2702,267,0 chrV 117134 . T C 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.570;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.785;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:2708,291,0 chrV 117705 . T A 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2881,291,0 chrV 117889 . C T 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.290;DP=121;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=9.89;ReadPosRankSum=-2.069;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1227,0,1350 chrV 118304 . A G 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=1;QD=24.73;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3248,333,0 chrV 119169 . T A 4053.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4053,406,0 chrV 122252 . G C 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.514;DP=179;Dels=0.00;FS=12.288;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.412;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,88:179:99:1731,0,1918 chrV 122351 . A G 1833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.544;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.424;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1863,0,1706 chrV 122456 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.664;DP=151;Dels=0.00;FS=8.400;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=7.85;ReadPosRankSum=1.625;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1216,0,1604 chrV 123266 . G A 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.749;DP=164;Dels=0.00;FS=3.403;HaplotypeScore=8.0994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.339;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1722,0,1659 chrV 123378 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.796;DP=167;Dels=0.00;FS=2.368;HaplotypeScore=3.9182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.394;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,72:167:99:1325,0,2140 chrV 123513 . C G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.278;DP=141;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.853;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1210,0,1712 chrV 123977 . G A 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.881;DP=148;Dels=0.00;FS=2.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.984;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,84:148:99:1901,0,1284 chrV 124061 . C T 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.426;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,80:137:99:1692,0,1088 chrV 124202 . C T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.549;DP=162;Dels=0.00;FS=3.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.564;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,71:162:99:1361,0,1977 chrV 124517 . C T 1925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.697;DP=169;Dels=0.00;FS=6.756;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.545;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,92:169:99:1955,0,1600 chrV 124763 . T C 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.635;DP=180;Dels=0.00;FS=4.477;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.963;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.348;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,89:180:99:1735,0,2016 chrV 124970 . A G 4777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.75;SB=-2.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4777,495,0 chrV 125141 . A G 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3416,363,0 chrV 125204 . G C 1985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;DP=176;Dels=0.00;FS=4.524;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.017;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,100:176:99:2015,0,1459 chrV 125211 . A T 4302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=24.31;SB=-2.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4302,445,0 chrV 125221 . C G 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;DP=158;Dels=0.00;FS=6.951;HaplotypeScore=2.8034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.583;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1648,0,1575 chrV 125279 . C T 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.708;DP=145;Dels=0.00;FS=4.158;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.193;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1669,0,1283 chrV 125368 . A T 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.660;DP=133;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=13.04;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,79:133:99:1764,0,1155 chrV 125388 . A G 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.852;DP=146;Dels=0.00;FS=1.382;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:146:99:1736,0,1287 chrV 125566 . C G 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.242;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,85:173:99:1655,0,1870 chrV 125694 . A G 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.089;DP=169;Dels=0.00;FS=8.283;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.736;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,91:169:99:1887,0,1648 chrV 125756 . T A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.950;DP=116;Dels=0.00;FS=7.552;HaplotypeScore=6.4098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.626;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.096;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:1606,0,972 chrV 125757 . G A 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.778;DP=116;Dels=0.00;FS=7.552;HaplotypeScore=5.4140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:1603,0,941 chrV 126071 . G A 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.879;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1730,0,1527 chrV 126254 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.164;DP=138;Dels=0.00;FS=4.317;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1212,0,1621 chrV 126316 . T G 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.841;DP=187;Dels=0.00;FS=2.621;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=1.073;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.368;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,88:187:99:1694,0,2060 chrV 126477 . C G 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;DP=135;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=5.7408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.421;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1547,0,1207 chrV 126497 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.459;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.397;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1308,0,1138 chrV 126600 . C T 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.423;DP=146;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1605,0,1465 chrV 126652 . A G 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.409;DP=128;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1329,0,1389 chrV 127024 . G A 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.259;DP=92;Dels=0.00;FS=5.415;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.847;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1041,0,918 chrV 127042 . T C 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.839;DP=94;Dels=0.00;FS=12.231;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.028;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.058;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:1045,0,830 chrV 127050 . A G 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.747;DP=95;Dels=0.00;FS=6.862;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.493;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:95:99:1050,0,973 chrV 127286 . T C 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.108;DP=144;Dels=0.00;FS=7.420;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=11.13;ReadPosRankSum=-3.384;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1633,0,1493 chrV 127516 . C T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.253;DP=139;Dels=0.00;FS=6.933;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.307;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,53:139:99:1058,0,1943 chrV 127548 . G T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.250;DP=139;Dels=0.00;FS=5.570;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1134,0,1811 chrV 127687 . G C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.204;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1266,0,1404 chrV 128035 . T C 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.503;DP=151;Dels=0.00;FS=2.117;HaplotypeScore=5.5309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.517;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1560,0,1622 chrV 128810 . T A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.870;DP=140;Dels=0.00;FS=2.179;HaplotypeScore=8.5403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.436;QD=10.46;ReadPosRankSum=2.882;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1494,0,1603 chrV 128953 . T C 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.109;DP=121;Dels=0.00;FS=1.442;HaplotypeScore=4.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.320;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1211,0,1392 chrV 129112 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.632;DP=121;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=1;MQRankSum=-0.559;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1263,0,1326 chrV 129286 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.715;DP=129;Dels=0.00;FS=8.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.077;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1451,0,1183 chrV 129322 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.352;DP=134;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1371,0,1344 chrV 129481 . C T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.480;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.082;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.028;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1303,0,1225 chrV 129523 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.966;DP=122;Dels=0.00;FS=2.727;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1397,0,1145 chrV 129628 . A G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.986;DP=117;Dels=0.00;FS=7.137;HaplotypeScore=3.5361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1072,0,1342 chrV 130108 . C T 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.535;DP=90;Dels=0.00;FS=12.038;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.266;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:964,0,928 chrV 130174 . T C 2277 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2310,246,0 chrV 130380 . T C 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.268;DP=101;Dels=0.00;FS=3.789;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.192;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:101:99:874,0,1200 chrV 130887 . G A 4303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4303,445,0 chrV 131173 . C A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.355;DP=111;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.212;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1228,0,1141 chrV 131177 . A C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;DP=112;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.135;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1166,0,1195 chrV 131211 . G C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;DP=131;Dels=0.02;FS=2.229;HaplotypeScore=3.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1303,0,1408 chrV 131667 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.355;DP=119;Dels=0.00;FS=7.312;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.259;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1360,0,1090 chrV 131751 . G A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.028;DP=135;Dels=0.00;FS=4.258;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.902;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1538,0,1302 chrV 132588 . G A 507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.461;DP=97;Dels=0.03;FS=3.887;HaplotypeScore=42.4920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.351;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,41:94:99:537,0,961 chrV 132767 . T A 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3578,358,0 chrV 132795 . A G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.682;DP=124;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=10.89;ReadPosRankSum=-2.173;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1380,0,1212 chrV 133048 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.157;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQ0=0;MQRankSum=2.960;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1060,0,1452 chrV 133078 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.779;DP=132;Dels=0.00;FS=2.171;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.055;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1356,0,1516 chrV 133173 . G A 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.197;DP=132;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=11.05;ReadPosRankSum=-2.260;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1489,0,1257 chrV 133566 . C T 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.35;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2822,300,0 chrV 133642 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.114;DP=125;Dels=0.00;FS=4.425;HaplotypeScore=4.7257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=1;MQRankSum=1.821;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.031;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1398,0,1280 chrV 133686 . A G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.478;DP=125;Dels=0.00;FS=3.193;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=1;MQRankSum=0.405;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.580;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1335,0,1334 chrV 133716 . C T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.120;DP=108;Dels=0.02;FS=1.574;HaplotypeScore=15.5556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=1;MQRankSum=1.350;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.763;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:1002,0,1263 chrV 133812 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.338;DP=124;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,48:124:99:918,0,1740 chrV 134351 . T A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;DP=130;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=3.6475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.175;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1460,0,1269 chrV 134484 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.630;DP=147;Dels=0.00;FS=6.201;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=8.71;ReadPosRankSum=2.706;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,60:147:99:1310,0,1827 chrV 134580 . A G 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.901;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.402;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1571,0,1635 chrV 134795 . T C 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.444;DP=140;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1110,0,1846 chrV 134805 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.363;DP=139;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,59:139:99:1172,0,1686 chrV 134844 . T G 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.539;DP=137;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.192;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,55:137:99:1021,0,1874 chrV 135505 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.344;DP=121;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1319,0,1226 chrV 135537 . C G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=138;Dels=0.00;FS=2.151;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.490;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1323,0,1398 chrV 135550 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.392;DP=113;Dels=0.00;FS=4.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.10;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1276,0,1090 chrV 135951 . C T 156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.443;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.038;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.495;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,34:67:99:186,0,427 chrV 136024 . T C 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.134;DP=146;Dels=0.00;FS=2.115;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=2.454;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.053;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1367,0,1562 chrV 136419 . T A 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.729;DP=141;Dels=0.00;FS=5.214;HaplotypeScore=2.7280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1740,0,1294 chrV 136461 . C G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.534;DP=118;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.138;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1371,0,1074 chrV 136691 . C T 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.797;DP=111;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.721;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.170;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:111:99:1409,0,937 chrV 136730 . G A 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.479;DP=130;Dels=0.00;FS=2.394;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1626,0,1133 chrV 136755 . A G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.929;DP=116;Dels=0.00;FS=4.789;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.278;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1380,0,1083 chrV 137525 . A G 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;DP=86;Dels=0.00;FS=2.918;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=10.20;ReadPosRankSum=2.579;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:907,0,922 chrV 137752 . C T 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.675;DP=109;Dels=0.00;FS=3.733;HaplotypeScore=2.4905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.215;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:1008,0,1327 chrV 137844 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.127;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=2.289;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1206,0,1262 chrV 137916 . G A 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.070;DP=117;Dels=0.00;FS=5.895;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.931;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:937,0,1514 chrV 138269 . T C 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.175;DP=112;Dels=0.00;FS=8.191;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.973;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,45:112:99:817,0,1431 chrV 138332 . A C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;DP=90;Dels=0.00;FS=35.485;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=2.735;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.501;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,60:90:99:1326,0,550 chrV 138369 . A G 1946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.99;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:81:99:1979,195,0 chrV 138567 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.150;DP=133;Dels=0.00;FS=9.034;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1147,0,1659 chrV 138640 . G A 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.848;DP=155;Dels=0.00;FS=7.130;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.171;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1547,0,1775 chrV 138653 . T C 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=25.98;ReadPosRankSum=1.642;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3975,384,0 chrV 138659 . A G 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.551;DP=161;Dels=0.00;FS=5.188;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.765;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.468;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1560,0,1760 chrV 138936 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.268;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.618;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1275,0,891 chrV 139176 . G T 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.135;DP=148;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=9.11;ReadPosRankSum=2.015;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,64:148:99:1379,0,1704 chrV 139269 . A C 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.954;DP=132;Dels=0.00;FS=5.284;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1254,0,1452 chrV 139492 . T G 2539 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2572,273,0 chrV 139659 . A G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.481;DP=136;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.616;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1332,0,1468 chrV 140109 . C T 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.497;DP=80;Dels=0.00;FS=6.201;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.386;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:706,0,887 chrV 140298 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.638;DP=142;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=4.3693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.035;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1511,0,1297 chrV 140379 . G T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.543;DP=116;Dels=0.00;FS=5.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1108,0,1233 chrV 140430 . T A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;DP=135;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.831;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1516,0,1382 chrV 140458 . A T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.373;DP=119;Dels=0.00;FS=5.658;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.120;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1230,0,1188 chrV 140700 . C T 3835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3835,400,0 chrV 140881 . G C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.444;DP=152;Dels=0.00;FS=4.845;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=1;MQRankSum=1.661;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.512;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,65:152:99:1234,0,1709 chrV 141117 . A G 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2603,270,0 chrV 141189 . G A 2011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2044,213,0 chrV 141485 . G A 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.240;DP=95;Dels=0.00;FS=2.125;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.724;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1002,0,965 chrV 141521 . T A 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.898;DP=73;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:702,0,836 chrV 141527 . T C 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.053;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.779;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,39:76:99:810,0,771 chrV 141779 . T C 4088.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.71;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4088,432,0 chrV 142188 . C T 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.663;DP=117;Dels=0.00;FS=7.559;HaplotypeScore=3.4982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.349;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:117:99:1068,0,1359 chrV 142227 . C T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.463;DP=139;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=3.5566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:139:99:1315,0,1555 chrV 142528 . G C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.237;DP=102;Dels=0.00;FS=2.789;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.807;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1072,0,990 chrV 142607 . C A 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3384,346,0 chrV 143085 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.237;DP=108;Dels=0.00;FS=4.733;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.705;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1208,0,1065 chrV 143292 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.168;DP=124;Dels=0.00;FS=3.270;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.116;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1274,0,1135 chrV 143305 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.378;DP=134;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.237;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:134:99:1270,0,1155 chrV 143606 . T A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.458;DP=135;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1277,0,1568 chrV 143676 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.794;DP=119;Dels=0.01;FS=3.437;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.935;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1351,0,1141 chrV 144159 . C T 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.312;DP=79;Dels=0.00;FS=1.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.965;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,45:79:99:1026,0,669 chrV 144265 . T C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.443;DP=92;Dels=0.00;FS=1.728;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:1012,0,964 chrV 144521 . A G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.895;DP=127;Dels=0.00;FS=5.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.149;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1275,0,1420 chrV 145503 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.261;DP=118;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1064,0,1431 chrV 146273 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.883;DP=121;Dels=0.00;FS=2.417;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1080,0,1396 chrV 146300 . G T 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.625;DP=104;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.367;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:964,0,1212 chrV 146442 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.797;DP=109;Dels=0.00;FS=1.563;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1237,0,985 chrV 146906 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.849;DP=107;Dels=0.00;FS=1.610;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1196,0,1054 chrV 147672 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.669;DP=105;Dels=0.00;FS=2.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1179,0,1035 chrV 148485 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.169;DP=100;Dels=0.00;FS=6.859;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.975;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1107,0,1008 chrV 148773 . A G 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.530;DP=95;Dels=0.00;FS=6.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.353;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:841,0,1191 chrV 149372 . C T 1801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.117;DP=154;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=2.8121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.094;QD=11.69;ReadPosRankSum=-2.010;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,86:154:99:1831,0,1342 chrV 150239 . A C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.091;DP=150;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=-1.989;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1294,0,1767 chrV 150922 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.069;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.336;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1138,0,1091 chrV 151707 . A G 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.411;DP=96;Dels=0.00;FS=1.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:879,0,1123 chrV 151918 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.876;DP=116;Dels=0.00;FS=6.508;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1216,0,1245 chrV 152071 . A T 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.029;DP=89;Dels=0.00;FS=12.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:1011,0,895 chrV 152106 . A G 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.920;DP=84;Dels=0.00;FS=22.025;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.022;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:817,0,964 chrV 152132 . C A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.422;DP=98;Dels=0.00;FS=14.643;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1196,0,890 chrV 152206 . G A 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.038;DP=120;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.361;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1340,0,1210 chrV 152275 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.893;DP=125;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=3.7913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.141;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1253,0,1333 chrV 152297 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.186;DP=124;Dels=0.00;FS=5.940;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1394,0,1248 chrV 152563 . C A 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.145;DP=119;Dels=0.00;FS=2.421;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.823;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,70:119:99:1603,0,941 chrV 152574 . A G 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.922;DP=136;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.042;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1683,0,1174 chrV 153075 . C A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.132;DP=128;Dels=0.00;FS=3.190;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.773;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1276,0,1280 chrV 153129 . A C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.380;DP=135;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.699;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,56:135:99:1080,0,1759 chrV 153175 . A T 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;DP=126;Dels=0.00;FS=3.171;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1222,0,1293 chrV 153416 . A G 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.947;DP=118;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.015;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:974,0,1595 chrV 153551 . A G 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.726;DP=120;Dels=0.00;FS=10.077;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1382,0,1120 chrV 153840 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.669;DP=134;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.646;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1355,0,1487 chrV 153989 . G T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.421;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.433;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1498,0,1210 chrV 154060 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.482;DP=112;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=3.9656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.412;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1273,0,1085 chrV 154354 . T C 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.311;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.786;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:1005,0,814 chrV 154390 . C G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;DP=108;Dels=0.00;FS=4.807;HaplotypeScore=7.2917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.096;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1274,0,915 chrV 154437 . C A 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.534;DP=97;Dels=0.00;FS=10.174;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.528;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,59:97:99:1302,0,704 chrV 154531 . T A 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3560,351,0 chrV 154915 . A C 2784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2817,294,0 chrV 155585 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.689;DP=137;Dels=0.00;FS=6.470;HaplotypeScore=3.8759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1615,0,1355 chrV 155613 . A T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;DP=137;Dels=0.00;FS=3.099;HaplotypeScore=2.1593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1380,0,1568 chrV 155918 . G T 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.192;DP=124;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.549;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:124:99:1154,0,1458 chrV 155956 . C T 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.590;DP=143;Dels=0.00;FS=9.443;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,58:143:99:1085,0,1761 chrV 155964 . T C 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.171;DP=138;Dels=0.00;FS=17.049;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.744;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,55:138:99:922,0,1815 chrV 155979 . A G 739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.627;DP=124;Dels=0.00;FS=13.124;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.323;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,46:124:99:769,0,1769 chrV 156540 . T G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1212,0,1556 chrV 156762 . T C 608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.902;DP=79;Dels=0.00;FS=0.867;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:638,0,1027 chrV 157149 . G A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3261,327,0 chrV 157238 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.308;DP=127;Dels=0.00;FS=3.191;HaplotypeScore=2.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.605;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1457,0,1231 chrV 157279 . T C 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.552;DP=95;Dels=0.00;FS=5.835;HaplotypeScore=2.6823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.300;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:818,0,1167 chrV 157328 . A T 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.713;DP=93;Dels=0.00;FS=1.875;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:704,0,1248 chrV 157488 . C T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;DP=119;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=2.5488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1382,0,1032 chrV 157503 . A G 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.255;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.344;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1193,0,1040 chrV 157547 . C A 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.334;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,49:122:99:916,0,1682 chrV 157552 . T A 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.681;DP=119;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.267;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:119:99:979,0,1598 chrV 157726 . A G 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.116;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1166,0,978 chrV 157769 . A G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.122;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.681;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:905,0,1335 chrV 157792 . A G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.928;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=8.97;ReadPosRankSum=-2.273;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1017,0,1393 chrV 158171 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.695;DP=149;Dels=0.00;FS=2.055;HaplotypeScore=3.4365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1556,0,1560 chrV 158386 . T C 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.382;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,46:121:99:876,0,1716 chrV 158690 . G A 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.989;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.498;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1704,0,1193 chrV 158705 . A G 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.918;DP=138;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=2.6420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.062;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1513,0,1349 chrV 159092 . A G 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.670;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.718;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:812,0,655 chrV 159381 . T C 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.801;DP=151;Dels=0.00;FS=7.433;HaplotypeScore=4.9656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.952;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.473;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1447,0,1742 chrV 159422 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.294;DP=129;Dels=0.00;FS=14.672;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1271,0,1474 chrV 159475 . C A 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;DP=138;Dels=0.00;FS=17.773;HaplotypeScore=2.5338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=2.543;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.308;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1617,0,1321 chrV 159570 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.310;DP=144;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.118;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1296,0,1657 chrV 159624 . G A 4444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4444,439,0 chrV 159810 . G A 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.854;DP=163;Dels=0.00;FS=2.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,88:163:99:1800,0,1573 chrV 159875 . A G 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.248;DP=148;Dels=0.00;FS=9.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,87:148:99:1815,0,1260 chrV 160010 . T C 4171.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=1;QD=24.54;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4171,432,0 chrV 160020 . G A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.517;DP=145;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=1;MQRankSum=-1.001;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1252,0,1509 chrV 160038 . T A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.791;DP=151;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.372;QD=8.53;ReadPosRankSum=-2.794;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1318,0,1655 chrV 160192 . A C 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;DP=148;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=2.2337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.042;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1537,0,1491 chrV 160282 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.975;DP=121;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.516;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1293,0,1261 chrV 160344 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.970;DP=129;Dels=0.00;FS=3.176;HaplotypeScore=5.9523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.261;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1332,0,1325 chrV 160481 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.779;DP=123;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.637;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1270,0,1331 chrV 160729 . T C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.464;DP=130;Dels=0.00;FS=7.043;HaplotypeScore=4.9570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.969;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1443,0,1349 chrV 160912 . T C 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.203;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=0.792;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.929;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:949,0,1416 chrV 161110 . T C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.998;DP=153;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.754;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1518,0,1651 chrV 161191 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.585;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.482;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,69:156:99:1418,0,1778 chrV 161419 . C T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.319;DP=122;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=3.1034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1366,0,1168 chrV 161770 . T C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.290;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=8.12;ReadPosRankSum=-1.691;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:129:99:1078,0,1673 chrV 161851 . C T 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.847;DP=143;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=4.1299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1608,0,1393 chrV 161933 . A G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.777;DP=120;Dels=0.00;FS=5.652;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.654;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1142,0,1366 chrV 162008 . T C 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.703;DP=133;Dels=0.00;FS=4.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.257;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:1120,0,1712 chrV 162250 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.390;DP=163;Dels=0.00;FS=2.017;HaplotypeScore=5.9028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.135;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,73:163:99:1345,0,2016 chrV 162251 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.587;DP=150;Dels=0.01;FS=2.992;HaplotypeScore=5.9028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.714;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,65:149:99:1390,0,1825 chrV 163290 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.004;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.179;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.413;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:897,0,1381 chrV 163466 . A C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.157;DP=105;Dels=0.00;FS=5.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1160,0,1046 chrV 164225 . A G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.717;DP=133;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.763;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1417,0,1297 chrV 164498 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.362;DP=93;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=11.30;ReadPosRankSum=-2.024;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1081,0,884 chrV 164516 . T G 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.036;DP=103;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1147,0,1066 chrV 165294 . G A 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3342,345,0 chrV 165458 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.549;DP=116;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=10.25;ReadPosRankSum=-2.137;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1219,0,1299 chrV 165526 . G A 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.728;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.952;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1731,0,1264 chrV 165547 . T G 3727.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3727,387,0 chrV 165567 . G A 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.916;DP=136;Dels=0.00;FS=3.396;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.010;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1728,0,1192 chrV 165924 . G A 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.86;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2903,303,0 chrV 166089 . G A 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.848;DP=117;Dels=0.00;FS=5.730;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:934,0,1488 chrV 166110 . G A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.034;DP=103;Dels=0.00;FS=3.828;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=11.46;ReadPosRankSum=2.432;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1210,0,1074 chrV 166422 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.813;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1265,0,1538 chrV 166670 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.088;DP=90;Dels=0.00;FS=2.840;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:1039,0,841 chrV 166861 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.508;DP=129;Dels=0.00;FS=9.610;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.676;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1356,0,1417 chrV 167040 . C T 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.501;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=2;MQRankSum=-1.048;QD=9.82;ReadPosRankSum=2.542;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1120,0,1098 chrV 167329 . A C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.347;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.780;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1031,0,973 chrV 167641 . A C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.978;DP=105;Dels=0.01;FS=2.545;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.569;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:931,0,1230 chrV 167761 . C T 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.328;DP=112;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1091,0,1177 chrV 168779 . C T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.831;DP=122;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:122:99:1297,0,1221 chrV 168930 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;DP=126;Dels=0.00;FS=12.585;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1236,0,1392 chrV 169005 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.118;DP=115;Dels=0.00;FS=2.394;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=1;MQRankSum=2.804;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:950,0,1439 chrV 169109 . C T 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2990,303,0 chrV 169164 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.735;DP=147;Dels=0.00;FS=2.992;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.431;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1402,0,1636 chrV 169329 . C T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.762;DP=126;Dels=0.00;FS=5.468;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1192,0,1468 chrV 169431 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.631;DP=125;Dels=0.00;FS=5.484;HaplotypeScore=3.5862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.309;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1246,0,1400 chrV 169452 . G A 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.872;DP=106;Dels=0.00;FS=9.301;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1202,0,1015 chrV 169464 . T C 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.481;DP=100;Dels=0.00;FS=9.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.892;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1049,0,1072 chrV 169611 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.235;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1014,0,1251 chrV 169674 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.999;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.553;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1363,0,1290 chrV 169761 . A G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.061;DP=119;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.328;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1379,0,1201 chrV 170070 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.802;DP=127;Dels=0.00;FS=4.790;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1133,0,1516 chrV 170228 . C A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.330;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.795;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1143,0,1110 chrV 170319 . C T 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.417;DP=112;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.973;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.719;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1266,0,1037 chrV 170706 . C T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.203;DP=118;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=1;MQRankSum=-0.297;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.488;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1330,0,1193 chrV 171200 . T A 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.059;DP=147;Dels=0.00;FS=3.956;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.192;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:147:99:1689,0,1436 chrV 171267 . T C 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.040;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.549;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1315,0,1468 chrV 171287 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.142;DP=150;Dels=0.00;FS=3.890;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.589;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1615,0,1491 chrV 171463 . T C 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.366;DP=138;Dels=0.00;FS=2.203;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.574;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1568,0,1258 chrV 171549 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;DP=141;Dels=0.00;FS=3.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1433,0,1534 chrV 171809 . A T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;DP=121;Dels=0.00;FS=15.907;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1404,0,1207 chrV 171972 . G A 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.462;DP=133;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=12.87;ReadPosRankSum=2.742;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:133:99:1742,0,1070 chrV 173217 . T G 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.707;DP=157;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=7.8538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.915;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1661,0,1654 chrV 173402 . C T 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.859;DP=153;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=6.5385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.948;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1612,0,1536 chrV 173562 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.837;DP=149;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.560;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1502,0,1526 chrV 173645 . C T 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3300,328,0 chrV 173763 . T A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;DP=147;Dels=0.00;FS=13.517;HaplotypeScore=7.9367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=2.271;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1369,0,1711 chrV 173841 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.709;DP=112;Dels=0.00;FS=4.761;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1362,0,910 chrV 173889 . G A 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.583;DP=129;Dels=0.00;FS=2.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.659;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,76:129:99:1697,0,1074 chrV 173893 . C A 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.361;DP=128;Dels=0.00;FS=2.287;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.524;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1665,0,1083 chrV 173989 . A G 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.596;DP=118;Dels=0.00;FS=3.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=7.90;ReadPosRankSum=2.041;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:962,0,1609 chrV 174633 . G A 3923.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.15;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3923,394,0 chrV 174650 . C T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.207;DP=134;Dels=0.00;FS=2.193;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.499;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1445,0,1397 chrV 174784 . G T 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;DP=109;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.028;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,64:109:99:1464,0,917 chrV 174794 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.101;DP=110;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.714;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.096;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1228,0,1050 chrV 174957 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.526;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1481,0,1156 chrV 175045 . T G 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.823;DP=110;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.164;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.648;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1052,0,1338 chrV 175154 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.405;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1073,0,950 chrV 175314 . C G 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;DP=107;Dels=0.00;FS=4.797;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.953;QD=8.52;ReadPosRankSum=3.041;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:942,0,1258 chrV 175352 . A G 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.777;DP=117;Dels=0.00;FS=6.081;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=-4.662;QD=7.02;ReadPosRankSum=-2.413;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:851,0,1514 chrV 175361 . G A 690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.448;DP=111;Dels=0.00;FS=5.353;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.23;MQ0=0;MQRankSum=-6.429;QD=6.22;ReadPosRankSum=-3.406;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,42:111:99:720,0,1477 chrV 175373 . T G 382.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.369;DP=109;Dels=0.00;FS=2.967;HaplotypeScore=3.2363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.28;MQ0=0;MQRankSum=-7.697;QD=3.50;ReadPosRankSum=-2.195;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,30:109:99:412,0,1828 chrV 175376 . C T 249.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.848;DP=102;Dels=0.00;FS=1.958;HaplotypeScore=3.2363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=-7.388;QD=2.44;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-7.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:279,0,1755 chrV 175379 . A G 278.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.840;DP=106;Dels=0.00;FS=8.357;HaplotypeScore=3.4409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQ0=0;MQRankSum=-5.656;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,25:106:99:308,0,1850 chrV 175383 . T C 221.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.980;DP=108;Dels=0.00;FS=18.393;HaplotypeScore=3.4409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-5.397;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,25:108:99:251,0,1960 chrV 175384 . C A 250.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.133;DP=107;Dels=0.00;FS=16.024;HaplotypeScore=3.4409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQ0=0;MQRankSum=-4.530;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,24:107:99:280,0,1878 chrV 175385 . T A 248.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;DP=107;Dels=0.00;FS=16.024;HaplotypeScore=3.4409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQ0=0;MQRankSum=-4.813;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.594;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,24:107:99:278,0,1916 chrV 175389 . T C 367.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.526;DP=113;Dels=0.00;FS=13.874;HaplotypeScore=2.5743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=-4.707;QD=3.25;ReadPosRankSum=-2.680;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,33:113:99:397,0,1880 chrV 175491 . G A 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.194;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.438;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1298,0,1292 chrV 175496 . T C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.717;DP=126;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.403;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1242,0,1320 chrV 175565 . G A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;DP=141;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.970;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1161,0,1678 chrV 175575 . A G 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.386;DP=127;Dels=0.00;FS=3.328;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,50:127:99:829,0,1710 chrV 175587 . T A 569.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.738;DP=116;Dels=0.00;FS=6.360;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.709;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.203;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,38:116:99:599,0,1775 chrV 175593 . T A 548.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.731;DP=110;Dels=0.00;FS=8.516;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=4.98;ReadPosRankSum=2.087;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,33:110:99:578,0,1742 chrV 175595 . T C 545.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=109;Dels=0.00;FS=8.448;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.949;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,33:109:99:575,0,1634 chrV 175646 . A T 239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;DP=103;Dels=0.00;FS=4.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=-4.415;QD=2.32;ReadPosRankSum=-4.840;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,26:103:99:269,0,1799 chrV 175655 . C T 137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.494;DP=100;Dels=0.00;FS=2.034;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-3.639;QD=1.37;ReadPosRankSum=-2.183;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,21:100:99:167,0,1804 chrV 175674 . T C 2201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2234,231,0 chrV 175700 . T C 188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=81;Dels=0.00;FS=2.094;HaplotypeScore=4.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQ0=2;MQRankSum=-2.510;QD=2.32;ReadPosRankSum=2.554;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:218,0,1235 chrV 175772 . T C 278.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.846;DP=83;Dels=0.00;FS=5.156;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=4;MQRankSum=-0.175;QD=3.35;ReadPosRankSum=-2.058;SB=-1.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:308,0,1352 chrV 175840 . T C 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3508,366,0 chrV 176447 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.386;DP=109;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=5.8786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1268,0,1116 chrV 176969 . C G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.170;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.068;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1443,0,1243 chrV 177073 . G A 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.831;DP=143;Dels=0.00;FS=3.073;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.563;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1495,0,1547 chrV 177079 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.714;DP=143;Dels=0.00;FS=4.071;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.479;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1366,0,1577 chrV 177138 . G C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.000;DP=133;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.939;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.664;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1313,0,1416 chrV 177351 . C T 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.619;DP=109;Dels=0.00;FS=13.145;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.076;QD=7.64;ReadPosRankSum=2.064;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:863,0,1508 chrV 177453 . T A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.596;DP=105;Dels=0.00;FS=37.907;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.836;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:966,0,1350 chrV 177489 . T C 437.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.145;DP=83;Dels=0.00;FS=28.982;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQ0=0;MQRankSum=-4.416;QD=5.27;ReadPosRankSum=-2.865;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,28:83:99:467,0,1339 chrV 177507 . G C 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.477;DP=99;Dels=0.01;FS=35.106;HaplotypeScore=8.6537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=0;MQRankSum=6.547;QD=14.95;ReadPosRankSum=5.707;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,67:98:99:1510,0,520 chrV 177849 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.308;DP=119;Dels=0.00;FS=4.420;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.703;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1292,0,1237 chrV 178044 . A G 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=23.03;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2912,303,0 chrV 178287 . T C 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3285,351,0 chrV 178671 . T A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.048;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1192,0,1420 chrV 178691 . G A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;DP=137;Dels=0.00;FS=3.048;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1232,0,1645 chrV 178728 . T A 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.744;DP=116;Dels=0.00;FS=8.653;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:960,0,1398 chrV 178729 . A C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;DP=118;Dels=0.00;FS=10.150;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=2.109;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:915,0,1362 chrV 178786 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.466;DP=127;Dels=0.00;FS=4.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.099;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1301,0,1363 chrV 178894 . T G 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.827;DP=109;Dels=0.00;FS=3.584;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.718;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1097,0,1193 chrV 179014 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.500;DP=113;Dels=0.00;FS=7.061;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.506;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1443,0,956 chrV 179020 . A G 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;DP=117;Dels=0.00;FS=6.377;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.555;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1466,0,986 chrV 179042 . G A 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.626;DP=144;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.500;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:144:99:1735,0,1334 chrV 179058 . A C 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.719;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1683,0,1276 chrV 179137 . C T 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.068;DP=84;Dels=0.00;FS=1.801;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:863,0,872 chrV 179143 . G T 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.564;DP=86;Dels=0.00;FS=4.116;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:870,0,927 chrV 179334 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.283;DP=112;Dels=0.00;FS=2.446;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.320;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1320,0,1068 chrV 179359 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;DP=116;Dels=0.00;FS=3.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.549;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1389,0,1068 chrV 179485 . A G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.722;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.268;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1154,0,1199 chrV 179488 . C A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.776;DP=115;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=6.8153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.378;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1205,0,1198 chrV 179545 . A G 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.817;DP=128;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.180;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,50:128:99:995,0,1852 chrV 179605 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.616;DP=147;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=3.9697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.053;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1207,0,1785 chrV 179647 . T C 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.340;DP=115;Dels=0.00;FS=3.443;HaplotypeScore=4.9624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.653;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:115:99:1083,0,1329 chrV 179788 . G A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.717;DP=103;Dels=0.00;FS=7.876;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.426;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1015,0,1107 chrV 179823 . C A 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.934;DP=87;Dels=0.00;FS=0.827;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.034;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:717,0,1102 chrV 179843 . A G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.233;DP=121;Dels=0.00;FS=5.672;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=8.50;ReadPosRankSum=-2.098;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1059,0,1338 chrV 180216 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.847;DP=129;Dels=0.00;FS=2.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1302,0,1513 chrV 180421 . C T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.834;DP=110;Dels=0.00;FS=2.463;HaplotypeScore=3.7748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.181;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1223,0,1135 chrV 180460 . C T 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3153,318,0 chrV 180517 . C T 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.339;DP=143;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.015;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1480,0,1402 chrV 180547 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=119;Dels=0.00;FS=7.016;HaplotypeScore=2.4052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1193,0,1314 chrV 181108 . C T 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.107;DP=91;Dels=0.00;FS=2.771;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:821,0,1104 chrV 181135 . T C 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.962;DP=114;Dels=0.00;FS=3.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:1024,0,1405 chrV 181486 . G A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.025;DP=127;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.822;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1351,0,1315 chrV 181705 . T C 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=22.78;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3199,327,0 chrV 182014 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.181;DP=140;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.113;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1290,0,1490 chrV 182044 . G C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.415;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.358;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:1380,0,1775 chrV 182242 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.576;DP=127;Dels=0.00;FS=2.293;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1333,0,1369 chrV 182338 . T C 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.636;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.904;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,74:126:99:1590,0,1105 chrV 182340 . A T 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;DP=127;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.019;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1680,0,1126 chrV 182381 . A T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.653;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1324,0,825 chrV 182701 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.872;DP=145;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1254,0,1783 chrV 183057 . C G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.352;DP=119;Dels=0.00;FS=12.006;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.736;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1102,0,1288 chrV 183309 . C A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.578;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.622;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1616,0,1475 chrV 183424 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.751;DP=119;Dels=0.00;FS=6.467;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.168;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1076,0,1440 chrV 183430 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.798;DP=126;Dels=0.00;FS=4.595;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1214,0,1409 chrV 183549 . C T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.656;DP=98;Dels=0.00;FS=0.835;HaplotypeScore=2.9470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:1002,0,957 chrV 183617 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.028;DP=100;Dels=0.00;FS=8.134;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.763;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,60:100:99:1326,0,837 chrV 183864 . T C 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.245;DP=161;Dels=0.00;FS=8.909;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.191;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1630,0,1712 chrV 183869 . A G 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.163;DP=167;Dels=0.00;FS=8.589;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1650,0,1776 chrV 183910 . C G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.732;DP=144;Dels=0.00;FS=6.970;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.840;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:144:99:1374,0,1584 chrV 183957 . A G 4167.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4167,444,0 chrV 184027 . A G 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.269;DP=133;Dels=0.00;FS=3.308;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1537,0,1205 chrV 184268 . T C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.783;DP=129;Dels=0.00;FS=3.579;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.597;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1339,0,1392 chrV 184291 . A C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.589;DP=138;Dels=0.00;FS=3.262;HaplotypeScore=4.8435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.580;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1312,0,1605 chrV 184684 . T C 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.691;DP=136;Dels=0.00;FS=6.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.988;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1390,0,1473 chrV 185755 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.776;DP=129;Dels=0.00;FS=4.170;HaplotypeScore=4.6268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:129:99:1343,0,1274 chrV 185983 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.442;DP=138;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.527;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1213,0,1724 chrV 186279 . G C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.456;DP=102;Dels=0.00;FS=3.814;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1269,0,911 chrV 186424 . A G 2156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.524;DP=201;Dels=0.00;FS=1.720;HaplotypeScore=5.1438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=10.73;ReadPosRankSum=2.531;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,105:201:99:2186,0,2018 chrV 186591 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.102;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.497;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1093,0,1316 chrV 186610 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.667;DP=101;Dels=0.00;FS=2.581;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1084,0,1051 chrV 186622 . T C 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.823;DP=83;Dels=0.00;FS=1.814;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.852;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:804,0,923 chrV 186649 . A G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.867;DP=126;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.567;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1350,0,1257 chrV 186791 . T G 2046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.397;DP=223;Dels=0.00;FS=2.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.385;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,107:223:99:2076,0,2495 chrV 187027 . T C 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.091;DP=180;Dels=0.00;FS=10.382;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,87:180:99:1669,0,2149 chrV 187071 . G T 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.757;DP=165;Dels=0.00;FS=3.995;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,75:165:99:1575,0,1938 chrV 187243 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.143;DP=154;Dels=0.00;FS=3.896;HaplotypeScore=2.9361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=7.94;ReadPosRankSum=-2.057;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:1253,0,1859 chrV 187252 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.455;DP=138;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.9361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=8.36;ReadPosRankSum=-2.215;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:138:99:1183,0,1694 chrV 187305 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.163;DP=119;Dels=0.00;FS=3.336;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=11.50;ReadPosRankSum=2.497;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1398,0,1173 chrV 187309 . A C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.106;DP=128;Dels=0.00;FS=6.571;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=9.65;ReadPosRankSum=2.662;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1265,0,1358 chrV 187357 . G A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.276;DP=129;Dels=0.00;FS=3.180;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.199;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1345,0,1302 chrV 187406 . A G 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.806;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.406;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1082,0,1307 chrV 187426 . A G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.840;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1098,0,1474 chrV 187466 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.087;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,61:143:99:1187,0,1772 chrV 187482 . T A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.999;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,59:144:99:1216,0,1887 chrV 187497 . C G 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.484;DP=141;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=3.944;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1672,0,1263 chrV 187519 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.336;DP=135;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1388,0,1484 chrV 187631 . A G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.247;DP=135;Dels=0.00;FS=5.264;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.692;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.530;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1350,0,1555 chrV 187642 . T C 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3595,366,0 chrV 187648 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.976;DP=143;Dels=0.00;FS=1.359;HaplotypeScore=5.3335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.208;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:143:99:1370,0,1565 chrV 187679 . C T 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.882;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1031,0,1259 chrV 187705 . A G 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.971;DP=115;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1131,0,1260 chrV 187751 . A T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.960;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.794;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1256,0,1129 chrV 187774 . T A 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;DP=95;Dels=0.00;FS=5.172;HaplotypeScore=38.7555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.560;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.950;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:901,0,1126 chrV 187805 . C T 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.981;DP=95;Dels=0.00;FS=5.129;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.14;MQ0=0;MQRankSum=-7.813;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:689,0,1204 chrV 187817 . T A 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.458;DP=119;Dels=0.00;FS=15.435;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=0;MQRankSum=-7.386;QD=7.01;ReadPosRankSum=-1.384;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,48:119:99:864,0,1571 chrV 187824 . C G 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.352;DP=130;Dels=0.00;FS=12.996;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-7.315;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,50:130:99:826,0,1717 chrV 187838 . A G 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.53;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3261,345,0 chrV 187860 . T C 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.634;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.20;MQ0=0;MQRankSum=-5.902;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.727;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,45:121:99:701,0,1781 chrV 187885 . T C 742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.483;DP=126;Dels=0.00;FS=1.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.56;MQ0=0;MQRankSum=-6.216;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.073;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:772,0,1728 chrV 187916 . C T 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.647;DP=134;Dels=0.00;FS=1.422;HaplotypeScore=45.7895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.75;MQ0=0;MQRankSum=-9.003;QD=5.52;ReadPosRankSum=2.844;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,51:134:99:770,0,1800 chrV 187939 . A G 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.927;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.32;MQ0=0;MQRankSum=-8.993;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,51:125:99:714,0,1705 chrV 188016 . T C 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.208;DP=135;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=4.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.206;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,54:135:99:945,0,1825 chrV 188018 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.168;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.474;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.228;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1032,0,1711 chrV 188040 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.445;DP=159;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=2.3999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.036;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1451,0,1871 chrV 188051 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.992;DP=158;Dels=0.00;FS=1.985;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=-3.499;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1577,0,1727 chrV 188144 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.066;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.904;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1275,0,1607 chrV 188246 . G C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.234;DP=155;Dels=0.00;FS=1.418;HaplotypeScore=4.0004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.700;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1404,0,1712 chrV 188310 . T C 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.937;DP=147;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=3.8117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1472,0,1542 chrV 188435 . A G 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.112;DP=126;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,74:126:99:1603,0,1073 chrV 188732 . T C 1780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.104;DP=156;Dels=0.00;FS=9.189;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.353;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,89:156:99:1810,0,1447 chrV 188774 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.090;DP=136;Dels=0.00;FS=3.523;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.850;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1634,0,1248 chrV 188775 . C T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.517;DP=137;Dels=0.00;FS=4.605;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.482;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1651,0,1274 chrV 188873 . G A 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.131;DP=118;Dels=0.00;FS=3.368;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.510;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1340,0,1147 chrV 189662 . A G 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.280;DP=125;Dels=0.00;FS=3.244;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.388;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1549,0,1120 chrV 190070 . A G 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.764;DP=159;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=3.7123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.360;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1704,0,1635 chrV 190283 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.211;DP=145;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.272;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1472,0,1531 chrV 190355 . C T 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.626;DP=156;Dels=0.00;FS=9.902;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.536;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,86:156:99:1804,0,1403 chrV 190531 . T A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.794;DP=114;Dels=0.00;FS=7.298;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.184;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1219,0,1219 chrV 190553 . C T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.369;DP=108;Dels=0.00;FS=6.073;HaplotypeScore=3.5107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.821;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1198,0,1063 chrV 190754 . C T 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.412;DP=123;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.352;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1173,0,1366 chrV 190835 . G A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.869;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.249;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1108,0,1715 chrV 190838 . A G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.792;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,78:133:99:1618,0,1151 chrV 191009 . T A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.269;DP=118;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.498;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1109,0,1462 chrV 191726 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.869;DP=154;Dels=0.00;FS=5.881;HaplotypeScore=2.4947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.158;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1482,0,1730 chrV 191818 . A G 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.112;DP=160;Dels=0.00;FS=1.973;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.842;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1586,0,1782 chrV 192065 . G T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.198;DP=114;Dels=0.00;FS=8.584;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=11.54;ReadPosRankSum=-2.807;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1346,0,1002 chrV 192377 . T G 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.016;DP=153;Dels=0.00;FS=2.033;HaplotypeScore=1.9085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.019;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1660,0,1556 chrV 192429 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.130;DP=156;Dels=0.00;FS=1.269;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:156:99:1535,0,1458 chrV 192719 . G A 5484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=211;Dels=0.00;FS=6.041;HaplotypeScore=11.5260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.185;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,208:211:99:5484,553,0 chrV 193011 . T C 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3620,390,0 chrV 193525 . T C 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3418,348,0 chrV 193624 . T C 4580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7171;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4580,472,0 chrV 193678 . A G 4857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.11;SB=-2.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4857,513,0 chrV 193876 . G A 4792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:4792,460,0 chrV 193912 . C A 4507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.49;SB=-2.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4507,436,0 chrV 193997 . G A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.324;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.478;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1442,0,1772 chrV 194101 . C A 5128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.16;SB=-2.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:196:99:5128,511,0 chrV 194166 . T G 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.889;DP=146;Dels=0.00;FS=6.094;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1536,0,1491 chrV 194498 . C T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.816;DP=161;Dels=0.00;FS=3.761;HaplotypeScore=3.5619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.727;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,75:161:99:1602,0,1731 chrV 194501 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;DP=161;Dels=0.00;FS=4.787;HaplotypeScore=3.5619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.923;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,75:161:99:1498,0,1729 chrV 194540 . T C 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.952;DP=195;Dels=0.00;FS=4.657;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=9.12;ReadPosRankSum=-2.525;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,94:195:99:1809,0,2131 chrV 194625 . T A 4414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4414,460,0 chrV 194646 . T G 4014.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.06;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4014,420,0 chrV 194686 . A G 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=151;Dels=0.00;FS=6.320;HaplotypeScore=68.0435;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=24.54;ReadPosRankSum=-1.386;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3706,387,0 chrV 194707 . C T 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.401;DP=161;Dels=0.00;FS=2.760;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1414,0,1287 chrV 194719 . G A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.101;DP=144;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=5.5674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.259;QD=7.83;ReadPosRankSum=2.892;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1157,0,1359 chrV 194739 . C T 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.601;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.832;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1245,0,1153 chrV 194840 . A G 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.994;DP=172;Dels=0.00;FS=1.935;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.823;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,89:172:99:1800,0,1740 chrV 194881 . C T 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.219;DP=173;Dels=0.00;FS=4.414;HaplotypeScore=4.8779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.610;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,82:173:99:1726,0,1885 chrV 194937 . G A 1893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.218;DP=174;Dels=0.00;FS=1.923;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,93:174:99:1923,0,1576 chrV 195191 . A G 1801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.190;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.625;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.027;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,85:149:99:1831,0,1289 chrV 195272 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.256;DP=154;Dels=0.00;FS=4.883;HaplotypeScore=2.1375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:154:99:1383,0,1662 chrV 195341 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.919;DP=165;Dels=0.00;FS=2.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.366;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,72:165:99:1434,0,1901 chrV 195368 . C G 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;DP=159;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.590;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,65:159:99:1146,0,1970 chrV 195425 . T C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.397;DP=143;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.350;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,57:143:99:1020,0,1895 chrV 195440 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.509;DP=146;Dels=0.00;FS=2.166;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.251;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,54:146:99:1002,0,2096 chrV 195529 . A G 5025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=1;QD=25.64;SB=-2.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:5025,508,0 chrV 195746 . A G 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3824,405,0 chrV 195765 . A G 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3499,384,0 chrV 195830 . T G 3933.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.74;SB=-2.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3933,417,0 chrV 195872 . G C 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;DP=165;Dels=0.00;FS=5.592;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1508,0,1747 chrV 195875 . T C 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.308;DP=166;Dels=0.00;FS=4.580;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,85:166:99:1622,0,1776 chrV 195975 . T C 4522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.69;SB=-2.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4522,468,0 chrV 196106 . T C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.654;DP=151;Dels=0.00;FS=7.219;HaplotypeScore=5.9031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=1;MQRankSum=-0.830;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1619,0,1468 chrV 196131 . T C 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.221;DP=154;Dels=0.00;FS=2.043;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.449;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,89:154:99:1801,0,1375 chrV 196190 . A G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.950;DP=141;Dels=0.00;FS=7.696;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.381;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1222,0,1803 chrV 196271 . C T 4170.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4207;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.90;SB=-2.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4170,409,0 chrV 196326 . A G 1894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.601;DP=189;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=4.2856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.983;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,97:189:99:1924,0,1859 chrV 196352 . T C 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=25.12;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3894,432,0 chrV 196355 . T C 4118.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=26.23;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4118,447,0 chrV 196385 . A G 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3910,417,0 chrV 196391 . G A 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3877,403,0 chrV 196478 . T C 1889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.048;DP=189;Dels=0.00;FS=9.703;HaplotypeScore=3.1507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,94:189:99:1919,0,2067 chrV 196526 . C T 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.10;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3142,327,0 chrV 196529 . A T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.573;DP=132;Dels=0.00;FS=11.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.43;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.827;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1240,0,1221 chrV 196553 . C T 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.574;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.98;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.841;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:758,0,814 chrV 196554 . T C 1929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.98;MQ0=0;QD=20.09;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:1962,219,0 chrV 196708 . G A 5107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:5107,529,0 chrV 196794 . C T 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.538;DP=184;Dels=0.00;FS=4.937;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.263;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,84:184:99:1708,0,2174 chrV 196832 . C T 4305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4305,418,0 chrV 196881 . T C 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.999;DP=137;Dels=0.00;FS=4.659;HaplotypeScore=3.3213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.656;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1149,0,1659 chrV 196983 . T C 3997.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:3997,414,0 chrV 196986 . C T 4160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4160,421,0 chrV 197102 . A T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.858;DP=148;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.464;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1421,0,1645 chrV 197103 . T C 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3812,402,0 chrV 197145 . G A 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3633,367,0 chrV 197322 . A G 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3874,402,0 chrV 197352 . T C 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3629,378,0 chrV 197415 . A G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3358,354,0 chrV 197493 . G A 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3883,388,0 chrV 197649 . T C 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.046;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,50:136:99:920,0,1889 chrV 197724 . T C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.142;DP=127;Dels=0.00;FS=12.858;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.365;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1072,0,1467 chrV 197751 . G A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.987;DP=116;Dels=0.00;FS=7.149;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.471;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1102,0,1289 chrV 197916 . C A 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3798,391,0 chrV 198077 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.336;DP=159;Dels=0.00;FS=2.816;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.122;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.291;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,71:159:99:1448,0,1935 chrV 198082 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.124;DP=152;Dels=0.00;FS=4.774;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.373;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1539,0,1718 chrV 198126 . G A 4215.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4215,412,0 chrV 198538 . T C 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.92;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3530,360,0 chrV 198629 . A G 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3422,360,0 chrV 198667 . G T 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.500;DP=148;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=3.7303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=11.53;ReadPosRankSum=-2.418;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1736,0,1394 chrV 198669 . G T 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.558;DP=147;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.578;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1432,0,1652 chrV 198865 . A G 2576 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2609,279,0 chrV 198962 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.302;DP=109;Dels=0.00;FS=1.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.277;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1270,0,1037 chrV 199099 . C T 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3385,354,0 chrV 199140 . G A 1786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.880;DP=162;Dels=0.00;FS=3.661;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1816,0,1575 chrV 199206 . G C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.510;DP=156;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=5.2796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:1428,0,1824 chrV 199231 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.663;DP=151;Dels=0.00;FS=7.130;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.619;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,66:151:99:1324,0,1810 chrV 199252 . T C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.116;DP=130;Dels=0.00;FS=6.674;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.262;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:1067,0,1702 chrV 199270 . A G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.919;DP=129;Dels=0.00;FS=3.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=7.98;ReadPosRankSum=2.161;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,53:129:99:1060,0,1667 chrV 199328 . T C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.885;DP=131;Dels=0.00;FS=3.451;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.359;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,49:131:99:952,0,1918 chrV 199354 . G A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.018;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,69:170:99:1345,0,2091 chrV 200053 . T C 2574 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=22.38;ReadPosRankSum=1.160;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2607,282,0 chrV 200350 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.011;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.716;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1433,0,1168 chrV 200737 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.035;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.802;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1472,0,1178 chrV 200759 . T G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.871;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.418;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:118:99:1303,0,1209 chrV 200851 . G A 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3555,361,0 chrV 200908 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.409;DP=119;Dels=0.00;FS=3.415;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.704;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1281,0,1245 chrV 201228 . A T 2056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;DP=168;Dels=0.00;FS=2.714;HaplotypeScore=3.6710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,92:168:99:2086,0,1589 chrV 201468 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.680;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,74:161:99:1494,0,1797 chrV 201582 . T G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.598;DP=181;Dels=0.00;FS=2.572;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.521;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,81:181:99:1514,0,2225 chrV 201726 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.699;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.232;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,60:142:99:1216,0,1732 chrV 201747 . A G 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.241;DP=141;Dels=0.00;FS=2.141;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.826;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1144,0,1778 chrV 201879 . C T 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.369;DP=142;Dels=0.00;FS=1.328;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.790;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1597,0,1441 chrV 201988 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.957;DP=128;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.187;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1405,0,1294 chrV 202172 . T A 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3279,325,0 chrV 202232 . G A 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.12;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3115,321,0 chrV 202285 . T C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.333;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.095;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1511,0,1294 chrV 202314 . T C 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.615;DP=127;Dels=0.00;FS=5.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=13.08;ReadPosRankSum=-1.957;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,76:127:99:1691,0,1045 chrV 202470 . C T 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.354;DP=152;Dels=0.00;FS=2.887;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1898,0,1385 chrV 202512 . C T 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.551;DP=169;Dels=0.00;FS=3.605;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,89:169:99:1804,0,1648 chrV 202835 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.893;DP=124;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=2.6210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1192,0,1303 chrV 202851 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.758;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=2.8265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:130:99:1420,0,1255 chrV 203211 . A G 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3316,339,0 chrV 203226 . T C 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3327,342,0 chrV 203238 . C T 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.05;SB=-2.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3783,384,0 chrV 203277 . T C 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8515;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3621,366,0 chrV 203553 . A G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.015;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.396;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1043,0,1275 chrV 203839 . A G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.566;DP=121;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.625;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1215,0,1312 chrV 203996 . A G 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3218,342,0 chrV 204069 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.119;DP=116;Dels=0.00;FS=4.523;HaplotypeScore=3.6134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1168,0,1240 chrV 204096 . A G 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.940;DP=114;Dels=0.00;FS=16.243;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.710;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1345,0,1051 chrV 204137 . G T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.055;DP=128;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=11.30;ReadPosRankSum=3.307;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1477,0,1160 chrV 204261 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.055;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.806;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1225,0,1460 chrV 204510 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.895;DP=132;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1220,0,1485 chrV 204525 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.431;DP=132;Dels=0.00;FS=4.312;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=8.56;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1160,0,1500 chrV 205014 . G A 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.673;DP=126;Dels=0.00;FS=4.631;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=1;MQRankSum=-0.027;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1469,0,1207 chrV 205045 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.325;DP=135;Dels=0.00;FS=5.570;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=-0.512;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.308;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1393,0,1495 chrV 205086 . T G 4049.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4049,414,0 chrV 206003 . C T 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.072;DP=106;Dels=0.00;FS=11.201;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1069,0,1170 chrV 206276 . T C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.780;DP=92;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.15;ReadPosRankSum=-2.749;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:964,0,966 chrV 206288 . T C 2256 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2289,228,0 chrV 206411 . G A 380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.941;DP=42;Dels=0.00;FS=1.250;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:410,0,433 chrV 206666 . G T 2554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2587,273,0 chrV 206836 . G C 2620 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=26.46;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2653,282,0 chrV 207156 . A G 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.588;DP=99;Dels=0.00;FS=10.115;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.343;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.887;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1080,0,1049 chrV 207179 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.118;DP=95;Dels=0.00;FS=5.827;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.87;MQ0=0;MQRankSum=-5.854;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.421;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:1022,0,1067 chrV 207187 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.346;DP=100;Dels=0.00;FS=0.840;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.32;MQ0=0;MQRankSum=-6.435;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:980,0,1099 chrV 207222 . C A 671.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.851;DP=94;Dels=0.00;FS=48.148;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.87;MQ0=0;MQRankSum=-8.348;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.991;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:701,0,1065 chrV 207241 . A C 538.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.444;DP=96;Dels=0.00;FS=59.718;HaplotypeScore=2.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.47;MQ0=0;MQRankSum=-8.096;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:568,0,1251 chrV 207276 . A G 401.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.669;DP=81;Dels=0.00;FS=40.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.47;MQ0=0;MQRankSum=-7.433;QD=4.95;ReadPosRankSum=-1.295;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,29:81:99:431,0,1166 chrV 207285 . A C 2126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.25;MQ0=0;QD=24.16;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2159,216,0 chrV 207299 . T C 411.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.451;DP=83;Dels=0.00;FS=29.526;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-7.280;QD=4.95;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:441,0,1313 chrV 207304 . C G 407.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;DP=83;Dels=0.00;FS=29.526;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-7.280;QD=4.90;ReadPosRankSum=-1.429;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:437,0,1263 chrV 207322 . T C 273.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.882;DP=82;Dels=0.00;FS=21.659;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.700;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:303,0,1413 chrV 207328 . C T 269.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.199;DP=64;Dels=0.00;FS=14.542;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQ0=0;MQRankSum=-6.080;QD=4.20;ReadPosRankSum=-2.447;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:299,0,1071 chrV 207338 . T C 184.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.437;DP=56;Dels=0.00;FS=19.772;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=0;MQRankSum=-5.813;QD=3.29;ReadPosRankSum=-5.232;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:214,0,930 chrV 207355 . T C 901.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.981;DP=69;Dels=0.00;FS=49.659;HaplotypeScore=6.4384;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=6.145;QD=13.07;ReadPosRankSum=4.784;SB=-3.474e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,40:69:12:934,12,0 chrV 207464 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.568;DP=111;Dels=0.00;FS=7.503;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.920;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1341,0,1000 chrV 207479 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.954;DP=100;Dels=0.00;FS=9.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=11.71;ReadPosRankSum=2.155;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1201,0,890 chrV 207516 . A G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.058;DP=92;Dels=0.00;FS=0.789;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.453;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,54:92:99:1059,0,832 chrV 207565 . T C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.699;DP=110;Dels=0.00;FS=2.595;HaplotypeScore=58.0375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.027;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:110:99:952,0,1133 chrV 207576 . G A 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.029;DP=104;Dels=0.00;FS=2.975;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=3.359;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.997;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:983,0,1270 chrV 207773 . T G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;DP=112;Dels=0.00;FS=6.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=12.78;ReadPosRankSum=-1.150;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1461,0,898 chrV 207821 . G A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.227;DP=116;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.825;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1210,0,1205 chrV 207968 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.042;DP=116;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.318;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1183,0,1167 chrV 208040 . T C 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.396;DP=106;Dels=0.00;FS=7.764;HaplotypeScore=2.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.171;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1026,0,1146 chrV 208304 . G A 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3478,345,0 chrV 208343 . C T 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3107,309,0 chrV 208366 . C A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.990;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1352,0,1192 chrV 208385 . G A 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.88;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3205,322,0 chrV 208450 . C T 2123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.54;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2156,222,0 chrV 208688 . T C 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3194,327,0 chrV 208703 . A G 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3226,330,0 chrV 208850 . C G 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.47;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3245,345,0 chrV 209069 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.254;DP=137;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.712;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1546,0,1361 chrV 209424 . A G 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;DP=132;Dels=0.00;FS=3.212;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=24.95;ReadPosRankSum=1.680;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3294,348,0 chrV 209620 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.501;DP=123;Dels=0.00;FS=6.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1335,0,1329 chrV 209836 . G A 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3236,327,0 chrV 209849 . T C 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3061,321,0 chrV 209928 . G A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.646;DP=130;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:130:99:1624,0,1015 chrV 210140 . G T 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.323;DP=110;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=5.9603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.323;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2902,267,0 chrV 210179 . G C 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3057,309,0 chrV 210347 . A G 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.96;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3855,399,0 chrV 210350 . G C 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.599;DP=134;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=4.4989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.678;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,80:134:99:1730,0,1027 chrV 210455 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.101;DP=113;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1206,0,1130 chrV 210480 . G T 2622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.96;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2655,273,0 chrV 210504 . G A 2255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2288,240,0 chrV 210614 . C A 2305 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:91:99:2338,231,0 chrV 210770 . A C 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.65;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2835,297,0 chrV 210777 . C T 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.68;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2878,288,0 chrV 210793 . T C 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3055,312,0 chrV 210827 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.559;DP=123;Dels=0.00;FS=3.356;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:123:99:963,0,1565 chrV 210833 . A G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3168,339,0 chrV 210930 . G T 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3919,376,0 chrV 210995 . G A 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3094,318,0 chrV 210996 . A G 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3061,321,0 chrV 211091 . T C 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=26.04;ReadPosRankSum=1.383;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3619,387,0 chrV 211171 . T C 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3188,327,0 chrV 211245 . T A 1891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.661;DP=166;Dels=0.00;FS=1.310;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.399;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,91:166:99:1921,0,1618 chrV 211284 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.373;DP=152;Dels=0.00;FS=4.349;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.756;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,66:152:99:1277,0,1773 chrV 211340 . A G 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3228,333,0 chrV 211386 . C T 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3344,339,0 chrV 211413 . G T 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3519,343,0 chrV 211419 . T C 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3676,372,0 chrV 211526 . A G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.136;DP=138;Dels=0.00;FS=1.349;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1391,0,1566 chrV 211559 . G A 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3099,318,0 chrV 211741 . T G 4194.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7267;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4194,435,0 chrV 211760 . G A 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3690,372,0 chrV 211770 . C A 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=48.6690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.18;MQ0=0;QD=24.59;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2910,294,0 chrV 212255 . C A 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3314,316,0 chrV 212373 . A C 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3767,399,0 chrV 212393 . G A 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3501,349,0 chrV 212430 . T C 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.73;MQ0=0;QD=25.24;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3112,333,0 chrV 212442 . C T 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=106.3340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.09;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2850,294,0 chrV 212499 . C A 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8096;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.72;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3206,327,0 chrV 212506 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.607;DP=121;Dels=0.00;FS=2.417;HaplotypeScore=2.6537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1154,0,1247 chrV 212585 . C A 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3649,355,0 chrV 212665 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.176;DP=124;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=3.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.647;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:124:99:1207,0,1281 chrV 212901 . A G 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3233,345,0 chrV 213076 . C T 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3457,343,0 chrV 213244 . G A 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.22;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2996,318,0 chrV 213423 . G A 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3331,340,0 chrV 213535 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=24.31;ReadPosRankSum=1.003;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3269,320,0 chrV 213822 . G A 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.62;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3704,385,0 chrV 213865 . T A 552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.23;MQ0=0;QD=4.60;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:63:585,63,0 chrV 213896 . T C 2147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.35;MQ0=0;QD=13.68;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:2180,231,0 chrV 214393 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.564;DP=122;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.513;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1217,0,1338 chrV 214752 . G T 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.496;DP=182;Dels=0.00;FS=0.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.315;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,89:182:99:1813,0,1990 chrV 214893 . C T 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5038;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:4021,406,0 chrV 216589 . C G 3971.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.13;SB=-2.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3971,423,0 chrV 217039 . T C 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3500,381,0 chrV 217242 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.492;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.612;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1472,0,967 chrV 217294 . T A 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;DP=126;Dels=0.00;FS=1.454;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1208,0,1467 chrV 218253 . A C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.804;DP=116;Dels=0.00;FS=10.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1317,0,1078 chrV 219873 . G A 1766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.928;DP=168;Dels=0.00;FS=2.866;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1796,0,1585 chrV 220108 . C T 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;DP=131;Dels=0.00;FS=5.324;HaplotypeScore=4.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=11.13;ReadPosRankSum=2.069;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1488,0,1226 chrV 220164 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.154;DP=151;Dels=0.00;FS=15.172;HaplotypeScore=11.9753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,62:151:99:1121,0,1892 chrV 220179 . T C 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.512;DP=144;Dels=0.00;FS=13.660;HaplotypeScore=3.4141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.955;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1579,0,1370 chrV 220674 . T G 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.353;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,81:143:99:1685,0,1289 chrV 220990 . T C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.217;DP=129;Dels=0.00;FS=4.283;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=8.95;ReadPosRankSum=-2.057;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1184,0,1293 chrV 221810 . C A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.641;DP=157;Dels=0.00;FS=6.344;HaplotypeScore=158.4748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1492,0,1639 chrV 221903 . T C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.284;DP=131;Dels=0.00;FS=8.909;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1040,0,1713 chrV 221992 . T G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.491;DP=174;Dels=0.01;FS=4.606;HaplotypeScore=9.6050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=7.67;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,71:173:99:1364,0,2141 chrV 222178 . T A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.946;DP=168;Dels=0.00;FS=5.622;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.894;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.294;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,80:168:99:1658,0,1847 chrV 222207 . A G 4644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:183:99:4644,495,0 chrV 222253 . G A 1990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.179;DP=179;Dels=0.00;FS=1.168;HaplotypeScore=2.6014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=-1.480;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.807;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,94:179:99:2020,0,1588 chrV 222592 . T A 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;DP=146;Dels=0.00;FS=4.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=0.006;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.183;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1702,0,1443 chrV 223004 . G A 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3303,336,0 chrV 223180 . A C 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;DP=129;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=2.483;QD=11.16;ReadPosRankSum=-2.065;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1470,0,1104 chrV 223618 . A G 3949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.99;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3949,408,0 chrV 223768 . A G 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.966;DP=145;Dels=0.00;FS=2.073;HaplotypeScore=2.8164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1421,0,1729 chrV 224276 . A G 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3009,321,0 chrV 225229 . C T 3482.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.75;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3482,357,0 chrV 225233 . G A 3233.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.78;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3266,330,0 chrV 225238 . G T 2836 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.92;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2869,297,0 chrV 225494 . G A 1724 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.35;MQ0=0;QD=20.52;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1757,183,0 chrV 225496 . A G 1520 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.71;MQ0=0;QD=21.71;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1553,168,0 chrV 225499 . T C 1580 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.02;MQ0=0;QD=22.25;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1613,165,0 chrV 225501 . G A 1659 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.02;MQ0=0;QD=23.37;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1692,174,0 chrV 225625 . C G 2285 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.76;MQ0=0;QD=25.39;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2318,240,0 chrV 225668 . T G 2387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.94;MQ0=0;QD=23.87;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2420,249,0 chrV 225778 . A G 544.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.266;DP=37;Dels=0.00;FS=8.656;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=14.70;ReadPosRankSum=4.224;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:46:574,0,46 chrV 225780 . G A 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;DP=37;Dels=0.00;FS=8.656;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=0.36;ReadPosRankSum=-4.087;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:43:43,0,597 chrV 225782 . T A 31.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;DP=40;Dels=0.00;FS=13.900;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.15;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=0.78;ReadPosRankSum=-4.043;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:61:61,0,638 chrV 225827 . C T 2214 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1713;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.38;MQ0=0;QD=26.05;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2247,228,0 chrV 226491 . C T 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.38;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3045,307,0 chrV 226500 . G A 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3433,343,0 chrV 226861 . C T 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.14;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3196,324,0 chrV 227640 . T C 2507 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2540,267,0 chrV 228104 . A G 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3093,327,0 chrV 228468 . A G 4343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.32;SB=-2.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4343,442,0 chrV 228601 . G A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.089;DP=148;Dels=0.00;FS=6.382;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.895;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:148:99:1375,0,1578 chrV 229119 . A G 4276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:169:99:4276,439,0 chrV 229595 . A G 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3734,387,0 chrV 229716 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.145;DP=145;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=6.6633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.047;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:145:99:1332,0,1626 chrV 229778 . C T 4079.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4079,397,0 chrV 229900 . A G 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.454;DP=164;Dels=0.00;FS=0.589;HaplotypeScore=5.0227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.661;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:1576,0,1656 chrV 230512 . A G 4371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.56;SB=-2.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4371,456,0 chrV 231027 . A T 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3492,349,0 chrV 231116 . G A 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.180;DP=143;Dels=0.00;FS=4.120;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.364;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1430,0,1589 chrV 231721 . G A 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3918,414,0 chrV 232364 . G C 4006.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.68;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4006,426,0 chrV 232580 . T C 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.296;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.122;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1017,0,1368 chrV 232869 . A T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.037;DP=139;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=2.4858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.947;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:139:99:1270,0,1733 chrV 233255 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.527;DP=127;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.181;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1172,0,1503 chrV 233356 . A G 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.377;DP=96;Dels=0.00;FS=0.828;HaplotypeScore=3.5155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:96:99:931,0,1172 chrV 233470 . G A 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.880;DP=130;Dels=0.00;FS=5.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.856;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.921;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1575,0,1168 chrV 233662 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.755;DP=110;Dels=0.00;FS=2.614;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.341;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1151,0,1198 chrV 233688 . A G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.286;DP=109;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=5.9456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.385;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:109:99:1016,0,1220 chrV 234239 . G A 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2920,288,0 chrV 234299 . T C 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2792,291,0 chrV 234408 . A G 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3417,351,0 chrV 234626 . T C 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3291,321,0 chrV 234669 . G T 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.078;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1703,0,1276 chrV 234749 . G A 4144.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4144,403,0 chrV 234931 . G A 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3419,334,0 chrV 235302 . T C 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3420,351,0 chrV 235505 . C T 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3851,376,0 chrV 235773 . A G 4128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4128,459,0 chrV 236202 . A G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.167;DP=109;Dels=0.00;FS=4.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=2.312;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1154,0,1182 chrV 236637 . G A 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.947;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1156,0,1032 chrV 236672 . G A 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.466;DP=113;Dels=0.00;FS=2.441;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.198;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1164,0,1225 chrV 237439 . A G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.828;DP=116;Dels=0.00;FS=3.409;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.445;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:116:99:1185,0,1217 chrV 237481 . G C 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3187,333,0 chrV 238031 . G A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.191;DP=106;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=3.0633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.814;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1304,0,937 chrV 238084 . C T 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.452;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1668,0,1345 chrV 238313 . G A 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.71;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3491,358,0 chrV 238917 . T A 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3391,345,0 chrV 239206 . T C 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2947,315,0 chrV 239875 . A G 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3009,321,0 chrV 240029 . C G 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3154,336,0 chrV 240035 . T C 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3375,357,0 chrV 240100 . T G 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3642,384,0 chrV 240112 . G C 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3295,345,0 chrV 240135 . C A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.183;DP=138;Dels=0.00;FS=1.566;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.471;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1507,0,1429 chrV 240310 . C T 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.904;DP=123;Dels=0.00;FS=1.774;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.202;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1259,0,1167 chrV 240371 . G T 4657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7139;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:178:99:4657,466,0 chrV 240446 . G A 4139.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.64;SB=-2.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4139,412,0 chrV 240598 . C T 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3095,310,0 chrV 240731 . G A 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3309,340,0 chrV 241047 . A G 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3200,333,0 chrV 241059 . G A 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3427,351,0 chrV 241084 . G A 2740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=22.83;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2773,273,0 chrV 241109 . G A 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3427,334,0 chrV 241166 . A G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.959;DP=119;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.591;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1072,0,1442 chrV 241256 . A G 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3154,327,0 chrV 241358 . G A 3755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3755,376,0 chrV 241371 . A G 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3480,363,0 chrV 241573 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;DP=143;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=11.3193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.882;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.870;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,61:143:99:1175,0,1606 chrV 241688 . T A 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3391,351,0 chrV 241698 . C T 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=115.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3514,358,0 chrV 241759 . C T 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3034,307,0 chrV 241799 . C A 2431 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=27.62;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2464,252,0 chrV 241800 . C G 2386 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=27.11;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2419,252,0 chrV 241849 . G A 1631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.009;DP=91;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.618;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:1664,149,0 chrV 241868 . T A 1978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=185.5696;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.97;MQ0=0;QD=18.66;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2011,207,0 chrV 241873 . T A 1910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.232;DP=104;Dels=0.00;FS=5.399;HaplotypeScore=479.4110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.55;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.633;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:1943,179,0 chrV 241909 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.321;DP=124;Dels=0.00;FS=0.999;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.295;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1216,0,1384 chrV 241980 . G A 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3662,372,0 chrV 242043 . A G 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;QD=22.98;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3493,360,0 chrV 242159 . T C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.861;DP=131;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=4.9648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1375,0,1347 chrV 242167 . G A 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3513,352,0 chrV 242244 . C T 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.647;DP=126;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.025;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:967,0,1497 chrV 242286 . G T 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3554,364,0 chrV 242361 . C T 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4003,415,0 chrV 242413 . T C 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3519,372,0 chrV 242456 . A G 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.37;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3699,378,0 chrV 242461 . T A 4222.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.33;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:4222,418,0 chrV 242472 . T C 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3932,402,0 chrV 242693 . G A 106.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=0.89;SB=-9.911e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:18:139,18,0 chrV 242752 . A G 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3309,354,0 chrV 242945 . C T 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2700,276,0 chrV 243107 . C T 2823 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2856,280,0 chrV 243157 . A C 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3194,333,0 chrV 243299 . T C 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3636,366,0 chrV 243350 . A G 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3763;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3541,366,0 chrV 243372 . A G 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3339,351,0 chrV 243452 . G A 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3602,361,0 chrV 243656 . C A 506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.16;MQ0=0;QD=3.98;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:60:539,60,0 chrV 243665 . G A 460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.53;MQ0=0;QD=2.87;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:51:493,51,0 chrV 243686 . G A 137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;DP=122;Dels=0.00;FS=320.888;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=1.12;ReadPosRankSum=-8.290;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,39:122:99:167,0,289 chrV 243707 . A G 314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.085;DP=93;Dels=0.00;FS=1.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=3.38;ReadPosRankSum=-1.887;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:344,0,566 chrV 243719 . G T 1529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.39;MQ0=0;QD=18.65;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1562,168,0 chrV 243816 . A G 2025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.94;MQ0=0;QD=22.75;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2058,222,0 chrV 243825 . T C 2122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.04;MQ0=0;QD=22.34;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2155,231,0 chrV 243828 . G A 2335 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.38;MQ0=0;QD=22.67;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2368,240,0 chrV 243885 . G A 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6398;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3206,336,0 chrV 243892 . A T 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3469,358,0 chrV 243981 . G A 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3661,369,0 chrV 244092 . A T 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.78;MQ0=0;QD=25.61;SB=-2.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3995,394,0 chrV 244113 . G A 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.70;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3431,331,0 chrV 244116 . T C 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.30;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3606,357,0 chrV 244404 . T G 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3311,351,0 chrV 244512 . G T 4107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4107,412,0 chrV 244596 . T C 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3707,387,0 chrV 244650 . C T 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3056,306,0 chrV 245552 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.837;DP=128;Dels=0.00;FS=3.366;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1514,0,1211 chrV 245593 . G C 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.12;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3343,360,0 chrV 245855 . G C 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3594,387,0 chrV 245951 . C G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.759;DP=129;Dels=0.00;FS=4.201;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=10.81;ReadPosRankSum=-2.043;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1425,0,1296 chrV 246143 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.559;DP=134;Dels=0.00;FS=17.374;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1380,0,1444 chrV 246194 . T C 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3503,357,0 chrV 246195 . C T 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3563,360,0 chrV 246282 . G A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.190;DP=118;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.584;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1123,0,1410 chrV 246498 . A C 2611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.11;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2644,276,0 chrV 246542 . C G 2477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2510,261,0 chrV 246588 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2922,300,0 chrV 246604 . T C 2603 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2636,261,0 chrV 246716 . C T 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3671,364,0 chrV 246845 . G C 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.17;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3152,327,0 chrV 247147 . G A 2552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=26.58;ReadPosRankSum=1.588;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2585,252,0 chrV 247282 . T C 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3574,372,0 chrV 247354 . G A 3892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3892,397,0 chrV 247516 . G A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.246;DP=99;Dels=0.00;FS=1.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1097,0,996 chrV 248286 . A G 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7478;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=1.337;QD=24.49;ReadPosRankSum=1.216;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2825,297,0 chrV 248414 . A G 179.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.162;DP=78;Dels=0.00;FS=4.528;HaplotypeScore=54.4866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.94;MQ0=0;MQRankSum=4.231;QD=2.29;ReadPosRankSum=-2.971;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,12:78:99:209,0,113 chrV 248415 . A C 113.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.485;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=54.4866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.13;MQ0=0;MQRankSum=2.685;QD=1.49;ReadPosRankSum=-2.556;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,9:76:99:143,0,152 chrV 248691 . T G 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8706;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=24.97;ReadPosRankSum=-1.208;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3004,290,0 chrV 248794 . G A 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.454;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,77:134:99:1641,0,1170 chrV 248822 . A G 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.657;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=26.82;ReadPosRankSum=1.259;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3728,372,0 chrV 248843 . A G 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3669,381,0 chrV 248941 . A G 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2526,261,0 chrV 248998 . T C 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2625,270,0 chrV 249123 . G A 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3141,304,0 chrV 249376 . A G 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3118,336,0 chrV 249511 . T C 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2886,300,0 chrV 249543 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.876;DP=117;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.561;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1311,0,1121 chrV 249550 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.209;DP=118;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.986;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1352,0,1135 chrV 249613 . C T 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.03;MQ0=0;QD=26.20;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3328,342,0 chrV 249616 . T A 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=26.63;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3302,328,0 chrV 249629 . C T 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=26.56;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2822,285,0 chrV 249705 . C A 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.59;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2602,276,0 chrV 249834 . T A 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.62;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2775,282,0 chrV 249909 . A C 304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.258;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.680;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:334,0,484 chrV 249919 . G C 824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.65;MQ0=0;QD=17.17;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:96:857,96,0 chrV 250205 . C A 84.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.54;MQ0=0;QD=14.16;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:117,9,0 chrV 250231 . C G 112.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.54;MQ0=0;QD=18.75;SB=-8.255e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:145,12,0 chrV 250253 . T C 96.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.54;MQ0=0;QD=19.30;SB=-5.355e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:129,12,0 chrV 250453 . C T 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.187;DP=109;Dels=0.00;FS=3.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.670;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1215,0,1114 chrV 250455 . A T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.376;DP=107;Dels=0.00;FS=3.550;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1136,0,1187 chrV 250528 . C A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.899;DP=109;Dels=0.00;FS=8.969;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.113;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1109,0,1103 chrV 250573 . G A 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2685,267,0 chrV 250605 . T C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2967,306,0 chrV 250625 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.447;DP=100;Dels=0.01;FS=1.652;HaplotypeScore=6.5905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=1;MQRankSum=0.870;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.784;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1216,0,945 chrV 250852 . G T 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;DP=106;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.185;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1099,0,1120 chrV 251006 . C G 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2837,291,0 chrV 251267 . C T 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3444,348,0 chrV 251279 . A G 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.656;DP=134;Dels=0.00;FS=4.400;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.816;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,53:134:99:919,0,1830 chrV 251309 . G A 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.211;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.242;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2966,285,0 chrV 251322 . C T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.550;DP=124;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=2.737;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,51:124:99:1002,0,1568 chrV 251651 . C T 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2857,283,0 chrV 251721 . G A 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.80;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3142,310,0 chrV 251925 . T A 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.975e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3657,384,0 chrV 252072 . G A 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2482,252,0 chrV 252103 . C A 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2861,291,0 chrV 252647 . A C 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.29;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2557,258,0 chrV 254274 . T A 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3186,312,0 chrV 254379 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.680;DP=117;Dels=0.00;FS=4.511;HaplotypeScore=2.5677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.409;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:897,0,1430 chrV 254391 . G A 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3421,340,0 chrV 255026 . A G 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.694;DP=94;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=8.8464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=1.996;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:954,0,1024 chrV 255332 . C T 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=126;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=2.7412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1536,0,1173 chrV 255344 . G A 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3451,346,0 chrV 255489 . G A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.010;DP=128;Dels=0.00;FS=6.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.112;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1597,0,1184 chrV 256159 . T C 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.75;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3425,351,0 chrV 256289 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.345;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.399;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.919;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:131:99:1064,0,1696 chrV 256376 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.299;DP=121;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=3.3098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1225,0,1190 chrV 256632 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.006;DP=118;Dels=0.00;FS=10.875;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.165;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1314,0,1225 chrV 256810 . A G 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2900,300,0 chrV 256999 . A G 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.609;DP=111;Dels=0.00;FS=2.441;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.286;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1095,0,1218 chrV 258361 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.595;DP=111;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1265,0,1039 chrV 258489 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.466;DP=110;Dels=0.00;FS=1.532;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=10.55;ReadPosRankSum=-2.391;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1191,0,1176 chrV 258531 . G T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.620;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.407;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1190,0,1098 chrV 258552 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.807;DP=96;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.141;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,55:96:99:1192,0,900 chrV 258579 . G A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.643;DP=95;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:1023,0,1013 chrV 258666 . G A 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3428,346,0 chrV 259303 . A G 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.739;DP=181;Dels=0.00;FS=3.432;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,85:181:99:1644,0,2110 chrV 259415 . C G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=1;MQRankSum=2.393;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1425,0,1576 chrV 259466 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=160;Dels=0.00;FS=2.806;HaplotypeScore=4.7973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.754;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1356,0,1713 chrV 259641 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.943;DP=157;Dels=0.00;FS=10.143;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.112;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,63:157:99:1165,0,2015 chrV 259696 . T G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.185;DP=104;Dels=0.00;FS=4.907;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:988,0,1249 chrV 259719 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.684;DP=130;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1298,0,1275 chrV 259740 . C T 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.144;DP=133;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=109.2634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=10.21;ReadPosRankSum=2.044;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1388,0,1303 chrV 259762 . T A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.632;DP=116;Dels=0.00;FS=3.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.438;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1330,0,1103 chrV 259785 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.564;DP=111;Dels=0.00;FS=2.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=11.57;ReadPosRankSum=-2.254;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1314,0,1006 chrV 260054 . A G 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.768;DP=94;Dels=0.00;FS=3.933;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.52;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.050;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,40:94:99:696,0,1053 chrV 260078 . T C 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3163,321,0 chrV 260094 . C T 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.265;DP=128;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=3.4539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.019;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1534,0,1157 chrV 260120 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.608;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=11.53;ReadPosRankSum=-2.077;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1218,0,941 chrV 260269 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.120;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1180,0,1074 chrV 260327 . A G 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.636;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:1006,0,1018 chrV 260511 . C T 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=28.06;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3395,337,0 chrV 260905 . C T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.172;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=13.98;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,67:109:99:1554,0,804 chrV 261125 . T G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.407;DP=124;Dels=0.00;FS=3.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1067,0,1548 chrV 261193 . A T 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3054,298,0 chrV 261299 . C T 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3288,336,0 chrV 261315 . T C 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.458;DP=136;Dels=0.00;FS=6.520;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.432;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1453,0,1299 chrV 261338 . T A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.884;DP=127;Dels=0.00;FS=3.488;HaplotypeScore=4.9112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.229;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1243,0,1006 chrV 261345 . A C 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.32;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3069,318,0 chrV 261462 . T A 2754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8928;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=20.86;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2787,288,0 chrV 261487 . T A 484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.134;DP=138;Dels=0.00;FS=358.667;HaplotypeScore=2.6015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=3.260;QD=3.51;ReadPosRankSum=-8.680;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:514,0,554 chrV 261489 . T A 160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.273;DP=111;Dels=0.00;FS=255.680;HaplotypeScore=2.6015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQ0=0;MQRankSum=2.321;QD=1.44;ReadPosRankSum=-7.898;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:190,0,567 chrV 261787 . G A 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=27.15;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4045,415,0 chrV 261846 . T C 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.457;DP=142;Dels=0.01;FS=7.457;HaplotypeScore=5.6723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.565;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,81:141:99:1682,0,1279 chrV 261965 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.738;DP=108;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=9.49;ReadPosRankSum=2.394;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1055,0,1270 chrV 262023 . A G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.651;DP=130;Dels=0.00;FS=4.202;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.863;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1209,0,1367 chrV 262033 . T A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.072;DP=136;Dels=0.00;FS=2.160;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.722;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1248,0,1563 chrV 262042 . C T 3835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7142;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.27;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3835,373,0 chrV 262066 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.536;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.491;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1420,0,1235 chrV 262133 . G A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.433;DP=148;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.302;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1616,0,1605 chrV 262212 . A G 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.684;DP=144;Dels=0.00;FS=3.133;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=25.43;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3662,363,0 chrV 262352 . G T 4405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.89;SB=-2.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4405,430,0 chrV 262462 . A T 4739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4739,475,0 chrV 262797 . T C 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3758,381,0 chrV 263456 . C T 2699 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2732,279,0 chrV 263549 . T C 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2776,291,0 chrV 263652 . T C 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3180,312,0 chrV 265533 . T C 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2798,297,0 chrV 265623 . C T 4023.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4023,400,0 chrV 265690 . A G 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3187,342,0 chrV 265875 . C T 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.488;DP=112;Dels=0.00;FS=2.707;HaplotypeScore=5.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.840;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.339;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:985,0,1271 chrV 265876 . G A 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.31;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2690,279,0 chrV 265937 . T C 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2951,312,0 chrV 266124 . T A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.114;DP=112;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.335;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1322,0,1112 chrV 266261 . T A 1994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.275;DP=125;Dels=0.00;FS=42.719;HaplotypeScore=18.2933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=15.95;ReadPosRankSum=2.711;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,110:125:99:2027,148,0 chrV 266375 . A G 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3695,384,0 chrV 266605 . A G 954.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.573;DP=114;Dels=0.00;FS=2.361;HaplotypeScore=2.3235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.76;MQ0=0;MQRankSum=-8.108;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:984,0,1265 chrV 266608 . T G 851.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.724;DP=109;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=2.3235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.92;MQ0=0;MQRankSum=-8.268;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:881,0,1289 chrV 266610 . T C 832.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.396;DP=106;Dels=0.00;FS=2.468;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.81;MQ0=0;MQRankSum=-8.212;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:862,0,1259 chrV 266611 . A T 877.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.334;DP=106;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.81;MQ0=0;MQRankSum=-8.289;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.556;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:106:99:907,0,1154 chrV 266614 . A G 817.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.527;DP=105;Dels=0.00;FS=4.823;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.13;MQ0=0;MQRankSum=-8.803;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:847,0,1214 chrV 266617 . T C 846.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.892;DP=108;Dels=0.00;FS=7.374;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.21;MQ0=0;MQRankSum=-8.929;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:876,0,1254 chrV 266620 . G A 889.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.811;DP=106;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.93;MQ0=0;MQRankSum=-8.574;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.606;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:919,0,1164 chrV 266625 . C T 700.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.632;DP=103;Dels=0.00;FS=4.947;HaplotypeScore=2.3070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.53;MQ0=0;MQRankSum=-8.625;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:103:99:730,0,1253 chrV 266626 . A G 673.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.464;DP=103;Dels=0.00;FS=4.845;HaplotypeScore=2.3070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.53;MQ0=0;MQRankSum=-8.557;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:703,0,1320 chrV 266629 . T C 702.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.390;DP=108;Dels=0.00;FS=4.779;HaplotypeScore=3.0957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.01;MQ0=0;MQRankSum=-8.900;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:732,0,1357 chrV 266632 . A G 671.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.472;DP=109;Dels=0.00;FS=6.079;HaplotypeScore=3.0957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQ0=0;MQRankSum=-8.906;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:109:99:701,0,1345 chrV 266644 . G A 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.129;DP=122;Dels=0.00;FS=11.872;HaplotypeScore=2.3696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-7.602;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.652;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,47:122:99:699,0,1649 chrV 266650 . A G 629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.658;DP=125;Dels=0.00;FS=16.007;HaplotypeScore=2.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQ0=0;MQRankSum=-6.765;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.108;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,46:125:99:659,0,1814 chrV 266854 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.220;DP=145;Dels=0.00;FS=8.869;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.077;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1473,0,1562 chrV 266991 . T C 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.840;DP=147;Dels=0.00;FS=5.220;HaplotypeScore=5.9547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=6.39;ReadPosRankSum=-1.926;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,52:147:99:969,0,2148 chrV 267133 . A G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.670;DP=119;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.746;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1344,0,1117 chrV 267136 . A C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.411;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=2.591;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.895;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1221,0,1190 chrV 267318 . T C 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3481,366,0 chrV 267350 . C T 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.214;DP=136;Dels=0.00;FS=9.223;HaplotypeScore=2.7739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1616,0,1201 chrV 267518 . A T 1319.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;DP=129;Dels=0.00;FS=5.388;HaplotypeScore=2.7772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.774;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.610;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1349,0,1317 chrV 267519 . C T 1330.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.193;DP=128;Dels=0.00;FS=6.635;HaplotypeScore=2.7772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.425;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1360,0,1197 chrV 267523 . G C 1269.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;DP=138;Dels=0.00;FS=9.114;HaplotypeScore=2.7772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.988;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1299,0,1238 chrV 267526 . G A 1301.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.602;DP=133;Dels=0.00;FS=10.960;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,77:133:99:1331,0,1075 chrV 267673 . G A 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3208,330,0 chrV 267773 . A T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.077;DP=148;Dels=0.00;FS=6.423;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1444,0,1778 chrV 268219 . G A 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.736;DP=115;Dels=0.00;FS=7.280;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.084;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.150;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1101,0,1244 chrV 268231 . C T 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3014,297,0 chrV 268451 . A C 2144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.80;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2177,231,0 chrV 268713 . C T 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.49;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2913,297,0 chrV 268771 . A T 2259 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.64;MQ0=0;QD=27.55;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2292,234,0 chrV 268978 . G T 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3195,316,0 chrV 269034 . A C 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3118,315,0 chrV 269057 . A G 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2987,294,0 chrV 269239 . T C 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5072;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2743,288,0 chrV 269894 . T C 2474 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=25.77;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2507,273,0 chrV 269910 . G T 2332 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.51;MQ0=0;QD=26.50;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2365,246,0 chrV 269950 . T C 2472 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.46;MQ0=0;QD=24.24;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2505,273,0 chrV 270049 . A T 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3053,309,0 chrV 270213 . A T 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3902,400,0 chrV 270233 . T C 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3363,360,0 chrV 270466 . C A 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3435,334,0 chrV 270473 . T C 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3159,330,0 chrV 271135 . T A 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2928,297,0 chrV 271156 . G A 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2852,288,0 chrV 271177 . C T 2383 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2416,243,0 chrV 271202 . T C 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2657,267,0 chrV 271319 . T C 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=24.99;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2482,270,0 chrV 271332 . A G 2009 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=86;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=4.8403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.611;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:2042,225,0 chrV 271333 . T A 2021 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.83;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:86:99:2054,225,0 chrV 271334 . T C 2035 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.19;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2068,228,0 chrV 271367 . G A 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.30;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=25.00;ReadPosRankSum=1.408;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2708,270,0 chrV 271374 . G A 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.96;MQ0=0;QD=24.25;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2749,276,0 chrV 271409 . G A 2816 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0711;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.32;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2849,285,0 chrV 271715 . C T 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.001;DP=111;Dels=0.00;FS=1.614;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.464;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:111:99:999,0,1197 chrV 271934 . T C 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2899,297,0 chrV 272025 . C T 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2868,294,0 chrV 272076 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.785;DP=128;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=3.612;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.132;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1482,0,1204 chrV 272169 . T C 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3844,391,0 chrV 272259 . T C 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3067,321,0 chrV 272511 . C T 2894 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.77;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2927,303,0 chrV 272517 . T C 2693 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.61;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2726,285,0 chrV 272521 . G A 2814 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.77;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2847,294,0 chrV 273196 . A G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.812;DP=107;Dels=0.00;FS=2.545;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.194;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.474;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:934,0,1307 chrV 273450 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.987;DP=116;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.955;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1275,0,1218 chrV 273721 . T A 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3599,361,0 chrV 274385 . C T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.372;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.579;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,83:167:99:1443,0,1339 chrV 274390 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.000;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,85:168:99:1354,0,1451 chrV 276619 . G T 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3518,354,0 chrV 276799 . A C 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=23.09;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3243,339,0 chrV 277822 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.308;DP=126;Dels=0.00;FS=4.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-4.511;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.823;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1066,0,1254 chrV 277840 . T C 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.243;DP=134;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.64;MQ0=0;MQRankSum=-5.269;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.655;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1103,0,1487 chrV 277849 . C T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.989;DP=131;Dels=0.00;FS=4.147;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.22;MQ0=0;MQRankSum=-3.154;QD=8.23;ReadPosRankSum=2.005;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1108,0,1437 chrV 277852 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.742;DP=131;Dels=0.00;FS=3.134;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=-3.639;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.943;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1113,0,1492 chrV 278705 . T G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.045;DP=150;Dels=0.00;FS=2.059;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1339,0,1787 chrV 280130 . C T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;DP=124;Dels=0.00;FS=3.473;HaplotypeScore=5.7525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1312,0,1192 chrV 281019 . G C 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;DP=158;Dels=0.00;FS=7.088;HaplotypeScore=2.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.016;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1718,0,1430 chrV 281160 . G A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.318;DP=149;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=3.5296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=1;MQRankSum=0.477;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.105;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1474,0,1539 chrV 281517 . T G 1830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;DP=175;Dels=0.00;FS=6.488;HaplotypeScore=3.6408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=2.065;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.202;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,95:175:99:1860,0,1586 chrV 282578 . G T 2048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.987;DP=163;Dels=0.00;FS=3.723;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,94:163:99:2078,0,1394 chrV 282737 . A C 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.442;DP=158;Dels=0.00;FS=3.726;HaplotypeScore=4.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=9.88;ReadPosRankSum=2.356;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,78:158:99:1591,0,1664 chrV 282873 . C G 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;DP=151;Dels=0.00;FS=6.032;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.794;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.270;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1623,0,1475 chrV 283424 . T C 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3644,375,0 chrV 283533 . T G 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3024,321,0 chrV 283675 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.075;DP=132;Dels=0.00;FS=2.212;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.497;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1546,0,1254 chrV 283814 . T A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.985;DP=131;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=2.8033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.118;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1449,0,1302 chrV 283875 . A G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;DP=124;Dels=0.00;FS=2.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.454;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1116,0,1491 chrV 284403 . A G 62.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=104;Dels=0.01;FS=1.104;HaplotypeScore=316.4687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.58;MQ0=1;MQRankSum=3.887;QD=0.60;ReadPosRankSum=-3.945;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,22:103:92:92,0,654 chrV 285116 . A G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.572;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=7.69;ReadPosRankSum=2.125;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,57:140:99:1106,0,1800 chrV 286762 . G A 4588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.67;SB=-2.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4588,457,0 chrV 286768 . A G 1885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.278;DP=166;Dels=0.00;FS=1.220;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.201;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,90:166:99:1915,0,1596 chrV 286902 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.477;DP=111;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=8.92;ReadPosRankSum=-2.066;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1020,0,1234 chrV 287475 . G A 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.879;DP=146;Dels=0.00;FS=8.495;HaplotypeScore=4.8359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.398;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1700,0,1306 chrV 287484 . A G 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.593;DP=140;Dels=0.00;FS=7.469;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.155;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1502,0,1303 chrV 287597 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.026;DP=151;Dels=0.00;FS=3.958;HaplotypeScore=57.2867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,62:151:99:1233,0,1942 chrV 287674 . G A 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.173;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.839;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,39:106:99:779,0,1482 chrV 288745 . A G 2214 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.51;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2247,228,0 chrV 288912 . C T 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.210;DP=134;Dels=0.00;FS=12.865;HaplotypeScore=9.5919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=12.60;ReadPosRankSum=-2.429;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,78:134:99:1719,0,1096 chrV 288966 . A C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.342;DP=153;Dels=0.00;FS=4.100;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.743;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1255,0,1838 chrV 289034 . G A 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=1;QD=27.04;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3732,388,0 chrV 289087 . C G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.359;DP=135;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1353,0,1389 chrV 289889 . G A 1107.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.677;DP=132;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=3.8065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQ0=7;MQRankSum=-4.932;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1137,0,1471 chrV 290339 . C T 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.566;DP=117;Dels=0.00;FS=2.544;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,43:117:99:818,0,1598 chrV 290577 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.716;DP=132;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.203;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1533,0,1223 chrV 290603 . A G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.115;DP=167;Dels=0.00;FS=2.764;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.148;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,73:167:99:1341,0,2036 chrV 290645 . T A 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.627;DP=142;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1651,0,1401 chrV 291008 . T C 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.965;DP=150;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,84:150:99:1740,0,1369 chrV 291014 . C A 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.559;DP=154;Dels=0.00;FS=2.024;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.864;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1744,0,1432 chrV 291022 . T G 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.608;DP=177;Dels=0.00;FS=1.183;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.038;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,93:177:99:1851,0,1774 chrV 291268 . C A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.259;DP=143;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=9.45;ReadPosRankSum=-2.079;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1382,0,1577 chrV 291713 . A G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.105;DP=132;Dels=0.00;FS=3.681;HaplotypeScore=4.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.546;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1341,0,1203 chrV 291865 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.419;DP=108;Dels=0.00;FS=2.541;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1143,0,1157 chrV 291891 . T A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.992;DP=112;Dels=0.00;FS=4.922;HaplotypeScore=3.9732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.482;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1229,0,1149 chrV 291989 . C T 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.688;DP=111;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.204;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1196,0,1066 chrV 292227 . C T 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.525;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.222;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:1001,0,1197 chrV 292245 . C T 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.322;DP=118;Dels=0.00;FS=5.865;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:888,0,1491 chrV 292416 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.058;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.168;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1181,0,1290 chrV 292624 . T C 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.250;DP=158;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=6.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.296;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,85:158:99:1872,0,1552 chrV 293091 . C T 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.213;DP=142;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.153;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1583,0,1379 chrV 293301 . G A 2600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2633,267,0 chrV 293965 . A C 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.898;DP=148;Dels=0.00;FS=7.346;HaplotypeScore=3.4260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1485,0,1553 chrV 294112 . A G 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.909e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3607,366,0 chrV 294285 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.518;DP=149;Dels=0.00;FS=2.911;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1381,0,1707 chrV 294584 . A T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.883;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.269;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1382,0,1815 chrV 294669 . C T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.002;DP=147;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=3.8917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.696;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1291,0,1559 chrV 294714 . T G 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3455,360,0 chrV 295532 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.795;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.725;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.210;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:977,0,1716 chrV 296561 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.929;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.279;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1180,0,1398 chrV 297070 . A G 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.490;DP=135;Dels=0.00;FS=1.447;HaplotypeScore=5.6362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1354,0,1481 chrV 297150 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.087;DP=116;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=3.2169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1208,0,1198 chrV 298190 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.462;DP=119;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1386,0,1166 chrV 298225 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.595;DP=114;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.032;QD=9.32;ReadPosRankSum=2.134;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1093,0,1298 chrV 298538 . T C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.128;DP=131;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.192;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1092,0,1582 chrV 298743 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.360;DP=119;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1272,0,1161 chrV 298831 . A G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.701;DP=114;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.674;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1348,0,1101 chrV 298897 . A C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.621;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.830;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1299,0,1434 chrV 299078 . C T 1859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.463;DP=148;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,84:148:99:1889,0,1191 chrV 299183 . G T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.233;DP=146;Dels=0.00;FS=5.076;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=1;MQRankSum=2.462;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.151;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1427,0,1552 chrV 299186 . C T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.267;DP=148;Dels=0.00;FS=3.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.981;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1446,0,1625 chrV 299219 . C T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.080;DP=147;Dels=0.00;FS=6.196;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:147:99:1437,0,1595 chrV 299237 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.165;DP=145;Dels=0.00;FS=5.212;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.769;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1308,0,1698 chrV 299795 . T C 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.466;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.200;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:774,0,1073 chrV 299873 . A C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;DP=108;Dels=0.00;FS=7.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:956,0,1336 chrV 300738 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.197;DP=164;Dels=0.00;FS=6.861;HaplotypeScore=3.5314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.902;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,70:164:99:1376,0,1943 chrV 300974 . C T 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.824;DP=163;Dels=0.00;FS=0.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,88:163:99:1865,0,1457 chrV 301091 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.571;DP=146;Dels=0.00;FS=3.911;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1400,0,1524 chrV 301211 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.071;DP=141;Dels=0.00;FS=1.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=7.71;ReadPosRankSum=-2.800;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,56:141:99:1117,0,1965 chrV 301292 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.432;DP=123;Dels=0.00;FS=11.454;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1082,0,1460 chrV 301376 . G C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;DP=126;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=2.6023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:126:99:1003,0,1426 chrV 301562 . G A 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.175;DP=166;Dels=0.00;FS=1.948;HaplotypeScore=4.6310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=10.19;ReadPosRankSum=3.338;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,93:166:99:1721,0,1525 chrV 301830 . G C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.742;DP=138;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1393,0,1458 chrV 301864 . C T 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.679;DP=125;Dels=0.00;FS=2.294;HaplotypeScore=2.9266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=2.150;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.311;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1091,0,1560 chrV 301867 . C A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.063;DP=126;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=2.9266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.117;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1142,0,1526 chrV 301899 . C T 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.520;DP=124;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.845;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1182,0,1493 chrV 301990 . T C 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.764;DP=138;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=3.7105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1333,0,1646 chrV 302064 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.302;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1343,0,1486 chrV 302655 . T C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.403;DP=137;Dels=0.00;FS=9.057;HaplotypeScore=6.7991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1244,0,1592 chrV 303277 . T A 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.036;DP=102;Dels=0.00;FS=5.579;HaplotypeScore=4.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:102:99:825,0,1293 chrV 303521 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.561;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1117,0,964 chrV 306159 . G A 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.455;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=13.06;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,82:136:99:1806,0,1055 chrV 308135 . G A 2861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.42;MQ0=0;QD=28.05;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2894,294,0 chrV 309522 . G A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.989;DP=132;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.123;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1301,0,1538 chrV 310081 . T A 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;DP=88;Dels=0.00;FS=1.849;HaplotypeScore=3.2834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.316;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:801,0,1087 chrV 310175 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.110;DP=113;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=4.4127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.515;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:113:99:1331,0,1046 chrV 310592 . A G 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.629;DP=139;Dels=0.00;FS=6.619;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=1;MQRankSum=-1.916;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1531,0,1398 chrV 311316 . A G 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.561;DP=131;Dels=0.00;FS=3.151;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1242,0,1610 chrV 311515 . T C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.303;DP=125;Dels=0.00;FS=4.517;HaplotypeScore=2.9369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=9.00;ReadPosRankSum=2.490;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1155,0,1517 chrV 311528 . A C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.874;DP=125;Dels=0.00;FS=5.785;HaplotypeScore=3.9732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.181;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1201,0,1473 chrV 311837 . A G 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.834;DP=135;Dels=0.00;FS=3.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.856;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1666,0,1233 chrV 311861 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.808;DP=134;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=9.54;ReadPosRankSum=2.541;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1309,0,1525 chrV 312465 . A G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.674;DP=140;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.172;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1561,0,1456 chrV 312677 . G A 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.429;DP=148;Dels=0.00;FS=4.881;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.731;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1577,0,1610 chrV 313206 . C A 1741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.192;DP=177;Dels=0.00;FS=3.733;HaplotypeScore=6.8983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.084;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,83:177:99:1771,0,1958 chrV 314449 . T C 1887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.213;DP=171;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,92:171:99:1917,0,1792 chrV 314857 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.975;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.162;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1067,0,1268 chrV 315976 . T A 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=28.22;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3273,331,0 chrV 315982 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.142;DP=112;Dels=0.00;FS=5.451;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1274,0,1125 chrV 316003 . C T 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.686;DP=91;Dels=0.00;FS=3.182;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:919,0,1041 chrV 316010 . G A 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.853;DP=84;Dels=0.00;FS=2.041;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:852,0,898 chrV 316022 . A G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.547;DP=106;Dels=0.00;FS=1.688;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.834;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1023,0,1100 chrV 316091 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.265;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.883;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1365,0,1469 chrV 316175 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.727;DP=112;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.470;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1261,0,1158 chrV 316219 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.292;DP=119;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1232,0,1276 chrV 316222 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.333;DP=118;Dels=0.00;FS=1.505;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.011;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1286,0,1234 chrV 316681 . G C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.571;DP=123;Dels=0.00;FS=6.029;HaplotypeScore=7.5153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=-0.839;QD=9.06;ReadPosRankSum=-2.064;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:123:99:1144,0,1267 chrV 317040 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.146;DP=131;Dels=0.00;FS=11.125;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.229;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1210,0,1609 chrV 317359 . A G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.172;DP=120;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1044,0,1375 chrV 317416 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.752;DP=115;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=2.3479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.031;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1187,0,1157 chrV 317554 . C G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.591;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1268,0,1107 chrV 317740 . G C,T 2662.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.33;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,52,60:112:99:2722,1478,1331,1244,0,1081 chrV 317773 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.197;DP=115;Dels=0.00;FS=4.551;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.434;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1176,0,1238 chrV 317776 . A C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.676;DP=123;Dels=0.00;FS=4.404;HaplotypeScore=4.7020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1350,0,1237 chrV 318281 . T C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.600;DP=132;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.671;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1124,0,1622 chrV 318309 . T C 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.315;DP=115;Dels=0.00;FS=2.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.811;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,47:115:99:842,0,1487 chrV 318318 . G T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.525;DP=106;Dels=0.00;FS=6.195;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:106:99:1326,0,894 chrV 318336 . G T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.564;DP=103;Dels=0.00;FS=7.966;HaplotypeScore=2.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.249;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:990,0,1235 chrV 318778 . T C 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.692;DP=98;Dels=0.00;FS=5.250;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.908;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:919,0,1101 chrV 319971 . G A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.985;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.912;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1503,0,1843 chrV 320053 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.160;DP=95;Dels=0.00;FS=4.170;HaplotypeScore=5.8225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.717;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:972,0,955 chrV 320301 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.888;DP=133;Dels=0.00;FS=5.318;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1169,0,1580 chrV 320500 . C T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.711;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.550;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1386,0,980 chrV 320724 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.733;DP=91;Dels=0.00;FS=8.463;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.458;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1014,0,909 chrV 320982 . T A 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.934;DP=95;Dels=0.00;FS=3.836;HaplotypeScore=2.6732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.842;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1022,0,1053 chrV 321086 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.335;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.877;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1249,0,1170 chrV 321111 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.051;DP=106;Dels=0.00;FS=2.584;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,64:106:99:1471,0,806 chrV 321201 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.568;DP=105;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.023;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1146,0,1008 chrV 321401 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.516;DP=115;Dels=0.00;FS=3.501;HaplotypeScore=2.4383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.330;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:115:99:1228,0,1122 chrV 321483 . T C 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.124;DP=149;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=11.36;ReadPosRankSum=-2.018;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,84:149:99:1723,0,1302 chrV 321531 . A T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;DP=117;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.539;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1346,0,1178 chrV 321624 . G T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.336;DP=95;Dels=0.00;FS=3.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.305;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:922,0,1021 chrV 321714 . A G 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.727;DP=105;Dels=0.00;FS=5.514;HaplotypeScore=4.9341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.791;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1166,0,1110 chrV 321779 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.206;DP=95;Dels=0.00;FS=6.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.623;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:897,0,1130 chrV 321783 . C T 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.424;DP=87;Dels=0.00;FS=8.812;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=9.17;ReadPosRankSum=2.024;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:828,0,1001 chrV 321832 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1411,0,1113 chrV 321873 . T C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.925;DP=107;Dels=0.00;FS=4.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.242;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.183;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,65:107:99:1359,0,890 chrV 321889 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.350;DP=110;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.459;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,65:110:99:1321,0,954 chrV 321901 . G T 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.056;DP=130;Dels=0.00;FS=3.263;HaplotypeScore=4.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=11.87;ReadPosRankSum=2.311;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1573,0,1211 chrV 321936 . T A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.038;DP=113;Dels=0.00;FS=2.457;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1371,0,1097 chrV 321958 . T C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.215;DP=117;Dels=0.00;FS=4.886;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1242,0,1345 chrV 321977 . A G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.214;DP=126;Dels=0.00;FS=9.740;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.730;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1241,0,1417 chrV 321991 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.472;DP=144;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=9.6975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1402,0,1531 chrV 322202 . C T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;DP=128;Dels=0.00;FS=4.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.603;QD=7.90;ReadPosRankSum=-1.147;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,52:128:99:1041,0,1684 chrV 322554 . G C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.544;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.681;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1243,0,1549 chrV 322875 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.738;DP=104;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1093,0,1141 chrV 323636 . A C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.696;DP=154;Dels=0.00;FS=1.268;HaplotypeScore=3.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.791;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1463,0,1670 chrV 323837 . A G 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.698;DP=165;Dels=0.00;FS=1.949;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1611,0,1874 chrV 323885 . G A 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;DP=167;Dels=0.00;FS=2.927;HaplotypeScore=4.3112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=2.461;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,83:167:99:1760,0,1759 chrV 324121 . A G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.334;DP=116;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.544;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1197,0,1276 chrV 324122 . C G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.953;DP=116;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.506;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1202,0,1210 chrV 324202 . A T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;DP=116;Dels=0.00;FS=1.495;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1210,0,1286 chrV 326507 . A G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.448;DP=125;Dels=0.00;FS=3.529;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=-0.788;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.348;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1325,0,1296 chrV 326711 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.465;DP=160;Dels=0.00;FS=6.229;HaplotypeScore=3.5831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:160:99:1479,0,1854 chrV 326865 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.289;DP=154;Dels=0.00;FS=2.039;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:154:99:1357,0,1718 chrV 326897 . T C 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.062;DP=146;Dels=0.00;FS=3.186;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.049;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1668,0,1371 chrV 326990 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.567;DP=161;Dels=0.00;FS=3.725;HaplotypeScore=2.7776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1456,0,1756 chrV 326999 . C T 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.725;DP=176;Dels=0.00;FS=3.633;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.449;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,82:176:99:1703,0,2013 chrV 327059 . A G 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.454;DP=160;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=11.19;ReadPosRankSum=2.045;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1820,0,1568 chrV 327363 . A C 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.966e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3780,399,0 chrV 327447 . C G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.849;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1202,0,1644 chrV 327914 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.685;DP=154;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,67:154:99:1290,0,1888 chrV 327970 . G A 3996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3996,394,0 chrV 328021 . C T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.685;DP=139;Dels=0.00;FS=19.170;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1429,0,1582 chrV 328191 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.865;DP=134;Dels=0.00;FS=6.342;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1448,0,1494 chrV 328271 . G A 4192.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4192,427,0 chrV 329730 . C T 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;DP=141;Dels=0.00;FS=9.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.153;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:1161,0,1756 chrV 331977 . G A 4085.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.35;SB=-2.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4085,385,0 chrV 332033 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=8.66;ReadPosRankSum=2.221;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,66:150:99:1329,0,1856 chrV 332072 . G C 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3414,357,0 chrV 332139 . G A 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3789,370,0 chrV 332194 . G A 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.138;DP=132;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=12.28;ReadPosRankSum=2.064;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1651,0,1202 chrV 332272 . C T 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3829,385,0 chrV 332349 . A T 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.117;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,79:175:99:1690,0,2042 chrV 332460 . C T 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4021,406,0 chrV 332482 . G A 4131.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4131,409,0 chrV 332507 . C T 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4179,418,0 chrV 332539 . C G 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1103,0,1339 chrV 332823 . C T 1831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.636;DP=161;Dels=0.00;FS=4.510;HaplotypeScore=5.4183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1861,0,1507 chrV 332899 . A G 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.122;DP=157;Dels=0.00;FS=3.179;HaplotypeScore=5.2894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,78:157:99:1663,0,1767 chrV 333114 . A G 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3611,375,0 chrV 333160 . A T 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3505,352,0 chrV 333164 . T C 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.66;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3329,351,0 chrV 333251 . G A 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.91;SB=-2.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4068,406,0 chrV 333273 . G T 4169.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:4169,418,0 chrV 333444 . G T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.189;DP=137;Dels=0.00;FS=5.312;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1504,0,1382 chrV 333572 . G A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.002;DP=168;Dels=0.00;FS=1.981;HaplotypeScore=8.9836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=7.40;ReadPosRankSum=3.766;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,66:168:99:1274,0,2238 chrV 333575 . C T 2165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;DP=167;Dels=0.00;FS=1.977;HaplotypeScore=8.2496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=12.96;ReadPosRankSum=-4.011;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,100:167:99:2195,0,1246 chrV 333619 . C T 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3804,396,0 chrV 333669 . C G 4429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4429,453,0 chrV 333688 . A G 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.30;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3769,393,0 chrV 333779 . C T 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3968,408,0 chrV 334031 . A G 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=22.90;SB=-2.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3641,378,0 chrV 334132 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.641;DP=137;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1411,0,1428 chrV 334139 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.770;DP=137;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1352,0,1518 chrV 334216 . C T 4346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.66;SB=-2.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4346,445,0 chrV 334232 . T G 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.530;DP=161;Dels=0.00;FS=6.871;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.002;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1705,0,1625 chrV 334274 . T G 4406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.03;SB=-2.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4406,471,0 chrV 334317 . A G 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.708;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.010;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,86:175:99:1817,0,1817 chrV 334331 . T C 4534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.62;SB=-2.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4534,468,0 chrV 334416 . G T 1854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.835;DP=175;Dels=0.00;FS=3.552;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,90:175:99:1884,0,1731 chrV 334487 . G A 4160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4160,421,0 chrV 334623 . G C 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.299;DP=148;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.048;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.100;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1507,0,1553 chrV 334625 . G A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.951;DP=149;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1633,0,1451 chrV 334650 . C A 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;DP=145;Dels=0.00;FS=5.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.710;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1677,0,1401 chrV 334743 . G A 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.124;DP=169;Dels=0.00;FS=3.542;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=1;MQRankSum=0.531;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.122;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,79:169:99:1674,0,1848 chrV 334750 . C T 4326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=1;QD=25.45;SB=-1.995e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4326,436,0 chrV 334754 . C T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.672;DP=167;Dels=0.00;FS=1.217;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=1;MQRankSum=-0.928;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.319;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:1651,0,1831 chrV 334787 . A G 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.381;DP=169;Dels=0.00;FS=2.679;HaplotypeScore=4.7620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.379;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,87:169:99:1755,0,1660 chrV 334833 . C T 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.350;DP=148;Dels=0.00;FS=7.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.182;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1441,0,1666 chrV 334881 . T C 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.244;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1748,0,1704 chrV 335515 . G A 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.727;DP=193;Dels=0.00;FS=4.277;HaplotypeScore=9.2306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.823;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,89:193:99:1704,0,2138 chrV 335604 . T C 3573.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3573,363,0 chrV 335632 . G A 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2900,282,0 chrV 335812 . T C 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.45;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2723,288,0 chrV 335874 . C T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.073;DP=113;Dels=0.00;FS=5.859;HaplotypeScore=2.8441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.049;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1143,0,1170 chrV 335993 . T C 2311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.987;DP=179;Dels=0.00;FS=9.525;HaplotypeScore=3.9324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,108:179:99:2341,0,1339 chrV 336024 . C T 1903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.441;DP=151;Dels=0.00;FS=3.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.111;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.519;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:151:99:1933,0,1266 chrV 336736 . T G 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.504;DP=152;Dels=0.00;FS=7.174;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.879;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,89:152:99:1762,0,1394 chrV 336771 . A G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.825;DP=137;Dels=0.00;FS=20.427;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.984;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1444,0,1315 chrV 337611 . A T 3979.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3979,415,0 chrV 337672 . T C 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3410,357,0 chrV 340329 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.138;DP=140;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=3.6837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.939;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1322,0,1668 chrV 340779 . G A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.606;DP=131;Dels=0.00;FS=2.254;HaplotypeScore=4.8979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1482,0,1193 chrV 341345 . A G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.344;DP=141;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=2.5251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=9.11;ReadPosRankSum=-2.357;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1314,0,1668 chrV 342178 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.825;DP=111;Dels=0.00;FS=3.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1214,0,1048 chrV 342686 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.081;DP=127;Dels=0.00;FS=3.365;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.908;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1363,0,1100 chrV 342707 . C T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.939;DP=145;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=3.6134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1225,0,1552 chrV 342731 . C A 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.908;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:159:99:1700,0,1578 chrV 342869 . T C 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.633;DP=143;Dels=0.00;FS=5.294;HaplotypeScore=4.5465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.018;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1486,0,1451 chrV 343116 . C T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.129;DP=157;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.599;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1564,0,1751 chrV 343118 . G A 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.766;DP=151;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.546;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1547,0,1642 chrV 343350 . C T 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.212;DP=172;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=0.506;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,80:172:99:1434,0,1833 chrV 343584 . T G 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;DP=133;Dels=0.00;FS=2.304;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1480,0,1393 chrV 343596 . G A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.327;DP=124;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.300;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1429,0,1268 chrV 343689 . A C 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;DP=144;Dels=0.00;FS=3.489;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:144:99:1665,0,1376 chrV 343865 . C T 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.914;DP=160;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.661;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1630,0,1542 chrV 344031 . T C 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.123;DP=177;Dels=0.00;FS=1.175;HaplotypeScore=5.9310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,88:177:99:1635,0,1869 chrV 344076 . G A 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.236;DP=162;Dels=0.00;FS=10.785;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.807;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1818,0,1599 chrV 344349 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.386;DP=137;Dels=0.00;FS=3.045;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1334,0,1539 chrV 344574 . G A 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.935;DP=138;Dels=0.00;FS=1.352;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.089;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1654,0,1233 chrV 344896 . A C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.016;DP=122;Dels=0.00;FS=4.435;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=9.53;ReadPosRankSum=-2.038;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1193,0,1283 chrV 345204 . G A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.610;DP=112;Dels=0.00;FS=1.542;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=10.80;ReadPosRankSum=2.095;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1240,0,1137 chrV 345278 . A G 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.675;DP=109;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.149;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:996,0,1360 chrV 345845 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.419;DP=151;Dels=0.00;FS=4.760;HaplotypeScore=4.2764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.851;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1531,0,1638 chrV 346125 . T C 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.601;DP=142;Dels=0.00;FS=6.236;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1392,0,1709 chrV 346248 . T C 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.098;DP=172;Dels=0.00;FS=3.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.805;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,85:172:99:1744,0,1949 chrV 346317 . C T 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.818;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.460;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1529,0,1548 chrV 346425 . A G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.264;DP=160;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1509,0,1773 chrV 346563 . G A 1789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;DP=146;Dels=0.00;FS=6.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=12.25;ReadPosRankSum=-2.880;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1819,0,1297 chrV 346596 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.727;DP=120;Dels=0.00;FS=3.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.953;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1202,0,1291 chrV 346614 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.852;DP=107;Dels=0.00;FS=6.054;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=10.43;ReadPosRankSum=2.509;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1146,0,1167 chrV 346707 . C T 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2937,300,0 chrV 346962 . G A 1452.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.202;DP=142;Dels=0.00;FS=3.936;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.345;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1482,0,1562 chrV 346966 . C T 1393.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.569;DP=140;Dels=0.00;FS=3.057;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.833;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:140:99:1423,0,1562 chrV 346971 . T A 1385.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.715;DP=140;Dels=0.00;FS=3.065;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1415,0,1573 chrV 347000 . C A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.720;DP=122;Dels=0.00;FS=2.299;HaplotypeScore=3.7147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1345,0,1220 chrV 347145 . C G 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.258;DP=107;Dels=0.00;FS=10.092;HaplotypeScore=2.5615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.891;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:987,0,1223 chrV 347202 . T A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.148;DP=119;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.836;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1212,0,1407 chrV 347367 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.805;DP=113;Dels=0.00;FS=4.574;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1227,0,1096 chrV 347565 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.915;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.334;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1341,0,1071 chrV 347641 . G A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.800;DP=136;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.010;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1261,0,1533 chrV 347954 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.798;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1397,0,1628 chrV 347966 . A G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.561;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.174;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1203,0,1629 chrV 348010 . G C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.122;DP=117;Dels=0.00;FS=7.161;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.761;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1094,0,1238 chrV 348013 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.831;DP=127;Dels=0.00;FS=5.416;HaplotypeScore=4.3100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.359;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1325,0,1321 chrV 348050 . C G 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.796;DP=143;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.568;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1301,0,1559 chrV 348231 . T A 1385.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.501;DP=126;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.493;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1415,0,1207 chrV 348234 . C T 1276.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.543;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.848;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1306,0,1243 chrV 348237 . A T 1253.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.716;DP=122;Dels=0.00;FS=4.395;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.099;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.994;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1283,0,1231 chrV 348378 . A C 2263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.257;DP=164;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.405;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,108:164:99:2293,0,1085 chrV 348419 . A G 2197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.275;DP=170;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,109:170:99:2227,0,1195 chrV 348780 . G A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.126;DP=125;Dels=0.00;FS=4.372;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.97;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.744;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1555,0,1105 chrV 349236 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.850;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1360,0,1288 chrV 349266 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.978;DP=114;Dels=0.00;FS=3.455;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1298,0,1022 chrV 349407 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.025;DP=117;Dels=0.00;FS=22.703;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.134;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1093,0,1412 chrV 349414 . G A 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.629;DP=115;Dels=0.00;FS=20.431;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1064,0,1299 chrV 349434 . C T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.464;DP=114;Dels=0.00;FS=12.183;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.777;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1223,0,1228 chrV 349507 . T C 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.364;DP=155;Dels=0.00;FS=3.798;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1734,0,1523 chrV 349582 . T C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.629;DP=148;Dels=0.00;FS=17.116;HaplotypeScore=3.4800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,63:148:99:1210,0,1979 chrV 349661 . C T 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.570;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.911;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.832;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1664,0,1289 chrV 349710 . G A 3965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3965,403,0 chrV 349715 . T C 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.118;DP=151;Dels=0.00;FS=1.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.502;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1554,0,1557 chrV 350100 . A G 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;DP=120;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.177;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1186,0,1184 chrV 350516 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.110;DP=122;Dels=0.00;FS=17.381;HaplotypeScore=3.3464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1304,0,1217 chrV 350543 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.500;DP=148;Dels=0.00;FS=3.889;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.490;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1464,0,1546 chrV 350741 . C T 4652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4652,457,0 chrV 350747 . T C 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.744;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,78:165:99:1588,0,1913 chrV 351233 . C T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=139;Dels=0.00;FS=2.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1316,0,1531 chrV 351279 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.430;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=9.62;ReadPosRankSum=2.250;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1387,0,1532 chrV 351535 . C T 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.977;DP=130;Dels=0.00;FS=3.403;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=1;MQRankSum=-3.104;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.984;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:1045,0,1651 chrV 351873 . G A 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.147;DP=144;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.450;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1817,0,1274 chrV 352270 . T C 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.457;DP=139;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1425,0,1388 chrV 352273 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.080;DP=138;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1394,0,1439 chrV 352394 . A G 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2951,303,0 chrV 352574 . T A 4173.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:4173,415,0 chrV 352751 . A T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;DP=114;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=2.3972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1160,0,1345 chrV 353028 . T C 1741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.631;DP=175;Dels=0.00;FS=1.898;HaplotypeScore=4.3703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=1;MQRankSum=0.370;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,89:175:99:1771,0,1769 chrV 353407 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.291;DP=140;Dels=0.00;FS=6.899;HaplotypeScore=7.5641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.677;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1619,0,1377 chrV 353446 . T G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.335;DP=129;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1445,0,1321 chrV 353499 . G T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.333;DP=118;Dels=0.00;FS=7.428;HaplotypeScore=2.6023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.741;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1300,0,1283 chrV 353583 . C A 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=26.43;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3330,339,0 chrV 353654 . G A 2680 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=26.80;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2713,270,0 chrV 353683 . G A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.343;DP=120;Dels=0.00;FS=1.593;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=10.40;ReadPosRankSum=-2.249;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1278,0,1195 chrV 353807 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.513;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.518;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.615;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1370,0,1400 chrV 353817 . G A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.020;DP=147;Dels=0.00;FS=3.011;HaplotypeScore=5.7646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.459;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.378;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1487,0,1579 chrV 353854 . C A 4088.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.18;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4088,412,0 chrV 353920 . T G 593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.221;DP=101;Dels=0.00;FS=8.141;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.569;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.498;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,37:101:99:623,0,1461 chrV 354190 . A T 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.772;DP=137;Dels=0.00;FS=6.889;HaplotypeScore=20.0544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.967;QD=6.58;ReadPosRankSum=2.278;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,47:137:99:932,0,1977 chrV 354207 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.760;DP=172;Dels=0.00;FS=5.819;HaplotypeScore=67.4410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.772;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,62:172:99:1167,0,2219 chrV 354576 . C T 1648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.82;MQ0=0;QD=21.40;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1681,165,0 chrV 354761 . G A 1893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.061;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;MQRankSum=5.033;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,78:101:46:1926,46,0 chrV 354793 . T G 1831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.094;DP=141;Dels=0.00;FS=4.058;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.35;MQ0=0;MQRankSum=3.044;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.455;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,83:141:99:1861,0,865 chrV 354800 . G A 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.208;DP=135;Dels=0.00;FS=9.423;HaplotypeScore=6.6639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.85;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.963;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,54:135:99:949,0,1735 chrV 354895 . G C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.657;DP=104;Dels=0.00;FS=0.800;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:104:99:900,0,1278 chrV 355019 . T C 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;DP=110;Dels=0.00;FS=3.882;HaplotypeScore=22.1540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.24;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=23.75;ReadPosRankSum=0.378;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2646,267,0 chrV 355038 . G T 313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;DP=147;Dels=0.00;FS=5.567;HaplotypeScore=4.7076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQ0=0;MQRankSum=-5.342;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.943;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,44:147:99:343,0,2342 chrV 355188 . T A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.120;DP=133;Dels=0.00;FS=2.225;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.659;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1189,0,1565 chrV 355336 . C G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;DP=108;Dels=0.00;FS=7.593;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.273;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1208,0,951 chrV 355397 . A G 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.404;DP=96;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.549;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:967,0,1080 chrV 355503 . C T 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;DP=89;Dels=0.00;FS=7.211;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.656;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,49:89:99:1043,0,846 chrV 355527 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.898;DP=110;Dels=0.00;FS=2.591;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.028;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:1005,0,1358 chrV 355632 . T G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.661;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1233,0,1179 chrV 356079 . G T 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.039;DP=135;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=8.7975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=11.47;ReadPosRankSum=-2.359;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1578,0,1285 chrV 356220 . A G 3800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;DP=152;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=25.00;ReadPosRankSum=0.998;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3800,355,0 chrV 356363 . C T 3869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3869,373,0 chrV 356575 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.984;DP=114;Dels=0.00;FS=4.545;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.848;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1257,0,1199 chrV 356665 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.056;DP=129;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.144;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1290,0,1502 chrV 356759 . A G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.487;DP=117;Dels=0.00;FS=2.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.458;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1086,0,1325 chrV 356837 . A G 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.483;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3167,330,0 chrV 357733 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.939;DP=125;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1273,0,1346 chrV 357876 . C T 2111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2144,216,0 chrV 358004 . A G 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.600;DP=136;Dels=0.00;FS=8.039;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.768;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1672,0,1239 chrV 358073 . T A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;DP=128;Dels=0.00;FS=2.259;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.797;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1529,0,1265 chrV 358357 . G A 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.047;DP=134;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=3.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1670,0,1165 chrV 359292 . C T 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3427,354,0 chrV 360247 . A G 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2863,297,0 chrV 360318 . C A 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1479,0,930 chrV 360409 . C A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.851;DP=121;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=12.87;ReadPosRankSum=1.406;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1587,0,1073 chrV 360556 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.745;DP=142;Dels=0.00;FS=7.503;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.282;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1363,0,1489 chrV 360622 . C A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.193;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.161;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1321,0,1506 chrV 360939 . T C 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.898;DP=121;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.387;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1150,0,1251 chrV 360941 . T C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.473;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1265,0,1118 chrV 360974 . T C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.671;DP=103;Dels=0.00;FS=1.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1061,0,1059 chrV 361213 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.809;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.457;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,64:156:99:1318,0,1996 chrV 361243 . T C 4050.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4050,417,0 chrV 361905 . G T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.106;DP=149;Dels=0.00;FS=19.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.069;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1563,0,1536 chrV 361960 . A G 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.883;DP=137;Dels=0.00;FS=22.464;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.394;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1025,0,1749 chrV 362084 . A T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;DP=149;Dels=0.00;FS=8.947;HaplotypeScore=4.4233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1331,0,1781 chrV 362194 . C T 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.353;DP=122;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.188;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1099,0,1523 chrV 362205 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.273;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.503;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1039,0,1611 chrV 362296 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.017;DP=116;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=1;MQRankSum=-1.838;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.825;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1236,0,1254 chrV 362305 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.280;DP=109;Dels=0.00;FS=2.630;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.39;MQ0=1;MQRankSum=-2.922;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1184,0,1113 chrV 362334 . G A 778.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.848;DP=89;Dels=0.00;FS=0.806;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.22;MQ0=1;MQRankSum=-6.432;QD=8.74;ReadPosRankSum=-2.133;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:808,0,978 chrV 362343 . G A 747.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.752;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.76;MQ0=1;MQRankSum=-6.866;QD=8.12;ReadPosRankSum=-2.625;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:777,0,981 chrV 362344 . A T 720.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.405;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.76;MQ0=1;MQRankSum=-7.191;QD=7.83;ReadPosRankSum=-2.537;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:750,0,1058 chrV 362389 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.796;DP=111;Dels=0.00;FS=3.988;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.571;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.447;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:918,0,1372 chrV 362397 . G T 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.121;DP=106;Dels=0.00;FS=0.815;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.311;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.514;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:106:99:958,0,1168 chrV 362438 . T A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;DP=123;Dels=0.00;FS=13.886;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.748;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1096,0,1584 chrV 362559 . T C 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.025;DP=135;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=3.838;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.762;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1607,0,1170 chrV 362609 . C T 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3451,357,0 chrV 362681 . T G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.891;DP=111;Dels=0.00;FS=10.840;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1250,0,1023 chrV 362682 . G C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;DP=109;Dels=0.00;FS=9.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1221,0,995 chrV 362739 . T C 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.400;DP=134;Dels=0.00;FS=2.250;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.574;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1469,0,1311 chrV 362788 . G A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.379;DP=137;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.41;MQ0=0;MQRankSum=-3.709;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1393,0,1401 chrV 362832 . C T 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=92.7124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2641,264,0 chrV 362834 . A T 273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;DP=99;Dels=0.00;FS=12.185;HaplotypeScore=129.4397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.93;MQ0=0;MQRankSum=-7.358;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:303,0,1380 chrV 362962 . T C 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.455;DP=127;Dels=0.00;FS=4.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.659;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1277,0,1471 chrV 363002 . C T 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.87;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2777,279,0 chrV 363023 . T C 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.277;DP=96;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=3.0199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.052;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,50:96:99:996,0,1020 chrV 363060 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.533;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.793;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1290,0,1160 chrV 363243 . T C 792.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.590;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.22;MQ0=10;MQRankSum=-0.368;QD=6.39;ReadPosRankSum=-1.366;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:822,0,1278 chrV 363470 . A G 837.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.243;DP=139;Dels=0.00;FS=3.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.37;MQ0=68;MQRankSum=1.356;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.425;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:139:99:867,0,563 chrV 363833 . T C 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.59;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3648,378,0 chrV 363955 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.878;DP=132;Dels=0.00;FS=5.284;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1393,0,1435 chrV 364042 . C T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.563;DP=135;Dels=0.00;FS=9.228;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=2.010;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.883;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1363,0,1499 chrV 364059 . T A 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3452,343,0 chrV 364082 . C T 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.24;SB=-2.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3910,382,0 chrV 364150 . C T 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3323,330,0 chrV 364196 . G A 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.368;DP=113;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1058,0,1222 chrV 364465 . G A 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.086;DP=100;Dels=0.00;FS=2.629;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:896,0,1161 chrV 365083 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.380;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1346,0,1457 chrV 365086 . C T 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.789;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1379,0,1550 chrV 365839 . T C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.053;DP=131;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.840;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1335,0,1381 chrV 366285 . G A 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2625,255,0 chrV 366434 . C T 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.524;DP=126;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.802;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1365,0,1240 chrV 366487 . C T 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.932;DP=123;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:123:99:1487,0,1023 chrV 366524 . A T 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.999;DP=147;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=5.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.577;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1672,0,1416 chrV 366566 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.164;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1395,0,1243 chrV 366971 . C A 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.080;DP=169;Dels=0.00;FS=4.571;HaplotypeScore=6.5388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.458;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,86:169:99:1880,0,1738 chrV 367485 . G A 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.930;DP=167;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1628,0,1827 chrV 367786 . G A 4552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4552,457,0 chrV 368184 . C T 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3070,309,0 chrV 368706 . A G 2704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2737,282,0 chrV 368771 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3048,315,0 chrV 368857 . T G 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2594,276,0 chrV 369110 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;DP=130;Dels=0.00;FS=21.233;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=8.85;ReadPosRankSum=-2.341;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:130:99:1180,0,1559 chrV 369120 . C T 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3798,370,0 chrV 369175 . A G 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.264;DP=98;Dels=0.00;FS=1.610;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:942,0,1185 chrV 369257 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.513;DP=112;Dels=0.00;FS=8.883;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1262,0,1097 chrV 369437 . G A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.919;DP=134;Dels=0.00;FS=23.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=8.62;ReadPosRankSum=-1.395;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1185,0,1620 chrV 369472 . T G 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;DP=108;Dels=0.00;FS=8.286;HaplotypeScore=3.6157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1005,0,1276 chrV 369728 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.031;DP=118;Dels=0.00;FS=4.515;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1260,0,1141 chrV 369931 . C T 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.332;DP=150;Dels=0.00;FS=4.535;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.421;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1580,0,1664 chrV 370253 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.742;DP=138;Dels=0.00;FS=7.676;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.931;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1303,0,1612 chrV 370268 . A T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.264;DP=146;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.111;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1152,0,1877 chrV 370286 . A G 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.035;DP=155;Dels=0.00;FS=7.648;HaplotypeScore=3.6008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.122;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.031;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,63:155:99:1121,0,2098 chrV 370316 . T C 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.388;DP=172;Dels=0.00;FS=7.873;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=7.64;ReadPosRankSum=-2.128;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,72:172:99:1344,0,2220 chrV 370346 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.464;DP=144;Dels=0.00;FS=15.811;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=7.74;ReadPosRankSum=1.468;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,58:144:99:1145,0,1920 chrV 370367 . C T 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.397;DP=133;Dels=0.00;FS=12.689;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=7.71;ReadPosRankSum=2.105;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1056,0,1745 chrV 370417 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.123;DP=154;Dels=0.00;FS=2.039;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=8.92;ReadPosRankSum=-2.405;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1403,0,1795 chrV 370435 . T G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.453;DP=147;Dels=0.00;FS=4.170;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.438;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,62:147:99:1257,0,1795 chrV 370455 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.310;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.773;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.629;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:144:99:1353,0,1551 chrV 370463 . G A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.261;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.916;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.061;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1504,0,1477 chrV 370471 . C T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.289;DP=148;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=2.9517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.277;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:148:99:1666,0,1424 chrV 370573 . C T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.256;DP=157;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.051;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1650,0,1680 chrV 370590 . A G 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.479;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.753;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1761,0,1602 chrV 370598 . A G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.701;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.232;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1350,0,1488 chrV 370611 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.350;DP=141;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.130;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1448,0,1520 chrV 370718 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;DP=132;Dels=0.00;FS=10.945;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.059;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.130;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1305,0,1498 chrV 370727 . C T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.387;DP=148;Dels=0.00;FS=4.860;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.252;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1437,0,1642 chrV 370746 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.973;DP=114;Dels=0.00;FS=17.971;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.273;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.621;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1383,0,1146 chrV 370850 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.071;DP=140;Dels=0.00;FS=2.161;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.261;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1471,0,1510 chrV 370893 . A T 4119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;QD=27.28;SB=-2.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4119,409,0 chrV 370904 . A G 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.60;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3553,372,0 chrV 370913 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.245;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.628;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,57:141:99:1109,0,1842 chrV 370940 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.845;DP=145;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=4.8385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,58:145:99:1112,0,1905 chrV 371210 . C T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.780;DP=134;Dels=0.00;FS=6.499;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.815;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1323,0,1491 chrV 371216 . G A 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3550,358,0 chrV 371288 . A G 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.556;DP=100;Dels=0.00;FS=3.750;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.522;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:877,0,1213 chrV 371302 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.238;DP=106;Dels=0.00;FS=3.772;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.113;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1032,0,1201 chrV 371386 . T G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.356;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1203,0,1337 chrV 371398 . G A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.834;DP=125;Dels=0.00;FS=4.553;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.899;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.755;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1403,0,1223 chrV 371820 . G A 1295.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.344;DP=130;Dels=0.00;FS=4.276;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.18;MQ0=0;MQRankSum=-6.081;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.932;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1325,0,1272 chrV 371824 . C T 1336.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.482;DP=132;Dels=0.00;FS=8.069;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.24;MQ0=0;MQRankSum=-6.268;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.523;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1366,0,1362 chrV 371829 . T A 1312.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.982;DP=135;Dels=0.00;FS=7.978;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.004;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1342,0,1471 chrV 371849 . C T 3174 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.05;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3207,325,0 chrV 371856 . T G 1134.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.347;DP=124;Dels=0.00;FS=11.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.92;MQ0=0;MQRankSum=-6.542;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1164,0,1321 chrV 371859 . C T 3127 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.18;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3160,319,0 chrV 371903 . G A 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;DP=97;Dels=0.00;FS=8.010;HaplotypeScore=3.1869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQ0=0;MQRankSum=3.605;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:97:99:816,0,1014 chrV 371929 . T C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.848;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=4.512;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.436;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:106:99:1020,0,1190 chrV 371986 . T C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.178;DP=103;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.605;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:990,0,1066 chrV 372057 . T C 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.617;DP=92;Dels=0.00;FS=7.194;HaplotypeScore=4.1884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:829,0,1036 chrV 372149 . A G 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.982;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.170;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:1050,0,973 chrV 372248 . T A 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;QD=28.04;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2641,273,0 chrV 372263 . A G 2205 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=85.4152;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.03;MQ0=0;QD=23.97;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2238,252,0 chrV 372487 . T C 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3227,336,0 chrV 372581 . G A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;DP=110;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.271;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1252,0,1039 chrV 372742 . A T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.706;DP=130;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1147,0,1578 chrV 372822 . A T 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.777;DP=124;Dels=0.00;FS=2.394;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1541,0,1029 chrV 372836 . C T 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.916;DP=118;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:1576,0,979 chrV 373154 . A C 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.471;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:106:99:854,0,1162 chrV 373232 . T C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;DP=116;Dels=0.00;FS=2.505;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1255,0,1235 chrV 373416 . G C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;DP=123;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=4.9560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1235,0,1305 chrV 373442 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.697;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.727;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1403,0,1399 chrV 373736 . A G 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=22.13;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3154,342,0 chrV 374086 . T C 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.301;DP=167;Dels=0.00;FS=2.694;HaplotypeScore=3.4822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.643;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,85:167:99:1734,0,1596 chrV 374737 . G A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.793;DP=131;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.911;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1623,0,1108 chrV 374835 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.153;DP=134;Dels=0.00;FS=10.837;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.754;QD=7.78;ReadPosRankSum=-1.835;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1073,0,1398 chrV 374887 . T C 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;DP=99;Dels=0.00;FS=4.109;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=-3.278;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.740;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:841,0,953 chrV 374891 . C T 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.025;DP=103;Dels=0.00;FS=8.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.515;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.438;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:957,0,954 chrV 374909 . T C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.025;DP=117;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=4.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.638;QD=8.78;ReadPosRankSum=2.638;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1057,0,1230 chrV 374915 . T G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.054;DP=110;Dels=0.00;FS=2.478;HaplotypeScore=3.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.638;QD=9.25;ReadPosRankSum=3.764;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1047,0,1254 chrV 375017 . C A,T 2836.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=126;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3482;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.45;MQ0=0;QD=22.51;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,61,64:125:99:2896,1542,1395,1354,0,1180 chrV 375200 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.274;DP=128;Dels=0.00;FS=9.800;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.779;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1069,0,1522 chrV 375429 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.252;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.325;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:138:99:1579,0,1335 chrV 375717 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.253;DP=123;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=2.209;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.591;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1323,0,1322 chrV 375822 . C G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;DP=103;Dels=0.00;FS=3.637;HaplotypeScore=1.8991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.485;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1032,0,1043 chrV 375908 . A G 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.049;DP=135;Dels=0.00;FS=18.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1542,0,1266 chrV 376001 . G T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;DP=165;Dels=0.00;FS=1.230;HaplotypeScore=2.7741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.051;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,69:165:99:1194,0,2065 chrV 376042 . T C 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.884;DP=155;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,64:155:99:1174,0,2109 chrV 376050 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.536;DP=157;Dels=0.00;FS=1.287;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.538;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.709;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,68:157:99:1246,0,2004 chrV 376073 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.838;DP=136;Dels=0.00;FS=9.810;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=8.79;ReadPosRankSum=2.094;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,59:136:99:1226,0,1673 chrV 376103 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.752;DP=121;Dels=0.00;FS=4.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.784;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1167,0,1428 chrV 376178 . C G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.697;DP=131;Dels=0.00;FS=6.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.734;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1295,0,1397 chrV 376204 . T C 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.058;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.366;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1521,0,1295 chrV 376275 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.516;DP=123;Dels=0.00;FS=1.431;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.144;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1273,0,1345 chrV 376375 . T C 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.515;DP=149;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:1779,0,1347 chrV 376468 . A C 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3631,375,0 chrV 376801 . T C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.748;DP=161;Dels=0.00;FS=2.868;HaplotypeScore=3.1435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.561;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,66:161:99:1292,0,1893 chrV 376886 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.843;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1308,0,1400 chrV 376958 . A G 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.935;DP=159;Dels=0.00;FS=3.694;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1468,0,1724 chrV 377102 . T C 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.324;DP=167;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.937;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.187;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,87:167:99:1718,0,1750 chrV 377190 . T C 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=1;QD=25.45;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3537,369,0 chrV 377272 . G A 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.380;DP=167;Dels=0.00;FS=1.233;HaplotypeScore=4.4318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=1;MQRankSum=0.313;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.037;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,83:167:99:1778,0,1783 chrV 377281 . C T 4534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=1;QD=26.67;SB=-2.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4534,454,0 chrV 377522 . A G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.302;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.567;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,82:171:99:1444,0,1810 chrV 377833 . T G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.002;DP=128;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1211,0,1413 chrV 377957 . C T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.054;DP=150;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1624,0,1341 chrV 377958 . C T 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.514;DP=147;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.022;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1660,0,1291 chrV 377999 . A G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.272;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1391,0,1547 chrV 378036 . A C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.852;DP=133;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1375,0,1387 chrV 378046 . T C 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.843;DP=127;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1318,0,1380 chrV 378074 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.341;DP=136;Dels=0.00;FS=3.649;HaplotypeScore=9.8610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.383;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1616,0,1258 chrV 378075 . A T 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.165;DP=133;Dels=0.00;FS=4.880;HaplotypeScore=10.6496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.117;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:133:99:1589,0,1239 chrV 378265 . T C 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.580;DP=151;Dels=0.00;FS=10.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.669;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,90:151:99:1821,0,1250 chrV 378269 . G A 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.435;DP=137;Dels=0.00;FS=7.111;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.303;QD=13.66;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,87:137:99:1901,0,946 chrV 378297 . T C 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.628;DP=138;Dels=0.00;FS=4.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.482;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,84:138:99:1685,0,1116 chrV 378395 . A C 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.248;DP=112;Dels=0.00;FS=6.013;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1390,0,944 chrV 378586 . C T 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.665;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6288;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.372;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:3893,391,0 chrV 379332 . C A 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=26.03;ReadPosRankSum=1.578;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:137:99:3566,341,0 chrV 379602 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.450;DP=151;Dels=0.00;FS=4.079;HaplotypeScore=4.3206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1477,0,1697 chrV 379864 . G A 1833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.711;DP=131;Dels=0.00;FS=1.519;HaplotypeScore=2.9008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.703;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.217;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,83:131:99:1863,0,921 chrV 379879 . T C 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.518;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,59:153:99:1133,0,2138 chrV 379893 . G A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.312;DP=143;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=2.006;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.392;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,57:143:99:1145,0,1863 chrV 379980 . G A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.175;DP=150;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.775;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1482,0,1563 chrV 380064 . C T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.950;DP=139;Dels=0.00;FS=4.141;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.849;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1479,0,1406 chrV 380502 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.712;DP=145;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.426;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1417,0,1710 chrV 380871 . C T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.240;DP=116;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1254,0,1274 chrV 381126 . G T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.214;DP=127;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.391;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1392,0,1332 chrV 381575 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.562;DP=126;Dels=0.00;FS=11.657;HaplotypeScore=2.8695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.242;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1397,0,1409 chrV 381719 . T C 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.343;DP=121;Dels=0.00;FS=3.363;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.675;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1408,0,1164 chrV 381747 . C G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.397;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1445,0,1030 chrV 381852 . T G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.334;DP=126;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.337;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1405,0,1230 chrV 381978 . A T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.285;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,75:133:99:1471,0,1147 chrV 382325 . G A 108.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.725;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.653;QD=1.32;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,51:82:99:138,0,310 chrV 382350 . T C 509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.670;DP=118;Dels=0.00;FS=5.837;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.34;MQ0=0;MQRankSum=-3.989;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.329;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:539,0,867 chrV 382366 . A G 505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.268;DP=112;Dels=0.00;FS=0.918;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQ0=0;MQRankSum=-6.082;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:535,0,1097 chrV 382369 . C A,G 1809.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=113;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=51.07;MQ0=0;QD=16.01;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,56,56:112:99:1869,685,556,1184,0,1103 chrV 382384 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.584;DP=130;Dels=0.00;FS=1.640;HaplotypeScore=3.8013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.944;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:908,0,1203 chrV 382388 . A G 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.330;DP=131;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=2.9346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.46;MQ0=0;MQRankSum=-3.537;QD=7.45;ReadPosRankSum=-2.143;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1006,0,1253 chrV 382470 . C T 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.042;DP=136;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,82:136:99:1901,0,985 chrV 382516 . T C 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.944;DP=131;Dels=0.00;FS=0.793;HaplotypeScore=136.7731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.124;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.223;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,79:131:99:1415,0,869 chrV 382763 . A T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.894;DP=129;Dels=0.00;FS=2.446;HaplotypeScore=4.7152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=7.90;ReadPosRankSum=-2.390;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,50:129:99:1049,0,1721 chrV 383077 . A C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.143;DP=116;Dels=0.00;FS=4.479;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1355,0,1124 chrV 383480 . C T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.440;DP=132;Dels=0.00;FS=2.275;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.481;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1567,0,1239 chrV 383543 . T G 3806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3806,408,0 chrV 383774 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.481;DP=114;Dels=0.00;FS=1.675;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.633;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1001,0,1278 chrV 383903 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.919;DP=141;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1242,0,1585 chrV 383986 . A G 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.044;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.038;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1423,0,1632 chrV 384008 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.294;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1145,0,1196 chrV 384035 . A G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.759;DP=129;Dels=0.00;FS=4.749;HaplotypeScore=3.9516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.265;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1342,0,1436 chrV 384158 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.835;DP=141;Dels=0.00;FS=6.448;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1370,0,1530 chrV 384497 . G A 2061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.665;DP=201;Dels=0.00;FS=0.534;HaplotypeScore=3.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.448;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,98:201:99:2091,0,2037 chrV 384808 . A T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;DP=129;Dels=0.00;FS=1.499;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1493,0,1250 chrV 384866 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.060;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.402;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1533,0,1378 chrV 385085 . T C 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.085;DP=84;Dels=0.00;FS=0.865;HaplotypeScore=3.9210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.295;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:940,0,931 chrV 385325 . C T 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.605;DP=105;Dels=0.00;FS=2.528;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:887,0,1221 chrV 385358 . T C 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.371;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:890,0,1097 chrV 385850 . G A 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.222;DP=95;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=3.9740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.915;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1025,0,950 chrV 385956 . C T 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.390;DP=89;Dels=0.00;FS=0.808;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.053;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1087,0,849 chrV 386230 . A G 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.590;DP=94;Dels=0.00;FS=2.757;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.814;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:965,0,913 chrV 386394 . C G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.693;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=8.10;ReadPosRankSum=-2.182;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:905,0,1055 chrV 386408 . T C 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.633;DP=105;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1062,0,1085 chrV 386462 . A G 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.141;DP=114;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1383,0,1038 chrV 386486 . T C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.083;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.393;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,64:113:99:1351,0,1052 chrV 386503 . G A 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2928,291,0 chrV 386508 . C T 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.714;DP=105;Dels=0.00;FS=4.809;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.523;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1222,0,1048 chrV 386529 . C T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.484;DP=108;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.366;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1097,0,1125 chrV 386588 . T C 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.077;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.137;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:975,0,993 chrV 386623 . G A 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3259,324,0 chrV 386670 . A G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.912;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.693;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1332,0,1209 chrV 386692 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.392;DP=110;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1166,0,1076 chrV 386715 . C T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.376;DP=123;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=4.3860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,73:123:99:1655,0,983 chrV 386773 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.497;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.954;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1475,0,1445 chrV 386824 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.089;DP=110;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.828;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1032,0,1274 chrV 386884 . A T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;DP=91;Dels=0.00;FS=3.920;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1097,0,922 chrV 386965 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.636;DP=117;Dels=0.00;FS=4.617;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1257,0,1124 chrV 387052 . T G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.959;DP=117;Dels=0.00;FS=7.227;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=10.11;ReadPosRankSum=-2.532;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1213,0,1259 chrV 387055 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.809;DP=116;Dels=0.00;FS=8.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=9.47;ReadPosRankSum=-2.198;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1129,0,1251 chrV 387086 . G A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.939;DP=121;Dels=0.00;FS=6.898;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.490;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1295,0,1220 chrV 387188 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.351;DP=116;Dels=0.00;FS=14.317;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1281,0,1024 chrV 387212 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;DP=104;Dels=0.00;FS=11.241;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.653;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1226,0,924 chrV 387695 . T A 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:104:99:2873,294,0 chrV 387929 . A G 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.815;DP=153;Dels=0.00;FS=6.417;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.451;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1560,0,1668 chrV 388012 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.693;DP=110;Dels=0.00;FS=8.986;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1112,0,1224 chrV 388541 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.138;DP=116;Dels=0.00;FS=3.549;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1402,0,1075 chrV 388556 . C G 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.440;DP=143;Dels=0.00;FS=6.324;HaplotypeScore=3.2179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.378;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,83:143:99:1777,0,1193 chrV 388646 . A T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.419;DP=134;Dels=0.00;FS=9.090;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.693;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1543,0,1317 chrV 388982 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.329;DP=119;Dels=0.00;FS=2.499;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.055;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1357,0,1192 chrV 389531 . A G 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3444,354,0 chrV 389561 . G C 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.512;DP=142;Dels=0.00;FS=8.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=11.23;ReadPosRankSum=3.139;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1625,0,1285 chrV 389576 . C T 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3367,345,0 chrV 389606 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.196;DP=130;Dels=0.00;FS=3.167;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.058;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1397,0,1291 chrV 389822 . C T 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3675,384,0 chrV 389845 . C T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.894;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.454;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1500,0,1382 chrV 389903 . C T 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.905;DP=132;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1333,0,1376 chrV 389931 . G T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=143;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=3.6893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1370,0,1484 chrV 389989 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.183;DP=117;Dels=0.00;FS=8.512;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.418;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1199,0,1289 chrV 390061 . G T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.400;DP=122;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1187,0,1292 chrV 390093 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.699;DP=134;Dels=0.00;FS=4.127;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.993;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.517;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1368,0,1492 chrV 390437 . C T 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3054,312,0 chrV 390537 . T A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;DP=127;Dels=0.00;FS=10.114;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.863;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1194,0,1535 chrV 390625 . C T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.980;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1492,0,1451 chrV 390667 . T C 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.134;DP=115;Dels=0.00;FS=6.017;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:985,0,1407 chrV 390851 . C A 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.541;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,82:172:99:1719,0,1843 chrV 391100 . A G 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.810;DP=150;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=2.5986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.942;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1368,0,1688 chrV 391292 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.631;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.713;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1399,0,1488 chrV 391589 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.277;DP=107;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.969;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1146,0,1191 chrV 391914 . T C 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.778;DP=126;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.322;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1548,0,1241 chrV 392090 . A G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.613;DP=115;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=1.744;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1300,0,1060 chrV 392252 . T C 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.479;DP=117;Dels=0.00;FS=2.451;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:890,0,1568 chrV 392305 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.553;DP=133;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.460;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1188,0,1561 chrV 392378 . G T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.160;DP=136;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=2.7579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=9.29;ReadPosRankSum=2.125;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1293,0,1463 chrV 392813 . T C 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.836;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=6.83;ReadPosRankSum=-2.406;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:122:99:863,0,1583 chrV 392867 . G A 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.583;DP=117;Dels=0.00;FS=1.628;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.412;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:979,0,1515 chrV 393117 . A G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.473;DP=138;Dels=0.00;FS=5.140;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.060;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1499,0,1358 chrV 393341 . A G 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.637;DP=137;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=3.8723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,51:136:99:956,0,1952 chrV 393494 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.721;DP=146;Dels=0.00;FS=1.310;HaplotypeScore=4.8734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.270;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1452,0,1572 chrV 393496 . T A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;DP=144;Dels=0.00;FS=2.102;HaplotypeScore=4.8734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1418,0,1519 chrV 393660 . C T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.318;DP=124;Dels=0.00;FS=2.311;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1366,0,1272 chrV 393768 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.210;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.283;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:127:99:1373,0,1307 chrV 393855 . A G 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2926,303,0 chrV 393858 . G C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;DP=113;Dels=0.00;FS=1.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1136,0,1180 chrV 393902 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.042;DP=139;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1353,0,1584 chrV 394021 . C T 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3148,327,0 chrV 394083 . T A 638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;DP=146;Dels=0.00;FS=2.977;HaplotypeScore=15.0571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:146:99:668,0,1404 chrV 394151 . C G 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.870;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:896,0,1358 chrV 394349 . G A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.410;DP=116;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1441,0,1025 chrV 394357 . A G 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3010,321,0 chrV 394442 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.859;DP=139;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.603;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1397,0,1472 chrV 394655 . A G 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.645;DP=134;Dels=0.00;FS=6.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.415;QD=12.65;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,79:134:99:1725,0,1089 chrV 394875 . T C 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.138;DP=154;Dels=0.00;FS=4.159;HaplotypeScore=2.8508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:154:99:1415,0,1846 chrV 394911 . G A 1872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.668;DP=161;Dels=0.00;FS=4.627;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,91:161:99:1902,0,1373 chrV 395011 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.446;DP=154;Dels=0.00;FS=8.065;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.564;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1431,0,1726 chrV 395075 . A G 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;DP=188;Dels=0.00;FS=4.630;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,93:188:99:1910,0,2050 chrV 395227 . C G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.608;DP=118;Dels=0.00;FS=2.691;HaplotypeScore=6.9860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.329;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:118:99:1401,0,690 chrV 395347 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.384;DP=131;Dels=0.00;FS=7.897;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.084;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1383,0,1360 chrV 395447 . C T 3981.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9482;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3981,391,0 chrV 395714 . T G 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.389;DP=136;Dels=0.00;FS=3.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=9.63;ReadPosRankSum=-2.111;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1340,0,1487 chrV 395786 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.268;DP=142;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.162;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.117;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1494,0,1386 chrV 395813 . C T 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.634;DP=129;Dels=0.00;FS=4.198;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1358,0,1311 chrV 395872 . T C 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.837;DP=154;Dels=0.00;FS=2.033;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=1;MQRankSum=-1.218;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1514,0,1518 chrV 396138 . C T 1199.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.974;DP=118;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.046;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1229,0,1166 chrV 396139 . C T 1148.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.059;DP=117;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.313;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1178,0,1167 chrV 396140 . T A 1151.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.136;DP=116;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.033;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1181,0,1218 chrV 396178 . G C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.230;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1215,0,1385 chrV 396344 . G T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;DP=95;Dels=0.00;FS=5.632;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.008;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,63:95:99:1462,0,568 chrV 396464 . G A 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.777;DP=154;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.571;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1708,0,1342 chrV 396494 . G C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.628;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.080;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1044,0,1102 chrV 396523 . A G 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.637;DP=122;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:122:99:1097,0,1389 chrV 396554 . C T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.339;DP=121;Dels=0.00;FS=4.433;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1110,0,1426 chrV 396831 . G A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.502;DP=89;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1069,0,896 chrV 397234 . T C 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.329;DP=148;Dels=0.00;FS=2.905;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.967;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1595,0,1592 chrV 397401 . A G 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.696;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.720;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,71:166:99:1431,0,2070 chrV 397724 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.987;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1192,0,1434 chrV 397753 . T G 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3730,390,0 chrV 397892 . G A 1861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.942;DP=178;Dels=0.00;FS=3.621;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.874;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,90:178:99:1891,0,1902 chrV 398975 . T G 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2986,312,0 chrV 399140 . C T 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.610;DP=158;Dels=0.00;FS=8.379;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.564;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1664,0,1627 chrV 399399 . C T 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.216;DP=146;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.446;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1774,0,1363 chrV 399487 . C T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.334;DP=171;Dels=0.00;FS=6.094;HaplotypeScore=4.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.104;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,73:171:99:1417,0,2174 chrV 399921 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.132;DP=117;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1317,0,1075 chrV 400005 . A G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.355;DP=126;Dels=0.00;FS=4.353;HaplotypeScore=3.1723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,51:126:99:929,0,1659 chrV 400033 . C T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.112;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.833;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1624,0,1678 chrV 400132 . C G 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;DP=143;Dels=0.00;FS=2.084;HaplotypeScore=2.7396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=1;MQRankSum=0.437;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.049;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1483,0,1383 chrV 400481 . T C 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3569,378,0 chrV 400836 . C T 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.997;DP=141;Dels=0.00;FS=2.990;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=10.68;ReadPosRankSum=-3.061;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1536,0,1367 chrV 400856 . C T 4145.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.74;SB=-2.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:4145,397,0 chrV 400882 . A G 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.578;DP=154;Dels=0.00;FS=2.857;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=9.30;ReadPosRankSum=-2.316;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1462,0,1675 chrV 400890 . G A 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.869;DP=146;Dels=0.00;FS=2.098;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.471;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1671,0,1314 chrV 400915 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.217;DP=152;Dels=0.00;FS=4.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1304,0,1781 chrV 401085 . G A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.628;DP=151;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=11.3465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.022;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1609,0,1565 chrV 401106 . G T 1832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.489;DP=152;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=5.1936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.137;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,86:152:99:1862,0,1335 chrV 401545 . A G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.142;DP=121;Dels=0.00;FS=5.558;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.068;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1392,0,1195 chrV 402148 . G A 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.195;DP=162;Dels=0.00;FS=1.959;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.486;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,77:162:99:1678,0,1669 chrV 402168 . C T 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.507;DP=160;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:160:99:1720,0,1550 chrV 402268 . T A 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.105;DP=151;Dels=0.00;FS=3.801;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.994;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.706;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1687,0,1555 chrV 402321 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.180;DP=131;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1239,0,1563 chrV 402400 . A T 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.186;DP=144;Dels=0.00;FS=6.219;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=-1.488;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.282;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1550,0,1536 chrV 402550 . C A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;DP=162;Dels=0.00;FS=3.630;HaplotypeScore=4.7905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,79:162:99:1624,0,1786 chrV 402722 . G A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.478;DP=137;Dels=0.00;FS=3.125;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.522;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:137:99:1108,0,1754 chrV 403012 . C A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;DP=130;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1523,0,1249 chrV 403054 . A G 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.812;DP=95;Dels=0.00;FS=1.677;HaplotypeScore=5.0979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:95:99:932,0,984 chrV 403078 . G A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.579;DP=104;Dels=0.00;FS=13.164;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.810;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:956,0,1235 chrV 403529 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.293;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.376;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:130:99:1132,0,1498 chrV 403557 . T C 2438 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2471,261,0 chrV 403690 . A T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.999;DP=120;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=2.9534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1248,0,1256 chrV 403778 . T C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.771;DP=123;Dels=0.00;FS=2.348;HaplotypeScore=6.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1090,0,1422 chrV 404317 . T C 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3706,396,0 chrV 404530 . A T 580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.974;DP=92;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=2.8485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=6.30;ReadPosRankSum=-1.422;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:610,0,461 chrV 404541 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.683;DP=102;Dels=0.00;FS=3.714;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.169;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.799;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,62:102:99:1060,0,362 chrV 404924 . T G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.744;DP=126;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.294;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1449,0,1188 chrV 406177 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.266;DP=129;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.203;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1374,0,1303 chrV 406216 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;DP=113;Dels=0.00;FS=4.593;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.497;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1053,0,1282 chrV 406271 . A G 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.631;DP=114;Dels=0.00;FS=1.609;HaplotypeScore=2.8815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.127;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:932,0,1497 chrV 406631 . A G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.925;DP=129;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.304;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:129:99:1098,0,1625 chrV 406750 . C T 525.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.748;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.541;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:78:99:555,0,987 chrV 406753 . G A 543.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.746;DP=76;Dels=0.00;FS=0.882;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.394;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,28:76:99:573,0,974 chrV 406754 . G A 543.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.149;DP=78;Dels=0.00;FS=0.881;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.282;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:78:99:573,0,994 chrV 406935 . G T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.602;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.514;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:1002,0,891 chrV 407018 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.515;DP=130;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1271,0,1582 chrV 407063 . C T 704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;DP=156;Dels=0.00;FS=3.883;HaplotypeScore=11.7866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.646;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,61:156:99:734,0,2054 chrV 407153 . T A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=0.093;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.060;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1252,0,1515 chrV 407199 . T C 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.519;DP=84;Dels=0.00;FS=4.338;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=12.86;ReadPosRankSum=1.255;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,51:84:99:1110,0,589 chrV 407205 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.477;DP=83;Dels=0.00;FS=4.182;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.47;ReadPosRankSum=2.097;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,49:83:99:1065,0,626 chrV 407246 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.143;DP=99;Dels=0.00;FS=6.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.823;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1149,0,987 chrV 407419 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.495;DP=117;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=10.26;ReadPosRankSum=2.952;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1230,0,1295 chrV 407658 . C A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.442;DP=142;Dels=0.00;FS=3.005;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.507;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1315,0,1684 chrV 407664 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.636;DP=137;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=8.82;ReadPosRankSum=-2.369;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1239,0,1708 chrV 407957 . G T 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=28.34;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3288,334,0 chrV 408132 . T C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.851;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.872;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1466,0,1098 chrV 408209 . G A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.080;DP=113;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1374,0,1147 chrV 408389 . G A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.783;DP=102;Dels=0.00;FS=3.799;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1010,0,1077 chrV 408422 . T C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.117;DP=116;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=2.5615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.761;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:116:99:1407,0,952 chrV 408467 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.706;DP=144;Dels=0.00;FS=8.028;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1508,0,1495 chrV 408635 . T A 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.291;DP=140;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:140:99:1758,0,1245 chrV 409151 . A G 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.755;DP=151;Dels=0.00;FS=2.932;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=11.50;ReadPosRankSum=-2.268;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,83:151:99:1766,0,1410 chrV 409170 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.748;DP=133;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=5.4349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1289,0,1477 chrV 409183 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.481;DP=140;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=4.4541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.457;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1330,0,1497 chrV 409209 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.567;DP=137;Dels=0.00;FS=5.581;HaplotypeScore=6.4718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.770;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1274,0,1603 chrV 409300 . T C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.981;DP=143;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.315;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1265,0,1597 chrV 409394 . A G 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.777;DP=98;Dels=0.00;FS=13.962;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.199;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1080,0,998 chrV 409500 . G A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.754;DP=130;Dels=0.00;FS=5.219;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1441,0,1040 chrV 409510 . C T 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5280;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.13;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3225,333,0 chrV 409701 . C T 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.913;DP=92;Dels=0.00;FS=3.875;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.562;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:991,0,925 chrV 409812 . T C 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.722;DP=97;Dels=0.00;FS=5.194;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,56:97:99:1150,0,885 chrV 410293 . C T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.915;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=2;MQRankSum=0.084;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1448,0,961 chrV 410311 . C G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.355;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=2;MQRankSum=0.383;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.171;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1156,0,955 chrV 410317 . G A 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.193;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=2;MQRankSum=-0.328;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1246,0,945 chrV 410473 . G A 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.998;DP=124;Dels=0.00;FS=3.274;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1356,0,1259 chrV 410518 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.335;DP=134;Dels=0.00;FS=4.611;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.700;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1535,0,1272 chrV 410808 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.161;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:1095,0,1889 chrV 410863 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.656;DP=138;Dels=0.00;FS=10.567;HaplotypeScore=6.3353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.418;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1112,0,1663 chrV 410947 . G A 4129.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.65;SB=-2.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4129,394,0 chrV 411192 . C T 1908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.079;DP=132;Dels=0.00;FS=4.325;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=14.45;ReadPosRankSum=0.560;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,83:132:99:1938,0,897 chrV 411913 . A G 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.783;DP=151;Dels=0.00;FS=2.184;HaplotypeScore=2.7570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1522,0,1585 chrV 412969 . T G 2252 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.374;DP=97;Dels=0.00;FS=2.797;HaplotypeScore=8.2570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=2.399;QD=23.22;ReadPosRankSum=1.688;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,95:97:99:2285,240,0 chrV 413281 . T A 2286 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2319,243,0 chrV 414190 . T A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.746;DP=157;Dels=0.00;FS=3.923;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.479;QD=9.31;ReadPosRankSum=2.085;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,67:157:99:1492,0,1880 chrV 414243 . A G 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.944;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,58:145:99:1126,0,1956 chrV 414642 . T C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.549;DP=131;Dels=0.00;FS=15.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.643;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1404,0,1328 chrV 414720 . C T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.745;DP=182;Dels=0.00;FS=1.270;HaplotypeScore=7.8900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.840;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,84:182:99:1642,0,2097 chrV 414780 . T C 2058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.016;DP=195;Dels=0.00;FS=4.085;HaplotypeScore=3.4852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.116;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,101:195:99:2088,0,2048 chrV 415070 . G A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.342;DP=119;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.474;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1086,0,1485 chrV 415310 . T C 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3992,420,0 chrV 415673 . G C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;DP=128;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=3.3171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1151,0,1383 chrV 416326 . A G 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.970;DP=123;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.227;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1340,0,1317 chrV 416432 . C G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;DP=140;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.754;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1380,0,1414 chrV 416654 . T A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;DP=138;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.016;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1460,0,1400 chrV 416792 . C T 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6070;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3147,316,0 chrV 416841 . C T 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3472,346,0 chrV 416871 . G C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.841;DP=131;Dels=0.01;FS=3.177;HaplotypeScore=6.8250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1278,0,1331 chrV 416905 . T G 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3743,399,0 chrV 417297 . A G 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3374,351,0 chrV 417511 . G A 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2912,294,0 chrV 418504 . A G 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2532,276,0 chrV 418792 . G A 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3208,321,0 chrV 419085 . C G 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3061,315,0 chrV 419378 . T C 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2971,303,0 chrV 419568 . G A 1292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=25.33;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1325,138,0 chrV 419631 . T G 1633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.43;MQ0=1;QD=18.77;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1666,171,0 chrV 419777 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.483;DP=129;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1323,0,1372 chrV 419827 . T A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;DP=118;Dels=0.00;FS=4.511;HaplotypeScore=2.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.398;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1093,0,1502 chrV 419849 . T A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.470;DP=120;Dels=0.00;FS=11.780;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1155,0,1511 chrV 420040 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.695;DP=127;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1341,0,1334 chrV 420175 . T C 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.437;DP=151;Dels=0.00;FS=15.665;HaplotypeScore=8.6970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.523;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1489,0,1550 chrV 420199 . T C 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.496;DP=154;Dels=0.00;FS=11.718;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1718,0,1572 chrV 420266 . T C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.179;DP=154;Dels=0.00;FS=2.861;HaplotypeScore=3.5735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:154:99:1296,0,1905 chrV 420279 . A G 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.986;DP=127;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=3.8715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.885;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1011,0,1648 chrV 420290 . C T 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.141;DP=114;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:912,0,1410 chrV 420292 . C T 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3204,342,0 chrV 420376 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.648;DP=140;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.753;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1367,0,1589 chrV 420432 . A G 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.665;DP=97;Dels=0.00;FS=5.875;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.018;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:951,0,1118 chrV 420478 . C A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.440;DP=120;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.528;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1145,0,1400 chrV 420596 . C A 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3439,349,0 chrV 420619 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.017;DP=138;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.700;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1341,0,1431 chrV 420828 . T G 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.770;DP=107;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.739;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:751,0,1295 chrV 420990 . G A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.974;DP=141;Dels=0.00;FS=6.295;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=10.69;ReadPosRankSum=-2.543;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1537,0,1425 chrV 421040 . C T 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2964,306,0 chrV 421100 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.913;DP=122;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.632;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1360,0,1153 chrV 421229 . C T 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.890;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.207;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1532,0,875 chrV 421423 . A T 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.755;DP=137;Dels=0.00;FS=2.176;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1575,0,1319 chrV 421634 . A G 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.927;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.774;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:970,0,1670 chrV 422021 . C T 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3353,348,0 chrV 422183 . C T 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=28.15;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3575,364,0 chrV 422226 . A C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;DP=118;Dels=0.00;FS=5.745;HaplotypeScore=4.3710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.047;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:118:99:1323,0,1110 chrV 422255 . T C 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=123;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.165;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:123:99:1333,0,1171 chrV 422613 . G C 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.22;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3101,330,0 chrV 423233 . G C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.199;DP=139;Dels=0.00;FS=3.571;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.626;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1217,0,1455 chrV 423401 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.486;DP=118;Dels=0.00;FS=2.578;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.291;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1366,0,1160 chrV 423827 . A G 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3121,330,0 chrV 424454 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.923;DP=124;Dels=0.00;FS=5.236;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.043;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1245,0,1310 chrV 424671 . T C 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.9663;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.417;QD=25.78;ReadPosRankSum=1.965;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,150:152:99:3919,397,0 chrV 424859 . C T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.604;DP=146;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.356;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1478,0,1627 chrV 425002 . G A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3264,328,0 chrV 425036 . G T 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.666;DP=106;Dels=0.00;FS=4.814;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:923,0,1072 chrV 425066 . A G 2211 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.84;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:2244,234,0 chrV 425334 . A G 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3569,366,0 chrV 425833 . G C 4118.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.11;SB=-2.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4118,426,0 chrV 425936 . C T 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3635,370,0 chrV 426243 . A G 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3723,393,0 chrV 426331 . C A 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3054,306,0 chrV 426348 . A G 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.036;DP=122;Dels=0.00;FS=4.413;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.441;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1130,0,1478 chrV 426433 . A G 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3513,375,0 chrV 426481 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3269,333,0 chrV 426512 . G T 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.956;DP=142;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,60:142:99:1241,0,1708 chrV 426811 . A G 2019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.980;DP=168;Dels=0.00;FS=1.256;HaplotypeScore=4.2794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.299;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.021;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,98:168:99:2049,0,1495 chrV 426940 . G T 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3089,312,0 chrV 426961 . T C 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3259,351,0 chrV 427627 . T A 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3637,370,0 chrV 427920 . A G 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6137;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3446,348,0 chrV 428227 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.032;DP=125;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.052;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1233,0,1386 chrV 428230 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.863;DP=127;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.385;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1381,0,1286 chrV 428251 . T G 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3520,369,0 chrV 428311 . C T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.797;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1562,0,1329 chrV 428507 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.263;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1449,0,1088 chrV 428551 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.727;DP=116;Dels=0.00;FS=4.534;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:116:99:1174,0,1252 chrV 428593 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.719;DP=134;Dels=0.00;FS=4.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1467,0,1270 chrV 428611 . C T 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.179;DP=124;Dels=0.00;FS=5.439;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.595;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1482,0,1228 chrV 428644 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.685;DP=130;Dels=0.00;FS=14.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.564;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1397,0,1345 chrV 428691 . T C 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.975;DP=162;Dels=0.00;FS=3.627;HaplotypeScore=2.4557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.407;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.792;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1658,0,1777 chrV 428860 . T C 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3681,381,0 chrV 428948 . A G 3871.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3871,390,0 chrV 429094 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.074;DP=146;Dels=0.00;FS=4.986;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.159;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1469,0,1588 chrV 429408 . C T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.410;DP=109;Dels=0.00;FS=3.676;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.580;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,66:109:99:1497,0,808 chrV 429460 . A C 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2933,309,0 chrV 429466 . C T 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3029,306,0 chrV 429589 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.504;DP=116;Dels=0.00;FS=3.375;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.525;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1102,0,1062 chrV 429593 . T A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.771;DP=118;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.682;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.671;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:118:99:1144,0,1203 chrV 429823 . A T 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3343,348,0 chrV 429966 . C G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.886;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=2.552;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:1274,0,1684 chrV 430009 . G A 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3257,319,0 chrV 430033 . G A 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.97;SB=-2.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4046,409,0 chrV 430454 . A T 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3465,355,0 chrV 430574 . A G 1643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.231;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:1676,186,0 chrV 430597 . A G 2356 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=1;QD=18.41;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:2389,258,0 chrV 430620 . T G 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3238,345,0 chrV 430652 . G A 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3544,349,0 chrV 430822 . A G 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3653,381,0 chrV 430837 . G A 4172.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4172,436,0 chrV 430899 . T C 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.71;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3754,396,0 chrV 430927 . T A 3953.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3953,385,0 chrV 431050 . C A 2748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.76;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2781,291,0 chrV 431114 . G A 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3371,340,0 chrV 431224 . C T 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2976,303,0 chrV 431454 . G T 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=98;Dels=0.00;FS=2.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.473;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:998,0,1043 chrV 431488 . G C 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.869;DP=83;Dels=0.00;FS=27.202;HaplotypeScore=25.1711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.163;QD=0.21;ReadPosRankSum=1.072;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,20:83:47:47,0,1206 chrV 431649 . A G 142.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.683;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.17;MQ0=24;MQRankSum=0.339;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,33:85:99:172,0,106 chrV 431690 . T A 80.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.80;MQ0=23;MQRankSum=3.689;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.728;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,5:91:87:110,0,87 chrV 431812 . T C 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;DP=16;Dels=0.00;FS=7.830;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.06;MQ0=2;MQRankSum=1.892;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.225;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,8:16:6:55,6,0 chrV 431815 . C T 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.073;DP=14;Dels=0.00;FS=18.921;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.48;MQ0=1;MQRankSum=0.691;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,11:14:6:58,6,0 chrV 431836 . C T 788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.31;MQ0=0;QD=9.85;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:80:87:821,87,0 chrV 431930 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.729;DP=112;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=4.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:112:99:1232,0,1230 chrV 432113 . C G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.730;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1458,0,1121 chrV 432587 . A G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.722;DP=131;Dels=0.00;FS=2.273;HaplotypeScore=2.9539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.854;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,52:131:99:1012,0,1842 chrV 432695 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.879;DP=118;Dels=0.00;FS=7.338;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.212;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1085,0,1440 chrV 433178 . C T 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.876;DP=131;Dels=0.00;FS=8.292;HaplotypeScore=14.2501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=0.20;ReadPosRankSum=-8.040;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,78:131:56:56,0,820 chrV 433628 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.018;DP=125;Dels=0.00;FS=3.562;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.086;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1309,0,1273 chrV 433760 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.637;DP=103;Dels=0.00;FS=5.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.077;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1281,0,946 chrV 433844 . T C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.472;DP=96;Dels=0.00;FS=1.660;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=9.49;ReadPosRankSum=-2.008;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:941,0,1086 chrV 434403 . A T 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.524;DP=98;Dels=0.00;FS=2.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.877;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:919,0,1255 chrV 434405 . A G 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.079;DP=97;Dels=0.00;FS=3.878;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=8.34;ReadPosRankSum=2.078;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:839,0,1268 chrV 434623 . T C 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.53;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2870,297,0 chrV 434860 . C T 433.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.199;DP=277;Dels=0.00;FS=35.766;HaplotypeScore=10.9573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.97;MQ0=154;MQRankSum=1.253;QD=1.56;ReadPosRankSum=2.073;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,34:277:99:463,0,1430 chrV 434869 . A G 498.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.919;DP=285;Dels=0.00;FS=26.837;HaplotypeScore=6.0505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.17;MQ0=146;MQRankSum=-0.002;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.075;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,41:285:99:528,0,1650 chrV 434924 . T C 678.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.199;DP=223;Dels=0.00;FS=25.014;HaplotypeScore=9.8382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.34;MQ0=70;MQRankSum=-0.391;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,50:222:99:708,0,1915 chrV 434928 . A G 691.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.853;DP=218;Dels=0.00;FS=22.484;HaplotypeScore=9.8382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.90;MQ0=66;MQRankSum=-0.127;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,50:218:99:721,0,1951 chrV 434949 . G A 1092.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.516;DP=166;Dels=0.00;FS=24.116;HaplotypeScore=8.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.05;MQ0=7;MQRankSum=1.953;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.896;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,62:166:99:1122,0,1858 chrV 434979 . T C 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.629;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.268;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1138,0,1205 chrV 434981 . T A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.932;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.031;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1266,0,1247 chrV 435085 . T A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.502;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.858;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1538,0,1420 chrV 435140 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.258;DP=117;Dels=0.00;FS=3.401;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:117:99:1338,0,1161 chrV 435174 . A G 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.019;DP=158;Dels=0.00;FS=5.768;HaplotypeScore=5.6800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.866;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:158:99:1676,0,1593 chrV 435194 . G C 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.384;DP=143;Dels=0.00;FS=3.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.236;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1642,0,1211 chrV 435213 . C G 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.747;DP=126;Dels=0.00;FS=3.299;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=11.90;ReadPosRankSum=-2.881;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1530,0,1001 chrV 435221 . G T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;DP=114;Dels=0.00;FS=3.474;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.88;MQ0=1;MQRankSum=-2.170;QD=11.50;ReadPosRankSum=-2.315;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1341,0,952 chrV 435243 . G A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.304;DP=111;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=1;MQRankSum=-3.057;QD=10.33;ReadPosRankSum=2.375;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1177,0,1043 chrV 435309 . T A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.235;DP=143;Dels=0.00;FS=6.461;HaplotypeScore=2.6204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.744;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1532,0,1392 chrV 435596 . C G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.099;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1403,0,1184 chrV 435632 . G A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.206;DP=128;Dels=0.00;FS=5.417;HaplotypeScore=3.2558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.108;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1582,0,1070 chrV 435665 . C T 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.119;DP=120;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.987;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,70:120:99:1574,0,937 chrV 435836 . T A 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;DP=107;Dels=0.00;FS=10.955;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.592;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,44:107:99:758,0,1389 chrV 435844 . A C 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.166;DP=110;Dels=0.00;FS=12.781;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:786,0,1362 chrV 435858 . A G 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;DP=105;Dels=0.00;FS=3.793;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQ0=0;MQRankSum=-4.089;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.668;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:705,0,1269 chrV 435863 . A T 2468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.75;MQ0=0;QD=24.44;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2501,249,0 chrV 435886 . G A 523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.379;DP=68;Dels=0.00;FS=6.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.106;QD=7.69;ReadPosRankSum=2.217;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:553,0,755 chrV 436418 . C T 322.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.658;DP=96;Dels=0.00;FS=31.977;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=0;MQRankSum=-4.390;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:352,0,1571 chrV 436499 . A G 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.802;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-4.417;QD=7.03;ReadPosRankSum=-2.636;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,39:100:99:733,0,1370 chrV 436528 . T C 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.911;DP=111;Dels=0.00;FS=3.554;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-3.846;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.385;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:957,0,1461 chrV 436536 . T G 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.611;DP=112;Dels=0.00;FS=3.507;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.372;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.167;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:926,0,1439 chrV 436572 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.982;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=4.808;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1185,0,902 chrV 436897 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.376;DP=115;Dels=0.00;FS=8.868;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=1;MQRankSum=0.342;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:115:99:1169,0,1273 chrV 437231 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.551;DP=113;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.003;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1337,0,1182 chrV 437378 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.177;DP=100;Dels=0.00;FS=2.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.989;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1114,0,926 chrV 437901 . C T 695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.832;DP=79;Dels=0.00;FS=3.091;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:725,0,884 chrV 438038 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.204;DP=89;Dels=0.00;FS=5.964;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.004;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,53:89:99:1155,0,763 chrV 438230 . T A 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3373,351,0 chrV 438396 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.855;DP=137;Dels=0.00;FS=27.393;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1277,0,1448 chrV 438514 . G C 3835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3835,390,0 chrV 438579 . C T 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.259;DP=129;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=9.55;ReadPosRankSum=-2.122;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1262,0,1384 chrV 438623 . A C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.364;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.788;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1175,0,1554 chrV 438684 . C A 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3179,301,0 chrV 438836 . A C 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.770;DP=100;Dels=0.00;FS=2.640;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=10.34;ReadPosRankSum=2.230;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1064,0,926 chrV 438881 . G A 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.644;DP=97;Dels=0.00;FS=2.639;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:965,0,1037 chrV 438887 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.701;DP=99;Dels=0.00;FS=2.609;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:968,0,1095 chrV 438929 . T C 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.842;DP=96;Dels=0.00;FS=2.684;HaplotypeScore=3.3415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.717;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:834,0,1174 chrV 439039 . C T 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.837;DP=89;Dels=0.00;FS=1.748;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=10.12;ReadPosRankSum=-2.121;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:931,0,975 chrV 439082 . G A 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.923;DP=100;Dels=0.00;FS=3.675;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.310;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1013,0,1040 chrV 439161 . A C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;DP=129;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=3.0689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.841;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1289,0,1445 chrV 439188 . A T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.565;DP=116;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.201;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1319,0,1286 chrV 439255 . A G 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3769,393,0 chrV 439285 . C T 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3337,331,0 chrV 439581 . C T 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.255;DP=127;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=2.6670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.400;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1098,0,1479 chrV 439909 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.694;DP=127;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=5.9544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1275,0,1489 chrV 440428 . C G 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.076;DP=98;Dels=0.00;FS=8.104;HaplotypeScore=5.1289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.950;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:939,0,1079 chrV 441142 . T G 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.293;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.7572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.190;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:97:99:911,0,848 chrV 441237 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=1;MQRankSum=-0.479;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.744;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1616,0,1657 chrV 441329 . C T 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.726;DP=131;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.385;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1586,0,1294 chrV 441415 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.104;DP=120;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=3.2704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.363;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1179,0,1304 chrV 441532 . G T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.428;DP=139;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.365;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1528,0,1292 chrV 441625 . C T 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.644;DP=134;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=6.4270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.395;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.119;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:134:99:1573,0,1327 chrV 441679 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.550;DP=165;Dels=0.00;FS=5.004;HaplotypeScore=4.2952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1451,0,1902 chrV 441820 . T C 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.993;DP=149;Dels=0.00;FS=2.911;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=10.04;ReadPosRankSum=-2.672;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1526,0,1772 chrV 441843 . A G 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.624;DP=140;Dels=0.00;FS=11.198;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1476,0,1539 chrV 441870 . T A 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.802;DP=135;Dels=0.00;FS=4.191;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=11.18;ReadPosRankSum=3.325;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1539,0,1471 chrV 441880 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.298;DP=132;Dels=0.00;FS=4.513;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=11.39;ReadPosRankSum=2.589;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1533,0,1386 chrV 441963 . T C 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.298;DP=123;Dels=0.00;FS=8.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.190;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1158,0,1382 chrV 442211 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.659;DP=114;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.957;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1033,0,1285 chrV 442386 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.732;DP=140;Dels=0.00;FS=5.356;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.084;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1330,0,1517 chrV 442510 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.755;DP=107;Dels=0.00;FS=4.841;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.708;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1346,0,933 chrV 442511 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.283;DP=107;Dels=0.00;FS=4.841;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.784;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1378,0,950 chrV 442543 . A G 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.510;DP=122;Dels=0.00;FS=10.194;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,50:122:99:974,0,1619 chrV 442565 . G A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;DP=128;Dels=0.00;FS=11.177;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.147;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1299,0,1396 chrV 442568 . T G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.552;DP=128;Dels=0.00;FS=8.069;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1183,0,1517 chrV 442662 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.106;DP=111;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.277;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1244,0,1176 chrV 442663 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.295;DP=111;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.513;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1272,0,1175 chrV 442769 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.641;DP=146;Dels=0.00;FS=2.393;HaplotypeScore=7.8076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.843;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1350,0,1765 chrV 442915 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.917;DP=117;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.505;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1138,0,1343 chrV 442961 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.769;DP=137;Dels=0.00;FS=5.171;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=9.37;ReadPosRankSum=2.104;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1313,0,1404 chrV 443051 . T C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.455;DP=111;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=2.171;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1332,0,1067 chrV 443089 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.157;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.986;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1182,0,1255 chrV 443290 . T G 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.91;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.423;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:786,0,885 chrV 443296 . T C 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.854;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.16;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:785,0,888 chrV 443322 . G A 485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.324;DP=61;Dels=0.00;FS=2.128;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.03;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.539;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:515,0,749 chrV 443323 . A G 477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.995;DP=61;Dels=0.00;FS=7.265;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.70;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.378;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:507,0,791 chrV 449159 . T A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.24;MQ0=18;QD=1.08;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,5:23:6:56,6,0 chrV 449277 . T C 578 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.23;MQ0=0;QD=23.12;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:69:611,69,0 chrV 449310 . C T 786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.08;MQ0=0;QD=26.20;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:81:819,81,0 chrV 449578 . A G 666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.55;MQ0=2;QD=23.79;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:78:699,78,0 chrV 449623 . T G 175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.241;DP=16;Dels=0.00;FS=36.994;HaplotypeScore=4.9680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.60;MQ0=1;MQRankSum=2.770;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-3.000e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:86:205,0,86 chrV 449630 . A T 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;DP=21;Dels=0.00;FS=15.513;HaplotypeScore=3.9367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.07;MQ0=1;MQRankSum=2.276;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.045;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:53:53,0,278 chrV 449685 . T C 249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=84;Dels=0.00;FS=19.645;HaplotypeScore=4.8622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.866;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,24:84:99:279,0,1320 chrV 449726 . C A 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.768;DP=113;Dels=0.00;FS=33.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=7.78;ReadPosRankSum=-3.070;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,45:113:99:909,0,1438 chrV 449755 . G A 718.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.664;DP=112;Dels=0.00;FS=31.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=6.41;ReadPosRankSum=4.849;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,40:112:99:748,0,1605 chrV 449759 . A T 621.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.527;DP=107;Dels=0.00;FS=36.874;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.80;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=5.80;ReadPosRankSum=5.584;SB=-8.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,37:107:99:651,0,1594 chrV 449760 . T C 624.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;DP=107;Dels=0.00;FS=36.874;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=5.83;ReadPosRankSum=5.689;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,37:107:99:654,0,1579 chrV 449815 . T A 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.072;DP=86;Dels=0.00;FS=10.951;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.257;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:908,0,965 chrV 449816 . T C 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.142;DP=86;Dels=0.00;FS=10.951;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:838,0,987 chrV 449829 . C T 742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.830;DP=84;Dels=0.00;FS=6.305;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.505;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,37:84:99:772,0,990 chrV 449841 . A G 651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.141;DP=83;Dels=0.00;FS=6.369;HaplotypeScore=30.9283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.90;MQ0=0;MQRankSum=-3.656;QD=7.84;ReadPosRankSum=2.808;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:681,0,1052 chrV 449874 . T C 540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;DP=65;Dels=0.00;FS=22.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.06;MQ0=0;MQRankSum=-4.748;QD=8.31;ReadPosRankSum=-2.055;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:570,0,675 chrV 449907 . C T 359.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.841;DP=52;Dels=0.00;FS=22.975;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.16;MQ0=0;MQRankSum=-4.406;QD=6.90;ReadPosRankSum=1.821;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:389,0,519 chrV 449908 . A G 339.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.388;DP=52;Dels=0.00;FS=22.975;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.16;MQ0=0;MQRankSum=-4.444;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.972;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:369,0,553 chrV 449914 . A G 342.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.908;DP=52;Dels=0.00;FS=27.196;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.16;MQ0=0;MQRankSum=-4.965;QD=6.58;ReadPosRankSum=2.270;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:372,0,514 chrV 449943 . G A 487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.609;DP=47;Dels=0.00;FS=21.746;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.835;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:517,0,392 chrV 449952 . A G 563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.929;DP=55;Dels=0.00;FS=42.047;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.874;SB=-2.168e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:593,0,471 chrV 449956 . T C 471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.814;DP=49;Dels=0.00;FS=34.913;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.49;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.693;SB=-1.818e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:501,0,454 chrV 450073 . C T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.227;DP=113;Dels=0.00;FS=3.440;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.01;MQ0=0;MQRankSum=2.761;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.040;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1132,0,1137 chrV 450248 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.728;DP=136;Dels=0.00;FS=4.035;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=2.797;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.034;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1534,0,1252 chrV 450260 . C T 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.406;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=2.936;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.026;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,84:146:99:1805,0,1272 chrV 450290 . A G 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.754;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=2.366;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.040;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:1631,0,1079 chrV 450386 . C T 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3131,324,0 chrV 450644 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.157;DP=121;Dels=0.00;FS=3.307;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.209;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1064,0,1426 chrV 451138 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.891;DP=140;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=8.9287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:140:99:1324,0,1655 chrV 451601 . G A 2005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.149;DP=176;Dels=0.00;FS=0.558;HaplotypeScore=9.4939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.518;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,97:176:99:2035,0,1544 chrV 451909 . A G 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.048;DP=144;Dels=0.00;FS=1.331;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.337;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.190;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1556,0,1547 chrV 452483 . A C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.196;DP=120;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.292;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1259,0,1275 chrV 452746 . G A 1867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.224;DP=165;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=5.7941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:1897,0,1529 chrV 452786 . A G 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.449;DP=138;Dels=0.00;FS=9.418;HaplotypeScore=3.7773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.981;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.419;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1635,0,1255 chrV 452827 . T C 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.446;DP=120;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,73:120:99:1567,0,967 chrV 452954 . T C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.934;DP=141;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.959;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1359,0,1597 chrV 453024 . T C 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.291;DP=160;Dels=0.00;FS=9.584;HaplotypeScore=2.6355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.531;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1499,0,1737 chrV 453309 . T G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.820;DP=98;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.513;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1092,0,971 chrV 453437 . G C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.583;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1141,0,1533 chrV 453661 . A G 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.652;DP=93;Dels=0.00;FS=3.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=1;MQRankSum=0.512;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.187;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:818,0,1005 chrV 453740 . C T 588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.287;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:618,0,840 chrV 453798 . C T 497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.517;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:527,0,826 chrV 453842 . T C 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.580;DP=111;Dels=0.00;FS=2.624;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:838,0,1388 chrV 453920 . T C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.988;DP=97;Dels=0.00;FS=12.004;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1111,0,976 chrV 454118 . G A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.113;DP=95;Dels=0.00;FS=5.243;HaplotypeScore=4.0562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,54:95:99:1174,0,795 chrV 454140 . C T 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.587;DP=116;Dels=0.00;FS=4.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.544;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1582,0,854 chrV 454541 . G A 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.114;DP=155;Dels=0.00;FS=5.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=9.42;ReadPosRankSum=-2.837;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1490,0,1679 chrV 454697 . A C 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.927;DP=144;Dels=0.00;FS=2.105;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.393;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1680,0,1335 chrV 454979 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.070;DP=108;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.679;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1134,0,1116 chrV 455275 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.149;DP=115;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1398,0,1028 chrV 455575 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.039;DP=111;Dels=0.00;FS=4.640;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.327;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1169,0,1213 chrV 455676 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.616;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.107;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1246,0,1334 chrV 455960 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.011;DP=105;Dels=0.00;FS=12.865;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1231,0,763 chrV 456048 . C T 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.431;DP=116;Dels=0.00;FS=3.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:993,0,1296 chrV 456087 . A G 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.344;DP=101;Dels=0.00;FS=2.582;HaplotypeScore=5.6340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.855;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:844,0,1225 chrV 456116 . A T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;DP=105;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.478;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1176,0,1067 chrV 456140 . G A 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.335;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1197,0,946 chrV 456254 . A G 607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.535;DP=69;Dels=0.00;FS=0.908;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:637,0,791 chrV 456278 . C A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.460;DP=97;Dels=0.00;FS=3.843;HaplotypeScore=5.7504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.735;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:967,0,1084 chrV 456505 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.682;DP=132;Dels=0.00;FS=5.324;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=10.75;ReadPosRankSum=-2.141;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1449,0,1376 chrV 456690 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.268;DP=124;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1332,0,1323 chrV 457177 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.437;DP=116;Dels=0.00;FS=1.524;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.171;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1536,0,983 chrV 457376 . C G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.551;DP=122;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.889;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1288,0,1153 chrV 457421 . C T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.341;DP=123;Dels=0.00;FS=4.447;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1418,0,1198 chrV 457524 . T A 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,79:133:99:1648,0,1125 chrV 457596 . T C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.678;DP=162;Dels=0.00;FS=4.703;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.488;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,73:162:99:1520,0,1917 chrV 458086 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.742;DP=139;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=4.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.508;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1439,0,1514 chrV 458088 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.996;DP=133;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.790;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1434,0,1439 chrV 458181 . C G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;DP=124;Dels=0.00;FS=5.538;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.150;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1163,0,1478 chrV 458604 . A T 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.734;DP=151;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.897;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1835,0,1522 chrV 458610 . A G 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.735;DP=166;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.968;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,86:166:99:1753,0,1685 chrV 458640 . T C 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.838;DP=138;Dels=0.00;FS=2.238;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1528,0,1562 chrV 458865 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.410;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1333,0,1472 chrV 458964 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.642;DP=137;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1039,0,1735 chrV 459185 . A G 1960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.333;DP=166;Dels=0.00;FS=8.935;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.405;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,91:166:99:1990,0,1645 chrV 459399 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.002;DP=150;Dels=0.00;FS=3.263;HaplotypeScore=6.9489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.294;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:150:99:1469,0,1708 chrV 459479 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.027;DP=143;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1484,0,1610 chrV 459578 . A G 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.146;DP=160;Dels=0.00;FS=2.786;HaplotypeScore=4.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1748,0,1671 chrV 459581 . T C 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.954;DP=164;Dels=0.00;FS=1.932;HaplotypeScore=4.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.003;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:1751,0,1661 chrV 459697 . C T 1833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.034;DP=156;Dels=0.00;FS=3.793;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.844;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.442;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,87:156:99:1863,0,1345 chrV 459740 . C T 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.203;DP=167;Dels=0.00;FS=1.997;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.849;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,89:167:99:1766,0,1609 chrV 459813 . A G 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.480;DP=140;Dels=0.00;FS=3.058;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,80:140:99:1716,0,1279 chrV 459953 . T C 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.585;DP=164;Dels=0.00;FS=10.771;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=2.208;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,76:164:99:1514,0,1847 chrV 460003 . C G 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.168;DP=173;Dels=0.00;FS=10.507;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.193;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.283;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,81:173:99:1606,0,1845 chrV 460008 . T C 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.597;DP=178;Dels=0.00;FS=11.611;HaplotypeScore=3.7665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.533;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,87:178:99:1712,0,1925 chrV 460044 . G A 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.020;DP=167;Dels=0.00;FS=3.647;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,87:167:99:1820,0,1627 chrV 460131 . A G 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.489;DP=164;Dels=0.00;FS=2.774;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.424;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,83:164:99:1610,0,1620 chrV 460182 . A G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.714;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.316;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1253,0,1411 chrV 460225 . A G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.920;DP=138;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=2;MQRankSum=1.156;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.726;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1284,0,1429 chrV 460772 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.381;DP=134;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.412;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1371,0,1511 chrV 460898 . A G 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.966;DP=207;Dels=0.00;FS=0.514;HaplotypeScore=7.5816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.958;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.189;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,89:207:99:1760,0,2582 chrV 460913 . C T 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.896;DP=206;Dels=0.00;FS=1.098;HaplotypeScore=4.1114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.766;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,81:206:99:1680,0,2658 chrV 461351 . G A 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.328;DP=157;Dels=0.00;FS=1.986;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.392;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,78:157:99:1673,0,1694 chrV 461615 . C T 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.766;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,85:174:99:1705,0,1793 chrV 462222 . C G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.750;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1367,0,1667 chrV 462226 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.231;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=66.3641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.623;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.978;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1331,0,1619 chrV 462249 . A G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.750;DP=151;Dels=0.00;FS=4.814;HaplotypeScore=2.7769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.446;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1516,0,1630 chrV 462261 . A G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.281;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1364,0,1636 chrV 462437 . A G 1286.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.210;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1316,0,1534 chrV 462446 . G A 1438.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.457;DP=139;Dels=0.00;FS=4.078;HaplotypeScore=6.4830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1468,0,1311 chrV 462447 . C T 1461.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.434;DP=139;Dels=0.00;FS=5.079;HaplotypeScore=5.4872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.192;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1491,0,1330 chrV 462614 . A G 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.897;DP=186;Dels=0.00;FS=2.800;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=9.61;ReadPosRankSum=-2.176;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,90:186:99:1818,0,2094 chrV 463004 . C T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.817;DP=119;Dels=0.00;FS=6.572;HaplotypeScore=4.2847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.456;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:119:99:979,0,1256 chrV 463157 . G A 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.111;DP=172;Dels=0.00;FS=2.668;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=2.528;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.064;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,92:172:99:1910,0,1583 chrV 463319 . C T 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.167;DP=156;Dels=0.00;FS=13.978;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=9.61;ReadPosRankSum=-2.020;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1529,0,1539 chrV 463593 . G T 4755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=22.97;SB=-2.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:4755,478,0 chrV 464103 . C T 2430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.427;DP=206;Dels=0.00;FS=5.331;HaplotypeScore=4.7602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.730;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,115:206:99:2460,0,1728 chrV 464164 . G A 2310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=2.374;QD=11.73;ReadPosRankSum=-3.353;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,108:197:99:2340,0,1687 chrV 464192 . A G 1890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.089;DP=183;Dels=0.00;FS=3.741;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.637;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,90:183:99:1920,0,2082 chrV 464291 . T C 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3525,369,0 chrV 464304 . C G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=137;Dels=0.00;FS=5.113;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=10.78;ReadPosRankSum=2.228;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1507,0,1346 chrV 464494 . G A 4365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4365,436,0 chrV 464736 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.691;DP=172;Dels=0.00;FS=7.844;HaplotypeScore=5.4945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=1.333;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.689;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,80:172:99:1643,0,1992 chrV 464776 . G A 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.533;DP=165;Dels=0.00;FS=4.580;HaplotypeScore=4.3661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=1;MQRankSum=-0.536;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1618,0,1808 chrV 464956 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.541;DP=123;Dels=0.00;FS=9.219;HaplotypeScore=2.8153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.572;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1194,0,1484 chrV 464985 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.059;DP=121;Dels=0.00;FS=10.657;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.159;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1116,0,1437 chrV 465018 . G A 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.166;DP=143;Dels=0.01;FS=6.390;HaplotypeScore=5.7053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.048;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1113,0,1486 chrV 465109 . T C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;DP=143;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.133;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1365,0,1531 chrV 465644 . A G 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.442;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.755;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,83:144:99:1821,0,1233 chrV 465653 . C A 1878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.686;DP=144;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,83:144:99:1908,0,1199 chrV 465743 . G A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.604;DP=138;Dels=0.00;FS=9.151;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.651;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.002;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1266,0,1638 chrV 465932 . A G 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.124;DP=155;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.884;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1604,0,1650 chrV 466246 . G T 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.366;DP=136;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.437;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1358,0,1558 chrV 466688 . G A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.321;DP=129;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.080;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1211,0,1523 chrV 466781 . C T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.470;DP=133;Dels=0.00;FS=4.415;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.016;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1111,0,1563 chrV 466823 . G C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.365;DP=162;Dels=0.00;FS=1.343;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.595;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,66:162:99:1184,0,2035 chrV 467219 . G A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.482;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.932;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,77:184:99:1524,0,2304 chrV 467312 . G A 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.456;DP=159;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=3.1835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,78:159:99:1615,0,1690 chrV 467489 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.011;DP=150;Dels=0.00;FS=3.880;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.454;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:150:99:1535,0,1493 chrV 467523 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.590;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.656;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1435,0,1395 chrV 467553 . T C 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3593,378,0 chrV 468178 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.753;DP=114;Dels=0.00;FS=3.357;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.907;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1134,0,1269 chrV 468183 . C G 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=116;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=2.7994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.288;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1046,0,1284 chrV 468194 . T C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.907;DP=112;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.435;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1030,0,1360 chrV 468269 . C T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.930;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.652;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1240,0,1066 chrV 468307 . G T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;DP=146;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1477,0,1425 chrV 468390 . C T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.784;DP=115;Dels=0.00;FS=4.534;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=10.52;ReadPosRankSum=2.403;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1240,0,1163 chrV 468645 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.832;DP=135;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1228,0,1532 chrV 468665 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.935;DP=121;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.016;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:121:99:1251,0,1126 chrV 468752 . C G 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;DP=138;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.760;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:138:99:1010,0,1807 chrV 468838 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.130;DP=144;Dels=0.00;FS=5.160;HaplotypeScore=3.2295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1605,0,1528 chrV 468932 . A T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.850;DP=106;Dels=0.00;FS=2.855;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.645;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1102,0,1167 chrV 469002 . C T 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;DP=120;Dels=0.00;FS=1.801;HaplotypeScore=5.2896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:817,0,1044 chrV 469007 . C T 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.854;DP=123;Dels=0.00;FS=0.808;HaplotypeScore=4.7112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:909,0,1114 chrV 469078 . A G 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.238;DP=133;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1574,0,1301 chrV 469111 . A C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.355;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.658;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:1378,0,1992 chrV 469112 . T C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.663;DP=170;Dels=0.00;FS=1.190;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=8.71;ReadPosRankSum=-2.129;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,77:170:99:1511,0,1994 chrV 469145 . T C 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.126;DP=188;Dels=0.00;FS=1.151;HaplotypeScore=5.0919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.621;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,87:188:99:1764,0,2088 chrV 469150 . T G 1796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.327;DP=194;Dels=0.00;FS=0.531;HaplotypeScore=5.4856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.846;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,92:194:99:1826,0,2104 chrV 469292 . G A 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.910;DP=155;Dels=0.00;FS=4.918;HaplotypeScore=2.3249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1685,0,1424 chrV 469325 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.494;DP=112;Dels=0.00;FS=16.846;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.361;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1257,0,1026 chrV 469327 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.785;DP=119;Dels=0.00;FS=19.927;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1343,0,1116 chrV 469412 . C T 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.297;DP=155;Dels=0.00;FS=4.725;HaplotypeScore=5.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.658;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.020;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1677,0,1572 chrV 469422 . T C 1374.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.616;DP=147;Dels=0.00;FS=4.896;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.594;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.982;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1404,0,1665 chrV 469423 . T C 1279.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.754;DP=154;Dels=0.00;FS=5.776;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.725;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1309,0,1764 chrV 469424 . T C 1222.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.215;DP=154;Dels=0.00;FS=5.776;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.787;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.645;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1252,0,1765 chrV 469454 . A G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.294;DP=132;Dels=0.00;FS=14.615;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1250,0,1488 chrV 469975 . C T 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.342;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.095;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1533,0,1422 chrV 470217 . A G 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.299;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.915;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,92:179:99:1854,0,1812 chrV 470253 . C T 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.788;DP=168;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=2.9732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,86:168:99:1760,0,1678 chrV 470259 . G A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.166;DP=146;Dels=0.00;FS=2.224;HaplotypeScore=2.8446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.292;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1503,0,1646 chrV 470764 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.482;DP=124;Dels=0.00;FS=6.832;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:124:99:1055,0,1494 chrV 470796 . T C 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.676;DP=138;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1420,0,1487 chrV 471259 . T A,C 2712.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.79;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,56,58:114:99:2772,1369,1203,1403,0,1241 chrV 471723 . T C 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.784;DP=150;Dels=0.00;FS=3.824;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:150:99:1676,0,1459 chrV 471759 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.822;DP=128;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.480;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1390,0,1388 chrV 471798 . G A 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.873;DP=150;Dels=0.00;FS=4.866;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.814;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1622,0,1462 chrV 471807 . C T 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.145;DP=141;Dels=0.00;FS=3.955;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.128;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.776;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1656,0,1319 chrV 471885 . A T 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1739,0,1522 chrV 471960 . C T 1950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.218;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.769;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,99:175:99:1980,0,1482 chrV 472051 . C T 1932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.865;DP=152;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.916;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,88:152:99:1962,0,1257 chrV 472093 . C T 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.840;DP=142;Dels=0.00;FS=5.042;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.545;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1645,0,1299 chrV 472109 . T C 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;DP=156;Dels=0.00;FS=4.748;HaplotypeScore=8.9963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:1634,0,1449 chrV 472245 . A G 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.869;DP=167;Dels=0.00;FS=3.067;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.187;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,81:167:99:1616,0,1747 chrV 472446 . G A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.632;DP=148;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=4.8786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.918;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1299,0,1487 chrV 472453 . G A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.097;DP=135;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=5.2896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1211,0,1305 chrV 472577 . C T 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.526;DP=191;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=8.4641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.936;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,97:191:99:1776,0,1978 chrV 472604 . T C 1754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.009;DP=176;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=18.1982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,91:176:99:1784,0,1761 chrV 472664 . G A 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.966;DP=185;Dels=0.00;FS=4.202;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.136;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,86:185:99:1840,0,2012 chrV 472738 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.302;DP=167;Dels=0.00;FS=4.280;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,74:167:99:1172,0,2109 chrV 472753 . A T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.278;DP=138;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.050;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.505;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:138:99:1141,0,1775 chrV 472756 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.248;DP=133;Dels=0.00;FS=2.395;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.120;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1143,0,1673 chrV 473281 . T C 1975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.846;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=2.647;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.833;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,100:203:99:2005,0,2171 chrV 473482 . A G 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.301;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.332;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,88:173:99:1738,0,1704 chrV 473791 . A G 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.224;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=0.224;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.489;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,78:165:99:1527,0,1855 chrV 473861 . T C 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.455;DP=158;Dels=0.00;FS=1.976;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=10.10;ReadPosRankSum=2.401;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1626,0,1651 chrV 473890 . G C 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;DP=144;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.271;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,86:144:99:1670,0,1077 chrV 473893 . C G 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.459;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1624,0,1372 chrV 473950 . C T 1980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.798;DP=167;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.441;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,91:167:99:2010,0,1489 chrV 474020 . A G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.915;DP=116;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.804;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:116:99:1335,0,1026 chrV 474031 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.236;DP=110;Dels=0.00;FS=2.538;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.166;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1456,0,933 chrV 474077 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.551;DP=131;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.927;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1290,0,1407 chrV 474191 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;DP=140;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=3.4894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.293;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.125;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1172,0,1223 chrV 474245 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.777;DP=147;Dels=0.00;FS=2.917;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.099;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1378,0,1521 chrV 474267 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.619;DP=149;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.055;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1426,0,1610 chrV 474268 . T C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.907;DP=151;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1468,0,1621 chrV 474470 . A G 1933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.149;DP=195;Dels=0.00;FS=2.483;HaplotypeScore=2.5625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,95:195:99:1963,0,2047 chrV 474506 . C T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.932;DP=165;Dels=0.00;FS=2.727;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.631;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1655,0,1662 chrV 474569 . G A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;DP=170;Dels=0.00;FS=1.921;HaplotypeScore=2.8558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,82:170:99:1375,0,1619 chrV 474622 . T C 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.499;DP=199;Dels=0.01;FS=25.978;HaplotypeScore=22.1518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=9.01;ReadPosRankSum=3.047;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,100:198:99:1823,0,2057 chrV 474623 . A G 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.648;DP=196;Dels=0.01;FS=22.517;HaplotypeScore=21.1585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=9.17;ReadPosRankSum=3.130;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,98:195:99:1828,0,2001 chrV 474636 . G A 1751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.938;DP=187;Dels=0.00;FS=28.188;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=2.396;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.115;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,87:187:99:1781,0,2006 chrV 474641 . C T 1960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.430;DP=179;Dels=0.00;FS=24.835;HaplotypeScore=2.8267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.177;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,96:179:99:1990,0,1609 chrV 474671 . C T 1970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.313;DP=189;Dels=0.00;FS=13.422;HaplotypeScore=2.4876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,98:189:99:2000,0,1849 chrV 474714 . G A 1587.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.553;DP=167;Dels=0.01;FS=0.586;HaplotypeScore=10.0808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.882;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1617,0,1472 chrV 474715 . C G 1531.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.885;DP=165;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.0808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.845;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,85:163:99:1561,0,1530 chrV 474722 . A G 1559.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.966;DP=154;Dels=0.00;FS=6.055;HaplotypeScore=9.0472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,85:154:99:1589,0,1418 chrV 474743 . A G 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.982;DP=153;Dels=0.00;FS=2.853;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=1.761;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1660,0,1433 chrV 474860 . G A 1934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.126;DP=168;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.622;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.693;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1964,0,1615 chrV 474936 . A G 1961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.279;DP=181;Dels=0.00;FS=2.012;HaplotypeScore=4.2666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=1;MQRankSum=3.309;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.095;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,93:181:99:1991,0,995 chrV 475014 . C T 1906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.859;DP=195;Dels=0.00;FS=2.483;HaplotypeScore=3.6932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.066;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,103:195:99:1936,0,1822 chrV 475027 . A T 2077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.115;DP=204;Dels=0.00;FS=0.514;HaplotypeScore=3.3056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.327;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,110:204:99:2107,0,2039 chrV 475031 . C T 2005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.885;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.275;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,106:198:99:2035,0,1855 chrV 475088 . A C 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.279;DP=150;Dels=0.00;FS=4.866;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.404;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.494;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1431,0,1714 chrV 475107 . C T 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.321;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1647,0,1792 chrV 475151 . G C 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.997;DP=170;Dels=0.00;FS=1.283;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.816;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,80:170:99:1596,0,1804 chrV 475154 . G A 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.341;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,84:174:99:1746,0,1743 chrV 475308 . T C 1884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.745;DP=181;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=5.8281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.260;QD=10.41;ReadPosRankSum=-2.056;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,91:181:99:1914,0,1947 chrV 475496 . T C 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.201;DP=152;Dels=0.00;FS=10.205;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.933;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:1642,0,1489 chrV 475529 . G A 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.165;DP=148;Dels=0.00;FS=13.236;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1732,0,1442 chrV 475583 . A G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.380;DP=115;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:115:99:1320,0,1165 chrV 475620 . C T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.835;DP=152;Dels=0.00;FS=2.869;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.333;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1562,0,1588 chrV 475649 . C T 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.205;DP=160;Dels=0.00;FS=1.947;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.119;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1809,0,1635 chrV 476003 . A G 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.811;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=2;MQRankSum=1.240;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.474;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1502,0,1623 chrV 476048 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.831;DP=124;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=3.5996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=2;MQRankSum=2.222;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.481;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1112,0,1424 chrV 476144 . G A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.314;DP=138;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=11.62;ReadPosRankSum=3.168;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1633,0,1233 chrV 476183 . A G 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.464;DP=129;Dels=0.00;FS=3.176;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1491,0,1304 chrV 476227 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.116;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.209;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1270,0,1268 chrV 476337 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.286;DP=143;Dels=0.00;FS=2.127;HaplotypeScore=52.6184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.855;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1184,0,1811 chrV 476465 . T C 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.574;DP=120;Dels=0.00;FS=5.546;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.451;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1277,0,1278 chrV 476681 . T C 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.889;DP=135;Dels=0.00;FS=4.095;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.386;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1524,0,1277 chrV 476809 . G A 2056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.250;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.394;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,90:151:99:2086,0,1073 chrV 476888 . C T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.196;DP=130;Dels=0.00;FS=8.043;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.628;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1247,0,1472 chrV 476891 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.203;DP=129;Dels=0.00;FS=5.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.263;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1168,0,1568 chrV 477110 . G A 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.148;DP=177;Dels=0.00;FS=0.557;HaplotypeScore=8.4356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.848;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,81:177:99:1558,0,2134 chrV 477331 . T G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.318;DP=142;Dels=0.00;FS=11.925;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.210;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,61:142:99:1114,0,1824 chrV 477332 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.906;DP=142;Dels=0.00;FS=11.950;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:142:99:1189,0,1828 chrV 477380 . T C 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.634;DP=164;Dels=0.00;FS=5.217;HaplotypeScore=3.0818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.361;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,73:164:99:1300,0,2008 chrV 477413 . G A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.691;DP=150;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.343;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.627;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1428,0,1668 chrV 477476 . C T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=138;Dels=0.00;FS=2.205;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1479,0,1386 chrV 477503 . A G 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.391;DP=153;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.954;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1587,0,1632 chrV 477563 . C T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.194;DP=122;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1250,0,1435 chrV 477635 . G A 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.353;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.826;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1026,0,1125 chrV 477753 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.966;DP=127;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.825;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1286,0,1406 chrV 477784 . G A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.009;DP=115;Dels=0.00;FS=1.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.255;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:1020,0,1368 chrV 477836 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.949;DP=124;Dels=0.00;FS=2.445;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.067;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1296,0,1230 chrV 478040 . A C 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.583;DP=145;Dels=0.00;FS=3.951;HaplotypeScore=2.1101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1432,0,1587 chrV 479609 . G T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.0703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.495;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:125:99:1425,0,1087 chrV 480007 . A C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.418;DP=117;Dels=0.00;FS=4.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1134,0,1363 chrV 480036 . A G 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2918,321,0 chrV 480047 . G C 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.395;DP=115;Dels=0.00;FS=2.441;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1088,0,1250 chrV 480125 . C T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.334;DP=118;Dels=0.00;FS=8.602;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1192,0,1166 chrV 480365 . A G 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.030;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,41:118:99:761,0,1750 chrV 480374 . A T 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;DP=107;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,39:107:99:761,0,1607 chrV 480402 . T C 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2846,300,0 chrV 480677 . A T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;DP=134;Dels=0.00;FS=11.039;HaplotypeScore=5.0659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:134:99:1615,0,1160 chrV 480891 . G A 2905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2938,300,0 chrV 480895 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.921;DP=123;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=10.88;ReadPosRankSum=-2.189;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1368,0,1113 chrV 480959 . A G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.712;DP=100;Dels=0.00;FS=1.628;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.079;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:100:99:1216,0,897 chrV 481233 . A G 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3154,333,0 chrV 481268 . C A 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3220,319,0 chrV 481400 . T C 3750.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3750,396,0 chrV 481448 . T C 4130.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.97;SB=-2.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4130,414,0 chrV 481570 . A G 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5937;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.90;SB=-2.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3807,396,0 chrV 481740 . T C 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3253,342,0 chrV 481764 . T C 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3274,348,0 chrV 481769 . G A 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3345,336,0 chrV 481967 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.050;DP=124;Dels=0.00;FS=3.268;HaplotypeScore=2.7700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1264,0,1261 chrV 482268 . C T 3561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.82;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3561,358,0 chrV 482384 . G C 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3214,345,0 chrV 482408 . A G 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.047;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.417;QD=24.72;ReadPosRankSum=1.014;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,147:149:99:3684,384,0 chrV 482461 . C G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;DP=146;Dels=0.00;FS=2.896;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.27;ReadPosRankSum=-2.334;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1529,0,1429 chrV 482513 . A T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;DP=139;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=8.14;ReadPosRankSum=-2.320;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1162,0,1760 chrV 482536 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.917;DP=136;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1326,0,1588 chrV 482671 . G A 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.192;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1728,0,1492 chrV 482745 . G A 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.998;DP=146;Dels=0.00;FS=3.899;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=2.290;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1608,0,1342 chrV 482776 . A G 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.260;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:142:99:1572,0,1364 chrV 482896 . G A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.082;DP=144;Dels=0.00;FS=3.932;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.753;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1436,0,1494 chrV 483316 . C T 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.894;DP=129;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.861;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1488,0,1197 chrV 483439 . C T 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.948;DP=152;Dels=0.00;FS=3.796;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=-0.035;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1610,0,1506 chrV 483535 . A T 4169.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5524;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:4169,424,0 chrV 483550 . G A 1876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.524;DP=156;Dels=0.00;FS=10.116;HaplotypeScore=2.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.286;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,87:155:99:1906,0,1410 chrV 483728 . C T 4048.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.35;SB=-2.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4048,400,0 chrV 483871 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.785;DP=131;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=3.8649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1196,0,1528 chrV 483994 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.355;DP=146;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=8.75;ReadPosRankSum=2.040;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1308,0,1810 chrV 484002 . T C 3727.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3727,396,0 chrV 484207 . C T 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.605;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1612,0,1313 chrV 484306 . T A 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.834e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3333,348,0 chrV 484412 . G C 4211.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7870;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4211,435,0 chrV 484537 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.337;DP=139;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=3.7644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1334,0,1443 chrV 484694 . G A 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.647;DP=165;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=2.785;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.601;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1635,0,1726 chrV 484723 . A G 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.867;DP=168;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1773,0,1688 chrV 484787 . G A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.544;DP=173;Dels=0.00;FS=0.560;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.253;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,85:173:99:1658,0,1869 chrV 484851 . T G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.337;DP=129;Dels=0.00;FS=1.418;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1148,0,1603 chrV 484910 . A G 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.988e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3780,390,0 chrV 484935 . A G 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3437,357,0 chrV 485053 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.971;DP=151;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.491;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1167,0,1987 chrV 485264 . A G 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3047,324,0 chrV 485288 . C G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;DP=130;Dels=0.00;FS=12.774;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1257,0,1348 chrV 485312 . T C 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3285,336,0 chrV 485333 . A G 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2972,303,0 chrV 485396 . G A 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=1;QD=26.72;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3079,312,0 chrV 485579 . C T 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3080,318,0 chrV 485599 . T C 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3151,330,0 chrV 485875 . G A 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.524;DP=170;Dels=0.00;FS=2.959;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.437;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,83:170:99:1690,0,1806 chrV 485936 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.614;DP=138;Dels=0.00;FS=6.275;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.748;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.693;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1384,0,1615 chrV 485939 . G A 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.194;DP=140;Dels=0.00;FS=6.314;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.225;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1674,0,1329 chrV 485993 . T C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.633;DP=180;Dels=0.00;FS=2.647;HaplotypeScore=5.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.194;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,77:180:99:1464,0,2329 chrV 486330 . A T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.286;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.309;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1232,0,1576 chrV 486661 . T C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.744;DP=117;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=9.21;ReadPosRankSum=2.058;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1108,0,1274 chrV 486920 . G A 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3749,355,0 chrV 487118 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.525;DP=114;Dels=0.00;FS=4.861;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:114:99:1224,0,1194 chrV 487184 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.244;DP=124;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.629;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1184,0,1457 chrV 487427 . T C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.366;DP=134;Dels=0.00;FS=3.344;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1351,0,1462 chrV 487604 . G A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.576;DP=132;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=2.8195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.463;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1523,0,1316 chrV 487678 . A G 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.964;DP=116;Dels=0.00;FS=4.807;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1021,0,1372 chrV 487689 . A C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.468;DP=115;Dels=0.00;FS=6.048;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:1015,0,1416 chrV 487792 . G C 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.649;DP=123;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=-4.302;QD=5.79;ReadPosRankSum=2.757;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:742,0,1593 chrV 488187 . G C 107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.855;DP=119;Dels=0.00;FS=3.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-4.124;QD=0.90;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,39:119:99:137,0,1784 chrV 488507 . A C 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.993;DP=107;Dels=0.00;FS=3.636;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=-3.640;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:869,0,1362 chrV 488516 . A G 729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.803;DP=92;Dels=0.00;FS=0.793;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQ0=0;MQRankSum=-4.069;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:759,0,1243 chrV 488527 . T G 2502 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2535,270,0 chrV 488534 . A G 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.58;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2711,288,0 chrV 488556 . G C 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.864;DP=129;Dels=0.00;FS=4.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.153;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.895;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1153,0,1510 chrV 488644 . C T 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.33;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2690,273,0 chrV 488650 . T C 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2615,273,0 chrV 488666 . T C 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.258;DP=113;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=3.7449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.113;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.610;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:910,0,1426 chrV 488835 . G A 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3189,322,0 chrV 488899 . G A 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.88;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3624,376,0 chrV 488982 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.901;DP=114;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1427,0,936 chrV 489011 . T C 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.419;DP=110;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=2.6935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.287;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1103,0,1169 chrV 489026 . A G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=25.56;ReadPosRankSum=-1.270;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,119:121:99:3126,302,0 chrV 489169 . C A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.418;DP=134;Dels=0.00;FS=3.115;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.132;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1309,0,1436 chrV 489262 . C G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.332;DP=154;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=3.7686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.054;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1605,0,1510 chrV 489427 . G A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.033;DP=175;Dels=0.00;FS=2.880;HaplotypeScore=3.8537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=2.667;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.649;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,79:175:99:1644,0,2042 chrV 489460 . T C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.602;DP=169;Dels=0.00;FS=1.235;HaplotypeScore=5.9539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.895;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,74:169:99:1404,0,2092 chrV 489879 . C T 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.499;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:120:99:1135,0,1274 chrV 489888 . G A 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.877;DP=110;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.794;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:957,0,1267 chrV 489897 . T C 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.700;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.336;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:818,0,1475 chrV 490057 . C T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.601;DP=130;Dels=0.00;FS=3.386;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.385;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1203,0,1546 chrV 490075 . A G 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.841;DP=157;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1502,0,1712 chrV 490102 . G A 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.767;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1673,0,1442 chrV 490183 . G A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.301;DP=150;Dels=0.00;FS=32.541;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=2.187;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.650;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1389,0,1660 chrV 490207 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.042;DP=145;Dels=0.00;FS=15.394;HaplotypeScore=3.2231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.590;QD=7.63;ReadPosRankSum=1.281;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:145:99:1137,0,1742 chrV 490267 . A G 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;DP=132;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=5.9218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=0.18;ReadPosRankSum=-3.479;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,12:132:54:54,0,1328 chrV 490291 . G A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.667;DP=126;Dels=0.00;FS=8.043;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.811;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1230,0,1278 chrV 490294 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.903;DP=127;Dels=0.00;FS=6.725;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-3.238;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.442;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1228,0,1297 chrV 490306 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.002;DP=125;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.159;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1162,0,1261 chrV 490354 . G A 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.510;DP=161;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.874;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1790,0,1521 chrV 490456 . A G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.103;DP=121;Dels=0.00;FS=13.769;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.315;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:988,0,1482 chrV 490516 . A C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.658;DP=154;Dels=0.00;FS=15.256;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=0.221;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.984;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1455,0,1760 chrV 490694 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.408;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.697;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,69:163:99:1352,0,2061 chrV 490952 . C T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.851;DP=139;Dels=0.01;FS=2.218;HaplotypeScore=15.7130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.006;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1609,0,1363 chrV 491135 . G A 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.021;DP=138;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.546;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1483,0,1416 chrV 491222 . G A 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.703;DP=156;Dels=0.00;FS=8.403;HaplotypeScore=5.4145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1629,0,1531 chrV 491262 . T C 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.979;DP=150;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=3.3551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.913;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1522,0,1446 chrV 491424 . G A 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.847;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.7782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=2.629;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.554;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,89:184:99:1898,0,1935 chrV 491522 . C T 2014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.561;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.536;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,96:185:99:2044,0,1786 chrV 491556 . T C 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.434;DP=156;Dels=0.00;FS=2.577;HaplotypeScore=5.3756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.229;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1602,0,1708 chrV 491806 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.013;DP=153;Dels=0.00;FS=6.162;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.334;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1473,0,1592 chrV 492013 . A T 144.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.950;DP=107;Dels=0.00;FS=124.242;HaplotypeScore=44.1645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.749;SB=-4.795e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:174,0,423 chrV 492048 . T C 340.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;DP=101;Dels=0.00;FS=44.986;HaplotypeScore=15.2171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.801;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,36:101:99:370,0,1176 chrV 492095 . G T 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.858;DP=87;Dels=0.00;FS=6.238;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:844,0,1004 chrV 492163 . A G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.571;DP=98;Dels=0.00;FS=1.697;HaplotypeScore=2.4691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,59:98:99:1230,0,801 chrV 492293 . A G 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.126;DP=93;Dels=0.00;FS=3.298;HaplotypeScore=2.7171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.896;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:793,0,1202 chrV 498517 . G A 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.321;QD=0.43;ReadPosRankSum=-5.147;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:53:53,0,739 chrV 498534 . G A 1888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.71;MQ0=0;QD=22.48;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1921,189,0 chrV 498570 . C A 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.668;DP=104;Dels=0.00;FS=11.214;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.35;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:971,0,1008 chrV 498571 . A G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.479;DP=104;Dels=0.00;FS=9.289;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.990;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:104:99:1020,0,981 chrV 498634 . C T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.616;DP=82;Dels=0.00;FS=26.370;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.71;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=15.85;ReadPosRankSum=2.105;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,57:82:99:1330,0,345 chrV 498849 . C T 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.945;DP=104;Dels=0.00;FS=4.916;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.797;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:965,0,1243 chrV 498872 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.362;DP=127;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=4.9349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.530;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1513,0,1117 chrV 498934 . G A 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.377;DP=150;Dels=0.00;FS=1.541;HaplotypeScore=62.3567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.412;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1558,0,1422 chrV 498959 . T C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.884;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1033,0,1258 chrV 499040 . T C 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.733;DP=91;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.283;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:814,0,1112 chrV 499569 . T C 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.620;DP=175;Dels=0.00;FS=2.636;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,90:175:99:1728,0,1756 chrV 499617 . A G 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3475,366,0 chrV 499716 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.727;DP=124;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.010;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1413,0,1321 chrV 499745 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.952;DP=106;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.779;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1192,0,1142 chrV 500063 . G T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.523;DP=135;Dels=0.00;FS=3.277;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1593,0,1288 chrV 500515 . A C 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.029;DP=116;Dels=0.00;FS=3.434;HaplotypeScore=3.8111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.882;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1386,0,1075 chrV 500524 . C G 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.118;DP=116;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.280;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:995,0,1407 chrV 500567 . G T 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3025,303,0 chrV 500599 . T A 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.347;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.220;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:99:99:1058,0,1082 chrV 500606 . T A 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=1;QD=24.75;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2755,279,0 chrV 500619 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.804;DP=116;Dels=0.00;FS=1.505;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=1;MQRankSum=0.310;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1171,0,1280 chrV 500680 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.205;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=1;MQRankSum=0.624;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.061;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1180,0,1327 chrV 500783 . G T 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.59;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3407,343,0 chrV 500797 . C T 1244.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.508;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.613;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1274,0,1252 chrV 500798 . T C 3148 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.10;MQ0=0;QD=23.67;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3181,339,0 chrV 500804 . G A 1284.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.111;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=2.158;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.403;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1314,0,1419 chrV 500850 . A G 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.233;DP=164;Dels=0.00;FS=3.651;HaplotypeScore=6.7546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1543,0,1813 chrV 500985 . T C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.186;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1280,0,1495 chrV 501338 . C T 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3976,400,0 chrV 501438 . T C 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.928;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.257;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1575,0,1846 chrV 501719 . A T 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3552,367,0 chrV 501764 . T C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3558,364,0 chrV 501989 . T G 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3651,381,0 chrV 502049 . A T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.720;DP=150;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1334,0,1799 chrV 502082 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.898;DP=120;Dels=0.00;FS=3.409;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=11.97;ReadPosRankSum=1.152;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1466,0,1032 chrV 502169 . T G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.558;DP=118;Dels=0.00;FS=7.056;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1234,0,1206 chrV 502906 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.035;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:129:99:1254,0,1389 chrV 502911 . T C 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3121,336,0 chrV 502929 . T A 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.138;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.709;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.469;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,87:160:99:1788,0,1570 chrV 502939 . T C 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.708;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.562;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,92:174:99:1848,0,1796 chrV 502995 . T A 4417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4417,442,0 chrV 503046 . C T 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.771;DP=175;Dels=0.00;FS=2.639;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=9.90;ReadPosRankSum=2.212;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,80:175:99:1763,0,2014 chrV 503099 . T C 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.442;DP=161;Dels=0.00;FS=4.779;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,89:161:99:1901,0,1588 chrV 503231 . G C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;DP=144;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.026;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1365,0,1506 chrV 503237 . T C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.435;DP=135;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.086;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1488,0,1391 chrV 503411 . A G 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.006;DP=181;Dels=0.00;FS=3.024;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.716;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,90:181:99:1800,0,1983 chrV 503447 . G A 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.997;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.0500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1654,0,1491 chrV 503456 . C T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.902;DP=151;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=5.5407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.516;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1506,0,1577 chrV 503600 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.601;DP=123;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.825;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1413,0,1113 chrV 503618 . T C 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.956;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1085,0,1543 chrV 503711 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.044;DP=141;Dels=0.00;FS=9.025;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.102;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1196,0,1699 chrV 503840 . T C 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.989e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3912,399,0 chrV 503864 . T C 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2881,303,0 chrV 503909 . T A 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4227;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=25.59;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2746,294,0 chrV 504008 . G A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.423;DP=125;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=3.3816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.181;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1244,0,1227 chrV 504013 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.374;DP=141;Dels=0.00;FS=3.256;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.358;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:141:99:1305,0,1481 chrV 504037 . A T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;DP=157;Dels=0.00;FS=2.941;HaplotypeScore=3.9622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=8.95;ReadPosRankSum=2.316;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,67:157:99:1435,0,2001 chrV 504050 . C T 4356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.56;SB=-2.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4356,430,0 chrV 504112 . G A 1786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.481;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.749;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,81:144:99:1816,0,1229 chrV 504185 . G A 4480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.05;SB=-2.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4480,430,0 chrV 504211 . A C 4139.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4139,409,0 chrV 504218 . A G 4178.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4178,417,0 chrV 504280 . G C 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3207,342,0 chrV 504324 . T C 3794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3794,384,0 chrV 504333 . G A 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4021,388,0 chrV 504390 . G A 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.928e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3601,355,0 chrV 504471 . T A 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3662,373,0 chrV 504506 . A G 4307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.64;SB=-2.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4307,444,0 chrV 504622 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.469;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.618;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1565,0,1401 chrV 504710 . T C 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.05;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3214,333,0 chrV 504711 . A T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.97;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3265,328,0 chrV 504723 . G A 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.36;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3156,313,0 chrV 504739 . T C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=132;Dels=0.00;FS=3.724;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=23.51;ReadPosRankSum=0.682;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3136,301,0 chrV 504934 . C T 4706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=1;QD=27.36;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4706,475,0 chrV 505084 . C T 1942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.142;DP=158;Dels=0.00;FS=6.301;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.129;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1972,0,1458 chrV 505198 . G A 3936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3936,388,0 chrV 505228 . C T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;DP=126;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=2.818;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1385,0,1338 chrV 506069 . C T 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.64;SB=-2.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3893,385,0 chrV 506330 . T C 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3837,399,0 chrV 506405 . T C 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3625,360,0 chrV 506534 . A G 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7030;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4122,412,0 chrV 506573 . T C 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3790,399,0 chrV 506669 . A G 4036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.38;SB=-2.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4036,417,0 chrV 506678 . C T 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.39;SB=-2.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3926,406,0 chrV 507153 . C A 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=1;QD=27.52;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3605,364,0 chrV 507154 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.115;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=1.382;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.973;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1379,0,1599 chrV 507407 . C A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;DP=143;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.103;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1545,0,1373 chrV 507644 . G A 4050.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4050,391,0 chrV 507906 . C T 4169.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4169,409,0 chrV 508179 . A G 4058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4058,426,0 chrV 508274 . T C 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3163,333,0 chrV 508304 . A G 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2936,309,0 chrV 508632 . C G 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3810,391,0 chrV 508911 . A G 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:4109,420,0 chrV 509188 . G A 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3313,325,0 chrV 509412 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.935;DP=119;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=2.7021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.748;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1136,0,1376 chrV 509583 . A G 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3928,405,0 chrV 509654 . G A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.746;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,61:142:99:1223,0,1651 chrV 509938 . C T 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.248;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.270;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1144,0,1555 chrV 510158 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.150;DP=99;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1143,0,926 chrV 510191 . G A 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3531,352,0 chrV 511446 . C T 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.003;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.869;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,74:117:99:1675,0,747 chrV 511692 . A G 736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.560;DP=89;Dels=0.00;FS=0.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-5.404;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.815;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:766,0,661 chrV 511711 . C T 741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.630;DP=85;Dels=0.00;FS=0.813;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.204;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:771,0,782 chrV 511800 . T C 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3773;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3042,321,0 chrV 511824 . C T 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3251,324,0 chrV 512486 . G A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.876;DP=118;Dels=0.00;FS=2.405;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,71:118:99:1619,0,889 chrV 512996 . A T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;DP=130;Dels=0.00;FS=5.390;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1344,0,1456 chrV 513049 . T C 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.441;DP=134;Dels=0.00;FS=9.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1327,0,1489 chrV 513154 . G A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.194;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=-0.528;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1278,0,1520 chrV 513424 . A T 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3059,306,0 chrV 514323 . G A 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2961,298,0 chrV 514855 . A G 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3242,336,0 chrV 514906 . G A 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3136,318,0 chrV 515086 . T G 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3876,405,0 chrV 515315 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.705;DP=115;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=2.5664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.578;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1353,0,1013 chrV 515785 . T C 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3022,318,0 chrV 515827 . A G 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.466;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.022;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2981,290,0 chrV 515835 . A C 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.756;DP=104;Dels=0.00;FS=2.555;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1118,0,1055 chrV 516235 . A T 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3008,309,0 chrV 516328 . C T 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3885,385,0 chrV 516427 . A G 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3599,369,0 chrV 516916 . G A 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.165;DP=110;Dels=0.00;FS=4.181;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.693;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2912,309,0 chrV 516964 . T C 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.606;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2818,300,0 chrV 517529 . T C 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.59;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3024,333,0 chrV 517582 . C T 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.275;DP=133;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.50;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.263;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1157,0,1370 chrV 517605 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.577;DP=130;Dels=0.00;FS=7.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1305,0,1252 chrV 517606 . G C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;DP=130;Dels=0.00;FS=7.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1361,0,1245 chrV 518188 . T C 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.723;DP=102;Dels=0.00;FS=1.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.864;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.673;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:996,0,1198 chrV 518374 . A G 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=23.07;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:2871,318,0 chrV 518390 . T C 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.880e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3723,399,0 chrV 518464 . G A 4305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4305,421,0 chrV 518749 . C T 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3482,336,0 chrV 518973 . A G 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2861,297,0 chrV 519067 . T A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;DP=129;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,52:129:99:1030,0,1710 chrV 519649 . C T 4152.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4152,421,0 chrV 519704 . C A 4314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.48;SB=-2.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4314,415,0 chrV 519742 . G A 1933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.264;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.139;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,93:163:99:1963,0,1344 chrV 520026 . T C 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.871;DP=148;Dels=0.00;FS=8.662;HaplotypeScore=4.7107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.687;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,84:148:99:1750,0,1256 chrV 520101 . A T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=148;Dels=0.00;FS=9.067;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1577,0,1595 chrV 520240 . A C 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.191;DP=140;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.866;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,84:140:99:1795,0,1119 chrV 520271 . G A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.446;DP=138;Dels=0.00;FS=2.223;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1274,0,1632 chrV 520333 . T C 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.066;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1624,0,1578 chrV 520484 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.766;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.428;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1339,0,1201 chrV 520666 . G A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.035;DP=133;Dels=0.00;FS=3.126;HaplotypeScore=6.9266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.855;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1245,0,1540 chrV 520669 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.236;DP=108;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=7.8207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.776;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1175,0,1088 chrV 520891 . A T 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.870;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.954;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.499;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1010,0,1143 chrV 520915 . A T 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4116;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2809,276,0 chrV 521001 . T G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.033;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.555;QD=9.64;ReadPosRankSum=-2.961;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1312,0,1339 chrV 521007 . T A 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.92;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3199,322,0 chrV 521119 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.999;DP=108;Dels=0.00;FS=7.756;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=2.439;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.264;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1411,0,871 chrV 521308 . T C 2109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=25.41;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2142,231,0 chrV 521361 . G T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.218;DP=118;Dels=0.00;FS=10.183;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.649;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1141,0,1381 chrV 521398 . A G 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3669,387,0 chrV 521557 . T A 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2810,279,0 chrV 521706 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.728;DP=124;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=2.5577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.298;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1443,0,1223 chrV 521857 . T C 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.421;DP=106;Dels=0.00;FS=5.995;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1052,0,1134 chrV 522010 . C T 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3349,336,0 chrV 522133 . A G 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.444;DP=169;Dels=0.00;FS=5.725;HaplotypeScore=2.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,94:169:99:1695,0,1612 chrV 522683 . C A 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.98;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3308,330,0 chrV 522685 . T C 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.95;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3214,327,0 chrV 522702 . G A 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=0;QD=22.49;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3024,303,0 chrV 522704 . A T 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.97;MQ0=0;QD=21.70;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3028,303,0 chrV 522739 . A C 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.84;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3252,345,0 chrV 522887 . T C 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.011;DP=138;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=2.8020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.796;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1526,0,1232 chrV 522899 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.006;DP=137;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=6.2166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.475;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:137:99:1127,0,1631 chrV 522900 . C A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.972;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1112,0,1473 chrV 522987 . A T 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;DP=141;Dels=0.01;FS=57.165;HaplotypeScore=54.1909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.67;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=0.11;ReadPosRankSum=-3.376;SB=-5.974e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,34:140:45:45,0,649 chrV 522998 . C T 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.524;DP=140;Dels=0.00;FS=216.823;HaplotypeScore=105.0842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.74;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=0.14;ReadPosRankSum=-4.828;SB=-4.795e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:50:50,0,822 chrV 523179 . A G 4223.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9703;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.39;SB=-2.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4223,444,0 chrV 523260 . C A 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3366,345,0 chrV 523266 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.114;DP=120;Dels=0.00;FS=11.827;HaplotypeScore=7.4366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1087,0,1438 chrV 523467 . C T 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.478;DP=140;Dels=0.00;FS=1.341;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.462;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.573;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1632,0,1181 chrV 523488 . A G 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3819,402,0 chrV 523592 . A G 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.055;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1763,0,1601 chrV 523683 . T C 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.56;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2530,276,0 chrV 523812 . C T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.316;DP=143;Dels=0.00;FS=3.174;HaplotypeScore=10.2416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.683;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:143:99:1486,0,1478 chrV 523831 . G A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.928;DP=126;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=10.31;ReadPosRankSum=3.359;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1329,0,1403 chrV 523845 . C G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.341;DP=124;Dels=0.00;FS=6.838;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=2.376;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1197,0,1417 chrV 524194 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.260;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.779;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:972,0,1159 chrV 524247 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.166;DP=110;Dels=0.00;FS=2.991;HaplotypeScore=5.9969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.894;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.958;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:110:99:1233,0,979 chrV 524394 . G A 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3571,343,0 chrV 524427 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.475;DP=131;Dels=0.00;FS=4.229;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1155,0,1534 chrV 524888 . C T 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.640;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.807;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1687,0,1391 chrV 524961 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.015;DP=126;Dels=0.00;FS=2.294;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.303;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1298,0,1351 chrV 525025 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.713;DP=147;Dels=0.00;FS=2.987;HaplotypeScore=2.6406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.459;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1611,0,1448 chrV 525027 . G T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;DP=151;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=2.6406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1624,0,1549 chrV 525075 . G A 3899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3899,394,0 chrV 525282 . A G 4121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:4121,438,0 chrV 525390 . T G 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=20.98;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:2928,321,0 chrV 525414 . G A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.783;DP=140;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.730;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1126,0,1289 chrV 525645 . G A 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.312;DP=158;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=3.9317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.916;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1701,0,1532 chrV 525755 . A G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.811;DP=145;Dels=0.00;FS=3.009;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1562,0,1557 chrV 525802 . G A 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.206;DP=137;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.891;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1356,0,1531 chrV 526092 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.351;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:1299,0,1752 chrV 526682 . G C 2611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2644,273,0 chrV 526712 . A T 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2913,292,0 chrV 526860 . A G 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.373;DP=121;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1383,0,1205 chrV 527192 . T C 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3182,321,0 chrV 527435 . C T 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6295;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2963,294,0 chrV 527504 . G A 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3210,310,0 chrV 527771 . C T 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3841,390,0 chrV 528932 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.808;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1289,0,1391 chrV 529484 . G T 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.229;DP=165;Dels=0.00;FS=5.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.582;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:1743,0,1838 chrV 529707 . T G 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.275;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:985,0,1297 chrV 530174 . T C 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.769;DP=99;Dels=0.00;FS=5.252;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.587;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:883,0,1114 chrV 530245 . A G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.314;DP=114;Dels=0.00;FS=3.805;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=12.96;ReadPosRankSum=-2.140;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,71:114:99:1507,0,865 chrV 530348 . C T 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.514;DP=141;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1608,0,1410 chrV 530754 . G A 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3570,361,0 chrV 530762 . G A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.512;DP=141;Dels=0.00;FS=2.184;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,56:141:99:1104,0,1816 chrV 531061 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.212;DP=147;Dels=0.00;FS=2.919;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.276;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.351;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1329,0,1673 chrV 531187 . A G 4652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4652,483,0 chrV 531723 . T A 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2490,246,0 chrV 531999 . T A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.730;DP=111;Dels=0.00;FS=5.980;HaplotypeScore=3.8474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.154;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1162,0,1255 chrV 532002 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.464;DP=115;Dels=0.00;FS=8.770;HaplotypeScore=2.8558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.497;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1316,0,1076 chrV 532191 . C T 1797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.842;DP=150;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.382;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,83:150:99:1827,0,1372 chrV 532205 . T A 2061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.777;DP=167;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,94:167:99:2091,0,1466 chrV 532386 . G A 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3341,340,0 chrV 532674 . G A 1843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.012;DP=153;Dels=0.00;FS=1.295;HaplotypeScore=3.9668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.621;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1873,0,1467 chrV 532728 . T C 4141.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7878;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.72;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4141,429,0 chrV 532772 . A T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.953;DP=137;Dels=0.00;FS=6.434;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=10.03;ReadPosRankSum=-2.801;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1404,0,1421 chrV 532794 . C T 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.654;DP=142;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1520,0,1557 chrV 533214 . C T 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.38;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2853,294,0 chrV 533244 . C A 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3280,325,0 chrV 533265 . G A 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3436,339,0 chrV 533502 . T G 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3319,345,0 chrV 534290 . A G 2106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2139,225,0 chrV 534723 . T C 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2920,303,0 chrV 534777 . T C 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.23;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2708,285,0 chrV 534888 . A T 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.672;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=-1.291;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.591;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:776,0,1056 chrV 535431 . T A 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.166;DP=104;Dels=0.00;FS=3.736;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=25.62;ReadPosRankSum=1.299;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2697,246,0 chrV 535583 . A G 4049.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.79;SB=-2.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4049,420,0 chrV 535647 . C T 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3294,328,0 chrV 535681 . G A 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3054,304,0 chrV 535805 . G A 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.32;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3415,349,0 chrV 536075 . C T 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3478,349,0 chrV 536254 . T A 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.920;DP=137;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=10.27;ReadPosRankSum=-2.370;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:136:99:1437,0,1507 chrV 536255 . T G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.054;DP=137;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=9.97;ReadPosRankSum=-2.361;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1396,0,1509 chrV 536413 . G A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.864;DP=123;Dels=0.00;FS=9.718;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.707;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.540;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1282,0,1413 chrV 536476 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.772;DP=118;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1289,0,1189 chrV 536698 . C T 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.466;DP=145;Dels=0.00;FS=3.966;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.797;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1712,0,1310 chrV 536714 . T C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.323;DP=122;Dels=0.00;FS=5.755;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1291,0,1167 chrV 536854 . T C 1789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.839;DP=136;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.223;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,86:136:99:1819,0,950 chrV 536873 . G C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;DP=156;Dels=0.00;FS=2.973;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.020;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,62:156:99:1143,0,1913 chrV 536935 . G A 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.052;DP=157;Dels=0.00;FS=2.988;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=1;MQRankSum=0.160;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.759;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1572,0,1605 chrV 537183 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.946;DP=144;Dels=0.00;FS=3.429;HaplotypeScore=1.9301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=9.22;ReadPosRankSum=-2.991;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1357,0,1673 chrV 537193 . G A 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.900;DP=125;Dels=0.00;FS=2.712;HaplotypeScore=2.8052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.685;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:125:99:1648,0,1070 chrV 537238 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.657;DP=138;Dels=0.00;FS=12.212;HaplotypeScore=3.2297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.737;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1361,0,1446 chrV 537259 . T C 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.841;DP=162;Dels=0.00;FS=1.234;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1694,0,1567 chrV 537307 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.470;DP=143;Dels=0.00;FS=5.066;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.413;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:143:99:1236,0,1606 chrV 537415 . G T 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;DP=111;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.214;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1241,0,1073 chrV 537699 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.861;DP=103;Dels=0.00;FS=4.900;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.085;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1150,0,1073 chrV 537745 . A G 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.666;DP=71;Dels=0.00;FS=1.992;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.678;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,40:71:99:848,0,642 chrV 537801 . A C 2250 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2283,237,0 chrV 537978 . G A 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.627;DP=122;Dels=0.00;FS=4.454;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.699;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1424,0,1244 chrV 538329 . A T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.468;DP=123;Dels=0.00;FS=2.738;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=11.03;ReadPosRankSum=-2.288;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1387,0,1249 chrV 538361 . A T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.971;DP=105;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.875;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1110,0,1160 chrV 538371 . A T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.589;DP=107;Dels=0.00;FS=6.881;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.527;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1176,0,1109 chrV 538885 . G C 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3258,345,0 chrV 538899 . T C 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3135,327,0 chrV 538956 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.543;DP=114;Dels=0.00;FS=2.487;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.198;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1234,0,1206 chrV 538976 . C T 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2786,279,0 chrV 539053 . G C 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3125,324,0 chrV 539207 . A T 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2936,294,0 chrV 539462 . T G 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2619,273,0 chrV 539540 . C T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.021;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.651;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1243,0,1240 chrV 539736 . A C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.787;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1326,0,1619 chrV 539935 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.358;DP=129;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=3.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1330,0,1351 chrV 540004 . T C 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.317;DP=127;Dels=0.00;FS=3.307;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.451;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:127:99:1491,0,1141 chrV 540205 . T C 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.805;DP=131;Dels=0.00;FS=3.321;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.362;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,79:131:99:1701,0,1056 chrV 540352 . A G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.097;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.721;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1332,0,1776 chrV 540409 . C A 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.696;DP=115;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.161;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:998,0,1443 chrV 540722 . T C 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3696;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3165,312,0 chrV 540957 . C T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.609;DP=127;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=3.0689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.849;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1371,0,1289 chrV 541003 . C G 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;DP=149;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.630;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.180;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1547,0,1475 chrV 541039 . G A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=137;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-2.000;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1320,0,1549 chrV 541065 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.578;DP=128;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1495,0,1174 chrV 541074 . C G 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3445,357,0 chrV 541157 . G C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.595;DP=125;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.483;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:125:99:1360,0,1128 chrV 541279 . C A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.723;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=7.5824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.913;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1199,0,1514 chrV 541352 . C T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.052;DP=154;Dels=0.00;FS=2.851;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.057;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1609,0,1700 chrV 541421 . C T 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.569;DP=159;Dels=0.00;FS=5.048;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=6.30;ReadPosRankSum=-2.051;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,55:159:99:1031,0,2300 chrV 541474 . T C 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.617;DP=129;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.97;MQ0=0;MQRankSum=-3.753;QD=6.19;ReadPosRankSum=1.905;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,49:129:99:828,0,1711 chrV 541487 . G A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.504;DP=130;Dels=0.00;FS=5.525;HaplotypeScore=4.7347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.32;MQ0=0;MQRankSum=-4.697;QD=7.12;ReadPosRankSum=2.308;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:956,0,1610 chrV 541537 . A G 595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;DP=142;Dels=0.00;FS=30.266;HaplotypeScore=4.1784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=-8.943;QD=4.19;ReadPosRankSum=-1.389;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,58:142:99:625,0,1250 chrV 541538 . T A 599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;DP=143;Dels=0.00;FS=28.908;HaplotypeScore=2.3569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.52;MQ0=0;MQRankSum=-9.085;QD=4.19;ReadPosRankSum=-1.372;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,59:143:99:629,0,1410 chrV 541549 . T A 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;DP=145;Dels=0.00;FS=9.197;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-7.676;QD=6.06;ReadPosRankSum=-2.635;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:908,0,1244 chrV 541579 . T G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.513;DP=142;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=4.9666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-5.662;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.214;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1055,0,1533 chrV 541614 . G A 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.222;DP=163;Dels=0.00;FS=2.762;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.612;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,84:163:99:1710,0,1637 chrV 541650 . G A 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.271;DP=159;Dels=0.00;FS=3.672;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:159:99:1745,0,1666 chrV 541859 . G C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.494;DP=125;Dels=0.00;FS=24.087;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.016;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1182,0,1398 chrV 541873 . G A 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3426,340,0 chrV 541972 . G A 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.294;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=0.606;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.304;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1700,0,1545 chrV 541980 . C T 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.201;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=0.367;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.980;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1689,0,1377 chrV 542049 . A G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.932;DP=149;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.205;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,63:149:99:1247,0,1904 chrV 542337 . A T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;DP=140;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:1297,0,1736 chrV 542582 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.606;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.332;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:963,0,1178 chrV 542706 . G C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.705;DP=139;Dels=0.00;FS=3.181;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.715;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1309,0,1588 chrV 542715 . C G 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.632;DP=137;Dels=0.00;FS=3.119;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.092;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1360,0,1477 chrV 542721 . T A 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;DP=137;Dels=0.00;FS=3.125;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.131;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1452,0,1485 chrV 542730 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.358;DP=139;Dels=0.00;FS=6.605;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.964;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1397,0,1612 chrV 542808 . T A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.439;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1260,0,1673 chrV 542893 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.310;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.188;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1343,0,1619 chrV 542915 . C A 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.895;DP=113;Dels=0.00;FS=1.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.388;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1106,0,1286 chrV 542939 . G A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.157;DP=112;Dels=0.00;FS=2.734;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1010,0,1301 chrV 542994 . G A 588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.799;DP=95;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.982;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,34:95:99:618,0,1340 chrV 543054 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.675;DP=145;Dels=0.00;FS=0.876;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.804;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:145:99:1506,0,1531 chrV 543103 . T C 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.623;DP=144;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=2.4115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:144:99:1640,0,1327 chrV 543135 . C T 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.593;DP=171;Dels=0.00;FS=5.207;HaplotypeScore=2.6786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.567;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,83:171:99:1782,0,1864 chrV 545025 . G T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3378,334,0 chrV 545850 . G A 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.748;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.284;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1455,0,1537 chrV 545863 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.741;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1430,0,1756 chrV 546069 . A C 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.983;DP=151;Dels=0.00;FS=3.830;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.909;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1670,0,1368 chrV 546108 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.379;DP=139;Dels=0.00;FS=1.347;HaplotypeScore=5.3190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.618;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:139:99:1346,0,1448 chrV 546141 . T A 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;DP=161;Dels=0.00;FS=8.449;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:161:99:1632,0,1760 chrV 546421 . T C 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.934;DP=100;Dels=0.00;FS=1.624;HaplotypeScore=5.7927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:100:99:883,0,946 chrV 546436 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.881;DP=128;Dels=0.00;FS=5.678;HaplotypeScore=11.3550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.596;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1413,0,983 chrV 546545 . T C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.106;DP=148;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=9.3857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.190;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,63:148:99:1166,0,1951 chrV 547317 . T C 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.620;DP=155;Dels=0.00;FS=8.503;HaplotypeScore=4.6336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.335;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1498,0,1749 chrV 547434 . G A 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.933;DP=120;Dels=0.00;FS=8.605;HaplotypeScore=2.7289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=7.61;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:943,0,1569 chrV 547620 . T C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.596;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1377,0,1577 chrV 548061 . T C 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3084,321,0 chrV 548133 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.665;DP=114;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1214,0,1232 chrV 548298 . A G 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3450,357,0 chrV 548318 . G A 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4557;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3563,358,0 chrV 548325 . A G 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4557;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3258,333,0 chrV 548345 . A G 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.10;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3067,315,0 chrV 548501 . T C 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3404,360,0 chrV 548562 . A T 3784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.82;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3784,382,0 chrV 548672 . C T 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2830,274,0 chrV 548869 . A T 4261.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4261,418,0 chrV 549055 . A G 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3652,369,0 chrV 549124 . A G 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3563,372,0 chrV 549232 . T C 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.617;DP=149;Dels=0.00;FS=7.288;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.873;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.778;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1685,0,1505 chrV 549289 . G A 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7044;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3677,373,0 chrV 549370 . T C 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2827,297,0 chrV 549585 . C T 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3787,382,0 chrV 549631 . A G 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3045,312,0 chrV 549645 . T C 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3792,396,0 chrV 549677 . A T 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3262,322,0 chrV 549690 . A C 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3153,318,0 chrV 549802 . A T 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3362,334,0 chrV 549929 . C T 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3332,328,0 chrV 549988 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.248;DP=115;Dels=0.00;FS=3.389;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.394;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1321,0,1142 chrV 550011 . C T 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2905,291,0 chrV 550074 . G A 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.944;DP=99;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.515;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:948,0,1082 chrV 550177 . G T 4187.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.50;SB=-2.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4187,415,0 chrV 550210 . A G 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5501;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3259,342,0 chrV 550227 . C T 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3087,307,0 chrV 550261 . G T 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.52;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3123,318,0 chrV 550284 . T C 2403 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.96;MQ0=0;QD=25.84;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2436,252,0 chrV 550287 . G A 2512 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;QD=26.72;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2545,255,0 chrV 550341 . T C 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3006,312,0 chrV 550381 . A G 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2472,252,0 chrV 550566 . C T 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=28.03;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2780,282,0 chrV 550744 . G C 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2491,273,0 chrV 550785 . T A 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2719,279,0 chrV 550834 . C T 2265 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2298,228,0 chrV 550949 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.946;DP=103;Dels=0.00;FS=1.610;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.482;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1236,0,847 chrV 551265 . T C 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.75;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3010,318,0 chrV 551369 . G A 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3695,387,0 chrV 551411 . T C 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.24;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3836,402,0 chrV 551439 . A G 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3619,381,0 chrV 551444 . A C 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3703,381,0 chrV 551815 . T C 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=23.52;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3020,321,0 chrV 551830 . C T 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5379;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3662,370,0 chrV 551927 . T C 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.093;DP=105;Dels=0.00;FS=2.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.248;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1251,0,988 chrV 552374 . A G 2218 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2251,246,0 chrV 552479 . C A 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2890,285,0 chrV 552597 . C T 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3206,309,0 chrV 552602 . A G 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3109,300,0 chrV 552684 . T C 2563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=1;QD=23.30;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2596,276,0 chrV 553016 . G A 2288 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.00;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2321,228,0 chrV 553226 . T C 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.274;DP=121;Dels=0.00;FS=3.194;HaplotypeScore=4.9641;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=24.14;ReadPosRankSum=1.474;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:2954,294,0 chrV 553237 . G A 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2772,261,0 chrV 553261 . T C 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2574,252,0 chrV 553262 . T C 2615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2648,261,0 chrV 553466 . A G 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3150,324,0 chrV 553849 . C T 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.74;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3292,339,0 chrV 554060 . G T 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.85;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3027,306,0 chrV 554139 . G T 1777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.23;MQ0=0;QD=22.49;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:79:99:1810,195,0 chrV 554157 . C T 1671 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.23;MQ0=0;QD=21.42;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1704,183,0 chrV 554160 . G A 1499 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.54;MQ0=0;QD=21.11;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1532,168,0 chrV 554162 . A G 1460 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.07;MQ0=0;QD=20.28;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1493,168,0 chrV 554170 . G A 1647 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.47;MQ0=0;QD=19.38;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1680,183,0 chrV 554189 . A G 1328 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.29;MQ0=0;QD=17.71;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1361,150,0 chrV 554200 . C T 1535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.32;MQ0=0;QD=20.47;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1568,162,0 chrV 554219 . T C 1674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.95;MQ0=0;QD=21.19;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1707,180,0 chrV 554292 . C T 1673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=0;QD=26.56;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1706,180,0 chrV 554301 . T C 1486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=39.6733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.97;MQ0=0;QD=25.62;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1519,165,0 chrV 554319 . A G 980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.24;MQ0=0;QD=19.22;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1013,111,0 chrV 554324 . A G 942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.24;MQ0=0;QD=18.47;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:975,108,0 chrV 554330 . G A 983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=0;QD=18.20;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1016,108,0 chrV 554406 . T G 1402 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.95;MQ0=0;QD=23.76;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1435,156,0 chrV 554409 . G A 1434 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.97;MQ0=0;QD=24.72;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1467,153,0 chrV 554414 . C T 1418 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.97;MQ0=0;QD=24.45;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1451,150,0 chrV 554416 . A G 1329 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.72;MQ0=0;QD=22.53;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1362,153,0 chrV 554422 . C A 1522 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.87;MQ0=0;QD=25.37;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1555,162,0 chrV 554437 . C T 1817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.64;MQ0=0;QD=25.96;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1850,192,0 chrV 554500 . C A 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.05;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2956,300,0 chrV 554536 . A T 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.81;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3201,324,0 chrV 554683 . G A 4391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;DP=170;Dels=0.00;FS=4.901;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.88;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.000;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:4391,402,0 chrV 554720 . C T 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3303,331,0 chrV 554734 . C T 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3348,354,0 chrV 554819 . A T 3661.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3661,352,0 chrV 554822 . A C 3470.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3470,342,0 chrV 554823 . T C 3451.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3451,339,0 chrV 554883 . T C 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.26;MQ0=0;QD=27.12;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2854,303,0 chrV 554931 . T C 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=119;Dels=0.00;FS=4.958;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.499;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3064,321,0 chrV 554949 . C T 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3667,370,0 chrV 554977 . A G 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3813,373,0 chrV 555084 . G A 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3428,343,0 chrV 555089 . A T 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3579,349,0 chrV 555117 . G A 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3702,364,0 chrV 555177 . T A 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8525;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3460,360,0 chrV 555234 . G A 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3684,361,0 chrV 555415 . A T 2313 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=21.03;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2346,234,0 chrV 555535 . T C 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6210;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.96;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3160,327,0 chrV 555788 . G C 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2797,288,0 chrV 555914 . T C 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3326,333,0 chrV 555949 . A T 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;DP=154;Dels=0.00;FS=7.338;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=10.04;ReadPosRankSum=-2.364;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1576,0,1622 chrV 555951 . C T 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3987,388,0 chrV 556026 . G A 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=27.93;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3324,348,0 chrV 556205 . A C 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8227;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3111,327,0 chrV 556281 . G A 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3343,333,0 chrV 556443 . C T 2403 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2436,246,0 chrV 556607 . A G 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.365;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.638;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1256,0,1620 chrV 556662 . C T 3895.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3895,391,0 chrV 556665 . C T 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.968;DP=161;Dels=0.00;FS=1.240;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.240;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.996;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,80:161:99:1552,0,1466 chrV 556734 . C T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3019,297,0 chrV 556791 . G A 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3362,339,0 chrV 556815 . A G 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3382,369,0 chrV 556831 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.545;DP=124;Dels=0.00;FS=6.819;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.918;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1530,0,968 chrV 557037 . T C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.385;DP=112;Dels=0.00;FS=1.523;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.882;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.874;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1196,0,1140 chrV 557054 . G A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.127;DP=126;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1412,0,1264 chrV 557076 . T C 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.379;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=25.00;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3233,306,0 chrV 557148 . A G 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2651,276,0 chrV 557265 . G A 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3664,370,0 chrV 557490 . T A 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:3904,382,0 chrV 557616 . C T 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3897,397,0 chrV 557877 . T C 4210.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4210,453,0 chrV 558228 . T C 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2825,303,0 chrV 558324 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.667;DP=134;Dels=0.00;FS=4.174;HaplotypeScore=7.3745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1411,0,1281 chrV 558366 . T A 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;DP=98;Dels=0.00;FS=3.873;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:98:99:923,0,1069 chrV 558368 . G T 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.721;DP=98;Dels=0.00;FS=3.771;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:976,0,1006 chrV 558441 . T A 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3046,309,0 chrV 558514 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.547;DP=129;Dels=0.00;FS=2.348;HaplotypeScore=3.7038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1355,0,1378 chrV 558633 . C T 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2786,285,0 chrV 558763 . T G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.402;DP=105;Dels=0.00;FS=2.517;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.369;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1133,0,1152 chrV 558993 . G A 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3079,313,0 chrV 559099 . A G 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3703,393,0 chrV 559138 . T C 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.031;DP=159;Dels=0.00;FS=5.837;HaplotypeScore=2.8540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.430;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,70:159:99:1409,0,1951 chrV 559376 . C T 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3243,333,0 chrV 559384 . C T 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=28.05;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3422,343,0 chrV 559405 . G A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.692;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.793;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1207,0,1719 chrV 559558 . C T 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.973e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3777,367,0 chrV 559696 . T C 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3590,360,0 chrV 559831 . T C 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3472,378,0 chrV 559837 . G A 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;QD=27.94;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3492,358,0 chrV 559859 . T C 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2786,300,0 chrV 559862 . T C 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3010,321,0 chrV 560011 . A G 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9408;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3273,348,0 chrV 560026 . T C 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.82;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2873,303,0 chrV 560290 . A C 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3664,384,0 chrV 560376 . T C 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3577,366,0 chrV 560680 . T C 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.793;DP=143;Dels=0.00;FS=39.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.700;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1591,0,1316 chrV 560686 . A G 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3597,360,0 chrV 560715 . A G 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.553;DP=151;Dels=0.00;FS=5.808;HaplotypeScore=5.8777;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=23.69;ReadPosRankSum=2.620;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,148:151:99:3577,396,0 chrV 560716 . G A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.937;DP=151;Dels=0.00;FS=18.529;HaplotypeScore=5.8777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=8.09;ReadPosRankSum=2.199;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1252,0,1602 chrV 560810 . A C 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.73;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2868,303,0 chrV 560836 . C T 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3544,358,0 chrV 561097 . C T 1596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.33;MQ0=0;QD=26.16;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1629,174,0 chrV 561141 . A G 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.552;DP=77;Dels=0.00;FS=2.055;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:689,0,911 chrV 561145 . C T 1878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.26;MQ0=0;QD=25.73;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1911,204,0 chrV 561154 . G A 1910 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.25;MQ0=0;QD=25.13;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1943,204,0 chrV 561160 . C T 1795 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=0;QD=23.31;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1828,201,0 chrV 561163 . A G 1431 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.70;MQ0=0;QD=22.71;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1464,162,0 chrV 561166 . G A 1461 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;QD=20.87;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1494,159,0 chrV 561193 . A G 1088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.30;MQ0=0;QD=18.76;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1121,120,0 chrV 561211 . G A 834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQ0=0;QD=18.13;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:96:867,96,0 chrV 561220 . A G 549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.46;MQ0=0;QD=16.64;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:66:582,66,0 chrV 561227 . T C 545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.91;MQ0=0;QD=16.03;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:66:578,66,0 chrV 561269 . G A 1018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.40;MQ0=0;QD=20.78;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1051,117,0 chrV 561292 . C G 963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.51;MQ0=0;QD=20.93;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:996,111,0 chrV 561299 . C T 966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.51;MQ0=0;QD=21.00;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:999,108,0 chrV 561309 . T C 728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.68;MQ0=0;QD=19.68;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:84:761,84,0 chrV 561353 . C T 596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.79;MQ0=0;QD=19.23;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:72:629,72,0 chrV 561355 . C T 618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.46;MQ0=0;QD=19.31;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:75:651,75,0 chrV 561364 . T A 748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.37;MQ0=0;QD=18.24;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:87:781,87,0 chrV 561373 . T C 844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.40;MQ0=0;QD=20.10;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:877,99,0 chrV 561379 . C T 1026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.77;MQ0=0;QD=21.37;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1059,117,0 chrV 561430 . A T 1551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.12;MQ0=0;QD=24.23;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1584,162,0 chrV 561461 . A G 1330 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.36;MQ0=0;QD=25.09;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1363,144,0 chrV 561500 . A G 635 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.82;MQ0=0;QD=21.90;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:78:668,78,0 chrV 561502 . C T 584 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.82;MQ0=0;QD=20.14;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:69:617,69,0 chrV 561510 . A G 456 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.38;MQ0=0;QD=14.71;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:57:489,57,0 chrV 561524 . T A 415 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.80;MQ0=0;QD=15.37;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:48:448,48,0 chrV 561529 . C T 470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.96;MQ0=0;QD=16.21;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:54:503,54,0 chrV 561538 . A G 613 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=17.51;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:72:646,72,0 chrV 561541 . C G 618 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=17.66;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:72:651,72,0 chrV 561545 . T C 617 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=17.14;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:72:650,72,0 chrV 561555 . A C 979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.80;MQ0=0;QD=19.98;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1012,114,0 chrV 561569 . C T 1014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.41;MQ0=0;QD=22.04;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1047,108,0 chrV 561578 . C T 1043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.40;MQ0=0;QD=22.19;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1076,111,0 chrV 561590 . G A 1477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.13;MQ0=0;QD=22.38;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1510,159,0 chrV 561678 . G A 2092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.61;MQ0=0;QD=27.17;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2125,225,0 chrV 561690 . G A 1523 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.49;MQ0=0;QD=24.56;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1556,174,0 chrV 561692 . T A 1467 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.03;MQ0=0;QD=24.86;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1500,165,0 chrV 561717 . C T 1151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.89;MQ0=0;QD=19.18;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1184,132,0 chrV 561736 . G A 1035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.56;MQ0=0;QD=18.48;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1068,117,0 chrV 561746 . G A 621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.30;MQ0=0;QD=15.15;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:69:654,69,0 chrV 561766 . A G 795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=31.7817;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=13.25;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:93:828,93,0 chrV 561802 . C A 1144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.65;MQ0=0;QD=16.34;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1177,132,0 chrV 561809 . T C 1260 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.52;MQ0=0;QD=16.80;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1293,147,0 chrV 561858 . C T 2405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.87;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2438,261,0 chrV 561877 . G A 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.85;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2968,300,0 chrV 561906 . C A 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.95;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3563,352,0 chrV 561915 . A G 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.33;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3392,354,0 chrV 562072 . T C 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2767,288,0 chrV 562097 . T C 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3218,317,0 chrV 562113 . C A 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3189,327,0 chrV 562155 . C T 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3796,376,0 chrV 562173 . T G 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3639,375,0 chrV 562264 . A G 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3472,363,0 chrV 562315 . T C 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3167,327,0 chrV 562359 . C T 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3057,306,0 chrV 562436 . C A 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2887,291,0 chrV 562473 . A G 2623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2656,273,0 chrV 562518 . A G 2494 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.25;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2527,273,0 chrV 562559 . C T 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=25.37;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3324,331,0 chrV 562570 . A G 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=24.10;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3069,321,0 chrV 562582 . A G 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=24.37;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3128,330,0 chrV 562610 . C T 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=25.97;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3253,342,0 chrV 562667 . C T 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2551,258,0 chrV 562683 . G A 2425 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.30;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2458,249,0 chrV 562846 . A G 2075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=25.62;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2108,213,0 chrV 562873 . T A 2186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=26.34;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2219,210,0 chrV 562888 . G A 2031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=25.07;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2064,216,0 chrV 562916 . G C 1704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=24.70;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1737,180,0 chrV 563000 . G A 2507 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.15;MQ0=0;QD=27.25;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2540,255,0 chrV 563005 . A G 2349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;QD=25.53;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2382,249,0 chrV 563017 . A C 2114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.42;MQ0=0;QD=22.49;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2147,225,0 chrV 563018 . T C 2110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.52;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=22.21;ReadPosRankSum=1.696;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:2143,225,0 chrV 563066 . A G 2091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.53;MQ0=0;QD=21.56;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2124,216,0 chrV 563074 . G A 2022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.72;MQ0=0;QD=22.47;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2055,204,0 chrV 563104 . A G 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.46;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2574,267,0 chrV 563174 . A G 2422 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.35;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2455,261,0 chrV 563249 . T G 1509 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.40;MQ0=0;QD=22.86;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1542,171,0 chrV 563275 . A C 1445 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.44;MQ0=0;QD=22.23;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:1478,168,0 chrV 563299 . T A 1086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.29;MQ0=0;QD=15.51;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1119,126,0 chrV 563318 . T C 1615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.87;MQ0=0;QD=19.00;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1648,183,0 chrV 563320 . A G 1614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.48;MQ0=0;QD=19.45;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1647,183,0 chrV 563347 . A G 1716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;MQ0=0;QD=20.19;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1749,195,0 chrV 563414 . C T 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.65;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2487,261,0 chrV 563421 . T A 2392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.36;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2425,258,0 chrV 563452 . T C 2435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.34;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2468,267,0 chrV 563474 . T G 2383 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.73;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2416,264,0 chrV 563507 . C T 2314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.29;MQ0=0;QD=26.00;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2347,246,0 chrV 563513 . A G 2257 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.32;MQ0=0;QD=25.08;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2290,246,0 chrV 563545 . G T 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.13;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2810,297,0 chrV 563565 . G A 2740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2773,294,0 chrV 563580 . G T 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.86;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3049,324,0 chrV 563607 . T C 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.96;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3135,330,0 chrV 563620 . T A 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.09;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3370,336,0 chrV 563665 . A T 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2939,286,0 chrV 563747 . C A 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2785,280,0 chrV 563781 . G A 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3051,315,0 chrV 563807 . A G 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=26.66;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3072,324,0 chrV 563882 . T A 2766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2799,285,0 chrV 563956 . T C 2757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.88;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2790,297,0 chrV 563964 . C G 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2844,315,0 chrV 564006 . C T 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.10;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3050,315,0 chrV 564048 . A G 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.58;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3110,321,0 chrV 564065 . A G 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.42;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2726,291,0 chrV 564074 . T A 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.64;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2887,300,0 chrV 564097 . T C 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=25.22;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2933,309,0 chrV 564135 . C A 2118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.11;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2151,237,0 chrV 564147 . C T 1946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.95;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1979,216,0 chrV 564195 . C A 1657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.99;MQ0=0;QD=24.37;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1690,192,0 chrV 564197 . C T 1629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.99;MQ0=0;QD=23.96;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1662,189,0 chrV 564206 . G A 957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.02;MQ0=0;QD=18.76;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:990,114,0 chrV 564212 . G A 1086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=20.49;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1119,126,0 chrV 564252 . C T 1270 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.42;MQ0=0;QD=20.82;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1303,150,0 chrV 564265 . T C 1127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.17;MQ0=0;QD=19.77;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1160,135,0 chrV 564272 . A T 1176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.77;MQ0=0;QD=19.93;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1209,135,0 chrV 564300 . T C 1290 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.50;MQ0=0;QD=20.81;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1323,153,0 chrV 564304 . C A 1341 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.87;MQ0=0;QD=22.35;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1374,156,0 chrV 564343 . A T 1220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=20.00;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1253,138,0 chrV 564355 . T C 1096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.49;MQ0=0;QD=21.08;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1129,126,0 chrV 564360 . T C 1151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=0;QD=21.31;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1184,132,0 chrV 564372 . A G 1207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=0;QD=22.77;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1240,138,0 chrV 564381 . A G 1151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.16;MQ0=0;QD=21.31;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1184,135,0 chrV 564395 . T G 835 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.80;MQ0=0;QD=20.37;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:868,108,0 chrV 564396 . G A 837 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.80;MQ0=0;QD=20.41;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:870,108,0 chrV 564397 . C T 837 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.80;MQ0=0;QD=20.41;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:870,108,0 chrV 564403 . A G 967 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.83;MQ0=0;QD=21.02;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1000,111,0 chrV 564406 . T G 957 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;QD=19.94;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:990,111,0 chrV 564431 . G A 755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=18.87;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:40:84:788,84,0 chrV 564461 . G A 479 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.80;MQ0=0;QD=17.74;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:54:512,54,0 chrV 564462 . T A 478 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.80;MQ0=0;QD=17.70;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:54:511,54,0 chrV 564472 . T G 499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=16.63;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:60:532,60,0 chrV 564535 . C T 1732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.60;MQ0=0;QD=24.39;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1765,183,0 chrV 564567 . T C 2416 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.16;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2449,252,0 chrV 564590 . T C 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;DP=112;Dels=0.00;FS=3.089;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.13;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=24.03;ReadPosRankSum=0.680;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2724,276,0 chrV 564680 . T C 1547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.26;MQ0=0;QD=22.42;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1580,174,0 chrV 564701 . A C 836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.53;MQ0=0;QD=19.44;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:43:99:869,99,0 chrV 564705 . T C 972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.65;MQ0=0;QD=19.84;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1005,114,0 chrV 564717 . G A 888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.69;MQ0=0;QD=21.66;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:921,102,0 chrV 564723 . C A 962 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.87;MQ0=0;QD=23.46;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:995,108,0 chrV 564730 . A G 825 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.77;MQ0=0;QD=19.64;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:96:858,96,0 chrV 564732 . T C 822 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.77;MQ0=0;QD=19.57;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:96:855,96,0 chrV 564809 . C T 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.36;MQ0=0;QD=26.40;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2805,291,0 chrV 564814 . T C 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.83;MQ0=0;QD=25.73;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2657,282,0 chrV 564841 . G A 2755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.91;MQ0=0;QD=27.28;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2788,288,0 chrV 564865 . A G 1486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.96;MQ0=0;QD=22.86;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1519,168,0 chrV 564880 . A C 1237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.82;MQ0=0;QD=19.95;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1270,144,0 chrV 564894 . A G 1055 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=0;QD=19.18;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1088,117,0 chrV 564898 . T C 1126 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=17.87;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1159,126,0 chrV 564904 . A G 1088 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=17.27;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1121,123,0 chrV 564935 . A C 868 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=17.36;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:901,99,0 chrV 564937 . T C 869 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=17.38;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:902,99,0 chrV 564938 . T C 823 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=16.46;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:96:856,96,0 chrV 564945 . C T 989 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=18.31;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1022,108,0 chrV 564949 . A C 943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.46;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:976,108,0 chrV 564968 . T C 1360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.68;MQ0=0;QD=22.30;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1393,159,0 chrV 565013 . A G 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.19;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2822,306,0 chrV 565036 . G C 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.83;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3236,342,0 chrV 565093 . T C 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.42;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2769,285,0 chrV 565120 . T A 2127 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.75;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=24.17;ReadPosRankSum=1.496;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:2160,219,0 chrV 565122 . T G 2038 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.57;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=23.98;ReadPosRankSum=1.447;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2071,213,0 chrV 565125 . A G 1927 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.690;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.29;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=23.50;ReadPosRankSum=1.352;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:1960,201,0 chrV 565208 . G A 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.43;MQ0=0;QD=25.93;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2574,264,0 chrV 565243 . G T 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.85;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2703,282,0 chrV 565254 . T A 1970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.01;MQ0=0;QD=24.94;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2003,213,0 chrV 565289 . T C 1452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=54.3143;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.07;MQ0=0;QD=23.42;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1485,174,0 chrV 565315 . G A 1425 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.29;MQ0=0;QD=21.92;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1458,162,0 chrV 565361 . A G 1158 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.34;MQ0=0;QD=21.85;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1191,138,0 chrV 565365 . T C 1043 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;DP=53;Dels=0.00;FS=2.747;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.37;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=19.68;ReadPosRankSum=2.357;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:1076,126,0 chrV 565371 . A G 1006 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.253;DP=50;Dels=0.00;FS=2.847;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=20.12;ReadPosRankSum=1.460;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:1039,120,0 chrV 565372 . A C 1004 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;DP=51;Dels=0.00;FS=2.893;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=19.69;ReadPosRankSum=1.092;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:1037,123,0 chrV 565382 . A C 923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.41;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.743;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:956,114,0 chrV 565388 . C G 1190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.94;MQ0=0;QD=22.88;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1223,141,0 chrV 565436 . C G 1359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=23.03;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1392,162,0 chrV 565441 . G C 1238 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.32;MQ0=0;QD=22.11;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1271,150,0 chrV 565475 . T C 1782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=23.76;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1815,215,0 chrV 565488 . T C 1665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.16;MQ0=0;QD=23.45;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1698,203,0 chrV 565507 . C T 1687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.11;MQ0=0;QD=23.43;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1720,201,0 chrV 565512 . A G 1497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.55;MQ0=0;QD=23.03;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1530,183,0 chrV 565539 . A C 2611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.34;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2644,291,0 chrV 565639 . C T 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.49;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3051,312,0 chrV 565651 . T C 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.05;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2539,270,0 chrV 565675 . G T 2102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.83;MQ0=0;QD=24.44;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2135,219,0 chrV 565711 . G A 1632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.75;MQ0=0;QD=21.19;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1665,177,0 chrV 565722 . A T 1120 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.91;MQ0=0;QD=19.31;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1153,123,0 chrV 565729 . T C 783 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.64;MQ0=0;QD=14.77;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:87:816,87,0 chrV 565731 . A G 779 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.64;MQ0=0;QD=14.70;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:87:812,87,0 chrV 565737 . A T 808 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.51;MQ0=0;QD=13.69;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:87:841,87,0 chrV 565740 . T A 776 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=13.38;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:84:809,84,0 chrV 565742 . G A 785 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=13.53;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:84:818,84,0 chrV 565746 . T A 724 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=0;QD=13.41;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:81:757,81,0 chrV 565749 . A C 723 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=0;QD=13.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:81:756,81,0 chrV 565750 . G T 751 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=0;QD=13.91;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:81:784,81,0 chrV 565761 . C T 458 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.24;MQ0=0;QD=12.05;SB=-6.588e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:51:491,51,0 chrV 565764 . C T 447 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.24;MQ0=0;QD=11.76;SB=-6.588e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:51:480,51,0 chrV 565775 . C T 365 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.09;MQ0=0;QD=11.41;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:42:398,42,0 chrV 565777 . G A 356 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.09;MQ0=0;QD=11.12;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:42:389,42,0 chrV 565780 . C T 370 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.09;MQ0=0;QD=11.56;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:42:403,42,0 chrV 565783 . G A 367 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.09;MQ0=0;QD=11.47;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:42:400,42,0 chrV 565785 . A G 347 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.09;MQ0=0;QD=10.84;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:42:380,42,0 chrV 565788 . G C 354 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.82;MQ0=0;QD=10.73;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:42:387,42,0 chrV 565791 . A T 361 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.82;MQ0=0;QD=10.94;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:42:394,42,0 chrV 565794 . T C 346 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.82;MQ0=0;QD=10.48;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:42:379,42,0 chrV 565800 . 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A G 75.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=15.10;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:108,12,0 chrV 565905 . A G 77.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=15.50;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:110,12,0 chrV 565909 . T G 76.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=15.30;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:109,12,0 chrV 565932 . A G 130.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.59;SB=-5.488e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:163,18,0 chrV 565935 . A G 131.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.73;SB=-5.288e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:164,18,0 chrV 565938 . T A 136.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=19.45;SB=-5.688e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:169,18,0 chrV 565939 . T G 132.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.88;SB=-5.488e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:165,18,0 chrV 565944 . A G 152.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.80;MQ0=0;QD=16.90;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:21:185,21,0 chrV 565950 . A T 190.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=19.00;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:24:223,24,0 chrV 565953 . T C 175.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=17.50;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:24:208,24,0 chrV 565980 . T G 232 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;QD=17.85;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30:265,30,0 chrV 565986 . A G 236 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;QD=18.15;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30:269,30,0 chrV 566006 . G C 243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;QD=18.69;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30:276,30,0 chrV 566008 . G A 250 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;QD=19.23;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30:283,30,0 chrV 566018 . A G 152.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.99;MQ0=0;QD=15.21;SB=-2.806e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:185,21,0 chrV 566019 . T C 149.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.99;MQ0=0;QD=14.91;SB=-2.806e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:182,21,0 chrV 566034 . T C 127.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=14.13;SB=-1.247e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:160,18,0 chrV 566041 . C T 113.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=16.18;SB=-2.044e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:146,15,0 chrV 566046 . T C 73.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=12.25;SB=-3.871e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:106,12,0 chrV 566053 . G A 81.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.30;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:114,12,0 chrV 566055 . G A 80.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.10;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:113,12,0 chrV 566064 . G T 111.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=18.54;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:144,15,0 chrV 566067 . A G 105.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.54;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:138,15,0 chrV 566070 . A G 103.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.21;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:136,15,0 chrV 566108 . A G 127.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=21.19;SB=-5.563e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:160,18,0 chrV 566109 . G A 132.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=22.02;SB=-5.763e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:165,18,0 chrV 566112 . T C 127.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=21.19;SB=-5.463e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:160,18,0 chrV 566115 . T C 121.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=20.19;SB=-5.363e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:154,18,0 chrV 566139 . T C 182.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=22.75;SB=-1.045e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:215,24,0 chrV 566149 . G A 132.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=22.02;SB=-7.817e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:165,18,0 chrV 566151 . T C 127.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=21.19;SB=-7.617e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:160,18,0 chrV 566152 . G A 132.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=22.02;SB=-7.817e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:165,18,0 chrV 566155 . G A 128.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.30;SB=-7.763e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:161,18,0 chrV 566160 . G T 129.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.45;SB=-7.663e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:162,18,0 chrV 566166 . C T 133.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=19.02;SB=-7.863e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:166,18,0 chrV 566169 . T C 124.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=15.52;SB=-9.863e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18:157,18,0 chrV 566175 . G A 153.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=17.01;SB=-1.078e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:21:186,21,0 chrV 566181 . T C 153.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=15.31;SB=-1.039e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:186,21,0 chrV 566184 . G A 136.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=15.13;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:169,18,0 chrV 566202 . C T 142.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=15.79;SB=-5.607e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:175,18,0 chrV 566231 . T G 139.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=15.46;SB=-2.711e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:172,18,0 chrV 566232 . G T 139.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=15.46;SB=-2.911e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:172,18,0 chrV 566242 . C A 133.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=14.79;SB=-3.011e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:166,18,0 chrV 566247 . C T 145.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=16.13;SB=-2.911e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:178,18,0 chrV 566268 . A C 239 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=23.90;SB=-2.700e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:272,30,0 chrV 566276 . T C 209.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQ0=0;QD=19.00;SB=-2.702e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27:242,27,0 chrV 566278 . A G 215.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQ0=0;QD=19.55;SB=-2.702e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27:248,27,0 chrV 566283 . C T 226 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=18.83;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:30:259,30,0 chrV 566286 . C T 238 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=19.83;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:30:271,30,0 chrV 566292 . G T 239 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=19.92;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:30:272,30,0 chrV 566295 . C T 238 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;QD=18.31;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30:271,30,0 chrV 566304 . A T 243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.88;MQ0=0;QD=17.36;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:30:276,30,0 chrV 566309 . G A 245 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.88;MQ0=0;QD=17.50;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:30:278,30,0 chrV 566319 . A G 203.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;QD=15.62;SB=-2.802e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:27:236,27,0 chrV 566328 . C T 179.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=14.92;SB=-2.804e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:212,24,0 chrV 566353 . A G 209.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=16.08;SB=-2.902e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:27:242,27,0 chrV 566354 . G A 221.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=17.00;SB=-2.902e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:27:254,27,0 chrV 566373 . G T 313 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.5646;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.31;MQ0=0;QD=22.36;SB=-8.153e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:36:346,36,0 chrV 566376 . A G 278 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.5646;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.31;MQ0=0;QD=19.86;SB=-8.153e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:36:311,36,0 chrV 566388 . G A 232.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=19.33;SB=-2.163e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:27:265,27,0 chrV 566400 . T C 210.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=21.00;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:27:243,27,0 chrV 566427 . T G 177.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=19.67;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:210,24,0 chrV 566434 . A G 129.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.45;SB=-7.359e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:162,18,0 chrV 566463 . G A 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=8.92;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:58,6,0 chrV 566466 . T C 69.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.90;MQ0=0;QD=13.90;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:102,12,0 chrV 566472 . A G 46.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=15.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 chrV 566499 . A G 129.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=21.52;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:162,18,0 chrV 566501 . A G 132.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=22.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:165,18,0 chrV 566502 . C T 129.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=21.52;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:162,18,0 chrV 566512 . C A 245 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.18;MQ0=0;QD=15.31;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:33:278,33,0 chrV 566542 . G C 956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=22.23;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:989,111,0 chrV 566565 . G A 1156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.19;MQ0=0;QD=23.59;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1189,129,0 chrV 566568 . T G 1107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.19;MQ0=0;QD=22.14;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1140,129,0 chrV 566580 . T C 1329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.29;MQ0=0;QD=23.32;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1362,150,0 chrV 566672 . C G 573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.78;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:66:606,66,0 chrV 566696 . G T 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.99;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 chrV 566768 . T C 10.44 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.60;MQ0=2;MQRankSum=-0.731;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.731;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:40,0,20 chrV 566842 . T A 10.44 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=11;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.25;MQ0=4;MQRankSum=-0.742;QD=0.95;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-2.202e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:20:40,0,20 chrV 566868 . C T 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.11;MQ0=4;QD=1.78;SB=-2.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:49,6,0 chrV 566988 . G A 79.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=5.68;SB=-2.952e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:12:112,12,0 chrV 567001 . A G 178.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.8546;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=9.89;SB=-2.804e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:24:211,24,0 chrV 567020 . G A 233.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=16.64;SB=-2.327e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:27:266,27,0 chrV 567098 . G T 432 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.78;MQ0=0;QD=16.00;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:48:465,48,0 chrV 567115 . T G 794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:90:827,90,0 chrV 567180 . A G 624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.77;MQ0=0;QD=21.52;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:75:657,75,0 chrV 567198 . A T 298 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.68;MQ0=0;QD=12.96;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:36:331,36,0 chrV 567203 . T C 246 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.54;MQ0=0;QD=13.67;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:33:279,33,0 chrV 567207 . T G 148.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=9.87;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:21:181,21,0 chrV 567210 . C T 125.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;MQ0=0;QD=6.59;SB=-1.501e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:18:158,18,0 chrV 567215 . A G 117.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;MQ0=0;QD=6.16;SB=-1.441e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:18:150,18,0 chrV 567221 . G C 150.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.92;MQ0=0;QD=7.90;SB=-1.761e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:183,21,0 chrV 567234 . A C 148.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.67;MQ0=0;QD=8.71;SB=-2.011e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:21:181,21,0 chrV 567247 . A G 369 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.358;DP=26;Dels=0.00;FS=6.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=14.19;ReadPosRankSum=1.299;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:48:402,48,0 chrV 567249 . A G 377 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.358;DP=26;Dels=0.00;FS=6.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=14.50;ReadPosRankSum=1.107;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:48:410,48,0 chrV 567251 . A G 385 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.358;DP=26;Dels=0.00;FS=6.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=14.81;ReadPosRankSum=2.069;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:48:418,48,0 chrV 567252 . G T 385 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.71;MQ0=0;QD=14.81;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:26:48:418,48,0 chrV 567283 . G A 668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=19.65;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:81:701,81,0 chrV 567296 . T C 569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.75;MQ0=0;QD=18.35;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:69:602,69,0 chrV 567300 . T C 559 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.75;MQ0=0;QD=18.03;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:69:592,69,0 chrV 567324 . A G 686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.84;MQ0=0;QD=19.60;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:84:719,84,0 chrV 567339 . G C 837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;QD=19.93;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:870,102,0 chrV 567354 . A T 958 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.88;MQ0=0;QD=22.81;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:991,108,0 chrV 567355 . T G 878 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.88;MQ0=0;QD=20.90;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:911,105,0 chrV 567375 . A G 1124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.76;MQ0=0;QD=21.21;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1157,138,0 chrV 567388 . C G 1240 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=0;QD=21.75;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1273,150,0 chrV 567395 . G A 1258 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.56;MQ0=0;QD=22.07;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1291,147,0 chrV 567403 . C T 1365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=22.75;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1398,159,0 chrV 567436 . T C 868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=22.26;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:901,111,0 chrV 567461 . A G 1058 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.53;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1091,126,0 chrV 567466 . A C 1022 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.44;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1055,123,0 chrV 567470 . G A 997 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.35;MQ0=0;QD=24.92;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1030,117,0 chrV 567473 . T C 956 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.93;MQ0=0;QD=23.90;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:989,117,0 chrV 567475 . C T 999 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.93;MQ0=0;QD=24.97;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1032,117,0 chrV 567560 . T G 1880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.27;MQ0=0;QD=24.42;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1913,207,0 chrV 567575 . T C 2258 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.66;MQ0=0;QD=25.95;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2291,243,0 chrV 567597 . G A 2498 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.61;MQ0=0;QD=26.02;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2531,267,0 chrV 567642 . G T 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.42;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3055,312,0 chrV 567681 . A T 2364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.40;MQ0=0;QD=24.88;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2397,255,0 chrV 567699 . T G 2083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.17;MQ0=0;QD=25.10;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2116,234,0 chrV 567720 . T C 1363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.53;MQ0=0;QD=19.20;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1396,162,0 chrV 567724 . A G 1184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.34;MQ0=0;QD=18.22;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1217,144,0 chrV 567741 . G C 1100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.35;MQ0=0;QD=19.30;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1133,132,0 chrV 567743 . A C 1112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.35;MQ0=0;QD=19.51;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1145,132,0 chrV 567757 . G A 1459 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.57;MQ0=0;QD=19.72;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1492,162,0 chrV 567867 . G A 1477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.69;MQ0=0;QD=23.44;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1510,156,0 chrV 567885 . G A 2102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.68;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2135,222,0 chrV 567899 . C A 2193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.39;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2226,231,0 chrV 567958 . G T 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.53;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3256,336,0 chrV 567960 . T A 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.65;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3324,336,0 chrV 567994 . T C 2382 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.71;MQ0=0;QD=25.89;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2415,264,0 chrV 568004 . G A 1890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.23;MQ0=0;QD=26.25;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1923,210,0 chrV 568023 . T G 190 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.02;MQ0=0;QD=3.28;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:58:30:223,30,0 chrV 568073 . T A 1164 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.27;MQ0=0;QD=20.79;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1197,129,0 chrV 568074 . C T 1145 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.20;MQ0=0;QD=22.90;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1178,129,0 chrV 568077 . A G 1117 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.96;MQ0=0;QD=21.48;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1150,129,0 chrV 568090 . T C 1752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.62;MQ0=0;QD=23.68;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1785,195,0 chrV 568123 . A G 2313 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.26;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2346,249,0 chrV 568132 . A G 2363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.73;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2396,255,0 chrV 568152 . A G 2378 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.40;MQ0=0;QD=26.42;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2411,249,0 chrV 568309 . G A 1759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.12;MQ0=0;QD=25.49;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1792,186,0 chrV 568351 . C T 2155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.75;MQ0=0;QD=25.35;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2188,234,0 chrV 568377 . T C 1604 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.99;MQ0=0;QD=22.28;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1637,183,0 chrV 568378 . G A 1648 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.32;MQ0=0;QD=23.21;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1681,180,0 chrV 568383 . A G 1560 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.43;MQ0=0;QD=22.94;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1593,171,0 chrV 568387 . C T 1588 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.41;MQ0=0;QD=24.43;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1621,168,0 chrV 568407 . A G 1449 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.55;MQ0=0;QD=22.64;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1482,165,0 chrV 568408 . C T 1453 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.55;MQ0=0;QD=22.70;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1486,162,0 chrV 568423 . C T 1013 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.33;MQ0=0;QD=23.56;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1046,108,0 chrV 568461 . G A 492 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.43;SB=-6.550e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:54:525,54,0 chrV 568469 . G A 486 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=22.09;SB=-6.552e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:54:519,54,0 chrV 568471 . T C 443 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=20.14;SB=-6.552e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:54:476,54,0 chrV 568484 . A G 406 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.37;SB=-6.640e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:48:439,48,0 chrV 569484 . A C 82.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.420;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,8:46:99:112,0,717 chrV 569519 . C T 965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.962;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.41;MQ0=0;MQRankSum=2.945;QD=17.55;ReadPosRankSum=2.456;SB=-5.900e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,43:55:57:998,57,0 chrV 569560 . T A 50.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;DP=32;Dels=0.00;FS=2.558;HaplotypeScore=18.6243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.74;MQ0=0;MQRankSum=2.111;QD=1.56;ReadPosRankSum=-1.719;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:80:80,0,173 chrV 569562 . A T 234.78 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.5903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.47;MQ0=0;QD=7.83;SB=-6.578e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:30:27:266,27,0 chrV 569565 . C A 115.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.190;DP=27;Dels=0.00;FS=13.358;HaplotypeScore=13.4110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.26;MQ0=1;MQRankSum=-0.870;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.501;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:88:145,0,88 chrV 569574 . C T 18.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.899;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.1944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.77;MQ0=1;MQRankSum=1.318;QD=1.01;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:13:48,0,13 chrV 569576 . T C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.857;DP=19;Dels=0.00;FS=2.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.53;MQ0=1;MQRankSum=0.421;QD=0.60;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:39:41,0,39 chrV 569588 . T A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5745;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.91;MQ0=1;MQRankSum=-0.811;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.377;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,7:14:6:56,6,0 chrV 569595 . T C 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.18;MQ0=1;MQRankSum=-0.633;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.383;SB=1.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,7:11:6:55,6,0 chrV 569619 . C T 247 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;DP=24;Dels=0.00;FS=5.006;HaplotypeScore=27.9364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.43;MQ0=2;MQRankSum=0.274;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-1.302e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:24:30:280,30,0 chrV 569627 . G A 166.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.5184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.89;MQ0=2;MQRankSum=-0.031;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.378;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:44:196,0,44 chrV 569628 . A G 154.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.848;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.5450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.89;MQ0=2;MQRankSum=-0.060;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.133;SB=-6.574e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:46:184,0,46 chrV 569660 . G A 122.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;DP=31;Dels=0.00;FS=16.320;HaplotypeScore=10.5133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.21;MQ0=3;MQRankSum=3.236;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,7:31:99:152,0,169 chrV 569663 . G A 242.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.423;DP=31;Dels=0.00;FS=20.078;HaplotypeScore=12.3387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.21;MQ0=3;MQRankSum=2.274;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.299;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:68:272,0,68 chrV 569670 . T C 202.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.192;DP=31;Dels=0.00;FS=6.094;HaplotypeScore=17.1256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.21;MQ0=3;MQRankSum=1.336;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:232,0,100 chrV 569680 . G A 131.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=29;Dels=0.00;FS=16.443;HaplotypeScore=12.3314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.70;MQ0=3;MQRankSum=3.353;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.694;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:161,0,172 chrV 569681 . A G 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.929;DP=28;Dels=0.00;FS=9.381;HaplotypeScore=12.9965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.97;MQ0=3;MQRankSum=-1.943;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:66:66,0,267 chrV 569691 . A G 162.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.232;DP=29;Dels=0.00;FS=14.418;HaplotypeScore=5.4743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.53;MQ0=3;MQRankSum=1.349;QD=5.59;ReadPosRankSum=2.335;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:192,0,163 chrV 569706 . A T 352 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4806;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.48;MQ0=4;QD=14.08;SB=-5.700e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:42:385,42,0 chrV 569712 . G T 153.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.30;MQ0=4;MQRankSum=1.065;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:55:183,0,55 chrV 569719 . A C 57.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=25;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=11.5055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.86;MQ0=5;MQRankSum=2.383;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.741;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:25:86:87,0,86 chrV 569735 . T C 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;DP=37;Dels=0.00;FS=4.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.90;MQ0=11;MQRankSum=-0.586;QD=0.60;ReadPosRankSum=3.123;SB=-1.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:52:52,0,208 chrV 569746 . G A 339.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.917;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.12;MQ0=10;MQRankSum=0.306;QD=5.47;ReadPosRankSum=2.176;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,38:62:99:369,0,128 chrV 569749 . A T 98.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.550;DP=64;Dels=0.00;FS=3.058;HaplotypeScore=9.6238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.60;MQ0=10;MQRankSum=1.280;QD=1.53;ReadPosRankSum=-1.726;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,10:64:99:128,0,406 chrV 569768 . C T 125.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.538;DP=103;Dels=0.00;FS=6.077;HaplotypeScore=21.2614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.10;MQ0=14;MQRankSum=-0.897;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.486;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,34:103:99:155,0,702 chrV 569769 . C T 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.484;DP=104;Dels=0.00;FS=2.074;HaplotypeScore=23.1639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.99;MQ0=15;MQRankSum=-1.580;QD=0.37;ReadPosRankSum=-0.768;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,23:104:68:68,0,778 chrV 569838 . A G 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.739;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.41;MQ0=11;MQRankSum=0.704;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.202;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,11:120:76:76,0,1154 chrV 569870 . T C 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.299;DP=61;Dels=0.00;FS=9.225;HaplotypeScore=17.2224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.43;MQ0=7;MQRankSum=0.110;QD=0.28;ReadPosRankSum=1.619;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,10:61:47:47,0,667 chrV 569912 . T C 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=39;Dels=0.00;FS=8.658;HaplotypeScore=12.9347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.18;MQ0=2;MQRankSum=-0.289;QD=1.08;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:72:72,0,405 chrV 569916 . A G 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.040;DP=39;Dels=0.00;FS=13.761;HaplotypeScore=11.5080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.18;MQ0=2;MQRankSum=-0.867;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,8:39:99:103,0,388 chrV 569999 . A G 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.0547;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.81;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.000;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,3:14:6:49,6,0 chrV 570014 . G A 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.4799;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.15;MQ0=1;MQRankSum=1.532;QD=1.34;ReadPosRankSum=2.003;SB=-1.476e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,2:14:6:50,6,0 chrV 570023 . G A 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.93;MQ0=1;MQRankSum=0.747;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.747;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:6:50,6,0 chrV 570039 . C T 45.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.41;MQ0=1;QD=5.75;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:78,9,0 chrV 570041 . C T 46.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.41;MQ0=1;MQRankSum=1.754;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,5:8:9:79,9,0 chrV 570099 . T C 41.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=14;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=7.2717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.89;MQ0=5;MQRankSum=1.203;QD=2.93;ReadPosRankSum=1.422;SB=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:17:71,0,17 chrV 570132 . G A 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.99;MQ0=4;MQRankSum=1.931;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.382;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:56:56,0,145 chrV 570134 . T C 116.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.99;MQ0=4;MQRankSum=-1.931;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:54:146,0,54 chrV 570146 . T A 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;DP=15;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=9.7576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.99;MQ0=4;MQRankSum=1.106;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:55:55,0,148 chrV 570147 . G C 43.14 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=15;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=9.7576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.99;MQ0=4;MQRankSum=-0.922;QD=2.88;ReadPosRankSum=2.017;SB=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:15:61:71,0,61 chrV 570163 . G A 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;DP=18;Dels=0.00;FS=10.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.17;MQ0=4;MQRankSum=-2.333;QD=1.39;ReadPosRankSum=1.768;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:55:55,0,207 chrV 570188 . T C 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=12;Dels=0.00;FS=7.123;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.34;MQ0=1;MQRankSum=-1.769;QD=2.67;ReadPosRankSum=-2.520;SB=-6.175e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:62:62,0,140 chrV 570198 . G C 91.27 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.27;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.495;SB=-4.831e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:9:121,0,9 chrV 570209 . G T 80.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.94;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-5.375e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:113,12,0 chrV 570218 . G A 84.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.94;MQ0=0;QD=16.90;SB=-5.575e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:117,12,0 chrV 570254 . A T 48.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.14;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.754;SB=-2.329e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:10:17:78,0,17 chrV 570498 . C T 259.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.371;DP=137;Dels=0.00;FS=74.272;HaplotypeScore=5.1023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.29;MQ0=48;MQRankSum=-2.792;QD=1.89;ReadPosRankSum=1.695;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,97:137:99:289,0,520 chrV 570791 . G A 86.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.569;DP=280;Dels=0.00;FS=4.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.54;MQ0=239;MQRankSum=2.188;QD=0.31;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,59:280:99:116,0,215 chrVI 506 . G A 62.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.79;MQ0=31;QD=1.74;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,11:36:12:95,12,0 chrVI 548 . C T 36.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.49;MQ0=46;MQRankSum=1.231;QD=0.72;ReadPosRankSum=1.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:37,14:51:9:69,9,0 chrVI 638 . T C 97.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.95;MQ0=62;MQRankSum=2.520;QD=1.33;ReadPosRankSum=1.034;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:59,14:73:15:130,15,0 chrVI 661 . C T 240 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.070;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.12;MQ0=58;MQRankSum=3.056;QD=3.16;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:63,13:76:30:273,30,0 chrVI 899 . G A 40.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;DP=24;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=18.4070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.41;MQ0=1;MQRankSum=-1.102;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:70:70,0,157 chrVI 918 . T C 166.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.563;DP=67;Dels=0.00;FS=2.642;HaplotypeScore=5.8133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.41;MQ0=4;MQRankSum=-2.848;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.521;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:196,0,732 chrVI 986 . C T 1145.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.395;DP=195;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=26.6790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.73;MQ0=38;MQRankSum=-2.189;QD=5.87;ReadPosRankSum=2.422;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,76:195:99:1175,0,1280 chrVI 990 . T C 1128.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.974;DP=194;Dels=0.00;FS=4.812;HaplotypeScore=24.4235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.60;MQ0=39;MQRankSum=-2.249;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.403;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,87:194:99:1158,0,1362 chrVI 1062 . C T 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.655;DP=160;Dels=0.00;FS=11.353;HaplotypeScore=25.3231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.63;MQ0=64;MQRankSum=-1.812;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.920;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,27:160:99:103,0,1141 chrVI 1076 . G A 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.808;DP=140;Dels=0.00;FS=24.036;HaplotypeScore=22.5935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.11;MQ0=46;MQRankSum=-2.044;QD=0.09;ReadPosRankSum=-4.543;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,18:140:43:43,0,1322 chrVI 1221 . G A 107.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.731;DP=66;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=16.2875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.06;MQ0=4;MQRankSum=-0.223;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.579;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:137,0,564 chrVI 1223 . A G 102.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;DP=66;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=13.3612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.06;MQ0=4;MQRankSum=-0.276;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-6.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:132,0,581 chrVI 1226 . A G 188.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.510;DP=79;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=11.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.87;MQ0=4;MQRankSum=-0.378;QD=2.38;ReadPosRankSum=-1.619;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:79:99:218,0,774 chrVI 1236 . A G 385.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.484;DP=104;Dels=0.00;FS=0.901;HaplotypeScore=16.4353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.73;MQ0=4;MQRankSum=-1.088;QD=3.70;ReadPosRankSum=-3.525;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,35:104:99:415,0,1006 chrVI 1238 . C A 365.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.387;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=26.2122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.73;MQ0=4;MQRankSum=-0.604;QD=3.51;ReadPosRankSum=-2.758;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:395,0,981 chrVI 1247 . A C 239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.868;DP=140;Dels=0.00;FS=2.746;HaplotypeScore=20.5292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.11;MQ0=3;MQRankSum=-0.275;QD=1.71;ReadPosRankSum=-2.837;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,31:140:99:269,0,1806 chrVI 1251 . G A 327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.234;DP=149;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.04;MQ0=3;MQRankSum=-0.678;QD=2.19;ReadPosRankSum=-2.757;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,34:149:99:357,0,1871 chrVI 1626 . A G 79.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;DP=244;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.94;MQ0=221;MQRankSum=3.272;QD=0.32;ReadPosRankSum=0.467;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,11:244:78:109,0,78 chrVI 4669 . C A 70.14 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=12;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.55;MQ0=6;MQRankSum=-1.380;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.380;SB=-2.636e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:12:100,0,12 chrVI 4670 . A G 66.11 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=11;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.55;MQ0=5;MQRankSum=-1.380;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.380;SB=-2.608e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:13:96,0,13 chrVI 4679 . T G 65.14 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=10;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.70;MQ0=4;MQRankSum=-1.380;QD=6.51;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-2.636e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:12:95,0,12 chrVI 4694 . C A 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.1052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.84;MQ0=1;MQRankSum=1.032;QD=2.27;ReadPosRankSum=2.023;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:80:80,0,105 chrVI 4826 . T C 42.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.8098;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=7.16;SB=-5.447e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:75,9,0 chrVI 4833 . T C 67.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=9.8662;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:12:100,12,0 chrVI 4838 . C A 11.34 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=4.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.61;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.000;SB=-1.704e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:36:41,0,36 chrVI 4842 . C T 10.46 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=5.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.550;SB=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:17:40,0,17 chrVI 4892 . G A 16.85 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.51;MQ0=0;QD=4.21;SB=-2.780e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:48,6,0 chrVI 4940 . C T 66.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.32;MQ0=0;QD=16.63;SB=-2.755e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 chrVI 4947 . A C 65.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.38;MQ0=0;QD=9.36;SB=-2.739e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:98,12,0 chrVI 5009 . C T 74.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.30;MQ0=1;MQRankSum=0.751;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.751;SB=-2.454e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,8:10:12:107,12,0 chrVI 5257 . C T 35.08 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.70;MQ0=2;MQRankSum=-0.731;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.731;SB=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:65,0,15 chrVI 5311 . G C 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.750;DP=55;Dels=0.00;FS=10.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.74;MQ0=3;MQRankSum=-0.221;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.569;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,43:55:95:810,0,95 chrVI 5324 . T G 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.829;DP=57;Dels=0.00;FS=13.036;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.32;MQ0=2;MQRankSum=-0.263;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.063;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,45:57:99:832,0,135 chrVI 5357 . C G 1218 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.335;DP=62;Dels=0.00;FS=4.051;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.52;MQ0=1;MQRankSum=-1.732;QD=19.65;ReadPosRankSum=1.335;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,61:62:98:1251,98,0 chrVI 5362 . C T 1238 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;DP=62;Dels=0.00;FS=4.051;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.52;MQ0=1;MQRankSum=-1.732;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.994;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,61:62:95:1271,95,0 chrVI 5379 . A C 11.34 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.862;DP=52;Dels=0.00;FS=23.333;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.463;QD=0.22;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,9:52:41:41,0,852 chrVI 5383 . C T 20.05 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.043;DP=51;Dels=0.00;FS=23.419;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.91;MQ0=2;MQRankSum=-1.582;QD=0.39;ReadPosRankSum=-0.176;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,9:51:50:50,0,809 chrVI 5387 . A G 681.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;DP=48;Dels=0.00;FS=15.630;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.88;MQ0=2;MQRankSum=0.692;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:82:711,0,82 chrVI 5404 . T A 325.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.49;MQ0=1;MQRankSum=-1.733;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-1.031e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:20:358,20,0 chrVI 5415 . G A 468 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.174;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.33;MQ0=5;MQRankSum=-1.509;QD=13.00;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,32:36:40:501,40,0 chrVI 5432 . T A 155.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.577;DP=42;Dels=0.00;FS=31.024;HaplotypeScore=6.7548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.21;MQ0=8;MQRankSum=1.063;QD=3.69;ReadPosRankSum=1.460;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:185,0,352 chrVI 5438 . T C 94.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.869;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.6868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.91;MQ0=10;MQRankSum=-0.623;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:124,0,407 chrVI 5448 . C T 253.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.526;DP=47;Dels=0.00;FS=28.452;HaplotypeScore=12.7520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.60;MQ0=13;MQRankSum=-2.532;QD=5.38;ReadPosRankSum=-3.330;SB=-6.800e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:283,0,260 chrVI 5455 . T A 194.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;DP=46;Dels=0.00;FS=24.148;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.02;MQ0=14;MQRankSum=2.322;QD=4.22;ReadPosRankSum=2.481;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:46:99:224,0,311 chrVI 5458 . A C 204.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.537;DP=47;Dels=0.00;FS=18.263;HaplotypeScore=4.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.38;MQ0=14;MQRankSum=2.549;QD=4.34;ReadPosRankSum=2.079;SB=-6.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:234,0,337 chrVI 5459 . A G 303.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.043;DP=47;Dels=0.00;FS=18.263;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.38;MQ0=14;MQRankSum=-2.585;QD=6.45;ReadPosRankSum=-2.224;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:333,0,238 chrVI 5466 . C T 567.64 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;DP=48;Dels=0.00;FS=6.698;HaplotypeScore=4.9649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.17;MQ0=14;MQRankSum=-0.329;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.110;SB=-2.886e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,37:48:11:600,11,0 chrVI 5519 . T C 222.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;DP=38;Dels=0.00;FS=11.606;HaplotypeScore=5.6664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.60;MQ0=10;MQRankSum=-1.935;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:252,0,184 chrVI 5541 . A T 163.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;DP=29;Dels=0.00;FS=17.910;HaplotypeScore=5.9587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.77;MQ0=5;MQRankSum=-0.290;QD=5.62;ReadPosRankSum=-2.375;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:193,0,141 chrVI 5554 . G C 190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.54;MQ0=1;QD=10.56;SB=-5.099e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:27:223,27,0 chrVI 5569 . T A 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.98;MQ0=3;MQRankSum=1.345;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.000;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:61:61,0,99 chrVI 5581 . C T 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=10;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=4.8601;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.82;MQ0=3;MQRankSum=-0.742;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.742;SB=-2.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:6:49,6,0 chrVI 5591 . A T 58.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.12;MQ0=3;MQRankSum=2.037;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:35:88,0,35 chrVI 5596 . G A 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.32;MQ0=3;MQRankSum=2.266;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.551;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:81:81,0,103 chrVI 5605 . C A 74.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.864;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.21;MQ0=3;MQRankSum=2.462;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.050;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:104,0,124 chrVI 5622 . C A 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.807;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.90;MQ0=2;MQRankSum=1.763;QD=1.53;ReadPosRankSum=2.154;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:56:56,0,149 chrVI 5625 . T C 239 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.35;MQ0=2;QD=14.94;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:30:272,30,0 chrVI 5626 . A G 116.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.35;MQ0=2;MQRankSum=-0.778;QD=7.25;ReadPosRankSum=-2.192;SB=-6.530e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:53:146,0,53 chrVI 5644 . C T 48.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.933;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.13;MQ0=2;MQRankSum=1.467;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.133;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:78:78,0,145 chrVI 5645 . G A 20.05 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.13;MQ0=2;MQRankSum=0.919;QD=1.25;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:50:50,0,173 chrVI 5650 . T C 48.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.65;MQ0=2;MQRankSum=1.898;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:78:78,0,164 chrVI 5656 . A G 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.65;MQ0=2;MQRankSum=0.196;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:44:44,0,184 chrVI 5660 . T C 122.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.95;MQ0=3;MQRankSum=-2.021;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.306;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:78:152,0,78 chrVI 5667 . T C 258 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.65;MQ0=2;QD=15.18;SB=-8.689e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:33:291,33,0 chrVI 5673 . T C 122.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.308;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.05;MQ0=2;MQRankSum=-0.488;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.247;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:78:152,0,78 chrVI 5682 . A G 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.882;DP=23;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.56;MQ0=3;MQRankSum=1.937;QD=0.87;ReadPosRankSum=-2.126;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:50:50,0,159 chrVI 5688 . G T 133.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.22;MQ0=3;QD=7.01;SB=-7.359e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:18:166,18,0 chrVI 5734 . C G 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.91;MQ0=5;MQRankSum=1.666;QD=1.63;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,5:14:6:54,6,0 chrVI 5761 . A C 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.243;DP=20;Dels=0.00;FS=8.674;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.44;MQ0=4;MQRankSum=-2.971;QD=1.05;ReadPosRankSum=-2.607;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:51:51,0,96 chrVI 5764 . C T 147.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=5;QD=7.01;SB=-8.163e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:18:180,18,0 chrVI 5791 . C T 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.88;MQ0=4;MQRankSum=-1.134;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.380;SB=-4.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:76:76,0,86 chrVI 5823 . A G 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=15;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.21;MQ0=4;MQRankSum=1.531;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:55:55,0,103 chrVI 5830 . T G 30.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;DP=13;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.78;MQ0=2;MQRankSum=1.377;QD=2.31;ReadPosRankSum=-2.262;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:60:60,0,105 chrVI 5840 . G A 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.377;DP=20;Dels=0.00;FS=8.929;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.42;MQ0=1;MQRankSum=0.570;QD=0.85;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:47:47,0,210 chrVI 5862 . G T 243 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.97;MQ0=1;QD=15.19;SB=-1.492e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:30:276,30,0 chrVI 5865 . T G 220 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.89;MQ0=0;QD=14.67;SB=-1.492e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:30:253,30,0 chrVI 5866 . T C 54.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.47;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=3.00;ReadPosRankSum=1.434;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:84:84,0,111 chrVI 5876 . A G 54.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.159;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:84:84,0,116 chrVI 5879 . T A,C 159.01 SnpCluster;filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=28.47;MQ0=0;QD=8.83;SB=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,14,4:18:76:219,91,76,128,0,116 chrVI 5883 . A G 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.393;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.58;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:71:71,0,217 chrVI 5897 . A G 254.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;DP=31;Dels=0.00;FS=7.924;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.69;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.208;SB=4.077e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:39:284,0,39 chrVI 5905 . T C 38.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.997;DP=36;Dels=0.00;FS=23.096;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.73;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.879;SB=-8.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:68:68,0,342 chrVI 5910 . G C 68.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.859;DP=37;Dels=0.00;FS=29.747;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=1.84;ReadPosRankSum=-1.679;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,8:37:98:98,0,296 chrVI 5914 . A G 282.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;DP=38;Dels=0.00;FS=45.167;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.682;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:312,0,128 chrVI 5917 . A C 205.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.545;DP=33;Dels=0.00;FS=45.515;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=6.21;ReadPosRankSum=3.114;SB=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:235,0,168 chrVI 5919 . T C 196.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.015;DP=33;Dels=0.00;FS=45.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=5.94;ReadPosRankSum=2.918;SB=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:226,0,159 chrVI 5922 . A T 498 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.55;MQ0=0;QD=15.09;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:57:531,57,0 chrVI 5923 . G C 213.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;DP=33;Dels=0.00;FS=45.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=6.45;ReadPosRankSum=2.801;SB=1.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:243,0,153 chrVI 5925 . G C 211.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;DP=35;Dels=0.00;FS=46.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=6.03;ReadPosRankSum=2.832;SB=-3.786e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:241,0,206 chrVI 5928 . A G 570 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.09;MQ0=1;QD=14.62;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:69:603,69,0 chrVI 5938 . T C 138.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.083;DP=43;Dels=0.00;FS=42.022;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.89;MQ0=1;MQRankSum=-0.278;QD=3.21;ReadPosRankSum=2.274;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:168,0,401 chrVI 5947 . C A 132.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;DP=56;Dels=0.00;FS=49.187;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.69;MQ0=1;MQRankSum=-1.776;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.088;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,34:56:99:162,0,461 chrVI 5953 . G C 131.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.381;DP=60;Dels=0.00;FS=39.577;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.63;MQ0=1;MQRankSum=-0.433;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,31:60:99:161,0,597 chrVI 5955 . A C 126.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;DP=61;Dels=0.00;FS=38.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.62;MQ0=1;MQRankSum=-1.331;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:156,0,665 chrVI 5957 . G T 124.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;DP=62;Dels=0.00;FS=37.372;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.76;MQ0=1;MQRankSum=-1.681;QD=2.00;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:154,0,669 chrVI 5961 . C T 164.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.330;DP=74;Dels=0.00;FS=35.966;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.38;MQ0=1;MQRankSum=0.039;QD=2.22;ReadPosRankSum=-2.640;SB=-5.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:194,0,696 chrVI 5970 . C T 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.030;DP=104;Dels=0.00;FS=8.100;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.71;MQ0=1;MQRankSum=1.010;QD=6.46;ReadPosRankSum=-3.423;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:702,0,894 chrVI 6045 . G C 580.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.166;DP=147;Dels=0.00;FS=41.955;HaplotypeScore=3.9455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.57;MQ0=0;MQRankSum=-4.785;QD=3.95;ReadPosRankSum=-4.086;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,38:147:99:610,0,2378 chrVI 6052 . A G 447.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.265;DP=147;Dels=0.00;FS=38.269;HaplotypeScore=3.9455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.52;MQ0=0;MQRankSum=-4.004;QD=3.04;ReadPosRankSum=-4.486;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,34:147:99:477,0,2475 chrVI 6065 . A G 131.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.149;DP=145;Dels=0.01;FS=28.649;HaplotypeScore=12.8405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.355;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.572;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,21:144:99:161,0,2722 chrVI 6066 . C T 134.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.368;DP=145;Dels=0.01;FS=28.649;HaplotypeScore=11.8472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.93;MQ0=0;MQRankSum=-3.521;QD=0.92;ReadPosRankSum=-3.713;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,21:144:99:164,0,2606 chrVI 6128 . A G 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;DP=56;Dels=0.00;FS=22.648;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=0.63;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:65:65,0,903 chrVI 6149 . G C 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.432;DP=36;Dels=0.00;FS=8.105;HaplotypeScore=14.3711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.194;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:55:55,0,539 chrVI 6160 . T G 149.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.474;DP=11;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=5.8967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.791;SB=-6.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:21:182,21,0 chrVI 6170 . C T 107.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=15.32;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:140,15,0 chrVI 6201 . A G 99.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=14.18;SB=-2.044e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:132,15,0 chrVI 6203 . C G 103.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=14.75;SB=-2.044e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:136,15,0 chrVI 6204 . T C 102.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=14.61;SB=-2.044e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:135,15,0 chrVI 6206 . A G 99.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=14.18;SB=-2.044e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:132,15,0 chrVI 6216 . C T 108.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=13.53;SB=-2.384e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15:141,15,0 chrVI 6230 . G A 219.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.91;SB=-1.946e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27:252,27,0 chrVI 6232 . C T 211.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.18;SB=-1.946e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27:244,27,0 chrVI 6233 . T G 219.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.91;SB=-1.946e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27:252,27,0 chrVI 6270 . G A 378 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.187;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:45:411,45,0 chrVI 6276 . C T 373 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;QD=19.63;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:45:406,45,0 chrVI 6327 . C T 110.79 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.09;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-8.038e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:4:140,0,4 chrVI 6334 . C T 113.79 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.59;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.589;SB=-7.283e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:4:143,0,4 chrVI 6370 . C T 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.33;MQ0=1;MQRankSum=-2.219;QD=2.30;ReadPosRankSum=1.652;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:53:53,0,84 chrVI 6417 . T C 290.33 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.632;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.05;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.616;SB=4.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:14:323,14,0 chrVI 6434 . A G 343 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.90;MQ0=0;QD=18.05;SB=-6.998e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:42:376,42,0 chrVI 6455 . A G 373 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=19.63;SB=-6.759e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:45:406,45,0 chrVI 6473 . T C 74.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.59;MQ0=2;QD=10.64;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:107,12,0 chrVI 6491 . T C 76.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.63;MQ0=3;QD=8.50;SB=-2.755e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:109,12,0 chrVI 6563 . C T 18.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.451;DP=49;Dels=0.00;FS=6.300;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.40;MQ0=21;MQRankSum=1.634;QD=0.37;ReadPosRankSum=-1.040;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,10:49:48:48,0,209 chrVI 6617 . G A 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.56;MQ0=4;QD=1.25;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:55,6,0 chrVI 6641 . G A 45.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.29;MQ0=3;QD=4.18;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:78,9,0 chrVI 6647 . G A 48.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.29;MQ0=3;QD=4.45;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:81,9,0 chrVI 6678 . G T 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.07;MQ0=3;QD=3.63;SB=-2.476e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:6:53,6,0 chrVI 6680 . A T 13.24 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.74;MQ0=3;MQRankSum=-0.727;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.727;SB=-2.003e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:19:43,0,19 chrVI 6686 . T C 19.81 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.90;MQ0=2;QD=4.95;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:51,6,0 chrVI 6697 . T G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.67;MQ0=1;QD=7.26;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrVI 6699 . A G 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.67;MQ0=1;QD=6.93;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:52,6,0 chrVI 6713 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.67;MQ0=1;QD=7.26;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrVI 6759 . A G 26.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=10;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.57;MQ0=3;MQRankSum=0.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-2.085e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:17:56,0,17 chrVI 6763 . G A 63.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.89;MQ0=4;QD=5.77;SB=-2.755e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:96,12,0 chrVI 6776 . G T 46.34 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.74;MQ0=6;MQRankSum=0.550;QD=3.31;ReadPosRankSum=-1.754;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:14:8:76,0,8 chrVI 6797 . T C 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;DP=27;Dels=0.00;FS=5.927;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.68;MQ0=8;MQRankSum=0.921;QD=1.00;ReadPosRankSum=1.096;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:57:57,0,70 chrVI 6847 . T C 211 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.28;MQ0=25;QD=2.78;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:30:244,30,0 chrVI 6988 . G A 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.902;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.60;MQ0=102;MQRankSum=-0.801;QD=0.28;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,25:155:74:74,0,419 chrVI 7000 . G C 267.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.458;DP=108;Dels=0.00;FS=4.424;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.36;MQ0=72;MQRankSum=0.099;QD=2.47;ReadPosRankSum=0.790;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:297,0,102 chrVI 7032 . T A 331.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.551;DP=91;Dels=0.00;FS=14.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.51;MQ0=50;MQRankSum=-0.047;QD=3.64;ReadPosRankSum=-1.307;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,64:91:31:361,0,31 chrVI 7037 . G A 334.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;DP=85;Dels=0.00;FS=17.389;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.96;MQ0=43;MQRankSum=-0.842;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,53:85:54:364,0,54 chrVI 7106 . T C 287.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.860;DP=197;Dels=0.00;FS=15.673;HaplotypeScore=27.1104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.43;MQ0=113;MQRankSum=1.096;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.820;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,38:197:99:317,0,560 chrVI 7110 . T G 229.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;DP=208;Dels=0.00;FS=8.565;HaplotypeScore=24.0670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.02;MQ0=121;MQRankSum=0.140;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.527;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,37:208:99:259,0,563 chrVI 7113 . T C 225.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.782;DP=205;Dels=0.00;FS=10.500;HaplotypeScore=21.1935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.04;MQ0=122;MQRankSum=-0.203;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.089;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,39:205:99:255,0,590 chrVI 7115 . A C 218.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=212;Dels=0.00;FS=6.492;HaplotypeScore=21.1935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.85;MQ0=126;MQRankSum=0.611;QD=1.03;ReadPosRankSum=2.133;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,38:212:99:248,0,570 chrVI 7118 . G A 219.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.119;DP=217;Dels=0.01;FS=6.335;HaplotypeScore=41.8083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.70;MQ0=130;MQRankSum=-0.352;QD=1.01;ReadPosRankSum=1.536;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,39:214:99:249,0,565 chrVI 7357 . G A 215.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.028;DP=287;Dels=0.00;FS=9.270;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.68;MQ0=85;MQRankSum=0.281;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,52:287:99:245,0,2963 chrVI 7397 . G T 208.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.081;DP=346;Dels=0.00;FS=2.786;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.54;MQ0=83;MQRankSum=-2.563;QD=0.60;ReadPosRankSum=3.301;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,56:346:99:238,0,4077 chrVI 7412 . C T 340.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.143;DP=373;Dels=0.00;FS=4.876;HaplotypeScore=119.0698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.18;MQ0=74;MQRankSum=-0.742;QD=0.91;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,60:373:99:370,0,4747 chrVI 7415 . T C 4911.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.085;DP=389;Dels=0.00;FS=5.922;HaplotypeScore=121.9192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.72;MQ0=74;MQRankSum=0.058;QD=12.62;ReadPosRankSum=-3.501;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,326:389:99:4911,0,350 chrVI 7418 . C T 161.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.057;DP=393;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=123.9019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.98;MQ0=74;MQRankSum=-3.178;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.721;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:340,53:393:99:191,0,5183 chrVI 7499 . G A 2341.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.156;DP=427;Dels=0.00;FS=7.396;HaplotypeScore=10.1790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.14;MQ0=28;MQRankSum=0.925;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.530;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,140:427:99:2371,0,5269 chrVI 7511 . A G 852.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.198;DP=369;Dels=0.00;FS=10.821;HaplotypeScore=45.8468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.62;MQ0=38;MQRankSum=-1.500;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.984;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,80:369:99:882,0,5152 chrVI 7520 . T C 5199.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;DP=344;Dels=0.00;FS=36.319;HaplotypeScore=47.5175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.18;MQ0=48;MQRankSum=0.856;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.836;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,292:344:66:5199,0,66 chrVI 7586 . A T 168.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.247;DP=110;Dels=0.00;FS=32.785;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.39;MQ0=52;MQRankSum=0.033;QD=1.53;ReadPosRankSum=-1.590;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,27:110:99:198,0,356 chrVI 7619 . A T 393 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=28;QD=6.14;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:51:426,51,0 chrVI 7643 . G C 112.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.19;MQ0=6;QD=4.67;SB=-1.076e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:18:145,18,0 chrVI 7656 . C T 86.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.41;MQ0=5;QD=7.84;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:119,15,0 chrVI 7684 . C G 76.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.05;MQ0=7;MQRankSum=0.540;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:57:106,0,57 chrVI 7689 . A C 82.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.08;MQ0=5;MQRankSum=0.694;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:59:112,0,59 chrVI 7692 . A G 82.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.08;MQ0=5;MQRankSum=-0.386;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:59:112,0,59 chrVI 7693 . G A 84.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.700;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.08;MQ0=5;MQRankSum=-0.694;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.386;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:53:114,0,53 chrVI 7699 . T C 85.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.88;MQ0=6;MQRankSum=0.185;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.849;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:31:115,0,31 chrVI 7701 . T C 87.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.46;MQ0=7;MQRankSum=-0.254;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.775;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:34:117,0,34 chrVI 7740 . C T 212.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.197;DP=82;Dels=0.00;FS=1.098;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.56;MQ0=34;MQRankSum=-2.917;QD=2.59;ReadPosRankSum=4.778;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,55:82:99:242,0,363 chrVI 7741 . C T 341.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;DP=82;Dels=0.00;FS=2.415;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.56;MQ0=34;MQRankSum=2.723;QD=4.16;ReadPosRankSum=-4.385;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:371,0,233 chrVI 7745 . A T 200.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.271;DP=87;Dels=0.00;FS=1.090;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.67;MQ0=35;MQRankSum=-3.058;QD=2.30;ReadPosRankSum=3.618;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,59:87:99:230,0,403 chrVI 7746 . G A 202.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.825;DP=88;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.09;MQ0=35;MQRankSum=-3.168;QD=2.30;ReadPosRankSum=3.673;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,59:88:99:232,0,410 chrVI 7752 . G A 233.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.411;DP=126;Dels=0.00;FS=14.378;HaplotypeScore=4.5934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.54;MQ0=50;MQRankSum=-4.445;QD=1.85;ReadPosRankSum=4.173;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:263,0,846 chrVI 7834 . A G 2094.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.680;DP=249;Dels=0.00;FS=23.669;HaplotypeScore=8.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.56;MQ0=20;MQRankSum=6.138;QD=8.41;ReadPosRankSum=-3.444;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,115:249:99:2124,0,1946 chrVI 7953 . G C 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.358;DP=144;Dels=0.00;FS=3.397;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.80;MQ0=46;MQRankSum=-0.760;QD=0.15;ReadPosRankSum=0.276;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,27:144:52:52,0,1086 chrVI 8038 . C T 730 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.81;MQ0=17;QD=13.52;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:84:763,84,0 chrVI 8186 . T C 90.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.35;MQ0=23;QD=3.11;SB=-2.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:15:123,15,0 chrVI 8193 . G A 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.96;MQ0=22;QD=0.75;SB=-2.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:6:50,6,0 chrVI 8262 . G A 414.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=60;Dels=0.00;FS=9.203;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.83;MQ0=30;MQRankSum=1.765;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.981;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,40:60:40:444,0,40 chrVI 8493 . T C 3228.29 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;DP=166;Dels=0.00;FS=21.239;HaplotypeScore=2.7196;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.09;MQ0=32;MQRankSum=2.080;QD=19.45;ReadPosRankSum=2.413;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,151:166:99:3262,303,0 chrVI 8532 . A G 1047.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;DP=124;Dels=0.00;FS=82.824;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.02;MQ0=50;MQRankSum=2.917;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,73:124:99:1077,0,257 chrVI 8569 . A C 305.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.166;DP=92;Dels=0.00;FS=16.153;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.78;MQ0=48;MQRankSum=-0.059;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,35:92:99:335,0,492 chrVI 8661 . A G 54.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.916;DP=28;Dels=0.00;FS=4.242;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.67;MQ0=9;MQRankSum=-0.634;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.465;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:84:84,0,256 chrVI 8668 . A C 184.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.459;DP=42;Dels=0.00;FS=10.976;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.73;MQ0=9;MQRankSum=-0.492;QD=4.38;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:214,0,376 chrVI 8753 . T C 969.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.759;DP=181;Dels=0.00;FS=14.498;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.44;MQ0=48;MQRankSum=0.853;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,73:181:99:999,0,1619 chrVI 8776 . T C 388.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.941;DP=102;Dels=0.00;FS=8.573;HaplotypeScore=6.9423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.50;MQ0=33;MQRankSum=-0.947;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,41:102:99:418,0,787 chrVI 8787 . T C 339.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.778;DP=72;Dels=0.00;FS=23.832;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.09;MQ0=31;MQRankSum=-1.111;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.092;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:369,0,401 chrVI 8801 . A G 275.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;DP=55;Dels=0.00;FS=16.246;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.52;MQ0=25;MQRankSum=-1.088;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.209;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:305,0,253 chrVI 8849 . G C 425 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.54;MQ0=3;QD=18.48;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:54:458,54,0 chrVI 8893 . A G 455 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.09;MQ0=10;MQRankSum=-1.419;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.158;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:54:488,54,0 chrVI 8910 . C A 1150 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.53;MQ0=9;QD=20.18;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:1183,120,0 chrVI 9061 . G A 281.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.26;MQ0=12;MQRankSum=-1.607;QD=5.85;ReadPosRankSum=-2.813;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:311,0,180 chrVI 9068 . G T 167.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.530;DP=42;Dels=0.00;FS=2.863;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.56;MQ0=12;MQRankSum=-2.580;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:197,0,180 chrVI 9074 . C T 87.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.292;DP=42;Dels=0.00;FS=4.371;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.24;MQ0=12;MQRankSum=1.841;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.648;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:117,0,269 chrVI 9077 . C G 80.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.07;MQ0=12;MQRankSum=-2.293;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.311;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:110,0,199 chrVI 9079 . G T 64.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.339;DP=36;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.04;MQ0=12;MQRankSum=-1.729;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.775;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:94:94,0,196 chrVI 9100 . C G 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;DP=27;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.67;MQ0=6;MQRankSum=-1.273;QD=1.59;ReadPosRankSum=1.504;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:73:73,0,182 chrVI 9106 . T G 248 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=22;Dels=0.00;FS=12.788;HaplotypeScore=5.8523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.30;MQ0=3;MQRankSum=-1.734;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.552;SB=-9.777e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:33:281,33,0 chrVI 9139 . G A 107.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;DP=38;Dels=0.00;FS=6.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.56;MQ0=19;MQRankSum=0.041;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:137,0,223 chrVI 9225 . T C 248 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.14;MQ0=3;QD=15.50;SB=-9.777e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:33:281,33,0 chrVI 9286 . G A 33.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;DP=64;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.30;MQ0=55;MQRankSum=1.652;QD=0.52;ReadPosRankSum=-1.159;SB=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:62:63,0,62 chrVI 9382 . G A 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;DP=98;Dels=0.00;FS=37.488;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.15;MQ0=75;MQRankSum=2.571;QD=0.42;ReadPosRankSum=-1.975;SB=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,30:98:71:71,0,201 chrVI 9611 . C T 262.79 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;DP=119;Dels=0.00;FS=8.371;HaplotypeScore=2.5859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.74;MQ0=90;MQRankSum=-0.847;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-1.227e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:52,66:118:10:295,10,0 chrVI 9621 . G A 100.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;DP=123;Dels=0.00;FS=6.628;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.25;MQ0=100;MQRankSum=0.226;QD=0.82;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:52,71:123:15:133,15,0 chrVI 9622 . G A 100.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;DP=124;Dels=0.00;FS=6.628;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.22;MQ0=101;MQRankSum=-0.980;QD=0.81;ReadPosRankSum=-1.281;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:53,71:124:15:133,15,0 chrVI 9959 . G A 1890.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.586;DP=179;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.06;MQ0=44;MQRankSum=-0.976;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.800;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,108:179:99:1920,0,639 chrVI 10267 . T C 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.742;DP=139;Dels=0.00;FS=51.003;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.02;MQ0=119;MQRankSum=-0.501;QD=0.40;ReadPosRankSum=0.656;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,54:139:86:86,0,198 chrVI 10278 . C T 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;DP=146;Dels=0.00;FS=49.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.49;MQ0=127;MQRankSum=-0.367;QD=0.46;ReadPosRankSum=2.817;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,58:146:97:97,0,151 chrVI 10511 . G A 130.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.899;DP=125;Dels=0.00;FS=11.335;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.94;MQ0=107;MQRankSum=-0.791;QD=1.04;ReadPosRankSum=-0.685;SB=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:26:160,0,26 chrVI 10517 . T A 122.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;DP=130;Dels=0.00;FS=9.565;HaplotypeScore=2.1557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.62;MQ0=110;MQRankSum=-0.555;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.079;SB=-6.485e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:75:152,0,75 chrVI 10546 . G A 105.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;DP=117;Dels=0.00;FS=10.212;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.17;MQ0=102;MQRankSum=0.061;QD=0.90;ReadPosRankSum=1.776;SB=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:29:135,0,29 chrVI 10580 . A G 608 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.70;MQ0=75;MQRankSum=-0.675;QD=5.53;ReadPosRankSum=-2.096;SB=-3.369e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:49,61:110:30:641,30,0 chrVI 10690 . A T 288 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.73;MQ0=39;QD=5.14;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:36:321,36,0 chrVI 10843 . C T 402.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.897;DP=129;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.73;MQ0=75;MQRankSum=-2.750;QD=3.12;ReadPosRankSum=-1.987;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:432,0,374 chrVI 10844 . C T 402.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.139;DP=129;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.73;MQ0=75;MQRankSum=-2.874;QD=3.12;ReadPosRankSum=-1.828;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:432,0,364 chrVI 10940 . T C 207.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.66;MQ0=66;MQRankSum=-2.096;QD=2.38;ReadPosRankSum=2.168;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:237,0,186 chrVI 10955 . G A 260.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.618;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.15;MQ0=46;MQRankSum=-1.828;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.082;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,38:67:99:290,0,120 chrVI 10993 . G A 301.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.333;DP=63;Dels=0.00;FS=6.335;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.06;MQ0=20;MQRankSum=-0.231;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:331,0,401 chrVI 11006 . A G 885 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.24;MQ0=13;MQRankSum=0.144;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.588;SB=-1.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:99:918,108,0 chrVI 11023 . G A 507.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.368;DP=124;Dels=0.00;FS=13.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.77;MQ0=13;MQRankSum=-3.361;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.690;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,50:124:99:537,0,1265 chrVI 11034 . A G 556.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.378;DP=142;Dels=0.00;FS=22.845;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.54;MQ0=11;MQRankSum=-3.074;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.379;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,56:142:99:586,0,1484 chrVI 11064 . A G 820.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.002;DP=196;Dels=0.00;FS=1.172;HaplotypeScore=125.5968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.09;MQ0=9;MQRankSum=-1.892;QD=4.18;ReadPosRankSum=-2.435;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,78:196:99:850,0,2066 chrVI 11104 . G A 524.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;DP=206;Dels=0.00;FS=2.059;HaplotypeScore=2.6624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.82;MQ0=24;MQRankSum=-3.629;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.478;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,80:206:99:554,0,1762 chrVI 11107 . C T 549.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.266;DP=207;Dels=0.00;FS=1.310;HaplotypeScore=3.6518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.61;MQ0=26;MQRankSum=-4.197;QD=2.65;ReadPosRankSum=1.254;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,83:207:99:579,0,1672 chrVI 11260 . T C 2515 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=149;Dels=0.01;FS=5.424;HaplotypeScore=6.7308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.72;MQ0=10;MQRankSum=-0.615;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,130:148:99:2548,150,0 chrVI 11277 . T C 2566 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;DP=125;Dels=0.00;FS=4.881;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.14;MQ0=9;MQRankSum=-0.585;QD=20.53;ReadPosRankSum=-1.658;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,111:125:99:2599,173,0 chrVI 11305 . G T 3120 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.501;DP=142;Dels=0.00;FS=15.407;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=8;MQRankSum=-0.457;QD=21.97;ReadPosRankSum=1.146;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,128:142:99:3153,206,0 chrVI 11404 . A G 1030.64 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;DP=144;Dels=0.00;FS=47.984;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.45;MQ0=52;MQRankSum=1.397;QD=7.16;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-2.236e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:45,99:144:11:1063,11,0 chrVI 11547 . G A 422.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.045;DP=166;Dels=0.00;FS=20.874;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.95;MQ0=90;MQRankSum=-1.061;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.964;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,89:166:99:452,0,282 chrVI 11581 . T C 707.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.912;DP=171;Dels=0.00;FS=27.361;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.15;MQ0=82;MQRankSum=-1.364;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,93:171:99:737,0,407 chrVI 11630 . C T 1829.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.677;DP=227;Dels=0.00;FS=6.090;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.78;MQ0=36;MQRankSum=1.378;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.370;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,110:227:99:1859,0,1842 chrVI 11659 . C T 2424.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.411;DP=256;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.73;MQ0=10;MQRankSum=1.056;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,123:256:99:2454,0,2391 chrVI 11844 . T A 70.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;DP=175;Dels=0.00;FS=42.514;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.69;MQ0=110;MQRankSum=0.992;QD=0.40;ReadPosRankSum=0.238;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,33:175:99:100,0,554 chrVI 11941 . C G 1141 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.88;MQ0=101;QD=6.52;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:1174,132,0 chrVI 12139 . C T 4441.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5246;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.64;MQ0=6;MQRankSum=0.039;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.358;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,181:182:99:4441,456,0 chrVI 12251 . G A 186.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.922;DP=175;Dels=0.00;FS=24.341;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.13;MQ0=87;MQRankSum=0.343;QD=1.06;ReadPosRankSum=2.114;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,66:175:99:216,0,1242 chrVI 12289 . G T 718.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.847;DP=171;Dels=0.00;FS=9.118;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.59;MQ0=87;MQRankSum=-0.103;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.608;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,73:171:99:748,0,750 chrVI 12416 . T A 6834.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=287;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9007;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.58;MQ0=10;QD=23.81;SB=-2.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,287:287:99:6834,676,0 chrVI 12436 . G A 2909.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.261;DP=268;Dels=0.00;FS=14.193;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.55;MQ0=7;MQRankSum=0.867;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.731;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,151:268:99:2939,0,2128 chrVI 12453 . T C 2519.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.780;DP=252;Dels=0.01;FS=23.490;HaplotypeScore=2.8702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.15;MQ0=29;MQRankSum=2.157;QD=10.00;ReadPosRankSum=-2.119;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,135:250:99:2549,0,1847 chrVI 12495 . A T 295.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.529;DP=143;Dels=0.00;FS=10.317;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.62;MQ0=69;MQRankSum=-2.923;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.509;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:325,0,895 chrVI 12663 . T C 263 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.11;MQ0=45;QD=4.38;SB=-9.777e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:33:296,33,0 chrVI 12665 . C T 266 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.47;MQ0=42;QD=4.67;SB=-9.777e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:33:299,33,0 chrVI 12763 . G T 105.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.359;DP=29;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.24;MQ0=17;MQRankSum=2.637;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.468;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,11:29:15:138,15,0 chrVI 12767 . T C 101.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.24;MQ0=17;MQRankSum=1.396;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.107;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,17:29:15:134,15,0 chrVI 12795 . C T 76.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.45;MQ0=21;QD=2.55;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:12:109,12,0 chrVI 12888 . T A 182.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.92;MQ0=9;QD=8.27;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:24:215,24,0 chrVI 12913 . A C 202.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.88;MQ0=6;QD=10.10;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:27:235,27,0 chrVI 12917 . C T 181.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.90;MQ0=1;QD=16.46;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:24:214,24,0 chrVI 12985 . T C 65.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.50;MQ0=33;MQRankSum=0.747;QD=1.59;ReadPosRankSum=0.747;SB=-2.705e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:14:95,0,14 chrVI 13031 . C T 41.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.01;MQ0=21;MQRankSum=-0.742;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:14:71,0,14 chrVI 13039 . G T 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.23;MQ0=6;QD=3.92;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:83,9,0 chrVI 13066 . C G 71.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.17;MQ0=4;QD=3.76;SB=-5.055e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:104,12,0 chrVI 13087 . A G 87.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;DP=36;Dels=0.00;FS=21.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.74;MQ0=21;MQRankSum=1.653;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.306;SB=-2.271e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:10:117,0,10 chrVI 13192 . T C 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.64;MQ0=9;QD=0.95;SB=-2.476e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:6:52,6,0 chrVI 13378 . C T 252 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.419;DP=70;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.63;MQ0=49;MQRankSum=1.857;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-1.339e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,59:70:33:285,33,0 chrVI 13396 . C T 118.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.98;MQ0=47;QD=1.82;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:18:151,18,0 chrVI 13477 . A G 214 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.10;MQ0=32;QD=4.12;SB=-2.700e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,49:52:30:247,30,0 chrVI 13529 . G A 462 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.17;MQ0=25;QD=8.88;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:60:495,60,0 chrVI 14545 . A G 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.46;MQ0=2;QD=3.76;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:50,6,0 chrVI 14557 . A T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.46;MQ0=2;QD=4.76;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:55,6,0 chrVI 14560 . A G 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.46;MQ0=2;QD=4.56;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:54,6,0 chrVI 14570 . G A 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.46;MQ0=2;QD=5.16;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:57,6,0 chrVI 14572 . G T 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.46;MQ0=2;QD=5.16;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:57,6,0 chrVI 14595 . C A 52.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=2;QD=8.83;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:9:85,9,0 chrVI 14614 . G T 53.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=2;QD=9.00;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:9:86,9,0 chrVI 14615 . A T 53.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=2;QD=9.00;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:9:86,9,0 chrVI 14632 . T A 54.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=2;QD=9.16;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:9:87,9,0 chrVI 14799 . G A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 chrVI 14800 . G A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 chrVI 14821 . G A 49.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 chrVI 14824 . A G 50.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.99;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 chrVI 14830 . G A 53.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.99;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 chrVI 14836 . A C 49.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 chrVI 14839 . A G 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=14.99;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 chrVI 14847 . T G 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 chrVI 14863 . C T 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 chrVI 14884 . C T 330 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.30;MQ0=0;QD=20.62;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:39:363,39,0 chrVI 14922 . C G 418 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.284;DP=21;Dels=0.00;FS=10.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.41;MQ0=0;MQRankSum=3.000;QD=19.90;ReadPosRankSum=3.000;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,17:21:48:451,48,0 chrVI 14925 . T A 434 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.761;DP=22;Dels=0.00;FS=10.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.69;MQ0=1;MQRankSum=3.000;QD=19.73;ReadPosRankSum=3.000;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,17:22:48:467,48,0 chrVI 14931 . G A 469 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.38;MQ0=1;QD=18.76;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:54:502,54,0 chrVI 14945 . T C 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.912;DP=33;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.12;MQ0=1;MQRankSum=-2.238;QD=2.03;ReadPosRankSum=-4.690;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:97:97,0,443 chrVI 14946 . A G 66.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.535;DP=33;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.12;MQ0=1;MQRankSum=-2.082;QD=2.00;ReadPosRankSum=-4.690;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:96:96,0,456 chrVI 14985 . G A 79.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.325;DP=24;Dels=0.00;FS=2.218;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.10;MQ0=6;MQRankSum=0.234;QD=3.29;ReadPosRankSum=-3.231;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:109,0,155 chrVI 14991 . T A 240 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.23;MQ0=6;QD=10.91;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:30:273,30,0 chrVI 15030 . C T 170.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.05;MQ0=5;QD=8.95;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:203,21,0 chrVI 15177 . G A 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.66;MQ0=0;QD=4.71;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:6:50,6,0 chrVI 15201 . T C 38.06 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.03;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:16:68,0,16 chrVI 15204 . A G 54.11 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.03;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-2.206e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:13:84,0,13 chrVI 15225 . G A 53.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=13.49;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:86,9,0 chrVI 15231 . T A 24.23 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.06;SB=17.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:6:55,6,0 chrVI 15240 . C T 18.10 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.358;SB=-3.350e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:19:48,0,19 chrVI 15243 . A G 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.99;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:77,9,0 chrVI 15249 . A G 14.20 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.231;SB=-3.360e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:19:44,0,19 chrVI 15258 . C T 50.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.19;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:83,9,0 chrVI 15280 . C T 51.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.39;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:84,9,0 chrVI 15354 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrVI 15390 . C T 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:56,6,0 chrVI 15393 . T G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrVI 15687 . A G 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrVI 15708 . T C 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrVI 15712 . T C 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrVI 15725 . C G 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrVI 15729 . A G 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrVI 15730 . A C 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrVI 15735 . A G 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrVI 15737 . T C 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrVI 16531 . T C 46.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.86;MQ0=0;QD=2.94;SB=-9.817e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:9:79,9,0 chrVI 16532 . G A 49.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.86;MQ0=0;QD=3.12;SB=-9.817e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:9:82,9,0 chrVI 16537 . G A 52.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=4.07;SB=-9.807e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:85,9,0 chrVI 16544 . T C 38.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=3.00;SB=-9.807e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:71,9,0 chrVI 16555 . G A 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=3.84;SB=-9.807e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:82,9,0 chrVI 16594 . A G 47.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQ0=0;QD=4.36;SB=-9.731e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:80,9,0 chrVI 16688 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=1.68;SB=-1.773e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:53,6,0 chrVI 16689 . C T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=1.83;SB=-1.773e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:55,6,0 chrVI 16699 . T C 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.31;MQ0=0;QD=1.41;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:51,6,0 chrVI 16722 . C T 45.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=4.60;SB=-9.731e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:78,9,0 chrVI 16723 . T C 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=4.50;SB=-9.731e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:77,9,0 chrVI 16726 . A C 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=4.50;SB=-9.731e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:77,9,0 chrVI 16727 . A G 42.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=4.30;SB=-9.731e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:75,9,0 chrVI 16730 . G A 53.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=4.91;SB=-9.775e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:86,9,0 chrVI 16733 . T A 76.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=6.96;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:109,12,0 chrVI 16736 . T C 73.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=6.68;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:106,12,0 chrVI 16759 . C G 198.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.86;MQ0=0;QD=11.65;SB=-2.375e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:27:231,27,0 chrVI 16763 . T C 204.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.86;MQ0=0;QD=12.00;SB=-2.375e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:27:237,27,0 chrVI 16769 . C T 214.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.70;MQ0=0;QD=14.27;SB=-2.354e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:247,27,0 chrVI 16770 . G C 207.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.70;MQ0=0;QD=13.80;SB=-2.354e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:240,27,0 chrVI 16803 . G C 671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.90;MQ0=0;QD=19.17;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:81:704,81,0 chrVI 16818 . A C 950 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.24;MQ0=0;QD=21.11;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:983,117,0 chrVI 16824 . A C 891 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.77;MQ0=0;QD=19.80;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:924,111,0 chrVI 16826 . G C 961 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.66;MQ0=0;QD=20.89;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:994,114,0 chrVI 16830 . T C 920 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.07;MQ0=0;QD=17.04;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:953,114,0 chrVI 16896 . C T 1555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.29;MQ0=0;QD=23.92;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1588,174,0 chrVI 16918 . A C 1754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.66;MQ0=0;QD=24.70;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1787,192,0 chrVI 16931 . A T 1762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.03;MQ0=0;QD=25.91;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1795,189,0 chrVI 17210 . A C 1342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=23.96;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1375,150,0 chrVI 17394 . C T 2068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2101,192,0 chrVI 17399 . A G 1982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=22.52;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2015,198,0 chrVI 17653 . A G 1419 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=21.83;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1452,153,0 chrVI 17723 . G A 1329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.135;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.299;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:1362,123,0 chrVI 17807 . C T 1438 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.68;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1471,147,0 chrVI 17843 . T C 1246 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.96;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1279,138,0 chrVI 17852 . A G 1370 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.85;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1403,150,0 chrVI 17963 . C T 1717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.059;DP=72;Dels=0.00;FS=4.424;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.636;QD=23.85;ReadPosRankSum=0.241;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,71:72:99:1750,151,0 chrVI 17987 . C T 1600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.528;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=23.53;ReadPosRankSum=1.223;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,67:68:99:1633,171,0 chrVI 18017 . G A 1538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.626;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=23.66;ReadPosRankSum=0.400;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:1571,159,0 chrVI 18212 . G A 1716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=23.51;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1749,180,0 chrVI 18304 . T G 1672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=22.00;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:76:99:1705,180,0 chrVI 18339 . G A 1507 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=24.31;ReadPosRankSum=1.006;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,61:62:99:1540,165,0 chrVI 18358 . G A 1496 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.71;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1529,165,0 chrVI 18380 . C T 1655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.27;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1688,174,0 chrVI 18546 . A G 1354 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=23.75;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1387,153,0 chrVI 18618 . G A 1508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.93;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1541,156,0 chrVI 18651 . T C 1710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.31;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1743,189,0 chrVI 18719 . C A 2002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=26.34;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2035,213,0 chrVI 18731 . C T 1746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=65.1691;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.86;MQ0=0;QD=25.30;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1779,189,0 chrVI 18775 . G C 1660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=24.78;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1693,183,0 chrVI 18810 . G C 2083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2116,228,0 chrVI 19068 . A G 1151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=23.02;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1184,129,0 chrVI 19129 . A T 1405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.65;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1438,153,0 chrVI 19184 . G A 1170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.00;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1203,129,0 chrVI 19219 . C T 1440 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.71;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1473,147,0 chrVI 19333 . T A 1432 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=25.12;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1465,156,0 chrVI 19346 . C T 1247 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=25.98;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1280,138,0 chrVI 19414 . G A 1842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.58;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1875,192,0 chrVI 19460 . T A 1883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.79;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1916,198,0 chrVI 19466 . A C 1746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.94;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1779,189,0 chrVI 19604 . A T 1212 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.52;MQ0=0;QD=25.25;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1245,123,0 chrVI 19616 . C T 1164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=24.77;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1197,123,0 chrVI 19711 . C T 1150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.10;MQ0=0;QD=26.14;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1183,120,0 chrVI 19827 . G T 1370 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.61;MQ0=0;QD=24.46;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1403,150,0 chrVI 19853 . C G 1293 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.44;MQ0=0;QD=24.87;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1326,147,0 chrVI 19876 . A T 1348 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.42;MQ0=0;QD=23.65;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1381,153,0 chrVI 19914 . A T 861 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.24;MQ0=0;QD=19.13;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:894,102,0 chrVI 19919 . C T 711 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.06;MQ0=0;QD=17.34;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:81:744,81,0 chrVI 19923 . T C 669 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.06;MQ0=0;QD=16.32;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:78:702,78,0 chrVI 19942 . A G 742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=17.67;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:90:775,90,0 chrVI 19952 . C A 839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.33;MQ0=0;QD=20.46;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:96:872,96,0 chrVI 19961 . C A 779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.57;MQ0=0;QD=19.00;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:93:812,93,0 chrVI 19969 . G C 726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.19;MQ0=0;QD=19.11;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:90:759,90,0 chrVI 19972 . C T 727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.14;MQ0=0;QD=19.65;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:87:760,87,0 chrVI 19980 . C T 792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.73;MQ0=0;QD=22.00;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:93:825,93,0 chrVI 20043 . C T 663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.42;MQ0=0;QD=23.68;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:78:696,78,0 chrVI 20049 . A G 674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.42;MQ0=0;QD=24.07;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:81:707,81,0 chrVI 20087 . C T 830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.63;MQ0=0;QD=23.71;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:96:863,96,0 chrVI 20096 . C T 812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.74;MQ0=0;QD=23.20;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:93:845,93,0 chrVI 20103 . T C 871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.24;MQ0=0;QD=22.92;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:904,102,0 chrVI 20134 . T C 723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.91;MQ0=0;QD=22.59;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:87:756,87,0 chrVI 20162 . T C 954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.98;MQ0=0;QD=22.71;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:987,117,0 chrVI 20170 . A G 859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.82;MQ0=0;QD=22.03;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:892,99,0 chrVI 20226 . A G 1390 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.01;MQ0=0;QD=23.56;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1423,147,0 chrVI 20296 . C A 1622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.27;MQ0=0;QD=24.95;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1655,168,0 chrVI 20333 . T G 1569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.59;MQ0=0;QD=25.72;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1602,171,0 chrVI 20335 . A G 1502 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.92;MQ0=0;QD=23.84;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1535,174,0 chrVI 20390 . A G 1269 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.57;MQ0=0;QD=22.66;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1302,132,0 chrVI 20451 . A G 1156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.48;MQ0=0;QD=23.59;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1189,135,0 chrVI 20567 . A C 669 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=19.68;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:81:702,81,0 chrVI 20569 . G A 712 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=20.94;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:81:745,81,0 chrVI 20573 . T A 727 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;QD=20.77;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:84:760,84,0 chrVI 20580 . T C 594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;MQ0=0;QD=20.48;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:69:627,69,0 chrVI 20597 . T G 587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.62;MQ0=0;QD=21.74;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:69:620,69,0 chrVI 20600 . C A 618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.72;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:69:651,69,0 chrVI 20719 . C G 821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.93;MQ0=0;QD=22.19;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:96:854,96,0 chrVI 20748 . G A 924 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.86;MQ0=0;QD=23.69;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:957,105,0 chrVI 20752 . A C 899 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.82;MQ0=0;QD=22.47;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:932,108,0 chrVI 20756 . A T 904 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.98;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:937,102,0 chrVI 20768 . C T 830 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.69;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:93:863,93,0 chrVI 20769 . G C 814 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.69;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:93:847,93,0 chrVI 20770 . G A 825 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.96;MQ0=0;QD=22.92;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:93:858,93,0 chrVI 20774 . T C 1030 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.01;MQ0=0;QD=20.60;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1063,117,0 chrVI 20817 . T C 1414 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.56;MQ0=0;QD=22.44;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1447,156,0 chrVI 20952 . A T 1437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7390;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.16;MQ0=0;QD=25.66;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1470,156,0 chrVI 21060 . G A 1344 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=25.85;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1377,141,0 chrVI 21267 . A G 1696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.56;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1729,174,0 chrVI 21408 . G A 1876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1909,195,0 chrVI 21492 . A G 1790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=23.87;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1823,180,0 chrVI 21552 . C A 1960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1993,195,0 chrVI 21881 . G A 1911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1944,204,0 chrVI 21975 . G A 2072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.23;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2105,222,0 chrVI 21999 . C T 2023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.27;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2056,216,0 chrVI 22035 . A G 1877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1910,201,0 chrVI 22065 . A T 1435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1468,153,0 chrVI 22204 . C G 2034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.21;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2067,225,0 chrVI 22274 . T C 1554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=21.00;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1587,165,0 chrVI 22395 . A G 2070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2103,240,0 chrVI 22414 . A C 1869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.59;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1902,210,0 chrVI 22525 . G C 1381 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.23;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1414,156,0 chrVI 22632 . T C 1217 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.84;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1250,132,0 chrVI 22715 . T G 1791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.53;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1824,189,0 chrVI 22833 . T G 2139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.041;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=23.77;ReadPosRankSum=1.656;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,88:90:99:2172,206,0 chrVI 22905 . C T 2525 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=101;Dels=0.00;FS=5.730;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.57;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=25.00;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2558,255,0 chrVI 22923 . A G 1683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.36;MQ0=0;QD=24.75;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1716,180,0 chrVI 22927 . T C 1609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.11;MQ0=0;QD=24.38;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1642,174,0 chrVI 23085 . A G 1394 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=25.35;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1427,162,0 chrVI 23089 . C T 1315 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=26.30;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1348,144,0 chrVI 23305 . T G 1907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.09;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1940,207,0 chrVI 23330 . A G 2041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.51;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2074,216,0 chrVI 23356 . G T 2019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.57;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2052,213,0 chrVI 23390 . T C 1855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.41;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1888,201,0 chrVI 23608 . G A 2018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2051,204,0 chrVI 23620 . C T 1824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1857,186,0 chrVI 24214 . G T 1404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.21;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1437,153,0 chrVI 26594 . A T 1695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.48;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1728,180,0 chrVI 27338 . G C 1547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=25.36;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1580,168,0 chrVI 27371 . C T 1413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=25.69;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1446,153,0 chrVI 27376 . A G 1350 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=54;Dels=0.00;FS=4.102;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=25.00;ReadPosRankSum=1.283;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:54:99:1383,150,0 chrVI 27436 . T A 1372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=24.95;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1405,147,0 chrVI 27484 . C T 1404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.44;MQ0=0;QD=25.53;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1437,156,0 chrVI 27574 . T C 489 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.65;MQ0=0;QD=9.59;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:63:522,63,0 chrVI 27592 . A G 861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.13;MQ0=0;QD=15.11;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:57:99:894,99,0 chrVI 27660 . A G 1389 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=24.80;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1422,153,0 chrVI 27763 . T C 1649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=22.59;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1682,186,0 chrVI 27878 . T C 1452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.47;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1485,162,0 chrVI 27960 . A G 1421 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=49.6654;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.84;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1454,159,0 chrVI 28033 . T G 1463 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1496,162,0 chrVI 28051 . T C 1278 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=23.24;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1311,141,0 chrVI 28146 . T C 1891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.88;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1924,210,0 chrVI 28283 . T C 1718 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.20;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1751,189,0 chrVI 28318 . A G 2085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2118,219,0 chrVI 28542 . T C 1964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.51;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1997,210,0 chrVI 28662 . T A 1859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.79;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1892,192,0 chrVI 28916 . T C 1086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.61;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1119,123,0 chrVI 29620 . G A 2009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.76;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2042,213,0 chrVI 29691 . G T 2073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2106,225,0 chrVI 29732 . A G 1741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.18;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1774,183,0 chrVI 29751 . T A 1692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=24.88;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1725,168,0 chrVI 29907 . G T 1555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.19;MQ0=0;QD=25.92;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1588,159,0 chrVI 30014 . G C 747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.72;MQ0=0;QD=21.97;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:87:780,87,0 chrVI 30085 . T C 378.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.129;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=19.90;ReadPosRankSum=2.192;SB=-2.190e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:26:411,26,0 chrVI 30187 . G A 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.96;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2595,249,0 chrVI 30312 . T C 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.812;DP=141;Dels=0.00;FS=40.435;HaplotypeScore=39.3044;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=4.301;QD=22.18;ReadPosRankSum=4.150;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,125:141:99:3161,324,0 chrVI 30348 . T C 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3356,354,0 chrVI 30357 . C T 3938.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.10;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3938,405,0 chrVI 30382 . G A 3929.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.37;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3929,396,0 chrVI 30393 . G T 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.63;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3777,378,0 chrVI 30510 . G C 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:139:99:3537,378,0 chrVI 30544 . A T 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3597,381,0 chrVI 30616 . T C 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.80;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3405,354,0 chrVI 30834 . T A 4069.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4069,412,0 chrVI 30887 . A G 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;DP=177;Dels=0.00;FS=3.524;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.693;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,86:177:99:1766,0,1879 chrVI 30954 . T A 4035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7280;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4035,415,0 chrVI 30964 . G A 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;DP=177;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=2.1434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.866;QD=9.61;ReadPosRankSum=-2.170;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,88:177:99:1731,0,1663 chrVI 31117 . T A 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3378,366,0 chrVI 31360 . G T 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3503,366,0 chrVI 31448 . G C 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.594;DP=151;Dels=0.00;FS=3.465;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=24.49;ReadPosRankSum=1.136;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3698,379,0 chrVI 31460 . A C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.980;DP=134;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=3.3090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.050;QD=8.45;ReadPosRankSum=-2.095;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1162,0,1482 chrVI 31484 . G C 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.746;DP=124;Dels=0.00;FS=3.340;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:124:99:2899,291,0 chrVI 31506 . A C 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.244;DP=141;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.452;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,58:141:99:981,0,1724 chrVI 31522 . G A 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.530;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.90;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3422,350,0 chrVI 31531 . C G 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=119;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=95.6756;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=23.83;ReadPosRankSum=1.004;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2869,295,0 chrVI 31596 . A G 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.46;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3087,336,0 chrVI 31613 . A G 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=94.5834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2600,294,0 chrVI 31648 . A G 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.72;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.525;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3089,317,0 chrVI 31669 . T G 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.131;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2979,297,0 chrVI 31855 . T A 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3258,342,0 chrVI 31946 . A C 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3690,393,0 chrVI 31980 . C T 3891.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3891,399,0 chrVI 32162 . G A 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3393,348,0 chrVI 32204 . C T 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3564,360,0 chrVI 32259 . T G 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3932,423,0 chrVI 32484 . C G 1755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.21;MQ0=0;QD=21.40;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1788,198,0 chrVI 32508 . T C 1246 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=21.48;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1279,150,0 chrVI 32748 . A C 15.88 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=7.94;SB=-2.576e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:47,6,0 chrVI 32754 . T C 334 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.91;MQ0=0;QD=4.64;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:42:367,42,0 chrVI 32800 . C T 1712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.02;MQ0=0;QD=14.27;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:1745,183,0 chrVI 32818 . C T 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.60;MQ0=0;QD=18.45;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:2487,255,0 chrVI 32886 . C A 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.40;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3513,369,0 chrVI 32918 . G A 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.43;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3252,351,0 chrVI 32931 . T G 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.05;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2948,333,0 chrVI 32955 . A C 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.90;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2838,312,0 chrVI 32964 . C T 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=87.9522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.64;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3076,333,0 chrVI 33008 . A T 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.22;MQ0=1;QD=25.81;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3259,348,0 chrVI 33158 . T A 2602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2635,267,0 chrVI 33177 . C A 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3139,318,0 chrVI 33187 . A C 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.92;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2903,303,0 chrVI 33222 . G A 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.59;MQ0=0;QD=26.67;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3180,327,0 chrVI 33267 . T A 2275 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.135;DP=87;Dels=0.00;FS=3.597;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=26.15;ReadPosRankSum=1.015;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:2308,223,0 chrVI 33328 . C T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.675;DP=110;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.565;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:110:99:1303,0,950 chrVI 33340 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.955;DP=117;Dels=0.00;FS=4.839;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=10.35;ReadPosRankSum=2.770;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1241,0,1165 chrVI 33496 . G A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.269;DP=147;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.642;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1448,0,1558 chrVI 33689 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.058;DP=150;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1427,0,1658 chrVI 33797 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.685;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=2.743;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1125,0,1190 chrVI 33886 . A C 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.764;DP=140;Dels=0.00;FS=7.903;HaplotypeScore=2.8026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=7.06;ReadPosRankSum=-2.018;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,56:140:99:1018,0,1851 chrVI 34508 . G A 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2865,294,0 chrVI 34667 . T A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.709;DP=116;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.099;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1158,0,1248 chrVI 34741 . T G 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2624,285,0 chrVI 34775 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.818;DP=120;Dels=0.00;FS=4.701;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.184;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:120:99:1224,0,1154 chrVI 34780 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.156;DP=117;Dels=0.00;FS=4.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.598;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1271,0,1063 chrVI 34881 . T C 1037.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;DP=111;Dels=0.00;FS=3.470;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.195;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1067,0,1234 chrVI 34884 . G A 982.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.091;DP=117;Dels=0.00;FS=7.213;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-3.819;QD=8.39;ReadPosRankSum=2.215;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1012,0,1376 chrVI 34886 . A G 949.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;DP=118;Dels=0.00;FS=7.100;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.866;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:979,0,1372 chrVI 34967 . T C 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3172,336,0 chrVI 35042 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.727;DP=137;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1388,0,1430 chrVI 35048 . T G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.999;DP=136;Dels=0.00;FS=1.361;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1325,0,1456 chrVI 35114 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.619;DP=123;Dels=0.00;FS=8.264;HaplotypeScore=5.9044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=2.481;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1233,0,1324 chrVI 35118 . A G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.347;DP=125;Dels=0.00;FS=9.688;HaplotypeScore=3.9195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1211,0,1382 chrVI 35261 . T C 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.537;DP=153;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.050;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1717,0,1406 chrVI 35262 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.004;DP=156;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,69:156:99:1435,0,1745 chrVI 35310 . G A 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3787,396,0 chrVI 35313 . C T 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3743,390,0 chrVI 35368 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=7.85;ReadPosRankSum=1.039;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1152,0,1712 chrVI 35370 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.800;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.500;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1181,0,1692 chrVI 35385 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.858;DP=144;Dels=0.00;FS=7.794;HaplotypeScore=4.8902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1257,0,1506 chrVI 35514 . A G 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3698,399,0 chrVI 35586 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.302;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.933;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1182,0,1202 chrVI 35589 . A G 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.649;DP=115;Dels=0.00;FS=1.509;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.955;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1131,0,1127 chrVI 35604 . A C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.826;DP=116;Dels=0.00;FS=5.731;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1058,0,1121 chrVI 35661 . C T 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.264;DP=162;Dels=0.01;FS=4.619;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,80:161:99:1612,0,1596 chrVI 35729 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.270;DP=136;Dels=0.00;FS=3.070;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.101;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1468,0,1293 chrVI 35789 . A G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.007;DP=141;Dels=0.00;FS=7.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.604;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1337,0,1461 chrVI 35794 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.871;DP=147;Dels=0.00;FS=6.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1353,0,1590 chrVI 35807 . T C 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;DP=164;Dels=0.00;FS=13.828;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.512;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,78:164:99:1553,0,1630 chrVI 35855 . G C 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;DP=138;Dels=0.00;FS=2.218;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.237;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1507,0,1157 chrVI 35905 . A C 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4033,447,0 chrVI 35915 . C T 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.24;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3769,387,0 chrVI 35920 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.841;DP=155;Dels=0.00;FS=3.865;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=-3.015;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1373,0,1525 chrVI 35940 . A T 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.66;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3801,402,0 chrVI 36075 . A G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.095;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1251,0,1372 chrVI 36181 . T C 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,76:124:99:1584,0,954 chrVI 36247 . A G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;DP=117;Dels=0.00;FS=3.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.837;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1461,0,1013 chrVI 36301 . C T 1840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.351;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.415;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,90:149:99:1870,0,1130 chrVI 36358 . T C 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.80;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3844,405,0 chrVI 36394 . G A 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3847,388,0 chrVI 36423 . T G 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3596,393,0 chrVI 36462 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.993;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.743;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1220,0,1496 chrVI 36552 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.701;DP=147;Dels=0.00;FS=2.070;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1495,0,1436 chrVI 36642 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.233;DP=161;Dels=0.00;FS=4.873;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=1;MQRankSum=-0.440;QD=7.27;ReadPosRankSum=2.976;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,63:161:99:1201,0,2012 chrVI 36795 . A T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.816;DP=151;Dels=0.00;FS=7.380;HaplotypeScore=3.7007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.966;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1417,0,1626 chrVI 36857 . G C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.878;DP=106;Dels=0.00;FS=1.633;HaplotypeScore=2.8982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.632;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:952,0,1161 chrVI 36925 . G T 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.94;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3023,315,0 chrVI 37000 . A G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.051;DP=129;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.898;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:129:99:1561,0,1111 chrVI 37039 . G C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;DP=105;Dels=0.00;FS=0.779;HaplotypeScore=5.2001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=12.71;ReadPosRankSum=-1.811;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,65:105:99:1365,0,734 chrVI 37159 . C T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.597;DP=125;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,77:125:99:1666,0,904 chrVI 37222 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;DP=134;Dels=0.00;FS=3.386;HaplotypeScore=4.7782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.273;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:134:99:1249,0,1444 chrVI 37497 . A G 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3245,342,0 chrVI 37537 . A G 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.09;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3313,357,0 chrVI 37852 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.669;DP=133;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=8.7205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=10.10;ReadPosRankSum=2.086;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1373,0,1261 chrVI 37951 . A T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.925;DP=110;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1212,0,1062 chrVI 38005 . G A 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.656;DP=84;Dels=0.00;FS=1.875;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.599;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:942,0,801 chrVI 38029 . C T 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.908;DP=88;Dels=0.00;FS=3.027;HaplotypeScore=2.8740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,51:88:99:1027,0,702 chrVI 38035 . C T 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;DP=80;Dels=0.00;FS=0.891;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.95;MQ0=0;MQRankSum=-2.910;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,45:80:99:901,0,699 chrVI 38041 . C T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.443;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.116;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,51:87:99:1033,0,690 chrVI 38255 . G A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.387;DP=138;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1405,0,1273 chrVI 38588 . G T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.666;DP=116;Dels=0.00;FS=2.362;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1145,0,1289 chrVI 38681 . T C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;DP=91;Dels=0.00;FS=5.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.681;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1040,0,865 chrVI 38909 . A G 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3068,324,0 chrVI 38918 . T C 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3063,318,0 chrVI 39269 . C T 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.076;DP=101;Dels=0.00;FS=1.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=9.73;ReadPosRankSum=2.252;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1013,0,1018 chrVI 39374 . C T 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.172;DP=106;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1019,0,1072 chrVI 39419 . G T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.293;DP=129;Dels=0.01;FS=0.669;HaplotypeScore=4.4993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.190;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:128:99:1324,0,1273 chrVI 39488 . G A 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3003,321,0 chrVI 39521 . G A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.284;DP=129;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.114;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1299,0,1367 chrVI 39566 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.316;DP=146;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1257,0,1690 chrVI 39674 . C G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.138;DP=148;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1593,0,1400 chrVI 39808 . C T 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.639;DP=131;Dels=0.00;FS=1.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1524,0,1098 chrVI 39950 . C A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.208;DP=142;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.739;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1390,0,1471 chrVI 39981 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.724;DP=136;Dels=0.00;FS=2.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1313,0,1337 chrVI 40027 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=131;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.076;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1307,0,1391 chrVI 40189 . A G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=1;QD=25.32;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2995,321,0 chrVI 40232 . A C 4019.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=1;QD=24.96;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4019,405,0 chrVI 40322 . C G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.644;DP=132;Dels=0.00;FS=10.746;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1327,0,1314 chrVI 40338 . A T 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3330,345,0 chrVI 40564 . C T 4000.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.48;SB=-2.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4000,405,0 chrVI 40603 . T C 2651 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=22.66;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2684,294,0 chrVI 40630 . T C 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=1;QD=24.40;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3132,354,0 chrVI 40771 . G A 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3549,363,0 chrVI 40798 . G A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.324;DP=154;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=3.5450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1582,0,1542 chrVI 40841 . G A 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3864,402,0 chrVI 41032 . G A 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3654;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3814,397,0 chrVI 41068 . G T 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.683;DP=138;Dels=0.00;FS=4.239;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.722;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:138:99:1582,0,1327 chrVI 41221 . G C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.683;DP=119;Dels=0.00;FS=5.907;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1361,0,1005 chrVI 41296 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.567;DP=136;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=3.080;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:136:99:1468,0,1258 chrVI 41412 . C G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.291;DP=123;Dels=0.00;FS=6.954;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.477;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.399;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1060,0,1375 chrVI 41461 . A C 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2671,294,0 chrVI 41500 . G A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3152,333,0 chrVI 41563 . G T 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3192,339,0 chrVI 41626 . T A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;DP=130;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1478,0,1272 chrVI 41688 . G A 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2981,312,0 chrVI 41722 . C T 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.148;DP=112;Dels=0.00;FS=3.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:835,0,1355 chrVI 41739 . C T 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;DP=132;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=2.4203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,83:132:99:1699,0,941 chrVI 41791 . A G 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=22.44;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2659,285,0 chrVI 41842 . T C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2931,318,0 chrVI 41899 . T G 2544 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2577,285,0 chrVI 41939 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.241;DP=129;Dels=0.00;FS=3.263;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1430,0,1172 chrVI 42070 . C G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.517;DP=125;Dels=0.00;FS=4.286;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=1;MQRankSum=-0.045;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.200;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1179,0,1337 chrVI 42167 . G A 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.315;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.469;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,40:101:99:812,0,1250 chrVI 42240 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.718;DP=170;Dels=0.00;FS=4.043;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.508;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,82:170:99:1482,0,1808 chrVI 42346 . A G 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3718,414,0 chrVI 42349 . T C 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.245;DP=148;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,85:148:99:1716,0,1252 chrVI 42562 . T C 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.162;DP=91;Dels=0.00;FS=1.799;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:91:99:784,0,1095 chrVI 42633 . G A 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3410,360,0 chrVI 42684 . T C 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.545;DP=134;Dels=0.00;FS=13.172;HaplotypeScore=3.3571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.967;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,83:134:99:1753,0,1035 chrVI 42772 . T A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.268;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=10.24;ReadPosRankSum=-2.035;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1412,0,1458 chrVI 42842 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;DP=131;Dels=0.00;FS=5.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.380;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1248,0,1461 chrVI 42955 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.798;DP=124;Dels=0.00;FS=3.298;HaplotypeScore=3.9242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:124:99:1219,0,1345 chrVI 42970 . T G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.711;DP=131;Dels=0.00;FS=12.588;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.932;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1222,0,1397 chrVI 42992 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.362;DP=128;Dels=0.00;FS=11.529;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=9.59;ReadPosRankSum=2.398;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1257,0,1341 chrVI 43072 . A G 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3605,375,0 chrVI 43129 . T C 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.86;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3085,333,0 chrVI 43169 . C T 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3313,345,0 chrVI 43198 . A G 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3065,324,0 chrVI 43492 . G A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.204;DP=119;Dels=0.00;FS=2.392;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.128;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1431,0,866 chrVI 43673 . G A 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3317,342,0 chrVI 43907 . G A 2430 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.13;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2463,258,0 chrVI 43976 . A G 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.786;DP=80;Dels=0.00;FS=6.041;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,36:80:99:706,0,933 chrVI 44192 . A G 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2602,270,0 chrVI 44552 . A G 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.743;DP=132;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.567;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1345,0,1349 chrVI 44724 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.502;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.184;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,50:96:99:980,0,944 chrVI 44748 . T C 2304 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2337,255,0 chrVI 44754 . C T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.021;DP=102;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1021,0,1044 chrVI 44763 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.080;DP=107;Dels=0.00;FS=3.560;HaplotypeScore=3.9499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.489;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:990,0,1169 chrVI 44772 . G A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.448;DP=102;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=2.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.251;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1172,0,954 chrVI 44835 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.255;DP=143;Dels=0.00;FS=13.657;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.261;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1306,0,1613 chrVI 44841 . C T 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.773;DP=141;Dels=0.00;FS=10.372;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1401,0,1418 chrVI 45217 . A G 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3254,339,0 chrVI 45764 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.742;DP=163;Dels=0.00;FS=4.630;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.646;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1369,0,1833 chrVI 45896 . C A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.272;DP=132;Dels=0.00;FS=5.475;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.528;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1288,0,1323 chrVI 45929 . T C 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.994;DP=131;Dels=0.00;FS=11.481;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.693;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1268,0,1386 chrVI 45941 . T C 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3337;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=24.60;ReadPosRankSum=1.147;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3493,357,0 chrVI 46010 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.535;DP=137;Dels=0.00;FS=5.237;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.865;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1202,0,1470 chrVI 46185 . T C 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.337;DP=158;Dels=0.00;FS=2.832;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.719;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:158:99:1508,0,1537 chrVI 46215 . A G 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.300;DP=141;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.574;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1526,0,1333 chrVI 46292 . T A 1991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.390;DP=145;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,89:145:99:2021,0,1013 chrVI 46302 . C T 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.967;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.439;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,85:139:99:1865,0,997 chrVI 46380 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.750;DP=132;Dels=0.00;FS=3.139;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.993;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1238,0,1475 chrVI 46778 . A G 2299 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2332,240,0 chrVI 46863 . T C 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2957,324,0 chrVI 46872 . C T 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3249,336,0 chrVI 47034 . A G 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.076;DP=113;Dels=0.00;FS=4.800;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=-0.457;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1019,0,1236 chrVI 47103 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.127;DP=150;Dels=0.00;FS=4.806;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.246;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1513,0,1586 chrVI 47740 . G A 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.177;DP=132;Dels=0.00;FS=16.166;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.553;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,75:132:99:1583,0,1072 chrVI 47833 . T C 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2854,306,0 chrVI 48016 . T A 3047 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.83;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3080,330,0 chrVI 48019 . A T 2960 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.19;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:2993,327,0 chrVI 48022 . A C 2814 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.24;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2847,321,0 chrVI 48036 . G C 2598 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.72;MQ0=0;QD=22.59;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2631,291,0 chrVI 48049 . G C 2462 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.57;MQ0=0;QD=21.98;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2495,276,0 chrVI 48052 . G T 2593 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.23;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2626,279,0 chrVI 48096 . C T 1901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.647;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.58;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=23.47;ReadPosRankSum=0.920;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:81:99:1934,207,0 chrVI 48102 . T A 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.439;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,44:79:99:826,0,679 chrVI 48411 . C T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3354,339,0 chrVI 48545 . T G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.663;DP=113;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=15.0631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.575;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.492;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1174,0,1116 chrVI 49181 . G A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.318;DP=133;Dels=0.00;FS=3.252;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=8.15;ReadPosRankSum=-2.103;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1114,0,1491 chrVI 49201 . T C 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.505;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.837;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,55:139:99:987,0,1775 chrVI 49360 . T A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;DP=130;Dels=0.00;FS=2.316;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.572;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1391,0,1259 chrVI 49381 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.495;DP=129;Dels=0.02;FS=5.484;HaplotypeScore=6.8860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.084;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1222,0,1260 chrVI 49453 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.949;DP=150;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.364;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.909;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,65:150:99:1337,0,1757 chrVI 49819 . T C 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.652;DP=135;Dels=0.00;FS=2.186;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1495,0,1336 chrVI 49826 . G A 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.581;DP=135;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.468;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:135:99:1589,0,1248 chrVI 49963 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.385;DP=144;Dels=0.00;FS=2.933;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.751;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1492,0,1423 chrVI 50137 . G A 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.688;DP=150;Dels=0.00;FS=8.530;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.848;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1453,0,1721 chrVI 50320 . T C 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.726;DP=149;Dels=0.00;FS=16.947;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=10.65;ReadPosRankSum=2.204;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1617,0,1383 chrVI 50410 . T C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.463;DP=122;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=6.9411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.216;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1092,0,1445 chrVI 50414 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.977;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.089;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1424,0,1076 chrVI 50685 . T C 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3411,357,0 chrVI 50825 . C T 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.140;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.203;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,86:176:99:1686,0,1734 chrVI 51009 . T A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;DP=155;Dels=0.00;FS=2.027;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.090;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1351,0,1580 chrVI 51060 . G T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;DP=113;Dels=0.00;FS=1.862;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.116;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1273,0,1026 chrVI 51067 . A G 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.166;DP=105;Dels=0.00;FS=4.856;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1127,0,1006 chrVI 51104 . C T 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.519;DP=121;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=4.7962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.870;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,71:121:99:1522,0,935 chrVI 51257 . A G 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.842;DP=102;Dels=0.00;FS=6.658;HaplotypeScore=41.6505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:820,0,1197 chrVI 51270 . C A 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.421;DP=103;Dels=0.00;FS=9.887;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.644;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.018;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:103:99:742,0,1227 chrVI 51333 . A G 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:104:99:2675,288,0 chrVI 51343 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.674;DP=106;Dels=0.00;FS=2.574;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1110,0,1079 chrVI 51603 . G A 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3412,357,0 chrVI 51748 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.664;DP=132;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1499,0,1269 chrVI 51876 . C T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=147;Dels=0.00;FS=6.060;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.638;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1563,0,1442 chrVI 52024 . A T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.538;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=8.50;ReadPosRankSum=-2.809;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1109,0,1543 chrVI 52073 . G T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.479;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.989;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1279,0,1354 chrVI 52194 . T C 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.023;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.610;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,76:163:99:1548,0,1833 chrVI 52462 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.900;DP=133;Dels=0.00;FS=8.126;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:133:99:1231,0,1412 chrVI 52640 . G A 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.537;DP=133;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.537;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,52:133:99:994,0,1571 chrVI 52648 . T C 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.029;DP=131;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.874;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,50:131:99:897,0,1748 chrVI 52810 . T C 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.550;DP=113;Dels=0.00;FS=7.461;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.65;MQ0=0;MQRankSum=-3.638;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:816,0,1352 chrVI 52838 . G A 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.949;DP=115;Dels=0.00;FS=2.481;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-5.775;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,44:115:99:838,0,1415 chrVI 52861 . G A 853.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.123;DP=123;Dels=0.00;FS=3.410;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.90;MQ0=0;MQRankSum=-4.692;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.638;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,45:123:99:883,0,1597 chrVI 52862 . G T 829.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.984;DP=121;Dels=0.00;FS=2.421;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQ0=0;MQRankSum=-5.746;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.732;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,45:121:99:859,0,1581 chrVI 52867 . C T 995.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.767;DP=124;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.122;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,50:124:99:1025,0,1476 chrVI 52873 . G A 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.861;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQ0=0;MQRankSum=-4.900;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:949,0,1512 chrVI 52925 . T G 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.524;DP=173;Dels=0.00;FS=18.368;HaplotypeScore=2.6744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=4.456;QD=9.49;ReadPosRankSum=-2.145;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,88:173:99:1672,0,1768 chrVI 53038 . A T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.931;DP=135;Dels=0.00;FS=4.986;HaplotypeScore=5.3232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.85;ReadPosRankSum=3.462;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1495,0,1353 chrVI 53077 . T A 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2861,285,0 chrVI 53160 . T C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.663;DP=132;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.075;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1348,0,1350 chrVI 53193 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.308;DP=135;Dels=0.00;FS=6.786;HaplotypeScore=4.6165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1357,0,1396 chrVI 53218 . G C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1312,0,1381 chrVI 54007 . G A 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3488,354,0 chrVI 54444 . G A 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.339;DP=125;Dels=0.00;FS=4.801;HaplotypeScore=43.1315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,78:125:99:1683,0,840 chrVI 54465 . T C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.062;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.622;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,82:132:99:1628,0,893 chrVI 54858 . A G 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=25.56;ReadPosRankSum=1.233;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3400,360,0 chrVI 54904 . A G 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.637;DP=133;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1454,0,1242 chrVI 55132 . A G 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.33;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3455,390,0 chrVI 55216 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.934;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1360,0,1672 chrVI 55223 . G C 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.906;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.600;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1573,0,1426 chrVI 55242 . C G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.286;DP=153;Dels=0.00;FS=4.072;HaplotypeScore=3.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.303;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1233,0,1744 chrVI 55480 . G A 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2923,300,0 chrVI 55831 . C T 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.894;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.139;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1531,0,1468 chrVI 55864 . A G 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3456,369,0 chrVI 56018 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.344;DP=127;Dels=0.00;FS=3.215;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1183,0,1442 chrVI 56052 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.542;DP=118;Dels=0.00;FS=2.533;HaplotypeScore=4.8404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.905;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1176,0,1215 chrVI 56074 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.912;DP=129;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=4.9333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.610;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1264,0,1358 chrVI 56167 . A C 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;DP=150;Dels=0.00;FS=3.832;HaplotypeScore=4.7471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.218;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1583,0,1455 chrVI 56298 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.421;DP=131;Dels=0.00;FS=6.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1226,0,1450 chrVI 56356 . C T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.559;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=0.218;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.410;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,62:150:99:1202,0,1830 chrVI 56477 . A G 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.561;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=1;MQRankSum=1.427;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.788;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1610,0,1439 chrVI 56809 . G A 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.976;DP=123;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-7.037;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.656;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1004,0,1360 chrVI 56830 . C A 949.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.549;DP=124;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.56;MQ0=0;MQRankSum=-8.080;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.735;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:979,0,1338 chrVI 56833 . C T 928.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.514;DP=123;Dels=0.00;FS=4.349;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.64;MQ0=0;MQRankSum=-7.758;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:958,0,1408 chrVI 56839 . C T 885.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.410;DP=122;Dels=0.00;FS=4.425;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.55;MQ0=0;MQRankSum=-7.660;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:915,0,1329 chrVI 56842 . C G 936.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.489;DP=130;Dels=0.00;FS=3.187;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-6.796;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:966,0,1455 chrVI 56854 . G A 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.56;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2992,315,0 chrVI 57139 . C A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.983;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.123;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1634,0,1520 chrVI 57772 . A G 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.344;DP=85;Dels=0.00;FS=9.089;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.087;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:892,0,816 chrVI 57807 . C T 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.065;DP=151;Dels=0.00;FS=12.917;HaplotypeScore=3.8069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.677;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1556,0,1598 chrVI 57825 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.151;DP=162;Dels=0.00;FS=1.968;HaplotypeScore=3.6492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.406;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,75:162:99:1549,0,1708 chrVI 57870 . A G 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.69;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3597,417,0 chrVI 58053 . C T 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.604;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.201;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,59:101:99:843,0,727 chrVI 58170 . T C 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2629,276,0 chrVI 58312 . A T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.435;DP=136;Dels=0.00;FS=6.429;HaplotypeScore=2.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1433,0,1353 chrVI 58319 . C G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.116;DP=139;Dels=0.00;FS=7.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.209;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1222,0,1434 chrVI 58327 . G T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.083;DP=134;Dels=0.00;FS=9.251;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.128;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1197,0,1518 chrVI 58523 . T G 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.261;DP=105;Dels=0.00;FS=1.591;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:992,0,1172 chrVI 58554 . C T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.641;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.381;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1061,0,742 chrVI 58653 . T C 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.430;DP=114;Dels=0.00;FS=6.326;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.522;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:114:99:1277,0,975 chrVI 58771 . A T 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.511;DP=121;Dels=0.00;FS=4.478;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.415;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1561,0,993 chrVI 58808 . C A 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.122;DP=136;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1681,0,1066 chrVI 58811 . G A 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.636;DP=135;Dels=0.00;FS=3.104;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1685,0,1066 chrVI 58952 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.826;DP=152;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=7.1045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.601;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1389,0,1595 chrVI 58994 . T C 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.113;DP=151;Dels=0.00;FS=2.932;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.227;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1567,0,1536 chrVI 59020 . C T 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.503;DP=148;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=8.8000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.116;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1529,0,1537 chrVI 59141 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.488;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.752;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1277,0,1480 chrVI 59156 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.830;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.779;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1328,0,1461 chrVI 59306 . A C 644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.488;DP=76;Dels=0.00;FS=4.499;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=2.398;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:674,0,885 chrVI 59441 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.402;DP=120;Dels=0.00;FS=3.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.709;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1274,0,1184 chrVI 59567 . A G 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3156,348,0 chrVI 59596 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.222;DP=133;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQ0=0;MQRankSum=-3.895;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:133:99:1375,0,1251 chrVI 59633 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.643;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQ0=0;MQRankSum=-7.751;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1155,0,1037 chrVI 59638 . T C 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.19;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2867,315,0 chrVI 59648 . G T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.506;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.10;MQ0=0;MQRankSum=-8.201;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1293,0,1204 chrVI 59651 . C A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.821;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQ0=0;MQRankSum=-8.652;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.213;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1229,0,1166 chrVI 59674 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.295;DP=118;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.05;MQ0=0;MQRankSum=-7.860;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1234,0,1138 chrVI 59678 . T C 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.263;DP=122;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-7.454;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:122:99:1130,0,1240 chrVI 59726 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3201,348,0 chrVI 59811 . C A 4029.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4029,441,0 chrVI 59912 . G A 664.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.780;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.348;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,40:79:99:694,0,787 chrVI 59918 . C T 808.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.961;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.938;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:838,0,745 chrVI 59919 . G A 827.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.030;DP=81;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.790;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,43:81:99:857,0,745 chrVI 59950 . A T 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.567;DP=90;Dels=0.00;FS=5.978;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:789,0,1085 chrVI 59951 . A G 2282 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=25.08;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2315,246,0 chrVI 60002 . A G 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.955;DP=97;Dels=0.00;FS=8.478;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:882,0,1033 chrVI 60161 . A T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.906;DP=126;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.868;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1415,0,1257 chrVI 60171 . C T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.478;DP=128;Dels=0.00;FS=2.248;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1421,0,1259 chrVI 60234 . G A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.676;DP=158;Dels=0.00;FS=11.079;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1633,0,1489 chrVI 60587 . G A 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.578;DP=129;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.227;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:1711,0,950 chrVI 60644 . T C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.580;DP=133;Dels=0.00;FS=2.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1407,0,1267 chrVI 60686 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.366;DP=135;Dels=0.00;FS=4.133;HaplotypeScore=3.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=2.343;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.636;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1296,0,1350 chrVI 60848 . A G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.936;DP=138;Dels=0.00;FS=4.138;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.223;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1444,0,1308 chrVI 61040 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:125:99:1253,0,1230 chrVI 61110 . T A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.204;DP=130;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.124;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1395,0,1258 chrVI 61214 . A G 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=1;QD=25.81;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3104,336,0 chrVI 61226 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.374;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.388;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1169,0,1382 chrVI 61419 . C T 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3373,354,0 chrVI 61488 . A G 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.447;DP=170;Dels=0.00;FS=0.567;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,87:170:99:1763,0,1669 chrVI 61490 . G C 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.948;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,87:169:99:1664,0,1543 chrVI 61610 . C T 3999.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3999,414,0 chrVI 61634 . G A 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;DP=152;Dels=0.00;FS=22.617;HaplotypeScore=2.5212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,86:152:99:1834,0,1311 chrVI 61686 . C T 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.81;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3208,333,0 chrVI 61694 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.480;DP=113;Dels=0.00;FS=0.800;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=8.33;ReadPosRankSum=-2.002;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:971,0,1349 chrVI 61745 . A G 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.635;DP=107;Dels=0.00;FS=1.769;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.251;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:987,0,1273 chrVI 61943 . A T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;DP=119;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1418,0,1101 chrVI 61997 . T C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.298;DP=103;Dels=0.00;FS=6.496;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,65:103:99:1313,0,771 chrVI 62018 . T C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;DP=107;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.335;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:107:99:1196,0,931 chrVI 62102 . C T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.242;DP=105;Dels=0.00;FS=8.184;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.753;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1007,0,1016 chrVI 62141 . G A 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.785;DP=111;Dels=0.00;FS=11.001;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.587;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1237,0,1089 chrVI 62735 . T C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.314;DP=128;Dels=0.00;FS=4.410;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.996;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1022,0,1606 chrVI 62777 . C A 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;DP=100;Dels=0.00;FS=3.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:785,0,1247 chrVI 62822 . A G 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.744;DP=132;Dels=0.00;FS=20.178;HaplotypeScore=4.4741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=3.069;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.302;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1537,0,1088 chrVI 62831 . C T 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=125;Dels=0.01;FS=4.914;HaplotypeScore=3.9179;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.592;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3103,292,0 chrVI 62924 . T C 748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.250;DP=107;Dels=0.00;FS=9.931;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.721;SB=-8.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:778,0,1441 chrVI 62973 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;DP=131;Dels=0.00;FS=5.182;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=7.57;ReadPosRankSum=2.881;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,52:131:99:1022,0,1709 chrVI 63014 . C T 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.30;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2487,258,0 chrVI 63136 . T A 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:941,0,1169 chrVI 63394 . C G 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2714,297,0 chrVI 63422 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.179;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1164,0,1495 chrVI 64052 . T G 2451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=23.80;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2484,270,0 chrVI 64249 . G A 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3608,375,0 chrVI 64491 . T C 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.570;DP=156;Dels=0.00;FS=3.483;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.511;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1593,0,1548 chrVI 64624 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.135;DP=114;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.637;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1238,0,1141 chrVI 64877 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.197;DP=143;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.688;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1451,0,1494 chrVI 64959 . A T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.752;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1364,0,1286 chrVI 65029 . T A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.039;DP=109;Dels=0.00;FS=4.706;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.918;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1139,0,1124 chrVI 65065 . A G 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.542;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:90:99:945,0,910 chrVI 65094 . C T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.839;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1207,0,993 chrVI 65123 . A T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.990;DP=124;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=6.5745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.695;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1294,0,995 chrVI 65183 . C T 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.967;DP=117;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=2.2990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:117:99:898,0,1316 chrVI 65500 . A G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.943;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1467,0,1693 chrVI 65504 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.331;DP=148;Dels=0.00;FS=2.065;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1532,0,1455 chrVI 65802 . T G 3660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3660,384,0 chrVI 66059 . G T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.786;DP=129;Dels=0.00;FS=7.125;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.092;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1394,0,1225 chrVI 66081 . A T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.681;DP=131;Dels=0.00;FS=7.389;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:131:99:1474,0,1281 chrVI 66782 . C T 1927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.926;DP=179;Dels=0.00;FS=3.553;HaplotypeScore=6.7317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.157;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,92:179:99:1957,0,1728 chrVI 66907 . C G 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.595;DP=116;Dels=0.00;FS=0.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.078;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,44:116:99:789,0,1567 chrVI 66948 . C T 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.045;DP=148;Dels=0.00;FS=1.328;HaplotypeScore=4.5446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:148:99:1215,0,1819 chrVI 68557 . G A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.017;DP=101;Dels=0.00;FS=1.610;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1229,0,730 chrVI 68669 . G A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.782;DP=119;Dels=0.00;FS=3.635;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1405,0,881 chrVI 68671 . T G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.829;DP=119;Dels=0.00;FS=3.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1370,0,939 chrVI 68758 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.983;DP=96;Dels=0.00;FS=5.542;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,57:96:99:1191,0,818 chrVI 68816 . A G 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.360;DP=114;Dels=0.00;FS=11.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1446,0,963 chrVI 68825 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.975;DP=112;Dels=0.00;FS=9.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1302,0,961 chrVI 68887 . G C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.953;DP=113;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.491;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1125,0,992 chrVI 68888 . A G 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.970;DP=107;Dels=0.00;FS=0.786;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1161,0,1046 chrVI 68994 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.918;DP=116;Dels=0.00;FS=1.924;HaplotypeScore=6.6239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1206,0,1201 chrVI 69022 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.859;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.326;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1443,0,1191 chrVI 69208 . G A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.021;DP=152;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:152:99:1514,0,1502 chrVI 69214 . T G 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.641;DP=157;Dels=0.00;FS=2.034;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1501,0,1637 chrVI 69412 . A G 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;DP=143;Dels=0.00;FS=10.474;HaplotypeScore=4.6098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=0.326;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.208;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1432,0,1421 chrVI 69547 . G A 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;DP=127;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1388,0,1223 chrVI 69559 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.094;DP=134;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1385,0,1404 chrVI 69598 . T A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.163;DP=132;Dels=0.00;FS=4.296;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1418,0,1275 chrVI 69625 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.438;DP=123;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.078;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1392,0,1129 chrVI 69634 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.756;DP=130;Dels=0.00;FS=2.238;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.216;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1602,0,1112 chrVI 69682 . C T 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.662;DP=142;Dels=0.00;FS=2.140;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1692,0,1200 chrVI 69706 . G C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.591;DP=124;Dels=0.01;FS=8.415;HaplotypeScore=19.5570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.278;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1270,0,991 chrVI 69778 . T C 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3544,393,0 chrVI 69817 . T C 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3254,348,0 chrVI 70009 . G A 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3666,381,0 chrVI 70057 . C T 3755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3755,387,0 chrVI 70279 . A T 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3399,354,0 chrVI 70295 . G A 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3114,324,0 chrVI 70309 . T C 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2933,327,0 chrVI 70348 . T A 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3355,348,0 chrVI 70408 . G A 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.173;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8936;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=26.09;ReadPosRankSum=1.311;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3653,396,0 chrVI 70639 . G A 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3818,402,0 chrVI 70822 . T C 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2876,315,0 chrVI 70827 . G A 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3106,318,0 chrVI 70891 . G A 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2978,309,0 chrVI 70957 . T C 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3366,351,0 chrVI 71011 . A G 2709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2742,294,0 chrVI 71083 . A G 2280 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.05;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2313,264,0 chrVI 71132 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.650;DP=130;Dels=0.00;FS=5.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1295,0,1423 chrVI 71197 . A G 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3471,369,0 chrVI 71500 . G A 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3867,408,0 chrVI 71518 . A G 3906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3906,411,0 chrVI 71932 . G A 4099.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4099,423,0 chrVI 71950 . C T 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4075,406,0 chrVI 71959 . C T 3927.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=23.80;SB=-2.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3927,394,0 chrVI 72261 . T A 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3018,306,0 chrVI 72603 . T A 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3757,375,0 chrVI 72607 . T G 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3442,369,0 chrVI 72636 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.814;DP=126;Dels=0.00;FS=6.614;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.181;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1200,0,1347 chrVI 72806 . G A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.095;DP=151;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=2.9163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.757;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1426,0,1453 chrVI 72876 . C T 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.080;DP=173;Dels=0.00;FS=10.387;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.311;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,88:173:99:1824,0,1682 chrVI 72886 . C T 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.407;DP=180;Dels=0.00;FS=7.559;HaplotypeScore=5.3119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,94:180:99:1779,0,1684 chrVI 72919 . G C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.833;DP=142;Dels=0.00;FS=1.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1345,0,1334 chrVI 73033 . T C 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3203,342,0 chrVI 73237 . A G 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2625,276,0 chrVI 73332 . T C 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.478;DP=89;Dels=0.00;FS=7.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:845,0,936 chrVI 73433 . A T 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.494;DP=96;Dels=0.00;FS=11.914;HaplotypeScore=2.2424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.221;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:738,0,1079 chrVI 73540 . A G 3949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3949,396,0 chrVI 73633 . T C 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3861,408,0 chrVI 73890 . C T 1797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.479;DP=159;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=2.718;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,87:159:99:1827,0,1414 chrVI 73933 . G A 4159.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:162:99:4159,433,0 chrVI 73981 . T C 4232.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.34;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4232,447,0 chrVI 74035 . G A 4362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:174:99:4362,441,0 chrVI 74044 . A G 3909.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.880e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3909,411,0 chrVI 74155 . A G 4534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.78;SB=-2.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4534,471,0 chrVI 74360 . A T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.766;DP=152;Dels=0.00;FS=7.576;HaplotypeScore=11.9044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:152:99:1399,0,1681 chrVI 74406 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.757;DP=112;Dels=0.00;FS=6.079;HaplotypeScore=2.6953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=1;MQRankSum=-0.488;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.015;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1377,0,877 chrVI 74817 . G C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.30;MQ0=0;MQRankSum=-4.157;QD=8.56;ReadPosRankSum=2.398;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:149:99:1306,0,1560 chrVI 74825 . A C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.425;DP=155;Dels=0.00;FS=1.694;HaplotypeScore=5.5596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.10;MQ0=0;MQRankSum=4.369;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.471;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1376,0,1430 chrVI 74850 . A T 1589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;DP=147;Dels=0.00;FS=6.146;HaplotypeScore=4.9420;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.683;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:147:99:1622,177,0 chrVI 74858 . A G 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.44;MQ0=0;QD=23.30;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3541,408,0 chrVI 74862 . A G 3954.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.27;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3954,441,0 chrVI 75044 . T A 963.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.393;DP=122;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:122:99:993,0,1335 chrVI 75052 . G A 1341.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.163;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=10.40;ReadPosRankSum=2.153;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1371,0,1056 chrVI 75054 . A G 2931 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.23;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2964,330,0 chrVI 75055 . A T 2941 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.97;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2974,324,0 chrVI 75101 . A G 1441 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8466;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.04;MQ0=0;QD=18.71;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1474,171,0 chrVI 75322 . A G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2111;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3231,348,0 chrVI 75434 . C T 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3452,348,0 chrVI 75453 . C T 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3662,381,0 chrVI 75463 . C T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.766;DP=147;Dels=0.00;FS=4.191;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.449;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3491,343,0 chrVI 75514 . C T 4128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4128,435,0 chrVI 75536 . A G 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.931;DP=159;Dels=0.00;FS=3.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.267;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,90:159:99:1843,0,1342 chrVI 76018 . G A 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=143.4494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.46;MQ0=0;QD=21.08;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:155:99:3309,354,0 chrVI 76126 . T C 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.07;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2741,318,0 chrVI 76174 . T A 782.27 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.453;DP=152;Dels=0.00;FS=134.770;HaplotypeScore=103.3439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=5.15;ReadPosRankSum=-8.562;SB=-2.716e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,43:152:9:812,0,9 chrVI 76268 . G T 2677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2710,279,0 chrVI 76442 . G A 2123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.57;MQ0=0;QD=21.44;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2156,237,0 chrVI 76481 . G A 292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.726;DP=103;Dels=0.00;FS=13.997;HaplotypeScore=12.9155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.81;MQ0=0;MQRankSum=-7.207;QD=2.84;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,37:103:99:322,0,1412 chrVI 76487 . T C 171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.905;DP=102;Dels=0.00;FS=13.269;HaplotypeScore=26.7838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.24;MQ0=0;MQRankSum=-5.171;QD=1.68;ReadPosRankSum=-3.628;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:201,0,1548 chrVI 76682 . A G 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3043,321,0 chrVI 76783 . A G 4062.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5043;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4062,420,0 chrVI 76851 . G A 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.18;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3163,333,0 chrVI 76860 . C T 2417 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=23.24;ReadPosRankSum=0.833;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2450,235,0 chrVI 76866 . C T 2573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.91;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2606,270,0 chrVI 76914 . T C 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3422,375,0 chrVI 76992 . T C 2123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6442;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.85;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2156,231,0 chrVI 77007 . T G 2280 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2313,237,0 chrVI 77296 . C A 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.629;DP=136;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1571,0,1143 chrVI 77340 . G A 3658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3658,381,0 chrVI 77599 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;DP=145;Dels=0.00;FS=2.101;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1285,0,1618 chrVI 77928 . T C 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3575,360,0 chrVI 77976 . G A 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3190,315,0 chrVI 78202 . A G 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2846,306,0 chrVI 78244 . G A 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2583,279,0 chrVI 78307 . T C 1892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8516;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.360;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:1925,185,0 chrVI 78568 . A G 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2867,309,0 chrVI 78613 . A T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.684;DP=118;Dels=0.00;FS=15.729;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1156,0,1349 chrVI 78750 . G A 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2965,306,0 chrVI 78805 . G T 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5846;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2482,264,0 chrVI 78862 . T A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.022;DP=107;Dels=0.00;FS=2.505;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.174;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1040,0,1166 chrVI 78930 . A G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3126,330,0 chrVI 79343 . G C 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.70;SB=-2.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3976,444,0 chrVI 79488 . C T 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3226,330,0 chrVI 79515 . A G 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3519,369,0 chrVI 79638 . C T 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2936,291,0 chrVI 79755 . T C 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2959,315,0 chrVI 79758 . T C 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2910,306,0 chrVI 79809 . A G 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3334,351,0 chrVI 80049 . G A 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3210,324,0 chrVI 80160 . T C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.919;DP=136;Dels=0.00;FS=5.240;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.607;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1407,0,1457 chrVI 80214 . C A 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;DP=102;Dels=0.00;FS=2.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.013;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:928,0,1209 chrVI 80232 . T C 2451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=22.28;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2484,279,0 chrVI 80328 . T A 4747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4747,472,0 chrVI 80524 . T C 2287 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.33;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2320,249,0 chrVI 80683 . C T 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=23.19;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2723,273,0 chrVI 80725 . A T 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6411;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2833,285,0 chrVI 80830 . A T 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.40;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3458,355,0 chrVI 81019 . C T 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3545,360,0 chrVI 81060 . A G 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2988,324,0 chrVI 81445 . C T 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3055,327,0 chrVI 81673 . A G 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3299,357,0 chrVI 81686 . T C 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3285,339,0 chrVI 81747 . C T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.276;DP=122;Dels=0.00;FS=3.457;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=10.25;ReadPosRankSum=-2.008;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1281,0,1116 chrVI 81803 . C T 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3702,376,0 chrVI 81869 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.191;DP=121;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.526;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1106,0,1280 chrVI 81877 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;DP=127;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.479;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1022,0,1410 chrVI 81880 . C G 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=22.87;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2914,321,0 chrVI 81945 . T C 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.825;DP=109;Dels=0.00;FS=2.785;HaplotypeScore=3.3673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:942,0,1303 chrVI 82157 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.794;DP=144;Dels=0.00;FS=6.289;HaplotypeScore=3.9509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.507;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,57:144:99:1044,0,1838 chrVI 82265 . T C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;DP=103;Dels=0.00;FS=4.861;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.320;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1043,0,930 chrVI 82679 . T A 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;DP=123;Dels=0.00;FS=3.278;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.332;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1218,0,1334 chrVI 82879 . A G 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.120;DP=93;Dels=0.00;FS=2.834;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=10.48;ReadPosRankSum=-2.262;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1005,0,866 chrVI 82990 . T G 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.786;DP=116;Dels=0.00;FS=3.427;HaplotypeScore=4.9504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=1;MQRankSum=1.974;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.470;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1227,0,1188 chrVI 83029 . A G 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.170;DP=116;Dels=0.00;FS=14.115;HaplotypeScore=4.7265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=1;MQRankSum=-1.021;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1199,0,1175 chrVI 83044 . A G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.332;DP=116;Dels=0.00;FS=8.723;HaplotypeScore=2.5412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=1;MQRankSum=0.859;QD=8.78;ReadPosRankSum=-2.425;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1048,0,1239 chrVI 83101 . G A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.944;DP=119;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=1;MQRankSum=-0.121;QD=9.18;ReadPosRankSum=2.153;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1123,0,1293 chrVI 83105 . G A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;DP=121;Dels=0.00;FS=2.360;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=1;MQRankSum=0.072;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.188;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:121:99:1186,0,1240 chrVI 83181 . A G 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.599;DP=131;Dels=0.00;FS=10.498;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1223,0,1538 chrVI 83323 . C T 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.565;DP=96;Dels=0.00;FS=6.693;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.748;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:971,0,1023 chrVI 83368 . C T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.987;DP=120;Dels=0.00;FS=2.362;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1291,0,1177 chrVI 83401 . A G 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.101;DP=116;Dels=0.00;FS=7.317;HaplotypeScore=3.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.712;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1120,0,1155 chrVI 83410 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.270;DP=130;Dels=0.00;FS=16.539;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=11.14;ReadPosRankSum=-2.309;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1478,0,1179 chrVI 83560 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.171;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.285;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:1441,0,1008 chrVI 83611 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.939;DP=124;Dels=0.00;FS=2.300;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.361;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1378,0,1157 chrVI 83687 . G A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.107;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=10.16;ReadPosRankSum=2.393;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1219,0,1267 chrVI 83894 . A G 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.435;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.017;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:892,0,1420 chrVI 83900 . T C 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2674,276,0 chrVI 84102 . C G 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;DP=91;Dels=0.00;FS=5.712;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=3.062;QD=9.41;ReadPosRankSum=-2.394;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:886,0,986 chrVI 84193 . C T 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.990;DP=118;Dels=0.00;FS=1.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.421;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,46:118:99:872,0,1520 chrVI 84235 . A G 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.436;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.214;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:121:99:957,0,1587 chrVI 84382 . A G 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.963;DP=115;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:981,0,1402 chrVI 84403 . G T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.184;DP=107;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.282;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1067,0,1174 chrVI 84512 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.994;DP=126;Dels=0.00;FS=1.532;HaplotypeScore=3.9227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.266;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1193,0,1343 chrVI 84689 . T A 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;DP=97;Dels=0.00;FS=8.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.369;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:948,0,1100 chrVI 84736 . A T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.082;DP=110;Dels=0.00;FS=4.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:922,0,1372 chrVI 85406 . T C 2496 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2529,270,0 chrVI 85575 . C T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.192;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,71:156:99:1382,0,1834 chrVI 85688 . G C 3722.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3722,390,0 chrVI 85718 . T A 4188.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4188,421,0 chrVI 85912 . C G 735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.826;DP=104;Dels=0.00;FS=5.158;HaplotypeScore=3.8885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.964;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,42:104:99:765,0,1320 chrVI 86322 . A G 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.626;DP=108;Dels=0.00;FS=1.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,70:108:99:1505,0,748 chrVI 86374 . A G 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.505;DP=141;Dels=0.00;FS=10.434;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1633,0,1238 chrVI 86446 . T C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.139;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=2.216;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1131,0,1412 chrVI 86452 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.712;DP=138;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=2.6105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1270,0,1473 chrVI 86499 . G A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.536;DP=123;Dels=0.00;FS=5.508;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.430;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1158,0,1408 chrVI 86631 . C T 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.568;DP=99;Dels=0.00;FS=1.671;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.888;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:912,0,1095 chrVI 86721 . G T 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.571;DP=99;Dels=0.00;FS=3.769;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.578;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1038,0,1028 chrVI 87106 . G A 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.144;DP=96;Dels=0.00;FS=1.772;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.048;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:849,0,1072 chrVI 87302 . T C 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.201;DP=158;Dels=0.00;FS=3.932;HaplotypeScore=2.0508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:1486,0,1653 chrVI 87400 . C T 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=22.49;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3046,300,0 chrVI 87438 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.543;DP=145;Dels=0.00;FS=2.286;HaplotypeScore=10.1546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.144;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:145:99:1303,0,1563 chrVI 87634 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.387;DP=136;Dels=0.00;FS=6.982;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.422;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1273,0,1568 chrVI 87650 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.133;DP=144;Dels=0.00;FS=4.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.283;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1312,0,1670 chrVI 87991 . C T 97.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.754;DP=129;Dels=0.00;FS=16.943;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=-4.083;QD=0.75;ReadPosRankSum=-3.615;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,23:129:99:127,0,2131 chrVI 88475 . T C 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.990;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.742;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:728,0,1522 chrVI 88711 . A T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.831;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1022,0,981 chrVI 88726 . G A 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.258;DP=116;Dels=0.00;FS=8.735;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.017;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1306,0,929 chrVI 88828 . A G 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.846;DP=112;Dels=0.00;FS=4.649;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.734;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:958,0,1213 chrVI 88843 . T A 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.627;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.745;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:985,0,1300 chrVI 88861 . G T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.421;DP=109;Dels=0.00;FS=9.144;HaplotypeScore=3.3471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.410;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1067,0,1015 chrVI 89012 . G A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.971;DP=117;Dels=0.00;FS=4.490;HaplotypeScore=7.7232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.786;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1015,0,1266 chrVI 89086 . A T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;DP=124;Dels=0.00;FS=5.558;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.287;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1304,0,1205 chrVI 89089 . T A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;DP=128;Dels=0.00;FS=8.034;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.822;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1243,0,1322 chrVI 89110 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.413;DP=139;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.916;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.268;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1383,0,1414 chrVI 89149 . G C 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;DP=110;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.021;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:810,0,1328 chrVI 89173 . C T 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.981;DP=118;Dels=0.00;FS=10.936;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.923;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:973,0,1411 chrVI 89272 . G C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.107;DP=134;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=4.7876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1105,0,1435 chrVI 89605 . T A 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.041;DP=112;Dels=0.00;FS=2.451;HaplotypeScore=2.6878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.899;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:999,0,1323 chrVI 89727 . A G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.969;DP=110;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.300;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1020,0,1181 chrVI 89897 . A T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.890;DP=120;Dels=0.00;FS=5.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=10.08;ReadPosRankSum=-2.103;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1239,0,1294 chrVI 90217 . A G 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.442;DP=172;Dels=0.00;FS=4.483;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.942;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,82:172:99:1598,0,1838 chrVI 90244 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.764;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.512;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,74:166:99:1403,0,1882 chrVI 90286 . G A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1523,0,1458 chrVI 90659 . C T 4330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3816;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4330,450,0 chrVI 90767 . C T 5151.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7374;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.00;SB=-2.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,206:206:99:5151,487,0 chrVI 90772 . T G 4602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.696;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9645;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=23.97;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-2.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,190:192:99:4602,456,0 chrVI 90829 . G A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.760;DP=148;Dels=0.00;FS=11.732;HaplotypeScore=3.9162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.392;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,63:148:99:1240,0,1823 chrVI 90851 . C A 4529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=1;QD=25.44;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4529,477,0 chrVI 90883 . G A 1999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.069;DP=182;Dels=0.00;FS=0.556;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=2;MQRankSum=-1.438;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.373;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,98:182:99:2029,0,1606 chrVI 91116 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.779;DP=149;Dels=0.00;FS=3.869;HaplotypeScore=4.9584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1369,0,1599 chrVI 91475 . C T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.226;DP=154;Dels=0.00;FS=14.046;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1642,0,1506 chrVI 91573 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.413;DP=130;Dels=0.00;FS=3.171;HaplotypeScore=5.7312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1396,0,1122 chrVI 91902 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.689;DP=134;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.131;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.492;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1626,0,1184 chrVI 91931 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.693;DP=106;Dels=0.00;FS=3.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.161;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1199,0,900 chrVI 92092 . G T 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.464;DP=137;Dels=0.00;FS=8.355;HaplotypeScore=3.9624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.925;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1603,0,1259 chrVI 92105 . A G 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=10.54;ReadPosRankSum=-2.666;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1622,0,1429 chrVI 92119 . A G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.878;DP=131;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=2.838;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1235,0,1370 chrVI 92208 . A G 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.579;DP=138;Dels=0.00;FS=9.172;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=3.616;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1481,0,1293 chrVI 92236 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.505;DP=141;Dels=0.00;FS=4.035;HaplotypeScore=4.6349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.755;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1102,0,1778 chrVI 92382 . A G 683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.431;DP=120;Dels=0.00;FS=21.153;HaplotypeScore=6.5876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.277;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,44:120:99:713,0,1682 chrVI 92383 . A G 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.753;DP=119;Dels=0.00;FS=19.316;HaplotypeScore=4.6408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.802;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.131;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,43:119:99:710,0,1681 chrVI 92421 . T C 161.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.911;DP=109;Dels=0.00;FS=15.978;HaplotypeScore=8.1808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQ0=1;MQRankSum=-5.729;QD=1.48;ReadPosRankSum=-5.752;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:191,0,1953 chrVI 92462 . G A 113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.591;DP=104;Dels=0.00;FS=8.847;HaplotypeScore=18.6978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.18;MQ0=1;MQRankSum=-7.763;QD=1.09;ReadPosRankSum=-3.894;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,30:104:99:143,0,1522 chrVI 92476 . G A 141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.025;DP=109;Dels=0.00;FS=9.492;HaplotypeScore=28.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.22;MQ0=1;MQRankSum=-7.924;QD=1.29;ReadPosRankSum=-2.809;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,40:109:99:171,0,1490 chrVI 92487 . C A 337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.435;DP=133;Dels=0.00;FS=10.965;HaplotypeScore=27.7378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQ0=1;MQRankSum=-9.557;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:367,0,1607 chrVI 92502 . G A 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.342;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=35.5156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.66;MQ0=1;MQRankSum=-9.403;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.038;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:712,0,1478 chrVI 92517 . A C 451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.248;DP=162;Dels=0.00;FS=6.833;HaplotypeScore=22.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.22;MQ0=0;MQRankSum=-6.671;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.333;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,45:162:99:481,0,1976 chrVI 92534 . A G 408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.560;DP=152;Dels=0.00;FS=9.655;HaplotypeScore=121.6702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.26;MQ0=0;MQRankSum=-4.700;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,58:152:99:438,0,1344 chrVI 92543 . G A 145.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.263;DP=146;Dels=0.00;FS=22.100;HaplotypeScore=139.0552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.38;MQ0=0;MQRankSum=-4.165;QD=0.99;ReadPosRankSum=4.804;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,19:146:99:175,0,2107 chrVI 92545 . G C 148.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.184;DP=143;Dels=0.00;FS=21.474;HaplotypeScore=6.4763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.71;MQ0=0;MQRankSum=-4.047;QD=1.04;ReadPosRankSum=4.588;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,19:143:99:178,0,2057 chrVI 92546 . G A 166.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.807;DP=142;Dels=0.00;FS=21.252;HaplotypeScore=5.4897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.883;QD=1.17;ReadPosRankSum=4.446;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,19:142:99:196,0,2047 chrVI 92547 . G A 158.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.026;DP=142;Dels=0.00;FS=21.608;HaplotypeScore=5.4897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.77;MQ0=0;MQRankSum=-4.162;QD=1.11;ReadPosRankSum=4.192;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,19:142:99:188,0,2061 chrVI 92548 . G C 108.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.212;DP=143;Dels=0.00;FS=22.243;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.84;MQ0=0;MQRankSum=-4.535;QD=0.76;ReadPosRankSum=3.881;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,19:143:99:138,0,2138 chrVI 92554 . T A 105.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;DP=146;Dels=0.00;FS=27.699;HaplotypeScore=134.8382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.05;MQ0=0;MQRankSum=-3.606;QD=0.72;ReadPosRankSum=0.226;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,19:146:99:135,0,2305 chrVI 92555 . A G 103.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.417;DP=148;Dels=0.00;FS=22.791;HaplotypeScore=134.8382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.03;MQ0=0;MQRankSum=-3.351;QD=0.70;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,20:148:99:133,0,2264 chrVI 92557 . A G 111.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.481;DP=145;Dels=0.00;FS=22.976;HaplotypeScore=115.9453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.36;MQ0=0;MQRankSum=-3.621;QD=0.77;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,20:145:99:141,0,2251 chrVI 92559 . A G 717.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.881;DP=145;Dels=0.00;FS=1.557;HaplotypeScore=80.5526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.56;MQ0=0;MQRankSum=-4.137;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.738;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,54:145:99:747,0,1827 chrVI 92566 . A G 103.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;DP=151;Dels=0.00;FS=23.950;HaplotypeScore=75.2101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.39;MQ0=0;MQRankSum=-3.521;QD=0.68;ReadPosRankSum=-2.264;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,19:151:99:133,0,2476 chrVI 92570 . A G 1239.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;DP=155;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=29.1597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.83;MQ0=0;MQRankSum=-8.288;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,88:155:99:1269,0,1329 chrVI 92573 . A G 1383.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.619;DP=162;Dels=0.00;FS=9.353;HaplotypeScore=29.7381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.11;MQ0=0;MQRankSum=-7.723;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,93:162:99:1413,0,1344 chrVI 92605 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.180;DP=120;Dels=0.00;FS=4.244;HaplotypeScore=6.8377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQ0=0;MQRankSum=-4.730;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.794;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1197,0,1155 chrVI 92623 . T G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.515;DP=108;Dels=0.00;FS=6.937;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.905;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.538;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1036,0,1125 chrVI 92735 . T A 315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.326;DP=93;Dels=0.00;FS=2.387;HaplotypeScore=73.4227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.069;QD=3.39;ReadPosRankSum=-5.528;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:345,0,1038 chrVI 92770 . G A 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.651;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.156;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.207;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:979,0,1349 chrVI 92797 . T C 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.212;DP=141;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=2.6493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQ0=0;MQRankSum=-4.189;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1074,0,1629 chrVI 92961 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.902;DP=144;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=5.6264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.184;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:144:99:1424,0,1530 chrVI 93077 . A C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.739;DP=108;Dels=0.00;FS=4.649;HaplotypeScore=10.1685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=8.65;ReadPosRankSum=3.129;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:964,0,1031 chrVI 94111 . G A 2039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.890;DP=200;Dels=0.00;FS=1.824;HaplotypeScore=2.6940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,100:200:99:2069,0,1915 chrVI 94477 . A G 3550.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.51;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=24.32;ReadPosRankSum=0.214;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3550,387,0 chrVI 94480 . G A 3815.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=12.4065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.86;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3815,402,0 chrVI 94481 . T C 3666.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5744;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.86;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3666,399,0 chrVI 94726 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.228;DP=124;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=2.7381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=2.532;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1298,0,1255 chrVI 94729 . C T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.413;DP=118;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1315,0,1121 chrVI 94981 . T C 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=22.98;ReadPosRankSum=1.682;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3204,328,0 chrVI 95387 . G C 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=23.07;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3101,330,0 chrVI 95546 . A G 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.084;DP=156;Dels=0.00;FS=4.753;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.833;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1552,0,1271 chrVI 95585 . T A 4503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4503,459,0 chrVI 95632 . G A 3838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.987e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3838,393,0 chrVI 95849 . T C 5125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.0292;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.17;SB=-2.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:212:99:5125,513,0 chrVI 96502 . T C 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:99:4011,435,0 chrVI 96678 . C T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.688;DP=176;Dels=0.00;FS=3.467;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=9.09;ReadPosRankSum=-2.664;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,84:176:99:1629,0,1854 chrVI 96802 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.564;DP=144;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=3.5264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.065;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1349,0,1335 chrVI 96814 . G A 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.705;DP=143;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1302,0,1460 chrVI 96832 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.271;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=8.40;ReadPosRankSum=-3.308;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1298,0,1684 chrVI 96955 . G T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.610;DP=148;Dels=0.00;FS=2.080;HaplotypeScore=3.0453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.874;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1479,0,1445 chrVI 96991 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.133;DP=168;Dels=0.00;FS=3.613;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.678;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,74:168:99:1475,0,1840 chrVI 97103 . G C 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;DP=117;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.147;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:908,0,1420 chrVI 97235 . T C 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3377,366,0 chrVI 97308 . G A 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=24.46;SB=-2.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3815,387,0 chrVI 97556 . C T 370.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.569;DP=158;Dels=0.00;FS=47.326;HaplotypeScore=4.7567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=2.34;ReadPosRankSum=-7.829;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,40:158:99:400,0,1821 chrVI 97558 . C T 176.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.573;DP=157;Dels=0.00;FS=46.516;HaplotypeScore=4.7567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=1.12;ReadPosRankSum=-7.960;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,37:157:99:206,0,1984 chrVI 97641 . A T 514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.884;DP=157;Dels=0.00;FS=23.582;HaplotypeScore=114.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=3.27;ReadPosRankSum=3.613;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,60:157:99:544,0,920 chrVI 97696 . C A 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.292;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=2.060;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.380;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1098,0,1140 chrVI 97737 . C T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;DP=150;Dels=0.00;FS=6.087;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.290;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:150:99:1467,0,1571 chrVI 97944 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.458;DP=120;Dels=0.00;FS=4.472;HaplotypeScore=4.6318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.749;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1305,0,1023 chrVI 98027 . T G 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.609;DP=144;Dels=0.00;FS=4.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.796;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,85:144:99:1722,0,1181 chrVI 98071 . C T 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3146,327,0 chrVI 98138 . G T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.550;DP=103;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1152,0,997 chrVI 98152 . A T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.078;DP=155;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=6.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.810;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1483,0,1709 chrVI 98244 . A G 1470.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.166;DP=138;Dels=0.00;FS=6.434;HaplotypeScore=3.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.748;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:138:99:1500,0,1199 chrVI 98246 . A G 1440.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.532;DP=133;Dels=0.00;FS=5.318;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.669;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1470,0,1168 chrVI 98252 . G C 1037.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.123;DP=134;Dels=0.00;FS=2.234;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1067,0,1511 chrVI 98281 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.965;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1399,0,1546 chrVI 98282 . C A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.646;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1357,0,1518 chrVI 98325 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.828;DP=149;Dels=0.00;FS=2.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.67;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1615,0,1487 chrVI 98330 . G A 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3904,402,0 chrVI 98351 . A C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.128;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.309;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1199,0,1501 chrVI 98368 . A G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.512;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.51;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.116;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1252,0,1534 chrVI 98380 . G A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.658;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.608;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1375,0,1473 chrVI 98423 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.016;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=9.00;ReadPosRankSum=-1.730;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1299,0,1473 chrVI 98428 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.653;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1303,0,1456 chrVI 98578 . A T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.754;DP=124;Dels=0.00;FS=13.537;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.995;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1280,0,1308 chrVI 98654 . C G 2522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.87;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2555,291,0 chrVI 98744 . T C 1562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.86;MQ0=0;QD=14.33;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:1595,177,0 chrVI 98747 . A T 1732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.04;MQ0=0;QD=15.33;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:1765,186,0 chrVI 98785 . C T 2217 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.72;MQ0=0;QD=19.79;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2250,237,0 chrVI 98835 . T A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;DP=105;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=2.6744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,61:105:99:1320,0,893 chrVI 98867 . G A 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.135;DP=140;Dels=0.00;FS=2.183;HaplotypeScore=6.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.453;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,84:140:99:1791,0,1092 chrVI 98877 . T C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.928;DP=145;Dels=0.00;FS=2.105;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=8.04;ReadPosRankSum=-2.110;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,60:145:99:1196,0,1808 chrVI 98885 . A T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.389;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:1082,0,1718 chrVI 98921 . T C 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.126;DP=101;Dels=0.00;FS=5.053;HaplotypeScore=2.7971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.631;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:870,0,1214 chrVI 98938 . G A 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.972;DP=100;Dels=0.00;FS=3.798;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=8.08;ReadPosRankSum=3.441;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:838,0,1174 chrVI 99039 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.416;DP=127;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=6.7398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1231,0,1396 chrVI 99131 . T C 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.696;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.129;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:622,0,886 chrVI 99195 . A T 624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.165;DP=110;Dels=0.00;FS=3.436;HaplotypeScore=4.1849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.67;MQ0=1;MQRankSum=1.104;QD=5.67;ReadPosRankSum=1.019;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:654,0,599 chrVI 99555 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.083;DP=118;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=3.8142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.476;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1140,0,1208 chrVI 99734 . A G 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3897,411,0 chrVI 99800 . C G 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3761,396,0 chrVI 99817 . G A 4169.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:4169,430,0 chrVI 99895 . G A 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.228;DP=140;Dels=0.00;FS=12.155;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.464;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1510,0,1233 chrVI 100276 . G T 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3645,372,0 chrVI 100338 . T C 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.864;DP=147;Dels=0.00;FS=3.862;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=2.966;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.374;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1327,0,1633 chrVI 100367 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.748;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.539;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1112,0,1182 chrVI 100382 . G A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.996;DP=95;Dels=0.00;FS=2.696;HaplotypeScore=40.6007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.726;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:967,0,997 chrVI 100428 . T C 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.126;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.438;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.664;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:996,0,950 chrVI 100449 . C T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.497;DP=117;Dels=0.00;FS=3.462;HaplotypeScore=4.4104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.884;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.331;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1250,0,1037 chrVI 100481 . C G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.498;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=9.44;ReadPosRankSum=2.819;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1408,0,1519 chrVI 100486 . G C 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.794;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.078;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1453,0,1457 chrVI 100526 . G A 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.56;MQ0=0;QD=27.28;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3274,345,0 chrVI 100551 . C G 935.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.968;DP=134;Dels=0.00;FS=2.326;HaplotypeScore=11.4365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQ0=2;MQRankSum=-8.779;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.171;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:965,0,1610 chrVI 100558 . A G 686.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.490;DP=130;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=7.8108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.91;MQ0=2;MQRankSum=-8.927;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.748;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,47:130:99:716,0,1805 chrVI 100560 . T C 712.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.384;DP=126;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=5.8509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.24;MQ0=2;MQRankSum=-9.041;QD=5.65;ReadPosRankSum=2.131;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,48:126:99:742,0,1630 chrVI 100561 . A G 722.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.058;DP=128;Dels=0.00;FS=2.344;HaplotypeScore=3.8928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.45;MQ0=2;MQRankSum=-8.734;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.648;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,50:128:99:752,0,1647 chrVI 100566 . T C 866.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.793;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.26;MQ0=2;MQRankSum=-7.504;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.078;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:896,0,1575 chrVI 100594 . T G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.504;DP=151;Dels=0.00;FS=8.828;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=2;MQRankSum=-5.575;QD=7.85;ReadPosRankSum=-2.124;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1216,0,1581 chrVI 100633 . A G 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.070;DP=162;Dels=0.00;FS=1.242;HaplotypeScore=9.1277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.42;MQ0=2;MQRankSum=-3.222;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.635;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1548,0,1469 chrVI 100677 . T C 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.604;DP=130;Dels=0.00;FS=6.888;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,77:130:99:1622,0,974 chrVI 100715 . G A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.321;DP=132;Dels=0.00;FS=16.680;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1138,0,1562 chrVI 100737 . T G 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.598;DP=106;Dels=0.00;FS=14.196;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.004;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:862,0,1321 chrVI 100756 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.780;DP=126;Dels=0.00;FS=5.631;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.935;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1266,0,1337 chrVI 100827 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.243;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=3.098;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.484;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1152,0,1046 chrVI 100853 . T C 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.336;DP=94;Dels=0.00;FS=12.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=9.44;ReadPosRankSum=-2.884;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:917,0,1052 chrVI 100859 . G T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.009;DP=103;Dels=0.00;FS=17.361;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.592;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1172,0,981 chrVI 100887 . G A 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.996;DP=88;Dels=0.00;FS=11.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.948;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:745,0,1009 chrVI 100932 . G A 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2927,312,0 chrVI 100946 . A C 2662 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2695,300,0 chrVI 101107 . C T 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.156;DP=146;Dels=0.00;FS=19.075;HaplotypeScore=4.8304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=2.119;QD=10.62;ReadPosRankSum=3.349;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:146:99:1581,0,1375 chrVI 101204 . G A 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.578;DP=139;Dels=0.00;FS=12.264;HaplotypeScore=3.3464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=3.173;QD=11.68;ReadPosRankSum=2.073;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1653,0,1145 chrVI 101210 . C T 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.493;DP=136;Dels=0.00;FS=10.703;HaplotypeScore=3.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=2.981;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.941;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1588,0,1125 chrVI 101264 . A T 658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.956;DP=110;Dels=0.00;FS=6.557;HaplotypeScore=3.2638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=5.98;ReadPosRankSum=3.844;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,38:110:99:688,0,1557 chrVI 101336 . A C 339.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=112;Dels=0.00;FS=52.169;HaplotypeScore=2.6105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQ0=0;MQRankSum=-5.340;QD=3.03;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,27:112:99:369,0,1900 chrVI 101439 . A G 488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.218;DP=95;Dels=0.00;FS=5.539;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.530;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.676;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,33:95:99:518,0,1424 chrVI 101518 . G C 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;DP=146;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.350;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3563,366,0 chrVI 101545 . C T 1856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.619;DP=136;Dels=0.00;FS=19.939;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=2.769;QD=13.65;ReadPosRankSum=1.987;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,85:136:99:1886,0,971 chrVI 101826 . G A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.783;DP=123;Dels=0.00;FS=6.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1345,0,1189 chrVI 101859 . G A 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3577,375,0 chrVI 101913 . A G 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.913;DP=153;Dels=0.00;FS=4.838;HaplotypeScore=4.7427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1530,0,1531 chrVI 102071 . G A 1914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=13.02;ReadPosRankSum=2.120;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,88:147:99:1944,0,1068 chrVI 102170 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.636;DP=111;Dels=0.00;FS=7.907;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.907;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:111:99:1318,0,949 chrVI 102345 . G A 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.898;DP=93;Dels=0.00;FS=12.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.781;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:887,0,945 chrVI 102443 . T C 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.642;DP=114;Dels=0.00;FS=4.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.373;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1008,0,1377 chrVI 102489 . T G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.318;DP=134;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.899;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.709;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1434,0,1320 chrVI 102528 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.312;DP=148;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.860;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1329,0,1640 chrVI 102609 . G A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.062;DP=107;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.247;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.527;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:997,0,1166 chrVI 102624 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.441;DP=117;Dels=0.00;FS=5.873;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.303;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1121,0,1328 chrVI 102635 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.274;DP=134;Dels=0.00;FS=4.208;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1324,0,1339 chrVI 102744 . C T 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.091;DP=106;Dels=0.00;FS=7.642;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.773;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:951,0,1152 chrVI 102761 . T C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.304;DP=118;Dels=0.00;FS=3.343;HaplotypeScore=5.4870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1116,0,1211 chrVI 102816 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.645;DP=123;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.952;QD=10.13;ReadPosRankSum=2.295;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1276,0,1189 chrVI 102880 . A T 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2991,321,0 chrVI 102885 . A G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.705;DP=123;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.043;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:991,0,1381 chrVI 102899 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.019;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1166,0,1276 chrVI 102960 . T C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.979;DP=135;Dels=0.00;FS=5.202;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1628,0,1122 chrVI 103002 . A G 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.162;DP=146;Dels=0.00;FS=8.805;HaplotypeScore=4.7933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.242;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,85:146:99:1709,0,1175 chrVI 103192 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.625;DP=129;Dels=0.00;FS=5.440;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-3.281;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.686;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1206,0,1468 chrVI 103213 . A T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.946;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=9.66;ReadPosRankSum=3.169;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1189,0,1326 chrVI 103369 . G A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.354;DP=157;Dels=0.00;FS=2.027;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,73:157:99:1460,0,1611 chrVI 103374 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.568;DP=158;Dels=0.00;FS=2.025;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:158:99:1265,0,1719 chrVI 103388 . T A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.344;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1275,0,1575 chrVI 103389 . T G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.237;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.285;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1245,0,1582 chrVI 103493 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.438;DP=141;Dels=0.00;FS=3.060;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1305,0,1565 chrVI 103509 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.575;DP=141;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=3.1207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1302,0,1552 chrVI 103548 . G A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.744;DP=127;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.314;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1254,0,1264 chrVI 103553 . G A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.905;DP=138;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.789;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.521;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1261,0,1360 chrVI 103689 . C T 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.201;DP=136;Dels=0.00;FS=9.496;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.959;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1611,0,1230 chrVI 103749 . G C 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1508,0,1205 chrVI 103824 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.422;DP=120;Dels=0.00;FS=2.757;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1298,0,1080 chrVI 103865 . A C 2165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.12;MQ0=0;QD=23.28;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2198,252,0 chrVI 103933 . A G 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.478;DP=103;Dels=0.00;FS=1.692;HaplotypeScore=198.5945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.497;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,63:103:99:1310,0,654 chrVI 104017 . C T 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.286;DP=133;Dels=0.00;FS=5.395;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.799;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1241,0,1517 chrVI 104113 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.683;DP=118;Dels=0.00;FS=1.539;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.339;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1109,0,1332 chrVI 104192 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.633;DP=121;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=3.9342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.336;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1187,0,1278 chrVI 104220 . G A 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.566;DP=120;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.105;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1113,0,1337 chrVI 104240 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.841;DP=111;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.850;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1093,0,1157 chrVI 104265 . C T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.252;DP=110;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=4.4281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.012;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1058,0,1121 chrVI 104388 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.568;DP=119;Dels=0.00;FS=14.127;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1236,0,1215 chrVI 104597 . T A 53.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=0.58;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:9:86,9,0 chrVI 104884 . G A 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.383;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.107;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1571,0,1166 chrVI 104938 . T C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.820;DP=154;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1466,0,1588 chrVI 105370 . A G 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3440,375,0 chrVI 105427 . A G 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3310,351,0 chrVI 105691 . G A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.302;DP=124;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=2.6777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.789;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1313,0,861 chrVI 105822 . C T 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.178;DP=94;Dels=0.00;FS=5.481;HaplotypeScore=4.9936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:997,0,873 chrVI 106096 . G A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;DP=128;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1319,0,1292 chrVI 106194 . A G 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.740;DP=153;Dels=0.00;FS=6.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=1;MQRankSum=0.825;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.965;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,80:153:99:1589,0,1501 chrVI 106461 . T C 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.762;DP=135;Dels=0.00;FS=14.267;HaplotypeScore=3.4278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:135:99:1038,0,1686 chrVI 106494 . C G 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3131,345,0 chrVI 106510 . C A 1036.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;DP=133;Dels=0.00;FS=7.236;HaplotypeScore=5.4078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=1.766;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.396;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1066,0,1440 chrVI 106511 . G A 1436.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.524;DP=133;Dels=0.00;FS=7.181;HaplotypeScore=5.4078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.284;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,78:132:99:1466,0,1003 chrVI 106518 . T A 1503.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.870;DP=135;Dels=0.00;FS=2.543;HaplotypeScore=3.3905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=11.13;ReadPosRankSum=-2.118;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,81:135:99:1533,0,1077 chrVI 106655 . A T 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;DP=114;Dels=0.00;FS=5.839;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.013;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.905;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1077,0,1135 chrVI 106692 . T C 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.387;DP=113;Dels=0.00;FS=7.501;HaplotypeScore=3.0110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.479;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1010,0,1048 chrVI 106724 . A G 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.325;DP=140;Dels=0.00;FS=2.191;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.140;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,81:140:99:1528,0,1117 chrVI 106837 . C T 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.863;DP=118;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=41.7192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.740;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:965,0,1411 chrVI 106991 . A C 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.583;DP=118;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.650;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1130,0,1269 chrVI 107085 . T C 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.233;DP=119;Dels=0.00;FS=4.447;HaplotypeScore=3.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.200;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1311,0,1148 chrVI 107101 . T A 2851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2884,297,0 chrVI 107198 . T C 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.315;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.663;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:808,0,1714 chrVI 107221 . C T 681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.636;DP=120;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=3.9633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.104;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,46:120:99:711,0,1492 chrVI 107432 . T C 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.409;DP=142;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.933;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.697;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1470,0,1322 chrVI 107648 . T G 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.866;DP=162;Dels=0.00;FS=13.935;HaplotypeScore=3.8757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.58;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.285;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1621,0,1576 chrVI 107735 . A G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.263;DP=161;Dels=0.00;FS=1.259;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.41;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.071;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:1156,0,1779 chrVI 107738 . C T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.485;DP=168;Dels=0.00;FS=1.222;HaplotypeScore=6.4774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.634;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,78:168:99:1197,0,1772 chrVI 107770 . T A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;DP=172;Dels=0.00;FS=13.085;HaplotypeScore=11.2430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.468;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,94:172:99:1464,0,1292 chrVI 107821 . G A 1090.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.451;DP=243;Dels=0.00;FS=217.882;HaplotypeScore=206.9130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.658;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,93:243:99:1120,0,1047 chrVI 107825 . G A 871.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.767;DP=249;Dels=0.00;FS=223.723;HaplotypeScore=221.0010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.096;QD=3.50;ReadPosRankSum=-6.334;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,85:249:99:901,0,1210 chrVI 107829 . G A 429.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.633;DP=235;Dels=0.00;FS=182.983;HaplotypeScore=259.2575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.41;MQ0=0;MQRankSum=-4.046;QD=1.83;ReadPosRankSum=-8.246;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,62:235:99:459,0,1401 chrVI 107838 . C T 471.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.730;DP=190;Dels=0.00;FS=264.002;HaplotypeScore=99.4586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.67;MQ0=0;MQRankSum=-5.333;QD=2.48;ReadPosRankSum=-10.103;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,46:190:99:501,0,1908 chrVI 107844 . G A 607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQ0=0;MQRankSum=-6.729;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:637,0,1340 chrVI 108272 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.511;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.351;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:139:99:1414,0,1266 chrVI 108416 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.306;DP=144;Dels=0.00;FS=8.616;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.390;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1470,0,1498 chrVI 108518 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.795;DP=148;Dels=0.00;FS=3.977;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.079;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,82:148:99:1654,0,1343 chrVI 108539 . T G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.244;DP=138;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.124;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1388,0,1457 chrVI 108637 . C A 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.661;DP=150;Dels=0.00;FS=1.291;HaplotypeScore=2.1557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.325;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1677,0,1462 chrVI 108834 . G C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.784;DP=163;Dels=0.00;FS=3.725;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.978;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,65:163:99:1170,0,2022 chrVI 109006 . C T 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;DP=112;Dels=0.00;FS=3.571;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,44:112:99:888,0,1466 chrVI 109031 . C T 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.592;DP=106;Dels=0.00;FS=3.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.238;QD=7.99;ReadPosRankSum=2.012;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:877,0,1350 chrVI 109112 . C T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.505;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1448,0,1230 chrVI 109247 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.160;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1231,0,1450 chrVI 109331 . T G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;DP=157;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=3.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,67:157:99:1284,0,1907 chrVI 109402 . A C 4167.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4167,444,0 chrVI 109415 . G A 4299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4299,436,0 chrVI 109624 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.491;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.414;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1276,0,1370 chrVI 109958 . G A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.516;DP=140;Dels=0.00;FS=5.132;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=1.961;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1431,0,1398 chrVI 110112 . G A 520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.955;DP=139;Dels=0.01;FS=8.190;HaplotypeScore=7.8538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.475;QD=3.74;ReadPosRankSum=-1.986;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,54:136:99:550,0,1706 chrVI 110132 . T A 567.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.616;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:597,0,1668 chrVI 110135 . C T 601.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.163;DP=144;Dels=0.01;FS=1.374;HaplotypeScore=6.4347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.751;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,61:142:99:631,0,1619 chrVI 110137 . G A 813.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;DP=146;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=5.6026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.739;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,63:146:99:843,0,1636 chrVI 110330 . G T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.324;DP=121;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=3.6794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.864;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1035,0,1347 chrVI 110354 . A G 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.765;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.412;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,52:131:99:957,0,1646 chrVI 110405 . C T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.589;DP=111;Dels=0.00;FS=2.441;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1079,0,1218 chrVI 110435 . C T 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.593;DP=108;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.707;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:832,0,1288 chrVI 110527 . C G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.019;DP=120;Dels=0.00;FS=4.416;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=-0.418;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.929;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1261,0,1079 chrVI 110535 . A T 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;DP=125;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=4.9565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=1;MQRankSum=0.874;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1038,0,1467 chrVI 110590 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.096;DP=112;Dels=0.00;FS=5.791;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.935;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.836;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1171,0,1061 chrVI 110650 . C T 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.009;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=9.74;ReadPosRankSum=2.450;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:897,0,967 chrVI 110685 . C T 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.041;DP=104;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.597;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.831;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:995,0,1114 chrVI 110813 . A T 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:767,0,1051 chrVI 111189 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.490;DP=127;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1364,0,1211 chrVI 111421 . T C 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.016;DP=86;Dels=0.00;FS=0.830;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.425;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,39:86:99:779,0,984 chrVI 111681 . A G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.356;DP=147;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=2.7474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.789;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1344,0,1583 chrVI 111687 . A G 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.22;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3436,378,0 chrVI 112003 . A G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.555;DP=123;Dels=0.00;FS=1.570;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1245,0,1176 chrVI 112108 . G T 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;DP=98;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1036,0,925 chrVI 112154 . T C 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3324,348,0 chrVI 112159 . A T 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.330;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=12.32;ReadPosRankSum=3.392;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1669,0,1179 chrVI 112214 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.858;DP=126;Dels=0.00;FS=4.299;HaplotypeScore=5.5105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.087;QD=9.76;ReadPosRankSum=-3.598;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1260,0,1314 chrVI 112256 . T C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.821;DP=119;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=1;MQRankSum=-1.262;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.742;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1163,0,1167 chrVI 112333 . A G 1396 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-5.598;DP=101;Dels=0.00;FS=1.606;HaplotypeScore=39.5053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.787;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,58:101:99:1429,111,0 chrVI 112349 . T C 2544 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2577,273,0 chrVI 112624 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.419;DP=109;Dels=0.00;FS=7.949;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.505;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1237,0,991 chrVI 112749 . G A 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.602;DP=134;Dels=0.00;FS=3.250;HaplotypeScore=5.9486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.761;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1562,0,1157 chrVI 113151 . T C 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.573;DP=102;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:102:99:860,0,1151 chrVI 113238 . C T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.177;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.727;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1443,0,1310 chrVI 113247 . T C 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3172,342,0 chrVI 113274 . A T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;DP=148;Dels=0.00;FS=4.900;HaplotypeScore=9.1123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1402,0,1591 chrVI 113283 . C T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.689;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.300;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1240,0,1529 chrVI 113389 . G A 1985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.711;DP=170;Dels=0.00;FS=2.828;HaplotypeScore=5.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,99:170:99:2015,0,1270 chrVI 113399 . C T 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.162;DP=141;Dels=0.00;FS=4.170;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1552,0,1258 chrVI 113483 . C T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.509;DP=136;Dels=0.00;FS=4.162;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=3.568;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.488;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1500,0,1212 chrVI 113799 . C T 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3280,339,0 chrVI 113835 . T G 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.921;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,46:122:99:767,0,1735 chrVI 113971 . G C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.737;DP=128;Dels=0.00;FS=4.279;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.067;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1357,0,1197 chrVI 114156 . T C 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.094;DP=127;Dels=0.00;FS=5.434;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=6.50;ReadPosRankSum=2.097;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:855,0,1247 chrVI 114171 . A T 2426 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=21.47;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2459,261,0 chrVI 114217 . G A 692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.467;DP=137;Dels=0.04;FS=5.438;HaplotypeScore=23.5248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=1;MQRankSum=1.261;QD=5.05;ReadPosRankSum=-2.978;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:131:99:722,0,1152 chrVI 114234 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.263;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=1;MQRankSum=-0.699;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.227;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1249,0,983 chrVI 114251 . T C 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;DP=152;Dels=0.00;FS=3.315;HaplotypeScore=2.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=1;MQRankSum=-0.024;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.355;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:152:99:1426,0,1025 chrVI 114275 . C G 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3598,372,0 chrVI 114277 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.345;DP=145;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.806;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1231,0,1569 chrVI 114294 . A T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.484;DP=141;Dels=0.00;FS=3.801;HaplotypeScore=4.6115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1383,0,1567 chrVI 114340 . T C 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3699,405,0 chrVI 114541 . T C 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6349;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3063,333,0 chrVI 114563 . A C 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.570;DP=111;Dels=0.00;FS=1.516;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.617;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1064,0,1197 chrVI 114641 . A G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.304;DP=134;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.667;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1553,0,1159 chrVI 114918 . C T 4059.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4059,420,0 chrVI 115080 . C T 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.503;DP=147;Dels=0.00;FS=3.076;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=2.432;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.468;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1580,0,1402 chrVI 115088 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;DP=122;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.679;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1308,0,1243 chrVI 115119 . T C 2189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.86;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2222,246,0 chrVI 115291 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.963;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1440,0,1403 chrVI 115411 . A C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.855;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.526;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1179,0,1284 chrVI 115494 . C G 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6970;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3453,357,0 chrVI 115754 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.530;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1354,0,1429 chrVI 115884 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.034;DP=141;Dels=0.00;FS=7.830;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.538;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1489,0,1310 chrVI 116042 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.653;DP=129;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=2.3604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:129:99:1187,0,1239 chrVI 116045 . T C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.395;DP=126;Dels=0.00;FS=2.251;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1146,0,1354 chrVI 116186 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.859;DP=122;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.458;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1350,0,1117 chrVI 116295 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.172;DP=105;Dels=0.00;FS=3.659;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.327;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1162,0,852 chrVI 116297 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.888;DP=105;Dels=0.00;FS=3.659;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.469;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1113,0,909 chrVI 116377 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.531;DP=122;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=11.03;ReadPosRankSum=-2.355;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1376,0,1057 chrVI 116573 . G A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.905;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1624,0,1571 chrVI 116660 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.152;DP=116;Dels=0.00;FS=5.784;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1151,0,1170 chrVI 116839 . G C 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2796,300,0 chrVI 117179 . C T 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.502;DP=94;Dels=0.00;FS=7.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=8.07;ReadPosRankSum=-2.133;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:789,0,1093 chrVI 117667 . A G 863.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.670;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.39;MQ0=23;MQRankSum=0.619;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:893,0,1121 chrVI 117833 . G A 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3252,342,0 chrVI 118346 . A G 2184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.27;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2217,234,0 chrVI 118499 . T C 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2823,312,0 chrVI 118550 . C T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.487;DP=128;Dels=0.00;FS=2.607;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.970;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.724;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1357,0,1304 chrVI 118563 . C A 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.78;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3348,348,0 chrVI 118597 . C G 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.899;DP=108;Dels=0.00;FS=1.680;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.891;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:970,0,1105 chrVI 118614 . G C 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.350;DP=96;Dels=0.00;FS=1.925;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.351;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:775,0,1193 chrVI 118653 . T C 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;DP=76;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.449;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,35:76:99:719,0,904 chrVI 118682 . T C 2206 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2239,249,0 chrVI 118701 . T C 2316 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2349,255,0 chrVI 118737 . C T 2160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2193,225,0 chrVI 118780 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.939;DP=96;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=2.7989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.801;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:96:99:977,0,987 chrVI 118792 . C A 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.35;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2536,267,0 chrVI 118816 . C T 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.762;DP=85;Dels=0.00;FS=6.401;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.261;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:891,0,835 chrVI 118855 . T C 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.686;DP=91;Dels=0.01;FS=4.158;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:963,0,917 chrVI 119009 . C T 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.578;DP=79;Dels=0.00;FS=1.943;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,47:79:99:1006,0,644 chrVI 119078 . G T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.844;DP=113;Dels=0.00;FS=5.905;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=10.96;ReadPosRankSum=2.013;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1269,0,1086 chrVI 119143 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.089;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=-3.220;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.738;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1175,0,1715 chrVI 119156 . T C 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.480;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.453;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,52:137:99:866,0,1873 chrVI 119224 . G C 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:2838,297,0 chrVI 119266 . C A,G 2087.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.03;MQ0=0;QD=18.97;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,58,52:110:99:2147,1011,882,1136,0,1013 chrVI 119276 . A G 2128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=91.6634;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=18.67;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2161,240,0 chrVI 119328 . T C 2051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=20.11;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2084,234,0 chrVI 119374 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.767;DP=123;Dels=0.00;FS=8.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1170,0,1386 chrVI 119414 . G A 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.95;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3944,399,0 chrVI 119659 . C T 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.14;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3529,369,0 chrVI 119681 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;DP=131;Dels=0.00;FS=3.519;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=11.39;ReadPosRankSum=-3.310;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1522,0,1188 chrVI 119749 . G A 1949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.682;DP=137;Dels=0.00;FS=6.739;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.038;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,88:137:99:1979,0,899 chrVI 119755 . G A 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.576;DP=126;Dels=0.00;FS=7.035;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.193;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,45:126:99:780,0,1745 chrVI 120002 . T A 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;DP=147;Dels=0.00;FS=2.965;HaplotypeScore=2.8741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=2.221;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.497;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:147:99:1672,0,1291 chrVI 120015 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;DP=131;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.122;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1626,0,1083 chrVI 120163 . A G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.630;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:943,0,1127 chrVI 120204 . T C 2733 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2766,294,0 chrVI 120376 . G A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.705;DP=110;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.154;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1284,0,904 chrVI 120381 . C T 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.822;DP=113;Dels=0.00;FS=4.748;HaplotypeScore=6.2953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:113:99:831,0,1339 chrVI 120516 . C T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;DP=104;Dels=0.00;FS=1.630;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.385;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:104:99:1104,0,973 chrVI 120550 . C T 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2915,288,0 chrVI 120736 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.915;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1074,0,1264 chrVI 120772 . G C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.274;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1175,0,1347 chrVI 120970 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.479;DP=113;Dels=0.00;FS=7.236;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.514;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1172,0,1183 chrVI 121195 . A G 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.533;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=12.09;ReadPosRankSum=2.346;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,76:129:99:1589,0,1047 chrVI 121761 . T A 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2523,267,0 chrVI 123397 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.959;DP=132;Dels=0.00;FS=13.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.282;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1475,0,1236 chrVI 123648 . C T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.106;DP=139;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.013;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1380,0,1317 chrVI 123799 . A G 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.787;DP=141;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.599;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1646,0,1168 chrVI 124176 . A C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.408;DP=137;Dels=0.00;FS=3.037;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.573;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1353,0,1381 chrVI 126508 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.032;DP=115;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=4.9562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,70:115:99:1467,0,889 chrVI 126669 . A G 1751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.492;DP=166;Dels=0.00;FS=2.941;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,91:166:99:1781,0,1487 chrVI 128175 . T C 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2890,324,0 chrVI 128803 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.092;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.944;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1298,0,1373 chrVI 128932 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.436;DP=130;Dels=0.00;FS=3.299;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.827;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1263,0,1320 chrVI 129074 . C T 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3071,306,0 chrVI 129214 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.359;DP=135;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.552;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1360,0,1295 chrVI 129743 . T A 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2950,312,0 chrVI 131087 . T C 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.074;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.851;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1649,0,1460 chrVI 131200 . C T 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2706,288,0 chrVI 131317 . T A 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.649;DP=109;Dels=0.00;FS=16.571;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.167;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:928,0,1233 chrVI 131646 . T C 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3098,330,0 chrVI 131953 . A G 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3333,366,0 chrVI 132250 . A G 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.506;DP=107;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=2;MQRankSum=1.337;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.835;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:935,0,1257 chrVI 132559 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.921;DP=119;Dels=0.00;FS=3.426;HaplotypeScore=3.7999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=11.00;ReadPosRankSum=-2.064;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:119:99:1339,0,1066 chrVI 132667 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.586;DP=105;Dels=0.00;FS=2.687;HaplotypeScore=9.3561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.181;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,65:105:99:1346,0,695 chrVI 132730 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.812;DP=111;Dels=0.00;FS=2.598;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.900;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,66:111:99:1444,0,828 chrVI 132951 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.416;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.005;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1260,0,1243 chrVI 133255 . A G 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2597,276,0 chrVI 133441 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=2.099;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.434;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1272,0,1251 chrVI 134104 . A T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.461;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1172,0,1207 chrVI 134123 . T G 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2854,291,0 chrVI 134248 . G A 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;DP=122;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1293,0,1300 chrVI 134422 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.904;DP=147;Dels=0.00;FS=10.249;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.508;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1324,0,1676 chrVI 134477 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.486;DP=143;Dels=0.00;FS=4.983;HaplotypeScore=3.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.983;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:143:99:1420,0,1363 chrVI 134528 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.097;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.374;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1312,0,1214 chrVI 134670 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.778;DP=119;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.983;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1494,0,896 chrVI 134777 . C T 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.777;DP=140;Dels=0.00;FS=3.034;HaplotypeScore=3.9035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=10.63;ReadPosRankSum=2.611;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1518,0,1201 chrVI 134989 . C A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.801;DP=122;Dels=0.00;FS=9.904;HaplotypeScore=5.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.264;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1160,0,1233 chrVI 135481 . G A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.260;DP=112;Dels=0.00;FS=4.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.008;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:933,0,1397 chrVI 135730 . T G 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.043;DP=103;Dels=0.00;FS=3.636;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.757;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.449;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1051,0,990 chrVI 135874 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.101;DP=165;Dels=0.00;FS=8.779;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.722;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,75:165:99:1569,0,1928 chrVI 135975 . T A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.900;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1092,0,1249 chrVI 135976 . T A 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.882;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1098,0,1149 chrVI 136585 . T C 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.294;DP=148;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=5.8866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1340,0,1559 chrVI 137019 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.550;DP=106;Dels=0.00;FS=2.655;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.063;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.989;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1044,0,1088 chrVI 137241 . C G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.408;DP=112;Dels=0.00;FS=2.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:988,0,1249 chrVI 137349 . A C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;DP=109;Dels=0.00;FS=6.117;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.270;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1058,0,1094 chrVI 137600 . T C 120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.029;DP=84;Dels=0.00;FS=6.691;HaplotypeScore=5.6854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.874;QD=1.43;ReadPosRankSum=-1.068;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:150,0,1371 chrVI 137601 . A C 109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.571;DP=88;Dels=0.00;FS=3.309;HaplotypeScore=3.7044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.72;MQ0=0;MQRankSum=-3.153;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.095;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:139,0,1460 chrVI 137634 . C A 534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.691;DP=103;Dels=0.00;FS=1.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.566;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.010;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,35:103:99:564,0,1466 chrVI 137735 . G A 1226 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.782;DP=62;Dels=0.00;FS=12.268;HaplotypeScore=4.9649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.97;MQ0=0;MQRankSum=1.963;QD=19.77;ReadPosRankSum=1.837;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,54:62:32:1259,32,0 chrVI 137880 . T C 645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;DP=37;Dels=0.00;FS=27.407;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.92;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=17.43;ReadPosRankSum=2.599;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,32:37:37:675,0,37 chrVI 137900 . C T 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.175;QD=0.71;ReadPosRankSum=-1.575;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:52:52,0,544 chrVI 137907 . T G 33.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.380;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.56;MQ0=3;MQRankSum=-0.756;QD=1.06;ReadPosRankSum=3.667;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:63:63,0,425 chrVI 137927 . T A 89.64 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;DP=20;Dels=0.00;FS=9.859;HaplotypeScore=4.4110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.35;MQ0=5;MQRankSum=2.770;QD=4.48;ReadPosRankSum=3.123;SB=-6.440e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:5:119,0,5 chrVI 138168 . T C 101.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.48;MQ0=40;MQRankSum=1.589;QD=2.11;ReadPosRankSum=1.589;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:42,6:48:15:134,15,0 chrVI 138175 . A G 96.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.59;MQ0=39;QD=2.14;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,6:45:15:129,15,0 chrVI 138176 . C T 105.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.59;MQ0=39;QD=2.34;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,6:45:15:138,15,0 chrVI 138181 . C A 106.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.23;MQ0=34;QD=2.66;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,5:39:15:139,15,0 chrVI 138184 . A T 109.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.68;MQ0=31;MQRankSum=-0.736;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.736;SB=2.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,5:37:15:142,15,0 chrVI 138191 . T A 105.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.81;MQ0=31;QD=2.92;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,5:36:15:138,15,0 chrVI 138202 . A C 105.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.65;MQ0=26;QD=3.40;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,5:31:15:138,15,0 chrVI 138222 . C T 109.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.67;MQ0=40;QD=2.43;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,31:45:15:142,15,0 chrVI 138223 . A C 103.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.67;MQ0=40;QD=2.29;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,31:45:15:136,15,0 chrVI 138231 . C T 109.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.36;MQ0=43;QD=2.28;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,5:48:15:142,15,0 chrVI 143802 . A G 10.42 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;DP=36;Dels=0.00;FS=21.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.44;MQ0=20;MQRankSum=-2.971;QD=0.29;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-2.376e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:36:40:40,0,85 chrVI 143803 . C T 10.42 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;DP=35;Dels=0.00;FS=21.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.73;MQ0=19;MQRankSum=-2.971;QD=0.30;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-2.602e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:40:40,0,82 chrVI 143808 . C A 10.42 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;DP=29;Dels=0.00;FS=22.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.40;MQ0=12;MQRankSum=-1.868;QD=0.36;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:40:40,0,85 chrVI 143811 . A T 10.42 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;DP=28;Dels=0.00;FS=22.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.82;MQ0=11;MQRankSum=-2.774;QD=0.37;ReadPosRankSum=-1.868;SB=-2.602e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:40:40,0,85 chrVI 143818 . T A 10.42 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;DP=19;Dels=0.00;FS=20.560;HaplotypeScore=7.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.34;MQ0=4;MQRankSum=-2.676;QD=0.55;ReadPosRankSum=-1.501;SB=-1.558e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:40:40,0,83 chrVI 143826 . C A 57.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=17.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.88;MQ0=2;MQRankSum=1.835;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.599;SB=-3.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:40:87,0,40 chrVI 143849 . C T 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.56;MQ0=1;MQRankSum=-1.754;QD=1.30;ReadPosRankSum=-1.754;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:40:40,0,67 chrVI 143858 . C T 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=8;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.56;MQ0=1;MQRankSum=-1.754;QD=1.42;ReadPosRankSum=-1.754;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:41:41,0,68 chrVI 144370 . C A 1235 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1268,132,0 chrVI 144681 . T A 1834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.20;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1867,195,0 chrVI 144890 . G A 163.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.818;DP=101;Dels=0.00;FS=53.856;HaplotypeScore=3.8069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.038;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:101:99:193,0,1659 chrVI 144966 . G A 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;DP=119;Dels=0.00;FS=17.136;HaplotypeScore=7.8091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.285;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,45:119:99:834,0,1643 chrVI 145086 . T C 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.418;DP=92;Dels=0.00;FS=5.554;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.092;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:816,0,1073 chrVI 145110 . A G 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.631;DP=90;Dels=0.00;FS=4.188;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.586;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:792,0,1026 chrVI 145543 . C T 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;DP=102;Dels=0.00;FS=2.578;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.376;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1023,0,993 chrVI 145894 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.804;DP=123;Dels=0.00;FS=2.413;HaplotypeScore=3.5973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.598;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:123:99:1360,0,1165 chrVI 146049 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.019;DP=120;Dels=0.00;FS=5.986;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=2.083;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:120:99:1278,0,1187 chrVI 146074 . C T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.336;DP=95;Dels=0.00;FS=4.270;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.210;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1049,0,972 chrVI 146172 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.046;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1236,0,1175 chrVI 146260 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.958;DP=125;Dels=0.00;FS=5.785;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1378,0,1098 chrVI 146334 . G A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.892;DP=129;Dels=0.00;FS=2.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.739;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1516,0,1128 chrVI 146341 . C T 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.003;DP=142;Dels=0.00;FS=5.131;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.429;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,80:142:99:1673,0,1230 chrVI 146469 . A G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.276;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1068,0,1613 chrVI 146545 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.329;DP=140;Dels=0.00;FS=3.029;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.830;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1327,0,1588 chrVI 146869 . G C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.153;DP=133;Dels=0.00;FS=2.212;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=1;MQRankSum=-2.185;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1099,0,1534 chrVI 146887 . G A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.875;DP=132;Dels=0.00;FS=2.265;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.208;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1161,0,1554 chrVI 147065 . A T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.538;DP=132;Dels=0.00;FS=1.790;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.29;MQ0=0;MQRankSum=-4.948;QD=9.51;ReadPosRankSum=-2.642;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1285,0,1362 chrVI 147067 . A T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.947;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.10;MQ0=0;MQRankSum=-4.770;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.159;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1156,0,1387 chrVI 147109 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;DP=128;Dels=0.00;FS=3.215;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.403;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1192,0,1351 chrVI 147121 . C T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.461;DP=144;Dels=0.00;FS=6.148;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=8.98;ReadPosRankSum=2.555;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1323,0,1583 chrVI 147171 . C G 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;DP=153;Dels=0.00;FS=2.883;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1591,0,1283 chrVI 147466 . G A 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3659,378,0 chrVI 147986 . G A 2057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.142;QD=25.71;ReadPosRankSum=2.111;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,78:80:99:2090,225,0 chrVI 148339 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.484;DP=107;Dels=0.00;FS=1.653;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.022;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1260,0,863 chrVI 148368 . C G 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.037;DP=82;Dels=0.00;FS=1.882;HaplotypeScore=3.6464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.744;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,47:82:99:1013,0,625 chrVI 148496 . C T 548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.485;DP=70;Dels=0.00;FS=3.628;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=-4.058;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.474;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:578,0,877 chrVI 148509 . C T 493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.595;DP=63;Dels=0.00;FS=6.518;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.77;MQ0=0;MQRankSum=-4.893;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:523,0,805 chrVI 148539 . A T 367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.613;DP=60;Dels=0.00;FS=2.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=-6.420;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:397,0,864 chrVI 148554 . A T 397.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.640;DP=64;Dels=0.00;FS=1.089;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=-6.663;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.449;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:427,0,908 chrVI 148557 . A T 389.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.400;DP=67;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=-6.754;QD=5.81;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:419,0,941 chrVI 148562 . A C 226.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.091;DP=64;Dels=0.00;FS=6.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.91;MQ0=0;MQRankSum=-6.463;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.343;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:256,0,973 chrVI 148564 . T C 226.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.393;DP=63;Dels=0.00;FS=4.256;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.77;MQ0=0;MQRankSum=-6.437;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:256,0,939 chrVI 148566 . A G 820.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.462;DP=63;Dels=0.00;FS=3.951;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQ0=0;MQRankSum=6.560;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.935;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,40:63:99:850,0,292 chrVI 148568 . A T 266.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;DP=60;Dels=0.00;FS=4.127;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-6.477;QD=4.43;ReadPosRankSum=-1.384;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:296,0,798 chrVI 148573 . G A 1224 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=34.7943;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.96;MQ0=0;QD=22.25;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1257,126,0 chrVI 148602 . T A 636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.49;MQ0=0;QD=19.87;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:69:669,69,0 chrVI 148623 . G A 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.852;DP=41;Dels=0.00;FS=24.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.20;MQ0=0;MQRankSum=-5.113;QD=0.90;ReadPosRankSum=1.107;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:67:67,0,611 chrVI 148650 . G A 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.191;DP=43;Dels=0.00;FS=27.493;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.59;MQ0=0;MQRankSum=-5.170;QD=1.00;ReadPosRankSum=-2.049;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:73:73,0,654 chrVI 148661 . G A 120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;DP=38;Dels=0.00;FS=9.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQ0=0;MQRankSum=-4.658;QD=3.16;ReadPosRankSum=-1.309;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:150,0,637 chrVI 148673 . T C 166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;DP=39;Dels=0.00;FS=6.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.12;MQ0=0;MQRankSum=-4.822;QD=4.26;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:196,0,623 chrVI 148676 . A G 159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;DP=41;Dels=0.00;FS=8.927;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=-4.870;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-6.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:189,0,670 chrVI 148693 . T C 226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;DP=48;Dels=0.00;FS=22.382;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.87;MQ0=0;MQRankSum=-4.549;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-7.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:256,0,691 chrVI 148700 . C T 353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.941;DP=60;Dels=0.00;FS=25.060;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=-4.652;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:383,0,812 chrVI 148751 . G A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.689;DP=99;Dels=0.00;FS=2.616;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.440;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1015,0,964 chrVI 148756 . T C 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.547;DP=99;Dels=0.00;FS=5.033;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.488;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.017;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:942,0,1055 chrVI 148828 . C T 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.502;DP=100;Dels=0.00;FS=9.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.069;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1052,0,965 chrVI 148875 . T C 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.641;DP=98;Dels=0.00;FS=9.621;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.274;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:868,0,1144 chrVI 148977 . T C 301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.708;DP=55;Dels=0.00;FS=1.024;HaplotypeScore=5.1642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.228;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:331,0,556 chrVI 148978 . T C 260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.386;DP=53;Dels=0.00;FS=1.043;HaplotypeScore=3.5868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.223;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:290,0,533 chrVI 149084 . C T 584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.129;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=7.21;ReadPosRankSum=2.416;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,34:81:99:614,0,1028 chrVI 149230 . G A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.464;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,68:115:99:1468,0,881 chrVI 149493 . A G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.405;DP=142;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.506;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1418,0,1580 chrVI 149514 . G A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.434;DP=151;Dels=0.00;FS=3.202;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.102;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1472,0,1688 chrVI 149797 . A G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.372;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:1585,0,1302 chrVI 149829 . C T 1780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.123;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.031;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:1810,0,1444 chrVI 149844 . T A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.345;DP=169;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=5.1940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.816;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,68:169:99:1287,0,2261 chrVI 149865 . T A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.938;DP=162;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=3.3594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,67:162:99:1210,0,2166 chrVI 149887 . A G 2006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;DP=163;Dels=0.00;FS=3.837;HaplotypeScore=3.5615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.928;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,96:163:99:2036,0,1329 chrVI 150002 . A G 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.644;DP=121;Dels=0.00;FS=3.429;HaplotypeScore=3.5428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.080;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1130,0,1387 chrVI 150453 . T C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.747;DP=93;Dels=0.00;FS=2.825;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:924,0,955 chrVI 150579 . G A 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.875;DP=105;Dels=0.00;FS=3.126;HaplotypeScore=4.4666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=7.98;ReadPosRankSum=2.910;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:868,0,1280 chrVI 150697 . G A 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;DP=105;Dels=0.00;FS=10.908;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=11.08;ReadPosRankSum=1.176;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1193,0,978 chrVI 150801 . G A 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.024;DP=93;Dels=0.00;FS=5.269;HaplotypeScore=3.5032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.265;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:878,0,983 chrVI 150822 . T A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.804;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.901;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1097,0,1232 chrVI 150855 . A G 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.282;DP=100;Dels=0.00;FS=3.858;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:749,0,1283 chrVI 151032 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.292;DP=112;Dels=0.00;FS=4.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1080,0,1248 chrVI 151587 . G A 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1048,0,1068 chrVI 151716 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.022;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1351,0,1228 chrVI 152831 . G A 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.129;DP=129;Dels=0.01;FS=2.329;HaplotypeScore=4.9073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1183,0,1429 chrVI 152981 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.798;DP=129;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=3.9391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.992;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1324,0,1363 chrVI 153047 . A G 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.284;DP=152;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.037;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1501,0,1479 chrVI 153106 . C T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.277;DP=136;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=5.8663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:136:99:1357,0,1472 chrVI 153178 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.957;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1224,0,1373 chrVI 153193 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.929;DP=114;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1168,0,1148 chrVI 153289 . A T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;DP=120;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=59.5218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=9.73;ReadPosRankSum=2.291;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1197,0,1295 chrVI 153323 . T A 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3525,369,0 chrVI 153342 . A G 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;DP=131;Dels=0.00;FS=4.237;HaplotypeScore=3.6655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.705;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:131:99:3045,320,0 chrVI 153360 . A G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.494;DP=131;Dels=0.00;FS=4.262;HaplotypeScore=7.9249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=7.91;ReadPosRankSum=-1.158;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:131:99:1066,0,1378 chrVI 153410 . A G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.517;DP=124;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.070;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1111,0,1258 chrVI 153710 . C T 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.900;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.643;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1738,0,1320 chrVI 153974 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.527;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.597;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,61:144:99:1200,0,1800 chrVI 153977 . T C 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;DP=149;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6658;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=24.41;ReadPosRankSum=1.241;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3637,396,0 chrVI 154568 . A G 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2919,303,0 chrVI 154845 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.731;DP=106;Dels=0.00;FS=2.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.780;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:1219,0,953 chrVI 154928 . A C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.477;DP=103;Dels=0.00;FS=6.210;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1078,0,996 chrVI 154988 . A G 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.012;DP=100;Dels=0.00;FS=12.027;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.349;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:987,0,1123 chrVI 154989 . C T 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.619;DP=100;Dels=0.00;FS=12.027;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.245;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1092,0,990 chrVI 155037 . T G 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.116;DP=97;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=9.45;ReadPosRankSum=-2.690;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:947,0,1053 chrVI 155068 . T C 727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.188;DP=86;Dels=0.00;FS=4.352;HaplotypeScore=4.4659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.164;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:757,0,969 chrVI 155127 . G T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.364;DP=109;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1236,0,952 chrVI 155140 . G A 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.626;DP=88;Dels=0.00;FS=1.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:952,0,827 chrVI 155178 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.216;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.267;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1064,0,745 chrVI 155228 . C A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.713;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1211,0,835 chrVI 155241 . T G 2462 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2495,273,0 chrVI 155336 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.795;DP=145;Dels=0.00;FS=3.121;HaplotypeScore=3.9596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=8.92;ReadPosRankSum=-2.777;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1323,0,1570 chrVI 155512 . G A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.448;DP=132;Dels=0.00;FS=4.730;HaplotypeScore=3.6561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1426,0,1301 chrVI 155598 . T C 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.133;DP=112;Dels=0.00;FS=3.585;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.607;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:927,0,1255 chrVI 155681 . G T 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.001;DP=124;Dels=0.00;FS=10.482;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1074,0,1387 chrVI 155852 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.564;DP=150;Dels=0.00;FS=3.881;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.272;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1325,0,1798 chrVI 156120 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.769;DP=158;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,68:158:99:1190,0,1875 chrVI 156375 . T C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.129;DP=109;Dels=0.00;FS=5.971;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.240;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:924,0,1212 chrVI 156651 . G A 1924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.828;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,91:158:99:1954,0,1315 chrVI 156765 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.495;DP=147;Dels=0.00;FS=6.025;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.455;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1416,0,1483 chrVI 156770 . A G 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.380;DP=158;Dels=0.00;FS=3.704;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.657;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,78:158:99:1442,0,1672 chrVI 156786 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.941;DP=129;Dels=0.00;FS=11.043;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.059;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1180,0,1475 chrVI 156928 . C T 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3014,306,0 chrVI 156996 . C T 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.405;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.610;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1140,0,1031 chrVI 157155 . G A 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.171;DP=119;Dels=0.00;FS=10.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.778;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.744;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1089,0,1342 chrVI 157162 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;DP=122;Dels=0.00;FS=13.817;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1451,0,1001 chrVI 157416 . T C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.725;DP=109;Dels=0.00;FS=1.541;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.392;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.077;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1143,0,1101 chrVI 157867 . G A 1658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.23;MQ0=0;QD=24.03;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1691,180,0 chrVI 157872 . G A 1522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.69;MQ0=0;QD=22.72;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1555,168,0 chrVI 157884 . T A 1269 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.94;MQ0=0;QD=20.80;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1302,141,0 chrVI 157913 . G A 1144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.23;MQ0=0;QD=19.39;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:59:99:1177,126,0 chrVI 158024 . T A 2552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2585,273,0 chrVI 158037 . G A 2325 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.67;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2358,240,0 chrVI 158046 . G C 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.76;MQ0=0;QD=25.30;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2588,282,0 chrVI 158080 . T C 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=26.08;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2798,303,0 chrVI 158086 . T C 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=24.95;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2603,282,0 chrVI 158136 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.730;DP=133;Dels=0.00;FS=4.399;HaplotypeScore=3.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=8.74;ReadPosRankSum=-1.844;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1192,0,1445 chrVI 158168 . G A 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2551,258,0 chrVI 158256 . A T 2427 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.87;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2460,261,0 chrVI 158283 . A G 2406 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.41;MQ0=0;QD=25.60;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2439,273,0 chrVI 158289 . G A 2167 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.90;MQ0=0;QD=26.43;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2200,234,0 chrVI 158290 . G A 2205 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.38;MQ0=0;QD=25.94;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2238,234,0 chrVI 158337 . A G 2610 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2643,300,0 chrVI 158348 . T G 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.11;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2714,303,0 chrVI 158375 . T C 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.212;DP=109;Dels=0.00;FS=4.705;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1100,0,1148 chrVI 158505 . A G 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3051,324,0 chrVI 158535 . G A 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3600,369,0 chrVI 158715 . A G 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3369,342,0 chrVI 158716 . A G 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3391,345,0 chrVI 158744 . T A 2687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2720,282,0 chrVI 158840 . G T 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3743,378,0 chrVI 158910 . C G 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;DP=123;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=2.2368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.737;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.447;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1423,0,1098 chrVI 159117 . T A 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3156,324,0 chrVI 159150 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.201;DP=122;Dels=0.00;FS=11.574;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.172;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.249;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1187,0,1360 chrVI 159165 . G A 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3339,345,0 chrVI 159235 . G C 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.11;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3270,351,0 chrVI 159554 . A G 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2652,279,0 chrVI 159623 . G A 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3146,324,0 chrVI 159710 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3268,330,0 chrVI 159955 . T G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.251;DP=116;Dels=0.00;FS=3.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1277,0,1031 chrVI 160138 . T A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.987;DP=135;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.608;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.096;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1347,0,1501 chrVI 160507 . T C 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.092;DP=119;Dels=0.00;FS=2.432;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1398,0,1055 chrVI 160515 . G A 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.710;DP=125;Dels=0.00;FS=3.210;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.052;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1491,0,1086 chrVI 160603 . A C 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;DP=108;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQ0=0;MQRankSum=2.118;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.030;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1016,0,1102 chrVI 160696 . G A 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.695;DP=101;Dels=0.00;FS=3.755;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.497;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:841,0,1189 chrVI 161044 . G C 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2642,285,0 chrVI 161071 . C T 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2901,288,0 chrVI 161110 . G A 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3498,343,0 chrVI 161152 . T C 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3169,345,0 chrVI 161167 . T C 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3455,372,0 chrVI 161436 . T C 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3551,378,0 chrVI 161506 . A G 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.46;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3012,312,0 chrVI 161565 . A G 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2672,279,0 chrVI 161636 . A G 2418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=26.00;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2451,258,0 chrVI 161852 . A G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.313;DP=103;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.712;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1068,0,1042 chrVI 161858 . C T 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=24.59;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2689,276,0 chrVI 161877 . G A 2229 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=81.9872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.36;MQ0=0;QD=22.52;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2262,228,0 chrVI 161967 . G C 1673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.488;DP=78;Dels=0.00;FS=5.703;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.30;MQ0=1;MQRankSum=2.909;QD=21.45;ReadPosRankSum=-1.935;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,74:78:99:1706,183,0 chrVI 162051 . A G 2119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.258;DP=103;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.36;MQ0=1;MQRankSum=2.931;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.059;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,99:103:99:2152,237,0 chrVI 162111 . A G 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.02;MQ0=0;QD=24.61;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2888,300,0 chrVI 162183 . A T 2240 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.74;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2273,234,0 chrVI 162197 . T C 2665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=25.87;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2698,294,0 chrVI 162211 . T A 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=26.59;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2559,264,0 chrVI 162300 . T G 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.027;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.410;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:742,0,825 chrVI 162346 . G C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.123;DP=100;Dels=0.00;FS=4.381;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.993;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1015,0,960 chrVI 162392 . T C 2331 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.62;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2364,267,0 chrVI 162613 . G A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.13;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3261,345,0 chrVI 162872 . A G 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.43;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3489,375,0 chrVI 162966 . T A 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.807;DP=101;Dels=0.00;FS=5.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.733;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:946,0,1225 chrVI 163321 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.183;DP=143;Dels=0.01;FS=2.338;HaplotypeScore=10.2975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.120;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1264,0,1477 chrVI 163435 . A G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.492;DP=115;Dels=0.00;FS=4.512;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.936;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1200,0,1155 chrVI 163447 . A G 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7669;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3297,348,0 chrVI 163549 . G A 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3467,360,0 chrVI 164557 . A G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4116;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3302,348,0 chrVI 164883 . G T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.096;DP=139;Dels=0.00;FS=4.110;HaplotypeScore=5.5266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.670;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,82:139:99:1515,0,1087 chrVI 165111 . A G 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.839;DP=139;Dels=0.00;FS=5.248;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.270;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,54:139:99:1009,0,1864 chrVI 166074 . A G 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.135;DP=98;Dels=0.01;FS=21.435;HaplotypeScore=7.5560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.740;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:922,0,1039 chrVI 166669 . C T 2307 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2340,237,0 chrVI 167082 . C T 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;DP=109;Dels=0.00;FS=14.971;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.869;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.614;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:891,0,1387 chrVI 167178 . T C 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.226;DP=146;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.608;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,84:146:99:1649,0,1158 chrVI 167198 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;DP=161;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=3.6537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.706;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.061;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,69:161:99:1321,0,1932 chrVI 167265 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.787;DP=127;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.031;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1341,0,1243 chrVI 167366 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.335;DP=105;Dels=0.00;FS=4.809;HaplotypeScore=5.9455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.897;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.363;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1169,0,950 chrVI 167402 . C T 624.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.920;DP=85;Dels=0.01;FS=5.639;HaplotypeScore=2.7456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=-5.549;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:654,0,884 chrVI 167403 . C G 581.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=86;Dels=0.00;FS=7.134;HaplotypeScore=2.7456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.94;MQ0=0;MQRankSum=-5.743;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,39:86:99:611,0,878 chrVI 167410 . A G 1929 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6397;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.74;MQ0=0;QD=22.17;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1962,210,0 chrVI 167434 . C T 660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.867;DP=83;Dels=0.00;FS=5.612;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.63;MQ0=0;MQRankSum=-4.352;QD=7.95;ReadPosRankSum=-2.438;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:690,0,731 chrVI 167598 . T C 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;DP=85;Dels=0.00;FS=5.517;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=2.202;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.444;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,42:85:99:875,0,800 chrVI 167615 . G A 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.196;DP=77;Dels=0.00;FS=7.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:879,0,723 chrVI 167647 . A G 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.893;DP=95;Dels=0.00;FS=3.824;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.294;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:841,0,1081 chrVI 167682 . G C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.186;DP=86;Dels=0.00;FS=5.511;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,47:86:99:915,0,748 chrVI 167690 . T G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.043;DP=89;Dels=0.00;FS=4.091;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,48:89:99:950,0,874 chrVI 167705 . A G 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.043;DP=90;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.743;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.872;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1004,0,866 chrVI 167712 . C T 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.115;DP=99;Dels=0.00;FS=0.771;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=2.713;QD=9.62;ReadPosRankSum=-2.083;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:982,0,1020 chrVI 167776 . T C 1988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.73;MQ0=0;QD=24.85;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2021,225,0 chrVI 167782 . T C 686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.537;DP=83;Dels=0.00;FS=4.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.671;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:716,0,949 chrVI 167789 . C T 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.294;DP=91;Dels=0.00;FS=8.455;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.664;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:888,0,963 chrVI 167818 . A C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.580;DP=96;Dels=0.00;FS=4.201;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=2.177;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.283;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:964,0,988 chrVI 167912 . T C 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.975;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=1.781;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.236;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:826,0,939 chrVI 168102 . T A 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2702,276,0 chrVI 168104 . T C 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.16;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2672,291,0 chrVI 168117 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.796;DP=101;Dels=0.00;FS=3.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=10.31;ReadPosRankSum=2.978;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1071,0,1054 chrVI 168122 . G A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.774;DP=105;Dels=0.00;FS=3.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.58;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.725;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1119,0,1007 chrVI 168136 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.770;DP=101;Dels=0.00;FS=8.134;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1178,0,891 chrVI 168202 . T C 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.643;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.883;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1514,0,1184 chrVI 168241 . T C 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3242,333,0 chrVI 168408 . G C 1923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.03;MQ0=0;QD=20.90;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:1956,216,0 chrVI 168422 . C T 2160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.75;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2193,222,0 chrVI 168596 . C T 4014.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4014,414,0 chrVI 168665 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.050;DP=134;Dels=0.00;FS=8.639;HaplotypeScore=2.8271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1090,0,1749 chrVI 168728 . A G 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.54;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2842,300,0 chrVI 168886 . A T 1196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-7.198;DP=113;Dels=0.00;FS=6.770;HaplotypeScore=58.9083;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.758;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:52,61:113:59:1229,59,0 chrVI 168984 . T C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.438;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.178;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.293;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1242,0,1157 chrVI 169035 . T C 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.595;DP=128;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=3.9688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1027,0,887 chrVI 169392 . A G 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=23.34;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3230,348,0 chrVI 169441 . G A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.634;DP=131;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1145,0,1408 chrVI 169531 . A T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.919;DP=111;Dels=0.00;FS=7.970;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.590;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1187,0,1170 chrVI 169586 . T C 773.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.388;DP=106;Dels=0.00;FS=15.204;HaplotypeScore=2.6653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.586;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:803,0,1298 chrVI 169591 . T C 2484 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7775;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.51;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2517,273,0 chrVI 169592 . T C 537.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.583;DP=90;Dels=0.00;FS=10.809;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=-4.623;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.229;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,34:90:99:567,0,1228 chrVI 169609 . C T 416.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.287;DP=83;Dels=0.00;FS=1.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.471;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,29:83:99:446,0,1197 chrVI 169614 . A G 430.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.479;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.94;MQ0=0;MQRankSum=-6.826;QD=4.94;ReadPosRankSum=-1.175;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:460,0,1246 chrVI 169617 . T C 427.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.08;MQ0=0;MQRankSum=-7.343;QD=4.85;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:457,0,1265 chrVI 169618 . G A 447.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.545;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.08;MQ0=0;MQRankSum=-7.213;QD=5.08;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:477,0,1189 chrVI 169635 . A G 2454 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.53;MQ0=0;QD=23.15;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2487,273,0 chrVI 169641 . G A 343.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.097;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.69;MQ0=0;MQRankSum=-7.714;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.469;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,40:110:99:373,0,1580 chrVI 169642 . C T 338.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.917;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.69;MQ0=0;MQRankSum=-7.932;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.581;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,40:110:99:368,0,1573 chrVI 169649 . T G 2346 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.66;MQ0=0;QD=20.95;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2379,264,0 chrVI 169653 . G A 324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.882;DP=113;Dels=0.00;FS=3.752;HaplotypeScore=236.7945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQ0=0;MQRankSum=-6.589;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.723;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,41:113:99:354,0,1629 chrVI 169872 . A G 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3078,321,0 chrVI 169900 . A C 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3307,345,0 chrVI 169942 . T C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.036;DP=147;Dels=0.00;FS=7.345;HaplotypeScore=3.2997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1350,0,1620 chrVI 170423 . T C 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3301,342,0 chrVI 170473 . G A 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3310,336,0 chrVI 170677 . C T 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.336;DP=157;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=2.9119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.152;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:1734,0,1433 chrVI 170689 . A C 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.422;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.795;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,79:163:99:1549,0,1735 chrVI 170794 . C T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3378,354,0 chrVI 171023 . A G 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9543;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3397,345,0 chrVI 171103 . G T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.853;DP=125;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=2.6336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1211,0,1272 chrVI 171241 . C T 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.863;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,82:166:99:1713,0,1633 chrVI 171355 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.022;DP=113;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1309,0,1038 chrVI 171376 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.137;DP=104;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.958;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1232,0,919 chrVI 171434 . C T 2679 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2712,285,0 chrVI 171485 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.008;DP=121;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.149;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1148,0,1285 chrVI 171501 . C T 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.789;DP=141;Dels=0.00;FS=5.424;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.260;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1556,0,1128 chrVI 171967 . T C 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.592;DP=114;Dels=0.00;FS=7.226;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:926,0,1373 chrVI 172180 . C T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.874;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:141:99:1316,0,1537 chrVI 172278 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.203;DP=126;Dels=0.00;FS=4.300;HaplotypeScore=4.8391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1176,0,1321 chrVI 172334 . G C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;DP=132;Dels=0.00;FS=10.951;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.482;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1155,0,1526 chrVI 172581 . C T 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3168,333,0 chrVI 172598 . A T 3901.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.57;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3901,397,0 chrVI 172612 . A G 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3591,375,0 chrVI 172701 . T C 1948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.536;DP=155;Dels=0.00;FS=13.446;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,94:155:99:1978,0,1194 chrVI 172967 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.591;DP=130;Dels=0.00;FS=4.213;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.239;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.479;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1129,0,1478 chrVI 173151 . T C 1998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.262;DP=169;Dels=0.00;FS=1.253;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=3.717;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,103:169:99:2028,0,1205 chrVI 173233 . A G 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;DP=138;Dels=0.00;FS=3.070;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.658;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1604,0,1250 chrVI 173376 . G A 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3157,327,0 chrVI 173398 . C T 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2727,282,0 chrVI 173500 . C T 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.455;DP=125;Dels=0.00;FS=3.565;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=26.38;ReadPosRankSum=1.067;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3298,325,0 chrVI 173599 . C T 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3133,330,0 chrVI 173685 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.676;DP=132;Dels=0.00;FS=3.143;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.767;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1512,0,1142 chrVI 173765 . A G 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.496;DP=124;Dels=0.00;FS=3.542;HaplotypeScore=4.3883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:1414,0,1007 chrVI 173916 . T A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;DP=155;Dels=0.00;FS=4.796;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1498,0,1561 chrVI 174110 . C G 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.963;DP=137;Dels=0.00;FS=6.110;HaplotypeScore=115.2515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.715;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:829,0,653 chrVI 174484 . A G 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.121;DP=191;Dels=0.00;FS=0.529;HaplotypeScore=4.0894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.693;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,92:191:99:1713,0,1936 chrVI 174519 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.327;DP=151;Dels=0.00;FS=9.361;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1533,0,1410 chrVI 174556 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.807;DP=139;Dels=0.00;FS=15.964;HaplotypeScore=3.4825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=10.54;ReadPosRankSum=2.235;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1495,0,1355 chrVI 174898 . G A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.498;DP=146;Dels=0.00;FS=2.121;HaplotypeScore=7.1459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:146:99:1408,0,1577 chrVI 175060 . T C 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.417;DP=153;Dels=0.00;FS=8.321;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1643,0,1401 chrVI 175127 . T C 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.062;DP=159;Dels=0.00;FS=7.073;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.882;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:1704,0,1481 chrVI 175153 . T C 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=22.80;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3488,378,0 chrVI 175342 . C A 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3313,354,0 chrVI 175594 . A G 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.616;DP=98;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.47;ReadPosRankSum=-3.016;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1056,0,953 chrVI 175597 . G A 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.664;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1062,0,1061 chrVI 176010 . T G 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.036;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,87:161:99:1765,0,1482 chrVI 176158 . T C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.156;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1335,0,1281 chrVI 176167 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.488;DP=146;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.418;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,64:146:99:1269,0,1666 chrVI 176260 . C T 2144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.801;DP=205;Dels=0.00;FS=1.120;HaplotypeScore=2.4626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=10.46;ReadPosRankSum=-2.593;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,106:205:99:2174,0,1922 chrVI 176266 . G A 2282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.539;DP=217;Dels=0.00;FS=1.666;HaplotypeScore=2.7119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.891;QD=10.52;ReadPosRankSum=-2.328;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,111:217:99:2312,0,2027 chrVI 176340 . T C 4468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4468,480,0 chrVI 176410 . G T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.961;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,88:174:99:1377,0,1179 chrVI 176518 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.017;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=1;MQRankSum=1.640;QD=7.63;ReadPosRankSum=1.916;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,76:185:99:1441,0,2129 chrVI 176548 . G A 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.400;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=1;MQRankSum=-0.655;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,72:180:99:1473,0,2095 chrVI 176588 . T C 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.978;DP=147;Dels=0.00;FS=2.985;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=7.16;ReadPosRankSum=-1.995;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,61:147:99:1083,0,1793 chrVI 176777 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.751;DP=142;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1232,0,1683 chrVI 176899 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;DP=131;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.878;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1200,0,1372 chrVI 177249 . G A 2080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,103:191:99:2110,0,1712 chrVI 177317 . G C 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;DP=161;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,70:161:99:1391,0,1890 chrVI 177337 . C T 1902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.101;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:163:99:1932,0,1403 chrVI 177366 . T C 4190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4190,432,0 chrVI 177453 . A G 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.53;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3581,399,0 chrVI 177491 . T C 1858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.777;DP=159;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=4.6646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,89:159:99:1888,0,1424 chrVI 177516 . G A 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3700,376,0 chrVI 177753 . T C 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=142;Dels=0.00;FS=3.741;HaplotypeScore=2.2931;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3403,366,0 chrVI 177798 . G A 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3422,357,0 chrVI 177890 . C T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.394;DP=144;Dels=0.00;FS=2.129;HaplotypeScore=2.5606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.508;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1435,0,1467 chrVI 177999 . T C 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.70;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3272,357,0 chrVI 178043 . T C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.242;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=22.71;ReadPosRankSum=1.693;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,130:134:99:3076,297,0 chrVI 178052 . T C 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;DP=131;Dels=0.00;FS=4.984;HaplotypeScore=3.7936;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.480;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.806;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,122:131:99:2689,147,0 chrVI 178054 . A T 2182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.251;DP=111;Dels=0.00;FS=2.850;HaplotypeScore=4.7095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.44;MQ0=0;MQRankSum=-3.425;QD=19.66;ReadPosRankSum=2.899;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,101:111:68:2215,68,0 chrVI 178063 . G A 1981.03 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;DP=116;Dels=0.00;FS=1.170;HaplotypeScore=26.1437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.057;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.324;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,103:116:20:2011,0,20 chrVI 178069 . T C 203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.028;DP=99;Dels=0.00;FS=2.053;HaplotypeScore=16.2193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQ0=0;MQRankSum=-4.270;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.128;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:99:99:233,0,1617 chrVI 178083 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.795;DP=88;Dels=0.00;FS=5.370;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-7.769e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,70:88:99:1369,0,155 chrVI 178096 . C T 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.769;DP=89;Dels=0.00;FS=10.887;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.38;MQ0=0;MQRankSum=-3.950;QD=0.46;ReadPosRankSum=-1.617;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,14:89:71:71,0,1483 chrVI 178120 . A C 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.547;DP=97;Dels=0.00;FS=1.064;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.82;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=16.81;ReadPosRankSum=-3.132;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,79:97:99:1661,0,121 chrVI 178193 . T C 196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.417;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.02;MQ0=0;MQRankSum=-6.161;QD=2.39;ReadPosRankSum=-2.492;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:226,0,1253 chrVI 178195 . A T 273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.211;DP=84;Dels=0.00;FS=0.887;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.95;MQ0=0;MQRankSum=-6.275;QD=3.25;ReadPosRankSum=-2.356;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,26:84:99:303,0,1248 chrVI 178204 . G A 438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.887;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.01;MQ0=0;MQRankSum=-5.981;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.509;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:468,0,1154 chrVI 178210 . T C 483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.493;DP=72;Dels=0.00;FS=0.904;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.54;MQ0=0;MQRankSum=-4.803;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.316;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:513,0,784 chrVI 178224 . A G 690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.007;DP=79;Dels=0.00;FS=11.519;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.30;MQ0=0;MQRankSum=-3.984;QD=8.73;ReadPosRankSum=2.310;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,42:79:99:720,0,687 chrVI 178237 . T C 720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.313;DP=85;Dels=0.00;FS=13.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.74;MQ0=0;MQRankSum=3.179;QD=8.47;ReadPosRankSum=-4.710;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:750,0,844 chrVI 178261 . A C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.858;DP=112;Dels=0.00;FS=35.816;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.898;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1258,0,964 chrVI 178373 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.866;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.060;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1404,0,1526 chrVI 178394 . T C 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;DP=141;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.291;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1442,0,1435 chrVI 178425 . G C 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3407,360,0 chrVI 178440 . G A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;DP=140;Dels=0.00;FS=5.288;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.797;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1433,0,1329 chrVI 178452 . A G 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.575;DP=135;Dels=0.00;FS=8.045;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.054;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1377,0,1367 chrVI 178649 . T C 885.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.093;DP=97;Dels=0.00;FS=1.660;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.336;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:915,0,1059 chrVI 178655 . C T 2393 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.659;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5510;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=25.19;ReadPosRankSum=1.440;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:2426,255,0 chrVI 178657 . T C 773.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.183;DP=97;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=2.5510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:803,0,1079 chrVI 179064 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.942;DP=135;Dels=0.00;FS=2.346;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1374,0,1400 chrVI 179094 . A G 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.021;DP=135;Dels=0.00;FS=1.625;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.401;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1494,0,1200 chrVI 179606 . G C 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;DP=112;Dels=0.00;FS=2.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.903;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1047,0,1241 chrVI 179773 . G C 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;DP=162;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=2.7816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1803,0,1500 chrVI 179957 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.411;DP=143;Dels=0.00;FS=9.000;HaplotypeScore=4.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1369,0,1489 chrVI 179977 . G T 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.662;DP=135;Dels=0.00;FS=4.108;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.942;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1559,0,1157 chrVI 179981 . T C 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3259,354,0 chrVI 180152 . C T 3935.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3935,405,0 chrVI 180324 . G A 1797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.399;DP=183;Dels=0.00;FS=10.149;HaplotypeScore=3.6266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=9.82;ReadPosRankSum=-2.830;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,90:183:99:1827,0,1834 chrVI 180531 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.871;DP=133;Dels=0.00;FS=2.393;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.874;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1290,0,1550 chrVI 180546 . T C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.492;DP=138;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.315;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1348,0,1549 chrVI 180611 . G T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.828;DP=134;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.444;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1148,0,1426 chrVI 180627 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.245;DP=136;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=3.5478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=-0.680;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.397;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1176,0,1408 chrVI 180656 . C G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;DP=138;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=-0.976;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.242;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1444,0,1271 chrVI 180840 . T C 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.354;DP=129;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1426,0,1180 chrVI 180916 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.044;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.668;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1260,0,1009 chrVI 180970 . G T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.395;DP=97;Dels=0.00;FS=8.241;HaplotypeScore=50.1241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.526;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,58:97:99:1132,0,740 chrVI 180971 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.977;DP=96;Dels=0.00;FS=6.815;HaplotypeScore=49.1576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.761;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,57:96:99:1171,0,733 chrVI 181059 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.490;DP=142;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=4.1323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1290,0,1259 chrVI 181094 . A C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.409;DP=140;Dels=0.00;FS=3.053;HaplotypeScore=2.0641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.697;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1320,0,1273 chrVI 181154 . A C 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.386;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=1;MQRankSum=0.256;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,98:175:99:1656,0,1291 chrVI 181190 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.096;DP=146;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=1;MQRankSum=-0.573;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.561;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1560,0,1196 chrVI 181197 . C A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.340;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=1;MQRankSum=-1.709;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.325;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1516,0,1313 chrVI 181248 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.197;DP=125;Dels=0.00;FS=4.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1335,0,1218 chrVI 181345 . A G 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.761;DP=170;Dels=0.00;FS=7.249;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:170:99:1726,0,1589 chrVI 181364 . C A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.839;DP=156;Dels=0.00;FS=7.898;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.008;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1423,0,1529 chrVI 181370 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.831;DP=152;Dels=0.00;FS=7.987;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1243,0,1598 chrVI 181376 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.808;DP=144;Dels=0.00;FS=4.454;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.340;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.697;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1270,0,1364 chrVI 181417 . T A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.885;DP=148;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=6.8959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=9.02;ReadPosRankSum=-2.374;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1365,0,1540 chrVI 181513 . C G 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.051;DP=173;Dels=0.00;FS=0.565;HaplotypeScore=7.3451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,93:173:99:1592,0,1580 chrVI 181692 . A G 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.971;DP=163;Dels=0.00;FS=1.268;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.293;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1571,0,1724 chrVI 181733 . T G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.614;DP=179;Dels=0.00;FS=4.742;HaplotypeScore=3.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.958;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,81:179:99:1553,0,2033 chrVI 181801 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.898;DP=169;Dels=0.00;FS=11.182;HaplotypeScore=13.7301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=8.43;ReadPosRankSum=2.483;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,78:169:99:1455,0,1928 chrVI 181817 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.948;DP=141;Dels=0.00;FS=4.158;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1268,0,1490 chrVI 181832 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.567;DP=133;Dels=0.00;FS=3.496;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1217,0,1435 chrVI 181852 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.737;DP=146;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.161;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1266,0,1563 chrVI 181971 . G C 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.849;DP=146;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=2.9269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1540,0,1365 chrVI 182036 . T C 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.297;DP=141;Dels=0.00;FS=2.990;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.525;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1559,0,1201 chrVI 182354 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.993;DP=141;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1107,0,1704 chrVI 182376 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.379;DP=161;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,66:161:99:1260,0,1854 chrVI 182391 . G A 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.956;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,74:173:99:1475,0,1946 chrVI 182440 . C T 1832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.325;DP=217;Dels=0.00;FS=1.107;HaplotypeScore=2.6904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.090;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,96:217:99:1862,0,2435 chrVI 182459 . A G 1913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.228;DP=228;Dels=0.00;FS=3.271;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=3.241;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.405;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,105:228:99:1943,0,2448 chrVI 182538 . C T 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;DP=184;Dels=0.00;FS=0.548;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.169;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,95:184:99:1929,0,1789 chrVI 182910 . A G 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;DP=149;Dels=0.00;FS=10.040;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.723;QD=4.95;ReadPosRankSum=-2.961;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:767,0,1304 chrVI 183446 . C T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.681;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.071;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,74:172:99:1299,0,1967 chrVI 183467 . A G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.623;DP=155;Dels=0.00;FS=1.344;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.022;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.978;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:155:99:1314,0,1633 chrVI 183476 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.243;DP=150;Dels=0.00;FS=4.997;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.275;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1231,0,1564 chrVI 183482 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.418;DP=152;Dels=0.00;FS=3.814;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.452;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1307,0,1523 chrVI 183726 . T G 2128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.677;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,106:188:99:2158,0,1663 chrVI 183941 . A G 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.270;DP=159;Dels=0.00;FS=14.466;HaplotypeScore=3.6143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=1;MQRankSum=-1.488;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.178;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,82:159:99:1547,0,1553 chrVI 184083 . G A 1976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.200;DP=190;Dels=0.00;FS=5.848;HaplotypeScore=6.4042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.355;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,94:190:99:2006,0,1705 chrVI 184158 . T C 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.706;DP=177;Dels=0.00;FS=10.084;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.102;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,86:177:99:1728,0,1851 chrVI 184168 . C T 1934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.574;DP=186;Dels=0.00;FS=5.975;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,92:186:99:1964,0,1846 chrVI 184225 . T C 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.497;DP=167;Dels=0.00;FS=4.637;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.542;QD=9.89;ReadPosRankSum=2.173;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,89:167:99:1681,0,1627 chrVI 184226 . T G 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.563;DP=167;Dels=0.00;FS=5.684;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.995;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.649;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,88:167:99:1658,0,1654 chrVI 184277 . C T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.499;DP=164;Dels=0.00;FS=13.829;HaplotypeScore=65.5715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.72;MQ0=0;MQRankSum=-6.973;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.943;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,80:164:99:1412,0,1787 chrVI 184289 . C G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.760;DP=159;Dels=0.00;FS=22.111;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.42;MQ0=0;MQRankSum=-6.974;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1362,0,1759 chrVI 184295 . C T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.631;DP=168;Dels=0.00;FS=13.664;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.60;MQ0=0;MQRankSum=-5.946;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.984;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,84:168:99:1593,0,1756 chrVI 184476 . C T 2541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.679;DP=207;Dels=0.00;FS=7.787;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=12.28;ReadPosRankSum=2.875;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,118:207:99:2571,0,1741 chrVI 184513 . A T 1966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.510;DP=181;Dels=0.00;FS=7.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.047;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,99:181:99:1996,0,1699 chrVI 184798 . C T 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.188;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.100;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1699,0,1645 chrVI 184844 . T A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.939;DP=149;Dels=0.00;FS=4.921;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.161;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1496,0,1600 chrVI 184878 . G A 1951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.593;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,95:195:99:1981,0,2002 chrVI 185546 . G A 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.594;DP=174;Dels=0.00;FS=4.555;HaplotypeScore=3.3418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.801;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,90:174:99:1751,0,1567 chrVI 185806 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.323;DP=144;Dels=0.00;FS=7.952;HaplotypeScore=8.9321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=1;MQRankSum=0.866;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.500;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1346,0,1489 chrVI 186267 . A G 364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.020;DP=101;Dels=0.00;FS=4.271;HaplotypeScore=4.6949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.745;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.308;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:101:99:394,0,1236 chrVI 187771 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.288;DP=121;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.061;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1257,0,1186 chrVI 188023 . T C 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.487;DP=171;Dels=0.00;FS=2.422;HaplotypeScore=3.6929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.559;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,83:171:99:1636,0,1873 chrVI 188077 . C T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.058;DP=163;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.798;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,65:163:99:1310,0,2062 chrVI 188203 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.895;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=2.045;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.834;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1305,0,1374 chrVI 188423 . C T 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.972;DP=101;Dels=0.00;FS=2.581;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.309;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1048,0,1026 chrVI 188428 . T G 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.378;DP=106;Dels=0.00;FS=3.588;HaplotypeScore=2.6392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.936;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:927,0,1184 chrVI 188704 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.443;DP=166;Dels=0.00;FS=10.812;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.538;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,71:166:99:1445,0,1925 chrVI 189096 . G A 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.504;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.871;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:968,0,1177 chrVI 189156 . G T 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=1;QD=24.38;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3202,339,0 chrVI 189505 . G A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.125;DP=102;Dels=0.00;FS=6.366;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.713;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1223,0,830 chrVI 189631 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.047;DP=129;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.488;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1142,0,1394 chrVI 189700 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.169;DP=99;Dels=0.00;FS=9.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.691;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1180,0,801 chrVI 189752 . T C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.823;DP=122;Dels=0.00;FS=6.923;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.025;QD=11.04;ReadPosRankSum=-2.881;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1377,0,1134 chrVI 189828 . A C 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2947,321,0 chrVI 189847 . G A 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3007,306,0 chrVI 189863 . C T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.158;DP=129;Dels=0.00;FS=4.205;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.309;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1321,0,1372 chrVI 190072 . T C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.636;DP=104;Dels=0.00;FS=1.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1104,0,976 chrVI 190129 . A G 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2686,282,0 chrVI 190170 . T C 2579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=22.82;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2612,276,0 chrVI 190174 . G A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;DP=111;Dels=0.00;FS=2.488;HaplotypeScore=2.6548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.018;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1136,0,895 chrVI 190306 . G A 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.203;DP=98;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.935;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:983,0,1027 chrVI 190339 . C T 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.226;DP=95;Dels=0.00;FS=0.799;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:999,0,949 chrVI 190366 . C T 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.802;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:965,0,799 chrVI 190474 . A G 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;DP=107;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=3.7280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.494;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:946,0,1173 chrVI 190534 . A T 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.615;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:696,0,1128 chrVI 190543 . T C 748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.606;DP=98;Dels=0.00;FS=1.718;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.531;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,40:98:99:778,0,1268 chrVI 190627 . G A 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.282;DP=91;Dels=0.00;FS=5.436;HaplotypeScore=2.4052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.090;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,37:91:99:712,0,1137 chrVI 190831 . C T 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.782;DP=111;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=8.73;ReadPosRankSum=-2.332;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:999,0,1164 chrVI 190849 . C T 2290 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2323,240,0 chrVI 190897 . A T 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.682;DP=129;Dels=0.00;FS=2.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=9.60;ReadPosRankSum=-3.078;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1268,0,1475 chrVI 191180 . C T 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3366,336,0 chrVI 191209 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.431;DP=140;Dels=0.00;FS=13.551;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.571;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1246,0,1406 chrVI 191256 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.640;DP=129;Dels=0.00;FS=6.615;HaplotypeScore=3.5863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.82;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.814;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1100,0,1236 chrVI 191392 . C T 1984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.70;MQ0=0;QD=20.67;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2017,228,0 chrVI 191395 . A T 1760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.96;MQ0=0;QD=20.23;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1793,195,0 chrVI 191409 . A T 1341 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.36;MQ0=0;QD=18.62;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1374,150,0 chrVI 191416 . G T 1225 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.73;MQ0=0;QD=16.78;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1258,138,0 chrVI 191424 . G T 167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.835;DP=67;Dels=0.00;FS=14.834;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.146;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:197,0,736 chrVI 191439 . G A 1091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.54;MQ0=0;QD=18.81;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1124,126,0 chrVI 191495 . A G 529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.69;MQ0=0;QD=9.98;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:63:562,63,0 chrVI 191655 . T C 1328 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.06;MQ0=0;QD=22.51;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1361,159,0 chrVI 191661 . T A 1462 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.94;MQ0=0;QD=20.89;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1495,171,0 chrVI 191671 . G T 1403 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.74;MQ0=0;QD=18.46;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1436,165,0 chrVI 191674 . T C 1368 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.24;MQ0=0;QD=18.49;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1401,165,0 chrVI 191680 . C T 1371 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.81;MQ0=0;QD=18.78;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1404,165,0 chrVI 191687 . A G 1590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.89;MQ0=0;QD=19.63;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1623,189,0 chrVI 191758 . A G 1414 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.97;MQ0=0;QD=24.38;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1447,165,0 chrVI 191775 . T C 1159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.92;MQ0=0;QD=23.65;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1192,138,0 chrVI 191780 . C T 1156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.40;MQ0=0;QD=22.23;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1189,138,0 chrVI 191793 . T C 657 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.99;MQ0=0;QD=16.42;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:84:690,84,0 chrVI 191794 . A G 687 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.99;MQ0=0;QD=17.17;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:84:720,84,0 chrVI 191799 . A G 657 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;QD=15.64;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:81:690,81,0 chrVI 191827 . T C 617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.38;MQ0=0;QD=16.24;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:78:650,78,0 chrVI 191836 . C T 518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.36;MQ0=0;QD=15.24;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:63:551,63,0 chrVI 191847 . G T 581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.80;MQ0=0;QD=16.14;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:69:614,69,0 chrVI 191856 . A C 567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.58;MQ0=0;QD=15.32;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:72:600,72,0 chrVI 191860 . T C 603 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.98;MQ0=0;QD=15.46;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:75:636,75,0 chrVI 191880 . T C 701 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.14;MQ0=0;QD=18.95;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:87:734,87,0 chrVI 191885 . G A 592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=0;QD=16.91;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:72:625,72,0 chrVI 191914 . T C 1037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.25;MQ0=0;QD=19.20;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1070,126,0 chrVI 191930 . G A 1189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.01;MQ0=0;QD=20.50;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1222,141,0 chrVI 191937 . G C 296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.447;DP=60;Dels=0.00;FS=14.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:326,0,574 chrVI 191945 . T C 1161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.04;MQ0=0;QD=18.73;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1194,144,0 chrVI 191963 . G C 1407 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.37;MQ0=0;QD=20.69;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1440,171,0 chrVI 191994 . G T 1359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.63;MQ0=0;QD=20.91;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1392,159,0 chrVI 192013 . C T 1428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.64;MQ0=0;QD=22.31;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:64:99:1461,165,0 chrVI 192028 . C T 1379 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.30;MQ0=0;QD=22.98;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1412,159,0 chrVI 192045 . A G 1449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.57;MQ0=0;QD=22.29;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1482,180,0 chrVI 192050 . A C 1457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.08;MQ0=0;QD=23.13;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1490,168,0 chrVI 192065 . C G 1702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=21.54;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1735,195,0 chrVI 192074 . A G 1791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=21.32;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1824,207,0 chrVI 192100 . C T 1504 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;QD=22.79;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1537,165,0 chrVI 192104 . A G 1327 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.67;MQ0=0;QD=20.11;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1360,162,0 chrVI 192122 . G A 1509 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.28;MQ0=0;QD=22.52;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1542,168,0 chrVI 192128 . C A 1802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=22.52;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1835,207,0 chrVI 192134 . T C 1824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.15;MQ0=0;QD=21.98;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1857,219,0 chrVI 192166 . G C 1540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.21;MQ0=0;QD=22.99;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1573,186,0 chrVI 192172 . T C 1600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.83;MQ0=0;QD=21.62;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1633,189,0 chrVI 192184 . C T 683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.682;DP=80;Dels=0.00;FS=18.322;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.356;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.652;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:713,0,800 chrVI 192234 . T C 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.056;DP=111;Dels=0.00;FS=3.683;HaplotypeScore=1.8991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.77;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.814;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:932,0,1306 chrVI 192240 . C T 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.346;DP=109;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.660;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:977,0,1210 chrVI 192288 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.327;DP=120;Dels=0.00;FS=13.372;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.84;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,71:120:99:1384,0,1002 chrVI 192358 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;DP=124;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.650;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1134,0,1447 chrVI 192485 . T C 2241 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.65;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2274,255,0 chrVI 192545 . C T 1692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.30;MQ0=0;QD=20.39;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1725,189,0 chrVI 192551 . T A 1777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.87;MQ0=0;QD=20.43;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1810,198,0 chrVI 192564 . A G 1635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.98;MQ0=0;QD=19.70;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1668,186,0 chrVI 192590 . A G 2124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=20.62;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2157,246,0 chrVI 192642 . G A 2346 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2379,252,0 chrVI 192701 . T G 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.063;DP=83;Dels=0.00;FS=7.386;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:742,0,962 chrVI 192707 . T C 2074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.86;MQ0=0;QD=24.69;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,83:84:99:2107,219,0 chrVI 192732 . T C 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.79;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2868,306,0 chrVI 192850 . A C 2391 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.33;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2424,261,0 chrVI 192937 . A G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.323;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.954;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1105,0,1093 chrVI 192981 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.716;DP=108;Dels=0.00;FS=2.489;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.178;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1085,0,1122 chrVI 193000 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.077;DP=103;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.122;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1054,0,955 chrVI 193023 . G A 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2801,288,0 chrVI 193039 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;DP=117;Dels=0.00;FS=3.418;HaplotypeScore=4.9437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.309;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1054,0,1295 chrVI 193175 . G A 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.658;DP=107;Dels=0.00;FS=2.550;HaplotypeScore=9.2532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.643;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:877,0,1281 chrVI 193303 . G A 2273 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2306,237,0 chrVI 193319 . A G 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.786;DP=111;Dels=0.00;FS=12.495;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=9.08;ReadPosRankSum=3.035;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1038,0,1162 chrVI 193326 . G C 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;DP=117;Dels=0.00;FS=10.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=10.66;ReadPosRankSum=-2.382;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1277,0,1070 chrVI 193344 . A G 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.286;DP=120;Dels=0.00;FS=3.266;HaplotypeScore=10.7749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1157,0,1262 chrVI 193346 . A C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.013;DP=120;Dels=0.00;FS=3.266;HaplotypeScore=10.7749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.144;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1159,0,1265 chrVI 193410 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.563;DP=118;Dels=0.00;FS=7.128;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=9.61;ReadPosRankSum=3.237;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1164,0,1296 chrVI 193556 . G C 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.409;DP=150;Dels=0.00;FS=2.053;HaplotypeScore=5.9105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:1571,0,1174 chrVI 193671 . C T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.600;DP=145;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.133;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1702,0,1228 chrVI 193711 . A G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.209;DP=130;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.200;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1253,0,1415 chrVI 193734 . T C 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3451,360,0 chrVI 193872 . T A 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3427,333,0 chrVI 194072 . A G 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.693;DP=124;Dels=0.00;FS=2.356;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.609;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,47:124:99:795,0,1679 chrVI 194081 . C T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.873;DP=135;Dels=0.00;FS=2.246;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,57:135:99:1057,0,1597 chrVI 194092 . A T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.072;DP=123;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.762;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:123:99:1415,0,1116 chrVI 194109 . A G 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.928;DP=133;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,80:133:99:1508,0,1064 chrVI 194154 . C T 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.270;DP=154;Dels=0.00;FS=5.950;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.386;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1598,0,1391 chrVI 194162 . A G 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3602,381,0 chrVI 194177 . A G 965.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.433;DP=121;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:995,0,1370 chrVI 194182 . T C 847.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.840;DP=115;Dels=0.00;FS=5.735;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=7.37;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:115:99:877,0,1338 chrVI 194187 . T C 1260.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.661;DP=126;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=10.00;ReadPosRankSum=3.202;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1290,0,1188 chrVI 194193 . A G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.202;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=10.26;ReadPosRankSum=2.950;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1261,0,1186 chrVI 194247 . G T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.109;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.664;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1299,0,1410 chrVI 194288 . C G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;DP=100;Dels=0.00;FS=7.776;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1022,0,1001 chrVI 194306 . C A 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.028;DP=102;Dels=0.02;FS=9.930;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=3.492;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.545;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:948,0,1037 chrVI 194310 . A G 902.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;DP=99;Dels=0.00;FS=6.701;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.229;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.668;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:932,0,1090 chrVI 194319 . C T 2749 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2782,291,0 chrVI 194320 . G C 922.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;DP=116;Dels=0.00;FS=3.464;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.495;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.914;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:952,0,1246 chrVI 194505 . T A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.619;DP=134;Dels=0.00;FS=3.382;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1429,0,1352 chrVI 194540 . G A 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.901;DP=101;Dels=0.00;FS=8.051;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.010;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:866,0,1218 chrVI 194593 . G T 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.52;MQ0=0;QD=23.03;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3096,324,0 chrVI 195150 . T A 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.887;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=11.03;ReadPosRankSum=-2.481;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:157:99:1761,0,1479 chrVI 195375 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.415;DP=112;Dels=0.00;FS=6.006;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1086,0,1116 chrVI 195395 . G A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.659;DP=121;Dels=0.00;FS=11.605;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.360;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:121:99:1191,0,1307 chrVI 195471 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;DP=135;Dels=0.00;FS=6.401;HaplotypeScore=3.2245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.165;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1329,0,1434 chrVI 195505 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.755;DP=142;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=3.4452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.695;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1406,0,1473 chrVI 195636 . T A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.802;DP=129;Dels=0.00;FS=7.995;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.855;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1410,0,1330 chrVI 195711 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.390;DP=130;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.729;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1333,0,1297 chrVI 195919 . G A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.550;DP=137;Dels=0.00;FS=6.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.251;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1422,0,1292 chrVI 196316 . C A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.534;DP=143;Dels=0.00;FS=2.974;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.581;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1481,0,1397 chrVI 196332 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;DP=131;Dels=0.00;FS=3.122;HaplotypeScore=3.4681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1478,0,1171 chrVI 197402 . G A 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3280,351,0 chrVI 197486 . A T 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3856,405,0 chrVI 197758 . G A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.272;DP=119;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.839;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.851;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1403,0,1067 chrVI 197775 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.534;DP=125;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.472;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1330,0,1182 chrVI 197794 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.254;DP=126;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.343;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1155,0,1434 chrVI 197849 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;DP=113;Dels=0.00;FS=7.234;HaplotypeScore=6.1162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.766;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.876;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1200,0,1087 chrVI 198089 . C T 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3531,360,0 chrVI 198092 . A G 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=24.07;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3418,369,0 chrVI 198116 . T C 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3363,348,0 chrVI 198275 . G T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.455;DP=160;Dels=0.00;FS=5.712;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=9.17;ReadPosRankSum=2.876;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:160:99:1497,0,1723 chrVI 198427 . C T 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.180;DP=99;Dels=0.00;FS=3.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:947,0,1022 chrVI 198446 . A G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.903;DP=123;Dels=0.01;FS=7.518;HaplotypeScore=16.8108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:122:99:1140,0,1195 chrVI 198501 . G A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;DP=122;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1284,0,1153 chrVI 198590 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.953;DP=140;Dels=0.00;FS=2.143;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.734;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1370,0,1387 chrVI 198602 . G A 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.361;DP=155;Dels=0.00;FS=2.873;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1554,0,1511 chrVI 198638 . T C 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.066;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1008,0,1522 chrVI 198689 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.283;DP=130;Dels=0.00;FS=9.510;HaplotypeScore=3.8281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1164,0,1530 chrVI 199107 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.128;DP=125;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.295;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1124,0,1313 chrVI 199207 . G A 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3286,339,0 chrVI 199246 . T C 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2970,327,0 chrVI 199313 . A C 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;DP=116;Dels=0.00;FS=1.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.65;MQ0=0;MQRankSum=5.586;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1504,0,912 chrVI 199316 . C T 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.65;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3116,324,0 chrVI 199448 . A T 1018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;DP=122;Dels=0.00;FS=9.507;HaplotypeScore=9.9236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=8.34;ReadPosRankSum=3.220;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,50:122:44:1051,44,0 chrVI 199469 . C A 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.320;DP=133;Dels=0.00;FS=6.253;HaplotypeScore=6.9331;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=23.31;ReadPosRankSum=1.414;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,131:133:99:3133,360,0 chrVI 199471 . A C 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.847;DP=133;Dels=0.00;FS=10.907;HaplotypeScore=7.9247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,79:133:99:1433,0,977 chrVI 199556 . G T 893.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.380;DP=128;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.72;MQ0=0;MQRankSum=-7.119;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.123;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:923,0,1530 chrVI 199558 . A T 1494.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;DP=129;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.78;MQ0=0;MQRankSum=7.202;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,76:129:99:1524,0,870 chrVI 199559 . G A 756.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.943;DP=117;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.21;MQ0=0;MQRankSum=-7.168;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.163;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:117:99:786,0,1492 chrVI 199563 . C T 780.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.419;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.05;MQ0=0;MQRankSum=-7.845;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.940;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,49:124:99:810,0,1590 chrVI 199576 . A C 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.01;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3139,348,0 chrVI 199586 . G C 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.051;DP=117;Dels=0.00;FS=1.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-6.373;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.081;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,45:117:99:837,0,1434 chrVI 199742 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.242;DP=124;Dels=0.00;FS=5.538;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.160;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1060,0,1353 chrVI 199767 . G A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.366;DP=112;Dels=0.00;FS=13.709;HaplotypeScore=2.8754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1328,0,989 chrVI 199771 . A C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.883;DP=114;Dels=0.00;FS=9.464;HaplotypeScore=2.8435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.499;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1260,0,1071 chrVI 199793 . C T 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.102;DP=120;Dels=0.00;FS=7.020;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.531;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1464,0,982 chrVI 199828 . G C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.618;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1302,0,1537 chrVI 199872 . A C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.750;DP=108;Dels=0.00;FS=1.667;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.324;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1001,0,1163 chrVI 199933 . G A 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.168;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.467;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1300,0,1149 chrVI 199969 . A G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3177,324,0 chrVI 200563 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.753;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1182,0,1155 chrVI 200644 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.457;DP=122;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=3.5590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1290,0,1214 chrVI 204006 . G C 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3319,348,0 chrVI 204894 . G T 2003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=152.7083;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.73;MQ0=0;QD=24.13;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2036,207,0 chrVI 205069 . A G 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=4.16;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:52,6,0 chrVI 205102 . A G 72.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=14.50;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:105,12,0 chrVI 205105 . G C 77.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=15.50;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:110,12,0 chrVI 205121 . C T 75.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=15.10;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:108,12,0 chrVI 205133 . A C 75.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=15.10;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:108,12,0 chrVI 205939 . C T 234 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=38.6896;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;QD=5.71;SB=-2.902e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:30:267,30,0 chrVI 205988 . T C 1702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.61;MQ0=0;QD=20.76;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1735,177,0 chrVI 206167 . G T 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:4081,394,0 chrVI 206215 . C T 3843.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=24.63;SB=-2.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3843,393,0 chrVI 206355 . T C 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3138,330,0 chrVI 206445 . G C 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3033,321,0 chrVI 206552 . G A 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3875,420,0 chrVI 206614 . C T 3019 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3052,312,0 chrVI 206615 . C T 3113 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.19;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3146,327,0 chrVI 206619 . G A 3096 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.29;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3129,324,0 chrVI 206706 . C T 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2850,303,0 chrVI 206741 . T A 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3672,378,0 chrVI 206918 . A G 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.19;MQ0=0;QD=26.19;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3745,396,0 chrVI 206984 . A G 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3357,345,0 chrVI 207041 . C T 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.31;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3499,372,0 chrVI 207125 . A G 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3361,351,0 chrVI 207192 . G A 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3569,369,0 chrVI 207279 . G A 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3730,366,0 chrVI 207335 . A G 3938.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.916;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:3938,420,0 chrVI 207357 . G C 4014.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4014,432,0 chrVI 207374 . G C 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3584,396,0 chrVI 207604 . C G 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.37;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3460,366,0 chrVI 207607 . C T 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3679,370,0 chrVI 207679 . A C 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0580;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.57;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3749,411,0 chrVI 207696 . G A 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4007,412,0 chrVI 207700 . G A 3806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3806,399,0 chrVI 207745 . C G 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.53;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3518,387,0 chrVI 207856 . A G 2506 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.18;MQ0=0;QD=19.58;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2539,279,0 chrVI 207862 . G A 2679 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.35;MQ0=0;QD=20.45;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2712,285,0 chrVI 207865 . T C 2611 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.49;MQ0=0;QD=20.08;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:2644,288,0 chrVI 208024 . T A 4104.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4104,418,0 chrVI 208153 . A G 2299 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=24.72;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2332,249,0 chrVI 208165 . T C 2254 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=24.77;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2287,252,0 chrVI 208668 . T C 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3181,333,0 chrVI 210967 . C G 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3731,393,0 chrVI 211652 . T C 4099.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.15;SB=-2.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4099,441,0 chrVI 211683 . T A 4163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5343;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4163,456,0 chrVI 211826 . T C 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2859,306,0 chrVI 212077 . T C 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3952,420,0 chrVI 212121 . C T 4623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4623,495,0 chrVI 212615 . G A 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3851,402,0 chrVI 212818 . T C 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3412,366,0 chrVI 213465 . C T 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3460,363,0 chrVI 213825 . G A 4246.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4246,433,0 chrVI 214157 . G A 4080.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:4080,429,0 chrVI 219079 . G A 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3431,351,0 chrVI 220148 . C T 1854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.648;DP=157;Dels=0.00;FS=5.821;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.825;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1884,0,1404 chrVI 220410 . T A 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.509;DP=158;Dels=0.00;FS=5.719;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.150;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1600,0,1555 chrVI 221115 . C T 1939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.226;DP=197;Dels=0.00;FS=8.597;HaplotypeScore=4.3458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,98:197:99:1969,0,1957 chrVI 221528 . C G 3898.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.74;MQ0=0;QD=20.96;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:3898,414,0 chrVI 221957 . G A 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.262;DP=101;Dels=0.00;FS=21.173;HaplotypeScore=3.0313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.938;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:101:99:1070,0,815 chrVI 222020 . C A 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.236;DP=123;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1183,0,1301 chrVI 222306 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.564;DP=158;Dels=0.00;FS=1.998;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.255;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:1370,0,1903 chrVI 222359 . T G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=150;Dels=0.00;FS=4.916;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.403;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.275;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:1057,0,1862 chrVI 222369 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.229;DP=143;Dels=0.00;FS=6.400;HaplotypeScore=2.8082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=2;MQRankSum=-4.954;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.874;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:143:99:972,0,1724 chrVI 222373 . C G 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.802;DP=137;Dels=0.00;FS=4.202;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQ0=2;MQRankSum=-4.205;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.771;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:813,0,1705 chrVI 222381 . G A 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.991;DP=133;Dels=0.00;FS=5.433;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.46;MQ0=2;MQRankSum=-4.298;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.328;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:929,0,1574 chrVI 222408 . G T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.326;DP=156;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=2;MQRankSum=-3.492;QD=7.56;ReadPosRankSum=-3.022;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1210,0,1606 chrVI 222435 . A G 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.289;DP=150;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.50;MQ0=2;MQRankSum=-3.511;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.076;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1214,0,1647 chrVI 222453 . C A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.292;DP=147;Dels=0.01;FS=2.982;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQ0=2;MQRankSum=-1.882;QD=8.31;ReadPosRankSum=3.727;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1251,0,1565 chrVI 222456 . C T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.248;DP=148;Dels=0.00;FS=4.859;HaplotypeScore=3.6394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=8.07;ReadPosRankSum=3.335;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1225,0,1603 chrVI 222477 . T C 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.623;DP=150;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1563,0,1540 chrVI 222531 . G A 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.789;DP=159;Dels=0.00;FS=2.005;HaplotypeScore=9.2962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.704;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,68:159:99:1279,0,1835 chrVI 222612 . T A 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;DP=141;Dels=0.00;FS=5.027;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.732;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1424,0,1456 chrVI 222858 . T C 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.442;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1423,0,1370 chrVI 223266 . T G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.553;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.460;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1618,0,1517 chrVI 223290 . T A 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.832;DP=148;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.346;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1763,0,1383 chrVI 223527 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.130;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.892;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1339,0,1586 chrVI 223531 . C T 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.123;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1661,0,1157 chrVI 223558 . T G 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.728;DP=143;Dels=0.00;FS=2.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.168;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1522,0,1354 chrVI 223620 . C T 1822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.273;DP=165;Dels=0.00;FS=7.875;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.257;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,89:165:99:1852,0,1464 chrVI 224029 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.109;DP=182;Dels=0.00;FS=1.637;HaplotypeScore=3.6820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=5.80;ReadPosRankSum=2.009;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,91:182:99:1085,0,1055 chrVI 224053 . A G 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.179;DP=204;Dels=0.00;FS=2.489;HaplotypeScore=4.7458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,112:204:99:1699,0,1394 chrVI 224143 . T C 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.309;DP=150;Dels=0.00;FS=6.099;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1579,0,1541 chrVI 224612 . T C 617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.550;DP=126;Dels=0.00;FS=6.687;HaplotypeScore=5.7568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:647,0,1399 chrVI 224816 . T A 2486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.586;DP=219;Dels=0.00;FS=4.014;HaplotypeScore=4.7604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=2;MQRankSum=-0.096;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.564;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,117:219:99:2516,0,2003 chrVI 224876 . A G 1816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;DP=197;Dels=0.00;FS=3.235;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=9.22;ReadPosRankSum=2.288;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,92:197:99:1846,0,2222 chrVI 225030 . A C 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3950,420,0 chrVI 225259 . A C 2069.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.919;DP=180;Dels=0.00;FS=1.176;HaplotypeScore=2.5577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,102:180:99:2099,0,1567 chrVI 225262 . G T 1412.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.718;DP=179;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.792;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,76:179:99:1442,0,2088 chrVI 225264 . C G 2031.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.052;DP=195;Dels=0.00;FS=2.497;HaplotypeScore=2.7971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,111:195:99:2061,0,1588 chrVI 225321 . C T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;DP=157;Dels=0.00;FS=4.925;HaplotypeScore=1.9367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1459,0,1691 chrVI 225483 . C T 1853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.314;DP=175;Dels=0.00;FS=5.447;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.551;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,89:175:99:1883,0,1746 chrVI 225572 . C A 2006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.347;DP=201;Dels=0.00;FS=0.518;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=2;MQRankSum=0.986;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,98:201:99:2036,0,1911 chrVI 225578 . A G 1884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.173;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=2;MQRankSum=0.862;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.179;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,95:196:99:1914,0,2020 chrVI 225749 . G A 1931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.674;DP=200;Dels=0.00;FS=4.268;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.106;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.063;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,99:200:99:1961,0,2016 chrVI 225853 . G T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.747;DP=158;Dels=0.00;FS=2.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.277;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1500,0,1551 chrVI 225968 . C G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.245;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.733;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,76:170:99:1397,0,1993 chrVI 226017 . G A 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.021;DP=179;Dels=0.00;FS=5.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.904;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.259;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,79:179:99:1607,0,2017 chrVI 226022 . A G 1981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.783;DP=189;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.823;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,105:189:99:2011,0,1758 chrVI 226036 . G C 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.982;DP=197;Dels=0.00;FS=0.528;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.639;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,84:197:99:1626,0,2332 chrVI 226167 . C G 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.381;DP=196;Dels=0.00;FS=8.118;HaplotypeScore=3.7620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=3.285;QD=4.08;ReadPosRankSum=-2.152;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,105:196:99:830,0,291 chrVI 226175 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.400;DP=201;Dels=0.00;FS=7.861;HaplotypeScore=3.6367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,108:201:99:888,0,469 chrVI 226226 . G T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.021;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1650,0,1675 chrVI 226274 . G A 2190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.513;DP=215;Dels=0.00;FS=1.070;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.056;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,109:215:99:2220,0,1993 chrVI 226361 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.212;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=1;MQRankSum=0.275;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,71:165:99:1406,0,1938 chrVI 226370 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.798;DP=161;Dels=0.00;FS=1.233;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=1;MQRankSum=0.014;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.408;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,71:161:99:1212,0,1964 chrVI 226390 . T C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.098;DP=157;Dels=0.00;FS=7.183;HaplotypeScore=2.5009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=1;MQRankSum=-0.604;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,67:157:99:1179,0,1783 chrVI 226463 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.606;DP=141;Dels=0.00;FS=3.100;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=0.188;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1439,0,1452 chrVI 226529 . A G 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.687;DP=180;Dels=0.00;FS=1.176;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=-0.091;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,84:180:99:1703,0,2106 chrVI 226592 . T C 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.026;DP=144;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1584,0,1425 chrVI 226794 . G A 914.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;DP=121;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=5.9447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:121:99:944,0,1353 chrVI 226796 . A G 1229.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.84;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1259,0,1714 chrVI 226800 . C G 1617.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=2.996;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.272;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1647,0,1492 chrVI 226804 . C A 4120.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.15;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4120,420,0 chrVI 226902 . G A 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.317;DP=188;Dels=0.00;FS=2.591;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,87:188:99:1728,0,1948 chrVI 226930 . A G 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-8.452;DP=211;Dels=0.00;FS=3.210;HaplotypeScore=102.3849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.936;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:101,110:211:99:2578,169,0 chrVI 227025 . T C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.027;DP=159;Dels=0.00;FS=2.021;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.718;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.384;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1497,0,1644 chrVI 227154 . C T 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.365;DP=161;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=3.5684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.695;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1658,0,1598 chrVI 227223 . G T 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.952;DP=158;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=10.56;ReadPosRankSum=-2.904;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1699,0,1418 chrVI 227357 . C T 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.567;DP=141;Dels=0.00;FS=4.143;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1541,0,1195 chrVI 227503 . A T 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.717;DP=155;Dels=0.03;FS=309.647;HaplotypeScore=42.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.177;QD=4.01;ReadPosRankSum=-6.168;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:651,0,335 chrVI 227505 . A T 222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.796;DP=155;Dels=0.02;FS=194.152;HaplotypeScore=42.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-6.239;QD=1.43;ReadPosRankSum=-5.966;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,58:152:99:252,0,369 chrVI 227640 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.208;DP=132;Dels=0.00;FS=6.579;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=1;MQRankSum=-1.308;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.791;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1226,0,1207 chrVI 227693 . G A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.516;DP=148;Dels=0.00;FS=2.905;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=1;MQRankSum=-1.698;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.962;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1579,0,1290 chrVI 228093 . C T 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.988;DP=190;Dels=0.00;FS=1.126;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,91:190:99:1758,0,1897 chrVI 228170 . G A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.848;DP=150;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=7.5251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.959;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1553,0,1478 chrVI 228332 . A G 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1564,0,1474 chrVI 228344 . G A 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.603;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.367;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1768,0,1626 chrVI 228509 . A G 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.457;DP=144;Dels=0.00;FS=11.905;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1603,0,1213 chrVI 228515 . A G 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.799;DP=140;Dels=0.00;FS=12.314;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1623,0,1240 chrVI 228554 . T C 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.019;DP=151;Dels=0.00;FS=17.566;HaplotypeScore=4.5836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.197;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1594,0,1466 chrVI 228605 . C T 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.029;DP=161;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=2.1557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.420;QD=9.89;ReadPosRankSum=-2.731;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1622,0,1558 chrVI 228617 . A G 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.499;DP=171;Dels=0.00;FS=5.491;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.627;QD=9.74;ReadPosRankSum=-3.777;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,85:171:99:1696,0,1736 chrVI 228620 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.613;DP=152;Dels=0.00;FS=16.370;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.976;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:1424,0,1645 chrVI 229320 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.019;DP=138;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=9.71;ReadPosRankSum=-2.271;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1370,0,1275 chrVI 229337 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.249;DP=136;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.378;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1330,0,1411 chrVI 229348 . C A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.227;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.363;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1205,0,1513 chrVI 229349 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.765;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.304;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:149:99:1198,0,1575 chrVI 229413 . G A 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.861;DP=166;Dels=0.00;FS=5.510;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.122;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,79:166:99:1651,0,1712 chrVI 229520 . A G 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.899;DP=156;Dels=0.00;FS=14.605;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1660,0,1407 chrVI 229526 . A G 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.563;DP=155;Dels=0.00;FS=11.581;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.765;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.021;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,84:155:99:1573,0,1388 chrVI 229568 . C T 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.855;DP=140;Dels=0.00;FS=3.234;HaplotypeScore=6.7812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:140:99:1598,0,1200 chrVI 229586 . C G 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;DP=158;Dels=0.00;FS=1.251;HaplotypeScore=5.3124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.398;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:158:99:1689,0,1452 chrVI 229757 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.173;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.504;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1440,0,1635 chrVI 229802 . G A 2000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.645;DP=187;Dels=0.00;FS=1.852;HaplotypeScore=5.2584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.431;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,98:187:99:2030,0,1732 chrVI 229838 . T A 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;DP=160;Dels=0.00;FS=2.000;HaplotypeScore=2.8999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.265;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1839,0,1608 chrVI 229887 . G A 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.384;DP=163;Dels=0.00;FS=4.572;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.344;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,80:163:99:1687,0,1723 chrVI 229951 . A G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.253;DP=139;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=3.6485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.487;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1253,0,1308 chrVI 230129 . T C 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.004;DP=160;Dels=0.00;FS=3.301;HaplotypeScore=5.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=2;MQRankSum=-0.143;QD=9.19;ReadPosRankSum=2.591;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,75:160:99:1501,0,1738 chrVI 230195 . T C 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.633;DP=146;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=1;MQRankSum=-0.270;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1279,0,1535 chrVI 230462 . C T 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.398;DP=141;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1670,0,1211 chrVI 230627 . C T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.489;DP=96;Dels=0.00;FS=2.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:895,0,1053 chrVI 230891 . G A 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.295;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.999;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1354,0,1421 chrVI 230918 . C T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.336;DP=148;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=3.5372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1412,0,1510 chrVI 230993 . A G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.947;DP=125;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1154,0,1343 chrVI 231001 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.935;DP=142;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.127;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1265,0,1651 chrVI 231077 . G A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;DP=121;Dels=0.00;FS=12.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.014;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1462,0,1101 chrVI 231098 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=115;Dels=0.00;FS=11.360;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1371,0,1063 chrVI 231278 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.431;DP=121;Dels=0.00;FS=1.475;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1193,0,1276 chrVI 231344 . T C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.725;DP=159;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1619,0,1560 chrVI 231638 . G A 1889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.981;DP=195;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=9.69;ReadPosRankSum=-2.455;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,93:195:99:1919,0,2049 chrVI 231713 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.310;DP=132;Dels=0.00;FS=14.027;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.325;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:132:99:1046,0,1722 chrVI 231775 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.161;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.412;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1190,0,1757 chrVI 231902 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;DP=159;Dels=0.00;FS=7.011;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.518;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,67:159:99:1312,0,1930 chrVI 232279 . A T 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.796;DP=146;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.945;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1575,0,1456 chrVI 232619 . G A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.142;DP=120;Dels=0.00;FS=7.077;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.556;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1222,0,1232 chrVI 232697 . T C 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1594,0,1359 chrVI 233077 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.163;DP=138;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.747;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1265,0,1309 chrVI 233456 . C T 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.859;DP=93;Dels=0.00;FS=3.882;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.497;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:890,0,995 chrVI 233790 . C G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1289,0,1380 chrVI 233830 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.734;DP=136;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=3.7579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=10.02;ReadPosRankSum=-4.736;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1393,0,1398 chrVI 234038 . G T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;DP=113;Dels=0.00;FS=1.584;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.666;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1094,0,1025 chrVI 234085 . G C 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.675;DP=122;Dels=0.00;FS=3.460;HaplotypeScore=4.4191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=24.87;ReadPosRankSum=1.533;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3067,315,0 chrVI 234160 . G A 2237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.32;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2270,249,0 chrVI 234233 . A G 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2491,270,0 chrVI 234355 . A G 3768.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=24.15;SB=-2.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3768,390,0 chrVI 234388 . A G 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3685,390,0 chrVI 234585 . A G 1372.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.936;DP=128;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.393;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,74:128:99:1402,0,1156 chrVI 234589 . T A 2952 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.81;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2985,315,0 chrVI 234593 . T C 3010 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.38;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3043,330,0 chrVI 234612 . G A 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.225;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=2.921;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.253;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1027,0,1173 chrVI 234694 . A G 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3137,321,0 chrVI 234833 . A G 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.157;DP=105;Dels=0.00;FS=0.789;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.730;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,38:105:99:714,0,1460 chrVI 234904 . A G 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3038,339,0 chrVI 234914 . G A 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3233,345,0 chrVI 235072 . T C 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2910,306,0 chrVI 235110 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.948;DP=126;Dels=0.01;FS=1.431;HaplotypeScore=3.9162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=10.67;ReadPosRankSum=2.331;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1375,0,1224 chrVI 235321 . A G 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3441,366,0 chrVI 235342 . A G 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2997,330,0 chrVI 235446 . G A 2213 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2246,231,0 chrVI 235489 . C T 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2672,276,0 chrVI 236008 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.966;DP=130;Dels=0.00;FS=5.259;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1349,0,1328 chrVI 236083 . G A 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.488;DP=104;Dels=0.00;FS=1.589;HaplotypeScore=3.6394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.157;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:937,0,1213 chrVI 236173 . C T 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.593;DP=119;Dels=0.00;FS=5.722;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.797;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1075,0,1330 chrVI 236248 . C G 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.903;DP=115;Dels=0.00;FS=12.505;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.387;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,45:115:99:838,0,1396 chrVI 236260 . G T 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.882;DP=122;Dels=0.00;FS=17.877;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.071;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,49:122:99:941,0,1475 chrVI 236462 . A T 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=86;Dels=0.00;FS=1.722;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.214;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:956,0,904 chrVI 236578 . G A 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.529;DP=95;Dels=0.00;FS=5.220;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.358;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:817,0,1172 chrVI 237463 . T A 2086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.41;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2119,213,0 chrVI 237962 . G A 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2928,297,0 chrVI 237965 . G A 2505 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2538,264,0 chrVI 238213 . C A 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2703,282,0 chrVI 238465 . G T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.581;DP=113;Dels=0.00;FS=7.257;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.353;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1145,0,1202 chrVI 238621 . A G 2623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2656,291,0 chrVI 238704 . C T 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2858,294,0 chrVI 238707 . A G 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2842,303,0 chrVI 238769 . C G 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2706,297,0 chrVI 238784 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.915;DP=116;Dels=0.00;FS=20.457;HaplotypeScore=3.7379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1312,0,1042 chrVI 238831 . G T 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.281;DP=113;Dels=0.00;FS=4.583;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.461;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:924,0,1366 chrVI 238877 . A C 2583 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=25.32;ReadPosRankSum=0.102;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2616,282,0 chrVI 238901 . A G 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=23.86;ReadPosRankSum=-1.214;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2586,275,0 chrVI 239066 . C T 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3217,324,0 chrVI 239277 . T A 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2895,294,0 chrVI 239360 . A G 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3461,375,0 chrVI 239478 . G A 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3045,321,0 chrVI 239489 . A G 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2812,306,0 chrVI 239639 . C G 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3674,408,0 chrVI 239766 . A G 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2802,288,0 chrVI 239793 . A G 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.194;DP=114;Dels=0.00;FS=2.445;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.984;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1359,0,924 chrVI 239828 . G T 2330 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2363,249,0 chrVI 239854 . T C 2514 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2547,276,0 chrVI 239986 . G A 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2736,288,0 chrVI 240002 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.771;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.822;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.335;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1170,0,1056 chrVI 240289 . C T 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.415;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3131,306,0 chrVI 240352 . G C 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.61;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2645,273,0 chrVI 240610 . T C 2873 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2906,312,0 chrVI 240613 . G A 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=111;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=25.93;ReadPosRankSum=0.140;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2911,291,0 chrVI 241183 . C T 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2663,282,0 chrVI 241694 . T C 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3060,333,0 chrVI 241696 . A G 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3079,339,0 chrVI 241803 . C T 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;DP=110;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=25.86;ReadPosRankSum=1.291;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2878,291,0 chrVI 241821 . G A 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2668,276,0 chrVI 241871 . G T 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2940,303,0 chrVI 241949 . T C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3318,351,0 chrVI 241984 . G C 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6176;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:2750,300,0 chrVI 242528 . G T 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.124;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=2.457;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.036;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:932,0,1141 chrVI 242595 . C G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=1;MQRankSum=0.455;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.255;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1033,0,1500 chrVI 242717 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.209;DP=144;Dels=0.00;FS=2.118;HaplotypeScore=2.7130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.032;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:144:99:1535,0,1310 chrVI 242750 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.505;DP=151;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=4.7278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.466;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1423,0,1612 chrVI 242843 . C G 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3133,324,0 chrVI 242888 . A G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.952;DP=139;Dels=0.00;FS=2.212;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.140;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1323,0,1492 chrVI 243163 . T C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.257;DP=135;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1350,0,1305 chrVI 243927 . G A 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=11.82;ReadPosRankSum=2.248;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:147:99:1768,0,1238 chrVI 244123 . T C 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.207;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1420,0,1503 chrVI 244183 . A G 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.461;DP=123;Dels=0.00;FS=7.129;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.449;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:964,0,1601 chrVI 244267 . G C 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.312;DP=117;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,71:117:99:1505,0,838 chrVI 244268 . C A 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;DP=117;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,71:117:99:1463,0,896 chrVI 244420 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.581;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=9.60;ReadPosRankSum=2.165;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1431,0,1487 chrVI 244444 . A T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;DP=159;Dels=0.00;FS=2.782;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=2.031;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:159:99:1634,0,1530 chrVI 244843 . G A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.142;DP=140;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1422,0,1368 chrVI 245376 . C T 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.327;DP=113;Dels=0.00;FS=7.402;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.396;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.722;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:961,0,1420 chrVI 245396 . T C 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.535;DP=122;Dels=0.00;FS=12.295;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.47;MQ0=0;MQRankSum=-4.178;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.016;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:976,0,1586 chrVI 245404 . G A 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.662;DP=109;Dels=0.00;FS=11.452;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.06;MQ0=0;MQRankSum=-5.534;QD=8.15;ReadPosRankSum=-2.214;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:918,0,1284 chrVI 245419 . C T 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;DP=104;Dels=0.00;FS=5.107;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.45;MQ0=0;MQRankSum=-6.574;QD=7.16;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:775,0,1343 chrVI 245429 . T C 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.959;DP=105;Dels=0.00;FS=2.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.76;MQ0=0;MQRankSum=-5.164;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:761,0,1384 chrVI 245438 . T C 633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;DP=96;Dels=0.00;FS=2.688;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=-3.282;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.127;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:663,0,1288 chrVI 245484 . T G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.738;DP=111;Dels=0.00;FS=4.835;HaplotypeScore=4.7569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.288;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1133,0,1106 chrVI 245505 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.820;DP=139;Dels=0.00;FS=1.341;HaplotypeScore=3.5705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.007;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1502,0,1302 chrVI 245636 . G A 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;DP=146;Dels=0.00;FS=2.050;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.926;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1490,0,1409 chrVI 245661 . G A 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3812,393,0 chrVI 245864 . C T 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.888;DP=134;Dels=0.00;FS=12.663;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1604,0,1216 chrVI 245878 . A G 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.445;DP=126;Dels=0.00;FS=8.238;HaplotypeScore=4.4636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.283;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1214,0,1440 chrVI 245900 . T C 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.115;DP=113;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1017,0,1350 chrVI 245910 . G A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.798;DP=122;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.855;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1180,0,1334 chrVI 245962 . T A 736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;DP=98;Dels=0.01;FS=13.411;HaplotypeScore=33.7355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.592;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:97:99:766,0,206 chrVI 246034 . A T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.094;DP=111;Dels=0.00;FS=8.711;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1116,0,1114 chrVI 246259 . A C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.588;DP=118;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1342,0,938 chrVI 246293 . G A 1147.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.051;DP=110;Dels=0.00;FS=4.692;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.615;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.106;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1177,0,902 chrVI 246299 . G A 1111.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.257;DP=105;Dels=0.00;FS=4.852;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.295;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.706;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1141,0,910 chrVI 246301 . T C 1074.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;DP=101;Dels=0.00;FS=2.591;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.640;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,60:101:99:1104,0,830 chrVI 246533 . C T 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.372;DP=114;Dels=0.00;FS=3.472;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:901,0,1416 chrVI 246625 . G A 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.402;DP=99;Dels=0.00;FS=8.414;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:777,0,1179 chrVI 246893 . A G 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3260,339,0 chrVI 247017 . G A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.788;DP=136;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=2.7620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.802;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1582,0,1145 chrVI 247084 . T C 792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.325;DP=100;Dels=0.00;FS=5.039;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.629;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:822,0,1213 chrVI 247276 . C A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.420;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.170;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1097,0,1491 chrVI 247441 . T C 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.726;DP=94;Dels=0.00;FS=2.815;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.208;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:907,0,1009 chrVI 247549 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.608;DP=106;Dels=0.00;FS=11.799;HaplotypeScore=3.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.993;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1172,0,920 chrVI 247588 . A G 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.986;DP=135;Dels=0.00;FS=12.439;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1503,0,1234 chrVI 247915 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.261;DP=146;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=4.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.581;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1291,0,1691 chrVI 248151 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.077;DP=129;Dels=0.00;FS=5.450;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.704;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1495,0,1182 chrVI 248195 . G T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.402;DP=127;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=2.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.221;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1134,0,1438 chrVI 248365 . A G 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=23.02;ReadPosRankSum=0.892;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3071,312,0 chrVI 248492 . G A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.809;DP=118;Dels=0.00;FS=4.495;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.937;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.294;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1080,0,1378 chrVI 248756 . G A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.131;DP=136;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.218;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1487,0,1191 chrVI 248790 . C G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;DP=125;Dels=0.00;FS=5.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1262,0,1223 chrVI 248810 . C T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.359;DP=146;Dels=0.00;FS=3.847;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.213;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1503,0,1390 chrVI 248816 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.908;DP=143;Dels=0.00;FS=2.127;HaplotypeScore=3.6018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1474,0,1295 chrVI 248849 . T C 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.687;DP=122;Dels=0.00;FS=9.987;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1409,0,1106 chrVI 248984 . T C 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.772;DP=157;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=4.7518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:1743,0,1493 chrVI 249566 . T C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.318;DP=126;Dels=0.00;FS=29.545;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.889;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1339,0,1301 chrVI 249889 . T G 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.178;DP=152;Dels=0.00;FS=7.026;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.626;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1545,0,1535 chrVI 250075 . T G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;DP=137;Dels=0.00;FS=9.174;HaplotypeScore=3.6069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.142;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:137:99:1366,0,1382 chrVI 250283 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.122;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1317,0,1680 chrVI 250303 . G C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.086;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.799;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:139:99:1209,0,1576 chrVI 250363 . G A 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.270;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.735;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:120:99:1105,0,1379 chrVI 250409 . T G 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.395;DP=145;Dels=0.00;FS=4.962;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.714;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1256,0,1670 chrVI 251006 . C G 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.932;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:973,0,1573 chrVI 251033 . G A 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.476;DP=122;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.046;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:987,0,1343 chrVI 251165 . A G 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.640;DP=139;Dels=0.00;FS=6.853;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.013;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1007,0,1776 chrVI 251816 . T C 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.472;DP=121;Dels=0.00;FS=2.324;HaplotypeScore=2.3391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1505,0,1027 chrVI 252169 . G C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;DP=139;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=4.3494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.038;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1520,0,1200 chrVI 252203 . A G 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.955;DP=144;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.362;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,81:144:99:1512,0,1259 chrVI 252230 . C T 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.291;DP=148;Dels=0.00;FS=5.108;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.235;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1546,0,1362 chrVI 252341 . A T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.864;DP=127;Dels=0.00;FS=3.184;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1165,0,1351 chrVI 252752 . A G 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;DP=103;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:874,0,1195 chrVI 253053 . A G 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.254;DP=108;Dels=0.00;FS=2.496;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.364;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:776,0,1361 chrVI 253095 . C T 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.325;DP=109;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.969;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:924,0,1185 chrVI 253134 . T C 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.183;DP=134;Dels=0.00;FS=7.052;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1454,0,1360 chrVI 253193 . A G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.412;DP=126;Dels=0.00;FS=15.484;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1350,0,1254 chrVI 253476 . G A 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.643;DP=151;Dels=0.00;FS=9.951;HaplotypeScore=3.7484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=4.68;ReadPosRankSum=-2.831;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:151:99:737,0,1743 chrVI 253673 . T G 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2880,318,0 chrVI 253709 . T G 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3121,348,0 chrVI 253758 . G A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.233;DP=131;Dels=0.00;FS=5.324;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.62;ReadPosRankSum=-2.221;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1421,0,1338 chrVI 253927 . G A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.669;DP=134;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1446,0,1350 chrVI 254049 . C G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.307;DP=120;Dels=0.00;FS=3.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1254,0,1181 chrVI 254081 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.575;DP=123;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.079;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1166,0,1410 chrVI 254393 . T G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.776;DP=183;Dels=0.00;FS=5.213;HaplotypeScore=5.4883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.819;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,84:183:99:1252,0,2173 chrVI 254401 . T C 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6935;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.27;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3571,396,0 chrVI 254411 . A G 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.441;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.418;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:1080,0,1814 chrVI 254423 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.461;DP=143;Dels=0.00;FS=2.613;HaplotypeScore=2.8986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,60:143:99:1174,0,1840 chrVI 254453 . T C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.833;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.669;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:1348,0,1806 chrVI 254504 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.777;DP=105;Dels=0.00;FS=6.156;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.035;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:971,0,1092 chrVI 254617 . G A 1876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.256;DP=160;Dels=0.00;FS=4.729;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.418;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,90:160:99:1906,0,1383 chrVI 254764 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.878;DP=147;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.697;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1254,0,1842 chrVI 254774 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.158;DP=153;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1312,0,1904 chrVI 254882 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.101;DP=108;Dels=0.00;FS=12.696;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1172,0,1070 chrVI 254963 . C T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.956;DP=126;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=9.33;ReadPosRankSum=-2.084;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1205,0,1333 chrVI 255149 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.282;DP=136;Dels=0.00;FS=10.226;HaplotypeScore=5.5993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.143;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1428,0,1165 chrVI 255164 . G A 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.459;DP=148;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=4.0032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.429;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,87:148:99:1815,0,1098 chrVI 255242 . C T 2180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.134;DP=186;Dels=0.00;FS=2.555;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.762;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,103:186:99:2210,0,1537 chrVI 255245 . A G 2148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.825;DP=186;Dels=0.00;FS=1.146;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.822;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,103:186:99:2178,0,1705 chrVI 255548 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.679;DP=145;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=2.5655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=1;MQRankSum=-0.960;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.660;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1511,0,1381 chrVI 255999 . A G 2181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.36;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2214,240,0 chrVI 257096 . T C 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.66;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3009,330,0 chrVI 258487 . T A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.700;DP=119;Dels=0.00;FS=5.708;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.326;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1069,0,1457 chrVI 258551 . C A 2242 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2275,246,0 chrVI 259014 . A G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.173;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.901;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.609;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:940,0,1347 chrVI 259217 . A G 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.328;DP=104;Dels=0.00;FS=5.344;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.403;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1045,0,1108 chrVI 259358 . G A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.375;DP=117;Dels=0.00;FS=11.186;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.423;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.746;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1067,0,1140 chrVI 259655 . C T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.599;DP=124;Dels=0.01;FS=2.445;HaplotypeScore=12.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.672;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1285,0,1285 chrVI 259914 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.607;DP=102;Dels=0.00;FS=1.686;HaplotypeScore=3.1977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=11.97;ReadPosRankSum=1.396;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1251,0,799 chrVI 259953 . T A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;DP=107;Dels=0.00;FS=3.917;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.27;ReadPosRankSum=-2.014;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1236,0,950 chrVI 261100 . C T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.762;DP=104;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.046;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1059,0,1029 chrVI 262022 . T C 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2536,264,0 chrVI 262451 . T C 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3370,360,0 chrVI 263080 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.464;DP=126;Dels=0.00;FS=2.328;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=0.200;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.336;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1232,0,1300 chrVI 264371 . C G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.108;DP=125;Dels=0.00;FS=6.831;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1218,0,1151 chrVI 265114 . G A 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.083;DP=127;Dels=0.00;FS=3.305;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,48:127:99:898,0,1689 chrVI 265273 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.742;DP=136;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=7.4774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.025;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1268,0,1464 chrVI 265935 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.119;DP=136;Dels=0.00;FS=3.914;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.691;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1634,0,1216 chrVI 266145 . T C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.434;DP=105;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=4.7268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=8.90;ReadPosRankSum=2.139;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:105:99:964,0,1138 chrVI 266251 . G A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.076;DP=111;Dels=0.00;FS=6.887;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.725;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:111:99:1428,0,935 chrVI 266451 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.677;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1407,0,1313 chrVI 267162 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.247;DP=128;Dels=0.00;FS=7.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=1.459;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1535,0,1072 chrVI 267901 . A G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.041;DP=137;Dels=0.00;FS=2.215;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.031;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,78:137:99:1509,0,1115 chrVI 268516 . C T 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2719,285,0 chrVI 268851 . G T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1258,0,893 chrVI 268853 . T C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.801;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.127;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:108:99:1206,0,912 chrVI 268894 . T A 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.963;DP=100;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=5.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.204;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1008,0,946 chrVI 269031 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.963;DP=117;Dels=0.00;FS=3.378;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1305,0,1089 chrVI 269289 . A G 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.832;DP=127;Dels=0.00;FS=2.300;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1450,0,1090 chrVI 269633 . A G 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.20;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2780,291,0 chrVI 269754 . T A 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2863,297,0 chrVI 269961 . C G 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.915;DP=85;Dels=0.00;FS=11.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.710;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,35:85:99:699,0,1040 chrVI 270091 . C T 484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.510;DP=71;Dels=0.00;FS=3.451;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.75;MQ0=0;MQRankSum=-5.269;QD=6.82;ReadPosRankSum=-5.524;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:514,0,713 chrVII 188 . C T 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=1;QD=8.26;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:56,6,0 chrVII 192 . T C 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=1;QD=7.93;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:55,6,0 chrVII 209 . C T 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=1;QD=8.92;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:58,6,0 chrVII 213 . T A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=1;QD=8.26;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:56,6,0 chrVII 395 . T A 45.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.75;MQ0=1;QD=3.06;SB=-9.813e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:9:78,9,0 chrVII 401 . C A 273 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=1;QD=11.87;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:33:306,33,0 chrVII 402 . G T 273.41 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=25;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.79;MQ0=1;MQRankSum=-1.300;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.867;SB=-1.244e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:13:306,13,0 chrVII 461 . C T 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.985;DP=58;Dels=0.00;FS=10.796;HaplotypeScore=19.1796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.36;MQ0=1;MQRankSum=2.683;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.109;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,38:58:99:820,0,159 chrVII 466 . A C 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.721;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.90;MQ0=1;MQRankSum=-0.426;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,45:56:99:854,0,139 chrVII 508 . C T 967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.49;MQ0=0;QD=19.73;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:96:1000,96,0 chrVII 520 . T G 1012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.75;MQ0=0;QD=19.84;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1045,111,0 chrVII 542 . C T 310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.898;DP=61;Dels=0.00;FS=86.166;HaplotypeScore=15.4937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.87;MQ0=0;MQRankSum=2.621;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.083;SB=-9.102e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:340,0,295 chrVII 559 . T C 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.083;DP=52;Dels=0.00;FS=2.382;HaplotypeScore=10.7316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.30;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=0.50;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,7:52:56:56,0,547 chrVII 564 . A G 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.202;DP=51;Dels=0.00;FS=2.375;HaplotypeScore=14.6886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=0.37;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,7:51:49:49,0,515 chrVII 575 . C G 496.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;DP=47;Dels=0.00;FS=22.393;HaplotypeScore=4.9305;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.71;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.284;SB=-6.591e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,40:47:9:529,9,0 chrVII 595 . T C 563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.08;MQ0=0;QD=12.51;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:66:596,66,0 chrVII 603 . T C 564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9293;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.28;MQ0=0;QD=13.43;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:66:597,66,0 chrVII 622 . T C 287.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.908;DP=46;Dels=0.00;FS=19.465;HaplotypeScore=14.7704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=6.24;ReadPosRankSum=-2.249;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:317,0,288 chrVII 623 . T C 288.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.642;DP=46;Dels=0.00;FS=19.465;HaplotypeScore=12.7872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.762;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.895;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:318,0,271 chrVII 626 . A G 179.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;DP=49;Dels=0.00;FS=5.147;HaplotypeScore=9.1941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.15;MQ0=0;MQRankSum=2.636;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.597;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:209,0,416 chrVII 630 . C A 288.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.697;DP=49;Dels=0.00;FS=19.718;HaplotypeScore=9.1941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.515;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:318,0,329 chrVII 641 . G A 658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.79;MQ0=0;QD=18.28;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:78:691,78,0 chrVII 663 . G A 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.989;DP=56;Dels=0.00;FS=23.220;HaplotypeScore=10.7394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.32;MQ0=0;MQRankSum=2.056;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.273;SB=-3.018e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,49:56:31:853,0,31 chrVII 673 . T A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.780;DP=107;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=11.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.29;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=14.72;ReadPosRankSum=2.045;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,85:107:41:1605,0,41 chrVII 680 . T C 2151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.12;MQ0=0;QD=19.73;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2184,240,0 chrVII 699 . T C 2076.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.542;DP=151;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=8.7627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.82;MQ0=0;MQRankSum=2.870;QD=13.75;ReadPosRankSum=2.105;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,114:151:99:2106,0,319 chrVII 700 . C T 164.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.223;DP=148;Dels=0.00;FS=8.878;HaplotypeScore=15.6138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=1.11;ReadPosRankSum=-1.785;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,28:148:99:194,0,2251 chrVII 702 . A G 207.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.292;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.6138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=1.35;ReadPosRankSum=-2.156;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,32:153:99:237,0,2415 chrVII 706 . T A 220.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.014;DP=160;Dels=0.00;FS=8.215;HaplotypeScore=15.6138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=1.38;ReadPosRankSum=-2.604;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,38:160:99:250,0,2414 chrVII 709 . A C 217.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.929;DP=169;Dels=0.00;FS=12.347;HaplotypeScore=16.6054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=1.28;ReadPosRankSum=-2.279;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,42:169:99:247,0,2420 chrVII 710 . G A 2876 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.953;DP=170;Dels=0.00;FS=7.024;HaplotypeScore=12.6521;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.02;MQ0=0;MQRankSum=2.314;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.816;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,163:170:99:2909,177,0 chrVII 723 . T C 216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.826;DP=160;Dels=0.00;FS=8.190;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.47;MQ0=0;MQRankSum=-3.322;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.771;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,43:160:99:246,0,2286 chrVII 932 . G C 160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.542;DP=138;Dels=0.00;FS=13.248;HaplotypeScore=14.7383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-6.923;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.724;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,33:138:99:190,0,2316 chrVII 954 . A G 157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.823;DP=162;Dels=0.00;FS=21.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.77;MQ0=0;MQRankSum=-7.434;QD=0.97;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-7.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,43:162:99:187,0,2841 chrVII 978 . A G 627.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.083;DP=174;Dels=0.00;FS=20.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.57;MQ0=0;MQRankSum=-9.013;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,59:174:99:657,0,2728 chrVII 987 . A T 2626.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.883;DP=174;Dels=0.00;FS=26.970;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.31;MQ0=0;MQRankSum=9.024;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.796;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,111:173:99:2656,0,746 chrVII 988 . G T 745.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.008;DP=177;Dels=0.00;FS=31.868;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.49;MQ0=0;MQRankSum=-9.249;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,60:177:99:775,0,2602 chrVII 1011 . A G 475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.545;DP=200;Dels=0.00;FS=37.646;HaplotypeScore=14.7631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.89;MQ0=0;MQRankSum=-7.048;QD=2.38;ReadPosRankSum=2.610;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,55:200:99:505,0,3350 chrVII 1025 . A G 588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.146;DP=184;Dels=0.00;FS=26.489;HaplotypeScore=3.8368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQ0=0;MQRankSum=-7.407;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,66:184:99:618,0,2706 chrVII 1046 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.526;DP=205;Dels=0.00;FS=5.035;HaplotypeScore=8.2836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.90;MQ0=0;MQRankSum=-7.547;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,84:205:99:1141,0,2641 chrVII 1070 . A T 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;DP=236;Dels=0.00;FS=5.336;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.49;MQ0=0;MQRankSum=-5.202;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.344;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,102:236:99:1815,0,2834 chrVII 1080 . C T 1872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.646;DP=239;Dels=0.00;FS=9.223;HaplotypeScore=5.5902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.94;MQ0=0;MQRankSum=-5.040;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.311;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,104:239:99:1902,0,2647 chrVII 1104 . T C 2039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.414;DP=236;Dels=0.00;FS=6.296;HaplotypeScore=12.9130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.876;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.024;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,110:236:99:2069,0,2522 chrVII 1136 . C T 2659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.545;DP=242;Dels=0.00;FS=26.939;HaplotypeScore=3.7585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,128:242:99:2689,0,2099 chrVII 1214 . A G 3138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.831;DP=280;Dels=0.00;FS=0.448;HaplotypeScore=5.3981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,147:280:99:3168,0,2855 chrVII 1217 . G A 2867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.391;DP=277;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=2.991;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.108;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,134:276:99:2897,0,3015 chrVII 1234 . C T 2867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.523;DP=254;Dels=0.00;FS=1.014;HaplotypeScore=3.8171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=2.188;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.571;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,128:254:99:2897,0,2597 chrVII 1354 . T C 4879.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4879,511,0 chrVII 1422 . G C 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.159;DP=200;Dels=0.00;FS=2.462;HaplotypeScore=3.7161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=7.06;ReadPosRankSum=-1.177;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,91:200:99:1442,0,2240 chrVII 1535 . T C 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.495;DP=224;Dels=0.00;FS=4.793;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,107:224:99:1935,0,2649 chrVII 1551 . T C 471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.527;DP=226;Dels=0.00;FS=2.127;HaplotypeScore=48.5840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.185;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,49:226:99:501,0,4178 chrVII 1557 . G T 2112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.264;DP=247;Dels=0.00;FS=3.635;HaplotypeScore=50.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-3.363;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.650;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,113:247:99:2142,0,2959 chrVII 1562 . G C 1962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=244;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.974;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,109:244:99:1992,0,2956 chrVII 1782 . G A 3942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.803;DP=228;Dels=0.00;FS=0.568;HaplotypeScore=4.1445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.429;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,171:228:99:3942,0,811 chrVII 1959 . C T 2826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.997;DP=233;Dels=0.00;FS=15.291;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.766;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,132:233:99:2856,0,1981 chrVII 1999 . G A 3086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.487;DP=231;Dels=0.00;FS=15.164;HaplotypeScore=2.6865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.348;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,139:231:99:3116,0,1826 chrVII 2004 . G A 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.848;DP=216;Dels=0.00;FS=17.523;HaplotypeScore=2.5239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.493;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,85:216:99:1761,0,2805 chrVII 2026 . A G 2771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.687;DP=210;Dels=0.00;FS=11.819;HaplotypeScore=3.8117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.131;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,129:210:99:2801,0,1601 chrVII 2061 . A T 2786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.453;DP=220;Dels=0.00;FS=1.662;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,127:220:99:2816,0,1921 chrVII 2086 . G A 6147.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=236;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=26.05;SB=-2.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,235:236:99:6147,595,0 chrVII 2184 . C G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;DP=146;Dels=0.00;FS=6.110;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.981;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1485,0,1555 chrVII 2188 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.711;DP=148;Dels=0.00;FS=7.136;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.704;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.130;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1602,0,1481 chrVII 2231 . C T 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.999;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.815;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.214;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:1753,0,1639 chrVII 2283 . C A 4106.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7044;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4106,403,0 chrVII 2300 . A G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.056;DP=153;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=4.5029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.607;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1585,0,1662 chrVII 2357 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.480;DP=146;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-7.088;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,63:146:99:1190,0,1913 chrVII 2370 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.849;DP=148;Dels=0.01;FS=1.331;HaplotypeScore=4.9143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-8.384;QD=7.12;ReadPosRankSum=-2.859;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,58:147:99:1084,0,1985 chrVII 2534 . G A 86.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.467;DP=118;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=4.1126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.055;QD=0.73;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,32:118:99:116,0,2030 chrVII 2572 . A T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=155;Dels=0.00;FS=2.837;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.206;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:155:99:1428,0,1844 chrVII 2686 . T C 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.143;DP=171;Dels=0.00;FS=6.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.335;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,85:171:99:1787,0,1912 chrVII 2738 . C T 2155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.649;DP=188;Dels=0.00;FS=0.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,100:188:99:2185,0,1840 chrVII 2817 . G A 2221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.776;DP=212;Dels=0.00;FS=4.310;HaplotypeScore=4.7616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,104:212:99:2251,0,2254 chrVII 2839 . T A 2238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.694;DP=199;Dels=0.00;FS=2.560;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.747;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,100:199:99:2268,0,2098 chrVII 2899 . C T 2085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.505;DP=168;Dels=0.00;FS=9.153;HaplotypeScore=4.8061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.687;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,92:168:99:2115,0,1503 chrVII 2966 . T C 1832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.462;DP=188;Dels=0.00;FS=7.214;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.711;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,91:188:99:1862,0,2179 chrVII 3367 . G C 2032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.299;DP=206;Dels=0.00;FS=1.079;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.461;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,105:206:99:2062,0,2163 chrVII 3417 . C T 2545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.133;DP=217;Dels=0.00;FS=3.851;HaplotypeScore=3.5623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,117:217:99:2575,0,1963 chrVII 3473 . G A 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.977;DP=236;Dels=0.00;FS=12.366;HaplotypeScore=2.8944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.165;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,55:236:99:787,0,4108 chrVII 3709 . C A 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.905;DP=249;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=1;MQRankSum=0.234;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.590;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,63:249:99:1038,0,4166 chrVII 3729 . G A 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.748;DP=229;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=1;MQRankSum=-2.110;QD=3.81;ReadPosRankSum=-2.173;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,57:229:99:903,0,3858 chrVII 3806 . T C 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.824;DP=188;Dels=0.00;FS=9.549;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,56:188:99:891,0,2969 chrVII 3823 . G C 307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;DP=194;Dels=0.00;FS=13.296;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.436;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,31:194:99:337,0,3524 chrVII 3929 . G C 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.850;DP=198;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.385;QD=3.14;ReadPosRankSum=1.573;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,43:198:99:651,0,3351 chrVII 4017 . T C 2356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.991;DP=239;Dels=0.00;FS=4.929;HaplotypeScore=2.9534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=-0.373;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.695;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,118:239:99:2386,0,2606 chrVII 4400 . T C 2015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.031;DP=200;Dels=0.00;FS=2.045;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.177;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,100:200:99:2045,0,2197 chrVII 4502 . T A 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;DP=160;Dels=0.00;FS=5.787;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,91:160:99:1813,0,1382 chrVII 4504 . T C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.80;MQ0=0;QD=23.08;SB=-2.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3624,396,0 chrVII 4516 . C T 4506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=72.4881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=25.90;SB=-2.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4506,460,0 chrVII 4574 . G A 1974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.921;DP=206;Dels=0.00;FS=0.511;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=2.105;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,96:206:99:2004,0,2317 chrVII 4631 . G A 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.051;DP=193;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=6.4233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=3.90;ReadPosRankSum=-3.439;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,48:193:99:782,0,3194 chrVII 4761 . C A 1854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.765;DP=205;Dels=0.00;FS=7.995;HaplotypeScore=8.6139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,90:205:99:1884,0,2386 chrVII 4809 . G C 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.664;DP=208;Dels=0.00;FS=1.093;HaplotypeScore=5.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=1;MQRankSum=0.337;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.767;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,93:208:99:1723,0,2326 chrVII 4815 . T G 1817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.334;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=1;MQRankSum=1.070;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.916;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,99:216:99:1847,0,2585 chrVII 4981 . A G 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.221;DP=221;Dels=0.00;FS=7.739;HaplotypeScore=5.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.132;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,100:221:99:1918,0,2705 chrVII 4984 . T G 1897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.226;DP=220;Dels=0.00;FS=9.004;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,100:220:99:1927,0,2758 chrVII 4998 . A G 6022.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=25.96;SB=-2.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,232:232:99:6022,640,0 chrVII 5025 . C T 2285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.309;DP=234;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.880;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,106:234:99:2315,0,2653 chrVII 5092 . C A 6951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=255;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=1;QD=27.26;SB=-3.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,255:255:99:6951,685,0 chrVII 5138 . C A 2600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.298;DP=235;Dels=0.00;FS=12.566;HaplotypeScore=2.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=1.890;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,120:235:99:2630,0,2394 chrVII 5182 . C T 2348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.132;DP=265;Dels=0.00;FS=10.652;HaplotypeScore=4.3874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=2.367;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.160;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,138:265:99:2378,0,2752 chrVII 5183 . A C 2218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.416;DP=243;Dels=0.00;FS=6.980;HaplotypeScore=2.8212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.026;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,127:243:99:2248,0,2569 chrVII 5343 . G A 2624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.192;DP=284;Dels=0.00;FS=8.134;HaplotypeScore=6.4923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.702;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,133:284:99:2654,0,3206 chrVII 5398 . T C 2566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.154;DP=251;Dels=0.00;FS=2.810;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,126:251:99:2596,0,2769 chrVII 5526 . G A 2656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.648;DP=252;Dels=0.00;FS=2.116;HaplotypeScore=7.4646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=1;MQRankSum=0.135;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.427;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,125:252:99:2686,0,2560 chrVII 5533 . C T 6392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=1;QD=26.86;SB=-3.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,237:238:99:6392,625,0 chrVII 5604 . A T 2720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.217;DP=232;Dels=0.00;FS=0.487;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=1.383;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,126:232:99:2750,0,2202 chrVII 5707 . G A 2248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.279;DP=212;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.660;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,108:212:99:2278,0,2142 chrVII 5717 . A C 2205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.221;DP=208;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,109:208:99:2235,0,2292 chrVII 5754 . A C 5802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.79;SB=-2.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,225:225:99:5802,612,0 chrVII 5755 . G A 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.303;DP=227;Dels=0.00;FS=6.686;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=4.47;ReadPosRankSum=-1.147;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,60:227:99:1044,0,3592 chrVII 5800 . C T 2252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.433;DP=210;Dels=0.00;FS=3.124;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.763;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,110:210:99:2282,0,2086 chrVII 5921 . A G 1981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.121;DP=167;Dels=0.00;FS=4.575;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=2.235;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,96:167:99:2011,0,1569 chrVII 6091 . T A 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;DP=197;Dels=0.00;FS=2.603;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.428;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,97:197:99:1801,0,2171 chrVII 6214 . G A 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.911;DP=222;Dels=0.00;FS=3.789;HaplotypeScore=5.2599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,111:222:99:1825,0,2373 chrVII 6652 . T C 2030.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.144;DP=123;Dels=0.00;FS=4.587;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.17;MQ0=3;MQRankSum=6.257;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.170;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,99:123:1:2059,1,0 chrVII 6997 . A G 1071.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.010;DP=171;Dels=0.00;FS=5.678;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.70;MQ0=10;MQRankSum=2.972;QD=6.26;ReadPosRankSum=3.277;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,67:170:99:1101,0,1263 chrVII 7126 . C G 501.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.717;DP=96;Dels=0.00;FS=42.935;HaplotypeScore=10.1503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.08;MQ0=0;MQRankSum=-5.673;QD=5.22;ReadPosRankSum=-2.477;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:531,0,945 chrVII 7134 . A G 392.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.720;DP=101;Dels=0.00;FS=72.547;HaplotypeScore=9.3111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.55;MQ0=0;MQRankSum=-5.779;QD=3.88;ReadPosRankSum=-2.254;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:422,0,1147 chrVII 7164 . A G 34.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.560;DP=87;Dels=0.00;FS=58.577;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.28;MQ0=0;MQRankSum=-6.140;QD=0.39;ReadPosRankSum=1.866;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:64:64,0,1471 chrVII 7167 . G A 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.752;DP=85;Dels=0.00;FS=75.134;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.28;MQ0=0;MQRankSum=-5.683;QD=0.48;ReadPosRankSum=1.637;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:71:71,0,1294 chrVII 7267 . T A 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.849;DP=78;Dels=0.00;FS=60.422;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.25;MQ0=2;MQRankSum=-7.057;QD=0.35;ReadPosRankSum=-2.032;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:57:57,0,1140 chrVII 7378 . A G 596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.282;DP=87;Dels=0.00;FS=9.278;HaplotypeScore=9.5563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.02;MQ0=2;MQRankSum=-3.929;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.636;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:626,0,813 chrVII 7398 . A G 510.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.087;DP=99;Dels=0.00;FS=13.066;HaplotypeScore=21.5662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQ0=5;MQRankSum=-4.560;QD=5.15;ReadPosRankSum=3.049;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:540,0,1174 chrVII 7460 . C T 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.120;DP=73;Dels=0.00;FS=4.536;HaplotypeScore=5.8931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.60;MQ0=9;MQRankSum=-3.380;QD=0.60;ReadPosRankSum=-1.729;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,21:73:74:74,0,1137 chrVII 7485 . A G 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.054;DP=92;Dels=0.00;FS=28.381;HaplotypeScore=18.6250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.95;MQ0=5;MQRankSum=-5.349;QD=0.29;ReadPosRankSum=-1.388;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:92:57:57,0,1558 chrVII 7600 . C T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.216;DP=137;Dels=0.01;FS=30.497;HaplotypeScore=33.4864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.77;MQ0=3;MQRankSum=-3.598;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.843;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1366,0,1190 chrVII 7857 . A G 435.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.228;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.26;MQ0=16;MQRankSum=0.203;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.419;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:465,0,450 chrVII 7948 . A G 1214.17 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;DP=78;Dels=0.00;FS=3.815;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.01;MQ0=20;MQRankSum=2.566;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.702;SB=-5.852e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,54:78:17:1247,17,0 chrVII 8012 . A T 338.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.402;DP=91;Dels=0.00;FS=1.944;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.42;MQ0=16;MQRankSum=-7.262;QD=3.71;ReadPosRankSum=2.105;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:368,0,1100 chrVII 8051 . A G 907.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.138;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.88;MQ0=13;MQRankSum=-6.516;QD=8.64;ReadPosRankSum=-2.274;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,67:105:99:937,0,746 chrVII 8205 . A G 1529.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.360;DP=110;Dels=0.00;FS=18.529;HaplotypeScore=16.4877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.63;MQ0=10;MQRankSum=-3.635;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,81:110:99:1559,0,485 chrVII 8216 . T C 1917.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.599;DP=148;Dels=0.00;FS=18.185;HaplotypeScore=16.4877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.79;MQ0=12;MQRankSum=-6.108;QD=12.95;ReadPosRankSum=2.019;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,100:148:99:1947,0,846 chrVII 8457 . C T 216.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.013;DP=112;Dels=0.00;FS=97.149;HaplotypeScore=18.7905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.90;MQ0=16;MQRankSum=-5.496;QD=1.93;ReadPosRankSum=-4.523;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,24:112:99:246,0,1604 chrVII 8460 . C A 142.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.939;DP=114;Dels=0.00;FS=25.021;HaplotypeScore=17.8240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.68;MQ0=16;MQRankSum=-4.794;QD=1.25;ReadPosRankSum=2.496;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,30:114:99:172,0,1649 chrVII 8467 . A G 209.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.417;DP=119;Dels=0.00;FS=80.493;HaplotypeScore=16.8307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.64;MQ0=15;MQRankSum=-4.587;QD=1.76;ReadPosRankSum=-2.936;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,25:119:99:239,0,1905 chrVII 8487 . C T 258.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.302;DP=111;Dels=0.00;FS=79.007;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.55;MQ0=14;MQRankSum=-4.270;QD=2.32;ReadPosRankSum=3.035;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:288,0,1754 chrVII 8488 . C T 259.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.565;DP=111;Dels=0.00;FS=76.508;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.63;MQ0=14;MQRankSum=-4.445;QD=2.33;ReadPosRankSum=3.333;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:289,0,1763 chrVII 8501 . C T 286.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.588;DP=98;Dels=0.00;FS=66.741;HaplotypeScore=3.8148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.59;MQ0=15;MQRankSum=-3.664;QD=2.92;ReadPosRankSum=3.247;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,20:98:99:316,0,1368 chrVII 8505 . A C 273.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.489;DP=104;Dels=0.00;FS=74.464;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.15;MQ0=16;MQRankSum=-3.696;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.558;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,22:104:99:303,0,1513 chrVII 8529 . A G 590.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.936;DP=122;Dels=0.00;FS=98.032;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.13;MQ0=20;MQRankSum=-4.412;QD=4.84;ReadPosRankSum=-2.268;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,34:122:99:620,0,1497 chrVII 8533 . T C 551.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.253;DP=113;Dels=0.00;FS=84.524;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.23;MQ0=16;MQRankSum=-4.641;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.676;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,33:113:99:581,0,1431 chrVII 8539 . G A 586.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.020;DP=111;Dels=0.00;FS=80.220;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.69;MQ0=17;MQRankSum=-4.119;QD=5.28;ReadPosRankSum=-2.796;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,33:111:99:616,0,1260 chrVII 8547 . C T 243.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.953;DP=106;Dels=0.00;FS=57.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.05;MQ0=21;MQRankSum=-3.613;QD=2.29;ReadPosRankSum=1.482;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,19:106:99:273,0,1428 chrVII 8553 . T C 262.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.300;DP=117;Dels=0.00;FS=94.962;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.65;MQ0=20;MQRankSum=-4.465;QD=2.24;ReadPosRankSum=-2.098;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,35:117:99:292,0,1417 chrVII 8560 . C T 263.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.572;DP=117;Dels=0.00;FS=105.818;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.11;MQ0=19;MQRankSum=-5.019;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,34:117:99:293,0,1402 chrVII 8562 . T A 278.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;DP=112;Dels=0.00;FS=110.342;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.08;MQ0=19;MQRankSum=-5.446;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,33:112:99:308,0,1325 chrVII 8574 . T A 247.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.233;DP=123;Dels=0.00;FS=104.300;HaplotypeScore=17.7306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.58;MQ0=25;MQRankSum=-7.602;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.613;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,32:123:99:277,0,1159 chrVII 8579 . A C 179.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.657;DP=124;Dels=0.00;FS=136.348;HaplotypeScore=18.5192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.76;MQ0=25;MQRankSum=-6.019;QD=1.44;ReadPosRankSum=1.291;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,32:124:99:209,0,1483 chrVII 8584 . A T 195.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.448;DP=126;Dels=0.00;FS=133.531;HaplotypeScore=18.5192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.65;MQ0=25;MQRankSum=-5.850;QD=1.55;ReadPosRankSum=2.411;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,31:126:99:225,0,1523 chrVII 8585 . T C 176.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=126;Dels=0.00;FS=131.939;HaplotypeScore=3.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.65;MQ0=25;MQRankSum=-5.828;QD=1.40;ReadPosRankSum=2.318;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,31:126:99:206,0,1512 chrVII 8596 . A C 183.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.803;DP=125;Dels=0.00;FS=146.025;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.40;MQ0=24;MQRankSum=-5.557;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.322;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,33:125:99:213,0,1494 chrVII 8608 . T C 218.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.874;DP=116;Dels=0.00;FS=130.734;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.11;MQ0=24;MQRankSum=-4.677;QD=1.88;ReadPosRankSum=-3.086;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,32:116:99:248,0,1272 chrVII 8613 . C T 122.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.988;DP=104;Dels=0.00;FS=112.825;HaplotypeScore=23.1766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.90;MQ0=23;MQRankSum=-3.872;QD=1.17;ReadPosRankSum=-3.902;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,27:104:99:152,0,1073 chrVII 8780 . T G 435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;DP=71;Dels=0.00;FS=20.249;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.53;MQ0=3;MQRankSum=-1.134;QD=6.13;ReadPosRankSum=-4.706;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,56:71:99:465,0,203 chrVII 8876 . C T 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=24.90;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3785,369,0 chrVII 8977 . A G 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2802,297,0 chrVII 9188 . C T 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=26.52;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2871,291,0 chrVII 9203 . G T 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=26.69;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3737,376,0 chrVII 9264 . G C 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3716,387,0 chrVII 9285 . G T 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3737,379,0 chrVII 9355 . T C 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4042;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.51;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=25.55;ReadPosRankSum=-1.612;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3679,381,0 chrVII 9425 . C T 1847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.54;MQ0=0;QD=27.57;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1880,198,0 chrVII 9430 . A G 1847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.67;MQ0=0;QD=23.09;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1880,204,0 chrVII 9477 . A G 1693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=72.5018;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.52;MQ0=0;QD=20.65;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1726,189,0 chrVII 9492 . G T 1838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=74.4850;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.72;MQ0=0;QD=20.89;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1871,189,0 chrVII 9493 . A G 1757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=74.4850;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.72;MQ0=0;QD=19.97;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1790,189,0 chrVII 9524 . T C 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.08;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2680,282,0 chrVII 9589 . T G 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.65;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3543,363,0 chrVII 9659 . A G 2100 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.14;MQ0=0;QD=25.00;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2133,234,0 chrVII 9663 . C T 1941 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.01;MQ0=0;QD=24.88;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1974,216,0 chrVII 9664 . T C 1926 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.01;MQ0=0;QD=24.69;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1959,216,0 chrVII 9710 . T C 2008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.47;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2041,225,0 chrVII 9720 . A G 1772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.18;MQ0=0;QD=22.43;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1805,207,0 chrVII 9746 . G C 1794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.97;MQ0=0;QD=22.71;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1827,207,0 chrVII 9795 . C G 1648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.81;MQ0=0;QD=24.24;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1681,186,0 chrVII 9800 . T C 1414 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.61;MQ0=0;QD=22.81;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1447,168,0 chrVII 9815 . A T 57.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.620;DP=68;Dels=0.00;FS=5.492;HaplotypeScore=59.2962;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=0.85;ReadPosRankSum=-4.651;SB=2.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:59,9:68:12:90,12,0 chrVII 9823 . G A 1794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=40.7103;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.14;MQ0=0;QD=21.11;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1827,207,0 chrVII 9841 . T C 1940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.59;MQ0=0;QD=22.30;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1973,219,0 chrVII 9859 . G C 1927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.78;MQ0=0;QD=21.18;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:1960,219,0 chrVII 9885 . T A 2186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.45;MQ0=0;QD=22.77;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2219,237,0 chrVII 9915 . A G 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.84;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2804,312,0 chrVII 10024 . T A 1123 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.26;MQ0=0;QD=19.36;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1156,123,0 chrVII 10028 . C T 754 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.75;MQ0=0;QD=14.78;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:87:787,87,0 chrVII 10029 . G A 690 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.45;MQ0=0;QD=16.05;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:78:723,78,0 chrVII 10045 . A T 777 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=13.63;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:84:810,84,0 chrVII 10048 . A G 703 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.65;MQ0=0;QD=13.02;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:81:736,81,0 chrVII 10050 . A G 712 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.65;MQ0=0;QD=13.19;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:81:745,81,0 chrVII 10060 . A G 762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.37;MQ0=0;QD=13.14;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:87:795,87,0 chrVII 10088 . C T 1074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.5088;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.87;MQ0=0;QD=17.32;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1107,114,0 chrVII 10093 . C T 1128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=62.4719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.71;MQ0=0;QD=17.09;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1161,123,0 chrVII 10135 . G A 1037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.09;MQ0=0;QD=20.74;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1070,114,0 chrVII 10154 . G C 1129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.25;MQ0=0;QD=21.71;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1162,129,0 chrVII 10166 . G A 1049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.41;MQ0=0;QD=21.41;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1082,114,0 chrVII 10182 . T G 944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.44;MQ0=0;QD=20.98;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:977,108,0 chrVII 10191 . T C 1227 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.42;MQ0=0;QD=22.72;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1260,147,0 chrVII 10198 . G A 1572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=63;Dels=0.00;FS=4.014;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=24.95;ReadPosRankSum=1.457;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,62:63:99:1605,174,0 chrVII 10242 . T A 2593 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.297;DP=99;Dels=0.00;FS=4.159;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.54;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=26.19;ReadPosRankSum=1.592;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2626,273,0 chrVII 10243 . T C 2504 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=104;Dels=0.00;FS=4.108;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.04;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=24.08;ReadPosRankSum=1.463;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2537,270,0 chrVII 10302 . G A 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.29;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2927,309,0 chrVII 10310 . T C 2507 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.23;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2540,279,0 chrVII 10346 . C A 1957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.33;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1990,210,0 chrVII 10386 . T A 1111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.33;MQ0=1;QD=20.20;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1144,123,0 chrVII 10396 . G C 926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.46;MQ0=1;QD=18.52;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:959,108,0 chrVII 10427 . C T 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.46;MQ0=1;QD=2.01;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:43,6,0 chrVII 10469 . T A 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.52;MQ0=0;QD=8.59;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 chrVII 10476 . A T 52.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=13.24;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:85,9,0 chrVII 10479 . A T 51.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.99;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:84,9,0 chrVII 10481 . C A 55.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=13.99;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:88,9,0 chrVII 10496 . C T 140.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.77;MQ0=0;QD=17.51;SB=-4.053e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:173,21,0 chrVII 10501 . G T 140.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.12;MQ0=0;QD=15.56;SB=-5.768e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:21:173,21,0 chrVII 10505 . T A 140.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.12;MQ0=0;QD=15.56;SB=-5.768e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:21:173,21,0 chrVII 10508 . G A 140.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.58;MQ0=0;QD=14.01;SB=-6.629e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:173,21,0 chrVII 10518 . A G 236 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=1;QD=15.73;SB=-1.032e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:33:269,33,0 chrVII 10538 . T C 387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.24;MQ0=1;QD=16.83;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:51:420,51,0 chrVII 10545 . C T 448 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.05;MQ0=1;QD=17.92;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:57:481,57,0 chrVII 10597 . A G 549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.20;MQ0=1;QD=18.30;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:69:582,69,0 chrVII 10613 . T A 608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.98;MQ0=0;QD=21.71;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:72:641,72,0 chrVII 10615 . C T 573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.09;MQ0=0;QD=21.22;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:69:606,69,0 chrVII 10652 . T C 537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.72;MQ0=0;QD=19.18;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:66:570,66,0 chrVII 10700 . G C 475 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.10;MQ0=1;QD=18.27;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:57:508,57,0 chrVII 10705 . G C 508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.45;MQ0=2;QD=16.39;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:60:541,60,0 chrVII 10728 . C T 680 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.650;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.13;MQ0=4;MQRankSum=-0.433;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.866;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:78:713,78,0 chrVII 10732 . C G 545 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.25;MQ0=4;QD=18.79;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:63:578,63,0 chrVII 10736 . A C 514 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.11;MQ0=4;QD=18.36;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:60:547,60,0 chrVII 10804 . A C 827 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.23;MQ0=2;QD=19.69;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:860,99,0 chrVII 10806 . T A 831 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.12;MQ0=2;QD=21.87;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:96:864,96,0 chrVII 10812 . C T 732 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.05;MQ0=0;QD=20.33;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:84:765,84,0 chrVII 10814 . T C 709 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.05;MQ0=0;QD=19.69;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:84:742,84,0 chrVII 10818 . C T 743 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQ0=0;QD=18.57;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:84:776,84,0 chrVII 10823 . T C 614 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.05;MQ0=0;QD=17.06;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:72:647,72,0 chrVII 10827 . G A 608 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.87;MQ0=0;QD=18.42;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:69:641,69,0 chrVII 10829 . C G 581 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.87;MQ0=0;QD=17.61;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:69:614,69,0 chrVII 10833 . T C 582 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.93;MQ0=0;QD=17.12;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:69:615,69,0 chrVII 10840 . A G 540 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.12;MQ0=0;QD=16.87;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:66:573,66,0 chrVII 10843 . T G 492 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.12;MQ0=0;QD=15.37;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:60:525,60,0 chrVII 10845 . A C 474 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.12;MQ0=0;QD=14.81;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:57:507,57,0 chrVII 10851 . A G 445 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.99;MQ0=0;QD=14.83;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:57:478,57,0 chrVII 10852 . A C 462 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.99;MQ0=0;QD=15.40;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:57:495,57,0 chrVII 10855 . A T 462 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=26.9039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.99;MQ0=0;QD=15.40;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:54:495,54,0 chrVII 10856 . T C 475 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=26.9039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.99;MQ0=0;QD=15.83;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:57:508,57,0 chrVII 10867 . A T 307 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.48;MQ0=0;QD=9.30;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:33:36:340,36,0 chrVII 10869 . T C 268.79 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=33;Dels=0.00;FS=6.154;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.48;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.628;SB=-1.528e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:10:301,10,0 chrVII 10875 . T C 649 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.33;MQ0=0;QD=14.42;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:75:682,75,0 chrVII 10877 . C G 682 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.33;MQ0=0;QD=15.16;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:78:715,78,0 chrVII 10891 . A G 789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=75.3876;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.22;MQ0=0;QD=15.47;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:90:822,90,0 chrVII 10893 . T A 798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=75.3876;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.22;MQ0=0;QD=15.65;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:90:831,90,0 chrVII 10975 . T A 650 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.59;MQ0=0;QD=21.67;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:75:683,75,0 chrVII 10982 . A T 603 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.71;MQ0=0;QD=24.12;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:66:636,66,0 chrVII 10985 . A G 505 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.71;MQ0=0;QD=20.20;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:63:538,63,0 chrVII 10988 . A C 580 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.28;MQ0=0;QD=22.31;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:66:613,66,0 chrVII 11008 . G A 1032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.25;MQ0=0;QD=25.80;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1065,111,0 chrVII 11014 . A G 1076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.35;MQ0=0;QD=23.39;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1109,120,0 chrVII 11028 . A G 1237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.66;MQ0=2;QD=20.62;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1270,147,0 chrVII 11031 . G C 1324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.43;MQ0=2;QD=21.35;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1357,150,0 chrVII 11076 . A G 1426 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.92;MQ0=3;QD=20.67;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1459,156,0 chrVII 11108 . C T 2426 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.473;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.91;MQ0=5;MQRankSum=0.275;QD=21.66;ReadPosRankSum=0.923;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2459,249,0 chrVII 11149 . A G 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.59;MQ0=3;QD=24.71;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3048,315,0 chrVII 11164 . A G 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.30;MQ0=2;QD=24.89;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2870,306,0 chrVII 11208 . T C 2654 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.64;MQ0=0;QD=22.68;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2687,303,0 chrVII 11217 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.98;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2922,321,0 chrVII 11253 . C T 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.33;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3062,315,0 chrVII 11256 . T A 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.28;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3179,318,0 chrVII 11286 . C T 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.89;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3334,336,0 chrVII 11371 . A G 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.79;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2829,291,0 chrVII 11390 . A C 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.879;DP=111;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=2.533;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1019,0,1190 chrVII 11415 . C T 2551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.05;MQ0=0;QD=24.77;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2584,261,0 chrVII 11454 . C T 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.50;MQ0=1;QD=25.92;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2832,288,0 chrVII 11565 . C T 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.70;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2870,288,0 chrVII 11606 . A G 2786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.90;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2819,282,0 chrVII 11631 . C T 2605 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.15;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2638,270,0 chrVII 11635 . G A 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.49;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2802,285,0 chrVII 11691 . G A 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.33;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2727,270,0 chrVII 11747 . C G 1511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=31.7535;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.07;MQ0=0;QD=23.98;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1544,168,0 chrVII 11768 . T C 792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=33.8004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.06;MQ0=0;QD=18.00;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:90:825,90,0 chrVII 11774 . C A 48.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=32.8613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.29;MQ0=0;QD=1.19;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:9:81,9,0 chrVII 11806 . G A 699 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.04;MQ0=0;QD=18.89;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:78:732,78,0 chrVII 11826 . T G 970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.19;MQ0=0;QD=23.10;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1003,108,0 chrVII 11838 . G A 1040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.76;MQ0=0;QD=23.11;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1073,111,0 chrVII 11900 . T G 2076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.72;MQ0=0;QD=24.71;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2109,225,0 chrVII 11908 . C T 2180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.18;MQ0=0;QD=25.35;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2213,231,0 chrVII 11932 . A G 1872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.26;MQ0=0;QD=24.31;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1905,210,0 chrVII 11980 . G A 587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.03;MQ0=0;QD=21.74;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:72:620,72,0 chrVII 11990 . A T 492 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.77;MQ0=0;QD=18.92;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:60:525,60,0 chrVII 12003 . T C 561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.37;MQ0=0;QD=20.04;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:72:594,72,0 chrVII 12007 . C T 536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.31;MQ0=0;QD=20.62;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:63:569,63,0 chrVII 12020 . A G 575 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.32;MQ0=0;QD=16.91;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:69:608,69,0 chrVII 12025 . A G 505 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.82;MQ0=0;QD=15.78;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:60:538,60,0 chrVII 12062 . G A 467 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.69;MQ0=0;QD=15.06;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:54:500,54,0 chrVII 12067 . C T 479 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.95;MQ0=0;QD=15.97;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:54:512,54,0 chrVII 12072 . A G 455 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.95;MQ0=0;QD=15.17;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:54:488,54,0 chrVII 12074 . T C 456 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.95;MQ0=0;QD=15.20;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:54:489,54,0 chrVII 12086 . G A 550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=15.71;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:60:583,60,0 chrVII 12101 . C T 537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.45;MQ0=0;QD=16.27;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:60:570,60,0 chrVII 12125 . C T 581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.51;MQ0=0;QD=21.52;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:66:614,66,0 chrVII 12155 . A G 621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.88;MQ0=0;QD=23.88;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:72:654,72,0 chrVII 12165 . G C 588 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.8417;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.83;MQ0=0;QD=23.52;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:69:621,69,0 chrVII 12180 . A G 643 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=21.43;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:78:676,78,0 chrVII 12185 . C T 557 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.11;MQ0=0;QD=21.42;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:66:590,66,0 chrVII 12186 . A G 541 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.11;MQ0=0;QD=20.81;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:66:574,66,0 chrVII 12187 . T C 542 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.11;MQ0=0;QD=20.85;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:66:575,66,0 chrVII 12192 . G A 574 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQ0=0;QD=20.50;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:66:607,66,0 chrVII 12210 . A G 460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=19.17;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:54:493,54,0 chrVII 12214 . C T 509 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=20.36;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:57:542,57,0 chrVII 12231 . T C 522 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.31;MQ0=0;QD=18.00;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:63:555,63,0 chrVII 12234 . A G 465 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.18;MQ0=0;QD=17.22;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:57:498,57,0 chrVII 12236 . C T 71.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.879;DP=27;Dels=0.00;FS=3.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.18;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:101,0,283 chrVII 12259 . T G 329 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.13;MQ0=0;QD=15.67;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:42:362,42,0 chrVII 12260 . C G 332 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.13;MQ0=0;QD=15.81;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:42:365,42,0 chrVII 12263 . A G 330 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.21;MQ0=0;QD=15.00;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:42:363,42,0 chrVII 12269 . C T 390 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=15.60;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:48:423,48,0 chrVII 12277 . A G 324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.62;MQ0=0;QD=12.96;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:42:357,42,0 chrVII 12322 . A C 747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.98;MQ0=0;QD=19.66;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:90:780,90,0 chrVII 12329 . G T 824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.01;MQ0=0;QD=21.13;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:93:857,93,0 chrVII 12339 . A C 777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.90;MQ0=0;QD=17.66;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:93:810,93,0 chrVII 12355 . A G 950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.66;MQ0=0;QD=18.63;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:983,114,0 chrVII 12386 . G T 958 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.63;MQ0=0;QD=20.83;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:991,111,0 chrVII 12387 . T A 932 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.63;MQ0=0;QD=20.26;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:965,111,0 chrVII 12388 . G T 983 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.63;MQ0=0;QD=21.37;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1016,114,0 chrVII 12396 . T A 949 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.87;MQ0=0;QD=18.61;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:982,111,0 chrVII 12436 . G C 1126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.31;MQ0=0;QD=21.65;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1159,135,0 chrVII 12448 . A G 1055 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.35;MQ0=0;QD=21.53;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1088,126,0 chrVII 12454 . T C 1077 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.56;MQ0=0;QD=20.32;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1110,126,0 chrVII 12455 . G A 1130 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.58;MQ0=0;QD=20.55;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1163,132,0 chrVII 12479 . G A 1859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.08;MQ0=0;QD=23.83;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1892,207,0 chrVII 12505 . G A 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.75;MQ0=0;QD=26.33;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2534,267,0 chrVII 12524 . A T 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.87;MQ0=0;QD=26.03;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2532,267,0 chrVII 12565 . A T 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.73;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3046,295,0 chrVII 12610 . T C 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.37;MQ0=0;QD=25.41;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2625,291,0 chrVII 12663 . T C 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.78;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3126,315,0 chrVII 12742 . G A 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.99;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3086,327,0 chrVII 12756 . T C 2341 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.23;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2374,261,0 chrVII 12769 . A G 2401 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=0;QD=22.65;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2434,264,0 chrVII 12778 . C T 2418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.13;MQ0=0;QD=23.03;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2451,264,0 chrVII 12793 . C T 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.41;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2777,306,0 chrVII 12853 . G A 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.29;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3133,324,0 chrVII 12857 . C T 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.93;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3173,327,0 chrVII 12874 . A G 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.93;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2916,324,0 chrVII 12884 . T C 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.41;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2940,327,0 chrVII 12937 . T C 2865 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.81;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:2898,303,0 chrVII 12940 . T C 2997 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.27;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3030,312,0 chrVII 12946 . C T 3098 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.41;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3131,315,0 chrVII 13009 . T C 2757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.39;MQ0=0;QD=25.29;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2790,312,0 chrVII 13045 . C T 2339 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.85;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2372,255,0 chrVII 13050 . T C 2087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.87;MQ0=0;QD=21.52;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2120,237,0 chrVII 13066 . C T 2212 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.29;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2245,243,0 chrVII 13105 . A G 2500 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.64;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2533,270,0 chrVII 13111 . T C 2216 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.62;MQ0=0;QD=23.08;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:96:99:2249,249,0 chrVII 13120 . T C 2218 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.88;MQ0=0;QD=24.11;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2251,249,0 chrVII 13185 . C T 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.91;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2686,282,0 chrVII 13197 . G A 2574 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.30;MQ0=0;QD=27.98;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2607,261,0 chrVII 13203 . T C 2487 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.55;MQ0=0;QD=26.74;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2520,264,0 chrVII 13216 . T C 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.08;MQ0=0;QD=26.43;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2491,267,0 chrVII 13261 . T A 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.82;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2833,288,0 chrVII 13281 . C T 2513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.61;MQ0=0;QD=27.32;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2546,252,0 chrVII 13343 . A G 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.102;DP=91;Dels=0.00;FS=3.980;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.636;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:891,0,1122 chrVII 13389 . T C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.577;DP=135;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=2.9360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.042;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1256,0,1541 chrVII 13446 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.409;DP=111;Dels=0.00;FS=3.592;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1220,0,1125 chrVII 13652 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.616;DP=94;Dels=0.00;FS=8.261;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=3.107;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.791;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1033,0,906 chrVII 13749 . T C 2746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2779,288,0 chrVII 14197 . T A 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.093;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1298,0,870 chrVII 14267 . G A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.019;DP=110;Dels=0.00;FS=3.639;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:110:99:850,0,1334 chrVII 14524 . A C 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.089;DP=109;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:945,0,1348 chrVII 14737 . T A 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.937;DP=132;Dels=0.00;FS=5.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.715;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,78:132:99:1696,0,1132 chrVII 14981 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.909;DP=115;Dels=0.00;FS=12.205;HaplotypeScore=2.8389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.748;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1073,0,1328 chrVII 15008 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.038;DP=109;Dels=0.00;FS=2.598;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.518;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1143,0,1182 chrVII 15337 . A G 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.95;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3069,330,0 chrVII 15420 . C G 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3488,346,0 chrVII 15437 . T C 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3316,345,0 chrVII 15512 . C T 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.95;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3398,334,0 chrVII 15518 . C T 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3363,331,0 chrVII 15533 . T C 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3413,345,0 chrVII 15557 . A G 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3438,369,0 chrVII 15596 . A G 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=26.35;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2747,285,0 chrVII 15647 . T C 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3233,330,0 chrVII 15689 . T C 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3032,318,0 chrVII 15770 . T C 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3352,357,0 chrVII 15803 . C T 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.93;SB=-2.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3932,391,0 chrVII 15848 . T C 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3400,348,0 chrVII 15887 . C T 4060.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4060,409,0 chrVII 15899 . T A 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3594,361,0 chrVII 16079 . T C 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3712,378,0 chrVII 16087 . T G 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3790,393,0 chrVII 16175 . A C 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3390,342,0 chrVII 16202 . A C 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3040,312,0 chrVII 16482 . T C 2210 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.41;MQ0=0;QD=22.10;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2243,243,0 chrVII 16485 . A G 2087 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.62;MQ0=0;QD=21.74;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2120,231,0 chrVII 16489 . T G 2007 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.62;MQ0=0;QD=22.05;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2040,225,0 chrVII 16503 . C T 2284 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.63;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2317,243,0 chrVII 16504 . G T 2305 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.63;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2338,243,0 chrVII 16509 . T C 2202 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.74;MQ0=0;QD=21.80;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2235,249,0 chrVII 16556 . C T 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.22;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2981,303,0 chrVII 16563 . A G 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.26;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2855,309,0 chrVII 16596 . C T 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2838,285,0 chrVII 16612 . C T 2461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.70;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2494,261,0 chrVII 16638 . T C 2227 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=81.5489;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=23.95;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2260,249,0 chrVII 16681 . T C 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.70;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3102,327,0 chrVII 16762 . C A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.54;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3152,330,0 chrVII 16765 . T C 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.32;MQ0=0;QD=22.19;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2629,282,0 chrVII 16798 . A G 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.74;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2805,297,0 chrVII 16807 . T A 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.07;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3192,324,0 chrVII 16848 . G C 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.78;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3035,312,0 chrVII 16905 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.99;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2922,312,0 chrVII 16946 . T A 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=12.6052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.49;MQ0=0;QD=21.58;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2860,291,0 chrVII 16997 . G A 2024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=67.6556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.54;MQ0=0;QD=19.84;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2057,222,0 chrVII 17017 . C T 1457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=31.7078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.43;MQ0=0;QD=19.43;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1490,156,0 chrVII 17039 . A G 1802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.92;MQ0=0;QD=21.45;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,83:84:99:1835,201,0 chrVII 17063 . C T 519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.658;DP=81;Dels=0.00;FS=0.902;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:549,0,953 chrVII 17111 . T C 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.36;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2750,279,0 chrVII 17166 . G T 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.16;MQ0=0;QD=27.98;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2747,279,0 chrVII 17176 . T C 2558 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.26;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2591,273,0 chrVII 17210 . C G 692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.072;DP=84;Dels=0.00;FS=0.826;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,39:84:99:722,0,858 chrVII 17223 . C T 1746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8713;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.05;MQ0=0;QD=22.97;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:76:99:1779,195,0 chrVII 17232 . T G 1354 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7130;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.63;MQ0=0;QD=19.07;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1387,159,0 chrVII 17234 . A G 1286 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.82;MQ0=0;QD=18.91;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1319,153,0 chrVII 17240 . C A 1405 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=18.99;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1438,159,0 chrVII 17260 . G A 1369 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=0;QD=19.56;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1402,156,0 chrVII 17261 . C T 1353 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=0;QD=19.33;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1386,156,0 chrVII 17265 . C T 1361 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.66;MQ0=0;QD=18.90;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1394,156,0 chrVII 17289 . G C 1268 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.97;MQ0=0;QD=18.65;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1301,150,0 chrVII 17299 . G A 1562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.84;MQ0=0;QD=20.03;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1595,177,0 chrVII 17314 . A C 1285 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.98;MQ0=0;QD=19.77;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1318,150,0 chrVII 17321 . T A 1457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.12;MQ0=0;QD=22.42;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1490,162,0 chrVII 17346 . A C 1360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.94;MQ0=0;QD=23.45;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1393,153,0 chrVII 17359 . A G 2071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.80;MQ0=0;QD=21.57;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2104,243,0 chrVII 17393 . T G 2079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.31;MQ0=0;QD=20.79;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2112,252,0 chrVII 17401 . G A 2280 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.99;MQ0=0;QD=22.57;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2313,255,0 chrVII 17412 . A G 2260 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.14;MQ0=0;QD=21.94;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2293,258,0 chrVII 17428 . T A 2312 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.11;MQ0=0;QD=22.89;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2345,258,0 chrVII 17611 . G A 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.52;MQ0=0;QD=27.64;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3344,328,0 chrVII 17668 . A G 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.62;MQ0=0;QD=27.05;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3489,378,0 chrVII 17690 . T C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.179;DP=128;Dels=0.00;FS=1.133;HaplotypeScore=4.0816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.24;MQ0=0;MQRankSum=4.986;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.439;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1413,0,1207 chrVII 17711 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.380;DP=132;Dels=0.00;FS=10.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.82;MQ0=0;MQRankSum=-7.052;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1275,0,1582 chrVII 17713 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.391;DP=134;Dels=0.00;FS=15.127;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.59;MQ0=0;MQRankSum=-7.086;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1076,0,1639 chrVII 17724 . C A 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.68;MQ0=0;QD=26.98;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3399,343,0 chrVII 17750 . G A 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.183;DP=116;Dels=0.00;FS=3.208;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=4.922;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1447,0,1022 chrVII 17785 . G C 1855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.45;MQ0=0;QD=25.76;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1888,189,0 chrVII 17798 . A T 570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;DP=66;Dels=0.00;FS=3.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.109;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:600,0,817 chrVII 17818 . T C 1890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;QD=25.20;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:75:99:1923,195,0 chrVII 17862 . T A 2048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=25.92;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:2081,216,0 chrVII 17874 . T G 1993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.03;MQ0=0;QD=25.23;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2026,213,0 chrVII 17959 . C G 1900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.63;MQ0=0;QD=24.05;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1933,207,0 chrVII 18342 . C T 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.38;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2690,285,0 chrVII 18346 . C T 2677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.33;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2710,285,0 chrVII 18380 . A G 1849 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.24;MQ0=0;QD=19.67;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:94:99:1882,213,0 chrVII 18382 . G T 1886 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.31;MQ0=0;QD=20.73;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:1919,207,0 chrVII 18388 . T C 1186 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.86;MQ0=0;QD=16.94;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1219,138,0 chrVII 18389 . C G 1203 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.86;MQ0=0;QD=17.19;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1236,138,0 chrVII 18418 . A G 1355 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.21;MQ0=0;QD=18.56;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1388,159,0 chrVII 18425 . A G 1410 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.21;MQ0=0;QD=19.32;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1443,162,0 chrVII 18426 . A T 1488 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.21;MQ0=0;QD=20.38;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1521,162,0 chrVII 18452 . A G 1746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.19;MQ0=0;QD=21.04;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1779,195,0 chrVII 18461 . T A 1630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.07;MQ0=0;QD=22.33;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1663,177,0 chrVII 18466 . A T 44.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;DP=88;Dels=0.00;FS=5.319;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.12;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=0.50;ReadPosRankSum=-3.043;SB=-2.184e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,9:88:10:74,0,10 chrVII 18481 . A G 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.779;DP=81;Dels=0.00;FS=1.925;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.12;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=0.15;ReadPosRankSum=3.172;SB=-8.838e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,77:81:6:43,6,0 chrVII 18516 . A T 1995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.91;MQ0=0;QD=22.17;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2028,216,0 chrVII 18535 . C T 1813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.07;MQ0=0;QD=21.33;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1846,198,0 chrVII 18545 . A T 1781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.59;MQ0=0;QD=21.20;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:84:99:1814,195,0 chrVII 18561 . G T 2265 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.93;MQ0=0;QD=25.45;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2298,237,0 chrVII 18598 . A C 2321 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.33;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2354,252,0 chrVII 18599 . C A 2363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.70;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2396,255,0 chrVII 18654 . T G 2644 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.17;MQ0=0;QD=26.71;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2677,285,0 chrVII 18690 . A G 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.93;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2689,297,0 chrVII 18699 . C T 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.80;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3335,348,0 chrVII 18729 . C T 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.02;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3461,349,0 chrVII 18748 . T C 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.59;MQ0=0;QD=26.46;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3208,330,0 chrVII 18909 . A G 2319 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.80;MQ0=0;QD=23.42;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2352,258,0 chrVII 18919 . C T 2322 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.88;MQ0=0;QD=23.22;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2355,255,0 chrVII 18921 . T C 2193 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.04;MQ0=0;QD=21.71;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2226,252,0 chrVII 18929 . T C 2458 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.38;MQ0=0;QD=22.97;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2491,276,0 chrVII 18954 . T A 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.81;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2978,318,0 chrVII 18987 . C G 2622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.42;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2655,294,0 chrVII 19051 . A T 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.54;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3785,376,0 chrVII 19093 . A G 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.68;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3020,318,0 chrVII 19168 . C T 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.30;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2754,294,0 chrVII 19173 . T C 2393 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.69;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2426,270,0 chrVII 19183 . G T 2558 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.15;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2591,273,0 chrVII 19186 . A T 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.56;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2850,297,0 chrVII 19222 . G A 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.82;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2657,285,0 chrVII 19226 . C T 2680 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.82;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2713,285,0 chrVII 19266 . A G 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.55;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3109,339,0 chrVII 19332 . A G 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.91;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3095,324,0 chrVII 19374 . G A 2459 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.42;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2492,258,0 chrVII 19378 . A G 2314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.94;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2347,249,0 chrVII 19402 . A G 1969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.56;MQ0=0;QD=22.37;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:87:99:2002,219,0 chrVII 19409 . A G 1902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.75;MQ0=0;QD=22.12;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1935,222,0 chrVII 19443 . C T 1837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=60.9381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.39;MQ0=0;QD=23.25;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1870,198,0 chrVII 19445 . A G 1765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.231;DP=81;Dels=0.00;FS=6.894;HaplotypeScore=62.5059;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.702;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,77:81:99:1798,198,0 chrVII 19473 . T G 1838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.53;MQ0=0;QD=20.42;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1871,207,0 chrVII 19481 . C T 2448 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.15;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2481,264,0 chrVII 19530 . G C 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.73;MQ0=0;QD=25.25;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2482,267,0 chrVII 19575 . A G 2242 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.35;MQ0=0;QD=21.56;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2275,246,0 chrVII 19599 . T C 1864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.71;MQ0=0;QD=21.93;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1897,204,0 chrVII 19600 . C A 1968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.71;MQ0=0;QD=23.15;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2001,204,0 chrVII 19636 . T C 1851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.95;MQ0=0;QD=20.57;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1884,204,0 chrVII 19660 . T C 1911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.24;MQ0=0;QD=21.23;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1944,207,0 chrVII 19669 . G A 2312 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.62;MQ0=0;QD=20.10;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2345,249,0 chrVII 19681 . T C 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.12;MQ0=0;QD=24.07;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2488,273,0 chrVII 19896 . A G 3955.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3955,408,0 chrVII 20174 . T C 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=1;QD=26.71;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3339,354,0 chrVII 20333 . G T 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.113;DP=91;Dels=0.00;FS=0.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.787;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:912,0,987 chrVII 20726 . T C 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3078,330,0 chrVII 21020 . T G 975 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.01;MQ0=0;QD=15.48;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1008,131,0 chrVII 21021 . C A 974 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.01;MQ0=0;QD=15.46;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1007,131,0 chrVII 21023 . G A 613 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.67;MQ0=0;QD=10.05;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:84:646,84,0 chrVII 21024 . A C 609 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.67;MQ0=0;QD=9.98;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:84:642,84,0 chrVII 21025 . A C 1151 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.67;MQ0=0;QD=18.87;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1184,150,0 chrVII 21035 . G A 1523 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.45;MQ0=0;QD=15.70;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:1556,168,0 chrVII 21039 . A C 1455 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;MQ0=0;QD=15.00;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:1488,165,0 chrVII 21041 . A G 1367 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.74;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.010;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:1400,130,0 chrVII 21088 . C T 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.953;DP=130;Dels=0.01;FS=4.478;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.23;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.598;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:2614,242,0 chrVII 21096 . G A 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.540;DP=126;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=20.59;ReadPosRankSum=1.457;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:2627,239,0 chrVII 21169 . C A 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.547;DP=112;Dels=0.00;FS=3.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.155;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2820,264,0 chrVII 21172 . C T 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;DP=104;Dels=0.00;FS=3.181;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.69;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=25.88;ReadPosRankSum=1.699;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2725,257,0 chrVII 21218 . C T 2672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.06;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2705,273,0 chrVII 21225 . T C 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.42;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2491,270,0 chrVII 21241 . G A 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.43;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2867,291,0 chrVII 21271 . C T 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.88;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3229,330,0 chrVII 21318 . C A 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.37;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3770,376,0 chrVII 21409 . T C 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2313;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.48;MQ0=0;QD=22.22;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3144,330,0 chrVII 21412 . A G 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.28;MQ0=0;QD=22.24;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3013,318,0 chrVII 21445 . T G 2016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.25;MQ0=0;QD=23.44;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2049,228,0 chrVII 21464 . C A 2066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.85;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2099,219,0 chrVII 21492 . G A 1645 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.30;MQ0=0;QD=23.84;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1678,177,0 chrVII 21493 . A T 1618 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.30;MQ0=0;QD=23.45;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1651,177,0 chrVII 21497 . A G 1623 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.15;MQ0=0;QD=21.64;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1656,192,0 chrVII 21504 . C T 1816 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.15;MQ0=0;QD=23.28;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1849,198,0 chrVII 21513 . G C 1709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=318.9477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.43;MQ0=0;QD=24.07;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1742,192,0 chrVII 21538 . T C 1471 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.45;MQ0=0;QD=22.29;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1504,171,0 chrVII 21565 . C T 1025 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=0;QD=22.28;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1058,114,0 chrVII 21569 . G A 1044 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=0;QD=22.70;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1077,114,0 chrVII 21574 . G A 1053 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.64;MQ0=0;QD=22.40;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1086,114,0 chrVII 21579 . A T 1010 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.45;MQ0=0;QD=21.04;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1043,108,0 chrVII 21586 . T A 1521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.90;MQ0=0;QD=22.37;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1554,165,0 chrVII 21602 . A G 1744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.22;MQ0=0;QD=23.57;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1777,201,0 chrVII 21626 . G A 2048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.15;MQ0=0;QD=26.95;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2081,216,0 chrVII 21658 . C T 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.672;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.475;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:991,0,723 chrVII 21664 . G T 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.345;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.70;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,37:82:99:785,0,955 chrVII 21694 . C T 1825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.69;MQ0=0;QD=23.10;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1858,195,0 chrVII 21704 . G A 720.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.366;DP=66;Dels=0.00;FS=0.959;HaplotypeScore=2.6474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.510;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,38:66:99:750,0,463 chrVII 21705 . T C 684.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.598;DP=66;Dels=0.00;FS=0.959;HaplotypeScore=2.6474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.951;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.084;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,38:66:99:714,0,501 chrVII 21710 . G A 410.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.202;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.61;MQ0=0;MQRankSum=2.519;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.965;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:440,0,785 chrVII 21712 . T A 1460 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.45;MQ0=0;QD=22.46;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:65:99:1493,156,0 chrVII 21719 . T G 615.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.662;DP=72;Dels=0.00;FS=0.922;HaplotypeScore=3.4612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.733;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,39:72:99:645,0,554 chrVII 21722 . T A 1749 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.71;MQ0=0;QD=22.71;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1782,195,0 chrVII 21919 . G C 4135.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=2;QD=25.68;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4135,423,0 chrVII 22018 . A T 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.16;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2602,276,0 chrVII 22028 . G A 2576 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.19;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2609,267,0 chrVII 22031 . C T 2667 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.07;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2700,276,0 chrVII 22035 . G A 2622 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.81;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2655,273,0 chrVII 22039 . A G 2646 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.93;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2679,291,0 chrVII 22111 . C T 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2813,288,0 chrVII 22192 . G A 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3310,322,0 chrVII 22195 . A T 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3282,316,0 chrVII 22309 . G A 3778.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3778,379,0 chrVII 22661 . A G 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3526,363,0 chrVII 22985 . G A 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3741,376,0 chrVII 23122 . C T 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.14;MQ0=0;QD=25.63;SB=-2.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3921,382,0 chrVII 23134 . T C 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3478,363,0 chrVII 23140 . G A 3909.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.61;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3909,391,0 chrVII 23215 . G T 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=154;Dels=0.00;FS=4.551;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=24.46;ReadPosRankSum=1.462;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:3767,373,0 chrVII 23231 . C T 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3767,367,0 chrVII 23244 . T C 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.46;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3294,342,0 chrVII 23473 . C A 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6289;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3415,334,0 chrVII 23602 . A G 2139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.87;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2172,225,0 chrVII 23885 . G A 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3614,358,0 chrVII 23922 . C T 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3335,334,0 chrVII 24075 . C T 1528 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=13.29;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:1561,156,0 chrVII 24222 . A G 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.266;DP=148;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1435,0,1677 chrVII 24501 . T C 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.741;DP=172;Dels=0.00;FS=1.213;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.753;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,90:172:99:1768,0,1815 chrVII 24525 . T C 4399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4399,456,0 chrVII 25032 . A G 4454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.069;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9064;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=25.45;ReadPosRankSum=1.712;SB=-2.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:4454,454,0 chrVII 25176 . C T 3937.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.78;SB=-2.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3937,388,0 chrVII 25442 . C T 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3604,352,0 chrVII 25445 . C A 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3653,361,0 chrVII 25542 . C A 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.66;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2743,276,0 chrVII 26122 . A T 4686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.33;SB=-2.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:178:99:4686,454,0 chrVII 26299 . A G 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4041,420,0 chrVII 26801 . G A 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3780,379,0 chrVII 26807 . A C 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3634,381,0 chrVII 26984 . T G 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=21.79;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3258,339,0 chrVII 27002 . A G 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3132,342,0 chrVII 27491 . C T 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3272,333,0 chrVII 28095 . C T 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.090;DP=114;Dels=0.00;FS=3.444;HaplotypeScore=5.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:114:99:1120,0,1289 chrVII 28127 . G A 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.116;DP=108;Dels=0.00;FS=4.898;HaplotypeScore=5.9379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=2.215;QD=10.81;ReadPosRankSum=2.153;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1197,0,1131 chrVII 28204 . T C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.337;DP=123;Dels=0.00;FS=6.923;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=0.874;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1063,0,1476 chrVII 28256 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.939;DP=131;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1087,0,1580 chrVII 28634 . T G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.143;DP=114;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=2.9680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=10.86;ReadPosRankSum=-2.164;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1268,0,1071 chrVII 28799 . C G 2577 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.51;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2610,279,0 chrVII 29011 . A G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.452;DP=96;Dels=0.00;FS=1.775;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:905,0,1155 chrVII 29079 . T C 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.460;DP=105;Dels=0.00;FS=1.567;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:983,0,1241 chrVII 29398 . C T 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.222;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:798,0,1158 chrVII 29571 . G A 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.546;DP=128;Dels=0.00;FS=9.934;HaplotypeScore=2.6000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.654;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1302,0,1303 chrVII 30029 . C T 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3584,372,0 chrVII 30591 . A G 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1982;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2762,294,0 chrVII 31473 . C A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.030;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1114,0,1278 chrVII 32037 . G A 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.450;DP=131;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.753;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1568,0,1099 chrVII 32155 . C A 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.100;DP=112;Dels=0.00;FS=6.075;HaplotypeScore=2.1593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.059;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:986,0,1334 chrVII 32862 . C T 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.793;DP=90;Dels=0.00;FS=11.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.583;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:973,0,981 chrVII 32898 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.060;DP=100;Dels=0.00;FS=1.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.265;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:100:99:1231,0,961 chrVII 33274 . C T 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.46;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2706,267,0 chrVII 33393 . A T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;DP=100;Dels=0.00;FS=1.620;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=11.13;ReadPosRankSum=2.349;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1143,0,1084 chrVII 33441 . G A 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2846,285,0 chrVII 33572 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.184;DP=128;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.647;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1431,0,1238 chrVII 33654 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.282;DP=116;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=3.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.602;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1326,0,1060 chrVII 33765 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.035;DP=101;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.445;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:1054,0,1095 chrVII 33815 . A C 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3196,333,0 chrVII 34019 . C T 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.50;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2842,285,0 chrVII 34081 . T C 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3174,327,0 chrVII 34247 . T C 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3387,348,0 chrVII 34292 . C G 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3655,381,0 chrVII 34666 . T C 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3235,330,0 chrVII 34691 . T C 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3242,342,0 chrVII 34702 . C A 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3428,346,0 chrVII 34805 . G A 2814 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2847,282,0 chrVII 34992 . G A 2513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2546,249,0 chrVII 35217 . A G 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.15;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2810,309,0 chrVII 35336 . C A 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3395,328,0 chrVII 35451 . C G 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.25;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2868,297,0 chrVII 35496 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.949;DP=97;Dels=0.00;FS=9.958;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.040;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1141,0,869 chrVII 35543 . T C 2061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.76;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2094,222,0 chrVII 35796 . G A 3996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3996,394,0 chrVII 35799 . G A 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3865,376,0 chrVII 35877 . A G 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2794,294,0 chrVII 35919 . A T 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2963,306,0 chrVII 36018 . C G 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3884,402,0 chrVII 36152 . A G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.753;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.032;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:905,0,1481 chrVII 36691 . T C 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3529,351,0 chrVII 36711 . A G 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3281,330,0 chrVII 36880 . G T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.344;DP=130;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1342,0,1290 chrVII 36979 . A C 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=24.86;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2966,315,0 chrVII 37058 . G A 4190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4190,412,0 chrVII 37094 . T C 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.855;DP=125;Dels=0.00;FS=3.244;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1577,0,1102 chrVII 37198 . A C 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3229,336,0 chrVII 37220 . C T 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.631;DP=92;Dels=0.00;FS=8.323;HaplotypeScore=3.4174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.062;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:927,0,982 chrVII 37229 . G A 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.987;DP=85;Dels=0.00;FS=2.970;HaplotypeScore=2.5105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.488;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:856,0,952 chrVII 37283 . T C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.270;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1021,0,1137 chrVII 37436 . A C 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3587,366,0 chrVII 37569 . T A 2022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.908;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,92:170:99:2052,0,1671 chrVII 37581 . T C 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.400;DP=153;Dels=0.00;FS=2.987;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.747;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1715,0,1530 chrVII 37655 . A T 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3912,394,0 chrVII 38036 . C T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.057;DP=136;Dels=0.00;FS=3.076;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.415;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:136:99:1368,0,1401 chrVII 38079 . G A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.109;DP=149;Dels=0.00;FS=3.035;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,61:149:99:1207,0,1797 chrVII 38202 . A G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.008;DP=126;Dels=0.00;FS=4.392;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1086,0,1500 chrVII 38265 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.945;DP=146;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.501;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1388,0,1754 chrVII 39197 . A G 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.088;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.074;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,48:127:99:876,0,1766 chrVII 39379 . C T 1772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.789;DP=123;Dels=0.00;FS=3.839;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.097;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,77:123:99:1802,0,791 chrVII 39412 . C T 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.040;DP=126;Dels=0.00;FS=2.345;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=13.77;ReadPosRankSum=-0.088;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,78:126:99:1765,0,892 chrVII 39454 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.168;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=11.48;ReadPosRankSum=2.056;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1189,0,1036 chrVII 39493 . C T 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.484;DP=110;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=4.3261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=11.05;ReadPosRankSum=-3.184;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1245,0,1087 chrVII 39549 . G A 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.647;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=10.17;ReadPosRankSum=2.729;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:905,0,883 chrVII 39775 . A G 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3748,387,0 chrVII 39784 . C T 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3497,343,0 chrVII 39973 . T C 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3481,360,0 chrVII 39988 . G A 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3378,328,0 chrVII 39991 . C T 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3337,328,0 chrVII 40063 . C T 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3604,370,0 chrVII 40138 . C T 5004.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=26.62;ReadPosRankSum=0.000;SB=-2.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,187:188:99:5004,476,0 chrVII 40655 . G C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3136,324,0 chrVII 40792 . T C 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6320;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3670,396,0 chrVII 41174 . A G 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=22.52;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3028,330,0 chrVII 41301 . G T 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.46;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3049,301,0 chrVII 41321 . C T 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.360;DP=115;Dels=0.00;FS=5.850;HaplotypeScore=2.7616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.589;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:115:99:1196,0,1256 chrVII 41395 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.894;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.569;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1253,0,1348 chrVII 41417 . A C 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.14;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3125,324,0 chrVII 41439 . C T 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.61;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3379,337,0 chrVII 41491 . T C 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3433,360,0 chrVII 42016 . A G 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.67;SB=-2.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4081,414,0 chrVII 42130 . C T 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.169;DP=160;Dels=0.00;FS=1.973;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.641;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1675,0,1714 chrVII 42721 . G A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.895;DP=121;Dels=0.00;FS=3.307;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.552;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1278,0,1270 chrVII 42910 . T C 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.027;DP=102;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.115;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:841,0,1295 chrVII 43204 . A T 582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;DP=83;Dels=0.00;FS=14.150;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.051;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:612,0,1184 chrVII 43308 . T G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.519;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=2.531;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:122:99:1100,0,857 chrVII 43365 . A C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.154;DP=135;Dels=0.00;FS=9.317;HaplotypeScore=2.7910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1104,0,1705 chrVII 43400 . A G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.728;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,77:164:99:1390,0,1900 chrVII 43525 . G A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.901;DP=127;Dels=0.00;FS=5.388;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.544;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1295,0,1442 chrVII 43798 . C T 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.106;DP=135;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.411;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:1848,0,1123 chrVII 44082 . A T 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.792;DP=108;Dels=0.00;FS=5.173;HaplotypeScore=4.6132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.056;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,42:108:99:789,0,1543 chrVII 44099 . C T 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.419;DP=117;Dels=0.00;FS=6.079;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.564;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:914,0,1545 chrVII 44224 . T C 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.584;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.812;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1394,0,1533 chrVII 44254 . C T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.529;DP=126;Dels=0.00;FS=2.282;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1493,0,1156 chrVII 44336 . G A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.095;DP=118;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1504,0,1067 chrVII 44898 . C T 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=1;QD=27.69;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2802,285,0 chrVII 45345 . T A 792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.072;DP=130;Dels=0.00;FS=6.857;HaplotypeScore=13.7078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.664;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:822,0,1091 chrVII 45371 . C T 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.459;DP=148;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:868,0,935 chrVII 45399 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.568;DP=133;Dels=0.00;FS=14.181;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=9.17;ReadPosRankSum=-2.113;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1250,0,1145 chrVII 45537 . C A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.938;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.209;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1311,0,1054 chrVII 45565 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.675;DP=122;Dels=0.00;FS=4.546;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=12.00;ReadPosRankSum=-1.204;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1494,0,1088 chrVII 45593 . C T 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.584;DP=127;Dels=0.00;FS=5.388;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.852;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1534,0,1267 chrVII 45639 . C T 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3493,352,0 chrVII 45669 . A T 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3332,340,0 chrVII 45694 . A G 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3485,357,0 chrVII 45723 . G A 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3455,339,0 chrVII 45763 . A G 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.007;DP=116;Dels=0.00;FS=5.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.058;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.382;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:1441,0,990 chrVII 46050 . A G 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.053;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.855;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1488,0,1339 chrVII 46197 . C T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.635;DP=119;Dels=0.00;FS=1.475;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=10.60;ReadPosRankSum=2.012;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1291,0,1217 chrVII 46230 . T C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.258;DP=95;Dels=0.00;FS=2.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.170;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1134,0,841 chrVII 46296 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.630;DP=99;Dels=0.00;FS=6.668;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.702;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,61:99:99:1224,0,799 chrVII 46456 . T C 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.923;DP=145;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.236;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1254,0,1771 chrVII 46524 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.694;DP=120;Dels=0.00;FS=4.530;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.384;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1169,0,1342 chrVII 46545 . A G 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.063;DP=141;Dels=0.00;FS=6.426;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1021,0,1694 chrVII 46634 . A G 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3506,363,0 chrVII 46890 . T C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.868;DP=123;Dels=0.00;FS=7.028;HaplotypeScore=4.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1135,0,1459 chrVII 46944 . T C 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.552;DP=114;Dels=0.00;FS=3.606;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.200;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:114:99:1387,0,1067 chrVII 47026 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.801;DP=126;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=11.66;ReadPosRankSum=-2.433;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1499,0,1146 chrVII 47565 . G C 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;DP=130;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.994;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1070,0,1430 chrVII 47922 . C G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;DP=130;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=3.5926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.057;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:963,0,1727 chrVII 47968 . A G 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.80;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3155,321,0 chrVII 47998 . A G 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.77;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3426,354,0 chrVII 48338 . T C 722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.528;DP=87;Dels=0.00;FS=12.921;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.566;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:752,0,925 chrVII 48681 . G A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.428;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.170;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,62:106:99:1425,0,870 chrVII 48835 . A T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;DP=117;Dels=0.00;FS=3.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=1;MQRankSum=1.494;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.126;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1540,0,1026 chrVII 49026 . A T 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.840;DP=124;Dels=0.00;FS=1.438;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.990;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,73:124:99:1653,0,1048 chrVII 49323 . C T 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.893;DP=156;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.921;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.666;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1750,0,1573 chrVII 49510 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.920;DP=124;Dels=0.00;FS=2.298;HaplotypeScore=3.4320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:1155,0,1496 chrVII 50143 . T A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.621;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1409,0,1121 chrVII 50346 . T A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.438;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.591;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1343,0,1617 chrVII 50451 . A C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.792;DP=127;Dels=0.00;FS=11.203;HaplotypeScore=3.5933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1351,0,1352 chrVII 50656 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.227;DP=117;Dels=0.00;FS=4.468;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.160;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1166,0,1348 chrVII 51531 . T C 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3220,333,0 chrVII 51897 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.531;DP=130;Dels=0.00;FS=7.419;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.819;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1308,0,1457 chrVII 51903 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.616;DP=132;Dels=0.00;FS=7.231;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1266,0,1448 chrVII 52267 . T C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.274;DP=141;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.136;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1525,0,1555 chrVII 52589 . G A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.488;DP=153;Dels=0.00;FS=4.955;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=1.824;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.582;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1421,0,1766 chrVII 52732 . T C 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.750;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.093;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1695,0,1720 chrVII 52740 . T A 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.585;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.704;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:159:99:1738,0,1728 chrVII 52959 . T C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.781;DP=140;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.391;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1243,0,1639 chrVII 53213 . T C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.221;DP=141;Dels=0.01;FS=6.945;HaplotypeScore=28.5064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=1;MQRankSum=2.115;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1157,0,1553 chrVII 53407 . A G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.082;DP=143;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.041;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1507,0,1438 chrVII 53419 . T C 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.500;DP=138;Dels=0.00;FS=5.154;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.788;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1530,0,1335 chrVII 53455 . G A 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.995;DP=134;Dels=0.00;FS=6.651;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1581,0,1112 chrVII 54056 . C T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.485;DP=144;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.618;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1695,0,1368 chrVII 54122 . G A 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.659;DP=154;Dels=0.00;FS=5.885;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,85:154:99:1834,0,1389 chrVII 54197 . A G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.206;DP=158;Dels=0.00;FS=4.714;HaplotypeScore=9.7678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.269;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.076;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:158:99:1427,0,1844 chrVII 54246 . T G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.320;DP=156;Dels=0.00;FS=7.066;HaplotypeScore=9.9201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=1;MQRankSum=1.609;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.334;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:156:99:1472,0,1829 chrVII 54324 . G C 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.941;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1481,0,1375 chrVII 54455 . C G 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;DP=171;Dels=0.00;FS=3.526;HaplotypeScore=3.4791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,90:171:99:1865,0,1578 chrVII 54561 . A G 1941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.905;DP=200;Dels=0.00;FS=3.196;HaplotypeScore=6.5584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.803;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,99:200:99:1971,0,2140 chrVII 54690 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.212;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.826;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1094,0,1189 chrVII 54816 . A G 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.986;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1692,0,1636 chrVII 54821 . T G 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.480;DP=161;Dels=0.00;FS=1.228;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1696,0,1610 chrVII 54879 . A G 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.718;DP=160;Dels=0.00;FS=1.972;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.563;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1736,0,1665 chrVII 54933 . G A 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.066;DP=195;Dels=0.00;FS=1.111;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.342;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,94:195:99:1854,0,2048 chrVII 55015 . G T 3767.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.93;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3767,379,0 chrVII 55016 . C T 1677.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.116;DP=138;Dels=0.00;FS=10.794;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.773;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1707,0,1253 chrVII 55023 . C T 1487.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.455;DP=141;Dels=0.00;FS=6.520;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.830;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.408;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1517,0,1282 chrVII 55107 . G A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.161;DP=150;Dels=0.00;FS=4.922;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.225;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:150:99:1219,0,1798 chrVII 55152 . C T 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.104;DP=165;Dels=0.01;FS=4.603;HaplotypeScore=4.7701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1680,0,1699 chrVII 55299 . G A 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.879;DP=143;Dels=0.00;FS=6.407;HaplotypeScore=3.5541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.291;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,80:143:99:1806,0,1160 chrVII 55419 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.960;DP=110;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.565;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.039;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1172,0,1147 chrVII 55455 . C A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.600;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.165;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1009,0,1522 chrVII 55464 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.642;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1085,0,1580 chrVII 55850 . G A 1995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.418;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.758;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,96:191:99:2025,0,2029 chrVII 55935 . C G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.280;DP=155;Dels=0.00;FS=3.001;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1489,0,1642 chrVII 56041 . C T 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.591;DP=170;Dels=0.00;FS=2.764;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=2.410;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.002;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,89:170:99:1872,0,1660 chrVII 56063 . C G 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;DP=176;Dels=0.00;FS=3.601;HaplotypeScore=2.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,87:176:99:1744,0,1698 chrVII 56091 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.054;DP=145;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=4.8036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.957;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,62:145:99:1248,0,1738 chrVII 56095 . A T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.811;DP=142;Dels=0.00;FS=2.113;HaplotypeScore=4.8036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.088;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1319,0,1728 chrVII 56199 . C T 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.136;DP=134;Dels=0.01;FS=13.606;HaplotypeScore=6.7857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.877;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1555,0,1263 chrVII 56406 . C A 1955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.814;DP=180;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=4.6784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.958;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,91:180:99:1985,0,1627 chrVII 56448 . A C 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.983;DP=158;Dels=0.00;FS=10.806;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.459;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,78:158:99:1478,0,1727 chrVII 58086 . G A 1830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.396;DP=157;Dels=0.00;FS=6.085;HaplotypeScore=5.8475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.081;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,90:157:99:1860,0,1323 chrVII 58485 . A G 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.515;DP=151;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1544,0,1608 chrVII 59068 . A T 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.681;DP=110;Dels=0.00;FS=2.719;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1182,0,1175 chrVII 59379 . T C 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.364;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:854,0,1252 chrVII 59601 . A G 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.875;DP=82;Dels=0.00;FS=0.845;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:795,0,1008 chrVII 59754 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.355;DP=92;Dels=0.00;FS=3.968;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=10.89;ReadPosRankSum=-2.506;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1032,0,898 chrVII 59802 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.740;DP=81;Dels=0.00;FS=0.833;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.850;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,43:81:99:888,0,819 chrVII 60011 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.849;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=1;MQRankSum=2.061;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1276,0,1201 chrVII 60093 . G A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.847;DP=114;Dels=0.00;FS=5.034;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=2.030;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1245,0,1192 chrVII 60096 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.462;DP=116;Dels=0.00;FS=4.913;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.137;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1260,0,1233 chrVII 60240 . C A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.859;DP=126;Dels=0.00;FS=10.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.367;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1587,0,1075 chrVII 60270 . C T 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.135;DP=132;Dels=0.00;FS=7.113;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.661;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1719,0,1103 chrVII 60280 . C T 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.228;DP=130;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.664;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,76:130:99:1791,0,1059 chrVII 60719 . G A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.832;DP=133;Dels=0.00;FS=3.327;HaplotypeScore=2.8004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.968;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1203,0,1439 chrVII 60729 . T C 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6773;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3336,339,0 chrVII 61022 . A C 641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.989;DP=66;Dels=0.00;FS=3.361;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,33:66:99:671,0,788 chrVII 61065 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.914;DP=102;Dels=0.00;FS=6.144;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1068,0,1060 chrVII 61140 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.412;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1178,0,1034 chrVII 61349 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.345;DP=121;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.912;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1090,0,1409 chrVII 61936 . C T 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5493;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2485,252,0 chrVII 62369 . T C 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.169;DP=110;Dels=0.00;FS=1.560;HaplotypeScore=2.8963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=7.72;ReadPosRankSum=-2.557;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:110:99:879,0,1301 chrVII 62452 . C G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;DP=91;Dels=0.00;FS=5.601;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.338;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:986,0,924 chrVII 62592 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.009;DP=89;Dels=0.00;FS=7.385;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.467;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1081,0,804 chrVII 62921 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.295;DP=120;Dels=0.00;FS=3.354;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.426;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:980,0,1637 chrVII 63041 . T A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.319;DP=136;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=4.6575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.004;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1353,0,1603 chrVII 63459 . A T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.477;DP=102;Dels=0.00;FS=2.544;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1205,0,1011 chrVII 64305 . A G 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.375;DP=108;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=0.841;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:976,0,1292 chrVII 64633 . A T 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=87;Dels=0.00;FS=7.686;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:706,0,1116 chrVII 65104 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.093;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.474;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1186,0,1162 chrVII 65202 . A C 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.831;DP=113;Dels=0.00;FS=2.546;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1025,0,1459 chrVII 65331 . G T 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.978;DP=103;Dels=0.00;FS=2.582;HaplotypeScore=2.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=10.25;ReadPosRankSum=2.873;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1086,0,1068 chrVII 65487 . T C 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.133;DP=95;Dels=0.00;FS=3.873;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.462;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:917,0,1170 chrVII 65688 . G A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.595;DP=122;Dels=0.00;FS=13.395;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=3.494;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1261,0,1315 chrVII 65790 . A G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.128;DP=123;Dels=0.00;FS=9.930;HaplotypeScore=7.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.133;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:123:99:1288,0,1232 chrVII 65798 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.652;DP=123;Dels=0.00;FS=9.803;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.752;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1431,0,1196 chrVII 65864 . T C 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.103;DP=118;Dels=0.00;FS=4.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.930;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1251,0,1282 chrVII 65909 . A C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.072;DP=119;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1259,0,1295 chrVII 66126 . T G 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3505,387,0 chrVII 66234 . A G 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.049;DP=122;Dels=0.00;FS=3.247;HaplotypeScore=6.6950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.724;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1442,0,1128 chrVII 66390 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.259;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1305,0,1279 chrVII 66605 . G A 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3191,322,0 chrVII 66617 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.426;DP=131;Dels=0.00;FS=2.224;HaplotypeScore=1.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.076;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1159,0,1550 chrVII 66622 . T C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.741;DP=134;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.266;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1124,0,1660 chrVII 66712 . G C 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3340,333,0 chrVII 66921 . G A 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.239;DP=132;Dels=0.00;FS=2.260;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.731;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1283,0,1430 chrVII 67009 . G A 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3868,373,0 chrVII 67083 . G C 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.169;DP=146;Dels=0.00;FS=6.102;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1450,0,1413 chrVII 67253 . T C 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3549,351,0 chrVII 67526 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.322;DP=112;Dels=0.00;FS=2.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.247;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1188,0,1245 chrVII 67624 . A G 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3541,372,0 chrVII 67903 . A G 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.340;DP=148;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1573,0,1567 chrVII 68009 . T A 1929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;DP=152;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=2.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,93:152:99:1959,0,1181 chrVII 68067 . A G 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.210;DP=119;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=3.008;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1354,0,1130 chrVII 68203 . T C 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3411,375,0 chrVII 68211 . G A 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3781,391,0 chrVII 68385 . G A 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.332;DP=164;Dels=0.00;FS=4.609;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.618;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,76:164:99:1590,0,1821 chrVII 68405 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.484;DP=156;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1612,0,1707 chrVII 68542 . T C 4099.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4099,426,0 chrVII 68680 . A C 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.051;DP=153;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=6.1876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1487,0,1644 chrVII 68806 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.073;DP=144;Dels=0.00;FS=3.865;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.295;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1473,0,1523 chrVII 68875 . A G 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.115;DP=141;Dels=0.00;FS=6.719;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.082;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1681,0,1442 chrVII 69074 . A C 705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.063;DP=96;Dels=0.00;FS=2.745;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=1.743;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.607;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:735,0,1276 chrVII 69214 . A T 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.121;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.2361;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=25.17;ReadPosRankSum=1.208;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3028,282,0 chrVII 69249 . G T 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=25.19;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2829,291,0 chrVII 69315 . T C 2224 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;QD=21.18;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2257,231,0 chrVII 69424 . T C 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.266;DP=116;Dels=0.00;FS=7.837;HaplotypeScore=11.9300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.117;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.026;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:116:99:843,0,1164 chrVII 69973 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.868;DP=97;Dels=0.00;FS=16.410;HaplotypeScore=2.5900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.406;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,56:97:99:1152,0,858 chrVII 70177 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.886;DP=115;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.848;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1364,0,1000 chrVII 70183 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.136;DP=116;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.091;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1190,0,1120 chrVII 70474 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.347;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1218,0,1214 chrVII 70531 . A G 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.767;DP=146;Dels=0.00;FS=4.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.951;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1429,0,1628 chrVII 70537 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.244;DP=145;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.326;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1479,0,1568 chrVII 70633 . T A 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.114;DP=120;Dels=0.00;FS=6.322;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1473,0,1153 chrVII 70735 . A C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.783;DP=124;Dels=0.00;FS=4.340;HaplotypeScore=6.5170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.638;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1237,0,1369 chrVII 70828 . A G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.469;DP=130;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=4.8349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.144;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1207,0,1425 chrVII 70861 . T C 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.732;DP=126;Dels=0.00;FS=3.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.582;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1311,0,1244 chrVII 71083 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.493;DP=110;Dels=0.00;FS=4.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.438;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1202,0,1138 chrVII 71095 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.322;DP=116;Dels=0.00;FS=5.819;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.088;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1172,0,1299 chrVII 71125 . C T 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;DP=108;Dels=0.00;FS=9.157;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.080;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.088;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:108:99:913,0,1127 chrVII 71209 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.272;DP=120;Dels=0.00;FS=3.412;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1289,0,1151 chrVII 71410 . G A 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3329,331,0 chrVII 72088 . G A 739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.747;DP=85;Dels=0.00;FS=2.947;HaplotypeScore=1.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.573;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:769,0,1055 chrVII 72738 . A G 2488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2521,267,0 chrVII 72788 . G A 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3122,318,0 chrVII 72874 . C T 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;DP=96;Dels=0.00;FS=3.102;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=26.23;ReadPosRankSum=1.696;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2551,243,0 chrVII 73077 . G A 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3489,357,0 chrVII 73118 . C G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;DP=134;Dels=0.00;FS=10.819;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=9.00;ReadPosRankSum=-1.681;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1236,0,1482 chrVII 73206 . C T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.514;DP=121;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.061;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1058,0,1482 chrVII 73220 . C T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.592;DP=127;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1194,0,1386 chrVII 73286 . A G 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.619;DP=103;Dels=0.00;FS=1.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.030;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1001,0,1144 chrVII 73336 . G A 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.029;DP=91;Dels=0.00;FS=1.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.843;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:846,0,1075 chrVII 73338 . A G 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.956;DP=99;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:760,0,1223 chrVII 73349 . C T 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.660;DP=110;Dels=0.00;FS=1.611;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=3.014;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.147;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1278,0,897 chrVII 73362 . G T 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.305;DP=116;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=3.4804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.462;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:935,0,1362 chrVII 73438 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.538;DP=127;Dels=0.00;FS=8.226;HaplotypeScore=2.8195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.877;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1093,0,1484 chrVII 73493 . C G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3168,321,0 chrVII 73615 . A G 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3055,321,0 chrVII 73684 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.632;DP=157;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.344;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.032;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,71:157:99:1339,0,1866 chrVII 74049 . A G 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.775;DP=109;Dels=0.00;FS=9.626;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=-2.517;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:835,0,1181 chrVII 74173 . A T 94.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;DP=133;Dels=0.00;FS=35.302;HaplotypeScore=14.9028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=-5.051;QD=0.71;ReadPosRankSum=-6.419;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,17:133:99:124,0,2287 chrVII 74322 . A G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.773;DP=92;Dels=0.00;FS=4.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.768;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:983,0,916 chrVII 74365 . C T 2373 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.04;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2406,246,0 chrVII 74414 . G A 2239 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.13;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2272,231,0 chrVII 74421 . A G 915.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.010;DP=93;Dels=0.00;FS=1.755;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.31;MQ0=0;MQRankSum=-3.038;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:945,0,858 chrVII 74423 . G T 985.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.021;DP=93;Dels=0.00;FS=1.729;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.31;MQ0=0;MQRankSum=-3.001;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1015,0,803 chrVII 74439 . C T 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.461;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.278;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.215;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1142,0,931 chrVII 74453 . T G 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.730;DP=109;Dels=0.00;FS=9.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.961;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1283,0,1013 chrVII 74547 . A G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.178;DP=117;Dels=0.00;FS=7.154;HaplotypeScore=3.7984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=1.852;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.854;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1153,0,1324 chrVII 74670 . A G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.701;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=8.77;ReadPosRankSum=2.322;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1276,0,1658 chrVII 74769 . G A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.720;DP=111;Dels=0.00;FS=1.063;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.421;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.823;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1129,0,1206 chrVII 74942 . T G 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7231;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2841,297,0 chrVII 74964 . C T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.592;DP=113;Dels=0.00;FS=7.715;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1107,0,1233 chrVII 74983 . A G 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2756,285,0 chrVII 74987 . A G 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.698;DP=116;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.176;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1372,0,1018 chrVII 75064 . G T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.356;DP=139;Dels=0.00;FS=4.044;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1371,0,1572 chrVII 75107 . G A 1832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.936;DP=156;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.453;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1862,0,1484 chrVII 75209 . T C 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2960,315,0 chrVII 75210 . A G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.822;DP=120;Dels=0.00;FS=4.695;HaplotypeScore=3.4681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.024;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:120:99:1111,0,1259 chrVII 75261 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.146;DP=112;Dels=0.00;FS=10.694;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:1005,0,1305 chrVII 75280 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.806;DP=97;Dels=0.00;FS=12.303;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=2.338;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.377;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1117,0,840 chrVII 75286 . C G 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;DP=106;Dels=0.00;FS=5.066;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:887,0,1207 chrVII 75292 . A G 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.888;DP=101;Dels=0.00;FS=5.111;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:831,0,1213 chrVII 75341 . T C 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.127;DP=91;Dels=0.00;FS=2.844;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:889,0,945 chrVII 75351 . A T 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.668;DP=93;Dels=0.00;FS=0.790;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:866,0,1027 chrVII 75358 . C G 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.519;DP=99;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=2.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:99:99:916,0,978 chrVII 75428 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.142;DP=109;Dels=0.00;FS=1.576;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.897;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1222,0,1045 chrVII 75458 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.106;DP=132;Dels=0.00;FS=3.142;HaplotypeScore=5.9380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1139,0,1569 chrVII 75494 . G T 46.06 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.849;DP=108;Dels=0.00;FS=1.564;HaplotypeScore=2.9483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=0.43;ReadPosRankSum=1.178;SB=-4.341e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:16:76,0,16 chrVII 75619 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.520;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.661;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1242,0,1204 chrVII 75625 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.683;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.126;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1138,0,1302 chrVII 75663 . T C 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.168;DP=92;Dels=0.00;FS=5.911;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.876;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:792,0,1119 chrVII 75791 . C T 1291 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=28.07;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1324,132,0 chrVII 76021 . A T 2600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2633,258,0 chrVII 76069 . G T 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.353;DP=145;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=2.5633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.699;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1441,0,1486 chrVII 76149 . G A 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.358;DP=141;Dels=0.00;FS=3.227;HaplotypeScore=2.8757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1640,0,1305 chrVII 76241 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.819;DP=150;Dels=0.00;FS=6.853;HaplotypeScore=3.7647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.021;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,66:150:99:1248,0,1843 chrVII 76247 . A G 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQ0=0;QD=25.74;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3578,372,0 chrVII 76490 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.303;DP=134;Dels=0.00;FS=3.207;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=7.90;ReadPosRankSum=-1.653;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,54:134:99:1088,0,1759 chrVII 76512 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.485;DP=151;Dels=0.00;FS=17.563;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.801;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.493;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,56:151:99:1139,0,2162 chrVII 76519 . G A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.060;DP=144;Dels=0.00;FS=2.670;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.512;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,59:144:99:1205,0,1914 chrVII 76600 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.539;DP=128;Dels=0.00;FS=5.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.091;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1162,0,1466 chrVII 76663 . G C 2138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2171,243,0 chrVII 76882 . T C 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=22.92;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3059,318,0 chrVII 76989 . T C 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2935,306,0 chrVII 77025 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.923;DP=138;Dels=0.00;FS=2.218;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.992;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1329,0,1497 chrVII 77052 . C T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.705;DP=127;Dels=0.00;FS=4.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.944;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1292,0,1299 chrVII 77580 . G A 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.883;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1549,0,1236 chrVII 77983 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.679;DP=114;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1231,0,904 chrVII 78029 . A G 643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.658;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.616;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,36:87:99:673,0,1153 chrVII 78636 . G A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.390;DP=130;Dels=0.00;FS=7.024;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.115;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1133,0,1575 chrVII 78859 . A G 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3299,330,0 chrVII 78965 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.365;DP=122;Dels=0.00;FS=0.810;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=-4.634;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1232,0,1024 chrVII 78970 . T C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.782;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=-5.034;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1051,0,1161 chrVII 78986 . A C 603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.598;DP=88;Dels=0.00;FS=1.984;HaplotypeScore=25.1543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.06;MQ0=0;MQRankSum=-6.146;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:633,0,1022 chrVII 79017 . T C 230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.544;DP=83;Dels=0.00;FS=8.717;HaplotypeScore=359.8308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.99;MQ0=3;MQRankSum=-1.266;QD=2.77;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:260,0,392 chrVII 79107 . T C 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9212;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=1;QD=24.05;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3183,327,0 chrVII 79268 . A G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.192;DP=118;Dels=0.00;FS=4.412;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1348,0,1168 chrVII 79358 . T C 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.764;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,82:147:99:1775,0,1425 chrVII 79504 . T G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.086;DP=114;Dels=0.00;FS=4.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.842;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1106,0,1362 chrVII 79586 . C A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.921;DP=123;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.028;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1146,0,1470 chrVII 79663 . G A 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.206;DP=104;Dels=0.00;FS=1.584;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.599;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:1002,0,1266 chrVII 80122 . T C 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3356,354,0 chrVII 80282 . A G 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.457;DP=121;Dels=0.00;FS=8.300;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.318;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1126,0,1438 chrVII 80305 . A G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=112;Dels=0.00;FS=9.155;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.629;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1222,0,1226 chrVII 80505 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.995;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.948;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1257,0,1231 chrVII 80643 . T C 567.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.147;DP=80;Dels=0.00;FS=3.294;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.793;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:80:99:597,0,483 chrVII 80653 . G A 657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.545;DP=86;Dels=0.00;FS=10.061;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=2.222;QD=7.64;ReadPosRankSum=1.565;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:687,0,520 chrVII 80674 . T C 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.899;DP=81;Dels=0.00;FS=13.183;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:729,0,739 chrVII 80875 . C A,T 2447.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,53,48:101:99:2507,1172,1022,1335,0,1206 chrVII 80909 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.890;DP=99;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.340;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1110,0,985 chrVII 80976 . T A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;DP=149;Dels=0.00;FS=3.853;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1421,0,1681 chrVII 81094 . T C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.631;DP=136;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1443,0,1331 chrVII 81260 . T C 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.346;DP=140;Dels=0.00;FS=2.181;HaplotypeScore=4.3743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1028,0,1826 chrVII 81268 . G A 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.782;DP=135;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.937;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1667,0,1135 chrVII 81306 . T A 4214.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4174;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=24.79;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4214,423,0 chrVII 81381 . G A 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.091;DP=138;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1455,0,1419 chrVII 82731 . G C 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.509;DP=143;Dels=0.00;FS=3.418;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.828;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1549,0,1364 chrVII 82858 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.035;DP=145;Dels=0.00;FS=4.011;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,60:145:99:1169,0,1928 chrVII 83286 . A T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;DP=143;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1467,0,1406 chrVII 84203 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.940;DP=113;Dels=0.00;FS=4.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.324;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1169,0,1199 chrVII 84308 . T C 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.768;DP=141;Dels=0.00;FS=1.352;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1149,0,1772 chrVII 84678 . A T 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.950;DP=154;Dels=0.00;FS=3.477;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1685,0,1690 chrVII 84714 . T A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.063;DP=131;Dels=0.00;FS=3.210;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.953;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1377,0,1561 chrVII 84785 . A G 379.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.297;DP=99;Dels=0.00;FS=36.176;HaplotypeScore=10.0418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,38:99:99:409,0,1217 chrVII 85120 . A G 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.672;DP=163;Dels=0.00;FS=5.618;HaplotypeScore=2.6461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.655;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,82:163:99:1692,0,1836 chrVII 85190 . A C 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.153;DP=158;Dels=0.00;FS=5.778;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.219;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1542,0,1727 chrVII 85238 . G A 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.737;DP=160;Dels=0.00;FS=2.818;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1790,0,1580 chrVII 85271 . C T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.307;DP=139;Dels=0.00;FS=6.844;HaplotypeScore=2.7724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1397,0,1501 chrVII 85337 . C T 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.606;DP=154;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.943;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1686,0,1510 chrVII 85539 . C T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.998;DP=149;Dels=0.00;FS=4.329;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=8.48;ReadPosRankSum=-2.181;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,63:149:99:1294,0,1855 chrVII 85628 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.068;DP=113;Dels=0.00;FS=12.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.371;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1337,0,1047 chrVII 86297 . C T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.670;DP=118;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.220;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:118:99:1303,0,1100 chrVII 86321 . T C 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.024;DP=150;Dels=0.00;FS=2.989;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.850;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1560,0,1554 chrVII 86411 . A C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.935;DP=133;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.565;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1269,0,1441 chrVII 86533 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.264;DP=120;Dels=0.00;FS=8.613;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1242,0,1057 chrVII 86574 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.474;DP=134;Dels=0.00;FS=4.139;HaplotypeScore=3.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=3.269;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.792;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1357,0,1268 chrVII 86645 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.525;DP=129;Dels=0.00;FS=5.458;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.477;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1449,0,1245 chrVII 86720 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.806;DP=123;Dels=0.00;FS=1.701;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.331;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:123:99:1265,0,1358 chrVII 86891 . T C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.200;DP=124;Dels=0.00;FS=3.298;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.259;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1500,0,1168 chrVII 87038 . G T 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.932;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.084;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,77:125:99:1570,0,881 chrVII 87051 . C A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.875;DP=129;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.276;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,78:129:99:1605,0,911 chrVII 87769 . A G 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4974;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3198,345,0 chrVII 87882 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.451;DP=143;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=109.9526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.555;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,80:143:99:1481,0,1308 chrVII 87949 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.599;DP=140;Dels=0.00;FS=1.353;HaplotypeScore=13.8872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.501;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1442,0,1250 chrVII 88301 . T C 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3824,376,0 chrVII 88664 . C T 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3651,370,0 chrVII 88681 . A G 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3685,390,0 chrVII 88718 . T C 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.394;DP=134;Dels=0.00;FS=6.551;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1456,0,1466 chrVII 89295 . T C 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.653;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.264;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1254,0,1285 chrVII 89311 . A G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.999;DP=135;Dels=0.00;FS=1.365;HaplotypeScore=1.8633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.407;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1276,0,1433 chrVII 89339 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.895;DP=140;Dels=0.00;FS=2.201;HaplotypeScore=5.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.117;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:140:99:1335,0,1572 chrVII 90087 . G A 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.933;DP=129;Dels=0.00;FS=3.516;HaplotypeScore=2.8265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.999;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.314;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:129:99:1639,0,1113 chrVII 90290 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.383;DP=139;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.000;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1452,0,1383 chrVII 90444 . A G 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.701;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.031;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,83:143:99:1709,0,1184 chrVII 90761 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.237;DP=137;Dels=0.00;FS=12.393;HaplotypeScore=3.9737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1430,0,1459 chrVII 91031 . C T 4095.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.154;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7568;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.387;QD=25.92;ReadPosRankSum=2.247;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,156:158:99:4095,387,0 chrVII 91652 . G T 4276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.76;SB=-2.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4276,424,0 chrVII 91958 . T C 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.102;DP=158;Dels=0.00;FS=4.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.217;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1587,0,1746 chrVII 91977 . G A 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.579;DP=149;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.946;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1547,0,1574 chrVII 92135 . C T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.674;DP=161;Dels=0.00;FS=2.910;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.428;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,71:161:99:1460,0,1841 chrVII 92390 . A T 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.65;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3659,379,0 chrVII 92485 . T C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.531;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.158;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1280,0,1257 chrVII 92820 . G A 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.080;DP=151;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1455,0,1686 chrVII 92844 . A T 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;DP=149;Dels=0.00;FS=2.888;HaplotypeScore=6.9349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1713,0,1401 chrVII 92892 . T C 4237.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.22;SB=-2.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4237,450,0 chrVII 93397 . G A 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3705,372,0 chrVII 94586 . T C 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.149;DP=176;Dels=0.00;FS=2.801;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,83:176:99:1637,0,2105 chrVII 94635 . A G 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.558;DP=164;Dels=0.00;FS=6.752;HaplotypeScore=2.5466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.691;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.957;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1629,0,1790 chrVII 94647 . A G 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.943;DP=160;Dels=0.00;FS=9.581;HaplotypeScore=5.5329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.776;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,80:160:99:1609,0,1792 chrVII 94727 . A G 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.421;DP=174;Dels=0.00;FS=6.529;HaplotypeScore=4.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,89:174:99:1910,0,1747 chrVII 94815 . C G 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;DP=163;Dels=0.00;FS=4.709;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,85:163:99:1672,0,1489 chrVII 95005 . T A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.782;DP=143;Dels=0.00;FS=2.123;HaplotypeScore=5.2860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=8.78;ReadPosRankSum=-2.417;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1285,0,1563 chrVII 95112 . A G 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.300;DP=145;Dels=0.00;FS=3.915;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1594,0,1369 chrVII 95130 . G T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.323;DP=154;Dels=0.00;FS=2.055;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1423,0,1654 chrVII 95334 . G A 1845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.444;DP=158;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=4.5965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.991;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1875,0,1375 chrVII 95396 . G C 1782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.001;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.542;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,86:171:99:1812,0,1683 chrVII 95510 . T C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.412;DP=117;Dels=0.00;FS=3.580;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1129,0,1265 chrVII 95788 . T C 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.787;DP=151;Dels=0.00;FS=3.315;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=-1.145;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.697;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1538,0,1698 chrVII 96007 . T A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;DP=149;Dels=0.00;FS=4.850;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.078;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1514,0,1731 chrVII 96070 . G A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.729;DP=136;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1194,0,1641 chrVII 96091 . G A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.584;DP=142;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.458;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,53:142:99:1080,0,1931 chrVII 96214 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.321;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.623;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:1175,0,1609 chrVII 96337 . T C 1957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.559;DP=173;Dels=0.00;FS=4.494;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.797;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,100:173:99:1987,0,1429 chrVII 96869 . G A 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3291,342,0 chrVII 96970 . A G 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.871;DP=125;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1104,0,1501 chrVII 97016 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.341;DP=128;Dels=0.00;FS=11.950;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1502,0,1196 chrVII 97113 . C A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.742;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=9.52;ReadPosRankSum=2.412;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1458,0,1749 chrVII 97616 . T C 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3767,384,0 chrVII 97818 . T A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.834;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1225,0,1317 chrVII 97982 . C T 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=141;Dels=0.00;FS=3.167;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=27.69;ReadPosRankSum=1.585;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3904,400,0 chrVII 98012 . T A 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3340,348,0 chrVII 98090 . C A 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.424;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:147:99:3674,370,0 chrVII 98124 . G T 4169.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.89;SB=-2.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4169,430,0 chrVII 98211 . A C 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;DP=179;Dels=0.00;FS=3.313;HaplotypeScore=2.1557;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.642;SB=-2.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,178:179:99:3918,397,0 chrVII 98228 . G T 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3575,361,0 chrVII 98329 . G A 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=22.47;SB=-2.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:3864,379,0 chrVII 98330 . C T 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=22.14;SB=-2.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:3808,379,0 chrVII 98387 . T G 4295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:169:99:4295,430,0 chrVII 98456 . G A 4417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.93;MQ0=0;QD=26.93;SB=-2.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4417,436,0 chrVII 98492 . C T 4943.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=26.72;SB=-2.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4943,499,0 chrVII 98507 . A G 4099.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4099,441,0 chrVII 98592 . A C 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.73;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3347,366,0 chrVII 98608 . G C 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=113.7439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.79;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3247,357,0 chrVII 98668 . A C 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.43;MQ0=0;QD=25.20;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3234,345,0 chrVII 98671 . C T 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.74;MQ0=0;QD=26.03;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3462,360,0 chrVII 98756 . A C 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.21;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4168,444,0 chrVII 98879 . G A 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3195,327,0 chrVII 98918 . C T 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4054,397,0 chrVII 98947 . G A 4156.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.620;DP=155;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=5.4715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=26.81;ReadPosRankSum=1.643;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:4156,421,0 chrVII 99026 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.852;DP=151;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=9.68;ReadPosRankSum=-2.777;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1492,0,1624 chrVII 99292 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.959;DP=137;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1259,0,1591 chrVII 99303 . T A 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8357;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:135:99:3582,358,0 chrVII 99361 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.372;DP=135;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=3.5018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.729;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:135:99:1192,0,1577 chrVII 99508 . A G 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.620;DP=132;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.740;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,75:132:99:1630,0,1210 chrVII 99853 . T C 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.007;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.690;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1386,0,1436 chrVII 100110 . T C 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8037;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2758,294,0 chrVII 100285 . C G 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3010,324,0 chrVII 100351 . T A 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2830,282,0 chrVII 100485 . A G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.699;DP=132;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1194,0,1625 chrVII 100684 . A G 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3097,333,0 chrVII 100717 . A G 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2957,312,0 chrVII 100756 . T C 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.36;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2827,294,0 chrVII 100825 . C T 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2657,270,0 chrVII 100858 . C T 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3314,345,0 chrVII 100904 . T C 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=1;QD=26.17;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3298,345,0 chrVII 101050 . A G 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3865,423,0 chrVII 101053 . T C 3939.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3939,420,0 chrVII 101815 . T C 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4179,432,0 chrVII 101923 . T C 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3506,351,0 chrVII 102020 . G C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.565;DP=126;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.349;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1339,0,1229 chrVII 102109 . G A 4132.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.32;SB=-2.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4132,385,0 chrVII 102229 . C G 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;DP=140;Dels=0.00;FS=3.327;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1579,0,1399 chrVII 102510 . G A 2346 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=17.91;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2379,252,0 chrVII 102955 . C G 3842.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=1;QD=26.14;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3842,408,0 chrVII 103278 . G A 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3667,355,0 chrVII 103776 . A G 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3256,348,0 chrVII 103842 . C T 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4306;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=25.66;ReadPosRankSum=1.330;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:139:99:3567,361,0 chrVII 103858 . T C 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3798,396,0 chrVII 103929 . A G 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.792;DP=136;Dels=0.00;FS=8.316;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.326;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1540,0,1383 chrVII 104051 . G T 187.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.911;DP=135;Dels=0.00;FS=253.129;HaplotypeScore=5.2334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=1.39;ReadPosRankSum=-7.947;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,41:135:99:217,0,1803 chrVII 104154 . A G 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3633,384,0 chrVII 104271 . A G 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7235;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3861,420,0 chrVII 104466 . C T 4700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.11;SB=-2.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4700,466,0 chrVII 104478 . T C 4546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.40;SB=-2.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4546,465,0 chrVII 104541 . T C 4485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=27.02;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4485,472,0 chrVII 104760 . G A 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3676,379,0 chrVII 104775 . G A 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=28.04;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4150,427,0 chrVII 104960 . T C 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3632,378,0 chrVII 105018 . G A 3882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3882,403,0 chrVII 105105 . T C 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2832,300,0 chrVII 105177 . G A 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2519,258,0 chrVII 105270 . T C 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3312,348,0 chrVII 105393 . C T 4338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6392;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=1;QD=26.61;SB=-2.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4338,424,0 chrVII 105414 . A G 4222.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=1;QD=25.59;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4222,429,0 chrVII 105492 . C T 4111.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.86;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4111,394,0 chrVII 105549 . T C 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3358,345,0 chrVII 105594 . T C 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3325,354,0 chrVII 106068 . C T 3573.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3573,366,0 chrVII 106124 . G A 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.671;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=-0.875;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.149;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1712,0,1470 chrVII 106214 . A G 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:118:99:3066,318,0 chrVII 106314 . C T 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3060,301,0 chrVII 106438 . A G 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2872,309,0 chrVII 106548 . G A 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=3.7149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3166,300,0 chrVII 106692 . C T 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2566,258,0 chrVII 106704 . T C 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.76;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2532,261,0 chrVII 106751 . C T 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2624,253,0 chrVII 106941 . T G 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3278,351,0 chrVII 107169 . C T 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.32;SB=-2.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:142:99:3880,382,0 chrVII 107461 . A G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3177,345,0 chrVII 107657 . A G 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2961,315,0 chrVII 107757 . T G 2628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.28;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2661,285,0 chrVII 107795 . A C 2240 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2273,243,0 chrVII 107810 . C T 2235 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2268,231,0 chrVII 107814 . C T 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2488,252,0 chrVII 108005 . A G 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.338;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3447,323,0 chrVII 108238 . G C 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2914,306,0 chrVII 108239 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.375;DP=122;Dels=0.00;FS=3.331;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=2.422;QD=8.34;ReadPosRankSum=2.294;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1047,0,1421 chrVII 108343 . A G 3973.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=155;Dels=0.00;FS=3.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.101;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:3973,384,0 chrVII 108349 . T C 4094.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;DP=162;Dels=0.00;FS=3.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=25.27;ReadPosRankSum=0.962;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4094,392,0 chrVII 108369 . A C 4289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4289,441,0 chrVII 108374 . A C 4671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4671,471,0 chrVII 108464 . G A 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2868,285,0 chrVII 108556 . G A 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:157:99:4083,397,0 chrVII 108797 . G A 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3131,315,0 chrVII 109424 . T G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2974,300,0 chrVII 109776 . T C 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3474,372,0 chrVII 109784 . G A 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3636,378,0 chrVII 109841 . C T 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3671,358,0 chrVII 109972 . T C 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2820,294,0 chrVII 110008 . T A 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2955,298,0 chrVII 110083 . C T 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.44;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3127,313,0 chrVII 110518 . A T 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.659;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=25.54;ReadPosRankSum=1.466;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:144:99:3678,340,0 chrVII 110545 . T G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.488;DP=116;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=8.87;ReadPosRankSum=-3.418;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1059,0,1387 chrVII 110740 . A G 1738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.45;MQ0=0;QD=24.48;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1771,186,0 chrVII 110976 . T C 358 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.76;MQ0=4;QD=12.34;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:45:391,45,0 chrVII 110996 . C A 238 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.49;MQ0=4;QD=8.50;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:30:271,30,0 chrVII 111027 . C T 118.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.10;MQ0=5;QD=6.56;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:18:151,18,0 chrVII 111570 . G T 17.15 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.736;SB=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:16:47,0,16 chrVII 111582 . T G 99.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=8.27;SB=-2.685e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:15:132,15,0 chrVII 111592 . G T 214.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.36;MQ0=0;QD=14.27;SB=-2.354e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:247,27,0 chrVII 111603 . A T 360 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=18.00;SB=-7.059e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:42:393,42,0 chrVII 111607 . A G 329 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.32;SB=-7.595e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:39:362,39,0 chrVII 111609 . A G 299 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=15.74;SB=-8.666e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:36:332,36,0 chrVII 111614 . G A 428 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=17.83;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:48:461,48,0 chrVII 111618 . T G 424 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.16;MQ0=0;QD=18.43;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:51:457,51,0 chrVII 111632 . G A 932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.19;MQ0=0;QD=22.19;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:965,102,0 chrVII 111678 . C T 2067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.94;MQ0=0;QD=25.52;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2100,219,0 chrVII 111703 . A T 2309 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.11;MQ0=0;QD=26.54;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2342,237,0 chrVII 111770 . G C 2030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.88;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2063,219,0 chrVII 111789 . T C 2195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.58;MQ0=0;QD=25.23;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2228,243,0 chrVII 111809 . A G 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.59;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3171,324,0 chrVII 111921 . G C 2412 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=24.61;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2445,258,0 chrVII 111953 . T C 2728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2761,285,0 chrVII 111972 . A G 1566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=42.1893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=14.64;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:1599,165,0 chrVII 112033 . G T 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2818,285,0 chrVII 112158 . C T 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.00;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2841,288,0 chrVII 112175 . C A 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.66;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2882,288,0 chrVII 112250 . C T 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.76;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3099,324,0 chrVII 112295 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.246;DP=117;Dels=0.00;FS=3.607;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.843;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1324,0,1135 chrVII 112754 . A G 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2802,300,0 chrVII 112793 . G A 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2783,276,0 chrVII 112826 . T A 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2618,267,0 chrVII 112862 . T C 2138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2171,225,0 chrVII 113084 . C T 2398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2431,243,0 chrVII 113123 . A G 2463 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2496,261,0 chrVII 113471 . G A 4229.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4229,412,0 chrVII 113653 . T C 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3004,315,0 chrVII 113828 . A C 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3124,333,0 chrVII 113994 . G T 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.077;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.963;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:167:99:1675,0,1866 chrVII 114272 . G A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.087;DP=121;Dels=0.00;FS=10.146;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1563,0,1024 chrVII 114332 . G A 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3143,321,0 chrVII 114793 . C A 2209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2242,225,0 chrVII 115232 . A G 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3465,345,0 chrVII 115467 . C T 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.37;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2867,280,0 chrVII 115589 . C T 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.62;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3011,292,0 chrVII 115633 . G A 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.15;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2711,270,0 chrVII 115872 . C A 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.19;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3379,334,0 chrVII 115956 . T C 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.639;DP=153;Dels=0.00;FS=1.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.392;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1499,0,1698 chrVII 115965 . T C 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4114,409,0 chrVII 116078 . A G 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3460,360,0 chrVII 116382 . T C 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3533,369,0 chrVII 116400 . A G 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3328,351,0 chrVII 116454 . C T 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9179;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3633,361,0 chrVII 116907 . C T 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3008,295,0 chrVII 117360 . T C 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3302,351,0 chrVII 117574 . G A 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3044,315,0 chrVII 117596 . G C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;DP=120;Dels=0.00;FS=0.835;HaplotypeScore=4.3371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:120:99:1221,0,1278 chrVII 117609 . A C 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.88;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2932,306,0 chrVII 117630 . A G 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3068,312,0 chrVII 117810 . C T 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.65;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2570,261,0 chrVII 117824 . A T 2234 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=26.60;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:84:99:2267,234,0 chrVII 117825 . A G 2229 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=26.86;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2262,237,0 chrVII 117896 . G A 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=1;QD=27.03;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3087,310,0 chrVII 118133 . C T 3828.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=25.02;SB=-2.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3828,385,0 chrVII 118274 . C T 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.77;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3065,310,0 chrVII 118535 . C T 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3555,346,0 chrVII 119177 . G A 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3505,349,0 chrVII 119852 . C T 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3436,334,0 chrVII 119894 . G A 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3673,367,0 chrVII 120263 . T G 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=1;QD=25.06;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3433,363,0 chrVII 120910 . A G 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3246,327,0 chrVII 120933 . G A 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3343,328,0 chrVII 121047 . T C 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.802;DP=113;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=8.8937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:113:99:1103,0,1048 chrVII 121176 . A G 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3034,318,0 chrVII 121571 . T C 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3194,339,0 chrVII 121697 . C T 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3538,349,0 chrVII 121738 . G A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.938;DP=125;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=5.4654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1433,0,1127 chrVII 121769 . G T 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3853,388,0 chrVII 121774 . C T 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3637,372,0 chrVII 121840 . G A 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3414,337,0 chrVII 121902 . A G 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2717,300,0 chrVII 121931 . G A 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3360,331,0 chrVII 121932 . T C 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3159,330,0 chrVII 122047 . G A 3905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3905,385,0 chrVII 122120 . G A 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3151,327,0 chrVII 122226 . T A 2778 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2811,282,0 chrVII 122234 . G C 2768 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2002;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2801,288,0 chrVII 122235 . T A 2871 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2002;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.25;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:114:99:2904,288,0 chrVII 122391 . C A 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.75;MQ0=0;QD=26.71;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2891,294,0 chrVII 122394 . A G 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.04;MQ0=0;QD=24.81;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2588,285,0 chrVII 122405 . C A 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.69;MQ0=0;QD=25.78;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2534,261,0 chrVII 122445 . T C 2929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.41;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2962,303,0 chrVII 122455 . T G 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.340;DP=123;Dels=0.00;FS=5.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.438;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.509;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1003,0,1426 chrVII 122466 . T A 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.95;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2965,298,0 chrVII 122499 . T A 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.12;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2854,288,0 chrVII 122622 . G A 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.96;MQ0=0;QD=22.45;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2929,283,0 chrVII 122646 . G A 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.169;DP=100;Dels=0.00;FS=1.725;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:819,0,1240 chrVII 122674 . A T 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2649,267,0 chrVII 122793 . A G 2469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2502,258,0 chrVII 123249 . G A 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.159;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.530;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.579;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:798,0,699 chrVII 123330 . G C 2018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.54;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2051,219,0 chrVII 123533 . C T 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2920,300,0 chrVII 123568 . T A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.562;DP=121;Dels=0.00;FS=11.733;HaplotypeScore=2.8406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=11.96;ReadPosRankSum=2.165;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:121:99:1477,0,1203 chrVII 123644 . T A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1560,0,1314 chrVII 123715 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.540;DP=121;Dels=0.00;FS=3.306;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.664;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1411,0,1086 chrVII 123716 . G T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;DP=118;Dels=0.00;FS=4.515;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1079,0,1355 chrVII 123776 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.616;DP=133;Dels=0.00;FS=5.259;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.470;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1357,0,1470 chrVII 123812 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.751;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.422;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1407,0,1350 chrVII 123839 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.217;DP=128;Dels=0.00;FS=2.248;HaplotypeScore=4.9670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.419;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1277,0,1361 chrVII 124158 . G A 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3360,334,0 chrVII 124205 . C T 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3096,309,0 chrVII 124322 . C T 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.89;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3260,339,0 chrVII 124342 . T C 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.537;DP=111;Dels=0.00;FS=12.761;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.298;QD=8.30;ReadPosRankSum=-3.012;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:951,0,1193 chrVII 124460 . A G 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3384,351,0 chrVII 124525 . G A 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3713,373,0 chrVII 124541 . T C 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3552,384,0 chrVII 124671 . A G 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3444,363,0 chrVII 124719 . A G 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3085,330,0 chrVII 124761 . A G 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3499,360,0 chrVII 124850 . T C 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3079,330,0 chrVII 124916 . A G 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.05;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3211,333,0 chrVII 124931 . T C 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3531,354,0 chrVII 125048 . C T 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3189,328,0 chrVII 125090 . T C 4209.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=25.05;SB=-2.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4209,435,0 chrVII 125128 . G A 4516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=24.81;SB=-2.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:182:99:4516,433,0 chrVII 125147 . T C 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.097;DP=184;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=2.238;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,92:184:99:1698,0,1971 chrVII 125174 . G T 1892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;DP=186;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=6.8183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,99:186:99:1922,0,1852 chrVII 125177 . G A 4521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=26.59;ReadPosRankSum=1.426;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:4521,457,0 chrVII 125195 . T C 4043.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:4043,432,0 chrVII 125277 . T C 1937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.692;DP=175;Dels=0.00;FS=11.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,93:175:99:1967,0,1707 chrVII 125279 . G A 4661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:175:99:4661,466,0 chrVII 125306 . G A 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.770;DP=151;Dels=0.00;FS=3.906;HaplotypeScore=4.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=2.052;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1662,0,1564 chrVII 125333 . A G 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.686;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1613,0,1690 chrVII 125498 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.563;DP=143;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=3.4301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:143:99:1249,0,1693 chrVII 125513 . A G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.715;DP=146;Dels=0.00;FS=2.939;HaplotypeScore=2.4274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=3.298;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.497;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:146:99:1312,0,1746 chrVII 125604 . G A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.630;DP=128;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1412,0,1265 chrVII 125640 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.369;DP=130;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=3.1425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.427;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1508,0,1271 chrVII 125655 . G T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;DP=137;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1347,0,1529 chrVII 125658 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.049;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1382,0,1577 chrVII 125730 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.396;DP=117;Dels=0.00;FS=7.962;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1433,0,1093 chrVII 125786 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.131;DP=137;Dels=0.00;FS=4.234;HaplotypeScore=4.7814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1472,0,1335 chrVII 125810 . C T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.627;DP=144;Dels=0.00;FS=3.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.780;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1649,0,1391 chrVII 126017 . A G 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.499;DP=139;Dels=0.00;FS=12.293;HaplotypeScore=2.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.573;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:139:99:1411,0,1457 chrVII 126093 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.741;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=3.097;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1329,0,1702 chrVII 126106 . A G 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.637;DP=129;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1099,0,1601 chrVII 126149 . G A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.898;DP=116;Dels=0.00;FS=2.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.044;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1097,0,1341 chrVII 126167 . A T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.631;DP=134;Dels=0.00;FS=4.126;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.530;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1221,0,1671 chrVII 126177 . G A 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.480;DP=134;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=2.4787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.025;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1724,0,1112 chrVII 126362 . C T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.554;DP=131;Dels=0.00;FS=9.454;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1195,0,1441 chrVII 126466 . A G 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3248,333,0 chrVII 126593 . C A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.531;DP=145;Dels=0.00;FS=6.094;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.077;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1609,0,1410 chrVII 126626 . C T 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.307;DP=155;Dels=0.00;FS=3.886;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.332;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1447,0,1725 chrVII 126683 . A G 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.737;DP=136;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.137;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1609,0,1196 chrVII 126761 . C T 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.224;DP=144;Dels=0.00;FS=5.205;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.589;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1523,0,1522 chrVII 126775 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.105;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.704;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,60:142:99:1234,0,1788 chrVII 126809 . T C 1906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.992;DP=177;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=3.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.631;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,94:177:99:1936,0,1723 chrVII 126818 . T C 1764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.109;DP=156;Dels=0.00;FS=3.146;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.085;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1794,0,1564 chrVII 126887 . A G 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.12;SB=-2.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3944,397,0 chrVII 126965 . A G 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3646,387,0 chrVII 127046 . A G 3869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.976e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3869,426,0 chrVII 127208 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.605;DP=135;Dels=0.00;FS=7.729;HaplotypeScore=2.9142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1287,0,1474 chrVII 127350 . G T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.341;DP=122;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=2.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.517;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1345,0,1131 chrVII 127453 . G A 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.371;DP=170;Dels=0.00;FS=3.601;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=2.193;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,72:170:99:1490,0,2110 chrVII 127817 . T C 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3476,363,0 chrVII 127838 . C T 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3594,364,0 chrVII 128174 . C A 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3447,340,0 chrVII 128183 . T C 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3386,345,0 chrVII 128273 . C T 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.75;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2917,300,0 chrVII 128438 . C T 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3546,355,0 chrVII 128542 . A G 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3558,372,0 chrVII 128627 . A G 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2881,309,0 chrVII 128648 . T A 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2841,285,0 chrVII 128890 . C G 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3410,366,0 chrVII 129074 . T G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.089;DP=148;Dels=0.00;FS=6.273;HaplotypeScore=5.6595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.610;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1277,0,1863 chrVII 129077 . A G 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.723;DP=150;Dels=0.00;FS=4.968;HaplotypeScore=4.6661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.285;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1686,0,1468 chrVII 129145 . C G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.612;DP=136;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.797;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.251;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1236,0,1550 chrVII 129170 . G C 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2600,276,0 chrVII 129312 . A G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.177;DP=159;Dels=0.00;FS=2.840;HaplotypeScore=4.6655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.655;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:1390,0,1885 chrVII 129354 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.245;DP=152;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=1.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.308;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1249,0,1905 chrVII 129417 . G C 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3471;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3301,333,0 chrVII 129467 . G A 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.829;DP=148;Dels=0.00;FS=2.076;HaplotypeScore=4.6790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.320;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1643,0,1457 chrVII 129556 . C T 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3598,361,0 chrVII 130374 . G A 2379 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2412,240,0 chrVII 130449 . T C 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3144,321,0 chrVII 130911 . T C 1819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.992;DP=148;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.295;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,85:148:99:1849,0,1339 chrVII 130936 . G C 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.011;DP=134;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=9.59;ReadPosRankSum=-2.069;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1315,0,1491 chrVII 130951 . A G 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.263;DP=123;Dels=0.00;FS=4.568;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=9.73;ReadPosRankSum=-2.021;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1227,0,1357 chrVII 131010 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.120;DP=152;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.828;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.408;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1448,0,1701 chrVII 131145 . T C 1909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.391;DP=176;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,90:176:99:1939,0,1781 chrVII 131213 . G A 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.182;DP=174;Dels=0.00;FS=15.212;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.566;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,76:174:99:1601,0,2110 chrVII 131368 . A T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;DP=116;Dels=0.00;FS=5.764;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1226,0,1260 chrVII 131402 . C T 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.190;DP=115;Dels=0.00;FS=4.555;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=13.23;ReadPosRankSum=1.863;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,68:115:99:1552,0,893 chrVII 131485 . A G 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3545,378,0 chrVII 131489 . A G 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3475,372,0 chrVII 131597 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.340;DP=136;Dels=0.00;FS=3.596;HaplotypeScore=3.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.718;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,56:136:99:1139,0,1816 chrVII 131888 . G A 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.546;DP=130;Dels=0.00;FS=4.320;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.919;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:130:99:1195,0,1501 chrVII 132076 . T A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.231;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.139;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1291,0,1358 chrVII 132304 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.451;DP=120;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.764;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1272,0,1369 chrVII 132340 . G A 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.631;DP=92;Dels=0.00;FS=3.875;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.781;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:968,0,1046 chrVII 132398 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.346;DP=98;Dels=0.00;FS=2.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.339;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1191,0,956 chrVII 132676 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.632;DP=105;Dels=0.00;FS=6.141;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.093;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1096,0,1137 chrVII 132872 . A G 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.987;DP=131;Dels=0.00;FS=11.287;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.952;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:131:99:1674,0,1147 chrVII 132965 . A G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.362;DP=127;Dels=0.00;FS=12.256;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.999;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1140,0,1504 chrVII 133213 . C T 4190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4190,430,0 chrVII 133278 . T C 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.737;DP=190;Dels=0.00;FS=1.805;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.695;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,85:190:99:1691,0,2297 chrVII 133650 . A C 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3810,393,0 chrVII 134263 . T C 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.306;DP=152;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.000;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1595,0,1607 chrVII 134502 . C T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.094;DP=142;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1460,0,1457 chrVII 134563 . G A 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.957;DP=144;Dels=0.00;FS=10.265;HaplotypeScore=2.5657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.854;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1705,0,1301 chrVII 134584 . C T 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.705;DP=152;Dels=0.00;FS=2.054;HaplotypeScore=4.9751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:152:99:1533,0,1689 chrVII 134668 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.988;DP=129;Dels=0.00;FS=2.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1404,0,1369 chrVII 135724 . A G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.112;DP=116;Dels=0.00;FS=2.389;HaplotypeScore=3.5076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:116:99:988,0,1489 chrVII 135812 . G T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.358;DP=137;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.315;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:137:99:1512,0,1303 chrVII 136153 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.809;DP=133;Dels=0.00;FS=0.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.125;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1064,0,1664 chrVII 136414 . T A 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7787;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3482,360,0 chrVII 136555 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.273;DP=116;Dels=0.00;FS=4.605;HaplotypeScore=2.6559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:116:99:1314,0,958 chrVII 136591 . T C 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.174;DP=123;Dels=0.00;FS=14.027;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1454,0,1247 chrVII 136657 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.592;DP=129;Dels=0.00;FS=4.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.001;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1303,0,1522 chrVII 136660 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.050;DP=133;Dels=0.00;FS=4.159;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.132;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1304,0,1496 chrVII 136777 . A G 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.638;DP=140;Dels=0.00;FS=6.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,58:140:99:1123,0,1909 chrVII 136894 . A G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.476;DP=125;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.274;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1207,0,1472 chrVII 137017 . A G 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3437,354,0 chrVII 137326 . T C 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.983;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.024;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1495,0,1474 chrVII 137377 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.659;DP=120;Dels=0.00;FS=3.323;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:120:99:1279,0,1288 chrVII 137398 . G T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.914;DP=121;Dels=0.00;FS=3.353;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1247,0,1315 chrVII 137467 . T G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.263;DP=116;Dels=0.00;FS=4.730;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1231,0,1257 chrVII 137617 . A G 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.667;DP=144;Dels=0.00;FS=1.571;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1545,0,1368 chrVII 137665 . G A 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.050;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.018;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1785,0,1257 chrVII 137722 . G A 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.124;DP=164;Dels=0.01;FS=0.575;HaplotypeScore=12.8963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,85:163:99:1692,0,1518 chrVII 137852 . C T 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.400;DP=176;Dels=0.00;FS=1.963;HaplotypeScore=4.9195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=0.467;QD=10.33;ReadPosRankSum=2.065;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,84:176:99:1848,0,1966 chrVII 138010 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.653;DP=139;Dels=0.00;FS=7.908;HaplotypeScore=3.8445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.162;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1428,0,1454 chrVII 138020 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.443;DP=128;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.053;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.717;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1440,0,1272 chrVII 138112 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.225;DP=120;Dels=0.00;FS=7.231;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.394;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,72:120:99:1484,0,1024 chrVII 138155 . G A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.271;DP=113;Dels=0.00;FS=1.524;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:113:99:1364,0,995 chrVII 138766 . G A 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.076;DP=133;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1592,0,1219 chrVII 138791 . C T 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3593,355,0 chrVII 138853 . A T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.495;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1701,0,1797 chrVII 139024 . A G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.757;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.116;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1458,0,1317 chrVII 139048 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.506;DP=139;Dels=0.00;FS=1.366;HaplotypeScore=3.7379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1374,0,1545 chrVII 139174 . G A 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.043;DP=134;Dels=0.00;FS=3.211;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,52:134:99:994,0,1768 chrVII 139179 . A T 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.960;DP=129;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,51:129:99:872,0,1804 chrVII 139322 . A G 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.949;DP=149;Dels=0.00;FS=18.317;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.808;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1720,0,1466 chrVII 139341 . A G 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3713,396,0 chrVII 139366 . T C 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.574;DP=142;Dels=0.00;FS=20.633;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.683;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1311,0,1707 chrVII 139372 . T C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.483;DP=137;Dels=0.00;FS=22.751;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1546,0,1393 chrVII 139538 . A G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.142;DP=140;Dels=0.00;FS=1.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1553,0,1348 chrVII 139539 . T C 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.395;DP=137;Dels=0.00;FS=2.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:137:99:1523,0,1335 chrVII 139626 . A G 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.716;DP=137;Dels=0.00;FS=3.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1519,0,1348 chrVII 139627 . A G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.746;DP=137;Dels=0.00;FS=3.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1553,0,1376 chrVII 139686 . C A 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.623;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.277;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1585,0,1391 chrVII 139797 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.174;DP=134;Dels=0.00;FS=2.194;HaplotypeScore=3.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.301;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1396,0,1467 chrVII 139824 . T C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.458;DP=125;Dels=0.00;FS=2.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.270;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1163,0,1530 chrVII 139909 . A G 1064.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.649;DP=133;Dels=0.00;FS=4.141;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.161;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1094,0,1631 chrVII 139917 . A G 1029.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.352;DP=125;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1059,0,1512 chrVII 139919 . T G 1065.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;DP=125;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1095,0,1484 chrVII 140030 . A G 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=27.21;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2863,303,0 chrVII 140046 . G A 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.464;DP=99;Dels=0.00;FS=4.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:1013,0,1123 chrVII 140080 . G C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=110;Dels=0.00;FS=6.013;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=2.135;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:948,0,1299 chrVII 140188 . C T 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.15;MQ0=0;QD=26.58;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3535,355,0 chrVII 140207 . G A 3660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.74;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3660,367,0 chrVII 140223 . C T 1462.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.162;DP=141;Dels=0.00;FS=5.081;HaplotypeScore=2.7209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.33;MQ0=0;MQRankSum=-9.052;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.685;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1492,0,1368 chrVII 140227 . T A 1223.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.60;MQ0=0;MQRankSum=-8.758;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.781;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1253,0,1362 chrVII 140232 . T C 1162.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.272;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.30;MQ0=0;MQRankSum=-9.282;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.598;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1192,0,1401 chrVII 140234 . T G 1134.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.595;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.30;MQ0=0;MQRankSum=-9.235;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.981;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1164,0,1391 chrVII 140259 . G A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.061;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQ0=0;MQRankSum=-8.857;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1030,0,1396 chrVII 140267 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.983;DP=125;Dels=0.00;FS=1.669;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQ0=0;MQRankSum=-9.407;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.744;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:125:99:1096,0,1460 chrVII 140290 . C T 1502.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.763;DP=152;Dels=0.00;FS=3.490;HaplotypeScore=121.3703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.65;MQ0=0;MQRankSum=-9.367;QD=9.88;ReadPosRankSum=-2.190;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:152:99:1532,0,1274 chrVII 140315 . A T 300.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.308;DP=125;Dels=0.00;FS=67.494;HaplotypeScore=104.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQ0=0;MQRankSum=-6.381;QD=2.40;ReadPosRankSum=-4.314;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,39:125:99:330,0,622 chrVII 140416 . C T 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.33;MQ0=0;QD=25.75;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2840,283,0 chrVII 140631 . T C 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2711,282,0 chrVII 140686 . G A 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.29;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2794,268,0 chrVII 140806 . G A 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2843,285,0 chrVII 140941 . T C 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2983,306,0 chrVII 141046 . A G 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2904,300,0 chrVII 141082 . A C 2330 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.02;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2363,249,0 chrVII 141115 . T C 1965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=23.39;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1998,222,0 chrVII 141144 . A G 2627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2660,285,0 chrVII 141196 . A G 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.750;DP=109;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:832,0,1430 chrVII 141286 . C G 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3081,318,0 chrVII 141481 . T A 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2818,274,0 chrVII 141723 . A G 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3455,354,0 chrVII 141743 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=126;Dels=0.00;FS=3.844;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=25.66;ReadPosRankSum=1.567;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3268,297,0 chrVII 141776 . T C 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3041,318,0 chrVII 141849 . G T 3766.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3766,364,0 chrVII 141864 . A G 4205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4205,423,0 chrVII 141946 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.874;DP=144;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=1;MQRankSum=2.198;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1285,0,1795 chrVII 142006 . C T 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.193;DP=141;Dels=0.00;FS=6.224;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQ0=2;MQRankSum=2.364;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.753;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1644,0,1293 chrVII 142031 . A T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.939;DP=135;Dels=0.00;FS=8.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=2;MQRankSum=-1.492;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.754;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1207,0,1718 chrVII 142176 . G A 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3258,322,0 chrVII 142177 . C A 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.847;DP=117;Dels=0.00;FS=2.360;HaplotypeScore=2.9885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.789;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1113,0,1399 chrVII 142353 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.100;DP=154;Dels=0.00;FS=3.870;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1472,0,1654 chrVII 142388 . A G 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.248;DP=164;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:164:99:1481,0,1935 chrVII 142398 . G T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.029;DP=157;Dels=0.00;FS=1.261;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=3.021;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.185;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,71:157:99:1470,0,1783 chrVII 142482 . A G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.069;DP=149;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=4.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.573;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1364,0,1735 chrVII 142616 . T C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.468;DP=102;Dels=0.00;FS=2.528;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1090,0,1022 chrVII 142631 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.393;DP=103;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1063,0,1071 chrVII 142650 . C G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;DP=101;Dels=0.00;FS=2.581;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1016,0,996 chrVII 142656 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.919;DP=106;Dels=0.00;FS=4.801;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.708;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1092,0,1098 chrVII 142677 . C T 2372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2405,240,0 chrVII 142710 . G T 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.908;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.043;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:809,0,1329 chrVII 142738 . T C 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.458;DP=136;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.122;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1587,0,1252 chrVII 142773 . T C 1816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.887;DP=143;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,86:143:99:1846,0,1199 chrVII 142926 . T C 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.090;DP=161;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.817;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1532,0,1894 chrVII 142935 . T C 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.676;DP=154;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1709,0,1554 chrVII 142953 . G A 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3499,352,0 chrVII 143025 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.140;DP=113;Dels=0.00;FS=1.558;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.379;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1124,0,1218 chrVII 143073 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.906;DP=109;Dels=0.00;FS=6.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.058;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:911,0,1315 chrVII 143078 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.796;DP=108;Dels=0.00;FS=9.156;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.850;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1244,0,1036 chrVII 143359 . T C 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.163;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.370;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1635,0,1811 chrVII 143828 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.623;DP=105;Dels=0.00;FS=3.893;HaplotypeScore=3.3851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.230;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1150,0,1050 chrVII 143923 . G A 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.995;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,58:140:99:1062,0,1781 chrVII 144099 . T C 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.576;DP=120;Dels=0.00;FS=7.167;HaplotypeScore=4.6074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=-8.036;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,46:120:99:866,0,1614 chrVII 144117 . C A 907.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.964;DP=124;Dels=0.00;FS=10.336;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.19;MQ0=0;MQRankSum=-7.985;QD=7.31;ReadPosRankSum=-2.096;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,48:124:99:937,0,1500 chrVII 144119 . G A 894.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.273;DP=123;Dels=0.00;FS=10.225;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.11;MQ0=0;MQRankSum=-7.831;QD=7.27;ReadPosRankSum=-2.043;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,47:123:99:924,0,1561 chrVII 144123 . G A 839.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.276;DP=119;Dels=0.00;FS=10.801;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.83;MQ0=0;MQRankSum=-8.010;QD=7.05;ReadPosRankSum=-2.329;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:869,0,1492 chrVII 144175 . G A 710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.797;DP=106;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.375;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:740,0,1427 chrVII 144176 . G A 713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.270;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.573;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:743,0,1468 chrVII 144235 . T C 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.494;DP=128;Dels=0.00;FS=10.183;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.142;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,47:128:99:930,0,1837 chrVII 144248 . G A 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.279;DP=110;Dels=0.00;FS=3.676;HaplotypeScore=38.6603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.828;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:795,0,1383 chrVII 144298 . T C 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.804;DP=85;Dels=0.00;FS=12.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,39:85:99:669,0,1034 chrVII 144318 . C T 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.634;DP=103;Dels=0.00;FS=20.324;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.466;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:875,0,1169 chrVII 144323 . G A 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.172;DP=105;Dels=0.00;FS=24.933;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.851;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:907,0,1204 chrVII 144347 . C T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.238;DP=119;Dels=0.00;FS=11.821;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.424;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1195,0,1223 chrVII 144382 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.502;DP=151;Dels=0.00;FS=8.409;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.125;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1494,0,1646 chrVII 144455 . A T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.848;DP=131;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=2.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.757;QD=9.86;ReadPosRankSum=2.309;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1322,0,1465 chrVII 144459 . A G 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=22.01;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3049,327,0 chrVII 144484 . T C 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.726;DP=117;Dels=0.00;FS=4.725;HaplotypeScore=6.9431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.658;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:973,0,1361 chrVII 144500 . C T 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.500;DP=121;Dels=0.00;FS=4.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:852,0,1539 chrVII 144516 . T A 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.100;DP=113;Dels=0.00;FS=4.687;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=6.70;ReadPosRankSum=-1.481;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:787,0,1541 chrVII 144562 . A G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.225;DP=141;Dels=0.00;FS=2.107;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.052;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1055,0,1737 chrVII 144725 . A C 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2910,309,0 chrVII 144744 . T C 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2650,273,0 chrVII 144765 . T A 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.238;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=24.36;ReadPosRankSum=1.426;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2518,227,0 chrVII 144768 . C T 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=103;Dels=0.01;FS=3.365;HaplotypeScore=4.7264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=24.63;ReadPosRankSum=0.883;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2570,255,0 chrVII 144828 . G A 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3041,304,0 chrVII 144867 . T C 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3276,336,0 chrVII 144924 . C T 2610 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.36;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2643,264,0 chrVII 145098 . G A 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.779;DP=107;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.165;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1053,0,1179 chrVII 145450 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.326;DP=112;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQ0=2;MQRankSum=-1.386;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1262,0,1067 chrVII 145485 . G A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.775;DP=98;Dels=0.00;FS=5.174;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.33;MQ0=2;MQRankSum=-2.242;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.004;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1018,0,870 chrVII 145505 . C T 805.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.586;DP=91;Dels=0.00;FS=8.887;HaplotypeScore=2.8909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQ0=2;MQRankSum=-2.577;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.027;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:835,0,856 chrVII 145512 . A G 726.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.217;DP=87;Dels=0.01;FS=16.750;HaplotypeScore=3.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=2;MQRankSum=-3.685;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.441;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:756,0,845 chrVII 145515 . G A 775.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.387;DP=88;Dels=0.00;FS=16.272;HaplotypeScore=3.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=2;MQRankSum=-4.457;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.265;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,48:88:99:805,0,789 chrVII 145516 . G A 771.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.387;DP=88;Dels=0.00;FS=16.272;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=2;MQRankSum=-3.918;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.204;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,48:88:99:801,0,796 chrVII 145655 . A G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.474;DP=93;Dels=0.00;FS=4.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1062,0,890 chrVII 145728 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.274;DP=101;Dels=0.00;FS=0.832;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.221;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1076,0,1020 chrVII 145758 . G C 2245 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2278,243,0 chrVII 145800 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.512;DP=93;Dels=0.00;FS=6.740;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1107,0,873 chrVII 145962 . T C 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.457;DP=101;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.269;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1056,0,986 chrVII 146025 . G A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.061;DP=112;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.021;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:973,0,1195 chrVII 146033 . A G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.694;DP=114;Dels=0.01;FS=3.490;HaplotypeScore=2.6952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:940,0,1351 chrVII 146134 . C T 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.002;DP=135;Dels=0.00;FS=9.845;HaplotypeScore=4.6725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=13.04;ReadPosRankSum=2.013;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:1791,0,1098 chrVII 146193 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.123;DP=136;Dels=0.00;FS=12.497;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=9.65;ReadPosRankSum=-3.229;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1343,0,1454 chrVII 146595 . T C 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.450;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:933,0,1080 chrVII 147077 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.423;DP=103;Dels=0.00;FS=1.610;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.043;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1276,0,850 chrVII 147379 . T G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.518;DP=141;Dels=0.00;FS=7.978;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.490;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1327,0,1724 chrVII 147385 . G A 4017.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4017,406,0 chrVII 147477 . T C 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3815,396,0 chrVII 148097 . G T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.601;DP=98;Dels=0.00;FS=2.685;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=11.18;ReadPosRankSum=-2.076;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1126,0,1004 chrVII 148118 . T C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.241;DP=103;Dels=0.00;FS=11.151;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.793;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1127,0,1079 chrVII 148145 . T C 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.108;DP=118;Dels=0.00;FS=7.289;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.880;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,71:118:99:1480,0,1008 chrVII 148265 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.114;DP=105;Dels=0.00;FS=9.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.993;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,65:105:99:1442,0,815 chrVII 148376 . T C 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.608;DP=104;Dels=0.00;FS=2.545;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.386;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:104:99:1014,0,1113 chrVII 148402 . C T 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.199;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.401;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1034,0,1130 chrVII 148615 . C A 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.325;DP=94;Dels=0.00;FS=11.991;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.426;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,41:94:99:836,0,1201 chrVII 148710 . A G 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.327;DP=115;Dels=0.00;FS=4.036;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1334,0,1097 chrVII 148767 . C T 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.954;DP=129;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=2.4131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.343;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,82:129:99:1803,0,879 chrVII 148771 . G T 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.385;DP=119;Dels=0.00;FS=7.543;HaplotypeScore=2.5802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.953;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,78:119:99:1772,0,775 chrVII 148854 . C G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.913;DP=107;Dels=0.00;FS=4.927;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.909;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:1416,0,883 chrVII 148891 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.714;DP=146;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=10.40;ReadPosRankSum=2.630;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1549,0,1482 chrVII 148906 . A C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.811;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1565,0,1268 chrVII 148947 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.615;DP=115;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.713;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1220,0,1216 chrVII 148957 . G A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.104;DP=117;Dels=0.00;FS=3.367;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1262,0,1129 chrVII 148993 . G C 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3153,321,0 chrVII 149107 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.437;DP=118;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.698;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1406,0,1061 chrVII 149109 . C G 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3023,312,0 chrVII 149140 . C T 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.818;DP=129;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.925;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.801;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1597,0,1084 chrVII 149142 . C T 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.748;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.489;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1628,0,1108 chrVII 149252 . G C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.566;DP=151;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=1;MQRankSum=0.126;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1364,0,1639 chrVII 149279 . A T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.308;DP=151;Dels=0.00;FS=2.103;HaplotypeScore=4.8919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=0.271;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.542;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1340,0,1717 chrVII 149298 . G T 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.870;DP=133;Dels=0.00;FS=7.886;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=1.677;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.106;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1120,0,1587 chrVII 149346 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.631;DP=125;Dels=0.00;FS=8.223;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.249;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1200,0,1513 chrVII 149387 . A G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.280;DP=130;Dels=0.00;FS=4.307;HaplotypeScore=4.0683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.040;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:1017,0,1674 chrVII 149393 . G A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.707;DP=133;Dels=0.00;FS=2.257;HaplotypeScore=4.0683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:133:99:1180,0,1622 chrVII 149498 . G T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.261;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.848;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1233,0,1342 chrVII 150130 . G A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.953;DP=92;Dels=0.00;FS=1.663;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.403;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:969,0,968 chrVII 150177 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.517;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.442;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1329,0,1308 chrVII 150234 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.587;DP=134;Dels=0.00;FS=14.171;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.640;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.254;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1234,0,1569 chrVII 150271 . A G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=130;Dels=0.00;FS=11.081;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.924;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1165,0,1657 chrVII 150302 . T A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.179;DP=129;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:129:99:1175,0,1708 chrVII 150329 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.398;DP=129;Dels=0.00;FS=8.837;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1322,0,1375 chrVII 150335 . A C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.619;DP=125;Dels=0.00;FS=9.051;HaplotypeScore=1.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.595;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1237,0,1379 chrVII 150399 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.273;DP=134;Dels=0.00;FS=6.327;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.253;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1373,0,1431 chrVII 150444 . G T 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.853;DP=109;Dels=0.00;FS=8.023;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.416;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:897,0,1324 chrVII 150466 . T G 522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.387;DP=103;Dels=0.00;FS=10.150;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,39:103:99:552,0,1534 chrVII 150477 . T C 463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.680;DP=98;Dels=0.00;FS=4.215;HaplotypeScore=2.9195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.070;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,36:98:99:493,0,1505 chrVII 150487 . A G 457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.658;DP=98;Dels=0.00;FS=0.801;HaplotypeScore=2.9114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.356;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,35:98:99:487,0,1476 chrVII 150517 . A G 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.565;DP=108;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=7.30;ReadPosRankSum=-1.115;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:818,0,1415 chrVII 150806 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.390;DP=104;Dels=0.00;FS=1.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,61:104:99:1262,0,888 chrVII 150832 . T A 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,66:107:99:1490,0,850 chrVII 150894 . G A 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.815;DP=123;Dels=0.00;FS=5.642;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=13.15;ReadPosRankSum=-1.344;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1648,0,1020 chrVII 150923 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.899;DP=129;Dels=0.00;FS=6.665;HaplotypeScore=2.5646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.134;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1433,0,1289 chrVII 150956 . C A 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.601;DP=108;Dels=0.00;FS=4.637;HaplotypeScore=4.3280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:862,0,1152 chrVII 150964 . C T 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.828;DP=103;Dels=0.00;FS=4.955;HaplotypeScore=6.1114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:779,0,1153 chrVII 151493 . T C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.629;DP=131;Dels=0.00;FS=9.354;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.132;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1525,0,1185 chrVII 151562 . A G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.642;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.306;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1284,0,1107 chrVII 151622 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.189;DP=126;Dels=0.00;FS=13.144;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:1092,0,1616 chrVII 151697 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.807;DP=121;Dels=0.00;FS=8.314;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.903;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1238,0,1334 chrVII 151811 . A G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.677;DP=156;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=2.5169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.031;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:156:99:1565,0,1681 chrVII 152066 . A G 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.175;DP=113;Dels=0.00;FS=2.472;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.096;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,64:113:99:1329,0,1057 chrVII 152150 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.771;DP=131;Dels=0.00;FS=5.373;HaplotypeScore=4.6831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.420;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1467,0,1165 chrVII 152183 . T G 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.993;DP=113;Dels=0.00;FS=7.657;HaplotypeScore=2.6387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:113:99:1104,0,1152 chrVII 152342 . C T 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.703;DP=121;Dels=0.00;FS=2.423;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.609;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,74:121:99:1591,0,882 chrVII 152354 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=117;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1436,0,1078 chrVII 152410 . C A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.093;DP=126;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=2.8491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.256;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1256,0,1297 chrVII 152484 . G C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:142:99:1198,0,1517 chrVII 152516 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.731;DP=123;Dels=0.00;FS=5.503;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.558;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1301,0,1218 chrVII 152561 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.673;DP=127;Dels=0.00;FS=3.191;HaplotypeScore=3.6471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.923;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1297,0,1376 chrVII 152609 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.740;DP=125;Dels=0.00;FS=4.287;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.677;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1427,0,1214 chrVII 152680 . A T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.468;DP=126;Dels=0.00;FS=5.576;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1270,0,1541 chrVII 152750 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.884;DP=105;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=12.33;ReadPosRankSum=-1.841;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,63:105:99:1325,0,886 chrVII 152759 . C A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.459;DP=107;Dels=0.00;FS=3.584;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.404;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:933,0,1340 chrVII 152783 . T C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.729;DP=120;Dels=0.00;FS=2.381;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.765;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,68:120:99:1468,0,1095 chrVII 152788 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.394;DP=118;Dels=0.00;FS=3.376;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.897;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.298;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1519,0,1084 chrVII 152800 . C T 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.219;DP=120;Dels=0.00;FS=4.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.951;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1523,0,1096 chrVII 152914 . G A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.148;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.089;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1211,0,1457 chrVII 152918 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.280;DP=131;Dels=0.00;FS=2.247;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.349;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1189,0,1557 chrVII 152948 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.092;DP=130;Dels=0.00;FS=7.239;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=-0.606;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1285,0,1409 chrVII 153123 . G C 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.439;DP=89;Dels=0.00;FS=2.995;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.604;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:788,0,981 chrVII 153164 . C T 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.096;DP=100;Dels=0.00;FS=2.934;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=2.618;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.770;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1019,0,1069 chrVII 153186 . T C 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.941;DP=107;Dels=0.00;FS=1.763;HaplotypeScore=6.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.407;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.696;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,44:107:99:889,0,1356 chrVII 153827 . T C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.653;DP=138;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=2.7164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.930;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1122,0,1724 chrVII 153833 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.365;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.561;QD=8.71;ReadPosRankSum=-2.149;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1171,0,1507 chrVII 153920 . G A 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.093;DP=135;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1527,0,1236 chrVII 154562 . T C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.346;DP=126;Dels=0.00;FS=12.559;HaplotypeScore=9.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=1;MQRankSum=1.690;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1111,0,1123 chrVII 154771 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.753;DP=141;Dels=0.00;FS=6.227;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.284;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1371,0,1681 chrVII 155445 . T C 1870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.879;DP=178;Dels=0.00;FS=0.562;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=2;MQRankSum=0.911;QD=10.51;ReadPosRankSum=-2.611;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,99:178:99:1900,0,1618 chrVII 155795 . A C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;DP=155;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.334;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,62:155:99:1116,0,2111 chrVII 156057 . T C 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.594;DP=149;Dels=0.00;FS=6.501;HaplotypeScore=2.8843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.358;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1659,0,1563 chrVII 156140 . T A 238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;DP=34;Dels=0.00;FS=5.685;HaplotypeScore=8.5581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=7.00;ReadPosRankSum=2.191;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:268,0,195 chrVII 156141 . A T 168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=34;Dels=0.00;FS=3.643;HaplotypeScore=9.5475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.667;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:198,0,298 chrVII 156212 . C T 377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.653;DP=48;Dels=0.00;FS=4.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=7.85;ReadPosRankSum=1.035;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:407,0,592 chrVII 156252 . G A 1707 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=27.10;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:63:99:1740,174,0 chrVII 156430 . C G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;DP=105;Dels=0.00;FS=11.576;HaplotypeScore=5.6159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.581;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1033,0,944 chrVII 156735 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.048;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=6.3249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.278;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:125:99:1371,0,1271 chrVII 157262 . T C 2003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.577;DP=193;Dels=0.00;FS=4.215;HaplotypeScore=5.8265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,109:193:99:2033,0,1806 chrVII 157782 . T C 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3615,375,0 chrVII 157819 . G C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.301;DP=118;Dels=0.00;FS=3.376;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.645;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1112,0,1321 chrVII 157962 . G C 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3410,351,0 chrVII 158256 . C T 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3950,406,0 chrVII 158425 . G A 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.764;DP=134;Dels=0.00;FS=4.936;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1348,0,1347 chrVII 158457 . C G 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=121;Dels=0.00;FS=7.012;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1383,0,1107 chrVII 158922 . A T 149.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;DP=131;Dels=0.00;FS=10.102;HaplotypeScore=391.0011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.260;QD=1.14;ReadPosRankSum=-2.459;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,23:131:99:179,0,989 chrVII 158928 . A T 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;DP=131;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=45.6935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.05;MQ0=0;MQRankSum=3.683;QD=8.06;ReadPosRankSum=-3.184;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,97:131:49:1086,0,49 chrVII 158961 . G A 42.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.179;DP=124;Dels=0.00;FS=5.918;HaplotypeScore=140.6621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.62;MQ0=0;MQRankSum=-5.875;QD=0.34;ReadPosRankSum=3.968;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,26:124:72:72,0,2011 chrVII 158964 . C T 381.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.889;DP=127;Dels=0.00;FS=4.358;HaplotypeScore=118.8632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.943;QD=3.00;ReadPosRankSum=-2.814;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,30:127:99:411,0,1448 chrVII 158967 . G A 146.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.961;DP=131;Dels=0.00;FS=8.180;HaplotypeScore=34.3369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.700;QD=1.11;ReadPosRankSum=2.083;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:176,0,1994 chrVII 158979 . A G 93.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.747;DP=122;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.13;MQ0=0;MQRankSum=-3.820;QD=0.76;ReadPosRankSum=-5.451;SB=-6.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,19:122:99:123,0,2092 chrVII 158982 . A T 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;DP=113;Dels=0.00;FS=4.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.51;MQ0=0;MQRankSum=-3.297;QD=0.18;ReadPosRankSum=-6.180;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,17:113:50:50,0,1979 chrVII 159045 . G A 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.568;DP=124;Dels=0.00;FS=3.257;HaplotypeScore=22.2056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=4.284;QD=10.69;ReadPosRankSum=5.977;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1356,0,657 chrVII 159141 . G A 3817.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3817,378,0 chrVII 159156 . T C 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4168,412,0 chrVII 159246 . G C 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3454,366,0 chrVII 159509 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.566;DP=112;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.405;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:962,0,1350 chrVII 159559 . A G 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3476,360,0 chrVII 159586 . C T 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3449,352,0 chrVII 159617 . C T 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3250,325,0 chrVII 159705 . G A 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2955,292,0 chrVII 159755 . T C 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3280,342,0 chrVII 160577 . A G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3214,330,0 chrVII 160667 . C T 3979.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3979,382,0 chrVII 160700 . C T 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3474,334,0 chrVII 160781 . G A 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3412,343,0 chrVII 160952 . A G 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.526;DP=110;Dels=0.00;FS=8.019;HaplotypeScore=6.7488;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=2.271;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.548;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,108:110:99:2717,273,0 chrVII 160998 . C A 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3158,316,0 chrVII 161187 . T C 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3281,342,0 chrVII 161445 . T C 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3047,312,0 chrVII 161978 . T G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.991;DP=161;Dels=0.00;FS=4.689;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,71:161:99:1346,0,2013 chrVII 162080 . G A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.313;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.921;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1389,0,1434 chrVII 162378 . G C 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;DP=100;Dels=0.00;FS=2.702;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:967,0,1125 chrVII 162554 . T C 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.686;DP=106;Dels=0.00;FS=4.855;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.249;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:869,0,1371 chrVII 162614 . A C 595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.669;DP=121;Dels=0.00;FS=2.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=4.92;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,39:121:99:625,0,1792 chrVII 162754 . A G 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.329;DP=121;Dels=0.00;FS=3.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1356,0,1227 chrVII 162856 . A T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.459;DP=104;Dels=0.00;FS=2.670;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1126,0,1137 chrVII 162922 . G A 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.066;DP=89;Dels=0.00;FS=5.394;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.563;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:911,0,939 chrVII 162943 . C T 1849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=26.80;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1882,183,0 chrVII 163245 . A T 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:948,0,1119 chrVII 163257 . A G 748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.806;DP=81;Dels=0.00;FS=1.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.008;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:778,0,955 chrVII 163275 . C G 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;DP=83;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=3.2917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.972;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:770,0,926 chrVII 163360 . A C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.067;DP=103;Dels=0.00;FS=4.852;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.486;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1107,0,999 chrVII 163361 . G T 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.075;DP=104;Dels=0.00;FS=3.693;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=10.56;ReadPosRankSum=2.162;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:104:99:1128,0,1009 chrVII 163491 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.337;DP=125;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=8.66;ReadPosRankSum=2.061;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1112,0,1587 chrVII 163894 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.462;DP=134;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.952;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1445,0,1389 chrVII 164025 . A G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.826;DP=120;Dels=0.00;FS=3.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1059,0,1516 chrVII 164066 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.433;DP=125;Dels=0.00;FS=4.287;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=11.09;ReadPosRankSum=-2.116;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1416,0,1187 chrVII 164429 . T A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.647;DP=101;Dels=0.00;FS=2.627;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.617;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,59:101:99:1372,0,906 chrVII 164486 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.491;DP=121;Dels=0.00;FS=5.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1279,0,1143 chrVII 164774 . T C 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.37;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2646,276,0 chrVII 164885 . A G 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=22.45;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2615,273,0 chrVII 164981 . T A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.885;DP=150;Dels=0.00;FS=2.982;HaplotypeScore=5.5791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.805;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:150:99:1459,0,1767 chrVII 164982 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.479;DP=146;Dels=0.00;FS=2.968;HaplotypeScore=5.5791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.869;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1426,0,1800 chrVII 165111 . T C 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3823,381,0 chrVII 165308 . G T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.293;DP=152;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1562,0,1466 chrVII 165349 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.484;DP=137;Dels=0.00;FS=2.169;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1439,0,1329 chrVII 165434 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.445;DP=157;Dels=0.00;FS=9.753;HaplotypeScore=87.8575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.851;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,66:157:99:1243,0,1894 chrVII 165441 . T A 1928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.127;DP=153;Dels=0.00;FS=9.962;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.769;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,90:153:99:1958,0,1235 chrVII 165469 . G A 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2880,291,0 chrVII 165497 . G C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.322;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:997,0,1153 chrVII 165523 . C A 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2729,273,0 chrVII 165778 . A G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.858;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.548;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1017,0,1192 chrVII 165780 . C A 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2746,273,0 chrVII 165832 . T A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;DP=93;Dels=0.00;FS=1.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.211;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1111,0,996 chrVII 165842 . A G 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2557,267,0 chrVII 165854 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.475;DP=122;Dels=0.00;FS=6.888;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1265,0,1370 chrVII 165866 . A G 2816 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2849,297,0 chrVII 165923 . C T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.132;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.618;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:133:99:1306,0,1360 chrVII 165944 . C T 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.499;DP=135;Dels=0.00;FS=2.243;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.456;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1398,0,1272 chrVII 166095 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;DP=113;Dels=0.00;FS=3.440;HaplotypeScore=3.6586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1188,0,925 chrVII 166195 . T G 298 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.380;DP=73;Dels=0.00;FS=6.874;HaplotypeScore=55.6629;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=2.239;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.110;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,71:73:39:331,39,0 chrVII 166200 . A G 44.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.0903;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=0.58;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,77:78:9:77,9,0 chrVII 166667 . C G 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3539,357,0 chrVII 166966 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.595;DP=130;Dels=0.00;FS=23.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.611;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1209,0,1517 chrVII 167076 . T C 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2868,294,0 chrVII 167099 . C T 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2682,270,0 chrVII 167210 . C T 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.502;DP=68;Dels=0.00;FS=1.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,37:68:99:847,0,570 chrVII 167443 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.786;DP=139;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.133;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1279,0,1693 chrVII 167578 . C T 2071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.90;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2104,213,0 chrVII 167583 . G C 1928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.72;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1961,213,0 chrVII 167889 . C T 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3819,379,0 chrVII 167983 . T C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.436;DP=120;Dels=0.00;FS=3.326;HaplotypeScore=3.9679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=10.80;ReadPosRankSum=-2.426;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1326,0,1161 chrVII 168156 . T C 3638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3638,375,0 chrVII 168285 . C T 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3682,367,0 chrVII 168518 . G A 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.889;DP=147;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1751,0,1302 chrVII 168582 . A T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.975;DP=123;Dels=0.00;FS=2.287;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=10.98;ReadPosRankSum=-2.936;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1381,0,1255 chrVII 168663 . C T 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.109;DP=142;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=11.58;ReadPosRankSum=2.219;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1675,0,1326 chrVII 168814 . G A 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.876;DP=156;Dels=0.00;FS=2.950;HaplotypeScore=4.9703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=1;MQRankSum=-0.335;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1732,0,1444 chrVII 168906 . T C 3775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3775,396,0 chrVII 168920 . A G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.358;DP=139;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=2.6543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.439;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1179,0,1744 chrVII 169048 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.235;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.043;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1048,0,1348 chrVII 169165 . C T 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3344,325,0 chrVII 169257 . G A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.311;DP=107;Dels=0.00;FS=2.544;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:1386,0,876 chrVII 169612 . A G 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2969,315,0 chrVII 169648 . A G 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.477;DP=134;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=3.4954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=0.489;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.611;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1505,0,1374 chrVII 169889 . G A 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.270;DP=112;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=2.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=9.05;ReadPosRankSum=-2.449;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1044,0,1234 chrVII 170211 . T C 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3466;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=21.72;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3301,345,0 chrVII 170580 . T C 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.509;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.301;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,46:92:99:989,0,1059 chrVII 170641 . G A 1210 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=11.1544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=17.79;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1243,126,0 chrVII 170718 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.177;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1184,0,1404 chrVII 170880 . A C 2728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2761,285,0 chrVII 171278 . G T 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2570,240,0 chrVII 171282 . T C 2272 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=23.42;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2305,219,0 chrVII 171310 . T C 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.953;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,41:78:99:791,0,782 chrVII 171503 . G C 2480 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2513,249,0 chrVII 171569 . G A 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.581;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9599;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=26.23;ReadPosRankSum=0.648;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:3050,297,0 chrVII 171571 . A T 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9599;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3128,301,0 chrVII 171676 . G A 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2700,273,0 chrVII 171763 . G A 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=1;QD=26.94;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2565,258,0 chrVII 171909 . G A 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2818,273,0 chrVII 171921 . T C 2338 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2371,246,0 chrVII 171949 . T C 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2916,315,0 chrVII 171995 . A G 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3472,348,0 chrVII 172009 . A C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.357;DP=132;Dels=0.00;FS=1.396;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.487;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1078,0,1662 chrVII 172032 . T C 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3695,378,0 chrVII 172111 . G A 4232.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:4232,421,0 chrVII 172132 . G A 4196.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:4196,424,0 chrVII 172210 . G A 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2904,291,0 chrVII 172231 . A T 2521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.696;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=25.99;ReadPosRankSum=-1.518;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:2554,258,0 chrVII 172290 . G A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.593;DP=88;Dels=0.00;FS=6.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.753;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:956,0,883 chrVII 172407 . A T 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3706,376,0 chrVII 172596 . A G 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2928,294,0 chrVII 172879 . G A 4181.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4181,406,0 chrVII 173276 . C T 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2618,267,0 chrVII 173282 . C T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.284;DP=107;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.527;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1111,0,1045 chrVII 173305 . G A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.360;DP=127;Dels=0.00;FS=8.321;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.419;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.524;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1274,0,1338 chrVII 173856 . T A 2468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2501,258,0 chrVII 174098 . C G 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=22.31;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3112,318,0 chrVII 174187 . G T 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.956e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3897,379,0 chrVII 174324 . T C 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3735,390,0 chrVII 174394 . A G 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.32;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2920,324,0 chrVII 174507 . A G 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.02;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3235,345,0 chrVII 174745 . C A 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=28.19;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3411,340,0 chrVII 174818 . A G 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3538,372,0 chrVII 175028 . T C 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3839;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3351,339,0 chrVII 175102 . G A 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3449,346,0 chrVII 175787 . A G 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3511,360,0 chrVII 175866 . G A 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3809,379,0 chrVII 175871 . A G 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3487,357,0 chrVII 175893 . C G 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3619,360,0 chrVII 176084 . G A 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.402;DP=119;Dels=0.00;FS=3.769;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1495,0,1047 chrVII 176107 . T C 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2996,306,0 chrVII 176415 . A G 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3117,327,0 chrVII 177152 . A C 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3683,393,0 chrVII 177165 . C T 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3804,396,0 chrVII 177524 . T C 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3456,360,0 chrVII 177632 . C T 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3190,313,0 chrVII 177687 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.561;DP=109;Dels=0.00;FS=1.551;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.213;QD=11.17;ReadPosRankSum=3.768;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1248,0,1072 chrVII 177783 . C T 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3424,337,0 chrVII 177792 . T G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;DP=137;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=8.7050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.862;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1168,0,1745 chrVII 177876 . A G 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3218,339,0 chrVII 177882 . T C 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3058,327,0 chrVII 178052 . G T 4162.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4162,424,0 chrVII 178133 . G A 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3464,346,0 chrVII 178179 . C T 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.598;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=26.52;ReadPosRankSum=1.114;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3448,327,0 chrVII 178295 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.902;DP=109;Dels=0.00;FS=2.462;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1117,0,1088 chrVII 178402 . G A 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3672,373,0 chrVII 178509 . T C 3857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3857,402,0 chrVII 178542 . T G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.885;DP=126;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.811;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1201,0,1424 chrVII 179910 . G A 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3489,346,0 chrVII 180027 . A G 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3144,339,0 chrVII 180873 . A G 2137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=22.26;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2170,237,0 chrVII 181036 . A G 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2772,288,0 chrVII 181069 . C G 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2755,288,0 chrVII 181935 . T A 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3700,358,0 chrVII 182104 . T C 3835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=1;QD=24.74;SB=-2.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3835,387,0 chrVII 182242 . T G 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.31;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3289,354,0 chrVII 182388 . C A 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3159,319,0 chrVII 182485 . T G 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3861,396,0 chrVII 182617 . A G 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.789;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.116;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1402,0,962 chrVII 182781 . A G 4137.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4137,421,0 chrVII 182995 . G A 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3671,367,0 chrVII 183038 . T C 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3590,375,0 chrVII 183250 . C T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.518;DP=138;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1352,0,1496 chrVII 183346 . A G 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.077;DP=142;Dels=0.00;FS=2.945;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1496,0,1478 chrVII 183481 . A G 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.600;DP=135;Dels=0.00;FS=2.208;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.223;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1301,0,1548 chrVII 183647 . A T 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;DP=144;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1601,0,1606 chrVII 183709 . T C 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3681,390,0 chrVII 183823 . A G 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.968;DP=155;Dels=0.00;FS=3.917;HaplotypeScore=11.8445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=1.182;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.420;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1523,0,1678 chrVII 183946 . T G 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;DP=137;Dels=0.00;FS=2.235;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.973;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:137:99:1537,0,1330 chrVII 183996 . A G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.820;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.326;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,60:104:99:1089,0,1008 chrVII 184072 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.117;DP=123;Dels=0.00;FS=5.620;HaplotypeScore=5.7360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.288;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1173,0,1332 chrVII 184074 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.334;DP=114;Dels=0.00;FS=4.840;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.932;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1106,0,1135 chrVII 184145 . T A 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.414;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1057,0,1268 chrVII 184213 . G T 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3538,355,0 chrVII 184280 . C G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.130;DP=111;Dels=0.00;FS=12.703;HaplotypeScore=2.2350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.180;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:111:99:1192,0,1110 chrVII 184357 . C T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.579;DP=139;Dels=0.00;FS=10.162;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.335;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1526,0,1478 chrVII 184422 . G A 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.870;DP=96;Dels=0.00;FS=5.127;HaplotypeScore=3.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.590;QD=7.89;ReadPosRankSum=-1.419;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:96:99:787,0,979 chrVII 184438 . T C 1806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=23.15;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1839,204,0 chrVII 184447 . A G 597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.663;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.255;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:627,0,904 chrVII 184464 . G A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.784;DP=89;Dels=0.00;FS=2.786;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:1032,0,897 chrVII 184572 . C T 2636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2669,264,0 chrVII 185139 . C T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;DP=114;Dels=0.00;FS=26.484;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.801;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1315,0,1114 chrVII 185143 . A G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.526;DP=119;Dels=0.00;FS=20.720;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.615;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1271,0,1124 chrVII 185240 . T G 2404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=22.90;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2437,252,0 chrVII 185248 . C A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.003;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:992,0,1277 chrVII 185280 . T C 2766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1515;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2799,300,0 chrVII 185393 . A C 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.525;DP=118;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.063;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1147,0,1261 chrVII 185549 . G A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.507;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1181,0,1511 chrVII 185620 . T C 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2793,300,0 chrVII 185671 . T A 1059.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.397;DP=150;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=59.4176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,58:150:99:1089,0,2121 chrVII 185672 . T A 1042.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.731;DP=150;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=59.4243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,59:150:99:1072,0,2112 chrVII 185681 . T C 977.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.597;DP=139;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,55:139:99:1007,0,1941 chrVII 185806 . G A 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.58;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3205,322,0 chrVII 185836 . A G 1610 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=43.7816;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=14.91;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:108:99:1643,171,0 chrVII 185846 . G A 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2731,270,0 chrVII 185889 . C T 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.566;DP=88;Dels=0.00;FS=7.592;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.320;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:760,0,1165 chrVII 185982 . C T 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=136.2777;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3876,373,0 chrVII 186184 . G T 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.140;DP=141;Dels=0.00;FS=7.535;HaplotypeScore=7.5225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1455,0,1486 chrVII 186206 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.933;DP=119;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1379,0,1245 chrVII 186207 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.099;DP=119;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:119:99:1324,0,1227 chrVII 186330 . G A 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3780,373,0 chrVII 186349 . T C 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.488;DP=152;Dels=0.00;FS=1.306;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=11.36;ReadPosRankSum=2.077;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1757,0,1353 chrVII 186367 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.901;DP=176;Dels=0.00;FS=0.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.262;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.076;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,78:176:99:1448,0,2194 chrVII 186430 . A G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.037;DP=146;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.153;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1428,0,1531 chrVII 186769 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.820;DP=114;Dels=0.00;FS=4.639;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.164;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:114:99:1106,0,1316 chrVII 186792 . C T 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9503;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=28.02;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3503,369,0 chrVII 186999 . T C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.219;DP=120;Dels=0.00;FS=14.135;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.040;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1067,0,1512 chrVII 187003 . T C 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=25.97;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:3019,318,0 chrVII 187054 . T G 2090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.88;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2123,225,0 chrVII 187102 . C G 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;DP=93;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.722;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,43:93:99:814,0,1042 chrVII 187174 . A G 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2958,312,0 chrVII 187348 . G T 2415 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.32;MQ0=0;QD=26.83;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2448,249,0 chrVII 187354 . A G 2290 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.99;MQ0=0;QD=25.73;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2323,252,0 chrVII 187556 . C G 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.47;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3706,396,0 chrVII 187678 . A G 2265 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=24.89;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2298,215,0 chrVII 187883 . G T 3907.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.58;SB=-2.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3907,391,0 chrVII 188242 . A G 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3285,336,0 chrVII 188702 . G T 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.392;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.265;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:843,0,775 chrVII 188705 . A G 738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.716;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:768,0,835 chrVII 188786 . A G 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.783;DP=93;Dels=0.00;FS=5.932;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:1034,0,951 chrVII 188827 . A G 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2530,258,0 chrVII 188911 . T C 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.254;DP=124;Dels=0.00;FS=5.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=1;MQRankSum=0.186;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.409;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1055,0,1437 chrVII 188978 . T A 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;DP=120;Dels=0.00;FS=4.498;HaplotypeScore=3.6337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=1;MQRankSum=0.518;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.819;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:988,0,1551 chrVII 189517 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.662;DP=132;Dels=0.00;FS=5.350;HaplotypeScore=3.4244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=-1.517;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1305,0,1459 chrVII 189602 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.761;DP=128;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.496;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1265,0,1439 chrVII 189613 . A G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.774;DP=128;Dels=0.00;FS=5.479;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.139;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1208,0,1526 chrVII 189647 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.985;DP=146;Dels=0.00;FS=2.117;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.332;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,63:146:99:1189,0,1838 chrVII 189679 . C T 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.277;DP=152;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.042;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1697,0,1428 chrVII 189823 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.390;DP=137;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=2.6332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1328,0,1590 chrVII 189910 . T G 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3412,357,0 chrVII 189920 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.018;DP=127;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.190;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1239,0,1449 chrVII 189986 . C T 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.211;DP=126;Dels=0.00;FS=19.927;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=10.47;ReadPosRankSum=2.377;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1349,0,1363 chrVII 190037 . C G 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3918,408,0 chrVII 190157 . G A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.593;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.872;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.267;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1018,0,1055 chrVII 190253 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.291;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.527;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1332,0,1132 chrVII 190288 . A G 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.760;DP=134;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1413,0,1360 chrVII 190333 . C T 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3834,379,0 chrVII 190505 . C T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3605,355,0 chrVII 190638 . T C 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.855;DP=161;Dels=0.00;FS=1.240;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.095;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,90:161:99:1835,0,1537 chrVII 190661 . G A 4341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.941;DP=162;Dels=0.00;FS=3.064;HaplotypeScore=7.9481;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=26.80;ReadPosRankSum=0.620;SB=-2.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4341,441,0 chrVII 191102 . A G 4108.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=22.21;SB=-2.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4108,414,0 chrVII 191348 . A G 1685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1718,186,0 chrVII 191489 . A G 2488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2521,264,0 chrVII 191625 . C T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.762;DP=133;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.147;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1469,0,1213 chrVII 191638 . G T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.611;DP=127;Dels=0.00;FS=2.374;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.491;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:127:99:1315,0,1288 chrVII 191779 . A G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.709;DP=135;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=3.7129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=2.684;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.927;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1392,0,1339 chrVII 191788 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.033;DP=131;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=10.40;ReadPosRankSum=2.174;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1393,0,1273 chrVII 191826 . A T 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3010,300,0 chrVII 191871 . G A 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.994;DP=141;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=9.63;ReadPosRankSum=2.058;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1388,0,1454 chrVII 191881 . G A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.576;DP=142;Dels=0.00;FS=1.329;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.383;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1487,0,1338 chrVII 191888 . G A 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.204;DP=139;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=10.24;ReadPosRankSum=2.029;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1453,0,1360 chrVII 192146 . G A 3523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.82;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3523,364,0 chrVII 192234 . C T 2200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.889;DP=118;Dels=0.00;FS=7.343;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.87;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=18.64;ReadPosRankSum=3.693;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,112:118:99:2233,206,0 chrVII 192254 . T C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.205;DP=128;Dels=0.00;FS=7.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.093;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1355,0,873 chrVII 192314 . G A 3994.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.159;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.53;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=26.45;ReadPosRankSum=1.319;SB=-1.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3994,409,0 chrVII 192323 . T C 3643.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.02;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3643,390,0 chrVII 192332 . G C 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.03;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3645,378,0 chrVII 192348 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.773;DP=131;Dels=0.00;FS=4.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.071;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1287,0,1497 chrVII 192722 . C T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.204;DP=110;Dels=0.00;FS=6.147;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=-0.125;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.572;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1361,0,951 chrVII 192749 . C T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.983;DP=135;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=1;MQRankSum=0.973;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.686;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1651,0,1190 chrVII 192839 . G A 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.358;DP=140;Dels=0.00;FS=9.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.276;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,80:140:99:1778,0,1144 chrVII 192842 . G A 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.041;DP=144;Dels=0.00;FS=8.975;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.999;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1777,0,1306 chrVII 193025 . C T 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.135;DP=141;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.619;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1524,0,1443 chrVII 193366 . A G 2255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=23.99;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2288,255,0 chrVII 193367 . G T 2396 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.04;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2429,255,0 chrVII 193460 . G A 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.23;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3128,307,0 chrVII 193477 . G A 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.11;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3308,331,0 chrVII 193504 . C T 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2735,276,0 chrVII 193537 . T A 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3611,375,0 chrVII 193564 . A C 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3897,402,0 chrVII 193573 . G A 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4046,400,0 chrVII 193598 . G A 3638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3638,375,0 chrVII 193839 . T C 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3406,372,0 chrVII 193852 . T C 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3509,378,0 chrVII 194064 . G A 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.296;DP=137;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.248;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1483,0,1467 chrVII 194481 . C T 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.864;DP=129;Dels=0.00;FS=4.510;HaplotypeScore=2.4750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.392;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1618,0,1115 chrVII 194880 . G A 1957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.534;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=2.495;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,93:170:99:1987,0,1480 chrVII 195062 . T C 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.685;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.760;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1055,0,1360 chrVII 195078 . A G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.235;DP=112;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.119;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1116,0,1174 chrVII 195096 . T G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.184;DP=115;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.092;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1101,0,1259 chrVII 195255 . T A 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;DP=144;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=11.69;ReadPosRankSum=2.104;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1714,0,1297 chrVII 195492 . G A 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.839;DP=163;Dels=0.00;FS=7.227;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.280;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1776,0,1589 chrVII 195522 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.412;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.377;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1456,0,1545 chrVII 195534 . G T 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.213;DP=136;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=3.842;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1598,0,1237 chrVII 195543 . T C 1488.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.553;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=4.553;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1518,0,1420 chrVII 195546 . G A 1380.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.076;DP=147;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.808;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.281;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1410,0,1642 chrVII 195549 . A G 1111.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.039;DP=142;Dels=0.00;FS=2.996;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-3.274;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.827;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1141,0,1758 chrVII 195555 . G A 1329.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.540;DP=148;Dels=0.00;FS=1.321;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.478;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.035;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1359,0,1676 chrVII 195635 . C G 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.818;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.430;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1181,0,1595 chrVII 195692 . G A 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;DP=127;Dels=0.00;FS=4.136;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=26.23;ReadPosRankSum=1.705;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3331,304,0 chrVII 195696 . G A 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.590;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.606;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:1113,0,1675 chrVII 195804 . T C 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.920;DP=167;Dels=0.00;FS=2.700;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1694,0,1893 chrVII 195843 . A G 1786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.474;DP=162;Dels=0.00;FS=4.740;HaplotypeScore=7.7084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.587;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,88:162:99:1816,0,1500 chrVII 195876 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.674;DP=141;Dels=0.00;FS=3.012;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:1085,0,1747 chrVII 195912 . A G 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3887,402,0 chrVII 196212 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.869;DP=119;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.871;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1053,0,1420 chrVII 196275 . C G 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.574;DP=145;Dels=0.00;FS=3.078;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1292,0,1462 chrVII 196356 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.151;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.998;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:151:99:1519,0,1501 chrVII 196468 . A G 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.098;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1515,0,1509 chrVII 196474 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.080;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.870;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1475,0,1586 chrVII 196504 . G C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;DP=122;Dels=0.00;FS=3.824;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1177,0,1388 chrVII 196614 . T C 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;DP=125;Dels=0.00;FS=2.592;HaplotypeScore=6.8631;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=22.82;ReadPosRankSum=1.960;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,122:125:99:2885,315,0 chrVII 196684 . G A 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.384;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.598;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,75:160:99:1549,0,1630 chrVII 196757 . A T 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.368;DP=166;Dels=0.00;FS=6.963;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,76:166:99:1463,0,2025 chrVII 196769 . C T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.594;DP=169;Dels=0.00;FS=5.013;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,76:169:99:1642,0,2000 chrVII 197043 . T C 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.744;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.397;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,87:172:99:1732,0,1824 chrVII 197057 . T C 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.372;DP=159;Dels=0.00;FS=1.970;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.585;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1683,0,1599 chrVII 197059 . G A 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.901;DP=162;Dels=0.00;FS=1.958;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.449;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1767,0,1554 chrVII 197150 . C A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.653;DP=118;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=4.2571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.792;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1316,0,1069 chrVII 197175 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.233;DP=140;Dels=0.00;FS=6.421;HaplotypeScore=3.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.353;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1270,0,1425 chrVII 197229 . C G 4324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4324,438,0 chrVII 197247 . G A 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.115;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,84:177:99:1666,0,1775 chrVII 197362 . G A 2155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.131;DP=187;Dels=0.00;FS=3.738;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,103:187:99:2185,0,1718 chrVII 197373 . G T 2094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.718;DP=188;Dels=0.00;FS=3.862;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=11.14;ReadPosRankSum=-2.353;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,108:188:99:2124,0,1603 chrVII 197380 . A G 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.953;DP=189;Dels=0.00;FS=2.892;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=7.96;ReadPosRankSum=2.261;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,81:189:99:1535,0,2429 chrVII 197465 . A G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.346;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.564;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1230,0,1524 chrVII 197628 . G A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.997;DP=125;Dels=0.00;FS=2.289;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=2.475;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.416;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1129,0,1419 chrVII 197813 . T C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.122;DP=128;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=104.5827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:128:99:1011,0,1572 chrVII 197942 . C T 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3621,370,0 chrVII 197989 . G A 4082.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=69.5192;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4082,408,0 chrVII 198003 . T A 1969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.039;DP=162;Dels=0.00;FS=7.578;HaplotypeScore=75.4010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=12.15;ReadPosRankSum=2.207;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,160:162:99:2002,195,0 chrVII 198124 . T C 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.033;DP=145;Dels=0.00;FS=1.358;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1588,0,1356 chrVII 198274 . C T 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3735,373,0 chrVII 198286 . C T 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3944,397,0 chrVII 198393 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.242;DP=117;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1498,0,875 chrVII 198476 . T C 4000.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=23.67;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4000,417,0 chrVII 198995 . T G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.308;DP=123;Dels=0.00;FS=2.659;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1208,0,1468 chrVII 199026 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.111;DP=136;Dels=0.00;FS=4.145;HaplotypeScore=3.5886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.895;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1404,0,1401 chrVII 199690 . A G 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3701,390,0 chrVII 199819 . G T 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.041;DP=157;Dels=0.00;FS=2.059;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=10.62;ReadPosRankSum=-2.035;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:157:99:1697,0,1503 chrVII 199882 . A G 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.158;DP=138;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=7.5127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.670;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1447,0,1417 chrVII 199894 . A G 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3355,354,0 chrVII 199917 . T G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.167;DP=122;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.937;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1208,0,1377 chrVII 200005 . C T 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.452;DP=146;Dels=0.00;FS=3.836;HaplotypeScore=3.7597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.245;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1667,0,1361 chrVII 200228 . G A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.757;DP=127;Dels=0.00;FS=13.232;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=8.96;ReadPosRankSum=2.958;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1168,0,1485 chrVII 200312 . T A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.912;DP=140;Dels=0.00;FS=2.192;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=10.46;ReadPosRankSum=2.354;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1494,0,1591 chrVII 200350 . G A 1847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.029;DP=165;Dels=0.00;FS=6.711;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.934;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,87:165:99:1877,0,1586 chrVII 200351 . C T 4469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.08;SB=-2.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4469,439,0 chrVII 200398 . T G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.869;DP=148;Dels=0.00;FS=10.017;HaplotypeScore=4.1691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=10.04;ReadPosRankSum=2.385;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:148:99:1516,0,1591 chrVII 200448 . G A 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3592,364,0 chrVII 200572 . C T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.916;DP=128;Dels=0.00;FS=10.144;HaplotypeScore=8.9238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.745;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1554,0,1109 chrVII 200728 . C T 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3057,304,0 chrVII 200782 . T C 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.815;DP=120;Dels=0.00;FS=8.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.087;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1087,0,1411 chrVII 200965 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.702;DP=123;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.947;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:1042,0,1647 chrVII 201040 . A G 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.531;DP=104;Dels=0.00;FS=9.286;HaplotypeScore=2.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.059;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:931,0,1298 chrVII 201093 . C T 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2772,273,0 chrVII 201278 . T C 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.115;DP=159;Dels=0.00;FS=5.060;HaplotypeScore=2.5721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.114;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,85:159:99:1733,0,1620 chrVII 201499 . G A 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3295,337,0 chrVII 201788 . G A 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3249,316,0 chrVII 201855 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.320;DP=89;Dels=0.00;FS=0.810;HaplotypeScore=3.4300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.991;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,51:89:99:1060,0,822 chrVII 202039 . T G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;DP=99;Dels=0.00;FS=1.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.815;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1251,0,841 chrVII 202082 . A T 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2976,303,0 chrVII 202338 . G T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;DP=121;Dels=0.00;FS=11.642;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=2.155;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.120;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1419,0,1194 chrVII 202475 . A G 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2672,282,0 chrVII 202531 . T C 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.721;DP=77;Dels=0.00;FS=0.859;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.944;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,36:77:99:719,0,941 chrVII 202665 . T A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.652;DP=96;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.468;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,58:96:99:1215,0,821 chrVII 203122 . G C 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.633;DP=143;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.024;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1533,0,1483 chrVII 203203 . T G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=121;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.661;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1331,0,1331 chrVII 203677 . A G 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.076;DP=104;Dels=0.00;FS=13.132;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:924,0,1310 chrVII 203693 . A G 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.733;DP=105;Dels=0.00;FS=15.376;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.513;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:907,0,1367 chrVII 203815 . C G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.677;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1116,0,898 chrVII 203897 . A T 2105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.31;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2138,213,0 chrVII 203956 . G A 709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.675;DP=68;Dels=0.00;FS=6.975;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.763;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,36:68:99:739,0,666 chrVII 203969 . C A 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.756;DP=69;Dels=0.00;FS=1.987;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,37:69:99:809,0,608 chrVII 203987 . A T 1637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.58;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1670,165,0 chrVII 204007 . C T 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.111;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:981,0,1040 chrVII 204092 . T G 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2978,315,0 chrVII 204113 . C T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.764;DP=115;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1007,0,1223 chrVII 204186 . A G 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.009;DP=99;Dels=0.00;FS=0.903;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.690;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:913,0,1133 chrVII 204202 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.726;DP=104;Dels=0.00;FS=4.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1117,0,1021 chrVII 204226 . G A 2146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.17;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2179,213,0 chrVII 204286 . G A 1902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1935,198,0 chrVII 204321 . A G 2134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.71;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2167,234,0 chrVII 204339 . G A 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3063,321,0 chrVII 204358 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.179;DP=119;Dels=0.00;FS=8.499;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.428;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1355,0,1230 chrVII 204427 . T C 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.165;DP=139;Dels=0.00;FS=3.226;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=1;MQRankSum=-1.695;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.221;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,82:139:99:1674,0,1219 chrVII 204579 . A T 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;DP=90;Dels=0.00;FS=8.579;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.908;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.112;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:862,0,1060 chrVII 204618 . C A 564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.628;DP=80;Dels=0.00;FS=2.936;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.30;MQ0=0;MQRankSum=-3.850;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:594,0,902 chrVII 204648 . T C 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.063;DP=88;Dels=0.00;FS=0.806;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.30;MQ0=0;MQRankSum=-3.524;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.295;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:677,0,1078 chrVII 204665 . T G 1967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.96;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2000,213,0 chrVII 204733 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.693;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.857;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.155;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1331,0,1180 chrVII 204736 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.395;DP=127;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.391;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.659;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1273,0,1259 chrVII 204746 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.651;DP=118;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.885;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1183,0,1170 chrVII 204760 . T C 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.815;DP=119;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.219;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1130,0,1218 chrVII 204785 . T G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;DP=122;Dels=0.00;FS=2.355;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.746;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1194,0,1396 chrVII 204825 . T C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.554;DP=116;Dels=0.00;FS=2.765;HaplotypeScore=2.7231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.368;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.127;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,46:116:99:914,0,1584 chrVII 204867 . G A 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.562;DP=106;Dels=0.00;FS=4.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.432;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.972;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:932,0,1291 chrVII 204881 . T C 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.669;DP=88;Dels=0.00;FS=5.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.570;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.680;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:764,0,1100 chrVII 204927 . C T 350.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.701;DP=86;Dels=0.00;FS=9.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.73;MQ0=0;MQRankSum=-5.975;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.294;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:380,0,1110 chrVII 204928 . G T 292.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.857;DP=84;Dels=0.00;FS=9.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.52;MQ0=0;MQRankSum=-6.220;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.007;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,34:84:99:322,0,1074 chrVII 204931 . C G 192.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.213;DP=76;Dels=0.00;FS=3.327;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.729;QD=2.53;ReadPosRankSum=2.713;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:222,0,1095 chrVII 204972 . G A 2152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=50.4528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.29;MQ0=0;QD=16.43;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2185,210,0 chrVII 205031 . C T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.414;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=3.077;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1642,0,1002 chrVII 205098 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.460;DP=136;Dels=0.00;FS=3.106;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQ0=0;MQRankSum=-3.490;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,55:136:99:1101,0,1754 chrVII 205114 . A T 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;DP=133;Dels=0.00;FS=4.216;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.978;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.492;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,51:133:99:1008,0,1855 chrVII 205122 . T C 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.233;DP=128;Dels=0.00;FS=7.062;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.156;QD=6.62;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,46:128:99:877,0,1873 chrVII 205126 . A C 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.926;DP=127;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQ0=0;MQRankSum=-3.028;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.281;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,47:127:99:855,0,1820 chrVII 205152 . C T 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.49;MQ0=0;QD=24.24;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2602,267,0 chrVII 205170 . A G 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.624;DP=121;Dels=0.00;FS=6.877;HaplotypeScore=46.5986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.877;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:866,0,1485 chrVII 205215 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.757;DP=128;Dels=0.00;FS=13.255;HaplotypeScore=3.5966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1289,0,1431 chrVII 205307 . T A 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3834,376,0 chrVII 205484 . C G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;DP=116;Dels=0.00;FS=4.545;HaplotypeScore=4.3799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.754;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1122,0,1240 chrVII 205559 . C A 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.43;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3258,319,0 chrVII 205653 . G A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.096;DP=102;Dels=0.00;FS=6.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.262;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:1030,0,1094 chrVII 205830 . T G 2307 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2340,240,0 chrVII 205832 . C T 2382 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2415,243,0 chrVII 205869 . G T 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.407;DP=104;Dels=0.00;FS=9.509;HaplotypeScore=3.8720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=2.064;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.398;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:995,0,1191 chrVII 206145 . G A 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=1;QD=24.60;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2690,258,0 chrVII 206526 . T C 2331 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2364,249,0 chrVII 206601 . C T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.346;DP=105;Dels=0.00;FS=8.139;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.585;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,64:105:99:1253,0,788 chrVII 206685 . A C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.118;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1104,0,1181 chrVII 206716 . T C 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.65;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3070,324,0 chrVII 206722 . G A 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.60;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3315,331,0 chrVII 206738 . T C 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3514,366,0 chrVII 206741 . C A 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.494;DP=145;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1590,0,1402 chrVII 207056 . A T 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.036;DP=146;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.864;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1555,0,1655 chrVII 207071 . T C 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3537,369,0 chrVII 207180 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.202;DP=122;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,50:122:99:1074,0,1567 chrVII 207473 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.920;DP=151;Dels=0.00;FS=16.609;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:151:99:1378,0,1797 chrVII 207520 . C A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.374;DP=122;Dels=0.00;FS=27.243;HaplotypeScore=2.5657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.658;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1324,0,1200 chrVII 207523 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.915;DP=138;Dels=0.00;FS=16.362;HaplotypeScore=3.2997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:138:99:1225,0,1365 chrVII 207551 . T C 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.22;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3060,327,0 chrVII 207761 . A G 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.154;DP=162;Dels=0.00;FS=4.699;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,78:162:99:1539,0,1814 chrVII 207781 . T G 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.878;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.052;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:147:99:1368,0,1653 chrVII 207893 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.924;DP=145;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1384,0,1459 chrVII 208001 . C A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.397;DP=165;Dels=0.00;FS=3.761;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.202;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,74:165:99:1461,0,1855 chrVII 208005 . T C 4090.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.085;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=24.64;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:4090,394,0 chrVII 208034 . C T 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3238,327,0 chrVII 208043 . T A 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3328,339,0 chrVII 208280 . G C 1876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.437;DP=174;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.719;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,91:174:99:1906,0,1636 chrVII 208315 . A G 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.265;DP=161;Dels=0.00;FS=4.831;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.118;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,87:161:99:1823,0,1546 chrVII 208340 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.031;DP=141;Dels=0.00;FS=1.341;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.270;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1370,0,1411 chrVII 208356 . A G 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.387;DP=125;Dels=0.00;FS=3.363;HaplotypeScore=3.4264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:125:99:1149,0,1410 chrVII 208469 . C T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.979;DP=151;Dels=0.00;FS=5.122;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.335;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:1357,0,1812 chrVII 208555 . A T 1832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.101;DP=164;Dels=0.00;FS=0.587;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=2.152;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1862,0,1757 chrVII 208622 . G A 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.73;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4076,412,0 chrVII 208634 . T C 1816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.958;DP=142;Dels=0.00;FS=2.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.160;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,84:142:99:1846,0,1210 chrVII 208639 . T A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.655;DP=143;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.080;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,57:143:99:1107,0,1961 chrVII 208689 . T C 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.087;DP=138;Dels=0.00;FS=6.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.128;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1599,0,1339 chrVII 208784 . T C 50.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.885;DP=83;Dels=0.00;FS=11.388;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=0.60;ReadPosRankSum=2.449;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:80:80,0,269 chrVII 208815 . A G 554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.088;DP=102;Dels=0.00;FS=7.840;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.808;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.708;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:584,0,753 chrVII 208818 . A C 629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.458;DP=102;Dels=0.00;FS=9.506;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=6.17;ReadPosRankSum=1.576;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:659,0,784 chrVII 208835 . G T 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.03;MQ0=0;QD=22.26;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2571,273,0 chrVII 208848 . A T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.912;DP=141;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.174;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1303,0,1457 chrVII 208875 . A G 1859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.943;DP=181;Dels=0.00;FS=2.030;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.376;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,90:181:99:1889,0,2019 chrVII 208955 . G A 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.464;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQ0=1;MQRankSum=0.520;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.348;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1489,0,1222 chrVII 208986 . G A 4164.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.48;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4164,409,0 chrVII 209011 . T C 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.472;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,81:168:99:1693,0,1843 chrVII 209066 . A G 3911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=21.37;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:3911,405,0 chrVII 209071 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.632;DP=125;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1249,0,1378 chrVII 209130 . A G 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.947;DP=153;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.922;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.352;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1583,0,1677 chrVII 209279 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.951;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1409,0,1531 chrVII 209671 . G T 4271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=1;QD=24.98;SB=-2.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:171:99:4271,432,0 chrVII 209977 . C T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.295;DP=130;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=4.6369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.957;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:1102,0,1583 chrVII 210027 . T C 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.627;DP=121;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.499;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1425,0,1198 chrVII 210083 . C G 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.498;DP=128;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=7.27;ReadPosRankSum=2.029;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,50:128:99:961,0,1692 chrVII 210093 . A G 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.821;DP=129;Dels=0.00;FS=6.771;HaplotypeScore=2.5584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.354;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:1024,0,1596 chrVII 210122 . A T 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;DP=107;Dels=0.00;FS=9.380;HaplotypeScore=50.5695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=7.45;ReadPosRankSum=-1.897;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:827,0,1168 chrVII 210194 . A G 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.504;DP=124;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.875;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.433;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1395,0,1223 chrVII 210517 . T C 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4045,435,0 chrVII 210538 . T C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.828;DP=155;Dels=0.00;FS=1.263;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1565,0,1782 chrVII 210688 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.022;DP=125;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=4.9308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.079;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1400,0,1270 chrVII 210745 . C T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=117;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1090,0,1287 chrVII 210785 . A G 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3607,369,0 chrVII 210946 . T C 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;DP=121;Dels=0.00;FS=3.838;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=25.37;ReadPosRankSum=0.988;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3103,308,0 chrVII 211015 . G A 4391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.628;DP=167;Dels=0.00;FS=3.594;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=26.29;ReadPosRankSum=0.550;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:167:99:4391,403,0 chrVII 211168 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.836;DP=128;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1354,0,1328 chrVII 211576 . G A 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.942;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:3174,316,0 chrVII 211747 . T C 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.736;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,71:168:99:1367,0,2209 chrVII 211876 . A G 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.179;DP=149;Dels=0.00;FS=1.298;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.296;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1634,0,1354 chrVII 211884 . A G 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.958;DP=155;Dels=0.00;FS=2.877;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.577;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:155:99:1661,0,1517 chrVII 211975 . C T 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3455,346,0 chrVII 212009 . T C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.551;DP=139;Dels=0.00;FS=4.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.325;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1509,0,1426 chrVII 212128 . C T 2407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.618;DP=187;Dels=0.00;FS=5.349;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=12.87;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,109:187:99:2437,0,1513 chrVII 212216 . T C 4143.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=23.95;ReadPosRankSum=0.334;SB=-2.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,171:173:99:4143,394,0 chrVII 212554 . G A 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3883,391,0 chrVII 212597 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.722;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.304;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1246,0,1756 chrVII 212679 . A T 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3154,304,0 chrVII 212731 . C T 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3286,331,0 chrVII 212869 . G A 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2855,294,0 chrVII 213119 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.922;DP=128;Dels=0.00;FS=4.280;HaplotypeScore=2.9181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.494;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:128:99:1381,0,1311 chrVII 213175 . G A 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3554,348,0 chrVII 213220 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.750;DP=135;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.168;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,54:135:99:1077,0,1792 chrVII 213411 . C A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.592;DP=122;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.056;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1406,0,1175 chrVII 213927 . A G 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.485;DP=109;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=6.8265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.720;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,43:109:99:742,0,1324 chrVII 214328 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.313;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.295;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1448,0,1444 chrVII 214440 . G A 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3459,334,0 chrVII 214473 . G C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.241;DP=132;Dels=0.00;FS=9.597;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1313,0,1432 chrVII 214683 . G A 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.742;DP=177;Dels=0.00;FS=0.553;HaplotypeScore=10.7405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=9.20;ReadPosRankSum=-2.206;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,78:177:99:1659,0,2004 chrVII 214710 . T C 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.594;DP=140;Dels=0.00;FS=5.213;HaplotypeScore=2.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=7.98;ReadPosRankSum=2.009;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1147,0,1753 chrVII 214758 . C G 4524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.59;SB=-2.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4524,483,0 chrVII 214822 . C T 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.249;DP=168;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=4.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.395;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,86:168:99:1848,0,1694 chrVII 214926 . C T 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8801;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4012,403,0 chrVII 215125 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.626;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.363;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1331,0,1505 chrVII 215143 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.840;DP=151;Dels=0.01;FS=3.862;HaplotypeScore=2.8489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.097;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1529,0,1726 chrVII 215210 . G A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.531;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=2.506;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.095;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1336,0,1204 chrVII 215394 . C T 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.940;DP=114;Dels=0.00;FS=14.392;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=8.36;ReadPosRankSum=-2.483;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:983,0,1376 chrVII 215404 . A G 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.586;DP=120;Dels=0.00;FS=20.303;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:120:99:919,0,1470 chrVII 215575 . A G 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5750;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3310,348,0 chrVII 215800 . G T 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.201;DP=163;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=5.9305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,80:163:99:1668,0,1674 chrVII 215826 . C T 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.414;DP=137;Dels=0.00;FS=4.064;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1496,0,1359 chrVII 215891 . C T 1468.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.898;DP=113;Dels=0.00;FS=8.988;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1498,0,896 chrVII 215893 . G A 1430.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.545;DP=113;Dels=0.00;FS=5.953;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1460,0,898 chrVII 215900 . T C 2710 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2743,297,0 chrVII 215909 . C T 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3142,313,0 chrVII 216083 . G A 4315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4315,430,0 chrVII 216137 . T A 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;DP=158;Dels=0.00;FS=3.862;HaplotypeScore=3.3394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.259;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1692,0,1624 chrVII 216207 . A G 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3526,372,0 chrVII 216267 . T C 3949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3949,408,0 chrVII 216479 . T C 4480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4480,457,0 chrVII 216543 . C T 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.367;DP=152;Dels=0.00;FS=7.189;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.696;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1706,0,1422 chrVII 216641 . T A 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.511;DP=164;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,78:164:99:1628,0,1992 chrVII 216695 . G A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.257;DP=125;Dels=0.00;FS=6.854;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=11.26;ReadPosRankSum=2.114;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1438,0,1215 chrVII 216869 . A G 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2916,315,0 chrVII 217016 . C T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.092;DP=148;Dels=0.00;FS=23.649;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:99:1315,0,1798 chrVII 217019 . A G 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.506;DP=144;Dels=0.00;FS=23.595;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.622;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1735,0,1358 chrVII 217082 . T C 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.640;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,49:127:99:943,0,1860 chrVII 217121 . A G 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.177;DP=124;Dels=0.00;FS=5.809;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.478;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,78:124:99:1621,0,993 chrVII 217362 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.922;DP=129;Dels=0.00;FS=6.913;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.855;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1075,0,1658 chrVII 217364 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.141;DP=128;Dels=0.00;FS=5.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=7.62;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1005,0,1607 chrVII 217417 . G C 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.58;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3117,330,0 chrVII 217455 . C A 1174.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.657;DP=148;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=7.93;ReadPosRankSum=2.198;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:148:99:1204,0,1834 chrVII 217457 . A G 1088.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.894;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.869;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.861;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,62:147:99:1118,0,1841 chrVII 217461 . A G 3606.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3606,375,0 chrVII 217697 . G A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.109;DP=135;Dels=0.00;FS=5.552;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=2.310;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1516,0,1312 chrVII 217776 . G T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.037;DP=139;Dels=0.00;FS=5.203;HaplotypeScore=3.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.407;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1343,0,1514 chrVII 217800 . T C 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3513,360,0 chrVII 217841 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.059;DP=136;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.011;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1096,0,1767 chrVII 217847 . A G 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3159,330,0 chrVII 218139 . G A 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2620,267,0 chrVII 218213 . T A 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;DP=96;Dels=0.00;FS=2.715;HaplotypeScore=4.6363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:910,0,1129 chrVII 218225 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.446;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.100;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1137,0,1351 chrVII 218227 . C A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.173;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.086;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1222,0,1250 chrVII 218285 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.185;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.605;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1133,0,1352 chrVII 218370 . G A 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.477;DP=126;Dels=0.00;FS=11.337;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=13.32;ReadPosRankSum=-1.149;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,76:126:99:1708,0,985 chrVII 218390 . G A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.566;DP=126;Dels=0.00;FS=11.331;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.951;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,49:126:99:1036,0,1732 chrVII 218406 . A G 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.761;DP=129;Dels=0.00;FS=19.840;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.290;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1582,0,1172 chrVII 218492 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.638;DP=117;Dels=0.00;FS=1.706;HaplotypeScore=2.7186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.866;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1112,0,1356 chrVII 218498 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.400;DP=117;Dels=0.00;FS=9.865;HaplotypeScore=3.6920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:117:99:1189,0,1332 chrVII 218628 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.345;DP=133;Dels=0.00;FS=2.197;HaplotypeScore=11.7456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.030;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.744;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1406,0,1381 chrVII 218669 . A G 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.544;DP=128;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=1;MQRankSum=-0.258;QD=8.72;ReadPosRankSum=-2.231;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1146,0,1454 chrVII 218745 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.648;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.902;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1532,0,960 chrVII 218798 . T C 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.053;DP=106;Dels=0.00;FS=9.508;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1220,0,1001 chrVII 218858 . A G 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.382;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:839,0,1454 chrVII 218900 . C T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.669;DP=119;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1153,0,1254 chrVII 218949 . C A 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2915,291,0 chrVII 218950 . G A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.186;DP=110;Dels=0.00;FS=4.593;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.083;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1121,0,1185 chrVII 218961 . T G 2784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2817,294,0 chrVII 219119 . A G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.066;DP=121;Dels=0.00;FS=7.029;HaplotypeScore=3.8029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.687;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1179,0,1341 chrVII 219263 . A G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.693;DP=100;Dels=0.00;FS=10.160;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.807;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1133,0,904 chrVII 219322 . A G 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.495;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=8.68;ReadPosRankSum=-3.760;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:811,0,983 chrVII 219563 . T C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.793;DP=122;Dels=0.00;FS=4.646;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.384;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:1365,0,1039 chrVII 219626 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.174;DP=108;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.669;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1270,0,972 chrVII 219733 . T C 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.781;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=7.89;ReadPosRankSum=-1.404;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:874,0,1422 chrVII 219776 . C T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.123;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.126;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:979,0,1431 chrVII 219779 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.523;DP=110;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.561;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:971,0,1287 chrVII 219792 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.314;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1148,0,1114 chrVII 219956 . A G 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.278;DP=148;Dels=0.00;FS=7.286;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=10.39;ReadPosRankSum=2.140;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1568,0,1511 chrVII 219971 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.226;DP=137;Dels=0.00;FS=6.330;HaplotypeScore=2.6308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.308;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1495,0,1396 chrVII 220064 . A G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.237;DP=115;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.643;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1403,0,996 chrVII 220109 . C A 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.629;DP=95;Dels=0.00;FS=0.817;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=14.03;ReadPosRankSum=-1.454;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,59:95:99:1363,0,697 chrVII 220121 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.006;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,57:94:99:1275,0,762 chrVII 220229 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.504;DP=108;Dels=0.00;FS=1.953;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:990,0,1349 chrVII 220380 . G A 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.132;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.848;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.530;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1124,0,869 chrVII 220475 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.574;DP=109;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.228;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1050,0,1172 chrVII 220519 . G A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.442;DP=103;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1186,0,918 chrVII 220697 . C A 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.440;DP=101;Dels=0.00;FS=2.629;HaplotypeScore=5.0347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.186;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:101:99:952,0,1065 chrVII 220747 . G A 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.127;DP=95;Dels=0.00;FS=1.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,52:95:99:1164,0,914 chrVII 220760 . G C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.325;DP=97;Dels=0.00;FS=8.301;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.690;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1050,0,973 chrVII 220877 . T A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.074;DP=118;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.9003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.348;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1441,0,1062 chrVII 220928 . C A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.958;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1096,0,1015 chrVII 220960 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.744;DP=110;Dels=0.00;FS=3.713;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.522;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1096,0,1302 chrVII 221031 . A G 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.407;DP=130;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,76:130:99:1634,0,1171 chrVII 221044 . G A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.403;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.642;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:123:99:1032,0,1539 chrVII 221066 . C A 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.305;DP=135;Dels=0.00;FS=6.600;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.910;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1664,0,1225 chrVII 221076 . T A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.500;DP=124;Dels=0.00;FS=4.412;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.510;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1619,0,1116 chrVII 221407 . A G 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.335;DP=170;Dels=0.00;FS=1.251;HaplotypeScore=5.8318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=1;MQRankSum=-2.004;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,80:170:99:1628,0,1987 chrVII 221698 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.848;DP=119;Dels=0.00;FS=11.917;HaplotypeScore=3.9170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.852;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1218,0,1316 chrVII 221962 . G A 1832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.381;DP=145;Dels=0.00;FS=2.990;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.002;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1862,0,1268 chrVII 221967 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.472;DP=131;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.266;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1249,0,1575 chrVII 221994 . C T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.476;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.684;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1080,0,1188 chrVII 222046 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.337;DP=137;Dels=0.00;FS=1.361;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=0.305;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1290,0,1553 chrVII 222140 . G T 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=137;Dels=0.00;FS=12.681;HaplotypeScore=2.9011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.734;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:137:99:1628,0,1315 chrVII 222215 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.030;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1546,0,1135 chrVII 222244 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.071;DP=110;Dels=0.00;FS=9.039;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1330,0,985 chrVII 222265 . G A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.194;DP=142;Dels=0.00;FS=13.925;HaplotypeScore=2.6660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1717,0,1215 chrVII 222370 . C A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.041;DP=121;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1478,0,1122 chrVII 222466 . C G 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;DP=140;Dels=0.00;FS=4.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.648;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,58:140:99:1120,0,1773 chrVII 222592 . A G 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.679;DP=111;Dels=0.00;FS=3.527;HaplotypeScore=3.4584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.198;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1118,0,1251 chrVII 222691 . A G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.805;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.522;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1458,0,1426 chrVII 223151 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.974;DP=139;Dels=0.00;FS=8.057;HaplotypeScore=5.9586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.005;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1370,0,1619 chrVII 223273 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.727;DP=131;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.892;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1468,0,1271 chrVII 223275 . G A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.283;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.460;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.771;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1492,0,1491 chrVII 223303 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.850;DP=127;Dels=0.00;FS=6.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=1;MQRankSum=0.112;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.610;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1275,0,1334 chrVII 223507 . G A 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.354;DP=118;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.769;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1082,0,1359 chrVII 223519 . G A 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.929;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.193;QD=8.33;ReadPosRankSum=2.174;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:921,0,1376 chrVII 223550 . T C 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.954;DP=112;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=8.44;ReadPosRankSum=-3.371;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:975,0,1272 chrVII 223742 . C T 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.653;DP=109;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.560;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:824,0,1424 chrVII 223756 . C T 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.846;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.265;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:918,0,1436 chrVII 223768 . G A 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.044;DP=106;Dels=0.00;FS=3.714;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.091;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:804,0,1397 chrVII 223861 . C T 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.398;DP=110;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.396;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.642;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:1043,0,1343 chrVII 223948 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.437;DP=125;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1387,0,1315 chrVII 224029 . C T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.213;DP=128;Dels=0.00;FS=6.788;HaplotypeScore=3.8159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.520;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1105,0,1558 chrVII 224467 . G C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=11.51;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1262,0,935 chrVII 224560 . T C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.112;DP=123;Dels=0.00;FS=7.028;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.008;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:948,0,1635 chrVII 224572 . C T 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.417;DP=129;Dels=0.00;FS=2.265;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.400;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,53:129:99:1019,0,1624 chrVII 224584 . A G 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.819;DP=122;Dels=0.00;FS=1.433;HaplotypeScore=7.9361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.318;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:993,0,1505 chrVII 224620 . C A 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=93;Dels=0.00;FS=2.738;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:872,0,968 chrVII 224644 . A G 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.771;DP=120;Dels=0.00;FS=1.462;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:976,0,1467 chrVII 224653 . G A 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.147;DP=123;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.737;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1078,0,1472 chrVII 224828 . C T 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.845;DP=116;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=37.5364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.53;MQ0=0;MQRankSum=-4.923;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:972,0,1073 chrVII 224851 . G A 82.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.891;DP=127;Dels=0.00;FS=5.121;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.416;QD=0.65;ReadPosRankSum=-4.082;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,33:127:99:112,0,1882 chrVII 224869 . G A 445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.954;DP=138;Dels=0.00;FS=7.910;HaplotypeScore=110.9706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-4.517;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,36:138:99:475,0,1768 chrVII 224983 . G A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.061;DP=179;Dels=0.00;FS=2.597;HaplotypeScore=9.6342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.329;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,82:179:99:1717,0,1855 chrVII 224994 . T C 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.434;DP=169;Dels=0.00;FS=1.198;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.270;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:169:99:1622,0,1919 chrVII 225389 . C T 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.401;DP=124;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.034;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1534,0,1212 chrVII 225550 . A G 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3758,393,0 chrVII 225598 . C G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.481;DP=129;Dels=0.00;FS=16.196;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:1675,0,1032 chrVII 225752 . A G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.460;DP=150;Dels=0.00;FS=3.275;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1444,0,1679 chrVII 225759 . A G 3800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3436;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3800,402,0 chrVII 225764 . G T 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.848;DP=154;Dels=0.00;FS=3.215;HaplotypeScore=2.9387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,84:154:99:1730,0,1391 chrVII 226054 . C T 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.93;SB=-2.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3986,394,0 chrVII 226152 . C T 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8212;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3667,364,0 chrVII 226182 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.055;DP=140;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1112,0,1693 chrVII 226396 . G A 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.092;DP=154;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1704,0,1494 chrVII 226434 . A G 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.148;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.641;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,89:165:99:1805,0,1610 chrVII 226902 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.940;DP=120;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.171;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1162,0,1261 chrVII 226920 . T C 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.871;DP=105;Dels=0.00;FS=0.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:912,0,1297 chrVII 226965 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.026;DP=130;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=2.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.503;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:1034,0,1615 chrVII 227280 . A G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.228;DP=128;Dels=0.00;FS=3.191;HaplotypeScore=10.4595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.108;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1271,0,1333 chrVII 227523 . T C 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.350;DP=164;Dels=0.00;FS=2.012;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.249;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,94:164:99:1850,0,1524 chrVII 227723 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.888;DP=111;Dels=0.00;FS=14.542;HaplotypeScore=6.2515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.379;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:111:99:1291,0,1017 chrVII 228148 . C T 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.724;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQ0=1;MQRankSum=-1.136;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.670;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,86:167:99:1761,0,1640 chrVII 228350 . C T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.868;DP=135;Dels=0.00;FS=8.362;HaplotypeScore=5.6247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.230;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1387,0,1356 chrVII 228403 . T A 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;DP=146;Dels=0.00;FS=2.607;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1700,0,1452 chrVII 228580 . A G 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.682;DP=110;Dels=0.00;FS=4.832;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.126;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1294,0,1085 chrVII 228659 . C G 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.020;DP=123;Dels=0.00;FS=3.246;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.753;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.388;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:869,0,1651 chrVII 228682 . C G 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.036;DP=118;Dels=0.00;FS=10.958;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.360;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,45:118:99:760,0,1590 chrVII 228702 . A C 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.222;DP=124;Dels=0.00;FS=5.290;HaplotypeScore=3.4914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=-3.536;QD=7.38;ReadPosRankSum=-2.328;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:945,0,1636 chrVII 228739 . C T 1090.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.276;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.87;MQ0=0;MQRankSum=-9.280;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.219;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1120,0,1350 chrVII 228740 . C T 1118.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.830;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.87;MQ0=0;MQRankSum=-9.132;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.358;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1148,0,1356 chrVII 228746 . C T 1111.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.158;DP=133;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=4.9562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.18;MQ0=0;MQRankSum=-8.815;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.074;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1141,0,1433 chrVII 228769 . G A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.312;DP=151;Dels=0.00;FS=3.029;HaplotypeScore=2.4888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.63;MQ0=0;MQRankSum=-8.375;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.852;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:151:99:1289,0,1696 chrVII 228776 . G C 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.006;DP=150;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=3.4804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.74;MQ0=0;MQRankSum=-7.749;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.177;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1188,0,1708 chrVII 228801 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.288;DP=163;Dels=0.00;FS=2.938;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=0;MQRankSum=-5.609;QD=7.81;ReadPosRankSum=-2.122;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,77:163:99:1303,0,1804 chrVII 228955 . G A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.592;DP=132;Dels=0.00;FS=5.269;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1421,0,1297 chrVII 229060 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.479;DP=144;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=2.9799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.120;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1413,0,1571 chrVII 229174 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.346;DP=135;Dels=0.00;FS=6.636;HaplotypeScore=2.1557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.742;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:135:99:1303,0,1449 chrVII 229302 . A G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.741;DP=121;Dels=0.00;FS=4.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.181;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1338,0,1097 chrVII 229543 . T A 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.427;DP=122;Dels=0.00;FS=3.306;HaplotypeScore=2.6834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=2.484;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:122:99:1124,0,1520 chrVII 229594 . C T 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.391;DP=132;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=2.3838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:132:99:1581,0,1236 chrVII 229638 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.240;DP=127;Dels=0.00;FS=2.323;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.069;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1214,0,1486 chrVII 229770 . A G 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.218;DP=132;Dels=0.00;FS=4.350;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,52:132:99:1004,0,1817 chrVII 230024 . C A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.126;DP=138;Dels=0.00;FS=2.134;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=9.09;ReadPosRankSum=3.005;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1285,0,1654 chrVII 230072 . A G 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3651,363,0 chrVII 230207 . A G 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3510,357,0 chrVII 230410 . G T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.971;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1411,0,1371 chrVII 230483 . G A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.325;DP=128;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=2.595;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1440,0,1239 chrVII 230648 . A C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.542;DP=141;Dels=0.00;FS=8.070;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=7.31;ReadPosRankSum=-1.171;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,58:141:99:1061,0,1863 chrVII 230653 . T C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.204;DP=145;Dels=0.00;FS=5.185;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,62:145:99:1161,0,1817 chrVII 230701 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.909;DP=122;Dels=0.00;FS=1.495;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.681;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1305,0,1169 chrVII 230742 . A G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.246;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.397;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1332,0,1204 chrVII 231071 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.733;DP=115;Dels=0.00;FS=7.496;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=-0.099;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.128;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1135,0,1256 chrVII 231409 . T A 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;DP=114;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1340,0,1135 chrVII 231415 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.765;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.119;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1199,0,1342 chrVII 231460 . G A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.414;DP=105;Dels=0.00;FS=4.904;HaplotypeScore=3.6968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.181;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:105:99:1133,0,1021 chrVII 231712 . A G 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3079,324,0 chrVII 231874 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.799;DP=113;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.491;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1235,0,1140 chrVII 232041 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.080;DP=103;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.907;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1169,0,1002 chrVII 232073 . C G 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2968,306,0 chrVII 232321 . T C 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2964,315,0 chrVII 232352 . G A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3540,357,0 chrVII 232533 . C T 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.060;DP=127;Dels=0.00;FS=5.648;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.453;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,49:127:99:943,0,1666 chrVII 232615 . T A 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3039,306,0 chrVII 232699 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.244;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1387,0,1503 chrVII 232997 . C T 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3399,331,0 chrVII 233347 . A G 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.970;DP=149;Dels=0.00;FS=13.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1752,0,1399 chrVII 233677 . G A 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.457;DP=121;Dels=0.00;FS=5.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.986;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1202,0,1440 chrVII 233683 . C T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.459;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.531;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1070,0,1418 chrVII 233748 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.725;DP=120;Dels=0.00;FS=10.127;HaplotypeScore=2.8718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.202;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1217,0,1298 chrVII 233752 . G A 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3139,307,0 chrVII 233794 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.884;DP=149;Dels=0.00;FS=11.120;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.311;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1389,0,1754 chrVII 234000 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.992;DP=137;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=2.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.334;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1440,0,1519 chrVII 234045 . A G 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.588;DP=146;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=2.5505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.902;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1534,0,1644 chrVII 234279 . G C 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=1;QD=24.12;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:128:99:3120,339,0 chrVII 234706 . A T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;DP=143;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=59.6737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=10.38;ReadPosRankSum=2.403;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:143:99:1514,0,1447 chrVII 234979 . C T 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.211;DP=145;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=4.8712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.651;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1614,0,1562 chrVII 235227 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.454;DP=140;Dels=0.00;FS=12.064;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1286,0,1612 chrVII 235392 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.267;DP=157;Dels=0.00;FS=5.120;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.476;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1643,0,1644 chrVII 235464 . G A 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3394,351,0 chrVII 235629 . T A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.539;DP=138;Dels=0.00;FS=9.177;HaplotypeScore=2.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.800;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.166;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1336,0,1653 chrVII 235941 . G A 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.157;DP=103;Dels=0.00;FS=13.421;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=2.557;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.710;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:994,0,1263 chrVII 236277 . C T 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.541;DP=100;Dels=0.00;FS=3.834;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.932;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,60:100:99:1414,0,793 chrVII 236530 . A C 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.056;DP=114;Dels=0.00;FS=2.421;HaplotypeScore=3.9422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:114:99:1066,0,1359 chrVII 236710 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.627;DP=131;Dels=0.00;FS=5.376;HaplotypeScore=5.8786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1355,0,1358 chrVII 236862 . A C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.309;DP=138;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=2.7748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=2;MQRankSum=0.585;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1322,0,1343 chrVII 236877 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.797;DP=142;Dels=0.00;FS=5.040;HaplotypeScore=2.8322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.242;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1634,0,1309 chrVII 237052 . A G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.575;DP=138;Dels=0.00;FS=4.046;HaplotypeScore=5.9271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1261,0,1635 chrVII 237114 . A G 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.433;DP=86;Dels=0.00;FS=0.848;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=9.77;ReadPosRankSum=2.620;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:870,0,1010 chrVII 237133 . T C 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.148;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.332;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:807,0,1008 chrVII 237207 . C T 502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.548;DP=72;Dels=0.00;FS=1.992;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:532,0,946 chrVII 237218 . A G 534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.893;DP=79;Dels=0.00;FS=4.378;HaplotypeScore=3.9422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.055;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:564,0,1098 chrVII 237523 . A G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.313;DP=156;Dels=0.00;FS=1.260;HaplotypeScore=6.5614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,71:156:99:1391,0,1817 chrVII 237668 . A G 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.383;DP=126;Dels=0.00;FS=6.996;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.260;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1095,0,1596 chrVII 237697 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.319;DP=116;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=8.74;ReadPosRankSum=-1.441;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:1044,0,1440 chrVII 237739 . A G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.266;DP=134;Dels=0.00;FS=8.560;HaplotypeScore=3.7849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.040;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1100,0,1707 chrVII 238184 . C A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.811;DP=134;Dels=0.00;FS=4.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.188;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,54:134:99:1060,0,1718 chrVII 238828 . T C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.315;DP=131;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.820;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1449,0,1366 chrVII 238829 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.273;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.955;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1429,0,1392 chrVII 238995 . C A 1859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.614;DP=161;Dels=0.00;FS=3.048;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.139;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1889,0,1602 chrVII 239108 . T C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.882;DP=165;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=0.264;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.254;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1407,0,1974 chrVII 239207 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.814;DP=141;Dels=0.00;FS=1.347;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=0.699;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.046;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1377,0,1551 chrVII 239625 . A T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;DP=130;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1567,0,1235 chrVII 239681 . A G 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.238;DP=138;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.717;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.067;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1498,0,1429 chrVII 239783 . G A 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.324;DP=144;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=1.593;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.840;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1473,0,1627 chrVII 239787 . C T 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.832;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=1;MQRankSum=2.788;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.196;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1510,0,1789 chrVII 240467 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.749;DP=116;Dels=0.00;FS=8.509;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.898;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1209,0,1156 chrVII 241157 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.628;DP=110;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.514;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:963,0,1247 chrVII 241162 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.953;DP=107;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.009;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1040,0,1140 chrVII 241508 . T C 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.969;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2752,275,0 chrVII 241743 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.648;DP=109;Dels=0.00;FS=3.780;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.248;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1311,0,883 chrVII 242295 . T A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.389;DP=135;Dels=0.00;FS=7.995;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=8.16;ReadPosRankSum=3.307;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,56:135:99:1132,0,1803 chrVII 242772 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.574;DP=118;Dels=0.00;FS=5.730;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.920;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1158,0,1345 chrVII 242796 . A G 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.365;DP=100;Dels=0.00;FS=5.289;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.762;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1037,0,1128 chrVII 243089 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;DP=139;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.070;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1371,0,1682 chrVII 243186 . T C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.355;DP=118;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1178,0,1301 chrVII 243903 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.705;DP=131;Dels=0.00;FS=15.104;HaplotypeScore=3.2906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1190,0,1588 chrVII 244125 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.487;DP=140;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=1;MQRankSum=-0.171;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1285,0,1721 chrVII 245694 . G T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.543;DP=135;Dels=0.00;FS=5.381;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQ0=0;MQRankSum=-4.629;QD=10.04;ReadPosRankSum=-3.159;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1385,0,1215 chrVII 245764 . A G 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.157;DP=155;Dels=0.00;FS=5.886;HaplotypeScore=6.6901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1614,0,1526 chrVII 245770 . T C 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.352;DP=144;Dels=0.00;FS=4.167;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=10.87;ReadPosRankSum=-2.093;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1595,0,1356 chrVII 248667 . G C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;DP=132;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=5.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1168,0,1606 chrVII 249026 . T G 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.788;DP=123;Dels=0.00;FS=2.429;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.607;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:965,0,1703 chrVII 250183 . C A 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.523;DP=139;Dels=0.00;FS=2.368;HaplotypeScore=3.4273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.375;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1710,0,1276 chrVII 250680 . G A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.571;DP=138;Dels=0.00;FS=6.382;HaplotypeScore=6.8164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.240;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,81:138:99:1609,0,981 chrVII 252721 . G A 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.610;DP=177;Dels=0.00;FS=1.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.888;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,90:177:99:1761,0,1715 chrVII 252804 . A T 4830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.83;SB=-2.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4830,502,0 chrVII 253916 . T C 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.635;DP=150;Dels=0.00;FS=2.958;HaplotypeScore=2.5939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.532;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1386,0,1748 chrVII 254177 . A G 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3451,366,0 chrVII 256487 . A G 3971.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3971,414,0 chrVII 256673 . G A 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.636;DP=144;Dels=0.00;FS=3.323;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=25.96;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3738,352,0 chrVII 256814 . T C 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3865,399,0 chrVII 256831 . T C 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3877,396,0 chrVII 256952 . C T 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.290;DP=149;Dels=0.00;FS=3.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=26.01;ReadPosRankSum=1.662;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3876,363,0 chrVII 257078 . A T 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3734,373,0 chrVII 257091 . T G 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=23.67;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3645,381,0 chrVII 257334 . G A 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.85;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2987,295,0 chrVII 257392 . A C 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2928,300,0 chrVII 257571 . A T 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3425,343,0 chrVII 261867 . T G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.964;DP=119;Dels=0.00;FS=4.504;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.414;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1381,0,1173 chrVII 263213 . G T 677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.365;DP=93;Dels=0.00;FS=5.460;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,35:93:99:707,0,1222 chrVII 263342 . T G 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.729;DP=120;Dels=0.00;FS=4.678;HaplotypeScore=9.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.609;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:819,0,1590 chrVII 263851 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.986;DP=120;Dels=0.00;FS=7.317;HaplotypeScore=10.5122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=7.63;ReadPosRankSum=1.465;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,46:120:99:946,0,1582 chrVII 264137 . A G 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.263;DP=120;Dels=0.00;FS=0.839;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1070,0,1580 chrVII 264565 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.665;DP=113;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1219,0,1130 chrVII 264746 . C T 1803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.157;DP=143;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=5.2885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=1;MQRankSum=0.729;QD=12.61;ReadPosRankSum=-1.345;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,83:143:99:1833,0,1113 chrVII 267395 . T G 87.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.050;DP=111;Dels=0.00;FS=190.006;HaplotypeScore=11.7034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=0.78;ReadPosRankSum=-3.900;SB=7.160e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,28:111:99:117,0,1900 chrVII 267458 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.296;DP=123;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=10.24;ReadPosRankSum=2.308;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1290,0,1369 chrVII 271308 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.675;DP=118;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=5.6282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.092;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1424,0,1048 chrVII 272310 . A G 64.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;DP=173;Dels=0.01;FS=3.182;HaplotypeScore=7.6686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=1;MQRankSum=0.910;QD=0.37;ReadPosRankSum=-7.452;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,45:172:94:94,0,1008 chrVII 273424 . C T 4107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.67;SB=-2.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4107,412,0 chrVII 273458 . G A 4176.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4176,418,0 chrVII 273503 . A G 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8706;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=22.45;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3131,330,0 chrVII 274142 . G A 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3508,343,0 chrVII 274448 . A C 2404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=22.47;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2437,261,0 chrVII 274637 . A G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.754;DP=143;Dels=0.00;FS=4.043;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=1;MQRankSum=-0.520;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.830;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1230,0,1488 chrVII 274741 . T A 537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.005;DP=102;Dels=0.00;FS=6.685;HaplotypeScore=4.3609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,35:102:99:567,0,1446 chrVII 274742 . T A 540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.928;DP=103;Dels=0.00;FS=6.700;HaplotypeScore=4.3609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.856;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,35:103:99:570,0,1479 chrVII 274754 . T G 563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;DP=109;Dels=0.00;FS=8.315;HaplotypeScore=3.9862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.749;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,38:109:99:593,0,1519 chrVII 274764 . A G 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.530;DP=118;Dels=0.00;FS=5.403;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,43:118:99:677,0,1647 chrVII 274882 . C G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.363;DP=114;Dels=0.00;FS=4.776;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:114:99:1064,0,1318 chrVII 275009 . T C 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3057,321,0 chrVII 275322 . C T 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3059,295,0 chrVII 275348 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=130;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=6.6726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1229,0,1508 chrVII 275428 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.953;DP=117;Dels=0.00;FS=2.588;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.688;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1151,0,1275 chrVII 275443 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.758;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.148;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1136,0,1260 chrVII 275467 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.370;DP=119;Dels=0.00;FS=4.999;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.700;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1287,0,1281 chrVII 275482 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.506;DP=146;Dels=0.00;FS=2.086;HaplotypeScore=2.8729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1298,0,1713 chrVII 275692 . C T 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.961;DP=156;Dels=0.00;FS=8.122;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1686,0,1438 chrVII 275701 . C T 4026.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4026,406,0 chrVII 275734 . G A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.863;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.595;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1545,0,1536 chrVII 275758 . A G 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.10;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2878,309,0 chrVII 275782 . T C 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3216,339,0 chrVII 276180 . G A 4582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4582,436,0 chrVII 276274 . T G 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.062;DP=134;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.016;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,56:134:99:1011,0,1770 chrVII 276276 . C T 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.375;DP=134;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.151;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,56:134:99:1028,0,1727 chrVII 276379 . G A 4314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4314,465,0 chrVII 276429 . A G 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3333,339,0 chrVII 276488 . G T 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3017,306,0 chrVII 276571 . G A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.716;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=11.48;ReadPosRankSum=-2.478;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1362,0,1168 chrVII 276844 . A T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.594;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1132,0,1520 chrVII 276845 . G A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.482;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1177,0,1505 chrVII 278853 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.373;DP=118;Dels=0.00;FS=3.817;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.758;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:897,0,843 chrVII 278904 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.333;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1196,0,1409 chrVII 278917 . T A 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.552;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.498;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:1070,0,1501 chrVII 279123 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.566;DP=133;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1393,0,1494 chrVII 279203 . C T 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.033;DP=175;Dels=0.00;FS=6.784;HaplotypeScore=7.4028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.087;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,93:175:99:1918,0,1666 chrVII 279435 . C T 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.444;DP=148;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=8.9131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.445;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.495;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1747,0,1404 chrVII 279477 . T C 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.724;DP=132;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.103;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1387,0,1394 chrVII 280080 . A C 68.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=121.5529;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.97;MQ0=0;QD=2.08;SB=-2.335e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:12:101,12,0 chrVII 280125 . T A 103.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;DP=29;Dels=0.00;FS=8.682;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.82;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=3.56;ReadPosRankSum=2.281;SB=-2.273e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:15:136,15,0 chrVII 280126 . T A 103.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;DP=31;Dels=0.00;FS=4.914;HaplotypeScore=2.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.621;SB=-2.293e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:15:136,15,0 chrVII 280128 . A T 103.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.96;MQ0=0;QD=3.44;SB=-1.953e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:30:15:136,15,0 chrVII 280134 . C A 481 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.76;MQ0=0;QD=11.73;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:54:514,54,0 chrVII 280135 . T A 473 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.76;MQ0=0;QD=11.54;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:54:506,54,0 chrVII 282333 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.173;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.997;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1384,0,1484 chrVII 282381 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.405;DP=123;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1290,0,1349 chrVII 284212 . C G 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3330,339,0 chrVII 284855 . A G 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3255,339,0 chrVII 286047 . C T 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3300,331,0 chrVII 286154 . G C 3971.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.882e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3971,417,0 chrVII 286247 . G A 4006.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.53;SB=-2.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4006,391,0 chrVII 286632 . A G 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3602,369,0 chrVII 286703 . G A 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3950,391,0 chrVII 287266 . G A 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2568,267,0 chrVII 287507 . T A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.489;DP=128;Dels=0.00;FS=14.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=1;MQRankSum=0.340;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1407,0,1340 chrVII 288164 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.567;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.588;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1167,0,1270 chrVII 288473 . G A 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.01;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3854,385,0 chrVII 289212 . T C 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3327,336,0 chrVII 290162 . G C 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.11;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2946,312,0 chrVII 291088 . C G 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3541,366,0 chrVII 291494 . A G 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3000,312,0 chrVII 291643 . A G 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=109.2405;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.66;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3102,312,0 chrVII 291653 . A G 44.34 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=0.37;ReadPosRankSum=1.674;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,118:119:8:74,0,8 chrVII 291925 . T C 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3430,360,0 chrVII 291992 . G A 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3648,367,0 chrVII 293254 . T C 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.82;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2763,291,0 chrVII 293255 . G A 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.22;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2839,285,0 chrVII 294111 . G A 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3091,312,0 chrVII 294404 . T C 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3289,345,0 chrVII 294462 . A G 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3668,384,0 chrVII 295605 . C G 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2786,294,0 chrVII 295864 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.299;DP=126;Dels=0.00;FS=4.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.274;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1288,0,1272 chrVII 295958 . G C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.285;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.076;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1022,0,1045 chrVII 296817 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.771;DP=93;Dels=0.00;FS=5.468;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.45;ReadPosRankSum=-2.015;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1002,0,993 chrVII 297533 . T A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;DP=110;Dels=0.00;FS=1.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.464;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1143,0,1309 chrVII 298874 . C T 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3534,334,0 chrVII 299216 . A G 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3517,375,0 chrVII 299249 . G A 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3234,327,0 chrVII 299630 . C G 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3148,315,0 chrVII 299664 . T C 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3695,369,0 chrVII 299945 . T A 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=1;QD=26.16;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3224,333,0 chrVII 300190 . G A 2443 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2476,246,0 chrVII 300493 . T C 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3057,321,0 chrVII 300952 . T C 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3204,348,0 chrVII 301018 . T C 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.11;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3219,342,0 chrVII 301042 . G A 4251.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4251,436,0 chrVII 301132 . G C 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3691,387,0 chrVII 301260 . G A 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2934,288,0 chrVII 301324 . G A 2251 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2284,228,0 chrVII 301405 . A G 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.19;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3006,315,0 chrVII 301525 . T A 4397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4397,442,0 chrVII 301819 . G T 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3091,309,0 chrVII 301891 . A T 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3235,322,0 chrVII 302104 . A G 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2859,315,0 chrVII 302319 . A G 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.73;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3602,366,0 chrVII 302394 . A G 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2916,300,0 chrVII 302483 . G A 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3076,315,0 chrVII 302623 . A C 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.378;DP=91;Dels=0.00;FS=7.171;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=9.89;ReadPosRankSum=-2.687;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:930,0,1023 chrVII 302788 . G A 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3720,361,0 chrVII 303261 . T C 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2911,318,0 chrVII 303645 . T C 3931.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=23.82;SB=-2.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3931,405,0 chrVII 303677 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.342;DP=158;Dels=0.00;FS=4.732;HaplotypeScore=2.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,65:158:99:1199,0,1981 chrVII 303887 . C T 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2870,294,0 chrVII 304107 . G A 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3521,358,0 chrVII 304214 . T A 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.403;DP=153;Dels=0.00;FS=2.874;HaplotypeScore=3.7730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.093;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1678,0,1638 chrVII 304566 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.715;DP=106;Dels=0.00;FS=26.264;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=11.67;ReadPosRankSum=-1.254;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1267,0,976 chrVII 304604 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.108;DP=126;Dels=0.00;FS=8.047;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1485,0,1165 chrVII 304609 . A T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.170;DP=122;Dels=0.00;FS=5.514;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.142;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1377,0,1230 chrVII 305019 . T C 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.267;DP=101;Dels=0.00;FS=15.395;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.785;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:911,0,1167 chrVII 305928 . G C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;DP=127;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=5.7322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=1;MQRankSum=0.430;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:127:99:1060,0,1472 chrVII 306050 . A G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.549;DP=124;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=2.3937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.414;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1068,0,1535 chrVII 306650 . C T 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.561;DP=112;Dels=0.00;FS=7.356;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.700;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:981,0,1263 chrVII 307064 . C G 476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.330;DP=62;Dels=0.00;FS=0.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:506,0,790 chrVII 307221 . A T 432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;DP=57;Dels=0.04;FS=5.704;HaplotypeScore=17.8357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=7.58;ReadPosRankSum=-1.614;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:462,0,635 chrVII 307499 . T C 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.655;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.832;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.579;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:947,0,1244 chrVII 307742 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.884;DP=127;Dels=0.00;FS=8.119;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.055;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1363,0,1367 chrVII 307868 . C T 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.056;DP=111;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.536;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1010,0,1262 chrVII 308715 . A C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.685;DP=108;Dels=0.00;FS=9.157;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.196;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1177,0,1102 chrVII 308800 . A G 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.848;DP=100;Dels=0.00;FS=4.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:979,0,1154 chrVII 309574 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.145;DP=142;Dels=0.00;FS=2.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=7.92;ReadPosRankSum=2.437;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1154,0,1661 chrVII 310446 . C G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.838;DP=122;Dels=0.00;FS=11.167;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1321,0,1059 chrVII 310527 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.536;DP=143;Dels=0.00;FS=7.358;HaplotypeScore=4.3074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:143:99:1476,0,1521 chrVII 310538 . A T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.315;DP=145;Dels=0.00;FS=10.014;HaplotypeScore=2.8624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1526,0,1636 chrVII 310899 . G A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.229;DP=118;Dels=0.00;FS=7.164;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.132;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1386,0,1094 chrVII 311272 . C T 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.817;DP=137;Dels=0.01;FS=5.336;HaplotypeScore=14.6296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1268,0,1485 chrVII 311762 . T C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.933;DP=109;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=10.55;ReadPosRankSum=-2.410;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1180,0,1144 chrVII 311795 . A T 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;DP=100;Dels=0.00;FS=5.019;HaplotypeScore=4.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.610;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:959,0,1204 chrVII 312743 . T G 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.252;DP=117;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=8.99;ReadPosRankSum=2.025;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:117:99:1082,0,1282 chrVII 312897 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.646;DP=127;Dels=0.00;FS=3.194;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.229;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1324,0,1384 chrVII 312966 . C T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.602;DP=123;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1288,0,1362 chrVII 313613 . G C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.618;DP=137;Dels=0.00;FS=2.168;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.148;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:137:99:1475,0,1397 chrVII 314032 . A G 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.865;DP=97;Dels=0.00;FS=0.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.468;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1013,0,1037 chrVII 314428 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.074;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1151,0,1494 chrVII 314439 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.445;DP=97;Dels=0.00;FS=0.854;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=2.741;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.302;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1248,0,851 chrVII 314597 . A C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.185;DP=101;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1040,0,1110 chrVII 314617 . G A 2602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2635,261,0 chrVII 314687 . C T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.659;DP=101;Dels=0.00;FS=6.599;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.215;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.089;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:101:99:1223,0,804 chrVII 315261 . T C 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.098;DP=114;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1007,0,1422 chrVII 315434 . T A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.548;DP=126;Dels=0.00;FS=4.335;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.393;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1093,0,1576 chrVII 315457 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.347;DP=117;Dels=0.00;FS=8.675;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.798;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1394,0,1093 chrVII 315504 . A G 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3077,321,0 chrVII 315635 . A G 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.876;DP=93;Dels=0.00;FS=2.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.966;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:802,0,1050 chrVII 316175 . G A 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.461;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.596;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1591,0,1670 chrVII 316332 . A G 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.779;DP=166;Dels=0.00;FS=2.765;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.190;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,76:166:99:1488,0,1947 chrVII 316588 . G A 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3456,366,0 chrVII 317991 . G C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.742;DP=100;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.698;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1177,0,924 chrVII 319571 . T C 669.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.368;DP=163;Dels=0.00;FS=13.095;HaplotypeScore=2.8251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.11;MQ0=6;MQRankSum=-5.260;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,55:163:99:699,0,2305 chrVII 319756 . T A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.609;DP=138;Dels=0.00;FS=5.315;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=3.043;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.795;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1392,0,1542 chrVII 325250 . G A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.882;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1251,0,1360 chrVII 328175 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.773;DP=115;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=2.8295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.048;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1246,0,1246 chrVII 329109 . A G 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.116;DP=148;Dels=0.00;FS=8.862;HaplotypeScore=3.6433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.413;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1564,0,1584 chrVII 330502 . G A 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.210;DP=103;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.777;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:960,0,1315 chrVII 330658 . G A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.013;DP=142;Dels=0.00;FS=5.318;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.511;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1416,0,1522 chrVII 330839 . G C 2357 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2390,255,0 chrVII 334704 . T C 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.124;DP=93;Dels=0.00;FS=5.820;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,38:93:99:751,0,1243 chrVII 334767 . T A 701.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.072;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:731,0,1246 chrVII 334768 . T G 658.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.927;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:688,0,1253 chrVII 334769 . T A 704.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:734,0,1237 chrVII 334770 . T A 713.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.293;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:743,0,1205 chrVII 336457 . T A 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.106;DP=139;Dels=0.00;FS=3.055;HaplotypeScore=4.9212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.256;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1739,0,1304 chrVII 337367 . G C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.461;DP=126;Dels=0.00;FS=5.484;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.515;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1082,0,1483 chrVII 338951 . T A 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3651,370,0 chrVII 339257 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.995;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1071,0,1129 chrVII 339606 . G T 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.847;DP=168;Dels=0.00;FS=6.637;HaplotypeScore=10.5618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:168:99:1745,0,1711 chrVII 340285 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.950;DP=107;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=3.7065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1100,0,1102 chrVII 341281 . G A 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3514,352,0 chrVII 342051 . A G 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3669,396,0 chrVII 342083 . A G 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.321;DP=149;Dels=0.00;FS=5.077;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.124;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1677,0,1465 chrVII 343639 . C T 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.906;DP=120;Dels=0.00;FS=4.458;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.327;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1480,0,1053 chrVII 345148 . T C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.416;DP=107;Dels=0.00;FS=3.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.402;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1011,0,1166 chrVII 347577 . T C 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;DP=119;Dels=0.00;FS=3.998;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=1.703;QD=25.00;ReadPosRankSum=1.116;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3008,312,0 chrVII 348251 . G A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.054;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1266,0,878 chrVII 348923 . T G 2531 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2564,270,0 chrVII 349512 . A G 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.296;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.419;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:956,0,774 chrVII 349969 . G C 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.635;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.382;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1087,0,1030 chrVII 350474 . G T 662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;DP=80;Dels=0.00;FS=2.936;HaplotypeScore=4.6928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.264;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:692,0,985 chrVII 350521 . T A 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.672;DP=116;Dels=0.00;FS=4.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=25.84;ReadPosRankSum=1.523;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:3030,285,0 chrVII 351063 . T C 2470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2503,258,0 chrVII 352026 . A G 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.711;DP=127;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=6.41;ReadPosRankSum=1.655;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,47:127:99:844,0,1805 chrVII 352482 . T A 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.132;DP=127;Dels=0.00;FS=2.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.136;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1388,0,1436 chrVII 352599 . C T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.355;DP=117;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=4.9139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1326,0,1073 chrVII 352951 . A G 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.149;DP=160;Dels=0.00;FS=4.845;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=2;MQRankSum=-0.297;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.423;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,78:160:99:1571,0,1817 chrVII 353196 . A C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.293;DP=125;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1272,0,1326 chrVII 353270 . C T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.082;DP=98;Dels=0.00;FS=5.103;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.608;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:1014,0,1067 chrVII 353297 . G C 2428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2461,264,0 chrVII 353314 . A C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.676;DP=97;Dels=0.00;FS=2.926;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=10.69;ReadPosRankSum=-2.649;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,57:97:99:1067,0,902 chrVII 353777 . G A 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3080,304,0 chrVII 353852 . G T 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3394,340,0 chrVII 353915 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2922,312,0 chrVII 353981 . C T 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.93;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3407,340,0 chrVII 354039 . T C 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.515;DP=148;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.428;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1591,0,1536 chrVII 354128 . G T 2412 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.89;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2445,243,0 chrVII 354140 . G A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.383;DP=90;Dels=0.00;FS=4.010;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:933,0,846 chrVII 354145 . C T 2177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2210,225,0 chrVII 354206 . G A 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2711,267,0 chrVII 354230 . G A 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2634,267,0 chrVII 354275 . T C 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2853,303,0 chrVII 354432 . C T 2177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=1;QD=19.97;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2210,225,0 chrVII 354732 . T C 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3020,312,0 chrVII 354740 . G A 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3224,322,0 chrVII 354828 . T C 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2860,300,0 chrVII 354898 . A G 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3208,321,0 chrVII 355070 . G A 886.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.283;DP=118;Dels=0.00;FS=3.368;HaplotypeScore=5.5400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.36;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=7.51;ReadPosRankSum=2.160;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:916,0,1417 chrVII 355076 . A C 2287 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.76;MQ0=0;QD=22.87;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2320,252,0 chrVII 355078 . T C 2380 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.45;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:2413,258,0 chrVII 355088 . T C 2324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.29;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2357,252,0 chrVII 355098 . T C 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.75;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2441,258,0 chrVII 355292 . G A 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.96;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2976,289,0 chrVII 355706 . C T 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.523;DP=149;Dels=0.00;FS=3.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=25.55;ReadPosRankSum=0.988;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3807,381,0 chrVII 355780 . G C 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3007,321,0 chrVII 355928 . T C 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2804,300,0 chrVII 356393 . A T 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3326,328,0 chrVII 357041 . C T 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3822,382,0 chrVII 357335 . A G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.710;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.784;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:998,0,1494 chrVII 357373 . A G 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.832;DP=125;Dels=0.00;FS=11.319;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.954;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1120,0,1307 chrVII 357841 . T C 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.736;DP=156;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=9.97;ReadPosRankSum=2.751;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1585,0,1686 chrVII 358192 . A G 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.240;DP=155;Dels=0.00;FS=20.700;HaplotypeScore=3.5472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.906;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1479,0,1661 chrVII 358202 . A G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.279;DP=153;Dels=0.00;FS=12.268;HaplotypeScore=3.6074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.704;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:153:99:1434,0,1763 chrVII 358656 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.837;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:122:99:1339,0,1153 chrVII 358861 . T G 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.682;DP=176;Dels=0.00;FS=0.557;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.959;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,87:176:99:1666,0,2057 chrVII 360498 . A G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.988;DP=127;Dels=0.00;FS=5.478;HaplotypeScore=2.5802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.900;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.385;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1422,0,1248 chrVII 360816 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.537;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.271;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1238,0,1607 chrVII 361541 . C T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.493;DP=125;Dels=0.00;FS=3.347;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1301,0,1225 chrVII 361547 . A G 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2767,282,0 chrVII 361695 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.722;DP=131;Dels=0.00;FS=2.304;HaplotypeScore=2.4836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1313,0,1402 chrVII 361737 . C T 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.008;DP=110;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=7.4061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.592;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1173,0,1066 chrVII 361880 . A G 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.778;DP=140;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.779;QD=11.15;ReadPosRankSum=2.143;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1591,0,1389 chrVII 362066 . G A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.897;DP=78;Dels=0.00;FS=0.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.147;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,46:78:99:1014,0,630 chrVII 362321 . A G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.686;DP=140;Dels=0.00;FS=5.162;HaplotypeScore=12.5559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.947;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1445,0,1357 chrVII 362516 . A T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.377;DP=143;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1420,0,1602 chrVII 363611 . C T 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.184;DP=137;Dels=0.00;FS=5.130;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.043;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1661,0,1256 chrVII 364120 . G C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;DP=124;Dels=0.00;FS=10.018;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.033;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1282,0,1169 chrVII 364650 . C G 519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.048;DP=93;Dels=0.00;FS=7.646;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.20;MQ0=3;MQRankSum=-2.353;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:549,0,1238 chrVII 365023 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.173;DP=101;Dels=0.00;FS=2.709;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.185;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1253,0,880 chrVII 365076 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.522;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=0;MQRankSum=2.084;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.344;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1296,0,1335 chrVII 365727 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.925;DP=122;Dels=0.00;FS=4.453;HaplotypeScore=2.7893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1263,0,1354 chrVII 366235 . G A 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.288;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.506;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1027,0,1065 chrVII 366323 . C G 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;DP=133;Dels=0.00;FS=5.293;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.562;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1436,0,1281 chrVII 366762 . A G 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.586;DP=82;Dels=0.00;FS=18.446;HaplotypeScore=2.7341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,49:82:99:941,0,621 chrVII 367697 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.717;DP=149;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:1181,0,1965 chrVII 367741 . G A 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.196;DP=116;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.334;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,45:116:99:918,0,1477 chrVII 367828 . G A 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.033;DP=82;Dels=0.00;FS=1.946;HaplotypeScore=6.9271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:82:99:854,0,847 chrVII 368346 . A C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;DP=136;Dels=0.00;FS=4.213;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1166,0,1691 chrVII 368495 . T G 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.950;DP=147;Dels=0.00;FS=5.374;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.952;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1457,0,1725 chrVII 369167 . G A 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.818;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.229;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1702,0,1444 chrVII 369600 . A G 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.753;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,85:147:99:1797,0,1349 chrVII 369666 . G T 1879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.931;DP=159;Dels=0.00;FS=9.684;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=-1.820;QD=11.82;ReadPosRankSum=-2.130;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:1909,0,1513 chrVII 369881 . C A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.989;DP=128;Dels=0.00;FS=1.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1450,0,1309 chrVII 370360 . A G 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.098;DP=117;Dels=0.00;FS=2.532;HaplotypeScore=5.0996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.604;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:117:99:1144,0,1287 chrVII 370476 . A G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.624;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=9.13;ReadPosRankSum=-2.195;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1418,0,1701 chrVII 370641 . G T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.407;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=9.11;ReadPosRankSum=2.487;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1205,0,1422 chrVII 370996 . T C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.182;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.202;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:997,0,1404 chrVII 371489 . T G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.344;DP=144;Dels=0.00;FS=4.898;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1335,0,1621 chrVII 371528 . A G 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.774;DP=158;Dels=0.00;FS=3.761;HaplotypeScore=4.8926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.101;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1752,0,1524 chrVII 371640 . T C 1847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.826;DP=189;Dels=0.00;FS=5.150;HaplotypeScore=6.7911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=9.77;ReadPosRankSum=-2.437;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,102:189:99:1877,0,1902 chrVII 371877 . A G 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.892;DP=142;Dels=0.00;FS=7.805;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=10.96;ReadPosRankSum=-2.231;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1586,0,1459 chrVII 371937 . A G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.564;DP=126;Dels=0.00;FS=15.325;HaplotypeScore=7.6774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.990;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:126:99:1449,0,1114 chrVII 372033 . G C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.998;DP=156;Dels=0.00;FS=11.546;HaplotypeScore=11.2908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1463,0,1656 chrVII 372223 . T G 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.175;DP=179;Dels=0.00;FS=3.413;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=2.851;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,93:179:99:1760,0,1879 chrVII 372293 . G A 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.645;DP=157;Dels=0.00;FS=3.915;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.942;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1935,0,1434 chrVII 372417 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.862;DP=126;Dels=0.00;FS=7.359;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.203;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1035,0,1535 chrVII 372605 . A T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;DP=141;Dels=0.00;FS=3.004;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.122;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1417,0,1621 chrVII 372717 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.272;DP=143;Dels=0.00;FS=5.037;HaplotypeScore=2.7431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.682;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1536,0,1513 chrVII 372926 . A C 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;DP=142;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.929;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:142:99:1585,0,1359 chrVII 373258 . A G 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.040;DP=149;Dels=0.00;FS=2.093;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.754;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.935;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1713,0,1509 chrVII 373471 . A T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;DP=123;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.230;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1399,0,1268 chrVII 373531 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.348;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.038;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.975;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1091,0,1191 chrVII 373580 . T C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.240;DP=130;Dels=0.00;FS=9.505;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=8.74;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1166,0,1597 chrVII 373624 . C T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.597;DP=152;Dels=0.00;FS=11.730;HaplotypeScore=3.2780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.107;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,57:152:99:1090,0,2186 chrVII 373646 . C T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.683;DP=155;Dels=0.00;FS=7.473;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=8.17;ReadPosRankSum=-2.940;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,66:155:99:1297,0,1915 chrVII 373713 . T C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.545;DP=154;Dels=0.00;FS=1.287;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.156;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1361,0,1830 chrVII 373766 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.961;DP=149;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.695;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1444,0,1624 chrVII 373781 . A G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.292;DP=170;Dels=0.00;FS=7.080;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.853;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,79:170:99:1553,0,1953 chrVII 373940 . C G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.139;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.874;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1274,0,1652 chrVII 373957 . A T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.258;DP=145;Dels=0.00;FS=2.966;HaplotypeScore=2.8540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.006;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.598;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1430,0,1543 chrVII 373958 . C T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.743;DP=142;Dels=0.00;FS=3.970;HaplotypeScore=3.5880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.078;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1446,0,1438 chrVII 374354 . A G 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.574;DP=161;Dels=0.00;FS=4.627;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1785,0,1589 chrVII 374582 . T C 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.459;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.336;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1676,0,1493 chrVII 374962 . C G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;DP=122;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1172,0,1293 chrVII 374973 . G A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.102;DP=122;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.090;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1329,0,1318 chrVII 375001 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.783;DP=140;Dels=0.00;FS=4.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1519,0,1302 chrVII 375036 . G A 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.264;DP=157;Dels=0.00;FS=6.283;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.506;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1806,0,1511 chrVII 375227 . A T 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.013;DP=138;Dels=0.00;FS=7.206;HaplotypeScore=3.7671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.403;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.521;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1604,0,1399 chrVII 375494 . G T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.824;DP=135;Dels=0.00;FS=7.758;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1484,0,1335 chrVII 375538 . G C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.278;DP=136;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.589;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,50:136:99:924,0,1839 chrVII 376112 . T A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;DP=123;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.026;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:123:99:1281,0,1235 chrVII 376235 . C T 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.838;DP=114;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.865;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1027,0,1195 chrVII 376314 . G A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.722;DP=121;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.689;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1221,0,1414 chrVII 376364 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.861;DP=135;Dels=0.01;FS=6.503;HaplotypeScore=6.7656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.997;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1313,0,1571 chrVII 377199 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.374;DP=124;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1321,0,1245 chrVII 378078 . C A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.411;DP=129;Dels=0.00;FS=5.367;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=9.44;ReadPosRankSum=-2.278;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1248,0,1505 chrVII 379743 . A G 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.905;DP=131;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=2.5009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:131:99:1283,0,1392 chrVII 380141 . C T 1812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.859;DP=149;Dels=0.00;FS=2.943;HaplotypeScore=5.2741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.739;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,86:149:99:1842,0,1229 chrVII 380177 . A T 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;DP=144;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=5.2765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1569,0,1419 chrVII 380323 . G A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.976;DP=145;Dels=0.00;FS=3.044;HaplotypeScore=3.5519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=2.608;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.381;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,62:145:99:1299,0,1790 chrVII 380368 . T C 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.401;DP=140;Dels=0.00;FS=6.640;HaplotypeScore=6.4355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.200;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,50:140:99:893,0,1964 chrVII 380930 . A G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.201;DP=134;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=7.5565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.875;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,56:134:99:991,0,1830 chrVII 381313 . C T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.582;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.053;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1454,0,1541 chrVII 381438 . A G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.809;DP=144;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=7.6813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.763;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1154,0,1741 chrVII 381441 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.447;DP=146;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=4.7023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.408;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1204,0,1661 chrVII 381517 . C G 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.808;DP=121;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.299;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1293,0,1283 chrVII 381897 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.092;DP=119;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.788;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1341,0,1193 chrVII 382144 . A C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.957;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1441,0,1429 chrVII 382210 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.162;DP=126;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=6.97;ReadPosRankSum=-2.537;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:908,0,1605 chrVII 382476 . A G 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3713,381,0 chrVII 382993 . G A 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.244;DP=160;Dels=0.00;FS=1.266;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.624;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,75:160:99:1645,0,1809 chrVII 383010 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.791;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.668;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,81:179:99:1541,0,2101 chrVII 383348 . T C 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3611,366,0 chrVII 383402 . A C 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2850,303,0 chrVII 383465 . C T 4571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4571,457,0 chrVII 383573 . G T 4759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.04;SB=-2.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4759,463,0 chrVII 383584 . T C 4340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4340,444,0 chrVII 383893 . A G 1780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.995;DP=165;Dels=0.00;FS=12.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1810,0,1653 chrVII 383977 . T C 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.742;DP=131;Dels=0.00;FS=4.291;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.287;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1636,0,1185 chrVII 384196 . C A 2009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.296;DP=158;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=12.72;ReadPosRankSum=3.074;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,93:158:99:2039,0,1335 chrVII 384239 . T C 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.148;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3599,366,0 chrVII 384425 . T C 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.828;DP=189;Dels=0.00;FS=0.556;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.276;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,88:189:99:1576,0,2180 chrVII 384641 . C A 2086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;DP=197;Dels=0.00;FS=1.136;HaplotypeScore=6.4796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.172;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,103:197:99:2116,0,1971 chrVII 384678 . G A 2217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.387;DP=199;Dels=0.00;FS=4.978;HaplotypeScore=3.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,106:199:99:2247,0,1870 chrVII 385178 . T A 1992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;DP=161;Dels=0.00;FS=4.994;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.341;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,92:161:99:2022,0,1367 chrVII 385194 . C T 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.784;DP=153;Dels=0.00;FS=2.988;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=11.63;ReadPosRankSum=2.392;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1809,0,1411 chrVII 385288 . A T 1816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.149;DP=127;Dels=0.00;FS=1.585;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=14.30;ReadPosRankSum=1.136;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,80:127:99:1846,0,972 chrVII 385495 . A C 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.155;DP=101;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.404;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:805,0,1256 chrVII 385519 . T C 1989 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.330;DP=86;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=4.6336;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.45;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=23.13;ReadPosRankSum=1.103;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,84:86:99:2022,198,0 chrVII 385522 . G T 2019 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;DP=90;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=5.6269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.87;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=22.43;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:90:99:2052,196,0 chrVII 385525 . A G 1959 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=89;Dels=0.00;FS=5.180;HaplotypeScore=6.6202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.88;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=22.01;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:1992,197,0 chrVII 385531 . C T 1948 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.208;DP=86;Dels=0.00;FS=5.195;HaplotypeScore=5.5432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.81;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=22.65;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:1981,189,0 chrVII 385534 . C T 1890 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.611;DP=86;Dels=0.00;FS=5.366;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.71;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.329;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:1923,183,0 chrVII 385540 . A G 1749 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=83;Dels=0.00;FS=5.574;HaplotypeScore=6.5128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.45;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=21.07;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:83:99:1782,176,0 chrVII 385542 . T C 1782 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=85;Dels=0.00;FS=5.677;HaplotypeScore=6.4136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.42;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=20.96;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:1815,185,0 chrVII 385555 . C A 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.334;DP=113;Dels=0.00;FS=4.968;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.49;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=22.12;ReadPosRankSum=-1.088;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2532,246,0 chrVII 385570 . T C 2356 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.567;DP=117;Dels=0.00;FS=3.243;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.36;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,115:117:99:2389,237,0 chrVII 385619 . C T 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.210;DP=133;Dels=0.00;FS=3.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.73;MQ0=0;MQRankSum=3.138;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.976;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1665,0,1116 chrVII 385714 . C T 1673.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.176;DP=150;Dels=0.00;FS=8.765;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.64;MQ0=6;MQRankSum=1.498;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.233;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1703,0,1301 chrVII 386494 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.668;DP=148;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.362;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1494,0,1513 chrVII 386539 . T C 2706 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.83;MQ0=1;QD=20.98;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:2739,300,0 chrVII 386548 . C A 2814 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.41;MQ0=1;QD=21.00;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:2847,303,0 chrVII 386549 . A C 2724 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.38;MQ0=1;QD=20.79;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:2757,303,0 chrVII 386557 . A C 2736 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.03;MQ0=1;QD=20.89;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:2769,297,0 chrVII 386563 . T C 2576 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.04;MQ0=1;QD=20.28;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:2609,291,0 chrVII 386581 . G A 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.87;MQ0=1;QD=23.97;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2718,282,0 chrVII 386593 . C T 2745 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.60;MQ0=1;QD=24.29;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2778,294,0 chrVII 386596 . C T 2744 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.90;MQ0=1;QD=23.86;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2777,297,0 chrVII 386599 . C T 2678 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.81;MQ0=1;QD=21.60;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:2711,285,0 chrVII 386608 . G A 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.21;MQ0=1;QD=24.58;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3155,339,0 chrVII 386978 . C G 2216 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.73;MQ0=2;QD=23.83;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2249,246,0 chrVII 386979 . G C 2246 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.01;MQ0=2;QD=24.15;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2279,249,0 chrVII 387205 . C A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.696;DP=159;Dels=0.00;FS=1.251;HaplotypeScore=4.8884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.322;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,68:159:99:1266,0,1990 chrVII 387637 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.466;DP=144;Dels=0.00;FS=6.234;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.134;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1389,0,1706 chrVII 387793 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.005;DP=133;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.538;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1389,0,1543 chrVII 387970 . T A 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.527;DP=167;Dels=0.00;FS=4.592;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.252;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,76:167:99:1657,0,1919 chrVII 387977 . T C 4067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4067,420,0 chrVII 388177 . G A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.749;DP=140;Dels=0.00;FS=2.143;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=9.08;ReadPosRankSum=3.623;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1301,0,1690 chrVII 388315 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.455;DP=113;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=2.7881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1309,0,1095 chrVII 388381 . C A 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.420;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.258;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:962,0,946 chrVII 388573 . A G 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.793;DP=165;Dels=0.00;FS=1.960;HaplotypeScore=3.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.243;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1740,0,1712 chrVII 388627 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.829;DP=117;Dels=0.00;FS=6.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.101;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1272,0,1144 chrVII 389105 . G A 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.45;SB=-2.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3767,361,0 chrVII 389155 . T C 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.383;DP=128;Dels=0.00;FS=4.254;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.994;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.458;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1487,0,1191 chrVII 389336 . C T 1817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.539;DP=145;Dels=0.00;FS=12.457;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=12.53;ReadPosRankSum=-1.828;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1847,0,1263 chrVII 389368 . G C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.935;DP=127;Dels=0.00;FS=5.416;HaplotypeScore=3.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.705;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1294,0,1340 chrVII 389472 . A C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.177;DP=121;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=4.8344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.767;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1078,0,1451 chrVII 389508 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.367;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=9.25;ReadPosRankSum=-2.658;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1214,0,1452 chrVII 389529 . C A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.482;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.113;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1033,0,1219 chrVII 389751 . A G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.653;DP=104;Dels=0.00;FS=2.566;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.258;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1079,0,1138 chrVII 389891 . C T 686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.848;DP=93;Dels=0.00;FS=2.083;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.051;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:716,0,1185 chrVII 389935 . A G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.145;DP=104;Dels=0.00;FS=2.563;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1105,0,1124 chrVII 390234 . T A 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.054;DP=97;Dels=0.00;FS=1.664;HaplotypeScore=2.1500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.982;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:892,0,1191 chrVII 390274 . A T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.569;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1364,0,1102 chrVII 390472 . C G 4298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.99;SB=-2.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4298,456,0 chrVII 390484 . A T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.919;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.916;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1567,0,1662 chrVII 390686 . A G 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.776;DP=133;Dels=0.00;FS=6.814;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.282;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1104,0,1743 chrVII 390921 . T C 3896.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=1;QD=25.80;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3896,417,0 chrVII 391138 . G T 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.592;DP=99;Dels=0.00;FS=3.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=25.31;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2539,228,0 chrVII 391186 . T C 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2674,285,0 chrVII 391249 . G A 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3383,337,0 chrVII 391279 . A G 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=26.16;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2675,270,0 chrVII 391406 . T C 2473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2506,264,0 chrVII 392010 . G A 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3076,309,0 chrVII 392315 . T C 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2524,261,0 chrVII 394511 . T A 2203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.06;MQ0=0;QD=19.32;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2236,228,0 chrVII 394661 . A G 2502 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=25.53;ReadPosRankSum=1.308;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2535,255,0 chrVII 395021 . G C 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2900,285,0 chrVII 395241 . C G 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2937,309,0 chrVII 395381 . A G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3214,324,0 chrVII 395698 . T C 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3479,354,0 chrVII 395734 . T C 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6474;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3496,354,0 chrVII 395752 . G C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3076,318,0 chrVII 395788 . A G 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3209,339,0 chrVII 395803 . G A 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3120,313,0 chrVII 395815 . A G 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.93;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2968,321,0 chrVII 395869 . G A 1027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.5861;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.93;MQ0=0;QD=9.34;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:1060,123,0 chrVII 395882 . C T 1673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.21;MQ0=0;QD=19.45;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1706,165,0 chrVII 396018 . T C 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2860,297,0 chrVII 396062 . T C 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=137;Dels=0.00;FS=3.586;HaplotypeScore=3.5333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=23.51;ReadPosRankSum=1.606;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3254,297,0 chrVII 396092 . C T 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3239;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3246,324,0 chrVII 396110 . A G 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3194,321,0 chrVII 396170 . T C 3901.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=25.66;ReadPosRankSum=1.231;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3901,385,0 chrVII 396232 . T C 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=156;Dels=0.00;FS=3.938;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=25.03;ReadPosRankSum=1.288;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3904,380,0 chrVII 396235 . C T 4130.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4130,400,0 chrVII 396269 . A G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3126,339,0 chrVII 396578 . G A 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3712,379,0 chrVII 396581 . C T 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3376,342,0 chrVII 397325 . T C 4427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4427,462,0 chrVII 397448 . T A 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4007,400,0 chrVII 397692 . A G 3882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3882,396,0 chrVII 397937 . A G 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3178,336,0 chrVII 398706 . G A 2556 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2589,261,0 chrVII 399014 . T C 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3120,327,0 chrVII 399032 . G A 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2566,252,0 chrVII 399494 . T C 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3058,315,0 chrVII 399537 . T A 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3486,351,0 chrVII 400162 . T C 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2956,318,0 chrVII 400432 . A G 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=23.15;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2487,270,0 chrVII 400495 . C T 2274 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2307,234,0 chrVII 401117 . A G 4120.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9318;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4120,414,0 chrVII 401528 . T C 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=1;QD=24.68;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2674,276,0 chrVII 401617 . G T 1468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.81;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1501,153,0 chrVII 401621 . T G 1413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.81;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1446,153,0 chrVII 401919 . G A 817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=19.93;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:81:850,81,0 chrVII 402262 . C A 16.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=8;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.85;MQ0=4;MQRankSum=-1.026;QD=2.01;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-1.249e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:43:46,0,43 chrVII 402268 . T C 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.85;MQ0=4;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-1.249e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:44:44,0,44 chrVII 402269 . C A 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=8;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.85;MQ0=4;MQRankSum=-1.026;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-1.249e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:45:45,0,45 chrVII 402273 . A G 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=8;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.85;MQ0=4;MQRankSum=-1.026;QD=1.77;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-1.249e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:44:44,0,47 chrVII 402357 . C T 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:56,6,0 chrVII 402365 . G A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 chrVII 402373 . C T 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.21;MQ0=0;QD=8.92;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:58,6,0 chrVII 402407 . A G 73.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.74;MQ0=0;QD=8.17;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:106,12,0 chrVII 402408 . C G 73.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.74;MQ0=0;QD=8.17;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:106,12,0 chrVII 402421 . T A 144.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.96;MQ0=0;QD=11.09;SB=-1.459e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:18:177,18,0 chrVII 402469 . G A 352 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.56;MQ0=0;QD=19.56;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:39:385,39,0 chrVII 402508 . A T 241.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.25;MQ0=0;QD=17.22;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:27:274,27,0 chrVII 403700 . T C 132.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.19;MQ0=6;QD=6.01;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:18:165,18,0 chrVII 403731 . C T 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.024;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.31;MQ0=8;MQRankSum=-2.389;QD=0.35;ReadPosRankSum=1.215;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:44:44,0,436 chrVII 403770 . T C 450.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.807;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.85;MQ0=11;MQRankSum=3.465;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.758;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:93:480,0,93 chrVII 404050 . G A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.899;DP=123;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.88;MQ0=1;MQRankSum=1.487;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.403;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1168,0,1368 chrVII 404288 . G A 444 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.34;MQ0=2;QD=24.67;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:48:477,48,0 chrVII 404404 . G A 254 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;MQ0=4;QD=18.14;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:30:287,30,0 chrVII 405296 . T A 1134 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.84;MQ0=26;QD=15.12;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,54:75:99:1167,123,0 chrVII 405315 . T C 1325 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.16;MQ0=28;QD=15.41;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,63:86:99:1358,150,0 chrVII 405345 . G A 1750 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=19;QD=19.66;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,75:89:99:1783,180,0 chrVII 405346 . G A 1814 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.14;MQ0=19;QD=19.72;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,78:92:99:1847,189,0 chrVII 405349 . G T 1875 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.46;MQ0=17;QD=20.38;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,80:92:99:1908,198,0 chrVII 405432 . C T 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9348;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3309,336,0 chrVII 405433 . T A 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9348;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.08;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3344,339,0 chrVII 405802 . A G 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3382,342,0 chrVII 406015 . C G 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3539,372,0 chrVII 406378 . C T 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3870,382,0 chrVII 407124 . G A 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2923,283,0 chrVII 408078 . G A 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3822,385,0 chrVII 408180 . T C 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3578,369,0 chrVII 408490 . G A 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3813,385,0 chrVII 408708 . G A 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2881,294,0 chrVII 408709 . A C 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2830,297,0 chrVII 408767 . G A 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3144,315,0 chrVII 408864 . G A 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:3003,298,0 chrVII 408942 . C T 2605 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.05;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2638,264,0 chrVII 409104 . T C 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2910,291,0 chrVII 410420 . C T 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2945,286,0 chrVII 410531 . G A 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2937,294,0 chrVII 410597 . G A 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=26.82;ReadPosRankSum=1.316;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3353,319,0 chrVII 410720 . G A 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3014,300,0 chrVII 410750 . A G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.4983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3214,327,0 chrVII 411540 . C A 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.097;DP=116;Dels=0.00;FS=6.930;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.302;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1073,0,1330 chrVII 411573 . G A 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3150,324,0 chrVII 411935 . G T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.636;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.087;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.814;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1314,0,1392 chrVII 412277 . C T 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=105.3494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=26.14;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2987,288,0 chrVII 412387 . T G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.236;DP=107;Dels=0.00;FS=10.793;HaplotypeScore=2.6113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.371;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1189,0,1058 chrVII 412400 . C T 3906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3906,388,0 chrVII 412411 . C T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.841;DP=139;Dels=0.00;FS=3.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=9.14;ReadPosRankSum=2.277;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1300,0,1587 chrVII 412477 . C T 1939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.550;DP=145;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.955;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,86:144:99:1969,0,1104 chrVII 412619 . A C 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2897,294,0 chrVII 412625 . T C 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=65.4727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=23.33;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:2879,306,0 chrVII 412672 . T C 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.015;DP=141;Dels=0.00;FS=5.561;HaplotypeScore=4.5429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.048;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,82:141:99:1456,0,1223 chrVII 412771 . G C 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.738;DP=149;Dels=0.00;FS=1.327;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1585,0,1472 chrVII 412810 . A G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.300;DP=141;Dels=0.00;FS=2.992;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1532,0,1371 chrVII 412828 . C T 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.550;DP=149;Dels=0.00;FS=6.060;HaplotypeScore=2.2368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.783;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1678,0,1526 chrVII 412850 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.071;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.494;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1353,0,1498 chrVII 412864 . T A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;DP=130;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1451,0,1295 chrVII 412886 . C T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.258;DP=127;Dels=0.00;FS=4.241;HaplotypeScore=54.1513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1312,0,1266 chrVII 412932 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.507;DP=147;Dels=0.00;FS=2.989;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1507,0,1497 chrVII 413016 . T C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.046;DP=167;Dels=0.00;FS=4.074;HaplotypeScore=6.7876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1511,0,1833 chrVII 413051 . T C 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.772;DP=166;Dels=0.00;FS=3.948;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.801;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,83:166:99:1696,0,1749 chrVII 413167 . T C 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.812;DP=154;Dels=0.00;FS=16.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1549,0,1650 chrVII 413312 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.462;DP=115;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=3.7426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1237,0,1061 chrVII 413440 . C T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.432;DP=137;Dels=0.00;FS=7.762;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.688;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.257;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:137:99:1501,0,1285 chrVII 413728 . C G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQ0=0;MQRankSum=-3.042;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1044,0,1419 chrVII 413797 . C T 2465 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.70;MQ0=0;QD=20.54;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2498,243,0 chrVII 414206 . C G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.811;DP=144;Dels=0.00;FS=4.966;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.468;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1524,0,1477 chrVII 414265 . G A 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.795;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=11.57;ReadPosRankSum=2.485;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1661,0,1352 chrVII 414479 . C T 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.704;DP=151;Dels=0.00;FS=10.295;HaplotypeScore=3.3007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.536;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:151:99:1603,0,1604 chrVII 414518 . C T 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.139;DP=159;Dels=0.00;FS=4.703;HaplotypeScore=6.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1663,0,1735 chrVII 414527 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.057;DP=149;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1462,0,1601 chrVII 414653 . G A 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3511,352,0 chrVII 414724 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.479;DP=131;Dels=0.00;FS=4.218;HaplotypeScore=8.2565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1335,0,1317 chrVII 414752 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.394;DP=145;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.331;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1231,0,1699 chrVII 414872 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.895;DP=143;Dels=0.00;FS=7.619;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.109;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1472,0,1516 chrVII 415124 . A G 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.817;DP=144;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1569,0,1491 chrVII 415307 . G A 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3883,388,0 chrVII 415371 . G T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.133;DP=141;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.329;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1383,0,1649 chrVII 415592 . A G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.438;DP=136;Dels=0.00;FS=2.158;HaplotypeScore=6.7978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.516;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1194,0,1642 chrVII 415922 . T C 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3229,336,0 chrVII 416624 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.019;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1341,0,1497 chrVII 416947 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.181;DP=125;Dels=0.00;FS=4.843;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=9.69;ReadPosRankSum=2.429;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:125:99:1241,0,1319 chrVII 416956 . G A 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3244,333,0 chrVII 417018 . C T 1908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.252;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,93:161:99:1938,0,1320 chrVII 417308 . A G 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=22.76;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3346,351,0 chrVII 417363 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.104;DP=149;Dels=0.00;FS=7.459;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.790;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,63:149:99:1115,0,1671 chrVII 417671 . A G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.423;DP=129;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1425,0,1285 chrVII 418253 . G A 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3098,318,0 chrVII 418271 . G A 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.495;DP=126;Dels=0.00;FS=11.614;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=8.53;ReadPosRankSum=2.446;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1105,0,1576 chrVII 418292 . A T 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.91;SB=-2.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3848,379,0 chrVII 418458 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.117;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.391;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1236,0,1304 chrVII 418502 . A G 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3671,372,0 chrVII 419249 . C G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.106;DP=128;Dels=0.00;FS=5.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.500;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1204,0,1273 chrVII 419557 . C T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.529;DP=109;Dels=0.00;FS=5.156;HaplotypeScore=8.8789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,69:109:99:1501,0,742 chrVII 420166 . G A 1900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.178;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:1930,0,1226 chrVII 420974 . T C 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3646,363,0 chrVII 421027 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.290;DP=126;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=2.1593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.675;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1383,0,1242 chrVII 421036 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.620;DP=125;Dels=0.00;FS=3.230;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.161;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1334,0,1241 chrVII 421235 . T C 926.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.305;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.033;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:956,0,795 chrVII 421238 . G T 712.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.112;DP=90;Dels=0.02;FS=0.796;HaplotypeScore=4.5252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQ0=0;MQRankSum=2.020;QD=7.91;ReadPosRankSum=-1.152;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:742,0,837 chrVII 421243 . A G 773.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.116;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.44;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.476;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:803,0,948 chrVII 421256 . C T 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.327;DP=89;Dels=0.00;FS=2.777;HaplotypeScore=2.6015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.829;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:949,0,794 chrVII 421272 . A G 1940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.51;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1973,210,0 chrVII 421291 . G A 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.612;DP=94;Dels=0.00;FS=6.660;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.351;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:988,0,790 chrVII 421299 . G A 2334 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.89;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2367,249,0 chrVII 421310 . A G 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.844;DP=94;Dels=0.00;FS=6.697;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:779,0,993 chrVII 421321 . C T 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.52;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2559,261,0 chrVII 421465 . C T 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.433;DP=141;Dels=0.00;FS=5.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1735,0,1232 chrVII 421471 . A G 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.919;DP=137;Dels=0.00;FS=4.242;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1478,0,1293 chrVII 421478 . T G 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.925;DP=132;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=2.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.647;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1471,0,1303 chrVII 421678 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.655;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.581;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1309,0,1063 chrVII 421865 . A G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.017;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=2.348;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.112;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1086,0,1343 chrVII 421889 . T C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.635;DP=102;Dels=0.00;FS=6.355;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=2.212;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.110;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1099,0,1084 chrVII 421943 . A G 1796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.555;DP=122;Dels=0.00;FS=5.152;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.533;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,83:122:99:1826,0,749 chrVII 422059 . T G 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.968;DP=117;Dels=0.00;FS=2.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,74:117:99:1624,0,892 chrVII 422141 . A T 652.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;DP=142;Dels=0.00;FS=132.816;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQ0=0;MQRankSum=-5.745;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.466;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,39:142:99:682,0,1712 chrVII 422142 . T G 633.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;DP=145;Dels=0.00;FS=133.608;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.42;MQ0=0;MQRankSum=-6.147;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.417;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,39:145:99:663,0,1825 chrVII 422202 . G A 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.006;DP=118;Dels=0.00;FS=11.067;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=2.803;QD=14.04;ReadPosRankSum=-2.122;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,73:118:99:1687,0,747 chrVII 422236 . G T 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.604;DP=130;Dels=0.00;FS=13.244;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.090;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,77:130:99:1646,0,1053 chrVII 422243 . T C 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.867;DP=118;Dels=0.00;FS=18.114;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.728;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1054,0,1525 chrVII 422330 . T G 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.228;DP=120;Dels=0.00;FS=6.969;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1120,0,1293 chrVII 422386 . C T 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.22;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2874,282,0 chrVII 422434 . A G 1803 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5433;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.64;MQ0=0;QD=18.21;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:1836,204,0 chrVII 422440 . G C 487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.518;DP=108;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=2.5433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.804;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:517,0,1254 chrVII 422454 . C G 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.157;DP=111;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=3.9508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:738,0,1308 chrVII 422564 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.776;DP=115;Dels=0.00;FS=16.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.031;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1295,0,1107 chrVII 422588 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.331;DP=145;Dels=0.00;FS=8.794;HaplotypeScore=5.7521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=8.64;ReadPosRankSum=2.698;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1283,0,1775 chrVII 422613 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.879;DP=139;Dels=0.00;FS=7.956;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.679;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1250,0,1765 chrVII 422776 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.104;DP=124;Dels=0.00;FS=1.609;HaplotypeScore=1.7306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.540;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1287,0,1444 chrVII 422836 . T A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.551;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.455;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1309,0,1343 chrVII 422866 . T A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.622;DP=117;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1260,0,1322 chrVII 422918 . C G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.924;DP=112;Dels=0.00;FS=2.455;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.885;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1365,0,959 chrVII 422951 . G A 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.663;DP=118;Dels=0.00;FS=8.773;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.539;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,71:118:99:1567,0,876 chrVII 423035 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.412;DP=141;Dels=0.00;FS=2.208;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.344;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1462,0,1546 chrVII 423215 . T C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.274;DP=116;Dels=0.00;FS=8.628;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=1;MQRankSum=-0.434;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.387;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1119,0,1175 chrVII 423339 . C T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.449;DP=115;Dels=0.00;FS=5.821;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1082,0,1375 chrVII 423472 . A C 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.345;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.626;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1583,0,1428 chrVII 423778 . C A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.954;DP=129;Dels=0.00;FS=2.264;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1147,0,1448 chrVII 423906 . G A 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.496;DP=144;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.166;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1684,0,1364 chrVII 423934 . C A 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.044;DP=143;Dels=0.00;FS=5.077;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,80:143:99:1710,0,1335 chrVII 424042 . A G 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.040;DP=163;Dels=0.00;FS=6.879;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:163:99:1496,0,2032 chrVII 424327 . A T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;DP=141;Dels=0.00;FS=8.845;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.995;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1420,0,1619 chrVII 424338 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.751;DP=133;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1260,0,1581 chrVII 424620 . C T 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.850;DP=102;Dels=0.00;FS=6.225;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.991;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1215,0,940 chrVII 424652 . A C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;DP=105;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.119;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1144,0,1108 chrVII 424942 . A T 2118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=22.29;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2151,210,0 chrVII 425130 . A T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.582;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1274,0,1475 chrVII 425181 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.441;DP=136;Dels=0.00;FS=4.325;HaplotypeScore=8.0590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.306;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1260,0,1590 chrVII 425227 . G C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.159;DP=129;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1181,0,1374 chrVII 425325 . T A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.034;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.137;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1311,0,1533 chrVII 425340 . G A 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.376;DP=143;Dels=0.00;FS=2.188;HaplotypeScore=5.6330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=9.95;ReadPosRankSum=2.110;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1453,0,1579 chrVII 425446 . A C 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3238,351,0 chrVII 425497 . A G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.724;DP=138;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1416,0,1551 chrVII 426119 . C T 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.522;DP=165;Dels=0.00;FS=2.725;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.128;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,87:165:99:1761,0,1621 chrVII 426136 . C T 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.261;DP=151;Dels=0.00;FS=2.032;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.200;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1588,0,1411 chrVII 426211 . T C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.135;DP=131;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.3779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.159;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1335,0,1385 chrVII 426538 . G T 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.980;DP=130;Dels=0.00;FS=4.753;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.389;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1667,0,1114 chrVII 426675 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.759;DP=106;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.152;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1283,0,985 chrVII 426969 . G T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;DP=118;Dels=0.00;FS=4.462;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.546;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1429,0,1045 chrVII 427248 . A G 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.596;DP=142;Dels=0.00;FS=8.985;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1500,0,1407 chrVII 427447 . A G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.665;DP=123;Dels=0.00;FS=1.431;HaplotypeScore=2.2267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.880;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1262,0,1261 chrVII 427600 . A G 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3487,354,0 chrVII 427741 . G A 2088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.375;DP=181;Dels=0.00;FS=0.589;HaplotypeScore=5.2838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=3.543;QD=11.54;ReadPosRankSum=2.089;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,97:181:99:2118,0,1669 chrVII 428022 . C T 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.721;DP=133;Dels=0.00;FS=2.649;HaplotypeScore=3.6063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.913;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1571,0,1240 chrVII 428076 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.660;DP=121;Dels=0.00;FS=7.256;HaplotypeScore=79.5734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1255,0,1212 chrVII 428152 . A G 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.375;DP=178;Dels=0.00;FS=8.140;HaplotypeScore=3.5558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.552;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,81:178:99:1517,0,2090 chrVII 428325 . C G 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:721,0,1247 chrVII 428363 . G A 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.955;DP=113;Dels=0.00;FS=16.663;HaplotypeScore=2.7384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.982;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.370;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1046,0,1333 chrVII 428397 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.499;DP=113;Dels=0.00;FS=8.767;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.549;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1113,0,1196 chrVII 428441 . T C 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.043;DP=95;Dels=0.00;FS=2.683;HaplotypeScore=3.7993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.220;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:919,0,1062 chrVII 428542 . C G 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4138;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.48;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3193,330,0 chrVII 428698 . A T 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.90;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3432,340,0 chrVII 428728 . T A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;DP=106;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.935;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1210,0,1061 chrVII 428729 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.445;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.879;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1152,0,1085 chrVII 428791 . G A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.564;DP=103;Dels=0.00;FS=1.589;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.499;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1219,0,1003 chrVII 428940 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.387;DP=136;Dels=0.00;FS=9.568;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=2.123;QD=11.43;ReadPosRankSum=3.368;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1585,0,1309 chrVII 429150 . G C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;DP=127;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=3.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.100;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1488,0,1093 chrVII 429467 . A T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.513;DP=93;Dels=0.01;FS=5.362;HaplotypeScore=6.6657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=1;MQRankSum=-1.663;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.259;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1164,0,810 chrVII 429706 . A C 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.746;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.470;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1535,0,1455 chrVII 429786 . A G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.624;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=42.4649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.518;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1216,0,1363 chrVII 429811 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.981;DP=135;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1148,0,1528 chrVII 429832 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.209;DP=123;Dels=0.00;FS=3.380;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1277,0,1277 chrVII 429941 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.060;DP=143;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.561;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1312,0,1690 chrVII 430401 . G A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.510;DP=102;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.134;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1114,0,1019 chrVII 430509 . T C 645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.080;DP=88;Dels=0.00;FS=4.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,37:88:99:675,0,1217 chrVII 430559 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.418;DP=123;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.978;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1091,0,1467 chrVII 430810 . T C 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.857;DP=158;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.521;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1793,0,1548 chrVII 430867 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.713;DP=152;Dels=0.00;FS=3.817;HaplotypeScore=57.3648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-3.198;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1477,0,1650 chrVII 430953 . A C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.783;DP=135;Dels=0.00;FS=6.693;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=9.44;ReadPosRankSum=2.309;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1305,0,1345 chrVII 431116 . T C 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5664;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3177,324,0 chrVII 431146 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.924;DP=120;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=2.5252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1015,0,1505 chrVII 431168 . G C 741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.173;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.082;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:771,0,1437 chrVII 431464 . T A 556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;DP=63;Dels=0.00;FS=2.145;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=3.868;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.586;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:586,0,603 chrVII 431474 . A G 544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.675;DP=68;Dels=0.00;FS=3.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=3.286;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:574,0,715 chrVII 431867 . A G 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.89;SB=-2.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3932,397,0 chrVII 432654 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.408;DP=130;Dels=0.00;FS=2.529;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.751;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:130:99:1358,0,1401 chrVII 432913 . C A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.896;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1538,0,1460 chrVII 432925 . A T 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.120;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1594,0,1446 chrVII 432934 . A G 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.949;DP=162;Dels=0.00;FS=1.236;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.935;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1669,0,1792 chrVII 433211 . G A 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=88.8528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.18;MQ0=0;QD=0.30;SB=-9.788e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:6:59,6,0 chrVII 433212 . G A 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=86.9922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.27;MQ0=0;QD=0.27;SB=-9.198e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:6:57,6,0 chrVII 433234 . A G 2074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.56;MQ0=0;QD=22.79;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2107,231,0 chrVII 433416 . T A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;DP=137;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1449,0,1272 chrVII 433556 . C T 624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.344;DP=103;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.823;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:654,0,887 chrVII 433865 . A T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.863;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1652,0,1334 chrVII 433976 . A T 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.017;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.609;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,86:189:99:1667,0,2216 chrVII 434030 . G A 1998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.757;DP=176;Dels=0.00;FS=1.860;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=3.674;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.611;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,96:176:99:2028,0,1488 chrVII 434259 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.014;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.099;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1181,0,1606 chrVII 434327 . T C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.187;DP=132;Dels=0.00;FS=5.276;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=10.59;ReadPosRankSum=-3.103;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1428,0,1394 chrVII 434361 . T C 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.124;DP=109;Dels=0.00;FS=3.536;HaplotypeScore=6.7524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=10.30;ReadPosRankSum=2.324;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1153,0,1133 chrVII 434380 . G T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.055;DP=107;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.221;QD=11.28;ReadPosRankSum=2.740;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:107:99:1237,0,1101 chrVII 434403 . A G 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.636;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1432,0,1344 chrVII 434442 . A G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.777;DP=118;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.707;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1101,0,1419 chrVII 434447 . A G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.895;DP=129;Dels=0.00;FS=7.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1142,0,1405 chrVII 434505 . A G 451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.309;DP=115;Dels=0.00;FS=6.944;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-7.564;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,43:115:99:481,0,1730 chrVII 434630 . A G 586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.437;DP=108;Dels=0.00;FS=9.626;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQ0=0;MQRankSum=-3.979;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.381;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,43:108:99:616,0,1561 chrVII 434654 . G A 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.830;DP=129;Dels=0.00;FS=4.569;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=-4.972;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.578;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,50:129:99:913,0,1739 chrVII 434679 . C A 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.252;DP=137;Dels=0.00;FS=6.444;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQ0=0;MQRankSum=-6.497;QD=6.48;ReadPosRankSum=2.637;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,46:137:99:918,0,2021 chrVII 434704 . T C 616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.874;DP=108;Dels=0.00;FS=1.690;HaplotypeScore=12.3284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.83;MQ0=0;MQRankSum=-7.311;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,38:108:99:646,0,1643 chrVII 434720 . A C 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.236;DP=110;Dels=0.00;FS=3.796;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-6.783;QD=5.26;ReadPosRankSum=-2.839;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,42:110:99:609,0,1615 chrVII 434752 . C G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=142;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.716;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.243;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,61:142:99:1062,0,1657 chrVII 434758 . C A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.346;DP=147;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=0;MQRankSum=-3.225;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.772;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1216,0,1740 chrVII 434905 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.677;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:133:99:1260,0,1496 chrVII 435041 . G C 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.955;DP=162;Dels=0.00;FS=6.605;HaplotypeScore=2.6145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.04;MQ0=1;MQRankSum=-4.518;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,66:162:99:1018,0,2167 chrVII 435053 . C A 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.159;DP=165;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=1;MQRankSum=-1.582;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.010;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,63:165:99:916,0,2296 chrVII 435054 . A G 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.260;DP=164;Dels=0.00;FS=2.155;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=1;MQRankSum=-1.402;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,64:164:99:885,0,2351 chrVII 435126 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.230;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1363,0,1799 chrVII 435215 . A C 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.666;DP=155;Dels=0.00;FS=2.142;HaplotypeScore=2.7502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1638,0,1670 chrVII 435314 . A G 1816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.570;DP=163;Dels=0.00;FS=3.934;HaplotypeScore=4.0063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.048;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:163:99:1846,0,1555 chrVII 435340 . T C 1898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.319;DP=171;Dels=0.00;FS=2.094;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.535;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,94:171:99:1928,0,1636 chrVII 435410 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.945;DP=109;Dels=0.00;FS=9.396;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.609;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1263,0,1008 chrVII 435457 . C T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.860;DP=119;Dels=0.00;FS=4.502;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1306,0,1263 chrVII 435514 . T C 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.080;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.382;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:867,0,1280 chrVII 435545 . A G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.380;DP=115;Dels=0.00;FS=2.499;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1179,0,1274 chrVII 435577 . T C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.961;DP=120;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.055;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1166,0,1347 chrVII 435609 . G A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.660;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.581;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1362,0,1321 chrVII 435682 . T C 1180.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.546;DP=109;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.217;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1210,0,1054 chrVII 435691 . T C 1039.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.537;DP=103;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=10.09;ReadPosRankSum=-2.658;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1069,0,938 chrVII 435692 . T C 1066.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.343;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1096,0,1076 chrVII 435931 . T C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.028;DP=108;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=6.1892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.714;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1238,0,956 chrVII 436038 . C T 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.896;DP=110;Dels=0.00;FS=3.701;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.562;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,43:110:99:862,0,1456 chrVII 436123 . G A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.854;DP=144;Dels=0.00;FS=10.276;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1186,0,1668 chrVII 436337 . G A 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.475;DP=98;Dels=0.00;FS=6.589;HaplotypeScore=3.8729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.278;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,58:98:99:1306,0,806 chrVII 436601 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.305;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.060;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1160,0,1278 chrVII 436605 . T C 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.564;DP=115;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=4.7619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1049,0,1346 chrVII 436628 . C T 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.935;DP=97;Dels=0.00;FS=1.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:964,0,1038 chrVII 436774 . T C 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.775;DP=128;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=4.9311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.509;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,74:128:99:1545,0,1158 chrVII 436994 . G A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.696;DP=132;Dels=0.00;FS=6.609;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.012;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:132:99:1459,0,1225 chrVII 437195 . A C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.917;DP=113;Dels=0.00;FS=3.549;HaplotypeScore=11.9188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=10.41;ReadPosRankSum=-2.003;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1206,0,1096 chrVII 437304 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.737;DP=138;Dels=0.00;FS=8.114;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.172;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.495;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1383,0,1464 chrVII 437336 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.092;DP=121;Dels=0.00;FS=9.928;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.175;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.703;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1114,0,1359 chrVII 437348 . A G 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.409;DP=110;Dels=0.00;FS=3.534;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQ0=0;MQRankSum=-4.181;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.286;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1001,0,1182 chrVII 437349 . G A 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.587;DP=115;Dels=0.00;FS=2.409;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQ0=0;MQRankSum=-3.030;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1081,0,1188 chrVII 438009 . G T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.800;DP=107;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.510;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1002,0,1238 chrVII 438031 . A G 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.524;DP=109;Dels=0.00;FS=5.983;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1150,0,1147 chrVII 438069 . A T 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;DP=100;Dels=0.00;FS=2.550;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.746;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:956,0,1183 chrVII 438333 . G T 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.466;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:977,0,1205 chrVII 438567 . T C 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.524;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.898;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,69:160:99:896,0,1793 chrVII 438674 . A G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.446;DP=147;Dels=0.03;FS=2.188;HaplotypeScore=14.0079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.922;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1195,0,1565 chrVII 438728 . A T 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.643;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=7.63;ReadPosRankSum=-1.725;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:976,0,1158 chrVII 438750 . C A 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.978;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.61;MQ0=0;MQRankSum=-3.479;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.583;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1034,0,1147 chrVII 438803 . T A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.243;DP=135;Dels=0.00;FS=3.314;HaplotypeScore=3.2103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.643;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.064;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1372,0,1388 chrVII 438997 . G A 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.134;DP=155;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=3.4280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.759;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1625,0,1617 chrVII 439216 . T C 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.553;DP=76;Dels=0.00;FS=0.888;HaplotypeScore=4.9008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,45:76:99:982,0,674 chrVII 439277 . C T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.990;DP=93;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=14.8777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=12.41;ReadPosRankSum=2.131;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:1184,0,833 chrVII 439789 . A G 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.571;DP=148;Dels=0.00;FS=2.078;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.716;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1583,0,1584 chrVII 439864 . A T 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.078;DP=108;Dels=0.00;FS=7.757;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=9.39;ReadPosRankSum=2.320;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1044,0,1314 chrVII 440586 . T C 487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.908;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=-5.791;QD=5.35;ReadPosRankSum=-2.801;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,31:91:99:517,0,1418 chrVII 440605 . G A 312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.484;DP=83;Dels=0.00;FS=4.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.172;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,24:83:99:342,0,1299 chrVII 440621 . C T 318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.208;DP=76;Dels=0.00;FS=11.951;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=-7.055;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:348,0,1135 chrVII 440626 . C T 291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.537;DP=70;Dels=0.00;FS=13.127;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-6.691;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:321,0,1014 chrVII 440636 . A T 341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.494;DP=77;Dels=0.00;FS=20.839;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.75;MQ0=0;MQRankSum=-7.275;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.695;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:371,0,1102 chrVII 440671 . A G 343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.815;DP=80;Dels=0.00;FS=9.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQ0=0;MQRankSum=-5.815;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.318;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,28:80:99:373,0,1249 chrVII 440674 . T A 366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;DP=79;Dels=0.00;FS=8.085;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQ0=0;MQRankSum=-6.042;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.450;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:396,0,1217 chrVII 440683 . C A 423.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.144;DP=80;Dels=0.00;FS=7.740;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.65;MQ0=0;MQRankSum=-5.364;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,29:80:99:453,0,1144 chrVII 440689 . A C 440.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.993;DP=84;Dels=0.01;FS=11.183;HaplotypeScore=6.6312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQ0=0;MQRankSum=-4.411;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.829;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:470,0,1194 chrVII 440693 . T A 2134 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6312;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.77;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2167,225,0 chrVII 440784 . C G 414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.274;DP=91;Dels=0.00;FS=25.936;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=-4.656;QD=4.55;ReadPosRankSum=-3.229;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:444,0,1366 chrVII 440984 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.574;DP=118;Dels=0.00;FS=7.538;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQ0=0;MQRankSum=-3.080;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1212,0,1192 chrVII 441041 . A G 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.942;DP=99;Dels=0.00;FS=1.677;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.497;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.026;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:979,0,1173 chrVII 441353 . G A 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2900,294,0 chrVII 441458 . A G 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.512;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,53:91:99:1121,0,764 chrVII 441493 . T G 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2854,297,0 chrVII 442082 . A G 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.509;DP=135;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=6.64;ReadPosRankSum=1.799;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,51:135:99:927,0,1897 chrVII 442175 . A C 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.057;DP=150;Dels=0.00;FS=3.077;HaplotypeScore=4.9617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.677;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,98:150:99:1899,0,839 chrVII 442184 . A G 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.238;DP=146;Dels=0.00;FS=7.702;HaplotypeScore=4.9104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.997;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,92:146:99:1834,0,929 chrVII 442299 . C G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;DP=126;Dels=0.00;FS=5.538;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.513;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1388,0,1241 chrVII 442339 . A G 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3291,330,0 chrVII 442464 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.108;DP=117;Dels=0.00;FS=3.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1260,0,1159 chrVII 442935 . C T 4039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4039,400,0 chrVII 442968 . A T 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.577;DP=159;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=3.3931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1623,0,1772 chrVII 442998 . T C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.575;DP=184;Dels=0.00;FS=4.205;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.652;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,84:184:99:1619,0,2197 chrVII 443007 . G A 5114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9290;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.50;SB=-2.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:5114,499,0 chrVII 443095 . G A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.373;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.508;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1502,0,1469 chrVII 443161 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.498;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.049;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1341,0,1526 chrVII 443525 . T A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.796;DP=128;Dels=0.00;FS=4.502;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.046;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:128:99:1212,0,1398 chrVII 443602 . T C 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.377;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.506;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1510,0,1658 chrVII 443639 . G T 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1632,0,1572 chrVII 443945 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.704;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.931;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1378,0,1336 chrVII 443969 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.753;DP=107;Dels=0.00;FS=14.328;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.288;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1242,0,991 chrVII 443972 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.664;DP=116;Dels=0.00;FS=14.635;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1303,0,1097 chrVII 444070 . C A 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.614;DP=149;Dels=0.00;FS=1.353;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=10.53;ReadPosRankSum=2.034;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1599,0,1451 chrVII 444107 . C A 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;DP=149;Dels=0.00;FS=3.831;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.306;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1722,0,1521 chrVII 444185 . G C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;DP=121;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.947;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1226,0,1264 chrVII 444190 . C T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.734;DP=128;Dels=0.00;FS=2.286;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.687;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1184,0,1484 chrVII 444466 . T C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3558,369,0 chrVII 445967 . C T 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.037;DP=116;Dels=0.00;FS=5.779;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.006;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1159,0,1115 chrVII 446000 . T C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.986;DP=131;Dels=0.00;FS=4.408;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.196;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1358,0,1351 chrVII 446059 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.495;DP=147;Dels=0.00;FS=3.951;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.631;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1306,0,1736 chrVII 446068 . C T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.538;DP=147;Dels=0.00;FS=8.595;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1503,0,1548 chrVII 446205 . G A 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3524,355,0 chrVII 446220 . A T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.001;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=10.50;ReadPosRankSum=-2.862;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1427,0,1420 chrVII 446231 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.105;DP=120;Dels=0.00;FS=4.715;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.247;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1304,0,1216 chrVII 446320 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.648;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.069;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1217,0,1226 chrVII 446369 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.294;DP=120;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.573;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1243,0,1355 chrVII 446399 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.727;DP=119;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=2.6493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1341,0,1246 chrVII 446904 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.005;DP=126;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1313,0,1209 chrVII 446910 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.230;DP=127;Dels=0.00;FS=1.420;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.015;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1419,0,1207 chrVII 447151 . G A 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.276;DP=119;Dels=0.00;FS=11.881;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1062,0,1384 chrVII 447761 . G C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3732,379,0 chrVII 447953 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.950;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1064,0,1238 chrVII 448106 . T C 2699 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=107;Dels=0.00;FS=3.218;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=25.22;ReadPosRankSum=1.117;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2732,291,0 chrVII 448446 . T C 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.256;DP=152;Dels=0.00;FS=2.138;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.010;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1629,0,1599 chrVII 448538 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.972;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1248,0,1587 chrVII 448899 . T C 157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.491;DP=151;Dels=0.00;FS=1.878;HaplotypeScore=109.6597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=1.04;ReadPosRankSum=-5.051;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,24:151:99:187,0,1959 chrVII 449504 . T C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.691;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=8.23;ReadPosRankSum=3.236;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1265,0,1847 chrVII 449525 . C T 3561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3561,375,0 chrVII 449549 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.835;DP=125;Dels=0.01;FS=3.420;HaplotypeScore=13.2623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.556;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1192,0,1474 chrVII 449637 . C T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.371;DP=139;Dels=0.00;FS=3.069;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.368;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1239,0,1745 chrVII 449763 . A G 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.711;DP=123;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=6.80;ReadPosRankSum=2.536;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:866,0,1545 chrVII 449772 . G T 1549.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.497;DP=122;Dels=0.00;FS=4.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=4.504;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.214;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1579,0,894 chrVII 449774 . A G 819.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.900;DP=134;Dels=0.00;FS=7.828;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.441;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:849,0,1666 chrVII 449776 . C T 931.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.806;DP=132;Dels=0.00;FS=6.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.688;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:961,0,1539 chrVII 449791 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.569;DP=137;Dels=0.00;FS=4.152;HaplotypeScore=3.4833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.237;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1189,0,1629 chrVII 449829 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.321;DP=138;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.540;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1237,0,1550 chrVII 449895 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.957;DP=139;Dels=0.00;FS=4.018;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=10.78;ReadPosRankSum=-2.149;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1529,0,1315 chrVII 449980 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.518;DP=121;Dels=0.00;FS=2.312;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.353;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1268,0,1112 chrVII 449999 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.640;DP=148;Dels=0.00;FS=2.123;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.992;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1248,0,1650 chrVII 450372 . C G 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3254,348,0 chrVII 450587 . G A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.499;DP=120;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.052;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1210,0,1214 chrVII 450623 . C G 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.689;DP=160;Dels=0.00;FS=5.762;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.474;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1591,0,1523 chrVII 450626 . G A 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.551;DP=165;Dels=0.00;FS=9.257;HaplotypeScore=2.5756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.172;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1800,0,1696 chrVII 450653 . G A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.079;DP=150;Dels=0.00;FS=18.855;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1623,0,1441 chrVII 450770 . A G 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4114,432,0 chrVII 450890 . C T 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.932;DP=160;Dels=0.00;FS=3.006;HaplotypeScore=3.5145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.474;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1699,0,1617 chrVII 450908 . G C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.431;DP=178;Dels=0.00;FS=4.508;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=8.32;ReadPosRankSum=2.459;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,79:178:99:1511,0,2053 chrVII 451307 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.267;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.192;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1482,0,1281 chrVII 451596 . T C 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.202;DP=170;Dels=0.00;FS=3.531;HaplotypeScore=4.6269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,86:170:99:1651,0,1842 chrVII 451682 . C T 1796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.630;DP=168;Dels=0.00;FS=4.531;HaplotypeScore=3.4783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:168:99:1826,0,1664 chrVII 451690 . C T 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.043;DP=167;Dels=0.00;FS=3.581;HaplotypeScore=5.8972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:1767,0,1732 chrVII 451829 . C T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.956;DP=150;Dels=0.00;FS=2.052;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1412,0,1616 chrVII 451921 . T C 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.99;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3673,375,0 chrVII 452058 . T C 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.884;DP=185;Dels=0.00;FS=5.683;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.979;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,87:185:99:1503,0,2147 chrVII 452296 . A C 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.704;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:127:99:3164,330,0 chrVII 452571 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.395;DP=143;Dels=0.00;FS=3.993;HaplotypeScore=6.7437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:143:99:1285,0,1747 chrVII 452691 . C T 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.181;DP=135;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.552;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1614,0,1303 chrVII 452776 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.484;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.282;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:136:99:1338,0,1468 chrVII 452796 . C T 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.679;DP=146;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1591,0,1447 chrVII 453255 . C T 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.956;DP=145;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.003;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,84:145:99:1792,0,1187 chrVII 454129 . C T 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.855;DP=135;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.225;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1227,0,1559 chrVII 454604 . A T 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.942;DP=130;Dels=0.00;FS=2.272;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1578,0,1282 chrVII 455013 . G A 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3399,340,0 chrVII 456180 . T C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3389,357,0 chrVII 456589 . A T 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.650;DP=103;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:884,0,1243 chrVII 456674 . C T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.061;DP=116;Dels=0.00;FS=3.629;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.665;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1326,0,1063 chrVII 456812 . G A 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=1;QD=27.61;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3153,316,0 chrVII 457022 . G A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.767;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.436;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:108:99:1130,0,1092 chrVII 457034 . G C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.312;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.304;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1324,0,1452 chrVII 457145 . G A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.968;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.085;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1525,0,1340 chrVII 457721 . G A 3901.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=1;QD=27.09;SB=-1.978e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3901,388,0 chrVII 458024 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.026;DP=149;Dels=0.00;FS=3.196;HaplotypeScore=3.7146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.133;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:149:99:1206,0,1992 chrVII 459620 . G A 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3557,364,0 chrVII 460330 . T C 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=1;QD=25.33;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3098,327,0 chrVII 461146 . A G 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3407,372,0 chrVII 461612 . T C 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.279;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.106;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:1679,0,1244 chrVII 461695 . T C 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.317;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.808;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1508,0,1931 chrVII 461804 . T C 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.511;DP=159;Dels=0.00;FS=4.651;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.053;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,82:159:99:1718,0,1704 chrVII 461875 . G A 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6416;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3711,379,0 chrVII 461876 . C T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.580;DP=134;Dels=0.00;FS=2.410;HaplotypeScore=2.6416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,54:134:99:1070,0,1742 chrVII 462144 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.118;DP=132;Dels=0.01;FS=2.251;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=9.79;ReadPosRankSum=-2.401;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1322,0,1450 chrVII 462190 . A G 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.118;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.652;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1175,0,1386 chrVII 462196 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.214;DP=121;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.848;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1297,0,1256 chrVII 462465 . G A 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.091;DP=147;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:147:99:1821,0,1286 chrVII 462703 . G A 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.978;DP=107;Dels=0.00;FS=6.088;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.626;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1131,0,1054 chrVII 462744 . C T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.663;DP=116;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.742;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1141,0,1299 chrVII 463027 . G A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.721;DP=120;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1189,0,1347 chrVII 463073 . A G 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;DP=129;Dels=0.00;FS=6.832;HaplotypeScore=2.8558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.176;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,74:129:99:1541,0,1130 chrVII 463348 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.433;DP=136;Dels=0.00;FS=1.678;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.596;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1273,0,1561 chrVII 463372 . C A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.538;DP=127;Dels=0.00;FS=3.631;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1460,0,1308 chrVII 463981 . A G 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.259;DP=126;Dels=0.00;FS=6.264;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1577,0,1146 chrVII 464215 . T C 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.464;DP=120;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1367,0,1140 chrVII 464366 . C T 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.046;DP=127;Dels=0.00;FS=12.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.723;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.524;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1600,0,1180 chrVII 464965 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.383;DP=156;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=3.2482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=8.46;ReadPosRankSum=-3.204;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1349,0,1629 chrVII 464972 . T C 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=22.87;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3339,357,0 chrVII 465091 . T C 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.693;DP=151;Dels=0.00;FS=5.694;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=1;MQRankSum=1.137;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.351;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1566,0,1563 chrVII 465118 . T C 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.314;DP=161;Dels=0.00;FS=7.612;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=1;MQRankSum=0.507;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1748,0,1619 chrVII 465428 . T C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.769;DP=123;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1326,0,1252 chrVII 465431 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.003;DP=133;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.853;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1235,0,1527 chrVII 465447 . T A 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;DP=137;Dels=0.00;FS=2.196;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.716;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1598,0,1338 chrVII 465488 . G A 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.420;DP=129;Dels=0.00;FS=2.266;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.633;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1540,0,1164 chrVII 465534 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.849;DP=111;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1246,0,1125 chrVII 465561 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.225;DP=101;Dels=0.00;FS=1.933;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1082,0,1086 chrVII 465626 . A G 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.861;DP=121;Dels=0.00;FS=2.519;HaplotypeScore=7.7390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=2.191;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:121:99:840,0,1137 chrVII 465790 . C T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.969;DP=118;Dels=0.00;FS=5.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.819;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1348,0,1102 chrVII 465905 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.661;DP=124;Dels=0.00;FS=5.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.720;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1269,0,1423 chrVII 466029 . A T 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3099,304,0 chrVII 466092 . T C 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.50;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2583,279,0 chrVII 466230 . G A 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.974;DP=135;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.625;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1643,0,1245 chrVII 466268 . A G 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.176;DP=138;Dels=0.00;FS=17.474;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:1664,0,1289 chrVII 466305 . C T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.919;DP=137;Dels=0.00;FS=24.378;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1310,0,1507 chrVII 466371 . C T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.617;DP=101;Dels=0.00;FS=5.203;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1299,0,897 chrVII 466404 . T C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.424;DP=104;Dels=0.00;FS=7.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.036;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1061,0,1056 chrVII 466418 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.177;DP=100;Dels=0.00;FS=13.154;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.175;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.153;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1155,0,956 chrVII 466974 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.544;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.495;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1430,0,1139 chrVII 467277 . A T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.022;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=11.46;ReadPosRankSum=2.125;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1233,0,1086 chrVII 467379 . G A 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=123;Dels=0.00;FS=3.331;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.488;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1544,0,1101 chrVII 467387 . T C 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3195,333,0 chrVII 467451 . C T 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.318;DP=116;Dels=0.00;FS=5.820;HaplotypeScore=4.1798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=8.77;ReadPosRankSum=-2.345;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1047,0,1228 chrVII 467473 . A G 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.156;DP=124;Dels=0.00;FS=5.682;HaplotypeScore=5.1020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.522;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:954,0,1479 chrVII 468372 . G A 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3880,379,0 chrVII 469269 . A G 290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.637;DP=116;Dels=0.00;FS=7.807;HaplotypeScore=16.3379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=2.50;ReadPosRankSum=1.066;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:116:99:320,0,1338 chrVII 470028 . A G 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.554;DP=99;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.920;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:985,0,1139 chrVII 470316 . A G 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2530,276,0 chrVII 470499 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.862;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.926;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1288,0,1229 chrVII 470529 . G A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.309;DP=106;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.107;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1145,0,1081 chrVII 471171 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.918;DP=131;Dels=0.00;FS=5.362;HaplotypeScore=2.4404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1228,0,1517 chrVII 471172 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.125;DP=130;Dels=0.00;FS=5.357;HaplotypeScore=2.4404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.329;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1388,0,1330 chrVII 472019 . T C 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.447;DP=161;Dels=0.00;FS=5.724;HaplotypeScore=7.4760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.435;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,86:161:99:1733,0,1593 chrVII 472038 . G A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.621;DP=144;Dels=0.00;FS=7.381;HaplotypeScore=2.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1644,0,1318 chrVII 472176 . T C 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3425,354,0 chrVII 472215 . A G 2554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=22.60;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2587,264,0 chrVII 472246 . G C 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.786;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,77:126:99:1496,0,830 chrVII 472372 . C A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.067;DP=145;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.755;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1404,0,1643 chrVII 472447 . A C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.055;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=1;MQRankSum=-1.291;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.759;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1119,0,1689 chrVII 472449 . G A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.883;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=1;MQRankSum=-0.678;QD=9.24;ReadPosRankSum=-2.448;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1287,0,1529 chrVII 472609 . A G 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9799;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3557,378,0 chrVII 472752 . C A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.890;DP=150;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=3.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=9.37;ReadPosRankSum=-2.270;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1435,0,1552 chrVII 472784 . T G 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;DP=161;Dels=0.00;FS=9.673;HaplotypeScore=4.6813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=9.76;ReadPosRankSum=2.961;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:161:99:1602,0,1660 chrVII 472807 . G T 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;DP=163;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.970;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,87:163:99:1719,0,1495 chrVII 472821 . G C 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3362,357,0 chrVII 472844 . T C 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.441;DP=142;Dels=0.00;FS=1.358;HaplotypeScore=7.5380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1636,0,1344 chrVII 473079 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.659;DP=147;Dels=0.00;FS=3.013;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.448;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1314,0,1798 chrVII 473495 . T C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.466;DP=127;Dels=0.00;FS=2.301;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.045;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.527;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1144,0,1502 chrVII 473502 . T C 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.742;DP=120;Dels=0.00;FS=4.502;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.831;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1102,0,1418 chrVII 473949 . A T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;DP=125;Dels=0.00;FS=5.455;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1380,0,1307 chrVII 473951 . G T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.933e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3267,310,0 chrVII 474296 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.775;DP=95;Dels=0.00;FS=3.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.584;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1102,0,858 chrVII 474400 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.202;DP=123;Dels=0.00;FS=12.807;HaplotypeScore=4.8502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.920;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1389,0,1192 chrVII 474600 . G A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.974;DP=99;Dels=0.00;FS=7.968;HaplotypeScore=3.9737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.273;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,58:99:99:1282,0,766 chrVII 474708 . T C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.713;DP=115;Dels=0.00;FS=2.427;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.797;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1348,0,1039 chrVII 474714 . G A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.542;DP=114;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.014;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1432,0,1025 chrVII 474798 . C T 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.778;DP=140;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=5.1361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.253;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.444;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1625,0,1202 chrVII 475074 . C T 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.379;DP=137;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=2.6320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.489;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,78:137:99:1708,0,1193 chrVII 475388 . T C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.743;DP=122;Dels=0.00;FS=7.054;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:122:99:1170,0,1239 chrVII 475390 . A T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;DP=121;Dels=0.00;FS=5.715;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1199,0,1297 chrVII 475766 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.023;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1128,0,1219 chrVII 475780 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.526;DP=119;Dels=0.00;FS=2.431;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.390;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1171,0,1249 chrVII 475858 . C T 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.713;DP=144;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=10.8068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.733;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1547,0,1490 chrVII 476186 . A G 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.706;DP=128;Dels=0.00;FS=2.271;HaplotypeScore=6.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.622;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1601,0,1182 chrVII 476814 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.043;DP=108;Dels=0.00;FS=4.847;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.558;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1093,0,1139 chrVII 476820 . A G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.144;DP=113;Dels=0.00;FS=2.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.520;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1044,0,1255 chrVII 477384 . T C 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3094,330,0 chrVII 478085 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.396;DP=148;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1615,0,1511 chrVII 478308 . A G 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.640;DP=147;Dels=0.01;FS=1.375;HaplotypeScore=6.8707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1439,0,1633 chrVII 478785 . C T 2510 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.364;DP=94;Dels=0.00;FS=3.933;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=26.70;ReadPosRankSum=1.474;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:2543,261,0 chrVII 478940 . A G 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3314,360,0 chrVII 479125 . C A 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.68;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3192,321,0 chrVII 479241 . A G 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3504,354,0 chrVII 479290 . C G 3616.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.43;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3616,366,0 chrVII 479323 . A C 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.49;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3053,324,0 chrVII 479326 . A T 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.44;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3018,309,0 chrVII 479349 . A G 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.42;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3105,327,0 chrVII 479356 . T C 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.49;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2939,306,0 chrVII 479387 . T A 2861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.66;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2894,291,0 chrVII 479658 . G A 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.285;DP=127;Dels=0.00;FS=5.496;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=1;MQRankSum=-3.748;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.584;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1051,0,1615 chrVII 479702 . A G 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.774;DP=126;Dels=0.00;FS=19.562;HaplotypeScore=5.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.53;MQ0=0;MQRankSum=5.046;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.872;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,78:126:99:1550,0,234 chrVII 479741 . C T 563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.229;DP=103;Dels=0.00;FS=11.323;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.157;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.358;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,43:103:99:593,0,1201 chrVII 480192 . C T 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.27;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3028,306,0 chrVII 480201 . G T 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.434;DP=123;Dels=0.00;FS=7.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:956,0,1595 chrVII 480357 . A T 2875 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.606;DP=110;Dels=0.00;FS=4.503;HaplotypeScore=6.3254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.67;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=26.14;ReadPosRankSum=1.354;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2908,306,0 chrVII 480363 . T G 2637 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;DP=111;Dels=0.00;FS=4.433;HaplotypeScore=3.8313;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.25;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=23.76;ReadPosRankSum=1.670;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2670,300,0 chrVII 480365 . T C 2623 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.91;MQ0=0;QD=24.06;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2656,294,0 chrVII 480366 . A G 2643 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.91;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2676,300,0 chrVII 480369 . T C 2755 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.91;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2788,306,0 chrVII 480374 . C T 2197 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;MQ0=0;QD=25.25;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2230,234,0 chrVII 480375 . T A 2236 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.42;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2269,237,0 chrVII 480378 . G A 2221 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.30;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2254,240,0 chrVII 480381 . C T 2382 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.68;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2415,258,0 chrVII 480384 . A G 2526 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.10;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2559,279,0 chrVII 480426 . G T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.314;DP=109;Dels=0.00;FS=8.840;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.84;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1244,0,866 chrVII 480515 . C T 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.613;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.398;SB=-2.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3786,364,0 chrVII 480612 . A G 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3152,327,0 chrVII 481104 . T C 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.997;DP=153;Dels=0.01;FS=5.025;HaplotypeScore=10.4268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.514;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1564,0,1600 chrVII 481287 . G C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;DP=134;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.311;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1292,0,1303 chrVII 481776 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.386;DP=131;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.218;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.099;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1171,0,1528 chrVII 482042 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.707;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.476;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1494,0,1417 chrVII 482213 . T G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.035;DP=129;Dels=0.00;FS=8.076;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.475;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1224,0,1486 chrVII 482318 . C G 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.751;DP=104;Dels=0.00;FS=8.146;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:938,0,1100 chrVII 482421 . A G 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3090,333,0 chrVII 482446 . G A 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.834;DP=134;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.827;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1195,0,1476 chrVII 482679 . T C 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.492;DP=132;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1391,0,1527 chrVII 482777 . G A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.980;DP=100;Dels=0.00;FS=2.898;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=10.89;ReadPosRankSum=2.065;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1119,0,1027 chrVII 482801 . A G 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.064;DP=93;Dels=0.00;FS=2.910;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.597;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,46:92:99:909,0,1065 chrVII 482923 . G A 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.551;DP=98;Dels=0.00;FS=1.815;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1057,0,1090 chrVII 482953 . C A,G 3005.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.65;MQ0=0;QD=22.77;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,64,68:132:99:3065,1544,1378,1521,0,1332 chrVII 482980 . T C 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3377,360,0 chrVII 483277 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.079;DP=129;Dels=0.00;FS=9.691;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1297,0,1322 chrVII 483370 . A G 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.621;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.298;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,80:153:99:1556,0,1591 chrVII 484544 . G A 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.756;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.487;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,40:82:99:733,0,887 chrVII 484830 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.553;DP=116;Dels=0.00;FS=5.830;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.407;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1319,0,1143 chrVII 484843 . C T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.528;DP=132;Dels=0.00;FS=13.158;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.387;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1198,0,1619 chrVII 485223 . G A 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.478;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=0.464;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.414;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1452,0,1762 chrVII 485256 . A G 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3376,351,0 chrVII 485299 . G A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.191;DP=126;Dels=0.00;FS=3.294;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.834;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.191;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1327,0,1143 chrVII 485424 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.242;DP=104;Dels=0.00;FS=2.566;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1172,0,986 chrVII 485631 . C T 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.112;DP=104;Dels=0.00;FS=2.826;HaplotypeScore=3.0776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:865,0,1196 chrVII 485694 . A T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;DP=115;Dels=0.00;FS=3.656;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=1;MQRankSum=1.357;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.640;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1080,0,1362 chrVII 485753 . G A 2007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.016;DP=170;Dels=0.00;FS=1.244;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,95:170:99:2037,0,1517 chrVII 485777 . A G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.263;DP=126;Dels=0.00;FS=3.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1348,0,1293 chrVII 486003 . T C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3620;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=1;QD=25.52;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3318,354,0 chrVII 486391 . G C 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.073;DP=168;Dels=0.00;FS=0.570;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.499;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,84:168:99:1664,0,1729 chrVII 486595 . C T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.438;DP=147;Dels=0.00;FS=5.460;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1737,0,1339 chrVII 486820 . C T 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.296;DP=146;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.971;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1627,0,1485 chrVII 487057 . C T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.346;DP=140;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.594;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1458,0,1404 chrVII 487114 . G A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.157;DP=130;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.531;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1307,0,1344 chrVII 487305 . C T 3588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3588,366,0 chrVII 487329 . G A 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3741,370,0 chrVII 487934 . A G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.436;DP=133;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.681;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1233,0,1574 chrVII 487937 . G A 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3516,349,0 chrVII 489481 . A G 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.878;DP=134;Dels=0.00;FS=12.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.364;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1538,0,1374 chrVII 489526 . T C 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.078;DP=160;Dels=0.00;FS=3.709;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1648,0,1767 chrVII 489593 . C T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.265;DP=125;Dels=0.00;FS=2.679;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=0.310;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.340;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1421,0,1244 chrVII 489693 . T A 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.359;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.014;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1544,0,1171 chrVII 489734 . T C 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8294;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3860,403,0 chrVII 489810 . T C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.631;DP=126;Dels=0.00;FS=8.328;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.134;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1324,0,1301 chrVII 489944 . A G 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3526,360,0 chrVII 490077 . C T 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3453,349,0 chrVII 490117 . C T 4034.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.970e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4034,412,0 chrVII 490209 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.559;DP=106;Dels=0.00;FS=3.592;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=2.515;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.897;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1170,0,1125 chrVII 490298 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.692;DP=103;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.532;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1257,0,951 chrVII 490467 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.991;DP=130;Dels=0.00;FS=7.797;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.808;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1434,0,1339 chrVII 490539 . C G 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3395,351,0 chrVII 490647 . G A 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.622;DP=156;Dels=0.00;FS=1.980;HaplotypeScore=4.2880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1840,0,1404 chrVII 490786 . C G 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.517;DP=135;Dels=0.00;FS=2.164;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.841;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1223,0,1414 chrVII 490925 . G T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.948;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.698;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.691;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1321,0,1305 chrVII 490943 . G T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.438;DP=130;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1399,0,1330 chrVII 490997 . C T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.918;DP=111;Dels=0.00;FS=2.429;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.105;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:111:99:1184,0,1106 chrVII 491066 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.554;DP=131;Dels=0.00;FS=4.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1342,0,1335 chrVII 491171 . A G 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.914;DP=132;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=2.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1556,0,1289 chrVII 491249 . G C 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.237;DP=146;Dels=0.00;FS=3.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:146:99:1655,0,1221 chrVII 491259 . A T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.950;DP=134;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1498,0,1313 chrVII 491350 . G A 4836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.72;SB=-2.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4836,472,0 chrVII 491698 . C A 3806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3806,367,0 chrVII 492276 . G A 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3585,370,0 chrVII 492296 . T C 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3254,339,0 chrVII 493773 . T C 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=22.34;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3183,342,0 chrVII 493848 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.222;DP=133;Dels=0.00;FS=1.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.170;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1626,0,1135 chrVII 493944 . G A 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.521;DP=138;Dels=0.00;FS=1.451;HaplotypeScore=3.2176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.192;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:138:99:1664,0,1172 chrVII 493949 . C T 1839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.906;DP=146;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=3.2176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1869,0,1180 chrVII 494197 . C T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.890;DP=147;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1382,0,1791 chrVII 494319 . A G 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.875;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.525;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1738,0,1509 chrVII 494624 . A G 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5509;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3228,354,0 chrVII 494636 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.855;DP=126;Dels=0.00;FS=11.575;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.083;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1286,0,1280 chrVII 495657 . A C 4227.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7702;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4227,423,0 chrVII 495671 . A G 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.356;DP=148;Dels=0.00;FS=3.013;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.848;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1479,0,1723 chrVII 495756 . A G 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5460;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.37;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3450,363,0 chrVII 495828 . C T 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.727;DP=133;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:133:99:1525,0,1194 chrVII 496008 . C T 4110.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.69;SB=-2.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4110,397,0 chrVII 496647 . C T 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2658,256,0 chrVII 496768 . C G 633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=6.21;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:663,0,787 chrVII 496875 . A G 580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.049;DP=81;Dels=0.00;FS=2.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.423;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,31:81:99:610,0,1150 chrVII 496881 . A G 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.581;DP=89;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.503;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,37:89:99:749,0,1172 chrVII 496909 . T C 2074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.929;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=25.29;ReadPosRankSum=1.690;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:2107,213,0 chrVII 496948 . A G,T 1315.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.8263;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=53.73;MQ0=0;QD=22.67;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,36,22:58:99:1375,502,394,873,0,810 chrVII 496982 . T C 547.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.704;DP=85;Dels=0.00;FS=1.116;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQ0=0;MQRankSum=-6.569;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,33:85:99:577,0,1246 chrVII 496988 . C T 501.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.794;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=47.6794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQ0=0;MQRankSum=-7.338;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,31:83:99:531,0,1203 chrVII 496991 . C A 490.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;DP=82;Dels=0.00;FS=1.096;HaplotypeScore=49.4597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.22;MQ0=0;MQRankSum=-6.916;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,32:82:99:520,0,1152 chrVII 497005 . A G 437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.964;DP=84;Dels=0.00;FS=3.823;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.66;MQ0=0;MQRankSum=-7.023;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.732;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:467,0,1180 chrVII 497008 . G A,T 1880.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=49.85;MQ0=0;QD=22.65;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,51,32:83:99:1940,667,525,1273,0,1195 chrVII 497019 . T G 1192.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.974;DP=86;Dels=0.00;FS=1.033;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=7.294;QD=13.86;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,55:86:99:1222,0,501 chrVII 497020 . A T 434.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;DP=85;Dels=0.00;FS=1.056;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-7.214;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.669;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:85:99:464,0,1269 chrVII 497029 . A G 412.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.343;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.51;MQ0=0;MQRankSum=-7.746;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.890;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:442,0,1394 chrVII 497046 . A T 560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.496;DP=86;Dels=0.00;FS=3.039;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-7.812;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:590,0,1222 chrVII 497050 . G A 580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.993;DP=89;Dels=0.00;FS=4.216;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-7.832;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,35:89:99:610,0,1184 chrVII 497059 . T C 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.754;DP=111;Dels=0.00;FS=9.109;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.30;MQ0=0;MQRankSum=-5.793;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,45:111:99:774,0,1508 chrVII 497123 . C G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.816;DP=126;Dels=0.00;FS=3.789;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=2.635;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1275,0,1371 chrVII 497155 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.432;DP=110;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.258;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1106,0,1246 chrVII 497307 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.750;DP=126;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1330,0,1327 chrVII 497405 . G A 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.701;DP=121;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=10.51;ReadPosRankSum=-2.118;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1302,0,1312 chrVII 497413 . A T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.550;DP=117;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1246,0,1352 chrVII 497422 . T A 1585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=13.55;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:1618,159,0 chrVII 497763 . G A 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.642;DP=141;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.812;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1670,0,1324 chrVII 497775 . G A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.774;DP=122;Dels=0.00;FS=0.785;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.129;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1281,0,1362 chrVII 497968 . A G 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.49;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2827,303,0 chrVII 498201 . G C 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=23.51;ReadPosRankSum=0.465;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3184,348,0 chrVII 498425 . T G 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.12;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2959,309,0 chrVII 498521 . T C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.515;DP=120;Dels=0.00;FS=5.795;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1397,0,1151 chrVII 498665 . C T 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3696,370,0 chrVII 498951 . A G 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.384;DP=147;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1635,0,1408 chrVII 499429 . T C 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.751;DP=111;Dels=0.00;FS=3.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:905,0,1248 chrVII 499455 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.482;DP=105;Dels=0.00;FS=3.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:962,0,1208 chrVII 499647 . T C 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3416,366,0 chrVII 499727 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.767;DP=128;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1309,0,1452 chrVII 499817 . C T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.971;DP=163;Dels=0.01;FS=12.273;HaplotypeScore=6.7817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:1326,0,1853 chrVII 499980 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.475;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1113,0,1526 chrVII 500059 . T G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.574;DP=126;Dels=0.00;FS=5.838;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.804;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1062,0,1538 chrVII 500187 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.428;DP=154;Dels=0.00;FS=3.882;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1452,0,1883 chrVII 500228 . A G 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3248,333,0 chrVII 500260 . C A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.747;DP=129;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=1.9312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.285;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1311,0,1439 chrVII 500434 . A G 3905.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.26;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3905,417,0 chrVII 500440 . G T 1415.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.146;DP=127;Dels=0.00;FS=3.231;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.207;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.357;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1445,0,1160 chrVII 500444 . C G 1376.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.428;DP=126;Dels=0.00;FS=4.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQ0=0;MQRankSum=-3.201;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.196;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1406,0,1118 chrVII 500449 . C T 1458.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.054;DP=126;Dels=0.00;FS=5.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.892;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1488,0,1140 chrVII 500467 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.130;DP=123;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.58;MQ0=0;MQRankSum=-3.126;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1449,0,1148 chrVII 500745 . G C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;DP=122;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1183,0,1326 chrVII 500877 . A T 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.631;DP=109;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:1027,0,1400 chrVII 501547 . A T 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3654,370,0 chrVII 501606 . T C 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3527,366,0 chrVII 501886 . T C 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7502;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3451,360,0 chrVII 502135 . G A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3263,330,0 chrVII 502282 . G T 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2646,261,0 chrVII 502321 . C T 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3187,304,0 chrVII 502398 . T A 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2708,276,0 chrVII 502491 . G A 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.880e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3915,370,0 chrVII 502807 . C T 2282 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6139;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.05;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2315,234,0 chrVII 502961 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.164;DP=110;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-3.095;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.028;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1222,0,1032 chrVII 502964 . A G 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.26;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2831,303,0 chrVII 502974 . T C 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;QD=22.94;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2671,288,0 chrVII 503498 . T C 3764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3764,372,0 chrVII 503654 . A G 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3038,309,0 chrVII 503685 . T C 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2628,279,0 chrVII 503816 . A G 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3511,357,0 chrVII 504168 . G C 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3904,393,0 chrVII 504342 . T A 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3654,355,0 chrVII 504558 . C T 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.976;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:1012,0,1449 chrVII 504753 . T C 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2916,288,0 chrVII 504804 . C T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.904;DP=129;Dels=0.00;FS=2.358;HaplotypeScore=3.5098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.068;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1562,0,1197 chrVII 504945 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.799;DP=106;Dels=0.00;FS=2.785;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.217;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1081,0,1207 chrVII 505200 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.922;DP=118;Dels=0.00;FS=4.756;HaplotypeScore=2.5186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.530;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1277,0,1183 chrVII 505867 . A T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.228;DP=146;Dels=0.00;FS=15.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.685;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1393,0,1773 chrVII 506019 . C T 2026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2059,219,0 chrVII 506275 . C T 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3229,316,0 chrVII 506941 . G A 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3147,304,0 chrVII 507137 . A T 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3578,361,0 chrVII 507287 . A T 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3742,367,0 chrVII 507304 . A G 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.245;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=25.08;ReadPosRankSum=1.450;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3386,351,0 chrVII 508084 . A G 4398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5174;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.172;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:167:99:4398,427,0 chrVII 508460 . G A 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3607,364,0 chrVII 508665 . G C 604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;DP=122;Dels=0.00;FS=4.610;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,43:122:99:634,0,1604 chrVII 509036 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.519;DP=121;Dels=0.00;FS=7.200;HaplotypeScore=4.4241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.103;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:121:99:1374,0,1194 chrVII 509119 . G T 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.792;DP=147;Dels=0.00;FS=17.937;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1398,0,1755 chrVII 509188 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.292;DP=113;Dels=0.00;FS=2.444;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.038;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1418,0,958 chrVII 509560 . T C 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.801;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,87:159:99:1749,0,1550 chrVII 509862 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.303;DP=135;Dels=0.00;FS=8.045;HaplotypeScore=4.9693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.155;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1331,0,1373 chrVII 509895 . T G 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3592,366,0 chrVII 509926 . T A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.561;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1214,0,1575 chrVII 510078 . C G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.466;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.521;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1129,0,1455 chrVII 510416 . A G 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2991,318,0 chrVII 510525 . G A 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.279;DP=143;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=2.8913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.286;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1699,0,1323 chrVII 510553 . A G 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3520,375,0 chrVII 510702 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.670;DP=117;Dels=0.00;FS=7.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1293,0,1214 chrVII 510742 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.083;DP=143;Dels=0.00;FS=3.094;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.999;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1471,0,1590 chrVII 510755 . G A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.540;DP=147;Dels=0.00;FS=4.035;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.763;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:147:99:1545,0,1546 chrVII 510898 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.046;DP=132;Dels=0.00;FS=5.324;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.078;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.773;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1370,0,1409 chrVII 511330 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.117;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1075,0,1281 chrVII 511398 . C T 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.419;DP=140;Dels=0.00;FS=2.375;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.046;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1508,0,1401 chrVII 511436 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.069;DP=138;Dels=0.00;FS=2.230;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1365,0,1459 chrVII 511938 . G A 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.807;DP=141;Dels=0.00;FS=4.027;HaplotypeScore=2.6392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1669,0,1172 chrVII 511961 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.941;DP=120;Dels=0.00;FS=5.870;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.013;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1259,0,1198 chrVII 512024 . G A 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.891;DP=145;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.945;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1627,0,1310 chrVII 512135 . T C 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3506,372,0 chrVII 512279 . A G 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.520;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1544,0,1306 chrVII 512350 . A T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;DP=122;Dels=0.00;FS=2.318;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.960;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1390,0,1196 chrVII 512816 . C T 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3504,358,0 chrVII 512835 . C T 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.514;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3345,348,0 chrVII 512884 . T C 2494 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2527,267,0 chrVII 513842 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.659;DP=122;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.093;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1346,0,1266 chrVII 514079 . G A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.839;DP=148;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=4.8396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.040;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:148:99:1097,0,1662 chrVII 514414 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.549;DP=149;Dels=0.00;FS=6.893;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.243;QD=7.53;ReadPosRankSum=-1.870;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:1152,0,1989 chrVII 514497 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.213;DP=133;Dels=0.00;FS=2.395;HaplotypeScore=3.7107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1167,0,1672 chrVII 514511 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.612;DP=135;Dels=0.00;FS=5.485;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.966;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1338,0,1604 chrVII 514736 . C G 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.381;DP=163;Dels=0.00;FS=3.721;HaplotypeScore=2.8334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=1;MQRankSum=-1.488;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.277;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,89:163:99:1845,0,1507 chrVII 514749 . A G 1947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.589;DP=187;Dels=0.00;FS=3.350;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=1;MQRankSum=0.873;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.742;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,100:187:99:1977,0,1925 chrVII 514934 . T C 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.261;DP=145;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.809;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1596,0,1573 chrVII 515177 . C T 2129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.851;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.884;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,97:185:99:2159,0,1748 chrVII 515594 . G A 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.681;DP=170;Dels=0.00;FS=3.520;HaplotypeScore=2.8809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.705;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,87:170:99:1835,0,1724 chrVII 515741 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.614;DP=159;Dels=0.00;FS=8.254;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1439,0,1845 chrVII 516026 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.767;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1445,0,1706 chrVII 516638 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.174;DP=152;Dels=0.00;FS=4.831;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.600;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:1471,0,1823 chrVII 516678 . G T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.501;DP=152;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=2.6559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1626,0,1511 chrVII 516867 . G A 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.137;DP=167;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.293;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:1665,0,1835 chrVII 517302 . T C 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.716;DP=152;Dels=0.00;FS=2.020;HaplotypeScore=3.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.096;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1486,0,1685 chrVII 517444 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.357;DP=138;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=2.159;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1250,0,1717 chrVII 517587 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.723;DP=139;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.865;QD=8.40;ReadPosRankSum=1.042;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1198,0,1753 chrVII 517605 . C G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;DP=120;Dels=0.00;FS=4.858;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1122,0,1381 chrVII 517615 . A G 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.053;DP=116;Dels=0.00;FS=3.564;HaplotypeScore=2.3924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:941,0,1581 chrVII 517640 . G C 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.007;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1662,0,1172 chrVII 517670 . T A 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;DP=130;Dels=0.00;FS=10.135;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.673;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:994,0,1744 chrVII 517674 . A G 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.942;DP=116;Dels=0.00;FS=2.630;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:953,0,1422 chrVII 517686 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.400;DP=131;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=3.8706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1243,0,1455 chrVII 517761 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.827;DP=149;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.834;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1404,0,1734 chrVII 517812 . C T 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.538;DP=155;Dels=0.00;FS=8.386;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.191;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:155:99:1547,0,1652 chrVII 517815 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.858;DP=156;Dels=0.00;FS=7.029;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.142;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,71:156:99:1484,0,1777 chrVII 517876 . A G 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.716;DP=180;Dels=0.00;FS=5.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,85:180:99:1666,0,2055 chrVII 517909 . T C 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.696;DP=164;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=2.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.220;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1644,0,1750 chrVII 518049 . G A 657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.820;DP=116;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=5.66;ReadPosRankSum=3.600;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,39:116:99:687,0,1695 chrVII 518061 . C T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.792;DP=102;Dels=0.00;FS=4.072;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.51;MQ0=0;MQRankSum=2.218;QD=15.04;ReadPosRankSum=-2.088;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,70:102:99:1564,0,554 chrVII 518071 . T A 1278.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.029;DP=83;Dels=0.00;FS=8.131;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.753;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,57:83:99:1308,0,510 chrVII 518077 . A G 1993 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.64;MQ0=0;QD=25.88;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2026,219,0 chrVII 518080 . G C 1866 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.15;MQ0=0;QD=25.56;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1899,201,0 chrVII 518084 . A G 1861 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.30;MQ0=0;QD=24.81;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1894,204,0 chrVII 518392 . G A 64.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.370;DP=97;Dels=0.00;FS=22.863;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=1.741;QD=0.66;ReadPosRankSum=-3.560;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,13:97:94:94,0,1727 chrVII 518403 . T A 343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.908;DP=107;Dels=0.00;FS=4.458;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=-0.658;QD=3.21;ReadPosRankSum=-3.224;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,25:107:99:373,0,1757 chrVII 518439 . T C 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.173;DP=132;Dels=0.00;FS=2.503;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.874;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,42:132:99:729,0,2030 chrVII 518449 . A T 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.560;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,58:166:99:1140,0,2466 chrVII 518487 . T C 1957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.792;DP=174;Dels=0.00;FS=0.571;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.834;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,93:174:99:1987,0,1694 chrVII 518845 . A G 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.404;DP=160;Dels=0.00;FS=2.250;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,80:160:99:1724,0,1719 chrVII 518896 . C G 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.473;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.347;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:972,0,1354 chrVII 519255 . A T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.046;DP=148;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=7.7972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.263;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.480;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1319,0,1759 chrVII 519278 . G A 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.214;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.360;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1770,0,1475 chrVII 519381 . G A 4097.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.973e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4097,412,0 chrVII 520131 . C A 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.355;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1767,0,1704 chrVII 520140 . A G 4272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.13;SB=-2.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4272,453,0 chrVII 520321 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.181;DP=125;Dels=0.00;FS=8.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.546;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1458,0,1199 chrVII 520558 . T A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.054;DP=126;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1391,0,1309 chrVII 520680 . A G 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3279,342,0 chrVII 520898 . A G 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=26.15;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2805,297,0 chrVII 521004 . T C 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3753,402,0 chrVII 521128 . G A 4027.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=1;QD=25.98;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4027,385,0 chrVII 521192 . G A 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=28.66;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3411,343,0 chrVII 521762 . C A 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.183;DP=172;Dels=0.00;FS=0.568;HaplotypeScore=3.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,83:172:99:1789,0,1471 chrVII 522036 . A C 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3025,315,0 chrVII 522131 . C T 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4051,403,0 chrVII 522136 . G A 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.248;DP=151;Dels=0.00;FS=2.081;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.102;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1590,0,1614 chrVII 522653 . A G 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3141,330,0 chrVII 522677 . T C 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3106,327,0 chrVII 522791 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.985;DP=143;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.410;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1592,0,1464 chrVII 522852 . T C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.674;DP=150;Dels=0.00;FS=2.059;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1513,0,1655 chrVII 523052 . G A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3723,361,0 chrVII 523190 . G T 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3000,301,0 chrVII 523348 . C T 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.72;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3033,315,0 chrVII 523385 . C T 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.919;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=27.41;ReadPosRankSum=1.653;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3618,364,0 chrVII 523392 . A G 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.14;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3190,345,0 chrVII 523412 . A G 3091 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.21;MQ0=0;QD=23.42;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3124,333,0 chrVII 523415 . G T 3271.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=126;Dels=0.00;FS=3.080;HaplotypeScore=4.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.622;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3271,314,0 chrVII 523417 . C T 3303.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.16;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3303,336,0 chrVII 524012 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.487;DP=121;Dels=0.00;FS=5.014;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.465;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1422,0,1225 chrVII 524176 . C T 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=1;QD=25.93;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3915,397,0 chrVII 524215 . C T 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3651,378,0 chrVII 524258 . G A 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.56;SB=-2.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3834,382,0 chrVII 524345 . G A 1777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.729;DP=161;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.740;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1807,0,1666 chrVII 524356 . C T 4101.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4101,415,0 chrVII 524372 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.501;DP=148;Dels=0.00;FS=3.083;HaplotypeScore=5.5473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1654,0,1491 chrVII 524588 . T C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.786;DP=145;Dels=0.00;FS=3.145;HaplotypeScore=2.9076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.734;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1511,0,1605 chrVII 524803 . T C 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.79;SB=-2.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4075,429,0 chrVII 525131 . G C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;DP=119;Dels=0.00;FS=11.645;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=0.886;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.805;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1243,0,1248 chrVII 525205 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.075;DP=140;Dels=0.00;FS=3.076;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1356,0,1563 chrVII 525390 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.302;DP=127;Dels=0.00;FS=1.628;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=1;MQRankSum=-0.822;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.734;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1328,0,1355 chrVII 525747 . C T 1839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.742;DP=146;Dels=0.00;FS=8.884;HaplotypeScore=4.8379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,85:146:99:1869,0,1096 chrVII 525947 . A G 4460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.78;SB=-2.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4460,474,0 chrVII 526684 . T C 3966.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.09;SB=-2.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3966,414,0 chrVII 526833 . T A 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;DP=150;Dels=0.00;FS=18.624;HaplotypeScore=16.3904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.02;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=17.49;ReadPosRankSum=3.353;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,145:150:99:2657,273,0 chrVII 526899 . G A 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.545;DP=161;Dels=0.00;FS=2.071;HaplotypeScore=3.5972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.541;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,87:161:99:1706,0,1478 chrVII 527159 . A G 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3668,387,0 chrVII 528447 . A C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.251;DP=125;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.465;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1043,0,1547 chrVII 528489 . C T 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.055;DP=153;Dels=0.00;FS=2.983;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:153:99:1455,0,1689 chrVII 528501 . T C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.267;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1424,0,1774 chrVII 528828 . C T 1840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.166;DP=165;Dels=0.00;FS=1.959;HaplotypeScore=7.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.201;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1870,0,1605 chrVII 528948 . T C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.978;DP=115;Dels=0.03;FS=1.651;HaplotypeScore=8.4565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.911;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1031,0,1088 chrVII 529080 . G A 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.346;DP=130;Dels=0.00;FS=2.264;HaplotypeScore=2.1146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.422;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1572,0,1202 chrVII 529158 . T C 1867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.280;DP=176;Dels=0.00;FS=8.465;HaplotypeScore=5.2131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=10.61;ReadPosRankSum=-2.229;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,93:176:99:1897,0,1821 chrVII 529248 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.169;DP=174;Dels=0.00;FS=3.607;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,75:174:99:1484,0,2088 chrVII 529347 . A T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;DP=170;Dels=0.00;FS=0.565;HaplotypeScore=5.8572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.972;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.478;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,77:170:99:1553,0,2044 chrVII 529383 . A G 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.535;DP=191;Dels=0.00;FS=8.300;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=8.25;ReadPosRankSum=2.443;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,86:191:99:1606,0,2309 chrVII 529504 . G A 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.647;DP=176;Dels=0.00;FS=4.411;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.021;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,79:176:99:1654,0,2063 chrVII 529563 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.992;DP=174;Dels=0.00;FS=0.582;HaplotypeScore=2.3460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.858;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,74:174:99:1364,0,2168 chrVII 529630 . A G 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.504;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.562;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,79:169:99:1530,0,1861 chrVII 529644 . A T 4334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=166;Dels=0.00;FS=2.392;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=2.715;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.964;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,163:166:99:4334,436,0 chrVII 529812 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.916;DP=141;Dels=0.00;FS=4.144;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1243,0,1641 chrVII 530016 . A C 86.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.768;DP=234;Dels=0.00;FS=35.708;HaplotypeScore=136.4673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.52;MQ0=1;MQRankSum=-4.846;QD=0.37;ReadPosRankSum=1.186;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,89:234:99:116,0,2683 chrVII 530034 . A C 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.006;DP=236;Dels=0.01;FS=10.746;HaplotypeScore=145.7023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.36;MQ0=1;MQRankSum=-2.440;QD=4.03;ReadPosRankSum=-2.379;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,98:234:99:981,0,1498 chrVII 530040 . A C 191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.988;DP=231;Dels=0.00;FS=18.763;HaplotypeScore=53.7577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.66;MQ0=1;MQRankSum=-3.873;QD=0.83;ReadPosRankSum=1.222;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,55:231:99:221,0,2357 chrVII 530067 . C A 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.386;DP=186;Dels=0.00;FS=3.289;HaplotypeScore=123.8582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.02;MQ0=1;MQRankSum=-2.720;QD=0.18;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,19:186:63:63,0,2595 chrVII 530071 . A T 263.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.005;DP=181;Dels=0.00;FS=34.503;HaplotypeScore=101.5277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.52;MQ0=1;MQRankSum=-5.391;QD=1.45;ReadPosRankSum=-1.569;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,37:181:99:293,0,2468 chrVII 530076 . T C 251.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.608;DP=166;Dels=0.00;FS=33.967;HaplotypeScore=47.4476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.60;MQ0=1;MQRankSum=-4.980;QD=1.51;ReadPosRankSum=-4.002;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,26:166:99:281,0,2405 chrVII 530079 . C A 256.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.981;DP=170;Dels=0.00;FS=33.869;HaplotypeScore=46.4097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.48;MQ0=1;MQRankSum=-5.335;QD=1.51;ReadPosRankSum=-5.002;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,29:170:99:286,0,2408 chrVII 530082 . T C 233.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.839;DP=169;Dels=0.00;FS=29.265;HaplotypeScore=48.7052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.92;MQ0=1;MQRankSum=-5.192;QD=1.38;ReadPosRankSum=-6.264;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,27:169:99:263,0,2524 chrVII 530308 . A G 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3198,324,0 chrVII 530472 . A T 2495 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2528,246,0 chrVII 530543 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.016;DP=114;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.017;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1341,0,1100 chrVII 530583 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.595;DP=104;Dels=0.00;FS=6.073;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.326;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1200,0,1128 chrVII 530647 . A G 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.943;DP=95;Dels=0.00;FS=11.885;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.31;MQ0=0;MQRankSum=-4.455;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:779,0,1078 chrVII 530805 . A T 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3829,373,0 chrVII 531034 . T C 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.834;DP=125;Dels=0.00;FS=5.699;HaplotypeScore=2.8953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.354;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1174,0,1446 chrVII 531080 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.352;DP=142;Dels=0.00;FS=1.737;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.340;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1290,0,1586 chrVII 531192 . T A 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;DP=149;Dels=0.00;FS=2.166;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.162;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1768,0,1508 chrVII 531261 . G T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.984;DP=128;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=9.77;ReadPosRankSum=2.027;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1281,0,1379 chrVII 531322 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.331;DP=107;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=2.5859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.691;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1072,0,1237 chrVII 531481 . T G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.576;DP=92;Dels=0.00;FS=4.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQ0=0;MQRankSum=4.476;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:963,0,1038 chrVII 531499 . C T 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.352;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=38.6603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.48;MQ0=0;MQRankSum=5.967;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.956;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:919,0,911 chrVII 531684 . A T 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.159;DP=69;Dels=0.00;FS=6.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.558;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:715,0,692 chrVII 531741 . A C 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.922;DP=80;Dels=0.00;FS=3.968;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.942;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.358;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,46:80:99:927,0,670 chrVII 531943 . T A 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.70;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2970,297,0 chrVII 531976 . T C 2195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.52;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2228,222,0 chrVII 532171 . C A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.931;DP=123;Dels=0.00;FS=3.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1402,0,1223 chrVII 532237 . C T 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.349;DP=127;Dels=0.00;FS=1.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1476,0,1136 chrVII 532420 . C T 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.036;DP=102;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.866;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:994,0,1137 chrVII 532429 . T C 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.800;DP=107;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.279;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:947,0,1205 chrVII 532483 . C T 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.653;DP=124;Dels=0.00;FS=8.916;HaplotypeScore=4.1921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.990;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1139,0,1386 chrVII 533140 . A C 697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.479;DP=84;Dels=0.00;FS=0.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:727,0,1072 chrVII 533956 . G A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.684;DP=102;Dels=0.00;FS=13.295;HaplotypeScore=7.2035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.119;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1075,0,867 chrVII 534011 . T C 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.561;DP=91;Dels=0.00;FS=1.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=7.43;ReadPosRankSum=-1.242;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:706,0,964 chrVII 534914 . A G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.759;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.422;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1245,0,1342 chrVII 535212 . G T 87.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.442;DP=76;Dels=0.00;FS=25.817;HaplotypeScore=3.0290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.647;QD=1.14;ReadPosRankSum=-5.962;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:117,0,1237 chrVII 536086 . A C 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 chrVII 536088 . A C 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 chrVII 536089 . T C 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 chrVII 541677 . T G 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=6.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:43,6,0 chrVII 541680 . T G 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=11.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 chrVII 541681 . T A 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=11.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 chrVII 541684 . C T 81.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.96;MQ0=0;QD=16.30;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:114,12,0 chrVII 541685 . A T 81.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.96;MQ0=0;QD=16.30;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:114,12,0 chrVII 541816 . G A 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.665;DP=113;Dels=0.00;FS=4.696;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.941;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:892,0,1415 chrVII 541817 . C T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.693;DP=114;Dels=0.00;FS=4.645;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.071;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:894,0,1392 chrVII 542317 . T G 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.695;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.772;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:907,0,1146 chrVII 543039 . C T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.406;DP=95;Dels=0.00;FS=5.272;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.127;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1239,0,773 chrVII 543481 . G A 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.25;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3308,319,0 chrVII 544944 . G C 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;DP=98;Dels=0.00;FS=0.806;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:830,0,1125 chrVII 545046 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.973;DP=91;Dels=0.00;FS=1.734;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,54:91:99:1139,0,758 chrVII 545135 . A G 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.196;DP=121;Dels=0.00;FS=7.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1292,0,1280 chrVII 545156 . A C 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.80;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2981,309,0 chrVII 545169 . T A 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3213,328,0 chrVII 545844 . T C 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3065,309,0 chrVII 546126 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.417;DP=116;Dels=0.00;FS=2.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.386;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1234,0,1218 chrVII 546385 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.697;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1167,0,1522 chrVII 546392 . G A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.012;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.273;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1336,0,1597 chrVII 546403 . A G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.027;DP=151;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.475;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1444,0,1641 chrVII 546446 . G T 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.444;DP=153;Dels=0.00;FS=5.995;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.808;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1682,0,1517 chrVII 546802 . T G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.501;DP=178;Dels=0.00;FS=1.874;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,79:178:99:1449,0,2239 chrVII 547845 . A G 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.479;DP=146;Dels=0.00;FS=2.107;HaplotypeScore=4.8873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=1;MQRankSum=0.951;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.477;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1451,0,1557 chrVII 547962 . T A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.509;DP=126;Dels=0.00;FS=8.155;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=10.25;ReadPosRankSum=-2.127;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1322,0,1455 chrVII 548025 . C T 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.609;DP=145;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.411;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1659,0,1296 chrVII 548106 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.422;DP=126;Dels=0.00;FS=5.398;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1189,0,1401 chrVII 548209 . A G 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.244;DP=158;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1639,0,1692 chrVII 548702 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.548;DP=134;Dels=0.00;FS=5.270;HaplotypeScore=5.5687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.775;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1184,0,1663 chrVII 549120 . A G 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.732;DP=112;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=9.3353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.414;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,44:112:99:863,0,1549 chrVII 549148 . T C 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.652;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.651;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:890,0,1069 chrVII 550003 . C T 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.700;DP=150;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=3.7069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.823;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1581,0,1581 chrVII 550438 . A C 498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.865;DP=76;Dels=0.00;FS=0.909;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.232;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,28:76:99:528,0,1115 chrVII 551356 . A G 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.670;DP=106;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.564;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1166,0,982 chrVII 551439 . A G 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.058;DP=145;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=3.9335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1521,0,1557 chrVII 551689 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.738;DP=134;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.681;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1353,0,1424 chrVII 552400 . C A 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;DP=147;Dels=0.01;FS=0.641;HaplotypeScore=17.4293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1650,0,1457 chrVII 553252 . G C 569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.615;DP=107;Dels=0.00;FS=1.624;HaplotypeScore=4.2294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=5.32;ReadPosRankSum=2.379;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,39:107:99:599,0,1476 chrVII 553492 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.044;DP=133;Dels=0.00;FS=1.652;HaplotypeScore=3.8148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1400,0,1336 chrVII 553711 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.441;DP=140;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:1200,0,1784 chrVII 553796 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.894;DP=156;Dels=0.00;FS=11.110;HaplotypeScore=3.3787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.568;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1461,0,1644 chrVII 553821 . C A 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.660;DP=177;Dels=0.00;FS=1.229;HaplotypeScore=5.9544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=9.51;ReadPosRankSum=2.430;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,85:177:99:1714,0,1792 chrVII 553824 . G A 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.918;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.892;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,86:177:99:1713,0,1873 chrVII 553878 . C T 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.018;DP=146;Dels=0.00;FS=2.132;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=10.80;ReadPosRankSum=-2.059;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1607,0,1526 chrVII 553967 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.595;DP=127;Dels=0.00;FS=4.924;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.313;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1155,0,1555 chrVII 554033 . C A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.259;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=10.19;ReadPosRankSum=2.479;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1243,0,1267 chrVII 554154 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.287;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.156;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,71:172:99:1374,0,2287 chrVII 554608 . T C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.198;DP=106;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:106:99:952,0,1300 chrVII 554830 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.099;DP=137;Dels=0.00;FS=10.428;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1417,0,1323 chrVII 554853 . T C 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.700;DP=149;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1390,0,1765 chrVII 554980 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.124;DP=110;Dels=0.00;FS=6.830;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1184,0,1173 chrVII 555047 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.451;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.967;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.938;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1217,0,1134 chrVII 555048 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.107;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.630;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1231,0,1161 chrVII 555111 . C T 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.569;DP=99;Dels=0.00;FS=3.852;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.430;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:815,0,1268 chrVII 555224 . G C 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.133;DP=124;Dels=0.00;FS=7.106;HaplotypeScore=6.9010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.643;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1017,0,1239 chrVII 555234 . A C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.387;DP=124;Dels=0.00;FS=2.413;HaplotypeScore=6.5767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.351;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1012,0,1440 chrVII 555526 . G A 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.306;DP=120;Dels=0.00;FS=4.481;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.617;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1152,0,1509 chrVII 555542 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.594;DP=136;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.635;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1228,0,1548 chrVII 556173 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.540;DP=118;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=8.64;ReadPosRankSum=2.014;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1049,0,1475 chrVII 556960 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.801;DP=113;Dels=0.00;FS=4.572;HaplotypeScore=3.5881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.164;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1142,0,1270 chrVII 557243 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.649;DP=141;Dels=0.00;FS=13.565;HaplotypeScore=4.9240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.178;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1236,0,1712 chrVII 557597 . C T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.992;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.067;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:905,0,1360 chrVII 558728 . A G 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.507;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=0.863;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:134:99:1025,0,1808 chrVII 558800 . G T 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=132;Dels=0.00;FS=4.196;HaplotypeScore=2.7213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.416;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:956,0,1715 chrVII 558809 . T C 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.637;DP=122;Dels=0.00;FS=7.196;HaplotypeScore=2.7213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,45:122:99:825,0,1748 chrVII 558946 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.205;DP=133;Dels=0.00;FS=2.195;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.530;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1200,0,1539 chrVII 558969 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.486;DP=133;Dels=0.00;FS=3.240;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.304;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1200,0,1663 chrVII 559340 . A G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.439;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1485,0,1126 chrVII 559498 . G A 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.453;DP=89;Dels=0.00;FS=0.923;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=0.656;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.355;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:989,0,848 chrVII 560083 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.725;DP=124;Dels=0.00;FS=2.354;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1496,0,1118 chrVII 560297 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.930;DP=118;Dels=0.00;FS=5.783;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.393;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1298,0,1137 chrVII 560314 . A C 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.786;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.532;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:949,0,1652 chrVII 560350 . C T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.897;DP=140;Dels=0.00;FS=7.920;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=2.221;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.927;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,51:140:99:1003,0,1909 chrVII 560364 . C T 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.291;DP=140;Dels=0.00;FS=9.243;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=2.311;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.279;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,53:140:99:945,0,1928 chrVII 560495 . C T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.848;DP=113;Dels=0.00;FS=2.771;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.906;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1504,0,959 chrVII 560557 . A G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.388;DP=121;Dels=0.00;FS=3.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.436;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1396,0,1022 chrVII 561434 . A C 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.200;DP=93;Dels=0.00;FS=2.750;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:93:99:872,0,1114 chrVII 561585 . A C 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3246,348,0 chrVII 561645 . G A 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.245;DP=122;Dels=0.00;FS=3.387;HaplotypeScore=51.0614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.116;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1051,0,1440 chrVII 561745 . A C 2427 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.57;MQ0=0;QD=24.27;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2460,267,0 chrVII 561747 . G T 519.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.817;DP=101;Dels=0.00;FS=64.135;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.77;MQ0=0;MQRankSum=-6.282;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:549,0,1497 chrVII 561756 . G A 435.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.539;DP=83;Dels=0.00;FS=81.330;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.99;MQ0=0;MQRankSum=-7.504;QD=5.24;ReadPosRankSum=-7.196;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:465,0,1132 chrVII 567760 . A T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;QD=7.93;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 chrVII 568130 . G C 586.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.386;DP=96;Dels=0.00;FS=2.003;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.161;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,38:96:99:616,0,1224 chrVII 568138 . G A 551.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.354;DP=85;Dels=0.00;FS=3.434;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,33:85:99:581,0,1089 chrVII 568139 . G A 532.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.221;DP=88;Dels=0.00;FS=6.316;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,35:88:99:562,0,1121 chrVII 568141 . G A 635.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.663;DP=93;Dels=0.00;FS=0.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,38:93:99:665,0,1127 chrVII 568150 . A G 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.243;DP=115;Dels=0.00;FS=2.488;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=7.14;ReadPosRankSum=-2.649;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:851,0,1280 chrVII 568237 . A G 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.774;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.657;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:1368,0,935 chrVII 568279 . G A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.636;DP=109;Dels=0.00;FS=9.787;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.157;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1386,0,887 chrVII 568306 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.682;DP=128;Dels=0.00;FS=1.454;HaplotypeScore=4.9557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1270,0,1441 chrVII 568323 . A G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.995;DP=123;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=9.72;ReadPosRankSum=-3.432;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1226,0,1390 chrVII 568421 . G T 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;DP=104;Dels=0.00;FS=1.747;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1262,0,972 chrVII 568463 . T A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.694;DP=105;Dels=0.00;FS=2.773;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.929;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:105:99:1187,0,1087 chrVII 568505 . G C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;DP=122;Dels=0.00;FS=10.296;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=2.121;QD=9.64;ReadPosRankSum=3.345;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1206,0,1343 chrVII 568510 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.432;DP=123;Dels=0.00;FS=8.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.18;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=9.28;ReadPosRankSum=2.963;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1171,0,1391 chrVII 568593 . T C 620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.208;DP=84;Dels=0.00;FS=9.131;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=7.38;ReadPosRankSum=2.020;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:650,0,1134 chrVII 568617 . G A 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.935;DP=94;Dels=0.00;FS=6.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:94:99:744,0,1205 chrVII 568646 . G C 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=100;Dels=0.00;FS=3.878;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.15;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=6.73;ReadPosRankSum=-2.033;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,38:100:99:703,0,1365 chrVII 568662 . G A 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.924;DP=80;Dels=0.00;FS=4.518;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.38;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:609,0,1149 chrVII 568669 . A T 470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.640;DP=71;Dels=0.00;FS=6.890;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.896;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:500,0,1087 chrVII 568674 . G C 426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;DP=72;Dels=0.00;FS=9.033;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=5.92;ReadPosRankSum=2.011;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:456,0,1059 chrVII 568732 . C T 289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.474;DP=32;Dels=0.00;FS=6.139;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.56;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=9.03;ReadPosRankSum=2.266;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:319,0,356 chrVII 568734 . T G 188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;DP=26;Dels=0.00;FS=4.075;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.877;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.077;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:218,0,327 chrVII 568743 . A G 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.30;MQ0=7;QD=1.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:11:6:52,6,0 chrVII 574724 . T C 65.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.055;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.98;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:95:95,0,197 chrVII 574745 . G A 329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.873;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.11;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:359,0,410 chrVII 574931 . G A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.294;DP=97;Dels=0.00;FS=3.928;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=1.815;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.158;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1119,0,988 chrVII 575122 . A G 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2942,306,0 chrVII 575328 . T A 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;DP=76;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=11.63;ReadPosRankSum=2.074;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,42:76:99:914,0,683 chrVII 575439 . A G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.631;DP=123;Dels=0.00;FS=5.675;HaplotypeScore=3.4648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:123:99:1445,0,1153 chrVII 575640 . A G 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.967;DP=109;Dels=0.00;FS=1.555;HaplotypeScore=7.6210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=11.60;ReadPosRankSum=2.782;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1294,0,970 chrVII 575955 . C T 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3990,409,0 chrVII 576078 . A G 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2789,291,0 chrVII 576318 . T C 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7030;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3242,342,0 chrVII 576519 . T C 4302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.92;SB=-2.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4302,438,0 chrVII 576592 . A G 4525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.834e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4525,486,0 chrVII 576820 . C G 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3844,414,0 chrVII 577029 . A T 2643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2676,273,0 chrVII 577533 . A C 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.95;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3226,342,0 chrVII 577565 . G A 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3438,358,0 chrVII 577801 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.778;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.472;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:143:99:1289,0,1610 chrVII 577881 . A G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.106;DP=124;Dels=0.00;FS=4.397;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.930;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1449,0,1187 chrVII 578083 . T A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.992;DP=97;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=3.5117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.725;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1086,0,1053 chrVII 578218 . T A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;DP=87;Dels=0.00;FS=0.939;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.151;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,52:87:99:1211,0,698 chrVII 578265 . G A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.777;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.515;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1161,0,1072 chrVII 578356 . G A 679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.192;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.167;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:99:709,0,1104 chrVII 578379 . G A 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.928;DP=81;Dels=0.00;FS=1.831;HaplotypeScore=4.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,34:81:99:703,0,979 chrVII 578422 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.866;DP=121;Dels=0.00;FS=3.348;HaplotypeScore=3.9317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=2.144;QD=10.77;ReadPosRankSum=2.123;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1333,0,1143 chrVII 578448 . G A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.178;DP=109;Dels=0.00;FS=10.845;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.462;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:109:99:1313,0,980 chrVII 578512 . C T 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.657;DP=121;Dels=0.00;FS=9.283;HaplotypeScore=2.5900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=9.10;ReadPosRankSum=2.086;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:121:99:1131,0,1349 chrVII 578520 . C A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.142;DP=127;Dels=0.00;FS=11.793;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.430;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1313,0,1349 chrVII 578702 . A G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.520;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:129:99:1355,0,1377 chrVII 578731 . T C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.953;DP=105;Dels=0.00;FS=2.529;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1161,0,1130 chrVII 578860 . T C 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.461;DP=113;Dels=0.00;FS=12.686;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.973;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1268,0,1008 chrVII 578924 . A G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.946;DP=114;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.082;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1225,0,1205 chrVII 579093 . T C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.447;DP=106;Dels=0.00;FS=6.186;HaplotypeScore=3.7533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.063;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1072,0,1146 chrVII 579120 . T C 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.704;DP=107;Dels=0.00;FS=10.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.222;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:967,0,1238 chrVII 579186 . A G 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.561;DP=106;Dels=0.00;FS=1.581;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=1;MQRankSum=0.738;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.479;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:910,0,1295 chrVII 579190 . A C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.813;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=1;MQRankSum=0.722;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.781;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:997,0,1282 chrVII 579227 . G C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.787;DP=128;Dels=0.00;FS=3.287;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=1;MQRankSum=2.361;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.095;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1163,0,1406 chrVII 579376 . G A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.469;DP=124;Dels=0.00;FS=6.994;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1345,0,1315 chrVII 579473 . A G 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.910;DP=142;Dels=0.00;FS=5.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1632,0,1269 chrVII 579474 . G C 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.173;DP=143;Dels=0.00;FS=8.178;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.165;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,80:143:99:1685,0,1266 chrVII 579508 . A G 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.267;DP=151;Dels=0.00;FS=3.811;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.906;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1697,0,1522 chrVII 579634 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.297;DP=77;Dels=0.00;FS=0.909;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,44:77:99:971,0,687 chrVII 579733 . T C 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.370;DP=136;Dels=0.00;FS=3.317;HaplotypeScore=3.3898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.235;QD=10.90;ReadPosRankSum=2.385;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:136:99:1512,0,1371 chrVII 579738 . A G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.981;DP=142;Dels=0.00;FS=3.179;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=3.274;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.399;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1253,0,1582 chrVII 579775 . T C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.163;DP=129;Dels=0.00;FS=7.998;HaplotypeScore=2.5606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.435;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.290;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1210,0,1342 chrVII 579785 . T A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.640;DP=129;Dels=0.00;FS=9.410;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.501;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1295,0,1295 chrVII 579795 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.986;DP=118;Dels=0.00;FS=8.505;HaplotypeScore=1.9120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.485;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.097;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1002,0,1287 chrVII 579802 . G T 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.544;DP=114;Dels=0.00;FS=8.651;HaplotypeScore=1.9120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=-3.379;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.428;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:961,0,1153 chrVII 579827 . T C 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.681;DP=136;Dels=0.00;FS=2.202;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.788;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1174,0,1449 chrVII 579860 . A T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.745;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1162,0,1437 chrVII 579915 . C T 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.812;DP=167;Dels=0.00;FS=3.618;HaplotypeScore=4.8525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.709;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,86:167:99:1741,0,1623 chrVII 580060 . G A 1808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.621;DP=140;Dels=0.00;FS=10.680;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,84:140:99:1838,0,1149 chrVII 580103 . G A 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.207;DP=151;Dels=0.00;FS=7.227;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.938;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1630,0,1426 chrVII 580178 . G T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.370;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=13.00;ReadPosRankSum=-1.796;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:1408,0,912 chrVII 580283 . G A 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.711;DP=150;Dels=0.00;FS=7.066;HaplotypeScore=4.7292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=1;MQRankSum=-0.459;QD=10.94;ReadPosRankSum=2.433;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1671,0,1322 chrVII 580425 . C G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.169;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1204,0,1457 chrVII 580852 . A G 4490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.66;SB=-2.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:175:99:4490,451,0 chrVII 581050 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.415;DP=134;Dels=0.00;FS=2.188;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.065;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1322,0,1487 chrVII 581134 . G C 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.350;DP=119;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:119:99:944,0,1542 chrVII 581206 . A G 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.995;DP=85;Dels=0.00;FS=2.957;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.343;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.577;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:868,0,876 chrVII 581386 . T G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.161;DP=127;Dels=0.00;FS=4.263;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.941;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1211,0,1403 chrVII 581392 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.358;DP=136;Dels=0.00;FS=3.078;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=3.394;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.599;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1347,0,1564 chrVII 581718 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.301;DP=119;Dels=0.00;FS=3.317;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.158;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1128,0,1384 chrVII 581814 . A G 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.046;DP=165;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=4.7541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.714;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1594,0,1780 chrVII 581949 . A G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.407;DP=117;Dels=0.00;FS=3.409;HaplotypeScore=4.1656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:117:99:1173,0,1289 chrVII 582077 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.086;DP=128;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.690;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1137,0,1502 chrVII 582233 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.617;DP=91;Dels=0.00;FS=8.467;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1081,0,905 chrVII 582267 . A C 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=93;Dels=0.00;FS=6.801;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:966,0,1000 chrVII 582559 . T A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;DP=111;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=13.5147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=11.57;ReadPosRankSum=2.362;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:111:99:1314,0,410 chrVII 582566 . T A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=11.23;ReadPosRankSum=2.123;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,71:117:99:1344,0,386 chrVII 582800 . C T 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=55.7254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3205,316,0 chrVII 583060 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.673;DP=130;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.107;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1411,0,1306 chrVII 583333 . A T 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.854;DP=132;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1114,0,1602 chrVII 583389 . A T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.993;DP=115;Dels=0.00;FS=0.830;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=10.36;ReadPosRankSum=-2.267;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1221,0,1127 chrVII 583936 . A G 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.816;DP=124;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:124:99:1539,0,1102 chrVII 583953 . G A 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.392;DP=129;Dels=0.00;FS=2.299;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=7.72;ReadPosRankSum=2.213;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,51:129:99:1026,0,1748 chrVII 583976 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.041;DP=107;Dels=0.00;FS=4.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.785;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1093,0,1143 chrVII 584011 . G A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.405;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1301,0,1314 chrVII 584220 . C T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.957;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1103,0,867 chrVII 584298 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.371;DP=117;Dels=0.00;FS=2.362;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.374;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1270,0,1107 chrVII 584310 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.515;DP=132;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.147;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1474,0,1237 chrVII 584383 . G A 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.950;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1577,0,1098 chrVII 584388 . G C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.661;DP=149;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=2.769;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.511;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,65:149:99:1360,0,1723 chrVII 584635 . A T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=21.55;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3491,375,0 chrVII 584636 . T A 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=21.83;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3514,378,0 chrVII 584683 . C G 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3428,357,0 chrVII 584898 . T A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;DP=139;Dels=0.00;FS=12.251;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,59:139:99:1184,0,1832 chrVII 584900 . A G 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.595;DP=138;Dels=0.00;FS=10.827;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.962;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.917;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1671,0,1167 chrVII 584916 . G A 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3749,361,0 chrVII 585062 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.883;DP=126;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=4.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.288;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1304,0,1256 chrVII 585274 . T C 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3334,345,0 chrVII 585438 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.676;DP=146;Dels=0.00;FS=8.850;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1296,0,1667 chrVII 585575 . C T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.003;DP=119;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.519;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1210,0,1378 chrVII 585680 . A G 4384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.650;SB=-2.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,168:169:99:4384,465,0 chrVII 585819 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.100;DP=117;Dels=0.00;FS=4.476;HaplotypeScore=6.3071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1217,0,1125 chrVII 586062 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.210;DP=140;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=5.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.534;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1368,0,1598 chrVII 586087 . A G 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7442;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3293,357,0 chrVII 586267 . G A 4485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.08;SB=-2.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4485,433,0 chrVII 586443 . G A 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3427,345,0 chrVII 586992 . A G 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;DP=128;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=24.64;ReadPosRankSum=-1.083;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3187,305,0 chrVII 587013 . G A 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.433;DP=118;Dels=0.00;FS=3.569;HaplotypeScore=6.5981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=25.69;ReadPosRankSum=0.508;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:118:99:3065,279,0 chrVII 587292 . T C 4173.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8186;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.84;SB=-2.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4173,435,0 chrVII 587364 . C T 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3575,364,0 chrVII 587508 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.394;DP=141;Dels=0.00;FS=7.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.669;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1379,0,1712 chrVII 587567 . T C 3833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3833,396,0 chrVII 587648 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.097;DP=115;Dels=0.00;FS=4.523;HaplotypeScore=2.7407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.316;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1264,0,1106 chrVII 588024 . C T 4277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4277,427,0 chrVII 588195 . T C 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3250,336,0 chrVII 588402 . G A 4127.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.63;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4127,417,0 chrVII 588484 . A T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1442,0,1554 chrVII 588489 . T C 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3198,333,0 chrVII 588807 . C T 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2891,289,0 chrVII 588888 . G T 4413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.58;SB=-2.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4413,433,0 chrVII 589047 . C T 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.634;DP=137;Dels=0.00;FS=6.453;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=1;MQRankSum=1.980;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.019;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,59:137:99:1259,0,1668 chrVII 589483 . G A 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.426;DP=154;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=4.5853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1744,0,1543 chrVII 589799 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.501;DP=110;Dels=0.00;FS=5.233;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1114,0,1221 chrVII 589840 . T C 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.794;DP=121;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.607;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1423,0,1111 chrVII 590065 . A G 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.471;DP=124;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.891;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1097,0,1397 chrVII 590527 . C G 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=22.69;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3119,336,0 chrVII 590615 . A T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.459;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1460,0,1464 chrVII 590933 . C A 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3744,364,0 chrVII 590990 . C T 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.919;DP=140;Dels=0.00;FS=2.103;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.645;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1685,0,1360 chrVII 591059 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.416;DP=106;Dels=0.00;FS=7.558;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=9.92;ReadPosRankSum=-3.111;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1081,0,1106 chrVII 591253 . C T 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.939;DP=155;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=11.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.758;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:155:99:1767,0,1467 chrVII 591385 . T A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;DP=134;Dels=0.00;FS=9.146;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.033;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1405,0,1492 chrVII 591793 . A C 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4007,414,0 chrVII 591823 . C T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.475;DP=132;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.165;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,52:132:99:1061,0,1650 chrVII 592123 . A T 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.072;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5564;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=24.26;ReadPosRankSum=1.430;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:127:99:3114,318,0 chrVII 592178 . G T 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=130;Dels=0.00;FS=5.119;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=26.58;ReadPosRankSum=1.572;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3455,346,0 chrVII 592271 . G A 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2846,285,0 chrVII 592278 . A G 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2801,294,0 chrVII 592414 . G C 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3000,321,0 chrVII 592474 . G C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;DP=138;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.189;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1511,0,1163 chrVII 592927 . C G 4334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4334,450,0 chrVII 592938 . G T 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.111;DP=168;Dels=0.00;FS=4.500;HaplotypeScore=2.5549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.027;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.450;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,83:168:99:1720,0,1666 chrVII 592944 . T A 4609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=25.61;SB=-2.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:180:99:4609,472,0 chrVII 593101 . A G 1836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.658;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,91:168:99:1866,0,1621 chrVII 593220 . G A 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.723;DP=149;Dels=0.00;FS=2.940;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.002;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1706,0,1376 chrVII 593465 . A C 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.837;DP=160;Dels=0.00;FS=6.869;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=3.259;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,82:160:99:1656,0,1642 chrVII 593486 . T A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.302;DP=151;Dels=0.00;FS=3.820;HaplotypeScore=6.6939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.846;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1517,0,1734 chrVII 593640 . A C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.884;DP=141;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1243,0,1782 chrVII 593663 . C A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.843;DP=165;Dels=0.00;FS=15.107;HaplotypeScore=3.2993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.892;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,65:165:99:1408,0,2208 chrVII 593817 . C T 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.790;DP=155;Dels=0.00;FS=2.052;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=1;MQRankSum=0.314;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.846;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,88:155:99:1929,0,1362 chrVII 594177 . G A 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.780;DP=147;Dels=0.00;FS=10.022;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1697,0,1314 chrVII 594770 . T A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.545;DP=102;Dels=0.00;FS=11.805;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1221,0,1006 chrVII 595403 . C T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.994;DP=134;Dels=0.00;FS=5.393;HaplotypeScore=2.4476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.376;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1174,0,1477 chrVII 595660 . C T 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.331;DP=153;Dels=0.00;FS=2.959;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.081;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1834,0,1426 chrVII 595824 . C A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.636;DP=134;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=10.07;ReadPosRankSum=3.278;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1380,0,1503 chrVII 595888 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.505;DP=152;Dels=0.00;FS=2.968;HaplotypeScore=2.9361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1401,0,1860 chrVII 595912 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.249;DP=148;Dels=0.00;FS=2.076;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.837;QD=8.87;ReadPosRankSum=2.556;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1343,0,1681 chrVII 595917 . G C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.514;DP=143;Dels=0.00;FS=5.119;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=8.89;ReadPosRankSum=3.036;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1301,0,1488 chrVII 595935 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.033;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.067;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.742;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1494,0,1521 chrVII 595950 . T C 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.646;DP=148;Dels=0.00;FS=3.858;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.961;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1552,0,1449 chrVII 596088 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.569;DP=122;Dels=0.00;FS=5.063;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=10.55;ReadPosRankSum=-2.022;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1317,0,1310 chrVII 596110 . T C 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3417,360,0 chrVII 596280 . A T 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.993;DP=146;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1834,0,1394 chrVII 596370 . T A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.982;DP=143;Dels=0.00;FS=10.142;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.067;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1397,0,1787 chrVII 596396 . A G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.493;DP=134;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=3.4097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.820;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1087,0,1656 chrVII 596464 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.187;DP=117;Dels=0.00;FS=12.520;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=10.55;ReadPosRankSum=2.157;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1264,0,1126 chrVII 596542 . A G 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.348;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=1;MQRankSum=-0.158;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.940;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1484,0,1494 chrVII 596544 . T C 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.462;DP=141;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=3.8117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=-1.245;QD=10.38;ReadPosRankSum=-2.118;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1493,0,1460 chrVII 596935 . A T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.426;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=11.25;ReadPosRankSum=-2.556;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1695,0,1536 chrVII 597126 . G C 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7239;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3646,387,0 chrVII 597202 . T G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.750;DP=110;Dels=0.00;FS=7.427;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1267,0,1051 chrVII 597250 . C T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3491,352,0 chrVII 598080 . C T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.737;DP=116;Dels=0.00;FS=1.655;HaplotypeScore=3.7114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.530;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1285,0,1228 chrVII 598538 . C T 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.575;DP=93;Dels=0.00;FS=5.592;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.796;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:809,0,1049 chrVII 598680 . C T 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.16;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3313,340,0 chrVII 598733 . C T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.030;DP=136;Dels=0.00;FS=8.338;HaplotypeScore=3.5298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1408,0,1327 chrVII 598851 . A T 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=9.85;ReadPosRankSum=-2.631;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1113,0,1258 chrVII 598883 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.032;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQ0=0;MQRankSum=4.876;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.453;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1272,0,1166 chrVII 599286 . C T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.853;DP=162;Dels=0.00;FS=1.242;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=3.252;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.597;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1506,0,1808 chrVII 599373 . T G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.943;DP=145;Dels=0.00;FS=6.113;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1263,0,1847 chrVII 599515 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.851;DP=104;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.685;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1288,0,929 chrVII 599725 . C T 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.352;DP=153;Dels=0.00;FS=2.231;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1601,0,1573 chrVII 599730 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.369;DP=139;Dels=0.00;FS=3.277;HaplotypeScore=4.9645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1357,0,1634 chrVII 599815 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.168;DP=121;Dels=0.00;FS=2.311;HaplotypeScore=2.8052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.231;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1289,0,1153 chrVII 600158 . A T 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.269;DP=168;Dels=0.00;FS=7.039;HaplotypeScore=5.7808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,82:168:99:1700,0,1693 chrVII 600628 . T C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.129;DP=136;Dels=0.00;FS=5.245;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=8.38;ReadPosRankSum=-2.413;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1170,0,1750 chrVII 600661 . A G 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.636;DP=146;Dels=0.01;FS=1.385;HaplotypeScore=6.5680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.998;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,87:145:99:1725,0,1200 chrVII 600706 . C T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.303;DP=133;Dels=0.00;FS=3.099;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1254,0,1571 chrVII 600718 . T G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.407;DP=128;Dels=0.00;FS=2.225;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.783;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.625;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1089,0,1559 chrVII 600721 . G A 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.353;DP=136;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.984;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1652,0,1207 chrVII 601612 . T A 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3551,358,0 chrVII 601696 . A G 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.747;DP=106;Dels=0.00;FS=5.098;HaplotypeScore=3.1960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:869,0,1276 chrVII 601780 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.545;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.195;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1212,0,1785 chrVII 601975 . T C 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.160;DP=142;Dels=0.00;FS=18.322;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.741;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1639,0,1361 chrVII 602057 . G A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.697;DP=136;Dels=0.00;FS=10.700;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1372,0,1440 chrVII 602135 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.912;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.164;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1422,0,1631 chrVII 602223 . A C 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.342;DP=137;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1617,0,1233 chrVII 602449 . T C 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.323;DP=159;Dels=0.00;FS=12.559;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.144;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,75:159:99:1523,0,1853 chrVII 602565 . C G 4504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4504,448,0 chrVII 602740 . A C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.095;DP=128;Dels=0.00;FS=4.162;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.771;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1395,0,1364 chrVII 602749 . A G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.431;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:1509,0,986 chrVII 602869 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.570;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1192,0,1154 chrVII 602908 . C A 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.403;DP=152;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1803,0,1303 chrVII 602932 . C T 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.938;DP=155;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=11.14;ReadPosRankSum=2.924;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1757,0,1571 chrVII 602980 . T A 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.870;DP=130;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=2.6484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=12.28;ReadPosRankSum=-3.289;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1627,0,1261 chrVII 603280 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.345;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.759;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1218,0,1320 chrVII 603795 . C G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;DP=139;Dels=0.00;FS=2.140;HaplotypeScore=3.5471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1434,0,1405 chrVII 604120 . C A 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2620,261,0 chrVII 605491 . G A 4354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4354,444,0 chrVII 605541 . A G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.770;DP=140;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1585,0,1349 chrVII 605648 . T C 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.049;DP=107;Dels=0.00;FS=3.218;HaplotypeScore=9.6476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.761;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2794,288,0 chrVII 605710 . C T 2512 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2545,258,0 chrVII 605893 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.350;DP=143;Dels=0.00;FS=1.358;HaplotypeScore=8.8135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.367;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:143:99:1312,0,1715 chrVII 606836 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.754;DP=119;Dels=0.00;FS=2.371;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1142,0,1270 chrVII 607146 . A G 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:3956,408,0 chrVII 607298 . A G 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=54.4422;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3110,327,0 chrVII 607624 . C A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.852;DP=102;Dels=0.00;FS=3.825;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1336,0,858 chrVII 608163 . G A 1883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.547;DP=147;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:147:99:1913,0,1286 chrVII 608565 . T C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.854;DP=119;Dels=0.00;FS=4.433;HaplotypeScore=5.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1296,0,1227 chrVII 609644 . T C 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3056,336,0 chrVII 610404 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.040;DP=150;Dels=0.00;FS=6.366;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.920;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1473,0,1641 chrVII 610519 . G A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.542;DP=121;Dels=0.00;FS=6.978;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1133,0,1461 chrVII 610674 . G A 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.491;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=1;MQRankSum=-0.682;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.731;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1521,0,1397 chrVII 610858 . C T 2085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.502;DP=168;Dels=0.00;FS=6.712;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.968;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,95:168:99:2115,0,1417 chrVII 610875 . C T 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.156;DP=145;Dels=0.00;FS=13.451;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.329;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1782,0,1205 chrVII 611358 . T C 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3041,309,0 chrVII 611628 . C T 612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.653;DP=71;Dels=0.00;FS=13.458;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-7.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,36:71:99:642,0,685 chrVII 611632 . C T 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.205;DP=75;Dels=0.00;FS=10.444;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.769;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:732,0,687 chrVII 611750 . T C 263.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.157;DP=111;Dels=0.00;FS=105.695;HaplotypeScore=140.2799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=2.37;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,25:111:99:293,0,1279 chrVII 611766 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.390;DP=129;Dels=0.02;FS=0.890;HaplotypeScore=25.3656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=8.20;ReadPosRankSum=-2.901;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1088,0,1154 chrVII 612759 . C T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.334;DP=131;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.520;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1297,0,1482 chrVII 612801 . T C 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.177;DP=132;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.177;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1133,0,1534 chrVII 613239 . A G 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.325;DP=139;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.399;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:139:99:1124,0,1762 chrVII 613257 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.135;DP=165;Dels=0.00;FS=1.994;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,70:165:99:1321,0,2075 chrVII 613680 . T C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.382;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:102:99:1157,0,1001 chrVII 613788 . G T 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3090,315,0 chrVII 613877 . C T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.354;DP=128;Dels=0.00;FS=4.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1361,0,1288 chrVII 614445 . A G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.221;DP=134;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.481;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1342,0,1465 chrVII 614457 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.083;DP=129;Dels=0.00;FS=2.251;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1323,0,1307 chrVII 614781 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.136;DP=145;Dels=0.00;FS=2.084;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.192;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1548,0,1426 chrVII 614889 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.884;DP=126;Dels=0.00;FS=11.880;HaplotypeScore=3.4836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=10.15;ReadPosRankSum=2.386;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1309,0,1201 chrVII 615063 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.523;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=4.7948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1152,0,1292 chrVII 615540 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.336;DP=178;Dels=0.00;FS=1.919;HaplotypeScore=4.6767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.176;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,69:178:99:1406,0,2293 chrVII 615761 . C G 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3688,381,0 chrVII 616021 . C A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.490;DP=142;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=2.7404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.331;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1426,0,1516 chrVII 616248 . G A 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.331;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.225;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:975,0,1094 chrVII 617190 . C T 1962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.808;DP=161;Dels=0.00;FS=1.990;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.088;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,88:161:99:1992,0,1466 chrVII 617944 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.986;DP=107;Dels=0.00;FS=3.660;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=-0.927;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.575;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1234,0,972 chrVII 619238 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.301;DP=122;Dels=0.00;FS=6.296;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=12.34;ReadPosRankSum=-2.838;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1536,0,1087 chrVII 619256 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;DP=116;Dels=0.00;FS=13.987;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1220,0,1216 chrVII 619274 . A G 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.203;DP=124;Dels=0.00;FS=19.359;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.608;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1359,0,1330 chrVII 619295 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.451;DP=129;Dels=0.00;FS=16.757;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.276;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1366,0,1324 chrVII 619415 . A G 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.040;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.105;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1306,0,1287 chrVII 619504 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.791;DP=137;Dels=0.00;FS=2.168;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.507;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1219,0,1675 chrVII 619523 . A C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.481;DP=140;Dels=0.00;FS=6.149;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1393,0,1553 chrVII 619702 . T C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.343;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=2.236;QD=9.37;ReadPosRankSum=-2.009;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1201,0,1388 chrVII 619787 . G A 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.207;DP=115;Dels=0.00;FS=14.498;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1062,0,1318 chrVII 619788 . T G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;DP=112;Dels=0.00;FS=9.217;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.329;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1057,0,1275 chrVII 619885 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.280;DP=88;Dels=0.00;FS=4.437;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.569;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1094,0,756 chrVII 620150 . A G 692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.217;DP=110;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,42:110:99:722,0,1574 chrVII 620222 . T A 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;DP=107;Dels=0.00;FS=2.490;HaplotypeScore=5.5720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1062,0,1225 chrVII 620225 . G T 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.891;DP=105;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=4.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:105:99:1037,0,1158 chrVII 620294 . A C 2375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2408,255,0 chrVII 620311 . G C 735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;DP=94;Dels=0.00;FS=5.670;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.175;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:765,0,1149 chrVII 620376 . A G 2574 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2607,267,0 chrVII 620379 . C T 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.111;DP=102;Dels=0.00;FS=9.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=2.010;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.152;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:877,0,1278 chrVII 620578 . T C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.994;DP=132;Dels=0.00;FS=4.340;HaplotypeScore=4.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.342;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1099,0,1783 chrVII 620637 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.221;DP=120;Dels=0.00;FS=1.433;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.643;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1263,0,1260 chrVII 620815 . A G 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3023,321,0 chrVII 620915 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.669;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1074,0,1493 chrVII 620954 . C T 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.844;DP=135;Dels=0.00;FS=7.679;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.188;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1522,0,1319 chrVII 621137 . A C 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.187;DP=123;Dels=0.00;FS=5.658;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=2.477;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.086;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1009,0,1693 chrVII 621311 . G A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.619;DP=127;Dels=0.00;FS=4.395;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=9.62;ReadPosRankSum=-2.338;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1252,0,1383 chrVII 621574 . A G 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.326;DP=113;Dels=0.00;FS=4.613;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=3.124;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1141,0,1291 chrVII 621754 . C T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.057;DP=140;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=4.5075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.878;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1503,0,1335 chrVII 621807 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.238;DP=116;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,67:116:99:1501,0,985 chrVII 621908 . T C 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.348;DP=82;Dels=0.00;FS=2.948;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.145;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.771;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:843,0,959 chrVII 622044 . A T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.247;DP=125;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.742;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1133,0,1527 chrVII 622096 . C G 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.103;DP=157;Dels=0.00;FS=3.040;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1660,0,1499 chrVII 622130 . A G 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.144;DP=150;Dels=0.00;FS=14.499;HaplotypeScore=3.4822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.340;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1466,0,1702 chrVII 622186 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.018;DP=117;Dels=0.00;FS=5.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.140;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1420,0,1107 chrVII 622236 . A T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.108;DP=147;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.423;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1642,0,1581 chrVII 622579 . G A 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3034,301,0 chrVII 622738 . C T 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3183,316,0 chrVII 623101 . T C 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3032,321,0 chrVII 623199 . G A 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2665,264,0 chrVII 623389 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.667;DP=118;Dels=0.00;FS=7.062;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.633;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1128,0,1328 chrVII 623404 . C A 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3203,324,0 chrVII 623585 . T C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.091;DP=143;Dels=0.00;FS=6.169;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.577;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1424,0,1484 chrVII 623606 . T A 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.452;DP=148;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=3.5314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.096;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1454,0,1596 chrVII 623608 . C A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.336;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1509,0,1593 chrVII 623695 . A G 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3366,357,0 chrVII 623700 . G A 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3370,337,0 chrVII 624410 . T G 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9430;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3415,372,0 chrVII 624442 . A G 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=23.03;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2682,294,0 chrVII 624487 . A G 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3103,324,0 chrVII 624490 . G A 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3128,315,0 chrVII 624507 . T C 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2771,297,0 chrVII 624532 . G A 4653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4653,466,0 chrVII 624564 . C T 4157.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4157,415,0 chrVII 625088 . G A 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3367,334,0 chrVII 625204 . A G 3966.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.8414;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3966,402,0 chrVII 625418 . A G 2803 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2836,303,0 chrVII 625784 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.226;DP=139;Dels=0.00;FS=7.860;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.052;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1197,0,1787 chrVII 625889 . G A 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.160;DP=120;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1179,0,1312 chrVII 625898 . A G 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2901,303,0 chrVII 625957 . G A 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3212,319,0 chrVII 626137 . C T 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3350,328,0 chrVII 626170 . C T 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3038,289,0 chrVII 626202 . T C 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3484,357,0 chrVII 626262 . G A 1808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.217;DP=145;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1838,0,1293 chrVII 626335 . C T 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3192,316,0 chrVII 626350 . C T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3163,315,0 chrVII 626453 . C T 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3645,373,0 chrVII 626470 . G A 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3459,363,0 chrVII 626794 . A T 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.95;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2548,261,0 chrVII 626899 . C T 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3041,292,0 chrVII 627218 . A T 63.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.632;DP=123;Dels=0.02;FS=155.471;HaplotypeScore=64.3014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=0.51;ReadPosRankSum=-6.591;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,20:121:93:93,0,1205 chrVII 627219 . G T 69.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.435;DP=121;Dels=0.03;FS=155.715;HaplotypeScore=64.3014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=0.57;ReadPosRankSum=-6.168;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,21:117:99:99,0,1118 chrVII 627362 . A T 4294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=26.18;SB=-2.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:164:99:4294,412,0 chrVII 627463 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.207;DP=140;Dels=0.00;FS=2.209;HaplotypeScore=4.9307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=2.320;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.920;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1427,0,1498 chrVII 627743 . A G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.546;DP=93;Dels=0.00;FS=3.817;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.719;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:929,0,1092 chrVII 627746 . T C 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.774;DP=94;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.052;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:925,0,1077 chrVII 627883 . A G 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.000;DP=104;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.808;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:909,0,1334 chrVII 627896 . T C 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.552;DP=97;Dels=0.00;FS=3.908;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.057;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:797,0,1235 chrVII 627924 . A C 2520 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.45;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2553,267,0 chrVII 628012 . G A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.773;DP=127;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=3.4991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.909;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1154,0,1402 chrVII 628050 . G T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.949;DP=125;Dels=0.00;FS=2.864;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.541;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1277,0,1378 chrVII 628090 . T A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.888;DP=131;Dels=0.00;FS=0.899;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1456,0,1376 chrVII 628345 . T C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.028;DP=144;Dels=0.00;FS=3.946;HaplotypeScore=3.2126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=8.89;ReadPosRankSum=2.104;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:144:99:1310,0,1765 chrVII 628417 . T C 1940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.202;DP=153;Dels=0.00;FS=10.322;HaplotypeScore=5.3382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.955;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,93:153:99:1970,0,1203 chrVII 628549 . C T 1973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.593;DP=146;Dels=0.00;FS=2.115;HaplotypeScore=4.6099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.575;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,86:146:99:2003,0,1191 chrVII 628576 . A G 1823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.550;DP=153;Dels=0.00;FS=2.052;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=11.92;ReadPosRankSum=2.084;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,88:153:99:1853,0,1347 chrVII 628627 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.090;DP=119;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1399,0,1190 chrVII 628640 . A C 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.597;DP=133;Dels=0.00;FS=4.102;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1540,0,1349 chrVII 628754 . T C 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.839;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1618,0,1745 chrVII 628917 . C T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.661;DP=149;Dels=0.00;FS=11.981;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1540,0,1621 chrVII 628958 . T A,G 3674.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;DP=154;Dels=0.00;FS=3.590;HaplotypeScore=4.8047;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.710;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,90,63:154:99:3674,1485,1279,2167,0,2021 chrVII 629110 . A T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.802;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.127;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1070,0,1013 chrVII 629203 . G A 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.699;DP=107;Dels=0.00;FS=3.610;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.739;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:955,0,1361 chrVII 629518 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.325;DP=135;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=-0.315;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1175,0,1636 chrVII 629731 . G A 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.856;DP=132;Dels=0.00;FS=3.234;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:132:99:921,0,1861 chrVII 629749 . T C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.423;DP=134;Dels=0.00;FS=4.276;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=6.67;ReadPosRankSum=-1.461;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,50:134:99:924,0,1955 chrVII 629819 . A G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.157;DP=115;Dels=0.00;FS=3.395;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1071,0,1430 chrVII 629962 . C T 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.458;DP=154;Dels=0.00;FS=2.913;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.895;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1683,0,1646 chrVII 629998 . C T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.676;DP=149;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=3.4897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.582;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1553,0,1529 chrVII 630340 . C G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;DP=121;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=2.2931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.424;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1028,0,1511 chrVII 630469 . A G 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.003;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:852,0,1489 chrVII 630496 . A C 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.751;DP=120;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=2.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:929,0,1613 chrVII 630532 . C T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.592;DP=110;Dels=0.00;FS=1.544;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.362;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1221,0,1107 chrVII 630535 . T C 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.029;DP=109;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1138,0,1098 chrVII 630604 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.315;DP=119;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1241,0,1205 chrVII 630680 . G A 2404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2437,249,0 chrVII 630686 . C A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.837;DP=111;Dels=0.00;FS=2.457;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.193;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1018,0,1317 chrVII 630709 . G A 587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.342;DP=99;Dels=0.00;FS=0.805;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.362;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,35:99:99:617,0,1426 chrVII 630817 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.961;DP=98;Dels=0.00;FS=4.947;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.657;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1030,0,986 chrVII 630914 . A G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.882;DP=101;Dels=0.00;FS=1.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.538;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:934,0,1247 chrVII 631257 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.213;DP=105;Dels=0.00;FS=4.890;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1040,0,1243 chrVII 631282 . C T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.943;DP=118;Dels=0.00;FS=6.917;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1187,0,1312 chrVII 631474 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.270;DP=116;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.718;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1381,0,1160 chrVII 631532 . A G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.163;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=10.48;ReadPosRankSum=-2.614;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:130:99:1392,0,1386 chrVII 631547 . A T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.299;DP=117;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=9.56;ReadPosRankSum=-2.567;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1148,0,1399 chrVII 631584 . C T 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.418;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=8.92;ReadPosRankSum=2.142;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:958,0,1322 chrVII 631970 . G C 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;DP=117;Dels=0.00;FS=1.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1383,0,990 chrVII 632209 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.970;DP=125;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.351;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1091,0,1586 chrVII 632357 . C A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.833;DP=115;Dels=0.00;FS=10.331;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.014;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1154,0,1261 chrVII 632457 . T C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.047;DP=119;Dels=0.00;FS=5.865;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1209,0,1298 chrVII 632984 . C T 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.667;DP=132;Dels=0.00;FS=3.126;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.025;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1627,0,1176 chrVII 633090 . C A 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.064;DP=122;Dels=0.00;FS=13.554;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=8.53;ReadPosRankSum=2.312;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1071,0,1457 chrVII 633133 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.074;DP=107;Dels=0.00;FS=12.992;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1033,0,1288 chrVII 633265 . A G 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.447;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=1;MQRankSum=-1.213;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1007,0,1688 chrVII 633390 . C T 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.518;DP=141;Dels=0.00;FS=10.013;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.597;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:141:99:1646,0,1329 chrVII 633626 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.482;DP=114;Dels=0.00;FS=4.594;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.591;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:114:99:1248,0,1129 chrVII 633803 . T C 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.051;DP=98;Dels=0.00;FS=6.520;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1089,0,1021 chrVII 633894 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.785;DP=136;Dels=0.00;FS=5.247;HaplotypeScore=2.6204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.217;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1268,0,1558 chrVII 633895 . T G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.309;DP=137;Dels=0.00;FS=3.083;HaplotypeScore=2.6204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.823;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:137:99:1316,0,1554 chrVII 634321 . G T 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.393;DP=104;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1032,0,1049 chrVII 634339 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.165;DP=106;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1139,0,1068 chrVII 634356 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.645;DP=123;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.053;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1231,0,1317 chrVII 634381 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.364;DP=123;Dels=0.00;FS=6.809;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.030;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1309,0,1200 chrVII 634480 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.870;DP=104;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.464;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:1068,0,1240 chrVII 634557 . G A 568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.061;DP=79;Dels=0.00;FS=3.043;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=1;MQRankSum=0.805;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.514;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:598,0,1014 chrVII 634592 . T G 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.783;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.304;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:660,0,954 chrVII 634626 . A G 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.170;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.706;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,44:79:99:916,0,732 chrVII 634640 . G A 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.273;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.666;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:923,0,712 chrVII 634798 . T C 521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.975;DP=66;Dels=0.00;FS=0.950;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:551,0,869 chrVII 634898 . G T 742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.816;DP=67;Dels=0.00;FS=10.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.420;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:772,0,681 chrVII 635290 . G A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.225;DP=94;Dels=0.00;FS=6.496;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.858;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:1075,0,918 chrVII 635353 . A G 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.660;DP=81;Dels=0.00;FS=5.835;HaplotypeScore=3.7918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,39:81:99:792,0,909 chrVII 635537 . T A 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.453;DP=82;Dels=0.00;FS=2.002;HaplotypeScore=34.8217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:863,0,878 chrVII 635585 . T G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.739;DP=112;Dels=0.00;FS=13.121;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.218;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1268,0,946 chrVII 635792 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.304;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,66:111:99:1385,0,884 chrVII 635804 . G A 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.397;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=14.20;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,72:114:99:1649,0,755 chrVII 635861 . C T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.828;DP=121;Dels=0.00;FS=4.415;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,72:121:99:1642,0,909 chrVII 636162 . G A 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.849;DP=108;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=3.6937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1041,0,1141 chrVII 636722 . T A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.829;DP=114;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1286,0,1200 chrVII 637449 . C T 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.250;DP=144;Dels=0.00;FS=2.138;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.842;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1589,0,1324 chrVII 637458 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.519;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1347,0,1269 chrVII 637614 . C T 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.376;DP=107;Dels=0.00;FS=11.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=7.57;ReadPosRankSum=3.473;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,43:107:99:840,0,1490 chrVII 637696 . G C 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.775;DP=156;Dels=0.00;FS=12.634;HaplotypeScore=30.5074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.753;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:156:99:992,0,780 chrVII 637963 . T C 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.921;DP=143;Dels=0.00;FS=6.247;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.387;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,81:143:99:1650,0,1352 chrVII 638188 . G A 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.227;DP=139;Dels=0.00;FS=5.528;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1572,0,1263 chrVII 638253 . T C 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.766;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.874;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1574,0,1515 chrVII 638787 . T C 3881.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3881,396,0 chrVII 638835 . C T 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3676,373,0 chrVII 638846 . A T 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3578,358,0 chrVII 638935 . A G 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3270,354,0 chrVII 639017 . C T 4543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.609;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6303;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=26.88;ReadPosRankSum=1.097;SB=-2.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,168:169:99:4543,430,0 chrVII 639055 . T G 4563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4563,469,0 chrVII 639145 . G C 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3682;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3352,360,0 chrVII 639262 . G T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.861;DP=109;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.163;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1291,0,957 chrVII 639300 . T C 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.343;DP=105;Dels=0.00;FS=2.690;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.827;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:913,0,1316 chrVII 639331 . T C 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3704,384,0 chrVII 639460 . C T 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.14;SB=-2.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3990,391,0 chrVII 639627 . G A 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.189;DP=135;Dels=0.00;FS=57.994;HaplotypeScore=2.3885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=12.16;ReadPosRankSum=-2.067;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:1672,0,1095 chrVII 639715 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.116;DP=162;Dels=0.00;FS=11.923;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQ0=0;MQRankSum=3.401;QD=8.25;ReadPosRankSum=-2.406;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,79:162:99:1366,0,851 chrVII 639931 . A G 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3109,318,0 chrVII 640009 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.126;DP=168;Dels=0.00;FS=3.542;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.003;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,81:168:99:1329,0,1403 chrVII 640411 . C T 1948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.242;DP=160;Dels=0.00;FS=3.736;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.478;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1978,0,1588 chrVII 640432 . A G 2058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.668;DP=183;Dels=0.00;FS=5.325;HaplotypeScore=3.3193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,98:183:99:2088,0,1834 chrVII 640786 . T C 4413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4413,451,0 chrVII 640811 . C T 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;DP=149;Dels=0.00;FS=14.104;HaplotypeScore=255.7796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=0.26;ReadPosRankSum=-3.177;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,4:149:68:68,0,266 chrVII 640813 . T C 18.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.259;DP=149;Dels=0.00;FS=14.104;HaplotypeScore=2.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=0.12;ReadPosRankSum=-3.412;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,4:149:48:48,0,266 chrVII 641220 . T C 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3521,369,0 chrVII 642042 . A G 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3243,336,0 chrVII 642145 . G A 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.96;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2833,291,0 chrVII 642162 . G A 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.85;MQ0=0;QD=26.38;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2908,297,0 chrVII 642168 . A G 2584 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=24.85;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2617,285,0 chrVII 642227 . A C 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3035,315,0 chrVII 642373 . T C 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3692,384,0 chrVII 642480 . A G 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3407,345,0 chrVII 642561 . A G 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3133,327,0 chrVII 642577 . C T 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3587,355,0 chrVII 642606 . A T 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3479,337,0 chrVII 642633 . C T 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.68;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3181,327,0 chrVII 642723 . T C 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3718,393,0 chrVII 642915 . T C 2441 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:101:99:2474,261,0 chrVII 643082 . G T 4132.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4132,409,0 chrVII 643091 . G T 4192.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4192,427,0 chrVII 643337 . C T 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3223,321,0 chrVII 643372 . C T 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3416,331,0 chrVII 643548 . G C 2420 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.74;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2453,258,0 chrVII 643560 . T C 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.62;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2493,264,0 chrVII 643620 . T G 2401 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2434,255,0 chrVII 643727 . A G 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3349,351,0 chrVII 643743 . A G 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3582,375,0 chrVII 643956 . C T 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.171;DP=109;Dels=0.00;FS=4.917;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=1;MQRankSum=0.835;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.325;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:831,0,1440 chrVII 644097 . A T 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:106:99:2821,294,0 chrVII 644400 . A G 670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.558;DP=84;Dels=0.00;FS=4.355;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=7.98;ReadPosRankSum=-2.251;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:700,0,1024 chrVII 644454 . C T 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.369;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=2.083;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.004;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:92:99:806,0,1080 chrVII 644803 . A T 306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.258;DP=50;Dels=0.00;FS=2.448;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.099;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:336,0,209 chrVII 644828 . C T 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.728;DP=75;Dels=0.00;FS=1.035;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=2.761;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:804,0,760 chrVII 644858 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.118;DP=106;Dels=0.00;FS=7.165;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1273,0,983 chrVII 645195 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.281;DP=95;Dels=0.00;FS=2.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:95:99:1064,0,838 chrVII 645493 . T G 2640 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2673,282,0 chrVII 645531 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.276;DP=108;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.363;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1293,0,892 chrVII 645889 . T C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.653;DP=137;Dels=0.00;FS=3.106;HaplotypeScore=5.5403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1497,0,1207 chrVII 645955 . C T 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.873;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1398,0,888 chrVII 645958 . G T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.648;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.440;QD=13.06;ReadPosRankSum=-1.040;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,64:113:99:1506,0,880 chrVII 646006 . G A 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.666;DP=156;Dels=0.00;FS=2.045;HaplotypeScore=4.8801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=10.52;ReadPosRankSum=2.534;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1671,0,1597 chrVII 646047 . T C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.676;DP=151;Dels=0.00;FS=2.042;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.409;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1497,0,1655 chrVII 646051 . G A 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.171;DP=150;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.688;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1562,0,1570 chrVII 646177 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.179;DP=135;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.456;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1224,0,1465 chrVII 648361 . C T 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.404;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,43:110:99:828,0,1503 chrVII 648461 . A C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.572;DP=121;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=3.4083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=0;MQRankSum=1.543;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.095;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:121:99:1143,0,1426 chrVII 648502 . C T 977.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.225;DP=148;Dels=0.00;FS=2.315;HaplotypeScore=5.7518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.46;MQ0=22;MQRankSum=1.375;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.196;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,55:148:99:1007,0,1571 chrVII 648752 . G A 839.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.760;DP=119;Dels=0.00;FS=7.973;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.08;MQ0=19;MQRankSum=-0.865;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.135;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:119:99:869,0,1130 chrVII 649033 . A C 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.05;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3360,363,0 chrVII 649041 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.328;DP=139;Dels=0.00;FS=4.143;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.192;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1380,0,1479 chrVII 649105 . G A 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3273,313,0 chrVII 649266 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.879;DP=126;Dels=0.00;FS=3.350;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.212;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1303,0,1483 chrVII 649641 . C T 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.187;DP=97;Dels=0.00;FS=1.714;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.255;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1175,0,891 chrVII 649739 . G C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.397;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.783;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1285,0,1517 chrVII 649777 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.438;DP=127;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.186;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1290,0,1364 chrVII 650357 . A G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.891;DP=115;Dels=0.00;FS=10.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.395;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,70:115:99:1445,0,955 chrVII 650619 . C T 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.282;DP=171;Dels=0.00;FS=4.525;HaplotypeScore=4.9543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.849;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,86:171:99:1747,0,1849 chrVII 650626 . C T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.902;DP=160;Dels=0.00;FS=9.596;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=8.84;ReadPosRankSum=2.551;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1445,0,1829 chrVII 650689 . A G 4552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4552,460,0 chrVII 650748 . G A 4396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4396,451,0 chrVII 650882 . C A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.303;DP=91;Dels=0.00;FS=6.868;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.236;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:997,0,839 chrVII 651108 . A G 1893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.689;DP=142;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,86:142:99:1923,0,1154 chrVII 651239 . G A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.748;DP=139;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=9.10;ReadPosRankSum=-2.163;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1295,0,1631 chrVII 651434 . A G 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3541,369,0 chrVII 652013 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.099;DP=130;Dels=0.00;FS=2.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.210;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1232,0,1509 chrVII 652017 . A G 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3391,348,0 chrVII 652481 . C T 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.798;DP=127;Dels=0.00;FS=5.557;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1434,0,1259 chrVII 652593 . G T 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.448;DP=145;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1441,0,1542 chrVII 653088 . C T 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.857;DP=148;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1547,0,1508 chrVII 653248 . A C 320 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.91;MQ0=0;QD=5.71;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:39:353,39,0 chrVII 653456 . G A 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.436;DP=159;Dels=0.00;FS=8.800;HaplotypeScore=5.5182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.643;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.519;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1580,0,1707 chrVII 653526 . A G 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3458,351,0 chrVII 653616 . C T 1777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.906;DP=155;Dels=0.00;FS=11.136;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=11.46;ReadPosRankSum=2.837;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1807,0,1470 chrVII 653705 . T G 2039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;DP=138;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=7.530;QD=14.78;ReadPosRankSum=6.002;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,91:138:99:2069,0,934 chrVII 653750 . C T 1878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.20;MQ0=0;QD=26.83;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1911,192,0 chrVII 653975 . A G 182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.971;DP=135;Dels=0.00;FS=3.342;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.171;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.917;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,48:135:99:212,0,2089 chrVII 654220 . A C 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.206;DP=119;Dels=0.00;FS=4.416;HaplotypeScore=9.4427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1039,0,1401 chrVII 654237 . C G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.402;DP=116;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=4.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=2.510;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.032;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:116:99:1108,0,1209 chrVII 654308 . A T 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.449;DP=142;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=3.556;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.242;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1817,0,1274 chrVII 654338 . G A 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.483;DP=125;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=2.111;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.795;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1467,0,1155 chrVII 654414 . G A 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.349;DP=141;Dels=0.00;FS=7.712;HaplotypeScore=4.4399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:141:99:1188,0,1285 chrVII 654526 . T C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.972;DP=122;Dels=0.00;FS=1.668;HaplotypeScore=3.4195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.651;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:122:99:1282,0,1274 chrVII 654601 . A C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.459;DP=127;Dels=0.00;FS=10.814;HaplotypeScore=6.9240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1407,0,1310 chrVII 654620 . G A 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.242;DP=137;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1692,0,1286 chrVII 654783 . T C 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;DP=147;Dels=0.00;FS=3.862;HaplotypeScore=5.9338;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=25.93;ReadPosRankSum=1.590;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:147:99:3811,396,0 chrVII 654977 . C T 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.701;DP=159;Dels=0.00;FS=4.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1753,0,1501 chrVII 655063 . C G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.928;DP=169;Dels=0.00;FS=4.556;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.512;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,73:169:99:1318,0,2004 chrVII 655090 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.328;DP=152;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.371;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1353,0,1785 chrVII 655504 . C T 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.859;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.924;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:870,0,1031 chrVII 656248 . T G 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3342,348,0 chrVII 656346 . A G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.159;DP=107;Dels=0.00;FS=5.032;HaplotypeScore=4.4651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.690;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1185,0,1070 chrVII 656445 . A G 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.751;DP=99;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.244;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:953,0,1189 chrVII 656495 . A T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.054;DP=126;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.869;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1260,0,1420 chrVII 656502 . A T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;DP=127;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=2.451;QD=10.76;ReadPosRankSum=-2.192;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1397,0,1272 chrVII 656877 . A G 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.164;DP=108;Dels=0.00;FS=8.073;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=8.74;ReadPosRankSum=-2.278;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:974,0,1361 chrVII 656911 . T C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.734;DP=97;Dels=0.00;FS=4.072;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.784;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,58:97:99:1252,0,802 chrVII 656948 . T C 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.368;DP=125;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.669;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1435,0,1161 chrVII 657040 . C G 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2887,312,0 chrVII 657221 . G A 1626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=13.90;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:1659,171,0 chrVII 657312 . A T 1792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.833;DP=142;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.693;QD=12.62;ReadPosRankSum=-1.519;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,85:142:99:1822,0,1147 chrVII 657389 . G A 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3162,313,0 chrVII 657546 . T C 4183.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4183,450,0 chrVII 657587 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.193;DP=153;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1320,0,1913 chrVII 657793 . G A 764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.287;DP=96;Dels=0.00;FS=3.851;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=2.122;QD=7.96;ReadPosRankSum=2.939;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:794,0,1192 chrVII 657794 . G A 770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.938;DP=88;Dels=0.00;FS=0.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=8.75;ReadPosRankSum=2.411;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:800,0,1024 chrVII 658597 . A G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.405;DP=100;Dels=0.00;FS=5.092;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.579;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1026,0,1108 chrVII 658613 . A G 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.966;DP=106;Dels=0.00;FS=4.868;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.496;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1058,0,1154 chrVII 658619 . G T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.688;DP=106;Dels=0.00;FS=4.848;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1208,0,1100 chrVII 658876 . T A 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2696,276,0 chrVII 659189 . T A 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;DP=91;Dels=0.00;FS=0.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:960,0,996 chrVII 659408 . C T 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.040;DP=93;Dels=0.00;FS=0.796;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.440;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:790,0,1255 chrVII 659521 . C T 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.118;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:1604,0,1031 chrVII 659791 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.045;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1210,0,1334 chrVII 659935 . T A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.628;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.532;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1097,0,1431 chrVII 659973 . G T 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.891;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.666;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:982,0,1526 chrVII 660023 . C T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.698;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:1062,0,1351 chrVII 660028 . G T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.928;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.987;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:123:99:1166,0,1378 chrVII 660121 . C T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.252;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.976;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.419;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,69:160:99:1419,0,1838 chrVII 660217 . A C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.420;DP=135;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.460;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1368,0,1485 chrVII 660221 . T C 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.085;DP=134;Dels=0.00;FS=1.414;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.569;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:134:99:1249,0,1425 chrVII 660351 . G A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.242;DP=123;Dels=0.00;FS=2.463;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1461,0,1064 chrVII 660461 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.493;DP=114;Dels=0.00;FS=7.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.295;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1290,0,1154 chrVII 660464 . G C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.251;DP=112;Dels=0.00;FS=5.827;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1184,0,1089 chrVII 660516 . G A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.043;DP=105;Dels=0.01;FS=8.045;HaplotypeScore=5.8540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=11.25;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1211,0,1001 chrVII 660534 . A C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;DP=100;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.362;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1059,0,1090 chrVII 660573 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.377;DP=114;Dels=0.00;FS=2.454;HaplotypeScore=3.5471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.938;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1138,0,1292 chrVII 660621 . T C 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.522;DP=152;Dels=0.00;FS=6.026;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.440;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:1669,0,1508 chrVII 660643 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.061;DP=137;Dels=0.00;FS=4.062;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1365,0,1504 chrVII 660685 . T C 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.227;DP=144;Dels=0.00;FS=3.957;HaplotypeScore=3.2371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.184;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:144:99:1338,0,1584 chrVII 660704 . C G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.006;DP=120;Dels=0.00;FS=7.114;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=10.40;ReadPosRankSum=-2.958;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,71:120:99:1278,0,995 chrVII 660946 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.712;DP=128;Dels=0.00;FS=6.664;HaplotypeScore=2.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.269;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1314,0,1348 chrVII 660968 . G C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.932;DP=134;Dels=0.00;FS=12.581;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.720;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1259,0,1414 chrVII 661080 . C T 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.327;DP=131;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.446;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.912;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1089,0,1629 chrVII 661126 . T C 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.965;DP=112;Dels=0.00;FS=2.533;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.889;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.112;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:845,0,1509 chrVII 661173 . G A 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.877;DP=118;Dels=0.00;FS=9.012;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.254;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1000,0,1383 chrVII 661248 . G C 379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=96;Dels=0.00;FS=19.068;HaplotypeScore=7.8867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-6.343;QD=3.95;ReadPosRankSum=-2.092;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:409,0,1067 chrVII 661260 . T A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.570;DP=101;Dels=0.00;FS=5.140;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=8.043;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.760;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1204,0,843 chrVII 661266 . A G 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=99;Dels=0.00;FS=1.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.85;MQ0=0;MQRankSum=-6.184;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:742,0,1206 chrVII 661281 . C T 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.005;DP=94;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQ0=0;MQRankSum=-5.475;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.170;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:806,0,1083 chrVII 661290 . A T 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.797;DP=93;Dels=0.00;FS=2.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.71;MQ0=0;MQRankSum=-5.268;QD=9.00;ReadPosRankSum=-1.034;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:867,0,1028 chrVII 661323 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.749;DP=116;Dels=0.00;FS=4.542;HaplotypeScore=4.9693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=4.076;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.723;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1286,0,1099 chrVII 661343 . A G 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.628;DP=114;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.637;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:881,0,1582 chrVII 661350 . C T 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.870;DP=118;Dels=0.01;FS=1.494;HaplotypeScore=2.9288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.622;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1052,0,1523 chrVII 661442 . C G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3231,336,0 chrVII 661475 . G A 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3177,316,0 chrVII 661528 . T A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.331;DP=119;Dels=0.00;FS=8.459;HaplotypeScore=4.6577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1264,0,1318 chrVII 661611 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.606;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1376,0,1150 chrVII 661628 . C T 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3057,304,0 chrVII 661642 . G A 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.181;DP=116;Dels=0.00;FS=7.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,70:116:99:1568,0,867 chrVII 661713 . C G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.562;DP=109;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.706;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1284,0,941 chrVII 661734 . T C 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.887;DP=103;Dels=0.00;FS=5.038;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.464;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:933,0,1231 chrVII 661735 . C T 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2717,276,0 chrVII 661892 . T A 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQ0=1;QD=23.34;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3525,355,0 chrVII 661984 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.871;DP=154;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=5.3117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=7.91;ReadPosRankSum=-1.390;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1248,0,1776 chrVII 662069 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.819;DP=106;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.401;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1176,0,977 chrVII 662230 . G A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.435;DP=123;Dels=0.01;FS=3.371;HaplotypeScore=2.9531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.497;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.559;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1503,0,1136 chrVII 662566 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.470;DP=140;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=10.9304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1172,0,1731 chrVII 662796 . G A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.215;DP=107;Dels=0.00;FS=6.166;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1145,0,1048 chrVII 663030 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.107;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.993;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1321,0,1248 chrVII 663196 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.893;DP=110;Dels=0.00;FS=1.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,67:110:99:1319,0,895 chrVII 663380 . A T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.426;DP=130;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.391;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1405,0,1036 chrVII 663419 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.256;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1378,0,1498 chrVII 663512 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.901;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.668;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1401,0,1254 chrVII 664238 . A G 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6543;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3015,318,0 chrVII 664328 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.971;DP=128;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.347;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1448,0,1153 chrVII 664343 . C T 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.509;DP=124;Dels=0.00;FS=3.276;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.539;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:914,0,1434 chrVII 664454 . G A 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.299;DP=108;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.166;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1076,0,1169 chrVII 664517 . A G 590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.707;DP=65;Dels=0.00;FS=0.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.403;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:620,0,689 chrVII 664700 . C G 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.281;DP=131;Dels=0.00;FS=3.226;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.334;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1517,0,1281 chrVII 664982 . A G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.451;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.349;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1113,0,1425 chrVII 664995 . G A 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3147,322,0 chrVII 665012 . T C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.182;DP=128;Dels=0.00;FS=8.495;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.093;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1180,0,1579 chrVII 665377 . A G 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.916;DP=128;Dels=0.00;FS=23.856;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=2.089;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.045;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1457,0,1232 chrVII 665432 . G A 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.583;DP=155;Dels=0.00;FS=8.686;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.757;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1818,0,1411 chrVII 665747 . G A 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.640;DP=127;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=2.5525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.899;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,78:127:99:1772,0,918 chrVII 665893 . A G 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.633;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.027;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1395,0,1004 chrVII 666261 . T A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.445;DP=119;Dels=0.00;FS=5.644;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.646;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1253,0,1334 chrVII 666285 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.305;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.976;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1541,0,1231 chrVII 666448 . T C 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.295;DP=146;Dels=0.00;FS=3.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,87:146:99:1809,0,1262 chrVII 666496 . A G 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.175;DP=135;Dels=0.00;FS=8.661;HaplotypeScore=5.6417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.172;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,79:135:99:1683,0,1203 chrVII 666547 . G A 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3884,394,0 chrVII 666548 . A G 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3751,390,0 chrVII 668284 . A G 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.008;DP=117;Dels=0.00;FS=7.244;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1508,0,974 chrVII 668528 . C T 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.499;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7348;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=25.24;ReadPosRankSum=1.150;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3037,306,0 chrVII 668812 . G A 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3097,304,0 chrVII 669880 . C T 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.374;DP=83;Dels=0.00;FS=2.953;HaplotypeScore=7.9441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.260;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,45:83:99:1054,0,784 chrVII 669985 . C T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.850;DP=105;Dels=0.00;FS=2.039;HaplotypeScore=3.7501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.116;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1203,0,911 chrVII 670056 . C T 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.621;DP=109;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=3.5117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=9.06;ReadPosRankSum=-2.402;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:1017,0,1350 chrVII 670080 . G C 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.442;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:117:99:989,0,1325 chrVII 670175 . A G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.689;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.011;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:112:99:1200,0,1097 chrVII 670257 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.344;DP=122;Dels=0.00;FS=3.620;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=1;MQRankSum=0.050;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1481,0,1064 chrVII 670263 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.185;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=1;MQRankSum=1.025;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1394,0,1385 chrVII 670287 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.902;DP=105;Dels=0.00;FS=2.563;HaplotypeScore=4.6004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:888,0,1283 chrVII 670291 . G A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.866;DP=107;Dels=0.00;FS=3.556;HaplotypeScore=4.6004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.954;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1021,0,1119 chrVII 670910 . C A 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3052,304,0 chrVII 671248 . C A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.964;DP=115;Dels=0.00;FS=4.205;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.529;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1245,0,1190 chrVII 671252 . C G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.647;DP=116;Dels=0.00;FS=2.877;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.193;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1176,0,1215 chrVII 671327 . A G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.632;DP=141;Dels=0.00;FS=2.260;HaplotypeScore=3.3602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.764;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,56:141:99:1061,0,1840 chrVII 671377 . G A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.735;DP=133;Dels=0.00;FS=2.201;HaplotypeScore=2.2931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.560;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1579,0,1206 chrVII 671774 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.607;DP=121;Dels=0.00;FS=8.328;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1377,0,1239 chrVII 672032 . A G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.989;DP=138;Dels=0.00;FS=6.362;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1250,0,1697 chrVII 672695 . G A 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3245,319,0 chrVII 673892 . A G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.911;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.469;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1325,0,1374 chrVII 674150 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.455;DP=107;Dels=0.00;FS=4.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.438;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1133,0,1215 chrVII 674712 . C A 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.231;DP=114;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=5.9899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1076,0,1348 chrVII 674874 . T C 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.630;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.519;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,52:141:99:1026,0,2033 chrVII 675528 . T C 580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.093;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=61.2705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=4.64;ReadPosRankSum=-3.587;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,34:125:99:610,0,1182 chrVII 675722 . T A 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.085;DP=138;Dels=0.00;FS=0.861;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.832;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1424,0,1690 chrVII 676517 . G A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.503;DP=164;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=3.8698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.950;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,78:164:99:1587,0,1783 chrVII 677274 . T C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.774;DP=117;Dels=0.01;FS=15.759;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.125;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:948,0,1438 chrVII 677484 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.903;DP=118;Dels=0.00;FS=14.181;HaplotypeScore=4.8347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.282;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:118:99:1355,0,1030 chrVII 677835 . C G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.413;DP=105;Dels=0.00;FS=10.088;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.471;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,61:105:99:1280,0,914 chrVII 678081 . T C 214.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.174;DP=137;Dels=0.00;FS=62.331;HaplotypeScore=47.5134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.44;MQ0=1;MQRankSum=-3.532;QD=1.56;ReadPosRankSum=-5.591;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,27:137:99:244,0,683 chrVII 678099 . C T 172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.237;DP=68;Dels=0.00;FS=13.981;HaplotypeScore=24.0835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQ0=0;MQRankSum=3.886;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.351;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,41:68:99:202,0,143 chrVII 678425 . A T 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.019;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.469;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1450,0,1581 chrVII 678429 . C T 3764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3764,382,0 chrVII 678454 . T A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1619,0,1718 chrVII 678805 . G A 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.747;DP=133;Dels=0.00;FS=7.800;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=2.338;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1447,0,1236 chrVII 678864 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.937;DP=142;Dels=0.00;FS=1.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.055;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1329,0,1612 chrVII 679354 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.997;DP=157;Dels=0.00;FS=5.882;HaplotypeScore=3.7245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,71:157:99:1334,0,1769 chrVII 679676 . G T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.502;DP=150;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.970;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1567,0,1524 chrVII 679936 . C T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.935;DP=118;Dels=0.00;FS=2.495;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.174;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1445,0,1026 chrVII 679999 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.455;DP=131;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.856;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:131:99:1392,0,1166 chrVII 680113 . C T 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.723;DP=98;Dels=0.00;FS=5.424;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.906;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1128,0,833 chrVII 680542 . T C 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.033;DP=157;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=3.8838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.982;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1489,0,1913 chrVII 680605 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.885;DP=124;Dels=0.00;FS=5.814;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.710;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1132,0,1455 chrVII 680773 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.565;DP=115;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.211;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1036,0,1471 chrVII 680935 . A G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.967;DP=131;Dels=0.00;FS=4.485;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.035;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1344,0,1457 chrVII 681013 . G A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.580;DP=134;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1328,0,1394 chrVII 681086 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.066;DP=138;Dels=0.00;FS=4.165;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1511,0,1419 chrVII 681289 . G A 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.045;DP=143;Dels=0.00;FS=2.995;HaplotypeScore=3.2482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.176;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1573,0,1422 chrVII 681411 . T C 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3154,336,0 chrVII 681415 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.337;DP=129;Dels=0.00;FS=5.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.900;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:1088,0,1548 chrVII 681502 . T C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.162;DP=134;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=3.5498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.094;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1196,0,1628 chrVII 681622 . T A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;DP=141;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=0.316;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.282;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1295,0,1703 chrVII 681706 . C T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.365;DP=120;Dels=0.00;FS=4.481;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.426;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1067,0,1441 chrVII 681775 . C T 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.523;DP=116;Dels=0.00;FS=4.592;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.698;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:957,0,1313 chrVII 682208 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.578;DP=101;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1241,0,877 chrVII 682309 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.568;DP=119;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.603;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1314,0,1239 chrVII 682324 . G T 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.194;DP=120;Dels=0.00;FS=4.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1222,0,1183 chrVII 682333 . G A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.355;DP=145;Dels=0.00;FS=5.055;HaplotypeScore=2.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.457;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1385,0,1531 chrVII 682394 . C T 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3066,312,0 chrVII 682466 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.834;DP=94;Dels=0.00;FS=6.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:1034,0,998 chrVII 682488 . A T 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;DP=96;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.095;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:1051,0,992 chrVII 682525 . C T 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2892,285,0 chrVII 682549 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.958;DP=114;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=8.4428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.273;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:114:99:1286,0,1008 chrVII 682639 . C T 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.167;DP=113;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=6.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:970,0,1356 chrVII 682640 . C T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.271;DP=112;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=6.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.830;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1352,0,1019 chrVII 682848 . T C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.268;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.417;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1266,0,1166 chrVII 683391 . A T 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3438,343,0 chrVII 683478 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.336;DP=100;Dels=0.00;FS=1.621;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.786;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1068,0,1065 chrVII 683669 . A G 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.531;DP=101;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.187;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:984,0,1177 chrVII 684022 . A G 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3962,417,0 chrVII 684041 . G A 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3995,382,0 chrVII 684165 . A G 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3414,360,0 chrVII 684595 . A G 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2985,312,0 chrVII 684623 . G T 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3397,337,0 chrVII 684644 . G A 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=22.21;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:2987,292,0 chrVII 684645 . G A 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2983,292,0 chrVII 684687 . C T 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3074,304,0 chrVII 685328 . T A 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3382,334,0 chrVII 685491 . C T 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.17;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3533,358,0 chrVII 685720 . G T 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.973e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4046,403,0 chrVII 685949 . G A 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3333,337,0 chrVII 686099 . A T 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3860,388,0 chrVII 686121 . T C 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3583,369,0 chrVII 686253 . C A 4004.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.87;SB=-2.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4004,391,0 chrVII 686708 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.994;DP=140;Dels=0.00;FS=2.130;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.406;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1217,0,1690 chrVII 686720 . T C 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.292;DP=99;Dels=0.00;FS=3.930;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=6.96;ReadPosRankSum=2.198;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,38:99:99:719,0,1398 chrVII 686883 . G T 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.440;DP=105;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:958,0,1296 chrVII 686910 . G A 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.625;DP=112;Dels=0.00;FS=5.940;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.995;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1125,0,1237 chrVII 687012 . G A 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.413;DP=82;Dels=0.00;FS=1.822;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.086;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:797,0,920 chrVII 687222 . A G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.076;DP=120;Dels=0.00;FS=3.266;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.063;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1105,0,1438 chrVII 687223 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.470;DP=121;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.044;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1172,0,1431 chrVII 687321 . A C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.825;DP=137;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.225;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1358,0,1516 chrVII 687814 . A G 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2467,252,0 chrVII 688062 . T C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.947;DP=122;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=9.22;ReadPosRankSum=2.145;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1155,0,1305 chrVII 688271 . C A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.866;DP=114;Dels=0.00;FS=3.613;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.910;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:114:99:1233,0,1181 chrVII 688371 . G A 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3195,318,0 chrVII 688494 . T C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3369,348,0 chrVII 688726 . C T 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3064,309,0 chrVII 688901 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.708;DP=135;Dels=0.00;FS=6.382;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.386;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1266,0,1565 chrVII 689170 . G T 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.449;DP=163;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1574,0,1903 chrVII 689263 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.275;DP=133;Dels=0.00;FS=17.930;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.724;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.192;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1522,0,1264 chrVII 689389 . G A 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.238;DP=126;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=7.90;ReadPosRankSum=2.183;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:1025,0,1568 chrVII 689420 . A G 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.989e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3831,396,0 chrVII 689452 . G A 795.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.610;DP=112;Dels=0.00;FS=4.683;HaplotypeScore=5.6265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=7.10;ReadPosRankSum=1.801;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:825,0,1500 chrVII 689454 . A G 2771 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2804,294,0 chrVII 689458 . C T 1451.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.778;DP=109;Dels=0.00;FS=2.546;HaplotypeScore=3.7665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=13.31;ReadPosRankSum=-2.737;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,66:109:99:1481,0,756 chrVII 689803 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.232;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.546;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1275,0,1634 chrVII 689812 . A G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.962;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1107,0,1638 chrVII 689905 . G A 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.321;DP=148;Dels=0.00;FS=6.091;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=0.557;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.006;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1642,0,1425 chrVII 690035 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.618;DP=133;Dels=0.00;FS=7.822;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.879;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1507,0,1295 chrVII 690039 . G C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;DP=135;Dels=0.00;FS=9.170;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.670;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1449,0,1391 chrVII 690131 . C T 3573.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3573,355,0 chrVII 690262 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=103;Dels=0.00;FS=5.049;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.944;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,63:103:99:1385,0,865 chrVII 690379 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.050;DP=108;Dels=0.00;FS=1.684;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:108:99:1365,0,898 chrVII 690505 . T C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.332;DP=125;Dels=0.00;FS=5.596;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.399;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1488,0,1198 chrVII 690685 . G A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.683;DP=121;Dels=0.00;FS=8.826;HaplotypeScore=3.6745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.597;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1251,0,1388 chrVII 690847 . G A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.232;DP=127;Dels=0.00;FS=2.561;HaplotypeScore=6.8722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.297;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1307,0,1441 chrVII 690893 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.837;DP=135;Dels=0.00;FS=3.592;HaplotypeScore=5.8272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1420,0,1404 chrVII 691114 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.450;DP=137;Dels=0.00;FS=5.230;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1464,0,1429 chrVII 691370 . C A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.799;DP=148;Dels=0.00;FS=3.905;HaplotypeScore=11.4397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1624,0,1480 chrVII 691567 . A G 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.323;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3637,361,0 chrVII 691606 . C G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;DP=144;Dels=0.00;FS=3.936;HaplotypeScore=5.9824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.853;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1425,0,1171 chrVII 692182 . T C 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.255;DP=135;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:1738,0,1181 chrVII 692218 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.413;DP=118;Dels=0.00;FS=4.389;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1376,0,1156 chrVII 692371 . T C 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.311;DP=118;Dels=0.00;FS=1.537;HaplotypeScore=6.8967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.225;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:942,0,1534 chrVII 692729 . G A 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.927;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1505,0,1396 chrVII 692857 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.166;DP=138;Dels=0.00;FS=2.135;HaplotypeScore=3.6378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.982;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1308,0,1391 chrVII 692867 . A G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.531;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=2.328;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:940,0,1286 chrVII 693017 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.078;DP=128;Dels=0.00;FS=1.414;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1427,0,1288 chrVII 693756 . G A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.377;DP=120;Dels=0.00;FS=1.492;HaplotypeScore=8.5735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=0.624;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:1023,0,1291 chrVII 694188 . T C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.494;DP=120;Dels=0.00;FS=3.357;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.624;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1108,0,1527 chrVII 694371 . C T 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.793;DP=154;Dels=0.00;FS=2.987;HaplotypeScore=3.7512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.857;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.677;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1733,0,1377 chrVII 694722 . T C 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.869;DP=155;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.356;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1544,0,1691 chrVII 695091 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.408;DP=132;Dels=0.00;FS=1.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.582;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1328,0,1390 chrVII 695230 . T A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.497;DP=130;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=3.5541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1428,0,1453 chrVII 695464 . T A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;DP=136;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1523,0,1428 chrVII 695662 . A G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.254;DP=121;Dels=0.00;FS=3.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.064;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1371,0,1201 chrVII 696190 . T C 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.494;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.596;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,74:170:99:1394,0,2119 chrVII 696994 . T C 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3056,330,0 chrVII 697071 . A G 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=25.97;ReadPosRankSum=-1.703;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3149,330,0 chrVII 697514 . A G 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3945,411,0 chrVII 697547 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.242;DP=147;Dels=0.00;FS=1.341;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.112;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1339,0,1888 chrVII 697548 . G A 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.91;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4075,406,0 chrVII 697829 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.858;DP=129;Dels=0.00;FS=9.616;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.176;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1321,0,1447 chrVII 697832 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.200;DP=130;Dels=0.00;FS=6.734;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.569;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1367,0,1287 chrVII 697892 . C T 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.940;DP=156;Dels=0.00;FS=5.733;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1570,0,1732 chrVII 698057 . C T 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.355;DP=150;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=10.3254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=10.44;ReadPosRankSum=-2.276;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1596,0,1552 chrVII 698120 . C T 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.744;DP=140;Dels=0.00;FS=3.028;HaplotypeScore=5.4606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=11.36;ReadPosRankSum=2.062;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1621,0,1387 chrVII 698252 . A G 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.252;DP=149;Dels=0.00;FS=3.417;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.413;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1573,0,1475 chrVII 698376 . T C 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.834;DP=98;Dels=0.03;FS=15.158;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.364;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:834,0,1230 chrVII 698504 . A G 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.875;DP=116;Dels=0.00;FS=2.649;HaplotypeScore=4.3710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=8.31;ReadPosRankSum=-2.096;SB=-7.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:994,0,1418 chrVII 698507 . T A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.737;DP=116;Dels=0.00;FS=5.716;HaplotypeScore=3.5043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.670;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1010,0,1511 chrVII 698531 . A G 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.489;DP=98;Dels=0.00;FS=6.595;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.386;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:981,0,1119 chrVII 699072 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.001;DP=125;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.101;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1369,0,1230 chrVII 699232 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.900;DP=105;Dels=0.00;FS=10.213;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1281,0,1018 chrVII 699298 . C T 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.945;DP=101;Dels=0.00;FS=11.299;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=9.87;ReadPosRankSum=-2.055;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1027,0,1044 chrVII 699348 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.144;DP=120;Dels=0.00;FS=0.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.911;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1307,0,1302 chrVII 699813 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.336;DP=135;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.433;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1162,0,1606 chrVII 699971 . C A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.195;DP=93;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=11.45;ReadPosRankSum=2.071;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1095,0,908 chrVII 700028 . T C 369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.487;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,44:69:99:399,0,222 chrVII 700436 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.821;DP=134;Dels=0.00;FS=5.281;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1462,0,1399 chrVII 700532 . A T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.180;DP=131;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=2.7569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1479,0,1268 chrVII 700554 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.205;DP=116;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.547;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1235,0,1172 chrVII 700580 . G C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.833;DP=132;Dels=0.00;FS=6.523;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.847;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.190;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1067,0,1422 chrVII 700611 . T C 947.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.326;DP=132;Dels=0.00;FS=31.444;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQ0=0;MQRankSum=-8.032;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:977,0,1564 chrVII 700613 . A C 935.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.894;DP=126;Dels=0.00;FS=27.223;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQ0=0;MQRankSum=-8.632;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:965,0,1523 chrVII 700617 . G A 808.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.905;DP=123;Dels=0.00;FS=10.008;HaplotypeScore=2.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.30;MQ0=0;MQRankSum=-9.262;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:838,0,1383 chrVII 700622 . A G 1185.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.970;DP=124;Dels=0.00;FS=10.094;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.13;MQ0=0;MQRankSum=8.591;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.887;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1215,0,942 chrVII 700627 . C T 897.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.567;DP=121;Dels=0.00;FS=10.352;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.73;MQ0=0;MQRankSum=-8.479;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.770;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:927,0,1266 chrVII 700641 . C A 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.860;DP=125;Dels=0.00;FS=10.405;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.71;MQ0=0;MQRankSum=-8.098;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1002,0,1142 chrVII 700652 . T A 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;DP=137;Dels=0.00;FS=5.417;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.12;MQ0=0;MQRankSum=-7.503;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.820;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1038,0,1456 chrVII 700660 . C T 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.167;DP=135;Dels=0.00;FS=3.142;HaplotypeScore=3.2482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-6.123;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.927;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1086,0,1431 chrVII 700775 . G A 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.658;DP=131;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.543;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1227,0,1351 chrVII 701060 . T G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.642;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.370;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:986,0,1300 chrVII 701087 . G C 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.705;DP=129;Dels=0.00;FS=2.305;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=1;MQRankSum=0.550;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.084;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1456,0,1113 chrVII 701124 . T C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.286;DP=128;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=1;MQRankSum=1.381;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1119,0,1562 chrVII 701166 . A T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.449;DP=129;Dels=0.00;FS=5.348;HaplotypeScore=3.9611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=1;MQRankSum=0.364;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.788;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1220,0,1584 chrVII 701229 . A T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.964;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.512;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:119:99:1373,0,1187 chrVII 701232 . C T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.961;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.856;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.124;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1391,0,1143 chrVII 701313 . T A 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;DP=144;Dels=0.00;FS=2.772;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.418;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1610,0,1586 chrVII 701385 . A G 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.045;DP=136;Dels=0.00;FS=3.533;HaplotypeScore=3.7434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1041,0,1769 chrVII 701596 . G A 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.553;DP=115;Dels=0.00;FS=1.564;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.027;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1455,0,967 chrVII 701914 . T A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;DP=113;Dels=0.00;FS=1.615;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=11.17;ReadPosRankSum=-2.603;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1292,0,1145 chrVII 701981 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.019;DP=113;Dels=0.00;FS=5.878;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.453;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1066,0,1220 chrVII 702018 . C T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.056;DP=109;Dels=0.00;FS=3.594;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1003,0,1286 chrVII 702020 . G A 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.503;DP=105;Dels=0.00;FS=4.895;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.695;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:963,0,1219 chrVII 702160 . T C 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.879;DP=91;Dels=0.00;FS=5.323;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.060;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:945,0,1027 chrVII 702626 . T C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.908;DP=107;Dels=0.00;FS=4.101;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.271;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,65:107:99:1375,0,881 chrVII 702776 . C T 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.812;DP=95;Dels=0.00;FS=2.870;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:962,0,822 chrVII 702790 . A C 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.225;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.159;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:977,0,895 chrVII 702791 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.592;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1035,0,872 chrVII 702821 . T C 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.622;DP=94;Dels=0.00;FS=1.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.257;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:866,0,1058 chrVII 702967 . C T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.600;DP=114;Dels=0.00;FS=1.615;HaplotypeScore=5.8308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.502;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1132,0,1181 chrVII 703087 . T A 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;DP=103;Dels=0.00;FS=3.778;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.676;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:1073,0,1190 chrVII 703126 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.403;DP=112;Dels=0.00;FS=2.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.042;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1186,0,1285 chrVII 703157 . G A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.850;DP=117;Dels=0.00;FS=5.793;HaplotypeScore=6.9447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.073;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1032,0,1324 chrVII 703431 . C T 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.488;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1482,0,1065 chrVII 703454 . T C 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.231;DP=116;Dels=0.00;FS=7.313;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.685;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1398,0,1101 chrVII 705215 . C T 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=28.42;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3244,322,0 chrVII 705639 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.725;DP=89;Dels=0.00;FS=2.835;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:1048,0,911 chrVII 705827 . G A 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.198;DP=151;Dels=0.00;FS=4.817;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.129;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1692,0,1438 chrVII 706027 . A G 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.549;DP=107;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=9.19;ReadPosRankSum=2.159;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1013,0,1181 chrVII 706175 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.402;DP=111;Dels=0.00;FS=3.698;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.051;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1354,0,994 chrVII 706202 . A G 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.752;DP=103;Dels=0.00;FS=3.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.514;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1199,0,969 chrVII 706228 . G A 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.934;DP=127;Dels=0.00;FS=3.232;HaplotypeScore=13.0219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.482;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.299;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:127:99:1576,0,1033 chrVII 706273 . T A 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;DP=82;Dels=0.00;FS=1.780;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.997;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:977,0,757 chrVII 706333 . T C 632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.955;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=7.90;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:662,0,1028 chrVII 706337 . G A 2078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2111,216,0 chrVII 706510 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.611;DP=145;Dels=0.00;FS=3.905;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.839;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1267,0,1669 chrVII 706511 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.407;DP=145;Dels=0.00;FS=3.905;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1303,0,1726 chrVII 706620 . G T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.298;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:894,0,1543 chrVII 706675 . C G 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.552;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:120:99:1150,0,1321 chrVII 706722 . T C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.409;DP=140;Dels=0.00;FS=3.029;HaplotypeScore=3.5129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1291,0,1663 chrVII 706800 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.087;DP=109;Dels=0.00;FS=1.557;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.270;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1127,0,1244 chrVII 707080 . T C 1484 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=14.69;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:1517,159,0 chrVII 707993 . G A 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.18;MQ0=11;QD=1.49;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:55,6,0 chrVII 708191 . A G 1085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.09;MQ0=0;QD=22.14;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1118,120,0 chrVII 708261 . T C 394 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.24;MQ0=8;QD=10.10;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:48:427,48,0 chrVII 708297 . G A 336 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.57;MQ0=15;QD=7.81;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:39:369,39,0 chrVII 708380 . T C 402 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.90;MQ0=16;QD=9.14;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:45:435,45,0 chrVII 708405 . C T 287 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.90;MQ0=10;QD=9.26;SB=-1.329e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:36:320,36,0 chrVII 708983 . T C 148.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.57;MQ0=21;QD=5.11;SB=-5.488e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:18:181,18,0 chrVII 708985 . A C 165.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.13;MQ0=21;QD=5.50;SB=-5.494e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:21:198,21,0 chrVII 709503 . T C 263 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.30;MQ0=21;QD=5.98;SB=-5.300e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:33:296,33,0 chrVII 709566 . C T 289 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.24;MQ0=22;QD=7.41;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:36:322,36,0 chrVII 709569 . C T 289 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.24;MQ0=22;QD=7.41;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:36:322,36,0 chrVII 709683 . C T 1496 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.71;MQ0=3;QD=22.00;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1529,150,0 chrVII 709707 . A G 1685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.94;MQ0=3;QD=22.47;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1718,168,0 chrVII 710803 . A G 978 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.12;MQ0=18;QD=15.28;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1011,111,0 chrVII 710836 . T C 1234 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.80;MQ0=12;QD=18.70;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1267,132,0 chrVII 710949 . T C 1089 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.99;MQ0=9;QD=20.17;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1122,111,0 chrVII 712545 . A T 109.42 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.48;MQ0=2;MQRankSum=1.001;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.422;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:7:139,0,7 chrVII 712963 . A G 1624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.05;MQ0=0;QD=21.37;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1657,180,0 chrVII 713686 . G A 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3200,316,0 chrVII 713767 . T G 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;DP=150;Dels=0.00;FS=3.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.224;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3758,393,0 chrVII 714147 . C T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.374;DP=128;Dels=0.00;FS=3.171;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.869;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1504,0,1237 chrVII 714699 . G T 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.088;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.592;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:129:99:1613,0,905 chrVII 716136 . G A 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=25.67;ReadPosRankSum=1.448;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3440,334,0 chrVII 717036 . A G 4318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4318,438,0 chrVII 717714 . A T 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3011,301,0 chrVII 720024 . T A 1889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.389;DP=201;Dels=0.00;FS=0.566;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,94:201:99:1919,0,2389 chrVII 720308 . A G 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2703,285,0 chrVII 720342 . C T 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.20;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3007,309,0 chrVII 721075 . T G 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3600,378,0 chrVII 721368 . A G 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6023;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3200,345,0 chrVII 722334 . G A 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:4179,409,0 chrVII 722341 . G A 4166.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4166,409,0 chrVII 722662 . T A 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3602,360,0 chrVII 723583 . C T 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3339,334,0 chrVII 723984 . T C 4470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.83;SB=-2.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4470,480,0 chrVII 724567 . C T 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3831,388,0 chrVII 724918 . G A 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3192,322,0 chrVII 724987 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.720;DP=111;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1220,0,1075 chrVII 725021 . C T 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.51;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2472,243,0 chrVII 725111 . T C 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3284,345,0 chrVII 725478 . C T 3967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:3967,394,0 chrVII 725577 . G A 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3865,382,0 chrVII 725720 . T C 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.516;DP=127;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.823;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1391,0,1287 chrVII 726549 . C A 770.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.239;DP=141;Dels=0.00;FS=1.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=2.099;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.447;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:800,0,1223 chrVII 726550 . A T 830.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.814;DP=141;Dels=0.00;FS=2.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=3.437;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.548;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:860,0,1175 chrVII 726553 . C T 955.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.269;DP=141;Dels=0.00;FS=2.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=6.77;ReadPosRankSum=1.677;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:985,0,1191 chrVII 726692 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.583;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1357,0,1659 chrVII 726889 . C T 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2598,261,0 chrVII 727123 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.069;DP=117;Dels=0.01;FS=1.461;HaplotypeScore=18.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.558;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1270,0,1158 chrVII 727267 . T A 2418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;DP=90;Dels=0.00;FS=5.022;HaplotypeScore=7.8162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=26.87;ReadPosRankSum=1.654;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:90:99:2451,252,0 chrVII 727448 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.934;DP=123;Dels=0.00;FS=6.889;HaplotypeScore=4.8069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1416,0,1247 chrVII 729257 . G T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.666;DP=125;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=5.4781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.120;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,46:125:99:894,0,1716 chrVII 729374 . T C 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3240,333,0 chrVII 730905 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.156;DP=104;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.819;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:104:99:897,0,1271 chrVII 730986 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.563;DP=124;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1088,0,1480 chrVII 731129 . G A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.771;DP=105;Dels=0.00;FS=2.531;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.420;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1075,0,1199 chrVII 731803 . A T 2043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;DP=168;Dels=0.00;FS=1.227;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.339;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,98:168:99:2073,0,1413 chrVII 731805 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.707;DP=167;Dels=0.00;FS=2.756;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,71:167:99:1416,0,1934 chrVII 734668 . A T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;DP=152;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=1;MQRankSum=1.164;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1483,0,1754 chrVII 734999 . T C 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.885;DP=127;Dels=0.00;FS=3.236;HaplotypeScore=4.9173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1391,0,1247 chrVII 735644 . C A 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;DP=115;Dels=0.00;FS=1.602;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,47:115:99:1008,0,1452 chrVII 736284 . T A 686.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;DP=158;Dels=0.00;FS=0.858;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.03;MQ0=58;MQRankSum=-0.238;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.664;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,38:158:99:716,0,1398 chrVII 737189 . C A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.044;DP=114;Dels=0.00;FS=3.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=1;MQRankSum=1.970;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.320;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1133,0,1329 chrVII 737862 . C T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.492;DP=131;Dels=0.00;FS=4.157;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.141;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1277,0,1346 chrVII 738177 . G A 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.603;DP=89;Dels=0.00;FS=0.881;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.612;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:903,0,868 chrVII 738192 . G A 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.62;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2493,258,0 chrVII 738263 . G C 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;DP=80;Dels=0.00;FS=7.895;HaplotypeScore=2.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:809,0,853 chrVII 738379 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.161;DP=93;Dels=0.00;FS=0.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.828;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,56:93:99:1142,0,721 chrVII 738435 . T A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;DP=97;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.333;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,57:97:99:1243,0,872 chrVII 738466 . T C 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.496;DP=135;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=11.86;ReadPosRankSum=-3.051;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1631,0,1197 chrVII 738493 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.147;DP=112;Dels=0.00;FS=8.960;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1333,0,1076 chrVII 738540 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.509;DP=153;Dels=0.01;FS=1.345;HaplotypeScore=23.7460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.033;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1569,0,1577 chrVII 738565 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.741;DP=115;Dels=0.00;FS=7.155;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.71;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1214,0,1224 chrVII 738759 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.563;DP=107;Dels=0.00;FS=3.550;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.720;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1125,0,1100 chrVII 738799 . T C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.597;DP=119;Dels=0.00;FS=19.895;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=2.426;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1238,0,1385 chrVII 738861 . C T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.108;DP=125;Dels=0.00;FS=8.212;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:125:99:1330,0,1233 chrVII 738891 . A T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;DP=132;Dels=0.00;FS=8.265;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.563;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.141;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1243,0,1524 chrVII 739026 . A C 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.136;DP=139;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1544,0,1402 chrVII 739067 . C G 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.644;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.357;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.678;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1617,0,1620 chrVII 739070 . C A 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.964;DP=143;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.367;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1620,0,1493 chrVII 739081 . T C 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.194;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-3.009;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.869;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1591,0,1585 chrVII 739088 . T C 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.878;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.143;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1599,0,1631 chrVII 739199 . A C 1065.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;DP=111;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.38;MQ0=0;MQRankSum=-3.336;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:111:99:1095,0,967 chrVII 739200 . C T 1075.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.043;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.38;MQ0=0;MQRankSum=-4.361;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.829;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:111:99:1105,0,933 chrVII 739206 . A G 1227.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.440;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.66;MQ0=0;MQRankSum=-4.092;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1257,0,1007 chrVII 739268 . T C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.487;DP=121;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=4.4514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.17;MQ0=0;MQRankSum=-5.129;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.352;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1073,0,1263 chrVII 739306 . A C 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.841;DP=135;Dels=0.00;FS=4.076;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.872;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.294;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1002,0,1645 chrVII 739449 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.841;DP=128;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.854;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1203,0,1377 chrVII 739461 . A G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.443;DP=123;Dels=0.00;FS=2.432;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.175;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1089,0,1505 chrVII 739469 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.410;DP=131;Dels=0.00;FS=2.435;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.714;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1182,0,1471 chrVII 739476 . C G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.095;DP=131;Dels=0.00;FS=2.435;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.023;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1107,0,1440 chrVII 739619 . A C 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.155;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1486,0,1353 chrVII 739622 . A T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;DP=143;Dels=0.01;FS=0.621;HaplotypeScore=11.3565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1497,0,1369 chrVII 739868 . C A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.207;DP=133;Dels=0.00;FS=9.688;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1476,0,1319 chrVII 739889 . T A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.987;DP=141;Dels=0.00;FS=1.694;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.429;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1605,0,1414 chrVII 740304 . G A 1814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.818;DP=152;Dels=0.00;FS=2.041;HaplotypeScore=2.9706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1844,0,1326 chrVII 740339 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.022;DP=131;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=5.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.021;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1455,0,1338 chrVII 740372 . T C 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.152;DP=136;Dels=0.00;FS=12.546;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1617,0,1264 chrVII 740444 . C T 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.048;DP=137;Dels=0.00;FS=9.140;HaplotypeScore=6.6172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1647,0,1131 chrVII 740993 . A G 724.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.638;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.469;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:754,0,1173 chrVII 741000 . A C 683.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.987;DP=92;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=3.8681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.762;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:713,0,1223 chrVII 741002 . A G 658.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.132;DP=93;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.670;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:688,0,1307 chrVII 741047 . C T 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.574;DP=109;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=8.26;ReadPosRankSum=-2.617;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:930,0,1343 chrVII 741068 . C T 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=108;Dels=0.00;FS=3.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=26.17;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2859,285,0 chrVII 741442 . C T 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.231;DP=112;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:112:99:1175,0,1102 chrVII 741491 . T C 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.397;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.762;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1367,0,1372 chrVII 741692 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.283;DP=135;Dels=0.00;FS=4.321;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1468,0,1314 chrVII 741819 . A G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.731;DP=142;Dels=0.00;FS=4.055;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1336,0,1641 chrVII 742069 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.627;DP=133;Dels=0.00;FS=8.812;HaplotypeScore=2.6274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.228;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1455,0,1499 chrVII 742081 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.811;DP=133;Dels=0.00;FS=14.286;HaplotypeScore=2.3779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.73;ReadPosRankSum=2.047;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1457,0,1428 chrVII 742129 . T C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.506;DP=135;Dels=0.00;FS=7.994;HaplotypeScore=6.8825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1099,0,1165 chrVII 742219 . A T 468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.823;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:498,0,425 chrVII 742255 . G A 346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.871;DP=68;Dels=0.00;FS=0.921;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.92;MQ0=0;MQRankSum=-6.120;QD=5.09;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:376,0,811 chrVII 742270 . T C 450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.037;DP=80;Dels=0.00;FS=1.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.78;MQ0=0;MQRankSum=-6.494;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.959;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:480,0,998 chrVII 742276 . C T 614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.929;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.74;MQ0=0;MQRankSum=-6.097;QD=7.31;ReadPosRankSum=-3.055;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:644,0,855 chrVII 742290 . G A 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.721;DP=90;Dels=0.00;FS=6.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.468;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.505;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:738,0,995 chrVII 742302 . T C 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.038;DP=94;Dels=0.00;FS=2.692;HaplotypeScore=5.9625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.79;MQ0=0;MQRankSum=-4.807;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.269;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:798,0,1041 chrVII 742390 . A G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.825;DP=136;Dels=0.00;FS=23.895;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=1;MQRankSum=-0.407;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1593,0,1135 chrVII 742513 . T C 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.858;DP=135;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=5.0922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.548;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1240,0,1509 chrVII 742966 . G C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.086;DP=133;Dels=0.00;FS=10.816;HaplotypeScore=5.1257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.191;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1140,0,1589 chrVII 743032 . G A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.046;DP=144;Dels=0.00;FS=2.991;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.008;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1428,0,1574 chrVII 743284 . C T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.402;DP=149;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.515;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1701,0,1492 chrVII 743456 . G A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.441;DP=135;Dels=0.00;FS=12.198;HaplotypeScore=3.8374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=10.50;ReadPosRankSum=2.739;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1448,0,1484 chrVII 743539 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.587;DP=130;Dels=0.00;FS=5.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.135;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1297,0,1372 chrVII 743755 . G A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.711;DP=136;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=6.6857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.514;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,54:136:99:1086,0,1743 chrVII 743797 . G A 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.330;DP=118;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.348;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:996,0,1428 chrVII 743803 . T C 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.068;DP=117;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=2.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.019;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:853,0,1569 chrVII 743899 . T C 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.162;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.572;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1459,0,1648 chrVII 744064 . C T 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.639;DP=126;Dels=0.00;FS=3.737;HaplotypeScore=3.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.550;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:1682,0,975 chrVII 744469 . A G 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.593;DP=106;Dels=0.00;FS=7.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.613;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:775,0,1576 chrVII 744682 . T C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.073;DP=108;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=3.5674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.056;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,65:108:99:1463,0,916 chrVII 744730 . A G 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.830;DP=103;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.023;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1181,0,858 chrVII 744731 . G A 2554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2587,270,0 chrVII 744769 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.885;DP=102;Dels=0.00;FS=2.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.302;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,60:102:99:1319,0,737 chrVII 745003 . A C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.815;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.132;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1216,0,1163 chrVII 745588 . G A 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.924e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3826,370,0 chrVII 746194 . G A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.064;DP=128;Dels=0.00;FS=5.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.127;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1133,0,1512 chrVII 746541 . A C 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.826;DP=75;Dels=0.00;FS=1.943;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.261;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:770,0,726 chrVII 746615 . T C 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.917;DP=117;Dels=0.00;FS=8.696;HaplotypeScore=22.5102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=1.821;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.664;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:721,0,1039 chrVII 746628 . C A 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.146;DP=111;Dels=0.01;FS=6.903;HaplotypeScore=17.1666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:952,0,1114 chrVII 746824 . A G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.360;DP=95;Dels=0.00;FS=5.311;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=9.05;ReadPosRankSum=2.135;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:890,0,1108 chrVII 746836 . T C 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.383;DP=100;Dels=0.00;FS=11.238;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.843;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:911,0,1182 chrVII 747045 . C T 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.857;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:102:99:796,0,1292 chrVII 747090 . T G 670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.577;DP=114;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=3.869;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.563;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:700,0,1501 chrVII 747244 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.156;DP=134;Dels=0.00;FS=5.320;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.634;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1449,0,1374 chrVII 747255 . C T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.621;DP=125;Dels=0.00;FS=5.572;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.180;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1459,0,1245 chrVII 747409 . A G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.338;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1077,0,1592 chrVII 747544 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.423;DP=135;Dels=0.00;FS=5.540;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1251,0,1481 chrVII 747545 . A G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.692;DP=135;Dels=0.00;FS=5.540;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1195,0,1589 chrVII 747860 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.360;DP=134;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1357,0,1444 chrVII 747900 . G A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.014;DP=123;Dels=0.00;FS=4.358;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=11.27;ReadPosRankSum=2.357;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1416,0,1210 chrVII 748014 . A G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.798;DP=138;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=4.9259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=-1.741;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.158;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1532,0,1392 chrVII 748214 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.556;DP=135;Dels=0.00;FS=2.191;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1569,0,1282 chrVII 748310 . A G 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2946,309,0 chrVII 748756 . C T 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3548,367,0 chrVII 748979 . T C 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3272,351,0 chrVII 749486 . C T 711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.241;DP=94;Dels=0.00;FS=4.080;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.713;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:94:99:741,0,1273 chrVII 749782 . T C 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.760;DP=142;Dels=0.00;FS=4.232;HaplotypeScore=3.7893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.502;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,50:142:99:875,0,2065 chrVII 752129 . A C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.613;DP=111;Dels=0.00;FS=3.699;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.623;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1136,0,1307 chrVII 754545 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.753;DP=113;Dels=0.00;FS=5.877;HaplotypeScore=2.3459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.618;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1150,0,1154 chrVII 754648 . C G 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.246;DP=139;Dels=0.00;FS=4.031;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.294;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1527,0,1251 chrVII 757758 . C G 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.361;DP=102;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1053,0,1010 chrVII 759905 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.841;DP=122;Dels=0.00;FS=22.231;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.734;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1278,0,1281 chrVII 760114 . A G 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.939;DP=150;Dels=0.00;FS=9.933;HaplotypeScore=3.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1617,0,1543 chrVII 760128 . G T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.479;DP=142;Dels=0.00;FS=3.981;HaplotypeScore=2.8290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.333;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1462,0,1482 chrVII 761743 . A G 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.521;DP=151;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.047;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1676,0,1501 chrVII 761980 . T C 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.627;DP=115;Dels=0.00;FS=6.045;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.951;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,43:115:99:786,0,1665 chrVII 762141 . C G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.477;DP=141;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.344;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1162,0,1617 chrVII 763543 . A G 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.563;DP=95;Dels=0.00;FS=2.671;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.093;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:889,0,1140 chrVII 763960 . T C 186.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.731;DP=153;Dels=0.00;FS=23.133;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.28;MQ0=8;MQRankSum=-1.648;QD=1.22;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,29:153:99:216,0,2486 chrVII 764377 . C G 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.716;DP=288;Dels=0.00;FS=8.353;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.393;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,60:288:99:849,0,5039 chrVII 764470 . A G 448.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.313;DP=234;Dels=0.00;FS=1.343;HaplotypeScore=5.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.74;MQ0=11;MQRankSum=-1.761;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.904;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,44:234:99:478,0,4131 chrVII 764644 . A G 384.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.192;DP=223;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.71;MQ0=66;MQRankSum=-0.126;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.194;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,56:223:99:414,0,2084 chrVII 764662 . G A 426.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.437;DP=232;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.35;MQ0=72;MQRankSum=-0.235;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,60:232:99:456,0,2014 chrVII 764689 . A G 951.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.136;DP=220;Dels=0.00;FS=4.809;HaplotypeScore=2.6496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.96;MQ0=69;MQRankSum=-1.377;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,94:220:99:981,0,1452 chrVII 764701 . A G 308.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.856;DP=198;Dels=0.00;FS=2.630;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.93;MQ0=64;MQRankSum=-0.719;QD=1.56;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-6.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,40:198:99:338,0,1924 chrVII 764826 . A T 71.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.077;DP=223;Dels=0.00;FS=36.416;HaplotypeScore=7.7798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.94;MQ0=2;MQRankSum=-0.636;QD=0.32;ReadPosRankSum=0.425;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,25:223:99:101,0,4387 chrVII 764935 . C T 416.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;DP=183;Dels=0.00;FS=38.675;HaplotypeScore=7.7296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.89;MQ0=20;MQRankSum=-0.481;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,39:183:99:446,0,2639 chrVII 764998 . T A 2405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.181;DP=248;Dels=0.00;FS=19.775;HaplotypeScore=28.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.52;MQ0=0;MQRankSum=2.548;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.241;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,127:248:99:2435,0,2257 chrVII 765005 . T A 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.447;DP=240;Dels=0.00;FS=12.955;HaplotypeScore=24.8233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.34;MQ0=0;MQRankSum=3.110;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.418;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,95:240:99:1882,0,2727 chrVII 766068 . A G 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.112;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.673;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1583,0,1533 chrVII 766129 . G A 1977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.215;DP=133;Dels=0.00;FS=5.564;HaplotypeScore=1.9861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.540;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,87:133:99:2007,0,739 chrVII 767034 . G A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.860;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1219,0,1540 chrVII 767249 . A G 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.722;DP=143;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=3.6832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.299;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1554,0,1454 chrVII 767304 . T C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.432;DP=126;Dels=0.00;FS=7.387;HaplotypeScore=3.3080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1242,0,1452 chrVII 767344 . C T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.130;DP=142;Dels=0.00;FS=6.981;HaplotypeScore=4.8671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.210;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1506,0,1505 chrVII 767458 . A T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.793;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1126,0,1153 chrVII 769305 . T A 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;DP=93;Dels=0.00;FS=2.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=10.30;ReadPosRankSum=2.249;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:988,0,1089 chrVII 769748 . A C 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.679;DP=144;Dels=0.00;FS=3.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1604,0,1483 chrVII 771068 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.519;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.051;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1292,0,1493 chrVII 771837 . A G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.194;DP=126;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=10.38;ReadPosRankSum=-2.210;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1338,0,1305 chrVII 773187 . C T 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.139;DP=115;Dels=0.00;FS=3.407;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.433;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1438,0,1097 chrVII 773594 . C G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;DP=122;Dels=0.00;FS=16.340;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1264,0,1186 chrVII 774486 . C T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.471;DP=108;Dels=0.00;FS=11.159;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.150;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:108:99:1345,0,953 chrVII 774950 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.747;DP=105;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.267;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1189,0,1016 chrVII 775204 . A G 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.303;DP=153;Dels=0.00;FS=5.624;HaplotypeScore=8.1143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.075;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1575,0,1803 chrVII 775301 . T C 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.554;DP=118;Dels=0.00;FS=6.706;HaplotypeScore=3.8933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1042,0,1473 chrVII 775320 . G A 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.982;DP=119;Dels=0.00;FS=4.944;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1137,0,1374 chrVII 775407 . G T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.964;DP=115;Dels=0.00;FS=10.639;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.884;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1212,0,1191 chrVII 776007 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.424;DP=112;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1172,0,1126 chrVII 777866 . A T 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;DP=91;Dels=0.00;FS=1.705;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:813,0,1190 chrVII 779080 . C G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.922;DP=122;Dels=0.00;FS=3.292;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.369;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1190,0,1317 chrVII 783929 . T C 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.333;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:122:99:1593,0,1037 chrVII 784494 . A G 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.433;DP=153;Dels=0.00;FS=2.030;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1503,0,1693 chrVII 784526 . G A 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.824;DP=157;Dels=0.00;FS=7.011;HaplotypeScore=8.6095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.849;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1657,0,1526 chrVII 784779 . G T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.446;DP=163;Dels=0.00;FS=8.051;HaplotypeScore=5.9114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=10.04;ReadPosRankSum=2.274;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1666,0,1827 chrVII 785199 . C T 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.683;DP=166;Dels=0.00;FS=7.389;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1697,0,1889 chrVII 785343 . G A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.730;DP=129;Dels=0.02;FS=2.508;HaplotypeScore=7.7965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.939;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1291,0,1262 chrVII 785945 . G T 4983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4244;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=27.08;SB=-2.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4983,475,0 chrVII 786402 . C T 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=152;Dels=0.00;FS=3.367;HaplotypeScore=2.9771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=25.24;ReadPosRankSum=1.504;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3837,360,0 chrVII 786669 . A G 4769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.10;SB=-2.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4769,498,0 chrVII 786698 . A G 4941.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.47;SB=-2.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:4941,507,0 chrVII 786726 . A G 4176.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4176,424,0 chrVII 786733 . C T 4835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.640;DP=188;Dels=0.00;FS=4.960;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.811;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,187:188:99:4835,447,0 chrVII 786848 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.228;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.562;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:1292,0,1798 chrVII 786858 . A C 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3591,363,0 chrVII 786976 . C A 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3560,360,0 chrVII 787089 . C T 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3358,331,0 chrVII 787302 . G A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.303;DP=113;Dels=0.00;FS=1.535;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.020;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1230,0,1079 chrVII 787546 . C T 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3300,334,0 chrVII 787750 . G A 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3293,333,0 chrVII 788083 . C T 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.111;DP=149;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.254;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1780,0,1377 chrVII 788249 . A T 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3184,322,0 chrVII 788427 . A G 2529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2562,270,0 chrVII 788472 . G A 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.902;DP=143;Dels=0.00;FS=4.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1305,0,1582 chrVII 788486 . T A 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=113.6753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.37;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3834,370,0 chrVII 788497 . T C 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.49;MQ0=0;QD=0.19;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:128:6:55,6,0 chrVII 788558 . T C 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.21;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2877,297,0 chrVII 788938 . A G 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=1;QD=24.69;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3654,381,0 chrVII 788947 . C T 3934.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3934,400,0 chrVII 789015 . C T 4020.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4020,400,0 chrVII 789213 . C T 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=27.00;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:3111,304,0 chrVII 789273 . A G 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3014,321,0 chrVII 789318 . G A 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3594,366,0 chrVII 789345 . C T 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3281,325,0 chrVII 789498 . C T 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3529,358,0 chrVII 789789 . T C 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3350,336,0 chrVII 789939 . C T 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2895,294,0 chrVII 789975 . A G 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:120:99:2999,312,0 chrVII 790041 . A G 4268.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.02;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4268,453,0 chrVII 790122 . G A 3933.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3933,397,0 chrVII 790684 . A G 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2833,294,0 chrVII 790861 . C T 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3489,352,0 chrVII 790909 . T C 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3544,363,0 chrVII 790915 . G A 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1869;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3701,370,0 chrVII 791092 . A T 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8928;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2929,291,0 chrVII 791137 . G A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.642;DP=103;Dels=0.00;FS=2.582;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.201;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1129,0,1030 chrVII 791235 . G C 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;DP=135;Dels=0.00;FS=2.190;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.152;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1516,0,1251 chrVII 791316 . T A 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.36;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2642,267,0 chrVII 791720 . A G 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.426;DP=152;Dels=0.00;FS=1.266;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.404;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1457,0,1794 chrVII 791734 . T C 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=23.34;SB=-2.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4061,414,0 chrVII 791799 . G A 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3322,334,0 chrVII 791887 . C T 4055.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4055,394,0 chrVII 791919 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.019;DP=139;Dels=0.00;FS=8.953;HaplotypeScore=2.9495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1298,0,1634 chrVII 791920 . A G 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9495;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3719,393,0 chrVII 792001 . T G 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3647,375,0 chrVII 792094 . C T 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:3008,307,0 chrVII 792224 . G C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.587;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.536;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1264,0,1473 chrVII 792484 . A T 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.977;DP=139;Dels=0.01;FS=8.899;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=1;MQRankSum=-0.852;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.510;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1438,0,1606 chrVII 792731 . G A 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3746,379,0 chrVII 792927 . T C 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.528;DP=142;Dels=0.00;FS=9.078;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.080;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1499,0,1438 chrVII 792997 . A C 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3569,366,0 chrVII 793207 . C A 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8280;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3629,366,0 chrVII 793218 . G A 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.521;DP=116;Dels=0.00;FS=2.456;HaplotypeScore=8.5327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.306;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,45:116:99:932,0,1584 chrVII 793300 . C T 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3042,310,0 chrVII 793301 . A T 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.211;DP=133;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=4.9637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=23.04;ReadPosRankSum=1.159;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3097,310,0 chrVII 793585 . G C 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3276,339,0 chrVII 793612 . A C 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.90;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3063,312,0 chrVII 793703 . A G 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.05;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3318,345,0 chrVII 793785 . T C 2359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4658;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.60;MQ0=1;QD=25.37;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2392,243,0 chrVII 793906 . C T 394 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.16;MQ0=0;QD=6.25;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:48:427,48,0 chrVII 793952 . G A 1750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=16.83;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:1783,183,0 chrVII 793963 . C T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.519;DP=107;Dels=0.00;FS=6.252;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1082,0,892 chrVII 794027 . C T 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3478,337,0 chrVII 794041 . T C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=25.67;ReadPosRankSum=1.627;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3389,348,0 chrVII 794286 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.160;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.160;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1001,0,1245 chrVII 794396 . C T 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.504;DP=130;Dels=0.00;FS=3.169;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1282,0,1425 chrVII 794497 . A G 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.765;DP=101;Dels=0.00;FS=9.636;HaplotypeScore=39.7575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.052;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:783,0,1287 chrVII 794535 . C T 611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.780;DP=86;Dels=0.00;FS=4.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.048;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,36:86:99:641,0,1068 chrVII 794605 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.443;DP=124;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.304;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1135,0,1517 chrVII 794614 . C A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.893;DP=127;Dels=0.00;FS=3.198;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.469;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1160,0,1530 chrVII 794620 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.369;DP=125;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.913;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.002;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1229,0,1448 chrVII 794838 . A G 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.561;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=9.87;ReadPosRankSum=-2.002;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1175,0,1306 chrVII 794890 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.738;DP=116;Dels=0.00;FS=7.102;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.143;QD=10.68;ReadPosRankSum=2.021;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1269,0,1264 chrVII 794912 . C T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.145;DP=99;Dels=0.00;FS=14.585;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.062;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1151,0,973 chrVII 794971 . T C 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.969;DP=101;Dels=0.00;FS=2.568;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.681;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:818,0,1290 chrVII 795142 . C T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3405,343,0 chrVII 795163 . T C 4005.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:4005,406,0 chrVII 795193 . G A 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.858e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3315,316,0 chrVII 795501 . A G 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4041,408,0 chrVII 795589 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.270;DP=136;Dels=0.00;FS=3.242;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.428;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1270,0,1616 chrVII 795705 . G A 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.910;DP=79;Dels=0.00;FS=5.803;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.034;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:899,0,812 chrVII 795743 . T A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;DP=97;Dels=0.00;FS=6.977;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.393;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1031,0,1050 chrVII 795856 . C T 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.460;DP=155;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=3.2923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1739,0,1555 chrVII 795876 . T G 4043.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4043,426,0 chrVII 795956 . T C 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3645,384,0 chrVII 796056 . A G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.761;DP=109;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1107,0,1135 chrVII 796187 . G A 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3678,367,0 chrVII 796217 . T G 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3427,363,0 chrVII 796263 . A G 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3418,372,0 chrVII 796264 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.625;DP=133;Dels=0.00;FS=6.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:1074,0,1833 chrVII 796304 . G A 3930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3930,391,0 chrVII 796396 . G A 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3700,376,0 chrVII 796413 . G T 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3615,364,0 chrVII 796494 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.148;DP=141;Dels=0.00;FS=1.327;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.937;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1381,0,1543 chrVII 796516 . A G 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3254,354,0 chrVII 797305 . T C 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2828,300,0 chrVII 797326 . A G 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2960,324,0 chrVII 797329 . C T 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3191,325,0 chrVII 797667 . G A 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3910,391,0 chrVII 797697 . G T 4094.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4094,403,0 chrVII 797776 . A G 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3446,357,0 chrVII 797870 . G C 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=22.70;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3382,351,0 chrVII 797989 . C T 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=28.61;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3634,367,0 chrVII 798002 . T C 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.357;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.720;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,52:128:99:1025,0,1801 chrVII 798046 . T C 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3571,384,0 chrVII 798196 . A G 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3492,363,0 chrVII 798399 . T C 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.559;DP=167;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.197;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:1738,0,1785 chrVII 799244 . T C 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3355,351,0 chrVII 799451 . C T 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3391,349,0 chrVII 799595 . A G 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2932,303,0 chrVII 799613 . G A 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2878,288,0 chrVII 799658 . T A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.333;DP=116;Dels=0.00;FS=5.832;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.615;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:956,0,1615 chrVII 799766 . C T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.999;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.469;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:137:99:1408,0,1425 chrVII 799904 . C T 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.03;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3087,309,0 chrVII 800053 . G A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.863;DP=130;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.797;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1359,0,1305 chrVII 800250 . T C 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3644,366,0 chrVII 800289 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.206;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1351,0,1312 chrVII 801604 . C T 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3171,321,0 chrVII 801751 . T C 2246 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:2279,249,0 chrVII 802060 . G T 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2818,282,0 chrVII 802496 . G A 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2650,267,0 chrVII 802512 . G A 2728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2761,276,0 chrVII 802532 . T C 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2771,300,0 chrVII 802550 . A G 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2567,279,0 chrVII 802619 . C T 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2932,294,0 chrVII 802712 . G A 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2839,276,0 chrVII 802784 . A G 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2893,321,0 chrVII 802790 . G A 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3189,328,0 chrVII 802832 . G T 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3742,384,0 chrVII 803006 . C T 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.101;DP=130;Dels=0.00;FS=3.193;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.372;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1723,0,1046 chrVII 803009 . T C 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3489,366,0 chrVII 803036 . T A 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3199,324,0 chrVII 803156 . C T 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3602,358,0 chrVII 803294 . G A 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.604;DP=129;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.012;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1617,0,1203 chrVII 803488 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.955;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1309,0,1495 chrVII 803574 . A G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.279;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.112;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1016,0,1432 chrVII 803618 . T C 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2890,294,0 chrVII 803660 . G A 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3476,349,0 chrVII 803802 . C T 4053.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4053,406,0 chrVII 803825 . T C 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3396,357,0 chrVII 803918 . C T 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2778,271,0 chrVII 803987 . C T 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3751,373,0 chrVII 804353 . T C 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3581,375,0 chrVII 804429 . G A 4162.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4162,412,0 chrVII 804767 . T C 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=22.81;SB=-2.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:3900,408,0 chrVII 804812 . A G 3901.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;DP=152;Dels=0.00;FS=4.829;HaplotypeScore=3.9705;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=25.66;ReadPosRankSum=1.003;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3901,432,0 chrVII 804950 . C T 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3642,367,0 chrVII 805132 . A C 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3364,369,0 chrVII 805202 . G A 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.43;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3813,385,0 chrVII 805410 . G T 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=21.92;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2641,267,0 chrVII 805540 . A G 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;QD=25.21;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2983,324,0 chrVII 805798 . G C 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4076,435,0 chrVII 806101 . G T 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.181;DP=132;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.794;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,77:132:99:1745,0,1085 chrVII 806255 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.570;DP=125;Dels=0.00;FS=2.309;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1248,0,1174 chrVII 806778 . A G 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.701;DP=158;Dels=0.00;FS=1.249;HaplotypeScore=6.5422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1543,0,1695 chrVII 806826 . A G 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.348;DP=131;Dels=0.00;FS=4.165;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.146;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1500,0,1199 chrVII 806961 . C T 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.171;DP=149;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.078;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:1899,0,1289 chrVII 807249 . A G 665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.814;DP=97;Dels=0.00;FS=3.950;HaplotypeScore=2.5849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.232;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,38:97:99:695,0,1326 chrVII 807532 . G T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.345;DP=111;Dels=0.00;FS=8.858;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1285,0,1058 chrVII 807533 . A C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.436;DP=111;Dels=0.00;FS=8.858;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.152;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1224,0,1127 chrVII 807574 . A G 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.745;DP=139;Dels=0.00;FS=3.065;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.748;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1372,0,1442 chrVII 807662 . T A 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=24.70;SB=-2.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3779,393,0 chrVII 807712 . G A 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.050;DP=150;Dels=0.00;FS=6.279;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.218;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1586,0,1517 chrVII 807738 . C T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.841;DP=147;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=7.5080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.705;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:147:99:1483,0,1518 chrVII 807765 . G T 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.347;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5230;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=24.82;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,118:120:99:3011,286,0 chrVII 807885 . G A 66.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.373;DP=117;Dels=0.03;FS=208.677;HaplotypeScore=51.1791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=0.56;ReadPosRankSum=-4.442;SB=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,27:114:96:96,0,299 chrVII 807906 . C T 277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.646;DP=108;Dels=0.00;FS=4.603;HaplotypeScore=15.1490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:108:99:307,0,385 chrVII 807938 . G A 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.179;DP=118;Dels=0.00;FS=3.442;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.513;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:905,0,981 chrVII 807996 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.252;DP=142;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.395;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1299,0,1591 chrVII 808049 . G A 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.517;DP=116;Dels=0.00;FS=2.539;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.391;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:861,0,1400 chrVII 808061 . G A 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.321;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.194;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.349;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:940,0,1604 chrVII 808065 . T G 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.558;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:792,0,1421 chrVII 808074 . A G 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.038;DP=117;Dels=0.00;FS=2.678;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.119;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:863,0,1405 chrVII 808093 . C G 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.492;DP=109;Dels=0.00;FS=11.373;HaplotypeScore=4.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.785;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:791,0,1348 chrVII 808199 . G T 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.136;DP=112;Dels=0.00;FS=4.775;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.961;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:880,0,1394 chrVII 808200 . A G 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.192;DP=114;Dels=0.00;FS=6.015;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.304;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.557;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:876,0,1453 chrVII 808247 . T C 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.065;DP=113;Dels=0.00;FS=10.932;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.130;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:968,0,1259 chrVII 808336 . T C 1791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=23.57;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1824,189,0 chrVII 808348 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.700;DP=79;Dels=0.00;FS=4.910;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=13.54;ReadPosRankSum=-2.031;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,52:79:99:1100,0,490 chrVII 808482 . T G 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.372;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=39.6268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=0.23;ReadPosRankSum=-1.508;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:55:55,0,1159 chrVII 808622 . T C 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.762;DP=129;Dels=0.00;FS=5.857;HaplotypeScore=2.7778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,80:129:99:1727,0,1008 chrVII 808820 . G A 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2760,270,0 chrVII 809259 . C A 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.800;DP=144;Dels=0.00;FS=2.107;HaplotypeScore=2.2100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.152;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1757,0,1295 chrVII 809363 . C T 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.024;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.562;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1547,0,1436 chrVII 809504 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.148;DP=153;Dels=0.00;FS=7.151;HaplotypeScore=7.9509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.321;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:153:99:1373,0,1852 chrVII 809640 . G T 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.150;DP=160;Dels=0.00;FS=9.546;HaplotypeScore=13.1279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1718,0,1620 chrVII 810028 . A C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.688;DP=133;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=7.2916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.070;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1235,0,1334 chrVII 810308 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.704;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:134:99:1378,0,1228 chrVII 810319 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.024;DP=125;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.644;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1185,0,1282 chrVII 810523 . T C 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3036,312,0 chrVII 810538 . C T 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.375;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1137,0,1167 chrVII 810717 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.755;DP=127;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=4.9560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.363;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,50:127:99:946,0,1609 chrVII 810721 . T C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.960;DP=134;Dels=0.00;FS=2.266;HaplotypeScore=4.9560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.922;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:900,0,1805 chrVII 810738 . T C 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.259;DP=137;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.206;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,53:137:99:898,0,1878 chrVII 810776 . C T 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.519;DP=105;Dels=0.00;FS=9.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:943,0,1261 chrVII 810921 . T C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.581;DP=89;Dels=0.00;FS=2.815;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.745;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:914,0,828 chrVII 810987 . A G 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.407;DP=141;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=2.5922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1655,0,1241 chrVII 811099 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.115;DP=127;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1353,0,1356 chrVII 811192 . C T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.674;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.812;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1110,0,1174 chrVII 811300 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.432;DP=103;Dels=0.00;FS=1.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.94;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1167,0,1052 chrVII 811341 . T C 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.413;DP=100;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:907,0,1181 chrVII 811447 . T A 23.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;DP=18;Dels=0.00;FS=8.820;HaplotypeScore=9.6185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.72;MQ0=1;MQRankSum=3.166;QD=1.29;ReadPosRankSum=-2.965;SB=-9.406e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:13:53,0,13 chrVII 823409 . T G 664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.861;DP=113;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.64;MQ0=2;MQRankSum=-1.058;QD=5.88;ReadPosRankSum=-2.523;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,45:113:99:694,0,1386 chrVII 823433 . T G 863.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.063;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=3.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.35;MQ0=0;MQRankSum=-4.128;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.749;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:893,0,1474 chrVII 823436 . C A 904.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.535;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.37;MQ0=0;MQRankSum=-4.643;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:934,0,1503 chrVII 823442 . A T 947.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;DP=130;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=7.5831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.46;MQ0=0;MQRankSum=-5.778;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.073;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:130:99:977,0,1592 chrVII 823443 . C G 898.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;DP=132;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=7.5831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.51;MQ0=0;MQRankSum=-5.866;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.488;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:928,0,1556 chrVII 823611 . T G 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.228;DP=145;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.694;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1440,0,1591 chrVII 823615 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.311;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQ0=0;MQRankSum=2.416;QD=10.25;ReadPosRankSum=-2.416;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1455,0,1513 chrVII 823674 . A G 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.083;DP=154;Dels=0.00;FS=5.869;HaplotypeScore=2.9212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=3.627;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1649,0,1704 chrVII 824079 . C A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.623;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.173;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,60:154:99:1172,0,1887 chrVII 824136 . C T 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.987;DP=149;Dels=0.00;FS=3.991;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.273;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,58:149:99:1115,0,1844 chrVII 824168 . C A 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.372;DP=127;Dels=0.00;FS=11.498;HaplotypeScore=4.5509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,49:127:99:932,0,1661 chrVII 826152 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.315;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1274,0,1827 chrVII 826599 . G A 1925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.435;DP=155;Dels=0.00;FS=4.880;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.600;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,87:155:99:1955,0,1306 chrVII 827331 . C A 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.469;DP=107;Dels=0.00;FS=0.849;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1367,0,1010 chrVII 827509 . G C 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.556;DP=125;Dels=0.00;FS=1.641;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.757;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1458,0,1178 chrVII 827544 . C T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.064;DP=121;Dels=0.00;FS=2.354;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.581;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1387,0,1207 chrVII 827791 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.320;DP=139;Dels=0.00;FS=3.157;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=2.273;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1431,0,1518 chrVII 827996 . T C 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.237;DP=135;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:135:99:1483,0,1309 chrVII 828031 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.452;DP=118;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=5.3435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.538;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.557;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1272,0,1253 chrVII 828034 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.346;DP=118;Dels=0.00;FS=1.542;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.563;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1298,0,1280 chrVII 828517 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.833;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1269,0,1263 chrVII 828662 . C T 1823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.069;DP=150;Dels=0.01;FS=2.074;HaplotypeScore=7.8754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=2.188;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.686;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1853,0,1341 chrVII 828816 . A T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.307;DP=129;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1242,0,1588 chrVII 828825 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.940;DP=129;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1172,0,1552 chrVII 828863 . C A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.477;DP=140;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=2.4673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1331,0,1602 chrVII 829194 . T G 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.301;DP=147;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1678,0,1453 chrVII 829589 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.098;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1502,0,1011 chrVII 829617 . G A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.839;DP=138;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1658,0,1154 chrVII 829683 . A G 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.501;DP=135;Dels=0.00;FS=5.785;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.213;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,79:135:99:1583,0,1173 chrVII 829847 . C T 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.264;DP=118;Dels=0.00;FS=3.788;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1186,0,1312 chrVII 829946 . G C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;DP=112;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.241;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1317,0,1003 chrVII 829998 . A G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.339;DP=143;Dels=0.00;FS=15.780;HaplotypeScore=11.4823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=10.71;ReadPosRankSum=2.292;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1561,0,1403 chrVII 830281 . G A 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.363;DP=90;Dels=0.00;FS=1.819;HaplotypeScore=3.3171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,50:90:99:1137,0,792 chrVII 830428 . G A 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.460;DP=123;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.352;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1367,0,1169 chrVII 830676 . G A 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.243;DP=125;Dels=0.00;FS=5.455;HaplotypeScore=5.7698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.768;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1169,0,1376 chrVII 830690 . T C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.720;DP=102;Dels=0.00;FS=3.704;HaplotypeScore=6.9348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.880;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1033,0,1101 chrVII 830766 . A C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;DP=106;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.940;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1186,0,1047 chrVII 830771 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.489;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.177;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1187,0,1023 chrVII 830787 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.329;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.812;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1209,0,1034 chrVII 830921 . A G 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.260;DP=164;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=2.7476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=-0.954;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,92:164:99:1720,0,1576 chrVII 830992 . G A 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.745;DP=135;Dels=0.00;FS=7.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=1;MQRankSum=0.396;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.095;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1721,0,1157 chrVII 831041 . A G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.017;DP=102;Dels=0.00;FS=7.840;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.505;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1140,0,1067 chrVII 831108 . G A 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.107;DP=99;Dels=0.00;FS=1.711;HaplotypeScore=3.3522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.202;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:986,0,1097 chrVII 831241 . C T 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=100;Dels=0.00;FS=0.902;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.480;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:987,0,1116 chrVII 831291 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.896;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.203;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:119:99:1341,0,1168 chrVII 831330 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.146;DP=113;Dels=0.00;FS=2.797;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.565;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1181,0,1225 chrVII 831597 . C T 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.811;DP=87;Dels=0.00;FS=6.995;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,48:87:99:1018,0,811 chrVII 831698 . G C 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.641;DP=101;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=2.1766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.595;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:951,0,1105 chrVII 832073 . C T 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.952;DP=81;Dels=0.00;FS=1.830;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.449;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:844,0,790 chrVII 832077 . T C 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.540;DP=83;Dels=0.00;FS=3.008;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.116;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,45:83:99:926,0,832 chrVII 832116 . T C 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.600;DP=79;Dels=0.00;FS=13.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.192;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,43:79:99:898,0,799 chrVII 832207 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.174;DP=128;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1397,0,1284 chrVII 832717 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.652;DP=136;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=2.4658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1106,0,1602 chrVII 832782 . T C 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.418;DP=120;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=1.753;QD=7.28;ReadPosRankSum=-2.218;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:120:99:904,0,1423 chrVII 832890 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.913;DP=113;Dels=0.00;FS=9.306;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1232,0,1094 chrVII 833104 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.391;DP=126;Dels=0.00;FS=4.441;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=11.40;ReadPosRankSum=2.555;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1466,0,1152 chrVII 833158 . A C 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.403;DP=129;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=5.7752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=10.80;ReadPosRankSum=-2.033;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:1423,0,1033 chrVII 833212 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.048;DP=106;Dels=0.00;FS=3.726;HaplotypeScore=4.5107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.169;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:106:99:1274,0,925 chrVII 833214 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.219;DP=108;Dels=0.00;FS=3.726;HaplotypeScore=4.5107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.316;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:108:99:1194,0,950 chrVII 833472 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.495;DP=123;Dels=0.00;FS=1.431;HaplotypeScore=4.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.363;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1239,0,1346 chrVII 833529 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.125;DP=118;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=1;MQRankSum=0.237;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.431;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1335,0,1148 chrVII 833622 . A T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;DP=144;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1492,0,1573 chrVII 833760 . C G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.408;DP=125;Dels=0.00;FS=2.684;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.532;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1173,0,1482 chrVII 833792 . C T 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.249;DP=146;Dels=0.00;FS=5.409;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.341;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1575,0,1523 chrVII 833796 . G A 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3875,385,0 chrVII 833804 . C A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.389;DP=139;Dels=0.00;FS=3.207;HaplotypeScore=3.8731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1450,0,1306 chrVII 833865 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.192;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1075,0,1184 chrVII 833973 . T C 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.822;DP=101;Dels=0.00;FS=8.141;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.277;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:896,0,1282 chrVII 834003 . C T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.157;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:127:99:1211,0,1338 chrVII 834032 . A T 790.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.792;DP=148;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=10.6738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:820,0,1263 chrVII 834033 . A T 820.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;DP=149;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=10.6738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:850,0,1265 chrVII 834034 . T A 1190.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.253;DP=148;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=10.6738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.903;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1220,0,878 chrVII 834078 . G A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.454;DP=136;Dels=0.00;FS=6.065;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.297;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:136:99:1122,0,1492 chrVII 834267 . G A 4096.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=28.25;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4096,418,0 chrVII 834404 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.965;DP=127;Dels=0.00;FS=7.158;HaplotypeScore=2.7468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1182,0,1428 chrVII 834413 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.526;DP=152;Dels=0.00;FS=10.257;HaplotypeScore=6.8376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.511;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1444,0,1699 chrVII 834807 . T C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.320;DP=101;Dels=0.00;FS=6.357;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.117;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1029,0,1112 chrVII 834852 . C T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.658;DP=126;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.554;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1342,0,1325 chrVII 834860 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.737;DP=126;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.139;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1260,0,1427 chrVII 834928 . T C 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.90;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2778,288,0 chrVII 835147 . T C 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3015,315,0 chrVII 835244 . C T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.488;DP=125;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=2.5608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1197,0,1390 chrVII 835248 . T C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.482;DP=130;Dels=0.00;FS=2.239;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.789;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1463,0,1290 chrVII 835424 . A T 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.704;DP=172;Dels=0.00;FS=1.895;HaplotypeScore=4.7610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,79:172:99:1653,0,2014 chrVII 835436 . T G 1866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;DP=165;Dels=0.00;FS=3.641;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.482;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,92:165:99:1896,0,1530 chrVII 835531 . C T 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.727;DP=139;Dels=0.00;FS=6.547;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1667,0,1363 chrVII 835894 . T G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=111;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.947;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1333,0,1094 chrVII 836029 . T C 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.140;DP=127;Dels=0.00;FS=12.270;HaplotypeScore=65.4323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.693;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1420,0,1270 chrVII 836201 . T G 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.339;DP=168;Dels=0.00;FS=1.917;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.802;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:168:99:1790,0,1720 chrVII 836443 . T C 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.425;DP=84;Dels=0.00;FS=4.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:882,0,906 chrVII 836910 . A G 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.373;DP=118;Dels=0.00;FS=3.654;HaplotypeScore=7.0119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.158;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:721,0,1363 chrVII 837113 . T C 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.505;DP=106;Dels=0.00;FS=2.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:777,0,1550 chrVII 837183 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.087;DP=127;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=3.9125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=1.520;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.560;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1268,0,1408 chrVII 837339 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.482;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.109;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.877;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1270,0,1557 chrVII 837417 . T C 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.977;DP=127;Dels=0.00;FS=5.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,51:127:99:913,0,1658 chrVII 837444 . G T 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.066;DP=137;Dels=0.00;FS=11.735;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1265,0,1569 chrVII 837489 . G T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.727;DP=140;Dels=0.00;FS=14.730;HaplotypeScore=3.6337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=1;MQRankSum=-1.914;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.267;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:140:99:1440,0,1411 chrVII 837741 . A G 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.648;DP=124;Dels=0.00;FS=2.337;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1549,0,1041 chrVII 837778 . G A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.895;DP=117;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=2.611;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.077;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,75:117:99:1676,0,816 chrVII 837786 . A G 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.662;DP=110;Dels=0.00;FS=3.843;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.335;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.158;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,73:110:99:1629,0,726 chrVII 837909 . C T 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3362,339,0 chrVII 838145 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.035;DP=123;Dels=0.00;FS=8.150;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.668;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1266,0,1229 chrVII 838381 . G A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.837;DP=143;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=5.8807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1408,0,1658 chrVII 838490 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.922;DP=122;Dels=0.00;FS=5.555;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1094,0,1605 chrVII 838500 . A C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.287;DP=121;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1069,0,1522 chrVII 838632 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.110;DP=140;Dels=0.00;FS=1.341;HaplotypeScore=3.1800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:140:99:1241,0,1642 chrVII 838743 . G A 773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.656;DP=102;Dels=0.00;FS=7.415;HaplotypeScore=2.4595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.425;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,41:102:99:803,0,1353 chrVII 839088 . G A 1934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.739;DP=161;Dels=0.00;FS=11.270;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.419;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,87:161:99:1964,0,1579 chrVII 839538 . T A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.943;DP=130;Dels=0.00;FS=4.219;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=8.93;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1191,0,1620 chrVII 839652 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.597;DP=138;Dels=0.00;FS=1.438;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1359,0,1480 chrVII 839712 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.772;DP=99;Dels=0.00;FS=5.216;HaplotypeScore=3.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=11.09;ReadPosRankSum=-2.393;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1128,0,937 chrVII 839937 . G A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.409;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.257;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.339;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1623,0,1331 chrVII 840315 . C T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.988;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1486,0,1526 chrVII 840381 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.316;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1452,0,1559 chrVII 840622 . A G 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.734;DP=109;Dels=0.00;FS=4.640;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.028;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:873,0,419 chrVII 840681 . G A 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.637;DP=131;Dels=0.00;FS=5.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=0.532;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.414;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1595,0,1134 chrVII 840852 . T G 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.074;DP=121;Dels=0.00;FS=3.417;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.430;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1301,0,1180 chrVII 841068 . T G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.266;DP=155;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=3.4365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1323,0,1869 chrVII 841352 . A G 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.839;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.577;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:784,0,564 chrVII 841664 . T C 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.825;DP=125;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.259;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1047,0,1431 chrVII 841665 . C T 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.251;DP=122;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.929;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1069,0,1314 chrVII 841693 . A G 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.527;DP=124;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1119,0,1339 chrVII 842090 . G A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.085;DP=89;Dels=0.00;FS=5.673;HaplotypeScore=3.7156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.907;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:1014,0,850 chrVII 842206 . T C 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3058,318,0 chrVII 842218 . T C 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.736;DP=112;Dels=0.00;FS=2.500;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:999,0,1320 chrVII 842447 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.959;DP=111;Dels=0.00;FS=2.494;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1358,0,966 chrVII 842495 . C T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.852;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1111,0,841 chrVII 842514 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.531;DP=131;Dels=0.00;FS=2.262;HaplotypeScore=6.1029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQ0=1;MQRankSum=-1.057;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.219;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1381,0,1279 chrVII 842531 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.864;DP=140;Dels=0.00;FS=7.711;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=1;MQRankSum=-1.861;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.339;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1470,0,1283 chrVII 842565 . C T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.664;DP=119;Dels=0.00;FS=19.245;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.14;MQ0=1;MQRankSum=-1.733;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.603;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1281,0,1199 chrVII 842582 . T G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.478;DP=126;Dels=0.00;FS=8.649;HaplotypeScore=3.8880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=1;MQRankSum=-2.131;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1165,0,1380 chrVII 842585 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.480;DP=129;Dels=0.00;FS=7.237;HaplotypeScore=3.2229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQ0=1;MQRankSum=-3.654;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.555;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1221,0,1372 chrVII 842605 . A C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.163;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.373;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.114;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1209,0,1464 chrVII 842710 . C G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.162;DP=154;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.655;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1409,0,1756 chrVII 843110 . G A 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3229,331,0 chrVII 843118 . A G 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.873;DP=117;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1471,0,1067 chrVII 843390 . G C 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3335,354,0 chrVII 843717 . T C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.639;DP=128;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=3;MQRankSum=0.244;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1243,0,1340 chrVII 844261 . A C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2976,306,0 chrVII 844377 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.368;DP=110;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.202;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:918,0,1445 chrVII 844451 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.320;DP=116;Dels=0.00;FS=4.549;HaplotypeScore=4.7055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.380;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1341,0,1094 chrVII 844489 . T C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.775;DP=102;Dels=0.00;FS=7.842;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.128;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:998,0,1116 chrVII 844768 . A G 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.643;DP=103;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=3.6350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:103:99:877,0,1268 chrVII 844977 . T C 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.326;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.008;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1582,0,1421 chrVII 844986 . C T 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.617;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.590;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1584,0,1264 chrVII 845298 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.502;DP=116;Dels=0.00;FS=7.140;HaplotypeScore=52.9439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.909;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1204,0,1257 chrVII 845570 . T G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.004;DP=124;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=5.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.387;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1113,0,1463 chrVII 845584 . T G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.265;DP=119;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.031;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1142,0,1369 chrVII 845605 . A G 858.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.117;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.196;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.494;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:888,0,1421 chrVII 845612 . C T 759.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.621;DP=90;Dels=0.00;FS=1.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.239;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.216;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,38:90:99:789,0,1097 chrVII 845614 . C A 2439 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:95:99:2472,249,0 chrVII 845774 . G A 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.618;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.654;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:705,0,1156 chrVII 845775 . T C 677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.489;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.508;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:707,0,1245 chrVII 845801 . T C 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.883;DP=103;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.923;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:885,0,1309 chrVII 845834 . C A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.417;DP=112;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1231,0,1090 chrVII 845902 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.423;DP=94;Dels=0.00;FS=1.712;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=12.70;ReadPosRankSum=-2.525;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,55:94:99:1224,0,729 chrVII 845918 . A C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.516;DP=100;Dels=0.00;FS=2.673;HaplotypeScore=3.5098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.865;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,61:100:99:1203,0,811 chrVII 846025 . C T 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.506;DP=102;Dels=0.00;FS=2.544;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.309;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:942,0,1129 chrVII 846115 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.431;DP=128;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.109;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1518,0,1090 chrVII 846304 . T C 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.492;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.343;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:896,0,1104 chrVII 846377 . G A 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.334;DP=90;Dels=0.00;FS=0.801;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.628;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,41:90:99:827,0,1052 chrVII 846385 . A G 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.689;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.726;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:962,0,1191 chrVII 846397 . G C 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.701;DP=94;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:901,0,962 chrVII 846529 . C T 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3259,328,0 chrVII 846611 . T G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.204;DP=130;Dels=0.00;FS=4.447;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.531;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1300,0,1438 chrVII 846613 . A C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.033;DP=128;Dels=0.00;FS=8.636;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.062;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.822;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1301,0,1448 chrVII 846634 . A G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.175;DP=131;Dels=0.00;FS=7.233;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1252,0,1474 chrVII 846696 . T C 679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.209;DP=89;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-5.789;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.792;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:709,0,980 chrVII 846715 . T C 608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.907;DP=81;Dels=0.00;FS=1.821;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-4.681;QD=7.51;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:638,0,917 chrVII 846724 . A G 372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.193;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.88;MQ0=0;MQRankSum=-6.206;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:402,0,818 chrVII 846740 . A T 428.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;DP=69;Dels=0.00;FS=0.939;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-6.133;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.173;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:458,0,914 chrVII 846741 . A G 400.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.407;DP=69;Dels=0.00;FS=0.939;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-5.622;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.307;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,29:69:99:430,0,917 chrVII 846746 . C T 658.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.846;DP=85;Dels=0.00;FS=5.891;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-4.537;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.287;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,39:85:99:688,0,967 chrVII 846750 . G A 802.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.085;DP=100;Dels=0.00;FS=7.094;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQ0=0;MQRankSum=-3.939;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.660;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:832,0,1121 chrVII 846917 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.992;DP=137;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=3.8142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.283;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1298,0,1495 chrVII 846930 . T C 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.771;DP=135;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=7.7815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.624;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1147,0,1539 chrVII 846945 . C T 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.505;DP=104;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.065;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:931,0,1226 chrVII 846990 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.968;DP=111;Dels=0.00;FS=3.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1174,0,1198 chrVII 847077 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.673;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1060,0,1155 chrVII 847143 . G A 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.432;DP=102;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=5.4986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1091,0,1038 chrVII 847197 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.905;DP=91;Dels=0.00;FS=5.328;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.100;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1138,0,831 chrVII 847338 . T A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.950;DP=116;Dels=0.00;FS=17.241;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=9.65;ReadPosRankSum=2.007;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1149,0,1271 chrVII 847392 . A G 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.779;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1054,0,1584 chrVII 847512 . A G 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.003;DP=118;Dels=0.00;FS=4.514;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.197;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1310,0,1108 chrVII 847754 . C A 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.810;DP=161;Dels=0.00;FS=8.373;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=10.80;ReadPosRankSum=2.003;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1769,0,1685 chrVII 847921 . G A 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.722;DP=170;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=5.7012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,81:170:99:1788,0,1860 chrVII 848688 . A G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.672;DP=135;Dels=0.00;FS=5.655;HaplotypeScore=4.6410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.913;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:135:99:1271,0,1542 chrVII 848696 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.514;DP=139;Dels=0.00;FS=3.117;HaplotypeScore=5.1578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1349,0,1306 chrVII 848849 . C T 1879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.476;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.124;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,92:178:99:1909,0,1619 chrVII 849134 . C G 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3984,414,0 chrVII 849250 . C A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.063;DP=129;Dels=0.00;FS=9.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1263,0,1456 chrVII 849405 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.131;DP=161;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=2.3839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.478;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,62:161:99:1086,0,2209 chrVII 849423 . C T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.317;DP=166;Dels=0.00;FS=8.041;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,67:166:99:1294,0,2088 chrVII 849504 . A G 1922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.788;DP=176;Dels=0.00;FS=6.675;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=10.92;ReadPosRankSum=-2.558;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,94:176:99:1952,0,1763 chrVII 849524 . G C 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.731;DP=171;Dels=0.00;FS=4.579;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,89:171:99:1537,0,1668 chrVII 849571 . C G 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.586;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1640,0,1262 chrVII 849599 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.621;DP=161;Dels=0.00;FS=1.325;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.256;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,74:161:99:1451,0,1911 chrVII 849600 . A G 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.476;DP=162;Dels=0.00;FS=2.117;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,89:162:99:1848,0,1551 chrVII 849759 . T C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.779;DP=122;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=3.1800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.243;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,73:122:99:1468,0,957 chrVII 849971 . G C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.128;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.605;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1325,0,1394 chrVII 850247 . C G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;DP=175;Dels=0.00;FS=1.913;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.312;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,75:175:99:1428,0,2157 chrVII 850524 . T C 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.015;DP=137;Dels=0.00;FS=7.624;HaplotypeScore=3.3727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.574;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1432,0,1456 chrVII 850549 . T C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.655;DP=146;Dels=0.00;FS=4.253;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.456;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1466,0,1721 chrVII 850592 . C A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.433;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.804;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1468,0,1520 chrVII 850641 . T C 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.924;DP=152;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=5.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.269;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1486,0,1725 chrVII 850794 . T C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.204;DP=154;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=135.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.465;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,65:154:99:1124,0,1930 chrVII 850923 . T C 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.865;DP=161;Dels=0.02;FS=6.569;HaplotypeScore=30.6542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.983;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,82:158:99:1683,0,1617 chrVII 851062 . G A 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.608;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=1;MQRankSum=-0.260;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,86:174:99:1730,0,1753 chrVII 851197 . T G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.031;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=8.20;ReadPosRankSum=2.475;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1137,0,1476 chrVII 851656 . C G 773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;DP=87;Dels=0.00;FS=5.493;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.149;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:803,0,941 chrVII 851746 . G A 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.693;DP=101;Dels=0.00;FS=3.953;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.700;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:843,0,1249 chrVII 851801 . A G 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2490,264,0 chrVII 851827 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.753;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.245;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1346,0,1035 chrVII 851899 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.069;DP=131;Dels=0.00;FS=5.920;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.618;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1121,0,1586 chrVII 851923 . C A 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.187;DP=117;Dels=0.00;FS=1.547;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1025,0,1359 chrVII 851981 . C T 751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.965;DP=104;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.578;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:104:99:781,0,1417 chrVII 852002 . A G 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3001,312,0 chrVII 852034 . A G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.366;DP=113;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.481;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1060,0,1354 chrVII 852119 . G A 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.923;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.738;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:812,0,955 chrVII 852133 . C T 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.705;DP=87;Dels=0.00;FS=1.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,47:87:99:1038,0,762 chrVII 852310 . C T 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.186;DP=152;Dels=0.00;FS=3.822;HaplotypeScore=4.5524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.398;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1588,0,1514 chrVII 852578 . G C 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;DP=111;Dels=0.00;FS=16.034;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:939,0,1260 chrVII 852763 . G C 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:843,0,1393 chrVII 853006 . T A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;DP=132;Dels=0.00;FS=9.480;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1320,0,1503 chrVII 853120 . T C 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.647;DP=150;Dels=0.00;FS=3.957;HaplotypeScore=5.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=8.65;ReadPosRankSum=-2.346;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1327,0,1856 chrVII 853279 . A G 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.071;DP=117;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.151;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:982,0,1494 chrVII 853470 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.070;DP=127;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1309,0,1314 chrVII 853758 . C T 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.529;DP=146;Dels=0.00;FS=3.019;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1763,0,1299 chrVII 853870 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.910;DP=113;Dels=0.00;FS=4.552;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1189,0,1043 chrVII 853975 . T A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.704;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.072;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1236,0,999 chrVII 854194 . G A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.709;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,55:94:99:1282,0,789 chrVII 854240 . C A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;DP=121;Dels=0.00;FS=2.494;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1372,0,1210 chrVII 854257 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.944;DP=106;Dels=0.00;FS=8.602;HaplotypeScore=4.7761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1168,0,1075 chrVII 854692 . C T 1934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.745;DP=158;Dels=0.00;FS=2.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.271;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,86:158:99:1964,0,1564 chrVII 854779 . G A 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3548,352,0 chrVII 854830 . G A 5588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7309;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.52;SB=-2.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:219:99:5588,559,0 chrVII 854879 . T C 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.148;DP=189;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,89:189:99:1753,0,2166 chrVII 854905 . G T 1943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.427;DP=180;Dels=0.00;FS=10.136;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,90:180:99:1973,0,1736 chrVII 854956 . T C 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.668;DP=148;Dels=0.00;FS=4.939;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.626;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,86:148:99:1845,0,1291 chrVII 854962 . G A 1973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.335;DP=154;Dels=0.00;FS=4.845;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.521;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,90:154:99:2003,0,1233 chrVII 854998 . A G 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.077;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.110;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:157:99:1653,0,1580 chrVII 855067 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.256;DP=116;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.254;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1290,0,1161 chrVII 855163 . T C 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3400,345,0 chrVII 855164 . T C 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3326,342,0 chrVII 855417 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.656;DP=135;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.787;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1383,0,1449 chrVII 855821 . C T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.996;DP=138;Dels=0.00;FS=7.886;HaplotypeScore=4.7062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.070;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1629,0,1367 chrVII 856790 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.869;DP=134;Dels=0.00;FS=5.294;HaplotypeScore=3.6767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.015;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1366,0,1359 chrVII 857024 . G A 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.863;DP=142;Dels=0.00;FS=3.046;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,80:142:99:1649,0,1295 chrVII 857025 . G A 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.060;DP=139;Dels=0.00;FS=3.076;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,79:139:99:1715,0,1247 chrVII 857160 . C T 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3460,349,0 chrVII 857176 . C T 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.853;DP=127;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,76:127:99:1795,0,1023 chrVII 857217 . A G 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3188,339,0 chrVII 857340 . G C 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.01;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3612,369,0 chrVII 857441 . G A 2993 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.62;MQ0=5;QD=25.15;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,114:119:99:3026,315,0 chrVII 857585 . C T 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=122.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3651,355,0 chrVII 857688 . A G 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.58;MQ0=0;QD=22.88;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2619,297,0 chrVII 857780 . G A 2508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2541,258,0 chrVII 857788 . C T 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8855;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2733,273,0 chrVII 857836 . C T 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2965,303,0 chrVII 857876 . A C 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3296,342,0 chrVII 857963 . T C 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3306,348,0 chrVII 857965 . C T 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3347,348,0 chrVII 858001 . G C 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=1;QD=25.49;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3875,408,0 chrVII 858110 . C T 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=28.53;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3366,331,0 chrVII 858139 . G A 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3088,306,0 chrVII 858225 . G T 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2965,298,0 chrVII 858261 . C A 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3352,328,0 chrVII 858310 . C T 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3649,373,0 chrVII 858478 . G C 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3553,381,0 chrVII 858511 . C T 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5569;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3614,364,0 chrVII 858514 . G A 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3557,361,0 chrVII 858611 . C A 4020.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4020,391,0 chrVII 858672 . C T 38.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.17;MQ0=0;QD=0.23;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:9:71,9,0 chrVII 858803 . A T 4452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=113.3265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=28.18;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4452,436,0 chrVII 858948 . G C 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3196,336,0 chrVII 859016 . A G 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3220,339,0 chrVII 859075 . G A 4247.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.019;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.904;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-2.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,169:171:99:4247,391,0 chrVII 859306 . G T 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3612,364,0 chrVII 859310 . C T 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3795,393,0 chrVII 859352 . A G 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3230,336,0 chrVII 859418 . C A 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6409;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.178;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3377,340,0 chrVII 859422 . G A 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3242,322,0 chrVII 859580 . T C 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2844,306,0 chrVII 859584 . C T 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3060,313,0 chrVII 859719 . T C 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2846,300,0 chrVII 859804 . A G 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3357,345,0 chrVII 859808 . T G 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3424,351,0 chrVII 859825 . A G 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3169,336,0 chrVII 860213 . A G 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3387,339,0 chrVII 860477 . A G 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3086,324,0 chrVII 860513 . T C 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2794,303,0 chrVII 860534 . A G 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2863,312,0 chrVII 860594 . G A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2997,300,0 chrVII 860672 . C A 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2905,297,0 chrVII 860690 . A G 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2763,288,0 chrVII 860732 . G A 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3003,306,0 chrVII 860821 . T C 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2487,273,0 chrVII 860831 . C A 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2914,294,0 chrVII 860945 . G A 2697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2730,273,0 chrVII 860975 . T C 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3172;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3450,351,0 chrVII 861152 . C T 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2767,273,0 chrVII 861190 . G C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3318,330,0 chrVII 861356 . G A 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2851,291,0 chrVII 861401 . C T 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3101,315,0 chrVII 861407 . A G 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.90;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2921,303,0 chrVII 861419 . T G 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.74;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3005,309,0 chrVII 861437 . G A 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4156;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.28;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3325,336,0 chrVII 861475 . A G 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2867,300,0 chrVII 861578 . T C 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2678,273,0 chrVII 861656 . A G 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=23.64;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2941,303,0 chrVII 861773 . C T 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3461,346,0 chrVII 861857 . A G 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3219,333,0 chrVII 861908 . T C 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2763,282,0 chrVII 861944 . A G 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3020,315,0 chrVII 861978 . C A 2549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2582,267,0 chrVII 862016 . A G 2480 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2513,267,0 chrVII 862090 . G A 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3585,355,0 chrVII 862103 . A G 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3652,381,0 chrVII 862232 . T C 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3651,375,0 chrVII 862303 . C T 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4562;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3069,304,0 chrVII 862364 . T C 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=108;Dels=0.00;FS=3.259;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=25.56;ReadPosRankSum=1.091;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2793,291,0 chrVII 862491 . T C 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3845,396,0 chrVII 862544 . A G 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=25.37;ReadPosRankSum=1.686;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3831,396,0 chrVII 862549 . A G 4017.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4017,414,0 chrVII 862646 . A T 3694.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3694,367,0 chrVII 862925 . G A 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3385,346,0 chrVII 862964 . G A 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2775,279,0 chrVII 863021 . C T 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2573,255,0 chrVII 863057 . G A 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3366,337,0 chrVII 863144 . A G 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2618,285,0 chrVII 863180 . A G 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3486,366,0 chrVII 863198 . C T 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=28.16;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3436,346,0 chrVII 863249 . T C 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3492,366,0 chrVII 863267 . T C 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.937e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3987,411,0 chrVII 863549 . T C 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2887,303,0 chrVII 863753 . T C 4090.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4090,429,0 chrVII 863960 . G A 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.74;SB=-2.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3761,367,0 chrVII 864350 . A G 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2940,300,0 chrVII 864419 . G T 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3503,349,0 chrVII 864725 . T C 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3520,357,0 chrVII 864758 . C T 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2823,282,0 chrVII 865499 . G C 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2982,291,0 chrVII 865578 . C T 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3020,298,0 chrVII 865622 . A G 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3360,348,0 chrVII 865628 . T C 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3412,357,0 chrVII 866222 . T A 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2487,234,0 chrVII 866494 . T C 2033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2066,213,0 chrVII 866722 . A C 2584 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2617,285,0 chrVII 866978 . T C 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.38;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2977,306,0 chrVII 867757 . T C 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3582,378,0 chrVII 868409 . C A 3998.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3998,394,0 chrVII 868460 . T C 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3375,369,0 chrVII 868490 . A T 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3391,348,0 chrVII 868494 . A C 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3459;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3484,363,0 chrVII 869060 . T C 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3336,348,0 chrVII 869330 . A G 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3717,381,0 chrVII 869612 . T C 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2999,315,0 chrVII 870051 . T C 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3244,330,0 chrVII 870131 . C T 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.765;DP=152;Dels=0.00;FS=2.578;HaplotypeScore=150.8603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=23.50;ReadPosRankSum=0.765;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,147:152:99:3572,343,0 chrVII 870303 . C T 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3007,295,0 chrVII 870646 . C T 4028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.665;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:4028,382,0 chrVII 870793 . C T 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2980,306,0 chrVII 870885 . C T 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3591,358,0 chrVII 870916 . A G 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3467,348,0 chrVII 871006 . C T 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3447,337,0 chrVII 871036 . A G 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3088,324,0 chrVII 871517 . T C 2259 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.253;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.615;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:2292,246,0 chrVII 871574 . A T 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.773;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,139:142:99:2490,191,0 chrVII 871790 . C A 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0818;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2694,276,0 chrVII 872246 . C G 2427 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2460,267,0 chrVII 873311 . G A 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3011,309,0 chrVII 873382 . C T 3190 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3223,313,0 chrVII 873389 . T C 3132 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3165,324,0 chrVII 873392 . G A 3293.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3293,333,0 chrVII 873502 . C T 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3306,345,0 chrVII 873790 . C T 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3377,340,0 chrVII 873895 . G A 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2714,270,0 chrVII 874466 . A T 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3056,304,0 chrVII 874585 . C T 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=27.33;ReadPosRankSum=1.587;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:120:99:3279,328,0 chrVII 874608 . G A 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3254,325,0 chrVII 874653 . G A 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.93;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3352,334,0 chrVII 875122 . G A 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3538,346,0 chrVII 875149 . A G 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3070,312,0 chrVII 875194 . C T 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2903,306,0 chrVII 875418 . G A 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3067,309,0 chrVII 875435 . C T 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2696,267,0 chrVII 875517 . T C 1978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=24.72;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2011,216,0 chrVII 875660 . T C 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:98:99:2566,270,0 chrVII 875675 . T C 2426 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9057;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2459,255,0 chrVII 875843 . T G 2429 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2462,258,0 chrVII 875845 . A T 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2576,252,0 chrVII 876033 . G A 877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.529;DP=34;Dels=0.00;FS=5.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.27;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=25.79;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:93:910,93,0 chrVII 876057 . T C 690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.67;MQ0=0;QD=23.00;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:81:723,81,0 chrVII 876081 . G A 1026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.59;MQ0=0;QD=22.80;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1059,108,0 chrVII 876178 . G T 533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.997;DP=92;Dels=0.00;FS=9.893;HaplotypeScore=4.5728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.70;MQ0=2;MQRankSum=-1.800;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:563,0,769 chrVII 876184 . C T 483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.690;DP=94;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=3.6080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.03;MQ0=2;MQRankSum=-2.499;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.742;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:513,0,879 chrVII 876208 . G A 356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.858;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.09;MQ0=2;MQRankSum=-4.242;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.098;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,24:101:99:386,0,1494 chrVII 876209 . T C 337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.720;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.09;MQ0=2;MQRankSum=-4.487;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.845;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,24:101:99:367,0,1551 chrVII 876351 . T C 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.44;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2692,276,0 chrVII 876384 . T C 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.19;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3013,309,0 chrVII 876387 . T C 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.32;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3005,312,0 chrVII 876560 . C T 2048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2081,213,0 chrVII 876569 . G A 2006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=27.11;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:2039,210,0 chrVII 876711 . T C 2580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2613,261,0 chrVII 876825 . C T 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3435,331,0 chrVII 876879 . T C 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=22.68;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3447,360,0 chrVII 876915 . A G 3562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3562,366,0 chrVII 876960 . T A 4163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.75;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:4163,400,0 chrVII 876965 . T C 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9348;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=22.42;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:156:99:3498,366,0 chrVII 877148 . A G 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.851;DP=128;Dels=0.00;FS=2.328;HaplotypeScore=4.7257;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=2.945;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.512;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,125:128:99:3029,309,0 chrVII 877174 . A G 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.885;DP=141;Dels=0.00;FS=9.397;HaplotypeScore=6.7726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-6.595;QD=0.14;ReadPosRankSum=-4.315;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,18:141:50:50,0,2744 chrVII 877182 . A G 309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.196;DP=155;Dels=0.00;FS=1.689;HaplotypeScore=15.6691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=0;MQRankSum=-7.775;QD=1.99;ReadPosRankSum=-5.549;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,29:155:99:339,0,2766 chrVII 877198 . G A 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.380;DP=160;Dels=0.00;FS=2.194;HaplotypeScore=9.8691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-6.987;QD=4.16;ReadPosRankSum=-3.759;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,48:160:99:696,0,2222 chrVII 877206 . G A 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.932;DP=161;Dels=0.00;FS=8.684;HaplotypeScore=9.8942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQ0=0;MQRankSum=-7.925;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,58:161:99:981,0,2042 chrVII 877209 . C T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.393;DP=154;Dels=0.00;FS=8.869;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=-7.689;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,59:154:99:990,0,1928 chrVII 877221 . A C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.929;DP=145;Dels=0.00;FS=5.027;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.89;MQ0=0;MQRankSum=-5.891;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.889;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1061,0,1814 chrVII 877222 . A G 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.857;DP=140;Dels=0.00;FS=3.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.49;MQ0=0;MQRankSum=-6.034;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.985;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1052,0,1635 chrVII 877263 . A G 155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.126;DP=137;Dels=0.01;FS=12.827;HaplotypeScore=17.4215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.78;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=1.13;ReadPosRankSum=-6.373;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,26:136:99:185,0,2473 chrVII 878070 . G A 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.85;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3148,315,0 chrVII 878256 . G A 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.26;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2841,282,0 chrVII 878298 . G A 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3020,295,0 chrVII 878461 . C T 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3356,348,0 chrVII 878463 . T G 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3318,348,0 chrVII 878834 . T C 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3130,330,0 chrVII 878835 . A T 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3271,331,0 chrVII 878869 . T C 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2717,291,0 chrVII 878949 . T C 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3399,363,0 chrVII 878997 . A C 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3555,372,0 chrVII 879079 . A G 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3469,351,0 chrVII 879230 . C T 4143.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2300;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4143,415,0 chrVII 879247 . T C 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3669,381,0 chrVII 879283 . A G 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:2987,318,0 chrVII 879321 . A C 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=1;QD=25.28;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3716,390,0 chrVII 879340 . C T 4064.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=1;QD=26.56;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4064,403,0 chrVII 879396 . A T 3999.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=1;QD=28.16;SB=-2.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3999,406,0 chrVII 879438 . C T 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3509,346,0 chrVII 879516 . C T 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.36;MQ0=0;QD=26.82;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2956,297,0 chrVII 879687 . T G 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3539,372,0 chrVII 879737 . T G 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3238,327,0 chrVII 879749 . T A 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2933,291,0 chrVII 879853 . T A 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.657;DP=139;Dels=0.00;FS=3.368;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=26.14;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3633,331,0 chrVII 879872 . T G 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3550,375,0 chrVII 879875 . T C 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3235,345,0 chrVII 879907 . T G 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3597,381,0 chrVII 880017 . C T 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2530,261,0 chrVII 880304 . A G 4028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.86;SB=-2.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4028,414,0 chrVII 880389 . C T 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3723,390,0 chrVII 880548 . C T 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2622,270,0 chrVII 881235 . T C 4220.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4220,432,0 chrVII 881265 . A G 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4021,423,0 chrVII 881307 . C T 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3297,339,0 chrVII 881331 . C T 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3529,352,0 chrVII 881397 . T C 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3213,342,0 chrVII 881406 . T C 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9044;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3253,348,0 chrVII 881583 . C T 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3583,364,0 chrVII 881676 . A G 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.433;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.37;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.236;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,149:151:99:3715,358,0 chrVII 881678 . G A 3740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.077;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=24.29;ReadPosRankSum=0.199;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,152:154:99:3740,355,0 chrVII 881694 . T C 4124.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2973;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.926;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,167:169:99:4124,397,0 chrVII 881739 . A T 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3529,357,0 chrVII 881907 . C T 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3341,336,0 chrVII 881935 . T C 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=24.88;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3093,324,0 chrVII 881985 . C T 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3258,336,0 chrVII 882051 . T C 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3319,354,0 chrVII 882099 . A C 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=23.64;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2822,303,0 chrVII 882202 . G A 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3410,340,0 chrVII 882264 . C T 4157.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4157,421,0 chrVII 882402 . G A 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=125.0477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.74;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3408,334,0 chrVII 882416 . T A 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.56;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3185,313,0 chrVII 882443 . A G 2246 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.17;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2279,243,0 chrVII 882517 . G A 2418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.37;MQ0=0;QD=26.28;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2451,264,0 chrVII 882535 . G A 2384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.45;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2417,261,0 chrVII 882564 . C T 2583 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.38;MQ0=0;QD=22.66;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2616,273,0 chrVII 882565 . C T 2492 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.59;MQ0=0;QD=22.25;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2525,264,0 chrVII 882573 . T A 2409 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.16;MQ0=0;QD=21.51;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2442,255,0 chrVII 882589 . T C 2062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.27;MQ0=0;QD=20.83;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2095,231,0 chrVII 882614 . C T 2158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.23;MQ0=0;QD=22.02;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2191,228,0 chrVII 882652 . G A 1513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.08;MQ0=0;QD=22.58;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1546,165,0 chrVII 882661 . G A 33.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.626;DP=65;Dels=0.00;FS=4.327;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=0.52;ReadPosRankSum=1.679;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:9:66,9,0 chrVII 882672 . T A 1638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.19;MQ0=0;QD=23.07;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1671,174,0 chrVII 882679 . G C 1434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.10;MQ0=0;QD=17.92;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1467,162,0 chrVII 882684 . T C 1384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.93;MQ0=0;QD=17.52;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1417,156,0 chrVII 882692 . A T 1628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6516;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.48;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=18.93;ReadPosRankSum=-1.088;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:1661,177,0 chrVII 882696 . A G 1559 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6622;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.46;MQ0=0;QD=17.72;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:88:99:1592,180,0 chrVII 882826 . C T 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.83;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3067,303,0 chrVII 883069 . T C 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.53;MQ0=1;QD=24.81;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3010,303,0 chrVII 883103 . G A 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.54;MQ0=1;QD=23.87;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3089,301,0 chrVII 883112 . G A 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.25;MQ0=1;QD=24.12;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2879,283,0 chrVII 883184 . G A 2599 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.38;MQ0=6;QD=25.23;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2632,273,0 chrVII 883187 . G A 2691 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.21;MQ0=6;QD=24.03;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2724,285,0 chrVII 883250 . G A 4266.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.78;MQ0=3;MQRankSum=0.820;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.800;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,173:174:99:4266,411,0 chrVII 883403 . T G 2260 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.52;MQ0=13;QD=21.73;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,100:104:99:2293,252,0 chrVII 883457 . A G 1255 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.03;MQ0=5;QD=14.76;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1288,141,0 chrVII 883496 . A G 1006 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.06;MQ0=5;QD=12.57;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:80:99:1039,117,0 chrVII 883502 . T C 1301 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.06;MQ0=5;QD=14.30;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:1334,144,0 chrVII 884075 . G A 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3328,339,0 chrVII 884107 . G A 4100.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.79;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4100,397,0 chrVII 884168 . C G 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.451;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.936;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3536,375,0 chrVII 884326 . C T 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.560;DP=121;Dels=0.00;FS=3.752;HaplotypeScore=5.5763;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.959;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3301,345,0 chrVII 884396 . T C 4343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4343,453,0 chrVII 884441 . A G 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3488,369,0 chrVII 885001 . C T 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3148,313,0 chrVII 885109 . C T 3925.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.901e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3925,367,0 chrVII 885165 . C T 4339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.46;SB=-2.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4339,448,0 chrVII 885186 . G C 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3946,409,0 chrVII 885274 . T G 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3200;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2941,309,0 chrVII 885279 . G A 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.0433;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3130,327,0 chrVII 885746 . G A 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3406,331,0 chrVII 885870 . T A 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3543,349,0 chrVII 886023 . T C 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=24.52;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3359,363,0 chrVII 886229 . A G 3989.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3989,444,0 chrVII 887698 . G T 4018.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=28.50;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:4018,406,0 chrVII 888123 . A G 2169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2202,228,0 chrVII 888247 . T A 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3074,313,0 chrVII 888345 . A T 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=1;QD=27.76;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3748,379,0 chrVII 888361 . A T 3784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.03;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3784,394,0 chrVII 888397 . G A 2290 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.060;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:2323,243,0 chrVII 888716 . A G 772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-7.287;DP=121;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=109.1880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=6.38;ReadPosRankSum=-8.042;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:77,44:121:70:805,70,0 chrVII 889615 . C T 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3407,349,0 chrVII 889998 . T C 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3720,372,0 chrVII 890309 . C T 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.74;SB=-2.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3958,382,0 chrVII 891078 . C T 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3575,360,0 chrVII 891371 . T C 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3382,360,0 chrVII 891431 . A C 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.880e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3631,387,0 chrVII 891611 . T C 3863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.858e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3863,408,0 chrVII 891656 . C T 4190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.03;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4190,412,0 chrVII 891990 . T C 3934.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=1;QD=25.88;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3934,411,0 chrVII 892025 . C T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3491,346,0 chrVII 892112 . A G 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3019,324,0 chrVII 892181 . G A 4467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.12;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4467,454,0 chrVII 892212 . G T 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3986,403,0 chrVII 892437 . A C 3709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3709,387,0 chrVII 892452 . T C 3869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3869,396,0 chrVII 892563 . A C 4229.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4229,423,0 chrVII 893054 . G A 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3172,313,0 chrVII 893214 . G T 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=1;QD=26.86;SB=-1.994e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3733,370,0 chrVII 893319 . C T 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3226,316,0 chrVII 893535 . A T 2171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2204,219,0 chrVII 893550 . C T 2350 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2383,228,0 chrVII 893850 . T C 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3787,390,0 chrVII 894066 . A T 3556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.991e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3556,352,0 chrVII 894078 . T A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3723,367,0 chrVII 894109 . T C 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;DP=140;Dels=0.00;FS=3.903;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=24.28;ReadPosRankSum=1.608;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3399,340,0 chrVII 894312 . C T 4863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4863,490,0 chrVII 895006 . G C 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3134,321,0 chrVII 895091 . G A 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3731,373,0 chrVII 895096 . A G 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3612,372,0 chrVII 895227 . A G 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.01;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3076,333,0 chrVII 895450 . C T 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2652,264,0 chrVII 895768 . G A 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2996,309,0 chrVII 896035 . A G 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3086,315,0 chrVII 896765 . T C 2016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.89;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2049,219,0 chrVII 896783 . T C 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=23.83;ReadPosRankSum=1.018;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,120:122:99:2940,280,0 chrVII 896840 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.120;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=25.14;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,123:126:99:3201,301,0 chrVII 896960 . A G 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3179,336,0 chrVII 897236 . G A 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.66;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3945,397,0 chrVII 897795 . G A 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3127,307,0 chrVII 897834 . C T 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3590,361,0 chrVII 897873 . G A 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3247,328,0 chrVII 898059 . G A 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.81;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3282,331,0 chrVII 898083 . T C 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3674,384,0 chrVII 898325 . A G 2988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3021,318,0 chrVII 898435 . T C 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3273,339,0 chrVII 898998 . A G 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3010,312,0 chrVII 899077 . T C 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2756,300,0 chrVII 899421 . T C 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2775,285,0 chrVII 899490 . T C 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=23.46;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3012,300,0 chrVII 899896 . G A 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5058;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3926,385,0 chrVII 900087 . C T 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3223,316,0 chrVII 900146 . T C 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2829,300,0 chrVII 900405 . C T 2573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2606,261,0 chrVII 900753 . C A 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3165,318,0 chrVII 901125 . G A 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=1;QD=26.22;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3408,337,0 chrVII 901215 . C A 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3736,370,0 chrVII 901763 . T C 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=1;QD=25.16;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3673,390,0 chrVII 902028 . A G 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3819,402,0 chrVII 902287 . C T 4221.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4221,421,0 chrVII 902358 . C T 4053.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4053,409,0 chrVII 902486 . C T 4087.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.43;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4087,415,0 chrVII 902502 . T C 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=22.33;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:3774,402,0 chrVII 902555 . T C 4675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4675,481,0 chrVII 902612 . G C 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3396,360,0 chrVII 902791 . G A 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=28.11;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3683,370,0 chrVII 902985 . A G 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3190,348,0 chrVII 903996 . A G 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.649;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=24.54;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3101,336,0 chrVII 904076 . T C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3318,345,0 chrVII 904249 . C T 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2900,285,0 chrVII 905027 . T C 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=1;QD=25.01;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3852,414,0 chrVII 905510 . T C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3558,369,0 chrVII 905641 . C G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5338;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3393,366,0 chrVII 905710 . T G 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2666,288,0 chrVII 906097 . A G 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3815,399,0 chrVII 906305 . C T 5003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:5003,490,0 chrVII 906371 . C T 4437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.89;SB=-2.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4437,460,0 chrVII 906509 . T G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3466,372,0 chrVII 906524 . T C 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3189,345,0 chrVII 906984 . C T 4615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4615,457,0 chrVII 907391 . T C 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2886,303,0 chrVII 907442 . C T 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3280,324,0 chrVII 907598 . T C 2126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.31;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2159,228,0 chrVII 907942 . C G 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=23.58;ReadPosRankSum=1.436;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3608,354,0 chrVII 908177 . T A 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3575,358,0 chrVII 908207 . G A 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3258,333,0 chrVII 908833 . G A 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3902,382,0 chrVII 909179 . G A 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3425,337,0 chrVII 909227 . A G 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.93;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3129,330,0 chrVII 909569 . A G 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2970,303,0 chrVII 909620 . T C 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3284,342,0 chrVII 909701 . C T 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2959,289,0 chrVII 909722 . A G 2328 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.77;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2361,246,0 chrVII 909914 . G A 4137.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3770;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4137,409,0 chrVII 909923 . C T 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4007,406,0 chrVII 910249 . G A 3617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3617,373,0 chrVII 910292 . T C 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3092,324,0 chrVII 910338 . T C 2147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.56;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2180,237,0 chrVII 910344 . A G 2220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=24.13;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2253,243,0 chrVII 910494 . T G 2531 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2564,267,0 chrVII 910560 . A T 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2850,288,0 chrVII 910572 . A G 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2601,264,0 chrVII 910638 . G A 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2566,252,0 chrVII 910647 . T C 2286 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2319,246,0 chrVII 910992 . A G 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3579,369,0 chrVII 911134 . C T 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=21.73;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:2966,294,0 chrVII 911141 . C T 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2850,279,0 chrVII 911221 . G A 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3457,351,0 chrVII 911377 . A G 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2808,297,0 chrVII 911431 . C G 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2963,315,0 chrVII 911531 . T G 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2750,291,0 chrVII 911599 . T C 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2961,315,0 chrVII 911822 . A G 2492 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2525,253,0 chrVII 911857 . G A 2410 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.70;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2443,240,0 chrVII 911978 . G A 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3719,367,0 chrVII 912111 . G A 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;DP=133;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=4.9615;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=26.71;ReadPosRankSum=1.706;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3553,364,0 chrVII 912560 . C T 4844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4844,487,0 chrVII 912728 . A C 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3248,327,0 chrVII 912779 . T C 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3729,399,0 chrVII 913000 . T C 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3503,366,0 chrVII 913057 . A G 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3575,375,0 chrVII 913063 . C T 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.21;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3790,376,0 chrVII 913078 . G A 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3425,346,0 chrVII 913222 . G A 4241.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.19;SB=-2.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4241,415,0 chrVII 913309 . G A 3967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.99;SB=-2.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3967,397,0 chrVII 913794 . C T 4637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4637,472,0 chrVII 913905 . T C 4563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4563,466,0 chrVII 914107 . C T 4400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.83;SB=-2.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4400,424,0 chrVII 914517 . C T 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.13;SB=-2.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3885,388,0 chrVII 914538 . G A 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3611,370,0 chrVII 914816 . C G 4844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6335;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.23;SB=-2.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:192:99:4844,490,0 chrVII 914881 . G A 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=19.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3746,391,0 chrVII 915330 . T C 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2984,318,0 chrVII 915876 . A G 4870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.63;SB=-2.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4870,504,0 chrVII 916077 . C T 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3657,370,0 chrVII 916305 . T C 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3358,363,0 chrVII 916324 . T C 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3538,366,0 chrVII 916389 . G A 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2700,276,0 chrVII 916476 . C T 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3157,318,0 chrVII 916672 . C T 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3311,331,0 chrVII 916923 . G A 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2937,303,0 chrVII 916953 . T C 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2745,300,0 chrVII 917004 . C T 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.97;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3476,349,0 chrVII 917241 . C T 4645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.966e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4645,463,0 chrVII 917249 . C T 4920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:187:99:4920,490,0 chrVII 917280 . G A 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3831,391,0 chrVII 917290 . G A 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3465,354,0 chrVII 917370 . C T 4286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4286,412,0 chrVII 917381 . A G 4245.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4245,433,0 chrVII 917454 . A G 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3108,336,0 chrVII 917483 . C T 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7044;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:140:99:3780,379,0 chrVII 917548 . C T 4374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:166:99:4374,412,0 chrVII 917785 . G A 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3521,343,0 chrVII 918497 . A C 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3385,354,0 chrVII 918518 . G A 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3543,357,0 chrVII 918731 . G A 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3214,324,0 chrVII 918808 . T C 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3079,336,0 chrVII 918846 . T C 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3083,336,0 chrVII 918902 . A G 4165.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4165,429,0 chrVII 918971 . T C 3892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3892,402,0 chrVII 919258 . T C 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3904,393,0 chrVII 919327 . C T 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3132,313,0 chrVII 919342 . T G 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.880;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3248,342,0 chrVII 919382 . T C 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3382,357,0 chrVII 919531 . G A 2861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2894,291,0 chrVII 919561 . A T 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2915,289,0 chrVII 919661 . C T 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3688,364,0 chrVII 919914 . A G 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9126;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3212,342,0 chrVII 919959 . G T 448.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;DP=82;Dels=0.00;FS=100.114;HaplotypeScore=49.2571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.932;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.611;SB=2.117e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,53:82:99:478,0,410 chrVII 919983 . C A 204.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.545;DP=77;Dels=0.00;FS=80.043;HaplotypeScore=48.6892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-4.223;QD=2.65;ReadPosRankSum=-3.766;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:77:99:234,0,582 chrVII 920047 . T C 1339 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.62;MQ0=0;QD=24.80;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1372,150,0 chrVII 920060 . G A 1590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.53;MQ0=0;QD=26.50;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1623,168,0 chrVII 920237 . C T 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.06;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2600,264,0 chrVII 920238 . A G 2475 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.12;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2508,264,0 chrVII 920871 . G T 2343 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.71;MQ0=0;QD=25.75;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:2376,246,0 chrVII 921067 . T G 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3277,345,0 chrVII 921308 . C T 2380 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.629;DP=101;Dels=0.00;FS=4.361;HaplotypeScore=2.6492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=23.56;ReadPosRankSum=1.218;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2413,233,0 chrVII 921861 . T A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;DP=87;Dels=0.00;FS=5.894;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.537;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,49:87:99:1067,0,803 chrVII 921947 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.141;DP=114;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=4.5407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.182;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1339,0,1071 chrVII 922006 . G A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.638;DP=125;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=3.109;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.733;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1344,0,1320 chrVII 922091 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.019;DP=133;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.007;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1549,0,1292 chrVII 922150 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.981;DP=126;Dels=0.00;FS=3.428;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=1;MQRankSum=0.664;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1378,0,1282 chrVII 922161 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.188;DP=137;Dels=0.00;FS=3.333;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=1;MQRankSum=1.740;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1262,0,1485 chrVII 922607 . C T 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.838;DP=115;Dels=0.00;FS=5.075;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1255,0,1115 chrVII 922984 . G C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;DP=133;Dels=0.00;FS=2.275;HaplotypeScore=3.4686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.052;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1397,0,1325 chrVII 923476 . T C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.944;DP=93;Dels=0.00;FS=4.198;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.479;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:941,0,1006 chrVII 923851 . C T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.326;DP=119;Dels=0.00;FS=10.228;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.067;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1107,0,1315 chrVII 924719 . T C 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.882;DP=133;Dels=0.00;FS=4.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=-0.540;QD=11.92;ReadPosRankSum=-2.362;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1615,0,1309 chrVII 924796 . G A 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.331;DP=120;Dels=0.00;FS=3.311;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=2.124;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1279,0,1115 chrVII 924899 . A G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.390;DP=125;Dels=0.00;FS=11.649;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.327;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1066,0,1596 chrVII 924911 . G A 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.489;DP=154;Dels=0.00;FS=14.292;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.738;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1491,0,1751 chrVII 925190 . G T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.994;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1370,0,1507 chrVII 925313 . C T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.292;DP=136;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.006;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1134,0,1601 chrVII 926236 . A G 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=25.91;ReadPosRankSum=0.009;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,135:137:99:3549,360,0 chrVII 926465 . T C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.703;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.361;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1372,0,1380 chrVII 926609 . A G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.018;DP=109;Dels=0.00;FS=2.472;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.040;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1106,0,1265 chrVII 927088 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.236;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1397,0,1718 chrVII 927149 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.019;DP=123;Dels=0.00;FS=7.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.878;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1127,0,1459 chrVII 927158 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.916;DP=133;Dels=0.00;FS=8.322;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=1;MQRankSum=0.735;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.167;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1151,0,1669 chrVII 927284 . T C 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.017;DP=119;Dels=0.00;FS=5.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.529;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,74:119:99:1507,0,921 chrVII 927341 . T A 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2908,295,0 chrVII 927609 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.354;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1289,0,1486 chrVII 927650 . A G 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.115;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.893;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1419,0,1691 chrVII 927723 . C A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.151;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1337,0,1084 chrVII 927944 . A T 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2904,300,0 chrVII 927992 . G C 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3473,357,0 chrVII 928475 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.931;DP=116;Dels=0.00;FS=8.004;HaplotypeScore=2.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.622;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.494;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1128,0,1345 chrVII 928933 . G A 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2733,270,0 chrVII 928950 . A G 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.570;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,73:114:99:1538,0,797 chrVII 929033 . A C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.551;DP=122;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.348;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1137,0,1394 chrVII 929519 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.509;DP=113;Dels=0.00;FS=10.750;HaplotypeScore=3.9439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.441;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1066,0,1275 chrVII 930044 . C A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.036;DP=125;Dels=0.00;FS=6.843;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.630;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:125:99:1230,0,1448 chrVII 930353 . C T 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.767;DP=145;Dels=0.00;FS=1.325;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=2.690;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.612;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1670,0,1318 chrVII 930476 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.189;DP=135;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=9.92;ReadPosRankSum=2.190;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1369,0,1434 chrVII 930575 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.805;DP=106;Dels=0.00;FS=6.156;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.929;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1066,0,1078 chrVII 930811 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.493;DP=110;Dels=0.00;FS=2.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1366,0,1014 chrVII 930875 . T G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.660;DP=94;Dels=0.00;FS=1.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=2.187;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1033,0,1006 chrVII 930881 . T C 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.443;DP=94;Dels=0.00;FS=2.832;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.063;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:912,0,1147 chrVII 930898 . G A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.477;DP=98;Dels=0.00;FS=3.956;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:997,0,1095 chrVII 930912 . T G 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.419;DP=104;Dels=0.00;FS=1.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.09;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1035,0,1160 chrVII 930939 . A C 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.721;DP=88;Dels=0.00;FS=5.629;HaplotypeScore=35.7678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.006;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:878,0,973 chrVII 931025 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.149;DP=111;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.174;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1190,0,1102 chrVII 931052 . G T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.667;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.499;QD=10.66;ReadPosRankSum=-2.056;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1427,0,1325 chrVII 931109 . C G 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.304;DP=80;Dels=0.00;FS=6.011;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.09;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.267;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:820,0,773 chrVII 931123 . T C 611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.947;DP=78;Dels=0.00;FS=8.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.42;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=7.83;ReadPosRankSum=-3.469;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:78:99:641,0,980 chrVII 931166 . A C 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;DP=38;Dels=0.00;FS=21.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=0.45;ReadPosRankSum=-3.331;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:47:47,0,641 chrVII 931595 . C T 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.992;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.973;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,34:71:99:609,0,577 chrVII 931627 . T A 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.604;DP=84;Dels=0.00;FS=2.873;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.425;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:814,0,985 chrVII 931659 . C T 685.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.918;DP=98;Dels=0.00;FS=1.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.931;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,37:98:99:715,0,1288 chrVII 931660 . A G 644.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.504;DP=98;Dels=0.00;FS=1.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.836;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.202;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,37:98:99:674,0,1356 chrVII 931666 . A G 435.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.795;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.71;MQ0=0;MQRankSum=-3.804;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.074;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,31:105:99:465,0,1671 chrVII 931830 . A G 1011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=25.92;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1044,114,0 chrVII 932056 . A G 646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.629;DP=134;Dels=0.00;FS=11.387;HaplotypeScore=4.7169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,51:134:99:676,0,1815 chrVII 932191 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.876;DP=122;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.257;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1415,0,1084 chrVII 932243 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.421;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.336;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1033,0,1132 chrVII 932340 . T C 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.941;DP=115;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.339;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1133,0,1280 chrVII 932498 . T C 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9221;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3601,375,0 chrVII 932508 . T C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.928;DP=137;Dels=0.00;FS=7.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1417,0,1474 chrVII 932540 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.779;DP=131;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1298,0,1459 chrVII 932723 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.776;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,56:87:99:1076,0,639 chrVII 933365 . T C 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2918,312,0 chrVII 933512 . T C 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3297,351,0 chrVII 933635 . C T 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.099;DP=136;Dels=0.00;FS=2.194;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.891;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1787,0,1076 chrVII 933869 . G T 2525 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2558,258,0 chrVII 934148 . A T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.933;DP=127;Dels=0.00;FS=5.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1389,0,1282 chrVII 934463 . C T 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2573,255,0 chrVII 934700 . G A 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3346,334,0 chrVII 934919 . C T 3930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3930,394,0 chrVII 934949 . T C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.647;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.005;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1417,0,1455 chrVII 935000 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.073;DP=141;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.423;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1190,0,1892 chrVII 935054 . T C 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.405;DP=146;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1663,0,1507 chrVII 935765 . G A 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8689;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.63;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2696,258,0 chrVII 935861 . T A 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3226,322,0 chrVII 936030 . G A 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.696;DP=146;Dels=0.00;FS=3.327;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.266;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1647,0,1459 chrVII 936066 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.064;DP=121;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.372;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1351,0,1221 chrVII 936067 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.145;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.958;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1411,0,1165 chrVII 936350 . A G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.415;DP=123;Dels=0.00;FS=12.213;HaplotypeScore=3.6938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1173,0,1205 chrVII 936413 . G C 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2646,285,0 chrVII 936431 . A G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.485;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.405;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,60:98:99:1230,0,781 chrVII 936948 . G C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.150;DP=120;Dels=0.01;FS=3.492;HaplotypeScore=9.8859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=1;MQRankSum=0.207;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.544;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1282,0,1104 chrVII 937170 . G A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.146;DP=138;Dels=0.00;FS=4.051;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=11.41;ReadPosRankSum=-2.241;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1605,0,1304 chrVII 937221 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.432;DP=111;Dels=0.00;FS=8.880;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.540;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1121,0,1181 chrVII 937376 . T G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.123;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1114,0,1157 chrVII 937513 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.826;DP=110;Dels=0.00;FS=4.658;HaplotypeScore=4.7317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1275,0,1001 chrVII 937670 . G A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.737;DP=130;Dels=0.00;FS=9.452;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1407,0,1307 chrVII 937718 . G C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.988;DP=117;Dels=0.00;FS=5.795;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:117:99:1022,0,1317 chrVII 937780 . A G 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3337,345,0 chrVII 937797 . G T 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.406;DP=137;Dels=0.00;FS=4.062;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1757,0,1215 chrVII 937858 . T G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.989;DP=141;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=3.2722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.966;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.122;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1469,0,1481 chrVII 937863 . T C 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3478,369,0 chrVII 937967 . T A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.894;DP=138;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.494;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1421,0,1601 chrVII 938120 . T C 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.312;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.399;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1456,0,1092 chrVII 938306 . C T 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.773;DP=153;Dels=0.00;FS=16.181;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.824;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1699,0,1472 chrVII 938364 . T C 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.232;DP=149;Dels=0.00;FS=3.084;HaplotypeScore=2.8932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.074;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1656,0,1353 chrVII 938447 . T C 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2485,264,0 chrVII 938528 . C A 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3199,321,0 chrVII 938706 . G A 608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.033;DP=81;Dels=0.00;FS=1.878;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.913;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:638,0,1064 chrVII 938768 . A C 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3565,372,0 chrVII 938789 . T C 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3444,357,0 chrVII 939128 . G A 3967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3967,394,0 chrVII 939290 . T C 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=141;Dels=0.00;FS=4.590;HaplotypeScore=5.9170;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=25.49;ReadPosRankSum=1.609;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3594,387,0 chrVII 939705 . T G 2474 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.0485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.76;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2507,264,0 chrVII 939707 . T G 748.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.464;DP=101;Dels=0.01;FS=6.505;HaplotypeScore=9.4366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQ0=0;MQRankSum=2.107;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:778,0,1264 chrVII 939713 . A G 2520 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=103;Dels=0.00;FS=3.501;HaplotypeScore=10.0598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2553,273,0 chrVII 939716 . T C 1122.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.102;DP=100;Dels=0.01;FS=9.906;HaplotypeScore=8.1337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.742;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,58:99:99:1152,0,842 chrVII 940082 . C T 2384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.232;DP=98;Dels=0.00;FS=3.635;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=24.33;ReadPosRankSum=1.268;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2417,229,0 chrVII 940454 . G C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.442;DP=129;Dels=0.00;FS=2.338;HaplotypeScore=4.7154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1405,0,1227 chrVII 940459 . G A 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7770;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3406,346,0 chrVII 940588 . C T 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3468,346,0 chrVII 940669 . C T 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3426,343,0 chrVII 940722 . C T 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2846,285,0 chrVII 940909 . G A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.416;DP=108;Dels=0.00;FS=2.989;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1272,0,1050 chrVII 941028 . A G 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2997,309,0 chrVII 941154 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.328;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.530;QD=10.53;ReadPosRankSum=-2.191;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1399,0,1325 chrVII 941292 . T C 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.755;DP=132;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.827;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1484,0,1242 chrVII 942040 . G C 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.964;DP=158;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.735;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1516,0,1607 chrVII 942301 . C A 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.441;DP=123;Dels=0.00;FS=17.726;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.716;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1011,0,1592 chrVII 942359 . G C 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.567;DP=129;Dels=0.00;FS=9.865;HaplotypeScore=4.8343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=2.346;QD=7.62;ReadPosRankSum=-1.822;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,52:129:99:1013,0,1587 chrVII 942440 . C G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.183;DP=121;Dels=0.00;FS=16.165;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=2.059;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.296;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1179,0,1308 chrVII 942469 . T G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.970;DP=130;Dels=0.00;FS=14.642;HaplotypeScore=5.8825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.488;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1367,0,1414 chrVII 942635 . C T 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.955;DP=141;Dels=0.01;FS=3.032;HaplotypeScore=7.9155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1482,0,1566 chrVII 942659 . C A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;DP=144;Dels=0.00;FS=3.009;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1538,0,1558 chrVII 942778 . T A 1854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;DP=152;Dels=0.00;FS=5.951;HaplotypeScore=2.8751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1884,0,1443 chrVII 943018 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.092;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1472,0,1107 chrVII 943244 . C T 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.965;DP=119;Dels=0.00;FS=17.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=1;MQRankSum=0.459;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.084;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1400,0,997 chrVII 943288 . T C 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.069;DP=138;Dels=0.00;FS=6.432;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=1.873;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1645,0,1176 chrVII 943580 . T G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.161;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.851;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:101:99:1251,0,943 chrVII 943671 . C T 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3308,325,0 chrVII 943786 . T C 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.860;DP=107;Dels=0.00;FS=4.735;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.338;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1088,0,1086 chrVII 943873 . T C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.230;DP=131;Dels=0.00;FS=11.244;HaplotypeScore=2.8608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.754;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1201,0,1553 chrVII 944106 . C T 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=1;QD=25.67;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3440,346,0 chrVII 944566 . C T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.903;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.799;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1277,0,1483 chrVII 944610 . T C 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.614;DP=96;Dels=0.00;FS=1.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.233;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:920,0,1129 chrVII 944660 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.502;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.862;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1044,0,1062 chrVII 944684 . G A 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2658,267,0 chrVII 944981 . T A 1798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.44;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1831,186,0 chrVII 945026 . A G 770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.393;DP=90;Dels=0.00;FS=1.703;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.995;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:800,0,1158 chrVII 945166 . C T 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.330;QD=26.82;ReadPosRankSum=1.972;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,101:103:99:2795,240,0 chrVII 945207 . G T 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3110,315,0 chrVII 945963 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.537;DP=138;Dels=0.00;FS=2.509;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.952;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1352,0,1596 chrVII 945978 . C T 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.40;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3945,409,0 chrVII 946200 . C T 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.798;DP=114;Dels=0.00;FS=5.058;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.388;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1150,0,1207 chrVII 946206 . T C 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.46;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3050,312,0 chrVII 946228 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.816;DP=113;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1309,0,1065 chrVII 946366 . C T 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3411,340,0 chrVII 946369 . G A 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3455,349,0 chrVII 946664 . G A 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3039,309,0 chrVII 946974 . A G 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3789,411,0 chrVII 947080 . T C 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2974,315,0 chrVII 947194 . A G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.430;DP=120;Dels=0.00;FS=8.530;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.228;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1140,0,1233 chrVII 947252 . C T 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3246,325,0 chrVII 947255 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.444;DP=120;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.622;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1136,0,1359 chrVII 947600 . A G 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2971,300,0 chrVII 947743 . T C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.098;DP=108;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1072,0,1158 chrVII 947792 . C T 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.443;DP=95;Dels=0.00;FS=8.412;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=2.841;QD=8.37;ReadPosRankSum=-2.031;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:825,0,1182 chrVII 947884 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.944;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.875;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1369,0,1031 chrVII 947885 . G T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.086;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.798;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1391,0,1035 chrVII 948052 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=144;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1420,0,1723 chrVII 948145 . G A 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3169,319,0 chrVII 948202 . T G 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3519,372,0 chrVII 948229 . G A 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.335;DP=139;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.261;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1687,0,1248 chrVII 948447 . T C 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3339,348,0 chrVII 948586 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.631;DP=144;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=9.1222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.520;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1535,0,1416 chrVII 948589 . T C 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.982;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.1222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.960;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1340,0,1476 chrVII 948634 . C T 3532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3532,355,0 chrVII 948637 . C A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.384;DP=134;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=9.80;ReadPosRankSum=2.171;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1343,0,1489 chrVII 948715 . G A 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.879;DP=128;Dels=0.00;FS=5.432;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.280;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1202,0,1445 chrVII 949014 . T C 2516 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=23.08;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2549,267,0 chrVII 949072 . C T 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=102;Dels=0.00;FS=3.458;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2629,238,0 chrVII 949090 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.403;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:1081,0,908 chrVII 949155 . G T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.257;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.612;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.612;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,54:95:99:1238,0,742 chrVII 949165 . T A 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;DP=117;Dels=0.00;FS=0.875;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1566,0,952 chrVII 949432 . C G 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,35:73:99:737,0,844 chrVII 949462 . T C 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.497;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:758,0,976 chrVII 949472 . T C 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.957;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,41:80:99:808,0,881 chrVII 949496 . G T 696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.247;DP=77;Dels=0.00;FS=0.859;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.000;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,34:77:99:726,0,864 chrVII 949572 . T C 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.168;DP=83;Dels=0.00;FS=9.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:795,0,1034 chrVII 949577 . C G 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.587;DP=82;Dels=0.00;FS=8.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:782,0,953 chrVII 949940 . A G 2118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2151,234,0 chrVII 949997 . A G 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.550;DP=96;Dels=0.00;FS=2.894;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.434;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:911,0,1073 chrVII 950132 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.663;DP=113;Dels=0.00;FS=1.850;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.646;QD=11.79;ReadPosRankSum=-2.496;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1362,0,944 chrVII 950138 . C G 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.452;DP=108;Dels=0.00;FS=0.829;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=11.81;ReadPosRankSum=-2.227;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1306,0,844 chrVII 950156 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.051;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.732;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1138,0,1026 chrVII 950426 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.055;DP=109;Dels=0.00;FS=8.113;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.022;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:109:99:1369,0,824 chrVII 950639 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.280;DP=115;Dels=0.00;FS=14.347;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1162,0,1119 chrVII 950699 . C A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.540;DP=118;Dels=0.00;FS=3.598;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.478;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1112,0,1388 chrVII 950759 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.334;DP=138;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=2;MQRankSum=1.598;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.676;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1257,0,1571 chrVII 950926 . G A 4280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4280,421,0 chrVII 951099 . A C 2046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.92;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2079,222,0 chrVII 951246 . T G 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.849;DP=65;Dels=0.00;FS=6.053;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.228;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:704,0,730 chrVII 951384 . A G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.748;DP=141;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.473;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:141:99:1200,0,1643 chrVII 951406 . A G 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.578;DP=110;Dels=0.00;FS=2.489;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,45:110:99:860,0,1422 chrVII 951468 . G T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.414;DP=133;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.378;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1116,0,1638 chrVII 951500 . G C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.048;DP=138;Dels=0.00;FS=1.366;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=1;MQRankSum=-0.123;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1233,0,1529 chrVII 951537 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.500;DP=131;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=1;MQRankSum=-0.780;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.713;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:131:99:1114,0,1457 chrVII 951544 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.898;DP=143;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQ0=1;MQRankSum=-1.290;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.682;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1263,0,1538 chrVII 951566 . C T 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.459;DP=128;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.50;MQ0=1;MQRankSum=-2.969;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.364;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1069,0,1335 chrVII 951573 . T A 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.258;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.22;MQ0=1;MQRankSum=-4.040;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1124,0,1404 chrVII 951595 . G A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.898;DP=131;Dels=0.00;FS=12.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.066;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:973,0,1435 chrVII 951635 . G A 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.99;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3069,330,0 chrVII 951655 . C T 2468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.59;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2501,270,0 chrVII 951659 . G A 2115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=22.03;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2148,234,0 chrVII 951675 . A G 1847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.35;MQ0=0;QD=21.23;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1880,210,0 chrVII 951689 . A G 323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.030;DP=81;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.650;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:353,0,885 chrVII 951690 . G A 1527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.32;MQ0=0;QD=19.58;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1560,168,0 chrVII 951700 . G A 335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.965;DP=83;Dels=0.00;FS=3.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=4.04;ReadPosRankSum=2.056;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,28:83:99:365,0,996 chrVII 951706 . G A 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.448;DP=81;Dels=0.00;FS=8.147;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.11;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,52:81:99:960,0,365 chrVII 951726 . C T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.080;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.7420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.45;MQ0=0;MQRankSum=2.698;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.178;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,55:86:99:1103,0,436 chrVII 951733 . A T 1096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.98;MQ0=0;QD=15.66;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1129,114,0 chrVII 951745 . A G 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.177;DP=69;Dels=0.01;FS=5.642;HaplotypeScore=5.8059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.04;MQ0=0;MQRankSum=3.279;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.649;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,44:68:99:811,0,401 chrVII 951752 . G A 338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.276;DP=68;Dels=0.00;FS=5.524;HaplotypeScore=6.6726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.32;MQ0=0;MQRankSum=-3.926;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.082;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,22:68:99:368,0,870 chrVII 951758 . C T 264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.060;DP=65;Dels=0.00;FS=3.973;HaplotypeScore=3.7224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.37;MQ0=0;MQRankSum=-4.075;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:294,0,932 chrVII 951773 . C T 1969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.66;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2002,210,0 chrVII 951785 . C T 310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.774;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.10;MQ0=0;MQRankSum=-5.110;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.530;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:340,0,957 chrVII 951823 . T C 151.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=47.2979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.748;QD=2.85;ReadPosRankSum=2.525;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:53:99:181,0,760 chrVII 951824 . G A 164.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.780;DP=54;Dels=0.04;FS=1.256;HaplotypeScore=12.6780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.82;MQ0=0;MQRankSum=-3.059;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.733;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,14:52:27:197,27,0 chrVII 951825 . A G 164.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=12.6269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.46;MQ0=0;QD=3.09;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:51:27:197,27,0 chrVII 951835 . A T 234 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.987;DP=60;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=38.6064;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.824;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.541;SB=-9.500e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,18:57:36:267,36,0 chrVII 951836 . A T 237 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.746;DP=60;Dels=0.02;FS=1.158;HaplotypeScore=36.6734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.138;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-9.400e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,20:59:36:270,36,0 chrVII 951845 . A C 383.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.908;DP=65;Dels=0.00;FS=1.018;HaplotypeScore=5.5159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,26:65:99:413,0,765 chrVII 951926 . A G 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.797;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.788;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:845,0,1159 chrVII 951959 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.130;DP=103;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQ0=0;MQRankSum=2.311;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.118;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,63:103:99:1346,0,789 chrVII 951976 . G A 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.38;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2947,288,0 chrVII 951983 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.926;DP=107;Dels=0.00;FS=3.735;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.22;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,68:107:99:1461,0,745 chrVII 952013 . G A 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.977;DP=117;Dels=0.00;FS=8.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQ0=0;MQRankSum=1.851;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.314;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,74:117:99:1568,0,769 chrVII 952025 . T G 729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.042;DP=107;Dels=0.00;FS=11.853;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.013;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:759,0,1459 chrVII 952043 . G A 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.453;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=8.56;ReadPosRankSum=-2.149;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:895,0,1175 chrVII 952051 . T G 2814 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.59;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2847,312,0 chrVII 952076 . A G 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.95;MQ0=0;QD=26.03;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2662,285,0 chrVII 952100 . A C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.539;DP=114;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.348;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:114:99:1221,0,1188 chrVII 952116 . G T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.390;DP=115;Dels=0.00;FS=7.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=2.328;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.574;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1127,0,1320 chrVII 952133 . G T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.598;DP=110;Dels=0.00;FS=9.955;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.954;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1361,0,1039 chrVII 952189 . G C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.304;DP=118;Dels=0.00;FS=22.793;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.39;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1135,0,1174 chrVII 952223 . T C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.059;DP=111;Dels=0.00;FS=3.826;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.84;MQ0=0;MQRankSum=1.873;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1058,0,1154 chrVII 952261 . T A 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.899;DP=109;Dels=0.00;FS=1.693;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:109:99:923,0,1230 chrVII 952285 . G A 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.553;DP=129;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=4.8916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.387;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,46:129:99:838,0,1729 chrVII 952286 . C T 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.377;DP=129;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=3.8983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,46:129:99:824,0,1765 chrVII 952297 . T C 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.463;DP=127;Dels=0.00;FS=2.671;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.043;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,43:127:99:705,0,1881 chrVII 952318 . G A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.003;DP=136;Dels=0.00;FS=13.739;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.208;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.706;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,54:136:99:1118,0,1778 chrVII 952426 . A G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.837;DP=137;Dels=0.00;FS=12.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.472;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1344,0,1578 chrVII 952472 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.029;DP=113;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.538;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1034,0,1406 chrVII 952505 . C T 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.395;DP=102;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:842,0,1264 chrVII 952509 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.305;DP=101;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,62:101:99:1379,0,773 chrVII 952725 . G A 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3868,391,0 chrVII 952860 . C T 2701 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2734,282,0 chrVII 953031 . C T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.822;DP=132;Dels=0.00;FS=2.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.446;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1361,0,1409 chrVII 953112 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.790;DP=141;Dels=0.00;FS=9.240;HaplotypeScore=7.3613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.190;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:141:99:1162,0,1817 chrVII 953319 . A T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;DP=146;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=0.208;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,58:146:99:1109,0,1902 chrVII 953335 . C A 2086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.734;DP=158;Dels=0.00;FS=4.195;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=2.522;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,99:158:99:2116,0,1046 chrVII 953343 . T C 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3873;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3454,360,0 chrVII 953373 . C T 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.352;DP=157;Dels=0.00;FS=6.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.000;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,63:157:99:1178,0,1892 chrVII 953540 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.623;DP=117;Dels=0.00;FS=2.420;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.245;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1143,0,1242 chrVII 953555 . T C 2429 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.64;MQ0=0;QD=23.58;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2462,267,0 chrVII 953557 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.032;DP=102;Dels=0.00;FS=6.974;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.655;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1063,0,990 chrVII 953586 . G A 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.189;DP=128;Dels=0.00;FS=3.280;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.676;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.235;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,76:128:99:1599,0,978 chrVII 953601 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.497;DP=117;Dels=0.00;FS=4.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.282;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,70:117:99:1481,0,864 chrVII 953629 . A C 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.09;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3199,339,0 chrVII 953709 . G A 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.325;DP=150;Dels=0.00;FS=6.504;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.173;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1726,0,1390 chrVII 953718 . G T 3913.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3913,397,0 chrVII 953865 . G A 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3170,310,0 chrVII 953897 . A C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.637;DP=119;Dels=0.00;FS=6.960;HaplotypeScore=2.4983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.813;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:986,0,1379 chrVII 953935 . T C 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2878,309,0 chrVII 954007 . C T 1912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.049;DP=151;Dels=0.00;FS=3.870;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=12.66;ReadPosRankSum=1.689;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:151:99:1942,0,1275 chrVII 954145 . T C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.091;DP=134;Dels=0.00;FS=6.656;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,51:134:99:1030,0,1879 chrVII 954301 . A G 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2679,285,0 chrVII 954455 . G C 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3091,324,0 chrVII 954667 . C G 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3602,366,0 chrVII 954701 . C T 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.737;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2642,267,0 chrVII 954726 . C T 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.874;DP=106;Dels=0.00;FS=3.559;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.993;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:1032,0,1253 chrVII 954734 . T C 2748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2781,282,0 chrVII 955004 . T C 2192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2225,234,0 chrVII 955260 . G A 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3151,321,0 chrVII 955297 . G A 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.816;DP=108;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1091,0,1150 chrVII 955308 . G C 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;DP=103;Dels=0.00;FS=2.545;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.962;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1062,0,1018 chrVII 955379 . C T 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3046,307,0 chrVII 955387 . A G 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2888,300,0 chrVII 955481 . G A 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2678,279,0 chrVII 955499 . A G 2620 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.44;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2653,282,0 chrVII 955592 . A T 2746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2779,285,0 chrVII 955631 . A G 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.719;DP=121;Dels=0.00;FS=2.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.234;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:992,0,1623 chrVII 955670 . T C 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2862,312,0 chrVII 955721 . C T 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.725;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=8.51;ReadPosRankSum=3.193;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:872,0,1280 chrVII 955769 . G T 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.412;DP=113;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=-0.036;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.585;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,70:113:99:1541,0,853 chrVII 955886 . T C 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.732;DP=76;Dels=0.00;FS=4.492;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.514;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,43:76:99:881,0,726 chrVII 955919 . T A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.801;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.288;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1226,0,1008 chrVII 955942 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.548;DP=120;Dels=0.00;FS=4.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1212,0,1281 chrVII 955973 . T A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;DP=132;Dels=0.00;FS=6.769;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1385,0,1413 chrVII 955988 . T C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.455;DP=133;Dels=0.00;FS=4.117;HaplotypeScore=3.9636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.245;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1351,0,1508 chrVII 956057 . C T 3806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3806,367,0 chrVII 956077 . T A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.724;DP=132;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.895;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1313,0,1464 chrVII 956078 . T A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;DP=132;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.129;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.899;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1457,0,1290 chrVII 956549 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.173;DP=126;Dels=0.00;FS=1.693;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=11.90;ReadPosRankSum=2.518;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1529,0,1263 chrVII 956978 . T C 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.236;DP=110;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:957,0,1424 chrVII 957479 . G A 158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.208;DP=95;Dels=0.00;FS=3.939;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.979;QD=1.66;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:188,0,113 chrVII 957494 . G A 232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.854;DP=98;Dels=0.00;FS=2.789;HaplotypeScore=13.6266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:98:99:262,0,935 chrVII 957830 . G A 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.759;DP=111;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.676;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1354,0,993 chrVII 958076 . T C 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;QD=25.16;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2951,312,0 chrVII 958078 . A T 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3046,315,0 chrVII 958224 . A C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;DP=124;Dels=0.00;FS=20.167;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.04;MQ0=1;MQRankSum=1.179;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.728;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1306,0,1209 chrVII 958233 . G A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.639;DP=113;Dels=0.00;FS=7.373;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQ0=1;MQRankSum=1.247;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.707;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:113:99:1157,0,1129 chrVII 958252 . C T 2737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.51;MQ0=1;QD=25.82;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2770,274,0 chrVII 958287 . A T 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.23;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2599,264,0 chrVII 958374 . T C 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=63.85;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3496,360,0 chrVII 958376 . C G 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=63.77;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3480,366,0 chrVII 958479 . A G 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3710,387,0 chrVII 958516 . T C 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3171,339,0 chrVII 958592 . A G 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3199,342,0 chrVII 958623 . A C 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3482,363,0 chrVII 958673 . C T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.069;DP=145;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=3.8596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.586;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:145:99:1310,0,1782 chrVII 958749 . C G 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;DP=139;Dels=0.00;FS=7.740;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.476;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,81:139:99:1711,0,1127 chrVII 958955 . G A 4240.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4240,421,0 chrVII 958980 . G A 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.937;DP=154;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=1;MQRankSum=1.320;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1744,0,1477 chrVII 959188 . C G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.361;DP=131;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.370;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1213,0,1534 chrVII 959223 . G A 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.032;DP=150;Dels=0.00;FS=2.968;HaplotypeScore=5.1284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:150:99:1721,0,1318 chrVII 959305 . C T 3905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3905,391,0 chrVII 959403 . T G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.001;DP=145;Dels=0.00;FS=15.961;HaplotypeScore=3.6161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1474,0,1540 chrVII 959502 . A C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.919;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.896;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1141,0,1230 chrVII 959629 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.570;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.899;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1281,0,1473 chrVII 959802 . A C 1098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=10.56;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:1131,120,0 chrVII 960080 . T C 2444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.695;DP=93;Dels=0.00;FS=3.250;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=26.28;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:2477,264,0 chrVII 960362 . C A 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=27.93;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2994,301,0 chrVII 960918 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.147;DP=148;Dels=0.00;FS=11.211;HaplotypeScore=2.7244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=1;MQRankSum=0.544;QD=8.60;ReadPosRankSum=-2.092;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:148:99:1303,0,1696 chrVII 960936 . A G 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=1;QD=24.64;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3039,312,0 chrVII 960996 . T G 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.083;DP=141;Dels=0.00;FS=11.949;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1377,0,1523 chrVII 961324 . T C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.271;DP=129;Dels=0.00;FS=4.371;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.813;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1375,0,1343 chrVII 962129 . A T 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;DP=106;Dels=0.00;FS=2.524;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:924,0,1386 chrVII 962142 . T C 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.503;DP=114;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1446,0,1014 chrVII 963324 . A C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.885;DP=119;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.550;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1109,0,1253 chrVII 963805 . C T 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3110,301,0 chrVII 963897 . T C 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3505,369,0 chrVII 963916 . G A 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3601,364,0 chrVII 963952 . T C 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,127:129:99:3352,333,0 chrVII 964040 . C G 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3084,336,0 chrVII 964269 . T C 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.675;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=26.07;ReadPosRankSum=0.880;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3214,345,0 chrVII 964575 . T C 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3277,342,0 chrVII 965476 . A T 2851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2884,297,0 chrVII 965676 . T G 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3070,309,0 chrVII 965972 . G A 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3798,388,0 chrVII 967790 . T A 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=150;Dels=0.00;FS=5.235;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=2;MQRankSum=-1.535;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.708;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:150:99:1730,0,1400 chrVII 968764 . C T 2891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2924,297,0 chrVII 968911 . G A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.446;DP=118;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=8.3916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.031;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1130,0,759 chrVII 970290 . A T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;DP=131;Dels=0.00;FS=1.605;HaplotypeScore=2.6163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=11.24;ReadPosRankSum=-2.432;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1502,0,1233 chrVII 971305 . A G 4188.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4188,412,0 chrVII 971746 . C T 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8747;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2947,280,0 chrVII 971893 . G C 2464 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=24.64;ReadPosRankSum=1.490;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2497,245,0 chrVII 972322 . T C 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.998e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3988,414,0 chrVII 972982 . G A 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=22.59;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:123:99:2811,294,0 chrVII 973057 . G A 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3785,388,0 chrVII 973111 . A G 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4046,429,0 chrVII 973243 . G A 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3485,358,0 chrVII 974135 . G A 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.573;DP=89;Dels=0.00;FS=9.957;HaplotypeScore=8.3906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=1;MQRankSum=0.129;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.064;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:745,0,916 chrVII 974583 . A C 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3647,381,0 chrVII 974638 . A G 2576 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=22.02;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2609,276,0 chrVII 974639 . C T 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=22.62;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2702,279,0 chrVII 974684 . A T 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3571,361,0 chrVII 975047 . T C 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2618,267,0 chrVII 975265 . A C 2432 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.60;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2465,261,0 chrVII 975463 . G A 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.29;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2762,276,0 chrVII 975718 . G A 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.872;DP=138;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.211;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1660,0,1351 chrVII 976931 . T C 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2928,321,0 chrVII 977842 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.566;DP=131;Dels=0.00;FS=7.857;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1180,0,1454 chrVII 978594 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.275;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.174;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1429,0,1142 chrVII 979368 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.381;DP=132;Dels=0.00;FS=5.309;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.714;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1112,0,1636 chrVII 979414 . G A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.182;DP=137;Dels=0.00;FS=12.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,53:137:99:1009,0,1874 chrVII 979418 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.180;DP=139;Dels=0.00;FS=10.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.002;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,54:139:99:980,0,1947 chrVII 979545 . A G 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3196,330,0 chrVII 979647 . T A 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.723;DP=179;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.171;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,85:179:99:1754,0,2076 chrVII 979683 . A C 4804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:4804,519,0 chrVII 981478 . A G 2542 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.68;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2575,273,0 chrVII 982687 . C T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.518;DP=158;Dels=0.00;FS=2.803;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1629,0,1515 chrVII 983061 . G C 2349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9693;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.45;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2382,243,0 chrVII 983063 . C T 2128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=88;Dels=0.00;FS=3.110;HaplotypeScore=4.9693;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.10;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.693;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:2161,200,0 chrVII 983089 . T C 1781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.60;MQ0=0;QD=21.46;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1814,195,0 chrVII 983091 . G C 1762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.22;MQ0=0;QD=21.49;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1795,192,0 chrVII 983112 . G A 2248 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.90;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2281,240,0 chrVII 983114 . T C 2195 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.90;MQ0=0;QD=21.95;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2228,240,0 chrVII 983122 . G C 1906 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.98;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:1939,210,0 chrVII 983124 . A T 1973 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.06;MQ0=0;QD=17.16;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2006,210,0 chrVII 983125 . A G 1866 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.41;MQ0=0;QD=16.09;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:1899,207,0 chrVII 983126 . C T 1996 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.41;MQ0=0;QD=17.21;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2029,210,0 chrVII 983160 . A G 2405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.74;MQ0=0;QD=18.50;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2438,270,0 chrVII 983164 . C T 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.86;MQ0=0;QD=19.92;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:2722,282,0 chrVII 983588 . G A 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3570,361,0 chrVII 984033 . C T 4531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=2;QD=26.81;SB=-2.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4531,454,0 chrVII 984084 . A G 3760.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7160;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3760,408,0 chrVII 984165 . A G 4350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.924e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4350,442,0 chrVII 984317 . G A 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.594;DP=149;Dels=0.00;FS=3.091;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1562,0,1596 chrVII 984362 . C T 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3983,403,0 chrVII 984464 . C T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.201;DP=127;Dels=0.00;FS=4.238;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.408;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1317,0,1397 chrVII 984558 . T C 4928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:4928,513,0 chrVII 984603 . G A 4949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4949,508,0 chrVII 984677 . A G 4094.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.316;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:4094,421,0 chrVII 985136 . C T 4193.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.973e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4193,409,0 chrVII 985210 . T C 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3807,399,0 chrVII 985218 . G A 4290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.32;SB=-2.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4290,436,0 chrVII 985412 . T G 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=1;QD=23.96;SB=-2.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3761,387,0 chrVII 985797 . C T 2356 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.09;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2389,243,0 chrVII 985817 . G A 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.07;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3704,382,0 chrVII 985834 . T A 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3330,334,0 chrVII 985898 . A G 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3411,369,0 chrVII 986049 . A C 3773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3773,390,0 chrVII 986277 . G A 4222.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4222,430,0 chrVII 986380 . A T 4830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4830,466,0 chrVII 986418 . C T 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3589,364,0 chrVII 986494 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.787;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.687;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,70:168:99:1357,0,2184 chrVII 986601 . T C 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3471,363,0 chrVII 986691 . T A 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3332,340,0 chrVII 986764 . G T 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3421,340,0 chrVII 986783 . G A 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3670,367,0 chrVII 986821 . C T 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3507,358,0 chrVII 986874 . G A 4172.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7192;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4172,415,0 chrVII 986910 . G A 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3914,385,0 chrVII 986969 . G A 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3866,391,0 chrVII 986990 . T C 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3565,372,0 chrVII 987011 . T A 4481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=27.49;SB=-2.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4481,460,0 chrVII 987032 . C A 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=28.46;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3500,361,0 chrVII 987084 . T G 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.38;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2861,306,0 chrVII 987134 . T A 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=22.24;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2524,252,0 chrVII 987273 . A G 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=1;QD=20.03;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2697,282,0 chrVII 987364 . A T 2071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.14;MQ0=0;QD=15.69;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2104,260,0 chrVII 987415 . C T 2521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.53;MQ0=0;QD=20.50;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2554,261,0 chrVII 987417 . T C 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.24;MQ0=0;QD=20.09;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:2745,297,0 chrVII 987430 . G C 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.723;DP=127;Dels=0.00;FS=4.261;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=0;MQRankSum=-4.032;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.601;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:942,0,1238 chrVII 987450 . T C 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8759;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3382,357,0 chrVII 987489 . A G 3817.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3817,396,0 chrVII 987590 . C T 4157.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=27.35;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4157,427,0 chrVII 987595 . C T 4532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.96;MQ0=0;QD=28.50;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4532,451,0 chrVII 987623 . G C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.110;DP=147;Dels=0.00;FS=5.995;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.349;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1370,0,1717 chrVII 987713 . A G 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.01;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3084,333,0 chrVII 987788 . T G 3869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.94;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3869,411,0 chrVII 987829 . T C 3907.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.73;MQ0=0;QD=24.89;SB=-2.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3907,411,0 chrVII 987872 . T G 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.90;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3602,375,0 chrVII 987900 . T G 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.5871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.25;MQ0=0;QD=21.98;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3022,324,0 chrVII 987926 . G A 2403 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.77;MQ0=0;QD=19.86;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2436,255,0 chrVII 987961 . A G 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.44;MQ0=0;QD=20.17;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:2877,306,0 chrVII 987973 . G A 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.68;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3367,340,0 chrVII 987979 . C T 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.32;MQ0=0;QD=23.16;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3451,357,0 chrVII 987992 . T C 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.66;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=23.38;ReadPosRankSum=-1.035;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3483,369,0 chrVII 988045 . C T 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.26;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3758,382,0 chrVII 988071 . A C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.014;DP=121;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1057,0,1396 chrVII 988108 . T C 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;DP=131;Dels=0.00;FS=3.464;HaplotypeScore=7.4205;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=25.16;ReadPosRankSum=1.388;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3296,333,0 chrVII 988142 . G A 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=28.03;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3032,307,0 chrVII 988162 . T C 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2986,321,0 chrVII 988195 . T C 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3619,369,0 chrVII 988333 . C T 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3329,331,0 chrVII 988358 . G A 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3475,331,0 chrVII 988387 . C T 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=27.71;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3547,346,0 chrVII 988528 . C T 4703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:185:99:4703,460,0 chrVII 989604 . T C 2577 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9360;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=24.78;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2610,279,0 chrVII 989845 . C T 2359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:93:99:2392,237,0 chrVII 989850 . T C 2419 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2452,258,0 chrVII 990245 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.829;DP=130;Dels=0.00;FS=2.649;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.105;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1257,0,1600 chrVII 990356 . C T 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3086,309,0 chrVII 990395 . C T 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3589,367,0 chrVII 990478 . G A 4132.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=26.83;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4132,403,0 chrVII 990505 . T C 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3801,387,0 chrVII 990538 . A G 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.75;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2948,318,0 chrVII 990540 . A C 2748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2781,309,0 chrVII 990576 . A G 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.60;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2693,300,0 chrVII 990609 . G T 2648 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.91;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2681,273,0 chrVII 990610 . G C 2544 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.07;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2577,276,0 chrVII 990611 . A C 2535 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.23;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2568,279,0 chrVII 990621 . C T 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.88;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2883,297,0 chrVII 990659 . T C 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.07;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3158,357,0 chrVII 990718 . T G 4024.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4024,417,0 chrVII 990841 . C A 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3546,355,0 chrVII 990893 . C A 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3290,319,0 chrVII 990971 . A T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.96;MQ0=0;QD=26.58;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2718,285,0 chrVII 991004 . G A 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.28;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3049,309,0 chrVII 991010 . G A 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3051,309,0 chrVII 991027 . C G 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.41;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3010,327,0 chrVII 991617 . G A 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3714,373,0 chrVII 991689 . T C 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3348,354,0 chrVII 991695 . G A 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3345,337,0 chrVII 991740 . C G 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3563,375,0 chrVII 991757 . A G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.076;DP=121;Dels=0.00;FS=3.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1300,0,1292 chrVII 991917 . A C 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.224;DP=140;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:140:99:1629,0,1334 chrVII 991938 . G A 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3721,387,0 chrVII 991998 . T C 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3751,399,0 chrVII 992004 . A G 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3574,390,0 chrVII 992205 . A G 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3189,333,0 chrVII 992313 . C T 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2782,270,0 chrVII 992385 . C T 4347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4347,448,0 chrVII 992448 . C T 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3568,358,0 chrVII 992799 . G A 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3600,355,0 chrVII 992805 . C T 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3669,370,0 chrVII 992889 . T C 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4030,412,0 chrVII 993608 . G T 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.337;DP=149;Dels=0.00;FS=7.772;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.325;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1547,0,1605 chrVII 994032 . A C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.335;DP=129;Dels=0.00;FS=5.496;HaplotypeScore=2.7989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.964;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1167,0,1375 chrVII 994228 . C T 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=24.93;ReadPosRankSum=-1.081;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3341,330,0 chrVII 994491 . G A 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3422,340,0 chrVII 994520 . C G 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2707,279,0 chrVII 994656 . T C 2154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6037;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.98;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:97:99:2187,227,0 chrVII 994670 . T A 2059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.41;MQ0=0;QD=22.14;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2092,219,0 chrVII 994685 . A G 1851 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.42;MQ0=0;QD=22.04;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1884,207,0 chrVII 994687 . T C 1858 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.81;MQ0=0;QD=22.12;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1891,207,0 chrVII 994688 . T C 1858 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.85;MQ0=0;QD=21.86;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1891,210,0 chrVII 994715 . A G 2271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=102;Dels=0.00;FS=4.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=22.26;ReadPosRankSum=0.204;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2304,228,0 chrVII 994782 . G A 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.62;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.527;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3037,271,0 chrVII 994826 . G A 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.20;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2917,285,0 chrVII 994829 . G A 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.26;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2917,285,0 chrVII 994918 . G T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.867;DP=138;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=10.05;ReadPosRankSum=-2.112;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1417,0,1388 chrVII 995040 . G A 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.47;MQ0=0;QD=26.49;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3364,342,0 chrVII 995093 . G A 2395 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.530;DP=103;Dels=0.00;FS=3.053;HaplotypeScore=5.9011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=23.25;ReadPosRankSum=1.261;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2428,232,0 chrVII 995121 . G T 2189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.26;MQ0=0;QD=24.05;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2222,234,0 chrVII 995127 . A G 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.955;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.15;MQ0=0;MQRankSum=-3.482;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.308;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,56:96:99:871,0,874 chrVII 995158 . T C 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.54;MQ0=0;QD=23.52;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2526,279,0 chrVII 995225 . C A 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=25.94;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2627,267,0 chrVII 995268 . T C 2030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=23.88;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:85:99:2063,228,0 chrVII 995282 . G A 2334 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=74.1294;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=21.81;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2367,234,0 chrVII 995326 . G A 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3317,333,0 chrVII 995359 . G A 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=27.34;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3068,315,0 chrVII 995370 . T C 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.106;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.255;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1419,0,1282 chrVII 995395 . T C 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3058,312,0 chrVII 995429 . C T 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3245,325,0 chrVII 995575 . A G 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3598,378,0 chrVII 995637 . G A 3911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3911,382,0 chrVII 995677 . G A 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.133;DP=166;Dels=0.00;FS=5.707;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.148;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,79:166:99:1618,0,1814 chrVII 995719 . A C 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3017,324,0 chrVII 995950 . G T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.392;DP=125;Dels=0.00;FS=3.304;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=2.816;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.250;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,75:125:99:1651,0,916 chrVII 996064 . C T 3938.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4658;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3938,400,0 chrVII 996153 . C T 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3840,394,0 chrVII 996178 . A G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.182;DP=117;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=3.8892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1240,0,1184 chrVII 996317 . A G 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.49;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3279,351,0 chrVII 996354 . A G 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.83;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3473,360,0 chrVII 996376 . G A 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3803,382,0 chrVII 996426 . A G 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=25.10;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3120,330,0 chrVII 996469 . A G 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1146;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3056,324,0 chrVII 997222 . T G 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3238,354,0 chrVII 997225 . A G 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3117,333,0 chrVII 997412 . A T 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=130;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.969;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:130:99:1583,0,1178 chrVII 997667 . C T 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3876,373,0 chrVII 997840 . A G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.87;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3358,363,0 chrVII 998074 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.148;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1286,0,1679 chrVII 998281 . C T 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3139,301,0 chrVII 998284 . C T 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3090,298,0 chrVII 998967 . T C 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7514;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:3744,381,0 chrVII 999229 . T C 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.36;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2578,276,0 chrVII 999231 . A G 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.739;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:944,0,1094 chrVII 999249 . T C 2465 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.19;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2498,264,0 chrVII 999251 . G A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.803;DP=112;Dels=0.00;FS=7.325;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1107,0,1091 chrVII 999269 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.577;DP=139;Dels=0.00;FS=5.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.656;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1473,0,1394 chrVII 999313 . A G 2974 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.78;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3007,321,0 chrVII 999317 . A G 2842 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.19;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2875,303,0 chrVII 999319 . G C 2859 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.43;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2892,309,0 chrVII 999344 . G T 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.359;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=25.32;ReadPosRankSum=-1.599;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3291,339,0 chrVII 999392 . C T 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3099,307,0 chrVII 999528 . T C 1760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9018;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=22.56;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1793,195,0 chrVII 999553 . T A 788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.065;DP=82;Dels=0.00;FS=6.598;HaplotypeScore=39.9484;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,75:82:44:821,44,0 chrVII 999604 . A G 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=20.61;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2548,273,0 chrVII 999647 . A G 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=24.50;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2802,297,0 chrVII 999668 . G C 2435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2468,252,0 chrVII 999737 . A C 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=139;Dels=0.00;FS=3.301;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=24.33;ReadPosRankSum=0.012;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3382,314,0 chrVII 1000197 . A G 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3732,396,0 chrVII 1000228 . G A 1960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.692;DP=175;Dels=0.00;FS=1.228;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.924;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,90:175:99:1990,0,1686 chrVII 1000371 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.610;DP=138;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1311,0,1491 chrVII 1000433 . A G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.01;MQ0=0;QD=22.98;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3181,342,0 chrVII 1000436 . G A 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.09;MQ0=0;QD=25.36;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3254,331,0 chrVII 1000855 . C T 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=23.04;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3120,304,0 chrVII 1001148 . T C 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3668,387,0 chrVII 1002934 . A G 2391 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2424,261,0 chrVII 1003183 . A G 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3064,315,0 chrVII 1003444 . G A 4102.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=26.46;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4102,403,0 chrVII 1003534 . G A 3955.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5228;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:154:99:3955,394,0 chrVII 1003675 . C T 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3062,301,0 chrVII 1003734 . G T 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.180;DP=94;Dels=0.00;FS=5.456;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.266;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:94:99:1118,0,863 chrVII 1003785 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.049;DP=124;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=2.4282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.517;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1314,0,1277 chrVII 1004007 . A G 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2725,291,0 chrVII 1004008 . G A 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2826,291,0 chrVII 1004023 . A G 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.07;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2551,273,0 chrVII 1004042 . A G 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.53;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2603,282,0 chrVII 1004073 . C T 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.33;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2386,243,0 chrVII 1004074 . C T 2323 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.33;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2356,243,0 chrVII 1004159 . C T 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=26.13;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3038,312,0 chrVII 1004169 . C A 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3132,318,0 chrVII 1004183 . C G 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.49;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2822,291,0 chrVII 1004292 . C T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.394;DP=102;Dels=0.00;FS=11.691;HaplotypeScore=5.4713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1130,0,1084 chrVII 1004505 . C T 1496 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=26.7599;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;QD=21.68;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1529,156,0 chrVII 1004566 . G A 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=26.56;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2716,270,0 chrVII 1004584 . G C 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=24.39;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2838,291,0 chrVII 1004599 . C T 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=25.80;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2948,291,0 chrVII 1004716 . G A 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9482;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2735,279,0 chrVII 1005100 . T C 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.882e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3466,357,0 chrVII 1005304 . A T 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;DP=119;Dels=0.00;FS=4.847;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=24.38;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:119:99:2934,275,0 chrVII 1005412 . T C 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.633;QD=24.42;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2597,252,0 chrVII 1005543 . G C 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.13;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3063,318,0 chrVII 1005829 . T C 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3696,381,0 chrVII 1005907 . T G 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3814,411,0 chrVII 1006061 . G A 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2860,297,0 chrVII 1006143 . C A 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3787,373,0 chrVII 1006156 . G A 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.60;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3883,397,0 chrVII 1006351 . A G 3794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3794,390,0 chrVII 1006364 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.352;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1509,0,1639 chrVII 1006715 . C T 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3185,310,0 chrVII 1007114 . G A 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3286,327,0 chrVII 1007125 . C T 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3307,333,0 chrVII 1007272 . A G 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3884,411,0 chrVII 1007291 . A G 3802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=144;Dels=0.00;FS=3.071;HaplotypeScore=5.3988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.467;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3802,405,0 chrVII 1007547 . C A 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3076,312,0 chrVII 1007580 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3201,327,0 chrVII 1007596 . G A 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3211,310,0 chrVII 1008064 . T C 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3355,354,0 chrVII 1008148 . A G 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.47;SB=-2.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3793,414,0 chrVII 1008259 . T C 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3458,345,0 chrVII 1008397 . A G 3909.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3909,417,0 chrVII 1008418 . T G 4457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4457,483,0 chrVII 1008427 . C T 4850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=28.20;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4850,490,0 chrVII 1008469 . C T 4933.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4933,496,0 chrVII 1008481 . T C 4424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4424,462,0 chrVII 1008513 . C T 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3748,373,0 chrVII 1008592 . T C 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3736,384,0 chrVII 1008710 . T C 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.300;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3945,391,0 chrVII 1008781 . T C 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3140,318,0 chrVII 1008855 . A G 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2993,324,0 chrVII 1008859 . T G 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2818,309,0 chrVII 1009042 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.798;DP=123;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.343;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1147,0,1384 chrVII 1009069 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.471;DP=108;Dels=0.00;FS=1.581;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.631;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1014,0,1203 chrVII 1009086 . C T 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=24.15;ReadPosRankSum=0.179;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2834,261,0 chrVII 1009123 . A G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.390;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=10.25;ReadPosRankSum=-2.472;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1332,0,1359 chrVII 1009263 . A G 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3678,393,0 chrVII 1009276 . A G 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3642,393,0 chrVII 1009496 . G A 2636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=27.18;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2669,270,0 chrVII 1009506 . A T 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.76;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2441,252,0 chrVII 1009687 . T C 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.975;DP=109;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=2.4919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=1;MQRankSum=0.118;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.651;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:944,0,1368 chrVII 1011163 . C G 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.714;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1398,0,1483 chrVII 1011166 . C A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.733;DP=141;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1415,0,1488 chrVII 1011203 . T C 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.118;DP=181;Dels=0.00;FS=0.545;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.033;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,85:181:99:1646,0,2051 chrVII 1011205 . C T 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.451;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.152;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,85:182:99:1684,0,2062 chrVII 1011221 . G C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.662;DP=189;Dels=0.00;FS=1.146;HaplotypeScore=4.9502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.533;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.222;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,84:189:99:1513,0,2276 chrVII 1011277 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.719;DP=169;Dels=0.00;FS=5.573;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.078;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,76:169:99:1577,0,1895 chrVII 1011306 . C T 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.274;DP=173;Dels=0.00;FS=1.918;HaplotypeScore=5.0398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.863;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.126;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,87:173:99:1824,0,1689 chrVII 1011328 . T A 1836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;DP=156;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.126;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,86:156:99:1866,0,1444 chrVII 1011503 . A G 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.337;DP=168;Dels=0.00;FS=7.282;HaplotypeScore=3.2817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.706;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,82:168:99:1630,0,1735 chrVII 1011639 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.886;DP=161;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.869;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,72:161:99:1400,0,1922 chrVII 1011792 . C T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.128;DP=147;Dels=0.01;FS=1.395;HaplotypeScore=29.1105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1147,0,1059 chrVII 1011819 . A T 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;DP=150;Dels=0.00;FS=97.848;HaplotypeScore=66.0112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.996;QD=0.11;ReadPosRankSum=-6.707;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,36:150:46:46,0,616 chrVII 1011827 . A T 121.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.232;DP=137;Dels=0.00;FS=199.573;HaplotypeScore=49.5688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=0.88;ReadPosRankSum=-7.889;SB=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,44:137:99:151,0,511 chrVII 1012000 . G C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;DP=153;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:153:99:1330,0,1690 chrVII 1012232 . T C 1230.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.043;DP=154;Dels=0.00;FS=4.271;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.684;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:154:99:1260,0,1688 chrVII 1012234 . T G 1274.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.988;DP=157;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.135;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,74:157:99:1304,0,1670 chrVII 1012235 . C A 1347.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.204;DP=159;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.053;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,75:159:99:1377,0,1601 chrVII 1012781 . A G 1951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.070;DP=175;Dels=0.00;FS=5.445;HaplotypeScore=4.2709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,98:175:99:1981,0,1597 chrVII 1013000 . C G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;DP=129;Dels=0.00;FS=9.763;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.026;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1136,0,1379 chrVII 1013600 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.377;DP=165;Dels=0.00;FS=1.991;HaplotypeScore=8.1087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.250;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,66:165:99:1295,0,2084 chrVII 1013720 . C T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.737;DP=137;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.438;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1634,0,1243 chrVII 1013788 . C A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.272;DP=120;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=4.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.633;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1119,0,1391 chrVII 1013837 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.306;DP=134;Dels=0.00;FS=9.273;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1289,0,1507 chrVII 1014204 . C G 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.991;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,76:163:99:1543,0,1812 chrVII 1014423 . C A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.093;DP=123;Dels=0.00;FS=6.730;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.727;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.544;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1464,0,1194 chrVII 1014663 . C G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.506;DP=116;Dels=0.00;FS=14.506;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.047;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1268,0,1091 chrVII 1015589 . G C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.641;DP=96;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:931,0,1043 chrVII 1015602 . A C 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.129;DP=80;Dels=0.00;FS=6.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.718;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:696,0,1083 chrVII 1015869 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.567;DP=106;Dels=0.00;FS=2.523;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.004;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:106:99:1181,0,988 chrVII 1015930 . G A 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.890;DP=91;Dels=0.00;FS=6.860;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:876,0,1000 chrVII 1017222 . A T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.719;DP=156;Dels=0.00;FS=3.747;HaplotypeScore=2.9013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.730;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,71:156:99:1415,0,1926 chrVII 1017723 . G A 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.616;DP=131;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.281;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1197,0,1615 chrVII 1018063 . A G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.167;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,68:113:99:1456,0,971 chrVII 1018075 . A G 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.246;DP=111;Dels=0.00;FS=4.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:939,0,1457 chrVII 1018177 . A G 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.255;DP=100;Dels=0.00;FS=0.806;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.044;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:831,0,1321 chrVII 1018509 . C G 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;DP=113;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=3.3929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:113:99:1319,0,1024 chrVII 1019203 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.127;DP=123;Dels=0.00;FS=4.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.978;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1152,0,1509 chrVII 1019210 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.200;DP=127;Dels=0.00;FS=4.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.938;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1174,0,1549 chrVII 1020978 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.396;DP=114;Dels=0.00;FS=4.729;HaplotypeScore=3.7688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1214,0,1108 chrVII 1022301 . A G 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.954;DP=146;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1282,0,1647 chrVII 1022645 . C T 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.798;DP=105;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:883,0,1288 chrVII 1023269 . C T 552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.473;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:582,0,1120 chrVII 1023277 . C T 557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.809;DP=80;Dels=0.00;FS=3.102;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.399;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,32:80:99:587,0,1059 chrVII 1023678 . A T 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;DP=138;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=2.5015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1511,0,1511 chrVII 1023928 . A C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.653;DP=118;Dels=0.00;FS=6.953;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.320;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.554;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1080,0,1454 chrVII 1024185 . C T 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.812;DP=119;Dels=0.00;FS=12.204;HaplotypeScore=10.1790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.385;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:119:99:1150,0,1320 chrVII 1024337 . G C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.588;DP=121;Dels=0.00;FS=17.771;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.827;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:1075,0,1468 chrVII 1024702 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.032;DP=118;Dels=0.00;FS=11.871;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1107,0,1326 chrVII 1025033 . A G 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.161;DP=126;Dels=0.00;FS=4.199;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.989;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.969;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:883,0,1297 chrVII 1025187 . G C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.448;DP=141;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=3.4618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.145;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1348,0,1496 chrVII 1027579 . T G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.995;DP=126;Dels=0.00;FS=8.431;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.372;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1094,0,1440 chrVII 1027936 . T C 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.420;DP=112;Dels=0.00;FS=3.749;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.567;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:846,0,1545 chrVII 1028091 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.858;DP=124;Dels=0.00;FS=2.299;HaplotypeScore=2.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1401,0,1214 chrVII 1028272 . T C 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.513;DP=112;Dels=0.00;FS=11.177;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.531;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,45:112:99:859,0,1477 chrVII 1028507 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.780;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.337;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1078,0,1183 chrVII 1029262 . T G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.685;DP=119;Dels=0.00;FS=2.320;HaplotypeScore=6.6917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.064;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:119:99:1111,0,1288 chrVII 1029431 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.106;DP=125;Dels=0.00;FS=2.332;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:125:99:1233,0,1379 chrVII 1029618 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.533;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1199,0,1093 chrVII 1029629 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.105;DP=123;Dels=0.00;FS=6.978;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1255,0,1297 chrVII 1029748 . A G 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.945;DP=91;Dels=0.00;FS=4.020;HaplotypeScore=4.8875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.795;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:91:99:864,0,951 chrVII 1029979 . C T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.487;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.141;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1136,0,1332 chrVII 1030321 . A G 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.882;DP=110;Dels=0.00;FS=12.572;HaplotypeScore=4.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.983;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:972,0,1286 chrVII 1030324 . C T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.375;DP=112;Dels=0.00;FS=7.356;HaplotypeScore=4.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.332;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1021,0,1303 chrVII 1030351 . T C 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.343;DP=106;Dels=0.00;FS=4.982;HaplotypeScore=4.6403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:958,0,1221 chrVII 1030416 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.261;DP=135;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.625;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1529,0,1238 chrVII 1030489 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.776;DP=135;Dels=0.00;FS=2.263;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1143,0,1446 chrVII 1030680 . C A 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.487;DP=95;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:951,0,953 chrVII 1030706 . A G 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.183;DP=96;Dels=0.01;FS=19.774;HaplotypeScore=3.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.683;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:920,0,1071 chrVII 1030794 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.698;DP=124;Dels=0.00;FS=8.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.088;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1477,0,1192 chrVII 1030897 . C T 1764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.377;DP=144;Dels=0.00;FS=3.036;HaplotypeScore=3.7090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.739;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1794,0,1286 chrVII 1030902 . C T 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.460;DP=136;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.939;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1636,0,1107 chrVII 1031026 . C T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.097;DP=129;Dels=0.00;FS=7.941;HaplotypeScore=4.4218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.026;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1460,0,1222 chrVII 1031040 . A T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.932;DP=118;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=4.6762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.281;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1256,0,1304 chrVII 1031055 . T C 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.690;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.665;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:869,0,1411 chrVII 1031217 . A C 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.072;DP=100;Dels=0.01;FS=1.672;HaplotypeScore=7.6764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.605;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:902,0,1176 chrVII 1031287 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.116;DP=96;Dels=0.00;FS=3.812;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=1.773;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1087,0,906 chrVII 1031392 . T A 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;DP=110;Dels=0.00;FS=4.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:1017,0,1384 chrVII 1031454 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.511;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.058;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1472,0,1403 chrVII 1031557 . A G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.235;DP=138;Dels=0.00;FS=1.382;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.622;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,52:138:99:991,0,1894 chrVII 1031725 . C T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.101;DP=152;Dels=0.00;FS=2.857;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.002;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,67:152:99:1370,0,1883 chrVII 1031741 . A C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.556;DP=158;Dels=0.00;FS=4.713;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1463,0,1873 chrVII 1031894 . C G 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.517;DP=164;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=2.5583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:1633,0,1740 chrVII 1031951 . G A 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.010;DP=162;Dels=0.00;FS=3.719;HaplotypeScore=3.5220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.932;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,84:162:99:1765,0,1656 chrVII 1031962 . A G 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.077;DP=156;Dels=0.00;FS=4.954;HaplotypeScore=2.9531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.471;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1693,0,1611 chrVII 1032459 . C T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.652;DP=171;Dels=0.00;FS=8.455;HaplotypeScore=5.9572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,85:171:99:1151,0,1303 chrVII 1033498 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.325;DP=118;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=5.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1339,0,1135 chrVII 1033530 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.697;DP=127;Dels=0.00;FS=10.091;HaplotypeScore=6.7182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.351;QD=11.06;ReadPosRankSum=2.245;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1435,0,1319 chrVII 1033602 . T C 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.862;DP=166;Dels=0.00;FS=2.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.425;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,75:166:99:1517,0,1975 chrVII 1033653 . A T 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.862;DP=155;Dels=0.00;FS=6.549;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.746;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1518,0,1788 chrVII 1033830 . G A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.871;DP=128;Dels=0.00;FS=4.293;HaplotypeScore=5.9003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1605,0,1042 chrVII 1034067 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.849;DP=126;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1323,0,1289 chrVII 1034541 . A G 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.285;DP=160;Dels=0.00;FS=3.725;HaplotypeScore=9.6686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.447;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1505,0,1827 chrVII 1034625 . T C 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.809;DP=160;Dels=0.00;FS=1.951;HaplotypeScore=10.7142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.007;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1593,0,1742 chrVII 1034846 . G A 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.050;DP=126;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1630,0,1041 chrVII 1035138 . G A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.033;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.032;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1421,0,1444 chrVII 1035498 . T C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.297;DP=135;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=3.9216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.613;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1359,0,1515 chrVII 1035627 . A G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.700;DP=104;Dels=0.00;FS=6.286;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1113,0,1091 chrVII 1036371 . T C 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.951;DP=128;Dels=0.00;FS=5.467;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.327;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1315,0,1433 chrVII 1036423 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.724;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.442;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1323,0,1573 chrVII 1037301 . T C 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.967;DP=82;Dels=0.00;FS=4.275;HaplotypeScore=4.7239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.910;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:797,0,821 chrVII 1037349 . C T 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.695;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:987,0,1091 chrVII 1037556 . A C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.263;DP=110;Dels=0.00;FS=3.542;HaplotypeScore=2.3620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=10.68;ReadPosRankSum=-2.003;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1205,0,1000 chrVII 1037706 . T A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.763;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1128,0,1268 chrVII 1037791 . A T 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.165;DP=113;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.020;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:997,0,1298 chrVII 1037793 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.783;DP=116;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:963,0,1352 chrVII 1037850 . C T 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.188;DP=114;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.696;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:893,0,1395 chrVII 1038689 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.892;DP=106;Dels=0.00;FS=8.972;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.403;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1114,0,1170 chrVII 1039298 . T G 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.739;DP=108;Dels=0.00;FS=10.815;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.673;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1010,0,1293 chrVII 1039378 . A C 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.352;DP=98;Dels=0.00;FS=2.588;HaplotypeScore=2.7456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1000,0,1059 chrVII 1039425 . A C 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:899,0,1085 chrVII 1039460 . T C 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.037;DP=84;Dels=0.00;FS=0.850;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.454;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,34:84:99:699,0,1154 chrVII 1039470 . C G 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.642;DP=91;Dels=0.00;FS=2.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.929;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:788,0,1156 chrVII 1039568 . T A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.698;DP=100;Dels=0.00;FS=0.771;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:100:99:1168,0,985 chrVII 1039575 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.077;DP=94;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.250;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1036,0,968 chrVII 1039621 . A G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.249;DP=114;Dels=0.00;FS=4.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.807;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1271,0,1177 chrVII 1039634 . A T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.629;DP=120;Dels=0.00;FS=3.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1466,0,1091 chrVII 1039642 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.928;DP=113;Dels=0.00;FS=7.300;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1318,0,1038 chrVII 1039678 . G A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.685;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.697;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1315,0,1219 chrVII 1039783 . T G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.052;DP=128;Dels=0.00;FS=8.034;HaplotypeScore=5.8760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.403;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1427,0,1354 chrVII 1039805 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.280;DP=128;Dels=0.00;FS=6.593;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.239;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1456,0,1235 chrVII 1040012 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.965;DP=140;Dels=0.00;FS=4.665;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1426,0,1629 chrVII 1040013 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.793;DP=134;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1449,0,1411 chrVII 1040349 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.364;DP=144;Dels=0.00;FS=2.956;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.762;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1462,0,1568 chrVII 1040573 . A G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.682;DP=139;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1316,0,1548 chrVII 1041497 . A G 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.911;DP=108;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1256,0,1072 chrVII 1041787 . G T 678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.600;DP=78;Dels=0.00;FS=0.882;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:708,0,913 chrVII 1041874 . T C 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.173;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,74:122:99:1617,0,975 chrVII 1042643 . T G 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.191;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.495;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:817,0,1575 chrVII 1043240 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.346;DP=106;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.849;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,63:106:99:1417,0,851 chrVII 1043244 . A G 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.786;DP=110;Dels=0.00;FS=3.664;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.873;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,68:110:99:1382,0,875 chrVII 1043528 . A G 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.682;DP=120;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=1.822;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.347;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,74:120:99:1687,0,913 chrVII 1043695 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.584;DP=115;Dels=0.00;FS=19.262;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.919;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.840;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1245,0,1060 chrVII 1044068 . G C 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.398;DP=144;Dels=0.00;FS=3.720;HaplotypeScore=2.8558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,81:144:99:1678,0,1223 chrVII 1044161 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.297;DP=124;Dels=0.00;FS=5.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.316;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1369,0,1253 chrVII 1044266 . A C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.596;DP=133;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.043;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1421,0,1386 chrVII 1044356 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.310;DP=123;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=1.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1106,0,1541 chrVII 1044371 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.254;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.314;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1249,0,1596 chrVII 1044698 . A T 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.759;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1266,0,1065 chrVII 1044782 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.643;DP=159;Dels=0.00;FS=1.991;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,75:159:99:1506,0,1795 chrVII 1044800 . T C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.931;DP=177;Dels=0.00;FS=1.168;HaplotypeScore=4.9670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.662;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,79:177:99:1525,0,2162 chrVII 1044835 . C A 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.375;DP=160;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1737,0,1718 chrVII 1044848 . G A 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.775;DP=160;Dels=0.00;FS=8.600;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1803,0,1673 chrVII 1044966 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.922;DP=121;Dels=0.00;FS=1.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1105,0,1514 chrVII 1045136 . T G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.612;DP=99;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.792;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,57:99:99:1169,0,896 chrVII 1045190 . C T 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.572;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:137:99:1648,0,1144 chrVII 1045214 . A T 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.054;DP=139;Dels=0.00;FS=2.278;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=11.14;ReadPosRankSum=2.052;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1578,0,1317 chrVII 1045298 . A T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.800;DP=138;Dels=0.00;FS=4.046;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.267;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1469,0,1523 chrVII 1045427 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.702;DP=137;Dels=0.00;FS=10.697;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=9.92;ReadPosRankSum=2.043;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1389,0,1506 chrVII 1045920 . G A 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.470;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.280;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1635,0,1292 chrVII 1046308 . A G 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.338;DP=149;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1504,0,1532 chrVII 1046581 . G T 2047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.923;DP=176;Dels=0.00;FS=3.883;HaplotypeScore=4.3764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.769;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,94:176:99:2077,0,1699 chrVII 1046800 . C T 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.525;DP=154;Dels=0.00;FS=11.237;HaplotypeScore=3.4666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.530;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1841,0,1450 chrVII 1046890 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.241;DP=141;Dels=0.00;FS=4.091;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.742;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1330,0,1673 chrVII 1047402 . G A 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.450;DP=183;Dels=0.00;FS=0.544;HaplotypeScore=8.2810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=1;MQRankSum=0.476;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,94:183:99:1754,0,1726 chrVII 1048054 . T C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.260;DP=135;Dels=0.00;FS=9.395;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.274;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1140,0,1520 chrVII 1048158 . C T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.420;DP=114;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1103,0,1290 chrVII 1048320 . G T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.926;DP=100;Dels=0.00;FS=2.852;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=11.99;ReadPosRankSum=-2.348;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1229,0,804 chrVII 1048332 . A C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.361;DP=111;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1212,0,1018 chrVII 1048356 . C T 2444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2477,243,0 chrVII 1048395 . A G 158.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.567;DP=121;Dels=0.00;FS=3.474;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.10;MQ0=0;MQRankSum=-6.166;QD=1.31;ReadPosRankSum=-5.649;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,42:121:99:188,0,1798 chrVII 1048402 . G A 292.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.696;DP=125;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-5.434;QD=2.34;ReadPosRankSum=-4.362;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,49:125:99:322,0,1621 chrVII 1048405 . T C 302.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.538;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-5.993;QD=2.42;ReadPosRankSum=-4.295;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:332,0,1637 chrVII 1048409 . G A 396.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.697;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-5.708;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:426,0,1520 chrVII 1048419 . T C 581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.938;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.43;MQ0=0;MQRankSum=-4.264;QD=4.61;ReadPosRankSum=4.708;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:126:99:611,0,1298 chrVII 1048437 . G A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.383;DP=117;Dels=0.00;FS=1.721;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.05;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.29;ReadPosRankSum=5.501;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,88:117:99:1351,0,397 chrVII 1048509 . A T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.312;DP=135;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=1;MQRankSum=1.760;QD=9.11;ReadPosRankSum=3.095;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1260,0,1547 chrVII 1048815 . T C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.387;DP=161;Dels=0.04;FS=1.344;HaplotypeScore=98.5435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.710;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1372,0,1540 chrVII 1048909 . A G 1894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.658;DP=176;Dels=0.00;FS=1.912;HaplotypeScore=3.9113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.003;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,95:176:99:1924,0,1725 chrVII 1048990 . C T 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.019;DP=173;Dels=0.00;FS=3.483;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.588;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,84:173:99:1834,0,1823 chrVII 1049349 . T C 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5035;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3418,363,0 chrVII 1049943 . G A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.927;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.109;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1407,0,1475 chrVII 1050080 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.884;DP=162;Dels=0.00;FS=2.015;HaplotypeScore=2.6906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.582;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,73:162:99:1484,0,1981 chrVII 1050332 . G T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.826;DP=149;Dels=0.00;FS=9.436;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.348;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1366,0,1788 chrVII 1051177 . A C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;DP=133;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=7.6644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:133:99:1131,0,1656 chrVII 1051213 . G T 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.688;DP=120;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=4.6123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.416;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1129,0,1491 chrVII 1051223 . T A 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.954;DP=119;Dels=0.00;FS=5.605;HaplotypeScore=4.9419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.054;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:119:99:1098,0,1460 chrVII 1051345 . C G 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;DP=117;Dels=0.00;FS=7.119;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.487;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1051,0,1310 chrVII 1051381 . C T 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.162;DP=126;Dels=0.00;FS=12.002;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1296,0,1387 chrVII 1051846 . C T 162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.548;DP=166;Dels=0.00;FS=78.467;HaplotypeScore=106.4751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.954;QD=0.98;ReadPosRankSum=-5.797;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,115:166:99:192,0,408 chrVII 1051899 . A G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.087;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=8.52;ReadPosRankSum=-2.983;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1197,0,1278 chrVII 1051973 . T C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.778;DP=151;Dels=0.00;FS=3.210;HaplotypeScore=2.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1210,0,1903 chrVII 1051991 . A G 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=22.94;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2969,321,0 chrVII 1051992 . G A 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.776;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:829,0,1528 chrVII 1052009 . G A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.896;DP=133;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=2.515;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.070;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1461,0,1263 chrVII 1052105 . G A 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3780,376,0 chrVII 1052107 . C T 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3690,364,0 chrVII 1052194 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.040;DP=136;Dels=0.00;FS=4.019;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1420,0,1445 chrVII 1052548 . A G 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3205,336,0 chrVII 1052907 . T C 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3649,378,0 chrVII 1052940 . G A 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3427,349,0 chrVII 1053156 . C T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.665;DP=154;Dels=0.00;FS=4.936;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.422;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1486,0,1744 chrVII 1053157 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.274;DP=143;Dels=0.00;FS=8.932;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.297;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1462,0,1477 chrVII 1053627 . C T 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3352,340,0 chrVII 1053897 . T A 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;DP=117;Dels=0.00;FS=2.956;HaplotypeScore=3.4849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=25.78;ReadPosRankSum=2.239;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,115:117:99:3049,315,0 chrVII 1054083 . A G 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3304,330,0 chrVII 1054260 . G A 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2570,246,0 chrVII 1054411 . T C 2223 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2256,228,0 chrVII 1054476 . A T 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3173,321,0 chrVII 1055001 . G A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.992;DP=119;Dels=0.00;FS=5.635;HaplotypeScore=5.4983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.241;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1228,0,1311 chrVII 1055127 . A G 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3434,354,0 chrVII 1055697 . A G 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.312;DP=144;Dels=0.01;FS=6.488;HaplotypeScore=6.6382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.372;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,83:143:99:1691,0,1305 chrVII 1056106 . G A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.214;DP=129;Dels=0.00;FS=9.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.497;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1320,0,1374 chrVII 1056558 . C T 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.268;DP=98;Dels=0.00;FS=1.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.698;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,40:98:99:842,0,1276 chrVII 1056872 . A G 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3875,384,0 chrVII 1057381 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.875;DP=115;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.149;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1192,0,1110 chrVII 1057542 . G A 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2796,285,0 chrVII 1057568 . T A 2425 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.75;MQ0=0;QD=25.80;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2458,243,0 chrVII 1057570 . C A 2399 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.75;MQ0=0;QD=25.52;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:94:99:2432,243,0 chrVII 1057752 . C T 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3011,309,0 chrVII 1057780 . C T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.173;DP=121;Dels=0.00;FS=10.667;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.169;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1300,0,1172 chrVII 1058359 . A G 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3445,369,0 chrVII 1058928 . C A 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;DP=73;Dels=0.00;FS=3.777;HaplotypeScore=4.7302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,35:73:99:777,0,812 chrVII 1058948 . G A 2421 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.60;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2454,252,0 chrVII 1058963 . A G 2312 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=25.41;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2345,255,0 chrVII 1059089 . C T 3957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3957,412,0 chrVII 1059129 . C T 4067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4067,403,0 chrVII 1059189 . G A 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3177,319,0 chrVII 1059339 . A G 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8146;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3309,339,0 chrVII 1059363 . G A 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3823,388,0 chrVII 1059368 . C T 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.093;DP=158;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1621,0,1550 chrVII 1059407 . C A 4136.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4136,409,0 chrVII 1059513 . C T 1967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.013;DP=172;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=5.9641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.212;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,93:172:99:1997,0,1558 chrVII 1059621 . G C 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2846,303,0 chrVII 1059629 . G A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.532;DP=114;Dels=0.00;FS=2.374;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=10.77;ReadPosRankSum=2.596;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1258,0,1183 chrVII 1059977 . T G 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3396,348,0 chrVII 1060055 . C T 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3444,352,0 chrVII 1060130 . A C 4015.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4015,417,0 chrVII 1060201 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.319;DP=117;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.982;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1249,0,1229 chrVII 1060260 . C T 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3695,376,0 chrVII 1060496 . T C 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3323,345,0 chrVII 1060520 . T C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.845;DP=133;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1146,0,1654 chrVII 1061003 . T C 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2694,276,0 chrVII 1061468 . C G 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=2.821;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.605;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:158:99:1749,0,1498 chrVII 1061571 . A G 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3810,384,0 chrVII 1061633 . A G 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2919,315,0 chrVII 1061731 . C T 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3639,355,0 chrVII 1062031 . T C 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2818,303,0 chrVII 1062188 . C G 2504 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2537,273,0 chrVII 1062488 . A T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.664;DP=118;Dels=0.00;FS=10.206;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=2.075;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.724;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1200,0,1371 chrVII 1062599 . A G 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3120,339,0 chrVII 1062869 . A G 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2905,306,0 chrVII 1062938 . A G 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2835,294,0 chrVII 1063067 . G T 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=27.19;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2969,303,0 chrVII 1063082 . G A 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.701;DP=112;Dels=0.00;FS=3.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.829;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1056,0,1339 chrVII 1063172 . A C 2187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=26.04;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2220,225,0 chrVII 1063193 . T C 2199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.69;MQ0=0;QD=26.49;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2232,231,0 chrVII 1063293 . G A 882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=9.91;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:87:915,87,0 chrVII 1063349 . T C 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.34;MQ0=0;QD=23.53;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2598,282,0 chrVII 1063368 . A G 1769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5886;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.40;MQ0=0;QD=22.39;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:79:99:1802,198,0 chrVII 1063378 . C T 1949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.0544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.21;MQ0=0;QD=24.36;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:80:99:1982,201,0 chrVII 1063387 . T C 1802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4605;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.06;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=23.40;ReadPosRankSum=0.697;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:77:99:1835,198,0 chrVII 1063495 . T C 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.580;DP=92;Dels=0.00;FS=20.389;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.94;MQ0=0;MQRankSum=2.864;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.720;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1064,0,923 chrVII 1063532 . T A 1024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.22;MQ0=0;QD=26.26;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1057,108,0 chrVII 1063533 . G A 1030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.67;MQ0=0;QD=27.11;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1063,108,0 chrVII 1063565 . C T 1259 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=24.21;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1292,132,0 chrVII 1063622 . G C 1530 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.39;MQ0=0;QD=22.17;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1563,165,0 chrVII 1063629 . T C 1629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.12;MQ0=0;QD=23.27;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1662,174,0 chrVII 1063653 . G A 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.229;DP=90;Dels=0.00;FS=5.772;HaplotypeScore=3.4006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=-3.428;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.742;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:729,0,1035 chrVII 1063668 . A C 2365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.75;MQ0=0;QD=24.64;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2398,258,0 chrVII 1063699 . C T 2307 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2340,237,0 chrVII 1063846 . T C 2146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.39;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2179,231,0 chrVII 1064413 . A G 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.130;DP=183;Dels=0.00;FS=5.968;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=2.203;QD=5.51;ReadPosRankSum=1.543;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,58:183:99:1038,0,2417 chrVII 1064829 . C A 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.306;DP=193;Dels=0.00;FS=2.786;HaplotypeScore=61.5291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.309;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,59:193:99:993,0,3019 chrVII 1064837 . C T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.803;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.6713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=6.62;ReadPosRankSum=2.763;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,74:214:99:1446,0,3102 chrVII 1064940 . T C 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.034;DP=199;Dels=0.01;FS=1.853;HaplotypeScore=7.6384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.443;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,67:198:99:1139,0,2947 chrVII 1064969 . A G 4246.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4246,444,0 chrVII 1064994 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.763;DP=180;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=7.0761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,66:180:99:1171,0,2592 chrVII 1065116 . A C 4838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4838,516,0 chrVII 1065185 . T C 4994.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.88;SB=-2.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4994,528,0 chrVII 1065196 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.625;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,61:195:99:1055,0,3185 chrVII 1065212 . G A 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.071;DP=196;Dels=0.00;FS=1.964;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.463;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,58:196:99:1042,0,3069 chrVII 1065232 . G A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.426;DP=200;Dels=0.00;FS=4.306;HaplotypeScore=8.5483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=7.01;ReadPosRankSum=-1.751;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,71:200:99:1432,0,2871 chrVII 1065342 . G A 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.014;DP=158;Dels=0.00;FS=3.238;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,49:158:99:942,0,2218 chrVII 1065367 . C A 4503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.38;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4503,442,0 chrVII 1065390 . T A 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.316;DP=248;Dels=0.00;FS=2.553;HaplotypeScore=4.7627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.216;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,82:248:99:1615,0,3620 chrVII 1065484 . G A 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.277;DP=190;Dels=0.00;FS=4.293;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.706;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,51:189:99:886,0,2990 chrVII 1065591 . T C 4573.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4573,475,0 chrVII 1065614 . G C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.234;DP=186;Dels=0.00;FS=6.765;HaplotypeScore=4.5654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,67:186:99:1362,0,2547 chrVII 1065722 . C T 5156.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=27.72;SB=-2.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:5156,523,0 chrVII 1065775 . C T 4295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4295,445,0 chrVII 1065808 . A T 4768.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=26.94;SB=-2.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4768,490,0 chrVII 1065857 . A G 4447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.74;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4447,477,0 chrVII 1065874 . A G 4236.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.42;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4236,468,0 chrVII 1065897 . C A 4162.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.61;MQ0=0;QD=25.69;SB=-2.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4162,435,0 chrVII 1065916 . A C 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.157;DP=187;Dels=0.00;FS=3.762;HaplotypeScore=57.3703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.09;MQ0=0;MQRankSum=-4.675;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,55:187:99:776,0,3129 chrVII 1065918 . C T 2561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.351;DP=177;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=52.4037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.274;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,117:177:99:2591,0,1091 chrVII 1065929 . T C 4340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.75;MQ0=0;QD=25.09;SB=-2.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4340,468,0 chrVII 1065950 . G T 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.955;DP=201;Dels=0.00;FS=16.621;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.157;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,57:201:99:900,0,3063 chrVII 1066008 . G A 4822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.66;MQ0=0;QD=25.38;SB=-2.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4822,505,0 chrVII 1066011 . T C 4456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.51;MQ0=0;QD=24.62;SB=-2.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4456,486,0 chrVII 1066023 . C T 5349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.73;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5349,547,0 chrVII 1066025 . G A 5476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.64;MQ0=0;QD=26.08;SB=-2.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,210:210:99:5476,550,0 chrVII 1066097 . C T 4889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=27.31;SB=-2.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4889,496,0 chrVII 1066166 . A G 4078.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:169:99:4078,429,0 chrVII 1066178 . T C 4449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4449,460,0 chrVII 1066252 . C G 5343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=25.32;SB=-2.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5343,553,0 chrVII 1066308 . A G 4793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=26.48;SB=-2.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4793,499,0 chrVII 1066316 . C T 5089.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=26.78;SB=-2.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:5089,514,0 chrVII 1066552 . T C 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.355;DP=186;Dels=0.00;FS=2.835;HaplotypeScore=4.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.888;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,58:186:99:950,0,2993 chrVII 1066557 . A T 5009.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.93;SB=-2.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:5009,514,0 chrVII 1066596 . G A 4701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4701,466,0 chrVII 1066693 . A G 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=132;Dels=0.00;FS=3.571;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.630;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3212,330,0 chrVII 1066810 . C G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.545;DP=207;Dels=0.00;FS=6.351;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.674;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,66:207:99:1143,0,3131 chrVII 1066820 . G A 5105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.73;SB=-2.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:5105,493,0 chrVII 1066836 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.096;DP=192;Dels=0.00;FS=15.157;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=6.24;ReadPosRankSum=-2.219;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,64:192:99:1228,0,2743 chrVII 1067111 . A C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;DP=183;Dels=0.00;FS=4.689;HaplotypeScore=199.0671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.477;QD=5.74;ReadPosRankSum=2.228;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,60:183:99:1080,0,2838 chrVII 1067117 . A T 191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;DP=180;Dels=0.00;FS=3.940;HaplotypeScore=143.9292;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=2.481;QD=1.06;ReadPosRankSum=-6.118;SB=-2.900e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:166,14:180:30:224,30,0 chrVII 1067171 . C A 5164.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.62;SB=-2.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:5164,511,0 chrVII 1067267 . G A 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.293;DP=232;Dels=0.00;FS=15.021;HaplotypeScore=3.3808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.180;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,104:232:99:1777,0,2769 chrVII 1067677 . G T 5236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.330;DP=319;Dels=0.00;FS=6.676;HaplotypeScore=250.7053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.907;SB=-2.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,227:319:99:5236,0,743 chrVII 1067738 . G T 6398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=8.570;DP=349;Dels=0.00;FS=116.980;HaplotypeScore=8.9398;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=10.328;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-3.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:42,306:349:99:6398,135,0 chrVII 1067897 . G A 12881.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=508;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2769;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.59;MQ0=0;QD=25.36;SB=-4.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,508:508:99:12881,1295,0 chrVII 1067985 . T A 2874.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=14.127;DP=478;Dels=0.00;FS=4.734;HaplotypeScore=8.9238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=3.978;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:311,167:478:99:2904,0,7036 chrVII 1068114 . G A 2594.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.694;DP=383;Dels=0.00;FS=1.259;HaplotypeScore=115.8272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,134:383:99:2624,0,5521 chrVII 1068123 . G C 2538.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.507;DP=424;Dels=0.00;FS=3.919;HaplotypeScore=128.7112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,138:424:99:2568,0,6112 chrVII 1068149 . G A 9994.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.723;DP=393;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=25.43;ReadPosRankSum=1.476;SB=-4.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,392:393:99:9994,1001,0 chrVII 1068305 . A G 10459.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=414;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=25.26;SB=-4.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,414:414:99:10459,1081,0 chrVII 1068524 . T C 8016.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=318;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.51;MQ0=0;QD=25.21;SB=-2.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,318:318:99:8016,853,0 chrVII 1068533 . G A 8162.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=309;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.68;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,309:309:99:8162,850,0 chrVII 1068569 . T C 8007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=358;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7622;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.57;MQ0=0;QD=22.37;SB=-2.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,358:358:99:8007,894,0 chrVII 1068602 . T C 7056.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.441;DP=293;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.42;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.632;SB=-3.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,291:293:99:7056,759,0 chrVII 1068608 . A G 6748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=279;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.06;MQ0=0;QD=24.19;SB=-3.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,279:279:99:6748,753,0 chrVII 1068680 . A G 2995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.820;DP=285;Dels=0.00;FS=13.641;HaplotypeScore=5.4212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=2;MQRankSum=5.579;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.372;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,150:285:99:3025,0,2775 chrVII 1068695 . C T 2839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.607;DP=315;Dels=0.00;FS=24.006;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.96;MQ0=2;MQRankSum=-5.141;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.180;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,145:315:99:2869,0,3379 chrVII 1068728 . T C 1943.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.612;DP=311;Dels=0.00;FS=7.263;HaplotypeScore=6.2133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.67;MQ0=4;MQRankSum=-9.384;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.223;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,136:311:99:1973,0,3555 chrVII 1068731 . A G 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.778;DP=295;Dels=0.00;FS=5.787;HaplotypeScore=4.4480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.47;MQ0=3;MQRankSum=-9.921;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.590;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,131:295:99:1935,0,3299 chrVII 1068740 . A G 1535.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-13.536;DP=280;Dels=0.00;FS=4.339;HaplotypeScore=3.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.72;MQ0=4;MQRankSum=-11.464;QD=5.48;ReadPosRankSum=2.016;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,115:280:99:1565,0,3445 chrVII 1068743 . T G 1431.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.703;DP=282;Dels=0.00;FS=5.997;HaplotypeScore=5.7448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.09;MQ0=5;MQRankSum=-10.905;QD=5.07;ReadPosRankSum=1.919;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,116:282:99:1461,0,3398 chrVII 1068831 . G A 1811 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.66;MQ0=10;QD=12.15;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:1844,192,0 chrVII 1068842 . T C 1343 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.46;MQ0=8;QD=9.66;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:1376,150,0 chrVII 1068848 . G A 1434 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.75;MQ0=5;QD=11.75;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:1467,156,0 chrVII 1068856 . G A 1752 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.13;MQ0=4;QD=14.13;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:1785,183,0 chrVII 1068865 . C A 2019 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=4;QD=15.90;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2052,210,0 chrVII 1068869 . C A 1844 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.892;DP=121;Dels=0.00;FS=9.516;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.62;MQ0=3;MQRankSum=3.872;QD=15.24;ReadPosRankSum=4.628;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,110:121:99:1877,201,0 chrVII 1068872 . T C 1874 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.559;DP=149;Dels=0.00;FS=15.098;HaplotypeScore=2.4485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.27;MQ0=2;MQRankSum=3.616;QD=12.58;ReadPosRankSum=4.569;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,140:149:99:1907,207,0 chrVII 1068878 . G A 3026 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.99;MQ0=1;QD=20.31;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3059,327,0 chrVII 1069265 . A G 5717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4306;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=24.75;SB=-2.978e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,229:230:99:5717,600,0 chrVII 1069334 . T C 5211.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=25.54;SB=-2.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,204:204:99:5211,538,0 chrVII 1069551 . C A 2936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.655;DP=216;Dels=0.00;FS=8.773;HaplotypeScore=67.3166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.700;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,132:216:99:2966,0,1627 chrVII 1069560 . G A 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.374;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=65.4704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.791;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,64:226:99:1050,0,3651 chrVII 1069607 . T C 5603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,226:226:99:5603,565,0 chrVII 1069845 . G A 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.082;DP=222;Dels=0.00;FS=5.872;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=7.90;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,90:222:99:1783,0,2846 chrVII 1069912 . G A 4288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.56;MQ0=0;QD=26.15;SB=-2.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4288,442,0 chrVII 1069969 . T A 60.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.536;DP=155;Dels=0.00;FS=1.549;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.981;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,48:155:90:90,0,721 chrVII 1070011 . C T 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.18;MQ0=0;QD=22.59;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3388,340,0 chrVII 1070032 . A T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;DP=177;Dels=0.00;FS=5.603;HaplotypeScore=2.7648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.616;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,62:177:99:1197,0,2559 chrVII 1070085 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.307;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=2.255;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.428;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,72:213:99:1231,0,3139 chrVII 1070173 . A G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.033;DP=193;Dels=0.00;FS=7.220;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,55:192:99:943,0,3184 chrVII 1070183 . C T 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.763;DP=190;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.292;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,56:190:99:1024,0,3006 chrVII 1070200 . T C 4848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4848,496,0 chrVII 1070214 . G A 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.607;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.214;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,52:195:99:884,0,3286 chrVII 1070598 . C A 5371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=1;QD=25.95;SB=-1.988e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5371,555,0 chrVII 1070644 . A T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.827;DP=154;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=45.6927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.576;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,63:154:99:1413,0,954 chrVII 1070709 . A G 439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.542;DP=148;Dels=0.00;FS=1.604;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,33:148:99:469,0,2678 chrVII 1070755 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.773;DP=207;Dels=0.00;FS=1.163;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.484;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,76:207:99:1403,0,2870 chrVII 1070793 . T C 4107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:167:99:4107,438,0 chrVII 1070892 . C G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.045;DP=225;Dels=0.00;FS=6.165;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,76:225:99:1262,0,3425 chrVII 1070938 . G A 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.313;DP=208;Dels=0.00;FS=7.905;HaplotypeScore=4.2137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=5.23;ReadPosRankSum=1.907;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,64:208:99:1117,0,3200 chrVII 1071019 . T A 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.932;DP=210;Dels=0.00;FS=1.210;HaplotypeScore=8.4938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=1;MQRankSum=-0.133;QD=4.73;ReadPosRankSum=2.207;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,59:210:99:1024,0,3467 chrVII 1071136 . G A 4962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;DP=197;Dels=0.00;FS=3.354;HaplotypeScore=5.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=25.19;ReadPosRankSum=0.783;SB=-2.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,196:197:99:4962,508,0 chrVII 1071144 . T C 4014.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;DP=168;Dels=0.00;FS=3.036;HaplotypeScore=5.9679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.99;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.417;SB=-2.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,166:168:99:4014,410,0 chrVII 1071147 . A G 4159.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=24.61;SB=-2.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4159,438,0 chrVII 1071149 . C T 925.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.008;DP=171;Dels=0.00;FS=12.908;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.43;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.755;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,56:171:99:955,0,2353 chrVII 1071150 . A G 4070.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.43;MQ0=0;QD=23.80;SB=-2.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4070,432,0 chrVII 1071302 . A G 4231.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.80;SB=-2.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:164:99:4231,459,0 chrVII 1071417 . C T 5448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2047;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.07;SB=-2.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5448,550,0 chrVII 1071815 . G T 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.248;DP=181;Dels=0.00;FS=7.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,60:181:99:1068,0,2699 chrVII 1071822 . A C 4838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4838,501,0 chrVII 1071914 . T C 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.676;DP=181;Dels=0.00;FS=1.282;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.936;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,52:181:99:858,0,2984 chrVII 1071959 . T C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.886;DP=201;Dels=0.00;FS=2.717;HaplotypeScore=2.6624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,65:201:99:1122,0,3114 chrVII 1072024 . G T 4624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:174:99:4624,475,0 chrVII 1072028 . G A 4517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.73;SB=-2.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4517,460,0 chrVII 1072066 . C G 5430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.02;SB=-2.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,217:217:99:5430,532,0 chrVII 1072360 . C T 4740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:181:99:4740,484,0 chrVII 1072449 . A G 4902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4902,510,0 chrVII 1072470 . T C 4982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4982,513,0 chrVII 1072500 . G A 4273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.73;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4273,418,0 chrVII 1072504 . T A 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.054;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,52:157:99:923,0,2466 chrVII 1072524 . C T 4159.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4159,418,0 chrVII 1072562 . T G 4480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=25.75;SB=-2.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4480,459,0 chrVII 1072638 . A T 3079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.125;DP=189;Dels=0.00;FS=2.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=16.29;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,136:189:99:3109,0,978 chrVII 1072664 . A G 4659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=26.32;SB=-2.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4659,481,0 chrVII 1072693 . G C 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.115;DP=172;Dels=0.00;FS=3.201;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.146;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,49:172:99:833,0,2810 chrVII 1072724 . G T 5265.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;QD=26.46;SB=-2.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:5265,508,0 chrVII 1072781 . G A 773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.106;DP=168;Dels=0.00;FS=2.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.378;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,46:168:99:803,0,2823 chrVII 1072857 . C T 4272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.64;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4272,448,0 chrVII 1072876 . T C 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.029;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,49:154:99:751,0,2315 chrVII 1072907 . G T 1212 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.46;MQ0=0;QD=22.87;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1245,132,0 chrVII 1072911 . T A 75.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=15.05;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:108,15,0 chrVII 1073151 . A C 228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.743;DP=116;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=3.5652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.351;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,37:116:99:258,0,597 chrVII 1073156 . G A 1162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.47;MQ0=0;QD=9.76;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:1195,126,0 chrVII 1073165 . A G 1100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.73;MQ0=0;QD=9.65;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:1133,126,0 chrVII 1073188 . G A 481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.367;DP=123;Dels=0.00;FS=2.510;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.30;MQ0=0;MQRankSum=-3.739;QD=3.91;ReadPosRankSum=2.882;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,39:123:99:511,0,1376 chrVII 1073194 . T A 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.42;MQ0=0;QD=21.61;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2864,300,0 chrVII 1073204 . T C 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.76;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3199,351,0 chrVII 1073216 . T A 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.01;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3080,321,0 chrVII 1073220 . A G 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.29;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2937,330,0 chrVII 1073306 . C T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.349;DP=129;Dels=0.00;FS=1.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.119;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,48:129:99:922,0,1757 chrVII 1073324 . T A 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3459,343,0 chrVII 1073366 . T A 3794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.92;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3794,361,0 chrVII 1073371 . C T 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.21;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3752,364,0 chrVII 1073426 . G T 4159.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.03;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4159,412,0 chrVII 1073467 . G A 5427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.36;MQ0=0;QD=27.83;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:5427,532,0 chrVII 1073551 . A T 4571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4571,454,0 chrVII 1073565 . T G 447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.094;DP=171;Dels=0.00;FS=4.667;HaplotypeScore=4.6602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.162;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,38:171:99:477,0,3137 chrVII 1073621 . T G 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3951,411,0 chrVII 1073622 . T G 3953.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3953,411,0 chrVII 1073680 . G T 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.87;MQ0=0;QD=25.28;SB=-2.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3918,385,0 chrVII 1073763 . G A 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3954;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3361,343,0 chrVII 1073767 . T A 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;DP=126;Dels=0.00;FS=7.361;HaplotypeScore=4.3901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.008;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,44:126:99:802,0,1894 chrVII 1073799 . T C 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.247;DP=130;Dels=0.00;FS=4.789;HaplotypeScore=2.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=4.112;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.056;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,46:130:99:828,0,1999 chrVII 1073844 . G A 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3674,364,0 chrVII 1073875 . T A 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3329,331,0 chrVII 1073884 . T C 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.397;DP=127;Dels=0.00;FS=3.517;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.428;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,40:127:99:717,0,1871 chrVII 1074147 . G C 2537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;DP=160;Dels=0.00;FS=2.513;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=15.86;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,117:160:99:2567,0,727 chrVII 1074171 . A G 628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.123;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.664;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,44:169:99:658,0,2935 chrVII 1074275 . A G 5936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=25.70;SB=-2.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,231:231:99:5936,610,0 chrVII 1074289 . G T 6361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=255;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=24.95;SB=-3.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,254:255:99:6361,631,0 chrVII 1074352 . C T 5492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.28;SB=-2.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:5492,541,0 chrVII 1074353 . A T 5484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.49;SB=-2.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,207:207:99:5484,532,0 chrVII 1074439 . T C 4252.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=23.89;SB=-2.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4252,441,0 chrVII 1074472 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.120;DP=205;Dels=0.00;FS=5.345;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.860;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,83:205:99:1455,0,2581 chrVII 1074534 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.546;DP=181;Dels=0.00;FS=13.510;HaplotypeScore=3.2297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.758;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.039;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,72:181:99:1465,0,2359 chrVII 1074589 . G C 4946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=26.17;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4946,514,0 chrVII 1074660 . A C 4301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=183;Dels=0.00;FS=3.082;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=23.50;ReadPosRankSum=1.543;SB=-2.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,182:183:99:4301,456,0 chrVII 1074661 . C A 4377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.35;MQ0=0;QD=24.45;SB=-2.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4377,459,0 chrVII 1074672 . C G 4345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.57;MQ0=0;QD=25.56;SB=-2.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4345,453,0 chrVII 1074691 . T C 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.127;DP=159;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.742;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,52:159:99:942,0,2498 chrVII 1074739 . T C 3959.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3959,417,0 chrVII 1074817 . C T 2366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.335;DP=153;Dels=0.00;FS=13.878;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,102:153:99:2396,0,945 chrVII 1074995 . G A 4569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.09;MQ0=0;QD=27.20;SB=-2.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4569,457,0 chrVII 1075085 . G A 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.854;DP=154;Dels=0.00;FS=7.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.936;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,49:154:99:896,0,2317 chrVII 1075097 . T C 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.561;DP=145;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.253;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,52:145:99:847,0,1986 chrVII 1075132 . C T 3485.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.637;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=23.71;ReadPosRankSum=1.258;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:147:99:3485,341,0 chrVII 1075138 . T C 3044 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.11;MQ0=0;QD=21.74;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3077,336,0 chrVII 1075139 . T C 3107 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.27;MQ0=0;QD=22.04;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3140,342,0 chrVII 1075157 . T C 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.71;MQ0=0;QD=22.15;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3434,375,0 chrVII 1075171 . T C 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.57;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3343,357,0 chrVII 1075222 . T C 2023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.505;DP=151;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=3.8020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,99:151:99:2053,0,984 chrVII 1075291 . T G 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4021,417,0 chrVII 1075322 . A T 3993.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3993,409,0 chrVII 1075323 . A T 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3945,397,0 chrVII 1075431 . C T 5389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.961e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5389,538,0 chrVII 1075509 . T A 5618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,213:213:99:5618,565,0 chrVII 1075526 . C T 5865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,217:217:99:5865,565,0 chrVII 1075576 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.426;DP=209;Dels=0.00;FS=8.339;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.383;QD=6.67;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,74:209:99:1424,0,2855 chrVII 1075581 . A G 4736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.19;SB=-2.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4736,498,0 chrVII 1075652 . G A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.644;DP=191;Dels=0.00;FS=2.643;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=6.45;ReadPosRankSum=2.027;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,66:191:99:1262,0,2717 chrVII 1075696 . C T 4324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=27.90;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4324,421,0 chrVII 1075820 . C A 4208.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=1;QD=26.30;SB=-2.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4208,415,0 chrVII 1075869 . A G 457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.062;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=1;MQRankSum=1.747;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.607;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,33:132:99:487,0,2291 chrVII 1075964 . G A 5444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7125;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.43;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,206:206:99:5444,547,0 chrVII 1076293 . A G 47.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.58;MQ0=12;QD=2.82;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:9:80,9,0 chrVII 1076432 . A G 98.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.09;MQ0=11;QD=4.47;SB=-2.476e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:15:131,15,0 chrVII 1076533 . C T 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.92;MQ0=12;QD=1.45;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:53,6,0 chrVII 1076562 . C G 155.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;DP=63;Dels=0.00;FS=4.912;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.20;MQ0=12;MQRankSum=0.611;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:185,0,816 chrVII 1076946 . C T 30.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.186;DP=91;Dels=0.00;FS=4.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.08;MQ0=68;MQRankSum=1.435;QD=0.33;ReadPosRankSum=-3.606;SB=-6.175e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,6:91:60:60,0,243 chrVII 1077054 . C T 245.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;DP=72;Dels=0.00;FS=7.605;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.40;MQ0=51;MQRankSum=3.618;QD=3.40;ReadPosRankSum=-3.693;SB=-1.661e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:14:275,0,14 chrVII 1077153 . T C 288.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.277;DP=117;Dels=0.00;FS=2.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.49;MQ0=92;MQRankSum=0.095;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-2.100e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,84:117:53:318,0,53 chrVII 1080548 . T C 58.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;DP=58;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.39;MQ0=40;MQRankSum=-1.115;QD=1.00;ReadPosRankSum=-1.965;SB=-6.247e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:39:88,0,39 chrVII 1080590 . T C 108.27 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=31;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.20;MQ0=24;MQRankSum=-0.742;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.742;SB=-3.146e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:9:138,0,9 chrVII 1080604 . G C 127.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.60;MQ0=23;QD=4.38;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,7:29:18:160,18,0 chrVII 1080620 . C T 100.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.04;MQ0=19;QD=4.18;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,5:24:15:133,15,0 chrVII 1080628 . G A 130.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.56;MQ0=19;QD=5.21;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,6:25:18:163,18,0 chrVII 1080629 . T G 127.13 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.81;MQ0=18;QD=5.30;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,6:24:18:160,18,0 chrVII 1080669 . A G 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.89;MQ0=2;QD=2.97;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:6:49,6,0 chrVII 1080672 . C G 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.89;MQ0=2;QD=3.14;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:6:50,6,0 chrVII 1080673 . A T 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.98;MQ0=1;QD=3.76;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:50,6,0 chrVII 1080674 . A G 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.98;MQ0=1;QD=3.57;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:49,6,0 chrVII 1080676 . C T 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.98;MQ0=1;QD=3.76;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:50,6,0 chrVII 1080688 . C T 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.27;MQ0=0;QD=3.76;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:50,6,0 chrVII 1080693 . T A 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.27;MQ0=0;QD=3.76;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:50,6,0 chrVII 1080758 . C G 105.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.86;MQ0=4;QD=8.77;SB=-8.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:15:138,15,0 chrVII 1081252 . C G 175.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=21.88;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:208,24,0 chrVII 1081257 . C T 180.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.81;MQ0=0;QD=20.00;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:213,24,0 chrVII 1081262 . T A 180.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.81;MQ0=0;QD=20.00;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:213,24,0 chrVII 1081320 . C T 223.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;DP=38;Dels=0.00;FS=16.107;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.89;MQ0=20;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.948;SB=-4.710e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:14:253,0,14 chrVII 1081363 . G A 404 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.93;MQ0=49;QD=5.77;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:42:437,42,0 chrVII 1081403 . C T 618 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6823;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.18;MQ0=47;MQRankSum=1.286;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.280;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,54:78:63:651,63,0 chrVII 1081407 . G A 490 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.375;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6823;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.83;MQ0=47;MQRankSum=1.255;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.418;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,52:76:51:523,51,0 chrVII 1081408 . G A 367.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.280;DP=75;Dels=0.00;FS=14.162;HaplotypeScore=3.5144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.35;MQ0=47;MQRankSum=0.890;QD=4.89;ReadPosRankSum=-1.093;SB=-1.000e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:76:397,0,76 chrVII 1081409 . G A 558 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.486;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.35;MQ0=47;MQRankSum=1.238;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.495;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,51:75:57:591,57,0 chrVII 1081456 . C T 196.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.53;MQ0=14;QD=6.76;SB=-2.903e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:24:229,24,0 chrVII 1081457 . T C 188.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.84;MQ0=14;QD=7.52;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:24:221,24,0 chrVII 1081460 . T G 185.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.92;MQ0=17;QD=6.61;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:24:218,24,0 chrVII 1081465 . G C 187.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.92;MQ0=17;QD=6.68;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:24:220,24,0 chrVII 1081530 . T A 383 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.83;MQ0=85;QD=3.45;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:45:416,45,0 chrVII 1081563 . T A 150.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;DP=152;Dels=0.00;FS=51.299;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.26;MQ0=117;MQRankSum=0.324;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.280;SB=-6.465e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,50:152:99:180,0,387 chrVII 1081655 . A G 233.45 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.775;DP=48;Dels=0.00;FS=6.788;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.09;MQ0=25;MQRankSum=2.105;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.236;SB=-2.692e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,17:48:7:265,7,0 chrVII 1081658 . G A 212.19 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.105;DP=41;Dels=0.00;FS=6.788;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.32;MQ0=18;MQRankSum=2.171;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.169;SB=-2.907e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,17:41:8:244,8,0 chrVII 1081660 . G A 171.12 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.439;DP=37;Dels=0.00;FS=6.788;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.18;MQ0=14;MQRankSum=2.372;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.768;SB=-2.994e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,17:37:5:202,5,0 chrVII 1081661 . C G 171.12 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.434;DP=37;Dels=0.00;FS=6.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.18;MQ0=14;MQRankSum=2.439;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.501;SB=-2.794e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,17:37:5:202,5,0 chrVII 1081664 . G A 264.41 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.820;DP=40;Dels=0.00;FS=8.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.05;MQ0=12;MQRankSum=2.228;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-2.921e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,22:40:13:297,13,0 chrVII 1081683 . G T 351 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.52;MQ0=6;QD=9.75;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:42:384,42,0 chrVII 1081686 . A G 152.98 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.708;DP=29;Dels=0.00;FS=10.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.24;MQ0=6;MQRankSum=2.506;QD=5.28;ReadPosRankSum=-1.437;SB=-2.220e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:3:182,0,3 chrVII 1081688 . C G 160.46 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;DP=30;Dels=0.00;FS=10.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.91;MQ0=7;MQRankSum=2.305;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-3.274e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:1:189,0,1 chrVII 1081731 . G A 371.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.808;DP=59;Dels=0.00;FS=1.923;HaplotypeScore=9.3726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.62;MQ0=12;MQRankSum=1.078;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,41:58:74:401,0,74 chrVII 1081752 . C A 422.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;DP=62;Dels=0.00;FS=4.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.98;MQ0=16;MQRankSum=1.406;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.723;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,43:62:74:452,0,74 chrVII 1081803 . G A 1304 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.686;DP=76;Dels=0.00;FS=4.828;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.16;MQ0=9;MQRankSum=2.024;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.410;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,66:76:99:1337,100,0 chrVII 1081815 . T C 1352 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.59;MQ0=9;QD=19.04;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1385,141,0 chrVII 1081887 . G A 1375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.42;MQ0=0;QD=20.52;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1408,153,0 chrVII 1081908 . A T 974 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.02;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=18.04;ReadPosRankSum=2.359;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:95:1007,95,0 chrVII 1081910 . C T 986 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.50;MQ0=0;QD=19.33;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1019,111,0 chrVII 1081912 . C T 981 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.50;MQ0=0;QD=19.24;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1014,111,0 chrVII 1081932 . C T 864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.30;MQ0=0;QD=15.71;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:897,99,0 chrVII 1081936 . A G 780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.72;MQ0=0;QD=15.00;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:96:813,96,0 chrVII 1081961 . T G 1913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.17;MQ0=0;QD=21.49;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1946,216,0 chrVII 1081991 . G A 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.27;MQ0=0;QD=25.40;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2624,273,0 chrVII 1082001 . A G 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.70;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3030,318,0 chrVII 1082123 . A T 1138.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.875;DP=163;Dels=0.00;FS=44.023;HaplotypeScore=20.7291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.35;MQ0=29;MQRankSum=-4.533;QD=6.98;ReadPosRankSum=-2.619;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,79:163:99:1168,0,1406 chrVII 1082133 . C A 727.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.231;DP=158;Dels=0.00;FS=39.735;HaplotypeScore=10.3465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.15;MQ0=31;MQRankSum=-3.052;QD=4.60;ReadPosRankSum=-2.407;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,49:158:99:757,0,1580 chrVII 1082167 . T C 742.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.480;DP=155;Dels=0.00;FS=31.200;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.71;MQ0=29;MQRankSum=-5.003;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.227;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,63:155:99:772,0,1629 chrVII 1082192 . C T 1011.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.602;DP=146;Dels=0.00;FS=16.009;HaplotypeScore=4.6776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.67;MQ0=30;MQRankSum=4.508;QD=6.92;ReadPosRankSum=-3.169;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1041,0,1059 chrVII 1082268 . T C 3768.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8902;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.67;MQ0=8;QD=21.78;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:3768,408,0 chrVII 1082304 . C T 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.925;DP=217;Dels=0.00;FS=5.894;HaplotypeScore=26.6805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.71;MQ0=1;MQRankSum=2.886;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,86:217:99:1546,0,2535 chrVII 1082317 . G A 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.079;DP=214;Dels=0.00;FS=4.087;HaplotypeScore=29.4788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.18;MQ0=1;MQRankSum=1.870;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.095;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,83:214:99:1493,0,2489 chrVII 1082352 . T G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.869;DP=216;Dels=0.00;FS=8.224;HaplotypeScore=45.2247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.54;MQ0=1;MQRankSum=1.262;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.893;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,77:216:99:1085,0,2834 chrVII 1082353 . G A 2195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.642;DP=216;Dels=0.00;FS=1.668;HaplotypeScore=45.2247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.54;MQ0=1;MQRankSum=2.624;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,105:216:99:2225,0,1650 chrVII 1082375 . G T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.272;DP=144;Dels=0.00;FS=6.221;HaplotypeScore=47.0037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.14;MQ0=1;MQRankSum=2.297;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.569;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:144:99:1655,0,879 chrVII 1082380 . G A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.127;DP=142;Dels=0.00;FS=6.218;HaplotypeScore=33.3907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.25;MQ0=1;MQRankSum=1.899;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.716;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1619,0,837 chrVII 1082396 . T C 266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.966;DP=119;Dels=0.00;FS=3.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.797;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.849;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,35:119:99:296,0,1741 chrVII 1082419 . G A 359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.391;DP=90;Dels=0.00;FS=9.081;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.932;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.552;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,30:90:99:389,0,1109 chrVII 1082442 . T C 1287 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.47;MQ0=2;QD=17.87;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1320,147,0 chrVII 1082444 . T C 643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.504;DP=71;Dels=0.00;FS=20.980;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.67;MQ0=2;MQRankSum=2.644;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.869;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,40:71:99:673,0,329 chrVII 1082456 . T C 1201 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.82;MQ0=2;QD=16.68;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:72:99:1234,138,0 chrVII 1082458 . A C 1151 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.91;MQ0=2;QD=16.21;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:71:99:1184,138,0 chrVII 1082459 . A G 710.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.633;DP=79;Dels=0.00;FS=30.164;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.23;MQ0=2;MQRankSum=4.999;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.781;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:740,0,280 chrVII 1082465 . C A 785.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.586;DP=90;Dels=0.00;FS=43.669;HaplotypeScore=6.9547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.20;MQ0=3;MQRankSum=4.574;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.374;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:815,0,306 chrVII 1082469 . A G 1291 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.2958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.52;MQ0=3;QD=14.84;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1324,144,0 chrVII 1082471 . C G 716.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.900;DP=101;Dels=0.00;FS=44.509;HaplotypeScore=13.6085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.89;MQ0=3;MQRankSum=2.880;QD=7.09;ReadPosRankSum=3.144;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:746,0,499 chrVII 1082475 . T A 473.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.326;DP=110;Dels=0.00;FS=15.797;HaplotypeScore=19.0301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.95;MQ0=3;MQRankSum=-0.925;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:503,0,791 chrVII 1082476 . A G 650.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.292;DP=105;Dels=0.00;FS=35.755;HaplotypeScore=16.3545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.13;MQ0=3;MQRankSum=2.552;QD=6.19;ReadPosRankSum=2.760;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:680,0,559 chrVII 1082477 . C A,T 1400.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2151;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=28.04;MQ0=3;QD=13.21;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,49,57:106:99:1460,860,788,600,0,501 chrVII 1082508 . C T 1797 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=4;QD=14.85;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:1830,198,0 chrVII 1082514 . C T 1587 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3380;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.39;MQ0=4;QD=13.92;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:1620,174,0 chrVII 1082522 . T C 495.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.308;DP=117;Dels=0.00;FS=42.207;HaplotypeScore=9.3008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.30;MQ0=4;MQRankSum=1.984;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.101;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:525,0,758 chrVII 1082534 . A C 286.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.393;DP=118;Dels=0.00;FS=61.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.40;MQ0=3;MQRankSum=2.358;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.906;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,38:118:99:316,0,905 chrVII 1082561 . G C 237.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;DP=108;Dels=0.00;FS=55.796;HaplotypeScore=6.6920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.48;MQ0=3;MQRankSum=2.182;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.396;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,32:108:99:267,0,959 chrVII 1082568 . T C 288.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.618;DP=106;Dels=0.00;FS=41.002;HaplotypeScore=5.8253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.00;MQ0=2;MQRankSum=1.041;QD=2.72;ReadPosRankSum=4.030;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,33:106:99:318,0,1070 chrVII 1082587 . A G 1274 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=1;QD=17.69;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1307,150,0 chrVII 1082592 . G A 1422 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=83;Dels=0.00;FS=2.471;HaplotypeScore=4.9130;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.29;MQ0=1;MQRankSum=1.531;QD=17.13;ReadPosRankSum=-2.396;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,80:83:85:1455,85,0 chrVII 1082599 . T G 316.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.542;DP=92;Dels=0.00;FS=9.202;HaplotypeScore=10.4718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.17;MQ0=1;MQRankSum=-1.620;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:346,0,1183 chrVII 1082601 . A C 317.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.986;DP=94;Dels=0.00;FS=7.276;HaplotypeScore=10.4718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.07;MQ0=1;MQRankSum=-2.058;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,31:94:99:347,0,1218 chrVII 1082608 . T G 208.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;DP=102;Dels=0.00;FS=28.679;HaplotypeScore=12.1983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.65;MQ0=1;MQRankSum=-1.092;QD=2.04;ReadPosRankSum=-1.948;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:238,0,1404 chrVII 1082613 . A C 80.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.825;DP=96;Dels=0.00;FS=22.873;HaplotypeScore=8.4613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.97;MQ0=1;MQRankSum=-1.725;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.621;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:110,0,1459 chrVII 1082614 . A T 73.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;DP=97;Dels=0.00;FS=22.857;HaplotypeScore=9.4192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.82;MQ0=1;MQRankSum=-0.541;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:103,0,1466 chrVII 1082615 . A C 78.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.870;DP=99;Dels=0.00;FS=25.350;HaplotypeScore=13.2118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.79;MQ0=1;MQRankSum=-1.123;QD=0.79;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:108,0,1488 chrVII 1082622 . A C 91.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.820;DP=96;Dels=0.00;FS=4.148;HaplotypeScore=11.3292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.63;MQ0=1;MQRankSum=-3.593;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.321;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:121,0,1545 chrVII 1082625 . G T 98.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.315;DP=95;Dels=0.00;FS=4.173;HaplotypeScore=3.7926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.79;MQ0=1;MQRankSum=-2.383;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.879;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,23:95:99:128,0,1424 chrVII 1082626 . C T 82.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.227;DP=95;Dels=0.00;FS=4.173;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.79;MQ0=1;MQRankSum=-2.964;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.906;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,23:95:99:112,0,1481 chrVII 1082627 . T C 85.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=91;Dels=0.00;FS=5.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.15;MQ0=1;MQRankSum=-2.905;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.444;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:115,0,1422 chrVII 1082629 . C T 116.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.436;DP=93;Dels=0.00;FS=5.879;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.50;MQ0=1;MQRankSum=-2.949;QD=1.25;ReadPosRankSum=1.037;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:146,0,1465 chrVII 1082633 . T G 94.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.291;DP=93;Dels=0.00;FS=5.834;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.543;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.812;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:124,0,1490 chrVII 1082639 . G C 98.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.152;DP=95;Dels=0.00;FS=7.556;HaplotypeScore=4.7054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.642;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.929;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:128,0,1475 chrVII 1082656 . G A 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.653;DP=114;Dels=0.00;FS=42.681;HaplotypeScore=24.6892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.71;MQ0=0;MQRankSum=-3.855;QD=0.23;ReadPosRankSum=0.891;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,20:113:56:56,0,1949 chrVII 1082681 . C A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.648;DP=107;Dels=0.00;FS=39.871;HaplotypeScore=4.7155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.914;QD=0.10;ReadPosRankSum=-2.213;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,19:107:40:40,0,1740 chrVII 1082775 . A G 988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.37;MQ0=0;QD=13.53;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1021,99,0 chrVII 1082819 . T C 154.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.531;DP=56;Dels=0.00;FS=30.706;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.40;MQ0=1;MQRankSum=-1.637;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.204;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:184,0,763 chrVII 1082821 . G A 182.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.027;DP=56;Dels=0.00;FS=21.595;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.40;MQ0=1;MQRankSum=-1.828;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:212,0,691 chrVII 1082828 . G A 191.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.686;DP=57;Dels=0.00;FS=29.993;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.32;MQ0=1;MQRankSum=-0.658;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:221,0,671 chrVII 1082858 . G T 535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3687;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.84;MQ0=1;QD=18.45;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:60:568,60,0 chrVII 1082861 . T C 314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.996;DP=30;Dels=0.00;FS=13.601;HaplotypeScore=7.3352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.63;MQ0=1;MQRankSum=1.308;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.574;SB=-1.705e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:76:344,0,76 chrVII 1082879 . G A 42.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;DP=21;Dels=0.00;FS=17.041;HaplotypeScore=3.9282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.79;MQ0=1;MQRankSum=-0.643;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.247;SB=-4.006e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:72:72,0,236 chrVII 1082883 . A G 320 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.15;MQ0=1;QD=16.84;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:39:353,39,0 chrVII 1082885 . C T 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.621;DP=19;Dels=0.00;FS=16.052;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.578;QD=2.26;ReadPosRankSum=1.555;SB=-6.506e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:73:73,0,199 chrVII 1082897 . C A 59.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;DP=15;Dels=0.00;FS=6.113;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.88;MQ0=1;MQRankSum=-0.710;QD=3.93;ReadPosRankSum=-2.905;SB=-2.879e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:55:89,0,55 chrVII 1082905 . T C 78.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.66;MQ0=1;QD=7.85;SB=-2.826e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:111,12,0 chrVII 1082922 . C T 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.538;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.59;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=0.96;ReadPosRankSum=0.601;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:51:51,0,184 chrVII 1082925 . C T 138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.279;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:55:168,0,55 chrVII 1082938 . G T 55.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.303;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:85:85,0,138 chrVII 1082939 . A G 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.204;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=2.33;ReadPosRankSum=1.796;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:79:79,0,144 chrVII 1082949 . T C 101.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.167;DP=22;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.839;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:131,0,106 chrVII 1082951 . G A 76.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.809;DP=22;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=3.45;ReadPosRankSum=1.379;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:106,0,153 chrVII 1082952 . C G 70.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;DP=22;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.59;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.248;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:100,0,155 chrVII 1082954 . C T 74.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;DP=22;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.59;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.525;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:104,0,158 chrVII 1082963 . A G 96.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.243;DP=25;Dels=0.00;FS=7.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.55;MQ0=0;MQRankSum=1.943;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.177;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:126,0,136 chrVII 1082972 . G A 338 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.03;MQ0=0;QD=13.52;SB=-7.595e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:39:371,39,0 chrVII 1082973 . T C 83.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;DP=26;Dels=0.00;FS=6.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.15;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:113,0,181 chrVII 1082974 . A G 87.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;DP=26;Dels=0.00;FS=6.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.15;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:117,0,160 chrVII 1082981 . T C 326 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.73;MQ0=0;QD=12.07;SB=-7.604e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:39:359,39,0 chrVII 1082991 . G A 339 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.73;MQ0=0;QD=12.56;SB=-7.604e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:39:372,39,0 chrVII 1082996 . G A 285 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.90;MQ0=0;QD=11.88;SB=-1.080e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:33:318,33,0 chrVII 1082999 . A G 20.05 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.674;DP=19;Dels=0.00;FS=3.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.40;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=1.06;ReadPosRankSum=2.023;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:50:50,0,171 chrVII 1083004 . G C 189.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;QD=12.60;SB=-3.878e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:24:222,24,0 chrVII 1083007 . A G 237 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.14;MQ0=0;QD=14.81;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:30:270,30,0 chrVII 1083020 . T G 52.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.163;DP=14;Dels=0.00;FS=18.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-2.925e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:67:82,0,67 chrVII 1083027 . T C 128.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.43;MQ0=0;QD=9.86;SB=-5.011e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:18:161,18,0 chrVII 1083057 . A G 124.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.11;MQ0=0;QD=10.34;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:18:157,18,0 chrVII 1083060 . T C 98.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=9.83;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:15:131,15,0 chrVII 1083061 . T G 97.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=9.73;SB=-7.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:15:130,15,0 chrVII 1083066 . A G 74.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.08;MQ0=0;QD=8.28;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:107,12,0 chrVII 1083181 . C T 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.70;MQ0=0;QD=3.22;SB=-5.780e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:57,6,0 chrVII 1083229 . G C 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.06;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.179;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:6:56,6,0 chrVII 1083231 . G C 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.06;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.179;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:6:55,6,0 chrVII 1083235 . G A 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.06;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.179;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:6:57,6,0 chrVII 1083237 . G T 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.06;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.179;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:6:49,6,0 chrVII 1083238 . A G 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.06;MQ0=0;QD=1.98;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:49,6,0 chrVII 1083240 . C T 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.06;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.666;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:6:57,6,0 chrVII 1083244 . C G 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;DP=11;Dels=0.00;FS=9.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.24;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.354;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:6:53,6,0 chrVII 1083249 . A G 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=9.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.24;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.118;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:6:56,6,0 chrVII 1083251 . C T 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.086;DP=13;Dels=0.00;FS=7.160;HaplotypeScore=5.4735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.39;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=1.98;ReadPosRankSum=2.073;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,11:13:6:57,6,0 chrVII 1083253 . T C 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=13;Dels=0.00;FS=9.622;HaplotypeScore=9.3317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.39;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:13:6:54,6,0 chrVII 1083282 . T C 288 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.950;DP=19;Dels=0.00;FS=9.863;HaplotypeScore=3.7488;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.24;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=15.16;ReadPosRankSum=-3.050;SB=-1.572e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,15:19:36:321,36,0 chrVII 1083289 . T C 314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;DP=23;Dels=0.00;FS=8.953;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.88;MQ0=0;MQRankSum=2.149;QD=13.65;ReadPosRankSum=-3.123;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,19:23:39:347,39,0 chrVII 1083316 . A T 526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.579;DP=36;Dels=0.00;FS=12.441;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=1;MQRankSum=0.495;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.014;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,31:36:60:559,60,0 chrVII 1083374 . G A 364.05 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.627;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.61;MQ0=7;MQRankSum=-0.484;QD=9.84;ReadPosRankSum=-2.627;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:22:397,22,0 chrVII 1083379 . T C 236 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.49;MQ0=7;QD=8.14;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:30:269,30,0 chrVII 1083404 . T G 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=15;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.01;MQ0=6;MQRankSum=0.573;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.203;SB=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:44:62,0,44 chrVII 1083423 . G A 110.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.41;MQ0=1;QD=13.78;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15:143,15,0 chrVII 1083425 . G A 44.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.41;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.937;SB=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:39:74,0,39 chrVII 1083426 . G A 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.41;MQ0=1;MQRankSum=0.550;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.937;SB=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:42:73,0,42 chrVII 1083429 . G A 44.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.41;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.937;SB=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:40:74,0,40 chrVII 1083430 . G A 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.41;MQ0=1;MQRankSum=-0.550;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.300;SB=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:40:71,0,40 chrVII 1083434 . G A 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.41;MQ0=1;MQRankSum=0.550;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.937;SB=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:38:71,0,38 chrVII 1083451 . A G 64.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.75;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.572;SB=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:14:94,0,14 chrVII 1083467 . T C 126.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.27;MQ0=0;QD=14.01;SB=-1.076e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:159,18,0 chrVII 1083474 . A G 156.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.99;MQ0=0;QD=15.61;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:189,21,0 chrVII 1083492 . A G 81.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;DP=11;Dels=0.00;FS=9.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.597;SB=-5.834e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:64:111,0,64 chrVII 1083495 . A G 29.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=11;Dels=0.00;FS=9.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.38;MQ0=0;MQRankSum=2.520;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-3.425e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:59:59,0,115 chrVII 1083498 . A G 153.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.99;MQ0=0;QD=15.31;SB=-5.494e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:186,21,0 chrVII 1083505 . A G 11.34 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=1.62;ReadPosRankSum=1.754;SB=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:41:41,0,45 chrVII 1083520 . T C 47.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.92;MQ0=0;QD=8.00;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:80,9,0 chrVII 1083521 . A G 14.20 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.720;SB=-9.284e-04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:20:44,0,20 chrVII 1083539 . T C 276 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.49;MQ0=0;QD=19.71;SB=-1.559e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:36:309,36,0 chrVII 1083541 . C T 192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.415;DP=15;Dels=0.00;FS=15.911;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.78;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-7.098e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:42:222,0,42 chrVII 1083596 . A T 379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;DP=28;Dels=0.00;FS=6.994;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=13.54;ReadPosRankSum=2.466;SB=-1.437e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:98:409,0,98 chrVII 1083619 . G A 376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.280;DP=28;Dels=0.00;FS=6.994;HaplotypeScore=3.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=13.43;ReadPosRankSum=-2.009;SB=-1.396e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:96:406,0,96 chrVII 1083624 . A T 508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.97;MQ0=0;QD=21.17;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:57:541,57,0 chrVII 1083637 . A G 181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.594;DP=22;Dels=0.00;FS=1.740;HaplotypeScore=6.5055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=8.23;ReadPosRankSum=-2.011;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:211,0,147 chrVII 1083655 . T G 103.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.338;DP=19;Dels=0.00;FS=7.701;HaplotypeScore=11.6989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.68;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.986;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:133,0,153 chrVII 1083662 . A G 136.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.298;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.44;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.648;SB=-5.626e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,9:15:15:169,15,0 chrVII 1083664 . G A 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;DP=15;Dels=0.00;FS=8.675;HaplotypeScore=14.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.177;SB=-3.900e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:57:66,0,57 chrVII 1083705 . A C 53.19 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=9.9401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.742;SB=13.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:8:9:85,9,0 chrVII 1083709 . A G 53.39 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=9;Dels=0.00;FS=14.472;HaplotypeScore=8.9031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.63;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.589;SB=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,6:9:9:85,9,0 chrVII 1083725 . C T 82.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.03;MQ0=0;QD=16.50;SB=-5.055e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:115,12,0 chrVII 1083754 . C T 101.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.84;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.736;SB=-2.876e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:7:15:134,15,0 chrVII 1083765 . C T 102.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.08;MQ0=0;QD=11.36;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:15:135,15,0 chrVII 1083769 . A G 93.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.08;MQ0=0;QD=10.36;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:15:126,15,0 chrVII 1083781 . G A 106.42 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=11;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=8.7318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.26;MQ0=1;MQRankSum=1.214;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.214;SB=-7.542e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:7:136,0,7 chrVII 1083785 . T G 123.64 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.1305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.77;MQ0=2;MQRankSum=0.423;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.606;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:5:153,0,5 chrVII 1083803 . C T 96.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.887;DP=21;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=17.7681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.52;MQ0=6;MQRankSum=-0.059;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:54:126,0,54 chrVII 1083805 . G A 47.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.059;DP=22;Dels=0.00;FS=11.994;HaplotypeScore=15.9271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.19;MQ0=6;MQRankSum=1.246;QD=2.14;ReadPosRankSum=1.813;SB=-3.504e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:77:77,0,97 chrVII 1083846 . A C 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.388;DP=32;Dels=0.00;FS=2.017;HaplotypeScore=10.1882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.73;MQ0=13;MQRankSum=-1.755;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.612;SB=-4.897e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:89:89,0,155 chrVII 1083875 . A C 599 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.46;MQ0=12;QD=13.61;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:63:632,63,0 chrVII 1083888 . C T 769 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.646;DP=51;Dels=0.00;FS=3.468;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.85;MQ0=11;MQRankSum=1.126;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:62:802,62,0 chrVII 1083925 . T G 141.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.600;DP=57;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=33.6014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.63;MQ0=7;MQRankSum=0.829;QD=2.47;ReadPosRankSum=-1.511;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:171,0,740 chrVII 1083926 . T A 150.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.556;DP=55;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=33.6014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.24;MQ0=5;MQRankSum=0.920;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.601;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:180,0,735 chrVII 1083933 . A G 228.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.251;DP=54;Dels=0.00;FS=6.438;HaplotypeScore=35.1559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.55;MQ0=4;MQRankSum=1.924;QD=4.22;ReadPosRankSum=4.523;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:258,0,650 chrVII 1083947 . T C 258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.951;DP=49;Dels=0.02;FS=8.862;HaplotypeScore=34.6695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.52;MQ0=3;MQRankSum=1.487;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.112;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:288,0,523 chrVII 1083971 . G A 121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.632;DP=38;Dels=0.00;FS=3.344;HaplotypeScore=35.0438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.69;MQ0=3;MQRankSum=1.199;QD=3.18;ReadPosRankSum=-2.798;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:151,0,400 chrVII 1083976 . G A 94.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.641;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=36.0172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.08;MQ0=3;MQRankSum=1.022;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:99:124,0,416 chrVII 1084000 . C G 82.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;DP=23;Dels=0.00;FS=3.982;HaplotypeScore=8.8757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.047;QD=3.57;ReadPosRankSum=1.795;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:112,0,193 chrVII 1084008 . G A 299 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8339;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.31;MQ0=0;QD=14.95;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:36:332,36,0 chrVII 1084026 . G A 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=8.8989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.13;MQ0=1;MQRankSum=0.922;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-2.350e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:43:43,0,43 chrVII 1084031 . A G 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=9;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=9.9510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.572;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:45:45,0,47 chrVII 1084034 . G A 44.06 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=9;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=8.9563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.421;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.421;SB=-2.555e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:16:74,0,16 chrVII 1084046 . G A 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=7.8414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.13;MQ0=1;MQRankSum=-0.198;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-6.491e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:42:42,0,43 chrVII 1084074 . G A 50.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.47;MQ0=1;MQRankSum=0.731;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:9:83,9,0 chrVII 1084094 . T C 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=7;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.34;MQ0=1;MQRankSum=0.406;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.988;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:36:42,0,36 chrVII 1084103 . A G 43.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.73;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.736;SB=-5.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:9:76,9,0 chrVII 1084114 . T G 43.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8404;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=1;MQRankSum=0.747;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.747;SB=-7.956e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:9:76,9,0 chrVII 1084160 . G A 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.533;DP=12;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=20.5682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.20;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.461;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:35:71,0,35 chrVII 1084186 . A G 29.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;DP=11;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=9.8125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.12;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-1.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:59:59,0,68 chrVII 1084191 . A G 59.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;DP=12;Dels=0.00;FS=10.925;HaplotypeScore=10.8851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.380;SB=-6.150e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:41:89,0,41 chrVII 1084197 . G A 10.42 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.793;DP=12;Dels=0.00;FS=10.925;HaplotypeScore=10.9297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.20;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:40:40,0,85 chrVII 1084199 . C T 68.11 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;DP=11;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=9.9350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.739;SB=-5.006e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:98,0,13 chrVII 1084204 . G A 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=9.9239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.296;SB=-2.949e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:40:71,0,40 chrVII 1084232 . A G 63.07 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.05;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.736;SB=-4.811e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:15:93,0,15 chrVII 1084297 . T G 725 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9506;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.51;MQ0=0;QD=23.39;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:75:758,75,0 chrVII 1084298 . T A 753 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.51;MQ0=0;QD=24.29;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:75:786,75,0 chrVII 1084303 . G A 548.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.727;DP=31;Dels=0.00;FS=2.034;HaplotypeScore=5.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=17.68;ReadPosRankSum=1.669;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:31:28:578,0,28 chrVII 1084329 . G C 281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;DP=29;Dels=0.00;FS=6.152;HaplotypeScore=4.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.02;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=9.69;ReadPosRankSum=-2.855;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:29:99:311,0,253 chrVIII 6 . A C 138.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.495;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=42.4395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.97;MQ0=1;MQRankSum=-2.376;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,29:62:99:168,0,157 chrVIII 48 . C T 162.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;DP=142;Dels=0.00;FS=4.434;HaplotypeScore=131.0866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.38;MQ0=1;MQRankSum=2.080;QD=1.14;ReadPosRankSum=5.280;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,19:142:99:192,0,2298 chrVIII 51 . C T 169.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.417;DP=154;Dels=0.00;FS=11.047;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.33;MQ0=0;MQRankSum=2.104;QD=1.10;ReadPosRankSum=5.857;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,19:154:99:199,0,2439 chrVIII 66 . C T 71.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;DP=156;Dels=0.00;FS=17.513;HaplotypeScore=3.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=0.46;ReadPosRankSum=-5.758;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,30:156:99:101,0,2546 chrVIII 67 . T A 174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.340;DP=159;Dels=0.00;FS=12.748;HaplotypeScore=3.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=1.09;ReadPosRankSum=-5.644;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,36:159:99:204,0,2536 chrVIII 118 . C T 359.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;DP=150;Dels=0.00;FS=10.377;HaplotypeScore=7.4529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.42;MQ0=4;MQRankSum=0.726;QD=2.39;ReadPosRankSum=-4.078;SB=-6.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,27:150:99:389,0,1722 chrVIII 138 . A G 1677 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.01;MQ0=7;MQRankSum=0.874;QD=14.21;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,110:118:99:1710,153,0 chrVIII 229 . G C 312.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;DP=84;Dels=0.00;FS=8.838;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.76;MQ0=29;MQRankSum=-3.014;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,53:84:99:342,0,131 chrVIII 267 . G A 276.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;DP=58;Dels=0.00;FS=53.442;HaplotypeScore=13.2131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.78;MQ0=1;MQRankSum=1.343;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-6.498e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:306,0,110 chrVIII 268 . T C 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.975;DP=58;Dels=0.00;FS=29.079;HaplotypeScore=13.2131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.78;MQ0=1;MQRankSum=-1.767;QD=0.84;ReadPosRankSum=-1.554;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:79:79,0,341 chrVIII 320 . A G 243.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.488;DP=53;Dels=0.00;FS=8.484;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.10;MQ0=5;MQRankSum=0.843;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.096;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:273,0,462 chrVIII 355 . T C 749 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=32.8613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.77;MQ0=6;QD=19.71;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:84:782,84,0 chrVIII 361 . G A 306.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.43;MQ0=9;MQRankSum=0.360;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.630;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:336,0,245 chrVIII 444 . T A 132.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;DP=69;Dels=0.00;FS=23.005;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.22;MQ0=40;MQRankSum=2.914;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,11:69:99:162,0,105 chrVIII 472 . T C 160.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=85;Dels=0.00;FS=22.368;HaplotypeScore=17.2452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.87;MQ0=51;MQRankSum=3.129;QD=1.88;ReadPosRankSum=-1.730;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,11:85:99:190,0,104 chrVIII 988 . C T 293.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.546;DP=296;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=5.4120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.83;MQ0=52;MQRankSum=-0.069;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,148:296:99:323,0,377 chrVIII 1306 . C T 72.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.386;DP=158;Dels=0.00;FS=8.222;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.31;MQ0=82;MQRankSum=2.138;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.028;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:132,26:158:12:105,12,0 chrVIII 1396 . T C 181.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;DP=32;Dels=0.00;FS=21.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.74;MQ0=17;MQRankSum=3.366;QD=5.66;ReadPosRankSum=2.040;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,10:32:24:214,24,0 chrVIII 1399 . G T 216.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.001;DP=26;Dels=0.00;FS=24.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.16;MQ0=11;MQRankSum=3.001;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.164;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,13:26:27:249,27,0 chrVIII 1569 . G A 127.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.739;DP=67;Dels=0.00;FS=47.244;HaplotypeScore=4.3726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.68;MQ0=7;MQRankSum=4.254;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.340;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:67:99:157,0,218 chrVIII 1672 . A G 366.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.168;DP=166;Dels=0.00;FS=9.091;HaplotypeScore=3.9588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.82;MQ0=66;MQRankSum=0.031;QD=2.20;ReadPosRankSum=-5.884;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,31:166:99:396,0,1343 chrVIII 1708 . A G 238.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.094;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=32.0395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.37;MQ0=30;MQRankSum=1.102;QD=1.92;ReadPosRankSum=2.848;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,22:124:99:268,0,1307 chrVIII 1714 . A T 1066.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;DP=120;Dels=0.00;FS=9.516;HaplotypeScore=30.0512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.09;MQ0=28;MQRankSum=1.203;QD=8.88;ReadPosRankSum=-3.970;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:120:99:1096,0,657 chrVIII 1748 . T C 109.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.6831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.54;MQ0=47;MQRankSum=-0.163;QD=1.10;ReadPosRankSum=4.203;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,27:99:99:139,0,909 chrVIII 1780 . C A 131.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.225;DP=59;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=6.9511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.11;MQ0=40;MQRankSum=1.266;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.122;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:86:161,0,86 chrVIII 1784 . C T 54.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.395;DP=62;Dels=0.00;FS=4.722;HaplotypeScore=11.9152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.66;MQ0=41;MQRankSum=1.902;QD=0.87;ReadPosRankSum=1.977;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,10:62:84:84,0,154 chrVIII 1798 . G A 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;DP=57;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=13.2202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.59;MQ0=40;MQRankSum=0.537;QD=0.27;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-6.628e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,7:57:43:45,0,43 chrVIII 1799 . A G 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;DP=57;Dels=0.00;FS=13.554;HaplotypeScore=13.2202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.59;MQ0=40;MQRankSum=2.583;QD=0.22;ReadPosRankSum=1.107;SB=-6.588e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,5:57:42:42,0,45 chrVIII 1801 . G A 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;DP=55;Dels=0.00;FS=6.422;HaplotypeScore=12.2269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.80;MQ0=38;MQRankSum=1.197;QD=0.24;ReadPosRankSum=0.441;SB=-6.656e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,3:55:42:43,0,42 chrVIII 1804 . G T 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;DP=51;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=12.2248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.25;MQ0=34;MQRankSum=2.012;QD=0.30;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-6.628e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,2:51:43:45,0,43 chrVIII 1805 . G T 17.09 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;DP=51;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=11.2335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.25;MQ0=34;MQRankSum=1.416;QD=0.34;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-6.656e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,2:51:42:47,0,42 chrVIII 1816 . C A 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;DP=40;Dels=0.00;FS=1.958;HaplotypeScore=8.2422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.57;MQ0=22;MQRankSum=0.272;QD=0.35;ReadPosRankSum=0.906;SB=-6.793e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:39:44,0,39 chrVIII 1835 . A G 16.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.61;MQ0=13;MQRankSum=0.412;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.412;SB=-3.377e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:19:46,0,19 chrVIII 1846 . A G 48.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2134;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.31;MQ0=7;QD=2.13;SB=-9.134e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:9:81,9,0 chrVIII 1856 . C T 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.71;MQ0=5;MQRankSum=-0.323;QD=0.85;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-6.606e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:44:46,0,44 chrVIII 1871 . G A 18.10 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.33;MQ0=3;MQRankSum=0.851;QD=1.39;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-3.363e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:19:48,0,19 chrVIII 1892 . T C 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.44;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.358;SB=1.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:55,6,0 chrVIII 1897 . G C 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.79;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.380;SB=1.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:56,6,0 chrVIII 1901 . G A 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.79;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.380;SB=1.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:55,6,0 chrVIII 1902 . A C 19.81 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.79;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.380;SB=1.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:51,6,0 chrVIII 1910 . G C 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=5.1310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.27;MQ0=1;MQRankSum=1.380;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.380;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:56,6,0 chrVIII 1912 . C T 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.27;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:7:6:57,6,0 chrVIII 1913 . G T 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=4.2643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.27;MQ0=1;MQRankSum=1.380;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.380;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:56,6,0 chrVIII 1916 . T G 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.67;MQ0=2;MQRankSum=1.495;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.495;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,2:9:6:55,6,0 chrVIII 1922 . C G 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.099;DP=16;Dels=0.00;FS=8.921;HaplotypeScore=6.0762;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.98;MQ0=3;MQRankSum=2.073;QD=1.49;ReadPosRankSum=2.073;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,2:16:6:55,6,0 chrVIII 1924 . G C 18.82 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;DP=15;Dels=0.00;FS=10.414;HaplotypeScore=3.4960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.20;MQ0=3;MQRankSum=2.041;QD=1.25;ReadPosRankSum=2.041;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,2:15:6:50,6,0 chrVIII 1927 . G A 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.606;DP=22;Dels=0.00;FS=19.117;HaplotypeScore=3.4960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.87;MQ0=4;MQRankSum=2.606;QD=1.13;ReadPosRankSum=1.540;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,3:22:6:56,6,0 chrVIII 1930 . A G 43.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;DP=25;Dels=0.00;FS=12.155;HaplotypeScore=2.5802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.28;MQ0=5;MQRankSum=1.465;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,5:25:9:76,9,0 chrVIII 1960 . C T 153.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.459;DP=90;Dels=0.00;FS=7.086;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.71;MQ0=8;MQRankSum=3.365;QD=1.70;ReadPosRankSum=-3.290;SB=-9.200e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:73:183,0,73 chrVIII 1981 . G A 141.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;DP=107;Dels=0.00;FS=4.960;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.79;MQ0=11;MQRankSum=3.253;QD=1.32;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,32:107:99:171,0,178 chrVIII 2197 . T C 75.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;DP=84;Dels=0.00;FS=37.842;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.59;MQ0=49;MQRankSum=3.493;QD=0.89;ReadPosRankSum=4.778;SB=-4.305e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,14:84:14:105,0,14 chrVIII 2242 . C T 43.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.56;MQ0=1;QD=3.66;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:9:76,9,0 chrVIII 2243 . T C 42.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.20;MQ0=1;QD=3.91;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:9:75,9,0 chrVIII 5198 . G C 38.06 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.14;MQ0=6;MQRankSum=0.922;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-2.503e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:16:68,0,16 chrVIII 5232 . C T 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.642;DP=83;Dels=0.00;FS=3.605;HaplotypeScore=47.8916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.35;MQ0=14;MQRankSum=-0.928;QD=0.27;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:52:52,0,357 chrVIII 5266 . C T 771.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.983;DP=121;Dels=0.00;FS=3.300;HaplotypeScore=13.7330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.09;MQ0=27;MQRankSum=2.193;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.756;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:121:99:801,0,229 chrVIII 5298 . C T 796.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.265;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.5695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.05;MQ0=25;MQRankSum=0.651;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.780;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,83:124:99:826,0,263 chrVIII 5306 . C T 762.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.019;DP=124;Dels=0.00;FS=4.157;HaplotypeScore=4.3765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.06;MQ0=25;MQRankSum=2.324;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.709;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:792,0,283 chrVIII 5334 . C T 464.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.859;DP=93;Dels=0.00;FS=15.523;HaplotypeScore=17.5295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.51;MQ0=18;MQRankSum=0.080;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.908;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,43:93:99:494,0,350 chrVIII 5336 . G C 404.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.377;DP=91;Dels=0.00;FS=9.652;HaplotypeScore=17.5295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.49;MQ0=18;MQRankSum=-0.103;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.568;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:91:99:434,0,307 chrVIII 5358 . T C 103.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.286;DP=95;Dels=0.00;FS=8.110;HaplotypeScore=22.0249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.94;MQ0=13;MQRankSum=3.265;QD=1.08;ReadPosRankSum=5.034;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,13:95:99:133,0,545 chrVIII 5379 . T A 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.473;DP=65;Dels=0.00;FS=17.575;HaplotypeScore=13.1136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.71;MQ0=2;MQRankSum=-4.110;QD=0.25;ReadPosRankSum=-2.003;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,55:65:46:46,0,203 chrVIII 5477 . C T 368.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.140;DP=83;Dels=0.00;FS=10.242;HaplotypeScore=9.0955;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.67;MQ0=3;MQRankSum=-0.051;QD=4.43;ReadPosRankSum=-2.659;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,78:83:24:401,24,0 chrVIII 5489 . G A 809 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.62;MQ0=5;QD=6.80;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:87:842,87,0 chrVIII 5556 . C T 1670 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.11;MQ0=6;QD=7.88;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:212:99:1703,165,0 chrVIII 5586 . T C 182.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.935;DP=128;Dels=0.00;FS=19.178;HaplotypeScore=4.7071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.54;MQ0=4;MQRankSum=2.238;QD=1.42;ReadPosRankSum=-4.548;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,31:128:99:212,0,663 chrVIII 5600 . T C 164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.455;DP=86;Dels=0.00;FS=42.576;HaplotypeScore=7.6282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.54;MQ0=3;MQRankSum=-1.537;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.005;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,39:86:99:194,0,377 chrVIII 5601 . A G 148.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.649;DP=85;Dels=0.00;FS=27.735;HaplotypeScore=5.6450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.44;MQ0=4;MQRankSum=-1.273;QD=1.74;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:178,0,383 chrVIII 5619 . C T 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.703;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.60;MQ0=4;MQRankSum=-0.203;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.792;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:47:47,0,122 chrVIII 5625 . T C 38.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=37;Dels=0.00;FS=2.945;HaplotypeScore=2.6652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.19;MQ0=4;MQRankSum=-0.755;QD=1.03;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:68:68,0,137 chrVIII 5631 . A G 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.02;MQ0=5;MQRankSum=-1.230;QD=1.30;ReadPosRankSum=-1.918;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:73:73,0,87 chrVIII 5635 . T C 57.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;DP=34;Dels=0.00;FS=2.741;HaplotypeScore=4.8757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.92;MQ0=5;MQRankSum=1.078;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.895;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:76:87,0,76 chrVIII 5642 . T C 141.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.51;MQ0=5;MQRankSum=-1.236;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:28:171,0,28 chrVIII 5645 . T C 138.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.97;MQ0=5;MQRankSum=0.714;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-7.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:52:168,0,52 chrVIII 5690 . A C 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;DP=37;Dels=0.00;FS=20.195;HaplotypeScore=3.7057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.53;MQ0=3;MQRankSum=0.610;QD=1.16;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-6.518e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,6:37:73:73,0,211 chrVIII 5709 . C G 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;DP=35;Dels=0.00;FS=3.746;HaplotypeScore=14.1577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.16;MQ0=2;MQRankSum=-2.459;QD=1.20;ReadPosRankSum=3.697;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:72:72,0,212 chrVIII 5724 . C T 230.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.55;MQ0=2;QD=10.00;SB=-1.359e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:27:263,27,0 chrVIII 5736 . C A 60.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.037;DP=23;Dels=0.00;FS=4.652;HaplotypeScore=2.8471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.09;MQ0=1;MQRankSum=-0.034;QD=2.61;ReadPosRankSum=2.013;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:90:90,0,119 chrVIII 5817 . C T 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.59;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.922;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:6:58,6,0 chrVIII 5822 . G T 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.59;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.736;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:7:6:54,6,0 chrVIII 5844 . C T 52.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.13;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.159;SB=-5.521e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,4:9:9:85,9,0 chrVIII 5856 . G A 52.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=3.8313;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.13;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.762;SB=-5.521e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:9:85,9,0 chrVIII 5865 . T G 51.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7470;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.12;MQ0=0;QD=6.50;SB=-2.721e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:84,9,0 chrVIII 5874 . G A 52.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.185;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.0756;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.52;MQ0=0;MQRankSum=2.404;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.479;SB=-2.721e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,3:12:9:85,9,0 chrVIII 5896 . T C 20.80 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.8161;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.65;MQ0=1;QD=1.89;SB=-2.476e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:11:6:52,6,0 chrVIII 5898 . T C 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.9845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.65;MQ0=1;QD=2.16;SB=-2.576e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:11:6:55,6,0 chrVIII 5901 . G C 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.6496;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.65;MQ0=1;MQRankSum=1.733;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-2.576e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,2:11:6:55,6,0 chrVIII 5905 . C A 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;DP=14;Dels=0.00;FS=15.355;HaplotypeScore=6.8058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.73;MQ0=1;MQRankSum=0.312;QD=0.88;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-1.995e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:42:42,0,50 chrVIII 5992 . G C 367.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;DP=78;Dels=0.00;FS=6.530;HaplotypeScore=10.4523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.48;MQ0=28;MQRankSum=1.631;QD=4.71;ReadPosRankSum=1.337;SB=-1.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:397,0,143 chrVIII 6063 . A G 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;DP=59;Dels=0.00;FS=17.422;HaplotypeScore=10.7774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.39;MQ0=27;MQRankSum=2.803;QD=0.70;ReadPosRankSum=-3.062;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,6:59:71:71,0,123 chrVIII 6067 . G A 65.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.545;DP=59;Dels=0.00;FS=16.394;HaplotypeScore=12.7285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.13;MQ0=26;MQRankSum=2.400;QD=1.10;ReadPosRankSum=-3.017;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,8:59:95:95,0,142 chrVIII 6098 . A G 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;DP=64;Dels=0.00;FS=1.331;HaplotypeScore=4.6518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.95;MQ0=21;MQRankSum=-1.016;QD=0.41;ReadPosRankSum=-0.849;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,11:64:56:56,0,483 chrVIII 6119 . G C 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;DP=76;Dels=0.00;FS=3.369;HaplotypeScore=14.3130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.28;MQ0=16;MQRankSum=2.484;QD=0.54;ReadPosRankSum=-1.428;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,9:76:71:71,0,704 chrVIII 6128 . C T 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.554;DP=69;Dels=0.00;FS=7.679;HaplotypeScore=5.8293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.59;MQ0=15;MQRankSum=3.657;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,7:69:86:86,0,737 chrVIII 6148 . T A 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;DP=86;Dels=0.00;FS=13.731;HaplotypeScore=6.7886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.25;MQ0=23;MQRankSum=3.871;QD=0.50;ReadPosRankSum=1.331;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,8:86:73:73,0,755 chrVIII 6149 . T G 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;DP=87;Dels=0.00;FS=8.550;HaplotypeScore=6.7886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.18;MQ0=23;MQRankSum=3.090;QD=0.45;ReadPosRankSum=0.734;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,9:87:69:69,0,756 chrVIII 6171 . G A 30.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.766;DP=90;Dels=0.00;FS=14.575;HaplotypeScore=6.8564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.12;MQ0=34;MQRankSum=4.137;QD=0.33;ReadPosRankSum=0.421;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,7:90:60:60,0,660 chrVIII 6296 . C T 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.939;DP=68;Dels=0.00;FS=20.937;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.10;MQ0=40;MQRankSum=0.180;QD=0.18;ReadPosRankSum=-3.299;SB=-5.431e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,5:68:42:42,0,309 chrVIII 6303 . C T 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.419;DP=68;Dels=0.00;FS=20.937;HaplotypeScore=14.2939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.10;MQ0=40;MQRankSum=0.300;QD=0.18;ReadPosRankSum=-2.219;SB=-5.431e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,5:68:42:42,0,330 chrVIII 6345 . T C 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=27;Dels=0.00;FS=19.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.02;MQ0=10;MQRankSum=-0.529;QD=1.52;ReadPosRankSum=2.646;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:71:71,0,102 chrVIII 6361 . C T 70.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.93;MQ0=6;QD=5.42;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,7:13:12:103,12,0 chrVIII 6377 . C T 38.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.36;MQ0=5;QD=3.54;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,6:11:9:71,9,0 chrVIII 6442 . G A 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.35;MQ0=0;QD=2.23;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:49,6,0 chrVIII 6465 . T C 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.05;MQ0=0;QD=1.78;SB=-1.706e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:49,6,0 chrVIII 6484 . T C 360.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.45;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=15.65;ReadPosRankSum=-1.909;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:26:393,26,0 chrVIII 6523 . T C 435 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.51;MQ0=1;MQRankSum=1.337;QD=15.00;ReadPosRankSum=1.931;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,26:29:51:468,51,0 chrVIII 6529 . T G 460 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7478;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=1;MQRankSum=1.890;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.967;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,25:28:51:493,51,0 chrVIII 6531 . A C 466 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.625;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7478;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=1;MQRankSum=0.625;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.491;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:28:51:499,51,0 chrVIII 6600 . G A 475 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6389;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.33;MQ0=0;QD=16.96;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:54:508,54,0 chrVIII 6609 . T C 157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.678;DP=32;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=4.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.17;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.893;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:187,0,291 chrVIII 6611 . C T 587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7985;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.21;MQ0=0;QD=20.24;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:66:620,66,0 chrVIII 6643 . C T 692 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.46;MQ0=0;QD=20.35;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:72:725,72,0 chrVIII 6644 . C T 293.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;DP=34;Dels=0.00;FS=9.936;HaplotypeScore=2.7476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.249;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:323,0,227 chrVIII 6645 . T G 291.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;DP=34;Dels=0.00;FS=5.188;HaplotypeScore=3.6635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.46;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.673;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:321,0,231 chrVIII 6734 . G A 125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;DP=38;Dels=0.00;FS=6.932;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.69;MQ0=3;MQRankSum=-0.253;QD=3.29;ReadPosRankSum=-1.801;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:155,0,357 chrVIII 6737 . G A 582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.81;MQ0=3;QD=16.17;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:60:615,60,0 chrVIII 6761 . G A 96.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;DP=29;Dels=0.00;FS=5.849;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.33;MQ0=4;MQRankSum=-0.311;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.028;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:126,0,246 chrVIII 6770 . G A 84.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;DP=23;Dels=0.00;FS=6.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.37;MQ0=4;MQRankSum=0.372;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.124;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:114,0,153 chrVIII 6778 . A C 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.715;DP=23;Dels=0.00;FS=6.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.37;MQ0=4;MQRankSum=0.122;QD=5.09;ReadPosRankSum=-1.429;SB=-7.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:147,0,114 chrVIII 6799 . C A 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.86;MQ0=3;MQRankSum=-1.453;QD=1.16;ReadPosRankSum=1.453;SB=-6.512e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:45:45,0,78 chrVIII 6812 . A G 34.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.26;MQ0=3;QD=3.50;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:67,9,0 chrVIII 7109 . C T 41.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=0;QD=13.92;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:73,6,0 chrVIII 7140 . T A 39.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=0;QD=13.25;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:71,6,0 chrVIII 7141 . A T 39.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=0;QD=13.25;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:71,6,0 chrVIII 7338 . A G 14.18 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.25;MQ0=6;MQRankSum=0.736;QD=1.58;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:3:44,3,0 chrVIII 7354 . T C 14.18 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.09;MQ0=2;QD=2.84;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:3:44,3,0 chrVIII 11962 . A C 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.40;MQ0=31;MQRankSum=-1.333;QD=0.71;ReadPosRankSum=0.000;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,6:45:62:62,0,178 chrVIII 11963 . C T 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.933;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.13;MQ0=33;MQRankSum=-1.333;QD=0.70;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:63:63,0,179 chrVIII 11971 . G A 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.97;MQ0=34;MQRankSum=-0.919;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.674;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,6:49:62:62,0,179 chrVIII 12142 . G A 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.327;DP=71;Dels=0.00;FS=17.043;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.87;MQ0=37;MQRankSum=1.378;QD=0.83;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,7:71:89:89,0,526 chrVIII 12184 . A C 181.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.262;DP=71;Dels=0.00;FS=44.730;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.46;MQ0=46;MQRankSum=2.742;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.779;SB=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:71:99:211,0,228 chrVIII 12262 . G A 68.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;DP=21;Dels=0.00;FS=32.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.82;MQ0=7;MQRankSum=1.276;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-2.858e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:13:98,0,13 chrVIII 12276 . G A 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.91;MQ0=1;QD=1.98;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:57,6,0 chrVIII 12332 . A G 210.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.808;DP=19;Dels=0.00;FS=45.028;HaplotypeScore=3.7402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.11;MQ0=1;MQRankSum=3.442;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-1.946e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,11:19:27:243,27,0 chrVIII 12344 . G T 211.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.379;DP=19;Dels=0.00;FS=36.403;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=2;MQRankSum=3.059;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-1.946e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,11:19:27:244,27,0 chrVIII 12345 . G T 202.19 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;DP=19;Dels=0.00;FS=10.792;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=2;MQRankSum=1.159;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.448;SB=-1.198e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,11:19:8:234,8,0 chrVIII 12348 . T A 239 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.056;DP=20;Dels=0.00;FS=26.107;HaplotypeScore=6.8138;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.67;MQ0=2;MQRankSum=3.154;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.183;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,13:20:30:272,30,0 chrVIII 12353 . A G 186.22 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;DP=20;Dels=0.00;FS=8.625;HaplotypeScore=9.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.67;MQ0=2;MQRankSum=0.632;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.054;SB=-3.224e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:10:216,0,10 chrVIII 12367 . G A 104.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.641;DP=27;Dels=0.00;FS=38.166;HaplotypeScore=17.9037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.72;MQ0=2;MQRankSum=1.252;QD=3.85;ReadPosRankSum=3.408;SB=-6.502e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:134,0,223 chrVIII 12400 . G T 159.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.343;DP=33;Dels=0.00;FS=27.985;HaplotypeScore=7.4666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.32;MQ0=1;MQRankSum=0.264;QD=4.82;ReadPosRankSum=-4.267;SB=-6.518e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:189,0,288 chrVIII 12403 . T C 144.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.338;DP=33;Dels=0.00;FS=45.313;HaplotypeScore=8.4244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.32;MQ0=1;MQRankSum=1.074;QD=4.36;ReadPosRankSum=-3.914;SB=-6.518e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:174,0,300 chrVIII 12409 . A G 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;DP=26;Dels=0.00;FS=19.071;HaplotypeScore=8.4244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.96;MQ0=1;MQRankSum=0.272;QD=0.51;ReadPosRankSum=-2.374;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:26:43:43,0,278 chrVIII 12452 . T C 276 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.750;DP=19;Dels=0.00;FS=14.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=14.53;ReadPosRankSum=-2.050;SB=-8.198e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,15:19:33:309,33,0 chrVIII 12481 . T C 233.34 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;DP=22;Dels=0.00;FS=8.653;HaplotypeScore=18.7541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.72;MQ0=0;MQRankSum=2.105;QD=10.61;ReadPosRankSum=2.392;SB=-3.341e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:8:263,0,8 chrVIII 12505 . A G 594 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.31;MQ0=0;QD=20.48;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:69:627,69,0 chrVIII 12511 . T A 596 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.18;MQ0=0;QD=22.07;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:69:629,69,0 chrVIII 12512 . T C 576 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.18;MQ0=0;QD=21.33;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:69:609,69,0 chrVIII 12513 . A C 577 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.18;MQ0=0;QD=21.37;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:69:610,69,0 chrVIII 12520 . T C 618 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQ0=0;QD=22.07;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:72:651,72,0 chrVIII 12522 . A G 623 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.25;MQ0=0;QD=22.25;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:72:656,72,0 chrVIII 12528 . G A 597 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.11;MQ0=0;QD=22.96;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:72:630,72,0 chrVIII 12529 . G T 580 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.11;MQ0=0;QD=22.31;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:72:613,72,0 chrVIII 12530 . C G 581 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.11;MQ0=0;QD=22.35;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:72:614,72,0 chrVIII 12533 . G A 606 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=17.31;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:72:639,72,0 chrVIII 12537 . C A 603 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=17.23;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:72:636,72,0 chrVIII 12546 . 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T A 1383 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.28;MQ0=0;QD=17.51;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1416,156,0 chrVIII 12616 . T A 1445 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.03;MQ0=0;QD=15.54;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:1478,162,0 chrVIII 12630 . A G 2220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.88;MQ0=0;QD=21.14;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2253,246,0 chrVIII 12662 . A G 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;DP=114;Dels=0.00;FS=14.982;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.01;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=23.21;ReadPosRankSum=1.147;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,110:114:99:2679,266,0 chrVIII 12664 . G A 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.918;DP=114;Dels=0.00;FS=14.982;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.01;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=23.92;ReadPosRankSum=1.101;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,110:114:99:2760,270,0 chrVIII 12721 . T A 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.142;DP=117;Dels=0.00;FS=5.265;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.25;MQ0=0;MQRankSum=2.077;QD=24.96;ReadPosRankSum=1.207;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,113:117:99:2953,287,0 chrVIII 12722 . T G 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.142;DP=120;Dels=0.00;FS=5.295;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.71;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=23.82;ReadPosRankSum=1.440;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,116:120:99:2891,293,0 chrVIII 12758 . A G 2510 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.24;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2543,282,0 chrVIII 12791 . C T 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.43;MQ0=0;QD=25.81;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3182,327,0 chrVIII 12803 . G T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=26.94;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3266,336,0 chrVIII 12866 . G A 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.34;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3438,337,0 chrVIII 12931 . G A 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.55;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3548,358,0 chrVIII 12972 . T C 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.09;MQ0=0;QD=23.30;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3039,339,0 chrVIII 12985 . C T 4409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.91;MQ0=0;QD=25.63;SB=-2.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4409,454,0 chrVIII 13001 . G A 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3494,352,0 chrVIII 13117 . T G 3827.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3827,396,0 chrVIII 13126 . T C 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3651,384,0 chrVIII 13155 . C T 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.18;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3607,369,0 chrVIII 13185 . A G 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3568,372,0 chrVIII 13244 . C T 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3868,388,0 chrVIII 13277 . A C 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3572,369,0 chrVIII 13526 . A G 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3031,318,0 chrVIII 13589 . A G 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=1;QD=25.89;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2777,291,0 chrVIII 13787 . A G 2655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;DP=109;Dels=0.00;FS=3.747;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=24.36;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2688,254,0 chrVIII 13851 . G A 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.594;DP=125;Dels=0.00;FS=3.410;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.455;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3187,289,0 chrVIII 13901 . C T 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2939,297,0 chrVIII 13934 . A G 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3061,327,0 chrVIII 13957 . G T 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2891,309,0 chrVIII 14034 . A C 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3145,309,0 chrVIII 14074 . C T 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2682,267,0 chrVIII 14102 . T G 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2480,261,0 chrVIII 14130 . G C 2209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2242,237,0 chrVIII 14146 . C T 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3125,318,0 chrVIII 14198 . G A 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3115,318,0 chrVIII 14381 . T C 2340 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0868;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2373,261,0 chrVIII 14584 . G C 1447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8923;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=20.97;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:69:99:1480,159,0 chrVIII 14669 . C T 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.66;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2650,258,0 chrVIII 14685 . T C 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3436,333,0 chrVIII 14739 . G A 3725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=1;QD=25.69;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3725,370,0 chrVIII 14784 . A G 2208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.634;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=1;MQRankSum=1.307;QD=20.64;ReadPosRankSum=1.634;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,105:107:99:2241,241,0 chrVIII 15755 . T C 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2949,312,0 chrVIII 15928 . T C 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=129;Dels=0.00;FS=3.364;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=21.64;ReadPosRankSum=-1.326;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:2825,300,0 chrVIII 16308 . T C 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=1;QD=24.49;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3119,336,0 chrVIII 16326 . G A 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=1;QD=25.59;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3327,339,0 chrVIII 16461 . A G 2151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.92;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2184,231,0 chrVIII 16717 . T C 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3497,360,0 chrVIII 16733 . G A 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3711,372,0 chrVIII 16805 . A G 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3385,348,0 chrVIII 16849 . G C 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3226,342,0 chrVIII 17120 . A C 1959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.78;MQ0=0;QD=21.06;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:1992,219,0 chrVIII 17127 . T A 1611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=75.3972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.47;MQ0=0;QD=16.44;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:1644,174,0 chrVIII 17132 . T G 1543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=78.3715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.58;MQ0=0;QD=17.94;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1576,171,0 chrVIII 17151 . A G 1737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.93;MQ0=0;QD=18.68;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:1770,201,0 chrVIII 17157 . A G 1903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.55;MQ0=0;QD=19.82;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:1936,210,0 chrVIII 17359 . A T 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3432,348,0 chrVIII 17470 . T C 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3675,390,0 chrVIII 17528 . G C 2471 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=45.5711;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=22.67;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2504,261,0 chrVIII 17641 . G A 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2744,288,0 chrVIII 18917 . G A 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4033,409,0 chrVIII 18954 . T C 4319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4319,438,0 chrVIII 19013 . G A 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3355,343,0 chrVIII 19035 . G A 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3330,345,0 chrVIII 19101 . A G 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3584,360,0 chrVIII 19172 . G A 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.12;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3084,315,0 chrVIII 19872 . G T 3562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3562,378,0 chrVIII 19879 . C T 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3717,384,0 chrVIII 21198 . T C 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3591,393,0 chrVIII 21351 . A T 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3211,321,0 chrVIII 21975 . G A 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=1;QD=24.42;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2646,270,0 chrVIII 22203 . C T 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3720,370,0 chrVIII 23105 . T C 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2749,282,0 chrVIII 23501 . T C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3389,339,0 chrVIII 23604 . T C 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3219,330,0 chrVIII 23611 . T C 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3289,342,0 chrVIII 23641 . T C 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3046,318,0 chrVIII 23734 . C T 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3538,352,0 chrVIII 24238 . G A 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2896,297,0 chrVIII 24273 . C T 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3361,348,0 chrVIII 24484 . G A 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3105,327,0 chrVIII 24487 . T G 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3013,318,0 chrVIII 24526 . C T 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3100,315,0 chrVIII 24674 . C T 3998.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3998,403,0 chrVIII 24799 . A G 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3439,363,0 chrVIII 24880 . T G 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3370,351,0 chrVIII 24929 . A G 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3378,354,0 chrVIII 25004 . C T 3925.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3925,403,0 chrVIII 25276 . G A 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3986,397,0 chrVIII 25318 . C T 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3355,348,0 chrVIII 25348 . A G 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3786,399,0 chrVIII 25360 . T C 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4012,417,0 chrVIII 25432 . G A 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3522,363,0 chrVIII 25522 . G T 4608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.18;SB=-2.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4608,457,0 chrVIII 25552 . C A 4868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7599;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4868,490,0 chrVIII 25581 . T C 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=25.89;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3858,400,0 chrVIII 25653 . G A 3461.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.16;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3461,355,0 chrVIII 25656 . T C 2992 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.59;MQ0=0;QD=24.52;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3025,324,0 chrVIII 25657 . C G 2840 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.72;MQ0=0;QD=23.09;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2873,327,0 chrVIII 25673 . T A 2736 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=23.59;ReadPosRankSum=1.493;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2769,291,0 chrVIII 25676 . A T 2707 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.35;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2740,288,0 chrVIII 25677 . C T 2742 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.35;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2775,288,0 chrVIII 25834 . G A 3409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3409,366,0 chrVIII 25892 . C T 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3225,328,0 chrVIII 25898 . C T 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3222,328,0 chrVIII 25911 . T C 2473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2506,273,0 chrVIII 25945 . G A 2600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.74;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2633,270,0 chrVIII 26799 . G A 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3988,403,0 chrVIII 27080 . A G 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3648,396,0 chrVIII 27920 . T A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;DP=107;Dels=0.00;FS=3.614;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1144,0,1206 chrVIII 27969 . A G 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.79;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2955,303,0 chrVIII 27972 . A C 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.41;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2882,297,0 chrVIII 27988 . A C 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2852,297,0 chrVIII 27996 . T G 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=23.04;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3212,333,0 chrVIII 28030 . C T 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.92;ReadPosRankSum=1.703;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:2783,262,0 chrVIII 28073 . C T 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3255,325,0 chrVIII 28143 . A G 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.334;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,149:151:99:3648,337,0 chrVIII 28335 . A G 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3339,348,0 chrVIII 28356 . T C 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=22.49;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2574,270,0 chrVIII 28362 . G T 2580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=23.67;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2613,264,0 chrVIII 28416 . C T 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2823,294,0 chrVIII 28452 . T C 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2964,303,0 chrVIII 28477 . T C 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=26.28;ReadPosRankSum=1.499;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3522,348,0 chrVIII 28758 . C T 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2933,294,0 chrVIII 28833 . G A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.439;DP=129;Dels=0.00;FS=12.090;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.266;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:129:99:1194,0,1419 chrVIII 28917 . A G 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3042,327,0 chrVIII 29141 . T C 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2658,267,0 chrVIII 29200 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;DP=101;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.792;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1091,0,1032 chrVIII 29692 . G A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.065;DP=103;Dels=0.00;FS=3.743;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.069;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1080,0,1024 chrVIII 29709 . T A 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.38;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2724,273,0 chrVIII 29763 . C T 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.728;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:839,0,1003 chrVIII 29863 . G A 2258 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=26.88;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2291,225,0 chrVIII 30017 . T C 590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.998;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.651;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:620,0,839 chrVIII 30051 . C T 1986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.48;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2019,201,0 chrVIII 30151 . G A 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;DP=96;Dels=0.00;FS=3.748;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.418;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:952,0,965 chrVIII 30386 . C T 2758 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2791,270,0 chrVIII 30556 . T C 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3013,312,0 chrVIII 30589 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.350;DP=100;Dels=0.00;FS=13.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.224;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1116,0,1041 chrVIII 30659 . T C 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.47;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2971,309,0 chrVIII 30979 . C T 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3414,360,0 chrVIII 31011 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.734;DP=104;Dels=0.00;FS=8.382;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.242;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1276,0,965 chrVIII 31041 . G A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.120;DP=106;Dels=0.00;FS=13.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.907;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,62:106:99:1382,0,846 chrVIII 31175 . A C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.457;DP=114;Dels=0.00;FS=5.793;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1321,0,1047 chrVIII 31191 . A G 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.114;DP=141;Dels=0.00;FS=10.759;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.443;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1591,0,1358 chrVIII 31196 . T G 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3680,390,0 chrVIII 31221 . T C 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.530;DP=131;Dels=0.00;FS=3.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.400;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1446,0,1313 chrVIII 31280 . C A 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.945;DP=132;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1473,0,1285 chrVIII 31447 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.695;DP=136;Dels=0.00;FS=2.221;HaplotypeScore=2.6287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=2.187;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.077;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,56:136:99:1152,0,1785 chrVIII 31482 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.894;DP=139;Dels=0.00;FS=6.609;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.942;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.664;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1198,0,1709 chrVIII 31566 . A G 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.558;DP=125;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.655;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,50:125:99:935,0,1621 chrVIII 31709 . T C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.018;DP=165;Dels=0.00;FS=8.084;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=-1.410;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.433;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1546,0,1746 chrVIII 31821 . A G 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;DP=127;Dels=0.00;FS=5.715;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.032;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,80:127:99:1793,0,937 chrVIII 31868 . A G 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.549;DP=139;Dels=0.00;FS=14.104;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.606;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1596,0,1378 chrVIII 31903 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;DP=126;Dels=0.00;FS=6.809;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1217,0,1317 chrVIII 31965 . C G 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.776;DP=112;Dels=0.00;FS=1.524;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.681;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1099,0,1167 chrVIII 31973 . C T 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.832;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1140,0,1094 chrVIII 31980 . A G,T 2579.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=54.88;MQ0=0;QD=23.03;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,57,55:112:99:2639,1233,1068,1406,0,1262 chrVIII 31999 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.414;DP=112;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=9.05;ReadPosRankSum=-2.040;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1044,0,1254 chrVIII 32029 . G A 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3606,363,0 chrVIII 32064 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.298;DP=137;Dels=0.00;FS=3.173;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=2.194;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1509,0,1327 chrVIII 32088 . A C 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3396,360,0 chrVIII 32115 . A T 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3140,333,0 chrVIII 32175 . A G 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3114,324,0 chrVIII 32190 . G A 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3288,339,0 chrVIII 32578 . C G 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3341,330,0 chrVIII 32731 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.832;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1169,0,1462 chrVIII 32783 . T G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.513;DP=111;Dels=0.00;FS=4.756;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.903;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1086,0,1186 chrVIII 32801 . T G 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;DP=117;Dels=0.00;FS=3.360;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1149,0,1233 chrVIII 32836 . G T 2429 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=63.5619;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.46;MQ0=0;QD=25.04;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2462,267,0 chrVIII 32859 . G A 2125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.286;DP=90;Dels=0.00;FS=13.238;HaplotypeScore=40.4155;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=23.61;ReadPosRankSum=2.231;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,88:90:99:2158,225,0 chrVIII 33068 . T C 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;DP=91;Dels=0.00;FS=5.380;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.687;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:991,0,969 chrVIII 33105 . C T 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.02;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2947,306,0 chrVIII 33167 . G A 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.47;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2998,294,0 chrVIII 33337 . G A 2644 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2677,279,0 chrVIII 33397 . C T 2471 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2504,255,0 chrVIII 33602 . C T 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.073;DP=120;Dels=0.00;FS=8.427;HaplotypeScore=8.3993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.150;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1241,0,1202 chrVIII 33844 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;DP=118;Dels=0.00;FS=4.477;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.101;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:118:99:1235,0,1217 chrVIII 34071 . C T 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3177,324,0 chrVIII 34347 . A G 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.552;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.446;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1018,0,1203 chrVIII 34368 . A G 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.86;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2594,270,0 chrVIII 34469 . T G 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;DP=164;Dels=0.00;FS=1.217;HaplotypeScore=5.2932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,80:164:99:1603,0,1760 chrVIII 34480 . C T 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;DP=170;Dels=0.00;FS=0.565;HaplotypeScore=4.3452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,84:170:99:1559,0,1816 chrVIII 34565 . G C 4360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4360,459,0 chrVIII 34710 . A G 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3689,378,0 chrVIII 34938 . A G 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.486;DP=126;Dels=0.00;FS=6.950;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.672;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:126:99:1526,0,1111 chrVIII 35022 . T A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.569;DP=128;Dels=0.00;FS=11.473;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1303,0,1446 chrVIII 35042 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;DP=135;Dels=0.00;FS=6.501;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:135:99:1374,0,1437 chrVIII 35149 . C T 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2708,288,0 chrVIII 35271 . T G 2679 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.58;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2712,282,0 chrVIII 35378 . A G 2811 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.15;MQ0=6;QD=23.62;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2844,297,0 chrVIII 35762 . G A 841.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.070;DP=89;Dels=0.00;FS=1.815;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.02;MQ0=5;MQRankSum=-3.019;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.228;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:871,0,743 chrVIII 35854 . C A 1280.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.540;DP=140;Dels=0.00;FS=2.168;HaplotypeScore=8.4693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.16;MQ0=5;MQRankSum=-4.395;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.588;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1310,0,1389 chrVIII 35975 . A G 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.67;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3309,357,0 chrVIII 36028 . C T 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.28;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3504,351,0 chrVIII 36040 . T C 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.13;MQ0=0;QD=22.43;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2994,312,0 chrVIII 36042 . T G 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.84;MQ0=0;QD=22.32;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2845,300,0 chrVIII 36052 . A G 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.49;MQ0=0;QD=22.20;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3074,327,0 chrVIII 36073 . C T 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.85;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2982,318,0 chrVIII 36128 . T C 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7161;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.92;MQ0=0;QD=26.03;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2792,294,0 chrVIII 36203 . G A 2001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=110;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=55.9084;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.49;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.449;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2034,204,0 chrVIII 36243 . G A,C 2602.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=49.22;MQ0=0;QD=17.23;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,81,69:150:99:2662,905,704,1757,0,1646 chrVIII 36271 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;DP=124;Dels=0.00;FS=7.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.61;MQ0=0;MQRankSum=5.679;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.566;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1303,0,763 chrVIII 36306 . C T 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3674,390,0 chrVIII 36501 . C G 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3595,360,0 chrVIII 36667 . G A 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.149;DP=152;Dels=0.00;FS=2.969;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1692,0,1436 chrVIII 37489 . G A 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.735;DP=150;Dels=0.00;FS=5.316;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1675,0,1440 chrVIII 37675 . A G 4130.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4130,453,0 chrVIII 37789 . G A 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.999;DP=159;Dels=0.00;FS=1.246;HaplotypeScore=6.0265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:159:99:1740,0,1516 chrVIII 37876 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.899;DP=137;Dels=0.00;FS=5.403;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1298,0,1313 chrVIII 37897 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.318;DP=139;Dels=0.00;FS=15.663;HaplotypeScore=2.6525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1363,0,1374 chrVIII 37900 . G A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.798;DP=137;Dels=0.00;FS=20.698;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1450,0,1271 chrVIII 37931 . A G 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;DP=168;Dels=0.00;FS=4.473;HaplotypeScore=6.8128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=9.92;ReadPosRankSum=2.252;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,85:168:99:1696,0,1746 chrVIII 38190 . C T 1913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.708;DP=164;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.212;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,93:164:99:1943,0,1262 chrVIII 38191 . G A 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.469;DP=165;Dels=0.00;FS=3.102;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.710;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,92:165:99:1901,0,1361 chrVIII 38260 . C T 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.330;DP=168;Dels=0.00;FS=7.809;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.482;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,85:168:99:1769,0,1672 chrVIII 38427 . T C 2147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.277;DP=197;Dels=0.00;FS=1.856;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=1;MQRankSum=-0.029;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.589;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,108:197:99:2177,0,1832 chrVIII 38619 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.409;DP=155;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=129.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=1;MQRankSum=-2.352;QD=8.56;ReadPosRankSum=2.349;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1357,0,1540 chrVIII 38887 . T C 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3577,363,0 chrVIII 38923 . T C 3965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6812;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=22.79;SB=-2.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:3965,420,0 chrVIII 39238 . G C 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.631;DP=152;Dels=0.00;FS=1.298;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=1.076;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.345;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1408,0,1697 chrVIII 39521 . C G 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=100.4394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=23.34;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2811,318,0 chrVIII 39721 . G A 4339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7097;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4339,450,0 chrVIII 39746 . C T 4042.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=137.0653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4042,406,0 chrVIII 39758 . T C 101.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=133.2192;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.99;MQ0=0;QD=0.69;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:15:134,15,0 chrVIII 39833 . C T 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=91;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.84;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.727;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:785,0,1067 chrVIII 39899 . C G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;DP=115;Dels=0.00;FS=6.032;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.856;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1255,0,1096 chrVIII 39974 . C T 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3300,334,0 chrVIII 40047 . A T 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1120,0,1232 chrVIII 40053 . G T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.853;DP=111;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1234,0,1114 chrVIII 40215 . A G 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2941,309,0 chrVIII 40287 . T C 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3121,318,0 chrVIII 40380 . C T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.036;DP=145;Dels=0.00;FS=2.994;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.241;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1391,0,1628 chrVIII 40596 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.578;DP=141;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.394;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1369,0,1499 chrVIII 40600 . G A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.268;DP=145;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1315,0,1387 chrVIII 40638 . T C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.988;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.299;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,81:171:99:1562,0,1853 chrVIII 40770 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.572;DP=175;Dels=0.00;FS=1.929;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.013;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,78:175:99:1506,0,2104 chrVIII 40812 . C T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.096;DP=160;Dels=0.00;FS=2.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.017;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,72:160:99:1445,0,1821 chrVIII 40899 . T C 3991.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.58;SB=-2.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3991,408,0 chrVIII 40985 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.460;DP=133;Dels=0.00;FS=6.624;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1307,0,1404 chrVIII 41049 . C T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.596;DP=160;Dels=0.00;FS=12.522;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,75:160:99:1544,0,1711 chrVIII 41050 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.883;DP=166;Dels=0.00;FS=13.748;HaplotypeScore=2.6766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,78:166:99:1530,0,1741 chrVIII 41245 . T A 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;DP=115;Dels=0.00;FS=4.479;HaplotypeScore=5.4949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.702;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2931,277,0 chrVIII 41310 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.690;DP=144;Dels=0.00;FS=6.318;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.760;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:144:99:1295,0,1645 chrVIII 41560 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.390;DP=122;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.364;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1242,0,1145 chrVIII 41576 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.336;DP=120;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1102,0,1206 chrVIII 41694 . T A 1992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.668;DP=154;Dels=0.00;FS=3.978;HaplotypeScore=2.5606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=12.94;ReadPosRankSum=-2.172;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,93:154:99:2022,0,1200 chrVIII 41712 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.089;DP=125;Dels=0.00;FS=6.790;HaplotypeScore=2.3696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.270;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1476,0,1124 chrVIII 41853 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.860;DP=142;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=0.242;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.735;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1222,0,1729 chrVIII 41868 . T C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.479;DP=142;Dels=0.00;FS=2.145;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1465,0,1365 chrVIII 41934 . C T 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.327;DP=130;Dels=0.00;FS=3.406;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.370;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1574,0,1064 chrVIII 42084 . A G 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.529;DP=163;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,73:163:99:1471,0,1992 chrVIII 42222 . G A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:141:99:1410,0,1415 chrVIII 42238 . A G 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3803,387,0 chrVIII 42255 . G A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.463;DP=138;Dels=0.00;FS=4.299;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1322,0,1429 chrVIII 42258 . A G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.909;DP=126;Dels=0.00;FS=4.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1140,0,1470 chrVIII 42501 . C T 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.621;DP=184;Dels=0.00;FS=1.915;HaplotypeScore=2.8494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=2;MQRankSum=0.033;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.602;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,80:184:99:1672,0,2252 chrVIII 42616 . G A 4264.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4264,433,0 chrVIII 42646 . G A 4271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4271,421,0 chrVIII 42655 . A G 2068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;DP=175;Dels=0.00;FS=1.185;HaplotypeScore=2.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.753;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,101:175:99:2098,0,1445 chrVIII 42657 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;DP=162;Dels=0.00;FS=2.012;HaplotypeScore=2.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.626;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.986;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,67:162:99:1283,0,2003 chrVIII 42709 . C T 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3759,388,0 chrVIII 42789 . C T 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.604;DP=145;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1758,0,1236 chrVIII 42880 . T C 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;DP=135;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:135:99:1495,0,1255 chrVIII 42946 . T C 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.493;DP=149;Dels=0.00;FS=2.079;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.117;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1777,0,1368 chrVIII 43430 . C T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;DP=114;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:1002,0,1366 chrVIII 43928 . G T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.574;DP=130;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.333;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:130:99:1562,0,1026 chrVIII 45571 . G A 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.349;DP=150;Dels=0.00;FS=3.889;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=11.05;ReadPosRankSum=-2.221;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1687,0,1374 chrVIII 45773 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.706;DP=142;Dels=0.00;FS=1.330;HaplotypeScore=7.8365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.039;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:142:99:1451,0,1543 chrVIII 46007 . A G 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.037;DP=161;Dels=0.00;FS=2.797;HaplotypeScore=5.4524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.962;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1294,0,1574 chrVIII 46055 . A G 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3631,387,0 chrVIII 46079 . G A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.316;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,68:159:99:1412,0,2006 chrVIII 46286 . G A 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.593;DP=163;Dels=0.00;FS=2.470;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.931;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,80:163:99:1743,0,1710 chrVIII 46496 . G A 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.005;DP=178;Dels=0.00;FS=1.217;HaplotypeScore=3.9257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.253;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,89:178:99:1839,0,1800 chrVIII 46562 . T C 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.123;DP=171;Dels=0.00;FS=6.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.787;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.534;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,87:171:99:1700,0,1779 chrVIII 46787 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.254;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1569,0,1705 chrVIII 47072 . A G 4431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.89;SB=-2.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4431,465,0 chrVIII 47467 . G A 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.987;DP=128;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=5.5008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=7.91;ReadPosRankSum=-1.969;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1042,0,1473 chrVIII 48088 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;DP=110;Dels=0.00;FS=47.555;HaplotypeScore=5.6873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=2.656;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.066;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,70:110:99:1313,0,809 chrVIII 48097 . C T 667.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.413;DP=118;Dels=0.04;FS=41.137;HaplotypeScore=110.5158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=5.65;ReadPosRankSum=-1.955;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,38:113:99:697,0,1251 chrVIII 48114 . T A 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.573;DP=171;Dels=0.01;FS=163.731;HaplotypeScore=13.4329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=0.15;ReadPosRankSum=-6.301;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,34:170:56:56,0,1706 chrVIII 48115 . G A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.399;DP=173;Dels=0.01;FS=133.013;HaplotypeScore=17.3276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=0.06;ReadPosRankSum=-5.812;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,27:171:40:40,0,1603 chrVIII 48187 . G A 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3471,355,0 chrVIII 48220 . A G 4006.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=177;Dels=0.00;FS=3.139;HaplotypeScore=8.8535;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.374;QD=22.63;ReadPosRankSum=3.669;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,168:177:99:4006,387,0 chrVIII 48235 . A G 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.249;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=440.3422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.311;QD=5.91;ReadPosRankSum=1.453;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,61:178:99:1082,0,1895 chrVIII 48299 . T C 4090.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.70;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:164:99:4090,429,0 chrVIII 48365 . T G 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1198;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3663,390,0 chrVIII 48551 . A G 4656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4516;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=23.63;SB=-2.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:4656,489,0 chrVIII 48651 . T C 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=14.5894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3233,348,0 chrVIII 48939 . T C 3996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3996,403,0 chrVIII 48948 . C T 3820.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3820,390,0 chrVIII 49098 . A G 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3555,369,0 chrVIII 49196 . T C 4556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=1;QD=24.23;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4556,468,0 chrVIII 49359 . C T 18.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.749;DP=184;Dels=0.00;FS=10.500;HaplotypeScore=20.8144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.004;QD=0.10;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,53:184:48:48,0,2756 chrVIII 49368 . C T 310.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.891;DP=161;Dels=0.00;FS=10.100;HaplotypeScore=24.2465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.95;MQ0=0;MQRankSum=-4.612;QD=1.93;ReadPosRankSum=0.702;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,66:161:99:340,0,1864 chrVIII 49374 . T C 659.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.992;DP=166;Dels=0.00;FS=14.227;HaplotypeScore=24.1341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.349;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.966;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,83:166:99:689,0,1616 chrVIII 49378 . T A 931.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.309;DP=172;Dels=0.00;FS=23.348;HaplotypeScore=25.1671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.468;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.295;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,97:172:99:961,0,1514 chrVIII 49395 . G C 712.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;DP=156;Dels=0.00;FS=8.067;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=4.56;ReadPosRankSum=-5.998;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,45:156:99:742,0,1329 chrVIII 49398 . C T 65.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.415;DP=142;Dels=0.00;FS=19.517;HaplotypeScore=5.7496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=0.46;ReadPosRankSum=-2.598;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,23:142:95:95,0,1586 chrVIII 49399 . G A 63.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.232;DP=142;Dels=0.00;FS=18.287;HaplotypeScore=5.7496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.95;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=0.44;ReadPosRankSum=-3.154;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,24:142:93:93,0,1560 chrVIII 49400 . T C 61.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;DP=132;Dels=0.00;FS=1.121;HaplotypeScore=5.7496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.352;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.107;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,13:132:91:91,0,1667 chrVIII 49404 . T C 31.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.275;DP=142;Dels=0.00;FS=2.585;HaplotypeScore=5.7496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.497;QD=0.22;ReadPosRankSum=-0.708;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,12:142:61:61,0,1947 chrVIII 49405 . G A 47.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.040;DP=142;Dels=0.00;FS=2.585;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.343;QD=0.33;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,12:142:77:77,0,1856 chrVIII 49406 . T C 38.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;DP=142;Dels=0.00;FS=2.585;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.326;QD=0.27;ReadPosRankSum=-1.324;SB=-1.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,12:142:68:68,0,1940 chrVIII 49510 . C T 3895.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.229;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7668;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.765;SB=-2.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:172:99:3895,376,0 chrVIII 49626 . T C 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=23.17;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3452,357,0 chrVIII 49719 . C T 4292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4292,427,0 chrVIII 49817 . A C 4387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.11;SB=-2.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4387,448,0 chrVIII 49899 . T C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.152;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.966;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1119,0,1164 chrVIII 50049 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.413;DP=136;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=2.7792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1164,0,1426 chrVIII 50050 . A G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3358,351,0 chrVIII 50240 . A G 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.632;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.410;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1521,0,1642 chrVIII 50254 . T C 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.936;DP=159;Dels=0.00;FS=2.809;HaplotypeScore=5.7950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.099;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:159:99:1474,0,1762 chrVIII 50268 . C T 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.848;DP=144;Dels=0.00;FS=3.977;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1735,0,1248 chrVIII 50321 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.157;DP=114;Dels=0.00;FS=15.969;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.482;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1160,0,1169 chrVIII 50351 . T C 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3743,381,0 chrVIII 50441 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.215;DP=127;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=2.6952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.080;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1498,0,1111 chrVIII 50566 . C G 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3413,357,0 chrVIII 50752 . T C 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3070,330,0 chrVIII 51053 . C A 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.068;DP=100;Dels=0.00;FS=9.403;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.621;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:995,0,932 chrVIII 51089 . G A 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3188,327,0 chrVIII 51217 . A G 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3624,378,0 chrVIII 51309 . T G 1926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.493;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.0527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.233;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,97:174:99:1956,0,1592 chrVIII 51314 . C A 4249.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.75;SB=-2.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4249,418,0 chrVIII 51344 . C T 1963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.138;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,90:144:99:1993,0,990 chrVIII 51378 . A T 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=26.55;SB=-2.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3743,376,0 chrVIII 51408 . C A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;DP=133;Dels=0.00;FS=3.270;HaplotypeScore=2.8248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.686;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1109,0,1564 chrVIII 51422 . G C 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.211;DP=128;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=2.9181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.447;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.112;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1049,0,1299 chrVIII 51441 . T C 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=23.30;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3379,354,0 chrVIII 51686 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.161;DP=160;Dels=0.00;FS=6.076;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.288;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,71:160:99:1480,0,1849 chrVIII 51773 . T C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.788;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.270;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,56:140:99:1124,0,1850 chrVIII 51856 . G T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.708;DP=149;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=5.7993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.701;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,60:149:99:1170,0,1943 chrVIII 51891 . T A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;DP=163;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,63:162:99:1252,0,2265 chrVIII 51937 . C G 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;DP=175;Dels=0.00;FS=6.776;HaplotypeScore=4.8902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.011;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,74:175:99:1466,0,2170 chrVIII 52133 . G A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.739;DP=142;Dels=0.00;FS=2.080;HaplotypeScore=2.8466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.671;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1421,0,1363 chrVIII 52179 . A G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.203;DP=143;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.646;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1381,0,1454 chrVIII 52183 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.145;DP=139;Dels=0.00;FS=2.179;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.738;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1508,0,1293 chrVIII 52244 . C T 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.810;DP=166;Dels=0.00;FS=18.928;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.852;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,89:166:99:1778,0,1572 chrVIII 52259 . G C 1866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;DP=172;Dels=0.00;FS=7.837;HaplotypeScore=7.6543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,96:172:99:1896,0,1527 chrVIII 52373 . T C 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.966;DP=147;Dels=0.00;FS=2.919;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.560;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1410,0,1644 chrVIII 52419 . G A 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;DP=148;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.125;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1722,0,1335 chrVIII 52427 . A T 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1749,0,1335 chrVIII 52538 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.995;DP=149;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.674;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1472,0,1470 chrVIII 52666 . G A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.910;DP=148;Dels=0.00;FS=5.356;HaplotypeScore=8.5534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.385;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:148:99:1431,0,1668 chrVIII 52712 . C T 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.183;DP=150;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.410;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1490,0,1624 chrVIII 52925 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;DP=118;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=-3.344;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.218;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1302,0,1124 chrVIII 52980 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.163;DP=130;Dels=0.00;FS=13.672;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-3.851;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1172,0,1359 chrVIII 52993 . G A 1328.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.847;DP=147;Dels=0.00;FS=9.162;HaplotypeScore=3.9366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-4.999;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1358,0,1550 chrVIII 52996 . T C 1135.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.028;DP=136;Dels=0.00;FS=12.632;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.876;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.404;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1165,0,1435 chrVIII 52999 . C T 1239.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.098;DP=137;Dels=0.00;FS=12.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=-4.126;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.251;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1269,0,1363 chrVIII 53006 . T A 1240.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.235;DP=146;Dels=0.00;FS=6.198;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-3.621;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1270,0,1622 chrVIII 53097 . G T 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.126;DP=157;Dels=0.00;FS=2.016;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1828,0,1454 chrVIII 53214 . T C 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.939;DP=164;Dels=0.00;FS=1.230;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.128;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1672,0,1822 chrVIII 53336 . T C 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.434;DP=168;Dels=0.00;FS=1.916;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,81:168:99:1622,0,1830 chrVIII 53483 . G A 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.020;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.698;QD=10.04;ReadPosRankSum=3.377;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,88:179:99:1828,0,1778 chrVIII 53579 . T C 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.783;DP=175;Dels=0.00;FS=7.768;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.166;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,82:175:99:1709,0,1965 chrVIII 53770 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.406;DP=114;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.328;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1308,0,1068 chrVIII 54187 . T G 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.204;DP=111;Dels=0.00;FS=4.848;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=9.11;ReadPosRankSum=-2.276;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1041,0,1286 chrVIII 54245 . A G 4367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4367,471,0 chrVIII 54264 . G A 2029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.467;DP=175;Dels=0.00;FS=3.109;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,95:175:99:2059,0,1713 chrVIII 54302 . C T 4810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=23.58;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,204:204:99:4810,469,0 chrVIII 54471 . A T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.065;DP=108;Dels=0.00;FS=2.535;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1257,0,1054 chrVIII 54588 . C G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.761;DP=138;Dels=0.00;FS=10.045;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.170;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1270,0,1369 chrVIII 54726 . A G 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3962,414,0 chrVIII 54763 . A G 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=20.65;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2718,276,0 chrVIII 55333 . A G 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.110;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=10.19;ReadPosRankSum=-3.043;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,88:166:99:1722,0,1641 chrVIII 55348 . A G 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.430;DP=158;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,80:158:99:1494,0,1589 chrVIII 55433 . A T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.957;DP=157;Dels=0.00;FS=4.706;HaplotypeScore=4.5422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.491;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,73:157:99:1537,0,1706 chrVIII 55477 . C T 1778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.075;DP=189;Dels=0.00;FS=1.137;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,87:189:99:1808,0,2047 chrVIII 55489 . G A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.781;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.623;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,84:193:99:1717,0,2288 chrVIII 55690 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.656;DP=140;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=7.6978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.563;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1198,0,1613 chrVIII 55762 . G A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.875;DP=161;Dels=0.00;FS=6.838;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=8.76;ReadPosRankSum=-2.188;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,75:161:99:1441,0,1361 chrVIII 55971 . C T 2058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.823;DP=168;Dels=0.00;FS=2.008;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.938;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,94:168:99:2088,0,1501 chrVIII 55990 . G T 2376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.821;DP=204;Dels=0.00;FS=0.518;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.024;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,111:204:99:2406,0,1865 chrVIII 56087 . C T 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.845;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=2.752;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.480;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,85:163:99:1745,0,1638 chrVIII 56135 . G A 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;DP=161;Dels=0.00;FS=2.882;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1766,0,1535 chrVIII 56225 . T C 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=20.47;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2694,291,0 chrVIII 56250 . C T 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2859,297,0 chrVIII 56364 . T G 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.68;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2796,300,0 chrVIII 56423 . C T 1043.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.126;DP=152;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=96.1074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.45;MQ0=1;MQRankSum=-0.603;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,50:152:99:1073,0,1173 chrVIII 56430 . C G 875.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.076;DP=105;Dels=0.00;FS=5.245;HaplotypeScore=74.2694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.96;MQ0=1;MQRankSum=-2.411;QD=8.33;ReadPosRankSum=3.254;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:905,0,283 chrVIII 56433 . T A 88.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.699;DP=92;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=52.2664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.65;MQ0=1;MQRankSum=-1.605;QD=0.96;ReadPosRankSum=-3.496;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,10:92:99:118,0,409 chrVIII 56439 . C T 94.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.408;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=52.2664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.17;MQ0=1;MQRankSum=-1.991;QD=0.94;ReadPosRankSum=-4.128;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,10:100:99:124,0,619 chrVIII 56463 . T C 295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.232;DP=110;Dels=0.00;FS=8.438;HaplotypeScore=3.7699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.91;MQ0=1;MQRankSum=-4.506;QD=2.68;ReadPosRankSum=-3.984;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,21:110:99:325,0,1267 chrVIII 56466 . C T 270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.752;DP=111;Dels=0.00;FS=6.353;HaplotypeScore=3.7699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.36;MQ0=1;MQRankSum=-3.546;QD=2.43;ReadPosRankSum=-6.481;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,21:111:99:300,0,1276 chrVIII 56538 . T A 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.49;MQ0=0;QD=26.12;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2984,303,0 chrVIII 56604 . G A 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.11;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3096,309,0 chrVIII 56784 . C T 2080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.153;DP=191;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=5.5445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.023;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,99:191:99:2110,0,1851 chrVIII 57044 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.433;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1377,0,1476 chrVIII 57572 . C T 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.183;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,80:166:99:1659,0,1713 chrVIII 57891 . G A 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;DP=128;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.708;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1539,0,1120 chrVIII 58390 . A G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=51.5161;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3466,354,0 chrVIII 58676 . A G 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3155,324,0 chrVIII 58677 . A G 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3172,324,0 chrVIII 58923 . A C 463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;DP=112;Dels=0.00;FS=5.801;HaplotypeScore=11.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.931;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:112:99:493,0,645 chrVIII 59106 . T C 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.389;DP=132;Dels=0.00;FS=17.873;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.250;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.890;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:909,0,1016 chrVIII 59801 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.438;DP=161;Dels=0.00;FS=4.385;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1494,0,1870 chrVIII 59916 . C T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.950;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.478;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:928,0,1224 chrVIII 59936 . G C 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2958,297,0 chrVIII 59990 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.601;DP=141;Dels=0.00;FS=6.901;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.474;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1336,0,1374 chrVIII 60191 . C T 1201.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.988;DP=124;Dels=0.00;FS=19.369;HaplotypeScore=8.6738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1231,0,1307 chrVIII 60199 . G A 845.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.899;DP=135;Dels=0.03;FS=9.619;HaplotypeScore=10.6618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.536;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:875,0,1738 chrVIII 60200 . A G 838.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.584;DP=136;Dels=0.00;FS=6.504;HaplotypeScore=10.6618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.830;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,54:136:99:868,0,1790 chrVIII 60493 . T C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.177;DP=151;Dels=0.00;FS=5.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1509,0,1648 chrVIII 60692 . C T 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.375;DP=121;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=7.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1266,0,1209 chrVIII 60764 . T C 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=22.10;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2950,309,0 chrVIII 60785 . C T 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3215,315,0 chrVIII 61032 . T C 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.968;DP=155;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1408,0,1703 chrVIII 61047 . G T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.080;DP=137;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.011;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1477,0,1232 chrVIII 61049 . C T 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3571,369,0 chrVIII 61125 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.580;DP=142;Dels=0.00;FS=5.208;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.069;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1360,0,1598 chrVIII 61373 . A G 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.595;DP=98;Dels=0.00;FS=3.860;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.528;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:842,0,1293 chrVIII 61550 . A T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.266;DP=125;Dels=0.00;FS=8.649;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=10.34;ReadPosRankSum=-2.664;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1322,0,1357 chrVIII 61765 . T A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;DP=124;Dels=0.00;FS=6.787;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1474,0,1134 chrVIII 62234 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.066;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.792;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1451,0,1552 chrVIII 62455 . G A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.885;DP=145;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1633,0,1490 chrVIII 62587 . G A 2346 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2379,231,0 chrVIII 62629 . C T 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.800;DP=110;Dels=0.00;FS=4.742;HaplotypeScore=3.5087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.611;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1235,0,962 chrVIII 62698 . T C 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;DP=133;Dels=0.00;FS=8.255;HaplotypeScore=2.9410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQ0=0;MQRankSum=-8.630;QD=7.17;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:983,0,1726 chrVIII 62702 . G A 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.33;MQ0=0;QD=25.98;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3533,360,0 chrVIII 62711 . A C 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.92;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3447,360,0 chrVIII 62714 . G C 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.737;DP=139;Dels=0.00;FS=4.489;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-9.483;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.433;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,55:139:99:987,0,1824 chrVIII 62730 . C A 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.870;DP=131;Dels=0.00;FS=4.939;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=-7.978;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.682;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:919,0,1703 chrVIII 62734 . C T 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.608;DP=125;Dels=0.00;FS=3.879;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQ0=0;MQRankSum=-8.502;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.932;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,51:125:99:876,0,1524 chrVIII 62903 . G A 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;DP=104;Dels=0.00;FS=17.283;HaplotypeScore=3.5619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=1.863;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,41:104:99:793,0,1158 chrVIII 62972 . C T 2254 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2287,231,0 chrVIII 62986 . T A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=96;Dels=0.00;FS=5.172;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.131;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:96:99:1096,0,966 chrVIII 63044 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.637;DP=108;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=2.9346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.610;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:108:99:1253,0,880 chrVIII 63067 . G T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.205;DP=109;Dels=0.00;FS=5.106;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.600;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1219,0,1021 chrVIII 63144 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;DP=141;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1295,0,1613 chrVIII 63183 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.233;DP=134;Dels=0.00;FS=9.372;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.913;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1267,0,1495 chrVIII 63279 . C T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.262;DP=140;Dels=0.00;FS=4.004;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.595;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1355,0,1500 chrVIII 63324 . T G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.949;DP=128;Dels=0.00;FS=7.380;HaplotypeScore=2.8723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1222,0,1448 chrVIII 63396 . G A 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;DP=142;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=7.5300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1578,0,1371 chrVIII 63582 . T C 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.082;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1491,0,1117 chrVIII 63583 . T G 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.157;DP=126;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=2.8881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.006;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1483,0,1095 chrVIII 63864 . T A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.162;DP=154;Dels=0.00;FS=10.104;HaplotypeScore=3.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=9.27;ReadPosRankSum=2.375;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:154:99:1457,0,1821 chrVIII 64155 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;DP=149;Dels=0.00;FS=2.995;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=2.100;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,58:149:99:1117,0,1929 chrVIII 64185 . A C 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3602,372,0 chrVIII 64236 . G A 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2703,273,0 chrVIII 64360 . A T 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3108,318,0 chrVIII 64748 . A G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3263,348,0 chrVIII 65200 . A G 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3469,372,0 chrVIII 65380 . A G 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3140,330,0 chrVIII 65566 . A G 4135.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4135,424,0 chrVIII 66280 . C T 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.056;DP=139;Dels=0.00;FS=3.268;HaplotypeScore=7.9093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,80:139:99:1741,0,1138 chrVIII 66482 . G A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.484;DP=114;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.006;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,69:114:99:1403,0,817 chrVIII 66559 . A G 692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.927;DP=133;Dels=0.00;FS=15.126;HaplotypeScore=70.4553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQ0=0;MQRankSum=-3.056;QD=5.20;ReadPosRankSum=-4.233;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,77:133:99:722,0,1228 chrVIII 66700 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.703;DP=156;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=2.6406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.475;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1634,0,1636 chrVIII 66992 . A G 1907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;DP=217;Dels=0.00;FS=1.042;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.216;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,100:217:99:1937,0,2439 chrVIII 67317 . T C 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.577;DP=133;Dels=0.00;FS=3.144;HaplotypeScore=5.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=25.35;ReadPosRankSum=1.627;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3371,348,0 chrVIII 67320 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.981;DP=140;Dels=0.00;FS=9.134;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.101;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1218,0,1632 chrVIII 67629 . G T 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7172;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.02;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.213;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:172:99:3260,318,0 chrVIII 67664 . A T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.347;DP=172;Dels=0.00;FS=2.784;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.347;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,81:172:99:1454,0,1558 chrVIII 67971 . C T 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3088,300,0 chrVIII 68025 . G A 4064.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4064,391,0 chrVIII 68079 . G A 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.909;DP=103;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=2.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:977,0,1049 chrVIII 68121 . C T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.982;DP=90;Dels=0.00;FS=3.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.641;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,52:90:99:1107,0,680 chrVIII 68259 . C A 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:939,0,1027 chrVIII 68352 . T C 2737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2770,276,0 chrVIII 68367 . C T 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.237;DP=106;Dels=0.00;FS=6.587;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.617;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:966,0,1237 chrVIII 68441 . T C 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.852;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1006,0,1245 chrVIII 68508 . A C 2472 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2505,258,0 chrVIII 68532 . A G 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.213;DP=104;Dels=0.00;FS=1.615;HaplotypeScore=6.4147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.776;QD=7.58;ReadPosRankSum=-2.712;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,43:104:99:818,0,1321 chrVIII 69096 . C T 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.458;DP=157;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.994;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,84:157:99:1713,0,1500 chrVIII 69126 . G A 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.947;DP=166;Dels=0.00;FS=7.957;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,75:166:99:1552,0,1734 chrVIII 69180 . G A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.951;DP=149;Dels=0.00;FS=3.963;HaplotypeScore=3.2245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.631;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1441,0,1619 chrVIII 69194 . T C 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.498;DP=153;Dels=0.00;FS=3.025;HaplotypeScore=3.7125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.411;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:153:99:1471,0,1713 chrVIII 69246 . C T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.120;DP=153;Dels=0.00;FS=4.914;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.659;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1602,0,1684 chrVIII 69672 . C T 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.854;DP=142;Dels=0.00;FS=5.111;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1450,0,1561 chrVIII 69830 . A G 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.893;DP=131;Dels=0.00;FS=7.896;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=8.63;ReadPosRankSum=-2.558;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1161,0,1419 chrVIII 70230 . A T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.543;DP=134;Dels=0.00;FS=3.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.555;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1323,0,1416 chrVIII 70234 . C T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;DP=136;Dels=0.00;FS=2.360;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=9.96;ReadPosRankSum=2.367;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1385,0,1428 chrVIII 70302 . G A 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.439;DP=134;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=3.8078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=8.49;ReadPosRankSum=-2.328;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:134:99:1167,0,1470 chrVIII 70542 . A G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.606;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.773;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.929;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1115,0,1612 chrVIII 70548 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.337;DP=133;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=9.23;ReadPosRankSum=-2.174;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1257,0,1617 chrVIII 70950 . G A 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3804,379,0 chrVIII 71181 . T C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.015;DP=104;Dels=0.00;FS=6.058;HaplotypeScore=3.1597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1255,0,930 chrVIII 71457 . T C 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3336,351,0 chrVIII 71610 . A G 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.653;DP=156;Dels=0.00;FS=2.019;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.292;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1604,0,1603 chrVIII 71788 . G C 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;DP=165;Dels=0.00;FS=6.998;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.057;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1515,0,1868 chrVIII 71900 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.508;DP=95;Dels=0.00;FS=4.711;HaplotypeScore=27.7682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQ0=1;MQRankSum=1.873;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.219;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,59:95:99:1145,0,495 chrVIII 71979 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.276;DP=87;Dels=0.00;FS=0.827;HaplotypeScore=3.5541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=10.92;ReadPosRankSum=-2.169;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,49:87:99:980,0,719 chrVIII 71987 . A G 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;DP=97;Dels=0.00;FS=1.807;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.989;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:869,0,1064 chrVIII 71994 . A G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;DP=99;Dels=0.00;FS=2.894;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=10.35;ReadPosRankSum=-2.186;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1055,0,846 chrVIII 72011 . G A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;DP=105;Dels=0.00;FS=2.616;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.339;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:105:99:1129,0,1010 chrVIII 72018 . G A 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.303;DP=113;Dels=0.00;FS=1.537;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1034,0,1302 chrVIII 72058 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.050;DP=112;Dels=0.00;FS=4.943;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1366,0,924 chrVIII 72171 . G A 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.029;DP=161;Dels=0.00;FS=3.878;HaplotypeScore=2.8120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.781;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1607,0,1558 chrVIII 72247 . C T 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3947,391,0 chrVIII 72256 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.801;DP=153;Dels=0.00;FS=5.131;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1305,0,1897 chrVIII 72400 . A G 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.831;DP=111;Dels=0.00;FS=8.905;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.364;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1223,0,1025 chrVIII 72478 . T C 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;DP=111;Dels=0.00;FS=3.455;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1311,0,1071 chrVIII 72487 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.661;DP=109;Dels=0.00;FS=3.626;HaplotypeScore=2.7569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1219,0,1043 chrVIII 72495 . G A 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.389;DP=128;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=2.7134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1247,0,1512 chrVIII 72547 . G A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.004;DP=144;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.371;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1440,0,1590 chrVIII 72569 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.095;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1369,0,1747 chrVIII 72635 . G T 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.784;DP=93;Dels=0.00;FS=2.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.857;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:994,0,1020 chrVIII 72697 . C G 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3127,318,0 chrVIII 72739 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.420;DP=128;Dels=0.00;FS=3.498;HaplotypeScore=4.7298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.319;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1302,0,1321 chrVIII 72757 . T A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.927;DP=130;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=7.0459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.238;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1395,0,1158 chrVIII 72759 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.427;DP=133;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=3.0752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.138;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1369,0,1247 chrVIII 72808 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;DP=110;Dels=0.00;FS=6.309;HaplotypeScore=10.2481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,68:110:99:1184,0,621 chrVIII 72850 . G A 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;DP=123;Dels=0.00;FS=6.889;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:874,0,1243 chrVIII 72925 . T C 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.067;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.666;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,75:133:99:1434,0,1169 chrVIII 73129 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;DP=115;Dels=0.00;FS=4.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.838;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1349,0,1014 chrVIII 73231 . T C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.728;DP=126;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.584;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:126:99:1146,0,1450 chrVIII 73264 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.717;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.981;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1102,0,1742 chrVIII 73285 . C T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.544;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.682;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1528,0,1284 chrVIII 73438 . A C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.632;DP=131;Dels=0.00;FS=2.249;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.061;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1101,0,1606 chrVIII 73516 . C T 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.584;DP=115;Dels=0.00;FS=1.505;HaplotypeScore=5.7524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.178;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1283,0,1115 chrVIII 73687 . C A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.159;DP=118;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.167;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:118:99:1077,0,1404 chrVIII 73735 . T C 1291.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.653;DP=140;Dels=0.00;FS=12.479;HaplotypeScore=2.4919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=0.616;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:140:99:1321,0,1539 chrVIII 73741 . G A 1577.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.316;DP=148;Dels=0.00;FS=6.348;HaplotypeScore=2.4919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=0.757;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1607,0,1420 chrVIII 73744 . A G 1389.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.126;DP=149;Dels=0.00;FS=4.032;HaplotypeScore=2.4919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=1;MQRankSum=0.750;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.424;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1419,0,1581 chrVIII 73843 . A G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.074;DP=122;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=4.8081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.730;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1241,0,1323 chrVIII 73929 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.160;DP=137;Dels=0.00;FS=3.063;HaplotypeScore=2.6865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.039;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1112,0,1742 chrVIII 73942 . A G 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.714;DP=146;Dels=0.00;FS=5.085;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.921;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1674,0,1329 chrVIII 73960 . G A 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.651;DP=137;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.080;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1688,0,1093 chrVIII 74059 . T G 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.162;DP=100;Dels=0.00;FS=13.360;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=2.608;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:100:99:957,0,907 chrVIII 74089 . A G 742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.303;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=9.16;ReadPosRankSum=-2.523;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,45:81:99:772,0,765 chrVIII 74101 . G A 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.136;DP=119;Dels=0.00;FS=7.572;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:785,0,1266 chrVIII 74246 . C T 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3708,370,0 chrVIII 74339 . C G 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.412;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:128:99:1372,0,1093 chrVIII 74400 . G A 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.929;DP=134;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=12.87;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,82:134:99:1755,0,923 chrVIII 74409 . A T 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.029;DP=140;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1750,0,1139 chrVIII 74435 . T C 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;DP=151;Dels=0.00;FS=2.916;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,84:151:99:1661,0,1350 chrVIII 74445 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.303;DP=139;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.023;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1546,0,1197 chrVIII 74465 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.804;DP=138;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.35;MQ0=0;MQRankSum=1.543;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.386;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1235,0,1605 chrVIII 74477 . C A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.544;DP=134;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1606,0,1199 chrVIII 74519 . G A 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.64;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:136:99:3560,358,0 chrVIII 74573 . C T 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.03;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3382,348,0 chrVIII 74611 . T C 3209.99 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=22.14;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3243,348,0 chrVIII 74612 . C T 3313.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.98;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3313,351,0 chrVIII 74618 . A G 2672 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.08;MQ0=0;QD=20.40;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2705,288,0 chrVIII 74649 . A G 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.26;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2975,330,0 chrVIII 74664 . T G 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2966,327,0 chrVIII 74714 . T C 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.31;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3004,333,0 chrVIII 74727 . C T 2810 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.78;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=22.13;ReadPosRankSum=2.945;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,124:127:99:2843,309,0 chrVIII 74730 . T C 2640 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=20.95;ReadPosRankSum=2.476;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,123:126:99:2673,303,0 chrVIII 74734 . C G 2765 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.44;MQ0=0;QD=21.60;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2798,315,0 chrVIII 74755 . A G 2464 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.41;MQ0=0;QD=21.43;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2497,282,0 chrVIII 74776 . G C 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.68;MQ0=0;QD=22.22;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2699,294,0 chrVIII 74806 . T C 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.84;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2754,297,0 chrVIII 74846 . G A 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3624,370,0 chrVIII 74924 . A T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3019,318,0 chrVIII 74968 . A G 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.456;DP=136;Dels=0.00;FS=30.777;HaplotypeScore=57.5444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.816;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1161,0,1143 chrVIII 74975 . G A 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7504;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.60;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2989,306,0 chrVIII 75030 . G T 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=25.71;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2758,282,0 chrVIII 75639 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.536;DP=105;Dels=0.00;FS=7.621;HaplotypeScore=6.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1154,0,1049 chrVIII 75768 . T C 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.634;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.762;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.938;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:932,0,1072 chrVIII 76673 . C T 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.566;DP=116;Dels=0.00;FS=7.657;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.830;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,43:116:99:884,0,1540 chrVIII 76691 . C T 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.676;DP=125;Dels=0.00;FS=5.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.540;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1068,0,1558 chrVIII 76739 . A G 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;DP=128;Dels=0.00;FS=2.403;HaplotypeScore=3.4742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.804;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1056,0,1584 chrVIII 76976 . C A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.876;DP=150;Dels=0.00;FS=2.089;HaplotypeScore=2.9028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,58:150:99:1121,0,1927 chrVIII 77201 . G A 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.290;DP=145;Dels=0.00;FS=2.965;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.930;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1759,0,1297 chrVIII 77331 . T A 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3590,366,0 chrVIII 77475 . G A 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3632,372,0 chrVIII 77694 . G A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=1;MQRankSum=1.627;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,69:157:99:1407,0,1897 chrVIII 77766 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.886;DP=118;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.121;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1337,0,1207 chrVIII 77853 . C T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;DP=139;Dels=0.00;FS=3.081;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.621;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1483,0,1446 chrVIII 77919 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.401;DP=130;Dels=0.00;FS=4.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1317,0,1354 chrVIII 77959 . G A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;DP=126;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1262,0,1424 chrVIII 78084 . T C 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.865;DP=123;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,75:123:99:1612,0,953 chrVIII 78204 . G A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.151;DP=117;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.011;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1274,0,1243 chrVIII 78570 . C T 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3188,313,0 chrVIII 78572 . C T 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3288,322,0 chrVIII 78609 . G T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;DP=113;Dels=0.00;FS=7.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.766;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,70:113:99:1537,0,837 chrVIII 78752 . A G 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=33.8278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2573,273,0 chrVIII 78822 . C A 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.421;DP=87;Dels=0.00;FS=0.853;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:903,0,844 chrVIII 79037 . A G 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2627,270,0 chrVIII 79120 . C T 2378 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2411,252,0 chrVIII 79127 . C T 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.347;DP=94;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.829;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.068;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:859,0,1101 chrVIII 79208 . G A 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:104:99:2765,294,0 chrVIII 79319 . A T 2634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2667,273,0 chrVIII 79578 . C A 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;DP=112;Dels=0.00;FS=2.502;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.481;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1019,0,1327 chrVIII 80077 . A G 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3441,363,0 chrVIII 80210 . G C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;DP=125;Dels=0.00;FS=2.305;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.208;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1328,0,1263 chrVIII 80249 . G T 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3293,339,0 chrVIII 80292 . A T 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;DP=140;Dels=0.00;FS=2.138;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.483;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1667,0,1328 chrVIII 80479 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.572;DP=179;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=5.3600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.378;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,91:179:99:1469,0,1877 chrVIII 80596 . T C 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.351;DP=140;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.153;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1597,0,1365 chrVIII 80825 . G A 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.969;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1680,0,1453 chrVIII 80882 . A G 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.919;DP=162;Dels=0.00;FS=1.964;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1735,0,1520 chrVIII 81666 . G C 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.712;DP=131;Dels=0.00;FS=4.285;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.051;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1503,0,1169 chrVIII 81685 . A G 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2895,300,0 chrVIII 81806 . C T 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;DP=95;Dels=0.00;FS=24.005;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=-0.412;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.405;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:939,0,1049 chrVIII 81882 . A G 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.482;DP=118;Dels=0.00;FS=38.141;HaplotypeScore=85.7043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-3.368;QD=0.50;ReadPosRankSum=3.442;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,40:118:89:89,0,230 chrVIII 82048 . G A 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=10.82;ReadPosRankSum=-2.804;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1437,0,1291 chrVIII 82198 . G T 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.926;DP=133;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=12.59;ReadPosRankSum=1.171;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,79:133:99:1704,0,1066 chrVIII 82223 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;DP=129;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=5.9225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.517;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1132,0,1599 chrVIII 82351 . A C 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3225,345,0 chrVIII 82408 . A G 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.404;DP=123;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=4.2172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1292,0,1211 chrVIII 82486 . G C 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3311,336,0 chrVIII 82509 . A G 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.073;DP=132;Dels=0.00;FS=3.202;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1399,0,1356 chrVIII 82570 . T A 727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;DP=105;Dels=0.00;FS=0.826;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.502;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,41:105:99:757,0,1424 chrVIII 82588 . G A 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=1;QD=25.43;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3135,318,0 chrVIII 83043 . T C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;DP=127;Dels=0.00;FS=4.318;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1586,0,974 chrVIII 83065 . C T 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;DP=134;Dels=0.00;FS=6.494;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.494;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1089,0,1541 chrVIII 83128 . T C 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0453;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3649,390,0 chrVIII 83436 . C A 4187.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4187,421,0 chrVIII 83441 . C T 4149.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4149,421,0 chrVIII 83700 . T C 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.89;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3609,402,0 chrVIII 83781 . A T 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3090,315,0 chrVIII 83838 . T C 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3099,312,0 chrVIII 83933 . G A 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;DP=133;Dels=0.00;FS=8.016;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.967;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1156,0,1544 chrVIII 83943 . T G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;DP=137;Dels=0.00;FS=1.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.487;QD=8.31;ReadPosRankSum=2.298;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1168,0,1731 chrVIII 84104 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.639;DP=135;Dels=0.00;FS=2.217;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.015;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1331,0,1425 chrVIII 84123 . G A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.329;DP=134;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1395,0,1309 chrVIII 84194 . C A 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;DP=142;Dels=0.00;FS=2.171;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,85:142:99:1845,0,1138 chrVIII 84235 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.709;DP=140;Dels=0.00;FS=3.072;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.321;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1219,0,1735 chrVIII 84302 . T C 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3792,390,0 chrVIII 84445 . G A 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3047,315,0 chrVIII 84491 . A G 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.966;DP=115;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1121,0,1234 chrVIII 84663 . C G 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.94;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2880,306,0 chrVIII 84686 . A G 2823 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.41;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2856,312,0 chrVIII 84687 . T C 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.41;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2978,315,0 chrVIII 84699 . A G 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.17;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3074,321,0 chrVIII 84708 . G A 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.64;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3035,321,0 chrVIII 84777 . A C 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2490,264,0 chrVIII 84820 . A G 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=24.64;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2793,288,0 chrVIII 84829 . T C 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3207,327,0 chrVIII 84887 . T C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3076,318,0 chrVIII 84910 . T C 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3453,351,0 chrVIII 84920 . C T 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3305,333,0 chrVIII 84962 . G A 1283.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.675;DP=118;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.585;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1313,0,1243 chrVIII 84967 . G T 1210.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;DP=127;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=2.8357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1240,0,1413 chrVIII 84969 . C T 3438.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8357;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3438,357,0 chrVIII 85001 . T C 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3440,363,0 chrVIII 85109 . C T 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.95;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2874,294,0 chrVIII 85132 . C T 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3159,315,0 chrVIII 85218 . C G 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.77;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2831,294,0 chrVIII 85374 . A G 487 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.83;MQ0=0;QD=20.29;SB=-6.536e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:57:520,57,0 chrVIII 85389 . G T 332.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;DP=19;Dels=0.00;FS=12.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.734;SB=-1.764e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17:365,17,0 chrVIII 85438 . C T 14.18 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.24;MQ0=0;QD=7.09;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:3:44,3,0 chrVIII 85468 . A G 14.18 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.24;MQ0=0;QD=7.09;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:3:44,3,0 chrVIII 87109 . G A 147.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.56;MQ0=19;QD=5.45;SB=-8.163e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,23:27:18:180,18,0 chrVIII 87112 . A G 141.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.56;MQ0=19;QD=5.23;SB=-7.563e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:18:174,18,0 chrVIII 91773 . G A 53.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.65;MQ0=1;QD=13.49;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:86,9,0 chrVIII 91774 . T G 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.65;MQ0=1;QD=12.74;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:83,9,0 chrVIII 91813 . G A 51.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.65;MQ0=1;QD=12.99;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:84,9,0 chrVIII 91841 . T A 51.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.01;MQ0=10;QD=4.00;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,4:13:9:84,9,0 chrVIII 91842 . A G 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.57;MQ0=11;QD=3.64;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,8:14:9:83,9,0 chrVIII 92142 . G A 285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.605;DP=54;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.805;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:315,0,345 chrVIII 92232 . C T 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.37;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2870,288,0 chrVIII 92259 . T C 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.989;DP=97;Dels=0.00;FS=2.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.89;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.957;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:99:1118,0,842 chrVIII 92264 . T C 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;DP=101;Dels=0.00;FS=5.225;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:910,0,1141 chrVIII 92289 . G A 2067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.44;MQ0=0;QD=24.61;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2100,222,0 chrVIII 92299 . G A 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.65;MQ0=0;QD=25.24;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2683,291,0 chrVIII 92307 . A G 991.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.299;DP=102;Dels=0.00;FS=0.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.338;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1021,0,1064 chrVIII 92312 . A G 2426 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.78;MQ0=0;QD=23.55;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2459,270,0 chrVIII 92313 . A G 2459 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.09;MQ0=0;QD=23.64;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2492,270,0 chrVIII 92343 . C A 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;DP=105;Dels=0.00;FS=2.803;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.63;MQ0=0;MQRankSum=1.978;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.635;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:904,0,1152 chrVIII 92385 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;DP=116;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.05;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=10.59;ReadPosRankSum=2.486;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1259,0,1031 chrVIII 92406 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;DP=98;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.420;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1175,0,854 chrVIII 92432 . C A 729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.199;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.23;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=7.15;ReadPosRankSum=2.718;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:102:99:759,0,1285 chrVIII 92455 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;DP=120;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.21;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.226;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1081,0,1380 chrVIII 92474 . C G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;DP=125;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.38;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=9.52;ReadPosRankSum=-2.197;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1220,0,1299 chrVIII 92505 . T G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.474;DP=122;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.10;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.724;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1156,0,1408 chrVIII 92522 . A T 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.78;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3080,321,0 chrVIII 92544 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.378;DP=144;Dels=0.00;FS=2.974;HaplotypeScore=3.6964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.097;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:144:99:1654,0,1359 chrVIII 92608 . G A 2404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.89;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2437,252,0 chrVIII 92658 . A G 2272 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.25;MQ0=0;QD=22.06;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2305,243,0 chrVIII 92677 . T A 2272 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.21;MQ0=0;QD=22.50;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2305,231,0 chrVIII 92692 . T G 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.12;MQ0=0;QD=23.44;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2518,252,0 chrVIII 92694 . G A 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2595,261,0 chrVIII 92759 . A C 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.90;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2881,297,0 chrVIII 92804 . T C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.663;DP=126;Dels=0.00;FS=4.015;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.858;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1078,0,1456 chrVIII 92864 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.556;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.76;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1267,0,1424 chrVIII 92914 . C A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.693;DP=139;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1225,0,1711 chrVIII 92927 . G T 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.33;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3349,345,0 chrVIII 92971 . T C 1936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.90;MQ0=0;QD=23.33;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1969,213,0 chrVIII 92978 . C G 1681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.04;MQ0=0;QD=25.09;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1714,186,0 chrVIII 93014 . G C 965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.24;MQ0=0;QD=19.69;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:998,117,0 chrVIII 93026 . T C 859 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.38;MQ0=0;QD=18.67;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:892,99,0 chrVIII 93033 . C T 749 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.36;MQ0=0;QD=16.64;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:84:782,84,0 chrVIII 93035 . G A 658 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.78;MQ0=0;QD=15.30;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:75:691,75,0 chrVIII 93055 . A G 479 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.28;MQ0=0;QD=11.97;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:57:512,57,0 chrVIII 93056 . A G 474 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.28;MQ0=0;QD=11.85;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:57:507,57,0 chrVIII 93062 . A G 532 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.98;MQ0=0;QD=14.00;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:63:565,63,0 chrVIII 93068 . A G 467 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=12.97;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:57:500,57,0 chrVIII 93086 . C T 604 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=15.10;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:69:637,69,0 chrVIII 93088 . T C 582 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.78;MQ0=0;QD=14.55;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:69:615,69,0 chrVIII 93095 . A G 523 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.72;MQ0=0;QD=13.76;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:63:556,63,0 chrVIII 93101 . T C 566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.01;MQ0=0;QD=14.51;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:66:599,66,0 chrVIII 93125 . C T 754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.24;MQ0=0;QD=19.84;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:87:787,87,0 chrVIII 93128 . G C 615 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=18.64;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:72:648,72,0 chrVIII 93136 . C T 660 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.74;MQ0=0;QD=21.29;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:75:693,75,0 chrVIII 93137 . C T 645 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.74;MQ0=0;QD=20.81;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:75:678,75,0 chrVIII 93140 . C T 589 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.74;MQ0=0;QD=19.00;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:75:622,75,0 chrVIII 93143 . T C 589 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.74;MQ0=0;QD=19.00;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:75:622,75,0 chrVIII 93146 . T C 640 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.74;MQ0=0;QD=20.65;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:75:673,75,0 chrVIII 93151 . T C 656 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.70;MQ0=0;QD=21.87;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:75:689,75,0 chrVIII 93153 . T C 617 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;DP=30;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.70;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.462;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:72:650,72,0 chrVIII 93158 . G A 462 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=23.10;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:54:495,54,0 chrVIII 93159 . T A 468 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:54:501,54,0 chrVIII 93161 . C T 454 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=21.62;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:54:487,54,0 chrVIII 93163 . C T 467 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=22.24;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:54:500,54,0 chrVIII 93164 . G C 402 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=17.48;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:51:435,51,0 chrVIII 93251 . C T 1317 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.94;MQ0=0;QD=23.95;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1350,144,0 chrVIII 93257 . C T 1395 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.94;MQ0=0;QD=25.36;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1428,150,0 chrVIII 93284 . A G 637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.19;MQ0=0;QD=19.91;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:75:670,75,0 chrVIII 93290 . C T 628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.90;MQ0=0;QD=19.62;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:72:661,72,0 chrVIII 93302 . G A 577 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.66;MQ0=0;QD=20.61;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:66:610,66,0 chrVIII 93305 . G A 582 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.66;MQ0=0;QD=20.79;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:66:615,66,0 chrVIII 93312 . T C 470 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.58;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:54:503,54,0 chrVIII 93318 . C T 405 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.29;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:48:438,48,0 chrVIII 93321 . T C 302 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.78;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:39:335,39,0 chrVIII 93323 . C T 334 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=18.56;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:39:367,39,0 chrVIII 93324 . C T 337 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=18.72;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:39:370,39,0 chrVIII 93328 . T C 127.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.442;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:157,0,129 chrVIII 93332 . A G 296 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.44;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:36:329,36,0 chrVIII 93335 . T C 246 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.57;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:30:279,30,0 chrVIII 93339 . A G 217.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.69;SB=-5.602e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:27:250,27,0 chrVIII 93340 . T C 111.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.935;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:57:141,0,57 chrVIII 93341 . C A 222.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.08;SB=-5.402e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:27:255,27,0 chrVIII 93346 . G T 192.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.00;SB=-5.603e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:225,24,0 chrVIII 93350 . G A 185.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.82;SB=-5.302e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:24:218,24,0 chrVIII 93372 . C T 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.55;SB=-1.428e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:56,6,0 chrVIII 93373 . C T 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.67;SB=-1.448e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:58,6,0 chrVIII 93376 . G A 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.61;SB=-1.438e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:57,6,0 chrVIII 93377 . G A 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.61;SB=-1.428e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:57,6,0 chrVIII 93382 . G A 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.41;SB=-1.748e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:58,6,0 chrVIII 93391 . T C 73.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.50;SB=-1.665e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:12:106,12,0 chrVIII 93392 . C G 72.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.45;SB=-1.525e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:12:105,12,0 chrVIII 93395 . A G 74.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.39;SB=-1.655e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:12:107,12,0 chrVIII 93398 . G A 79.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.61;SB=-1.715e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:12:112,12,0 chrVIII 93401 . A G 74.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.39;SB=-1.705e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:12:107,12,0 chrVIII 93405 . T C 78.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.57;SB=-1.705e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:12:111,12,0 chrVIII 93407 . A G 76.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.48;SB=-1.685e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:12:109,12,0 chrVIII 93417 . T G 157.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.04;SB=-2.781e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:21:190,21,0 chrVIII 93422 . G A 223.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.26;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:27:256,27,0 chrVIII 93425 . T C 240 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.00;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:30:273,30,0 chrVIII 93446 . T A 355 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=13.65;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:42:388,42,0 chrVIII 93450 . A G 351 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=13.50;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:42:384,42,0 chrVIII 93466 . T C 340 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=14.78;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:42:373,42,0 chrVIII 93467 . A G 334 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=14.52;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:42:367,42,0 chrVIII 93482 . G A 491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=18.88;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:57:524,57,0 chrVIII 93486 . C A 441 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=18.37;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:51:474,51,0 chrVIII 93500 . A G 472 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.67;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:54:505,54,0 chrVIII 93506 . G C 472 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.45;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:54:505,54,0 chrVIII 93509 . G A 466 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.18;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:54:499,54,0 chrVIII 93512 . G C 413 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=20.65;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:48:446,48,0 chrVIII 93518 . G A 366 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=20.33;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:42:399,42,0 chrVIII 93525 . T C 323 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=20.19;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:16:39:356,39,0 chrVIII 93533 . A T 333 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=22.20;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:39:366,39,0 chrVIII 93534 . T A 327 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.80;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:39:360,39,0 chrVIII 93546 . A G 483 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=24.15;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:57:516,57,0 chrVIII 93547 . T C 470 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=23.50;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:57:503,57,0 chrVIII 93555 . A G 432 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=0;QD=24.00;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:51:465,51,0 chrVIII 93557 . G A 432 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=0;QD=24.00;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:51:465,51,0 chrVIII 93558 . C T 435 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=0;QD=24.17;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:51:468,51,0 chrVIII 93563 . T C 438 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=21.90;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:51:471,51,0 chrVIII 93566 . A T 443 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=22.15;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:51:476,51,0 chrVIII 93569 . A C 185.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.634;DP=19;Dels=0.00;FS=4.337;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-1.127e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,12:19:1:214,1,0 chrVIII 93571 . G A 194.54 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.986;DP=19;Dels=0.00;FS=4.337;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-5.410e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,12:19:2:224,2,0 chrVIII 93574 . T C 188.76 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=19;Dels=0.00;FS=12.788;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.552;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:6:220,6,0 chrVIII 93578 . A G 143.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=8.94;SB=-7.483e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:21:176,21,0 chrVIII 93580 . G C 153.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=9.57;SB=-7.483e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:21:186,21,0 chrVIII 93581 . A G 144.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=9.00;SB=-7.483e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:21:177,21,0 chrVIII 93585 . T C 327 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=16.35;SB=-7.604e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:39:360,39,0 chrVIII 93602 . A G 216.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.192;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.03;ReadPosRankSum=4.140;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,18:27:6:248,6,0 chrVIII 93624 . T G 79.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.63;SB=-5.205e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:12:112,12,0 chrVIII 93629 . T C 82.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.88;SB=-5.205e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:12:115,12,0 chrVIII 93632 . T A 99.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.31;MQ0=0;QD=7.09;SB=-2.227e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:15:132,15,0 chrVIII 93638 . T C 174.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.63;MQ0=0;QD=10.24;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:24:207,24,0 chrVIII 93655 . G A 520 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.30;MQ0=0;QD=19.26;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:60:553,60,0 chrVIII 93659 . T A 539 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.09;MQ0=0;QD=18.59;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:63:572,63,0 chrVIII 93665 . C T 839 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.30;MQ0=0;QD=22.08;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:93:872,93,0 chrVIII 93752 . A G 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.36;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2598,294,0 chrVIII 93770 . A T 2280 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.07;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2313,252,0 chrVIII 93824 . T A 295 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.56;MQ0=0;QD=13.41;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:36:328,36,0 chrVIII 93830 . A G 71.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=4.47;SB=-2.252e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:12:104,12,0 chrVIII 93832 . T C 74.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=4.66;SB=-2.252e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:12:107,12,0 chrVIII 93833 . T C 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.00;SB=-9.815e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:9:77,9,0 chrVIII 93839 . G A 80.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.03;SB=-5.225e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:12:113,12,0 chrVIII 93842 . A G 104.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.13;SB=-2.728e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:15:137,15,0 chrVIII 93848 . T G 103.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.38;SB=-2.723e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:15:136,15,0 chrVIII 93857 . A G 101.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.79;SB=-2.718e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:15:134,15,0 chrVIII 93872 . T C 69.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.95;SB=-5.140e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:102,12,0 chrVIII 93873 . C G 78.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.85;SB=-5.140e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:111,12,0 chrVIII 93875 . G A 84.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.45;SB=-5.140e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:117,12,0 chrVIII 93878 . T G 132.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.01;SB=-1.399e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:18:165,18,0 chrVIII 93884 . T C 116.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=9.68;SB=-1.399e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:18:149,18,0 chrVIII 93896 . A G 105.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.53;SB=-2.642e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:15:138,15,0 chrVIII 93928 . G T 79.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.83;SB=-5.053e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:112,12,0 chrVIII 93929 . A G 78.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.72;SB=-5.053e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:111,12,0 chrVIII 93932 . A G 79.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.83;SB=-5.053e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:112,12,0 chrVIII 93935 . C T 81.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.15;SB=-5.140e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:114,12,0 chrVIII 93938 . C A 83.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.35;SB=-5.140e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:116,12,0 chrVIII 93950 . T C 104.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-2.556e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:15:137,15,0 chrVIII 93961 . A G 198.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=16.50;SB=-2.163e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:27:231,27,0 chrVIII 93962 . C T 215.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=17.92;SB=-2.163e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:27:248,27,0 chrVIII 93968 . A G 231 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=17.77;SB=-1.410e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30:264,30,0 chrVIII 93971 . T G 209.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=16.08;SB=-2.163e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:27:242,27,0 chrVIII 93974 . G A 240 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=18.46;SB=-1.410e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30:273,30,0 chrVIII 93977 . T C 183.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=15.25;SB=-3.878e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:216,24,0 chrVIII 93980 . A G 203.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=15.62;SB=-2.272e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:27:236,27,0 chrVIII 93983 . A G 200.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.36;MQ0=0;QD=13.33;SB=-2.354e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:233,27,0 chrVIII 93995 . G A 236 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=14.75;SB=-1.506e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:30:269,30,0 chrVIII 93997 . A C 243 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=15.19;SB=-1.506e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:30:276,30,0 chrVIII 94007 . T C 215.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.36;MQ0=0;QD=14.33;SB=-2.354e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:27:248,27,0 chrVIII 94010 . T C 215.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.31;MQ0=0;QD=15.36;SB=-2.327e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:27:248,27,0 chrVIII 94012 . A G 216.01 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.31;MQ0=0;QD=15.43;SB=-2.327e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:27:249,27,0 chrVIII 94022 . G T 180.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=13.85;SB=-3.987e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:24:213,24,0 chrVIII 94024 . C T 182.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;QD=14.00;SB=-3.987e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:24:215,24,0 chrVIII 94034 . T G 180.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=15.00;SB=-3.878e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:213,24,0 chrVIII 94038 . A G 175.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=14.59;SB=-3.878e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:208,24,0 chrVIII 94040 . T C 188.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=15.67;SB=-3.878e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:24:221,24,0 chrVIII 94041 . 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A T 49.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.33;SB=-8.463e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:82,9,0 chrVIII 94070 . T C 51.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.66;SB=-8.463e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:84,9,0 chrVIII 94081 . T C 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 chrVIII 94115 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.90;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 chrVIII 94124 . A G 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:56,6,0 chrVIII 94130 . 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A G 22.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.60;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 chrVIII 94162 . C A 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.93;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 chrVIII 94166 . C T 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.95;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:55,6,0 chrVIII 94171 . T C 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.44;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:57,6,0 chrVIII 94172 . C A 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.69;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:58,6,0 chrVIII 94175 . C T 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.95;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:55,6,0 chrVIII 94184 . G A 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.44;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:57,6,0 chrVIII 94196 . T C 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.19;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:56,6,0 chrVIII 94197 . T C 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.44;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:57,6,0 chrVIII 94204 . G T 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.95;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:55,6,0 chrVIII 94208 . T C 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.95;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:55,6,0 chrVIII 94346 . G T 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=5.95;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 chrVIII 94351 . A G 16.85 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=5.62;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:48,6,0 chrVIII 94352 . T C 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=0;QD=5.95;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 chrVIII 94972 . A G 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=0.66;SB=-6.677e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:6:49,6,0 chrVIII 94976 . T C 85.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.32;MQ0=0;QD=2.94;SB=-1.163e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:15:118,15,0 chrVIII 94977 . C T 85.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.32;MQ0=0;QD=2.94;SB=-1.233e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:15:118,15,0 chrVIII 94981 . A G 198.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.27;MQ0=0;QD=5.50;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:27:231,27,0 chrVIII 95000 . G A 242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;DP=49;Dels=0.00;FS=2.512;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.58;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:272,0,240 chrVIII 95092 . A G 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;DP=142;Dels=0.00;FS=6.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.745;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1415,0,1614 chrVIII 95107 . G A 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;DP=161;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=1;MQRankSum=0.674;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1749,0,1556 chrVIII 95119 . T C 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.054;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQ0=1;MQRankSum=0.851;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1708,0,1580 chrVIII 95292 . G A 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.715;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=10.33;ReadPosRankSum=2.051;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1455,0,1405 chrVIII 95322 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.012;DP=133;Dels=0.00;FS=9.518;HaplotypeScore=4.8586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=10.62;ReadPosRankSum=-2.748;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,78:133:99:1442,0,1045 chrVIII 95481 . C A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.260;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1196,0,1390 chrVIII 95661 . A T 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.350;DP=123;Dels=0.00;FS=2.342;HaplotypeScore=5.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=1;MQRankSum=-0.054;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.751;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1296,0,1338 chrVIII 95675 . A G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.475;DP=123;Dels=0.00;FS=4.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1253,0,1290 chrVIII 96126 . A G 2851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2884,315,0 chrVIII 96393 . C T 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3076,309,0 chrVIII 96485 . C T 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3459,363,0 chrVIII 96527 . T G 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3097,321,0 chrVIII 96654 . T A 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3517,358,0 chrVIII 97362 . C T 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.256;DP=182;Dels=0.00;FS=1.237;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,78:182:99:1519,0,2169 chrVIII 97536 . T C 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3505,366,0 chrVIII 97599 . A G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.056;DP=144;Dels=0.00;FS=13.528;HaplotypeScore=3.7081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.498;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1284,0,1665 chrVIII 97611 . G T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.253;DP=152;Dels=0.00;FS=7.262;HaplotypeScore=3.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1356,0,1753 chrVIII 97650 . T C 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3203,333,0 chrVIII 97668 . A G 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.380;DP=154;Dels=0.00;FS=3.817;HaplotypeScore=6.7583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.176;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1686,0,1495 chrVIII 97838 . C T 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.920;DP=132;Dels=0.00;FS=8.052;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1325,0,1257 chrVIII 97856 . C T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;DP=118;Dels=0.00;FS=8.674;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.539;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1067,0,1256 chrVIII 97875 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;DP=113;Dels=0.00;FS=2.419;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1215,0,1070 chrVIII 97896 . C T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.432;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=2.7739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.516;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1187,0,1291 chrVIII 98223 . C T 532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.958;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:562,0,947 chrVIII 98284 . G A 1155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=73.8869;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=9.39;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:1188,120,0 chrVIII 98376 . C T 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.462;DP=163;Dels=0.00;FS=1.985;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=1;MQRankSum=0.338;QD=9.14;ReadPosRankSum=-2.570;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1519,0,1940 chrVIII 98412 . G C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;DP=173;Dels=0.00;FS=2.686;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.345;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,77:173:99:1461,0,2021 chrVIII 98484 . A T 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.48;SB=-2.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3950,400,0 chrVIII 98525 . C T 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.579;DP=148;Dels=0.00;FS=8.638;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.412;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1491,0,1540 chrVIII 98622 . C G 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=22.88;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:164:99:3752,384,0 chrVIII 98643 . C A 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.88;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3408,351,0 chrVIII 98933 . A G 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;DP=89;Dels=0.00;FS=7.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=0.076;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.025;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:801,0,1050 chrVIII 99007 . A G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.328;DP=93;Dels=0.00;FS=1.772;HaplotypeScore=3.8715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.966;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:1059,0,871 chrVIII 99089 . G A 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.349;DP=103;Dels=0.00;FS=1.649;HaplotypeScore=6.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.425;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:1007,0,1071 chrVIII 99112 . A G 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2576,264,0 chrVIII 100079 . A G 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2985,315,0 chrVIII 100241 . A G 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.00;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2997,315,0 chrVIII 100262 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.130;DP=102;Dels=0.00;FS=2.892;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.139;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1169,0,915 chrVIII 101005 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.618;DP=159;Dels=0.00;FS=12.476;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.417;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,71:159:99:1304,0,1769 chrVIII 101020 . G A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.107;DP=148;Dels=0.00;FS=13.332;HaplotypeScore=2.9444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.483;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,83:148:99:1486,0,1182 chrVIII 101246 . A T 3709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.658;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.364;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3709,358,0 chrVIII 101284 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;DP=120;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.247;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1334,0,1241 chrVIII 101494 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.153;DP=137;Dels=0.00;FS=10.016;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.786;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1314,0,1472 chrVIII 101857 . G A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.306;DP=146;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=6.5819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:146:99:1526,0,1575 chrVIII 102030 . A G 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;DP=134;Dels=0.00;FS=8.397;HaplotypeScore=5.9335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,54:134:99:1009,0,1806 chrVIII 102263 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.914;DP=112;Dels=0.00;FS=2.451;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1103,0,1293 chrVIII 102818 . G T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.394;DP=132;Dels=0.00;FS=6.806;HaplotypeScore=2.7611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.225;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1343,0,1336 chrVIII 102970 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;DP=135;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1428,0,1385 chrVIII 103046 . A G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.875;DP=113;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1071,0,1247 chrVIII 103049 . G T 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.147;DP=112;Dels=0.00;FS=10.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.431;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1063,0,1273 chrVIII 103070 . T C 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;DP=105;Dels=0.00;FS=8.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.067;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:869,0,1257 chrVIII 103079 . T C 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.234;DP=102;Dels=0.00;FS=13.172;HaplotypeScore=4.9394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.927;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1055,0,1086 chrVIII 103106 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;DP=91;Dels=0.00;FS=10.265;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:972,0,963 chrVIII 103247 . A T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.807;DP=120;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1326,0,1133 chrVIII 103616 . A G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.961;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=2.009;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1551,0,1037 chrVIII 103737 . G A 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.474;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.074;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,85:159:99:1764,0,1461 chrVIII 104040 . C T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.301;DP=117;Dels=0.00;FS=1.620;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.373;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:117:99:1126,0,1270 chrVIII 104052 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.928;DP=117;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.148;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1265,0,1195 chrVIII 104091 . A C 584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.473;DP=71;Dels=0.00;FS=1.962;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.159;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:614,0,819 chrVIII 104146 . C T 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.563;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:861,0,887 chrVIII 104423 . C A 486.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;DP=101;Dels=0.00;FS=0.786;HaplotypeScore=4.2621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.167;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:101:99:516,0,1353 chrVIII 104426 . A C 2214 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2247,234,0 chrVIII 104429 . G A 613.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.006;DP=93;Dels=0.00;FS=4.110;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.384;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,34:93:99:643,0,1180 chrVIII 104540 . A T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.853;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.979;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1025,0,980 chrVIII 104571 . C A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.501;DP=116;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.631;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1289,0,1083 chrVIII 104953 . G A 1020.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.983;DP=115;Dels=0.00;FS=4.086;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=17;MQRankSum=0.281;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.316;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:1050,0,986 chrVIII 105227 . C A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;DP=140;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.75;MQ0=1;MQRankSum=2.535;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.195;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1399,0,1477 chrVIII 105292 . T A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;DP=124;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=9.52;ReadPosRankSum=-2.036;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1211,0,1375 chrVIII 105298 . T A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.023;DP=119;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.839;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1242,0,1286 chrVIII 105424 . G T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.481;DP=111;Dels=0.00;FS=3.626;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.209;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1152,0,1032 chrVIII 105464 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.978;DP=102;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.663;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1100,0,1010 chrVIII 105532 . C T 1710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=25.91;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1743,180,0 chrVIII 105612 . A T 527.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.573;DP=59;Dels=0.00;FS=1.052;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQ0=0;MQRankSum=-5.776;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.478;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:557,0,694 chrVIII 105615 . T A 496.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;DP=63;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.27;MQ0=0;MQRankSum=-6.125;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.117;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:526,0,748 chrVIII 105621 . C T 466.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;DP=62;Dels=0.00;FS=2.309;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.768;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.993;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,30:62:99:496,0,704 chrVIII 105634 . C T 437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;DP=61;Dels=0.00;FS=2.442;HaplotypeScore=58.8093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.27;MQ0=0;MQRankSum=-6.528;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.988;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:467,0,676 chrVIII 105646 . T G 619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.26;MQ0=0;MQRankSum=6.350;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.461;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,30:71:99:649,0,782 chrVIII 105670 . T A 1631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.35;MQ0=0;QD=25.89;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:63:99:1664,174,0 chrVIII 105685 . G T 562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.485;DP=63;Dels=0.00;FS=2.198;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.086;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:592,0,701 chrVIII 105958 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.385;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1230,0,937 chrVIII 106261 . T A 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2722,279,0 chrVIII 106528 . T C 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3092,318,0 chrVIII 107541 . T C 1901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1934,204,0 chrVIII 107723 . G A 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;DP=97;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=2.8066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.264;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:97:99:1034,0,979 chrVIII 107868 . A G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.947;DP=97;Dels=0.00;FS=2.708;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.274;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,56:97:99:1185,0,873 chrVIII 107993 . T A 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3338,328,0 chrVIII 108134 . C T 2430 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.30;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2463,252,0 chrVIII 108351 . C T 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2622,267,0 chrVIII 108387 . G A 2429 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2462,249,0 chrVIII 108431 . G A 2391 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.17;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2424,255,0 chrVIII 108437 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.514;DP=86;Dels=0.00;FS=4.258;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=2.145;QD=13.26;ReadPosRankSum=-1.837;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,51:86:99:1170,0,687 chrVIII 108568 . G A 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2524,258,0 chrVIII 109025 . A G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6280;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:130:99:3231,345,0 chrVIII 110021 . C T 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3813,373,0 chrVIII 110256 . C T 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3024,309,0 chrVIII 110439 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.049;DP=118;Dels=0.00;FS=5.735;HaplotypeScore=2.9506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.901;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1302,0,1224 chrVIII 110477 . C T 1789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.794;DP=155;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.622;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,83:155:99:1819,0,1476 chrVIII 110970 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.090;DP=114;Dels=0.00;FS=9.500;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1206,0,1259 chrVIII 111246 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.483;DP=102;Dels=0.00;FS=4.984;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1169,0,972 chrVIII 111289 . G A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.698;DP=103;Dels=0.00;FS=13.036;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.275;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1221,0,876 chrVIII 111464 . G C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1337,0,1026 chrVIII 111477 . G T 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.101;DP=123;Dels=0.00;FS=1.645;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:1545,0,1060 chrVIII 111583 . C T 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.843;DP=143;Dels=0.00;FS=0.864;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:143:99:1772,0,1263 chrVIII 111623 . G T 4325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=167;Dels=0.00;FS=5.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.24;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.296;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:167:99:4325,433,0 chrVIII 111695 . G A 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3242,333,0 chrVIII 111760 . T C 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;DP=153;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1609,0,1595 chrVIII 111971 . C T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;DP=152;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.325;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1435,0,1657 chrVIII 112034 . T C 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.171;DP=117;Dels=0.00;FS=5.849;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.296;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:117:99:1052,0,1380 chrVIII 112360 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.200;DP=148;Dels=0.00;FS=2.089;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,63:148:99:1286,0,1722 chrVIII 112492 . A T 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3471,354,0 chrVIII 112829 . A T 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=22.78;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:2971,294,0 chrVIII 112944 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.496;DP=112;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.764;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1231,0,1090 chrVIII 112966 . G A 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3049,321,0 chrVIII 113512 . A C 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3048,315,0 chrVIII 113571 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1049,0,1357 chrVIII 113931 . C T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.722;DP=102;Dels=0.00;FS=4.975;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.611;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.065;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1007,0,953 chrVIII 114144 . A G 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3318,354,0 chrVIII 114181 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.145;DP=142;Dels=0.00;FS=4.841;HaplotypeScore=4.8374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.869;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:1167,0,1895 chrVIII 114241 . C T 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.969;DP=144;Dels=0.00;FS=12.178;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,57:144:99:949,0,1906 chrVIII 114337 . G A 2456 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7107;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.41;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2489,258,0 chrVIII 114567 . G A 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.29;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2739,282,0 chrVIII 114634 . T A 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;DP=107;Dels=0.00;FS=1.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.653;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:1354,0,929 chrVIII 114674 . A G 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.388;DP=102;Dels=0.00;FS=3.661;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=7.19;ReadPosRankSum=1.234;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:763,0,1373 chrVIII 114900 . A G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1225,0,1662 chrVIII 114934 . A G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;DP=122;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=8.8482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:122:99:1276,0,1194 chrVIII 115110 . G A 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=81;Dels=0.01;FS=1.884;HaplotypeScore=8.5973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=0.084;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.506;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,33:80:99:677,0,1030 chrVIII 115445 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=113;Dels=0.00;FS=2.804;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.384;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1233,0,940 chrVIII 115907 . T C 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.687;DP=68;Dels=0.00;FS=8.261;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,35:68:99:751,0,665 chrVIII 115917 . A T 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;DP=75;Dels=0.00;FS=7.773;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.334;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:75:99:877,0,725 chrVIII 115977 . A T 2267 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.630;DP=88;Dels=0.00;FS=4.531;HaplotypeScore=3.9615;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=25.76;ReadPosRankSum=1.614;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:2300,216,0 chrVIII 116063 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.193;DP=125;Dels=0.00;FS=2.284;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.810;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1347,0,1179 chrVIII 116184 . A T 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;DP=96;Dels=0.00;FS=0.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.864;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1089,0,953 chrVIII 116213 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;DP=98;Dels=0.00;FS=6.158;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1074,0,959 chrVIII 116228 . G T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.640;DP=102;Dels=0.00;FS=17.839;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.592;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.508;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:102:99:1082,0,1001 chrVIII 116242 . C T 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.362;DP=99;Dels=0.00;FS=5.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.637;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:999,0,934 chrVIII 116251 . C T 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.505;DP=98;Dels=0.00;FS=8.136;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.798;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.111;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1063,0,875 chrVIII 116306 . T C 602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.246;DP=73;Dels=0.00;FS=10.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQ0=0;MQRankSum=-5.437;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,40:73:99:632,0,733 chrVIII 116310 . C T 1744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.19;MQ0=0;QD=23.89;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1777,189,0 chrVIII 116318 . T C 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.577;DP=71;Dels=0.00;FS=4.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.64;MQ0=0;MQRankSum=-3.554;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,39:71:99:717,0,675 chrVIII 116330 . G A 1864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.23;MQ0=0;QD=24.21;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1897,198,0 chrVIII 116378 . C A 1736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.32;MQ0=0;QD=25.16;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1769,192,0 chrVIII 116445 . A T 101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;DP=69;Dels=0.00;FS=4.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.54;MQ0=1;MQRankSum=-4.512;QD=1.46;ReadPosRankSum=-2.550;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,12:69:99:131,0,1266 chrVIII 116452 . G A 72.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;DP=69;Dels=0.00;FS=7.125;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.53;MQ0=1;MQRankSum=-3.914;QD=1.04;ReadPosRankSum=-2.815;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,11:69:99:102,0,1221 chrVIII 116556 . T C 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.79;MQ0=2;MQRankSum=-6.050;QD=0.43;ReadPosRankSum=1.946;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:67:67,0,1474 chrVIII 116565 . C T 93.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.541;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.30;MQ0=3;MQRankSum=-6.405;QD=1.07;ReadPosRankSum=0.589;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:87:99:123,0,1396 chrVIII 116778 . A G 145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.400;DP=83;Dels=0.00;FS=21.643;HaplotypeScore=9.8260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.704;QD=1.75;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:175,0,1425 chrVIII 116801 . A T 415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.293;DP=80;Dels=0.00;FS=5.946;HaplotypeScore=6.9302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.163;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.938;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:445,0,1178 chrVIII 116814 . A G 447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;DP=77;Dels=0.00;FS=1.934;HaplotypeScore=5.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.444;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:477,0,1033 chrVIII 116923 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;DP=121;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=1.515;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.664;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1302,0,1136 chrVIII 116958 . G A 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.720;DP=141;Dels=0.00;FS=3.110;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.398;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1420,0,1483 chrVIII 116975 . C T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;DP=110;Dels=0.00;FS=9.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1014,0,1278 chrVIII 116997 . T C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;DP=100;Dels=0.00;FS=10.884;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.341;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:892,0,1284 chrVIII 117152 . A G 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.400;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,53:91:99:1164,0,770 chrVIII 117168 . T C 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;DP=108;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=2.6949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:911,0,1359 chrVIII 117170 . A G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.998;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.621;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1355,0,944 chrVIII 117504 . G A 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=25.76;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3150,330,0 chrVIII 117534 . A T 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8897;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.71;MQ0=0;QD=25.34;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3345,357,0 chrVIII 117556 . C T 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.98;MQ0=0;QD=25.31;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3316,360,0 chrVIII 117572 . C T 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.25;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3015,321,0 chrVIII 117586 . A G 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.76;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2808,303,0 chrVIII 117605 . G C 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.82;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3006,318,0 chrVIII 117608 . A G 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.05;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2900,309,0 chrVIII 117849 . C T 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.159;DP=151;Dels=0.00;FS=4.938;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.236;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1647,0,1451 chrVIII 118068 . A G 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3072,327,0 chrVIII 118143 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.046;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1113,0,1387 chrVIII 118187 . T C 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2601,273,0 chrVIII 118467 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.245;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.424;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1626,0,1184 chrVIII 118511 . A G 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.503;DP=142;Dels=0.00;FS=4.138;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.114;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:1117,0,1875 chrVIII 118543 . G T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.119;DP=117;Dels=0.00;FS=7.193;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1471,0,956 chrVIII 118544 . A T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;DP=116;Dels=0.00;FS=7.430;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1465,0,955 chrVIII 118687 . C T 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3273,342,0 chrVIII 118950 . C A 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.609;DP=106;Dels=0.00;FS=3.605;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.714;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1016,0,1144 chrVIII 119053 . C T 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2614,261,0 chrVIII 119057 . A G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.089;DP=102;Dels=0.00;FS=2.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.651;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1288,0,882 chrVIII 119178 . C A 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.369;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=25.30;ReadPosRankSum=1.285;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3170,327,0 chrVIII 119193 . A C 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3205,327,0 chrVIII 119502 . C T 1959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.19;MQ0=0;QD=24.49;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1992,210,0 chrVIII 119552 . T A 565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.668;DP=103;Dels=0.00;FS=10.856;HaplotypeScore=29.5535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.371;QD=5.49;ReadPosRankSum=-5.594;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,33:103:99:595,0,566 chrVIII 119726 . A G 2000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=1;QD=23.81;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2033,219,0 chrVIII 119759 . C T 2344 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2377,252,0 chrVIII 119946 . A G 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3691,375,0 chrVIII 119964 . G A 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.715;DP=144;Dels=0.00;FS=5.165;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,57:144:99:1124,0,1860 chrVIII 120044 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.182;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.749;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:126:99:1199,0,1333 chrVIII 120226 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.495;DP=153;Dels=0.00;FS=5.864;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1511,0,1645 chrVIII 120385 . T G 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3383,348,0 chrVIII 120445 . A G 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.419;DP=145;Dels=0.00;FS=6.146;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1682,0,1328 chrVIII 120946 . T C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;DP=119;Dels=0.00;FS=3.351;HaplotypeScore=3.5580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.147;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1040,0,1413 chrVIII 121315 . T C 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.077;DP=151;Dels=0.00;FS=3.820;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,84:151:99:1716,0,1391 chrVIII 121477 . A T 4069.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:4069,418,0 chrVIII 122053 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.770;DP=139;Dels=0.00;FS=4.038;HaplotypeScore=15.8890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.630;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1502,0,1222 chrVIII 122315 . T C 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.078;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.030;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1633,0,1414 chrVIII 122655 . G A 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.09;MQ0=0;QD=23.07;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3101,324,0 chrVIII 123099 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.795;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1285,0,1450 chrVIII 123306 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.506;DP=130;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.413;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1259,0,1429 chrVIII 123473 . A G 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.216;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.797;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1500,0,1270 chrVIII 123874 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;DP=140;Dels=0.00;FS=17.999;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1357,0,1585 chrVIII 123915 . C T 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;DP=124;Dels=0.00;FS=10.529;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.64;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=7.78;ReadPosRankSum=-1.184;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:995,0,1261 chrVIII 124092 . T A 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3663;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3759,399,0 chrVIII 124457 . T C 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.594;DP=123;Dels=0.00;FS=3.373;HaplotypeScore=2.9110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.493;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1220,0,1372 chrVIII 124744 . G A 4715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.64;SB=-2.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4715,469,0 chrVIII 125040 . A G 4536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.06;SB=-2.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4536,477,0 chrVIII 125084 . T C 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.439;DP=147;Dels=0.00;FS=13.176;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.34;ReadPosRankSum=-2.961;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1550,0,1519 chrVIII 125108 . G A 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.546;DP=147;Dels=0.00;FS=2.973;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.978;QD=10.27;ReadPosRankSum=2.962;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1540,0,1515 chrVIII 125140 . T C 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.834;DP=149;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=4.7069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1706,0,1334 chrVIII 125163 . C T 1979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.499;DP=167;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=11.85;ReadPosRankSum=-2.921;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,94:167:99:2009,0,1456 chrVIII 125249 . C T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.850;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1483,0,1354 chrVIII 125354 . C T 1966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.336;DP=171;Dels=0.00;FS=4.433;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.911;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,89:171:99:1996,0,1596 chrVIII 125441 . G A 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.441;DP=169;Dels=0.00;FS=9.222;HaplotypeScore=2.9311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.313;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,84:169:99:1795,0,1673 chrVIII 125465 . C T 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;DP=155;Dels=0.00;FS=11.792;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.334;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.423;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1542,0,1620 chrVIII 125771 . C T 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=26.69;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2969,312,0 chrVIII 125900 . T G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.212;DP=109;Dels=0.00;FS=2.844;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1043,0,840 chrVIII 125937 . T C 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.00;SB=-2.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3848,390,0 chrVIII 125980 . C T 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.625;DP=157;Dels=0.00;FS=2.961;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1663,0,1592 chrVIII 126017 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.522;DP=147;Dels=0.00;FS=6.102;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1456,0,1548 chrVIII 126068 . C T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.146;DP=139;Dels=0.00;FS=2.204;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.133;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1306,0,1555 chrVIII 126131 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.282;DP=136;Dels=0.00;FS=5.296;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1275,0,1386 chrVIII 126142 . C G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.669;DP=144;Dels=0.00;FS=3.014;HaplotypeScore=110.2679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.704;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1192,0,1438 chrVIII 126148 . C A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.024;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=115.0468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.519;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1290,0,1292 chrVIII 126255 . T C 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.614;DP=136;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.738;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1504,0,1353 chrVIII 126325 . A T 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;DP=145;Dels=0.00;FS=10.491;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.630;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1741,0,1374 chrVIII 126397 . T G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.306;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1295,0,1431 chrVIII 126572 . T C 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3085,315,0 chrVIII 126788 . G A 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;DP=111;Dels=0.00;FS=1.670;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,45:111:99:876,0,1437 chrVIII 126792 . C T 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.44;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3240,336,0 chrVIII 126873 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;DP=153;Dels=0.00;FS=6.087;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,70:153:99:1440,0,1815 chrVIII 126953 . C T 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.425;DP=114;Dels=0.00;FS=1.523;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.655;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:114:99:941,0,1390 chrVIII 127010 . A T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;DP=132;Dels=0.00;FS=5.601;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1291,0,1387 chrVIII 127040 . A T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;DP=114;Dels=0.00;FS=5.931;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.641;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1342,0,1072 chrVIII 127304 . G C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.086;DP=118;Dels=0.00;FS=2.419;HaplotypeScore=3.6363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.688;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1289,0,1053 chrVIII 127727 . C G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.546;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1427,0,1218 chrVIII 127758 . C T 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.010;DP=139;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.924;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1670,0,1267 chrVIII 127766 . G C 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.817;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1596,0,1178 chrVIII 127853 . A G 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.080;DP=141;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=3.4078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.385;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1681,0,1232 chrVIII 127914 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.238;DP=119;Dels=0.00;FS=3.447;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=-0.361;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.926;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1269,0,1186 chrVIII 127976 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.648;DP=126;Dels=0.00;FS=7.294;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.946;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1343,0,1349 chrVIII 128112 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.434;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=12.17;ReadPosRankSum=2.233;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1369,0,936 chrVIII 128119 . C T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.411;DP=121;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=11.30;ReadPosRankSum=2.685;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:121:99:1397,0,1105 chrVIII 128376 . A C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.814;DP=145;Dels=0.00;FS=2.307;HaplotypeScore=4.5088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1377,0,1566 chrVIII 128669 . T C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.393;DP=114;Dels=0.00;FS=3.470;HaplotypeScore=2.9000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:114:99:1184,0,1169 chrVIII 128736 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.388;DP=116;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=4.7891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=2.289;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.846;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1055,0,1250 chrVIII 128904 . C T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.310;DP=130;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.710;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1443,0,1318 chrVIII 129223 . A T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.268;DP=151;Dels=0.01;FS=2.070;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.994;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1695,0,1467 chrVIII 129228 . C T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.708;DP=154;Dels=0.00;FS=2.030;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1695,0,1465 chrVIII 129265 . C T 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.935;DP=158;Dels=0.01;FS=0.595;HaplotypeScore=11.7043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1641,0,1646 chrVIII 129445 . A G 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=152;Dels=0.00;FS=25.098;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.245;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1709,0,1406 chrVIII 130043 . C T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.226;DP=110;Dels=0.00;FS=2.465;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:110:99:1190,0,1034 chrVIII 130198 . A C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.342;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1205,0,1125 chrVIII 130265 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.388;DP=123;Dels=0.00;FS=4.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.048;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1341,0,1207 chrVIII 130533 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;DP=126;Dels=0.00;FS=4.373;HaplotypeScore=2.7586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.953;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:126:99:1321,0,1197 chrVIII 130538 . T C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;DP=116;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.729;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.142;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1365,0,1060 chrVIII 130619 . C T 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=130;Dels=0.00;FS=3.273;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.392;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:130:99:1509,0,1178 chrVIII 130652 . A G 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.677;DP=146;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1622,0,1543 chrVIII 130783 . T C 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.599;DP=126;Dels=0.00;FS=8.172;HaplotypeScore=2.9737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=1;MQRankSum=0.671;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.138;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,74:126:99:1540,0,1029 chrVIII 131102 . A T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.345;DP=106;Dels=0.00;FS=15.739;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.851;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1070,0,1171 chrVIII 131183 . C T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.520;DP=108;Dels=0.00;FS=5.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.015;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1194,0,949 chrVIII 131216 . C T 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3173,319,0 chrVIII 131324 . T C 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3415,375,0 chrVIII 131505 . T A 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.12;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2749,285,0 chrVIII 131549 . G T 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=107.0748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2868,288,0 chrVIII 131693 . G T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;DP=125;Dels=0.00;FS=11.426;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1322,0,1315 chrVIII 131716 . T C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.650;DP=150;Dels=0.00;FS=19.293;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.244;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1436,0,1816 chrVIII 131723 . C A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.454;DP=146;Dels=0.00;FS=17.571;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.961;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1386,0,1635 chrVIII 131898 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.388;DP=107;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=5.6173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=12.25;ReadPosRankSum=-2.260;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:107:99:1341,0,881 chrVIII 131900 . T A 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;DP=105;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=5.6173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=8.08;ReadPosRankSum=2.315;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:878,0,1299 chrVIII 132095 . C A 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.630;DP=88;Dels=0.00;FS=1.801;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.680;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:773,0,1063 chrVIII 132165 . T C 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.905;DP=88;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=9.66;ReadPosRankSum=2.268;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:880,0,1033 chrVIII 132728 . A C 2367 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2400,252,0 chrVIII 132840 . A G 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.607;DP=114;Dels=0.00;FS=25.398;HaplotypeScore=5.3899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1161,0,1189 chrVIII 132907 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.220;DP=101;Dels=0.00;FS=22.328;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.303;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1178,0,975 chrVIII 132911 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.089;DP=89;Dels=0.00;FS=24.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1036,0,922 chrVIII 132947 . G A 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;DP=81;Dels=0.00;FS=11.174;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.216;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,43:81:99:871,0,826 chrVIII 132971 . G A 677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.643;DP=78;Dels=0.00;FS=1.873;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.444;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.194;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,44:78:99:707,0,741 chrVIII 132987 . G A 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.922;DP=80;Dels=0.00;FS=1.890;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.802;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,48:80:99:896,0,642 chrVIII 133001 . C T 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.426;DP=71;Dels=0.00;FS=8.393;HaplotypeScore=35.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQ0=0;MQRankSum=-3.414;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.052;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,40:71:99:710,0,617 chrVIII 133012 . T C 16.85 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.486;DP=73;Dels=0.00;FS=6.578;HaplotypeScore=35.8011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.832;QD=0.23;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-2.328e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,40:73:6:48,6,0 chrVIII 133061 . C A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.545;DP=111;Dels=0.00;FS=8.850;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1436,0,866 chrVIII 133330 . T C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.076;DP=102;Dels=0.00;FS=10.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQ0=0;MQRankSum=2.146;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.347;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,66:102:99:1365,0,679 chrVIII 133512 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.236;DP=94;Dels=0.00;FS=2.733;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.448;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:1020,0,857 chrVIII 133583 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;DP=118;Dels=0.00;FS=4.002;HaplotypeScore=11.4657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=1;MQRankSum=-2.457;QD=9.83;ReadPosRankSum=2.211;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1190,0,1203 chrVIII 133760 . A C 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.811;DP=109;Dels=0.00;FS=4.122;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.06;MQ0=3;MQRankSum=-4.357;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.223;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1016,0,1176 chrVIII 133952 . A T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.971;DP=138;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=-4.350;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.215;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1407,0,1516 chrVIII 133963 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.744;DP=128;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=-3.861;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.213;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1197,0,1446 chrVIII 133967 . A C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.509;DP=124;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.216;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.017;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1213,0,1400 chrVIII 133995 . T A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.240;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQ0=0;MQRankSum=4.907;QD=10.01;ReadPosRankSum=2.177;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1402,0,1468 chrVIII 134097 . A G 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.930;DP=119;Dels=0.00;FS=4.440;HaplotypeScore=2.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.747;QD=11.37;ReadPosRankSum=2.851;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1383,0,1003 chrVIII 134157 . T C 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.688;DP=101;Dels=0.00;FS=10.289;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=10.74;ReadPosRankSum=-2.339;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1115,0,992 chrVIII 134172 . C T 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.529;DP=107;Dels=0.00;FS=11.879;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:998,0,1178 chrVIII 134180 . G A 681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.829;DP=88;Dels=0.00;FS=4.128;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=7.74;ReadPosRankSum=1.007;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:711,0,1024 chrVIII 134208 . G A 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;DP=101;Dels=0.00;FS=1.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:919,0,1027 chrVIII 134240 . A T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.760;DP=128;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.364;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1190,0,1375 chrVIII 134252 . A C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.794;DP=127;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=53.9901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=4.218;QD=10.79;ReadPosRankSum=-2.103;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1400,0,1088 chrVIII 134264 . T G 488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.619;DP=133;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=55.1178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.636;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:518,0,1622 chrVIII 135273 . G A 815.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.498;DP=95;Dels=0.00;FS=24.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.881;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:845,0,1226 chrVIII 135417 . A C 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.327;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.635;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:973,0,1228 chrVIII 136404 . C T 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.993;DP=92;Dels=0.00;FS=1.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.933;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.105;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,46:92:99:960,0,942 chrVIII 136467 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.266;DP=104;Dels=0.00;FS=9.620;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.268;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:971,0,1237 chrVIII 136628 . T G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.978;DP=144;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.786;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.959;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1482,0,1526 chrVIII 136639 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.973;DP=135;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.911;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1339,0,1521 chrVIII 136744 . G A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.313;DP=107;Dels=0.00;FS=3.610;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=2.434;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1109,0,1115 chrVIII 137107 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.437;DP=121;Dels=0.00;FS=12.720;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.966;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1378,0,1128 chrVIII 137643 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.729;DP=117;Dels=0.00;FS=11.976;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.582;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1341,0,907 chrVIII 137688 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.905;DP=125;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=2.127;QD=10.08;ReadPosRankSum=-2.157;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1290,0,1186 chrVIII 137713 . A G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.283;DP=118;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1216,0,1137 chrVIII 137850 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.222;DP=102;Dels=0.00;FS=1.585;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.148;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1092,0,826 chrVIII 137880 . T C 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.700;DP=94;Dels=0.00;FS=2.768;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.113;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:893,0,933 chrVIII 137997 . G A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.023;DP=130;Dels=0.00;FS=3.654;HaplotypeScore=14.8338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:130:99:1036,0,975 chrVIII 138316 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.952;DP=140;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.672;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1501,0,1432 chrVIII 138375 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.788;DP=131;Dels=0.00;FS=3.287;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.164;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1201,0,1496 chrVIII 138502 . T G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.175;DP=102;Dels=0.00;FS=6.566;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.614;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1026,0,1011 chrVIII 138587 . T C 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.87;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2853,306,0 chrVIII 138717 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;DP=131;Dels=0.00;FS=4.142;HaplotypeScore=2.6414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.851;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.626;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:131:99:1380,0,1352 chrVIII 139207 . G C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=101;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:900,0,1174 chrVIII 139248 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.742;DP=133;Dels=0.00;FS=4.145;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.441;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1162,0,1578 chrVIII 139383 . C T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;DP=123;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.181;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1152,0,1504 chrVIII 139404 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.464;DP=146;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.681;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1327,0,1728 chrVIII 139405 . C T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.914;DP=146;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:146:99:1355,0,1699 chrVIII 139444 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=132;Dels=0.00;FS=4.372;HaplotypeScore=3.3954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.532;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1149,0,1652 chrVIII 139506 . C T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;DP=153;Dels=0.00;FS=4.773;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.382;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1652,0,1613 chrVIII 139958 . A T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.640;DP=152;Dels=0.00;FS=16.063;HaplotypeScore=8.5987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1299,0,1883 chrVIII 140065 . G A 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2488,261,0 chrVIII 140068 . T G 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.348;DP=112;Dels=0.00;FS=4.701;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.980;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:895,0,1432 chrVIII 140398 . G A 1393.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.308;DP=138;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1423,0,1410 chrVIII 140403 . G A 1389.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.456;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1419,0,1499 chrVIII 140407 . C T 1415.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.356;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.241;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.730;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1445,0,1413 chrVIII 140488 . T C 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.664;DP=137;Dels=0.00;FS=3.063;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.877;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1526,0,1341 chrVIII 140536 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.501;DP=149;Dels=0.00;FS=4.938;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1354,0,1720 chrVIII 140940 . C A 1972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.475;DP=171;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.365;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,92:171:99:2002,0,1626 chrVIII 140991 . A G 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.155;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.161;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,87:184:99:1705,0,2143 chrVIII 141325 . C G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.854;DP=144;Dels=0.00;FS=10.250;HaplotypeScore=4.8662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.070;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1516,0,1380 chrVIII 141337 . G A 1865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.560;DP=175;Dels=0.00;FS=3.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.999;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.775;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,90:175:99:1895,0,1790 chrVIII 141479 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.073;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.85;MQ0=1;MQRankSum=-1.698;QD=9.22;ReadPosRankSum=2.916;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1090,0,1340 chrVIII 141628 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.568;DP=124;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.812;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1302,0,1226 chrVIII 141659 . A C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.578;DP=126;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=9.6699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.230;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1228,0,1102 chrVIII 141740 . A T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.251;DP=146;Dels=0.00;FS=7.551;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1737,0,1419 chrVIII 142155 . G A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.992;DP=130;Dels=0.00;FS=2.483;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.287;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1624,0,999 chrVIII 142191 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.488;DP=114;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1237,0,1101 chrVIII 142299 . T C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.825;DP=166;Dels=0.00;FS=3.045;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=9.23;ReadPosRankSum=-2.166;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,79:166:99:1562,0,1880 chrVIII 142302 . A G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.456;DP=169;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.743;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:169:99:1618,0,1902 chrVIII 142335 . T C 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.805;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.966;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1630,0,1649 chrVIII 142791 . A G 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.420;DP=151;Dels=0.00;FS=14.926;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.285;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,85:151:99:1780,0,1413 chrVIII 142800 . G C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.554;DP=149;Dels=0.00;FS=14.919;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.632;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:1290,0,1838 chrVIII 142863 . A G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.308;DP=152;Dels=0.00;FS=5.946;HaplotypeScore=4.8578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.510;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1381,0,1763 chrVIII 143214 . A T 3953.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.994e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3953,417,0 chrVIII 143824 . A G 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2866,300,0 chrVIII 143930 . C T 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.18;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2979,312,0 chrVIII 143949 . T C 143.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=121.1692;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.59;MQ0=0;QD=1.21;SB=-8.456e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:116:21:176,21,0 chrVIII 144253 . T C 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3281,330,0 chrVIII 144280 . G T 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3251,325,0 chrVIII 144393 . A G 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.75;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3430,357,0 chrVIII 144613 . T C 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2846,318,0 chrVIII 144688 . T C 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3549,366,0 chrVIII 145315 . G C 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2980,303,0 chrVIII 145363 . C T 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3241,333,0 chrVIII 145441 . C T 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3333,351,0 chrVIII 145684 . C T 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.22;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2865,288,0 chrVIII 145768 . A G 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3990,429,0 chrVIII 145828 . G A 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3481,358,0 chrVIII 145861 . G C 3588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3588,381,0 chrVIII 145867 . A G 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3335,351,0 chrVIII 146182 . G A 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=25.86;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3214,333,0 chrVIII 146380 . C A 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;DP=141;Dels=0.00;FS=34.914;HaplotypeScore=4.7956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.03;MQ0=1;MQRankSum=3.242;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.566;SB=-9.257e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,87:141:99:1910,0,677 chrVIII 146382 . G A 1891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;DP=142;Dels=0.00;FS=34.691;HaplotypeScore=2.8146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.90;MQ0=2;MQRankSum=3.639;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.021;SB=-9.222e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,88:142:99:1921,0,667 chrVIII 146822 . C A 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3238,336,0 chrVIII 146900 . T C 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.572;DP=152;Dels=0.00;FS=2.034;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1727,0,1437 chrVIII 147004 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;DP=147;Dels=0.00;FS=7.259;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.301;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1643,0,1456 chrVIII 149077 . C T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.998;DP=132;Dels=0.00;FS=2.730;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1497,0,1265 chrVIII 149347 . C T 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.23;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3023,297,0 chrVIII 149382 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.163;DP=113;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.237;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.445;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1218,0,1123 chrVIII 149511 . A C 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2806,303,0 chrVIII 149519 . T C 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3197,336,0 chrVIII 149564 . A C 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3469,366,0 chrVIII 149577 . A G 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3584,375,0 chrVIII 149614 . T C 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3115,336,0 chrVIII 149622 . A G 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3174,339,0 chrVIII 149665 . G A 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2976,309,0 chrVIII 149706 . G A 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3343,339,0 chrVIII 149795 . T A 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3570,366,0 chrVIII 149856 . G A 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3669,373,0 chrVIII 149906 . C T 4113.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4113,415,0 chrVIII 149951 . T C 3970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3970,426,0 chrVIII 149962 . A G 3906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3906,423,0 chrVIII 150051 . C T 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2880,306,0 chrVIII 150079 . G A 2448 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.03;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2481,270,0 chrVIII 150081 . A G 2430 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.03;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2463,270,0 chrVIII 150083 . C T 2492 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.03;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2525,273,0 chrVIII 150086 . G A 2662 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=119;Dels=0.00;FS=3.352;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=22.37;ReadPosRankSum=-1.266;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2695,297,0 chrVIII 150136 . C G 2392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.04;MQ0=0;QD=21.55;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2425,267,0 chrVIII 150142 . A G 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.25;MQ0=0;QD=21.39;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2493,273,0 chrVIII 150182 . T C 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3560,375,0 chrVIII 150224 . C T 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.393;DP=128;Dels=0.00;FS=2.271;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.420;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1063,0,1597 chrVIII 150232 . C T 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3487,357,0 chrVIII 150248 . G T 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3807,384,0 chrVIII 150338 . A G 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3512,378,0 chrVIII 150392 . A T 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=24.86;SB=-2.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3928,396,0 chrVIII 150421 . T C 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3663,372,0 chrVIII 150444 . T C 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3487,354,0 chrVIII 150470 . A G 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:125:99:3014,327,0 chrVIII 150476 . C T 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3262,330,0 chrVIII 150593 . C A 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.815;DP=97;Dels=0.00;FS=11.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.656;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1022,0,872 chrVIII 150619 . C T 2236 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.27;MQ0=0;QD=25.12;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2269,234,0 chrVIII 150639 . C T 2135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=24.83;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:86:99:2168,231,0 chrVIII 150723 . T C 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=22.69;ReadPosRankSum=1.573;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3006,306,0 chrVIII 150802 . T C 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=24.73;ReadPosRankSum=0.198;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3734,362,0 chrVIII 150919 . G T 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3593,369,0 chrVIII 151003 . A G 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3398,345,0 chrVIII 151118 . C G 2559 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.34;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2592,276,0 chrVIII 151171 . T G 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3272,339,0 chrVIII 151313 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.782;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.281;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1094,0,1343 chrVIII 151325 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.792;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.717;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1180,0,1114 chrVIII 151416 . T C 2682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6331;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=21.46;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:2715,297,0 chrVIII 151599 . T C 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=22.85;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2866,297,0 chrVIII 151640 . A G 2672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=21.55;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2705,279,0 chrVIII 151733 . T C 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2693,285,0 chrVIII 151824 . A G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.541;DP=126;Dels=0.00;FS=1.454;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=10.37;ReadPosRankSum=3.256;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1337,0,1265 chrVIII 151950 . A G 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.290;DP=120;Dels=0.00;FS=5.817;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.066;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,74:120:99:1604,0,947 chrVIII 152094 . A C 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3675,381,0 chrVIII 152121 . G A 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3714,375,0 chrVIII 152274 . C T 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3468,354,0 chrVIII 152397 . C T 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-2.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3975,400,0 chrVIII 152625 . T C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3732,381,0 chrVIII 152677 . C T 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3887,402,0 chrVIII 152692 . A G 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.199;DP=165;Dels=0.00;FS=17.076;HaplotypeScore=3.8635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.116;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1667,0,1862 chrVIII 152769 . T C 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3316,351,0 chrVIII 152802 . T C 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3360,348,0 chrVIII 152925 . T C 2558 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2591,273,0 chrVIII 152944 . T C 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2921,306,0 chrVIII 152946 . G A 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2939,300,0 chrVIII 153195 . A G 4016.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.74;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4016,411,0 chrVIII 153282 . G A 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3951,417,0 chrVIII 153442 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.929;DP=151;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=3.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.402;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1443,0,1749 chrVIII 153651 . G A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.424;DP=132;Dels=0.00;FS=3.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.802;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1203,0,1473 chrVIII 153731 . T C 4100.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4100,432,0 chrVIII 153859 . A G 2022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.490;DP=187;Dels=0.00;FS=0.568;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,96:187:99:2052,0,2002 chrVIII 153963 . A G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.893;DP=109;Dels=0.00;FS=6.727;HaplotypeScore=2.8500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.118;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1020,0,1227 chrVIII 153991 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.287;DP=136;Dels=0.00;FS=8.909;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=8.78;ReadPosRankSum=2.096;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1224,0,1464 chrVIII 154167 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.734;DP=156;Dels=0.00;FS=2.001;HaplotypeScore=9.3771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.360;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1411,0,1706 chrVIII 154199 . A G 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.526;DP=127;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=5.5999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:127:99:994,0,1620 chrVIII 154225 . T C 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.698;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=8.21;ReadPosRankSum=-2.340;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1138,0,1652 chrVIII 154229 . C T 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3445,354,0 chrVIII 154554 . C T 694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.158;DP=83;Dels=0.00;FS=0.982;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,38:83:99:724,0,959 chrVIII 154571 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.507;DP=90;Dels=0.00;FS=1.832;HaplotypeScore=2.5802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:980,0,900 chrVIII 154608 . A G 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.152;DP=75;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,47:75:99:1004,0,555 chrVIII 154677 . T A 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.86;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2386,252,0 chrVIII 154680 . A G 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;DP=91;Dels=0.00;FS=12.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.631;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:961,0,967 chrVIII 154704 . A G 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;DP=95;Dels=0.00;FS=17.218;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=1.906;QD=9.31;ReadPosRankSum=2.830;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:914,0,1041 chrVIII 154746 . G A 2234 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2267,231,0 chrVIII 154932 . C T 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=94;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.745;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:1019,0,943 chrVIII 154980 . A T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.778;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.320;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:1109,0,709 chrVIII 155037 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.192;DP=109;Dels=0.00;FS=9.216;HaplotypeScore=5.7956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.398;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1276,0,870 chrVIII 155087 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;DP=107;Dels=0.00;FS=3.551;HaplotypeScore=3.7406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.090;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1228,0,1036 chrVIII 155157 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.502;DP=108;Dels=0.00;FS=3.560;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.295;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1296,0,932 chrVIII 155175 . T C 2546 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2579,273,0 chrVIII 155186 . A G 2361 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2394,252,0 chrVIII 155332 . G T 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;DP=101;Dels=0.00;FS=5.016;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.473;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1144,0,983 chrVIII 155521 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.319;DP=122;Dels=0.00;FS=5.300;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.491;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,73:122:99:1494,0,993 chrVIII 155572 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.384;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=8.92;ReadPosRankSum=3.331;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1189,0,1557 chrVIII 155587 . G A 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3541,355,0 chrVIII 155635 . G A 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.262;DP=133;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.563;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1564,0,1275 chrVIII 155735 . G A 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.373;DP=101;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=5.8924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:934,0,1166 chrVIII 155994 . G T 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;DP=148;Dels=0.00;FS=10.105;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.500;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1670,0,1430 chrVIII 156096 . A C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.788;DP=135;Dels=0.00;FS=3.074;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.931;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1252,0,1586 chrVIII 156276 . C A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.058;DP=116;Dels=0.00;FS=6.105;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1140,0,1228 chrVIII 156307 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.777;DP=121;Dels=0.00;FS=7.989;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.241;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1221,0,1423 chrVIII 156420 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.733;DP=145;Dels=0.00;FS=3.195;HaplotypeScore=3.5637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1414,0,1643 chrVIII 156477 . A G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.774;DP=154;Dels=0.00;FS=3.476;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.017;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1320,0,1866 chrVIII 156690 . A C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.361;DP=144;Dels=0.00;FS=2.982;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1378,0,1659 chrVIII 156698 . T G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;DP=136;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=3.4799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1378,0,1474 chrVIII 156724 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=136;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.627;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1272,0,1626 chrVIII 156924 . G A 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3369,342,0 chrVIII 157305 . A G 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3069,321,0 chrVIII 157424 . A G 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3189,348,0 chrVIII 157435 . A G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.016;DP=121;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.229;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1392,0,1155 chrVIII 157495 . T A 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.33;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2831,300,0 chrVIII 157497 . A T 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.16;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2811,297,0 chrVIII 157616 . A G 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3893,402,0 chrVIII 157807 . T C 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3769,408,0 chrVIII 158014 . G A 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3015,312,0 chrVIII 158092 . G T 3906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.70;SB=-2.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3906,396,0 chrVIII 158098 . G T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.457;DP=161;Dels=0.00;FS=1.982;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.266;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,67:161:99:1402,0,1870 chrVIII 158374 . A G 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3413,348,0 chrVIII 158566 . G A 2338 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.69;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2371,243,0 chrVIII 158962 . G C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=1;QD=22.64;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2976,306,0 chrVIII 159088 . A T 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.665;DP=166;Dels=0.00;FS=1.231;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.098;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,85:166:99:1742,0,1730 chrVIII 159238 . T G 2573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2606,273,0 chrVIII 159377 . T A 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.69;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2649,264,0 chrVIII 159599 . G A 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2936,303,0 chrVIII 159758 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.708;DP=148;Dels=0.00;FS=7.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1380,0,1579 chrVIII 159782 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.828;DP=123;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.999;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1206,0,1245 chrVIII 159794 . T G 161.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.273;DP=116;Dels=0.00;FS=182.156;HaplotypeScore=9.7848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=1.39;ReadPosRankSum=-3.790;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,39:116:99:191,0,1589 chrVIII 159848 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.793;DP=124;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.040;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1196,0,1341 chrVIII 159887 . A C 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3101,321,0 chrVIII 159950 . G T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.941;DP=124;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.176;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1439,0,1131 chrVIII 159962 . G A 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.130;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.666;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:1584,0,1063 chrVIII 160136 . T C 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.472;DP=133;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.335;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1102,0,1188 chrVIII 160450 . T C 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=145;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.185;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1531,0,1499 chrVIII 160876 . C T 4785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4785,478,0 chrVIII 161504 . T C 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=1;QD=25.43;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3059,315,0 chrVIII 161715 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.632;DP=122;Dels=0.00;FS=4.416;HaplotypeScore=8.8128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:1009,0,1393 chrVIII 161791 . G T 94.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.770;DP=108;Dels=0.00;FS=83.963;HaplotypeScore=5.7251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=0.87;ReadPosRankSum=-4.917;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:108:99:124,0,1392 chrVIII 161961 . G A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.662;DP=107;Dels=0.00;FS=9.318;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:992,0,1137 chrVIII 161994 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.676;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.129;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1316,0,1176 chrVIII 162108 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.045;DP=143;Dels=0.00;FS=7.570;HaplotypeScore=2.7075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1313,0,1521 chrVIII 162618 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.392;DP=96;Dels=0.00;FS=1.707;HaplotypeScore=3.3827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.444;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:96:99:1014,0,900 chrVIII 162628 . C T 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.419;DP=98;Dels=0.00;FS=3.783;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=12.10;ReadPosRankSum=2.312;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1216,0,847 chrVIII 162659 . C T 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.303;DP=103;Dels=0.00;FS=11.129;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.386;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:823,0,1202 chrVIII 162837 . G A 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.930;DP=156;Dels=0.00;FS=4.905;HaplotypeScore=3.6843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.432;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,87:156:99:1736,0,1313 chrVIII 162897 . T C 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.982;DP=144;Dels=0.00;FS=13.836;HaplotypeScore=5.4671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.122;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1523,0,1342 chrVIII 163422 . G C 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=1;QD=25.83;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3565,372,0 chrVIII 163476 . A G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.476;DP=145;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-0.689;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.170;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1485,0,1395 chrVIII 163571 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.338;DP=107;Dels=0.00;FS=6.190;HaplotypeScore=5.8502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.157;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:107:99:1176,0,1079 chrVIII 163731 . C T 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3304,336,0 chrVIII 164197 . T C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.735;DP=134;Dels=0.00;FS=17.659;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.402;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1346,0,1488 chrVIII 164274 . A G 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.529;DP=138;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1141,0,1689 chrVIII 164613 . C T 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.219;DP=143;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.531;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1616,0,1320 chrVIII 164807 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;DP=112;Dels=0.00;FS=4.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.857;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1198,0,1134 chrVIII 164863 . C T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;DP=139;Dels=0.00;FS=7.801;HaplotypeScore=4.5491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.111;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1281,0,1462 chrVIII 164870 . T C 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.30;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3202,333,0 chrVIII 164881 . C A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.331;DP=144;Dels=0.00;FS=2.997;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.44;MQ0=0;MQRankSum=-4.538;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1128,0,1569 chrVIII 164891 . T C 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.327;DP=135;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQ0=0;MQRankSum=-4.243;QD=7.31;ReadPosRankSum=-1.235;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1017,0,1477 chrVIII 164893 . A G 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;DP=135;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQ0=0;MQRankSum=-3.924;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1041,0,1422 chrVIII 164927 . T A 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.128;DP=129;Dels=0.00;FS=10.038;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQ0=0;MQRankSum=-4.384;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.582;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:831,0,1414 chrVIII 164952 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;DP=137;Dels=0.00;FS=5.257;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.666;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1046,0,1564 chrVIII 165142 . G A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.775;DP=148;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.653;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1597,0,1458 chrVIII 165143 . G A 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.459;DP=148;Dels=0.00;FS=3.914;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.446;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1595,0,1467 chrVIII 165566 . A G 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.628;DP=109;Dels=0.00;FS=2.549;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.166;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:109:99:848,0,1228 chrVIII 165647 . A G 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.772;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.870;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1177,0,1498 chrVIII 165678 . C T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.752;DP=120;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1061,0,1496 chrVIII 165698 . A G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3181,351,0 chrVIII 165727 . G A 4088.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4088,427,0 chrVIII 165797 . T C 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3601,375,0 chrVIII 165835 . G A 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3084,318,0 chrVIII 165848 . G C 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.370;DP=157;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=5.8589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1504,0,1696 chrVIII 165867 . T G 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;DP=142;Dels=0.00;FS=3.529;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.635;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3678,381,0 chrVIII 165986 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.609;DP=131;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.948;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1090,0,1616 chrVIII 166195 . A G 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.911;DP=177;Dels=0.00;FS=4.336;HaplotypeScore=2.7188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.891;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,86:177:99:1776,0,1987 chrVIII 166541 . G A 3802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3802,402,0 chrVIII 166655 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.492;DP=121;Dels=0.00;FS=25.128;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1217,0,1370 chrVIII 166793 . A G 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.38;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2764,288,0 chrVIII 166864 . G A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.276;DP=143;Dels=0.00;FS=1.344;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=1;MQRankSum=2.137;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.343;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:143:99:1695,0,1244 chrVIII 166940 . T C 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3415,357,0 chrVIII 166991 . A C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.985;DP=146;Dels=0.00;FS=8.781;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.417;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1349,0,1592 chrVIII 167064 . T C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.136;DP=147;Dels=0.00;FS=2.065;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1396,0,1685 chrVIII 167096 . G A 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.947;DP=148;Dels=0.00;FS=12.074;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.037;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1716,0,1275 chrVIII 167156 . A G 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.752;DP=146;Dels=0.00;FS=2.082;HaplotypeScore=3.9408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.281;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1591,0,1352 chrVIII 167277 . T C 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.286;DP=145;Dels=0.00;FS=5.123;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=2.578;QD=10.77;ReadPosRankSum=-2.000;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1592,0,1468 chrVIII 167286 . T C 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.846;DP=135;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.37;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=8.96;ReadPosRankSum=2.250;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1240,0,1519 chrVIII 167413 . C T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.650;DP=114;Dels=0.00;FS=3.626;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=2.109;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.907;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1184,0,1214 chrVIII 167453 . G A 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.047;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.937;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:76:99:877,0,662 chrVIII 167475 . G A 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.617;DP=76;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.71;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.444;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,45:76:99:1002,0,599 chrVIII 167487 . C T 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.226;DP=75;Dels=0.00;FS=0.891;HaplotypeScore=3.2231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.455;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:983,0,544 chrVIII 167512 . C T 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.829;DP=84;Dels=0.00;FS=1.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.984;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:815,0,882 chrVIII 167543 . T C 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.35;MQ0=0;QD=23.61;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2583,282,0 chrVIII 167557 . T A 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=93.7513;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.41;MQ0=0;QD=23.69;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2639,282,0 chrVIII 167569 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.458;DP=108;Dels=0.00;FS=6.348;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.54;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.988;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:108:99:1096,0,816 chrVIII 167575 . G T 2179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.28;MQ0=0;QD=21.36;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2212,234,0 chrVIII 167580 . G A 2193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.72;MQ0=0;QD=21.09;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2226,234,0 chrVIII 167593 . T C 2164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.03;MQ0=0;QD=20.81;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2197,234,0 chrVIII 167637 . T C 51.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.924;DP=106;Dels=0.00;FS=2.564;HaplotypeScore=218.1453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.28;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=0.48;ReadPosRankSum=1.170;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,19:106:81:81,0,995 chrVIII 167656 . T C 1800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=42.9601;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.05;MQ0=0;QD=19.78;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:1833,198,0 chrVIII 167671 . A G 584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.806;DP=91;Dels=0.00;FS=1.715;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.862;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.084;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:614,0,993 chrVIII 167797 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.044;DP=129;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1387,0,1221 chrVIII 167848 . C T 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;DP=85;Dels=0.00;FS=0.831;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=2.183;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.205;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,50:85:99:1100,0,685 chrVIII 167876 . C A 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.470;DP=89;Dels=0.00;FS=0.828;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.203;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:792,0,1085 chrVIII 167910 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.635;DP=110;Dels=0.00;FS=2.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=1.925;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.494;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1112,0,1082 chrVIII 167923 . C T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.657;DP=124;Dels=0.00;FS=3.213;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.635;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1297,0,1241 chrVIII 167968 . C T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.282;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1033,0,1109 chrVIII 168070 . C T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.811;DP=129;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=3.3435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=2.699;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1316,0,1227 chrVIII 168253 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.626;DP=104;Dels=0.00;FS=9.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.990;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1115,0,945 chrVIII 168433 . T C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.892;DP=96;Dels=0.00;FS=3.831;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:931,0,1056 chrVIII 168439 . C T 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;DP=110;Dels=0.00;FS=2.468;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1089,0,1170 chrVIII 168681 . G T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.133;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=2.591;QD=12.86;ReadPosRankSum=-1.260;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,56:95:99:1252,0,713 chrVIII 168804 . G A 2038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.40;MQ0=0;QD=20.38;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2071,219,0 chrVIII 169586 . T A 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2841,294,0 chrVIII 169760 . A G 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.30;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2794,300,0 chrVIII 169769 . G A 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4931;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.82;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3224,342,0 chrVIII 169868 . C T 2175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.59;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2208,225,0 chrVIII 170035 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.346;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=1;MQRankSum=0.671;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.411;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1449,0,1468 chrVIII 170595 . C T 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=21.68;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3047,306,0 chrVIII 170680 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;DP=120;Dels=0.00;FS=4.971;HaplotypeScore=3.1091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.187;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1036,0,1062 chrVIII 170740 . C G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.260;DP=152;Dels=0.00;FS=4.830;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.926;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1486,0,1655 chrVIII 171171 . A G 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.697;DP=185;Dels=0.01;FS=1.229;HaplotypeScore=19.3899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=7.70;ReadPosRankSum=2.526;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,76:184:99:1454,0,2294 chrVIII 171268 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.403;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.830;QD=10.29;ReadPosRankSum=2.559;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1254,0,1155 chrVIII 171273 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.986;DP=110;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=11.19;ReadPosRankSum=3.195;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1261,0,1040 chrVIII 171279 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;DP=112;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.119;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.955;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1289,0,1079 chrVIII 171537 . A C 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;DP=185;Dels=0.00;FS=0.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,89:185:99:1702,0,2052 chrVIII 171548 . A C 2128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.730;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.271;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,103:195:99:2158,0,1820 chrVIII 171564 . G A 1784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.909;DP=195;Dels=0.00;FS=1.749;HaplotypeScore=3.6426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,93:195:99:1814,0,2135 chrVIII 171761 . G T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;DP=134;Dels=0.00;FS=6.508;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.138;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1208,0,1679 chrVIII 172258 . C T 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.113;DP=165;Dels=0.00;FS=1.950;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.924;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1727,0,1622 chrVIII 172443 . G A 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.265;DP=148;Dels=0.00;FS=2.895;HaplotypeScore=4.1674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.231;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.186;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1544,0,1574 chrVIII 172560 . G T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.467;DP=128;Dels=0.00;FS=4.241;HaplotypeScore=5.5017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1382,0,1286 chrVIII 172608 . G A 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;DP=156;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=6.7265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.209;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:156:99:1570,0,1685 chrVIII 172701 . C T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.020;DP=135;Dels=0.00;FS=5.388;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1459,0,1233 chrVIII 172808 . T C 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.120;DP=146;Dels=0.00;FS=4.942;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.747;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:146:99:1588,0,1481 chrVIII 172837 . C G 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3746,381,0 chrVIII 172909 . C T 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.057;DP=135;Dels=0.00;FS=3.085;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.381;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1541,0,1207 chrVIII 173105 . G A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.861;DP=156;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=47.2865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQ0=0;MQRankSum=-3.854;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:1374,0,1790 chrVIII 173130 . A T 29.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.672;DP=150;Dels=0.00;FS=9.768;HaplotypeScore=216.6919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.61;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=0.19;ReadPosRankSum=-3.885;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,8:150:59:59,0,290 chrVIII 173140 . A C 1580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-8.755;DP=145;Dels=0.00;FS=2.286;HaplotypeScore=90.3940;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.25;MQ0=0;MQRankSum=6.477;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.550;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:74,71:145:99:1613,115,0 chrVIII 173207 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.680;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.741;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1135,0,1268 chrVIII 173271 . A G 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.897;DP=155;Dels=0.00;FS=26.259;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=23.99;ReadPosRankSum=4.949;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,145:155:99:3718,390,0 chrVIII 173295 . G A 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-1.994e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3589,364,0 chrVIII 173412 . G A 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.857;DP=176;Dels=0.00;FS=0.559;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,86:176:99:1751,0,1795 chrVIII 173562 . G A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;DP=150;Dels=0.00;FS=6.030;HaplotypeScore=3.8715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.482;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,66:150:99:1313,0,1679 chrVIII 173637 . G T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.019;DP=147;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.432;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1330,0,1674 chrVIII 173923 . T G 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.797;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.368;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,94:179:99:1887,0,1786 chrVIII 174093 . T C 4860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:189:99:4860,519,0 chrVIII 174120 . A C 4650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4650,480,0 chrVIII 174165 . A C 4327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4327,433,0 chrVIII 174625 . G A 1937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.613;DP=181;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.931;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,90:181:99:1967,0,1819 chrVIII 175012 . C T 5508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5508,556,0 chrVIII 175141 . T C 1876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.513;DP=173;Dels=0.00;FS=0.564;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.026;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,96:173:99:1906,0,1534 chrVIII 175263 . T C 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.109;DP=146;Dels=0.00;FS=6.308;HaplotypeScore=2.5633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=2.096;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1605,0,1310 chrVIII 175480 . C T 4685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4685,460,0 chrVIII 175661 . T C 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.881;DP=169;Dels=0.00;FS=1.230;HaplotypeScore=6.9644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,99:169:99:1882,0,1474 chrVIII 175731 . A C 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.757;DP=147;Dels=0.00;FS=6.229;HaplotypeScore=4.4545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.647;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,83:147:99:1587,0,1364 chrVIII 175734 . A C 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.899;DP=151;Dels=0.00;FS=7.329;HaplotypeScore=4.4545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.126;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:151:99:1545,0,1327 chrVIII 176382 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.779;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.968;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1498,0,1240 chrVIII 176426 . A G 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3964,408,0 chrVIII 176480 . G A 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.131;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.867;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1620,0,1476 chrVIII 176679 . T C 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.122;DP=205;Dels=0.00;FS=0.547;HaplotypeScore=4.0357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.590;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,98:205:99:1690,0,2196 chrVIII 176826 . T C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.367;DP=152;Dels=0.00;FS=8.641;HaplotypeScore=4.2194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.352;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,91:152:99:1437,0,1084 chrVIII 177049 . A G 4922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:4922,502,0 chrVIII 177076 . T C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=170;Dels=0.00;FS=7.236;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.979;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,73:170:99:1428,0,2124 chrVIII 177113 . C T 2200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.661;DP=175;Dels=0.00;FS=2.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.083;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,102:175:99:2230,0,1383 chrVIII 177333 . A G 1826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.730;DP=172;Dels=0.00;FS=1.960;HaplotypeScore=3.2560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQ0=0;MQRankSum=2.449;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.545;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,91:172:99:1856,0,1627 chrVIII 177610 . T C 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.503;DP=139;Dels=0.00;FS=4.093;HaplotypeScore=2.2788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=22.78;ReadPosRankSum=1.452;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:139:99:3200,333,0 chrVIII 177619 . A C 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3621,369,0 chrVIII 177676 . C T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.615;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.686;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1156,0,1660 chrVIII 177766 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.542;DP=148;Dels=0.00;FS=6.679;HaplotypeScore=5.1618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.080;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:148:99:1382,0,1712 chrVIII 177778 . G C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.168;DP=144;Dels=0.00;FS=5.269;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.474;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1369,0,1508 chrVIII 177793 . C G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.853;DP=133;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=3.6626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.128;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1251,0,1454 chrVIII 177867 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.806;DP=131;Dels=0.00;FS=5.314;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1269,0,1488 chrVIII 178041 . G T 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=27.42;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2967,306,0 chrVIII 178061 . C G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.484;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1272,0,1068 chrVIII 178097 . T A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.686;DP=128;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.220;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1563,0,1171 chrVIII 178104 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.808;DP=118;Dels=0.00;FS=4.754;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQ0=0;MQRankSum=1.753;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1096,0,1362 chrVIII 178121 . G A 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.442;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.578;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1091,0,1419 chrVIII 178125 . A G 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.352;DP=140;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.119;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1256,0,1630 chrVIII 178134 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;DP=140;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=1.876;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.696;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1270,0,1601 chrVIII 178170 . A T 681.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.760;DP=128;Dels=0.00;FS=15.983;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.319;QD=5.32;ReadPosRankSum=3.320;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:711,0,1558 chrVIII 178171 . T G 681.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.172;DP=128;Dels=0.00;FS=15.983;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.798;QD=5.32;ReadPosRankSum=3.162;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:711,0,1595 chrVIII 178172 . T C 730.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.287;DP=128;Dels=0.00;FS=13.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.257;QD=5.70;ReadPosRankSum=3.032;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:760,0,1612 chrVIII 178173 . T A 849.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;DP=130;Dels=0.00;FS=13.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-4.157;QD=6.53;ReadPosRankSum=2.853;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:879,0,1601 chrVIII 178196 . C A 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;DP=141;Dels=0.00;FS=10.312;HaplotypeScore=2.4595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.051;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1617,0,1332 chrVIII 178230 . A G 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3736,411,0 chrVIII 178242 . A G 1875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;DP=162;Dels=0.00;FS=2.008;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=2.612;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,89:162:99:1905,0,1475 chrVIII 178458 . A G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.660;DP=143;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.979;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.435;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1405,0,1596 chrVIII 178619 . G A 4102.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4102,424,0 chrVIII 178632 . A G 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:4068,417,0 chrVIII 178659 . A T 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.633;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,95:178:99:1773,0,1744 chrVIII 178672 . A G 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.760;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1706,0,1418 chrVIII 178799 . T C 3604.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3604,393,0 chrVIII 178801 . A G 1389.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.573;DP=151;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1419,0,1754 chrVIII 178808 . G A 1406.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.460;DP=155;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.329;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,69:155:99:1436,0,1839 chrVIII 178843 . C T 4177.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.835;DP=170;Dels=0.00;FS=5.144;HaplotypeScore=4.7488;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=24.57;ReadPosRankSum=1.406;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:4177,408,0 chrVIII 178873 . T A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.506;DP=165;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1533,0,1832 chrVIII 178909 . C T 4094.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.08;SB=-2.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4094,427,0 chrVIII 179026 . C T 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2624,264,0 chrVIII 179071 . T A 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.65;MQ0=0;QD=26.08;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3006,315,0 chrVIII 179085 . A G 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.93;MQ0=0;QD=24.47;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2774,300,0 chrVIII 179088 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.735;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=9.09;ReadPosRankSum=2.726;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1084,0,1261 chrVIII 179112 . C T 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.569;DP=107;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1178,0,992 chrVIII 179142 . T C 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=22.94;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2717,288,0 chrVIII 179208 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.954;DP=142;Dels=0.00;FS=8.886;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.205;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1398,0,1560 chrVIII 179241 . C T 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3499,360,0 chrVIII 179265 . C T 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4738;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3237,333,0 chrVIII 179371 . C T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.600;DP=163;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.131;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,76:163:99:1538,0,1890 chrVIII 179402 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.038;DP=117;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.370;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1346,0,1097 chrVIII 179572 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.247;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1173,0,1252 chrVIII 179748 . C T 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3894,397,0 chrVIII 179821 . C T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.915;DP=142;Dels=0.01;FS=2.178;HaplotypeScore=4.6982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.010;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1352,0,1567 chrVIII 179923 . C T 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.461;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.280;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:3012,286,0 chrVIII 180100 . G A 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2941,303,0 chrVIII 180223 . T A 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.92;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2833,285,0 chrVIII 180918 . A G 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.348;DP=119;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1398,0,1047 chrVIII 181049 . G A 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.305;DP=145;Dels=0.00;FS=5.152;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=1;MQRankSum=1.151;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1495,0,1474 chrVIII 181082 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.550;DP=132;Dels=0.00;FS=9.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=1;MQRankSum=-1.563;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.964;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1324,0,1353 chrVIII 181124 . T G 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.536;DP=154;Dels=0.00;FS=2.821;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=11.07;ReadPosRankSum=-2.138;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1735,0,1536 chrVIII 181132 . A G 1926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.311;DP=173;Dels=0.00;FS=0.560;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=11.13;ReadPosRankSum=-2.178;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,93:173:99:1956,0,1688 chrVIII 181265 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.638;DP=161;Dels=0.00;FS=1.969;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=9.61;ReadPosRankSum=3.450;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1578,0,1790 chrVIII 181842 . G A 1112.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.355;DP=127;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=8.76;ReadPosRankSum=2.461;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1142,0,1462 chrVIII 181848 . G C 1430.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;DP=139;Dels=0.00;FS=3.118;HaplotypeScore=3.6591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=10.29;ReadPosRankSum=-2.346;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1460,0,1219 chrVIII 181849 . C T 1415.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.890;DP=138;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=3.6591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=10.25;ReadPosRankSum=-2.253;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1445,0,1248 chrVIII 182092 . T C 4230.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.33;SB=-2.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:167:99:4230,438,0 chrVIII 182246 . A C 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;DP=162;Dels=0.00;FS=15.807;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,84:162:99:1563,0,1634 chrVIII 182297 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.917;DP=126;Dels=0.00;FS=5.639;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1280,0,1233 chrVIII 182330 . T C 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.237;DP=132;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1315,0,1353 chrVIII 182333 . A T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.798;DP=124;Dels=0.00;FS=3.257;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.099;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.425;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1264,0,1271 chrVIII 182354 . A G 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.886;DP=112;Dels=0.00;FS=10.570;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:112:99:1119,0,1085 chrVIII 182378 . A G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.328;DP=119;Dels=0.00;FS=10.282;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1284,0,1118 chrVIII 182747 . G A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.480;DP=138;Dels=0.00;FS=2.169;HaplotypeScore=3.1615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.900;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1010,0,1705 chrVIII 182852 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;DP=141;Dels=0.00;FS=3.040;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1371,0,1679 chrVIII 182918 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;DP=139;Dels=0.00;FS=6.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.513;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1226,0,1604 chrVIII 183041 . C G 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.169;DP=146;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.895;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1398,0,1619 chrVIII 183062 . A T 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.184;DP=138;Dels=0.00;FS=4.119;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1561,0,1408 chrVIII 183275 . T C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;DP=115;Dels=0.00;FS=0.767;HaplotypeScore=6.6406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1232,0,1150 chrVIII 183402 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;DP=133;Dels=0.00;FS=9.195;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.630;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1220,0,1608 chrVIII 183482 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.928;DP=118;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.601;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1167,0,1295 chrVIII 183721 . T C 2079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2112,225,0 chrVIII 183728 . G A 681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.573;DP=74;Dels=0.00;FS=4.528;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:711,0,719 chrVIII 183741 . C T 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=73;Dels=0.00;FS=12.063;HaplotypeScore=2.6392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.723;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:669,0,773 chrVIII 183744 . C T 628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.031;DP=74;Dels=0.00;FS=3.142;HaplotypeScore=2.6392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.531;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:658,0,860 chrVIII 183845 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.682;DP=119;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.960;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1164,0,1302 chrVIII 183913 . C G 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.184;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:788,0,1037 chrVIII 183923 . T C 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.310;DP=105;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=1.776;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.176;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:869,0,1343 chrVIII 184065 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;DP=99;Dels=0.00;FS=23.139;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=5.693;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.571;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1122,0,960 chrVIII 184104 . C T 2464 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.18;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2497,261,0 chrVIII 184122 . T A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.427;DP=92;Dels=0.00;FS=2.844;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.534;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1115,0,833 chrVIII 184171 . A G 593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;DP=74;Dels=0.00;FS=11.258;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.184;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:623,0,918 chrVIII 184258 . A G 2341 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.30;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2374,252,0 chrVIII 184281 . G A 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.692;DP=97;Dels=0.00;FS=8.671;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.128;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:864,0,1257 chrVIII 184323 . A G 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;DP=93;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:885,0,1089 chrVIII 184374 . A G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.760;DP=130;Dels=0.00;FS=6.457;HaplotypeScore=3.4119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.800;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1188,0,1385 chrVIII 184572 . A G 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;DP=130;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.841;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,52:130:99:953,0,1663 chrVIII 184766 . C T 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.990;DP=88;Dels=0.00;FS=2.797;HaplotypeScore=3.8424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.677;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.649;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:845,0,1007 chrVIII 184847 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.305;DP=105;Dels=0.00;FS=2.606;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.112;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1047,0,1106 chrVIII 184872 . A G 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:99:99:1175,0,845 chrVIII 185022 . G A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;DP=136;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1307,0,1589 chrVIII 185064 . G A 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;DP=161;Dels=0.00;FS=6.999;HaplotypeScore=4.8717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.134;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1719,0,1693 chrVIII 185325 . C T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.139;DP=143;Dels=0.00;FS=11.041;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1363,0,1636 chrVIII 185403 . C T 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.943;DP=105;Dels=0.00;FS=4.798;HaplotypeScore=7.7832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.203;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:970,0,1200 chrVIII 185478 . T C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;DP=123;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.635;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1266,0,1299 chrVIII 185480 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.996;DP=125;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.358;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1311,0,1305 chrVIII 185547 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.802;DP=148;Dels=0.00;FS=2.942;HaplotypeScore=2.3617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.493;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1295,0,1722 chrVIII 185766 . C T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=123;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1110,0,1452 chrVIII 186657 . C T 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.154;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1665,0,912 chrVIII 186876 . C T 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=48.3254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2996,300,0 chrVIII 186921 . G A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.593;DP=117;Dels=0.00;FS=4.509;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=2.259;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.583;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1104,0,1338 chrVIII 187275 . A C 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.066;DP=116;Dels=0.00;FS=2.399;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1026,0,1374 chrVIII 187320 . A C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=124;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1321,0,1307 chrVIII 187527 . T A 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,82:163:99:1559,0,1759 chrVIII 187908 . G A 2104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.588;DP=185;Dels=0.00;FS=17.004;HaplotypeScore=5.6490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,101:185:99:2134,0,1637 chrVIII 188188 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.570;DP=154;Dels=0.00;FS=1.255;HaplotypeScore=6.4008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.555;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.047;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1509,0,1718 chrVIII 188673 . C A 4266.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.35;SB=-2.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4266,433,0 chrVIII 188821 . C T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.442;DP=169;Dels=0.00;FS=1.227;HaplotypeScore=3.3525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,71:169:99:1459,0,2020 chrVIII 188841 . A G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.969;DP=163;Dels=0.00;FS=1.946;HaplotypeScore=2.4413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.478;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,73:163:99:1348,0,1875 chrVIII 188853 . G A 4354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.07;SB=-2.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4354,442,0 chrVIII 188873 . T C 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.408;DP=158;Dels=0.00;FS=4.872;HaplotypeScore=3.5478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.497;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,78:158:99:1580,0,1684 chrVIII 188964 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.550;DP=147;Dels=0.00;FS=2.957;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.073;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:147:99:1356,0,1596 chrVIII 189054 . T C 4288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.47;SB=-2.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4288,459,0 chrVIII 189143 . A G 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.263;DP=170;Dels=0.00;FS=3.114;HaplotypeScore=4.9648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.080;SB=-2.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:3217,322,0 chrVIII 189187 . T C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.468;DP=135;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=4.8586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.046;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1210,0,1501 chrVIII 189221 . C G 4244.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.57;SB=-2.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4244,453,0 chrVIII 189257 . G A 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;DP=159;Dels=0.00;FS=1.273;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.219;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:159:99:1716,0,1490 chrVIII 189330 . G A 2015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.444;DP=189;Dels=0.00;FS=2.572;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.274;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,104:189:99:2045,0,1566 chrVIII 189356 . G A 1845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.709;DP=207;Dels=0.00;FS=1.070;HaplotypeScore=7.8091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.494;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,97:207:99:1875,0,2082 chrVIII 189608 . A G 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.917;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.405;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,88:173:99:1711,0,1711 chrVIII 190024 . C T 4438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4438,466,0 chrVIII 190064 . T C 4482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2290;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4482,480,0 chrVIII 190125 . A T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.017;DP=187;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=0.562;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.012;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,79:187:99:1426,0,2188 chrVIII 190423 . C G 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.243;DP=171;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=5.5212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.665;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,84:171:99:1526,0,1546 chrVIII 190428 . T A 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.693;DP=181;Dels=0.00;FS=4.009;HaplotypeScore=7.3032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.407;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,88:181:99:1625,0,1926 chrVIII 190671 . C T 2003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.548;DP=185;Dels=0.00;FS=0.544;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.552;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,100:185:99:2033,0,1751 chrVIII 190872 . A C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.841;DP=135;Dels=0.00;FS=5.174;HaplotypeScore=2.8248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.655;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1257,0,1511 chrVIII 191072 . T C 4121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4121,432,0 chrVIII 191248 . A G 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.989e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3803,417,0 chrVIII 191304 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.170;DP=213;Dels=0.00;FS=2.562;HaplotypeScore=7.7924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.670;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,76:213:99:1402,0,2814 chrVIII 191348 . A T 4794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.49;SB=-2.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4794,484,0 chrVIII 191460 . T C 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.678;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,84:170:99:1704,0,1882 chrVIII 191478 . C T 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.891;DP=170;Dels=0.00;FS=1.201;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.111;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,86:170:99:1854,0,1698 chrVIII 191529 . T A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;DP=182;Dels=0.00;FS=7.879;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.744;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.198;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,75:182:99:1368,0,2356 chrVIII 191643 . C A 1994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.728;DP=171;Dels=0.00;FS=4.749;HaplotypeScore=17.5526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.513;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,93:171:99:2024,0,1565 chrVIII 191691 . C T 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.925;DP=163;Dels=0.00;FS=1.254;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,85:163:99:1763,0,1597 chrVIII 191947 . C T 1915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.642;DP=162;Dels=0.00;FS=8.415;HaplotypeScore=5.8877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.441;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:162:99:1945,0,1370 chrVIII 192124 . T C 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.046;DP=186;Dels=0.00;FS=1.233;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.562;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,88:186:99:1728,0,2055 chrVIII 192252 . G A 1807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.781;DP=165;Dels=0.00;FS=1.931;HaplotypeScore=4.3806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1837,0,1449 chrVIII 192892 . C T 2576 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.59;MQ0=8;QD=20.44;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2609,270,0 chrVIII 192904 . A T 1708 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.60;MQ0=8;QD=18.17;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:94:99:1741,180,0 chrVIII 192928 . A G 382.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.438;DP=103;Dels=0.00;FS=0.897;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.53;MQ0=7;MQRankSum=-2.026;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.048;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:412,0,1118 chrVIII 192973 . G A 2384 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.22;MQ0=5;QD=23.84;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2417,249,0 chrVIII 193075 . G A 1108 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.605;DP=84;Dels=0.00;FS=4.535;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.88;MQ0=11;MQRankSum=1.321;QD=13.19;ReadPosRankSum=-2.370;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,74:84:43:1141,43,0 chrVIII 193114 . T C 946 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.54;MQ0=8;QD=15.26;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:979,105,0 chrVIII 193183 . T G 1532 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.41;MQ0=6;MQRankSum=1.537;QD=19.90;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,71:77:99:1565,150,0 chrVIII 193245 . C T 1514.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.810;DP=96;Dels=0.00;FS=30.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.17;MQ0=11;MQRankSum=5.505;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.631;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,72:96:50:1544,0,50 chrVIII 193626 . G C 2000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=22.22;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2033,219,0 chrVIII 193633 . A G 2101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.94;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2134,225,0 chrVIII 194221 . G T 323.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.702;DP=115;Dels=0.00;FS=36.933;HaplotypeScore=7.6380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.81;MQ0=5;MQRankSum=-6.816;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.081;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,34:115:99:353,0,1782 chrVIII 194236 . G A 421.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;DP=107;Dels=0.00;FS=19.982;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.27;MQ0=5;MQRankSum=-6.960;QD=3.93;ReadPosRankSum=-3.834;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,38:107:99:451,0,1621 chrVIII 194266 . G A 309.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.126;DP=97;Dels=0.00;FS=33.031;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.55;MQ0=4;MQRankSum=-6.446;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,33:97:99:339,0,1385 chrVIII 194308 . A G 931.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.691;DP=99;Dels=0.00;FS=14.474;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.04;MQ0=6;MQRankSum=-1.871;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.373;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:961,0,972 chrVIII 194338 . A G 870.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.271;DP=110;Dels=0.00;FS=15.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.85;MQ0=9;MQRankSum=-5.620;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:900,0,1222 chrVIII 194446 . T G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.529;DP=131;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.71;MQ0=3;MQRankSum=0.677;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1318,0,1264 chrVIII 194627 . T A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.335;DP=119;Dels=0.00;FS=3.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.821;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1109,0,1321 chrVIII 194783 . C T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;DP=155;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=5.2961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.565;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1501,0,1738 chrVIII 194974 . T G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.924;DP=131;Dels=0.00;FS=15.486;HaplotypeScore=5.8980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=8.45;ReadPosRankSum=3.078;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1137,0,1624 chrVIII 195481 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;DP=115;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.400;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1214,0,1247 chrVIII 196135 . C T 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3228,330,0 chrVIII 196160 . G A 3879.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3879,394,0 chrVIII 196216 . C T 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.272;DP=156;Dels=0.00;FS=2.860;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.999;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,88:156:99:1775,0,1335 chrVIII 196468 . A G 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3061,315,0 chrVIII 196532 . A G 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2915,309,0 chrVIII 196732 . T C 2573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2606,279,0 chrVIII 196831 . C T 4152.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4152,427,0 chrVIII 197030 . A G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.404;DP=111;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1062,0,1189 chrVIII 197728 . T A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.894;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:967,0,1438 chrVIII 197824 . C A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;DP=117;Dels=0.00;FS=5.974;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:980,0,1515 chrVIII 197974 . G A 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.158;DP=133;Dels=0.00;FS=4.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1527,0,1277 chrVIII 198244 . T A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.612;DP=152;Dels=0.00;FS=3.230;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=1;MQRankSum=1.562;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.175;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1462,0,1645 chrVIII 198281 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;DP=138;Dels=0.00;FS=3.470;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.849;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1317,0,1461 chrVIII 198394 . G C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.943;DP=111;Dels=0.01;FS=16.816;HaplotypeScore=8.7487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.560;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1041,0,1278 chrVIII 198412 . T G 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.527;DP=98;Dels=0.00;FS=8.916;HaplotypeScore=2.4626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.421;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:895,0,1134 chrVIII 198453 . G A 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;DP=123;Dels=0.00;FS=2.414;HaplotypeScore=5.4303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:998,0,1321 chrVIII 198473 . A G 79.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.683;DP=120;Dels=0.00;FS=13.588;HaplotypeScore=213.8877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=0.66;ReadPosRankSum=-3.511;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,14:120:99:109,0,1242 chrVIII 198549 . T C 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;DP=101;Dels=0.00;FS=12.111;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.613;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:944,0,1030 chrVIII 198648 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.596;DP=109;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=3.5983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1180,0,1031 chrVIII 199139 . G A 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;DP=108;Dels=0.00;FS=6.783;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1101,0,1153 chrVIII 199421 . C A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.101;DP=140;Dels=0.00;FS=6.386;HaplotypeScore=3.1526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.318;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:140:99:1170,0,1721 chrVIII 199753 . T C 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=138;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=11.3334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.519;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1547,0,1328 chrVIII 199777 . A G 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.080;DP=137;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.519;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1306,0,1565 chrVIII 199794 . T C 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.864;DP=136;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.175;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1592,0,1260 chrVIII 199875 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.710;DP=116;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.386;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1200,0,1306 chrVIII 199940 . C T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.936;DP=139;Dels=0.00;FS=4.117;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.162;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1372,0,1503 chrVIII 200453 . C T 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.234;DP=134;Dels=0.00;FS=4.129;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=-0.571;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1607,0,1179 chrVIII 200617 . A G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.576;DP=145;Dels=0.00;FS=5.064;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.781;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1499,0,1527 chrVIII 200796 . T G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;DP=121;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.919;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1116,0,1437 chrVIII 201335 . G A 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=140;Dels=0.00;FS=3.318;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1618,0,1347 chrVIII 201548 . G A 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.062;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:758,0,812 chrVIII 201705 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.713;DP=135;Dels=0.00;FS=10.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.072;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1465,0,1401 chrVIII 201817 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.499;DP=109;Dels=0.00;FS=6.474;HaplotypeScore=2.3913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:109:99:1390,0,817 chrVIII 201845 . C G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.782;DP=101;Dels=0.00;FS=8.164;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=12.24;ReadPosRankSum=-2.744;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,63:101:99:1266,0,651 chrVIII 202037 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;DP=118;Dels=0.00;FS=7.400;HaplotypeScore=2.4658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.472;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1346,0,1026 chrVIII 202143 . T G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.486;DP=130;Dels=0.00;FS=4.232;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.897;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1314,0,1326 chrVIII 202145 . G A 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.982;DP=125;Dels=0.00;FS=5.491;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.016;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1467,0,1238 chrVIII 202219 . T C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.283;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=10.16;ReadPosRankSum=2.448;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1280,0,1279 chrVIII 202236 . C A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.166;DP=109;Dels=0.00;FS=4.834;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,65:109:99:1391,0,869 chrVIII 202259 . C T 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.671;DP=119;Dels=0.00;FS=7.282;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=13.33;ReadPosRankSum=-2.076;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,73:119:99:1616,0,868 chrVIII 202307 . C T 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.689;DP=135;Dels=0.00;FS=9.443;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.581;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1518,0,1241 chrVIII 202480 . T C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.241;DP=121;Dels=0.00;FS=10.538;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.642;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1255,0,1225 chrVIII 202550 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.002;DP=99;Dels=0.00;FS=1.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.349;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1183,0,885 chrVIII 202635 . T C 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;DP=98;Dels=0.00;FS=10.136;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.359;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1024,0,1062 chrVIII 202714 . A T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;DP=118;Dels=0.00;FS=3.406;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.693;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:118:99:1095,0,1394 chrVIII 202737 . A C 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6461;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3368,345,0 chrVIII 202738 . A T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.752;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.325;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1202,0,1523 chrVIII 202839 . C G 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;DP=96;Dels=0.00;FS=5.833;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.849;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1117,0,857 chrVIII 202861 . C T 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.611;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,40:70:99:888,0,631 chrVIII 202893 . C T 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.164;DP=91;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=6.7892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.497;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:91:99:1017,0,872 chrVIII 202988 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.482;DP=136;Dels=0.00;FS=3.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.548;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1214,0,1564 chrVIII 203255 . T G 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3032,300,0 chrVIII 203274 . C A 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9506;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3433,337,0 chrVIII 203292 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.148;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1378,0,1457 chrVIII 203310 . G A 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.497;DP=118;Dels=0.00;FS=0.829;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:990,0,1352 chrVIII 203380 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.372;DP=128;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.565;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1380,0,1257 chrVIII 203446 . T C 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.815;DP=117;Dels=0.00;FS=4.816;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1088,0,1368 chrVIII 203456 . C G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.232;DP=114;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1143,0,1239 chrVIII 203533 . G A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.931;DP=123;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=1;MQRankSum=0.430;QD=10.54;ReadPosRankSum=2.019;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1327,0,1229 chrVIII 203615 . A G 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.843;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.702;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1455,0,1325 chrVIII 203842 . C T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.270;DP=140;Dels=0.00;FS=17.056;HaplotypeScore=4.8051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.417;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,58:140:99:1130,0,1670 chrVIII 203888 . A G 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.444;DP=83;Dels=0.00;FS=6.091;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.687;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:705,0,1093 chrVIII 204117 . A C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.750;DP=123;Dels=0.00;FS=3.240;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.342;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1262,0,1258 chrVIII 204484 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.617;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.173;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,68:156:99:1291,0,1887 chrVIII 204520 . C T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.011;DP=142;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=2.5525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,58:142:99:1109,0,1850 chrVIII 204704 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.759;DP=142;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.892;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1479,0,1453 chrVIII 204882 . C T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.066;DP=171;Dels=0.00;FS=2.677;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.718;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,84:171:99:1538,0,1664 chrVIII 205191 . A C 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.456;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1147,0,995 chrVIII 205278 . A T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.851;DP=127;Dels=0.00;FS=6.011;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.805;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1445,0,1240 chrVIII 205476 . C A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;DP=147;Dels=0.00;FS=8.617;HaplotypeScore=10.7143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.025;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1560,0,1472 chrVIII 205941 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.002;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=2.7355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.881;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1135,0,1557 chrVIII 206063 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.570;DP=111;Dels=0.00;FS=21.494;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.953;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1071,0,1157 chrVIII 206103 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.390;DP=112;Dels=0.00;FS=21.554;HaplotypeScore=3.3137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.026;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1270,0,1080 chrVIII 206460 . G A 500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.346;DP=82;Dels=0.00;FS=0.859;HaplotypeScore=2.3857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.028;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,29:82:99:530,0,1123 chrVIII 207052 . T A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.856;DP=121;Dels=0.00;FS=2.365;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,71:121:99:1508,0,1008 chrVIII 207624 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.587;DP=124;Dels=0.00;FS=5.564;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1179,0,1410 chrVIII 207734 . C T 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.737;DP=135;Dels=0.00;FS=7.783;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.511;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1255,0,1459 chrVIII 208076 . G T 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;DP=148;Dels=0.00;FS=2.974;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.175;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1687,0,1320 chrVIII 208566 . C T 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.465;DP=158;Dels=0.00;FS=1.253;HaplotypeScore=4.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:158:99:1635,0,1509 chrVIII 208592 . G A 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;DP=149;Dels=0.00;FS=6.152;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.335;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:149:99:1725,0,1341 chrVIII 208805 . T G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.764;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:164:99:1486,0,1888 chrVIII 208949 . T A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;DP=139;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=3.3003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.377;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1380,0,1478 chrVIII 209037 . C T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.197;DP=149;Dels=0.00;FS=4.927;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.409;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1412,0,1627 chrVIII 209078 . A C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.106;DP=125;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.778;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1212,0,1278 chrVIII 209079 . C T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.813;DP=124;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.215;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1230,0,1306 chrVIII 209095 . C A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.091;DP=123;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1314,0,1277 chrVIII 209176 . C T 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;DP=124;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.527;QD=12.33;ReadPosRankSum=2.231;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:1559,0,1072 chrVIII 209243 . C T 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3497,355,0 chrVIII 209247 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.762;DP=127;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1401,0,1251 chrVIII 209977 . T C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.662;DP=103;Dels=0.00;FS=9.324;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=9.53;ReadPosRankSum=-2.053;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1012,0,1141 chrVIII 210535 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.181;DP=132;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.257;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1259,0,1377 chrVIII 210710 . A T 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2731,261,0 chrVIII 211251 . T C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.376;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.464;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1413,0,1498 chrVIII 211462 . T C 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2929,306,0 chrVIII 211534 . T A 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3566,369,0 chrVIII 211550 . C G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;DP=113;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1363,0,870 chrVIII 211655 . T G 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.998;DP=119;Dels=0.00;FS=3.322;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.170;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1104,0,1378 chrVIII 211693 . G A 2382 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2415,243,0 chrVIII 211701 . G A 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2668,270,0 chrVIII 211825 . G A 2292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;QD=25.47;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2325,243,0 chrVIII 212243 . C G 4625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.14;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4625,474,0 chrVIII 212441 . C T 921.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.19;MQ0=32;MQRankSum=-0.491;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.622;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,60:87:99:951,0,280 chrVIII 212536 . C T 446.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.67;MQ0=54;MQRankSum=0.032;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.348;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,60:90:99:476,0,287 chrVIII 212556 . C T 391.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.41;MQ0=60;MQRankSum=0.741;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.171;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,59:92:99:421,0,267 chrVIII 212751 . A G 209.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.376;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.14;MQ0=59;MQRankSum=-0.888;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,53:80:99:239,0,172 chrVIII 212762 . C G 208.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.04;MQ0=60;MQRankSum=-0.959;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,53:81:99:238,0,167 chrVIII 212828 . A G 16.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.99;MQ0=80;MQRankSum=-0.736;QD=0.19;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,56:83:19:46,0,19 chrVIII 214261 . T C 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.46;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:49,6,0 chrVIII 215511 . C T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.25;MQ0=59;QD=0.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:6:55,6,0 chrVIII 215534 . T C 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.14;MQ0=64;QD=0.76;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,45:67:9:83,9,0 chrVIII 215742 . T C 163.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.17;MQ0=79;QD=1.87;SB=-4.053e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,63:87:21:196,21,0 chrVIII 215821 . T C 243 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.98;MQ0=47;QD=4.26;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,49:57:30:276,30,0 chrVIII 215912 . T C 475 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.28;MQ0=47;QD=7.20;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:57:508,57,0 chrVIII 215947 . C T 806 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.66;MQ0=52;QD=9.83;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:90:839,90,0 chrVIII 216123 . C T 1914 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.32;MQ0=36;QD=18.06;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:1947,207,0 chrVIII 216235 . C T 2423 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7250;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=7;QD=24.23;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2456,261,0 chrVIII 216338 . C G 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.24;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3217,324,0 chrVIII 217047 . C T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.235;DP=128;Dels=0.00;FS=13.000;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1371,0,1397 chrVIII 217505 . A G 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.686;DP=146;Dels=0.00;FS=3.369;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.055;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.044;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,61:146:99:1099,0,1869 chrVIII 217526 . C A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.744;DP=140;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.183;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1362,0,1505 chrVIII 217536 . A G 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3554,366,0 chrVIII 217540 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.286;DP=142;Dels=0.00;FS=3.493;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1354,0,1644 chrVIII 217604 . G A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.790;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.588;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1450,0,1663 chrVIII 218189 . T C 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=110.1819;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.09;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3529,378,0 chrVIII 218532 . A T 4052.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4052,418,0 chrVIII 222523 . A G 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.09;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3023,315,0 chrVIII 223791 . T C 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3359,348,0 chrVIII 225748 . A G 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2921,309,0 chrVIII 226212 . G C 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3178,339,0 chrVIII 226266 . A G 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3096,315,0 chrVIII 226755 . G A 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2923,297,0 chrVIII 227192 . T G 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3230,324,0 chrVIII 227323 . T G 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=24.00;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3033,318,0 chrVIII 227343 . T C 2191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=22.13;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2224,228,0 chrVIII 227344 . T C 1945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=21.14;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:1978,213,0 chrVIII 227411 . G A 2440 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2473,252,0 chrVIII 227429 . A G 2352 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.13;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2385,252,0 chrVIII 227444 . T C 2637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2670,297,0 chrVIII 227519 . A G 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3124,333,0 chrVIII 227951 . A C 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.909e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3772,393,0 chrVIII 227964 . G A 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3342,345,0 chrVIII 228006 . G C 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=1;QD=25.51;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2839,306,0 chrVIII 228015 . A G 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=1;QD=25.19;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2930,318,0 chrVIII 228402 . G A 4437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4437,451,0 chrVIII 228507 . G A 4549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.14;SB=-2.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4549,457,0 chrVIII 228696 . G C 2751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2784,306,0 chrVIII 228831 . G C 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2879,315,0 chrVIII 228850 . C T 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2767,288,0 chrVIII 228881 . C T 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2866,306,0 chrVIII 228903 . G A 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2763,291,0 chrVIII 229142 . T C 4128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4128,442,0 chrVIII 229184 . T A 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6240;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;QD=24.14;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3283,345,0 chrVIII 229265 . G C 1961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=16.91;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:1994,231,0 chrVIII 229427 . T C 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3431,354,0 chrVIII 229448 . T C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3369,345,0 chrVIII 229583 . T C 3140 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.42;MQ0=5;QD=25.12;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3173,336,0 chrVIII 229613 . T C 2744 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.47;MQ0=5;QD=24.28;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2777,309,0 chrVIII 229640 . G A 3073 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.15;MQ0=5;QD=25.61;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3106,327,0 chrVIII 229700 . A T 3279.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=6;QD=24.29;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,129:135:99:3279,333,0 chrVIII 229721 . G T 3803.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=6;QD=25.19;SB=-2.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,145:151:99:3803,376,0 chrVIII 229784 . A G 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2985,309,0 chrVIII 229853 . C T 2552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3826;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2585,261,0 chrVIII 230165 . G A 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3595,358,0 chrVIII 230196 . C T 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1557;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3447,354,0 chrVIII 230282 . C T 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3621,370,0 chrVIII 230333 . A G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2995,324,0 chrVIII 230390 . A G 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;QD=26.06;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2743,285,0 chrVIII 230432 . T C 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.11;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2848,294,0 chrVIII 230731 . C T 4792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.90;SB=-2.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4792,475,0 chrVIII 230850 . G A 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3870,385,0 chrVIII 230863 . C T 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3678,367,0 chrVIII 230894 . A G 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;QD=24.61;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2568,279,0 chrVIII 231163 . C G 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.18;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3404,351,0 chrVIII 231221 . G A 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.34;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3115,324,0 chrVIII 231290 . A G 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.01;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:129:99:3355,351,0 chrVIII 231411 . T G 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3443,366,0 chrVIII 231446 . A C 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3207,336,0 chrVIII 231674 . C T 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2996,312,0 chrVIII 231830 . T C 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3705,369,0 chrVIII 232014 . A T 2377 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.29;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2410,255,0 chrVIII 232078 . C A 2651 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2684,279,0 chrVIII 232174 . C T 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3866,391,0 chrVIII 232258 . T C 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3801,396,0 chrVIII 232321 . T C 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3198,333,0 chrVIII 232525 . C T 4238.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.601;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=26.65;ReadPosRankSum=1.623;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:4238,403,0 chrVIII 232747 . C T 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3362,351,0 chrVIII 233140 . T C 4013.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4013,432,0 chrVIII 233357 . A C 2509 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=22.60;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2542,267,0 chrVIII 233361 . G A 2418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=12.4716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=21.98;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2451,252,0 chrVIII 233495 . C A 3903.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.79;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3903,397,0 chrVIII 233523 . C T 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.33;MQ0=0;QD=26.48;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3601,384,0 chrVIII 233526 . T C 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;DP=139;Dels=0.00;FS=5.520;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=25.34;ReadPosRankSum=1.184;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3522,354,0 chrVIII 233556 . A C 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.89;MQ0=0;QD=25.97;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3765,393,0 chrVIII 233563 . G A 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.39;MQ0=0;QD=25.34;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3395,354,0 chrVIII 233575 . C T 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.74;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3237,325,0 chrVIII 233665 . C T 3993.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3993,420,0 chrVIII 233885 . T C 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=153;Dels=0.00;FS=3.493;HaplotypeScore=2.7250;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=24.41;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3735,384,0 chrVIII 234257 . T A 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3799,390,0 chrVIII 234687 . A T 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3968,414,0 chrVIII 234904 . C T 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3765,382,0 chrVIII 234919 . A T 4031.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4031,421,0 chrVIII 234994 . T C 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:142:99:3644,393,0 chrVIII 235033 . C A 4367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.48;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4367,465,0 chrVIII 235081 . A G 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.29;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3922,402,0 chrVIII 235096 . G A 3682.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.19;MQ0=0;QD=24.22;SB=-2.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3682,358,0 chrVIII 235097 . G A 3677.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.26;MQ0=0;QD=23.88;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3677,364,0 chrVIII 235099 . G T 3968.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.38;MQ0=0;QD=25.11;SB=-2.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3968,391,0 chrVIII 235192 . C T 5215.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=1;QD=25.56;SB=-2.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,204:204:99:5215,544,0 chrVIII 235729 . T C 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3995,429,0 chrVIII 236987 . G A 120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.894;DP=131;Dels=0.00;FS=375.489;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.25;MQ0=0;MQRankSum=5.300;QD=0.92;ReadPosRankSum=-6.601;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:150,0,590 chrVIII 236993 . T A 65.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.724;DP=124;Dels=0.00;FS=359.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.07;MQ0=0;MQRankSum=5.807;QD=0.52;ReadPosRankSum=-9.311;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:95:95,0,644 chrVIII 236999 . T A 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;DP=114;Dels=0.00;FS=272.384;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.89;MQ0=0;MQRankSum=4.293;QD=0.28;ReadPosRankSum=-7.498;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:62:62,0,892 chrVIII 237318 . T C 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3672,375,0 chrVIII 237328 . C T 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3590,375,0 chrVIII 237556 . T C 3957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8801;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3957,411,0 chrVIII 237578 . C T 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3872,391,0 chrVIII 237787 . C G 1846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=17.58;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:1879,213,0 chrVIII 238746 . C G 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3467,366,0 chrVIII 239033 . G T 1312 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=11.82;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:1345,141,0 chrVIII 240144 . C T 3766.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3766,378,0 chrVIII 241413 . C T 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=1;QD=26.71;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2544,261,0 chrVIII 241546 . T C 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3782,396,0 chrVIII 242062 . C T 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2735,267,0 chrVIII 242088 . G T 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2685,273,0 chrVIII 242214 . C T 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0461;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=24.11;ReadPosRankSum=0.485;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3047,309,0 chrVIII 242215 . T C 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2574;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=23.33;ReadPosRankSum=0.531;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:2926,303,0 chrVIII 242300 . G A 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3918,408,0 chrVIII 244248 . A C 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3865,396,0 chrVIII 245718 . A T 4082.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.77;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4082,427,0 chrVIII 246363 . T C 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3400,339,0 chrVIII 246934 . A G 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3516,354,0 chrVIII 246987 . T C 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3186,339,0 chrVIII 247398 . C T 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2917,306,0 chrVIII 247503 . G A 3623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3623,352,0 chrVIII 248178 . T C 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3110,339,0 chrVIII 248390 . C T 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.53;SB=-2.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3702,358,0 chrVIII 249231 . A G 2450 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2483,255,0 chrVIII 249234 . T C 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2707,276,0 chrVIII 249457 . G A 2363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2396,243,0 chrVIII 249622 . C T 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2681,267,0 chrVIII 249790 . T G 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3279,339,0 chrVIII 249854 . T C 3687.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3687,381,0 chrVIII 250162 . G A 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3114,324,0 chrVIII 250289 . T C 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3602,384,0 chrVIII 250465 . G C 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2727,276,0 chrVIII 250612 . A C 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3782,384,0 chrVIII 250683 . A G 4027.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4027,438,0 chrVIII 250856 . G A 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2850,291,0 chrVIII 250913 . A T 2469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2502,252,0 chrVIII 250941 . A G 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2620,267,0 chrVIII 251007 . A G 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2637,285,0 chrVIII 251694 . A G 2324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2357,243,0 chrVIII 252321 . C T 4072.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4072,429,0 chrVIII 252363 . G A 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.68;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3868,388,0 chrVIII 252467 . C T 2409 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.485;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=24.33;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2442,226,0 chrVIII 252956 . C G 2682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.25;MQ0=0;QD=20.63;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2715,288,0 chrVIII 252968 . C G 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.38;MQ0=0;QD=22.27;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2795,297,0 chrVIII 253019 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.41;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3048,318,0 chrVIII 253492 . A C 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3011,318,0 chrVIII 253745 . T A 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3520,348,0 chrVIII 253858 . T C 2758 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2791,303,0 chrVIII 253898 . T C 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3302,345,0 chrVIII 253999 . T C 2784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2817,297,0 chrVIII 254158 . A T 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2785,285,0 chrVIII 254195 . C T 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2728,282,0 chrVIII 254246 . A C 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2597,267,0 chrVIII 254330 . T C 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3000,318,0 chrVIII 254553 . T A 2216 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.47;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2249,237,0 chrVIII 254816 . A G 2512 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=106;Dels=0.00;FS=3.351;HaplotypeScore=6.7974;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=23.70;ReadPosRankSum=1.177;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2545,259,0 chrVIII 254859 . C T 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2861,291,0 chrVIII 255011 . A G 1989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.615;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=23.68;ReadPosRankSum=1.928;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,81:84:99:2022,219,0 chrVIII 255648 . A G 2658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.16;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2691,291,0 chrVIII 256019 . A G 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2745,285,0 chrVIII 256079 . C T 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3426,334,0 chrVIII 256905 . G A 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.81;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2846,285,0 chrVIII 256969 . C T 2662 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2695,282,0 chrVIII 257163 . A T 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3018,306,0 chrVIII 257199 . C T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3354,324,0 chrVIII 257670 . G A 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3316,337,0 chrVIII 257823 . G A 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2911,309,0 chrVIII 258019 . C T 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.696;DP=98;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7777;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:97:99:2534,255,0 chrVIII 258203 . T G 2517 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.42;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2550,273,0 chrVIII 258412 . A G 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3153,330,0 chrVIII 258421 . A G 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3112,330,0 chrVIII 258469 . T C 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:3952,405,0 chrVIII 258472 . G A 4016.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4016,415,0 chrVIII 258556 . A G 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3355,372,0 chrVIII 258587 . C T 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3100,313,0 chrVIII 258754 . A G 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3142,327,0 chrVIII 259012 . C T 2392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2425,252,0 chrVIII 259045 . A G 2152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=23.65;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2185,234,0 chrVIII 259570 . T C 1896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1929,198,0 chrVIII 259588 . T C 1958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1991,204,0 chrVIII 259896 . C T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3491,372,0 chrVIII 259960 . A G 2426 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.54;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2459,261,0 chrVIII 260343 . T C 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2815,306,0 chrVIII 261043 . G A 2429 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2462,252,0 chrVIII 261465 . C A 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6399;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3343,340,0 chrVIII 261627 . G A 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.10;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3232,333,0 chrVIII 261631 . T G 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.43;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2827,294,0 chrVIII 261638 . A G 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.96;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2746,279,0 chrVIII 261724 . A T 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3565,349,0 chrVIII 262063 . A G 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6366;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=26.78;ReadPosRankSum=1.401;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3642,363,0 chrVIII 262073 . A G 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=26.56;ReadPosRankSum=0.483;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3904,381,0 chrVIII 262417 . C T 2090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.12;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2123,219,0 chrVIII 262470 . C T 2201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.84;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2234,240,0 chrVIII 262610 . A G 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.446;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3005,315,0 chrVIII 262624 . C G 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3229,342,0 chrVIII 262647 . A G 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3221,342,0 chrVIII 262734 . C T 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3123,315,0 chrVIII 262967 . C T 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2774,288,0 chrVIII 263049 . T C 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3516,351,0 chrVIII 263170 . A G 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3461,357,0 chrVIII 263207 . G A 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2619,273,0 chrVIII 263248 . T G 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2854,294,0 chrVIII 263279 . T C 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;DP=113;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2885,276,0 chrVIII 263344 . A G 2505 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.37;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2538,273,0 chrVIII 263629 . G A 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7134;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2866,294,0 chrVIII 264180 . G C 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3247,354,0 chrVIII 264351 . G A 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3327,348,0 chrVIII 265775 . G A 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3622,358,0 chrVIII 266203 . T C 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3084,342,0 chrVIII 266326 . C G 2236 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:2269,243,0 chrVIII 266439 . A G 2451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2484,261,0 chrVIII 266713 . T G 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=127;Dels=0.00;FS=3.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.97;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=21.91;ReadPosRankSum=1.650;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:2816,280,0 chrVIII 266720 . A G 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3053,330,0 chrVIII 266732 . G A 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.94;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3360,357,0 chrVIII 266757 . C T 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3604,364,0 chrVIII 267185 . G A 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3183,315,0 chrVIII 267532 . T C 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3350,357,0 chrVIII 268627 . C T 2206 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.95;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2239,231,0 chrVIII 268759 . T C 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3650,381,0 chrVIII 269348 . T A 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3449,354,0 chrVIII 269395 . A G 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3382,348,0 chrVIII 270109 . A G 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2749,288,0 chrVIII 270259 . T C 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.05;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3090,327,0 chrVIII 270272 . C T 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3319,339,0 chrVIII 271018 . C T 4205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.64;SB=-2.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4205,423,0 chrVIII 271937 . G A 2583 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=85.8414;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.71;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2616,273,0 chrVIII 272115 . A T 4031.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:4031,417,0 chrVIII 272308 . T C 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=1;QD=24.21;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3776,381,0 chrVIII 272489 . C T 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3318,324,0 chrVIII 272512 . C G 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=21.60;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3252,339,0 chrVIII 272617 . A G 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3858,426,0 chrVIII 272785 . G C 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3076;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3855,387,0 chrVIII 273067 . C T 4943.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.61;SB=-2.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4943,481,0 chrVIII 273116 . T C 4399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6349;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=25.73;ReadPosRankSum=0.132;SB=-2.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,170:171:99:4399,440,0 chrVIII 273164 . A C 4037.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.689;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2329;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=25.07;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:161:99:4037,408,0 chrVIII 273178 . A T 4318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4318,439,0 chrVIII 273214 . G A 3888.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3888,394,0 chrVIII 273222 . G A 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3566,361,0 chrVIII 273274 . C T 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6744;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3081,306,0 chrVIII 273346 . T C 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3348,345,0 chrVIII 273972 . T C 3933.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3933,394,0 chrVIII 274227 . T C 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=115;Dels=0.00;FS=3.447;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=23.03;ReadPosRankSum=1.039;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2682,288,0 chrVIII 274295 . G A 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3130,318,0 chrVIII 275355 . C G 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2828,297,0 chrVIII 275572 . A T 4476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.115;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8804;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.055;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,173:174:99:4476,444,0 chrVIII 276173 . G A 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3220,336,0 chrVIII 276177 . A T 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3060,324,0 chrVIII 276665 . A G 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3035,318,0 chrVIII 276701 . T A 2222 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=23.39;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2255,237,0 chrVIII 276706 . A T 2082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2115,222,0 chrVIII 276817 . G T 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2491,249,0 chrVIII 276928 . A G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3466,351,0 chrVIII 276944 . C A 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3826,391,0 chrVIII 277837 . G A 2651 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2684,273,0 chrVIII 278206 . C T 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.371;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=25.74;ReadPosRankSum=1.516;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3706,363,0 chrVIII 278298 . T C 4277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4277,436,0 chrVIII 278404 . C T 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3848,388,0 chrVIII 278605 . C T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3285,345,0 chrVIII 278773 . C T 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=1;QD=25.76;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2970,306,0 chrVIII 278821 . A C 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3109,339,0 chrVIII 278857 . A T 3740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=1;QD=26.52;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3740,384,0 chrVIII 279197 . T G 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2999,324,0 chrVIII 279622 . T C 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3517,384,0 chrVIII 279897 . T C 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3168,333,0 chrVIII 280101 . C T 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.454;DP=138;Dels=0.00;FS=6.711;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.325;QD=25.10;ReadPosRankSum=1.808;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,136:138:99:3464,337,0 chrVIII 280455 . C T 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3191,318,0 chrVIII 280472 . T C 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3292,333,0 chrVIII 280642 . C G 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.38;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2876,303,0 chrVIII 280864 . T C 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2949,303,0 chrVIII 280897 . A T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3354,328,0 chrVIII 280990 . G A 2544 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2577,270,0 chrVIII 281002 . C T 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2682,282,0 chrVIII 281374 . A G 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3816,381,0 chrVIII 282587 . G A 1970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0248;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=18.24;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2003,210,0 chrVIII 283226 . T C 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9054;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:123:99:2901,321,0 chrVIII 283616 . T C 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=133.1109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.52;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3719,393,0 chrVIII 284047 . C G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3302,336,0 chrVIII 285125 . T C 3773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.976e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3773,405,0 chrVIII 285862 . A C 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3805,387,0 chrVIII 286572 . T A 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3575,367,0 chrVIII 286796 . T C 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3115,327,0 chrVIII 286927 . A T 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6230;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2914,297,0 chrVIII 287084 . C A 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3463,349,0 chrVIII 287468 . A G 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2702;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3919,405,0 chrVIII 287687 . G A 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=0;QD=26.59;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3855,388,0 chrVIII 287708 . A G 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3285,348,0 chrVIII 287946 . C T 2130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.58;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2163,228,0 chrVIII 287993 . A T 2020 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.71;MQ0=0;QD=24.05;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2053,216,0 chrVIII 287996 . G C 1859 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.12;MQ0=0;QD=22.40;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1892,207,0 chrVIII 288002 . A T 1949 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.53;MQ0=0;QD=21.66;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1982,213,0 chrVIII 288005 . T C 1738 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.41;MQ0=0;QD=22.00;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1771,195,0 chrVIII 288007 . A G 2071 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.93;MQ0=0;QD=22.51;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2104,234,0 chrVIII 288031 . A G 2453 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.23;MQ0=0;QD=23.14;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2486,270,0 chrVIII 288095 . G A 2407 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.44;MQ0=0;QD=26.16;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2440,249,0 chrVIII 288305 . T C 1973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;QD=24.97;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2006,207,0 chrVIII 288386 . T C 1391 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.49;MQ0=0;QD=21.73;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1424,156,0 chrVIII 288392 . T G 1372 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.53;MQ0=0;QD=22.13;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1405,153,0 chrVIII 288394 . C A 1211 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.92;MQ0=0;QD=20.53;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1244,147,0 chrVIII 288395 . T A 1191 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.45;MQ0=0;QD=20.53;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1224,147,0 chrVIII 288397 . A G 1487 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.96;MQ0=0;QD=21.24;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1520,186,0 chrVIII 288430 . A T 1423.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.574;DP=69;Dels=0.00;FS=4.774;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.268;SB=-4.131e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,62:69:20:1456,20,0 chrVIII 288629 . T A 2500 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2533,258,0 chrVIII 288884 . T G 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=107;Dels=0.00;FS=3.859;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=26.39;ReadPosRankSum=1.441;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2857,297,0 chrVIII 289028 . A T 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.695;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=2;MQRankSum=-1.471;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.466;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:2470,255,0 chrVIII 289350 . A G 410 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.10;MQ0=0;QD=6.41;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:51:443,51,0 chrVIII 289502 . G A 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2828,291,0 chrVIII 289513 . T C 2231 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;QD=24.52;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2264,246,0 chrVIII 289546 . G C 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.54;MQ0=0;QD=24.28;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3190,357,0 chrVIII 289695 . T C 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.32;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3474,360,0 chrVIII 289718 . A T 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.30;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3248,336,0 chrVIII 289811 . A T 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3435,360,0 chrVIII 289865 . G A 4082.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.294;DP=158;Dels=0.00;FS=4.827;HaplotypeScore=3.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=25.84;ReadPosRankSum=1.579;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:4082,420,0 chrVIII 289928 . G T 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3731,379,0 chrVIII 290277 . G T 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.48;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3247,336,0 chrVIII 290541 . C A 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=1;QD=26.04;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2976,300,0 chrVIII 290774 . C T 4202.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4202,418,0 chrVIII 291312 . G A 2785 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.90;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2818,297,0 chrVIII 291315 . A G 2721 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.68;MQ0=0;QD=21.77;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2754,300,0 chrVIII 291318 . G A 2622 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.72;MQ0=1;QD=21.49;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:2655,288,0 chrVIII 291327 . T G 2255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=100.8243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.77;MQ0=1;QD=19.96;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2288,255,0 chrVIII 291360 . T G 2139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.53;MQ0=1;QD=19.10;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2172,240,0 chrVIII 291363 . A T 1776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=1;QD=17.76;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:1809,204,0 chrVIII 291381 . G A 1726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.57;MQ0=1;QD=14.15;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:122:99:1759,192,0 chrVIII 291396 . G A 1786 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.28;MQ0=1;QD=14.64;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:1819,201,0 chrVIII 291399 . A G 1743 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.03;MQ0=1;QD=14.40;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:1776,198,0 chrVIII 291402 . A T 1866 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.16;MQ0=1;QD=14.93;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:125:99:1899,204,0 chrVIII 291411 . G A 1907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.58;MQ0=1;QD=15.13;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:1940,207,0 chrVIII 291731 . T C 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3227,351,0 chrVIII 291996 . G A 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2874,288,0 chrVIII 291998 . C G 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2871,297,0 chrVIII 292266 . A G 2514 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2547,261,0 chrVIII 292444 . A G 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2923,303,0 chrVIII 292494 . A G 2074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=22.06;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2107,228,0 chrVIII 293111 . C A 2380 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=1;QD=21.06;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2413,249,0 chrVIII 293299 . G A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;DP=89;Dels=0.00;FS=201.545;HaplotypeScore=2.3617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.14;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=0.12;ReadPosRankSum=-7.074;SB=-2.684e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:40:40,0,463 chrVIII 293373 . A C 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.278;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4054;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.577;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2651,285,0 chrVIII 293377 . A C 2709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4054;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=23.15;ReadPosRankSum=1.258;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2742,303,0 chrVIII 293487 . G A 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3193,327,0 chrVIII 293785 . G C 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3203,339,0 chrVIII 293825 . T C 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3291,351,0 chrVIII 294166 . G C 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3560,372,0 chrVIII 294201 . G A 4171.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4171,412,0 chrVIII 294202 . G A 4173.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4173,412,0 chrVIII 294432 . A G 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3595,360,0 chrVIII 294569 . C G 3959.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3959,402,0 chrVIII 295005 . T C 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.23;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3212,345,0 chrVIII 295787 . A G 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3088,315,0 chrVIII 296229 . T G 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8350;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2957,303,0 chrVIII 296649 . A G 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2907,303,0 chrVIII 296845 . A G 4099.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2474;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4099,420,0 chrVIII 296890 . G A 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.85;SB=-2.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3976,373,0 chrVIII 297072 . A T 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3410,345,0 chrVIII 297766 . A G 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3667,366,0 chrVIII 298950 . T A 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2841,288,0 chrVIII 298979 . A G 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2719,297,0 chrVIII 299939 . C G 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=135;Dels=0.00;FS=4.869;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=26.00;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3510,366,0 chrVIII 300410 . A C 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=1;QD=25.56;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3655,375,0 chrVIII 301054 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3269,339,0 chrVIII 301325 . C T 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.72;SB=-2.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3987,405,0 chrVIII 301413 . G A 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3855,396,0 chrVIII 301676 . T A 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=25.24;ReadPosRankSum=1.381;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3735,347,0 chrVIII 302087 . T C 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;DP=131;Dels=0.00;FS=3.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=23.85;ReadPosRankSum=1.600;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3157,324,0 chrVIII 303260 . A G 1991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.28;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2024,225,0 chrVIII 304267 . C G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3466,357,0 chrVIII 304629 . T C 2247 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2280,240,0 chrVIII 304632 . A G 2235 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2268,234,0 chrVIII 304696 . A C 2069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2102,222,0 chrVIII 305002 . T C 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2892,309,0 chrVIII 305927 . G A 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.03;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2844,288,0 chrVIII 306260 . C T 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2970,306,0 chrVIII 306523 . G C 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3508,357,0 chrVIII 309237 . C A 1843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.850;DP=147;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=4.9588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.002;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,85:147:99:1873,0,1245 chrVIII 309963 . A G 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2866,300,0 chrVIII 310071 . A T 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3821,393,0 chrVIII 311170 . G T 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3610,349,0 chrVIII 311326 . A G 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3331,336,0 chrVIII 311445 . C G 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2982,309,0 chrVIII 311928 . A G 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2491,273,0 chrVIII 312174 . T G 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3188,339,0 chrVIII 313101 . A G 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3916,420,0 chrVIII 313409 . C T 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3884,394,0 chrVIII 314156 . G T 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.16;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2524,267,0 chrVIII 314614 . C T 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9506;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3352,336,0 chrVIII 314622 . G A 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3300,333,0 chrVIII 315347 . G A 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.678;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.524;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3307,316,0 chrVIII 315358 . T C 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.742;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3092,296,0 chrVIII 315367 . T C 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.326;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3240,314,0 chrVIII 315450 . A G 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9668;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=1;QD=25.30;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3567,363,0 chrVIII 315782 . G A 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3370,342,0 chrVIII 315789 . T C 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3584,372,0 chrVIII 315879 . T C 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3302,351,0 chrVIII 316017 . A G 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3298,342,0 chrVIII 316075 . A T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3378,348,0 chrVIII 316541 . C T 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3528,360,0 chrVIII 317021 . T A 2087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2120,216,0 chrVIII 317030 . T C 2231 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2264,225,0 chrVIII 317153 . C T 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:111:99:2702,285,0 chrVIII 317247 . C T 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.970;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3320,339,0 chrVIII 317296 . A G 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3274,345,0 chrVIII 317384 . A G 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3172,324,0 chrVIII 317401 . G A 2464 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2497,249,0 chrVIII 317423 . G A 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.51;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2711,276,0 chrVIII 317435 . A G 2677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.50;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2710,282,0 chrVIII 317992 . G A 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2939,297,0 chrVIII 318122 . T C 3724.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3724,390,0 chrVIII 318497 . G A 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3163,312,0 chrVIII 318514 . A G 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3714,378,0 chrVIII 319010 . A T 3969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3969,408,0 chrVIII 319046 . C T 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3363,342,0 chrVIII 319202 . G A 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3474,357,0 chrVIII 319400 . C A 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3732,381,0 chrVIII 319436 . A G 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.82;SB=-2.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3897,397,0 chrVIII 319491 . G A 3957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3957,391,0 chrVIII 319904 . G T 4091.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4091,435,0 chrVIII 320440 . A C 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3759,387,0 chrVIII 320473 . G A 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.49;SB=-2.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3796,373,0 chrVIII 320515 . T C 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=1;QD=24.96;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3944,396,0 chrVIII 320578 . A G 3643.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=1;QD=23.97;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3643,373,0 chrVIII 320927 . G A 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3161,318,0 chrVIII 320985 . G C 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3673,378,0 chrVIII 321073 . A G 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3086,330,0 chrVIII 321242 . T C 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3140,327,0 chrVIII 321670 . A T 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3222,333,0 chrVIII 322064 . G A 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3107,307,0 chrVIII 322084 . C G 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2840,294,0 chrVIII 322875 . T A 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.698;DP=125;Dels=0.00;FS=3.774;HaplotypeScore=8.6727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.117;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:125:99:3193,333,0 chrVIII 324517 . T C 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3457,366,0 chrVIII 325071 . A G 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=26.00;ReadPosRankSum=1.700;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2867,297,0 chrVIII 325302 . G A 4237.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4237,403,0 chrVIII 325975 . T C 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3405,354,0 chrVIII 326153 . G A 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7375;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4083,412,0 chrVIII 326461 . G C 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3331,339,0 chrVIII 326679 . C T 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4076,397,0 chrVIII 326825 . G T 2316 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.62;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2349,246,0 chrVIII 327083 . G A 4290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4290,441,0 chrVIII 327200 . A G 2929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2962,315,0 chrVIII 327257 . T C 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3634,381,0 chrVIII 327854 . C T 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3590,367,0 chrVIII 328055 . A G 4323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.42;SB=-2.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4323,450,0 chrVIII 328271 . C A 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3813,394,0 chrVIII 328366 . T A 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3545,357,0 chrVIII 329277 . C T 4024.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7246;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=1;QD=26.83;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4024,423,0 chrVIII 329295 . T C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4619;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3369,351,0 chrVIII 329544 . G A 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=6.9477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=25.49;ReadPosRankSum=1.215;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3416,331,0 chrVIII 329634 . T C 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3602,369,0 chrVIII 330227 . G T 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.14;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3018,306,0 chrVIII 330629 . T C 1693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=23.85;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1726,189,0 chrVIII 332120 . T G 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2719,291,0 chrVIII 332738 . T A 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3507,354,0 chrVIII 333780 . C T 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3689,375,0 chrVIII 334794 . G A 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.42;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3329,348,0 chrVIII 334853 . A G 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.73;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2679,279,0 chrVIII 334860 . A T 2607 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.07;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2640,273,0 chrVIII 334983 . G A 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3128,318,0 chrVIII 335688 . T C 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=14.7339;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2888,294,0 chrVIII 335817 . G T 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.924e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3700,355,0 chrVIII 335859 . C T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3354,327,0 chrVIII 335899 . C T 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3876,388,0 chrVIII 336067 . C T 4053.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4053,406,0 chrVIII 337147 . C A 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2999,306,0 chrVIII 337281 . C T 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3380,340,0 chrVIII 337323 . G A 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:104:99:2786,291,0 chrVIII 337365 . T A 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3159,330,0 chrVIII 337372 . C T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3163,327,0 chrVIII 337794 . T A 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3007,297,0 chrVIII 337824 . A G 2735 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2768,291,0 chrVIII 338392 . G A 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3528,357,0 chrVIII 339361 . C T 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2982,306,0 chrVIII 339601 . A C 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2987,315,0 chrVIII 340031 . T A 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.96;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2834,297,0 chrVIII 340175 . C T 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.27;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3914,397,0 chrVIII 340247 . C T 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3758,373,0 chrVIII 340348 . G T 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.357;DP=115;Dels=0.00;FS=126.139;HaplotypeScore=28.6841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=0.49;ReadPosRankSum=-1.505;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,36:115:86:86,0,1442 chrVIII 340712 . T C 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3103,336,0 chrVIII 341299 . T C 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3636,378,0 chrVIII 341383 . C T 4656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4656,481,0 chrVIII 341482 . T C 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=21.82;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3197,345,0 chrVIII 341488 . G A 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.882e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3483,363,0 chrVIII 341532 . T A 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.228;DP=144;Dels=0.00;FS=2.613;HaplotypeScore=8.4473;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=25.66;ReadPosRankSum=1.221;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,142:144:99:3695,360,0 chrVIII 341556 . C T 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.580;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=25.92;ReadPosRankSum=-1.151;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:140:99:3629,352,0 chrVIII 341676 . C T 4568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.637;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=26.25;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,173:174:99:4568,453,0 chrVIII 342138 . G A 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.68;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4109,424,0 chrVIII 342157 . G C 3895.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.97;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3895,426,0 chrVIII 342575 . G A 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2645,267,0 chrVIII 342829 . C G 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2979,318,0 chrVIII 342881 . A T 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2696,279,0 chrVIII 343035 . A C 2479 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.292;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=24.54;ReadPosRankSum=1.526;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2512,253,0 chrVIII 343227 . T C 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3456,378,0 chrVIII 343303 . C G 3933.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8242;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.54;SB=-2.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3933,405,0 chrVIII 343333 . T G 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3552,390,0 chrVIII 343392 . G C 4362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4362,450,0 chrVIII 343561 . G A 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.64;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3203,330,0 chrVIII 343605 . G A 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3092,321,0 chrVIII 344585 . A G 3888.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3888,399,0 chrVIII 344636 . T G 4072.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4072,411,0 chrVIII 344831 . G A 2393 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2426,255,0 chrVIII 344834 . C T 2288 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2321,240,0 chrVIII 344900 . C A 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2969,309,0 chrVIII 344942 . C T 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.543;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=25.83;ReadPosRankSum=1.165;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2874,280,0 chrVIII 345071 . C A 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2981,303,0 chrVIII 345359 . T C 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.12;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2984,321,0 chrVIII 345371 . C T 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.86;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3331,354,0 chrVIII 345425 . T C 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3767,379,0 chrVIII 345440 . G A 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=1;QD=25.29;SB=-2.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4021,414,0 chrVIII 345623 . G A 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=25.68;ReadPosRankSum=1.567;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2729,269,0 chrVIII 346315 . G T 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3767,370,0 chrVIII 346538 . C A 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3369,348,0 chrVIII 347320 . A T 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3385,337,0 chrVIII 347353 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3269,327,0 chrVIII 347674 . A G 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3385,351,0 chrVIII 348037 . G C 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3005,321,0 chrVIII 348041 . A C 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2880,303,0 chrVIII 348142 . G A 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.12;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2985,303,0 chrVIII 348154 . C A 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.74;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2927,306,0 chrVIII 348178 . T C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2967,333,0 chrVIII 348194 . G T 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3414,360,0 chrVIII 348326 . A C 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3708,370,0 chrVIII 348442 . T A 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3609,372,0 chrVIII 348455 . C A 3667.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3667,370,0 chrVIII 348461 . G A 3703.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3703,370,0 chrVIII 348462 . T C 3599.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3599,369,0 chrVIII 348572 . G A 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3803,384,0 chrVIII 348634 . G T 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3093,321,0 chrVIII 348790 . A G 2239 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2272,249,0 chrVIII 348802 . A G 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2530,267,0 chrVIII 348868 . C T 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3305,327,0 chrVIII 348883 . T C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2976,306,0 chrVIII 348973 . A C 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.53;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2903,306,0 chrVIII 348982 . A G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3181,324,0 chrVIII 349120 . G A 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7419;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3362,334,0 chrVIII 349353 . G A 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3094,318,0 chrVIII 349489 . G A 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=4.284;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=26.42;ReadPosRankSum=0.763;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3150,324,0 chrVIII 349648 . T G 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.44;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3179,339,0 chrVIII 349745 . C G 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.96;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3003,327,0 chrVIII 349748 . A G 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.59;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3053,324,0 chrVIII 349882 . G A 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3421,345,0 chrVIII 349912 . A C 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=23.29;SB=-2.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3749,378,0 chrVIII 350240 . C A 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3491,363,0 chrVIII 350566 . T C 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=21.81;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3043,330,0 chrVIII 350971 . T C 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3134,324,0 chrVIII 351025 . T A 2101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.301;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=22.84;ReadPosRankSum=0.301;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:2134,246,0 chrVIII 351026 . A T 2072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.52;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2105,243,0 chrVIII 351568 . C T 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2601,261,0 chrVIII 351601 . T C 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:2970,318,0 chrVIII 351610 . T C 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3335,342,0 chrVIII 351767 . C T 2614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.95;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2647,273,0 chrVIII 351784 . G A 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2386,243,0 chrVIII 351889 . G A 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5731;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2794,282,0 chrVIII 352207 . C T 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.477;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=25.44;ReadPosRankSum=0.408;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3460,337,0 chrVIII 353024 . A C 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3304,354,0 chrVIII 353232 . A G 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3232,321,0 chrVIII 353281 . G C 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2811,282,0 chrVIII 353586 . G T 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2754,273,0 chrVIII 353681 . T C 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3424,360,0 chrVIII 354035 . T G 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3020,309,0 chrVIII 354125 . T C 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2690,294,0 chrVIII 354218 . C G 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2957,294,0 chrVIII 354347 . T C 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=1;QD=25.70;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3701,378,0 chrVIII 354672 . T G 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=23.10;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2805,288,0 chrVIII 355198 . G A 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3331,336,0 chrVIII 355733 . T C 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2956,318,0 chrVIII 356127 . C A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.022;DP=145;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1330,0,1670 chrVIII 356286 . C T 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.26;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3407,337,0 chrVIII 357046 . C T 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3366,339,0 chrVIII 357235 . C A 2428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.11;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2461,258,0 chrVIII 358013 . A G 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2735,285,0 chrVIII 358019 . A G 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2532,273,0 chrVIII 358619 . A G 2704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.729;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.72;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2737,270,0 chrVIII 359203 . C T 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.372;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3576,342,0 chrVIII 359228 . T A 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3632,367,0 chrVIII 359671 . A T 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3135,315,0 chrVIII 360080 . C T 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3581,369,0 chrVIII 360105 . G A 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3814,385,0 chrVIII 360543 . G A 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.55;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3048,298,0 chrVIII 360689 . A G 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3542,363,0 chrVIII 361205 . A G 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3398,363,0 chrVIII 361212 . C T 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4028;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.144;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:108:99:2686,291,0 chrVIII 361272 . G T 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.85;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3437,357,0 chrVIII 361910 . A T 1756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.802;DP=119;Dels=0.00;FS=1.892;HaplotypeScore=10.5674;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=14.76;ReadPosRankSum=-2.028;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,114:119:99:1789,183,0 chrVIII 362833 . C T 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3796,379,0 chrVIII 364094 . A G 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3451,363,0 chrVIII 364268 . C T 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3458,355,0 chrVIII 365208 . G A 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=26.19;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3071,315,0 chrVIII 365358 . A G 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.81;MQ0=0;QD=25.02;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2685,297,0 chrVIII 365403 . G A 881 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.72;MQ0=0;QD=23.81;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:914,99,0 chrVIII 365406 . G A 693 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.521;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.14;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=23.10;ReadPosRankSum=1.867;SB=-3.368e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:81:726,81,0 chrVIII 365407 . T C 656 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.537;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9257;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=22.62;ReadPosRankSum=2.471;SB=-3.106e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,26:29:58:689,58,0 chrVIII 365412 . T A 615 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=25.62;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:24:69:648,69,0 chrVIII 365413 . T C 608 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=24;Dels=0.00;FS=3.388;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=25.33;ReadPosRankSum=1.156;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:641,69,0 chrVIII 365421 . G C 479 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:512,57,0 chrVIII 365424 . A C 196.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.78;SB=-5.596e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:229,27,0 chrVIII 365425 . T C 172.77 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;DP=38;Dels=0.00;FS=3.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=4.55;ReadPosRankSum=4.464;SB=-1.977e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:0:201,0,0 chrVIII 365429 . C G 169.02 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;DP=41;Dels=0.00;FS=3.519;HaplotypeScore=4.4780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=4.12;ReadPosRankSum=3.606;SB=-1.202e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,9:41:23:199,0,23 chrVIII 365433 . A G,T 266.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;DP=44;Dels=0.00;FS=8.751;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=31.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=6.05;ReadPosRankSum=1.380;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,34,8:44:99:326,189,171,137,0,113 chrVIII 365437 . T G 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.001;DP=44;Dels=0.00;FS=5.532;HaplotypeScore=5.4727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.939;QD=0.93;ReadPosRankSum=-2.715;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,4:44:71:71,0,166 chrVIII 365448 . G A 361 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.285;DP=47;Dels=0.00;FS=2.602;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.284;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,44:47:42:394,42,0 chrVIII 365460 . C A 775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.67;MQ0=0;QD=11.57;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:87:808,87,0 chrVIII 365464 . C T 968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=13.83;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1001,105,0 chrVIII 366002 . T C 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3439,354,0 chrVIII 366115 . G A 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2679,267,0 chrVIII 366145 . T G 2453 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.29;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2486,273,0 chrVIII 366283 . C T 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3290,336,0 chrVIII 366421 . C T 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.00;SB=-2.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4030,400,0 chrVIII 368328 . C T 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3141,330,0 chrVIII 368350 . C T 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3325,346,0 chrVIII 368503 . T C 4025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4025,415,0 chrVIII 369175 . T G 4373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:178:99:4373,444,0 chrVIII 369483 . T A 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3609,352,0 chrVIII 369871 . C T 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.54;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3415,346,0 chrVIII 369898 . G A 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.31;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3277,333,0 chrVIII 370284 . T C 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=23.44;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3197,336,0 chrVIII 370997 . C A 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7355;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3777,385,0 chrVIII 371149 . G C 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3546,387,0 chrVIII 372964 . T C 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3781,390,0 chrVIII 373060 . T C 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.636;DP=108;Dels=0.00;FS=3.802;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.385;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2697,303,0 chrVIII 373115 . A T 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.36;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2725,288,0 chrVIII 373116 . T G 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=108;Dels=0.00;FS=4.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.42;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.99;ReadPosRankSum=0.096;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2624,282,0 chrVIII 373133 . T C 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.374;DP=102;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=24.82;ReadPosRankSum=0.611;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2565,276,0 chrVIII 373555 . C T 3981.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3981,406,0 chrVIII 373666 . G A 4063.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4063,397,0 chrVIII 373927 . C A 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2960,306,0 chrVIII 373987 . T C 3838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.14;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3838,393,0 chrVIII 374065 . C T 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3522,357,0 chrVIII 374812 . T C 4448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4448,468,0 chrVIII 375550 . C T 2003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQ0=0;QD=22.26;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:90:99:2036,210,0 chrVIII 376014 . T C 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3223,348,0 chrVIII 376320 . G C 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4081,406,0 chrVIII 376332 . T C 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3728,375,0 chrVIII 376425 . C T 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3789,379,0 chrVIII 377022 . A G 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3657,384,0 chrVIII 377086 . G C 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4618;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3351,351,0 chrVIII 377259 . G A 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.639;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=25.50;ReadPosRankSum=1.237;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2889,291,0 chrVIII 377268 . T C 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.2747;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.320;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2680,285,0 chrVIII 377320 . G A 2468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2501,273,0 chrVIII 377322 . A G 2421 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2454,270,0 chrVIII 377373 . A G 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3051,336,0 chrVIII 377406 . C T 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3572,369,0 chrVIII 377460 . A G 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3674,384,0 chrVIII 377956 . T C 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3850,414,0 chrVIII 378025 . A G 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3549,381,0 chrVIII 378065 . A G 2560 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=1;MQRankSum=0.752;QD=23.93;ReadPosRankSum=0.719;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2593,288,0 chrVIII 378101 . C T 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.32;MQ0=1;QD=27.37;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3071,318,0 chrVIII 378194 . T C 1615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.73;MQ0=0;QD=16.48;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:1648,180,0 chrVIII 378228 . A G 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=21.30;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2482,261,0 chrVIII 378234 . A G 2371 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.809;DP=108;Dels=0.00;FS=6.225;HaplotypeScore=5.8298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.718;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,106:108:99:2404,243,0 chrVIII 378273 . A G 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3553,369,0 chrVIII 378566 . T C 2290 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2323,255,0 chrVIII 378579 . G A 2306 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2339,240,0 chrVIII 378618 . T C 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2777,306,0 chrVIII 378642 . A C 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2783,312,0 chrVIII 379379 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.095;DP=97;Dels=0.00;FS=3.812;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1030,0,1021 chrVIII 379889 . C T 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2901,300,0 chrVIII 379913 . A G 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3225,339,0 chrVIII 379965 . C T 2519 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.22;MQ0=0;QD=20.99;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2552,264,0 chrVIII 380069 . G A 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3292,336,0 chrVIII 380124 . A C 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.04;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3397,345,0 chrVIII 380309 . T C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;DP=118;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.5664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.581;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:931,0,1480 chrVIII 380378 . A T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;DP=116;Dels=0.00;FS=3.602;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=-0.540;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1149,0,1269 chrVIII 380481 . T G 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.638;DP=121;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.652;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1177,0,1278 chrVIII 380512 . T C 2605 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2638,273,0 chrVIII 380673 . A G 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3351,348,0 chrVIII 380685 . A G 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3225,333,0 chrVIII 380750 . C T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.173;DP=130;Dels=0.00;FS=1.547;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.249;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1537,0,1123 chrVIII 381183 . G T 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.514;DP=103;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.964;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:103:99:971,0,538 chrVIII 381482 . C T 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;DP=117;Dels=0.00;FS=2.455;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:868,0,1488 chrVIII 381497 . T C 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.109;DP=120;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,78:120:99:1653,0,813 chrVIII 381507 . C T 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.35;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2989,303,0 chrVIII 381514 . C G 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.24;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2876,309,0 chrVIII 381521 . T A 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.24;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3046,312,0 chrVIII 381527 . T A 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3051,312,0 chrVIII 381677 . G A 2035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=26.78;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2068,219,0 chrVIII 381704 . T A 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=90;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:955,0,995 chrVIII 381772 . A T 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2645,273,0 chrVIII 381790 . T C 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2605,273,0 chrVIII 382367 . T C 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;DP=89;Dels=0.00;FS=5.394;HaplotypeScore=38.4464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:871,0,895 chrVIII 382417 . G A 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;DP=83;Dels=0.00;FS=11.155;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQ0=2;MQRankSum=0.647;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.252;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:811,0,862 chrVIII 382421 . T C 724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.649;DP=90;Dels=0.00;FS=10.537;HaplotypeScore=3.7836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=2;MQRankSum=0.875;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.745;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:90:99:754,0,1003 chrVIII 382504 . A T 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.613;DP=86;Dels=0.00;FS=8.927;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=8.12;ReadPosRankSum=-2.404;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:728,0,1071 chrVIII 382524 . A C 523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;DP=81;Dels=0.00;FS=5.714;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.946;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.994;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,33:81:99:553,0,1071 chrVIII 382544 . A G 345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;DP=78;Dels=0.00;FS=0.914;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.609;QD=4.42;ReadPosRankSum=1.016;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:375,0,1147 chrVIII 382545 . G A 350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.015;DP=78;Dels=0.00;FS=0.914;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.72;MQ0=0;MQRankSum=-5.526;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.036;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:380,0,1136 chrVIII 382565 . A G 301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;DP=61;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.45;MQ0=0;MQRankSum=-3.949;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.661;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:331,0,880 chrVIII 382601 . G A 1942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.30;MQ0=0;QD=25.55;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1975,207,0 chrVIII 382602 . T A 1897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.30;MQ0=0;QD=24.96;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1930,207,0 chrVIII 382626 . C T 2256 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.67;MQ0=0;QD=25.35;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2289,240,0 chrVIII 382788 . T C 2583 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.31;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2616,270,0 chrVIII 382813 . C T 2400 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.99;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2433,252,0 chrVIII 382878 . T C 1850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=25.34;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1883,195,0 chrVIII 382904 . C G 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.056;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.068;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,42:77:99:795,0,616 chrVIII 382967 . G A 1880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=25.07;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1913,189,0 chrVIII 383024 . G A 372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.209;DP=74;Dels=0.00;FS=9.084;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.12;MQ0=0;MQRankSum=-3.530;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.857;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:402,0,1143 chrVIII 383029 . A G 1692 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.48;MQ0=0;QD=24.52;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1725,195,0 chrVIII 383035 . G A 1772 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.61;MQ0=0;QD=25.68;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1805,189,0 chrVIII 383037 . C T 1741 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.37;MQ0=0;QD=25.60;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1774,189,0 chrVIII 383055 . C A 1608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=24.36;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1641,180,0 chrVIII 383077 . T A 1535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.65;MQ0=0;QD=25.16;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1568,171,0 chrVIII 383114 . A C 1823 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.57;MQ0=0;QD=24.31;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1856,201,0 chrVIII 383160 . G A 1965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.58;MQ0=0;QD=25.86;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1998,213,0 chrVIII 383194 . G A 2009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.20;MQ0=0;QD=23.92;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2042,219,0 chrVIII 383199 . C T 1948 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.88;MQ0=0;QD=23.47;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1981,213,0 chrVIII 383205 . G A 1142 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.29;MQ0=0;QD=19.03;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1175,129,0 chrVIII 383206 . C T 1150 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.29;MQ0=0;QD=19.17;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1183,129,0 chrVIII 383265 . A G 1559 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.39;MQ0=0;QD=22.59;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1592,174,0 chrVIII 383266 . G T 1571 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=22.77;ReadPosRankSum=1.682;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,68:69:99:1604,174,0 chrVIII 383636 . A T 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=116;Dels=0.00;FS=4.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2942,275,0 chrVIII 383825 . T C 2709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2742,300,0 chrVIII 383847 . C T 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2935,297,0 chrVIII 383960 . T C 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7496;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3110,333,0 chrVIII 384317 . T C 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;DP=120;Dels=0.00;FS=2.536;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=7.88;ReadPosRankSum=-2.389;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:976,0,1515 chrVIII 384736 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.861;DP=93;Dels=0.00;FS=1.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1113,0,875 chrVIII 384779 . A G 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.717;DP=108;Dels=0.00;FS=6.125;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.235;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1008,0,1307 chrVIII 384823 . C T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.907;DP=122;Dels=0.00;FS=8.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1437,0,1106 chrVIII 384865 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.738;DP=111;Dels=0.00;FS=10.564;HaplotypeScore=3.4491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.566;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1121,0,1188 chrVIII 385054 . C T 773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.315;DP=91;Dels=0.00;FS=4.205;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:91:99:803,0,1113 chrVIII 385228 . T A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;DP=112;Dels=0.00;FS=7.555;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.428;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1176,0,1215 chrVIII 385313 . C A 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.254;DP=92;Dels=0.00;FS=2.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.093;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:860,0,1072 chrVIII 385620 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.220;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.681;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1221,0,1648 chrVIII 385715 . T A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.497;DP=128;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1253,0,1420 chrVIII 385966 . C T 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.367;DP=110;Dels=0.00;FS=3.924;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;MQ0=0;MQRankSum=2.110;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1068,0,1209 chrVIII 386000 . C T 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.241;DP=84;Dels=0.00;FS=0.831;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.635;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:838,0,900 chrVIII 386052 . C T 367.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.925;DP=132;Dels=0.00;FS=3.459;HaplotypeScore=68.4244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.28;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.796;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,20:132:99:397,0,848 chrVIII 386060 . T C 210.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.385;DP=130;Dels=0.00;FS=3.860;HaplotypeScore=4.8844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=1.62;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,16:130:99:240,0,957 chrVIII 386061 . T C 872.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;DP=129;Dels=0.00;FS=8.668;HaplotypeScore=3.8897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.279;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.935;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,114:129:99:902,0,243 chrVIII 386073 . A C 717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.870;DP=132;Dels=0.00;FS=21.691;HaplotypeScore=12.9282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.75;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=5.43;ReadPosRankSum=-9.010;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:747,0,424 chrVIII 386466 . T A 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.715;DP=126;Dels=0.00;FS=1.697;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:893,0,1592 chrVIII 386829 . C T 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.097;DP=113;Dels=0.00;FS=3.427;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1115,0,1216 chrVIII 386919 . A C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.957;DP=112;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1078,0,1224 chrVIII 387076 . T G 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.179;DP=113;Dels=0.00;FS=21.583;HaplotypeScore=9.4805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.437;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:1030,0,1206 chrVIII 387077 . T A 1057.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;DP=112;Dels=0.00;FS=27.368;HaplotypeScore=9.4805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.438;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:1087,0,1197 chrVIII 387439 . T C 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;DP=106;Dels=0.00;FS=6.156;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:955,0,1261 chrVIII 387620 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.242;DP=131;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=6.7938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:131:99:1451,0,1285 chrVIII 387685 . G A 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.044;DP=111;Dels=0.00;FS=7.526;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.089;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1247,0,1051 chrVIII 387749 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;DP=120;Dels=0.00;FS=1.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.909;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.648;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1047,0,1470 chrVIII 387771 . G A 767.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;DP=104;Dels=0.00;FS=10.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.01;MQ0=0;MQRankSum=-7.696;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:797,0,1297 chrVIII 387777 . G A 810.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.150;DP=105;Dels=0.00;FS=16.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-7.430;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.661;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:840,0,1307 chrVIII 387780 . C T 2663 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.01;MQ0=0;QD=25.61;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2696,276,0 chrVIII 387797 . C T 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.007;DP=112;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQ0=0;MQRankSum=-7.680;QD=7.21;ReadPosRankSum=-2.375;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:838,0,1452 chrVIII 387812 . T C 678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.903;DP=95;Dels=0.00;FS=2.751;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.67;MQ0=0;MQRankSum=-4.967;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.744;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:708,0,1272 chrVIII 387848 . A G 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.536;DP=90;Dels=0.00;FS=11.534;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.195;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.266;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:848,0,993 chrVIII 388052 . A G 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.883;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.200;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:1630,0,1390 chrVIII 388103 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.195;DP=119;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.018;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1096,0,1260 chrVIII 388130 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.152;DP=129;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=3.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.025;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1275,0,1328 chrVIII 388214 . G C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.503;DP=136;Dels=0.00;FS=3.173;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.811;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.031;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1148,0,1570 chrVIII 388271 . C T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.147;DP=112;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=2.9441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1326,0,1059 chrVIII 388478 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.268;DP=125;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1034,0,1618 chrVIII 388520 . A G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.420;DP=122;Dels=0.00;FS=11.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:983,0,1524 chrVIII 388553 . T C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.885;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.035;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1131,0,1301 chrVIII 388619 . C A 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;DP=100;Dels=0.00;FS=12.027;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=2.039;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.073;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1022,0,1049 chrVIII 388664 . A G 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.284;DP=149;Dels=0.00;FS=6.269;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1544,0,1535 chrVIII 388791 . C A 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.64;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2877,294,0 chrVIII 388948 . G T 564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.840;DP=104;Dels=0.00;FS=14.341;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.555;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,35:104:99:594,0,1502 chrVIII 388949 . G T 565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.176;DP=105;Dels=0.00;FS=16.273;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.682;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,35:105:99:595,0,1547 chrVIII 389023 . A G 1594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.40;MQ0=0;QD=22.14;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:72:99:1627,168,0 chrVIII 389035 . T A 1313 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.027;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=19.31;ReadPosRankSum=1.917;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,61:68:49:1346,49,0 chrVIII 389050 . A G 1618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.23;MQ0=0;QD=22.79;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1651,168,0 chrVIII 389052 . G A 1696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.92;MQ0=0;QD=23.23;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1729,174,0 chrVIII 389626 . T C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.495;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1022,0,1041 chrVIII 389677 . T A 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.894;DP=85;Dels=0.00;FS=3.017;HaplotypeScore=6.6756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=1.825;QD=9.75;ReadPosRankSum=-2.124;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:859,0,948 chrVIII 389730 . C T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;DP=133;Dels=0.00;FS=6.635;HaplotypeScore=5.1106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.173;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1197,0,1485 chrVIII 389801 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.420;DP=126;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.335;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1277,0,1287 chrVIII 389898 . T A 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.558;DP=95;Dels=0.00;FS=0.779;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=1;MQRankSum=0.956;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.182;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:914,0,1044 chrVIII 389909 . A G 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;DP=101;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=1;MQRankSum=-2.065;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1029,0,989 chrVIII 389922 . C T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.278;DP=105;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.990;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1136,0,1045 chrVIII 389953 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.482;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.754;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1424,0,1200 chrVIII 390025 . C G 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;DP=103;Dels=0.00;FS=15.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.178;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:811,0,1287 chrVIII 390041 . A T 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2686,288,0 chrVIII 390063 . A G 598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;DP=87;Dels=0.00;FS=11.320;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.87;ReadPosRankSum=-1.840;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,34:87:99:628,0,1198 chrVIII 390123 . T C 683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.372;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.514;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:713,0,1180 chrVIII 390446 . G A 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;DP=99;Dels=0.00;FS=2.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1007,0,1040 chrVIII 390561 . T C 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2858,288,0 chrVIII 390597 . G A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.094;DP=105;Dels=0.00;FS=1.622;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.497;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1194,0,967 chrVIII 390630 . C T 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.161;DP=92;Dels=0.00;FS=2.812;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=9.00;ReadPosRankSum=2.333;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:858,0,1057 chrVIII 390647 . G A 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.329;DP=87;Dels=0.00;FS=10.928;HaplotypeScore=2.4696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,44:87:99:908,0,834 chrVIII 390715 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.334;DP=123;Dels=0.00;FS=13.290;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.768;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1147,0,1429 chrVIII 390769 . T C 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.421;DP=118;Dels=0.00;FS=3.474;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:950,0,1533 chrVIII 390792 . G A 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.515;DP=103;Dels=0.00;FS=4.845;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:954,0,1149 chrVIII 390900 . C T 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2931,291,0 chrVIII 391049 . A G 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.351;DP=87;Dels=0.00;FS=8.669;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.294;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,47:87:99:982,0,865 chrVIII 391158 . G A 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.143;DP=93;Dels=0.00;FS=1.732;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1025,0,781 chrVIII 391205 . T A 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.431;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.771;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.409;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:90:99:948,0,918 chrVIII 391222 . C T 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.473;DP=79;Dels=0.00;FS=2.992;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:795,0,861 chrVIII 391307 . G A 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;DP=114;Dels=0.00;FS=7.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1117,0,1270 chrVIII 391334 . A G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.461;DP=115;Dels=0.00;FS=5.817;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1028,0,1309 chrVIII 391559 . G A 1926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=25.68;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:75:99:1959,198,0 chrVIII 391599 . C T 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;DP=82;Dels=0.00;FS=2.880;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=2.618;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:859,0,878 chrVIII 391739 . A G 321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=73;Dels=0.00;FS=1.977;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.535;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:73:99:351,0,875 chrVIII 391874 . A T 307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.070;DP=66;Dels=0.00;FS=9.652;HaplotypeScore=42.6346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=4.65;ReadPosRankSum=-2.351;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:337,0,375 chrVIII 391885 . A T 205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;DP=66;Dels=0.03;FS=2.729;HaplotypeScore=60.6685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.90;MQ0=1;MQRankSum=-1.745;QD=3.11;ReadPosRankSum=-3.482;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:235,0,542 chrVIII 391951 . A G 123.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;DP=64;Dels=0.00;FS=14.793;HaplotypeScore=5.9400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.69;MQ0=1;MQRankSum=1.017;QD=1.92;ReadPosRankSum=-2.372;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:153,0,1072 chrVIII 392043 . T C 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;DP=83;Dels=0.00;FS=8.821;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.381;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,36:83:99:715,0,1047 chrVIII 392078 . G C 751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.797;DP=89;Dels=0.00;FS=2.094;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:781,0,1040 chrVIII 392172 . C T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.819;DP=91;Dels=0.00;FS=0.873;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.756;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1080,0,836 chrVIII 392401 . C T 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.466;DP=107;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:982,0,1283 chrVIII 392524 . C T 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2808,294,0 chrVIII 392676 . T C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.993;DP=101;Dels=0.00;FS=3.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.289;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1003,0,1083 chrVIII 393017 . C T 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.658;DP=149;Dels=0.00;FS=3.986;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.227;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1731,0,1436 chrVIII 393074 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.970;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.795;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1049,0,1079 chrVIII 393364 . T C 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.794;DP=115;Dels=0.00;FS=2.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.436;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,45:115:99:819,0,1498 chrVIII 393466 . A T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.426;DP=117;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.266;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1022,0,1332 chrVIII 393530 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.739;DP=121;Dels=0.00;FS=7.266;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.438;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1114,0,1288 chrVIII 393725 . A G 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;DP=133;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:133:99:1430,0,1114 chrVIII 393734 . T C 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2987,318,0 chrVIII 394103 . G A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.921;DP=128;Dels=0.00;FS=4.268;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.921;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1207,0,1362 chrVIII 394179 . A G 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.061;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:914,0,1122 chrVIII 394302 . C T 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.023;DP=85;Dels=0.00;FS=1.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:807,0,954 chrVIII 394453 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.760;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.465;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1117,0,1073 chrVIII 394728 . A G 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3004,309,0 chrVIII 394731 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.691;DP=129;Dels=0.00;FS=5.354;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.355;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1346,0,1264 chrVIII 394959 . G A 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3639,361,0 chrVIII 395132 . G A 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.683;DP=154;Dels=0.00;FS=3.012;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.376;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1707,0,1612 chrVIII 395164 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.171;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=171.0719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.544;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1345,0,1424 chrVIII 395246 . G C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;DP=141;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1298,0,1500 chrVIII 395277 . A G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.596;DP=157;Dels=0.00;FS=18.000;HaplotypeScore=7.3271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=9.15;ReadPosRankSum=2.305;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,74:157:99:1467,0,1690 chrVIII 395310 . C A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.940;DP=127;Dels=0.00;FS=5.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.987;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1464,0,1165 chrVIII 395453 . T C 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;DP=140;Dels=0.00;FS=15.411;HaplotypeScore=6.3910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.004;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1515,0,1458 chrVIII 395596 . A C 4028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.49;SB=-2.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4028,432,0 chrVIII 395607 . G A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3723,379,0 chrVIII 395667 . A G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;DP=133;Dels=0.00;FS=4.455;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.230;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.598;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1510,0,1291 chrVIII 395713 . C T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.194;DP=127;Dels=0.00;FS=3.254;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1391,0,1144 chrVIII 396288 . A T 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;DP=138;Dels=0.00;FS=1.414;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1441,0,1370 chrVIII 396423 . C T 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.547;DP=155;Dels=0.00;FS=1.282;HaplotypeScore=5.0180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1519,0,1564 chrVIII 396474 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.174;DP=147;Dels=0.00;FS=3.091;HaplotypeScore=6.8977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.597;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:147:99:1369,0,1494 chrVIII 396631 . A G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.311;DP=156;Dels=0.00;FS=1.251;HaplotypeScore=4.5596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.716;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1618,0,1628 chrVIII 396784 . C T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.576;DP=126;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=6.9204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1435,0,1253 chrVIII 396971 . G A 55.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.748;DP=101;Dels=0.00;FS=94.250;HaplotypeScore=6.5430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=0.54;ReadPosRankSum=-3.120;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,16:101:85:85,0,899 chrVIII 396997 . A G 998.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.246;DP=125;Dels=0.00;FS=8.431;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.62;MQ0=0;MQRankSum=-3.737;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:125:99:1028,0,1081 chrVIII 397001 . A G 1034.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;DP=123;Dels=0.00;FS=3.755;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.762;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1064,0,1018 chrVIII 397005 . G T 1038.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;DP=120;Dels=0.00;FS=2.595;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.673;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1068,0,941 chrVIII 397281 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.366;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=9.00;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:142:99:1308,0,1526 chrVIII 397561 . C T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;DP=147;Dels=0.00;FS=1.307;HaplotypeScore=2.9310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.664;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1303,0,1795 chrVIII 397682 . C G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;DP=125;Dels=0.00;FS=2.328;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=9.93;ReadPosRankSum=-2.017;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1271,0,1237 chrVIII 397787 . A G 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.842;DP=136;Dels=0.00;FS=2.186;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.435;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1164,0,1635 chrVIII 397848 . G A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;DP=125;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.076;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1274,0,1373 chrVIII 398012 . T C 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.392;DP=171;Dels=0.00;FS=2.793;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,78:171:99:1564,0,1962 chrVIII 398045 . C T 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3950,388,0 chrVIII 398099 . G A 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.719;DP=160;Dels=0.00;FS=5.639;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.080;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1746,0,1676 chrVIII 398112 . C T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;DP=127;Dels=0.00;FS=3.218;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.446;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1478,0,1303 chrVIII 398139 . T C 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.101;DP=165;Dels=0.00;FS=1.260;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.310;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1613,0,1939 chrVIII 398207 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.245;DP=118;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.253;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1213,0,1352 chrVIII 398225 . A G 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.938;DP=112;Dels=0.00;FS=0.851;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.281;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.828;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1084,0,1189 chrVIII 398255 . A T 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;DP=100;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.467;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:811,0,1287 chrVIII 398366 . A G 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.623;DP=87;Dels=0.00;FS=1.917;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.499;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:921,0,924 chrVIII 398452 . T C 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.290;DP=146;Dels=0.00;FS=7.895;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.464;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1527,0,1599 chrVIII 398618 . C T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.665;DP=96;Dels=0.00;FS=0.807;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1007,0,1006 chrVIII 398985 . G A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.657;DP=96;Dels=0.00;FS=6.422;HaplotypeScore=4.8586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.84;MQ0=0;MQRankSum=-3.049;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:1021,0,999 chrVIII 399012 . C T 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.413;DP=110;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQ0=0;MQRankSum=-3.303;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.463;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1065,0,1215 chrVIII 399021 . C A 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.977;DP=112;Dels=0.00;FS=2.618;HaplotypeScore=2.7792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.70;MQ0=0;MQRankSum=-4.861;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.432;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1003,0,1301 chrVIII 399043 . A G 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.798;DP=100;Dels=0.00;FS=0.885;HaplotypeScore=18.4365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.49;MQ0=0;MQRankSum=-5.866;QD=6.47;ReadPosRankSum=-2.838;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:677,0,1334 chrVIII 399087 . G A 62.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;DP=86;Dels=0.00;FS=5.887;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=-5.622;QD=0.72;ReadPosRankSum=-1.962;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,30:86:92:92,0,1290 chrVIII 399099 . T A 265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;DP=92;Dels=0.00;FS=10.989;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.90;MQ0=0;MQRankSum=-5.179;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.487;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:295,0,1415 chrVIII 399104 . C T 285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.626;DP=88;Dels=0.00;FS=16.303;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.90;MQ0=0;MQRankSum=-4.952;QD=3.24;ReadPosRankSum=2.135;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:315,0,1306 chrVIII 399258 . A G 2024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2057,216,0 chrVIII 399316 . T C 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=26.77;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2897,303,0 chrVIII 399367 . G A 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;DP=105;Dels=0.00;FS=7.621;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=2.964;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.894;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1076,0,1142 chrVIII 399409 . A G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.439;DP=137;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.475;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1348,0,1282 chrVIII 399427 . G A 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.249;DP=150;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=2.9142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,83:150:99:1821,0,1254 chrVIII 399484 . T G 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3416,354,0 chrVIII 399595 . A T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.894;DP=125;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.755;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1405,0,1231 chrVIII 399628 . A C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.401;DP=132;Dels=0.00;FS=4.140;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1203,0,1493 chrVIII 399631 . T A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;DP=131;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1267,0,1526 chrVIII 399862 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.632;DP=142;Dels=0.00;FS=3.005;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.692;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1269,0,1672 chrVIII 399901 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.920;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1048,0,1642 chrVIII 400015 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.187;DP=143;Dels=0.00;FS=4.009;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=1;MQRankSum=0.335;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.621;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1297,0,1603 chrVIII 400069 . A G 4079.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4079,426,0 chrVIII 400443 . G C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;DP=137;Dels=0.00;FS=6.336;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1384,0,1474 chrVIII 400451 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.162;DP=130;Dels=0.00;FS=3.228;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.379;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.413;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1192,0,1538 chrVIII 400618 . C T 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2651,276,0 chrVIII 400642 . A T 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2708,282,0 chrVIII 401130 . A G 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.031;DP=103;Dels=0.00;FS=2.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.195;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1118,0,1032 chrVIII 401172 . C T 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.885;DP=83;Dels=0.00;FS=0.858;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,45:83:99:825,0,712 chrVIII 401325 . A G 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.095;DP=101;Dels=0.00;FS=2.700;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.324;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1118,0,978 chrVIII 401408 . C T 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3029,315,0 chrVIII 401484 . G A 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.346;DP=121;Dels=0.00;FS=4.446;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.401;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1159,0,1366 chrVIII 401862 . G A 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.515;DP=97;Dels=0.01;FS=2.757;HaplotypeScore=3.2092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1042,0,918 chrVIII 401915 . A C 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.318;DP=95;Dels=0.00;FS=1.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:844,0,1057 chrVIII 402413 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.616;DP=137;Dels=0.00;FS=3.146;HaplotypeScore=4.4271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.966;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1349,0,1457 chrVIII 402478 . T C 2481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2514,264,0 chrVIII 402653 . T A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.283;DP=118;Dels=0.00;FS=2.364;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.648;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1009,0,1322 chrVIII 402730 . G C 660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:690,0,989 chrVIII 402916 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.158;DP=95;Dels=0.00;FS=2.862;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.182;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1077,0,997 chrVIII 402933 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;DP=94;Dels=0.00;FS=1.812;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1064,0,946 chrVIII 402947 . A C 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.179;DP=96;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.730;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:976,0,1078 chrVIII 402964 . C T 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;DP=118;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.760;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.703;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1157,0,1323 chrVIII 402986 . T C 2456 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.58;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2489,252,0 chrVIII 402990 . C A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.959;DP=96;Dels=0.00;FS=4.033;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.114;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:1009,0,1020 chrVIII 403022 . G T 2469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2502,258,0 chrVIII 403089 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;DP=105;Dels=0.00;FS=6.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1090,0,1153 chrVIII 403115 . G C 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;DP=104;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.339;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1156,0,1033 chrVIII 403151 . C A 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.805;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1081,0,956 chrVIII 403215 . A G 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2963,303,0 chrVIII 403244 . G C 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.432;DP=101;Dels=0.00;FS=3.983;HaplotypeScore=4.4839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=2.480;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:101:99:1077,0,970 chrVIII 403478 . C T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.226;DP=135;Dels=0.01;FS=2.181;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=1.106;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1405,0,1450 chrVIII 403641 . T C 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.700;DP=145;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1512,0,1533 chrVIII 403847 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.222;DP=116;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.357;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1360,0,1020 chrVIII 404288 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;DP=99;Dels=0.00;FS=8.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.672;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.525;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1109,0,944 chrVIII 404452 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.493;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.233;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1396,0,1214 chrVIII 404640 . C A 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.677;DP=74;Dels=0.00;FS=2.026;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.650;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,39:74:99:882,0,670 chrVIII 404646 . G A 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.149;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.791;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,40:75:99:901,0,651 chrVIII 404657 . A T 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;DP=76;Dels=0.00;FS=0.900;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.843;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:75:99:858,0,730 chrVIII 405006 . G A 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.097;DP=98;Dels=0.00;FS=3.786;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:964,0,1138 chrVIII 405293 . G T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.168;DP=114;Dels=0.00;FS=3.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1136,0,1136 chrVIII 405569 . T A 724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;DP=78;Dels=0.00;FS=3.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:754,0,963 chrVIII 405579 . G A 544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.676;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:574,0,984 chrVIII 406060 . G A 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.867;DP=76;Dels=0.00;FS=3.114;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.907;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,41:76:99:870,0,681 chrVIII 406077 . A G 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.756;DP=76;Dels=0.00;FS=4.501;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=11.67;ReadPosRankSum=-2.138;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,43:76:99:917,0,678 chrVIII 406328 . A C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.719;DP=134;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=1.105;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.241;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1358,0,1427 chrVIII 406414 . A G 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.634;DP=123;Dels=0.00;FS=6.254;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.124;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,74:123:99:1580,0,1032 chrVIII 406429 . A G 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.463;DP=129;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.334;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,81:129:99:1656,0,909 chrVIII 406474 . A G 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.967;DP=136;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,83:136:99:1756,0,1057 chrVIII 406498 . T C 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2603,258,0 chrVIII 406524 . C A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.184;DP=97;Dels=0.00;FS=3.195;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.314;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,59:97:99:1329,0,767 chrVIII 406593 . T C 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.114;DP=138;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=2.7685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.351;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:138:99:1311,0,1553 chrVIII 406597 . T C 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7685;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3811,399,0 chrVIII 406625 . G T 3903.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3903,388,0 chrVIII 406670 . C T 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.404;DP=129;Dels=0.00;FS=4.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1278,0,1426 chrVIII 406734 . C T 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3129,315,0 chrVIII 407003 . G A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.117;DP=130;Dels=0.00;FS=3.216;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1258,0,1416 chrVIII 407076 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.971;DP=120;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.924;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1275,0,1224 chrVIII 407300 . A G 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4588;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4011,400,0 chrVIII 407302 . C T 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.577;DP=159;Dels=0.00;FS=4.660;HaplotypeScore=5.1928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:1766,0,1447 chrVIII 407637 . G T 2352 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.35;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2385,243,0 chrVIII 407850 . C A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.634;DP=117;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1311,0,1092 chrVIII 408482 . A G 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.563;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.170;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1038,0,1446 chrVIII 409115 . T C 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.458;DP=143;Dels=0.00;FS=2.190;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1426,0,1437 chrVIII 409404 . C G 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.95;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3017,315,0 chrVIII 409526 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;DP=128;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=5.7444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1200,0,1390 chrVIII 409664 . A G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;DP=116;Dels=0.00;FS=3.513;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=8.22;ReadPosRankSum=2.091;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:983,0,1408 chrVIII 410129 . T C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.131;DP=116;Dels=0.00;FS=2.546;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1185,0,1301 chrVIII 410162 . T C 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.229;DP=113;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1055,0,1422 chrVIII 410489 . T C 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3373,357,0 chrVIII 410842 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.849;DP=150;Dels=0.00;FS=2.083;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.229;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1448,0,1624 chrVIII 410979 . G A 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.526;DP=149;Dels=0.00;FS=2.085;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.770;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.075;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:149:99:1190,0,1615 chrVIII 411599 . T A 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;DP=117;Dels=0.00;FS=16.186;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:951,0,1345 chrVIII 411647 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.370;DP=127;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=10.31;ReadPosRankSum=2.230;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1339,0,1274 chrVIII 411976 . A G 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;DP=160;Dels=0.00;FS=1.282;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.792;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1649,0,1689 chrVIII 412143 . C A 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.631;DP=92;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.986;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1052,0,880 chrVIII 412170 . G A 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.343;DP=96;Dels=0.00;FS=2.645;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.469;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:904,0,1120 chrVIII 412427 . G A 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.035;DP=114;Dels=0.00;FS=7.496;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=2.867;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.580;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,44:114:99:871,0,1544 chrVIII 412903 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1413,0,1247 chrVIII 413175 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;DP=132;Dels=0.00;FS=6.886;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1242,0,1500 chrVIII 413239 . T C 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.891;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,47:115:99:842,0,1437 chrVIII 413311 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.907;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=9.96;ReadPosRankSum=2.232;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1424,0,1460 chrVIII 413370 . C T 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.971;DP=110;Dels=0.00;FS=3.652;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1048,0,1326 chrVIII 413704 . G T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;DP=111;Dels=0.00;FS=8.184;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.239;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1277,0,1098 chrVIII 414234 . C T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.674;DP=122;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=5.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.975;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1437,0,1165 chrVIII 414275 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.216;DP=122;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=1;MQRankSum=0.516;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1264,0,1298 chrVIII 414289 . C T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.905;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=-0.412;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1412,0,1301 chrVIII 415310 . T C 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.607;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=26.29;ReadPosRankSum=0.733;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2951,309,0 chrVIII 415356 . T C 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.193;DP=103;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.331;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:1014,0,1191 chrVIII 415374 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.187;DP=108;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.908;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1073,0,1167 chrVIII 415439 . G A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.732;DP=93;Dels=0.00;FS=2.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.795;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:973,0,993 chrVIII 415445 . G A 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;DP=94;Dels=0.00;FS=3.847;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=11.10;ReadPosRankSum=-2.641;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:1073,0,917 chrVIII 416196 . G A 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.277;DP=168;Dels=0.00;FS=6.825;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:168:99:1750,0,1725 chrVIII 416592 . T C 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;DP=176;Dels=0.00;FS=1.197;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.091;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.040;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,86:176:99:1714,0,1851 chrVIII 416601 . G C 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=161;Dels=0.00;FS=1.251;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,80:161:99:1553,0,1643 chrVIII 416694 . A C 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;DP=171;Dels=0.00;FS=8.965;HaplotypeScore=3.8020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.361;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,91:171:99:1854,0,1571 chrVIII 416745 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.557;DP=115;Dels=0.00;FS=3.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1285,0,969 chrVIII 416784 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.438;DP=139;Dels=0.00;FS=3.021;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.714;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1304,0,1542 chrVIII 417002 . A G 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.110;DP=147;Dels=0.00;FS=7.273;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1519,0,1529 chrVIII 417042 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.864;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.277;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1389,0,1110 chrVIII 417054 . G A 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3042,309,0 chrVIII 417114 . A G 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.466;DP=112;Dels=0.00;FS=3.950;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1415,0,902 chrVIII 417310 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.779;DP=126;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.256;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1376,0,1234 chrVIII 417602 . C T 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.537;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1821,0,1351 chrVIII 417907 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.031;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=46.5112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.96;MQ0=0;MQRankSum=8.836;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.713;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1231,0,1119 chrVIII 418084 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.684;DP=112;Dels=0.00;FS=2.618;HaplotypeScore=2.2337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1244,0,1012 chrVIII 418376 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.535;DP=144;Dels=0.00;FS=7.403;HaplotypeScore=5.3413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=9.55;ReadPosRankSum=-2.419;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1405,0,1498 chrVIII 418718 . A G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.049;DP=151;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1474,0,1645 chrVIII 418913 . C T 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.650;DP=89;Dels=0.00;FS=8.579;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:856,0,980 chrVIII 419125 . G A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.056;DP=104;Dels=0.00;FS=6.318;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1168,0,986 chrVIII 419187 . T G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.391;DP=134;Dels=0.00;FS=11.019;HaplotypeScore=3.8486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.076;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1424,0,1369 chrVIII 419449 . G A 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.506;DP=128;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.708;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.546;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:128:99:1073,0,1464 chrVIII 419566 . A G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;DP=122;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=2.3984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1235,0,1257 chrVIII 419617 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;DP=122;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.651;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1236,0,1329 chrVIII 419744 . T G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.277;DP=100;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:100:99:1225,0,893 chrVIII 419882 . C T 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.353;DP=122;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:122:99:1516,0,983 chrVIII 419975 . T C 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.197;DP=119;Dels=0.00;FS=7.280;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.307;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1056,0,1335 chrVIII 420065 . C G 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;DP=155;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1500,0,1593 chrVIII 420220 . A C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;DP=116;Dels=0.00;FS=4.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.922;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1208,0,1151 chrVIII 420248 . A T 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.346;DP=130;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.705;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3356,318,0 chrVIII 420265 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;DP=143;Dels=0.00;FS=2.143;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1329,0,1557 chrVIII 420455 . T G 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.637;DP=164;Dels=0.00;FS=4.649;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.591;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:164:99:1455,0,1982 chrVIII 420484 . A G 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.579;DP=133;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1166,0,1556 chrVIII 420823 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.200;DP=129;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=2.7134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1321,0,1351 chrVIII 420865 . G T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.508;DP=131;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.472;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1361,0,1318 chrVIII 420997 . C T 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.509;DP=182;Dels=0.00;FS=6.409;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,88:182:99:1720,0,1973 chrVIII 421000 . T C 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.581;DP=174;Dels=0.00;FS=4.501;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,86:174:99:1481,0,1867 chrVIII 421159 . T C 2059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.346;DP=209;Dels=0.00;FS=0.512;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,105:209:99:2089,0,2021 chrVIII 421312 . A G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.911;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.266;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:150:99:1416,0,1535 chrVIII 421321 . C T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.592;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.340;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.054;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1624,0,1441 chrVIII 421330 . T C 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.738;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.150;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1550,0,1536 chrVIII 421474 . C T 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.449;DP=150;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.339;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:150:99:1627,0,1528 chrVIII 421507 . T C 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.061;DP=156;Dels=0.00;FS=4.745;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=3.018;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:1721,0,1513 chrVIII 421975 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.278;DP=156;Dels=0.00;FS=2.832;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.502;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1492,0,1673 chrVIII 422041 . G C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;DP=153;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.530;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1378,0,1734 chrVIII 422328 . G A 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.914;DP=161;Dels=0.00;FS=2.842;HaplotypeScore=5.8762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.117;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,71:161:99:1490,0,1789 chrVIII 422434 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.256;DP=122;Dels=0.00;FS=7.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=2.597;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1327,0,1246 chrVIII 422538 . G A 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.70;MQ0=1;QD=24.46;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3140,336,0 chrVIII 422801 . A G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.273;DP=133;Dels=0.00;FS=3.316;HaplotypeScore=3.3533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1380,0,1390 chrVIII 422957 . A G 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.859;DP=113;Dels=0.00;FS=4.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.337;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:744,0,1470 chrVIII 422992 . A G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3264,345,0 chrVIII 423045 . T C 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.387;DP=160;Dels=0.00;FS=4.661;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.834;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,80:160:99:1574,0,1679 chrVIII 423389 . T C 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.628;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1418,0,1527 chrVIII 423420 . G A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.231;DP=136;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1410,0,1329 chrVIII 423426 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.433;DP=142;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.357;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1476,0,1417 chrVIII 423677 . T A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.457;DP=130;Dels=0.00;FS=8.070;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQ0=1;MQRankSum=-2.313;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.800;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1533,0,1133 chrVIII 423870 . T C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.805;DP=128;Dels=0.00;FS=10.943;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1292,0,1264 chrVIII 424109 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.857;DP=155;Dels=0.00;FS=8.524;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,66:155:99:1309,0,1820 chrVIII 424149 . T C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.045;DP=138;Dels=0.00;FS=3.128;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=-0.751;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.261;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:1020,0,1789 chrVIII 424239 . C T 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.395;DP=146;Dels=0.00;FS=4.993;HaplotypeScore=2.4485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=0.725;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1349,0,1560 chrVIII 424278 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.568;DP=135;Dels=0.00;FS=14.405;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1263,0,1471 chrVIII 424326 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;DP=131;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1228,0,1348 chrVIII 424817 . G A 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.001;DP=169;Dels=0.00;FS=4.186;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.882;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,85:169:99:1745,0,1660 chrVIII 425219 . G A 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.132;DP=155;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,88:155:99:1836,0,1208 chrVIII 425300 . G T 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2947,309,0 chrVIII 425301 . C T 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2936,306,0 chrVIII 425312 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.074;DP=146;Dels=0.00;FS=2.129;HaplotypeScore=4.6829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1465,0,1414 chrVIII 425823 . T C 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;DP=104;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1098,0,1078 chrVIII 426069 . T A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;DP=133;Dels=0.00;FS=9.223;HaplotypeScore=2.7609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.096;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1337,0,1351 chrVIII 426298 . C T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.801;DP=131;Dels=0.00;FS=4.291;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.770;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,78:131:99:1737,0,1031 chrVIII 426306 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;DP=126;Dels=0.00;FS=3.314;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=12.18;ReadPosRankSum=2.226;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1565,0,1094 chrVIII 426350 . G A 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.147;DP=144;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1679,0,1343 chrVIII 426591 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.501;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.285;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1254,0,848 chrVIII 426665 . A G 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.045;DP=106;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=17.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:927,0,828 chrVIII 426716 . A G 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.209;DP=107;Dels=0.00;FS=6.172;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.240;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1006,0,1130 chrVIII 426873 . T G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.144;DP=113;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1291,0,1087 chrVIII 427277 . A G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.737;DP=131;Dels=0.00;FS=2.811;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1428,0,1395 chrVIII 427565 . A C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.123;DP=121;Dels=0.00;FS=2.337;HaplotypeScore=2.5475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.056;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.365;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:121:99:1159,0,1329 chrVIII 427619 . T C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.608;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.769;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1417,0,1229 chrVIII 427646 . T G 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;DP=93;Dels=0.00;FS=0.779;HaplotypeScore=5.5371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.505;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1030,0,843 chrVIII 427782 . A G 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.968;DP=92;Dels=0.00;FS=9.987;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:914,0,989 chrVIII 427901 . G A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.774;DP=137;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.036;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1386,0,1492 chrVIII 428027 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.502;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.935;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1352,0,1126 chrVIII 428194 . T C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.062;DP=111;Dels=0.00;FS=9.167;HaplotypeScore=2.5200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1131,0,1275 chrVIII 428387 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;DP=142;Dels=0.00;FS=1.327;HaplotypeScore=5.3771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.196;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1330,0,1381 chrVIII 428411 . A G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.310;DP=126;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=3.2139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.048;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1043,0,1488 chrVIII 428428 . T C 743.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.321;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.093;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:773,0,1605 chrVIII 428429 . C T 776.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.568;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,50:124:99:806,0,1531 chrVIII 428431 . C T 947.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.172;DP=133;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=9.0040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:977,0,1534 chrVIII 428623 . G A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.849;DP=143;Dels=0.00;FS=8.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1514,0,1475 chrVIII 428738 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;DP=128;Dels=0.00;FS=5.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1249,0,1450 chrVIII 429302 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;DP=101;Dels=0.00;FS=8.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,61:101:99:1295,0,814 chrVIII 429323 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.876;DP=101;Dels=0.00;FS=12.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=13.84;ReadPosRankSum=-2.116;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,66:101:99:1428,0,621 chrVIII 429343 . T C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.321;DP=103;Dels=0.00;FS=7.919;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.650;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:103:99:1310,0,815 chrVIII 429526 . C T 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.046;DP=141;Dels=0.00;FS=9.366;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.505;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1612,0,1291 chrVIII 429532 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.052;DP=134;Dels=0.00;FS=13.605;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.297;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1269,0,1534 chrVIII 429990 . T C 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;DP=139;Dels=0.00;FS=4.059;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1098,0,1678 chrVIII 430130 . T C 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.587;DP=147;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=2.6000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:985,0,1751 chrVIII 430583 . T C 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.285;DP=106;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:896,0,1370 chrVIII 430901 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.638;DP=156;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.811;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:156:99:1507,0,1748 chrVIII 431051 . T A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;DP=112;Dels=0.00;FS=1.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.740;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1266,0,1069 chrVIII 431870 . C T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.644;DP=90;Dels=0.00;FS=1.717;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.602;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:905,0,920 chrVIII 431945 . A G 658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;DP=51;Dels=0.00;FS=2.471;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,32:51:99:688,0,375 chrVIII 433037 . T C 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.153;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1038,0,1159 chrVIII 433202 . G A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.305;DP=132;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.070;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1329,0,1359 chrVIII 433302 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.607;DP=119;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.839;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1171,0,1301 chrVIII 433331 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.665;DP=123;Dels=0.00;FS=3.292;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1477,0,1099 chrVIII 433370 . T G 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.110;DP=143;Dels=0.00;FS=2.095;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.251;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1541,0,1466 chrVIII 433529 . A T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;DP=130;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1239,0,1478 chrVIII 433703 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;DP=136;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.401;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.374;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1548,0,1306 chrVIII 433706 . A G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;DP=137;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.165;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1565,0,1306 chrVIII 434154 . G C 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.633;DP=124;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:1551,0,1067 chrVIII 434588 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.663;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1313,0,1310 chrVIII 434957 . G A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.274;DP=130;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.704;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1433,0,1212 chrVIII 435305 . C T 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.236;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:136:99:1129,0,1651 chrVIII 435329 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.864;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.502;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1330,0,1518 chrVIII 435539 . C A 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.390;DP=127;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1298,0,1369 chrVIII 435764 . G A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.489;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.674;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1245,0,1391 chrVIII 435830 . T C 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.833;DP=141;Dels=0.00;FS=4.079;HaplotypeScore=5.5156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=-0.701;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.484;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:141:99:1126,0,1772 chrVIII 436433 . A G 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.115;DP=135;Dels=0.00;FS=4.083;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1512,0,1338 chrVIII 436457 . A G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.932;DP=124;Dels=0.00;FS=5.632;HaplotypeScore=6.4910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:124:99:1307,0,1245 chrVIII 436613 . T C 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.551;DP=108;Dels=0.00;FS=4.637;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1025,0,1116 chrVIII 436638 . T G 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.652;DP=116;Dels=0.00;FS=4.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.725;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.564;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1164,0,1196 chrVIII 436654 . A G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.996;DP=120;Dels=0.00;FS=4.434;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.158;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1304,0,1108 chrVIII 436695 . G T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.476;DP=109;Dels=0.00;FS=0.789;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.282;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1095,0,1125 chrVIII 436805 . G A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.570;DP=110;Dels=0.00;FS=2.468;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:978,0,1305 chrVIII 436859 . T C 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.087;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:774,0,908 chrVIII 436939 . G T 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.864;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:930,0,773 chrVIII 436978 . G A 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.273;DP=95;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=2.3294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:95:99:965,0,769 chrVIII 437014 . G T 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=23.64;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2822,270,0 chrVIII 437680 . G A 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3467,351,0 chrVIII 437704 . G A 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3096,318,0 chrVIII 437716 . G A 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;DP=108;Dels=0.00;FS=6.636;HaplotypeScore=5.9500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:1019,0,1233 chrVIII 437974 . A G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.681;DP=126;Dels=0.00;FS=4.379;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.343;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1322,0,1274 chrVIII 438040 . A G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.129;DP=121;Dels=0.00;FS=6.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.501;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1195,0,1333 chrVIII 438265 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.063;DP=123;Dels=0.00;FS=7.637;HaplotypeScore=4.4326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=9.77;ReadPosRankSum=-2.284;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1232,0,1337 chrVIII 438307 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.957;DP=141;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.530;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.018;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1531,0,1359 chrVIII 438697 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.753;DP=114;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.003;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1149,0,1218 chrVIII 439062 . C T 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3439,339,0 chrVIII 439232 . A G 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.396;DP=142;Dels=0.00;FS=5.149;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.504;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1494,0,1445 chrVIII 439617 . G T 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.103;DP=137;Dels=0.00;FS=5.488;HaplotypeScore=3.3011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,80:137:99:1722,0,1053 chrVIII 439647 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.150;DP=136;Dels=0.00;FS=6.396;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=2.301;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.008;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1508,0,1355 chrVIII 439710 . A G 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;DP=149;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=1.9312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.481;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1567,0,1611 chrVIII 439716 . T G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.599;DP=150;Dels=0.00;FS=2.957;HaplotypeScore=2.7199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.488;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:150:99:1417,0,1626 chrVIII 439725 . A G 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.211;DP=156;Dels=0.00;FS=2.803;HaplotypeScore=2.7199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1616,0,1655 chrVIII 439766 . A T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.455;DP=177;Dels=0.00;FS=2.005;HaplotypeScore=5.4670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.920;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,71:177:99:1436,0,2275 chrVIII 440234 . A G 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.375;DP=165;Dels=0.00;FS=7.964;HaplotypeScore=5.5434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.679;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:1843,0,1535 chrVIII 440297 . C T 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=25.67;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2985,300,0 chrVIII 440625 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.545;DP=140;Dels=0.00;FS=5.165;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.26;ReadPosRankSum=2.086;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1466,0,1390 chrVIII 440806 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.875;DP=137;Dels=0.00;FS=2.228;HaplotypeScore=2.7359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.167;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1585,0,1333 chrVIII 441044 . G A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.049;DP=135;Dels=0.00;FS=4.068;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.950;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1345,0,1546 chrVIII 441167 . A G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.131;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1361,0,1466 chrVIII 441789 . A T 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.073;DP=121;Dels=0.00;FS=2.359;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.499;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.543;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1529,0,1063 chrVIII 441833 . A G 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.835;DP=120;Dels=0.00;FS=4.434;HaplotypeScore=3.6419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.145;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1293,0,1186 chrVIII 442149 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;DP=114;Dels=0.00;FS=6.056;HaplotypeScore=126.5569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-3.062;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.792;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1183,0,1232 chrVIII 442495 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.646;DP=112;Dels=0.00;FS=6.133;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.498;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1141,0,1207 chrVIII 442498 . T C 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.960;DP=110;Dels=0.00;FS=6.151;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1139,0,1092 chrVIII 444367 . A G 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:139:99:3429,351,0 chrVIII 444619 . T C 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3404,339,0 chrVIII 445169 . T C 2929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2962,300,0 chrVIII 445735 . G A 2508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2541,258,0 chrVIII 445905 . A C 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3137,327,0 chrVIII 447419 . T C 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3544,357,0 chrVIII 447550 . G A 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3477,343,0 chrVIII 447631 . C T 4383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=27.06;SB=-2.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4383,457,0 chrVIII 447755 . A G 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2566,273,0 chrVIII 447756 . G T 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2573,273,0 chrVIII 447769 . T C 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2586,279,0 chrVIII 447838 . G A 2510 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=25.35;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2543,264,0 chrVIII 447930 . C T 2345 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2378,240,0 chrVIII 448880 . A G 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2882,303,0 chrVIII 448924 . T G 2432 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2465,261,0 chrVIII 448997 . G A 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3286,333,0 chrVIII 449277 . A G 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3589,375,0 chrVIII 449402 . T G 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3037,321,0 chrVIII 450131 . G A 4569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4569,454,0 chrVIII 450218 . A C 4025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.419;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1778;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.687;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4025,426,0 chrVIII 450239 . G A 4009.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4009,397,0 chrVIII 450254 . T C 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3988,400,0 chrVIII 450359 . G A 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3426,345,0 chrVIII 450572 . T C 2988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3021,315,0 chrVIII 450770 . A G 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3044,324,0 chrVIII 451172 . G A 2602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2635,273,0 chrVIII 451932 . C T 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3477,357,0 chrVIII 452163 . A G 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3446,369,0 chrVIII 452436 . T C 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3191,333,0 chrVIII 452903 . C T 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2915,306,0 chrVIII 452923 . C A 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3509,363,0 chrVIII 452955 . A G 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3708,378,0 chrVIII 453196 . A G 4253.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4253,424,0 chrVIII 453472 . A G 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3928,390,0 chrVIII 453526 . A C 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3419,337,0 chrVIII 453557 . A G 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3524,363,0 chrVIII 453608 . A T 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3541,355,0 chrVIII 453686 . T C 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2973,315,0 chrVIII 453712 . T C 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;DP=125;Dels=0.00;FS=3.726;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=24.11;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3047,294,0 chrVIII 453738 . A G 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3122,321,0 chrVIII 453771 . A G 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3284,339,0 chrVIII 453813 . G A 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3619,369,0 chrVIII 453862 . T C 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3748,393,0 chrVIII 453897 . C T 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3606,375,0 chrVIII 453908 . C T 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3368,342,0 chrVIII 454213 . C T 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.678;DP=127;Dels=0.00;FS=3.556;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=26.06;ReadPosRankSum=1.023;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3310,336,0 chrVIII 454227 . G A 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3542,363,0 chrVIII 454283 . T C 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2825,300,0 chrVIII 454385 . A G 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3261,345,0 chrVIII 454605 . C T 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3463,349,0 chrVIII 455518 . A G 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3950,411,0 chrVIII 455744 . C T 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3546,358,0 chrVIII 455862 . A G 2611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3571;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=19.06;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:2644,261,0 chrVIII 456019 . G C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3269,333,0 chrVIII 456475 . C T 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.38;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3456,346,0 chrVIII 458341 . C G 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3129,345,0 chrVIII 462825 . T G 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3521,351,0 chrVIII 463432 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.822;DP=115;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1353,0,1025 chrVIII 463786 . G A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.283;DP=130;Dels=0.00;FS=5.481;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.122;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1516,0,1238 chrVIII 464525 . G A 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.003;DP=114;Dels=0.00;FS=3.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.899;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1045,0,1264 chrVIII 464596 . A G 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;DP=109;Dels=0.00;FS=10.737;HaplotypeScore=2.4987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:979,0,1245 chrVIII 464600 . T G 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.319;DP=107;Dels=0.00;FS=14.778;HaplotypeScore=3.4853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.159;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:979,0,1266 chrVIII 464637 . C A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;DP=103;Dels=0.00;FS=6.224;HaplotypeScore=4.5175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.234;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1130,0,1027 chrVIII 464754 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;DP=104;Dels=0.00;FS=11.212;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.327;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1192,0,968 chrVIII 464855 . G A 2701 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2734,273,0 chrVIII 465075 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.649;DP=97;Dels=0.00;FS=2.639;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.222;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1063,0,949 chrVIII 465339 . T C 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;DP=85;Dels=0.00;FS=5.738;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.594;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,50:85:99:1074,0,726 chrVIII 465579 . T C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.004;DP=117;Dels=0.00;FS=5.716;HaplotypeScore=2.4889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=2.138;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1170,0,1164 chrVIII 465638 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.062;DP=112;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.172;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1082,0,1234 chrVIII 465674 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.301;DP=111;Dels=0.00;FS=4.875;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.847;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.540;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1198,0,1138 chrVIII 465684 . G A 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2571,252,0 chrVIII 465708 . T A 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.31;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3059,295,0 chrVIII 465742 . C T 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;DP=94;Dels=0.00;FS=8.028;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.630;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:854,0,1106 chrVIII 465769 . C T 2066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.25;MQ0=0;QD=25.82;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2099,222,0 chrVIII 465784 . G A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.317;DP=72;Dels=0.00;FS=22.667;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.718;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,46:72:99:1067,0,439 chrVIII 465841 . T C 1191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.40;MQ0=0;QD=18.90;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1224,129,0 chrVIII 465846 . A T 389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;DP=63;Dels=0.00;FS=1.537;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.51;MQ0=0;MQRankSum=1.925;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.973;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:419,0,597 chrVIII 465996 . C T 2607 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2640,273,0 chrVIII 466004 . C A 2529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2562,264,0 chrVIII 466032 . T C 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.560;DP=103;Dels=0.00;FS=2.539;HaplotypeScore=4.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.385;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:934,0,1212 chrVIII 466045 . C T 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;DP=103;Dels=0.00;FS=13.327;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.327;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:926,0,1197 chrVIII 466048 . C T 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.037;DP=105;Dels=0.00;FS=13.077;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.10;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:910,0,1113 chrVIII 466143 . A C 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.505;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8622;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.28;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=26.16;ReadPosRankSum=1.570;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2832,280,0 chrVIII 466181 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.643;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.84;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1124,0,1408 chrVIII 466187 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.568;DP=119;Dels=0.00;FS=0.790;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1050,0,1475 chrVIII 466240 . T G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.540;DP=132;Dels=0.00;FS=5.984;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.159;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1485,0,1325 chrVIII 466269 . T A 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.383;DP=107;Dels=0.00;FS=8.165;HaplotypeScore=3.7634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.059;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1165,0,1089 chrVIII 466305 . A T 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.671;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.916;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.694;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,47:88:99:891,0,870 chrVIII 466324 . A G 2085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.50;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2118,234,0 chrVIII 466334 . A G 1728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.37;MQ0=0;QD=21.33;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:81:99:1761,192,0 chrVIII 466339 . C T 1709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.28;MQ0=0;QD=21.36;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1742,186,0 chrVIII 466361 . A G 1752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.81;MQ0=0;QD=20.37;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1785,201,0 chrVIII 466372 . T A 665.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.950;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.207;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,41:90:99:695,0,865 chrVIII 466379 . G C 1651 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.13;MQ0=0;QD=19.65;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1684,198,0 chrVIII 466381 . A C 1672 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.40;MQ0=0;QD=19.67;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1705,201,0 chrVIII 466403 . T C 2268 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.33;MQ0=0;QD=22.24;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2301,255,0 chrVIII 466454 . C T 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.099;DP=66;Dels=0.00;FS=2.085;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.40;MQ0=0;MQRankSum=2.367;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.083;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,34:66:99:660,0,682 chrVIII 466472 . T G 544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.702;DP=65;Dels=0.00;FS=3.646;HaplotypeScore=40.6914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.435;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.419;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:574,0,758 chrVIII 466475 . A G 1702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=52.6050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.83;MQ0=0;QD=23.64;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:72:99:1735,192,0 chrVIII 466485 . A C 1444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9070;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.60;MQ0=0;QD=20.93;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1477,156,0 chrVIII 466489 . G C 365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.248;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:99:395,0,870 chrVIII 466598 . G C 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.078;DP=83;Dels=0.00;FS=0.831;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.925;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:853,0,915 chrVIII 466650 . C A 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=25.55;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2639,273,0 chrVIII 466657 . G A 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.43;MQ0=0;QD=25.46;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2783,285,0 chrVIII 466663 . G C 2478 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.32;MQ0=0;QD=24.29;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2511,267,0 chrVIII 466691 . C T 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=116;Dels=0.00;FS=7.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.47;MQ0=2;MQRankSum=1.146;QD=8.08;ReadPosRankSum=-2.620;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:967,0,1244 chrVIII 466717 . C G 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.46;MQ0=2;QD=23.22;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2657,288,0 chrVIII 466727 . C T 2431 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.86;MQ0=2;QD=25.06;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2464,258,0 chrVIII 466785 . C T 1963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.22;MQ0=2;QD=26.17;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1996,216,0 chrVIII 466818 . G A 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.98;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2652,276,0 chrVIII 466826 . G A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.448;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.196;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:969,0,1102 chrVIII 466868 . C T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.130;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1288,0,1149 chrVIII 466878 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1246,0,1280 chrVIII 466929 . G A 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.26;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2615,270,0 chrVIII 466953 . G A 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.140;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:742,0,1146 chrVIII 466959 . T C 2344 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=47.4352;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.22;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2377,243,0 chrVIII 466968 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.896;DP=104;Dels=0.00;FS=6.408;HaplotypeScore=100.2304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.483;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:104:99:1014,0,976 chrVIII 468037 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.209;DP=109;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.882;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1194,0,1162 chrVIII 468050 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.245;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1093,0,1377 chrVIII 468164 . G A 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;DP=100;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.905;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:893,0,1186 chrVIII 468183 . C A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.271;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.313;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:956,0,1168 chrVIII 468239 . C T 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.006;DP=147;Dels=0.00;FS=2.936;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.289;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1496,0,1545 chrVIII 468386 . A G 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;DP=117;Dels=0.00;FS=1.999;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1237,0,1308 chrVIII 468422 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.047;DP=136;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1337,0,1489 chrVIII 468473 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.525;DP=108;Dels=0.00;FS=1.831;HaplotypeScore=2.6935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.091;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1200,0,1077 chrVIII 468677 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.552;DP=117;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.335;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1200,0,1311 chrVIII 468680 . A T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.463;DP=123;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.220;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1198,0,1357 chrVIII 468734 . T G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=155;Dels=0.00;FS=5.885;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.174;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:155:99:1403,0,1827 chrVIII 468936 . T C 2487 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.64;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2520,258,0 chrVIII 468962 . A G 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.755;DP=117;Dels=0.00;FS=9.415;HaplotypeScore=4.8020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1051,0,1321 chrVIII 469046 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.303;DP=148;Dels=0.00;FS=5.991;HaplotypeScore=4.7519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1374,0,1739 chrVIII 469211 . C T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.839;DP=131;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=4.6411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.575;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1429,0,1124 chrVIII 469214 . C T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.437;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.027;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1380,0,1202 chrVIII 469259 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.331;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1328,0,1462 chrVIII 469286 . T C 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.262;DP=138;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.440;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1300,0,1560 chrVIII 469438 . C G 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.789;DP=103;Dels=0.00;FS=1.595;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.176;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:866,0,1225 chrVIII 469510 . T A 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.007;DP=108;Dels=0.00;FS=15.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.031;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:911,0,1409 chrVIII 469573 . A C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.130;DP=134;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.468;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1429,0,1346 chrVIII 469598 . G A 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.991;DP=130;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.266;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:130:99:1479,0,1101 chrVIII 469661 . A G 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3445,363,0 chrVIII 469751 . T C 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.639;DP=137;Dels=0.00;FS=2.258;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.240;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1531,0,1284 chrVIII 469787 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.750;DP=109;Dels=0.00;FS=8.959;HaplotypeScore=3.3196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.313;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1090,0,1192 chrVIII 469805 . A G 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.732;DP=114;Dels=0.00;FS=5.846;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=9.56;ReadPosRankSum=-2.111;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1120,0,1199 chrVIII 469813 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.592;DP=114;Dels=0.00;FS=7.248;HaplotypeScore=3.2215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.607;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1163,0,1221 chrVIII 469995 . T C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.462;DP=146;Dels=0.00;FS=4.047;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.803;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1128,0,1832 chrVIII 470052 . A G 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.597;DP=136;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.149;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1538,0,1263 chrVIII 471244 . T C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;DP=118;Dels=0.00;FS=7.086;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.802;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1178,0,1232 chrVIII 471466 . C T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.594;DP=120;Dels=0.00;FS=1.463;HaplotypeScore=2.9413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:120:99:1239,0,1093 chrVIII 472560 . T A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.264;DP=113;Dels=0.00;FS=2.931;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1250,0,1157 chrVIII 472675 . A C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.228;DP=127;Dels=0.00;FS=7.311;HaplotypeScore=10.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=3.705;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.246;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1117,0,1385 chrVIII 472879 . A G 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.235;DP=94;Dels=0.00;FS=1.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.051;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:1088,0,827 chrVIII 473100 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;DP=110;Dels=0.00;FS=9.298;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=1;MQRankSum=-0.258;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1093,0,1179 chrVIII 473884 . A G 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3818,414,0 chrVIII 474166 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.864;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.640;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1160,0,1642 chrVIII 474210 . T C 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3032,312,0 chrVIII 474258 . G A 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.436;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.357;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1081,0,980 chrVIII 474449 . C G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;DP=127;Dels=0.00;FS=2.437;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1315,0,1291 chrVIII 474485 . C G 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;DP=128;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.635;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1574,0,1142 chrVIII 474521 . T A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;DP=110;Dels=0.00;FS=6.151;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.632;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,65:110:99:1409,0,931 chrVIII 474537 . A G 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=108;Dels=0.00;FS=6.301;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.056;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:903,0,1402 chrVIII 474566 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;DP=118;Dels=0.00;FS=11.532;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1270,0,1146 chrVIII 475005 . T C 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;DP=101;Dels=0.00;FS=3.781;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.241;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1056,0,998 chrVIII 475158 . T C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.827;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.641;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1061,0,1071 chrVIII 475895 . G A 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.067;DP=114;Dels=0.00;FS=3.717;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=12.80;ReadPosRankSum=1.299;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,69:114:99:1489,0,839 chrVIII 476842 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.079;DP=156;Dels=0.00;FS=11.678;HaplotypeScore=3.9563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.068;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1451,0,1581 chrVIII 476872 . G A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.618;DP=145;Dels=0.00;FS=10.666;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1364,0,1635 chrVIII 476968 . A C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.320;DP=126;Dels=0.00;FS=9.883;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=1;MQRankSum=-0.382;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1525,0,1134 chrVIII 477096 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.874;DP=144;Dels=0.00;FS=3.435;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1452,0,1506 chrVIII 477127 . A T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.609;DP=117;Dels=0.00;FS=7.896;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=10.27;ReadPosRankSum=2.036;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1231,0,1263 chrVIII 477340 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.051;DP=149;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:149:99:1400,0,1644 chrVIII 477370 . C T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.047;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.552;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1147,0,1338 chrVIII 477509 . A G 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.494;DP=114;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=3.2149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.479;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:901,0,1438 chrVIII 477510 . A G 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;DP=116;Dels=0.00;FS=3.534;HaplotypeScore=4.4703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:933,0,1376 chrVIII 477792 . C T 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;DP=147;Dels=0.00;FS=7.368;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.909;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1487,0,1577 chrVIII 477793 . C A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.285;DP=151;Dels=0.00;FS=7.217;HaplotypeScore=5.9508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.602;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.212;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1487,0,1647 chrVIII 477824 . C T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.117;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.965;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1372,0,1401 chrVIII 477970 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;DP=137;Dels=0.00;FS=5.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.687;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1346,0,1548 chrVIII 478429 . A T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.559;DP=154;Dels=0.00;FS=3.388;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.435;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:154:99:1425,0,1807 chrVIII 478458 . G A 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.060;DP=141;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1521,0,1490 chrVIII 478552 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.991;DP=107;Dels=0.00;FS=1.668;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=2.005;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1039,0,1199 chrVIII 478714 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;DP=151;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=3.3550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=9.61;ReadPosRankSum=2.016;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1481,0,1524 chrVIII 478873 . C T 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;DP=95;Dels=0.00;FS=8.203;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.108;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:826,0,1104 chrVIII 478875 . G A 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.177;DP=105;Dels=0.00;FS=2.520;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1006,0,1140 chrVIII 478978 . C T 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.173;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.087;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1241,0,1272 chrVIII 479113 . T C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.407;DP=122;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.924;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1084,0,1444 chrVIII 479158 . T G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.061;DP=128;Dels=0.00;FS=8.262;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.294;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1156,0,1454 chrVIII 479173 . A G 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.997;DP=111;Dels=0.00;FS=7.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.533;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:1003,0,1404 chrVIII 479278 . G A 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.212;DP=120;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1363,0,1113 chrVIII 479389 . G A 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.510;DP=160;Dels=0.00;FS=3.694;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=10.14;ReadPosRankSum=2.080;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1652,0,1658 chrVIII 480127 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.807;DP=151;Dels=0.00;FS=2.037;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=8.70;ReadPosRankSum=2.975;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1343,0,1655 chrVIII 480214 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.786;DP=132;Dels=0.00;FS=5.286;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.723;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1216,0,1578 chrVIII 480301 . T G 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.808;DP=137;Dels=0.00;FS=2.155;HaplotypeScore=2.3070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.946;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1310,0,1556 chrVIII 480415 . G A 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.031;DP=148;Dels=0.00;FS=2.132;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=11.18;ReadPosRankSum=4.508;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1685,0,1416 chrVIII 480491 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.735;DP=105;Dels=0.00;FS=3.595;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.644;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1088,0,1080 chrVIII 480863 . A G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.263;DP=117;Dels=0.00;FS=4.806;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.128;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1101,0,1308 chrVIII 481169 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.152;DP=119;Dels=0.00;FS=5.831;HaplotypeScore=5.2198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1402,0,1039 chrVIII 481190 . G T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.566;DP=124;Dels=0.00;FS=4.681;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.121;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1359,0,1129 chrVIII 481335 . T C 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;DP=153;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=1;MQRankSum=0.482;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1314,0,1704 chrVIII 481403 . C T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;DP=135;Dels=0.00;FS=4.081;HaplotypeScore=4.3024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1134,0,1586 chrVIII 481437 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.179;DP=153;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.422;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,64:153:99:1173,0,1996 chrVIII 481494 . G C 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.137;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,80:168:99:1551,0,1933 chrVIII 481553 . A G 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;DP=150;Dels=0.00;FS=5.089;HaplotypeScore=3.8142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:150:99:1650,0,1484 chrVIII 481687 . C T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;DP=135;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=4.4303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1311,0,1492 chrVIII 481690 . C A 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.969;DP=132;Dels=0.00;FS=2.460;HaplotypeScore=3.4387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.895;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1283,0,1443 chrVIII 481787 . G A 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.539;DP=141;Dels=0.00;FS=13.844;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1447,0,1647 chrVIII 481932 . G A 1876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;DP=174;Dels=0.00;FS=6.381;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.537;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,90:174:99:1906,0,1795 chrVIII 481975 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;DP=157;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=4.2026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.295;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1529,0,1751 chrVIII 482275 . T G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;DP=162;Dels=0.00;FS=2.103;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,76:162:99:1416,0,1851 chrVIII 482326 . T C 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.974;DP=139;Dels=0.00;FS=3.292;HaplotypeScore=2.5114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.495;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,53:139:99:961,0,1867 chrVIII 482614 . A G 1879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.711;DP=190;Dels=0.00;FS=9.465;HaplotypeScore=3.8127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=9.89;ReadPosRankSum=2.104;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,96:190:99:1909,0,1944 chrVIII 482671 . G A 2149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.808;DP=194;Dels=0.00;FS=3.263;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.699;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,105:194:99:2179,0,1783 chrVIII 482776 . A G 4368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.40;SB=-2.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4368,462,0 chrVIII 482818 . G A 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.920;DP=147;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=3.0659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.319;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,83:147:99:1848,0,1303 chrVIII 482896 . C G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;DP=144;Dels=0.00;FS=2.996;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.843;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1381,0,1612 chrVIII 483007 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.174;DP=128;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,76:128:99:1406,0,1081 chrVIII 483130 . A G 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3468,369,0 chrVIII 483190 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.563;DP=140;Dels=0.00;FS=2.142;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1319,0,1479 chrVIII 483220 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.609;DP=133;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1163,0,1474 chrVIII 483295 . A G 2221 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5135;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.96;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2254,237,0 chrVIII 483396 . A C 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3489,351,0 chrVIII 483435 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.804;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.653;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1187,0,978 chrVIII 483472 . A G 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.978;DP=92;Dels=0.00;FS=5.382;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:92:99:815,0,834 chrVIII 483796 . T C 4274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4274,444,0 chrVIII 483978 . A G 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;DP=162;Dels=0.00;FS=7.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=9.53;ReadPosRankSum=-2.587;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:162:99:1574,0,1570 chrVIII 484007 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.391;DP=141;Dels=0.00;FS=5.167;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1532,0,1417 chrVIII 484023 . G C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.434;DP=159;Dels=0.00;FS=4.926;HaplotypeScore=2.8069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.898;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,67:159:99:1266,0,1876 chrVIII 484057 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.782;DP=173;Dels=0.00;FS=6.798;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,73:173:99:1430,0,1983 chrVIII 484090 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.243;DP=167;Dels=0.00;FS=1.954;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.822;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,77:167:99:1457,0,1907 chrVIII 484091 . A T 1927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=165;Dels=0.00;FS=2.778;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.616;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,89:165:99:1957,0,1479 chrVIII 484159 . T C 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.853;DP=161;Dels=0.00;FS=3.649;HaplotypeScore=6.4686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.833;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1512,0,1644 chrVIII 484312 . A T 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.634;DP=160;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1761,0,1692 chrVIII 484477 . T C 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.154;DP=163;Dels=0.00;FS=2.068;HaplotypeScore=3.7317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.560;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,84:163:99:1735,0,1661 chrVIII 485324 . A G 1184.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.698;DP=113;Dels=0.00;FS=3.453;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.522;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1214,0,1104 chrVIII 485331 . A G 1092.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.397;DP=113;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.370;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1122,0,1235 chrVIII 485332 . A T 1111.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;DP=113;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.571;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1141,0,1216 chrVIII 485522 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.589;DP=111;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.056;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1290,0,1060 chrVIII 485700 . G A 4579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4579,466,0 chrVIII 485969 . G A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;DP=111;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=6.5877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.735;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1212,0,1099 chrVIII 485972 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.433;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.5035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.098;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1303,0,1127 chrVIII 486077 . T C 1802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.730;DP=178;Dels=0.00;FS=3.791;HaplotypeScore=5.6240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=10.12;ReadPosRankSum=-2.444;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,91:178:99:1832,0,1761 chrVIII 486368 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.087;DP=111;Dels=0.00;FS=1.564;HaplotypeScore=3.5355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.724;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:111:99:911,0,1273 chrVIII 486776 . A T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.334;DP=139;Dels=0.00;FS=2.183;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.338;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1445,0,1529 chrVIII 487008 . A T 2120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.211;DP=195;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.692;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,106:195:99:2150,0,1819 chrVIII 487308 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;DP=132;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1378,0,1399 chrVIII 487338 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;DP=118;Dels=0.00;FS=7.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.283;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1112,0,1427 chrVIII 488047 . C T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.918;DP=147;Dels=0.00;FS=1.295;HaplotypeScore=5.9288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.162;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1458,0,1526 chrVIII 488330 . T C 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.869;DP=149;Dels=0.00;FS=29.922;HaplotypeScore=4.1089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.564;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1576,0,1449 chrVIII 488383 . C A 580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.899;DP=129;Dels=0.05;FS=7.809;HaplotypeScore=18.4191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:610,0,1118 chrVIII 488425 . C A 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.985;DP=103;Dels=0.00;FS=1.576;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.612;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.991;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1025,0,872 chrVIII 488458 . A C 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.386;DP=127;Dels=0.00;FS=3.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.360;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,76:127:99:1531,0,1090 chrVIII 488465 . A C 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.241;DP=140;Dels=0.00;FS=3.099;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,84:140:99:1724,0,1165 chrVIII 488588 . G A 1914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.140;DP=150;Dels=0.00;FS=3.135;HaplotypeScore=4.5292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,90:150:99:1944,0,1141 chrVIII 488773 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.777;DP=131;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=4.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=2.312;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1110,0,1535 chrVIII 489580 . T C 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.889;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.83;ReadPosRankSum=2.171;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1288,0,1404 chrVIII 489755 . C T 1996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.081;DP=179;Dels=0.00;FS=5.284;HaplotypeScore=3.9508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.056;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,94:179:99:2026,0,1713 chrVIII 490123 . T C 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.112;DP=127;Dels=0.00;FS=3.279;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:971,0,1578 chrVIII 490956 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.405;DP=136;Dels=0.00;FS=1.418;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1201,0,1513 chrVIII 491018 . A G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.597;DP=152;Dels=0.00;FS=3.079;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.487;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1233,0,1797 chrVIII 491126 . G T 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.474;DP=161;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=7.6637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.631;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1766,0,1563 chrVIII 492468 . T C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;DP=125;Dels=0.00;FS=4.744;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1124,0,1482 chrVIII 492752 . A G 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.492;DP=131;Dels=0.00;FS=9.849;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.542;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1406,0,1326 chrVIII 493139 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.718;DP=102;Dels=0.00;FS=1.671;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1132,0,1001 chrVIII 495688 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.868;DP=148;Dels=0.00;FS=3.892;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.225;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,65:148:99:1312,0,1847 chrVIII 495830 . A G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.707;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1170,0,1359 chrVIII 496664 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.115;DP=116;Dels=0.00;FS=3.441;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.079;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1420,0,1000 chrVIII 496972 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;DP=149;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=3.9391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.671;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1472,0,1580 chrVIII 497237 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.218;DP=123;Dels=0.00;FS=6.813;HaplotypeScore=3.7565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.908;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1341,0,1204 chrVIII 497476 . T C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;DP=133;Dels=0.00;FS=12.793;HaplotypeScore=3.4839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.187;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:133:99:1541,0,1180 chrVIII 497907 . A G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.700;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=8.03;ReadPosRankSum=2.394;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:129:99:1066,0,1608 chrVIII 498021 . T C 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.356;DP=188;Dels=0.00;FS=6.753;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.485;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,95:188:99:1899,0,1906 chrVIII 498433 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.850;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:141:99:1290,0,1460 chrVIII 498753 . G A 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.892;DP=108;Dels=0.00;FS=4.968;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.782;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.506;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:991,0,1294 chrVIII 498861 . G A 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.842;DP=152;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.045;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.385;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1686,0,1387 chrVIII 498868 . A T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.273;DP=140;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1445,0,1474 chrVIII 499040 . A G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.397;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.075;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1371,0,1426 chrVIII 499459 . A G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.215;DP=133;Dels=0.00;FS=5.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.476;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.138;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1252,0,1503 chrVIII 499676 . G T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.049;DP=153;Dels=0.00;FS=4.871;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.064;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1560,0,1576 chrVIII 500211 . A G 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.023;DP=134;Dels=0.00;FS=6.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.344;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,51:134:99:973,0,1889 chrVIII 500294 . G A 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.424;DP=123;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.153;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,44:123:99:825,0,1766 chrVIII 500928 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;DP=132;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=4.8033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=1;MQRankSum=-0.496;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.104;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1464,0,1292 chrVIII 501881 . A C 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;DP=133;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1540,0,1244 chrVIII 501912 . A G 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.75;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2904,300,0 chrVIII 502369 . G A 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.328;DP=123;Dels=0.00;FS=4.917;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-4.063;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.762;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:911,0,1484 chrVIII 502447 . G A 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3459,342,0 chrVIII 502641 . G A 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2879,288,0 chrVIII 502645 . G T 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.303;DP=116;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.057;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,45:116:99:859,0,1438 chrVIII 503516 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1036,0,988 chrVIII 503518 . C T 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.364;DP=98;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1018,0,955 chrVIII 504196 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.191;DP=122;Dels=0.00;FS=3.329;HaplotypeScore=11.4717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.081;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1377,0,1189 chrVIII 504926 . G A 1403.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.933;DP=94;Dels=0.00;FS=6.537;HaplotypeScore=1.9203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=9;MQRankSum=5.812;QD=14.93;ReadPosRankSum=2.527;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,62:94:26:1433,0,26 chrVIII 504953 . G A 561.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.936;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.94;MQ0=6;MQRankSum=-1.854;QD=5.39;ReadPosRankSum=-1.436;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:591,0,1296 chrVIII 505427 . T G 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.581;DP=115;Dels=0.00;FS=3.283;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.618;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2915,318,0 chrVIII 505687 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;DP=142;Dels=0.00;FS=2.953;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1541,0,1377 chrVIII 505776 . G T 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.031;DP=129;Dels=0.00;FS=7.997;HaplotypeScore=5.1078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1213,0,1367 chrVIII 505979 . C T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.978;DP=110;Dels=0.00;FS=2.474;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.012;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1243,0,962 chrVIII 506142 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;DP=154;Dels=0.00;FS=12.094;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.342;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1424,0,1744 chrVIII 506159 . T C 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.327;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.0374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,85:167:99:1738,0,1649 chrVIII 506267 . T C 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;DP=123;Dels=0.00;FS=11.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.117;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:881,0,1585 chrVIII 506331 . T C 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.443;DP=139;Dels=0.00;FS=7.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.881;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,55:139:99:957,0,1908 chrVIII 506423 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.109;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.188;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1475,0,1395 chrVIII 506680 . G C 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;DP=138;Dels=0.00;FS=2.154;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.046;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1515,0,1366 chrVIII 506773 . C T 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.532;DP=134;Dels=0.00;FS=2.416;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1245,0,1527 chrVIII 506933 . A T 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1131,0,1433 chrVIII 507096 . T G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.073;DP=133;Dels=0.00;FS=5.303;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=10.18;ReadPosRankSum=2.325;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1384,0,1370 chrVIII 507449 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.439;DP=128;Dels=0.00;FS=15.910;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1275,0,1464 chrVIII 507860 . T C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.254;DP=132;Dels=0.00;FS=5.622;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,52:132:99:1022,0,1713 chrVIII 507863 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.250;DP=139;Dels=0.00;FS=4.247;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,54:139:99:1039,0,1858 chrVIII 508115 . T A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;DP=127;Dels=0.00;FS=2.305;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1416,0,1319 chrVIII 508373 . G A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;DP=118;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.071;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1407,0,1072 chrVIII 508535 . C T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;DP=144;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1517,0,1405 chrVIII 508646 . G A 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.602;DP=154;Dels=0.00;FS=1.279;HaplotypeScore=4.7144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=1.503;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1735,0,1508 chrVIII 508754 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.967;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=1.343;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.295;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1163,0,1367 chrVIII 509257 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;DP=118;Dels=0.00;FS=5.672;HaplotypeScore=2.4595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.025;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1203,0,1180 chrVIII 509478 . A G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.749;DP=118;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1307,0,1072 chrVIII 509492 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.369;DP=136;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=3.7610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=1.921;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.688;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1217,0,1478 chrVIII 509537 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.835;DP=147;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=16.2441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.915;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.080;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1381,0,1533 chrVIII 509653 . G A 98.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=150;Dels=0.00;FS=37.606;HaplotypeScore=3.2869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-3.435;QD=0.65;ReadPosRankSum=2.412;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,39:150:99:128,0,2442 chrVIII 510285 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.050;DP=113;Dels=0.00;FS=2.409;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1167,0,1199 chrVIII 510388 . A G 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3837,396,0 chrVIII 510826 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.121;DP=134;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.496;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1314,0,1455 chrVIII 510985 . T C 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.545;DP=123;Dels=0.00;FS=5.681;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=9.41;ReadPosRankSum=2.137;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1188,0,1321 chrVIII 512241 . T C 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.814;DP=124;Dels=0.00;FS=2.907;HaplotypeScore=4.6383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.390;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:124:99:609,0,1319 chrVIII 512283 . A T 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.172;DP=132;Dels=0.00;FS=9.739;HaplotypeScore=3.3594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=7.70;ReadPosRankSum=3.611;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1046,0,1443 chrVIII 512489 . C T 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.751;DP=120;Dels=0.00;FS=3.486;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=1;MQRankSum=2.049;QD=9.57;ReadPosRankSum=2.416;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1178,0,1274 chrVIII 512521 . C G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.089;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1178,0,1136 chrVIII 512746 . C T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.146;DP=123;Dels=0.00;FS=9.902;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1240,0,1282 chrVIII 513025 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.909;DP=140;Dels=0.00;FS=3.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=1;MQRankSum=-0.099;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1334,0,1578 chrVIII 513034 . T C 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.657;DP=149;Dels=0.00;FS=2.949;HaplotypeScore=4.9584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=1;MQRankSum=1.312;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.035;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1423,0,1636 chrVIII 513526 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.926;DP=126;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.298;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1291,0,1255 chrVIII 513634 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.443;DP=158;Dels=0.00;FS=5.742;HaplotypeScore=2.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:1430,0,1843 chrVIII 514601 . A T 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.715;DP=109;Dels=0.00;FS=22.076;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:857,0,1283 chrVIII 514870 . A G 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.814;DP=91;Dels=0.00;FS=6.120;HaplotypeScore=16.6382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=2.193;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.564;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:930,0,777 chrVIII 515104 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.996;DP=107;Dels=0.00;FS=15.337;HaplotypeScore=3.7044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.139;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:107:99:1124,0,1049 chrVIII 516015 . T G 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3431,354,0 chrVIII 516108 . G A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;DP=97;Dels=0.00;FS=2.682;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1130,0,936 chrVIII 516468 . T C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.486;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=12.03;ReadPosRankSum=-2.138;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,74:126:99:1546,0,1032 chrVIII 516618 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.975;DP=130;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.042;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.654;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1386,0,1316 chrVIII 516779 . G A 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.67;SB=-2.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3748,379,0 chrVIII 516811 . G A 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3208,336,0 chrVIII 516852 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.334;DP=125;Dels=0.00;FS=4.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.983;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1396,0,1259 chrVIII 517336 . C T 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3566,369,0 chrVIII 517375 . A G 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;DP=159;Dels=0.00;FS=2.768;HaplotypeScore=3.5601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.626;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:159:99:1680,0,1450 chrVIII 518179 . C T 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5130;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3254,330,0 chrVIII 518458 . G A 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3670,376,0 chrVIII 518542 . C G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;DP=129;Dels=0.00;FS=12.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.356;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1135,0,1407 chrVIII 518911 . T C 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3235,333,0 chrVIII 518945 . A G 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3900,408,0 chrVIII 519006 . G A 2504 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.15;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2537,264,0 chrVIII 519007 . T A 1006.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.600;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.055;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1036,0,1028 chrVIII 519013 . G A 2515 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.10;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2548,264,0 chrVIII 519077 . T A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.711;DP=140;Dels=0.00;FS=13.289;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQ0=0;MQRankSum=5.426;QD=7.00;ReadPosRankSum=2.118;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:140:99:1010,0,1304 chrVIII 519115 . A G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.284;DP=146;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=2.5186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.65;MQ0=0;MQRankSum=-4.869;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1066,0,1360 chrVIII 519116 . G A 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.247;DP=147;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=2.5186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.70;MQ0=0;MQRankSum=-4.924;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1099,0,1344 chrVIII 519144 . A G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.294;DP=131;Dels=0.00;FS=11.174;HaplotypeScore=2.7413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.70;MQ0=0;MQRankSum=-5.209;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.979;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1215,0,1302 chrVIII 519146 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;DP=138;Dels=0.00;FS=13.996;HaplotypeScore=2.7413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-6.278;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.680;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1326,0,1353 chrVIII 519219 . A C 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.444;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=3.319;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.854;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,83:160:99:1768,0,1296 chrVIII 519230 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.010;DP=159;Dels=0.00;FS=4.922;HaplotypeScore=5.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.971;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1354,0,1730 chrVIII 519269 . T C 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3853,394,0 chrVIII 519381 . C G 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3406,381,0 chrVIII 519408 . C A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.163;DP=157;Dels=0.00;FS=1.998;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.560;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1498,0,1692 chrVIII 519425 . G C 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.117;DP=162;Dels=0.00;FS=5.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.743;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,74:162:99:1477,0,1915 chrVIII 519587 . A G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.671;DP=117;Dels=0.00;FS=7.149;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.156;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1325,0,1117 chrVIII 519988 . T C 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.871;DP=113;Dels=0.00;FS=3.407;HaplotypeScore=2.6851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:113:99:1019,0,1229 chrVIII 520065 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;DP=118;Dels=0.00;FS=22.608;HaplotypeScore=6.5742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=9.68;ReadPosRankSum=-2.079;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1172,0,1259 chrVIII 520123 . C G 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3012,315,0 chrVIII 520239 . A T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=108;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1218,0,1096 chrVIII 520242 . G T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.926;DP=109;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1246,0,1071 chrVIII 520634 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.610;DP=120;Dels=0.00;FS=2.463;HaplotypeScore=3.6071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=2.151;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.087;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:120:99:1275,0,1163 chrVIII 521047 . G A 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=59.3159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3090,312,0 chrVIII 521515 . T C 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.732;DP=182;Dels=0.00;FS=1.144;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.056;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,82:182:99:1547,0,2049 chrVIII 522136 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.604;DP=154;Dels=0.00;FS=9.950;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.429;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1485,0,1690 chrVIII 522772 . A C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.012;DP=140;Dels=0.00;FS=5.185;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.024;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1355,0,1507 chrVIII 522950 . C T 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.626;DP=110;Dels=0.00;FS=1.610;HaplotypeScore=6.6741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=1.767;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:703,0,1151 chrVIII 523665 . T C 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;DP=96;Dels=0.00;FS=3.896;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:886,0,1194 chrVIII 523907 . A G 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.514;DP=128;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=5.9463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.575;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1157,0,1528 chrVIII 524455 . A G 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.561;DP=92;Dels=0.00;FS=1.724;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:898,0,1015 chrVIII 524850 . C G 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.550;DP=67;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,32:67:99:660,0,672 chrVIII 524864 . A T 650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,33:62:99:680,0,592 chrVIII 525056 . T C 472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.575;DP=102;Dels=0.00;FS=1.629;HaplotypeScore=18.8574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.423;QD=4.63;ReadPosRankSum=-4.032;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:502,0,1193 chrVIII 525065 . C G 566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.487;DP=114;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=25.7982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.402;QD=4.96;ReadPosRankSum=-4.082;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:596,0,1352 chrVIII 525074 . C A 348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.087;DP=117;Dels=0.00;FS=8.605;HaplotypeScore=23.8397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.69;MQ0=0;MQRankSum=-5.937;QD=2.97;ReadPosRankSum=-6.922;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,24:117:99:378,0,1696 chrVIII 525242 . T C 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.365;DP=128;Dels=0.00;FS=7.925;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.066;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1489,0,1266 chrVIII 525297 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;DP=105;Dels=0.00;FS=13.885;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.990;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1115,0,1152 chrVIII 525401 . G A 637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;DP=74;Dels=0.00;FS=1.007;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.83;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:667,0,731 chrVIII 525441 . C A 782.04 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=50;Dels=0.00;FS=62.803;HaplotypeScore=5.8603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;MQRankSum=2.196;QD=15.64;ReadPosRankSum=3.121;SB=-4.984e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,44:50:23:815,23,0 chrVIII 525442 . A G 749.04 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;DP=50;Dels=0.00;FS=72.011;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;MQRankSum=2.642;QD=14.98;ReadPosRankSum=3.299;SB=-4.984e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,44:50:23:782,23,0 chrVIII 525446 . A C 732.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.558;DP=61;Dels=0.00;FS=121.459;HaplotypeScore=5.8404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.783;QD=12.00;ReadPosRankSum=3.983;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,48:61:99:762,0,166 chrVIII 525451 . T C 653.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.027;DP=66;Dels=0.00;FS=137.017;HaplotypeScore=7.7079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.88;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.525;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,49:66:99:683,0,245 chrVIII 525454 . G A 688.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.054;DP=60;Dels=0.00;FS=128.098;HaplotypeScore=7.7010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.745;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,42:60:99:718,0,243 chrVIII 525457 . C A 658.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.471;DP=58;Dels=0.00;FS=130.404;HaplotypeScore=8.6168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.03;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.824;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,40:58:99:688,0,267 chrVIII 525464 . G A 172.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;DP=36;Dels=0.03;FS=80.645;HaplotypeScore=44.0818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.44;MQ0=1;MQRankSum=0.416;QD=4.78;ReadPosRankSum=3.156;SB=-2.948e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:202,0,360 chrVIII 525465 . C G 151.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;DP=44;Dels=0.00;FS=94.004;HaplotypeScore=32.4011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.04;MQ0=4;MQRankSum=0.391;QD=3.43;ReadPosRankSum=3.492;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:181,0,453 chrVIII 525466 . C T 134.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;DP=45;Dels=0.00;FS=78.429;HaplotypeScore=32.4011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.71;MQ0=5;MQRankSum=0.274;QD=2.98;ReadPosRankSum=3.623;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:45:99:164,0,451 chrVIII 525468 . C T 21.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;DP=45;Dels=0.00;FS=37.764;HaplotypeScore=31.4277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.71;MQ0=5;MQRankSum=0.558;QD=0.47;ReadPosRankSum=2.790;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,8:45:51:51,0,587 chrVIII 525469 . A G 10.42 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.311;DP=45;Dels=0.00;FS=37.764;HaplotypeScore=31.5070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.71;MQ0=5;MQRankSum=-0.085;QD=0.23;ReadPosRankSum=2.790;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,8:45:40:40,0,595 chrVIII 525470 . G C 19.06 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;DP=46;Dels=0.00;FS=32.121;HaplotypeScore=31.5070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.38;MQ0=6;MQRankSum=0.605;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.712;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,7:46:49:49,0,589 chrVIII 525472 . G A 158.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;DP=46;Dels=0.00;FS=94.004;HaplotypeScore=29.5602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.38;MQ0=6;MQRankSum=0.615;QD=3.43;ReadPosRankSum=2.738;SB=-2.948e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:188,0,457 chrVIII 525475 . G A 166.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.453;DP=50;Dels=0.00;FS=81.689;HaplotypeScore=122.7432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.22;MQ0=7;MQRankSum=-0.160;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.933;SB=-8.884e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:196,0,432 chrVIII 525479 . T C 158.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.230;DP=53;Dels=0.00;FS=72.712;HaplotypeScore=117.6603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.50;MQ0=7;MQRankSum=-0.236;QD=2.98;ReadPosRankSum=2.127;SB=-6.502e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:188,0,537 chrVIII 525481 . A G 148.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;DP=54;Dels=0.00;FS=66.005;HaplotypeScore=111.7095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.38;MQ0=7;MQRankSum=-0.492;QD=2.74;ReadPosRankSum=1.915;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:178,0,546 chrVIII 525483 . C T 135.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.434;DP=60;Dels=0.00;FS=25.044;HaplotypeScore=129.5435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.34;MQ0=7;MQRankSum=0.217;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.155;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:165,0,566 chrVIII 525486 . C A 31.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;DP=59;Dels=0.00;FS=45.798;HaplotypeScore=73.1640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.35;MQ0=7;MQRankSum=0.340;QD=0.53;ReadPosRankSum=2.345;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,8:59:61:61,0,554 chrVIII 525487 . A T 10.42 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;DP=59;Dels=0.00;FS=41.139;HaplotypeScore=73.1640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.35;MQ0=7;MQRankSum=0.175;QD=0.18;ReadPosRankSum=2.385;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:59:40:40,0,563 chrVIII 525491 . C G 18.07 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.056;DP=63;Dels=0.00;FS=21.996;HaplotypeScore=74.1374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.33;MQ0=7;MQRankSum=-0.831;QD=0.29;ReadPosRankSum=1.674;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,8:63:48:48,0,658 chrVIII 525493 . G A 27.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.324;DP=62;Dels=0.02;FS=21.984;HaplotypeScore=83.8714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.33;MQ0=7;MQRankSum=-0.524;QD=0.44;ReadPosRankSum=1.205;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,8:61:57:57,0,662 chrVIII 525495 . G A 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.735;DP=65;Dels=0.00;FS=21.996;HaplotypeScore=61.3273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.87;MQ0=9;MQRankSum=0.105;QD=0.40;ReadPosRankSum=1.206;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,8:65:56:56,0,659 chrVIII 525496 . G A 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;DP=65;Dels=0.00;FS=21.996;HaplotypeScore=61.3273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.87;MQ0=9;MQRankSum=0.012;QD=0.40;ReadPosRankSum=1.206;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,8:65:56:56,0,664 chrVIII 525501 . G A 110.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;DP=85;Dels=0.00;FS=131.455;HaplotypeScore=70.2066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.90;MQ0=9;MQRankSum=-0.652;QD=1.29;ReadPosRankSum=-6.533;SB=-2.909e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,47:85:99:140,0,548 chrVIII 525502 . T C 87.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=85;Dels=0.00;FS=147.403;HaplotypeScore=71.1800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.90;MQ0=9;MQRankSum=0.345;QD=1.02;ReadPosRankSum=-6.328;SB=-2.847e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,46:85:99:117,0,540 chrVIII 525505 . G A 115.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;DP=87;Dels=0.00;FS=146.636;HaplotypeScore=71.2701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.90;MQ0=9;MQRankSum=-0.026;QD=1.32;ReadPosRankSum=-6.902;SB=-2.847e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:87:99:145,0,552 chrVIII 525511 . T C 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;DP=89;Dels=0.00;FS=68.029;HaplotypeScore=54.5763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.91;MQ0=9;MQRankSum=0.643;QD=0.55;ReadPosRankSum=-5.691;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:79:79,0,634 chrVIII 525514 . A C 59.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;DP=89;Dels=0.00;FS=120.147;HaplotypeScore=72.4449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.91;MQ0=9;MQRankSum=0.289;QD=0.66;ReadPosRankSum=-5.923;SB=-4.795e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:89:89:89,0,558 chrVIII 525517 . T C 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.751;DP=89;Dels=0.00;FS=67.931;HaplotypeScore=53.6467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.85;MQ0=10;MQRankSum=0.884;QD=0.55;ReadPosRankSum=-1.064;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:79:79,0,641 chrVIII 525523 . C T 139.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.053;DP=90;Dels=0.00;FS=151.355;HaplotypeScore=53.6467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.85;MQ0=10;MQRankSum=-0.030;QD=1.54;ReadPosRankSum=-4.264;SB=-3.003e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,51:90:99:169,0,545 chrVIII 525526 . G A 52.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.282;DP=92;Dels=0.00;FS=71.840;HaplotypeScore=35.7722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.64;MQ0=11;MQRankSum=-0.024;QD=0.57;ReadPosRankSum=2.148;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,33:92:82:82,0,626 chrVIII 525530 . T A 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.458;DP=73;Dels=0.00;FS=112.130;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.64;MQ0=11;MQRankSum=0.655;QD=0.44;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-6.514e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:62:62,0,613 chrVIII 525556 . G A 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.823;DP=71;Dels=0.00;FS=46.256;HaplotypeScore=26.7246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.43;MQ0=11;MQRankSum=1.488;QD=0.30;ReadPosRankSum=1.123;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:71:51:51,0,386 chrVIII 525577 . T C 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.381;DP=65;Dels=0.00;FS=28.057;HaplotypeScore=21.7498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.79;MQ0=5;MQRankSum=1.395;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.993;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,11:65:73:73,0,784 chrVIII 525578 . G C 156.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;DP=66;Dels=0.00;FS=11.823;HaplotypeScore=32.6291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.64;MQ0=5;MQRankSum=2.911;QD=2.36;ReadPosRankSum=2.403;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,27:66:99:186,0,661 chrVIII 525579 . G A 163.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;DP=65;Dels=0.00;FS=11.752;HaplotypeScore=43.5002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.49;MQ0=5;MQRankSum=3.135;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.828;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:193,0,638 chrVIII 525593 . A G 101.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.894;DP=59;Dels=0.00;FS=5.817;HaplotypeScore=80.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.40;MQ0=3;MQRankSum=2.793;QD=1.71;ReadPosRankSum=2.491;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:131,0,659 chrVIII 525594 . C T 40.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;DP=59;Dels=0.00;FS=23.195;HaplotypeScore=91.7657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.40;MQ0=3;MQRankSum=1.629;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.011;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,11:59:70:70,0,733 chrVIII 525599 . C T 139.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.183;DP=63;Dels=0.00;FS=3.792;HaplotypeScore=70.4532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.45;MQ0=3;MQRankSum=2.512;QD=2.21;ReadPosRankSum=1.441;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,24:63:99:169,0,665 chrVIII 525601 . A G 137.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=77.3904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.50;MQ0=3;MQRankSum=2.366;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.019;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:167,0,671 chrVIII 525604 . T C 53.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.418;DP=69;Dels=0.00;FS=33.652;HaplotypeScore=88.8092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.50;MQ0=3;MQRankSum=0.726;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.806;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,13:69:83:83,0,752 chrVIII 525610 . C T 141.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;DP=70;Dels=0.00;FS=11.024;HaplotypeScore=85.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.50;MQ0=3;MQRankSum=2.768;QD=2.01;ReadPosRankSum=-2.528;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,30:70:99:171,0,678 chrVIII 525611 . G A 50.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.653;DP=70;Dels=0.00;FS=3.793;HaplotypeScore=85.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.50;MQ0=3;MQRankSum=1.940;QD=0.71;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:80:80,0,743 chrVIII 525613 . A T 85.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.403;DP=70;Dels=0.00;FS=8.019;HaplotypeScore=88.7308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.50;MQ0=3;MQRankSum=2.650;QD=1.21;ReadPosRankSum=-2.333;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:70:99:115,0,706 chrVIII 525616 . A G 47.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.487;DP=76;Dels=0.00;FS=36.022;HaplotypeScore=81.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.33;MQ0=3;MQRankSum=1.153;QD=0.62;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:77:77,0,858 chrVIII 525622 . T G 21.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.861;DP=70;Dels=0.00;FS=15.895;HaplotypeScore=65.5130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.38;MQ0=1;MQRankSum=1.681;QD=0.30;ReadPosRankSum=-1.697;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:70:51:51,0,902 chrVIII 525628 . T A 47.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.875;DP=74;Dels=0.00;FS=32.178;HaplotypeScore=79.4670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.25;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=0.64;ReadPosRankSum=-1.402;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:74:77:77,0,841 chrVIII 525631 . G T 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.285;DP=73;Dels=0.00;FS=18.353;HaplotypeScore=82.4528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.38;MQ0=0;MQRankSum=2.164;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.713;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:73:73:73,0,862 chrVIII 525634 . T C 93.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.990;DP=74;Dels=0.00;FS=3.571;HaplotypeScore=66.5587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.12;MQ0=2;MQRankSum=3.372;QD=1.26;ReadPosRankSum=-3.384;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:74:99:123,0,873 chrVIII 525635 . G A 94.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.300;DP=75;Dels=0.00;FS=3.618;HaplotypeScore=58.6111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.93;MQ0=3;MQRankSum=3.359;QD=1.25;ReadPosRankSum=-3.429;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:124,0,895 chrVIII 525637 . T C 30.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.966;DP=75;Dels=0.00;FS=27.867;HaplotypeScore=56.6131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.93;MQ0=3;MQRankSum=2.454;QD=0.40;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:60:60,0,955 chrVIII 525644 . A C 51.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;DP=80;Dels=0.00;FS=30.809;HaplotypeScore=55.5557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.99;MQ0=3;MQRankSum=1.354;QD=0.64;ReadPosRankSum=-0.981;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:81:81,0,985 chrVIII 525649 . C T 248.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;DP=74;Dels=0.00;FS=33.556;HaplotypeScore=31.7152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.92;MQ0=3;MQRankSum=1.018;QD=3.35;ReadPosRankSum=-2.221;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:74:99:278,0,702 chrVIII 525666 . G A 464.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=70;Dels=0.00;FS=30.846;HaplotypeScore=71.3691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.38;MQ0=7;MQRankSum=-2.406;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.372;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,33:70:99:494,0,264 chrVIII 525714 . A G 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;DP=80;Dels=0.00;FS=68.719;HaplotypeScore=42.4478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.82;MQ0=14;MQRankSum=2.005;QD=0.45;ReadPosRankSum=0.759;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,28:80:66:66,0,685 chrVIII 525730 . T C 59.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.887;DP=84;Dels=0.00;FS=28.969;HaplotypeScore=30.7619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.25;MQ0=14;MQRankSum=1.609;QD=0.70;ReadPosRankSum=-1.892;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:89:89,0,611 chrVIII 525733 . T C 65.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.068;DP=84;Dels=0.00;FS=29.555;HaplotypeScore=37.7124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.46;MQ0=13;MQRankSum=1.601;QD=0.77;ReadPosRankSum=-1.762;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,39:84:95:95,0,618 chrVIII 525736 . T C 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;DP=85;Dels=0.00;FS=87.448;HaplotypeScore=57.6004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.72;MQ0=12;MQRankSum=0.959;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,33:85:66:66,0,636 chrVIII 525744 . G C 66.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.525;DP=85;Dels=0.00;FS=29.044;HaplotypeScore=64.2538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.69;MQ0=12;MQRankSum=1.912;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.391;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:96:96,0,618 chrVIII 525746 . A G 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.275;DP=86;Dels=0.00;FS=80.988;HaplotypeScore=63.2622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.85;MQ0=12;MQRankSum=1.217;QD=0.30;ReadPosRankSum=-0.005;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,32:86:56:56,0,670 chrVIII 525749 . G T 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.143;DP=97;Dels=0.00;FS=94.377;HaplotypeScore=67.1645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.57;MQ0=14;MQRankSum=1.049;QD=0.36;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:65:65,0,710 chrVIII 525763 . T A 269.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;DP=90;Dels=0.00;FS=21.974;HaplotypeScore=33.6593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.25;MQ0=10;MQRankSum=2.263;QD=2.99;ReadPosRankSum=-1.085;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:90:99:299,0,592 chrVIII 525767 . T C 243.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;DP=87;Dels=0.00;FS=18.430;HaplotypeScore=36.6788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.01;MQ0=10;MQRankSum=1.128;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.393;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:273,0,621 chrVIII 525769 . A G 152.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;DP=88;Dels=0.00;FS=64.167;HaplotypeScore=46.6154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.64;MQ0=10;MQRankSum=-0.124;QD=1.73;ReadPosRankSum=1.660;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:88:99:182,0,714 chrVIII 525775 . T C 217.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.368;DP=92;Dels=0.00;FS=16.985;HaplotypeScore=35.7070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.39;MQ0=10;MQRankSum=-0.584;QD=2.36;ReadPosRankSum=1.261;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:247,0,726 chrVIII 525778 . C T 146.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.267;DP=98;Dels=0.00;FS=68.697;HaplotypeScore=47.5645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.39;MQ0=10;MQRankSum=-1.043;QD=1.49;ReadPosRankSum=2.086;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,33:98:99:176,0,881 chrVIII 525784 . T C 203.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.134;DP=99;Dels=0.00;FS=16.996;HaplotypeScore=37.5375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.74;MQ0=8;MQRankSum=-0.584;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.449;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:233,0,868 chrVIII 525787 . C T 42.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.173;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=38.4509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.32;MQ0=8;MQRankSum=0.555;QD=0.43;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,26:97:72:72,0,1057 chrVIII 525797 . G A 167.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.954;DP=89;Dels=0.00;FS=30.698;HaplotypeScore=66.5859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.01;MQ0=6;MQRankSum=-0.984;QD=1.88;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:197,0,927 chrVIII 525799 . A C 212.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;DP=90;Dels=0.00;FS=22.489;HaplotypeScore=49.8181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.40;MQ0=4;MQRankSum=-1.137;QD=2.36;ReadPosRankSum=-1.456;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:242,0,999 chrVIII 525803 . C T 122.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.421;DP=100;Dels=0.00;FS=36.759;HaplotypeScore=64.6328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.07;MQ0=4;MQRankSum=-2.769;QD=1.22;ReadPosRankSum=-0.863;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:100:99:152,0,1081 chrVIII 525811 . G A 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;DP=100;Dels=0.00;FS=3.989;HaplotypeScore=69.6748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.27;MQ0=3;MQRankSum=-0.754;QD=0.44;ReadPosRankSum=-2.273;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,17:100:74:74,0,1291 chrVIII 525820 . T C 497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.365;DP=102;Dels=0.00;FS=12.184;HaplotypeScore=44.2397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.20;MQ0=3;MQRankSum=-3.306;QD=4.87;ReadPosRankSum=-2.442;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:527,0,1019 chrVIII 525838 . G A 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.506;DP=118;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=29.4033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.28;MQ0=2;MQRankSum=-2.483;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.288;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:968,0,900 chrVIII 525868 . A G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.106;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=48.0869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.32;MQ0=0;MQRankSum=2.333;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:139:99:1079,0,1436 chrVIII 525877 . T C 632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.781;DP=147;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=48.0418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.318;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,46:147:99:662,0,2046 chrVIII 525889 . A G 573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.402;DP=145;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=13.5878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.36;MQ0=1;MQRankSum=-1.236;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,46:145:99:603,0,1917 chrVIII 525892 . C T 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=145;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=18.4727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.87;MQ0=1;MQRankSum=-2.060;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.496;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,50:145:99:712,0,1828 chrVIII 525946 . G A 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.961;DP=120;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=29.2255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.94;MQ0=3;MQRankSum=0.278;QD=6.95;ReadPosRankSum=2.487;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:864,0,1111 chrVIII 525958 . A C 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.079;DP=117;Dels=0.00;FS=0.970;HaplotypeScore=25.9286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.66;MQ0=3;MQRankSum=-2.258;QD=8.41;ReadPosRankSum=-3.642;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:1014,0,836 chrVIII 525980 . G C 1465 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.389;DP=82;Dels=0.00;FS=7.463;HaplotypeScore=26.5949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.17;MQ0=3;MQRankSum=2.855;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,75:82:99:1498,153,0 chrVIII 525986 . A T 153.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.898;DP=81;Dels=0.00;FS=9.605;HaplotypeScore=39.8414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.39;MQ0=2;MQRankSum=0.053;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.731;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:183,0,1032 chrVIII 525997 . C T 435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;DP=67;Dels=0.00;FS=12.605;HaplotypeScore=61.3227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.06;MQ0=1;MQRankSum=-0.545;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.187;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:465,0,557 chrVIII 526004 . A G 1053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=53.5342;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.46;MQ0=1;QD=18.47;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1086,117,0 chrVIII 526027 . A T 133.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;DP=51;Dels=0.00;FS=49.089;HaplotypeScore=13.6902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.30;MQ0=6;MQRankSum=-2.684;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.011;SB=-3.000e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:163,0,414 chrVIII 526030 . C T 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;DP=49;Dels=0.00;FS=56.767;HaplotypeScore=18.5801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.24;MQ0=6;MQRankSum=-0.942;QD=0.73;ReadPosRankSum=0.350;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:49:66:66,0,463 chrVIII 526032 . A T 99.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.095;DP=51;Dels=0.00;FS=47.813;HaplotypeScore=18.5859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.09;MQ0=6;MQRankSum=-3.803;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.834;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:129,0,522 chrVIII 526042 . G A 63.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.707;DP=57;Dels=0.00;FS=35.709;HaplotypeScore=9.5262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.44;MQ0=6;MQRankSum=-4.325;QD=1.11;ReadPosRankSum=-1.335;SB=-1.075e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:93:93,0,546 chrVIII 526043 . C A 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;DP=57;Dels=0.00;FS=35.709;HaplotypeScore=9.5256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.44;MQ0=6;MQRankSum=-4.534;QD=1.04;ReadPosRankSum=-1.713;SB=-1.275e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:89:89,0,589 chrVIII 526060 . C A 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;DP=63;Dels=0.00;FS=16.371;HaplotypeScore=5.5361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.01;MQ0=6;MQRankSum=-3.977;QD=0.57;ReadPosRankSum=-1.635;SB=-3.879e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:66:66,0,713 chrVIII 526188 . C A 1561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.346;DP=101;Dels=0.00;FS=6.966;HaplotypeScore=8.9279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.20;MQ0=0;MQRankSum=6.407;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,67:101:99:1594,142,0 chrVIII 526276 . C T 1440 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.234;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=24.0625;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.24;MQ0=1;MQRankSum=0.899;QD=14.69;ReadPosRankSum=1.331;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,91:98:77:1473,77,0 chrVIII 526301 . T C 1129 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.80;MQ0=1;QD=16.13;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1162,132,0 chrVIII 526302 . T C 1079 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.79;MQ0=1;QD=15.87;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1112,126,0 chrVIII 526309 . T C 1005 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;DP=68;Dels=0.00;FS=8.301;HaplotypeScore=17.5447;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=1;MQRankSum=3.114;QD=14.78;ReadPosRankSum=1.992;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,63:68:99:1038,123,0 chrVIII 526348 . C T 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;DP=65;Dels=0.00;FS=4.008;HaplotypeScore=7.8323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.66;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.723;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:45:818,0,45 chrVIII 526356 . C T 23.03 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;DP=64;Dels=0.00;FS=6.323;HaplotypeScore=38.3459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=0.36;ReadPosRankSum=0.339;SB=-6.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:64:53:53,0,615 chrVIII 526360 . T C 71.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;DP=78;Dels=0.00;FS=9.959;HaplotypeScore=58.0989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=0.91;ReadPosRankSum=-2.205;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:99:101,0,644 chrVIII 526366 . C T 705.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.150;DP=78;Dels=0.00;FS=14.701;HaplotypeScore=55.1726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.400;SB=-2.955e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,64:78:12:738,12,0 chrVIII 526369 . G A 662.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;DP=75;Dels=0.00;FS=2.136;HaplotypeScore=67.9285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.53;MQ0=1;MQRankSum=-0.645;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.455;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,53:75:88:692,0,88 chrVIII 526378 . C T 201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.975;DP=91;Dels=0.00;FS=25.249;HaplotypeScore=83.8127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.27;MQ0=1;MQRankSum=0.048;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:231,0,679 chrVIII 526385 . T C 224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.177;DP=113;Dels=0.00;FS=5.626;HaplotypeScore=115.6161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.41;MQ0=1;MQRankSum=-1.421;QD=1.98;ReadPosRankSum=-3.504;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,29:113:99:254,0,987 chrVIII 526390 . C T 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.025;DP=139;Dels=0.00;FS=35.225;HaplotypeScore=104.1897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.63;MQ0=1;MQRankSum=-1.959;QD=6.77;ReadPosRankSum=-3.709;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,109:139:99:971,0,279 chrVIII 526405 . G A 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.478;DP=214;Dels=0.00;FS=10.643;HaplotypeScore=96.3491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.12;MQ0=1;MQRankSum=1.927;QD=0.10;ReadPosRankSum=1.690;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,26:214:51:51,0,2385 chrVIII 526453 . T G 2293.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.775;DP=265;Dels=0.00;FS=10.718;HaplotypeScore=68.0313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.33;MQ0=12;MQRankSum=2.203;QD=8.65;ReadPosRankSum=2.302;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,184:265:99:2323,0,582 chrVIII 526513 . C T 1617 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.909;DP=145;Dels=0.00;FS=25.927;HaplotypeScore=15.4782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.72;MQ0=38;MQRankSum=0.529;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,127:145:93:1650,93,0 chrVIII 526525 . C T 1671 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.695;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.7890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.35;MQ0=34;MQRankSum=0.801;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.695;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:131:99:1704,165,0 chrVIII 526552 . G C 1592 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9365;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.59;MQ0=34;QD=12.94;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:1625,168,0 chrVIII 526588 . T G 1304.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;DP=130;Dels=0.00;FS=12.963;HaplotypeScore=20.2786;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=40;MQRankSum=0.246;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.111;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,114:130:29:1337,29,0 chrVIII 526648 . C T 207.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.39;MQ0=32;QD=3.23;SB=-2.202e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:27:240,27,0 chrVIII 526660 . C T 156.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.761;DP=55;Dels=0.00;FS=9.031;HaplotypeScore=13.4278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.36;MQ0=21;MQRankSum=-1.216;QD=2.84;ReadPosRankSum=2.751;SB=-6.863e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,39:55:38:186,0,38 chrVIII 526669 . C T 145.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.416;DP=54;Dels=0.00;FS=13.341;HaplotypeScore=19.3874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.00;MQ0=17;MQRankSum=-1.291;QD=2.69;ReadPosRankSum=2.112;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:67:175,0,67 chrVIII 526680 . C T 156.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;DP=62;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=14.7463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.65;MQ0=21;MQRankSum=-0.928;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:186,0,121 chrVIII 526714 . C T 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.070;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=24.1442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.03;MQ0=32;MQRankSum=-0.596;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.714;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,32:100:71:71,0,493 chrVIII 526720 . C T 435.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.145;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=32.9123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.64;MQ0=32;MQRankSum=-0.205;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.508;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,80:94:40:465,0,40 chrVIII 526783 . C T 695.06 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.490;DP=132;Dels=0.00;FS=6.074;HaplotypeScore=27.0533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.73;MQ0=33;MQRankSum=-2.957;QD=5.27;ReadPosRankSum=2.224;SB=-3.481e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,118:132:16:725,0,16 chrVIII 526795 . C T 379.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.063;DP=104;Dels=0.00;FS=0.933;HaplotypeScore=66.3284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.59;MQ0=26;MQRankSum=-1.737;QD=3.64;ReadPosRankSum=4.000;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,75:104:99:409,0,101 chrVIII 526804 . T C 387.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;DP=109;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=48.4278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.33;MQ0=24;MQRankSum=-1.180;QD=3.55;ReadPosRankSum=2.101;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,71:109:99:417,0,109 chrVIII 526810 . G A 173.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;DP=122;Dels=0.00;FS=19.693;HaplotypeScore=83.9604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.03;MQ0=24;MQRankSum=0.511;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.012;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,26:122:99:203,0,524 chrVIII 526816 . T C 132.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.297;DP=126;Dels=0.00;FS=22.912;HaplotypeScore=103.3521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.45;MQ0=22;MQRankSum=0.442;QD=1.05;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,32:126:99:162,0,558 chrVIII 526819 . T C 187.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.710;DP=130;Dels=0.00;FS=40.075;HaplotypeScore=121.8295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.67;MQ0=21;MQRankSum=1.392;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,36:130:99:217,0,347 chrVIII 526825 . C T 256.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.788;DP=121;Dels=0.00;FS=2.695;HaplotypeScore=134.2439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.72;MQ0=18;MQRankSum=3.038;QD=2.12;ReadPosRankSum=3.284;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,38:121:99:286,0,384 chrVIII 526828 . T A 261.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.888;DP=117;Dels=0.00;FS=0.815;HaplotypeScore=113.0034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.10;MQ0=18;MQRankSum=2.353;QD=2.23;ReadPosRankSum=2.738;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,33:117:99:291,0,427 chrVIII 526834 . C T 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.307;DP=115;Dels=0.00;FS=2.000;HaplotypeScore=107.3802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.14;MQ0=16;MQRankSum=-0.634;QD=0.11;ReadPosRankSum=0.750;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,23:115:42:42,0,592 chrVIII 526839 . A T 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;DP=118;Dels=0.00;FS=32.589;HaplotypeScore=69.7077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.19;MQ0=14;MQRankSum=0.612;QD=0.57;ReadPosRankSum=0.392;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,28:118:97:97,0,599 chrVIII 526855 . T C 729.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.219;DP=111;Dels=0.00;FS=35.196;HaplotypeScore=67.7889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.00;MQ0=7;MQRankSum=0.788;QD=6.57;ReadPosRankSum=2.132;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,86:111:99:759,0,116 chrVIII 526858 . T G 457.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;DP=106;Dels=0.00;FS=5.716;HaplotypeScore=63.2563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.52;MQ0=5;MQRankSum=-1.331;QD=4.31;ReadPosRankSum=2.044;SB=-1.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,54:106:99:487,0,198 chrVIII 526869 . G A 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.940;DP=101;Dels=0.00;FS=34.387;HaplotypeScore=55.0934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.08;MQ0=2;MQRankSum=-0.994;QD=0.37;ReadPosRankSum=-3.224;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,30:101:67:67,0,873 chrVIII 526879 . C T 70.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;DP=80;Dels=0.00;FS=18.254;HaplotypeScore=148.0095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.21;MQ0=2;MQRankSum=-0.432;QD=0.88;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:80:99:100,0,589 chrVIII 526921 . T C 309.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;DP=106;Dels=0.00;FS=14.053;HaplotypeScore=57.3030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.67;MQ0=5;MQRankSum=-1.540;QD=2.92;ReadPosRankSum=5.144;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:106:99:339,0,890 chrVIII 526930 . C T 1075.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.080;DP=118;Dels=0.00;FS=7.358;HaplotypeScore=57.7363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.83;MQ0=4;MQRankSum=0.830;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,84:118:99:1105,0,311 chrVIII 526939 . T C 232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.155;DP=122;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=65.7846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.15;MQ0=3;MQRankSum=-0.413;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,34:122:99:262,0,1600 chrVIII 526950 . C T 1505.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.600;DP=131;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=59.1132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.45;MQ0=12;MQRankSum=2.051;QD=11.49;ReadPosRankSum=3.312;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,90:131:99:1535,0,259 chrVIII 526990 . C T 1730 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=6.565;DP=148;Dels=0.00;FS=11.661;HaplotypeScore=14.0512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.67;MQ0=26;MQRankSum=2.440;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,124:148:31:1763,31,0 chrVIII 527041 . C T 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.754;DP=64;Dels=0.00;FS=10.670;HaplotypeScore=2.7044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.40;MQ0=24;MQRankSum=1.704;QD=0.42;ReadPosRankSum=-2.512;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:57:57,0,255 chrVIII 527053 . C T 185.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;DP=33;Dels=0.00;FS=17.299;HaplotypeScore=7.7302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.39;MQ0=10;MQRankSum=-0.768;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.303;SB=-1.421e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:46:215,0,46 chrVIII 527056 . A T 205.03 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;DP=32;Dels=0.00;FS=26.641;HaplotypeScore=9.6459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.60;MQ0=10;MQRankSum=0.371;QD=6.41;ReadPosRankSum=1.113;SB=-3.030e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:32:20:235,0,20 chrVIII 527065 . C T 249 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.281;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.23;MQ0=14;MQRankSum=0.226;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.734;SB=-8.498e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,32:38:30:282,30,0 chrVIII 527092 . G C 212.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.82;MQ0=12;QD=6.06;SB=-8.396e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:27:245,27,0 chrVIII 527128 . T G 2127 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.9778;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.66;MQ0=20;MQRankSum=2.372;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-6.585e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,149:171:44:2160,44,0 chrVIII 527169 . G C 4257.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6296;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.72;MQ0=14;QD=18.75;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,226:226:99:4257,447,0 chrVIII 527220 . C T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.580;DP=166;Dels=0.00;FS=17.523;HaplotypeScore=78.8555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.99;MQ0=1;MQRankSum=-1.875;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.130;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,70:166:99:1207,0,1557 chrVIII 527230 . C T 792.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.548;DP=157;Dels=0.00;FS=11.890;HaplotypeScore=75.2666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.35;MQ0=1;MQRankSum=-3.116;QD=5.04;ReadPosRankSum=-1.372;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,57:157:99:822,0,1623 chrVIII 527236 . C T 144.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.519;DP=151;Dels=0.00;FS=7.767;HaplotypeScore=164.3594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.22;MQ0=1;MQRankSum=-5.599;QD=0.95;ReadPosRankSum=-1.035;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,35:151:99:174,0,2271 chrVIII 527239 . C T 115.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.415;DP=149;Dels=0.00;FS=4.871;HaplotypeScore=163.3700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.69;MQ0=1;MQRankSum=-5.559;QD=0.77;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,35:149:99:145,0,2222 chrVIII 527243 . C T 40.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.329;DP=142;Dels=0.00;FS=8.463;HaplotypeScore=25.4226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.03;MQ0=1;MQRankSum=-5.015;QD=0.28;ReadPosRankSum=1.088;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,30:142:70:70,0,2320 chrVIII 527244 . A T 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.783;DP=142;Dels=0.00;FS=10.054;HaplotypeScore=23.3420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.03;MQ0=1;MQRankSum=-5.077;QD=0.25;ReadPosRankSum=1.474;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,32:142:65:65,0,2360 chrVIII 527245 . A G 23.03 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.175;DP=142;Dels=0.00;FS=10.472;HaplotypeScore=22.3487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.81;MQ0=1;MQRankSum=-4.588;QD=0.16;ReadPosRankSum=1.696;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,29:142:53:53,0,2347 chrVIII 527254 . C T 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.847;DP=136;Dels=0.00;FS=5.471;HaplotypeScore=38.9339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.41;MQ0=2;MQRankSum=-5.340;QD=0.24;ReadPosRankSum=3.269;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,31:136:63:63,0,2138 chrVIII 527269 . C T 156.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.582;DP=122;Dels=0.00;FS=7.942;HaplotypeScore=49.9133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.21;MQ0=2;MQRankSum=-8.087;QD=1.28;ReadPosRankSum=1.803;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,41:122:99:186,0,1754 chrVIII 527270 . A G 59.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;DP=122;Dels=0.00;FS=15.958;HaplotypeScore=48.9217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.94;MQ0=2;MQRankSum=-6.697;QD=0.48;ReadPosRankSum=2.597;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,37:122:89:89,0,1835 chrVIII 527274 . G A 103.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.366;DP=127;Dels=0.00;FS=4.413;HaplotypeScore=27.6156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.08;MQ0=2;MQRankSum=-7.888;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,48:127:99:133,0,1673 chrVIII 527311 . T A 367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.108;DP=135;Dels=0.00;FS=6.102;HaplotypeScore=18.0217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.18;MQ0=3;MQRankSum=-4.350;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.741;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,38:135:99:397,0,1878 chrVIII 527373 . C G 380.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.919;DP=169;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.59;MQ0=5;MQRankSum=-0.311;QD=2.25;ReadPosRankSum=3.368;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,43:169:99:410,0,2217 chrVIII 527374 . T C 395.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.148;DP=156;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.66;MQ0=5;MQRankSum=-1.492;QD=2.53;ReadPosRankSum=2.801;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,42:156:99:425,0,2227 chrVIII 527450 . T G 65.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.770;DP=138;Dels=0.00;FS=12.721;HaplotypeScore=47.8734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.51;MQ0=1;MQRankSum=-5.487;QD=0.47;ReadPosRankSum=-3.960;SB=-5.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,31:138:95:95,0,2262 chrVIII 527492 . A G 610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.705;DP=140;Dels=0.00;FS=2.595;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.31;MQ0=3;MQRankSum=-0.832;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.625;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,45:140:99:640,0,1942 chrVIII 527578 . G A 4211.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.40;MQ0=3;QD=23.79;SB=-2.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4211,427,0 chrVIII 527636 . A T 1897 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6091;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.61;MQ0=7;QD=18.97;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:1930,204,0 chrVIII 527764 . A G 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.801;DP=107;Dels=0.00;FS=6.936;HaplotypeScore=2.6000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.63;MQ0=13;MQRankSum=-1.818;QD=0.13;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,15:107:44:44,0,1579 chrVIII 527776 . T C 1762 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.481;DP=101;Dels=0.00;FS=18.525;HaplotypeScore=5.9887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.78;MQ0=12;MQRankSum=-0.208;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,99:101:99:1795,198,0 chrVIII 527797 . T G 1391 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.45;MQ0=9;QD=17.39;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:80:99:1424,156,0 chrVIII 527820 . C T 1261 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.353;DP=73;Dels=0.00;FS=18.017;HaplotypeScore=6.9498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.67;MQ0=7;MQRankSum=2.242;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.216;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,65:73:99:1294,117,0 chrVIII 527830 . C T 941 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.899;DP=62;Dels=0.00;FS=12.400;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.53;MQ0=6;MQRankSum=2.725;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.372;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,52:62:65:974,65,0 chrVIII 527851 . G A 468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.57;MQ0=3;QD=15.10;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:31:54:501,54,0 chrVIII 527877 . C T 41.06 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=10;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.38;MQ0=1;MQRankSum=1.179;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-4.955e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:16:71,0,16 chrVIII 527903 . G A 220.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.192;DP=25;Dels=0.00;FS=7.858;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.85;MQ0=6;MQRankSum=0.863;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-1.246e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:6:252,6,0 chrVIII 528033 . C T 104.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.869;DP=234;Dels=0.00;FS=4.200;HaplotypeScore=6.9463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.72;MQ0=9;MQRankSum=-1.007;QD=0.44;ReadPosRankSum=0.262;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,30:234:99:134,0,4241 chrVIII 528045 . G A 831.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.693;DP=241;Dels=0.00;FS=8.722;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.94;MQ0=8;MQRankSum=0.568;QD=3.45;ReadPosRankSum=-1.637;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,62:241:99:861,0,3788 chrVIII 528155 . A G 835.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;DP=222;Dels=0.00;FS=0.546;HaplotypeScore=25.4042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.87;MQ0=18;MQRankSum=-4.548;QD=3.76;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,83:222:99:865,0,1965 chrVIII 528226 . A G 4734.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=257;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.23;MQ0=25;QD=18.42;SB=-2.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,257:257:99:4734,495,0 chrVIII 528367 . A G 5042.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.40;MQ0=8;QD=22.31;SB=-2.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,226:226:99:5042,519,0 chrVIII 528406 . T A 316.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;DP=146;Dels=0.00;FS=9.117;HaplotypeScore=5.8519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.67;MQ0=19;MQRankSum=1.131;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,33:146:99:346,0,1880 chrVIII 528435 . T A 2622 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=155;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=58.7935;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.43;MQ0=24;MQRankSum=-1.302;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.195;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:2655,285,0 chrVIII 528437 . A G 131.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.439;DP=155;Dels=0.00;FS=29.503;HaplotypeScore=81.1365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.40;MQ0=23;MQRankSum=-1.965;QD=0.85;ReadPosRankSum=-2.714;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,30:155:99:161,0,1987 chrVIII 528438 . G A 344.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.489;DP=158;Dels=0.00;FS=14.156;HaplotypeScore=82.1231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.07;MQ0=23;MQRankSum=0.473;QD=2.18;ReadPosRankSum=1.174;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,34:158:99:374,0,1811 chrVIII 528444 . C T 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;DP=149;Dels=0.00;FS=26.871;HaplotypeScore=95.0101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.70;MQ0=20;MQRankSum=-2.550;QD=0.17;ReadPosRankSum=-2.441;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,26:149:56:56,0,1975 chrVIII 528677 . A G 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.041;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=33.7489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.41;MQ0=2;MQRankSum=0.554;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,86:123:99:1872,0,681 chrVIII 528782 . C T 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;DP=145;Dels=0.00;FS=9.250;HaplotypeScore=5.9547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.49;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=7.06;ReadPosRankSum=-1.012;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,52:145:99:1053,0,2085 chrVIII 529231 . C T 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.653;DP=173;Dels=0.00;FS=3.713;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=2.904;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.639;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,60:173:99:1023,0,2558 chrVIII 530012 . A G 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.44;MQ0=3;QD=20.91;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:3597,393,0 chrVIII 530206 . C T 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.255;DP=150;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=1;MQRankSum=-3.765;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.520;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,53:150:99:810,0,2210 chrVIII 530218 . T G 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.05;MQ0=1;QD=25.71;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3753,390,0 chrVIII 530335 . C A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.884;DP=192;Dels=0.00;FS=4.545;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQ0=3;MQRankSum=-3.803;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.552;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,67:192:99:1149,0,2791 chrVIII 530342 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.588;DP=196;Dels=0.00;FS=4.585;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.46;MQ0=2;MQRankSum=-2.231;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.488;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,66:196:99:1076,0,2985 chrVIII 531068 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.127;DP=225;Dels=0.00;FS=3.952;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=1;MQRankSum=-0.216;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.455;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,65:225:99:980,0,3486 chrVIII 531108 . A T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.900;DP=216;Dels=0.00;FS=4.475;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=3.039;QD=5.85;ReadPosRankSum=2.485;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,70:216:99:1293,0,3259 chrVIII 531121 . G A 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.986;DP=201;Dels=0.00;FS=4.802;HaplotypeScore=6.1550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,55:201:99:840,0,3296 chrVIII 531278 . G A 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.248;DP=149;Dels=0.00;FS=5.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,46:149:99:826,0,2202 chrVIII 531721 . C T 772.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.704;DP=161;Dels=0.00;FS=13.135;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.04;MQ0=27;MQRankSum=-0.713;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.266;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,54:161:99:802,0,1652 chrVIII 532035 . G A 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.85;MQ0=77;MQRankSum=0.429;QD=0.56;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-1.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,31:108:90:90,0,405 chrVIII 532755 . G C 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.795;DP=81;Dels=0.00;FS=2.891;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.94;MQ0=12;MQRankSum=0.139;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,15:81:79:79,0,1291 chrVIII 532813 . A G 324 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.03;MQ0=1;QD=19.06;SB=-7.475e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:39:357,39,0 chrVIII 534007 . G A 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.676;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.55;MQ0=85;MQRankSum=1.501;QD=0.23;ReadPosRankSum=0.326;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,34:100:53:53,0,133 chrVIII 536364 . C T 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.53;MQ0=80;MQRankSum=0.312;QD=0.12;ReadPosRankSum=0.555;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:41:41,0,41 chrVIII 536513 . A G 45.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.43;MQ0=89;MQRankSum=-0.952;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,33:115:75:75,0,106 chrVIII 536581 . T C 507.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.617;DP=129;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.48;MQ0=47;MQRankSum=0.970;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.029;SB=-1.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,41:129:99:537,0,980 chrVIII 536756 . G C 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.76;MQ0=95;MQRankSum=-0.041;QD=0.35;ReadPosRankSum=0.041;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,41:116:71:71,0,177 chrVIII 536813 . G A 47.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.26;MQ0=66;MQRankSum=1.511;QD=0.53;ReadPosRankSum=0.553;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:77:77,0,129 chrVIII 536864 . G A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.64;MQ0=81;MQRankSum=0.684;QD=0.12;ReadPosRankSum=0.322;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:40:40,0,40 chrVIII 540930 . C G 1386.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.674;DP=183;Dels=0.00;FS=7.306;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.26;MQ0=33;MQRankSum=-2.260;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,98:183:99:1416,0,1473 chrVIII 541353 . A G 548.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.729;DP=264;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=5.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.62;MQ0=49;MQRankSum=-0.495;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.053;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,63:264:99:578,0,2859 chrVIII 541686 . C A 103.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.256;DP=156;Dels=0.00;FS=7.020;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.10;MQ0=114;MQRankSum=0.884;QD=0.66;ReadPosRankSum=-1.390;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,67:156:99:133,0,227 chrVIII 549371 . A G 77.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.41;MQ0=1;QD=15.50;SB=-2.755e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:110,12,0 chrVIII 549375 . A G 41.07 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.71;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-2.110e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:15:71,0,15 chrVIII 549376 . C T 43.07 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.71;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-2.110e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:15:73,0,15 chrVIII 549731 . A G 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.90;MQ0=114;MQRankSum=2.894;QD=0.17;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,20:144:54:54,0,565 chrVIII 549805 . A T 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;DP=106;Dels=0.00;FS=188.465;HaplotypeScore=31.4741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.35;MQ0=37;MQRankSum=1.653;QD=0.63;ReadPosRankSum=-5.083;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,65:106:97:97,0,190 chrVIII 549806 . C T 69.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;DP=97;Dels=0.00;FS=168.444;HaplotypeScore=28.7265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.37;MQ0=37;MQRankSum=2.648;QD=0.71;ReadPosRankSum=-4.781;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,57:97:99:99,0,153 chrVIII 549816 . T G 260 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.72;MQ0=9;QD=10.00;SB=-1.073e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:33:293,33,0 chrVIII 549933 . G A 90.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.778;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.06;MQ0=175;MQRankSum=0.790;QD=0.44;ReadPosRankSum=1.656;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,31:204:99:120,0,397 chrVIII 549961 . G A 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=244;Dels=0.00;FS=3.633;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.17;MQ0=206;MQRankSum=-0.627;QD=0.25;ReadPosRankSum=0.519;SB=-4.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,35:244:90:90,0,665 chrVIII 550175 . G A 29.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.780;DP=266;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.51;MQ0=219;MQRankSum=-0.314;QD=0.11;ReadPosRankSum=-2.077;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,36:266:59:59,0,852 chrVIII 550281 . A G 926.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;DP=207;Dels=0.00;FS=4.789;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.95;MQ0=124;MQRankSum=-1.388;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.802;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,84:207:99:956,0,731 chrVIII 550292 . C T 72.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.424;DP=283;Dels=0.00;FS=0.898;HaplotypeScore=10.7029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.36;MQ0=105;MQRankSum=-0.302;QD=0.25;ReadPosRankSum=2.651;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,33:283:99:102,0,3370 chrVIII 550304 . T C 29.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;DP=310;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=3.6908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.84;MQ0=88;MQRankSum=1.116;QD=0.09;ReadPosRankSum=1.866;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,35:310:59:59,0,4473 chrVIII 550309 . C T 30.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.221;DP=298;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.59;MQ0=78;MQRankSum=0.163;QD=0.10;ReadPosRankSum=2.001;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,32:298:60:60,0,4251 chrVIII 550372 . G A 356.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.991;DP=338;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=1.9048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.97;MQ0=70;MQRankSum=-1.492;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.552;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,50:336:99:386,0,4621 chrVIII 550651 . T A 294.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.283;DP=245;Dels=0.00;FS=17.298;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.93;MQ0=227;MQRankSum=-0.690;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-2.169e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,216:245:33:324,0,33 chrVIII 551354 . A T 2678.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.811;DP=385;Dels=0.00;FS=4.341;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.66;MQ0=122;MQRankSum=-0.312;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.158;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,195:385:99:2708,0,2704 chrVIII 552734 . C T 90.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;DP=254;Dels=0.00;FS=22.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.61;MQ0=224;MQRankSum=-0.894;QD=0.35;ReadPosRankSum=1.018;SB=-6.506e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,191:254:99:120,0,170 chrVIII 553253 . G A 597.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.700;DP=311;Dels=0.00;FS=25.439;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.29;MQ0=134;MQRankSum=-2.172;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.051;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,79:311:99:627,0,2644 chrVIII 553346 . T C 870.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.579;DP=323;Dels=0.00;FS=10.030;HaplotypeScore=89.6235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.50;MQ0=32;MQRankSum=-1.975;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.517;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,95:323:99:900,0,3218 chrVIII 553366 . G A 1440.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.284;DP=321;Dels=0.00;FS=102.921;HaplotypeScore=3.4800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.13;MQ0=33;MQRankSum=-14.173;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.538;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,193:321:99:1470,0,2773 chrVIII 553540 . A C 505.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.818;DP=560;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=14.7672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQ0=1;MQRankSum=3.265;QD=0.90;ReadPosRankSum=-1.772;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:483,77:560:99:535,0,10818 chrVIII 553563 . A T 3183.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.205;DP=537;Dels=0.00;FS=0.331;HaplotypeScore=11.1403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.47;MQ0=0;MQRankSum=3.735;QD=5.93;ReadPosRankSum=-2.646;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:361,176:537:99:3213,0,7290 chrVIII 553644 . A G 4849.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.011;DP=525;Dels=0.00;FS=7.297;HaplotypeScore=58.4965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.199;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,269:525:99:4849,0,5598 chrVIII 553648 . A G 3758.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.901;DP=530;Dels=0.00;FS=2.441;HaplotypeScore=55.6502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:300,229:530:99:3758,0,6624 chrVIII 554135 . G A 5622.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.26;MQ0=0;QD=22.58;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,249:249:99:5622,598,0 chrVIII 554142 . G A 5738.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=253;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.69;MQ0=0;QD=22.68;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,253:253:99:5738,604,0 chrVIII 554143 . T A 5625.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=253;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.69;MQ0=0;QD=22.23;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,253:253:99:5625,601,0 chrVIII 554151 . T G 6171.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=284;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.62;MQ0=0;QD=21.73;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,284:284:99:6171,696,0 chrVIII 554157 . T C 7666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=339;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.10;MQ0=0;QD=22.61;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,339:339:99:7666,846,0 chrVIII 554162 . C T 7957.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=325;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.46;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,325:325:99:7957,841,0 chrVIII 554170 . T C 7676.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=327;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.22;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,327:327:99:7676,849,0 chrVIII 554171 . C T 7898.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=328;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.32;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,328:328:99:7898,853,0 chrVIII 554202 . A G 7861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=316;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2685;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.52;MQ0=0;QD=24.88;SB=-2.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,315:316:99:7861,862,0 chrVIII 554280 . C T 497 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=441;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=395.4794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.54;MQ0=4;QD=1.13;SB=-5.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,441:441:57:530,57,0 chrVIII 554298 . T A 10979.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=439;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8936;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.95;MQ0=4;QD=25.01;SB=-5.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,438:438:99:10979,1100,0 chrVIII 554362 . A T 899.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;DP=415;Dels=0.00;FS=7.743;HaplotypeScore=7.1483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=1;MQRankSum=1.124;QD=2.17;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:337,78:415:99:929,0,7798 chrVIII 554389 . A G 10644.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=432;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4635;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.02;MQ0=0;QD=24.64;SB=-4.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,432:432:99:10644,1155,0 chrVIII 554454 . C A 8650.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.342;DP=496;Dels=0.00;FS=0.417;HaplotypeScore=4.2150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-3.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,392:496:99:8650,0,1247 chrVIII 554668 . G A 5459.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.809;DP=577;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=10.3071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.75;MQ0=0;MQRankSum=2.317;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.309;SB=-2.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:310,267:577:99:5459,0,6490 chrVIII 554852 . A G 3299.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.243;DP=370;Dels=0.00;FS=5.951;HaplotypeScore=38.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.97;MQ0=53;MQRankSum=-13.836;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.176;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,236:370:99:3299,0,2741 chrVIII 554888 . A G 4240.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.481;DP=414;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=7.2088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.82;MQ0=36;MQRankSum=-8.656;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.838;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,259:414:99:4240,0,2822 chrVIII 554922 . A G 4438.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.848;DP=388;Dels=0.00;FS=2.351;HaplotypeScore=3.7068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.15;MQ0=35;MQRankSum=-4.631;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.756;SB=-2.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,251:388:99:4438,0,2268 chrVIII 554951 . A G 217.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.405;DP=376;Dels=0.00;FS=1.946;HaplotypeScore=3.4600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.92;MQ0=31;MQRankSum=-0.193;QD=0.58;ReadPosRankSum=-0.744;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:320,56:376:99:247,0,6705 chrVIII 555032 . T C 3651.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.338;DP=338;Dels=0.00;FS=25.284;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.60;MQ0=52;MQRankSum=-12.370;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,230:338:99:3651,0,2122 chrVIII 555254 . G C 5557.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.415;DP=452;Dels=0.00;FS=4.089;HaplotypeScore=29.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.06;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.269;SB=-2.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,265:452:99:5557,0,3444 chrVIII 555293 . G A 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.397;DP=445;Dels=0.00;FS=0.572;HaplotypeScore=4.0767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=4.511;QD=0.10;ReadPosRankSum=1.152;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:399,46:445:73:73,0,8883 chrVIII 555454 . T C 6132.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.333;DP=399;Dels=0.00;FS=8.912;HaplotypeScore=15.0483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.71;MQ0=34;MQRankSum=-9.847;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.364;SB=-2.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,345:398:99:6132,0,383 chrVIII 555636 . C T 2326.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.067;DP=401;Dels=0.00;FS=1.644;HaplotypeScore=83.7134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.49;MQ0=11;MQRankSum=-2.361;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,184:401:99:2356,0,3799 chrVIII 555637 . G A 4010.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.692;DP=403;Dels=0.00;FS=0.818;HaplotypeScore=83.7134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.40;MQ0=12;MQRankSum=-4.078;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.587;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,273:403:99:4010,0,2164 chrVIII 555652 . C T 2437.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.758;DP=397;Dels=0.00;FS=6.562;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.18;MQ0=14;MQRankSum=-7.353;QD=6.14;ReadPosRankSum=-2.253;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,265:397:99:2467,0,2504 chrVIII 555679 . T A 1676.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.828;DP=340;Dels=0.00;FS=12.048;HaplotypeScore=2.1483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.22;MQ0=16;MQRankSum=-10.094;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.013;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,213:340:99:1706,0,2398 chrVIII 555682 . C T 1446.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.712;DP=350;Dels=0.00;FS=15.601;HaplotypeScore=2.1483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.54;MQ0=16;MQRankSum=-10.071;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.157;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,225:350:99:1476,0,2402 chrVIII 555736 . C T 5913.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.338;DP=396;Dels=0.00;FS=3.086;HaplotypeScore=3.9485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.61;MQ0=6;MQRankSum=-6.078;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.550;SB=-2.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,332:396:99:5913,0,663 chrVIII 555742 . A G 5809.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.487;DP=398;Dels=0.00;FS=6.338;HaplotypeScore=4.4821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.11;MQ0=5;MQRankSum=-6.914;QD=14.60;ReadPosRankSum=2.521;SB=-2.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,329:398:99:5809,0,864 chrVIII 555748 . C T 6360.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.637;DP=394;Dels=0.00;FS=6.793;HaplotypeScore=2.8195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.67;MQ0=2;MQRankSum=-7.155;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.390;SB=-2.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,332:394:99:6360,0,646 chrVIII 555751 . C T 6181.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.062;DP=394;Dels=0.00;FS=11.705;HaplotypeScore=4.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.53;MQ0=1;MQRankSum=-7.253;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.190;SB=-2.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,335:394:99:6181,0,531 chrVIII 555754 . T A 6046.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.445;DP=376;Dels=0.00;FS=12.325;HaplotypeScore=4.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.06;MQ0=1;MQRankSum=-7.224;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.364;SB=-2.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,320:376:99:6046,0,604 chrVIII 555840 . G A 5465.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.936;DP=382;Dels=0.00;FS=20.863;HaplotypeScore=4.8287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.12;MQ0=0;MQRankSum=-3.059;QD=14.31;ReadPosRankSum=1.108;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,289:382:99:5465,0,1385 chrVIII 555849 . C G 5152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;DP=337;Dels=0.00;FS=13.827;HaplotypeScore=4.5022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.627;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.106;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,257:337:99:5152,0,1235 chrVIII 555860 . A G 4792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;DP=325;Dels=0.00;FS=21.113;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.95;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=14.74;ReadPosRankSum=2.350;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,240:325:99:4792,0,1468 chrVIII 555862 . T G 4836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.379;DP=331;Dels=0.00;FS=19.108;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=1;MQRankSum=-1.863;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.853;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,245:331:99:4836,0,1434 chrVIII 555971 . T A 9073.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.102;DP=468;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=7.3273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.181;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-2.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,425:468:11:9073,11,0 chrVIII 555993 . G A 9184.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.113;DP=475;Dels=0.00;FS=6.917;HaplotypeScore=4.8847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.79;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.925;SB=-3.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,425:475:87:9184,0,87 chrVIII 556005 . T A 10338.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=427;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.85;MQ0=0;QD=24.21;SB=-4.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,427:427:99:10338,1081,0 chrVIII 556024 . C A 8818.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.942;DP=456;Dels=0.00;FS=2.015;HaplotypeScore=11.5078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=19.34;ReadPosRankSum=-2.425;SB=-4.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:42,413:456:59:8818,59,0 chrVIII 556069 . G A 568.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.699;DP=386;Dels=0.00;FS=4.726;HaplotypeScore=5.5565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.300;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:323,63:386:99:598,0,7042 chrVIII 556128 . T A 5320.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;DP=362;Dels=0.00;FS=4.571;HaplotypeScore=2.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.29;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.515;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,246:362:99:5320,0,2010 chrVIII 556220 . T C 76.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.260;DP=321;Dels=0.00;FS=44.994;HaplotypeScore=98.8736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQ0=1;MQRankSum=1.893;QD=0.24;ReadPosRankSum=-1.519;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,53:321:99:106,0,5869 chrVIII 556225 . A T 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.346;DP=271;Dels=0.00;FS=21.212;HaplotypeScore=116.5205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.63;MQ0=1;MQRankSum=-0.789;QD=2.86;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,64:271:99:805,0,4475 chrVIII 556248 . T C 1074.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;DP=201;Dels=0.00;FS=87.149;HaplotypeScore=49.4933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.45;MQ0=1;MQRankSum=-1.978;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.426;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,75:201:99:1104,0,2480 chrVIII 556252 . A G 1412.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.719;DP=185;Dels=0.00;FS=138.539;HaplotypeScore=49.5133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.33;MQ0=1;MQRankSum=-4.448;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,86:185:99:1442,0,1902 chrVIII 556256 . T G 73.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.570;DP=183;Dels=0.00;FS=48.073;HaplotypeScore=55.0497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.21;MQ0=2;MQRankSum=-2.235;QD=0.40;ReadPosRankSum=-4.665;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,25:183:99:103,0,3229 chrVIII 556263 . G A 879.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.708;DP=159;Dels=0.00;FS=99.672;HaplotypeScore=27.1947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.31;MQ0=2;MQRankSum=-6.430;QD=5.53;ReadPosRankSum=-1.967;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,58:159:99:909,0,1866 chrVIII 556264 . G A 862.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;DP=162;Dels=0.00;FS=107.022;HaplotypeScore=26.2282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.36;MQ0=2;MQRankSum=-6.865;QD=5.32;ReadPosRankSum=-2.147;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,59:162:99:892,0,2049 chrVIII 556273 . C A 403.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;DP=145;Dels=0.01;FS=58.421;HaplotypeScore=23.9002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.52;MQ0=2;MQRankSum=-4.916;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.405;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,33:144:99:433,0,1899 chrVIII 556283 . G A 370.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.672;DP=146;Dels=0.00;FS=37.902;HaplotypeScore=21.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.94;MQ0=2;MQRankSum=-4.686;QD=2.53;ReadPosRankSum=-2.098;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,30:146:99:400,0,2247 chrVIII 556291 . G A 325.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.883;DP=144;Dels=0.00;FS=32.936;HaplotypeScore=3.8139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.41;MQ0=2;MQRankSum=-4.398;QD=2.26;ReadPosRankSum=-3.499;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,27:144:99:355,0,2224 chrVIII 556311 . G C 500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;DP=111;Dels=0.00;FS=9.840;HaplotypeScore=20.3132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.97;MQ0=1;MQRankSum=-2.258;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,36:111:99:530,0,1408 chrVIII 556318 . T G 1128.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.267;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=45.1748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.57;MQ0=1;MQRankSum=0.532;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.034;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,62:86:99:1158,0,300 chrVIII 556322 . T C 89.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.771;DP=88;Dels=0.00;FS=11.136;HaplotypeScore=58.2687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.95;MQ0=1;MQRankSum=0.791;QD=1.01;ReadPosRankSum=-1.507;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,14:88:99:119,0,1385 chrVIII 556324 . G C 84.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.642;DP=84;Dels=0.00;FS=2.729;HaplotypeScore=45.4803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.92;MQ0=1;MQRankSum=0.871;QD=1.00;ReadPosRankSum=1.272;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,13:84:99:114,0,1284 chrVIII 556327 . A G 30.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=42.5175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.77;MQ0=1;MQRankSum=-0.075;QD=0.38;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,12:80:60:60,0,1356 chrVIII 556341 . A T 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.025;DP=73;Dels=0.00;FS=2.375;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.48;MQ0=1;MQRankSum=2.491;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.502;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,42:73:99:863,0,405 chrVIII 556344 . G A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.756;DP=72;Dels=0.00;FS=2.353;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=1;MQRankSum=2.532;QD=11.39;ReadPosRankSum=3.009;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:850,0,382 chrVIII 556369 . G A 1133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.237;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.64;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=23.12;ReadPosRankSum=1.450;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1166,120,0 chrVIII 556384 . C T 1051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.07;MQ0=1;QD=19.83;SB=-8.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1084,111,0 chrVIII 556476 . G A 79.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;DP=25;Dels=0.00;FS=1.660;HaplotypeScore=22.2443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.31;MQ0=1;MQRankSum=2.202;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.521;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:109,0,102 chrVIII 556504 . A G 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;DP=13;Dels=0.00;FS=18.195;HaplotypeScore=13.7156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.80;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.408;SB=-2.150e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:37:68,0,37 chrVIII 556510 . T A 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;DP=12;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=5.9306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.32;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.741;SB=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:44:45,0,44 chrVIII 556555 . G A 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.118;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.62;MQ0=1;MQRankSum=-0.224;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.969;SB=-2.926e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:6:57,6,0 chrVIII 556562 . C T 81.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=11.2667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.23;MQ0=2;QD=3.71;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:12:114,12,0 chrVIII 556593 . T C 169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;DP=36;Dels=0.00;FS=11.417;HaplotypeScore=2.6249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.36;MQ0=3;MQRankSum=-0.413;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-6.037e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:36:48:199,0,48 chrVIII 556648 . A G 2582.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;DP=174;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=25.8336;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.62;MQ0=2;MQRankSum=3.666;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.174;SB=-7.451e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,143:174:5:2613,5,0 chrVIII 556665 . G A 2461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.036;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=45.6022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.55;MQ0=1;MQRankSum=5.070;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.472;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,134:179:99:2491,0,255 chrVIII 556675 . A T 2598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.635;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=24.7993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.59;MQ0=3;MQRankSum=5.550;QD=13.46;ReadPosRankSum=2.432;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,138:193:99:2628,0,320 chrVIII 556750 . A T 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.278;DP=129;Dels=0.00;FS=10.933;HaplotypeScore=17.2279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.64;MQ0=3;MQRankSum=0.509;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.042;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,84:129:99:854,0,270 chrVIII 556785 . G A 662.09 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.744;DP=92;Dels=0.04;FS=12.502;HaplotypeScore=42.6556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.08;MQ0=1;MQRankSum=0.590;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.532;SB=-9.506e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,67:88:14:692,0,14 chrVIII 556812 . A T 442 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;DP=52;Dels=0.00;FS=4.885;HaplotypeScore=11.5451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.53;MQ0=1;MQRankSum=1.025;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.149;SB=-2.194e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,43:52:54:475,54,0 chrVIII 556813 . A G 440 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.157;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=25.1654;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.64;MQ0=1;MQRankSum=-0.121;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.777;SB=-2.194e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,43:51:54:473,54,0 chrVIII 556991 . A C 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6793;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.32;MQ0=4;MQRankSum=0.776;QD=0.88;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-5.644e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,20:27:6:55,6,0 chrVIII 557000 . T C 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.582;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6793;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.61;MQ0=6;MQRankSum=0.446;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-5.413e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,21:29:6:53,6,0 chrVIII 557001 . G T 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.200;DP=30;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=13.4497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.28;MQ0=7;MQRankSum=0.670;QD=0.79;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-5.613e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,21:29:6:55,6,0 chrVIII 557188 . G T 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.67;MQ0=27;MQRankSum=-1.156;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.964;SB=2.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,25:45:9:83,9,0 chrVIII 560564 . A G 62.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.564;DP=203;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.43;MQ0=161;MQRankSum=0.970;QD=0.31;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-6.177e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,72:203:38:92,0,38 chrVIII 560604 . T G 442.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.408;DP=233;Dels=0.00;FS=6.889;HaplotypeScore=8.4914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.36;MQ0=136;MQRankSum=-0.778;QD=1.90;ReadPosRankSum=2.698;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,90:232:99:472,0,514 chrVIII 561073 . A G 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.34;MQ0=154;MQRankSum=1.866;QD=0.14;ReadPosRankSum=0.741;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:160,4:164:6:54,6,0 chrVIII 562348 . G A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.93;MQ0=98;MQRankSum=-0.411;QD=0.08;ReadPosRankSum=0.032;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,5:127:40:40,0,437 chrVIII 562374 . G A 360.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;DP=135;Dels=0.00;FS=3.899;HaplotypeScore=7.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.97;MQ0=96;MQRankSum=1.363;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-1.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,85:135:99:390,0,271 chrVIII 562424 . A T 444.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.552;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.91;MQ0=72;MQRankSum=1.455;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,38:133:99:474,0,376 chrVIII 562425 . G A 374.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;DP=132;Dels=0.00;FS=12.292;HaplotypeScore=4.4923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.00;MQ0=71;MQRankSum=3.802;QD=2.83;ReadPosRankSum=1.011;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,33:132:99:404,0,444 chrVIII 562639 . T G 65.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.7159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.26;MQ0=1;MQRankSum=0.250;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.083;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:95:95,0,155 chrX 15488 . C A 14.21 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=4.47;MQ0=90;MQRankSum=0.358;QD=0.15;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,34:95:18:44,0,18 chrX 15796 . C T 102.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.48;MQ0=56;MQRankSum=0.945;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:53:132,0,53 chrX 15824 . G A 147.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.923;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.85;MQ0=61;MQRankSum=2.011;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:67:177,0,67 chrX 15923 . C G 124.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.80;MQ0=35;QD=2.59;SB=-2.688e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:18:157,18,0 chrX 15965 . T C 428.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;DP=89;Dels=0.00;FS=0.972;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.01;MQ0=29;MQRankSum=0.134;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:458,0,636 chrX 15974 . T C 477.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.907;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.19;MQ0=23;MQRankSum=-0.523;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.851;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:507,0,723 chrX 16013 . G A 959.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.717;DP=118;Dels=0.00;FS=3.538;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.91;MQ0=7;MQRankSum=0.926;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.092;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:989,0,1253 chrX 16128 . G A 54.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.81;MQ0=60;MQRankSum=-0.380;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:82:84,0,82 chrX 16129 . G C 54.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.69;MQ0=62;MQRankSum=-0.689;QD=0.73;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:82:84,0,82 chrX 16243 . T C 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.001;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.99;MQ0=46;MQRankSum=1.076;QD=0.23;ReadPosRankSum=-2.095;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:44:44,0,204 chrX 16325 . G A 100.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.34;MQ0=41;QD=1.97;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:15:133,15,0 chrX 16333 . C T 100.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.03;MQ0=45;QD=1.82;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:15:133,15,0 chrX 18553 . A T 95.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.92;MQ0=57;MQRankSum=0.736;QD=1.51;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:10:125,0,10 chrX 18770 . T G 111.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.993;DP=66;Dels=0.00;FS=7.505;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.39;MQ0=50;MQRankSum=-2.468;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.473;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:141,0,174 chrX 18791 . G C 124.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.644;DP=69;Dels=0.00;FS=15.215;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.87;MQ0=35;MQRankSum=-4.160;QD=1.80;ReadPosRankSum=2.319;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,23:69:99:154,0,501 chrX 18792 . A G 110.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.454;DP=68;Dels=0.00;FS=15.215;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.05;MQ0=34;MQRankSum=-4.086;QD=1.62;ReadPosRankSum=2.282;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,23:68:99:140,0,523 chrX 18807 . A C 66.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.448;DP=75;Dels=0.00;FS=5.223;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.45;MQ0=23;MQRankSum=-4.686;QD=0.88;ReadPosRankSum=2.930;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:96:96,0,942 chrX 18842 . T C 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.183;DP=75;Dels=0.00;FS=10.652;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.78;MQ0=3;MQRankSum=-4.779;QD=0.31;ReadPosRankSum=-1.360;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,11:75:53:53,0,1477 chrX 19946 . T C 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.58;MQ0=12;MQRankSum=0.322;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.322;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:67:67,0,69 chrX 19970 . T C 210.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.19;MQ0=12;QD=9.13;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:27:243,27,0 chrX 20021 . A C 105.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.20;MQ0=15;MQRankSum=0.323;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.226;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:135,0,134 chrX 20033 . C A 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.652;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.42;MQ0=11;MQRankSum=0.059;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.059;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:26:97:97,0,193 chrX 20045 . T C 158.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.22;MQ0=11;MQRankSum=0.536;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.289;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:52:188,0,52 chrX 20048 . C T 157.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.29;MQ0=10;MQRankSum=-0.254;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:26:187,0,26 chrX 20081 . A T 193.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.53;MQ0=8;QD=8.77;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:24:226,24,0 chrX 20118 . T G 132.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.37;MQ0=4;QD=7.77;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:18:165,18,0 chrX 20198 . C T 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.294;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.23;MQ0=1;MQRankSum=-0.764;QD=1.15;ReadPosRankSum=1.924;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:61:61,0,247 chrX 20220 . A G 423 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.98;MQ0=4;QD=15.11;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:51:456,51,0 chrX 20267 . T C 165.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.306;DP=55;Dels=0.00;FS=14.225;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.24;MQ0=5;MQRankSum=-1.897;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.398;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:195,0,821 chrX 20276 . T C 224.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.966;DP=75;Dels=0.00;FS=10.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.94;MQ0=7;MQRankSum=-1.901;QD=2.99;ReadPosRankSum=1.019;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,20:75:99:254,0,1118 chrX 20279 . G A 251.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.909;DP=77;Dels=0.00;FS=8.044;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.35;MQ0=7;MQRankSum=-1.252;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.462;SB=-4.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:281,0,1092 chrX 20312 . T C 808.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.653;DP=88;Dels=0.00;FS=3.466;HaplotypeScore=13.9240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.66;MQ0=7;MQRankSum=2.753;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.618;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,48:88:99:838,0,474 chrX 20378 . G A 764.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.48;MQ0=24;MQRankSum=-0.572;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.576;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:794,0,659 chrX 20420 . T C 470.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.209;DP=81;Dels=0.00;FS=1.053;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.64;MQ0=22;MQRankSum=0.114;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.812;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:500,0,558 chrX 20462 . C T 201.03 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.21;MQ0=8;MQRankSum=1.212;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.053;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:20:231,0,20 chrX 20504 . T C 133.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.80;MQ0=1;MQRankSum=0.751;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.751;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:18:166,18,0 chrX 20525 . C T 131.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.80;MQ0=1;QD=13.11;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:18:164,18,0 chrX 20528 . C G 34.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=14;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.67;MQ0=2;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.536;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:64:64,0,88 chrX 20582 . C T 277 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=24;QD=7.49;SB=-3.000e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,27:37:33:310,33,0 chrX 20693 . G C 48.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.61;MQ0=30;QD=1.36;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,19:36:9:81,9,0 chrX 20705 . C T 53.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.73;MQ0=29;QD=1.54;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,18:35:9:86,9,0 chrX 20706 . G T 53.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.73;MQ0=29;MQRankSum=1.537;QD=1.54;ReadPosRankSum=-1.537;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,11:35:9:86,9,0 chrX 20867 . G A 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.93;MQ0=20;QD=1.03;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:6:55,6,0 chrX 20930 . T C 139.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.165;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.10;MQ0=24;MQRankSum=0.471;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.468;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:169,0,121 chrX 20933 . C T 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.03;MQ0=25;MQRankSum=0.369;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.053;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:90:90,0,276 chrX 20942 . A G 258.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.351;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.58;MQ0=24;MQRankSum=1.031;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.289;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:288,0,105 chrX 20968 . A T 359.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;DP=63;Dels=0.00;FS=5.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.43;MQ0=27;MQRankSum=3.853;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,33:63:99:389,0,168 chrX 21101 . A G 590.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.028;DP=44;Dels=0.00;FS=34.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.94;MQ0=5;MQRankSum=4.732;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,30:44:28:623,28,0 chrX 21125 . A G 561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.148;DP=43;Dels=0.00;FS=38.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.97;MQ0=2;MQRankSum=4.578;QD=13.05;ReadPosRankSum=2.846;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:30:591,0,30 chrX 21131 . C T 567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.644;DP=41;Dels=0.00;FS=34.771;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.57;MQ0=1;MQRankSum=4.324;QD=13.83;ReadPosRankSum=3.615;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:25:597,0,25 chrX 21149 . C T 155.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.223;DP=43;Dels=0.00;FS=39.370;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.70;MQ0=1;MQRankSum=-3.469;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.436;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:185,0,486 chrX 21152 . C A 160.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.431;DP=42;Dels=0.00;FS=45.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.08;MQ0=1;MQRankSum=-3.229;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:190,0,462 chrX 21158 . C T 764 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.69;MQ0=1;QD=20.11;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:87:797,87,0 chrX 21165 . G A 361.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;DP=36;Dels=0.00;FS=34.921;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.560;SB=-6.485e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:391,0,249 chrX 21176 . C T 787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.30;MQ0=0;QD=20.71;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:87:820,87,0 chrX 21199 . A G 697 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.46;MQ0=0;QD=17.42;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:78:730,78,0 chrX 21206 . C T 767 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.06;MQ0=0;QD=18.26;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:84:800,84,0 chrX 21207 . G A 763 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.06;MQ0=0;QD=18.17;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:84:796,84,0 chrX 21360 . A G 1354 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.07;MQ0=0;QD=24.18;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1387,147,0 chrX 21430 . G A 1551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.86;MQ0=0;QD=23.86;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1584,153,0 chrX 21499 . C T 1462 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.07;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1495,156,0 chrX 21598 . G A 1279 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=24.60;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1312,129,0 chrX 21662 . T C 1236 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=22.89;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1269,144,0 chrX 22089 . C T 1795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.93;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1828,198,0 chrX 22254 . G A 1546 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.94;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1579,165,0 chrX 22350 . A G 2071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=24.65;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2104,222,0 chrX 22600 . G A 1291 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=25.82;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1324,138,0 chrX 22621 . C T 1418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=26.26;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1451,150,0 chrX 22651 . C T 1446 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=24.93;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:58:99:1479,150,0 chrX 22679 . C T 1660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=24.06;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1693,174,0 chrX 22702 . A G 1648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=23.88;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1681,180,0 chrX 22709 . C T 1562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=26.03;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1595,168,0 chrX 22772 . C G 1893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=25.58;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1926,204,0 chrX 22895 . T G 1916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.28;MQ0=0;QD=25.21;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1949,204,0 chrX 22911 . A G 1812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=24.82;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1845,198,0 chrX 22914 . T C 1840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.97;MQ0=0;QD=25.21;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1873,201,0 chrX 22975 . G A 1819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.54;MQ0=0;QD=26.36;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1852,195,0 chrX 22999 . C T 1788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.47;MQ0=0;QD=26.69;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1821,192,0 chrX 23066 . C T 1099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.16;MQ0=0;QD=23.38;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1132,120,0 chrX 23074 . A T 1197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.75;MQ0=0;QD=23.47;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1230,129,0 chrX 23082 . A T 913 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.42;MQ0=0;QD=19.02;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:946,102,0 chrX 23085 . A G 835 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.51;MQ0=0;QD=17.77;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:868,99,0 chrX 23086 . G A 842 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.51;MQ0=0;QD=17.91;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:875,99,0 chrX 23131 . C T 1228 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.68;MQ0=0;QD=22.74;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1261,132,0 chrX 23258 . A C 1952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.39;MQ0=0;QD=25.03;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1985,204,0 chrX 23308 . G A 2513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.06;MQ0=0;QD=25.91;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2546,261,0 chrX 23342 . A G 1862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=23.87;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1895,198,0 chrX 23465 . A C 1798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=25.69;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1831,198,0 chrX 23550 . A C 1342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;QD=24.85;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1375,150,0 chrX 23561 . C T 1576 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=26.27;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1609,165,0 chrX 23563 . C T 1630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=27.17;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1663,168,0 chrX 23690 . C T 2009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=25.76;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2042,207,0 chrX 23723 . G A 2245 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2278,228,0 chrX 23889 . A G 1797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.09;MQ0=0;QD=25.31;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1830,195,0 chrX 23906 . G C 1020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.24;MQ0=0;QD=22.17;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1053,117,0 chrX 23915 . C T 962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.44;MQ0=0;QD=24.67;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:995,105,0 chrX 23939 . A G 907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.55;MQ0=0;QD=23.26;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:940,102,0 chrX 23956 . T C 934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.88;MQ0=0;QD=20.76;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:967,105,0 chrX 23965 . A T 954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=22.19;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:987,105,0 chrX 23985 . A C 609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.92;MQ0=0;QD=19.65;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:72:642,72,0 chrX 24002 . A G 712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.36;MQ0=0;QD=20.34;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:81:745,81,0 chrX 24026 . G A 906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.50;MQ0=0;QD=23.23;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:96:939,96,0 chrX 24042 . A G 1337 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.29;MQ0=0;QD=25.23;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1370,144,0 chrX 24129 . T G 1902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.47;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1935,198,0 chrX 24246 . G A 1688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=25.58;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1721,171,0 chrX 24299 . A T 1558 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=24.73;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1591,153,0 chrX 24374 . C T 1710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.10;MQ0=0;QD=22.50;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1743,177,0 chrX 24410 . G A 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.313;DP=92;Dels=0.00;FS=55.660;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.567;QD=0.38;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,24:92:65:65,0,1546 chrX 24413 . G C 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.224;DP=92;Dels=0.00;FS=55.660;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=-6.602;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.227;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,24:92:65:65,0,1502 chrX 24436 . C T 1455.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.216;DP=91;Dels=0.00;FS=42.810;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQ0=0;MQRankSum=6.347;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,65:91:99:1485,0,148 chrX 24438 . T C 129.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.010;DP=86;Dels=0.00;FS=39.922;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQ0=0;MQRankSum=-6.956;QD=1.50;ReadPosRankSum=1.707;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:159,0,1495 chrX 24440 . A C 126.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.031;DP=89;Dels=0.00;FS=39.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.91;MQ0=0;MQRankSum=-6.856;QD=1.42;ReadPosRankSum=1.720;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:156,0,1563 chrX 24442 . T C 137.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;DP=89;Dels=0.00;FS=39.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.91;MQ0=0;MQRankSum=-6.696;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.673;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:167,0,1562 chrX 24461 . C A,T 1895.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=52.23;MQ0=0;QD=21.53;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,23,65:88:99:1955,1581,1536,374,0,197 chrX 24473 . A G 363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.529;DP=92;Dels=0.00;FS=1.958;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=-5.685;QD=3.95;ReadPosRankSum=-1.784;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,27:92:99:393,0,1478 chrX 24488 . A T 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.84;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2441,255,0 chrX 24532 . G A 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.625;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-6.453;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.067;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:875,0,1209 chrX 24569 . T C 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.830;DP=90;Dels=0.00;FS=0.799;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQ0=0;MQRankSum=6.789;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.807;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:999,0,894 chrX 24638 . G A 1285.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.122;DP=106;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=4.8339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.22;MQ0=0;MQRankSum=4.992;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1315,0,950 chrX 24640 . T C 942.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;DP=106;Dels=0.00;FS=3.606;HaplotypeScore=4.8339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.22;MQ0=0;MQRankSum=-4.829;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.203;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:972,0,1299 chrX 24647 . T A 835.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.690;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.248;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:865,0,1377 chrX 24710 . G A 112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.160;DP=80;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=2.9387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQ0=0;MQRankSum=-5.202;QD=1.40;ReadPosRankSum=-2.356;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:142,0,1394 chrX 24716 . C T 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.107;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.89;MQ0=0;MQRankSum=-4.875;QD=0.20;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,13:77:45:45,0,1421 chrX 24785 . C T 2265 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.21;MQ0=0;QD=25.17;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2298,231,0 chrX 24873 . A G 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.256;DP=77;Dels=0.00;FS=19.032;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.676;QD=0.15;ReadPosRankSum=1.573;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,13:77:41:41,0,1518 chrX 24887 . C T 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;DP=67;Dels=0.00;FS=18.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.82;MQ0=0;MQRankSum=-3.385;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,13:67:74:74,0,1235 chrX 24894 . T C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;DP=66;Dels=0.00;FS=18.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.00;MQ0=0;MQRankSum=2.693;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.693;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,53:66:79:1258,0,79 chrX 24908 . G A 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.234;DP=67;Dels=0.00;FS=16.295;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.319;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,12:67:58:58,0,1228 chrX 24913 . G A 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.804;DP=76;Dels=0.00;FS=14.767;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.33;MQ0=0;MQRankSum=2.365;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.502;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,62:76:60:1473,0,60 chrX 24947 . A T 1347 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.78;MQ0=0;QD=22.83;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1380,150,0 chrX 24968 . G A 718 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.46;MQ0=0;QD=17.51;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:81:751,81,0 chrX 24971 . A G 607 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.22;MQ0=0;QD=16.41;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:72:640,72,0 chrX 24974 . A G 579 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.45;MQ0=0;QD=16.54;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:69:612,69,0 chrX 24983 . C T 689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.48;MQ0=0;QD=18.62;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:78:722,78,0 chrX 24986 . G C 650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=17.11;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:81:683,81,0 chrX 24996 . T G 691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.51;MQ0=0;QD=17.72;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:84:724,84,0 chrX 25025 . A T 556 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=0;QD=20.59;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:63:589,63,0 chrX 25027 . G T 558 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=0;QD=20.67;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:63:591,63,0 chrX 25055 . C T 625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=24.04;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:72:658,72,0 chrX 25070 . C A 758 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.09;MQ0=0;QD=23.69;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:87:791,87,0 chrX 25079 . A G 757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=22.94;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:90:790,90,0 chrX 25082 . T G 726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=22.00;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:87:759,87,0 chrX 25091 . G A 832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.17;MQ0=0;QD=23.77;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:93:865,93,0 chrX 25099 . G A 864 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.22;MQ0=0;QD=23.35;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:96:897,96,0 chrX 25103 . G A 790 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.43;MQ0=0;QD=23.24;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:90:823,90,0 chrX 25106 . T C 790 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.45;MQ0=0;QD=22.57;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:90:823,90,0 chrX 25127 . G A 921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=24.24;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:954,102,0 chrX 25133 . T C 871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.74;MQ0=0;QD=23.54;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:904,99,0 chrX 25145 . A G 907 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.26;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:940,102,0 chrX 25151 . T C 957 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.77;MQ0=0;QD=22.79;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:990,111,0 chrX 25154 . G A 1041 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.79;MQ0=0;QD=23.13;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1074,114,0 chrX 25160 . G A 1119 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.62;MQ0=0;QD=22.38;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1152,126,0 chrX 25165 . T C 874 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=21.85;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:907,99,0 chrX 25166 . T A 886 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=22.15;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:919,99,0 chrX 25169 . G A 885 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=22.12;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:918,99,0 chrX 25170 . T C 841 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=21.02;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:874,99,0 chrX 25175 . A G 840 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.36;MQ0=0;QD=18.67;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:873,102,0 chrX 25190 . C T 848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.10;MQ0=0;QD=19.72;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:96:881,96,0 chrX 25208 . A G 1136 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.94;MQ0=0;QD=20.65;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1169,132,0 chrX 25211 . T A 1147 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=21.24;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1180,129,0 chrX 25214 . T C 1037 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.90;MQ0=0;QD=19.57;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1070,123,0 chrX 25223 . T C 1034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.88;MQ0=0;QD=19.88;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1067,120,0 chrX 25232 . G A 1275 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.08;MQ0=0;QD=20.24;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1308,144,0 chrX 25238 . A G 1149 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.08;MQ0=0;QD=18.24;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1182,132,0 chrX 25239 . A T 1133 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.08;MQ0=0;QD=17.98;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1166,129,0 chrX 25243 . T G 1107 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.15;MQ0=0;QD=16.28;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1140,135,0 chrX 25250 . G C 1022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.05;MQ0=0;QD=16.75;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1055,120,0 chrX 25259 . C T 1030 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.15;MQ0=0;QD=18.07;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1063,114,0 chrX 25262 . G A 1015 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=0;QD=18.80;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1048,114,0 chrX 25264 . T C 934 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=0;QD=17.30;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:54:99:967,111,0 chrX 25298 . C T 1270 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.08;MQ0=0;QD=20.16;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1303,144,0 chrX 25304 . A G 1020 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=18.55;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1053,120,0 chrX 25306 . C T 1071 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=19.47;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1104,120,0 chrX 25310 . C A 1094 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.17;MQ0=0;QD=18.86;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1127,123,0 chrX 25313 . G A 1104 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.05;MQ0=0;QD=18.10;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1137,123,0 chrX 25319 . G A 1335 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.91;MQ0=0;QD=18.80;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1368,153,0 chrX 25322 . G T 1426 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.91;MQ0=0;QD=20.08;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1459,159,0 chrX 25326 . T C 1219 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.84;MQ0=0;QD=18.19;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1252,147,0 chrX 25340 . A G 1775 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=0;QD=22.47;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1808,210,0 chrX 25346 . A G 1851 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.76;MQ0=0;QD=22.04;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1884,230,0 chrX 25349 . G A 2051 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.84;MQ0=0;QD=23.57;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2084,231,0 chrX 25352 . A T 2089 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.43;MQ0=0;QD=24.01;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2122,237,0 chrX 25358 . C T 2053 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.01;MQ0=0;QD=23.33;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2086,237,0 chrX 25563 . A G 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.11;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3274,339,0 chrX 25622 . A G 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.329;DP=105;Dels=0.00;FS=9.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=2.907;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.157;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:906,0,1155 chrX 25720 . C T 4434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4434,454,0 chrX 25877 . G T 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.236;DP=149;Dels=0.00;FS=7.216;HaplotypeScore=4.7245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.817;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1656,0,1444 chrX 26108 . C T 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3252,342,0 chrX 26191 . G A 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=25.90;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3730,367,0 chrX 26202 . T C 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.978e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3714,381,0 chrX 26272 . T C 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2764,294,0 chrX 26321 . C G 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;DP=101;Dels=0.01;FS=7.935;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.907;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:960,0,1083 chrX 26368 . G A 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2651,270,0 chrX 26481 . A G 2309 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2342,258,0 chrX 26493 . A G 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.086;DP=91;Dels=0.00;FS=12.166;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:955,0,906 chrX 26556 . G A 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3009,303,0 chrX 26567 . G T 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2913,288,0 chrX 26602 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.469;DP=109;Dels=0.00;FS=4.672;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1236,0,907 chrX 26631 . C T 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2598,258,0 chrX 26666 . G T 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2665,273,0 chrX 26695 . A G 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3115,336,0 chrX 26910 . G A 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3191,327,0 chrX 26946 . T C 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3320,363,0 chrX 26958 . G A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2997,306,0 chrX 26988 . T C 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2920,315,0 chrX 27163 . C T 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3167,304,0 chrX 27203 . C T 2380 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.59;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2413,237,0 chrX 27210 . C T 2422 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2455,249,0 chrX 27301 . G A 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.03;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3582,357,0 chrX 27330 . G A 2905 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.71;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2938,297,0 chrX 27332 . T C 3155 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.57;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3188,336,0 chrX 27339 . T C 2943 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.27;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2976,318,0 chrX 27494 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.978;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1413,0,1046 chrX 27510 . T C 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=22.09;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:2883,300,0 chrX 27780 . T C 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.46;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2630,282,0 chrX 27930 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.044;DP=112;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.428;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1293,0,1056 chrX 27942 . C T 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3359,340,0 chrX 28011 . T C 4001.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=1;QD=25.16;SB=-2.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4001,411,0 chrX 28144 . A G 4274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8374;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=24.99;SB=-2.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:171:99:4274,441,0 chrX 28147 . G C 4145.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4145,426,0 chrX 28178 . C T 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4054,412,0 chrX 28314 . G A 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.50;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3053,321,0 chrX 28338 . C T 109.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=77.3207;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.96;MQ0=0;QD=1.24;SB=-9.753e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:15:142,15,0 chrX 28380 . C T 2379 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.17;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2412,252,0 chrX 28401 . G A 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3359,345,0 chrX 28422 . T C 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3158,327,0 chrX 28769 . G T 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3514,366,0 chrX 28795 . G A 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.29;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3493,360,0 chrX 28824 . A G 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8844;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=24.80;ReadPosRankSum=1.175;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3547,351,0 chrX 28846 . T C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.096;DP=132;Dels=0.00;FS=2.212;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1468,0,1185 chrX 28919 . T A 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;QD=24.42;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3183,342,0 chrX 28984 . C T 577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.193;DP=112;Dels=0.00;FS=8.885;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=1;MQRankSum=-0.985;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:607,0,1051 chrX 29052 . A G 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.427;DP=140;Dels=0.00;FS=4.096;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=2.786;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.626;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,55:140:99:1045,0,1875 chrX 29088 . A T 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3436,349,0 chrX 29145 . C A 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3669,375,0 chrX 29241 . G A 2593 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2626,264,0 chrX 29255 . A T 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3162,324,0 chrX 29300 . C T 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2926,306,0 chrX 29329 . G A 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3187,339,0 chrX 29376 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.320;DP=120;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.387;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1302,0,1132 chrX 29423 . T C 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3149,342,0 chrX 29443 . C T 2720 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=473.5890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.58;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2753,294,0 chrX 29515 . G A 2053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.03;MQ0=0;QD=21.61;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2086,210,0 chrX 29538 . C G 2113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.69;MQ0=0;QD=21.34;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2146,231,0 chrX 29540 . G T 2231 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.82;MQ0=0;QD=23.00;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2264,234,0 chrX 29610 . C G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3177,342,0 chrX 29671 . G T 3820.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.97;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3820,382,0 chrX 29791 . A T 2388 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2421,252,0 chrX 29806 . A T 2556 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.20;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2589,267,0 chrX 29815 . G T 2207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;QD=25.08;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:88:99:2240,228,0 chrX 29943 . T C 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.84;MQ0=0;QD=23.26;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2731,300,0 chrX 29944 . T C 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.84;MQ0=0;QD=23.79;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2793,300,0 chrX 29957 . G A 1893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.63;MQ0=0;QD=17.53;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:1926,201,0 chrX 30010 . T C 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.484;DP=111;Dels=0.00;FS=1.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:856,0,820 chrX 30160 . G T 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=24.47;ReadPosRankSum=1.649;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3092,321,0 chrX 30164 . T G 3523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3523,369,0 chrX 30203 . T C 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.380;DP=128;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.294;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1498,0,1211 chrX 30226 . G A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.473;DP=122;Dels=0.00;FS=4.454;HaplotypeScore=3.5243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.228;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1161,0,1349 chrX 30252 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.362;DP=126;Dels=0.00;FS=5.703;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1279,0,1320 chrX 30273 . T C 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.59;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2941,315,0 chrX 30288 . G T 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3454,346,0 chrX 30291 . C T 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3488,349,0 chrX 30332 . A G 4001.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=25.01;SB=-2.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4001,426,0 chrX 30485 . G C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.391;DP=106;Dels=0.00;FS=6.504;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:1346,0,769 chrX 30542 . C T 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=26.98;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2731,279,0 chrX 30579 . T G 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3075,315,0 chrX 30629 . T C 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.27;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2948,309,0 chrX 30656 . C T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.91;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3019,315,0 chrX 30667 . A G 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.72;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2954,324,0 chrX 30685 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.527;DP=112;Dels=0.00;FS=5.981;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.85;MQ0=0;MQRankSum=-3.894;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.090;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:908,0,1298 chrX 30689 . G A 2755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2788,285,0 chrX 30701 . C A 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.62;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3053,318,0 chrX 30890 . A T 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.13;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2689,276,0 chrX 30925 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.569;DP=124;Dels=0.00;FS=6.821;HaplotypeScore=3.8715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.02;ReadPosRankSum=-2.079;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1273,0,1317 chrX 30982 . G A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.062;DP=123;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.089;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1210,0,1416 chrX 31017 . T C 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.18;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3569,375,0 chrX 31171 . A T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.099;DP=128;Dels=0.00;FS=8.329;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.342;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1346,0,1378 chrX 31175 . T A 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3486,363,0 chrX 31505 . T C 3616.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3616,384,0 chrX 31610 . T C 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=23.50;ReadPosRankSum=1.708;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3384,354,0 chrX 31614 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.816;DP=142;Dels=0.00;FS=8.846;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.290;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1389,0,1500 chrX 31621 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;DP=147;Dels=0.00;FS=10.177;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.074;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1384,0,1559 chrX 31720 . G A 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.378;DP=125;Dels=0.00;FS=3.289;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.495;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1065,0,1451 chrX 31756 . A T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.393;DP=117;Dels=0.00;FS=5.878;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.552;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1469,0,1047 chrX 31774 . A G 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.523;DP=122;Dels=0.00;FS=8.223;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.334;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1402,0,1126 chrX 31779 . A T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.686;DP=118;Dels=0.00;FS=4.509;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.084;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1430,0,1044 chrX 31798 . C G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2995,312,0 chrX 31824 . G A 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.334;DP=110;Dels=0.00;FS=8.791;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=-3.222;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.072;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1078,0,1070 chrX 31838 . G A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.105;DP=111;Dels=0.00;FS=4.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.657;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.298;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1067,0,1118 chrX 31900 . A G 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.204;DP=148;Dels=0.00;FS=1.298;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.514;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1654,0,1430 chrX 31964 . T C 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2970,336,0 chrX 31975 . T C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.473;DP=118;Dels=0.00;FS=10.039;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1242,0,1266 chrX 32004 . G A 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3551,366,0 chrX 32051 . T C 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3693,390,0 chrX 32287 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.797;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.644;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1535,0,1171 chrX 32714 . G A 4077.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4077,412,0 chrX 32847 . G A 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.451;DP=153;Dels=0.00;FS=1.272;HaplotypeScore=73.4777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:153:99:1710,0,1381 chrX 32961 . A T 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.140;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.833;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.086;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1741,0,1393 chrX 32964 . A G 3906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3906,426,0 chrX 33178 . A G 2688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.22;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2721,312,0 chrX 33235 . A G 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=22.54;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3031,321,0 chrX 33256 . G A 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2769,285,0 chrX 33289 . G A 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3120,321,0 chrX 33473 . T C 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2821,300,0 chrX 33525 . C G 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2811,294,0 chrX 33710 . A T 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.379;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1024,0,1343 chrX 33728 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.772;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.315;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1279,0,1163 chrX 33800 . A G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.484;DP=106;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.180;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1100,0,1105 chrX 33822 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.369;DP=108;Dels=0.00;FS=1.551;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1124,0,1102 chrX 33847 . T G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.713;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1026,0,1210 chrX 33926 . C T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.454;DP=137;Dels=0.00;FS=2.325;HaplotypeScore=3.8207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.002;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1315,0,1501 chrX 34012 . A G 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.113;DP=100;Dels=0.00;FS=5.186;HaplotypeScore=3.9624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.207;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:878,0,1143 chrX 34093 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.601;DP=147;Dels=0.00;FS=6.074;HaplotypeScore=4.6940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.792;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1494,0,1547 chrX 34147 . A G 4047.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4047,435,0 chrX 34341 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.561;DP=164;Dels=0.00;FS=3.829;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1467,0,1843 chrX 34438 . G A 4352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:165:99:4352,451,0 chrX 34465 . A G 4290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4290,453,0 chrX 34681 . G A 2180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.738;DP=167;Dels=0.00;FS=2.765;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,99:167:99:2210,0,1273 chrX 34692 . G A 2042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.884;DP=153;Dels=0.00;FS=4.894;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.663;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,90:153:99:2072,0,1148 chrX 34810 . A G 1883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.225;DP=198;Dels=0.00;FS=1.113;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.245;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.142;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,103:198:99:1913,0,2010 chrX 34837 . T C 4951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.51;SB=-2.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:4951,517,0 chrX 34918 . G A 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.763;DP=131;Dels=0.00;FS=9.333;HaplotypeScore=2.7165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.547;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:131:99:1586,0,1021 chrX 35035 . A T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=2.179;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.343;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1232,0,1163 chrX 35176 . G C 1849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.019;DP=146;Dels=0.00;FS=26.235;HaplotypeScore=2.7398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.292;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,90:146:99:1879,0,997 chrX 35269 . G A 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.979;DP=117;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.489;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,80:117:99:1813,0,591 chrX 35362 . A G 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.738;DP=131;Dels=0.00;FS=3.375;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.940;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1519,0,1095 chrX 35365 . G A 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.772;DP=131;Dels=0.00;FS=3.376;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.133;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:131:99:1596,0,1077 chrX 35494 . G T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.797;DP=139;Dels=0.00;FS=5.095;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.582;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1497,0,1414 chrX 35512 . C T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.630;DP=123;Dels=0.00;FS=2.287;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.272;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1405,0,1168 chrX 35524 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.830;DP=117;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.275;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1151,0,1253 chrX 35563 . T C 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=22.97;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2491,270,0 chrX 35569 . A G 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.888;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.329;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:856,0,1380 chrX 35623 . A C 3398.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3398,348,0 chrX 35625 . G A 1278.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.466;DP=143;Dels=0.00;FS=5.017;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.051;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1308,0,1587 chrX 35632 . G A 3482.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3482,349,0 chrX 35651 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.439;DP=125;Dels=0.00;FS=5.483;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1411,0,1135 chrX 35680 . A G 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3705,399,0 chrX 35704 . T C 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.528;DP=144;Dels=0.00;FS=3.038;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,81:144:99:1680,0,1293 chrX 35752 . G A 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.001;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.235;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1583,0,1354 chrX 35812 . G A 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.088;DP=91;Dels=0.00;FS=1.706;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.379;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:1053,0,867 chrX 35830 . A G 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.863;DP=103;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.851;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1150,0,981 chrX 35895 . C T 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.308;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.312;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1182,0,1404 chrX 35923 . C G 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.398;DP=135;Dels=0.00;FS=4.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1423,0,1204 chrX 36034 . A G 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3371,372,0 chrX 36050 . G A 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.114;DP=142;Dels=0.00;FS=6.487;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.329;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,83:142:99:1843,0,1165 chrX 36085 . G A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.296;DP=145;Dels=0.00;FS=3.006;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,60:145:99:1210,0,1746 chrX 36139 . A C 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.293;DP=151;Dels=0.00;FS=2.960;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1680,0,1431 chrX 36168 . T C 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.640;DP=159;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=2.190;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.570;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,82:159:99:1667,0,1551 chrX 36217 . C T 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3455,360,0 chrX 36357 . A G 2644 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.99;MQ0=0;QD=21.50;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:2677,312,0 chrX 36362 . A C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.413;DP=122;Dels=0.00;FS=4.365;HaplotypeScore=5.7688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQ0=0;MQRankSum=-3.182;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.513;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1004,0,1235 chrX 36391 . G A 1031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=126.5112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=3;QD=6.29;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:1064,111,0 chrX 36583 . A G 3825.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.76;SB=-2.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3825,414,0 chrX 36599 . T G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.633;DP=163;Dels=0.00;FS=3.615;HaplotypeScore=3.3917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.785;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,80:163:99:1618,0,1721 chrX 36747 . G A 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.143;DP=159;Dels=0.00;FS=1.985;HaplotypeScore=2.7569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.840;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1748,0,1474 chrX 36769 . C G 1699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;DP=173;Dels=0.00;FS=7.674;HaplotypeScore=3.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=9.82;ReadPosRankSum=2.215;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,88:173:99:1729,0,1684 chrX 36808 . G C 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.611;DP=158;Dels=0.00;FS=1.241;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.169;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1659,0,1495 chrX 36818 . C G 3879.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3879,423,0 chrX 37127 . T C 4125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9198;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4125,429,0 chrX 37215 . G A 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.219;DP=155;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=6.0362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=1.519;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1719,0,1418 chrX 37236 . G A 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.620;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=1.824;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.049;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,80:160:99:1690,0,1611 chrX 37272 . G A 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.319;DP=152;Dels=0.00;FS=2.037;HaplotypeScore=3.9629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1690,0,1436 chrX 37281 . C T 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.555;DP=156;Dels=0.00;FS=1.270;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.022;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1721,0,1525 chrX 37360 . G A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.590;DP=138;Dels=0.00;FS=5.053;HaplotypeScore=3.5637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.574;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1374,0,1421 chrX 37362 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.481;DP=137;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=2.8986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.260;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1363,0,1430 chrX 37922 . G A 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2646,276,0 chrX 37925 . G C 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2536,273,0 chrX 37938 . T G 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.34;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3234,345,0 chrX 38304 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.530;DP=143;Dels=0.00;FS=2.972;HaplotypeScore=2.9008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.740;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.370;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1269,0,1663 chrX 38466 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.801;DP=110;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.389;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1407,0,930 chrX 38691 . A G 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3223,345,0 chrX 38964 . C T 1983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.647;DP=164;Dels=0.00;FS=6.487;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.011;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,91:164:99:2013,0,1411 chrX 39008 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.314;DP=136;Dels=0.00;FS=12.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1136,0,1743 chrX 39525 . G A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.461;DP=108;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:108:99:1433,0,844 chrX 39598 . A G 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3473,351,0 chrX 39814 . C T 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3546,367,0 chrX 40100 . A T 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.327;DP=119;Dels=0.00;FS=13.302;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.514;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,42:119:99:777,0,1765 chrX 40107 . G T 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.101;DP=121;Dels=0.00;FS=16.820;HaplotypeScore=3.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.585;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,44:121:99:842,0,1684 chrX 40195 . C T 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.756;DP=119;Dels=0.00;FS=6.193;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=1;MQRankSum=0.225;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.412;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1018,0,1456 chrX 40239 . T C 2208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;QD=24.26;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2241,240,0 chrX 40454 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.278;DP=138;Dels=0.00;FS=7.620;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1405,0,1429 chrX 41076 . A T 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;DP=131;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=5.4113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1213,0,1520 chrX 41107 . T C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.775;DP=124;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.597;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1195,0,1325 chrX 41200 . G T 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.314;DP=140;Dels=0.00;FS=3.170;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.721;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1632,0,1270 chrX 41577 . T C 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3183,336,0 chrX 41794 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.567;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.464;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1457,0,1537 chrX 41803 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.881;DP=135;Dels=0.00;FS=3.744;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1412,0,1387 chrX 42451 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.554;DP=116;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.570;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1369,0,951 chrX 42493 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.956;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.335;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1198,0,1437 chrX 42655 . A G 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.903;DP=111;Dels=0.00;FS=1.590;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.340;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:993,0,1257 chrX 42694 . C A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.292;DP=110;Dels=0.00;FS=17.011;HaplotypeScore=5.7475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.591;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1307,0,960 chrX 42718 . G A 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.000;DP=117;Dels=0.00;FS=7.120;HaplotypeScore=5.6748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:998,0,1321 chrX 42736 . T C 1081.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.040;DP=139;Dels=0.00;FS=4.088;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.162;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:139:99:1111,0,1658 chrX 42739 . A G 1631.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.786;DP=143;Dels=0.00;FS=2.998;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,84:143:99:1661,0,1193 chrX 42745 . C T 1768.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.534;DP=142;Dels=0.00;FS=1.330;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=2.290;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.209;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1798,0,1193 chrX 42882 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.594;DP=127;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.717;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1234,0,1427 chrX 42958 . A G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.464;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,52:124:99:986,0,1543 chrX 43189 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.071;DP=123;Dels=0.00;FS=4.578;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=9.49;ReadPosRankSum=2.293;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1197,0,1385 chrX 43261 . G C 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.409;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.648;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:996,0,1543 chrX 43500 . T G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.290;DP=120;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=3.1000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.677;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:120:99:1183,0,1243 chrX 43594 . A C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.359;DP=116;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.656;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1034,0,1319 chrX 43681 . G A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;DP=122;Dels=0.00;FS=7.329;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.530;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1219,0,1238 chrX 43722 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.790;DP=115;Dels=0.00;FS=5.953;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.932;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1234,0,1179 chrX 43768 . C T 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.364;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.831;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:87:99:899,0,874 chrX 43779 . T C 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.924;DP=81;Dels=0.00;FS=0.840;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.347;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,39:81:99:763,0,884 chrX 43846 . C T 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;DP=100;Dels=0.00;FS=2.789;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=8.60;ReadPosRankSum=2.383;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:890,0,1132 chrX 44566 . C T 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;DP=139;Dels=0.00;FS=2.188;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,82:139:99:1800,0,1114 chrX 44626 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.526;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.946;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,62:144:99:1269,0,1756 chrX 44714 . G A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.655;DP=133;Dels=0.00;FS=3.108;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.110;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1461,0,1336 chrX 44863 . G A 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3586,361,0 chrX 44980 . T C 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3526,360,0 chrX 45138 . A G 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.897;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1545,0,1211 chrX 45217 . C T 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.901e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3761,385,0 chrX 45262 . A G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.119;DP=132;Dels=0.00;FS=5.495;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1258,0,1307 chrX 45922 . G A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.167;DP=133;Dels=0.00;FS=2.250;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.911;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.047;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:133:99:1154,0,1605 chrX 47059 . T C 670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.268;DP=139;Dels=0.00;FS=3.151;HaplotypeScore=20.6972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.134;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,52:139:99:700,0,1446 chrX 47473 . T C 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;DP=125;Dels=0.00;FS=5.287;HaplotypeScore=3.8916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=24.58;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3105,299,0 chrX 47899 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.767;DP=124;Dels=0.00;FS=3.216;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1442,0,1214 chrX 47941 . C T 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.406;DP=113;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.687;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1282,0,1083 chrX 48186 . G A 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3072,309,0 chrX 48515 . G C 3978.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:3978,426,0 chrX 48559 . C G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1339,0,1375 chrX 48799 . G A 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3666,361,0 chrX 49015 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.734;DP=135;Dels=0.00;FS=3.073;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.349;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1386,0,1483 chrX 49357 . G A 1895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.730;DP=146;Dels=0.00;FS=4.084;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.259;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,86:146:99:1925,0,1208 chrX 49501 . G A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.814;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.941;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1405,0,1134 chrX 49768 . T C 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3852,420,0 chrX 50063 . G A 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.731;DP=176;Dels=0.00;FS=3.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=10.19;ReadPosRankSum=2.158;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,92:176:99:1824,0,1740 chrX 50362 . A C 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.568;DP=140;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=23.6464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.319;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1147,0,1562 chrX 50434 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.247;DP=157;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=7.87;ReadPosRankSum=2.596;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1265,0,1579 chrX 50613 . A C 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;DP=108;Dels=0.00;FS=1.626;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.135;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1156,0,1097 chrX 50773 . A T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;DP=113;Dels=0.00;FS=14.795;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=12.36;ReadPosRankSum=-2.187;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1427,0,1038 chrX 51007 . C T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.950;DP=138;Dels=0.00;FS=3.362;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:138:99:1033,0,1695 chrX 52454 . T C 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.660;DP=112;Dels=0.00;FS=2.452;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:877,0,1462 chrX 52600 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.300;DP=114;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1427,0,907 chrX 52757 . C T 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.349;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.867;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1745,0,1251 chrX 52825 . C T 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.210;DP=137;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=4.6993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.734;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1525,0,1365 chrX 52870 . T A 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.984;DP=123;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1483,0,1185 chrX 52932 . T C 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3089,321,0 chrX 53177 . G A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.489;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.767;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.075;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:123:99:1118,0,1427 chrX 53312 . A G 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3314,354,0 chrX 53317 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.441;DP=138;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1499,0,1341 chrX 53513 . A T 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3223,336,0 chrX 53550 . G A 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3311,339,0 chrX 53568 . G A 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3674,361,0 chrX 53592 . T C 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3257,342,0 chrX 53727 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.827;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=7.08;ReadPosRankSum=-1.951;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,70:157:99:1141,0,1926 chrX 53842 . A G 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3615,387,0 chrX 53872 . G A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.441;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.017;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1097,0,1431 chrX 54177 . A G 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.445;DP=130;Dels=0.00;FS=4.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1543,0,1249 chrX 54232 . C G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;DP=106;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.417;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1085,0,1109 chrX 54260 . T C 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;DP=150;Dels=0.00;FS=5.973;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.341;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1386,0,1737 chrX 54420 . T C 4077.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4077,438,0 chrX 54825 . G A 3709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.68;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3709,384,0 chrX 54966 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.786;DP=152;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,65:152:99:1322,0,1884 chrX 55276 . A T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;DP=117;Dels=0.00;FS=8.686;HaplotypeScore=3.8402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1300,0,1238 chrX 55292 . G T 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.726;DP=111;Dels=0.00;FS=3.502;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.068;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1255,0,1148 chrX 55335 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.822;DP=127;Dels=0.00;FS=5.499;HaplotypeScore=10.9008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1263,0,1394 chrX 55919 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.412;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=10.54;ReadPosRankSum=-2.635;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1443,0,1231 chrX 56320 . G A 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3421,328,0 chrX 57144 . T C 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.535;DP=134;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.564;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,51:134:99:942,0,1875 chrX 57359 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.103;DP=124;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1184,0,1358 chrX 57489 . T A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.882;DP=148;Dels=0.00;FS=4.891;HaplotypeScore=2.7227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=2;MQRankSum=-0.482;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.035;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1633,0,1522 chrX 58028 . G A 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.182;DP=152;Dels=0.00;FS=4.887;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.522;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1734,0,1454 chrX 58040 . A G 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.361;DP=169;Dels=0.00;FS=10.896;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:169:99:1682,0,1691 chrX 58202 . C A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3060;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3262,354,0 chrX 58385 . G A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.393;DP=133;Dels=0.00;FS=4.270;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1278,0,1440 chrX 58400 . G T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.161;DP=143;Dels=0.00;FS=5.001;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1494,0,1475 chrX 58414 . T C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.584;DP=131;Dels=0.00;FS=5.347;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.338;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1316,0,1418 chrX 58679 . A C 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.113;DP=141;Dels=0.00;FS=5.088;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.229;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1589,0,1437 chrX 58706 . T C 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.476;DP=141;Dels=0.00;FS=5.136;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.008;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1584,0,1312 chrX 58998 . T C 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;DP=145;Dels=0.00;FS=4.528;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.374;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1454,0,1680 chrX 59187 . T C 4194.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=24.82;SB=-2.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4194,441,0 chrX 59202 . A G 4399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4399,450,0 chrX 59251 . T C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.209;DP=137;Dels=0.00;FS=6.209;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1511,0,1308 chrX 59301 . T C 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.913;DP=105;Dels=0.00;FS=9.584;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.048;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:875,0,1278 chrX 59376 . C T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.488;DP=131;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.497;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1544,0,1182 chrX 59484 . A G 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.555;DP=152;Dels=0.00;FS=10.049;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=1.515;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.943;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1598,0,1548 chrX 59485 . G T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.820;DP=149;Dels=0.00;FS=7.425;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.864;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1484,0,1636 chrX 59496 . G A 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3781,399,0 chrX 59557 . T A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=145;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.67;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1556,0,1597 chrX 59610 . G A 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.970;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.794;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.091;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:804,0,1211 chrX 59636 . G T 1130.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.446;DP=103;Dels=0.00;FS=1.696;HaplotypeScore=29.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.04;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=10.97;ReadPosRankSum=2.438;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1160,0,675 chrX 59637 . G A 1102.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.865;DP=100;Dels=0.00;FS=2.752;HaplotypeScore=29.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.74;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=11.02;ReadPosRankSum=2.881;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1132,0,667 chrX 59642 . G A 1396 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.8273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.56;MQ0=0;QD=15.69;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1429,150,0 chrX 59645 . G T 386.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.068;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.183;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:416,0,1063 chrX 59646 . T C 378.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.456;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,30:89:99:408,0,1201 chrX 59648 . T A 2070 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=23.6460;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.98;MQ0=0;QD=22.75;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2103,222,0 chrX 59662 . A G 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.968;DP=105;Dels=0.00;FS=4.918;HaplotypeScore=49.4515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.55;MQ0=0;MQRankSum=2.121;QD=11.01;ReadPosRankSum=3.372;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1186,0,363 chrX 59681 . T C 60.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.784;DP=117;Dels=0.00;FS=3.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.238;QD=0.51;ReadPosRankSum=-2.566;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:90:90,0,1390 chrX 59683 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.909;DP=118;Dels=0.00;FS=4.466;HaplotypeScore=52.1914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.62;MQ0=0;MQRankSum=2.221;QD=10.75;ReadPosRankSum=2.285;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1299,0,173 chrX 59703 . T C 378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.918;DP=116;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=49.2901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.174;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:116:99:408,0,1306 chrX 59791 . A C 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.615;DP=167;Dels=0.00;FS=6.643;HaplotypeScore=5.4846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.953;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,81:167:99:1611,0,1800 chrX 59804 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.847;DP=172;Dels=0.00;FS=2.665;HaplotypeScore=2.5130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.011;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,82:172:99:1654,0,1844 chrX 59946 . G A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.647;DP=128;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.352;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1553,0,1139 chrX 59967 . G A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.578;DP=121;Dels=0.00;FS=4.496;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,75:121:99:1676,0,812 chrX 59991 . C T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.658;DP=125;Dels=0.00;FS=5.692;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.643;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:125:99:1458,0,997 chrX 60178 . T A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;DP=127;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.439;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1338,0,1398 chrX 60211 . T C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.246;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1280,0,1429 chrX 60299 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.279;DP=152;Dels=0.00;FS=3.077;HaplotypeScore=2.6210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=8.22;ReadPosRankSum=2.155;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1280,0,1750 chrX 60425 . T C 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.656;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:139:99:1386,0,1418 chrX 60645 . A T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.691;DP=134;Dels=0.00;FS=4.157;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.89;MQ0=0;MQRankSum=-3.245;QD=7.08;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:979,0,1720 chrX 60675 . T A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.873;DP=114;Dels=0.00;FS=4.218;HaplotypeScore=14.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.949;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.017;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1023,0,1274 chrX 60697 . G T 616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.789;DP=153;Dels=0.00;FS=363.630;HaplotypeScore=76.1024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.73;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=4.03;ReadPosRankSum=-9.106;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:646,0,154 chrX 60842 . T A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.252;DP=142;Dels=0.00;FS=2.127;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.484;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1542,0,1448 chrX 60959 . T C 1796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.928;DP=168;Dels=0.00;FS=2.796;HaplotypeScore=3.1396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.882;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,93:168:99:1826,0,1526 chrX 60979 . T A 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;DP=147;Dels=0.00;FS=6.105;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.015;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1618,0,1504 chrX 61012 . A G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.427;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=2.626;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1197,0,1377 chrX 61050 . A G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.354;DP=128;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.592;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1115,0,1492 chrX 61323 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.955;DP=137;Dels=0.00;FS=9.352;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.071;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1498,0,1280 chrX 61449 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;DP=153;Dels=0.00;FS=4.003;HaplotypeScore=5.9420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1408,0,1714 chrX 61584 . A G 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.132;DP=151;Dels=0.00;FS=3.161;HaplotypeScore=5.4236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.995;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,89:151:99:1929,0,1250 chrX 61680 . C T 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2625,264,0 chrX 61713 . G A 2229 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.578;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=24.77;ReadPosRankSum=1.694;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:90:99:2262,223,0 chrX 61814 . G A 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6786;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:142:99:3612,364,0 chrX 61827 . C T 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.648;DP=153;Dels=0.00;FS=2.038;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.520;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1664,0,1467 chrX 61833 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.881;DP=142;Dels=0.00;FS=5.010;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1227,0,1606 chrX 61893 . T C 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.041;DP=158;Dels=0.00;FS=5.810;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.129;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1799,0,1557 chrX 61926 . T A 4071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4071,409,0 chrX 61974 . A T 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3479,358,0 chrX 61995 . C T 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3634,376,0 chrX 62016 . A G 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2981,321,0 chrX 62065 . T C 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3356,351,0 chrX 62287 . G A 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.389;DP=152;Dels=0.00;FS=4.085;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1720,0,1452 chrX 62571 . A G 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3439,369,0 chrX 62857 . A G 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3347,360,0 chrX 62910 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.203;DP=145;Dels=0.00;FS=4.171;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.695;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1305,0,1655 chrX 63405 . T C 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8232;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=21.98;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:3605,369,0 chrX 63496 . C A 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.839;DP=155;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.414;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1588,0,1610 chrX 63597 . C T 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.13;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3893,411,0 chrX 63649 . T A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;DP=123;Dels=0.00;FS=6.630;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1353,0,1313 chrX 63874 . G A 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.901;DP=140;Dels=0.00;FS=9.551;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1607,0,1337 chrX 64093 . A C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.201;DP=136;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=5.6296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:136:99:1513,0,1324 chrX 64119 . G A 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.726;DP=137;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1516,0,1256 chrX 64213 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.676;DP=113;Dels=0.00;FS=9.148;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1208,0,1148 chrX 64629 . A G 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2726,288,0 chrX 64691 . A G 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.292;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=2.138;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1193,0,1104 chrX 65076 . G A 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2858,297,0 chrX 65469 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.989;DP=125;Dels=0.00;FS=9.763;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:125:99:1556,0,989 chrX 65790 . T C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.935;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.179;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:105:99:1020,0,1162 chrX 65819 . T A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;DP=93;Dels=0.00;FS=1.797;HaplotypeScore=2.9388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.195;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:972,0,974 chrX 65955 . T C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.631;DP=172;Dels=0.01;FS=6.242;HaplotypeScore=5.7646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.144;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,78:171:99:1438,0,2030 chrX 66411 . A G 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.958;DP=120;Dels=0.00;FS=7.411;HaplotypeScore=3.9096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=3.169;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:992,0,1374 chrX 66738 . A G 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.170;DP=126;Dels=0.00;FS=5.460;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1199,0,1485 chrX 66981 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.718;DP=124;Dels=0.00;FS=3.365;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.213;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1396,0,1158 chrX 67074 . T A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.002;DP=146;Dels=0.00;FS=2.383;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,57:146:99:1166,0,1952 chrX 67117 . C T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.132;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,74:119:99:1537,0,865 chrX 67305 . T A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.295;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1223,0,1297 chrX 67409 . C T 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.605;DP=178;Dels=0.00;FS=1.175;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.652;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,89:178:99:1882,0,1806 chrX 67499 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.595;DP=119;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1158,0,1287 chrX 67631 . C A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.994;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1310,0,1505 chrX 67654 . C T 1210.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.587;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.26;MQ0=0;MQRankSum=-5.726;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1240,0,1635 chrX 67660 . T C 924.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.234;DP=132;Dels=0.00;FS=3.786;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.41;MQ0=0;MQRankSum=-5.776;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.710;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,51:132:99:954,0,1843 chrX 67662 . A G 998.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.473;DP=127;Dels=0.00;FS=1.724;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQ0=0;MQRankSum=-6.006;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.741;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:1028,0,1691 chrX 67686 . G A 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.183;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.629;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.719;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,43:107:99:897,0,1370 chrX 67836 . A T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.339;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1272,0,1473 chrX 68303 . C A 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.040;DP=180;Dels=0.00;FS=1.831;HaplotypeScore=5.9508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.389;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,90:180:99:1845,0,1864 chrX 68438 . T C 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.395;DP=151;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.534;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:151:99:1399,0,1669 chrX 68514 . T C 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.880;DP=184;Dels=0.00;FS=0.558;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.357;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,89:184:99:1769,0,1982 chrX 68834 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.584;DP=115;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.392;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1357,0,1011 chrX 68840 . A T 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;DP=106;Dels=0.00;FS=4.893;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1008,0,1287 chrX 68863 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.022;DP=138;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=7.6760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.951;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1366,0,1515 chrX 68878 . T C 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.659;DP=127;Dels=0.00;FS=3.240;HaplotypeScore=3.6588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.352;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1493,0,1205 chrX 68963 . A G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.574;DP=121;Dels=0.00;FS=4.809;HaplotypeScore=2.8251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.751;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:120:99:1380,0,1135 chrX 68995 . G T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.947;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=7.35;ReadPosRankSum=2.054;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,58:140:99:1059,0,1710 chrX 69154 . C T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.696;DP=105;Dels=0.00;FS=1.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.452;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1061,0,1135 chrX 69568 . A G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.964;DP=141;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.841;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1241,0,1691 chrX 69580 . A G 3954.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3954,408,0 chrX 69643 . T G 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.671;DP=161;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,89:161:99:1836,0,1512 chrX 69760 . G A 3970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.998e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3970,411,0 chrX 69814 . T C 2891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2924,321,0 chrX 70069 . A G 1341.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.318;DP=146;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=2.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=9.18;ReadPosRankSum=-2.023;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1371,0,1652 chrX 70072 . A G 1363.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.683;DP=152;Dels=0.00;FS=3.058;HaplotypeScore=2.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.389;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.780;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1393,0,1704 chrX 70075 . C T 1386.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.450;DP=149;Dels=0.00;FS=2.184;HaplotypeScore=2.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.157;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.749;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:149:99:1416,0,1671 chrX 70147 . G A 4128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=27.52;SB=-2.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4128,418,0 chrX 70162 . A G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.485;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1428,0,1641 chrX 70181 . T C 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.004;DP=160;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.495;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,86:160:99:1800,0,1561 chrX 70321 . G A 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.69;SB=-2.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4007,406,0 chrX 70786 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.812;DP=112;Dels=0.00;FS=2.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=1;MQRankSum=1.226;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.371;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:980,0,1370 chrX 70825 . A G 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.056;DP=120;Dels=0.00;FS=2.470;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=1.634;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1013,0,1442 chrX 71179 . G A 2687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2720,279,0 chrX 71182 . G A 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2718,282,0 chrX 71194 . T A 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.035;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,57:96:99:1300,0,747 chrX 71273 . G A 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.678;DP=128;Dels=0.00;FS=3.210;HaplotypeScore=112.6035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:787,0,1241 chrX 71275 . T C 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.291;DP=129;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=122.5412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:129:99:699,0,1116 chrX 71395 . G A 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.982;DP=174;Dels=0.00;FS=6.746;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.554;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.246;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,80:174:99:1682,0,1997 chrX 71410 . A C 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.563;DP=166;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.772;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,81:166:99:1665,0,1822 chrX 71449 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.964;DP=135;Dels=0.00;FS=5.215;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1548,0,1227 chrX 71533 . G A 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.577;DP=123;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=10.34;ReadPosRankSum=-2.006;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1302,0,1223 chrX 71578 . C T 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3330,337,0 chrX 71752 . G A 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3028,300,0 chrX 71980 . C A 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=135;Dels=0.00;FS=3.108;HaplotypeScore=9.4384;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.885;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3487,352,0 chrX 72245 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.794;DP=129;Dels=0.01;FS=23.992;HaplotypeScore=11.4099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1191,0,1256 chrX 72544 . G C 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.75;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3152,330,0 chrX 72550 . A G 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.71;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3137,324,0 chrX 72556 . G A 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.74;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3388,343,0 chrX 73193 . T C 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3575,387,0 chrX 73368 . G A 4016.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4016,412,0 chrX 73391 . T C 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4054,435,0 chrX 73403 . C T 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.802;DP=150;Dels=0.00;FS=3.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.878;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1621,0,1624 chrX 73608 . T C 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3781,414,0 chrX 73745 . G A 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3234,322,0 chrX 73879 . A G 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3952,420,0 chrX 74038 . G A 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.048;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1527,0,1725 chrX 74077 . T C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.62;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3279,360,0 chrX 74341 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;DP=137;Dels=0.00;FS=4.098;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.015;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1200,0,1603 chrX 74530 . G A 2331 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=22.20;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2364,237,0 chrX 74625 . T C 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.560;DP=134;Dels=0.00;FS=9.481;HaplotypeScore=104.2642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=3.255;QD=0.32;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,78:134:73:73,0,87 chrX 74857 . T G 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2862,321,0 chrX 74905 . G A 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3864,385,0 chrX 74906 . T A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.663;DP=144;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1458,0,1639 chrX 74943 . G A 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.877;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.500;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1719,0,1276 chrX 75337 . A T 2709 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.72;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2742,279,0 chrX 75340 . C T 2903 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.44;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2936,297,0 chrX 75343 . G C 2830 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.94;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2863,306,0 chrX 75366 . C G 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2634,294,0 chrX 75467 . A G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.286;DP=143;Dels=0.00;FS=4.166;HaplotypeScore=2.6841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.584;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1474,0,1445 chrX 75666 . C T 812.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.250;DP=122;Dels=0.00;FS=4.607;HaplotypeScore=6.5147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.488;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:842,0,1131 chrX 75669 . C T 2415 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.17;MQ0=0;QD=21.56;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2448,252,0 chrX 75672 . G A 2093 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.27;MQ0=0;QD=22.03;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2126,222,0 chrX 75674 . C T 2077 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=21.64;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2110,222,0 chrX 75699 . G A 2387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.44;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2420,261,0 chrX 75793 . G A 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.113;DP=114;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.091;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1082,0,1130 chrX 75975 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.473;DP=141;Dels=0.00;FS=2.146;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=2.507;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.388;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1185,0,1708 chrX 76069 . A G 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3024,318,0 chrX 76073 . A G 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2683,288,0 chrX 76157 . G C 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;DP=159;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.353;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1591,0,1600 chrX 76159 . C T 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.678;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.151;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1588,0,1640 chrX 76206 . G A 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3916,388,0 chrX 76676 . T C 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.531;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.134;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:863,0,1400 chrX 76677 . T C 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.770;DP=101;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=8.41;ReadPosRankSum=-2.251;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:879,0,1230 chrX 76747 . A G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.515;DP=133;Dels=0.00;FS=4.672;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.976;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1207,0,1522 chrX 76787 . T C 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.931;DP=115;Dels=0.00;FS=3.442;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.559;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1006,0,1288 chrX 76793 . G A 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.243;DP=114;Dels=0.00;FS=3.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.980;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1052,0,1293 chrX 76842 . C T 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.138;DP=91;Dels=0.00;FS=1.733;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.788;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:91:99:832,0,1090 chrX 77140 . T G 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4927;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3567,378,0 chrX 77203 . A G 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3705,381,0 chrX 77355 . A G 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.804;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:853,0,1562 chrX 77525 . A G 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.126;DP=108;Dels=0.00;FS=2.562;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.788;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:961,0,1273 chrX 77730 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.400;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1220,0,1608 chrX 78222 . A G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.719;DP=108;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1094,0,1120 chrX 78273 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.760;DP=100;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.121;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:963,0,1123 chrX 78486 . G C 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.560;DP=153;Dels=0.00;FS=6.227;HaplotypeScore=3.7494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.830;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1456,0,1679 chrX 78942 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;DP=136;Dels=0.00;FS=6.449;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.224;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.142;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1218,0,1619 chrX 78981 . C T 274.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.948;DP=128;Dels=0.00;FS=42.697;HaplotypeScore=81.3681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.91;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=2.14;ReadPosRankSum=-4.077;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,27:128:99:304,0,1422 chrX 79092 . G A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.578;DP=114;Dels=0.00;FS=10.180;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1181,0,1226 chrX 79609 . C A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.211;DP=143;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=7.6037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.822;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,56:143:99:1014,0,1920 chrX 79642 . A G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.211;DP=143;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1165,0,1741 chrX 79647 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.814;DP=149;Dels=0.00;FS=4.932;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.307;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:1271,0,1831 chrX 79806 . C T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.457;DP=140;Dels=0.00;FS=2.197;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1599,0,1315 chrX 79812 . G A 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3633,367,0 chrX 79831 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.111;DP=133;Dels=0.00;FS=9.235;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.421;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1164,0,1507 chrX 79835 . A C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.306;DP=141;Dels=0.00;FS=11.919;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.241;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1266,0,1569 chrX 80008 . A T 980.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.238;DP=124;Dels=0.00;FS=50.539;HaplotypeScore=16.4049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=7.90;ReadPosRankSum=4.043;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,51:124:99:1010,0,1311 chrX 80055 . T A 4147.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4147,421,0 chrX 80077 . T G 1751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.403;DP=168;Dels=0.00;FS=1.972;HaplotypeScore=3.8020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.294;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,85:168:99:1781,0,1726 chrX 80094 . A T 4350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.739;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=26.52;ReadPosRankSum=1.457;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,163:164:99:4350,439,0 chrX 80102 . T G 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.844;DP=163;Dels=0.00;FS=2.810;HaplotypeScore=4.9641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.563;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,80:163:99:1646,0,1765 chrX 80159 . T C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.167;DP=128;Dels=0.00;FS=11.049;HaplotypeScore=3.3519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.194;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1058,0,1586 chrX 80208 . A G 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3751,387,0 chrX 80223 . T C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.712;DP=141;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=3.3901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.742;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:141:99:1232,0,1691 chrX 80358 . G A 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3373,339,0 chrX 80359 . G A 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3354,342,0 chrX 80433 . C T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.243;DP=125;Dels=0.00;FS=3.215;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=9.82;ReadPosRankSum=2.043;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:125:99:1258,0,1250 chrX 80439 . T C 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3116,345,0 chrX 80595 . A G 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.361;DP=155;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=3.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1352,0,1812 chrX 80604 . G A 4204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4204,427,0 chrX 80649 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.960;DP=133;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1462,0,1305 chrX 80742 . G A 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.233;DP=161;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1562,0,1678 chrX 80826 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.448;DP=123;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.260;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1456,0,1034 chrX 81028 . A G 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.696;DP=153;Dels=0.00;FS=6.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.134;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:1737,0,1442 chrX 81385 . A C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.861;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.143;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1294,0,1488 chrX 81387 . C A 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3516,360,0 chrX 81511 . G C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;DP=131;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.785;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1163,0,1588 chrX 81514 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.575;DP=136;Dels=0.00;FS=2.186;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=8.85;ReadPosRankSum=2.431;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1234,0,1681 chrX 81758 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.078;DP=167;Dels=0.00;FS=2.866;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=8.01;ReadPosRankSum=2.222;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,71:167:99:1368,0,2088 chrX 81810 . C T 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.919;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,67:158:99:1367,0,1808 chrX 82053 . G T 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.915;DP=184;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=3.7075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.333;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,77:184:99:1536,0,2212 chrX 82182 . A G 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.415;DP=140;Dels=0.00;FS=3.076;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,57:140:99:1046,0,1836 chrX 82254 . C A 3722.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3722,379,0 chrX 82274 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.861;DP=131;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.523;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1478,0,1261 chrX 82401 . T C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.942;DP=133;Dels=0.00;FS=3.240;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=9.90;ReadPosRankSum=2.337;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1347,0,1376 chrX 82573 . C T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.407;DP=129;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1147,0,1303 chrX 82787 . A G 3794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3794,399,0 chrX 82809 . T C 3788.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3788,393,0 chrX 82983 . G A 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3293,339,0 chrX 83081 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.728;DP=161;Dels=0.00;FS=1.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=7.75;ReadPosRankSum=-3.835;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1278,0,1851 chrX 83194 . A G 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.220;DP=150;Dels=0.01;FS=0.612;HaplotypeScore=6.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=10.65;ReadPosRankSum=2.004;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1628,0,1545 chrX 83220 . T C 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.219;DP=135;Dels=0.00;FS=4.297;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.703;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1490,0,1409 chrX 83246 . C T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.104;DP=149;Dels=0.00;FS=6.381;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.809;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1501,0,1594 chrX 83271 . G C 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.609;DP=157;Dels=0.00;FS=3.844;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.573;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:157:99:1821,0,1457 chrX 83298 . G A 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3504,354,0 chrX 83441 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.420;DP=143;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.832;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1336,0,1640 chrX 83621 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.134;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.754;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1466,0,1691 chrX 83777 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.472;DP=147;Dels=0.00;FS=9.190;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.190;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.763;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,63:147:99:1232,0,1723 chrX 83798 . C T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.208;DP=129;Dels=0.00;FS=7.377;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.59;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.306;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1147,0,1426 chrX 83941 . A G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.722;DP=133;Dels=0.00;FS=6.741;HaplotypeScore=72.3948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=7.23;ReadPosRankSum=3.205;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,51:133:99:991,0,1455 chrX 84349 . A G 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;DP=131;Dels=0.00;FS=5.380;HaplotypeScore=4.8318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.361;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1340,0,1285 chrX 84655 . T C 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2728,288,0 chrX 84895 . A G 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3170,336,0 chrX 84907 . A G 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3080,333,0 chrX 85167 . A C 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2949,312,0 chrX 85185 . A G 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3032,315,0 chrX 85264 . C T 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.64;SB=-2.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3718,373,0 chrX 85405 . T A 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2544,255,0 chrX 85483 . G T 2688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.35;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2721,276,0 chrX 85607 . G C 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.20;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2574,279,0 chrX 85615 . T C 2481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.06;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2514,276,0 chrX 85656 . T A 4137.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4137,409,0 chrX 85785 . T C 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3567,360,0 chrX 85818 . T C 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3880,408,0 chrX 85862 . C T 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3450,346,0 chrX 85894 . C T 4273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4273,421,0 chrX 86001 . T G 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3047,321,0 chrX 86057 . A T 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.663;DP=139;Dels=0.00;FS=2.603;HaplotypeScore=5.7824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=24.21;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,137:139:99:3365,337,0 chrX 86090 . T C 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=26.19;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3667,356,0 chrX 86158 . T C 3959.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3959,414,0 chrX 86328 . A T 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2915,300,0 chrX 86351 . G A 2610 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2643,282,0 chrX 86444 . T C 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3231,342,0 chrX 86567 . G A 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2821,282,0 chrX 86690 . C T 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3593,361,0 chrX 86754 . T C 4115.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.38;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4115,438,0 chrX 86930 . A G 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2867,315,0 chrX 87159 . C A 4009.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4009,400,0 chrX 87529 . C T 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3177,327,0 chrX 88456 . C G 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3701,393,0 chrX 88473 . G A 4119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.75;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4119,418,0 chrX 88506 . G A 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3688,382,0 chrX 88580 . G A 2658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2691,279,0 chrX 88585 . C T 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2789,288,0 chrX 88714 . T C 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=1;QD=24.81;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3449,390,0 chrX 88837 . A G 2119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2152,243,0 chrX 89050 . G A 2508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2541,258,0 chrX 89071 . T C 2333 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2366,261,0 chrX 89089 . C T 2294 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2327,240,0 chrX 89149 . C T 2528 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2561,258,0 chrX 89204 . G A 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2567,264,0 chrX 89224 . T C 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3037,327,0 chrX 89270 . C G 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2858,309,0 chrX 89288 . G A 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2726,282,0 chrX 89312 . G A 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2583,267,0 chrX 89346 . T C 2557 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2590,273,0 chrX 89438 . G A 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2976,300,0 chrX 89456 . G A 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3133,330,0 chrX 89544 . C T 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3626,360,0 chrX 89618 . C T 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8342;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=25.29;ReadPosRankSum=1.507;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3144,306,0 chrX 89645 . A G 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3044,327,0 chrX 89840 . G A 3725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3725,378,0 chrX 89888 . T A 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3674,373,0 chrX 89907 . T G 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=21.75;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3328,360,0 chrX 90035 . G C 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:3894,420,0 chrX 90165 . C T 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2865,294,0 chrX 90197 . G C 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2969,309,0 chrX 90241 . C A 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=24.59;ReadPosRankSum=0.163;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2910,291,0 chrX 90254 . G A 2718 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8249;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2751,273,0 chrX 90357 . G C 3839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3839,411,0 chrX 90410 . G C 4062.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4062,423,0 chrX 90432 . T A 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3345,336,0 chrX 90680 . T G 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.82;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3171,339,0 chrX 90685 . A G 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.04;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2899,312,0 chrX 91169 . T A 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2620,273,0 chrX 91221 . C T 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3446,340,0 chrX 91264 . A G 3980.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3980,396,0 chrX 91365 . A C 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=24.86;ReadPosRankSum=-0.749;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3680,360,0 chrX 91730 . G A 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.15;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3061,315,0 chrX 91804 . A T 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=154;Dels=0.00;FS=3.746;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.11;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=24.74;ReadPosRankSum=1.485;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:3810,370,0 chrX 91817 . A T 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.260;DP=131;Dels=0.01;FS=10.314;HaplotypeScore=12.2043;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.95;MQ0=0;MQRankSum=2.412;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.844;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,128:130:99:3359,333,0 chrX 92206 . C T 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2645,264,0 chrX 92239 . C T 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2789,288,0 chrX 92479 . G A 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3317,333,0 chrX 92512 . G A 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.92;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3284,342,0 chrX 92630 . G A 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.37;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2671,279,0 chrX 92932 . T C 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.48;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3167,327,0 chrX 92996 . C T 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:93:99:2487,249,0 chrX 93007 . G A 2270 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2303,237,0 chrX 93121 . G T 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.817;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=2.344;QD=24.52;ReadPosRankSum=1.432;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,114:116:99:2877,280,0 chrX 93538 . G A 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.62;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2518,261,0 chrX 93585 . G A 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2756,276,0 chrX 93751 . C T 3638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=150;Dels=0.00;FS=3.837;HaplotypeScore=5.3096;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.386;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3638,359,0 chrX 93782 . A G 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3541,387,0 chrX 93919 . G T 3871.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3871,385,0 chrX 94118 . T C 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3390,360,0 chrX 94327 . A G 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2975,321,0 chrX 94353 . C T 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3099,318,0 chrX 94501 . C T 4019.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4019,405,0 chrX 94749 . A T 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3700,370,0 chrX 94776 . G A 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3459,348,0 chrX 94846 . A G 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3003,327,0 chrX 94893 . C T 1833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.15;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:1866,189,0 chrX 94944 . G A 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3366,351,0 chrX 95089 . A G 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=1;QD=24.99;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3698,393,0 chrX 95205 . T C 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5495;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3804,399,0 chrX 95565 . T C 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=21.80;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2911,306,0 chrX 95814 . A G 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3322,357,0 chrX 95996 . C T 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2618,267,0 chrX 96194 . C T 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.93;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3380,343,0 chrX 96249 . A G 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2915,312,0 chrX 96324 . A G 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2979,321,0 chrX 96365 . C A 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2692,282,0 chrX 96379 . C T 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2976,300,0 chrX 96425 . C T 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3255,327,0 chrX 96464 . C T 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3246,334,0 chrX 96721 . C T 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3526,354,0 chrX 96724 . C T 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3435,357,0 chrX 96768 . T C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3136,315,0 chrX 96890 . G T 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=26.31;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2980,309,0 chrX 96902 . A G 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=24.27;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2727,303,0 chrX 96909 . C T 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=25.75;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3123,330,0 chrX 96997 . G A 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2488,255,0 chrX 97036 . G A 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2871,297,0 chrX 97063 . C T 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2975,309,0 chrX 97118 . G A 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3200,312,0 chrX 97211 . C T 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=145;Dels=0.00;FS=3.418;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.490;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3661,393,0 chrX 97232 . C T 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3123,330,0 chrX 97325 . C T 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.24;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2709,282,0 chrX 97369 . A G 2504 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2537,264,0 chrX 97454 . T C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.36;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3076,327,0 chrX 97478 . G A 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3105,321,0 chrX 97556 . C T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3163,318,0 chrX 98063 . C T 2786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.80;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2819,285,0 chrX 98106 . C T 3556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3556,337,0 chrX 98630 . T C 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3181,336,0 chrX 98678 . A G 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3136,339,0 chrX 98930 . C T 4082.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4082,421,0 chrX 99116 . G C 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3452,372,0 chrX 99725 . A G 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=26.51;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3002,315,0 chrX 99851 . G T 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8752;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4075,406,0 chrX 99905 . A T 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3216,330,0 chrX 99929 . A G 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2714,294,0 chrX 99941 . A G 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2764,291,0 chrX 99962 . G A 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3205,324,0 chrX 100283 . C T 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.91;SB=-2.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3983,394,0 chrX 101180 . A G 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.92;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3040,324,0 chrX 101201 . G A 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3209,327,0 chrX 101236 . C T 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2888,294,0 chrX 101464 . T G 2602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=21.33;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2635,273,0 chrX 101513 . G A 2185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.01;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2218,228,0 chrX 101792 . C A 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2917,282,0 chrX 102209 . A C 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2927,315,0 chrX 102363 . C T 2755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=22.22;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2788,282,0 chrX 102407 . A G 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.045;DP=121;Dels=0.00;FS=3.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.215;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3114,304,0 chrX 102489 . T G 2786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.912;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2819,284,0 chrX 102662 . A G 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3233,351,0 chrX 103352 . A G 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3002,306,0 chrX 103478 . T C 2326 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2359,255,0 chrX 103601 . A G 2082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.70;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2115,234,0 chrX 104552 . C T 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.536;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=25.39;ReadPosRankSum=1.536;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2750,256,0 chrX 104563 . C T 2720 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2753,279,0 chrX 105022 . A G 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3163,342,0 chrX 105170 . C T 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8631;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3336,339,0 chrX 105490 . G A 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3607,367,0 chrX 105643 . C T 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3338,342,0 chrX 105664 . G A 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3543,366,0 chrX 105718 . C T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3605,367,0 chrX 105829 . G A 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.67;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3387,351,0 chrX 106108 . C T 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.85;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3679,376,0 chrX 106172 . G A 4230.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.37;MQ0=0;QD=26.60;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4230,439,0 chrX 106326 . G A 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2885,294,0 chrX 106893 . T C 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3224,333,0 chrX 106919 . T G 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2854,300,0 chrX 107092 . A G 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3340,360,0 chrX 107239 . C T 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3444,351,0 chrX 107257 . T C 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3170,354,0 chrX 107323 . A G 4371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.84;SB=-2.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4371,441,0 chrX 107397 . A G 4180.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.79;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4180,436,0 chrX 107470 . T C 4796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4796,502,0 chrX 107485 . C T 5309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:5309,535,0 chrX 107518 . C T 4481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4481,460,0 chrX 107557 . A G 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3822,402,0 chrX 107689 . G T 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3652,352,0 chrX 107980 . A G 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.993e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3680,384,0 chrX 108091 . A G 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6868;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3648,369,0 chrX 108143 . A G 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2682,282,0 chrX 108247 . C T 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2565,267,0 chrX 108259 . C T 2476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.34;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2509,261,0 chrX 108384 . A G 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2941,318,0 chrX 108466 . A G 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=24.00;ReadPosRankSum=1.609;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:114:99:2769,288,0 chrX 108616 . C T 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3318,340,0 chrX 108712 . A G 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3529,366,0 chrX 108722 . C T 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3846,382,0 chrX 108784 . G A 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2889,297,0 chrX 108877 . T C 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3086,324,0 chrX 108904 . A G 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3545,381,0 chrX 108954 . G T 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3359,340,0 chrX 109213 . T C 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.16;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2977,321,0 chrX 109412 . G A 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.94;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3146,321,0 chrX 109567 . A G 3755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3755,408,0 chrX 109687 . T A 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2843,285,0 chrX 110560 . G A 2873 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2906,300,0 chrX 110608 . G A 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3467,343,0 chrX 110637 . A G 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3336,339,0 chrX 110860 . C T 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3397,354,0 chrX 110925 . T C 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3919;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3595,381,0 chrX 111001 . T C 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3323,345,0 chrX 111089 . T G 2584 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.19;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2617,285,0 chrX 111644 . T A 4107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7130;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=27.20;ReadPosRankSum=1.227;SB=-1.989e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:4107,424,0 chrX 111661 . T C 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3277,342,0 chrX 111903 . C T 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3854,382,0 chrX 112233 . C A 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=153;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=4.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=26.28;ReadPosRankSum=1.008;SB=-1.854e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4021,395,0 chrX 112239 . A G 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.957;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3246,335,0 chrX 112473 . T C 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3015,315,0 chrX 112575 . A G 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=2;QD=24.56;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3783,381,0 chrX 112731 . G A 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2992,306,0 chrX 112791 . T C 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2864,318,0 chrX 112938 . T A 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2998,300,0 chrX 112965 . T C 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3906;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2984,309,0 chrX 112991 . T C 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3434,357,0 chrX 113461 . T C 1906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.16;MQ0=0;QD=22.69;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1939,216,0 chrX 113505 . G A 2055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.78;MQ0=0;QD=18.51;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2088,222,0 chrX 113667 . T C 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3075,324,0 chrX 113753 . A G 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.08;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2692,300,0 chrX 113977 . T C 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3803,399,0 chrX 114133 . A G 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3987,426,0 chrX 114174 . C G 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3123,333,0 chrX 114214 . T C 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6840;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3702,402,0 chrX 114298 . A G 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3188,336,0 chrX 114582 . C T 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3585,378,0 chrX 114588 . T C 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3353,369,0 chrX 114623 . T C 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2756,291,0 chrX 114631 . C T 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.62;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2942,306,0 chrX 114825 . T C 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;DP=114;Dels=0.00;FS=3.757;HaplotypeScore=7.2415;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.064;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2937,318,0 chrX 114831 . T G 2510 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.569;DP=106;Dels=0.00;FS=8.534;HaplotypeScore=5.5142;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.290;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,104:106:99:2543,260,0 chrX 115219 . G A 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.22;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3331,342,0 chrX 115225 . G A 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3280,336,0 chrX 115633 . A G 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3887,402,0 chrX 115680 . G C 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2093;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=23.36;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3807,399,0 chrX 115900 . T C 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3080,321,0 chrX 116020 . G A 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.10;MQ0=0;QD=22.39;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2899,297,0 chrX 116021 . T C 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.21;MQ0=0;QD=21.32;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2783,300,0 chrX 116066 . G A 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.79;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3632,364,0 chrX 116153 . T G 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3615,381,0 chrX 116273 . A C 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3521,348,0 chrX 116295 . C A 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3376,331,0 chrX 116404 . T G 126.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.41;MQ0=0;QD=0.96;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:18:159,18,0 chrX 116413 . G A 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.10;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3420,334,0 chrX 116526 . A G 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=21.76;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2470,264,0 chrX 116540 . C G 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2778,300,0 chrX 116568 . T C 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3081,330,0 chrX 116829 . C T 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3914,400,0 chrX 116870 . C T 4399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4399,454,0 chrX 116906 . T G 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4114,417,0 chrX 116986 . C T 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3045,312,0 chrX 117039 . C A 2668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2701,276,0 chrX 117075 . G A 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2625,276,0 chrX 117184 . G C 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.46;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2910,300,0 chrX 117559 . C T 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=1;QD=26.33;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3607,367,0 chrX 117715 . C T 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=99;Dels=0.00;FS=3.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=26.32;ReadPosRankSum=1.382;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2639,264,0 chrX 117792 . G A 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3552,355,0 chrX 117878 . G A 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3379,346,0 chrX 118010 . G A 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3003,315,0 chrX 118040 . G A 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.21;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3126,321,0 chrX 118136 . C T 2600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2633,273,0 chrX 118200 . C T 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3429,346,0 chrX 118265 . C T 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3744,387,0 chrX 118277 . T A 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3147,333,0 chrX 118419 . A G 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3491,363,0 chrX 118625 . T C 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.04;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2726,294,0 chrX 118772 . A G 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=22.55;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:3992,423,0 chrX 118830 . G A 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3719,370,0 chrX 118904 . G T 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2963,309,0 chrX 118934 . C G 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=25.89;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2674,288,0 chrX 119064 . G T 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.40;MQ0=0;QD=25.74;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2658,276,0 chrX 119092 . A C 2470 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.92;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2503,282,0 chrX 119095 . A C 2359 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=22.68;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2392,270,0 chrX 119099 . A G 2208 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.23;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2241,261,0 chrX 119105 . A G 2687 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.88;MQ0=0;QD=22.58;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2720,303,0 chrX 119112 . C T 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3429,363,0 chrX 119135 . A G 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.97;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3347,369,0 chrX 119163 . G T 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.20;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3868,403,0 chrX 119236 . T A 4125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=26.27;SB=-2.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4125,424,0 chrX 119645 . G A 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=110;Dels=0.00;FS=4.503;HaplotypeScore=5.9501;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=25.68;ReadPosRankSum=1.480;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2858,300,0 chrX 119720 . A C 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2586,270,0 chrX 119845 . G A 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3300,336,0 chrX 119906 . G A 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3926,379,0 chrX 120106 . A T 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2902,297,0 chrX 120196 . G T 2222 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.45;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:84:99:2255,228,0 chrX 120217 . C T 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2837,291,0 chrX 120291 . T A 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2754,285,0 chrX 120394 . T C 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3303,348,0 chrX 120416 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.817;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.594;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3268,309,0 chrX 120628 . A T 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2568,258,0 chrX 120634 . A C 2430 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=22.29;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2463,264,0 chrX 120734 . A T 2327 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=102;Dels=0.00;FS=12.487;HaplotypeScore=2.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.98;MQ0=0;MQRankSum=3.352;QD=22.81;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,97:102:99:2360,187,0 chrX 120736 . C T 2286 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.699;DP=105;Dels=0.00;FS=3.758;HaplotypeScore=3.7697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.19;MQ0=0;MQRankSum=3.721;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.117;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,99:105:99:2319,165,0 chrX 120754 . G A 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.11;MQ0=0;QD=21.99;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2276,228,0 chrX 120823 . T C 82.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.315;DP=99;Dels=0.00;FS=1.747;HaplotypeScore=7.5445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.089;QD=0.83;ReadPosRankSum=0.011;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,33:99:99:112,0,1314 chrX 120829 . T C 1759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;DP=104;Dels=0.00;FS=4.167;HaplotypeScore=7.5445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.21;MQ0=0;MQRankSum=2.739;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.788;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,99:104:99:1792,174,0 chrX 120874 . C T 1955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.77;MQ0=0;QD=23.00;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1988,219,0 chrX 120877 . T C 1744 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.27;MQ0=0;QD=21.01;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1777,201,0 chrX 120886 . C T 107.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.091;DP=69;Dels=0.00;FS=2.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=1.55;ReadPosRankSum=-3.542;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:137,0,1017 chrX 120887 . A G 1360 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.30;MQ0=0;QD=20.00;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1393,165,0 chrX 120895 . T C 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.190;DP=64;Dels=0.00;FS=5.340;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=0.50;ReadPosRankSum=-2.857;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,10:64:62:62,0,985 chrX 120925 . C T 890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.84;MQ0=0;QD=20.70;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:923,105,0 chrX 120943 . T C 571 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.45;MQ0=0;QD=20.39;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:72:604,72,0 chrX 120971 . G A 376 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.788;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=17.09;ReadPosRankSum=-1.734;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:48:409,48,0 chrX 120973 . T C 370 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.30;MQ0=0;QD=16.82;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:48:403,48,0 chrX 120997 . C T 603 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.238;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7097;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.11;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=21.54;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:72:636,72,0 chrX 121015 . T C 675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.90;MQ0=0;QD=20.45;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:84:708,84,0 chrX 121043 . G A 975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.51;MQ0=0;QD=22.16;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1008,111,0 chrX 121045 . T C 952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.51;MQ0=0;QD=21.64;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:985,114,0 chrX 121075 . T C 1093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.123;DP=63;Dels=0.00;FS=14.535;HaplotypeScore=9.5632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=2.963;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,56:63:82:1126,82,0 chrX 121168 . T C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.457;DP=71;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=8.9433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.92;MQ0=0;MQRankSum=3.282;QD=17.01;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,60:71:33:1238,0,33 chrX 121180 . C T 1730 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.220;DP=75;Dels=0.00;FS=12.586;HaplotypeScore=6.9520;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.85;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=23.07;ReadPosRankSum=1.069;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:1763,189,0 chrX 121186 . T C 1531 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.377;DP=72;Dels=0.00;FS=13.985;HaplotypeScore=4.9640;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=21.26;ReadPosRankSum=2.269;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,66:72:99:1564,174,0 chrX 121189 . T C 1409 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.045;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.54;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.393;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,66:71:75:1442,75,0 chrX 121192 . C T 1783 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.03;MQ0=0;QD=24.42;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1816,192,0 chrX 121279 . C T 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.81;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2524,264,0 chrX 121348 . C T 2988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.20;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3021,315,0 chrX 121384 . T C 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.94;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3026,333,0 chrX 121598 . T C 4200.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.21;MQ0=0;QD=25.93;SB=-2.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4200,426,0 chrX 121600 . G A 4116.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.21;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4116,412,0 chrX 121624 . C T 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3853,388,0 chrX 121836 . C T 3888.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3888,388,0 chrX 122039 . C T 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=114.4600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.89;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.585;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2966,291,0 chrX 122051 . A G 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.71;MQ0=0;QD=23.02;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3003,321,0 chrX 122072 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.454;DP=131;Dels=0.00;FS=10.974;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=24.68;ReadPosRankSum=2.639;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,128:131:99:3268,339,0 chrX 122668 . G C 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2912,324,0 chrX 122671 . G C 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.16;MQ0=0;QD=22.72;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2828,318,0 chrX 122680 . G A 2622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.95;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2655,285,0 chrX 123314 . C G 2474 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2507,285,0 chrX 123370 . C G 2641 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=21.65;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2674,285,0 chrX 123378 . A G 2407 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.36;MQ0=0;QD=20.57;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2440,264,0 chrX 123380 . C T 2472 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.50;MQ0=0;QD=20.77;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2505,270,0 chrX 123421 . A G 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=23.41;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2491,267,0 chrX 123440 . G T 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.49;MQ0=0;QD=24.86;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2469,258,0 chrX 123508 . C T 2371 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.69;MQ0=0;QD=24.70;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2404,258,0 chrX 123510 . G A 2348 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=76.9901;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.55;MQ0=0;QD=25.25;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2381,252,0 chrX 123517 . G C 2077 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=85.6887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.31;MQ0=0;QD=22.82;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2110,228,0 chrX 123546 . C T 2289 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=83.1197;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.33;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2322,255,0 chrX 123564 . A C 2237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.16;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2270,249,0 chrX 123590 . G A 2045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.30;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2078,216,0 chrX 123636 . G A 2781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.48;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2814,297,0 chrX 123832 . A G 1562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=15.31;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:1595,180,0 chrX 123919 . G T 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3489,343,0 chrX 124064 . G A 4352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4352,459,0 chrX 124136 . C T 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;DP=141;Dels=0.00;FS=3.231;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=23.58;ReadPosRankSum=1.708;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3325,333,0 chrX 124142 . T C 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=23.08;ReadPosRankSum=1.133;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3600,369,0 chrX 124157 . C T 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.995e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4033,400,0 chrX 124187 . G A 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3769,379,0 chrX 124553 . T C 4224.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.40;SB=-2.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4224,435,0 chrX 124555 . G A 4225.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4225,427,0 chrX 124612 . A C 3878.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;DP=153;Dels=0.00;FS=3.396;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=25.35;ReadPosRankSum=1.709;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3878,385,0 chrX 124652 . C T 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3805,385,0 chrX 124691 . T C 3794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3794,405,0 chrX 124862 . A T 3827.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3827,382,0 chrX 124877 . G A 3972.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.79;SB=-2.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3972,394,0 chrX 124924 . A G 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3791,414,0 chrX 124929 . A G 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3399,347,0 chrX 125021 . A G 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3824,399,0 chrX 125051 . T C 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;DP=148;Dels=0.00;FS=2.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.317;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.686;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,146:148:99:3651,369,0 chrX 125052 . T C 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.125;DP=148;Dels=0.00;FS=2.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.350;QD=24.84;ReadPosRankSum=1.852;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,146:148:99:3677,372,0 chrX 125166 . T C 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3670,408,0 chrX 125244 . T C 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3758,387,0 chrX 125246 . A G 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3717,396,0 chrX 125297 . T C 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3533,366,0 chrX 125340 . C T 3886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3886,394,0 chrX 125428 . C T 4693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=1;QD=26.66;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4693,466,0 chrX 126843 . A G 4029.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4029,417,0 chrX 126877 . G A 4085.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4085,412,0 chrX 126900 . C A 3724.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.18;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3724,382,0 chrX 127054 . T C 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3390,375,0 chrX 127081 . C T 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3121,309,0 chrX 127326 . A G 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=23.77;ReadPosRankSum=1.150;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3147,342,0 chrX 127567 . A C 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3057,330,0 chrX 127608 . T C 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3489,360,0 chrX 127680 . A G 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3716,381,0 chrX 127734 . A G 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=22.57;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3103,324,0 chrX 127843 . G A 3989.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.77;SB=-2.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3989,420,0 chrX 128403 . A G 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2873,300,0 chrX 128489 . T C 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4207;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3271,348,0 chrX 128527 . G A 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3287,336,0 chrX 128560 . C T 2919 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2952,297,0 chrX 128573 . C T 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3455,346,0 chrX 128613 . T C 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3804,399,0 chrX 128646 . C T 4316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.48;SB=-2.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4316,441,0 chrX 128810 . T C 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2882,321,0 chrX 129357 . T C 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3261,360,0 chrX 129912 . G A 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2964,303,0 chrX 130079 . T C 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3195,342,0 chrX 130174 . G A 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3422,343,0 chrX 130238 . C T 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3317,342,0 chrX 130425 . A C 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2989,312,0 chrX 130493 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2922,309,0 chrX 130653 . C A 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3228,333,0 chrX 130774 . T A 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=1;QD=26.20;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3328,334,0 chrX 131168 . C T 4074.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4074,406,0 chrX 131236 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=22.77;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3268,351,0 chrX 131240 . C T 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.964e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3872,405,0 chrX 131746 . T C 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3039,318,0 chrX 132405 . C T 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3614,373,0 chrX 132673 . G A 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3224,330,0 chrX 133192 . G A 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3690,376,0 chrX 133342 . T C 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.286;DP=127;Dels=0.00;FS=3.404;HaplotypeScore=3.9492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=26.01;ReadPosRankSum=1.623;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3303,345,0 chrX 133354 . T C 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.014;DP=125;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=8.7574;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.984;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3164,330,0 chrX 133964 . C T 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3347,345,0 chrX 134085 . C T 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=1;QD=25.10;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3890,402,0 chrX 134512 . G A 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=1;QD=25.88;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3313,334,0 chrX 134950 . C T 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3534,352,0 chrX 135096 . T C 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3501,375,0 chrX 136195 . G A 2589 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.63;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2622,273,0 chrX 136202 . C T 2236 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2269,234,0 chrX 136204 . T C 2109 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.71;MQ0=0;QD=25.11;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2142,234,0 chrX 136506 . C T 3660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3660,373,0 chrX 136543 . C T 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5165;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.454;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3168,327,0 chrX 136605 . A G 3965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.25;SB=-2.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3965,423,0 chrX 136623 . A C 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3472,387,0 chrX 136648 . C T 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3900,405,0 chrX 136872 . T C 2257 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=20.15;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2290,249,0 chrX 137767 . G A 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3866,393,0 chrX 137840 . C T 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3286,342,0 chrX 138281 . A G 2409 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.84;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2442,276,0 chrX 138413 . C T 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3106,315,0 chrX 138806 . A C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.586;DP=101;Dels=0.00;FS=6.896;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.392;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1090,0,996 chrX 139013 . T C 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=23.13;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3285,336,0 chrX 139034 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.501;DP=141;Dels=0.00;FS=2.151;HaplotypeScore=4.8020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=8.68;ReadPosRankSum=2.033;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1254,0,1641 chrX 139088 . A G 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.682;DP=118;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.284;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1126,0,1307 chrX 139142 . T C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.116;DP=115;Dels=0.00;FS=7.391;HaplotypeScore=2.4607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1358,0,1090 chrX 139143 . A G 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.490;DP=115;Dels=0.00;FS=6.049;HaplotypeScore=2.4607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.949;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:115:99:1282,0,1024 chrX 139214 . G A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;DP=115;Dels=0.00;FS=2.574;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1425,0,1030 chrX 139431 . C G 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;DP=104;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.225;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:996,0,1125 chrX 139438 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.497;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1246,0,1042 chrX 139468 . A T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1412,0,1440 chrX 139505 . A G 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3627,360,0 chrX 139506 . A G 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.529;DP=144;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.661;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1382,0,1550 chrX 139563 . C T 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=136;Dels=0.00;FS=4.433;HaplotypeScore=5.8003;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=26.58;ReadPosRankSum=1.503;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3615,359,0 chrX 139713 . T C 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3123,333,0 chrX 139819 . A G 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3416,366,0 chrX 139888 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.736;DP=98;Dels=0.00;FS=6.411;HaplotypeScore=3.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.540;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:990,0,1125 chrX 140078 . C T 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.503;DP=138;Dels=0.00;FS=3.113;HaplotypeScore=5.5982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.227;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1196,0,1688 chrX 140117 . A G 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.89;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3433,378,0 chrX 140129 . C T 3039 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.44;MQ0=0;QD=24.31;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3072,327,0 chrX 140130 . G A 3002 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.44;MQ0=0;QD=24.02;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3035,327,0 chrX 140133 . T G 2973 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.84;MQ0=0;QD=23.98;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3006,324,0 chrX 140135 . T C 2834 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.51;MQ0=0;QD=23.04;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2867,324,0 chrX 140161 . G C 2754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7555;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.81;MQ0=0;QD=22.95;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2787,309,0 chrX 140231 . G A 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.313;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:914,0,1084 chrX 140417 . G A 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.512;DP=200;Dels=0.00;FS=1.184;HaplotypeScore=2.5671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.231;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,92:200:99:1892,0,2167 chrX 140649 . T A 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.26;MQ0=0;QD=26.35;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3795,394,0 chrX 140782 . A G 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.752;DP=154;Dels=0.00;FS=5.145;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1595,0,1653 chrX 140874 . A G 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.059;DP=129;Dels=0.00;FS=2.265;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.032;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,53:129:99:939,0,1651 chrX 140952 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.390;DP=119;Dels=0.00;FS=2.376;HaplotypeScore=5.9205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=2.004;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.833;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1094,0,1380 chrX 140994 . T G 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;DP=100;Dels=0.00;FS=4.162;HaplotypeScore=2.1790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.488;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:801,0,1292 chrX 141042 . A G 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.488;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=2.212;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:942,0,1093 chrX 141078 . G A 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.833;DP=135;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=22.8719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=10.54;ReadPosRankSum=7.066;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1453,0,587 chrX 141083 . G A 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.281;DP=143;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=23.6605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=10.13;ReadPosRankSum=7.134;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1479,0,644 chrX 141376 . T C 2334 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8248;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=21.22;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2367,246,0 chrX 141409 . G A 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.441;DP=114;Dels=0.00;FS=2.750;HaplotypeScore=6.0850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:114:99:1305,0,952 chrX 141451 . A G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.476;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.078;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1247,0,1160 chrX 141656 . G T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.517;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.942;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,55:142:99:1121,0,1769 chrX 141721 . A G 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.942;DP=158;Dels=0.00;FS=1.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.121;QD=11.83;ReadPosRankSum=-2.558;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,92:158:99:1899,0,1387 chrX 141743 . A G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.808;DP=128;Dels=0.00;FS=4.555;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.219;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1222,0,1435 chrX 141900 . C T 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3158,321,0 chrX 141908 . A C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.679;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.176;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1096,0,1331 chrX 141924 . G A 2851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2884,297,0 chrX 141977 . A G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.326;DP=146;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=2.270;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.459;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1461,0,1515 chrX 142022 . G A 3617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.367;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1378;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=25.12;ReadPosRankSum=-0.920;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,141:144:99:3617,334,0 chrX 142054 . C T 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.582;DP=140;Dels=0.00;FS=15.146;HaplotypeScore=5.4804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.125;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1488,0,1353 chrX 142055 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;DP=137;Dels=0.00;FS=13.750;HaplotypeScore=5.4804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.006;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1452,0,1375 chrX 142115 . C A 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.435;DP=173;Dels=0.00;FS=5.505;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.449;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,82:173:99:1752,0,1817 chrX 142168 . C T 3828.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.684;DP=143;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=26.77;ReadPosRankSum=-1.320;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3828,399,0 chrX 142223 . T C 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6927;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.146;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3548,384,0 chrX 142249 . C T 1428.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.748;DP=148;Dels=0.00;FS=5.005;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=9.65;ReadPosRankSum=2.548;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1458,0,1649 chrX 142256 . C T 3607.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3607,372,0 chrX 142259 . G C 3411.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8478;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3411,375,0 chrX 142307 . T C 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3153,333,0 chrX 142474 . C T 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.481;DP=122;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1227,0,1407 chrX 142535 . T C 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2881,315,0 chrX 142640 . C T 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3319,343,0 chrX 142749 . T A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;DP=145;Dels=0.00;FS=5.398;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=1;MQRankSum=1.282;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1419,0,1603 chrX 142859 . T G 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;DP=108;Dels=0.00;FS=11.235;HaplotypeScore=2.7765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.194;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1083,0,1268 chrX 143026 . T A 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3005,303,0 chrX 143033 . G C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2976,306,0 chrX 143163 . G A 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2840,291,0 chrX 143166 . G A 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2804,291,0 chrX 143208 . C A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.740;DP=109;Dels=0.00;FS=14.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.975;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,66:109:99:1509,0,838 chrX 143387 . A T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.860;DP=139;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=9.88;ReadPosRankSum=2.419;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1403,0,1543 chrX 143426 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.758;DP=135;Dels=0.00;FS=7.753;HaplotypeScore=5.6550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=8.70;ReadPosRankSum=2.201;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1204,0,1484 chrX 143719 . C T 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3363,342,0 chrX 144131 . T C 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.64;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2990,312,0 chrX 144137 . G A 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.975;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=25.66;ReadPosRankSum=0.801;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3087,288,0 chrX 144344 . T C 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=22.51;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3049,324,0 chrX 144368 . G A 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2774,282,0 chrX 144558 . A G 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3430,354,0 chrX 144696 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.102;DP=140;Dels=0.00;FS=3.176;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=8.40;ReadPosRankSum=-2.332;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1206,0,1739 chrX 144723 . C T 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.324;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,72:121:99:1606,0,919 chrX 144890 . C T 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=13.5648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3270,339,0 chrX 144958 . G T 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7457;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=23.44;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3221,318,0 chrX 145104 . T G 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.957;DP=108;Dels=0.00;FS=0.808;HaplotypeScore=7.6367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.243;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1024,0,1143 chrX 145139 . C T 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.881;DP=99;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.775;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:99:99:936,0,1057 chrX 145142 . T C 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;DP=99;Dels=0.00;FS=4.108;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=8.69;ReadPosRankSum=2.112;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:890,0,1107 chrX 145171 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.155;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1237,0,1318 chrX 145291 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.211;DP=125;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=2.5636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=8.85;ReadPosRankSum=2.360;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1136,0,1449 chrX 145341 . C T 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3640,358,0 chrX 145376 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.948;DP=130;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.529;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1394,0,1289 chrX 145573 . T C 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.050;DP=99;Dels=0.00;FS=1.766;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.576;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,60:99:99:1220,0,780 chrX 145633 . A G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.899;DP=107;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1208,0,1030 chrX 145645 . C A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.847;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.565;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1182,0,1009 chrX 145699 . G T 1877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.470;DP=159;Dels=0.00;FS=1.992;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.382;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:1907,0,1516 chrX 145720 . T C 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.421;DP=146;Dels=0.00;FS=5.006;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,64:146:99:1314,0,1772 chrX 145879 . A G 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3199,327,0 chrX 146059 . C G 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0257;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=1;QD=24.01;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3601,384,0 chrX 146117 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.307;DP=120;Dels=0.00;FS=4.409;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=8.70;ReadPosRankSum=1.174;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1074,0,1427 chrX 146196 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.190;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1096,0,1024 chrX 146367 . G A 909.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.508;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.971;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.066;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:939,0,1568 chrX 146369 . G A 3061 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.39;MQ0=0;QD=23.73;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3094,315,0 chrX 146376 . T C 904.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.717;DP=131;Dels=0.00;FS=1.666;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.439;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:934,0,1537 chrX 146388 . C T 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3311,342,0 chrX 146394 . A G 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.071;DP=115;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:959,0,1206 chrX 146412 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;DP=125;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.655;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1175,0,1209 chrX 146419 . C G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;DP=126;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=8.28;ReadPosRankSum=2.098;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1073,0,1413 chrX 146535 . G A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.394;DP=141;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.535;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1251,0,1689 chrX 146580 . C T 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.712;DP=107;Dels=0.00;FS=1.698;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.993;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:985,0,1214 chrX 146598 . T A 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.548;DP=109;Dels=0.00;FS=2.592;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,48:109:99:912,0,1312 chrX 146615 . G A 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.815;DP=96;Dels=0.00;FS=3.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.352;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1124,0,874 chrX 146640 . G A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.949;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:106:99:1207,0,935 chrX 146738 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.108;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1035,0,1249 chrX 146896 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.665;DP=119;Dels=0.00;FS=0.818;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.913;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1413,0,1059 chrX 146952 . G A 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.564;DP=144;Dels=0.00;FS=8.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1577,0,1376 chrX 147014 . G T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.397;DP=115;Dels=0.00;FS=5.910;HaplotypeScore=6.8770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=9.17;ReadPosRankSum=2.102;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1084,0,1274 chrX 147143 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.060;DP=117;Dels=0.00;FS=8.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.932;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1465,0,933 chrX 147612 . T C 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.435;DP=86;Dels=0.00;FS=2.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:818,0,912 chrX 147613 . T C 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.686;DP=88;Dels=0.00;FS=2.791;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.159;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:832,0,938 chrX 147766 . T C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.143;DP=103;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.095;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1165,0,884 chrX 147768 . C T 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.283;DP=104;Dels=0.00;FS=1.610;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.278;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:806,0,1266 chrX 147787 . A G 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.250;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.055;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:774,0,1322 chrX 147794 . C T 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.675;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.325;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:862,0,1214 chrX 147864 . A T 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;DP=102;Dels=0.00;FS=4.948;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.853;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:942,0,1261 chrX 147905 . T G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.611;DP=92;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.877;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.383;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1047,0,859 chrX 147963 . C T 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.369;DP=82;Dels=0.00;FS=1.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.892;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:689,0,837 chrX 148061 . G A 3905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3905,388,0 chrX 148152 . C T 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.579;DP=138;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=2.171;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.162;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1552,0,1254 chrX 148168 . G C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.934;DP=132;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1467,0,1101 chrX 148285 . G C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.290;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.697;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1041,0,1332 chrX 148288 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.330;DP=135;Dels=0.00;FS=3.072;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.139;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1480,0,1276 chrX 148303 . T C 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.767;DP=141;Dels=0.00;FS=3.128;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1598,0,1334 chrX 148525 . T G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.519;DP=111;Dels=0.00;FS=2.524;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.974;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.024;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1136,0,1222 chrX 148549 . A G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3393,348,0 chrX 148561 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.217;DP=133;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1248,0,1506 chrX 148569 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.880;DP=133;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1313,0,1364 chrX 148594 . G A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.900;DP=125;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=1;MQRankSum=-0.645;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.866;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1151,0,1388 chrX 149426 . A G 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.333;DP=121;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.071;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:989,0,1527 chrX 149680 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.608;DP=129;Dels=0.00;FS=3.739;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.450;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1116,0,1644 chrX 149821 . T C 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.601;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,47:124:99:848,0,1715 chrX 149864 . A G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.369;DP=153;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.022;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:153:99:1465,0,1713 chrX 149902 . G A 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.021;DP=144;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.530;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1588,0,1330 chrX 150061 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.602;DP=124;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1259,0,1244 chrX 150181 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.110;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1149,0,1361 chrX 150210 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.148;DP=137;Dels=0.00;FS=2.492;HaplotypeScore=7.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=7.64;ReadPosRankSum=1.098;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:137:99:1076,0,1640 chrX 150264 . G A 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.937;DP=134;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.555;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,46:134:99:829,0,1886 chrX 150265 . G A 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.750;DP=136;Dels=0.00;FS=3.292;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.614;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,46:136:99:843,0,1861 chrX 150482 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.302;DP=111;Dels=0.00;FS=6.011;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.194;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1135,0,1112 chrX 150563 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.974;DP=113;Dels=0.00;FS=3.539;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.426;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1136,0,1106 chrX 150584 . A G 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.517;DP=106;Dels=0.00;FS=3.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.572;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:993,0,1080 chrX 150688 . C A 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=87;Dels=0.00;FS=0.827;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=8.62;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:780,0,962 chrX 150695 . T C 626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.984;DP=80;Dels=0.00;FS=3.014;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.075;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,35:80:99:656,0,984 chrX 150706 . G A 616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.661;DP=72;Dels=0.00;FS=6.280;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.686;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:646,0,807 chrX 150764 . A C 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.317;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=9.89;ReadPosRankSum=-2.479;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:841,0,859 chrX 150818 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.492;DP=96;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=9.58;ReadPosRankSum=3.056;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:950,0,1021 chrX 150829 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1495,0,1020 chrX 150921 . T C 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2665,282,0 chrX 151221 . C T 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3307,339,0 chrX 151394 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.985;DP=122;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=5.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.904;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.128;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1283,0,1165 chrX 151494 . G A 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3163,324,0 chrX 151609 . C T 3724.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3724,382,0 chrX 151845 . C T 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3082,321,0 chrX 152136 . C T 3573.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7431;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3573,372,0 chrX 152244 . T C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2976,309,0 chrX 152412 . C G 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2931,309,0 chrX 152475 . A G 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2865,300,0 chrX 152592 . T C 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2815,288,0 chrX 153003 . A T 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.87;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2724,270,0 chrX 154059 . A G 320 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.372;DP=107;Dels=0.00;FS=8.981;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.84;MQ0=77;MQRankSum=0.707;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.291;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,79:107:39:353,39,0 chrX 154071 . G A 300 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.494;DP=113;Dels=0.00;FS=5.082;HaplotypeScore=2.8735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.42;MQ0=84;MQRankSum=0.418;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,84:113:36:333,36,0 chrX 154708 . A G 2512 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.78;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2545,264,0 chrX 154716 . C T 2539 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2572,255,0 chrX 154727 . C T 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.03;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3153,321,0 chrX 155119 . A C 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3347,366,0 chrX 155353 . G A 4677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.13;SB=-2.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4677,469,0 chrX 156988 . T C 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3045,336,0 chrX 157129 . A T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.310;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.690;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1210,0,1151 chrX 157130 . A G 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3013,318,0 chrX 157487 . A G 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;DP=125;Dels=0.00;FS=5.171;HaplotypeScore=5.7663;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=23.33;ReadPosRankSum=1.261;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:2949,299,0 chrX 157619 . A T 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3992,415,0 chrX 158685 . A G 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=1;QD=24.82;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3450,351,0 chrX 159788 . A T 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3412,357,0 chrX 159830 . G A 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3493,363,0 chrX 159859 . A G 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.35;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2927,315,0 chrX 159893 . T C 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.90;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2568,291,0 chrX 159934 . T C 2575 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.40;MQ0=0;QD=22.20;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2608,285,0 chrX 159938 . C T 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.18;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3007,318,0 chrX 160149 . G A 2444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.56;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2477,270,0 chrX 160169 . G A 2232 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.73;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2265,243,0 chrX 160171 . G A 2135 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.45;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2168,231,0 chrX 160173 . C A 2151 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=68.3571;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.47;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2184,228,0 chrX 160189 . A G 1650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.87;MQ0=0;QD=19.88;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1683,186,0 chrX 160190 . A T 1706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.87;MQ0=0;QD=20.55;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1739,186,0 chrX 160206 . G C 1717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.78;MQ0=0;QD=18.27;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:1750,195,0 chrX 160222 . T C 1423 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.161;DP=97;Dels=0.00;FS=6.443;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.125;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:1456,159,0 chrX 160223 . C A 1460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.79;MQ0=0;QD=15.05;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:1493,159,0 chrX 160269 . T C 1648 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=87.4986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.13;MQ0=0;QD=15.26;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:1681,186,0 chrX 160273 . G A 1510 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.73;MQ0=0;QD=14.95;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:1543,159,0 chrX 160275 . C T 1544 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.73;MQ0=0;QD=15.29;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:1577,162,0 chrX 160500 . C T 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.95;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3135,306,0 chrX 160654 . G A 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3040,312,0 chrX 160930 . G A 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3135,324,0 chrX 161023 . C T 4303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.56;SB=-2.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4303,436,0 chrX 161596 . A G 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:3805,405,0 chrX 162192 . A G 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3487,360,0 chrX 162208 . G T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.31;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3019,312,0 chrX 162223 . A T 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.74;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2993,312,0 chrX 162228 . C G 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.15;MQ0=0;QD=23.19;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3001,321,0 chrX 162327 . A G 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;DP=126;Dels=0.00;FS=3.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=22.48;ReadPosRankSum=1.347;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:2866,290,0 chrX 162424 . G A 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=24.77;ReadPosRankSum=1.673;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2956,280,0 chrX 162437 . G A 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2602,267,0 chrX 162522 . C A 2257 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2290,234,0 chrX 162643 . A G 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.826;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3347,328,0 chrX 162765 . C A 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3325,330,0 chrX 162768 . G A 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3301,325,0 chrX 162822 . A G 2614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2647,288,0 chrX 162832 . A C 2593 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2626,288,0 chrX 162922 . G A 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3650,367,0 chrX 162937 . C T 4612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4612,460,0 chrX 163218 . C T 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.192;DP=117;Dels=0.00;FS=3.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=26.01;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3076,288,0 chrX 163370 . C T 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2839,285,0 chrX 163417 . G A 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2650,276,0 chrX 163422 . T C 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2804,294,0 chrX 163446 . A T 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3250,327,0 chrX 163467 . G C 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.68;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2526,273,0 chrX 163507 . T C 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2916,306,0 chrX 163656 . C G 2320 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2353,255,0 chrX 163830 . A C 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2674,282,0 chrX 163958 . C T 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2772,291,0 chrX 163993 . A G 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2801,288,0 chrX 164155 . C T 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2816,285,0 chrX 164308 . C T 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2893,282,0 chrX 164955 . C G 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3654,402,0 chrX 165402 . G A 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3615,378,0 chrX 165714 . T C 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3450,363,0 chrX 167289 . C T 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3525,349,0 chrX 167370 . G A 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.378;DP=138;Dels=0.00;FS=3.042;HaplotypeScore=6.5792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=2.343;QD=26.47;ReadPosRankSum=1.149;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,136:138:99:3653,375,0 chrX 169122 . A G 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;DP=112;Dels=0.01;FS=3.551;HaplotypeScore=7.5023;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.733;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2808,284,0 chrX 169440 . G A 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3962,406,0 chrX 170079 . A G 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3685,399,0 chrX 170274 . A G 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3717,387,0 chrX 170556 . T A 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.244;DP=136;Dels=0.00;FS=2.744;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,134:136:99:3440,338,0 chrX 170649 . C A 4008.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.37;SB=-2.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4008,409,0 chrX 171301 . G A 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3338,340,0 chrX 171357 . A G 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2615,291,0 chrX 171411 . T C 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3586,375,0 chrX 171615 . C T 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4041,409,0 chrX 171627 . C T 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3392,351,0 chrX 171764 . T C 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3606,378,0 chrX 172157 . C T 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3169,315,0 chrX 172240 . A G 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=23.52;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2620,279,0 chrX 172536 . A G 2438 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.56;MQ0=0;QD=25.13;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2471,267,0 chrX 172657 . A T 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=27.56;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3390,346,0 chrX 172660 . A G 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=26.15;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3197,336,0 chrX 173226 . G A 1440 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=18.95;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1473,156,0 chrX 173342 . G A 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.56;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2602,264,0 chrX 173354 . A G 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2700,282,0 chrX 173397 . G A 2453 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.82;MQ0=0;QD=23.36;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2486,255,0 chrX 173399 . C T 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.73;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2598,267,0 chrX 173420 . T C 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.12;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3040,318,0 chrX 173479 . T A 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3096,312,0 chrX 173581 . A T 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3510,354,0 chrX 173707 . C T 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3765,384,0 chrX 173746 . T C 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3443,348,0 chrX 173883 . A G 3881.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3881,393,0 chrX 174136 . C T 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.698;QD=24.17;ReadPosRankSum=1.362;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2523,249,0 chrX 174178 . C T 2640 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2673,273,0 chrX 174303 . A G 4024.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4024,426,0 chrX 174334 . A C 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3242,348,0 chrX 174512 . C T 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3480,348,0 chrX 175309 . C T 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6814;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3379,337,0 chrX 175555 . T A 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2899,297,0 chrX 175870 . C T 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3345,354,0 chrX 175883 . A T 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3295,354,0 chrX 176179 . A G 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3200,354,0 chrX 176228 . T C 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3691,384,0 chrX 176664 . T C 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2683,294,0 chrX 176866 . A G 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=23.90;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2686,282,0 chrX 177415 . T C 2709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2742,291,0 chrX 177553 . T C 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.07;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2614,273,0 chrX 177604 . A G 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.79;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2810,306,0 chrX 177700 . A C 1310 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.83;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1343,147,0 chrX 178010 . G T 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.95;MQ0=0;QD=26.77;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3031,309,0 chrX 178077 . C G 2332 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2365,258,0 chrX 178106 . A G 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=22.85;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2752,285,0 chrX 179489 . C T 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3502,363,0 chrX 179659 . C T 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3630,372,0 chrX 180162 . G A 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3254,327,0 chrX 180185 . T A 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3151,327,0 chrX 180249 . C T 3523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3523,354,0 chrX 181205 . G A 4207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.02;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4207,439,0 chrX 181523 . G C 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.101;DP=144;Dels=0.00;FS=2.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=24.19;ReadPosRankSum=1.255;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,142:144:99:3484,324,0 chrX 181680 . T C 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3214,351,0 chrX 181883 . A G 2035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.45;MQ0=0;QD=19.02;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2068,222,0 chrX 181907 . T G 2228 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.73;MQ0=0;QD=20.07;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2261,237,0 chrX 181967 . T C 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=25.55;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3321,363,0 chrX 182227 . G C 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3316,348,0 chrX 182825 . G A 4105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4105,415,0 chrX 183608 . T C 4028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4028,426,0 chrX 183648 . G C 3967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3967,405,0 chrX 183666 . G A 4149.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4149,418,0 chrX 183738 . C T 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3992,412,0 chrX 183827 . T C 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3707,381,0 chrX 183834 . C T 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3703,375,0 chrX 184128 . C A 4384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4384,439,0 chrX 184421 . G T 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.12;MQ0=0;QD=24.07;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2729,276,0 chrX 184438 . A G 2622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.49;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2655,285,0 chrX 184439 . A G 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.53;MQ0=0;QD=23.09;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2619,288,0 chrX 184592 . C T 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.16;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2939,300,0 chrX 184778 . A G 3768.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3768,426,0 chrX 184824 . C T 4278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4278,445,0 chrX 184846 . G A 3965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.18;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3965,403,0 chrX 184848 . T C 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3852,417,0 chrX 184948 . G A 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2966,312,0 chrX 185090 . T C 3899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.32;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:3899,405,0 chrX 185641 . T C 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2658,282,0 chrX 188416 . C T 3969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3969,406,0 chrX 189289 . G A 2551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=19.62;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:2584,261,0 chrX 189631 . G T 3613.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.96;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3613,370,0 chrX 189655 . A T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3378,348,0 chrX 191229 . A G 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2778,300,0 chrX 191341 . T C 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3230,345,0 chrX 191353 . T C 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9599;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3456,363,0 chrX 191458 . A T 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.998e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3824,394,0 chrX 191467 . T G 4005.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4005,417,0 chrX 191621 . A T 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3745,384,0 chrX 192229 . C A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3152,324,0 chrX 194790 . G A 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3601,358,0 chrX 194922 . A T 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3436,349,0 chrX 195076 . C T 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5382;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.77;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3453,360,0 chrX 195349 . T C 1948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1981,201,0 chrX 195664 . G C 2355 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=24.53;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2388,252,0 chrX 195964 . G A 2636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2669,276,0 chrX 196038 . A G 2411 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.38;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2444,261,0 chrX 196043 . G A 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.67;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2567,261,0 chrX 196206 . C G 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2601,273,0 chrX 196451 . G A 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;DP=105;Dels=0.00;FS=3.584;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=25.82;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2744,257,0 chrX 196502 . T C 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3056,321,0 chrX 196517 . C T 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2893,297,0 chrX 197018 . G C 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8644;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3385,363,0 chrX 197412 . A T 1784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=84;Dels=0.00;FS=8.592;HaplotypeScore=9.8026;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.70;MQ0=0;MQRankSum=2.750;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,76:84:75:1817,75,0 chrX 198141 . A G 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.566;DP=168;Dels=0.00;FS=2.039;HaplotypeScore=2.4317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.96;MQ0=2;MQRankSum=0.577;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,58:168:99:904,0,2290 chrX 198342 . C T 180.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.255;DP=121;Dels=0.00;FS=5.166;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.90;MQ0=57;MQRankSum=-0.968;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,31:121:99:210,0,548 chrX 198911 . T C 317.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.833;DP=145;Dels=0.00;FS=6.926;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.92;MQ0=19;MQRankSum=0.759;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.736;SB=-1.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,34:145:99:347,0,1996 chrX 198934 . G A 83.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.718;DP=106;Dels=0.00;FS=5.573;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.32;MQ0=22;MQRankSum=0.033;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.035;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:113,0,1162 chrX 199029 . A C 253.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.897;DP=141;Dels=0.00;FS=1.745;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.48;MQ0=18;MQRankSum=-0.694;QD=1.79;ReadPosRankSum=-2.374;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,30:141:99:283,0,1937 chrX 199115 . G A 405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.773;DP=196;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=2;MQRankSum=-4.726;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,39:196:99:435,0,3514 chrX 199116 . G A 407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.713;DP=196;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=2;MQRankSum=-4.586;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,39:196:99:437,0,3393 chrX 199170 . A C 2350 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.90;MQ0=16;QD=20.80;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2383,276,0 chrX 199735 . A C 1530.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.430;DP=173;Dels=0.00;FS=1.873;HaplotypeScore=2.7085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.16;MQ0=43;MQRankSum=0.935;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.538;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,102:173:99:1560,0,716 chrX 200219 . A G 1672 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6293;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.79;MQ0=20;QD=16.08;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:1705,195,0 chrX 200530 . G C 2861.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.021;DP=207;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.89;MQ0=5;MQRankSum=-1.774;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,152:207:99:2891,0,960 chrX 200931 . C A 1169.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;DP=165;Dels=0.00;FS=3.915;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.25;MQ0=12;MQRankSum=-1.502;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.520;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1199,0,1713 chrX 202608 . G A 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.712;DP=134;Dels=0.00;FS=1.076;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.83;MQ0=54;MQRankSum=-0.595;QD=0.87;ReadPosRankSum=0.547;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,25:134:99:147,0,1162 chrX 203836 . A T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=1;QD=7.93;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:55,6,0 chrX 203875 . C G 68.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.13;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:101,12,0 chrX 203899 . A G 103.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.74;MQ0=1;QD=14.75;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:136,15,0 chrX 203921 . C G 45.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.34;MQ0=6;MQRankSum=-0.312;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:75:75,0,138 chrX 204132 . T A 121.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;DP=55;Dels=0.00;FS=15.022;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.22;MQ0=13;MQRankSum=-0.067;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.614;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:151,0,404 chrX 204133 . A G 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;DP=54;Dels=0.00;FS=14.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.34;MQ0=13;MQRankSum=0.014;QD=2.17;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:147,0,404 chrX 204155 . G A 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;DP=47;Dels=0.00;FS=1.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.28;MQ0=23;MQRankSum=-0.477;QD=0.98;ReadPosRankSum=-1.491;SB=-4.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,9:47:76:76,0,178 chrX 204204 . T C 77.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;DP=77;Dels=0.00;FS=11.137;HaplotypeScore=7.6530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.59;MQ0=43;MQRankSum=0.742;QD=1.00;ReadPosRankSum=2.225;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,10:77:99:107,0,254 chrX 204223 . A G 76.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.889;DP=72;Dels=0.00;FS=19.268;HaplotypeScore=5.9491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.12;MQ0=37;MQRankSum=-0.152;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:106,0,272 chrX 204230 . G A 55.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.210;DP=71;Dels=0.00;FS=15.248;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.80;MQ0=38;MQRankSum=-0.356;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.767;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,12:71:85:85,0,258 chrX 204233 . A G 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.775;DP=71;Dels=0.00;FS=18.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.85;MQ0=37;MQRankSum=-0.883;QD=0.37;ReadPosRankSum=0.739;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,12:71:56:56,0,308 chrX 204237 . G A 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.509;DP=73;Dels=0.00;FS=18.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.71;MQ0=38;MQRankSum=-1.007;QD=0.45;ReadPosRankSum=0.495;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,13:73:63:63,0,300 chrX 204339 . C G 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.291;DP=106;Dels=0.00;FS=6.775;HaplotypeScore=10.4586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-4.616;QD=0.56;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,13:106:89:89,0,1862 chrX 204926 . T G 2402 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=22.45;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2435,264,0 chrX 205194 . G A 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.632;DP=141;Dels=0.00;FS=5.027;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1500,0,1312 chrX 205246 . A G 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3490,354,0 chrX 206537 . T C 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3056,333,0 chrX 207517 . G T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.34;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3378,343,0 chrX 207641 . A G 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3033,333,0 chrX 207695 . T A 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.11;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3864,385,0 chrX 208377 . G A 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2922,297,0 chrX 208398 . T C 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.89;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2597,285,0 chrX 208641 . C T 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2910,306,0 chrX 209220 . T C 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3655,378,0 chrX 209321 . T A 4064.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=1;QD=26.39;SB=-2.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4064,400,0 chrX 209759 . G A 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3050,300,0 chrX 209763 . T C 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3084,315,0 chrX 209814 . C T 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2988,306,0 chrX 209866 . A G 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3296,360,0 chrX 209880 . A T 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3318,328,0 chrX 209951 . C T 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3425,343,0 chrX 210345 . C A 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:98:99:2603,270,0 chrX 210526 . C A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.654;DP=126;Dels=0.00;FS=3.192;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.215;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1456,0,1205 chrX 210759 . G C 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3729,399,0 chrX 210824 . T A 2514 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2547,261,0 chrX 211009 . A C 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.89;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3391,369,0 chrX 211301 . G A 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2893,297,0 chrX 211343 . T C 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2985,303,0 chrX 211638 . A T 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3748,382,0 chrX 211845 . C A 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2651,273,0 chrX 212117 . G A 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3012,315,0 chrX 212471 . C T 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2939,309,0 chrX 213175 . T C 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4122,415,0 chrX 213431 . G A 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3703,361,0 chrX 213641 . C T 4411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8373;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4411,442,0 chrX 213827 . C T 2419 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2452,246,0 chrX 213944 . C T 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3350,339,0 chrX 214033 . C T 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3218,327,0 chrX 214163 . A G 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.1124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=24.31;ReadPosRankSum=1.299;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3306,357,0 chrX 214698 . A G 2448 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2481,261,0 chrX 214797 . T C 2343 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2376,258,0 chrX 214997 . G A 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3797,382,0 chrX 215069 . C T 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2337;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2957,303,0 chrX 215224 . A G 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3251,336,0 chrX 215249 . T C 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.688;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9453;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=24.75;ReadPosRankSum=1.133;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3861,383,0 chrX 215426 . A G 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.40;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2755,312,0 chrX 215480 . G A 2594 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.98;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2627,267,0 chrX 215481 . G A 2599 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.06;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2632,267,0 chrX 215482 . T C 2499 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.12;MQ0=0;QD=23.36;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2532,267,0 chrX 215637 . A G 2271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=24.96;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2304,246,0 chrX 215948 . G A 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.34;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3272,330,0 chrX 215951 . G A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.14;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3261,325,0 chrX 215960 . C T 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.71;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2947,294,0 chrX 216038 . C T 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3067,318,0 chrX 216132 . A C 2301 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=25.85;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:2334,258,0 chrX 216313 . G A 4064.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.973e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4064,406,0 chrX 216509 . A G 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2603,276,0 chrX 217028 . C T 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3900,408,0 chrX 217367 . T C 2407 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.88;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2440,270,0 chrX 218068 . A G 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3747,402,0 chrX 218107 . G A 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3371,351,0 chrX 218143 . A G 2826 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.61;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2859,306,0 chrX 218146 . T C 2749 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.42;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2782,288,0 chrX 218152 . C T 2866 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2899,288,0 chrX 218206 . T C 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2975,318,0 chrX 218293 . C T 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3627,369,0 chrX 218308 . G T 3839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=26.29;ReadPosRankSum=0.119;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3839,391,0 chrX 218340 . G A 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3606,358,0 chrX 218503 . G A 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3272,328,0 chrX 218719 . G A 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3849,384,0 chrX 218728 . G A 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.928e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4007,397,0 chrX 218964 . A G 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.21;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3799,411,0 chrX 219051 . T C 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3025,312,0 chrX 219066 . T C 2459 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=21.76;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2492,258,0 chrX 219267 . G A 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3303,354,0 chrX 219324 . T C 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3598,381,0 chrX 219354 . A C 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.56;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2759,294,0 chrX 219419 . C T 2051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2084,216,0 chrX 219452 . C T 2102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.27;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2135,225,0 chrX 219542 . T C 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2796,294,0 chrX 219727 . T C 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3662,393,0 chrX 219735 . A G 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3508,390,0 chrX 219914 . G A 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3292,345,0 chrX 219997 . T C 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3824,399,0 chrX 220326 . C A 4009.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4009,418,0 chrX 220333 . G C 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3361,363,0 chrX 220447 . A G 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.79;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3004,324,0 chrX 220448 . A G 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.88;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3027,324,0 chrX 220459 . C A 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.89;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3286,342,0 chrX 220469 . A T 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.51;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2966,321,0 chrX 220502 . T C 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.12;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3086,336,0 chrX 220527 . T A 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.39;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2984,300,0 chrX 220622 . G C 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.063;DP=110;Dels=0.00;FS=3.338;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=23.91;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2663,255,0 chrX 220711 . A G 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;DP=132;Dels=0.00;FS=5.078;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=25.30;ReadPosRankSum=-1.575;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3340,323,0 chrX 220733 . G T 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.982;DP=120;Dels=0.00;FS=4.559;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=24.64;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:2990,279,0 chrX 220756 . T A 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.392;DP=106;Dels=0.00;FS=3.441;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=25.70;ReadPosRankSum=1.111;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2757,264,0 chrX 220988 . T A 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3714,376,0 chrX 221757 . C T 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3797,381,0 chrX 222067 . T G 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3232,339,0 chrX 222216 . T C 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3574,366,0 chrX 222376 . T C 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3521,372,0 chrX 222564 . C T 3820.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3820,382,0 chrX 223145 . A G 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3064,339,0 chrX 223295 . T C 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=22.44;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3434,366,0 chrX 223465 . C T 4266.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=27.35;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4266,439,0 chrX 223746 . C T 2816 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2849,285,0 chrX 225118 . G A 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3052,315,0 chrX 225521 . A G 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3314,354,0 chrX 225601 . A G 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=25.34;ReadPosRankSum=1.132;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3801,372,0 chrX 225658 . T C 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3734,366,0 chrX 225914 . T C 2231 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.6698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=20.66;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2264,252,0 chrX 226023 . G A 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3367,351,0 chrX 226353 . T C 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3287,357,0 chrX 226665 . C T 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3351,330,0 chrX 226843 . T C 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2776,291,0 chrX 226899 . A G 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.55;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3073,321,0 chrX 227070 . A G 1891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=21.01;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1924,216,0 chrX 227303 . A T 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2918,300,0 chrX 227829 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3266,357,0 chrX 227961 . C T 3905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8801;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3905,385,0 chrX 228001 . G C 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=22.87;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2961,315,0 chrX 228198 . T C 2668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.93;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2701,285,0 chrX 228529 . T G 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=1;QD=24.71;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2776,291,0 chrX 228720 . T C 1847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.34;MQ0=0;QD=23.99;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1880,210,0 chrX 228732 . A G 1725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.11;MQ0=0;QD=23.31;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1758,198,0 chrX 228740 . T C 1601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.43;MQ0=0;QD=23.54;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1634,180,0 chrX 228756 . A G 1334 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.79;MQ0=0;QD=23.00;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1367,150,0 chrX 228773 . C T 1711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=25.16;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1744,183,0 chrX 228793 . A T 1771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.19;MQ0=0;QD=24.94;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1804,192,0 chrX 228945 . A G 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2783,285,0 chrX 228996 . T A 2409 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2442,249,0 chrX 229006 . T A 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2806,279,0 chrX 229200 . A G 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2923,312,0 chrX 229400 . A G 2153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2186,240,0 chrX 229414 . T C 2487 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2520,273,0 chrX 229445 . T C 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3222,345,0 chrX 229688 . T C 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3115,312,0 chrX 229742 . T G 2551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=25.77;ReadPosRankSum=1.592;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2584,273,0 chrX 229979 . A T 4299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4299,433,0 chrX 230024 . G A 3903.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3903,382,0 chrX 230069 . T C 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=22.18;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:2739,288,0 chrX 230084 . G A 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.636;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=26.38;ReadPosRankSum=1.668;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2882,280,0 chrX 230256 . T G 4084.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=23.61;SB=-2.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4084,417,0 chrX 230257 . C T 4027.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=25.17;ReadPosRankSum=1.537;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:160:99:4027,381,0 chrX 230372 . C T 3616.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3616,376,0 chrX 230438 . A G 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7214;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3121,327,0 chrX 230464 . G C 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.02;SB=-2.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3964,417,0 chrX 230470 . T C 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.37;SB=-2.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3983,405,0 chrX 230666 . C T 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=1;QD=27.36;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3125,324,0 chrX 230768 . G A 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3628,366,0 chrX 230867 . T C 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=24.74;SB=-2.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3958,396,0 chrX 231314 . A G 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2851,306,0 chrX 231417 . T G 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2871,300,0 chrX 231423 . T A 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3041,306,0 chrX 231610 . C A 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3305,336,0 chrX 231816 . G A 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2904,294,0 chrX 232272 . T C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3732,396,0 chrX 232348 . T C 3562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3562,372,0 chrX 232467 . C T 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3425,345,0 chrX 232656 . A G 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3483,375,0 chrX 232663 . G A 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3437,360,0 chrX 233083 . C T 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=25.65;ReadPosRankSum=1.296;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3668,364,0 chrX 233256 . C T 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2931,297,0 chrX 233261 . C T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3163,327,0 chrX 233289 . A G 2505 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2538,258,0 chrX 233469 . C T 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3982,402,0 chrX 233472 . G A 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3902,388,0 chrX 233503 . C T 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.689;DP=159;Dels=0.00;FS=4.610;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.601;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:4075,377,0 chrX 233575 . A T 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4012,417,0 chrX 233724 . C G 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3240,354,0 chrX 233808 . T C 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3059,318,0 chrX 233923 . G A 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3289,336,0 chrX 233924 . A C 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.933;DP=135;Dels=0.00;FS=11.369;HaplotypeScore=1.9889;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=23.17;ReadPosRankSum=2.888;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,132:135:99:3161,336,0 chrX 233961 . G T 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2853,291,0 chrX 234213 . A G 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.530;DP=103;Dels=0.00;FS=4.446;HaplotypeScore=99.0195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=24.30;ReadPosRankSum=1.160;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2536,257,0 chrX 234309 . G A 2531 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.06;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2564,261,0 chrX 234413 . T C 2075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2108,225,0 chrX 234635 . C A 2476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2509,252,0 chrX 234824 . G A 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3485,366,0 chrX 235091 . G A 3616.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3616,355,0 chrX 235232 . G A 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2765,282,0 chrX 235235 . A G 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2722,279,0 chrX 235355 . T C 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3707,384,0 chrX 235362 . G T 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3691,370,0 chrX 235475 . T C 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3015,306,0 chrX 235604 . A C 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=22.50;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3397,345,0 chrX 235976 . G C 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3390,342,0 chrX 236075 . G A 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3676,381,0 chrX 236081 . A G 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3527,381,0 chrX 236172 . T A 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=127;Dels=0.00;FS=3.610;HaplotypeScore=3.6108;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=2;MQRankSum=1.704;QD=25.37;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:127:99:3255,336,0 chrX 236421 . T C 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=97.3755;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3745,405,0 chrX 236523 . G A 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3370,339,0 chrX 236615 . C A 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3058,301,0 chrX 236829 . G A 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.626;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=26.65;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3465,345,0 chrX 236856 . C T 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3241,336,0 chrX 236901 . T A 2438 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=19.66;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2471,249,0 chrX 236905 . A G 2494 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=18.34;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:2527,276,0 chrX 236912 . A G 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.87;MQ0=0;QD=19.46;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:2679,288,0 chrX 236974 . T C 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3114,345,0 chrX 237017 . A C 4705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.25;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4705,501,0 chrX 237020 . G A 4806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.71;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4806,490,0 chrX 237032 . G C 4424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4424,471,0 chrX 237035 . T G 4754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4754,489,0 chrX 237784 . G A 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3490,358,0 chrX 239145 . C T 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=1;QD=25.79;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2870,297,0 chrX 239198 . A G 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.60;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2714,297,0 chrX 239199 . A C 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.94;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2776,294,0 chrX 239361 . C T 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=1;QD=26.46;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3155,330,0 chrX 240082 . C A 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3311,336,0 chrX 240118 . G A 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.798;DP=112;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1117,0,1127 chrX 240556 . C T 3978.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3978,400,0 chrX 240623 . G A 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=3.278;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=25.23;ReadPosRankSum=0.336;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3381,339,0 chrX 240983 . T A 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3645,384,0 chrX 241554 . A G 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3156,330,0 chrX 241715 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.057;DP=152;Dels=0.00;FS=5.738;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.769;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1346,0,1604 chrX 241994 . T C 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.363;DP=110;Dels=0.00;FS=2.768;HaplotypeScore=2.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:877,0,1444 chrX 242162 . T C 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.759;DP=102;Dels=0.00;FS=13.325;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.506;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1174,0,1029 chrX 242169 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.304;DP=103;Dels=0.00;FS=13.159;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1243,0,946 chrX 242370 . A G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.140;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=7.63;ReadPosRankSum=-2.801;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,69:171:99:1335,0,2267 chrX 242557 . A C 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.441;DP=131;Dels=0.00;FS=4.641;HaplotypeScore=4.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=24.51;ReadPosRankSum=1.653;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3244,345,0 chrX 242684 . G A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.473;DP=136;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.400;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1223,0,1572 chrX 242776 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.582;DP=120;Dels=0.00;FS=2.337;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.241;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1323,0,1252 chrX 242936 . A G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.059;DP=99;Dels=0.00;FS=6.962;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1017,0,960 chrX 242939 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.994;DP=97;Dels=0.00;FS=7.166;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.625;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:897,0,1020 chrX 243339 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.849;DP=108;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=2.6386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.351;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:897,0,1292 chrX 243488 . G A 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.351;DP=159;Dels=0.00;FS=4.173;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.284;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1657,0,1676 chrX 243509 . C T 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.555;DP=154;Dels=0.00;FS=3.037;HaplotypeScore=3.7976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1721,0,1558 chrX 243711 . G C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.166;DP=128;Dels=0.00;FS=4.347;HaplotypeScore=8.8938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.381;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1518,0,1142 chrX 243812 . C A 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3620,367,0 chrX 243941 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;DP=109;Dels=0.00;FS=1.651;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.119;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1326,0,993 chrX 243956 . T C 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.237;DP=107;Dels=0.00;FS=1.716;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.374;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:107:99:880,0,1314 chrX 244181 . C T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.098;DP=124;Dels=0.00;FS=8.647;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.203;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1345,0,1212 chrX 244406 . C T 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.802;DP=128;Dels=0.00;FS=2.332;HaplotypeScore=5.9473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.554;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,50:128:99:983,0,1612 chrX 244474 . G A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.389;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.767;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1372,0,1284 chrX 244531 . G A 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.659;DP=158;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=1.913;QD=11.01;ReadPosRankSum=-2.008;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,82:158:99:1770,0,1446 chrX 244538 . A G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.694;DP=160;Dels=0.00;FS=4.027;HaplotypeScore=2.5476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=0.608;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.125;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1593,0,1720 chrX 244609 . G A 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3341,343,0 chrX 244637 . T C 2542 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2575,279,0 chrX 244650 . A G 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.419;DP=102;Dels=0.00;FS=1.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.406;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:954,0,1165 chrX 244689 . G A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.289;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.511;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1015,0,1164 chrX 244726 . A G 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2919,291,0 chrX 245030 . A G 736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.373;DP=104;Dels=0.00;FS=2.782;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.766;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:766,0,1353 chrX 245037 . G A 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.734;DP=112;Dels=0.00;FS=1.677;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.079;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:938,0,1256 chrX 245229 . A C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.473;DP=117;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.625;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1282,0,1175 chrX 245341 . G A 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.017;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.13;MQ0=0;MQRankSum=-5.665;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1237,0,1307 chrX 245368 . C A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.498;DP=107;Dels=0.00;FS=3.641;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-3.643;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:933,0,1161 chrX 245399 . T A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;DP=124;Dels=0.00;FS=0.950;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.046;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.776;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1375,0,1249 chrX 245416 . T G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.678;DP=132;Dels=0.00;FS=2.969;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1332,0,1369 chrX 245436 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.968;DP=124;Dels=0.00;FS=2.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.618;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1308,0,1312 chrX 245568 . C T 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.679;DP=95;Dels=0.00;FS=4.108;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=13.00;ReadPosRankSum=1.048;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,56:95:99:1265,0,737 chrX 245734 . T C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.900;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.308;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1127,0,1088 chrX 245918 . C T 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.821;DP=129;Dels=0.00;FS=6.597;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.701;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1488,0,1214 chrX 246253 . G A 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.668;DP=132;Dels=0.00;FS=3.138;HaplotypeScore=3.7878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.616;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1586,0,1233 chrX 246266 . G A 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.419;DP=152;Dels=0.00;FS=5.952;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=11.23;ReadPosRankSum=-2.142;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1737,0,1362 chrX 246302 . T G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.875;DP=115;Dels=0.00;FS=7.145;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.352;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1048,0,1222 chrX 246303 . G T 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.011;DP=114;Dels=0.00;FS=7.377;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.983;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1213,0,1045 chrX 246321 . C T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.714;DP=119;Dels=0.00;FS=3.771;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.880;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1250,0,1175 chrX 246407 . G A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.720;DP=138;Dels=0.00;FS=4.320;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.055;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1441,0,1461 chrX 246420 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.211;DP=136;Dels=0.00;FS=4.321;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.315;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1461,0,1401 chrX 246451 . C G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1280,0,1044 chrX 246591 . C T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.356;DP=156;Dels=0.00;FS=2.948;HaplotypeScore=3.8333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.167;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:156:99:1443,0,1834 chrX 246614 . C G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;DP=141;Dels=0.00;FS=6.199;HaplotypeScore=2.6979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.741;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1348,0,1515 chrX 246652 . C T 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.490;DP=121;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=3.8937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.008;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1255,0,1262 chrX 247000 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.838;DP=114;Dels=0.00;FS=3.565;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=2.083;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.534;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1331,0,979 chrX 247029 . A G 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.476;DP=99;Dels=0.00;FS=2.770;HaplotypeScore=3.4101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.886;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1011,0,1088 chrX 247088 . C T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.203;DP=108;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.182;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1103,0,1200 chrX 247233 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.406;DP=122;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=2.9114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1393,0,1136 chrX 247277 . C T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.604;DP=116;Dels=0.00;FS=5.812;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1108,0,1272 chrX 247320 . T A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;DP=120;Dels=0.00;FS=2.670;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1233,0,1303 chrX 247356 . A G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.806;DP=148;Dels=0.00;FS=2.221;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,65:148:99:1203,0,1807 chrX 247484 . T C 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.183;DP=120;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.276;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1240,0,1238 chrX 247487 . T C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.907;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.021;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.513;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1166,0,1241 chrX 247585 . G A 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.174;DP=161;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=4.8805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.362;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,87:161:99:1839,0,1419 chrX 247668 . G A 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.170;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.597;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1744,0,1127 chrX 247938 . T G 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.436;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=1;MQRankSum=-1.010;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.526;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:864,0,1085 chrX 248169 . A G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.745;DP=130;Dels=0.00;FS=12.930;HaplotypeScore=4.8973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.881;QD=6.73;ReadPosRankSum=-2.570;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:905,0,1373 chrX 248312 . G A 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.563;DP=95;Dels=0.00;FS=7.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.679;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.372;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:831,0,1103 chrX 248378 . G C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;DP=124;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.683;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1290,0,1257 chrX 248957 . G A 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2493,249,0 chrX 249076 . G A 2286 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2319,246,0 chrX 249343 . G A 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2910,306,0 chrX 249801 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.563;DP=146;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.564;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:146:99:1508,0,1301 chrX 249923 . T C 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3782,414,0 chrX 249990 . A G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:120:99:2995,312,0 chrX 250151 . T C 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.24;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3210,339,0 chrX 250158 . C T 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.22;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2923,303,0 chrX 250174 . G A 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.24;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3029,306,0 chrX 250185 . A G 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.119;DP=132;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.556;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:987,0,1452 chrX 250241 . A G 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.99;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3083,327,0 chrX 250329 . G A 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.907;DP=125;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.291;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1159,0,1490 chrX 250353 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.417;DP=123;Dels=0.00;FS=5.590;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.348;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1253,0,1279 chrX 250419 . A G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.698;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=1.743;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1204,0,1640 chrX 250428 . A G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.595;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.398;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1203,0,1641 chrX 250812 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.811;DP=122;Dels=0.00;FS=2.355;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1359,0,1158 chrX 251191 . C G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=138;Dels=0.00;FS=3.014;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1418,0,1433 chrX 251498 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.304;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.366;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1176,0,1185 chrX 251581 . A G 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.330;DP=94;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.504;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:996,0,955 chrX 251673 . G A 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.386;DP=137;Dels=0.00;FS=1.576;HaplotypeScore=2.7269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.705;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1293,0,1367 chrX 251780 . A G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.603;DP=128;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.434;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1437,0,1211 chrX 251884 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.223;DP=116;Dels=0.00;FS=10.688;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.239;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1289,0,1067 chrX 252108 . A G 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.126;DP=126;Dels=0.00;FS=3.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.506;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,76:126:99:1580,0,1025 chrX 252111 . C T 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.944;DP=128;Dels=0.00;FS=6.382;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.316;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1045,0,1572 chrX 252286 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.642;DP=139;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=5.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.083;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:139:99:1274,0,1677 chrX 252393 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.034;DP=135;Dels=0.00;FS=4.396;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=2.425;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.355;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1352,0,1596 chrX 252496 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.069;DP=157;Dels=0.00;FS=1.331;HaplotypeScore=8.6738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.800;QD=9.67;ReadPosRankSum=2.717;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1548,0,1722 chrX 252499 . C G 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.055;DP=156;Dels=0.00;FS=2.998;HaplotypeScore=7.6777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=9.69;ReadPosRankSum=2.431;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1541,0,1699 chrX 252564 . T C 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2839,300,0 chrX 252565 . G A 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.311;DP=117;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=7.67;ReadPosRankSum=-1.215;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:927,0,1341 chrX 252640 . G C 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=22.91;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3172,345,0 chrX 252649 . G A 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.380;DP=139;Dels=0.00;FS=10.757;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.055;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1447,0,1420 chrX 252688 . A G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.420;DP=129;Dels=0.00;FS=4.187;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.404;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1405,0,1233 chrX 252733 . A G 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.507;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.575;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1460,0,1173 chrX 252960 . G A 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.714;DP=111;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=5.9500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.156;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1079,0,1192 chrX 252967 . A G 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.540;DP=99;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.157;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:958,0,1094 chrX 252997 . G C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=115;Dels=0.01;FS=0.707;HaplotypeScore=9.6123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1075,0,1206 chrX 253125 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.367;DP=121;Dels=0.00;FS=4.367;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1343,0,1156 chrX 253186 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.643;DP=127;Dels=0.00;FS=4.592;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.230;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1449,0,1215 chrX 253312 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.368;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,53:92:99:1135,0,744 chrX 253339 . G A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.478;DP=103;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.096;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1185,0,890 chrX 253378 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.284;DP=105;Dels=0.00;FS=4.794;HaplotypeScore=3.7814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.230;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1176,0,1012 chrX 253393 . G A 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.225;DP=98;Dels=0.00;FS=3.906;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.039;QD=11.17;ReadPosRankSum=-2.546;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1125,0,865 chrX 253405 . G A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.436;DP=98;Dels=0.00;FS=3.907;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1080,0,940 chrX 253426 . T A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.324;DP=110;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=2.2788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.797;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.463;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1135,0,1111 chrX 253440 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.823;DP=114;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=3.5315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.875;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1111,0,1191 chrX 254075 . A G 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;DP=133;Dels=0.00;FS=3.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.847;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3390,365,0 chrX 254173 . C T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.454;DP=124;Dels=0.00;FS=9.906;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.300;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1243,0,1316 chrX 254247 . T C 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3444,375,0 chrX 254540 . G A 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3107,306,0 chrX 254626 . G C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;DP=120;Dels=0.00;FS=4.581;HaplotypeScore=6.8344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.995;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.073;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1075,0,1207 chrX 254631 . A G 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0023;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2928,300,0 chrX 254700 . C T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.181;DP=104;Dels=0.00;FS=3.755;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,60:104:99:1240,0,890 chrX 255496 . C A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.740;DP=125;Dels=0.00;FS=4.359;HaplotypeScore=2.6414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.243;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1416,0,1199 chrX 255752 . C T 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.810;DP=98;Dels=0.00;FS=6.519;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1227,0,823 chrX 256372 . T C 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.723;DP=109;Dels=0.00;FS=5.177;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.137;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1269,0,1005 chrX 256404 . C T 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.203;DP=113;Dels=0.00;FS=3.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1488,0,935 chrX 256852 . T C 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.772;DP=118;Dels=0.00;FS=15.849;HaplotypeScore=2.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.780;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:970,0,1453 chrX 256883 . C A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.463;DP=119;Dels=0.00;FS=15.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1403,0,1099 chrX 256957 . A G 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.957;DP=170;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=4.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,82:170:99:1659,0,1790 chrX 256964 . A T 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.325;DP=170;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=3.6279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=10.09;ReadPosRankSum=-2.023;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,87:170:99:1746,0,1654 chrX 256986 . T C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.525;DP=151;Dels=0.00;FS=3.937;HaplotypeScore=3.5460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.036;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1497,0,1544 chrX 256990 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.591;DP=157;Dels=0.00;FS=2.857;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1511,0,1598 chrX 257035 . G A 4233.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4233,436,0 chrX 257097 . G A 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.466;DP=138;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.431;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,81:138:99:1821,0,1152 chrX 257102 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.339;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:1196,0,1646 chrX 257134 . T G 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.625;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.514;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1560,0,1508 chrX 257445 . G T 1926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.550;DP=184;Dels=0.00;FS=3.463;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,94:184:99:1956,0,1807 chrX 257687 . G A 1822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.815;DP=150;Dels=0.00;FS=3.167;HaplotypeScore=5.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.115;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,85:150:99:1852,0,1215 chrX 257759 . T C 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.555;DP=107;Dels=0.00;FS=1.567;HaplotypeScore=3.6728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1056,0,1202 chrX 257783 . A C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.042;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.130;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:990,0,1295 chrX 257871 . T C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.159;DP=98;Dels=0.00;FS=4.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1069,0,976 chrX 258022 . T A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.731;DP=125;Dels=0.00;FS=3.218;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.308;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1364,0,1264 chrX 258025 . T C 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3096,327,0 chrX 258142 . G A 2662 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2695,279,0 chrX 258292 . G T 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.235;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.718;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:998,0,974 chrX 258301 . T C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.376;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.179;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:988,0,1214 chrX 258322 . T C 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.071;DP=103;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1130,0,994 chrX 258370 . A G 770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.562;DP=118;Dels=0.00;FS=3.511;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.032;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,44:118:99:800,0,1572 chrX 259162 . A C 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.245;DP=92;Dels=0.00;FS=4.053;HaplotypeScore=3.0453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.720;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:849,0,1034 chrX 259182 . C T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.183;DP=89;Dels=0.00;FS=4.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.211;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:905,0,924 chrX 259194 . C A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.702;DP=96;Dels=0.00;FS=4.005;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1119,0,840 chrX 259357 . G A 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3278,333,0 chrX 259504 . G A 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.929;DP=137;Dels=0.00;FS=3.074;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.542;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:137:99:1731,0,1166 chrX 259771 . T G 710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.865;DP=120;Dels=0.00;FS=2.920;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.504;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,45:120:99:740,0,1678 chrX 260037 . C A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.004;DP=118;Dels=0.00;FS=3.377;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:118:99:1186,0,1236 chrX 260294 . T C 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=21.85;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:2939,318,0 chrX 260320 . T C 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=22.28;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2774,294,0 chrX 260357 . G C 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2833,297,0 chrX 260440 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.959;DP=134;Dels=0.00;FS=5.281;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.595;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1418,0,1290 chrX 260627 . A T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.259;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1404,0,1277 chrX 260920 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.557;DP=99;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.795;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1022,0,1038 chrX 261296 . C A 3561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3561,357,0 chrX 261413 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.206;DP=173;Dels=0.00;FS=8.940;HaplotypeScore=8.3287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.551;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,85:173:99:1389,0,1990 chrX 261474 . C G 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3662,387,0 chrX 261812 . A G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.926;DP=126;Dels=0.01;FS=8.215;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1115,0,1449 chrX 261829 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.717;DP=128;Dels=0.00;FS=8.107;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.381;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1201,0,1491 chrX 261902 . C T 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.443;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:118:99:1125,0,1246 chrX 262115 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.861;DP=139;Dels=0.00;FS=2.146;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=1;MQRankSum=0.215;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1268,0,1602 chrX 262236 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;DP=144;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.938;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1507,0,1413 chrX 262403 . A T 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3535,354,0 chrX 262565 . T C 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.671;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.612;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1079,0,1082 chrX 262898 . A G 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.096;DP=122;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.132;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1223,0,1336 chrX 263201 . A G 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.184;DP=103;Dels=0.00;FS=2.566;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=7.91;ReadPosRankSum=-2.683;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:845,0,1286 chrX 263465 . T G 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.432;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:104:99:880,0,1235 chrX 263508 . C T 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3022,321,0 chrX 263528 . G A 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.910;DP=106;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.341;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1053,0,1073 chrX 263540 . C A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.382;DP=114;Dels=0.00;FS=3.545;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1196,0,1106 chrX 263687 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.814;DP=148;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=4.6480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.146;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1484,0,1492 chrX 263723 . G T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.016;DP=151;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=7.76;ReadPosRankSum=-2.107;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1202,0,1801 chrX 263732 . A G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.819;DP=144;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:144:99:1194,0,1806 chrX 263741 . A G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.506;DP=138;Dels=0.00;FS=3.125;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.599;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1028,0,1772 chrX 263882 . A C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.672;DP=163;Dels=0.00;FS=2.796;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.754;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1437,0,1718 chrX 264087 . T C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.483;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.064;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1397,0,1207 chrX 264194 . T C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.231;DP=136;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=7.5304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.222;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1413,0,1411 chrX 264272 . C T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.954;DP=111;Dels=0.00;FS=8.813;HaplotypeScore=4.6617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.392;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1192,0,1023 chrX 264413 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.941;DP=154;Dels=0.00;FS=8.398;HaplotypeScore=8.6697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.622;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,65:154:99:1192,0,1958 chrX 264671 . G A 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.983;DP=128;Dels=0.00;FS=13.277;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,52:128:99:1061,0,1548 chrX 264773 . C A 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.451;DP=120;Dels=0.00;FS=6.322;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.534;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1017,0,1371 chrX 264790 . A G 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.490;DP=123;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.402;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1123,0,1413 chrX 265229 . A G 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3823,408,0 chrX 265353 . A G 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=22.77;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3325,351,0 chrX 265456 . A T 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3151,321,0 chrX 265464 . G A 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3121,315,0 chrX 265530 . A G 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3348,354,0 chrX 265828 . C T 2432 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=1;QD=22.94;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2465,267,0 chrX 266123 . T C 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2843,306,0 chrX 266229 . A T 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.75;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2842,282,0 chrX 266273 . C T 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3184,309,0 chrX 266570 . T C 2459 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.59;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2492,267,0 chrX 266638 . C A 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=1;QD=25.62;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2518,258,0 chrX 266741 . T A 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=1;QD=26.36;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3637,370,0 chrX 266987 . T A 2473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=22.90;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2506,279,0 chrX 266988 . A T 2466 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=22.83;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2499,279,0 chrX 267174 . A G 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.882;DP=89;Dels=0.00;FS=1.734;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.038;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:901,0,973 chrX 267355 . A C 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2602,282,0 chrX 267660 . T C 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.615;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.973;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1416,0,1278 chrX 267697 . G C 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.474;DP=155;Dels=0.00;FS=1.290;HaplotypeScore=3.6337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1705,0,1412 chrX 267767 . A C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.255;DP=124;Dels=0.00;FS=2.337;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1163,0,1443 chrX 267848 . A C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.849;DP=116;Dels=0.00;FS=4.447;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1299,0,1155 chrX 267890 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.169;DP=123;Dels=0.00;FS=4.323;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.535;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1466,0,1201 chrX 267900 . A T 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.276;DP=127;Dels=0.00;FS=2.247;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=2.738;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.162;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1525,0,1243 chrX 267977 . A G 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2970,306,0 chrX 268004 . C T 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.257;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1282,0,1100 chrX 268091 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.289;DP=132;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1234,0,1343 chrX 268166 . T G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=124;Dels=0.00;FS=3.343;HaplotypeScore=6.0206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1023,0,1458 chrX 268286 . G A 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.184;DP=119;Dels=0.00;FS=11.901;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.229;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:119:99:1073,0,1180 chrX 268553 . T C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.199;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=1;MQRankSum=0.255;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.493;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:900,0,1027 chrX 268877 . A G 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.249;DP=144;Dels=0.00;FS=2.096;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1455,0,1466 chrX 269086 . T C 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.535;DP=112;Dels=0.00;FS=2.584;HaplotypeScore=2.8988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.294;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:112:99:1008,0,1150 chrX 269197 . T G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.004;DP=160;Dels=0.00;FS=2.787;HaplotypeScore=3.5605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=2.134;QD=8.67;ReadPosRankSum=2.541;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,75:160:99:1417,0,1825 chrX 269458 . G T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.559;DP=122;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1097,0,1347 chrX 269482 . G A 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.433;DP=107;Dels=0.00;FS=6.210;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:942,0,1152 chrX 269821 . C T 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.573;DP=112;Dels=0.00;FS=3.506;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.606;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.354;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:907,0,1437 chrX 269832 . T C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.232;DP=109;Dels=0.00;FS=4.774;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,48:109:99:952,0,1345 chrX 269888 . T C 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;DP=111;Dels=0.00;FS=4.867;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.357;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1006,0,1155 chrX 269967 . C T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.133;DP=96;Dels=0.00;FS=3.905;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.498;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,58:96:99:1311,0,655 chrX 269989 . G A 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.645;DP=81;Dels=0.00;FS=0.840;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,45:81:99:1006,0,675 chrX 270011 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.506;DP=94;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:1162,0,852 chrX 270055 . C G 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=113;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,45:113:99:881,0,1424 chrX 270695 . C G 2235 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=22.13;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2268,237,0 chrX 270696 . G A 566.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.670;DP=99;Dels=0.00;FS=6.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.698;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:596,0,1181 chrX 270705 . A G 1037.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.968;DP=83;Dels=0.00;FS=0.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.440;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,49:83:99:1067,0,712 chrX 270752 . A G 2627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2660,282,0 chrX 271118 . G A 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.451;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1237,0,1100 chrX 271336 . C T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.563;DP=108;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1352,0,941 chrX 271346 . G A 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2733,285,0 chrX 271436 . T A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;DP=119;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1140,0,1405 chrX 271477 . T C 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2960,318,0 chrX 271727 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.415;DP=134;Dels=0.00;FS=4.129;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=10.60;ReadPosRankSum=2.510;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1451,0,1322 chrX 271764 . G C 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.527;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1491,0,1307 chrX 272069 . T C 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=22.85;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:2843,309,0 chrX 272123 . A G 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.50;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3922,399,0 chrX 272177 . C T 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3334,337,0 chrX 272191 . T C 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3162,327,0 chrX 272315 . A G 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3237,345,0 chrX 272381 . A G 2709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2742,303,0 chrX 272439 . T C 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.376;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.009;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:977,0,1257 chrX 272756 . A G 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8057;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3680,390,0 chrX 272958 . T C 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.87;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2918,315,0 chrX 273302 . T C 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.674;DP=91;Dels=0.00;FS=4.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.924;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1130,0,864 chrX 273652 . T C 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.273;DP=113;Dels=0.00;FS=7.867;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:982,0,1368 chrX 273828 . G T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.185;DP=121;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=3.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1204,0,1228 chrX 273972 . C T 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.551;DP=111;Dels=0.00;FS=5.962;HaplotypeScore=5.8955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.528;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:1019,0,1368 chrX 275124 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.132;DP=128;Dels=0.00;FS=2.688;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.038;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1302,0,1339 chrX 275495 . C T 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.515;DP=119;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=6.2118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1367,0,1070 chrX 275537 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.482;DP=139;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.594;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.396;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1421,0,1457 chrX 275542 . C T 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.666;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.023;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1476,0,1448 chrX 275588 . C T 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.964;DP=144;Dels=0.00;FS=1.359;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1358,0,1623 chrX 275597 . T C 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.755;DP=143;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1268,0,1746 chrX 275952 . G A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.722;DP=167;Dels=0.00;FS=5.858;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.876;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,72:167:99:1487,0,2034 chrX 276355 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.362;DP=129;Dels=0.00;FS=2.251;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1364,0,1382 chrX 276470 . C T 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9416;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2972,289,0 chrX 276481 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.428;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.008;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1176,0,1277 chrX 276572 . G A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.460;DP=101;Dels=0.00;FS=2.590;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.465;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1121,0,1005 chrX 276704 . T C 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.296;DP=95;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.301;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:943,0,1066 chrX 277220 . G T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.414;DP=131;Dels=0.00;FS=2.416;HaplotypeScore=9.0495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:131:99:1375,0,1188 chrX 277465 . C T 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3490,360,0 chrX 277623 . T C 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3518,369,0 chrX 277760 . C T 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3581,366,0 chrX 278408 . C A 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.225;DP=146;Dels=0.00;FS=8.696;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.110;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1727,0,1305 chrX 278411 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.828;DP=153;Dels=0.00;FS=8.487;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1321,0,1897 chrX 278676 . G A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.611;DP=100;Dels=0.00;FS=0.821;HaplotypeScore=3.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:966,0,1004 chrX 278810 . C T 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.188;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1533,0,1159 chrX 279028 . A T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.143;DP=139;Dels=0.00;FS=3.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.555;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1504,0,1402 chrX 279072 . A T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.567;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.962;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1340,0,1435 chrX 279101 . A G 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.679;DP=117;Dels=0.00;FS=5.762;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:930,0,1372 chrX 279109 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.709;DP=122;Dels=0.00;FS=5.583;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.564;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1456,0,996 chrX 279200 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.389;DP=123;Dels=0.00;FS=5.535;HaplotypeScore=19.8411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=5.177;QD=10.10;ReadPosRankSum=5.172;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1272,0,395 chrX 279207 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.019;DP=114;Dels=0.00;FS=2.423;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.15;MQ0=0;MQRankSum=6.050;QD=11.04;ReadPosRankSum=3.792;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1289,0,235 chrX 279266 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.184;DP=133;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1204,0,1215 chrX 279703 . G A 4426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.04;SB=-2.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4426,442,0 chrX 280016 . C A 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;DP=165;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.204;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1845,0,1608 chrX 280514 . T C 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.731;DP=166;Dels=0.00;FS=0.570;HaplotypeScore=4.8037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,88:166:99:1658,0,1650 chrX 280674 . G A 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.717;DP=158;Dels=0.00;FS=4.878;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.395;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1734,0,1601 chrX 281003 . T C 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.903;DP=166;Dels=0.00;FS=1.985;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.497;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,79:166:99:1490,0,1899 chrX 281006 . C A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.980;DP=152;Dels=0.00;FS=3.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.741;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1477,0,1637 chrX 281056 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.257;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.589;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1401,0,1582 chrX 281134 . A G 1827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.221;DP=189;Dels=0.00;FS=6.553;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.480;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,92:189:99:1857,0,2062 chrX 281289 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.961;DP=111;Dels=0.00;FS=12.726;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.000;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1162,0,1192 chrX 281583 . T C 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.824;DP=186;Dels=0.00;FS=0.539;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.587;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,89:186:99:1733,0,2090 chrX 281676 . T C 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.294;DP=165;Dels=0.00;FS=2.886;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.440;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,75:165:99:1444,0,1992 chrX 282456 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.159;DP=122;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.278;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1191,0,1252 chrX 282525 . T C 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.692;DP=133;Dels=0.01;FS=2.281;HaplotypeScore=12.6625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,51:132:99:889,0,1789 chrX 282699 . G A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.738;DP=120;Dels=0.00;FS=3.279;HaplotypeScore=4.1863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.559;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1301,0,1188 chrX 282729 . T C 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.391;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.537;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1254,0,1172 chrX 282738 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.268;DP=143;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1365,0,1605 chrX 283218 . G A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.488;DP=118;Dels=0.00;FS=16.251;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.320;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1031,0,1338 chrX 283478 . T G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.344;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1365,0,1108 chrX 283526 . C T 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.500;DP=137;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.028;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,80:137:99:1541,0,1112 chrX 283542 . T C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.467;DP=147;Dels=0.00;FS=4.199;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.487;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1513,0,1480 chrX 283605 . C G 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.581;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.964;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1470,0,1528 chrX 284198 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.962;DP=144;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.215;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1309,0,1621 chrX 284309 . C T 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=25.00;ReadPosRankSum=1.389;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3058,321,0 chrX 284561 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.786;DP=114;Dels=0.00;FS=4.489;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.193;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1183,0,1223 chrX 284933 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.445;DP=131;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.618;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1378,0,1297 chrX 285038 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.369;DP=152;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=3.6394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.485;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1448,0,1628 chrX 285059 . C A 1855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.258;DP=154;Dels=0.00;FS=2.039;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,86:154:99:1885,0,1367 chrX 285086 . A G 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.880;DP=156;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.133;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1701,0,1565 chrX 285278 . G A 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.746;DP=149;Dels=0.00;FS=3.495;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.599;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1821,0,1307 chrX 285553 . C T 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.935;DP=151;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=3.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.48;ReadPosRankSum=3.828;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1613,0,1524 chrX 285555 . T C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.262;DP=154;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=9.63;ReadPosRankSum=3.565;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1513,0,1643 chrX 285967 . G T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.321;DP=142;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=5.3821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.158;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1404,0,1568 chrX 286028 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.979;DP=152;Dels=0.00;FS=5.983;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.437;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,66:152:99:1187,0,1813 chrX 286349 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.192;DP=154;Dels=0.00;FS=2.022;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=8.06;ReadPosRankSum=-2.008;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1272,0,1778 chrX 286446 . C T 1930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.252;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,95:157:99:1960,0,1236 chrX 286569 . T A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.720;DP=113;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.865;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:113:99:1033,0,1258 chrX 286743 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.940;DP=143;Dels=0.00;FS=10.213;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.415;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1495,0,1504 chrX 287040 . A G 1432.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.899;DP=145;Dels=0.00;FS=7.953;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1462,0,1479 chrX 287043 . A G 1218.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.594;DP=136;Dels=0.00;FS=5.849;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.188;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1248,0,1496 chrX 287049 . A G 1374.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.684;DP=146;Dels=0.00;FS=3.091;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.820;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.252;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1404,0,1550 chrX 287517 . A G 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.586;DP=164;Dels=0.00;FS=2.720;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.553;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:1758,0,1693 chrX 287718 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.561;DP=142;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=4.8578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,61:142:99:1127,0,1601 chrX 287737 . C T 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.070;DP=145;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.463;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1595,0,1142 chrX 287921 . A G 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.805;DP=143;Dels=0.00;FS=2.141;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,59:143:99:967,0,1935 chrX 288142 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.804;DP=134;Dels=0.00;FS=6.656;HaplotypeScore=2.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=9.20;ReadPosRankSum=-2.675;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1263,0,1381 chrX 288305 . T G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.831;DP=109;Dels=0.00;FS=2.748;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=10.88;ReadPosRankSum=-2.117;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1216,0,1047 chrX 288319 . A G 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7550;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3706,402,0 chrX 288454 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.353;DP=142;Dels=0.00;FS=6.220;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.473;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1286,0,1497 chrX 288609 . G A 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3355,334,0 chrX 288751 . A G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.811;DP=146;Dels=0.00;FS=4.975;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.338;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1336,0,1675 chrX 289825 . A T 4453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4453,445,0 chrX 289892 . C G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.434;DP=129;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=6.9273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1392,0,1241 chrX 289974 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.912;DP=110;Dels=0.00;FS=14.104;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1132,0,1223 chrX 290043 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.711;DP=148;Dels=0.00;FS=6.068;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.716;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1400,0,1691 chrX 290358 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.324;DP=110;Dels=0.00;FS=2.465;HaplotypeScore=10.5754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.955;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1102,0,1062 chrX 290364 . G T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.750;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1066,0,1046 chrX 290444 . A G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.323;DP=114;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=3.1713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,69:114:99:1364,0,880 chrX 290515 . A G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.006;DP=129;Dels=0.00;FS=5.351;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=8.54;ReadPosRankSum=-2.504;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1132,0,1404 chrX 290520 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.202;DP=135;Dels=0.00;FS=4.075;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=4.130;QD=9.93;ReadPosRankSum=-3.004;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1370,0,1325 chrX 290542 . G A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.254;DP=149;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=3.3809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.051;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1431,0,1583 chrX 290883 . G A 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3642,376,0 chrX 290968 . T G 1724.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.495;DP=180;Dels=0.00;FS=11.832;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.652;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,87:180:99:1754,0,1930 chrX 290969 . A G 1726.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.546;DP=178;Dels=0.00;FS=12.002;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=9.70;ReadPosRankSum=-2.027;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,92:178:99:1756,0,1783 chrX 290972 . A G 1741.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.499;DP=171;Dels=0.00;FS=11.064;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.884;QD=10.18;ReadPosRankSum=-2.221;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,88:171:99:1771,0,1753 chrX 291073 . A G 2012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.470;DP=169;Dels=0.00;FS=0.571;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=11.91;ReadPosRankSum=2.004;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,96:169:99:2042,0,1413 chrX 291165 . T C 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.940;DP=146;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.268;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1529,0,1405 chrX 291200 . T C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.004;DP=148;Dels=0.00;FS=2.924;HaplotypeScore=3.7644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1407,0,1624 chrX 291229 . G C 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.798;DP=143;Dels=0.00;FS=3.993;HaplotypeScore=4.4506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=10.80;ReadPosRankSum=-3.136;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1574,0,1193 chrX 291251 . T A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.797;DP=116;Dels=0.00;FS=4.512;HaplotypeScore=6.2027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1318,0,1092 chrX 291405 . G A 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3162,318,0 chrX 291438 . A G 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.882;DP=93;Dels=0.00;FS=5.232;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:862,0,1068 chrX 291807 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.701;DP=142;Dels=0.00;FS=17.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.126;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1224,0,1669 chrX 291846 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.931;DP=155;Dels=0.00;FS=2.917;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1331,0,1819 chrX 291863 . T A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;DP=150;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=2.3620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1365,0,1721 chrX 291915 . G T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.586;DP=146;Dels=0.00;FS=13.105;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.949;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1433,0,1507 chrX 291927 . G A 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.490;DP=152;Dels=0.00;FS=5.852;HaplotypeScore=2.9008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.582;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1467,0,1562 chrX 291961 . G A 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3681,372,0 chrX 291966 . G T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;DP=152;Dels=0.00;FS=5.921;HaplotypeScore=2.5361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.678;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:152:99:1492,0,1444 chrX 292070 . C T 1959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.400;DP=156;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.731;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,90:156:99:1989,0,1159 chrX 292518 . A C 2193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.590;DP=219;Dels=0.00;FS=2.353;HaplotypeScore=11.2240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,108:219:99:2223,0,2253 chrX 292545 . A G 1992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.650;DP=221;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,110:221:99:2022,0,2251 chrX 292616 . T C 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;DP=155;Dels=0.00;FS=3.016;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.339;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.974;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,153:155:99:3621,383,0 chrX 292672 . A G 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.671;DP=180;Dels=0.00;FS=1.840;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=2.624;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,91:180:99:1778,0,1821 chrX 292752 . A T 1872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;DP=165;Dels=0.00;FS=6.075;HaplotypeScore=5.7706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.028;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:165:99:1902,0,1485 chrX 292759 . G A 1846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.797;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.361;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,88:182:99:1876,0,1854 chrX 292848 . T A 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;DP=207;Dels=0.00;FS=1.790;HaplotypeScore=6.1073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=2.202;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.473;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,94:207:99:1935,0,2386 chrX 292851 . T C 1873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.643;DP=213;Dels=0.00;FS=5.048;HaplotypeScore=5.2751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.150;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,100:213:99:1903,0,2443 chrX 292930 . T C 4609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=25.61;ReadPosRankSum=1.116;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,179:180:99:4609,480,0 chrX 292958 . T C 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.296;DP=160;Dels=0.00;FS=3.826;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1425,0,1715 chrX 293109 . G A 83.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.427;DP=196;Dels=0.00;FS=40.955;HaplotypeScore=3.4022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.58;MQ0=0;MQRankSum=-5.334;QD=0.42;ReadPosRankSum=-5.234;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,73:196:99:113,0,2469 chrX 293117 . T C 231.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.837;DP=196;Dels=0.00;FS=51.978;HaplotypeScore=4.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.40;MQ0=0;MQRankSum=-6.462;QD=1.18;ReadPosRankSum=-3.579;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,80:196:99:261,0,2140 chrX 293118 . A T 248.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.844;DP=192;Dels=0.00;FS=32.639;HaplotypeScore=4.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.81;MQ0=0;MQRankSum=-5.193;QD=1.29;ReadPosRankSum=1.790;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,80:192:99:278,0,2302 chrX 293121 . G A 325.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.504;DP=198;Dels=0.00;FS=33.579;HaplotypeScore=4.2382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.31;MQ0=0;MQRankSum=-4.422;QD=1.64;ReadPosRankSum=4.945;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,86:198:99:355,0,2253 chrX 293133 . G A 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.002;DP=197;Dels=0.00;FS=43.284;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=4.50;ReadPosRankSum=7.236;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,110:197:99:916,0,1610 chrX 293142 . C A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.721;DP=200;Dels=0.00;FS=53.490;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.350;QD=6.44;ReadPosRankSum=-11.326;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,77:200:99:1318,0,1266 chrX 293571 . G A 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2944,306,0 chrX 293718 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.298;DP=133;Dels=0.00;FS=4.114;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1204,0,1495 chrX 293844 . G C 1882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.180;DP=177;Dels=0.00;FS=5.671;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.574;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,93:177:99:1912,0,1726 chrX 293868 . C T 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.731;DP=176;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.088;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,92:176:99:1871,0,1673 chrX 293985 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.106;DP=140;Dels=0.00;FS=5.223;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.601;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1376,0,1482 chrX 294039 . A G 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.375;DP=145;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=1;MQRankSum=0.124;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.378;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1594,0,1406 chrX 294093 . C T 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.339;DP=162;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=1;MQRankSum=1.057;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.047;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:162:99:1817,0,1431 chrX 294232 . G A 2286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.766;DP=201;Dels=0.00;FS=13.655;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.009;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,112:201:99:2316,0,1649 chrX 294234 . G A 2310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.742;DP=196;Dels=0.00;FS=12.550;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,111:196:99:2340,0,1591 chrX 294296 . G A 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.687;DP=167;Dels=0.00;FS=6.653;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1803,0,1611 chrX 294333 . T C 4541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.84;MQ0=0;QD=24.95;SB=-2.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:182:99:4541,465,0 chrX 294467 . A G 84.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.042;DP=56;Dels=0.00;FS=7.437;HaplotypeScore=44.4814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.71;MQ0=0;MQRankSum=3.484;QD=1.50;ReadPosRankSum=-5.282;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:114,0,158 chrX 294468 . T C 63.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.892;DP=55;Dels=0.00;FS=7.478;HaplotypeScore=43.4920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.79;MQ0=0;MQRankSum=2.178;QD=1.15;ReadPosRankSum=-5.103;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:93:93,0,158 chrX 294469 . G C,T 128.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;DP=55;Dels=0.00;FS=3.335;HaplotypeScore=9.9083;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=33.79;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=2.33;ReadPosRankSum=-1.644;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:29,11,15:55:66:188,80,110,66,0,99 chrX 294471 . G C 63.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;DP=56;Dels=0.00;FS=2.382;HaplotypeScore=50.4365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.44;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=1.13;ReadPosRankSum=-3.033;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:93:93,0,150 chrX 294475 . A G 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.435;DP=101;Dels=0.00;FS=43.475;HaplotypeScore=33.7391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.83;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=0.39;ReadPosRankSum=-8.578;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:69:69,0,163 chrX 294480 . A C 46.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.364;DP=104;Dels=0.00;FS=46.955;HaplotypeScore=50.6045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.04;MQ0=0;MQRankSum=2.561;QD=0.44;ReadPosRankSum=6.098;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,62:104:76:76,0,142 chrX 294481 . A C 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.469;DP=104;Dels=0.00;FS=46.955;HaplotypeScore=50.6045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=0.47;ReadPosRankSum=6.191;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,62:104:79:79,0,137 chrX 294549 . T G 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.005;DP=106;Dels=0.00;FS=4.003;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.487;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:885,0,882 chrX 294578 . A T 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.07;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3547,367,0 chrX 294584 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.001;DP=145;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.35;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.533;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1249,0,1565 chrX 294608 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.481;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=3.391;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1389,0,1667 chrX 294617 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.350;DP=154;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.17;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1430,0,1780 chrX 294711 . C A 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.566;DP=177;Dels=0.00;FS=4.628;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQ0=0;MQRankSum=1.756;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.492;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,90:177:99:1859,0,1828 chrX 294720 . C T 1843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.371;DP=175;Dels=0.00;FS=5.679;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,89:175:99:1873,0,1720 chrX 294816 . C G 1472.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;DP=122;Dels=0.00;FS=3.428;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.259;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,73:122:99:1502,0,842 chrX 294820 . G A 858.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.437;DP=120;Dels=0.00;FS=5.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.95;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.828;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:888,0,1368 chrX 294826 . G A 2775 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.51;MQ0=0;QD=22.56;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2808,291,0 chrX 294827 . A G 2675 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.58;MQ0=0;QD=21.57;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2708,294,0 chrX 294947 . G T 4850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4850,487,0 chrX 294972 . T A 1995.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.020;DP=186;Dels=0.00;FS=5.299;HaplotypeScore=2.9339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.776;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.154;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,98:186:99:2025,0,1806 chrX 294973 . G A 1761.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.182;DP=183;Dels=0.00;FS=7.606;HaplotypeScore=2.9339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.798;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,87:183:99:1791,0,2001 chrX 294982 . G C 1685.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.986;DP=176;Dels=0.00;FS=1.889;HaplotypeScore=5.9131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.451;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,86:176:99:1715,0,1876 chrX 295055 . T C 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.921;DP=134;Dels=0.00;FS=4.131;HaplotypeScore=3.8866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.332;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1211,0,1478 chrX 295057 . T A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;DP=130;Dels=0.00;FS=5.444;HaplotypeScore=2.8932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1474,0,1233 chrX 295121 . T G 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.310;DP=89;Dels=0.00;FS=5.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:952,0,939 chrX 295148 . C T 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3663,370,0 chrX 295184 . C T 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3902,400,0 chrX 295233 . G T 1826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.275;DP=165;Dels=0.00;FS=4.564;HaplotypeScore=6.6837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1856,0,1495 chrX 295430 . G T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.038;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1599,0,1362 chrX 295833 . A G 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.178;DP=164;Dels=0.00;FS=1.947;HaplotypeScore=4.4899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:1641,0,1536 chrX 296106 . A T 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3836,388,0 chrX 296447 . A C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.451;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.021;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1166,0,880 chrX 296619 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=95;Dels=0.00;FS=2.799;HaplotypeScore=11.1971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.489;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,56:95:99:1204,0,621 chrX 296661 . A T 700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.780;DP=91;Dels=0.00;FS=1.800;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.000;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:730,0,1092 chrX 296872 . T A 1999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=21.27;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2032,195,0 chrX 296895 . G A 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;DP=80;Dels=0.00;FS=11.352;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.891;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.017;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:732,0,852 chrX 296897 . T C 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.204;DP=79;Dels=0.00;FS=9.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.121;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:689,0,898 chrX 296919 . G A 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.186;DP=102;Dels=0.00;FS=1.596;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.166;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:906,0,1257 chrX 296964 . T G 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.939;DP=122;Dels=0.00;FS=8.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:995,0,1543 chrX 296966 . A G 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.670;DP=129;Dels=0.00;FS=8.076;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1031,0,1564 chrX 297012 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.285;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.726;QD=8.73;ReadPosRankSum=2.227;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1270,0,1580 chrX 297016 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.421;DP=139;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=2.3017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.086;QD=8.77;ReadPosRankSum=2.250;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1249,0,1562 chrX 297025 . G A 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.483;DP=105;Dels=0.00;FS=1.628;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.47;MQ0=0;MQRankSum=-3.958;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.900;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1046,0,993 chrX 297043 . T C 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.58;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3338,360,0 chrX 297050 . T G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.446;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=4.103;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.385;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1318,0,1529 chrX 297083 . C T 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;DP=140;Dels=0.00;FS=4.308;HaplotypeScore=3.3916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=3.646;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1586,0,1340 chrX 297116 . G T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.856;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.630;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1218,0,1222 chrX 297192 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.966;DP=139;Dels=0.00;FS=2.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,79:139:99:1616,0,1268 chrX 297296 . T A 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;DP=114;Dels=0.00;FS=14.286;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1079,0,1319 chrX 297331 . T C 534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.198;DP=92;Dels=0.00;FS=10.390;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.286;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:564,0,1067 chrX 297365 . A G 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.450;DP=93;Dels=0.00;FS=4.018;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=8.12;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:785,0,1121 chrX 297650 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.337;DP=126;Dels=0.00;FS=11.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1239,0,1357 chrX 297688 . C T 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.635;DP=125;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.531;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1349,0,1247 chrX 297732 . T G 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.960;DP=148;Dels=0.00;FS=3.252;HaplotypeScore=4.7603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=24.78;ReadPosRankSum=1.334;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3668,374,0 chrX 297800 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.852;DP=158;Dels=0.00;FS=1.267;HaplotypeScore=3.4680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.005;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.277;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1444,0,1707 chrX 297848 . A C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.745;DP=143;Dels=0.00;FS=10.485;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,61:143:99:1194,0,1893 chrX 297976 . C T 4503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.33;SB=-2.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4503,448,0 chrX 297985 . A T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;DP=178;Dels=0.00;FS=8.877;HaplotypeScore=4.6207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,76:178:99:1439,0,2238 chrX 298390 . C A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.503;DP=146;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.532;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1486,0,1496 chrX 298531 . A G 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.935;DP=143;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=5.9562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.031;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1281,0,1692 chrX 298682 . T G 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3307,357,0 chrX 298833 . G T 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3647,375,0 chrX 298915 . C T 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3062,312,0 chrX 299141 . T C 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3698,390,0 chrX 299346 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.037;DP=133;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.507;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1379,0,1368 chrX 299490 . T C 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.002;DP=177;Dels=0.00;FS=1.248;HaplotypeScore=6.5577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.137;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,89:177:99:1715,0,1859 chrX 299496 . G A 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.347;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.850;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,88:174:99:1840,0,1633 chrX 299551 . C T 1782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.207;DP=174;Dels=0.00;FS=1.217;HaplotypeScore=3.7487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.054;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,85:174:99:1812,0,1822 chrX 299577 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.134;DP=161;Dels=0.00;FS=2.763;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.763;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1529,0,1624 chrX 299757 . A G 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3136,327,0 chrX 299820 . T C 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3299,345,0 chrX 299874 . C T 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3550,355,0 chrX 299961 . A G 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2767,315,0 chrX 300158 . T G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.808;DP=120;Dels=0.00;FS=3.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.916;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1156,0,1300 chrX 300176 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.916;DP=132;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=11.5947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.872;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1407,0,1243 chrX 300626 . C T 4135.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6961;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.37;SB=-2.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4135,427,0 chrX 300732 . A T 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3336,339,0 chrX 300806 . G T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.619;DP=157;Dels=0.00;FS=8.560;HaplotypeScore=2.3838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,74:157:99:1399,0,1684 chrX 300813 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.213;DP=146;Dels=0.00;FS=6.486;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.146;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1626,0,1336 chrX 300843 . T A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.055;DP=131;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1350,0,1364 chrX 300846 . T C 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3419,363,0 chrX 301020 . T C 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.23;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3344,372,0 chrX 301035 . G T 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3311,348,0 chrX 301062 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.014;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1154,0,1586 chrX 301233 . T C 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3469,366,0 chrX 301479 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.680;DP=135;Dels=0.00;FS=30.171;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1317,0,1409 chrX 301512 . A G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.137;DP=136;Dels=0.00;FS=5.564;HaplotypeScore=2.9346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.621;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,55:136:99:1055,0,1768 chrX 301515 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.384;DP=140;Dels=0.00;FS=3.202;HaplotypeScore=2.9346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.157;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,57:140:99:1154,0,1784 chrX 301759 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.726;DP=126;Dels=0.00;FS=9.438;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.764;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1216,0,1429 chrX 301847 . T C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.909;DP=111;Dels=0.00;FS=14.986;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.909;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.534;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1146,0,1134 chrX 301867 . T C 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6096;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=22.47;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2752,294,0 chrX 301980 . G A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.139;DP=135;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.565;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1433,0,1395 chrX 302097 . A G 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3698,396,0 chrX 302697 . G C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.749;DP=128;Dels=0.00;FS=3.214;HaplotypeScore=3.1859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1372,0,1130 chrX 302882 . G A 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2235;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3153,321,0 chrX 302885 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.154;DP=122;Dels=0.00;FS=4.566;HaplotypeScore=2.3294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.439;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:122:99:1331,0,1180 chrX 302979 . T C 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3191,336,0 chrX 303071 . A G 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3578,378,0 chrX 303269 . A G 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3489,366,0 chrX 303316 . C A 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=1;MQRankSum=-1.613;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.045;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3032,288,0 chrX 303495 . T C 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3875,405,0 chrX 303556 . G A 3562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3562,366,0 chrX 303606 . G A 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3590,358,0 chrX 303780 . T A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;DP=125;Dels=0.00;FS=11.294;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.030;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1276,0,1374 chrX 304233 . C T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.087;DP=123;Dels=0.00;FS=0.796;HaplotypeScore=3.5606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1198,0,1282 chrX 304262 . T A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.093;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1191,0,1538 chrX 304591 . T A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;DP=128;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.575;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1196,0,1562 chrX 304829 . G C 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3061,336,0 chrX 305004 . A G 1972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=22.67;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2005,222,0 chrX 305203 . T A 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.062;DP=151;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.740;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1638,0,1547 chrX 305635 . A G 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.365;DP=138;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=4.6820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.151;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,80:138:99:1642,0,1227 chrX 305699 . G A 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.938;DP=125;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1614,0,975 chrX 305909 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.848;DP=106;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=4.1514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.836;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:106:99:993,0,1182 chrX 305953 . T C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.700;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1291,0,1477 chrX 305977 . G T 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3064,309,0 chrX 308216 . T G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.195;DP=150;Dels=0.00;FS=10.085;HaplotypeScore=7.7679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:1605,0,1348 chrX 308673 . T C 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3958,426,0 chrX 308727 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.279;DP=144;Dels=0.00;FS=2.179;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,61:144:99:1225,0,1863 chrX 309327 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.530;DP=127;Dels=0.00;FS=9.550;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1295,0,1363 chrX 309343 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.688;DP=109;Dels=0.00;FS=13.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1073,0,1181 chrX 309348 . T G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.122;DP=115;Dels=0.00;FS=14.403;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.222;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1105,0,1237 chrX 309768 . C T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.071;DP=140;Dels=0.00;FS=6.370;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.006;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1634,0,1285 chrX 310155 . T C 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.709;DP=127;Dels=0.00;FS=1.516;HaplotypeScore=5.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1118,0,1422 chrX 310656 . T C 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.491;DP=136;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=2.880;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.414;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1311,0,1515 chrX 310843 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.781;DP=100;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1127,0,935 chrX 310994 . C T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.638;DP=115;Dels=0.00;FS=16.111;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=2;MQRankSum=0.804;QD=9.26;ReadPosRankSum=-2.152;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1095,0,1120 chrX 311045 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.008;DP=145;Dels=0.00;FS=9.090;HaplotypeScore=3.4373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.660;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1366,0,1488 chrX 311117 . C T 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.489;DP=162;Dels=0.00;FS=17.121;HaplotypeScore=4.4639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,82:162:99:1683,0,1634 chrX 311593 . G T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.207;DP=140;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.984;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1362,0,1504 chrX 311627 . A C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.155;DP=118;Dels=0.00;FS=6.105;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.450;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1414,0,1058 chrX 311658 . G A 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.867;DP=145;Dels=0.00;FS=11.855;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.608;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1754,0,1253 chrX 311660 . C T 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.669;DP=151;Dels=0.00;FS=11.403;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.264;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,84:151:99:1772,0,1329 chrX 311840 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.708;DP=157;Dels=0.00;FS=2.035;HaplotypeScore=3.1547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1496,0,1637 chrX 311915 . T C 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.492;DP=142;Dels=0.00;FS=1.330;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.072;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1649,0,1313 chrX 312119 . G A 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.583;DP=147;Dels=0.00;FS=7.460;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.558;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:147:99:1748,0,1297 chrX 312305 . T A 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;DP=139;Dels=0.00;FS=2.179;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1681,0,1342 chrX 312403 . T C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.712;DP=145;Dels=0.00;FS=8.717;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=10.42;ReadPosRankSum=2.557;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1541,0,1457 chrX 312482 . T G 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.550;DP=149;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.488;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1483,0,1556 chrX 312782 . G C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.049;DP=140;Dels=0.00;FS=8.069;HaplotypeScore=2.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1370,0,1420 chrX 312940 . T G 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.908;DP=111;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.906;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.236;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:992,0,1325 chrX 313030 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.617;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.653;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1152,0,981 chrX 313349 . G A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.484;DP=128;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1537,0,1127 chrX 313385 . T C 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.335;DP=119;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.367;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,68:119:99:1344,0,1098 chrX 313409 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.629;DP=114;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1286,0,981 chrX 313669 . C T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.125;DP=123;Dels=0.00;FS=5.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1323,0,1201 chrX 313670 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.064;DP=126;Dels=0.00;FS=5.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1274,0,1272 chrX 313709 . A T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;DP=116;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=3.8351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.711;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1082,0,1275 chrX 313739 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.530;DP=121;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:121:99:1246,0,1099 chrX 313782 . C T 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.716;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.186;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,37:88:99:701,0,1107 chrX 313793 . T C 618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.134;DP=90;Dels=0.00;FS=0.818;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:648,0,1213 chrX 313822 . T C 693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.884;DP=99;Dels=0.00;FS=5.072;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.518;QD=7.00;ReadPosRankSum=-1.694;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:723,0,1298 chrX 313829 . G A 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.003;DP=97;Dels=0.00;FS=5.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=8.28;ReadPosRankSum=-2.641;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:833,0,1086 chrX 313850 . G T 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.953;DP=116;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1114,0,1217 chrX 314154 . T C 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.220;DP=144;Dels=0.00;FS=4.172;HaplotypeScore=11.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,60:144:99:1110,0,1824 chrX 314406 . C G 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;DP=173;Dels=0.00;FS=5.502;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=2.297;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.647;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,80:173:99:1547,0,1916 chrX 314438 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.528;DP=175;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=3.8263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,74:175:99:1408,0,2166 chrX 314471 . G A 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.693;DP=176;Dels=0.00;FS=1.206;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.647;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,76:176:99:1549,0,2104 chrX 314515 . T C 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.445;DP=158;Dels=0.00;FS=2.007;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.532;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1567,0,1653 chrX 314996 . T A 1963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;DP=155;Dels=0.00;FS=6.288;HaplotypeScore=5.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=12.66;ReadPosRankSum=-1.688;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,91:155:99:1993,0,1180 chrX 315022 . G A 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.412;DP=145;Dels=0.00;FS=4.976;HaplotypeScore=3.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.580;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1637,0,1349 chrX 315237 . T C 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.956e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3738,393,0 chrX 315357 . C T 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.662;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1637,0,1483 chrX 315571 . T C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.206;DP=115;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=2.8723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1090,0,1237 chrX 315714 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.395;DP=130;Dels=0.00;FS=5.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1065,0,1483 chrX 316206 . C T 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.757;DP=179;Dels=0.00;FS=1.850;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.446;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,85:179:99:1778,0,1889 chrX 316285 . A G 3936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5818;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3936,435,0 chrX 316535 . C T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.377;DP=118;Dels=0.00;FS=4.476;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.531;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1110,0,1305 chrX 316571 . G T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.384;DP=128;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=3.3992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.508;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1340,0,1198 chrX 316590 . T C 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.992;DP=126;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.537;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1188,0,1309 chrX 317004 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.057;DP=163;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=4.9617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.593;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,72:163:99:1316,0,1850 chrX 317287 . A G 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.978;DP=110;Dels=0.00;FS=3.528;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=10.46;ReadPosRankSum=2.897;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1181,0,1135 chrX 317989 . C T 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.790;DP=151;Dels=0.00;FS=1.274;HaplotypeScore=7.9835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1600,0,1490 chrX 318429 . A G 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.955;DP=102;Dels=0.00;FS=3.008;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1056,0,993 chrX 318543 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.862;DP=133;Dels=0.00;FS=4.141;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.359;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1377,0,1371 chrX 318573 . G A 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.276;DP=95;Dels=0.00;FS=3.852;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.815;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1052,0,940 chrX 318721 . T A 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=113;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1227,0,934 chrX 318723 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.155;DP=112;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=3.3627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1179,0,917 chrX 318780 . A C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;DP=128;Dels=0.00;FS=9.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.924;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1628,0,1050 chrX 318863 . C A 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=95;Dels=0.00;FS=8.203;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:923,0,1024 chrX 318879 . A G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;DP=92;Dels=0.00;FS=8.343;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.129;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:988,0,898 chrX 318887 . T C 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.426;DP=88;Dels=0.00;FS=8.870;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.950;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,48:88:99:891,0,882 chrX 318923 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.859;DP=106;Dels=0.00;FS=20.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.444;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:1283,0,893 chrX 319272 . C T 2363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.85;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2396,252,0 chrX 319451 . A G 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.604;DP=155;Dels=0.00;FS=7.289;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.534;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,83:155:99:1624,0,1347 chrX 319453 . A G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.902;DP=151;Dels=0.00;FS=4.905;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.470;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1271,0,1746 chrX 319805 . G T 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.886;DP=142;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=4.5697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.499;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.646;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1548,0,1494 chrX 319864 . C T 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.498;DP=171;Dels=0.00;FS=7.551;HaplotypeScore=3.6570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.105;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,93:171:99:1929,0,1555 chrX 320259 . C T 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3690,376,0 chrX 320394 . A C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;DP=132;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.429;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1324,0,1400 chrX 320908 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.915;DP=150;Dels=0.00;FS=2.032;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.622;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1452,0,1678 chrX 321770 . T C 739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.858;DP=93;Dels=0.00;FS=0.856;HaplotypeScore=6.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:769,0,1199 chrX 323030 . G A 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3212,327,0 chrX 323069 . A G 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3252,333,0 chrX 323146 . T C 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3237,342,0 chrX 323294 . G A 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.84;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2815,291,0 chrX 323313 . G A 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.21;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2888,300,0 chrX 323314 . G A 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.74;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2935,309,0 chrX 323333 . A G 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.142;DP=135;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.91;MQ0=0;MQRankSum=-3.972;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.083;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1097,0,1524 chrX 323341 . C T 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.81;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2733,291,0 chrX 323357 . C T 2502 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.08;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2535,273,0 chrX 323361 . T C 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.31;MQ0=0;QD=21.50;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2441,273,0 chrX 323385 . A G 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.72;MQ0=0;QD=23.17;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2744,309,0 chrX 323463 . C T 2525 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.41;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2558,261,0 chrX 323517 . A G 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.033;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=1.800;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.137;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1045,0,975 chrX 323601 . C G 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;DP=123;Dels=0.01;FS=8.711;HaplotypeScore=3.5313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.000;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1306,0,1179 chrX 323637 . G A 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;DP=133;Dels=0.00;FS=5.256;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=1.990;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.165;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1608,0,1158 chrX 323703 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.265;DP=137;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=10.30;ReadPosRankSum=-2.375;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1441,0,1374 chrX 323802 . C T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.697;DP=137;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.566;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1311,0,1378 chrX 323895 . T C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.092;DP=121;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=2.798;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1111,0,1341 chrX 324264 . T C 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.526;DP=107;Dels=0.00;FS=14.778;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.777;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:929,0,1196 chrX 324432 . A C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;DP=185;Dels=0.00;FS=5.515;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,82:185:99:988,0,2325 chrX 324627 . T C 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.287;DP=106;Dels=0.00;FS=3.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.356;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:798,0,1386 chrX 324792 . G A 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.015;DP=104;Dels=0.00;FS=1.588;HaplotypeScore=4.4116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.086;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:903,0,1159 chrX 324830 . T A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.627;DP=115;Dels=0.00;FS=5.935;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1090,0,1399 chrX 324897 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=132;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=4.5491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.872;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1299,0,1490 chrX 324913 . T C 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.492;DP=146;Dels=0.00;FS=2.112;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1408,0,1613 chrX 324924 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.452;DP=126;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1239,0,1355 chrX 324999 . T C 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.190;DP=160;Dels=0.00;FS=3.769;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=1;MQRankSum=2.916;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.236;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1631,0,1660 chrX 325190 . C T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.196;DP=126;Dels=0.00;FS=1.505;HaplotypeScore=5.5148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.408;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:126:99:1288,0,1319 chrX 325332 . G A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.179;DP=123;Dels=0.00;FS=3.405;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1228,0,1417 chrX 325366 . A G 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.895;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=0.357;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.716;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,77:134:99:1537,0,1218 chrX 325369 . A C 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.328;DP=122;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=1.887;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:966,0,1549 chrX 325435 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.026;DP=125;Dels=0.00;FS=1.547;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.548;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.046;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1170,0,1501 chrX 325505 . A T 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.122;DP=111;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=3.3392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.807;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.324;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:919,0,1405 chrX 325620 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.503;DP=107;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=9.95;ReadPosRankSum=-2.428;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1095,0,1115 chrX 325758 . A G 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.456;DP=128;Dels=0.00;FS=1.424;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.270;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1420,0,1224 chrX 325803 . C T 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3029,303,0 chrX 325860 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;DP=113;Dels=0.00;FS=9.234;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1115,0,1271 chrX 325946 . A G 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.566;DP=89;Dels=0.00;FS=4.005;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.242;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:931,0,866 chrX 326091 . C G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.712;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.144;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:983,0,940 chrX 326098 . G A 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.113;DP=97;Dels=0.00;FS=2.781;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.766;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:97:99:1041,0,910 chrX 326293 . T C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.003;DP=125;Dels=0.00;FS=3.256;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.851;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.740;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1232,0,1445 chrX 326422 . G A 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3165,315,0 chrX 326497 . A G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.911;DP=130;Dels=0.00;FS=6.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.367;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1417,0,1357 chrX 326548 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.265;DP=129;Dels=0.00;FS=3.207;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.717;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1389,0,1256 chrX 326617 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.953;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1318,0,1556 chrX 326683 . A G 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.919;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=5.97;ReadPosRankSum=-1.997;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,55:151:99:931,0,2161 chrX 326989 . G A 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.482;DP=97;Dels=0.00;FS=0.801;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.304;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:881,0,1142 chrX 327501 . C T 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3640,370,0 chrX 327718 . T C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.440;DP=130;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1069,0,1616 chrX 327809 . C G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;DP=147;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=3.9140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.754;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1392,0,1502 chrX 327851 . A G 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.40;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3156,339,0 chrX 327946 . C G 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.464;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.736;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,84:150:99:1681,0,1323 chrX 327986 . G C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.597;DP=114;Dels=0.00;FS=4.595;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.526;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1332,0,987 chrX 328162 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.603;DP=121;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=1;MQRankSum=-0.108;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.218;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1208,0,1276 chrX 328274 . G T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.204;DP=153;Dels=0.00;FS=1.274;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.005;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,80:153:99:1609,0,1502 chrX 328451 . A G 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2804,312,0 chrX 328485 . C T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.295;DP=134;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,77:134:99:1666,0,1047 chrX 328739 . G A 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3093,303,0 chrX 328877 . G T 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3609,369,0 chrX 328946 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.299;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.119;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1032,0,1232 chrX 329090 . A G 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.684;DP=165;Dels=0.00;FS=1.224;HaplotypeScore=2.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.755;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,83:165:99:1657,0,1789 chrX 329192 . G A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.005;DP=151;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=3.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.564;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,58:151:99:1121,0,1950 chrX 329323 . C T 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3474,346,0 chrX 329730 . G A 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3482,346,0 chrX 329858 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.655;DP=147;Dels=0.00;FS=4.952;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.779;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,62:147:99:1231,0,1820 chrX 329903 . C T 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.140;DP=150;Dels=0.00;FS=2.048;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.286;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1542,0,1476 chrX 329995 . A G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.913;DP=134;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.895;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1514,0,1277 chrX 330001 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.271;DP=139;Dels=0.00;FS=2.231;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1462,0,1421 chrX 330050 . A G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.086;DP=121;Dels=0.00;FS=11.549;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1322,0,1229 chrX 330144 . C T 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.130;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,84:154:99:1764,0,1452 chrX 330191 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.854;DP=128;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.832;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1220,0,1237 chrX 330228 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.038;DP=123;Dels=0.00;FS=4.224;HaplotypeScore=64.2800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.993;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:123:99:1067,0,1254 chrX 330372 . T A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=110;Dels=0.00;FS=3.528;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1036,0,1272 chrX 330470 . C G 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3592,381,0 chrX 330557 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;DP=127;Dels=0.00;FS=4.238;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.422;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1339,0,1345 chrX 330767 . C T 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3281,334,0 chrX 331030 . C G 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;DP=123;Dels=0.00;FS=6.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.20;MQ0=0;MQRankSum=-3.548;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.783;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1438,0,1124 chrX 331031 . T A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;DP=121;Dels=0.00;FS=7.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.07;MQ0=0;MQRankSum=-3.127;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.554;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1451,0,1120 chrX 331044 . T G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.234;DP=112;Dels=0.00;FS=7.412;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-5.371;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.244;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1273,0,1051 chrX 331050 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.008;DP=117;Dels=0.00;FS=7.172;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.90;MQ0=0;MQRankSum=-4.888;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.050;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1310,0,1085 chrX 331064 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.954;DP=129;Dels=0.00;FS=6.598;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQ0=0;MQRankSum=-4.152;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1346,0,1308 chrX 331109 . A C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.859;DP=149;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.322;QD=7.00;ReadPosRankSum=-1.135;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,58:149:99:1073,0,2019 chrX 331412 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.420;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1103,0,1111 chrX 331423 . A T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;DP=125;Dels=0.00;FS=4.322;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.488;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1270,0,1482 chrX 331526 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.819;DP=130;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.955;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1276,0,1330 chrX 331559 . C G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;DP=144;Dels=0.00;FS=12.241;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1240,0,1511 chrX 331574 . G C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;DP=118;Dels=0.00;FS=15.697;HaplotypeScore=2.8178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.187;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1031,0,1283 chrX 331604 . T G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.852;DP=129;Dels=0.00;FS=19.232;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.285;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1078,0,1550 chrX 331639 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.078;DP=131;Dels=0.00;FS=5.321;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.398;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1502,0,1197 chrX 331707 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.223;DP=143;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1259,0,1455 chrX 331811 . A G 1002.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.520;DP=119;Dels=0.00;FS=5.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.149;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1032,0,1320 chrX 331813 . T G 1232.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.182;DP=119;Dels=0.00;FS=4.433;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.408;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1262,0,1190 chrX 331818 . C T 1206.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.163;DP=120;Dels=0.00;FS=4.433;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.460;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1236,0,1161 chrX 331934 . C T 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=143;Dels=0.00;FS=17.551;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,81:143:99:1779,0,1271 chrX 331946 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.995;DP=148;Dels=0.00;FS=15.005;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1279,0,1780 chrX 331988 . C T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.249;DP=169;Dels=0.00;FS=1.200;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.011;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:169:99:1593,0,1812 chrX 332018 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.796;DP=154;Dels=0.00;FS=2.863;HaplotypeScore=3.6596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.864;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1362,0,1730 chrX 332030 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.358;DP=154;Dels=0.00;FS=4.706;HaplotypeScore=3.5098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.018;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1345,0,1659 chrX 332146 . G T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.311;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1428,0,1386 chrX 332162 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.926;DP=131;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1435,0,1262 chrX 332198 . G T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.368;DP=142;Dels=0.00;FS=4.242;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1313,0,1427 chrX 332246 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.671;DP=154;Dels=0.00;FS=6.363;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.276;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1530,0,1518 chrX 332261 . T G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.298;DP=150;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=3.7401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1412,0,1481 chrX 332335 . G A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.578;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.770;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1212,0,1336 chrX 332394 . A T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.927;DP=143;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1366,0,1584 chrX 332396 . G C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.171;DP=145;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1356,0,1543 chrX 332423 . A T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.577;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.303;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1119,0,1419 chrX 332434 . T C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.041;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.909;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1051,0,1679 chrX 332541 . G A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.689;DP=99;Dels=0.00;FS=4.990;HaplotypeScore=3.2245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.440;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1031,0,982 chrX 332595 . A T 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;DP=112;Dels=0.00;FS=6.436;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.993;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:968,0,1276 chrX 332597 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.905;DP=108;Dels=0.00;FS=9.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=1.988;QD=8.80;ReadPosRankSum=-2.086;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:980,0,1158 chrX 332621 . A G 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.029;DP=110;Dels=0.00;FS=15.427;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=4.402;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.471;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,42:110:99:712,0,1454 chrX 333075 . A G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.434;DP=152;Dels=0.00;FS=6.022;HaplotypeScore=4.4685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=-0.811;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.028;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,65:152:99:1197,0,1806 chrX 333110 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.522;DP=135;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=4.7950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1078,0,1601 chrX 333407 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.262;DP=137;Dels=0.00;FS=6.397;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1481,0,1283 chrX 333469 . G A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.952;DP=136;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.542;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1030,0,1716 chrX 334125 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.850;DP=136;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=10.6891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.025;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1219,0,1419 chrX 334204 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.626;DP=150;Dels=0.00;FS=6.109;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.636;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:1218,0,1879 chrX 334264 . C T 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;DP=155;Dels=0.00;FS=3.935;HaplotypeScore=4.7602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.956;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1578,0,1602 chrX 334291 . T C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.653;DP=134;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.748;QD=10.49;ReadPosRankSum=2.501;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1436,0,1394 chrX 334681 . A G 1945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.090;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.887;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,96:176:99:1975,0,1700 chrX 334858 . C T 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.546;DP=144;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1591,0,1320 chrX 334934 . A G 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.080;DP=141;Dels=0.00;FS=6.397;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.544;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1493,0,1390 chrX 335148 . C T 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.304;DP=126;Dels=0.00;FS=6.934;HaplotypeScore=2.6492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.975;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:1028,0,1478 chrX 335332 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.577;DP=116;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=1;MQRankSum=0.801;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.278;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1318,0,1080 chrX 335788 . C A 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3056,309,0 chrX 336167 . T G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.549;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.334;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:124:99:1320,0,1117 chrX 336284 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.539;DP=131;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1303,0,1438 chrX 336383 . G A 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.980;DP=140;Dels=0.00;FS=6.860;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.219;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1091,0,1723 chrX 336512 . C T 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.984;DP=118;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.977;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1215,0,1216 chrX 336551 . C T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.013;DP=119;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=2.6812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1153,0,1123 chrX 336583 . C G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;DP=123;Dels=0.00;FS=4.386;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=-0.597;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1125,0,1221 chrX 336677 . G A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.721;DP=141;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=2.5838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.497;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1560,0,1382 chrX 336725 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.385;DP=134;Dels=0.00;FS=3.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1349,0,1415 chrX 336755 . G A 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.330;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1025,0,1680 chrX 336944 . T C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.035;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.162;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1339,0,1776 chrX 337050 . T A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.288;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1442,0,1401 chrX 337087 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.873;DP=135;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1343,0,1393 chrX 337133 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.558;DP=129;Dels=0.00;FS=3.293;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.523;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1367,0,1334 chrX 337222 . A C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.365;DP=119;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=3.5448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=10.72;ReadPosRankSum=2.494;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1306,0,1074 chrX 337263 . A C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.088;DP=125;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=4.2432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:125:99:1316,0,1274 chrX 337345 . A C 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.793;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1344,0,1079 chrX 337436 . A T 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;DP=85;Dels=0.00;FS=4.309;HaplotypeScore=2.4546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:784,0,937 chrX 337468 . G A 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;DP=117;Dels=0.00;FS=3.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1011,0,1380 chrX 337551 . T C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.668;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=1;MQRankSum=2.632;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.908;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1520,0,1529 chrX 337579 . C T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.621;DP=150;Dels=0.00;FS=2.107;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=-0.435;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1527,0,1474 chrX 337727 . A T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;DP=152;Dels=0.00;FS=8.480;HaplotypeScore=4.9422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.362;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1449,0,1704 chrX 337825 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.271;DP=122;Dels=0.00;FS=2.316;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=10.71;ReadPosRankSum=-2.332;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1337,0,1116 chrX 337959 . T C 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.839;DP=137;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=2.8389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.300;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.300;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:950,0,1327 chrX 338049 . G A 1271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.858;DP=118;Dels=0.00;FS=3.437;HaplotypeScore=7.1493;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:62,56:118:73:1304,73,0 chrX 338075 . G C 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;DP=157;Dels=0.00;FS=3.784;HaplotypeScore=6.2053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.878;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1519,0,1574 chrX 338810 . C T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.681;DP=125;Dels=0.00;FS=8.269;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1321,0,1194 chrX 338993 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.959;DP=128;Dels=0.00;FS=13.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQ0=3;MQRankSum=2.892;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1218,0,1310 chrX 339013 . A C 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3096,318,0 chrX 339050 . T C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.497;DP=118;Dels=0.00;FS=11.908;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1084,0,1307 chrX 339346 . G A 3788.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3788,373,0 chrX 339426 . C T 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;DP=104;Dels=0.00;FS=11.330;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.055;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1122,0,1029 chrX 339429 . T C 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.234;DP=106;Dels=0.00;FS=13.079;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.589;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1087,0,1028 chrX 339446 . T A 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;DP=95;Dels=0.00;FS=9.867;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=1;MQRankSum=-0.231;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.683;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:889,0,1014 chrX 339451 . G A 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.467;DP=91;Dels=0.00;FS=10.187;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=1;MQRankSum=-0.416;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.820;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:887,0,919 chrX 339493 . C T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.299;DP=117;Dels=0.00;FS=10.317;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=1;MQRankSum=0.188;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.526;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1079,0,1102 chrX 339512 . A T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.130;DP=111;Dels=0.00;FS=2.474;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=1;MQRankSum=1.534;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1226,0,1103 chrX 339657 . C T 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3087,309,0 chrX 339669 . C G 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.73;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3805,387,0 chrX 339996 . T G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.991;DP=146;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.975;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1449,0,1548 chrX 340014 . T C 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.736;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.898;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1606,0,1569 chrX 340095 . C T 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3349,348,0 chrX 340159 . T C 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.950;DP=148;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.256;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1645,0,1449 chrX 340218 . C A 1751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.923;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,82:136:99:1781,0,1035 chrX 340255 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.866;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.078;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1206,0,1547 chrX 340449 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.262;DP=131;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1427,0,1299 chrX 340465 . T G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.103;DP=123;Dels=0.00;FS=4.436;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.070;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1217,0,1293 chrX 340572 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.113;DP=138;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1400,0,1449 chrX 340641 . C T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.992;DP=103;Dels=0.00;FS=0.793;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1195,0,876 chrX 340737 . G A 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3094,309,0 chrX 340754 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.386;DP=122;Dels=0.00;FS=11.744;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1449,0,999 chrX 340776 . A G 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.589;DP=93;Dels=0.00;FS=12.377;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.722;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.652;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:798,0,1143 chrX 340947 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.389;DP=131;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=6.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.420;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1449,0,1276 chrX 341057 . A G 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.209;DP=154;Dels=0.00;FS=1.255;HaplotypeScore=3.2158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.962;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1654,0,1541 chrX 341086 . G A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.570;DP=140;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.851;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1676,0,1283 chrX 341290 . C T 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2920,291,0 chrX 341296 . G A 2682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2715,273,0 chrX 341344 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.428;DP=117;Dels=0.00;FS=12.150;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1501,0,918 chrX 341422 . C G 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3610,375,0 chrX 341566 . A G 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.952;DP=118;Dels=0.00;FS=2.489;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.236;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:939,0,1492 chrX 341578 . T A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.254;DP=137;Dels=0.00;FS=5.364;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.940;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1498,0,1436 chrX 341586 . T C 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3084,330,0 chrX 341797 . G A 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3683,376,0 chrX 341813 . C A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.777;DP=126;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=3.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=2.103;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1349,0,1230 chrX 341843 . A G 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3279,354,0 chrX 341852 . A G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.478;DP=123;Dels=0.00;FS=2.409;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.768;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1323,0,1182 chrX 342013 . C T 1828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.546;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1858,0,1478 chrX 342290 . T C 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=24.62;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2618,288,0 chrX 342457 . C G 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3498,372,0 chrX 342479 . T C 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3515,366,0 chrX 342505 . T C 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3358,354,0 chrX 342558 . A G 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3776,387,0 chrX 342956 . A T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;DP=129;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=3.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.197;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:129:99:1390,0,1269 chrX 343292 . C T 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.050;DP=130;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,77:130:99:1622,0,1078 chrX 343412 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.178;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1036,0,1315 chrX 343445 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.161;DP=109;Dels=0.00;FS=4.861;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1093,0,1169 chrX 343823 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.565;DP=113;Dels=0.00;FS=2.458;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.059;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1218,0,1067 chrX 343856 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.705;DP=137;Dels=0.00;FS=1.524;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.531;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1208,0,1559 chrX 343871 . A G 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.916;DP=140;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=8.62;ReadPosRankSum=-2.393;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:1237,0,1644 chrX 344460 . C T 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;DP=112;Dels=0.00;FS=3.586;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.704;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:955,0,1340 chrX 344732 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.587;DP=130;Dels=0.00;FS=1.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.891;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1406,0,1317 chrX 344747 . A C 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.17;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3348,348,0 chrX 344915 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.611;DP=110;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.594;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1224,0,1086 chrX 346441 . G T 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.539;DP=85;Dels=0.00;FS=0.895;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.869;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,39:85:99:813,0,991 chrX 346488 . T C 2089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2122,228,0 chrX 346495 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.994;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,49:89:99:1068,0,768 chrX 346858 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.119;DP=124;Dels=0.00;FS=4.527;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.956;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1173,0,1384 chrX 346882 . G A 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.114;DP=102;Dels=0.00;FS=2.591;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.927;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1246,0,858 chrX 347471 . G A 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.445;DP=80;Dels=0.00;FS=3.015;HaplotypeScore=2.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.871;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,34:80:99:728,0,993 chrX 347503 . C T 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;DP=102;Dels=0.00;FS=3.746;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.349;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:983,0,1170 chrX 347852 . G A 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2733,276,0 chrX 347951 . T A 3842.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3842,393,0 chrX 348200 . G A 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3296,339,0 chrX 348292 . A G 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3404,366,0 chrX 348584 . A G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.843;DP=133;Dels=0.00;FS=5.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1373,0,1353 chrX 348652 . A G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.733;DP=176;Dels=0.00;FS=2.715;HaplotypeScore=3.3851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.973;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,84:176:99:1618,0,1901 chrX 348689 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.224;DP=135;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.881;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1273,0,1499 chrX 348750 . C T 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.738;DP=113;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=2.5953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=11.75;ReadPosRankSum=2.432;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1358,0,965 chrX 348753 . C A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.430;DP=108;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=3.5618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.766;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1301,0,899 chrX 348770 . T C 2672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=24.51;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2705,285,0 chrX 348976 . A G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.619;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1325,0,1182 chrX 348978 . C T 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.488;DP=125;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1450,0,1167 chrX 349384 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.868;DP=133;Dels=0.00;FS=3.144;HaplotypeScore=2.3913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:133:99:1214,0,1503 chrX 349396 . T A 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.544;DP=122;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,46:122:99:932,0,1658 chrX 349479 . A T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;DP=116;Dels=0.00;FS=7.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.254;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1422,0,1003 chrX 349640 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.503;DP=138;Dels=0.00;FS=9.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1323,0,1530 chrX 349864 . G A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.265;DP=117;Dels=0.00;FS=2.455;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.747;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,73:117:99:1605,0,825 chrX 349943 . A G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.265;DP=108;Dels=0.00;FS=2.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1208,0,1073 chrX 350351 . G A 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.425;DP=95;Dels=0.00;FS=4.340;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:923,0,984 chrX 350420 . C G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.595;DP=114;Dels=0.00;FS=11.941;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.817;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1189,0,982 chrX 350468 . G T 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;DP=93;Dels=0.00;FS=2.786;HaplotypeScore=3.5579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:824,0,1076 chrX 350651 . G A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.669;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.956;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1327,0,870 chrX 350741 . T G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;DP=118;Dels=0.00;FS=3.366;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1271,0,1134 chrX 350771 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.021;DP=129;Dels=0.00;FS=3.187;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.597;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1484,0,1243 chrX 350948 . A G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.261;DP=135;Dels=0.00;FS=9.088;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.503;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1507,0,1181 chrX 351163 . G A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.323;DP=107;Dels=0.00;FS=10.918;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.115;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1122,0,1031 chrX 352000 . T A 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.009;DP=149;Dels=0.00;FS=13.999;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1752,0,1328 chrX 352449 . C G 1848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.017;DP=161;Dels=0.00;FS=3.693;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=1;MQRankSum=0.969;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.941;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,88:161:99:1878,0,1366 chrX 353165 . C T 3740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3740,384,0 chrX 353330 . T C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.498;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.912;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1033,0,1603 chrX 353336 . G A 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.009;DP=139;Dels=0.00;FS=3.506;HaplotypeScore=11.7180;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.184;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3601,369,0 chrX 353471 . C T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3405,337,0 chrX 353655 . T C 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.812;DP=91;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.47;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.155;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:894,0,963 chrX 353713 . G C 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.970;DP=103;Dels=0.00;FS=4.084;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:791,0,1234 chrX 353743 . G A 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.819;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.597;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.851;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,47:115:99:798,0,1378 chrX 353747 . T C 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.54;MQ0=0;QD=24.71;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2875,315,0 chrX 353754 . G A 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.97;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3270,351,0 chrX 353801 . C T 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;DP=118;Dels=0.00;FS=2.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.871;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.312;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:870,0,1484 chrX 353805 . C T 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.53;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3042,309,0 chrX 353826 . T C 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.81;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3006,315,0 chrX 353839 . A G 2577 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2610,276,0 chrX 353862 . C T 2130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.50;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2163,222,0 chrX 353900 . G C 1370 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.21;MQ0=0;QD=23.62;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1403,156,0 chrX 354033 . A C 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;DP=95;Dels=0.00;FS=14.147;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.79;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=8.74;ReadPosRankSum=2.564;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:860,0,983 chrX 354067 . C T 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.850;DP=103;Dels=0.00;FS=13.736;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.083;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:944,0,1160 chrX 354367 . A G 650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:72:683,72,0 chrX 354442 . A G 400 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.86;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:48:433,48,0 chrX 354467 . G C 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;DP=24;Dels=0.00;FS=40.264;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.44;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=0.96;ReadPosRankSum=-3.137;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:53:53,0,361 chrX 354679 . C A 377 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.82;MQ0=0;QD=16.39;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:45:410,45,0 chrX 354692 . T C 324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.72;MQ0=0;QD=14.09;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:39:357,39,0 chrX 354706 . T C 432 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.82;MQ0=0;QD=15.43;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:51:465,51,0 chrX 354975 . T C 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.23;MQ0=3;QD=3.11;SB=-2.476e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,4:7:6:53,6,0 chrX 355169 . T G 38.04 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:18:68,0,18 chrX 355170 . C A 38.06 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:16:68,0,16 chrX 355172 . A T 41.06 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.96;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.000;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:16:71,0,16 chrX 355202 . C T 185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.435;DP=75;Dels=0.00;FS=3.664;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=2.47;ReadPosRankSum=0.674;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,28:75:99:215,0,379 chrX 355334 . G A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.502;DP=105;Dels=0.00;FS=15.039;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1010,0,1102 chrX 355581 . C A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.381;DP=150;Dels=0.00;FS=1.273;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.566;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1470,0,1563 chrX 356479 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.486;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.201;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:158:99:1602,0,1713 chrX 357352 . A G 3762.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3762,408,0 chrX 357534 . G C 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.944;DP=169;Dels=0.00;FS=5.665;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.093;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,94:169:99:1868,0,1522 chrX 357575 . A G 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.258;DP=164;Dels=0.00;FS=2.007;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.370;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,76:164:99:1319,0,1829 chrX 357835 . A G 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.736;DP=180;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=7.9128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.534;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,86:180:99:1665,0,2040 chrX 357838 . A G 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.329;DP=178;Dels=0.00;FS=6.296;HaplotypeScore=5.9547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.278;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,85:178:99:1571,0,1955 chrX 358040 . G C 398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.717;DP=128;Dels=0.00;FS=3.994;HaplotypeScore=24.1627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.38;MQ0=0;MQRankSum=-7.432;QD=3.11;ReadPosRankSum=-3.733;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,42:128:99:428,0,1894 chrX 358190 . T C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.984;DP=137;Dels=0.00;FS=1.632;HaplotypeScore=2.6794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.084;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1343,0,1430 chrX 358208 . C G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;DP=126;Dels=0.00;FS=0.876;HaplotypeScore=107.8488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=9.25;ReadPosRankSum=-2.159;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1196,0,961 chrX 358315 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.108;DP=133;Dels=0.01;FS=13.873;HaplotypeScore=4.2964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=10.47;ReadPosRankSum=-2.939;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1423,0,1298 chrX 358354 . C T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.737;DP=134;Dels=0.00;FS=5.365;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.881;QD=10.92;ReadPosRankSum=2.149;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1493,0,1301 chrX 358391 . G C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;DP=146;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=3.3937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.382;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1562,0,1251 chrX 358552 . A G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.518;DP=142;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1373,0,1527 chrX 358691 . G A 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.180;DP=158;Dels=0.00;FS=8.199;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=1;MQRankSum=0.676;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.705;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1544,0,1619 chrX 358755 . C T 4845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=1;QD=26.77;SB=-2.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:181:99:4845,487,0 chrX 358777 . T C 1874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.630;DP=178;Dels=0.00;FS=1.913;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=1;MQRankSum=0.418;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.100;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,93:178:99:1904,0,1721 chrX 358813 . G A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.190;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.525;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1624,0,1284 chrX 358909 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.953;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:139:99:1430,0,1186 chrX 358915 . A G 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.805;DP=130;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=6.7949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.518;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1034,0,1561 chrX 358957 . A G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.772;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.395;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1335,0,1456 chrX 359074 . A G 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.652;DP=158;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=6.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,70:158:99:1310,0,1995 chrX 359251 . C T 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.941;DP=166;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=6.4175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1800,0,1769 chrX 359301 . T G 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.898;DP=170;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.119;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,79:170:99:1525,0,2023 chrX 359404 . T C 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.126;DP=145;Dels=0.00;FS=2.998;HaplotypeScore=3.8011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.181;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,83:145:99:1593,0,1134 chrX 359445 . C T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.799;DP=129;Dels=0.00;FS=1.433;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.521;QD=11.53;ReadPosRankSum=-2.416;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1517,0,1020 chrX 359606 . C G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;DP=139;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=3.7665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=0.115;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.604;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1474,0,1271 chrX 359747 . C T 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.804;DP=162;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.134;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1785,0,1468 chrX 359859 . G T 726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.735;DP=163;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=1.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,70:163:99:756,0,1773 chrX 360017 . G A 1893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.454;DP=178;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.901;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,90:178:99:1923,0,1786 chrX 360052 . A C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.433;DP=126;Dels=0.00;FS=8.735;HaplotypeScore=3.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:126:99:1141,0,1401 chrX 360140 . A G 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.244;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:927,0,1173 chrX 360186 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.137;DP=164;Dels=0.00;FS=2.821;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.331;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,76:164:99:1227,0,1576 chrX 360306 . T C 2042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.885;DP=184;Dels=0.00;FS=1.163;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.502;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,102:184:99:2072,0,1655 chrX 360317 . G A 2490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.219;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.188;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,116:214:99:2520,0,1836 chrX 360333 . G A 2245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.052;DP=202;Dels=0.00;FS=1.804;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,107:202:99:2275,0,1758 chrX 360588 . G A 2110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.325;DP=215;Dels=0.00;FS=3.827;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.036;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,106:215:99:2140,0,2299 chrX 360746 . T C 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.173;DP=151;Dels=0.00;FS=16.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.651;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1572,0,1562 chrX 361124 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.051;DP=177;Dels=0.00;FS=2.071;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.311;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,82:177:99:1605,0,2035 chrX 361145 . T A 2056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;DP=183;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=6.8061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,98:183:99:2086,0,1810 chrX 361340 . G C 4105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.88;SB=-2.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4105,435,0 chrX 361362 . A G 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.259;DP=167;Dels=0.00;FS=5.590;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:1590,0,1906 chrX 361485 . T C 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=21.35;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3171,336,0 chrX 361518 . T C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.860;DP=145;Dels=0.00;FS=4.113;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,59:145:99:986,0,1729 chrX 361532 . C T 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.455;DP=156;Dels=0.00;FS=11.355;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.469;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,66:156:99:1268,0,1756 chrX 361557 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.679;DP=162;Dels=0.00;FS=2.783;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.66;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,68:162:99:1287,0,1950 chrX 361967 . T C 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.474;DP=170;Dels=0.00;FS=3.489;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.821;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,86:170:99:1683,0,1698 chrX 362118 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.943;DP=127;Dels=0.00;FS=5.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=2.597;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1321,0,1347 chrX 362153 . C T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.135;DP=117;Dels=0.00;FS=7.355;HaplotypeScore=2.4370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.010;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1025,0,1325 chrX 362196 . A G 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.772;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.505;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:146:99:995,0,1440 chrX 362316 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.617;DP=133;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.344;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1238,0,1387 chrX 362443 . A C 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.717;DP=167;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=212.6569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,81:167:85:1773,0,85 chrX 362496 . C T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.366;DP=178;Dels=0.00;FS=0.555;HaplotypeScore=2.3002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.011;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,81:178:99:1527,0,1949 chrX 362584 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.644;DP=180;Dels=0.00;FS=4.459;HaplotypeScore=6.0439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=7.00;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,77:180:99:1290,0,2236 chrX 362680 . C T 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.196;DP=164;Dels=0.00;FS=2.743;HaplotypeScore=2.5433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1746,0,1526 chrX 362838 . C G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.497;DP=133;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=1.9312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.885;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1267,0,1272 chrX 362886 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.808;DP=131;Dels=0.00;FS=3.170;HaplotypeScore=3.6655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=9.55;ReadPosRankSum=-2.090;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:131:99:1281,0,1294 chrX 363087 . G A 1779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.802;DP=151;Dels=0.00;FS=8.988;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.153;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,88:151:99:1809,0,1199 chrX 363678 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.179;DP=137;Dels=0.00;FS=4.125;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1349,0,1415 chrX 363723 . C T 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.929;DP=157;Dels=0.00;FS=5.913;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1734,0,1440 chrX 363726 . C T 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.456;DP=156;Dels=0.00;FS=6.018;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1851,0,1398 chrX 364028 . T C 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2934,324,0 chrX 364146 . C T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.137;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,87:172:99:1676,0,1730 chrX 364186 . A G 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3494,393,0 chrX 364332 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.473;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.553;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1577,0,1621 chrX 364397 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.707;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.244;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.292;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,78:175:99:1522,0,2064 chrX 364407 . A G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.294;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:1322,0,2069 chrX 364569 . T C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.801;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=1.064;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.775;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1293,0,1384 chrX 364721 . G A 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.602;DP=148;Dels=0.00;FS=1.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.260;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1479,0,1512 chrX 364761 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.270;DP=126;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.163;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1234,0,1425 chrX 364938 . T C 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.320;DP=107;Dels=0.00;FS=6.066;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1138,0,1055 chrX 365022 . G A 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.980;DP=123;Dels=0.00;FS=8.838;HaplotypeScore=3.4694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.695;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1169,0,1283 chrX 365255 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.116;DP=121;Dels=0.00;FS=7.048;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.625;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1279,0,1148 chrX 365260 . C T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.275;DP=140;Dels=0.00;FS=8.796;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=2.090;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.477;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1312,0,1405 chrX 365554 . A C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;DP=117;Dels=0.00;FS=8.524;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.208;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1271,0,1164 chrX 365807 . G C 4292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4292,453,0 chrX 366123 . C T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.664;DP=149;Dels=0.00;FS=4.959;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,59:149:99:1109,0,1892 chrX 366400 . T C 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.983;DP=125;Dels=0.00;FS=8.295;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:965,0,1482 chrX 366482 . A C 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.622;DP=130;Dels=0.00;FS=4.247;HaplotypeScore=7.6741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.260;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1000,0,1235 chrX 366492 . T C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.114;DP=125;Dels=0.00;FS=5.577;HaplotypeScore=2.3609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.645;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:923,0,1177 chrX 366494 . T G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.418;DP=125;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=2.3609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1110,0,1005 chrX 366635 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.130;DP=126;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=3.8689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=2.318;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:126:99:1343,0,1300 chrX 366669 . T C 1072.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.428;DP=119;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.088;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1102,0,1273 chrX 366671 . C A 1263.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.227;DP=120;Dels=0.00;FS=3.325;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.081;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1293,0,1165 chrX 366673 . A G 1138.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.612;DP=120;Dels=0.00;FS=4.422;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.373;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1168,0,1251 chrX 366855 . A G 928.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.532;DP=149;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=2.8627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQ0=4;MQRankSum=3.123;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,57:149:99:958,0,1639 chrX 366915 . G A 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.825;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.91;MQ0=4;MQRankSum=-1.564;QD=0.43;ReadPosRankSum=-1.599;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,23:102:74:74,0,1298 chrX 367017 . T C 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5223;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3037,333,0 chrX 367200 . G A 1413.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.263;DP=137;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.05;MQ0=4;MQRankSum=4.158;QD=10.31;ReadPosRankSum=2.182;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,82:137:99:1443,0,549 chrX 367212 . C T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.722;DP=130;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=2.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.73;MQ0=3;MQRankSum=4.963;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.581;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,85:130:99:1526,0,411 chrX 367233 . A G 700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.866;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQ0=2;MQRankSum=-1.417;QD=4.52;ReadPosRankSum=-1.286;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,55:155:99:730,0,2030 chrX 367284 . C T 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.260;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.983;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,86:147:99:1608,0,1025 chrX 367390 . A G 2613 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.21;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2646,279,0 chrX 367396 . T C 68.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.219;DP=106;Dels=0.00;FS=21.561;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=0.64;ReadPosRankSum=-2.101;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,17:106:98:98,0,1872 chrX 367398 . G C 20.05 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;DP=101;Dels=0.00;FS=35.924;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=0.20;ReadPosRankSum=-3.877;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,14:101:50:50,0,1722 chrX 367399 . A G 2366 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2399,249,0 chrX 367417 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;DP=95;Dels=0.00;FS=5.578;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=1.895;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,56:95:99:1166,0,640 chrX 367418 . G A 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.989;DP=95;Dels=0.00;FS=4.112;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.976;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:660,0,1129 chrX 367443 . C T 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.037;DP=107;Dels=0.00;FS=1.639;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=7.36;ReadPosRankSum=3.423;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:818,0,1124 chrX 367478 . T C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.983;DP=120;Dels=0.00;FS=15.809;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.533;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:120:99:990,0,1194 chrX 367566 . G T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.898;DP=136;Dels=0.00;FS=5.174;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.329;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1373,0,1456 chrX 367594 . G A 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3430,345,0 chrX 367856 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.502;DP=142;Dels=0.00;FS=17.814;HaplotypeScore=6.9371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.006;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1420,0,1388 chrX 368795 . G A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;DP=93;Dels=0.00;FS=2.781;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,57:93:99:1282,0,702 chrX 369198 . T C 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.115;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.982;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:898,0,1462 chrX 369202 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.349;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1165,0,1398 chrX 369324 . C T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.596;DP=135;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.922;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.967;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1291,0,1473 chrX 369426 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.955;DP=145;Dels=0.00;FS=3.877;HaplotypeScore=9.8928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.470;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1337,0,1664 chrX 369507 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.787;DP=131;Dels=0.00;FS=2.213;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.094;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1142,0,1456 chrX 369900 . T C 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3420,369,0 chrX 370407 . T C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.270;DP=132;Dels=0.00;FS=3.094;HaplotypeScore=4.9341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.508;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1165,0,1513 chrX 370550 . G T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;DP=125;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1564,0,1049 chrX 371571 . T A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;DP=135;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.186;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1389,0,1480 chrX 372444 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.371;DP=109;Dels=0.00;FS=11.030;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.131;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1201,0,1118 chrX 372476 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.437;DP=118;Dels=0.00;FS=16.566;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1325,0,1147 chrX 372585 . T C 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.624;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.924;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:887,0,1659 chrX 372699 . G A 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.914;DP=115;Dels=0.00;FS=3.529;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.388;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:890,0,1409 chrX 373143 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.600;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1110,0,1341 chrX 373251 . T C 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.134;DP=118;Dels=0.00;FS=4.672;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=3.190;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1055,0,1434 chrX 373427 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.008;DP=116;Dels=0.00;FS=12.169;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1160,0,1230 chrX 373527 . A G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.857;DP=127;Dels=0.00;FS=2.301;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1499,0,1227 chrX 373755 . A G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.143;DP=126;Dels=0.00;FS=13.049;HaplotypeScore=4.3146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=9.95;ReadPosRankSum=2.923;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1284,0,1287 chrX 373775 . G C 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;DP=119;Dels=0.00;FS=3.375;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:909,0,1458 chrX 373964 . T A 1033.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.032;DP=97;Dels=0.00;FS=2.670;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.682;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1063,0,1034 chrX 373972 . A G 877.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.238;DP=102;Dels=0.00;FS=4.894;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:907,0,1112 chrX 373973 . G T 1029.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.529;DP=107;Dels=0.00;FS=6.116;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.275;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1059,0,1054 chrX 373982 . C T 1179.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.411;DP=120;Dels=0.00;FS=5.635;HaplotypeScore=3.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:120:99:1209,0,1159 chrX 374127 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.956;DP=126;Dels=0.00;FS=2.375;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.471;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1226,0,1421 chrX 374196 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.311;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1187,0,1030 chrX 374244 . C T 2687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2720,273,0 chrX 374306 . A G 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.919;DP=107;Dels=0.00;FS=5.034;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:865,0,1244 chrX 374317 . C A 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.480;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.43;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:119:99:1050,0,1285 chrX 374343 . G A 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.328;DP=102;Dels=0.00;FS=9.888;HaplotypeScore=3.2563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.166;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:885,0,1210 chrX 374407 . G A 598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;DP=101;Dels=0.00;FS=1.684;HaplotypeScore=53.1591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=1;MQRankSum=-0.989;QD=5.92;ReadPosRankSum=2.636;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:101:99:628,0,1276 chrX 374408 . G C 559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;DP=100;Dels=0.00;FS=1.694;HaplotypeScore=53.1591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=1;MQRankSum=-0.097;QD=5.59;ReadPosRankSum=2.802;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,38:100:99:589,0,1254 chrX 374592 . G T 773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.390;DP=94;Dels=0.00;FS=1.679;HaplotypeScore=5.6816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:94:99:803,0,1076 chrX 374607 . T C 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.185;DP=103;Dels=0.00;FS=6.349;HaplotypeScore=7.4992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.394;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,41:103:99:758,0,1338 chrX 374624 . T C 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.067;DP=100;Dels=0.00;FS=9.663;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.308;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:702,0,1293 chrX 374664 . G A 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.949;DP=98;Dels=0.00;FS=3.950;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.356;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.366;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:888,0,1004 chrX 374698 . C T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.114;DP=92;Dels=0.00;FS=17.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,58:92:99:1097,0,593 chrX 374699 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.292;DP=93;Dels=0.00;FS=17.510;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.163;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,58:93:99:1087,0,624 chrX 374928 . C T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.756;DP=86;Dels=0.00;FS=1.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.789;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:1003,0,760 chrX 375038 . T G 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.907;DP=143;Dels=0.00;FS=6.233;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,55:143:99:935,0,1917 chrX 375069 . G C 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;DP=126;Dels=0.00;FS=5.030;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.267;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,79:126:99:1631,0,854 chrX 375100 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.291;DP=131;Dels=0.00;FS=11.140;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.082;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1522,0,1117 chrX 375282 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.082;DP=122;Dels=0.00;FS=8.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.410;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1360,0,1224 chrX 375290 . T C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.292;DP=119;Dels=0.00;FS=12.444;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.023;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.603;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1135,0,1320 chrX 375298 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.531;DP=118;Dels=0.00;FS=4.574;HaplotypeScore=4.9654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.287;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1160,0,1236 chrX 375392 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.231;DP=109;Dels=0.00;FS=2.502;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1413,0,879 chrX 375438 . C T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.724;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:110:99:1205,0,1085 chrX 375921 . T G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;DP=94;Dels=0.00;FS=8.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.287;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1075,0,871 chrX 375929 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.637;DP=99;Dels=0.00;FS=8.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.502;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1162,0,883 chrX 375981 . T C 2378 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2411,252,0 chrX 376048 . T A 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.640;DP=136;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.678;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1598,0,1185 chrX 376071 . C T 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.173;DP=151;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=3.9335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1741,0,1267 chrX 376279 . A T 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:852,0,794 chrX 376316 . C T 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.186;DP=70;Dels=0.00;FS=5.563;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.041;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:660,0,668 chrX 376379 . A G 427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.624;DP=73;Dels=0.00;FS=4.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:457,0,985 chrX 376600 . C T 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.899;DP=95;Dels=0.00;FS=2.061;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.760;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1015,0,948 chrX 377108 . T C 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.689;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.806;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1597,0,1456 chrX 377456 . A C 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;DP=120;Dels=0.00;FS=4.112;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1333,0,1215 chrX 377543 . C T 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2571,264,0 chrX 377632 . T A 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2744,273,0 chrX 377731 . T G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.328;DP=117;Dels=0.00;FS=13.815;HaplotypeScore=3.8312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=1.891;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.663;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1218,0,1223 chrX 377745 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.829;DP=120;Dels=0.00;FS=10.831;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.18;MQ0=0;MQRankSum=3.169;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1360,0,1065 chrX 377783 . G T 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.94;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3318,337,0 chrX 377800 . A T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=4.492;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1462,0,1209 chrX 377828 . G C 710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.353;DP=113;Dels=0.00;FS=12.803;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.38;MQ0=0;MQRankSum=-7.354;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.894;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:113:99:740,0,1287 chrX 377853 . A C 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.130;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.84;MQ0=0;MQRankSum=-8.631;QD=6.87;ReadPosRankSum=-2.854;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:806,0,1342 chrX 377861 . G A 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.816;DP=102;Dels=0.00;FS=8.225;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.37;MQ0=0;MQRankSum=-8.376;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:755,0,1208 chrX 377874 . G T 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.603;DP=110;Dels=0.00;FS=9.840;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.84;MQ0=0;MQRankSum=-9.008;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.741;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:851,0,1314 chrX 377883 . C A 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.075;DP=120;Dels=0.00;FS=7.351;HaplotypeScore=2.8139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.79;MQ0=0;MQRankSum=-8.950;QD=6.54;ReadPosRankSum=2.824;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:815,0,1513 chrX 377896 . C T 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.215;DP=118;Dels=0.00;FS=7.362;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQ0=0;MQRankSum=-8.594;QD=7.39;ReadPosRankSum=2.290;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:902,0,1439 chrX 378005 . A G 1089.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.555;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.00;MQ0=0;MQRankSum=6.158;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.410;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,54:95:99:1119,0,729 chrX 378006 . C T 703.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.760;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.00;MQ0=0;MQRankSum=-4.978;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:733,0,1161 chrX 378009 . A G 639.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.614;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.94;MQ0=0;MQRankSum=-3.928;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.596;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:669,0,1209 chrX 378013 . T C 747.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.94;MQ0=0;MQRankSum=-3.589;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.648;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:777,0,1180 chrX 378111 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.299;DP=128;Dels=0.00;FS=4.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQ0=0;MQRankSum=3.818;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1286,0,1356 chrX 378131 . C T 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.558;DP=114;Dels=0.00;FS=4.579;HaplotypeScore=3.8476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=7.77;ReadPosRankSum=2.410;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:916,0,1401 chrX 378171 . A G 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.451;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.86;MQ0=0;MQRankSum=-5.491;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:704,0,1229 chrX 378185 . T G 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.888;DP=112;Dels=0.00;FS=7.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.04;MQ0=0;MQRankSum=-7.636;QD=6.89;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:802,0,1444 chrX 378189 . G C 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.109;DP=116;Dels=0.00;FS=5.801;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.55;MQ0=0;MQRankSum=-7.683;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.038;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:732,0,1522 chrX 378204 . T G 699.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.172;DP=116;Dels=0.00;FS=7.371;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.04;MQ0=0;MQRankSum=-8.309;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.978;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:729,0,1541 chrX 378208 . A G 662.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.537;DP=113;Dels=0.00;FS=12.913;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQ0=0;MQRankSum=-7.629;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:692,0,1528 chrX 378211 . A T 688.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.707;DP=110;Dels=0.00;FS=10.868;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.57;MQ0=0;MQRankSum=-7.825;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:718,0,1453 chrX 378217 . T A 2522 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.94;MQ0=0;QD=21.56;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2555,264,0 chrX 378252 . T A 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.322;DP=115;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.602;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.268;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:860,0,1429 chrX 378266 . T A 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.450;DP=104;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=2.7303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:104:99:784,0,1332 chrX 378337 . G A 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.338;DP=106;Dels=0.00;FS=1.606;HaplotypeScore=45.5642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:884,0,1299 chrX 378557 . T C 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.26;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3421,339,0 chrX 378608 . G A 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=1;QD=23.86;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3317,321,0 chrX 378869 . C T 1877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:78:99:1910,189,0 chrX 378873 . G A 1918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1951,195,0 chrX 379020 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.040;DP=104;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.133;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1217,0,972 chrX 379268 . T C 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.006;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:773,0,788 chrX 379298 . C T 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.271;DP=85;Dels=0.00;FS=9.250;HaplotypeScore=2.3537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.941;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:805,0,945 chrX 379394 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.484;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1040,0,1104 chrX 379586 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.920;DP=129;Dels=0.00;FS=2.311;HaplotypeScore=4.6566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.643;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1376,0,1294 chrX 380097 . T C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.778;DP=122;Dels=0.00;FS=14.343;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.115;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:956,0,1355 chrX 380280 . T C 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.488;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:883,0,881 chrX 380353 . C T 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.009;DP=77;Dels=0.00;FS=10.051;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:881,0,731 chrX 380369 . G A 1979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.39;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2012,204,0 chrX 380394 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.016;DP=93;Dels=0.00;FS=0.864;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.103;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1020,0,947 chrX 380408 . A G 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.110;DP=106;Dels=0.00;FS=1.602;HaplotypeScore=4.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.794;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1124,0,1050 chrX 380423 . T C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.170;DP=97;Dels=0.00;FS=1.628;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.025;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1061,0,959 chrX 380706 . T C 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3874,396,0 chrX 380729 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.502;DP=126;Dels=0.00;FS=2.559;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.220;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1389,0,1203 chrX 380852 . A G 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.155;DP=139;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.225;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1119,0,1659 chrX 380913 . A T 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.636;DP=177;Dels=0.00;FS=6.385;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.910;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,83:177:99:1769,0,1962 chrX 380992 . T C 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.921;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.277;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1083,0,1431 chrX 381023 . A G 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2954,321,0 chrX 381270 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.882;DP=119;Dels=0.00;FS=6.967;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.763;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1236,0,1347 chrX 381644 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.350;DP=117;Dels=0.00;FS=4.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=2.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.218;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:962,0,1400 chrX 381650 . T C 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.445;DP=116;Dels=0.00;FS=4.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:890,0,1446 chrX 381672 . A G 722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.242;DP=111;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,43:111:99:752,0,1478 chrX 382499 . C T 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.540;DP=112;Dels=0.00;FS=6.470;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.150;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:940,0,1297 chrX 382505 . A G 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.300;DP=116;Dels=0.00;FS=5.221;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1283,0,1035 chrX 382565 . T C 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3078,339,0 chrX 382880 . A G 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=1;QD=24.45;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2551,270,0 chrX 383067 . T G 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.370;DP=133;Dels=0.00;FS=4.141;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1382,0,1414 chrX 383259 . G A 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.150;DP=91;Dels=0.00;FS=2.844;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=2.803;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:777,0,1090 chrX 383282 . G A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.604;DP=98;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=10.71;ReadPosRankSum=2.126;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1080,0,967 chrX 383417 . T C 2472 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2505,276,0 chrX 383576 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;DP=139;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.434;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1376,0,1492 chrX 384523 . A C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.267;DP=144;Dels=0.00;FS=5.001;HaplotypeScore=3.3976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1339,0,1558 chrX 384853 . C T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.038;DP=151;Dels=0.00;FS=4.851;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.285;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1537,0,1592 chrX 384940 . G T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.946;DP=133;Dels=0.01;FS=0.687;HaplotypeScore=4.6815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.727;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1395,0,1271 chrX 384973 . C T 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.480;DP=145;Dels=0.00;FS=8.681;HaplotypeScore=4.5051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1635,0,1279 chrX 385072 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.661;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1122,0,1315 chrX 385186 . T A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;DP=113;Dels=0.00;FS=4.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.591;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1122,0,1293 chrX 385354 . T C 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.573;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.730;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,43:113:99:798,0,1604 chrX 385546 . G A 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.016;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=12.62;ReadPosRankSum=3.385;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,83:143:99:1834,0,1140 chrX 385636 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.303;DP=124;Dels=0.00;FS=3.249;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.690;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1285,0,1297 chrX 385903 . A T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;DP=111;Dels=0.00;FS=2.426;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1021,0,1356 chrX 385921 . A T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;DP=103;Dels=0.00;FS=3.713;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.175;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:922,0,1252 chrX 385990 . G T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.807;DP=124;Dels=0.00;FS=11.165;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.065;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1153,0,1265 chrX 385991 . C T 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.499;DP=119;Dels=0.00;FS=3.121;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=24.69;ReadPosRankSum=1.266;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2971,292,0 chrX 386167 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.171;DP=154;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=8.9014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.380;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,62:154:99:1232,0,2004 chrX 386286 . A C 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.58;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3240,327,0 chrX 386296 . A T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;DP=119;Dels=0.00;FS=1.686;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.382;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1158,0,1364 chrX 386362 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.792;DP=134;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=5.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1067,0,1726 chrX 386494 . G T 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2628,267,0 chrX 386916 . G A 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.014;DP=152;Dels=0.00;FS=2.914;HaplotypeScore=4.3136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:152:99:1755,0,1308 chrX 387413 . A G 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.625;DP=149;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.963;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:1682,0,1379 chrX 387637 . G A 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.814;DP=125;Dels=0.00;FS=5.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:999,0,1560 chrX 387767 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.486;DP=110;Dels=0.00;FS=4.859;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.115;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1116,0,1135 chrX 387798 . C G 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;DP=98;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.950;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1045,0,924 chrX 387842 . T C 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.618;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.374;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1536,0,1434 chrX 388154 . T C 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.849;DP=142;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1486,0,1498 chrX 388187 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.122;DP=133;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1490,0,1383 chrX 388199 . C T 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=28.06;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3283,342,0 chrX 388253 . T C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.454;DP=121;Dels=0.00;FS=49.541;HaplotypeScore=183.7450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.781;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,77:121:99:1310,0,846 chrX 388388 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;DP=134;Dels=0.00;FS=7.958;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.083;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:134:99:1482,0,1356 chrX 388472 . T C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.069;DP=127;Dels=0.00;FS=1.454;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1252,0,1299 chrX 388638 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.203;DP=128;Dels=0.00;FS=1.568;HaplotypeScore=5.7879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.709;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1485,0,1220 chrX 388639 . G A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.074;DP=128;Dels=0.00;FS=1.568;HaplotypeScore=5.7879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.953;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1440,0,1200 chrX 388820 . A C 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3681,393,0 chrX 388825 . T C 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=25.26;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3840,399,0 chrX 388844 . C T 3901.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=25.83;SB=-2.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3901,397,0 chrX 389003 . A C 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9400;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3420,381,0 chrX 389114 . A G 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=1;QD=24.80;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3232,351,0 chrX 389243 . G A 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3697,376,0 chrX 389413 . C T 4372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7644;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4372,444,0 chrX 389645 . A C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.601;DP=154;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1361,0,1759 chrX 389732 . T C 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.728;DP=177;Dels=0.00;FS=6.059;HaplotypeScore=6.6893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=2.267;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.207;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,84:177:99:1716,0,1917 chrX 389780 . C T 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3718,370,0 chrX 390043 . A G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.91;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3126,360,0 chrX 390044 . G A 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.65;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3113,357,0 chrX 390902 . G C 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3836,399,0 chrX 391247 . A G 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3815,402,0 chrX 391361 . C G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;DP=148;Dels=0.00;FS=6.206;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,82:148:99:1510,0,1254 chrX 391511 . T A 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.873;DP=167;Dels=0.00;FS=9.213;HaplotypeScore=4.2817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=10.41;ReadPosRankSum=-3.767;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,90:167:99:1769,0,1592 chrX 391657 . T C 4097.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4097,435,0 chrX 391671 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.351;DP=146;Dels=0.00;FS=3.901;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1383,0,1468 chrX 391693 . T C 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3294,360,0 chrX 391774 . A G 1772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.271;DP=168;Dels=0.01;FS=1.254;HaplotypeScore=6.6312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=10.55;ReadPosRankSum=-2.598;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,88:167:99:1802,0,1678 chrX 391817 . A G 4283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4283,441,0 chrX 392321 . C T 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3500,355,0 chrX 392346 . G A 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.512;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3663,344,0 chrX 392498 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.931;DP=139;Dels=0.00;FS=6.314;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.526;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.259;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1415,0,1429 chrX 392787 . A G 3935.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.41;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3935,423,0 chrX 392970 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.211;DP=127;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=4.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=9.38;ReadPosRankSum=-3.017;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1221,0,1437 chrX 393288 . T C 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.873;DP=144;Dels=0.00;FS=2.098;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.846;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1528,0,1426 chrX 393423 . T C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.044;DP=149;Dels=0.00;FS=5.033;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.676;QD=7.31;ReadPosRankSum=2.119;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,63:149:99:1119,0,1934 chrX 393501 . C T 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3210,321,0 chrX 393564 . G C 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.06;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2752,297,0 chrX 393843 . T A 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;DP=122;Dels=0.00;FS=92.274;HaplotypeScore=74.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=0.11;ReadPosRankSum=-4.555;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,20:122:43:43,0,836 chrX 393918 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;DP=131;Dels=0.00;FS=3.122;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.303;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1267,0,1483 chrX 394236 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.160;DP=118;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=3.7828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1171,0,1234 chrX 394260 . T A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;DP=118;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=2.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.936;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.228;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:1005,0,1477 chrX 394324 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.002;DP=120;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.119;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1112,0,1389 chrX 394341 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.710;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1175,0,1271 chrX 394692 . C T 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.24;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3208,325,0 chrX 394713 . T C 2492 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.19;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2525,276,0 chrX 395004 . A T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;DP=151;Dels=0.00;FS=8.470;HaplotypeScore=4.0391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.974;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:151:99:1418,0,1690 chrX 395144 . T C 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.094;DP=148;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=6.7395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.674;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1691,0,1391 chrX 395512 . C T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.029;DP=144;Dels=0.00;FS=8.129;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.437;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1306,0,1743 chrX 395741 . G T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=109;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=3.6484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=9.42;ReadPosRankSum=3.280;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1057,0,1186 chrX 395772 . A T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;DP=118;Dels=0.00;FS=7.713;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.982;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1393,0,1184 chrX 395805 . G A 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3082,309,0 chrX 395845 . G T 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.654;DP=90;Dels=0.00;FS=2.948;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.325;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:967,0,884 chrX 395898 . C A 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.891;DP=99;Dels=0.00;FS=13.135;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.019;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1008,0,957 chrX 396122 . A G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.041;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1338,0,1116 chrX 396269 . G A 4160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=1;QD=26.84;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4160,430,0 chrX 396515 . A C 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.87;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3215,330,0 chrX 396551 . C T 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.75;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3830,388,0 chrX 396613 . C T 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3639,367,0 chrX 396640 . A G 3687.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3687,396,0 chrX 396692 . C T 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.251;DP=159;Dels=0.00;FS=5.638;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.948;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.939;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:159:99:1733,0,1595 chrX 396723 . A G 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3100,333,0 chrX 396848 . T G 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3261,339,0 chrX 397072 . G A 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4168,418,0 chrX 397262 . C T 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3385,343,0 chrX 397295 . T C 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3102,330,0 chrX 397474 . T C 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2588;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3285,357,0 chrX 397497 . C T 3802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3802,385,0 chrX 398093 . C T 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2907,300,0 chrX 398145 . A T 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3703,375,0 chrX 398191 . T C 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3357,354,0 chrX 398357 . G T 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.97;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3668,367,0 chrX 398445 . G A 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.147;DP=101;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.805;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:909,0,1165 chrX 398512 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.959;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=7.62;ReadPosRankSum=-1.290;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1105,0,1643 chrX 398531 . C T 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.602;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1671,0,1522 chrX 398569 . T A 4457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4457,463,0 chrX 398592 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.516;DP=156;Dels=0.00;FS=1.999;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,71:156:99:1363,0,1901 chrX 398858 . C T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.034;DP=141;Dels=0.00;FS=10.535;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.190;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1486,0,1390 chrX 398997 . A G 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3467,366,0 chrX 399038 . G T 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3295,345,0 chrX 400246 . A G 30.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.237;DP=182;Dels=0.00;FS=32.932;HaplotypeScore=23.2430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.68;MQ0=0;MQRankSum=-8.297;QD=0.16;ReadPosRankSum=-2.660;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,35:182:60:60,0,3455 chrX 400254 . A T 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.747;DP=185;Dels=0.00;FS=38.586;HaplotypeScore=14.8750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQ0=0;MQRankSum=-7.441;QD=0.11;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,36:184:51:51,0,3407 chrX 400260 . T A 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;DP=181;Dels=0.00;FS=40.622;HaplotypeScore=12.9898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQ0=0;MQRankSum=-7.976;QD=0.23;ReadPosRankSum=1.348;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,39:181:71:71,0,3301 chrX 400267 . A G 153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.746;DP=189;Dels=0.00;FS=33.956;HaplotypeScore=6.0900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQ0=0;MQRankSum=-8.069;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.970;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,48:189:99:183,0,3137 chrX 400272 . A T 236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.188;DP=196;Dels=0.00;FS=40.960;HaplotypeScore=9.3623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.37;MQ0=0;MQRankSum=-7.465;QD=1.20;ReadPosRankSum=1.996;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,51:196:99:266,0,3226 chrX 400303 . A G 548.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.772;DP=227;Dels=0.00;FS=23.270;HaplotypeScore=105.0632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.72;MQ0=0;MQRankSum=-6.635;QD=2.41;ReadPosRankSum=-4.255;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,56:227:99:578,0,3271 chrX 400307 . G A 1368.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.238;DP=219;Dels=0.00;FS=17.281;HaplotypeScore=93.7516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-3.564;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,95:219:99:1398,0,2401 chrX 400308 . A T 213.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.131;DP=211;Dels=0.00;FS=21.592;HaplotypeScore=89.7830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.91;MQ0=0;MQRankSum=-6.764;QD=1.01;ReadPosRankSum=-4.893;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,42:211:99:243,0,3371 chrX 400323 . A T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;DP=176;Dels=0.00;FS=4.907;HaplotypeScore=9.6457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.027;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,81:176:99:1252,0,2144 chrX 400808 . T C 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.607;DP=147;Dels=0.00;FS=15.977;HaplotypeScore=2.7933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,56:147:99:1088,0,1915 chrX 401572 . T G 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.019;DP=160;Dels=0.00;FS=8.136;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.632;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,83:160:99:1703,0,1590 chrX 401663 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.318;DP=148;Dels=0.00;FS=2.943;HaplotypeScore=3.4011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.306;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:99:1323,0,1779 chrX 402164 . A G 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.508;DP=128;Dels=0.00;FS=3.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=2.803;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.524;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1421,0,1254 chrX 402165 . A G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.388;DP=128;Dels=0.00;FS=3.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.725;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1428,0,1230 chrX 402396 . T C 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.817;DP=149;Dels=0.00;FS=13.214;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.009;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1527,0,1459 chrX 402471 . T C 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.612;DP=168;Dels=0.00;FS=2.762;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.533;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,87:168:99:1657,0,1661 chrX 402683 . T G 4557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:174:99:4557,489,0 chrX 402779 . T A 4310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.998e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4310,439,0 chrX 402808 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.210;DP=148;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=2.7209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.855;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1370,0,1683 chrX 402983 . T C 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3665,411,0 chrX 403003 . A G 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.205;DP=153;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=2.7134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,86:153:99:1760,0,1335 chrX 403066 . G A 1942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.891;DP=161;Dels=0.00;FS=2.899;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.628;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,92:161:99:1972,0,1281 chrX 404050 . C T 4315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.80;SB=-2.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4315,445,0 chrX 404273 . G A 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3791,393,0 chrX 404579 . T A 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3545,363,0 chrX 404642 . G A 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3375,342,0 chrX 404816 . T C 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3354,363,0 chrX 404952 . A T 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.965e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3693,370,0 chrX 405244 . A G 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2752,285,0 chrX 405306 . G A 2038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.55;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2071,213,0 chrX 405389 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.960;DP=139;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1440,0,1377 chrX 405572 . G C 2701 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2734,297,0 chrX 405721 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.139;DP=124;Dels=0.00;FS=5.413;HaplotypeScore=4.6269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.256;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1248,0,1252 chrX 405884 . C T 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2865,294,0 chrX 405945 . C A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.538;DP=124;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=2.368;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.123;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1273,0,1291 chrX 405995 . A G 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8083;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3298,348,0 chrX 406673 . A G 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.164;DP=137;Dels=0.00;FS=5.395;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,86:137:99:1806,0,1005 chrX 406848 . T C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.976;DP=139;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=1;MQRankSum=-0.320;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.742;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1292,0,1527 chrX 407030 . C T 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.254;DP=152;Dels=0.00;FS=3.929;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.931;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,66:152:99:1283,0,1877 chrX 407337 . T G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.123;DP=133;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=4.4252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.931;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1253,0,1598 chrX 407617 . C T 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3583,354,0 chrX 408145 . T C 4492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4492,468,0 chrX 408211 . C T 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.547;DP=138;Dels=0.00;FS=3.059;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1550,0,1283 chrX 408928 . A G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.414;DP=104;Dels=0.00;FS=1.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1101,0,1073 chrX 409193 . T C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.892;DP=139;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=8.12;ReadPosRankSum=2.172;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1159,0,1757 chrX 409312 . C T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.093;DP=125;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.701;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1344,0,1316 chrX 409479 . G A 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.94;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3050,321,0 chrX 409825 . T C 2453 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2486,264,0 chrX 409993 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.505;DP=119;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=4.8016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=2.858;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.380;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1253,0,1186 chrX 410060 . A G 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.767;DP=115;Dels=0.00;FS=7.158;HaplotypeScore=2.8139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.480;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:965,0,1358 chrX 410082 . A G 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2711,273,0 chrX 410110 . A G 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=23.67;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2731,288,0 chrX 410131 . A C 2264 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.49;MQ0=0;QD=21.36;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2297,243,0 chrX 410140 . G T 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;DP=129;Dels=0.00;FS=3.472;HaplotypeScore=5.6451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.75;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=22.78;ReadPosRankSum=1.276;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:2972,300,0 chrX 410143 . G C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.620;DP=133;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=7.6356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.496;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:900,0,1450 chrX 410189 . G A 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3018,309,0 chrX 410312 . C T 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.386;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.641;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1551,0,1180 chrX 410365 . A G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.485;DP=122;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.112;QD=9.59;ReadPosRankSum=2.502;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1200,0,1366 chrX 410366 . T C 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.37;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3194,363,0 chrX 410379 . A G 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3139,345,0 chrX 410405 . C T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=26.42;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3019,315,0 chrX 410528 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.976;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.563;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1374,0,975 chrX 410563 . C T 578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.694;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.105;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,36:94:99:608,0,1246 chrX 410824 . C A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.208;DP=129;Dels=0.00;FS=2.300;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.709;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1332,0,1305 chrX 410930 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.713;DP=120;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=9.59;ReadPosRankSum=3.117;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1181,0,1312 chrX 410951 . T C 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2998,306,0 chrX 410980 . T C 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.422;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=8.33;ReadPosRankSum=-2.184;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:118:99:1013,0,1401 chrX 411303 . G A 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3437,357,0 chrX 411342 . T C 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.495;DP=124;Dels=0.00;FS=3.274;HaplotypeScore=5.8656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,51:124:99:967,0,1671 chrX 411444 . A C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.094;DP=120;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1197,0,1024 chrX 411771 . C T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.823;DP=119;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=1;MQRankSum=0.460;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.509;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1478,0,1014 chrX 411973 . A T 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.700;DP=100;Dels=0.00;FS=1.623;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=10.53;ReadPosRankSum=-2.265;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1083,0,1046 chrX 412056 . G A 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.872;DP=121;Dels=0.00;FS=3.300;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.091;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1193,0,1319 chrX 412212 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.602;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1549,0,1523 chrX 412419 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.074;DP=120;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.688;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1172,0,1197 chrX 412734 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.875;DP=136;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.351;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1230,0,1567 chrX 412914 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.426;DP=116;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.591;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1303,0,1095 chrX 413049 . T G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.261;DP=107;Dels=0.00;FS=3.717;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.007;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1071,0,1162 chrX 413202 . C T 1944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.553;DP=147;Dels=0.00;FS=3.024;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.593;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,87:147:99:1974,0,1167 chrX 413347 . T A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.367;DP=134;Dels=0.00;FS=2.271;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.336;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1291,0,1527 chrX 414093 . A G 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.877;DP=95;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:899,0,1020 chrX 414104 . C T 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2683,270,0 chrX 414125 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.751;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.511;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1323,0,1117 chrX 414179 . G A 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.899;DP=94;Dels=0.00;FS=0.876;HaplotypeScore=3.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.027;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:910,0,995 chrX 414197 . A C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1488,0,1223 chrX 414544 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.509;DP=141;Dels=0.00;FS=12.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1363,0,1489 chrX 414830 . C T 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.813;DP=90;Dels=0.00;FS=8.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.593;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:926,0,940 chrX 415367 . C T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.762;DP=112;Dels=0.00;FS=6.302;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.455;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1033,0,1282 chrX 415838 . G A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.498;DP=105;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.978;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.349;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1023,0,1153 chrX 415963 . C T 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.014;DP=72;Dels=0.00;FS=1.965;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:937,0,557 chrX 416049 . A T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.021;DP=111;Dels=0.00;FS=7.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=2.374;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1330,0,1066 chrX 416446 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.498;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.3793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1384,0,1285 chrX 416528 . C T 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.671;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1095,0,1283 chrX 417327 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1055,0,1358 chrX 417877 . T C 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=1;QD=24.20;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3252,351,0 chrX 418423 . T C 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.732;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1254,0,1626 chrX 419079 . A G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.263;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.267;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1185,0,863 chrX 419227 . T A 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;DP=86;Dels=0.00;FS=5.669;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:906,0,912 chrX 419279 . C T 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.195;DP=93;Dels=0.00;FS=3.965;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:892,0,943 chrX 419397 . G A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.499;DP=131;Dels=0.00;FS=14.755;HaplotypeScore=4.5290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1555,0,1107 chrX 419759 . C T 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.508;DP=128;Dels=0.00;FS=7.966;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.027;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1000,0,1294 chrX 419761 . G C 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.883;DP=132;Dels=0.00;FS=6.866;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.048;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:987,0,1382 chrX 419940 . A T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.975;DP=148;Dels=0.00;FS=13.931;HaplotypeScore=4.5001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:148:99:1224,0,1917 chrX 421930 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.348;DP=137;Dels=0.00;FS=3.365;HaplotypeScore=4.7641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.355;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1466,0,1357 chrX 423483 . A G 2342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.46;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2375,258,0 chrX 423584 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3048,312,0 chrX 423783 . T C 2786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=1;QD=24.02;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2819,303,0 chrX 423805 . G T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.931;DP=104;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=-0.750;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.171;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:979,0,1053 chrX 423966 . G A 2407 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2440,240,0 chrX 424406 . A T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;DP=120;Dels=0.00;FS=5.887;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,74:120:99:1609,0,873 chrX 424420 . G T 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.069;DP=127;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=46.4958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,77:127:99:1627,0,880 chrX 424535 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.469;DP=107;Dels=0.00;FS=3.723;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.125;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1160,0,1070 chrX 424695 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.137;DP=149;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=4.8388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.532;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1388,0,1711 chrX 424721 . G T 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.351;DP=110;Dels=0.00;FS=4.725;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.786;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1265,0,1029 chrX 424805 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.342;DP=106;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.242;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1190,0,1066 chrX 424833 . A G 2737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.28;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2770,300,0 chrX 424928 . G T 84.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.907;DP=86;Dels=0.03;FS=217.039;HaplotypeScore=10.6998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=0.98;ReadPosRankSum=-5.969;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:83:99:114,0,375 chrX 425083 . A T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.634;DP=132;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.157;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1431,0,1374 chrX 425108 . C G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;DP=126;Dels=0.00;FS=3.309;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1308,0,1266 chrX 425240 . A G 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.796;DP=104;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:104:99:935,0,1121 chrX 425928 . G A 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.501;DP=117;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=2.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1081,0,1362 chrX 426067 . G A 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.662;DP=149;Dels=0.00;FS=3.219;HaplotypeScore=6.6787;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.663;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3985,388,0 chrX 426069 . G A 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.766;DP=149;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=6.6787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.20;ReadPosRankSum=-2.644;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1699,0,1423 chrX 427737 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.560;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1321,0,1450 chrX 428088 . G A 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3721,367,0 chrX 428242 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.632;DP=119;Dels=0.00;FS=4.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.922;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1216,0,1300 chrX 429437 . A C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.908;DP=143;Dels=0.00;FS=3.964;HaplotypeScore=3.5556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.091;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.565;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1324,0,1608 chrX 430092 . A G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.027;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.711;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1275,0,1006 chrX 430183 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.279;DP=108;Dels=0.00;FS=1.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.005;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1134,0,1069 chrX 431022 . A G 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.178;DP=121;Dels=0.00;FS=5.705;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.084;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1415,0,1138 chrX 431354 . T C 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.683;DP=144;Dels=0.00;FS=7.605;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.480;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1450,0,1592 chrX 431392 . T C 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.801;DP=143;Dels=0.00;FS=15.708;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.499;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.376;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,59:143:99:945,0,1817 chrX 431409 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.435;DP=134;Dels=0.00;FS=10.990;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.891;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1078,0,1642 chrX 431531 . T C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.363;DP=105;Dels=0.00;FS=9.226;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.952;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1072,0,1144 chrX 431547 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.731;DP=114;Dels=0.00;FS=11.958;HaplotypeScore=5.9241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=9.32;ReadPosRankSum=2.494;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1093,0,1267 chrX 431554 . C G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;DP=102;Dels=0.00;FS=11.213;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.657;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1020,0,1016 chrX 431673 . C A 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.557;DP=129;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.756;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1106,0,1550 chrX 431895 . T A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=115;Dels=0.00;FS=2.531;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.822;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1274,0,1072 chrX 432578 . A T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;DP=119;Dels=0.00;FS=4.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1407,0,1066 chrX 433110 . G T 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;DP=132;Dels=0.00;FS=3.479;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1099,0,1604 chrX 433178 . T A 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;DP=119;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.698;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1053,0,1418 chrX 433328 . G A 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.909;DP=97;Dels=0.00;FS=12.264;HaplotypeScore=1.8801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=7.91;ReadPosRankSum=3.071;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,38:97:99:797,0,1285 chrX 433686 . A G 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.063;DP=122;Dels=0.01;FS=13.503;HaplotypeScore=6.6128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.257;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1256,0,1286 chrX 434034 . C T 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.501;DP=109;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:878,0,1352 chrX 434060 . C T 722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.275;DP=98;Dels=0.00;FS=4.232;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.374;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,38:98:99:752,0,1288 chrX 434435 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.053;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:94:99:946,0,885 chrX 434839 . C T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.307;DP=176;Dels=0.00;FS=4.334;HaplotypeScore=5.2900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,82:176:99:1737,0,1883 chrX 434858 . A G 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.257;DP=186;Dels=0.00;FS=1.825;HaplotypeScore=10.8632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,80:186:99:1550,0,2349 chrX 434887 . G A 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.289;DP=190;Dels=0.00;FS=8.356;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.395;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,82:189:99:1738,0,2124 chrX 434906 . T C 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.518;DP=170;Dels=0.00;FS=4.932;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.022;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,77:170:99:1408,0,2073 chrX 435102 . T A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.928;DP=116;Dels=0.00;FS=2.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.965;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.092;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1265,0,1210 chrX 435254 . A T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;DP=145;Dels=0.00;FS=1.307;HaplotypeScore=3.8958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.624;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.300;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1418,0,1613 chrX 435638 . T A 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3844,382,0 chrX 435812 . A T 459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;DP=91;Dels=0.00;FS=19.032;HaplotypeScore=2.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:489,0,1283 chrX 436041 . T C 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.872;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1074,0,1078 chrX 436111 . G A 2396 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.70;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2429,237,0 chrX 436217 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.697;DP=133;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=2.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=10.64;ReadPosRankSum=2.065;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:133:99:1445,0,1312 chrX 436312 . A G 523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;DP=74;Dels=0.00;FS=2.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:553,0,871 chrX 436332 . T A 445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQ0=1;MQRankSum=1.805;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.168;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:475,0,876 chrX 436344 . G T 267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.373;DP=79;Dels=0.00;FS=0.867;HaplotypeScore=4.9654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=1;MQRankSum=1.566;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,30:79:99:297,0,1037 chrX 436432 . A C 456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=6.33;ReadPosRankSum=1.424;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:486,0,944 chrX 436446 . C G 413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.414;DP=80;Dels=0.00;FS=9.755;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.353;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.701;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:443,0,1009 chrX 436468 . G C 393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;DP=71;Dels=0.00;FS=6.552;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.326;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:423,0,796 chrX 436479 . G A 1722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.0622;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.02;MQ0=0;QD=22.96;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1755,186,0 chrX 436602 . T C 2549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.49;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2582,273,0 chrX 436609 . G C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;DP=104;Dels=0.00;FS=1.935;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1122,0,944 chrX 437314 . G T 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.843;DP=172;Dels=0.00;FS=1.207;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.069;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,88:172:99:1818,0,1754 chrX 437758 . C G 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3507,378,0 chrX 438505 . G A 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3840,387,0 chrX 438727 . A G 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.488;DP=131;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:131:99:1609,0,1145 chrX 438761 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.681;DP=129;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1121,0,1456 chrX 438766 . G A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.403;DP=128;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.005;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1587,0,1037 chrX 438853 . G T 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3387,360,0 chrX 439624 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.287;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.722;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1353,0,1370 chrX 439651 . G A 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3701,379,0 chrX 440511 . A G 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.724;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1082,0,1363 chrX 440601 . G T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.298;DP=125;Dels=0.00;FS=15.243;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1311,0,1222 chrX 440709 . C T 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.492;DP=135;Dels=0.00;FS=3.123;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.666;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1657,0,1162 chrX 440847 . T C 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3008,318,0 chrX 440867 . A C 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3211,333,0 chrX 441260 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.748;DP=134;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.946;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.478;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1271,0,1427 chrX 441305 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.465;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.677;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1280,0,1127 chrX 441314 . T G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.137;DP=110;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.853;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1279,0,961 chrX 441384 . A G 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.045;DP=106;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.068;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1080,0,1130 chrX 441507 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=110;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.616;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1159,0,1169 chrX 441617 . C T 2387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2420,237,0 chrX 441699 . A T 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3022,300,0 chrX 441727 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.596;DP=143;Dels=0.00;FS=7.191;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1219,0,1702 chrX 442545 . G A 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=1;QD=26.70;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2890,303,0 chrX 443121 . C G 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.854e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3848,402,0 chrX 443196 . T C 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3080,321,0 chrX 443517 . A G 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3001,315,0 chrX 443643 . T C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.614;DP=132;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.361;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1252,0,1486 chrX 443723 . T C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.314;DP=126;Dels=0.00;FS=6.763;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-2.415;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1346,0,1343 chrX 443746 . G A 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3889,385,0 chrX 444108 . C A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.981;DP=139;Dels=0.00;FS=5.132;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.386;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1442,0,1437 chrX 444601 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.036;DP=136;Dels=0.00;FS=5.244;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.825;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1233,0,1574 chrX 444972 . C T 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3384,343,0 chrX 445175 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.894;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.332;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1322,0,1335 chrX 445286 . T C 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.389;DP=114;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:954,0,1303 chrX 445339 . A C 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.13;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2697,294,0 chrX 446085 . G C 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.57;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2846,303,0 chrX 446453 . A G 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.348;DP=153;Dels=0.00;FS=1.269;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.491;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1592,0,1649 chrX 446576 . G A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3264,324,0 chrX 447086 . G C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;DP=130;Dels=0.00;FS=9.670;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.740;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1364,0,1234 chrX 447433 . G A 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.210;DP=89;Dels=0.00;FS=14.744;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.696;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:864,0,989 chrX 447484 . T C 2342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2375,258,0 chrX 447638 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.366;DP=126;Dels=0.00;FS=2.264;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.500;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1317,0,1274 chrX 447807 . T A 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;DP=112;Dels=0.00;FS=5.819;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.923;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1024,0,1400 chrX 447881 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.965;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1222,0,1397 chrX 448029 . C T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.748;DP=123;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.814;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1299,0,1195 chrX 448328 . C T 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.289;DP=102;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.793;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1086,0,1055 chrX 448448 . T C 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3092,333,0 chrX 448489 . T C 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.698;DP=98;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.099;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:940,0,1005 chrX 448936 . T C 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.85;MQ0=0;QD=22.23;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2634,264,0 chrX 449033 . G A 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3472,352,0 chrX 449051 . C T 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=134;Dels=0.00;FS=4.459;HaplotypeScore=3.5446;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3498,354,0 chrX 449164 . T C 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.198;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.349;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:963,0,1268 chrX 449239 . G A 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3132,318,0 chrX 449256 . T C 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3075,321,0 chrX 449350 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.902;DP=132;Dels=0.00;FS=3.393;HaplotypeScore=3.7334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.476;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1346,0,1287 chrX 449403 . G A 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3209,330,0 chrX 449520 . T A 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3845,393,0 chrX 449718 . G C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.597;DP=112;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=6.4584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.789;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1233,0,1077 chrX 449874 . A T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.381;DP=123;Dels=0.00;FS=5.642;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1149,0,1410 chrX 450069 . A G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.969;DP=94;Dels=0.00;FS=2.696;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.136;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1086,0,861 chrX 450124 . A T 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;DP=92;Dels=0.00;FS=4.204;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.648;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:986,0,988 chrX 450154 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.319;DP=121;Dels=0.00;FS=2.316;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1246,0,1288 chrX 450273 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.434;DP=105;Dels=0.00;FS=1.573;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.375;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:968,0,1177 chrX 450339 . G A 1816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.175;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.127;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,83:134:99:1846,0,898 chrX 450348 . G A 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.713;DP=132;Dels=0.00;FS=2.281;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=13.04;ReadPosRankSum=2.065;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,78:132:99:1751,0,984 chrX 450386 . C A 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.707;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,87:168:99:1898,0,1600 chrX 450764 . T C 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.398;DP=85;Dels=0.00;FS=2.064;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.690;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:847,0,997 chrX 450783 . G T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.575;DP=104;Dels=0.00;FS=5.120;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.406;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.333;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1072,0,992 chrX 450888 . A G 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.325;DP=78;Dels=0.00;FS=1.912;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=0.423;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,40:78:99:784,0,828 chrX 451295 . T C 683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.297;DP=68;Dels=0.00;FS=0.926;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=10.04;ReadPosRankSum=2.304;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,36:68:99:713,0,675 chrX 451382 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.972;DP=118;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.762;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:1088,0,1412 chrX 451436 . T C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.627;DP=122;Dels=0.00;FS=4.402;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.436;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1342,0,1181 chrX 451760 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.845;DP=103;Dels=0.00;FS=3.678;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.735;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1044,0,1065 chrX 452144 . G A 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.882e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3708,378,0 chrX 452205 . T C 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.537;DP=157;Dels=0.00;FS=10.076;HaplotypeScore=6.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1423,0,1732 chrX 452579 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.455;DP=128;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1484,0,1217 chrX 452693 . A T 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.591;DP=153;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.078;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:153:99:1510,0,1662 chrX 452919 . T A 3588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.0190;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:139:99:3588,358,0 chrX 452924 . T C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.853;DP=131;Dels=0.00;FS=2.202;HaplotypeScore=4.0232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:131:99:1375,0,1300 chrX 452975 . C T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.469;DP=138;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.129;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:137:99:1174,0,1730 chrX 453005 . T C 1825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.437;DP=154;Dels=0.00;FS=2.043;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,89:154:99:1855,0,1321 chrX 453099 . C A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.108;DP=134;Dels=0.00;FS=2.197;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1221,0,1559 chrX 453323 . A G 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3357,348,0 chrX 453326 . C A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.672;DP=130;Dels=0.00;FS=3.167;HaplotypeScore=2.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.412;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1310,0,1375 chrX 453420 . G A 4078.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4078,423,0 chrX 453464 . G A 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.317;DP=142;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.302;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1483,0,1527 chrX 453621 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.108;DP=116;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.966;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1318,0,1141 chrX 454055 . G A 143.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.785;DP=168;Dels=0.00;FS=25.070;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=3;MQRankSum=-7.217;QD=0.85;ReadPosRankSum=2.703;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,31:168:99:173,0,2920 chrX 454274 . T G 124.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.062;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.83;MQ0=15;MQRankSum=-3.448;QD=0.85;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,39:146:99:154,0,2361 chrX 454367 . A G 55.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.034;DP=146;Dels=0.00;FS=17.524;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=2;MQRankSum=-4.398;QD=0.38;ReadPosRankSum=-2.547;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,23:146:85:85,0,2943 chrX 455051 . C A 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.777;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.740;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:763,0,1003 chrX 455168 . T C 773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.466;DP=85;Dels=0.00;FS=10.780;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.391;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:803,0,914 chrX 455246 . A C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.956;DP=113;Dels=0.00;FS=6.051;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.659;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:113:99:1429,0,892 chrX 455247 . T C 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.252;DP=111;Dels=0.00;FS=6.057;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:882,0,1413 chrX 455260 . C T 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3070,315,0 chrX 455330 . T A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.728;DP=110;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.653;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1395,0,987 chrX 455334 . C G 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;DP=111;Dels=0.00;FS=2.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.938;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:955,0,1363 chrX 455390 . A T 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2858,285,0 chrX 455495 . T G 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.901;DP=156;Dels=0.00;FS=12.186;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=10.46;ReadPosRankSum=2.007;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1662,0,1564 chrX 455563 . T A 1881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;DP=162;Dels=0.01;FS=1.982;HaplotypeScore=6.9674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.356;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,91:161:99:1911,0,1518 chrX 455859 . G A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.112;DP=161;Dels=0.00;FS=9.552;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.416;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1514,0,1692 chrX 456040 . G A 701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.326;DP=84;Dels=0.00;FS=0.827;HaplotypeScore=2.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.380;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:84:99:731,0,913 chrX 456089 . A G 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.596;DP=59;Dels=0.00;FS=1.734;HaplotypeScore=223.0981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.69;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=0.37;ReadPosRankSum=-2.370;SB=-5.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,6:59:52:52,0,517 chrX 456110 . C T 456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.684;DP=63;Dels=0.00;FS=2.167;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:486,0,691 chrX 456250 . T C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.171;DP=101;Dels=0.00;FS=2.705;HaplotypeScore=3.6690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1063,0,1047 chrX 456781 . T C 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3078,336,0 chrX 456916 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.207;DP=122;Dels=0.00;FS=8.325;HaplotypeScore=2.8868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.335;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1169,0,1351 chrX 456997 . T A 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;DP=134;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=-1.171;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.277;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,80:134:99:1702,0,1077 chrX 457156 . T C 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.315;DP=124;Dels=0.00;FS=6.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.461;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1019,0,1586 chrX 457678 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.489;DP=94;Dels=0.00;FS=3.939;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.486;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1067,0,860 chrX 457744 . C T 2350 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2383,240,0 chrX 458269 . C G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.067;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1159,0,1171 chrX 458564 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.160;DP=106;Dels=0.00;FS=5.133;HaplotypeScore=4.1207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.869;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,63:106:99:1260,0,854 chrX 458980 . T C 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2650,267,0 chrX 459216 . G C 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3313,348,0 chrX 459229 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.234;DP=125;Dels=0.00;FS=3.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.817;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1378,0,1194 chrX 459261 . C T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.982;DP=136;Dels=0.01;FS=14.510;HaplotypeScore=11.8176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.201;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1500,0,1301 chrX 459384 . A G 738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.587;DP=97;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.070;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,39:97:99:768,0,1341 chrX 459433 . T G 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3066,345,0 chrX 459535 . C T 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.127;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.687;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1099,0,1462 chrX 459776 . T C 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;DP=136;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.1070;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=23.38;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3213,305,0 chrX 459804 . T C 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3018,315,0 chrX 460047 . A G 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3218,327,0 chrX 462490 . G A 4397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4397,439,0 chrX 462542 . A G 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.874;DP=168;Dels=0.00;FS=1.898;HaplotypeScore=3.9162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.008;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,86:168:99:1748,0,1774 chrX 462583 . T C 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=125;Dels=0.00;FS=6.819;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.012;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3137,333,0 chrX 462586 . G C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1207,0,1505 chrX 462605 . A G 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=22.91;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3172,333,0 chrX 462634 . A G 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=23.02;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3706,369,0 chrX 462687 . A G 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.317;DP=118;Dels=0.00;FS=19.416;HaplotypeScore=3.9948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=6.81;ReadPosRankSum=-1.850;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:118:99:833,0,1268 chrX 462689 . A G 2450 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=20.94;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2483,270,0 chrX 462713 . G A 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.040;DP=124;Dels=0.00;FS=11.490;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.842;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1044,0,1153 chrX 462726 . T C 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.476;DP=112;Dels=0.00;FS=6.436;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=8.22;ReadPosRankSum=-2.459;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:951,0,1038 chrX 462930 . G A 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.873;DP=87;Dels=0.00;FS=1.779;HaplotypeScore=3.9212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.219;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,36:87:99:738,0,1053 chrX 463005 . C T 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.816;DP=105;Dels=0.00;FS=0.831;HaplotypeScore=2.4919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.221;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1040,0,1108 chrX 463068 . C T 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.346;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:998,0,783 chrX 463086 . T C 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.869;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.202;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:943,0,854 chrX 463170 . T C 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.673;DP=87;Dels=0.02;FS=0.947;HaplotypeScore=19.9945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.234;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:677,0,971 chrX 463222 . C T 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.30;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3145,322,0 chrX 463257 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.782;DP=111;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.794;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1022,0,1230 chrX 463350 . T C 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.125;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.236;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:826,0,987 chrX 463413 . T G 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.386;DP=142;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.894;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1328,0,1645 chrX 463516 . C G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;DP=110;Dels=0.00;FS=7.581;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.454;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.678;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1245,0,905 chrX 463561 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;DP=146;Dels=0.00;FS=5.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.544;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:146:99:1506,0,1474 chrX 463573 . T C 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.630;DP=157;Dels=0.00;FS=12.946;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.636;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.170;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1598,0,1490 chrX 463641 . A G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.614;DP=137;Dels=0.01;FS=0.694;HaplotypeScore=9.8718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1331,0,1506 chrX 464009 . C A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.349;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1210,0,1173 chrX 464252 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.155;DP=117;Dels=0.00;FS=14.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=0.436;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.435;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1047,0,1378 chrX 464565 . C A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.014;DP=135;Dels=0.00;FS=4.133;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.763;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1433,0,1349 chrX 465021 . G A 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5395;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3807,390,0 chrX 465282 . G A 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.362;DP=145;Dels=0.00;FS=7.783;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.096;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:145:99:1520,0,1503 chrX 465531 . A G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.410;DP=135;Dels=0.00;FS=5.428;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.112;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1276,0,1394 chrX 465795 . G A 4644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.39;SB=-2.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4644,460,0 chrX 465816 . T G 4342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4342,447,0 chrX 466050 . G A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.347;DP=151;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.199;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1597,0,1483 chrX 466110 . A T 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2953,306,0 chrX 466167 . A G 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.18;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2756,294,0 chrX 466425 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.745;DP=133;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.128;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1249,0,1441 chrX 466454 . C T 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3793,393,0 chrX 466683 . T C 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.428;DP=125;Dels=0.00;FS=3.219;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:942,0,1444 chrX 466776 . G A 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.973;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.580;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,89:171:99:1797,0,1618 chrX 467010 . C G 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3351,342,0 chrX 467107 . C T 3899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3899,373,0 chrX 467162 . A G 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3696,387,0 chrX 467199 . A G 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=23.44;SB=-1.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:3774,402,0 chrX 467589 . C T 4142.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.05;SB=-2.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4142,427,0 chrX 469146 . C A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.593;DP=100;Dels=0.00;FS=4.871;HaplotypeScore=3.7336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.883;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1031,0,1023 chrX 469194 . G A 1874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.605;DP=164;Dels=0.00;FS=1.279;HaplotypeScore=2.9195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.406;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,89:164:99:1904,0,1513 chrX 469358 . G C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.780;DP=134;Dels=0.00;FS=19.072;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=0.965;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1465,0,1294 chrX 469453 . C T 4048.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.83;SB=-2.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4048,397,0 chrX 469520 . T C 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.56;SB=-2.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3988,432,0 chrX 469702 . A G 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.781;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,182:184:99:4083,432,0 chrX 470286 . G A 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.115;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.491;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:719,0,1340 chrX 471278 . C T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.976;DP=134;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=3.0340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.303;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1285,0,1308 chrX 471366 . A G 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3391,375,0 chrX 471486 . T A 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2875,300,0 chrX 471532 . C T 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3335,336,0 chrX 471770 . T C 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2615,273,0 chrX 472011 . A G 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3065,336,0 chrX 472246 . C T 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.07;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3456,349,0 chrX 472296 . C T 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.41;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3479,366,0 chrX 484352 . C T 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.03;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2994,312,0 chrX 484353 . T C 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.08;MQ0=0;QD=22.98;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2951,312,0 chrX 484372 . C T 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.97;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3292,336,0 chrX 484451 . G T 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3206,318,0 chrX 484530 . G A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.355;DP=128;Dels=0.00;FS=4.198;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.155;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1502,0,1164 chrX 484644 . A G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.469;DP=120;Dels=0.00;FS=4.553;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.266;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:120:99:1209,0,1203 chrX 484754 . T A 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3371,345,0 chrX 485193 . T C 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.299;DP=163;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=3.558;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.294;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,79:163:99:1611,0,1877 chrX 485198 . G T 4039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4039,414,0 chrX 485426 . T C 4108.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4108,420,0 chrX 485434 . G C 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;DP=168;Dels=0.00;FS=4.639;HaplotypeScore=2.4696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.075;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,94:168:99:1818,0,1450 chrX 485447 . G A 3778.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2582;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.980e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3778,376,0 chrX 486009 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.293;DP=112;Dels=0.00;FS=7.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1213,0,1100 chrX 486166 . A G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.104;DP=157;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=4.6936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.192;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1675,0,1611 chrX 486193 . C T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.894;DP=145;Dels=0.00;FS=5.060;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1649,0,1360 chrX 486292 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.159;DP=116;Dels=0.02;FS=1.594;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.282;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1325,0,1045 chrX 486407 . A C 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.505;DP=139;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=3.5122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.845;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1338,0,1413 chrX 486432 . T G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.046;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1279,0,1465 chrX 486501 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.835;DP=144;Dels=0.01;FS=0.625;HaplotypeScore=5.4377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=2.163;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.729;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1370,0,1629 chrX 486724 . A G 2919 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.16;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2952,312,0 chrX 487807 . G A 4036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4036,403,0 chrX 487992 . A G 4577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4577,492,0 chrX 488230 . T C 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2610;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3803,414,0 chrX 488777 . T C 1254.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.168;DP=147;Dels=0.00;FS=8.086;HaplotypeScore=2.1461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=4.642;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:147:99:1284,0,1757 chrX 488779 . A G 1440.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.147;DP=142;Dels=0.00;FS=11.758;HaplotypeScore=2.1461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.252;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.667;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1470,0,1443 chrX 488781 . C T 1462.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.160;DP=134;Dels=0.00;FS=13.770;HaplotypeScore=2.1461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=-3.228;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.519;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1492,0,1285 chrX 488782 . T C 3438.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1461;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3438,375,0 chrX 488944 . C T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.384;DP=119;Dels=0.00;FS=5.078;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,74:119:99:1554,0,753 chrX 489013 . C T 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3051,315,0 chrX 489085 . G A 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.107;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:900,0,1308 chrX 489283 . A G 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.967;DP=108;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=8.0644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.404;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:967,0,1258 chrX 489341 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.682;DP=120;Dels=0.00;FS=0.771;HaplotypeScore=3.2945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.739;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:120:99:1444,0,1027 chrX 489721 . C G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;DP=140;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1532,0,1313 chrX 489978 . C G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.831;DP=130;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1371,0,1278 chrX 489987 . T A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1315,0,1465 chrX 490198 . A G 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.227;DP=154;Dels=0.00;FS=7.611;HaplotypeScore=5.5022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1676,0,1459 chrX 490357 . A T 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;DP=135;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.540;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1157,0,1731 chrX 491476 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.850;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.807;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1121,0,1204 chrX 492267 . T G 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=129;Dels=0.00;FS=13.274;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.945;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:129:99:1567,0,1122 chrX 493614 . C T 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.969;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.501;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1222,0,1278 chrX 494056 . G A 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.077;DP=99;Dels=0.00;FS=4.367;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:703,0,1449 chrX 494400 . T A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.977;DP=130;Dels=0.00;FS=1.373;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.882;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1409,0,1326 chrX 495112 . T A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.870;DP=138;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.208;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1198,0,1728 chrX 495954 . G A 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.159;DP=146;Dels=0.00;FS=11.014;HaplotypeScore=8.8253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.885;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1783,0,1299 chrX 496520 . A C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.532;DP=121;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.549;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1343,0,1179 chrX 497212 . A G 423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.397;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,29:84:99:453,0,1244 chrX 498452 . G T 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.895;DP=153;Dels=0.00;FS=3.769;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=10.18;ReadPosRankSum=2.138;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1587,0,1632 chrX 498578 . T G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.363;DP=109;Dels=0.00;FS=3.512;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1091,0,1196 chrX 498791 . G A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.562;DP=126;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1281,0,1285 chrX 499118 . G A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.382;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.955;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1267,0,1137 chrX 499382 . G A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.180;DP=134;Dels=0.00;FS=12.501;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.760;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.438;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1254,0,1465 chrX 500057 . C T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.817;DP=132;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1394,0,1292 chrX 500147 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.179;DP=133;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.224;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1498,0,1113 chrX 500159 . G A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.455;DP=133;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.958;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1560,0,1141 chrX 500174 . A G 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.623;DP=114;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1282,0,1061 chrX 500192 . A G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.347;DP=124;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1331,0,1214 chrX 500362 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.533;DP=119;Dels=0.00;FS=6.947;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=1;MQRankSum=1.002;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.673;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1146,0,1111 chrX 500407 . C T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.210;DP=128;Dels=0.00;FS=16.765;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=-0.166;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1393,0,1202 chrX 500495 . T A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;DP=118;Dels=0.00;FS=1.609;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:118:99:1393,0,987 chrX 500602 . A G 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.567;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.269;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1193,0,1475 chrX 501283 . C T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.973;DP=151;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=5.9318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=7.83;ReadPosRankSum=2.197;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1212,0,1760 chrX 501659 . T A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;DP=113;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.582;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:1009,0,1304 chrX 501861 . G A 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.182;DP=131;Dels=0.00;FS=7.923;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.671;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1183,0,1502 chrX 502163 . G A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.790;DP=115;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.474;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1172,0,1216 chrX 502687 . C T 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.837;DP=152;Dels=0.00;FS=2.912;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1825,0,1376 chrX 502861 . G A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.387;DP=94;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.987;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1107,0,838 chrX 502945 . C T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.438;DP=143;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1538,0,1528 chrX 503263 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.901;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.296;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1384,0,1186 chrX 503332 . C G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.788;DP=116;Dels=0.00;FS=1.608;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.161;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1338,0,1034 chrX 503779 . A G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.636;DP=120;Dels=0.00;FS=4.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1057,0,1451 chrX 503880 . G C 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3323,342,0 chrX 503940 . C T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.425;DP=123;Dels=0.00;FS=4.515;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.866;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1326,0,1258 chrX 504158 . A G 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.32;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3520,372,0 chrX 504222 . C T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.820;DP=119;Dels=0.00;FS=4.760;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.778;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1382,0,1035 chrX 504709 . T C 2403 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2168;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2436,255,0 chrX 504862 . A C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.662;DP=125;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.188;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1273,0,1380 chrX 505150 . G A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=1;MQRankSum=-2.413;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,57:140:99:1036,0,1773 chrX 505156 . G A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.141;DP=150;Dels=0.00;FS=1.344;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=1;MQRankSum=-1.296;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.139;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,57:150:99:997,0,2000 chrX 505163 . A G 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.261;DP=136;Dels=0.00;FS=3.366;HaplotypeScore=3.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=1;MQRankSum=-1.875;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.397;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,50:136:99:749,0,1887 chrX 505193 . C T 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.809;DP=149;Dels=0.00;FS=3.810;HaplotypeScore=13.8563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=1;MQRankSum=0.025;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.632;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1522,0,1493 chrX 505224 . T C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.397;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.742;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1104,0,1221 chrX 505297 . A T 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;DP=110;Dels=0.00;FS=3.595;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.327;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:939,0,1350 chrX 505396 . C T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;DP=126;Dels=0.00;FS=3.213;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.590;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1446,0,1255 chrX 505450 . C A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;DP=105;Dels=0.00;FS=3.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1083,0,1119 chrX 505554 . T G 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.290;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.642;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1582,0,1258 chrX 505607 . T C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.071;DP=130;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.670;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1404,0,1273 chrX 506036 . C A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.841;DP=115;Dels=0.00;FS=0.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.882;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1326,0,1128 chrX 506055 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.124;DP=113;Dels=0.00;FS=3.666;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.365;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1233,0,1110 chrX 506424 . G A 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:119:99:3172,312,0 chrX 506521 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.490;DP=96;Dels=0.00;FS=1.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.300;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:980,0,1015 chrX 506574 . T C 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.911;DP=99;Dels=0.00;FS=1.618;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1054,0,1021 chrX 506881 . C T 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.146;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.631;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,43:110:99:862,0,1422 chrX 506903 . T C 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.721;DP=106;Dels=0.00;FS=15.613;HaplotypeScore=3.5010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:106:99:809,0,1310 chrX 507091 . G C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.765;DP=114;Dels=0.00;FS=10.402;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.099;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1128,0,1147 chrX 507511 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.181;DP=128;Dels=0.00;FS=4.420;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1353,0,1203 chrX 507583 . A G 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.710;DP=92;Dels=0.00;FS=6.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:935,0,976 chrX 508212 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.991;DP=128;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=3.9679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1293,0,1320 chrX 508514 . T A 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3557,360,0 chrX 508529 . A C 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3093,327,0 chrX 508682 . T C 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.943;DP=118;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=4.7972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.534;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1035,0,1483 chrX 508754 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.254;DP=138;Dels=0.00;FS=16.502;HaplotypeScore=2.5466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1418,0,1501 chrX 509332 . C T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.334;DP=124;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,81:124:99:1666,0,731 chrX 509431 . C T 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.587;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:148:99:1613,0,1480 chrX 509825 . T A 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=1;QD=26.11;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3707,369,0 chrX 509883 . G A 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.189;DP=129;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.339;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1197,0,1468 chrX 510183 . C T 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3295,333,0 chrX 510268 . T G 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.785;DP=88;Dels=0.00;FS=4.068;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:817,0,1025 chrX 510548 . G A 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3337,351,0 chrX 510695 . C T 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.651;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3678,356,0 chrX 510914 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.033;DP=111;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=3.7097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1095,0,1237 chrX 510934 . T C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.493;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.637;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1043,0,1274 chrX 510956 . G A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.410;DP=109;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1112,0,1145 chrX 511279 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.633;DP=127;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=9.39;ReadPosRankSum=-2.621;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1222,0,1351 chrX 511281 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.355;DP=127;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=9.42;ReadPosRankSum=-2.269;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1226,0,1382 chrX 511607 . A G 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.466;DP=132;Dels=0.00;FS=2.402;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.391;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1447,0,1227 chrX 511879 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.047;DP=111;Dels=0.00;FS=3.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.987;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1009,0,1296 chrX 511949 . C T 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3312,339,0 chrX 512002 . G T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.273;DP=123;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=4.7994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1579,0,1010 chrX 512096 . C T 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.61;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2747,279,0 chrX 512114 . G T 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;DP=111;Dels=0.00;FS=2.492;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.185;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:994,0,1329 chrX 512140 . T C 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2792,285,0 chrX 512272 . C T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.435;DP=121;Dels=0.00;FS=3.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.830;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1192,0,1342 chrX 512347 . C T 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.034;DP=158;Dels=0.00;FS=5.742;HaplotypeScore=2.6989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.805;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1631,0,1634 chrX 512401 . A G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.379;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1213,0,1599 chrX 512491 . C T 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3642,364,0 chrX 512710 . T C 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.751;DP=113;Dels=0.00;FS=3.598;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=8.81;ReadPosRankSum=-2.022;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1025,0,1263 chrX 513143 . A G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.432;DP=134;Dels=0.00;FS=18.395;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1216,0,1547 chrX 513191 . G A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.087;DP=116;Dels=0.00;FS=10.150;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1322,0,1057 chrX 513265 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;DP=123;Dels=0.00;FS=10.404;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=8.81;ReadPosRankSum=-2.011;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1114,0,1422 chrX 513398 . C T 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.806;DP=105;Dels=0.00;FS=7.695;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1048,0,1087 chrX 513875 . G C 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.660;DP=151;Dels=0.00;FS=6.283;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1490,0,1550 chrX 514163 . C T 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.596;DP=135;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.612;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.945;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1687,0,1151 chrX 514177 . C T 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.211;DP=140;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=4.0555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.454;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1761,0,1172 chrX 514245 . A G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.907;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.719;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1524,0,1653 chrX 514246 . G A 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.935;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.483;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1568,0,1593 chrX 514264 . G A 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.978;DP=161;Dels=0.00;FS=7.114;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1646,0,1613 chrX 514273 . A G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.272;DP=151;Dels=0.00;FS=7.389;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=9.40;ReadPosRankSum=-2.227;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:151:99:1449,0,1559 chrX 514366 . T C 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;DP=141;Dels=0.00;FS=4.009;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.517;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1661,0,1321 chrX 514465 . G A 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.409;DP=157;Dels=0.00;FS=1.972;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=1;MQRankSum=1.450;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1680,0,1560 chrX 514490 . C T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.418;DP=154;Dels=0.00;FS=3.763;HaplotypeScore=2.6653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=1;MQRankSum=-1.294;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.859;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1634,0,1609 chrX 514559 . G A 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.671;DP=143;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=12.10;ReadPosRankSum=2.012;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1760,0,1267 chrX 514663 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.475;DP=123;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=9.28;ReadPosRankSum=2.128;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1171,0,1406 chrX 514702 . C T 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.104;DP=126;Dels=0.00;FS=2.413;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1349,0,1276 chrX 514731 . A G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.423;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.109;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1170,0,1358 chrX 514825 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.872;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=10.01;ReadPosRankSum=-2.033;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1311,0,1322 chrX 514851 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.898;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.775;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.487;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1407,0,1293 chrX 515263 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.381;DP=103;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.909;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1171,0,996 chrX 515338 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.061;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.863;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.270;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1366,0,1534 chrX 515351 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.396;DP=143;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.437;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1244,0,1638 chrX 515450 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.528;DP=137;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.787;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1399,0,1504 chrX 515737 . G A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.877;DP=141;Dels=0.00;FS=1.321;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=2.328;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.444;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1523,0,1307 chrX 516019 . C T 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.747;DP=108;Dels=0.00;FS=5.794;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:966,0,1273 chrX 516099 . T C 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;DP=82;Dels=0.00;FS=0.879;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,37:82:99:719,0,976 chrX 516190 . C T 2655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2688,288,0 chrX 516246 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.851;DP=136;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1452,0,1364 chrX 516436 . G A 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.43;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3292,328,0 chrX 516694 . A G 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.250;DP=131;Dels=0.00;FS=5.475;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.724;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1310,0,1485 chrX 516695 . A G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.613;DP=132;Dels=0.00;FS=4.280;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=9.50;ReadPosRankSum=-2.037;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1284,0,1467 chrX 516754 . A G 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.704;DP=153;Dels=0.00;FS=2.863;HaplotypeScore=2.8052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.815;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:153:99:1658,0,1476 chrX 516801 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.158;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.695;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1309,0,1274 chrX 516802 . T G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.223;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.458;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1247,0,1337 chrX 516831 . C T 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2634,270,0 chrX 516847 . T C 2174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=24.16;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2207,237,0 chrX 517244 . G C 2600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2633,288,0 chrX 517494 . T G 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3072,321,0 chrX 517501 . C T 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3063,318,0 chrX 517612 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.051;DP=140;Dels=0.00;FS=4.031;HaplotypeScore=66.0458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=1;MQRankSum=1.186;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.495;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1349,0,1460 chrX 517657 . T C 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.027;DP=171;Dels=0.00;FS=2.839;HaplotypeScore=3.9668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.932;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,89:171:99:1792,0,1659 chrX 517771 . A C 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.678;DP=140;Dels=0.00;FS=3.139;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1719,0,1178 chrX 517906 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.308;DP=151;Dels=0.00;FS=2.074;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.420;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1363,0,1771 chrX 517919 . T A 1826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.351;DP=150;Dels=0.00;FS=2.986;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=5.329;QD=12.17;ReadPosRankSum=-2.928;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:1856,0,1330 chrX 518093 . T C 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.243;DP=144;Dels=0.00;FS=4.179;HaplotypeScore=10.6278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.108;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,54:144:99:1014,0,1813 chrX 518283 . A T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;DP=133;Dels=0.00;FS=5.315;HaplotypeScore=2.8754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=2.174;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.939;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1413,0,1140 chrX 518360 . C A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.374;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.573;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1465,0,1146 chrX 518451 . C T 1768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.348;DP=150;Dels=0.00;FS=3.970;HaplotypeScore=2.9406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1798,0,1285 chrX 518465 . A G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.353;DP=138;Dels=0.00;FS=3.285;HaplotypeScore=7.5448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.812;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:138:99:1458,0,1376 chrX 518469 . C T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.570;DP=145;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=5.5975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1543,0,1288 chrX 518494 . G C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.742;DP=108;Dels=0.00;FS=4.077;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.608;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:108:99:1175,0,926 chrX 518528 . G A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.208;DP=119;Dels=0.00;FS=3.771;HaplotypeScore=2.4591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.867;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.160;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1207,0,1117 chrX 518647 . G T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;DP=146;Dels=0.00;FS=3.807;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.984;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1528,0,1538 chrX 518690 . C T 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.030;DP=175;Dels=0.00;FS=3.575;HaplotypeScore=5.7532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.991;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,81:175:99:1595,0,2053 chrX 518721 . C T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.457;DP=122;Dels=0.00;FS=6.944;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=11.96;ReadPosRankSum=2.356;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1489,0,1146 chrX 518745 . A G 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.944;DP=137;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=8.6687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=11.42;ReadPosRankSum=2.428;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1595,0,1326 chrX 518934 . C A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.357;DP=141;Dels=0.00;FS=9.091;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.145;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1289,0,1590 chrX 518979 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.343;DP=145;Dels=0.00;FS=15.569;HaplotypeScore=3.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=9.22;ReadPosRankSum=-2.392;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1367,0,1748 chrX 519012 . T C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.290;DP=168;Dels=0.00;FS=1.950;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=6.93;ReadPosRankSum=2.071;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,71:168:99:1195,0,2139 chrX 519508 . C G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.560;DP=106;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.409;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1002,0,946 chrX 520154 . G T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.466;DP=107;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=9.35;ReadPosRankSum=-2.276;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1030,0,1124 chrX 520853 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.747;DP=132;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:132:99:1238,0,1508 chrX 520988 . T C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.396;DP=109;Dels=0.00;FS=7.527;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.045;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1182,0,1009 chrX 521093 . G A 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3894,397,0 chrX 521432 . G A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.757;DP=118;Dels=0.00;FS=2.389;HaplotypeScore=3.8795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1203,0,1184 chrX 521645 . T G 4661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.04;SB=-2.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4661,474,0 chrX 522284 . T C 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.55;SB=-2.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4051,408,0 chrX 522481 . C G 4311.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.78;SB=-2.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4311,441,0 chrX 522484 . C T 1592.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.656;DP=168;Dels=0.00;FS=0.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,78:168:99:1622,0,1864 chrX 522489 . T C 1535.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.897;DP=141;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=2.350;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1565,0,1333 chrX 522503 . G A 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.246;DP=134;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=4.4386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.470;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1300,0,1507 chrX 522547 . A G 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.492;DP=171;Dels=0.00;FS=7.843;HaplotypeScore=5.6762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,87:171:99:1755,0,1812 chrX 522608 . T C 4632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.38;SB=-2.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4632,486,0 chrX 522848 . T C 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.024;DP=182;Dels=0.00;FS=2.610;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.400;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.432;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,90:182:99:1779,0,1956 chrX 522926 . C T 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.970;DP=175;Dels=0.00;FS=1.864;HaplotypeScore=2.7547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.369;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,84:175:99:1754,0,1806 chrX 523142 . C T 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3804,390,0 chrX 523349 . G A 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.512;DP=158;Dels=0.00;FS=15.950;HaplotypeScore=4.7643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.838;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,78:158:99:1671,0,1602 chrX 523373 . C T 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.574;DP=156;Dels=0.00;FS=14.079;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.565;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1644,0,1644 chrX 523867 . T G 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.864;DP=101;Dels=0.00;FS=11.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1011,0,1059 chrX 524098 . A T 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1213,0,1465 chrX 524113 . T G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.905;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.587;QD=9.18;ReadPosRankSum=-2.087;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:134:99:1260,0,1453 chrX 524213 . T C 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.172;DP=188;Dels=0.00;FS=1.150;HaplotypeScore=3.6464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=7.74;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,84:188:99:1486,0,2262 chrX 524254 . A C 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.434;DP=171;Dels=0.00;FS=9.108;HaplotypeScore=3.6618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,84:171:99:1715,0,1771 chrX 524255 . A G 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.718;DP=170;Dels=0.00;FS=10.464;HaplotypeScore=3.6618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=2.151;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,87:170:99:1648,0,1801 chrX 524311 . G C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.949;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.750;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1464,0,1567 chrX 524341 . C T 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.19;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3308,342,0 chrX 524361 . A G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.679;DP=123;Dels=0.00;FS=10.020;HaplotypeScore=2.4397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.25;MQ0=0;MQRankSum=5.339;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1332,0,1178 chrX 524370 . T C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.252;DP=118;Dels=0.00;FS=8.524;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.67;MQ0=0;MQRankSum=-5.180;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.539;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:118:99:1023,0,1366 chrX 524384 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.382;DP=122;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.295;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1081,0,1380 chrX 524404 . G A 1071.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.793;DP=123;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.94;MQ0=0;MQRankSum=-6.286;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1101,0,1231 chrX 524408 . C T 980.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.659;DP=125;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=-6.596;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1010,0,1352 chrX 524412 . C T 954.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.468;DP=122;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQ0=0;MQRankSum=-6.308;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:984,0,1310 chrX 524435 . C T 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.998;DP=115;Dels=0.00;FS=5.244;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.84;MQ0=0;MQRankSum=-3.885;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1056,0,1088 chrX 524483 . G T 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.434;DP=100;Dels=0.00;FS=8.134;HaplotypeScore=2.3620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.245;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:961,0,1099 chrX 524618 . G A 2766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2799,288,0 chrX 524703 . C A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.161;DP=110;Dels=0.00;FS=5.165;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=2.182;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.675;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1228,0,782 chrX 524968 . G T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.733;DP=126;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1370,0,1277 chrX 525584 . A G 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.210;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=9.64;ReadPosRankSum=-2.141;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1534,0,1723 chrX 525720 . C A 99.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.192;DP=96;Dels=0.01;FS=97.748;HaplotypeScore=11.2285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=1;MQRankSum=1.123;QD=1.03;ReadPosRankSum=-6.185;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,28:95:99:129,0,405 chrX 525722 . C A 111.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.753;DP=93;Dels=0.00;FS=80.655;HaplotypeScore=13.0960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=2.114;QD=1.19;ReadPosRankSum=-6.132;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:141,0,164 chrX 525724 . G A 76.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;DP=95;Dels=0.00;FS=67.037;HaplotypeScore=14.8178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=0.80;ReadPosRankSum=-4.375;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:95:99:106,0,252 chrX 525729 . G A 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;DP=85;Dels=0.00;FS=43.720;HaplotypeScore=46.7161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.407;QD=0.31;ReadPosRankSum=-1.937;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,12:85:56:56,0,349 chrX 525737 . A G 468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.994;DP=75;Dels=0.00;FS=7.941;HaplotypeScore=26.7962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.81;MQ0=0;MQRankSum=2.293;QD=6.24;ReadPosRankSum=2.550;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,44:75:99:498,0,233 chrX 525745 . C A 1092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=26.3740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.56;MQ0=0;QD=15.83;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1125,126,0 chrX 525864 . A C 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.929;DP=178;Dels=0.00;FS=2.914;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,80:178:99:1491,0,1893 chrX 525918 . G A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.681;DP=179;Dels=0.00;FS=1.912;HaplotypeScore=2.5583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.145;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,73:179:99:1122,0,2321 chrX 526036 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.726;DP=129;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1086,0,1423 chrX 526305 . A G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.271;DP=163;Dels=0.00;FS=2.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.485;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:163:99:1417,0,1940 chrX 527538 . A G 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=22.33;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:3551,378,0 chrX 528102 . C T 4175.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7555;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=1;QD=25.61;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4175,429,0 chrX 528488 . T G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.964;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=9.47;ReadPosRankSum=-2.333;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1337,0,1557 chrX 528491 . C T 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.468;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=11.17;ReadPosRankSum=2.064;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1605,0,1372 chrX 528509 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.899;DP=127;Dels=0.00;FS=8.242;HaplotypeScore=61.3226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:127:99:1064,0,1464 chrX 528574 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.159;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.475;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1475,0,1273 chrX 528639 . A T 4273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1271;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.267;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,163:165:99:4273,430,0 chrX 528798 . G A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.887;DP=146;Dels=0.00;FS=2.999;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.667;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1472,0,1510 chrX 528849 . G A 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3525,360,0 chrX 528913 . A G 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2950,312,0 chrX 529045 . A G 2891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2924,312,0 chrX 529184 . G A 4516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.72;SB=-2.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4516,448,0 chrX 529296 . A T 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2917,303,0 chrX 529307 . G A 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.89;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3111,315,0 chrX 529308 . G A 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.89;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3074,315,0 chrX 529362 . G A 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.83;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3992,417,0 chrX 529374 . A G 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.12;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3291,345,0 chrX 529383 . A G 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.19;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3567,372,0 chrX 529442 . T C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.07;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3732,402,0 chrX 529470 . T C 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.02;MQ0=0;QD=22.26;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3016,333,0 chrX 529486 . A G 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5640;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.39;MQ0=0;QD=21.64;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2565,282,0 chrX 529522 . A T 166.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=96.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.70;MQ0=0;QD=1.46;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:21:199,21,0 chrX 529549 . T C 2402 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.40;MQ0=0;QD=20.89;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2435,279,0 chrX 529553 . C T 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.72;MQ0=0;QD=21.56;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2469,264,0 chrX 529640 . C T 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3674,387,0 chrX 529795 . G A 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=23.83;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2917,300,0 chrX 529812 . A C 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=26.19;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2888,306,0 chrX 530079 . T C 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3253,351,0 chrX 530192 . G A 1830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.541;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1860,0,1364 chrX 530523 . G A 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3649,373,0 chrX 530814 . G A 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3164,327,0 chrX 531033 . A G 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2840,303,0 chrX 531048 . C T 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2646,279,0 chrX 531409 . C A 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2749,276,0 chrX 531521 . G A 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3776,364,0 chrX 531568 . C T 2438 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.938;DP=96;Dels=0.00;FS=3.912;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=25.40;ReadPosRankSum=1.696;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2471,234,0 chrX 531599 . T G 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.77;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2976,312,0 chrX 531713 . T C 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.98;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2968,312,0 chrX 531747 . T G 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2778,294,0 chrX 531751 . T C 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.57;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2490,273,0 chrX 531789 . G T 676.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.756;DP=79;Dels=0.00;FS=4.340;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.085;QD=8.56;ReadPosRankSum=2.046;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:706,0,805 chrX 531790 . T C 626.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;DP=80;Dels=0.00;FS=4.366;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.530;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.684;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,39:80:99:656,0,838 chrX 531791 . A G 1921 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.89;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1954,219,0 chrX 531794 . T C 1980 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.24;MQ0=0;QD=23.86;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2013,228,0 chrX 531806 . T A 658.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;DP=89;Dels=0.00;FS=5.719;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=7.39;ReadPosRankSum=2.186;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,36:89:99:688,0,1118 chrX 531807 . G A 2209 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.23;MQ0=0;QD=25.10;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2242,237,0 chrX 531814 . T A 2403 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.36;MQ0=0;QD=25.56;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2436,258,0 chrX 531946 . C T 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.752;DP=92;Dels=0.00;FS=10.732;HaplotypeScore=3.3471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQ0=0;MQRankSum=-5.479;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:92:99:793,0,987 chrX 531953 . G A 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.871;DP=94;Dels=0.00;FS=5.569;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQ0=0;MQRankSum=-5.624;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.319;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:770,0,1079 chrX 531961 . G A 722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.886;DP=102;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.86;MQ0=0;MQRankSum=-5.699;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:752,0,1275 chrX 531967 . G A 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.467;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.26;MQ0=0;MQRankSum=-7.259;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,43:103:99:715,0,1265 chrX 531989 . C T 555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.412;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.53;MQ0=0;MQRankSum=-6.365;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.953;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,39:104:99:585,0,1368 chrX 532000 . C A 612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.007;DP=108;Dels=0.00;FS=5.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-5.444;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.633;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:642,0,1435 chrX 532003 . G A 620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.345;DP=109;Dels=0.00;FS=5.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-5.962;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.352;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:650,0,1425 chrX 532027 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.405;DP=107;Dels=0.00;FS=2.611;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.79;MQ0=0;MQRankSum=4.180;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.282;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,67:107:99:1325,0,686 chrX 532273 . G C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;DP=130;Dels=0.00;FS=11.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=10.94;ReadPosRankSum=-2.319;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1452,0,1122 chrX 532441 . C T 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.041;DP=103;Dels=0.00;FS=6.518;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.846;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.220;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:857,0,1255 chrX 532743 . C T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.528;DP=109;Dels=0.00;FS=7.251;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.143;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1049,0,1275 chrX 532916 . T A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.952;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1265,0,1248 chrX 532931 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.756;DP=127;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.166;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1259,0,1345 chrX 533243 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.965;DP=115;Dels=0.00;FS=1.513;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1319,0,1031 chrX 533424 . A C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.470;DP=137;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=0.658;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1185,0,1758 chrX 533833 . T C 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.45;MQ0=0;QD=25.79;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3025,321,0 chrX 534002 . G T 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.410;DP=107;Dels=0.00;FS=15.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.858;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:783,0,1303 chrX 534203 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.425;DP=128;Dels=0.00;FS=6.687;HaplotypeScore=2.9119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.067;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1449,0,1196 chrX 534212 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.872;DP=122;Dels=0.00;FS=4.376;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.253;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.797;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1243,0,1265 chrX 534224 . T C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.142;DP=131;Dels=0.00;FS=3.208;HaplotypeScore=3.7039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.784;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1313,0,1397 chrX 534296 . A G 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3382,363,0 chrX 534345 . G T 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.961;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:950,0,1203 chrX 534756 . A G 1428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.62;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1461,150,0 chrX 534967 . G A 695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.111;DP=87;Dels=0.00;FS=4.185;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.251;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:725,0,1075 chrX 535328 . A G 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.869;DP=103;Dels=0.00;FS=7.702;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.486;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1097,0,978 chrX 535364 . A G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.619;DP=110;Dels=0.00;FS=9.238;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1316,0,1045 chrX 535428 . G A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.377;DP=119;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.985;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1136,0,1312 chrX 535430 . T C 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3065,318,0 chrX 535531 . A G 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.141;DP=141;Dels=0.00;FS=4.005;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.950;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1679,0,1312 chrX 535551 . T A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.304;DP=154;Dels=0.00;FS=5.882;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.530;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1519,0,1823 chrX 535622 . T C 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.032;DP=116;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=7.8844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.215;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:911,0,1532 chrX 535866 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.047;DP=102;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.038;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1199,0,813 chrX 535873 . C T 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2815,279,0 chrX 535930 . G C 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;DP=110;Dels=0.00;FS=5.084;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:927,0,1347 chrX 536352 . A G 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.436;DP=111;Dels=0.00;FS=5.115;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.460;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:965,0,1341 chrX 536354 . C T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.669;DP=110;Dels=0.00;FS=8.122;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.407;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:928,0,1238 chrX 537007 . G A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.386;DP=109;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=2.707;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1144,0,1186 chrX 537203 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.801;DP=98;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.808;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1064,0,909 chrX 537207 . A G 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2599,261,0 chrX 537704 . A G 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.807;DP=85;Dels=0.00;FS=0.818;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:916,0,881 chrX 537808 . C T 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.795;DP=96;Dels=0.00;FS=1.896;HaplotypeScore=4.9302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=1.918;QD=10.16;ReadPosRankSum=2.541;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:1005,0,922 chrX 537810 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;DP=99;Dels=0.00;FS=2.925;HaplotypeScore=3.9386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=2.036;QD=9.85;ReadPosRankSum=2.547;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:1005,0,1019 chrX 538006 . G A 2194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.93;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2227,231,0 chrX 538044 . T C 424 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.42;MQ0=0;QD=13.25;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:51:457,51,0 chrX 538049 . C T 481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.33;MQ0=0;QD=17.18;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:54:514,54,0 chrX 538084 . A G 379 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.22;MQ0=0;QD=18.95;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:45:412,45,0 chrX 538523 . T C 1992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.22;MQ0=0;QD=24.29;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2025,213,0 chrX 538944 . T C 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2629,273,0 chrX 538946 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.377;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1231,0,1023 chrX 539053 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.519;DP=105;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.711;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1187,0,999 chrX 539146 . A G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.548;DP=109;Dels=0.00;FS=3.557;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1108,0,1138 chrX 539272 . A G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.476;DP=122;Dels=0.00;FS=4.367;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1258,0,1315 chrX 539275 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.526;DP=123;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1297,0,1221 chrX 539286 . G A 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.429;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.315;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1056,0,1177 chrX 539337 . T A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;DP=102;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1166,0,1032 chrX 539414 . T A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;DP=109;Dels=0.00;FS=2.615;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.616;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1250,0,1055 chrX 539524 . T G 238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.318;DP=61;Dels=0.00;FS=9.403;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQ0=0;MQRankSum=-5.010;QD=3.90;ReadPosRankSum=-3.391;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:268,0,772 chrX 539608 . A T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.442;DP=122;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.219;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1376,0,1124 chrX 539652 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.697;DP=105;Dels=0.00;FS=6.511;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.448;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1136,0,1033 chrX 539780 . C T 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2690,276,0 chrX 539960 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.385;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.5034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.027;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1148,0,1093 chrX 540022 . C G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;DP=103;Dels=0.00;FS=7.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.710;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1240,0,870 chrX 540054 . A G 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.078;DP=107;Dels=0.00;FS=9.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=2.086;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.368;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:744,0,1490 chrX 540077 . T C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.119;DP=95;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.614;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1122,0,819 chrX 540365 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.382;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1220,0,1031 chrX 540420 . G A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.617;DP=102;Dels=0.00;FS=11.810;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.603;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1032,0,1097 chrX 540433 . A G 2366 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.14;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:98:99:2399,258,0 chrX 540450 . G A 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.413;DP=89;Dels=0.00;FS=4.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:905,0,880 chrX 540617 . A G 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.132;DP=80;Dels=0.00;FS=15.023;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.011;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,44:80:99:893,0,755 chrX 540782 . A G 1441 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.655;DP=79;Dels=0.00;FS=43.088;HaplotypeScore=7.9413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.23;MQ0=0;MQRankSum=4.297;QD=18.24;ReadPosRankSum=5.543;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,61:79:99:1474,153,0 chrX 540790 . G C 1301 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.175;DP=76;Dels=0.00;FS=44.318;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.71;MQ0=0;MQRankSum=4.836;QD=17.12;ReadPosRankSum=4.001;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,59:76:99:1334,141,0 chrX 540795 . C T 1436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.254;DP=79;Dels=0.00;FS=53.486;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.03;MQ0=0;MQRankSum=4.389;QD=18.18;ReadPosRankSum=2.928;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,61:79:99:1469,150,0 chrX 540805 . G T 1414 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.38;MQ0=0;QD=18.85;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1447,147,0 chrX 540858 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.410;DP=106;Dels=0.00;FS=8.032;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQ0=2;MQRankSum=-3.716;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.057;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,67:106:99:1206,0,761 chrX 540860 . G A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.622;DP=107;Dels=0.00;FS=9.796;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.62;MQ0=2;MQRankSum=-4.062;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.182;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,67:107:99:1282,0,715 chrX 540890 . A G 1414.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.295;DP=141;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.10;MQ0=4;MQRankSum=-4.890;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,82:141:99:1444,0,1205 chrX 540907 . G T 1390.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.989;DP=143;Dels=0.00;FS=6.527;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.72;MQ0=4;MQRankSum=-4.697;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1420,0,1281 chrX 540929 . A G 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.311;DP=120;Dels=0.00;FS=15.831;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.02;MQ0=2;MQRankSum=5.102;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.163;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1083,0,1189 chrX 540972 . A T 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8529;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.89;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2693,279,0 chrX 541000 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;DP=105;Dels=0.00;FS=11.114;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=1.795;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.641;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:1020,0,1142 chrX 541067 . C A 1617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.15;MQ0=0;QD=26.51;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1650,174,0 chrX 541095 . T C 1125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.06;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1158,123,0 chrX 541169 . A T 240.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=2;MQRankSum=1.504;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.042;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:27:273,27,0 chrX 541188 . C G 221.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.10;MQ0=6;MQRankSum=0.744;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.488;SB=-8.496e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,13:20:27:254,27,0 chrX 541254 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=21;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.73;MQ0=17;MQRankSum=1.026;QD=1.04;ReadPosRankSum=1.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,2:21:6:53,6,0 chrX 541377 . C T 64.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=19;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.96;MQ0=10;MQRankSum=2.219;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.159;SB=-2.752e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:32:94,0,32 chrX 541379 . A G 62.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=18;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.42;MQ0=9;MQRankSum=1.881;QD=3.44;ReadPosRankSum=-1.159;SB=-2.752e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:32:92,0,32 chrX 541380 . G A 65.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;DP=18;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.42;MQ0=9;MQRankSum=1.307;QD=3.61;ReadPosRankSum=-1.159;SB=-2.753e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:30:95,0,30 chrX 541384 . C T 64.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=15;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.00;MQ0=7;MQRankSum=1.920;QD=4.27;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-2.753e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:29:94,0,29 chrX 541385 . G A 64.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=14;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.67;MQ0=6;MQRankSum=1.920;QD=4.57;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-2.753e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:30:94,0,30 chrX 541389 . A C 57.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=13;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.41;MQ0=5;MQRankSum=1.920;QD=4.39;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-2.752e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:32:87,0,32 chrX 541392 . C T 66.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=13;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.41;MQ0=5;MQRankSum=1.221;QD=5.08;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-2.752e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:32:96,0,32 chrX 541398 . A G 62.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=11;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.19;MQ0=3;MQRankSum=0.956;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-2.752e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:32:92,0,32 chrX 541399 . G A 65.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=11;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.19;MQ0=3;MQRankSum=1.221;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-2.753e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:30:95,0,30 chrX 541404 . T C 56.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=9;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.53;MQ0=1;MQRankSum=1.221;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-2.752e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:32:86,0,32 chrX 541411 . T G 60.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=9;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.53;MQ0=1;MQRankSum=0.956;QD=6.67;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-2.752e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:31:90,0,31 chrX 541461 . G T 344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=66;Dels=0.00;FS=2.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.758;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:374,0,415 chrX 541613 . A T 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.06;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3250,316,0 chrX 541712 . A T 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;DP=111;Dels=0.00;FS=2.463;HaplotypeScore=2.9063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1349,0,1039 chrX 541972 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.977;DP=106;Dels=0.00;FS=12.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1192,0,1006 chrX 542113 . G A 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.942;DP=101;Dels=0.00;FS=14.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.520;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:101:99:775,0,1303 chrX 542131 . C T 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.155;DP=95;Dels=0.00;FS=22.252;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:790,0,1200 chrX 542293 . C T 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.876;DP=128;Dels=0.00;FS=2.451;HaplotypeScore=2.7902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.640;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1047,0,1507 chrX 542308 . A G 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.925;DP=135;Dels=0.00;FS=9.327;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=7.28;ReadPosRankSum=2.724;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,57:135:99:1013,0,1692 chrX 542323 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.938;DP=122;Dels=0.00;FS=6.058;HaplotypeScore=4.4754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=1.955;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1417,0,1088 chrX 542527 . T C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.427;DP=120;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.478;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:986,0,1533 chrX 542554 . T G 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.674;DP=108;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:926,0,1207 chrX 542620 . G A 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.343;DP=124;Dels=0.00;FS=8.602;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.679;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,78:124:99:1708,0,879 chrX 542636 . C T 688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.004;DP=103;Dels=0.00;FS=10.216;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=6.68;ReadPosRankSum=-2.368;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,37:103:99:718,0,1395 chrX 542637 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.258;DP=103;Dels=0.00;FS=10.216;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=13.78;ReadPosRankSum=2.286;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,66:103:99:1449,0,686 chrX 542771 . G A 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.872;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.700;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1453,0,1028 chrX 542947 . A G 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.570;DP=86;Dels=0.00;FS=5.577;HaplotypeScore=41.3823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.855;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,37:86:80:820,0,80 chrX 543047 . T C 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.992;DP=111;Dels=0.00;FS=2.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.850;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,43:111:99:815,0,1531 chrX 543104 . T C 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3644,375,0 chrX 543140 . G A 4310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4310,430,0 chrX 543157 . G A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.721;DP=163;Dels=0.00;FS=8.658;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,72:163:99:1486,0,1900 chrX 543204 . A G 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.553;DP=112;Dels=0.00;FS=9.373;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,39:112:99:704,0,1682 chrX 543250 . T G 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3102,333,0 chrX 543266 . C G,T 2610.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.24;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,43,67:110:99:2670,1633,1513,1037,0,850 chrX 543656 . G A 1441 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.19;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1474,150,0 chrX 543721 . A G 349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.757;DP=91;Dels=0.00;FS=6.800;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=1;MQRankSum=-3.183;QD=3.84;ReadPosRankSum=-3.506;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:379,0,1119 chrX 543725 . A G 360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.488;DP=91;Dels=0.00;FS=9.087;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=1;MQRankSum=-3.223;QD=3.96;ReadPosRankSum=-3.061;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:390,0,1107 chrX 543776 . T C 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.362;DP=116;Dels=0.00;FS=5.112;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.123;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:773,0,1318 chrX 543844 . G C 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.293;DP=91;Dels=0.00;FS=0.849;HaplotypeScore=5.5916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.309;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:844,0,971 chrX 543878 . T G 2677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8103;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=20.13;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2710,285,0 chrX 543880 . G T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.804;DP=118;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=4.8103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.802;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1195,0,1027 chrX 543909 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.624;DP=120;Dels=0.00;FS=2.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=1.800;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.030;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1055,0,1520 chrX 544009 . T C 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.840;DP=108;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=2.5352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.275;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:108:99:807,0,1347 chrX 544304 . G A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.951;DP=116;Dels=0.00;FS=1.668;HaplotypeScore=6.5793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.334;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1121,0,1164 chrX 544322 . C G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.191;DP=116;Dels=0.00;FS=2.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.130;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1236,0,1079 chrX 544484 . C T 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.436;DP=92;Dels=0.00;FS=1.833;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.329;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,38:92:99:793,0,1069 chrX 544523 . T C 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.084;DP=93;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=6.6614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:856,0,1038 chrX 544735 . G T 1910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.630;DP=158;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=0.002;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.703;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,88:158:99:1940,0,1397 chrX 545038 . A G 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9405;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3457,360,0 chrX 545053 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.670;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.895;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,76:128:99:1611,0,1064 chrX 545209 . T C 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3533,360,0 chrX 545233 . C T 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3629,364,0 chrX 545239 . C A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.651;DP=154;Dels=0.00;FS=4.940;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.134;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1341,0,1579 chrX 545249 . A G 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3414,345,0 chrX 545260 . G T 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.634;DP=121;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.537;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1131,0,1188 chrX 545745 . A G 1963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.385;DP=225;Dels=0.00;FS=1.061;HaplotypeScore=10.8076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.266;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,100:225:99:1993,0,2560 chrX 545817 . G C 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3079,324,0 chrX 546078 . T C 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2886,309,0 chrX 546096 . T C 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.508;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1387,0,1261 chrX 546103 . T C 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3256,345,0 chrX 546190 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.878;DP=137;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1359,0,1383 chrX 546192 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.105;DP=131;Dels=0.00;FS=2.237;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1266,0,1450 chrX 546305 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.361;DP=117;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=6.0357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=2.837;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1121,0,1216 chrX 546368 . T A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.609;DP=145;Dels=0.00;FS=3.973;HaplotypeScore=7.7343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1442,0,1532 chrX 546527 . T C 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3045,324,0 chrX 546530 . A G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.005;DP=121;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1247,0,1304 chrX 546704 . C T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.009;DP=127;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.314;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,78:127:99:1702,0,933 chrX 546734 . T C 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.923;DP=144;Dels=0.00;FS=6.216;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.708;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1752,0,1290 chrX 546746 . T A 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3757,370,0 chrX 546803 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.038;DP=129;Dels=0.01;FS=4.380;HaplotypeScore=7.6573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=2.059;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.525;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1219,0,1529 chrX 546863 . C T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.221;DP=151;Dels=0.00;FS=3.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.677;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:151:99:1517,0,1610 chrX 546884 . T C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.525;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.776;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1201,0,1266 chrX 547067 . C T 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3473,357,0 chrX 547082 . C G 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3317,360,0 chrX 547200 . C T 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7787;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.11;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3767,385,0 chrX 547229 . C T 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3104,318,0 chrX 547598 . C A 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.098;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.244;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3704,370,0 chrX 547730 . C T 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3046,309,0 chrX 547820 . C A 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=1;QD=25.98;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3203,324,0 chrX 548012 . G A 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3461,352,0 chrX 548174 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.185;DP=131;Dels=0.00;FS=8.982;HaplotypeScore=2.6301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1200,0,1459 chrX 548247 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.956;DP=124;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.845;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1380,0,1153 chrX 548463 . G A 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3060,306,0 chrX 548488 . T A 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;DP=126;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:1550,0,1061 chrX 548667 . A T 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3486,352,0 chrX 548670 . A G 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3274,360,0 chrX 549010 . T G 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.314;DP=157;Dels=0.00;FS=1.999;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.776;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.393;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,80:157:99:1525,0,1546 chrX 549542 . T C 2413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.88;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2446,276,0 chrX 550333 . T C 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.411;DP=149;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.147;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1545,0,1426 chrX 550587 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.227;DP=135;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.812;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1424,0,1320 chrX 550609 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.660;DP=135;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.083;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1400,0,1313 chrX 550632 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.754;DP=135;Dels=0.00;FS=2.173;HaplotypeScore=4.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1541,0,1242 chrX 550837 . T C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.463;DP=129;Dels=0.00;FS=7.982;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.677;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1482,0,1091 chrX 551230 . C T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.002;DP=148;Dels=0.00;FS=7.332;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.871;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1467,0,1554 chrX 551673 . G A 1998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.953;DP=182;Dels=0.00;FS=9.904;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,94:182:99:2028,0,1840 chrX 551863 . T A 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;DP=138;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1726,0,1193 chrX 552134 . G A 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3361,336,0 chrX 552241 . A G 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.790;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6861;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=26.04;ReadPosRankSum=1.426;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3542,355,0 chrX 552529 . T C 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.68;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2896,324,0 chrX 552584 . A T 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3797,391,0 chrX 552605 . A G 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3444,372,0 chrX 552851 . A G 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.982;DP=122;Dels=0.00;FS=4.555;HaplotypeScore=8.5296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.726;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,47:122:99:900,0,1625 chrX 553078 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.862;DP=91;Dels=0.00;FS=2.857;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.946;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1078,0,798 chrX 553314 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.132;DP=114;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.808;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1145,0,1228 chrX 553578 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.996;DP=120;Dels=0.00;FS=2.454;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.565;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1139,0,1348 chrX 553579 . C G 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;DP=124;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=2.7648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.328;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1164,0,1309 chrX 553911 . G T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.207;DP=134;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1218,0,1590 chrX 554464 . T C 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3475,372,0 chrX 554517 . A T 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3413,345,0 chrX 554957 . C T 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4122,412,0 chrX 554999 . C T 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3330,351,0 chrX 555054 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.271;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.978;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1384,0,1796 chrX 555162 . G A 2012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.79;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2045,213,0 chrX 555827 . G A 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.290;DP=92;Dels=0.01;FS=1.706;HaplotypeScore=4.9338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:898,0,966 chrX 556085 . G T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.055;DP=119;Dels=0.00;FS=14.650;HaplotypeScore=2.4626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1059,0,1406 chrX 556246 . A G 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.221;DP=127;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1281,0,1316 chrX 556366 . T C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.768;DP=112;Dels=0.00;FS=2.603;HaplotypeScore=3.7640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.309;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1022,0,1214 chrX 556711 . T C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.813;DP=115;Dels=0.00;FS=1.541;HaplotypeScore=6.7846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=8.35;ReadPosRankSum=2.887;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:990,0,1326 chrX 556720 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.677;DP=113;Dels=0.00;FS=3.530;HaplotypeScore=3.5479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.111;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:963,0,1236 chrX 557590 . A G 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2680,285,0 chrX 557983 . C A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.071;DP=127;Dels=0.00;FS=15.067;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.688;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1358,0,1235 chrX 558025 . A G 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.397;DP=171;Dels=0.00;FS=5.438;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=10.15;ReadPosRankSum=-2.036;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,89:171:99:1766,0,1745 chrX 558226 . T C 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.81;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3209,336,0 chrX 558314 . T C 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.57;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2820,297,0 chrX 558606 . A G 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.914;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.427;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1548,0,1582 chrX 559033 . T C 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.546;DP=122;Dels=0.00;FS=2.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.317;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1139,0,1415 chrX 559588 . A G 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.001;DP=92;Dels=0.00;FS=1.706;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.212;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:849,0,1068 chrX 559758 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.718;DP=157;Dels=0.00;FS=3.747;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.159;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,74:157:99:1522,0,1664 chrX 559813 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.921;DP=123;Dels=0.00;FS=2.406;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.534;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1275,0,1164 chrX 559883 . T C 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.939;DP=132;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.792;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1469,0,1217 chrX 559922 . A G 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.214;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.336;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1594,0,1434 chrX 559982 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.130;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1188,0,1206 chrX 560037 . T C 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2973,315,0 chrX 560078 . G A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.546;DP=119;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.046;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1133,0,1277 chrX 560244 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.566;DP=141;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=8.08;ReadPosRankSum=-2.179;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1169,0,1748 chrX 560267 . A T 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.193;DP=132;Dels=0.00;FS=4.355;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.105;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,77:132:99:1668,0,1028 chrX 560285 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.790;DP=139;Dels=0.00;FS=3.155;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1226,0,1560 chrX 560570 . C G 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.105;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.400;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1627,0,1297 chrX 560603 . T G 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.961e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3874,402,0 chrX 560616 . C A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.744;DP=131;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1484,0,1277 chrX 561055 . A G 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3037,318,0 chrX 561503 . T A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1290,0,1366 chrX 561590 . A G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.973;DP=157;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=4.8653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=8.65;ReadPosRankSum=2.039;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,73:157:99:1388,0,1816 chrX 562463 . T C 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.376;DP=132;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1392,0,1361 chrX 562628 . T C 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.645;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,83:145:99:1765,0,1259 chrX 562685 . A G 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.252;DP=145;Dels=0.00;FS=4.940;HaplotypeScore=4.6345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.226;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1535,0,1341 chrX 562775 . G A 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.673;DP=125;Dels=0.00;FS=5.542;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:125:99:1469,0,1132 chrX 562979 . T G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.517;DP=125;Dels=0.00;FS=3.240;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1200,0,1454 chrX 563075 . T C 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.477;DP=117;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.287;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:885,0,1444 chrX 563141 . T C 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.820;DP=122;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.919;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1087,0,1505 chrX 563290 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.980;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:133:99:1216,0,1508 chrX 563498 . T C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.664;DP=128;Dels=0.00;FS=3.169;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1350,0,1311 chrX 563508 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.009;DP=125;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1239,0,1372 chrX 563528 . G A 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.569;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1227,0,1234 chrX 563993 . G A 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;DP=108;Dels=0.00;FS=2.527;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.369;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.519;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1065,0,1288 chrX 564092 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.521;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1075,0,1682 chrX 564269 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.404;DP=144;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=4.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=0.358;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1371,0,1582 chrX 564290 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.561;DP=120;Dels=0.00;FS=2.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=0.130;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.088;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1075,0,1394 chrX 564333 . T G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.163;DP=119;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.285;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1153,0,1351 chrX 564368 . A C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.918;DP=124;Dels=0.00;FS=4.334;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.595;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1192,0,1376 chrX 564566 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.479;DP=108;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.823;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1150,0,1100 chrX 564773 . T C 1778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.180;DP=162;Dels=0.00;FS=2.771;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=10.98;ReadPosRankSum=2.117;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1808,0,1599 chrX 564818 . T C 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.956;DP=143;Dels=0.00;FS=3.068;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=1;MQRankSum=0.250;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1635,0,1359 chrX 565262 . T C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.822;DP=125;Dels=0.00;FS=5.917;HaplotypeScore=2.6196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=3.417;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:125:99:1375,0,1120 chrX 565364 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.656;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.672;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1184,0,1139 chrX 565373 . T C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.918;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.903;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1161,0,1133 chrX 565457 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.477;DP=108;Dels=0.00;FS=6.260;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.612;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1319,0,945 chrX 565604 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.995;DP=124;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.228;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1384,0,1146 chrX 565667 . A C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.233;DP=98;Dels=0.00;FS=3.891;HaplotypeScore=2.4804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.741;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1129,0,792 chrX 565712 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.892;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.038;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,59:93:99:1342,0,647 chrX 565724 . G A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.146;DP=94;Dels=0.00;FS=1.868;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.297;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,59:94:99:1344,0,655 chrX 566021 . T A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=122;Dels=0.00;FS=4.343;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1083,0,1486 chrX 566045 . C T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.889;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.464;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1134,0,1363 chrX 566093 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.873;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.448;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1298,0,1367 chrX 566114 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.305;DP=127;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.137;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1343,0,1245 chrX 566519 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.773;DP=119;Dels=0.00;FS=4.432;HaplotypeScore=4.6465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1198,0,1136 chrX 566594 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;DP=118;Dels=0.00;FS=2.364;HaplotypeScore=3.8916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.260;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1184,0,1197 chrX 566600 . G C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.090;DP=105;Dels=0.00;FS=1.563;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.189;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1015,0,1006 chrX 566656 . A G 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.324;DP=110;Dels=0.00;FS=1.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.736;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1127,0,1112 chrX 567062 . G A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.410;DP=149;Dels=0.00;FS=2.123;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1425,0,1521 chrX 567157 . T C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.101;DP=127;Dels=0.00;FS=3.194;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.758;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1252,0,1371 chrX 567191 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.529;DP=124;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=3.3029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.008;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1298,0,1207 chrX 567298 . C T 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.242;DP=103;Dels=0.00;FS=6.785;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:965,0,1227 chrX 567375 . C A 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.755;DP=162;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,82:162:99:1715,0,1614 chrX 567462 . A G 1830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.607;DP=155;Dels=0.00;FS=5.561;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,87:155:99:1860,0,1466 chrX 567511 . T A 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=12.82;ReadPosRankSum=1.411;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,84:146:99:1901,0,1259 chrX 567525 . A G 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.896;DP=138;Dels=0.00;FS=5.401;HaplotypeScore=2.4326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.861;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,82:138:99:1733,0,1130 chrX 568363 . G A 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3038,315,0 chrX 568539 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.166;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.985;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:908,0,897 chrX 568783 . C T 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.401;DP=137;Dels=0.00;FS=3.145;HaplotypeScore=4.8333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=1;MQRankSum=-1.127;QD=6.33;ReadPosRankSum=1.868;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:897,0,1157 chrX 568787 . T C 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.466;DP=133;Dels=0.00;FS=3.292;HaplotypeScore=3.8887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=1;MQRankSum=2.702;QD=5.92;ReadPosRankSum=1.671;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:817,0,1082 chrX 568805 . C T 2492 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.626;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=19.02;ReadPosRankSum=-1.626;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:2525,237,0 chrX 568992 . A T 2309 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.10;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2342,240,0 chrX 570422 . T C 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.805;DP=166;Dels=0.00;FS=1.229;HaplotypeScore=2.7398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.207;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,81:166:99:1704,0,1736 chrX 570512 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.116;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1477,0,1424 chrX 570648 . C G 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.547;DP=136;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=5.2507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.196;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1141,0,1216 chrX 570721 . T C 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.976;DP=164;Dels=0.00;FS=3.104;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,84:164:99:1680,0,1686 chrX 570822 . A G 1948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.3369;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.19;MQ0=0;QD=18.04;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:1981,222,0 chrX 571066 . A G 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.790;DP=159;Dels=0.00;FS=9.590;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.744;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:159:99:1471,0,1752 chrX 571276 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.620;DP=150;Dels=0.00;FS=3.029;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.227;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,62:150:99:1239,0,1875 chrX 571651 . G A 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.105;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.635;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,80:166:99:1638,0,1816 chrX 571765 . A T 1996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.816;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,94:170:99:2026,0,1413 chrX 571854 . T C 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.993;DP=148;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=5.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.889;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1411,0,1607 chrX 571909 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.492;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.273;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.127;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1518,0,1642 chrX 572041 . C T 1874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.929;DP=174;Dels=0.00;FS=13.162;HaplotypeScore=2.5433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.186;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,88:174:99:1904,0,1678 chrX 572117 . A G 1882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.343;DP=181;Dels=0.00;FS=1.152;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,94:181:99:1912,0,1827 chrX 572144 . C A 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.702;DP=170;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,83:170:99:1774,0,1698 chrX 572450 . G C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.157;DP=141;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=2.6904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.163;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1239,0,1512 chrX 572675 . A G 1864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.995;DP=168;Dels=0.00;FS=2.775;HaplotypeScore=3.7647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.466;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,93:168:99:1894,0,1545 chrX 572786 . G T 2004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.445;DP=169;Dels=0.00;FS=1.267;HaplotypeScore=8.5857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.233;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,96:169:99:2034,0,1324 chrX 572936 . C T 4804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.97;SB=-2.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4804,472,0 chrX 573283 . A G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.287;DP=176;Dels=0.00;FS=1.898;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.241;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,74:176:99:1361,0,2195 chrX 573325 . C T 2014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.078;DP=174;Dels=0.00;FS=4.421;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.933;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,97:174:99:2044,0,1411 chrX 573331 . T C 1889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.923;DP=174;Dels=0.00;FS=5.363;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.161;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,97:174:99:1919,0,1513 chrX 573386 . A G 4423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;DP=178;Dels=0.00;FS=3.366;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=24.85;ReadPosRankSum=0.681;SB=-2.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,177:178:99:4423,449,0 chrX 573581 . T C 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.854;DP=175;Dels=0.00;FS=0.556;HaplotypeScore=4.7985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,89:175:99:1777,0,1864 chrX 573598 . G A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.794;DP=170;Dels=0.00;FS=5.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,82:170:99:1717,0,1774 chrX 574034 . C G 4374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4374,477,0 chrX 574073 . C T 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;DP=145;Dels=0.00;FS=3.894;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1491,0,1531 chrX 574091 . T C 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.363;DP=153;Dels=0.00;FS=2.849;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.597;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1579,0,1613 chrX 574115 . G A 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.751;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,82:147:99:1779,0,1279 chrX 574232 . G A 1983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.798;DP=162;Dels=0.00;FS=0.582;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.909;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.815;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:162:99:2013,0,1369 chrX 574262 . A G 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.795;DP=162;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:162:99:1851,0,1422 chrX 574310 . G A 1983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.547;DP=160;Dels=0.00;FS=4.068;HaplotypeScore=6.0468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.069;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,91:160:99:2013,0,1221 chrX 574412 . C T 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.697;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=1.407;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.329;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,83:170:99:1766,0,1576 chrX 574529 . G A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.580;DP=170;Dels=0.00;FS=0.565;HaplotypeScore=5.4153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.408;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,81:170:99:1658,0,1698 chrX 574799 . T C 4187.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4187,450,0 chrX 575206 . G A 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.055;DP=106;Dels=0.00;FS=13.624;HaplotypeScore=8.0400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.048;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:106:99:982,0,990 chrX 575549 . G A 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.914;DP=104;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:897,0,1254 chrX 575801 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.980;DP=156;Dels=0.00;FS=4.972;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.250;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1430,0,1872 chrX 575876 . C T 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3866,388,0 chrX 576155 . T C 4311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=26.61;ReadPosRankSum=0.941;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4311,459,0 chrX 576182 . G A 4008.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4008,409,0 chrX 576323 . G A 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3143,315,0 chrX 576604 . C T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.895;DP=159;Dels=0.00;FS=3.672;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1486,0,1655 chrX 577387 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.567;DP=138;Dels=0.00;FS=10.727;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1303,0,1484 chrX 577732 . G A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.464;DP=139;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=3.6901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.175;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1448,0,1448 chrX 577996 . G A 1751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.961;DP=179;Dels=0.00;FS=7.448;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.740;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,85:179:99:1781,0,1822 chrX 578056 . G A 3895.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3895,385,0 chrX 578278 . G A 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3874,388,0 chrX 578407 . G C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;DP=153;Dels=0.00;FS=9.930;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,62:153:99:1238,0,1890 chrX 578426 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.874;DP=150;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,61:150:99:1264,0,1844 chrX 578455 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.598;DP=158;Dels=0.00;FS=5.871;HaplotypeScore=2.6940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,66:158:99:1320,0,2006 chrX 578703 . T A 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.647;DP=145;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.387;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1632,0,1430 chrX 578943 . C T 2031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.414;DP=156;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=5.3498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.994;QD=13.02;ReadPosRankSum=-1.596;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,93:156:99:2061,0,1268 chrX 579112 . A G 1768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.858;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=10.40;ReadPosRankSum=-2.178;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:170:99:1798,0,1583 chrX 579361 . A T 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.033;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8266;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=26.46;ReadPosRankSum=1.065;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2917,291,0 chrX 579663 . G A 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3829,396,0 chrX 579671 . G A 4473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4473,463,0 chrX 579750 . C T 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.442;DP=163;Dels=0.00;FS=5.082;HaplotypeScore=3.2327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.260;QD=9.42;ReadPosRankSum=2.284;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,77:163:99:1566,0,1794 chrX 579947 . G A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.275;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.309;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1423,0,1204 chrX 580075 . A C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.830;DP=177;Dels=0.00;FS=2.658;HaplotypeScore=2.8212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.314;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,82:177:99:1465,0,2101 chrX 580104 . T C 4265.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4265,441,0 chrX 580119 . T C 4133.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4133,420,0 chrX 580312 . T C 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.16;MQ0=0;QD=20.30;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:2794,327,0 chrX 580576 . A G 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2904,324,0 chrX 580624 . A G 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.932;DP=113;Dels=0.00;FS=10.849;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.272;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:981,0,1340 chrX 580666 . T A 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3338,340,0 chrX 580696 . G A 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3166,318,0 chrX 580702 . G T 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3071,312,0 chrX 581065 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.031;DP=119;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1082,0,1339 chrX 581086 . T C 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8211;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3338,357,0 chrX 581101 . A G 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2709,282,0 chrX 581278 . A C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.180;DP=106;Dels=0.00;FS=2.527;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.736;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,60:106:99:1134,0,956 chrX 581323 . C G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;DP=95;Dels=0.00;FS=8.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.878;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,59:95:99:1295,0,647 chrX 581428 . A C 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3053,321,0 chrX 581494 . G A 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3195,336,0 chrX 581638 . G C 2372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.71;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2405,255,0 chrX 581739 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1073,0,806 chrX 581835 . T C 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.93;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3548,360,0 chrX 581933 . C T 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3203,321,0 chrX 582214 . T C 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;DP=113;Dels=0.00;FS=2.688;HaplotypeScore=4.9610;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.751;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,111:113:99:2679,266,0 chrX 582306 . T A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.943;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1170,0,1298 chrX 582359 . A G 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3071,327,0 chrX 582415 . G A 2682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=77.3207;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.65;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2715,282,0 chrX 582462 . A T 2127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=22.39;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2160,213,0 chrX 582558 . G A 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.57;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=25.82;ReadPosRankSum=-1.499;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3106,296,0 chrX 582597 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.541;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.888;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1349,0,1446 chrX 582722 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.439;DP=127;Dels=0.00;FS=3.287;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1343,0,1257 chrX 582788 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.719;DP=122;Dels=0.00;FS=3.786;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.393;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1330,0,1134 chrX 582845 . G T 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3043,309,0 chrX 583178 . A C 2386 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2419,252,0 chrX 583223 . C T 2233 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2266,234,0 chrX 583236 . C T 2374 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2407,246,0 chrX 583424 . C A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.846;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1360,0,1184 chrX 583447 . G A 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3437,345,0 chrX 583742 . G A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.055;DP=124;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=0.231;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.719;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1172,0,1397 chrX 584062 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.601;DP=117;Dels=0.00;FS=8.537;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.721;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1279,0,1059 chrX 584125 . G A 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3067,315,0 chrX 584131 . T C 2640 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2673,297,0 chrX 584209 . G A 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3252,330,0 chrX 584485 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.486;DP=119;Dels=0.00;FS=4.639;HaplotypeScore=2.3617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.353;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1293,0,1183 chrX 584584 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.200;DP=137;Dels=0.00;FS=2.219;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=9.72;ReadPosRankSum=-2.225;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1362,0,1430 chrX 584590 . C G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.290;DP=134;Dels=0.00;FS=3.159;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=10.01;ReadPosRankSum=-2.569;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1371,0,1322 chrX 584641 . A G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.103;DP=118;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=4.7577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.921;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1348,0,1106 chrX 584647 . T C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.807;DP=115;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.222;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:988,0,1345 chrX 584668 . G A 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.000;DP=123;Dels=0.00;FS=3.294;HaplotypeScore=2.0641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.450;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1447,0,970 chrX 584922 . G A 612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.972;DP=95;Dels=0.00;FS=10.604;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.871;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,36:95:99:642,0,1313 chrX 584992 . C T 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.675;DP=135;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:135:99:1146,0,1492 chrX 585612 . A G 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.171;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.101;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1352,0,1311 chrX 585618 . G A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.943;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1416,0,1108 chrX 585641 . A G 1164.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.487;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.132;QD=10.12;ReadPosRankSum=2.336;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:115:99:1194,0,1052 chrX 585642 . A G 1171.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.406;DP=119;Dels=0.00;FS=1.523;HaplotypeScore=3.8142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.564;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1201,0,1047 chrX 585643 . A G 1126.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.430;DP=119;Dels=0.00;FS=2.409;HaplotypeScore=3.8142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.417;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.726;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1156,0,1030 chrX 585779 . A G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.878;DP=114;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1215,0,1089 chrX 585794 . T C 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.997;DP=114;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=3.4839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=9.89;ReadPosRankSum=-2.321;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:114:99:1158,0,959 chrX 585858 . A G 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.469;DP=109;Dels=0.00;FS=6.251;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.835;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,41:109:99:775,0,1447 chrX 585883 . C T 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.509;DP=133;Dels=0.00;FS=5.462;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.618;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,51:133:99:962,0,1738 chrX 585923 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.229;DP=118;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.711;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1654,0,845 chrX 585937 . T G 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.657;DP=127;Dels=0.00;FS=4.465;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.282;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,80:127:99:1745,0,888 chrX 586163 . A G 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.214;DP=114;Dels=0.00;FS=14.300;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.068;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1003,0,1355 chrX 586561 . C A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.340;DP=116;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1245,0,1182 chrX 586627 . G A 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;DP=106;Dels=0.00;FS=5.617;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.987;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:976,0,1183 chrX 586715 . G A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.137;DP=139;Dels=0.00;FS=6.782;HaplotypeScore=3.4689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=11.36;ReadPosRankSum=2.147;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1609,0,1218 chrX 586827 . A G 4067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;DP=165;Dels=0.00;FS=6.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.270;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:4067,450,0 chrX 586915 . T C 726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.667;DP=87;Dels=0.00;FS=7.117;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.524;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:87:99:756,0,988 chrX 586932 . C T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.186;DP=97;Dels=0.00;FS=11.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1059,0,964 chrX 586948 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.417;DP=99;Dels=0.00;FS=11.477;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.179;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1100,0,986 chrX 586966 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.271;DP=115;Dels=0.00;FS=12.037;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.109;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1260,0,1155 chrX 587243 . G C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;DP=108;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1155,0,1023 chrX 587254 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.642;DP=101;Dels=0.00;FS=2.601;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1141,0,902 chrX 587344 . A G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.203;DP=117;Dels=0.00;FS=5.873;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1113,0,1384 chrX 587392 . C G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.185;DP=138;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=2.7881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.092;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1366,0,1387 chrX 587401 . T C 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.426;DP=133;Dels=0.00;FS=5.293;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1409,0,1338 chrX 587423 . T C 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.631;DP=126;Dels=0.00;FS=5.664;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.681;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:944,0,1554 chrX 587511 . G T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.405;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.873;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1370,0,1447 chrX 587592 . A G 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2933,303,0 chrX 587671 . G T 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3785,376,0 chrX 587808 . G C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.291;DP=154;Dels=0.00;FS=1.325;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.385;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,67:154:99:1335,0,1837 chrX 587843 . T C 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3679,375,0 chrX 588162 . G C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.084;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.938;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1171,0,1342 chrX 588360 . T C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.448;DP=140;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.352;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1443,0,1376 chrX 588782 . T C 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.59;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3270,342,0 chrX 588829 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.105;DP=113;Dels=0.00;FS=2.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1247,0,1148 chrX 588893 . G A 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:104:99:2723,270,0 chrX 589113 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.555;DP=156;Dels=0.00;FS=2.073;HaplotypeScore=3.8687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=-1.501;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.274;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1423,0,1781 chrX 589176 . G A 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.994;DP=135;Dels=0.00;FS=5.414;HaplotypeScore=2.7586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.802;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,79:135:99:1757,0,1069 chrX 589204 . G A 2171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.611;DP=171;Dels=0.00;FS=6.955;HaplotypeScore=6.9169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.717;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,98:171:99:2201,0,1377 chrX 589267 . T G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=118;Dels=0.00;FS=18.004;HaplotypeScore=4.9328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.063;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1184,0,1270 chrX 589418 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;DP=103;Dels=0.00;FS=4.861;HaplotypeScore=1.9301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1090,0,1097 chrX 589497 . A G 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;DP=103;Dels=0.00;FS=2.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:889,0,1295 chrX 589577 . C T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.413;DP=90;Dels=0.00;FS=5.673;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:928,0,878 chrX 589790 . T C 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.459;DP=90;Dels=0.00;FS=5.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:893,0,947 chrX 589825 . T A 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=96;Dels=0.00;FS=1.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:970,0,1106 chrX 589855 . G A 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2482,252,0 chrX 589903 . T C 2172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=24.13;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:90:99:2205,237,0 chrX 589961 . G A 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.959;DP=112;Dels=0.00;FS=7.374;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:907,0,1385 chrX 589982 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.413;DP=103;Dels=0.00;FS=3.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1337,0,806 chrX 590030 . A G 2873 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2906,312,0 chrX 590069 . T C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.554;DP=96;Dels=0.00;FS=1.705;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.999;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:914,0,1172 chrX 590085 . C G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;DP=101;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1015,0,932 chrX 590113 . T G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.977;DP=109;Dels=0.00;FS=1.697;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:968,0,1280 chrX 590218 . A G 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.272;DP=103;Dels=0.00;FS=2.563;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:933,0,1174 chrX 590241 . A G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.075;DP=106;Dels=0.00;FS=9.301;HaplotypeScore=2.7051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.093;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.003;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:106:99:1012,0,1192 chrX 590592 . T A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.497;DP=116;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.567;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1359,0,1008 chrX 590713 . G A 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3518,366,0 chrX 590923 . A G 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.493;DP=113;Dels=0.00;FS=7.839;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.065;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,45:113:99:820,0,1513 chrX 590949 . C T 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.246;DP=119;Dels=0.00;FS=4.486;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.033;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1113,0,1333 chrX 591544 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.495;DP=118;Dels=0.00;FS=1.645;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1055,0,1406 chrX 591553 . A G 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.493;DP=114;Dels=0.00;FS=8.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:936,0,1455 chrX 591944 . A G 2076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2109,225,0 chrX 591972 . A G 2461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2494,264,0 chrX 592363 . A G 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3235,342,0 chrX 592394 . G A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.335;DP=116;Dels=0.00;FS=3.446;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:116:99:1194,0,1066 chrX 592549 . A T 2554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2587,258,0 chrX 592687 . C T 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3338,337,0 chrX 592732 . A G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.068;DP=100;Dels=0.00;FS=11.238;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.124;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1012,0,1110 chrX 592918 . G C 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.54;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2769,303,0 chrX 593029 . C T 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.564;DP=140;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1693,0,1008 chrX 593074 . T C 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.72;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2919,306,0 chrX 593414 . C G 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;DP=113;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=0.582;QD=7.45;ReadPosRankSum=2.148;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,45:113:99:872,0,1395 chrX 593947 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.795;DP=109;Dels=0.00;FS=10.739;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.387;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1222,0,1020 chrX 593953 . C T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.143;DP=112;Dels=0.00;FS=18.276;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1090,0,1279 chrX 594047 . G T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.685;DP=129;Dels=0.00;FS=2.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.272;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1320,0,1181 chrX 594204 . T C 58.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;DP=99;Dels=0.00;FS=11.616;HaplotypeScore=121.9888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.49;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=0.59;ReadPosRankSum=-4.035;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,9:99:88:88,0,724 chrX 594207 . T C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.733;DP=97;Dels=0.00;FS=16.574;HaplotypeScore=87.2809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=0.12;ReadPosRankSum=-3.557;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,6:97:41:41,0,731 chrX 594216 . T C 156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.594;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:186,0,320 chrX 594711 . T C 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.356;DP=130;Dels=0.00;FS=0.796;HaplotypeScore=3.6408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,46:130:99:845,0,1900 chrX 594733 . A G 635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.389;DP=115;Dels=0.00;FS=5.385;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,39:115:99:665,0,1776 chrX 595037 . G A 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3219,322,0 chrX 595041 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.427;DP=125;Dels=0.00;FS=9.559;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:125:99:1167,0,1291 chrX 595640 . G C 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.676;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=24.82;ReadPosRankSum=-1.397;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3111,330,0 chrX 595662 . A G 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.106;DP=129;Dels=0.00;FS=2.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.747;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:1655,0,1022 chrX 595868 . C T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;DP=113;Dels=0.00;FS=3.486;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.101;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.020;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1252,0,959 chrX 595994 . T C 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3665,384,0 chrX 596003 . A C 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3489,369,0 chrX 596318 . C T 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3831,382,0 chrX 596360 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.807;DP=131;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=3.1930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.684;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1400,0,1257 chrX 596468 . G C 2552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2585,282,0 chrX 596612 . T C 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.320;DP=74;Dels=0.00;FS=6.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=9.74;ReadPosRankSum=-2.049;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:751,0,742 chrX 596669 . G A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.817;DP=123;Dels=0.00;FS=4.515;HaplotypeScore=3.8729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.257;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1287,0,1197 chrX 596838 . C T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.648;DP=109;Dels=0.00;FS=11.921;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=2.281;QD=10.96;ReadPosRankSum=2.360;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1225,0,973 chrX 596894 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.492;DP=130;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=2.9346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1220,0,1275 chrX 597290 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.255;DP=157;Dels=0.00;FS=9.546;HaplotypeScore=3.6408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1496,0,1684 chrX 597293 . A G 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.693;DP=156;Dels=0.00;FS=5.836;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.418;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1639,0,1509 chrX 597461 . A G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.636;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.615;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:147:99:1323,0,1581 chrX 597633 . G C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1136,0,1254 chrX 597659 . G A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.356;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.891;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1502,0,1291 chrX 597944 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.080;DP=148;Dels=0.00;FS=19.316;HaplotypeScore=2.7783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.723;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:148:99:1535,0,1425 chrX 598115 . T C 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.892;DP=155;Dels=0.00;FS=9.635;HaplotypeScore=4.5814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.460;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1582,0,1485 chrX 598202 . T C 4047.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.991e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4047,420,0 chrX 598360 . T A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.900;DP=156;Dels=0.00;FS=2.833;HaplotypeScore=3.7136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.972;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,71:156:99:1380,0,1878 chrX 598412 . T G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.872;DP=153;Dels=0.00;FS=2.101;HaplotypeScore=2.5922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.676;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,66:153:99:1279,0,1963 chrX 598472 . A C 4251.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4251,438,0 chrX 598877 . A G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.170;DP=153;Dels=0.00;FS=5.914;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1418,0,1738 chrX 599070 . G A 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.053;DP=128;Dels=0.00;FS=8.402;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=2;MQRankSum=-0.179;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1558,0,1080 chrX 599340 . C T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.386;DP=151;Dels=0.00;FS=14.999;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.509;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1634,0,1481 chrX 599394 . T C 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.721;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.853;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,90:178:99:1767,0,1936 chrX 599916 . A C 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.157;DP=166;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.696;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,86:166:99:1713,0,1718 chrX 600173 . T C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.103;DP=133;Dels=0.00;FS=15.360;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.773;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1565,0,1269 chrX 600241 . C T 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.562;DP=143;Dels=0.00;FS=3.962;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.784;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1722,0,1352 chrX 600288 . A T 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.044;DP=159;Dels=0.00;FS=19.538;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1699,0,1621 chrX 600396 . A C 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.160;DP=111;Dels=0.00;FS=10.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=9.64;ReadPosRankSum=-2.813;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1100,0,1240 chrX 600487 . C T 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.250;DP=107;Dels=0.00;FS=7.570;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1129,0,927 chrX 600589 . T C 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.114;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.375;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1634,0,1304 chrX 600714 . T G 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.228;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.204;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1317,0,1784 chrX 600970 . A G 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3867,426,0 chrX 601098 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.812;DP=125;Dels=0.00;FS=6.763;HaplotypeScore=3.6863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1328,0,1251 chrX 601100 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.452;DP=123;Dels=0.00;FS=8.264;HaplotypeScore=2.6996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.555;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1257,0,1335 chrX 601587 . C T 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.122;DP=159;Dels=0.00;FS=2.917;HaplotypeScore=3.7065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=0.715;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1740,0,1448 chrX 602432 . A G 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.670;DP=148;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.200;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,60:148:99:1052,0,1951 chrX 602469 . C T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.816;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.344;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1105,0,1332 chrX 602644 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.077;DP=109;Dels=0.00;FS=3.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=2.600;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.356;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1274,0,997 chrX 602831 . G A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.534;DP=118;Dels=0.00;FS=8.524;HaplotypeScore=5.6296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.248;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:118:99:1191,0,1199 chrX 602940 . T C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=2.352;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.244;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:105:99:964,0,1133 chrX 603039 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.685;DP=125;Dels=0.00;FS=4.330;HaplotypeScore=6.4578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=-1.007;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.247;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1237,0,1321 chrX 603092 . G A 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.131;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=1;MQRankSum=0.751;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.252;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1241,0,1309 chrX 603257 . T C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.912;DP=109;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1084,0,1114 chrX 603329 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.454;DP=115;Dels=0.00;FS=4.599;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1272,0,1112 chrX 603693 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.400;DP=124;Dels=0.01;FS=9.885;HaplotypeScore=12.3868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=8.83;ReadPosRankSum=-2.193;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1125,0,1267 chrX 603769 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.661;DP=174;Dels=0.00;FS=0.567;HaplotypeScore=2.5922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.464;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.168;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,73:174:99:1514,0,2026 chrX 604040 . G A 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.616;DP=127;Dels=0.00;FS=5.467;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1208,0,1333 chrX 604069 . C T 1166.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.962;DP=125;Dels=0.00;FS=6.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.287;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1196,0,1240 chrX 604070 . C T 1142.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.097;DP=125;Dels=0.00;FS=6.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=2.067;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.247;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1172,0,1293 chrX 604072 . T C 1173.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.808;DP=127;Dels=0.00;FS=8.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.775;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1203,0,1344 chrX 604111 . T G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.469;DP=119;Dels=0.00;FS=7.055;HaplotypeScore=2.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.889;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1085,0,1312 chrX 604156 . G A 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.188;DP=118;Dels=0.00;FS=4.493;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.278;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1056,0,1323 chrX 604368 . C T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.465;DP=133;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=6.4545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.638;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1553,0,1055 chrX 604715 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.718;DP=130;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.445;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1336,0,1409 chrX 604788 . G T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.731;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.956;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:113:99:1148,0,1218 chrX 604929 . G A 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.557;DP=112;Dels=0.00;FS=4.688;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:112:99:993,0,1365 chrX 605076 . G A 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3581,360,0 chrX 605082 . A G 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3329,354,0 chrX 605173 . C T 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4799;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2583,270,0 chrX 605419 . T C 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.338;DP=102;Dels=0.00;FS=1.585;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:893,0,1229 chrX 605547 . G A 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2939,306,0 chrX 605963 . A T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.243;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1462,0,1252 chrX 606285 . C A 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3435,357,0 chrX 606300 . T A 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2680,273,0 chrX 606367 . T C 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2850,306,0 chrX 606382 . C A 2421 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.27;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2454,264,0 chrX 606409 . C G 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.95;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2657,285,0 chrX 606410 . G A 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.98;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2717,282,0 chrX 606423 . T C 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.36;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2623,276,0 chrX 606479 . A G 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=24.32;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2927,321,0 chrX 606498 . A C 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=24.09;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3300,345,0 chrX 606575 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.203;DP=149;Dels=0.00;FS=6.045;HaplotypeScore=3.6151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.276;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1303,0,1654 chrX 606584 . G A 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.61;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3314,348,0 chrX 606602 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.384;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1263,0,1192 chrX 606614 . T G 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.31;MQ0=0;QD=23.67;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2874,315,0 chrX 606726 . T C 2328 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.65;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2361,261,0 chrX 606755 . C T 724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.859;DP=81;Dels=0.00;FS=0.836;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.30;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.158;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:754,0,736 chrX 606777 . C G 1679 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.47;MQ0=0;QD=20.99;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1712,198,0 chrX 606787 . T A 1131 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.70;MQ0=0;QD=17.95;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1164,144,0 chrX 606788 . C A 976 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.70;MQ0=0;QD=15.49;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1009,131,0 chrX 606789 . C A 837 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.70;MQ0=0;QD=13.29;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:870,114,0 chrX 606791 . C T 535 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.29;MQ0=0;QD=6.22;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:75:568,75,0 chrX 606792 . T C 530 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.67;MQ0=0;QD=6.09;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:75:563,75,0 chrX 606841 . T C 2311 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.92;MQ0=0;QD=22.01;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2344,258,0 chrX 606964 . A T 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3377,330,0 chrX 606979 . G A 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=24.55;SB=-2.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3904,382,0 chrX 607047 . T C 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.87;MQ0=0;QD=22.82;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3091,342,0 chrX 607188 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.745;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.286;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1261,0,1156 chrX 607230 . C T 2402 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.44;MQ0=0;QD=25.83;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2435,246,0 chrX 607232 . C T 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;DP=90;Dels=0.00;FS=1.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.033;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,38:90:99:751,0,1156 chrX 607262 . T C 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2602,264,0 chrX 607298 . G A 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2627,264,0 chrX 607312 . T A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.193;DP=96;Dels=0.00;FS=5.125;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.466;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:1018,0,949 chrX 607361 . C T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.671;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:1061,0,885 chrX 607387 . C T 2173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=81;Dels=0.00;FS=3.287;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=26.83;ReadPosRankSum=1.689;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:81:99:2206,231,0 chrX 607391 . G A 2177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2210,231,0 chrX 607434 . A T 2284 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;QD=25.10;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2317,240,0 chrX 607442 . T C 1993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.88;MQ0=0;QD=25.55;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2026,213,0 chrX 607458 . G T 1995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.60;MQ0=0;QD=24.04;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2028,210,0 chrX 607508 . G A 2159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:84:99:2192,225,0 chrX 607523 . G T 2309 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.63;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2342,234,0 chrX 607528 . C A 646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.046;DP=90;Dels=0.00;FS=5.421;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=2.211;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.655;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:676,0,1132 chrX 607590 . A G 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.425;DP=106;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.957;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1096,0,1070 chrX 607636 . G A 2423 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2456,243,0 chrX 607672 . T C 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2493,255,0 chrX 607746 . A G 2584 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2617,276,0 chrX 607750 . C T 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2760,273,0 chrX 607764 . T C 413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.685;DP=84;Dels=0.00;FS=0.885;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.308;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,28:84:99:443,0,1244 chrX 607806 . C T 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.65;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2622,273,0 chrX 607808 . T C 2418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.72;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2451,276,0 chrX 607843 . A G 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=88.8269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=23.26;ReadPosRankSum=0.820;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2708,269,0 chrX 607948 . T C 660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.275;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.372;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,39:118:99:690,0,1728 chrX 607975 . T C 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2994,315,0 chrX 608011 . T A 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.33;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3140,336,0 chrX 608091 . C T 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.114;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=23.12;ReadPosRankSum=1.701;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2623,237,0 chrX 608120 . A G 1828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.75;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1861,201,0 chrX 608157 . C T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.492;DP=105;Dels=0.00;FS=15.025;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.298;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1079,0,896 chrX 608181 . A C 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=21.48;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3062,321,0 chrX 608184 . A T 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=22.45;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3131,315,0 chrX 608299 . A G 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3761,414,0 chrX 608323 . G A 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4003,415,0 chrX 608495 . C T 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3547,372,0 chrX 608521 . G A 4365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4365,439,0 chrX 608870 . T A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.698;DP=138;Dels=0.00;FS=3.091;HaplotypeScore=5.9486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.664;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1296,0,1570 chrX 608960 . A G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.860;DP=131;Dels=0.00;FS=2.315;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=-0.778;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.388;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1287,0,1411 chrX 609410 . C G 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2913,309,0 chrX 609498 . G T 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2857,288,0 chrX 609835 . T A 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.134;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1576,0,1238 chrX 610270 . C T 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.60;SB=-2.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4045,409,0 chrX 610306 . T C 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.286;DP=160;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=4.6037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=2.469;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1595,0,1717 chrX 610450 . T G 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3081,306,0 chrX 610784 . G A 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2706,273,0 chrX 610792 . C A 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2651,270,0 chrX 610951 . T C 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3230,342,0 chrX 610977 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.490;DP=123;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.897;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1207,0,1267 chrX 611160 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.370;DP=109;Dels=0.00;FS=17.980;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:109:99:1206,0,1037 chrX 611484 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.987;DP=123;Dels=0.00;FS=22.346;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1326,0,1185 chrX 611514 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.748;DP=123;Dels=0.00;FS=13.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.342;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1263,0,1267 chrX 611869 . G A 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.282;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1592,0,1548 chrX 612134 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.628;DP=117;Dels=0.00;FS=9.889;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.348;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.126;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1368,0,1183 chrX 612176 . A G 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.636;DP=87;Dels=0.00;FS=3.074;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.048;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:87:99:892,0,922 chrX 612199 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.607;DP=117;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1169,0,1227 chrX 612210 . A C 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.407;DP=111;Dels=0.00;FS=6.057;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.035;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1074,0,1222 chrX 612277 . C G 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.783;DP=123;Dels=0.00;FS=7.921;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.438;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1127,0,1199 chrX 612442 . C T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.388;DP=108;Dels=0.00;FS=2.496;HaplotypeScore=7.7289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.508;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1079,0,1086 chrX 612976 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.136;DP=113;Dels=0.00;FS=2.432;HaplotypeScore=2.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1193,0,1191 chrX 613133 . T C 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.770;DP=79;Dels=0.00;FS=3.081;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.784;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:622,0,1031 chrX 613234 . G A 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.353;DP=120;Dels=0.00;FS=5.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.053;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1567,0,959 chrX 613441 . T C 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.311;DP=157;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.954;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1485,0,1807 chrX 613470 . C T 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.248;DP=158;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=10.13;ReadPosRankSum=2.754;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1630,0,1735 chrX 613673 . G C 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1552,0,1447 chrX 613939 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.432;DP=133;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.922;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.297;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1167,0,1564 chrX 613959 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.348;DP=153;Dels=0.00;FS=4.267;HaplotypeScore=6.8145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.781;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1303,0,1820 chrX 614002 . G A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.467;DP=156;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=3.1496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=10.81;ReadPosRankSum=-2.086;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1717,0,1472 chrX 614058 . A G 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.404;DP=125;Dels=0.00;FS=4.343;HaplotypeScore=2.5233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=0.414;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.217;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1460,0,1127 chrX 614199 . A G 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;DP=130;Dels=0.00;FS=6.225;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=11.15;ReadPosRankSum=-2.160;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1480,0,1311 chrX 614575 . T C 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;DP=119;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=2.428;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.767;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1174,0,1387 chrX 614663 . T C 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.601;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.603;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:955,0,1525 chrX 614716 . A T 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.956;DP=111;Dels=0.00;FS=6.397;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.087;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.553;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:930,0,1351 chrX 614889 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.174;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1330,0,1256 chrX 615089 . T A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.515;DP=132;Dels=0.00;FS=12.878;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1332,0,1459 chrX 615106 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.543;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1178,0,1396 chrX 615149 . G C 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;DP=133;Dels=0.00;FS=2.415;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,51:133:99:994,0,1715 chrX 615169 . C G 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.139;DP=134;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.744;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,54:134:99:999,0,1749 chrX 615233 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.339;DP=115;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.859;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.150;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:1001,0,1428 chrX 615340 . A C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;DP=116;Dels=0.01;FS=5.857;HaplotypeScore=3.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.842;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1356,0,1024 chrX 615401 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.568;DP=109;Dels=0.00;FS=11.435;HaplotypeScore=3.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:109:99:1096,0,1175 chrX 615716 . C T 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.604;DP=88;Dels=0.00;FS=1.762;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.287;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,37:88:99:753,0,1148 chrX 615743 . G A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.810;DP=118;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.292;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1230,0,1206 chrX 615792 . A G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.657;DP=113;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1295,0,1065 chrX 616115 . G A 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.569;DP=116;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.393;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:943,0,1347 chrX 616200 . G C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.337;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1164,0,981 chrX 616756 . C T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.519;DP=150;Dels=0.00;FS=5.999;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.052;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1310,0,1682 chrX 617338 . G T 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.036;DP=105;Dels=0.00;FS=6.816;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.792;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1206,0,957 chrX 617649 . T C 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.763;DP=112;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.379;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,68:112:99:1412,0,907 chrX 617775 . T A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=133;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1470,0,1414 chrX 617869 . T G 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.706;DP=136;Dels=0.00;FS=2.224;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=9.35;ReadPosRankSum=-3.158;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1301,0,1463 chrX 617897 . T A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;DP=126;Dels=0.00;FS=4.423;HaplotypeScore=3.4531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.075;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,50:126:99:1031,0,1735 chrX 617903 . C T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.368;DP=124;Dels=0.00;FS=4.451;HaplotypeScore=2.4905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.548;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,51:124:99:1072,0,1602 chrX 618088 . T A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=9.33;ReadPosRankSum=-2.128;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1178,0,1251 chrX 618157 . A G 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.899;DP=135;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=3.076;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1239,0,1570 chrX 618202 . T A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;DP=135;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.633;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1182,0,1607 chrX 618545 . C T 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.050;DP=138;Dels=0.00;FS=17.015;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.142;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,84:138:99:1851,0,1051 chrX 618797 . G A 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.445;DP=145;Dels=0.00;FS=7.431;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=1;MQRankSum=1.798;QD=11.43;ReadPosRankSum=-3.001;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1688,0,1290 chrX 619831 . G A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.251;DP=135;Dels=0.00;FS=2.849;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.244;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.244;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1412,0,1473 chrX 619871 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.171;DP=102;Dels=0.00;FS=1.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=4.019;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.730;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1101,0,996 chrX 619975 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.854;DP=138;Dels=0.00;FS=2.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.030;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1226,0,1617 chrX 620010 . C G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.417;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.394;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1337,0,1356 chrX 620054 . T C 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.049;DP=107;Dels=0.00;FS=1.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.383;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.424;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:775,0,1448 chrX 620064 . T C 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;DP=101;Dels=0.00;FS=8.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.380;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.914;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:785,0,1225 chrX 620255 . T A 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;QD=27.01;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2896,300,0 chrX 620284 . G A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.948;DP=136;Dels=0.00;FS=24.198;HaplotypeScore=2.0234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.505;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.344;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1018,0,1426 chrX 620362 . T C 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.935;DP=136;Dels=0.00;FS=3.048;HaplotypeScore=4.2850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.490;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.849;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:870,0,1408 chrX 620371 . T C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.881;DP=135;Dels=0.00;FS=6.562;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=7.21;ReadPosRankSum=2.327;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1003,0,1461 chrX 620583 . T C 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.598;DP=106;Dels=0.00;FS=7.094;HaplotypeScore=10.4135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=2.321;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.759;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1077,0,925 chrX 621701 . G T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.860;DP=127;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1347,0,1182 chrX 621779 . A G 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.989;DP=121;Dels=0.00;FS=10.019;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.586;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1052,0,1386 chrX 621875 . T G 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.340;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.243;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1193,0,1318 chrX 622079 . C T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.385;DP=163;Dels=0.00;FS=6.761;HaplotypeScore=3.3898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,79:163:99:1544,0,1717 chrX 622163 . A G 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.294;DP=155;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.335;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1502,0,1550 chrX 622386 . C T 4123.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:4123,427,0 chrX 622424 . A G 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.885;DP=151;Dels=0.00;FS=6.790;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1542,0,1446 chrX 622445 . A T 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;DP=154;Dels=0.00;FS=2.943;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.439;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1691,0,1566 chrX 622463 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.436;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.305;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1239,0,1410 chrX 622592 . G A 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.771;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1782,0,1346 chrX 622799 . A G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.380;DP=165;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1532,0,1677 chrX 622874 . G A 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.083;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.862;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,76:130:99:1647,0,1044 chrX 622910 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.973;DP=128;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1499,0,1109 chrX 623040 . T C 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.133;DP=154;Dels=0.00;FS=12.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=2.084;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.076;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1318,0,1802 chrX 623184 . C G 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3696,405,0 chrX 623186 . C T 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3701,375,0 chrX 623311 . C T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.350;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.146;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1342,0,1302 chrX 623447 . G T 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.978;DP=165;Dels=0.00;FS=2.875;HaplotypeScore=8.8838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,93:165:99:1918,0,1461 chrX 623546 . A T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;DP=152;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1535,0,1702 chrX 623827 . G A 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.225;DP=135;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=6.4042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.020;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:135:99:1527,0,1273 chrX 623961 . C T 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.824;DP=158;Dels=0.00;FS=0.587;HaplotypeScore=3.6633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.883;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1732,0,1486 chrX 624069 . T C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.799;DP=153;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=3.7196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=9.40;ReadPosRankSum=-2.016;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1468,0,1577 chrX 624389 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=154;Dels=0.00;FS=5.946;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1412,0,1706 chrX 624405 . T C 3750.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.15;SB=-2.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3750,393,0 chrX 624474 . C T 4375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.86;SB=-2.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4375,451,0 chrX 624658 . T C 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.703;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=11.91;ReadPosRankSum=-2.104;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,78:134:99:1626,0,1140 chrX 624670 . A G 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.193;DP=106;Dels=0.00;FS=3.535;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.250;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:982,0,1215 chrX 624789 . T G 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.827;DP=176;Dels=0.00;FS=1.189;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,93:176:99:1722,0,1779 chrX 624801 . A G 4293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=23.98;SB=-2.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4293,465,0 chrX 624837 . T C 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.139;DP=185;Dels=0.00;FS=0.537;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.188;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,86:185:99:1668,0,2097 chrX 625035 . C T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.171;DP=148;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=2.6464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.622;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1590,0,1491 chrX 625116 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.817;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.943;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1482,0,1155 chrX 625188 . T C 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3237,363,0 chrX 625191 . G A 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3316,342,0 chrX 625578 . T A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.697;DP=141;Dels=0.00;FS=11.995;HaplotypeScore=4.7769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.744;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1717,0,1361 chrX 625737 . C G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.322;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.521;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1241,0,1129 chrX 625757 . A G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.149;DP=127;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=4.5443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.391;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1341,0,1261 chrX 625794 . G A 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.925;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.089;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1551,0,1350 chrX 625994 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.593;DP=126;Dels=0.00;FS=4.446;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1231,0,1395 chrX 626304 . T C 3506.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3506,369,0 chrX 626305 . A G 920.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.764;DP=127;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.917;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:950,0,1639 chrX 626313 . G A 1036.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.739;DP=132;Dels=0.00;FS=4.211;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1066,0,1575 chrX 626625 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.018;DP=135;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.292;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1389,0,1393 chrX 626664 . G A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.157;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:147:99:1542,0,1487 chrX 626736 . A C 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2944,315,0 chrX 626887 . T C 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.772;DP=131;Dels=0.00;FS=2.299;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.751;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1066,0,1607 chrX 626925 . C T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.825;DP=137;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.906;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1380,0,1485 chrX 626941 . T C 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.674;DP=138;Dels=0.00;FS=5.174;HaplotypeScore=2.7156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.506;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:138:99:1510,0,1311 chrX 626946 . C T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.423;DP=135;Dels=0.00;FS=4.108;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.782;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1317,0,1467 chrX 626974 . C T 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.691;DP=143;Dels=0.00;FS=5.179;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.189;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,80:143:99:1799,0,1239 chrX 627062 . C G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;DP=149;Dels=0.00;FS=3.894;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.320;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:1246,0,1793 chrX 627134 . T C 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3031,318,0 chrX 627282 . G A 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.86;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2671,270,0 chrX 627341 . T C 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;DP=155;Dels=0.00;FS=4.500;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=24.86;ReadPosRankSum=-1.576;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:3853,409,0 chrX 627352 . C T 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.594;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1785,0,1477 chrX 627547 . G A 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.077;DP=113;Dels=0.00;FS=6.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.059;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.385;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:983,0,1406 chrX 627628 . T C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.517;DP=112;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1258,0,1057 chrX 627942 . G A 1586.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.556;DP=140;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=11.33;ReadPosRankSum=-2.152;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1616,0,1236 chrX 627948 . G A 1499.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.383;DP=138;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.868;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1529,0,1259 chrX 627950 . T G 1110.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.910;DP=130;Dels=0.00;FS=2.307;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.755;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1140,0,1439 chrX 628038 . A G 1856.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.341;DP=156;Dels=0.00;FS=1.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.533;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,92:156:99:1886,0,1268 chrX 628044 . T C 1837.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.097;DP=155;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,88:155:99:1867,0,1354 chrX 628048 . G A 4111.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4111,418,0 chrX 628435 . A T 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.787;DP=150;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.226;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1690,0,1537 chrX 628508 . T C 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.030;DP=96;Dels=0.00;FS=1.754;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=3.558;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.323;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:940,0,1070 chrX 628564 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.104;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=3.362;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.656;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:993,0,1166 chrX 628724 . T C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.767;DP=104;Dels=0.00;FS=22.581;HaplotypeScore=2.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=3.249;QD=12.28;ReadPosRankSum=2.137;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,62:104:99:1307,0,795 chrX 628739 . G T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.791;DP=92;Dels=0.00;FS=13.895;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=3.859;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,65:92:99:1540,0,407 chrX 628770 . G A 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.781;DP=111;Dels=0.00;FS=30.230;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQ0=0;MQRankSum=5.352;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.158;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,76:110:99:1715,0,551 chrX 628891 . C T 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6232;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3370,345,0 chrX 628897 . A T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;DP=132;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=3.2861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,54:132:99:1061,0,1699 chrX 629035 . G A 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.476;DP=133;Dels=0.00;FS=8.209;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.325;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1047,0,1488 chrX 629082 . A G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;DP=112;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.044;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1132,0,1088 chrX 629091 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.238;DP=113;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.978;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1086,0,1133 chrX 629098 . G C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.958;DP=111;Dels=0.00;FS=5.905;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1122,0,1052 chrX 629134 . T C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.217;DP=144;Dels=0.00;FS=10.524;HaplotypeScore=5.9478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1509,0,1448 chrX 629161 . A T 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;DP=130;Dels=0.00;FS=3.216;HaplotypeScore=4.7893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.301;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1485,0,1260 chrX 629183 . C T 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.103;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.695;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1611,0,1315 chrX 629308 . A G 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.752;DP=161;Dels=0.00;FS=4.612;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.828;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1757,0,1621 chrX 629316 . T G 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3845,417,0 chrX 629422 . T C 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.418;DP=118;Dels=0.00;FS=4.526;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1027,0,1479 chrX 629482 . G A 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;DP=124;Dels=0.00;FS=3.945;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=26.61;ReadPosRankSum=1.704;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3300,312,0 chrX 629495 . G A 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3233,319,0 chrX 629557 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.145;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.399;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1183,0,1750 chrX 629566 . A G 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=47.1521;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.38;MQ0=0;QD=22.06;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:122:99:2724,297,0 chrX 629879 . A G 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3144,321,0 chrX 630149 . A T 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;DP=115;Dels=0.00;FS=8.779;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=2.046;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1379,0,1069 chrX 630373 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.552;DP=117;Dels=0.00;FS=2.410;HaplotypeScore=5.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1180,0,1150 chrX 630419 . G A 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.156;DP=142;Dels=0.00;FS=3.958;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1618,0,1390 chrX 630494 . C T 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3594,375,0 chrX 630716 . C T 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.558;DP=130;Dels=0.00;FS=2.342;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1245,0,1395 chrX 630728 . A C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.180;DP=132;Dels=0.00;FS=4.508;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.078;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1238,0,1549 chrX 631268 . T C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.482;DP=122;Dels=0.00;FS=0.771;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=1;MQRankSum=0.657;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.906;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1101,0,1382 chrX 631286 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.942;DP=117;Dels=0.00;FS=3.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=1;MQRankSum=0.942;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1166,0,1270 chrX 631679 . T G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.739;DP=129;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1299,0,1285 chrX 631978 . A G 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.462;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.327;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1644,0,1431 chrX 631982 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.449;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.719;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1448,0,1327 chrX 633146 . A G 308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.654;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.142;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,25:96:99:338,0,1670 chrX 633240 . A C 578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.840;DP=101;Dels=0.00;FS=12.783;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=5.72;ReadPosRankSum=2.045;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:608,0,1559 chrX 633350 . T C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.260;DP=103;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:923,0,1269 chrX 633390 . C T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.088;DP=115;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.343;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:979,0,1393 chrX 633425 . A G 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.125;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=6.25;ReadPosRankSum=-2.330;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,45:114:99:742,0,1575 chrX 633463 . C T 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.692;DP=101;Dels=0.00;FS=3.796;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:810,0,1287 chrX 633487 . T C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.108;DP=124;Dels=0.00;FS=5.547;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1464,0,1092 chrX 633743 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.358;DP=131;Dels=0.00;FS=7.875;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1366,0,1339 chrX 633800 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.912;DP=117;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.180;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1236,0,1194 chrX 634268 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.526;DP=126;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=4.6341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.073;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1316,0,1369 chrX 634421 . T C 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.230;DP=154;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.435;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1648,0,1611 chrX 634423 . G A 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.122;DP=154;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.446;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1692,0,1574 chrX 634484 . G C 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.755;DP=147;Dels=0.00;FS=7.337;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=0.339;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1529,0,1337 chrX 634657 . G C 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.152;DP=159;Dels=0.00;FS=3.364;HaplotypeScore=2.9177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.223;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1671,0,1526 chrX 634727 . G A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.702;DP=130;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1251,0,1461 chrX 634739 . T A 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=6.50;ReadPosRankSum=-2.020;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:790,0,1551 chrX 635210 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.577;DP=106;Dels=0.00;FS=2.519;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.474;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1174,0,1111 chrX 635213 . T A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;DP=105;Dels=0.00;FS=4.796;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.914;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1206,0,1115 chrX 635444 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.442;DP=122;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.402;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1374,0,1207 chrX 635710 . G A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.806;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=1;MQRankSum=0.805;QD=11.28;ReadPosRankSum=-2.344;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1372,0,1050 chrX 635927 . T A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.675;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1086,0,933 chrX 636335 . C T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.831;DP=127;Dels=0.00;FS=7.051;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.817;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1126,0,1521 chrX 636347 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.056;DP=136;Dels=0.00;FS=8.437;HaplotypeScore=3.9157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.041;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,59:136:99:1286,0,1617 chrX 636485 . T C 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.588;DP=169;Dels=0.00;FS=8.991;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.320;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,87:169:99:1792,0,1699 chrX 636506 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.912;DP=143;Dels=0.00;FS=4.212;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.709;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1507,0,1442 chrX 636838 . T A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.042;DP=168;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=4.5412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.044;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,70:168:99:1443,0,2290 chrX 636960 . T C 212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=23.7745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:77:99:242,0,851 chrX 637056 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.821;DP=162;Dels=0.00;FS=4.841;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.108;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,69:162:99:993,0,1642 chrX 637392 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.412;DP=147;Dels=0.00;FS=2.084;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=-0.782;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,63:147:99:1324,0,1768 chrX 637464 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.568;DP=132;Dels=0.00;FS=9.432;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1209,0,1227 chrX 637574 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.025;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.740;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1351,0,1599 chrX 637742 . G A 1823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.901;DP=164;Dels=0.00;FS=1.290;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:1853,0,1647 chrX 638577 . A T 2297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.148;DP=191;Dels=0.00;FS=3.463;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=12.03;ReadPosRankSum=-2.327;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,107:191:99:2327,0,1744 chrX 638730 . T C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.842;DP=159;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.596;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,75:159:99:1404,0,1780 chrX 639041 . T C 5175.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7928;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=24.41;SB=-2.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:212:99:5175,522,0 chrX 639220 . G T 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;DP=157;Dels=0.00;FS=351.652;HaplotypeScore=4.3317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.63;MQ0=1;MQRankSum=1.845;QD=0.09;ReadPosRankSum=-8.845;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,45:157:44:44,0,613 chrX 639270 . T C 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.138;DP=118;Dels=0.00;FS=3.583;HaplotypeScore=3.9389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.100;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:899,0,1046 chrX 639288 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.682;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.627;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1354,0,1222 chrX 639321 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.737;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1489,0,1535 chrX 639332 . A G 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.719;DP=167;Dels=0.00;FS=1.206;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.685;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,83:167:99:1616,0,1646 chrX 639333 . T G 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.865;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.696;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,85:169:99:1603,0,1646 chrX 639365 . A C 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.396;DP=172;Dels=0.00;FS=1.188;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.24;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.225;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,85:172:99:1692,0,1780 chrX 639519 . G C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;DP=108;Dels=0.00;FS=2.835;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.891;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,76:108:99:1438,0,512 chrX 639618 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.503;DP=135;Dels=0.00;FS=6.401;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1401,0,936 chrX 639706 . T G 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.251;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=174.3265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.788;QD=11.23;ReadPosRankSum=2.994;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,48:79:99:917,0,458 chrX 639731 . T C 816 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.8560;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.04;MQ0=0;QD=15.40;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:96:849,96,0 chrX 639844 . G T 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;DP=117;Dels=0.00;FS=4.764;HaplotypeScore=2.5365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=1;MQRankSum=2.817;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1024,0,1376 chrX 639984 . G A 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.109;DP=114;Dels=0.00;FS=9.149;HaplotypeScore=83.1347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=5.581;QD=8.25;ReadPosRankSum=3.879;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:970,0,974 chrX 639986 . G C 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.587;DP=106;Dels=0.00;FS=9.404;HaplotypeScore=103.4516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.51;MQ0=0;MQRankSum=-6.866;QD=7.99;ReadPosRankSum=-3.791;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:106:99:877,0,876 chrX 640024 . C T 386.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.133;DP=109;Dels=0.00;FS=31.101;HaplotypeScore=33.2977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.701;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,40:109:99:416,0,547 chrX 640026 . C T 438.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.640;DP=123;Dels=0.00;FS=1.558;HaplotypeScore=35.2844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.521;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:468,0,844 chrX 640028 . C T 1726 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.991;DP=122;Dels=0.00;FS=29.386;HaplotypeScore=32.3329;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=2.818;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,114:122:99:1759,198,0 chrX 640468 . C T 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.52;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3136,315,0 chrX 640502 . G C 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3411,348,0 chrX 640514 . A G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.879;DP=129;Dels=0.00;FS=2.311;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1288,0,1282 chrX 640711 . A C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.695;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=1.222;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.763;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1140,0,1747 chrX 640718 . A G 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.892;DP=145;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=0.236;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.660;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1741,0,1309 chrX 641019 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.677;DP=147;Dels=0.00;FS=4.996;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.735;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:147:99:1324,0,1540 chrX 641050 . A G 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.897;DP=143;Dels=0.00;FS=1.347;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.813;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1146,0,1719 chrX 641298 . G A 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.367;DP=149;Dels=0.00;FS=2.195;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1702,0,1346 chrX 641346 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.041;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.258;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,77:164:99:1448,0,1849 chrX 641571 . T C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.275;DP=135;Dels=0.00;FS=9.521;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.126;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1143,0,1705 chrX 641631 . T C 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.541;DP=146;Dels=0.00;FS=10.614;HaplotypeScore=4.7116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.187;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:965,0,1845 chrX 641753 . G A 4304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4304,462,0 chrX 641780 . C T 1992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.266;DP=173;Dels=0.00;FS=5.011;HaplotypeScore=3.6002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,92:173:99:2022,0,1658 chrX 641813 . T G 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.563;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.708;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3743,374,0 chrX 641931 . T C 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.497;DP=112;Dels=0.00;FS=11.291;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:875,0,873 chrX 642047 . C A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.228;DP=128;Dels=0.00;FS=6.557;HaplotypeScore=4.7276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=11.02;ReadPosRankSum=2.290;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1440,0,1194 chrX 642236 . A G 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.443;DP=106;Dels=0.00;FS=2.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.438;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:829,0,1241 chrX 642317 . T C 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3552,363,0 chrX 642324 . A G 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.321;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.959;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,86:149:99:1664,0,1202 chrX 642375 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.966;DP=104;Dels=0.00;FS=1.570;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1030,0,1070 chrX 642510 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.430;DP=113;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=3.2328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.059;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:113:99:1353,0,926 chrX 642651 . C T 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.672;DP=130;Dels=0.00;FS=2.345;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.969;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,43:130:99:793,0,1866 chrX 643441 . G C 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.638;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.691;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:140:99:1383,0,1443 chrX 643548 . C T 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.326;DP=107;Dels=0.00;FS=7.854;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.373;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.315;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:1398,0,857 chrX 643787 . A G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.017;DP=109;Dels=0.00;FS=3.580;HaplotypeScore=4.9307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.634;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.882;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1154,0,1171 chrX 644097 . G C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:1500,0,960 chrX 644512 . T G 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.083;DP=135;Dels=0.00;FS=6.401;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.819;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1191,0,1530 chrX 644548 . T G 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3530,357,0 chrX 644706 . A T 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3922,391,0 chrX 644805 . T C 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.873;DP=128;Dels=0.00;FS=3.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=13.34;ReadPosRankSum=-2.441;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,79:128:99:1738,0,1020 chrX 644952 . A C 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.835;DP=128;Dels=0.00;FS=4.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.885;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1098,0,1573 chrX 644958 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.432;DP=128;Dels=0.00;FS=2.299;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.596;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1218,0,1395 chrX 645000 . A G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.579;DP=137;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=2.2702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.678;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1262,0,1551 chrX 645026 . G A 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3260,328,0 chrX 645113 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.903;DP=135;Dels=0.00;FS=6.870;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.181;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1343,0,1357 chrX 645177 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.626;DP=126;Dels=0.00;FS=5.508;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.255;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1248,0,1374 chrX 645288 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.907;DP=130;Dels=0.00;FS=4.328;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:1071,0,1576 chrX 645361 . A T 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2815,288,0 chrX 645471 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.738;DP=103;Dels=0.00;FS=2.604;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.567;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1037,0,1068 chrX 645559 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.394;DP=121;Dels=0.00;FS=8.762;HaplotypeScore=2.4993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.522;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:121:99:1245,0,1210 chrX 645565 . C T 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6320;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3114,318,0 chrX 645828 . C T 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.641;DP=123;Dels=0.00;FS=4.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1487,0,987 chrX 645972 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.459;DP=121;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=5.6878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.119;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.189;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1268,0,1195 chrX 646018 . A C 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3371,357,0 chrX 646155 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.231;DP=134;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=2.5704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=-0.133;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.731;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:134:99:1084,0,1261 chrX 646268 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.719;DP=123;Dels=0.00;FS=5.681;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1292,0,1258 chrX 646356 . G A 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.26;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3283,336,0 chrX 646401 . A G 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.641;DP=121;Dels=0.00;FS=3.339;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.222;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:121:99:896,0,1539 chrX 646475 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;DP=126;Dels=0.00;FS=2.508;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1350,0,1191 chrX 646496 . T C 2559 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2592,288,0 chrX 646873 . G A 1781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.634;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.369;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,87:170:99:1811,0,1677 chrX 646943 . C T 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.191;DP=178;Dels=0.00;FS=0.553;HaplotypeScore=2.7196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.619;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,92:178:99:1859,0,1730 chrX 647196 . C T 4158.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7763;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.51;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4158,430,0 chrX 647399 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.966;DP=135;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1441,0,1406 chrX 647651 . T C 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.982;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=2;MQRankSum=-1.038;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.209;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1603,0,1691 chrX 647675 . G A 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.766;DP=163;Dels=0.00;FS=2.744;HaplotypeScore=5.6798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=1;MQRankSum=-0.429;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.965;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,84:163:99:1704,0,1479 chrX 648002 . C T 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.748;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.860;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1137,0,1167 chrX 648026 . T A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;DP=130;Dels=0.00;FS=2.232;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.349;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1176,0,1549 chrX 648251 . C A 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.110;DP=121;Dels=0.00;FS=1.462;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.716;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1159,0,1269 chrX 648431 . T C 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.522;DP=126;Dels=0.00;FS=3.080;HaplotypeScore=7.6819;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=24.73;ReadPosRankSum=1.072;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3149,336,0 chrX 648461 . G A 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3232,330,0 chrX 648638 . T C 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.444;DP=124;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=3.8507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:773,0,1065 chrX 648662 . T C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=147;Dels=0.00;FS=6.028;HaplotypeScore=3.3772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.141;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:923,0,1133 chrX 648980 . T C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.275;DP=143;Dels=0.00;FS=3.120;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1232,0,1630 chrX 649197 . A T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;DP=124;Dels=0.00;FS=8.312;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=11.73;ReadPosRankSum=-2.253;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1484,0,1096 chrX 649204 . A T 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;DP=135;Dels=0.00;FS=6.521;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.602;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,57:135:99:980,0,1633 chrX 649217 . A G 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.202;DP=112;Dels=0.00;FS=7.447;HaplotypeScore=97.5143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=7.71;ReadPosRankSum=2.459;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:893,0,1270 chrX 649422 . T G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.226;DP=107;Dels=0.00;FS=7.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=-0.945;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.180;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1039,0,1180 chrX 649429 . T G 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.653;DP=105;Dels=0.00;FS=1.573;HaplotypeScore=4.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=0.195;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1000,0,1197 chrX 649486 . T C 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.159;DP=107;Dels=0.00;FS=13.003;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=8.30;ReadPosRankSum=3.217;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:918,0,1317 chrX 649585 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.548;DP=118;Dels=0.00;FS=7.062;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1201,0,1190 chrX 649616 . C T 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.920;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:154:99:1671,0,1489 chrX 649659 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.644;DP=139;Dels=0.00;FS=11.370;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1414,0,1486 chrX 649660 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.272;DP=134;Dels=0.00;FS=8.447;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1381,0,1441 chrX 649802 . T G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.791;DP=118;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.283;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1188,0,1347 chrX 649976 . A G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.332;DP=142;Dels=0.00;FS=8.945;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1465,0,1491 chrX 650055 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.185;DP=131;Dels=0.00;FS=4.176;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.773;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1167,0,1541 chrX 650201 . T C 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.568;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.894;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1504,0,1378 chrX 650204 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.035;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.527;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1338,0,1501 chrX 650265 . T C 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.868;DP=126;Dels=0.00;FS=11.886;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.262;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1102,0,1544 chrX 650270 . T C 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.322;DP=129;Dels=0.00;FS=10.081;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.537;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1085,0,1623 chrX 650299 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.774;DP=132;Dels=0.00;FS=26.756;HaplotypeScore=4.7577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.707;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1381,0,1407 chrX 650350 . A G 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.914;DP=106;Dels=0.00;FS=13.686;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1051,0,1228 chrX 650584 . C T 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.326;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.147;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1235,0,1620 chrX 650585 . A G 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7833;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3666,390,0 chrX 650625 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.366;DP=131;Dels=0.00;FS=5.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.209;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1346,0,1289 chrX 650654 . C G 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.360;DP=148;Dels=0.00;FS=4.900;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1411,0,1524 chrX 650707 . A G 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.887;DP=164;Dels=0.00;FS=3.728;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.975;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,80:164:99:1643,0,1793 chrX 650894 . A G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.264;DP=120;Dels=0.00;FS=2.471;HaplotypeScore=2.2460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:120:99:1165,0,1328 chrX 650906 . G A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.287;DP=126;Dels=0.00;FS=4.422;HaplotypeScore=3.4525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1307,0,1334 chrX 651009 . A C 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.428;DP=117;Dels=0.00;FS=12.017;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.110;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:117:99:1103,0,1243 chrX 651084 . T C 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.029;DP=127;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.190;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1087,0,1538 chrX 651089 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.513;DP=126;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.736;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1117,0,1474 chrX 651146 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.214;DP=139;Dels=0.00;FS=6.269;HaplotypeScore=5.6274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.919;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1395,0,1458 chrX 651274 . C T 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3528,363,0 chrX 651313 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.144;DP=120;Dels=0.00;FS=3.359;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.462;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1090,0,1314 chrX 651316 . G T 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.723;DP=125;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.985;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1241,0,1329 chrX 651412 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.445;DP=149;Dels=0.00;FS=13.725;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1366,0,1809 chrX 651638 . T C 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.032;DP=115;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.513;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:905,0,1357 chrX 652362 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.270;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.178;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1231,0,1276 chrX 652730 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.573;DP=141;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1351,0,1496 chrX 652931 . T C 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.149;DP=135;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=22.2993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=2.635;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:1314,0,920 chrX 653016 . T C 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.033;DP=114;Dels=0.00;FS=5.834;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:943,0,1048 chrX 653755 . T C 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3855,408,0 chrX 654059 . T G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.003;DP=135;Dels=0.00;FS=9.083;HaplotypeScore=3.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.289;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1482,0,1248 chrX 654612 . A T 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.24;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3087,318,0 chrX 655280 . A C 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.681;DP=137;Dels=0.00;FS=2.195;HaplotypeScore=10.7190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1311,0,1428 chrX 655475 . C T 2519 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.68;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2552,267,0 chrX 655865 . C T 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.513;DP=109;Dels=0.00;FS=3.670;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.721;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.132;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:964,0,1346 chrX 656003 . G C 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.357;DP=124;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1502,0,1033 chrX 656567 . C T 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3442,352,0 chrX 657475 . T G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.432;DP=139;Dels=0.00;FS=12.437;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1276,0,1662 chrX 657710 . C T 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.50;SB=-2.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3672,364,0 chrX 657832 . T A 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;DP=124;Dels=0.00;FS=4.922;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.104;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,49:124:99:930,0,1722 chrX 657858 . A G 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3238,351,0 chrX 657928 . A G 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2769,300,0 chrX 658094 . G A 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3326,339,0 chrX 658561 . G A 3879.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3879,396,0 chrX 658665 . T C 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;DP=136;Dels=0.00;FS=10.419;HaplotypeScore=31.8007;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.42;MQ0=0;MQRankSum=4.515;QD=17.90;ReadPosRankSum=-3.591;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,122:136:99:2467,247,0 chrX 658912 . C T 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.32;SB=-2.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:3976,403,0 chrX 659016 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.477;DP=129;Dels=0.00;FS=19.230;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1246,0,1412 chrX 659193 . C G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;DP=125;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.052;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:125:99:1490,0,1090 chrX 659243 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.021;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.364;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:169:99:1457,0,1908 chrX 659384 . T A 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;DP=145;Dels=0.00;FS=13.599;HaplotypeScore=5.5422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=-0.354;QD=10.91;ReadPosRankSum=-2.033;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:145:99:1612,0,1380 chrX 659425 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.217;DP=138;Dels=0.00;FS=8.899;HaplotypeScore=6.9433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.898;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1494,0,1325 chrX 659775 . C T 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.275;DP=144;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1600,0,1428 chrX 659931 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.303;DP=135;Dels=0.00;FS=5.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.255;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1502,0,1290 chrX 660402 . A G 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3605,384,0 chrX 660487 . A G 4233.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.50;SB=-2.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4233,438,0 chrX 660518 . C T 2324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.192;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.008;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,112:194:99:2354,0,1596 chrX 660546 . C T 3882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3882,391,0 chrX 660753 . C T 4121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.688;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.556;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:4121,406,0 chrX 660770 . C G 3709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3709,396,0 chrX 660786 . G A 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3926,397,0 chrX 661047 . C T 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=25.08;ReadPosRankSum=1.585;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2992,312,0 chrX 661050 . T C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=25.15;ReadPosRankSum=1.466;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2976,315,0 chrX 661144 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.229;DP=136;Dels=0.00;FS=7.979;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1390,0,1337 chrX 661171 . T C 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3117,333,0 chrX 661230 . A G 4309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.80;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4309,456,0 chrX 661266 . G A 4759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.59;SB=-2.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4759,472,0 chrX 661370 . C T 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3106,321,0 chrX 661398 . A G 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3034,324,0 chrX 661506 . C T 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3692,375,0 chrX 661545 . C G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.311;DP=148;Dels=0.00;FS=2.074;HaplotypeScore=2.8990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.527;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,64:148:99:1251,0,1668 chrX 661788 . C T 1651 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.3732;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.02;MQ0=0;QD=10.32;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:1684,177,0 chrX 661920 . A G 3873.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.989e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3873,408,0 chrX 661926 . G A 4026.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=25.16;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:4026,408,0 chrX 662140 . C T 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.035;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=2.936;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.130;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1743,0,1261 chrX 662146 . C T 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.745e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4012,406,0 chrX 662191 . T C 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3154,339,0 chrX 662193 . C A 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3032,309,0 chrX 662204 . C A 2662 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.26;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2695,282,0 chrX 662262 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.383;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1141,0,1266 chrX 662282 . C T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.289;DP=123;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.164;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1285,0,1253 chrX 662322 . G A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.940;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.474;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1394,0,1189 chrX 662418 . C G 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3121,327,0 chrX 662443 . A C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.566;DP=139;Dels=0.00;FS=2.135;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.144;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1322,0,1469 chrX 662711 . A G 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.699;DP=156;Dels=0.00;FS=2.006;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.239;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,83:156:99:1687,0,1524 chrX 662769 . G A 4143.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9296;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4143,436,0 chrX 662968 . C T 1866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.984;DP=169;Dels=0.00;FS=3.581;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,90:169:99:1896,0,1483 chrX 663013 . A C 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3701,402,0 chrX 663082 . A G 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3486,369,0 chrX 663083 . A G 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3452,369,0 chrX 663098 . A G 3913.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3913,402,0 chrX 663161 . T C 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.072;DP=132;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.531;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:132:99:1277,0,1358 chrX 663511 . T C 4353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.16;SB=-2.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4353,468,0 chrX 663534 . A T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;DP=160;Dels=0.00;FS=3.781;HaplotypeScore=2.9404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=7.65;ReadPosRankSum=2.376;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,62:160:99:1254,0,2128 chrX 663590 . A C 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.30;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3770,411,0 chrX 663682 . G A 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.104;DP=111;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=4.9355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.104;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1037,0,1225 chrX 663968 . T A 2336 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.704;DP=136;Dels=0.00;FS=17.724;HaplotypeScore=17.3158;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=17.18;ReadPosRankSum=1.595;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,130:136:99:2369,252,0 chrX 664155 . G T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.837;DP=169;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.134;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,84:169:99:1737,0,1717 chrX 664236 . C T 1901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.475;DP=159;Dels=0.00;FS=1.978;HaplotypeScore=3.6426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.243;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,89:159:99:1931,0,1282 chrX 664288 . T C 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.443;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.087;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,88:176:99:1733,0,1886 chrX 664330 . T C 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.992;DP=178;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=3.6470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=2.937;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.215;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,90:178:99:1804,0,1890 chrX 664690 . C T 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.046;DP=154;Dels=0.00;FS=2.860;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.564;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1732,0,1398 chrX 664824 . A G 4053.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4053,414,0 chrX 665027 . T C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1449,0,1343 chrX 665035 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.535;DP=136;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.764;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1476,0,1363 chrX 665051 . T C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.357;DP=151;Dels=0.00;FS=2.100;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=2.105;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.813;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1511,0,1606 chrX 665076 . C T 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.385;DP=145;Dels=0.00;FS=2.084;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1597,0,1454 chrX 665172 . T C 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.411;DP=150;Dels=0.00;FS=2.901;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,85:150:99:1769,0,1367 chrX 665597 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.537;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=10.11;ReadPosRankSum=2.032;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1314,0,1294 chrX 666046 . T C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.227;DP=143;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=3.7647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:143:99:1396,0,1470 chrX 666087 . G A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.539;DP=148;Dels=0.00;FS=6.227;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.715;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1537,0,1589 chrX 666164 . C T 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.700;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.520;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1818,0,1328 chrX 666201 . A G 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.797;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=1;MQRankSum=-0.400;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1431,0,1458 chrX 666321 . A C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.122;DP=151;Dels=0.01;FS=1.269;HaplotypeScore=7.7269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1449,0,1693 chrX 666422 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.116;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.242;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1353,0,1318 chrX 666622 . A G 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3359,366,0 chrX 666742 . T G 4157.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4157,423,0 chrX 667126 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.546;DP=120;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.582;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1231,0,1190 chrX 667152 . C G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.849;DP=118;Dels=0.00;FS=5.260;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.353;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1112,0,1244 chrX 667389 . A T 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2974,312,0 chrX 667452 . C T 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.59;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3118,318,0 chrX 667942 . T G 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.151;DP=149;Dels=0.00;FS=7.120;HaplotypeScore=4.9568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=6.56;ReadPosRankSum=2.061;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,58:149:99:1007,0,1952 chrX 667943 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.354;DP=166;Dels=0.00;FS=3.259;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.021;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,71:166:99:1277,0,1932 chrX 668091 . G C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.743;DP=102;Dels=0.00;FS=10.841;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1086,0,983 chrX 668102 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;DP=107;Dels=0.00;FS=17.061;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1075,0,1102 chrX 668331 . C T 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.307;DP=100;Dels=0.00;FS=18.683;HaplotypeScore=6.1771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.085;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,39:100:99:758,0,1004 chrX 668437 . C G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;DP=117;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=3.8751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.025;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1192,0,1104 chrX 668528 . T C 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.644;DP=133;Dels=0.00;FS=2.508;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1422,0,1382 chrX 668723 . A T 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.089;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.076;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,52:124:99:984,0,1597 chrX 668873 . G A 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.224;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:993,0,1419 chrX 669077 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.914;DP=116;Dels=0.00;FS=4.723;HaplotypeScore=2.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.095;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1095,0,1222 chrX 669427 . G A 2333 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2366,231,0 chrX 669743 . A C 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2758,291,0 chrX 669761 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.759;DP=110;Dels=0.00;FS=4.695;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.220;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1272,0,1020 chrX 670831 . G A 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.444;DP=118;Dels=0.00;FS=5.864;HaplotypeScore=4.9329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.421;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.990;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:118:99:1437,0,1025 chrX 670892 . G A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.188;DP=135;Dels=0.00;FS=2.168;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1362,0,1528 chrX 670934 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.376;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.497;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1309,0,1202 chrX 671070 . G A 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=1;QD=25.71;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3985,417,0 chrX 671129 . T A 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;DP=133;Dels=0.00;FS=3.149;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.341;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1631,0,1240 chrX 671183 . C G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;DP=127;Dels=0.00;FS=8.197;HaplotypeScore=3.9847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1426,0,1107 chrX 671474 . G A 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.634;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=0.441;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1029,0,1008 chrX 671525 . A G 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.769;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:845,0,791 chrX 671636 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.189;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1243,0,1219 chrX 671669 . G A 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.023;DP=124;Dels=0.00;FS=2.283;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.646;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1455,0,1171 chrX 672143 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.059;DP=146;Dels=0.00;FS=2.958;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.097;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1383,0,1622 chrX 672252 . A G 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.765;DP=150;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:1799,0,1276 chrX 672311 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.388;DP=128;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.507;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1461,0,1166 chrX 672566 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.616;DP=146;Dels=0.00;FS=11.665;HaplotypeScore=2.4637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.908;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1579,0,1384 chrX 672712 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.680;DP=106;Dels=0.00;FS=4.883;HaplotypeScore=5.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=2.376;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1188,0,1006 chrX 672728 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.478;DP=105;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=4.9714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.946;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.446;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1095,0,1042 chrX 672768 . G A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.315;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.022;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1345,0,1081 chrX 672845 . A C 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.154;DP=98;Dels=0.00;FS=1.637;HaplotypeScore=47.5830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.752;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:749,0,1153 chrX 673554 . C T 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.772;DP=157;Dels=0.00;FS=1.248;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.694;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1634,0,1567 chrX 673602 . G A 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3950,403,0 chrX 673954 . A G 2558 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=23.69;ReadPosRankSum=1.155;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2591,246,0 chrX 674143 . G C 3820.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3820,411,0 chrX 674350 . T C 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.288;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:896,0,1189 chrX 674570 . G A 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.123;DP=108;Dels=0.00;FS=3.707;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2826,283,0 chrX 674656 . T A 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;DP=75;Dels=0.00;FS=1.958;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.472;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:776,0,812 chrX 675076 . T C 2194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=89;Dels=0.00;FS=3.212;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.591;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:2227,216,0 chrX 675286 . T A 3762.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=144;Dels=0.00;FS=4.594;HaplotypeScore=7.6866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=26.13;ReadPosRankSum=1.010;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3762,393,0 chrX 676487 . C T 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.299;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.014;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1038,0,1171 chrX 676590 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.251;DP=135;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1248,0,1568 chrX 676954 . T A 2285 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2318,231,0 chrX 677000 . C T 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.583;DP=103;Dels=0.00;FS=7.773;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.783;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:846,0,1238 chrX 677009 . T C 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2913,318,0 chrX 677087 . A G 2640 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2673,300,0 chrX 677297 . C T 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.727;DP=114;Dels=0.00;FS=2.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.439;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:987,0,1322 chrX 677369 . T C 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;DP=98;Dels=0.00;FS=0.981;HaplotypeScore=3.7149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,40:98:99:764,0,1266 chrX 677385 . T C 2278 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=48.3254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.49;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2311,255,0 chrX 677705 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.541;DP=114;Dels=0.00;FS=2.453;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.369;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1106,0,1262 chrX 677706 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.683;DP=114;Dels=0.00;FS=2.453;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.244;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1162,0,1294 chrX 677717 . T C 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.892;DP=127;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.681;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1070,0,1637 chrX 677952 . T C 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.501;DP=116;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=6.1710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:880,0,933 chrX 678445 . C T 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.233;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.349;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:970,0,1036 chrX 678464 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.568;DP=119;Dels=0.00;FS=3.723;HaplotypeScore=3.6416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.083;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1121,0,1400 chrX 678652 . T C 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.483;DP=98;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=2;MQRankSum=2.372;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.313;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,57:98:99:1211,0,787 chrX 678865 . T A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;DP=124;Dels=0.00;FS=8.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.465;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1512,0,1084 chrX 679143 . G A 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.952;DP=127;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1227,0,1361 chrX 679927 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.452;DP=142;Dels=0.00;FS=3.014;HaplotypeScore=7.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.469;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1370,0,1553 chrX 680328 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;DP=126;Dels=0.00;FS=21.381;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1369,0,1267 chrX 680733 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.379;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1116,0,1008 chrX 680856 . C A 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.694;DP=92;Dels=0.00;FS=1.745;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:943,0,994 chrX 680931 . A G 551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.232;DP=75;Dels=0.00;FS=0.907;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.136;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,32:75:99:581,0,929 chrX 681144 . C G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;DP=115;Dels=0.00;FS=4.651;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.144;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,69:115:99:1342,0,915 chrX 681414 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.996;DP=125;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=3.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.351;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1247,0,1372 chrX 681476 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.593;DP=119;Dels=0.00;FS=5.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.105;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1318,0,1097 chrX 681606 . T C 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.474;DP=147;Dels=0.00;FS=6.543;HaplotypeScore=4.7000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.404;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1682,0,1411 chrX 681843 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.955;DP=117;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.400;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1308,0,1137 chrX 681964 . G A 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.198;DP=98;Dels=0.00;FS=6.527;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.889;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.169;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:963,0,1059 chrX 682344 . T A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.972;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1223,0,986 chrX 682690 . T C 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.556;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.883;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1639,0,1308 chrX 682740 . T C 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=129;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=26.07;ReadPosRankSum=0.846;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3363,372,0 chrX 682784 . A C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.598;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=8.14;ReadPosRankSum=-2.782;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1048,0,1399 chrX 683353 . G A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.410;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.947;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1080,0,953 chrX 683621 . C T 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.646;DP=130;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1142,0,1550 chrX 683647 . T A 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.525;DP=124;Dels=0.00;FS=2.337;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.087;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,49:124:99:923,0,1644 chrX 683675 . A G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.790;DP=125;Dels=0.00;FS=6.883;HaplotypeScore=3.0498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.710;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1373,0,1243 chrX 683804 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.168;DP=124;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.816;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1234,0,1266 chrX 683820 . A G 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.214;DP=129;Dels=0.00;FS=2.222;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.813;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1518,0,1253 chrX 683975 . T C 2473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.03;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2506,258,0 chrX 684046 . T A,G 1602.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.41;MQ0=0;QD=20.54;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,45,33:78:99:1662,716,608,946,0,859 chrX 684047 . G A 1841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.88;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1874,195,0 chrX 684348 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.904;DP=135;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.875;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1145,0,1555 chrX 684510 . G A 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.196;DP=116;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,45:116:99:895,0,1526 chrX 684758 . G C 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2756,291,0 chrX 684785 . T C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.447;DP=103;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.386;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1092,0,1047 chrX 685154 . A G 2644 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.67;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2677,288,0 chrX 685208 . C T 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3946,397,0 chrX 685862 . T C 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2805,303,0 chrX 685872 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.111;DP=101;Dels=0.00;FS=9.630;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.810;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1163,0,853 chrX 685982 . T C 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3028,321,0 chrX 686433 . C A 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;DP=100;Dels=0.00;FS=2.609;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.128;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:827,0,985 chrX 686498 . G A 631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.043;DP=96;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.186;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:661,0,1152 chrX 686736 . A G 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3274,339,0 chrX 686758 . G T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;DP=112;Dels=0.00;FS=5.107;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=12.33;ReadPosRankSum=1.014;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1411,0,933 chrX 686778 . C T 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.646;DP=98;Dels=0.00;FS=5.088;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.818;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:908,0,1123 chrX 686894 . A C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.499;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1080,0,1142 chrX 687329 . A G 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.963;DP=119;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=3.9195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1126,0,1385 chrX 687612 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.427;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.672;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1323,0,1388 chrX 687719 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.661;DP=125;Dels=0.00;FS=1.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.067;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1461,0,1128 chrX 688286 . A G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.107;DP=117;Dels=0.00;FS=3.416;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.315;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:890,0,1525 chrX 688529 . T C 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.972;DP=149;Dels=0.00;FS=8.522;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.211;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1433,0,1444 chrX 688898 . C T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.578;DP=134;Dels=0.00;FS=2.222;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.411;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1505,0,1370 chrX 689090 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.662;DP=126;Dels=0.00;FS=5.635;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.707;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1468,0,1201 chrX 689592 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.392;DP=123;Dels=0.00;FS=3.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.757;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1481,0,1010 chrX 690126 . A G 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.639;DP=92;Dels=0.00;FS=2.743;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.601;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:902,0,1043 chrX 690711 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.994;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.548;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:143:99:1456,0,1476 chrX 690731 . A T 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;DP=141;Dels=0.00;FS=4.117;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=10.33;ReadPosRankSum=2.600;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1487,0,1524 chrX 690963 . G T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.263;DP=124;Dels=0.00;FS=3.343;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=10.24;ReadPosRankSum=2.553;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1300,0,1293 chrX 691035 . T A 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;DP=100;Dels=0.00;FS=6.644;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.641;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:828,0,1279 chrX 691098 . G A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.921;DP=121;Dels=0.00;FS=9.336;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.924;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1069,0,1400 chrX 691149 . T C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.295;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1358,0,1368 chrX 691434 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.780;DP=114;Dels=0.00;FS=2.428;HaplotypeScore=4.9558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=10.12;ReadPosRankSum=2.670;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:114:99:1184,0,1151 chrX 691648 . G A 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.843;DP=122;Dels=0.00;FS=1.577;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:122:99:982,0,1535 chrX 691681 . T C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.841;DP=137;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.309;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1292,0,1593 chrX 691772 . C T 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.815;DP=107;Dels=0.00;FS=7.523;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1146,0,1103 chrX 692064 . G A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.741;DP=117;Dels=0.00;FS=3.946;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=1;MQRankSum=1.771;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.017;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:933,0,1459 chrX 692082 . A G 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;DP=116;Dels=0.00;FS=10.493;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=1;MQRankSum=0.368;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.053;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,46:116:99:857,0,1517 chrX 692163 . A T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.790;DP=146;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=6.9156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.939;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.040;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1515,0,1503 chrX 692358 . G A 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.293;DP=145;Dels=0.00;FS=6.225;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1651,0,1381 chrX 692544 . T G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.732;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=10.24;ReadPosRankSum=2.404;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:128:99:1341,0,1304 chrX 692661 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.636;DP=114;Dels=0.00;FS=7.300;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.096;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1220,0,1168 chrX 692804 . C T 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.497;DP=130;Dels=0.00;FS=7.980;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1259,0,1389 chrX 692865 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.818;DP=110;Dels=0.00;FS=6.391;HaplotypeScore=3.8715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1160,0,1109 chrX 693120 . C T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.214;DP=112;Dels=0.00;FS=7.484;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1080,0,1190 chrX 693176 . T C 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.679;DP=91;Dels=0.00;FS=0.796;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.266;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:926,0,1019 chrX 693187 . T C 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2662,291,0 chrX 693257 . G A 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.952;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.7611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.879;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:913,0,1043 chrX 693260 . A C 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.935;DP=94;Dels=0.00;FS=2.726;HaplotypeScore=12.7505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:927,0,919 chrX 694022 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.803;DP=125;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.687;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1234,0,1163 chrX 694041 . T C 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.490;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1340,0,1096 chrX 694162 . T G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.912;DP=111;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1156,0,1196 chrX 694296 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.423;DP=121;Dels=0.00;FS=8.381;HaplotypeScore=3.5327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.198;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.430;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1040,0,1439 chrX 694443 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.620;DP=125;Dels=0.00;FS=23.006;HaplotypeScore=3.4573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=9.76;ReadPosRankSum=3.062;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:125:99:1250,0,1289 chrX 694458 . A G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.690;DP=122;Dels=0.00;FS=25.541;HaplotypeScore=4.6170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.812;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:122:99:1295,0,1197 chrX 694479 . A G 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.380;DP=129;Dels=0.00;FS=15.176;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=10.98;ReadPosRankSum=-2.363;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1446,0,1220 chrX 694743 . A C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.831;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.330;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,62:106:99:1346,0,923 chrX 695217 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.975;DP=113;Dels=0.00;FS=14.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.704;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1138,0,1140 chrX 695712 . G C 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3110,336,0 chrX 695721 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.066;DP=116;Dels=0.00;FS=3.410;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.372;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1202,0,1263 chrX 695757 . T C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.702;DP=114;Dels=0.00;FS=6.015;HaplotypeScore=5.8354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.404;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:113:99:1140,0,1222 chrX 696001 . C G 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.520;DP=132;Dels=0.00;FS=6.589;HaplotypeScore=5.3776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.815;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1521,0,1210 chrX 696080 . G A 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.011;DP=147;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.134;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1626,0,1307 chrX 696477 . A G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.986;DP=111;Dels=0.01;FS=1.816;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=1;MQRankSum=0.526;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1017,0,1180 chrX 696739 . C G 2256 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2289,243,0 chrX 696964 . C A 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3625,363,0 chrX 697206 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.682;DP=155;Dels=0.00;FS=2.885;HaplotypeScore=6.9450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1365,0,1591 chrX 697486 . T C 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.967;DP=153;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=3.3267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1688,0,1539 chrX 697654 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.964;DP=163;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=4.7030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.219;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,75:163:99:1335,0,1758 chrX 697881 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.476;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.299;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1246,0,1651 chrX 697923 . A G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.912;DP=116;Dels=0.00;FS=8.647;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.311;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:116:99:1170,0,1188 chrX 698028 . A T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.629;DP=137;Dels=0.00;FS=2.195;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1350,0,1525 chrX 698322 . A T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;DP=150;Dels=0.00;FS=2.934;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=8.31;ReadPosRankSum=-2.139;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,65:150:99:1276,0,1829 chrX 698439 . C T 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.281;DP=126;Dels=0.00;FS=4.438;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:1023,0,1472 chrX 698466 . C T 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.953;DP=127;Dels=0.00;FS=6.958;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.500;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,48:127:99:975,0,1537 chrX 698725 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.134;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:1411,0,810 chrX 698785 . A G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.470;DP=138;Dels=0.00;FS=5.161;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.208;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1390,0,1424 chrX 698908 . A G 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.639;DP=144;Dels=0.00;FS=2.094;HaplotypeScore=7.5471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.276;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1707,0,1228 chrX 699021 . T C 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.013;DP=138;Dels=0.00;FS=22.308;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1643,0,1265 chrX 699058 . A T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;DP=124;Dels=0.00;FS=7.009;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.628;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1230,0,1482 chrX 699108 . T C 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.791;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.292;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1416,0,1436 chrX 699217 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.810;DP=109;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:990,0,1324 chrX 699340 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.004;DP=128;Dels=0.00;FS=5.685;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.694;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1532,0,1126 chrX 699851 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.590;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.510;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1239,0,1104 chrX 699928 . A G 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.411;DP=148;Dels=0.00;FS=3.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.512;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1610,0,1479 chrX 701241 . T A 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;DP=143;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=10.9256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,87:143:99:1636,0,934 chrX 701476 . G A 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.303;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.347;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:965,0,1155 chrX 701827 . C T 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.26;MQ0=1;QD=24.55;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3731,340,0 chrX 701892 . A G 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.271;DP=108;Dels=0.00;FS=9.282;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.22;MQ0=1;MQRankSum=-0.807;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.218;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:906,0,1160 chrX 701912 . G A 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.543;DP=128;Dels=0.00;FS=7.648;HaplotypeScore=50.5523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.731;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3205,316,0 chrX 701944 . C G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.701;DP=139;Dels=0.00;FS=4.086;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=7.90;ReadPosRankSum=-2.360;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1128,0,1572 chrX 702141 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.995;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.902;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1090,0,1937 chrX 702597 . C A 2770 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.15;MQ0=5;QD=24.95;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2803,288,0 chrX 702870 . C T 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.755;DP=109;Dels=0.03;FS=0.766;HaplotypeScore=7.7884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.237;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:819,0,1291 chrX 702874 . G A 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.291;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:913,0,1236 chrX 702912 . C T 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.451;DP=102;Dels=0.00;FS=4.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.873;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.672;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:886,0,1173 chrX 702917 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.233;DP=117;Dels=0.00;FS=3.512;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.106;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1171,0,1145 chrX 702981 . G A 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.20;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3102,304,0 chrX 702986 . C T 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3067,306,0 chrX 703027 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;DP=116;Dels=0.00;FS=8.703;HaplotypeScore=6.6787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=2.987;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.667;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1373,0,1061 chrX 703226 . G A 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3389,348,0 chrX 703279 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.482;DP=117;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.502;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1200,0,1022 chrX 703327 . G A 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.38;MQ0=0;QD=27.62;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3287,351,0 chrX 703332 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.862;DP=131;Dels=0.00;FS=2.919;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.979;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1200,0,1537 chrX 703339 . A G 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=24.60;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3370,378,0 chrX 703419 . C T 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.880;DP=97;Dels=0.00;FS=3.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1114,0,905 chrX 703431 . C A 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.709;DP=100;Dels=0.00;FS=2.683;HaplotypeScore=35.7628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=2.138;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1027,0,1031 chrX 703467 . C A 2456 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.54;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2489,261,0 chrX 703473 . T C 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.205;DP=104;Dels=0.00;FS=3.644;HaplotypeScore=41.6523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQ0=0;MQRankSum=-3.591;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:770,0,1386 chrX 703504 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.912;DP=114;Dels=0.00;FS=2.425;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=4.891;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.253;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1380,0,947 chrX 703619 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.446;DP=136;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.978;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1173,0,1522 chrX 703814 . C T 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.30;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3576,370,0 chrX 703858 . G A 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3841,385,0 chrX 703893 . C T 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3549,355,0 chrX 704310 . C T 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3665,372,0 chrX 704419 . A G 1583.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.740;DP=141;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,86:141:99:1613,0,1098 chrX 704425 . G A 3441.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.85;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3441,345,0 chrX 704426 . C A 1655.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.626;DP=139;Dels=0.00;FS=1.383;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-3.155;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.355;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,84:139:99:1685,0,1034 chrX 704499 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.904;DP=129;Dels=0.00;FS=12.951;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:129:99:1361,0,1054 chrX 704513 . C T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.264;DP=120;Dels=0.00;FS=17.893;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.399;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1187,0,1010 chrX 704535 . G A 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2665,279,0 chrX 704627 . G A 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.725;DP=171;Dels=0.00;FS=7.705;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.304;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,88:171:99:1882,0,1689 chrX 704664 . C G 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.221;DP=154;Dels=0.00;FS=37.729;HaplotypeScore=7.9016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=2.178;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,86:154:99:1763,0,1389 chrX 704699 . G A 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3054,327,0 chrX 704705 . T C 626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.939;DP=100;Dels=0.00;FS=10.586;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.048;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,35:100:99:656,0,1511 chrX 704768 . C G 2391 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=23.44;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2424,264,0 chrX 704820 . G A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.723;DP=112;Dels=0.00;FS=4.753;HaplotypeScore=4.1074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.237;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1256,0,1099 chrX 704861 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.855;DP=109;Dels=0.00;FS=12.696;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1338,0,889 chrX 704987 . G A 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.704;DP=102;Dels=0.00;FS=3.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.102;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.738;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:893,0,1043 chrX 704992 . T C 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.585;DP=110;Dels=0.00;FS=2.478;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:887,0,1271 chrX 704998 . C T 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.53;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2850,288,0 chrX 705014 . T C 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.477;DP=117;Dels=0.00;FS=4.540;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQ0=1;MQRankSum=-1.236;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.395;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:835,0,1466 chrX 705055 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.192;DP=152;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=1;MQRankSum=-0.359;QD=7.45;ReadPosRankSum=-1.424;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,60:152:99:1162,0,1901 chrX 705450 . C T 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2879,294,0 chrX 705542 . A G 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3611,381,0 chrX 705581 . A G 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.954;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.181;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:884,0,1368 chrX 705586 . C A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.443;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.772;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1090,0,1338 chrX 705639 . C T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.091;DP=126;Dels=0.00;FS=1.639;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.285;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.347;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1380,0,1317 chrX 705848 . G C 4058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4058,408,0 chrX 705865 . C T 4084.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.403;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=25.69;ReadPosRankSum=1.128;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,156:159:99:4084,392,0 chrX 705917 . A G 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:4061,423,0 chrX 705920 . T C 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.854e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3951,420,0 chrX 706135 . G A 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3849,390,0 chrX 706199 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.070;DP=121;Dels=0.00;FS=5.606;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.594;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1324,0,1125 chrX 706547 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.095;DP=146;Dels=0.00;FS=5.016;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.681;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1578,0,1371 chrX 706608 . A T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;DP=162;Dels=0.00;FS=5.644;HaplotypeScore=3.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:1737,0,1687 chrX 707018 . G A 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3196,324,0 chrX 707030 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.300;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1128,0,1527 chrX 707043 . C A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.931;DP=153;Dels=0.00;FS=2.885;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1103,0,1837 chrX 707089 . G A 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3347,357,0 chrX 707206 . C T 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.784;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1463,0,1598 chrX 707260 . G A 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3712,370,0 chrX 707333 . C T 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.362;DP=104;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=2.7113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.836;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:104:99:856,0,946 chrX 707549 . G A 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.903;DP=131;Dels=0.00;FS=11.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1179,0,1487 chrX 707550 . C A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.526;DP=131;Dels=0.00;FS=11.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.966;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.920;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1215,0,1446 chrX 707903 . A T 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;DP=123;Dels=0.00;FS=2.326;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1259,0,1296 chrX 708177 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.710;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:972,0,1271 chrX 708229 . G A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.466;DP=131;Dels=0.00;FS=5.554;HaplotypeScore=5.7002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=2.822;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.629;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1232,0,1474 chrX 708302 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.974;DP=116;Dels=0.00;FS=3.539;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.921;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,68:116:99:1336,0,953 chrX 708320 . A C 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.352;DP=107;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.150;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:840,0,1172 chrX 708329 . G A 531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.369;DP=82;Dels=0.00;FS=5.779;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.028;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:561,0,1021 chrX 708347 . C G 569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.747;DP=77;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:77:99:599,0,892 chrX 708349 . C G 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.470;DP=85;Dels=0.00;FS=5.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.260;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:728,0,986 chrX 708426 . A T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.378;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.988;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.851;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1539,0,1185 chrX 708500 . C A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;DP=115;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=3.6345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=-2.908;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.213;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:115:99:980,0,1316 chrX 708504 . G T 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.423;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=42.2249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.614;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.712;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:892,0,1370 chrX 708569 . A G 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.076;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.902;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:906,0,1124 chrX 708614 . G A 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.551;DP=84;Dels=0.00;FS=0.861;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.452;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:911,0,775 chrX 708644 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.964;DP=101;Dels=0.00;FS=2.710;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.349;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1077,0,958 chrX 708696 . A G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.180;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.199;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1115,0,1248 chrX 708844 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.648;DP=124;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=3.5789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.300;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1022,0,1474 chrX 708931 . A G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.957;DP=114;Dels=0.00;FS=7.459;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.321;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:929,0,1424 chrX 708946 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.239;DP=119;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.863;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1151,0,1357 chrX 709147 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.643;DP=130;Dels=0.00;FS=4.127;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.609;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1273,0,1425 chrX 709369 . C T 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=24.64;SB=-2.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3597,355,0 chrX 709455 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.332;DP=173;Dels=0.00;FS=10.481;HaplotypeScore=3.6811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQ0=0;MQRankSum=2.311;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,61:173:99:1151,0,2270 chrX 709484 . C T 88.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.481;DP=182;Dels=0.00;FS=39.922;HaplotypeScore=29.6032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-6.246;QD=0.48;ReadPosRankSum=-2.335;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,27:182:99:118,0,3485 chrX 709489 . A G 2311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.773;DP=187;Dels=0.00;FS=3.042;HaplotypeScore=28.6085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,120:187:99:2341,0,1348 chrX 709498 . C G 2199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.293;DP=178;Dels=0.00;FS=2.134;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.039;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,113:178:99:2229,0,1248 chrX 709621 . A G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.752;DP=169;Dels=0.00;FS=15.165;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=3.290;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,55:169:99:988,0,2476 chrX 709747 . A C 2400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.554;DP=172;Dels=0.00;FS=1.285;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.671;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,117:172:99:2430,0,1035 chrX 709864 . C T 2867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.734;DP=194;Dels=0.00;FS=2.633;HaplotypeScore=3.2018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.124;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,127:194:99:2897,0,1217 chrX 709925 . C A 2974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;DP=193;Dels=0.00;FS=7.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.743;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,130:193:99:3004,0,1072 chrX 709978 . A C 2964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.111;DP=190;Dels=0.00;FS=9.906;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.973;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,136:190:99:2994,0,939 chrX 710013 . A G 4709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=24.27;SB=-2.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:194:99:4709,507,0 chrX 710097 . T C 545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.252;DP=173;Dels=0.00;FS=11.031;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,44:173:99:575,0,2894 chrX 710469 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.548;DP=136;Dels=0.00;FS=4.115;HaplotypeScore=65.1320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=10.88;ReadPosRankSum=3.394;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1509,0,1301 chrX 710763 . G A 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.494;DP=119;Dels=0.00;FS=1.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.260;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,74:119:99:1671,0,871 chrX 711083 . A T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;DP=134;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.312;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1309,0,1581 chrX 711149 . T A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;DP=136;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1634,0,1260 chrX 711174 . G T 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.462;DP=145;Dels=0.00;FS=6.195;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=11.82;ReadPosRankSum=2.865;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1744,0,1342 chrX 711200 . T C 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.938;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.874;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.982;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1755,0,1357 chrX 711237 . G T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.202;DP=140;Dels=0.00;FS=4.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.204;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1513,0,1374 chrX 711284 . G A 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.369;DP=124;Dels=0.00;FS=8.261;HaplotypeScore=3.5289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1452,0,1099 chrX 711398 . G A 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.431;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=12.81;ReadPosRankSum=-1.695;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,68:114:99:1490,0,898 chrX 711399 . C T 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.742;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=12.86;ReadPosRankSum=-1.863;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,68:114:99:1496,0,860 chrX 711556 . C T 479.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.486;DP=102;Dels=0.00;FS=5.260;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.13;MQ0=0;MQRankSum=-7.379;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,34:102:99:509,0,1455 chrX 711557 . G A 484.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.234;DP=102;Dels=0.00;FS=5.334;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.13;MQ0=0;MQRankSum=-7.197;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,34:102:99:514,0,1443 chrX 711558 . G A 496.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.034;DP=98;Dels=0.00;FS=5.458;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.78;MQ0=0;MQRankSum=-7.852;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,32:98:99:526,0,1453 chrX 711565 . C T 493.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.411;DP=111;Dels=0.00;FS=10.142;HaplotypeScore=4.5443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.34;MQ0=0;MQRankSum=-8.294;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,34:111:99:523,0,1706 chrX 711577 . A G 223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.857;DP=96;Dels=0.00;FS=9.195;HaplotypeScore=4.9648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.58;MQ0=0;MQRankSum=-6.935;QD=2.32;ReadPosRankSum=-2.933;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:253,0,1770 chrX 711580 . C A 216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;DP=95;Dels=0.00;FS=9.624;HaplotypeScore=4.9648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQ0=0;MQRankSum=-6.964;QD=2.27;ReadPosRankSum=-4.193;SB=-1.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:246,0,1761 chrX 711876 . G T 1105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.02;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1138,117,0 chrX 712830 . A G 97.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.54;MQ0=3;QD=5.12;SB=-4.730e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:15:130,15,0 chrX 714056 . A G 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.181;DP=91;Dels=0.00;FS=12.286;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.57;MQ0=0;MQRankSum=-3.553;QD=7.59;ReadPosRankSum=2.354;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:721,0,1252 chrX 714093 . A C 225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.034;DP=93;Dels=0.00;FS=4.976;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQ0=0;MQRankSum=-4.344;QD=2.42;ReadPosRankSum=-6.288;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:255,0,1695 chrX 714315 . C T 14.20 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.94;MQ0=44;MQRankSum=1.050;QD=0.23;ReadPosRankSum=-2.450;SB=-1.271e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,12:63:20:44,0,20 chrX 714600 . C A 470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.408;DP=119;Dels=0.00;FS=5.308;HaplotypeScore=4.8093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=3.95;ReadPosRankSum=2.739;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,31:119:99:500,0,1810 chrX 714603 . C T 460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;DP=117;Dels=0.00;FS=8.859;HaplotypeScore=4.8093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=3.93;ReadPosRankSum=2.575;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,30:117:99:490,0,1842 chrX 714619 . C T 522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.434;DP=119;Dels=0.00;FS=8.340;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=4.39;ReadPosRankSum=3.315;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,33:119:99:552,0,1765 chrX 714763 . T G 93.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.960;DP=64;Dels=0.00;FS=127.892;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.48;MQ0=0;MQRankSum=2.615;QD=1.45;ReadPosRankSum=-1.802;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:64:99:123,0,803 chrX 715072 . G T 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.798;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.747;QD=0.52;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,10:69:66:66,0,1078 chrX 715081 . T G 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.093;DP=67;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=2.9310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.94;MQ0=1;MQRankSum=-1.396;QD=0.40;ReadPosRankSum=0.902;SB=-1.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,10:67:57:57,0,1080 chrX 715087 . A G 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.755;DP=70;Dels=0.00;FS=3.197;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.85;MQ0=5;MQRankSum=-1.609;QD=0.50;ReadPosRankSum=0.864;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:65:65,0,997 chrX 715095 . G A 796.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;DP=69;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.54;MQ0=9;MQRankSum=1.577;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.716;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,50:69:94:826,0,94 chrX 715099 . G T 674.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.326;DP=66;Dels=0.00;FS=3.168;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.38;MQ0=9;MQRankSum=2.154;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.960;SB=-2.649e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,46:66:76:704,0,76 chrX 715108 . A T 624.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;DP=72;Dels=0.00;FS=8.598;HaplotypeScore=4.7577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.49;MQ0=12;MQRankSum=2.236;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-2.118e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,46:72:99:654,0,112 chrX 715114 . G A 592.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.947;DP=84;Dels=0.00;FS=9.443;HaplotypeScore=170.2137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.50;MQ0=18;MQRankSum=3.534;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.026;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,49:84:99:622,0,109 chrX 715132 . T A 247.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;DP=83;Dels=0.00;FS=9.073;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.74;MQ0=22;MQRankSum=3.885;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.973;SB=-1.198e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:277,0,107 chrX 715141 . A G 484.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.729;DP=93;Dels=0.00;FS=6.575;HaplotypeScore=5.9479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.21;MQ0=24;MQRankSum=4.764;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.054;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:77:514,0,77 chrX 715306 . A T 2171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.67;MQ0=3;QD=24.95;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2204,219,0 chrX 715456 . A G 357.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.147;DP=88;Dels=0.00;FS=26.601;HaplotypeScore=3.9359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQ0=0;MQRankSum=-6.141;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:387,0,1464 chrX 715468 . A G 192.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;DP=85;Dels=0.00;FS=23.882;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.59;MQ0=0;MQRankSum=-5.839;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:222,0,1580 chrX 715471 . T C 165.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.578;DP=84;Dels=0.00;FS=23.517;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.012;QD=1.96;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:195,0,1599 chrX 715483 . C T 94.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;DP=79;Dels=0.00;FS=14.036;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.129;QD=1.19;ReadPosRankSum=-4.102;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:124,0,1459 chrX 715567 . G C 1621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;DP=70;Dels=0.00;FS=2.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=2.380;QD=23.16;ReadPosRankSum=-1.675;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,68:70:99:1654,168,0 chrX 715574 . C T 1563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.65;MQ0=0;QD=24.81;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1596,156,0 chrX 716647 . C T 1509 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1542,159,0 chrX 716913 . A G 1098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.40;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1131,126,0 chrX 718417 . C A 2222 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.25;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2255,225,0 chrX 718433 . G A 2116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.80;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2149,219,0 chrX 719114 . C T 1341 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.38;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1374,135,0 chrX 719596 . T G 1567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.34;MQ0=0;QD=24.87;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1600,168,0 chrX 719602 . A G 1561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.39;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1594,174,0 chrX 719662 . C T 937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=22.31;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:93:970,93,0 chrX 719842 . G A 1754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.20;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1787,180,0 chrX 720754 . T G 1333 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.15;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1366,147,0 chrX 721302 . G A 1202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1235,129,0 chrX 722194 . A T 1531 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1564,159,0 chrX 722324 . A G 1975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.09;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2008,222,0 chrX 722506 . G A 1314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.33;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1347,141,0 chrX 722676 . A C 1494 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.71;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1527,159,0 chrX 722816 . T A 1229 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1262,126,0 chrX 722891 . C A 1437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.66;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1470,153,0 chrX 723691 . A G 1306 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.19;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1339,141,0 chrX 723930 . C T 2086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.09;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2119,225,0 chrX 724397 . G A 1513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1546,159,0 chrX 724819 . C T 1513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.09;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1546,159,0 chrX 725020 . A G 1363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.72;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1396,150,0 chrX 725143 . C A 1775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.36;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1808,192,0 chrX 726071 . G A 1724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.99;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1757,174,0 chrX 726109 . C T 1679 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.44;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1712,177,0 chrX 726314 . C T 1660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.54;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1693,177,0 chrX 727023 . G C 1237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.800;DP=52;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=5.8967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=23.79;ReadPosRankSum=0.933;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:1270,135,0 chrX 727128 . T A 1893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1926,192,0 chrX 727369 . T C 1599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.98;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1632,171,0 chrX 727432 . A G 1692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.88;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1725,183,0 chrX 727905 . A T 1120 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=23.83;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1153,123,0 chrX 727911 . A G 1082 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.93;MQ0=0;QD=24.59;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1115,123,0 chrX 727914 . C T 1043 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.96;MQ0=0;QD=24.26;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:43:99:1076,117,0 chrX 727915 . T C 1030 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.575;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:99:1063,117,0 chrX 728001 . C T 1619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.74;MQ0=0;QD=23.81;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:68:99:1652,180,0 chrX 728166 . T A 1144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.654;DP=44;Dels=0.00;FS=3.212;HaplotypeScore=7.1073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=26.00;ReadPosRankSum=0.787;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:99:1177,123,0 chrX 728402 . T C 1755 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;QD=24.37;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1788,183,0 chrX 728403 . T A 1818 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;QD=25.25;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1851,183,0 chrX 728404 . G A 1832 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;QD=25.44;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1865,183,0 chrX 728412 . G A 1806 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;QD=24.74;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1839,180,0 chrX 729048 . T C 140.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.367;DP=206;Dels=0.00;FS=13.179;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.81;MQ0=27;MQRankSum=-3.514;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.097;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,48:206:99:170,0,2961 chrX 729142 . T C 3862.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=40;QD=16.79;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:3862,420,0 chrX 729842 . A G 39.05 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.89;MQ0=43;MQRankSum=-0.727;QD=0.83;ReadPosRankSum=0.727;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,8:47:17:69,0,17 chrX 729847 . A G 13.24 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.26;MQ0=34;MQRankSum=-0.736;QD=0.36;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,2:37:20:43,0,20 chrX 729849 . C T 20.08 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.26;MQ0=34;MQRankSum=0.736;QD=0.54;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,2:37:18:50,0,18 chrX 729855 . C G 16.16 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.94;MQ0=37;MQRankSum=-0.736;QD=0.40;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,2:40:17:46,0,17 chrX 743001 . C G 118.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.44;MQ0=18;QD=4.54;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:26:18:151,18,0 chrX 743029 . G A 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.33;MQ0=9;MQRankSum=-1.268;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.676;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:60:90,0,60 chrX 743116 . A G 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.18;MQ0=4;QD=2.48;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:51,6,0 chrX 743331 . C T 339 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.99;MQ0=19;QD=8.27;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:39:372,39,0 chrX 743332 . C T 342 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.55;MQ0=17;QD=8.77;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:39:375,39,0 chrX 743425 . C G 390.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.511;DP=211;Dels=0.00;FS=10.497;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.41;MQ0=69;MQRankSum=-5.088;QD=1.85;ReadPosRankSum=-5.421;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,105:211:99:420,0,2242 chrX 743850 . C G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.90;MQ0=4;QD=0.70;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:6:53,6,0 chrX 743851 . G C 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.47;MQ0=2;QD=0.67;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:6:50,6,0 chrX 744072 . A G 827.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.711;DP=245;Dels=0.00;FS=6.956;HaplotypeScore=57.6344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.46;MQ0=41;MQRankSum=2.056;QD=3.38;ReadPosRankSum=-1.861;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,71:245:99:857,0,1924 chrX 744108 . G A 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.614;DP=217;Dels=0.00;FS=1.944;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.90;MQ0=57;MQRankSum=-0.559;QD=0.17;ReadPosRankSum=3.400;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,27:217:67:67,0,1926 chrX 744291 . T C 1110.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.508;DP=271;Dels=0.00;FS=7.430;HaplotypeScore=4.6286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.40;MQ0=36;MQRankSum=2.176;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.351;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,76:271:99:1140,0,2386 chrX 744408 . C G 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.807;DP=157;Dels=0.00;FS=21.300;HaplotypeScore=6.0468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.26;MQ0=80;MQRankSum=1.314;QD=0.15;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,30:157:53:53,0,301 chrX 744449 . G C 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;DP=182;Dels=0.00;FS=43.180;HaplotypeScore=21.2646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.12;MQ0=99;MQRankSum=-2.769;QD=0.10;ReadPosRankSum=0.938;SB=-3.079e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,41:182:49:49,0,299 chrX 744922 . G T 34.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.764;DP=194;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=9.3330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.30;MQ0=163;MQRankSum=1.488;QD=0.18;ReadPosRankSum=-2.008;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,16:194:64:64,0,156 chrX 744966 . G A 40.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.289;DP=225;Dels=0.00;FS=2.586;HaplotypeScore=15.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.79;MQ0=197;MQRankSum=1.167;QD=0.18;ReadPosRankSum=2.653;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,12:225:70:70,0,137 chrX 744973 . T C 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;DP=228;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=16.6289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.64;MQ0=201;MQRankSum=0.636;QD=0.11;ReadPosRankSum=0.968;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,30:228:56:56,0,140 chrX 745017 . C T 310.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.633;DP=300;Dels=0.00;FS=23.183;HaplotypeScore=35.3809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.07;MQ0=182;MQRankSum=1.219;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.105;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,75:300:99:340,0,749 chrX 745020 . T C 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.345;DP=285;Dels=0.00;FS=3.892;HaplotypeScore=41.7771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.59;MQ0=166;MQRankSum=1.133;QD=0.09;ReadPosRankSum=1.788;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,29:285:57:57,0,1078 chrX 745045 . T C 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;DP=359;Dels=0.00;FS=32.384;HaplotypeScore=60.1204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.90;MQ0=201;MQRankSum=2.287;QD=0.10;ReadPosRankSum=-1.395;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:347,12:359:65:65,0,1419 chrX 745049 . A G 168.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.035;DP=357;Dels=0.00;FS=22.510;HaplotypeScore=60.1386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.05;MQ0=199;MQRankSum=1.873;QD=0.47;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:324,33:357:99:198,0,1313 chrX 745053 . G T 22.03 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.941;DP=370;Dels=0.00;FS=37.970;HaplotypeScore=25.9163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.38;MQ0=203;MQRankSum=1.688;QD=0.06;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:354,16:370:52:52,0,1579 chrX 745070 . G A 209.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.885;DP=391;Dels=0.00;FS=25.225;HaplotypeScore=87.8900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.54;MQ0=212;MQRankSum=0.864;QD=0.53;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,53:391:99:239,0,1499 chrX 745071 . C T 94.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.473;DP=391;Dels=0.00;FS=4.856;HaplotypeScore=88.7221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.54;MQ0=212;MQRankSum=-0.291;QD=0.24;ReadPosRankSum=-1.562;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:316,61:391:99:124,0,1499 chrX 745080 . G A 165.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;DP=398;Dels=0.00;FS=58.377;HaplotypeScore=88.9281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.02;MQ0=212;MQRankSum=2.561;QD=0.41;ReadPosRankSum=2.553;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:367,31:398:99:195,0,1668 chrX 745088 . G A 177.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.774;DP=407;Dels=0.00;FS=60.403;HaplotypeScore=3.6523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.81;MQ0=214;MQRankSum=2.587;QD=0.43;ReadPosRankSum=3.263;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:372,35:407:99:207,0,1795 chrX 745114 . A C 173.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.762;DP=298;Dels=0.00;FS=12.080;HaplotypeScore=91.2948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.64;MQ0=164;MQRankSum=-0.855;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.475;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,60:298:99:203,0,1513 chrX 745115 . G T 97.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.062;DP=289;Dels=0.00;FS=35.044;HaplotypeScore=89.6305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.89;MQ0=158;MQRankSum=0.588;QD=0.34;ReadPosRankSum=-1.290;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,55:289:99:127,0,1571 chrX 745121 . G C 312.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.201;DP=284;Dels=0.00;FS=30.017;HaplotypeScore=50.1623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.93;MQ0=152;MQRankSum=0.762;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.883;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,54:284:99:342,0,1264 chrX 745330 . G A 249.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.419;DP=415;Dels=0.00;FS=5.989;HaplotypeScore=61.6747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.60;MQ0=32;MQRankSum=3.822;QD=0.60;ReadPosRankSum=2.514;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:371,44:415:99:279,0,6190 chrX 745379 . T C 1674.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.087;DP=322;Dels=0.00;FS=0.940;HaplotypeScore=31.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.27;MQ0=38;MQRankSum=3.513;QD=5.20;ReadPosRankSum=-1.484;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,119:322:99:1704,0,2844 chrX 745401 . C T 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.509;DP=267;Dels=0.00;FS=7.179;HaplotypeScore=52.5354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.37;MQ0=36;MQRankSum=-0.690;QD=0.16;ReadPosRankSum=2.628;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,30:267:73:73,0,3436 chrX 745411 . G C 207.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;DP=226;Dels=0.00;FS=44.426;HaplotypeScore=58.9611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.21;MQ0=29;MQRankSum=-0.663;QD=0.92;ReadPosRankSum=1.658;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,34:226:99:237,0,2574 chrX 745413 . C G 218.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;DP=227;Dels=0.00;FS=46.439;HaplotypeScore=21.8254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.88;MQ0=29;MQRankSum=-0.369;QD=0.96;ReadPosRankSum=1.930;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,33:227:99:248,0,2580 chrX 745436 . T C 375.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;DP=152;Dels=0.00;FS=81.913;HaplotypeScore=163.5659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.56;MQ0=10;MQRankSum=-2.033;QD=2.47;ReadPosRankSum=1.916;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,50:152:99:405,0,1079 chrX 745451 . G A 522.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.785;DP=131;Dels=0.00;FS=2.777;HaplotypeScore=60.2467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.25;MQ0=4;MQRankSum=-0.630;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:552,0,1020 chrX 745461 . A T 599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.678;DP=142;Dels=0.00;FS=4.744;HaplotypeScore=33.5918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.99;MQ0=3;MQRankSum=-0.411;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,60:142:99:629,0,1210 chrX 745488 . G A 262.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.365;DP=148;Dels=0.00;FS=26.214;HaplotypeScore=86.2497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.45;MQ0=3;MQRankSum=-5.078;QD=1.77;ReadPosRankSum=1.917;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,59:148:99:292,0,1637 chrX 745492 . A G 213.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.842;DP=139;Dels=0.00;FS=28.100;HaplotypeScore=96.7983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.94;MQ0=2;MQRankSum=-4.646;QD=1.53;ReadPosRankSum=1.178;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,53:139:99:243,0,1674 chrX 745495 . G A 1293.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.231;DP=140;Dels=0.00;FS=0.800;HaplotypeScore=111.4670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.88;MQ0=2;MQRankSum=4.793;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.634;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1323,0,626 chrX 745504 . A G 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.085;DP=129;Dels=0.00;FS=31.344;HaplotypeScore=39.2569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.84;MQ0=2;MQRankSum=4.908;QD=11.98;ReadPosRankSum=5.015;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,86:129:48:1575,0,48 chrX 745529 . G A 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.852;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.5496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.14;MQ0=2;MQRankSum=2.650;QD=8.89;ReadPosRankSum=2.172;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1026,0,687 chrX 745571 . G A 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.048;DP=67;Dels=0.00;FS=10.025;HaplotypeScore=29.0075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.41;MQ0=0;MQRankSum=1.464;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.351;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,49:67:69:776,0,69 chrX 745593 . C G 616.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;DP=57;Dels=0.00;FS=2.423;HaplotypeScore=12.7449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.453;SB=-1.518e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,45:57:27:646,0,27 chrX 745597 . A T 649.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;DP=54;Dels=0.00;FS=2.400;HaplotypeScore=22.6592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.151;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,48:54:41:679,0,41 chrX 745598 . A G 630.06 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.342;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=23.6236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-1.346e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,46:51:16:660,0,16 chrX 745609 . T C 304.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=21.4175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.97;MQ0=0;QD=9.21;SB=-7.906e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:32:39:337,39,0 chrX 745692 . G T 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;DP=37;Dels=0.03;FS=1.942;HaplotypeScore=62.1262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.00;MQ0=3;MQRankSum=0.732;QD=0.41;ReadPosRankSum=1.724;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,8:36:45:45,0,174 chrX 745698 . T G 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;DP=35;Dels=0.03;FS=8.900;HaplotypeScore=55.8372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.61;MQ0=3;MQRankSum=0.172;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.516;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:76:76,0,111 chrX 745747 . G T 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.76;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=0.87;ReadPosRankSum=-1.134;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:40:40,0,62 chrXI 100 . C G 193.03 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.417;DP=26;Dels=0.00;FS=5.579;HaplotypeScore=12.7560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.472;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:19:223,0,19 chrXI 139 . T C 245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;DP=29;Dels=0.00;FS=13.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.62;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-1.848e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:32:275,0,32 chrXI 155 . C T 241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;DP=34;Dels=0.00;FS=5.347;HaplotypeScore=8.8794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.091;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:271,0,192 chrXI 162 . C T 218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=31;Dels=0.00;FS=5.632;HaplotypeScore=11.3908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.652;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:248,0,214 chrXI 179 . C A 87.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;DP=25;Dels=0.00;FS=1.697;HaplotypeScore=4.4980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.54;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=3.48;ReadPosRankSum=-4.105;SB=-4.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:117,0,254 chrXI 218 . A G 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.245;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.52;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.485;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:54:54,0,199 chrXI 236 . C T 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=17;Dels=0.00;FS=6.422;HaplotypeScore=5.9613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.95;MQ0=0;MQRankSum=2.205;QD=0.89;ReadPosRankSum=2.079;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:45:45,0,190 chrXI 237 . C A 283 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.95;MQ0=0;QD=16.65;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:39:316,39,0 chrXI 240 . T A 17.09 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;DP=16;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=3.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.27;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=1.07;ReadPosRankSum=2.018;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:47:47,0,173 chrXI 243 . T C 69.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.486;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.880;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:80:99,0,80 chrXI 249 . T C 53.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.22;MQ0=0;QD=6.75;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:86,9,0 chrXI 250 . T C 50.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.22;MQ0=0;QD=6.37;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:83,9,0 chrXI 254 . C T 51.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.22;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.922;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,4:8:9:84,9,0 chrXI 307 . G A 89.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;DP=49;Dels=0.00;FS=9.499;HaplotypeScore=8.8719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.48;MQ0=14;MQRankSum=0.433;QD=1.82;ReadPosRankSum=-1.546;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,9:49:99:119,0,389 chrXI 324 . T A 108.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;DP=47;Dels=0.00;FS=3.848;HaplotypeScore=13.5525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.58;MQ0=15;MQRankSum=-0.283;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,8:47:99:138,0,364 chrXI 329 . A G 123.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.761;DP=49;Dels=0.00;FS=5.305;HaplotypeScore=16.3492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.73;MQ0=15;MQRankSum=1.473;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.583;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:153,0,385 chrXI 347 . A G 133.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;DP=48;Dels=0.00;FS=6.017;HaplotypeScore=3.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.00;MQ0=14;MQRankSum=-0.273;QD=2.77;ReadPosRankSum=-1.327;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,9:48:99:163,0,389 chrXI 437 . G T 110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.047;DP=22;Dels=0.00;FS=23.529;HaplotypeScore=8.7508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.01;MQ0=1;MQRankSum=1.196;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.890;SB=-1.252e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:22:29:140,0,29 chrXI 438 . T C 218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.01;MQ0=1;QD=9.91;SB=-1.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:27:251,27,0 chrXI 492 . T C 138.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.636;DP=40;Dels=0.00;FS=13.414;HaplotypeScore=15.6984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.084;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.922;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:168,0,412 chrXI 497 . C A 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.081;DP=42;Dels=0.00;FS=7.469;HaplotypeScore=15.7001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.340;QD=0.93;ReadPosRankSum=-2.149;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:69:69,0,481 chrXI 498 . T A 298.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;DP=43;Dels=0.00;FS=26.913;HaplotypeScore=20.5702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.43;MQ0=0;MQRankSum=3.348;QD=6.93;ReadPosRankSum=1.984;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:328,0,236 chrXI 509 . G T 83.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.283;DP=41;Dels=0.00;FS=32.548;HaplotypeScore=14.6100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.72;MQ0=0;MQRankSum=-3.583;QD=2.02;ReadPosRankSum=-2.817;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:41:99:113,0,340 chrXI 510 . T C 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;DP=41;Dels=0.00;FS=21.725;HaplotypeScore=14.6100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.140;QD=0.39;ReadPosRankSum=-2.869;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:46:46,0,481 chrXI 546 . T G 48.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.430;DP=38;Dels=0.00;FS=36.795;HaplotypeScore=5.5414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.86;MQ0=1;MQRankSum=-4.399;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:78:78,0,407 chrXI 581 . A C 92.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.79;MQ0=1;QD=6.59;SB=-5.314e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:15:125,15,0 chrXI 595 . A G,T 52.42 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=17.50;MQ0=1;QD=5.24;SB=-2.546e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,3:10:38:112,47,38,65,0,59 chrXI 634 . A G 91.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.08;MQ0=0;QD=8.30;SB=-5.314e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:124,15,0 chrXI 640 . T A,C 54.34 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=24.27;MQ0=0;QD=6.04;SB=-5.276e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,3,6:9:39:114,66,60,48,0,39 chrXI 667 . G A 104.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.95;MQ0=0;QD=9.48;SB=-2.556e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:137,15,0 chrXI 673 . A G 90.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.95;MQ0=0;QD=8.21;SB=-2.556e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:123,15,0 chrXI 687 . A G 66.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.62;MQ0=0;MQRankSum=2.766;QD=3.48;ReadPosRankSum=3.427;SB=-9.212e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:14:96,0,14 chrXI 689 . T A 78.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.14;MQ0=0;QD=4.36;SB=-4.542e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:18:12:111,12,0 chrXI 704 . T C 437 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.07;MQ0=0;QD=14.10;SB=-6.545e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:54:470,54,0 chrXI 709 . T A 45.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.293;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.95;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=1.25;ReadPosRankSum=-1.235;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:75:75,0,307 chrXI 715 . C T 57.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.420;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.05;MQ0=0;MQRankSum=-3.099;QD=1.19;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:87:87,0,361 chrXI 724 . T G 633 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=31.3305;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.82;MQ0=0;QD=12.17;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:75:666,75,0 chrXI 725 . T C 67.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.190;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=33.2970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.81;MQ0=0;MQRankSum=2.351;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.092;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,7:53:97:97,0,424 chrXI 726 . C T 125.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.3786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.81;MQ0=0;MQRankSum=4.049;QD=2.36;ReadPosRankSum=-1.052;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:155,0,374 chrXI 733 . C A 318 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.980;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.5307;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.19;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.793;SB=3.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,23:49:39:351,39,0 chrXI 743 . C T 312.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;DP=53;Dels=0.00;FS=4.232;HaplotypeScore=47.5763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.74;MQ0=0;MQRankSum=4.395;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:342,0,150 chrXI 746 . C T 51.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;DP=59;Dels=0.00;FS=7.634;HaplotypeScore=55.7526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.52;MQ0=1;MQRankSum=3.345;QD=0.86;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,10:59:81:81,0,497 chrXI 749 . T C 55.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.1985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.52;MQ0=1;MQRankSum=-0.922;QD=0.93;ReadPosRankSum=2.596;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:59:85:85,0,482 chrXI 755 . T C 729 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.35;MQ0=2;QD=12.15;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:84:762,84,0 chrXI 831 . C G 185.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.791;DP=265;Dels=0.00;FS=1.465;HaplotypeScore=48.8897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.67;MQ0=5;MQRankSum=-0.562;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.046;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,38:265:99:215,0,4171 chrXI 932 . C A 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.065;DP=171;Dels=0.00;FS=32.113;HaplotypeScore=18.3096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.68;MQ0=1;MQRankSum=-3.984;QD=0.21;ReadPosRankSum=1.060;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,46:171:66:66,0,2564 chrXI 938 . A G 142.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.182;DP=201;Dels=0.00;FS=33.836;HaplotypeScore=12.5610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.354;QD=0.71;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,53:201:99:172,0,3007 chrXI 940 . T C 181.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.850;DP=205;Dels=0.00;FS=39.714;HaplotypeScore=37.1837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.12;MQ0=0;MQRankSum=-2.992;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.244;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,58:205:99:211,0,3154 chrXI 949 . C G 2110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.100;DP=196;Dels=0.00;FS=26.624;HaplotypeScore=105.6816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.48;MQ0=0;MQRankSum=2.801;QD=10.77;ReadPosRankSum=2.793;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,109:196:99:2140,0,1034 chrXI 959 . T C 1955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.530;DP=187;Dels=0.00;FS=19.050;HaplotypeScore=116.0240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.51;MQ0=0;MQRankSum=3.230;QD=10.45;ReadPosRankSum=3.124;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,102:187:99:1985,0,1173 chrXI 986 . C T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.160;DP=209;Dels=0.00;FS=2.489;HaplotypeScore=21.1543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.98;MQ0=2;MQRankSum=0.188;QD=7.29;ReadPosRankSum=2.134;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,85:209:99:1553,0,2192 chrXI 1010 . G T 1815.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.640;DP=205;Dels=0.00;FS=6.111;HaplotypeScore=12.7164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.31;MQ0=8;MQRankSum=2.065;QD=8.85;ReadPosRankSum=-2.521;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,105:205:99:1845,0,1586 chrXI 1012 . C T 1758.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.589;DP=198;Dels=0.00;FS=3.436;HaplotypeScore=40.7289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.36;MQ0=8;MQRankSum=1.929;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.977;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,99:198:99:1788,0,1548 chrXI 1021 . T A 366.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.487;DP=201;Dels=0.00;FS=2.523;HaplotypeScore=47.6588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.63;MQ0=9;MQRankSum=-1.667;QD=1.82;ReadPosRankSum=-1.514;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,32:201:99:396,0,3159 chrXI 1056 . G C 605.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.919;DP=144;Dels=0.00;FS=4.244;HaplotypeScore=19.7404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.26;MQ0=9;MQRankSum=-1.512;QD=4.20;ReadPosRankSum=-1.038;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,59:144:99:635,0,1566 chrXI 1061 . C A 195.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.224;DP=139;Dels=0.00;FS=2.016;HaplotypeScore=38.0195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.09;MQ0=9;MQRankSum=0.244;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,19:139:99:225,0,1851 chrXI 1067 . T C 689.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.534;DP=109;Dels=0.00;FS=3.910;HaplotypeScore=24.7156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.96;MQ0=9;MQRankSum=-3.568;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.409;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:719,0,794 chrXI 1077 . C A 114.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;DP=97;Dels=0.00;FS=10.199;HaplotypeScore=12.7572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.94;MQ0=13;MQRankSum=0.438;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.862;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,11:97:99:144,0,1024 chrXI 1115 . G A 328.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.90;MQ0=16;MQRankSum=0.371;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.966;SB=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,38:44:31:358,0,31 chrXI 1118 . C G 250.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;DP=43;Dels=0.00;FS=3.247;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.68;MQ0=16;MQRankSum=-0.655;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.843;SB=-6.816e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,34:43:37:280,0,37 chrXI 1129 . T A,G 226.34 filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;DP=47;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=17.83;MQ0=25;MQRankSum=1.261;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.000;SB=-3.389e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:10,32,5:47:38:286,65,38,221,0,212 chrXI 1167 . T C 55.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.000;DP=74;Dels=0.00;FS=2.993;HaplotypeScore=2.9410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.56;MQ0=51;MQRankSum=1.291;QD=0.74;ReadPosRankSum=-1.228;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,9:74:85:85,0,157 chrXI 1179 . T C 18.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.501;DP=89;Dels=0.00;FS=7.364;HaplotypeScore=12.0989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.21;MQ0=57;MQRankSum=-0.627;QD=0.20;ReadPosRankSum=-2.526;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:48:48,0,169 chrXI 1187 . A T 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.46;MQ0=62;MQRankSum=2.800;QD=0.46;ReadPosRankSum=1.339;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,8:101:76:76,0,356 chrXI 1200 . G T 70.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.291;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.61;MQ0=62;MQRankSum=2.693;QD=0.68;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,12:103:99:100,0,364 chrXI 1203 . G C 123.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;DP=104;Dels=0.00;FS=3.078;HaplotypeScore=20.9010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.00;MQ0=64;MQRankSum=-2.433;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.585;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,18:104:99:153,0,256 chrXI 1212 . G A 400.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;DP=108;Dels=0.00;FS=3.227;HaplotypeScore=22.8842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.33;MQ0=64;MQRankSum=0.567;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,39:108:72:430,0,72 chrXI 1220 . C T 123.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.478;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.1259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.27;MQ0=61;MQRankSum=3.758;QD=1.12;ReadPosRankSum=-2.220;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,10:110:99:153,0,281 chrXI 1233 . T A 125.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.79;MQ0=53;MQRankSum=4.378;QD=1.21;ReadPosRankSum=-4.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,10:103:99:155,0,320 chrXI 1272 . G A 183.02 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.194;DP=71;Dels=0.00;FS=23.295;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.02;MQ0=45;MQRankSum=1.639;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.194;SB=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:22:213,0,22 chrXI 1284 . T C 154.98 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=61;Dels=0.00;FS=26.881;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.89;MQ0=39;MQRankSum=1.954;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-9.725e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:3:184,0,3 chrXI 1299 . G A 126.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.574;DP=70;Dels=0.00;FS=16.250;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.56;MQ0=47;MQRankSum=0.837;QD=1.80;ReadPosRankSum=0.837;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,13:70:69:156,0,69 chrXI 1305 . G A 101.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.000;DP=76;Dels=0.00;FS=11.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.65;MQ0=53;MQRankSum=0.403;QD=1.33;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,13:76:94:131,0,94 chrXI 1347 . C A 198.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;DP=83;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.39;MQ0=61;MQRankSum=0.785;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,14:83:99:228,0,118 chrXI 1348 . A C 148.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.856;DP=83;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.39;MQ0=61;MQRankSum=0.580;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,14:83:99:178,0,120 chrXI 1354 . A G 197.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;DP=91;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.61;MQ0=66;MQRankSum=-0.083;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.860;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,15:91:99:227,0,150 chrXI 1366 . T C 263.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.982;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.48;MQ0=64;MQRankSum=0.210;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:293,0,141 chrXI 1379 . G A 199.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.789;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.18;MQ0=57;MQRankSum=0.127;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.602;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,20:85:99:229,0,112 chrXI 1381 . T C 198.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.789;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.18;MQ0=57;MQRankSum=-0.025;QD=2.33;ReadPosRankSum=1.754;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,20:85:99:228,0,125 chrXI 1411 . C T 169.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;DP=68;Dels=0.00;FS=2.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.45;MQ0=42;MQRankSum=-0.161;QD=2.49;ReadPosRankSum=-1.525;SB=1.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:25:199,0,25 chrXI 1417 . C A 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;DP=60;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.16;MQ0=39;MQRankSum=-0.251;QD=0.63;ReadPosRankSum=-0.452;SB=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:39:68,0,39 chrXI 1447 . T C 41.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.795;DP=71;Dels=0.00;FS=5.275;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.91;MQ0=48;MQRankSum=0.484;QD=0.58;ReadPosRankSum=-1.081;SB=1.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:17:71,0,17 chrXI 1454 . C T 41.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;DP=64;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.97;MQ0=46;MQRankSum=0.887;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.493;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:17:71,0,17 chrXI 1551 . G A 54.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.53;MQ0=15;QD=1.49;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:9:87,9,0 chrXI 1593 . G T 82.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7656;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.50;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:115,12,0 chrXI 1596 . T C 76.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=15.30;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:109,12,0 chrXI 1602 . A G 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.93;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 chrXI 1603 . C G 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:56,6,0 chrXI 1605 . A G 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrXI 1679 . T C 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.67;MQ0=4;QD=1.75;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:54,6,0 chrXI 2035 . A G 46.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.67;MQ0=1;QD=3.13;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:9:79,9,0 chrXI 2041 . T C 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.36;MQ0=0;QD=2.16;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:55,6,0 chrXI 2050 . G A 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.36;MQ0=0;QD=2.16;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:55,6,0 chrXI 2059 . A G 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.36;MQ0=0;QD=2.16;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:55,6,0 chrXI 2071 . G A 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.66;MQ0=0;QD=2.38;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:55,6,0 chrXI 2080 . A G 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.02;MQ0=0;QD=2.53;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:54,6,0 chrXI 2146 . G A 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.89;MQ0=0;QD=1.34;SB=-1.639e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:50,6,0 chrXI 2158 . A G 66.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.22;MQ0=1;MQRankSum=0.964;QD=3.50;ReadPosRankSum=-1.735;SB=-4.882e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:12:99,12,0 chrXI 2183 . A G 416 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.76;MQ0=1;QD=10.40;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:45:449,45,0 chrXI 2326 . A G 1455 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.02;MQ0=9;QD=20.21;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1488,153,0 chrXI 2538 . T C 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;DP=115;Dels=0.00;FS=14.936;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.13;MQ0=18;MQRankSum=-4.066;QD=0.38;ReadPosRankSum=1.011;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,18:115:74:74,0,1737 chrXI 2549 . C A 44.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.170;DP=118;Dels=0.00;FS=22.309;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.56;MQ0=20;MQRankSum=-4.006;QD=0.37;ReadPosRankSum=1.633;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:74:74,0,1682 chrXI 2550 . A G 31.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;DP=118;Dels=0.00;FS=22.309;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.56;MQ0=20;MQRankSum=-3.575;QD=0.26;ReadPosRankSum=1.726;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:61:61,0,1744 chrXI 2556 . T G 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.399;DP=109;Dels=0.00;FS=26.222;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.81;MQ0=20;MQRankSum=-3.172;QD=0.14;ReadPosRankSum=0.148;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,19:109:45:45,0,1538 chrXI 2591 . T A 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;DP=93;Dels=0.00;FS=27.705;HaplotypeScore=4.7439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.07;MQ0=22;MQRankSum=-1.122;QD=0.54;ReadPosRankSum=-1.316;SB=-6.515e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,13:93:80:80,0,1258 chrXI 2592 . G A 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;DP=93;Dels=0.00;FS=27.705;HaplotypeScore=8.6201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.07;MQ0=22;MQRankSum=-1.925;QD=0.53;ReadPosRankSum=-1.464;SB=-6.512e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,13:93:79:79,0,1245 chrXI 2602 . A T 135.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.675;DP=91;Dels=0.00;FS=75.675;HaplotypeScore=9.7362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.01;MQ0=17;MQRankSum=-0.835;QD=1.48;ReadPosRankSum=0.360;SB=-3.000e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:165,0,1251 chrXI 2720 . A G 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.953;DP=104;Dels=0.00;FS=36.625;HaplotypeScore=18.8358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.22;MQ0=2;MQRankSum=-4.393;QD=0.18;ReadPosRankSum=2.322;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,18:104:49:49,0,1845 chrXI 2722 . C G 218.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.292;DP=103;Dels=0.00;FS=103.674;HaplotypeScore=18.8358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.42;MQ0=1;MQRankSum=-2.862;QD=2.12;ReadPosRankSum=-5.097;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:248,0,1581 chrXI 2734 . C T 58.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.583;DP=73;Dels=0.00;FS=18.161;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.99;MQ0=1;MQRankSum=-5.154;QD=0.79;ReadPosRankSum=2.174;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:88:88,0,1230 chrXI 2820 . A T 588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.520;DP=74;Dels=0.00;FS=15.737;HaplotypeScore=7.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=1;MQRankSum=-1.940;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-6.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:618,0,917 chrXI 2840 . A G 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.023;DP=84;Dels=0.00;FS=12.998;HaplotypeScore=6.9542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.894;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.515;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:706,0,972 chrXI 2849 . C A 751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.247;DP=87;Dels=0.00;FS=5.460;HaplotypeScore=5.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.091;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:781,0,927 chrXI 2865 . A T 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.330;DP=91;Dels=0.00;FS=10.325;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:871,0,961 chrXI 2928 . A G 1542 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.65;MQ0=0;QD=22.35;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1575,177,0 chrXI 2946 . T C 1767 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.98;MQ0=0;QD=22.95;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1800,186,0 chrXI 2960 . C T 1544 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.95;MQ0=0;QD=23.75;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1577,156,0 chrXI 3028 . G A 1688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=84;Dels=0.00;FS=9.243;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.91;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.650;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,83:84:99:1721,165,0 chrXI 3030 . C A 1785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=21.00;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1818,192,0 chrXI 3042 . T G 1503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.55;MQ0=0;QD=19.03;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1536,165,0 chrXI 3047 . C T 1563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.86;MQ0=0;QD=19.30;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1596,174,0 chrXI 3107 . T G 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.68;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3429,372,0 chrXI 3136 . T C 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.36;MQ0=0;QD=25.78;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3919,402,0 chrXI 3207 . C T 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3220,309,0 chrXI 3224 . A C 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6537;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=23.94;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2618,270,0 chrXI 3263 . A G 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.54;MQ0=0;QD=26.21;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3100,336,0 chrXI 3277 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.439;DP=115;Dels=0.00;FS=5.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.899;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1200,0,1233 chrXI 3299 . T C 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.38;MQ0=0;QD=27.02;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3005,321,0 chrXI 3391 . C T 1683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.26;MQ0=0;QD=20.28;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1716,180,0 chrXI 3393 . G A 1633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.26;MQ0=0;QD=19.67;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:83:99:1666,180,0 chrXI 3599 . C T 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3175,333,0 chrXI 3638 . A G 2791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2824,294,0 chrXI 3640 . T A 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2993,306,0 chrXI 3696 . T C 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.892;DP=73;Dels=0.00;FS=1.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,35:73:99:710,0,802 chrXI 3898 . A G 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3423,363,0 chrXI 3926 . A G 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3239,339,0 chrXI 3968 . A T 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3710,378,0 chrXI 4004 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;DP=113;Dels=0.00;FS=7.419;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1214,0,1218 chrXI 4436 . T C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.945;DP=103;Dels=0.00;FS=2.563;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.335;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:103:99:997,0,1023 chrXI 4534 . G A 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2927,306,0 chrXI 5114 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.433;DP=133;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.6548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.787;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:133:99:1327,0,1421 chrXI 5676 . G C 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.643;DP=114;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:921,0,1210 chrXI 5780 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.682;DP=129;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.177;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1502,0,1138 chrXI 6504 . C A 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.010;DP=133;Dels=0.00;FS=1.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.298;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,53:133:99:946,0,1708 chrXI 6589 . A G 2190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:99:2223,249,0 chrXI 6715 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.289;DP=125;Dels=0.00;FS=15.977;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=9.86;ReadPosRankSum=2.030;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1263,0,1223 chrXI 7040 . T C 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3673,390,0 chrXI 7228 . C T 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.565;DP=115;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.424;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1092,0,1234 chrXI 7552 . A T 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3270,339,0 chrXI 7571 . T G 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.99;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2782,297,0 chrXI 7595 . C T 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=26.73;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2813,285,0 chrXI 7651 . A C 1599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=61.6398;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.71;MQ0=0;QD=23.87;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1632,171,0 chrXI 7691 . C T 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.978;DP=78;Dels=0.00;FS=3.133;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.496;QD=10.13;ReadPosRankSum=-2.230;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:820,0,711 chrXI 7704 . A G 1684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.71;MQ0=0;QD=23.72;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1717,189,0 chrXI 7717 . G A 738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;DP=81;Dels=0.00;FS=0.895;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.300;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:768,0,833 chrXI 7726 . C T 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.187;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.089;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,46:85:99:951,0,810 chrXI 7765 . A T 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;DP=91;Dels=0.00;FS=0.830;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.095;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:814,0,1176 chrXI 7823 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.340;DP=100;Dels=0.00;FS=3.738;HaplotypeScore=3.1346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=11.10;ReadPosRankSum=2.022;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:100:99:1140,0,949 chrXI 7940 . A G 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3488,387,0 chrXI 8044 . G A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.485;DP=130;Dels=0.01;FS=8.144;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=2.592;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.773;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1168,0,1447 chrXI 8174 . G C 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3377,366,0 chrXI 8196 . C A 1248.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;DP=127;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=3.4821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1278,0,1377 chrXI 8197 . T C 1337.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.706;DP=128;Dels=0.00;FS=6.798;HaplotypeScore=3.4821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.562;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1367,0,1336 chrXI 8204 . C G 3408.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3408,360,0 chrXI 8306 . A G 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;DP=77;Dels=0.00;FS=0.933;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.990;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:878,0,663 chrXI 8317 . A G 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.004;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:749,0,960 chrXI 8368 . C T 1903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=136;Dels=0.00;FS=6.422;HaplotypeScore=3.5571;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.09;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:1936,204,0 chrXI 8390 . A G 507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.981;DP=126;Dels=0.00;FS=0.823;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.18;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=4.02;ReadPosRankSum=0.032;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:537,0,907 chrXI 8566 . A T 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3059,315,0 chrXI 8603 . A C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;DP=107;Dels=0.00;FS=2.584;HaplotypeScore=3.9342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.462;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1141,0,1116 chrXI 8651 . G A 2547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2580,258,0 chrXI 8716 . T G 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3171,339,0 chrXI 8720 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=104;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.281;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1092,0,1041 chrXI 8772 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.253;DP=113;Dels=0.00;FS=5.853;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.422;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1159,0,1179 chrXI 8789 . C T 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.545;DP=128;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.428;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1235,0,1386 chrXI 8828 . A G 2325 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.20;MQ0=0;QD=25.00;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2358,273,0 chrXI 8855 . T C 2155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=25.65;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2188,240,0 chrXI 8856 . T C 2136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=25.43;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2169,240,0 chrXI 8867 . G A 620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.440;DP=86;Dels=0.00;FS=2.886;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.68;MQ0=0;MQRankSum=-5.607;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.064;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,36:86:99:650,0,1026 chrXI 8876 . G A 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.072;DP=86;Dels=0.00;FS=2.972;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.22;MQ0=0;MQRankSum=4.303;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:971,0,604 chrXI 8878 . G A 537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.374;DP=85;Dels=0.00;FS=5.865;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.73;MQ0=0;MQRankSum=-6.378;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.492;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:567,0,936 chrXI 8889 . A G 623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.527;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.50;MQ0=0;MQRankSum=-5.078;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.144;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:653,0,1124 chrXI 8893 . A C 2095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.49;MQ0=0;QD=22.05;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2128,234,0 chrXI 8909 . A G 617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.378;DP=100;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=-4.225;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.309;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:647,0,1136 chrXI 8944 . T A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.888;DP=108;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQ0=0;MQRankSum=5.685;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.469;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1093,0,1008 chrXI 8980 . C T 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.59;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3563,372,0 chrXI 9055 . T C 4002.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4002,423,0 chrXI 9097 . G A 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.651;DP=107;Dels=0.00;FS=2.488;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1152,0,1099 chrXI 9262 . T C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.536;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1097,0,1201 chrXI 9305 . G A 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=128;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,74:128:99:1586,0,1055 chrXI 9486 . C T 653.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.682;DP=107;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.016;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,44:107:99:683,0,1352 chrXI 9487 . G A 644.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.372;DP=107;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.035;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,44:107:99:674,0,1289 chrXI 9490 . T C 608.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.288;DP=115;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:638,0,1492 chrXI 9690 . G A 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.198;DP=142;Dels=0.00;FS=3.217;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.474;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1601,0,1197 chrXI 9915 . G A 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3260,336,0 chrXI 10393 . G A 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2989,315,0 chrXI 10540 . T C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.625;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.605;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1438,0,1374 chrXI 10550 . C T 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3711,370,0 chrXI 10565 . T A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.018;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.466;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1278,0,1472 chrXI 10641 . G A 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.220;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.209;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1294,0,1326 chrXI 10762 . A G 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3668,396,0 chrXI 10897 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=109;Dels=0.00;FS=3.575;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.417;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1039,0,1214 chrXI 10927 . T G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.019;DP=120;Dels=0.00;FS=2.413;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1060,0,1334 chrXI 10969 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.772;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.363;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1261,0,1081 chrXI 11105 . C T 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.844;DP=121;Dels=0.00;FS=4.444;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.591;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1139,0,1281 chrXI 11267 . T G 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.705;DP=128;Dels=0.00;FS=5.522;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.722;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1555,0,1051 chrXI 11470 . T A 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.594;DP=112;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.871;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1028,0,1372 chrXI 11657 . A C 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.780;DP=98;Dels=0.00;FS=0.817;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.355;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1056,0,928 chrXI 11751 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.716;DP=126;Dels=0.00;FS=3.309;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.466;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1250,0,1235 chrXI 11792 . A G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2974,321,0 chrXI 11839 . G T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.322;DP=142;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=2.6779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.361;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1483,0,1482 chrXI 11861 . T C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.203;DP=127;Dels=0.00;FS=2.247;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.133;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1258,0,1269 chrXI 12051 . C G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.645;DP=120;Dels=0.00;FS=1.641;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.612;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:120:99:1044,0,1257 chrXI 12060 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.695;DP=118;Dels=0.00;FS=2.657;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1093,0,1230 chrXI 12080 . A G 770.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.210;DP=111;Dels=0.00;FS=3.595;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=6.94;ReadPosRankSum=2.373;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:800,0,1421 chrXI 12084 . C T 796.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.982;DP=110;Dels=0.00;FS=7.516;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=7.24;ReadPosRankSum=3.047;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,43:110:99:826,0,1404 chrXI 12089 . A G 1114.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.696;DP=102;Dels=0.00;FS=13.529;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=2.215;QD=10.92;ReadPosRankSum=-2.126;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1144,0,827 chrXI 12136 . T A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.528;DP=114;Dels=0.00;FS=3.754;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=2.028;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1036,0,1318 chrXI 12201 . A G 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.546;DP=101;Dels=0.00;FS=4.931;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=2.690;QD=10.55;ReadPosRankSum=-2.227;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1096,0,965 chrXI 12224 . T C 1173.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.273;DP=107;Dels=0.00;FS=2.625;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.641;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1203,0,958 chrXI 12231 . G T 916.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.579;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.068;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:946,0,1242 chrXI 12232 . G A 916.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.577;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.171;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:946,0,1258 chrXI 12236 . A G 690.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.568;DP=94;Dels=0.00;FS=3.901;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:94:99:720,0,1205 chrXI 12256 . G A 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.434;DP=88;Dels=0.00;FS=7.269;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=12.23;ReadPosRankSum=2.406;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:1106,0,717 chrXI 12271 . G T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.903;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.736;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1112,0,1018 chrXI 12322 . C T 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.500;DP=125;Dels=0.00;FS=3.254;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.546;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1036,0,1471 chrXI 12346 . G A 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.617;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=72.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.610;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,51:125:99:910,0,1462 chrXI 12369 . T C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.838;DP=134;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1097,0,1545 chrXI 12437 . C T 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.72;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3380,345,0 chrXI 12444 . G T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.191;DP=124;Dels=0.01;FS=9.163;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.286;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1305,0,1216 chrXI 12451 . A C 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.72;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3173,336,0 chrXI 12460 . G A 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.47;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2908,303,0 chrXI 12525 . T C 2195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2228,255,0 chrXI 12560 . G A 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2978,300,0 chrXI 12572 . T G 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3039,318,0 chrXI 12606 . T C 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.899;DP=83;Dels=0.00;FS=2.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.552;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:888,0,848 chrXI 12620 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.470;DP=102;Dels=0.00;FS=1.772;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.226;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1176,0,893 chrXI 12646 . T C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.687;DP=130;Dels=0.00;FS=5.565;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=1.871;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.046;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1500,0,1158 chrXI 12657 . A C 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.295;DP=117;Dels=0.00;FS=7.353;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.316;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:881,0,1492 chrXI 12688 . G T 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.618;DP=132;Dels=0.00;FS=3.681;HaplotypeScore=48.6681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.145;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,51:132:99:787,0,1641 chrXI 12708 . G A 4200.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.51;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4200,430,0 chrXI 12724 . A G 3617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3617,381,0 chrXI 12741 . A G 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.538;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1317,0,1516 chrXI 12770 . G A 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;DP=152;Dels=0.00;FS=3.973;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=3.507;QD=10.73;ReadPosRankSum=-2.475;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1661,0,1527 chrXI 12817 . T A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;DP=129;Dels=0.00;FS=3.210;HaplotypeScore=2.6318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.773;QD=11.53;ReadPosRankSum=-2.688;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1517,0,1217 chrXI 12868 . T C 2233 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=20.68;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2266,249,0 chrXI 13003 . G C 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;DP=134;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=6.99;ReadPosRankSum=2.226;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,52:134:99:966,0,1784 chrXI 13004 . A T 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.134;DP=134;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=13.38;ReadPosRankSum=-2.440;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,82:134:99:1823,0,1012 chrXI 13039 . C G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.605;DP=115;Dels=0.00;FS=18.183;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.509;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1043,0,1338 chrXI 13108 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;DP=128;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.947;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1460,0,1090 chrXI 13115 . T G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.197;DP=116;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=8.55;ReadPosRankSum=-2.429;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1022,0,1379 chrXI 13223 . C T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.466;DP=131;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.340;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1195,0,1539 chrXI 13282 . T C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.486;DP=118;Dels=0.00;FS=3.652;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.991;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1031,0,1398 chrXI 13310 . G A,C 2993.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.60;MQ0=0;QD=21.53;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,67,72:139:99:3053,1568,1406,1485,0,1296 chrXI 13321 . C A 1317.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.080;DP=130;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.271;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1347,0,1258 chrXI 13322 . C A 1330.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.319;DP=129;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.185;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1360,0,1221 chrXI 13330 . A G 1020.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;DP=125;Dels=0.00;FS=4.334;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1050,0,1493 chrXI 13357 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;DP=95;Dels=0.00;FS=5.305;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=2.227;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.509;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1206,0,579 chrXI 13362 . T C 490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.129;DP=94;Dels=0.00;FS=3.973;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.101;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,37:94:99:520,0,1260 chrXI 13378 . A G 2017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.65;MQ0=0;QD=22.41;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2050,228,0 chrXI 13443 . T C 524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.514;DP=93;Dels=0.00;FS=4.344;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,38:93:99:554,0,1293 chrXI 13542 . A C 644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.461;DP=90;Dels=0.00;FS=5.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.172;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,37:90:99:674,0,1163 chrXI 13635 . A T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;DP=116;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.217;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.520;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1166,0,1329 chrXI 13712 . C T 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.100;DP=95;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:931,0,1049 chrXI 13729 . T G 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.899;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.425;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.098;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:881,0,1281 chrXI 13787 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.560;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1246,0,877 chrXI 13813 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.487;DP=109;Dels=0.00;FS=2.717;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=9.39;ReadPosRankSum=2.815;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1054,0,1115 chrXI 13945 . C A 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3315,336,0 chrXI 13973 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.235;DP=126;Dels=0.00;FS=7.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1063,0,1611 chrXI 14122 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.793;DP=117;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:1020,0,1436 chrXI 14229 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;DP=125;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=2.8052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1366,0,1245 chrXI 14280 . G C 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;DP=76;Dels=0.00;FS=0.873;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,35:76:99:714,0,876 chrXI 14288 . A G 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.118;DP=71;Dels=0.00;FS=1.998;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.152;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,42:71:99:831,0,592 chrXI 14300 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.257;DP=74;Dels=0.00;FS=0.894;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,43:74:99:888,0,633 chrXI 14320 . G A 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.693;DP=81;Dels=0.00;FS=3.003;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.697;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:764,0,824 chrXI 14349 . C T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;DP=88;Dels=0.00;FS=5.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.464;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:1061,0,686 chrXI 14350 . A G 590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.733;DP=86;Dels=0.00;FS=4.201;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.688;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:620,0,1104 chrXI 14360 . A G 656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.742;DP=90;Dels=0.00;FS=6.949;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.708;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:686,0,1128 chrXI 14361 . A T 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;DP=90;Dels=0.00;FS=6.949;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.627;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:703,0,1101 chrXI 14438 . A G 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.380;DP=117;Dels=0.00;FS=12.960;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.957;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:930,0,1379 chrXI 14456 . T C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.167;DP=109;Dels=0.00;FS=7.493;HaplotypeScore=2.3782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1023,0,1153 chrXI 14510 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.208;DP=124;Dels=0.00;FS=2.422;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.598;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1314,0,1326 chrXI 14550 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.479;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1270,0,1051 chrXI 14569 . G A 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.450;DP=123;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.928;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1302,0,1228 chrXI 14705 . G A 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.197;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,43:81:99:951,0,716 chrXI 14729 . T C 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2536,273,0 chrXI 15132 . A G 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3163,327,0 chrXI 15236 . G A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.035;DP=118;Dels=0.00;FS=12.876;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.438;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1262,0,1094 chrXI 15300 . G A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.585;DP=123;Dels=0.00;FS=5.416;HaplotypeScore=2.9611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.176;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1180,0,1229 chrXI 15315 . C A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=10.36;ReadPosRankSum=-2.898;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1397,0,1262 chrXI 15430 . A G 633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.911;DP=84;Dels=0.00;FS=1.799;HaplotypeScore=2.8340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.712;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,37:84:99:663,0,1045 chrXI 15715 . G A 1866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.94;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1899,192,0 chrXI 15842 . A G 1025 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.88;MQ0=0;QD=21.81;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1058,111,0 chrXI 15843 . A G 1022 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.55;MQ0=0;QD=21.29;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:1055,111,0 chrXI 15848 . A G 909 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.13;MQ0=0;QD=21.14;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:43:99:942,99,0 chrXI 15909 . T C 191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;DP=40;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=10.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.321;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.722;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:221,0,605 chrXI 15916 . T A 996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.04;MQ0=0;QD=23.71;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1029,108,0 chrXI 16008 . A C 349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.68;MQ0=0;QD=16.62;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:21:45:382,45,0 chrXI 16024 . A C 160.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.277;QD=4.85;ReadPosRankSum=3.406;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:190,0,172 chrXI 16031 . C T 132.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.017;DP=35;Dels=0.00;FS=5.023;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.95;MQ0=0;MQRankSum=-2.202;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.540;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:162,0,156 chrXI 16032 . G A 131.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=35;Dels=0.00;FS=5.023;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.142;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:161,0,161 chrXI 16053 . T A 447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.22;MQ0=0;QD=11.76;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:51:480,51,0 chrXI 16070 . A G 131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;DP=40;Dels=0.00;FS=9.360;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.025;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:161,0,293 chrXI 16089 . A T 290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.999;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.230;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:320,0,420 chrXI 16098 . T A 294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.009;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=6.53;ReadPosRankSum=2.191;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:324,0,418 chrXI 16115 . T G 228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;DP=41;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.474;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:258,0,463 chrXI 16121 . T C 500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.56;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.839;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:46:99:530,0,284 chrXI 16142 . C T 1071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=24.34;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1104,105,0 chrXI 16259 . T G 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.283;DP=78;Dels=0.00;FS=0.882;HaplotypeScore=4.3425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:701,0,864 chrXI 16263 . T A 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.254;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:797,0,870 chrXI 16303 . T C 650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.782;DP=79;Dels=0.00;FS=0.849;HaplotypeScore=4.8020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.115;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:680,0,924 chrXI 16344 . T C 539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.090;DP=63;Dels=0.00;FS=3.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:569,0,709 chrXI 16345 . T C 444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.406;DP=61;Dels=0.00;FS=3.697;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:474,0,732 chrXI 16395 . T C 751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.227;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,40:94:99:781,0,1204 chrXI 16419 . A G 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.428;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1453,0,1000 chrXI 16425 . G A 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.761;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.065;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:1007,0,1420 chrXI 16458 . T C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.746;DP=121;Dels=0.00;FS=4.681;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1402,0,1065 chrXI 16472 . G A 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.703;DP=98;Dels=0.00;FS=6.520;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.211;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1164,0,834 chrXI 16535 . G C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.074;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1108,0,1167 chrXI 16537 . T A 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.176;DP=115;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.003;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1195,0,1238 chrXI 16603 . G T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;DP=106;Dels=0.00;FS=11.434;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.038;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1094,0,1139 chrXI 16671 . T C 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3191,342,0 chrXI 16677 . T C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.750;DP=123;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=6.7897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1238,0,1231 chrXI 16703 . A G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.108;DP=124;Dels=0.00;FS=1.451;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.543;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1226,0,1326 chrXI 16738 . T C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.400;DP=120;Dels=0.00;FS=5.647;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1182,0,1282 chrXI 16782 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.301;DP=116;Dels=0.00;FS=19.088;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1102,0,1328 chrXI 16794 . T A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.983;DP=115;Dels=0.00;FS=23.884;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.320;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1021,0,1405 chrXI 16846 . T C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.212;DP=131;Dels=0.00;FS=20.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1255,0,1498 chrXI 16866 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.032;DP=133;Dels=0.00;FS=12.441;HaplotypeScore=2.7007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1270,0,1471 chrXI 16973 . T C 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.333;DP=95;Dels=0.00;FS=7.337;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.138;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:821,0,1120 chrXI 17061 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.553;DP=125;Dels=0.00;FS=3.265;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1127,0,1439 chrXI 17134 . A C 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.264;DP=119;Dels=0.00;FS=4.600;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.478;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1007,0,1457 chrXI 17206 . T A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.253;DP=119;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=6.7008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.457;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1018,0,1413 chrXI 17217 . G A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.766;DP=96;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,50:96:99:1122,0,953 chrXI 17482 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.533;DP=124;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.243;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1269,0,1153 chrXI 17520 . C T 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.152;DP=112;Dels=0.00;FS=4.659;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=2.460;QD=9.55;ReadPosRankSum=2.105;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1100,0,1201 chrXI 17570 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.207;DP=106;Dels=0.00;FS=1.600;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=13.55;ReadPosRankSum=2.465;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,65:106:99:1466,0,742 chrXI 17681 . A G 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.039;DP=98;Dels=0.00;FS=2.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.574;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:989,0,1100 chrXI 17863 . C A 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.167;DP=109;Dels=0.00;FS=4.731;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.736;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1197,0,983 chrXI 17883 . C T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.173;DP=134;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=7.6479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1197,0,1554 chrXI 18001 . G T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.724;DP=128;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.503;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1254,0,1259 chrXI 18055 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.627;DP=141;Dels=0.00;FS=2.125;HaplotypeScore=4.8396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.067;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.894;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1139,0,1644 chrXI 18152 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.528;DP=123;Dels=0.00;FS=3.280;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.335;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1284,0,1311 chrXI 18574 . A G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.550;DP=139;Dels=0.00;FS=2.183;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1312,0,1395 chrXI 18639 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.713;DP=93;Dels=0.00;FS=3.892;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:1217,0,796 chrXI 18739 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.015;DP=140;Dels=0.00;FS=3.214;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.390;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1399,0,1317 chrXI 18848 . A G 2725 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.67;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2758,297,0 chrXI 18850 . G C 2705 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.50;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2738,297,0 chrXI 18852 . A T 2837 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.575;DP=110;Dels=0.00;FS=4.181;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.61;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=25.79;ReadPosRankSum=1.575;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2870,297,0 chrXI 18863 . T A 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.29;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3185,336,0 chrXI 18921 . G A 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.23;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3270,342,0 chrXI 19032 . C T 2754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=1;QD=25.27;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2787,291,0 chrXI 19074 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.050;DP=107;Dels=0.00;FS=8.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=1;MQRankSum=-0.539;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1064,0,1101 chrXI 19206 . T C 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.51;MQ0=0;QD=24.84;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2567,276,0 chrXI 19335 . C T 2018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.30;MQ0=0;QD=26.91;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2051,213,0 chrXI 19367 . G A 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.97;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2946,291,0 chrXI 19443 . C T 2576 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.51;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2609,276,0 chrXI 19447 . T G 2471 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.93;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2504,276,0 chrXI 19491 . C T 1978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.49;MQ0=0;QD=21.98;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2011,213,0 chrXI 19503 . A G 1628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.72;MQ0=0;QD=19.38;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1661,195,0 chrXI 19521 . C T 1733 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.66;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1766,189,0 chrXI 19529 . C T 1721 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.25;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1754,189,0 chrXI 19537 . C G 1562 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.59;MQ0=0;QD=19.52;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1595,177,0 chrXI 19538 . G A 1621 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.59;MQ0=0;QD=20.26;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1654,174,0 chrXI 19543 . T G 639.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.071;DP=90;Dels=0.00;FS=4.481;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.824;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:669,0,650 chrXI 19563 . C T 1332 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.39;MQ0=0;QD=19.88;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1365,147,0 chrXI 19629 . C T 1951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.65;MQ0=0;QD=22.95;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1984,210,0 chrXI 19632 . T C 1866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.09;MQ0=0;QD=21.45;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1899,207,0 chrXI 19657 . T C 2176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.87;MQ0=0;QD=25.01;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2209,246,0 chrXI 20014 . T C 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4012,414,0 chrXI 20104 . C T 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.23;MQ0=1;QD=26.27;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3441,363,0 chrXI 20142 . T C 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.294;DP=94;Dels=0.00;FS=0.851;HaplotypeScore=2.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.691;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:94:99:790,0,1127 chrXI 20175 . A C 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;DP=84;Dels=0.04;FS=6.964;HaplotypeScore=63.1454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.38;MQ0=0;MQRankSum=2.011;QD=0.27;ReadPosRankSum=-2.581;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,5:81:30:53,0,30 chrXI 20209 . G A 343 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=49.6052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.34;MQ0=0;QD=3.33;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:39:376,39,0 chrXI 20275 . C T 2051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.19;MQ0=0;QD=22.29;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2084,225,0 chrXI 20281 . G T 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.179;DP=92;Dels=0.00;FS=6.834;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.19;MQ0=0;MQRankSum=-6.100;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.225;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,40:92:99:622,0,1009 chrXI 20291 . G C 531.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;DP=96;Dels=0.00;FS=1.667;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.23;MQ0=0;MQRankSum=-5.410;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.274;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:561,0,1040 chrXI 20294 . A G 573.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;DP=95;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.38;MQ0=0;MQRankSum=-6.413;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.529;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:603,0,1125 chrXI 20296 . C T 611.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.220;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.11;MQ0=0;MQRankSum=-5.792;QD=6.17;ReadPosRankSum=1.274;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:641,0,1119 chrXI 20395 . C G 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.31;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3075,327,0 chrXI 20424 . A G 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.86;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2618,276,0 chrXI 20445 . T C 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.52;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2469,273,0 chrXI 20496 . C T 2563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;QD=26.15;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2596,273,0 chrXI 20522 . T C 2527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.25;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2560,261,0 chrXI 20543 . C G 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.18;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2586,273,0 chrXI 20567 . A T 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.57;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2866,291,0 chrXI 20616 . G A 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.86;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3041,321,0 chrXI 20761 . T C 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.99;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3183,336,0 chrXI 20802 . A T 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2551,264,0 chrXI 20805 . A G 2366 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.66;MQ0=0;QD=21.51;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2399,273,0 chrXI 20824 . A T 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.38;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3080,318,0 chrXI 20841 . C T 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=25.51;ReadPosRankSum=0.907;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3247,327,0 chrXI 21006 . C G 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3595,381,0 chrXI 21157 . G A 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;DP=101;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:990,0,998 chrXI 21193 . C T 2132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2165,222,0 chrXI 21194 . A G 2117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2150,222,0 chrXI 21250 . A T 1695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=48.6392;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.67;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:1728,171,0 chrXI 21328 . C T 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3022,321,0 chrXI 21329 . T A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.952;DP=127;Dels=0.00;FS=3.374;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=9.13;ReadPosRankSum=-2.961;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1189,0,1229 chrXI 21391 . T C 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3488,369,0 chrXI 21448 . A G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.845;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.080;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1323,0,1751 chrXI 21546 . A G 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3134,330,0 chrXI 21568 . T C 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2866,318,0 chrXI 21855 . C T 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3676,381,0 chrXI 21870 . T C 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3893,399,0 chrXI 22075 . G T 486 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.565;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.690;SB=-6.554e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:83:54:519,54,0 chrXI 22082 . G A 753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.49;MQ0=0;QD=8.18;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:84:786,84,0 chrXI 22088 . C T 1040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.79;MQ0=0;QD=10.95;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:1073,114,0 chrXI 22120 . T G 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=22.09;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2551,279,0 chrXI 22343 . G A 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5221;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3458,358,0 chrXI 22917 . C T 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3928,411,0 chrXI 23064 . C T 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3362,348,0 chrXI 23463 . T C 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3550,354,0 chrXI 23570 . C T 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.781;DP=140;Dels=0.00;FS=4.233;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,84:140:99:1801,0,962 chrXI 23805 . C T 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;DP=105;Dels=0.00;FS=2.626;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:879,0,1252 chrXI 24058 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.978;DP=162;Dels=0.00;FS=8.556;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.087;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,77:162:99:1403,0,1744 chrXI 24181 . A G 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.01;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3479,390,0 chrXI 24282 . A G 2346 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.80;MQ0=0;QD=22.78;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2379,276,0 chrXI 24291 . C T 2314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.09;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2347,255,0 chrXI 24307 . G A 2012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=22.61;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2045,216,0 chrXI 24311 . A T 2018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.58;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2051,216,0 chrXI 24330 . A C 1540 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.314;DP=91;Dels=0.00;FS=14.889;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=16.92;ReadPosRankSum=4.447;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,82:91:99:1573,192,0 chrXI 24332 . T G 1106 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.536;DP=91;Dels=0.00;FS=14.889;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=12.15;ReadPosRankSum=4.899;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,82:91:99:1139,155,0 chrXI 24333 . G T 927.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.613;DP=94;Dels=0.00;FS=15.128;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.48;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=9.86;ReadPosRankSum=4.562;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,85:94:35:957,0,35 chrXI 24349 . C T 1974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.61;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2007,213,0 chrXI 24357 . A G 1947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.58;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1980,219,0 chrXI 24373 . A G 1977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.12;MQ0=0;QD=22.47;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2010,222,0 chrXI 24425 . T C 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=99.5503;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.04;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3198,336,0 chrXI 24438 . T C 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.38;MQ0=0;QD=0.16;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:6:51,6,0 chrXI 24444 . G A 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.13;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3224,336,0 chrXI 24785 . C T 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;DP=123;Dels=0.00;FS=3.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=1.815;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:971,0,1492 chrXI 24924 . T C 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.582;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=0;MQRankSum=2.044;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.454;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:122:99:884,0,1473 chrXI 25154 . C T 2167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.84;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2200,228,0 chrXI 25337 . C T 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2915,297,0 chrXI 25349 . A G 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=24.87;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2744,285,0 chrXI 25386 . G A 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3418,348,0 chrXI 25508 . T C 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2929,303,0 chrXI 25610 . T G 2429 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2462,276,0 chrXI 25667 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.095;DP=116;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1305,0,1177 chrXI 26043 . T C 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:3823,393,0 chrXI 26078 . C T 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3830,373,0 chrXI 26422 . A G 2387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2420,261,0 chrXI 26450 . T G 2384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=25.09;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2417,270,0 chrXI 26672 . T C 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3564;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=24.55;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2586,273,0 chrXI 26673 . G T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.867;DP=106;Dels=0.00;FS=1.761;HaplotypeScore=3.3564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.758;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:988,0,1003 chrXI 26709 . C A 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3032,306,0 chrXI 26730 . T C 2385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2418,267,0 chrXI 26749 . A G 2402 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=24.26;ReadPosRankSum=1.592;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2435,267,0 chrXI 26810 . A T 2640 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2673,282,0 chrXI 27322 . T G 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.586;DP=98;Dels=0.00;FS=6.520;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.288;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:993,0,994 chrXI 27328 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.019;DP=115;Dels=0.00;FS=8.647;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.881;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1040,0,1097 chrXI 27340 . A G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.356;DP=113;Dels=0.00;FS=10.451;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.784;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1132,0,1181 chrXI 27368 . G A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.596;DP=104;Dels=0.00;FS=9.292;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.896;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1123,0,943 chrXI 27541 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;DP=118;Dels=0.00;FS=2.369;HaplotypeScore=5.5894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1127,0,1174 chrXI 27643 . T C 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.575;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2645,279,0 chrXI 28033 . T C 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.68;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2649,291,0 chrXI 28267 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.542;DP=138;Dels=0.00;FS=6.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.023;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1154,0,1589 chrXI 28300 . G C 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.429;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2815,300,0 chrXI 28372 . A T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.588;DP=116;Dels=0.00;FS=5.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1168,0,1168 chrXI 28396 . C T 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2926,294,0 chrXI 28399 . G A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.149;DP=115;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=9.44;ReadPosRankSum=2.492;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1116,0,1194 chrXI 28487 . G A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3723,390,0 chrXI 28551 . A G 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3099,327,0 chrXI 29323 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.992;DP=128;Dels=0.00;FS=3.245;HaplotypeScore=3.9444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.091;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1302,0,1319 chrXI 29380 . C G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.372;DP=98;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.878;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1069,0,1018 chrXI 29485 . G A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.841;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.390;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1219,0,1221 chrXI 29650 . A G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.795;DP=122;Dels=0.00;FS=3.427;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=1;MQRankSum=-1.275;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.841;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1216,0,1197 chrXI 29680 . G A 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=1;QD=25.66;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3592,375,0 chrXI 29722 . G A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.074;DP=119;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1232,0,1209 chrXI 29801 . A G 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.339;DP=123;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=2.9616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.507;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:933,0,1564 chrXI 29889 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.271;DP=111;Dels=0.00;FS=2.534;HaplotypeScore=4.9535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.704;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:111:99:1136,0,1170 chrXI 29986 . A G 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3381,357,0 chrXI 30016 . A G 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.32;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3375,354,0 chrXI 30025 . C T 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3452,351,0 chrXI 30028 . C T 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.98;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3239,330,0 chrXI 30052 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.662;DP=117;Dels=0.00;FS=9.014;HaplotypeScore=2.7706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1319,0,1171 chrXI 30716 . T G 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3273,342,0 chrXI 30923 . A C 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=1;QD=25.74;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3199,333,0 chrXI 31042 . G A 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;DP=124;Dels=0.00;FS=1.442;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.469;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1028,0,1541 chrXI 31094 . G A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.665;DP=122;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.780;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1225,0,1278 chrXI 31185 . T C 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.947;DP=113;Dels=0.00;FS=16.184;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.462;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1120,0,1189 chrXI 31220 . G T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.938;DP=112;Dels=0.00;FS=12.806;HaplotypeScore=4.0207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1067,0,1108 chrXI 31297 . C T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.049;DP=115;Dels=0.00;FS=8.790;HaplotypeScore=5.5002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:115:99:1058,0,1225 chrXI 31754 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.188;DP=124;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1257,0,1328 chrXI 32054 . C T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.815;DP=170;Dels=0.00;FS=1.200;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.158;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,78:170:99:1602,0,1822 chrXI 32212 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.370;DP=105;Dels=0.00;FS=11.435;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.355;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,62:105:99:1285,0,766 chrXI 32581 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.664;DP=142;Dels=0.00;FS=9.923;HaplotypeScore=8.6667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.470;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:142:99:1199,0,1700 chrXI 32644 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.053;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=2.215;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.009;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1096,0,1169 chrXI 32862 . T C 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.177;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1623,0,1699 chrXI 32956 . C T 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.925;DP=117;Dels=0.00;FS=6.237;HaplotypeScore=2.5769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.008;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:950,0,1404 chrXI 33219 . C G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.829;DP=148;Dels=0.00;FS=8.589;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1370,0,1523 chrXI 33673 . G A 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.19;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2835,297,0 chrXI 33790 . G A 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:136:99:3451,351,0 chrXI 33976 . T C 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.634;DP=122;Dels=0.00;FS=5.482;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:913,0,1202 chrXI 33994 . C T 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.127;DP=125;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1087,0,1198 chrXI 34378 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.605;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.609;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1495,0,1385 chrXI 34404 . A G 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.861;DP=147;Dels=0.00;FS=3.856;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.497;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1694,0,1396 chrXI 34444 . C G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.857;DP=140;Dels=0.00;FS=7.774;HaplotypeScore=2.2100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.381;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1467,0,1363 chrXI 34555 . A C 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.764;DP=145;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.013;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1675,0,1260 chrXI 34971 . T G 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.013;DP=92;Dels=0.00;FS=0.796;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:882,0,955 chrXI 35136 . T C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=9.10;ReadPosRankSum=2.282;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:126:99:1177,0,1376 chrXI 35244 . G A 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.975;DP=136;Dels=0.00;FS=14.482;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.723;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1706,0,1042 chrXI 35283 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;DP=109;Dels=0.00;FS=17.422;HaplotypeScore=8.0810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.749;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:109:99:1180,0,908 chrXI 35427 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.877;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1076,0,1020 chrXI 35593 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;DP=135;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.420;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1239,0,1532 chrXI 35608 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.204;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1217,0,1242 chrXI 35853 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.743;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.883;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1494,0,975 chrXI 36243 . T C 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.163;DP=96;Dels=0.00;FS=10.556;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,55:96:99:1126,0,850 chrXI 36249 . C G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;DP=102;Dels=0.00;FS=10.197;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.686;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,61:102:99:1176,0,810 chrXI 36369 . A G 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.774;DP=113;Dels=0.00;FS=4.552;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.763;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:981,0,1297 chrXI 36393 . G A 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.034;DP=94;Dels=0.00;FS=3.906;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1137,0,767 chrXI 36454 . C T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.180;DP=85;Dels=0.00;FS=14.007;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=13.85;ReadPosRankSum=2.579;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,55:85:99:1207,0,495 chrXI 36537 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;DP=124;Dels=0.00;FS=26.832;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.91;ReadPosRankSum=-2.483;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,73:124:99:1507,0,957 chrXI 36695 . T C 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.735;DP=127;Dels=0.00;FS=14.939;HaplotypeScore=1.9889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=13.20;ReadPosRankSum=-1.758;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,79:127:99:1707,0,983 chrXI 36777 . A T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;DP=86;Dels=0.00;FS=3.390;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,55:86:99:1260,0,576 chrXI 36900 . A G 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.819;DP=127;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.730;QD=13.77;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,84:127:99:1779,0,822 chrXI 37146 . C T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.306;DP=133;Dels=0.00;FS=8.184;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=12.12;ReadPosRankSum=2.004;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1642,0,1176 chrXI 37242 . T G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.451;DP=117;Dels=0.00;FS=10.147;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1048,0,1264 chrXI 37338 . A G 1877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.907;DP=164;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.055;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,93:164:99:1907,0,1337 chrXI 37524 . T C 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.80;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2860,303,0 chrXI 37530 . G A 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3036,303,0 chrXI 37551 . A G 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=23.34;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:3944,411,0 chrXI 37566 . G A 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.978;DP=176;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.924;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,85:176:99:1776,0,1727 chrXI 37578 . C T 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.199;DP=165;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.452;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,87:165:99:1719,0,1602 chrXI 37590 . C T 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.61;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3593,372,0 chrXI 37740 . T G 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3039,324,0 chrXI 37956 . G A 1567.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.475;DP=133;Dels=0.00;FS=12.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=11.78;ReadPosRankSum=2.739;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1597,0,1200 chrXI 37962 . T C 1000.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.357;DP=146;Dels=0.00;FS=10.358;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.818;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,63:146:99:1030,0,1852 chrXI 37965 . A G 909.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.169;DP=144;Dels=0.00;FS=3.081;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,58:144:99:939,0,1858 chrXI 37995 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3269,336,0 chrXI 37998 . G A 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3243,339,0 chrXI 38007 . T C 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.590;DP=122;Dels=0.00;FS=2.395;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,76:122:99:1548,0,870 chrXI 38034 . G A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.203;DP=119;Dels=0.00;FS=3.370;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.396;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1526,0,944 chrXI 38261 . A G 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.206;DP=156;Dels=0.00;FS=4.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.603;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,98:156:99:1892,0,978 chrXI 38472 . A G 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.897;DP=137;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,78:137:99:1613,0,1170 chrXI 38739 . G A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.689;DP=156;Dels=0.00;FS=3.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.670;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1450,0,1639 chrXI 38767 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.088;DP=144;Dels=0.00;FS=1.352;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.778;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1341,0,1497 chrXI 38813 . G A 1849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.925;DP=166;Dels=0.00;FS=3.605;HaplotypeScore=6.4026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,91:166:99:1879,0,1461 chrXI 39073 . C T 1417.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.651;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=1;MQRankSum=1.062;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1447,0,1434 chrXI 39078 . A G 1322.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.637;DP=145;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=1;MQRankSum=-2.560;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.054;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1352,0,1501 chrXI 39081 . A G 1413.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;DP=154;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.670;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.111;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1443,0,1569 chrXI 39127 . G C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.997;DP=134;Dels=0.00;FS=2.552;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=1;MQRankSum=1.713;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.538;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1463,0,1294 chrXI 39160 . G T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.005;DP=151;Dels=0.00;FS=8.415;HaplotypeScore=5.6664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.193;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1666,0,1387 chrXI 39184 . C G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;DP=132;Dels=0.00;FS=22.734;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1351,0,1301 chrXI 39899 . A T 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3390,348,0 chrXI 40023 . C T 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.663;DP=113;Dels=0.00;FS=1.571;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.227;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,43:113:99:779,0,1421 chrXI 40080 . T C 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.622;DP=116;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=1.9312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.084;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:891,0,1442 chrXI 40092 . G T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.275;DP=133;Dels=0.00;FS=3.107;HaplotypeScore=4.7146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1228,0,1463 chrXI 40103 . T C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.444;DP=126;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.156;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:990,0,1521 chrXI 40164 . G A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.310;DP=123;Dels=0.00;FS=7.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=8.05;ReadPosRankSum=-2.786;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1020,0,1438 chrXI 40206 . C G 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;DP=94;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=2.6163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:919,0,1049 chrXI 40246 . G A 716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.619;DP=95;Dels=0.00;FS=1.741;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:746,0,1183 chrXI 40356 . A T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;DP=113;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.066;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1253,0,1129 chrXI 40479 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.154;DP=118;Dels=0.00;FS=4.576;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.142;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,69:118:99:1306,0,993 chrXI 40617 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;DP=124;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=3.6471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.778;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1289,0,1282 chrXI 40776 . T C 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.212;DP=101;Dels=0.00;FS=4.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.817;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:912,0,1067 chrXI 40860 . T A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;DP=125;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=2.6940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.077;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1434,0,1157 chrXI 40941 . A G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.248;DP=126;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.552;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1215,0,1184 chrXI 40977 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.743;DP=125;Dels=0.00;FS=2.795;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.057;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1343,0,1276 chrXI 40989 . T C 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.66;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2958,303,0 chrXI 40998 . C G 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=23.65;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2918,315,0 chrXI 41115 . C A 1751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.478;DP=149;Dels=0.00;FS=6.095;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.181;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1781,0,1323 chrXI 41268 . C T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.619;DP=138;Dels=0.00;FS=4.088;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1526,0,1400 chrXI 41369 . G A 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3874,394,0 chrXI 41373 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.442;DP=142;Dels=0.00;FS=3.115;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.945;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,57:142:99:1074,0,1805 chrXI 41391 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.415;DP=148;Dels=0.00;FS=8.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.777;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,65:148:99:1225,0,1727 chrXI 41430 . C T 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.232;DP=98;Dels=0.00;FS=18.422;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.332;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:916,0,999 chrXI 41442 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.815;DP=98;Dels=0.00;FS=4.678;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.499;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.314;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1030,0,1004 chrXI 41490 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.865;DP=131;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.791;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1270,0,1415 chrXI 41527 . G T 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.586;DP=144;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.545;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1409,0,1495 chrXI 41535 . G A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.765;DP=117;Dels=0.00;FS=2.591;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1144,0,1191 chrXI 41601 . C T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.375;DP=121;Dels=0.00;FS=5.675;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=12.46;ReadPosRankSum=3.100;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1538,0,912 chrXI 41703 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.012;DP=108;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1264,0,970 chrXI 42021 . A G 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2623,288,0 chrXI 42093 . A G 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.998;DP=98;Dels=0.00;FS=9.764;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:98:99:909,0,1043 chrXI 42126 . A G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.191;DP=112;Dels=0.00;FS=3.878;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1251,0,1010 chrXI 42141 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;DP=123;Dels=0.00;FS=5.291;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:123:99:1331,0,1128 chrXI 42198 . A T 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3428,357,0 chrXI 42210 . A G 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.535;DP=149;Dels=0.00;FS=4.930;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=9.67;ReadPosRankSum=2.147;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1471,0,1595 chrXI 42355 . T A 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=93;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=20.5911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,51:90:99:916,0,726 chrXI 42356 . A T 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;DP=94;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=20.5911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.828;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:943,0,711 chrXI 42424 . T C 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;DP=92;Dels=0.00;FS=12.297;HaplotypeScore=7.6515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.020;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:839,0,1057 chrXI 42450 . G A 2371 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2714;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2404,234,0 chrXI 42555 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.932;DP=122;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.353;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1298,0,1118 chrXI 42588 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.987;DP=111;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=3.4825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.377;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:111:99:1036,0,1224 chrXI 42738 . A G 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;DP=113;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.188;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:947,0,1299 chrXI 42757 . C G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=132;Dels=0.00;FS=5.759;HaplotypeScore=2.3002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.297;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1020,0,1610 chrXI 42807 . A G 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.944;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.135;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1019,0,1627 chrXI 42834 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.872;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=2.288;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.378;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:971,0,1500 chrXI 42835 . T C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.373;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.531;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1041,0,1508 chrXI 43005 . C T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.067;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1326,0,1322 chrXI 43185 . T C 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.936;DP=128;Dels=0.00;FS=7.921;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:929,0,1694 chrXI 43195 . C T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.627;DP=132;Dels=0.00;FS=2.419;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.447;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1629,0,1164 chrXI 43241 . G T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;DP=144;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1504,0,1406 chrXI 43368 . G A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.167;DP=128;Dels=0.00;FS=5.467;HaplotypeScore=12.4700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1272,0,1364 chrXI 43451 . T C 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.493;DP=148;Dels=0.00;FS=5.804;HaplotypeScore=4.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1552,0,1505 chrXI 43498 . T C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.899;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.257;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1488,0,1721 chrXI 43629 . G A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.976;DP=126;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=10.95;ReadPosRankSum=2.039;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1410,0,1068 chrXI 43668 . A T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;DP=123;Dels=0.00;FS=2.288;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=11.99;ReadPosRankSum=-2.938;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1505,0,1074 chrXI 43744 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.871;DP=100;Dels=0.00;FS=5.159;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.573;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,62:100:99:1332,0,700 chrXI 43800 . C T 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.505;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.590;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:947,0,1249 chrXI 43830 . A G 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.048;DP=107;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:881,0,1283 chrXI 43946 . A G 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.380;DP=93;Dels=0.00;FS=5.174;HaplotypeScore=7.3999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.548;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:808,0,1112 chrXI 44246 . T C 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3327,354,0 chrXI 44293 . C T 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3145,318,0 chrXI 44298 . G A 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3040,315,0 chrXI 44328 . A T 1251.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.660;DP=130;Dels=0.00;FS=7.962;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.140;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1281,0,1422 chrXI 44334 . C T 3133 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.05;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3166,333,0 chrXI 44336 . A G 2857 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.70;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2890,312,0 chrXI 44440 . G A 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3359,330,0 chrXI 44500 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.382;DP=121;Dels=0.00;FS=6.978;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1407,0,1083 chrXI 44573 . A G 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3128,327,0 chrXI 45069 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.615;DP=127;Dels=0.00;FS=5.735;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.943;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1074,0,1401 chrXI 45141 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.613;DP=141;Dels=0.00;FS=2.280;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.076;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1241,0,1611 chrXI 45213 . A G 2335 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=23.59;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2368,258,0 chrXI 45217 . G T 2615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.15;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2648,267,0 chrXI 45238 . G A 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.480;DP=96;Dels=0.00;FS=1.647;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.392;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:917,0,1032 chrXI 45362 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.607;DP=128;Dels=0.00;FS=5.549;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.218;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1342,0,1239 chrXI 45375 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;DP=123;Dels=0.00;FS=4.330;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.089;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1276,0,1259 chrXI 45525 . A G 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3313,357,0 chrXI 45578 . T G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.586;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1355,0,1031 chrXI 45588 . C A 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;DP=111;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:983,0,1332 chrXI 45765 . A G 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2898,306,0 chrXI 46074 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.700;DP=141;Dels=0.00;FS=5.125;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.864;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1403,0,1357 chrXI 46101 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.629;DP=127;Dels=0.00;FS=5.395;HaplotypeScore=2.5343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1301,0,1305 chrXI 46134 . T G 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;DP=150;Dels=0.00;FS=8.673;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.611;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1542,0,1551 chrXI 46275 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.230;DP=139;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=3.1952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.055;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1383,0,1430 chrXI 46282 . C T 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.108;DP=133;Dels=0.00;FS=3.286;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.398;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1365,0,1291 chrXI 46381 . A T 693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;DP=99;Dels=0.00;FS=1.756;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=7.00;ReadPosRankSum=2.838;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,41:99:99:723,0,1200 chrXI 46444 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=111;Dels=0.00;FS=8.850;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1009,0,1257 chrXI 46587 . A C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.497;DP=106;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=6.1523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.608;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1033,0,1091 chrXI 46608 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.847;DP=130;Dels=0.00;FS=3.351;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.530;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.788;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1592,0,1112 chrXI 46631 . T G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.967;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1396,0,1141 chrXI 46715 . A T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.742;DP=134;Dels=0.00;FS=3.059;HaplotypeScore=5.7514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.287;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1327,0,1451 chrXI 46718 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.821;DP=139;Dels=0.00;FS=2.131;HaplotypeScore=5.7514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1357,0,1416 chrXI 46843 . C T 915.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.775;DP=93;Dels=0.00;FS=1.676;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.066;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:945,0,890 chrXI 46848 . C A 967.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.613;DP=103;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.646;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:997,0,1078 chrXI 46850 . T G 964.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.314;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.697;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.214;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:994,0,1045 chrXI 46912 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.796;DP=101;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.642;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:101:99:1238,0,860 chrXI 46995 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.332;DP=124;Dels=0.00;FS=3.371;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.433;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1326,0,1187 chrXI 47023 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=120;Dels=0.00;FS=2.541;HaplotypeScore=3.6492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:120:99:1353,0,1116 chrXI 47201 . T C 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.143;DP=99;Dels=0.00;FS=2.767;HaplotypeScore=5.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.870;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:982,0,1056 chrXI 47225 . G A 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.330;DP=106;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.994;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:941,0,1139 chrXI 47231 . A C 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.102;DP=112;Dels=0.00;FS=10.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.871;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.039;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:853,0,1426 chrXI 47241 . A G 696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.343;DP=102;Dels=0.00;FS=7.869;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=6.82;ReadPosRankSum=2.160;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:726,0,1264 chrXI 47357 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.340;DP=103;Dels=0.00;FS=3.806;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.451;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1264,0,766 chrXI 47435 . A T 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.518;DP=105;Dels=0.00;FS=1.604;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:105:99:1012,0,1139 chrXI 47481 . A G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.730;DP=152;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.282;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.427;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1561,0,1405 chrXI 47531 . G A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.192;DP=129;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1517,0,1117 chrXI 47705 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.630;DP=99;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.968;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1048,0,874 chrXI 47837 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.689;DP=147;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=1.232;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1413,0,1439 chrXI 48319 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.923;DP=125;Dels=0.00;FS=2.273;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1167,0,1424 chrXI 48391 . G T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.022;DP=129;Dels=0.00;FS=8.113;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1495,0,1232 chrXI 48477 . A G 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.642;DP=145;Dels=0.00;FS=5.701;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1459,0,1479 chrXI 48522 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.956;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.432;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1536,0,1520 chrXI 48601 . G A 1930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.395;DP=161;Dels=0.00;FS=15.207;HaplotypeScore=2.7284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.005;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,92:161:99:1960,0,1353 chrXI 48790 . G A 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.332;DP=130;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=4.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.569;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1041,0,1515 chrXI 48808 . C T 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3220,336,0 chrXI 49741 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.548;DP=143;Dels=0.00;FS=3.011;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=1;MQRankSum=1.712;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1280,0,1690 chrXI 49804 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.605;DP=117;Dels=0.00;FS=4.830;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.019;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1380,0,1065 chrXI 49819 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.229;DP=129;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.494;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1148,0,1444 chrXI 50038 . G A 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3191,324,0 chrXI 50257 . G A 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.033;DP=144;Dels=0.00;FS=5.112;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.028;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1733,0,1195 chrXI 50395 . T G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.882;DP=129;Dels=0.00;FS=10.055;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=9.72;ReadPosRankSum=-2.033;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1284,0,1373 chrXI 50810 . C T 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.321;DP=102;Dels=0.00;FS=4.483;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.949;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:932,0,1256 chrXI 51472 . T C 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.109;DP=75;Dels=0.00;FS=0.869;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:75:99:791,0,758 chrXI 51512 . A G 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.116;DP=93;Dels=0.00;FS=3.947;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.734;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:872,0,1013 chrXI 51558 . C T 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.123;DP=94;Dels=0.00;FS=2.673;HaplotypeScore=3.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:942,0,1037 chrXI 52588 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.700;DP=163;Dels=0.00;FS=11.246;HaplotypeScore=8.6958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,63:163:99:1065,0,2210 chrXI 52628 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.284;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,71:159:99:1380,0,1796 chrXI 53112 . A G 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.271;DP=116;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=4.7166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.437;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,46:116:99:832,0,1506 chrXI 53379 . T C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.698;DP=99;Dels=0.00;FS=6.718;HaplotypeScore=5.9556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:99:99:1015,0,827 chrXI 53539 . C T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;DP=141;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.172;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1590,0,1277 chrXI 53656 . T C 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.215;DP=110;Dels=0.00;FS=1.575;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=6.54;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:110:99:749,0,1528 chrXI 53931 . A G 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.476;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5486;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=2.414;QD=24.47;ReadPosRankSum=1.032;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,136:139:99:3402,348,0 chrXI 54204 . T C 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3630,408,0 chrXI 54420 . A G 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.531;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.024;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:967,0,1028 chrXI 55068 . A T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.042;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.222;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:109:99:1190,0,937 chrXI 55092 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.973;DP=111;Dels=0.00;FS=3.625;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.796;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:980,0,1229 chrXI 55108 . G A 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;DP=105;Dels=0.00;FS=6.948;HaplotypeScore=4.4524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.640;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:964,0,1194 chrXI 55185 . T A 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.487;DP=114;Dels=0.00;FS=2.487;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.454;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1048,0,1160 chrXI 56302 . C T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.562;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.137;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1366,0,1043 chrXI 56438 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.222;DP=129;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1351,0,1288 chrXI 57781 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.070;DP=147;Dels=0.00;FS=2.086;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:147:99:1398,0,1630 chrXI 57957 . G C 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2870,306,0 chrXI 58110 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3269,354,0 chrXI 58239 . G A 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3718,387,0 chrXI 58428 . A G 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3848,420,0 chrXI 58464 . A G 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3783,402,0 chrXI 58743 . A G 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.994;DP=158;Dels=0.00;FS=7.264;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1865,0,1424 chrXI 59004 . T A 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.399;DP=115;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1002,0,1235 chrXI 59215 . G C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;DP=110;Dels=0.00;FS=9.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.040;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,66:110:99:1395,0,832 chrXI 60173 . G A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.704;DP=158;Dels=0.00;FS=2.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=8.71;ReadPosRankSum=1.025;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:1406,0,1814 chrXI 60356 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.768;DP=150;Dels=0.00;FS=1.266;HaplotypeScore=4.5638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1549,0,1547 chrXI 61338 . G C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.102;DP=114;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1231,0,999 chrXI 62759 . T C 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.224;DP=123;Dels=0.00;FS=4.414;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.085;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1045,0,1489 chrXI 63630 . A C 1900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.163;DP=141;Dels=0.00;FS=9.291;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.191;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,90:141:99:1930,0,992 chrXI 63649 . T C 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.684;DP=129;Dels=0.00;FS=9.904;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=12.78;ReadPosRankSum=2.132;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,81:129:99:1678,0,914 chrXI 63943 . C G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.623;DP=135;Dels=0.00;FS=12.159;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=1;MQRankSum=-1.400;QD=9.77;ReadPosRankSum=2.987;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1349,0,1233 chrXI 63975 . G A 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.305;DP=86;Dels=0.00;FS=9.300;HaplotypeScore=6.9414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.935;QD=10.14;ReadPosRankSum=-2.358;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:902,0,777 chrXI 63984 . C T 374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;DP=73;Dels=0.00;FS=5.580;HaplotypeScore=6.9529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.921;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:73:99:404,0,987 chrXI 63999 . C G 125.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.411;DP=72;Dels=0.00;FS=6.888;HaplotypeScore=5.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQ0=0;MQRankSum=-4.382;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.576;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:155,0,1224 chrXI 64001 . G T 187.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.727;DP=73;Dels=0.00;FS=6.875;HaplotypeScore=7.8574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQ0=0;MQRankSum=-4.394;QD=2.56;ReadPosRankSum=0.287;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:217,0,1232 chrXI 64023 . A C 58.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.297;DP=68;Dels=0.00;FS=8.104;HaplotypeScore=9.7320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQ0=0;MQRankSum=-5.063;QD=0.85;ReadPosRankSum=-1.965;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,11:68:88:88,0,1264 chrXI 64059 . C T 92.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.379;DP=67;Dels=0.00;FS=5.870;HaplotypeScore=20.7799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.82;MQ0=0;MQRankSum=-3.667;QD=1.37;ReadPosRankSum=-3.408;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:122,0,1004 chrXI 64062 . T C 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.357;DP=69;Dels=0.00;FS=11.208;HaplotypeScore=20.6519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.728;QD=0.38;ReadPosRankSum=-2.131;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:56:56,0,1125 chrXI 64092 . A C 561.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;DP=92;Dels=0.00;FS=10.958;HaplotypeScore=31.7567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=-3.313;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.366;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,38:92:99:591,0,965 chrXI 64094 . T G 531.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.015;DP=93;Dels=0.00;FS=7.146;HaplotypeScore=32.7514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.192;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.660;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,38:93:99:561,0,1166 chrXI 64101 . A C 770.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;DP=92;Dels=0.00;FS=20.072;HaplotypeScore=17.8654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.841;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.981;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:800,0,897 chrXI 64224 . C T 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.296;DP=85;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=6.8922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.192;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.307;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,49:85:99:1000,0,747 chrXI 64248 . C T 228.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.202;DP=92;Dels=0.00;FS=16.296;HaplotypeScore=8.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.341;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.086;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,27:92:99:258,0,1400 chrXI 64251 . T C 141.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.923;DP=91;Dels=0.00;FS=39.404;HaplotypeScore=73.1125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:171,0,1477 chrXI 64254 . C T 177.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.705;DP=89;Dels=0.00;FS=18.984;HaplotypeScore=67.2387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.043;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:89:99:207,0,1432 chrXI 64260 . C T 384.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.328;DP=92;Dels=0.00;FS=26.546;HaplotypeScore=43.4379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=4.17;ReadPosRankSum=2.148;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,26:92:99:414,0,1289 chrXI 64560 . A G 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.888;DP=111;Dels=0.00;FS=26.303;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.171;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:900,0,1181 chrXI 64563 . A T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.715;DP=107;Dels=0.01;FS=19.351;HaplotypeScore=11.8581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.913;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1064,0,1155 chrXI 64590 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.745;DP=124;Dels=0.00;FS=3.940;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.781;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1318,0,1296 chrXI 64785 . T C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.577;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.617;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:997,0,1384 chrXI 64947 . G A 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.981;DP=119;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=7.4752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.307;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1071,0,1378 chrXI 65661 . A G 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.240;DP=139;Dels=0.00;FS=4.266;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.801;QD=11.39;ReadPosRankSum=-2.073;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,79:139:99:1613,0,1219 chrXI 65922 . A G 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.633;DP=159;Dels=0.00;FS=2.780;HaplotypeScore=5.4397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=9.02;ReadPosRankSum=-2.272;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1464,0,1669 chrXI 66027 . G A 1846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.459;DP=166;Dels=0.00;FS=3.657;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.717;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,88:166:99:1876,0,1515 chrXI 66073 . A T 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.248;DP=161;Dels=0.00;FS=1.985;HaplotypeScore=10.2085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.110;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1672,0,1662 chrXI 66130 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.044;DP=164;Dels=0.00;FS=3.094;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,71:164:99:1462,0,1939 chrXI 66233 . A T 990.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.997;DP=120;Dels=0.00;FS=4.569;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1020,0,1383 chrXI 66234 . G A 972.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.542;DP=122;Dels=0.00;FS=2.423;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.562;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1002,0,1480 chrXI 66236 . G A 979.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.875;DP=125;Dels=0.00;FS=2.396;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.195;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1009,0,1570 chrXI 66285 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.597;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.620;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1323,0,1467 chrXI 66342 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.764;DP=103;Dels=0.00;FS=5.092;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.470;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1275,0,842 chrXI 66426 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.934;DP=135;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=3.7518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1269,0,1574 chrXI 66546 . A G 4220.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4220,450,0 chrXI 66663 . A G 4424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.85;SB=-2.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4424,459,0 chrXI 66678 . T C 4195.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4195,447,0 chrXI 66804 . C T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.524;DP=150;Dels=0.00;FS=6.005;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.357;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1554,0,1429 chrXI 66860 . A G 1971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.621;DP=168;Dels=0.00;FS=3.725;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,95:168:99:2001,0,1415 chrXI 66882 . C T 1900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.193;DP=150;Dels=0.00;FS=6.117;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.921;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,87:150:99:1930,0,1147 chrXI 66927 . C T 1962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.894;DP=156;Dels=0.00;FS=3.814;HaplotypeScore=3.6994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.591;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,92:156:99:1992,0,1210 chrXI 67187 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.583;DP=160;Dels=0.00;FS=23.148;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1588,0,1784 chrXI 67386 . G C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=2.914;QD=9.59;ReadPosRankSum=2.570;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1546,0,1674 chrXI 67440 . A C 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.842;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,87:184:99:1749,0,2073 chrXI 67488 . G A 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;DP=177;Dels=0.00;FS=5.550;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.399;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,86:177:99:1753,0,1854 chrXI 67619 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=154;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=4.9573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1433,0,1679 chrXI 67635 . C T 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.628;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.900;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.644;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1068,0,1781 chrXI 67641 . T C 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=23.67;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3432,402,0 chrXI 67672 . G A 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.908;DP=184;Dels=0.00;FS=5.392;HaplotypeScore=4.7548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.109;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,87:184:99:1762,0,2055 chrXI 67691 . A C 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=68.5125;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.95;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3594,411,0 chrXI 67740 . C G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;DP=152;Dels=0.00;FS=5.474;HaplotypeScore=3.8400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.00;MQ0=0;MQRankSum=-4.756;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:1529,0,1423 chrXI 67755 . G T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.264;DP=144;Dels=0.00;FS=36.536;HaplotypeScore=4.9331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.45;MQ0=0;MQRankSum=-4.870;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.797;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1493,0,1241 chrXI 67783 . T C 506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.315;DP=165;Dels=0.00;FS=15.977;HaplotypeScore=59.4620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.42;MQ0=1;MQRankSum=-4.889;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.007;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,56:165:99:536,0,775 chrXI 67802 . G A 385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.358;DP=111;Dels=0.00;FS=15.752;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.92;MQ0=0;MQRankSum=-8.498;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.249;SB=-5.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:415,0,287 chrXI 67816 . G A 500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.352;DP=122;Dels=0.00;FS=14.238;HaplotypeScore=107.9398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.45;MQ0=0;MQRankSum=-9.287;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.713;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:530,0,567 chrXI 67844 . G A 410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.656;DP=108;Dels=0.00;FS=16.906;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.65;MQ0=0;MQRankSum=-8.654;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:440,0,970 chrXI 67862 . C G 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.14;MQ0=0;QD=20.25;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2544,294,0 chrXI 67872 . C G 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.25;MQ0=0;QD=20.88;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2685,294,0 chrXI 67884 . A G 603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.962;DP=135;Dels=0.00;FS=18.257;HaplotypeScore=88.3131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.63;MQ0=0;MQRankSum=-9.731;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.483;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:135:99:633,0,1748 chrXI 67934 . T C 665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.764;DP=121;Dels=0.00;FS=4.358;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.29;MQ0=0;MQRankSum=-8.970;QD=5.50;ReadPosRankSum=-4.021;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:695,0,1451 chrXI 67954 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.073;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=7.940;QD=11.52;ReadPosRankSum=3.431;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1481,0,800 chrXI 67955 . G A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.974;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=0;MQRankSum=-6.121;QD=6.12;ReadPosRankSum=-2.775;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:807,0,1479 chrXI 67997 . T A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.119;DP=146;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.47;MQ0=0;MQRankSum=-4.268;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.784;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1321,0,1756 chrXI 67998 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.337;DP=133;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.842;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.236;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1337,0,1316 chrXI 68014 . C T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.220;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.414;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.477;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1443,0,1366 chrXI 68113 . T A 508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.383;DP=134;Dels=0.00;FS=32.171;HaplotypeScore=7.1202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQ0=1;MQRankSum=-5.275;QD=3.79;ReadPosRankSum=-3.886;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:538,0,1402 chrXI 68117 . G A 549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.258;DP=139;Dels=0.00;FS=31.574;HaplotypeScore=8.7410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.31;MQ0=1;MQRankSum=-4.037;QD=3.95;ReadPosRankSum=-3.520;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:579,0,1487 chrXI 68129 . T C 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;DP=155;Dels=0.00;FS=7.930;HaplotypeScore=7.9600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQ0=0;MQRankSum=6.163;QD=9.97;ReadPosRankSum=2.908;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,84:155:99:1575,0,796 chrXI 68137 . T A 739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;DP=154;Dels=0.00;FS=4.284;HaplotypeScore=6.3353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQ0=0;MQRankSum=-4.427;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.564;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:769,0,1720 chrXI 68162 . A G 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.155;DP=140;Dels=0.00;FS=2.305;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQ0=0;MQRankSum=-4.755;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:864,0,1597 chrXI 68168 . A T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.613;DP=140;Dels=0.00;FS=6.705;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQ0=0;MQRankSum=-4.914;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:922,0,1539 chrXI 68184 . C T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.806;DP=150;Dels=0.00;FS=2.059;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.86;MQ0=0;MQRankSum=-3.761;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.291;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1368,0,1460 chrXI 68250 . T C 4655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.12;MQ0=1;QD=24.37;SB=-2.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4655,486,0 chrXI 68298 . C T 4090.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7510;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.45;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4090,421,0 chrXI 68337 . G A 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.17;MQ0=0;QD=25.53;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3677,387,0 chrXI 68360 . G T 192.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=669.2630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.53;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=1.44;ReadPosRankSum=-4.825;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,15:133:99:222,0,368 chrXI 68369 . G T 297 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;DP=125;Dels=0.01;FS=6.955;HaplotypeScore=565.5265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.592;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:36:330,36,0 chrXI 68377 . G A 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.085;DP=133;Dels=0.01;FS=8.561;HaplotypeScore=104.1087;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.53;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=20.26;ReadPosRankSum=1.869;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,129:132:99:2728,285,0 chrXI 68447 . A G 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=121.6541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.52;MQ0=0;QD=21.53;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2875,321,0 chrXI 68563 . T C 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8239;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.73;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4033,438,0 chrXI 68580 . T C 4691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=24.43;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4691,504,0 chrXI 68691 . A C 4274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=24.15;SB=-2.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4274,456,0 chrXI 68802 . G A 1983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2337;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=14.16;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:2016,213,0 chrXI 68824 . T C 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=16.24;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:2534,279,0 chrXI 68859 . G A 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2969,312,0 chrXI 68934 . G A 4692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4692,478,0 chrXI 68969 . T C 4491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=23.76;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4491,510,0 chrXI 68994 . C G 4422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4422,480,0 chrXI 69070 . A T 4838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=216;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7272;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=22.40;SB=-2.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,215:216:99:4838,486,0 chrXI 69087 . A C 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.319;DP=192;Dels=0.00;FS=8.351;HaplotypeScore=4.8377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.307;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,100:192:99:1692,0,1484 chrXI 69153 . C T 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=21.49;ReadPosRankSum=1.569;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3235,328,0 chrXI 69417 . C T 4175.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.15;SB=-2.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4175,450,0 chrXI 69425 . C T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.273;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.400;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1702,0,1597 chrXI 69662 . T C 4306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4306,474,0 chrXI 69696 . G A 4799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.53;SB=-2.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4799,504,0 chrXI 69921 . G A 1817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.348;DP=174;Dels=0.00;FS=1.197;HaplotypeScore=2.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,91:174:99:1847,0,1689 chrXI 69940 . A G 1002.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.296;DP=122;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1032,0,1364 chrXI 69941 . G T 3053 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3086,327,0 chrXI 69942 . G A 3078 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3111,327,0 chrXI 69964 . A G 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.74;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3486,378,0 chrXI 70043 . T C 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3714,417,0 chrXI 70228 . T C 4431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4431,492,0 chrXI 70422 . A G 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.707;DP=155;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=7.0976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.052;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,59:155:99:1088,0,2061 chrXI 70425 . A G 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.608;DP=155;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=6.1397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.139;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,59:155:99:1030,0,2104 chrXI 70540 . A T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.040;DP=157;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,68:156:99:1383,0,1933 chrXI 70579 . A C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.332;DP=182;Dels=0.01;FS=7.656;HaplotypeScore=70.1612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.249;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,70:181:99:1213,0,2294 chrXI 70690 . T C 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.611;DP=183;Dels=0.00;FS=17.928;HaplotypeScore=3.7034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.830;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,92:183:99:1829,0,1884 chrXI 70692 . C T 1833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.422;DP=185;Dels=0.00;FS=17.802;HaplotypeScore=3.7034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.265;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,91:185:99:1863,0,1905 chrXI 70711 . C T 2140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.995;DP=205;Dels=0.00;FS=9.218;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,108:205:99:2170,0,1889 chrXI 70780 . T C 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.994;DP=140;Dels=0.00;FS=4.017;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.606;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1524,0,1335 chrXI 71068 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.060;DP=163;Dels=0.00;FS=8.073;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.572;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,76:162:99:1455,0,1857 chrXI 71070 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.220;DP=159;Dels=0.00;FS=8.237;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.745;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:1354,0,1781 chrXI 71145 . A G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.521;DP=143;Dels=0.00;FS=2.361;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1304,0,1680 chrXI 71177 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.107;DP=153;Dels=0.00;FS=1.272;HaplotypeScore=3.6445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.935;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.972;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,70:153:99:1389,0,1776 chrXI 71199 . T C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.984;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.402;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,78:162:99:1428,0,1825 chrXI 71203 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.338;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.285;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1405,0,1813 chrXI 71211 . C T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.734;DP=147;Dels=0.00;FS=1.420;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.853;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.513;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1394,0,1420 chrXI 71233 . A G 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.809;DP=135;Dels=0.00;FS=1.759;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.392;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1149,0,1583 chrXI 71333 . A G 2085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.302;DP=198;Dels=0.00;FS=1.114;HaplotypeScore=4.9302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=0.572;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.730;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,103:198:99:2115,0,1977 chrXI 71541 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.171;DP=122;Dels=0.00;FS=2.275;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1308,0,1131 chrXI 71901 . G A 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.489;DP=165;Dels=0.00;FS=8.164;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1825,0,1584 chrXI 71930 . C T 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=4.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=24.54;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3100,315,0 chrXI 71943 . C A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.646;DP=115;Dels=0.00;FS=12.037;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1123,0,1183 chrXI 71963 . A G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.669;DP=135;Dels=0.00;FS=5.179;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1252,0,1448 chrXI 71964 . C T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.695;DP=139;Dels=0.00;FS=6.258;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1344,0,1392 chrXI 72168 . G A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.636;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.723;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1107,0,1113 chrXI 72189 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.207;DP=115;Dels=0.01;FS=0.717;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1134,0,1198 chrXI 72294 . C T 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3791,405,0 chrXI 72330 . A G 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3418,372,0 chrXI 72384 . C T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.266;DP=142;Dels=0.00;FS=7.595;HaplotypeScore=3.3594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1429,0,1431 chrXI 72431 . C T 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3042,309,0 chrXI 72501 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.239;DP=134;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.847;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1304,0,1242 chrXI 72528 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.806;DP=127;Dels=0.00;FS=8.201;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1324,0,1326 chrXI 72570 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.855;DP=126;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.005;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1286,0,1310 chrXI 72594 . C T 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2759,294,0 chrXI 72612 . T C 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.548;DP=108;Dels=0.00;FS=3.533;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.028;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:108:99:886,0,1231 chrXI 72614 . T C 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2573,285,0 chrXI 72681 . T A 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;DP=119;Dels=0.00;FS=4.689;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.764;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:119:99:1013,0,1465 chrXI 73029 . T A 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.201;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1568,0,1325 chrXI 73132 . T A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.925;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,64:160:99:1203,0,2096 chrXI 73164 . A G 4423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4423,468,0 chrXI 73194 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.347;DP=171;Dels=0.00;FS=1.200;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.279;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,74:171:99:1464,0,2035 chrXI 73235 . A G 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3599,366,0 chrXI 73263 . T C 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3239,336,0 chrXI 73279 . C T 4176.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.77;SB=-2.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4176,418,0 chrXI 73320 . T C 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.52;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2714,306,0 chrXI 73424 . A G 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3247,342,0 chrXI 73701 . A G 4055.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4055,417,0 chrXI 73935 . T A 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.353;DP=129;Dels=0.00;FS=2.274;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1300,0,1399 chrXI 73999 . A G 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.871;DP=118;Dels=0.00;FS=5.605;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1242,0,1222 chrXI 74052 . T C 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.481;DP=116;Dels=0.00;FS=5.812;HaplotypeScore=2.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.01;MQ0=0;MQRankSum=-4.312;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.230;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:814,0,1223 chrXI 74086 . C T 356.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.101;DP=105;Dels=0.00;FS=9.790;HaplotypeScore=5.4408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.90;MQ0=0;MQRankSum=-8.425;QD=3.39;ReadPosRankSum=-3.355;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:386,0,1111 chrXI 74090 . G C 379.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.109;DP=106;Dels=0.00;FS=7.969;HaplotypeScore=6.2295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQ0=0;MQRankSum=-8.800;QD=3.58;ReadPosRankSum=-2.655;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:409,0,1097 chrXI 74091 . C T 379.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.781;DP=108;Dels=0.00;FS=11.973;HaplotypeScore=6.2295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.24;MQ0=0;MQRankSum=-8.567;QD=3.51;ReadPosRankSum=-2.325;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:409,0,1209 chrXI 74093 . G A 372.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.551;DP=108;Dels=0.00;FS=7.870;HaplotypeScore=6.2295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.24;MQ0=0;MQRankSum=-8.863;QD=3.44;ReadPosRankSum=-2.426;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:402,0,1199 chrXI 74103 . C A 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.43;MQ0=0;QD=18.74;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2488,261,0 chrXI 74114 . T A 572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.663;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.74;MQ0=0;MQRankSum=-6.689;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.620;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:602,0,1673 chrXI 74157 . T C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.323;DP=124;Dels=0.00;FS=6.267;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:923,0,1357 chrXI 74163 . C T 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.288;DP=126;Dels=0.00;FS=3.700;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1018,0,1370 chrXI 74223 . T C 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.991;DP=159;Dels=0.00;FS=1.981;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,88:159:99:1830,0,1373 chrXI 74352 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.939;DP=145;Dels=0.00;FS=2.166;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.777;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1441,0,1543 chrXI 74375 . C G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;DP=149;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.56;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.012;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1551,0,1455 chrXI 74603 . A T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.770;DP=114;Dels=0.00;FS=8.806;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=1.320;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1271,0,1114 chrXI 74756 . C T 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.935;DP=131;Dels=0.00;FS=28.026;HaplotypeScore=2.8771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.831;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1266,0,1414 chrXI 76124 . A G 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.219;DP=92;Dels=0.00;FS=5.380;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.282;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:92:99:807,0,962 chrXI 76522 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.723;DP=101;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.026;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1080,0,946 chrXI 76804 . C T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.505;DP=169;Dels=0.00;FS=4.631;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,86:169:99:1737,0,1634 chrXI 76914 . T C 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.319;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:130:99:1333,0,1309 chrXI 77001 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.250;DP=130;Dels=0.00;FS=2.201;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1198,0,1269 chrXI 77002 . A G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.777;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1209,0,1177 chrXI 77172 . C T 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.086;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=25.95;ReadPosRankSum=1.318;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3477,363,0 chrXI 77212 . A T 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.207;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.214;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1699,0,1357 chrXI 77517 . A C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.754;DP=138;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.571;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1294,0,1436 chrXI 77878 . C A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.890;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.371;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1138,0,1491 chrXI 77891 . G A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.860;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.493;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:1020,0,1405 chrXI 77942 . G A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;DP=131;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.925;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1222,0,1476 chrXI 77969 . T A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.657;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1083,0,1103 chrXI 78014 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.741;DP=115;Dels=0.00;FS=3.489;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.199;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1339,0,1140 chrXI 78107 . T C 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.762;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,59:137:99:1013,0,1723 chrXI 78125 . T C 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.114;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,91:155:99:1871,0,1287 chrXI 78131 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;DP=145;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.118;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1290,0,1609 chrXI 78137 . C T 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.118;DP=145;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=4.7030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=1;MQRankSum=0.283;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1284,0,1562 chrXI 78169 . G A 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.447;DP=153;Dels=0.00;FS=8.596;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=1;MQRankSum=0.066;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.018;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,62:153:99:1294,0,1805 chrXI 78245 . T C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.154;DP=130;Dels=0.00;FS=19.085;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.372;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1146,0,1429 chrXI 78269 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.268;DP=127;Dels=0.00;FS=5.891;HaplotypeScore=5.8165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.003;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:127:99:1337,0,1161 chrXI 78341 . C T 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.929;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1013,0,1201 chrXI 78422 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.205;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1049,0,1652 chrXI 78566 . A T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;DP=128;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=3.7865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.370;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1357,0,1248 chrXI 78581 . A G 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3398,348,0 chrXI 78615 . G C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.273;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.445;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1252,0,1591 chrXI 78639 . A G 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2850,303,0 chrXI 78708 . A T 2045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:81:99:2078,204,0 chrXI 78767 . T A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.690;DP=116;Dels=0.00;FS=6.897;HaplotypeScore=3.4195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=2.835;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,74:116:99:1364,0,830 chrXI 78779 . A T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.980;DP=107;Dels=0.00;FS=0.908;HaplotypeScore=6.3025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQ0=0;MQRankSum=3.512;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.317;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,67:107:99:1108,0,775 chrXI 78797 . C T 542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.410;DP=99;Dels=0.00;FS=7.925;HaplotypeScore=8.9755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=5.47;ReadPosRankSum=-2.811;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,34:99:99:572,0,1079 chrXI 78816 . T C 147.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;DP=102;Dels=0.00;FS=37.610;HaplotypeScore=85.9773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.179;QD=1.44;ReadPosRankSum=-3.717;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,17:102:99:177,0,765 chrXI 79002 . G C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.216;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:924,0,1280 chrXI 79142 . T G 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;DP=106;Dels=0.00;FS=15.207;HaplotypeScore=2.8522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=9.43;ReadPosRankSum=2.205;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1030,0,1240 chrXI 79181 . A G 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.383;DP=94;Dels=0.00;FS=3.812;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.148;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:825,0,1070 chrXI 79514 . G A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.609;DP=120;Dels=0.00;FS=9.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1433,0,1019 chrXI 79566 . G A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.686;DP=121;Dels=0.00;FS=2.338;HaplotypeScore=6.8929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.708;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.663;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1322,0,1138 chrXI 79688 . G A 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;DP=132;Dels=0.00;FS=9.574;HaplotypeScore=2.4521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:132:99:1070,0,1733 chrXI 79729 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.071;DP=132;Dels=0.00;FS=8.563;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.402;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1335,0,1492 chrXI 79772 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.601;DP=122;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.433;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1168,0,1298 chrXI 79805 . A G 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.750;DP=134;Dels=0.00;FS=5.258;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1496,0,1267 chrXI 79814 . G A 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.278;DP=132;Dels=0.00;FS=6.672;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.557;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1156,0,1481 chrXI 80298 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.791;DP=122;Dels=0.00;FS=5.799;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.551;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1165,0,1319 chrXI 80355 . G A 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;DP=142;Dels=0.00;FS=7.431;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1554,0,1422 chrXI 80472 . G A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.661;DP=164;Dels=0.00;FS=2.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,71:164:99:1385,0,1942 chrXI 80724 . C T 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.95;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3508,363,0 chrXI 80750 . T G 3532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3532,372,0 chrXI 80751 . C A 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3541,372,0 chrXI 80792 . A G 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3947,420,0 chrXI 80807 . T A 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3611,370,0 chrXI 80882 . A G 2409 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.62;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2442,264,0 chrXI 81143 . G A 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.453;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,68:156:99:1348,0,1763 chrXI 81244 . T C 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3203,342,0 chrXI 81327 . T C 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=147;Dels=0.00;FS=9.565;HaplotypeScore=3.6843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=10.65;ReadPosRankSum=3.493;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1595,0,1382 chrXI 81400 . A C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;DP=129;Dels=0.00;FS=9.602;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1302,0,1284 chrXI 81406 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.125;DP=136;Dels=0.00;FS=10.467;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1363,0,1369 chrXI 81479 . G A 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.025;DP=112;Dels=0.00;FS=2.437;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1052,0,1172 chrXI 81517 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.373;DP=123;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=7.96;ReadPosRankSum=2.719;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1009,0,1450 chrXI 81518 . T C 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:2719,285,0 chrXI 81532 . T C 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2711,276,0 chrXI 81727 . C T 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.890;DP=99;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.602;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:882,0,1089 chrXI 81758 . A G 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3069,333,0 chrXI 81776 . T C 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=114;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,45:114:99:849,0,1503 chrXI 81838 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.892;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.063;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1270,0,1363 chrXI 81865 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.416;DP=134;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1337,0,1324 chrXI 81883 . G T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.243;DP=131;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1257,0,1301 chrXI 81964 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.932;DP=104;Dels=0.00;FS=2.523;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.025;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1133,0,944 chrXI 81976 . A G 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2559,270,0 chrXI 82002 . A G 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.376;DP=97;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.311;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:904,0,1071 chrXI 82057 . A G 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.515;DP=86;Dels=0.00;FS=0.820;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,46:86:99:902,0,868 chrXI 82441 . C T 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3279,327,0 chrXI 82465 . T C 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.190;DP=129;Dels=0.01;FS=1.435;HaplotypeScore=14.1797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.540;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,77:128:99:1517,0,946 chrXI 82621 . G A 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;DP=98;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.082;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:979,0,1056 chrXI 82791 . G C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;DP=121;Dels=0.00;FS=4.493;HaplotypeScore=2.8164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.317;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:121:99:1275,0,1192 chrXI 83076 . T C 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.042;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1338,0,1763 chrXI 83235 . G C 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.843;DP=107;Dels=0.00;FS=4.836;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.919;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:975,0,1149 chrXI 83549 . A G 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3496,369,0 chrXI 83733 . A G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.15;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3263,366,0 chrXI 83745 . T G 3149 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.13;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3182,360,0 chrXI 83746 . G A 3200 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.13;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3233,357,0 chrXI 83753 . A G 2868 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.91;MQ0=0;QD=22.94;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2901,336,0 chrXI 83760 . A G 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.29;MQ0=0;QD=23.07;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2917,336,0 chrXI 83792 . C G 1999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.14;MQ0=0;QD=19.60;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2032,228,0 chrXI 83795 . C T 1957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.68;MQ0=0;QD=17.95;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:1990,219,0 chrXI 83830 . T C 1847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.25;MQ0=0;QD=18.29;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:1880,210,0 chrXI 83853 . C T 2157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=0;QD=21.15;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2190,237,0 chrXI 83889 . C T 2514 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.88;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2547,264,0 chrXI 83901 . G A 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.23;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2821,291,0 chrXI 84009 . C T 2324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=24.21;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2357,246,0 chrXI 84020 . T C 2208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.13;MQ0=0;QD=22.30;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2241,243,0 chrXI 84029 . C A 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.90;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2568,267,0 chrXI 84057 . G A 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.82;MQ0=0;QD=23.64;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2917,318,0 chrXI 84078 . T C 2109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.25;MQ0=0;QD=21.52;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2142,249,0 chrXI 84086 . G T 2302 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.54;MQ0=0;QD=23.25;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2335,258,0 chrXI 84139 . A G 2206 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.49;MQ0=0;QD=23.22;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2239,255,0 chrXI 84151 . C T 1672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.46;MQ0=0;QD=18.79;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1705,189,0 chrXI 84163 . C T 1599 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.76;MQ0=0;QD=19.74;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1632,183,0 chrXI 84166 . G T 1626 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.76;MQ0=0;QD=20.32;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1659,180,0 chrXI 84171 . C G 1539 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.76;MQ0=0;QD=19.48;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1572,177,0 chrXI 84180 . G C 1672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.63;MQ0=0;QD=20.14;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1705,201,0 chrXI 84187 . T C 1515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.09;MQ0=0;QD=19.18;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1548,174,0 chrXI 84259 . T C 2628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.96;MQ0=0;QD=25.51;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2661,297,0 chrXI 84308 . A T 2240 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=58.9265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.78;MQ0=0;QD=19.15;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2273,249,0 chrXI 84319 . T C 2358 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.65;MQ0=0;QD=20.50;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2391,261,0 chrXI 84335 . C T 1632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.19;MQ0=0;QD=18.98;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1665,177,0 chrXI 84350 . G A 1660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.21;MQ0=0;QD=19.08;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1693,186,0 chrXI 84421 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.594;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.884;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1335,0,1108 chrXI 84589 . C T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.967;DP=132;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.787;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1243,0,1359 chrXI 84611 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.555;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.294;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1176,0,1399 chrXI 84689 . G A 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.133;DP=96;Dels=0.00;FS=4.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.407;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:817,0,1058 chrXI 85003 . T C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.154;DP=140;Dels=0.00;FS=3.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=1;MQRankSum=1.563;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:140:99:1509,0,1270 chrXI 85027 . A G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.430;DP=159;Dels=0.00;FS=9.650;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=0.492;QD=10.35;ReadPosRankSum=-2.095;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,88:159:99:1675,0,1423 chrXI 85423 . T A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.689;DP=150;Dels=0.00;FS=2.856;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.485;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1548,0,1636 chrXI 85435 . C T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.886;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1538,0,1380 chrXI 85468 . C G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.311;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1275,0,1323 chrXI 85522 . C T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.423;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.160;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1467,0,1250 chrXI 85567 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;DP=114;Dels=0.00;FS=2.519;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.646;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1270,0,1083 chrXI 85801 . T C 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;DP=109;Dels=0.00;FS=0.910;HaplotypeScore=3.9347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=1.037;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.555;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:955,0,1200 chrXI 85821 . T C 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.304;DP=101;Dels=0.00;FS=0.908;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:834,0,1185 chrXI 85837 . T G 679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.375;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.319;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:709,0,1251 chrXI 86206 . C T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.410;DP=119;Dels=0.00;FS=5.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1151,0,1225 chrXI 86234 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;DP=112;Dels=0.00;FS=2.604;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1319,0,1008 chrXI 86327 . T C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;DP=124;Dels=0.00;FS=3.585;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1347,0,1155 chrXI 86346 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.677;DP=118;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1435,0,1027 chrXI 86885 . G A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.452;DP=117;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1245,0,1085 chrXI 87002 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.159;DP=121;Dels=0.00;FS=2.554;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:121:99:1404,0,1092 chrXI 87117 . T C 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.442;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.643;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1367,0,1539 chrXI 87119 . C T 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3675,375,0 chrXI 87176 . T A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.820;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.599;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1444,0,1677 chrXI 87312 . C G 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;DP=141;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.974;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1146,0,1700 chrXI 87337 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.900;DP=135;Dels=0.00;FS=4.354;HaplotypeScore=2.4002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1136,0,1600 chrXI 87410 . T A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;DP=139;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1411,0,1540 chrXI 87422 . T G 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3473,366,0 chrXI 87451 . A G 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.738;DP=139;Dels=0.00;FS=9.010;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.574;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1479,0,1477 chrXI 87764 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.292;DP=133;Dels=0.00;FS=9.219;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.048;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1279,0,1542 chrXI 87839 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.478;DP=121;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.474;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.361;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1259,0,1167 chrXI 88322 . T C 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2941,315,0 chrXI 88476 . C A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.459;DP=134;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=-0.680;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1429,0,1231 chrXI 88776 . G A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.020;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.626;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:997,0,1147 chrXI 88836 . G A 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.923;DP=113;Dels=0.00;FS=4.572;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.548;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1193,0,1110 chrXI 88890 . G A 1125.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.569;DP=116;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.698;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1155,0,1221 chrXI 88896 . T C 1165.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.550;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1195,0,1241 chrXI 88900 . G A 1322.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.374;DP=125;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1352,0,1165 chrXI 89063 . A T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.225;DP=108;Dels=0.00;FS=11.529;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,66:108:99:1399,0,830 chrXI 89097 . T G 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3216,333,0 chrXI 89124 . A G 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.792;DP=152;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.674;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1681,0,1421 chrXI 89225 . T A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.852;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1556,0,1304 chrXI 89253 . A C 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.631;DP=135;Dels=0.00;FS=2.517;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.618;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1279,0,1507 chrXI 89262 . G A 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3698,381,0 chrXI 89273 . A G 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=145;Dels=0.00;FS=4.055;HaplotypeScore=133.7475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.02;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.944;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3606,378,0 chrXI 89285 . T C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.129;DP=123;Dels=0.00;FS=8.483;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=-4.015;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.647;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:915,0,1332 chrXI 89332 . T C 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.30;MQ0=0;QD=22.97;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2583,294,0 chrXI 89366 . T C 1054.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.225;DP=121;Dels=0.00;FS=2.358;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.019;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1084,0,1309 chrXI 89367 . T C 2967 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.76;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3000,327,0 chrXI 89374 . A G 3025 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2215;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.26;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3058,333,0 chrXI 89443 . C A 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.549;DP=120;Dels=0.00;FS=6.129;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=1;MQRankSum=-0.818;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.143;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:965,0,1467 chrXI 89534 . A T 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=22.58;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2901,297,0 chrXI 89545 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.820;DP=132;Dels=0.00;FS=7.989;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=1.951;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:132:99:1180,0,1367 chrXI 89554 . C T 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3615,363,0 chrXI 89613 . A T 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;DP=171;Dels=0.00;FS=3.847;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=2.874;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.100;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,82:171:99:1723,0,1782 chrXI 89923 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.211;DP=107;Dels=0.00;FS=3.550;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.340;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1075,0,1089 chrXI 90349 . A G 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=23.05;ReadPosRankSum=-0.277;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3480,346,0 chrXI 90412 . A G 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3782,390,0 chrXI 90418 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.860;DP=153;Dels=0.00;FS=7.344;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.768;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,66:153:99:1311,0,1688 chrXI 90600 . G C 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.21;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2696,297,0 chrXI 90681 . C T 4035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4035,418,0 chrXI 90922 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.166;DP=130;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.515;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1512,0,1082 chrXI 91045 . C T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.744;DP=142;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=3.7542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.045;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1651,0,1280 chrXI 91192 . G A 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3016,315,0 chrXI 91339 . G A 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2908,291,0 chrXI 91402 . T C 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3310,330,0 chrXI 91504 . C T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.739;DP=110;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.383;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1126,0,1192 chrXI 91565 . C T 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8955;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3841,385,0 chrXI 91796 . C T 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.68;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3182,330,0 chrXI 91825 . G C 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=23.11;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3014,333,0 chrXI 92069 . G A 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=22.37;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3076,327,0 chrXI 92125 . T C 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.952;DP=119;Dels=0.00;FS=3.337;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1211,0,1149 chrXI 92145 . T C 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.01;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2974,324,0 chrXI 92154 . T C 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.41;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2841,309,0 chrXI 92158 . C T 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.13;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2951,306,0 chrXI 92193 . C T 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=0;QD=25.25;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2659,297,0 chrXI 92202 . A G 1931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.62;MQ0=0;QD=23.84;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1964,222,0 chrXI 92251 . G T 2356 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.73;MQ0=0;QD=25.61;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2389,261,0 chrXI 92252 . T A 2353 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.73;MQ0=0;QD=25.58;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2386,261,0 chrXI 92259 . T A 707.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.398;DP=101;Dels=0.00;FS=3.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.39;MQ0=0;MQRankSum=-4.568;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.642;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:737,0,1213 chrXI 92262 . C G 707.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;DP=100;Dels=0.00;FS=2.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.75;MQ0=0;MQRankSum=-4.445;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.212;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:737,0,1105 chrXI 92272 . C A 1518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=62.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.56;MQ0=0;QD=18.74;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1551,171,0 chrXI 92313 . T C 1851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.84;MQ0=0;QD=20.34;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:1884,228,0 chrXI 92330 . G T 2009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.23;MQ0=0;QD=22.32;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2042,222,0 chrXI 92358 . A G 2060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.79;MQ0=0;QD=24.82;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2093,237,0 chrXI 92395 . T C 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.73;MQ0=0;QD=24.39;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2716,306,0 chrXI 92422 . C T 2307 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.51;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2340,261,0 chrXI 92424 . C T 2201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.32;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2234,252,0 chrXI 92435 . C T 2307 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.85;MQ0=0;QD=23.30;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2340,264,0 chrXI 92441 . G T 2359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.01;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2392,270,0 chrXI 92500 . T G 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.33;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3105,327,0 chrXI 92507 . G T 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.86;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3330,331,0 chrXI 92653 . G A 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=110.6790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.29;MQ0=0;QD=24.25;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3064,324,0 chrXI 92679 . T G 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.357;DP=105;Dels=0.00;FS=21.001;HaplotypeScore=2.9444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:816,0,1147 chrXI 92948 . A T 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:4046,417,0 chrXI 93041 . G A 3955.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3955,405,0 chrXI 93302 . T G 4260.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=165;Dels=0.00;FS=3.367;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.522;SB=-1.980e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:4260,444,0 chrXI 93349 . G T 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3946,409,0 chrXI 93352 . G A 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3877,408,0 chrXI 93391 . C T 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3319,342,0 chrXI 93445 . C T 4080.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=21.94;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4080,405,0 chrXI 93529 . C G 4473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.31;SB=-2.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4473,468,0 chrXI 93538 . T C 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.225;DP=160;Dels=0.00;FS=1.239;HaplotypeScore=2.9310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.663;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1432,0,1728 chrXI 93562 . C T 4229.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.32;SB=-2.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4229,427,0 chrXI 93694 . G T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.303;DP=142;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=2.1101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.209;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1331,0,1523 chrXI 93696 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.405;DP=142;Dels=0.00;FS=3.006;HaplotypeScore=2.1101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.859;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1482,0,1416 chrXI 93806 . C G 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.77;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2782,303,0 chrXI 93852 . A G 2087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=22.93;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:2120,240,0 chrXI 93931 . T C 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.998;DP=98;Dels=0.00;FS=2.736;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.480;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:949,0,1000 chrXI 93937 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.915;DP=106;Dels=0.00;FS=6.114;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1116,0,932 chrXI 94000 . A C 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6353;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=23.11;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3397,372,0 chrXI 94374 . C G 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3225,345,0 chrXI 94473 . T C 3954.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=67.6556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3954,402,0 chrXI 94945 . C A 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3393,357,0 chrXI 94985 . C T 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3040,318,0 chrXI 95277 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.156;DP=131;Dels=0.00;FS=1.578;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.256;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1297,0,1409 chrXI 95374 . G A 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2823;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3602,378,0 chrXI 95430 . C T 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.56;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3680,396,0 chrXI 95443 . G A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.313;DP=134;Dels=0.00;FS=8.639;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.222;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1460,0,1338 chrXI 96552 . C T 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2869,303,0 chrXI 96792 . T G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.668;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1416,0,1507 chrXI 96863 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.600;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,66:157:99:1228,0,2031 chrXI 97113 . T C 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2903,324,0 chrXI 97143 . G A 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3503,357,0 chrXI 97362 . C T 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3410,351,0 chrXI 97380 . C T 3930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.595;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.820;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3930,411,0 chrXI 97410 . C T 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3207,330,0 chrXI 97680 . T C 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=22.35;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2693,306,0 chrXI 97716 . C T 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3758,399,0 chrXI 97758 . G A 4125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.62;SB=-2.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4125,415,0 chrXI 97897 . G A 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3376,333,0 chrXI 97922 . T G 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.351;DP=107;Dels=0.00;FS=2.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.486;QD=8.92;ReadPosRankSum=2.199;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:984,0,1261 chrXI 97953 . G A 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3499,357,0 chrXI 98046 . T C 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.920;DP=141;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.468;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,52:141:99:878,0,1889 chrXI 98085 . A G 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.090;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=5.45;ReadPosRankSum=-1.048;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,45:128:99:728,0,1810 chrXI 98109 . C T 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;DP=114;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=3.4271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=13.06;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,73:114:99:1519,0,694 chrXI 98124 . G A 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.589;DP=121;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=4.4263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.202;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1064,0,1205 chrXI 98162 . T A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.977;DP=138;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.563;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,53:138:99:967,0,1785 chrXI 98172 . C T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.233;DP=152;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,61:152:99:1102,0,1886 chrXI 98175 . G C 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3707,381,0 chrXI 98324 . A G 3882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;DP=171;Dels=0.00;FS=3.854;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=22.70;ReadPosRankSum=1.345;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:3882,426,0 chrXI 98325 . C T 4217.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.975e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4217,427,0 chrXI 98422 . A G 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2934,318,0 chrXI 98452 . C T 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2686,273,0 chrXI 98707 . A C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.732;DP=151;Dels=0.00;FS=10.894;HaplotypeScore=5.9208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.674;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1245,0,1923 chrXI 98713 . A G 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.823;DP=148;Dels=0.00;FS=13.022;HaplotypeScore=4.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.107;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,86:148:99:1815,0,1273 chrXI 99008 . T C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.375;DP=130;Dels=0.00;FS=15.703;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=2.229;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.023;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1488,0,1124 chrXI 99092 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.663;DP=136;Dels=0.00;FS=5.409;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.313;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1323,0,1469 chrXI 99213 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.385;DP=145;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=2.9471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:145:99:1286,0,1493 chrXI 99224 . T C 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3580,378,0 chrXI 99591 . T C 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;DP=168;Dels=0.00;FS=0.570;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,80:168:99:1583,0,1880 chrXI 99633 . A G 4604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=23.85;SB=-2.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4604,456,0 chrXI 99673 . C T 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.929;DP=183;Dels=0.00;FS=10.119;HaplotypeScore=11.7218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,86:183:99:1728,0,1978 chrXI 99839 . T G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.328;DP=148;Dels=0.00;FS=1.347;HaplotypeScore=4.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=0.188;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1218,0,1661 chrXI 99991 . T C 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.528;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=9.98;ReadPosRankSum=2.067;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,87:168:99:1717,0,1685 chrXI 100167 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.652;DP=104;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.571;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1054,0,1019 chrXI 100445 . A G 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=3.046;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=24.92;ReadPosRankSum=1.074;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3048,309,0 chrXI 100619 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.576;DP=136;Dels=0.00;FS=6.089;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.627;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1321,0,1562 chrXI 100670 . T C 3722.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3722,387,0 chrXI 101564 . A G 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.20;SB=-2.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3654,390,0 chrXI 102671 . G A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.027;DP=131;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=6.6883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.914;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1560,0,1191 chrXI 102908 . C T 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3799,378,0 chrXI 103037 . C T 4638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.91;SB=-2.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4638,460,0 chrXI 103301 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.133;DP=122;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=3.4786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.597;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:122:99:1535,0,1054 chrXI 103312 . T C 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.579;DP=136;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=2.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.338;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,80:136:99:1639,0,1106 chrXI 103490 . T C 4205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;DP=175;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=7.5239;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=24.03;ReadPosRankSum=0.980;SB=-2.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:4205,471,0 chrXI 103493 . C T 4693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.304;DP=186;Dels=0.00;FS=3.201;HaplotypeScore=7.5239;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=25.23;ReadPosRankSum=0.968;SB=-2.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,185:186:99:4693,481,0 chrXI 103508 . T C 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3812,396,0 chrXI 103649 . G A 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.712;QD=22.78;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:172:99:3918,383,0 chrXI 103811 . C T 4019.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.10;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4019,426,0 chrXI 103928 . A G 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=24.70;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,160:161:99:3976,423,0 chrXI 104318 . G T 4601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4601,475,0 chrXI 104492 . T C 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3304,348,0 chrXI 104549 . C T 3998.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.965e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3998,423,0 chrXI 105107 . C A 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85;SB=-2.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3852,411,0 chrXI 105188 . C T 4370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.17;SB=-2.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4370,450,0 chrXI 105974 . A G 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2909,318,0 chrXI 106209 . T C 4387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.79;SB=-2.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4387,456,0 chrXI 106606 . C G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.285;DP=137;Dels=0.00;FS=4.321;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.847;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1342,0,1345 chrXI 106700 . C T 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3447,345,0 chrXI 106779 . C G 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;DP=111;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.830;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:876,0,1319 chrXI 106896 . A G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.861;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1086,0,1577 chrXI 106961 . A G 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.051;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.171;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,78:126:99:1688,0,897 chrXI 107231 . C A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.540;DP=133;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.453;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1322,0,1462 chrXI 107762 . T A 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.439;DP=134;Dels=0.00;FS=4.028;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.853;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3501,342,0 chrXI 107858 . G C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.263;DP=144;Dels=0.00;FS=2.126;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,58:144:99:1033,0,1873 chrXI 108778 . T C 1452.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.126;DP=129;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1482,0,1189 chrXI 108780 . T G 3339.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3339,351,0 chrXI 108782 . T C 3111 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3144,351,0 chrXI 108816 . T C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.734;DP=146;Dels=0.00;FS=4.485;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=2.593;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1465,0,1593 chrXI 108841 . T G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=8.94;ReadPosRankSum=2.122;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1362,0,1700 chrXI 109023 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.314;DP=104;Dels=0.00;FS=1.808;HaplotypeScore=5.8459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.647;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1140,0,776 chrXI 109080 . G C 2367 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=21.32;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2400,252,0 chrXI 109206 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.336;DP=149;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.771;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.158;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1346,0,1547 chrXI 109538 . C T 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.271;DP=121;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1193,0,1255 chrXI 109640 . G A 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.762;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1024,0,1321 chrXI 109648 . A T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.441;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1577,0,1078 chrXI 109778 . G A 2005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.02;MQ0=0;QD=26.04;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2038,204,0 chrXI 109806 . T C 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.107;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.13;MQ0=0;MQRankSum=-5.038;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:875,0,1194 chrXI 109823 . T C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.20;MQ0=0;MQRankSum=-4.305;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:915,0,1126 chrXI 109825 . T C 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.955;DP=106;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=3.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.36;MQ0=0;MQRankSum=-3.705;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:934,0,1191 chrXI 109838 . C G 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=48.5979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.83;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=22.47;ReadPosRankSum=1.580;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2595,285,0 chrXI 109873 . T A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.400;DP=105;Dels=0.00;FS=9.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.724;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,61:105:99:1130,0,938 chrXI 110327 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.299;DP=147;Dels=0.00;FS=1.291;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.80;ReadPosRankSum=2.044;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1471,0,1532 chrXI 110429 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.215;DP=136;Dels=0.00;FS=3.483;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.486;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1187,0,1557 chrXI 110470 . A G 1822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.322;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,91:156:99:1852,0,1312 chrXI 110492 . A G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.239;DP=165;Dels=0.00;FS=1.961;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=7.74;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,70:165:99:1307,0,2016 chrXI 110746 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.923;DP=133;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=8.78;ReadPosRankSum=2.384;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1198,0,1527 chrXI 110832 . G C 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3521,363,0 chrXI 110834 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.347;DP=136;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1306,0,1504 chrXI 110926 . C T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.682;DP=130;Dels=0.00;FS=3.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1506,0,1256 chrXI 111034 . T C 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2898,312,0 chrXI 111039 . T G 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2797,300,0 chrXI 111187 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.925;DP=116;Dels=0.00;FS=1.758;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.598;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:1020,0,1445 chrXI 111232 . G A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.621;DP=118;Dels=0.00;FS=2.649;HaplotypeScore=5.4665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.519;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:967,0,1470 chrXI 111236 . G A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=119;Dels=0.00;FS=5.094;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1009,0,1394 chrXI 111256 . T C 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.850;DP=103;Dels=0.00;FS=5.181;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:873,0,1221 chrXI 111265 . A G 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.182;DP=106;Dels=0.00;FS=2.520;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.804;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.381;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:841,0,1135 chrXI 111552 . C T 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.629;DP=135;Dels=0.00;FS=4.228;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=25.78;ReadPosRankSum=0.680;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3480,343,0 chrXI 111679 . C T 3784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3784,367,0 chrXI 111701 . C T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.167;DP=157;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=2.7766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.772;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,73:157:99:1469,0,1674 chrXI 111787 . T G 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2832,306,0 chrXI 112039 . T C 2654 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2687,303,0 chrXI 112062 . G A 2643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2676,282,0 chrXI 112116 . G A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.562;DP=142;Dels=0.00;FS=5.035;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.467;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1161,0,1680 chrXI 112117 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.937;DP=139;Dels=0.00;FS=4.051;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.410;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1160,0,1636 chrXI 112929 . A T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.923;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,59:99:99:1220,0,858 chrXI 113110 . C A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.498;DP=123;Dels=0.00;FS=11.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.349;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1359,0,1161 chrXI 113142 . A T 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.236;DP=135;Dels=0.00;FS=2.191;HaplotypeScore=2.7164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1584,0,1305 chrXI 113638 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.425;DP=137;Dels=0.00;FS=4.261;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.653;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1509,0,1334 chrXI 113698 . A T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.747;DP=127;Dels=0.00;FS=8.215;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.571;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1370,0,1302 chrXI 113884 . G A 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3175,333,0 chrXI 113998 . C T 3977.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3977,402,0 chrXI 114166 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.164;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.532;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1247,0,1398 chrXI 114199 . A G 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3123,321,0 chrXI 114400 . C T 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2818,291,0 chrXI 114933 . A G 2202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2235,228,0 chrXI 115293 . T C 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2746,297,0 chrXI 115499 . A G 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2716,303,0 chrXI 115557 . G A 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3234,333,0 chrXI 115603 . C T 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.151;DP=110;Dels=0.00;FS=1.643;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=8.75;ReadPosRankSum=3.187;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:993,0,1237 chrXI 115612 . C G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;DP=119;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=4.4937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=11.06;ReadPosRankSum=-2.227;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1346,0,1044 chrXI 115636 . T C 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.37;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2748,300,0 chrXI 115680 . G A 2701 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2734,264,0 chrXI 115797 . A G 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.33;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2904,312,0 chrXI 115840 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.555;DP=123;Dels=0.00;FS=3.293;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:123:99:1273,0,1182 chrXI 115863 . A G 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2885,309,0 chrXI 115888 . C G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;DP=138;Dels=0.01;FS=0.656;HaplotypeScore=7.6195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.127;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1335,0,1318 chrXI 115962 . T C 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3216,348,0 chrXI 115995 . G A 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3096,318,0 chrXI 116406 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.404;DP=137;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=1;MQRankSum=0.272;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.194;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1323,0,1386 chrXI 116643 . A G 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.695;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.40;ReadPosRankSum=2.606;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1559,0,1490 chrXI 116904 . C T 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.42;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3241,333,0 chrXI 117198 . A G 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2858,321,0 chrXI 117204 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.544;DP=113;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.855;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1273,0,1068 chrXI 117695 . A G 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2944,312,0 chrXI 117801 . T C 1839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.406;DP=159;Dels=0.00;FS=4.855;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.687;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.121;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,93:159:99:1869,0,1315 chrXI 117908 . C A,T 3912.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.60;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,93,71:164:99:3912,1651,1396,2261,0,2063 chrXI 118012 . T G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;DP=129;Dels=0.00;FS=23.519;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.497;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1300,0,1265 chrXI 118015 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.364;DP=127;Dels=0.00;FS=24.046;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1180,0,1332 chrXI 118316 . C T 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.308;DP=109;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=5.7802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.138;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:737,0,1456 chrXI 118487 . C A 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3692,376,0 chrXI 118549 . C A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;DP=138;Dels=0.00;FS=3.064;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.261;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1296,0,1606 chrXI 118559 . T C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.386;DP=140;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.391;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1265,0,1652 chrXI 118745 . G A 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.040;DP=114;Dels=0.00;FS=2.456;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:897,0,1406 chrXI 118759 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.629;DP=143;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.788;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1371,0,1588 chrXI 119116 . C T 1772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.864;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.029;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,82:138:99:1802,0,1035 chrXI 119177 . G A 1861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;DP=189;Dels=0.00;FS=2.954;HaplotypeScore=3.5908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.554;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,90:189:99:1891,0,2064 chrXI 119221 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.333;DP=167;Dels=0.00;FS=1.980;HaplotypeScore=3.7230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.483;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,66:167:99:1169,0,2057 chrXI 119238 . G A 4064.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.72;SB=-2.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4064,409,0 chrXI 119264 . T A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.391;DP=130;Dels=0.00;FS=3.131;HaplotypeScore=4.3895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1352,0,1335 chrXI 119302 . A G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.334;DP=144;Dels=0.00;FS=1.331;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.813;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1437,0,1579 chrXI 119339 . T C 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3676,381,0 chrXI 119350 . G T 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;DP=145;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.575;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1447,0,1525 chrXI 119431 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.436;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.113;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1318,0,1523 chrXI 119501 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.335;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.406;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1434,0,1407 chrXI 119794 . G C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.359;DP=128;Dels=0.00;FS=3.196;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1172,0,1268 chrXI 120088 . A G 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.09;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2746,297,0 chrXI 120268 . C T 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3077,315,0 chrXI 120563 . T C 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2786,297,0 chrXI 120740 . A G 2791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2824,324,0 chrXI 120989 . T C 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2954,315,0 chrXI 120995 . A T 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3264,333,0 chrXI 121247 . T C 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.29;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2941,315,0 chrXI 121252 . C T 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.146;DP=120;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=3.4207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.454;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1262,0,1200 chrXI 121508 . T C 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.052;DP=135;Dels=0.00;FS=2.247;HaplotypeScore=4.2233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:135:99:1558,0,1216 chrXI 121522 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.170;DP=128;Dels=0.00;FS=2.305;HaplotypeScore=7.0620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1184,0,1420 chrXI 121760 . G A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.698;DP=123;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.767;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1423,0,991 chrXI 122192 . G A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.867;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.389;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1320,0,1033 chrXI 122402 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.113;DP=121;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.885;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.514;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1365,0,1082 chrXI 122779 . C T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.014;DP=155;Dels=0.00;FS=2.000;HaplotypeScore=4.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1564,0,1587 chrXI 122858 . G A 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.159;DP=171;Dels=0.00;FS=6.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=8.89;ReadPosRankSum=-2.179;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,78:171:99:1550,0,1920 chrXI 122945 . C T 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.845;DP=154;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=2.4546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,84:154:99:1787,0,1356 chrXI 123123 . T C 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.562;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1555,0,1254 chrXI 123302 . A C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.098;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.496;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1069,0,1438 chrXI 123413 . G C 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;DP=97;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.280;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:838,0,1121 chrXI 123578 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.536;DP=129;Dels=0.00;FS=2.409;HaplotypeScore=3.9668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.267;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1257,0,1389 chrXI 123581 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.103;DP=124;Dels=0.00;FS=2.532;HaplotypeScore=4.8827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.973;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1290,0,1234 chrXI 123611 . A G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.214;DP=129;Dels=0.00;FS=2.511;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1179,0,1489 chrXI 123617 . A G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.586;DP=128;Dels=0.00;FS=1.593;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1204,0,1418 chrXI 123831 . A T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;DP=121;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.321;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1094,0,1505 chrXI 123848 . A G 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.743;DP=128;Dels=0.00;FS=3.182;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.259;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1429,0,1206 chrXI 123855 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.914;DP=110;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=6.6312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.265;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.311;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1175,0,1071 chrXI 123867 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.124;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=9.35;ReadPosRankSum=2.061;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1152,0,1259 chrXI 123889 . T G 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.862;DP=138;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1518,0,1289 chrXI 123941 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.060;DP=128;Dels=0.00;FS=8.783;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.753;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1221,0,1332 chrXI 124007 . T C 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.672;DP=136;Dels=0.00;FS=5.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1656,0,1176 chrXI 124022 . T C 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.588;DP=157;Dels=0.00;FS=7.746;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.510;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1821,0,1542 chrXI 124031 . A G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.503;DP=157;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.265;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,84:157:99:1618,0,1510 chrXI 124073 . A G 1946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.391;DP=181;Dels=0.00;FS=3.503;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=1;MQRankSum=-0.525;QD=10.75;ReadPosRankSum=-2.037;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,100:181:99:1976,0,1555 chrXI 124109 . T C 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.245;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=-0.163;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.879;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,91:178:99:1738,0,1731 chrXI 124463 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.732;DP=140;Dels=0.00;FS=15.675;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:140:99:1414,0,1477 chrXI 124472 . G C 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;DP=145;Dels=0.00;FS=11.831;HaplotypeScore=4.9448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=9.53;ReadPosRankSum=3.122;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1412,0,1576 chrXI 124690 . G A 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.199;DP=129;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=3.8936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.205;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,79:129:99:1783,0,945 chrXI 124741 . A G 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.830;DP=136;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1589,0,1206 chrXI 124920 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.126;DP=139;Dels=0.00;FS=3.227;HaplotypeScore=3.7044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1365,0,1487 chrXI 125057 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.147;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,74:165:99:1444,0,1736 chrXI 125147 . G A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.590;DP=133;Dels=0.00;FS=3.157;HaplotypeScore=2.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.043;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1116,0,1622 chrXI 125207 . A G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.604;DP=132;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.062;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1315,0,1197 chrXI 125303 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.747;DP=136;Dels=0.00;FS=6.448;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1248,0,1583 chrXI 125453 . T A 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.672;DP=107;Dels=0.00;FS=3.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.651;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:953,0,1294 chrXI 125483 . T A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.479;DP=122;Dels=0.00;FS=1.469;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.069;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1172,0,1397 chrXI 125523 . G C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.452;DP=136;Dels=0.00;FS=7.701;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.627;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:136:99:1393,0,1372 chrXI 125562 . A G 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.419;DP=138;Dels=0.00;FS=4.057;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1446,0,1386 chrXI 125651 . T A 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=107;Dels=0.00;FS=3.859;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=24.93;ReadPosRankSum=1.052;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2700,273,0 chrXI 125664 . C A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.912;DP=140;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.847;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1349,0,1528 chrXI 125800 . A G 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.805;DP=146;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.814;QD=10.98;ReadPosRankSum=-2.532;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1633,0,1444 chrXI 125830 . A G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.946;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.902;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1332,0,1452 chrXI 125920 . A G 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.113;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:806,0,1023 chrXI 126208 . T C 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.688;DP=101;Dels=0.00;FS=1.625;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=1.206;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.956;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1064,0,911 chrXI 126748 . A G 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2989,327,0 chrXI 127159 . C T 4077.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4077,429,0 chrXI 127196 . G A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.808;DP=126;Dels=0.00;FS=5.914;HaplotypeScore=9.6957;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=23.52;ReadPosRankSum=2.848;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,123:126:99:2997,303,0 chrXI 127198 . A T 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.098;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1043,0,1302 chrXI 127208 . G A 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9668;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3379,342,0 chrXI 127867 . G A 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3580,366,0 chrXI 128164 . T C 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3644,387,0 chrXI 128185 . A G 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3151,336,0 chrXI 128195 . A C 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3079,348,0 chrXI 128199 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.784;DP=133;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.795;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1430,0,1284 chrXI 128646 . C T 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3404,354,0 chrXI 129022 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.912;DP=146;Dels=0.00;FS=6.110;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.253;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1330,0,1612 chrXI 129198 . C G 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3191,339,0 chrXI 129511 . A G 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.66;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3138,336,0 chrXI 129623 . C A 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=21.60;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3370,345,0 chrXI 129844 . A G 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2804,309,0 chrXI 129862 . G A 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2746,294,0 chrXI 130226 . C T 3953.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3953,394,0 chrXI 130584 . G T 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3335,330,0 chrXI 130801 . G A 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3406,333,0 chrXI 131399 . T C 2244 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2277,261,0 chrXI 131862 . C T 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3255,330,0 chrXI 132044 . G A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.024;DP=132;Dels=0.00;FS=9.411;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.150;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1020,0,1542 chrXI 132074 . A G 2627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6895;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=23.67;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2660,285,0 chrXI 132152 . G A 2304 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.60;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2337,246,0 chrXI 132155 . C T 2308 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.64;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2341,246,0 chrXI 132251 . T A 2237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.32;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2270,234,0 chrXI 132257 . C T 2260 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.28;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2293,240,0 chrXI 132287 . T C 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.30;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2614,273,0 chrXI 132298 . A G 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2595,267,0 chrXI 132383 . C T 2152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.24;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2185,228,0 chrXI 132408 . C T 2494 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.53;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2527,258,0 chrXI 132423 . C T 2495 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.72;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2528,264,0 chrXI 132442 . G A 2349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.53;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2382,243,0 chrXI 132521 . G A 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3315,345,0 chrXI 132731 . T C 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3082,318,0 chrXI 133227 . T C 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3854,411,0 chrXI 133251 . T C 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3541,369,0 chrXI 133472 . C A 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2727,282,0 chrXI 133596 . C G 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3493,390,0 chrXI 133597 . A T 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3342,357,0 chrXI 133744 . C T 3613.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3613,375,0 chrXI 133991 . G A 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=1;QD=25.42;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3033,315,0 chrXI 134323 . C T 4006.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4006,417,0 chrXI 134344 . C T 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3416,354,0 chrXI 135083 . A G 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3380,378,0 chrXI 135691 . C G 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2840,285,0 chrXI 135796 . C T 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2909,300,0 chrXI 136049 . G A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.545;DP=122;Dels=0.00;FS=3.365;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=1;MQRankSum=1.158;QD=8.71;ReadPosRankSum=1.762;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1093,0,1272 chrXI 136140 . T A 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1138;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=1;MQRankSum=1.669;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.779;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,109:111:99:2830,303,0 chrXI 136268 . C T 2217 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2250,225,0 chrXI 136273 . T A 2163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2196,222,0 chrXI 136395 . C G 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=24.61;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2642,288,0 chrXI 136401 . C T 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.58;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3656,384,0 chrXI 136421 . A C 2679 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.98;MQ0=0;QD=26.01;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2712,288,0 chrXI 136588 . T C 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3135,333,0 chrXI 136692 . G A 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2950,291,0 chrXI 136700 . A C 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:2982,309,0 chrXI 136782 . G A 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2777,282,0 chrXI 136836 . G T 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2743,297,0 chrXI 136860 . A G 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2945,309,0 chrXI 136898 . T C 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2821,303,0 chrXI 136931 . A C 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2813,294,0 chrXI 137272 . G A 3638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3638,366,0 chrXI 137449 . G A 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2915,300,0 chrXI 137613 . T G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.774;DP=128;Dels=0.00;FS=2.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.512;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1128,0,1347 chrXI 137708 . A G 2287 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.13;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2320,255,0 chrXI 137740 . A G 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.835;DP=112;Dels=0.00;FS=4.748;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1306,0,974 chrXI 138163 . A G 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2642,276,0 chrXI 138169 . T C 2615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2648,282,0 chrXI 138829 . A G 2279 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2312,246,0 chrXI 138955 . C T 2573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2606,270,0 chrXI 139006 . T A 2544 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.379;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2577,264,0 chrXI 139012 . A G 2481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2514,267,0 chrXI 139532 . A G 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3912,417,0 chrXI 140593 . G A 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8374;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=25.23;ReadPosRankSum=0.425;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2707,267,0 chrXI 140833 . T G 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3035,312,0 chrXI 141102 . G T 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=118;Dels=0.00;FS=3.439;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2969,312,0 chrXI 141104 . A G 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=3.439;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.163;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,116:118:99:2957,312,0 chrXI 141113 . C T 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=115;Dels=0.00;FS=3.447;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.738;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2895,303,0 chrXI 141122 . A G 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;DP=113;Dels=0.00;FS=3.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=24.57;ReadPosRankSum=1.211;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2809,300,0 chrXI 141163 . G A 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.05;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3900,388,0 chrXI 141217 . A C 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3855,414,0 chrXI 141227 . G A 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3914,420,0 chrXI 141291 . T C 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.21;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3530,375,0 chrXI 141507 . A T 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.37;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2722,285,0 chrXI 141805 . G C 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3022,324,0 chrXI 141809 . A G 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3176,345,0 chrXI 141842 . A G 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2782,297,0 chrXI 142310 . A G 2065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=111;Dels=0.00;FS=5.917;HaplotypeScore=7.7746;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.724;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,103:111:99:2098,231,0 chrXI 142523 . T C 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;DP=140;Dels=0.00;FS=2.976;HaplotypeScore=7.9556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=2.326;QD=23.57;ReadPosRankSum=0.929;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,137:140:99:3300,357,0 chrXI 142535 . T C 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;DP=126;Dels=0.00;FS=15.957;HaplotypeScore=4.0237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=2.274;QD=22.33;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,120:126:99:2846,306,0 chrXI 142780 . C T 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=1;QD=25.98;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3351,348,0 chrXI 142986 . A G 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.89;SB=-2.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3858,390,0 chrXI 143177 . G A 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2796,288,0 chrXI 143668 . C T 4364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.13;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4364,433,0 chrXI 143713 . C T 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3710,381,0 chrXI 143731 . A T 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:140:99:3621,381,0 chrXI 143785 . A T 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3615,366,0 chrXI 143865 . T C 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2960,318,0 chrXI 144069 . A G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3168,333,0 chrXI 144520 . A T 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.11;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2966,312,0 chrXI 144571 . T C 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=20.33;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:2839,303,0 chrXI 144577 . C T 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.579;DP=137;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=2.5583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.10;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.503;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:2833,276,0 chrXI 144619 . T A 2143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.621;DP=113;Dels=0.00;FS=7.309;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.72;MQ0=0;MQRankSum=2.384;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.817;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,111:113:99:2176,201,0 chrXI 144646 . T C 1911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;DP=95;Dels=0.00;FS=2.845;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;MQRankSum=1.724;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.609;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,93:95:99:1944,188,0 chrXI 144700 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.030;DP=83;Dels=0.00;FS=33.678;HaplotypeScore=66.3513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.146;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,58:83:93:1022,0,93 chrXI 144718 . T C 438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.493;DP=82;Dels=0.00;FS=12.707;HaplotypeScore=20.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.63;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=5.34;ReadPosRankSum=-3.897;SB=-7.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:468,0,584 chrXI 144760 . A G 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.468;DP=97;Dels=0.00;FS=44.497;HaplotypeScore=4.3932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.80;MQ0=0;MQRankSum=3.557;QD=9.23;ReadPosRankSum=2.838;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,73:97:99:925,0,183 chrXI 144772 . T C 93.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;DP=85;Dels=0.00;FS=17.032;HaplotypeScore=17.2542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.101;QD=1.09;ReadPosRankSum=-2.101;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,11:85:99:123,0,1109 chrXI 144799 . A G 141.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.492;DP=72;Dels=0.00;FS=20.078;HaplotypeScore=10.7681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.03;MQ0=0;MQRankSum=-3.989;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.686;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:171,0,950 chrXI 144802 . A T 165.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.195;DP=71;Dels=0.00;FS=23.415;HaplotypeScore=10.7642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.81;MQ0=0;MQRankSum=-4.191;QD=2.32;ReadPosRankSum=2.374;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:195,0,857 chrXI 144803 . A T 162.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;DP=71;Dels=0.00;FS=23.415;HaplotypeScore=10.7642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.81;MQ0=0;MQRankSum=-4.012;QD=2.28;ReadPosRankSum=2.622;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:192,0,874 chrXI 144814 . A G 87.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=83;Dels=0.00;FS=39.164;HaplotypeScore=7.7828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.141;QD=1.05;ReadPosRankSum=-2.316;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:117,0,918 chrXI 144826 . T C 97.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;DP=80;Dels=0.00;FS=30.479;HaplotypeScore=7.9300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.20;MQ0=0;MQRankSum=3.079;QD=1.21;ReadPosRankSum=-2.109;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,12:80:99:127,0,1128 chrXI 144844 . C T 88.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.789;DP=100;Dels=0.00;FS=36.046;HaplotypeScore=61.6770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.16;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=0.88;ReadPosRankSum=-2.663;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:100:99:118,0,1294 chrXI 144850 . T C 529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.633;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=48.8285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=4.85;ReadPosRankSum=-2.725;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:559,0,975 chrXI 144862 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.662;DP=104;Dels=0.00;FS=25.702;HaplotypeScore=17.4545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.56;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.963;SB=-6.974e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,78:104:99:1219,0,178 chrXI 144880 . C T 892.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.374;DP=112;Dels=0.00;FS=2.531;HaplotypeScore=9.5552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.776;QD=7.96;ReadPosRankSum=-2.716;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:922,0,756 chrXI 144883 . G A 868.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.546;DP=112;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=8.7665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.350;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:898,0,826 chrXI 144889 . T C 2077 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;DP=116;Dels=0.00;FS=5.315;HaplotypeScore=9.3449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.97;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=17.91;ReadPosRankSum=2.922;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,113:116:99:2110,225,0 chrXI 144916 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.684;DP=96;Dels=0.00;FS=8.532;HaplotypeScore=23.2997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.76;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.450;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,78:96:34:1474,0,34 chrXI 144919 . C T 345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.664;DP=100;Dels=0.00;FS=1.959;HaplotypeScore=22.3050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=3.45;ReadPosRankSum=-4.291;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:375,0,1177 chrXI 144928 . G A 95.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.902;DP=106;Dels=0.00;FS=14.328;HaplotypeScore=6.9482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.157;SB=-1.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:125,0,1558 chrXI 145063 . T C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.750;DP=116;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=2.267;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1063,0,1354 chrXI 145495 . T C 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2467,261,0 chrXI 145622 . C T 4237.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4271;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;QD=23.67;SB=-2.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4237,447,0 chrXI 145687 . A T 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3084,324,0 chrXI 145747 . C T 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.02;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2852,297,0 chrXI 145779 . T C 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=23.46;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2966,318,0 chrXI 145797 . G A 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.83;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3085,315,0 chrXI 145814 . T C 2405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=24.05;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2438,261,0 chrXI 145832 . A G 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=24.78;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2536,270,0 chrXI 145859 . G A 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2783,291,0 chrXI 145993 . G C 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3032,339,0 chrXI 146213 . A G 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3437,363,0 chrXI 146436 . T C 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.44;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3378,363,0 chrXI 146489 . G A 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.25;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3631,375,0 chrXI 146583 . A G 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.37;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3118,351,0 chrXI 146593 . A G 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.66;MQ0=0;QD=21.67;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2568,300,0 chrXI 146595 . T C 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.69;MQ0=0;QD=22.58;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2652,294,0 chrXI 146606 . T C 2201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4511;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.21;MQ0=0;QD=20.57;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2234,258,0 chrXI 146631 . A C 2095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.34;MQ0=0;QD=20.95;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2128,240,0 chrXI 146650 . A T 2217 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.10;MQ0=0;QD=22.86;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2250,237,0 chrXI 146689 . A T 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.75;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2488,264,0 chrXI 146743 . A T 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.64;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2804,285,0 chrXI 146875 . T C 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.56;MQ0=1;QD=24.61;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2716,300,0 chrXI 146915 . A G 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=93.6994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.79;MQ0=1;QD=23.28;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2570,282,0 chrXI 147072 . T C 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=22.83;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2933,309,0 chrXI 147232 . T C 4257.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.86;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4257,450,0 chrXI 147261 . C T 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.38;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3846,388,0 chrXI 147343 . G A 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3290,336,0 chrXI 147354 . G T 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.26;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3350,339,0 chrXI 147360 . C T 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3442,351,0 chrXI 147421 . G C 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3398,366,0 chrXI 147443 . A T 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3431,357,0 chrXI 147476 . G C 3722.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3722,402,0 chrXI 147617 . G A 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3176,318,0 chrXI 147885 . T C 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3720,393,0 chrXI 147892 . T A 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3511,369,0 chrXI 147911 . G T 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3047,315,0 chrXI 147977 . T C 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5555;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=24.11;ReadPosRankSum=1.459;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2782,306,0 chrXI 148038 . G A 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3358,351,0 chrXI 148063 . C T 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3225,336,0 chrXI 148157 . T C 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3567,360,0 chrXI 148221 . G T 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2760,303,0 chrXI 148284 . T C 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2689,282,0 chrXI 148560 . G T 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=2;QD=25.48;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3091,321,0 chrXI 148617 . T A 2554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2587,267,0 chrXI 148629 . G T 2238 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2271,237,0 chrXI 148756 . G A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.254;DP=103;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1119,0,983 chrXI 148757 . A T 2516 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2549,276,0 chrXI 148801 . T C 2429 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.33;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2462,279,0 chrXI 148844 . C T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.002;DP=98;Dels=0.00;FS=5.142;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=3.507;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.887;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1104,0,958 chrXI 148894 . T C 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2623,273,0 chrXI 148938 . A G 2279 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2312,249,0 chrXI 148984 . G T 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2650,273,0 chrXI 149114 . T G 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.63;MQ0=0;QD=25.33;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2490,264,0 chrXI 149118 . C T 2365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2398,255,0 chrXI 149131 . G A 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.70;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3159,345,0 chrXI 149142 . T C 2393 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=21.95;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2426,270,0 chrXI 149176 . T C 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=23.91;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2806,294,0 chrXI 149301 . T C 2748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2781,297,0 chrXI 149328 . G A 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3606,369,0 chrXI 149344 . A G 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.215;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=23.57;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:2885,305,0 chrXI 149388 . A C 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3030,327,0 chrXI 149548 . A G 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3019,342,0 chrXI 149596 . T G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.656;DP=113;Dels=0.00;FS=20.618;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=9.34;ReadPosRankSum=-2.324;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1085,0,1220 chrXI 149765 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.097;DP=136;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.7145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1541,0,1348 chrXI 149835 . G T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.338;DP=133;Dels=0.00;FS=3.188;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.451;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1366,0,1356 chrXI 150494 . G C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;DP=126;Dels=0.00;FS=8.203;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.583;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1134,0,1423 chrXI 150554 . G A 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.04;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2663,276,0 chrXI 150786 . C T 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.175;DP=83;Dels=0.00;FS=1.893;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.884;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,51:83:99:1122,0,569 chrXI 150866 . C T 2477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.92;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2510,258,0 chrXI 150910 . G A 2255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=22.55;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2288,231,0 chrXI 151057 . T C 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.476;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.536;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:805,0,1107 chrXI 151192 . T G 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.233;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:912,0,927 chrXI 151229 . G T 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2574,261,0 chrXI 151420 . A T 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2877,297,0 chrXI 151863 . C T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.792;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1310,0,1130 chrXI 151866 . G T 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3206,327,0 chrXI 152063 . G A 657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.849;DP=100;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:687,0,1339 chrXI 152116 . T A 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3299,325,0 chrXI 152140 . G A 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3386,348,0 chrXI 152290 . G A 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3995,408,0 chrXI 152294 . A G 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.994e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3819,393,0 chrXI 152402 . G A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7047;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3540,357,0 chrXI 152485 . A C 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2956,312,0 chrXI 152571 . T G 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2654,282,0 chrXI 152614 . A G 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=23.72;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2619,294,0 chrXI 152632 . C T 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.45;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2833,294,0 chrXI 152668 . T C 436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.470;DP=74;Dels=0.00;FS=8.228;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.620;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,29:74:99:466,0,981 chrXI 152688 . A G 1536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=21.94;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:70:99:1569,171,0 chrXI 152690 . G A 1628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.26;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1661,174,0 chrXI 153052 . C T 2028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2061,213,0 chrXI 153266 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.674;DP=96;Dels=0.00;FS=1.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1155,0,806 chrXI 153463 . G A 2757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2790,294,0 chrXI 153726 . C A 2735 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=1;QD=25.09;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2768,291,0 chrXI 154502 . G A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.724;DP=120;Dels=0.00;FS=4.420;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.471;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:120:99:1272,0,1153 chrXI 154564 . T G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.988;DP=102;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.385;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:983,0,1120 chrXI 154732 . C T 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3217,330,0 chrXI 155453 . C T 2740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.35;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2773,273,0 chrXI 156972 . C A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.943;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.737;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1144,0,1164 chrXI 157764 . T C 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.981;DP=131;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=4.5613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.194;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:131:99:1469,0,1172 chrXI 159179 . G A 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.119;DP=98;Dels=0.00;FS=12.030;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.542;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:934,0,1093 chrXI 159676 . A T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;DP=124;Dels=0.00;FS=3.315;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1207,0,1329 chrXI 160854 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.548;DP=153;Dels=0.00;FS=6.169;HaplotypeScore=2.7669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.029;QD=8.95;ReadPosRankSum=-2.690;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,80:153:99:1400,0,1596 chrXI 162162 . G A 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.500;DP=142;Dels=0.00;FS=5.130;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.118;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1505,0,1362 chrXI 163306 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.470;DP=123;Dels=0.00;FS=2.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1457,0,1044 chrXI 163309 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.035;DP=126;Dels=0.00;FS=3.268;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1496,0,1107 chrXI 163340 . G A 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.432;DP=127;Dels=0.00;FS=8.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,76:127:99:1667,0,983 chrXI 163346 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.045;DP=131;Dels=0.00;FS=6.538;HaplotypeScore=3.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.050;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1546,0,1166 chrXI 163461 . G A 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.910;DP=115;Dels=0.00;FS=2.495;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.026;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,43:115:99:842,0,1515 chrXI 163464 . A G 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.934;DP=115;Dels=0.00;FS=2.492;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.311;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,42:115:99:787,0,1596 chrXI 163473 . G A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.759;DP=119;Dels=0.00;FS=4.739;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.779;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,44:119:99:807,0,1576 chrXI 164020 . G T 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2958,306,0 chrXI 166502 . G A 4119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4119,406,0 chrXI 166543 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.576;DP=127;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.467;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1246,0,1405 chrXI 166672 . T C 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;DP=88;Dels=0.00;FS=5.385;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.107;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:851,0,949 chrXI 166681 . G A 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.221;DP=91;Dels=0.00;FS=12.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.790;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:887,0,947 chrXI 166687 . A G 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.270;DP=89;Dels=0.00;FS=15.142;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.834;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:842,0,993 chrXI 166774 . C T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.908;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.274;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1292,0,1248 chrXI 167254 . T C 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.896;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.653;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:977,0,860 chrXI 167261 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.449;DP=103;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=3.5740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:103:99:1002,0,1004 chrXI 167454 . C T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.728;DP=107;Dels=0.00;FS=6.158;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.284;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:107:99:1202,0,875 chrXI 167518 . A T 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.855;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,60:96:99:918,0,718 chrXI 167599 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.893;DP=123;Dels=0.00;FS=8.511;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1064,0,1479 chrXI 167684 . A T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;DP=143;Dels=0.00;FS=7.692;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1449,0,1554 chrXI 168140 . G A 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.132;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.349;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1029,0,1066 chrXI 168730 . G A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.146;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.151;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:966,0,1211 chrXI 168746 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.341;DP=98;Dels=0.00;FS=6.915;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1064,0,922 chrXI 168931 . C A 607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;DP=67;Dels=0.00;FS=2.091;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.321;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:637,0,769 chrXI 168942 . A G 591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.406;DP=74;Dels=0.00;FS=4.799;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.308;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.038;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:621,0,912 chrXI 168974 . G A 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=101;Dels=0.00;FS=6.323;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQ0=0;MQRankSum=-4.792;QD=9.89;ReadPosRankSum=-2.231;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1029,0,1002 chrXI 168990 . G A 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.332;DP=98;Dels=0.00;FS=9.774;HaplotypeScore=36.0869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.46;MQ0=0;MQRankSum=-4.366;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.327;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:968,0,1053 chrXI 169077 . T C 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;DP=89;Dels=0.00;FS=5.498;HaplotypeScore=5.5806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.636;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:934,0,912 chrXI 169169 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;DP=121;Dels=0.00;FS=10.410;HaplotypeScore=4.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:121:99:1371,0,1054 chrXI 169216 . T C 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.779;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:959,0,1201 chrXI 169345 . G A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.615;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.890;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1154,0,1228 chrXI 169720 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.244;DP=120;Dels=0.00;FS=4.524;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1143,0,1268 chrXI 170245 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.988;DP=147;Dels=0.00;FS=3.336;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1228,0,1743 chrXI 170407 . G A 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.836;DP=153;Dels=0.00;FS=5.919;HaplotypeScore=9.1689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.035;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1641,0,1469 chrXI 170773 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.126;DP=162;Dels=0.00;FS=12.890;HaplotypeScore=5.2553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.592;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,65:162:99:1208,0,2125 chrXI 170962 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.180;DP=149;Dels=0.00;FS=8.862;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.737;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,59:149:99:1138,0,1764 chrXI 171082 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.709;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.340;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1225,0,1227 chrXI 171116 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.673;DP=124;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.078;QD=10.02;ReadPosRankSum=2.493;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1272,0,1351 chrXI 171212 . G A 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.166;DP=157;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.16;MQ0=0;MQRankSum=8.839;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.048;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1703,0,1399 chrXI 171261 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.533;DP=128;Dels=0.00;FS=6.771;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=4.561;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.808;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1339,0,1301 chrXI 171276 . T C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.652;DP=121;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.875;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1170,0,1363 chrXI 171454 . C T 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.356;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.250;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,87:154:99:1750,0,1276 chrXI 171646 . T A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.717;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1206,0,1665 chrXI 171647 . G A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.484;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=8.52;ReadPosRankSum=2.047;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1223,0,1617 chrXI 171742 . C T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.494;DP=137;Dels=0.00;FS=4.078;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.153;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1448,0,1363 chrXI 171755 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.008;DP=130;Dels=0.00;FS=3.190;HaplotypeScore=2.6653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.885;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1390,0,1348 chrXI 171772 . G A 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.059;DP=165;Dels=0.01;FS=7.889;HaplotypeScore=7.4131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1795,0,1533 chrXI 171892 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.799;DP=129;Dels=0.00;FS=6.764;HaplotypeScore=8.3926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.372;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1199,0,1542 chrXI 171996 . C T 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.526;DP=133;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.603;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1157,0,1558 chrXI 172064 . G A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.316;DP=141;Dels=0.00;FS=4.042;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1644,0,1104 chrXI 172092 . C T 2109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.915;DP=178;Dels=0.00;FS=6.453;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,101:178:99:2139,0,1442 chrXI 172175 . A G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.606;DP=146;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.814;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1391,0,1616 chrXI 172179 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.889;DP=149;Dels=0.00;FS=1.295;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.971;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1353,0,1664 chrXI 172199 . C T 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.008;DP=120;Dels=0.00;FS=3.342;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.393;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1065,0,1384 chrXI 172220 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.497;DP=140;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=3.6561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1235,0,1639 chrXI 172262 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.651;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1457,0,1621 chrXI 172481 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.416;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1132,0,1385 chrXI 172796 . C T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.729;DP=156;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.404;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1651,0,1409 chrXI 173024 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.179;DP=144;Dels=0.00;FS=19.710;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.114;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,61:144:99:1237,0,1675 chrXI 173315 . G C 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;DP=165;Dels=0.00;FS=1.226;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=1;MQRankSum=0.183;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.488;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,82:165:99:1598,0,1610 chrXI 173411 . G T 2005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;DP=158;Dels=0.00;FS=2.011;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,91:158:99:2035,0,1314 chrXI 173558 . T C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.872;DP=137;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.627;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1377,0,1330 chrXI 174509 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.837;DP=130;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1375,0,1282 chrXI 176335 . G A 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3797,399,0 chrXI 176487 . C T 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3441,354,0 chrXI 176528 . G A 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.975;DP=144;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.172;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1581,0,1367 chrXI 176572 . G A 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3376,351,0 chrXI 176582 . G A 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3119,333,0 chrXI 176605 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.746;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1457,0,1581 chrXI 176741 . G A 1831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.501;DP=165;Dels=0.00;FS=2.083;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=11.10;ReadPosRankSum=2.934;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1861,0,1580 chrXI 177209 . A T 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3224,345,0 chrXI 177248 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.843;DP=135;Dels=0.01;FS=1.376;HaplotypeScore=16.1326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=7.78;ReadPosRankSum=1.847;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1080,0,1574 chrXI 177254 . T C 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7898;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3158,327,0 chrXI 177366 . A G 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.563;DP=131;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.706;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,78:131:99:1649,0,1047 chrXI 177426 . T C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3279,363,0 chrXI 177482 . G A 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2794,291,0 chrXI 177512 . A G 2502 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.79;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2535,270,0 chrXI 177551 . C T 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2813,291,0 chrXI 177557 . A G 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2808,288,0 chrXI 177950 . A G 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.405;DP=93;Dels=0.00;FS=3.975;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:93:99:884,0,919 chrXI 177965 . T C 2268 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2301,246,0 chrXI 178177 . G A 4415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4415,451,0 chrXI 178223 . A G 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=21.57;SB=-2.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:3667,414,0 chrXI 178243 . G A 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3397;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3830,399,0 chrXI 178268 . C A 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.86;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3621,384,0 chrXI 178305 . T A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;DP=153;Dels=0.00;FS=3.105;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.465;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1605,0,1526 chrXI 178399 . A G 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.52;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3019,321,0 chrXI 178417 . T A 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.40;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2972,303,0 chrXI 178422 . G A 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.71;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3113,327,0 chrXI 178434 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;DP=122;Dels=0.00;FS=2.333;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=2.386;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.095;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1303,0,1171 chrXI 178495 . A C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;DP=134;Dels=0.00;FS=9.293;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=2.502;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.367;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1368,0,1404 chrXI 178613 . G A 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2972,312,0 chrXI 178928 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.779;DP=103;Dels=0.00;FS=5.314;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.506;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:911,0,1222 chrXI 179179 . A G 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=121.7800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.97;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3151,321,0 chrXI 179200 . T A 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3322,330,0 chrXI 179232 . T C 2500 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=21.93;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2533,261,0 chrXI 179266 . C A 136.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.573;DP=94;Dels=0.00;FS=75.409;HaplotypeScore=15.6939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=1.45;ReadPosRankSum=-3.273;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,30:94:99:166,0,1227 chrXI 179281 . T C 623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;DP=87;Dels=0.01;FS=5.296;HaplotypeScore=13.0486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,39:86:99:653,0,998 chrXI 179329 . C T 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.186;DP=110;Dels=0.00;FS=24.321;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.436;SB=-8.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1045,0,1149 chrXI 179341 . G A 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=25.56;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2896,285,0 chrXI 179358 . T C 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.774;DP=109;Dels=0.00;FS=27.126;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.203;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:963,0,1202 chrXI 179372 . A G 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2603,261,0 chrXI 179413 . C T 2373 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.46;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2406,240,0 chrXI 179422 . T C 2055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=23.62;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2088,231,0 chrXI 179509 . G A 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.77;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3402,340,0 chrXI 179553 . T C 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.123;DP=121;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1118,0,1301 chrXI 179564 . T C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;DP=91;Dels=0.00;FS=2.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=2.275;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1061,0,752 chrXI 179612 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.677;DP=123;Dels=0.00;FS=4.338;HaplotypeScore=1.9577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.182;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1397,0,1199 chrXI 179688 . T C 3895.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3895,426,0 chrXI 179703 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.973;DP=125;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=9.29;ReadPosRankSum=-2.379;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1191,0,1451 chrXI 179723 . C T 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3493,360,0 chrXI 179783 . T C 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:2828,297,0 chrXI 179887 . A G 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2912,309,0 chrXI 179928 . T C 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=22.40;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2743,294,0 chrXI 179939 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.055;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.374;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1093,0,1243 chrXI 179949 . C T 2758 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2791,279,0 chrXI 180023 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.403;DP=122;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=2.307;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.591;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1305,0,1262 chrXI 180074 . G A 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3204,315,0 chrXI 180104 . G A 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=23.84;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2441,255,0 chrXI 180128 . A G 2409 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.84;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2442,252,0 chrXI 180146 . C T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;DP=88;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,54:88:99:1158,0,615 chrXI 180215 . T C 2419 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=23.72;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2452,246,0 chrXI 180297 . A C 2185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=18.84;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2218,240,0 chrXI 180413 . T A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;DP=117;Dels=0.00;FS=0.820;HaplotypeScore=3.7603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.193;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1319,0,1177 chrXI 180498 . A T 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;DP=92;Dels=0.00;FS=2.810;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.743;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:901,0,1034 chrXI 180524 . A C 2018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.87;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2051,225,0 chrXI 180554 . G A 1901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.77;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1934,195,0 chrXI 180583 . C T 2147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2180,222,0 chrXI 180730 . C A 2470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2503,252,0 chrXI 180738 . T C 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.076;DP=96;Dels=0.00;FS=1.667;HaplotypeScore=2.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.927;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:789,0,1166 chrXI 180758 . A G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.731;DP=122;Dels=0.00;FS=2.295;HaplotypeScore=2.8653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.826;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1284,0,1206 chrXI 181074 . C T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.972;DP=126;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1190,0,1395 chrXI 181420 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.599;DP=140;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=3.5058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=2.545;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.194;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1360,0,1393 chrXI 181802 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.958;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1060,0,1143 chrXI 181834 . T C 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;DP=99;Dels=0.00;FS=3.719;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:928,0,1152 chrXI 181933 . C T 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.423;DP=99;Dels=0.00;FS=2.599;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:908,0,1036 chrXI 182195 . G A 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.363;DP=137;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.620;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1637,0,1142 chrXI 182309 . C G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;DP=128;Dels=0.00;FS=9.382;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1275,0,1341 chrXI 182342 . G A 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;DP=129;Dels=0.00;FS=11.043;HaplotypeScore=2.8251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.384;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1396,0,1264 chrXI 182392 . G T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.016;DP=126;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=9.88;ReadPosRankSum=-2.649;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1275,0,1259 chrXI 182533 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.329;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.327;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1201,0,1036 chrXI 182544 . G T 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.556;DP=107;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.334;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1161,0,1043 chrXI 182850 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.545;DP=120;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.843;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:120:99:1312,0,1154 chrXI 182853 . C T 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3126,304,0 chrXI 182950 . T G 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2812,297,0 chrXI 182993 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.323;DP=129;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=9.64;ReadPosRankSum=-2.160;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1273,0,1394 chrXI 183657 . C T 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3145,324,0 chrXI 184014 . T C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.718;DP=94;Dels=0.00;FS=5.944;HaplotypeScore=6.5316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.633;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:1061,0,836 chrXI 184100 . C T 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.723;DP=118;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.048;QD=7.89;ReadPosRankSum=2.965;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:961,0,1466 chrXI 184112 . T C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.376;DP=111;Dels=0.00;FS=3.463;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.654;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:900,0,1331 chrXI 184445 . A G 704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.213;DP=86;Dels=0.00;FS=1.927;HaplotypeScore=1.9621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.630;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:734,0,1008 chrXI 184501 . G A 506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.171;DP=78;Dels=0.00;FS=5.595;HaplotypeScore=64.0210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.152;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,57:78:99:536,0,409 chrXI 184628 . A G 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.610;DP=64;Dels=0.00;FS=0.964;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.549;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:710,0,590 chrXI 184691 . T G 1918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.71;MQ0=0;QD=24.91;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1951,210,0 chrXI 184745 . C T 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.251;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2783,260,0 chrXI 184772 . C T 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2782,282,0 chrXI 184809 . C T 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4029;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=26.01;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2868,300,0 chrXI 184965 . A C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.822;DP=111;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.186;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1141,0,1132 chrXI 185018 . T A 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.750;DP=87;Dels=0.00;FS=2.821;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=2.203;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:87:99:920,0,957 chrXI 185063 . C T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.158;DP=118;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=2.602;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.833;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1060,0,1372 chrXI 185280 . T C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.651;DP=107;Dels=0.00;FS=3.551;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.748;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1101,0,1112 chrXI 185287 . C T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;DP=104;Dels=0.00;FS=6.058;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.161;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1136,0,1075 chrXI 185662 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;DP=93;Dels=0.00;FS=3.952;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:918,0,996 chrXI 185704 . C G 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;DP=96;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=4.8326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:885,0,978 chrXI 185734 . A G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.810;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.052;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1111,0,959 chrXI 185749 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.064;DP=102;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=11.9152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=2.293;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.904;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1123,0,940 chrXI 185811 . G A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.466;DP=120;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=10.00;ReadPosRankSum=-2.034;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1230,0,1221 chrXI 185846 . C T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.649;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=-0.008;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1292,0,1142 chrXI 185997 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.201;DP=117;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.816;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1170,0,1293 chrXI 186196 . A T 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;DP=83;Dels=0.00;FS=15.632;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.159;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:873,0,884 chrXI 186216 . G A 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.458;DP=94;Dels=0.00;FS=2.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,41:94:99:830,0,1154 chrXI 186423 . G A 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3322,339,0 chrXI 186438 . T C 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3233,330,0 chrXI 186658 . T C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.12;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3369,354,0 chrXI 186668 . A G 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3427,357,0 chrXI 186698 . G T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.342;DP=140;Dels=0.00;FS=3.173;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.157;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:1239,0,1630 chrXI 186750 . T A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=11.09;ReadPosRankSum=-2.151;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1439,0,1208 chrXI 186827 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.471;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=12.59;ReadPosRankSum=-1.184;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1402,0,856 chrXI 187243 . C T 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2863,300,0 chrXI 187769 . A T 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;DP=116;Dels=0.00;FS=4.510;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.047;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1050,0,1354 chrXI 188016 . C G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;DP=138;Dels=0.00;FS=2.996;HaplotypeScore=3.3353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.686;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1336,0,1420 chrXI 188327 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.623;DP=150;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=4.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1366,0,1705 chrXI 188548 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=96;Dels=0.00;FS=3.791;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=10.03;ReadPosRankSum=-2.473;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:993,0,1014 chrXI 188557 . T C 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2620,291,0 chrXI 188805 . C A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.935;DP=104;Dels=0.00;FS=6.246;HaplotypeScore=7.5858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.336;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1187,0,928 chrXI 188875 . T A 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2858,285,0 chrXI 188900 . A G 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.556;DP=116;Dels=0.00;FS=4.601;HaplotypeScore=4.9104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.674;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:116:99:958,0,1254 chrXI 188984 . T G 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.283;DP=131;Dels=0.00;FS=6.750;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.991;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1058,0,1641 chrXI 189011 . G A 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.985;DP=127;Dels=0.00;FS=5.876;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=6.90;ReadPosRankSum=1.231;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:906,0,1781 chrXI 189184 . G A 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=153;Dels=0.00;FS=9.172;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.790;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1630,0,1568 chrXI 189326 . G A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.320;DP=105;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,64:105:99:1448,0,673 chrXI 189510 . G A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.197;DP=128;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.715;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1256,0,1359 chrXI 189718 . G A 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3847,399,0 chrXI 190144 . G A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.360;DP=158;Dels=0.00;FS=1.988;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.728;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.902;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1446,0,1707 chrXI 190193 . T C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.630;DP=153;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=3.4334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=2.316;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.566;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1628,0,1484 chrXI 190221 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.340;DP=130;Dels=0.00;FS=7.347;HaplotypeScore=2.5505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.054;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1477,0,1280 chrXI 190222 . A G 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.712;DP=133;Dels=0.00;FS=7.218;HaplotypeScore=2.5505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1475,0,1266 chrXI 190290 . T A 1840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;DP=175;Dels=0.00;FS=1.883;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.852;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,89:175:99:1870,0,1790 chrXI 190797 . C T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.461;DP=134;Dels=0.00;FS=2.161;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.167;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1500,0,1260 chrXI 190915 . T C 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.448;DP=119;Dels=0.00;FS=5.765;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1045,0,1430 chrXI 190945 . G A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.182;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.258;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1229,0,1415 chrXI 191257 . A C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.388;DP=137;Dels=0.00;FS=4.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.500;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1302,0,1451 chrXI 191290 . A G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.977;DP=113;Dels=0.00;FS=2.901;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:998,0,1280 chrXI 191315 . T C 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.415;DP=122;Dels=0.00;FS=1.929;HaplotypeScore=2.4203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.749;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:985,0,1441 chrXI 191390 . G A 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3171,330,0 chrXI 191416 . G A 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.431;DP=151;Dels=0.00;FS=3.863;HaplotypeScore=3.3809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.435;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1396,0,1477 chrXI 191510 . G T 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.506;DP=112;Dels=0.00;FS=4.010;HaplotypeScore=2.9387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.944;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1086,0,1218 chrXI 191520 . T C 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.71;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2913,297,0 chrXI 191609 . G A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.232;DP=105;Dels=0.00;FS=4.874;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1154,0,1049 chrXI 191873 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.901;DP=130;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1217,0,1485 chrXI 191928 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.732;DP=112;Dels=0.00;FS=3.423;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.601;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1178,0,1149 chrXI 192038 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.071;DP=137;Dels=0.00;FS=10.742;HaplotypeScore=7.6564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=1.273;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.219;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1228,0,1453 chrXI 192111 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.976;DP=135;Dels=0.00;FS=5.238;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=-1.218;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.114;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1417,0,1277 chrXI 192187 . C T 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.608;DP=107;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=4.2773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.078;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1241,0,984 chrXI 192348 . A G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.308;DP=117;Dels=0.00;FS=3.464;HaplotypeScore=3.8618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.191;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1028,0,1383 chrXI 192706 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.688;DP=142;Dels=0.00;FS=6.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.158;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1109,0,1731 chrXI 192713 . C T 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.834;DP=145;Dels=0.00;FS=6.307;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.534;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,62:145:99:1157,0,1636 chrXI 192718 . T C 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.704;DP=142;Dels=0.00;FS=3.063;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.658;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:958,0,1805 chrXI 193044 . G C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;DP=109;Dels=0.00;FS=6.242;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.088;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1116,0,1179 chrXI 193196 . A G 2462 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2495,267,0 chrXI 193235 . A G 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.905;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.737;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:728,0,1056 chrXI 193314 . T C 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.490;DP=122;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=3.7016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.513;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1070,0,1374 chrXI 193550 . A T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;DP=149;Dels=0.00;FS=4.072;HaplotypeScore=4.8308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.010;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1428,0,1657 chrXI 193814 . A G 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.115;DP=114;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,70:114:99:1420,0,909 chrXI 194063 . G A 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3612,372,0 chrXI 194176 . G A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.996;DP=105;Dels=0.00;FS=32.438;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.841;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,65:105:99:1482,0,787 chrXI 194206 . G A 4067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:4067,435,0 chrXI 194220 . C T 4287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4287,453,0 chrXI 194270 . T C 4379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.671;DP=170;Dels=0.00;FS=6.072;HaplotypeScore=2.6803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.958;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:4379,480,0 chrXI 194297 . G A 4071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4071,417,0 chrXI 194421 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.437;DP=138;Dels=0.00;FS=4.329;HaplotypeScore=3.8054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1138,0,1594 chrXI 194470 . T C 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:3804,408,0 chrXI 194564 . A C 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=25.40;ReadPosRankSum=1.494;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3327,351,0 chrXI 194575 . C T 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3097,315,0 chrXI 194609 . C T 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3809,399,0 chrXI 194709 . C T 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3594,372,0 chrXI 195038 . G T 1956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=77;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=25.40;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:77:99:1989,192,0 chrXI 195050 . T C 1849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=67.6556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=23.41;ReadPosRankSum=-1.601;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:1882,184,0 chrXI 195077 . C T 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.214;DP=94;Dels=0.00;FS=8.289;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.737;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:903,0,965 chrXI 195199 . T C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3176,360,0 chrXI 195226 . A C 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3628,396,0 chrXI 195269 . G A 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=140;Dels=0.00;FS=6.690;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.435;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3627,359,0 chrXI 195507 . A G 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.788;DP=118;Dels=0.00;FS=3.511;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.055;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:895,0,1622 chrXI 195729 . A G 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2961,321,0 chrXI 195771 . G A 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3164,321,0 chrXI 195819 . T C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;DP=130;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1359,0,1316 chrXI 196002 . G A 2988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3021,315,0 chrXI 196171 . A G 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2793,306,0 chrXI 196264 . T C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1355,0,1366 chrXI 196346 . T A 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3490,360,0 chrXI 196560 . G A 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.719;DP=162;Dels=0.00;FS=1.968;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.220;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,77:162:99:1610,0,1689 chrXI 196565 . C T 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;DP=161;Dels=0.00;FS=1.969;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.628;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1667,0,1668 chrXI 196712 . T C 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2018;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3747,399,0 chrXI 196916 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.408;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=10.71;ReadPosRankSum=2.420;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1433,0,1197 chrXI 196937 . G A 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3009,315,0 chrXI 196966 . C T 552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.163;DP=110;Dels=0.00;FS=1.725;HaplotypeScore=22.1456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.324;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:110:99:582,0,954 chrXI 197099 . G T 4319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.26;SB=-2.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4319,441,0 chrXI 197297 . A G 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=21.81;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2890,327,0 chrXI 197329 . T C 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;DP=116;Dels=0.00;FS=3.485;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=23.82;ReadPosRankSum=1.224;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2796,299,0 chrXI 197364 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;DP=115;Dels=0.00;FS=3.462;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1147,0,1301 chrXI 197402 . C T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.348;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1372,0,1185 chrXI 197500 . A G 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3228,354,0 chrXI 197642 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.975;DP=125;Dels=0.00;FS=1.475;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:125:99:1408,0,1262 chrXI 198479 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.514;DP=98;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.451;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,61:98:99:1278,0,686 chrXI 198833 . C T 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.021;DP=89;Dels=0.00;FS=7.049;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.963;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:831,0,995 chrXI 200056 . T C 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.202;DP=132;Dels=0.00;FS=4.094;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=2.337;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.790;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1223,0,1459 chrXI 200297 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;DP=128;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.412;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1224,0,1378 chrXI 200384 . T C 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.250;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=132.5596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.042;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1519,0,1760 chrXI 200402 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.535;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.693;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1316,0,1485 chrXI 200910 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.017;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.920;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1181,0,1376 chrXI 201803 . A G 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3040,345,0 chrXI 201819 . A T 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2972,309,0 chrXI 201927 . C T 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=1;QD=26.18;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3227,333,0 chrXI 201996 . G A 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3431,360,0 chrXI 202018 . A C 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.086;DP=140;Dels=0.00;FS=3.196;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=11.30;ReadPosRankSum=-2.227;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:140:99:1612,0,1267 chrXI 202082 . C T 3991.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.61;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3991,406,0 chrXI 202106 . A G 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3315,354,0 chrXI 202339 . A G 4289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4289,441,0 chrXI 202432 . C T 3978.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.44;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3978,400,0 chrXI 202506 . G A 2328 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=25.30;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2361,249,0 chrXI 202593 . A G 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.25;MQ0=0;QD=21.68;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2526,273,0 chrXI 202594 . T A 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.70;MQ0=0;QD=23.23;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2472,264,0 chrXI 202631 . G C 997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;DP=44;Dels=0.00;FS=4.130;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.23;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=22.66;ReadPosRankSum=1.575;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:99:1030,123,0 chrXI 203086 . G C 1944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.62;MQ0=0;QD=24.30;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1977,216,0 chrXI 203125 . T A 206.45 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.745;DP=126;Dels=0.00;FS=31.511;HaplotypeScore=217.4216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=2.093;QD=1.64;ReadPosRankSum=-5.213;SB=1.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:113,13:126:7:238,7,0 chrXI 203127 . T C 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.336;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=217.4216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=0.18;ReadPosRankSum=-4.445;SB=-6.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,9:128:53:53,0,192 chrXI 203268 . A C 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.55;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2795,294,0 chrXI 203301 . G A 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=24.65;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2745,282,0 chrXI 203317 . C T 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=26.56;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2875,306,0 chrXI 203486 . C T 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3094,321,0 chrXI 203582 . G T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.480;DP=122;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=5.7870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.470;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:122:99:1169,0,1358 chrXI 204122 . C T 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=1;QD=26.24;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2919,300,0 chrXI 204194 . A T 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3227,330,0 chrXI 204464 . G A 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3220,333,0 chrXI 204491 . C T 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3488,354,0 chrXI 204566 . A T 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.706;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1886;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=25.07;ReadPosRankSum=-1.219;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2741,274,0 chrXI 204941 . C T 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2971,306,0 chrXI 205087 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.177;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1458,0,1130 chrXI 205160 . T C 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2897,303,0 chrXI 205207 . G A 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=25.45;ReadPosRankSum=0.719;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3309,311,0 chrXI 205356 . C G 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3072,330,0 chrXI 205481 . G T 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3083,312,0 chrXI 205525 . C T 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3782,393,0 chrXI 205826 . G A 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.714;DP=109;Dels=0.00;FS=5.063;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.446;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1071,0,1135 chrXI 206087 . T C 2873 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2906,324,0 chrXI 206168 . A G 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.461;DP=122;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=2.8026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:856,0,1551 chrXI 206606 . C T 4275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=1;QD=26.07;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4275,444,0 chrXI 206732 . G A 4071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4071,417,0 chrXI 207105 . G A 3832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3832,402,0 chrXI 207119 . G A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;DP=151;Dels=0.00;FS=5.921;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.563;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1605,0,1495 chrXI 207131 . T C 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;DP=152;Dels=0.00;FS=3.623;HaplotypeScore=4.9181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=25.09;ReadPosRankSum=1.618;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3813,393,0 chrXI 207179 . A G 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3557,375,0 chrXI 207353 . T C 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9546;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=23.70;ReadPosRankSum=1.201;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,163:164:99:3887,426,0 chrXI 207429 . C T 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3574,361,0 chrXI 208114 . T C 2600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=23.64;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2633,279,0 chrXI 208115 . A T 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2735,279,0 chrXI 208258 . T C 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3387,369,0 chrXI 208639 . C A 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3514,352,0 chrXI 208745 . A G 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3276,363,0 chrXI 209185 . T A 4042.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2944;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4042,412,0 chrXI 209311 . T C 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3405,372,0 chrXI 209449 . G A 4151.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4151,424,0 chrXI 209467 . G A 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.787;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3698,369,0 chrXI 209485 . A C 2448 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.468;DP=105;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.940;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2481,260,0 chrXI 209488 . A G 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;DP=110;Dels=0.00;FS=3.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=23.55;ReadPosRankSum=0.913;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2624,270,0 chrXI 209515 . T C 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.20;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3396,366,0 chrXI 209743 . G A 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3282,339,0 chrXI 209836 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.362;DP=107;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.640;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1168,0,1023 chrXI 209983 . A G 3996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:3996,420,0 chrXI 210106 . T C 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3555,393,0 chrXI 210124 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.799;DP=133;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.741;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1336,0,1317 chrXI 210190 . T A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;DP=125;Dels=0.00;FS=4.342;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:125:99:1524,0,1076 chrXI 210267 . G A 4190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.02;SB=-2.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4190,415,0 chrXI 210381 . A G 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3194,333,0 chrXI 210395 . G T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.884;DP=114;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.091;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1151,0,1213 chrXI 210518 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=125;Dels=0.00;FS=5.485;HaplotypeScore=3.7581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.570;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1339,0,1251 chrXI 210799 . C T 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3558,369,0 chrXI 211081 . C T 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3812,393,0 chrXI 211438 . C T 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3651,366,0 chrXI 211471 . G A 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2863,303,0 chrXI 211477 . A C 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8635;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2852,324,0 chrXI 211951 . T C 2445 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2478,267,0 chrXI 211999 . G A 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2830,282,0 chrXI 212173 . A G 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2276,258,0 chrXI 212189 . G A 2306 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2339,252,0 chrXI 212630 . G A 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2599,261,0 chrXI 212874 . G A 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2961,285,0 chrXI 212912 . C T 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3088,318,0 chrXI 213004 . C G 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3701,396,0 chrXI 213044 . C T 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2891,294,0 chrXI 213298 . A T 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2945,294,0 chrXI 213351 . T G 2213 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.15;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2246,246,0 chrXI 213389 . T G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=24.85;ReadPosRankSum=1.353;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3214,321,0 chrXI 213480 . T C 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2994,324,0 chrXI 213501 . T C 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3053,318,0 chrXI 213552 . G A 2655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2688,291,0 chrXI 213597 . T G 2100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=82.0067;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.88;MQ0=0;QD=23.33;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2133,252,0 chrXI 213630 . C T 2207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2240,240,0 chrXI 213680 . G A 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3063,321,0 chrXI 213714 . A G 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.17;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3078,336,0 chrXI 213763 . A G 2442 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.92;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2475,261,0 chrXI 213789 . T A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;DP=97;Dels=0.00;FS=7.448;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.480;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1035,0,909 chrXI 213977 . T A 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2965,321,0 chrXI 214537 . A G 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2795,291,0 chrXI 214838 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.791;DP=126;Dels=0.00;FS=4.206;HaplotypeScore=3.9645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.799;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1171,0,1434 chrXI 215041 . C T 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2973,309,0 chrXI 215474 . T C 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.42;MQ0=0;QD=26.39;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2725,297,0 chrXI 215493 . C T 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.581;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=24.64;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2867,271,0 chrXI 215522 . T C 2427 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.55;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2460,258,0 chrXI 215535 . A G 2206 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.68;MQ0=0;QD=23.72;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2239,240,0 chrXI 215546 . C G 2055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.493;DP=87;Dels=0.00;FS=4.344;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.657;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:2088,211,0 chrXI 215560 . C T 2197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.39;MQ0=0;QD=25.55;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2230,234,0 chrXI 215651 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3201,336,0 chrXI 215962 . A G 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3092,336,0 chrXI 215965 . T C 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2928,321,0 chrXI 216046 . G A 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2594,264,0 chrXI 216382 . C T 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.03;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3183,333,0 chrXI 216646 . T C 2425 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=23.77;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2458,273,0 chrXI 216707 . A G 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3102,327,0 chrXI 216709 . A C 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.05;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3015,312,0 chrXI 216788 . A T 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2570,261,0 chrXI 216915 . G A 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=27.20;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3161,324,0 chrXI 216924 . A G 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.17;MQ0=0;QD=24.75;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3152,333,0 chrXI 216939 . G A 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=22.17;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3070,306,0 chrXI 216953 . T A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.294;DP=131;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.206;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:1015,0,1699 chrXI 216973 . A G 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3384,357,0 chrXI 216985 . G A 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3404,351,0 chrXI 217162 . G T 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;DP=145;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,84:145:99:865,0,813 chrXI 217203 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;DP=131;Dels=0.00;FS=3.172;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1266,0,1415 chrXI 217225 . G T 3863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3863,414,0 chrXI 217254 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.444;DP=131;Dels=0.00;FS=8.111;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1232,0,1377 chrXI 217298 . C A 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.92;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2725,282,0 chrXI 217457 . A T 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:3003,318,0 chrXI 217514 . A T 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3646,378,0 chrXI 217553 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;DP=129;Dels=0.00;FS=2.341;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.940;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1228,0,1367 chrXI 217814 . A G 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3736,393,0 chrXI 217895 . C T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.141;DP=130;Dels=0.00;FS=4.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1492,0,1090 chrXI 218177 . C T 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.994e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3853,388,0 chrXI 218544 . G A 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2835,306,0 chrXI 218728 . C T 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3614,349,0 chrXI 218804 . A G 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3514,366,0 chrXI 218861 . G C 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3077,330,0 chrXI 218948 . T A 2929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.82;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2962,306,0 chrXI 218976 . A G 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3499,369,0 chrXI 219042 . T G 3873.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.83;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3873,408,0 chrXI 219155 . C T 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3583,358,0 chrXI 219196 . C G 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.250;DP=129;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1088,0,1607 chrXI 219404 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.34;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3048,318,0 chrXI 219413 . T C 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=23.04;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3144,336,0 chrXI 219454 . G C 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.73;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2719,291,0 chrXI 219481 . C T 2471 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.83;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2504,258,0 chrXI 219665 . A T 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=0;QD=26.57;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3168,336,0 chrXI 219692 . C T 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.22;MQ0=0;QD=26.60;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3172,342,0 chrXI 219742 . A G 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2925,312,0 chrXI 219747 . C T 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2957,315,0 chrXI 219762 . A T 2461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.84;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2494,264,0 chrXI 219829 . G C 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=25.25;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2937,318,0 chrXI 219842 . G A 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.83;MQ0=0;QD=25.28;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3117,327,0 chrXI 219865 . A C 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.77;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2909,315,0 chrXI 219881 . A G 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=110.0233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.27;MQ0=0;QD=22.77;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2743,306,0 chrXI 219986 . A G 2546 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=119;Dels=0.00;FS=4.091;HaplotypeScore=4.8516;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=21.39;ReadPosRankSum=0.499;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:119:99:2579,270,0 chrXI 220092 . T C 2755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2788,306,0 chrXI 220132 . A G 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.65;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2803,297,0 chrXI 220166 . C T 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3158,330,0 chrXI 220273 . A G 2432 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.32;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2465,270,0 chrXI 220310 . G C 2580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.38;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2613,270,0 chrXI 220315 . A G 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.48;MQ0=0;QD=24.02;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2603,288,0 chrXI 220323 . C A 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2889,294,0 chrXI 220573 . G A 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3335,336,0 chrXI 220608 . T C 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3258,345,0 chrXI 220647 . A G 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2694,285,0 chrXI 220701 . T C 2603 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2636,291,0 chrXI 220819 . C A 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2834,288,0 chrXI 220881 . G A 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2769,282,0 chrXI 221014 . C T 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3234,330,0 chrXI 221236 . G T 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3748,384,0 chrXI 221351 . A T 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.769;DP=85;Dels=0.00;FS=9.135;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,47:85:99:976,0,779 chrXI 221455 . T C 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=22.34;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2624,267,0 chrXI 221472 . A C 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.42;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2915,303,0 chrXI 221497 . A G 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2798,300,0 chrXI 221683 . T C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3732,381,0 chrXI 221752 . G A 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3134,306,0 chrXI 221820 . G A 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3057,318,0 chrXI 221896 . A G 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3015,312,0 chrXI 222020 . A T 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.939;DP=132;Dels=0.01;FS=4.097;HaplotypeScore=2.5382;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=25.90;ReadPosRankSum=0.886;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3419,321,0 chrXI 222033 . A G 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3394,369,0 chrXI 223086 . G A 3806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3806,399,0 chrXI 223233 . T C 1922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0811;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=22.09;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:87:99:1955,213,0 chrXI 223237 . T C 558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;DP=89;Dels=0.00;FS=4.172;HaplotypeScore=7.0677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.063;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,36:89:99:588,0,1030 chrXI 223281 . A C 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.36;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2594,288,0 chrXI 223330 . T C 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2523,273,0 chrXI 223560 . C T 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3045,309,0 chrXI 224066 . T A 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.79;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3301,348,0 chrXI 224474 . C T 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3277,324,0 chrXI 224757 . A G 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8373;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:151:99:3734,378,0 chrXI 224943 . C T 2578 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=22.81;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2611,261,0 chrXI 224949 . A T 2301 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2334,237,0 chrXI 225480 . T G 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.91;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3550,378,0 chrXI 225552 . T A 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;DP=105;Dels=0.00;FS=4.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.543;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:979,0,1168 chrXI 225609 . T C 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2774,297,0 chrXI 225687 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.406;DP=143;Dels=0.00;FS=5.070;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=1;MQRankSum=0.238;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1205,0,1637 chrXI 225819 . C T 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2657,267,0 chrXI 225834 . A T 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3136,336,0 chrXI 225909 . T A 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3481,357,0 chrXI 226045 . T A 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.60;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2725,291,0 chrXI 226260 . T C 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2926,321,0 chrXI 226659 . T C 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2804,297,0 chrXI 226952 . T C 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2918,303,0 chrXI 227012 . C T 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2707,270,0 chrXI 227319 . C T 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6961;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3118,318,0 chrXI 227322 . C T 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3058,309,0 chrXI 227405 . A C 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=19.56;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:2908,312,0 chrXI 227408 . C A 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=22.63;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3065,318,0 chrXI 227436 . T C 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3180,339,0 chrXI 227610 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.141;DP=128;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.749;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1231,0,1275 chrXI 227625 . C T 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3433,340,0 chrXI 227751 . T C 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3164,339,0 chrXI 227793 . A G 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3375,360,0 chrXI 227955 . C T 2627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2660,276,0 chrXI 228015 . A G 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2936,321,0 chrXI 228147 . C A 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3400,342,0 chrXI 228339 . G A 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3544,366,0 chrXI 228480 . A G 3891.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.132;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.201;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3891,411,0 chrXI 228638 . C A 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3068,312,0 chrXI 228782 . A T 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=2;QD=25.80;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2845,294,0 chrXI 229405 . G T 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.324;DP=140;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.179;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1548,0,1398 chrXI 229432 . C T 4143.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.73;SB=-2.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4143,421,0 chrXI 229929 . C T 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3673,381,0 chrXI 230068 . A G 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.27;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3470,381,0 chrXI 230092 . C A 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3417,363,0 chrXI 230159 . T C 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.15;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3530,381,0 chrXI 230442 . G T 3832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3832,382,0 chrXI 230894 . A G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.834;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=0.381;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.135;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1197,0,1523 chrXI 231216 . T C 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.078;DP=109;Dels=0.00;FS=12.627;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.470;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:996,0,1218 chrXI 231248 . C T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.251;DP=128;Dels=0.00;FS=16.857;HaplotypeScore=2.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1320,0,1252 chrXI 231393 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.645;DP=114;Dels=0.00;FS=4.760;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.854;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:1005,0,1243 chrXI 231462 . C T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.430;DP=119;Dels=0.00;FS=10.285;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1147,0,1174 chrXI 231464 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.097;DP=116;Dels=0.00;FS=10.673;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.285;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1237,0,1012 chrXI 231764 . C T 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.061;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.263;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1596,0,1265 chrXI 231791 . A T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.464;DP=126;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=3.7585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1544,0,1157 chrXI 231797 . T G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.280;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:131:99:1116,0,1640 chrXI 231860 . A G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.558;DP=119;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.227;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1403,0,1036 chrXI 231899 . G A 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.857;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.149;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1742,0,1454 chrXI 231902 . C A 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.479;DP=156;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.217;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1696,0,1484 chrXI 231929 . T A 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.719;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.698;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,86:146:99:1756,0,1202 chrXI 232086 . G C 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.030;DP=164;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1624,0,1615 chrXI 232523 . C T 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.319;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.704;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1756,0,1150 chrXI 232567 . T C 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=23.43;ReadPosRankSum=1.360;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:150:99:3515,384,0 chrXI 232667 . A T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;DP=100;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:100:99:1180,0,834 chrXI 232739 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.900;DP=117;Dels=0.00;FS=2.414;HaplotypeScore=5.7553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.941;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1193,0,1104 chrXI 232793 . C T 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3294,351,0 chrXI 232838 . T C 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3259,357,0 chrXI 232839 . C T 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3390,357,0 chrXI 232919 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.629;DP=128;Dels=0.00;FS=9.376;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1237,0,1368 chrXI 233252 . T G 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.987;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1548,0,1650 chrXI 233436 . T C 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.863;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=12.43;ReadPosRankSum=-2.035;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,84:140:99:1770,0,1089 chrXI 233962 . A G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.275;DP=100;Dels=0.00;FS=3.866;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=9.93;ReadPosRankSum=-3.261;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1023,0,1051 chrXI 234119 . G A 612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.247;DP=91;Dels=0.00;FS=2.890;HaplotypeScore=25.7588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.695;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:642,0,711 chrXI 234187 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;DP=120;Dels=0.00;FS=6.011;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1237,0,1005 chrXI 234252 . G A 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3183,342,0 chrXI 234299 . G A 2473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=22.69;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2506,270,0 chrXI 234378 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.339;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.685;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:148:99:1475,0,1487 chrXI 234436 . T G 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.443;DP=161;Dels=0.00;FS=2.791;HaplotypeScore=2.8919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.576;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,92:161:99:1865,0,1482 chrXI 234462 . C T 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.636;DP=172;Dels=0.00;FS=6.713;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,80:172:99:1607,0,1873 chrXI 234818 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.356;DP=129;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=3.8716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.214;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1224,0,1453 chrXI 234821 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.423;DP=131;Dels=0.00;FS=2.204;HaplotypeScore=3.8716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.786;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1218,0,1465 chrXI 234921 . A G 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3661,393,0 chrXI 234932 . G A 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.980e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3944,412,0 chrXI 234968 . G A 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3831,408,0 chrXI 234980 . G C 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3746,402,0 chrXI 235023 . C T 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.230;DP=152;Dels=0.00;FS=0.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1576,0,1526 chrXI 235232 . A G 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.581;DP=166;Dels=0.00;FS=12.847;HaplotypeScore=3.7568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.474;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.350;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,97:166:99:1929,0,1438 chrXI 235310 . A G 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5830;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.18;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2634,294,0 chrXI 235318 . G A 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=235.7947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.93;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2615,279,0 chrXI 235346 . C T 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.010;DP=83;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=11.9006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=9.55;ReadPosRankSum=-2.940;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,41:83:99:823,0,424 chrXI 235358 . T C 1450 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.059;DP=124;Dels=0.00;FS=1.295;HaplotypeScore=19.4708;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.92;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=11.69;ReadPosRankSum=-4.604;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,113:124:99:1483,174,0 chrXI 235370 . T C 571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.712;DP=127;Dels=0.00;FS=3.640;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=4.50;ReadPosRankSum=-8.832;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,37:127:99:601,0,904 chrXI 235387 . A C 1764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.77;MQ0=0;QD=15.21;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:1797,201,0 chrXI 235424 . T C 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.68;MQ0=0;QD=22.20;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3185,354,0 chrXI 235446 . G A 3879.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3879,391,0 chrXI 235565 . C T 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3415,354,0 chrXI 235797 . C A 4129.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.202;DP=159;Dels=0.00;FS=6.794;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=25.97;ReadPosRankSum=2.264;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,157:159:99:4129,391,0 chrXI 235819 . A G 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3519,369,0 chrXI 235951 . A G 4514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.94;SB=-2.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4514,483,0 chrXI 236044 . T A 4023.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4023,403,0 chrXI 236124 . T C 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.292;DP=123;Dels=0.00;FS=6.150;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.267;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,75:123:99:1572,0,967 chrXI 236129 . G A 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2941,312,0 chrXI 236208 . G A 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3808,396,0 chrXI 236227 . T C 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3029,345,0 chrXI 236254 . A G 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.787;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:2970,303,0 chrXI 236335 . A C 4387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.36;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4387,456,0 chrXI 236491 . A G 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3481,378,0 chrXI 236539 . G A 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.76;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3030,327,0 chrXI 236740 . T G 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,87:175:99:1690,0,1839 chrXI 236875 . G T 4349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.36;SB=-2.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4349,447,0 chrXI 236884 . A T 4401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.20;SB=-2.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4401,448,0 chrXI 237017 . C T 4181.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4181,421,0 chrXI 237186 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.914;DP=113;Dels=0.00;FS=4.676;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.997;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1151,0,1177 chrXI 237250 . A T 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3335,340,0 chrXI 237287 . T C 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7669;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3819,417,0 chrXI 237351 . C G 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3344,357,0 chrXI 237391 . G A 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2019;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=21.68;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3177,333,0 chrXI 237525 . C T 4926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.26;SB=-2.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:4926,493,0 chrXI 237528 . A G 4838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.68;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4838,484,0 chrXI 237610 . A G 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3674,393,0 chrXI 237666 . T G 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.42;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3737,396,0 chrXI 237829 . C T 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.485;DP=139;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1457,0,1322 chrXI 238139 . A T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.382;DP=153;Dels=0.00;FS=5.222;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.439;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1258,0,1758 chrXI 238513 . C G 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3408,360,0 chrXI 238663 . G A 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3399,351,0 chrXI 239004 . C T 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:2939,300,0 chrXI 239120 . T C 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2823,318,0 chrXI 239145 . T C 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.66;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2646,279,0 chrXI 239182 . A G 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2980,327,0 chrXI 239209 . C T 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3398,336,0 chrXI 239221 . G A 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3490,340,0 chrXI 239265 . C T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.054;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1393,0,1430 chrXI 239350 . G A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.847;DP=127;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=12.71;ReadPosRankSum=-2.871;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,75:127:99:1644,0,994 chrXI 239573 . T C 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3217,336,0 chrXI 239599 . T A 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2862,312,0 chrXI 239865 . T C 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.259;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=25.50;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,127:129:99:3290,322,0 chrXI 239982 . G A 4120.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4120,400,0 chrXI 240139 . A G 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=22.50;SB=-2.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:3758,393,0 chrXI 240270 . T C 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6420;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3139,333,0 chrXI 240429 . A G 4731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=25.71;SB=-2.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4731,484,0 chrXI 240637 . G A 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.40;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=26.13;ReadPosRankSum=1.131;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3195,336,0 chrXI 241054 . G A 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=25.93;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:132:99:3423,372,0 chrXI 241060 . T C 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3642,399,0 chrXI 241285 . A G 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3112,333,0 chrXI 241344 . C A 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3218,330,0 chrXI 241359 . G A 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3352,348,0 chrXI 241374 . G A 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3053,318,0 chrXI 241418 . C T 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3215,324,0 chrXI 241444 . G C 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3103,324,0 chrXI 241660 . A G 2376 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2409,267,0 chrXI 241692 . C T 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2663,285,0 chrXI 241961 . C T 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3511,355,0 chrXI 241962 . C T 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3543,358,0 chrXI 242032 . T C 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=22.78;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3600,384,0 chrXI 242387 . A G 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3362,351,0 chrXI 242407 . C T 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3647,373,0 chrXI 242473 . C T 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.976e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3894,394,0 chrXI 242634 . G C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3369,360,0 chrXI 242651 . G A 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3526,366,0 chrXI 242669 . A G 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3325,366,0 chrXI 242695 . G A 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3300,342,0 chrXI 242705 . C A 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3254,330,0 chrXI 242919 . G A 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3470,352,0 chrXI 243178 . G A 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3030,321,0 chrXI 243211 . A G 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.02;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:2934,309,0 chrXI 243364 . G A 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=25.59;ReadPosRankSum=1.472;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3403,348,0 chrXI 243628 . A G 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3258,363,0 chrXI 243838 . C T 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3975,409,0 chrXI 243997 . A G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.523;DP=138;Dels=0.00;FS=10.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1561,0,1217 chrXI 244000 . C G 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;DP=124;Dels=0.00;FS=5.474;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1130,0,1264 chrXI 244328 . T A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;DP=138;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=5.5806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:1619,0,1244 chrXI 244570 . C T 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3507,357,0 chrXI 244669 . G A 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.799;DP=73;Dels=0.00;FS=3.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.957;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:99:834,0,692 chrXI 244846 . T C 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.880;DP=156;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=2.7094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.138;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1550,0,1649 chrXI 244906 . T C 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3413,354,0 chrXI 245452 . A G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.575;DP=107;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1057,0,1184 chrXI 245474 . G A 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;DP=117;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.835;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1300,0,1160 chrXI 245804 . A T 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2977,315,0 chrXI 245907 . T C 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2865,324,0 chrXI 246068 . G A 1988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=25.49;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2021,216,0 chrXI 246115 . G A 135.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=72.2364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=1.47;SB=-8.931e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:18:168,18,0 chrXI 246131 . G A 2583 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=25.08;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2616,273,0 chrXI 246336 . G A 4018.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4018,403,0 chrXI 246578 . G C 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3414,375,0 chrXI 246698 . A G 3106 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.66;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3139,339,0 chrXI 246699 . A C 3018 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.40;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3051,330,0 chrXI 246708 . C T 2978 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.69;MQ0=0;QD=23.27;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3011,318,0 chrXI 246716 . T C 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.34;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3271,351,0 chrXI 246807 . A G 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3452,372,0 chrXI 246986 . T A 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2915,309,0 chrXI 247756 . G A 4101.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.09;MQ0=0;QD=25.79;SB=-2.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4101,435,0 chrXI 247793 . T C 3562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.74;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3562,387,0 chrXI 247813 . G A 4121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.19;MQ0=0;QD=26.42;SB=-2.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4121,418,0 chrXI 247876 . G T 2374 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.87;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2407,252,0 chrXI 247882 . C T 2159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.67;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2192,234,0 chrXI 247896 . A G 2304 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=82.7631;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.907;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2337,261,0 chrXI 247900 . A T 2310 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=82.7631;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.75;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=23.10;ReadPosRankSum=0.935;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2343,255,0 chrXI 247927 . G T 2029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.89;MQ0=0;QD=22.54;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2062,219,0 chrXI 247951 . G T 1964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.79;MQ0=0;QD=22.07;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1997,219,0 chrXI 247983 . A T 2117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=23.26;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2150,231,0 chrXI 247987 . G A 2194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.15;MQ0=0;QD=23.09;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2227,240,0 chrXI 248004 . C T 1947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.59;MQ0=0;QD=20.94;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:1980,210,0 chrXI 248028 . A G 2147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.05;MQ0=0;QD=23.86;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2180,237,0 chrXI 248307 . G C 2307 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;QD=18.76;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2340,255,0 chrXI 248310 . C A 2327 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.97;MQ0=0;QD=19.72;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2360,243,0 chrXI 248315 . A G 2275 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.07;MQ0=0;QD=19.61;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2308,243,0 chrXI 248487 . G A 4074.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.65;MQ0=1;QD=25.30;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4074,423,0 chrXI 248663 . G A 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3583,366,0 chrXI 248727 . A G 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3017,327,0 chrXI 249055 . G A 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2354;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3189,336,0 chrXI 249447 . T A 3933.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3933,400,0 chrXI 249660 . A G 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3706,384,0 chrXI 249723 . T C 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.442;DP=122;Dels=0.00;FS=3.514;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=25.16;ReadPosRankSum=1.300;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,120:122:99:3103,295,0 chrXI 249846 . C T 5057.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:5057,508,0 chrXI 249855 . T C 4383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:175:99:4383,459,0 chrXI 249882 . A G 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3922,408,0 chrXI 249915 . T C 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2989,324,0 chrXI 249960 . A G 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2854,312,0 chrXI 250094 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.709;DP=139;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.381;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1224,0,1593 chrXI 250113 . G A 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3567,378,0 chrXI 250134 . G A 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3707,393,0 chrXI 250275 . C T 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.576;DP=139;Dels=0.00;FS=2.281;HaplotypeScore=6.0090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.482;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1125,0,1647 chrXI 250309 . T G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.720;DP=138;Dels=0.00;FS=2.159;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1244,0,1475 chrXI 250387 . G A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.808;DP=139;Dels=0.00;FS=2.154;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.865;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1347,0,1389 chrXI 250668 . C T 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.841;DP=163;Dels=0.00;FS=1.229;HaplotypeScore=7.6775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.545;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:163:99:1510,0,1847 chrXI 250875 . G A 1849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.965;DP=162;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=2.6232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:162:99:1879,0,1327 chrXI 250932 . A G 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;DP=145;Dels=0.00;FS=3.590;HaplotypeScore=3.2373;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=-0.794;QD=24.46;ReadPosRankSum=1.708;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3547,361,0 chrXI 250944 . A G 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.491;DP=160;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=3.6404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=1.718;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.399;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,68:160:99:1317,0,1980 chrXI 250992 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.290;DP=138;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=1;MQRankSum=1.341;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:138:99:1110,0,1680 chrXI 251021 . A G 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.154;DP=139;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1508,0,1358 chrXI 251058 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.086;DP=135;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=4.9237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.612;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1220,0,1571 chrXI 251136 . C T 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3684,381,0 chrXI 251520 . A G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.599;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=2.004;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1043,0,949 chrXI 251664 . C A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.272;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.277;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1223,0,1260 chrXI 251703 . T C 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3655,393,0 chrXI 251749 . G A 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3782,384,0 chrXI 251928 . C T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3405,348,0 chrXI 252123 . A T 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3174,330,0 chrXI 252204 . C T 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3505,354,0 chrXI 252294 . C T 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3192,339,0 chrXI 252326 . C G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.026;DP=126;Dels=0.00;FS=8.743;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.556;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1273,0,1291 chrXI 252870 . T C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.233;DP=112;Dels=0.01;FS=5.936;HaplotypeScore=16.7873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1004,0,1243 chrXI 252887 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.054;DP=127;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=9.71;ReadPosRankSum=-2.607;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1263,0,1417 chrXI 252966 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.973;DP=153;Dels=0.01;FS=2.929;HaplotypeScore=7.5993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.534;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1619,0,1541 chrXI 253117 . G A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.323;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,60:146:99:1180,0,1696 chrXI 253234 . A G 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.590;DP=149;Dels=0.00;FS=4.012;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1701,0,1530 chrXI 253350 . A G 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.395;DP=131;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.914;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1034,0,1609 chrXI 253749 . C A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.197;DP=143;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=9.76;ReadPosRankSum=2.258;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1425,0,1493 chrXI 253838 . A G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.587;DP=123;Dels=0.00;FS=6.924;HaplotypeScore=2.3924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1201,0,1271 chrXI 253845 . T A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.429;DP=135;Dels=0.00;FS=6.420;HaplotypeScore=5.3671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.557;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1450,0,1398 chrXI 254023 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.284;DP=131;Dels=0.00;FS=4.246;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.581;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1305,0,1396 chrXI 254141 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.919;DP=135;Dels=0.00;FS=1.352;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1435,0,1293 chrXI 254328 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.440;DP=126;Dels=0.00;FS=12.985;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1318,0,1270 chrXI 254342 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.276;DP=122;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1115,0,1317 chrXI 254358 . C T 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=26.20;ReadPosRankSum=0.233;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:142:99:3721,390,0 chrXI 254579 . T C 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.411;DP=116;Dels=0.00;FS=3.488;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:891,0,1484 chrXI 254951 . G C 2623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2656,282,0 chrXI 254966 . A G 2130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2163,252,0 chrXI 255050 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.703;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:127:99:1198,0,1317 chrXI 255077 . G A 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3259,336,0 chrXI 255600 . C T 2244 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=22.22;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2277,243,0 chrXI 256639 . A G 2260 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=1;QD=21.32;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2293,255,0 chrXI 256761 . A G 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3586,366,0 chrXI 257249 . C A 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3139,336,0 chrXI 257258 . C T 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2995,315,0 chrXI 257878 . T A 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2825,300,0 chrXI 257882 . T A 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3199,339,0 chrXI 257966 . T C 2544 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.63;MQ0=0;QD=24.70;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2577,276,0 chrXI 257969 . T C 525.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.075;DP=97;Dels=0.00;FS=0.836;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.856;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,32:97:99:555,0,1319 chrXI 257970 . C A 2215 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.86;MQ0=0;QD=22.84;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2248,234,0 chrXI 257993 . G T 2722 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.18;MQ0=0;QD=22.31;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2755,285,0 chrXI 258001 . T A 2851 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.59;MQ0=0;QD=22.81;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2884,288,0 chrXI 258002 . C A 2807 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.65;MQ0=0;QD=22.28;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2840,291,0 chrXI 258466 . G A 4184.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.05;SB=-2.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4184,423,0 chrXI 258604 . A T 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2861,303,0 chrXI 258873 . A G 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2983,327,0 chrXI 259285 . C A 2446 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2479,255,0 chrXI 259426 . T A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.206;DP=124;Dels=0.00;FS=5.538;HaplotypeScore=4.5813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1224,0,1149 chrXI 259465 . T C 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=22.08;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:2970,321,0 chrXI 259753 . A G 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9048;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2733,294,0 chrXI 259774 . T A 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3083,318,0 chrXI 259792 . G A 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3012,303,0 chrXI 260006 . T C 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3550,387,0 chrXI 260037 . G A 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3200,330,0 chrXI 260038 . C T 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3167,324,0 chrXI 260152 . C T 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3664,378,0 chrXI 260236 . G A 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3343,336,0 chrXI 260245 . A C 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3186,351,0 chrXI 260276 . C A 3820.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3820,391,0 chrXI 260286 . A G 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3633,399,0 chrXI 260406 . A G 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3648,405,0 chrXI 260554 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.074;DP=154;Dels=0.00;FS=5.863;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.478;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1389,0,1687 chrXI 260780 . A G 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.228;DP=176;Dels=0.00;FS=3.527;HaplotypeScore=87.7238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,95:176:99:1898,0,1712 chrXI 260911 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;DP=146;Dels=0.00;FS=12.049;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-3.241;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.389;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1374,0,1505 chrXI 260914 . A G 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.222;DP=146;Dels=0.00;FS=12.029;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.325;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1410,0,1484 chrXI 260953 . T C 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;DP=139;Dels=0.00;FS=3.293;HaplotypeScore=61.7452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.043;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:927,0,1530 chrXI 260961 . T C 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.902;DP=123;Dels=0.00;FS=3.583;HaplotypeScore=9.0555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.784;QD=7.51;ReadPosRankSum=-1.203;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:954,0,1353 chrXI 261069 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.080;DP=111;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.566;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1022,0,1113 chrXI 261093 . A T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.847;DP=147;Dels=0.00;FS=2.198;HaplotypeScore=3.6572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.736;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1389,0,1571 chrXI 261359 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.795;DP=117;Dels=0.00;FS=5.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1181,0,1173 chrXI 261608 . T C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.381;DP=156;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1324,0,1743 chrXI 261680 . T C 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.390;DP=157;Dels=0.00;FS=5.138;HaplotypeScore=3.6591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1638,0,1580 chrXI 261697 . C T 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.534;DP=161;Dels=0.00;FS=2.861;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.360;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1690,0,1630 chrXI 261863 . A G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.496;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.433;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1425,0,1497 chrXI 262136 . C A 3886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=1;QD=26.26;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3886,397,0 chrXI 262447 . T C 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.332;DP=130;Dels=0.00;FS=2.308;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1338,0,1337 chrXI 262474 . T C 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;DP=151;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.252;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1533,0,1568 chrXI 262597 . A G 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.483;DP=167;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.334;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,80:167:99:1584,0,1860 chrXI 262636 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.386;DP=137;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1309,0,1465 chrXI 263004 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.298;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1400,0,1515 chrXI 263047 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.995;DP=128;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1263,0,1396 chrXI 263187 . C T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.228;DP=171;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.188;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,73:171:99:1448,0,2069 chrXI 263206 . T C 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.919;DP=159;Dels=0.00;FS=6.832;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1498,0,1756 chrXI 263834 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.912;DP=156;Dels=0.00;FS=2.916;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.149;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1373,0,1703 chrXI 263873 . A G 3963.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.24;SB=-2.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3963,420,0 chrXI 263921 . T A 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;DP=177;Dels=0.00;FS=6.340;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.735;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,90:177:99:1880,0,1781 chrXI 263970 . C T 1826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.249;DP=174;Dels=0.00;FS=1.185;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.418;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,87:174:99:1856,0,1761 chrXI 264078 . A G 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.800;DP=176;Dels=0.00;FS=0.555;HaplotypeScore=2.6562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,76:176:99:1463,0,2102 chrXI 264213 . G A 1948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.199;DP=161;Dels=0.00;FS=5.209;HaplotypeScore=2.7171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.340;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,90:161:99:1978,0,1381 chrXI 264216 . A G 4142.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.993;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7171;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,163:164:99:4142,406,0 chrXI 264387 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.774;DP=131;Dels=0.00;FS=2.668;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:131:99:1250,0,1314 chrXI 264567 . C T 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.615;DP=120;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=3.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1039,0,1370 chrXI 264611 . T G 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.04;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2923,318,0 chrXI 264824 . T C 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3441,372,0 chrXI 264974 . C T 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3181,318,0 chrXI 265405 . G C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;DP=164;Dels=0.00;FS=2.029;HaplotypeScore=16.8576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.797;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,70:164:99:1405,0,1849 chrXI 265911 . C T 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;DP=122;Dels=0.00;FS=3.621;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.704;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3089,300,0 chrXI 266213 . G A 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.583;DP=97;Dels=0.00;FS=2.862;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:929,0,1115 chrXI 266290 . C T 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.203;DP=138;Dels=0.00;FS=6.407;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.831;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1542,0,1368 chrXI 266376 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.420;DP=116;Dels=0.00;FS=3.428;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.422;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1383,0,1005 chrXI 266462 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.285;DP=126;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.333;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1414,0,1112 chrXI 266523 . A G 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.966;DP=102;Dels=0.00;FS=2.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.329;QD=9.62;ReadPosRankSum=-2.506;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,60:102:99:1011,0,937 chrXI 266528 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.949;DP=107;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1187,0,1039 chrXI 266610 . G A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;DP=109;Dels=0.00;FS=8.309;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.306;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1346,0,955 chrXI 266664 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.978;DP=128;Dels=0.00;FS=2.258;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=9.83;ReadPosRankSum=3.082;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1288,0,1459 chrXI 266730 . A T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;DP=138;Dels=0.00;FS=22.281;HaplotypeScore=3.1435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.724;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1205,0,1673 chrXI 266841 . G A 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.425;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:943,0,959 chrXI 267171 . C T 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.282;DP=108;Dels=0.00;FS=9.137;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.085;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:986,0,1312 chrXI 267180 . A G 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;DP=116;Dels=0.00;FS=10.317;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.615;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1058,0,1382 chrXI 267501 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.935;DP=122;Dels=0.00;FS=2.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.346;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1212,0,1404 chrXI 267504 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;DP=125;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.037;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1218,0,1396 chrXI 267528 . C T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.320;DP=119;Dels=0.00;FS=8.721;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1212,0,1223 chrXI 267597 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;DP=124;Dels=0.00;FS=3.257;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1402,0,1128 chrXI 267639 . T A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.139;DP=137;Dels=0.00;FS=3.236;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.582;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:137:99:1523,0,1100 chrXI 267702 . A T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=137;Dels=0.00;FS=7.831;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=2.690;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.728;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1619,0,1320 chrXI 267712 . C T 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.917;DP=138;Dels=0.00;FS=6.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.113;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1667,0,1250 chrXI 267738 . A G 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.499;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=11.51;ReadPosRankSum=-3.842;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,88:158:99:1848,0,1461 chrXI 267822 . G A 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.123;DP=149;Dels=0.00;FS=10.085;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.744;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.305;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1752,0,1270 chrXI 268601 . A G 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.442;DP=147;Dels=0.00;FS=10.587;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,87:147:99:1757,0,1273 chrXI 269100 . T C 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.627;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.991;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:898,0,1581 chrXI 269184 . A T 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.457;DP=133;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1558,0,1168 chrXI 269383 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.887;DP=139;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.385;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1357,0,1434 chrXI 269500 . G A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.008;DP=129;Dels=0.00;FS=4.377;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.369;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:129:99:1605,0,1027 chrXI 269524 . G A 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3539,363,0 chrXI 269563 . T C 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.490;DP=128;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.803;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,77:128:99:1641,0,1009 chrXI 269826 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;DP=116;Dels=0.00;FS=10.210;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.001;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1014,0,1446 chrXI 270096 . T C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.918;DP=123;Dels=0.00;FS=3.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1209,0,1240 chrXI 270178 . G C 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=1;QD=24.57;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2932,309,0 chrXI 270231 . A G 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2913,297,0 chrXI 270342 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.042;DP=136;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1149,0,1699 chrXI 270451 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.511;DP=128;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1355,0,1249 chrXI 270852 . A G 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2982,312,0 chrXI 270883 . T C 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.878;DP=126;Dels=0.00;FS=5.620;HaplotypeScore=4.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.737;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.618;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:980,0,1547 chrXI 270966 . C A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.590;DP=110;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.689;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.141;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1140,0,1146 chrXI 270990 . T C 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.264;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.318;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1390,0,1121 chrXI 271016 . G A 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3402,348,0 chrXI 271045 . T G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.326;DP=138;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.084;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1134,0,1738 chrXI 271048 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.778;DP=128;Dels=0.00;FS=5.506;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:128:99:1456,0,1174 chrXI 271129 . C T 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3358,330,0 chrXI 271156 . T G 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.827;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1383,0,1318 chrXI 271321 . C T 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3311,345,0 chrXI 271323 . T A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;DP=139;Dels=0.00;FS=9.038;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.496;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:139:99:1282,0,1491 chrXI 271532 . C T 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.312;DP=126;Dels=0.00;FS=11.556;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1266,0,1122 chrXI 271548 . A C 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2970,315,0 chrXI 271602 . T G 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.398;DP=112;Dels=0.00;FS=8.960;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1292,0,1015 chrXI 271621 . A T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.973;DP=124;Dels=0.00;FS=5.538;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1417,0,1069 chrXI 271663 . G A 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3180,322,0 chrXI 271696 . G A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.207;DP=120;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.007;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.041;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1033,0,1364 chrXI 271718 . A G 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.34;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3220,354,0 chrXI 271850 . T C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.456;DP=117;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1176,0,1264 chrXI 272205 . C T 1777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.807;DP=139;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,82:139:99:1807,0,1127 chrXI 272320 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.526;DP=103;Dels=0.00;FS=1.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,61:103:99:1351,0,813 chrXI 272389 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.421;DP=117;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.608;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.384;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1298,0,1117 chrXI 272494 . G A 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.210;DP=155;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=3.8025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1613,0,1472 chrXI 272811 . T C 729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.823;DP=75;Dels=0.00;FS=4.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.111;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:759,0,851 chrXI 272960 . G C 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;DP=135;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1503,0,1305 chrXI 273068 . C T 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.960;DP=139;Dels=0.00;FS=2.132;HaplotypeScore=4.9338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.987;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1508,0,1283 chrXI 273074 . A T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;DP=137;Dels=0.00;FS=3.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.915;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1350,0,1531 chrXI 273176 . C T 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2937,303,0 chrXI 273206 . A G 2216 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2249,249,0 chrXI 273558 . T A 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3563,378,0 chrXI 273580 . G A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.658;DP=120;Dels=0.00;FS=7.026;HaplotypeScore=2.6377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.867;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1436,0,1032 chrXI 273860 . A G 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3091,336,0 chrXI 273882 . A G 3561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3561,372,0 chrXI 273936 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.676;DP=138;Dels=0.00;FS=2.179;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1430,0,1403 chrXI 274112 . C T 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3689,372,0 chrXI 274155 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3268,342,0 chrXI 274224 . A G 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3242,348,0 chrXI 274263 . C A 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3479,366,0 chrXI 274276 . T C 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3432,372,0 chrXI 274314 . G A 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3113,324,0 chrXI 274403 . G A 2426 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5427;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.10;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2459,258,0 chrXI 274476 . G A 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3860,405,0 chrXI 274746 . T C 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3528,381,0 chrXI 274968 . T C 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3226,333,0 chrXI 275016 . A G 4370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4370,456,0 chrXI 275220 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.754;DP=104;Dels=0.00;FS=2.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.131;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1199,0,933 chrXI 275312 . G A 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.410;DP=135;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=5.8097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=2.066;QD=11.45;ReadPosRankSum=3.208;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1576,0,1212 chrXI 275360 . A C 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.830;DP=124;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=4.6738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1115,0,1388 chrXI 275426 . T C 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.720;DP=79;Dels=0.00;FS=7.480;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.200;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,43:79:99:838,0,787 chrXI 275624 . G T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.571;DP=104;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.260;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1133,0,1065 chrXI 277506 . T C 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.819;DP=106;Dels=0.00;FS=1.568;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.299;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:896,0,1187 chrXI 278102 . A G 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.093;DP=139;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1540,0,1325 chrXI 278119 . C A 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.94;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3398,360,0 chrXI 278143 . T G 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;DP=160;Dels=0.00;FS=4.886;HaplotypeScore=13.7434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.137;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1533,0,1643 chrXI 278179 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;DP=154;Dels=0.00;FS=4.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:154:99:1461,0,1707 chrXI 278223 . T A 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.376;DP=165;Dels=0.00;FS=2.858;HaplotypeScore=7.8392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=2.618;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.276;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1636,0,1771 chrXI 278388 . C T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.242;DP=135;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.718;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1291,0,1400 chrXI 278756 . A C 2436 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.433;DP=104;Dels=0.00;FS=3.095;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.299;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2469,264,0 chrXI 278761 . C A 614.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.827;DP=100;Dels=0.00;FS=5.187;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.564;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:644,0,1282 chrXI 278762 . T C 2263 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.02;MQ0=0;QD=22.86;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2296,249,0 chrXI 278767 . T C 2430 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.28;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2463,270,0 chrXI 278776 . G C 2516 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.17;MQ0=0;QD=23.30;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2549,282,0 chrXI 278847 . C T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.266;DP=115;Dels=0.00;FS=4.664;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.798;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:990,0,1192 chrXI 278902 . T A 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:3791,384,0 chrXI 278924 . A T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;DP=161;Dels=0.00;FS=3.363;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=8.24;ReadPosRankSum=-2.487;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:1356,0,1819 chrXI 279017 . T A 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3163,333,0 chrXI 279067 . G T 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3668,366,0 chrXI 279099 . G A 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.68;SB=-2.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3900,379,0 chrXI 279188 . T C 4645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.66;SB=-2.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4645,474,0 chrXI 279367 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.808;DP=133;Dels=0.00;FS=4.144;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1139,0,1692 chrXI 279830 . T C 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.641;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=11.80;ReadPosRankSum=1.334;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,89:147:99:1765,0,1104 chrXI 279884 . C T 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.694;DP=139;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=0.770;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.033;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,80:139:99:1719,0,1087 chrXI 280607 . T C 604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.049;DP=98;Dels=0.00;FS=2.807;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.310;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:634,0,1424 chrXI 282240 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.556;DP=118;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:1339,0,1043 chrXI 282383 . G T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.769;DP=159;Dels=0.00;FS=1.972;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.942;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1666,0,1528 chrXI 282489 . A T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;DP=124;Dels=0.00;FS=4.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.460;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1022,0,1377 chrXI 282515 . C A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.204;DP=130;Dels=0.00;FS=6.045;HaplotypeScore=4.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.567;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1240,0,1370 chrXI 282982 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.306;DP=116;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.154;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1202,0,1217 chrXI 283059 . T C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.310;DP=123;Dels=0.00;FS=3.259;HaplotypeScore=2.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1157,0,1418 chrXI 283085 . C T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.740;DP=104;Dels=0.00;FS=1.616;HaplotypeScore=4.9516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.524;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:988,0,1145 chrXI 283164 . G A 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.968;DP=128;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.514;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,76:128:99:1543,0,953 chrXI 283762 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.150;DP=123;Dels=0.01;FS=1.505;HaplotypeScore=11.7298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,75:122:99:1337,0,976 chrXI 283885 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.726;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.110;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1178,0,1590 chrXI 283904 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.733;DP=139;Dels=0.01;FS=5.307;HaplotypeScore=8.7992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1260,0,1562 chrXI 284122 . A G 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.621;DP=154;Dels=0.00;FS=7.473;HaplotypeScore=5.6327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.568;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.755;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1677,0,1510 chrXI 284248 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.510;DP=132;Dels=0.00;FS=5.378;HaplotypeScore=2.5352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.057;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1259,0,1288 chrXI 284656 . A C 1891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;DP=165;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=3.7585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.337;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,92:165:99:1921,0,1421 chrXI 284714 . T C 1792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.384;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.402;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,88:161:99:1822,0,1403 chrXI 284721 . A C 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.560;DP=166;Dels=0.00;FS=1.260;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.999;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.886;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,91:166:99:1795,0,1496 chrXI 284914 . C T 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;DP=101;Dels=0.00;FS=11.442;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.499;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.500;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:851,0,1241 chrXI 285242 . A G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3358,357,0 chrXI 285365 . A G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.982;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.820;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,56:135:99:1066,0,1773 chrXI 286581 . G A 4278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.46;SB=-2.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4278,421,0 chrXI 287276 . C G 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.608;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=25.78;ReadPosRankSum=1.639;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2920,291,0 chrXI 289859 . G C 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3108,330,0 chrXI 291117 . T C 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.803;DP=131;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.212;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1638,0,1102 chrXI 292055 . G A 2425 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2458,249,0 chrXI 292739 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.801;DP=157;Dels=0.00;FS=4.677;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,73:157:99:1354,0,1743 chrXI 293821 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.795;DP=122;Dels=0.00;FS=4.408;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1200,0,1362 chrXI 293858 . A C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.195;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=8.13;ReadPosRankSum=2.357;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:900,0,1293 chrXI 294093 . T C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.025;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:915,0,1145 chrXI 294337 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.094;DP=136;Dels=0.00;FS=3.273;HaplotypeScore=2.7134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.088;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:135:99:1212,0,1541 chrXI 294411 . G A 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.851;DP=131;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1489,0,1190 chrXI 294837 . C T 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.111;DP=81;Dels=0.00;FS=2.952;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:703,0,860 chrXI 294979 . C T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.300;DP=99;Dels=0.00;FS=6.460;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=10.21;ReadPosRankSum=-2.146;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1041,0,947 chrXI 295501 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.922;DP=129;Dels=0.00;FS=12.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.701;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1378,0,1201 chrXI 295536 . G T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;DP=107;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.815;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1190,0,1013 chrXI 295546 . T A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.913;DP=109;Dels=0.00;FS=2.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.404;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1243,0,1057 chrXI 295672 . A G 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.950;DP=101;Dels=0.00;FS=4.006;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=9.52;ReadPosRankSum=2.015;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:992,0,1100 chrXI 295702 . G A 795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.037;DP=94;Dels=0.00;FS=1.710;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.578;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,41:94:99:825,0,1047 chrXI 295849 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.853;DP=124;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1440,0,1160 chrXI 296196 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.942;DP=114;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.785;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1269,0,1020 chrXI 296535 . G A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.379;DP=115;Dels=0.00;FS=7.173;HaplotypeScore=3.0675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1102,0,933 chrXI 297280 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.360;DP=137;Dels=0.00;FS=2.537;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.153;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1409,0,1397 chrXI 297401 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.160;DP=118;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.560;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1219,0,1170 chrXI 297476 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.056;DP=116;Dels=0.00;FS=13.980;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.395;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.971;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1072,0,1292 chrXI 297512 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.931;DP=143;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=2.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=2;MQRankSum=0.655;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1280,0,1554 chrXI 297561 . G A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=107;Dels=0.00;FS=6.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=1;MQRankSum=-1.564;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1067,0,1114 chrXI 297833 . C G 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.656;DP=135;Dels=0.00;FS=4.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1227,0,1413 chrXI 297875 . G A 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.875;DP=145;Dels=0.00;FS=2.112;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.141;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1294,0,1542 chrXI 297992 . G C 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.749;DP=150;Dels=0.00;FS=4.876;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=11.14;ReadPosRankSum=-2.357;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:1701,0,1278 chrXI 298392 . G A 1979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.769;DP=146;Dels=0.00;FS=2.169;HaplotypeScore=3.6318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.571;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,92:146:99:2009,0,1007 chrXI 299678 . A C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.574;DP=115;Dels=0.00;FS=3.440;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.973;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.523;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1011,0,1357 chrXI 300201 . G A 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.258;DP=123;Dels=0.00;FS=11.681;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.262;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1255,0,1286 chrXI 300203 . A T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;DP=121;Dels=0.00;FS=8.698;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.994;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1218,0,1343 chrXI 301521 . A G 2720 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2753,279,0 chrXI 302002 . A C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.113;DP=115;Dels=0.00;FS=7.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=2.028;QD=9.82;ReadPosRankSum=2.117;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1159,0,1226 chrXI 302097 . T C 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3062,336,0 chrXI 302470 . G T 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3113,324,0 chrXI 302490 . T A 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3099,315,0 chrXI 302581 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.959;DP=101;Dels=0.00;FS=5.024;HaplotypeScore=5.9208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.166;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1103,0,1062 chrXI 302585 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;DP=105;Dels=0.00;FS=4.884;HaplotypeScore=3.9398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.099;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1115,0,1151 chrXI 302846 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.863;DP=100;Dels=0.00;FS=3.759;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.879;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1191,0,970 chrXI 302883 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.524;DP=105;Dels=0.00;FS=1.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.670;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1014,0,1216 chrXI 302903 . T A 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.620;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.213;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:842,0,1259 chrXI 302911 . C T 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.183;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.646;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:858,0,1322 chrXI 303165 . C T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.867;DP=126;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1104,0,1481 chrXI 303330 . T A 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;DP=95;Dels=0.00;FS=1.891;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.748;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:823,0,1158 chrXI 303363 . C T 686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.966;DP=101;Dels=0.00;FS=2.770;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.801;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.610;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,37:101:99:716,0,1359 chrXI 303510 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.491;DP=118;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.331;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1106,0,1233 chrXI 303647 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;DP=114;Dels=0.00;FS=2.527;HaplotypeScore=2.8723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,70:114:99:1509,0,887 chrXI 303742 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.435;DP=107;Dels=0.00;FS=2.666;HaplotypeScore=2.5577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.086;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,65:107:99:1381,0,809 chrXI 304104 . C A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.020;DP=109;Dels=0.00;FS=6.478;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1107,0,1122 chrXI 304169 . T A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;DP=108;Dels=0.00;FS=7.668;HaplotypeScore=3.7625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.148;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1077,0,1236 chrXI 304331 . T C 568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.423;DP=90;Dels=0.00;FS=0.807;HaplotypeScore=8.5118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.454;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,34:90:99:598,0,1212 chrXI 304416 . C G 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.751;DP=112;Dels=0.00;FS=3.496;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.815;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:893,0,1307 chrXI 304756 . A T 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.656;DP=120;Dels=0.00;FS=3.520;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=11.23;ReadPosRankSum=3.442;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1378,0,1206 chrXI 304785 . T A 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.301;DP=90;Dels=0.00;FS=3.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.025;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.597;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:923,0,949 chrXI 304902 . G A 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.303;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.8320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.685;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.909;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:122:99:893,0,1357 chrXI 304908 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.764;DP=131;Dels=0.00;FS=5.400;HaplotypeScore=41.5514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.925;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1155,0,1247 chrXI 304925 . A T 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;DP=123;Dels=0.00;FS=2.759;HaplotypeScore=3.7739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.865;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.043;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:926,0,1275 chrXI 304937 . A T 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.256;DP=118;Dels=0.00;FS=5.094;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQ0=0;MQRankSum=-3.852;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.566;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:810,0,1333 chrXI 305086 . A T 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;DP=91;Dels=0.00;FS=2.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.068;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:976,0,934 chrXI 305305 . A G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.689;DP=135;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.991;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1509,0,1241 chrXI 305339 . A G 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.290;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1497,0,1376 chrXI 305729 . C A 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3216,342,0 chrXI 306260 . T C 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.790;DP=89;Dels=0.00;FS=4.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.245;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:865,0,1043 chrXI 306262 . T C 769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.393;DP=87;Dels=0.00;FS=0.830;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.399;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:799,0,1025 chrXI 306296 . C T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.703;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1067,0,1237 chrXI 306444 . G A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.487;DP=118;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1109,0,1332 chrXI 306453 . T G 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2728,291,0 chrXI 306530 . T A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.761;DP=126;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.205;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1308,0,1318 chrXI 306545 . A G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.215;DP=134;Dels=0.00;FS=8.642;HaplotypeScore=4.0608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.859;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.683;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1245,0,1431 chrXI 306618 . C A 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.037;DP=108;Dels=0.00;FS=9.019;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=9.16;ReadPosRankSum=2.299;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:1019,0,1199 chrXI 306678 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.152;DP=107;Dels=0.00;FS=10.831;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.019;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1033,0,1148 chrXI 306702 . T A 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.375;DP=98;Dels=0.00;FS=14.083;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=8.51;ReadPosRankSum=2.331;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:864,0,1118 chrXI 306732 . A C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.067;DP=102;Dels=0.00;FS=3.642;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:915,0,1072 chrXI 306764 . G A 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.180;DP=105;Dels=0.00;FS=2.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=-3.600;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:873,0,1093 chrXI 306770 . G A 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.928;DP=109;Dels=0.00;FS=2.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:941,0,1269 chrXI 306775 . C T 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;DP=109;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.283;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:907,0,1300 chrXI 306863 . T G 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.331;DP=93;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.302;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.111;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:843,0,1054 chrXI 306879 . G A 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.368;DP=83;Dels=0.00;FS=7.415;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.433;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:860,0,790 chrXI 307030 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.767;DP=100;Dels=0.00;FS=5.187;HaplotypeScore=5.4976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.920;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,62:100:99:1406,0,648 chrXI 307102 . A C 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.094;DP=121;Dels=0.00;FS=9.305;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.713;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,73:121:99:1539,0,991 chrXI 307139 . A T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;DP=103;Dels=0.00;FS=1.627;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.723;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1305,0,895 chrXI 307166 . T G 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.501;DP=103;Dels=0.00;FS=2.746;HaplotypeScore=2.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.640;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1046,0,1066 chrXI 307341 . G A 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.805;DP=110;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.403;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1007,0,1287 chrXI 307466 . C G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;DP=119;Dels=0.00;FS=4.609;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=1;MQRankSum=-0.253;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.653;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,71:119:99:1485,0,915 chrXI 307722 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.486;DP=113;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=2.436;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.756;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,64:113:99:1269,0,880 chrXI 307854 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.026;DP=123;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=70.3315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:123:99:1274,0,1165 chrXI 307916 . A G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;DP=113;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.451;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1148,0,1207 chrXI 307998 . C A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.729;DP=116;Dels=0.00;FS=7.378;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=2;MQRankSum=0.624;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.429;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1431,0,962 chrXI 308031 . T A 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;DP=100;Dels=0.00;FS=5.196;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=2;MQRankSum=0.480;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.601;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1218,0,847 chrXI 308142 . A T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.344;DP=110;Dels=0.00;FS=12.378;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.090;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1041,0,1194 chrXI 308234 . A G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.999;DP=128;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=5.4434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.315;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1148,0,1440 chrXI 308236 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.415;DP=128;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=7.3764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1182,0,1318 chrXI 308425 . T C 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3422,366,0 chrXI 308513 . C T 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.104;DP=93;Dels=0.00;FS=1.772;HaplotypeScore=5.8423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.203;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:783,0,1032 chrXI 308560 . A C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.566;DP=116;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.229;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1270,0,1194 chrXI 308593 . T C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.790;DP=151;Dels=0.00;FS=9.821;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.843;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1395,0,1709 chrXI 308610 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.053;DP=145;Dels=0.00;FS=8.966;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1452,0,1593 chrXI 308754 . T G 4194.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4194,444,0 chrXI 309009 . C T 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3673,390,0 chrXI 309090 . T A 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3790,399,0 chrXI 309188 . T C 3924.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7706;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3924,420,0 chrXI 309294 . G A 3523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3523,334,0 chrXI 309634 . A C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.587;DP=112;Dels=0.00;FS=7.518;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=9.96;ReadPosRankSum=3.283;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:112:99:1146,0,911 chrXI 309751 . T G 2556 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=116;Dels=0.00;FS=3.924;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=22.03;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2589,267,0 chrXI 309823 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.501;DP=132;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=1.351;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.122;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1327,0,1359 chrXI 309985 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.939;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1232,0,1272 chrXI 310373 . G A 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;DP=106;Dels=0.00;FS=3.819;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=25.06;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2689,264,0 chrXI 310423 . T A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.907;DP=106;Dels=0.00;FS=14.685;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1201,0,1011 chrXI 310507 . C T 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1593;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.67;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2623,279,0 chrXI 310580 . A G 580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.515;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.409;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:610,0,819 chrXI 310692 . G A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.548;DP=129;Dels=0.00;FS=3.403;HaplotypeScore=4.9627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1256,0,1417 chrXI 310702 . C A 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.201;DP=137;Dels=0.00;FS=4.465;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3634,342,0 chrXI 310798 . C A 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.84;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3702,387,0 chrXI 310861 . A G 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.920;DP=130;Dels=0.00;FS=2.213;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=2.309;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.479;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1455,0,1217 chrXI 311030 . T C 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3133,333,0 chrXI 311077 . G A 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.35;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3153,324,0 chrXI 311174 . T G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.420;DP=149;Dels=0.00;FS=7.269;HaplotypeScore=2.3885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.44;ReadPosRankSum=-7.806;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,63:149:99:1139,0,176 chrXI 311221 . G A 446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.470;DP=106;Dels=0.00;FS=4.818;HaplotypeScore=29.2739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.957;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:476,0,414 chrXI 311233 . G C 638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=109;Dels=0.00;FS=5.978;HaplotypeScore=44.6835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.97;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.682;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:668,0,548 chrXI 311278 . T C 2155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.11;MQ0=0;QD=24.77;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2188,249,0 chrXI 311288 . A G 449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;DP=92;Dels=0.00;FS=1.853;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.94;MQ0=0;MQRankSum=-4.051;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:479,0,1475 chrXI 311294 . A C 2301 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.09;MQ0=0;QD=25.29;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2334,255,0 chrXI 311302 . C G 384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.44;MQ0=0;MQRankSum=-5.230;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,30:98:99:414,0,1534 chrXI 311306 . A G 462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.569;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.46;MQ0=0;MQRankSum=-4.349;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.973;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,33:102:99:492,0,1560 chrXI 311331 . T C 2718 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.81;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2751,294,0 chrXI 311338 . C T 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.936;DP=111;Dels=0.00;FS=7.770;HaplotypeScore=2.2955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.643;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.918;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,40:111:99:702,0,1590 chrXI 311410 . A T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.202;DP=138;Dels=0.00;FS=5.134;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1329,0,1462 chrXI 311431 . A T 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.69;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3277,336,0 chrXI 311462 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.638;DP=126;Dels=0.00;FS=5.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.783;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1302,0,1241 chrXI 311476 . C G 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.36;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2877,327,0 chrXI 311501 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.387;DP=111;Dels=0.00;FS=3.556;HaplotypeScore=2.7515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.316;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:968,0,1190 chrXI 311502 . A G 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7515;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.45;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2623,282,0 chrXI 311526 . T C 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.90;MQ0=0;QD=23.34;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2694,288,0 chrXI 311569 . A G 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.785;DP=116;Dels=0.00;FS=12.147;HaplotypeScore=2.5458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.616;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:884,0,1331 chrXI 311590 . C T 2420 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.19;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2453,258,0 chrXI 311668 . A G 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.26;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3259,336,0 chrXI 311735 . G A 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3088,321,0 chrXI 311744 . T G 2477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.662;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3504;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2510,253,0 chrXI 311786 . T C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.818;DP=94;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1012,0,897 chrXI 311803 . C T 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.711;DP=88;Dels=0.00;FS=2.904;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.122;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,48:88:99:1027,0,791 chrXI 311806 . C T 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.111;DP=88;Dels=0.00;FS=4.151;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.059;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:871,0,961 chrXI 311820 . T C 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2668,285,0 chrXI 311850 . T A 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.166;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:102:99:1044,0,1042 chrXI 311851 . C T 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.713;DP=104;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:937,0,1008 chrXI 311897 . A G 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2855,306,0 chrXI 311898 . A G 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2904,306,0 chrXI 311925 . T C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.194;DP=120;Dels=0.00;FS=3.343;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.068;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1184,0,1223 chrXI 311975 . G A 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3282,345,0 chrXI 312014 . G C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;DP=134;Dels=0.00;FS=3.249;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.992;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1252,0,1394 chrXI 312016 . C T 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3508,363,0 chrXI 312042 . C T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.752;DP=137;Dels=0.00;FS=7.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.584;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1306,0,1459 chrXI 312103 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.562;DP=132;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.553;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1406,0,1217 chrXI 312273 . G A 2531 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2564,273,0 chrXI 312289 . C T 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2681,285,0 chrXI 312328 . T G 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.727;DP=91;Dels=0.00;FS=4.083;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=2.544;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.084;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:966,0,944 chrXI 312353 . T C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.742;DP=100;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=5.3808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.080;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1059,0,991 chrXI 312361 . C T 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;DP=93;Dels=0.00;FS=2.713;HaplotypeScore=5.3086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,43:93:99:897,0,1064 chrXI 312511 . T C 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3192,336,0 chrXI 312545 . T G 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3052,333,0 chrXI 312553 . T C 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2811,324,0 chrXI 312734 . A C 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3618,390,0 chrXI 313024 . T C 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3460,387,0 chrXI 313063 . C T 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3297,333,0 chrXI 313073 . A C 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3244,333,0 chrXI 313195 . G A 4116.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.33;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4116,414,0 chrXI 313226 . A G 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.930;DP=127;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,79:127:99:1570,0,959 chrXI 313299 . T C 2173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.95;MQ0=0;QD=24.98;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2206,246,0 chrXI 313318 . G A 2262 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.33;MQ0=0;QD=26.30;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2295,243,0 chrXI 313345 . G T 1864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.63;MQ0=0;QD=22.73;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1897,204,0 chrXI 313349 . T C 1715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.32;MQ0=0;QD=21.71;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1748,195,0 chrXI 313365 . C T 1920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.86;MQ0=0;QD=22.86;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1953,213,0 chrXI 313367 . G A 1965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.52;MQ0=0;QD=20.26;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:1998,213,0 chrXI 313392 . A G 748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.381;DP=101;Dels=0.00;FS=2.319;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=7.41;ReadPosRankSum=2.298;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:778,0,1154 chrXI 313486 . G A 2375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.13;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2408,252,0 chrXI 313488 . T A,G 2081.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=46.52;MQ0=0;QD=20.01;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,59,45:104:99:2141,818,665,1323,0,1218 chrXI 313507 . T C 543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.436;DP=112;Dels=0.00;FS=2.524;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.08;MQ0=0;MQRankSum=-4.770;QD=4.85;ReadPosRankSum=-1.946;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,40:112:99:573,0,1572 chrXI 313513 . T G 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.89;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2485,264,0 chrXI 313523 . T A 2513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.57;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2546,261,0 chrXI 313544 . A C 441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.24;MQ0=0;MQRankSum=-3.771;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.137;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:471,0,1237 chrXI 313602 . G A 444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.15;MQ0=0;QD=20.18;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:51:477,51,0 chrXI 313671 . C T 97.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.22;MQ0=2;QD=7.48;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:15:130,15,0 chrXI 313695 . G C 306 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.57;MQ0=2;QD=12.24;SB=-1.839e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:33:339,33,0 chrXI 313738 . A G 585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.10;MQ0=2;QD=13.30;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:54:618,54,0 chrXI 313757 . C T 719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=1;QD=14.98;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:69:752,69,0 chrXI 313761 . C T 740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.05;MQ0=1;QD=14.23;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:72:773,72,0 chrXI 313827 . C T 350 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.36;MQ0=0;QD=14.00;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:42:383,42,0 chrXI 313858 . T C 71.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.25;MQ0=0;QD=4.47;SB=-5.355e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:12:104,12,0 chrXI 313924 . G A 397 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.86;MQ0=0;QD=7.49;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:48:430,48,0 chrXI 313970 . C T 632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.314;DP=94;Dels=0.00;FS=10.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.008;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:662,0,624 chrXI 313985 . G A 2147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.74;MQ0=0;QD=19.17;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2180,216,0 chrXI 313997 . T C 2400 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.99;MQ0=0;QD=21.43;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2433,252,0 chrXI 314119 . G C 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;DP=93;Dels=0.00;FS=3.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.35;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.196;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1010,0,886 chrXI 314126 . G A 2315 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.35;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2348,246,0 chrXI 314131 . T C 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.565;DP=83;Dels=0.00;FS=2.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.843;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:883,0,833 chrXI 314163 . A G 1705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.29;MQ0=0;QD=25.07;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1738,192,0 chrXI 314522 . T G 86.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=14.38;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:119,15,0 chrXI 314523 . C A 89.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=0;QD=12.75;SB=-2.914e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:122,15,0 chrXI 314524 . A C 91.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=0;QD=13.04;SB=-2.814e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:124,15,0 chrXI 314572 . G A 352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.791;DP=71;Dels=0.00;FS=3.321;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.13;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:382,0,460 chrXI 314623 . T C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.489;DP=103;Dels=0.00;FS=1.696;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1131,0,931 chrXI 314694 . A G 2392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;DP=94;Dels=0.00;FS=4.049;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=25.45;ReadPosRankSum=1.622;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:2425,267,0 chrXI 314713 . C T 2066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.70;MQ0=0;QD=25.20;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2099,222,0 chrXI 314746 . A C 378.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;DP=103;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.576;QD=3.67;ReadPosRankSum=2.329;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,33:103:99:408,0,1583 chrXI 314749 . G A 365.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.501;DP=96;Dels=0.00;FS=1.901;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.55;MQ0=0;MQRankSum=-7.411;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.038;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,32:96:99:395,0,1454 chrXI 314752 . T C 2068 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.90;MQ0=0;QD=22.00;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2101,234,0 chrXI 314758 . A G 328.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=-6.817;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,31:96:99:358,0,1499 chrXI 314765 . T C 338.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.720;DP=104;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=66.4565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.83;MQ0=0;MQRankSum=-5.650;QD=3.25;ReadPosRankSum=-2.102;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,33:104:99:368,0,1674 chrXI 314766 . A G 436.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.271;DP=109;Dels=0.00;FS=1.673;HaplotypeScore=66.4565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.60;MQ0=0;MQRankSum=-6.216;QD=4.00;ReadPosRankSum=-3.189;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,38:109:99:466,0,1594 chrXI 314787 . C T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.793;DP=117;Dels=0.00;FS=14.416;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.75;MQ0=0;MQRankSum=6.602;QD=13.41;ReadPosRankSum=3.807;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,72:117:99:1599,0,687 chrXI 314820 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.434;DP=110;Dels=0.00;FS=15.719;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.87;MQ0=0;MQRankSum=4.963;QD=12.22;ReadPosRankSum=-4.318;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,67:110:99:1374,0,815 chrXI 314862 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.353;DP=112;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=3.9364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.72;MQ0=0;MQRankSum=2.645;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.842;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1180,0,1164 chrXI 314906 . A G 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.65;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2939,306,0 chrXI 315068 . G A 2980 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.68;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3013,300,0 chrXI 315069 . A G 2955 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2988,309,0 chrXI 315072 . A G 1145.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.136;DP=120;Dels=0.00;FS=7.015;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.295;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1175,0,1311 chrXI 315107 . G C 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2981,318,0 chrXI 315295 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;DP=138;Dels=0.00;FS=4.124;HaplotypeScore=6.7663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.368;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:138:99:1175,0,1580 chrXI 315335 . T C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.207;DP=137;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1332,0,1476 chrXI 315617 . A G 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=55.4757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=23.90;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2997,336,0 chrXI 315654 . G C 2376 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.84;MQ0=0;QD=24.49;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2409,261,0 chrXI 315726 . A G 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.35;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2678,285,0 chrXI 315735 . G A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.682;DP=114;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1151,0,1177 chrXI 315777 . A G 2413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.82;MQ0=0;QD=25.40;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2446,261,0 chrXI 315805 . G A 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.21;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2738,276,0 chrXI 315840 . G A 1908 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.65;MQ0=0;QD=22.99;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1941,207,0 chrXI 315844 . T C 1707 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.45;MQ0=0;QD=20.82;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1740,201,0 chrXI 315847 . A G 521.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.817;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.25;MQ0=0;MQRankSum=-3.112;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.451;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:551,0,825 chrXI 315867 . A G 1389 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.33;MQ0=0;QD=20.43;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1422,153,0 chrXI 315893 . G T 1468 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.71;MQ0=0;QD=21.28;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1501,168,0 chrXI 315895 . C T 1506 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.13;MQ0=0;QD=22.15;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1539,165,0 chrXI 315903 . C T 1458 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.99;MQ0=0;QD=18.94;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1491,165,0 chrXI 315904 . T A 1461 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.90;MQ0=0;QD=18.73;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1494,165,0 chrXI 315915 . A G 1875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.24;MQ0=0;QD=22.32;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1908,213,0 chrXI 315953 . G A 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.099;DP=109;Dels=0.00;FS=2.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:866,0,1268 chrXI 316100 . A T 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.451;DP=101;Dels=0.00;FS=2.890;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:830,0,1314 chrXI 316142 . T C 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.01;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2783,279,0 chrXI 316198 . C T 2065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.14;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2098,222,0 chrXI 316238 . A T 2004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=137.2442;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.18;MQ0=0;QD=24.74;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2037,222,0 chrXI 316252 . T C 409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.154;DP=76;Dels=0.00;FS=17.017;HaplotypeScore=71.5995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:439,0,957 chrXI 316255 . C T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.159;DP=76;Dels=0.00;FS=17.017;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.261;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,47:76:99:1007,0,466 chrXI 316332 . A G 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.41;MQ0=1;QD=23.97;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2838,300,0 chrXI 316346 . A G 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.94;MQ0=1;QD=24.34;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2832,297,0 chrXI 316362 . C A 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.95;MQ0=1;QD=25.08;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2942,300,0 chrXI 316499 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.734;DP=128;Dels=0.00;FS=10.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.874;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1387,0,1212 chrXI 316511 . G A 2364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.308;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.813;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2397,237,0 chrXI 316643 . C T 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.714;DP=108;Dels=0.00;FS=9.134;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=2.339;QD=8.84;ReadPosRankSum=2.592;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:985,0,1219 chrXI 316707 . A G 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3044,321,0 chrXI 316845 . A G 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5509;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3037,318,0 chrXI 317019 . A G 2456 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2489,282,0 chrXI 317059 . G A 646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.997;DP=72;Dels=0.00;FS=0.896;HaplotypeScore=72.4866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.006;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,36:72:99:676,0,715 chrXI 317215 . T A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.710;DP=120;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=2.191;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.465;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1163,0,1286 chrXI 317287 . C A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.797;DP=142;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.580;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1286,0,1646 chrXI 317370 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.890;DP=116;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=3.5441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.706;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1326,0,993 chrXI 317375 . A G 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.31;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3137,327,0 chrXI 317506 . A T 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;DP=94;Dels=0.00;FS=1.673;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.995;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:938,0,1001 chrXI 317534 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.480;DP=124;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=4.6317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1250,0,1310 chrXI 317549 . C T 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.69;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3264,336,0 chrXI 317644 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.494;DP=120;Dels=0.00;FS=4.520;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1132,0,1344 chrXI 317671 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.472;DP=122;Dels=0.00;FS=6.913;HaplotypeScore=2.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.869;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1253,0,1312 chrXI 317712 . C G 2479 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2512,264,0 chrXI 317755 . A G 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.112;DP=107;Dels=0.00;FS=2.482;HaplotypeScore=3.8287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:862,0,1288 chrXI 318485 . A T 1860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.767;DP=164;Dels=0.00;FS=18.041;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,90:164:99:1890,0,1604 chrXI 318519 . A G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.201;DP=136;Dels=0.00;FS=10.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.973;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1427,0,1357 chrXI 318978 . C T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.790;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.651;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1223,0,1227 chrXI 319011 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.682;DP=154;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.907;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1477,0,1601 chrXI 319054 . C T 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.198;DP=163;Dels=0.00;FS=10.984;HaplotypeScore=3.1539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,80:163:99:1641,0,1704 chrXI 319143 . T C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.321;DP=134;Dels=0.00;FS=7.838;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1143,0,1530 chrXI 320400 . A G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.116;DP=133;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=4.9167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=2.502;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.218;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1418,0,1334 chrXI 320676 . T C 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.738;DP=145;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.771;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1675,0,1439 chrXI 320943 . G A 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.681;DP=173;Dels=0.00;FS=13.338;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.296;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,87:173:99:1845,0,1784 chrXI 321333 . A G 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.493;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.895;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,89:172:99:1785,0,1658 chrXI 321619 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.168;DP=135;Dels=0.00;FS=4.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.451;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1511,0,1359 chrXI 321711 . C T 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.447;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7420;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.987;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:3805,361,0 chrXI 322024 . C A 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.313;DP=147;Dels=0.00;FS=5.002;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=1;MQRankSum=0.630;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.521;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1570,0,1463 chrXI 322331 . G A 718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.382;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:748,0,846 chrXI 322379 . G A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.932;DP=83;Dels=0.00;FS=4.330;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.848;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:850,0,945 chrXI 322391 . C A 751.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;DP=82;Dels=0.00;FS=3.126;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,37:82:99:781,0,1009 chrXI 322437 . C G 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;DP=93;Dels=0.00;FS=7.386;HaplotypeScore=2.5946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.842;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:917,0,1006 chrXI 322497 . C T 620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.028;DP=61;Dels=0.00;FS=17.975;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,30:61:99:650,0,605 chrXI 323019 . A T 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.95;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3348,351,0 chrXI 323027 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.398;DP=130;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.028;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1237,0,1406 chrXI 323380 . C T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.103;DP=138;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=-0.153;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.872;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1506,0,1314 chrXI 323565 . C T 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.452;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.039;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1668,0,1616 chrXI 323761 . G A 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.498;DP=103;Dels=0.00;FS=8.104;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.599;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1159,0,911 chrXI 323867 . A T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.237;DP=151;Dels=0.00;FS=5.912;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.961;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1492,0,1780 chrXI 323933 . C T 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.754;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,83:165:99:1782,0,1638 chrXI 324286 . T C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.631;DP=153;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,63:153:99:1155,0,1893 chrXI 324419 . G A 4001.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4001,403,0 chrXI 324505 . T G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.042;DP=156;Dels=0.00;FS=1.271;HaplotypeScore=2.6132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=7.71;ReadPosRankSum=-3.651;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1232,0,1772 chrXI 324658 . T A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.370;DP=151;Dels=0.00;FS=5.927;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.881;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1471,0,1639 chrXI 324673 . A G 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.453;DP=155;Dels=0.00;FS=3.736;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.116;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1492,0,1579 chrXI 324697 . T C 1754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.674;DP=164;Dels=0.00;FS=1.949;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.340;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,88:164:99:1784,0,1518 chrXI 324820 . G C 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.942;DP=167;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=9.83;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,85:167:99:1672,0,1549 chrXI 324885 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.748;DP=145;Dels=0.00;FS=7.312;HaplotypeScore=4.2588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.337;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.737;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1389,0,1611 chrXI 325126 . A T 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1098,0,932 chrXI 325158 . C G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;DP=116;Dels=0.00;FS=2.823;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.012;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1337,0,1043 chrXI 325263 . C T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.071;DP=119;Dels=0.00;FS=4.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1372,0,1067 chrXI 325505 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.751;DP=108;Dels=0.00;FS=17.003;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=0.321;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.212;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1064,0,1108 chrXI 326734 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.553;DP=122;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1201,0,1203 chrXI 326759 . T G 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2811,294,0 chrXI 326798 . G A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.089;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.236;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1382,0,1051 chrXI 327569 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.144;DP=153;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.219;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1387,0,1811 chrXI 327764 . A T 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.844;DP=151;Dels=0.00;FS=8.892;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.32;MQ0=0;MQRankSum=2.057;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.044;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,90:151:99:1401,0,843 chrXI 328028 . C G 4385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:172:99:4385,477,0 chrXI 328619 . A T 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3703,387,0 chrXI 328709 . G C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.163;DP=132;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1312,0,1239 chrXI 329085 . G A 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=175;Dels=0.00;FS=10.955;HaplotypeScore=8.6241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.483;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,79:175:99:1500,0,1967 chrXI 329572 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.752;DP=136;Dels=0.00;FS=7.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.336;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1400,0,1321 chrXI 329675 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.477;DP=138;Dels=0.00;FS=12.512;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=2.542;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1397,0,1401 chrXI 329802 . G A 2273 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2306,249,0 chrXI 329813 . T C 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.765;DP=77;Dels=0.00;FS=10.373;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:805,0,797 chrXI 329895 . A T 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.299;DP=91;Dels=0.00;FS=1.778;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=9.22;ReadPosRankSum=-2.655;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:869,0,988 chrXI 330549 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.899;DP=149;Dels=0.00;FS=2.127;HaplotypeScore=5.9171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.651;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1531,0,1489 chrXI 330610 . C A 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3524,360,0 chrXI 330692 . G A 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:116:99:1057,0,1339 chrXI 330865 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.263;DP=112;Dels=0.00;FS=5.819;HaplotypeScore=2.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.787;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1221,0,1080 chrXI 331388 . A G 2571 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=23.81;ReadPosRankSum=1.476;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2604,271,0 chrXI 331868 . T G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.591;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.208;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1114,0,943 chrXI 332101 . A G 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.027;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=9.79;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1430,0,1383 chrXI 332454 . A G 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.339;DP=118;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1193,0,1264 chrXI 332476 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.585;DP=114;Dels=0.00;FS=3.441;HaplotypeScore=6.3985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.017;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1178,0,1187 chrXI 332863 . A C 686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.698;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,38:90:99:716,0,1129 chrXI 332964 . G A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.701;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.684;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,52:95:99:1112,0,799 chrXI 332967 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.218;DP=100;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.122;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1181,0,809 chrXI 333057 . C T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.072;DP=123;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=1;MQRankSum=1.664;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.592;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1246,0,1350 chrXI 333073 . T C 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.507;DP=117;Dels=0.00;FS=2.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.494;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1123,0,1378 chrXI 333079 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.484;DP=116;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1128,0,1382 chrXI 333397 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.698;DP=109;Dels=0.00;FS=1.570;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=2.494;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1271,0,874 chrXI 333502 . G A 630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.489;DP=85;Dels=0.00;FS=9.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,33:85:99:660,0,1083 chrXI 333556 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.182;DP=117;Dels=0.00;FS=3.455;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:117:99:1190,0,1010 chrXI 333577 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.407;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.771;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1136,0,1028 chrXI 333609 . C T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;DP=131;Dels=0.00;FS=9.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.273;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1141,0,1462 chrXI 334135 . C A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;DP=123;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1055,0,1347 chrXI 334735 . C T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.262;DP=137;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.944;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1506,0,1253 chrXI 334980 . T C 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.849;DP=124;Dels=0.00;FS=1.607;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.854;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1434,0,1145 chrXI 334995 . G A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.279;DP=118;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.939;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:1440,0,1024 chrXI 335143 . C G 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;DP=36;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=9.9321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=0.31;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-3.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:41:41,0,196 chrXI 335281 . A G 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.958;DP=140;Dels=0.00;FS=7.204;HaplotypeScore=3.3591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.885;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1419,0,1388 chrXI 335312 . G A 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.533;DP=142;Dels=0.00;FS=2.356;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.409;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1659,0,1162 chrXI 335383 . C T 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.995;DP=144;Dels=0.00;FS=2.189;HaplotypeScore=5.3516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.557;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1206,0,1497 chrXI 335408 . T G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.813;DP=144;Dels=0.00;FS=9.160;HaplotypeScore=2.5946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:144:99:1315,0,1654 chrXI 335429 . C T 3562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.63;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3562,378,0 chrXI 335465 . G C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;DP=123;Dels=0.00;FS=2.375;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.937;QD=9.53;ReadPosRankSum=2.177;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1202,0,1270 chrXI 335606 . A G 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.195;DP=178;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=3.8400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=1;MQRankSum=-0.289;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,91:178:99:1815,0,1910 chrXI 335869 . T G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.919;DP=126;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.074;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1202,0,1301 chrXI 336012 . C T 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.370;DP=123;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.315;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:972,0,1463 chrXI 336028 . T C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.978;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.167;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,52:124:99:924,0,1484 chrXI 336058 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.296;DP=150;Dels=0.00;FS=3.862;HaplotypeScore=4.9275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1324,0,1682 chrXI 336059 . T C 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.875;DP=150;Dels=0.00;FS=3.862;HaplotypeScore=4.9275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1249,0,1738 chrXI 336133 . C T 1777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.043;DP=147;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.261;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,85:147:99:1807,0,1172 chrXI 336232 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.861;DP=105;Dels=0.00;FS=3.856;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.537;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1234,0,947 chrXI 336457 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;DP=134;Dels=0.00;FS=4.218;HaplotypeScore=6.3554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.924;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.196;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1271,0,1399 chrXI 336540 . G A 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.722;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1227,0,925 chrXI 336698 . G A 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.613;DP=113;Dels=0.00;FS=5.965;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:959,0,1306 chrXI 337206 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.608;DP=134;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.215;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1351,0,1381 chrXI 337365 . T G 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;DP=151;Dels=0.00;FS=2.050;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1438,0,1679 chrXI 337387 . T A 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.978;DP=155;Dels=0.00;FS=6.988;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.056;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.381;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1520,0,1600 chrXI 337485 . C T 78.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;DP=109;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=5.8114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=0.72;ReadPosRankSum=-4.331;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,14:109:99:108,0,1252 chrXI 337486 . T A 53.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;DP=109;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=4.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=0.49;ReadPosRankSum=-4.550;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,14:109:83:83,0,1298 chrXI 337513 . G T 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.325;DP=92;Dels=0.00;FS=14.615;HaplotypeScore=7.9458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-5.571;QD=0.23;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:51:51,0,1124 chrXI 337581 . C T 73.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.775;DP=98;Dels=0.02;FS=4.776;HaplotypeScore=9.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.50;MQ0=0;MQRankSum=-6.958;QD=0.74;ReadPosRankSum=1.269;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,31:96:99:103,0,1340 chrXI 337585 . G T 84.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.967;DP=95;Dels=0.00;FS=6.452;HaplotypeScore=11.4255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQ0=0;MQRankSum=-6.663;QD=0.88;ReadPosRankSum=1.372;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,33:95:99:114,0,1263 chrXI 337772 . T C 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3194,333,0 chrXI 337857 . T C 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.745;DP=139;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=3.5855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1409,0,1555 chrXI 338019 . A T 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;DP=97;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1137,0,920 chrXI 338045 . A G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.742;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1173,0,1227 chrXI 338056 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.580;DP=116;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=3.9113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.995;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1199,0,1240 chrXI 338231 . G A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.593;DP=127;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:127:99:1174,0,1481 chrXI 338713 . C G 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.398;DP=146;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1673,0,1305 chrXI 338730 . A T 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.044;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,54:135:99:1099,0,1731 chrXI 338893 . G A 1847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.92;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1880,201,0 chrXI 339113 . T C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.290;DP=127;Dels=0.00;FS=4.313;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=2.285;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.328;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1099,0,1538 chrXI 339180 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.129;DP=150;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=3.2245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.893;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1461,0,1536 chrXI 339266 . T C 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.212;DP=121;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.269;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1028,0,1461 chrXI 339482 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.014;DP=116;Dels=0.00;FS=3.485;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.862;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1155,0,1239 chrXI 339536 . A G 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3423,348,0 chrXI 339765 . C G 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.730;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.573;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,48:124:99:898,0,1550 chrXI 340007 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.827;DP=127;Dels=0.00;FS=11.138;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1032,0,1428 chrXI 340064 . A G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.342;DP=149;Dels=0.00;FS=2.911;HaplotypeScore=2.8277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.655;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1425,0,1575 chrXI 340155 . T G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.170;DP=134;Dels=0.01;FS=5.299;HaplotypeScore=12.8641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.233;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1203,0,1605 chrXI 340197 . T G 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.356;DP=150;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=2.105;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1563,0,1531 chrXI 340231 . G C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3624,381,0 chrXI 340235 . A G 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.527;DP=144;Dels=0.00;FS=5.357;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.816;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.536;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1419,0,1520 chrXI 340285 . G C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.149;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1307,0,1511 chrXI 340583 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;DP=127;Dels=0.00;FS=3.305;HaplotypeScore=7.3519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.186;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1231,0,1320 chrXI 340721 . G A 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.052;DP=129;Dels=0.00;FS=3.479;HaplotypeScore=12.4677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=1;MQRankSum=-1.261;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:829,0,1070 chrXI 340770 . T A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.250;DP=141;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1425,0,1372 chrXI 340783 . C T 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.324;DP=164;Dels=0.00;FS=3.016;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.806;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:1774,0,1481 chrXI 340811 . T C 4302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4302,450,0 chrXI 341413 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;DP=124;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.384;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1233,0,1278 chrXI 341641 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.507;DP=112;Dels=0.00;FS=3.481;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1135,0,1190 chrXI 341753 . A T 3881.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.039;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8751;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=25.87;ReadPosRankSum=1.709;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3881,390,0 chrXI 342298 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.677;DP=141;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1358,0,1544 chrXI 342308 . G C 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.238;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.893;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,79:162:99:1543,0,1665 chrXI 342445 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.737;DP=144;Dels=0.00;FS=3.023;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.664;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:144:99:1198,0,1740 chrXI 342529 . C T 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.917;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.840;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:985,0,1520 chrXI 342813 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.830;DP=105;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=2.3039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=2.033;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.467;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1155,0,976 chrXI 342972 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.598;DP=110;Dels=0.00;FS=4.684;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.743;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.713;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1040,0,1121 chrXI 343095 . A C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.000;DP=104;Dels=0.00;FS=15.166;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.769;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1029,0,1128 chrXI 343212 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.694;DP=109;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.556;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1162,0,902 chrXI 343231 . C G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.836;DP=110;Dels=0.00;FS=6.356;HaplotypeScore=2.9544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.411;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1215,0,968 chrXI 343371 . A G 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.942;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.242;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:972,0,1598 chrXI 343477 . C T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.098;DP=118;Dels=0.00;FS=4.581;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.114;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1446,0,1036 chrXI 343519 . T C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.187;DP=121;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,74:121:99:1518,0,968 chrXI 343528 . C A 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.195;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.169;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,75:123:99:1665,0,910 chrXI 343642 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.074;DP=130;Dels=0.00;FS=3.185;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1427,0,1192 chrXI 343772 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;DP=116;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=4.7980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.150;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1373,0,1012 chrXI 343793 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;DP=132;Dels=0.00;FS=4.131;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.419;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1360,0,1339 chrXI 343926 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.641;DP=149;Dels=0.00;FS=19.768;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1494,0,1618 chrXI 343932 . G A 1796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.164;DP=161;Dels=0.00;FS=18.543;HaplotypeScore=6.4147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=11.16;ReadPosRankSum=-2.831;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1826,0,1462 chrXI 343968 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.213;DP=149;Dels=0.00;FS=1.291;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.769;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1461,0,1660 chrXI 344089 . T C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.670;DP=124;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1377,0,1234 chrXI 344106 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.286;DP=115;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1304,0,1070 chrXI 344217 . G A 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.417;DP=142;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.040;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,57:142:99:1038,0,1682 chrXI 344242 . G A 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.048;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.273;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:989,0,1489 chrXI 344249 . C A 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.48;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2887,300,0 chrXI 344412 . A G 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.557;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.161;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1354,0,1416 chrXI 344465 . T C 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;DP=132;Dels=0.00;FS=4.246;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.301;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1420,0,1356 chrXI 344684 . C T 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.902;DP=137;Dels=0.00;FS=3.236;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.281;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1241,0,1601 chrXI 344692 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;DP=126;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.887;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1124,0,1497 chrXI 345510 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.401;DP=118;Dels=0.00;FS=3.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.343;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1222,0,1212 chrXI 345623 . T C 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.402;DP=131;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1537,0,1153 chrXI 347287 . T G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.219;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.222;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1226,0,1074 chrXI 347700 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.244;DP=126;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1154,0,1389 chrXI 347878 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.719;DP=112;Dels=0.00;FS=3.493;HaplotypeScore=3.3502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1064,0,1251 chrXI 348083 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.201;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.724;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1135,0,1028 chrXI 348351 . C T 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.933;DP=118;Dels=0.00;FS=3.711;HaplotypeScore=12.6901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.581;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1557,0,755 chrXI 348711 . C T 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.684;DP=93;Dels=0.00;FS=2.741;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.894;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1122,0,831 chrXI 348805 . C T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=122;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=4.6977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.774;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1404,0,1170 chrXI 348900 . G A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.372;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.428;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1181,0,1173 chrXI 349155 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;DP=107;Dels=0.00;FS=13.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=2.205;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.982;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1190,0,1056 chrXI 349504 . A G 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=23.92;ReadPosRankSum=1.573;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3190,339,0 chrXI 349680 . A C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.086;DP=127;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1366,0,1204 chrXI 349875 . C T 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3912,388,0 chrXI 349920 . C T 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.286;DP=141;Dels=0.00;FS=2.125;HaplotypeScore=3.5488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.385;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1365,0,1404 chrXI 349935 . G A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.500;DP=122;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.517;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.163;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1133,0,1451 chrXI 349947 . A G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.991;DP=122;Dels=0.00;FS=5.599;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.838;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1108,0,1376 chrXI 349964 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.213;DP=113;Dels=0.00;FS=6.073;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.393;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1150,0,1123 chrXI 350022 . A G 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.691;DP=106;Dels=0.00;FS=4.867;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.105;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.398;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1025,0,1174 chrXI 350428 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;DP=112;Dels=0.00;FS=1.548;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.131;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1032,0,1147 chrXI 350464 . A T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.552;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.173;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1399,0,1180 chrXI 350473 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;DP=125;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1265,0,1231 chrXI 350485 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.818;DP=124;Dels=0.00;FS=3.337;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.403;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1175,0,1335 chrXI 350584 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.030;DP=138;Dels=0.00;FS=6.313;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1374,0,1378 chrXI 350701 . T G 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3801,402,0 chrXI 350761 . C A 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.565;DP=140;Dels=0.00;FS=3.107;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.805;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1280,0,1423 chrXI 351078 . T A 3687.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3687,393,0 chrXI 351443 . C A 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.081;DP=164;Dels=0.00;FS=3.700;HaplotypeScore=4.7383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.065;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,83:164:99:1682,0,1449 chrXI 351518 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.239;DP=136;Dels=0.00;FS=3.199;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1246,0,1467 chrXI 351593 . C A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;DP=131;Dels=0.00;FS=2.557;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1314,0,1343 chrXI 351752 . A G 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2769,309,0 chrXI 351755 . A G 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;DP=110;Dels=0.00;FS=9.195;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.130;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:110:99:1096,0,1118 chrXI 351788 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.241;DP=108;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.444;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1277,0,986 chrXI 351869 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.123;DP=124;Dels=0.00;FS=2.326;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1257,0,1302 chrXI 351887 . T C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.112;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.456;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1119,0,1167 chrXI 351893 . C A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.809;DP=116;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1181,0,1259 chrXI 352136 . G A 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.629;DP=129;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=5.3830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.991;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,47:129:99:842,0,1787 chrXI 352346 . T A 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3478,351,0 chrXI 352550 . A G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.031;DP=139;Dels=0.00;FS=7.734;HaplotypeScore=2.6457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1396,0,1499 chrXI 352674 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.189;DP=138;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.402;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1259,0,1659 chrXI 353056 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.321;DP=126;Dels=0.00;FS=5.695;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.712;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1071,0,1435 chrXI 353091 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.196;DP=142;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1416,0,1519 chrXI 353277 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.392;DP=143;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.652;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1451,0,1533 chrXI 353409 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.308;DP=116;Dels=0.00;FS=3.617;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1030,0,1359 chrXI 353417 . C T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.253;DP=113;Dels=0.00;FS=2.603;HaplotypeScore=4.4401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:988,0,1337 chrXI 353525 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.207;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.447;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1394,0,1446 chrXI 353672 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.230;DP=136;Dels=0.00;FS=3.327;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.463;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1367,0,1345 chrXI 353705 . G A 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.382;DP=151;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1703,0,1342 chrXI 353786 . G C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;DP=142;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=4.9570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.850;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1368,0,1312 chrXI 354073 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.303;DP=122;Dels=0.00;FS=7.184;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.672;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1168,0,1111 chrXI 354092 . T C 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.700;DP=109;Dels=0.00;FS=4.925;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=9.50;ReadPosRankSum=-3.027;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1066,0,1108 chrXI 354272 . T C 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;DP=158;Dels=0.00;FS=4.893;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.214;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:158:99:1708,0,1544 chrXI 354293 . G A 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;DP=171;Dels=0.00;FS=5.975;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.642;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,91:171:99:1882,0,1662 chrXI 354596 . C T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.316;DP=128;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1291,0,1303 chrXI 354752 . C T 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.830;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,87:148:99:1747,0,1199 chrXI 354797 . T C 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.352;DP=135;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.352;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:1700,0,1014 chrXI 354822 . C T 2064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.554;DP=159;Dels=0.00;FS=2.023;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.128;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,95:159:99:2094,0,1145 chrXI 355074 . C A 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.305;DP=149;Dels=0.00;FS=5.988;HaplotypeScore=3.6199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.940;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.663;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1620,0,1486 chrXI 355082 . C A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.286;DP=138;Dels=0.00;FS=2.153;HaplotypeScore=6.7647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.032;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1524,0,1316 chrXI 355096 . G A 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.481;DP=103;Dels=0.00;FS=2.684;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=9.78;ReadPosRankSum=2.231;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1037,0,1035 chrXI 355103 . G C 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.740;DP=99;Dels=0.00;FS=3.982;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.645;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.645;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1006,0,930 chrXI 355110 . G A 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.619;DP=100;Dels=0.00;FS=5.201;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.077;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1059,0,1024 chrXI 355187 . A G 70.42 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.995;DP=135;Dels=0.00;FS=3.775;HaplotypeScore=135.1213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.045;QD=0.52;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-5.142e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,6:135:7:100,0,7 chrXI 355203 . A C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.947;DP=152;Dels=0.00;FS=6.320;HaplotypeScore=10.8693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=6.039;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.510;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:152:99:1293,0,1445 chrXI 355225 . A G 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.982;DP=123;Dels=0.00;FS=15.498;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-6.397;QD=6.23;ReadPosRankSum=2.035;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:796,0,1444 chrXI 355235 . C T 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.736;DP=117;Dels=0.00;FS=14.427;HaplotypeScore=1.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=-5.433;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.535;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:789,0,1384 chrXI 355400 . T G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.354;DP=138;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.711;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1394,0,1480 chrXI 355411 . C T 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5082;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.83;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3769,393,0 chrXI 355412 . G A 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.939;DP=145;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=3.5082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.864;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:145:99:1544,0,1423 chrXI 355436 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.371;DP=154;Dels=0.00;FS=2.864;HaplotypeScore=4.4372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=2.914;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1362,0,1711 chrXI 355474 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.790;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1403,0,1160 chrXI 355535 . C G 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.849;DP=146;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1550,0,1269 chrXI 355543 . A G 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.541;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.004;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1356,0,1253 chrXI 355752 . C G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3113,345,0 chrXI 355989 . G A 4460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=25.78;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:4460,445,0 chrXI 356064 . G C 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.68;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2736,282,0 chrXI 356078 . T A 883.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.303;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.879;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:913,0,1110 chrXI 356084 . G A 824.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.540;DP=89;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.50;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.366;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:854,0,970 chrXI 356086 . A G 829.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.711;DP=83;Dels=0.00;FS=4.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.891;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:859,0,853 chrXI 356125 . T G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.842;DP=137;Dels=0.00;FS=5.236;HaplotypeScore=3.2986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=7.85;ReadPosRankSum=-2.653;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1105,0,1646 chrXI 356171 . G A 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4215;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.32;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3213,333,0 chrXI 356199 . A G 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.92;MQ0=0;QD=25.51;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3247,345,0 chrXI 356200 . C A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.272;DP=126;Dels=0.00;FS=10.938;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.458;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1275,0,1336 chrXI 356276 . C T 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2954,297,0 chrXI 356343 . T C 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=24.09;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2683,288,0 chrXI 356360 . G C 2547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=24.49;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2580,276,0 chrXI 356361 . T C 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.610;DP=104;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.635;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:883,0,1198 chrXI 356492 . A G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.571;DP=112;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=8.5159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1071,0,1017 chrXI 356613 . A T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.024;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=10.77;ReadPosRankSum=2.551;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1624,0,1476 chrXI 356861 . A C 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.776;DP=139;Dels=0.00;FS=7.852;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,80:139:99:1661,0,1177 chrXI 356876 . A G 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3559,387,0 chrXI 357243 . C T 1863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.106;DP=163;Dels=0.00;FS=1.264;HaplotypeScore=7.8973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.311;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:163:99:1893,0,1299 chrXI 357380 . T C 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3239,342,0 chrXI 357712 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;DP=132;Dels=0.00;FS=6.519;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.113;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1381,0,1287 chrXI 357746 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.906;DP=126;Dels=0.00;FS=18.745;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.095;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1399,0,1094 chrXI 357892 . C T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.951;DP=128;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.208;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1393,0,1279 chrXI 357937 . G C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;DP=106;Dels=0.00;FS=11.434;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1111,0,927 chrXI 357992 . A G 967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.680;DP=91;Dels=0.00;FS=4.052;HaplotypeScore=48.2530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=-1.433;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:51,40:91:80:1000,80,0 chrXI 358014 . T A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.726;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=-0.213;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:973,0,834 chrXI 358024 . A C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.009;DP=117;Dels=0.00;FS=5.134;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=-0.179;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.610;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1352,0,960 chrXI 358489 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.641;DP=144;Dels=0.00;FS=9.214;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1133,0,721 chrXI 358579 . T A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.394;DP=134;Dels=0.00;FS=2.188;HaplotypeScore=2.5566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1439,0,1356 chrXI 358714 . G A 2430 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2463,252,0 chrXI 358834 . C T 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2910,288,0 chrXI 358845 . A G 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.433;DP=96;Dels=0.00;FS=1.674;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.488;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1021,0,973 chrXI 359142 . T C 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3172,336,0 chrXI 359162 . A C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.647;DP=137;Dels=0.00;FS=4.078;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1239,0,1566 chrXI 359596 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.328;DP=114;Dels=0.00;FS=8.825;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.609;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1253,0,1057 chrXI 359764 . C T 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.447;DP=97;Dels=0.00;FS=11.830;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.642;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:872,0,1180 chrXI 359850 . T C 2446 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;QD=25.22;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2479,267,0 chrXI 359854 . G A 2488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.29;MQ0=0;QD=25.39;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2521,270,0 chrXI 359868 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.431;DP=105;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=9.05;ReadPosRankSum=-2.285;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:980,0,1167 chrXI 359874 . A G 2627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2660,291,0 chrXI 359908 . A G 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.555;DP=110;Dels=0.00;FS=4.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.365;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:899,0,1376 chrXI 359938 . G A 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.861;DP=106;Dels=0.00;FS=3.639;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.286;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:986,0,1184 chrXI 360006 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.919;DP=138;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.415;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1415,0,1412 chrXI 360238 . G C 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3130,327,0 chrXI 360304 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.530;DP=110;Dels=0.00;FS=0.845;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1290,0,1043 chrXI 360391 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.460;DP=137;Dels=0.00;FS=5.188;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1253,0,1485 chrXI 360863 . A T 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.419;DP=110;Dels=0.00;FS=5.910;HaplotypeScore=3.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.713;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1077,0,1197 chrXI 360902 . T A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.901;DP=131;Dels=0.00;FS=3.176;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.515;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:131:99:1173,0,1567 chrXI 360927 . C T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.301;DP=137;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=3.4106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.694;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:1062,0,1724 chrXI 360932 . C T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.343;DP=140;Dels=0.00;FS=3.084;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.152;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.384;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1059,0,1712 chrXI 360940 . C T 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.531;DP=138;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1075,0,1676 chrXI 361385 . T C 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3058,321,0 chrXI 361475 . T C 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2943,312,0 chrXI 361482 . T C 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2793,294,0 chrXI 361682 . G A 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.84;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3468,354,0 chrXI 361703 . G A 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;QD=25.95;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2862,300,0 chrXI 361774 . G T 2461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.06;MQ0=0;QD=25.64;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2494,258,0 chrXI 361800 . T C 2299 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.05;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2332,246,0 chrXI 361807 . A G 2411 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.97;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2444,264,0 chrXI 361812 . G A 2375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.63;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2408,246,0 chrXI 361861 . T G 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=24.82;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2714,276,0 chrXI 361878 . A C 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2797,291,0 chrXI 361973 . T C 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2743,282,0 chrXI 362017 . A C 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3141,330,0 chrXI 362034 . T C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.391;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.563;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1215,0,1290 chrXI 362074 . T C 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.820;DP=111;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=2.5939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.077;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1086,0,1142 chrXI 362101 . T C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.389;DP=144;Dels=0.00;FS=3.062;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.516;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1258,0,1482 chrXI 362114 . T C 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=24.12;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,142:144:99:3473,344,0 chrXI 362157 . T C 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.627;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1399,0,1515 chrXI 362170 . G T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.212;DP=151;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.529;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1285,0,1550 chrXI 362171 . A G 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.814;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.32;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=23.52;ReadPosRankSum=0.975;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:152:99:3575,384,0 chrXI 362231 . T C 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.888;DP=128;Dels=0.00;FS=5.159;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1240,0,1330 chrXI 362247 . C T 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.23;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3699,375,0 chrXI 362299 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.961;DP=144;Dels=0.00;FS=2.945;HaplotypeScore=3.6794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.165;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1634,0,1277 chrXI 362322 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.124;DP=111;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1180,0,1113 chrXI 362641 . G T 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.582;DP=104;Dels=0.00;FS=4.954;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=2.080;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.627;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1278,0,853 chrXI 362657 . A G 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.875;DP=119;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=7.53;ReadPosRankSum=-1.747;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:926,0,1532 chrXI 362665 . G A 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.442;DP=119;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:119:99:909,0,1532 chrXI 362812 . G A 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.970;DP=126;Dels=0.00;FS=8.131;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.911;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:126:99:1280,0,1275 chrXI 363248 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.041;DP=83;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.024;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,52:82:99:1146,0,512 chrXI 363372 . T C 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.033;DP=83;Dels=0.00;FS=0.845;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:837,0,924 chrXI 363449 . T C 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2523,255,0 chrXI 363791 . A G 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.685;DP=129;Dels=0.00;FS=7.970;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1354,0,1343 chrXI 363812 . G C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.902;DP=128;Dels=0.00;FS=11.225;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.805;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1319,0,1275 chrXI 363953 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.129;DP=111;Dels=0.00;FS=4.681;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=0.317;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1093,0,1182 chrXI 364133 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.819;DP=129;Dels=0.00;FS=5.435;HaplotypeScore=4.1358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=0.261;QD=8.88;ReadPosRankSum=-2.554;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1176,0,1289 chrXI 364194 . C T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.417;DP=88;Dels=0.00;FS=4.467;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.210;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,49:88:99:1003,0,745 chrXI 364367 . G A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.916;DP=146;Dels=0.01;FS=2.158;HaplotypeScore=7.6663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:145:99:1205,0,1665 chrXI 364384 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.935;DP=148;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=5.5088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.168;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,64:148:99:1236,0,1819 chrXI 364488 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;DP=110;Dels=0.00;FS=3.279;HaplotypeScore=150.4738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1242,0,995 chrXI 364489 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.434;DP=110;Dels=0.00;FS=3.279;HaplotypeScore=150.4738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1268,0,1012 chrXI 364568 . T C 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.506;DP=93;Dels=0.00;FS=1.763;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.804;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:699,0,1051 chrXI 364596 . T A 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3039,312,0 chrXI 364605 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.994;DP=114;Dels=0.00;FS=3.520;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.045;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1078,0,1250 chrXI 364621 . G A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.340;DP=117;Dels=0.00;FS=1.596;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.025;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:992,0,1382 chrXI 364623 . C T 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.600;DP=118;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.577;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.691;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1004,0,1263 chrXI 364711 . A T 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1600,0,1692 chrXI 364928 . G A 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.678;DP=138;Dels=0.00;FS=9.151;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:138:99:1165,0,1726 chrXI 364951 . T G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.484;DP=127;Dels=0.00;FS=8.448;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.836;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:1071,0,1617 chrXI 364965 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.861;DP=131;Dels=0.00;FS=8.202;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.567;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1122,0,1611 chrXI 365020 . C G 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;DP=130;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.202;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1131,0,1475 chrXI 365043 . C T 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.605;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.871;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,82:142:99:1758,0,1142 chrXI 365138 . A G 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.520;DP=179;Dels=0.00;FS=0.547;HaplotypeScore=7.2319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=1;MQRankSum=0.581;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,86:179:99:1665,0,1954 chrXI 365167 . C A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=156;Dels=0.00;FS=2.055;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=1;MQRankSum=1.145;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.690;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1254,0,1738 chrXI 365209 . G A 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.169;DP=157;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=10.0095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=1.217;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.816;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1574,0,1628 chrXI 365224 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.152;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=1;MQRankSum=0.801;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.353;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1272,0,1460 chrXI 365364 . A C 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.45;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2934,318,0 chrXI 365381 . A G 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.72;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2678,303,0 chrXI 365453 . C G 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3822,408,0 chrXI 365859 . G A 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3634,366,0 chrXI 365937 . G A 4208.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4208,427,0 chrXI 365994 . C A 4434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4434,457,0 chrXI 366024 . A C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.690;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.203;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:1233,0,1897 chrXI 366045 . T C 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3619,387,0 chrXI 366064 . C T 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.937e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4114,424,0 chrXI 366118 . G A 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.372;DP=150;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.467;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1718,0,1295 chrXI 366156 . A G 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3577,363,0 chrXI 366174 . G C 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.568;DP=128;Dels=0.00;FS=3.114;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=24.14;ReadPosRankSum=1.268;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3123,327,0 chrXI 366213 . C T 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3807,388,0 chrXI 366261 . G T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.545;DP=135;Dels=0.00;FS=3.124;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.029;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1383,0,1396 chrXI 366486 . T C 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2987,324,0 chrXI 366579 . C T 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.642;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=21.06;ReadPosRankSum=1.053;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3255,307,0 chrXI 366581 . T C 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=20.27;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3134,327,0 chrXI 366681 . A C 2007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=1;QD=21.13;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2040,225,0 chrXI 366732 . A C 1981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=1;QD=21.07;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:94:99:2014,216,0 chrXI 366804 . T C 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3100,315,0 chrXI 366808 . T C 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3187,315,0 chrXI 366840 . C T 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3242,330,0 chrXI 366957 . C T 2357 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2390,237,0 chrXI 366981 . G A 2067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.52;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2100,213,0 chrXI 367128 . A T 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=1;QD=25.81;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2949,297,0 chrXI 367140 . G C 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.310;DP=116;Dels=0.00;FS=3.393;HaplotypeScore=2.5151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=1;MQRankSum=1.325;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.213;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1088,0,1174 chrXI 367251 . A G 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3861,402,0 chrXI 367407 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.584;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1148,0,1540 chrXI 367442 . C G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.483;DP=152;Dels=0.00;FS=2.021;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=8.66;ReadPosRankSum=-3.076;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1347,0,1425 chrXI 367533 . C T 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.34;MQ0=0;QD=26.11;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3525,363,0 chrXI 367554 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.444;DP=121;Dels=0.00;FS=6.155;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=2.410;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1295,0,1185 chrXI 367626 . T C 2488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2521,270,0 chrXI 367701 . A G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3126,345,0 chrXI 367753 . A G 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.19;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3271,363,0 chrXI 367768 . C G 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.15;MQ0=0;QD=22.51;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2982,330,0 chrXI 367787 . T C 2215 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.60;MQ0=0;QD=22.37;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2248,246,0 chrXI 367788 . C T 2268 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.60;MQ0=0;QD=22.91;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2301,246,0 chrXI 367790 . G A 2382 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.98;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2415,255,0 chrXI 367833 . A T 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.58;MQ0=0;QD=23.00;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3115,330,0 chrXI 367892 . T C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.327;DP=143;Dels=0.00;FS=10.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1464,0,1449 chrXI 367941 . G A 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.569;DP=146;Dels=0.00;FS=6.153;HaplotypeScore=2.7487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:146:99:1557,0,1403 chrXI 367950 . T C 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3458,366,0 chrXI 368071 . C T 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3693,367,0 chrXI 368145 . C T 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.113;DP=164;Dels=0.00;FS=4.617;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,84:164:99:1792,0,1507 chrXI 368193 . A G 4657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;DP=180;Dels=0.00;FS=3.108;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=25.87;ReadPosRankSum=1.520;SB=-2.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,179:180:99:4657,480,0 chrXI 368205 . G C 4396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4396,486,0 chrXI 368244 . G A 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.181;DP=160;Dels=0.00;FS=17.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.818;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1603,0,1691 chrXI 368278 . T C 4079.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=23.58;SB=-2.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4079,426,0 chrXI 368313 . T C 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.086;DP=179;Dels=0.00;FS=1.847;HaplotypeScore=3.5555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.479;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,90:179:99:1730,0,1846 chrXI 368418 . G A 1909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.149;DP=173;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=7.3891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.933;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,95:173:99:1939,0,1443 chrXI 368459 . C A 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.905;DP=151;Dels=0.00;FS=3.911;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1527,0,1580 chrXI 368502 . G T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.527;DP=151;Dels=0.00;FS=3.964;HaplotypeScore=2.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1537,0,1392 chrXI 368644 . G A 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.570;DP=146;Dels=0.00;FS=4.181;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.025;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1562,0,1361 chrXI 368904 . G A 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.945;DP=158;Dels=0.00;FS=2.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=-1.693;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.152;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:158:99:1552,0,1637 chrXI 368997 . T C 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.408;DP=125;Dels=0.00;FS=11.501;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.932;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1024,0,1532 chrXI 369034 . C T 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.798;DP=163;Dels=0.00;FS=1.223;HaplotypeScore=2.6050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.452;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:163:99:1529,0,1785 chrXI 369378 . G A 3925.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3925,400,0 chrXI 369479 . C T 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.619;DP=147;Dels=0.00;FS=5.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1546,0,1325 chrXI 369689 . A T 3973.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9175;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:169:99:3973,399,0 chrXI 369785 . T C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.110;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.018;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1565,0,1382 chrXI 369878 . C T 4299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:162:99:4299,442,0 chrXI 370232 . T C 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.801;DP=136;Dels=0.00;FS=3.242;HaplotypeScore=3.2889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.478;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,89:136:99:1746,0,890 chrXI 370412 . T C 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.233;DP=189;Dels=0.00;FS=1.126;HaplotypeScore=3.4606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.129;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,91:189:99:1762,0,2090 chrXI 370478 . T C 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=189;Dels=0.00;FS=7.202;HaplotypeScore=5.8484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.036;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,91:189:99:1793,0,2064 chrXI 370565 . A C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;DP=122;Dels=0.00;FS=2.327;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.180;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1178,0,1405 chrXI 370652 . A G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.281;DP=150;Dels=0.00;FS=4.988;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.137;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1509,0,1641 chrXI 370874 . A G 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.191;DP=109;Dels=0.00;FS=4.790;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.456;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:902,0,1411 chrXI 371345 . G A 1847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.895;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.473;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,90:149:99:1877,0,1116 chrXI 371456 . A T 2417 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=99.8860;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=19.65;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2450,258,0 chrXI 371503 . A G 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.214;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1360,0,1429 chrXI 371535 . A T 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1542,0,1504 chrXI 371569 . T A 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.049;DP=163;Dels=0.00;FS=1.242;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,88:163:99:1788,0,1561 chrXI 371576 . A G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.826;DP=155;Dels=0.00;FS=4.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.263;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1585,0,1424 chrXI 371603 . C T 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3297,336,0 chrXI 371682 . G C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;DP=144;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=2.2931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.006;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1541,0,1314 chrXI 371802 . C T 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2802,291,0 chrXI 371814 . A C 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.000;DP=113;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.837;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:790,0,1424 chrXI 371995 . C G 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.506;DP=149;Dels=0.00;FS=2.080;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.937;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1587,0,1427 chrXI 372140 . T G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.482;DP=145;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=2;MQRankSum=0.612;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1366,0,1443 chrXI 372141 . G A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.251;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=2;MQRankSum=-1.075;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1407,0,1520 chrXI 372260 . G A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.568;DP=136;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1284,0,1507 chrXI 372314 . T C 1920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.881;DP=144;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.193;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,90:144:99:1950,0,1089 chrXI 372401 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.104;DP=110;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.527;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1289,0,989 chrXI 372443 . C T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.471;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1394,0,892 chrXI 372458 . A G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;DP=101;Dels=0.00;FS=0.789;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1230,0,892 chrXI 372746 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.762;DP=119;Dels=0.00;FS=7.113;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1066,0,1411 chrXI 372830 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.823;DP=139;Dels=0.00;FS=1.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.425;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.302;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1419,0,1282 chrXI 372878 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.525;DP=128;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1248,0,1386 chrXI 372925 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.594;DP=126;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=2.8161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.126;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1050,0,1562 chrXI 373181 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.808;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.747;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1314,0,1015 chrXI 373211 . A G 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.482;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1191,0,1067 chrXI 373328 . C T 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.114;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1660,0,1366 chrXI 373404 . G A 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;DP=149;Dels=0.00;FS=2.897;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1558,0,1462 chrXI 373448 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.077;DP=136;Dels=0.00;FS=13.954;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1270,0,1365 chrXI 373454 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;DP=128;Dels=0.00;FS=15.043;HaplotypeScore=2.8082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:128:99:1174,0,1413 chrXI 373556 . C T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.549;DP=122;Dels=0.00;FS=6.237;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.786;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1203,0,1277 chrXI 373559 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.896;DP=124;Dels=0.00;FS=7.665;HaplotypeScore=2.6279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.695;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1188,0,1380 chrXI 374056 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.459;DP=142;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=2.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=-0.077;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1244,0,1666 chrXI 374254 . A T 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;DP=105;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1051,0,1202 chrXI 374794 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.185;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=2.6938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1389,0,1120 chrXI 374941 . C G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;DP=132;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=3.7016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.519;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1165,0,1494 chrXI 375495 . T C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.147;DP=108;Dels=0.00;FS=6.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1296,0,982 chrXI 375794 . A G 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3058,312,0 chrXI 376286 . A C 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2970,309,0 chrXI 376297 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;DP=109;Dels=0.00;FS=6.032;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.119;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1048,0,1239 chrXI 376508 . T C 2364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2397,264,0 chrXI 376721 . A G 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3190,351,0 chrXI 376913 . A C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.924;DP=107;Dels=0.00;FS=1.639;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.747;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.276;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:107:99:1346,0,854 chrXI 377297 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.772;DP=137;Dels=0.00;FS=0.790;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1274,0,1569 chrXI 377373 . A G 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3542,372,0 chrXI 377390 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;DP=146;Dels=0.00;FS=3.950;HaplotypeScore=3.5645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,61:146:99:1147,0,1862 chrXI 377618 . T C 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.020;DP=105;Dels=0.00;FS=0.866;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,71:105:99:1588,0,613 chrXI 377781 . C A 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3791,394,0 chrXI 377954 . A C 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3508,416,0 chrXI 377975 . C G 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2941,336,0 chrXI 378422 . A G 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3345,345,0 chrXI 378458 . A G 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3289,345,0 chrXI 378519 . T G 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3457,378,0 chrXI 378531 . A G 3993.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3993,438,0 chrXI 378602 . T G 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3682,387,0 chrXI 378653 . T C 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3361,363,0 chrXI 378664 . A T 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3415,351,0 chrXI 378818 . C T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;DP=113;Dels=0.00;FS=6.837;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.894;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1153,0,1223 chrXI 378856 . T C 2704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.79;MQ0=0;QD=25.27;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2737,306,0 chrXI 378899 . C T 2599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.40;MQ0=0;QD=25.73;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2632,270,0 chrXI 378901 . T G 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.30;MQ0=0;QD=25.06;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2539,270,0 chrXI 378920 . A G 2530 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.50;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2563,279,0 chrXI 378934 . A G 2276 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.32;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2309,246,0 chrXI 378957 . T C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.44;MQ0=0;QD=23.11;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3176,363,0 chrXI 378962 . T C 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7407;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.36;MQ0=0;QD=24.70;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2750,291,0 chrXI 378999 . T C 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=119;Dels=0.00;FS=10.004;HaplotypeScore=5.2334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=-3.201;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.667;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:922,0,1411 chrXI 379000 . T C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.087;DP=119;Dels=0.00;FS=10.004;HaplotypeScore=4.3003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:948,0,1447 chrXI 379146 . T G 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.897;DP=90;Dels=0.00;FS=8.780;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=-4.148;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.065;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,41:90:99:779,0,1083 chrXI 379149 . G A 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.366;DP=87;Dels=0.00;FS=8.879;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-4.392;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:823,0,946 chrXI 379215 . T C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;DP=105;Dels=0.00;FS=2.525;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.835;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:892,0,1296 chrXI 379283 . G A 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.438;DP=113;Dels=0.00;FS=5.932;HaplotypeScore=9.5943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.79;MQ0=0;MQRankSum=2.255;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.435;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1056,0,1221 chrXI 379287 . C G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;DP=119;Dels=0.00;FS=5.659;HaplotypeScore=10.7506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.513;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1077,0,1310 chrXI 379301 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.840;DP=104;Dels=0.00;FS=11.330;HaplotypeScore=5.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1047,0,1055 chrXI 379380 . C T 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.665;DP=104;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.57;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.875;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:1047,0,1120 chrXI 379410 . C T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.334;DP=102;Dels=0.00;FS=3.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.03;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.147;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1107,0,996 chrXI 379423 . A G 2120 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.64;MQ0=0;QD=26.17;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2153,231,0 chrXI 379427 . A G 700.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.002;DP=81;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.010;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:730,0,1002 chrXI 379432 . A G 861.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.471;DP=83;Dels=0.00;FS=3.116;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,46:83:99:891,0,744 chrXI 379434 . G A 680.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.844;DP=80;Dels=0.00;FS=4.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.614;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,36:80:99:710,0,954 chrXI 379453 . T G 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.216;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:782,0,1076 chrXI 379495 . G T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.552;DP=80;Dels=0.00;FS=1.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.17;MQ0=0;MQRankSum=1.939;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,44:80:99:895,0,665 chrXI 379499 . A C 557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.296;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.028;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,34:72:99:587,0,797 chrXI 379628 . T A 2076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.11;MQ0=0;QD=22.81;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2109,228,0 chrXI 379650 . C T 1514 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.97;MQ0=0;QD=19.92;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:76:99:1547,165,0 chrXI 380065 . T C 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.33;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3426,357,0 chrXI 380193 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;DP=126;Dels=0.00;FS=1.541;HaplotypeScore=2.7245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:126:99:1271,0,1136 chrXI 380440 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.279;DP=109;Dels=0.00;FS=4.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.518;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1162,0,994 chrXI 380521 . C T 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.771;DP=156;Dels=0.00;FS=5.733;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.837;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1620,0,1576 chrXI 380602 . C T 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.26;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3736,367,0 chrXI 380707 . A C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.027;DP=120;Dels=0.00;FS=4.447;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:120:99:1094,0,1288 chrXI 380995 . C T 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.290;DP=130;Dels=0.00;FS=2.507;HaplotypeScore=3.6706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.555;QD=0.18;ReadPosRankSum=-5.906;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,13:130:54:54,0,2283 chrXI 381019 . C A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.112;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.313;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1526,0,1347 chrXI 381058 . G A 4280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=173;Dels=0.00;FS=4.822;HaplotypeScore=8.0555;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=24.74;ReadPosRankSum=0.831;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:4280,438,0 chrXI 381254 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.286;DP=131;Dels=0.00;FS=5.284;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1400,0,1254 chrXI 381316 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.687;DP=143;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=3.088;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1246,0,1573 chrXI 381581 . T A 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.02;MQ0=0;QD=23.13;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3063,318,0 chrXI 381640 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.350;DP=133;Dels=0.00;FS=2.209;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.042;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1369,0,1341 chrXI 381664 . C T 1688.20 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.363;DP=142;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=198.4283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.914;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-4.982e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:2:1717,0,2 chrXI 381721 . A G 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.027;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.199;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,90:160:99:1765,0,1406 chrXI 381726 . T C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.147;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,68:160:99:1294,0,1918 chrXI 381847 . A G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.921;DP=149;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.148;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:1247,0,1722 chrXI 381954 . C T 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.460;DP=177;Dels=0.00;FS=0.554;HaplotypeScore=3.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=1;MQRankSum=0.351;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.426;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,84:177:99:1718,0,1863 chrXI 382357 . C T 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=4.674;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=1;MQRankSum=1.601;QD=23.10;ReadPosRankSum=0.892;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3105,305,0 chrXI 382614 . T A 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.96;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2874,306,0 chrXI 382938 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.301;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.337;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:977,0,1304 chrXI 383052 . G A 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3327,351,0 chrXI 383133 . A G 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8348;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.961e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4033,432,0 chrXI 383538 . A G 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2749,291,0 chrXI 383706 . T C 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2970,318,0 chrXI 384068 . A G 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.48;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3378,381,0 chrXI 384196 . C T 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3692,367,0 chrXI 385128 . G T 748.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;DP=150;Dels=0.00;FS=385.962;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-5.312;QD=4.99;ReadPosRankSum=-9.605;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,51:150:99:778,0,532 chrXI 385129 . A T 739.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.799;DP=149;Dels=0.00;FS=396.535;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-5.611;QD=4.96;ReadPosRankSum=-9.718;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,49:149:99:769,0,558 chrXI 385133 . C T 536.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.922;DP=150;Dels=0.00;FS=329.839;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-5.616;QD=3.57;ReadPosRankSum=-8.538;SB=-2.948e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,44:150:99:566,0,675 chrXI 385247 . C T 1922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.103;DP=186;Dels=0.00;FS=0.544;HaplotypeScore=6.5562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.097;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,96:186:99:1952,0,1830 chrXI 385606 . T A 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;DP=125;Dels=0.00;FS=3.234;HaplotypeScore=5.7475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=7.64;ReadPosRankSum=2.126;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:985,0,1055 chrXI 385616 . T G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.640;DP=132;Dels=0.00;FS=5.282;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.086;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1022,0,1214 chrXI 385688 . G A 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.978;DP=152;Dels=0.00;FS=4.231;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.737;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.023;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1621,0,1541 chrXI 385708 . C G 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.385;DP=145;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1555,0,1386 chrXI 385829 . C T 1848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.916;DP=188;Dels=0.00;FS=0.537;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,95:188:99:1878,0,1822 chrXI 385892 . A G 4299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4299,450,0 chrXI 385928 . A C 1863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.772;DP=188;Dels=0.00;FS=5.076;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.941;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,95:188:99:1893,0,1972 chrXI 386072 . C G 4112.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4112,435,0 chrXI 386153 . A C 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3211,339,0 chrXI 386669 . T C 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.092;DP=160;Dels=0.00;FS=3.679;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=2.637;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.200;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1472,0,1752 chrXI 386756 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.362;DP=149;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=8.3063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.290;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1541,0,1468 chrXI 386780 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.913;DP=138;Dels=0.00;FS=3.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1407,0,1413 chrXI 387042 . A G 814.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.469;DP=128;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=-2.502;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.104;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:844,0,1497 chrXI 387050 . C T 880.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.883;DP=125;Dels=0.00;FS=5.690;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.921;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.393;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:910,0,1407 chrXI 387052 . A G 812.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.945;DP=121;Dels=0.00;FS=2.401;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.956;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.592;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:842,0,1546 chrXI 387069 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.700;DP=124;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-3.864;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.535;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1073,0,1421 chrXI 387089 . C A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.927;DP=136;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.610;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.381;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1142,0,1496 chrXI 387148 . G A 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.331;DP=135;Dels=0.00;FS=2.263;HaplotypeScore=43.1521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.97;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=5.07;ReadPosRankSum=-3.292;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,49:135:99:715,0,1423 chrXI 387224 . A T 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;DP=118;Dels=0.03;FS=3.377;HaplotypeScore=67.0272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.511;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:840,0,1342 chrXI 387697 . A G 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.260;DP=158;Dels=0.00;FS=1.270;HaplotypeScore=3.3036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,69:158:99:1356,0,1959 chrXI 387720 . C T 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.079;DP=129;Dels=0.00;FS=6.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.402;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1098,0,1586 chrXI 387755 . T C 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.517;DP=128;Dels=0.00;FS=5.423;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1432,0,1091 chrXI 387756 . T C 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.241;DP=130;Dels=0.00;FS=5.367;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.061;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1054,0,1594 chrXI 387783 . A G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.287;DP=142;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.543;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,60:142:99:1094,0,1866 chrXI 388314 . A C 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3202,336,0 chrXI 388368 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;DP=132;Dels=0.00;FS=2.235;HaplotypeScore=5.9531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.334;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:132:99:1374,0,1339 chrXI 388509 . T C 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.569;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.462;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1712,0,1539 chrXI 388737 . A G 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.752;DP=183;Dels=0.00;FS=1.146;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.679;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,93:183:99:1843,0,1850 chrXI 388947 . G T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.148;DP=126;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.649;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.779;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1078,0,1546 chrXI 389051 . A T 440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;DP=76;Dels=0.00;FS=11.073;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=-4.982;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.389;SB=-7.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:470,0,1089 chrXI 389074 . A G 241.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.994;DP=71;Dels=0.00;FS=5.481;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.78;MQ0=0;MQRankSum=-5.786;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-7.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:271,0,1159 chrXI 389078 . C G 103.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-5.504;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:133,0,1005 chrXI 389081 . G A 91.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;DP=58;Dels=0.00;FS=1.239;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=-5.308;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:121,0,1016 chrXI 389086 . T A 61.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.681;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQ0=0;MQRankSum=-5.126;QD=1.07;ReadPosRankSum=0.415;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:91:91,0,1069 chrXI 389135 . G A 472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.123;DP=73;Dels=0.00;FS=4.713;HaplotypeScore=7.7770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.35;MQ0=0;MQRankSum=-7.055;QD=6.47;ReadPosRankSum=-3.363;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:73:99:502,0,869 chrXI 389150 . A T 403.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.495;DP=106;Dels=0.00;FS=33.169;HaplotypeScore=122.1809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.97;MQ0=0;MQRankSum=-4.964;QD=3.80;ReadPosRankSum=-6.125;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,25:106:99:433,0,1058 chrXI 389369 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.905;DP=152;Dels=0.00;FS=7.270;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1385,0,1732 chrXI 389917 . A G 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.544;DP=127;Dels=0.00;FS=8.562;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.511;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1031,0,1499 chrXI 389926 . A G 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.715;DP=128;Dels=0.00;FS=8.923;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.141;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1038,0,1455 chrXI 389964 . C T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.793;DP=139;Dels=0.00;FS=6.995;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,59:139:99:1211,0,1606 chrXI 389996 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.368;DP=127;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1071,0,1416 chrXI 390146 . A G 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.171;DP=129;Dels=0.00;FS=4.543;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.271;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:1630,0,1051 chrXI 390414 . C T 605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.853;DP=94;Dels=0.00;FS=13.115;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.863;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.329;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,32:94:99:635,0,1321 chrXI 391584 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.225;DP=135;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.809;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1318,0,1395 chrXI 391885 . T C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.023;DP=114;Dels=0.00;FS=12.155;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1059,0,1268 chrXI 392532 . G T 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.926;DP=116;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.743;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1186,0,1268 chrXI 393120 . T C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.488;DP=132;Dels=0.00;FS=5.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.772;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.923;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1243,0,1441 chrXI 393245 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.171;DP=108;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.341;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1128,0,1083 chrXI 393606 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.722;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.619;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1285,0,1498 chrXI 393718 . A G 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.16;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3271,333,0 chrXI 394215 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.566;DP=108;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=2.5640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.547;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1075,0,1187 chrXI 394222 . C A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;DP=109;Dels=0.00;FS=1.548;HaplotypeScore=2.5640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1147,0,1081 chrXI 394442 . G A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.149;DP=117;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=2.6904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.680;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:117:99:1116,0,1224 chrXI 394572 . A T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1073,0,1357 chrXI 394829 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.390;DP=129;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=5.8635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1257,0,1308 chrXI 394878 . T C 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3566,381,0 chrXI 395017 . T C 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3043,327,0 chrXI 395025 . A C 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2937,306,0 chrXI 395041 . G A 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3155,315,0 chrXI 395065 . A G 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.34;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2735,303,0 chrXI 395161 . A G 2428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2461,261,0 chrXI 395566 . A G 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.381;DP=169;Dels=0.00;FS=3.545;HaplotypeScore=6.3977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.788;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,82:169:99:1601,0,1834 chrXI 395650 . T C 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.700;DP=130;Dels=0.01;FS=4.554;HaplotypeScore=12.5250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.147;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:129:99:934,0,1627 chrXI 395770 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.851;DP=123;Dels=0.00;FS=5.893;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1192,0,1303 chrXI 395794 . C T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.557;DP=134;Dels=0.00;FS=3.347;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1321,0,1451 chrXI 396036 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.672;DP=131;Dels=0.00;FS=3.465;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.924;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1137,0,1594 chrXI 396283 . G A 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.805;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,82:158:99:1672,0,1508 chrXI 396469 . G T 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3864,385,0 chrXI 396593 . G A 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.009;DP=129;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=2.6384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.983;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1505,0,1161 chrXI 396726 . C G 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3797,384,0 chrXI 396781 . G A 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3757,390,0 chrXI 397000 . C T 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.646;DP=138;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=5.9376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.192;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1697,0,1161 chrXI 397159 . G A 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.679;DP=140;Dels=0.00;FS=1.344;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.399;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1694,0,1253 chrXI 397398 . A T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.428;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1624,0,1377 chrXI 397458 . C T 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.697;DP=127;Dels=0.00;FS=2.532;HaplotypeScore=2.3391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1510,0,1129 chrXI 397509 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.533;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.641;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1182,0,1355 chrXI 397560 . G A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.457;DP=113;Dels=0.00;FS=1.499;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1229,0,985 chrXI 397598 . T C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.055;DP=127;Dels=0.00;FS=2.617;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=11.32;ReadPosRankSum=2.338;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1468,0,1154 chrXI 397710 . A G 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.086;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.103;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:949,0,1402 chrXI 397717 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.506;DP=131;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=3.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1148,0,1444 chrXI 397723 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.452;DP=142;Dels=0.00;FS=10.494;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1107,0,1665 chrXI 397781 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.698;DP=149;Dels=0.00;FS=11.890;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1615,0,1514 chrXI 397815 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=133;Dels=0.00;FS=6.459;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.125;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1366,0,1339 chrXI 397890 . A G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.315;DP=129;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.481;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1335,0,1361 chrXI 397895 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.020;DP=128;Dels=0.00;FS=2.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.495;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1261,0,1363 chrXI 397941 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.636;DP=122;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1167,0,1315 chrXI 397947 . C T 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3056,306,0 chrXI 397992 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.491;DP=131;Dels=0.00;FS=8.781;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.510;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1076,0,1596 chrXI 399915 . C G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.039;DP=171;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=4.8259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.038;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,81:171:99:1529,0,1855 chrXI 400341 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.846;DP=136;Dels=0.00;FS=2.158;HaplotypeScore=4.6768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.246;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1451,0,1328 chrXI 400358 . C T 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.338;DP=148;Dels=0.00;FS=2.073;HaplotypeScore=2.2064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.928;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1618,0,1440 chrXI 400402 . T A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;DP=145;Dels=0.00;FS=7.338;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.243;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1425,0,1566 chrXI 400521 . G A 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.274;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=2.250;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.139;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,82:165:99:1752,0,1731 chrXI 400569 . T G 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.351;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1414,0,1397 chrXI 400786 . T C 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.643;DP=131;Dels=0.00;FS=11.962;HaplotypeScore=4.3414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.561;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:131:99:1156,0,1430 chrXI 401769 . C G 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=22.98;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3020,327,0 chrXI 402355 . C T 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.788;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.875;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1752,0,1420 chrXI 402723 . A G 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.862;DP=185;Dels=0.00;FS=1.162;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=1;MQRankSum=1.324;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.619;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,85:185:99:1685,0,2055 chrXI 403069 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.321;DP=112;Dels=0.00;FS=4.874;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.368;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1192,0,1094 chrXI 403095 . T A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.457;DP=127;Dels=0.01;FS=21.628;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.735;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1205,0,1429 chrXI 403212 . G A 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.006;DP=168;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,79:168:99:1566,0,1755 chrXI 403353 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.720;DP=172;Dels=0.00;FS=4.647;HaplotypeScore=5.7506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.405;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,68:172:99:1261,0,2238 chrXI 403407 . G T 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3187,351,0 chrXI 403614 . G A 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.095;DP=141;Dels=0.00;FS=5.134;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=11.46;ReadPosRankSum=-2.088;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1646,0,1273 chrXI 403713 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.274;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1259,0,1303 chrXI 403748 . C G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;DP=131;Dels=0.01;FS=4.225;HaplotypeScore=14.8359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1101,0,1514 chrXI 403926 . T C 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.878;DP=154;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.128;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,87:154:99:1728,0,1293 chrXI 404075 . C A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.723;DP=128;Dels=0.00;FS=11.313;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.998;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1244,0,1361 chrXI 404302 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.073;DP=139;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=6.6130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.074;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1440,0,1448 chrXI 404344 . A G 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.720;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.451;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1667,0,1338 chrXI 404440 . C T 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3910,405,0 chrXI 404696 . G A 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2893,303,0 chrXI 404713 . G C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.024;DP=113;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.206;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.143;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1377,0,921 chrXI 404773 . G A 2435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2468,255,0 chrXI 404905 . C G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3268,360,0 chrXI 405007 . C T 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.0522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3601,366,0 chrXI 405121 . A T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;DP=138;Dels=0.00;FS=5.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1331,0,1502 chrXI 405209 . T C 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.583;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1634,0,1290 chrXI 405309 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.464;DP=123;Dels=0.00;FS=3.353;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.140;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1042,0,1388 chrXI 405331 . C A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;DP=113;Dels=0.00;FS=6.016;HaplotypeScore=4.9349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.232;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:113:99:1321,0,955 chrXI 405337 . G A 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.937;DP=114;Dels=0.00;FS=8.792;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.998;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1117,0,959 chrXI 405361 . A C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=131;Dels=0.00;FS=3.691;HaplotypeScore=3.5662;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=25.33;ReadPosRankSum=-0.886;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3318,339,0 chrXI 405409 . G A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=2.075;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.206;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1093,0,1092 chrXI 405592 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.654;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1250,0,1510 chrXI 405871 . C G 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=23.42;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3125,318,0 chrXI 405960 . A G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.631;DP=139;Dels=0.00;FS=3.084;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1335,0,1472 chrXI 406060 . G A 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3484,360,0 chrXI 406069 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.528;DP=127;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1166,0,1459 chrXI 406357 . T C 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.759;DP=127;Dels=0.00;FS=17.137;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.723;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1592,0,1113 chrXI 406489 . A G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=142;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=2.942;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1396,0,1473 chrXI 406558 . A G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.244;DP=114;Dels=0.00;FS=4.615;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.283;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1235,0,1059 chrXI 406897 . G A 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.842;DP=128;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.555;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.866;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,78:128:99:1694,0,946 chrXI 407067 . A G 1843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.620;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=10.84;ReadPosRankSum=-2.574;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:170:99:1873,0,1664 chrXI 407104 . T G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;DP=161;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.942;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1588,0,1592 chrXI 407274 . A G 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;DP=156;Dels=0.00;FS=2.234;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.018;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,91:156:99:1786,0,1289 chrXI 407314 . T C 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.149;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:163:99:1880,0,1428 chrXI 407572 . T C 2242 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2275,246,0 chrXI 408121 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.595;DP=115;Dels=0.00;FS=3.485;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1077,0,1330 chrXI 408493 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.969;DP=129;Dels=0.00;FS=3.167;HaplotypeScore=3.4790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.166;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1236,0,1335 chrXI 408636 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.862;DP=148;Dels=0.00;FS=2.917;HaplotypeScore=1.9577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1337,0,1591 chrXI 408938 . C T 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.775;DP=122;Dels=0.00;FS=1.544;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,50:122:99:975,0,1457 chrXI 408960 . C G 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3246,342,0 chrXI 409333 . A G 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.833;DP=78;Dels=0.00;FS=7.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:702,0,910 chrXI 409377 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.536;DP=94;Dels=0.00;FS=10.380;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.082;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1022,0,923 chrXI 409808 . A G 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.364;DP=86;Dels=0.00;FS=2.903;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,46:86:99:993,0,803 chrXI 409950 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.524;DP=118;Dels=0.00;FS=6.951;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=1.284;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.140;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1329,0,1033 chrXI 410208 . C T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.333;DP=81;Dels=0.00;FS=6.984;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,46:81:99:1021,0,681 chrXI 410250 . G A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;DP=90;Dels=0.00;FS=1.779;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,52:90:99:1158,0,750 chrXI 410346 . A G 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.324;DP=78;Dels=0.00;FS=3.113;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:733,0,880 chrXI 410388 . C T 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.395;DP=97;Dels=0.00;FS=6.441;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.417;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:926,0,1063 chrXI 410430 . C G 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;DP=80;Dels=0.00;FS=0.851;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:798,0,890 chrXI 410472 . T C 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.548;DP=96;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:858,0,1116 chrXI 410503 . T C 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.411;DP=107;Dels=0.00;FS=2.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.003;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1054,0,1161 chrXI 410677 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;DP=132;Dels=0.00;FS=3.131;HaplotypeScore=2.7374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.967;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1264,0,1345 chrXI 410730 . C T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;DP=116;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1181,0,1216 chrXI 410781 . T G 642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.676;DP=82;Dels=0.00;FS=10.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:672,0,956 chrXI 410796 . A G 661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.719;DP=83;Dels=0.00;FS=12.165;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.096;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:83:99:691,0,954 chrXI 410848 . T C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.061;DP=91;Dels=0.00;FS=3.217;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:941,0,993 chrXI 410974 . C G 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5349;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2536,264,0 chrXI 410991 . A G 2341 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5433;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=22.51;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2374,243,0 chrXI 410995 . T C 2289 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=21.80;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2322,255,0 chrXI 411001 . C A 2533 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2566,264,0 chrXI 411118 . G A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3540,357,0 chrXI 411183 . T C 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3036,315,0 chrXI 411351 . A G 2891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2924,309,0 chrXI 411637 . G A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3262,330,0 chrXI 411643 . A G 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2842,309,0 chrXI 411756 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;DP=131;Dels=0.00;FS=17.945;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=-0.526;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1451,0,1177 chrXI 411997 . T C 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3344,357,0 chrXI 412238 . G A 4052.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4052,412,0 chrXI 412494 . C A 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3390,340,0 chrXI 412504 . A G 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3599,390,0 chrXI 412524 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.953;DP=120;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.293;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1298,0,1178 chrXI 412602 . C T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3019,309,0 chrXI 412789 . T C 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3001,327,0 chrXI 413234 . A T 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2990,303,0 chrXI 413439 . G T 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3218,327,0 chrXI 413669 . G A 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2627,264,0 chrXI 413727 . C A 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.893;DP=97;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.408;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:954,0,1076 chrXI 413931 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.005;DP=113;Dels=0.00;FS=5.828;HaplotypeScore=3.7581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.440;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1328,0,1037 chrXI 414169 . A G 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3042,339,0 chrXI 414179 . T C 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3109,317,0 chrXI 414232 . G C 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2934,312,0 chrXI 414336 . C T 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2895,297,0 chrXI 414688 . T C 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3674,393,0 chrXI 414997 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.059;DP=108;Dels=0.00;FS=2.555;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.872;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1117,0,1046 chrXI 415240 . G A 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4091;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3331,339,0 chrXI 415294 . G A 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.60;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3105,315,0 chrXI 415378 . A C 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.95;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3152,348,0 chrXI 415407 . C T 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3581,372,0 chrXI 415441 . T C 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.64;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3059,336,0 chrXI 415456 . A G 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=24.90;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3120,333,0 chrXI 415517 . G A 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2873,294,0 chrXI 415531 . T C 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.81;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2588,264,0 chrXI 415542 . A G 2559 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.14;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2592,273,0 chrXI 415738 . C T 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3086,327,0 chrXI 415800 . T C 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=1;QD=24.05;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3256,351,0 chrXI 415864 . C G 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3296,351,0 chrXI 415894 . A G 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3285,351,0 chrXI 416349 . A T 2467 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2500,264,0 chrXI 416398 . A G 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2485,279,0 chrXI 416471 . T A 4452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4452,445,0 chrXI 416779 . G T 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3682,355,0 chrXI 417049 . G A 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.368;DP=168;Dels=0.00;FS=1.940;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.419;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,81:168:99:1737,0,1739 chrXI 417173 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.595;DP=117;Dels=0.00;FS=0.909;HaplotypeScore=4.9565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1287,0,1151 chrXI 417398 . T C 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3348,357,0 chrXI 417408 . G A 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3557,363,0 chrXI 417416 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;DP=132;Dels=0.00;FS=3.145;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=8.61;ReadPosRankSum=-2.407;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1166,0,1554 chrXI 417757 . G A 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4076,408,0 chrXI 418731 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.792;DP=137;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=4.7788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.824;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:137:99:1383,0,1400 chrXI 418958 . C G 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2802,288,0 chrXI 419090 . A G 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=22.64;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3022,339,0 chrXI 419192 . A G 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9398;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3122,336,0 chrXI 419400 . G A 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3332,333,0 chrXI 419413 . A G 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3294,342,0 chrXI 419746 . C A 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.496;DP=99;Dels=0.00;FS=0.832;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:922,0,1097 chrXI 420060 . G A 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2672,276,0 chrXI 420104 . T C 2704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2737,297,0 chrXI 420245 . C A 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2755,276,0 chrXI 420643 . T G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.25;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3113,351,0 chrXI 421142 . C T 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=21.35;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2809,285,0 chrXI 421239 . G T 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3809,405,0 chrXI 421550 . T C 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3426,375,0 chrXI 423332 . A T 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3745,379,0 chrXI 423403 . C T 4605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4605,483,0 chrXI 423496 . A T 4093.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.11;SB=-2.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4093,423,0 chrXI 423753 . T A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.562;DP=137;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.566;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1407,0,1494 chrXI 423977 . A G 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3889,414,0 chrXI 424002 . T A 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:4007,415,0 chrXI 424151 . G A 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3460,363,0 chrXI 424217 . T C 4476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4476,477,0 chrXI 424227 . A G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.133;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,81:170:99:1585,0,1947 chrXI 424283 . T C 4766.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4766,507,0 chrXI 424499 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.474;DP=122;Dels=0.00;FS=1.462;HaplotypeScore=3.9588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.176;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:122:99:1169,0,1273 chrXI 424564 . C T 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3875,402,0 chrXI 424739 . G T 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3517,351,0 chrXI 424829 . C T 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4054,418,0 chrXI 424954 . C T 4297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4297,450,0 chrXI 424958 . G A 3999.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3999,412,0 chrXI 425366 . C T 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.958;DP=163;Dels=0.00;FS=3.617;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.533;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,82:163:99:1722,0,1606 chrXI 425387 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.789;DP=158;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1460,0,1667 chrXI 425437 . T C 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3447,363,0 chrXI 425450 . G A 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3416,348,0 chrXI 425593 . T C 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3035,339,0 chrXI 425666 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.008;DP=129;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.714;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1317,0,1260 chrXI 425936 . T C 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3595,393,0 chrXI 426033 . A C 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3414,363,0 chrXI 426177 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.964;DP=130;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.279;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:1066,0,1697 chrXI 426199 . C T 4173.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4173,450,0 chrXI 426409 . C T 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;DP=124;Dels=0.00;FS=8.537;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1182,0,1411 chrXI 426732 . C T 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.348;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.816;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,79:134:99:1718,0,1030 chrXI 426822 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.920;DP=135;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1343,0,1473 chrXI 427165 . G A 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.942;DP=144;Dels=0.00;FS=5.064;HaplotypeScore=2.5257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.493;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1539,0,1497 chrXI 427291 . T C 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.59;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3338,348,0 chrXI 427367 . A G 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2654,294,0 chrXI 427568 . G T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.552;DP=141;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=2.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=2.783;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,57:141:99:1107,0,1718 chrXI 427643 . A T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;DP=126;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.481;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:1579,0,951 chrXI 427808 . A G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.386;DP=145;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=4.6264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1342,0,1672 chrXI 427982 . C T 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.983;DP=148;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=3.4587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.067;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1582,0,1440 chrXI 428081 . C G 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.817;DP=141;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.786;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:141:99:1673,0,1132 chrXI 428291 . G C 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3337,354,0 chrXI 428519 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.382;DP=141;Dels=0.00;FS=9.011;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.886;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:141:99:1443,0,1434 chrXI 428951 . G A 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.573;DP=92;Dels=0.01;FS=12.878;HaplotypeScore=8.4509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.463;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,53:91:99:945,0,751 chrXI 429453 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.068;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.363;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1063,0,1180 chrXI 429704 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.811;DP=116;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1275,0,1154 chrXI 429856 . C T 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3154,321,0 chrXI 429958 . C T 2304 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.04;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2337,243,0 chrXI 430228 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;DP=107;Dels=0.00;FS=4.731;HaplotypeScore=2.9262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.414;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1231,0,1020 chrXI 430549 . C G 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=61.0674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.997;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:117:99:996,0,1325 chrXI 430572 . T G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.250;DP=135;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.757;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1116,0,1560 chrXI 430641 . T C 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.059;DP=128;Dels=0.00;FS=3.213;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.759;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:987,0,1505 chrXI 430806 . A T 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3986,397,0 chrXI 430831 . T C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.890;DP=148;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,64:148:99:1185,0,1814 chrXI 430859 . T C 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3648,381,0 chrXI 430903 . G T 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.978e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3747,408,0 chrXI 430973 . A G 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.198;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.349;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:877,0,1107 chrXI 431202 . C A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.752;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.542;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1524,0,1030 chrXI 431261 . C A 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=59.6038;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.84;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3147,342,0 chrXI 431262 . T C 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=59.6038;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.84;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3070,342,0 chrXI 431291 . A G 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.226;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.107;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:948,0,1493 chrXI 431303 . C T 713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.178;DP=104;Dels=0.00;FS=0.887;HaplotypeScore=177.3965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.16;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.017;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:104:99:743,0,1178 chrXI 431353 . T A 608.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;DP=76;Dels=0.00;FS=3.158;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=8.00;ReadPosRankSum=-2.114;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,45:76:99:638,0,338 chrXI 431356 . A C 320.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.880;DP=79;Dels=0.00;FS=3.152;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.03;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.993;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:350,0,695 chrXI 431361 . C A 488.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.131;DP=89;Dels=0.00;FS=0.816;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.38;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=5.48;ReadPosRankSum=2.493;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:518,0,735 chrXI 431381 . A G 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.588;DP=113;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=7.53;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:881,0,1061 chrXI 431451 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.284;DP=145;Dels=0.00;FS=7.723;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=2.240;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1219,0,1706 chrXI 431473 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;DP=128;Dels=0.00;FS=3.214;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.378;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1244,0,1482 chrXI 431506 . T A 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=59.3715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3215,345,0 chrXI 431520 . G A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.257;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1186,0,1405 chrXI 431543 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.867;DP=142;Dels=0.00;FS=1.804;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1477,0,1440 chrXI 431610 . A G 2961 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2994,330,0 chrXI 431614 . G A 1204.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.315;DP=127;Dels=0.00;FS=4.238;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=2.159;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.765;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1234,0,1267 chrXI 431617 . G C 1142.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;DP=126;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:126:99:1172,0,1171 chrXI 431684 . C T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.179;DP=121;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.475;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1194,0,1355 chrXI 431700 . C T 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3465,360,0 chrXI 431704 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.772;DP=134;Dels=0.00;FS=4.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=8.40;ReadPosRankSum=1.314;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1155,0,1540 chrXI 431740 . C G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.170;DP=150;Dels=0.00;FS=13.627;HaplotypeScore=1.8991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1469,0,1294 chrXI 432073 . G A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.347;DP=110;Dels=0.00;FS=3.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.767;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1378,0,917 chrXI 432094 . A T 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3197,330,0 chrXI 432116 . G T 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;DP=105;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1051,0,1105 chrXI 432256 . C T 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.022;DP=125;Dels=0.00;FS=15.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1026,0,1502 chrXI 432319 . C G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;DP=108;Dels=0.00;FS=24.874;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=1.796;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.839;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1142,0,968 chrXI 432344 . A T 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.712;DP=113;Dels=0.00;FS=1.591;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=11.93;ReadPosRankSum=-2.945;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1378,0,992 chrXI 432569 . C G 2063 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.92;MQ0=16;QD=20.23;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2096,234,0 chrXI 432748 . A G 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3498,363,0 chrXI 432897 . T G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.581;DP=103;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1066,0,892 chrXI 433630 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.813;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1093,0,1613 chrXI 433721 . A G 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.341;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.127;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1325,0,1483 chrXI 433722 . T A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.082;DP=139;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.203;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1410,0,1435 chrXI 433806 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.615;DP=137;Dels=0.00;FS=6.731;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1289,0,1462 chrXI 433906 . G T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.383;DP=132;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.627;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1207,0,1394 chrXI 434001 . C T 4288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4288,450,0 chrXI 434444 . G T 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.531;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1687,0,1194 chrXI 434756 . A G 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3488,363,0 chrXI 434869 . G C 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.822;DP=145;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1614,0,1362 chrXI 434977 . A G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.394;DP=127;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.106;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1222,0,1405 chrXI 434978 . C T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.357;DP=130;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1313,0,1348 chrXI 435067 . G A 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.30;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2873,297,0 chrXI 435648 . A G 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2901,309,0 chrXI 437524 . T G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.170;DP=144;Dels=0.00;FS=2.972;HaplotypeScore=2.3459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.639;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1351,0,1669 chrXI 438455 . C G 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3551,387,0 chrXI 439671 . A T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;DP=133;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=4.2348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.956;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:133:99:1297,0,1465 chrXI 439860 . G A 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.161;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=0.502;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.481;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:951,0,1063 chrXI 439973 . G A 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2810,273,0 chrXI 440174 . A T 1171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.52;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1204,123,0 chrXI 440190 . A G 496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;DP=57;Dels=0.00;FS=1.022;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.040;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:526,0,656 chrXI 442302 . T G 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3158,339,0 chrXI 442829 . C T 2754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2787,285,0 chrXI 443215 . C G 2521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2554,270,0 chrXI 443498 . C T 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3652,384,0 chrXI 443541 . T C 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.471;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.375;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1340,0,1731 chrXI 443630 . T C 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5929;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3547,381,0 chrXI 443807 . A G 3960.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3960,426,0 chrXI 443960 . T C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.673;DP=121;Dels=0.00;FS=10.035;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.960;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1256,0,1199 chrXI 444125 . T C 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3928,426,0 chrXI 444152 . T C 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3671,402,0 chrXI 444997 . T C 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3152,345,0 chrXI 445026 . T C 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2809,306,0 chrXI 445084 . G C 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.435;DP=120;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.840;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1079,0,1378 chrXI 445342 . T C 2679 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2712,303,0 chrXI 445854 . T C 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5047;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:3808,402,0 chrXI 446566 . G A 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3082,327,0 chrXI 446828 . T C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;DP=95;Dels=0.00;FS=6.529;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:892,0,1070 chrXI 446892 . A G 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.17;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2859,294,0 chrXI 447048 . A G 2521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2554,261,0 chrXI 447357 . C T 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3413,351,0 chrXI 447456 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.819;DP=123;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1015,0,1534 chrXI 447546 . T C 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3815,396,0 chrXI 447605 . T C 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.498;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.551;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1133,0,1361 chrXI 447771 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.258;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1290,0,1388 chrXI 448103 . G A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.906;DP=123;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=8.1752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,72:123:99:1555,0,922 chrXI 448144 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.382;DP=102;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=12.30;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,60:102:99:1285,0,789 chrXI 449024 . T A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.992;DP=102;Dels=0.00;FS=1.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.559;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1067,0,1081 chrXI 449379 . G C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.089;DP=116;Dels=0.00;FS=3.409;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.814;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1190,0,1117 chrXI 449495 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.782;DP=153;Dels=0.00;FS=11.189;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.565;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1440,0,1525 chrXI 453639 . A G 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2759,300,0 chrXI 454121 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.192;DP=154;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.826;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:154:99:1262,0,1804 chrXI 454594 . T C 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3445,363,0 chrXI 455513 . T G 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.595;DP=133;Dels=0.00;FS=4.231;HaplotypeScore=7.0436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=11.77;ReadPosRankSum=-2.165;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,79:133:99:1596,0,1046 chrXI 455731 . T C 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3250,357,0 chrXI 456074 . A G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.211;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.390;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:132:99:1416,0,1268 chrXI 457446 . C T 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2806,285,0 chrXI 457702 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.088;DP=146;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=3.6877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:146:99:1489,0,1389 chrXI 457801 . G A 1002.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;DP=93;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.035;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1032,0,807 chrXI 457806 . G T 968.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;DP=86;Dels=0.00;FS=0.819;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.851;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,50:86:99:998,0,735 chrXI 457807 . G C 893.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.185;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,46:80:99:923,0,684 chrXI 457854 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.663;DP=112;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.402;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1078,0,1185 chrXI 458064 . G A 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.172;DP=129;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.494;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1241,0,1472 chrXI 458141 . G T 153.46 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;DP=14;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.57;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-3.829e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:1:182,0,1 chrXI 458675 . T A 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8043;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.83;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2881,303,0 chrXI 458734 . A G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.810;DP=135;Dels=0.00;FS=2.168;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.182;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1437,0,1325 chrXI 458781 . C T 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3984,420,0 chrXI 459646 . A G 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=24.96;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2828,309,0 chrXI 459870 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.882;DP=100;Dels=0.00;FS=4.931;HaplotypeScore=1.9621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.207;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1096,0,990 chrXI 460324 . C T 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.785;DP=117;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=8.75;ReadPosRankSum=-2.256;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1054,0,1366 chrXI 460920 . T C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.166;DP=97;Dels=0.00;FS=6.569;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.918;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1057,0,949 chrXI 461216 . C T 4606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4606,457,0 chrXI 461853 . G C 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.713;DP=147;Dels=0.00;FS=3.341;HaplotypeScore=2.6221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.178;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,83:147:99:1701,0,1204 chrXI 461989 . T C 711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.429;DP=89;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.310;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:741,0,1118 chrXI 462364 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.460;DP=105;Dels=0.00;FS=14.969;HaplotypeScore=2.6287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1068,0,984 chrXI 462985 . T A 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.258;QD=10.69;ReadPosRankSum=3.709;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1430,0,1322 chrXI 464375 . A G 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.426;DP=144;Dels=0.00;FS=5.047;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.148;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,81:144:99:1493,0,1138 chrXI 465192 . A G 166.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;DP=48;Dels=0.00;FS=25.450;HaplotypeScore=29.5092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.107;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:196,0,444 chrXI 465193 . A T 101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=46;Dels=0.00;FS=4.309;HaplotypeScore=30.2979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.428;SB=-1.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:131,0,491 chrXI 465463 . A G 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;DP=74;Dels=0.00;FS=10.126;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,38:74:99:719,0,733 chrXI 466582 . C A 1837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.412;DP=149;Dels=0.00;FS=7.427;HaplotypeScore=4.9329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.614;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:1867,0,1265 chrXI 467127 . T C 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.085;DP=147;Dels=0.00;FS=3.937;HaplotypeScore=5.2060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=2.135;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:147:99:1705,0,1328 chrXI 467162 . A G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.567;DP=129;Dels=0.00;FS=8.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.048;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1456,0,1084 chrXI 467237 . G A 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;DP=98;Dels=0.00;FS=1.828;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=9.73;ReadPosRankSum=-2.406;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:984,0,1025 chrXI 467243 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.271;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.867;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1053,0,1162 chrXI 467309 . A G 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.093;DP=98;Dels=0.00;FS=13.698;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.144;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:987,0,1092 chrXI 467328 . T C 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.599;DP=91;Dels=0.00;FS=12.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.657;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:819,0,1036 chrXI 467504 . G A 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=132;Dels=0.00;FS=5.361;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.793;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,78:132:99:1646,0,1021 chrXI 467546 . A G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.298;DP=127;Dels=0.00;FS=3.251;HaplotypeScore=2.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.184;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1204,0,1267 chrXI 467564 . T G 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.033;DP=133;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.386;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1439,0,1266 chrXI 467627 . C T 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.675;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.366;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1638,0,1300 chrXI 467651 . T C 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.851;DP=147;Dels=0.00;FS=4.226;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=10.84;ReadPosRankSum=-2.063;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1623,0,1360 chrXI 467666 . A G 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.784;DP=136;Dels=0.00;FS=5.660;HaplotypeScore=2.7130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.493;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1301,0,1360 chrXI 467744 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.437;DP=132;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=3.0926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1296,0,1407 chrXI 467777 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.086;DP=131;Dels=0.00;FS=5.368;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.601;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1137,0,1342 chrXI 467786 . T A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=126;Dels=0.00;FS=4.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.492;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1209,0,1310 chrXI 467982 . T G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.662;DP=121;Dels=0.00;FS=5.629;HaplotypeScore=3.0215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.560;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1296,0,1218 chrXI 468208 . T C 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.907;DP=113;Dels=0.00;FS=5.201;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:903,0,1360 chrXI 468315 . A T 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;DP=131;Dels=0.00;FS=3.044;HaplotypeScore=5.9481;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=25.78;ReadPosRankSum=0.621;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3377,330,0 chrXI 468482 . A G 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;DP=104;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=7.53;ReadPosRankSum=1.812;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,42:104:99:813,0,1391 chrXI 468581 . T C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.392;DP=98;Dels=0.00;FS=6.583;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.341;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1061,0,1010 chrXI 468702 . C T 1087.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.721;DP=116;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.381;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1117,0,1149 chrXI 468708 . G A 1280.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.807;DP=129;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.552;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1310,0,1217 chrXI 468710 . G T 1280.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.994;DP=132;Dels=0.00;FS=2.206;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1310,0,1264 chrXI 469130 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;DP=114;Dels=0.00;FS=9.338;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.187;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1249,0,1052 chrXI 469423 . C T 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3274,327,0 chrXI 469719 . G C 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3654,375,0 chrXI 469831 . C T 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=25.03;ReadPosRankSum=1.503;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3404,351,0 chrXI 470292 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.086;DP=142;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.694;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1449,0,1331 chrXI 470607 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.279;DP=135;Dels=0.00;FS=4.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.297;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1406,0,1364 chrXI 470867 . G A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.170;DP=119;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.194;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1203,0,1135 chrXI 471365 . T G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.364;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.325;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3126,336,0 chrXI 471378 . A C 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2973,327,0 chrXI 471379 . C A,G 2565.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=55.87;MQ0=0;QD=21.55;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,54,65:119:99:2625,1363,1216,1263,0,1080 chrXI 471830 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.823;DP=141;Dels=0.00;FS=3.965;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1384,0,1421 chrXI 471993 . G A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.490;DP=116;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=6.5161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1351,0,1015 chrXI 472945 . C T 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3239,336,0 chrXI 473318 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.734;DP=111;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1105,0,1177 chrXI 473351 . G A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.024;DP=129;Dels=0.00;FS=13.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.430;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1212,0,1344 chrXI 473414 . G A 1135.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.686;DP=110;Dels=0.00;FS=8.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=10.32;ReadPosRankSum=2.807;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1165,0,1099 chrXI 473416 . C T 1156.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.635;DP=109;Dels=0.00;FS=9.980;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=10.61;ReadPosRankSum=2.792;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1186,0,1118 chrXI 473424 . C A 1078.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;DP=113;Dels=0.00;FS=11.149;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.608;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1108,0,1246 chrXI 473427 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.265;DP=121;Dels=0.00;FS=2.387;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=9.45;ReadPosRankSum=2.908;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1173,0,1342 chrXI 473465 . A G 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;DP=96;Dels=0.00;FS=5.195;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:824,0,1201 chrXI 473531 . G T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.081;DP=133;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1288,0,1391 chrXI 473650 . G A 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.55;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3334,339,0 chrXI 473718 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.365;DP=124;Dels=0.00;FS=11.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.137;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1271,0,1250 chrXI 473879 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.019;DP=117;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.084;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1015,0,1282 chrXI 474169 . C A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.096;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.624;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1351,0,1553 chrXI 474761 . A G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.640;DP=144;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.969;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1338,0,1606 chrXI 474803 . A G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.954;DP=143;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=2.7249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1348,0,1548 chrXI 474932 . A G 4047.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4047,435,0 chrXI 475195 . C T 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.510;DP=172;Dels=0.00;FS=1.868;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.438;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,89:172:99:1828,0,1752 chrXI 475331 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.361;DP=143;Dels=0.00;FS=3.982;HaplotypeScore=7.2103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.218;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1339,0,1547 chrXI 475354 . T G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.584;DP=129;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.616;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1443,0,1229 chrXI 475412 . A G 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.455;DP=151;Dels=0.00;FS=3.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.580;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1682,0,1459 chrXI 475562 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.607;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1339,0,1601 chrXI 475709 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.122;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1326,0,1471 chrXI 475733 . C T 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.450;DP=153;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=10.41;ReadPosRankSum=2.615;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1623,0,1556 chrXI 476391 . T C 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.354;DP=140;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1561,0,1245 chrXI 476611 . T A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.784;DP=143;Dels=0.00;FS=2.958;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.017;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1351,0,1648 chrXI 476876 . A T 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;DP=137;Dels=0.00;FS=4.506;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,82:137:99:1721,0,1062 chrXI 476927 . A G 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;DP=154;Dels=0.00;FS=9.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.337;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1643,0,1587 chrXI 476928 . T A 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.757;DP=154;Dels=0.00;FS=9.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.265;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1703,0,1582 chrXI 476968 . T A 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.171;DP=176;Dels=0.00;FS=6.962;HaplotypeScore=4.9588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=10.16;ReadPosRankSum=-3.736;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,88:176:99:1818,0,1912 chrXI 477203 . T C 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3690,411,0 chrXI 477243 . T A 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.597;DP=182;Dels=0.00;FS=0.542;HaplotypeScore=3.6745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.885;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,82:182:99:1631,0,2132 chrXI 477574 . C T 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.293;DP=110;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.138;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1018,0,1057 chrXI 477643 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.539;DP=127;Dels=0.00;FS=6.967;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.374;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1310,0,1221 chrXI 478643 . G A 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3295,327,0 chrXI 478682 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.577;DP=131;Dels=0.00;FS=5.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1191,0,1478 chrXI 478945 . T A 2155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.088;DP=185;Dels=0.01;FS=2.850;HaplotypeScore=3.9162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,103:184:99:2185,0,1681 chrXI 479040 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.279;DP=123;Dels=0.00;FS=0.779;HaplotypeScore=4.9487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1319,0,1279 chrXI 479195 . T C 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2733,303,0 chrXI 479336 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.319;DP=143;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=3.5831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.787;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.660;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1386,0,1552 chrXI 479339 . C T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.497;DP=141;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1419,0,1431 chrXI 479482 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.449;DP=138;Dels=0.00;FS=1.347;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=10.88;ReadPosRankSum=2.626;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1531,0,1359 chrXI 479521 . A G 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=22.34;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3306,366,0 chrXI 479695 . C T 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.416;DP=132;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1532,0,1115 chrXI 479881 . T G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.901;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1425,0,1296 chrXI 479989 . T C 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.678;DP=130;Dels=0.00;FS=15.338;HaplotypeScore=3.9487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:895,0,1649 chrXI 480055 . G A 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.997;DP=167;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.523;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,85:167:99:1709,0,1545 chrXI 480152 . G T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;DP=162;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=4.5507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.033;QD=10.01;ReadPosRankSum=-2.087;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1652,0,1684 chrXI 480386 . A G 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.775;DP=140;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.839;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1531,0,1275 chrXI 480438 . A C 1884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.618;DP=182;Dels=0.00;FS=1.152;HaplotypeScore=2.9301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=1;MQRankSum=1.981;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,96:182:99:1914,0,1728 chrXI 480455 . A C 4546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=1;QD=24.05;SB=-2.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4546,477,0 chrXI 480529 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.432;DP=108;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1316,0,904 chrXI 480565 . C T 1864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.043;DP=172;Dels=0.00;FS=6.495;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.755;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,87:172:99:1894,0,1747 chrXI 480613 . G A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.573;DP=156;Dels=0.00;FS=4.147;HaplotypeScore=2.7059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.112;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1525,0,1689 chrXI 480772 . C T 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.111;DP=104;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1086,0,1057 chrXI 480796 . A C 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;DP=118;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=2.6334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:991,0,1418 chrXI 480814 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;DP=119;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,48:119:99:888,0,1523 chrXI 480844 . T C 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.484;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.198;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:113:99:851,0,1394 chrXI 481069 . T C 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.085;DP=186;Dels=0.00;FS=8.709;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.271;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,89:186:99:1708,0,2032 chrXI 481136 . T C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.321;DP=127;Dels=0.00;FS=6.664;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.707;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1255,0,1438 chrXI 481321 . A T 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;DP=173;Dels=0.00;FS=2.645;HaplotypeScore=2.7547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=2.121;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,88:173:99:1716,0,1765 chrXI 481819 . C T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.860;DP=141;Dels=0.00;FS=2.164;HaplotypeScore=3.8424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.499;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:141:99:1454,0,1461 chrXI 481901 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.690;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.756;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1480,0,1088 chrXI 481978 . A G 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.028;DP=172;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=3.3542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.926;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,81:172:99:1560,0,1871 chrXI 482131 . T A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.246;DP=157;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=7.84;ReadPosRankSum=-2.009;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,64:157:99:1261,0,2172 chrXI 482154 . A G 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=131;Dels=0.00;FS=6.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=25.83;ReadPosRankSum=1.306;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,129:131:99:3384,357,0 chrXI 482182 . T C 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.20;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2937,306,0 chrXI 482212 . T C 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.488;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.743;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:976,0,1099 chrXI 482277 . C G 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.545;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=11.25;ReadPosRankSum=-1.035;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,54:97:99:1121,0,848 chrXI 482307 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.686;DP=115;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=9.13;ReadPosRankSum=-2.721;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1080,0,1300 chrXI 482428 . T C 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=1;QD=25.51;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3520,381,0 chrXI 482531 . G A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2997,306,0 chrXI 482546 . G A 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3063,312,0 chrXI 482863 . G C 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3213,339,0 chrXI 482900 . A G 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3427,363,0 chrXI 482943 . T C 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3225,336,0 chrXI 483093 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.620;DP=130;Dels=0.00;FS=9.507;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1494,0,1208 chrXI 483131 . G A 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3039,315,0 chrXI 483198 . A T 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2777,282,0 chrXI 483319 . A T 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;DP=116;Dels=0.00;FS=18.388;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.443;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1016,0,1467 chrXI 483350 . A G 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2991,318,0 chrXI 483429 . A G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.074;DP=132;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.444;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1211,0,1426 chrXI 483430 . G T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.127;DP=131;Dels=0.00;FS=2.237;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.458;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1300,0,1362 chrXI 483589 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.953;DP=147;Dels=0.00;FS=6.650;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.826;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1435,0,1436 chrXI 483858 . G A 2459 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2492,249,0 chrXI 484031 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.994;DP=120;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=3.0744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1304,0,1164 chrXI 484090 . C T 4688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4688,466,0 chrXI 484132 . C T 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=25.58;ReadPosRankSum=0.935;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3555,339,0 chrXI 484168 . A T 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3057,327,0 chrXI 484393 . G A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2997,321,0 chrXI 484438 . C A 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.728;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,84:145:99:1752,0,1191 chrXI 484474 . C T 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3056,321,0 chrXI 484615 . T C 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=23.38;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3213,366,0 chrXI 484732 . T C 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3145,330,0 chrXI 484786 . A G 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2935,315,0 chrXI 484810 . G A 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3163,318,0 chrXI 484887 . C T 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4405;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3632,381,0 chrXI 484948 . A G 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3434,351,0 chrXI 485106 . A G 130.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;DP=136;Dels=0.00;FS=12.141;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=0.96;ReadPosRankSum=-4.675;SB=-2.132e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:128,8:136:18:163,18,0 chrXI 485195 . A G 1995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=16.22;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2028,216,0 chrXI 485255 . A G 2327 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=19.39;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2360,258,0 chrXI 485630 . C T 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5482;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3220,348,0 chrXI 486335 . C T 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3729,399,0 chrXI 486368 . G A 4240.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4240,432,0 chrXI 486393 . A G 4796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.11;SB=-2.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4796,489,0 chrXI 486704 . A G 4125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4125,426,0 chrXI 487013 . A T 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3320,345,0 chrXI 487028 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.858;DP=109;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1135,0,1129 chrXI 487095 . G C 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5147;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2999,324,0 chrXI 487297 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.899;DP=120;Dels=0.00;FS=7.344;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1338,0,1040 chrXI 487361 . T A 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3627,375,0 chrXI 487615 . C T 2278 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:99:2311,231,0 chrXI 487626 . C T 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2809,282,0 chrXI 487649 . A G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.311;DP=121;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=5.5046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.810;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1388,0,1105 chrXI 487726 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.967;DP=150;Dels=0.00;FS=6.188;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1534,0,1559 chrXI 487734 . A G 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3502,369,0 chrXI 487769 . G A 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.66;SB=-2.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4054,391,0 chrXI 488000 . G T 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3063,318,0 chrXI 488186 . A G 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3249,336,0 chrXI 488282 . A G 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3320,330,0 chrXI 488294 . G A 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3320,330,0 chrXI 488339 . T C 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3031,336,0 chrXI 488573 . A G 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2916,297,0 chrXI 488882 . A G 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2857,306,0 chrXI 489665 . C T 2232 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2265,234,0 chrXI 489732 . A T 2575 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2608,270,0 chrXI 489820 . C T 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7934;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=21.82;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2782,276,0 chrXI 489849 . A G 1487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.124;DP=145;Dels=0.00;FS=1.537;HaplotypeScore=58.6959;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:78,66:145:29:1520,29,0 chrXI 489903 . T C 2427 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;QD=23.11;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2460,285,0 chrXI 489913 . T A 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.444;DP=119;Dels=0.00;FS=2.401;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:909,0,1336 chrXI 489952 . G A 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.88;MQ0=0;QD=25.14;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2798,303,0 chrXI 489958 . A G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.078;DP=107;Dels=0.00;FS=1.698;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.757;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1012,0,923 chrXI 490016 . A G 534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;DP=78;Dels=0.00;FS=1.941;HaplotypeScore=181.7035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.997;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:564,0,703 chrXI 490017 . A G 1565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=136.2777;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.10;MQ0=0;QD=17.58;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1598,177,0 chrXI 490084 . G A 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.50;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2792,288,0 chrXI 490208 . T C 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.81;MQ0=1;QD=25.33;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3648,378,0 chrXI 490246 . C T 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.24;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3742,376,0 chrXI 490284 . G T 3725.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.234;DP=153;Dels=0.00;FS=3.039;HaplotypeScore=2.8265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=24.35;ReadPosRankSum=0.917;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3725,370,0 chrXI 490311 . G A 647.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.220;DP=131;Dels=0.00;FS=13.657;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.47;MQ0=0;MQRankSum=-3.351;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,48:131:99:677,0,1815 chrXI 490312 . G A 634.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.025;DP=129;Dels=0.00;FS=13.803;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQ0=0;MQRankSum=-4.172;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,47:129:99:664,0,1815 chrXI 490320 . T C 1507.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.237;DP=119;Dels=0.00;FS=7.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.57;MQ0=0;MQRankSum=5.918;QD=12.66;ReadPosRankSum=2.186;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,71:119:99:1537,0,580 chrXI 490325 . C T 501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.253;DP=110;Dels=0.00;FS=13.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQ0=0;MQRankSum=-5.040;QD=4.55;ReadPosRankSum=-2.426;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,45:110:99:531,0,1456 chrXI 490335 . G A 2378 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.59;MQ0=0;QD=22.43;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2411,261,0 chrXI 490356 . T A 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.601;DP=122;Dels=0.00;FS=7.221;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.005;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.492;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,46:122:99:669,0,1731 chrXI 490374 . A G 616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.095;DP=100;Dels=0.00;FS=3.902;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.261;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:646,0,1315 chrXI 490500 . C T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;DP=125;Dels=0.00;FS=11.412;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.894;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1258,0,1250 chrXI 490506 . A T 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.639;DP=135;Dels=0.00;FS=29.203;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=10.56;ReadPosRankSum=-2.893;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1455,0,1327 chrXI 490531 . G T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.459;DP=151;Dels=0.00;FS=19.069;HaplotypeScore=5.9130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=8.09;ReadPosRankSum=3.021;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:1251,0,1731 chrXI 490578 . A G 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3902,396,0 chrXI 490666 . G C 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;DP=133;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1527,0,1293 chrXI 490755 . C A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.566;DP=112;Dels=0.00;FS=9.206;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.692;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1318,0,979 chrXI 490776 . A C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.444;DP=125;Dels=0.00;FS=2.292;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.622;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1170,0,1465 chrXI 490822 . T A 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;DP=139;Dels=0.00;FS=3.065;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.655;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:139:99:1063,0,1778 chrXI 490933 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.167;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.979;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1318,0,1615 chrXI 490945 . T A 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3301,339,0 chrXI 490946 . T A,C 2892.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.58;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,63,63:126:99:2952,1402,1228,1550,0,1385 chrXI 491161 . T C 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2630,270,0 chrXI 491191 . C T 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3028,306,0 chrXI 491405 . G A 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2795,279,0 chrXI 491647 . T A 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3099,333,0 chrXI 491873 . T C 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2798,315,0 chrXI 492251 . T C 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3188,336,0 chrXI 492262 . G A 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3340,342,0 chrXI 492613 . C T 2002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.084;DP=167;Dels=0.00;FS=2.011;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,97:167:99:2032,0,1381 chrXI 493137 . G A 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2775,273,0 chrXI 493230 . A G 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=1;QD=24.27;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3374,369,0 chrXI 493329 . T C 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.06;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3165,327,0 chrXI 493349 . T C 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3284,330,0 chrXI 493599 . T A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;DP=113;Dels=0.00;FS=13.192;HaplotypeScore=10.4343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.546;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1275,0,742 chrXI 493756 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.051;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,69:159:99:1336,0,1931 chrXI 493865 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.253;DP=109;Dels=0.00;FS=3.800;HaplotypeScore=12.4606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.031;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:109:99:1321,0,840 chrXI 494125 . C A 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2595,267,0 chrXI 494237 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.661;DP=125;Dels=0.00;FS=5.998;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.547;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1065,0,1381 chrXI 494424 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.594;DP=106;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:911,0,1130 chrXI 494436 . T C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.485;DP=102;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1030,0,947 chrXI 494571 . G A 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7861;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3502,366,0 chrXI 494622 . T A 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6711;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=25.50;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:135:99:3443,345,0 chrXI 495036 . C T 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3171,324,0 chrXI 495081 . G A 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3356,357,0 chrXI 495360 . G C 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3667,396,0 chrXI 495546 . C T 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3713,393,0 chrXI 495774 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;DP=136;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1343,0,1537 chrXI 495813 . A G 4034.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4034,423,0 chrXI 495938 . G A 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7568;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2729,279,0 chrXI 495974 . C T 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.589;DP=133;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=50.8436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.369;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1401,0,1285 chrXI 495985 . C T 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3122,321,0 chrXI 496185 . C T 2427 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9906;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.67;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2460,246,0 chrXI 496275 . C T 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3279,325,0 chrXI 496317 . A T 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3253,330,0 chrXI 496326 . G A 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3379,348,0 chrXI 496395 . A G 2577 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=24.31;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2610,273,0 chrXI 496396 . G A 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=26.45;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2704,276,0 chrXI 496416 . G A 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.417;DP=110;Dels=0.00;FS=3.882;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.449;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2873,291,0 chrXI 497181 . C T 2302 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2335,237,0 chrXI 497389 . C T 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.592;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=25.67;ReadPosRankSum=1.102;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2574,264,0 chrXI 497576 . G A 2758 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.54;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2791,294,0 chrXI 497626 . C T 2516 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2549,261,0 chrXI 497655 . A C 2213 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.44;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2246,237,0 chrXI 497998 . T A 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3272,336,0 chrXI 498028 . T A 2286 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2319,246,0 chrXI 498076 . A G 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=118;Dels=0.00;FS=5.278;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=23.42;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2796,274,0 chrXI 498151 . A T 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2697,282,0 chrXI 498163 . C T 2098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2131,222,0 chrXI 498193 . C T 2079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2112,219,0 chrXI 498304 . C T 2628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2661,273,0 chrXI 498394 . C T 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.174;DP=134;Dels=0.00;FS=10.801;HaplotypeScore=6.6026;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=2.138;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.367;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,132:134:99:3387,332,0 chrXI 498571 . G C 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=22.75;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2649,264,0 chrXI 498942 . C T 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3571,349,0 chrXI 499111 . G C 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2854,297,0 chrXI 499266 . A T 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3046,312,0 chrXI 499300 . C T 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2878,291,0 chrXI 499635 . T A 2142 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=22.55;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2175,228,0 chrXI 499641 . C T 2110 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.49;MQ0=0;QD=21.98;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2143,228,0 chrXI 499645 . A G 1845 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.37;MQ0=0;QD=20.73;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1878,207,0 chrXI 499816 . G A 2177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.31;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2210,234,0 chrXI 499999 . A G 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2757,294,0 chrXI 500101 . A G 2401 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2434,255,0 chrXI 500262 . C A 2284 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2317,240,0 chrXI 500383 . T C 2514 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.14;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2547,276,0 chrXI 500428 . A G 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3026,315,0 chrXI 501250 . T A 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6152;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2487,246,0 chrXI 501319 . T C 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.44;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2526,285,0 chrXI 501970 . A G 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;DP=145;Dels=0.00;FS=3.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=24.60;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3567,393,0 chrXI 502007 . A G 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2936,318,0 chrXI 502040 . T C 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2666,273,0 chrXI 502121 . T C 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3422,363,0 chrXI 502603 . A G 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3609,378,0 chrXI 502693 . C T 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.218;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.604;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3444,350,0 chrXI 502712 . A G 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3382,351,0 chrXI 503144 . A T 4183.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4183,421,0 chrXI 503229 . G A 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3534,360,0 chrXI 504179 . A G 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3171,327,0 chrXI 504362 . T C 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2719,279,0 chrXI 504450 . G A 2509 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2542,252,0 chrXI 504574 . T C 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3051,318,0 chrXI 504632 . G T 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2881,297,0 chrXI 504700 . T G 2295 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2328,258,0 chrXI 504944 . G A 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2759,279,0 chrXI 505177 . T C 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3037,321,0 chrXI 505462 . A G 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.93;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3730,399,0 chrXI 505493 . C T 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.46;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3469,372,0 chrXI 505505 . A G 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.73;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3188,345,0 chrXI 505511 . G A 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.62;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3227,345,0 chrXI 505526 . G T 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.94;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2931,309,0 chrXI 505559 . C T 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.12;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2620,276,0 chrXI 505564 . C T 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.42;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2826,306,0 chrXI 505640 . G A 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2972,312,0 chrXI 505715 . C T 2873 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2906,303,0 chrXI 506135 . C T 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3209,321,0 chrXI 506484 . A G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.8869;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=21.21;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:3393,360,0 chrXI 506614 . A G 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3031,318,0 chrXI 506914 . C T 4009.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4009,397,0 chrXI 507254 . G A 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3567,355,0 chrXI 507344 . A G 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3586,375,0 chrXI 507512 . C T 3124 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3157,327,0 chrXI 507516 . G A 3233.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3269,345,0 chrXI 507521 . A G 2876 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2909,327,0 chrXI 507608 . C T 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3478,354,0 chrXI 507899 . C G 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=21.19;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3042,321,0 chrXI 507925 . C T 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3032,315,0 chrXI 507968 . A G 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3235,345,0 chrXI 508472 . G A 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2863,309,0 chrXI 508533 . C T 4163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4163,424,0 chrXI 508894 . T C 4330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9463;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:175:99:4330,444,0 chrXI 508942 . C T 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3536,354,0 chrXI 509426 . C T 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3321,330,0 chrXI 509442 . T G 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2993,327,0 chrXI 510755 . A T 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=21.97;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:2999,309,0 chrXI 511186 . A G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3263,345,0 chrXI 511327 . A G 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3797,405,0 chrXI 511345 . A C 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3375,372,0 chrXI 511387 . G A 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3429,363,0 chrXI 511693 . T C 4184.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4184,435,0 chrXI 511926 . T A 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3091,315,0 chrXI 512425 . G C 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;DP=130;Dels=0.00;FS=5.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=23.49;ReadPosRankSum=1.652;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3087,335,0 chrXI 512449 . A G 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3440,357,0 chrXI 513184 . C T 3764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3764,390,0 chrXI 513418 . A T 1999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.66;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2032,222,0 chrXI 513430 . A C 1830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.94;MQ0=0;QD=22.87;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1863,216,0 chrXI 513438 . A T 2022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.141;DP=82;Dels=0.00;FS=3.340;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=24.66;ReadPosRankSum=1.563;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:2055,222,0 chrXI 513454 . G A 1704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.19;MQ0=0;QD=22.13;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1737,189,0 chrXI 513462 . A G 1697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.41;MQ0=0;QD=21.48;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1730,195,0 chrXI 513482 . G A 1993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.95;MQ0=0;QD=23.17;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2026,210,0 chrXI 513512 . A C 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.87;MQ0=0;QD=22.74;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3171,336,0 chrXI 513535 . C G 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.44;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3427,348,0 chrXI 513791 . C T 225.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;DP=135;Dels=0.00;FS=15.392;HaplotypeScore=96.3759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.83;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=1.67;ReadPosRankSum=-6.926;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,24:135:99:255,0,1927 chrXI 513808 . T C 2223 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9387;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.68;MQ0=0;QD=20.78;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2256,252,0 chrXI 513809 . A C 2321 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9387;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.81;MQ0=0;QD=20.91;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2354,261,0 chrXI 514126 . T G 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=24.95;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2678,285,0 chrXI 514265 . T A 4479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4479,448,0 chrXI 514518 . T C 2115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.49;MQ0=0;QD=23.24;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2148,240,0 chrXI 515018 . C T 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3235,342,0 chrXI 515627 . T G 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2990,318,0 chrXI 516074 . A G 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3621,378,0 chrXI 516535 . G A 4087.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4087,397,0 chrXI 516541 . T C 3979.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6461;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3979,399,0 chrXI 516614 . G C 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3786,408,0 chrXI 517129 . T A 2658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=26.06;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2691,288,0 chrXI 517143 . T C 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.13;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2706,297,0 chrXI 517179 . T C 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.49;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3208,327,0 chrXI 517238 . C T 2345 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.21;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2378,246,0 chrXI 517282 . T C 2059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.03;MQ0=0;QD=24.51;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2092,222,0 chrXI 517456 . G T 62.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=1;QD=10.42;SB=-5.655e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:12:95,12,0 chrXI 517860 . T G 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.78;MQ0=0;QD=22.37;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3187,333,0 chrXI 517936 . T C 3794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3794,384,0 chrXI 518082 . T C 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.095;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=406.6071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQ0=0;MQRankSum=2.161;QD=0.08;ReadPosRankSum=-3.121;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,4:135:40:40,0,163 chrXI 518114 . T C 1853 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=6.520;DP=125;Dels=0.03;FS=211.907;HaplotypeScore=85.2346;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=1;MQRankSum=2.557;QD=14.82;ReadPosRankSum=-3.837;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,82:121:99:1886,236,0 chrXI 518117 . T C 917 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.876;DP=122;Dels=0.00;FS=239.151;HaplotypeScore=85.2346;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.61;MQ0=1;MQRankSum=3.914;QD=7.52;ReadPosRankSum=-5.500;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,79:122:99:950,128,0 chrXI 518139 . T C 713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.59;MQ0=1;MQRankSum=0.919;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.697;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,97:100:99:746,101,0 chrXI 518221 . C T 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3343,360,0 chrXI 518390 . A G 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3433,366,0 chrXI 518577 . G A 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3512,360,0 chrXI 518583 . G A 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3415,342,0 chrXI 518593 . G A 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3708,372,0 chrXI 518633 . T A 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3404,369,0 chrXI 519799 . C T 1744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=19.16;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:1777,186,0 chrXI 519910 . G A 4126.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6087;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4126,426,0 chrXI 520210 . T C 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3614,387,0 chrXI 520433 . A G 4580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4580,480,0 chrXI 520834 . G A 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7798;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=22.19;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:3816,385,0 chrXI 521017 . C T 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3394,357,0 chrXI 521137 . C T 4618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4618,489,0 chrXI 521811 . A C 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=140.3162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.15;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:167:99:4007,405,0 chrXI 522077 . A G 4522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;QD=25.69;SB=-2.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:176:99:4522,460,0 chrXI 522139 . G A 4138.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4138,436,0 chrXI 522153 . G A 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4150,433,0 chrXI 522169 . C A 4677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4677,484,0 chrXI 522200 . T C 5460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:211:99:5460,568,0 chrXI 522560 . C G 4181.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4181,462,0 chrXI 522994 . C A 4877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.65;SB=-2.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4877,505,0 chrXI 523140 . T C 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2927,321,0 chrXI 523149 . C T 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3037,327,0 chrXI 523152 . A C 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.02;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2803,309,0 chrXI 523410 . T A 5095.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=1;QD=25.73;SB=-2.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5095,499,0 chrXI 523718 . G A 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.95;MQ0=0;QD=21.92;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:2861,297,0 chrXI 524066 . A T 61.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.902;DP=188;Dels=0.00;FS=288.941;HaplotypeScore=77.0188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=1;MQRankSum=-0.906;QD=0.32;ReadPosRankSum=-7.972;SB=-2.974e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,48:188:91:91,0,330 chrXI 524076 . C T 114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.355;DP=205;Dels=0.00;FS=364.614;HaplotypeScore=18.9194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=1;MQRankSum=1.303;QD=0.56;ReadPosRankSum=-7.419;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,41:205:99:144,0,841 chrXI 524191 . A G 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=21.64;ReadPosRankSum=0.155;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3192,351,0 chrXI 524202 . G A 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3780,390,0 chrXI 525489 . T A 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=18.79;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:2757,276,0 chrXI 525645 . T C 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3287,345,0 chrXI 526035 . C G 4342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.981e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4342,444,0 chrXI 526065 . T C 4311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4311,465,0 chrXI 526637 . A T 4395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.64;SB=-2.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4395,457,0 chrXI 527047 . G A 4214.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4214,427,0 chrXI 527357 . C T 4170.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4170,435,0 chrXI 527413 . T C 4541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2610;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=24.28;SB=-2.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4541,468,0 chrXI 527464 . C A 4220.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.27;SB=-2.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4220,433,0 chrXI 527466 . T C 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=24.45;ReadPosRankSum=0.818;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:3985,429,0 chrXI 527498 . G C 4631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.31;SB=-2.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4631,480,0 chrXI 527511 . A G 4441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.09;SB=-2.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4441,468,0 chrXI 527595 . A G 4372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4372,462,0 chrXI 527629 . T C 4707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4707,484,0 chrXI 527630 . C A 4666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4666,480,0 chrXI 527758 . G T 4088.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4088,412,0 chrXI 527886 . G A 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3701,367,0 chrXI 528174 . G A 4712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.107;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7267;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.767;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,182:183:99:4712,501,0 chrXI 528401 . C G 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3815,402,0 chrXI 528645 . C T 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3809,411,0 chrXI 528889 . G C 4363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=22.26;SB=-2.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4363,468,0 chrXI 528896 . C A 4266.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4266,453,0 chrXI 529274 . C T 4476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4476,477,0 chrXI 529834 . C T 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9048;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3014,309,0 chrXI 530782 . G C 2088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.607;DP=83;Dels=0.00;FS=5.211;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=25.16;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:83:99:2121,204,0 chrXI 531450 . A G 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3395,357,0 chrXI 531608 . C T 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3816,384,0 chrXI 532628 . C T 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2711,276,0 chrXI 534003 . T C 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=22.74;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2716,276,0 chrXI 535201 . T C 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3144,327,0 chrXI 535579 . G T 1965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.86;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1998,204,0 chrXI 535712 . T C 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2954,297,0 chrXI 535976 . G C 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2763,288,0 chrXI 536766 . T C 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3209,333,0 chrXI 536945 . A G 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3403,366,0 chrXI 537672 . G A 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.584;DP=117;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=26.26;ReadPosRankSum=1.673;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3106,289,0 chrXI 538650 . C A 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.12;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2802,288,0 chrXI 539120 . T C 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3630,396,0 chrXI 539491 . C T 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3041,315,0 chrXI 539613 . C T 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3202,330,0 chrXI 539661 . G A 3977.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.49;SB=-2.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3977,414,0 chrXI 539877 . A G 2476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2509,270,0 chrXI 540072 . T C 3991.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.961e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3991,426,0 chrXI 540723 . C T 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3287,330,0 chrXI 540875 . G C 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.53;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3287,366,0 chrXI 540879 . G A 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.58;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3482,357,0 chrXI 540987 . C A 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3069,306,0 chrXI 541354 . C T 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3635,363,0 chrXI 541571 . G C 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3158,336,0 chrXI 541792 . C T 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.54;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2767,288,0 chrXI 541941 . G C 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3024,321,0 chrXI 541976 . T C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3176,345,0 chrXI 542352 . C T 2167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.232;DP=90;Dels=0.00;FS=4.228;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=24.08;ReadPosRankSum=1.655;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:90:99:2200,196,0 chrXI 542597 . T C 2306 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2339,252,0 chrXI 542924 . G C 2196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2229,228,0 chrXI 542955 . C T 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2682,279,0 chrXI 543193 . A G 2823 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2856,303,0 chrXI 543203 . G A 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2724,285,0 chrXI 543396 . C T 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3123,321,0 chrXI 543609 . A T 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2566,270,0 chrXI 543841 . T C 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3129,330,0 chrXI 543951 . T C 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3040,321,0 chrXI 544557 . G A 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3439,360,0 chrXI 545136 . C G 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3303,354,0 chrXI 545315 . A C 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3815,399,0 chrXI 545405 . T C 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3461,369,0 chrXI 545416 . G A 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3182,324,0 chrXI 545874 . C T 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.34;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2983,315,0 chrXI 545963 . T C 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2960,303,0 chrXI 546387 . C A 2074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=23.57;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2107,219,0 chrXI 546403 . G A 2214 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.36;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2247,237,0 chrXI 546444 . G A 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2763,282,0 chrXI 546456 . G A 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3038,312,0 chrXI 546501 . C T 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2874,297,0 chrXI 546559 . C T 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3117,318,0 chrXI 546589 . C A 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3203,327,0 chrXI 547133 . A G 2177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.31;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2210,240,0 chrXI 547574 . T A 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3485,354,0 chrXI 548064 . C T 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3350,339,0 chrXI 548175 . A G 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8020;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3975,417,0 chrXI 548301 . A C 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2987,324,0 chrXI 548668 . C T 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3460,354,0 chrXI 548697 . A G 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3703,363,0 chrXI 549094 . A T 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2841,294,0 chrXI 549098 . T A 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2830,291,0 chrXI 549235 . T G 2283 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=23.54;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2316,252,0 chrXI 549266 . G A 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3029,318,0 chrXI 549422 . G A 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7059;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.68;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2986,303,0 chrXI 549435 . G T 2988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.84;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3021,312,0 chrXI 549438 . C T 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.68;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2889,297,0 chrXI 549464 . A C 2200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=91;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=85.5541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.933;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2233,240,0 chrXI 549543 . G A 2085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.39;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2118,219,0 chrXI 549575 . C T 2718 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2751,285,0 chrXI 549752 . G A 2226 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2259,231,0 chrXI 550068 . T C 1814 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=23.87;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1847,210,0 chrXI 550089 . C T 1775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.49;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1808,183,0 chrXI 550227 . T C 1329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.16;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1362,156,0 chrXI 550278 . C T 1648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.58;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1681,171,0 chrXI 550329 . A G 2098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=24.11;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2131,222,0 chrXI 550359 . C T 2349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.10;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2382,240,0 chrXI 550408 . T A 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.093;DP=113;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=15.7241;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=25.41;ReadPosRankSum=1.083;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2904,285,0 chrXI 551004 . C T 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.679;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=26.20;ReadPosRankSum=0.773;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3406,336,0 chrXI 551284 . C T 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3252,336,0 chrXI 551392 . T C 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3249,342,0 chrXI 551512 . G T 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.07;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3016,303,0 chrXI 551750 . T C 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2778,297,0 chrXI 551797 . A T 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2934,309,0 chrXI 551886 . G T 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3585,363,0 chrXI 551893 . C T 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3435,343,0 chrXI 551986 . G T 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3375,339,0 chrXI 552248 . A G 2241 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2274,240,0 chrXI 552591 . C A 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3360,334,0 chrXI 552756 . C G 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2992,318,0 chrXI 552927 . G A 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3104,321,0 chrXI 552941 . C T 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3235,333,0 chrXI 552953 . A C 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3099,327,0 chrXI 552998 . A G 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3473,360,0 chrXI 553084 . A G 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=24.40;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2839,321,0 chrXI 553094 . G A 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2961,294,0 chrXI 553207 . T C 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.87;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3040,345,0 chrXI 553304 . T A 3998.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3998,411,0 chrXI 553630 . C T 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3122,321,0 chrXI 553687 . A T 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3255,348,0 chrXI 553738 . C T 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5580;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3632,366,0 chrXI 553992 . T C 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3448,360,0 chrXI 554054 . G A 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3145,315,0 chrXI 554162 . G A 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2873,294,0 chrXI 554163 . G A 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2745,282,0 chrXI 554185 . A G 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.14;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2597,270,0 chrXI 554227 . A G 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3585,381,0 chrXI 554305 . C G 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2930,330,0 chrXI 554493 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.228;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=24.41;ReadPosRankSum=-1.008;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2718,261,0 chrXI 554746 . A G 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=24.45;ReadPosRankSum=0.787;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:2991,290,0 chrXI 554905 . G A 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3521,352,0 chrXI 554945 . A G 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.03;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3416,357,0 chrXI 555214 . T C 917 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.43;MQ0=42;QD=9.76;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:950,105,0 chrXI 555610 . C T 354 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.99;MQ0=84;QD=3.37;SB=-8.600e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:46,59:105:42:387,42,0 chrXI 556475 . A T 1874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=24.34;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1907,204,0 chrXI 556484 . A G 1763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;QD=23.51;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1796,195,0 chrXI 556642 . C T 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2992,306,0 chrXI 556720 . G A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3152,324,0 chrXI 556988 . G A 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3844,382,0 chrXI 557093 . T C 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3047,330,0 chrXI 557299 . G A 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.65;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3539,361,0 chrXI 557824 . C G 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3320,336,0 chrXI 557935 . A G 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=3.237;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=26.49;ReadPosRankSum=1.233;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3159,336,0 chrXI 558102 . C G 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3668,387,0 chrXI 558133 . G A 3523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;DP=147;Dels=0.00;FS=3.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.954;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3523,366,0 chrXI 558486 . G A 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3716,379,0 chrXI 558496 . A G 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3452,363,0 chrXI 558522 . G A 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2759,276,0 chrXI 558543 . C T 2233 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2266,234,0 chrXI 558670 . T C 2171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2204,231,0 chrXI 558690 . T C 2398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.24;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2431,264,0 chrXI 558747 . G A 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3040,312,0 chrXI 558798 . T G 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3307,369,0 chrXI 558964 . C T 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.78;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2833,291,0 chrXI 558976 . T C 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2841,300,0 chrXI 559063 . G A 4018.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4018,397,0 chrXI 559170 . C T 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3284,340,0 chrXI 559244 . A C 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2482,255,0 chrXI 559313 . C T 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=1;QD=25.35;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2745,291,0 chrXI 559408 . C T 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3665,378,0 chrXI 559595 . G A 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3445,349,0 chrXI 559636 . T A 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3441,345,0 chrXI 559644 . G A 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3496,340,0 chrXI 559707 . T C 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3363,345,0 chrXI 559809 . G A 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3468,355,0 chrXI 560783 . A G 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3864,399,0 chrXI 561047 . T C 2133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2166,231,0 chrXI 561071 . C T 1802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1835,195,0 chrXI 561959 . G A 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2831,297,0 chrXI 562081 . C T 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2786,288,0 chrXI 562229 . G A 3996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3996,394,0 chrXI 562426 . T C 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2988,315,0 chrXI 562470 . G T 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3541,358,0 chrXI 562768 . T C 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:3791,387,0 chrXI 562866 . A G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3168,339,0 chrXI 563008 . C T 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3461,360,0 chrXI 563181 . G A 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3198,330,0 chrXI 563365 . T C 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2863,312,0 chrXI 563390 . G A 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3016,318,0 chrXI 563641 . A T 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3050,309,0 chrXI 563812 . T C 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2965,306,0 chrXI 564538 . T C 2380 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.11;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2413,264,0 chrXI 564676 . C T 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3754,399,0 chrXI 564715 . T G 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3530,372,0 chrXI 565014 . T C 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2893,309,0 chrXI 565671 . A G 4251.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.30;SB=-2.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4251,447,0 chrXI 565796 . G A 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3512,366,0 chrXI 566044 . A G 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=137;Dels=0.00;FS=3.514;HaplotypeScore=3.9132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=25.67;ReadPosRankSum=1.505;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3517,369,0 chrXI 566085 . C T 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.41;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2618,264,0 chrXI 566095 . A C 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=83.7306;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2598,276,0 chrXI 566185 . C T 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3865,379,0 chrXI 566379 . G A 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.32;SB=-2.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4051,385,0 chrXI 566530 . T C 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.54;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3467,381,0 chrXI 566543 . T C 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3796,399,0 chrXI 566551 . T C 3827.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=23.92;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3827,402,0 chrXI 566653 . G A 4094.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.75;SB=-2.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4094,429,0 chrXI 566731 . G A 4571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.25;SB=-2.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4571,448,0 chrXI 567055 . G A 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.93;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2746,285,0 chrXI 567076 . T G 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.40;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3173,330,0 chrXI 567180 . G A 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.45;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3693,381,0 chrXI 567277 . T C 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3387,354,0 chrXI 567526 . C T 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3205,336,0 chrXI 567588 . T A 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3195,330,0 chrXI 567598 . T G 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3298,354,0 chrXI 567633 . C T 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3453,360,0 chrXI 568028 . A G 3709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=23.33;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3709,408,0 chrXI 568037 . T C 4107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4107,450,0 chrXI 568100 . T C 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3719,399,0 chrXI 568283 . T C 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3048,321,0 chrXI 568316 . T C 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5116;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3172,330,0 chrXI 568472 . C T 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3995,412,0 chrXI 568502 . T C 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3781,399,0 chrXI 568908 . G A 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3894,391,0 chrXI 569085 . T C 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3332,351,0 chrXI 569468 . G A 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3176,333,0 chrXI 569606 . C T 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2665,276,0 chrXI 570049 . G A 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3391,354,0 chrXI 570352 . G A 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3698,381,0 chrXI 570688 . T C 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3854,390,0 chrXI 570835 . A G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2974,309,0 chrXI 570916 . C T 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.13;MQ0=0;QD=25.51;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2839,291,0 chrXI 570918 . C T 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.03;MQ0=0;QD=24.77;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2733,291,0 chrXI 570938 . C T 2664 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.82;MQ0=0;QD=24.90;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2697,291,0 chrXI 570942 . T C 2474 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.43;MQ0=0;QD=22.91;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2507,294,0 chrXI 570944 . A G 2765 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.56;MQ0=0;QD=24.69;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2798,294,0 chrXI 571008 . T C 2477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2510,267,0 chrXI 571051 . G A 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3151,312,0 chrXI 571146 . T A 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2877,297,0 chrXI 571190 . C T 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2879,306,0 chrXI 571204 . G C 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=26.11;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2775,297,0 chrXI 571236 . A G 2179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=26.25;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2212,237,0 chrXI 571243 . T A 2159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.791;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=26.65;ReadPosRankSum=1.647;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:81:99:2192,225,0 chrXI 571283 . A T 2130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=26.96;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2163,222,0 chrXI 571323 . C T 1764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=23.84;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1797,183,0 chrXI 571329 . A G 1820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=23.64;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1853,198,0 chrXI 571557 . C T 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=103.4164;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2829,291,0 chrXI 571596 . A G 2737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2770,288,0 chrXI 571752 . G A 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2526,258,0 chrXI 571872 . T C 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=23.02;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2957,315,0 chrXI 572316 . T C 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3330,345,0 chrXI 572346 . C T 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3295,342,0 chrXI 572448 . T A 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3546,366,0 chrXI 572498 . T C 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6822;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2898,318,0 chrXI 572586 . A G 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=4.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.513;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3164,321,0 chrXI 572589 . G A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.678;DP=127;Dels=0.00;FS=4.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.368;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3297,322,0 chrXI 572739 . C T 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3169,321,0 chrXI 573116 . G A 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3256,316,0 chrXI 573180 . T A 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3447,363,0 chrXI 573386 . T A 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3402,357,0 chrXI 574134 . C T 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;DP=129;Dels=0.00;FS=3.397;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=24.05;ReadPosRankSum=1.544;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3136,293,0 chrXI 574626 . C T 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.44;SB=-2.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4122,411,0 chrXI 574660 . C T 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3877,388,0 chrXI 574667 . G A 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7307;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3805,388,0 chrXI 574704 . G A 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3510,366,0 chrXI 574927 . G A 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3693,390,0 chrXI 575132 . A G 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2747,297,0 chrXI 575153 . A T 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3194,327,0 chrXI 575157 . T C 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.501;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=23.04;ReadPosRankSum=1.706;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3143,330,0 chrXI 575225 . G A 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3813,396,0 chrXI 575327 . G A 4611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.858e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4611,478,0 chrXI 575413 . T C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3136,342,0 chrXI 575606 . T G 3523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7957;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3523,369,0 chrXI 575717 . G A 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3837,396,0 chrXI 575843 . A G 3999.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.999e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:162:99:3999,438,0 chrXI 575852 . A G 4074.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;DP=159;Dels=0.00;FS=3.294;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.767;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:4074,405,0 chrXI 576007 . C T 3980.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.665;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.443;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3980,402,0 chrXI 576483 . C G 2138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=60.8900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.01;MQ0=0;QD=20.96;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2171,252,0 chrXI 576555 . A G 1220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=1;QD=13.86;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1253,147,0 chrXI 576797 . G A 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5869;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3032,300,0 chrXI 576947 . A G 2528 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2561,270,0 chrXI 577185 . A G 4120.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5210;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4120,429,0 chrXI 577326 . C T 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3141,318,0 chrXI 577353 . T C 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3088,336,0 chrXI 577440 . A G 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3460,366,0 chrXI 577769 . T C 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.37;SB=-2.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3801,408,0 chrXI 577779 . G T 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.42;SB=-2.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3956,403,0 chrXI 578482 . A G 3971.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=1;MQRankSum=1.438;QD=23.92;ReadPosRankSum=1.438;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:3971,414,0 chrXI 578669 . G A 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3226,327,0 chrXI 578716 . C T 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3080,309,0 chrXI 578824 . T C 4212.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4212,429,0 chrXI 578904 . G C 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.32;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3950,438,0 chrXI 578942 . G A 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3867,402,0 chrXI 578945 . T A 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3932,411,0 chrXI 579126 . T C 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2804,288,0 chrXI 579180 . A G 2517 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2550,273,0 chrXI 579541 . T C 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.44;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2599,285,0 chrXI 579622 . T G 2366 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.65;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2399,258,0 chrXI 579634 . G T 2697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.44;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2730,288,0 chrXI 579792 . T C 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.61;MQ0=0;QD=24.94;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3791,399,0 chrXI 580030 . T C 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.67;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:2992,318,0 chrXI 580181 . C T 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3519,360,0 chrXI 580214 . G A 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3700,384,0 chrXI 580227 . A G 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3102,342,0 chrXI 580415 . C T 2688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=1;QD=26.10;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2721,282,0 chrXI 580625 . T C 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;DP=143;Dels=0.00;FS=3.169;HaplotypeScore=5.9492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=23.71;ReadPosRankSum=1.707;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:143:99:3390,329,0 chrXI 581051 . C T 1405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=20.97;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1438,150,0 chrXI 581056 . T C 1194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=17.82;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1227,138,0 chrXI 584625 . C A 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3988,415,0 chrXI 585038 . C A 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3743,387,0 chrXI 585298 . T C 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3400,354,0 chrXI 586229 . G A 2072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.58;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2105,225,0 chrXI 586256 . T C 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.44;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2386,255,0 chrXI 586259 . A G 2443 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.99;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2476,267,0 chrXI 586293 . C T 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=26.68;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2728,282,0 chrXI 586298 . G A 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3140,336,0 chrXI 586366 . T C 2286 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.58;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2319,261,0 chrXI 586587 . A G 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3730,387,0 chrXI 587074 . G A 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3581,372,0 chrXI 587134 . T C 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3275,342,0 chrXI 587530 . T C 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3950,402,0 chrXI 587857 . G A 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2764,285,0 chrXI 588209 . G T 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8645;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3494,352,0 chrXI 588593 . A G 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2876,306,0 chrXI 588609 . T C 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3134,327,0 chrXI 588805 . G A 2342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2375,255,0 chrXI 588890 . C T 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3430,354,0 chrXI 588930 . T C 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3320,351,0 chrXI 588939 . T C 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3283,351,0 chrXI 589078 . A G 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2982,321,0 chrXI 589279 . A G 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=21.66;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3087,330,0 chrXI 589327 . C T 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3343,328,0 chrXI 589369 . A G 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3338,342,0 chrXI 589384 . T C 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2837,315,0 chrXI 589512 . C A 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=3.119;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.301;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3044,321,0 chrXI 589534 . G C 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3276,339,0 chrXI 589580 . G T 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.544;DP=129;Dels=0.00;FS=3.253;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=25.02;ReadPosRankSum=1.705;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3260,330,0 chrXI 589694 . T C 2600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2633,285,0 chrXI 589750 . T A 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.31;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2622,276,0 chrXI 589759 . G C 2267 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.61;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2300,249,0 chrXI 589814 . C T 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3044,306,0 chrXI 589828 . T C 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2699,282,0 chrXI 589892 . C G 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2840,291,0 chrXI 589939 . T C 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2985,327,0 chrXI 589997 . T G 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2735,303,0 chrXI 590023 . C T 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.702;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2946,309,0 chrXI 590065 . C T 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2966,291,0 chrXI 590067 . T G 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2793,297,0 chrXI 590322 . A G 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=22.25;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2659,285,0 chrXI 590748 . A G 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3374,342,0 chrXI 590994 . C T 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=1;QD=25.58;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3376,357,0 chrXI 591644 . T C 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3300,351,0 chrXI 591688 . G A 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3324,330,0 chrXI 591782 . T C 2748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2781,297,0 chrXI 591912 . T C 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3394,357,0 chrXI 591920 . T C 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3384,354,0 chrXI 592340 . A G 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3210,345,0 chrXI 592349 . A G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3177,354,0 chrXI 592478 . A G 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.260;DP=132;Dels=0.00;FS=5.185;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=26.02;ReadPosRankSum=0.551;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3434,344,0 chrXI 592577 . A G 2784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2817,303,0 chrXI 592615 . T C 2531 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=22.80;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2564,285,0 chrXI 592616 . C G 2479 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2512,288,0 chrXI 592727 . C A 4645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4645,466,0 chrXI 594186 . T G 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3278,348,0 chrXI 594718 . A G 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3824,408,0 chrXI 594744 . C T 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.15;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3635,381,0 chrXI 594835 . A G 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.34;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2744,291,0 chrXI 594943 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3269,324,0 chrXI 594957 . C T 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3078,306,0 chrXI 594987 . T C 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3106,336,0 chrXI 595260 . T G 2622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=22.41;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2655,291,0 chrXI 595509 . G A 5163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=26.48;SB=-2.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:5163,544,0 chrXI 595517 . A G 4586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4586,489,0 chrXI 595879 . C T 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3335,342,0 chrXI 595973 . C A 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3137,318,0 chrXI 596000 . A G 2891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2924,321,0 chrXI 596201 . A G 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5210;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3144,330,0 chrXI 596520 . C G 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3159,327,0 chrXI 596556 . C G 2614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2647,288,0 chrXI 596725 . G A 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3287,336,0 chrXI 596823 . A G 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3187,333,0 chrXI 596996 . G A 1856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.35;MQ0=0;QD=25.78;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1889,192,0 chrXI 597058 . C T 2320 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2353,246,0 chrXI 597106 . T C 2317 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.72;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2350,246,0 chrXI 597150 . A G 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8562;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3307,354,0 chrXI 597240 . C G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1043,0,1011 chrXI 597399 . A G 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3360,351,0 chrXI 597700 . T C 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=22.82;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3091,330,0 chrXI 597862 . C T 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3594,358,0 chrXI 597866 . A G 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3386,342,0 chrXI 597928 . G A 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2920,303,0 chrXI 598496 . T C 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2959,309,0 chrXI 598795 . A T 4034.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.37;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4034,406,0 chrXI 598922 . C G 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5252;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3389,366,0 chrXI 599122 . C T 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3518,366,0 chrXI 599337 . T C 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=23.02;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3187,333,0 chrXI 599535 . A G 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3234,363,0 chrXI 599658 . G A 3869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3869,411,0 chrXI 599778 . G A 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2758,288,0 chrXI 599836 . G T 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2930,315,0 chrXI 599871 . G A 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3029,315,0 chrXI 599953 . C G 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3319,357,0 chrXI 600024 . T C 2399 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2432,252,0 chrXI 600099 . G A 2196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:87:99:2229,228,0 chrXI 600159 . T C 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2681,282,0 chrXI 600363 . G A 2438 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2471,252,0 chrXI 600406 . T G 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2642,288,0 chrXI 600423 . G A 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3495,351,0 chrXI 600450 . A G 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3580,360,0 chrXI 601065 . A G 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3215,354,0 chrXI 601089 . A G 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3747,387,0 chrXI 601260 . G C 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3438,372,0 chrXI 601632 . T C 2677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.74;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2710,294,0 chrXI 602166 . T G 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3599,393,0 chrXI 603232 . C G 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3510,381,0 chrXI 603765 . T C 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3150,330,0 chrXI 604356 . A G 2551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.07;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2584,276,0 chrXI 604816 . C T 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2666,273,0 chrXI 605062 . A G 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2885,303,0 chrXI 605107 . C T 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3200,339,0 chrXI 605622 . C T 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=1;QD=26.59;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3064,321,0 chrXI 606047 . C T 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3449,357,0 chrXI 606185 . A G 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=2;QD=22.14;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:2978,315,0 chrXI 606902 . T C 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3290,339,0 chrXI 606908 . A G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3302,342,0 chrXI 607403 . T G 2377 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=23.77;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2410,255,0 chrXI 607664 . G A 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=1;QD=24.82;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3160,327,0 chrXI 607676 . T C 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3423,375,0 chrXI 608132 . T C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3389,345,0 chrXI 608300 . T G 3917.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3917,393,0 chrXI 608429 . T C 2784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2817,303,0 chrXI 608448 . C T 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2927,306,0 chrXI 608493 . C T 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2902,303,0 chrXI 608546 . G A 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5458;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3107,321,0 chrXI 608639 . A G 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2666,282,0 chrXI 608641 . G A 2687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2720,282,0 chrXI 608711 . A T 2365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2398,243,0 chrXI 608840 . G A 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3351,343,0 chrXI 609095 . C T 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9879;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3619,369,0 chrXI 609137 . C T 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3356,348,0 chrXI 609362 . C T 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.882e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3400,351,0 chrXI 609438 . A G 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3273,348,0 chrXI 609526 . C G 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3190,354,0 chrXI 609667 . A G 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=22.87;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3568,372,0 chrXI 609738 . A G 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3272,345,0 chrXI 610106 . T C 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3481,375,0 chrXI 610214 . C T 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.416;DP=146;Dels=0.00;FS=2.974;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=2.416;QD=25.99;ReadPosRankSum=2.248;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,144:146:99:3795,355,0 chrXI 610232 . A T 4169.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4169,432,0 chrXI 610295 . C T 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3625,364,0 chrXI 610394 . G A 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3295,351,0 chrXI 610451 . G A 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.29;SB=-2.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3920,402,0 chrXI 610473 . C T 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3793,393,0 chrXI 610521 . C T 4208.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4208,427,0 chrXI 610937 . G T 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3287,336,0 chrXI 611187 . C G 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3672,381,0 chrXI 611206 . T C 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3405,366,0 chrXI 611219 . T C 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3330,357,0 chrXI 611427 . G A 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3429,354,0 chrXI 611581 . C A 3977.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.66;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3977,426,0 chrXI 611629 . C G 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=22.99;SB=-2.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:3633,375,0 chrXI 611929 . G A 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3207,336,0 chrXI 612127 . C T 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3483,369,0 chrXI 612138 . G A 3788.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3788,402,0 chrXI 612307 . C T 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3323,339,0 chrXI 612420 . T C 2699 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9214;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2732,282,0 chrXI 612496 . T C 2161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.36;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2194,231,0 chrXI 612505 . G A 2236 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.68;MQ0=0;QD=23.05;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2269,237,0 chrXI 612508 . A G 2203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.696;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.87;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=22.95;ReadPosRankSum=1.371;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2236,240,0 chrXI 612630 . C T 4389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.97;SB=-2.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4389,453,0 chrXI 612875 . T C 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3227,348,0 chrXI 612914 . G A 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3559,372,0 chrXI 612940 . T C 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.94;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3186,351,0 chrXI 613340 . A G 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5822;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.32;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3337,345,0 chrXI 613391 . T C 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2874,324,0 chrXI 613535 . A G 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8931;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.599;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,131:133:99:3115,327,0 chrXI 613583 . G A 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.44;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3072,327,0 chrXI 613616 . A G 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.64;MQ0=0;QD=22.39;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2966,348,0 chrXI 613619 . G A 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.93;MQ0=0;QD=22.41;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3148,342,0 chrXI 613649 . T A 529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.48;MQ0=0;QD=4.07;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:63:562,63,0 chrXI 613652 . T A 482 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.373;DP=130;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.599;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:57:515,57,0 chrXI 613790 . G A 218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.335;DP=125;Dels=0.02;FS=12.805;HaplotypeScore=406.3802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=-3.236;QD=1.74;ReadPosRankSum=4.338;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,93:123:63:248,0,63 chrXI 614125 . C A 4264.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4264,436,0 chrXI 614193 . C T 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=120.4648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.37;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:140:99:3599,375,0 chrXI 614248 . G A 74.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=164.5741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=0.42;SB=-2.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:12:107,12,0 chrXI 614464 . A C 4937.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.56;SB=-2.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:4937,537,0 chrXI 614538 . T A 4043.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:4043,426,0 chrXI 614618 . T C 4379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.60;SB=-2.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4379,456,0 chrXI 614836 . A G 4356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.75;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4356,459,0 chrXI 614931 . C T 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3416,363,0 chrXI 615148 . C T 4688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.90;SB=-2.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4688,475,0 chrXI 615175 . A G 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3094;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.17;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3876,411,0 chrXI 615234 . A G 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3235;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3372,375,0 chrXI 615345 . G C 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3783,414,0 chrXI 615433 . T C 4023.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4023,429,0 chrXI 615578 . T C 4391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4391,444,0 chrXI 615858 . C T 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3099,330,0 chrXI 615914 . G C 2816 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=22.35;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:2849,281,0 chrXI 616020 . C T 4486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4486,465,0 chrXI 616059 . A G 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=22.76;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3619,390,0 chrXI 616170 . T C 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=22.39;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2809,315,0 chrXI 616176 . C T 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3031,321,0 chrXI 616203 . T C 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.449;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7334;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=24.70;ReadPosRankSum=0.808;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3335,322,0 chrXI 616209 . C T 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.604;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3207;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.475;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3349,318,0 chrXI 616404 . T C 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3650,381,0 chrXI 616713 . T C 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3224,351,0 chrXI 616902 . A G 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3624,402,0 chrXI 616917 . G A 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3627,375,0 chrXI 617158 . T G 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3425,360,0 chrXI 617259 . T A 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.89;SB=-2.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3883,391,0 chrXI 617508 . A C 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3156,345,0 chrXI 617524 . A G 2527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=23.62;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2560,309,0 chrXI 617543 . A T 2558 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=26.65;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2591,273,0 chrXI 617624 . T C 2289 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=20.62;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2322,243,0 chrXI 617954 . A G 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2702,279,0 chrXI 618029 . G A 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.51;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:96:99:2482,261,0 chrXI 618498 . T C 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4179,447,0 chrXI 618779 . C A 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3460,354,0 chrXI 619007 . A G 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:121:99:2958,315,0 chrXI 619045 . G A 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3130,330,0 chrXI 619260 . A T 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3530,351,0 chrXI 619286 . C T 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3402,328,0 chrXI 619469 . A C 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3736,396,0 chrXI 619475 . G A 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3435,354,0 chrXI 619794 . G A 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3897,402,0 chrXI 620047 . G A 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8306;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2984,309,0 chrXI 620113 . T C 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2741,306,0 chrXI 620156 . A T 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6703;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3169,321,0 chrXI 620157 . G C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3076,321,0 chrXI 620182 . G A 2658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2691,276,0 chrXI 620930 . G A 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2871,306,0 chrXI 620968 . C A 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2948,306,0 chrXI 621046 . G A 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.53;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3316,345,0 chrXI 621343 . G A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3263,345,0 chrXI 621359 . A T 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3134,324,0 chrXI 621586 . G A 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=26.76;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2763,300,0 chrXI 621589 . T A 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2921,312,0 chrXI 621619 . A G 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3144,342,0 chrXI 621820 . G A 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3534,363,0 chrXI 622408 . C G 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2882,303,0 chrXI 622853 . G A 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3615,370,0 chrXI 623020 . G A 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.892e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3646,370,0 chrXI 623443 . A G 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3391,354,0 chrXI 623581 . A T 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7374;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3212,336,0 chrXI 623815 . A G 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.37;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3400,369,0 chrXI 624088 . G A 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3010,300,0 chrXI 624190 . G A 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.27;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2569,270,0 chrXI 624268 . C T 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3096,321,0 chrXI 624424 . T C 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2762,300,0 chrXI 624645 . A G 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.7296;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.59;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2868,312,0 chrXI 624652 . A G 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.21;MQ0=0;QD=21.98;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2649,285,0 chrXI 624661 . A G 2529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.374;DP=116;Dels=0.00;FS=4.412;HaplotypeScore=3.8936;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.19;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.553;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2562,279,0 chrXI 624667 . A G 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.186;DP=113;Dels=0.00;FS=4.472;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.54;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=22.26;ReadPosRankSum=1.361;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2548,273,0 chrXI 624837 . G C 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=1;QD=24.22;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2842,309,0 chrXI 624919 . C T 3843.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3843,394,0 chrXI 625172 . A G 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.292;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2672,278,0 chrXI 625415 . G A 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2601;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3593,366,0 chrXI 625684 . C T 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2700,273,0 chrXI 627014 . C T 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3090,321,0 chrXI 627386 . C A 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3107,318,0 chrXI 627504 . A G 2140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=99.3600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=1.787;QD=20.58;ReadPosRankSum=2.284;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,102:104:99:2173,243,0 chrXI 627507 . A G 2135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=197.2146;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=2.105;QD=19.95;ReadPosRankSum=2.128;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,105:107:99:2168,246,0 chrXI 627536 . C T 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.078;DP=119;Dels=0.00;FS=6.434;HaplotypeScore=1.9411;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=24.66;ReadPosRankSum=0.879;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,117:119:99:2967,315,0 chrXI 627879 . A T 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2091;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.39;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2725,282,0 chrXI 627998 . C T 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.67;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2805,288,0 chrXI 628100 . T C 3974.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.99;SB=-2.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3974,420,0 chrXI 628202 . G A 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=1;QD=23.83;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2869,279,0 chrXI 628397 . C G 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3590,378,0 chrXI 628658 . C T 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2908,297,0 chrXI 628847 . T C 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.63;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2802,306,0 chrXI 628859 . C T 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.11;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2711,285,0 chrXI 628874 . T C 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=112;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.464;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2559,279,0 chrXI 628888 . G A 2075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.13;MQ0=0;QD=17.89;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2108,225,0 chrXI 628896 . C T 2086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.95;MQ0=0;QD=17.83;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2119,219,0 chrXI 628913 . T A 2282 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.474;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:2315,222,0 chrXI 629063 . T C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2967,336,0 chrXI 629129 . C A 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3620,369,0 chrXI 629639 . C T 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3618,390,0 chrXI 629750 . G A 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3407,354,0 chrXI 629864 . T C 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3301,345,0 chrXI 629976 . C T 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.396;DP=135;Dels=0.00;FS=4.281;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.008;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:135:99:3498,328,0 chrXI 630120 . T C 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3194,342,0 chrXI 630340 . G A 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3675,363,0 chrXI 630667 . G C 2055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.76;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2088,219,0 chrXI 631029 . C G 2699 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.969;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2732,280,0 chrXI 631523 . T C 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3544,384,0 chrXI 631526 . A T 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3680,381,0 chrXI 631559 . C T 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3399,357,0 chrXI 632009 . T C 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3038,324,0 chrXI 632031 . T C 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3329,357,0 chrXI 632039 . C T 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;DP=125;Dels=0.00;FS=4.342;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=23.81;ReadPosRankSum=-1.649;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3009,290,0 chrXI 632117 . T C 2823 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2856,318,0 chrXI 632408 . G A 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3609,369,0 chrXI 632513 . T C 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=1;QD=23.72;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2524,285,0 chrXI 632654 . T C 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2987,318,0 chrXI 632869 . A G 973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.72;MQ0=0;QD=12.64;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1006,120,0 chrXI 632920 . C T 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2480,261,0 chrXI 632929 . A G 2433 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2466,261,0 chrXI 633272 . A G 4463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2833;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=24.39;ReadPosRankSum=1.085;SB=-2.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,182:183:99:4463,489,0 chrXI 633329 . G A 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3607,363,0 chrXI 633545 . G A 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3479,354,0 chrXI 633641 . T A 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3105,324,0 chrXI 633794 . A G 3955.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.956e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3955,420,0 chrXI 633878 . T C 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3818,408,0 chrXI 634397 . C T 2308 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.49;MQ0=0;QD=21.77;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2341,240,0 chrXI 634414 . A G 2550 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.95;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2583,279,0 chrXI 634418 . G A 2563 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7369;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:104:99:2596,276,0 chrXI 634424 . A G 2544 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.88;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2577,279,0 chrXI 634474 . C T 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9588;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.84;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2830,297,0 chrXI 635532 . A G 2194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=22.62;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2227,240,0 chrXI 635886 . T C 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2629,282,0 chrXI 636649 . C T 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=1;QD=25.47;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3795,388,0 chrXI 636832 . G A 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=22.46;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3200,330,0 chrXI 636838 . A C 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=21.96;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3173,333,0 chrXI 637026 . T C 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3856,411,0 chrXI 637305 . C T 4458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.38;SB=-2.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4458,442,0 chrXI 637350 . T C 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.44;SB=-2.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3968,426,0 chrXI 637392 . G C 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3599,384,0 chrXI 638131 . C T 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3984,411,0 chrXI 638438 . C T 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;DP=157;Dels=0.01;FS=129.102;HaplotypeScore=14.1855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=0.32;ReadPosRankSum=-7.182;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,50:155:80:80,0,861 chrXI 638618 . T G 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3546,375,0 chrXI 638898 . G A 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3539,369,0 chrXI 639032 . A T 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3439,348,0 chrXI 639090 . C T 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3961,396,0 chrXI 639099 . G A 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3738,381,0 chrXI 639300 . A C 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3127,333,0 chrXI 639414 . G C 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3060,324,0 chrXI 640812 . T C 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=24.10;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3471,378,0 chrXI 641098 . A G 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7931;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3485,363,0 chrXI 641599 . G A 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2966,306,0 chrXI 641793 . C A 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3415,357,0 chrXI 642681 . T C 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.58;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2276,246,0 chrXI 643799 . G T 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.700;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2839,265,0 chrXI 644029 . C T 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2749,294,0 chrXI 645006 . A T 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.07;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2829,288,0 chrXI 645157 . T A 1603 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.57;MQ0=0;QD=24.66;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1636,180,0 chrXI 659095 . G A 47.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.85;MQ0=23;QD=1.60;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:9:80,9,0 chrXI 660700 . T C 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.90;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 chrXI 660936 . T G 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.92;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 chrXI 661088 . G A 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.94;MQ0=9;QD=2.16;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:55,6,0 chrXI 661093 . G C 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.62;MQ0=8;QD=2.18;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:53,6,0 chrXI 661167 . C T 291 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.85;MQ0=3;QD=18.19;SB=-1.649e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:36:324,36,0 chrXI 661199 . A G 289 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.85;MQ0=3;QD=18.06;SB=-1.599e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:36:322,36,0 chrXI 661241 . A G 109.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=3;QD=12.13;SB=-2.788e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:18:142,18,0 chrXI 661415 . A G 39.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.47;MQ0=2;QD=6.66;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:72,9,0 chrXI 665600 . A G 385 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.02;MQ0=0;QD=20.26;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:48:418,48,0 chrXI 665602 . G A 415 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.02;MQ0=0;QD=21.84;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:48:448,48,0 chrXI 665610 . A G 286 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.30;MQ0=0;QD=22.00;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:36:319,36,0 chrXI 665629 . A T 294 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.07;MQ0=0;QD=21.00;SB=-1.649e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:36:327,36,0 chrXI 665798 . G C 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.12;MQ0=6;MQRankSum=0.988;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-2.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,3:12:6:50,6,0 chrXI 665831 . A G 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.18;MQ0=0;QD=4.46;SB=-2.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:49,6,0 chrXI 665861 . T C 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.21;MQ0=0;QD=7.26;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrXI 665871 . C T 17.13 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.358;SB=-4.063e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:18:47,0,18 chrXI 665888 . G A 78.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=15.70;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:111,12,0 chrXI 665890 . T A 11.34 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.574e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:41:41,0,46 chrXI 665891 . T G 75.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=15.10;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:108,12,0 chrXI 665895 . G A 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=2.45;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-6.950e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:37:42,0,37 chrXI 665902 . A G 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.628e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:42:42,0,43 chrXI 665903 . A G 12.27 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=2.45;ReadPosRankSum=1.231;SB=-6.588e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:42:42,0,45 chrXI 665925 . G A 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;DP=18;Dels=0.00;FS=2.218;HaplotypeScore=7.1161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.58;MQ0=1;MQRankSum=-1.759;QD=1.17;ReadPosRankSum=1.055;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:51:51,0,220 chrXI 665927 . C T 309 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.0319;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.58;MQ0=1;QD=17.17;SB=-1.639e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:33:342,33,0 chrXI 665974 . T G 284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.994;DP=35;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=6.5837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.63;MQ0=1;MQRankSum=3.617;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.309;SB=-1.669e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:314,0,123 chrXI 665985 . A G 293.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;DP=38;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=6.5837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.52;MQ0=4;MQRankSum=3.307;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.998;SB=-1.789e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:323,0,123 chrXI 665996 . A G 279.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.222;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.95;MQ0=6;MQRankSum=3.956;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.645;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:309,0,189 chrXI 666012 . T A 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.623;DP=52;Dels=0.00;FS=9.359;HaplotypeScore=9.5921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.66;MQ0=8;MQRankSum=-3.208;QD=0.83;ReadPosRankSum=3.062;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:73:73,0,497 chrXI 666019 . T C 248.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.473;DP=52;Dels=0.00;FS=4.430;HaplotypeScore=18.6993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=8;MQRankSum=-2.180;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.166;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:278,0,253 chrXI 666054 . A T 193.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;DP=49;Dels=0.00;FS=8.078;HaplotypeScore=39.8311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.38;MQ0=8;MQRankSum=1.361;QD=3.94;ReadPosRankSum=2.393;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:223,0,281 chrXI 666055 . T G 472.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;DP=48;Dels=0.00;FS=2.015;HaplotypeScore=39.5428;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.54;MQ0=8;MQRankSum=0.078;QD=9.84;ReadPosRankSum=2.483;SB=-1.543e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,32:48:12:505,12,0 chrXI 666062 . G A 504.10 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.269;DP=55;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=34.9699;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.92;MQ0=8;MQRankSum=1.939;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-2.011e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,41:55:19:537,19,0 chrXI 666072 . C G 575 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.647;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.2332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.71;MQ0=8;MQRankSum=1.745;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.930;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,42:54:46:608,46,0 chrXI 666116 . A C 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.666;DP=33;Dels=0.00;FS=7.389;HaplotypeScore=31.9647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:65:65,0,230 chrXI 666117 . A G 306 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=31.9647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.07;MQ0=0;QD=9.27;SB=-7.544e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:33:39:339,39,0 chrXI 666123 . C G 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;DP=35;Dels=0.00;FS=6.425;HaplotypeScore=17.8964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.75;MQ0=1;MQRankSum=-1.382;QD=1.11;ReadPosRankSum=0.577;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:69:69,0,200 chrXI 666143 . G A 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.910;DP=57;Dels=0.00;FS=2.417;HaplotypeScore=4.8584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.88;MQ0=5;MQRankSum=1.504;QD=0.35;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,8:57:50:50,0,604 chrXI 666177 . G A 548.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.900;DP=145;Dels=0.00;FS=14.918;HaplotypeScore=6.3334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.95;MQ0=13;MQRankSum=-3.004;QD=3.78;ReadPosRankSum=3.207;SB=-1.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,46:145:99:578,0,1946 chrXI 666186 . G A 590.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.751;DP=159;Dels=0.01;FS=20.453;HaplotypeScore=5.3364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.13;MQ0=13;MQRankSum=-2.132;QD=3.71;ReadPosRankSum=2.698;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,50:158:99:620,0,2095 chrXI 666198 . A G 3653.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.6207;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=13;QD=20.64;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:3653,342,0 chrXI 666203 . A G 221.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;DP=185;Dels=0.00;FS=13.179;HaplotypeScore=34.7252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.79;MQ0=13;MQRankSum=-0.982;QD=1.19;ReadPosRankSum=4.344;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,29:185:99:251,0,3048 chrXI 666300 . A G 18.07 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.161;DP=54;Dels=0.02;FS=20.693;HaplotypeScore=24.3098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.31;MQ0=2;MQRankSum=-3.873;QD=0.33;ReadPosRankSum=-0.981;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:48:48,0,851 chrXI 666462 . T C 115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.612;DP=51;Dels=0.00;FS=2.748;HaplotypeScore=5.2995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.30;MQ0=0;MQRankSum=-4.274;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:145,0,815 chrXI 666468 . A G 116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.452;DP=53;Dels=0.00;FS=1.156;HaplotypeScore=4.5602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.33;MQ0=0;MQRankSum=-4.452;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-7.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:146,0,871 chrXI 666608 . T A 111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;DP=51;Dels=0.04;FS=28.609;HaplotypeScore=102.5477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.66;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:141,0,228 chrXII 4 . A C 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.477;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=45.4449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.62;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=0.33;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-6.588e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:40:40,0,45 chrXII 67 . C A 273.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.595;DP=138;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=283.7020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.777;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,41:136:99:303,0,840 chrXII 77 . T A 437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.368;DP=145;Dels=0.05;FS=3.948;HaplotypeScore=224.6101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.59;MQ0=1;MQRankSum=-2.603;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.625;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,52:138:99:467,0,1279 chrXII 86 . C T 392.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.322;DP=149;Dels=0.00;FS=3.195;HaplotypeScore=96.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.42;MQ0=4;MQRankSum=-3.884;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.632;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,47:149:99:422,0,1685 chrXII 92 . C T 878.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.203;DP=182;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=53.2064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.70;MQ0=6;MQRankSum=-3.498;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.233;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,72:182:99:908,0,1775 chrXII 107 . T C 1103.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.130;DP=242;Dels=0.00;FS=19.454;HaplotypeScore=11.0562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.93;MQ0=7;MQRankSum=-5.352;QD=4.56;ReadPosRankSum=-5.038;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,97:242:99:1133,0,2676 chrXII 176 . G A 1072.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.934;DP=260;Dels=0.00;FS=4.463;HaplotypeScore=31.6347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.00;MQ0=21;MQRankSum=-1.966;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.705;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,76:260:99:1102,0,2900 chrXII 182 . C T 1756.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;DP=249;Dels=0.00;FS=3.505;HaplotypeScore=31.6347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.10;MQ0=27;MQRankSum=-2.283;QD=7.05;ReadPosRankSum=2.103;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,104:249:99:1786,0,1968 chrXII 217 . G T 303.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.325;DP=98;Dels=0.00;FS=5.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.77;MQ0=54;MQRankSum=-0.931;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.827;SB=-7.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,27:98:99:333,0,458 chrXII 237 . G A 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.520;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.62;MQ0=70;MQRankSum=-0.597;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,9:81:80:80,0,158 chrXII 241 . T A 49.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.12;MQ0=71;MQRankSum=-0.365;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,9:81:79:79,0,146 chrXII 347 . T C 99.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.000;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.14;MQ0=61;MQRankSum=0.472;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,9:84:99:129,0,232 chrXII 378 . G A 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.325;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.5576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.20;MQ0=61;MQRankSum=1.035;QD=0.44;ReadPosRankSum=0.022;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,7:94:71:71,0,462 chrXII 399 . G A 240.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.053;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.52;MQ0=63;MQRankSum=0.062;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.644;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,15:93:99:270,0,204 chrXII 641 . C G 99.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.92;MQ0=5;QD=9.93;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,5:10:15:132,15,0 chrXII 687 . T C 40.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.55;MQ0=47;MQRankSum=1.231;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.358;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:37:70,0,37 chrXII 5305 . G A 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.76;MQ0=73;MQRankSum=-0.736;QD=0.34;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:67,9:76:6:57,6,0 chrXII 5646 . C A 319 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.22;MQ0=10;QD=13.87;SB=-1.699e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,15:23:36:352,36,0 chrXII 5647 . A G 313 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.05;MQ0=7;QD=15.65;SB=-1.669e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,15:20:36:346,36,0 chrXII 5656 . T G 245.19 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.36;MQ0=4;MQRankSum=-0.290;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-1.388e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,12:16:8:277,8,0 chrXII 5735 . C T 93.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.595;DP=136;Dels=0.00;FS=94.058;HaplotypeScore=55.7959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.59;MQ0=2;MQRankSum=-4.746;QD=0.68;ReadPosRankSum=-7.336;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,36:136:99:123,0,1840 chrXII 5741 . T C 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.908;DP=160;Dels=0.00;FS=97.695;HaplotypeScore=65.1923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.47;MQ0=2;MQRankSum=6.435;QD=10.22;ReadPosRankSum=7.180;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,92:160:99:1665,0,588 chrXII 5756 . C T 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.475;DP=173;Dels=0.00;FS=3.398;HaplotypeScore=30.7275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.68;MQ0=5;MQRankSum=-1.261;QD=0.09;ReadPosRankSum=1.328;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,23:173:45:45,0,2246 chrXII 5757 . A T 1290.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;DP=172;Dels=0.00;FS=129.918;HaplotypeScore=30.7275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.66;MQ0=5;MQRankSum=7.386;QD=7.50;ReadPosRankSum=4.178;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,70:172:99:1320,0,1020 chrXII 5803 . C T 859.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.028;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=23.8974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.74;MQ0=4;MQRankSum=2.192;QD=7.16;ReadPosRankSum=-2.796;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,70:120:99:889,0,249 chrXII 5807 . C G 383.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;DP=108;Dels=0.00;FS=4.915;HaplotypeScore=15.4116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.11;MQ0=4;MQRankSum=-0.936;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.715;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:413,0,612 chrXII 5843 . G A 221 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.932;DP=26;Dels=0.00;FS=2.948;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.39;MQ0=2;MQRankSum=0.366;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.470;SB=-1.302e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:30:254,30,0 chrXII 5854 . G T 94.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.63;MQ0=5;MQRankSum=-0.636;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.212;SB=-6.508e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:53:124,0,53 chrXII 5874 . G A 107.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.269;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.74;MQ0=15;MQRankSum=0.634;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:137,0,126 chrXII 5878 . T A 105.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.170;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.55;MQ0=15;MQRankSum=0.634;QD=3.18;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:135,0,143 chrXII 5891 . T G 66.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.134;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.73;MQ0=19;MQRankSum=1.880;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:96:96,0,187 chrXII 5892 . G T 71.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.977;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.73;MQ0=19;MQRankSum=2.037;QD=1.73;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:99:101,0,177 chrXII 5897 . A G 67.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.977;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.8466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.73;MQ0=19;MQRankSum=1.254;QD=1.63;ReadPosRankSum=-1.489;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:97:97,0,188 chrXII 5899 . C T 69.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.8466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.73;MQ0=19;MQRankSum=1.802;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.332;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:99:99,0,185 chrXII 5904 . G C 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.86;MQ0=20;MQRankSum=0.033;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.303;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,10:43:69:69,0,234 chrXII 5943 . T C 141.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.48;MQ0=28;MQRankSum=0.170;QD=2.56;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:171,0,243 chrXII 5957 . T C 75.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.40;MQ0=25;MQRankSum=-0.915;QD=1.50;ReadPosRankSum=-1.470;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,10:50:99:105,0,246 chrXII 5961 . C T 27.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.525;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.08;MQ0=25;MQRankSum=-1.551;QD=0.57;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,7:47:57:57,0,253 chrXII 5962 . T C 28.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.50;MQ0=24;MQRankSum=-1.225;QD=0.65;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,7:43:58:58,0,209 chrXII 5966 . C G 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.32;MQ0=25;MQRankSum=-1.056;QD=0.80;ReadPosRankSum=-1.225;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:65:65,0,201 chrXII 5995 . A G 212.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.768;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.64;MQ0=28;MQRankSum=2.171;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.107;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,13:69:99:242,0,495 chrXII 6036 . G A 203.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.086;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.71;MQ0=32;MQRankSum=1.914;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,12:66:99:233,0,348 chrXII 6119 . T A 66.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.53;MQ0=37;MQRankSum=-0.278;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.246;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,5:48:62:96,0,62 chrXII 6147 . T C 78.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.4302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.94;MQ0=47;MQRankSum=-0.717;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.387;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,6:58:91:108,0,91 chrXII 11224 . A C 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.008;DP=24;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=34.1418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.28;MQ0=4;MQRankSum=0.436;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.611;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:76:76,0,96 chrXII 11399 . C T 56.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.457;DP=20;Dels=0.00;FS=2.017;HaplotypeScore=6.7962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.83;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=2.80;ReadPosRankSum=-3.439;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:86:86,0,136 chrXII 11430 . T C 157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;DP=20;Dels=0.00;FS=2.128;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.83;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:25:187,0,25 chrXII 11448 . T C 60.11 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;DP=13;Dels=0.00;FS=5.304;HaplotypeScore=9.4496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.086;SB=-2.733e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:13:90,0,13 chrXII 11458 . G A 44.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=7.4577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.40;MQ0=1;MQRankSum=-0.742;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-5.015e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:13:74,0,13 chrXII 11530 . T C 53.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.58;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=3.79;ReadPosRankSum=2.001;SB=-6.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:83:83,0,110 chrXII 11536 . A G 51.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;DP=13;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=4.8460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.02;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.791;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:81:81,0,88 chrXII 11554 . G A 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.0788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.85;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:11:66:66,0,84 chrXII 11572 . G C 47.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=0;QD=9.59;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:80,9,0 chrXII 11652 . T C 314 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.61;MQ0=4;QD=14.27;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,19:22:33:347,33,0 chrXII 11846 . T C 134.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;DP=28;Dels=0.00;FS=7.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.59;MQ0=11;MQRankSum=0.102;QD=4.79;ReadPosRankSum=-1.123;SB=-7.359e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,19:28:18:167,18,0 chrXII 13338 . C T 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3286;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.55;MQ0=114;MQRankSum=-0.667;QD=0.18;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:113,15:128:6:54,6,0 chrXII 13550 . G A 152.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.059;DP=99;Dels=0.00;FS=23.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.13;MQ0=83;MQRankSum=2.606;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.586;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:82,17:99:21:185,21,0 chrXII 13552 . T G 151.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=103;Dels=0.00;FS=23.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.97;MQ0=87;MQRankSum=2.266;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.473;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:86,17:103:21:184,21,0 chrXII 13556 . C T 151.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.266;DP=104;Dels=0.00;FS=24.693;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.15;MQ0=87;MQRankSum=2.266;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.001;SB=-4.053e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:87,17:104:21:184,21,0 chrXII 13561 . T A 171.03 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.197;DP=110;Dels=0.00;FS=26.107;HaplotypeScore=3.3286;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.64;MQ0=92;MQRankSum=2.366;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:92,18:110:24:204,24,0 chrXII 13610 . A G 115.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.366;DP=93;Dels=0.00;FS=38.085;HaplotypeScore=3.3286;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.73;MQ0=78;MQRankSum=3.366;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.772;SB=-7.359e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:80,13:93:18:148,18,0 chrXII 13683 . G A 191.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.27;MQ0=12;QD=7.35;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:24:224,24,0 chrXII 13781 . G A 41.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=12;Dels=0.00;FS=9.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.97;MQ0=4;MQRankSum=0.747;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.747;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:9:74,9,0 chrXII 13790 . G A 67.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.81;MQ0=2;QD=8.44;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,6:8:12:100,12,0 chrXII 13791 . A T 67.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.81;MQ0=2;QD=8.44;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,6:8:12:100,12,0 chrXII 13817 . C A 101.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.29;MQ0=1;QD=7.79;SB=-2.707e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:15:134,15,0 chrXII 13818 . A G 73.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.34;MQ0=2;QD=5.25;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:12:106,12,0 chrXII 13824 . T A 103.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.48;MQ0=3;QD=6.88;SB=-2.707e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:15:15:136,15,0 chrXII 13875 . A T 206.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.91;MQ0=2;QD=10.84;SB=-9.602e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:27:239,27,0 chrXII 13876 . G T 207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.91;MQ0=2;QD=10.90;SB=-9.902e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:27:240,27,0 chrXII 13888 . A T 389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.55;MQ0=2;MQRankSum=-0.777;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.299;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:27:422,27,0 chrXII 13986 . G A 1266 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.98;MQ0=0;QD=24.82;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:51:99:1299,135,0 chrXII 13990 . T C 929 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.88;MQ0=0;QD=21.60;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:962,108,0 chrXII 13992 . G T 1003 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1036,111,0 chrXII 14020 . T C 888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.24;MQ0=0;QD=20.18;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:921,102,0 chrXII 14041 . A T 807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.23;MQ0=0;QD=19.21;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:90:840,90,0 chrXII 14063 . T G 1075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.49;MQ0=0;QD=21.50;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1108,120,0 chrXII 14087 . T G 1094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.30;MQ0=0;QD=23.78;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1127,120,0 chrXII 14265 . G T 1362 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.47;MQ0=0;QD=25.22;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1395,144,0 chrXII 14312 . T G 986 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.32;MQ0=0;QD=23.48;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1019,111,0 chrXII 14317 . G A 911 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.90;MQ0=0;QD=23.36;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:944,102,0 chrXII 14318 . C T 920 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.90;MQ0=0;QD=23.59;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:953,102,0 chrXII 14785 . A G 1043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.70;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1076,114,0 chrXII 14801 . T A 1099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1132,114,0 chrXII 15102 . T G 1799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.46;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1832,201,0 chrXII 15147 . T G 1650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1683,177,0 chrXII 15269 . C T 1518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.505;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.335;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.164;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:99:1551,145,0 chrXII 15466 . G A 1680 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.35;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1713,168,0 chrXII 15467 . C T 1673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.25;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1706,168,0 chrXII 15806 . G A 1775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1808,189,0 chrXII 15923 . A C 1417 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.62;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:60:99:1450,165,0 chrXII 15995 . C T 1889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1922,195,0 chrXII 16099 . A T 1454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1487,156,0 chrXII 16137 . T C 1515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.84;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1548,168,0 chrXII 16146 . A G 1765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.58;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1798,195,0 chrXII 16175 . A C 1283 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.76;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1316,135,0 chrXII 16311 . G A 1503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=25.47;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1536,159,0 chrXII 16338 . A C 1792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=24.89;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1825,198,0 chrXII 16487 . G A 1091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.56;MQ0=0;QD=22.73;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1124,117,0 chrXII 16523 . C G 1258 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.465;DP=86;Dels=0.00;FS=92.962;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.09;MQ0=0;MQRankSum=3.592;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.898;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,59:86:55:1291,55,0 chrXII 16528 . G A 1238 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.836;DP=85;Dels=0.00;FS=94.960;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.19;MQ0=0;MQRankSum=3.478;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,58:85:48:1271,48,0 chrXII 16531 . T C 1168 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-5.528;DP=81;Dels=0.00;FS=91.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.09;MQ0=0;MQRankSum=3.333;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.492;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,55:81:43:1201,43,0 chrXII 16532 . T C 1194 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.848;DP=81;Dels=0.00;FS=91.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.09;MQ0=0;MQRankSum=3.374;QD=14.74;ReadPosRankSum=1.786;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,55:81:44:1227,44,0 chrXII 16562 . T A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.311;DP=81;Dels=0.00;FS=55.219;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.44;MQ0=0;MQRankSum=2.221;QD=16.65;ReadPosRankSum=3.380;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,63:81:61:1379,0,61 chrXII 16672 . G A 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.246;DP=109;Dels=0.00;FS=6.373;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.976;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,71:109:99:1551,0,651 chrXII 16745 . G A 536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.601;DP=87;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=3.4721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.110;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:566,0,1072 chrXII 17262 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.775;DP=133;Dels=0.00;FS=8.389;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.505;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1088,0,1724 chrXII 17299 . A G 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.592;DP=133;Dels=0.00;FS=15.084;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,50:133:99:912,0,1881 chrXII 18460 . C T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.149;DP=111;Dels=0.00;FS=7.905;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.507;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.601;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1132,0,1136 chrXII 18491 . G A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;DP=114;Dels=0.00;FS=5.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.524;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1168,0,1214 chrXII 18699 . T C 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3171,336,0 chrXII 19080 . C T 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3454,343,0 chrXII 19164 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.940;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1221,0,1481 chrXII 19191 . T A 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.78;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3220,330,0 chrXII 19236 . A G 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3477,378,0 chrXII 19419 . A G 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3194,333,0 chrXII 19593 . C T 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3789,376,0 chrXII 19608 . G C 4067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=1;QD=26.07;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4067,411,0 chrXII 19788 . A G 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3673,372,0 chrXII 19819 . T G 3588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.68;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3588,384,0 chrXII 19832 . C T 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3456,360,0 chrXII 19877 . C T 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.68;MQ0=0;QD=26.55;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2953,318,0 chrXII 19889 . G A 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=27.24;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3029,318,0 chrXII 19910 . A T 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.4171;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.67;MQ0=0;QD=21.55;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2597,276,0 chrXII 19941 . A C 1078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.49;MQ0=0;QD=13.15;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1111,123,0 chrXII 20003 . G A 2786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.41;MQ0=0;QD=23.22;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2819,294,0 chrXII 20019 . C T 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.59;MQ0=0;QD=25.78;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3583,381,0 chrXII 20041 . A C 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.61;MQ0=0;QD=25.49;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2964,327,0 chrXII 20097 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.81;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2718,288,0 chrXII 20103 . G C 2608 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.44;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2641,291,0 chrXII 20108 . G C 2341 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.35;MQ0=0;QD=22.73;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2374,261,0 chrXII 20109 . C T 2413 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.35;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2446,261,0 chrXII 20114 . C T 2272 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=88.9188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.25;MQ0=0;QD=20.29;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2305,249,0 chrXII 20157 . G A 2092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.72;MQ0=0;QD=21.57;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2125,231,0 chrXII 20163 . A G 1944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=96;Dels=0.00;FS=3.590;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.443;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:1977,197,0 chrXII 20194 . A T 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;DP=95;Dels=0.00;FS=3.827;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:903,0,795 chrXII 20200 . A G 1818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.09;MQ0=0;QD=20.66;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1851,210,0 chrXII 20228 . G T 2152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.97;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2185,225,0 chrXII 20235 . G A 2146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.18;MQ0=0;QD=26.17;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2179,219,0 chrXII 20241 . C T 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.45;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2573,264,0 chrXII 20301 . G A 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3062,315,0 chrXII 20344 . T A 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.61;MQ0=0;QD=26.77;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3005,309,0 chrXII 20366 . T C 2677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=105;Dels=0.00;FS=3.584;HaplotypeScore=6.8435;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=25.50;ReadPosRankSum=1.600;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2710,260,0 chrXII 20402 . A G 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3038,318,0 chrXII 20423 . C G 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.21;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3474,351,0 chrXII 20452 . G A 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.27;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3401,342,0 chrXII 20602 . T C 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=24.92;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3048,321,0 chrXII 20619 . A G 2361 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.55;MQ0=0;QD=22.92;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2394,252,0 chrXII 20630 . C A 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.30;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2762,279,0 chrXII 20686 . C T 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=1;QD=26.20;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2574,261,0 chrXII 20945 . A C 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3458,378,0 chrXII 20990 . C A 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3691,358,0 chrXII 21053 . T A 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2774,291,0 chrXII 21252 . T C 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3415,381,0 chrXII 21384 . T C 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.222;DP=143;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=8.86;ReadPosRankSum=2.814;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1297,0,1615 chrXII 21405 . A G 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3494,357,0 chrXII 21407 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.324;DP=138;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.820;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1398,0,1458 chrXII 21440 . G A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;DP=122;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=4.9634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=9.82;ReadPosRankSum=-2.761;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:121:99:1228,0,1272 chrXII 21474 . C T 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.274;DP=168;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=5.4899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=10.53;ReadPosRankSum=-2.879;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,84:168:99:1799,0,1701 chrXII 21693 . C G 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.892e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3721,378,0 chrXII 21830 . T C 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3866,417,0 chrXII 21837 . C A,G 3815.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.12;MQ0=0;QD=22.57;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,82,87:169:99:3815,1952,1735,1863,0,1641 chrXII 21869 . A G 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2960,333,0 chrXII 21957 . C T 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3353,354,0 chrXII 21959 . C T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3285,339,0 chrXII 22019 . T C 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.92;MQ0=0;QD=23.19;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3140,333,0 chrXII 22028 . A G 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.68;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3144,333,0 chrXII 22049 . T C 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.85;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2685,279,0 chrXII 22074 . T C 2885 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.28;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2918,324,0 chrXII 22078 . A G 2815 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.14;MQ0=0;QD=22.89;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2848,315,0 chrXII 22083 . T C 2974 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.55;MQ0=0;QD=24.18;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3007,330,0 chrXII 22201 . A G 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3586,378,0 chrXII 22367 . T G 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.730;DP=114;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=6.5535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.880;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1045,0,1319 chrXII 22395 . C T 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.38;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=26.09;ReadPosRankSum=1.545;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2929,297,0 chrXII 22420 . C A 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.802;DP=110;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=-4.215;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.985;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:847,0,1341 chrXII 22436 . G A 2559 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.78;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2592,276,0 chrXII 22437 . G A 2578 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.78;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2611,276,0 chrXII 22443 . A G 2434 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.94;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2467,282,0 chrXII 22491 . G A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.72;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2997,315,0 chrXII 22509 . G A 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.90;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2898,303,0 chrXII 22572 . G A 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.83;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2878,297,0 chrXII 22603 . T C 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2534,279,0 chrXII 22642 . G T 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.41;MQ0=0;QD=22.58;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3194,315,0 chrXII 22753 . T C 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3299,348,0 chrXII 22902 . T A 3658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.76;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3658,373,0 chrXII 23030 . A G 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=1;QD=25.53;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:3982,403,0 chrXII 23062 . T A 1780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.169;DP=169;Dels=0.00;FS=1.219;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.819;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,87:169:99:1810,0,1723 chrXII 23159 . G A 4034.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.37;SB=-2.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4034,412,0 chrXII 23228 . A G 4107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4107,432,0 chrXII 23505 . A G 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.033;DP=157;Dels=0.00;FS=1.273;HaplotypeScore=118.0654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.673;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1528,0,1758 chrXII 23568 . T C 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3738,387,0 chrXII 23820 . G C 2672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.18;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2705,291,0 chrXII 23826 . C G 2640 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.25;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2673,285,0 chrXII 23845 . T A 2247 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.83;MQ0=0;QD=22.25;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2280,237,0 chrXII 23846 . C A 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.83;MQ0=0;QD=22.21;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2276,237,0 chrXII 23860 . A G 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.77;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2798,303,0 chrXII 23981 . C T 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3586,358,0 chrXII 24051 . T C 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5387;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3890,411,0 chrXII 24053 . T A 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;DP=155;Dels=0.00;FS=5.981;HaplotypeScore=5.5387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.369;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1617,0,1650 chrXII 24179 . G A 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.30;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3770,384,0 chrXII 24246 . T G 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3715,405,0 chrXII 24279 . T C 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4009;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3432,357,0 chrXII 24315 . G A 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3620,364,0 chrXII 24323 . C T 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.669;DP=126;Dels=0.00;FS=6.779;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.379;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1173,0,1439 chrXII 24384 . T C 2328 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.03;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2361,252,0 chrXII 24591 . T A 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7359;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.86;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3868,391,0 chrXII 24681 . C T 4115.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=1;QD=25.72;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:4115,424,0 chrXII 24687 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.832;DP=157;Dels=0.00;FS=9.857;HaplotypeScore=4.9802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=1;MQRankSum=1.297;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.796;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:157:99:1502,0,1719 chrXII 24890 . G A 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3270,310,0 chrXII 24893 . T A 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3208,310,0 chrXII 24926 . G A 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3389,340,0 chrXII 24948 . T C 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.54;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3371,348,0 chrXII 25143 . G A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;DP=128;Dels=0.00;FS=2.264;HaplotypeScore=4.9670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.445;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1203,0,1466 chrXII 25333 . C T 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=26.85;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2637,273,0 chrXII 25369 . T G 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.941;DP=119;Dels=0.00;FS=11.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.754;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,116:119:99:2717,300,0 chrXII 25388 . A T 787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;DP=106;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=49.3201;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.564;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:64:820,64,0 chrXII 25389 . A T 803 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.509;DP=105;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=52.3042;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.426;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:64:836,64,0 chrXII 25411 . C T 1862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.343;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:1895,180,0 chrXII 25449 . C T 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=24.23;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3183,339,0 chrXII 25493 . C T 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=28.30;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3396,355,0 chrXII 25499 . A G 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3403,366,0 chrXII 25545 . C T 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3303,336,0 chrXII 25640 . G A 3996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3996,414,0 chrXII 25817 . T G 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.548;DP=158;Dels=0.00;FS=3.733;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.314;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1535,0,1751 chrXII 25933 . A G 3941.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3941,411,0 chrXII 26176 . G A 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3801,388,0 chrXII 26194 . C G 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3720,390,0 chrXII 26362 . C G 4537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=24.52;SB=-2.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4537,460,0 chrXII 27093 . T C 4747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.94;SB=-2.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4747,487,0 chrXII 27108 . C A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.137;DP=161;Dels=0.00;FS=1.230;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.829;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,71:161:99:1468,0,1893 chrXII 27180 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;DP=137;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=2.7114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:137:99:1398,0,1095 chrXII 27238 . C T 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.868;DP=137;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.686;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1193,0,1091 chrXII 27526 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;DP=128;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.091;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1412,0,1205 chrXII 27921 . C T 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.423;DP=154;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=4.1260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.607;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1691,0,1464 chrXII 28252 . A G 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.615;DP=113;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.112;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:783,0,1230 chrXII 28285 . A T 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3736,373,0 chrXII 28293 . T C 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.37;SB=-2.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3856,393,0 chrXII 28349 . C T 4315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4315,450,0 chrXII 28431 . T C 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.869;DP=164;Dels=0.00;FS=3.724;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.267;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,90:164:99:1935,0,1446 chrXII 28676 . G C 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4075,423,0 chrXII 28713 . C G 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.939;DP=162;Dels=0.00;FS=3.842;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1724,0,1576 chrXII 28784 . G A 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.364;DP=167;Dels=0.00;FS=21.261;HaplotypeScore=2.9583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=2.125;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.677;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,75:167:99:1598,0,1911 chrXII 28824 . G C 4399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.03;SB=-2.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4399,459,0 chrXII 28868 . G A 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3531,372,0 chrXII 29013 . C T 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.005;DP=161;Dels=0.00;FS=5.983;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.825;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1769,0,1613 chrXII 29085 . G C 4949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.32;SB=-2.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4949,508,0 chrXII 29137 . G A 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;DP=171;Dels=0.00;FS=1.269;HaplotypeScore=3.6113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,87:171:99:1851,0,1788 chrXII 29160 . C T 4963.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.97;SB=-2.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4963,481,0 chrXII 29379 . T C 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.248;DP=159;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.40;ReadPosRankSum=-2.448;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1524,0,1842 chrXII 29414 . A C 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.89;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3531,378,0 chrXII 29437 . T C 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.84;MQ0=0;QD=20.53;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3408,372,0 chrXII 29440 . C T 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3968,429,0 chrXII 29612 . A G 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3928,423,0 chrXII 29663 . G T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.027;DP=159;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=1.744;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:1654,0,1488 chrXII 29773 . C A 3908.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.32;MQ0=0;QD=26.41;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3908,397,0 chrXII 29781 . T G 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.32;MQ0=0;QD=25.11;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3641,390,0 chrXII 29948 . T A 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4114,415,0 chrXII 30012 . A G 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2917,306,0 chrXII 30087 . A G 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2776,291,0 chrXII 30327 . C T 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3296,339,0 chrXII 30768 . C T 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3815,376,0 chrXII 30930 . C T 3768.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3768,382,0 chrXII 30995 . T C 1853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.802;DP=175;Dels=0.00;FS=10.358;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.193;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,94:175:99:1883,0,1689 chrXII 31128 . C T 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3380,340,0 chrXII 31221 . T C 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3646,399,0 chrXII 31341 . C T 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.904;DP=157;Dels=0.00;FS=3.737;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,70:157:99:1438,0,1861 chrXII 31551 . C A 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.333;DP=129;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1647,0,1014 chrXII 31630 . G A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.117;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1015,0,1314 chrXII 31899 . T A 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2488,264,0 chrXII 32169 . C G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;DP=133;Dels=0.00;FS=4.128;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.042;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1254,0,1421 chrXII 32552 . T C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.742;DP=124;Dels=0.00;FS=5.530;HaplotypeScore=2.9361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.003;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1209,0,1450 chrXII 32690 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.306;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.403;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1403,0,1200 chrXII 33112 . A G 1900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.36;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1933,201,0 chrXII 33349 . A C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.707;DP=111;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1168,0,1099 chrXII 33353 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.544;DP=112;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.382;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1259,0,1087 chrXII 34210 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.375;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.213;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1408,0,1203 chrXII 34564 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;DP=103;Dels=0.00;FS=6.411;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1197,0,1000 chrXII 34786 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.096;DP=146;Dels=0.00;FS=15.589;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1274,0,1522 chrXII 35020 . T A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;DP=126;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.740;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.025;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1194,0,1481 chrXII 35196 . A G 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.12;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3173,348,0 chrXII 35207 . C T 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3720,382,0 chrXII 35238 . T G 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;DP=133;Dels=0.00;FS=4.163;HaplotypeScore=4.5527;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=26.09;ReadPosRankSum=1.602;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3470,344,0 chrXII 35267 . T C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.144;DP=137;Dels=0.00;FS=7.727;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.901;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1307,0,1577 chrXII 35302 . T C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;DP=119;Dels=0.00;FS=4.400;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.083;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1078,0,1468 chrXII 35464 . C G 299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.388;DP=99;Dels=0.00;FS=7.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=3.02;ReadPosRankSum=-1.507;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,34:99:99:329,0,1345 chrXII 35481 . T C 419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.452;DP=96;Dels=0.00;FS=7.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.708;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,35:96:99:449,0,1420 chrXII 35482 . A G 423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.295;DP=96;Dels=0.00;FS=7.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.967;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,35:96:99:453,0,1399 chrXII 35569 . T C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;DP=116;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.188;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1159,0,1272 chrXII 35587 . C T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.683;DP=125;Dels=0.00;FS=4.340;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1404,0,1224 chrXII 35616 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.606;DP=138;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=5.9498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.621;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1203,0,1577 chrXII 35779 . T C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.380;DP=139;Dels=0.00;FS=1.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.787;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1313,0,1588 chrXII 35854 . T C 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.826;DP=134;Dels=0.00;FS=14.810;HaplotypeScore=4.6349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=2.169;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.927;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,50:134:99:908,0,1963 chrXII 36311 . C T 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3179,330,0 chrXII 36662 . G A 1204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=44.6154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=11.15;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:1237,126,0 chrXII 36804 . T A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1269,0,1001 chrXII 37034 . C T 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.890;DP=91;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.508;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:91:99:749,0,1072 chrXII 37184 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.386;DP=108;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=11.15;ReadPosRankSum=2.169;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1234,0,1073 chrXII 37196 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.376;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.720;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1353,0,1176 chrXII 37425 . G A 638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.191;DP=94;Dels=0.00;FS=5.839;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.305;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,35:94:99:668,0,1298 chrXII 37611 . T C 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.768;DP=83;Dels=0.00;FS=15.516;HaplotypeScore=6.9542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:839,0,900 chrXII 37705 . T C 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.876;DP=118;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=3.7763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1392,0,1116 chrXII 37762 . A T 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;DP=126;Dels=0.00;FS=8.273;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.200;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1053,0,1525 chrXII 37937 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.166;DP=124;Dels=0.00;FS=3.365;HaplotypeScore=4.1740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=8.34;ReadPosRankSum=2.200;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1064,0,1553 chrXII 37966 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.209;DP=117;Dels=0.00;FS=2.405;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.278;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1078,0,1446 chrXII 38224 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.828;DP=129;Dels=0.00;FS=5.351;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1152,0,1515 chrXII 38338 . G T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.748;DP=142;Dels=0.00;FS=1.352;HaplotypeScore=4.1368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1254,0,1631 chrXII 38737 . T G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.943;DP=118;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1169,0,1288 chrXII 39312 . C G 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.215;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.060;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,74:118:99:1513,0,798 chrXII 39313 . G A 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.891;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.347;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,72:117:99:1580,0,863 chrXII 39652 . A G 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.469;DP=124;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.786;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.145;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1294,0,1251 chrXII 40119 . G A 2053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.37;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2086,213,0 chrXII 41556 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.060;DP=95;Dels=0.00;FS=1.686;HaplotypeScore=4.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1040,0,930 chrXII 41600 . T C 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.213;DP=84;Dels=0.00;FS=7.184;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.152;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:802,0,940 chrXII 41628 . C T 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.518;DP=90;Dels=0.00;FS=14.529;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:878,0,990 chrXII 45070 . A G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.633;DP=137;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.534;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1585,0,1357 chrXII 45294 . T C 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;DP=144;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1496,0,1521 chrXII 45778 . T C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.491;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.636;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1057,0,1536 chrXII 46414 . T A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;DP=140;Dels=0.00;FS=4.237;HaplotypeScore=83.5702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1369,0,1400 chrXII 46479 . T A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.046;DP=128;Dels=0.00;FS=4.605;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.779;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1449,0,1258 chrXII 46528 . A T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=115;Dels=0.00;FS=3.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.56;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.676;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1317,0,1027 chrXII 46645 . A G 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.558;DP=105;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.674;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:669,0,1370 chrXII 46783 . C T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.107;DP=114;Dels=0.00;FS=6.148;HaplotypeScore=3.4542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.778;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1102,0,1019 chrXII 47058 . G A 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.085;DP=106;Dels=0.00;FS=0.837;HaplotypeScore=4.9543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.967;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.801;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:995,0,1318 chrXII 47080 . C T 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.560;DP=90;Dels=0.00;FS=0.861;HaplotypeScore=2.9741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.500;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:852,0,871 chrXII 47928 . G A 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.91;MQ0=2;QD=25.40;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3328,348,0 chrXII 48757 . G A 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;DP=147;Dels=0.00;FS=2.121;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=1;MQRankSum=-1.219;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1689,0,1431 chrXII 48820 . T A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;DP=136;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQ0=0;MQRankSum=-5.635;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1376,0,1533 chrXII 48832 . T G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.587;DP=136;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=3.9900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-5.850;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:136:99:1300,0,1573 chrXII 48833 . T A 3722.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.42;MQ0=0;QD=27.37;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3722,390,0 chrXII 48847 . T C 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.308;DP=109;Dels=0.00;FS=6.563;HaplotypeScore=88.4739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQ0=0;MQRankSum=-8.080;QD=8.51;ReadPosRankSum=-4.086;SB=-5.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:958,0,1282 chrXII 48880 . G A 276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.972;DP=168;Dels=0.03;FS=435.594;HaplotypeScore=8.5464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=3;MQRankSum=1.951;QD=1.64;ReadPosRankSum=-6.740;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,72:163:99:306,0,467 chrXII 48888 . G A 53.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.739;DP=151;Dels=0.01;FS=349.771;HaplotypeScore=19.5545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.16;MQ0=2;MQRankSum=2.110;QD=0.35;ReadPosRankSum=-8.430;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,48:149:83:83,0,761 chrXII 48923 . G C 694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.874;DP=113;Dels=0.00;FS=14.456;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:724,0,1275 chrXII 49638 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.748;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=8.94;ReadPosRankSum=2.109;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1228,0,1515 chrXII 49822 . G T 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.403;DP=83;Dels=0.00;FS=1.892;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.957;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.336;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,53:83:99:1139,0,557 chrXII 49831 . T A 2061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.83;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2094,210,0 chrXII 49993 . C G 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;DP=132;Dels=0.00;FS=4.131;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.126;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1599,0,1149 chrXII 50192 . A G 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3685,363,0 chrXII 50531 . C T 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;DP=155;Dels=0.00;FS=2.830;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,84:155:99:1686,0,1477 chrXII 54190 . G A 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.843;DP=176;Dels=0.00;FS=1.188;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,85:176:99:1801,0,1866 chrXII 55033 . C T 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.74;SB=-2.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3877,382,0 chrXII 56365 . T C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.668;DP=138;Dels=0.00;FS=4.257;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1381,0,1474 chrXII 56781 . G T 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3234,315,0 chrXII 57868 . C T 605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.642;DP=70;Dels=0.00;FS=0.912;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:635,0,841 chrXII 58510 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.959;DP=125;Dels=0.00;FS=15.209;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1383,0,1237 chrXII 59265 . C T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.458;DP=132;Dels=0.00;FS=10.914;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.859;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1417,0,1309 chrXII 59339 . C T 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=126;Dels=0.00;FS=1.454;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.719;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1410,0,1206 chrXII 59908 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.117;DP=135;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=3.7125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.576;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1242,0,1546 chrXII 60105 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.742;DP=119;Dels=0.00;FS=6.965;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1224,0,1235 chrXII 61318 . A G 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3076,321,0 chrXII 62020 . A C 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.110;DP=109;Dels=0.00;FS=4.756;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.800;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,65:109:99:1386,0,883 chrXII 62349 . T A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.003;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1319,0,1060 chrXII 62362 . A G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.033;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.381;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1461,0,1112 chrXII 62374 . C T 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.091;DP=118;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=4.4499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.940;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:118:99:957,0,1555 chrXII 63559 . G A 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.933;DP=141;Dels=0.00;FS=7.688;HaplotypeScore=5.8754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=10.89;ReadPosRankSum=-2.165;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1566,0,1332 chrXII 63675 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.578;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.425;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1180,0,1303 chrXII 63798 . G T 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.742;DP=172;Dels=0.00;FS=3.520;HaplotypeScore=4.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.035;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,95:172:99:1766,0,1558 chrXII 63809 . T C 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.733;DP=134;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.591;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1016,0,1673 chrXII 63859 . C G 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3092,321,0 chrXII 63864 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.095;DP=124;Dels=0.00;FS=4.346;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1270,0,1297 chrXII 64266 . A C 235.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.924;DP=133;Dels=0.00;FS=47.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.90;MQ0=2;MQRankSum=-2.807;QD=1.77;ReadPosRankSum=-2.544;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,21:133:99:265,0,2016 chrXII 64272 . C T 284.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.463;DP=127;Dels=0.00;FS=30.406;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.07;MQ0=2;MQRankSum=-2.004;QD=2.24;ReadPosRankSum=-2.278;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,23:127:99:314,0,1774 chrXII 64275 . T A 313.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.362;DP=125;Dels=0.00;FS=30.436;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.64;MQ0=2;MQRankSum=-1.696;QD=2.50;ReadPosRankSum=-2.053;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,23:125:99:343,0,1776 chrXII 64278 . C T 293.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.732;DP=128;Dels=0.00;FS=30.565;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.57;MQ0=2;MQRankSum=-1.579;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,23:128:99:323,0,1792 chrXII 64284 . A G 248.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.292;DP=119;Dels=0.00;FS=38.543;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.48;MQ0=2;MQRankSum=-1.835;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,23:119:99:278,0,1670 chrXII 64307 . G A 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.90;MQ0=2;QD=21.24;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2645,273,0 chrXII 64437 . T C 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;DP=161;Dels=0.00;FS=10.481;HaplotypeScore=10.1375;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=4.357;QD=19.80;ReadPosRankSum=-2.182;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,142:161:83:3220,83,0 chrXII 64548 . A G 136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.749;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=58.1695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.26;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=1.37;ReadPosRankSum=-5.076;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:166,0,1781 chrXII 64614 . A G 1131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.11;MQ0=0;QD=22.18;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1164,132,0 chrXII 64683 . G A 598 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=15.33;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:49:631,49,0 chrXII 64692 . A G 262.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.08;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=10.09;ReadPosRankSum=-2.165;SB=-1.013e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:14:295,14,0 chrXII 64722 . A C 326.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;DP=42;Dels=0.00;FS=23.743;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.39;MQ0=3;MQRankSum=2.876;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.628;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:69:356,0,69 chrXII 64728 . C T 337.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.285;DP=42;Dels=0.00;FS=30.490;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.52;MQ0=4;MQRankSum=3.702;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.255;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:48:367,0,48 chrXII 64731 . T A 364.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;DP=43;Dels=0.00;FS=23.743;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.81;MQ0=4;MQRankSum=3.089;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.415;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:71:394,0,71 chrXII 64734 . C T 382.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.668;DP=43;Dels=0.00;FS=31.092;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.81;MQ0=4;MQRankSum=3.761;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:41:412,0,41 chrXII 64740 . A G 353.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.459;DP=42;Dels=0.00;FS=40.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.11;MQ0=4;MQRankSum=3.530;QD=8.40;ReadPosRankSum=-2.569;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:44:383,0,44 chrXII 64763 . G A 697 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.545;DP=52;Dels=0.00;FS=23.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.72;MQ0=4;MQRankSum=0.343;QD=13.40;ReadPosRankSum=4.489;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,41:52:34:730,34,0 chrXII 64824 . A G 1752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;DP=73;Dels=0.00;FS=3.949;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=1;MQRankSum=1.299;QD=24.00;ReadPosRankSum=0.385;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,71:73:99:1785,204,0 chrXII 64866 . C T 2111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;DP=77;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=27.42;ReadPosRankSum=0.382;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:77:99:2144,219,0 chrXII 64944 . G A 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.51;MQ0=0;MQRankSum=-6.705;QD=0.40;ReadPosRankSum=-4.494;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:73:73,0,2014 chrXII 64947 . T C 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.821;DP=109;Dels=0.00;FS=2.022;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.23;MQ0=0;MQRankSum=-6.819;QD=0.36;ReadPosRankSum=-4.552;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:69:69,0,2041 chrXII 64950 . A C 30.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.124;DP=111;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.13;MQ0=0;MQRankSum=-6.825;QD=0.27;ReadPosRankSum=-3.663;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:60:60,0,2080 chrXII 64953 . G T 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.950;DP=111;Dels=0.00;FS=3.269;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.32;MQ0=0;MQRankSum=-6.607;QD=0.39;ReadPosRankSum=-2.918;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:73:73,0,1979 chrXII 64956 . C T 46.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.373;DP=110;Dels=0.00;FS=3.395;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.25;MQ0=0;MQRankSum=-6.594;QD=0.42;ReadPosRankSum=-2.244;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,21:110:76:76,0,2034 chrXII 64958 . A G 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.816;DP=109;Dels=0.00;FS=4.907;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=-6.658;QD=0.38;ReadPosRankSum=-1.594;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:71:71,0,2055 chrXII 64962 . C T 66.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.572;DP=116;Dels=0.00;FS=1.901;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.44;MQ0=0;MQRankSum=-7.187;QD=0.57;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,26:116:96:96,0,2073 chrXII 64965 . A G 60.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.373;DP=114;Dels=0.00;FS=1.907;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.30;MQ0=0;MQRankSum=-7.316;QD=0.53;ReadPosRankSum=-0.651;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,26:114:90:90,0,2026 chrXII 64968 . A G 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.455;DP=116;Dels=0.00;FS=1.830;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.44;MQ0=0;MQRankSum=-7.049;QD=0.34;ReadPosRankSum=0.418;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,27:116:69:69,0,2095 chrXII 64971 . G A 61.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.118;DP=120;Dels=0.00;FS=1.753;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=0;MQRankSum=-6.561;QD=0.51;ReadPosRankSum=0.585;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,30:120:91:91,0,2062 chrXII 64974 . C T 138.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;DP=118;Dels=0.00;FS=1.772;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.31;MQ0=0;MQRankSum=-6.443;QD=1.17;ReadPosRankSum=1.332;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,30:118:99:168,0,2028 chrXII 65485 . C T 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3271,351,0 chrXII 65517 . T C 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3262,366,0 chrXII 65523 . A T 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3637,378,0 chrXII 65695 . C A 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3511,361,0 chrXII 65728 . G A 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3831,408,0 chrXII 65835 . C T 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3414,354,0 chrXII 65841 . G A 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3519,360,0 chrXII 65892 . A G 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3051,336,0 chrXII 65992 . C T 4184.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4184,415,0 chrXII 66169 . C T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.375;DP=119;Dels=0.00;FS=2.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1527,0,966 chrXII 66330 . C A 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.333;DP=138;Dels=0.00;FS=6.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.136;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1578,0,1354 chrXII 66338 . G A 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3789,385,0 chrXII 66595 . A G 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.34;MQ0=0;QD=25.10;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3640,381,0 chrXII 66714 . T C 3960.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2145;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.36;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3960,417,0 chrXII 66743 . A T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;DP=159;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=2.8643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.133;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1500,0,1853 chrXII 66926 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.573;DP=119;Dels=0.00;FS=21.131;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1326,0,1070 chrXII 66946 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.004;DP=128;Dels=0.00;FS=11.987;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.313;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1046,0,1555 chrXII 67069 . A G 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.814;DP=168;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=2.8959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.522;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,75:168:99:1454,0,2026 chrXII 67247 . A G 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=24.62;SB=-2.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3964,411,0 chrXII 67354 . G A 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.325;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.870;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.765;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:140:99:1640,0,1206 chrXII 67367 . A G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.090;DP=140;Dels=0.01;FS=1.356;HaplotypeScore=8.2730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.272;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:139:99:1371,0,1444 chrXII 67368 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.824;DP=140;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=8.2730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.099;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1495,0,1371 chrXII 67726 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.006;DP=146;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.868;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1451,0,1584 chrXII 68071 . T C 4130.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4130,435,0 chrXII 68090 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.167;DP=145;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.715;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1470,0,1537 chrXII 68253 . G A 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3472,360,0 chrXII 68368 . T A 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3051,315,0 chrXII 68373 . A T 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3081,321,0 chrXII 68671 . A G 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3596,369,0 chrXII 69006 . T A 4006.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4006,423,0 chrXII 69233 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.095;DP=160;Dels=0.00;FS=5.809;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=1;MQRankSum=-1.559;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.472;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,72:160:99:1519,0,1838 chrXII 70044 . G A 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3541,361,0 chrXII 70244 . C T 3998.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5573;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3998,406,0 chrXII 70508 . A G 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.18;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3349,357,0 chrXII 70541 . A T 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;DP=114;Dels=0.00;FS=4.658;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=26.11;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:3010,294,0 chrXII 71063 . C G 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;DP=163;Dels=0.00;FS=7.010;HaplotypeScore=4.9601;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.982;QD=24.74;ReadPosRankSum=0.204;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,161:163:99:4033,396,0 chrXII 71524 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.768;DP=127;Dels=0.00;FS=3.194;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1168,0,1464 chrXII 71641 . C G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.130;DP=125;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.795;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1267,0,1206 chrXII 71722 . A G 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3039,318,0 chrXII 72502 . T C 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.221;DP=135;Dels=0.00;FS=7.864;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.103;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1130,0,1573 chrXII 72520 . A G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;DP=126;Dels=0.00;FS=4.352;HaplotypeScore=5.5477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.881;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.203;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1322,0,1307 chrXII 72632 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.803;DP=130;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.600;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1281,0,1360 chrXII 72811 . A C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.385;DP=112;Dels=0.00;FS=2.595;HaplotypeScore=4.5736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1227,0,904 chrXII 72877 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.771;DP=109;Dels=0.00;FS=1.535;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1238,0,1022 chrXII 72975 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.186;DP=102;Dels=0.00;FS=2.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.616;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1001,0,1150 chrXII 72987 . C T 2270 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2303,231,0 chrXII 73178 . C T 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.630;DP=95;Dels=0.00;FS=6.584;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.286;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:973,0,999 chrXII 73290 . C A 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2867,279,0 chrXII 73717 . T G 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3416,363,0 chrXII 73718 . C G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.835;DP=139;Dels=0.00;FS=13.918;HaplotypeScore=2.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.322;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1362,0,1338 chrXII 73752 . G A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;DP=132;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=2.5877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.005;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1272,0,1485 chrXII 73830 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.842;DP=122;Dels=0.00;FS=4.374;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1260,0,1364 chrXII 73852 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.947;DP=139;Dels=0.00;FS=7.633;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.409;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1358,0,1475 chrXII 74130 . C G 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.208;DP=150;Dels=0.00;FS=2.038;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=2.641;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1459,0,1519 chrXII 74238 . A G 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.592;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.491;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,77:129:99:1613,0,1116 chrXII 74258 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.815;DP=157;Dels=0.00;FS=2.934;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:157:99:1615,0,1435 chrXII 74519 . T C 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.970;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:938,0,1069 chrXII 74641 . T C 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3527,384,0 chrXII 74846 . A G 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.771;DP=142;Dels=0.00;FS=9.208;HaplotypeScore=3.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.434;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1595,0,1336 chrXII 74872 . C T 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3489,357,0 chrXII 75086 . A C 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2910,294,0 chrXII 75488 . T C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;DP=116;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.107;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1206,0,1229 chrXII 75506 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;DP=124;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=3.9462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1295,0,1288 chrXII 75545 . C G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.300;DP=112;Dels=0.00;FS=3.585;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.955;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:905,0,1416 chrXII 75713 . C T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.109;DP=115;Dels=0.00;FS=5.887;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.739;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:115:99:979,0,1403 chrXII 75903 . C T 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2594,261,0 chrXII 76057 . G A 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3285,331,0 chrXII 76465 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.136;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.900;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1224,0,1105 chrXII 76544 . A T 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3131,327,0 chrXII 76603 . G T 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3564,355,0 chrXII 76840 . T C 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6663;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.30;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2841,303,0 chrXII 76842 . G A 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6663;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.51;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2967,309,0 chrXII 76925 . A G 689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;DP=71;Dels=0.00;FS=0.908;HaplotypeScore=49.0207;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.258;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.088;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:42,29:71:53:722,53,0 chrXII 76942 . C A 668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.810;DP=74;Dels=0.00;FS=4.544;HaplotypeScore=8.1983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:698,0,699 chrXII 77051 . A G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.602;DP=126;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=2.6779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.27;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.756;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1396,0,1226 chrXII 77139 . G A 2492 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.38;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2525,249,0 chrXII 77473 . C T 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.811;DP=133;Dels=0.01;FS=9.212;HaplotypeScore=7.3024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.366;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1410,0,1399 chrXII 77520 . C T 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3922,394,0 chrXII 77743 . A C 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3131,333,0 chrXII 78276 . G A 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3105,315,0 chrXII 78394 . C T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.247;DP=133;Dels=0.00;FS=4.254;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.095;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1425,0,1374 chrXII 79336 . G A 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2709,276,0 chrXII 79798 . G C 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2762,300,0 chrXII 79977 . G A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.428;DP=98;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.508;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1122,0,943 chrXII 79987 . C T 2395 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2428,246,0 chrXII 80023 . T C 2221 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.96;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2254,240,0 chrXII 80089 . C T 2137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.38;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2170,225,0 chrXII 80666 . C T 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;DP=105;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,40:105:99:779,0,1411 chrXII 80880 . T G 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2532,276,0 chrXII 81026 . C T 2293 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.88;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2326,237,0 chrXII 81045 . T C 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;DP=114;Dels=0.00;FS=5.862;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:905,0,1206 chrXII 81096 . G A 2688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=22.40;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:2721,288,0 chrXII 81240 . C T 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.303;DP=125;Dels=0.00;FS=9.654;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.248;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:125:99:1281,0,1188 chrXII 81713 . G A 1741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,83:136:99:1771,0,996 chrXII 82033 . A G 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2948,318,0 chrXII 82171 . A G 4134.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4134,432,0 chrXII 82288 . T C 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2480,276,0 chrXII 82318 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.765;DP=127;Dels=0.00;FS=4.238;HaplotypeScore=2.8529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.533;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1205,0,1471 chrXII 82321 . C T 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=26.67;ReadPosRankSum=1.703;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3233,310,0 chrXII 82618 . A G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.520;DP=135;Dels=0.00;FS=10.671;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.736;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1338,0,1534 chrXII 82757 . A G 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2757,291,0 chrXII 82762 . T C 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.120;DP=102;Dels=0.00;FS=2.725;HaplotypeScore=2.7620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.298;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:984,0,1152 chrXII 82779 . A T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;DP=117;Dels=0.00;FS=2.358;HaplotypeScore=6.7314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1203,0,1277 chrXII 82792 . A G 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3402,351,0 chrXII 82946 . T C 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.616;DP=171;Dels=0.00;FS=2.783;HaplotypeScore=2.5953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.155;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,86:171:99:1707,0,1804 chrXII 83008 . C G 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3816,402,0 chrXII 83875 . C T 1878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.331;DP=209;Dels=0.00;FS=1.145;HaplotypeScore=4.5482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.618;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,97:209:99:1908,0,2404 chrXII 84031 . C T 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.230;DP=181;Dels=0.00;FS=6.272;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.577;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,84:181:99:1777,0,2001 chrXII 84147 . G A 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.530;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.882;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1685,0,1495 chrXII 84296 . A G 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.803;DP=137;Dels=0.00;FS=19.718;HaplotypeScore=60.8319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.669;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,46:137:99:737,0,1908 chrXII 84314 . A C 75.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.328;DP=127;Dels=0.00;FS=25.160;HaplotypeScore=19.8745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.65;MQ0=0;MQRankSum=-5.989;QD=0.59;ReadPosRankSum=-2.860;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,23:127:99:105,0,2161 chrXII 84315 . A G 91.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.997;DP=129;Dels=0.00;FS=25.315;HaplotypeScore=25.7028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.83;MQ0=0;MQRankSum=-6.775;QD=0.71;ReadPosRankSum=-2.120;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,27:129:99:121,0,2235 chrXII 84320 . T C 146.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.127;DP=124;Dels=0.01;FS=20.250;HaplotypeScore=48.9174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.56;MQ0=0;MQRankSum=-6.316;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.534;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,27:123:99:176,0,1709 chrXII 84326 . C A 162.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.866;DP=117;Dels=0.01;FS=14.817;HaplotypeScore=48.5542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.10;MQ0=0;MQRankSum=-5.913;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.473;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:116:99:192,0,1334 chrXII 84451 . A G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5955;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3393,345,0 chrXII 84455 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.212;DP=141;Dels=0.00;FS=3.111;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=9.06;ReadPosRankSum=-2.031;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1308,0,1362 chrXII 84504 . G A 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=21.32;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3348,348,0 chrXII 84695 . C G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.283;DP=113;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.812;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1075,0,1236 chrXII 84883 . T C 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.523;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.005;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,92:167:99:1766,0,1535 chrXII 84935 . C T 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.803;DP=147;Dels=0.00;FS=10.406;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.445;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,87:147:99:1850,0,1074 chrXII 85153 . C T 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.697;DP=152;Dels=0.00;FS=2.043;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.170;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1696,0,1388 chrXII 85270 . C G 4163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4163,429,0 chrXII 85385 . G A 3643.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3643,358,0 chrXII 85632 . T G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.761;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.376;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1228,0,1749 chrXII 85694 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.157;DP=134;Dels=0.00;FS=5.259;HaplotypeScore=6.0996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.356;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.124;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1296,0,1482 chrXII 86191 . C T 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.361;DP=145;Dels=0.00;FS=10.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1455,0,1563 chrXII 86369 . A T 4261.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=27.31;SB=-2.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4261,430,0 chrXII 86595 . T C 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=121.3942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.58;MQ0=0;QD=19.79;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:2923,312,0 chrXII 86612 . A T 109.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=118.1448;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.29;MQ0=0;QD=0.64;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:15:142,15,0 chrXII 86628 . T C 2130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.81;MQ0=0;QD=14.39;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:2163,240,0 chrXII 86679 . C T 2474 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.25;MQ0=0;QD=24.02;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2507,264,0 chrXII 86723 . T A 599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.906;DP=170;Dels=0.01;FS=55.796;HaplotypeScore=161.1681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.441;QD=3.52;ReadPosRankSum=-4.916;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,93:169:99:629,0,1326 chrXII 86742 . C A 260.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.241;DP=161;Dels=0.05;FS=210.859;HaplotypeScore=26.3423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.11;MQ0=0;MQRankSum=-3.167;QD=1.61;ReadPosRankSum=-7.681;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,34:153:99:290,0,1100 chrXII 86817 . A T 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.693;DP=158;Dels=0.00;FS=4.791;HaplotypeScore=2.6445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=1;MQRankSum=0.660;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.712;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:1485,0,1757 chrXII 86881 . T C 4221.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4221,438,0 chrXII 86978 . T A 4478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7546;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=25.88;ReadPosRankSum=1.088;SB=-2.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:4478,448,0 chrXII 87080 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.963;DP=121;Dels=0.00;FS=7.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=0.955;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.060;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1335,0,1199 chrXII 87286 . C T 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3014,303,0 chrXII 87340 . A G 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3129,327,0 chrXII 87687 . T C 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.13;SB=-2.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3812,384,0 chrXII 87781 . T C 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.516;DP=142;Dels=0.00;FS=1.325;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.731;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1574,0,1276 chrXII 88053 . A T 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3406,348,0 chrXII 88069 . A G 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2832,297,0 chrXII 88167 . A G 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.237;DP=127;Dels=0.00;FS=1.524;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.628;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.052;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,48:127:99:830,0,1785 chrXII 88298 . G A 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3648,367,0 chrXII 88420 . G C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;DP=129;Dels=0.00;FS=6.623;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.606;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1262,0,1444 chrXII 88422 . A T 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3486,352,0 chrXII 88452 . G A 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2917,294,0 chrXII 88703 . T C 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3468,360,0 chrXII 88892 . T C 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3397,369,0 chrXII 89132 . C T 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3983,403,0 chrXII 89180 . C A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.702;DP=150;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=10.3286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=-0.699;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:150:99:1501,0,1551 chrXII 89279 . C T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.469;DP=122;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1347,0,1166 chrXII 89774 . A T 3978.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3978,403,0 chrXII 89864 . G A 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2576,264,0 chrXII 90629 . C G 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6127;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3108,336,0 chrXII 91617 . T G 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.421;DP=114;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=4.8294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.465;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:884,0,1536 chrXII 91767 . G A 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;DP=116;Dels=0.00;FS=4.488;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.212;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1246,0,1208 chrXII 91832 . C G 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.138;DP=93;Dels=0.00;FS=10.495;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.548;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:792,0,1089 chrXII 91951 . T C 1937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.07;MQ0=0;QD=23.91;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1970,222,0 chrXII 91967 . G A 1772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.635;DP=71;Dels=0.00;FS=5.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.36;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=24.96;ReadPosRankSum=1.000;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:71:99:1805,189,0 chrXII 92007 . T C 1161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.92;MQ0=0;QD=21.11;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1194,129,0 chrXII 92018 . C A 1667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.23;MQ0=0;QD=24.88;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1700,174,0 chrXII 92092 . G T 707.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.154;DP=82;Dels=0.00;FS=6.034;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.07;MQ0=0;MQRankSum=-4.583;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:737,0,928 chrXII 92095 . A G 648.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.709;DP=81;Dels=0.00;FS=5.983;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.27;MQ0=0;MQRankSum=-4.415;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:678,0,945 chrXII 92100 . G A 479.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.395;DP=68;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.97;MQ0=0;MQRankSum=-3.388;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.092;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:509,0,891 chrXII 92134 . T A 1371 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.87;MQ0=5;QD=22.48;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1404,147,0 chrXII 92153 . C G 1299 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.71;MQ0=5;QD=20.62;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1332,138,0 chrXII 92163 . T A 306.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;DP=65;Dels=0.00;FS=5.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.44;MQ0=5;MQRankSum=-4.987;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.973;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:336,0,799 chrXII 92233 . T C 454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;DP=98;Dels=0.00;FS=10.940;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.37;MQ0=2;MQRankSum=-5.237;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.332;SB=-8.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,37:98:99:484,0,1231 chrXII 92258 . A T 2220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.56;MQ0=1;QD=23.87;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2253,228,0 chrXII 92266 . C T 2184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.82;MQ0=1;QD=24.00;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2217,228,0 chrXII 92295 . C T 1728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.30;MQ0=0;QD=23.67;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1761,183,0 chrXII 92314 . C A 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.300;DP=64;Dels=0.00;FS=0.953;HaplotypeScore=2.7829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.18;MQ0=0;MQRankSum=1.766;QD=10.56;ReadPosRankSum=-2.186;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:706,0,515 chrXII 92366 . G T 2391 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.49;MQ0=0;QD=25.71;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2424,246,0 chrXII 92405 . A G 705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.684;DP=90;Dels=0.00;FS=1.987;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.369;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:735,0,1126 chrXII 92408 . G A 2235 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.12;MQ0=0;QD=25.40;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2268,234,0 chrXII 92471 . T C 1585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.49;MQ0=0;QD=20.06;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1618,183,0 chrXII 92472 . T C 1573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.32;MQ0=0;QD=20.97;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1606,177,0 chrXII 92482 . G A 1607 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.92;MQ0=0;QD=20.87;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1640,177,0 chrXII 92496 . C A 1510 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.79;MQ0=0;QD=20.68;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:73:99:1543,165,0 chrXII 92501 . C T 1638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.85;MQ0=0;QD=21.00;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1671,177,0 chrXII 92528 . T C 2265 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.29;MQ0=0;QD=23.59;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2298,255,0 chrXII 92535 . C T 2361 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.79;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2394,255,0 chrXII 92595 . C A 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.35;MQ0=0;QD=26.45;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2757,291,0 chrXII 92596 . T C 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.35;MQ0=0;QD=25.33;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2642,288,0 chrXII 92677 . C A 1901 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.42;MQ0=0;QD=22.36;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1934,192,0 chrXII 92680 . T C 1945 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.31;MQ0=0;QD=23.15;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1978,210,0 chrXII 92685 . T A 2483 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.82;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2516,261,0 chrXII 92744 . T G 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.12;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2480,264,0 chrXII 92789 . G T 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2942,297,0 chrXII 92800 . A T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.407;DP=110;Dels=0.00;FS=8.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1041,0,1337 chrXII 92878 . T C 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.92;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2841,300,0 chrXII 93019 . G A 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3248,330,0 chrXII 93045 . T G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.528;DP=120;Dels=0.00;FS=4.422;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=9.36;ReadPosRankSum=-2.514;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1153,0,1341 chrXII 93073 . G A 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3485,345,0 chrXII 93102 . T C 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3282,324,0 chrXII 93142 . A G 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2797,297,0 chrXII 93161 . G A 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3166,324,0 chrXII 93274 . C A 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=112.1149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.10;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3415,351,0 chrXII 93314 . A T 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.06;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2685,270,0 chrXII 93341 . C A 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3150,315,0 chrXII 93360 . T C 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.12;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2697,282,0 chrXII 93418 . G A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.556;DP=158;Dels=0.00;FS=4.824;HaplotypeScore=4.9487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.055;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,69:158:99:1412,0,1933 chrXII 93488 . G A 4350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4350,436,0 chrXII 93654 . G A 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=131;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=3.2445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.886;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3486,346,0 chrXII 93662 . A G 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9212;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=23.64;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3225,336,0 chrXII 93671 . A T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=2;MQRankSum=-1.170;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.802;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1289,0,1345 chrXII 93814 . G C 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.45;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3308,372,0 chrXII 93954 . G A 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2961,300,0 chrXII 94031 . A G 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.98;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2639,276,0 chrXII 94032 . A T 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2692,276,0 chrXII 94044 . C T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.17;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3019,306,0 chrXII 94172 . A G 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5288;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3106,351,0 chrXII 94500 . G A 3750.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3750,369,0 chrXII 94522 . G A 4246.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4246,418,0 chrXII 94566 . C G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3168,339,0 chrXII 94617 . T C 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4114,420,0 chrXII 94650 . G A 4278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.25;SB=-2.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4278,424,0 chrXII 94681 . C T 4188.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4188,421,0 chrXII 94959 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.063;DP=137;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=2.8986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.315;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1206,0,1603 chrXII 95188 . C T 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.00;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3046,294,0 chrXII 95356 . A G 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6744;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=23.80;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2794,294,0 chrXII 95641 . T A 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.01;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2928,291,0 chrXII 95821 . G T 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.15;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3370,340,0 chrXII 95935 . A G 1580 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.245;DP=108;Dels=0.00;FS=9.611;HaplotypeScore=4.9536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.54;MQ0=44;MQRankSum=1.678;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.487;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,80:108:99:1613,157,0 chrXII 95937 . C A 1612 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=108;Dels=0.00;FS=9.611;HaplotypeScore=4.9536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.54;MQ0=44;MQRankSum=1.678;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.650;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,80:108:99:1645,154,0 chrXII 95938 . A G 1574 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.347;DP=105;Dels=0.00;FS=10.212;HaplotypeScore=4.9536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.61;MQ0=42;MQRankSum=1.677;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.687;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,78:105:99:1607,157,0 chrXII 95944 . C T 1409 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.627;DP=109;Dels=0.00;FS=10.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.83;MQ0=42;MQRankSum=1.680;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.155;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,81:109:99:1442,156,0 chrXII 95945 . T C 1401 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.787;DP=105;Dels=0.00;FS=10.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.28;MQ0=38;MQRankSum=1.680;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.155;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,80:105:99:1434,156,0 chrXII 95992 . G A 1306 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.39;MQ0=27;QD=14.20;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,66:91:99:1339,141,0 chrXII 96004 . C T 1325 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.20;MQ0=28;QD=14.10;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,66:94:99:1358,144,0 chrXII 96010 . A G 1422 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.94;MQ0=26;QD=14.22;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,74:100:99:1455,165,0 chrXII 96022 . G A 1436 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.95;MQ0=27;QD=14.36;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,73:100:99:1469,156,0 chrXII 96025 . G A 1385 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.90;MQ0=26;QD=14.43;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,70:96:99:1418,150,0 chrXII 96028 . G A 1475 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.15;MQ0=26;QD=14.60;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,75:101:99:1508,159,0 chrXII 96034 . A G 1454 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=29;QD=14.12;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,76:103:99:1487,168,0 chrXII 96040 . A G 1549 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.37;MQ0=29;QD=14.61;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,79:106:99:1582,174,0 chrXII 96151 . G A 1748 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;DP=96;Dels=0.00;FS=3.641;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.83;MQ0=22;MQRankSum=0.843;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,84:96:99:1781,168,0 chrXII 96166 . A G 1680 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=92;Dels=0.00;FS=4.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.29;MQ0=16;MQRankSum=1.413;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,84:92:99:1713,170,0 chrXII 96169 . G A 1821 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.593;DP=92;Dels=0.00;FS=4.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.29;MQ0=16;MQRankSum=1.048;QD=19.79;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,84:92:99:1854,171,0 chrXII 96340 . A G 567.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.178;DP=118;Dels=0.00;FS=59.769;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.52;MQ0=69;MQRankSum=2.018;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.580;SB=-4.402e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,73:118:99:597,0,158 chrXII 96400 . T A 365.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;DP=111;Dels=0.00;FS=45.055;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.37;MQ0=63;MQRankSum=0.323;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.366;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:395,0,162 chrXII 96451 . T C 171.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.976;DP=81;Dels=0.00;FS=9.472;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.00;MQ0=51;MQRankSum=0.251;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,39:81:99:201,0,115 chrXII 96472 . G A 296.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;DP=81;Dels=0.00;FS=12.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.28;MQ0=51;MQRankSum=2.281;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:76:326,0,76 chrXII 96505 . T C 168.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;DP=46;Dels=0.00;FS=12.420;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.53;MQ0=27;MQRankSum=-1.479;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-8.459e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:198,0,146 chrXII 96514 . A G 296 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=13;QD=11.38;SB=-2.800e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:36:329,36,0 chrXII 96580 . C T 314.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.868;DP=133;Dels=0.00;FS=45.114;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.78;MQ0=77;MQRankSum=3.395;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.465;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,35:133:99:344,0,330 chrXII 97108 . C T 2249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;DP=194;Dels=0.00;FS=77.391;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.71;MQ0=2;MQRankSum=4.346;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,114:194:99:2279,0,1534 chrXII 97129 . G A 2518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.074;DP=194;Dels=0.00;FS=109.184;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.74;MQ0=1;MQRankSum=4.966;QD=12.98;ReadPosRankSum=-2.219;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,122:194:99:2548,0,1335 chrXII 97147 . G A 2655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.068;DP=214;Dels=0.00;FS=107.580;HaplotypeScore=4.3387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.04;MQ0=1;MQRankSum=4.194;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,130:214:99:2685,0,1487 chrXII 97153 . G T 2303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.922;DP=209;Dels=0.00;FS=89.135;HaplotypeScore=4.2630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.82;MQ0=1;MQRankSum=3.491;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.369;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,121:209:99:2333,0,1600 chrXII 97159 . G A 2344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.643;DP=194;Dels=0.00;FS=76.958;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.52;MQ0=1;MQRankSum=3.140;QD=12.08;ReadPosRankSum=2.097;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,113:194:99:2374,0,1441 chrXII 97171 . A G 2597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.882;DP=195;Dels=0.00;FS=68.437;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.80;MQ0=0;MQRankSum=2.902;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.173;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,124:195:99:2627,0,1264 chrXII 97240 . T C 111.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.344;DP=147;Dels=0.00;FS=17.205;HaplotypeScore=47.8003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQ0=0;MQRankSum=-4.452;QD=0.76;ReadPosRankSum=-4.205;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,25:147:99:141,0,2875 chrXII 97243 . G C 71.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;DP=143;Dels=0.00;FS=13.245;HaplotypeScore=44.8207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.30;MQ0=0;MQRankSum=-4.820;QD=0.50;ReadPosRankSum=-4.775;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,22:143:99:101,0,2715 chrXII 97246 . T C 1132.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.482;DP=135;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=28.3051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.51;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1162,0,1499 chrXII 97429 . G A 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.75;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3560,361,0 chrXII 97559 . T C 4372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.998e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4372,441,0 chrXII 97599 . C T 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3690,384,0 chrXII 97654 . A C 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.36;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3479,378,0 chrXII 97828 . C T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3354,351,0 chrXII 98056 . T C 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3228,336,0 chrXII 98260 . C T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.191;DP=141;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1380,0,1549 chrXII 98309 . G A 3613.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3613,367,0 chrXII 98471 . A G 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=142;Dels=0.00;FS=5.612;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=25.35;ReadPosRankSum=1.269;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3599,361,0 chrXII 98655 . G A 2398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.509;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=25.78;ReadPosRankSum=0.726;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:2431,229,0 chrXII 98696 . G T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.393;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.780;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1062,0,1194 chrXII 98889 . T G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.216;DP=139;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=3.9506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1392,0,1542 chrXII 99134 . C T 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.442;DP=161;Dels=0.00;FS=4.740;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,94:161:99:1803,0,1162 chrXII 99257 . G A 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.614;DP=165;Dels=0.00;FS=1.227;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.649;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,89:165:99:1813,0,1558 chrXII 99539 . T A 5239.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.87;SB=-2.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:5239,541,0 chrXII 99667 . G A 4444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4444,442,0 chrXII 100126 . C T 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2833,276,0 chrXII 100131 . C T 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.614;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:773,0,1502 chrXII 100150 . C G 2751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2784,294,0 chrXII 100257 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.407;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=2.465;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.497;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1264,0,1476 chrXII 100410 . C T 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.698;DP=141;Dels=0.00;FS=3.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1665,0,1330 chrXII 100464 . T C 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.301;DP=163;Dels=0.01;FS=5.311;HaplotypeScore=16.9882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=-1.808;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.286;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,78:162:99:1647,0,1862 chrXII 100604 . T A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.149;DP=129;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.889;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1275,0,1518 chrXII 100615 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.355;DP=134;Dels=0.00;FS=2.173;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=9.60;ReadPosRankSum=3.410;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1316,0,1505 chrXII 100682 . A G 3773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3773,387,0 chrXII 101099 . A G 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.651;DP=153;Dels=0.00;FS=5.985;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1359,0,1699 chrXII 101108 . G C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.753;DP=139;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.015;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1215,0,1481 chrXII 101237 . A G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.357;DP=140;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1225,0,1698 chrXII 101264 . T C 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;DP=127;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=3.9679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.100;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.089;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1314,0,1426 chrXII 101321 . T C 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.490;DP=158;Dels=0.00;FS=1.984;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=1;MQRankSum=-1.066;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1663,0,1648 chrXII 101330 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.164;DP=145;Dels=0.00;FS=3.876;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=1;MQRankSum=-0.242;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1389,0,1639 chrXII 101382 . G A 1930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.644;DP=146;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=-1.921;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,88:146:99:1960,0,1067 chrXII 101399 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.564;DP=144;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=10.75;ReadPosRankSum=3.701;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,81:144:99:1578,0,1342 chrXII 101560 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.829;DP=152;Dels=0.00;FS=3.950;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1440,0,1570 chrXII 101577 . G A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.125;DP=161;Dels=0.00;FS=6.112;HaplotypeScore=2.9404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:161:99:1421,0,1736 chrXII 101592 . A G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.786;DP=148;Dels=0.00;FS=4.052;HaplotypeScore=2.3479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1331,0,1747 chrXII 101723 . A G 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.278;DP=149;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=9.23;ReadPosRankSum=-3.104;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1406,0,1417 chrXII 101729 . A T 4039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4039,409,0 chrXII 101916 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.820;DP=114;Dels=0.00;FS=4.804;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1270,0,1043 chrXII 101965 . T G 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2900,309,0 chrXII 102125 . C A 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.404;DP=139;Dels=0.00;FS=8.086;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=2.288;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.837;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1571,0,1257 chrXII 102251 . A G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.347;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.998;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1486,0,1811 chrXII 102371 . G A 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3703,385,0 chrXII 102471 . T G 4115.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4115,423,0 chrXII 102614 . C G 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.710;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.499;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1497,0,1078 chrXII 103352 . C T 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3127,318,0 chrXII 103524 . C T 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.99;MQ0=1;QD=27.77;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3416,349,0 chrXII 103584 . A G 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.26;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3312,345,0 chrXII 103655 . A G 1752.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.313;DP=206;Dels=0.00;FS=107.243;HaplotypeScore=17.0975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.69;MQ0=0;MQRankSum=-6.189;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.383;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,101:206:99:1782,0,1597 chrXII 103660 . A C 1746.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.088;DP=211;Dels=0.00;FS=101.489;HaplotypeScore=22.2650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.60;MQ0=0;MQRankSum=-7.005;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.575;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,97:211:99:1776,0,1894 chrXII 103664 . T C 1643.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.204;DP=213;Dels=0.00;FS=100.067;HaplotypeScore=23.2583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.49;MQ0=0;MQRankSum=-6.855;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.386;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,95:213:99:1673,0,1926 chrXII 103670 . C T 1904.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.569;DP=214;Dels=0.00;FS=65.712;HaplotypeScore=22.1909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.91;MQ0=0;MQRankSum=-8.514;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.323;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,110:214:99:1934,0,1658 chrXII 103682 . C T 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;DP=213;Dels=0.00;FS=80.878;HaplotypeScore=54.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.03;MQ0=0;MQRankSum=-8.417;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,87:213:99:1463,0,2168 chrXII 103697 . T C 1612.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.858;DP=243;Dels=0.00;FS=38.102;HaplotypeScore=64.4356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.58;MQ0=0;MQRankSum=-9.975;QD=6.63;ReadPosRankSum=2.421;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,101:243:99:1642,0,2760 chrXII 103700 . A G 5561.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=238;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=61.2831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.11;MQ0=0;QD=23.37;SB=-3.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,238:238:99:5561,597,0 chrXII 103706 . G A 1170.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.203;DP=221;Dels=0.00;FS=12.149;HaplotypeScore=30.3266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.17;MQ0=0;MQRankSum=-8.306;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.241;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,72:221:99:1200,0,3160 chrXII 103707 . A G 1389.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.142;DP=221;Dels=0.00;FS=19.097;HaplotypeScore=30.3266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.17;MQ0=0;MQRankSum=-10.449;QD=6.29;ReadPosRankSum=4.584;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,86:221:99:1419,0,3022 chrXII 103713 . G A 1551.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.450;DP=221;Dels=0.00;FS=20.452;HaplotypeScore=57.3656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.03;MQ0=0;MQRankSum=-11.090;QD=7.02;ReadPosRankSum=3.750;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,90:221:99:1581,0,2750 chrXII 103723 . T C 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.755;DP=189;Dels=0.00;FS=2.552;HaplotypeScore=35.0516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.73;MQ0=0;MQRankSum=-8.779;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.626;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,87:189:99:1529,0,1666 chrXII 103729 . G A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.943;DP=183;Dels=0.00;FS=1.186;HaplotypeScore=32.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.30;MQ0=0;MQRankSum=-7.966;QD=6.05;ReadPosRankSum=1.469;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,68:183:99:1138,0,2279 chrXII 103737 . G T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.445;DP=173;Dels=0.00;FS=2.651;HaplotypeScore=22.1081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.59;MQ0=0;MQRankSum=-8.941;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.307;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,79:173:99:1313,0,1910 chrXII 103751 . C T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.919;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8320;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=22.82;ReadPosRankSum=3.166;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,148:153:99:3491,284,0 chrXII 103778 . T C 294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.435;DP=145;Dels=0.00;FS=3.578;HaplotypeScore=7.9174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-8.355;QD=2.03;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,36:145:99:324,0,2558 chrXII 103806 . A G 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2741,282,0 chrXII 103918 . C T 3929.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3929,411,0 chrXII 104468 . A T 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.04;SB=-2.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4081,406,0 chrXII 104637 . G A 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.103;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.761;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:912,0,1196 chrXII 104679 . C G 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=126;Dels=0.00;FS=3.080;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:2841,312,0 chrXII 105555 . T C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.259;DP=101;Dels=0.00;FS=3.076;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.356;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.853;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1108,0,1049 chrXII 106104 . G C 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;DP=126;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.204;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1391,0,1123 chrXII 106136 . A G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.995;DP=123;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.014;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1233,0,1265 chrXII 106190 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.396;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1002,0,1328 chrXII 106406 . G A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.808;DP=151;Dels=0.00;FS=7.493;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,55:151:99:1109,0,1964 chrXII 107406 . G A 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3946,406,0 chrXII 108039 . T C 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.572;DP=142;Dels=0.00;FS=7.431;HaplotypeScore=70.0011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.949;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1150,0,1302 chrXII 108688 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.205;DP=142;Dels=0.00;FS=17.323;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=1.034;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1419,0,1470 chrXII 108813 . G A 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.965e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3792,376,0 chrXII 109033 . T C 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2858,309,0 chrXII 109073 . T A 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=22.57;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2674,276,0 chrXII 109155 . A G 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3068,333,0 chrXII 109244 . A G 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=21.88;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:2987,318,0 chrXII 109357 . C T 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3347,345,0 chrXII 109365 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3268,351,0 chrXII 109400 . A G 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;DP=141;Dels=0.00;FS=3.167;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=24.87;ReadPosRankSum=-1.339;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3506,341,0 chrXII 109403 . A C 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3386,348,0 chrXII 109427 . A T 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3049,306,0 chrXII 109508 . G A 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3250,319,0 chrXII 109577 . C T 4589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.07;SB=-2.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4589,451,0 chrXII 109707 . T A 4069.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4069,409,0 chrXII 109729 . A C 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3277,342,0 chrXII 109736 . G A 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3384,334,0 chrXII 109765 . T C 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3008,315,0 chrXII 109886 . G A 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9420;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3230,322,0 chrXII 110064 . C T 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.774;DP=170;Dels=0.00;FS=2.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,88:170:99:1868,0,1615 chrXII 110463 . C T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.141;DP=116;Dels=0.00;FS=1.563;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.268;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:116:99:1021,0,1410 chrXII 110709 . C T 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.650;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=10.85;ReadPosRankSum=2.211;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1690,0,1403 chrXII 110807 . A G 4246.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;DP=174;Dels=0.00;FS=3.485;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.394;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,173:174:99:4246,432,0 chrXII 110988 . G C 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3360,378,0 chrXII 111167 . T G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.111;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.426;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1499,0,1641 chrXII 111246 . G A 4144.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.27;SB=-2.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4144,412,0 chrXII 111423 . A G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.036;DP=111;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.843;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1044,0,1223 chrXII 111825 . C T 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.623;DP=124;Dels=0.00;FS=5.471;HaplotypeScore=4.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=4.133;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.948;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1284,0,1273 chrXII 111826 . T C 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=125;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=4.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=25.45;ReadPosRankSum=1.372;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3214,336,0 chrXII 111932 . T C 1251.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.003;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.971;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.044;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1281,0,1425 chrXII 111940 . G A 1187.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.712;DP=133;Dels=0.00;FS=4.144;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.605;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1217,0,1520 chrXII 111941 . A C 1145.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.055;DP=133;Dels=0.00;FS=4.144;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.605;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1175,0,1606 chrXII 111993 . C A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.201;DP=147;Dels=0.01;FS=2.135;HaplotypeScore=3.9439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.785;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,64:146:99:1352,0,1786 chrXII 112101 . G A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.116;DP=108;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:108:99:1422,0,933 chrXII 112204 . T C 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=111;Dels=0.00;FS=2.562;HaplotypeScore=3.3007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1052,0,1115 chrXII 112240 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.441;DP=133;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=2.5922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.925;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1302,0,1264 chrXII 112278 . G A 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3566,363,0 chrXII 112356 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.999;DP=139;Dels=0.00;FS=4.038;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.552;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1069,0,1803 chrXII 112358 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.712;DP=143;Dels=0.00;FS=5.058;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.327;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,59:143:99:1192,0,1697 chrXII 112546 . C A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.155;DP=147;Dels=0.00;FS=10.462;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.889;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1385,0,1647 chrXII 112689 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;DP=128;Dels=0.00;FS=7.262;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.163;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1431,0,1193 chrXII 112702 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.984;DP=109;Dels=0.00;FS=13.254;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.058;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1202,0,1003 chrXII 112732 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.650;DP=115;Dels=0.00;FS=12.235;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.722;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.514;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1306,0,1138 chrXII 113068 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.392;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.844;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,61:101:99:1377,0,798 chrXII 113144 . T C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.838;DP=119;Dels=0.00;FS=3.264;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.282;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1119,0,1229 chrXII 113145 . T C 2387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=23.17;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2420,276,0 chrXII 113171 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.588;DP=106;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.921;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1048,0,1017 chrXII 113252 . T C 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.741;DP=105;Dels=0.00;FS=9.250;HaplotypeScore=2.2967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.048;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:944,0,1161 chrXII 113367 . G A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.743;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:933,0,853 chrXII 113420 . G T 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.423;DP=87;Dels=0.00;FS=1.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:921,0,877 chrXII 113494 . A G 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.511;DP=90;Dels=0.00;FS=2.783;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.882;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.929;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:816,0,1007 chrXII 113564 . T C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.496;DP=124;Dels=0.00;FS=2.283;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.136;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1182,0,1461 chrXII 113660 . A G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.922;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.167;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1561,0,1359 chrXII 113673 . G C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;DP=130;Dels=0.00;FS=6.336;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1500,0,1220 chrXII 113758 . T C 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2887,297,0 chrXII 113832 . T A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.099;DP=96;Dels=0.00;FS=6.616;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.385;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:973,0,1087 chrXII 113903 . G A 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3557,364,0 chrXII 114079 . T C 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.305;DP=114;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=7.57;ReadPosRankSum=0.395;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:893,0,1422 chrXII 114214 . C T 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.303;DP=156;Dels=0.00;FS=6.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1485,0,1770 chrXII 114242 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.986;DP=144;Dels=0.00;FS=7.515;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.788;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1334,0,1654 chrXII 114311 . G T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.599;DP=96;Dels=0.00;FS=2.699;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1158,0,913 chrXII 114330 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.906;DP=113;Dels=0.00;FS=12.188;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.491;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1128,0,1179 chrXII 114529 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.533;DP=124;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.505;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1128,0,1418 chrXII 114559 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;DP=150;Dels=0.00;FS=1.299;HaplotypeScore=5.6246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=9.76;ReadPosRankSum=-3.490;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1494,0,1565 chrXII 114649 . T C 1264.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.286;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1294,0,1598 chrXII 114650 . C T 1285.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.660;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.167;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1315,0,1544 chrXII 114659 . G A 1126.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.773;DP=121;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.913;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.633;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1156,0,1321 chrXII 114724 . T C 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=25.65;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2752,288,0 chrXII 114772 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.764;DP=138;Dels=0.00;FS=6.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1350,0,1511 chrXII 114858 . T C 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.306;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1070,0,1570 chrXII 114988 . A G 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.118;DP=135;Dels=0.00;FS=7.891;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.733;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1451,0,1425 chrXII 115039 . C G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.560;DP=136;Dels=0.00;FS=9.026;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1245,0,1523 chrXII 115047 . C G 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.244;DP=127;Dels=0.00;FS=6.701;HaplotypeScore=3.5300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1050,0,1401 chrXII 115108 . T C 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.558;DP=104;Dels=0.00;FS=6.334;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:975,0,1257 chrXII 115271 . G A 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.562;DP=125;Dels=0.00;FS=3.298;HaplotypeScore=2.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=10.98;ReadPosRankSum=-2.141;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1403,0,1208 chrXII 115378 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.111;DP=116;Dels=0.00;FS=3.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.912;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1360,0,1035 chrXII 115400 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.958;DP=113;Dels=0.00;FS=4.579;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.502;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1273,0,1049 chrXII 115469 . A G 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.119;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.754;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1031,0,1259 chrXII 115486 . C T 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.745;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1098,0,1137 chrXII 115512 . A G 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.244;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:780,0,1065 chrXII 115522 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.460;DP=93;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1078,0,873 chrXII 115585 . T A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;DP=110;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.155;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1108,0,1280 chrXII 115717 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.764;DP=97;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1128,0,885 chrXII 115808 . T C 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.467;DP=93;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:808,0,1180 chrXII 115940 . C T 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.927;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.339;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:891,0,909 chrXII 115948 . T C 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.471;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:863,0,949 chrXII 116128 . A G 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.091;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.144;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:941,0,1248 chrXII 116314 . A G 748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.029;DP=92;Dels=0.00;FS=0.785;HaplotypeScore=2.4573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.730;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:778,0,1188 chrXII 116337 . C T 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.436;DP=100;Dels=0.00;FS=1.657;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.238;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:836,0,1299 chrXII 116402 . T A 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;DP=101;Dels=0.00;FS=2.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=-0.221;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.221;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1028,0,1021 chrXII 116497 . A T 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;DP=108;Dels=0.00;FS=2.785;HaplotypeScore=2.6163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.130;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:1018,0,1342 chrXII 116524 . A C 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.411;DP=112;Dels=0.00;FS=6.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.215;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:895,0,1429 chrXII 116680 . T C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.220;DP=126;Dels=0.00;FS=4.300;HaplotypeScore=7.9349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1129,0,1473 chrXII 116686 . T C 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.089;DP=126;Dels=0.00;FS=3.247;HaplotypeScore=3.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1158,0,1455 chrXII 116806 . C A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.993;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1142,0,1325 chrXII 116824 . T G 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3182,351,0 chrXII 116980 . G A 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.30;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2900,294,0 chrXII 117244 . G C 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.505;DP=85;Dels=0.00;FS=5.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.110;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,47:85:99:973,0,784 chrXII 117385 . T C 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.635;DP=129;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=5.2874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1016,0,1541 chrXII 117391 . G C 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3207,330,0 chrXII 117460 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.255;DP=115;Dels=0.00;FS=2.499;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.015;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1233,0,1212 chrXII 117481 . C T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.492;DP=112;Dels=0.00;FS=4.743;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.419;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1090,0,1205 chrXII 117484 . C A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.132;DP=111;Dels=0.00;FS=3.598;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.245;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.117;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:111:99:1110,0,1191 chrXII 117532 . C T 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;DP=88;Dels=0.00;FS=15.791;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.873;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:753,0,1003 chrXII 117788 . T C 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.443;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,76:126:99:1643,0,997 chrXII 117856 . T C 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.689;DP=127;Dels=0.00;FS=6.727;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1591,0,1085 chrXII 117952 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.023;DP=104;Dels=0.01;FS=0.742;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.562;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1286,0,866 chrXII 118322 . A G 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.643;DP=126;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.717;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.121;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1413,0,1280 chrXII 118337 . G A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.823;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1372,0,1174 chrXII 118486 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.635;DP=120;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1213,0,1290 chrXII 118640 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.814;DP=100;Dels=0.00;FS=3.713;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=9.50;ReadPosRankSum=3.807;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:980,0,1173 chrXII 118665 . C T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.791;DP=96;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.099;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,50:96:99:1070,0,924 chrXII 119291 . A G 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2985,300,0 chrXII 119330 . A G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3181,330,0 chrXII 120187 . A C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.478;DP=134;Dels=0.00;FS=4.152;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1381,0,1474 chrXII 120216 . C T 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3659,364,0 chrXII 120550 . C T 3938.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3938,391,0 chrXII 120577 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.230;DP=123;Dels=0.00;FS=8.239;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=8.90;ReadPosRankSum=-2.942;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1125,0,1272 chrXII 120592 . A G 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3116,327,0 chrXII 121206 . T G 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3353,333,0 chrXII 121492 . C T 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.906;DP=102;Dels=0.00;FS=11.728;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:844,0,1288 chrXII 121537 . A G 604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;DP=90;Dels=0.00;FS=5.616;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.029;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,34:90:99:634,0,1230 chrXII 121567 . T A 2474 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2507,255,0 chrXII 121811 . T G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.128;DP=102;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=1;MQRankSum=0.961;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.003;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:963,0,1111 chrXII 121819 . T C 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.513;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=1;MQRankSum=-0.367;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:959,0,1116 chrXII 121843 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.400;DP=131;Dels=0.00;FS=3.219;HaplotypeScore=3.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=2.882;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.159;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1363,0,1329 chrXII 122034 . A C 236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.232;DP=141;Dels=0.00;FS=313.073;HaplotypeScore=18.5586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.62;MQ0=3;MQRankSum=1.622;QD=1.67;ReadPosRankSum=7.278;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,80:141:99:266,0,629 chrXII 122098 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.273;DP=117;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1155,0,1094 chrXII 122138 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.121;DP=132;Dels=0.00;FS=4.166;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.423;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1309,0,1470 chrXII 122140 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.660;DP=132;Dels=0.00;FS=4.166;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.081;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1333,0,1464 chrXII 122340 . A G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.929;DP=97;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1020,0,1069 chrXII 122353 . T C 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.211;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:932,0,929 chrXII 122930 . A G 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2901,303,0 chrXII 123527 . A G 76.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.664;DP=105;Dels=0.00;FS=8.116;HaplotypeScore=6.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.96;MQ0=0;MQRankSum=-6.830;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:105:99:106,0,1328 chrXII 123533 . G T 330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.034;DP=112;Dels=0.00;FS=3.545;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.502;QD=2.95;ReadPosRankSum=-1.380;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:360,0,1299 chrXII 123551 . A G 654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.695;DP=105;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.996;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:684,0,1124 chrXII 123596 . T G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;DP=134;Dels=0.00;FS=2.280;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.649;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1195,0,1556 chrXII 123743 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.245;DP=107;Dels=0.00;FS=2.539;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=2.579;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1198,0,1001 chrXII 123990 . T C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.903;DP=146;Dels=0.00;FS=2.098;HaplotypeScore=2.7487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.752;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.376;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1307,0,1618 chrXII 124013 . A G 3960.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.909e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:3960,408,0 chrXII 124067 . A G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.334;DP=165;Dels=0.00;FS=4.711;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.774;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,73:165:99:1405,0,1877 chrXII 124218 . G C 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3454,366,0 chrXII 124231 . C G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;DP=125;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.573;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1187,0,1354 chrXII 124421 . T C 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3516,369,0 chrXII 124642 . G T 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=23.42;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:3982,394,0 chrXII 125128 . C T 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3446,352,0 chrXII 125416 . T C 237.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.708;DP=113;Dels=0.00;FS=33.777;HaplotypeScore=39.4611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=2.10;ReadPosRankSum=-3.361;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,22:113:99:267,0,922 chrXII 125459 . T A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=99;Dels=0.00;FS=1.624;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.235;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1157,0,940 chrXII 125849 . T C 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3515,372,0 chrXII 126014 . A G 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3777,414,0 chrXII 126203 . A G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.001;DP=126;Dels=0.00;FS=5.366;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1240,0,1343 chrXII 126664 . A C 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.517;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.716;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,75:159:99:1505,0,1762 chrXII 126688 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.469;DP=148;Dels=0.00;FS=2.928;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1457,0,1533 chrXII 126691 . C T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.638;DP=150;Dels=0.00;FS=2.901;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1506,0,1552 chrXII 126722 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;DP=136;Dels=0.00;FS=14.067;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.560;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1328,0,1536 chrXII 126934 . C T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3605,361,0 chrXII 127004 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.105;DP=172;Dels=0.00;FS=3.591;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.988;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,76:172:99:1467,0,2105 chrXII 127006 . G A 4276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4276,424,0 chrXII 127022 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.411;DP=175;Dels=0.00;FS=6.640;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.505;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,80:175:99:1461,0,2051 chrXII 127219 . G A 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3864,397,0 chrXII 127234 . A G 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3499,366,0 chrXII 127407 . A T 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=105.3544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=0.15;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:6:49,6,0 chrXII 127478 . C T 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3865,394,0 chrXII 127487 . T C 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3500,366,0 chrXII 127531 . T C 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3581,378,0 chrXII 128653 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.439;DP=119;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1186,0,1377 chrXII 129090 . C T 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.06;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3572,352,0 chrXII 129226 . G A 1716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.41;MQ0=0;QD=11.52;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:1749,186,0 chrXII 129236 . G A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;DP=131;Dels=0.00;FS=305.039;HaplotypeScore=22.8761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.361;QD=9.33;ReadPosRankSum=-4.500;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,98:131:48:1252,0,48 chrXII 129260 . C T 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.002;DP=64;Dels=0.00;FS=81.799;HaplotypeScore=6.4468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.393;QD=0.30;ReadPosRankSum=-3.837;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,10:64:49:49,0,766 chrXII 129764 . A G 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3253,345,0 chrXII 129894 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.349;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.067;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1213,0,1802 chrXII 130006 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;DP=111;Dels=0.00;FS=2.554;HaplotypeScore=5.3117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=2.068;QD=9.85;ReadPosRankSum=2.168;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1123,0,1103 chrXII 130181 . C T 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.261;DP=139;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=1;MQRankSum=2.083;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,79:139:99:1644,0,1182 chrXII 130209 . A G 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=1;QD=24.17;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3650,396,0 chrXII 130212 . G A 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.581;DP=146;Dels=0.00;FS=5.311;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=1;MQRankSum=0.987;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.568;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1453,0,1492 chrXII 130405 . C G 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.837;DP=132;Dels=0.00;FS=3.208;HaplotypeScore=6.3592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1294,0,1221 chrXII 130729 . C T 4016.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:99:4016,406,0 chrXII 130739 . G A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.815;DP=178;Dels=0.00;FS=1.873;HaplotypeScore=3.6929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=5.042;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.394;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,80:178:99:1633,0,2000 chrXII 130771 . G T 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.975;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=2.744;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.188;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,75:165:99:1525,0,1801 chrXII 131340 . A G 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.923;DP=110;Dels=0.00;FS=3.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1131,0,1167 chrXII 131532 . T C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.806;DP=127;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.373;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1586,0,1104 chrXII 132130 . C A 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.246;DP=139;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1670,0,1170 chrXII 132144 . T A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.454;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.412;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:135:99:1597,0,1166 chrXII 132151 . A G 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.358;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.941;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1431,0,1278 chrXII 132260 . A G 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;DP=142;Dels=0.00;FS=4.270;HaplotypeScore=200.7683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.75;MQ0=2;MQRankSum=1.682;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.059;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:142:99:2586,276,0 chrXII 133123 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.076;DP=140;Dels=0.00;FS=4.999;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1319,0,1457 chrXII 133678 . G A 2225 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2258,234,0 chrXII 133766 . G A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.541;DP=119;Dels=0.00;FS=3.396;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.650;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1421,0,976 chrXII 134346 . A G 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.060;DP=77;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.565;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:836,0,818 chrXII 134351 . T C 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.979;DP=78;Dels=0.00;FS=3.460;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.889;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:851,0,794 chrXII 134569 . T C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.916;DP=140;Dels=0.00;FS=3.030;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.377;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1185,0,1705 chrXII 134767 . A G 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3621,378,0 chrXII 135031 . G A 3981.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3981,403,0 chrXII 135067 . T G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.872;DP=150;Dels=0.00;FS=3.853;HaplotypeScore=4.7588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.284;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,65:150:99:1311,0,1867 chrXII 135592 . A G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;DP=114;Dels=0.00;FS=11.950;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.613;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1254,0,1129 chrXII 136215 . A G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.835;DP=117;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.952;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:117:99:1125,0,1303 chrXII 136300 . T C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.614;DP=141;Dels=0.00;FS=6.397;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1397,0,1453 chrXII 136315 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.065;DP=129;Dels=0.00;FS=5.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.667;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1322,0,1438 chrXII 136383 . C A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.688;DP=127;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=4.9142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.958;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1186,0,1451 chrXII 136527 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.112;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.666;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1075,0,1591 chrXII 137383 . G T 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.397;DP=103;Dels=0.00;FS=3.940;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=-0.059;QD=13.39;ReadPosRankSum=-1.964;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,62:103:99:1409,0,692 chrXII 137707 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;DP=114;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=10.76;ReadPosRankSum=3.028;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1257,0,1097 chrXII 138124 . G C 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2548,264,0 chrXII 138153 . C T 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.832;DP=120;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.568;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:971,0,1276 chrXII 138154 . C T 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.834;DP=121;Dels=0.00;FS=1.463;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.620;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:969,0,1339 chrXII 138279 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.258;DP=133;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1208,0,1504 chrXII 138957 . T C 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.331;DP=120;Dels=0.00;FS=4.505;HaplotypeScore=4.4364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.726;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:120:99:894,0,1513 chrXII 139269 . G T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.303;DP=130;Dels=0.00;FS=2.235;HaplotypeScore=2.7525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1421,0,1331 chrXII 139283 . T C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.002;DP=132;Dels=0.00;FS=6.454;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.626;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1339,0,1313 chrXII 139321 . A T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.009;DP=135;Dels=0.00;FS=2.368;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1369,0,1449 chrXII 139322 . A T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=132;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1363,0,1427 chrXII 139437 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;DP=121;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.870;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.796;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1162,0,1404 chrXII 139668 . A G 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;DP=70;Dels=0.00;FS=24.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:806,0,714 chrXII 139713 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;DP=112;Dels=0.00;FS=3.426;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.871;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1133,0,1207 chrXII 139773 . G A 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.990;DP=106;Dels=0.00;FS=3.003;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.161;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1167,0,987 chrXII 139887 . G A 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.992;DP=95;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.708;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:859,0,1111 chrXII 140082 . C T 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;DP=103;Dels=0.00;FS=1.596;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.639;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1000,0,1087 chrXII 140584 . T C 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.442;DP=104;Dels=0.00;FS=7.702;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.194;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:938,0,1339 chrXII 140635 . A T 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;DP=97;Dels=0.00;FS=3.146;HaplotypeScore=3.3279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.382;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:841,0,1158 chrXII 140797 . C T 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.458;DP=118;Dels=0.00;FS=4.726;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=1;MQRankSum=0.518;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.147;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:982,0,1458 chrXII 140874 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.910;DP=129;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.412;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1273,0,1287 chrXII 141078 . C T 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.723;DP=160;Dels=0.00;FS=1.996;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.438;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1670,0,1526 chrXII 141135 . C T 2039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.720;DP=165;Dels=0.00;FS=1.966;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.651;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,95:165:99:2069,0,1384 chrXII 141192 . C T 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.939;DP=144;Dels=0.00;FS=4.432;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.617;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1283,0,1719 chrXII 141291 . T C 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.884;DP=135;Dels=0.00;FS=2.193;HaplotypeScore=7.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:135:99:1118,0,1604 chrXII 141390 . C T 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2731,273,0 chrXII 141900 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.669;DP=90;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.375;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.248;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,50:90:99:1163,0,769 chrXII 141933 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.908;DP=102;Dels=0.00;FS=1.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.168;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:972,0,1206 chrXII 142077 . A G 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.560;DP=116;Dels=0.00;FS=5.849;HaplotypeScore=2.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.141;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:972,0,1385 chrXII 142324 . A C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.571;DP=131;Dels=0.00;FS=3.641;HaplotypeScore=4.8220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.762;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1465,0,1270 chrXII 142524 . G A 529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.939;DP=102;Dels=0.00;FS=4.114;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.113;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,30:102:99:559,0,1584 chrXII 142670 . T G 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.313;DP=124;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1463,0,1127 chrXII 142998 . G A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.331;DP=130;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=3.1451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.438;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1319,0,1320 chrXII 143009 . C G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.901;DP=152;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=3.7564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.679;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1392,0,1561 chrXII 143093 . G A 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.013;DP=125;Dels=0.00;FS=4.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=1.408;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1088,0,1512 chrXII 143135 . G A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.857;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=-0.069;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.607;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,59:139:99:1205,0,1723 chrXII 143164 . C A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.841;DP=134;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1216,0,1601 chrXII 143452 . T C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.872;DP=134;Dels=0.00;FS=2.193;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:924,0,1133 chrXII 143487 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.128;DP=115;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.339;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1173,0,961 chrXII 143539 . C G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.771;DP=127;Dels=0.00;FS=5.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1341,0,1260 chrXII 143659 . C G 598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.971;DP=90;Dels=0.00;FS=2.839;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=6.64;ReadPosRankSum=-1.738;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,35:90:99:628,0,1164 chrXII 143752 . C T 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.104;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1525,0,1574 chrXII 143974 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.784;DP=140;Dels=0.00;FS=2.188;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,56:140:99:1114,0,1826 chrXII 143996 . C T 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.422;DP=113;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.714;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.488;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,42:113:99:859,0,1430 chrXII 144049 . G A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.627;DP=132;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:1093,0,1732 chrXII 144379 . A G 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2769,300,0 chrXII 144481 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.405;DP=113;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,64:113:99:1290,0,1006 chrXII 144822 . G A 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3893,385,0 chrXII 145042 . G T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.899;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1466,0,1241 chrXII 145067 . G A 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5489;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3549,363,0 chrXII 145416 . G A 704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.671;DP=83;Dels=0.00;FS=7.443;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.263;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,36:83:99:734,0,973 chrXII 145531 . G T 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.717;DP=110;Dels=0.00;FS=6.439;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.979;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:845,0,1285 chrXII 145744 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.230;DP=121;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1111,0,1364 chrXII 145780 . C T 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3055,309,0 chrXII 146140 . G A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;DP=188;Dels=0.00;FS=0.552;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,83:188:99:1391,0,2300 chrXII 146210 . G A 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.535;DP=160;Dels=0.00;FS=3.683;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.369;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,75:160:99:1651,0,1693 chrXII 146347 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.268;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.340;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1204,0,1215 chrXII 146506 . G A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.231;DP=145;Dels=0.00;FS=6.242;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.994;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,61:145:99:1245,0,1608 chrXII 146588 . G A 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.261;DP=157;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=3.8858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.207;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1575,0,1560 chrXII 146668 . A G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.046;DP=119;Dels=0.00;FS=3.318;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1043,0,1426 chrXII 147929 . C T 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.394;DP=119;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=2.5916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:969,0,1464 chrXII 148252 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.700;DP=119;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1110,0,1260 chrXII 148549 . T C 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.781;DP=127;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1102,0,1503 chrXII 149035 . T C 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.294;DP=118;Dels=0.00;FS=10.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=6.95;ReadPosRankSum=-2.022;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,45:118:99:850,0,1603 chrXII 149617 . C A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.190;DP=95;Dels=0.00;FS=1.657;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.492;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1068,0,905 chrXII 149857 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.772;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.603;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1206,0,927 chrXII 149893 . G A 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.915;DP=102;Dels=0.00;FS=8.222;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=8.57;ReadPosRankSum=-3.098;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:904,0,1226 chrXII 150249 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.203;DP=114;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=2.5646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1232,0,1155 chrXII 150352 . G A 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.034;DP=94;Dels=0.00;FS=1.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.811;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:94:99:797,0,1161 chrXII 150367 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.287;DP=110;Dels=0.00;FS=6.394;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.335;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1033,0,1243 chrXII 150435 . T A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;DP=120;Dels=0.00;FS=6.980;HaplotypeScore=2.7113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.958;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.556;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1259,0,1351 chrXII 150440 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.328;DP=121;Dels=0.00;FS=3.308;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.398;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1186,0,1386 chrXII 150496 . C A 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.126;DP=83;Dels=0.00;FS=2.936;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.98;MQ0=0;MQRankSum=-4.553;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,36:83:99:749,0,937 chrXII 150499 . C T 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.736;DP=85;Dels=0.00;FS=2.902;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.993;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:728,0,984 chrXII 150544 . C T 183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.237;DP=90;Dels=0.00;FS=12.737;HaplotypeScore=3.7089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=-5.101;QD=2.03;ReadPosRankSum=-6.083;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:90:99:213,0,1000 chrXII 150645 . A C 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.072;DP=103;Dels=0.00;FS=20.229;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQ0=0;MQRankSum=-4.818;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1095,0,1061 chrXII 150660 . A G 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.785;DP=111;Dels=0.00;FS=11.752;HaplotypeScore=2.7565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=0;MQRankSum=-5.375;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.532;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:954,0,1202 chrXII 150816 . C T 318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.348;DP=53;Dels=0.00;FS=13.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.963;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:348,0,775 chrXII 150826 . G T 304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;DP=53;Dels=0.00;FS=16.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.301;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.080;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:334,0,768 chrXII 150833 . T A 321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;DP=55;Dels=0.00;FS=15.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.496;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:351,0,817 chrXII 150858 . G T 456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.725;DP=83;Dels=0.00;FS=3.295;HaplotypeScore=93.2098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=5.49;ReadPosRankSum=1.722;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:486,0,850 chrXII 150874 . A C 400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.043;DP=84;Dels=0.00;FS=3.243;HaplotypeScore=65.2523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.87;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.859;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,25:84:99:430,0,803 chrXII 150875 . C A 433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.870;DP=82;Dels=0.00;FS=0.957;HaplotypeScore=50.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.302;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:463,0,778 chrXII 150917 . A G 484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;DP=70;Dels=0.00;FS=4.801;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:514,0,908 chrXII 150955 . A G 615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.054;DP=61;Dels=0.00;FS=3.558;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:645,0,604 chrXII 150983 . C T 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.537;DP=72;Dels=0.00;FS=1.992;HaplotypeScore=2.6820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,41:72:99:767,0,617 chrXII 151001 . G A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.460;DP=70;Dels=0.00;FS=0.959;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.440;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,44:70:99:969,0,455 chrXII 151034 . T A 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;DP=71;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.625;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,45:70:99:962,0,504 chrXII 151046 . T A 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;DP=66;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=10.64;ReadPosRankSum=2.997;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:732,0,600 chrXII 151102 . G A 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.227;DP=67;Dels=0.00;FS=18.677;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.583;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,34:67:99:715,0,635 chrXII 151170 . G A 707.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;DP=80;Dels=0.00;FS=19.887;HaplotypeScore=4.9448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.97;MQ0=0;MQRankSum=-3.841;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.232;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,39:80:99:737,0,873 chrXII 151173 . G A 709.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=81;Dels=0.00;FS=19.941;HaplotypeScore=4.9448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.810;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.130;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,39:81:99:739,0,885 chrXII 151178 . T C 684.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.317;DP=85;Dels=0.00;FS=13.895;HaplotypeScore=2.9599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.390;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.797;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:99:714,0,992 chrXII 151249 . C A 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.651;DP=103;Dels=0.00;FS=15.747;HaplotypeScore=5.3032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=9.02;ReadPosRankSum=2.923;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:959,0,1190 chrXII 151308 . C T 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2883,285,0 chrXII 151453 . G C 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3188,318,0 chrXII 151548 . C A 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.335;DP=123;Dels=0.00;FS=3.384;HaplotypeScore=6.1470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=12.85;ReadPosRankSum=-3.149;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,73:123:99:1610,0,907 chrXII 151611 . T C 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.261;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:1422,0,975 chrXII 151726 . C T 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.076;DP=112;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=2.5625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.216;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:112:99:957,0,1288 chrXII 151811 . C T 1859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.026;DP=152;Dels=0.00;FS=1.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.283;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,87:152:99:1889,0,1343 chrXII 151989 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.970;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.073;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1476,0,1197 chrXII 152060 . A T 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.459;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:921,0,941 chrXII 152079 . A G 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.819;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.985;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:767,0,1066 chrXII 152081 . A C 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.733;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.973;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:812,0,1019 chrXII 152313 . A G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7334;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2974,312,0 chrXII 152507 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.678;DP=113;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=2.6416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.203;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1243,0,1192 chrXII 152571 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.519;DP=119;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=2.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1247,0,1241 chrXII 152808 . G T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.351;DP=125;Dels=0.00;FS=5.608;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.558;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1167,0,1427 chrXII 153157 . T C 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.308;DP=95;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.118;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:677,0,1310 chrXII 153164 . T C 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;DP=96;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,57:96:99:1254,0,762 chrXII 153450 . A G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.512;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1322,0,1343 chrXII 153780 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.039;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1287,0,1287 chrXII 154310 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.759;DP=116;Dels=0.00;FS=6.309;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1376,0,944 chrXII 154511 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.041;DP=129;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=11.12;ReadPosRankSum=2.234;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1465,0,1266 chrXII 154678 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.685;DP=114;Dels=0.00;FS=10.176;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1228,0,1124 chrXII 154729 . A T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.849;DP=127;Dels=0.00;FS=5.549;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1376,0,1386 chrXII 155264 . G A 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.816;DP=97;Dels=0.00;FS=2.743;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=10.78;ReadPosRankSum=-2.431;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1076,0,925 chrXII 155280 . A G 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.642;DP=94;Dels=0.00;FS=3.887;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.527;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:992,0,937 chrXII 156014 . G A 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.672;DP=109;Dels=0.00;FS=6.097;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1016,0,1266 chrXII 156836 . C T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.061;DP=102;Dels=0.00;FS=2.622;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.757;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1033,0,1092 chrXII 157014 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.149;DP=97;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.467;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1093,0,948 chrXII 158461 . A G 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.026;DP=166;Dels=0.00;FS=3.013;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1750,0,1748 chrXII 158537 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.448;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.104;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1259,0,1336 chrXII 159272 . A C 2072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.095;DP=162;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,100:162:99:2102,0,1274 chrXII 159591 . G A 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.988;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.696;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:144:99:1608,0,1308 chrXII 159671 . C G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;DP=146;Dels=0.00;FS=2.195;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1335,0,1516 chrXII 160059 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.843;DP=105;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.696;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1283,0,906 chrXII 160435 . A C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.012;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.282;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1395,0,1546 chrXII 160951 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;DP=129;Dels=0.00;FS=9.551;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.111;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1374,0,1295 chrXII 161416 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;DP=131;Dels=0.00;FS=4.191;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.631;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1280,0,1519 chrXII 161602 . C A 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.932;DP=80;Dels=0.00;FS=3.166;HaplotypeScore=5.5345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.487;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:779,0,866 chrXII 162566 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.800;DP=141;Dels=0.00;FS=9.114;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=0.676;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:141:99:1534,0,1326 chrXII 162900 . C T 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.009;DP=108;Dels=0.00;FS=6.055;HaplotypeScore=2.3823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.373;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1100,0,1134 chrXII 162922 . G A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.567;DP=116;Dels=0.00;FS=8.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=10.66;ReadPosRankSum=-2.181;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1267,0,1102 chrXII 163192 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.657;DP=137;Dels=0.00;FS=5.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1333,0,1498 chrXII 163290 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.870;DP=126;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.361;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1268,0,1301 chrXII 163451 . A G 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3091,336,0 chrXII 163466 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.364;DP=119;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1046,0,1399 chrXII 164023 . A T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;DP=106;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.122;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,65:106:99:1134,0,843 chrXII 164111 . A G 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.418;DP=96;Dels=0.00;FS=13.741;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.842;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:915,0,1105 chrXII 164123 . A C 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;DP=116;Dels=0.00;FS=1.492;HaplotypeScore=2.6996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=7.91;ReadPosRankSum=-2.981;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:947,0,1255 chrXII 164197 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.560;DP=116;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.752;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1280,0,1138 chrXII 164240 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.772;DP=111;Dels=0.00;FS=6.098;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,67:111:99:1302,0,873 chrXII 164242 . T C 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.942;DP=110;Dels=0.00;FS=9.156;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.076;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1344,0,911 chrXII 164280 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.259;DP=124;Dels=0.00;FS=12.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.242;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1465,0,1069 chrXII 164329 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1263,0,1541 chrXII 164402 . A G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.967;DP=140;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.747;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1207,0,1622 chrXII 164682 . G A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.664;DP=125;Dels=0.00;FS=4.423;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1471,0,1109 chrXII 164691 . G A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.963;DP=125;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=4.4500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1503,0,1048 chrXII 164733 . C T 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.686;DP=140;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=10.39;ReadPosRankSum=2.595;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1485,0,1344 chrXII 164734 . A G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.322;DP=142;Dels=0.00;FS=3.053;HaplotypeScore=3.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.760;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1509,0,1410 chrXII 164865 . G C 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;DP=137;Dels=0.00;FS=3.311;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,82:137:99:1748,0,1062 chrXII 164910 . T C 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.536;DP=139;Dels=0.00;FS=4.048;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1556,0,1330 chrXII 164928 . A C 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.311;DP=161;Dels=0.00;FS=2.785;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=10.17;ReadPosRankSum=-2.290;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,90:161:99:1667,0,1446 chrXII 164945 . A G 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.260;DP=140;Dels=0.00;FS=5.104;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1603,0,1309 chrXII 165084 . A G 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.047;DP=153;Dels=0.00;FS=7.175;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.297;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,86:153:99:1688,0,1403 chrXII 165173 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.504;DP=127;Dels=0.00;FS=3.333;HaplotypeScore=1.9301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1387,0,1153 chrXII 165412 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.010;DP=144;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.840;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1512,0,1407 chrXII 165796 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.046;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1137,0,1352 chrXII 166036 . T C 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;DP=153;Dels=0.00;FS=3.929;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=2.753;QD=7.01;ReadPosRankSum=2.461;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,59:153:99:1102,0,2026 chrXII 166160 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.055;DP=118;Dels=0.00;FS=8.640;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.850;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1257,0,1181 chrXII 166428 . G T 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.188;DP=138;Dels=0.00;FS=5.179;HaplotypeScore=2.6414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.093;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1561,0,1332 chrXII 166515 . G A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.294;DP=120;Dels=0.00;FS=7.008;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1391,0,1112 chrXII 166641 . G A 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.144;DP=133;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=1;MQRankSum=0.368;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1589,0,1224 chrXII 166947 . A G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.939;DP=111;Dels=0.00;FS=2.481;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.347;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1044,0,1344 chrXII 167296 . C A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.371;DP=143;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1374,0,1637 chrXII 167521 . A G 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.902;DP=159;Dels=0.00;FS=3.127;HaplotypeScore=5.7716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1549,0,1805 chrXII 167640 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.189;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.392;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1216,0,1164 chrXII 167671 . A C 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.786;DP=97;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1014,0,1032 chrXII 167685 . T C 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.384;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:873,0,1001 chrXII 167737 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.517;DP=142;Dels=0.00;FS=3.271;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.324;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1489,0,1506 chrXII 167878 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;DP=136;Dels=0.00;FS=11.224;HaplotypeScore=2.8843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.144;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1333,0,1560 chrXII 168055 . A G 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.875;DP=86;Dels=0.00;FS=1.819;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.907;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:869,0,857 chrXII 168135 . C G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;DP=107;Dels=0.00;FS=3.542;HaplotypeScore=2.9517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=2.225;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:934,0,1316 chrXII 168149 . G A 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.644;DP=112;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.908;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,45:112:99:971,0,1405 chrXII 168169 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.411;DP=105;Dels=0.00;FS=6.325;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.992;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1093,0,1159 chrXII 168351 . G T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.946;DP=98;Dels=0.00;FS=3.857;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:1049,0,1070 chrXII 168352 . G A 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2728,279,0 chrXII 168376 . C T 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.441;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.608;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1052,0,1259 chrXII 168588 . G A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.118;DP=156;Dels=0.00;FS=6.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1717,0,1415 chrXII 168739 . A G 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.929;DP=151;Dels=0.00;FS=0.835;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,89:151:99:1865,0,1324 chrXII 168897 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.368;DP=117;Dels=0.00;FS=8.582;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1215,0,1291 chrXII 168969 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.340;DP=133;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=64.4192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.119;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1390,0,1378 chrXII 169124 . G T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.897;DP=113;Dels=0.00;FS=9.007;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1251,0,1134 chrXII 169203 . T A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;DP=145;Dels=0.00;FS=2.080;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.058;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.349;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1395,0,1603 chrXII 169210 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.574;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=9.35;ReadPosRankSum=-2.210;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1339,0,1522 chrXII 169381 . T C 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.644;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=11.70;ReadPosRankSum=-2.014;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,81:139:99:1656,0,1164 chrXII 169633 . C T 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.920;DP=116;Dels=0.01;FS=9.545;HaplotypeScore=7.8389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1039,0,1325 chrXII 169954 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1231,0,1296 chrXII 169985 . G A 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.315;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=9.61;ReadPosRankSum=2.007;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1568,0,1760 chrXII 170342 . C T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.541;DP=112;Dels=0.00;FS=5.922;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1230,0,1022 chrXII 170350 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.569;DP=121;Dels=0.00;FS=4.508;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.692;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1226,0,1302 chrXII 170369 . C T 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.801;DP=119;Dels=0.00;FS=4.504;HaplotypeScore=4.9324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=9.38;ReadPosRankSum=2.020;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1146,0,1340 chrXII 170451 . T G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.252;DP=112;Dels=0.00;FS=8.928;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.958;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1290,0,1068 chrXII 170705 . G A 72.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;DP=68;Dels=0.01;FS=8.360;HaplotypeScore=4.6982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQ0=0;MQRankSum=-5.085;QD=1.06;ReadPosRankSum=0.205;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:102,0,1125 chrXII 170730 . T C 240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.893;DP=66;Dels=0.00;FS=3.194;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.04;MQ0=0;MQRankSum=-5.520;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:270,0,1004 chrXII 170741 . A G 230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;DP=65;Dels=0.00;FS=5.117;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQ0=0;MQRankSum=-5.483;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:260,0,1005 chrXII 170816 . A G 436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.582;DP=56;Dels=0.00;FS=14.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.016;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:466,0,707 chrXII 170821 . A G 372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.611;DP=59;Dels=0.00;FS=14.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.817;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,26:59:99:402,0,723 chrXII 170859 . G A 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.148;DP=78;Dels=0.00;FS=11.503;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.563;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,42:77:99:911,0,699 chrXII 170876 . G A 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.662;DP=90;Dels=0.00;FS=5.357;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.941;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.215;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:955,0,964 chrXII 170932 . T A 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;DP=97;Dels=0.00;FS=6.964;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:955,0,1181 chrXII 170937 . C A 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.889;DP=113;Dels=0.00;FS=0.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.417;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.428;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1164,0,1264 chrXII 170963 . A G 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;DP=109;Dels=0.00;FS=0.848;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.701;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:995,0,1263 chrXII 171013 . G A 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.936;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.322;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:832,0,996 chrXII 171038 . C T 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.679;DP=81;Dels=0.00;FS=4.362;HaplotypeScore=6.0200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.935;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,39:81:99:721,0,758 chrXII 171076 . T G 567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.008;DP=96;Dels=0.00;FS=2.675;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=5.91;ReadPosRankSum=2.371;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:597,0,1000 chrXII 171205 . T C 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.328;DP=109;Dels=0.00;FS=3.519;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.734;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:832,0,1385 chrXII 171251 . C G 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.641;DP=108;Dels=0.00;FS=3.035;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.639;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:895,0,1252 chrXII 171320 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.452;DP=117;Dels=0.00;FS=8.516;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.822;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1124,0,1341 chrXII 171335 . T C 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.812;DP=112;Dels=0.00;FS=4.683;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:982,0,1351 chrXII 171872 . A G 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.106;DP=97;Dels=0.00;FS=5.507;HaplotypeScore=5.7949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.106;QD=8.40;ReadPosRankSum=1.100;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:845,0,1066 chrXII 171923 . C T 677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-5.327;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,39:98:99:707,0,1216 chrXII 171935 . A T 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;DP=110;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=38.6885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.54;MQ0=0;MQRankSum=-6.937;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.711;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,42:110:99:721,0,1427 chrXII 171952 . C T 632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.069;DP=126;Dels=0.00;FS=4.194;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.92;MQ0=0;MQRankSum=-8.648;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:662,0,1523 chrXII 171967 . G A 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.635;DP=121;Dels=0.00;FS=3.027;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.14;MQ0=0;MQRankSum=-8.560;QD=5.59;ReadPosRankSum=-2.202;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:706,0,1338 chrXII 171984 . G A 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.942;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.66;MQ0=0;MQRankSum=-8.579;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.625;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:677,0,1166 chrXII 171991 . G A 624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.075;DP=109;Dels=0.00;FS=2.118;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.32;MQ0=0;MQRankSum=-8.458;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:654,0,1202 chrXII 172080 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;DP=129;Dels=0.00;FS=8.573;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-3.066;QD=9.82;ReadPosRankSum=-2.571;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1297,0,1308 chrXII 172105 . G T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.391;DP=147;Dels=0.00;FS=4.850;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1619,0,1337 chrXII 172316 . A G 705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.376;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:735,0,1200 chrXII 172462 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;DP=120;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.310;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.192;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1220,0,1262 chrXII 172703 . C A 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.479;DP=88;Dels=0.00;FS=2.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:948,0,917 chrXII 173020 . G A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.402;DP=152;Dels=0.00;FS=1.292;HaplotypeScore=4.6903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.646;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1565,0,1634 chrXII 173735 . A G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.245;DP=98;Dels=0.00;FS=0.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.224;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,57:98:99:1079,0,858 chrXII 173861 . T A 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.559;DP=120;Dels=0.00;FS=3.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=24.16;ReadPosRankSum=1.212;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:2932,268,0 chrXII 173892 . A T 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2932,303,0 chrXII 173948 . C T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.486;DP=146;Dels=0.00;FS=2.082;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1453,0,1511 chrXII 173951 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.038;DP=150;Dels=0.00;FS=2.907;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1309,0,1750 chrXII 174195 . T A 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.975;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1164,0,1179 chrXII 174263 . A G 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.915;DP=94;Dels=0.00;FS=7.219;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:94:99:874,0,1061 chrXII 174526 . T A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;DP=145;Dels=0.00;FS=6.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=9.50;ReadPosRankSum=3.506;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1407,0,1647 chrXII 174938 . A C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.464;DP=165;Dels=0.00;FS=8.202;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.158;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1586,0,1905 chrXII 175067 . A C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.389;DP=113;Dels=0.00;FS=5.502;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.785;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.463;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1265,0,1138 chrXII 175068 . T A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;DP=112;Dels=0.00;FS=5.704;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.616;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1144,0,1309 chrXII 175138 . G A 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.568;DP=88;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=-3.055;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.953;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,45:88:99:853,0,915 chrXII 175158 . G A 1209.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.842;DP=105;Dels=0.00;FS=2.738;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.367;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.127;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,61:105:99:1239,0,902 chrXII 175160 . A G 1178.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.119;DP=107;Dels=0.00;FS=3.791;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.546;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.179;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1208,0,990 chrXII 175163 . C A 1211.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.097;DP=109;Dels=0.00;FS=3.861;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQ0=0;MQRankSum=-3.546;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.132;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1241,0,992 chrXII 175187 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.993;DP=118;Dels=0.00;FS=2.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.390;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1187,0,1259 chrXII 175203 . G A 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.394;DP=111;Dels=0.00;FS=4.039;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.799;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1008,0,1330 chrXII 175217 . T C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;DP=121;Dels=0.00;FS=2.627;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.709;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1397,0,1087 chrXII 175306 . A G 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.299;DP=144;Dels=0.00;FS=3.946;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.214;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1468,0,1588 chrXII 175382 . C A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.798;DP=138;Dels=0.00;FS=7.480;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.721;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1532,0,1339 chrXII 175770 . C T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.788;DP=147;Dels=0.00;FS=1.349;HaplotypeScore=5.6706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=1;MQRankSum=1.182;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.728;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1405,0,1627 chrXII 175892 . C T 1996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.789;DP=169;Dels=0.00;FS=6.790;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.509;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,91:169:99:2026,0,1551 chrXII 175946 . T C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.623;DP=121;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1282,0,1187 chrXII 175979 . T C 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;DP=128;Dels=0.00;FS=4.274;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.645;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1418,0,1204 chrXII 176336 . T C 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.877;DP=149;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.365;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.531;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1506,0,1568 chrXII 176348 . G T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.130;DP=150;Dels=0.00;FS=1.285;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.668;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1453,0,1612 chrXII 176833 . T G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.246;DP=144;Dels=0.00;FS=6.148;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.298;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1532,0,1469 chrXII 176968 . C T 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.398;DP=141;Dels=0.00;FS=6.205;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.287;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1678,0,1313 chrXII 177188 . T C 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.885;DP=169;Dels=0.00;FS=4.474;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,86:169:99:1702,0,1609 chrXII 177491 . T C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.726;DP=154;Dels=0.00;FS=7.894;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.192;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1586,0,1616 chrXII 177586 . T A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;DP=133;Dels=0.00;FS=4.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1318,0,1404 chrXII 177754 . G A 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.314;DP=152;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.524;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1540,0,1625 chrXII 177778 . C T 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3536,375,0 chrXII 178195 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;DP=137;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.062;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1371,0,1480 chrXII 178246 . G C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.912;DP=124;Dels=0.00;FS=5.791;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.094;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1355,0,1129 chrXII 178408 . A G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;DP=114;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1364,0,962 chrXII 178474 . C T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.004;DP=120;Dels=0.00;FS=6.020;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.168;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,70:120:99:1568,0,931 chrXII 178531 . T A 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.807;DP=106;Dels=0.00;FS=3.750;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.090;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1091,0,1259 chrXII 178818 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.427;DP=129;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=5.1822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.351;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1318,0,1263 chrXII 178944 . C T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.577;DP=122;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=4.9446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.979;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1347,0,1110 chrXII 178986 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.530;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.760;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1067,0,1132 chrXII 179029 . A G 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.266;DP=103;Dels=0.00;FS=11.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.194;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1181,0,972 chrXII 179034 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.787;DP=111;Dels=0.00;FS=11.146;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.877;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1243,0,1091 chrXII 179121 . G T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.456;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1429,0,1153 chrXII 179135 . A G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.170;DP=125;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1461,0,1149 chrXII 179159 . A G 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.102;DP=135;Dels=0.00;FS=5.317;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,79:135:99:1711,0,1161 chrXII 179195 . T C 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.069;DP=145;Dels=0.00;FS=3.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.768;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,85:145:99:1761,0,1265 chrXII 179265 . A G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.067;DP=138;Dels=0.00;FS=23.200;HaplotypeScore=8.5564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1290,0,1600 chrXII 179276 . A C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.365;DP=142;Dels=0.00;FS=20.649;HaplotypeScore=4.8754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1368,0,1581 chrXII 179526 . T A 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;DP=116;Dels=0.01;FS=1.786;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=1;MQRankSum=-0.573;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,71:115:99:1566,0,891 chrXII 179579 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.027;DP=113;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=-0.591;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.779;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1277,0,1122 chrXII 179648 . A G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.627;DP=123;Dels=0.00;FS=3.259;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1173,0,1401 chrXII 179688 . G A 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.096;DP=87;Dels=0.00;FS=1.763;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.236;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,42:87:99:915,0,968 chrXII 179807 . T A 665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.905;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,35:84:99:695,0,904 chrXII 179815 . T A 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.810;DP=83;Dels=0.00;FS=0.863;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=8.08;ReadPosRankSum=3.172;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:99:701,0,938 chrXII 179828 . G T 605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.328;DP=77;Dels=0.00;FS=1.992;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=7.86;ReadPosRankSum=3.457;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,32:77:99:635,0,860 chrXII 179876 . A T 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.559;DP=94;Dels=0.00;FS=10.365;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=2.501;QD=8.24;ReadPosRankSum=-2.600;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,41:94:99:805,0,1129 chrXII 179902 . T C 2332 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.295;DP=100;Dels=0.00;FS=2.017;HaplotypeScore=7.3604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=1.996;QD=23.32;ReadPosRankSum=1.750;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,96:100:99:2365,243,0 chrXII 180474 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.357;DP=121;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.527;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1173,0,1339 chrXII 180622 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.727;DP=116;Dels=0.00;FS=7.406;HaplotypeScore=4.7069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1270,0,1148 chrXII 180683 . T C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.354;DP=118;Dels=0.01;FS=8.589;HaplotypeScore=3.9447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1104,0,1255 chrXII 180796 . G A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.565;DP=137;Dels=0.00;FS=10.615;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.118;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1470,0,1458 chrXII 180860 . T C 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.689;DP=165;Dels=0.00;FS=6.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1553,0,1865 chrXII 180920 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.465;DP=106;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1237,0,966 chrXII 180960 . C A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;DP=113;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.465;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1421,0,977 chrXII 181052 . C T 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.235;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1533,0,997 chrXII 181167 . A G 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.164;DP=149;Dels=0.00;FS=11.667;HaplotypeScore=5.7242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.254;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1480,0,1526 chrXII 181828 . C T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.457;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1486,0,1004 chrXII 181944 . A G 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.249;DP=118;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,71:118:99:1580,0,925 chrXII 182119 . C T 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.524;DP=111;Dels=0.00;FS=3.573;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.738;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1054,0,1327 chrXII 182125 . A G 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.110;DP=112;Dels=0.00;FS=7.502;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=8.71;ReadPosRankSum=1.417;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:112:99:1006,0,1311 chrXII 182230 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.392;DP=119;Dels=0.00;FS=5.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.659;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1094,0,1212 chrXII 182314 . T C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=104;Dels=0.00;FS=12.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.335;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1144,0,1046 chrXII 182398 . C T 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.455;DP=106;Dels=0.00;FS=2.522;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=1;MQRankSum=-0.282;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.638;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:944,0,1302 chrXII 182437 . T G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.249;DP=128;Dels=0.00;FS=6.753;HaplotypeScore=4.9366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:128:99:1107,0,1350 chrXII 182506 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.822;DP=135;Dels=0.00;FS=8.518;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1506,0,1134 chrXII 183064 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.066;DP=147;Dels=0.00;FS=2.076;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1198,0,1767 chrXII 183090 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.909;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.382;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1307,0,1308 chrXII 183178 . G A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.129;DP=137;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=11.58;ReadPosRankSum=-2.701;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1616,0,1206 chrXII 183187 . T C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.793;DP=134;Dels=0.00;FS=5.681;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.729;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1464,0,1256 chrXII 184289 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.714;DP=139;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=3.7044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.369;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1476,0,1335 chrXII 184588 . T G 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.277;DP=156;Dels=0.00;FS=2.801;HaplotypeScore=3.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.407;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1634,0,1607 chrXII 184645 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.300;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.073;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1345,0,1503 chrXII 185932 . G A 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.089;DP=124;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=2.6618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.198;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1195,0,1461 chrXII 186034 . T C 1832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.795;DP=168;Dels=0.00;FS=2.679;HaplotypeScore=3.6425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.445;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,90:168:99:1862,0,1637 chrXII 186045 . T C 4226.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5349;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.77;SB=-2.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4226,432,0 chrXII 186083 . C A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.313;DP=131;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1445,0,1262 chrXII 186386 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.464;DP=123;Dels=0.00;FS=1.462;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.899;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.702;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1149,0,1362 chrXII 186394 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.202;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1260,0,1306 chrXII 186461 . G A 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.551;DP=146;Dels=0.00;FS=8.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.388;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1500,0,1454 chrXII 186855 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;DP=127;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1549,0,1106 chrXII 186882 . A C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.789;DP=117;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,72:116:99:1437,0,854 chrXII 186926 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.969;DP=106;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.856;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1209,0,959 chrXII 186972 . G A 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.633;DP=122;Dels=0.00;FS=7.016;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.331;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:870,0,1540 chrXII 186973 . G A 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.426;DP=123;Dels=0.00;FS=6.882;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:903,0,1548 chrXII 187694 . C T 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2472,252,0 chrXII 187807 . G A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.309;DP=107;Dels=0.00;FS=3.646;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.018;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,65:107:99:1448,0,834 chrXII 188197 . A G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;DP=121;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1236,0,1348 chrXII 188360 . C T 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.679;DP=145;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.553;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1663,0,1357 chrXII 188839 . A T 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=109;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.130;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:858,0,1210 chrXII 188842 . A C 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.263;DP=105;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:802,0,1191 chrXII 188851 . G A 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.027;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:834,0,1090 chrXII 189387 . G T 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.681;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1525,0,1442 chrXII 189603 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.889;DP=127;Dels=0.00;FS=4.423;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=1;MQRankSum=-0.081;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.056;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1479,0,1162 chrXII 189724 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.206;DP=143;Dels=0.00;FS=3.930;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.766;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1314,0,1363 chrXII 189814 . A G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.800;DP=125;Dels=0.00;FS=5.584;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.354;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1252,0,1226 chrXII 190161 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.878;DP=108;Dels=0.00;FS=1.565;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1128,0,1155 chrXII 190285 . C T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.680;DP=110;Dels=0.00;FS=6.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.943;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1062,0,1286 chrXII 190353 . T C 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3571,378,0 chrXII 190522 . G A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.704;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.155;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1126,0,1310 chrXII 190554 . A G 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.036;DP=138;Dels=0.00;FS=3.410;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1475,0,1308 chrXII 190914 . C T 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.669;DP=97;Dels=0.00;FS=2.639;HaplotypeScore=4.5499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=10.11;ReadPosRankSum=2.248;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1011,0,1023 chrXII 191548 . G T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.794;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1133,0,854 chrXII 191926 . C T 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.700;DP=113;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.640;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1284,0,1075 chrXII 191977 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.188;DP=127;Dels=0.00;FS=8.053;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.603;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1272,0,1427 chrXII 192181 . G C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.838;DP=129;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1312,0,1224 chrXII 192373 . C T 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.193;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.425;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1516,0,1253 chrXII 192746 . T C 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.908;DP=106;Dels=0.00;FS=2.526;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:912,0,1299 chrXII 192850 . G C 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.295;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:979,0,1293 chrXII 193468 . G A 611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.306;DP=87;Dels=0.00;FS=0.855;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.567;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:641,0,1023 chrXII 193629 . A C 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.629;DP=120;Dels=0.00;FS=4.435;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=2.243;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.152;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:899,0,1468 chrXII 193664 . C T 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.053;DP=135;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.373;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,56:135:99:1054,0,1727 chrXII 193884 . A T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;DP=112;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.835;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1105,0,1324 chrXII 193924 . C T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.661;DP=123;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.170;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1500,0,1015 chrXII 194047 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.859;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1298,0,1355 chrXII 194145 . C G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;DP=136;Dels=0.00;FS=2.201;HaplotypeScore=9.9209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.196;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1409,0,1354 chrXII 194272 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.556;DP=152;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=3.3971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.499;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1615,0,1570 chrXII 194277 . T C 4146.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4146,435,0 chrXII 194407 . T C 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2776,297,0 chrXII 194691 . A G 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.202;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.240;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1674,0,1337 chrXII 194811 . C T 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.298;DP=158;Dels=0.00;FS=2.819;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:158:99:1723,0,1538 chrXII 195525 . C T 2623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.98;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2656,273,0 chrXII 195537 . G A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.327;DP=101;Dels=0.00;FS=0.832;HaplotypeScore=2.8986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.690;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.269;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:1014,0,1046 chrXII 195892 . T C 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.302;DP=106;Dels=0.00;FS=3.535;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.220;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1088,0,1184 chrXII 195920 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.887;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1204,0,1205 chrXII 196093 . T C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.513;DP=118;Dels=0.00;FS=2.558;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.336;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1396,0,1133 chrXII 196681 . C A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.026;DP=114;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1014,0,1312 chrXII 196695 . C T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.786;DP=122;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.305;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1348,0,1218 chrXII 196718 . G C 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;DP=156;Dels=0.00;FS=11.343;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.214;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.473;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1696,0,1440 chrXII 196845 . A G 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3206,339,0 chrXII 196849 . T C 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3634,375,0 chrXII 196991 . T C 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3872,408,0 chrXII 197186 . G C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;DP=119;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.327;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1244,0,1114 chrXII 197459 . C T 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.023;DP=154;Dels=0.00;FS=3.783;HaplotypeScore=3.7263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.159;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1785,0,1328 chrXII 197759 . C T 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.879;DP=121;Dels=0.00;FS=6.927;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1518,0,964 chrXII 197801 . A C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.630;DP=127;Dels=0.00;FS=5.704;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1373,0,1221 chrXII 198205 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.416;DP=147;Dels=0.00;FS=13.181;HaplotypeScore=2.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.670;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1343,0,1670 chrXII 198410 . A T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;DP=136;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.835;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1654,0,1226 chrXII 198484 . A C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.472;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.950;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1132,0,1318 chrXII 198564 . A G 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.475;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1564,0,1583 chrXII 198637 . A C 1084.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.033;DP=118;Dels=0.00;FS=2.487;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.813;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1114,0,1355 chrXII 198638 . G A 1140.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.676;DP=116;Dels=0.00;FS=3.596;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.814;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1170,0,1292 chrXII 198641 . C A 1368.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.765;DP=118;Dels=0.00;FS=3.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.532;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1398,0,1135 chrXII 198744 . C T 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.225;DP=141;Dels=0.00;FS=9.913;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.860;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1661,0,1099 chrXII 198763 . C T 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.327;DP=152;Dels=0.00;FS=11.210;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,85:152:99:1743,0,1152 chrXII 198770 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.881;DP=155;Dels=0.00;FS=11.175;HaplotypeScore=3.4484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.461;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:155:99:1234,0,1657 chrXII 198992 . T C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.383;DP=130;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.557;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1134,0,1588 chrXII 199043 . A G 4089.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4089,429,0 chrXII 199079 . T G 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.629;DP=155;Dels=0.00;FS=7.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.463;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1739,0,1460 chrXII 199528 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=9.51;ReadPosRankSum=-2.266;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1324,0,1372 chrXII 199529 . A G 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.211;DP=140;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=13.5551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.962;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1398,0,1416 chrXII 199567 . C T 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.691;DP=173;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=3.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=9.47;ReadPosRankSum=2.181;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,81:173:99:1668,0,1853 chrXII 199705 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.426;DP=131;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.607;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1264,0,1415 chrXII 200284 . C A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.656;DP=142;Dels=0.00;FS=12.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.564;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1329,0,1649 chrXII 200338 . G C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.939;DP=157;Dels=0.00;FS=19.113;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.197;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,71:157:99:1482,0,1733 chrXII 200350 . A G 4437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.651;SB=-2.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:4437,442,0 chrXII 200465 . C T 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3609,355,0 chrXII 200595 . A G 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.241;DP=155;Dels=0.00;FS=5.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.505;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1797,0,1481 chrXII 200917 . C T 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.393;DP=148;Dels=0.00;FS=2.053;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.154;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1628,0,1382 chrXII 201288 . A G 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3202,330,0 chrXII 201354 . T G 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.236;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.559;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1164,0,1116 chrXII 201654 . A G 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.991;DP=129;Dels=0.00;FS=0.899;HaplotypeScore=2.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.074;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1423,0,1256 chrXII 201658 . T G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.436;DP=129;Dels=0.00;FS=1.825;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=9.74;ReadPosRankSum=2.527;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1286,0,1351 chrXII 201693 . A G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.355;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1017,0,838 chrXII 201727 . T C 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.675;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.963;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.666;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:950,0,784 chrXII 201879 . G T 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.873;DP=110;Dels=0.00;FS=2.586;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:968,0,1111 chrXII 202093 . G A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.328;DP=133;Dels=0.00;FS=2.222;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.191;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1432,0,1323 chrXII 202134 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;DP=122;Dels=0.00;FS=6.919;HaplotypeScore=2.7490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.475;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:122:99:1298,0,1252 chrXII 202261 . G A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.456;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.69;MQ0=3;MQRankSum=-4.123;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,68:111:99:1385,0,773 chrXII 203413 . G T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.793;DP=109;Dels=0.00;FS=3.580;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.452;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1201,0,1074 chrXII 204141 . A G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.044;DP=109;Dels=0.00;FS=9.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1044,0,1322 chrXII 204524 . A G 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.165;DP=83;Dels=0.00;FS=0.823;HaplotypeScore=3.6165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.462;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.425;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,42:83:99:814,0,919 chrXII 204536 . G A 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.196;DP=85;Dels=0.00;FS=4.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.454;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,46:85:99:970,0,784 chrXII 204555 . T C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.331;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.072;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:914,0,1020 chrXII 204716 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.015;DP=110;Dels=0.00;FS=12.359;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.541;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1047,0,1227 chrXII 205127 . A T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;DP=155;Dels=0.00;FS=6.089;HaplotypeScore=3.5321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.340;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1498,0,1641 chrXII 205437 . A T 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;DP=114;Dels=0.00;FS=7.786;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.977;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,39:114:99:788,0,1676 chrXII 206144 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.178;DP=128;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.829;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1303,0,1323 chrXII 206423 . A G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.355;DP=134;Dels=0.00;FS=5.281;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=0.745;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.420;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1342,0,1364 chrXII 206779 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.264;DP=146;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=2.015;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.075;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1337,0,1721 chrXII 206894 . C A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.484;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=10.07;ReadPosRankSum=2.053;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1258,0,1260 chrXII 207033 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.733;DP=123;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=10.98;ReadPosRankSum=-2.193;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1381,0,1201 chrXII 207274 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.112;DP=109;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=2.167;QD=10.97;ReadPosRankSum=2.779;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1226,0,1127 chrXII 207288 . G A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.384;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=11.86;ReadPosRankSum=3.087;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1406,0,1065 chrXII 207372 . T C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.911;DP=111;Dels=0.00;FS=5.936;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.115;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1177,0,1106 chrXII 207426 . A G 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.847;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.954;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,54:135:99:1104,0,1703 chrXII 207526 . G A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.701;DP=125;Dels=0.00;FS=4.355;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.217;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1502,0,1043 chrXII 207537 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.015;DP=131;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.561;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1531,0,1176 chrXII 207684 . A C 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.774;DP=147;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=6.9037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=2.351;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1576,0,1453 chrXII 207885 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.280;DP=97;Dels=0.00;FS=2.691;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.678;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1138,0,876 chrXII 207908 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;DP=108;Dels=0.00;FS=2.587;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.704;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1267,0,919 chrXII 207990 . G A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.781;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.657;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1121,0,1395 chrXII 208056 . T C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.325;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:924,0,826 chrXII 208218 . G T 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.934;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1698,0,1490 chrXII 208290 . G A 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.354;DP=129;Dels=0.00;FS=21.507;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.894;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:129:99:1218,0,1298 chrXII 208353 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.145;DP=145;Dels=0.00;FS=7.534;HaplotypeScore=2.9142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.962;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1266,0,1758 chrXII 208422 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;DP=157;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=1;MQRankSum=-0.504;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,74:157:99:1444,0,1777 chrXII 208514 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.647;DP=156;Dels=0.00;FS=2.023;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=3;MQRankSum=0.225;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.291;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1401,0,1647 chrXII 208550 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.084;DP=102;Dels=0.00;FS=7.133;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=2;MQRankSum=-0.801;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.988;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1171,0,971 chrXII 208651 . G A 2036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=73.5633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.54;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2069,213,0 chrXII 208751 . A G 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=108;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=24.08;ReadPosRankSum=1.700;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2634,273,0 chrXII 208796 . T C 1948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1981,216,0 chrXII 208797 . T C 1939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.85;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1972,210,0 chrXII 209075 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.770;DP=148;Dels=0.00;FS=3.178;HaplotypeScore=2.3924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.848;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,59:148:99:1209,0,1910 chrXII 209252 . C T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.983;DP=135;Dels=0.00;FS=4.200;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.089;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,57:135:99:1151,0,1644 chrXII 209501 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.633;DP=122;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1278,0,1226 chrXII 209540 . A G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3168,342,0 chrXII 209708 . T C 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.94;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2731,297,0 chrXII 209847 . G A 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.765;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=25.69;ReadPosRankSum=1.437;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3340,351,0 chrXII 210023 . C G 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3458,357,0 chrXII 210043 . G A 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3344,328,0 chrXII 210102 . T C 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3633,378,0 chrXII 210476 . A G 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3425,342,0 chrXII 210527 . G A 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3168,315,0 chrXII 210539 . A G 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2615,276,0 chrXII 210560 . A G 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2674,279,0 chrXII 210572 . G A 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2902,294,0 chrXII 210638 . A G 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2852,297,0 chrXII 210644 . C T 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2941,300,0 chrXII 210791 . C T 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9549;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.909e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3542,357,0 chrXII 211019 . C T 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3603,361,0 chrXII 211028 . T A 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3509,349,0 chrXII 211045 . A G 3857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3857,390,0 chrXII 211130 . A C 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3611,372,0 chrXII 211178 . A G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.820;DP=119;Dels=0.00;FS=1.475;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.459;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.327;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1211,0,1283 chrXII 211190 . A G 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3357,351,0 chrXII 211217 . G A 4000.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.997e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4000,400,0 chrXII 211226 . C T 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.37;SB=-2.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4046,403,0 chrXII 211485 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.138;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.288;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1116,0,1286 chrXII 211592 . T C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.604;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,73:118:99:1562,0,885 chrXII 211658 . A C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.739;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.582;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1187,0,1009 chrXII 212026 . G A 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.0866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2726,282,0 chrXII 212081 . G A 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3665,358,0 chrXII 212126 . T A 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;DP=124;Dels=0.00;FS=10.899;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.398;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1363,0,1333 chrXII 212189 . A G 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.988;DP=116;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.322;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,40:116:99:763,0,1750 chrXII 212321 . T C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;DP=130;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.253;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.946;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1466,0,1183 chrXII 212531 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.489;DP=146;Dels=0.00;FS=1.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.578;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1533,0,1491 chrXII 212683 . T C 2430 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2463,258,0 chrXII 212873 . A G 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.037;DP=149;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.063;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:1599,0,1345 chrXII 213037 . T C 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3005,315,0 chrXII 213069 . C G 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2898,309,0 chrXII 213226 . T C 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=23.58;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2745,300,0 chrXII 213278 . C T 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3025,306,0 chrXII 213307 . C T 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.83;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3498,354,0 chrXII 213308 . G T 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3503,352,0 chrXII 213334 . G A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3540,352,0 chrXII 213413 . C T 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2739,279,0 chrXII 213421 . A G 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2743,285,0 chrXII 213585 . T C 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3191,327,0 chrXII 213659 . T C 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7902;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3237,354,0 chrXII 213996 . A G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3263,342,0 chrXII 214112 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.731;DP=137;Dels=0.00;FS=2.197;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1470,0,1323 chrXII 214228 . A G 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3378,363,0 chrXII 214283 . G A 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3537,369,0 chrXII 214310 . A G 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3394,351,0 chrXII 214399 . T G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.947;DP=102;Dels=0.00;FS=7.780;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1101,0,1018 chrXII 214500 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.554;DP=116;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=12.8759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:116:99:1163,0,1201 chrXII 214592 . C T 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.40;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2739,279,0 chrXII 214673 . A G 2278 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.30;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2311,252,0 chrXII 214692 . T A 518.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.587;DP=92;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=17.5613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.76;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.023;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,35:88:99:548,0,960 chrXII 214693 . G A 1734 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=17.5613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.31;MQ0=0;QD=19.05;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1767,201,0 chrXII 214696 . A G 1702 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=92;Dels=0.00;FS=3.377;HaplotypeScore=17.5613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.28;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=18.50;ReadPosRankSum=3.984;SB=-9.658e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,84:92:99:1735,182,0 chrXII 214703 . T C 2306 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.18;MQ0=0;QD=21.96;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2339,252,0 chrXII 214706 . T A 2427 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.39;MQ0=0;QD=22.68;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2460,261,0 chrXII 214730 . G A 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.57;MQ0=0;QD=22.41;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2386,252,0 chrXII 214737 . A G 2244 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.21;MQ0=0;QD=21.79;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2277,246,0 chrXII 214742 . T C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.569;DP=109;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1011,0,928 chrXII 214840 . T C 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.47;MQ0=0;QD=25.67;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3311,345,0 chrXII 214850 . T C 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=25.44;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2984,306,0 chrXII 214867 . A G 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.040;DP=119;Dels=0.00;FS=2.460;HaplotypeScore=2.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.16;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.072;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1099,0,1395 chrXII 215008 . T C 2546 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.38;MQ0=0;QD=26.25;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2579,276,0 chrXII 215016 . C G 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:885,0,948 chrXII 221188 . A G 2487 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2520,270,0 chrXII 221190 . C T 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.67;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2605,276,0 chrXII 221313 . A G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;DP=110;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQ0=0;MQRankSum=2.122;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.009;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1072,0,1282 chrXII 221368 . A G 2558 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.72;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:97:99:2591,270,0 chrXII 221376 . A G 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.57;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2882,300,0 chrXII 221392 . T A 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.53;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2785,285,0 chrXII 221668 . A G 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3551,363,0 chrXII 221843 . C T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.363;DP=109;Dels=0.00;FS=2.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1007,0,1268 chrXII 222046 . C T 2063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2096,213,0 chrXII 222157 . A G 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.363;DP=114;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.350;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1161,0,1216 chrXII 222397 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.336;DP=122;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.381;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1307,0,1245 chrXII 222430 . T C 2420 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.02;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2453,258,0 chrXII 222469 . T A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.803;DP=124;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=3.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.056;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1145,0,1493 chrXII 222754 . G A 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.284;DP=121;Dels=0.00;FS=10.992;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=1;MQRankSum=0.304;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:959,0,1488 chrXII 222793 . A G 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.618;DP=133;Dels=0.00;FS=1.803;HaplotypeScore=4.4907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=1;MQRankSum=-1.399;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:933,0,1792 chrXII 222884 . G C 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;DP=120;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.230;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,43:120:99:751,0,1691 chrXII 223067 . G T 543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.280;DP=109;Dels=0.00;FS=6.431;HaplotypeScore=89.0890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.010;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,38:109:99:573,0,1497 chrXII 223085 . C T 428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.234;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,34:100:99:458,0,1447 chrXII 223100 . G A 2488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.52;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2521,261,0 chrXII 223162 . C T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.859;DP=117;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1090,0,1416 chrXII 223258 . T C 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=21.15;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3078,333,0 chrXII 223315 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.126;DP=127;Dels=0.00;FS=4.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=1;MQRankSum=1.398;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1369,0,1306 chrXII 223337 . C T 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=1;QD=26.93;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3286,325,0 chrXII 223509 . G A 2578 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2611,261,0 chrXII 223519 . A G 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2802,291,0 chrXII 223685 . G T 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3652,363,0 chrXII 223716 . A C 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3403,339,0 chrXII 223719 . A G 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3122,321,0 chrXII 223732 . T A 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3475,340,0 chrXII 223779 . G A 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3386,351,0 chrXII 223833 . G A 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.24;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3460,360,0 chrXII 223875 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=108;Dels=0.00;FS=5.034;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1164,0,1103 chrXII 223880 . G A 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2995,306,0 chrXII 223946 . T C 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2539,276,0 chrXII 224012 . A G 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2786,297,0 chrXII 224139 . C T 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3451,346,0 chrXII 224592 . G A 2274 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.84;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2307,237,0 chrXII 224760 . C T 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.93;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2699,270,0 chrXII 225174 . T C 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3001,315,0 chrXII 225226 . T C 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3416,354,0 chrXII 225405 . A T 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=14.2090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3956,405,0 chrXII 225447 . T C 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2918,300,0 chrXII 225676 . G C 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3004,318,0 chrXII 225795 . T C 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2981,324,0 chrXII 225831 . T G 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=1;QD=25.64;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3238,342,0 chrXII 225921 . C T 2603 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=1;QD=25.27;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2636,273,0 chrXII 225953 . A G 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;QD=25.64;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2725,285,0 chrXII 225993 . A T 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2758,273,0 chrXII 226047 . G A 1782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.83;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1815,183,0 chrXII 226119 . T C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2967,306,0 chrXII 226142 . G T 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3156,310,0 chrXII 226242 . T C 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=25.91;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3343,357,0 chrXII 226438 . A G 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3103,315,0 chrXII 226485 . T C 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3105,330,0 chrXII 226560 . T C 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3017,339,0 chrXII 226605 . T C 3556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3556,375,0 chrXII 226659 . C T 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.996;DP=133;Dels=0.00;FS=4.337;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.701;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1531,0,1291 chrXII 226728 . C A 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2780,279,0 chrXII 226803 . G A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3152,321,0 chrXII 226806 . A G 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3154,342,0 chrXII 227193 . T C 2324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.99;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2357,249,0 chrXII 227328 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2718,276,0 chrXII 227856 . T C 732.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.763;DP=97;Dels=0.00;FS=5.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:762,0,1181 chrXII 227858 . G A 781.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.513;DP=97;Dels=0.00;FS=5.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.151;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:811,0,1154 chrXII 227865 . C T 722.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.280;DP=95;Dels=0.00;FS=4.076;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:752,0,1148 chrXII 228126 . G A 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.866;DP=104;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.767;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:883,0,1249 chrXII 228303 . T C 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3728,372,0 chrXII 228348 . T C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3279,348,0 chrXII 228420 . C T 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3499,351,0 chrXII 228510 . A G 2201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2234,231,0 chrXII 228527 . A G 2314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:96:99:2347,246,0 chrXII 228807 . C T 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2731,270,0 chrXII 228852 . C T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.024;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,52:81:99:1153,0,539 chrXII 228889 . T C 2637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2670,285,0 chrXII 228957 . C G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.090;DP=120;Dels=0.00;FS=4.458;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=8.61;ReadPosRankSum=-2.180;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1063,0,1374 chrXII 229054 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.158;DP=127;Dels=0.00;FS=4.301;HaplotypeScore=3.1966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.879;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1415,0,1220 chrXII 229120 . T G 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3213,330,0 chrXII 229136 . T G 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.69;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3119,321,0 chrXII 229166 . T C 2774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.12;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2807,306,0 chrXII 229196 . G C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.874;DP=123;Dels=0.00;FS=3.306;HaplotypeScore=3.1837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.144;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:123:99:1117,0,1310 chrXII 229358 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.106;DP=115;Dels=0.00;FS=2.540;HaplotypeScore=3.6422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-3.258;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.059;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1415,0,964 chrXII 229498 . A T 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3106,315,0 chrXII 229583 . T G 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.604;DP=114;Dels=0.00;FS=2.442;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:945,0,1402 chrXII 229597 . T G 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.199;DP=107;Dels=0.01;FS=0.750;HaplotypeScore=7.6322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.155;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.965;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:958,0,1260 chrXII 229618 . T C 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3040,327,0 chrXII 229623 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.281;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.776;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1129,0,1493 chrXII 229736 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.174;DP=98;Dels=0.00;FS=9.888;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.513;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1233,0,836 chrXII 229921 . C T 745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.911;DP=84;Dels=0.00;FS=0.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.523;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,37:84:99:775,0,941 chrXII 230005 . G A 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2666,270,0 chrXII 230030 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.163;DP=124;Dels=0.00;FS=2.332;HaplotypeScore=4.8851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.268;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:124:99:1121,0,1450 chrXII 230210 . G A 3189 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6043;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.75;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3222,327,0 chrXII 230212 . A G 1074.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.088;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:120:99:1104,0,1445 chrXII 230218 . G A 936.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.312;DP=116;Dels=0.00;FS=4.551;HaplotypeScore=3.4568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.756;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:966,0,1367 chrXII 230777 . C T 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.815;DP=129;Dels=0.00;FS=11.766;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.137;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,76:129:99:1727,0,979 chrXII 230960 . T C 3532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6638;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3532,381,0 chrXII 231044 . G A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.914;DP=135;Dels=0.00;FS=3.153;HaplotypeScore=2.7145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1287,0,1487 chrXII 231281 . A T 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3056,309,0 chrXII 231283 . A G 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.519;DP=109;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.955;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:952,0,1393 chrXII 231304 . T A 1026.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;DP=112;Dels=0.00;FS=2.516;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1056,0,1304 chrXII 231306 . C A 1320.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.122;DP=113;Dels=0.00;FS=1.542;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.124;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1350,0,1047 chrXII 231307 . C A 1029.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.292;DP=113;Dels=0.00;FS=2.468;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.165;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1059,0,1234 chrXII 231400 . A G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.771;DP=117;Dels=0.00;FS=3.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.400;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1253,0,1158 chrXII 231403 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.285;DP=114;Dels=0.00;FS=3.379;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.355;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1115,0,1231 chrXII 231430 . T C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=129;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1358,0,1311 chrXII 231434 . T G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.766;DP=133;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1307,0,1539 chrXII 231692 . T C 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3799,405,0 chrXII 231809 . C T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.287;DP=123;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=2.300;QD=11.57;ReadPosRankSum=2.391;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1453,0,1183 chrXII 232046 . A G 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3337,366,0 chrXII 232063 . G T 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.833;DP=104;Dels=0.00;FS=3.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.266;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2755,285,0 chrXII 232208 . C T 2534 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.88;MQ0=0;QD=24.60;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2567,261,0 chrXII 232216 . G A 2590 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.38;MQ0=0;QD=23.76;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2623,282,0 chrXII 232217 . T G 2439 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.38;MQ0=0;QD=22.38;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2472,273,0 chrXII 232561 . A G 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.73;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3605,390,0 chrXII 232816 . G T 219.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.476;DP=110;Dels=0.00;FS=15.897;HaplotypeScore=23.0104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.02;MQ0=0;MQRankSum=-6.635;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,29:110:99:249,0,1802 chrXII 232817 . G A 224.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.637;DP=107;Dels=0.00;FS=13.966;HaplotypeScore=22.3453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQ0=0;MQRankSum=-7.176;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.133;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:254,0,1764 chrXII 232818 . T G 238.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=106;Dels=0.00;FS=14.017;HaplotypeScore=23.2120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQ0=0;MQRankSum=-6.881;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.209;SB=-1.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:106:99:268,0,1721 chrXII 232849 . T C 87.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=103;Dels=0.00;FS=36.770;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQ0=0;MQRankSum=-6.781;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,19:103:99:117,0,1996 chrXII 232935 . C T 1854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.40;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1887,189,0 chrXII 233140 . C G 29.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;DP=91;Dels=0.00;FS=2.209;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-3.183;QD=0.32;ReadPosRankSum=-0.005;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,18:91:59:59,0,1705 chrXII 233149 . G A 113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.898;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-3.991;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.363;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,21:92:99:143,0,1562 chrXII 233182 . A G 225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;DP=77;Dels=0.00;FS=5.273;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=2.92;ReadPosRankSum=2.122;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:255,0,1356 chrXII 233229 . C T 96.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;DP=83;Dels=0.00;FS=10.815;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=1.16;ReadPosRankSum=-3.581;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,14:83:99:126,0,1577 chrXII 233290 . G A 63.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.383;DP=91;Dels=0.00;FS=37.203;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.489;QD=0.69;ReadPosRankSum=-3.594;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:93:93,0,1521 chrXII 234672 . C G 4175.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4175,426,0 chrXII 234767 . G A 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3635,361,0 chrXII 234824 . C T 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3922,388,0 chrXII 235352 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.225;DP=123;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=2.7765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.257;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.305;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1328,0,1227 chrXII 235891 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.911;DP=105;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.181;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:105:99:1198,0,919 chrXII 235940 . G C 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=150;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,84:150:99:1790,0,1246 chrXII 236237 . T C 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.106;DP=161;Dels=0.00;FS=9.362;HaplotypeScore=2.4658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1620,0,1626 chrXII 236268 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.181;DP=165;Dels=0.00;FS=8.078;HaplotypeScore=4.4747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.510;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1616,0,1717 chrXII 236470 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;DP=112;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.158;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1249,0,1062 chrXII 236611 . T A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;DP=114;Dels=0.00;FS=9.270;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.157;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:114:99:1191,0,1212 chrXII 236638 . G A 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.050;DP=138;Dels=0.00;FS=7.745;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.071;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1614,0,1262 chrXII 236662 . G A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.781;DP=132;Dels=0.00;FS=2.257;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.606;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,75:132:99:1605,0,1133 chrXII 236885 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.698;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.390;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1133,0,1577 chrXII 237080 . G A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.635;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.028;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1555,0,1260 chrXII 237225 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.438;DP=136;Dels=0.00;FS=10.658;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:136:99:1449,0,1341 chrXII 237608 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.174;DP=137;Dels=0.00;FS=5.145;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1232,0,1589 chrXII 237728 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.541;DP=128;Dels=0.00;FS=2.259;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.133;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1196,0,1528 chrXII 237808 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.092;DP=118;Dels=0.00;FS=4.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.140;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1248,0,1280 chrXII 237814 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.532;DP=125;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.745;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1244,0,1423 chrXII 237951 . T A 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;DP=100;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:1004,0,1215 chrXII 237982 . T C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.143;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.635;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1097,0,1286 chrXII 238074 . A G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.299;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.663;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1111,0,1073 chrXII 238148 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=124;Dels=0.00;FS=4.382;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1232,0,1354 chrXII 238192 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=123;Dels=0.00;FS=2.326;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.727;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1333,0,1248 chrXII 238196 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.634;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=9.70;ReadPosRankSum=-2.304;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1233,0,1323 chrXII 238228 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.991;DP=126;Dels=0.00;FS=2.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.339;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1440,0,1211 chrXII 238301 . C T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.066;DP=106;Dels=0.00;FS=2.779;HaplotypeScore=5.4864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:106:99:1130,0,970 chrXII 238303 . T C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.605;DP=107;Dels=0.00;FS=5.132;HaplotypeScore=5.4885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.315;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1063,0,1041 chrXII 238370 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.476;DP=128;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=1;MQRankSum=-1.304;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.109;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1271,0,1185 chrXII 238466 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;DP=120;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.502;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1289,0,1160 chrXII 238667 . C T 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.065;DP=116;Dels=0.00;FS=4.630;HaplotypeScore=3.2527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.289;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.920;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1092,0,1323 chrXII 238758 . G A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;DP=122;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.105;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1347,0,1173 chrXII 238919 . G C 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=167;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,87:167:99:1773,0,1561 chrXII 238951 . A G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.245;DP=153;Dels=0.00;FS=5.624;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.797;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1524,0,1560 chrXII 238970 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;DP=147;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=5.5796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1494,0,1395 chrXII 239098 . C G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.197;DP=122;Dels=0.00;FS=3.481;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.005;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1156,0,1260 chrXII 239186 . A G 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.719;DP=105;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.854;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:830,0,1338 chrXII 239561 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.254;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:138:99:1180,0,1626 chrXII 239575 . G C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.118;DP=128;Dels=0.00;FS=3.251;HaplotypeScore=2.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1348,0,1153 chrXII 239804 . C T 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.417;DP=89;Dels=0.00;FS=5.502;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.684;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:774,0,1126 chrXII 239896 . T A 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;DP=97;Dels=0.00;FS=1.648;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.220;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:995,0,1069 chrXII 240031 . G A 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;DP=118;Dels=0.00;FS=8.581;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1169,0,1323 chrXII 240159 . G A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.807;DP=133;Dels=0.00;FS=6.496;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1313,0,1527 chrXII 240627 . G A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.215;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1329,0,1587 chrXII 240793 . G A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.592;DP=115;Dels=0.00;FS=3.440;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.201;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1123,0,1274 chrXII 243437 . C G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.695;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1252,0,1347 chrXII 243795 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;DP=126;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1164,0,1356 chrXII 243850 . C T 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.914;DP=93;Dels=0.00;FS=5.283;HaplotypeScore=4.3704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:972,0,835 chrXII 243864 . T C 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.856;DP=96;Dels=0.00;FS=3.843;HaplotypeScore=2.4626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.432;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:874,0,928 chrXII 244310 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.916;DP=122;Dels=0.00;FS=13.434;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1277,0,1283 chrXII 244859 . G T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.532;DP=108;Dels=0.00;FS=4.832;HaplotypeScore=4.8860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.028;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1165,0,1154 chrXII 245465 . T C 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.022;DP=133;Dels=0.00;FS=2.186;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1223,0,1506 chrXII 245604 . G A 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.610;DP=120;Dels=0.00;FS=2.546;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1274,0,1163 chrXII 246274 . C T 2082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=21.46;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2115,222,0 chrXII 246315 . T A 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.76;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2816,300,0 chrXII 246534 . A G 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3077,312,0 chrXII 246804 . A G 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2822,294,0 chrXII 246984 . C T 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3137,327,0 chrXII 247140 . T C 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3073,330,0 chrXII 247374 . T C 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3066,327,0 chrXII 247393 . T C 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3027,324,0 chrXII 247449 . G A 3764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.13;SB=-2.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3764,369,0 chrXII 248269 . C T 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.623;DP=97;Dels=0.00;FS=6.480;HaplotypeScore=6.2967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.856;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:972,0,1067 chrXII 248314 . C G 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;DP=99;Dels=0.00;FS=5.027;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=2.368;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:841,0,1134 chrXII 248559 . G T 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.44;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3038,315,0 chrXII 248615 . A G 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.25;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3928,408,0 chrXII 248656 . G T 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3591,361,0 chrXII 248752 . A G 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.576;DP=119;Dels=0.00;FS=2.626;HaplotypeScore=3.9093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:852,0,1117 chrXII 249052 . A C 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.978e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3771,381,0 chrXII 249224 . A G 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;DP=133;Dels=0.00;FS=4.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.142;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1570,0,1218 chrXII 249539 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;DP=121;Dels=0.00;FS=6.991;HaplotypeScore=2.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:121:99:1335,0,1173 chrXII 249558 . A G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.357;DP=109;Dels=0.00;FS=5.987;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.708;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:986,0,1264 chrXII 249616 . T G 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3057,324,0 chrXII 249640 . C T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3605,369,0 chrXII 249742 . T G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.590;DP=128;Dels=0.00;FS=10.150;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.846;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1201,0,1390 chrXII 249743 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.539;DP=127;Dels=0.00;FS=11.856;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.516;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:127:99:1329,0,1337 chrXII 249788 . G A 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.041;DP=157;Dels=0.00;FS=6.006;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.158;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1731,0,1531 chrXII 249826 . C T 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.291;DP=164;Dels=0.00;FS=3.941;HaplotypeScore=3.5651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.112;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,75:164:99:1522,0,1855 chrXII 249947 . A G 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.474;DP=126;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.862;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1481,0,1160 chrXII 250030 . C T 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.113;DP=87;Dels=0.00;FS=2.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=8.39;ReadPosRankSum=2.023;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:760,0,996 chrXII 250169 . A T 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;DP=92;Dels=0.00;FS=1.749;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:998,0,925 chrXII 250337 . C G 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.184;DP=162;Dels=0.00;FS=4.689;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,79:162:99:1604,0,1616 chrXII 250359 . C T 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.268;DP=174;Dels=0.00;FS=1.215;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.457;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,80:174:99:1582,0,1994 chrXII 250412 . A G 3722.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3722,396,0 chrXII 250583 . T A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;DP=136;Dels=0.00;FS=14.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.269;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1228,0,1679 chrXII 250588 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.131;DP=133;Dels=0.00;FS=14.481;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.579;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1075,0,1656 chrXII 250697 . A G 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.190;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1606,0,1448 chrXII 250711 . G A 4118.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4118,409,0 chrXII 250891 . T A 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.018;DP=140;Dels=0.01;FS=0.653;HaplotypeScore=13.7836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=11.84;ReadPosRankSum=-3.105;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,81:139:99:1688,0,1150 chrXII 250979 . A T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=12.75;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1407,0,946 chrXII 251868 . T C 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.765;DP=185;Dels=0.00;FS=4.381;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,86:185:99:1666,0,2195 chrXII 252448 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.611;DP=143;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.281;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1337,0,1619 chrXII 252507 . A G 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.055;DP=151;Dels=0.00;FS=4.992;HaplotypeScore=2.7222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=2.127;QD=11.03;ReadPosRankSum=-2.064;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1696,0,1373 chrXII 252562 . G T 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.994;DP=199;Dels=0.00;FS=1.769;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,90:199:99:1789,0,2317 chrXII 252615 . T G 5462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;DP=218;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=25.06;ReadPosRankSum=1.335;SB=-2.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,217:218:99:5462,567,0 chrXII 252643 . C A 2127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.632;DP=191;Dels=0.00;FS=1.145;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.537;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,100:191:99:2157,0,1867 chrXII 252766 . T A 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=24.8365;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.22;MQ0=0;QD=18.29;SB=-2.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:2722,288,0 chrXII 252808 . C T 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.321;DP=141;Dels=0.00;FS=8.833;HaplotypeScore=3.8096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.30;MQ0=0;MQRankSum=-8.437;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:909,0,1622 chrXII 252815 . T C 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.336;DP=132;Dels=0.00;FS=10.956;HaplotypeScore=3.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.16;MQ0=0;MQRankSum=-6.730;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.332;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:669,0,1774 chrXII 252833 . G A 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.821;DP=151;Dels=0.00;FS=18.617;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.94;MQ0=0;MQRankSum=5.845;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.116;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:151:99:1674,0,1066 chrXII 252889 . G C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.994;DP=226;Dels=0.00;FS=4.857;HaplotypeScore=2.7062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.841;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,148:226:99:1282,0,1336 chrXII 252907 . G C 57.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.103;DP=215;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=276.4529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.813;QD=0.27;ReadPosRankSum=-4.735;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,28:215:87:87,0,2021 chrXII 252940 . A C 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.200;DP=200;Dels=0.00;FS=15.595;HaplotypeScore=2.5671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.18;MQ0=0;MQRankSum=-6.180;QD=0.19;ReadPosRankSum=-5.748;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,46:200:67:67,0,3036 chrXII 252945 . C G 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;DP=195;Dels=0.00;FS=10.392;HaplotypeScore=3.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.44;MQ0=0;MQRankSum=-6.672;QD=0.12;ReadPosRankSum=-7.880;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,46:195:54:54,0,2983 chrXII 253240 . C A 2229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.946;DP=229;Dels=0.00;FS=3.838;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=9.73;ReadPosRankSum=2.566;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,111:229:99:2259,0,2465 chrXII 253266 . A G 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.144;DP=206;Dels=0.00;FS=0.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.881;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,103:206:99:1910,0,2315 chrXII 253274 . A G 5153.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.70;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:5153,541,0 chrXII 253789 . G A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.453;DP=130;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=8.8346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=9.23;ReadPosRankSum=-2.251;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:130:99:1230,0,1456 chrXII 253806 . T C 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.864;DP=122;Dels=0.00;FS=3.305;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=2.125;QD=11.52;ReadPosRankSum=2.773;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1435,0,1106 chrXII 254321 . T C 4050.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4954;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4050,438,0 chrXII 254691 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.604;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=-0.804;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.265;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1393,0,1691 chrXII 254994 . C T 1891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.236;DP=171;Dels=0.00;FS=3.759;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.923;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,90:171:99:1921,0,1667 chrXII 255134 . T C 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.592;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.428;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.101;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1229,0,1357 chrXII 255238 . C A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.164;DP=114;Dels=0.00;FS=2.960;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.014;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1161,0,1124 chrXII 255562 . T A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.319;DP=167;Dels=0.00;FS=3.673;HaplotypeScore=7.3606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=3.456;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.693;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,72:167:99:1494,0,2008 chrXII 255647 . T C 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.747;DP=131;Dels=0.00;FS=3.151;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.086;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1431,0,1301 chrXII 255736 . T C 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2658,282,0 chrXII 256010 . T C 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.622;DP=140;Dels=0.00;FS=9.340;HaplotypeScore=5.3977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.515;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.512;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,80:140:99:1578,0,1179 chrXII 256166 . T C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.129;DP=151;Dels=0.00;FS=3.012;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.735;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1468,0,1576 chrXII 256202 . T C 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.373;DP=140;Dels=0.00;FS=3.449;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.904;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1453,0,1384 chrXII 256217 . T G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.013;DP=146;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.838;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.357;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1403,0,1502 chrXII 256226 . T C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.268;DP=144;Dels=0.00;FS=3.987;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.293;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.783;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1358,0,1505 chrXII 256392 . C G 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=129;Dels=0.00;FS=6.727;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.281;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1229,0,1460 chrXII 256508 . A G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.164;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.632;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.471;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1391,0,1151 chrXII 256525 . A G 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.544;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.703;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1120,0,1076 chrXII 256528 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.742;DP=114;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.465;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1143,0,1070 chrXII 256592 . C T 1915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.766;DP=172;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=6.5140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,90:172:99:1945,0,1669 chrXII 256620 . T C 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.004;DP=164;Dels=0.00;FS=3.576;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:1660,0,1762 chrXII 256650 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;DP=130;Dels=0.00;FS=7.797;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.423;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1402,0,1349 chrXII 256727 . T C 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.949;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1743,0,1226 chrXII 256737 . A G 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.828;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1573,0,1175 chrXII 256826 . T C 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.189;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,42:85:99:906,0,944 chrXII 257091 . G C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;DP=117;Dels=0.00;FS=5.730;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=1;MQRankSum=0.940;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.670;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1046,0,1307 chrXII 257316 . G T 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2881,291,0 chrXII 257334 . A G 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2892,312,0 chrXII 257366 . T A 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3681,370,0 chrXII 257504 . A G 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3875,414,0 chrXII 257654 . A G 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3212,327,0 chrXII 257917 . T C 4455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:177:99:4455,474,0 chrXII 257942 . A G 2192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;DP=178;Dels=0.00;FS=2.942;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.728;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,102:178:99:2222,0,1505 chrXII 257971 . A T 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.762;DP=175;Dels=0.00;FS=7.759;HaplotypeScore=4.4893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,81:175:99:1716,0,2051 chrXII 258268 . G A 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.705;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.867;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,81:166:99:1715,0,1692 chrXII 258928 . G A 2038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.887;DP=202;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=3.7487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,97:202:99:2068,0,2118 chrXII 259051 . C T 3924.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3924,403,0 chrXII 259210 . G A 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2976,309,0 chrXII 259471 . G T 4608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4608,451,0 chrXII 259579 . A T 3899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3899,399,0 chrXII 260002 . G C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;DP=142;Dels=0.00;FS=2.183;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:142:99:1164,0,1705 chrXII 260116 . G T 1884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.155;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.538;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,92:180:99:1914,0,1630 chrXII 260197 . A G 4299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.71;SB=-2.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4299,462,0 chrXII 260496 . G A 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.241;DP=155;Dels=0.00;FS=2.166;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1500,0,1828 chrXII 262055 . C T 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3419,342,0 chrXII 262532 . G A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.864;DP=145;Dels=0.00;FS=3.894;HaplotypeScore=5.3294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.439;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1633,0,1396 chrXII 262607 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.438;DP=117;Dels=0.00;FS=18.082;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1237,0,1235 chrXII 262933 . T C 2125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.91;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2158,225,0 chrXII 262942 . T A 2065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=26.47;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2098,210,0 chrXII 262959 . A T 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;DP=98;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,40:98:99:710,0,1315 chrXII 262996 . C T 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.983;DP=76;Dels=0.00;FS=0.888;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,42:76:99:870,0,675 chrXII 263008 . G A 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.215;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.807;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,39:85:99:786,0,981 chrXII 263039 . G T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.597;DP=93;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.907;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1097,0,866 chrXII 263065 . A G 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.032;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.799;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,50:85:99:1052,0,622 chrXII 263076 . T C 439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.773;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:469,0,1000 chrXII 263081 . C G 420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.028;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:450,0,1041 chrXII 263103 . C T 578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.385;DP=87;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:608,0,1117 chrXII 263142 . G C 2443 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2476,255,0 chrXII 263151 . C T 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2851,288,0 chrXII 263219 . A C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.021;DP=98;Dels=0.00;FS=5.021;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:988,0,1088 chrXII 263230 . C T 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2588,267,0 chrXII 263279 . A G 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;DP=92;Dels=0.00;FS=2.136;HaplotypeScore=3.2782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:946,0,938 chrXII 263416 . C G 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.806;DP=119;Dels=0.00;FS=4.619;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.102;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,48:119:99:871,0,1565 chrXII 263502 . G A 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.349;DP=82;Dels=0.00;FS=9.928;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=1.491;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:921,0,786 chrXII 263669 . C T 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.934;DP=118;Dels=0.00;FS=0.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1410,0,1113 chrXII 264597 . C A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.512;DP=124;Dels=0.00;FS=3.404;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1145,0,1354 chrXII 265971 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.232;DP=95;Dels=0.00;FS=3.570;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,54:95:99:1196,0,807 chrXII 266061 . G A 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.314;DP=109;Dels=0.00;FS=14.923;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.398;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1348,0,952 chrXII 266094 . A G 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3488,354,0 chrXII 266367 . C T 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.522;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.694;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1128,0,1543 chrXII 266577 . T C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.953;DP=116;Dels=0.00;FS=1.576;HaplotypeScore=2.6132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.296;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1372,0,1019 chrXII 266628 . T G 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.903;DP=145;Dels=0.00;FS=2.222;HaplotypeScore=4.7892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.781;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,83:145:99:1751,0,1246 chrXII 266739 . C T 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.166;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.047;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:158:99:1669,0,1493 chrXII 266889 . A G 1244.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.699;DP=129;Dels=0.00;FS=4.212;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.982;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1274,0,1369 chrXII 266895 . T C 1197.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.136;DP=128;Dels=0.00;FS=3.214;HaplotypeScore=3.0662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.393;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1227,0,1348 chrXII 266899 . C T 2872 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.21;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2905,294,0 chrXII 266958 . C G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=3.739;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.028;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1085,0,1110 chrXII 266966 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.101;DP=108;Dels=0.00;FS=9.216;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.235;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1055,0,1170 chrXII 266973 . G A 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3110,318,0 chrXII 267137 . G A 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;DP=121;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,76:121:99:1581,0,905 chrXII 267357 . A G 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.043;DP=111;Dels=0.00;FS=1.567;HaplotypeScore=4.5567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:910,0,1354 chrXII 267477 . T C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.182;DP=111;Dels=0.00;FS=1.548;HaplotypeScore=3.9071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1128,0,1223 chrXII 269351 . G T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.208;DP=140;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=2.9000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.950;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1221,0,1746 chrXII 269565 . A G 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3684,393,0 chrXII 270012 . A T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.660;DP=88;Dels=0.00;FS=0.805;HaplotypeScore=5.9619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,51:88:99:1123,0,743 chrXII 270950 . G A 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.029;DP=92;Dels=0.00;FS=0.830;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=9.10;ReadPosRankSum=2.192;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:867,0,1074 chrXII 272030 . A T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.481;DP=119;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.730;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1425,0,1127 chrXII 272455 . C T 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3691,376,0 chrXII 274041 . A G 2378 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=21.42;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2411,252,0 chrXII 274243 . G C 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3654,372,0 chrXII 274429 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.253;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1055,0,1190 chrXII 274474 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.665;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.643;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1373,0,1222 chrXII 274580 . G C 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3540,372,0 chrXII 274665 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.801;DP=120;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=5.4175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.980;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1278,0,1190 chrXII 275047 . T C 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.707;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.696;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:100:99:1087,0,860 chrXII 275113 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.969;DP=105;Dels=0.00;FS=3.691;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.357;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1171,0,1001 chrXII 275215 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;DP=115;Dels=0.00;FS=7.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.462;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1272,0,1101 chrXII 275241 . G T 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.115;DP=109;Dels=0.00;FS=2.472;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.611;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1086,0,1201 chrXII 275287 . C T 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3257,330,0 chrXII 276011 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;DP=121;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.066;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1278,0,1291 chrXII 276224 . A G 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.294;DP=158;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1830,0,1449 chrXII 276795 . C T 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.457;DP=120;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.076;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1268,0,1239 chrXII 276807 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.725;DP=126;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.795;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1210,0,1463 chrXII 276838 . C T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.731;DP=125;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1223,0,1329 chrXII 277033 . G A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.864;DP=111;Dels=0.00;FS=2.537;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.367;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:966,0,1374 chrXII 277307 . T C 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.930;DP=137;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.686;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1568,0,1330 chrXII 277416 . T C 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.035;DP=154;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1572,0,1534 chrXII 277574 . C T 4441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4441,448,0 chrXII 277604 . A T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.667;DP=127;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.432;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1458,0,1326 chrXII 277652 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.189;DP=115;Dels=0.00;FS=5.794;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.681;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1335,0,1053 chrXII 278461 . C T 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.472;DP=151;Dels=0.00;FS=4.257;HaplotypeScore=3.3992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1756,0,1330 chrXII 278475 . T A 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3650,367,0 chrXII 278491 . C T 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8773;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3795,396,0 chrXII 278546 . C G 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;DP=154;Dels=0.00;FS=4.888;HaplotypeScore=4.2830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1360,0,1705 chrXII 278861 . A G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.549;DP=162;Dels=0.00;FS=2.769;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,77:162:99:1456,0,1921 chrXII 278916 . G T 1922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.327;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.340;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,93:186:99:1952,0,1929 chrXII 279029 . T A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.204;DP=161;Dels=0.00;FS=2.789;HaplotypeScore=4.2972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.169;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1717,0,1580 chrXII 279188 . G C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.436;DP=139;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.883;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1393,0,1333 chrXII 279218 . T C 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.311;DP=138;Dels=0.00;FS=4.204;HaplotypeScore=6.8174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.410;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.247;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1394,0,1455 chrXII 279224 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.338;DP=143;Dels=0.00;FS=5.170;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.864;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1249,0,1438 chrXII 279239 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.363;DP=131;Dels=0.00;FS=4.298;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1081,0,1487 chrXII 279272 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.976;DP=132;Dels=0.00;FS=4.579;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1084,0,1538 chrXII 279352 . A T 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.772;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=1;MQRankSum=-0.297;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.891;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:134:99:937,0,1259 chrXII 279415 . G A 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;DP=157;Dels=0.00;FS=5.793;HaplotypeScore=16.0959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,85:157:99:1570,0,1226 chrXII 279746 . C T 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1670,0,1323 chrXII 280319 . T C 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.231;DP=157;Dels=0.00;FS=2.005;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:157:99:1688,0,1514 chrXII 280340 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.306;DP=150;Dels=0.00;FS=2.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1498,0,1665 chrXII 280412 . G A 4017.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4017,406,0 chrXII 280582 . A G 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.481;DP=158;Dels=0.00;FS=1.993;HaplotypeScore=2.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=11.04;ReadPosRankSum=-2.307;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1774,0,1456 chrXII 280635 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.449;DP=150;Dels=0.00;FS=5.867;HaplotypeScore=2.6934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.585;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1458,0,1550 chrXII 280717 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.813;DP=140;Dels=0.00;FS=3.160;HaplotypeScore=2.5141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:140:99:1362,0,1255 chrXII 281166 . A G 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.995;DP=175;Dels=0.00;FS=2.623;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.551;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,84:175:99:1717,0,1950 chrXII 281178 . A C 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3847,414,0 chrXII 281283 . T C 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.849;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.231;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1637,0,1503 chrXII 281289 . A G 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5975;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3594,375,0 chrXII 281532 . G A 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.735;DP=116;Dels=0.00;FS=5.779;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1053,0,1291 chrXII 281816 . C T 376 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=79.9623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=3.11;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:42:409,42,0 chrXII 281896 . A C 2728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6384;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=21.82;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2761,318,0 chrXII 282094 . G A 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3748,378,0 chrXII 282215 . C T 4860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=23.59;SB=-2.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,206:206:99:4860,469,0 chrXII 282385 . A G 5074.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:5074,499,0 chrXII 282399 . G T 4367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8723;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=25.99;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4367,430,0 chrXII 282495 . A T 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3197,339,0 chrXII 282505 . C T 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.80;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2954,312,0 chrXII 282557 . A T 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=97.1034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2956,306,0 chrXII 282741 . G A 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.93;MQ0=0;QD=22.29;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2931,303,0 chrXII 283602 . A C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.335;DP=147;Dels=0.00;FS=3.990;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.386;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,63:147:99:1263,0,1870 chrXII 283638 . A T 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3485,349,0 chrXII 283645 . T A 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.719;DP=135;Dels=0.00;FS=2.618;HaplotypeScore=2.9534;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,133:135:99:3537,322,0 chrXII 283710 . T C 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3371,363,0 chrXII 283719 . G A 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.29;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3559,373,0 chrXII 283731 . G A 3827.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.41;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3827,400,0 chrXII 283746 . G T 4067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4067,421,0 chrXII 283794 . C T 2707 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=21.31;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2740,282,0 chrXII 284108 . G A 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3789,385,0 chrXII 284270 . A G 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3150,321,0 chrXII 284305 . G A 2022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.093;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.973;QD=13.22;ReadPosRankSum=1.664;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,92:153:99:2052,0,1075 chrXII 284378 . T G 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.238;DP=168;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.685;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,80:168:99:1610,0,1956 chrXII 284459 . C T 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3810,388,0 chrXII 284594 . G A 2720 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2753,288,0 chrXII 284627 . A T 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3183,333,0 chrXII 284741 . T C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;DP=127;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1361,0,1288 chrXII 284763 . G A 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.94;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2996,306,0 chrXII 284777 . T C 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.73;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2605,291,0 chrXII 284813 . T C 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2925,312,0 chrXII 284930 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.020;DP=121;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1353,0,1160 chrXII 284978 . C T 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3807,373,0 chrXII 285138 . C T 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3525,354,0 chrXII 286333 . T C 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.76;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3475,369,0 chrXII 286348 . C T 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3229,336,0 chrXII 286350 . G A 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3237,333,0 chrXII 286729 . C T 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3039,318,0 chrXII 286816 . G T 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3462,343,0 chrXII 286864 . T A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2997,315,0 chrXII 287005 . T C 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3053,318,0 chrXII 287010 . A G 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2948,312,0 chrXII 287397 . A G 1948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=24.66;ReadPosRankSum=0.811;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:1981,204,0 chrXII 287409 . G A 1925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.01;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1958,198,0 chrXII 287935 . C G 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3399,351,0 chrXII 288047 . A G 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.25;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3308,348,0 chrXII 288282 . A G 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.496;DP=155;Dels=0.00;FS=2.019;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1483,0,1711 chrXII 288347 . A G 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=22.66;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3490,363,0 chrXII 288386 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.052;DP=134;Dels=0.00;FS=3.109;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.966;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1285,0,1567 chrXII 288473 . T C 3638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3638,375,0 chrXII 288491 . C T 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3420,346,0 chrXII 288572 . C T 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3579,358,0 chrXII 288614 . A G 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3086,333,0 chrXII 289373 . G A 2298 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.567;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.61;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.687;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:2331,252,0 chrXII 289382 . C T 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.82;MQ0=0;QD=21.14;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2570,261,0 chrXII 289396 . A G 2384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.71;MQ0=0;QD=19.23;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2417,264,0 chrXII 289433 . G T 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.75;MQ0=0;QD=22.90;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2827,291,0 chrXII 289538 . G A 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3692,370,0 chrXII 289582 . T C 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3403,357,0 chrXII 289627 . C T 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2966,300,0 chrXII 289660 . C G 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2986,306,0 chrXII 289669 . C T 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2672,267,0 chrXII 289704 . G A 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.872;DP=113;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.268;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.049;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1061,0,1274 chrXII 289996 . C T 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2642,264,0 chrXII 289997 . A G 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.84;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2895,309,0 chrXII 290016 . C T 2687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=25.84;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:104:99:2720,279,0 chrXII 290058 . A T 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2904,297,0 chrXII 290159 . T C 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3293,345,0 chrXII 290328 . T C 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3587,354,0 chrXII 290359 . T C 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3651,390,0 chrXII 290595 . C T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;DP=128;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=4.5038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.708;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1429,0,1292 chrXII 290718 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.457;DP=126;Dels=0.00;FS=2.277;HaplotypeScore=2.7409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1190,0,1337 chrXII 290736 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.130;DP=120;Dels=0.00;FS=3.325;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1249,0,1270 chrXII 291050 . G T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.435;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1382,0,1496 chrXII 291216 . G A 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2979,309,0 chrXII 291384 . A G 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.91;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3093,324,0 chrXII 291386 . A G 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.68;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3167,333,0 chrXII 291459 . T C 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3151,333,0 chrXII 291599 . C G 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.377;DP=122;Dels=0.00;FS=7.011;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:936,0,1411 chrXII 291969 . T C 2665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.68;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2698,288,0 chrXII 291984 . T C 2529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.64;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2562,279,0 chrXII 292312 . C A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.538;DP=135;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.253;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1374,0,1444 chrXII 292518 . C G 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.148;DP=88;Dels=0.00;FS=2.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.647;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:882,0,891 chrXII 292529 . T C 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.419;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.605;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:87:99:858,0,966 chrXII 292618 . G C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.395;DP=115;Dels=0.00;FS=8.687;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.055;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1073,0,1269 chrXII 292698 . T C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.986;DP=135;Dels=0.00;FS=5.590;HaplotypeScore=6.0282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.147;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1466,0,1299 chrXII 292858 . C T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.936;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1223,0,1167 chrXII 292883 . T C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.973;DP=132;Dels=0.00;FS=2.243;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.545;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1043,0,1635 chrXII 292952 . A G 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.980;DP=147;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1631,0,1423 chrXII 293009 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.687;DP=141;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=1.936;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.531;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1324,0,1624 chrXII 293060 . G A 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.760;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.346;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1019,0,1254 chrXII 293333 . C T 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.495;DP=84;Dels=0.00;FS=4.763;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,40:84:99:888,0,933 chrXII 293457 . G A 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.603;DP=95;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.061;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:976,0,1026 chrXII 293709 . G A 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.615;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.263;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:943,0,1201 chrXII 293839 . C T 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3150,316,0 chrXII 293882 . A G 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3081,312,0 chrXII 294067 . A G 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.051;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:932,0,1563 chrXII 294090 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.096;DP=106;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:1362,0,833 chrXII 294289 . G A 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3410,345,0 chrXII 294637 . G A 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2557,252,0 chrXII 294655 . T G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.504;DP=105;Dels=0.00;FS=5.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,61:105:99:1271,0,901 chrXII 294718 . G A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.721;DP=90;Dels=0.00;FS=10.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.572;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,50:90:99:1110,0,805 chrXII 295045 . C T 2308 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.656;DP=91;Dels=0.00;FS=3.463;HaplotypeScore=5.9522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=25.36;ReadPosRankSum=1.199;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2341,215,0 chrXII 295063 . A G 2208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.00;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2241,240,0 chrXII 295222 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.074;DP=112;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1185,0,1186 chrXII 295250 . T C 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.826;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=8.86;ReadPosRankSum=2.101;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:978,0,1314 chrXII 295292 . C T 2544 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2577,258,0 chrXII 295360 . C T 2369 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2402,249,0 chrXII 295384 . A G 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.134;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=7.19;ReadPosRankSum=1.330;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:828,0,1415 chrXII 295402 . A G 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.696;DP=111;Dels=0.00;FS=9.248;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.111;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:111:99:1157,0,1090 chrXII 295520 . G A 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;DP=107;Dels=0.00;FS=5.051;HaplotypeScore=5.2789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.376;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:107:99:957,0,1114 chrXII 295930 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.437;DP=107;Dels=0.00;FS=2.561;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1075,0,1144 chrXII 296083 . T A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;DP=105;Dels=0.00;FS=4.052;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1209,0,951 chrXII 296228 . A G 610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,32:79:99:640,0,969 chrXII 296236 . C A 1845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=22.50;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1878,189,0 chrXII 296418 . G A 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.944;DP=115;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=3.7745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.557;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1047,0,1342 chrXII 296473 . C T 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2914,291,0 chrXII 296854 . T A 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;DP=106;Dels=0.00;FS=5.995;HaplotypeScore=3.6462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1066,0,1167 chrXII 297011 . A T 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2867,294,0 chrXII 297081 . A G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.941;DP=132;Dels=0.00;FS=4.254;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.030;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1467,0,1214 chrXII 297157 . G T 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3958,391,0 chrXII 297293 . T C 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.075;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=23.57;ReadPosRankSum=0.722;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,146:148:99:3488,347,0 chrXII 297445 . G C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;DP=123;Dels=0.00;FS=3.355;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.212;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1382,0,1178 chrXII 297726 . T G 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.88;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:2984,312,0 chrXII 297969 . G C 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.489;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.796;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1047,0,1142 chrXII 298290 . A G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.132;DP=134;Dels=0.00;FS=3.211;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.858;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1142,0,1615 chrXII 298292 . T C 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.941;DP=135;Dels=0.00;FS=2.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1537,0,1267 chrXII 298405 . C T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.154;DP=106;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1195,0,1005 chrXII 298644 . A G 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3329,357,0 chrXII 298872 . A G 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.646;DP=139;Dels=0.00;FS=4.203;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=-0.872;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,86:139:99:1840,0,1031 chrXII 298893 . C T 1946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.420;DP=159;Dels=0.00;FS=2.828;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=1.767;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.940;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,89:159:99:1976,0,1229 chrXII 299037 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.608;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1365,0,1323 chrXII 299174 . A G 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3570,378,0 chrXII 299209 . C T 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3274,327,0 chrXII 299315 . G T 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3032,303,0 chrXII 299526 . A C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3624,387,0 chrXII 299532 . A G 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3698,381,0 chrXII 300539 . T C 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.60;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2772,288,0 chrXII 300621 . G A 1988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.775;DP=163;Dels=0.00;FS=3.684;HaplotypeScore=5.4989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=1.853;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,95:163:99:2018,0,1359 chrXII 300802 . C T 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.200;DP=145;Dels=0.00;FS=2.997;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,86:145:99:1898,0,1146 chrXII 300832 . C A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.389;DP=115;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1032,0,1196 chrXII 301075 . T C 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.590;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=11.39;ReadPosRankSum=2.841;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:141:99:1636,0,1260 chrXII 301123 . G A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.519;DP=137;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=10.90;ReadPosRankSum=2.402;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1523,0,1375 chrXII 301172 . T C 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.929;DP=156;Dels=0.00;FS=5.889;HaplotypeScore=8.8788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=10.16;ReadPosRankSum=-2.546;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,88:156:99:1615,0,1501 chrXII 301177 . T C 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.520;DP=133;Dels=0.00;FS=13.441;HaplotypeScore=11.6952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=6.99;ReadPosRankSum=4.501;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,52:133:99:959,0,1808 chrXII 301291 . G A 4189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.51;SB=-2.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4189,433,0 chrXII 301957 . G A 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3586,357,0 chrXII 301966 . A G 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3090,330,0 chrXII 302144 . T C 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3983,417,0 chrXII 302196 . C G 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3585,393,0 chrXII 302258 . T A 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:1800,0,1706 chrXII 302282 . T G 4181.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4181,444,0 chrXII 302332 . T A 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3601,364,0 chrXII 302440 . A G 3660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3660,360,0 chrXII 302671 . G C 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3419,366,0 chrXII 302764 . A T 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3720,379,0 chrXII 302944 . A G 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.815;DP=147;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=3.7542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.413;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1727,0,1328 chrXII 303103 . G A 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.065;DP=155;Dels=0.00;FS=2.006;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.112;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1593,0,1681 chrXII 303266 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.740;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.061;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1132,0,1462 chrXII 303358 . G A 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.128;DP=103;Dels=0.00;FS=3.656;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.073;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:1091,0,1114 chrXII 303516 . A G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.703;DP=140;Dels=0.00;FS=3.027;HaplotypeScore=2.9206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1153,0,1657 chrXII 303553 . G A 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.485;DP=169;Dels=0.00;FS=8.051;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.722;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,93:169:99:1725,0,1550 chrXII 303601 . C T 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.097;DP=156;Dels=0.00;FS=11.559;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.197;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1733,0,1575 chrXII 303604 . G A 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.881;DP=155;Dels=0.00;FS=7.351;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.771;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1693,0,1515 chrXII 303878 . A G 4102.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4102,438,0 chrXII 304243 . G A 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3213,330,0 chrXII 304352 . G A 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.032;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.057;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:161:99:1797,0,1418 chrXII 304381 . A G 3892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3892,405,0 chrXII 304435 . A G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;DP=156;Dels=0.00;FS=2.127;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.812;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1551,0,1712 chrXII 305253 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.074;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=10.73;ReadPosRankSum=2.344;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1285,0,1054 chrXII 305296 . C T 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.513;DP=119;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.190;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,40:119:99:760,0,1705 chrXII 305313 . A G 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.345;DP=134;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.263;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,85:134:99:1660,0,1004 chrXII 305324 . G A 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3568,364,0 chrXII 305397 . A C 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.855;DP=154;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1571,0,1611 chrXII 305614 . C T 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.366;DP=156;Dels=0.00;FS=8.261;HaplotypeScore=4.9533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.131;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1663,0,1578 chrXII 305656 . A C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.179;DP=140;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1357,0,1554 chrXII 305731 . A G 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3677,366,0 chrXII 305736 . C A 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3912,379,0 chrXII 305771 . A G 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3396,360,0 chrXII 305899 . C T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.541;DP=139;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.230;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1602,0,1248 chrXII 305934 . G A 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.584;DP=156;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.085;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1773,0,1434 chrXII 305998 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.388;DP=136;Dels=0.00;FS=7.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1363,0,1501 chrXII 306415 . A G 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3701,399,0 chrXII 306582 . C G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.257;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1273,0,1111 chrXII 306665 . C T 2368 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=20.59;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2401,252,0 chrXII 306867 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.695;DP=100;Dels=0.00;FS=6.391;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.135;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1036,0,994 chrXII 307335 . A G 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.189;DP=80;Dels=0.00;FS=5.683;HaplotypeScore=2.4458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:699,0,962 chrXII 307503 . G T 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.842;DP=99;Dels=0.00;FS=2.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.109;QD=6.81;ReadPosRankSum=-1.464;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:704,0,1288 chrXII 307601 . A G 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.176;DP=105;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.875;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1099,0,1073 chrXII 308322 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.752;DP=134;Dels=0.00;FS=4.189;HaplotypeScore=5.9282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.802;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:134:99:1111,0,1640 chrXII 308379 . C T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.481;DP=124;Dels=0.00;FS=3.268;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=10.36;ReadPosRankSum=-2.001;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1315,0,1214 chrXII 308483 . G A 1911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.407;DP=163;Dels=0.00;FS=3.769;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.160;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,90:163:99:1941,0,1447 chrXII 308503 . T C 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.045;DP=142;Dels=0.00;FS=4.051;HaplotypeScore=2.8402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,84:142:99:1710,0,1189 chrXII 308630 . G A 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3102,318,0 chrXII 308703 . T C 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2480,273,0 chrXII 308802 . C T 4215.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4215,436,0 chrXII 308940 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.651;DP=132;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.689;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1311,0,1370 chrXII 308994 . A G 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.181;DP=129;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1462,0,1268 chrXII 309006 . A T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;DP=130;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.765;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1626,0,1172 chrXII 309630 . G A 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.759;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.149;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1027,0,845 chrXII 310006 . G T 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2567,261,0 chrXII 310404 . A G 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2518,267,0 chrXII 310613 . C T 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2875,288,0 chrXII 310770 . C T 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2767,285,0 chrXII 310983 . T C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3318,348,0 chrXII 310986 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.227;DP=136;Dels=0.00;FS=2.215;HaplotypeScore=4.7546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1212,0,1473 chrXII 311540 . C G 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.748;DP=135;Dels=0.00;FS=3.232;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.212;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1436,0,1357 chrXII 311784 . T C 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2883,285,0 chrXII 311889 . G A 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3350,339,0 chrXII 311937 . G A 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.976e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3595,364,0 chrXII 312135 . G A 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3140,318,0 chrXII 312163 . T C 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3524,369,0 chrXII 312168 . G C 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3576,366,0 chrXII 312362 . C T 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.971;DP=163;Dels=0.00;FS=8.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=8.96;ReadPosRankSum=2.094;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,72:163:99:1490,0,1893 chrXII 312399 . G A 4074.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.15;SB=-2.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4074,397,0 chrXII 312573 . T C 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3275,345,0 chrXII 312732 . G A 4073.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4073,415,0 chrXII 312984 . T A 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3557,364,0 chrXII 313107 . T G 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2867,309,0 chrXII 313320 . T C 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3067,330,0 chrXII 313374 . T C 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;DP=135;Dels=0.00;FS=3.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=23.69;ReadPosRankSum=1.039;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3231,351,0 chrXII 313809 . A G 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3130,330,0 chrXII 313812 . G A 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3380,354,0 chrXII 313848 . G A 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3741,385,0 chrXII 313878 . A G 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3162,336,0 chrXII 313965 . G A 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=1;QD=25.63;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3691,376,0 chrXII 314151 . T C 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.218;DP=122;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=2.6478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.217;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1425,0,1090 chrXII 315246 . A G 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.565;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.542;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,38:92:99:760,0,1200 chrXII 315348 . G C 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2746,294,0 chrXII 315383 . T C 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3029,309,0 chrXII 315459 . T C 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2578,279,0 chrXII 315521 . C T 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3154,318,0 chrXII 315543 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.253;DP=124;Dels=0.00;FS=9.644;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.984;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1148,0,1286 chrXII 315642 . T C 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4573;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3232,342,0 chrXII 315901 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.321;DP=143;Dels=0.00;FS=3.017;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.681;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1257,0,1718 chrXII 316223 . A C 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3355,366,0 chrXII 316490 . G A 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3880,394,0 chrXII 316628 . T C 3929.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3929,414,0 chrXII 316631 . T C 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.478;DP=150;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1411,0,1634 chrXII 316725 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.777;DP=143;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1434,0,1520 chrXII 316731 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.817;DP=140;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.098;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1290,0,1631 chrXII 317117 . C T 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3712,358,0 chrXII 317384 . G T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.792;DP=117;Dels=0.00;FS=5.843;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.782;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1067,0,1388 chrXII 317498 . G A 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;DP=150;Dels=0.00;FS=3.009;HaplotypeScore=3.8472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=2.377;QD=6.61;ReadPosRankSum=-2.203;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,57:150:99:1022,0,2067 chrXII 317534 . C T 4770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8322;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.95;SB=-2.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4770,487,0 chrXII 317539 . T G 1889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.468;DP=175;Dels=0.00;FS=1.193;HaplotypeScore=3.4211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=10.79;ReadPosRankSum=-2.765;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,101:175:99:1919,0,1559 chrXII 317605 . A G 4057.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.04;SB=-2.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4057,438,0 chrXII 317614 . A T 4488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.20;SB=-2.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4488,451,0 chrXII 317989 . G A 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4147;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.72;SB=-2.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3883,394,0 chrXII 318033 . G A 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.944;DP=136;Dels=0.00;FS=2.256;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=12.27;ReadPosRankSum=2.073;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1699,0,1164 chrXII 318348 . A G 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3040,327,0 chrXII 318458 . A C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.188;DP=136;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=5.6257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=0.434;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.676;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1467,0,1277 chrXII 318570 . T C 4153.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4153,432,0 chrXII 318879 . G A 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3086,321,0 chrXII 318969 . C T 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3841,388,0 chrXII 319560 . G A 4027.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4027,415,0 chrXII 319635 . A G 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2965,315,0 chrXII 319896 . A G 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-1.993e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:3856,396,0 chrXII 320409 . A G 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.325;DP=194;Dels=0.00;FS=7.765;HaplotypeScore=5.9074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.249;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,66:194:99:985,0,2748 chrXII 320465 . C T 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6638;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3984,415,0 chrXII 320513 . T C 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.881;DP=162;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=1.9833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.645;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,82:162:99:1743,0,1694 chrXII 320775 . T C 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.537;DP=171;Dels=0.00;FS=1.256;HaplotypeScore=3.3138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.661;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,83:171:99:1709,0,1783 chrXII 320802 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;DP=160;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.790;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1634,0,1612 chrXII 320814 . G A 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3858,391,0 chrXII 320834 . A G 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.121;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.018;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1483,0,1501 chrXII 320904 . G A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3297,339,0 chrXII 321077 . C T 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3471,360,0 chrXII 321084 . C T 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=23.10;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3650,381,0 chrXII 321294 . C T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6069;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3491,358,0 chrXII 321345 . G A 3927.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.981e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3927,394,0 chrXII 321460 . A G 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.901;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.352;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1739,0,1477 chrXII 321603 . G A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.126;DP=150;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.621;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1404,0,1666 chrXII 321772 . T C 4193.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4193,450,0 chrXII 321825 . A G 4065.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4065,426,0 chrXII 322042 . C T 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3438,357,0 chrXII 322071 . T C 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=23.36;SB=-2.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3877,405,0 chrXII 322162 . A G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.470;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.592;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,68:114:99:1200,0,937 chrXII 322311 . T G 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3124,327,0 chrXII 322717 . G A 1967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.779;DP=166;Dels=0.00;FS=13.704;HaplotypeScore=5.2467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,90:166:99:1997,0,1445 chrXII 322903 . G A 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2885,297,0 chrXII 323271 . C T 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=25.41;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3430,342,0 chrXII 323467 . G A 4521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:171:99:4521,430,0 chrXII 323570 . T A 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3554,360,0 chrXII 323599 . A G 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3450,348,0 chrXII 323636 . A G 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3777,387,0 chrXII 323645 . T C 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3701,393,0 chrXII 323709 . G A 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3844,397,0 chrXII 324014 . A G 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9527;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3056,333,0 chrXII 324173 . A C 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2905,297,0 chrXII 324302 . A T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.671;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1225,0,1466 chrXII 324449 . C T 4080.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.642;DP=155;Dels=0.00;FS=3.363;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=26.32;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:4080,389,0 chrXII 324470 . G A 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.834e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3874,385,0 chrXII 324662 . A G 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3125,330,0 chrXII 325271 . G T 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2841,285,0 chrXII 325334 . C A 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2726,273,0 chrXII 325403 . C A 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.43;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2835,288,0 chrXII 325522 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.191;DP=132;Dels=0.00;FS=5.564;HaplotypeScore=2.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.089;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1339,0,1348 chrXII 326213 . A G 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=1;QD=24.15;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2810,300,0 chrXII 326408 . T C 3993.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3836;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3993,420,0 chrXII 326975 . C T 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3596,369,0 chrXII 326981 . T C 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.36;SB=-2.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3702,390,0 chrXII 327095 . C T 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.586;DP=147;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,83:147:99:1834,0,1133 chrXII 327112 . A G 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3377,357,0 chrXII 327373 . T C 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3293,351,0 chrXII 327506 . C A 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3062,312,0 chrXII 327514 . A T 2767 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2800,282,0 chrXII 327967 . C A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.477;DP=100;Dels=0.00;FS=2.648;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=10.05;ReadPosRankSum=-2.465;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1035,0,982 chrXII 328168 . G A 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3868,391,0 chrXII 328302 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.284;DP=144;Dels=0.00;FS=5.039;HaplotypeScore=5.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.437;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1334,0,1521 chrXII 328471 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.691;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:1474,0,993 chrXII 328528 . A G 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=22.49;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3419,363,0 chrXII 328635 . C T 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3633,375,0 chrXII 328989 . T C 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3416,369,0 chrXII 328990 . A G 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3315,363,0 chrXII 330265 . C G 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;DP=140;Dels=0.00;FS=2.359;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1531,0,1310 chrXII 330526 . A G 4028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4028,417,0 chrXII 330772 . T C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.887;DP=154;Dels=0.01;FS=3.838;HaplotypeScore=5.8833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.353;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1361,0,1761 chrXII 330832 . C T 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3622,369,0 chrXII 331041 . T G 2265 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.82;MQ0=0;QD=24.89;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2298,243,0 chrXII 331044 . C T 2504 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.16;MQ0=0;QD=26.08;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2537,258,0 chrXII 331075 . G C 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.33;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2569,279,0 chrXII 331078 . A G 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.26;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2699,291,0 chrXII 331090 . T C 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.54;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2865,300,0 chrXII 331208 . G C 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;DP=130;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.794;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1297,0,1305 chrXII 331273 . T C 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3177,327,0 chrXII 331395 . C A 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3217,319,0 chrXII 331937 . T G 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9564;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=24.44;ReadPosRankSum=1.611;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,170:171:99:4179,403,0 chrXII 331984 . C T 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3626,370,0 chrXII 332094 . C T 4433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4433,439,0 chrXII 332157 . A T 4283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4283,448,0 chrXII 332457 . T C 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.284;DP=128;Dels=0.00;FS=6.121;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.685;QD=25.80;ReadPosRankSum=2.945;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,125:128:99:3302,360,0 chrXII 332566 . G A 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3812,385,0 chrXII 333217 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.655;DP=160;Dels=0.00;FS=1.995;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.209;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1626,0,1722 chrXII 333360 . T C 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.103;DP=159;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.278;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:1760,0,1542 chrXII 333417 . G A 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.518;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1768,0,1438 chrXII 334170 . A G 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3335,342,0 chrXII 334261 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.152;DP=107;Dels=0.01;FS=0.735;HaplotypeScore=3.9386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:1189,0,983 chrXII 335529 . G T 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.817;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1255,0,1667 chrXII 335574 . C T 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.136;DP=151;Dels=0.00;FS=1.306;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.077;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1665,0,1456 chrXII 335835 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.565;DP=116;Dels=0.00;FS=1.499;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.54;ReadPosRankSum=-3.627;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:115:99:1137,0,1259 chrXII 336921 . A T 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;DP=104;Dels=0.00;FS=7.776;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.055;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.130;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1077,0,1138 chrXII 336975 . G A 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.058;DP=103;Dels=0.00;FS=1.654;HaplotypeScore=3.7038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1247,0,914 chrXII 337003 . A G 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.868;DP=111;Dels=0.00;FS=6.093;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.043;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1229,0,1111 chrXII 337500 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.958;DP=126;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1238,0,1385 chrXII 338262 . G A 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.920;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.148;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1740,0,1378 chrXII 338295 . C T 1930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.718;DP=158;Dels=0.00;FS=4.021;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.536;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1960,0,1321 chrXII 338892 . A G 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;DP=110;Dels=0.00;FS=4.286;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.701;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2771,288,0 chrXII 339111 . G A 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3666,370,0 chrXII 339377 . T C 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3557,375,0 chrXII 339393 . T C 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3183,345,0 chrXII 339496 . G A 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=26.15;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2831,285,0 chrXII 339567 . G A 4025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4025,391,0 chrXII 339777 . A G 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3527,369,0 chrXII 339830 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.374;DP=134;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.120;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1439,0,1228 chrXII 340838 . T G 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.215;DP=120;Dels=0.00;FS=8.806;HaplotypeScore=10.0925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.631;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:120:99:911,0,1171 chrXII 340839 . C A 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.251;DP=121;Dels=0.00;FS=11.930;HaplotypeScore=9.1031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.455;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:961,0,1072 chrXII 340931 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.179;DP=141;Dels=0.00;FS=3.023;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.349;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1400,0,1486 chrXII 341005 . A G 1741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;DP=153;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.726;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,85:153:99:1771,0,1366 chrXII 341688 . T A 4096.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4096,430,0 chrXII 342052 . T C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.045;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.637;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1129,0,1139 chrXII 342533 . G A 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3073,309,0 chrXII 342889 . G C 2580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=25.05;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2613,279,0 chrXII 343120 . G A 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=1;QD=26.22;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3330,322,0 chrXII 344475 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.929;DP=128;Dels=0.00;FS=8.297;HaplotypeScore=5.6212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:128:99:1293,0,1405 chrXII 344703 . A G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.988;DP=136;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=6.5964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1209,0,1569 chrXII 345042 . C T 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.799;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.768;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,77:133:99:1631,0,1143 chrXII 345102 . T C 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.701;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,89:148:99:1840,0,1218 chrXII 345153 . T C 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.271;DP=154;Dels=0.00;FS=4.818;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.494;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,87:154:99:1821,0,1412 chrXII 345204 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.472;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.226;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1363,0,1583 chrXII 345249 . A G 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.511;DP=136;Dels=0.00;FS=5.567;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1293,0,1486 chrXII 345286 . T C 1054.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.272;DP=118;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.175;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1084,0,1326 chrXII 345293 . G A 1025.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.060;DP=110;Dels=0.01;FS=0.712;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.872;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.039;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1055,0,1163 chrXII 345295 . C T 963.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.219;DP=102;Dels=0.01;FS=0.741;HaplotypeScore=5.8219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQ0=0;MQRankSum=-4.546;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.051;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:993,0,1087 chrXII 345339 . G A 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.389;DP=106;Dels=0.00;FS=5.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.781;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.711;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:986,0,1106 chrXII 345397 . T C 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.966;DP=132;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1432,0,1225 chrXII 345417 . T C 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.903;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.998;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1416,0,1465 chrXII 345771 . T C 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.487;DP=138;Dels=0.00;FS=4.109;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=11.59;ReadPosRankSum=-2.386;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1629,0,1330 chrXII 346092 . T A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;DP=150;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-3.336;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.526;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:150:99:1537,0,1600 chrXII 346127 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.153;DP=105;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.6299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.53;MQ0=0;MQRankSum=-4.294;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:104:99:1015,0,978 chrXII 346167 . G A 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.841;DP=84;Dels=0.00;FS=10.604;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.12;MQ0=0;MQRankSum=-7.526;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.342;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:699,0,830 chrXII 346177 . A G 650.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.908;DP=83;Dels=0.00;FS=18.481;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.59;MQ0=0;MQRankSum=-7.605;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:680,0,857 chrXII 346181 . G A 648.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;DP=87;Dels=0.00;FS=20.536;HaplotypeScore=3.4053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.27;MQ0=0;MQRankSum=-7.754;QD=7.45;ReadPosRankSum=-1.401;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,47:87:99:678,0,837 chrXII 346187 . A G 553.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;DP=93;Dels=0.00;FS=8.345;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQ0=0;MQRankSum=-7.469;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:583,0,1080 chrXII 346204 . T C 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.437;DP=95;Dels=0.00;FS=3.950;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=-6.223;QD=6.54;ReadPosRankSum=-1.847;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:651,0,1224 chrXII 346228 . T A 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.122;DP=113;Dels=0.00;FS=3.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.890;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:901,0,1466 chrXII 346231 . T G 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.798;DP=111;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-4.469;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:823,0,1491 chrXII 346360 . A T 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.075;DP=115;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:1036,0,1447 chrXII 346407 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.772;DP=136;Dels=0.00;FS=3.322;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.685;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,54:136:99:1039,0,1785 chrXII 346449 . T G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.130;DP=132;Dels=0.00;FS=4.233;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:132:99:1140,0,1579 chrXII 346533 . C G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.041;DP=114;Dels=0.00;FS=12.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.111;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1128,0,1215 chrXII 346554 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;DP=117;Dels=0.00;FS=10.129;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.742;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1263,0,1255 chrXII 346698 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.458;DP=138;Dels=0.00;FS=7.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1458,0,1411 chrXII 346884 . T G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.178;DP=104;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=-0.400;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.755;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1168,0,976 chrXII 347086 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.491;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.716;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1389,0,1395 chrXII 347194 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.048;DP=119;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.493;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1208,0,1237 chrXII 347271 . C T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.215;DP=127;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1294,0,1326 chrXII 347536 . T G 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.331;DP=122;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=5.6557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.213;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1097,0,1457 chrXII 347644 . T C 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.980;DP=97;Dels=0.00;FS=1.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.754;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:915,0,1145 chrXII 347880 . G A 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.540;DP=144;Dels=0.00;FS=4.015;HaplotypeScore=5.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.595;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1643,0,1354 chrXII 347911 . C T 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.497;DP=144;Dels=0.00;FS=2.959;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1595,0,1403 chrXII 348234 . A C 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.500;DP=151;Dels=0.00;FS=8.413;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=10.59;ReadPosRankSum=2.051;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1629,0,1596 chrXII 348259 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.649;DP=138;Dels=0.00;FS=6.323;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1374,0,1535 chrXII 348314 . A C 770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.239;DP=106;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.394;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:106:99:800,0,1363 chrXII 348328 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.601;DP=115;Dels=0.00;FS=3.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.269;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,48:115:99:1022,0,1418 chrXII 348674 . G C 2475 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=24.03;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2508,273,0 chrXII 348730 . C T 631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.821;DP=79;Dels=0.00;FS=3.292;HaplotypeScore=14.6885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.174;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,44:79:99:661,0,533 chrXII 348790 . C T 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.098;DP=123;Dels=0.00;FS=4.654;HaplotypeScore=4.0320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.041;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:902,0,1280 chrXII 348827 . A G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.927;DP=127;Dels=0.00;FS=2.383;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.022;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.398;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1100,0,1362 chrXII 348896 . G A 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;DP=146;Dels=0.00;FS=7.795;HaplotypeScore=3.1000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:1159,0,1848 chrXII 349138 . C T 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.889;DP=158;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=2.9808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,86:158:99:1850,0,1396 chrXII 349585 . A G 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.222;DP=149;Dels=0.00;FS=8.644;HaplotypeScore=2.4326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.926;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.635;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,82:149:99:1735,0,1331 chrXII 349780 . T C 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.496;DP=162;Dels=0.00;FS=1.271;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,91:162:99:1901,0,1442 chrXII 349864 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.962;DP=117;Dels=0.00;FS=2.389;HaplotypeScore=3.6112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1364,0,1019 chrXII 350013 . T C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.750;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.047;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1500,0,1292 chrXII 350749 . C A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.334;DP=135;Dels=0.00;FS=4.382;HaplotypeScore=14.3190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.611;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1441,0,1264 chrXII 350783 . T G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.319;DP=125;Dels=0.00;FS=8.413;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.399;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1165,0,1478 chrXII 350896 . G A 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.350;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.173;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1769,0,1220 chrXII 351004 . A G 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;DP=98;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,58:98:99:1199,0,807 chrXII 351138 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.548;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.365;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1208,0,1428 chrXII 351600 . G C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.941;DP=137;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1127,0,1576 chrXII 351631 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.307;DP=145;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=6.4910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=10.91;ReadPosRankSum=2.013;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1612,0,1281 chrXII 351769 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.209;DP=131;Dels=0.00;FS=3.216;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1248,0,1523 chrXII 352013 . C T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.445;DP=136;Dels=0.00;FS=2.209;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,56:136:99:1014,0,1736 chrXII 352236 . C T 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.519;DP=141;Dels=0.00;FS=3.263;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.924;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,83:141:99:1787,0,1104 chrXII 352942 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.614;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.881;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1084,0,1237 chrXII 352956 . C A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.967;DP=115;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1225,0,1201 chrXII 353392 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;DP=136;Dels=0.00;FS=7.904;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.040;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1162,0,1625 chrXII 353484 . T C 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.724;DP=104;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.463;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:949,0,1267 chrXII 353555 . G T 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.758;DP=118;Dels=0.00;FS=22.640;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.554;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:942,0,1418 chrXII 354414 . C A 2034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.753;DP=177;Dels=0.00;FS=7.662;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,96:177:99:2064,0,1579 chrXII 354477 . C T 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.174;DP=135;Dels=0.00;FS=5.324;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,81:135:99:1790,0,984 chrXII 354979 . A G 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.288;DP=96;Dels=0.00;FS=1.785;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.885;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:96:99:1012,0,956 chrXII 355027 . C T 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.347;DP=114;Dels=0.00;FS=12.962;HaplotypeScore=3.5197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.674;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:114:99:1193,0,1084 chrXII 355221 . C T 595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.833;DP=103;Dels=0.00;FS=5.328;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:625,0,1420 chrXII 355289 . C A 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.446;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.246;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:927,0,1163 chrXII 355321 . G A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.028;DP=106;Dels=0.00;FS=7.837;HaplotypeScore=4.1788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=12.87;ReadPosRankSum=1.700;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:1394,0,808 chrXII 355771 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.649;DP=97;Dels=0.00;FS=3.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.649;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.308;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1150,0,877 chrXII 355823 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.483;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.472;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1226,0,1095 chrXII 355883 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.861;DP=100;Dels=0.00;FS=2.756;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.686;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:950,0,1140 chrXII 356263 . G A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.732;DP=125;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.057;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1502,0,1085 chrXII 356631 . A C 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.517;DP=128;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.411;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,77:128:99:1648,0,1023 chrXII 357438 . G T 3994.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3994,409,0 chrXII 357529 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.077;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:137:99:1414,0,1462 chrXII 357535 . A G 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.350;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1453,0,1588 chrXII 357550 . C T 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.318;DP=154;Dels=0.00;FS=2.183;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.539;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1596,0,1620 chrXII 357577 . C T 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.887;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.900;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1639,0,1579 chrXII 357639 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;DP=117;Dels=0.00;FS=2.426;HaplotypeScore=2.7062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=9.85;ReadPosRankSum=-2.511;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1183,0,1218 chrXII 357640 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.232;DP=119;Dels=0.00;FS=3.410;HaplotypeScore=2.7062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=9.60;ReadPosRankSum=-2.822;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1172,0,1240 chrXII 357723 . C T 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4012,409,0 chrXII 357940 . T C 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.967;DP=158;Dels=0.00;FS=3.759;HaplotypeScore=10.7850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.798;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,86:158:99:1724,0,1483 chrXII 358177 . C T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.222;DP=127;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=2.4612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1225,0,1363 chrXII 358302 . A G 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.944;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1415,0,1456 chrXII 358336 . C T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.444;DP=117;Dels=0.00;FS=3.366;HaplotypeScore=3.6307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.859;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1207,0,1165 chrXII 358692 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.662;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1495,0,1152 chrXII 359226 . G A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.577;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=8.52;ReadPosRankSum=2.021;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:1018,0,1415 chrXII 359296 . T C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.664;DP=112;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=7.8314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:952,0,1248 chrXII 359469 . A G 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.354;DP=146;Dels=0.00;FS=1.321;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,87:146:99:1882,0,1158 chrXII 359887 . T G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.410;DP=134;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=12.0760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.490;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1336,0,1536 chrXII 360772 . A G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.247;DP=116;Dels=0.00;FS=4.537;HaplotypeScore=4.9461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.754;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1179,0,1234 chrXII 360910 . G C 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;DP=99;Dels=0.00;FS=8.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.595;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:729,0,1327 chrXII 360970 . G A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.419;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1262,0,1128 chrXII 361284 . T C 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6520;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2488,258,0 chrXII 361294 . A G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.650;DP=100;Dels=0.00;FS=4.917;HaplotypeScore=4.7463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.210;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:929,0,1026 chrXII 361865 . A G 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2854,309,0 chrXII 361870 . G A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.596;DP=133;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=3.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1436,0,1278 chrXII 361969 . T A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.379;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.015;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1249,0,1143 chrXII 364406 . T C 2466 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.52;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2499,270,0 chrXII 365170 . G A 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=1;QD=26.47;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3865,397,0 chrXII 365654 . C T 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.023;DP=129;Dels=0.00;FS=6.762;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,78:129:99:1757,0,943 chrXII 366845 . C T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.225;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1105,0,1392 chrXII 367056 . C T 4170.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=25.74;ReadPosRankSum=1.347;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4170,425,0 chrXII 367138 . G A 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.080;DP=149;Dels=0.00;FS=2.088;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.113;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1854,0,1340 chrXII 367241 . T G 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.259;DP=128;Dels=0.00;FS=8.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.125;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1577,0,1121 chrXII 367293 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.678;DP=123;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.230;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1279,0,1195 chrXII 367326 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.033;DP=131;Dels=0.00;FS=4.350;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1248,0,1504 chrXII 367348 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.553;DP=130;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.014;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1235,0,1401 chrXII 367397 . C T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.389;DP=150;Dels=0.00;FS=2.879;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.736;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1452,0,1588 chrXII 367483 . G C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;DP=149;Dels=0.00;FS=9.883;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1402,0,1720 chrXII 367545 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.229;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.440;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1384,0,1187 chrXII 367624 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.088;DP=114;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.898;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1171,0,1258 chrXII 367625 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.158;DP=114;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.847;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1163,0,1223 chrXII 367673 . A G 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.605;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3127,324,0 chrXII 367824 . C T 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.721;DP=165;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1722,0,1664 chrXII 367857 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.361;DP=143;Dels=0.00;FS=3.005;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.335;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1321,0,1658 chrXII 367953 . T C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.311;DP=124;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.870;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1111,0,1473 chrXII 367964 . T C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.625;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.044;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1101,0,1386 chrXII 369062 . G A 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.357;DP=163;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,88:163:99:1871,0,1459 chrXII 369119 . G A 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.939;DP=175;Dels=0.00;FS=13.066;HaplotypeScore=5.8192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.734;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,82:175:99:1733,0,1893 chrXII 370464 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.158;DP=122;Dels=0.00;FS=3.874;HaplotypeScore=6.1790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.046;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1123,0,1245 chrXII 371097 . T C 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.816;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.060;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1613,0,1666 chrXII 371874 . T A 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.008;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.283;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1280,0,1693 chrXII 372021 . C T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.840;DP=154;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=4.9574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1568,0,1663 chrXII 372265 . T C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.540;DP=139;Dels=0.00;FS=4.116;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.019;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1266,0,1597 chrXII 372291 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.209;DP=124;Dels=0.00;FS=3.267;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.091;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1295,0,1271 chrXII 372303 . C T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.463;DP=135;Dels=0.00;FS=2.168;HaplotypeScore=2.8897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1418,0,1412 chrXII 372524 . C T 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.285;DP=120;Dels=0.00;FS=3.512;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.237;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:942,0,1446 chrXII 372655 . A G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.835;DP=160;Dels=0.00;FS=4.671;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.481;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:160:99:1437,0,1904 chrXII 372738 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.139;DP=148;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=5.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.251;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,56:148:99:977,0,1983 chrXII 373070 . G A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.088;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.616;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.692;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1130,0,1049 chrXII 373094 . T C 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.520;DP=121;Dels=0.00;FS=1.604;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.855;QD=7.63;ReadPosRankSum=1.044;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:953,0,1342 chrXII 373100 . G T 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.154;DP=123;Dels=0.00;FS=1.532;HaplotypeScore=3.0128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.45;MQ0=0;MQRankSum=-5.175;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1098,0,1247 chrXII 373117 . T A 518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;DP=115;Dels=0.00;FS=4.507;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-6.287;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:548,0,1339 chrXII 373121 . C T 395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.981;DP=90;Dels=0.00;FS=10.779;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=-5.461;QD=4.39;ReadPosRankSum=-2.074;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,41:90:99:425,0,1067 chrXII 373132 . G A 471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.037;DP=93;Dels=0.00;FS=25.806;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.201;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:501,0,1195 chrXII 373138 . A C 535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;DP=97;Dels=0.00;FS=15.656;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-5.413;QD=5.52;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:565,0,1228 chrXII 373147 . C T 494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.290;DP=96;Dels=0.00;FS=18.204;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.52;MQ0=0;MQRankSum=-4.670;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.298;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:524,0,1269 chrXII 373233 . A T 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;DP=109;Dels=0.00;FS=4.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=8.15;ReadPosRankSum=2.150;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:918,0,1420 chrXII 373243 . C T 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.551;DP=115;Dels=0.00;FS=7.328;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.200;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,48:115:99:994,0,1508 chrXII 373260 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.921;DP=131;Dels=0.00;FS=33.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.198;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1309,0,1420 chrXII 373279 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.437;DP=118;Dels=0.00;FS=9.072;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.912;QD=10.64;ReadPosRankSum=2.450;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1285,0,1193 chrXII 373385 . T A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.961;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.179;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1168,0,1682 chrXII 373453 . C G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.291;DP=162;Dels=0.00;FS=18.012;HaplotypeScore=117.4230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.090;QD=6.70;ReadPosRankSum=3.407;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,56:162:99:1116,0,2341 chrXII 373488 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.046;DP=149;Dels=0.00;FS=5.436;HaplotypeScore=3.9135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.19;MQ0=0;MQRankSum=-4.382;QD=8.03;ReadPosRankSum=-2.769;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,63:149:99:1226,0,1894 chrXII 373508 . A G 701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.017;DP=117;Dels=0.00;FS=4.643;HaplotypeScore=9.8097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQ0=0;MQRankSum=-6.613;QD=5.99;ReadPosRankSum=-3.077;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:731,0,1544 chrXII 373516 . T C 639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.030;DP=116;Dels=0.01;FS=10.636;HaplotypeScore=5.8876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.757;QD=5.51;ReadPosRankSum=-2.286;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,46:115:99:669,0,1578 chrXII 373567 . C G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;DP=125;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.452;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.022;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1244,0,1344 chrXII 373579 . T G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.336;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=-3.272;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.864;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1163,0,1308 chrXII 373640 . T A 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.770;DP=110;Dels=0.00;FS=9.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.57;MQ0=0;MQRankSum=-6.180;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:937,0,1263 chrXII 373650 . T C 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.447;DP=131;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.42;MQ0=0;MQRankSum=-6.198;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.551;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1025,0,1583 chrXII 373658 . T C 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.052;DP=128;Dels=0.00;FS=2.261;HaplotypeScore=95.4931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=-6.974;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1085,0,1554 chrXII 373806 . T C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.539;DP=137;Dels=0.00;FS=5.234;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.919;QD=10.86;ReadPosRankSum=-2.457;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1518,0,1375 chrXII 373838 . C G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.841;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=2.076;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.515;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1085,0,1408 chrXII 373842 . T C 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.615;DP=121;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.437;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:960,0,1540 chrXII 373866 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.287;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1235,0,1535 chrXII 373988 . A C 244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.227;DP=86;Dels=0.00;FS=11.754;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=1;MQRankSum=-4.267;QD=2.84;ReadPosRankSum=-5.100;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:86:99:274,0,1499 chrXII 374445 . A G 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.438;DP=138;Dels=0.00;FS=7.693;HaplotypeScore=4.8009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.032;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1508,0,1254 chrXII 374666 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.198;DP=118;Dels=0.00;FS=13.813;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.291;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1163,0,1247 chrXII 374847 . T C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.962;DP=128;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.651;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.798;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1067,0,1439 chrXII 374858 . T C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.854;DP=122;Dels=0.00;FS=4.318;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.896;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.307;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1104,0,1388 chrXII 374863 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.192;DP=119;Dels=0.00;FS=5.660;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.603;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1232,0,1296 chrXII 374933 . T A 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.810;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.099;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:125:99:1088,0,1525 chrXII 374962 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.802;DP=132;Dels=0.00;FS=6.969;HaplotypeScore=3.6040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1295,0,1399 chrXII 374970 . A T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.287;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1543,0,1409 chrXII 375009 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=120;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.033;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.701;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1309,0,1173 chrXII 375089 . G C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;DP=102;Dels=0.00;FS=2.528;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.784;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.309;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1023,0,1059 chrXII 375099 . T C 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.596;DP=92;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:777,0,1113 chrXII 375126 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.892;DP=113;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1094,0,1273 chrXII 375154 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.595;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1189,0,1257 chrXII 375271 . A G 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.373;DP=105;Dels=0.00;FS=6.331;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-5.353;QD=6.90;ReadPosRankSum=2.574;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:755,0,1358 chrXII 375290 . C T 854.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.686;DP=111;Dels=0.00;FS=10.707;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-7.311;QD=7.69;ReadPosRankSum=-2.320;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:884,0,1278 chrXII 375294 . T C 666.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.372;DP=107;Dels=0.00;FS=4.933;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.94;MQ0=0;MQRankSum=-7.037;QD=6.22;ReadPosRankSum=-2.202;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,43:107:99:696,0,1334 chrXII 375295 . T G 690.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.828;DP=108;Dels=0.00;FS=6.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.979;QD=6.39;ReadPosRankSum=-2.222;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,43:108:99:720,0,1370 chrXII 375302 . C T 694.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.310;DP=109;Dels=0.00;FS=11.027;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.38;MQ0=0;MQRankSum=-7.439;QD=6.37;ReadPosRankSum=-3.562;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:724,0,1293 chrXII 375309 . C T 334.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.212;DP=92;Dels=0.00;FS=35.879;HaplotypeScore=20.5037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.89;MQ0=0;MQRankSum=-7.418;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.983;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:364,0,1225 chrXII 375310 . G A 354.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.217;DP=91;Dels=0.00;FS=36.470;HaplotypeScore=20.5037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-7.268;QD=3.89;ReadPosRankSum=-2.437;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,31:90:99:384,0,1170 chrXII 375322 . T A 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;DP=91;Dels=0.00;FS=10.755;HaplotypeScore=5.7860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQ0=0;MQRankSum=-6.157;QD=0.25;ReadPosRankSum=2.719;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:53:53,0,1534 chrXII 375329 . C T 53.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.595;DP=111;Dels=0.00;FS=3.916;HaplotypeScore=8.7604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.85;MQ0=0;MQRankSum=-8.234;QD=0.48;ReadPosRankSum=-1.858;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,40:111:83:83,0,1462 chrXII 375353 . T C 214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.985;DP=127;Dels=0.00;FS=10.297;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQ0=0;MQRankSum=-8.828;QD=1.69;ReadPosRankSum=-1.895;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:244,0,1629 chrXII 375370 . G A 241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.112;DP=125;Dels=0.00;FS=15.629;HaplotypeScore=13.8798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.47;MQ0=0;MQRankSum=-8.773;QD=1.93;ReadPosRankSum=-1.535;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:271,0,1411 chrXII 375386 . T C 62.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.963;DP=106;Dels=0.00;FS=16.307;HaplotypeScore=13.8753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-8.025;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.975;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,35:106:92:92,0,1622 chrXII 375388 . A G 128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.821;DP=113;Dels=0.00;FS=15.647;HaplotypeScore=12.8792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-7.635;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.420;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,38:113:99:158,0,1616 chrXII 375412 . A G 401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.107;DP=129;Dels=0.00;FS=2.289;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQ0=0;MQRankSum=-6.337;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,51:129:99:431,0,1807 chrXII 375438 . T C 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.033;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQ0=0;MQRankSum=-3.527;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,60:144:99:816,0,1922 chrXII 375556 . T C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.236;DP=152;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.705;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1628,0,1515 chrXII 375574 . T G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.888;DP=149;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=5.1528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.416;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1499,0,1503 chrXII 375697 . G A 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.344;DP=100;Dels=0.00;FS=18.117;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=10.69;ReadPosRankSum=-2.646;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1099,0,906 chrXII 375724 . C T 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.593;DP=105;Dels=0.00;FS=6.266;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.476;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:871,0,1302 chrXII 375813 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.756;DP=140;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=4.7560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.042;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1155,0,1707 chrXII 375947 . T C 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.890;DP=151;Dels=0.00;FS=14.918;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=8.20;ReadPosRankSum=2.257;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:1268,0,1812 chrXII 375973 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.973;DP=156;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.229;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1502,0,1750 chrXII 376012 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.793;DP=152;Dels=0.00;FS=3.031;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1267,0,1847 chrXII 376222 . C T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.545;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.937;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:134:99:1562,0,1249 chrXII 376303 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.948;DP=163;Dels=0.00;FS=9.486;HaplotypeScore=2.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=3.837;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.365;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1519,0,1788 chrXII 376495 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.461;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.162;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1354,0,1198 chrXII 376585 . G A 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.683;DP=140;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.762;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.256;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1473,0,1430 chrXII 376900 . A G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.756;DP=131;Dels=0.00;FS=14.550;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:131:99:929,0,1742 chrXII 376993 . C G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;DP=146;Dels=0.00;FS=3.908;HaplotypeScore=6.9047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=3.386;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1370,0,1579 chrXII 377350 . A C 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.102;DP=174;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,75:174:99:1445,0,2186 chrXII 377477 . C T 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.709;DP=134;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.649;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1570,0,1163 chrXII 377512 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.482;DP=131;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1498,0,1178 chrXII 377522 . G T 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.580;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.246;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1266,0,1142 chrXII 377564 . T C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.844;DP=109;Dels=0.00;FS=3.595;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=7.91;ReadPosRankSum=-1.629;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:892,0,1344 chrXII 377594 . T C 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;DP=113;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:995,0,1425 chrXII 377619 . T G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.946;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=2.185;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.506;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,66:151:99:1297,0,1859 chrXII 377629 . A G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.048;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=2.019;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.680;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:99:1338,0,1810 chrXII 377691 . A G 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.075;DP=154;Dels=0.00;FS=4.160;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.478;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1415,0,1808 chrXII 377739 . A G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.045;DP=136;Dels=0.00;FS=6.429;HaplotypeScore=2.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1562,0,1230 chrXII 377913 . C G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.155;DP=109;Dels=0.00;FS=4.577;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1132,0,1019 chrXII 377948 . T A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.191;DP=124;Dels=0.00;FS=2.572;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.974;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1264,0,1465 chrXII 378020 . A C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.094;DP=159;Dels=0.00;FS=1.972;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.153;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1520,0,1769 chrXII 378215 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.742;DP=127;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1382,0,1202 chrXII 378221 . G C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.763;DP=130;Dels=0.00;FS=4.145;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1407,0,1143 chrXII 378260 . T C 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.444;DP=132;Dels=0.00;FS=5.432;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.138;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,75:132:99:1568,0,1138 chrXII 378380 . A T 2021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.056;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,91:172:99:2051,0,1656 chrXII 378437 . A G 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.316;DP=141;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1464,0,1431 chrXII 379144 . A G 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.614;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.764;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1214,0,1599 chrXII 379889 . A G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.387;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1388,0,1062 chrXII 379915 . T C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.390;DP=127;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=8.04;ReadPosRankSum=-2.096;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1051,0,1532 chrXII 379925 . A T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=2.041;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.088;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1130,0,1596 chrXII 381081 . C T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.674;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.970;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1292,0,1688 chrXII 381157 . G C 3532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.05;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3532,369,0 chrXII 381256 . T C 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3025,306,0 chrXII 381370 . G C 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3531,351,0 chrXII 381823 . A G 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3772,390,0 chrXII 381898 . C T 4401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;DP=167;Dels=0.00;FS=4.519;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=26.35;ReadPosRankSum=1.234;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:167:99:4401,433,0 chrXII 381902 . A G 4088.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=162;Dels=0.00;FS=4.613;HaplotypeScore=5.9570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.604;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4088,414,0 chrXII 381911 . C T 4443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.98;SB=-2.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4443,421,0 chrXII 382117 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.176;DP=111;Dels=0.00;FS=0.789;HaplotypeScore=2.9119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:111:99:1107,0,1072 chrXII 382204 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.878;DP=121;Dels=0.00;FS=4.429;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.725;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1166,0,1257 chrXII 382340 . G A 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3433,334,0 chrXII 382385 . C T 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.073;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1085,0,1182 chrXII 382405 . C T 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=98;Dels=0.00;FS=3.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:961,0,1140 chrXII 382560 . T C 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3046,333,0 chrXII 382590 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;DP=133;Dels=0.00;FS=3.315;HaplotypeScore=6.8228;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.602;QD=24.31;ReadPosRankSum=1.576;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3265,332,0 chrXII 382692 . A T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;DP=122;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1406,0,1103 chrXII 382777 . C T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.743;DP=120;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=1;MQRankSum=1.257;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1211,0,1187 chrXII 382783 . G A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.658;DP=119;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=0.722;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1287,0,1092 chrXII 383137 . A G 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.83;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3550,363,0 chrXII 383230 . A G 2124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2157,219,0 chrXII 383295 . G A 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2994,306,0 chrXII 383350 . G T 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.693;DP=158;Dels=0.00;FS=2.011;HaplotypeScore=4.7253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.748;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1672,0,1580 chrXII 383407 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;DP=131;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.035;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1227,0,1392 chrXII 383428 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.446;DP=156;Dels=0.00;FS=3.734;HaplotypeScore=12.6468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=2.185;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.756;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:156:99:1271,0,1752 chrXII 383499 . T C 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.539;DP=162;Dels=0.01;FS=3.743;HaplotypeScore=3.9140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1656,0,1667 chrXII 383587 . G A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.311;DP=109;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=4.9071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1295,0,947 chrXII 383595 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.941;DP=121;Dels=0.00;FS=3.308;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1257,0,1202 chrXII 383611 . C A,G 2956.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.83;MQ0=0;QD=22.39;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,72,60:132:99:3016,1387,1200,1630,0,1464 chrXII 383695 . G A 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3568,363,0 chrXII 383785 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.441;DP=137;Dels=0.00;FS=3.038;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.497;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:137:99:1357,0,1418 chrXII 383848 . T C 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.621;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.538;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1379,0,1560 chrXII 383932 . T C 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3026,324,0 chrXII 384348 . G A 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.643;DP=142;Dels=0.00;FS=3.958;HaplotypeScore=1.9301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.875;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1630,0,1296 chrXII 384511 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.085;DP=140;Dels=0.00;FS=5.043;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.437;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1532,0,1296 chrXII 384661 . G A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.332;DP=135;Dels=0.00;FS=2.263;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.855;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1404,0,1454 chrXII 384729 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.189;DP=148;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.737;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,63:148:99:1268,0,1855 chrXII 384821 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.105;DP=127;Dels=0.00;FS=2.272;HaplotypeScore=6.0153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=1;MQRankSum=1.635;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1349,0,1286 chrXII 385263 . T G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.169;DP=126;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.134;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1375,0,1190 chrXII 385590 . C G 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;DP=116;Dels=0.00;FS=5.920;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:702,0,1527 chrXII 385605 . A G 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;DP=124;Dels=0.00;FS=5.415;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:857,0,1462 chrXII 385802 . G A 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;DP=111;Dels=0.00;FS=5.540;HaplotypeScore=6.8542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=26.84;ReadPosRankSum=1.670;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:3012,295,0 chrXII 385902 . T C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;DP=94;Dels=0.00;FS=4.006;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:1179,0,840 chrXII 385909 . T C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.847;DP=90;Dels=0.00;FS=4.009;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.960;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,54:90:99:1201,0,748 chrXII 385938 . A G 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;DP=96;Dels=0.00;FS=6.647;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,57:96:99:1223,0,772 chrXII 385953 . A C 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.864;DP=120;Dels=0.00;FS=4.600;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,77:120:99:1595,0,743 chrXII 385960 . A G 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.639;DP=117;Dels=0.00;FS=4.663;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.796;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,73:117:99:1584,0,797 chrXII 386133 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.491;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.284;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,71:157:99:1400,0,1798 chrXII 386145 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.251;DP=156;Dels=0.00;FS=2.102;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.190;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1471,0,1749 chrXII 386191 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.996;DP=128;Dels=0.00;FS=1.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.880;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1376,0,1395 chrXII 386192 . A C 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.509;DP=127;Dels=0.00;FS=2.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.064;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1318,0,1399 chrXII 386217 . T A 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.920;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.110;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1500,0,1195 chrXII 386239 . A G 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.360;DP=114;Dels=0.00;FS=4.787;HaplotypeScore=1.9367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.862;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:970,0,1470 chrXII 386266 . A G 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.510;DP=132;Dels=0.00;FS=11.099;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.938;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,80:132:99:1682,0,1063 chrXII 386311 . A G 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.416;DP=143;Dels=0.00;FS=9.660;HaplotypeScore=63.4158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.711;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.159;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,81:143:99:1686,0,1301 chrXII 386351 . G A 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.339;DP=126;Dels=0.00;FS=2.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1467,0,1228 chrXII 386427 . C A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.284;DP=110;Dels=0.01;FS=3.509;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.252;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1132,0,1094 chrXII 386504 . A C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.028;DP=118;Dels=0.00;FS=10.201;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1301,0,1154 chrXII 386651 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.529;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1330,0,1509 chrXII 386700 . G A 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.117;DP=161;Dels=0.00;FS=1.239;HaplotypeScore=3.4404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1785,0,1500 chrXII 386841 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.576;DP=112;Dels=0.00;FS=7.659;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.082;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1103,0,1161 chrXII 387039 . T A 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;DP=112;Dels=0.00;FS=2.452;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.616;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1025,0,1408 chrXII 387074 . C T 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.066;DP=142;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.486;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1333,0,1626 chrXII 387140 . A G 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3630,363,0 chrXII 387257 . A G 2090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.705;DP=188;Dels=0.00;FS=0.540;HaplotypeScore=16.5043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,107:188:99:2120,0,1741 chrXII 387416 . G A 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.683;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:1026,0,1465 chrXII 387438 . A G 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.976;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.379;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1451,0,1133 chrXII 387636 . C G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.280;DP=133;Dels=0.00;FS=5.657;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.120;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1155,0,1453 chrXII 387806 . C T 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.985;DP=159;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.791;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,80:159:99:1721,0,1394 chrXII 387915 . T C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.970;DP=144;Dels=0.00;FS=6.495;HaplotypeScore=2.9361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.844;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1313,0,1592 chrXII 388107 . G A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.272;DP=95;Dels=0.00;FS=3.933;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.456;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:95:99:973,0,900 chrXII 388456 . C T 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=60.8645;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.39;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2826,276,0 chrXII 388705 . A G 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.305;DP=94;Dels=0.00;FS=9.189;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1003,0,888 chrXII 388785 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.734;DP=100;Dels=0.00;FS=3.008;HaplotypeScore=2.5549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:100:99:1257,0,794 chrXII 388801 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.267;DP=100;Dels=0.00;FS=6.734;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1151,0,878 chrXII 388930 . G A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:997,0,1151 chrXII 389128 . G A 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.543;DP=163;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.871;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1557,0,1791 chrXII 389347 . C T 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3560,360,0 chrXII 389413 . T A 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.089;DP=147;Dels=0.00;FS=6.052;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.652;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1473,0,1547 chrXII 389584 . G A 4321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=27.35;ReadPosRankSum=1.162;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:4321,448,0 chrXII 389800 . G A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.221;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.522;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1364,0,1235 chrXII 389815 . A G 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3172,351,0 chrXII 389841 . A G 3031 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.98;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3064,327,0 chrXII 389845 . A G 2962 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.74;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2995,318,0 chrXII 389851 . A G 2922 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=3.645;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.289;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:2955,296,0 chrXII 389937 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.289;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1071,0,1638 chrXII 389953 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.762;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.328;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1511,0,1322 chrXII 390142 . T C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.051;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.754;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1350,0,1542 chrXII 390280 . C T 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.474;DP=152;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.759;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:1380,0,1610 chrXII 390311 . A T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.969;DP=148;Dels=0.00;FS=6.564;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:99:1351,0,1802 chrXII 390321 . C T 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.242;DP=145;Dels=0.00;FS=5.261;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.280;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1688,0,1304 chrXII 390651 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.069;DP=131;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.56;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.905;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:131:99:1490,0,1150 chrXII 390677 . G T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.271;DP=148;Dels=0.00;FS=2.093;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,61:148:99:1288,0,1833 chrXII 390724 . C T 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3508,355,0 chrXII 390784 . T C 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.488;DP=135;Dels=0.00;FS=5.322;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.490;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1519,0,1145 chrXII 390805 . C T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.434;DP=135;Dels=0.00;FS=2.196;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=8.15;ReadPosRankSum=2.140;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1130,0,1619 chrXII 390856 . T C 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3547,369,0 chrXII 390963 . G A 4388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4365;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=24.51;SB=-2.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4388,448,0 chrXII 391007 . G A 1859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.163;DP=160;Dels=0.00;FS=15.922;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=11.62;ReadPosRankSum=3.252;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,89:160:99:1889,0,1249 chrXII 391126 . G C 4049.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.57;MQ0=0;QD=24.99;SB=-2.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4049,429,0 chrXII 391140 . C T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.111;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.892;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.593;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1590,0,1666 chrXII 391201 . C T 2926 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.82;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2959,306,0 chrXII 391204 . G A 398.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.320;DP=113;Dels=0.00;FS=8.993;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.52;MQ0=0;MQRankSum=-7.320;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.073;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,30:113:99:428,0,1737 chrXII 391206 . G C 2607 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.46;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2640,288,0 chrXII 391207 . C T 359.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.635;DP=107;Dels=0.00;FS=11.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQ0=0;MQRankSum=-6.553;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:389,0,1709 chrXII 391214 . C T 2929 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2962,318,0 chrXII 391224 . G A 374.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.256;DP=127;Dels=0.00;FS=19.980;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.94;MQ0=0;MQRankSum=-6.871;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,36:127:99:404,0,2044 chrXII 391229 . C A 464.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.648;DP=112;Dels=0.00;FS=14.247;HaplotypeScore=3.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-5.737;QD=4.14;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,35:112:99:494,0,1721 chrXII 391232 . A T 2877 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.67;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2910,297,0 chrXII 391233 . C G 433.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;DP=114;Dels=0.00;FS=13.952;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-5.498;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,35:114:99:463,0,1803 chrXII 391272 . T A 2643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.78;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2676,282,0 chrXII 391314 . T A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;DP=113;Dels=0.00;FS=4.707;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.30;MQ0=0;MQRankSum=5.118;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.682;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1270,0,1114 chrXII 391324 . C T 1482.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.191;DP=121;Dels=0.00;FS=5.935;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.48;MQ0=0;MQRankSum=6.131;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.972;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1512,0,1041 chrXII 391328 . T C 923.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.555;DP=117;Dels=0.00;FS=13.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.86;MQ0=0;MQRankSum=-6.076;QD=7.89;ReadPosRankSum=2.585;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:953,0,1561 chrXII 391332 . G T 1437.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.522;DP=117;Dels=0.00;FS=19.986;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.91;MQ0=0;MQRankSum=5.511;QD=12.28;ReadPosRankSum=-2.146;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1467,0,998 chrXII 391361 . T C 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.686;DP=122;Dels=0.00;FS=20.987;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.05;MQ0=0;MQRankSum=-6.566;QD=6.54;ReadPosRankSum=-2.247;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,44:122:99:828,0,1740 chrXII 391369 . T C 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.816;DP=130;Dels=0.00;FS=9.789;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQ0=0;MQRankSum=-6.685;QD=6.35;ReadPosRankSum=-3.843;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:855,0,1783 chrXII 391455 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.105;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.58;MQ0=0;MQRankSum=8.160;QD=11.62;ReadPosRankSum=2.030;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,70:118:99:1401,0,623 chrXII 391460 . T G 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.80;MQ0=0;QD=21.35;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2595,279,0 chrXII 391472 . A C 629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.361;DP=125;Dels=0.00;FS=7.186;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.92;MQ0=0;MQRankSum=-8.453;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.052;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,45:125:99:659,0,1831 chrXII 391500 . C G 593.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;DP=115;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=3.4829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=-8.094;QD=5.16;ReadPosRankSum=1.193;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,38:115:99:623,0,1605 chrXII 391501 . C T 629.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.103;DP=116;Dels=0.00;FS=1.648;HaplotypeScore=3.4829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.51;MQ0=0;MQRankSum=-7.980;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.432;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,38:116:99:659,0,1681 chrXII 391503 . C T 759.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.890;DP=127;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=5.4656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.63;MQ0=0;MQRankSum=-8.134;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.474;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,44:127:99:789,0,1748 chrXII 391518 . C T 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.575;DP=120;Dels=0.00;FS=5.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-6.973;QD=7.47;ReadPosRankSum=-2.177;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,47:120:99:926,0,1500 chrXII 391536 . C T 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.762;DP=123;Dels=0.00;FS=13.946;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=-7.587;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,46:123:99:807,0,1639 chrXII 391542 . G T 1772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.706;DP=132;Dels=0.00;FS=11.692;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.22;MQ0=0;MQRankSum=7.799;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.247;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,85:132:99:1802,0,838 chrXII 391573 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.129;DP=146;Dels=0.00;FS=13.025;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.54;MQ0=0;MQRankSum=-6.637;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.742;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1182,0,1843 chrXII 391581 . C G 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.577;DP=145;Dels=0.00;FS=9.724;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=7.172;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.589;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,83:145:99:1772,0,1168 chrXII 391592 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.115;DP=144;Dels=0.00;FS=8.448;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=-5.517;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.269;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,62:144:99:1192,0,1726 chrXII 391611 . G A 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.826;DP=125;Dels=0.00;FS=1.627;HaplotypeScore=2.7231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=-5.743;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.283;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,50:125:99:943,0,1607 chrXII 391639 . T G 729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.554;DP=132;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.52;MQ0=0;MQRankSum=-6.543;QD=5.52;ReadPosRankSum=-1.378;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,45:132:99:759,0,1945 chrXII 391658 . G T 164.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.103;DP=103;Dels=0.00;FS=10.769;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.18;MQ0=0;MQRankSum=-7.351;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,29:103:99:194,0,1679 chrXII 391659 . G A 149.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.178;DP=103;Dels=0.00;FS=10.769;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.18;MQ0=0;MQRankSum=-7.366;QD=1.45;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,29:103:99:179,0,1645 chrXII 391660 . A G 146.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;DP=105;Dels=0.00;FS=10.950;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=-7.393;QD=1.39;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,29:105:99:176,0,1766 chrXII 391666 . G A 256.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.856;DP=109;Dels=0.00;FS=15.743;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-7.825;QD=2.35;ReadPosRankSum=-2.091;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,36:109:99:286,0,1600 chrXII 391669 . G C 2236 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.88;MQ0=0;QD=20.70;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2269,228,0 chrXII 391670 . C T 247.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.793;DP=106;Dels=0.00;FS=14.064;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.94;MQ0=0;MQRankSum=-7.376;QD=2.33;ReadPosRankSum=-2.284;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,35:106:99:277,0,1503 chrXII 391675 . T C 1518.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.711;DP=108;Dels=0.00;FS=16.350;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.13;MQ0=0;MQRankSum=7.332;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.346;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,73:108:99:1548,0,309 chrXII 391690 . C T 482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.797;DP=127;Dels=0.00;FS=1.505;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-7.619;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.078;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,43:127:99:512,0,1803 chrXII 391738 . G A 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.690;DP=118;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.04;MQ0=0;MQRankSum=-5.413;QD=7.01;ReadPosRankSum=2.006;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,45:118:99:857,0,1521 chrXII 391818 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;DP=99;Dels=0.00;FS=16.202;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.64;MQ0=0;MQRankSum=-3.975;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.496;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1102,0,903 chrXII 391823 . G T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.844;DP=93;Dels=0.00;FS=15.043;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.003;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.359;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1101,0,782 chrXII 391861 . C G 1861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.91;MQ0=0;QD=21.15;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1894,216,0 chrXII 391873 . C T 552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.59;MQ0=0;MQRankSum=-5.859;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,35:72:99:582,0,640 chrXII 391886 . T C 517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;DP=69;Dels=0.00;FS=8.390;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.78;MQ0=0;MQRankSum=-5.635;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:547,0,645 chrXII 391903 . C T 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.972;DP=80;Dels=0.00;FS=9.420;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQ0=0;MQRankSum=-6.020;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,44:80:99:761,0,673 chrXII 391911 . T C 700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=84;Dels=0.00;FS=5.796;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.66;MQ0=0;MQRankSum=-5.504;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.712;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:730,0,782 chrXII 391936 . T C 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.096;DP=94;Dels=0.00;FS=6.496;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.14;MQ0=0;MQRankSum=4.867;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.592;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:908,0,854 chrXII 391951 . T A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;DP=94;Dels=0.00;FS=5.203;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.00;MQ0=0;MQRankSum=-6.744;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.598;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,45:94:99:807,0,1043 chrXII 391960 . G A 2361 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.24;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2394,267,0 chrXII 391967 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.362;DP=98;Dels=0.00;FS=8.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQ0=0;MQRankSum=6.898;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.981;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1071,0,830 chrXII 391981 . G A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.745;DP=120;Dels=0.00;FS=6.824;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.18;MQ0=0;MQRankSum=-6.472;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.769;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1109,0,1285 chrXII 392010 . C T 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.553;DP=121;Dels=0.00;FS=8.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.60;MQ0=0;MQRankSum=-7.042;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:997,0,1439 chrXII 392012 . T C 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.46;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2960,318,0 chrXII 392046 . C T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.746;DP=118;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-5.092;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.012;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1291,0,1221 chrXII 392081 . A T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.348;DP=109;Dels=0.00;FS=3.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-5.417;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.737;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,48:109:99:894,0,1330 chrXII 392101 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.041;DP=89;Dels=0.00;FS=4.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=6.098;QD=12.55;ReadPosRankSum=2.635;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,52:89:99:1147,0,619 chrXII 392112 . T C 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.323;DP=88;Dels=0.00;FS=2.039;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=6.121;QD=11.65;ReadPosRankSum=3.436;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,53:88:99:1055,0,530 chrXII 392130 . T A 222.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;DP=85;Dels=0.00;FS=2.016;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.87;MQ0=0;MQRankSum=-7.110;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:252,0,1339 chrXII 392135 . G A 175.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;DP=85;Dels=0.00;FS=2.103;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.18;MQ0=0;MQRankSum=-7.103;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,25:85:99:205,0,1318 chrXII 392139 . G A 112.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.983;DP=84;Dels=0.00;FS=14.663;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=0;MQRankSum=-6.690;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.687;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:142,0,1296 chrXII 392150 . G A 156.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.522;DP=98;Dels=0.00;FS=17.557;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.35;MQ0=0;MQRankSum=-6.957;QD=1.59;ReadPosRankSum=1.513;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:186,0,1580 chrXII 392158 . C T 157.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.282;DP=91;Dels=0.00;FS=21.473;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQ0=0;MQRankSum=-6.921;QD=1.73;ReadPosRankSum=1.166;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:187,0,1385 chrXII 392165 . T C 120.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.917;DP=102;Dels=0.00;FS=30.340;HaplotypeScore=13.6891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.77;MQ0=0;MQRankSum=-6.031;QD=1.18;ReadPosRankSum=1.077;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:150,0,1834 chrXII 392173 . C T 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.538;DP=84;Dels=0.00;FS=33.520;HaplotypeScore=13.6891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=5.453;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.674;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,65:84:99:1559,0,109 chrXII 392197 . G A 162.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;DP=104;Dels=0.00;FS=30.918;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQ0=0;MQRankSum=-6.006;QD=1.56;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,23:104:99:192,0,1863 chrXII 392235 . G T 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;DP=96;Dels=0.00;FS=26.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.10;MQ0=0;MQRankSum=-4.966;QD=0.76;ReadPosRankSum=2.198;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,19:96:99:103,0,1766 chrXII 392241 . C T 86.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;DP=92;Dels=0.00;FS=29.466;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=-4.975;QD=0.93;ReadPosRankSum=2.062;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:116,0,1697 chrXII 392257 . G T 63.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.652;DP=74;Dels=0.00;FS=27.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=-4.814;QD=0.85;ReadPosRankSum=0.659;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:93:93,0,1290 chrXII 392269 . A G 85.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.391;DP=62;Dels=0.00;FS=18.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=-4.865;QD=1.37;ReadPosRankSum=-1.956;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:115,0,1164 chrXII 392292 . C T 1034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.61;MQ0=0;QD=24.62;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1067,114,0 chrXII 392309 . A G 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.380;DP=47;Dels=0.00;FS=1.549;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.028;QD=0.32;ReadPosRankSum=-1.781;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,10:47:45:45,0,879 chrXII 392329 . A G 65.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.746;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.964;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.662;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:95:95,0,993 chrXII 392356 . T C 185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.298;DP=62;Dels=0.00;FS=5.978;HaplotypeScore=77.0950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.78;MQ0=0;MQRankSum=-4.413;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.733;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:215,0,1051 chrXII 392407 . C A 1309 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.90;MQ0=0;QD=24.70;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:53:99:1342,144,0 chrXII 392410 . G A 1307 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.09;MQ0=0;QD=25.63;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1340,141,0 chrXII 392412 . T A 1277 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.09;MQ0=0;QD=25.04;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1310,141,0 chrXII 392417 . G A 87.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.571;DP=56;Dels=0.00;FS=4.695;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.610;QD=1.55;ReadPosRankSum=1.242;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:117,0,895 chrXII 392418 . T C 81.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.523;DP=56;Dels=0.00;FS=4.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.765;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.087;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:111,0,931 chrXII 392424 . A G 764.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.233;DP=52;Dels=0.00;FS=10.057;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.00;MQ0=0;MQRankSum=3.043;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,39:52:99:794,0,130 chrXII 392441 . A G 30.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.406;DP=46;Dels=0.00;FS=3.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.600;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.471;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,9:46:60:60,0,764 chrXII 392444 . T A 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;DP=48;Dels=0.00;FS=3.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.63;MQ0=0;MQRankSum=-3.249;QD=0.54;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,9:48:56:56,0,844 chrXII 392469 . A G 953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.82;MQ0=0;QD=21.18;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:45:99:986,108,0 chrXII 392474 . C T 1027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.55;MQ0=0;QD=22.33;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1060,111,0 chrXII 392482 . C T 1187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.841;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.05;MQ0=0;MQRankSum=2.715;QD=21.20;ReadPosRankSum=1.073;SB=-4.925e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,50:56:99:1220,107,0 chrXII 392549 . G A 1726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.35;MQ0=0;QD=24.66;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1759,189,0 chrXII 392576 . C T 1576 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.362;DP=84;Dels=0.00;FS=8.432;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=4.686;QD=18.76;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,75:84:52:1609,52,0 chrXII 392605 . G A 1806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.349;DP=85;Dels=0.00;FS=5.366;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=4.620;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.836;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,76:85:56:1839,56,0 chrXII 392647 . G A 1815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.86;MQ0=0;QD=26.30;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1848,192,0 chrXII 392702 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.855;DP=84;Dels=0.00;FS=3.422;HaplotypeScore=20.7216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQ0=0;MQRankSum=4.564;QD=15.80;ReadPosRankSum=2.909;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,61:84:99:1357,0,323 chrXII 392735 . T C 444.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;DP=83;Dels=0.00;FS=4.930;HaplotypeScore=57.5034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;MQRankSum=-4.132;QD=5.36;ReadPosRankSum=3.389;SB=-9.679e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:62,21:83:10:477,10,0 chrXII 392790 . C T 270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;DP=71;Dels=0.00;FS=47.579;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-6.110;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.643;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:300,0,995 chrXII 392810 . G T 33.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.655;DP=74;Dels=0.00;FS=34.658;HaplotypeScore=94.3638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=1;MQRankSum=-5.882;QD=0.45;ReadPosRankSum=-0.930;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:74:63:63,0,1045 chrXII 392857 . G A 160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.742;DP=70;Dels=0.00;FS=3.945;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=1;MQRankSum=-6.037;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.397;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:190,0,1139 chrXII 392858 . G A 148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.472;DP=75;Dels=0.00;FS=2.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.07;MQ0=1;MQRankSum=-5.911;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.912;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:178,0,1282 chrXII 392897 . G T 141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=76;Dels=0.00;FS=3.468;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.88;MQ0=1;MQRankSum=-6.534;QD=1.86;ReadPosRankSum=0.180;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:171,0,1237 chrXII 392908 . A G 131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.419;DP=79;Dels=0.00;FS=3.544;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.87;MQ0=1;MQRankSum=-6.418;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.482;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:161,0,1382 chrXII 392930 . A G 281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.135;DP=95;Dels=0.00;FS=3.202;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=-6.872;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:311,0,1660 chrXII 392940 . T A 458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;DP=111;Dels=0.00;FS=12.474;HaplotypeScore=2.9349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.36;MQ0=0;MQRankSum=-7.685;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,32:111:99:488,0,1797 chrXII 392995 . G A 643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;DP=104;Dels=0.00;FS=7.976;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.35;MQ0=0;MQRankSum=-4.480;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.099;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:673,0,1408 chrXII 393011 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.162;DP=115;Dels=0.00;FS=5.795;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.67;MQ0=0;MQRankSum=-4.796;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.913;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1040,0,1326 chrXII 393031 . A C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.949;DP=107;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.39;MQ0=0;MQRankSum=-4.962;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.491;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1183,0,1036 chrXII 393076 . T C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.416;DP=134;Dels=0.00;FS=3.108;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.606;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.644;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1443,0,1289 chrXII 393128 . G A 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.312;DP=106;Dels=0.00;FS=5.494;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.89;MQ0=0;MQRankSum=-4.318;QD=7.16;ReadPosRankSum=-1.619;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:789,0,1298 chrXII 393145 . T C 640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.220;DP=105;Dels=0.00;FS=18.194;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.56;MQ0=0;MQRankSum=-5.888;QD=6.10;ReadPosRankSum=-2.147;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:670,0,1343 chrXII 393156 . T A 395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.894;DP=97;Dels=0.00;FS=21.750;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.64;MQ0=0;MQRankSum=-6.787;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.015;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:425,0,1581 chrXII 393158 . T C 339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.854;DP=97;Dels=0.00;FS=19.294;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.64;MQ0=0;MQRankSum=-6.403;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.463;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,27:97:99:369,0,1617 chrXII 393183 . A G 411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.650;DP=101;Dels=0.00;FS=25.147;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-7.664;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.148;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:441,0,1545 chrXII 393184 . G C 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.64;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2583,264,0 chrXII 393220 . A T 381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;DP=112;Dels=0.00;FS=8.659;HaplotypeScore=25.1292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.67;MQ0=0;MQRankSum=-7.964;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.459;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,34:112:99:411,0,1789 chrXII 393235 . G A 419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.382;DP=116;Dels=0.00;FS=5.612;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.52;MQ0=0;MQRankSum=-8.087;QD=3.61;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,35:116:99:449,0,1750 chrXII 393242 . A G 362.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;DP=122;Dels=0.00;FS=5.523;HaplotypeScore=5.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=-8.329;QD=2.97;ReadPosRankSum=-2.253;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,38:122:99:392,0,1911 chrXII 393247 . T C 165.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.962;DP=92;Dels=0.00;FS=3.448;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=0;MQRankSum=-7.607;QD=1.79;ReadPosRankSum=-2.177;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,28:92:99:195,0,1562 chrXII 393250 . G C 168.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.894;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.21;MQ0=0;MQRankSum=-7.454;QD=1.70;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,29:99:99:198,0,1492 chrXII 393251 . T C 188.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.623;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.02;MQ0=0;MQRankSum=-7.706;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.411;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,30:100:99:218,0,1684 chrXII 393267 . A C 212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.743;DP=111;Dels=0.00;FS=5.412;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.87;MQ0=0;MQRankSum=-8.052;QD=1.91;ReadPosRankSum=-2.931;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,39:111:99:242,0,1738 chrXII 393278 . A G 249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.293;DP=117;Dels=0.00;FS=10.391;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.32;MQ0=0;MQRankSum=-7.412;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.872;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,42:117:99:279,0,1846 chrXII 393287 . T C 465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.378;DP=133;Dels=0.00;FS=14.040;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.49;MQ0=0;MQRankSum=-6.299;QD=3.50;ReadPosRankSum=-0.823;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,49:133:99:495,0,1950 chrXII 393394 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.136;DP=127;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.582;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.145;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1355,0,1294 chrXII 393433 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.760;DP=120;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.111;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1376,0,1120 chrXII 393452 . G A 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.438;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=3.286;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.453;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:1001,0,1105 chrXII 393632 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.707;DP=116;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.69;MQ0=0;MQRankSum=4.407;QD=9.14;ReadPosRankSum=-2.024;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1090,0,1242 chrXII 393700 . A G 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.055;DP=108;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.538;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.979;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:889,0,1372 chrXII 393759 . A G 208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.667;DP=94;Dels=0.00;FS=0.827;HaplotypeScore=8.7119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.04;MQ0=0;MQRankSum=-5.059;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,35:94:99:238,0,1290 chrXII 393777 . A C 518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.649;DP=98;Dels=0.00;FS=0.767;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=-4.719;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.212;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:548,0,1216 chrXII 393859 . T C 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.564;DP=110;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=6.2404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=4.753;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.065;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:110:99:1010,0,1162 chrXII 393905 . A G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.760;DP=120;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=5.5561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.103;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1355,0,1136 chrXII 393936 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.862;DP=116;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=-3.118;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.017;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1194,0,1215 chrXII 393979 . G T 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.401;DP=113;Dels=0.00;FS=3.431;HaplotypeScore=4.3863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.86;MQ0=0;MQRankSum=3.580;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.985;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1193,0,1106 chrXII 394006 . T A 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;DP=116;Dels=0.03;FS=2.508;HaplotypeScore=4.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.79;MQ0=0;MQRankSum=-4.237;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:838,0,1312 chrXII 394020 . G A 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.238;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQ0=0;MQRankSum=-3.961;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:895,0,1191 chrXII 394070 . T C 450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;DP=79;Dels=0.00;FS=6.185;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-7.447;QD=5.70;ReadPosRankSum=-1.806;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:480,0,939 chrXII 394085 . G A 472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.178;DP=73;Dels=0.00;FS=17.757;HaplotypeScore=30.7208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.09;MQ0=0;MQRankSum=-6.620;QD=6.47;ReadPosRankSum=-2.600;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,35:73:99:502,0,793 chrXII 394098 . A T 508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.993;DP=78;Dels=0.00;FS=18.404;HaplotypeScore=33.8278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQ0=0;MQRankSum=-6.784;QD=6.51;ReadPosRankSum=-1.851;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:538,0,964 chrXII 394150 . C A 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.963;DP=92;Dels=0.00;FS=10.237;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=-4.463;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.292;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,46:92:99:847,0,860 chrXII 394165 . C A 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.169;DP=104;Dels=0.00;FS=3.589;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=7.537;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1058,0,951 chrXII 394174 . A G 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.194;DP=99;Dels=0.00;FS=1.632;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.01;MQ0=0;MQRankSum=-5.787;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:846,0,1057 chrXII 394198 . C G 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.13;MQ0=0;MQRankSum=-5.367;QD=8.45;ReadPosRankSum=-2.895;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:89:99:782,0,890 chrXII 394201 . G A 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.923;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=-5.773;QD=8.39;ReadPosRankSum=-2.117;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:785,0,912 chrXII 394224 . T C 516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.358;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.83;MQ0=0;MQRankSum=-6.263;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.661;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:546,0,1218 chrXII 394244 . A C 518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.69;MQ0=0;MQRankSum=-7.153;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:548,0,1037 chrXII 394281 . A G 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2544,267,0 chrXII 394298 . G T 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.075;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.513;QD=7.32;ReadPosRankSum=2.238;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:102:99:777,0,1361 chrXII 394373 . T C 424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.072;DP=93;Dels=0.00;FS=2.825;HaplotypeScore=6.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.325;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,32:93:99:454,0,1388 chrXII 394387 . C G 303.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.317;DP=90;Dels=0.00;FS=4.306;HaplotypeScore=3.7613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-7.166;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.545;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,29:90:99:333,0,1350 chrXII 394391 . A G 338.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;DP=90;Dels=0.00;FS=4.306;HaplotypeScore=5.7475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-7.140;QD=3.76;ReadPosRankSum=1.589;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,29:90:99:368,0,1377 chrXII 394392 . G A 362.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.297;DP=90;Dels=0.00;FS=5.966;HaplotypeScore=5.7475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-6.825;QD=4.02;ReadPosRankSum=1.816;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,28:90:99:392,0,1349 chrXII 394403 . C T 378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.269;DP=98;Dels=0.00;FS=7.165;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.32;MQ0=0;MQRankSum=-7.487;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.635;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,31:98:99:408,0,1496 chrXII 394411 . T G 380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.643;DP=99;Dels=0.00;FS=6.858;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=-8.146;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.276;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,34:99:99:410,0,1467 chrXII 394426 . C T 611.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;DP=107;Dels=0.00;FS=7.840;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.58;MQ0=0;MQRankSum=-8.746;QD=5.71;ReadPosRankSum=-2.564;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,43:107:99:641,0,1399 chrXII 394430 . T A 608.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.551;DP=109;Dels=0.00;FS=9.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.79;MQ0=0;MQRankSum=-8.801;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.235;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:638,0,1499 chrXII 394433 . C T 593.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.254;DP=111;Dels=0.00;FS=11.618;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.37;MQ0=0;MQRankSum=-8.315;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,42:111:99:623,0,1446 chrXII 394445 . A G 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.182;DP=101;Dels=0.00;FS=10.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.51;MQ0=0;MQRankSum=-6.884;QD=5.86;ReadPosRankSum=-2.050;SB=-1.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:622,0,1341 chrXII 394482 . T G 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.711;DP=118;Dels=0.00;FS=4.597;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQ0=0;MQRankSum=-4.761;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.557;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:927,0,1369 chrXII 394493 . T C 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.648;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=-4.211;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.604;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1147,0,1298 chrXII 394534 . G A 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3271,333,0 chrXII 394605 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.069;DP=129;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=2.0234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.361;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.663;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1138,0,1521 chrXII 394627 . T G 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.700;DP=135;Dels=0.00;FS=2.218;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.447;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.802;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:135:99:1227,0,1617 chrXII 394740 . C T 3727.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1420;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.33;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3727,373,0 chrXII 394760 . C T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.621;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=2.060;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1141,0,1415 chrXII 394924 . A G 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.826;DP=112;Dels=0.00;FS=11.731;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=-0.889;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.752;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:961,0,1306 chrXII 394949 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.326;DP=134;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=3.6576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=-0.074;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.772;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1327,0,1457 chrXII 394951 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.765;DP=127;Dels=0.00;FS=3.228;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=0.041;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.798;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1321,0,1268 chrXII 395049 . A G 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.385;DP=112;Dels=0.00;FS=10.864;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.396;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,44:112:99:802,0,1543 chrXII 395053 . A G 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.753;DP=112;Dels=0.00;FS=3.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.509;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:791,0,1569 chrXII 395140 . T G 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.864;DP=113;Dels=0.00;FS=2.487;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.251;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,44:113:99:744,0,1544 chrXII 395194 . A C 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.580;DP=100;Dels=0.00;FS=1.720;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:780,0,1186 chrXII 395203 . C T 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.718;DP=100;Dels=0.00;FS=4.045;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.664;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:100:99:795,0,1086 chrXII 395250 . A G 686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.190;DP=99;Dels=0.00;FS=0.756;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.429;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:716,0,1299 chrXII 395256 . T C 557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.483;DP=85;Dels=0.00;FS=0.850;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:587,0,1172 chrXII 395272 . A G 560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.469;DP=90;Dels=0.00;FS=2.921;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:590,0,1250 chrXII 395347 . A C 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.527;DP=127;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.075;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1477,0,1159 chrXII 395350 . G A 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.390;DP=127;Dels=0.00;FS=2.289;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=2.309;QD=12.80;ReadPosRankSum=1.407;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1656,0,1088 chrXII 395386 . G A 1865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.749;DP=147;Dels=0.00;FS=4.952;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,85:147:99:1895,0,1198 chrXII 395410 . T C 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;DP=141;Dels=0.00;FS=3.148;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.031;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:141:99:1717,0,1235 chrXII 395431 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.959;DP=119;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.788;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1475,0,1042 chrXII 395528 . T G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.066;DP=125;Dels=0.00;FS=3.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.588;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1273,0,1364 chrXII 395587 . G A 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.843;DP=138;Dels=0.00;FS=3.143;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1617,0,1305 chrXII 395597 . G T 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.277;DP=140;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=2.8192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1571,0,1294 chrXII 395771 . T G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.602;DP=103;Dels=0.00;FS=1.781;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.282;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1162,0,937 chrXII 395835 . G A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.240;DP=109;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.594;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1256,0,1020 chrXII 395850 . C T 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2956,306,0 chrXII 395986 . A C 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.689;DP=110;Dels=0.00;FS=4.943;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.628;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1064,0,1306 chrXII 396020 . T C 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.040;DP=113;Dels=0.00;FS=2.562;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:958,0,1453 chrXII 396106 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.494;DP=132;Dels=0.00;FS=10.991;HaplotypeScore=3.3895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.236;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1285,0,1367 chrXII 396184 . A T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;DP=120;Dels=0.00;FS=14.253;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:120:99:1117,0,1374 chrXII 396529 . T C 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.235;DP=117;Dels=0.00;FS=3.379;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.224;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1062,0,1355 chrXII 396641 . A G 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.34;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3009,315,0 chrXII 396805 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;DP=70;Dels=0.00;FS=5.138;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.193;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,43:70:99:972,0,509 chrXII 396982 . C A 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.793;DP=144;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=5.2617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.629;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,81:144:99:1786,0,1184 chrXII 397180 . A G 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3249,363,0 chrXII 397246 . C T 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3849,391,0 chrXII 397306 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.524;DP=121;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1327,0,1199 chrXII 397579 . A G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.858;DP=112;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.748;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1085,0,1237 chrXII 397756 . A G 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2834,294,0 chrXII 397759 . A G 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2859,297,0 chrXII 398152 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.706;DP=129;Dels=0.00;FS=6.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=9.48;ReadPosRankSum=2.787;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1253,0,1430 chrXII 398325 . A G 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2652,276,0 chrXII 398573 . A G 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.220;DP=113;Dels=0.00;FS=15.211;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=7.30;ReadPosRankSum=2.659;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:855,0,1529 chrXII 398693 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.122;DP=118;Dels=0.00;FS=10.060;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.124;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1250,0,1209 chrXII 398827 . A C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.652;DP=120;Dels=0.00;FS=2.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.701;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1033,0,1390 chrXII 398871 . T G 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3522,372,0 chrXII 399251 . G A 4052.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4052,400,0 chrXII 399304 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.489;DP=123;Dels=0.00;FS=3.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.211;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1133,0,1436 chrXII 399343 . T C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.864;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.421;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1143,0,1185 chrXII 399414 . G A 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.12;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3631,366,0 chrXII 399506 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.688;DP=164;Dels=0.00;FS=3.698;HaplotypeScore=5.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=3.008;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.116;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1508,0,1792 chrXII 399563 . G C 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3851,372,0 chrXII 399634 . G A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;DP=108;Dels=0.00;FS=4.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:933,0,1277 chrXII 400253 . A G 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.967;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.327;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:808,0,1337 chrXII 400418 . A G 495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;DP=65;Dels=0.00;FS=0.951;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:525,0,800 chrXII 400563 . C T 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.616;DP=96;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.188;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.444;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:852,0,1130 chrXII 400601 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.824;DP=98;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=4.4847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.684;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:963,0,1079 chrXII 400625 . C A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.414;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.938;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1097,0,1289 chrXII 400709 . T A 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3408,334,0 chrXII 400731 . A G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.667;DP=120;Dels=0.00;FS=7.214;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=2.177;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.018;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1160,0,1388 chrXII 400910 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.867;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.074;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1267,0,1401 chrXII 400931 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.047;DP=125;Dels=0.00;FS=4.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1257,0,1374 chrXII 401045 . T C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.254;DP=102;Dels=0.00;FS=3.058;HaplotypeScore=5.2930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.378;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1116,0,993 chrXII 401097 . C T 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.93;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2756,282,0 chrXII 401162 . C A 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;DP=96;Dels=0.00;FS=3.810;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,50:96:99:1039,0,921 chrXII 401489 . A G 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.591;DP=98;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=9.20;ReadPosRankSum=-2.096;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:932,0,1133 chrXII 401532 . C G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;DP=96;Dels=0.00;FS=1.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.248;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:940,0,1096 chrXII 401664 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.288;DP=107;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1239,0,965 chrXII 401837 . G C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;DP=133;Dels=0.00;FS=1.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.230;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1252,0,1344 chrXII 402030 . G T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.878;DP=140;Dels=0.00;FS=6.426;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.691;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1544,0,1366 chrXII 402189 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.065;DP=112;Dels=0.00;FS=0.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.738;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1207,0,1102 chrXII 402385 . A G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.176;DP=98;Dels=0.00;FS=2.644;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:986,0,1048 chrXII 402496 . A G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.569;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1170,0,1460 chrXII 402630 . C T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.215;DP=106;Dels=0.00;FS=2.483;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.773;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1041,0,1112 chrXII 402932 . T C 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3420,351,0 chrXII 402998 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3201,336,0 chrXII 403049 . G A 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3289,345,0 chrXII 403061 . A C 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3117,342,0 chrXII 403089 . A G 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.23;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3135,354,0 chrXII 403244 . G A 2740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.332;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2773,267,0 chrXII 403319 . G A 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3552,351,0 chrXII 403445 . C T 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2793,279,0 chrXII 403476 . C T 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3107,303,0 chrXII 403641 . C T 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.782;DP=161;Dels=0.00;FS=1.997;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=-0.902;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.156;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,74:161:99:1546,0,1801 chrXII 403669 . C T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.719;DP=141;Dels=0.00;FS=2.141;HaplotypeScore=15.5869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.013;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1590,0,1347 chrXII 403898 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.974;DP=119;Dels=0.00;FS=11.771;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.365;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1167,0,1301 chrXII 404007 . C T 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.565;DP=124;Dels=0.00;FS=7.037;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.272;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1571,0,1069 chrXII 404233 . A T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.292;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1060,0,1432 chrXII 405138 . C A 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.793;DP=133;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.270;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,52:133:99:1044,0,1767 chrXII 405208 . A C 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.484;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1077,0,1347 chrXII 405334 . C G 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;DP=118;Dels=0.00;FS=8.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1065,0,1327 chrXII 405433 . A C 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.647;DP=100;Dels=0.00;FS=3.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.956;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1002,0,1165 chrXII 405614 . G A 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.131;DP=99;Dels=0.00;FS=1.646;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:804,0,1218 chrXII 405741 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.365;DP=134;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=6.4820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=9.40;ReadPosRankSum=2.956;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1290,0,1510 chrXII 405942 . C G 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.781;DP=90;Dels=0.00;FS=9.140;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:947,0,873 chrXII 405959 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.400;DP=93;Dels=0.00;FS=6.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.519;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1066,0,903 chrXII 408423 . G C 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9588;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3195,339,0 chrXII 408647 . G A 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3402,343,0 chrXII 411473 . G T 293.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.022;DP=190;Dels=0.00;FS=21.258;HaplotypeScore=7.9318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=1;MQRankSum=-4.483;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.255;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,35:190:99:323,0,3450 chrXII 411475 . T C 276.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.164;DP=190;Dels=0.00;FS=23.991;HaplotypeScore=8.9234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=1;MQRankSum=-3.999;QD=1.45;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,35:190:99:306,0,3576 chrXII 411601 . T C 4777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7515;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=24.75;SB=-2.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,193:193:99:4777,501,0 chrXII 411634 . A G 535.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.203;DP=156;Dels=0.00;FS=7.217;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQ0=0;MQRankSum=-6.439;QD=3.43;ReadPosRankSum=-1.881;SB=-1.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,38:156:99:565,0,2685 chrXII 411637 . T C 370.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.999;DP=155;Dels=0.00;FS=12.226;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-5.767;QD=2.39;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-1.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,38:155:99:400,0,2706 chrXII 411640 . C T 374.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.992;DP=153;Dels=0.00;FS=32.803;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-6.215;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.464;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,32:153:99:404,0,2550 chrXII 411643 . T C 353.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.385;DP=155;Dels=0.01;FS=32.496;HaplotypeScore=10.6747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=-6.019;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.577;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,33:154:99:383,0,2784 chrXII 411760 . T A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.415;DP=224;Dels=0.00;FS=1.731;HaplotypeScore=5.9188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.262;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.285;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,80:224:99:1458,0,3307 chrXII 411841 . T A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;DP=237;Dels=0.00;FS=0.507;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-4.859;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.570;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,81:237:99:1436,0,3596 chrXII 411982 . C T 75.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.727;DP=180;Dels=0.00;FS=11.701;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-4.071;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,23:180:99:105,0,3388 chrXII 413007 . C G 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.304;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:2485,258,0 chrXII 414595 . G A 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3406,354,0 chrXII 417641 . C T 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3062,318,0 chrXII 417956 . G A 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3615,361,0 chrXII 418313 . A G 4201.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4201,444,0 chrXII 423854 . G C 4270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=1;QD=23.85;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4270,418,0 chrXII 424412 . G A 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3915,388,0 chrXII 424491 . T C 4523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4523,480,0 chrXII 425824 . C T 4287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=161;Dels=0.00;FS=4.510;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.764;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,160:161:99:4287,438,0 chrXII 430049 . G A 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3789,396,0 chrXII 431739 . T C 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2573,267,0 chrXII 431754 . G A 2803 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2836,279,0 chrXII 432315 . A T 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=129;Dels=0.00;FS=4.293;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=26.81;ReadPosRankSum=1.356;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3459,334,0 chrXII 432592 . C T 2153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.94;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:83:99:2186,213,0 chrXII 433340 . C T 4333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.690;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=26.58;ReadPosRankSum=-1.392;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:4333,407,0 chrXII 435111 . C G 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3212,345,0 chrXII 435472 . G A 4047.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4047,400,0 chrXII 438775 . G C 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3280,330,0 chrXII 441545 . A T 1907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=20.73;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:1940,207,0 chrXII 441925 . T C 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=1;QD=25.51;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3571,372,0 chrXII 442078 . A G 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3543,366,0 chrXII 442615 . C T 2403 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2436,240,0 chrXII 444126 . A T 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3333,342,0 chrXII 444168 . T C 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3334,354,0 chrXII 444569 . C T 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=23.30;SB=-2.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3681,376,0 chrXII 444593 . G A 3857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3857,388,0 chrXII 444668 . G A 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3673,378,0 chrXII 444770 . C T 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3716,370,0 chrXII 444806 . T C 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3274,348,0 chrXII 444929 . T C 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3030,327,0 chrXII 445043 . G A 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3095,306,0 chrXII 445082 . A C 2362 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.54;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:2395,252,0 chrXII 445085 . C T 2347 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.98;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2380,246,0 chrXII 445132 . G A 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3280,319,0 chrXII 445179 . C T 4113.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4113,403,0 chrXII 445227 . T C 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7359;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3066,324,0 chrXII 445298 . G T 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3082,315,0 chrXII 445923 . A G 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3188,330,0 chrXII 447548 . A G 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3885,408,0 chrXII 450044 . C T 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3629,352,0 chrXII 450246 . C G 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.75;SB=-2.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3861,393,0 chrXII 458989 . C T 692 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.238;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.41;MQ0=972;MQRankSum=0.000;QD=0.69;ReadPosRankSum=1.486;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,983:1000:56:725,56,0 chrXII 459039 . G A 769 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;DP=997;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.66;MQ0=965;MQRankSum=-0.217;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.433;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,956:997:66:802,66,0 chrXII 459058 . A G 1930 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2596;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.42;MQ0=917;MQRankSum=-0.888;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:78,922:1000:73:1963,73,0 chrXII 459070 . C T 2071 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.550;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.00;MQ0=924;MQRankSum=0.000;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.459;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,983:1000:99:2104,198,0 chrXII 459080 . A G 1520.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.18;MQ0=921;MQRankSum=-0.127;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.397;SB=-6.517e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,843:1000:54:1550,0,54 chrXII 459249 . C A 2461 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.240;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.76;MQ0=906;MQRankSum=0.013;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.485;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,984:1000:99:2494,223,0 chrXII 459549 . G C 5117.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.822;DP=999;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.34;MQ0=638;MQRankSum=-0.587;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.200;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,979:999:99:5117,426,0 chrXII 460070 . A C 20284.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.688;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=1.757;HaplotypeScore=7.8228;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.257;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.169;SB=-9.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,977:1000:99:20284,1947,0 chrXII 460094 . A G 20828.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.842;DP=998;DS;Dels=0.00;FS=20.767;HaplotypeScore=7.0592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=20.87;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-2.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:62,934:998:99:20828,1347,0 chrXII 460115 . A T 24606.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=8.167;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.891;QD=24.61;ReadPosRankSum=2.577;SB=-1.081e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,967:1000:99:24606,1959,0 chrXII 460152 . T G 22917.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=36.429;HaplotypeScore=11.2168;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.84;MQ0=1;MQRankSum=-7.590;QD=22.92;ReadPosRankSum=3.451;SB=-6.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:48,951:999:99:22917,1594,0 chrXII 460162 . T C 15436.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-13.145;DP=997;DS;Dels=0.00;FS=20.242;HaplotypeScore=11.3989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.48;MQ0=0;MQRankSum=-12.267;QD=15.48;ReadPosRankSum=4.878;SB=-7.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:69,926:997:99:15436,317,0 chrXII 460262 . G A 4634.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.029;DP=998;DS;Dels=0.00;FS=1.988;HaplotypeScore=513.6719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=4.64;ReadPosRankSum=-11.802;SB=-2.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,681:998:99:4634,0,6574 chrXII 460329 . T C 18958.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.740;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=10.438;HaplotypeScore=7.0253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=18.96;ReadPosRankSum=4.301;SB=-8.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,847:1000:99:18958,0,630 chrXII 460549 . C A 22391.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.011;DP=994;DS;Dels=0.00;FS=19.422;HaplotypeScore=11.7229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.40;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.047;SB=-1.200e+04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,966:994:99:22391,1826,0 chrXII 460640 . T C 9990.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-10.552;DP=999;DS;Dels=0.00;FS=7.885;HaplotypeScore=21.0183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.55;MQ0=379;MQRankSum=0.430;QD=10.00;ReadPosRankSum=2.460;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:53,946:999:99:9990,264,0 chrXII 460659 . C T 8689.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=994;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=63.1347;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.51;MQ0=136;QD=8.74;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,994:994:99:8689,987,0 chrXII 460688 . A G 2997.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-14.838;DP=1000;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=134.0332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.17;MQ0=34;MQRankSum=-0.243;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,838:1000:99:3027,0,287 chrXII 460824 . A G 3723.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.705;DP=999;DS;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.96;MQ0=841;MQRankSum=-0.030;QD=3.73;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,971:999:99:3723,323,0 chrXII 490443 . A G 827 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.73;MQ0=5;QD=20.67;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:40:96:860,96,0 chrXII 490487 . T C 1207 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.76;MQ0=4;QD=21.55;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,52:56:99:1240,135,0 chrXII 490584 . A G 4107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.88;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4107,426,0 chrXII 490641 . A G 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.04;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3547,366,0 chrXII 490736 . T G 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3082,330,0 chrXII 490778 . A G 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3451,372,0 chrXII 490779 . A G 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3330,369,0 chrXII 490822 . G C 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3445,378,0 chrXII 490994 . G A 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.03;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2820,297,0 chrXII 491056 . C T 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.93;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3384,348,0 chrXII 491075 . A G 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.93;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3770,405,0 chrXII 491084 . T C 4186.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.12;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4186,444,0 chrXII 491106 . G A 4594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.23;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4594,478,0 chrXII 491119 . C G 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3624,393,0 chrXII 491187 . C T 4301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:168:99:4301,430,0 chrXII 491269 . A G 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=25.47;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3064,336,0 chrXII 491270 . A G 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.499;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.10;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3020,311,0 chrXII 491307 . C T 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3164,327,0 chrXII 491511 . C T 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=115.8469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.45;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3916,405,0 chrXII 491674 . T C 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6515;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.03;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2840,303,0 chrXII 491685 . T G 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.23;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2671,288,0 chrXII 491704 . T C 2453 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=20.97;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2486,270,0 chrXII 491710 . G T 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.387;DP=118;Dels=0.00;FS=6.673;HaplotypeScore=2.5220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=21.75;ReadPosRankSum=1.762;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,116:118:99:2600,273,0 chrXII 491810 . A G 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.74;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2970,315,0 chrXII 491842 . G A 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.72;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2892,306,0 chrXII 491851 . A T 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2857,303,0 chrXII 491881 . T C 2382 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.95;MQ0=0;QD=21.08;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2415,264,0 chrXII 491884 . T C 2359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.64;MQ0=0;QD=20.51;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2392,261,0 chrXII 491896 . T A 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.90;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3271,339,0 chrXII 492575 . T C 2720 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4573;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=23.05;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2753,291,0 chrXII 493579 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3266,333,0 chrXII 493681 . G A 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3207,316,0 chrXII 493693 . A G 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3384,339,0 chrXII 493774 . T C 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3099,321,0 chrXII 493842 . C A 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2872,288,0 chrXII 493918 . A G 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3413,363,0 chrXII 494317 . T C 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2754,294,0 chrXII 494491 . A G 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2729,279,0 chrXII 494709 . G A 2377 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.76;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2410,249,0 chrXII 494711 . C T 2405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.05;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2438,249,0 chrXII 494889 . A G 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2969,303,0 chrXII 495002 . C G 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=23.21;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3143,333,0 chrXII 495344 . A C 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.13;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3310,345,0 chrXII 495807 . A G 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3493,369,0 chrXII 495892 . T A 2525 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2558,264,0 chrXII 496218 . T C 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.90;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2523,267,0 chrXII 496434 . C T 4313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=162;Dels=0.00;FS=4.171;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=26.62;ReadPosRankSum=0.941;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4313,436,0 chrXII 496701 . C T 3687.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3687,372,0 chrXII 496835 . A G 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3844,396,0 chrXII 496986 . T C 2627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2660,276,0 chrXII 497405 . T C 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2679,276,0 chrXII 497835 . T C 2658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2691,288,0 chrXII 497970 . T C 2445 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;DP=100;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=24.45;ReadPosRankSum=1.420;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2478,270,0 chrXII 498271 . T C 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3593,381,0 chrXII 498294 . T A 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3637,364,0 chrXII 498457 . T C 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3108;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2642,273,0 chrXII 498746 . C T 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.13;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2834,288,0 chrXII 498921 . A G 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3313,339,0 chrXII 499674 . A G 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2601,288,0 chrXII 500275 . G T 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2598,261,0 chrXII 500303 . C T 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3195,318,0 chrXII 500366 . C T 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2970,306,0 chrXII 500416 . C G 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3183,333,0 chrXII 500522 . C T 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3402,354,0 chrXII 500577 . T C 3971.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3971,405,0 chrXII 500587 . A G 4098.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4098,414,0 chrXII 500740 . G A 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3816,376,0 chrXII 500806 . G A 4307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4307,427,0 chrXII 500833 . T C 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3315,351,0 chrXII 500887 . T C 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3563,372,0 chrXII 501100 . C T 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3437,349,0 chrXII 501434 . T G 2037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=22.63;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:90:99:2070,231,0 chrXII 501512 . G A 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3177,315,0 chrXII 501527 . A G 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.22;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2959,306,0 chrXII 501622 . G A 2264 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.16;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2297,222,0 chrXII 501644 . A G 1980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=22.76;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:87:99:2013,216,0 chrXII 501701 . T C 2507 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=106;Dels=0.00;FS=3.263;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=23.65;ReadPosRankSum=0.458;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2540,267,0 chrXII 501734 . T C 2440 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2473,261,0 chrXII 502072 . G A 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3801,394,0 chrXII 502281 . G A 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3315,331,0 chrXII 502331 . G A 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.73;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3849,391,0 chrXII 502353 . A G 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.69;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3777,399,0 chrXII 502411 . A G 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3489,366,0 chrXII 502531 . C T 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.650;DP=126;Dels=0.00;FS=3.844;HaplotypeScore=4.7994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.457;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3298,298,0 chrXII 502604 . G A 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2879,288,0 chrXII 502625 . G A 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2990,300,0 chrXII 502894 . A T 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2838,291,0 chrXII 502957 . C T 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3983,403,0 chrXII 503086 . A G 2488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2521,267,0 chrXII 503164 . C T 2320 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.07;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2353,246,0 chrXII 503193 . A G 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2767,303,0 chrXII 503204 . G A 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2863,294,0 chrXII 503241 . C T 2757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2790,291,0 chrXII 503302 . G A 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3854,408,0 chrXII 503456 . A G 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3171,327,0 chrXII 503512 . G C 3913.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3913,426,0 chrXII 503710 . A G 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3710,408,0 chrXII 503839 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3265,339,0 chrXII 503902 . C T 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3644,364,0 chrXII 504219 . C T 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3296,336,0 chrXII 504528 . G A 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3340,334,0 chrXII 504665 . A G 3911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.980e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3911,408,0 chrXII 505593 . G A 4551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4551,451,0 chrXII 505673 . C T 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3479,355,0 chrXII 505760 . C T 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3088,306,0 chrXII 505886 . A G 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.99;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3204,336,0 chrXII 505926 . C T 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.80;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3206,327,0 chrXII 505937 . T A 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.67;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2796,285,0 chrXII 506247 . T C 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3737,399,0 chrXII 506310 . T A 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2405;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3657,370,0 chrXII 506556 . C T 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3736,373,0 chrXII 507075 . C T 4181.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.97;SB=-2.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4181,415,0 chrXII 507081 . C T 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3834,388,0 chrXII 507213 . G A 4535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4535,460,0 chrXII 507486 . A C 1316 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.89;MQ0=0;QD=19.64;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1349,153,0 chrXII 508294 . G A 2238 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.936;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=25.43;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:88:99:2271,204,0 chrXII 509114 . A G 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3213;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.994e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4021,411,0 chrXII 509279 . G A 4189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4189,415,0 chrXII 509324 . T C 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3116,339,0 chrXII 509342 . G A 4015.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4015,418,0 chrXII 509438 . A C 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3704,420,0 chrXII 509592 . T C 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.54;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3435,378,0 chrXII 509612 . C A 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6079;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.13;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:130:99:3397,357,0 chrXII 509642 . G A 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3975,411,0 chrXII 509653 . C T 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3564,363,0 chrXII 509796 . G C 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=23.27;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3467,396,0 chrXII 510308 . T A 2781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=120;Dels=0.00;FS=6.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.559;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:2814,282,0 chrXII 510379 . T C 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.86;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3619,399,0 chrXII 510430 . A G 34.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-9.609;DP=157;Dels=0.00;FS=73.131;HaplotypeScore=3.9408;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=0.22;ReadPosRankSum=-4.646;SB=-9.797e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:106,51:157:9:67,9,0 chrXII 510469 . T C 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.29;MQ0=0;QD=21.37;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2597,300,0 chrXII 510486 . T A 1990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.82;MQ0=0;QD=23.98;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2023,216,0 chrXII 510537 . C T 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=8.92;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 chrXII 510538 . C A 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=8.92;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 chrXII 510540 . C G 45.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.77;MQ0=0;QD=15.32;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:78,9,0 chrXII 510559 . C T 827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.91;MQ0=0;QD=10.09;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:93:860,93,0 chrXII 510901 . C T 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2995,300,0 chrXII 511071 . A C 3983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3983,420,0 chrXII 511090 . T C 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.23;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4012,435,0 chrXII 511197 . C T 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3598,378,0 chrXII 511233 . T A 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3196,333,0 chrXII 511423 . C G 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3664,399,0 chrXII 511441 . T C 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3522,378,0 chrXII 511512 . A T 2445 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=72.4881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.56;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2478,258,0 chrXII 511683 . A G 4115.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6335;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4115,432,0 chrXII 511697 . C G 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3680,390,0 chrXII 511773 . C T 4873.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:4873,487,0 chrXII 511884 . C T 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3798,391,0 chrXII 512637 . C T 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3394,342,0 chrXII 512877 . C T 3925.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3925,400,0 chrXII 513001 . A T 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3002,300,0 chrXII 513012 . C T 2665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2698,273,0 chrXII 513092 . T A 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3327,322,0 chrXII 513887 . T C 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3851,384,0 chrXII 514007 . A G 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.639;DP=192;Dels=0.00;FS=12.532;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=0.11;ReadPosRankSum=-2.869;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,3:192:51:51,0,82 chrXII 514008 . A G 47.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;DP=192;Dels=0.00;FS=12.532;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=1.874;QD=0.24;ReadPosRankSum=2.880;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,189:192:52:77,0,52 chrXII 514581 . G C 2406 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=1;QD=25.33;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2439,270,0 chrXII 514739 . T A 4154.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4154,418,0 chrXII 514740 . C G 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4061,418,0 chrXII 514832 . G A 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3703,367,0 chrXII 514988 . C T 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=1;QD=24.00;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2601,267,0 chrXII 515239 . G T 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3600,369,0 chrXII 516197 . G A 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.834e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3547,363,0 chrXII 516236 . G T 3939.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3939,388,0 chrXII 517114 . A G 4105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4105,444,0 chrXII 517338 . A G 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3599,396,0 chrXII 519256 . T C 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3330,360,0 chrXII 520061 . C A 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8379;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3134,327,0 chrXII 520774 . T C 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3130,345,0 chrXII 520933 . T C 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3645,393,0 chrXII 521905 . A G 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3826,393,0 chrXII 522608 . A G 4049.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4049,408,0 chrXII 522914 . G C 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3162,330,0 chrXII 522946 . A G 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3319,342,0 chrXII 523174 . C T 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3175,333,0 chrXII 523357 . G A 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2771,282,0 chrXII 524814 . G A 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3131,318,0 chrXII 524918 . A G 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2841,297,0 chrXII 525196 . C T 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=1;QD=26.78;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3455,351,0 chrXII 525385 . T G 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2798,309,0 chrXII 525417 . C A 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3106,318,0 chrXII 525539 . G A 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3223,327,0 chrXII 525791 . G A 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3653,378,0 chrXII 525800 . T C 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=22.89;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3100,354,0 chrXII 526192 . A G 2414 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=24.63;ReadPosRankSum=1.589;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2447,258,0 chrXII 526230 . A T 3862.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3862,388,0 chrXII 526265 . G A 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.975e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3650,369,0 chrXII 526330 . C T 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3506,358,0 chrXII 526397 . C T 4036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4036,406,0 chrXII 526414 . C T 4190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.03;SB=-2.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4190,415,0 chrXII 526550 . T A 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.10;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3087,318,0 chrXII 526685 . C G 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3007,324,0 chrXII 526779 . T C 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3184,333,0 chrXII 526817 . C T 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3421,345,0 chrXII 526820 . C T 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3551,369,0 chrXII 526847 . T A 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.80;SB=-2.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3947,403,0 chrXII 526922 . G A 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3779,382,0 chrXII 527012 . A G 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3102,321,0 chrXII 527035 . C T 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3438,343,0 chrXII 527111 . T C 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3155,330,0 chrXII 527419 . T G 2435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2468,255,0 chrXII 527582 . G C 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2953,312,0 chrXII 527715 . T C 2326 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2359,246,0 chrXII 527873 . G A 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=107;Dels=0.00;FS=5.380;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=26.75;ReadPosRankSum=-1.052;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2895,294,0 chrXII 528191 . T A 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3161,316,0 chrXII 528743 . T C 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.72;SB=-2.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3819,417,0 chrXII 528749 . T A 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.17;SB=-2.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3747,387,0 chrXII 529055 . G A 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4011,391,0 chrXII 529568 . T C 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.41;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2467,264,0 chrXII 529574 . G A 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2729,285,0 chrXII 529586 . A G 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.18;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2630,276,0 chrXII 529715 . C T 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3154,318,0 chrXII 530015 . G A 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3595,370,0 chrXII 530261 . C T 3917.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3917,394,0 chrXII 530350 . T G 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3601,369,0 chrXII 530377 . G A 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3813,385,0 chrXII 530558 . T C 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=22.24;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2746,297,0 chrXII 530780 . T A 2473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2506,249,0 chrXII 531361 . A G 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.73;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2976,333,0 chrXII 531751 . T C 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3331,360,0 chrXII 531796 . T A 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3625,364,0 chrXII 531820 . T C 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3543,366,0 chrXII 531847 . T C 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3849,420,0 chrXII 532084 . C T 4517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4517,463,0 chrXII 532146 . T G 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3671,408,0 chrXII 532381 . A G 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3227,333,0 chrXII 532540 . A G 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4200;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:126:99:3102,315,0 chrXII 532555 . C G 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2922,297,0 chrXII 532723 . G A 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3791,385,0 chrXII 532747 . A G 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=25.40;ReadPosRankSum=-1.076;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3353,345,0 chrXII 532789 . G A 3917.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.29;SB=-2.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3917,393,0 chrXII 532861 . A G 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6443;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3733,399,0 chrXII 532984 . A G 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.86;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2645,273,0 chrXII 533081 . A G 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3368,372,0 chrXII 534544 . G A 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3384,348,0 chrXII 534602 . A G 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3138,336,0 chrXII 534690 . A G 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2973,315,0 chrXII 534832 . G A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3261,324,0 chrXII 535013 . C T 4042.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4042,412,0 chrXII 535065 . A T 4207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.14;SB=-2.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4207,415,0 chrXII 535113 . T C 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2879,318,0 chrXII 535290 . G A 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2865,282,0 chrXII 535340 . T C 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3553,372,0 chrXII 535533 . G A 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3371,348,0 chrXII 535537 . T C 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3039,324,0 chrXII 535603 . C T 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3333,331,0 chrXII 535696 . A G 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3055,324,0 chrXII 535711 . C A 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3109,310,0 chrXII 535744 . G A 3935.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.59;SB=-2.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3935,400,0 chrXII 535963 . G A 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.82;SB=-2.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3822,373,0 chrXII 536245 . T A 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2028;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.628;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3456,338,0 chrXII 536332 . C T 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3589,364,0 chrXII 536548 . T C 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2969,306,0 chrXII 536776 . C T 3896.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3896,400,0 chrXII 536833 . A G 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3603,384,0 chrXII 536867 . C T 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3483,343,0 chrXII 536876 . T A 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=94.7178;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3358,334,0 chrXII 536931 . C T 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3013,303,0 chrXII 537250 . C T 4566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4566,457,0 chrXII 537901 . A G 2383 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2416,252,0 chrXII 538387 . A G 3942.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3942,399,0 chrXII 538762 . G A 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3283,324,0 chrXII 539905 . G A 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2839,285,0 chrXII 539923 . T C 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2966,309,0 chrXII 539979 . G A 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3166,324,0 chrXII 540557 . T C 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.18;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3288,348,0 chrXII 540690 . A G 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1290;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=2;MQRankSum=0.638;QD=25.19;ReadPosRankSum=1.253;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:3880,396,0 chrXII 540824 . A G 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3382,348,0 chrXII 540965 . C T 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3874,400,0 chrXII 541001 . C T 4611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4611,451,0 chrXII 541018 . G C 4385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:172:99:4385,436,0 chrXII 541115 . A G 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2804,306,0 chrXII 541213 . C A 4481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4481,454,0 chrXII 541773 . C T 2389 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2422,252,0 chrXII 543095 . G T 202.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.488;DP=122;Dels=0.00;FS=135.982;HaplotypeScore=3.8458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.061;QD=1.66;ReadPosRankSum=-4.648;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,46:122:99:232,0,1223 chrXII 543240 . T C 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2693,285,0 chrXII 543480 . G A 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3354;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3535,355,0 chrXII 543940 . A C 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3202,333,0 chrXII 544246 . G A 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3683,375,0 chrXII 544316 . A G 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=130;Dels=0.00;FS=3.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=25.85;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3360,357,0 chrXII 544840 . C A 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.04;SB=-2.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4081,412,0 chrXII 545104 . G A 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3239,336,0 chrXII 545130 . G A 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3119,321,0 chrXII 545221 . G A 3896.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3896,388,0 chrXII 545338 . T A 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3682,373,0 chrXII 545567 . A C 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3367,339,0 chrXII 545673 . G A 4154.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4154,412,0 chrXII 545998 . C A 2481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.62;MQ0=0;QD=23.19;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2514,261,0 chrXII 546249 . A C 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3077,318,0 chrXII 546382 . A G 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3032,324,0 chrXII 547572 . A G 2389 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2422,258,0 chrXII 547847 . C T 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2637,267,0 chrXII 548297 . C T 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9411;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3535,355,0 chrXII 548327 . A G 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3627,402,0 chrXII 548452 . A G 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3097,324,0 chrXII 548551 . G A 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2830,276,0 chrXII 548709 . C T 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3758,390,0 chrXII 548742 . A G 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3348,363,0 chrXII 549170 . C T 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3380,357,0 chrXII 549297 . A G 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2956,315,0 chrXII 549369 . G C 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2794,300,0 chrXII 549562 . A G 2384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.40;MQ0=0;QD=19.87;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2417,258,0 chrXII 549570 . C T 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.45;MQ0=0;QD=21.33;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2571,270,0 chrXII 549589 . A G 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.13;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3282,348,0 chrXII 549694 . A G 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3040,333,0 chrXII 549760 . G A 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3233,327,0 chrXII 550279 . A C 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3393,342,0 chrXII 550665 . T C 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2858,318,0 chrXII 550771 . C T 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3189,327,0 chrXII 550837 . G A 4127.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9460;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.29;SB=-2.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:4127,418,0 chrXII 550965 . G C 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3391,357,0 chrXII 551033 . G A 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3630,364,0 chrXII 551145 . G A 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3700,370,0 chrXII 551454 . T C 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3719,405,0 chrXII 551535 . C T 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6355;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3539,360,0 chrXII 551847 . C T 4630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.46;SB=-2.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4630,457,0 chrXII 552056 . A G 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3299,357,0 chrXII 552323 . T G 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4051,429,0 chrXII 552618 . A G 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3054,327,0 chrXII 552649 . C G 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3365,348,0 chrXII 552832 . C T 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.06;MQ0=0;QD=27.28;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2979,309,0 chrXII 553063 . A G 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3417,360,0 chrXII 553294 . C A 3978.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=25.50;SB=-2.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:3978,391,0 chrXII 553360 . C G 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3091,318,0 chrXII 553658 . G A 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2962;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.34;MQ0=0;QD=24.35;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3053,315,0 chrXII 553728 . G A 1636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6910;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.35;MQ0=0;QD=16.36;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:1669,174,0 chrXII 553789 . A G 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.88;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3856,385,0 chrXII 553790 . C A 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=26.76;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3987,382,0 chrXII 553806 . A G 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=22.56;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3723,360,0 chrXII 554262 . G T 4166.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.0224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4166,421,0 chrXII 554679 . A G 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3330,375,0 chrXII 554694 . C G 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5241;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3412,351,0 chrXII 554937 . A G 4271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4271,447,0 chrXII 554971 . T C 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3786,402,0 chrXII 555034 . A G 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3885,408,0 chrXII 555043 . G T 4166.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4166,418,0 chrXII 555075 . G A 3859.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3859,382,0 chrXII 555432 . T G 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2920,327,0 chrXII 555570 . A G 156.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.558;DP=116;Dels=0.00;FS=7.406;HaplotypeScore=162.0902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=1.34;ReadPosRankSum=-5.769;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,16:116:99:186,0,372 chrXII 555573 . A G 408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=3.74;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:51:441,51,0 chrXII 555688 . G C 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3673,381,0 chrXII 555957 . G A 3800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3800,379,0 chrXII 555993 . A G 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3361,357,0 chrXII 556056 . C T 3970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.29;SB=-2.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3970,391,0 chrXII 556347 . G A 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3645,358,0 chrXII 556472 . T C 71.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;DP=120;Dels=0.03;FS=52.185;HaplotypeScore=109.3651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=0.59;ReadPosRankSum=3.141;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:101,0,1096 chrXII 556583 . C T 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=111.1484;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.34;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3471,346,0 chrXII 556879 . G A 4350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4350,436,0 chrXII 557249 . C T 4163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.536;DP=159;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=26.18;ReadPosRankSum=1.166;SB=-2.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:4163,438,0 chrXII 557420 . A G 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3678,375,0 chrXII 557852 . G A 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3803,394,0 chrXII 557861 . C G 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3577,375,0 chrXII 557979 . C T 4478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8662;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4478,445,0 chrXII 558134 . C T 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2998,309,0 chrXII 558341 . T C 3930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3930,417,0 chrXII 558665 . C T 4680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=175;Dels=0.00;FS=3.797;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=26.74;ReadPosRankSum=0.366;SB=-2.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,174:175:99:4680,454,0 chrXII 558890 . T C 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.725;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=24.22;ReadPosRankSum=0.074;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2867,279,0 chrXII 558945 . C T 4153.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.111;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=26.62;ReadPosRankSum=0.200;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:4153,398,0 chrXII 559835 . T C 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3589,393,0 chrXII 559898 . G A 4419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6732;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:168:99:4419,451,0 chrXII 560519 . G A 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2783,282,0 chrXII 560760 . C T 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3982,409,0 chrXII 561120 . G A 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=1;QD=26.55;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2794,291,0 chrXII 561666 . C T 2173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2206,225,0 chrXII 562305 . C G 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3541,372,0 chrXII 563770 . G A 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3203,318,0 chrXII 564068 . T C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.87;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3389,348,0 chrXII 564107 . A T 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3421,360,0 chrXII 564356 . C T 3842.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3842,376,0 chrXII 565153 . A G 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3439,357,0 chrXII 565274 . G T 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3826,379,0 chrXII 565346 . A G 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4012,426,0 chrXII 565625 . A G 4207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4207,432,0 chrXII 566015 . T C 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3336,342,0 chrXII 566168 . C T 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3448,349,0 chrXII 566301 . T C 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2987,327,0 chrXII 566468 . G T 2492 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2525,261,0 chrXII 566515 . G A 4037.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4037,415,0 chrXII 566615 . T C 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3988,417,0 chrXII 566944 . G T 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3360,336,0 chrXII 567011 . T C 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.80;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3596,366,0 chrXII 567232 . G A 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3510,363,0 chrXII 567293 . T C 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:2936,309,0 chrXII 567305 . A C 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=23.02;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2565,282,0 chrXII 567321 . G A 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3023,318,0 chrXII 567366 . G A 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3625;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3280,336,0 chrXII 567428 . G C 2480 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2513,264,0 chrXII 567485 . T C 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3113,309,0 chrXII 567725 . G A 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2657,273,0 chrXII 567740 . G A 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5239;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2914,300,0 chrXII 567878 . G A 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3230,325,0 chrXII 567889 . C T 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3234,327,0 chrXII 567957 . C T 2445 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2478,255,0 chrXII 567995 . G A 2068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7419;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2101,216,0 chrXII 568092 . A G 2213 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=21.70;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2246,240,0 chrXII 568114 . A T 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=90.8518;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.32;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2602,273,0 chrXII 568449 . A T 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3251,327,0 chrXII 568546 . G A 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3681,381,0 chrXII 568917 . T C 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3745,381,0 chrXII 569539 . C T 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2885,294,0 chrXII 569580 . G A 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3157,313,0 chrXII 570154 . C T 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2995,306,0 chrXII 570426 . T C 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3186,324,0 chrXII 570428 . A C 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3217,318,0 chrXII 570676 . T C 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2534,264,0 chrXII 570786 . T C 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3192,333,0 chrXII 570914 . G A 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3393,351,0 chrXII 571066 . C T 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3166,330,0 chrXII 571412 . C T 3907.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.54;SB=-2.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3907,388,0 chrXII 571562 . C T 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3451,328,0 chrXII 571751 . T C 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3010,333,0 chrXII 571755 . A G 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3097,336,0 chrXII 571826 . A G 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.44;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3484,372,0 chrXII 572011 . G A 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3513,349,0 chrXII 572164 . T C 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3716,369,0 chrXII 572186 . A G 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.31;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2893,315,0 chrXII 572294 . G A 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3551,360,0 chrXII 572620 . C A 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8189;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3114,306,0 chrXII 572946 . T C 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3400,360,0 chrXII 574459 . G A 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.973e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3847,393,0 chrXII 574666 . A G 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1968;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3281,360,0 chrXII 574950 . T C 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.51;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2839,288,0 chrXII 574980 . C G 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3347,345,0 chrXII 575257 . C A 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3787,396,0 chrXII 575473 . T G 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3045,339,0 chrXII 575719 . C A 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3706,376,0 chrXII 576016 . G A 4654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.90;SB=-2.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4654,472,0 chrXII 576037 . G A 4155.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.70;SB=-2.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4155,424,0 chrXII 577917 . C A 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3239,330,0 chrXII 579749 . T G 2413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2446,255,0 chrXII 579759 . A G 2415 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2448,255,0 chrXII 579898 . G A 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3874,391,0 chrXII 580383 . A G 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2904,294,0 chrXII 581412 . T G 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2696,306,0 chrXII 581415 . G A 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2942,306,0 chrXII 581964 . G A 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2674,273,0 chrXII 585567 . C G 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=109;Dels=0.00;FS=5.149;HaplotypeScore=3.9014;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.802;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:109:99:2792,291,0 chrXII 585608 . T G 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.35;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2948,309,0 chrXII 585709 . A T 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3304,331,0 chrXII 585942 . A T 64.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.872;DP=141;Dels=0.01;FS=80.302;HaplotypeScore=141.7948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.96;MQ0=0;MQRankSum=-4.455;QD=0.45;ReadPosRankSum=2.453;SB=-6.528e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,12:140:54:94,0,54 chrXII 586124 . G A 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3390,351,0 chrXII 586163 . T C 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=25.56;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3323,351,0 chrXII 586255 . T C 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.57;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3094,324,0 chrXII 586284 . C T 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3435,348,0 chrXII 586855 . C T 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3748,376,0 chrXII 586892 . G A 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3121,306,0 chrXII 586907 . T C 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3026,318,0 chrXII 587018 . C T 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3143,312,0 chrXII 587176 . G A 4530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:172:99:4530,436,0 chrXII 587297 . G A 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3084,321,0 chrXII 587519 . T C 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=23.74;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3537,375,0 chrXII 587824 . C T 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3305,345,0 chrXII 587884 . C T 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2948,294,0 chrXII 587977 . G T 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5009;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:3025,315,0 chrXII 588163 . C T 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3253,339,0 chrXII 588394 . T C 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2871,309,0 chrXII 588421 . C T 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3274,336,0 chrXII 589024 . A G 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3144,336,0 chrXII 589093 . C A 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=118.9595;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3355,343,0 chrXII 589169 . C A 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3227,324,0 chrXII 589177 . C A 2758 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2791,273,0 chrXII 589319 . T G 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2675,288,0 chrXII 589339 . T C 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3359,351,0 chrXII 589413 . G A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3297,325,0 chrXII 589563 . A G 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2909,294,0 chrXII 589773 . G T 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3675,379,0 chrXII 589830 . T C 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.89;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3010,312,0 chrXII 590013 . A G 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3219,330,0 chrXII 590017 . T C 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3475,354,0 chrXII 590125 . T A 4232.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4232,442,0 chrXII 590868 . T G 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=22.91;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3240,339,0 chrXII 591222 . T A 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.16;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2574,267,0 chrXII 591465 . A T 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3245,330,0 chrXII 591568 . G T 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3095,316,0 chrXII 591955 . G T 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2927,291,0 chrXII 591978 . C A 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3493,360,0 chrXII 592223 . C T 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.680;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,131:133:99:3485,343,0 chrXII 592353 . G A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3297,336,0 chrXII 592578 . C T 2174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.89;MQ0=0;QD=24.99;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2207,231,0 chrXII 593144 . A C 42.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.53;SB=-9.818e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:9:75,9,0 chrXII 593188 . A G 129.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=4.30;SB=-1.420e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:30:18:162,18,0 chrXII 593306 . A T 237 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.06;MQ0=1;QD=21.55;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:30:270,30,0 chrXII 593318 . T C 168.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.85;MQ0=1;QD=18.67;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:24:201,24,0 chrXII 598602 . C T 52.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.50;MQ0=9;QD=4.41;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:12:9:85,9,0 chrXII 598739 . G A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 chrXII 598772 . A G 69.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.38;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:102,12,0 chrXII 598890 . A T 507 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.30;MQ0=1;QD=24.14;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:57:540,57,0 chrXII 598968 . T C 150.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.20;MQ0=1;QD=18.76;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:21:183,21,0 chrXII 598986 . T C 155.20 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.26;MQ0=1;MQRankSum=-0.751;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.751;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:2:184,0,2 chrXII 598987 . A T 163.46 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.26;MQ0=1;MQRankSum=-0.751;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.751;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:1:192,0,1 chrXII 598992 . G A 115.42 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.55;MQ0=1;MQRankSum=-1.739;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-1.301e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:7:145,0,7 chrXII 598993 . T C 112.34 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.55;MQ0=1;MQRankSum=-1.739;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-8.044e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:8:142,0,8 chrXII 599008 . A T 476 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.502;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=15.87;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-1.087e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:33:509,33,0 chrXII 599017 . C T 486 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-1.087e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:33:519,33,0 chrXII 599020 . C A 482 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=16.07;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-1.087e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:33:515,33,0 chrXII 599046 . C A 589 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.019;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=17.32;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-6.865e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:44:622,44,0 chrXII 599056 . T A 557 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.612;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=16.38;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-7.209e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:41:590,41,0 chrXII 599059 . C T 562 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.893;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=17.03;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-7.209e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:41:595,41,0 chrXII 599143 . A G 1832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.67;MQ0=0;QD=24.76;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1865,195,0 chrXII 599195 . T C 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.92;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2623,276,0 chrXII 599206 . A C 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.52;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2769,285,0 chrXII 599406 . G A 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3118,318,0 chrXII 599482 . G T 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2854,285,0 chrXII 599602 . G A 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.325;DP=128;Dels=0.00;FS=5.161;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.298;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3410,326,0 chrXII 599667 . G A 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2944,303,0 chrXII 599986 . C T 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2775,279,0 chrXII 600107 . C T 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4061,415,0 chrXII 600505 . T C 2823 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2856,303,0 chrXII 600509 . C T 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3045,312,0 chrXII 601489 . A G 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3458,366,0 chrXII 602218 . T C 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:2960,297,0 chrXII 602357 . A T 2464 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2497,261,0 chrXII 603319 . A G 1798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=23.66;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1831,195,0 chrXII 603584 . T A 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3596,357,0 chrXII 604223 . C T 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3350,339,0 chrXII 604895 . A C 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3102,315,0 chrXII 605256 . G A 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3718,379,0 chrXII 605478 . G A 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3162,315,0 chrXII 605679 . T A 4002.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=605.9282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4002,397,0 chrXII 605792 . A G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1471;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3168,342,0 chrXII 605998 . T C 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2857,318,0 chrXII 607250 . T C 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3866,414,0 chrXII 607420 . T C 4454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.90;SB=-2.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4454,465,0 chrXII 607680 . A G 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2629,297,0 chrXII 607923 . T C 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.75;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3451,366,0 chrXII 608154 . C T 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.24;SB=-2.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3858,391,0 chrXII 608155 . C T 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.05;SB=-2.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3830,388,0 chrXII 608472 . C T 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3448,354,0 chrXII 608666 . C T 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2917,300,0 chrXII 608673 . C T 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2914,300,0 chrXII 608685 . T C 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=26.25;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2789,294,0 chrXII 608709 . A G 2665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2698,291,0 chrXII 608724 . C T 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2760,297,0 chrXII 608748 . G A 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3332,331,0 chrXII 608774 . T C 3907.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3907,399,0 chrXII 608886 . G T 4743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4743,490,0 chrXII 609039 . T C 4094.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4094,420,0 chrXII 609087 . G A 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3445,358,0 chrXII 609126 . C T 4163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4163,424,0 chrXII 609213 . A G 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3603,372,0 chrXII 609308 . G A 4274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:4274,433,0 chrXII 609380 . G A 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3696,367,0 chrXII 609488 . A T 4166.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4166,418,0 chrXII 609555 . A G 3871.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.16;SB=-2.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3871,396,0 chrXII 609572 . A G 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3653,387,0 chrXII 609589 . G T 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3651,373,0 chrXII 609688 . C T 4700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4700,463,0 chrXII 609791 . G A 5525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.0863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=26.06;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-2.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,211:212:99:5525,568,0 chrXII 611179 . T C 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3737,414,0 chrXII 611769 . C T 4806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.16;SB=-2.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4806,487,0 chrXII 611779 . A G 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.35;SB=-2.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3945,429,0 chrXII 611812 . T A 4281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.26;SB=-2.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4281,445,0 chrXII 611853 . C G 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3515,375,0 chrXII 611973 . G A 4161.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4161,421,0 chrXII 611994 . A G 4214.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4214,447,0 chrXII 612183 . A G 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3512,372,0 chrXII 612202 . A G 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3491,375,0 chrXII 612214 . T C 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=25.38;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3452,372,0 chrXII 612238 . C T 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3830,403,0 chrXII 612358 . T C 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3502,366,0 chrXII 612479 . C T 4534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4534,454,0 chrXII 612516 . T C 4663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4663,484,0 chrXII 612541 . G A 4558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4558,466,0 chrXII 612562 . T G 4627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4627,483,0 chrXII 612708 . T C 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3846,414,0 chrXII 612784 . G T 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3590,372,0 chrXII 613011 . C T 4623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.13;SB=-2.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4623,463,0 chrXII 613200 . T A 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3921,388,0 chrXII 613292 . A T 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3312,331,0 chrXII 613464 . T C 2111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5350;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.95;MQ0=0;QD=22.22;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2144,225,0 chrXII 613593 . C T 470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.25;MQ0=1;QD=13.82;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:54:503,54,0 chrXII 613597 . T G 176.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.90;MQ0=1;QD=6.07;SB=-4.041e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:24:209,24,0 chrXII 613827 . G C 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.85;MQ0=0;QD=3.47;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:52,6,0 chrXII 613836 . C T 50.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.59;MQ0=0;QD=5.66;SB=-2.891e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:83,9,0 chrXII 613839 . C T 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=0;QD=5.00;SB=-2.895e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:82,9,0 chrXII 613848 . C T 105.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.95;MQ0=0;QD=8.77;SB=-5.626e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:15:138,15,0 chrXII 613851 . T C 124.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.41;MQ0=0;QD=8.87;SB=-8.113e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:18:157,18,0 chrXII 613857 . A G 151.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.70;MQ0=0;QD=7.19;SB=-2.421e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:21:184,21,0 chrXII 613864 . C A 411 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.58;MQ0=1;QD=14.17;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:48:444,48,0 chrXII 613866 . C T 411 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.58;MQ0=1;QD=14.17;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:48:444,48,0 chrXII 613867 . C T 415 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.58;MQ0=1;QD=14.31;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:48:448,48,0 chrXII 613890 . C T 548 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.92;MQ0=1;QD=14.81;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:63:581,63,0 chrXII 614059 . C T 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.45;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2890,294,0 chrXII 614178 . G C 2519 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2552,270,0 chrXII 614304 . A G 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3048,330,0 chrXII 614403 . T C 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3671,372,0 chrXII 614438 . A G 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2852,321,0 chrXII 614604 . A G 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.23;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2892,285,0 chrXII 614907 . A C 4091.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=25.89;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:4091,401,0 chrXII 616056 . C T 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3092,304,0 chrXII 616096 . A G 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=24.09;ReadPosRankSum=1.432;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3093,333,0 chrXII 616224 . T C 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3157,324,0 chrXII 616887 . G A 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3759,376,0 chrXII 617208 . G T 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3714,378,0 chrXII 617372 . A T 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=24.95;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3667,361,0 chrXII 617373 . T C 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=24.04;ReadPosRankSum=1.331;SB=-1.964e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3534,360,0 chrXII 617568 . G A 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.928e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3818,388,0 chrXII 617706 . A G 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3847,396,0 chrXII 617865 . G A 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4081,415,0 chrXII 618108 . G A 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3209,325,0 chrXII 618254 . A G 4194.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4194,447,0 chrXII 618279 . T C 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3391,366,0 chrXII 619023 . T C 1700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.29;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1733,186,0 chrXII 619341 . T C 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=25.56;ReadPosRankSum=1.509;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3202,342,0 chrXII 619476 . T C 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2835,297,0 chrXII 619650 . A G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;DP=137;Dels=0.00;FS=3.443;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=23.22;ReadPosRankSum=-1.454;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3214,312,0 chrXII 619731 . T C 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3201,336,0 chrXII 619752 . G A 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3055,312,0 chrXII 619971 . T G 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0313;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.01;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3276,348,0 chrXII 620411 . G A 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3578,355,0 chrXII 620541 . T C 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.58;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3179,348,0 chrXII 620586 . T A 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2982,306,0 chrXII 621039 . A C 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2618,267,0 chrXII 621336 . G A 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3252,322,0 chrXII 621513 . T A 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3847,382,0 chrXII 621546 . C T 4196.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4196,418,0 chrXII 621672 . G T 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7457;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3321,336,0 chrXII 621897 . G A 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3447,354,0 chrXII 622068 . T C 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3085,312,0 chrXII 622344 . C T 2557 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2590,252,0 chrXII 622969 . A G 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.54;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2868,303,0 chrXII 622999 . A G 2482 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.69;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2515,261,0 chrXII 623016 . C T 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2672,267,0 chrXII 623059 . A G 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3156,339,0 chrXII 623494 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3267,339,0 chrXII 623830 . C G 4043.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4043,432,0 chrXII 624328 . C T 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3106,315,0 chrXII 624955 . T C 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3083,327,0 chrXII 625037 . T C 2214 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.78;MQ0=0;QD=24.33;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2247,249,0 chrXII 625055 . A G 2124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=63.5696;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.14;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2157,231,0 chrXII 626422 . T A 2198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.466;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.1043;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.324;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:92:99:2231,237,0 chrXII 627007 . T C 2428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2461,261,0 chrXII 627201 . G C 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3434,351,0 chrXII 627274 . T A 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3880,385,0 chrXII 627361 . C T 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.466;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=23.46;ReadPosRankSum=1.538;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3355,319,0 chrXII 627370 . G A 3879.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3879,396,0 chrXII 627543 . T C 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=1;QD=25.31;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2918,300,0 chrXII 628215 . G T 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3683,381,0 chrXII 628274 . G C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3389,366,0 chrXII 628278 . T G 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3672,399,0 chrXII 628350 . G A 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2917,288,0 chrXII 628361 . A T 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2882,291,0 chrXII 628365 . C A 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2883,291,0 chrXII 628424 . A G 1815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.69;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1848,198,0 chrXII 628661 . T C 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.50;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3402,357,0 chrXII 629441 . C T 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2977,300,0 chrXII 629690 . T C 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.49;SB=-2.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3845,387,0 chrXII 629914 . A G 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.986;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9395;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.466;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3391,357,0 chrXII 629974 . A G 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3340,351,0 chrXII 630048 . G A 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2930,303,0 chrXII 630314 . A G 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3222,345,0 chrXII 630550 . T C 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.71;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3445,375,0 chrXII 630568 . T C 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2842,309,0 chrXII 630870 . C T 2733 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2766,285,0 chrXII 630917 . T C 2154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=22.91;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2187,234,0 chrXII 630958 . A G 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2780,309,0 chrXII 631177 . G A 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3887,382,0 chrXII 631526 . T G 3935.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.89;SB=-2.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3935,423,0 chrXII 631540 . T C 3760.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7618;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:3760,399,0 chrXII 632381 . A C 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3363,339,0 chrXII 632607 . T C 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9247;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3083,330,0 chrXII 632722 . C T 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2851,285,0 chrXII 633127 . A G 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.25;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2912,294,0 chrXII 633163 . G A 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3093,310,0 chrXII 633316 . G A 4108.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4108,406,0 chrXII 633355 . T C 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3738,396,0 chrXII 633455 . A G 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3013,306,0 chrXII 633486 . G A 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3355,327,0 chrXII 633590 . C T 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3852,385,0 chrXII 633782 . C T 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3236,327,0 chrXII 633951 . G A 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7504;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3117,318,0 chrXII 634219 . C T 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3372,351,0 chrXII 635025 . A G 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3640,387,0 chrXII 635115 . T C 3930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;DP=156;Dels=0.00;FS=3.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=25.19;ReadPosRankSum=1.288;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3930,386,0 chrXII 635187 . T C 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.79;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3482,384,0 chrXII 635220 . G A 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3735,382,0 chrXII 635391 . T C 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5836;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3830,402,0 chrXII 635617 . G T 4247.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.13;SB=-2.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4247,415,0 chrXII 635886 . A G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3181,336,0 chrXII 636568 . C T 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.967;DP=169;Dels=0.00;FS=275.368;HaplotypeScore=9.8960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.80;MQ0=0;MQRankSum=1.931;QD=0.10;ReadPosRankSum=-5.037;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,92:169:47:47,0,798 chrXII 636754 . T C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3558,375,0 chrXII 637862 . C A 4333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4333,448,0 chrXII 638411 . G A 4531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4531,463,0 chrXII 638912 . T C 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3620,375,0 chrXII 639116 . C T 3750.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3750,382,0 chrXII 639930 . C T 2293 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.48;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2326,234,0 chrXII 640238 . A G 2255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2288,249,0 chrXII 640787 . G A 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3105,318,0 chrXII 641145 . A G 4171.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4171,441,0 chrXII 641406 . A G 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3253,336,0 chrXII 641415 . C T 3623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3623,369,0 chrXII 641496 . G A 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.46;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2679,273,0 chrXII 641499 . G A 2677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.50;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2710,273,0 chrXII 641592 . A G 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3145,333,0 chrXII 641607 . T C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3369,360,0 chrXII 641676 . C T 4184.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4184,418,0 chrXII 641691 . C T 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.978e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3730,370,0 chrXII 641709 . C T 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3612,369,0 chrXII 642018 . A G 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2668,288,0 chrXII 642188 . T A 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3496,352,0 chrXII 642815 . A G 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3327,375,0 chrXII 642855 . A G 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=1;QD=24.51;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3407,372,0 chrXII 644045 . A G 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:162:99:4007,423,0 chrXII 644656 . T G 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3720,402,0 chrXII 644667 . G A 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3837,388,0 chrXII 644812 . C T 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3259,330,0 chrXII 645338 . G A 4158.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4158,433,0 chrXII 645452 . A G 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3415,363,0 chrXII 645574 . A G 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3228,357,0 chrXII 645674 . C A 4138.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4138,429,0 chrXII 645770 . T C 314.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.216;DP=193;Dels=0.03;FS=23.084;HaplotypeScore=219.5653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=1;MQRankSum=1.758;QD=1.63;ReadPosRankSum=-3.465;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,51:187:99:344,0,1374 chrXII 645771 . C T 334.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.250;DP=193;Dels=0.03;FS=23.178;HaplotypeScore=249.2677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=1;MQRankSum=0.336;QD=1.73;ReadPosRankSum=-4.379;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,50:187:99:364,0,1242 chrXII 645776 . T C 518.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.161;DP=190;Dels=0.00;FS=67.334;HaplotypeScore=272.8148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.743;QD=2.73;ReadPosRankSum=-7.351;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,61:190:99:548,0,1422 chrXII 645848 . T A 5025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=25.51;SB=-2.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:5025,502,0 chrXII 646238 . G C 4156.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.50;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4156,444,0 chrXII 646485 . G A 4095.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.28;SB=-2.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4095,418,0 chrXII 646513 . C T 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.48;SB=-2.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3950,400,0 chrXII 646705 . A G 4437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.50;SB=-2.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4437,474,0 chrXII 646831 . C T 4484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.92;SB=-2.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4484,448,0 chrXII 646878 . G A 4106.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.84;SB=-2.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4106,423,0 chrXII 647017 . C T 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3092,315,0 chrXII 647095 . A G 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1399;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3615,381,0 chrXII 647371 . T C 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3018,324,0 chrXII 647512 . A G 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3416,360,0 chrXII 647752 . T C 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:3826,402,0 chrXII 647778 . G A 3817.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3817,390,0 chrXII 647788 . T C 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3708,396,0 chrXII 647854 . C T 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3198,327,0 chrXII 647953 . G A 4090.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=156;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=26.22;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:4090,412,0 chrXII 648148 . A G 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3073,324,0 chrXII 648309 . G A 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3377,342,0 chrXII 648649 . C T 4284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4284,436,0 chrXII 648877 . T C 4156.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4156,441,0 chrXII 648953 . T C 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=25.59;ReadPosRankSum=-1.599;SB=-1.979e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3992,417,0 chrXII 649036 . G A 4107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6425;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4107,421,0 chrXII 649258 . C T 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3877,385,0 chrXII 649385 . C G 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=24.17;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3408,350,0 chrXII 649837 . A G 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3321,348,0 chrXII 650212 . T C 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3653,396,0 chrXII 650260 . C T 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3072,306,0 chrXII 650613 . C G 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=26.52;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3394,363,0 chrXII 650644 . T C 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;QD=25.08;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3193,333,0 chrXII 650753 . A G 2003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.27;MQ0=0;QD=23.85;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2036,222,0 chrXII 650767 . C T 1405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.36;MQ0=0;QD=26.51;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1438,147,0 chrXII 656583 . C T 1020 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.20;MQ0=34;QD=13.97;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,43:73:99:1053,111,0 chrXII 656667 . T C 285 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.95;MQ0=11;QD=12.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,13:23:36:318,36,0 chrXII 656673 . G A 247 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.95;MQ0=11;QD=10.74;SB=-1.302e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,13:23:30:280,30,0 chrXII 656674 . T C 238 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.95;MQ0=11;QD=10.35;SB=-1.302e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,13:23:30:271,30,0 chrXII 656689 . A T 279 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.83;MQ0=6;QD=9.62;SB=-1.087e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,23:29:33:312,33,0 chrXII 656698 . C T 283 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.77;MQ0=4;QD=10.48;SB=-1.087e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,23:27:33:316,33,0 chrXII 656701 . C A 281 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.28;MQ0=3;QD=10.81;SB=-1.087e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,23:26:33:314,33,0 chrXII 656743 . A T 77.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.43;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.589;SB=-5.426e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,6:8:15:110,15,0 chrXII 656843 . T G 1857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.79;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1890,201,0 chrXII 656891 . G A 2319 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.29;MQ0=0;QD=26.35;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2352,228,0 chrXII 656932 . C T 2279 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.01;MQ0=0;QD=25.90;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2312,237,0 chrXII 657022 . T C 1117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.27;MQ0=0;QD=22.34;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1150,129,0 chrXII 657027 . T C 1093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.27;MQ0=0;QD=21.86;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1126,129,0 chrXII 657041 . G A 1184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=23.68;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1217,126,0 chrXII 657049 . G A 1180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.18;MQ0=0;QD=24.08;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1213,126,0 chrXII 657181 . A C 2374 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.36;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2407,246,0 chrXII 657234 . T G 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;DP=119;Dels=0.00;FS=3.595;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=24.66;ReadPosRankSum=0.888;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2968,321,0 chrXII 657303 . A G 2332 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.54;MQ0=0;QD=22.42;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2365,264,0 chrXII 657321 . G A 2306 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.82;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2339,240,0 chrXII 657332 . G C 2025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.25;MQ0=0;QD=22.25;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2058,228,0 chrXII 657492 . C G 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.96;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2909,300,0 chrXII 657536 . G T 3561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.39;MQ0=0;QD=26.77;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3561,361,0 chrXII 657602 . G A 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.71;MQ0=0;QD=25.18;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3450,345,0 chrXII 657631 . C T 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.08;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2937,300,0 chrXII 657792 . C G 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.52;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2539,279,0 chrXII 657805 . T C 1989 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.12;MQ0=0;QD=24.26;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2022,231,0 chrXII 657808 . C T 1753 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.67;MQ0=0;QD=21.64;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:81:99:1786,189,0 chrXII 657809 . C T 1726 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.73;MQ0=0;QD=21.57;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1759,186,0 chrXII 657814 . C T 1745 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.73;MQ0=0;QD=21.81;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1778,189,0 chrXII 657820 . G A 1805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.75;MQ0=0;QD=23.44;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1838,195,0 chrXII 657825 . T C 1833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.77;MQ0=0;QD=22.08;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:83:99:1866,204,0 chrXII 657860 . G A 2295 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.89;MQ0=0;QD=25.50;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2328,240,0 chrXII 657866 . A G 2191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.90;MQ0=0;QD=23.82;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2224,243,0 chrXII 657899 . A G 1925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.30;MQ0=0;QD=18.69;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:1958,216,0 chrXII 657914 . T C 2128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.95;MQ0=0;QD=19.35;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2161,240,0 chrXII 657918 . A T 2085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=166.7267;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.02;MQ0=0;QD=18.95;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2118,225,0 chrXII 658054 . A T 4513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.28;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4513,445,0 chrXII 658456 . G A 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3834,382,0 chrXII 658599 . G T 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3897,394,0 chrXII 659071 . C T 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3400,340,0 chrXII 659350 . C T 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.997e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3657,367,0 chrXII 659428 . A G 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2488,270,0 chrXII 659916 . T C 3948.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3948,408,0 chrXII 659919 . G A 4019.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4019,409,0 chrXII 660046 . T C 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3509,366,0 chrXII 660296 . C T 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=26.08;SB=-2.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3860,391,0 chrXII 660472 . G A 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=1;QD=26.00;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3153,310,0 chrXII 660622 . A T 2988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.68;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3021,312,0 chrXII 660916 . A G 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3874,379,0 chrXII 661444 . G A 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3325,354,0 chrXII 661750 . C T 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3796,382,0 chrXII 661864 . T C 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3208,363,0 chrXII 661927 . A G 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3271,342,0 chrXII 662311 . T C 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.616;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3793,384,0 chrXII 662318 . G T 4065.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4065,397,0 chrXII 662353 . G A 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3639,361,0 chrXII 662494 . C G 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=1;QD=25.67;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3850,402,0 chrXII 662515 . G A 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=1;QD=26.85;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3571,370,0 chrXII 662627 . T C 4636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=1;QD=25.47;SB=-2.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4636,457,0 chrXII 662864 . A T 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3488,354,0 chrXII 662978 . G A 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3017,315,0 chrXII 663017 . T C 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3482,363,0 chrXII 663332 . G A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=4.091;HaplotypeScore=2.3346;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.499;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3152,318,0 chrXII 663368 . A G 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3483,351,0 chrXII 663890 . T C 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3686,378,0 chrXII 664139 . C T 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3399,345,0 chrXII 664157 . A G 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3012,309,0 chrXII 664658 . G A 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3148,330,0 chrXII 665236 . T G 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3447,366,0 chrXII 665343 . G T 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:147:99:3676,384,0 chrXII 665345 . T C 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3650,405,0 chrXII 665413 . A G 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3450,363,0 chrXII 665680 . A T 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3767,382,0 chrXII 665873 . G A 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3255,327,0 chrXII 665977 . A G 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.63;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2886,303,0 chrXII 666395 . T C 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3391,351,0 chrXII 666935 . A G 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2867,315,0 chrXII 667554 . G A 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3007,312,0 chrXII 667631 . T A 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.487;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:114:99:3043,304,0 chrXII 667877 . T C 2389 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2422,252,0 chrXII 668131 . T C 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3371,351,0 chrXII 668207 . G C 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2911,312,0 chrXII 668244 . C T 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3215,333,0 chrXII 668550 . G A 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3545,361,0 chrXII 669013 . T C 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3765,402,0 chrXII 669053 . G A 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3241;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.854e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3819,373,0 chrXII 669236 . C A 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8778;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3470,354,0 chrXII 669290 . T A 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3526,360,0 chrXII 669293 . G C 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3287,357,0 chrXII 669897 . C A 1761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=19.14;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:1794,186,0 chrXII 669920 . G T 2138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.77;MQ0=0;QD=20.56;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2171,219,0 chrXII 669990 . T A 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2840,294,0 chrXII 669994 . G A 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2812,291,0 chrXII 670009 . T A 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2571,267,0 chrXII 670291 . T A 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.78;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2536,264,0 chrXII 670299 . T G 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2708,288,0 chrXII 670304 . G C 269 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.75;MQ0=0;QD=2.24;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:39:302,39,0 chrXII 670368 . G A 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3586,361,0 chrXII 670460 . C G 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.52;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2738,291,0 chrXII 670631 . G T 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4595;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3261,339,0 chrXII 670634 . T C 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3360,351,0 chrXII 670933 . G A 2277 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2310,231,0 chrXII 671112 . A G 2136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2169,231,0 chrXII 671167 . A G 2094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2127,225,0 chrXII 671255 . C T 2058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2091,222,0 chrXII 671257 . T C 1942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=22.07;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1975,222,0 chrXII 671310 . A G 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2679,276,0 chrXII 671323 . G C 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2860,315,0 chrXII 671359 . T C 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.171;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=23.94;ReadPosRankSum=0.756;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3400,357,0 chrXII 671397 . A T 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3645,375,0 chrXII 671463 . T C 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3511,363,0 chrXII 671465 . G A 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3648,366,0 chrXII 671555 . C T 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3027,307,0 chrXII 671563 . T C 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3051,324,0 chrXII 671612 . A C 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3569,372,0 chrXII 671669 . G A 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3477,349,0 chrXII 671821 . T C 3806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.54;SB=-2.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3806,396,0 chrXII 671956 . A C 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3664,393,0 chrXII 672242 . G A 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3465,346,0 chrXII 672265 . A G 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3345,354,0 chrXII 672293 . A G 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2708,285,0 chrXII 672317 . T C 2330 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.33;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2363,258,0 chrXII 672355 . G C 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2651,279,0 chrXII 672394 . C T 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2980,291,0 chrXII 672505 . G C 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:3914,411,0 chrXII 672556 . T G 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.39;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3504,354,0 chrXII 672637 . T C 2156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.22;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2189,234,0 chrXII 672683 . T G 2206 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.65;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2239,249,0 chrXII 672778 . C A 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3224,333,0 chrXII 672956 . A G 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=24.65;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2843,303,0 chrXII 673080 . T C 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.57;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2718,288,0 chrXII 673090 . T C 2746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2779,294,0 chrXII 673274 . T C 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3425,363,0 chrXII 673337 . G A 51.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.252;DP=96;Dels=0.00;FS=3.950;HaplotypeScore=71.4244;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=0.54;ReadPosRankSum=6.411;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,79:96:9:84,9,0 chrXII 673354 . C G 1889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.96;MQ0=0;QD=23.32;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1922,210,0 chrXII 673369 . G A 1673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=63.6429;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.19;MQ0=0;QD=22.01;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:76:99:1706,177,0 chrXII 673405 . T C 2013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.89;MQ0=0;QD=22.62;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2046,222,0 chrXII 673436 . T C 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.23;MQ0=0;QD=24.18;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2741,300,0 chrXII 673500 . G T 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3162,321,0 chrXII 673533 . A G 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2823,303,0 chrXII 673539 . G A 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2907,303,0 chrXII 673886 . G A 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7419;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3611,361,0 chrXII 673905 . G A 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3686,361,0 chrXII 674025 . G A 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3544,360,0 chrXII 674079 . A C 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9419;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=24.91;ReadPosRankSum=0.709;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2649,273,0 chrXII 674152 . A G 2081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2114,225,0 chrXII 674158 . C T 2135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.72;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2168,222,0 chrXII 674199 . A G 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.37;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2672,285,0 chrXII 674615 . G A 2413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.81;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2446,255,0 chrXII 674624 . G A 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2771,285,0 chrXII 674647 . G A 2631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2664,282,0 chrXII 674711 . T C 2232 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.26;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2265,252,0 chrXII 674763 . T A 2363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.11;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2396,240,0 chrXII 674781 . T C 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3156,324,0 chrXII 674877 . A G 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.67;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2728,291,0 chrXII 674975 . C G 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.24;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3307,351,0 chrXII 675001 . T C 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3538,390,0 chrXII 675042 . G A 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3763,388,0 chrXII 675229 . G A 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3603,378,0 chrXII 675312 . C T 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3036,309,0 chrXII 675358 . A G 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3125,342,0 chrXII 675394 . T A 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3634,358,0 chrXII 675407 . C T 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3504,355,0 chrXII 675607 . T C 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2805,303,0 chrXII 675924 . T C 2037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2070,225,0 chrXII 675925 . A G 2023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.52;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2056,222,0 chrXII 675961 . C G 2215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2248,231,0 chrXII 676076 . G C 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.286;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:2995,324,0 chrXII 676609 . G A 3879.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.91;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3879,397,0 chrXII 676612 . C G 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.13;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3632,390,0 chrXII 676835 . T C 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3157,324,0 chrXII 676885 . G A 4067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4067,397,0 chrXII 676925 . G C 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3743,390,0 chrXII 677005 . A G 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3669,381,0 chrXII 677132 . C T 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.40;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3453,351,0 chrXII 677164 . A G 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.46;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3261,336,0 chrXII 677241 . G A 1907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.45;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1940,189,0 chrXII 677323 . A G 2340 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.37;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2373,255,0 chrXII 677357 . C T 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2994,306,0 chrXII 677608 . C T 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3433,340,0 chrXII 677675 . G A 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3662,372,0 chrXII 677699 . T G 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3104,327,0 chrXII 677766 . C T 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3264,330,0 chrXII 677814 . T C 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3146,324,0 chrXII 677900 . T C 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.987e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3621,372,0 chrXII 677991 . G A 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3398,342,0 chrXII 678096 . T C 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=1;QD=25.69;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3853,382,0 chrXII 678194 . C T 3871.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.858e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3871,391,0 chrXII 678531 . C T 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=1;QD=26.74;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3135,315,0 chrXII 678619 . C T 2223 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2256,234,0 chrXII 678645 . T C 2345 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.18;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:96:99:2378,258,0 chrXII 678751 . T C 3573.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3573,390,0 chrXII 678793 . C G 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3160,321,0 chrXII 678817 . T A 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3204,318,0 chrXII 679157 . T C 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3050,327,0 chrXII 679180 . G A 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3030,312,0 chrXII 679296 . T C 2644 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2677,288,0 chrXII 679403 . T C 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2576,267,0 chrXII 679496 . A G 2504 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.08;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2537,279,0 chrXII 679600 . C T 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.636;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=24.16;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2642,252,0 chrXII 679807 . G A 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3490,354,0 chrXII 680005 . A C 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=23.99;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2624,276,0 chrXII 680159 . C T 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3900,385,0 chrXII 680346 . T C 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2745,288,0 chrXII 680364 . C T 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3284,328,0 chrXII 680887 . G A 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.84;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3285,339,0 chrXII 680926 . G A 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=27.34;ReadPosRankSum=0.701;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3581,373,0 chrXII 680974 . A G 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=126.3623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3329,366,0 chrXII 681097 . T C 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3964,420,0 chrXII 681563 . A G 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3887,402,0 chrXII 681614 . G A 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3564,367,0 chrXII 681851 . A G 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3669,372,0 chrXII 682248 . A C 2668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2701,279,0 chrXII 682445 . A G 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2813,315,0 chrXII 682830 . G A 2623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2656,267,0 chrXII 682839 . C A 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2649,270,0 chrXII 682874 . T C 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2576,273,0 chrXII 683405 . T C 1946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.45;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:83:99:1979,210,0 chrXII 683462 . G A 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.54;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3191,322,0 chrXII 683588 . T G 2905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2938,303,0 chrXII 683664 . C A 2472 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2505,255,0 chrXII 683798 . C T 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.94;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2943,306,0 chrXII 683834 . G A 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.45;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2778,279,0 chrXII 683858 . T C 2579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2612,270,0 chrXII 684068 . T G 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3008,324,0 chrXII 684167 . T C 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3161,327,0 chrXII 684641 . T C 1752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;QD=24.33;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1785,204,0 chrXII 684650 . T A 1990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.86;MQ0=0;QD=26.53;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2023,210,0 chrXII 684653 . T C 1843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=25.25;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1876,204,0 chrXII 684785 . G A 3775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3775,385,0 chrXII 685228 . A T 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2860,297,0 chrXII 685721 . A T 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3538,355,0 chrXII 685853 . T C 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1770;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2887,300,0 chrXII 686000 . C T 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2700,270,0 chrXII 686213 . G A 2494 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2527,258,0 chrXII 686636 . C T 2349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2382,243,0 chrXII 686785 . G A 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3160,324,0 chrXII 686789 . G A 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3042,315,0 chrXII 687405 . T C 1881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=65.6501;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=25.77;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1914,204,0 chrXII 687646 . G A 1357 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.30;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1390,144,0 chrXII 687662 . T C 1534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.73;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1567,165,0 chrXII 687735 . T A 2017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.87;MQ0=0;QD=25.21;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2050,189,0 chrXII 687769 . G T 1715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.38;MQ0=0;QD=25.22;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1748,165,0 chrXII 687807 . A T 1619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=25.30;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1652,162,0 chrXII 687816 . G A 1756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.79;MQ0=0;QD=26.21;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1789,177,0 chrXII 687957 . A T 81.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.15;SB=-8.552e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:12:114,12,0 chrXII 687963 . C A 166.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.87;MQ0=0;QD=2.24;SB=-1.141e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:21:199,21,0 chrXII 687973 . A C 480 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.21;MQ0=0;QD=5.78;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:54:513,54,0 chrXII 688077 . G A 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.36;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2724,291,0 chrXII 688146 . T C 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.70;MQ0=1;MQRankSum=0.679;QD=24.13;ReadPosRankSum=1.372;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3073,312,0 chrXII 688227 . C A 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.08;MQ0=1;QD=25.28;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2966,297,0 chrXII 688237 . T G 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.55;MQ0=0;QD=23.74;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2810,282,0 chrXII 688246 . C A 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.09;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2963,294,0 chrXII 688263 . T A 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.19;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3278,327,0 chrXII 688265 . G A 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.25;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3292,324,0 chrXII 688326 . T C 2011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.94;MQ0=0;QD=24.83;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2044,222,0 chrXII 688347 . C T 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2622,267,0 chrXII 688417 . C T 2320 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.15;MQ0=0;QD=24.68;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2353,237,0 chrXII 688424 . C G 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.97;MQ0=0;QD=22.98;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2469,267,0 chrXII 688445 . C G 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.80;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2619,276,0 chrXII 688464 . G A 2360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=26.22;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2393,240,0 chrXII 688522 . C T 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.92;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2994,309,0 chrXII 688604 . T C 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2624,279,0 chrXII 688606 . T A 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2583,264,0 chrXII 688733 . T C 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3039,327,0 chrXII 688772 . T C 2262 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2295,249,0 chrXII 688789 . C T 2502 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.53;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2535,264,0 chrXII 688902 . G A 1920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.43;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1953,201,0 chrXII 688961 . C T 2166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2199,228,0 chrXII 689147 . G A 2929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2962,300,0 chrXII 689216 . G T 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2719,276,0 chrXII 689323 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3265,342,0 chrXII 689355 . T G 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3297,330,0 chrXII 689357 . C T 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3374,328,0 chrXII 689502 . G C 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2629,273,0 chrXII 689510 . G A 2365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2398,249,0 chrXII 689527 . A G 2010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=23.93;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2043,228,0 chrXII 689587 . T C 2400 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2433,264,0 chrXII 689626 . T C 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2834,288,0 chrXII 689719 . G A 2482 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.98;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2515,252,0 chrXII 689793 . A G 2636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2669,279,0 chrXII 689916 . C T 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2530,258,0 chrXII 689955 . C T 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3279,328,0 chrXII 690015 . G A 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3299,331,0 chrXII 690162 . T C 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3489,375,0 chrXII 690274 . G A 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3192,321,0 chrXII 690280 . A G 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3063,312,0 chrXII 690475 . C T 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3395,339,0 chrXII 690479 . C T 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3357,333,0 chrXII 690497 . T C 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3099,321,0 chrXII 690766 . C T 3660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3660,375,0 chrXII 691332 . A T 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3105,327,0 chrXII 691605 . A G 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3780,393,0 chrXII 691647 . T C 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8395;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3779,387,0 chrXII 691716 . C T 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3572,352,0 chrXII 691842 . A G 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3495,369,0 chrXII 691866 . A G 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3795,405,0 chrXII 692043 . A C 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2759,300,0 chrXII 692160 . C T 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3382,351,0 chrXII 692181 . T C 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3183,339,0 chrXII 692874 . T C 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3452,363,0 chrXII 693267 . C T 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2629,273,0 chrXII 693579 . A G 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1966;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2929,318,0 chrXII 693615 . C T 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.47;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2786,291,0 chrXII 693687 . C T 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3004,289,0 chrXII 693756 . G A 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3074,318,0 chrXII 693786 . T C 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3177,339,0 chrXII 693904 . A G 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3710,384,0 chrXII 694170 . G A 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3885,400,0 chrXII 694211 . C T 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3377,331,0 chrXII 694318 . C T 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2858,285,0 chrXII 694377 . C T 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3217,324,0 chrXII 694826 . A T 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3184,324,0 chrXII 694841 . T C 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2974,318,0 chrXII 694915 . T C 2634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.57;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2667,276,0 chrXII 694939 . A G 2392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2425,267,0 chrXII 694951 . A G 2173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2206,237,0 chrXII 694982 . C T 2375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2408,249,0 chrXII 696350 . A G 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2822,291,0 chrXII 696384 . G A 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=25.79;ReadPosRankSum=0.315;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2870,278,0 chrXII 696795 . A G 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.31;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3552,372,0 chrXII 696819 . C T 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3596,352,0 chrXII 696862 . G A 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3252,330,0 chrXII 696967 . T C 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3262,357,0 chrXII 696990 . T C 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9257;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3705,393,0 chrXII 697072 . G T 3960.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3960,397,0 chrXII 697261 . A G 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3004,327,0 chrXII 697759 . C T 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3548,352,0 chrXII 698011 . C G 13.94 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=6.97;SB=-2.676e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:45,6,0 chrXII 698015 . A T 223.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.36;MQ0=0;QD=6.37;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:27:256,27,0 chrXII 698944 . G A 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2941,294,0 chrXII 699067 . C T 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3670,366,0 chrXII 699181 . T C 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3444,360,0 chrXII 699478 . T C 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2841,306,0 chrXII 699566 . A G 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3783,396,0 chrXII 699870 . T C 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=1;QD=26.21;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3073,330,0 chrXII 699895 . C T 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.7560;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.52;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2897,309,0 chrXII 700111 . G A 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3652,375,0 chrXII 700524 . C A 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3244,333,0 chrXII 700890 . T A 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3947,382,0 chrXII 701265 . A G 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=25.24;ReadPosRankSum=1.199;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2986,315,0 chrXII 701540 . C T 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2969,289,0 chrXII 701665 . A G 3532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3532,351,0 chrXII 701793 . A T 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3477,357,0 chrXII 702075 . C T 3948.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3948,408,0 chrXII 702204 . T C 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3852,411,0 chrXII 702318 . T C 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3292,342,0 chrXII 702363 . G A 3218.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3252,336,0 chrXII 702384 . T C 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3352,351,0 chrXII 702585 . C G 3359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3359,348,0 chrXII 702788 . G A 4590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=26.69;SB=-2.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4590,466,0 chrXII 702936 . A G 4307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4307,435,0 chrXII 702990 . T C 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=22.82;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:2863,324,0 chrXII 703102 . C T 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3279,336,0 chrXII 703356 . C A 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3306,334,0 chrXII 703572 . G A 2483 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2516,264,0 chrXII 703659 . G A 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3853,394,0 chrXII 703815 . C T 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4030,415,0 chrXII 703971 . T C 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3392,366,0 chrXII 704021 . C T 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.506;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.703;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:3686,355,0 chrXII 704793 . A G 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3109,327,0 chrXII 704829 . G A 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3769,373,0 chrXII 704992 . T G 4162.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.38;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4162,423,0 chrXII 705020 . T C 4136.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4136,415,0 chrXII 705029 . C T 4247.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=25.28;SB=-2.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4247,424,0 chrXII 705093 . C T 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3758,379,0 chrXII 705096 . A T 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3877,382,0 chrXII 705118 . T C 4415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:171:99:4415,453,0 chrXII 705128 . A G 4322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4322,439,0 chrXII 705191 . G A 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3995,406,0 chrXII 705209 . G A 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3782,399,0 chrXII 705221 . C T 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.76;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3291,336,0 chrXII 705704 . A G 4254.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.32;SB=-2.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4254,438,0 chrXII 706365 . G A 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.34;MQ0=0;QD=25.34;SB=-2.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3776,391,0 chrXII 706444 . A G 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4272;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3798,378,0 chrXII 706747 . G A 2339 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2372,240,0 chrXII 706756 . T C 2257 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.12;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:94:99:2290,249,0 chrXII 706780 . A G 1943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.79;MQ0=0;QD=24.29;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1976,210,0 chrXII 706789 . A G 2496 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2529,273,0 chrXII 706807 . G A 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=100;Dels=0.00;FS=4.089;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=26.21;ReadPosRankSum=-1.559;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2654,248,0 chrXII 706906 . T C 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3787,393,0 chrXII 706966 . C T 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3962,397,0 chrXII 706978 . A G 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3499,363,0 chrXII 707020 . T C 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3641,378,0 chrXII 707098 . T C 4120.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4120,438,0 chrXII 707238 . C T 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2651,267,0 chrXII 707302 . C T 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.44;MQ0=0;QD=24.27;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3164,333,0 chrXII 707305 . T C 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=24.52;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3073,324,0 chrXII 707318 . A G 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6504;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;QD=24.42;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3134,336,0 chrXII 707644 . A G 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3079,318,0 chrXII 707757 . A G 2253 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=102;Dels=0.00;FS=3.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.32;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=22.09;ReadPosRankSum=1.630;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2286,232,0 chrXII 707758 . T A 2297 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.65;MQ0=0;QD=21.27;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2330,258,0 chrXII 707772 . G C 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2706,288,0 chrXII 707950 . G A 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5464;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.700;QD=25.61;ReadPosRankSum=0.524;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2825,269,0 chrXII 708185 . G A 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2811,285,0 chrXII 708261 . T C 2549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2582,273,0 chrXII 708383 . A T 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7776;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3129,318,0 chrXII 708425 . C T 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4061,403,0 chrXII 708567 . C T 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3848,388,0 chrXII 708595 . G A 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3653,364,0 chrXII 708796 . C T 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3814,376,0 chrXII 708814 . A T 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.44;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3411,337,0 chrXII 708837 . T G 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3179,333,0 chrXII 708840 . G A 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3189,321,0 chrXII 708955 . C T 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2735,276,0 chrXII 709059 . A G 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7518;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.61;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2594,270,0 chrXII 709063 . A T 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.88;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2641,267,0 chrXII 709102 . T A 2214 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.85;MQ0=0;QD=25.45;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2247,231,0 chrXII 709175 . G C 1908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.58;MQ0=0;QD=23.27;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1941,207,0 chrXII 709384 . A G 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3112,330,0 chrXII 709537 . C T 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3821,388,0 chrXII 709879 . G A 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9701;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3650,378,0 chrXII 709888 . T C 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4238;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3510,369,0 chrXII 710056 . T C 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3155,348,0 chrXII 710068 . C A 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3131,321,0 chrXII 710090 . A G 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2599,291,0 chrXII 710116 . A G 2494 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2527,276,0 chrXII 710157 . A G 2842 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=26.07;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2875,297,0 chrXII 710161 . A G 2905 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.22;MQ0=0;QD=26.17;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2938,303,0 chrXII 710167 . G A 2717 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.38;MQ0=0;QD=26.64;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2750,279,0 chrXII 710215 . G A 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2729,279,0 chrXII 710283 . T G 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.49;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2658,279,0 chrXII 710358 . T G 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3234,336,0 chrXII 710493 . A T 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3551,355,0 chrXII 710635 . C T 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.43;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3133,321,0 chrXII 710704 . G A 2766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2799,279,0 chrXII 710709 . G A 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2833,291,0 chrXII 710871 . G A 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3823,373,0 chrXII 710894 . C G 4056.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4056,405,0 chrXII 711045 . T G 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3646,372,0 chrXII 711058 . T C 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=24.96;ReadPosRankSum=1.307;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2878,279,0 chrXII 711067 . C T 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3083,303,0 chrXII 711312 . C T 2614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2647,267,0 chrXII 711337 . A G 2448 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2481,267,0 chrXII 711354 . G T 2363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.16;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2396,249,0 chrXII 711432 . C T 2187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8908;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=22.32;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2220,231,0 chrXII 711837 . T G 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2882,294,0 chrXII 712040 . C T 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3146,324,0 chrXII 712134 . T C 2489 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.68;MQ0=0;QD=24.89;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2522,267,0 chrXII 712302 . C T 1989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:2022,219,0 chrXII 712581 . C T 2134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2167,225,0 chrXII 712942 . T C 2579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.57;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2612,279,0 chrXII 712958 . C T 2427 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.61;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2460,258,0 chrXII 712973 . T C 2306 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.582;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:2339,255,0 chrXII 712990 . A C 1491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.06;MQ0=0;QD=23.30;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1524,174,0 chrXII 713059 . C T 2276 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.94;MQ0=0;QD=22.99;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2309,237,0 chrXII 713068 . T A 2373 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.76;MQ0=0;QD=23.26;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2406,249,0 chrXII 713180 . G T 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3450,360,0 chrXII 713310 . T A 106.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;DP=122;Dels=0.00;FS=1.523;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=0.87;ReadPosRankSum=-4.437;SB=-6.313e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:115,7:122:18:139,18,0 chrXII 713479 . T C 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.08;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2709,273,0 chrXII 713507 . A G 3015 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.79;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3048,333,0 chrXII 713513 . G A 2610 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.43;MQ0=0;QD=19.77;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:2643,279,0 chrXII 713516 . T C 2108 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.48;MQ0=0;QD=18.65;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2141,231,0 chrXII 713543 . A C 2075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.27;MQ0=0;QD=19.76;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2108,228,0 chrXII 713644 . A G 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2968,315,0 chrXII 713693 . G C 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.446;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=23.59;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,122:124:99:2958,280,0 chrXII 713843 . T C 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2905,297,0 chrXII 713994 . A C 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.30;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2816,297,0 chrXII 714002 . G A 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.61;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3016,315,0 chrXII 714020 . G A 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.74;MQ0=0;QD=27.54;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2622,273,0 chrXII 714062 . A G 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3420,345,0 chrXII 714134 . A G 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3416,366,0 chrXII 714158 . A G 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2902,303,0 chrXII 714185 . G A 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3045,306,0 chrXII 714200 . C T 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4304;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=25.39;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3105,309,0 chrXII 714302 . G A 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.52;SB=-2.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3752,370,0 chrXII 714320 . G T 3409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3409,336,0 chrXII 714407 . A G 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3198,330,0 chrXII 714439 . G A 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3065,312,0 chrXII 714546 . G A 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2945,285,0 chrXII 714587 . C T 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:137:99:3522,340,0 chrXII 714641 . G A 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3185,315,0 chrXII 714966 . G C 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2649,276,0 chrXII 715068 . G A 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3205,318,0 chrXII 715073 . C A 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.74;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3095,306,0 chrXII 715129 . G A 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3716,390,0 chrXII 715235 . C T 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9399;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3543,355,0 chrXII 715595 . A G 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2716,285,0 chrXII 715622 . A C 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:116:99:2794,288,0 chrXII 715772 . G T 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3560,363,0 chrXII 715867 . C T 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3785,376,0 chrXII 715886 . G A 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.928;DP=155;Dels=0.00;FS=3.515;HaplotypeScore=5.6681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=23.67;ReadPosRankSum=0.771;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:3669,342,0 chrXII 715955 . C T 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3321,336,0 chrXII 715982 . G A 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3371,339,0 chrXII 716177 . C T 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3641,370,0 chrXII 716369 . G A 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3737,382,0 chrXII 716399 . C T 4059.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4059,409,0 chrXII 716594 . T C 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.12;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2620,285,0 chrXII 716777 . G A 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3271,342,0 chrXII 716852 . A C 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2945,324,0 chrXII 717136 . G A 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.57;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2641,267,0 chrXII 717181 . T C 2372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=12.8778;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2405,249,0 chrXII 717475 . G A 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.78;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2637,261,0 chrXII 717529 . C T 2015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.51;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2048,207,0 chrXII 717712 . A G 2419 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2452,255,0 chrXII 717897 . G T 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2681,267,0 chrXII 717949 . G C 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2386,255,0 chrXII 717952 . T C 2423 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2456,258,0 chrXII 718104 . G A 1989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=50.0642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.02;MQ0=0;QD=23.13;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2022,210,0 chrXII 718154 . A G 1483 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.40;MQ0=0;QD=13.99;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:1516,168,0 chrXII 718211 . G A 2400 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=26.37;ReadPosRankSum=1.504;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2433,249,0 chrXII 718266 . A G 2399 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2432,255,0 chrXII 718278 . T A 2651 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2684,276,0 chrXII 718479 . T C 2444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2477,261,0 chrXII 718515 . A G 2314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2347,255,0 chrXII 718521 . T C 2279 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2312,243,0 chrXII 718593 . G A 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3058,315,0 chrXII 718821 . T C 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2914,300,0 chrXII 718878 . G A 2218 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.38;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2251,228,0 chrXII 718896 . G A 2929 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2962,303,0 chrXII 718962 . G A 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2652,267,0 chrXII 719036 . T C 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3100,333,0 chrXII 719106 . G A 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3121,315,0 chrXII 719400 . G A 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3368,345,0 chrXII 720191 . A G 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2731,276,0 chrXII 721200 . T C 2348 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2381,249,0 chrXII 721257 . G A 1869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.60;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1902,198,0 chrXII 721436 . A C 2176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=21.98;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2209,246,0 chrXII 721538 . T C 1630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.70;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1663,168,0 chrXII 721788 . C T 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7586;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3745,379,0 chrXII 722023 . A G 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2887,303,0 chrXII 723463 . T C 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2798,297,0 chrXII 723998 . C A 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3228,318,0 chrXII 724534 . A G 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.45;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3087,321,0 chrXII 724901 . C T 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3673,358,0 chrXII 725284 . T C 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=23.37;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2837,321,0 chrXII 725538 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=20.37;SB=-2.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3048,306,0 chrXII 725578 . T C 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=21.45;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3143,342,0 chrXII 725693 . A T 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3387,328,0 chrXII 725936 . G A 4493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.90;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4493,451,0 chrXII 726161 . C G 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.24;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3369,375,0 chrXII 726449 . G A 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3189,333,0 chrXII 726556 . T C 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3354,351,0 chrXII 726801 . G A 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2878,294,0 chrXII 726848 . A G 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3444,369,0 chrXII 727094 . G A 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3545,369,0 chrXII 727106 . T C 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3654,372,0 chrXII 727328 . A G 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2840,315,0 chrXII 727454 . C T 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=25.35;ReadPosRankSum=-1.556;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3024,312,0 chrXII 727539 . T C 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;DP=127;Dels=0.00;FS=4.604;HaplotypeScore=3.5674;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=23.72;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3046,302,0 chrXII 727688 . A G 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3405,381,0 chrXII 728082 . G A 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3298,339,0 chrXII 728727 . C A 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3944,385,0 chrXII 728790 . A G 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2870,297,0 chrXII 728808 . C T 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2744,273,0 chrXII 729050 . T C 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3482,372,0 chrXII 729104 . A G 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3350,357,0 chrXII 729242 . T C 3773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5335;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.99;SB=-2.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3773,390,0 chrXII 729312 . G A 4463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4463,445,0 chrXII 729344 . C T 4726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.55;SB=-2.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4726,463,0 chrXII 729446 . A G 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3405,366,0 chrXII 729605 . G T 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3947,403,0 chrXII 729962 . T C 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3260,342,0 chrXII 730362 . T C 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5646;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3308,336,0 chrXII 731012 . C T 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3777,373,0 chrXII 731151 . A G 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3133,327,0 chrXII 731172 . C T 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3168,319,0 chrXII 731454 . C T 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3466,352,0 chrXII 731466 . A C 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3275,336,0 chrXII 731569 . A C 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.12;MQ0=1;QD=24.55;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2930,309,0 chrXII 731664 . T C 1021 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.76;MQ0=0;QD=21.72;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1054,114,0 chrXII 731668 . T A 806 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.53;MQ0=1;QD=18.74;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:839,102,0 chrXII 731669 . G A 825 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.53;MQ0=1;QD=19.19;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:858,105,0 chrXII 731671 . A T 824 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.41;MQ0=1;QD=19.62;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:857,105,0 chrXII 731747 . T G 34.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.89;MQ0=12;MQRankSum=1.466;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.386;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:25:64:64,0,104 chrXII 732004 . A C 57.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.593;DP=74;Dels=0.00;FS=19.465;HaplotypeScore=6.4345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.71;MQ0=1;MQRankSum=0.644;QD=0.77;ReadPosRankSum=3.571;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,6:74:87:87,0,166 chrXII 732073 . T C 1908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.57;MQ0=0;QD=21.44;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1941,210,0 chrXII 732212 . G T 2472 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2505,249,0 chrXII 732213 . A C 2262 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.87;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2295,249,0 chrXII 732344 . A T 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3531,358,0 chrXII 732435 . G A 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3676,358,0 chrXII 732451 . C T 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.02;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3893,382,0 chrXII 733015 . T C 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2875,312,0 chrXII 733803 . T C 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3569,366,0 chrXII 733837 . G A 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3313,328,0 chrXII 733882 . C T 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3350,351,0 chrXII 734033 . A G 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.90;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2649,285,0 chrXII 734064 . A G 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3191,336,0 chrXII 734068 . T C 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2998,330,0 chrXII 734157 . A T 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3992,420,0 chrXII 734238 . G A 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.34;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3212,319,0 chrXII 734286 . T A 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2989,306,0 chrXII 734442 . A G 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;QD=26.40;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3855,414,0 chrXII 734446 . C T 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.11;MQ0=0;QD=27.91;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3628,367,0 chrXII 734599 . T C 1743 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;DP=87;Dels=0.01;FS=4.293;HaplotypeScore=11.7015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.82;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.370;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:1776,198,0 chrXII 734602 . C T 1740 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.610;DP=86;Dels=0.01;FS=4.243;HaplotypeScore=13.6864;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.42;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.080;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:1773,175,0 chrXII 734608 . C A 1694 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.531;DP=86;Dels=0.00;FS=3.663;HaplotypeScore=13.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.450;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:1727,172,0 chrXII 734612 . T G 1607 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.183;DP=85;Dels=0.00;FS=3.854;HaplotypeScore=6.8922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=18.91;ReadPosRankSum=1.691;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:1640,164,0 chrXII 734628 . T C 1641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;DP=83;Dels=0.00;FS=3.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=19.77;ReadPosRankSum=-1.023;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:83:99:1674,166,0 chrXII 734633 . G C 1549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.43;MQ0=0;QD=18.89;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1582,174,0 chrXII 734648 . C A 1621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.690;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.30;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=19.77;ReadPosRankSum=0.507;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:82:99:1654,156,0 chrXII 734649 . A T 1629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.30;MQ0=0;QD=19.87;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:82:99:1662,180,0 chrXII 734662 . T C 1651 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8192;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.55;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=19.42;ReadPosRankSum=1.447;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:1684,163,0 chrXII 734674 . G A 1860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.35;MQ0=0;QD=20.90;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1893,204,0 chrXII 734706 . C T 1629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=21.16;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1662,177,0 chrXII 734728 . T C 1569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.06;MQ0=0;QD=21.79;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1602,180,0 chrXII 734732 . T C 1639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=22.76;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1672,189,0 chrXII 734740 . A G 1410 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.13;MQ0=0;QD=21.04;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1443,171,0 chrXII 734763 . C G 1835 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.76;MQ0=0;QD=23.23;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1868,210,0 chrXII 734768 . A C 1814 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.76;MQ0=0;QD=22.40;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:81:99:1847,210,0 chrXII 734773 . G A 1772 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.95;MQ0=0;QD=22.43;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1805,201,0 chrXII 734774 . T A 1798 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.95;MQ0=0;QD=22.76;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1831,201,0 chrXII 734786 . A T 1773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.18;MQ0=0;QD=21.11;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1806,198,0 chrXII 735147 . C T 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.32;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3718,387,0 chrXII 735461 . C T 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3049,318,0 chrXII 735680 . G A 4334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4334,439,0 chrXII 735713 . A G 4074.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:99:4074,417,0 chrXII 735833 . A G 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=23.64;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3759,414,0 chrXII 736001 . A G 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4045,429,0 chrXII 736058 . G A 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3464,354,0 chrXII 736088 . A G 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3221,342,0 chrXII 736154 . G A 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3674,373,0 chrXII 736586 . G A 3881.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.860;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3881,370,0 chrXII 737618 . A G 3954.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3954,411,0 chrXII 737716 . C T 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3306,330,0 chrXII 738125 . T C 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=25.41;ReadPosRankSum=-0.534;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3380,345,0 chrXII 739624 . T C 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3123,333,0 chrXII 740841 . T C 1385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=20.67;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1418,156,0 chrXII 741197 . T C 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3705,393,0 chrXII 741599 . T C 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2808,306,0 chrXII 742174 . C T 4270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.689;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=26.69;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:160:99:4270,412,0 chrXII 743763 . C T 4952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4952,499,0 chrXII 744290 . G T 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.51;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3961,409,0 chrXII 744299 . C T 3927.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3927,403,0 chrXII 744842 . T C 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2778,294,0 chrXII 744885 . T A 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2696,267,0 chrXII 745706 . C T 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4041,409,0 chrXII 746201 . T C 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3711,390,0 chrXII 746714 . G T 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3017,315,0 chrXII 747529 . G T 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3469,349,0 chrXII 747877 . C T 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9611;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3130,327,0 chrXII 747949 . C T 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3311,337,0 chrXII 748140 . T C 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=21.47;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2845,306,0 chrXII 748260 . C T 4138.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.05;SB=-2.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4138,430,0 chrXII 748299 . C T 4471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4471,439,0 chrXII 748361 . A G 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.933e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3771,399,0 chrXII 748416 . A T 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2808,294,0 chrXII 749415 . T C 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3748,372,0 chrXII 749442 . C T 3573.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3573,358,0 chrXII 749546 . T G 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2865,318,0 chrXII 749793 . A G 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;DP=119;Dels=0.00;FS=3.352;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=24.94;ReadPosRankSum=-1.237;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3001,308,0 chrXII 749830 . T G 2814 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2847,303,0 chrXII 751123 . A G 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2825,297,0 chrXII 753654 . C T 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3574,367,0 chrXII 755553 . C T 4330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.711;SB=-2.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:4330,421,0 chrXII 755941 . A G 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2964,315,0 chrXII 756137 . C T 5381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,202:202:99:5381,529,0 chrXII 757905 . T A 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3220,333,0 chrXII 758118 . C T 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3459,358,0 chrXII 758451 . A C 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3831,411,0 chrXII 758744 . T C 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3530,363,0 chrXII 758853 . C T 4009.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4009,388,0 chrXII 758967 . C T 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3723,358,0 chrXII 759162 . A G 2385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2418,261,0 chrXII 759318 . T G 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9641;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.829;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3167,336,0 chrXII 759452 . A G 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3430,360,0 chrXII 759480 . A T 3965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3965,397,0 chrXII 759815 . A G 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2988,327,0 chrXII 759842 . T C 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3380,357,0 chrXII 759860 . T C 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2886,306,0 chrXII 759872 . G A 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2386,249,0 chrXII 759985 . A G 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3665,399,0 chrXII 760163 . C G 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2736,300,0 chrXII 760396 . G A 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3851,396,0 chrXII 760719 . A T 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3274,330,0 chrXII 760907 . G A 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3418,340,0 chrXII 761145 . C T 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2762,282,0 chrXII 761210 . G A 2330 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.83;MQ0=0;QD=25.05;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2363,243,0 chrXII 761214 . C T 2363 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.73;MQ0=0;QD=22.08;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2396,243,0 chrXII 761221 . T C 2482 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=22.77;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2515,273,0 chrXII 761223 . T C 2616 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=24.00;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2649,273,0 chrXII 761264 . A G 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0020;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=24.71;ReadPosRankSum=1.701;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2801,297,0 chrXII 761322 . T C 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3373,369,0 chrXII 761335 . T C 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3090,348,0 chrXII 761502 . C G 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2964,309,0 chrXII 761706 . G A 3940.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3940,394,0 chrXII 762046 . C T 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3912,391,0 chrXII 762129 . C T 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3513,360,0 chrXII 762492 . A G 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.10;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3034,327,0 chrXII 762938 . T C 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3230,342,0 chrXII 763151 . A G 4058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4058,406,0 chrXII 763199 . C T 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3384,351,0 chrXII 763214 . G A 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3192,322,0 chrXII 763325 . A G 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3118,321,0 chrXII 763412 . T C 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=1;QD=24.79;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3346,357,0 chrXII 763502 . T C 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3123,330,0 chrXII 763742 . C T 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2973,303,0 chrXII 764095 . C G 4275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.00;SB=-2.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4275,432,0 chrXII 764193 . A C 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.11;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3420,354,0 chrXII 764314 . C T 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4109,435,0 chrXII 764448 . G A 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3765,385,0 chrXII 764481 . T C 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.577;DP=132;Dels=0.00;FS=3.802;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.394;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3210,328,0 chrXII 764623 . T C 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3344,354,0 chrXII 764640 . A G 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3109,345,0 chrXII 764796 . T A 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3484,355,0 chrXII 765566 . A G 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3576,381,0 chrXII 766135 . T C 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3457,369,0 chrXII 766225 . T G 4206.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4206,430,0 chrXII 766489 . G A 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=32.8723;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=1;QD=22.16;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3324,351,0 chrXII 770182 . T C 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.18;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3201,348,0 chrXII 770243 . G A 3804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3804,376,0 chrXII 770842 . A T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3267,336,0 chrXII 771112 . G A 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3047,306,0 chrXII 771115 . G A 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3241,330,0 chrXII 771397 . T C 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2656;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3089,318,0 chrXII 771559 . G T 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.924e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3912,400,0 chrXII 771799 . G A 1759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=1;QD=25.49;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1792,180,0 chrXII 772424 . T G 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3228,336,0 chrXII 773016 . G T 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3251,333,0 chrXII 773142 . C T 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3525,358,0 chrXII 773493 . A C 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3116,336,0 chrXII 773796 . A G 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2883,321,0 chrXII 774054 . T G 2210 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.40;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2243,243,0 chrXII 774096 . G C 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2974,312,0 chrXII 775104 . T C 2873 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2906,303,0 chrXII 776349 . A G 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.71;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3451,366,0 chrXII 776367 . A G 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.07;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2960,315,0 chrXII 776377 . A T 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.10;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2908,300,0 chrXII 776391 . C T 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.10;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2889,306,0 chrXII 776421 . T G 2036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.15;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2069,225,0 chrXII 776424 . T A 2153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.34;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2186,225,0 chrXII 776449 . A T 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=26.57;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2663,279,0 chrXII 776887 . G A 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3413,340,0 chrXII 776923 . A G 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2838,315,0 chrXII 777115 . T C 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3542,363,0 chrXII 777169 . C G 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3254,342,0 chrXII 777487 . G A 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3303,333,0 chrXII 777814 . A G 4086.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4086,432,0 chrXII 778114 . T G 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3461,360,0 chrXII 778146 . A G 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3314,351,0 chrXII 778218 . T C 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2675,282,0 chrXII 778362 . G A 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5562;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2785,288,0 chrXII 778497 . G A 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3057,306,0 chrXII 778775 . T G 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3387,351,0 chrXII 778938 . T C 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2848,297,0 chrXII 779222 . G A 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3742,370,0 chrXII 779367 . G A 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2882,288,0 chrXII 779373 . G A 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2801,294,0 chrXII 780019 . T C 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3110,327,0 chrXII 780099 . G A 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3547,364,0 chrXII 780201 . C T 3970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3970,388,0 chrXII 780306 . A G 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3138,333,0 chrXII 780315 . C G 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3000,318,0 chrXII 780447 . T A 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2928,291,0 chrXII 780550 . A G 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2946,312,0 chrXII 780589 . G C 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3016,324,0 chrXII 780660 . T A 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3681,373,0 chrXII 780841 . A G 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3193,351,0 chrXII 781630 . G A 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3294,334,0 chrXII 781631 . C G 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3230,345,0 chrXII 781671 . T A 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3398,348,0 chrXII 781674 . C T 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3205,327,0 chrXII 781778 . A C 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3563,378,0 chrXII 781999 . A G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2995,327,0 chrXII 782137 . A G 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3527,366,0 chrXII 782809 . A G 3756.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.498;DP=148;Dels=0.00;FS=7.079;HaplotypeScore=5.9400;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.404;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3756,399,0 chrXII 782815 . T C 4249.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;DP=163;Dels=0.00;FS=5.889;HaplotypeScore=8.5032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.541;QD=26.07;ReadPosRankSum=1.520;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:4249,447,0 chrXII 782839 . A G 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3404,363,0 chrXII 782878 . C T 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3237,330,0 chrXII 782905 . G T 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3298,333,0 chrXII 782933 . A C 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.32;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3122,327,0 chrXII 782987 . G A 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2842,285,0 chrXII 783530 . T C 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3299,348,0 chrXII 783557 . C T 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3031,309,0 chrXII 783739 . A G 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=22.54;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3144,342,0 chrXII 783750 . C T 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.078;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=21.13;ReadPosRankSum=1.514;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3054,291,0 chrXII 783852 . G A 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5718;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=18.29;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:2557,267,0 chrXII 784087 . T G 4104.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.18;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4104,435,0 chrXII 784121 . C T 4052.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.09;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4052,409,0 chrXII 784144 . T C 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.56;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3748,402,0 chrXII 784173 . C A 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.95;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3412,363,0 chrXII 784196 . G A 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.79;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3039,324,0 chrXII 784218 . C A 1884 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.42;MQ0=0;QD=17.94;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:1917,207,0 chrXII 784219 . G A 1901 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.91;MQ0=0;QD=18.82;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:1934,207,0 chrXII 784223 . C A 2026 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.18;MQ0=0;QD=19.30;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2059,225,0 chrXII 784242 . A G 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.615;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.21;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=22.07;ReadPosRankSum=-1.527;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2637,276,0 chrXII 784276 . A G 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.24;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3418,366,0 chrXII 784462 . A G 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.99;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3256,336,0 chrXII 784477 . T A 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.96;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2966,312,0 chrXII 784725 . G T 2576 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2609,264,0 chrXII 784791 . A T 4058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=24.90;SB=-2.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4058,400,0 chrXII 784849 . G A 2387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=87.0108;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:97:99:2420,255,0 chrXII 784881 . T C 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3058,327,0 chrXII 785038 . G A 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3036,306,0 chrXII 785067 . T A 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2786,282,0 chrXII 785227 . C T 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3013,315,0 chrXII 785869 . A G 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2941,306,0 chrXII 786201 . G T 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.05;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2971,309,0 chrXII 786265 . C T 161.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=88.6052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=1.51;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:21:194,21,0 chrXII 786288 . C T 2305 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=21.54;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2338,240,0 chrXII 786447 . A G 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2681,294,0 chrXII 786562 . T C 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3205,342,0 chrXII 787756 . T C 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.79;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3378,360,0 chrXII 788548 . G A 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3223,330,0 chrXII 788601 . C A 4044.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4044,400,0 chrXII 788615 . A G 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.24;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3577,366,0 chrXII 788626 . A G 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.24;MQ0=0;QD=22.10;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3293,345,0 chrXII 788638 . A G 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.56;MQ0=0;QD=23.06;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:3598,363,0 chrXII 788663 . A G 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.98;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3688,381,0 chrXII 788987 . G A 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4150,418,0 chrXII 789096 . C T 4402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.628;DP=167;Dels=0.00;FS=3.251;HaplotypeScore=2.8670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.322;SB=-2.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:167:99:4402,445,0 chrXII 789140 . A G 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8645;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=2;QD=23.19;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3210,333,0 chrXII 789236 . G A 4225.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=25.92;ReadPosRankSum=1.711;SB=-1.956e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:4225,425,0 chrXII 789259 . A G 3550.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;DP=137;Dels=0.00;FS=3.964;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.707;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3550,387,0 chrXII 789264 . T C 2895 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=119;Dels=0.00;FS=3.854;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=24.33;ReadPosRankSum=1.616;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2928,330,0 chrXII 789266 . G A 3143 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.528;DP=119;Dels=0.00;FS=3.854;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.24;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=26.41;ReadPosRankSum=1.616;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3176,328,0 chrXII 789268 . G A 3016 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.389;DP=121;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=24.93;ReadPosRankSum=1.560;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3049,324,0 chrXII 789269 . G A 3057 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.959;DP=121;Dels=0.00;FS=3.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=25.26;ReadPosRankSum=1.474;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3090,327,0 chrXII 789272 . G T 3304.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;DP=128;Dels=0.00;FS=3.364;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.245;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3304,345,0 chrXII 789356 . G A 2404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.53;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2437,246,0 chrXII 789358 . C A 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.72;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2470,249,0 chrXII 789373 . T C 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.09;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2803,291,0 chrXII 789615 . C G 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2830,291,0 chrXII 789623 . A G 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=24.34;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2808,300,0 chrXII 790272 . T A 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3464,355,0 chrXII 790622 . A G 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2830,294,0 chrXII 790674 . G T 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3519,352,0 chrXII 790718 . T C 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3614,384,0 chrXII 790747 . C T 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3404,346,0 chrXII 790841 . T C 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3301,342,0 chrXII 790871 . G A 3911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3911,394,0 chrXII 790990 . C T 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3209,333,0 chrXII 791350 . C T 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.662;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=26.28;ReadPosRankSum=-1.616;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3915,374,0 chrXII 791363 . G A 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7711;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3821,382,0 chrXII 791497 . G T 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4250;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3697,373,0 chrXII 791568 . G A 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3466,352,0 chrXII 792137 . G A 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3016,309,0 chrXII 792151 . T C 2573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=19.95;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:2606,282,0 chrXII 793351 . A T 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2654,264,0 chrXII 793555 . C T 1239 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.90;MQ0=0;QD=25.29;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1272,129,0 chrXII 793631 . A G 1812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.31;MQ0=0;QD=25.17;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1845,180,0 chrXII 794003 . T G 2088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2121,225,0 chrXII 794238 . T A 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:97:99:2557,264,0 chrXII 794427 . T A 2851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.41;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2884,303,0 chrXII 794440 . G A 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.00;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2868,300,0 chrXII 794468 . A G 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2706,279,0 chrXII 794631 . C A 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3404,348,0 chrXII 794638 . T C 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3274,342,0 chrXII 795312 . G A 2571 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2604,261,0 chrXII 795999 . A G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2974,294,0 chrXII 796025 . A T 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.27;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2939,288,0 chrXII 796042 . C T 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.74;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2993,300,0 chrXII 796074 . G A 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3286,339,0 chrXII 796093 . G A 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7343;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2932,306,0 chrXII 796132 . T A 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=1;QD=26.77;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3587,375,0 chrXII 796413 . T A 2574 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7666;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=20.93;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2607,258,0 chrXII 796574 . T C 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=126;Dels=0.00;FS=5.287;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=24.54;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3125,327,0 chrXII 796621 . A T 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3466,343,0 chrXII 796703 . C T 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2921,291,0 chrXII 796778 . G C 3817.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3817,390,0 chrXII 796782 . C T 3989.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3989,403,0 chrXII 796946 . T C 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3815,390,0 chrXII 797346 . G C 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2067;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2926,303,0 chrXII 797513 . T C 2679 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2712,285,0 chrXII 797627 . C T 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3429,349,0 chrXII 797757 . G A 2543 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2235;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=21.55;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2576,270,0 chrXII 797849 . T C 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3211,339,0 chrXII 797871 . G A 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3456,348,0 chrXII 797945 . G A 2846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2879,303,0 chrXII 797990 . C T 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.39;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2662,276,0 chrXII 797996 . C T 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.21;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2700,279,0 chrXII 798014 . A G 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3178,324,0 chrXII 798050 . C T 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2950,297,0 chrXII 798121 . C T 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3445,354,0 chrXII 798281 . C T 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2963,300,0 chrXII 800672 . T G 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2877,318,0 chrXII 800955 . A T 3906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.41;SB=-2.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3906,408,0 chrXII 801849 . G A 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.658;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.485;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3708,370,0 chrXII 802287 . C T 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3311,336,0 chrXII 803833 . A G 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7334;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3378,363,0 chrXII 807302 . A C 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=21.80;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3172,351,0 chrXII 808209 . C T 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.605;DP=137;Dels=0.01;FS=3.482;HaplotypeScore=3.8389;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=25.83;ReadPosRankSum=1.707;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3539,342,0 chrXII 808279 . T A 4036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4036,403,0 chrXII 808452 . G A 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3323,339,0 chrXII 808492 . G A 2464 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2497,255,0 chrXII 808557 . A G 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.95;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3227,339,0 chrXII 808740 . C G 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3508,363,0 chrXII 808993 . T A 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3826,367,0 chrXII 809043 . A T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3405,342,0 chrXII 809044 . A T 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3517,343,0 chrXII 809227 . G C 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3137,339,0 chrXII 809989 . G A 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3946,382,0 chrXII 810333 . G C 4487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5067;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:179:99:4487,465,0 chrXII 810422 . T C 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7329;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3536,375,0 chrXII 811065 . G A 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3306,333,0 chrXII 811301 . C T 2704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2737,279,0 chrXII 811798 . T G 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=163;Dels=0.00;FS=4.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=22.99;ReadPosRankSum=0.563;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:3747,390,0 chrXII 813365 . G A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3297,331,0 chrXII 814017 . G T 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3637,361,0 chrXII 814963 . C T 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3337,342,0 chrXII 815561 . G T 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3230,324,0 chrXII 815763 . C T 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=22.42;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3105,309,0 chrXII 815784 . T G 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3424,351,0 chrXII 816068 . A G 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2860,300,0 chrXII 816749 . C T 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2899,285,0 chrXII 817376 . T A 2329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.40;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2362,240,0 chrXII 817463 . G A 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5395;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2488,246,0 chrXII 817737 . G A 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=24.22;ReadPosRankSum=-1.187;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2649,258,0 chrXII 818015 . C A 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=1;QD=26.31;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3368,337,0 chrXII 818317 . C T 4392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4392,448,0 chrXII 818454 . A G 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.67;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2780,288,0 chrXII 818574 . A G 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2709,279,0 chrXII 818790 . A G 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3026,318,0 chrXII 819282 . T A 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3130,321,0 chrXII 819432 . A G 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3031,306,0 chrXII 819670 . A C 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3316,348,0 chrXII 819681 . A G 2774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2807,300,0 chrXII 819713 . C T 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.6400;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2733,279,0 chrXII 819771 . A T 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2854,291,0 chrXII 819834 . C G 2547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.73;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2580,285,0 chrXII 820297 . G A 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3521,369,0 chrXII 820606 . C G 2444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6496;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:103:99:2477,273,0 chrXII 822430 . A G 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3011,324,0 chrXII 822585 . G T 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3772,376,0 chrXII 822768 . A C 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3263,348,0 chrXII 823375 . T G 2699 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=175.6299;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2732,276,0 chrXII 826195 . G A 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3385,345,0 chrXII 826629 . A T 134.77 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=1.51;ReadPosRankSum=1.421;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,88:89:0:163,0,0 chrXII 827781 . T C 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3463,366,0 chrXII 828201 . G A 2751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2784,282,0 chrXII 828244 . T C 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=22.01;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:3676,390,0 chrXII 828257 . G C 4191.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.95;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4191,453,0 chrXII 828622 . T G 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=24.96;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3053,330,0 chrXII 828903 . C T 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3445,343,0 chrXII 829269 . C T 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.568;DP=148;Dels=0.00;FS=3.779;HaplotypeScore=7.1709;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.983;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3652,364,0 chrXII 829435 . G A 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.48;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3149,330,0 chrXII 829486 . T C 4485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.44;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4485,453,0 chrXII 829513 . C T 4774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.25;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4774,469,0 chrXII 829620 . C T 4309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:99:4309,430,0 chrXII 829636 . A G 4113.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4113,429,0 chrXII 830392 . C T 3616.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=138;Dels=0.00;FS=3.545;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:3616,361,0 chrXII 830462 . T C 3835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3835,399,0 chrXII 830534 . G A 4354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.04;SB=-2.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4354,433,0 chrXII 830644 . T A 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.802;DP=127;Dels=0.00;FS=2.437;HaplotypeScore=3.8729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.21;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=24.87;ReadPosRankSum=2.865;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,124:127:99:3191,305,0 chrXII 830647 . G T 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.06;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3202,324,0 chrXII 830721 . G A 2531 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.03;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2564,264,0 chrXII 830731 . A G 2297 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.81;MQ0=0;QD=23.44;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2330,261,0 chrXII 830741 . T A 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.26;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3010,306,0 chrXII 830945 . C T 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3416,346,0 chrXII 831007 . T C 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.09;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3197,336,0 chrXII 831032 . T G 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;DP=117;Dels=0.00;FS=3.123;HaplotypeScore=3.9447;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.229;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2870,296,0 chrXII 831036 . A T 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9447;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.97;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3119,324,0 chrXII 831046 . G A 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.53;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=26.06;ReadPosRankSum=-1.347;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3082,300,0 chrXII 831096 . A G 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.85;MQ0=0;QD=25.25;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3189,339,0 chrXII 831136 . G A 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3168,327,0 chrXII 831164 . G A 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2990,298,0 chrXII 831658 . C T 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9777;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2968,300,0 chrXII 831805 . C T 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=26.04;ReadPosRankSum=-1.587;SB=-1.965e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3723,339,0 chrXII 832172 . G A 2688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.05;MQ0=0;QD=26.88;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2721,294,0 chrXII 832198 . T C 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.46;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3184,351,0 chrXII 832234 . A T 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.74;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3134,339,0 chrXII 832249 . G T 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.99;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3513,381,0 chrXII 832255 . A G 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.60;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3422,378,0 chrXII 832264 . G A 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.21;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3437,366,0 chrXII 832282 . T C 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.05;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2822,309,0 chrXII 832312 . G A 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.671;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2993,315,0 chrXII 832387 . G T 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3432,351,0 chrXII 832594 . T G 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3332,363,0 chrXII 832633 . C T 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3271,328,0 chrXII 832932 . A G 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3777,408,0 chrXII 833260 . T C 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3032,321,0 chrXII 833326 . C T 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.533;DP=122;Dels=0.00;FS=3.382;HaplotypeScore=4.5513;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=26.11;ReadPosRankSum=0.028;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3218,307,0 chrXII 833446 . A G 3839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3839,393,0 chrXII 833500 . T C 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.10;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3214,354,0 chrXII 833647 . A G 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=25.49;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3747,387,0 chrXII 833686 . T C 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=25.33;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3394,363,0 chrXII 833760 . T G 1078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.97;MQ0=0;QD=17.11;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1111,123,0 chrXII 833774 . C T 1510 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.10;MQ0=0;QD=22.21;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1543,162,0 chrXII 833779 . C T 1380 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.24;MQ0=0;QD=21.90;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1413,147,0 chrXII 833859 . A G 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=24.99;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2832,300,0 chrXII 833865 . G A 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=25.95;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2914,297,0 chrXII 833890 . C A 2644 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2677,276,0 chrXII 833930 . T C 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3647,378,0 chrXII 833983 . A T 3842.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.992e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3842,382,0 chrXII 834031 . G A 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3449,343,0 chrXII 834053 . A G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3358,351,0 chrXII 834075 . G A 3638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3638,364,0 chrXII 834108 . A G 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2598,282,0 chrXII 834111 . A G 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2831,291,0 chrXII 834217 . A C 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2905,312,0 chrXII 834769 . C T 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3022,300,0 chrXII 834784 . G A 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3307,333,0 chrXII 835013 . A G 2688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2721,279,0 chrXII 835169 . C T 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3248,336,0 chrXII 835197 . T C 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7546;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3100,333,0 chrXII 835269 . G A 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3542,358,0 chrXII 835400 . G A 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.639;DP=149;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=25.37;ReadPosRankSum=1.546;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3780,382,0 chrXII 835412 . C T 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3809,382,0 chrXII 835497 . A T 3588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3588,369,0 chrXII 835509 . G A 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3810,388,0 chrXII 835692 . G A 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.92;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3546,366,0 chrXII 835791 . T C 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=23.11;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2829,291,0 chrXII 836779 . A C 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3434,348,0 chrXII 837118 . T C 2197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.15;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2230,240,0 chrXII 837401 . C T 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=27.05;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3036,315,0 chrXII 837471 . C T 4212.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.33;MQ0=0;QD=24.63;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4212,415,0 chrXII 837482 . G A 4306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.15;MQ0=0;QD=24.19;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4306,427,0 chrXII 837518 . T C 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=137;Dels=0.00;FS=6.592;HaplotypeScore=115.1878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.699;QD=0.12;ReadPosRankSum=2.216;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,7:137:46:46,0,541 chrXII 837543 . G A 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.556;DP=118;Dels=0.00;FS=4.591;HaplotypeScore=6.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.675;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2780,288,0 chrXII 837595 . C T 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=24.53;ReadPosRankSum=1.251;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:146:99:3581,363,0 chrXII 837744 . T C 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3142,339,0 chrXII 837839 . T A 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3076,309,0 chrXII 839246 . C T 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3435,343,0 chrXII 839360 . A G 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3692,390,0 chrXII 839487 . G A 2654 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2687,270,0 chrXII 839654 . A G 3557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=146;Dels=0.00;FS=3.862;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.498;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3557,350,0 chrXII 839722 . A G 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3374,348,0 chrXII 839783 . C G 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=23.19;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2839,300,0 chrXII 839881 . G A 251 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=1.48;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:170:30:284,30,0 chrXII 840068 . A G 2773 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;QD=22.92;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2806,315,0 chrXII 840073 . T C 2966 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.36;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2999,321,0 chrXII 840076 . A T 2983 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.49;MQ0=0;QD=22.95;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3016,303,0 chrXII 840079 . C T 3187 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.99;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3220,327,0 chrXII 840217 . T C 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3387,348,0 chrXII 840287 . T C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3624,372,0 chrXII 840577 . T C 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3823,405,0 chrXII 840682 . T C 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2991,315,0 chrXII 840750 . C T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3163,321,0 chrXII 841117 . A T 4503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4503,472,0 chrXII 841783 . A G 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3424,357,0 chrXII 842441 . T C 2754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2787,288,0 chrXII 842770 . G A 4010.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4010,406,0 chrXII 842917 . G A 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3003,306,0 chrXII 843392 . C G 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2886,312,0 chrXII 843400 . T C 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2693,300,0 chrXII 843685 . A G 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3807,390,0 chrXII 844038 . T C 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2925,309,0 chrXII 844191 . C A 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4030,406,0 chrXII 844293 . T C 2095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2128,234,0 chrXII 844425 . C T 2335 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.58;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2368,246,0 chrXII 844641 . T C 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3230,345,0 chrXII 845226 . C T 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2940,306,0 chrXII 845436 . T C 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.753;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=25.88;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3752,381,0 chrXII 846071 . C T 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3102,307,0 chrXII 846079 . G A 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3064,306,0 chrXII 846312 . T C 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3145,333,0 chrXII 846354 . C A 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2891,291,0 chrXII 846636 . A G 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7937;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2936,309,0 chrXII 846812 . T C 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3071,321,0 chrXII 847107 . C G 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2951,303,0 chrXII 847703 . A G 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7546;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3115,336,0 chrXII 847957 . C G 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3223,339,0 chrXII 847972 . T C 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3343,339,0 chrXII 848108 . G A 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.83;SB=-2.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3874,382,0 chrXII 848195 . A T 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=1;QD=26.40;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3696,387,0 chrXII 848443 . C T 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2872,291,0 chrXII 848719 . C T 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3254,328,0 chrXII 848842 . A G 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2641,282,0 chrXII 848908 . C G 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2570,267,0 chrXII 849017 . A G 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3575,384,0 chrXII 849160 . C A 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3249,333,0 chrXII 849445 . T G 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3851,396,0 chrXII 849491 . T C 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2771,288,0 chrXII 849515 . T C 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2792,294,0 chrXII 849610 . C G 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3191,330,0 chrXII 849651 . T C 413.11 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.664;DP=97;Dels=0.00;FS=7.226;HaplotypeScore=211.6653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=4.26;ReadPosRankSum=-6.276;SB=-9.114e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:13:443,0,13 chrXII 849654 . T C 159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;DP=99;Dels=0.00;FS=1.149;HaplotypeScore=211.6653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=1.61;ReadPosRankSum=4.855;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,84:99:99:189,0,322 chrXII 850042 . C T 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3696,361,0 chrXII 850147 . A G 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3710,387,0 chrXII 850372 . C T 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2958,300,0 chrXII 850558 . G A 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3196,324,0 chrXII 850897 . A G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3126,327,0 chrXII 850957 . G A 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3071,306,0 chrXII 851089 . A G 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3030,303,0 chrXII 851170 . T C 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2926,306,0 chrXII 851171 . C A 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3043,309,0 chrXII 851231 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2718,273,0 chrXII 851512 . T A 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2859,285,0 chrXII 851587 . C A 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2578,264,0 chrXII 851617 . T C 2070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2103,222,0 chrXII 851760 . C G 2114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.10;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2147,231,0 chrXII 851969 . A G 2230 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.24;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2263,231,0 chrXII 852007 . A G 2072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:86:99:2105,231,0 chrXII 852037 . A T 2559 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2592,258,0 chrXII 852274 . C T 2172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2205,228,0 chrXII 853448 . C G 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2931,318,0 chrXII 854687 . C G 2435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2468,270,0 chrXII 854761 . C T 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3272,324,0 chrXII 854846 . T A 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3079,309,0 chrXII 855144 . T C 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3511,372,0 chrXII 855154 . T C 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3339,357,0 chrXII 857000 . T A 2179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.76;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2212,225,0 chrXII 857019 . C T 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.07;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2665,279,0 chrXII 857137 . A G 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2750,297,0 chrXII 857477 . T C 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2700,288,0 chrXII 857516 . A T 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.72;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2652,267,0 chrXII 857614 . T C 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2820,282,0 chrXII 857630 . G C 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6711;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3118,321,0 chrXII 857656 . G A 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2977,306,0 chrXII 857685 . C T 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.575;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2805,262,0 chrXII 857745 . G A 2125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=86;Dels=0.00;FS=4.160;HaplotypeScore=4.4748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=24.71;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:2158,202,0 chrXII 857770 . T C 2345 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;DP=98;Dels=0.00;FS=4.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=23.93;ReadPosRankSum=0.141;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2378,229,0 chrXII 857849 . T C 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2954,297,0 chrXII 859351 . G T 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2837,282,0 chrXII 860959 . G A 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3076,309,0 chrXII 862078 . A G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=132;Dels=0.00;FS=4.578;HaplotypeScore=2.6938;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=24.23;ReadPosRankSum=1.653;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3231,336,0 chrXII 862341 . T C 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3894,405,0 chrXII 862412 . T C 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3416,363,0 chrXII 862568 . C T 3722.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=127.5324;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3722,378,0 chrXII 863943 . A G 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3011,324,0 chrXII 864291 . A G 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3034,339,0 chrXII 864999 . G T 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3349,336,0 chrXII 866286 . C A 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2861,294,0 chrXII 866496 . G T 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2794,279,0 chrXII 866643 . A G 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2654,282,0 chrXII 866895 . C T 2250 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.00;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2283,240,0 chrXII 867114 . T C 1636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=16.69;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:1669,183,0 chrXII 867118 . A T 2087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=22.20;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:94:99:2120,216,0 chrXII 867841 . C T 4366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4366,415,0 chrXII 869105 . A G 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3604,375,0 chrXII 869210 . T C 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3259,357,0 chrXII 870134 . A T 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.408;QD=25.53;ReadPosRankSum=-1.912;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,117:119:99:3071,274,0 chrXII 870213 . G A 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3504,348,0 chrXII 870323 . T G 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3429,354,0 chrXII 872180 . T C 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3077,327,0 chrXII 872357 . A G 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3486,360,0 chrXII 873021 . T C 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.25;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3990,423,0 chrXII 873153 . T C 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.21;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3565,366,0 chrXII 873155 . C A 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.71;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3686,370,0 chrXII 873227 . G A 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3315,348,0 chrXII 873300 . T C 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3563,369,0 chrXII 874247 . A G 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3880,408,0 chrXII 874259 . T A 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=26.22;SB=-2.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3986,403,0 chrXII 874343 . T C 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=131;Dels=0.00;FS=3.319;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=25.21;ReadPosRankSum=1.600;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3303,345,0 chrXII 874373 . G A 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3045,306,0 chrXII 874379 . G A 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.64;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3014,303,0 chrXII 874397 . G A 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.424;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.50;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=22.59;ReadPosRankSum=1.655;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3083,296,0 chrXII 874427 . T C 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;QD=22.83;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3424,387,0 chrXII 874433 . C T 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.27;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3115,324,0 chrXII 874454 . C T 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.82;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3175,333,0 chrXII 874715 . G A 4146.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4146,424,0 chrXII 874812 . A G 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3706,384,0 chrXII 874900 . T G 4835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.42;SB=-2.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:4835,483,0 chrXII 875066 . G C 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3620,369,0 chrXII 875363 . T C 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3102,324,0 chrXII 875555 . A G 4207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4207,435,0 chrXII 875602 . T C 4218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6963;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=23.97;ReadPosRankSum=1.475;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,175:176:99:4218,456,0 chrXII 876120 . G A 3726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3726,376,0 chrXII 876714 . A G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=22.46;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3302,345,0 chrXII 877286 . G A 4019.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4019,415,0 chrXII 877560 . T G 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=216.4978;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.46;MQ0=0;QD=24.27;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3261,360,0 chrXII 877593 . C T 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.08;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3025,324,0 chrXII 877606 . C A 2236 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.14;MQ0=0;QD=20.90;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2269,243,0 chrXII 877607 . T A 2263 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.14;MQ0=0;QD=21.15;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2296,243,0 chrXII 877625 . C T 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.14;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3388,360,0 chrXII 877647 . C T 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.64;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3559,366,0 chrXII 877736 . C T 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.88;MQ0=0;QD=22.20;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2874,300,0 chrXII 877739 . T A 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.95;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3158,327,0 chrXII 877782 . C T 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.67;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3355,336,0 chrXII 877787 . G A 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.77;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3482,340,0 chrXII 877944 . C T 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3792,387,0 chrXII 877967 . A T 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3529,357,0 chrXII 878009 . T C 4274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4274,450,0 chrXII 878188 . T C 4210.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.933e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4210,430,0 chrXII 878238 . T C 4427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.74;SB=-2.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4427,462,0 chrXII 878842 . A G 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9815;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2914,312,0 chrXII 878875 . G A 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3139,321,0 chrXII 879385 . A G 2473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2506,279,0 chrXII 879756 . C T 4089.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4089,415,0 chrXII 880035 . G A 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3104,306,0 chrXII 880251 . C A 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3308,334,0 chrXII 880276 . G C 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2963,318,0 chrXII 880319 . C T 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8096;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2782,288,0 chrXII 880937 . C T 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3352,331,0 chrXII 881541 . T C 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2966,312,0 chrXII 881580 . A G 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3037,330,0 chrXII 881641 . C T 2078 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.50;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2111,219,0 chrXII 881642 . C T 2095 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.50;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2128,219,0 chrXII 881645 . C T 2079 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.81;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2112,219,0 chrXII 881789 . C A 2479 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.83;MQ0=0;QD=25.56;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2512,255,0 chrXII 881897 . C T 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3599,352,0 chrXII 882085 . A G 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.42;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3329,342,0 chrXII 882430 . T C 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3599,375,0 chrXII 882523 . T C 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3585,387,0 chrXII 882626 . C A 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3602,373,0 chrXII 882901 . G A 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2967,306,0 chrXII 882976 . T C 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=25.71;ReadPosRankSum=1.452;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3496,351,0 chrXII 883249 . G A 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3112,318,0 chrXII 883429 . T C 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.11;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3742,381,0 chrXII 883499 . A G 3979.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:3979,405,0 chrXII 884518 . T C 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.970e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3713,378,0 chrXII 884621 . A G 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6478;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3046,336,0 chrXII 884656 . C T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.15;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3019,303,0 chrXII 884838 . T C 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3710;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.25;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3586,387,0 chrXII 884976 . T C 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.41;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2694,300,0 chrXII 885037 . G C 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.17;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3612,384,0 chrXII 885068 . C T 4096.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=138.8544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4096,400,0 chrXII 885146 . G T 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2963,303,0 chrXII 885190 . A T 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3050,312,0 chrXII 885216 . T C 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3594,378,0 chrXII 885248 . T A 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3647,364,0 chrXII 885268 . T C 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3739,384,0 chrXII 885303 . A G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3168,336,0 chrXII 885401 . A G 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3884,396,0 chrXII 885458 . C T 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2923,303,0 chrXII 885490 . C T 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3212,333,0 chrXII 885524 . A C 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3431,348,0 chrXII 885536 . G A 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3498,337,0 chrXII 885677 . T G 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3345,363,0 chrXII 885724 . G A 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3368,343,0 chrXII 885745 . T C 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3282,348,0 chrXII 886357 . A G 3973.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3973,426,0 chrXII 886589 . T A 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3701,367,0 chrXII 886649 . A G 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6914;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.341;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3250,342,0 chrXII 886772 . A G 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3684,378,0 chrXII 886838 . C T 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3313,334,0 chrXII 886844 . G A 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3239,319,0 chrXII 886881 . G C 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3191,339,0 chrXII 886902 . C T 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2763,282,0 chrXII 887067 . T C 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3543,381,0 chrXII 887300 . C T 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3109,321,0 chrXII 887306 . C T 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3101,318,0 chrXII 887672 . T C 2042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=22.44;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2075,231,0 chrXII 888137 . G A 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3731,384,0 chrXII 888182 . A G 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3626,375,0 chrXII 888260 . C T 2101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2134,213,0 chrXII 888362 . G C 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2923,297,0 chrXII 888653 . C T 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=26.59;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2532,264,0 chrXII 888676 . T A 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2965,294,0 chrXII 888713 . A G 2321 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2354,243,0 chrXII 888715 . T A 2370 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2403,243,0 chrXII 888722 . T A 2830 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2863,294,0 chrXII 888875 . A G 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3162,321,0 chrXII 889106 . C T 3909.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4458;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3909,382,0 chrXII 889289 . C A 4017.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.95;SB=-2.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4017,408,0 chrXII 889361 . C T 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3373,345,0 chrXII 889388 . T C 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3494,375,0 chrXII 889415 . T C 2851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2884,300,0 chrXII 889427 . G A 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2963,297,0 chrXII 889750 . G A 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3410,349,0 chrXII 890158 . A G 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2915,291,0 chrXII 890224 . A G 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3186,330,0 chrXII 890351 . G C 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=136;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.535;SB=-1.745e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3316,345,0 chrXII 890536 . C A 2563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0509;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2596,261,0 chrXII 890548 . C T 2339 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.28;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2372,246,0 chrXII 890591 . A G 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2441,264,0 chrXII 891003 . T C 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.12;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2566,276,0 chrXII 891197 . A G 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3293,339,0 chrXII 891299 . T G 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2876,297,0 chrXII 891320 . A G 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=21.90;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2551,282,0 chrXII 891323 . C T 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2723,279,0 chrXII 891452 . C T 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3136,313,0 chrXII 891875 . T C 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2747,294,0 chrXII 891881 . G A 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2830,291,0 chrXII 892172 . T A 3800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3800,391,0 chrXII 892383 . A T 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3446,354,0 chrXII 892436 . C T 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.373;DP=128;Dels=0.00;FS=6.475;HaplotypeScore=8.8799;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.392;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.700;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,126:128:99:2945,275,0 chrXII 892496 . A G 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3193,354,0 chrXII 892508 . A G 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2971,330,0 chrXII 893140 . T C 4117.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4117,408,0 chrXII 893372 . C T 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.32;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3363,351,0 chrXII 893382 . G A 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.20;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3324,345,0 chrXII 893396 . G A 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.53;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3439,355,0 chrXII 893440 . T A 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.18;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3257,333,0 chrXII 893453 . A T 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.60;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3309,334,0 chrXII 893464 . T A 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.08;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.995e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3651,373,0 chrXII 893651 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9270;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3268,339,0 chrXII 893936 . A G 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3224,345,0 chrXII 894104 . T A 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3636,364,0 chrXII 894212 . G A 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3031,306,0 chrXII 894452 . T C 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3272,345,0 chrXII 894680 . A G 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=1;QD=22.40;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:2922,318,0 chrXII 894758 . C A 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.78;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3915,394,0 chrXII 894791 . C G 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3912,402,0 chrXII 894953 . G A 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3238,330,0 chrXII 895061 . C T 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3123,312,0 chrXII 895451 . C T 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2722,273,0 chrXII 896189 . C T 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2741,285,0 chrXII 896197 . A G 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2823,294,0 chrXII 897689 . T C 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;DP=154;Dels=0.00;FS=3.951;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=24.73;ReadPosRankSum=1.080;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:3809,371,0 chrXII 897975 . A G 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.58;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3504,375,0 chrXII 898044 . G A 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3233,333,0 chrXII 898095 . C T 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3558,366,0 chrXII 898119 . G A 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3508,349,0 chrXII 898209 . G A 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3204,324,0 chrXII 898212 . A G 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3240,330,0 chrXII 898520 . C T 4092.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4092,409,0 chrXII 899119 . A G 2140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0535;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=23.26;ReadPosRankSum=0.753;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:2173,234,0 chrXII 899154 . T C 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=83.1708;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2727,297,0 chrXII 899303 . T C 4235.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=164;Dels=0.00;FS=4.060;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.308;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:164:99:4235,435,0 chrXII 899462 . A C 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3019,330,0 chrXII 899557 . C A 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2215;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3207,315,0 chrXII 899580 . C G 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3499,363,0 chrXII 899679 . C T 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=1;QD=26.17;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3095,315,0 chrXII 899955 . T C 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2812,303,0 chrXII 899979 . G A 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3860,397,0 chrXII 900280 . T C 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3478,375,0 chrXII 900312 . A G 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3401,348,0 chrXII 900812 . C G 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:149:99:3829,411,0 chrXII 900885 . A G 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3741,384,0 chrXII 901022 . C G 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;DP=110;Dels=0.00;FS=3.693;HaplotypeScore=5.6792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.512;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2917,309,0 chrXII 901179 . C T 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3814,379,0 chrXII 901473 . G A 4431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4431,454,0 chrXII 901592 . G A 4410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4410,433,0 chrXII 901809 . G A 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3113,318,0 chrXII 901826 . C T 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3779,393,0 chrXII 902330 . T C 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2829,291,0 chrXII 902591 . G A 4010.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4010,391,0 chrXII 902616 . T C 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6235;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3690,369,0 chrXII 902761 . G A 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3387,340,0 chrXII 902948 . C A 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.980e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3608,373,0 chrXII 903374 . A T 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8635;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3315,330,0 chrXII 903464 . A G 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4045,400,0 chrXII 903720 . T A 4660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4660,478,0 chrXII 903957 . T C 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3357,354,0 chrXII 904002 . C T 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3710,384,0 chrXII 904239 . T C 2508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=22.19;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2541,273,0 chrXII 904437 . C T 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2759,276,0 chrXII 904580 . C T 2005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.73;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2038,207,0 chrXII 904696 . A G 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=25.02;ReadPosRankSum=0.992;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3277,348,0 chrXII 904915 . G A 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3240,327,0 chrXII 905508 . C T 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3193,322,0 chrXII 905606 . T A 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3549,358,0 chrXII 905672 . T C 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3197,342,0 chrXII 905691 . A G 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3063,333,0 chrXII 905771 . A T 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3387,354,0 chrXII 905887 . C T 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=22.14;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2867,291,0 chrXII 906336 . C T 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3149,324,0 chrXII 906431 . T C 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3023,312,0 chrXII 907052 . G C 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2851,303,0 chrXII 907076 . A G 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3093,324,0 chrXII 907910 . C T 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2965,309,0 chrXII 908027 . G A 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3739,382,0 chrXII 908778 . A G 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3384,360,0 chrXII 908930 . C T 2509 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.41;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2542,252,0 chrXII 909231 . T G 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0467;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3123,333,0 chrXII 909328 . T A 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3453,349,0 chrXII 909639 . G A 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3491,357,0 chrXII 909986 . C A 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=1;QD=25.77;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3126,306,0 chrXII 910020 . G A 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2950,297,0 chrXII 910090 . C T 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3011,315,0 chrXII 910292 . A G 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2645,264,0 chrXII 910376 . G A 2588 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2621,267,0 chrXII 910431 . A G 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3146,324,0 chrXII 910517 . T A 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3186,316,0 chrXII 910650 . A G 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.095;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3158,316,0 chrXII 910661 . C T 4226.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=26.09;ReadPosRankSum=-0.791;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4226,404,0 chrXII 910890 . T C 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2490,267,0 chrXII 911258 . T C 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2805,312,0 chrXII 911387 . G T 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3222,325,0 chrXII 911501 . A G 2552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2585,279,0 chrXII 911510 . T C 2451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2484,258,0 chrXII 912351 . C T 1840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.67;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1873,192,0 chrXII 912364 . T C 1856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1889,201,0 chrXII 912538 . C T 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3602,361,0 chrXII 912718 . C G 2235 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.29;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2268,246,0 chrXII 912982 . G T 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3735,376,0 chrXII 913000 . A G 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=134;Dels=0.00;FS=4.369;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=24.00;ReadPosRankSum=0.052;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3249,354,0 chrXII 913066 . A G 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3431,357,0 chrXII 913219 . C T 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.38;SB=-2.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3798,385,0 chrXII 913342 . G A 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2724,273,0 chrXII 913431 . A G 2650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2683,285,0 chrXII 913684 . G A 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3328,345,0 chrXII 913801 . G A 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3558,381,0 chrXII 913906 . A G 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3062,315,0 chrXII 913948 . G A 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3203,322,0 chrXII 914086 . C T 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3774,379,0 chrXII 914428 . A G 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3460,381,0 chrXII 914928 . C T 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3702,381,0 chrXII 914959 . C G 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3100,336,0 chrXII 914980 . G A 4310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-2.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4310,421,0 chrXII 915065 . A G 3817.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.649;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=22.72;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:168:99:3817,399,0 chrXII 915110 . C T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3378,345,0 chrXII 915461 . A T 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6961;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3816,385,0 chrXII 915712 . T C 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3098,327,0 chrXII 916326 . G A 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3467,352,0 chrXII 916338 . C T 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3427,349,0 chrXII 917166 . G C 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3701,372,0 chrXII 917305 . T C 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3110,339,0 chrXII 917406 . C T 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3746,376,0 chrXII 917418 . C T 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3703,370,0 chrXII 917691 . G A 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4041,412,0 chrXII 917724 . G A 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3897,394,0 chrXII 918048 . T C 4044.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.81;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4044,429,0 chrXII 918216 . G A 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3502,357,0 chrXII 918511 . T C 4382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9125;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=23.82;SB=-2.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:184:99:4382,453,0 chrXII 918570 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3266,351,0 chrXII 918735 . C T 4133.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4133,415,0 chrXII 918824 . A G 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3628,378,0 chrXII 919081 . G A 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.34;SB=-2.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3846,402,0 chrXII 919181 . T C 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3789,396,0 chrXII 919261 . T G 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3064,330,0 chrXII 919424 . T C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;DP=114;Dels=0.00;FS=3.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=25.74;ReadPosRankSum=0.912;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2967,315,0 chrXII 919648 . C T 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3574,370,0 chrXII 920189 . G T 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3167,321,0 chrXII 920406 . A G 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2861,303,0 chrXII 920445 . T C 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2867,300,0 chrXII 920484 . T C 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3087,321,0 chrXII 920502 . G A 3643.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3643,369,0 chrXII 920529 . A G 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3798,393,0 chrXII 920774 . C T 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3578,378,0 chrXII 920946 . C T 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3961,403,0 chrXII 921053 . A G 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3690,384,0 chrXII 921081 . G A 3933.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6227;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3933,394,0 chrXII 921316 . G A 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3541,360,0 chrXII 921404 . A C 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3654,390,0 chrXII 921420 . T C 4479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.61;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4479,480,0 chrXII 921443 . G C 4483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.33;SB=-2.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4483,459,0 chrXII 922026 . C A 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3611,375,0 chrXII 922092 . A G 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3274,339,0 chrXII 922242 . C G 4483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4483,465,0 chrXII 922517 . A G 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3880,396,0 chrXII 922595 . G A 4088.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4088,412,0 chrXII 922882 . T C 3709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3709,402,0 chrXII 923234 . T G 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3698,381,0 chrXII 923248 . G A 4058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.989e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4058,415,0 chrXII 923570 . G A 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3716,379,0 chrXII 923628 . A G 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3951,432,0 chrXII 923659 . C G 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3877,405,0 chrXII 923885 . C T 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.436;DP=132;Dels=0.01;FS=4.838;HaplotypeScore=24.6728;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=25.98;ReadPosRankSum=1.256;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3429,349,0 chrXII 924128 . A G 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.00;SB=-2.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4030,420,0 chrXII 924245 . A C 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=24.14;ReadPosRankSum=0.027;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3123,313,0 chrXII 924335 . T A 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3910,403,0 chrXII 924464 . G A 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3529,360,0 chrXII 924492 . T C 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3170,333,0 chrXII 924534 . C G 3899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=146;Dels=0.00;FS=4.801;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.155;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3899,405,0 chrXII 924556 . T C 3934.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3934,414,0 chrXII 924908 . A T 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3080,318,0 chrXII 925036 . T C 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4404;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3111,336,0 chrXII 925356 . C T 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3513,372,0 chrXII 925463 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3266,336,0 chrXII 925665 . T C 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3501,369,0 chrXII 925788 . T C 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3054;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.25;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3088,348,0 chrXII 925840 . G A 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3730,376,0 chrXII 925971 . A G 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3693,387,0 chrXII 926441 . T G 3973.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3973,402,0 chrXII 926623 . C T 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3445,351,0 chrXII 926814 . A G 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.655;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.244;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3414,366,0 chrXII 926836 . T C 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3020,321,0 chrXII 927424 . G A 3905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3905,385,0 chrXII 927454 . T C 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3571,372,0 chrXII 927499 . A C 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3332,354,0 chrXII 927638 . C T 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3418,346,0 chrXII 927914 . G A 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3458,357,0 chrXII 928158 . G T 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2973,294,0 chrXII 928259 . A C 1940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.67;MQ0=0;QD=24.56;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1973,219,0 chrXII 928263 . T C 2048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.95;MQ0=0;QD=23.01;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2081,231,0 chrXII 928273 . A G 2186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.99;MQ0=0;QD=21.86;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2219,243,0 chrXII 928276 . A T 2055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.35;MQ0=0;QD=20.55;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2088,222,0 chrXII 928304 . T C 2211 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.18;MQ0=0;QD=21.89;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2244,243,0 chrXII 928330 . C G 2241 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;MQ0=0;QD=22.19;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2274,240,0 chrXII 928539 . C G 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2746,279,0 chrXII 928626 . C G 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3445,357,0 chrXII 930728 . A G 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3851,396,0 chrXII 932266 . G A 4386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.74;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4386,465,0 chrXII 932624 . C G 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.163;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=23.98;ReadPosRankSum=1.706;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3246,317,0 chrXII 934434 . C T 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3572,370,0 chrXII 935517 . C G 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3173,339,0 chrXII 937855 . A G 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3688,387,0 chrXII 938134 . A G 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.98;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3229,339,0 chrXII 940926 . G T 1954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1987,210,0 chrXII 941196 . G A 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.81;MQ0=2;MQRankSum=1.666;QD=1.80;ReadPosRankSum=-1.666;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,2:11:6:51,6,0 chrXII 941385 . G C 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.798;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.97;MQ0=88;MQRankSum=1.623;QD=0.55;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,18:107:89:89,0,261 chrXII 941431 . C T 261.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.357;DP=109;Dels=0.00;FS=3.360;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.94;MQ0=72;MQRankSum=-0.843;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.904;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:291,0,372 chrXII 941634 . A C 40.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.79;MQ0=118;MQRankSum=1.883;QD=0.26;ReadPosRankSum=1.481;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,17:151:70:70,0,268 chrXII 944238 . C A 81.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.281;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3693;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.89;MQ0=97;MQRankSum=0.548;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:56,70:126:12:114,12,0 chrXII 944429 . C T 129.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;DP=378;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.13;MQ0=248;MQRankSum=-1.720;QD=0.34;ReadPosRankSum=1.881;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:331,46:378:99:159,0,2202 chrXII 946282 . A C 71.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.383;DP=92;Dels=0.00;FS=1.206;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.24;MQ0=50;MQRankSum=0.733;QD=0.77;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-4.284e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,24:92:27:101,0,27 chrXII 947105 . T A 67.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.03;MQ0=5;MQRankSum=-0.731;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.731;SB=-2.413e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:14:97,0,14 chrXII 947537 . A T 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=26.83;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2662,273,0 chrXII 948612 . C T 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2992,303,0 chrXII 949489 . C T 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3487,363,0 chrXII 950322 . A G 1750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.04;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:1783,201,0 chrXII 950340 . A T 136.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.4704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.66;MQ0=0;QD=1.38;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:18:169,18,0 chrXII 950350 . T A 2207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.089;DP=117;Dels=0.00;FS=54.990;HaplotypeScore=107.4134;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.26;MQ0=0;MQRankSum=2.700;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,105:117:99:2240,230,0 chrXII 950788 . T C 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2857,309,0 chrXII 950793 . G A 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3003,303,0 chrXII 950859 . C T 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2693,279,0 chrXII 951032 . C T 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.23;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3455,348,0 chrXII 951088 . A G 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.13;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2986,336,0 chrXII 951524 . T C 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3413,363,0 chrXII 951540 . A G 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3438,366,0 chrXII 951629 . A T 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3622,367,0 chrXII 952187 . C T 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3276,324,0 chrXII 952262 . G A 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3526,348,0 chrXII 952346 . G A 4020.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6214;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4020,411,0 chrXII 952469 . C T 3879.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3879,388,0 chrXII 952975 . G A 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3667,367,0 chrXII 952994 . C T 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3852,379,0 chrXII 953059 . G T 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3319,337,0 chrXII 953266 . C T 2356 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.47;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2389,243,0 chrXII 953330 . T C 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3082,318,0 chrXII 953605 . A G 4356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4356,430,0 chrXII 953884 . G T 4293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=1;QD=25.71;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4293,433,0 chrXII 954049 . G A 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3608,369,0 chrXII 954254 . T G 4693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37;SB=-2.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4693,469,0 chrXII 954366 . C T 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3602,364,0 chrXII 954609 . G C 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=23.52;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3458,363,0 chrXII 954827 . T C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.59;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2976,312,0 chrXII 954897 . A G 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3669,375,0 chrXII 955168 . A G 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=23.93;SB=-2.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4068,420,0 chrXII 955729 . C T 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2975,306,0 chrXII 955765 . G C 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3125,324,0 chrXII 955822 . T C 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=19.34;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:2972,318,0 chrXII 956170 . G A 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3488,352,0 chrXII 956371 . G C 4446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4446,477,0 chrXII 956536 . T C 3018 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.41;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3051,345,0 chrXII 956543 . C T 3371.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.76;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3371,351,0 chrXII 956545 . A G 3317.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3317,354,0 chrXII 956593 . G A 3588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.55;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3588,364,0 chrXII 956833 . A G 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3508,393,0 chrXII 957061 . A G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3177,351,0 chrXII 957064 . G A 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3436,351,0 chrXII 957115 . C T 3977.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5130;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.33;SB=-2.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3977,400,0 chrXII 957510 . C T 4300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4300,442,0 chrXII 958009 . A G 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2999,333,0 chrXII 958253 . G A 2668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8304;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.90;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2701,279,0 chrXII 958334 . A G 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3344,354,0 chrXII 958370 . A G 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.59;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3669,387,0 chrXII 958385 . C A 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.00;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3915,405,0 chrXII 958478 . T C 2137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=23.48;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2170,234,0 chrXII 958590 . A G 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3642,390,0 chrXII 958623 . A G 4070.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4070,438,0 chrXII 959018 . A G 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2806,303,0 chrXII 959099 . C T 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3590,372,0 chrXII 959121 . A T 110.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=194.3903;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=1.03;ReadPosRankSum=-4.635;SB=-3.126e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:98,8:107:15:143,15,0 chrXII 959190 . T C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3624,393,0 chrXII 959546 . G A 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2760,285,0 chrXII 959627 . C T 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3012,309,0 chrXII 959679 . C A 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2899,288,0 chrXII 959687 . A G 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=24.94;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2926,306,0 chrXII 959702 . A C 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=24.13;ReadPosRankSum=1.456;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2760,306,0 chrXII 959834 . C T 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:3017,312,0 chrXII 960045 . C T 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3295,337,0 chrXII 960131 . C T 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2914,303,0 chrXII 960141 . A G 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=24.42;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2964,318,0 chrXII 960158 . G A 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3157,324,0 chrXII 960228 . A C 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3146,342,0 chrXII 960476 . G A 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3500,357,0 chrXII 960996 . C T 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2867,297,0 chrXII 960999 . A C 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=26.02;ReadPosRankSum=1.573;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2869,306,0 chrXII 961196 . A T 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3700,375,0 chrXII 961235 . T A 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3524,369,0 chrXII 961565 . A T 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3200,321,0 chrXII 961655 . G A 2919 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.44;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2952,300,0 chrXII 961667 . A G 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.52;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2700,279,0 chrXII 961676 . C T 2767 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.52;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2800,285,0 chrXII 961688 . T C 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.51;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2725,294,0 chrXII 961731 . A G 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.17;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2953,321,0 chrXII 961961 . A G 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2728,285,0 chrXII 961974 . C T 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3008,303,0 chrXII 962189 . G A 2547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2580,258,0 chrXII 962683 . G A 4421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4421,427,0 chrXII 962717 . T C 3736.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.50;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3736,381,0 chrXII 963090 . G A 4394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.55;SB=-2.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4394,436,0 chrXII 963160 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2922,315,0 chrXII 963364 . C G 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2823,288,0 chrXII 963392 . A G 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2985,294,0 chrXII 963469 . A G 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2518,261,0 chrXII 963501 . C A 106.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=96.2369;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=0.97;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:15:139,15,0 chrXII 963619 . T C 2484 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2517,261,0 chrXII 963807 . G A 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3712,361,0 chrXII 963928 . T C 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2857,300,0 chrXII 964054 . A G 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6801;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3107,324,0 chrXII 964078 . G A 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2900,297,0 chrXII 964132 . C T 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2869,291,0 chrXII 964450 . C T 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3155,315,0 chrXII 964503 . A G 2198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=21.76;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2231,237,0 chrXII 964507 . T C 2275 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=23.21;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2308,246,0 chrXII 964591 . T G 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3000,315,0 chrXII 964951 . C T 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3757,373,0 chrXII 964996 . G A 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3733,376,0 chrXII 965047 . T A 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3130,330,0 chrXII 965215 . C T 2354 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=27.06;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2387,246,0 chrXII 965233 . G A 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.97;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2690,270,0 chrXII 965294 . T C 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2571,264,0 chrXII 965342 . G A 2697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2730,294,0 chrXII 965348 . T C 2219 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.827;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:2252,224,0 chrXII 965441 . C T 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.67;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2600,264,0 chrXII 965658 . G A 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2994,291,0 chrXII 966011 . A G 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3342,354,0 chrXII 966217 . C T 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.06;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2639,267,0 chrXII 966807 . C T 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3127,312,0 chrXII 966841 . A G 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3399,366,0 chrXII 967075 . C G 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3197,333,0 chrXII 967268 . A G 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2519,267,0 chrXII 967302 . T C 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3057,321,0 chrXII 967624 . G A 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=26.13;ReadPosRankSum=-1.489;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3344,324,0 chrXII 968703 . C T 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3276,345,0 chrXII 969880 . A G 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2573,288,0 chrXII 969967 . G A 1943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1976,207,0 chrXII 970288 . G T 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3417,354,0 chrXII 974574 . A G 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3744,393,0 chrXII 974822 . C T 2298 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2331,240,0 chrXII 974945 . G A 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.74;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3055,309,0 chrXII 974973 . A G 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.19;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3124,339,0 chrXII 975467 . G C 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3206,336,0 chrXII 975612 . C T 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3352,339,0 chrXII 975675 . G A 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3175,316,0 chrXII 975964 . T G 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=86.0192;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.74;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3130,339,0 chrXII 975966 . A G 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=88.9188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.13;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2815,297,0 chrXII 976122 . T C 1947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.44;MQ0=0;QD=24.96;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1980,210,0 chrXII 978665 . G T 296.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.87;MQ0=42;MQRankSum=0.168;QD=1.69;ReadPosRankSum=0.008;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,37:175:99:326,0,1807 chrXII 981116 . A G 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;DP=338;Dels=0.00;FS=2.965;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=4.79;MQ0=310;MQRankSum=-0.941;QD=0.05;ReadPosRankSum=-1.976;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:323,15:338:47:47,0,204 chrXII 981371 . T A 874.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.136;DP=536;Dels=0.00;FS=3.410;HaplotypeScore=46.0582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.38;MQ0=320;MQRankSum=-0.327;QD=1.63;ReadPosRankSum=2.063;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:377,139:536:99:904,0,1736 chrXII 981378 . T A 66.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;DP=476;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=45.2260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.05;MQ0=263;MQRankSum=0.201;QD=0.14;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:414,62:476:96:96,0,2702 chrXII 981461 . A G 104.34 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.90;MQ0=90;QD=0.81;SB=9.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,71:129:15:137,15,0 chrXII 981894 . C T 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.86;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2870,294,0 chrXII 981911 . A G 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.98;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2827,288,0 chrXII 982371 . T A 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3962,414,0 chrXII 982986 . C A 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=22.97;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2767,273,0 chrXII 983190 . C T 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3487,349,0 chrXII 986998 . A G 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3318,333,0 chrXII 986999 . T C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3279,333,0 chrXII 987115 . A G 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3041,330,0 chrXII 987151 . G A 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3436,346,0 chrXII 987293 . T C 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4174;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:99:3855,396,0 chrXII 987375 . A G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3358,348,0 chrXII 987608 . A G 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=1;QD=25.24;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2860,300,0 chrXII 987807 . T C 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=23.81;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3810,396,0 chrXII 987906 . C T 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3130,321,0 chrXII 987942 . C T 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2937,294,0 chrXII 987981 . G A 2709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2742,279,0 chrXII 987999 . G A 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2866,291,0 chrXII 988464 . G A 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2725,282,0 chrXII 988495 . A G 2265 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2298,246,0 chrXII 989078 . A G 2313 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=24.87;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:93:99:2346,243,0 chrXII 989108 . A G 2498 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.629;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=24.73;ReadPosRankSum=0.669;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2531,258,0 chrXII 989610 . G A 2270 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2303,240,0 chrXII 989828 . A G 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2864,306,0 chrXII 989831 . C T 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2917,297,0 chrXII 989981 . A G 2529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;DP=98;Dels=0.00;FS=3.191;HaplotypeScore=6.6872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.273;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2562,264,0 chrXII 990547 . A G 4341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4341,453,0 chrXII 990580 . G A 4256.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4256,436,0 chrXII 990741 . G A 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=13.5311;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2578,264,0 chrXII 990848 . A G 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3849,387,0 chrXII 990875 . C T 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3251,331,0 chrXII 990920 . G T 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3388,340,0 chrXII 990941 . A G 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3743,390,0 chrXII 991073 . C T 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3211,321,0 chrXII 992601 . A C 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7738;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3404,369,0 chrXII 992990 . A G 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=1;QD=24.23;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:151:99:3683,381,0 chrXII 993389 . G T 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3251,325,0 chrXII 1001659 . T C 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3781,399,0 chrXII 1002243 . G C 613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.425;DP=90;Dels=0.00;FS=11.987;HaplotypeScore=22.5254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.20;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.987;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:90:69:646,69,0 chrXII 1003643 . A G 257.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;DP=192;Dels=0.00;FS=79.135;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.01;MQ0=8;MQRankSum=-8.803;QD=1.34;ReadPosRankSum=4.239;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,41:192:99:287,0,3547 chrXII 1003797 . C T 515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;DP=196;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQ0=3;MQRankSum=-6.996;QD=2.63;ReadPosRankSum=-3.412;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,47:196:99:545,0,3284 chrXII 1003840 . T A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.643;DP=234;Dels=0.00;FS=11.636;HaplotypeScore=3.7453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=3;MQRankSum=-8.363;QD=5.09;ReadPosRankSum=5.567;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,78:234:99:1220,0,3531 chrXII 1005023 . T C 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3518,372,0 chrXII 1006150 . C T 2361 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:90:99:2394,249,0 chrXII 1006710 . G A 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3223,339,0 chrXII 1006859 . T A 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3159,325,0 chrXII 1006977 . A G 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2746,279,0 chrXII 1007069 . A G 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3392,345,0 chrXII 1007084 . G A 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3461,337,0 chrXII 1007202 . T G 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2998,303,0 chrXII 1007613 . G A 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2605,267,0 chrXII 1007694 . T C 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3364,366,0 chrXII 1007751 . G A 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3767,390,0 chrXII 1008642 . G A 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5012;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3867,391,0 chrXII 1008837 . A G 2464 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2497,267,0 chrXII 1008873 . A T 2466 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2499,252,0 chrXII 1009056 . C T 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3466,357,0 chrXII 1009176 . C T 4887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5059;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.70;SB=-2.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4887,490,0 chrXII 1009478 . C T 2560 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.540;DP=108;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=23.70;ReadPosRankSum=1.219;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2593,247,0 chrXII 1009770 . C A 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3304,321,0 chrXII 1010871 . A G 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7822;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=1;QD=25.48;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3975,432,0 chrXII 1010934 . G C 4324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.89;SB=-2.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4324,444,0 chrXII 1011169 . T G 4218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4218,453,0 chrXII 1011170 . C A 4422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4422,451,0 chrXII 1011440 . C T 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=21.10;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:121:99:2586,264,0 chrXII 1011654 . T C 4457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4457,474,0 chrXII 1012326 . C G 89.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.460;DP=114;Dels=0.00;FS=218.804;HaplotypeScore=148.2953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=2.610;QD=0.78;ReadPosRankSum=-7.562;SB=-2.995e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:119,0,808 chrXII 1012572 . C T 5296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.07;SB=-2.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:5296,529,0 chrXII 1013592 . A C 4156.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.89;SB=-2.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4156,432,0 chrXII 1014017 . C T 5156.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=2;QD=25.65;SB=-2.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,201:201:99:5156,505,0 chrXII 1014332 . C T 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=22.71;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3270,339,0 chrXII 1014919 . C T 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.82;SB=-2.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3821,385,0 chrXII 1014976 . C T 4701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.27;SB=-2.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4701,487,0 chrXII 1014992 . G A 4361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=26.92;ReadPosRankSum=1.711;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4361,421,0 chrXII 1015108 . G A 4201.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4201,433,0 chrXII 1015543 . T A 4205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:178:99:4205,453,0 chrXII 1015747 . G A 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3465,360,0 chrXII 1016099 . T C 4078.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.33;SB=-2.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4078,400,0 chrXII 1016185 . G A 4181.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4181,438,0 chrXII 1016924 . A G 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2880,312,0 chrXII 1016933 . G A 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3230,333,0 chrXII 1016971 . G A 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.17;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3047,306,0 chrXII 1016982 . T C 3409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.76;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3409,360,0 chrXII 1017002 . A G 4184.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.63;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4184,423,0 chrXII 1017008 . C T 4187.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:4187,409,0 chrXII 1017052 . C A 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3985,409,0 chrXII 1017081 . C T 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3297,340,0 chrXII 1017336 . T A 4375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4375,436,0 chrXII 1017453 . C T 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3560,361,0 chrXII 1017596 . C A 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3569,369,0 chrXII 1017718 . C T 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2662,279,0 chrXII 1017741 . T A 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2658,276,0 chrXII 1019050 . A G 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=23.37;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2534,279,0 chrXII 1019140 . A T 72.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.385;DP=87;Dels=0.00;FS=1.647;HaplotypeScore=34.5831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.535;QD=0.83;ReadPosRankSum=5.501;SB=2.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:62,25:87:12:105,12,0 chrXII 1019141 . T A 88.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.980;DP=87;Dels=0.00;FS=1.647;HaplotypeScore=30.7171;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.554;QD=1.01;ReadPosRankSum=5.342;SB=-1.926e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:62,25:87:15:121,15,0 chrXII 1019199 . A G 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2460;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.09;MQ0=0;QD=22.85;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3450,366,0 chrXII 1019284 . C T 3616.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3616,370,0 chrXII 1019336 . G A 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3627,355,0 chrXII 1019357 . G T 2988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3021,300,0 chrXII 1019502 . G A 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:131:99:3414,348,0 chrXII 1019765 . T C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3558,378,0 chrXII 1019825 . G A 4156.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4156,409,0 chrXII 1019989 . T G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3266,336,0 chrXII 1020038 . G A 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3680,375,0 chrXII 1020076 . C T 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3428,349,0 chrXII 1020118 . A T 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2652,279,0 chrXII 1020119 . G T 2634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2667,279,0 chrXII 1020142 . T C 2576 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.98;MQ0=0;QD=24.53;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2609,276,0 chrXII 1020176 . A G 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3116,324,0 chrXII 1020245 . T G 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3205,342,0 chrXII 1020317 . G C 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3238,363,0 chrXII 1020320 . C T 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3458,360,0 chrXII 1020437 . T C 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2915,297,0 chrXII 1020605 . T C 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=1;QD=25.48;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2785,288,0 chrXII 1020991 . T G 2478 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2511,264,0 chrXII 1021226 . A C 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=151;Dels=0.00;FS=4.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=23.08;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3485,363,0 chrXII 1021339 . T C 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3600,378,0 chrXII 1021405 . G A 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.57;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3195,330,0 chrXII 1021444 . T A 2627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.97;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2660,273,0 chrXII 1021463 . A G 2131 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.46;MQ0=0;QD=21.97;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2164,234,0 chrXII 1021464 . G A 2224 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.60;MQ0=0;QD=22.69;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2257,237,0 chrXII 1021471 . T C 2518 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.32;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2551,276,0 chrXII 1021493 . A G 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.81;MQ0=0;QD=22.25;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2926,324,0 chrXII 1021577 . C T 4406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4406,454,0 chrXII 1021580 . C T 4296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4296,442,0 chrXII 1021739 . A G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3358,363,0 chrXII 1021808 . T G 3967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3967,435,0 chrXII 1022290 . A G 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3024,327,0 chrXII 1022329 . G A 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3103,318,0 chrXII 1022511 . C T 4362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4362,433,0 chrXII 1022570 . T G 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3535,372,0 chrXII 1022895 . T C 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=1;QD=23.44;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3563,369,0 chrXII 1022933 . C T 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=1;QD=27.39;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3479,352,0 chrXII 1023101 . T C 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2566,282,0 chrXII 1023320 . G A 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3680,367,0 chrXII 1023413 . C T 3766.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.62;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3766,373,0 chrXII 1023823 . C A 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3314,336,0 chrXII 1024016 . T C 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.40;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2619,273,0 chrXII 1024017 . C T 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.05;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2716,276,0 chrXII 1024168 . G C 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.41;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3380,354,0 chrXII 1024253 . G A 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3165,318,0 chrXII 1024265 . T C 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1925;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3154,327,0 chrXII 1024509 . C A 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3024,294,0 chrXII 1024747 . A G 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3170,321,0 chrXII 1024893 . T C 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3276,339,0 chrXII 1025001 . G T 481.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.237;DP=114;Dels=0.01;FS=181.187;HaplotypeScore=25.7245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=1;MQRankSum=-1.353;QD=4.22;ReadPosRankSum=-2.868;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:511,0,519 chrXII 1025005 . A T 477.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.458;DP=120;Dels=0.01;FS=180.885;HaplotypeScore=27.6804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.259;QD=3.98;ReadPosRankSum=-3.689;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:507,0,583 chrXII 1025007 . A T 442.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.641;DP=120;Dels=0.01;FS=193.341;HaplotypeScore=27.6804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.483;QD=3.68;ReadPosRankSum=-4.255;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,44:119:99:472,0,628 chrXII 1025009 . G T 399.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.739;DP=121;Dels=0.01;FS=200.161;HaplotypeScore=27.6804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=1;MQRankSum=-0.943;QD=3.30;ReadPosRankSum=-5.138;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,46:120:99:429,0,689 chrXII 1025145 . A G 3289.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.412;DP=129;Dels=0.00;FS=2.765;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=25.50;ReadPosRankSum=0.315;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,127:129:99:3289,342,0 chrXII 1025149 . G T 3450.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.84;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3450,349,0 chrXII 1025152 . C T 3529.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.92;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3529,360,0 chrXII 1025223 . G A 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.09;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2764,282,0 chrXII 1025420 . G A 2657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2690,264,0 chrXII 1025702 . C T 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3477,360,0 chrXII 1025733 . C G 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3124,333,0 chrXII 1025753 . T C 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.17;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2833,300,0 chrXII 1025801 . T C 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3261,345,0 chrXII 1026008 . C A 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3586,358,0 chrXII 1026103 . G T 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3356,343,0 chrXII 1026205 . A G 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2747,285,0 chrXII 1026208 . G C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2931,306,0 chrXII 1026243 . C T 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3016,294,0 chrXII 1026338 . C T 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3464,349,0 chrXII 1026523 . C T 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2759,273,0 chrXII 1026527 . A T 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2570,255,0 chrXII 1026581 . T C 2311 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.12;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:99:2344,243,0 chrXII 1026781 . G C 2165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.691;QD=25.77;ReadPosRankSum=1.361;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,83:84:99:2198,234,0 chrXII 1026865 . G A 2183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2216,225,0 chrXII 1026880 . G A 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2619,264,0 chrXII 1026889 . T C 2575 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2608,270,0 chrXII 1027477 . C T 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3641,369,0 chrXII 1027483 . A G 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6342;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3376,354,0 chrXII 1027555 . A G 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3428,357,0 chrXII 1027573 . T C 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3031,315,0 chrXII 1027615 . C T 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3771,382,0 chrXII 1027717 . G A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.964e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3723,373,0 chrXII 1028133 . G A 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3496,352,0 chrXII 1028155 . G T 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.50;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2889,300,0 chrXII 1028305 . T C 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3626,378,0 chrXII 1028480 . C T 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3714,381,0 chrXII 1028684 . T C 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3125,342,0 chrXII 1028958 . C T 3800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3800,387,0 chrXII 1028974 . C G 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=0.15;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:135:6:51,6,0 chrXII 1029028 . A T 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3025,312,0 chrXII 1029053 . C T 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.04;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3251,339,0 chrXII 1030090 . C T 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2863,291,0 chrXII 1030200 . T G 2296 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;DP=99;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=23.19;ReadPosRankSum=1.417;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2329,240,0 chrXII 1030239 . G A 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3037,297,0 chrXII 1030355 . A T 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2998,309,0 chrXII 1030577 . T C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.41;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2976,321,0 chrXII 1030580 . G A 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=25.93;ReadPosRankSum=0.061;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2989,295,0 chrXII 1030604 . T G 3184 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.71;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3217,348,0 chrXII 1030608 . C T 3166 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.79;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3199,333,0 chrXII 1030614 . A G 2953 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.42;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2986,327,0 chrXII 1031518 . A G 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2519,279,0 chrXII 1031571 . G A 2129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2162,228,0 chrXII 1031689 . C T 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=1;QD=25.45;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2883,294,0 chrXII 1032016 . C T 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.933;DP=130;Dels=0.00;FS=4.418;HaplotypeScore=3.9444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=26.75;ReadPosRankSum=1.439;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3477,319,0 chrXII 1032050 . A C 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3497,384,0 chrXII 1032238 . G A 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3485,349,0 chrXII 1032807 . A G 4189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4189,429,0 chrXII 1032821 . A C 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3826,387,0 chrXII 1032857 . C T 4639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7259;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.51;SB=-2.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:175:99:4639,475,0 chrXII 1032869 . T C 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.92;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2774,306,0 chrXII 1033418 . T C 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3294,342,0 chrXII 1033763 . C T 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3620,370,0 chrXII 1033895 . C T 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3205,333,0 chrXII 1033917 . A G 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3673,405,0 chrXII 1034027 . G A 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3256,333,0 chrXII 1034073 . G A 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3401,363,0 chrXII 1034264 . G A 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3666,373,0 chrXII 1034877 . A G 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3652,387,0 chrXII 1036112 . T C 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3112,327,0 chrXII 1036568 . G A 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=141;Dels=0.00;FS=3.363;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=26.26;ReadPosRankSum=-1.683;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3703,370,0 chrXII 1037268 . A T 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4083,409,0 chrXII 1037313 . A G 4038.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4038,414,0 chrXII 1037554 . A G 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2986,312,0 chrXII 1037985 . T C 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3587,372,0 chrXII 1038326 . C T 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=1;QD=27.15;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3747,381,0 chrXII 1038369 . G A 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.618;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7353;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=26.38;ReadPosRankSum=1.303;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3225,307,0 chrXII 1038631 . A G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2995,312,0 chrXII 1038798 . A T 2481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.39;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2514,258,0 chrXII 1038948 . A G 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3318,345,0 chrXII 1039009 . C G 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2923,321,0 chrXII 1039064 . C T 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2569,264,0 chrXII 1039156 . A G 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2922,309,0 chrXII 1039160 . T C 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2919,315,0 chrXII 1039238 . G A 2751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=22.74;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2784,288,0 chrXII 1039435 . T A 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3212,316,0 chrXII 1039504 . T C 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2796,306,0 chrXII 1040029 . A G 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3330,342,0 chrXII 1040062 . C T 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.33;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3039,313,0 chrXII 1040071 . A G 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.48;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3040,336,0 chrXII 1040171 . T C 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3711,378,0 chrXII 1040317 . C T 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=23.94;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2810,282,0 chrXII 1040343 . C T 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3288,327,0 chrXII 1040530 . C T 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3704,370,0 chrXII 1040616 . C T 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3476,345,0 chrXII 1040785 . G A 2735 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2768,285,0 chrXII 1040981 . A G 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3095,324,0 chrXII 1041619 . A T 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2887,288,0 chrXII 1041713 . A G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2974,318,0 chrXII 1041774 . A G 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9624;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=1;QD=25.00;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3400,360,0 chrXII 1041901 . G A 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5165;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2947,297,0 chrXII 1042079 . C T 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3253,336,0 chrXII 1042132 . A G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3177,345,0 chrXII 1042339 . A C 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3334,339,0 chrXII 1042381 . T C 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2961,312,0 chrXII 1042494 . A G 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2741,291,0 chrXII 1042759 . T C 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2834,312,0 chrXII 1043086 . T A 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3514,343,0 chrXII 1043638 . T C 1708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.88;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1741,186,0 chrXII 1043699 . G A 2168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.690;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9388;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=26.12;ReadPosRankSum=1.690;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:83:99:2201,228,0 chrXII 1043701 . C T 2171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.690;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=26.16;ReadPosRankSum=1.690;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:83:99:2204,228,0 chrXII 1043965 . C T 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2775,267,0 chrXII 1044126 . A T 2588 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2621,258,0 chrXII 1044567 . A C 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7244;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2618,288,0 chrXII 1044768 . G A 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2908,303,0 chrXII 1045358 . G A 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2860,294,0 chrXII 1046184 . G A 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3404,348,0 chrXII 1046304 . C T 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2792,282,0 chrXII 1046803 . G A 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9571;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2985,303,0 chrXII 1046930 . A C 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0818;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3419,366,0 chrXII 1047100 . G A 2501 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2534,264,0 chrXII 1047210 . A T 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3088,318,0 chrXII 1047367 . C T 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3188,327,0 chrXII 1047470 . A G 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3323,351,0 chrXII 1047516 . C T 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2840,285,0 chrXII 1047572 . A G 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3427,348,0 chrXII 1048002 . C T 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3100,297,0 chrXII 1048338 . T C 2615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2648,282,0 chrXII 1048356 . C G 2261 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2294,261,0 chrXII 1048617 . T C 4246.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4246,414,0 chrXII 1048761 . C A 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.113;DP=140;Dels=0.00;FS=3.073;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=26.04;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3646,358,0 chrXII 1048831 . G A 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3347,339,0 chrXII 1049830 . G A 1925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.74;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1958,198,0 chrXII 1050157 . A G 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.42;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2569,270,0 chrXII 1051260 . G T 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=26.50;ReadPosRankSum=0.000;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3286,333,0 chrXII 1051424 . A T 2129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=1;QD=24.76;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2162,216,0 chrXII 1052153 . G C 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.07;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2472,261,0 chrXII 1052276 . T A 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3644,352,0 chrXII 1052454 . T A 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3367,330,0 chrXII 1052563 . T C 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3594,363,0 chrXII 1052610 . G C 3775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3775,372,0 chrXII 1052950 . C T 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3035,304,0 chrXII 1053107 . G C 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2651,282,0 chrXII 1053367 . A G 1936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=20.17;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:1969,219,0 chrXII 1053429 . A G 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3142,333,0 chrXII 1053517 . T A 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2999,315,0 chrXII 1054059 . G A 1859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9496;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=18.05;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:1892,195,0 chrXII 1054279 . C T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4383;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3378,343,0 chrXII 1054922 . T C 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.84;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3134,336,0 chrXII 1055114 . T A 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2386,243,0 chrXII 1055129 . T C 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=22.72;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2441,264,0 chrXII 1055250 . G A 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2904,303,0 chrXII 1055417 . T C 2253 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.03;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2286,240,0 chrXII 1055554 . T C 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2960,309,0 chrXII 1055655 . A T 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.49;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2735,270,0 chrXII 1055717 . T C 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3413,360,0 chrXII 1055730 . C T 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2772,282,0 chrXII 1055950 . T G 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2639,279,0 chrXII 1056105 . G C 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=1;QD=26.20;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3203,342,0 chrXII 1056262 . T C 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2573,267,0 chrXII 1056565 . G A 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2666,273,0 chrXII 1056569 . G C 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2838,300,0 chrXII 1056760 . G C 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2652,294,0 chrXII 1056900 . G A 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.547;DP=131;Dels=0.00;FS=3.179;HaplotypeScore=3.4743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=26.57;ReadPosRankSum=0.304;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3481,331,0 chrXII 1057013 . C T 3828.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.06;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3828,382,0 chrXII 1057047 . G T 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.07;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3394,343,0 chrXII 1057084 . T G 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.62;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3180,339,0 chrXII 1057194 . A T 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2979,306,0 chrXII 1057223 . C T 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2829,285,0 chrXII 1057696 . C T 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.536;DP=107;Dels=0.00;FS=3.625;HaplotypeScore=4.3862;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=25.93;ReadPosRankSum=1.503;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:107:99:2808,262,0 chrXII 1057759 . T C 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.25;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3012,309,0 chrXII 1057870 . G A 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3393,345,0 chrXII 1057933 . T C 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.91;SB=-2.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3986,405,0 chrXII 1058607 . C T 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3166,324,0 chrXII 1058899 . A G 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2999,330,0 chrXII 1059052 . T C 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7616;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=22.64;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2999,306,0 chrXII 1059054 . G A 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7616;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3103,312,0 chrXII 1059176 . C A 2320 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.53;MQ0=0;QD=20.35;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2353,243,0 chrXII 1059203 . G T 2211 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.43;MQ0=0;QD=20.86;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2244,231,0 chrXII 1059412 . C T 862 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.016;DP=70;Dels=0.00;FS=6.706;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.21;MQ0=4;MQRankSum=-0.954;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,65:70:32:895,32,0 chrXII 1059428 . A T 453.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.016;DP=65;Dels=0.00;FS=14.914;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=3;MQRankSum=-2.410;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.936;SB=-4.145e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,62:65:13:486,13,0 chrXII 1061954 . T C 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.14;MQ0=1;QD=7.60;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 chrXII 1062016 . G A 65.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.46;MQ0=4;QD=8.25;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:98,9,0 chrXII 1062165 . C T 52.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.66;MQ0=1;QD=10.59;SB=-5.221e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:85,9,0 chrXII 1062492 . A G 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 chrXII 1062603 . C A 178.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.12;MQ0=4;MQRankSum=-1.061;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.296;SB=1.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,11:15:6:210,6,0 chrXII 1062635 . G A 170.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.293;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.10;MQ0=5;MQRankSum=0.594;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,17:20:6:202,6,0 chrXII 1062638 . T C 169.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.10;MQ0=5;MQRankSum=0.065;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.632;SB=1.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,14:20:6:201,6,0 chrXII 1062650 . A G 174.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.718;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.10;MQ0=5;MQRankSum=0.065;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.588;SB=1.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,14:20:6:206,6,0 chrXII 1062672 . G C 167.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9664;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.80;MQ0=5;MQRankSum=-0.182;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.788;SB=1.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,15:21:6:199,6,0 chrXII 1062701 . A G 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.19;MQ0=3;MQRankSum=1.589;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.572;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,2:11:6:49,6,0 chrXII 1062702 . G A 19.81 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=10;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=4.2298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.79;MQ0=2;MQRankSum=1.920;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,6:10:6:51,6,0 chrXII 1062706 . T C 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.69;MQ0=0;QD=3.57;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:49,6,0 chrXII 1062713 . C G 39.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.93;MQ0=0;QD=3.63;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:72,9,0 chrXII 1062747 . A G 65.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.599;DP=20;Dels=0.00;FS=2.527;HaplotypeScore=5.0274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.66;MQ0=2;MQRankSum=1.022;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.933;SB=-3.871e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,11:20:12:98,12,0 chrXII 1062751 . T C 43.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.931;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6917;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.84;MQ0=2;MQRankSum=1.032;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.454;SB=-2.272e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,12:21:9:76,9,0 chrXII 1062793 . A G 129.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;DP=24;Dels=0.00;FS=2.682;HaplotypeScore=16.8756;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.32;MQ0=1;MQRankSum=0.708;QD=5.38;ReadPosRankSum=2.571;SB=-3.949e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,19:24:18:162,18,0 chrXII 1062794 . T A 135.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.246;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.32;MQ0=1;MQRankSum=1.631;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-3.949e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,12:24:18:168,18,0 chrXII 1062802 . A G 131.52 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.697;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.9556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.66;MQ0=1;MQRankSum=2.148;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.880;SB=-4.352e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:6:161,0,6 chrXII 1062804 . T A 160.08 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.153;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.0742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.66;MQ0=1;MQRankSum=1.345;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.673;SB=-4.002e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,13:22:21:193,21,0 chrXII 1062809 . A G 132.52 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.697;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=25.4081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.66;MQ0=1;MQRankSum=2.429;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.373;SB=-4.352e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:6:162,0,6 chrXII 1062813 . C A 193.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.433;DP=21;Dels=0.00;FS=2.602;HaplotypeScore=19.2948;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.77;MQ0=1;MQRankSum=2.763;QD=9.19;ReadPosRankSum=2.598;SB=-4.302e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,14:21:24:226,24,0 chrXII 1062815 . T C 130.64 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.355;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.3441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.64;MQ0=1;MQRankSum=3.179;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.766;SB=-4.364e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:5:160,0,5 chrXII 1062832 . G A 112.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.8196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.10;MQ0=1;MQRankSum=-0.208;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.770;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:142,0,201 chrXII 1062835 . T C 82.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.263;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.8196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.53;MQ0=1;MQRankSum=-1.097;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.809;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:112,0,230 chrXII 1062841 . G A 81.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;DP=52;Dels=0.00;FS=2.203;HaplotypeScore=35.7197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.798;QD=1.56;ReadPosRankSum=-1.375;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,34:52:99:111,0,249 chrXII 1062847 . C T 195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.607;DP=54;Dels=0.00;FS=6.033;HaplotypeScore=35.7197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.41;MQ0=1;MQRankSum=1.912;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.023;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:225,0,138 chrXII 1062865 . A T 246.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.242;DP=72;Dels=0.00;FS=24.579;HaplotypeScore=8.6813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.43;MQ0=5;MQRankSum=1.776;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.799;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:276,0,160 chrXII 1062868 . C A 233.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.569;DP=74;Dels=0.00;FS=32.059;HaplotypeScore=21.0587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.81;MQ0=5;MQRankSum=2.054;QD=3.15;ReadPosRankSum=1.217;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:263,0,180 chrXII 1062869 . C A 237.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.029;DP=75;Dels=0.00;FS=32.448;HaplotypeScore=21.0587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.03;MQ0=5;MQRankSum=1.803;QD=3.16;ReadPosRankSum=1.335;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:267,0,210 chrXII 1062872 . T C 71.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.817;DP=75;Dels=0.00;FS=31.303;HaplotypeScore=25.8938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.51;MQ0=5;MQRankSum=-2.896;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.808;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,47:75:99:101,0,359 chrXII 1062874 . T C 72.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.170;DP=77;Dels=0.00;FS=31.754;HaplotypeScore=26.7259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.33;MQ0=6;MQRankSum=-2.991;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.918;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,48:77:99:102,0,351 chrXII 1062881 . T C 210.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.658;DP=91;Dels=0.00;FS=51.537;HaplotypeScore=28.8185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.92;MQ0=7;MQRankSum=1.061;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.590;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:91:99:240,0,334 chrXII 1062942 . C T 351.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.556;DP=92;Dels=0.00;FS=23.356;HaplotypeScore=2.8582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.76;MQ0=10;MQRankSum=-0.367;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:381,0,315 chrXII 1062988 . A C 576 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.19;MQ0=6;QD=13.40;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:69:609,69,0 chrXII 1063020 . T G 70.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.111;DP=59;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=5.5826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.33;MQ0=10;MQRankSum=1.226;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.684;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:100,0,540 chrXII 1063110 . T C 317.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.369;DP=167;Dels=0.00;FS=14.364;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.50;MQ0=12;MQRankSum=-2.356;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,38:167:99:347,0,1477 chrXII 1063152 . C T 408.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;DP=194;Dels=0.00;FS=6.109;HaplotypeScore=6.5596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.08;MQ0=13;MQRankSum=1.646;QD=2.10;ReadPosRankSum=-3.475;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,34:194:99:438,0,1931 chrXII 1063453 . A G 304.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.055;DP=73;Dels=0.00;FS=38.672;HaplotypeScore=33.3253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.93;MQ0=0;MQRankSum=-4.304;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.192;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:334,0,1066 chrXII 1063479 . T C 442.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.860;DP=75;Dels=0.00;FS=35.355;HaplotypeScore=6.6608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.64;MQ0=0;MQRankSum=-5.436;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:472,0,1053 chrXII 1063482 . T C 453.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;DP=72;Dels=0.00;FS=28.450;HaplotypeScore=7.4495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.01;MQ0=0;MQRankSum=-5.700;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.466;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:483,0,960 chrXII 1063488 . A G 259.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.516;DP=62;Dels=0.00;FS=10.440;HaplotypeScore=46.1666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.09;MQ0=0;MQRankSum=-4.962;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:289,0,897 chrXII 1063491 . G A 249.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.688;DP=60;Dels=0.00;FS=8.271;HaplotypeScore=75.2098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.35;MQ0=0;MQRankSum=-4.910;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:279,0,866 chrXII 1063512 . T C 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;DP=66;Dels=0.00;FS=4.354;HaplotypeScore=39.5847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.81;MQ0=1;MQRankSum=-3.436;QD=0.70;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:76:76,0,1170 chrXII 1063518 . A G 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;DP=62;Dels=0.00;FS=9.170;HaplotypeScore=18.3215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.37;MQ0=6;MQRankSum=-2.002;QD=0.68;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,8:62:72:72,0,976 chrXII 1063550 . C T 415.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;DP=71;Dels=0.00;FS=5.033;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.12;MQ0=7;MQRankSum=-6.213;QD=5.85;ReadPosRankSum=-1.223;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,34:71:99:445,0,782 chrXII 1063559 . T G 358.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.363;DP=74;Dels=0.00;FS=3.502;HaplotypeScore=2.9419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.71;MQ0=10;MQRankSum=-5.297;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.264;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:388,0,815 chrXII 1063572 . T C 1143.04 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;DP=78;Dels=0.00;FS=8.078;HaplotypeScore=9.4310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.06;MQ0=10;MQRankSum=4.000;QD=14.65;ReadPosRankSum=3.420;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,60:78:23:1176,23,0 chrXII 1063576 . C A 608.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;DP=95;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=17.3819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.96;MQ0=15;MQRankSum=5.005;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:638,0,701 chrXII 1063611 . T C 261.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.801;DP=88;Dels=0.00;FS=10.369;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.01;MQ0=19;MQRankSum=-0.689;QD=2.97;ReadPosRankSum=-2.710;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:291,0,805 chrXII 1063659 . A T 100.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;DP=91;Dels=0.00;FS=10.117;HaplotypeScore=25.1800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.35;MQ0=33;MQRankSum=2.162;QD=1.10;ReadPosRankSum=-0.932;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,11:91:99:130,0,745 chrXII 1063660 . G A 421.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.902;DP=92;Dels=0.00;FS=31.469;HaplotypeScore=25.1800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.24;MQ0=34;MQRankSum=4.555;QD=4.58;ReadPosRankSum=2.581;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,24:92:99:451,0,421 chrXII 1063667 . G T 54.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.691;DP=89;Dels=0.00;FS=36.386;HaplotypeScore=24.0314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.61;MQ0=39;MQRankSum=-1.170;QD=0.61;ReadPosRankSum=0.738;SB=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,15:89:84:84,0,671 chrXII 1063673 . G A 98.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.471;DP=91;Dels=0.00;FS=72.189;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.78;MQ0=43;MQRankSum=0.467;QD=1.08;ReadPosRankSum=1.246;SB=-3.008e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,18:91:99:128,0,594 chrXII 1063684 . T C 322.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;DP=82;Dels=0.00;FS=56.613;HaplotypeScore=2.8452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.81;MQ0=47;MQRankSum=1.142;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.712;SB=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:352,0,177 chrXII 1063686 . A G 272.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.822;DP=81;Dels=0.00;FS=45.278;HaplotypeScore=2.8452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.92;MQ0=46;MQRankSum=2.096;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.182;SB=-6.175e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:302,0,201 chrXII 1063703 . A G 652 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.34;MQ0=54;MQRankSum=1.529;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.121;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:55,33:88:75:685,75,0 chrXII 1063705 . C T 199.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;DP=88;Dels=0.00;FS=70.645;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.34;MQ0=54;MQRankSum=-1.156;QD=2.26;ReadPosRankSum=2.398;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,16:88:99:229,0,320 chrXII 1063712 . T A 233.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;DP=98;Dels=0.00;FS=63.001;HaplotypeScore=2.8945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=61;MQRankSum=1.098;QD=2.38;ReadPosRankSum=-1.995;SB=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,15:98:99:263,0,329 chrXII 1063718 . A G 261.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.213;DP=86;Dels=0.00;FS=44.031;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.64;MQ0=61;MQRankSum=-0.032;QD=3.03;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-4.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:85:99:291,0,109 chrXII 1063730 . T C 233.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.906;DP=86;Dels=0.00;FS=41.590;HaplotypeScore=2.9242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.57;MQ0=63;MQRankSum=-1.855;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.315;SB=-4.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:263,0,111 chrXII 1063736 . T G 329.02 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=78;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=2.9366;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.48;MQ0=57;MQRankSum=0.908;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.908;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:58,20:78:25:362,25,0 chrXII 1063737 . G T 353.02 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.239;DP=78;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=2.9366;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.48;MQ0=57;MQRankSum=0.908;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.908;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:58,20:78:25:386,25,0 chrXII 1063745 . C T 37.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=79;Dels=0.00;FS=29.863;HaplotypeScore=1.9577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.39;MQ0=58;MQRankSum=0.372;QD=0.47;ReadPosRankSum=-1.197;SB=4.350e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,5:79:67:67,0,241 chrXII 1063747 . A T 38.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;DP=80;Dels=0.00;FS=29.863;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.31;MQ0=59;MQRankSum=1.858;QD=0.48;ReadPosRankSum=-1.445;SB=4.350e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,5:80:68:68,0,245 chrXII 1063748 . A T 37.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=81;Dels=0.00;FS=29.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.22;MQ0=60;MQRankSum=0.867;QD=0.46;ReadPosRankSum=-1.445;SB=4.350e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,5:81:67:67,0,247 chrXII 1063761 . C T 81.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.528;DP=85;Dels=0.00;FS=45.405;HaplotypeScore=4.9787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.41;MQ0=59;MQRankSum=2.917;QD=0.95;ReadPosRankSum=-1.528;SB=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,8:85:99:111,0,274 chrXII 1063772 . G A 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;DP=80;Dels=0.00;FS=17.910;HaplotypeScore=3.7538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.57;MQ0=56;MQRankSum=2.767;QD=0.19;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,6:80:45:45,0,237 chrXII 1063779 . C T 269.21 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7327;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.43;MQ0=57;MQRankSum=0.528;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.281;SB=-1.972e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:58,22:80:16:302,16,0 chrXII 1063785 . C T 238.41 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.255;DP=78;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=9.5033;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.46;MQ0=55;MQRankSum=0.927;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.818;SB=-1.904e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:57,21:78:13:271,13,0 chrXII 1063800 . A G 225.41 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;DP=76;Dels=0.00;FS=2.760;HaplotypeScore=2.8945;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.45;MQ0=52;MQRankSum=1.135;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.309;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:55,21:76:13:258,13,0 chrXII 1063802 . G A 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;DP=80;Dels=0.00;FS=31.480;HaplotypeScore=4.8102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.17;MQ0=54;MQRankSum=1.003;QD=0.84;ReadPosRankSum=2.083;SB=-4.348e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,12:80:97:97,0,136 chrXII 1063812 . C T 40.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;DP=73;Dels=0.00;FS=27.580;HaplotypeScore=5.8759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.61;MQ0=50;MQRankSum=-1.775;QD=0.55;ReadPosRankSum=-1.130;SB=-9.979e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,8:73:70:70,0,108 chrXII 1063821 . A C 53.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;DP=77;Dels=0.00;FS=4.330;HaplotypeScore=6.0923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.73;MQ0=54;MQRankSum=3.389;QD=0.69;ReadPosRankSum=-1.130;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,8:77:83:83,0,116 chrXII 1063826 . A G 47.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.447;DP=80;Dels=0.00;FS=2.126;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.47;MQ0=58;MQRankSum=3.652;QD=0.59;ReadPosRankSum=-2.150;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,8:80:77:77,0,117 chrXII 1063843 . G A 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.617;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.72;MQ0=70;MQRankSum=-0.462;QD=1.23;ReadPosRankSum=-1.224;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,14:95:99:147,0,136 chrXII 1063872 . C T 288 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.323;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.96;MQ0=79;MQRankSum=2.079;QD=3.00;ReadPosRankSum=1.953;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:79,17:96:36:321,36,0 chrXII 1063884 . C A 237.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;DP=89;Dels=0.00;FS=7.858;HaplotypeScore=2.3036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.17;MQ0=70;MQRankSum=3.179;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.023;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,14:89:36:267,0,36 chrXII 1063888 . T A 221.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.621;DP=86;Dels=0.00;FS=7.375;HaplotypeScore=3.6337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.21;MQ0=68;MQRankSum=2.443;QD=2.57;ReadPosRankSum=3.065;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,13:86:38:251,0,38 chrXII 1063902 . G A 258.41 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.180;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.88;MQ0=68;MQRankSum=2.491;QD=3.15;ReadPosRankSum=1.090;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:68,14:82:13:291,13,0 chrXII 1063955 . A T 42.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;DP=56;Dels=0.00;FS=23.015;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.37;MQ0=42;MQRankSum=-1.467;QD=0.75;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-7.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,37:56:72:72,0,113 chrXII 1063966 . G C 66.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;DP=47;Dels=0.00;FS=25.233;HaplotypeScore=3.5764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.41;MQ0=33;MQRankSum=-0.710;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-7.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,32:47:82:96,0,82 chrXII 1063969 . C T 177.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5764;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.55;MQ0=32;QD=3.85;SB=-1.039e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,43:46:24:210,24,0 chrXII 1064046 . A T 1189 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.917;DP=72;Dels=0.01;FS=11.750;HaplotypeScore=7.9032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.73;MQ0=14;MQRankSum=0.296;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.678;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,63:71:52:1222,52,0 chrXII 1064078 . T G 1796 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.78;MQ0=7;QD=20.18;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:1829,180,0 chrXII 1064102 . C G 1788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.465;DP=85;Dels=0.00;FS=4.514;HaplotypeScore=6.9009;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.30;MQ0=3;MQRankSum=0.084;QD=21.04;ReadPosRankSum=1.352;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:1821,186,0 chrXII 1064153 . G T 619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.859;DP=36;Dels=0.00;FS=6.232;HaplotypeScore=3.9175;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.84;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.458;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,33:36:34:652,34,0 chrXII 1064156 . A G 636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.44;MQ0=0;QD=18.71;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:81:669,81,0 chrXII 1064182 . C T 213.52 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.548;DP=17;Dels=0.00;FS=2.667;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-8.452e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:6:243,0,6 chrXII 1064183 . A G 210.34 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;DP=17;Dels=0.00;FS=2.667;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.057;SB=-8.034e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:8:240,0,8 chrXII 1064199 . C T 57.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=5.70;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-1.082e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:27:87,0,27 chrXII 1064246 . C A 127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.712;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.30;MQ0=0;MQRankSum=1.837;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:56:157,0,56 chrXII 1064255 . C T 52.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.420;DP=25;Dels=0.00;FS=2.722;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:25:82:82,0,107 chrXII 1064257 . T C 226 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.10;MQ0=0;QD=9.04;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:33:259,33,0 chrXII 1064262 . G A 65.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.377;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=2.17;ReadPosRankSum=-1.606;SB=-1.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:95:95,0,158 chrXII 1064267 . G A 124.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;DP=31;Dels=0.00;FS=4.451;HaplotypeScore=3.9070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.22;MQ0=0;MQRankSum=2.022;QD=4.00;ReadPosRankSum=2.622;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:154,0,150 chrXII 1064268 . T C 227.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.32;MQ0=0;MQRankSum=2.246;QD=6.49;ReadPosRankSum=2.510;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:92:257,0,92 chrXII 1064276 . C T 95.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.156;DP=49;Dels=0.00;FS=1.383;HaplotypeScore=11.7662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.02;MQ0=0;MQRankSum=-3.113;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:125,0,514 chrXII 1064292 . T A,G 822.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=27.78;MQ0=1;QD=13.05;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,54,9:63:62:882,149,62,733,0,709 chrXII 1064309 . A G 34.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.640;DP=88;Dels=0.00;FS=1.262;HaplotypeScore=14.4987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.27;MQ0=6;MQRankSum=-3.429;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.952;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,11:88:64:64,0,1104 chrXII 1064345 . G A 186.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.355;DP=84;Dels=0.00;FS=25.491;HaplotypeScore=37.7207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.62;MQ0=6;MQRankSum=-4.521;QD=2.21;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,26:84:99:216,0,867 chrXII 1064354 . G A 773.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.534;DP=82;Dels=0.00;FS=12.811;HaplotypeScore=49.2553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.66;MQ0=6;MQRankSum=4.117;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.492;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,49:82:99:803,0,266 chrXII 1064363 . G A 128.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.324;DP=80;Dels=0.00;FS=1.109;HaplotypeScore=39.6847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.91;MQ0=6;MQRankSum=-2.790;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.335;SB=-6.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:158,0,877 chrXII 1064375 . T A 796 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.05;MQ0=6;QD=14.74;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:87:829,87,0 chrXII 1064401 . C T 29.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;DP=15;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=11.4695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.60;MQ0=1;MQRankSum=1.670;QD=1.93;ReadPosRankSum=0.910;SB=-5.204e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:59:59,0,110 chrXII 1064407 . T C 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=5.5202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.03;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.937;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:34:65,0,34 chrXII 1064408 . A G 92.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.01;MQ0=0;QD=15.38;SB=-4.830e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:125,15,0 chrXII 1064409 . A G 98.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.01;MQ0=0;QD=16.38;SB=-4.730e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:131,15,0 chrXII 1064427 . G A 44.06 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.550;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:16:74,0,16 chrXII 1064432 . T G 96.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.22;MQ0=0;QD=12.03;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15:129,15,0 chrXII 1064435 . T A 73.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.46;MQ0=0;QD=10.50;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:106,12,0 chrXII 1064481 . G T 116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;DP=31;Dels=0.00;FS=15.244;HaplotypeScore=5.6430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.13;MQ0=3;MQRankSum=2.110;QD=3.74;ReadPosRankSum=3.636;SB=-2.300e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:146,0,159 chrXII 1064487 . C G 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;DP=33;Dels=0.00;FS=5.718;HaplotypeScore=26.4980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.11;MQ0=3;MQRankSum=1.929;QD=0.79;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:33:56:56,0,289 chrXII 1064493 . A C 363.12 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.630;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.2242;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.99;MQ0=3;MQRankSum=1.796;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-1.729e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,27:37:5:394,5,0 chrXII 1064494 . T G 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.708;DP=38;Dels=0.00;FS=3.366;HaplotypeScore=22.2242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.24;MQ0=3;MQRankSum=-1.475;QD=0.92;ReadPosRankSum=-1.581;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:65:65,0,344 chrXII 1064514 . A G 1040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7929;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.55;MQ0=3;QD=15.07;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:69:99:1073,114,0 chrXII 1064563 . G A 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.080;DP=92;Dels=0.04;FS=9.219;HaplotypeScore=59.9086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.12;MQ0=1;MQRankSum=-4.409;QD=0.47;ReadPosRankSum=1.017;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:73:73,0,1330 chrXII 1064565 . C T 38.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.794;DP=92;Dels=0.02;FS=6.787;HaplotypeScore=58.8722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.45;MQ0=1;MQRankSum=-4.831;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.961;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,23:90:68:68,0,1305 chrXII 1064573 . T A 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;DP=97;Dels=0.00;FS=31.463;HaplotypeScore=44.6667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.15;MQ0=1;MQRankSum=-2.933;QD=0.14;ReadPosRankSum=-1.438;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,14:97:43:43,0,1501 chrXII 1064621 . G C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;DP=82;Dels=0.00;FS=3.879;HaplotypeScore=23.8906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.11;MQ0=1;MQRankSum=3.169;QD=14.01;ReadPosRankSum=3.891;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,65:82:99:1179,0,123 chrXII 1064629 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.295;DP=98;Dels=0.00;FS=5.417;HaplotypeScore=22.1319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.35;MQ0=1;MQRankSum=1.629;QD=10.82;ReadPosRankSum=6.052;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,64:98:99:1090,0,550 chrXII 1064643 . T C 2041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.12;MQ0=1;QD=20.41;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2074,210,0 chrXII 1064679 . A T 170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;DP=118;Dels=0.00;FS=27.254;HaplotypeScore=29.3492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.88;MQ0=1;MQRankSum=-3.947;QD=1.44;ReadPosRankSum=-3.263;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,35:118:99:200,0,1811 chrXII 1064687 . G A 145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.695;DP=116;Dels=0.00;FS=43.806;HaplotypeScore=18.2951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.36;MQ0=1;MQRankSum=-5.645;QD=1.25;ReadPosRankSum=-1.214;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,33:116:99:175,0,1833 chrXII 1064693 . A T 185.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;DP=129;Dels=0.00;FS=42.099;HaplotypeScore=20.9569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.38;MQ0=0;MQRankSum=-4.410;QD=1.43;ReadPosRankSum=-2.180;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,35:129:99:215,0,2044 chrXII 1064716 . A G 190.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.298;DP=130;Dels=0.02;FS=30.517;HaplotypeScore=35.4558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.91;MQ0=2;MQRankSum=-4.296;QD=1.46;ReadPosRankSum=-2.745;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,30:127:99:220,0,2164 chrXII 1064738 . G A 2106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.27;MQ0=3;QD=21.49;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2139,213,0 chrXII 1064749 . T C 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.757;DP=96;Dels=0.00;FS=14.231;HaplotypeScore=4.7038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.36;MQ0=3;MQRankSum=3.613;QD=15.06;ReadPosRankSum=-3.836;SB=-6.694e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,75:96:99:1476,0,147 chrXII 1064756 . A G 92.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.733;DP=92;Dels=0.00;FS=20.656;HaplotypeScore=3.7105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.62;MQ0=3;MQRankSum=-4.234;QD=1.00;ReadPosRankSum=2.691;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:122,0,1388 chrXII 1064788 . G A 779.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.038;DP=73;Dels=0.00;FS=7.371;HaplotypeScore=31.9482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.03;MQ0=3;MQRankSum=1.479;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.872;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,52:73:99:809,0,240 chrXII 1064795 . A G 296.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;DP=46;Dels=0.00;FS=2.829;HaplotypeScore=36.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.11;MQ0=3;MQRankSum=0.293;QD=6.43;ReadPosRankSum=-1.567;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:326,0,244 chrXII 1064796 . G A 28.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;DP=44;Dels=0.00;FS=12.954;HaplotypeScore=36.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.01;MQ0=3;MQRankSum=-0.060;QD=0.64;ReadPosRankSum=1.375;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,5:44:58:58,0,506 chrXII 1064797 . T C,G 529.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=44;Dels=0.00;FS=3.144;HaplotypeScore=17.5779;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=28.01;MQ0=3;MQRankSum=-0.030;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.604;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,11,31:44:99:589,422,426,145,0,113 chrXII 1064799 . G C 370.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;DP=44;Dels=0.00;FS=5.348;HaplotypeScore=31.1119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.01;MQ0=3;MQRankSum=-0.865;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.501;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,31:44:99:400,0,143 chrXII 1064802 . G A 291.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.453;DP=42;Dels=0.00;FS=1.283;HaplotypeScore=35.0620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.23;MQ0=2;MQRankSum=3.077;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:321,0,196 chrXII 1064804 . G C,T 491.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;DP=45;Dels=0.00;FS=3.770;HaplotypeScore=34.2164;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=27.69;MQ0=1;MQRankSum=-0.838;QD=10.91;ReadPosRankSum=3.642;SB=-3.542e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,6,32:45:67:551,430,437,102,0,67 chrXII 1064805 . A G,T 490.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=34.2648;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=27.69;MQ0=1;MQRankSum=-0.393;QD=10.89;ReadPosRankSum=3.334;SB=-3.269e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,33,6:45:72:550,105,72,424,0,434 chrXII 1064814 . A G 281.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.881;DP=46;Dels=0.04;FS=6.820;HaplotypeScore=51.6154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.911;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.371;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,36:44:88:311,0,88 chrXII 1064816 . G T 220.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;DP=45;Dels=0.00;FS=5.893;HaplotypeScore=36.9844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.47;MQ0=1;MQRankSum=-0.164;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.821;SB=-2.922e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:99:250,0,105 chrXII 1064818 . A G 212.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=34.8829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.43;MQ0=1;MQRankSum=1.947;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.168;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:242,0,154 chrXII 1064835 . G A 345.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.2894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.52;MQ0=0;QD=8.03;SB=-3.834e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:43:42:378,42,0 chrXII 1064837 . C T 506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.168;DP=43;Dels=0.00;FS=3.112;HaplotypeScore=15.2638;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.52;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.652;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:60:539,60,0 chrXII 1064851 . G A 23.03 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.215;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.1385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=0.46;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,7:50:53:53,0,539 chrXII 1064854 . A T 556.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;DP=50;Dels=0.00;FS=3.384;HaplotypeScore=12.3401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.62;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.966;SB=-3.599e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,42:50:43:586,0,43 chrXII 1064858 . G A 608 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.173;DP=49;Dels=0.00;FS=22.148;HaplotypeScore=7.4319;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.41;MQ0=0;MQRankSum=2.362;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.743;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,44:49:32:641,32,0 chrXII 1064897 . G T 376 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;DP=27;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=6.7793;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:45:409,45,0 chrXII 1064908 . G A 440 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5395;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=0;QD=15.17;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:29:51:473,51,0 chrXII 1064917 . A G 631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.4648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.64;MQ0=0;QD=16.61;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:75:664,75,0 chrXII 1064959 . G A 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.495;DP=87;Dels=0.00;FS=15.430;HaplotypeScore=13.1093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.59;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.070;SB=-5.838e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,70:87:58:1682,0,58 chrXII 1064984 . G C 363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.497;DP=112;Dels=0.00;FS=3.181;HaplotypeScore=9.9422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.989;QD=3.24;ReadPosRankSum=3.229;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:112:99:393,0,1800 chrXII 1064997 . A G 413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.227;DP=111;Dels=0.00;FS=4.285;HaplotypeScore=5.9509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.47;MQ0=0;MQRankSum=-3.434;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,31:111:99:443,0,1873 chrXII 1065033 . T G 260.22 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;DP=60;Dels=0.00;FS=18.169;HaplotypeScore=60.8678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.96;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=4.34;ReadPosRankSum=2.875;SB=-1.952e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,36:60:10:290,0,10 chrXII 1065039 . T G 160.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;DP=64;Dels=0.00;FS=45.457;HaplotypeScore=73.9089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.98;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=2.50;ReadPosRankSum=1.940;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,39:64:99:190,0,132 chrXII 1065041 . T G 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.094;DP=69;Dels=0.00;FS=5.145;HaplotypeScore=76.7830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.71;MQ0=0;MQRankSum=-3.247;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,10:69:73:73,0,290 chrXII 1065293 . C T 435.19 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.250;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.87;MQ0=9;MQRankSum=-0.952;QD=12.80;ReadPosRankSum=1.352;SB=-1.116e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,32:34:8:467,8,0 chrXII 1065325 . C T 323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;DP=23;Dels=0.00;FS=8.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.18;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-1.823e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:30:353,0,30 chrXII 1065350 . T G 78.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.442;DP=44;Dels=0.00;FS=2.448;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.38;MQ0=2;MQRankSum=0.810;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,8:44:99:108,0,532 chrXII 1065396 . G A 83.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.639;DP=56;Dels=0.00;FS=12.919;HaplotypeScore=5.8805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.80;MQ0=13;MQRankSum=-2.471;QD=1.48;ReadPosRankSum=-2.812;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:113,0,310 chrXII 1065403 . T G 75.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.632;DP=59;Dels=0.00;FS=12.723;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.66;MQ0=15;MQRankSum=-2.180;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.473;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:105,0,348 chrXII 1065450 . C T 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.99;MQ0=21;MQRankSum=0.047;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.470;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:81:81,0,164 chrXII 1065504 . T C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.66;MQ0=7;MQRankSum=-1.754;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:41:41,0,71 chrXII 1065658 . A C 90.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.43;MQ0=135;MQRankSum=2.219;QD=0.63;ReadPosRankSum=0.361;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:138,6:144:15:123,15,0 chrXII 1065860 . A G 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.20;MQ0=1;QD=4.36;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:53,6,0 chrXII 1065913 . A C 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=6;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.99;MQ0=2;MQRankSum=0.727;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.727;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:9:82,9,0 chrXIII 84 . T A 52.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;DP=77;Dels=0.00;FS=8.158;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.91;MQ0=48;MQRankSum=-0.664;QD=0.68;ReadPosRankSum=-2.454;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,12:77:82:82,0,463 chrXIII 134 . C T 447 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.13;MQ0=62;QD=4.97;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,70:90:42:480,42,0 chrXIII 460 . T A 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.74;MQ0=60;MQRankSum=1.231;QD=0.43;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:60,5:65:6:59,6,0 chrXIII 5306 . T C 162.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=4;QD=14.73;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:21:195,21,0 chrXIII 8175 . G A 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.880;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.88;MQ0=66;MQRankSum=-2.357;QD=0.37;ReadPosRankSum=0.960;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:62:62,0,334 chrXIII 8262 . A G 54.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.85;MQ0=31;MQRankSum=-1.532;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:84:84,0,149 chrXIII 8301 . T C 158.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.908;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.45;MQ0=31;MQRankSum=-1.796;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.373;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:188,0,264 chrXIII 8362 . C T 256.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.644;DP=63;Dels=0.00;FS=2.657;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.27;MQ0=14;MQRankSum=-1.208;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:286,0,738 chrXIII 8415 . T G 242.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.620;DP=81;Dels=0.00;FS=23.903;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.56;MQ0=2;MQRankSum=-3.219;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:272,0,1479 chrXIII 8429 . C G 252.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;DP=87;Dels=0.00;FS=29.892;HaplotypeScore=3.8894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.69;MQ0=1;MQRankSum=-3.590;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:282,0,1492 chrXIII 8431 . G T 280.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.157;DP=87;Dels=0.00;FS=32.472;HaplotypeScore=16.8793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.69;MQ0=1;MQRankSum=-3.548;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:310,0,1522 chrXIII 8449 . A G 90.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.265;DP=72;Dels=0.00;FS=21.894;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQ0=0;MQRankSum=-5.622;QD=1.25;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,13:72:99:120,0,1456 chrXIII 8450 . C T 86.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;DP=73;Dels=0.00;FS=24.561;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQ0=0;MQRankSum=-5.631;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,13:73:99:116,0,1405 chrXIII 8461 . A T 153.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.619;DP=75;Dels=0.00;FS=35.984;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.632;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.938;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:183,0,1413 chrXIII 8523 . A G 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.175;DP=82;Dels=0.00;FS=6.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=-6.201;QD=0.14;ReadPosRankSum=-1.680;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:41:41,0,1430 chrXIII 8537 . A G 230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.716;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=-6.593;QD=2.71;ReadPosRankSum=-2.988;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:260,0,1364 chrXIII 8596 . A C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.894;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-5.300;QD=9.06;ReadPosRankSum=2.800;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1162,0,1544 chrXIII 8714 . C G 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=110;Dels=0.00;FS=2.490;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.127;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1030,0,1226 chrXIII 8815 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.593;DP=103;Dels=0.00;FS=3.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.12;MQ0=1;MQRankSum=2.825;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1295,0,833 chrXIII 8846 . G A 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.470;DP=99;Dels=0.00;FS=0.793;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.934;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:958,0,1051 chrXIII 8859 . A G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;DP=95;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.040;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.975;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:95:99:1020,0,1048 chrXIII 8872 . C T 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.725;DP=103;Dels=0.00;FS=6.572;HaplotypeScore=43.7404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.511;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1091,0,1035 chrXIII 8939 . A G 902.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.822;DP=104;Dels=0.00;FS=1.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQ0=0;MQRankSum=-4.097;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:932,0,1183 chrXIII 8946 . G A 1070.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.280;DP=111;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.06;MQ0=0;MQRankSum=-4.275;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.608;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1100,0,1163 chrXIII 8949 . A G 1010.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.985;DP=107;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-4.502;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.994;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1040,0,1183 chrXIII 8968 . A T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;DP=111;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQ0=0;MQRankSum=-4.419;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.351;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1082,0,1327 chrXIII 8973 . G T 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.862;DP=123;Dels=0.00;FS=4.330;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQ0=0;MQRankSum=-3.392;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1308,0,1294 chrXIII 9141 . C T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.394;DP=126;Dels=0.00;FS=1.591;HaplotypeScore=9.9521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1702,0,1089 chrXIII 9191 . G A 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.967;DP=119;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.494;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1197,0,1374 chrXIII 9200 . A G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.519;DP=124;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=9.9197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=2.049;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1106,0,1561 chrXIII 9360 . A G 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.302;DP=126;Dels=0.00;FS=4.559;HaplotypeScore=3.4108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=2.061;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:126:99:1520,0,1140 chrXIII 9517 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.006;DP=122;Dels=0.00;FS=6.841;HaplotypeScore=2.7609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1081,0,1312 chrXIII 9525 . A C 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;DP=121;Dels=0.00;FS=6.824;HaplotypeScore=47.4687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.935;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:121:99:1010,0,1191 chrXIII 9601 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.717;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=9.28;ReadPosRankSum=2.165;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1376,0,1471 chrXIII 9730 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.279;DP=96;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=3.3884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.072;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1071,0,994 chrXIII 9746 . C T 2288 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.57;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2321,231,0 chrXIII 9755 . C T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.350;DP=80;Dels=0.00;FS=3.830;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.381;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:905,0,825 chrXIII 9790 . T A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.223;DP=101;Dels=0.00;FS=8.510;HaplotypeScore=9.7656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1104,0,1078 chrXIII 9828 . T G 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.569;DP=109;Dels=0.00;FS=9.843;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1001,0,1396 chrXIII 9829 . T C 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2935,297,0 chrXIII 9896 . C T 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.718;DP=111;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=8.19;ReadPosRankSum=3.162;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,45:111:99:939,0,1447 chrXIII 10239 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.553;DP=104;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1037,0,1113 chrXIII 10479 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.669;DP=108;Dels=0.00;FS=3.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1385,0,992 chrXIII 10737 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.864;DP=103;Dels=0.00;FS=13.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.915;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1228,0,1042 chrXIII 10868 . G A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.385;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1205,0,1627 chrXIII 10941 . T C 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.587;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.268;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1534,0,1544 chrXIII 11305 . A G 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0968;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=27.42;ReadPosRankSum=1.438;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2939,300,0 chrXIII 11318 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.476;DP=106;Dels=0.00;FS=7.543;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.213;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1202,0,1098 chrXIII 11319 . T A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;DP=105;Dels=0.00;FS=9.466;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.376;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1288,0,1101 chrXIII 11831 . T C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.847;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:900,0,1201 chrXIII 11972 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.105;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.843;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1127,0,1349 chrXIII 12086 . A T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;DP=120;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.121;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1155,0,1433 chrXIII 12311 . A G 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.522;DP=99;Dels=0.00;FS=1.731;HaplotypeScore=4.7253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=2.356;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.414;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,38:99:99:760,0,1324 chrXIII 12329 . G A 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.785;DP=99;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=2.6132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.667;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:852,0,1270 chrXIII 12440 . C T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.536;DP=118;Dels=0.00;FS=8.881;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=8.04;ReadPosRankSum=2.868;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:979,0,1472 chrXIII 12524 . T C 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.424;DP=149;Dels=0.00;FS=2.897;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.904;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1609,0,1535 chrXIII 12620 . C T 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.645;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1140,0,1376 chrXIII 12983 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.169;DP=109;Dels=0.00;FS=3.608;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.325;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1260,0,1113 chrXIII 13240 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.336;DP=131;Dels=0.00;FS=5.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1501,0,1324 chrXIII 13242 . T G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.898;DP=132;Dels=0.00;FS=5.534;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1379,0,1416 chrXIII 13364 . C T 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=119;Dels=0.00;FS=3.352;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.208;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3151,287,0 chrXIII 13439 . A T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.993;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1354,0,1583 chrXIII 13572 . T C 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.280;DP=102;Dels=0.00;FS=3.622;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.222;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.391;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:944,0,1249 chrXIII 13601 . C T 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.430;DP=109;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.703;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:958,0,1352 chrXIII 13605 . A C 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.484;DP=108;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.436;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:901,0,1508 chrXIII 13809 . C G 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.265;DP=100;Dels=0.00;FS=4.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=7.97;ReadPosRankSum=-2.085;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:827,0,1031 chrXIII 13831 . A G 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.977;DP=96;Dels=0.00;FS=3.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:885,0,1048 chrXIII 13852 . T A 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.797;DP=93;Dels=0.00;FS=4.134;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.304;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:906,0,1098 chrXIII 13907 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.098;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:115:99:1267,0,1243 chrXIII 13915 . G A 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.767;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.270;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:1046,0,1251 chrXIII 13986 . C T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.132;DP=118;Dels=0.00;FS=8.537;HaplotypeScore=3.5168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.274;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1355,0,1169 chrXIII 14228 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.128;DP=98;Dels=0.00;FS=0.785;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.060;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1217,0,871 chrXIII 14260 . G C 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.634;DP=80;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.361;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,43:80:99:869,0,781 chrXIII 14341 . G C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:102:99:1031,0,1107 chrXIII 14478 . G C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;DP=126;Dels=0.00;FS=5.559;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.337;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1230,0,1487 chrXIII 14562 . A G 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.212;DP=117;Dels=0.00;FS=10.290;HaplotypeScore=3.1925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.919;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1131,0,1319 chrXIII 14580 . A G 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.505;DP=97;Dels=0.00;FS=2.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:989,0,1101 chrXIII 14592 . A T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.629;DP=101;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=2.394;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1067,0,1133 chrXIII 14705 . G A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.881;DP=115;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1108,0,1377 chrXIII 14781 . C A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1392,0,1458 chrXIII 14857 . C T 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.741;DP=96;Dels=0.00;FS=2.835;HaplotypeScore=4.9645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,37:96:99:742,0,1331 chrXIII 14933 . C A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.981;DP=118;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.616;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1268,0,1116 chrXIII 14934 . G T 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;DP=114;Dels=0.00;FS=3.452;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.531;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1262,0,1157 chrXIII 15055 . A T 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.489;DP=154;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=2.8153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1555,0,1726 chrXIII 15102 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.433;DP=137;Dels=0.00;FS=8.193;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.687;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1401,0,1472 chrXIII 15357 . A G 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.115;DP=123;Dels=0.00;FS=10.176;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=0.195;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.517;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:1011,0,1713 chrXIII 15446 . C T 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.525;DP=101;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.840;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:1050,0,1076 chrXIII 15470 . C T 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.628;DP=110;Dels=0.00;FS=3.529;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:872,0,1349 chrXIII 15621 . T C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.440;DP=134;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1243,0,1517 chrXIII 15903 . A G 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.761;DP=133;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.625;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:133:99:1526,0,1386 chrXIII 16145 . T C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.846;DP=104;Dels=0.00;FS=1.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.202;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:1004,0,1311 chrXIII 16406 . G A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.110;DP=127;Dels=0.00;FS=2.288;HaplotypeScore=2.9508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.511;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1462,0,1170 chrXIII 16426 . C T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.268;DP=130;Dels=0.00;FS=9.474;HaplotypeScore=5.6257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.659;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1521,0,1189 chrXIII 16498 . G T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3378,334,0 chrXIII 16521 . T C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.655;DP=146;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=7.75;ReadPosRankSum=2.055;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1161,0,1817 chrXIII 16593 . G A 694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.639;DP=100;Dels=0.00;FS=9.794;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.311;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,39:100:99:724,0,1368 chrXIII 16764 . G A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.547;DP=120;Dels=0.00;FS=4.576;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1375,0,1224 chrXIII 17364 . T C 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.345;DP=145;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.266;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1690,0,1483 chrXIII 17462 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.852;DP=149;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.363;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1401,0,1807 chrXIII 17526 . C T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.332;DP=135;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=3.9131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.220;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1243,0,1691 chrXIII 17648 . T C 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.384;DP=153;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=3.8148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.225;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1613,0,1665 chrXIII 17690 . A G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.994;DP=144;Dels=0.00;FS=6.495;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=9.64;ReadPosRankSum=2.115;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1418,0,1614 chrXIII 17699 . A C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.895;DP=130;Dels=0.00;FS=5.919;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.402;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1298,0,1509 chrXIII 17708 . T C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;DP=128;Dels=0.00;FS=6.164;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.990;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.122;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1395,0,1402 chrXIII 17810 . C T 1936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.188;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,88:165:99:1966,0,1552 chrXIII 17913 . T C 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.484;DP=178;Dels=0.00;FS=0.562;HaplotypeScore=4.6056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.095;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,80:178:99:1654,0,2177 chrXIII 17933 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.047;DP=158;Dels=0.00;FS=2.007;HaplotypeScore=2.7051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:158:99:1546,0,1756 chrXIII 17955 . T G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.050;DP=155;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.617;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,68:155:99:1403,0,1926 chrXIII 18546 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.565;DP=112;Dels=0.00;FS=7.518;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.518;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1407,0,1004 chrXIII 18729 . C T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.674;DP=116;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=2;MQRankSum=-0.777;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.584;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1230,0,1202 chrXIII 19234 . G A 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;DP=129;Dels=0.00;FS=2.266;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=12.19;ReadPosRankSum=-2.231;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1603,0,1169 chrXIII 19498 . A G 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.648;DP=145;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.056;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1661,0,1466 chrXIII 20284 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.966;DP=122;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.748;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:122:99:1498,0,991 chrXIII 20313 . A G 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.416;DP=147;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.404;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,82:147:99:1678,0,1427 chrXIII 20392 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.802;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1234,0,1522 chrXIII 20497 . T C 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.375;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,88:159:99:1579,0,1553 chrXIII 21082 . C T 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;DP=127;Dels=0.00;FS=15.922;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.50;MQ0=0;MQRankSum=-8.455;QD=6.12;ReadPosRankSum=-2.521;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:807,0,1862 chrXIII 21100 . G T 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.261;DP=124;Dels=0.00;FS=25.438;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQ0=0;MQRankSum=-8.817;QD=6.19;ReadPosRankSum=-3.365;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,46:124:99:798,0,1759 chrXIII 21105 . T C 632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.596;DP=125;Dels=0.00;FS=23.319;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.57;MQ0=0;MQRankSum=-8.744;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.972;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,44:125:99:662,0,1932 chrXIII 21121 . T C 578.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.844;DP=130;Dels=0.00;FS=35.685;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQ0=0;MQRankSum=-9.159;QD=4.45;ReadPosRankSum=1.336;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,43:130:99:608,0,2044 chrXIII 21124 . G A 641.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.301;DP=133;Dels=0.00;FS=41.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQ0=0;MQRankSum=-9.074;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.399;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,44:133:99:671,0,2016 chrXIII 21130 . C T 471.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.805;DP=106;Dels=0.00;FS=50.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.81;MQ0=0;MQRankSum=-8.350;QD=4.44;ReadPosRankSum=2.271;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,35:106:99:501,0,1539 chrXIII 21139 . A G 392.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.578;DP=103;Dels=0.00;FS=56.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQ0=0;MQRankSum=-8.289;QD=3.81;ReadPosRankSum=2.608;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,35:103:99:422,0,1628 chrXIII 21154 . G A 469.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.881;DP=96;Dels=0.00;FS=76.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.02;MQ0=0;MQRankSum=-8.260;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.745;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,38:96:99:499,0,1290 chrXIII 21157 . A G 390.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.384;DP=95;Dels=0.00;FS=72.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-8.193;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.935;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:420,0,1380 chrXIII 21163 . A G 338.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.687;DP=84;Dels=0.00;FS=69.752;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.83;MQ0=0;MQRankSum=-7.751;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,34:84:99:368,0,1245 chrXIII 21175 . A G 192.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.234;DP=82;Dels=0.00;FS=48.648;HaplotypeScore=2.6537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQ0=0;MQRankSum=-7.397;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.885;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:222,0,1298 chrXIII 21211 . G A 189.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.414;DP=88;Dels=0.00;FS=47.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.59;MQ0=0;MQRankSum=-7.291;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:219,0,1536 chrXIII 21229 . A G 233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.624;DP=84;Dels=0.00;FS=8.502;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQ0=0;MQRankSum=-7.042;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:263,0,1439 chrXIII 21231 . A G 235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.479;DP=91;Dels=0.00;FS=6.425;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQ0=0;MQRankSum=-7.146;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.470;SB=-8.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:265,0,1650 chrXIII 21241 . A G 353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.294;DP=101;Dels=0.00;FS=9.038;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQ0=0;MQRankSum=-7.840;QD=3.50;ReadPosRankSum=-0.792;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,29:101:99:383,0,1624 chrXIII 21244 . G A 426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=103;Dels=0.00;FS=13.185;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.67;MQ0=0;MQRankSum=-7.872;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,29:103:99:456,0,1630 chrXIII 21253 . G A 423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;DP=106;Dels=0.00;FS=8.905;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.65;MQ0=0;MQRankSum=-7.999;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.417;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:453,0,1700 chrXIII 21269 . A G 389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.052;DP=106;Dels=0.00;FS=10.782;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=0;MQRankSum=-7.999;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.175;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:419,0,1838 chrXIII 21274 . T A 403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;DP=116;Dels=0.00;FS=6.293;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.24;MQ0=0;MQRankSum=-8.596;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.218;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,36:116:99:433,0,1928 chrXIII 21280 . C T 384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.024;DP=116;Dels=0.00;FS=3.821;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.70;MQ0=0;MQRankSum=-8.458;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.603;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,34:116:99:414,0,1920 chrXIII 21286 . C T 316.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.478;DP=115;Dels=0.00;FS=6.676;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQ0=0;MQRankSum=-8.369;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.776;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,33:115:99:346,0,1917 chrXIII 21292 . C T 394.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.682;DP=116;Dels=0.00;FS=3.677;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.43;MQ0=0;MQRankSum=-8.364;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.254;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,36:116:99:424,0,1838 chrXIII 21295 . G A 333.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.827;DP=112;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.61;MQ0=0;MQRankSum=-8.323;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.179;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,33:112:99:363,0,1836 chrXIII 21298 . T C 311.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.464;DP=112;Dels=0.00;FS=1.658;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQ0=0;MQRankSum=-8.394;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,34:112:99:341,0,1936 chrXIII 21301 . A G 274.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.616;DP=109;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=-8.343;QD=2.51;ReadPosRankSum=-1.024;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,34:109:99:304,0,1778 chrXIII 21307 . T C 283.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQ0=0;MQRankSum=-8.201;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.828;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,32:109:99:313,0,1746 chrXIII 21309 . G A 288.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.107;DP=112;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQ0=0;MQRankSum=-8.247;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,32:112:99:318,0,1781 chrXIII 21310 . T C 237.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.972;DP=112;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQ0=0;MQRankSum=-8.247;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,32:112:99:267,0,1880 chrXIII 21316 . A G 214.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.424;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.21;MQ0=0;MQRankSum=-8.479;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.382;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,35:113:99:244,0,1817 chrXIII 21319 . G A 274.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.145;DP=111;Dels=0.00;FS=1.620;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.06;MQ0=0;MQRankSum=-8.444;QD=2.47;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,35:111:99:304,0,1721 chrXIII 21328 . A G 201.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=119;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=6.7281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.49;MQ0=0;MQRankSum=-8.503;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,34:119:99:231,0,1935 chrXIII 21331 . G A 158.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.603;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=-8.453;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.445;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,33:121:99:188,0,2008 chrXIII 21334 . T C 86.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.701;DP=113;Dels=0.00;FS=0.809;HaplotypeScore=3.8353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.95;MQ0=0;MQRankSum=-8.098;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.770;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,30:113:99:116,0,1972 chrXIII 21337 . G C 58.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;DP=108;Dels=0.00;FS=1.831;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQ0=0;MQRankSum=-7.855;QD=0.54;ReadPosRankSum=1.034;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,28:108:88:88,0,1828 chrXIII 21345 . G C 69.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;DP=114;Dels=0.00;FS=1.724;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQ0=0;MQRankSum=-8.196;QD=0.61;ReadPosRankSum=0.911;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:99,0,1894 chrXIII 21370 . A G 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.747;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=-7.388;QD=0.16;ReadPosRankSum=1.069;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:46:46,0,1808 chrXIII 21375 . C T 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.166;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.35;MQ0=0;MQRankSum=-7.246;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.808;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:68:68,0,1716 chrXIII 21408 . G A 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.535;DP=102;Dels=0.00;FS=5.067;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-6.782;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,19:102:73:73,0,1945 chrXIII 21409 . T C 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.521;DP=102;Dels=0.00;FS=5.130;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-6.782;QD=0.34;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,19:102:65:65,0,2026 chrXIII 21424 . A G 76.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.214;DP=100;Dels=0.00;FS=2.021;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQ0=0;MQRankSum=-7.014;QD=0.76;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,21:100:99:106,0,1903 chrXIII 21430 . A G 100.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.922;DP=97;Dels=0.00;FS=2.125;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=-6.722;QD=1.03;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,20:97:99:130,0,1893 chrXIII 21436 . G A 187.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.050;DP=111;Dels=0.00;FS=10.590;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=0;MQRankSum=-8.057;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:217,0,1844 chrXIII 21439 . G A 230.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.710;DP=114;Dels=0.00;FS=21.220;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQ0=0;MQRankSum=-8.479;QD=2.02;ReadPosRankSum=-2.748;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,35:114:99:260,0,1740 chrXIII 21454 . T A 292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.613;DP=117;Dels=0.00;FS=29.521;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.90;MQ0=0;MQRankSum=-8.613;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.198;SB=-6.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,36:117:99:322,0,1932 chrXIII 21463 . A G 301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.677;DP=118;Dels=0.00;FS=31.827;HaplotypeScore=2.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.12;MQ0=0;MQRankSum=-8.695;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.835;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,37:118:99:331,0,1939 chrXIII 21478 . C A 350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.924;DP=112;Dels=0.00;FS=54.745;HaplotypeScore=5.7955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.27;MQ0=0;MQRankSum=-8.586;QD=3.13;ReadPosRankSum=1.559;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,37:112:99:380,0,1668 chrXIII 21480 . A C 298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.745;DP=112;Dels=0.00;FS=54.745;HaplotypeScore=3.9067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.27;MQ0=0;MQRankSum=-8.586;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.652;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,37:112:99:328,0,1829 chrXIII 21490 . A G 313.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.223;DP=118;Dels=0.00;FS=47.652;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.98;MQ0=0;MQRankSum=-8.630;QD=2.65;ReadPosRankSum=1.768;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,36:118:99:343,0,1977 chrXIII 21496 . A G 307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.922;DP=124;Dels=0.00;FS=43.596;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=-9.040;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.234;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,41:124:99:337,0,1999 chrXIII 21523 . A G 377.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.098;DP=132;Dels=0.00;FS=20.407;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.08;MQ0=0;MQRankSum=-9.338;QD=2.86;ReadPosRankSum=-1.581;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,44:132:99:407,0,2028 chrXIII 21525 . A T 395.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;DP=140;Dels=0.00;FS=15.141;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.40;MQ0=0;MQRankSum=-9.530;QD=2.82;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,45:140:99:425,0,2221 chrXIII 21531 . C T 491.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.530;DP=145;Dels=0.00;FS=16.353;HaplotypeScore=2.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-9.629;QD=3.39;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,51:145:99:521,0,2077 chrXIII 21547 . C T 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;DP=146;Dels=0.00;FS=9.129;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQ0=0;MQRankSum=-8.051;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,56:146:99:779,0,1995 chrXIII 21556 . A G 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.881;DP=153;Dels=0.00;FS=13.273;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.23;MQ0=0;MQRankSum=-7.776;QD=5.54;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,62:153:99:877,0,2044 chrXIII 21607 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.507;DP=141;Dels=0.00;FS=12.242;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQ0=0;MQRankSum=-3.635;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.130;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1384,0,1489 chrXIII 21881 . C G 2089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.314;DP=167;Dels=0.00;FS=0.816;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.243;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,100:167:99:2119,0,1373 chrXIII 22318 . A G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.947;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.949;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1510,0,1514 chrXIII 22495 . G A 1948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.942;DP=143;Dels=0.00;FS=3.193;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.375;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,85:143:99:1978,0,1064 chrXIII 22567 . G A 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.028;DP=117;Dels=0.00;FS=2.548;HaplotypeScore=2.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=1;MQRankSum=0.839;QD=13.38;ReadPosRankSum=-1.824;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,72:117:99:1595,0,844 chrXIII 22768 . A G 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.951;DP=147;Dels=0.00;FS=9.179;HaplotypeScore=4.4000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1623,0,1367 chrXIII 22888 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;DP=128;Dels=0.00;FS=6.808;HaplotypeScore=2.7944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.328;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1415,0,1318 chrXIII 22939 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.692;DP=105;Dels=0.00;FS=1.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.377;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1246,0,1005 chrXIII 22987 . T C 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.212;DP=148;Dels=0.00;FS=14.493;HaplotypeScore=2.9058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=10.63;ReadPosRankSum=2.044;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1603,0,1542 chrXIII 23203 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.534;DP=127;Dels=0.00;FS=2.277;HaplotypeScore=5.4412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.436;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1257,0,1506 chrXIII 23248 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.998;DP=144;Dels=0.00;FS=2.217;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.758;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:144:99:1347,0,1503 chrXIII 23483 . T A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;DP=127;Dels=0.00;FS=3.252;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.191;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1151,0,1478 chrXIII 23620 . G A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.830;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.453;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,73:160:99:1470,0,1948 chrXIII 23630 . A C 1942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.957;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.070;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,87:161:99:1972,0,1544 chrXIII 23828 . A G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.025;DP=96;Dels=0.00;FS=0.874;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:929,0,1065 chrXIII 23863 . A G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.363;DP=119;Dels=0.00;FS=3.385;HaplotypeScore=15.5523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,68:119:99:1105,0,1131 chrXIII 23864 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.837;DP=119;Dels=0.00;FS=3.464;HaplotypeScore=15.5523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.382;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:119:99:1134,0,1101 chrXIII 24034 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.140;DP=136;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.798;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,56:136:99:1148,0,1764 chrXIII 24106 . C G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.368;DP=118;Dels=0.00;FS=5.768;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=1;MQRankSum=-1.055;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1167,0,1231 chrXIII 24134 . A T 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.102;DP=104;Dels=0.00;FS=13.234;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=1;MQRankSum=1.154;QD=9.34;ReadPosRankSum=2.476;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:1001,0,1276 chrXIII 24474 . G T 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.746;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=2.764;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1616,0,1517 chrXIII 24544 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.092;DP=141;Dels=0.00;FS=2.992;HaplotypeScore=3.8983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.506;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1286,0,1613 chrXIII 24556 . T G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.172;DP=132;Dels=0.00;FS=10.895;HaplotypeScore=2.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.329;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.721;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:132:99:1333,0,1478 chrXIII 24565 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.438;DP=131;Dels=0.00;FS=10.904;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=4.185;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1370,0,1272 chrXIII 24568 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;DP=136;Dels=0.00;FS=15.953;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.429;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.583;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1381,0,1473 chrXIII 24592 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.963;DP=124;Dels=0.00;FS=9.805;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.693;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1216,0,1350 chrXIII 24595 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.449;DP=126;Dels=0.00;FS=9.560;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.656;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1230,0,1388 chrXIII 24618 . G A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.635;DP=122;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQ0=0;MQRankSum=-3.484;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1174,0,1356 chrXIII 24637 . A G 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.344;DP=160;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=6.9133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-3.000;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:160:99:1385,0,1892 chrXIII 24712 . C A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.559;DP=150;Dels=0.00;FS=13.657;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=10.23;ReadPosRankSum=2.105;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1565,0,1645 chrXIII 24775 . C T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.223;DP=141;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.107;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1368,0,1714 chrXIII 24787 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.250;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1367,0,1787 chrXIII 24997 . T C 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.724;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,51:127:99:894,0,1740 chrXIII 25021 . C A 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.938;DP=129;Dels=0.00;FS=2.484;HaplotypeScore=4.1607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.126;QD=6.08;ReadPosRankSum=2.171;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,45:129:99:814,0,1839 chrXIII 25025 . A G 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4267;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3336,345,0 chrXIII 25036 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;DP=134;Dels=0.00;FS=11.082;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.526;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1064,0,1679 chrXIII 25114 . T A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;DP=124;Dels=0.00;FS=3.283;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1538,0,1062 chrXIII 25168 . G A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.786;DP=119;Dels=0.00;FS=7.143;HaplotypeScore=3.9467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.349;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1633,0,996 chrXIII 25294 . A G 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3544,369,0 chrXIII 25303 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.628;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.446;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1308,0,1454 chrXIII 25638 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;DP=122;Dels=0.00;FS=3.240;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.146;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1160,0,1457 chrXIII 26333 . G A 1918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.450;DP=171;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=9.5560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.399;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,94:171:99:1948,0,1443 chrXIII 26434 . G A 4315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.277;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.974;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:160:99:4315,430,0 chrXIII 26468 . T C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.631;DP=124;Dels=0.00;FS=1.947;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.23;MQ0=0;MQRankSum=3.043;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1108,0,1579 chrXIII 26589 . A T 715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.348;DP=74;Dels=0.03;FS=9.304;HaplotypeScore=143.0079;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=9.66;ReadPosRankSum=6.494;SB=-1.800e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,47:72:78:748,78,0 chrXIII 26706 . T C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.799;DP=157;Dels=0.01;FS=8.091;HaplotypeScore=54.9049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.663;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,86:156:99:1520,0,1123 chrXIII 26922 . A C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.106;DP=135;Dels=0.00;FS=9.297;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1438,0,1445 chrXIII 26928 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.525;DP=134;Dels=0.00;FS=10.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1452,0,1372 chrXIII 27274 . C T 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.047;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.133;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1801,0,1484 chrXIII 27643 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.298;DP=129;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=10.21;ReadPosRankSum=-3.304;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1347,0,1420 chrXIII 27865 . G T 2120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.071;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=14.32;ReadPosRankSum=2.004;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,93:148:99:2150,0,1108 chrXIII 28338 . T C 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.540;DP=129;Dels=0.00;FS=6.868;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1480,0,1316 chrXIII 28519 . A C 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.223;DP=106;Dels=0.00;FS=6.221;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:928,0,1231 chrXIII 28623 . T C 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;DP=92;Dels=0.00;FS=2.790;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.656;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:717,0,1245 chrXIII 28695 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.780;DP=135;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.396;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1373,0,1534 chrXIII 28764 . A T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;DP=119;Dels=0.00;FS=4.414;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.434;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1192,0,1438 chrXIII 29145 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.727;DP=138;Dels=0.00;FS=7.583;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.123;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:138:99:1299,0,1554 chrXIII 29616 . T A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;DP=142;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=5.8608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.863;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:142:99:1229,0,1663 chrXIII 29721 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.341;DP=129;Dels=0.00;FS=3.201;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:129:99:1475,0,1225 chrXIII 29779 . T C 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.723;DP=132;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,77:132:99:1654,0,1172 chrXIII 29826 . C T 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3054,295,0 chrXIII 29994 . T G 4351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4351,445,0 chrXIII 30303 . T C 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.192;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.999;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:1665,0,1503 chrXIII 30379 . T A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;DP=134;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.492;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1319,0,1675 chrXIII 30523 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.007;DP=125;Dels=0.00;FS=6.791;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.166;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1251,0,1453 chrXIII 30585 . G C 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;DP=149;Dels=0.00;FS=2.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.052;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:1211,0,1939 chrXIII 30827 . A G 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7850;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3962,411,0 chrXIII 30836 . G A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.750;DP=147;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=4.7223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1322,0,1807 chrXIII 31110 . C T 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.637;DP=134;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=7.4257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.696;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1487,0,1340 chrXIII 31154 . A G 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.514;DP=133;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.617;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1625,0,1233 chrXIII 31404 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.517;DP=117;Dels=0.00;FS=3.360;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.960;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.693;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1075,0,1358 chrXIII 31828 . G A 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.975;DP=106;Dels=0.00;FS=3.689;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.350;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:823,0,1448 chrXIII 32108 . T C 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.363;DP=147;Dels=0.00;FS=1.301;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1409,0,1703 chrXIII 32119 . T C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.036;DP=147;Dels=0.00;FS=2.086;HaplotypeScore=2.4272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.168;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1436,0,1671 chrXIII 32457 . G T 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.857;DP=140;Dels=0.00;FS=8.976;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.922;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1680,0,1320 chrXIII 32504 . G A 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.479;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.177;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:1581,0,970 chrXIII 32621 . G A 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.946;DP=128;Dels=0.01;FS=4.378;HaplotypeScore=4.5175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=0.587;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1607,0,1001 chrXIII 32868 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.214;DP=137;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1519,0,1412 chrXIII 33005 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.525;DP=136;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=6.2068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1407,0,1505 chrXIII 33236 . G A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.631;DP=120;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.248;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1461,0,1147 chrXIII 33242 . G T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.753;DP=119;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1417,0,1138 chrXIII 33341 . A T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.956;DP=116;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.599;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1240,0,1216 chrXIII 33368 . G A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.563;DP=126;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.511;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1289,0,1423 chrXIII 33464 . A G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;DP=116;Dels=0.00;FS=12.421;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=12.88;ReadPosRankSum=1.817;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,67:116:99:1524,0,1040 chrXIII 33506 . C A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.839;DP=109;Dels=0.00;FS=2.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1225,0,1065 chrXIII 33680 . T C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.390;DP=132;Dels=0.00;FS=4.312;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1180,0,1615 chrXIII 33731 . C T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.891;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1111,0,1125 chrXIII 33836 . G A 713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.235;DP=111;Dels=0.00;FS=3.509;HaplotypeScore=42.4504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.269;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,44:111:99:743,0,1436 chrXIII 34473 . T G 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3598,361,0 chrXIII 34648 . G A 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.486;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.880;QD=11.39;ReadPosRankSum=-2.557;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1716,0,1379 chrXIII 34672 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.532;DP=135;Dels=0.00;FS=5.179;HaplotypeScore=2.9120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.776;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1286,0,1520 chrXIII 34690 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=126;Dels=0.00;FS=6.744;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.096;QD=9.74;ReadPosRankSum=2.042;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1257,0,1428 chrXIII 34777 . G A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.878;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.596;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1429,0,1002 chrXIII 34804 . C A 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.128;DP=139;Dels=0.00;FS=2.205;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.201;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,82:139:99:1848,0,1129 chrXIII 34805 . T A 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.092;DP=138;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.440;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,81:138:99:1830,0,1170 chrXIII 35547 . C T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.038;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.784;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1501,0,1250 chrXIII 35559 . C G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.156;DP=132;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=2.7227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.469;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1324,0,1394 chrXIII 35592 . T C 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.873;DP=107;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1020,0,1318 chrXIII 35651 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.285;DP=131;Dels=0.00;FS=3.172;HaplotypeScore=2.7776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1392,0,1322 chrXIII 35658 . C A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.421;DP=136;Dels=0.00;FS=8.338;HaplotypeScore=2.7041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.399;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1304,0,1469 chrXIII 35720 . T A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;DP=129;Dels=0.01;FS=6.968;HaplotypeScore=5.7795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1335,0,1453 chrXIII 35874 . C T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.967;DP=114;Dels=0.00;FS=4.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1405,0,1034 chrXIII 36081 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.161;DP=113;Dels=0.00;FS=4.712;HaplotypeScore=4.8335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.790;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1187,0,1275 chrXIII 36176 . C T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.198;DP=152;Dels=0.00;FS=3.519;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.727;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1443,0,1745 chrXIII 36261 . G A 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.912;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.858;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1746,0,1686 chrXIII 36440 . T C 3936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3936,394,0 chrXIII 36544 . T C 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.832;DP=136;Dels=0.00;FS=6.732;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1530,0,1503 chrXIII 36940 . G A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.859;DP=120;Dels=0.00;FS=7.007;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.172;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1191,0,1401 chrXIII 37053 . T C 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3289,339,0 chrXIII 37465 . T C 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.362;DP=176;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=5.4957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,89:176:99:1799,0,1831 chrXIII 37516 . G C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;DP=127;Dels=0.00;FS=3.924;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1313,0,1382 chrXIII 37611 . C T 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.793;DP=178;Dels=0.00;FS=1.208;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.064;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,79:178:99:1623,0,1914 chrXIII 37647 . G A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.339;DP=165;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=7.9451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.334;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:1470,0,1905 chrXIII 37836 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.117;DP=124;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1210,0,1286 chrXIII 37845 . A T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.844;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.111;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1422,0,1336 chrXIII 37888 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.651;DP=127;Dels=0.00;FS=5.837;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.673;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1295,0,1436 chrXIII 37897 . A T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.991;DP=138;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1399,0,1603 chrXIII 37925 . T A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1261,0,1408 chrXIII 37977 . T G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.002;DP=131;Dels=0.00;FS=4.606;HaplotypeScore=2.5309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:131:99:1271,0,1499 chrXIII 38045 . G T 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.823;DP=100;Dels=0.00;FS=6.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.035;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:1075,0,1163 chrXIII 38072 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.004;DP=120;Dels=0.00;FS=2.498;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.818;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1101,0,1486 chrXIII 38121 . A C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.970;DP=131;Dels=0.00;FS=4.280;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=9.88;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1324,0,1441 chrXIII 38744 . G T 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.379;DP=122;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1157,0,1530 chrXIII 39077 . G A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.714;DP=120;Dels=0.00;FS=3.577;HaplotypeScore=4.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.690;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1136,0,1434 chrXIII 39248 . T C 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.398;DP=149;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1753,0,1514 chrXIII 39443 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.323;DP=126;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1121,0,1548 chrXIII 39858 . T C 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.525;DP=143;Dels=0.00;FS=2.982;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.855;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1609,0,1538 chrXIII 39888 . G A 1772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.719;DP=155;Dels=0.00;FS=5.846;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.853;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,83:155:99:1802,0,1498 chrXIII 39977 . C T 1843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.585;DP=177;Dels=0.00;FS=3.466;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=10.41;ReadPosRankSum=2.510;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,88:177:99:1873,0,1941 chrXIII 40087 . T G 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.352;DP=137;Dels=0.00;FS=15.951;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=11.78;ReadPosRankSum=-1.482;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1644,0,1340 chrXIII 40376 . C A 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.593;DP=129;Dels=0.00;FS=17.412;HaplotypeScore=4.9355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=12.39;ReadPosRankSum=2.255;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:129:99:1628,0,1105 chrXIII 40406 . A G 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.094;DP=126;Dels=0.00;FS=5.298;HaplotypeScore=2.8757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.651;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:126:99:1658,0,1090 chrXIII 40487 . T C 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.325;DP=140;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1505,0,1505 chrXIII 40511 . G A 1784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.850;DP=167;Dels=0.00;FS=2.126;HaplotypeScore=6.9149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:1814,0,1746 chrXIII 41051 . G T 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3852,373,0 chrXIII 41731 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.149;DP=160;Dels=0.00;FS=10.435;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.260;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,71:160:99:1485,0,1999 chrXIII 42127 . A G 4372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.57;SB=-2.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4372,441,0 chrXIII 42136 . A G 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.871;DP=151;Dels=0.00;FS=7.233;HaplotypeScore=3.8343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.751;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1497,0,1451 chrXIII 42196 . C G 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.761;DP=160;Dels=0.00;FS=8.713;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1707,0,1764 chrXIII 42593 . G T 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.788;DP=134;Dels=0.00;FS=6.472;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.149;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1516,0,1318 chrXIII 43096 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.875;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.982;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1338,0,1452 chrXIII 43166 . A G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.543;DP=141;Dels=0.00;FS=6.444;HaplotypeScore=1.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.928;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.582;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1427,0,1521 chrXIII 44287 . T C 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.347;DP=152;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=1.8288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.255;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,86:152:99:1739,0,1369 chrXIII 45254 . A G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.541;DP=154;Dels=0.00;FS=2.019;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.660;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:154:99:1379,0,1940 chrXIII 45369 . A G 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.199;DP=131;Dels=0.00;FS=8.590;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.412;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1382,0,1396 chrXIII 45656 . G A 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.430;DP=160;Dels=0.00;FS=5.425;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.611;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1734,0,1647 chrXIII 45743 . G A 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.976;DP=144;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.913;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1775,0,1350 chrXIII 45947 . A G 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.893;DP=135;Dels=0.00;FS=17.486;HaplotypeScore=3.9394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.556;QD=5.68;ReadPosRankSum=-3.809;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,49:135:99:797,0,2093 chrXIII 46009 . C T 1049.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.110;DP=142;Dels=0.00;FS=45.345;HaplotypeScore=4.4197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.163;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,56:142:99:1079,0,1889 chrXIII 46074 . G A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.403;DP=154;Dels=0.00;FS=13.944;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1517,0,1676 chrXIII 46256 . C G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.504;DP=140;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=5.9127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.145;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:140:99:1427,0,1391 chrXIII 46362 . G C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;DP=115;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=8.57;ReadPosRankSum=2.300;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1015,0,1418 chrXIII 46508 . T C 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.151;DP=115;Dels=0.00;FS=8.932;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.996;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:115:99:903,0,1414 chrXIII 46758 . C T 633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.214;DP=103;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.052;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:663,0,1475 chrXIII 47331 . C T 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.941;DP=140;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=2.6420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.623;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1645,0,1350 chrXIII 47403 . A T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.641;DP=124;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=3.8135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1514,0,1182 chrXIII 47781 . A C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.641;DP=131;Dels=0.00;FS=4.254;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1124,0,1619 chrXIII 47811 . A G 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;DP=134;Dels=0.00;FS=4.152;HaplotypeScore=5.9582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.909;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:1065,0,1691 chrXIII 48342 . C T 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.562;DP=83;Dels=0.00;FS=3.261;HaplotypeScore=1.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.172;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:1028,0,728 chrXIII 48378 . G A 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.674;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.423;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:1001,0,876 chrXIII 48393 . G C 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.834;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:895,0,924 chrXIII 48814 . A G 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.630;DP=144;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1632,0,1457 chrXIII 48882 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.069;DP=127;Dels=0.00;FS=4.278;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1362,0,1371 chrXIII 49588 . C T 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.730;DP=103;Dels=0.00;FS=3.815;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,40:103:99:854,0,1386 chrXIII 49937 . T G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.324;DP=105;Dels=0.00;FS=2.976;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1039,0,1194 chrXIII 50514 . T A 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.722;DP=145;Dels=0.00;FS=6.312;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.894;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,84:145:99:1929,0,1286 chrXIII 50831 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.880;DP=126;Dels=0.00;FS=8.215;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.057;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:126:99:1470,0,1086 chrXIII 50890 . C A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.053;DP=127;Dels=0.00;FS=3.187;HaplotypeScore=2.8494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.674;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1379,0,1253 chrXIII 50955 . T G 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;DP=154;Dels=0.00;FS=3.031;HaplotypeScore=3.9210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1653,0,1676 chrXIII 51084 . T C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.766;DP=136;Dels=0.00;FS=4.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1463,0,1459 chrXIII 51141 . A T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;DP=109;Dels=0.00;FS=4.767;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.316;QD=8.93;ReadPosRankSum=2.445;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:1003,0,1442 chrXIII 51256 . C T 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.603;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=3.196;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.464;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1686,0,1238 chrXIII 51317 . T C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.799;DP=124;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=2.046;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1348,0,1176 chrXIII 51358 . G T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.859;DP=124;Dels=0.00;FS=6.893;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.187;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1439,0,1157 chrXIII 51433 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.974;DP=118;Dels=0.00;FS=7.127;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1224,0,1313 chrXIII 51596 . A G 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.817;DP=129;Dels=0.00;FS=2.261;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.245;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1555,0,1248 chrXIII 51658 . A G 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.253;DP=138;Dels=0.00;FS=7.661;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1647,0,1372 chrXIII 51750 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.386;DP=115;Dels=0.00;FS=5.220;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.388;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.148;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1190,0,1259 chrXIII 51822 . A T 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;DP=114;Dels=0.00;FS=4.615;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.711;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1296,0,1231 chrXIII 51951 . T A 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.874;DP=143;Dels=0.00;FS=7.554;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.359;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1773,0,1374 chrXIII 52335 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.851;DP=127;Dels=0.00;FS=9.648;HaplotypeScore=2.6406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1379,0,1355 chrXIII 52482 . G A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.908;DP=151;Dels=0.00;FS=8.638;HaplotypeScore=2.5975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.103;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:1429,0,1810 chrXIII 52494 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.407;DP=148;Dels=0.00;FS=2.927;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.478;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1362,0,1773 chrXIII 52925 . C T 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.593;DP=134;Dels=0.00;FS=5.240;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1639,0,1237 chrXIII 52926 . C A 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.863;DP=136;Dels=0.00;FS=5.209;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1649,0,1218 chrXIII 53052 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.597;DP=134;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1388,0,1490 chrXIII 53073 . A G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.235;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.967;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1445,0,1725 chrXIII 53235 . T C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.837;DP=138;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=6.3521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.899;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.665;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1449,0,1497 chrXIII 53276 . C G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;DP=137;Dels=0.00;FS=4.232;HaplotypeScore=2.7412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.756;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1434,0,1376 chrXIII 53532 . G A 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.488;DP=97;Dels=0.00;FS=2.697;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.257;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:921,0,972 chrXIII 53537 . T C 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.480;DP=98;Dels=0.00;FS=3.812;HaplotypeScore=2.4383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:855,0,1022 chrXIII 53642 . A G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.693;DP=127;Dels=0.00;FS=4.472;HaplotypeScore=6.7937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.705;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1315,0,1266 chrXIII 53825 . C A 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.636;DP=109;Dels=0.00;FS=7.595;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.549;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.463;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1048,0,965 chrXIII 53841 . A G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.527;DP=120;Dels=0.00;FS=2.388;HaplotypeScore=2.4326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.645;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,73:120:99:1133,0,993 chrXIII 53934 . T C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.831;DP=135;Dels=0.00;FS=4.084;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.343;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1299,0,1355 chrXIII 53982 . C G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.710;DP=131;Dels=0.00;FS=2.206;HaplotypeScore=3.2300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=9.76;ReadPosRankSum=2.088;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1308,0,1308 chrXIII 53991 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.543;DP=126;Dels=0.00;FS=1.420;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.787;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1353,0,1299 chrXIII 54136 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.832;DP=121;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.077;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1421,0,1151 chrXIII 54192 . A C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.911;DP=113;Dels=0.00;FS=2.528;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.298;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1429,0,1102 chrXIII 54576 . G C 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.406;DP=126;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=11.66;ReadPosRankSum=-2.166;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1499,0,1064 chrXIII 54586 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.945;DP=125;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=2.4905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=1.997;QD=11.75;ReadPosRankSum=-2.092;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:125:99:1499,0,1059 chrXIII 54663 . C T 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.400;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.293;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:900,0,974 chrXIII 54916 . A G 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.218;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1006,0,1274 chrXIII 55092 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.183;DP=129;Dels=0.00;FS=3.279;HaplotypeScore=13.5332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1363,0,1342 chrXIII 55098 . A C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.504;DP=119;Dels=0.00;FS=2.463;HaplotypeScore=9.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1228,0,1212 chrXIII 55152 . A G 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.080;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1175,0,1158 chrXIII 55558 . A G 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.410;DP=112;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1130,0,1303 chrXIII 55582 . A G 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.255;DP=104;Dels=0.00;FS=2.539;HaplotypeScore=3.6464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:975,0,1148 chrXIII 55751 . G A 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.980;DP=99;Dels=0.00;FS=6.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:859,0,1330 chrXIII 55773 . G C 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;DP=110;Dels=0.00;FS=3.517;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:919,0,1378 chrXIII 55803 . G T 717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.881;DP=93;Dels=0.00;FS=4.157;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.770;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,38:93:99:747,0,1242 chrXIII 56422 . G C 561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.229;DP=85;Dels=0.00;FS=5.618;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=2.157;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,34:85:99:591,0,1174 chrXIII 58688 . T G 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.653;DP=133;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.015;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1504,0,1419 chrXIII 58718 . T A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.580;DP=125;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1411,0,1392 chrXIII 58847 . T G 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.155;DP=77;Dels=0.00;FS=0.856;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.678;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:863,0,741 chrXIII 59135 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.155;DP=139;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.512;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1461,0,1433 chrXIII 59485 . A G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.104;DP=124;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.160;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:124:99:1312,0,1213 chrXIII 59627 . G A 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.996;DP=129;Dels=0.02;FS=1.816;HaplotypeScore=7.6206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1513,0,1266 chrXIII 59776 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.304;DP=107;Dels=0.00;FS=2.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,62:107:99:1332,0,931 chrXIII 60420 . G C 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;DP=106;Dels=0.00;FS=8.192;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:841,0,1361 chrXIII 60431 . C T 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.573;DP=111;Dels=0.00;FS=4.946;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:993,0,1377 chrXIII 60610 . C T 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.662;DP=147;Dels=0.00;FS=10.037;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.045;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1627,0,1514 chrXIII 60742 . G A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.727;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.586;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1391,0,934 chrXIII 60754 . T G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.675;DP=102;Dels=0.00;FS=1.985;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,61:102:99:1367,0,898 chrXIII 60925 . G A 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=9.97;ReadPosRankSum=2.354;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:1007,0,1150 chrXIII 60944 . G A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.724;DP=113;Dels=0.00;FS=4.672;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1406,0,984 chrXIII 61147 . A G 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.643;DP=120;Dels=0.00;FS=3.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1395,0,1130 chrXIII 61164 . A C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.308;DP=122;Dels=0.00;FS=3.786;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.270;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1347,0,1147 chrXIII 61366 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.904;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.932;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1218,0,1579 chrXIII 61391 . G A 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.933;DP=124;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=4.9627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1298,0,1407 chrXIII 61433 . C T 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.915;DP=106;Dels=0.00;FS=3.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.266;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:959,0,1419 chrXIII 61486 . C T 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.285;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.012;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:848,0,1438 chrXIII 61663 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;DP=117;Dels=0.00;FS=1.468;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.887;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1385,0,1202 chrXIII 61741 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.776;DP=86;Dels=0.00;FS=20.489;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.183;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:918,0,918 chrXIII 61840 . A T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;DP=107;Dels=0.00;FS=6.051;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.508;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1251,0,1139 chrXIII 62010 . G C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;DP=112;Dels=0.00;FS=8.905;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1029,0,1312 chrXIII 62344 . C A 564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.143;DP=63;Dels=0.00;FS=0.996;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.724;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:594,0,709 chrXIII 62513 . A C 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.649;DP=102;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:882,0,1176 chrXIII 62570 . C T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.783;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1316,0,1281 chrXIII 62572 . G A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;DP=124;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1301,0,1398 chrXIII 62594 . A G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.607;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.579;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1434,0,1537 chrXIII 62630 . G T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.774;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1602,0,1291 chrXIII 62996 . C T 1914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.260;DP=156;Dels=0.00;FS=5.825;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.900;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:1944,0,1442 chrXIII 63305 . T A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.699;DP=129;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.836;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1502,0,1397 chrXIII 63358 . C A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.726;DP=136;Dels=0.00;FS=3.106;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1496,0,1481 chrXIII 63473 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.505;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.473;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1478,0,1193 chrXIII 63566 . A G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.453;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.601;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1077,0,1339 chrXIII 63905 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.302;DP=118;Dels=0.00;FS=2.361;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=9.65;ReadPosRankSum=-2.086;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1169,0,1305 chrXIII 63947 . T A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;DP=121;Dels=0.00;FS=4.411;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=10.70;ReadPosRankSum=2.735;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1325,0,1309 chrXIII 64467 . G T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.928;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1174,0,1054 chrXIII 64972 . C A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.580;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1362,0,1325 chrXIII 65232 . A G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1336,0,1246 chrXIII 65350 . T C 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.406;DP=147;Dels=0.00;FS=7.501;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.048;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1610,0,1530 chrXIII 65629 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.203;DP=129;Dels=0.00;FS=13.462;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1336,0,1461 chrXIII 67415 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.806;DP=130;Dels=0.00;FS=4.242;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=1;MQRankSum=-1.643;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.087;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1457,0,1276 chrXIII 67645 . G C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.866;DP=113;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1291,0,1163 chrXIII 67702 . T C 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;DP=126;Dels=0.00;FS=18.328;HaplotypeScore=60.5866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=-4.556;QD=0.11;ReadPosRankSum=-5.685;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,20:126:44:44,0,1571 chrXIII 67707 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.564;DP=133;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=60.5866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.867;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1151,0,1551 chrXIII 67979 . G T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.097;DP=111;Dels=0.00;FS=3.520;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.244;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1316,0,977 chrXIII 67986 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.778;DP=118;Dels=0.00;FS=3.376;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1350,0,1128 chrXIII 68126 . A T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;DP=125;Dels=0.00;FS=4.392;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.088;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,50:125:99:1007,0,1687 chrXIII 68826 . T C 1940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.817;DP=168;Dels=0.00;FS=2.714;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.539;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,95:168:99:1970,0,1505 chrXIII 69109 . C G 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.165;DP=169;Dels=0.00;FS=1.995;HaplotypeScore=2.9181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.530;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,81:169:99:1664,0,1722 chrXIII 69113 . A G 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.073;DP=161;Dels=0.00;FS=5.024;HaplotypeScore=6.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:1500,0,1844 chrXIII 70163 . A G 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1457,0,1790 chrXIII 70356 . C T 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.237;DP=116;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.469;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,73:116:99:1617,0,756 chrXIII 71137 . A G 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.332;DP=172;Dels=0.00;FS=3.700;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,84:172:99:1757,0,1812 chrXIII 71382 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.608;DP=144;Dels=0.00;FS=11.859;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.642;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.140;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1189,0,1798 chrXIII 71390 . A C 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.539;DP=170;Dels=0.00;FS=6.535;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=8.87;ReadPosRankSum=-2.866;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,86:170:99:1538,0,1944 chrXIII 71397 . T C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.800;DP=161;Dels=0.00;FS=2.813;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.909;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1404,0,1882 chrXIII 71867 . A T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;DP=148;Dels=0.00;FS=4.924;HaplotypeScore=2.7635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.418;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1454,0,1786 chrXIII 72027 . C T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.673;DP=128;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.153;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1389,0,1353 chrXIII 72351 . C A 2134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;DP=156;Dels=0.00;FS=13.515;HaplotypeScore=3.1217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=13.68;ReadPosRankSum=-2.593;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,93:156:99:2164,0,1270 chrXIII 73368 . G A 2365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.364;DP=200;Dels=0.00;FS=0.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,104:200:99:2395,0,1939 chrXIII 73993 . C T 1923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.076;DP=157;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.174;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,84:157:99:1953,0,1552 chrXIII 74014 . C T 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.314;DP=150;Dels=0.00;FS=2.550;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1882,0,1446 chrXIII 74282 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.776;DP=128;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1242,0,1361 chrXIII 74346 . C T 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.293;DP=136;Dels=0.00;FS=3.318;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.902;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1607,0,1364 chrXIII 74436 . C T 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.575;DP=124;Dels=0.00;FS=3.263;HaplotypeScore=2.8489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1154,0,1448 chrXIII 74599 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.723;DP=163;Dels=0.00;FS=2.813;HaplotypeScore=3.7811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.528;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,70:163:99:1415,0,2021 chrXIII 74632 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;DP=134;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.265;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1273,0,1573 chrXIII 74704 . A G 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.979;DP=141;Dels=0.00;FS=3.046;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1457,0,1636 chrXIII 75046 . C A 2276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.862;DP=181;Dels=0.00;FS=0.587;HaplotypeScore=2.9312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.724;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,101:181:99:2306,0,1602 chrXIII 75133 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.247;DP=134;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=11.33;ReadPosRankSum=2.189;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1548,0,1264 chrXIII 75251 . G C 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;DP=176;Dels=0.00;FS=2.620;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.163;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,87:176:99:1815,0,1933 chrXIII 75304 . T C 2052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.215;DP=177;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=6.4690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.215;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,96:177:99:2082,0,1717 chrXIII 75396 . T C 1741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.044;DP=153;Dels=0.00;FS=4.799;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1771,0,1544 chrXIII 75576 . A G 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.195;DP=167;Dels=0.00;FS=7.027;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.627;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:1626,0,1958 chrXIII 75773 . A T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.803;DP=127;Dels=0.00;FS=16.859;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=11.45;ReadPosRankSum=-2.108;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1484,0,1329 chrXIII 75781 . T A 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;DP=153;Dels=0.00;FS=31.901;HaplotypeScore=3.8388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1745,0,1561 chrXIII 76188 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.951;DP=137;Dels=0.00;FS=4.564;HaplotypeScore=3.6482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1392,0,1464 chrXIII 76194 . A C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.237;DP=154;Dels=0.00;FS=6.702;HaplotypeScore=4.5394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1360,0,1725 chrXIII 76222 . A T 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;DP=168;Dels=0.00;FS=9.451;HaplotypeScore=3.5158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,74:168:99:1556,0,2170 chrXIII 76243 . A G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.036;DP=156;Dels=0.00;FS=5.840;HaplotypeScore=5.8690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.451;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:1361,0,2000 chrXIII 76517 . A G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1514,0,1339 chrXIII 76522 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.480;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1324,0,1397 chrXIII 76593 . C T 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.190;DP=149;Dels=0.00;FS=2.056;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.004;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1766,0,1332 chrXIII 76723 . A G 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.968;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.792;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.182;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,82:148:99:1761,0,1430 chrXIII 76932 . G C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.462;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=1;MQRankSum=-0.340;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.803;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1616,0,1417 chrXIII 77019 . C G 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.709;DP=160;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,88:160:99:1823,0,1546 chrXIII 77482 . C T 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.369;DP=153;Dels=0.00;FS=11.599;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.528;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1476,0,1836 chrXIII 77501 . C T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.865;DP=159;Dels=0.00;FS=12.873;HaplotypeScore=5.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.790;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:1492,0,1778 chrXIII 77737 . G A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.225;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.546;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1582,0,1587 chrXIII 77739 . G C 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.258;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.822;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1490,0,1589 chrXIII 77879 . T G 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3199,333,0 chrXIII 77934 . C T 2605 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2365;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=26.58;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2638,270,0 chrXIII 77979 . T G 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3115,318,0 chrXIII 77997 . C T 3909.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3909,379,0 chrXIII 78097 . A G 3330.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.76;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3330,345,0 chrXIII 78101 . T C 3220.05 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4147;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.70;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3253,342,0 chrXIII 78103 . A G 3324.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4147;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.54;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3324,337,0 chrXIII 78125 . C T 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.13;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3488,343,0 chrXIII 78446 . T A 4242.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4242,415,0 chrXIII 78658 . T C 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2905,309,0 chrXIII 78710 . A C 3942.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3942,403,0 chrXIII 78777 . T C 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.47;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3415,360,0 chrXIII 78806 . A G 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.571;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5257;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=24.08;ReadPosRankSum=1.571;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:130:99:3163,333,0 chrXIII 78836 . A G 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=22.77;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:3597,361,0 chrXIII 78839 . G A 4093.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4093,403,0 chrXIII 78923 . C T 4123.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49;SB=-2.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4123,421,0 chrXIII 78960 . T C 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.291;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.886;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1416,0,1409 chrXIII 79575 . C A 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.940;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.604;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:846,0,1188 chrXIII 79680 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.982;DP=96;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,57:96:99:1261,0,848 chrXIII 79713 . T C 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2845,294,0 chrXIII 79739 . C T 2628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2661,267,0 chrXIII 79761 . T G 2655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=103;Dels=0.00;FS=3.694;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=25.78;ReadPosRankSum=1.059;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2688,264,0 chrXIII 79783 . T C 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2870,309,0 chrXIII 79850 . A G 3949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=150;Dels=0.00;FS=3.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=26.33;ReadPosRankSum=1.062;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3949,388,0 chrXIII 79968 . C T 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3787,355,0 chrXIII 80160 . C T 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3328,328,0 chrXIII 80220 . G A 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3104,310,0 chrXIII 80292 . T C 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3422,337,0 chrXIII 80403 . T C 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=24.41;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:102:99:2523,258,0 chrXIII 80527 . C T 3722.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.880e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3722,364,0 chrXIII 80728 . G A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.599;DP=152;Dels=0.00;FS=10.135;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1488,0,1798 chrXIII 80821 . A C 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.263;DP=114;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:864,0,1523 chrXIII 80887 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.299;DP=127;Dels=0.00;FS=11.279;HaplotypeScore=4.9588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=9.37;ReadPosRankSum=2.108;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1220,0,1521 chrXIII 81047 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.558;DP=141;Dels=0.00;FS=10.731;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.788;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1204,0,1548 chrXIII 81063 . G A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.415;DP=140;Dels=0.00;FS=3.061;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=9.27;ReadPosRankSum=2.058;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1328,0,1358 chrXIII 81072 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.151;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-3.351;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.390;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1361,0,1157 chrXIII 81111 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.239;DP=124;Dels=0.00;FS=4.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1560,0,1087 chrXIII 81228 . G A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.907;DP=124;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=3.7290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1460,0,1286 chrXIII 81243 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.129;DP=130;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=3.6425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.464;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1271,0,1446 chrXIII 81343 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.668;DP=97;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.749;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1127,0,939 chrXIII 81589 . T A 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1298,0,1368 chrXIII 81909 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.014;DP=117;Dels=0.00;FS=5.388;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1286,0,1181 chrXIII 81991 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.613;DP=114;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1334,0,1204 chrXIII 82027 . A G 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.35;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3092,321,0 chrXIII 82308 . T A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.943;DP=121;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1405,0,1195 chrXIII 82357 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.368;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.668;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:908,0,1621 chrXIII 82552 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.979;DP=146;Dels=0.00;FS=10.208;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.244;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1417,0,1674 chrXIII 83128 . T C 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.323;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=27.13;ReadPosRankSum=1.008;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:3017,318,0 chrXIII 83176 . T C 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.959;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2896,312,0 chrXIII 83404 . G A 1859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.294;DP=165;Dels=0.00;FS=2.740;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.543;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1889,0,1650 chrXIII 83417 . C A 1870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.004;DP=166;Dels=0.00;FS=6.758;HaplotypeScore=2.3235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.654;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,89:166:99:1900,0,1636 chrXIII 83501 . A G 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.550;DP=148;Dels=0.00;FS=2.073;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,83:148:99:1776,0,1435 chrXIII 83860 . T C 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.523;DP=118;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.381;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1068,0,1402 chrXIII 83905 . T C 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.075;DP=96;Dels=0.00;FS=9.118;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.513;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:942,0,1103 chrXIII 83964 . G A 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2840,279,0 chrXIII 84058 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.950;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=11.57;ReadPosRankSum=-1.267;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:101:99:1199,0,827 chrXIII 84059 . G T 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.070;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1216,0,781 chrXIII 84176 . T C 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.453;DP=125;Dels=0.00;FS=2.277;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.304;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1445,0,1318 chrXIII 84178 . G A 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=28.42;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3581,355,0 chrXIII 84233 . T C 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2628,276,0 chrXIII 84550 . T C 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.503;DP=113;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=1;MQRankSum=1.673;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.033;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1150,0,1245 chrXIII 84551 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.351;DP=112;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=1;MQRankSum=0.363;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.670;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1217,0,1213 chrXIII 84712 . C T 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3201,310,0 chrXIII 84896 . A C 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3701;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=26.09;ReadPosRankSum=1.509;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3653,347,0 chrXIII 85213 . G A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.470;DP=122;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=2.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1144,0,1494 chrXIII 85247 . T C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.037;DP=132;Dels=0.00;FS=1.655;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.775;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,54:132:99:986,0,1839 chrXIII 85307 . G A 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3277,328,0 chrXIII 85402 . A T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.641;DP=103;Dels=0.00;FS=6.344;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1330,0,839 chrXIII 85411 . T A 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.147;DP=91;Dels=0.00;FS=3.962;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:793,0,1115 chrXIII 85546 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.396;DP=124;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=4.8392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:124:99:1375,0,1249 chrXIII 86212 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.094;DP=133;Dels=0.00;FS=9.299;HaplotypeScore=2.6478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.858;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1287,0,1542 chrXIII 86512 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.660;DP=120;Dels=0.00;FS=2.344;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.042;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1556,0,1018 chrXIII 86646 . C T 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.095;DP=105;Dels=0.00;FS=2.737;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.145;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:1024,0,1262 chrXIII 86779 . A G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.865;DP=111;Dels=0.00;FS=2.486;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=8.10;ReadPosRankSum=2.003;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,45:111:99:929,0,1498 chrXIII 86842 . G A 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.083;DP=135;Dels=0.00;FS=2.253;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.698;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.369;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,83:135:99:1757,0,923 chrXIII 86893 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.697;DP=103;Dels=0.00;FS=8.893;HaplotypeScore=3.7087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1170,0,1070 chrXIII 86901 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.769;DP=106;Dels=0.00;FS=5.528;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.959;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1232,0,1075 chrXIII 86906 . C T 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.429;DP=109;Dels=0.00;FS=6.884;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=8.86;ReadPosRankSum=2.884;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:996,0,1235 chrXIII 87025 . T C 124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.329;DP=34;Dels=0.00;FS=6.680;HaplotypeScore=5.7903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.09;MQ0=1;MQRankSum=-2.017;QD=3.65;ReadPosRankSum=-1.822;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:154,0,167 chrXIII 87110 . C T 2269 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2302,225,0 chrXIII 87219 . T A 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;DP=119;Dels=0.00;FS=7.280;HaplotypeScore=7.5788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.658;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,71:119:99:1635,0,998 chrXIII 87318 . T C 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3811,364,0 chrXIII 87357 . A G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=137;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=3.9175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1390,0,1467 chrXIII 87360 . T C 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3321,325,0 chrXIII 87448 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.577;DP=123;Dels=0.00;FS=3.549;HaplotypeScore=6.2613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.971;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:123:99:1001,0,1642 chrXIII 87584 . C T 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.834e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3639,361,0 chrXIII 87621 . G A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.310;DP=121;Dels=0.00;FS=5.607;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.635;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1266,0,1325 chrXIII 87715 . T C 1807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.438;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.727;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.303;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,88:160:99:1837,0,1511 chrXIII 87741 . G C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3558,387,0 chrXIII 87907 . C T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.119;DP=118;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1247,0,1348 chrXIII 87915 . C T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.303;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.393;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1404,0,1349 chrXIII 88035 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.552;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=5.5947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.583;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1308,0,1404 chrXIII 88106 . T C 2786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2819,300,0 chrXIII 88125 . A G 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.821;DP=112;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=2.3346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:780,0,1642 chrXIII 88188 . G A 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.145;DP=89;Dels=0.00;FS=17.017;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:924,0,1024 chrXIII 88266 . T C 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.863;DP=106;Dels=0.00;FS=4.308;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:918,0,1452 chrXIII 88377 . T C 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.355;DP=144;Dels=0.01;FS=4.040;HaplotypeScore=14.5759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=0.355;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.074;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,80:142:99:1610,0,1336 chrXIII 88443 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.740;DP=126;Dels=0.00;FS=5.451;HaplotypeScore=3.7379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.116;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:126:99:1132,0,1467 chrXIII 88542 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.894;DP=129;Dels=0.00;FS=6.902;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.640;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1212,0,1538 chrXIII 88808 . A T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;DP=133;Dels=0.00;FS=2.900;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.817;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1448,0,1505 chrXIII 89001 . C T 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.000;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=11.70;ReadPosRankSum=2.827;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1083,0,880 chrXIII 89059 . T G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.500;DP=121;Dels=0.00;FS=8.514;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.479;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1511,0,1137 chrXIII 89321 . T C 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3225,333,0 chrXIII 89325 . A C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.891;DP=116;Dels=0.00;FS=2.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.118;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1461,0,1058 chrXIII 89355 . T A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.872;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.348;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1497,0,1006 chrXIII 89556 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.137;DP=117;Dels=0.00;FS=2.388;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.947;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1334,0,1144 chrXIII 89571 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.527;DP=104;Dels=0.00;FS=2.520;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.306;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1259,0,1027 chrXIII 89649 . T A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.765;DP=117;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.331;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1182,0,1369 chrXIII 89691 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.656;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1412,0,1163 chrXIII 89806 . T C 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.549;DP=135;Dels=0.00;FS=2.225;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1568,0,1202 chrXIII 89860 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.343;DP=114;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.697;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1369,0,1001 chrXIII 89876 . C T 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3180,310,0 chrXIII 90205 . T A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.644;DP=152;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=7.1051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1206,0,1927 chrXIII 90285 . T C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.181;DP=142;Dels=0.00;FS=2.109;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.027;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1628,0,1427 chrXIII 90409 . G A 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.736;DP=162;Dels=0.00;FS=2.840;HaplotypeScore=6.8453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=9.59;ReadPosRankSum=-3.131;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,73:162:99:1584,0,1981 chrXIII 90424 . T C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.763;DP=151;Dels=0.00;FS=3.009;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1293,0,2053 chrXIII 90476 . G A 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.841;DP=152;Dels=0.00;FS=4.814;HaplotypeScore=3.2191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.848;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.243;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1640,0,1412 chrXIII 90773 . A G 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;DP=130;Dels=0.00;FS=5.904;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.767;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1631,0,1169 chrXIII 90833 . G C 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;DP=134;Dels=0.00;FS=2.247;HaplotypeScore=6.2585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.879;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,81:134:99:1568,0,1030 chrXIII 91086 . A G 4142.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.26;SB=-2.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4142,426,0 chrXIII 91149 . G A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.965;DP=131;Dels=0.00;FS=4.166;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.807;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1609,0,1209 chrXIII 91346 . C T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.253;DP=136;Dels=0.00;FS=2.263;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1404,0,1340 chrXIII 91376 . A G 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.605;DP=153;Dels=0.00;FS=3.026;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1619,0,1578 chrXIII 91439 . G A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.354;DP=128;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.434;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1563,0,1168 chrXIII 91448 . A G 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.031;DP=135;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=2.7666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.324;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1626,0,1234 chrXIII 91485 . G A 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3579,364,0 chrXIII 91492 . A G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.260;DP=131;Dels=0.00;FS=5.670;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.409;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:131:99:988,0,1753 chrXIII 91527 . A G 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.534;DP=140;Dels=0.00;FS=7.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.284;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.542;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1479,0,1487 chrXIII 91532 . T C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.535;DP=143;Dels=0.00;FS=4.991;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.262;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1525,0,1596 chrXIII 91587 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.257;DP=136;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.533;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1360,0,1509 chrXIII 91667 . A G 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.296;DP=144;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.461;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.850;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1531,0,1587 chrXIII 91733 . G C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.056;DP=151;Dels=0.00;FS=6.262;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=7.28;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,62:151:99:1129,0,1893 chrXIII 91890 . A G 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.925;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:1740,0,1233 chrXIII 91978 . T C 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.938;DP=122;Dels=0.00;FS=3.314;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:994,0,1475 chrXIII 92028 . C T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.795;DP=108;Dels=0.00;FS=6.252;HaplotypeScore=3.5524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1197,0,1031 chrXIII 92156 . A G 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.854;DP=140;Dels=0.00;FS=3.118;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.281;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1628,0,1437 chrXIII 92165 . T A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.955;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.609;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:136:99:1416,0,1505 chrXIII 92384 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.163;DP=131;Dels=0.00;FS=2.348;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1123,0,1594 chrXIII 92531 . G A 2013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.330;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=12.66;ReadPosRankSum=1.659;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,87:159:99:2043,0,1490 chrXIII 93208 . C T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.086;DP=121;Dels=0.00;FS=7.293;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=1;MQRankSum=-0.528;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.379;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1153,0,1325 chrXIII 93860 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.871;DP=116;Dels=0.00;FS=7.440;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.307;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1357,0,1087 chrXIII 93961 . A G 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=24.96;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3544,351,0 chrXIII 93980 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.798;DP=133;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.051;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1357,0,1504 chrXIII 94055 . T C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.534;DP=142;Dels=0.00;FS=3.986;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.658;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1546,0,1392 chrXIII 94190 . T C 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.121;DP=139;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1415,0,1594 chrXIII 94301 . A G 748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.279;DP=99;Dels=0.00;FS=5.153;HaplotypeScore=48.0574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.108;QD=7.56;ReadPosRankSum=-2.396;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:778,0,1148 chrXIII 94338 . T A 287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.715;DP=74;Dels=0.00;FS=23.637;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.399;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.311;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:317,0,861 chrXIII 94394 . T A 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=84;Dels=0.00;FS=11.992;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,47:84:99:914,0,840 chrXIII 94572 . T C 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3346,348,0 chrXIII 94695 . C T 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=1;QD=26.85;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3148,316,0 chrXIII 94812 . C T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.091;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.90;ReadPosRankSum=2.077;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1371,0,1282 chrXIII 94898 . G C 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4003,388,0 chrXIII 95017 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.458;DP=146;Dels=0.00;FS=10.185;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.301;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1181,0,1917 chrXIII 95277 . A C 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.129;DP=151;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=3.2646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.774;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:151:99:1746,0,1331 chrXIII 95343 . A C 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.041;DP=137;Dels=0.00;FS=3.339;HaplotypeScore=2.7438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.830;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1447,0,1402 chrXIII 95482 . A C 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.077;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1392,0,1240 chrXIII 95529 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.518;DP=118;Dels=0.00;FS=2.614;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.732;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1399,0,1072 chrXIII 95736 . T A 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.568;DP=131;Dels=0.00;FS=16.487;HaplotypeScore=132.6244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=2;MQRankSum=0.535;QD=0.20;ReadPosRankSum=-3.141;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,11:131:56:56,0,1433 chrXIII 95780 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.314;DP=125;Dels=0.00;FS=6.886;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=2;MQRankSum=-1.075;QD=9.55;ReadPosRankSum=-2.285;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1224,0,1236 chrXIII 95911 . G A 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.880;DP=106;Dels=0.00;FS=9.232;HaplotypeScore=3.9097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.106;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:106:99:1167,0,1022 chrXIII 96019 . C T 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2909,283,0 chrXIII 96022 . G A 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2885,291,0 chrXIII 96273 . C T 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.807;DP=124;Dels=0.00;FS=15.309;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=12.27;ReadPosRankSum=-2.138;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1552,0,1196 chrXIII 96832 . A G 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3309,345,0 chrXIII 96883 . A G 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3432,360,0 chrXIII 97548 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.073;DP=122;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=5.9020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.595;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1219,0,1315 chrXIII 97573 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.890;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=43.7375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.244;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.488;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1133,0,1269 chrXIII 97577 . A C 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.455;DP=111;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=44.6953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.86;MQ0=0;MQRankSum=-4.831;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:824,0,1277 chrXIII 97600 . G A 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.720;DP=105;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQ0=0;MQRankSum=-5.081;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:763,0,1121 chrXIII 97636 . A G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.099;DP=107;Dels=0.00;FS=9.340;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1113,0,1036 chrXIII 97775 . G A 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.302;DP=126;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=11.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.439;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1424,0,1176 chrXIII 97791 . T C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.357;DP=118;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=5.4100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.574;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1332,0,1000 chrXIII 97825 . A T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;DP=111;Dels=0.00;FS=2.500;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1319,0,1036 chrXIII 98070 . G A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.665;DP=121;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.989;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1232,0,1282 chrXIII 98310 . T C 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3526,352,0 chrXIII 98853 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.204;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.038;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1169,0,935 chrXIII 98939 . A G 3710.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3710,361,0 chrXIII 99579 . G A 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3636,375,0 chrXIII 99586 . T C 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3193,336,0 chrXIII 99676 . G A 4022.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.64;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4022,391,0 chrXIII 99717 . G A 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3738,352,0 chrXIII 99870 . C A 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.427;DP=165;Dels=0.00;FS=1.213;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.344;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1768,0,1728 chrXIII 99880 . C T 4299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.87;SB=-2.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4299,415,0 chrXIII 99908 . G C 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.081;DP=164;Dels=0.00;FS=2.024;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.188;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,75:164:99:1471,0,1860 chrXIII 99929 . T C 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.779;DP=161;Dels=0.00;FS=2.018;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.552;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,87:161:99:1742,0,1572 chrXIII 100054 . A G 4240.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.67;SB=-2.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4240,442,0 chrXIII 100097 . A G 1870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.229;DP=200;Dels=0.00;FS=1.770;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.001;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.978;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,93:200:99:1900,0,2260 chrXIII 100124 . G A 2050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.955;DP=183;Dels=0.00;FS=4.354;HaplotypeScore=3.6038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.199;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,97:183:99:2080,0,1722 chrXIII 100208 . T G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=142;Dels=0.00;FS=11.743;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1424,0,1642 chrXIII 100340 . T G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.516;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.625;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1477,0,1758 chrXIII 100374 . G A 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.834;DP=151;Dels=0.00;FS=3.881;HaplotypeScore=2.8189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1828,0,1516 chrXIII 100457 . G A 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.482;DP=139;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=3.364;QD=10.31;ReadPosRankSum=-2.176;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1463,0,1470 chrXIII 100551 . C T 3949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3949,385,0 chrXIII 100562 . T A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.331;DP=140;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,56:140:99:1145,0,1829 chrXIII 100625 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.689;DP=131;Dels=0.00;FS=4.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1457,0,1231 chrXIII 100694 . T C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3558,363,0 chrXIII 100803 . G C 4025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4025,400,0 chrXIII 100969 . G A 1954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.959;DP=172;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.906;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,94:172:99:1984,0,1665 chrXIII 101006 . G A 4258.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4258,433,0 chrXIII 101193 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.054;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1242,0,1344 chrXIII 101308 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.215;DP=166;Dels=0.00;FS=4.708;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.078;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,64:166:99:1341,0,2089 chrXIII 101469 . A T 4159.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4159,397,0 chrXIII 101681 . T C 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.755;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1469,0,1278 chrXIII 101716 . T C 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=141;Dels=0.00;FS=3.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3479,353,0 chrXIII 101856 . T C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.355;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.643;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.987;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,78:174:99:1619,0,2094 chrXIII 102104 . C G 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.540;DP=156;Dels=0.00;FS=6.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.286;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1663,0,1466 chrXIII 102269 . A G 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.360;DP=139;Dels=0.00;FS=5.165;HaplotypeScore=3.7731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.604;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1646,0,1216 chrXIII 102554 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.142;DP=121;Dels=0.00;FS=3.401;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.868;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1374,0,1220 chrXIII 102605 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.694;DP=89;Dels=0.00;FS=5.888;HaplotypeScore=4.9508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.482;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:977,0,939 chrXIII 102686 . G A 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.177;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.511;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:135:99:1642,0,1164 chrXIII 103133 . T C 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3591,358,0 chrXIII 103222 . G A 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.548;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1603,0,1479 chrXIII 103247 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.107;DP=150;Dels=0.00;FS=2.064;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1400,0,1667 chrXIII 103250 . A T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.265;DP=150;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1422,0,1698 chrXIII 103280 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.747;DP=128;Dels=0.00;FS=5.417;HaplotypeScore=2.9766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=10.67;ReadPosRankSum=-2.863;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1396,0,1237 chrXIII 103361 . A G 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.431;DP=141;Dels=0.00;FS=3.988;HaplotypeScore=4.0907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.497;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1420,0,1696 chrXIII 104435 . T C 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.367;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.326;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1643,0,1279 chrXIII 104510 . T G 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.701;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.881;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1491,0,1230 chrXIII 104516 . A G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.569;DP=120;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=2.5664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=10.95;ReadPosRankSum=3.713;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1344,0,1253 chrXIII 104675 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.228;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1602,0,1437 chrXIII 104896 . A G 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.442;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1629,0,1615 chrXIII 105255 . T C 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2616;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3113,318,0 chrXIII 105326 . G A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.259;DP=121;Dels=0.00;FS=2.341;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.74;ReadPosRankSum=-2.806;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:121:99:1450,0,1073 chrXIII 105355 . A G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.481;DP=120;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=2.8350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.720;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1185,0,1346 chrXIII 105406 . G A 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.345;DP=173;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=2.9036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.026;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,86:173:99:1910,0,1656 chrXIII 105409 . T C 1778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.526;DP=173;Dels=0.00;FS=1.235;HaplotypeScore=2.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,86:173:99:1808,0,1773 chrXIII 105707 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.774;DP=138;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=7.9433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=1;MQRankSum=-0.192;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1373,0,1223 chrXIII 106249 . A G 4104.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4104,403,0 chrXIII 106723 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;DP=119;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.444;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1499,0,1077 chrXIII 107083 . T C 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.217;DP=122;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=10.9162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=1;MQRankSum=0.547;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1254,0,1454 chrXIII 107242 . C T 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.243;DP=182;Dels=0.00;FS=2.602;HaplotypeScore=12.6821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,80:182:99:1637,0,2212 chrXIII 107248 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.714;DP=155;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=7.8113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.829;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.002;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,62:155:99:1276,0,2014 chrXIII 107332 . T C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.846;DP=151;Dels=0.00;FS=4.949;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.750;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1377,0,1788 chrXIII 107365 . T C 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3024,312,0 chrXIII 107666 . T G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;DP=113;Dels=0.00;FS=3.371;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=26.21;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2995,281,0 chrXIII 107914 . C T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.484;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1479,0,1675 chrXIII 107957 . C T 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.616;DP=149;Dels=0.00;FS=3.950;HaplotypeScore=2.8173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.569;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3865,365,0 chrXIII 108139 . A T 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;DP=134;Dels=0.00;FS=3.316;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1686,0,1310 chrXIII 108668 . T C 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3012,315,0 chrXIII 108702 . T A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1369,0,1358 chrXIII 108789 . A G 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3582,363,0 chrXIII 108901 . C T 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3053,295,0 chrXIII 109270 . T C 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2923,294,0 chrXIII 109435 . A G 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3495,349,0 chrXIII 109543 . T C 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.718;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=10.17;ReadPosRankSum=2.185;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1474,0,1467 chrXIII 109858 . C T 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.460;DP=140;Dels=0.00;FS=16.348;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1438,0,1362 chrXIII 109860 . C A 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2923;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3590,349,0 chrXIII 110039 . T C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.899;DP=113;Dels=0.00;FS=9.093;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=2.015;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1031,0,1491 chrXIII 110068 . G A 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;DP=102;Dels=0.00;FS=9.640;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.942;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:918,0,1315 chrXIII 110077 . A G 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.385;DP=101;Dels=0.00;FS=6.487;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.692;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:881,0,1354 chrXIII 110109 . C T 681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.959;DP=83;Dels=0.00;FS=1.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.289;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:711,0,1104 chrXIII 110245 . G A 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.344;DP=112;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1153,0,1275 chrXIII 110807 . T C 2347 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.51;MQ0=0;QD=23.71;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2380,243,0 chrXIII 111909 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=122;Dels=0.00;FS=1.492;HaplotypeScore=7.6805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.886;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1341,0,1225 chrXIII 112648 . T C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.911;DP=90;Dels=0.00;FS=1.800;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.603;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,51:90:99:1063,0,844 chrXIII 112670 . T C 2153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2186,213,0 chrXIII 112781 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.370;DP=103;Dels=0.00;FS=2.755;HaplotypeScore=6.1320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.006;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1338,0,819 chrXIII 113072 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.847;DP=121;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.221;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1427,0,1207 chrXIII 113091 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.061;DP=119;Dels=0.00;FS=7.106;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.470;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1216,0,1282 chrXIII 113406 . C T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.197;DP=124;Dels=0.00;FS=10.556;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=0.679;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.467;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1288,0,1312 chrXIII 113467 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.622;DP=126;Dels=0.00;FS=11.961;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.561;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1343,0,1375 chrXIII 113483 . G A 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.440;DP=128;Dels=0.00;FS=11.584;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.019;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1430,0,1397 chrXIII 113575 . T C 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;DP=113;Dels=0.00;FS=7.968;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1034,0,1403 chrXIII 113641 . C T 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2990,303,0 chrXIII 113691 . G T 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.680;DP=80;Dels=0.00;FS=1.845;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.930;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:866,0,938 chrXIII 113797 . G T 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.654;DP=122;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.424;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1246,0,1291 chrXIII 113812 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.663;DP=141;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.539;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1308,0,1650 chrXIII 113839 . A G 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.309;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.971;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1406,0,1610 chrXIII 114280 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=121;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.630;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1304,0,1304 chrXIII 114304 . T C 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3116,315,0 chrXIII 114310 . T C 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.719;DP=120;Dels=0.00;FS=7.092;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=9.23;ReadPosRankSum=2.834;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1138,0,1479 chrXIII 114535 . C T 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3245,316,0 chrXIII 114553 . C T 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3367,328,0 chrXIII 114963 . G A 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3840,382,0 chrXIII 115183 . A G 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.32;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3046,307,0 chrXIII 115293 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.011;DP=109;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1346,0,1023 chrXIII 115316 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.131;DP=123;Dels=0.00;FS=1.532;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.652;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1170,0,1311 chrXIII 115465 . C T 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;DP=128;Dels=0.00;FS=6.313;HaplotypeScore=2.8528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:128:99:1020,0,1528 chrXIII 115471 . G A 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.08;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3412,334,0 chrXIII 115670 . T C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.196;DP=113;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=4.7298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.716;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1092,0,1287 chrXIII 115816 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.579;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=5.9634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.018;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1243,0,1325 chrXIII 115959 . C T 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3786,370,0 chrXIII 116112 . A G 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=24.34;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3051,292,0 chrXIII 116448 . T C 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3186,330,0 chrXIII 117294 . T C 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3856,385,0 chrXIII 117342 . C T 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3307,325,0 chrXIII 117377 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.057;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1243,0,1510 chrXIII 117651 . A G 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2470,258,0 chrXIII 117732 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.858;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.750;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1460,0,1424 chrXIII 118473 . A G 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3348,336,0 chrXIII 118517 . A G 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.028;DP=148;Dels=0.00;FS=5.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.012;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1601,0,1697 chrXIII 118891 . G A 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3610,361,0 chrXIII 119016 . A G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.728;DP=138;Dels=0.00;FS=2.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.960;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1465,0,1649 chrXIII 119087 . A C 1815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.21;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:72:99:1848,186,0 chrXIII 119306 . A G 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3985,411,0 chrXIII 119408 . T G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.250;DP=123;Dels=0.00;FS=1.505;HaplotypeScore=2.8348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.363;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:123:99:1241,0,1361 chrXIII 119467 . A G 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3279,336,0 chrXIII 119476 . G A 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3569,360,0 chrXIII 119630 . C T 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3309,331,0 chrXIII 120287 . G A 1909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.900;DP=163;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=5.2879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.204;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:163:99:1939,0,1434 chrXIII 120376 . C T 4623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.610;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=27.19;ReadPosRankSum=0.917;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:4623,433,0 chrXIII 120947 . A G 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3435,345,0 chrXIII 120995 . G A 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.198;DP=127;Dels=0.00;FS=8.150;HaplotypeScore=3.8086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=2.392;QD=26.13;ReadPosRankSum=1.694;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,125:127:99:3319,331,0 chrXIII 121136 . A T 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;DP=100;Dels=0.00;FS=4.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.813;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:767,0,1361 chrXIII 121512 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.658;DP=113;Dels=0.00;FS=5.953;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:1035,0,1421 chrXIII 121603 . A G 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.240;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=2.345;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,117:119:99:3031,263,0 chrXIII 121834 . G T 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.813;DP=119;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1296,0,1276 chrXIII 121847 . G A 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=26.50;ReadPosRankSum=1.347;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3134,319,0 chrXIII 121935 . C T 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3067,307,0 chrXIII 121948 . G C 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.15;MQ0=0;QD=21.32;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:2933,318,0 chrXIII 121951 . T C 2509 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.89;MQ0=0;QD=22.01;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2542,279,0 chrXIII 121965 . T C 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.76;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2810,288,0 chrXIII 122028 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.118;DP=130;Dels=0.00;FS=4.488;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=2.160;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.120;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1212,0,1739 chrXIII 122094 . G T 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3845,370,0 chrXIII 122176 . A G 4078.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=26.14;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:4078,421,0 chrXIII 122193 . A G 4424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.20;MQ0=0;QD=26.49;SB=-2.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4424,442,0 chrXIII 122298 . G T 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3420,337,0 chrXIII 122317 . C T 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3988,394,0 chrXIII 122362 . G A 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3910,394,0 chrXIII 122795 . G A 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.850;DP=107;Dels=0.00;FS=2.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.54;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:790,0,409 chrXIII 122837 . G A 2781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2814,282,0 chrXIII 123828 . G A 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3260,336,0 chrXIII 123833 . G A 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.86;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2917,297,0 chrXIII 123850 . C T 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.02;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3632,364,0 chrXIII 123855 . G A 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.54;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3450,351,0 chrXIII 124000 . T A 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=1;QD=27.82;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3783,385,0 chrXIII 124027 . C T 4157.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.65;MQ0=0;QD=28.28;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4157,409,0 chrXIII 124036 . G A 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=129.3675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.36;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3852,385,0 chrXIII 124113 . T C 2300 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2333,249,0 chrXIII 124135 . G A 2517 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2550,249,0 chrXIII 124216 . C A 2872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2905,289,0 chrXIII 124283 . C G 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3609,387,0 chrXIII 124309 . A G 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3361,354,0 chrXIII 124356 . C T 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3218,333,0 chrXIII 124357 . A G 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.63;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3076,321,0 chrXIII 124406 . C G 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=21.68;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:2852,303,0 chrXIII 124408 . C G 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=21.99;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2892,297,0 chrXIII 124455 . T C 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3270,336,0 chrXIII 124497 . A G 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3621,369,0 chrXIII 124499 . C T 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.98;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3919,373,0 chrXIII 124576 . G A 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3122,313,0 chrXIII 124675 . T C 4301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.965e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4301,424,0 chrXIII 124697 . T C 4411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4411,447,0 chrXIII 124711 . G T 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.990;DP=142;Dels=0.01;FS=4.063;HaplotypeScore=2.7944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1734,0,1355 chrXIII 124777 . C T 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=27.21;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3945,400,0 chrXIII 124793 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.300;DP=136;Dels=0.00;FS=2.692;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=2.890;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.981;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1532,0,1231 chrXIII 124802 . C T 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3612,349,0 chrXIII 124844 . G A 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3205,310,0 chrXIII 124877 . G T 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3066,307,0 chrXIII 125006 . G A 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3679,375,0 chrXIII 125173 . G A 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.690;DP=142;Dels=0.00;FS=2.141;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1559,0,1436 chrXIII 125244 . A G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3113,321,0 chrXIII 125640 . T C 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=1;QD=25.49;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3721,373,0 chrXIII 125779 . G A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;DP=83;Dels=0.00;FS=1.832;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:969,0,907 chrXIII 125874 . T C 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3052,315,0 chrXIII 125883 . A T 3428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3428,343,0 chrXIII 125916 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.531;DP=130;Dels=0.00;FS=2.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.719;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1426,0,1342 chrXIII 125926 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.033;DP=130;Dels=0.00;FS=3.220;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.801;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1297,0,1360 chrXIII 125951 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.413;DP=119;Dels=0.00;FS=3.321;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1199,0,1337 chrXIII 126014 . C T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.056;DP=144;Dels=0.00;FS=6.169;HaplotypeScore=3.7980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.031;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:144:99:1408,0,1564 chrXIII 126211 . T C 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.944;DP=138;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1153,0,1811 chrXIII 126625 . C T 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=28.47;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3758,370,0 chrXIII 126663 . C T 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.745e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3366,325,0 chrXIII 127093 . T C 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3085,330,0 chrXIII 127329 . G C 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;DP=151;Dels=0.00;FS=1.341;HaplotypeScore=4.2695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.508;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1630,0,1631 chrXIII 127429 . T C 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3447,354,0 chrXIII 127550 . T C 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3250,333,0 chrXIII 127589 . A T 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3653,346,0 chrXIII 128432 . A G 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3317,351,0 chrXIII 128498 . G A 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3101,301,0 chrXIII 128877 . A G 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3817;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.89;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3072,315,0 chrXIII 129009 . C T 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3730,373,0 chrXIII 129083 . G A 4310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.63;SB=-2.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4310,427,0 chrXIII 129400 . T G 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.07;SB=-2.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4041,406,0 chrXIII 129456 . T C 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3260,328,0 chrXIII 129926 . C T 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3451,349,0 chrXIII 129978 . C G 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.930;DP=159;Dels=0.00;FS=9.836;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.993;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,78:159:99:1645,0,1708 chrXIII 130073 . T C 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3877,397,0 chrXIII 130218 . T C 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7035;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3371,334,0 chrXIII 130349 . A C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;DP=105;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.048;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1208,0,1107 chrXIII 130360 . C A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.882;DP=103;Dels=0.00;FS=3.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.811;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1200,0,997 chrXIII 130721 . A G 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=1;QD=26.16;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2911,294,0 chrXIII 131106 . T C 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3406,348,0 chrXIII 131349 . G T 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3484,337,0 chrXIII 131365 . T A 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3424,328,0 chrXIII 131423 . A G 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2996,321,0 chrXIII 131647 . G C 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3625,358,0 chrXIII 131930 . A T 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3237,313,0 chrXIII 132028 . A T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.108;DP=99;Dels=0.00;FS=1.624;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.652;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1195,0,1018 chrXIII 132039 . G A 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2714,273,0 chrXIII 132061 . A G 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.37;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2625,273,0 chrXIII 132065 . G T 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.16;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:104:99:2675,267,0 chrXIII 132088 . T C 1964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.33;MQ0=0;QD=23.95;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1997,213,0 chrXIII 132246 . G A 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.682;DP=162;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=5.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.813;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,78:162:99:1688,0,1754 chrXIII 132350 . G A 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3904,385,0 chrXIII 132409 . A G 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.866;DP=149;Dels=0.00;FS=3.378;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=25.93;ReadPosRankSum=1.568;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:149:99:3864,356,0 chrXIII 132552 . C T 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3449,340,0 chrXIII 132728 . C T 1751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.21;MQ0=0;QD=19.46;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1784,183,0 chrXIII 132734 . T A 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.468;DP=96;Dels=0.00;FS=1.664;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.62;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:824,0,725 chrXIII 132741 . T C 2014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.06;MQ0=0;QD=20.14;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2047,213,0 chrXIII 132751 . C A 1836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.23;MQ0=0;QD=19.53;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:1869,192,0 chrXIII 132818 . C T 2484 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2517,249,0 chrXIII 132842 . C G 2326 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2359,237,0 chrXIII 132856 . C T 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.27;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2987,286,0 chrXIII 132910 . C T 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2675,267,0 chrXIII 133001 . A T 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3332,325,0 chrXIII 133099 . T C 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6312;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3100,318,0 chrXIII 133212 . T C 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2834,285,0 chrXIII 133405 . T C 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:98:99:2524,264,0 chrXIII 133436 . A G 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2645,273,0 chrXIII 133555 . G T 4407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.72;SB=-2.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4407,430,0 chrXIII 133610 . T C 3970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3970,397,0 chrXIII 133649 . G A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.664;DP=106;Dels=0.00;FS=4.938;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.488;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:1474,0,821 chrXIII 133858 . T C 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3228,336,0 chrXIII 134620 . C T 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.924;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=25.19;ReadPosRankSum=0.895;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3056,276,0 chrXIII 135169 . A G 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3009,306,0 chrXIII 135233 . C A 2474 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2507,246,0 chrXIII 135252 . T C 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2651,267,0 chrXIII 135343 . T C 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3451,345,0 chrXIII 135387 . G A 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3047,298,0 chrXIII 135470 . G A 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.65;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3213,313,0 chrXIII 136477 . A G 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=1;QD=25.16;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3271,342,0 chrXIII 136675 . A G 4211.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.83;SB=-2.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4211,421,0 chrXIII 136702 . T G 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3858,402,0 chrXIII 136948 . A G 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3355,342,0 chrXIII 137116 . T C 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2675,285,0 chrXIII 137172 . C A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.724;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.603;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1155,0,1637 chrXIII 137286 . C T 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=28.41;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3494,340,0 chrXIII 137347 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.010;DP=123;Dels=0.00;FS=4.400;HaplotypeScore=5.9302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1105,0,1521 chrXIII 137451 . G A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.643;DP=117;Dels=0.00;FS=3.869;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=26.66;ReadPosRankSum=1.377;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3152,316,0 chrXIII 137475 . C T 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3237,325,0 chrXIII 137716 . G A 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2992,292,0 chrXIII 137717 . C T 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3004,295,0 chrXIII 137768 . C A 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=118;Dels=0.00;FS=3.085;HaplotypeScore=4.6259;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=26.24;ReadPosRankSum=1.439;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3129,290,0 chrXIII 137804 . T C 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2914,303,0 chrXIII 137879 . C T 3965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.643;DP=156;Dels=0.00;FS=4.007;HaplotypeScore=5.6992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=25.42;ReadPosRankSum=1.199;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3965,391,0 chrXIII 138042 . A G 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3235,327,0 chrXIII 138066 . G A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.807;DP=115;Dels=0.00;FS=4.823;HaplotypeScore=2.4809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.967;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1123,0,1360 chrXIII 138467 . A G 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.72;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4061,420,0 chrXIII 138823 . C T 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=28.29;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3706,373,0 chrXIII 138914 . G A 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3507,343,0 chrXIII 139013 . A G 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2806,282,0 chrXIII 139131 . T C 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.815;DP=131;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=2.5612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.067;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1444,0,1285 chrXIII 139239 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.288;DP=125;Dels=0.00;FS=6.856;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.006;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.467;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1654,0,1016 chrXIII 139575 . T C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.347;DP=126;Dels=0.00;FS=4.321;HaplotypeScore=5.4298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1296,0,1185 chrXIII 139632 . C T 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3642,367,0 chrXIII 139664 . T C 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.21;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3260,345,0 chrXIII 140328 . G A 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2880,286,0 chrXIII 140395 . G A 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.896;DP=126;Dels=0.00;FS=6.683;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1568,0,1195 chrXIII 140757 . C T 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.01;SB=-2.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3824,382,0 chrXIII 140935 . A G 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3075,327,0 chrXIII 140970 . A G 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3586,369,0 chrXIII 140984 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.554;DP=133;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1422,0,1378 chrXIII 141068 . A T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.672;DP=143;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.923;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1316,0,1567 chrXIII 141366 . C T 2107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.689;DP=170;Dels=0.00;FS=2.893;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.700;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,94:170:99:2137,0,1585 chrXIII 141627 . C T 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2774,276,0 chrXIII 141877 . T C 4116.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.57;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4116,435,0 chrXIII 141979 . C T 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.303;DP=113;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=23.83;ReadPosRankSum=1.180;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2726,257,0 chrXIII 141982 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.192;DP=111;Dels=0.00;FS=3.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1229,0,1013 chrXIII 142186 . A G 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3515,363,0 chrXIII 142190 . A G 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3552,375,0 chrXIII 142206 . T G 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3622,370,0 chrXIII 142395 . C T 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=1;QD=26.82;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3513,358,0 chrXIII 142575 . G A 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3900,376,0 chrXIII 142704 . C T 4065.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.84;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4065,397,0 chrXIII 142824 . G A 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2901,292,0 chrXIII 142869 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;DP=127;Dels=0.00;FS=8.053;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.917;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1353,0,1420 chrXIII 142984 . G A 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3327,331,0 chrXIII 143064 . A C 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3044,324,0 chrXIII 143613 . G A 4859.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4859,493,0 chrXIII 143946 . G C 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.202;DP=145;Dels=0.00;FS=5.409;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.014;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1587,0,1544 chrXIII 144507 . C T 3898.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3898,394,0 chrXIII 144771 . T C 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2808,300,0 chrXIII 145063 . T C 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.149;DP=168;Dels=0.00;FS=10.581;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.327;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,86:168:99:1793,0,1815 chrXIII 145373 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.417;DP=172;Dels=0.00;FS=2.539;HaplotypeScore=4.8086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.002;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,73:172:99:1443,0,2215 chrXIII 146101 . A G 65.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.320;DP=170;Dels=0.01;FS=24.913;HaplotypeScore=26.5888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.324;QD=0.38;ReadPosRankSum=-5.945;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,20:169:95:95,0,2956 chrXIII 146108 . A G 604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.455;DP=149;Dels=0.00;FS=18.988;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.326;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,60:149:99:634,0,1931 chrXIII 146132 . T C 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.009;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.441;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1653,0,1729 chrXIII 146198 . T C 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3243,330,0 chrXIII 146992 . A G 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.338;DP=148;Dels=0.00;FS=4.945;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1653,0,1517 chrXIII 147350 . T C 2672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.97;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2705,291,0 chrXIII 148537 . A C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.759;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.294;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1012,0,1691 chrXIII 148702 . G C 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;DP=141;Dels=0.00;FS=3.614;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.931;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,80:141:99:1740,0,1292 chrXIII 148721 . C T 2774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.12;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2807,282,0 chrXIII 149072 . A G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.840;DP=134;Dels=0.00;FS=3.117;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1236,0,1617 chrXIII 149109 . T C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.182;DP=138;Dels=0.00;FS=9.080;HaplotypeScore=2.2788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1463,0,1443 chrXIII 149583 . A G 3967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3967,411,0 chrXIII 150480 . A T 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.04;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2897,297,0 chrXIII 151234 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.293;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.444;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1247,0,1617 chrXIII 151733 . A G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.031;DP=134;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1380,0,1538 chrXIII 153930 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.627;DP=109;Dels=0.00;FS=5.952;HaplotypeScore=4.5127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.458;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:109:99:1065,0,1176 chrXIII 153969 . C A 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.660;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.947;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.388;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1208,0,1221 chrXIII 154077 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.475;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.555;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1461,0,1333 chrXIII 154359 . A G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.100;DP=138;Dels=0.00;FS=2.198;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.654;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1240,0,1671 chrXIII 154578 . A G 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.429;DP=149;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.210;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1541,0,1580 chrXIII 154896 . G C 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.728;DP=128;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,76:128:99:1714,0,1022 chrXIII 155151 . C T 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.169;DP=139;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=0.449;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.011;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1576,0,1387 chrXIII 155379 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.283;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1207,0,1396 chrXIII 155649 . G A 4781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.27;SB=-2.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4781,463,0 chrXIII 155650 . G C 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;DP=185;Dels=0.00;FS=2.596;HaplotypeScore=4.3394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.301;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.215;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,78:185:99:1463,0,2300 chrXIII 155697 . C A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.348;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.755;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1324,0,1434 chrXIII 155934 . T C 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.731;DP=171;Dels=0.00;FS=2.064;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.704;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,82:171:99:1572,0,2037 chrXIII 156156 . C T 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.211;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=0.079;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.177;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1765,0,1586 chrXIII 156612 . C T 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.250;DP=130;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.065;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1480,0,1394 chrXIII 156687 . C T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.015;DP=124;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1323,0,1373 chrXIII 156727 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.732;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.193;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1249,0,1255 chrXIII 156786 . C T 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.058;DP=110;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=5.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.722;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:110:99:892,0,1338 chrXIII 156894 . A T 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.283;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1782,0,1636 chrXIII 157143 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.249;DP=156;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=2.5838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.336;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,63:156:99:1256,0,2032 chrXIII 157287 . A C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.221;DP=130;Dels=0.00;FS=4.297;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,52:130:99:1032,0,1813 chrXIII 157392 . T A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=131;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.471;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:131:99:1085,0,1766 chrXIII 158144 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.979;DP=140;Dels=0.00;FS=5.086;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=1.780;QD=9.52;ReadPosRankSum=-2.163;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1363,0,1523 chrXIII 158208 . G T 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.087;DP=135;Dels=0.00;FS=14.373;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=0.561;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,79:135:99:1823,0,1124 chrXIII 158433 . T A 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.527;DP=87;Dels=0.00;FS=142.676;HaplotypeScore=3.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=0.29;ReadPosRankSum=-3.072;SB=-1.366e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:55:55,0,509 chrXIII 158463 . A C 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.957;DP=99;Dels=0.00;FS=1.946;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.064;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:785,0,875 chrXIII 158483 . T C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.240;DP=105;Dels=0.00;FS=5.069;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1090,0,1168 chrXIII 158538 . T C 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.392;DP=139;Dels=0.00;FS=3.998;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.432;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1622,0,1384 chrXIII 158654 . G A 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.565;DP=104;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:927,0,1327 chrXIII 158834 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.106;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.569;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1327,0,1443 chrXIII 158927 . C T 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.994;DP=122;Dels=0.00;FS=3.331;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=1.983;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.550;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:1432,0,998 chrXIII 158936 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.175;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.173;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,74:126:99:1270,0,1148 chrXIII 158957 . T C 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.889;DP=141;Dels=0.00;FS=2.148;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1453,0,1266 chrXIII 158997 . A G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.876;DP=134;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1208,0,1444 chrXIII 159018 . T A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;DP=133;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=3.9120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.924;QD=9.57;ReadPosRankSum=-2.360;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1303,0,1474 chrXIII 159039 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.666;DP=137;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.810;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1314,0,1424 chrXIII 159043 . A G 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.786;DP=113;Dels=0.00;FS=5.962;HaplotypeScore=3.7149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.973;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.165;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:926,0,1324 chrXIII 159055 . G A 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;DP=115;Dels=0.00;FS=4.679;HaplotypeScore=5.9570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.550;QD=8.67;ReadPosRankSum=2.438;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1027,0,1309 chrXIII 159532 . C T 4056.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4056,391,0 chrXIII 159727 . T C 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3170,321,0 chrXIII 159728 . T C 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3123,321,0 chrXIII 159757 . T G 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2982,300,0 chrXIII 159950 . A T 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=28.06;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3592,349,0 chrXIII 160000 . C T 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3151,307,0 chrXIII 160037 . C A 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2889,280,0 chrXIII 160146 . C T 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.658;DP=141;Dels=0.00;FS=3.167;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=27.46;ReadPosRankSum=0.602;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3872,365,0 chrXIII 160611 . T C 3766.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3766,387,0 chrXIII 160665 . G A 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.60;SB=-2.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3661,369,0 chrXIII 160704 . C T 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3714,370,0 chrXIII 160785 . G A 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3075,301,0 chrXIII 160953 . C G 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0923;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=23.64;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3758,393,0 chrXIII 161085 . T C 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3201,330,0 chrXIII 161370 . T A 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3790,385,0 chrXIII 161385 . C T 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=28.07;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3789,376,0 chrXIII 161406 . C T 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.345;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=27.06;ReadPosRankSum=1.316;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,139:141:99:3815,352,0 chrXIII 161572 . T C 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3248,339,0 chrXIII 161922 . C A 2930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=1;QD=23.82;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2963,294,0 chrXIII 162035 . G C 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3894,403,0 chrXIII 162123 . T C 3899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3899,391,0 chrXIII 162309 . G A 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=28.08;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3314,328,0 chrXIII 162461 . A G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3466,354,0 chrXIII 162681 . C T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.449;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.721;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1340,0,1256 chrXIII 162716 . A G 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.865;DP=117;Dels=0.00;FS=4.568;HaplotypeScore=2.5238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.682;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1034,0,1192 chrXIII 162731 . T C 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.857;DP=101;Dels=0.00;FS=13.608;HaplotypeScore=7.4583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.253;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.615;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:699,0,1085 chrXIII 162755 . A G 118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.950;DP=80;Dels=0.00;FS=7.417;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.79;MQ0=0;MQRankSum=-5.083;QD=1.48;ReadPosRankSum=-2.050;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:148,0,1216 chrXIII 162758 . G A 106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;DP=74;Dels=0.00;FS=8.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.95;MQ0=0;MQRankSum=-5.101;QD=1.43;ReadPosRankSum=-2.441;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:136,0,1185 chrXIII 162797 . A G 1606 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.23;MQ0=4;QD=22.31;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:1639,177,0 chrXIII 162859 . T C 40.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;DP=96;Dels=0.00;FS=16.656;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.08;MQ0=5;MQRankSum=-4.220;QD=0.42;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,15:96:70:70,0,1772 chrXIII 162865 . A G 137.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.614;DP=93;Dels=0.00;FS=14.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.10;MQ0=5;MQRankSum=-3.833;QD=1.47;ReadPosRankSum=-1.653;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:167,0,1624 chrXIII 162867 . T C 138.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.243;DP=93;Dels=0.00;FS=14.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.10;MQ0=5;MQRankSum=-4.168;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:168,0,1577 chrXIII 162876 . G C 164.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=92;Dels=0.00;FS=8.638;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.58;MQ0=4;MQRankSum=-4.014;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:194,0,1465 chrXIII 162878 . T C 183.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.731;DP=86;Dels=0.00;FS=5.003;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.50;MQ0=4;MQRankSum=-4.202;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,22:86:99:213,0,1473 chrXIII 162884 . A G 212.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.314;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.01;MQ0=4;MQRankSum=-5.234;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:242,0,1505 chrXIII 162886 . T C 206.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.818;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.01;MQ0=4;MQRankSum=-4.929;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:236,0,1508 chrXIII 162890 . T C 231.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.070;DP=93;Dels=0.00;FS=1.882;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.26;MQ0=3;MQRankSum=-5.586;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,29:93:99:261,0,1463 chrXIII 162895 . T G 280.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.816;DP=100;Dels=0.00;FS=6.944;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.31;MQ0=3;MQRankSum=-5.134;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,35:100:99:310,0,1505 chrXIII 162907 . G C 311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;DP=98;Dels=0.00;FS=5.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.61;MQ0=1;MQRankSum=-5.811;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.635;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,37:98:99:341,0,1346 chrXIII 163055 . C T 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.29;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2859,282,0 chrXIII 163283 . T C 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2870,297,0 chrXIII 163286 . C T 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.661;DP=103;Dels=0.00;FS=4.980;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.681;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,61:103:99:1367,0,852 chrXIII 163496 . A G 3588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3588,375,0 chrXIII 163509 . T G 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.263;DP=143;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.410;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1508,0,1553 chrXIII 163519 . G C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.613;DP=134;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.870;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1359,0,1404 chrXIII 164021 . G A 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=24.93;SB=-2.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3664,346,0 chrXIII 164102 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.988;DP=134;Dels=0.00;FS=5.310;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.513;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1112,0,1741 chrXIII 164304 . G A 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3317,325,0 chrXIII 164532 . G A 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3721,376,0 chrXIII 164666 . C A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.445;DP=134;Dels=0.00;FS=6.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.108;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1602,0,1230 chrXIII 165032 . G T 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8047;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3485,337,0 chrXIII 165218 . A G 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3063,321,0 chrXIII 165482 . A G 1898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=18.43;ReadPosRankSum=1.497;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:1931,207,0 chrXIII 166349 . T C 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2969,309,0 chrXIII 166364 . A G 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2996,312,0 chrXIII 166589 . A C 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3507,357,0 chrXIII 166619 . G A 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3950,385,0 chrXIII 166876 . G A 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=1;QD=27.24;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3759,367,0 chrXIII 167027 . A T 2701 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2734,273,0 chrXIII 167444 . A G 1797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.788;DP=165;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,88:165:99:1827,0,1680 chrXIII 167521 . G A 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;DP=125;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=3.7100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=25.73;ReadPosRankSum=1.122;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3249,297,0 chrXIII 167925 . A G 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.22;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3228,330,0 chrXIII 167929 . C T 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.40;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3331,328,0 chrXIII 167959 . T C 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.12;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2947,300,0 chrXIII 167962 . C T 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=101.4673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.23;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3247,327,0 chrXIII 168000 . C T 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.907;DP=114;Dels=0.00;FS=4.902;HaplotypeScore=4.8648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=7.25;ReadPosRankSum=2.736;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,42:114:99:856,0,1567 chrXIII 168084 . C T 3791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.89;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3791,379,0 chrXIII 168134 . G A 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.27;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2794,276,0 chrXIII 168139 . C T 2289 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.82;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2322,237,0 chrXIII 168229 . T C 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.64;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2863,282,0 chrXIII 168683 . T C 82.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.477;DP=33;Dels=0.00;FS=8.098;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=2.49;ReadPosRankSum=3.477;SB=-7.065e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:33:36:112,0,36 chrXIII 168709 . T C 841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.30;MQ0=0;QD=14.75;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:93:874,93,0 chrXIII 168722 . C A 1512 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=0;QD=19.64;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1545,156,0 chrXIII 168744 . T C 2019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.26;MQ0=0;QD=22.19;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2052,216,0 chrXIII 168750 . A G 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.546;DP=98;Dels=0.00;FS=3.929;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.753;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:773,0,986 chrXIII 168773 . T C 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=105;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=24.66;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2622,270,0 chrXIII 168774 . T G 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;QD=23.95;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2548,276,0 chrXIII 168838 . C T 2098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.94;MQ0=0;QD=24.40;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2131,210,0 chrXIII 169412 . T G 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3251,328,0 chrXIII 169495 . T C 1672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.89;MQ0=0;QD=14.80;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:1705,221,0 chrXIII 169765 . A G 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2469,264,0 chrXIII 169803 . C A 2274 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=73.4546;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=27.40;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2307,237,0 chrXIII 170785 . T A 4552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.62;SB=-2.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:171:99:4552,451,0 chrXIII 172166 . T C 2346 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2379,234,0 chrXIII 172925 . C T 3891.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3891,385,0 chrXIII 177342 . G A 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2869,292,0 chrXIII 178379 . G A 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3323,336,0 chrXIII 179115 . T A 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3249,330,0 chrXIII 179439 . C T 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2917,286,0 chrXIII 179588 . A G 2628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2661,273,0 chrXIII 179677 . T A 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.60;MQ0=0;QD=24.29;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2754,276,0 chrXIII 179713 . G C 2067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9574;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.89;MQ0=0;QD=13.69;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:2100,225,0 chrXIII 179725 . T C 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.575;DP=151;Dels=0.00;FS=58.634;HaplotypeScore=5.1894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.416;QD=5.04;ReadPosRankSum=-4.948;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,55:151:99:791,0,1164 chrXIII 179731 . T C 612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.707;DP=153;Dels=0.00;FS=56.946;HaplotypeScore=5.1676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.93;MQ0=0;MQRankSum=-4.712;QD=4.00;ReadPosRankSum=-5.374;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,50:153:99:642,0,1365 chrXIII 179737 . T C 498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.125;DP=158;Dels=0.00;FS=49.136;HaplotypeScore=3.5902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.87;MQ0=0;MQRankSum=-6.349;QD=3.15;ReadPosRankSum=-6.418;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,45:158:99:528,0,1667 chrXIII 179752 . G A 2287 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.91;MQ0=0;QD=19.72;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2320,237,0 chrXIII 179965 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3201,316,0 chrXIII 180101 . G A 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3200,316,0 chrXIII 180122 . G A 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3245,322,0 chrXIII 180294 . C G 2622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2655,276,0 chrXIII 180733 . T G 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.675;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4458;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.136;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3040,315,0 chrXIII 181019 . A G 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3693,364,0 chrXIII 181112 . A G 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3202,327,0 chrXIII 181117 . A G 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2789,288,0 chrXIII 181539 . G A 3794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3794,376,0 chrXIII 181557 . A C 3288.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3288,348,0 chrXIII 181905 . G A 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3040,289,0 chrXIII 182131 . G A 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.98;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3637,358,0 chrXIII 182493 . T C 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5914;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3767,379,0 chrXIII 182631 . T C 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6461;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3014,312,0 chrXIII 182695 . A T 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2903,285,0 chrXIII 182705 . T C 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2739,273,0 chrXIII 183093 . C T 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3450,342,0 chrXIII 183207 . A G 1967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.22;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2000,210,0 chrXIII 183321 . T G 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2566,261,0 chrXIII 183574 . A T 1401 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=28.02;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1434,144,0 chrXIII 183601 . A G 1600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=27.59;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1633,168,0 chrXIII 183799 . T C 720 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.76;MQ0=0;QD=18.00;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:81:753,81,0 chrXIII 183800 . A T 699 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.43;MQ0=0;QD=19.42;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:81:732,81,0 chrXIII 183802 . T C 741 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.43;MQ0=0;QD=20.58;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:81:774,81,0 chrXIII 183815 . T C 667 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.86;MQ0=0;QD=18.03;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:75:700,75,0 chrXIII 183816 . A C 670 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.75;MQ0=0;QD=19.14;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:75:703,75,0 chrXIII 183824 . G T 748 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.62;MQ0=0;QD=19.68;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:81:781,81,0 chrXIII 183876 . T C 917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.88;MQ0=0;QD=24.78;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:950,99,0 chrXIII 183980 . G A 785 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.60;MQ0=0;QD=25.32;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:84:818,84,0 chrXIII 184060 . T A 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.26;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 chrXIII 190087 . T C 39.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=1.18;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-2.798e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:9:72,9,0 chrXIII 190128 . G C 851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.37;MQ0=0;QD=15.20;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:90:884,90,0 chrXIII 190298 . C T 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.254;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=26.16;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:3067,282,0 chrXIII 190628 . C T 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3568,352,0 chrXIII 190760 . A G 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2871,291,0 chrXIII 190786 . A G 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9668;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3096,315,0 chrXIII 191033 . A C 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3057,315,0 chrXIII 191314 . T G 1968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=22.88;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2001,213,0 chrXIII 191318 . C T 1821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;DP=78;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=23.35;ReadPosRankSum=0.266;SB=-9.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,77:78:99:1854,169,0 chrXIII 191452 . T C 1918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.59;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1951,201,0 chrXIII 191569 . T C 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=24.36;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2883,309,0 chrXIII 191792 . A T 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.43;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2798,274,0 chrXIII 191837 . A G 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.66;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2682,264,0 chrXIII 191860 . G A 2767 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2800,279,0 chrXIII 191863 . C T 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.63;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2891,283,0 chrXIII 191932 . A T 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.69;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2602,253,0 chrXIII 191956 . G C 2267 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.08;MQ0=0;QD=25.19;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2300,240,0 chrXIII 191998 . T A 174.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.406;DP=110;Dels=0.00;FS=67.758;HaplotypeScore=137.2920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=1.58;ReadPosRankSum=-6.245;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,19:110:99:204,0,404 chrXIII 192044 . C A 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3318,343,0 chrXIII 192110 . T C 4121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8903;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4121,406,0 chrXIII 192147 . C T 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3486,334,0 chrXIII 192321 . T C 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.964e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3795,367,0 chrXIII 192372 . T C 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3628,375,0 chrXIII 192396 . C T 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=28.53;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:3029,304,0 chrXIII 192432 . T C 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3148,327,0 chrXIII 192436 . T C 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3333,331,0 chrXIII 192743 . G A 877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=109;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=67.2100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.570;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:910,99,0 chrXIII 193083 . A G 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3321,336,0 chrXIII 193159 . A G 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3478,357,0 chrXIII 193330 . T C 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9408;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2992,312,0 chrXIII 193709 . C A 4789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.75;SB=-2.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:179:99:4789,463,0 chrXIII 193723 . G A 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3476,346,0 chrXIII 193971 . A G 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3233,339,0 chrXIII 194335 . C T 2233 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2266,234,0 chrXIII 194436 . A G 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3152,330,0 chrXIII 194614 . T C 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3104,318,0 chrXIII 195045 . C A 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=1;QD=27.85;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3124,316,0 chrXIII 195227 . A G 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3639,369,0 chrXIII 195282 . A G 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3649,378,0 chrXIII 195330 . C A 4268.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.84;SB=-2.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4268,430,0 chrXIII 195360 . T C 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3698,372,0 chrXIII 195417 . T C 3764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3764,375,0 chrXIII 195423 . C T 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3693,361,0 chrXIII 195744 . T C 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3453,339,0 chrXIII 195860 . A T 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3453,349,0 chrXIII 195862 . G T 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3581,361,0 chrXIII 195938 . A G 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.97;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2990,303,0 chrXIII 195968 . G A 2324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.51;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2357,231,0 chrXIII 195989 . G A 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.18;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2614,258,0 chrXIII 196113 . T C 2228 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.72;MQ0=1;QD=22.51;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2261,237,0 chrXIII 196123 . A G 2126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.46;MQ0=1;QD=25.01;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:85:99:2159,228,0 chrXIII 196201 . A G 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.73;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3167,316,0 chrXIII 196246 . C T 3682.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.83;MQ0=6;QD=25.39;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3682,361,0 chrXIII 201924 . G A 27.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=2.31;SB=-1.772e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:59,6,0 chrXIII 201928 . A G 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=2.15;SB=-1.772e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:57,6,0 chrXIII 201932 . A C 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.98;SB=-1.772e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:55,6,0 chrXIII 201937 . C A 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.98;SB=-1.773e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:57,6,0 chrXIII 201944 . C T 29.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=2.13;SB=-1.773e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:61,6,0 chrXIII 201946 . A G 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.84;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:57,6,0 chrXIII 201947 . C T 27.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.98;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:59,6,0 chrXIII 201949 . A T 27.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.98;SB=-1.773e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:59,6,0 chrXIII 201951 . C G 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=1.84;SB=-1.773e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:57,6,0 chrXIII 201959 . T C 15.88 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=0.84;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:47,6,0 chrXIII 201960 . A G 15.88 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=0.84;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:47,6,0 chrXIII 201961 . C T 15.88 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=0.84;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:47,6,0 chrXIII 201962 . A G 17.84 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=0.94;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:49,6,0 chrXIII 201974 . T G 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.95;MQ0=3;QD=1.22;SB=-1.774e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,19:22:6:58,6,0 chrXIII 202191 . C A 110.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.77;MQ0=8;QD=2.04;SB=-2.729e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,46:54:15:143,15,0 chrXIII 202192 . T G 104.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=7;QD=1.97;SB=-2.729e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,46:53:15:137,15,0 chrXIII 202197 . T C 271 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.05;MQ0=5;QD=3.99;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,63:68:33:304,33,0 chrXIII 202206 . T C 372 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.11;MQ0=2;QD=5.47;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:68:42:405,42,0 chrXIII 202207 . T A 407 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.11;MQ0=2;QD=5.99;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,66:68:45:440,45,0 chrXIII 202222 . A C 688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.65;MQ0=0;QD=9.42;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:75:721,75,0 chrXIII 202482 . A G 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.63;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2982,294,0 chrXIII 202531 . T C 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.527;DP=118;Dels=0.00;FS=3.998;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.82;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.998;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3083,312,0 chrXIII 203104 . C T 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2907,297,0 chrXIII 205923 . A G 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3076,321,0 chrXIII 207607 . A C 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3491,375,0 chrXIII 207757 . A G 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=26.51;ReadPosRankSum=1.547;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:3002,315,0 chrXIII 208962 . G A 2418 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2451,249,0 chrXIII 209014 . G A 2433 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.58;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2466,246,0 chrXIII 209233 . C T 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3528,346,0 chrXIII 209344 . C T 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.650;DP=162;Dels=0.00;FS=10.849;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.127;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1717,0,1814 chrXIII 212859 . T C 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3306,342,0 chrXIII 213972 . G A 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=1;QD=26.43;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:93:99:2491,249,0 chrXIII 214086 . C T 1734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=13.76;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:1767,177,0 chrXIII 214378 . A G 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3312,342,0 chrXIII 215334 . T C 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3126,315,0 chrXIII 215544 . C T 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3367,345,0 chrXIII 215595 . T C 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3454,351,0 chrXIII 216027 . C T 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.831;DP=123;Dels=0.00;FS=5.217;HaplotypeScore=4.6740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3316,337,0 chrXIII 217030 . T G 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3460,357,0 chrXIII 217284 . A C 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3799,370,0 chrXIII 217356 . C G 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3795,382,0 chrXIII 218590 . C T 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3392,340,0 chrXIII 218882 . T C 2552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.420;DP=100;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=25.52;ReadPosRankSum=1.351;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2585,247,0 chrXIII 219326 . G A 4250.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.78;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4250,424,0 chrXIII 220290 . A G 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3754,388,0 chrXIII 220725 . A G 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3782,384,0 chrXIII 220830 . C T 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.22;SB=-2.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3697,364,0 chrXIII 220900 . G A 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3336,328,0 chrXIII 221398 . A C 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3438,345,0 chrXIII 223396 . G A 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3287,322,0 chrXIII 223427 . A T 2905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2938,289,0 chrXIII 223500 . C T 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=1;QD=26.46;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3995,391,0 chrXIII 223977 . G A 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3503,358,0 chrXIII 224225 . T A 2905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2938,292,0 chrXIII 224339 . A G 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;DP=140;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=2.7129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=25.58;ReadPosRankSum=-1.624;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,138:140:99:3581,337,0 chrXIII 224490 . G C 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3108,324,0 chrXIII 225178 . T C 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3177,324,0 chrXIII 225252 . A G 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.20;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3580,375,0 chrXIII 225259 . T C 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.88;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3366,354,0 chrXIII 225309 . A T 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=1;QD=27.46;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3570,361,0 chrXIII 225438 . T C 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.42;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3108,312,0 chrXIII 225447 . C T 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.26;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3182,313,0 chrXIII 225454 . T C 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.60;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3452,354,0 chrXIII 225553 . A G 2475 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.29;MQ0=0;QD=26.33;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2508,270,0 chrXIII 225572 . C T 2823 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=105;Dels=0.00;FS=3.399;HaplotypeScore=9.7370;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.841;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:2856,289,0 chrXIII 225581 . T C 2248 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.554;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.4092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.952;QD=22.71;ReadPosRankSum=1.380;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,97:99:99:2281,270,0 chrXIII 225582 . G T 2251 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.060;DP=99;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.697;QD=22.74;ReadPosRankSum=1.661;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:98:99:2284,270,0 chrXIII 225586 . G A 2610 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.32;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2643,273,0 chrXIII 225614 . G A 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.14;MQ0=0;QD=26.29;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2741,288,0 chrXIII 225656 . A G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.67;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3231,348,0 chrXIII 225678 . G A 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.46;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3821,379,0 chrXIII 225802 . C T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3605,358,0 chrXIII 225831 . A G 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3690,378,0 chrXIII 226024 . C T 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3884,379,0 chrXIII 226071 . G A 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:3122,307,0 chrXIII 226093 . G A 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3503,343,0 chrXIII 226121 . C A 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3798,382,0 chrXIII 226133 . C T 4008.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.594;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.524;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:4008,369,0 chrXIII 226181 . C T 4143.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4143,415,0 chrXIII 226649 . T C 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.49;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2668,270,0 chrXIII 226822 . A T 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.51;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3004,304,0 chrXIII 226951 . T C 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=22.52;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2600,258,0 chrXIII 227065 . C T 2285 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2318,228,0 chrXIII 227084 . C T 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2557,249,0 chrXIII 227257 . C T 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.54;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2649,267,0 chrXIII 227342 . A G 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3062,324,0 chrXIII 227660 . T C 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3496,363,0 chrXIII 227957 . G A 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:3065,307,0 chrXIII 227971 . G A 3310.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.90;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3310,328,0 chrXIII 227975 . T G 2928 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2961,306,0 chrXIII 227978 . G A 2803 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.46;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2836,291,0 chrXIII 228065 . G A 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2874,285,0 chrXIII 228182 . A C 1757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.43;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1790,198,0 chrXIII 228183 . C T 1786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.14;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1819,198,0 chrXIII 228217 . C T 2579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.32;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2612,258,0 chrXIII 228514 . G A 2726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2759,268,0 chrXIII 228523 . G A 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2675,264,0 chrXIII 229206 . G A 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3040,304,0 chrXIII 229364 . A G 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2880,291,0 chrXIII 229786 . C T 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3218,319,0 chrXIII 230652 . G A 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3589,361,0 chrXIII 230823 . C T 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:122:99:3319,331,0 chrXIII 230928 . A G 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3507,360,0 chrXIII 230942 . C T 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=28.04;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3281,325,0 chrXIII 230978 . G A 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3449,325,0 chrXIII 230996 . C T 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3263,310,0 chrXIII 231292 . A G 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3705,378,0 chrXIII 231382 . A G 2100 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=23.33;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2133,231,0 chrXIII 231391 . A C 1776 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.87;MQ0=0;QD=22.48;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1809,195,0 chrXIII 231392 . A G 1754 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.87;MQ0=0;QD=22.20;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1787,195,0 chrXIII 231506 . C T 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=1;QD=26.45;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2652,258,0 chrXIII 231733 . T G 4263.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.93;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4263,429,0 chrXIII 232186 . C T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3285,331,0 chrXIII 232336 . G T 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2796,280,0 chrXIII 232390 . A C 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3465,342,0 chrXIII 232662 . C T 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.41;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3536,352,0 chrXIII 232771 . A G 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3461,349,0 chrXIII 232832 . C T 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2831,288,0 chrXIII 233147 . A G 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3046,309,0 chrXIII 233202 . T A 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3365,322,0 chrXIII 233569 . A G 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3284,318,0 chrXIII 233610 . C T 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3499,337,0 chrXIII 233612 . G A 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3427,334,0 chrXIII 233723 . C A 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3904,391,0 chrXIII 233936 . G A 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2835,282,0 chrXIII 234329 . C T 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3546,334,0 chrXIII 234471 . T C 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3308,333,0 chrXIII 234542 . T A 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3062,310,0 chrXIII 234544 . T A 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2993,309,0 chrXIII 234644 . A G 2281 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.05;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2314,246,0 chrXIII 235023 . A G 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4003,409,0 chrXIII 235149 . T C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3732,370,0 chrXIII 235288 . T C 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.005;DP=132;Dels=0.00;FS=5.357;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.319;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1588,0,1273 chrXIII 235377 . T C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.317;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1328,0,1167 chrXIII 235419 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.945;DP=120;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=2.5352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.274;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:120:99:1338,0,1202 chrXIII 235455 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.042;DP=126;Dels=0.00;FS=3.240;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:126:99:1224,0,1471 chrXIII 235548 . T A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.714;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.358;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1414,0,1658 chrXIII 235740 . A G 4220.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4220,429,0 chrXIII 235759 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.511;DP=145;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1602,0,1516 chrXIII 235798 . G A 4353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.90;SB=-2.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4353,436,0 chrXIII 236124 . G C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.776;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,71:167:99:1448,0,2108 chrXIII 236156 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.497;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.081;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1407,0,1657 chrXIII 236173 . T A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.465;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=10.91;ReadPosRankSum=-2.289;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1405,0,1327 chrXIII 236312 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.036;DP=121;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.175;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.047;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1137,0,1520 chrXIII 236318 . A C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.331;DP=123;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1073,0,1556 chrXIII 236327 . A G 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.967;DP=112;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=3.317;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1345,0,1066 chrXIII 236370 . C T 2528 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=26.33;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2561,264,0 chrXIII 236387 . T A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;DP=107;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=-4.253;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.441;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:107:99:1273,0,1019 chrXIII 236390 . C A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.493;DP=108;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.07;MQ0=0;MQRankSum=-4.721;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1284,0,1019 chrXIII 236398 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.452;DP=119;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.07;MQ0=0;MQRankSum=-4.379;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.163;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1237,0,1180 chrXIII 236403 . T A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.870;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.682;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1263,0,1503 chrXIII 236833 . C T 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3061,298,0 chrXIII 237033 . C T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.984;DP=107;Dels=0.00;FS=1.657;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.020;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:1448,0,835 chrXIII 237159 . T C 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8895;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=1;QD=24.51;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2754,291,0 chrXIII 237284 . A G 726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.292;DP=75;Dels=0.00;FS=7.912;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.473;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,35:75:99:756,0,935 chrXIII 237477 . T C 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2902,309,0 chrXIII 237965 . A G 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3191,324,0 chrXIII 238236 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.428;DP=119;Dels=0.00;FS=4.515;HaplotypeScore=1.9900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.470;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:962,0,1578 chrXIII 238290 . T C 2138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.53;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=23.49;ReadPosRankSum=1.504;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2171,237,0 chrXIII 238291 . G A 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.172;DP=90;Dels=0.00;FS=10.589;HaplotypeScore=7.6661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.440;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:866,0,856 chrXIII 238380 . A G 1887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.52;MQ0=0;QD=20.97;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1920,198,0 chrXIII 238422 . G A 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.15;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2877,291,0 chrXIII 238506 . A G 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.945;DP=113;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=3.9461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.919;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:811,0,1423 chrXIII 238751 . A G 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.78;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:118:99:2816,300,0 chrXIII 238806 . G T 148.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;DP=104;Dels=0.00;FS=165.932;HaplotypeScore=12.1265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.98;MQ0=0;MQRankSum=-4.423;QD=1.42;ReadPosRankSum=-6.473;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,21:104:99:178,0,440 chrXIII 239384 . A G 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.798;DP=112;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=8.7925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.54;MQ0=0;MQRankSum=2.547;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.224;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:872,0,464 chrXIII 239420 . A G 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.481;DP=136;Dels=0.00;FS=6.464;HaplotypeScore=2.8437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.964;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,83:136:99:1754,0,1121 chrXIII 239557 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.257;DP=144;Dels=0.00;FS=14.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1585,0,1526 chrXIII 239731 . A G 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.055;DP=138;Dels=0.00;FS=5.399;HaplotypeScore=4.8880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.574;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1372,0,1488 chrXIII 239758 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.675;DP=117;Dels=0.00;FS=1.544;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=9.69;ReadPosRankSum=2.182;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1164,0,1307 chrXIII 239887 . T C 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.085;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.559;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,39:87:99:715,0,1030 chrXIII 240460 . C T 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2917,291,0 chrXIII 240594 . T C 3643.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=137;Dels=0.00;FS=3.106;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=26.59;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3643,375,0 chrXIII 241006 . A G 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.338;DP=154;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.338;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.046;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:154:99:1533,0,1742 chrXIII 241279 . A T 1947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.715;DP=173;Dels=0.00;FS=10.338;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.414;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,92:173:99:1977,0,1791 chrXIII 241545 . G C 2470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2503,267,0 chrXIII 241597 . C T 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2741,274,0 chrXIII 241669 . C T 2404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2437,237,0 chrXIII 241788 . C T 2444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.03;MQ0=0;QD=26.86;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:2477,252,0 chrXIII 241937 . A T 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;DP=109;Dels=0.00;FS=1.883;HaplotypeScore=5.4395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.701;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:1032,0,1247 chrXIII 242258 . T A 4742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4742,478,0 chrXIII 242415 . C T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.788;DP=122;Dels=0.00;FS=4.497;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.760;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1418,0,1270 chrXIII 242460 . C T 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3598,367,0 chrXIII 242493 . G A 4892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.18;SB=-2.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4892,484,0 chrXIII 242794 . G A 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.464;DP=137;Dels=0.00;FS=4.117;HaplotypeScore=6.0119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1247,0,1605 chrXIII 242850 . T G 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.478;DP=152;Dels=0.00;FS=14.905;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.212;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1584,0,1527 chrXIII 242853 . G A 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3845,379,0 chrXIII 242871 . A C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;DP=154;Dels=0.00;FS=7.451;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:154:99:1284,0,1729 chrXIII 242910 . C T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.132;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.844;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1344,0,1895 chrXIII 243056 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.418;DP=147;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.056;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1384,0,1679 chrXIII 243473 . A G 4018.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:4018,409,0 chrXIII 243623 . G A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.845;DP=150;Dels=0.00;FS=2.095;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1616,0,1595 chrXIII 243777 . G T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.245;DP=142;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.192;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1629,0,1367 chrXIII 243978 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.590;DP=124;Dels=0.00;FS=5.550;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1135,0,1301 chrXIII 244001 . G C 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=22.92;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3346,348,0 chrXIII 244141 . A G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;DP=174;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=3.4888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,71:174:99:1485,0,2320 chrXIII 244246 . A G 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.961;DP=149;Dels=0.00;FS=2.067;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1360,0,1865 chrXIII 244359 . C T 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4083,400,0 chrXIII 244448 . G A 1990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.355;DP=201;Dels=0.00;FS=7.944;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,100:201:99:2020,0,2106 chrXIII 244497 . C T 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.917;DP=144;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=2.6744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.694;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1409,0,1641 chrXIII 244520 . G A 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.904;DP=175;Dels=0.00;FS=1.263;HaplotypeScore=6.9311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=2.023;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,84:175:99:1887,0,1906 chrXIII 244883 . C T 4246.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4246,436,0 chrXIII 244904 . T A 2053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.459;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=12.75;ReadPosRankSum=2.898;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,88:161:99:2083,0,1619 chrXIII 245006 . C A 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.920;DP=152;Dels=0.00;FS=2.892;HaplotypeScore=2.4905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.445;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1668,0,1478 chrXIII 245090 . G A 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.317;DP=163;Dels=0.00;FS=1.222;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.032;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,85:163:99:1850,0,1596 chrXIII 245123 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.393;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.771;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,82:172:99:1605,0,2013 chrXIII 245129 . C T 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.578;DP=167;Dels=0.00;FS=1.951;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,86:167:99:1843,0,1733 chrXIII 245142 . C T 1826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.321;DP=165;Dels=0.00;FS=2.004;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,83:165:99:1856,0,1708 chrXIII 245312 . C T 1874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.374;DP=140;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.184;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1904,0,1171 chrXIII 245459 . G A 1973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.865;DP=174;Dels=0.00;FS=1.881;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.185;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,95:174:99:2003,0,1507 chrXIII 245572 . C T 2083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.051;DP=169;Dels=0.00;FS=2.758;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=3.147;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,96:169:99:2113,0,1497 chrXIII 245622 . G A 1579.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.118;DP=162;Dels=0.00;FS=11.114;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.142;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,78:162:99:1609,0,1739 chrXIII 245624 . C T 4409.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4409,436,0 chrXIII 245628 . A G 4097.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4097,418,0 chrXIII 245654 . C T 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.308;DP=134;Dels=0.00;FS=6.787;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1522,0,1314 chrXIII 245675 . T G 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.412;DP=118;Dels=0.00;FS=1.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=2.138;QD=8.64;ReadPosRankSum=2.485;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1050,0,1399 chrXIII 246258 . C T 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=1;QD=26.31;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3920,385,0 chrXIII 246803 . T C 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;DP=147;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=4.8833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=10.37;ReadPosRankSum=2.846;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1555,0,1726 chrXIII 246910 . A T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;DP=146;Dels=0.00;FS=11.764;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.184;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1585,0,1687 chrXIII 247126 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.238;DP=168;Dels=0.00;FS=5.573;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,74:168:99:1323,0,2120 chrXIII 247466 . G C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.533;DP=144;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.972;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.510;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1233,0,1658 chrXIII 247590 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.418;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.423;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1318,0,1586 chrXIII 247727 . A T 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3508,355,0 chrXIII 247728 . T G 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3431,357,0 chrXIII 247856 . T A 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3598,346,0 chrXIII 247929 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.180;DP=134;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=2.8656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.820;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1435,0,1389 chrXIII 247975 . A G 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3746,390,0 chrXIII 248110 . A T 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6823;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3408,337,0 chrXIII 248123 . A C 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3655,381,0 chrXIII 248171 . C T 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.403;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.688;SB=-2.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:3968,375,0 chrXIII 248618 . G C 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.13;MQ0=0;QD=24.78;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3866,397,0 chrXIII 248627 . G A 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3482,343,0 chrXIII 248629 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.872;DP=139;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=3.7725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.121;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.160;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:139:99:1090,0,1712 chrXIII 248645 . A G 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3176,333,0 chrXIII 248834 . C T 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.688;DP=148;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1865,0,1452 chrXIII 249138 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.864;DP=145;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1337,0,1789 chrXIII 249155 . G A 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;DP=136;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1305,0,1623 chrXIII 249389 . G T 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.947;DP=138;Dels=0.00;FS=2.126;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.728;QD=9.93;ReadPosRankSum=2.112;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1401,0,1483 chrXIII 249476 . T C 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3219,342,0 chrXIII 249495 . G A 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.056;DP=122;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:1642,0,1061 chrXIII 249527 . T C 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.603;DP=142;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1690,0,1385 chrXIII 250529 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.904;DP=131;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.701;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1217,0,1437 chrXIII 250990 . T C 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.516;DP=144;Dels=0.01;FS=10.567;HaplotypeScore=2.7286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.014;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1268,0,1799 chrXIII 251233 . T G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.236;DP=118;Dels=0.00;FS=1.475;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.073;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1068,0,1503 chrXIII 251246 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.746;DP=116;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.147;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1477,0,987 chrXIII 251274 . A C 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3483,369,0 chrXIII 251543 . A C 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.381;DP=178;Dels=0.00;FS=8.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.228;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,84:178:99:1712,0,2069 chrXIII 251607 . T C 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.493;DP=109;Dels=0.00;FS=4.900;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.567;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1138,0,1019 chrXIII 251609 . A G 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;QD=25.13;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2747,288,0 chrXIII 251727 . A G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.888;DP=141;Dels=0.00;FS=2.727;HaplotypeScore=6.5591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1089,0,1469 chrXIII 251736 . T G 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.627;DP=166;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=18.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=22.63;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:3757,399,0 chrXIII 251941 . G A 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3538,357,0 chrXIII 252178 . G A 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.450;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.736;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1654,0,1671 chrXIII 252422 . T C 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;DP=150;Dels=0.00;FS=9.016;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.423;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1571,0,1628 chrXIII 252727 . A T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;DP=117;Dels=0.00;FS=2.379;HaplotypeScore=2.5721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1272,0,1310 chrXIII 252757 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.267;DP=120;Dels=0.00;FS=3.394;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.585;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1224,0,1307 chrXIII 252877 . G A 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.820;DP=136;Dels=0.00;FS=7.907;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1424,0,1418 chrXIII 253031 . T A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;DP=114;Dels=0.00;FS=2.772;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.402;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1404,0,1063 chrXIII 253274 . G A 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3363,334,0 chrXIII 253290 . G C 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3583,372,0 chrXIII 253309 . T C 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.9040;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3412,366,0 chrXIII 253431 . G A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.614;DP=103;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.200;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1329,0,856 chrXIII 253470 . G A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.619;DP=113;Dels=0.00;FS=7.223;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=2.066;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1301,0,1099 chrXIII 253503 . G T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.604;DP=120;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.834;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1211,0,1378 chrXIII 253603 . C A 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.466;DP=111;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:885,0,1232 chrXIII 253616 . T C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.600;DP=132;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.817;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.045;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:132:99:1407,0,1051 chrXIII 253877 . G A 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;DP=106;Dels=0.00;FS=2.486;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.041;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1045,0,1156 chrXIII 253962 . G A 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.949;DP=117;Dels=0.00;FS=11.802;HaplotypeScore=2.6251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.687;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1050,0,1360 chrXIII 254018 . C T 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.789;DP=117;Dels=0.00;FS=5.739;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.224;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1206,0,1291 chrXIII 254048 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.953;DP=134;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1480,0,1270 chrXIII 254293 . A T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;DP=118;Dels=0.00;FS=15.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.064;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1187,0,1357 chrXIII 254427 . A G,T 2778.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.94;MQ0=0;QD=23.15;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,49,71:120:99:2838,1676,1541,1161,0,975 chrXIII 254807 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=97;Dels=0.00;FS=12.089;HaplotypeScore=4.6227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:97:99:980,0,1050 chrXIII 254816 . G T 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2863,291,0 chrXIII 255052 . G A 526.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.233;DP=145;Dels=0.00;FS=37.733;HaplotypeScore=36.4129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQ0=0;MQRankSum=-3.315;QD=3.63;ReadPosRankSum=-6.245;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,35:145:99:556,0,1703 chrXIII 255332 . C T 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.926;DP=95;Dels=0.00;FS=4.001;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.347;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:817,0,1194 chrXIII 255485 . T C 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.036;DP=115;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:961,0,1500 chrXIII 255554 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.143;DP=132;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.206;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1529,0,1293 chrXIII 255569 . A G,T 3107.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=23.72;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,74,56:131:99:3167,1363,1159,1804,0,1648 chrXIII 255602 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.181;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.615;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1457,0,1303 chrXIII 255722 . A G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.339;DP=128;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.108;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1221,0,1394 chrXIII 256023 . A G 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.613;DP=104;Dels=0.00;FS=3.778;HaplotypeScore=4.1501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.294;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:914,0,1235 chrXIII 256193 . T C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.141;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=12.36;ReadPosRankSum=2.008;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:1464,0,1033 chrXIII 256812 . G A 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;DP=109;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=9.86;ReadPosRankSum=2.699;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1105,0,1325 chrXIII 256814 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.726;DP=110;Dels=0.00;FS=2.580;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.176;QD=9.64;ReadPosRankSum=2.296;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1090,0,1374 chrXIII 257082 . A C 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3430,369,0 chrXIII 257100 . T C 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3670,381,0 chrXIII 257710 . G A 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.716;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.650;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,79:166:99:1723,0,1872 chrXIII 257756 . G A 4035.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-2.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:4035,381,0 chrXIII 257811 . G A 3903.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3903,391,0 chrXIII 258020 . C G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.157;DP=111;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.328;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1137,0,1314 chrXIII 258455 . T C 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.678;DP=136;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1553,0,1370 chrXIII 258655 . A G 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.842;DP=101;Dels=0.00;FS=3.879;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.896;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:738,0,1367 chrXIII 259015 . A C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;DP=119;Dels=0.00;FS=1.696;HaplotypeScore=9.8999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=9.80;ReadPosRankSum=2.012;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1196,0,1377 chrXIII 259069 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.589;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,49:84:99:897,0,781 chrXIII 259244 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;DP=121;Dels=0.00;FS=2.395;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.080;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1233,0,1300 chrXIII 259259 . T G 1275.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.694;DP=129;Dels=0.00;FS=3.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.825;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.144;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1305,0,1377 chrXIII 259263 . T A 1315.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;DP=128;Dels=0.00;FS=5.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1345,0,1417 chrXIII 259265 . C T 1313.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.039;DP=122;Dels=0.00;FS=4.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.261;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.202;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1343,0,1294 chrXIII 259267 . G A 1320.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.098;DP=124;Dels=0.00;FS=3.427;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.003;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1350,0,1258 chrXIII 259663 . T C 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3251,321,0 chrXIII 260334 . T C 2430 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;DP=96;Dels=0.00;FS=3.590;HaplotypeScore=2.9133;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=25.31;ReadPosRankSum=1.588;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2463,255,0 chrXIII 260437 . G A 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3142,318,0 chrXIII 260462 . A G 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3119,339,0 chrXIII 260541 . A G 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.935;DP=113;Dels=0.00;FS=2.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1149,0,1250 chrXIII 260580 . T C 2114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2147,231,0 chrXIII 260820 . G A 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.634;DP=106;Dels=0.00;FS=3.918;HaplotypeScore=6.6725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=27.32;ReadPosRankSum=1.111;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2929,279,0 chrXIII 261191 . A G 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3622,369,0 chrXIII 261255 . A G 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3585,363,0 chrXIII 261722 . G A 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3084,304,0 chrXIII 261864 . A G 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3210,339,0 chrXIII 262071 . G T 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.96;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2801,271,0 chrXIII 262219 . C T 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.826;DP=138;Dels=0.00;FS=10.618;HaplotypeScore=8.4514;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.378;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.327;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,136:138:99:3829,391,0 chrXIII 262578 . G A 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3477,346,0 chrXIII 262580 . T C 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3476,351,0 chrXIII 262749 . T C 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2835,282,0 chrXIII 262788 . T C 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;DP=119;Dels=0.00;FS=7.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.897;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:994,0,1532 chrXIII 262820 . G C 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2869,303,0 chrXIII 262904 . G A 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.672;DP=117;Dels=0.01;FS=3.402;HaplotypeScore=9.8210;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=24.85;ReadPosRankSum=1.284;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2941,292,0 chrXIII 262915 . T A 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3342,345,0 chrXIII 262958 . G A 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3091,307,0 chrXIII 263216 . A G 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=25.38;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2571,267,0 chrXIII 263244 . C T 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3683,355,0 chrXIII 263467 . T C 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.91;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2599,273,0 chrXIII 264178 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.977;DP=109;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.394;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1280,0,1049 chrXIII 264400 . A G 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3048,312,0 chrXIII 264463 . T C 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2859,300,0 chrXIII 264816 . A G 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6017;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=25.79;ReadPosRankSum=1.703;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3102,318,0 chrXIII 264995 . A C 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2523,252,0 chrXIII 265251 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.065;DP=100;Dels=0.00;FS=3.942;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.370;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1186,0,988 chrXIII 265689 . T C 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.19;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2809,291,0 chrXIII 266166 . G A 3784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=28.03;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3784,376,0 chrXIII 266327 . C A 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3345,319,0 chrXIII 266878 . T A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;DP=117;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=9.3183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.241;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:1432,0,652 chrXIII 266926 . G C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.139;DP=145;Dels=0.00;FS=5.616;HaplotypeScore=4.8326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1234,0,1596 chrXIII 267659 . C T 2891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.27;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2924,297,0 chrXIII 267866 . A G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.753;DP=108;Dels=0.01;FS=3.542;HaplotypeScore=2.9579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.786;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:107:99:1353,0,1000 chrXIII 267867 . A T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;DP=109;Dels=0.00;FS=2.450;HaplotypeScore=2.9579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.879;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1413,0,1038 chrXIII 267926 . T A 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=27.98;SB=-2.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3889,379,0 chrXIII 267945 . T C 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3417,351,0 chrXIII 268003 . A G 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.580;DP=114;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.064;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2975,283,0 chrXIII 268043 . C T 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2813,276,0 chrXIII 268064 . C G 12.99 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=106.7726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.96;MQ0=0;QD=0.13;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:101:6:44,6,0 chrXIII 268317 . T C 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=1;QD=27.34;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3013,306,0 chrXIII 268353 . G A 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=1;QD=27.14;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3127,315,0 chrXIII 268453 . A G 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3109,321,0 chrXIII 268510 . A G 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.933;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=26.13;ReadPosRankSum=1.406;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3090,321,0 chrXIII 268600 . C G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;DP=103;Dels=0.00;FS=3.716;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.703;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1298,0,843 chrXIII 268621 . T A 1981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=27.14;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2014,198,0 chrXIII 268655 . G A 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2945,286,0 chrXIII 268659 . A G 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.228;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=2.645;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:926,0,1182 chrXIII 268760 . A C 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2831,300,0 chrXIII 269778 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.410;DP=135;Dels=0.00;FS=12.498;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=1;MQRankSum=-0.248;QD=8.84;ReadPosRankSum=2.363;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1224,0,1436 chrXIII 270183 . T G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.942;DP=138;Dels=0.00;FS=3.170;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:1101,0,1918 chrXIII 270321 . A G 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.246;DP=147;Dels=0.00;FS=5.238;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.606;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1587,0,1579 chrXIII 270930 . T C 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.834;DP=133;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=11.25;ReadPosRankSum=-3.253;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1526,0,1340 chrXIII 271064 . T C 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.133;DP=135;Dels=0.00;FS=4.361;HaplotypeScore=9.6946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1433,0,1446 chrXIII 271498 . G A 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.084;DP=147;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.115;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1825,0,1376 chrXIII 271672 . A C 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3668,390,0 chrXIII 271938 . A G 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.19;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2652,273,0 chrXIII 272495 . G A 4421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:164:99:4421,439,0 chrXIII 272503 . C G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;DP=163;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.484;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,70:163:99:1375,0,2022 chrXIII 272693 . T C 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.857;DP=121;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.273;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1158,0,1444 chrXIII 272743 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.848;DP=113;Dels=0.00;FS=4.226;HaplotypeScore=55.6791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.286;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1292,0,1134 chrXIII 272746 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.682;DP=110;Dels=0.00;FS=4.295;HaplotypeScore=55.6791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.792;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1192,0,1121 chrXIII 272852 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.399;DP=112;Dels=0.00;FS=3.435;HaplotypeScore=3.7136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1117,0,1220 chrXIII 272987 . G T 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.066;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.507;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1173,0,1568 chrXIII 273113 . A C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.125;DP=100;Dels=0.00;FS=2.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1015,0,1134 chrXIII 273116 . A C 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.867;DP=97;Dels=0.00;FS=3.904;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:922,0,1141 chrXIII 273179 . A G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.334;DP=136;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=8.67;ReadPosRankSum=-2.026;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1209,0,1568 chrXIII 273245 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.249;DP=135;Dels=0.00;FS=1.361;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.426;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1334,0,1564 chrXIII 273267 . C T 4311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=25.97;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:4311,406,0 chrXIII 273333 . T C 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.160;DP=162;Dels=0.00;FS=3.139;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.797;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,76:162:99:1613,0,1946 chrXIII 273468 . C G 718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;DP=86;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=3.9455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=2.032;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:86:99:748,0,984 chrXIII 273484 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.673;DP=114;Dels=0.00;FS=3.452;HaplotypeScore=3.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:993,0,1377 chrXIII 273995 . C T 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.868;DP=135;Dels=0.00;FS=3.142;HaplotypeScore=51.6397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.570;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1378,0,1454 chrXIII 274088 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.842;DP=111;Dels=0.00;FS=5.916;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.573;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1324,0,1077 chrXIII 274105 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.384;DP=129;Dels=0.00;FS=7.972;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.898;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1509,0,1241 chrXIII 274143 . A G 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.398;DP=142;Dels=0.00;FS=3.027;HaplotypeScore=3.5531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.246;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1483,0,1384 chrXIII 274730 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.534;DP=121;Dels=0.00;FS=13.582;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.567;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1049,0,1632 chrXIII 274880 . T C 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.956;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.540;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1066,0,1501 chrXIII 274946 . T C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.260;DP=146;Dels=0.00;FS=2.121;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1296,0,1865 chrXIII 275441 . A G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.829;DP=146;Dels=0.00;FS=2.914;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1565,0,1531 chrXIII 275717 . T A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.041;DP=144;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=3.4332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.255;QD=9.47;ReadPosRankSum=2.732;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1393,0,1777 chrXIII 275773 . T C 569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.684;DP=108;Dels=0.01;FS=12.783;HaplotypeScore=9.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.39;MQ0=0;MQRankSum=-6.475;QD=5.27;ReadPosRankSum=-2.759;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:599,0,1433 chrXIII 275774 . T C 583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.035;DP=104;Dels=0.01;FS=11.334;HaplotypeScore=9.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.94;MQ0=0;MQRankSum=-7.723;QD=5.61;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:613,0,1439 chrXIII 275790 . A G 590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.780;DP=108;Dels=0.00;FS=17.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.40;MQ0=0;MQRankSum=-8.700;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.407;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:620,0,1447 chrXIII 275822 . C T 546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.975;DP=96;Dels=0.00;FS=6.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQ0=0;MQRankSum=-8.327;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.041;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:576,0,1232 chrXIII 275831 . A G 651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.705;DP=108;Dels=0.00;FS=2.532;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQ0=0;MQRankSum=-8.836;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.536;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:681,0,1501 chrXIII 275836 . G A 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.202;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.02;MQ0=0;MQRankSum=-8.630;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:719,0,1232 chrXIII 275847 . T C 550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.407;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.20;MQ0=0;MQRankSum=-6.999;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.059;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:580,0,1286 chrXIII 275851 . C T 584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;DP=97;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.32;MQ0=0;MQRankSum=-7.088;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:614,0,1289 chrXIII 275891 . G A 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.550;DP=118;Dels=0.00;FS=9.299;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.941;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:1043,0,1507 chrXIII 275910 . C G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.652;DP=124;Dels=0.00;FS=3.371;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.281;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.228;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1185,0,1410 chrXIII 275928 . T C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.131;DP=146;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=5.7023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.540;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1525,0,1567 chrXIII 276220 . T C 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=120;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.228;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1220,0,1366 chrXIII 276222 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.552;DP=123;Dels=0.00;FS=1.438;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=2.204;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.273;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1200,0,1458 chrXIII 276641 . C T 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3274,325,0 chrXIII 276727 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.889;DP=135;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.351;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1365,0,1572 chrXIII 276740 . A G 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.494;DP=128;Dels=0.00;FS=3.213;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.109;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1199,0,1502 chrXIII 276755 . C A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.911;DP=131;Dels=0.00;FS=4.212;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=10.81;ReadPosRankSum=-2.281;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1446,0,1375 chrXIII 276983 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.187;DP=110;Dels=0.00;FS=1.566;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1296,0,1093 chrXIII 277019 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.688;DP=125;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.323;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:125:99:1569,0,1071 chrXIII 277070 . T C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.87;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2931,294,0 chrXIII 277164 . A G 4091.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4091,402,0 chrXIII 277293 . T G 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3711,381,0 chrXIII 277367 . C T 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2622,267,0 chrXIII 277529 . G A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.152;DP=131;Dels=0.00;FS=3.299;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=2.326;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1391,0,1573 chrXIII 277557 . G A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.133;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1395,0,1432 chrXIII 277591 . A G 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3621,390,0 chrXIII 277897 . T A 4042.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.88;SB=-2.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4042,388,0 chrXIII 277968 . G A 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.669;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.025;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,86:174:99:1788,0,1865 chrXIII 278212 . T C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.670;DP=124;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1361,0,1362 chrXIII 278376 . T C 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.956;DP=122;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.101;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1553,0,1183 chrXIII 278550 . C G 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3144,318,0 chrXIII 278658 . A C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.525;DP=116;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1372,0,1173 chrXIII 278809 . A G 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.556;DP=101;Dels=0.00;FS=2.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:868,0,1293 chrXIII 278966 . G T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.181;DP=135;Dels=0.00;FS=2.251;HaplotypeScore=5.9404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.820;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,54:135:99:1084,0,1696 chrXIII 279103 . A G 3863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3863,378,0 chrXIII 279388 . T C 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4054,405,0 chrXIII 279616 . C T 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3235,325,0 chrXIII 279667 . G A 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3345,343,0 chrXIII 279785 . T A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;DP=126;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=8.2357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.755;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1477,0,1219 chrXIII 279942 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.395;DP=116;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=2.467;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.936;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1114,0,1159 chrXIII 280077 . A C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.318;DP=114;Dels=0.00;FS=2.687;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.159;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1030,0,1212 chrXIII 280278 . C T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;DP=139;Dels=0.01;FS=1.463;HaplotypeScore=12.3912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=1;MQRankSum=-0.172;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1195,0,1753 chrXIII 280284 . C T 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.949;DP=136;Dels=0.00;FS=1.492;HaplotypeScore=3.8574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=1;MQRankSum=1.513;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.629;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1730,0,1233 chrXIII 280719 . A G 414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.607;DP=128;Dels=0.00;FS=8.370;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=2;MQRankSum=-0.564;QD=3.23;ReadPosRankSum=-2.902;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:444,0,1332 chrXIII 281241 . A G 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3484,360,0 chrXIII 281820 . T C 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2810,288,0 chrXIII 281850 . A G 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.164;DP=107;Dels=0.00;FS=20.273;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:996,0,1254 chrXIII 281871 . A C 2637 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2670,279,0 chrXIII 282019 . C A 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.646;DP=98;Dels=0.00;FS=6.711;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1029,0,980 chrXIII 282022 . T C 2410 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2443,249,0 chrXIII 282084 . G A 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.407;DP=105;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:1034,0,1138 chrXIII 282333 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.702;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.1016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1081,0,1312 chrXIII 282462 . G A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=109;Dels=0.00;FS=4.796;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=9.03;ReadPosRankSum=3.289;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:1014,0,1340 chrXIII 282531 . C T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.659;DP=120;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.217;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,75:120:99:1737,0,882 chrXIII 282723 . A G 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.142;DP=124;Dels=0.00;FS=3.321;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.202;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1479,0,1119 chrXIII 282738 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.005;DP=111;Dels=0.00;FS=2.481;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.14;ReadPosRankSum=2.184;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1377,0,1084 chrXIII 283093 . T C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.543;DP=125;Dels=0.00;FS=11.505;HaplotypeScore=5.9090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=8.84;ReadPosRankSum=2.206;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1135,0,1501 chrXIII 283144 . A G 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=2.106;QD=24.90;ReadPosRankSum=0.483;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,148:150:99:3735,334,0 chrXIII 283178 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.292;DP=134;Dels=0.00;FS=4.374;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=8.64;ReadPosRankSum=2.653;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1188,0,1675 chrXIII 283212 . T C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.633;DP=166;Dels=0.00;FS=3.600;HaplotypeScore=4.6593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=8.93;ReadPosRankSum=-1.794;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,77:166:99:1513,0,2063 chrXIII 283234 . C T 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.459;DP=180;Dels=0.00;FS=1.194;HaplotypeScore=5.9564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=9.61;ReadPosRankSum=-2.338;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,84:180:99:1760,0,2015 chrXIII 283368 . T C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.346;DP=139;Dels=0.00;FS=4.008;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1347,0,1611 chrXIII 283596 . C G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;DP=116;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=9.30;ReadPosRankSum=2.604;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1109,0,1319 chrXIII 283603 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.096;DP=117;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=9.87;ReadPosRankSum=2.556;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1185,0,1340 chrXIII 283900 . T C 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.311;DP=139;Dels=0.00;FS=4.002;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1710,0,1306 chrXIII 284260 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.301;DP=121;Dels=0.00;FS=7.127;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:121:99:1426,0,1202 chrXIII 284383 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.215;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.201;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1123,0,1425 chrXIII 284422 . T C 729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.772;DP=97;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.472;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.895;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:759,0,1323 chrXIII 284434 . G A 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.420;DP=105;Dels=0.00;FS=2.578;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.958;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.724;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:818,0,1392 chrXIII 284443 . T C 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2748,276,0 chrXIII 284449 . T C 663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.508;DP=105;Dels=0.00;FS=7.940;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.563;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,41:105:99:693,0,1513 chrXIII 284491 . C T 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3369,325,0 chrXIII 284509 . G T 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;DP=126;Dels=0.00;FS=3.570;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.581;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,50:126:99:992,0,1698 chrXIII 284673 . C A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;DP=135;Dels=0.00;FS=3.101;HaplotypeScore=6.4317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1275,0,1801 chrXIII 285831 . T C 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3572,375,0 chrXIII 285841 . C T 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3926,397,0 chrXIII 286123 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.348;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.379;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1460,0,1345 chrXIII 286312 . C G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;DP=124;Dels=0.00;FS=8.284;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=9.83;ReadPosRankSum=-2.134;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1249,0,1291 chrXIII 286577 . T C 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.357;DP=146;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=11.9174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.011;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1501,0,1545 chrXIII 286781 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.577;DP=161;Dels=0.00;FS=2.768;HaplotypeScore=3.2948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.702;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1533,0,1754 chrXIII 286816 . A G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.453;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1116,0,1468 chrXIII 286912 . C T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.149;DP=115;Dels=0.00;FS=2.702;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:115:99:1025,0,1379 chrXIII 287411 . G A 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3030,298,0 chrXIII 287490 . A G 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3456,351,0 chrXIII 288100 . C T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.869;DP=102;Dels=0.00;FS=6.321;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.573;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:1049,0,1114 chrXIII 288415 . T C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.491;DP=135;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1518,0,1358 chrXIII 288433 . T A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3540,343,0 chrXIII 288558 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.593;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:110:99:1134,0,1222 chrXIII 289929 . T C 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.314;DP=116;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=3.042;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:1498,0,995 chrXIII 290342 . T G 330.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.996;DP=79;Dels=0.00;FS=66.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=4.18;ReadPosRankSum=-2.894;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:360,0,1294 chrXIII 290445 . A G 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2627,261,0 chrXIII 290717 . G A 4135.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.01;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.976e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4135,409,0 chrXIII 290765 . G A 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.58;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3564,343,0 chrXIII 290769 . T C 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3299,327,0 chrXIII 290779 . A G 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2871,288,0 chrXIII 290867 . G T 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.46;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3789,382,0 chrXIII 290874 . T C 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.66;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3519,366,0 chrXIII 291003 . A G 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3956,414,0 chrXIII 291392 . A G 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=17.8460;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.80;SB=-2.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3745,378,0 chrXIII 291580 . G A 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3664,367,0 chrXIII 291877 . T C 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3190,339,0 chrXIII 291990 . T C 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3159,342,0 chrXIII 292060 . C T 4008.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.987e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4008,379,0 chrXIII 292403 . T C 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.339;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.009;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:837,0,1029 chrXIII 292678 . A G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.286;DP=143;Dels=0.00;FS=8.934;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1235,0,1838 chrXIII 292852 . A T 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3809,376,0 chrXIII 292872 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.102;DP=136;Dels=0.00;FS=6.386;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.685;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1507,0,1343 chrXIII 292953 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.602;DP=137;Dels=0.00;FS=2.140;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.860;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1376,0,1586 chrXIII 293346 . A G 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3648,378,0 chrXIII 293407 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.346;DP=126;Dels=0.00;FS=2.274;HaplotypeScore=1.9755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1303,0,1314 chrXIII 293539 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.031;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.836;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1360,0,1260 chrXIII 293618 . A G 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.906;DP=166;Dels=0.00;FS=3.191;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.477;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,74:166:99:1549,0,2024 chrXIII 293931 . G A 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=28.39;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3293,325,0 chrXIII 294133 . A G 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=141;Dels=0.00;FS=3.468;HaplotypeScore=3.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=26.09;ReadPosRankSum=1.707;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:141:99:3679,375,0 chrXIII 294166 . T C 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3624,367,0 chrXIII 294548 . T C 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.396;DP=133;Dels=0.00;FS=5.416;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.378;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1495,0,1348 chrXIII 295343 . C T 2097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.257;DP=171;Dels=0.00;FS=2.094;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.644;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.849;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,94:171:99:2127,0,1554 chrXIII 295428 . C T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.173;DP=119;Dels=0.00;FS=13.871;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.882;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.291;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1126,0,1404 chrXIII 295500 . T A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;DP=113;Dels=0.00;FS=5.791;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.375;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:113:99:1154,0,1344 chrXIII 295950 . G A 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.803;DP=105;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=2.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.535;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1042,0,1104 chrXIII 296751 . C A 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.423;DP=123;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.114;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1562,0,1205 chrXIII 296780 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.155;DP=125;Dels=0.00;FS=5.589;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.600;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1332,0,1345 chrXIII 296838 . T C 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.943;DP=104;Dels=0.00;FS=3.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:970,0,1222 chrXIII 296848 . C G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.228;DP=122;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.260;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1254,0,1354 chrXIII 297132 . C T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.493;DP=119;Dels=0.00;FS=4.724;HaplotypeScore=3.8177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.514;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1372,0,1223 chrXIII 297139 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.628;DP=117;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=3.8177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.205;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1278,0,1222 chrXIII 297405 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.579;DP=100;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.285;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1202,0,1050 chrXIII 297599 . A G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.014;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.663;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1068,0,1389 chrXIII 297626 . A G 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.494;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.245;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1480,0,1241 chrXIII 297840 . T A 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.107;DP=113;Dels=0.00;FS=5.664;HaplotypeScore=5.9517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=9.33;ReadPosRankSum=-2.302;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1084,0,1316 chrXIII 298131 . T A 4069.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.68;SB=-2.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4069,406,0 chrXIII 298188 . C T 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;DP=117;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.247;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:117:99:968,0,1665 chrXIII 298344 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.446;DP=122;Dels=0.00;FS=7.174;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1381,0,1124 chrXIII 298460 . G C 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.278;DP=132;Dels=0.00;FS=6.495;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.584;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1573,0,1258 chrXIII 298658 . A G 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.724;DP=123;Dels=0.00;FS=3.336;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.749;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,74:123:99:1525,0,963 chrXIII 298699 . T G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.164;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=8.88;ReadPosRankSum=-3.007;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1255,0,1572 chrXIII 298799 . A G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.160;DP=122;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=0.429;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1418,0,1218 chrXIII 298845 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.455;DP=150;Dels=0.00;FS=4.297;HaplotypeScore=2.6779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1337,0,1820 chrXIII 299038 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.293;DP=113;Dels=0.00;FS=4.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.043;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1231,0,1221 chrXIII 299044 . G T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.031;DP=116;Dels=0.00;FS=2.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.848;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1397,0,1188 chrXIII 299124 . T C 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;DP=121;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.441;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:121:99:1533,0,1013 chrXIII 299137 . A G 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.900;DP=122;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:959,0,1605 chrXIII 299304 . A G 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.469;DP=166;Dels=0.00;FS=9.528;HaplotypeScore=4.1087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.941;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,82:166:99:1615,0,1888 chrXIII 299524 . G A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.638;DP=124;Dels=0.00;FS=2.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.142;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1526,0,1161 chrXIII 299843 . C T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.987;DP=110;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.177;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.143;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:110:99:1317,0,983 chrXIII 300324 . G C 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;DP=99;Dels=0.00;FS=1.913;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.812;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:916,0,1159 chrXIII 300558 . G A 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.147;DP=138;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=2.5657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1612,0,1266 chrXIII 301985 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.533;DP=140;Dels=0.00;FS=5.068;HaplotypeScore=2.6297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.422;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:1370,0,1517 chrXIII 302126 . A G 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.197;DP=141;Dels=0.00;FS=5.034;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1395,0,1618 chrXIII 302962 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.285;DP=127;Dels=0.00;FS=4.346;HaplotypeScore=2.8949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.587;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:1037,0,1488 chrXIII 303266 . A G 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3893,399,0 chrXIII 303343 . C T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.341;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.003;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1041,0,1274 chrXIII 303419 . T A 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.198;DP=134;Dels=0.00;FS=7.866;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=2.746;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.214;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1193,0,1577 chrXIII 303491 . T C 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.440;DP=124;Dels=0.00;FS=5.563;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.187;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:1056,0,1577 chrXIII 303638 . A T 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;DP=171;Dels=0.00;FS=1.216;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.369;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,82:171:99:1736,0,1954 chrXIII 303930 . C G 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;DP=151;Dels=0.00;FS=6.068;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.039;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.383;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1402,0,1757 chrXIII 304046 . T G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.181;DP=138;Dels=0.00;FS=3.077;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1225,0,1771 chrXIII 304117 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.794;DP=138;Dels=0.00;FS=3.070;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.465;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1155,0,1726 chrXIII 304118 . G A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.775;DP=136;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1126,0,1661 chrXIII 304595 . T C 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=1;QD=25.79;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3920,414,0 chrXIII 304685 . T A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;DP=134;Dels=0.00;FS=3.208;HaplotypeScore=4.7560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=1;MQRankSum=1.322;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.066;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1428,0,1415 chrXIII 304742 . G A 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.293;DP=153;Dels=0.00;FS=6.769;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.792;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.736;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,80:153:99:1783,0,1412 chrXIII 305303 . A G 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.585;DP=129;Dels=0.00;FS=5.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.652;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1534,0,1250 chrXIII 305614 . G T 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.028;DP=149;Dels=0.00;FS=1.309;HaplotypeScore=7.6905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.231;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,61:149:99:1154,0,1737 chrXIII 305615 . T A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;DP=147;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=7.6905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.636;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,63:147:99:1209,0,1729 chrXIII 305799 . C T 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.267;DP=143;Dels=0.00;FS=3.029;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.489;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:143:99:1550,0,1522 chrXIII 305906 . G A 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.914;DP=131;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.853;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1280,0,1382 chrXIII 306044 . G A 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.821;DP=156;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1749,0,1688 chrXIII 306722 . C G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;DP=110;Dels=0.00;FS=2.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.974;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1264,0,893 chrXIII 306769 . C T 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.743;DP=124;Dels=0.00;FS=2.452;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=13.31;ReadPosRankSum=-1.897;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1680,0,957 chrXIII 306904 . G A 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.301;DP=153;Dels=0.00;FS=2.039;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.148;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,70:153:99:1483,0,1821 chrXIII 307008 . C T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;DP=122;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1385,0,1191 chrXIII 307069 . T G 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.937;DP=131;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=1;MQRankSum=0.321;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,78:131:99:1726,0,1105 chrXIII 307219 . G A 3954.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=151;Dels=0.00;FS=3.632;HaplotypeScore=4.9014;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=26.19;ReadPosRankSum=0.739;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:151:99:3954,385,0 chrXIII 307416 . T C 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3493,369,0 chrXIII 307426 . A G 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3636,387,0 chrXIII 307541 . A G 4312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.29;SB=-2.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4312,468,0 chrXIII 307593 . C T 4428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3901;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.33;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4428,445,0 chrXIII 307654 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.720;DP=112;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=2.6520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.263;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1250,0,1175 chrXIII 307796 . G A 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6798;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3080,307,0 chrXIII 308296 . T A 2530 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=28.43;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2563,255,0 chrXIII 308551 . C T 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3567,352,0 chrXIII 309279 . C G 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;DP=172;Dels=0.00;FS=4.606;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.270;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,73:172:99:1453,0,2167 chrXIII 309285 . C T 4331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.55;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:169:99:4331,424,0 chrXIII 309296 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.390;DP=164;Dels=0.00;FS=3.624;HaplotypeScore=4.7069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.719;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:164:99:1451,0,1946 chrXIII 309305 . T A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.316;DP=156;Dels=0.00;FS=1.990;HaplotypeScore=4.7069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1695,0,1675 chrXIII 309469 . T A 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.981;DP=125;Dels=0.00;FS=2.312;HaplotypeScore=4.3748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1550,0,1121 chrXIII 309473 . G A 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.488;DP=121;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=4.3748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=12.91;ReadPosRankSum=-2.596;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1592,0,1029 chrXIII 309524 . C A 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.648;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=13.06;ReadPosRankSum=1.603;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,86:144:99:1910,0,1103 chrXIII 309891 . C T 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.682;DP=159;Dels=0.00;FS=23.669;HaplotypeScore=8.3150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1705,0,1577 chrXIII 309981 . G A 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.198;DP=145;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=12.00;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,84:145:99:1770,0,1237 chrXIII 310028 . T A 1741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.805;DP=131;Dels=0.00;FS=2.295;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.515;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,79:131:99:1771,0,1139 chrXIII 310152 . T A 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;DP=118;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1088,0,1262 chrXIII 310154 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.354;DP=120;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1093,0,1211 chrXIII 311035 . G A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.920;DP=112;Dels=0.00;FS=5.808;HaplotypeScore=2.7468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1244,0,1227 chrXIII 312253 . T G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.316;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1469,0,1456 chrXIII 312983 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.401;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.837;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:1014,0,1600 chrXIII 312998 . T C 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.558;DP=118;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.482;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,46:118:99:867,0,1703 chrXIII 313051 . C T 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.462;DP=159;Dels=0.00;FS=8.272;HaplotypeScore=2.8033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1559,0,1833 chrXIII 313064 . C T 4213.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.83;SB=-2.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4213,403,0 chrXIII 313311 . T C 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.568;DP=165;Dels=0.00;FS=1.211;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.300;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,74:165:99:1600,0,2053 chrXIII 313329 . G A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.974;DP=164;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.651;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,73:164:99:1606,0,1944 chrXIII 313379 . C T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.982;DP=113;Dels=0.00;FS=2.545;HaplotypeScore=3.6310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,68:113:99:1649,0,919 chrXIII 314078 . A G 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.188;DP=139;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=4.9013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.231;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1579,0,1402 chrXIII 315093 . G A 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.383;DP=134;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=6.1515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=1.205;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.966;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1532,0,1344 chrXIII 315372 . T A 2476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.79;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2509,261,0 chrXIII 315598 . A G 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.458;DP=154;Dels=0.00;FS=2.360;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.261;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1483,0,1886 chrXIII 315605 . G A 1847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.781;DP=162;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=4.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1877,0,1607 chrXIII 315961 . C T 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.143;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:120:99:1144,0,1413 chrXIII 316074 . A G 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.703;DP=142;Dels=0.00;FS=6.461;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.654;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1630,0,1398 chrXIII 316408 . T G 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3386,357,0 chrXIII 316466 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.291;DP=143;Dels=0.00;FS=8.754;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=10.22;ReadPosRankSum=2.259;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1492,0,1580 chrXIII 316605 . A G 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2960,309,0 chrXIII 316612 . G A 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=23.02;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2796,277,0 chrXIII 317105 . A T 3972.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3972,391,0 chrXIII 317162 . A G 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=24.35;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3774,381,0 chrXIII 317231 . A G 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.776;DP=130;Dels=0.00;FS=3.370;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.275;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1582,0,1217 chrXIII 317397 . A G 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.283;DP=141;Dels=0.00;FS=2.482;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.545;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:1120,0,1872 chrXIII 317457 . T C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.279;DP=130;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1343,0,1454 chrXIII 318108 . A C 4365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=166;Dels=0.00;FS=3.063;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=26.30;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-2.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:4365,451,0 chrXIII 318119 . C G 3938.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.91;SB=-2.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3938,405,0 chrXIII 318647 . C T 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3068,301,0 chrXIII 318728 . A G 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.630;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.363;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1658,0,1556 chrXIII 318850 . G T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.911;DP=106;Dels=0.00;FS=4.833;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:1049,0,1276 chrXIII 319018 . G A 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3298,328,0 chrXIII 319036 . T C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.243;DP=130;Dels=0.00;FS=9.496;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1509,0,1179 chrXIII 319040 . T C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3389,336,0 chrXIII 319247 . T C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.029;DP=94;Dels=0.00;FS=0.825;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:923,0,1144 chrXIII 319443 . T C 3871.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;DP=152;Dels=0.00;FS=4.337;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3871,354,0 chrXIII 319703 . A G 2668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.90;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2701,264,0 chrXIII 319767 . T C 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;DP=116;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1458,0,1098 chrXIII 319884 . A G 2767 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2800,291,0 chrXIII 319962 . A G 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3225;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.102;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3280,336,0 chrXIII 319980 . A T 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.403;DP=137;Dels=0.00;FS=3.305;HaplotypeScore=6.6636;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=23.33;ReadPosRankSum=1.631;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3229,310,0 chrXIII 319989 . C T 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.347;DP=117;Dels=0.00;FS=3.606;HaplotypeScore=8.4709;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=22.36;ReadPosRankSum=0.933;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2649,264,0 chrXIII 320147 . C G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;DP=132;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=2.5525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.981;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1335,0,1515 chrXIII 320166 . A G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.787;DP=130;Dels=0.00;FS=4.434;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.183;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1486,0,1283 chrXIII 320282 . T C 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.825;DP=114;Dels=0.00;FS=7.263;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.885;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1409,0,1172 chrXIII 320868 . A C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.149;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1004,0,1263 chrXIII 320923 . T A 599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;DP=85;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=4.9229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=7.05;ReadPosRankSum=2.360;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:629,0,1233 chrXIII 320924 . A G 578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.680;DP=85;Dels=0.00;FS=3.049;HaplotypeScore=3.9282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=6.80;ReadPosRankSum=2.588;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,31:85:99:608,0,1231 chrXIII 321660 . G A 1821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.90;MQ0=0;QD=24.28;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1854,177,0 chrXIII 322257 . C A 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.277;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=2.6287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.148;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1483,0,1236 chrXIII 323439 . T C 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.841;DP=85;Dels=0.00;FS=1.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.650;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:777,0,1044 chrXIII 323942 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.516;DP=95;Dels=0.00;FS=3.909;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.730;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1192,0,818 chrXIII 324012 . A G 601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.527;DP=84;Dels=0.00;FS=17.065;HaplotypeScore=5.7948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.817;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.856;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:631,0,1021 chrXIII 325675 . A G 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.416;DP=115;Dels=0.00;FS=7.469;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.668;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:115:99:1007,0,1324 chrXIII 325729 . T G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.197;DP=133;Dels=0.00;FS=5.279;HaplotypeScore=11.3380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1286,0,1532 chrXIII 325905 . T A 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3823,367,0 chrXIII 325924 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.411;DP=143;Dels=0.00;FS=2.127;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.087;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1253,0,1710 chrXIII 326343 . A G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.653;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1086,0,1538 chrXIII 327911 . A G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.159;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1207,0,1316 chrXIII 327938 . A G 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.331;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=27.14;ReadPosRankSum=1.256;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:132:99:3582,364,0 chrXIII 328866 . T C 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2594,282,0 chrXIII 329249 . T C 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.429;DP=119;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.329;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1066,0,1531 chrXIII 329611 . C A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.429;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1320,0,1767 chrXIII 330811 . G T 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;DP=146;Dels=0.00;FS=1.347;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.701;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1400,0,1728 chrXIII 330956 . C G 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3053,318,0 chrXIII 330962 . T C 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3297,336,0 chrXIII 331508 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.424;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.110;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1259,0,1139 chrXIII 331677 . G A 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;DP=107;Dels=0.00;FS=2.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:865,0,1216 chrXIII 331678 . A G 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.237;DP=108;Dels=0.00;FS=2.533;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:866,0,1264 chrXIII 331689 . G A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.789;DP=109;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.598;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1291,0,1147 chrXIII 333053 . T G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.056;DP=125;Dels=0.00;FS=5.466;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.106;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1274,0,1432 chrXIII 333449 . G A 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3910,382,0 chrXIII 333646 . C T 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.618;DP=132;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=8.81;ReadPosRankSum=2.948;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1193,0,1559 chrXIII 333939 . C T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.202;DP=143;Dels=0.00;FS=2.133;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,61:143:99:1221,0,1848 chrXIII 334583 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.177;DP=148;Dels=0.00;FS=2.070;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1338,0,1677 chrXIII 334830 . T G 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3496,354,0 chrXIII 335290 . G C 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;DP=154;Dels=0.00;FS=1.270;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:154:99:1486,0,1741 chrXIII 335404 . T A 4096.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:4096,406,0 chrXIII 335870 . T A 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;DP=135;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.976;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1557,0,1156 chrXIII 336366 . A G 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.857;DP=136;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.468;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1513,0,1415 chrXIII 336381 . A G 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3653,364,0 chrXIII 336793 . C T 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.420;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.070;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:116:99:1401,0,999 chrXIII 336802 . C A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.170;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.865;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.395;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:1529,0,885 chrXIII 336845 . C T 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.308;DP=143;Dels=0.00;FS=3.989;HaplotypeScore=4.1555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.173;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1887,0,1134 chrXIII 337100 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.695;DP=127;Dels=0.00;FS=2.308;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.123;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1460,0,1395 chrXIII 337377 . G A 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.527;DP=83;Dels=0.00;FS=0.860;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.178;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,38:83:99:832,0,970 chrXIII 337875 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.399;DP=140;Dels=0.00;FS=4.009;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.207;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1382,0,1665 chrXIII 338041 . G C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.779;DP=116;Dels=0.00;FS=5.845;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.202;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:988,0,1279 chrXIII 339902 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.994;DP=150;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:150:99:1357,0,1918 chrXIII 341020 . G A 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2947,297,0 chrXIII 341910 . G A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.581;DP=105;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.813;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1033,0,1253 chrXIII 342874 . A T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.724;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.192;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1254,0,1476 chrXIII 343341 . C A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;DP=142;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=3.5372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1459,0,1513 chrXIII 343507 . A G 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.299;DP=144;Dels=0.00;FS=4.018;HaplotypeScore=3.8549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1496,0,1539 chrXIII 343536 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.113;DP=127;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=0.624;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1220,0,1410 chrXIII 344475 . G A 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.336;DP=131;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.100;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1711,0,1115 chrXIII 344869 . G A 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.799;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.029;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1113,0,1213 chrXIII 346141 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.582;DP=125;Dels=0.00;FS=4.317;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.195;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1295,0,1311 chrXIII 346162 . C T 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3717,364,0 chrXIII 347164 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.066;DP=117;Dels=0.00;FS=7.581;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1369,0,1123 chrXIII 347381 . A G 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3691,381,0 chrXIII 347780 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.891;DP=113;Dels=0.00;FS=3.441;HaplotypeScore=3.1583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=10.40;ReadPosRankSum=2.059;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1205,0,1251 chrXIII 348249 . G A 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.498;DP=130;Dels=0.00;FS=3.788;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1510,0,1259 chrXIII 348457 . A G 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.969;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=10.50;ReadPosRankSum=2.013;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1447,0,1534 chrXIII 349796 . G A 2266 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.66;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2299,234,0 chrXIII 350056 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.003;DP=125;Dels=0.00;FS=3.307;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.809;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1324,0,1276 chrXIII 350057 . A G 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.322;DP=126;Dels=0.00;FS=3.287;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.890;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1360,0,1295 chrXIII 350139 . C G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;DP=138;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=2.7888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.157;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1271,0,1628 chrXIII 350144 . T C 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3531,366,0 chrXIII 350236 . A G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.926;DP=124;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=2.6683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.324;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1350,0,1196 chrXIII 350249 . C T 3620.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3620,369,0 chrXIII 350290 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.159;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1373,0,1132 chrXIII 350297 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.047;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.264;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1231,0,1350 chrXIII 350323 . G A 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3581,352,0 chrXIII 350608 . C T 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.772;DP=114;Dels=0.00;FS=3.544;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1098,0,1284 chrXIII 351168 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.813;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.466;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1220,0,1239 chrXIII 351723 . C A 1942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.306;DP=155;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,87:155:99:1972,0,1391 chrXIII 353259 . G A 1917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.262;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=1.268;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,86:139:99:1947,0,993 chrXIII 353545 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.674;DP=131;Dels=0.00;FS=4.445;HaplotypeScore=3.2437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.413;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1365,0,1288 chrXIII 353716 . T A 661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;DP=87;Dels=0.00;FS=5.474;HaplotypeScore=13.4239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=7.60;ReadPosRankSum=-2.283;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,48:87:99:691,0,734 chrXIII 353859 . C A 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.582;DP=133;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.493;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1348,0,1442 chrXIII 354389 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.923;DP=130;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.067;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1273,0,1485 chrXIII 354763 . G A 1216.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.665;DP=145;Dels=0.00;FS=3.046;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=6;MQRankSum=-1.225;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.737;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1246,0,1593 chrXIII 354953 . T C 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.284;DP=91;Dels=0.00;FS=19.577;HaplotypeScore=2.4485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:830,0,971 chrXIII 355100 . C T 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.68;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:3016,301,0 chrXIII 355589 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.272;DP=129;Dels=0.00;FS=9.469;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.323;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1206,0,1553 chrXIII 356409 . G C 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=25.60;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2772,294,0 chrXIII 357016 . G T 71.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;DP=23;Dels=0.00;FS=21.847;HaplotypeScore=38.6603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.66;MQ0=5;MQRankSum=-0.070;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.773;SB=-3.019e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:30:101,0,30 chrXIII 357021 . G T 98.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;DP=23;Dels=0.00;FS=21.847;HaplotypeScore=14.4976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.66;MQ0=5;MQRankSum=-0.070;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.211;SB=-3.019e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:30:128,0,30 chrXIII 357053 . A T 69.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;DP=36;Dels=0.00;FS=16.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.55;MQ0=19;MQRankSum=0.819;QD=1.92;ReadPosRankSum=-1.953;SB=-2.974e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:36:52:99,0,52 chrXIII 361550 . G A 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.06;MQ0=1;QD=8.50;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:83,9,0 chrXIII 361765 . G T 50.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.34;MQ0=16;QD=2.22;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:9:83,9,0 chrXIII 362868 . T C 125.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.708;DP=40;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.11;MQ0=22;MQRankSum=-2.496;QD=3.13;ReadPosRankSum=-3.027;SB=-6.175e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:84:155,0,84 chrXIII 362870 . G A 131.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;DP=34;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.81;MQ0=16;MQRankSum=-3.027;QD=3.85;ReadPosRankSum=-3.027;SB=-5.974e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:83:161,0,83 chrXIII 362871 . A G 131.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;DP=34;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.81;MQ0=16;MQRankSum=-3.027;QD=3.85;ReadPosRankSum=-3.027;SB=-6.175e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:85:161,0,85 chrXIII 362875 . T C 125.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;DP=32;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.48;MQ0=14;MQRankSum=-1.646;QD=3.91;ReadPosRankSum=-3.027;SB=-6.246e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:85:155,0,85 chrXIII 362876 . A G 119.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;DP=32;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.48;MQ0=14;MQRankSum=-1.858;QD=3.72;ReadPosRankSum=-3.027;SB=-5.833e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:83:149,0,83 chrXIII 362880 . C A 142.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.693;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.28;MQ0=12;MQRankSum=-2.784;QD=3.94;ReadPosRankSum=-2.784;SB=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:36:53:172,0,53 chrXIII 362883 . T C 211.54 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=33;Dels=0.00;FS=13.802;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.36;MQ0=9;MQRankSum=-1.156;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-2.550e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,24:33:4:242,4,0 chrXIII 362889 . G A 133.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;DP=33;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.36;MQ0=9;MQRankSum=-1.743;QD=4.03;ReadPosRankSum=-3.137;SB=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:83:163,0,83 chrXIII 362890 . A G 131.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;DP=33;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.36;MQ0=9;MQRankSum=-2.672;QD=3.97;ReadPosRankSum=-3.137;SB=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:86:161,0,86 chrXIII 362895 . C T 136.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.060;DP=29;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.05;MQ0=5;MQRankSum=-1.898;QD=4.69;ReadPosRankSum=-3.137;SB=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:78:166,0,78 chrXIII 362902 . G T 140.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.672;DP=27;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.03;MQ0=3;MQRankSum=-1.665;QD=5.19;ReadPosRankSum=-3.137;SB=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:82:170,0,82 chrXIII 362925 . T C 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.55;MQ0=0;MQRankSum=2.091;QD=0.41;ReadPosRankSum=-2.135;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,3:47:49:49,0,198 chrXIII 362992 . G A 2105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.88;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2138,204,0 chrXIII 363595 . T C 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3856,402,0 chrXIII 363801 . T C 4186.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4186,427,0 chrXIII 363840 . C T 4464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.90;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4464,451,0 chrXIII 363895 . A G 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2747,294,0 chrXIII 364102 . G A 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3026,304,0 chrXIII 364252 . G T 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3534,349,0 chrXIII 364264 . C A 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.57;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3281,325,0 chrXIII 364294 . C G 2171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.16;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2204,237,0 chrXIII 364324 . T C 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2951,312,0 chrXIII 364384 . A G 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=105;Dels=0.00;FS=3.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:868,0,1259 chrXIII 364548 . A G 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1348;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3375,348,0 chrXIII 364627 . A G 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.21;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3335,348,0 chrXIII 364636 . G T 3775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.76;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.980e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3775,379,0 chrXIII 364639 . G A 4205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.18;MQ0=0;QD=26.12;SB=-2.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4205,424,0 chrXIII 364671 . T C 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.870;DP=153;Dels=0.00;FS=3.850;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:153:99:1648,0,1608 chrXIII 365054 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.724;DP=138;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.005;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1495,0,1342 chrXIII 365286 . T G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.328;DP=129;Dels=0.00;FS=9.418;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.607;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1219,0,1396 chrXIII 365359 . C T 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3321,331,0 chrXIII 365365 . T A 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3367,345,0 chrXIII 365455 . G A 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.759;DP=106;Dels=0.00;FS=7.753;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.598;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,43:106:99:925,0,1359 chrXIII 365504 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.983;DP=112;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=3.5428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1221,0,1124 chrXIII 365505 . G C 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.371;DP=112;Dels=0.00;FS=3.590;HaplotypeScore=3.5428;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=24.39;ReadPosRankSum=0.742;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2765,261,0 chrXIII 365551 . C T 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.554;QD=25.68;ReadPosRankSum=1.495;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3038,306,0 chrXIII 365580 . G A 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3395,340,0 chrXIII 365788 . T A 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3110,312,0 chrXIII 365953 . T C 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.944;DP=126;Dels=0.00;FS=12.641;HaplotypeScore=4.9741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=20.24;ReadPosRankSum=1.186;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,122:126:99:2583,273,0 chrXIII 366043 . T C 4177.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4177,415,0 chrXIII 366401 . G T 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=1;QD=27.09;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3765,361,0 chrXIII 366559 . T C 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3478,366,0 chrXIII 366629 . C G 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3316,339,0 chrXIII 366707 . A G 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3352,342,0 chrXIII 366806 . T C 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3061,315,0 chrXIII 366938 . T C 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3224,324,0 chrXIII 367008 . C T 3936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.59;SB=-2.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3936,376,0 chrXIII 367636 . T C 3898.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3166;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3898,408,0 chrXIII 367845 . C A 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=28.16;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3159,307,0 chrXIII 367942 . A T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.93;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3285,316,0 chrXIII 368619 . G A 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3071,301,0 chrXIII 369062 . A C 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3443,339,0 chrXIII 369419 . T C 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3581,387,0 chrXIII 369465 . C T 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3488,349,0 chrXIII 369610 . A G 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3430,339,0 chrXIII 370022 . C T 1907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.977;DP=132;Dels=0.00;FS=5.978;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,81:132:99:1937,0,1054 chrXIII 371117 . A G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.675;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3177,318,0 chrXIII 371207 . G A 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.528;DP=140;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1732,0,1313 chrXIII 371525 . G A 3840.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.26;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3840,382,0 chrXIII 371527 . A G 3678.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.08;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3678,373,0 chrXIII 371533 . G A 3625.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.35;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3625,370,0 chrXIII 371651 . A G 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.51;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3014,315,0 chrXIII 371667 . C A 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2891,283,0 chrXIII 371689 . C T 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2946,297,0 chrXIII 371755 . A G 2042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.95;MQ0=0;QD=25.85;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:79:99:2075,219,0 chrXIII 371760 . A T 2208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.62;MQ0=0;QD=27.95;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2241,228,0 chrXIII 371821 . A G 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.41;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3241,322,0 chrXIII 371851 . A T 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.37;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3072,310,0 chrXIII 371856 . A C 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.87;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3213,342,0 chrXIII 371874 . A T 2018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.78;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=23.74;ReadPosRankSum=-1.528;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2051,207,0 chrXIII 371909 . C G 1907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.765;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.78;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.725;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:1940,210,0 chrXIII 371910 . T C 1930 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.78;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.876;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:1963,210,0 chrXIII 371920 . A G 1991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.68;MQ0=0;QD=22.37;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2024,210,0 chrXIII 371940 . C T 1689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.75;MQ0=0;QD=22.22;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1722,183,0 chrXIII 371941 . T A 1724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.75;MQ0=0;QD=22.68;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1757,183,0 chrXIII 371956 . G A 1634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.73;MQ0=0;QD=22.69;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1667,174,0 chrXIII 371963 . G T 1677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.45;MQ0=0;QD=21.78;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1710,174,0 chrXIII 371979 . T C 1705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.65;MQ0=0;QD=23.68;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1738,189,0 chrXIII 371989 . C G 1724 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.41;MQ0=0;QD=23.30;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1757,192,0 chrXIII 371993 . C T 2096 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.37;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2129,225,0 chrXIII 371997 . A G 1995 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.39;MQ0=0;QD=22.42;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2028,219,0 chrXIII 372077 . T C 2521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.95;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=24.72;ReadPosRankSum=1.325;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2554,261,0 chrXIII 372089 . C T 2454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.695;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.42;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=26.39;ReadPosRankSum=1.248;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:2487,224,0 chrXIII 372090 . T G 2510 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.02;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2543,255,0 chrXIII 372103 . G A 2598 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9240;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.65;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2631,258,0 chrXIII 372225 . T G 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.32;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2671,270,0 chrXIII 372297 . A G 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.39;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2854,300,0 chrXIII 372301 . C T 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.13;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3217,324,0 chrXIII 372322 . C T 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.72;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3231,322,0 chrXIII 372428 . C A 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.63;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3921,373,0 chrXIII 372531 . A G 2217 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=25.48;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2250,234,0 chrXIII 378680 . T A 1242 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.81;MQ0=0;QD=12.18;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:1275,126,0 chrXIII 378772 . C G 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.46;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3018,303,0 chrXIII 378811 . A G 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.56;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2724,282,0 chrXIII 378833 . C G 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.03;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:111:99:2803,294,0 chrXIII 378917 . A G 4332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.20;MQ0=0;QD=25.63;SB=-2.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4332,424,0 chrXIII 378957 . C G 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.75;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3861,385,0 chrXIII 379022 . T C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.649;DP=139;Dels=0.00;FS=2.246;HaplotypeScore=3.0845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1339,0,1678 chrXIII 379425 . A C 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.75;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2795,282,0 chrXIII 379439 . A G 2746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2779,288,0 chrXIII 379450 . C G 2187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=26.04;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2220,240,0 chrXIII 379507 . T A 4057.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4057,394,0 chrXIII 379602 . G C 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3361,345,0 chrXIII 379777 . A G 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3531,369,0 chrXIII 379795 . C T 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3130,315,0 chrXIII 379813 . G A 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3154,319,0 chrXIII 379976 . T A 2605 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=27.71;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2638,270,0 chrXIII 379984 . G A 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2796,280,0 chrXIII 380063 . T A 648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;DP=109;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:678,0,1243 chrXIII 380241 . A C 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5550;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2990,318,0 chrXIII 380333 . G A 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3559,355,0 chrXIII 380859 . A G 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.410;DP=173;Dels=0.00;FS=0.558;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=9.71;ReadPosRankSum=2.148;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,86:173:99:1709,0,1960 chrXIII 381204 . T C 4105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4105,435,0 chrXIII 381248 . T C 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3526,384,0 chrXIII 381609 . A G 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.81;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3036,306,0 chrXIII 381711 . A G 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3345,342,0 chrXIII 382194 . C T 4015.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=1;QD=26.07;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4015,388,0 chrXIII 382384 . A T 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3212,321,0 chrXIII 382792 . T C 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3150,318,0 chrXIII 382813 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.981;DP=126;Dels=0.00;FS=4.396;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.257;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1160,0,1581 chrXIII 383224 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.013;DP=124;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1217,0,1421 chrXIII 383408 . A G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.586;DP=164;Dels=0.00;FS=1.990;HaplotypeScore=3.9529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.886;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,72:164:99:1437,0,2113 chrXIII 384682 . C G 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2898,312,0 chrXIII 385680 . A T 1927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.986;DP=157;Dels=0.00;FS=5.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=12.27;ReadPosRankSum=3.331;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,85:157:99:1957,0,1554 chrXIII 385805 . T A 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3861,393,0 chrXIII 387028 . G A 5012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.09;MQ0=0;QD=28.16;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:5012,505,0 chrXIII 387084 . C G 2614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.92;MQ0=0;QD=26.95;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2647,282,0 chrXIII 387174 . A G 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3565,381,0 chrXIII 387573 . T C 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3782,387,0 chrXIII 387621 . C T 4062.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4932;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.62;SB=-2.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4062,391,0 chrXIII 387876 . G A 3218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3251,322,0 chrXIII 387879 . A C 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3099,324,0 chrXIII 388149 . A C 4160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4160,432,0 chrXIII 388450 . A G 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3809,393,0 chrXIII 388831 . G A 4334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=25.95;SB=-2.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4334,430,0 chrXIII 389020 . A G 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3786,387,0 chrXIII 389031 . C T 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3695,370,0 chrXIII 389395 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.599;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.743;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1384,0,1443 chrXIII 389517 . C T 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3225,321,0 chrXIII 389982 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.761;DP=160;Dels=0.00;FS=2.042;HaplotypeScore=3.4826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.026;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,68:160:99:1330,0,2114 chrXIII 390009 . G A 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=28.38;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3377,331,0 chrXIII 390237 . T C 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3339,337,0 chrXIII 390310 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.585;DP=119;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.297;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1139,0,1466 chrXIII 390351 . T C 3775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3775,384,0 chrXIII 390358 . C A 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3818,373,0 chrXIII 390486 . T G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=22.65;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3181,315,0 chrXIII 390664 . C G 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2970,300,0 chrXIII 391021 . A T 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2999,303,0 chrXIII 391230 . G C 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.509;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:926,0,1373 chrXIII 391266 . T A 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:1037,0,1479 chrXIII 391381 . T C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.272;DP=147;Dels=0.01;FS=2.904;HaplotypeScore=18.4887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.044;QD=9.51;ReadPosRankSum=2.893;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1428,0,1737 chrXIII 391443 . T C 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.67;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2985,306,0 chrXIII 391504 . C T 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3213,310,0 chrXIII 391574 . G A 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2880,291,0 chrXIII 391763 . G A 2905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2938,297,0 chrXIII 391847 . A G 2131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2164,222,0 chrXIII 392000 . A G 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;DP=151;Dels=0.00;FS=2.031;HaplotypeScore=5.9585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.494;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1573,0,1803 chrXIII 392147 . G A 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;DP=105;Dels=0.00;FS=2.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,38:104:99:779,0,1438 chrXIII 392206 . T C 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.981;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.954;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1110,0,1109 chrXIII 392476 . T C 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3781,381,0 chrXIII 392572 . T C 1848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.464;DP=153;Dels=0.00;FS=10.187;HaplotypeScore=5.6206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.720;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,87:153:99:1878,0,1439 chrXIII 392802 . A G 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.875;DP=117;Dels=0.00;FS=10.111;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1377,0,1177 chrXIII 393315 . A G 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.531;DP=112;Dels=0.00;FS=7.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.808;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1340,0,1100 chrXIII 393573 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.856;DP=129;Dels=0.00;FS=2.244;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1513,0,1309 chrXIII 393579 . G C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;DP=118;Dels=0.00;FS=7.317;HaplotypeScore=5.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:118:99:1234,0,1213 chrXIII 393588 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.262;DP=112;Dels=0.00;FS=5.858;HaplotypeScore=5.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1220,0,1229 chrXIII 394309 . C T 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.062;DP=77;Dels=0.00;FS=3.060;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.464;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:815,0,805 chrXIII 394707 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.531;DP=112;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.677;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1317,0,1105 chrXIII 394731 . G C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;DP=117;Dels=0.00;FS=1.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1247,0,1284 chrXIII 394755 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.136;DP=117;Dels=0.00;FS=1.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.401;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1269,0,1378 chrXIII 394852 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.172;DP=95;Dels=0.00;FS=1.688;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1055,0,1002 chrXIII 394901 . G C 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2920,297,0 chrXIII 394921 . A T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;DP=104;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=10.32;ReadPosRankSum=-2.081;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1103,0,1127 chrXIII 395016 . T C 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.227;DP=103;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=0.583;QD=8.97;ReadPosRankSum=-2.224;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:954,0,1232 chrXIII 395714 . T C 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3499,369,0 chrXIII 395983 . C G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;DP=118;Dels=0.00;FS=2.391;HaplotypeScore=2.3984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.294;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1212,0,1337 chrXIII 396401 . C T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.103;DP=157;Dels=0.00;FS=2.904;HaplotypeScore=2.6162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.800;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,67:157:99:1391,0,2008 chrXIII 396483 . T C 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2887,300,0 chrXIII 396594 . C A 4151.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4151,397,0 chrXIII 396704 . C T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.162;DP=134;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1397,0,1457 chrXIII 396726 . C A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.155;DP=127;Dels=0.00;FS=3.212;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1487,0,1282 chrXIII 396782 . T C 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3543,357,0 chrXIII 396793 . A G 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3310,331,0 chrXIII 396798 . T C 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.783;DP=124;Dels=0.00;FS=9.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.878;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1297,0,1334 chrXIII 397296 . G T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.996;DP=121;Dels=0.00;FS=12.005;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.599;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1306,0,1193 chrXIII 397297 . G T 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.712;DP=119;Dels=0.00;FS=11.842;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.050;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1284,0,1292 chrXIII 398025 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.674;DP=111;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:111:99:1076,0,1289 chrXIII 398046 . T C 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.950;DP=112;Dels=0.00;FS=4.775;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.905;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.875;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1398,0,924 chrXIII 398086 . G A 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.111;DP=112;Dels=0.00;FS=11.505;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.914;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:994,0,1273 chrXIII 398240 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.263;DP=131;Dels=0.00;FS=5.360;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1346,0,1547 chrXIII 398301 . G A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.425;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.531;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1093,0,1556 chrXIII 398491 . A G 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.317;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=12.65;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1598,0,1080 chrXIII 398504 . A C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.072;DP=115;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.161;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1464,0,1050 chrXIII 398994 . C T 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2829,282,0 chrXIII 399408 . C T 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=28.38;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3434,334,0 chrXIII 399446 . C T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3163,313,0 chrXIII 399709 . A C 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3636,364,0 chrXIII 400907 . A G 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3749,366,0 chrXIII 401218 . A G 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.473;DP=155;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1491,0,1780 chrXIII 401333 . G C 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;DP=165;Dels=0.00;FS=9.221;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.009;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1785,0,1667 chrXIII 401933 . C G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.440;DP=106;Dels=0.00;FS=1.570;HaplotypeScore=3.9268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.863;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1251,0,1006 chrXIII 401983 . A C 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.501;DP=120;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=2.9544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.241;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.257;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1088,0,1348 chrXIII 402254 . G A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.028;DP=108;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.233;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1395,0,973 chrXIII 402422 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.114;DP=143;Dels=0.01;FS=6.118;HaplotypeScore=5.3839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1462,0,1522 chrXIII 402534 . G A 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.329;DP=151;Dels=0.00;FS=5.052;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.773;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1718,0,1555 chrXIII 402537 . A G 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.414;DP=150;Dels=0.00;FS=5.091;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.132;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1660,0,1515 chrXIII 402902 . G C 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;DP=127;Dels=0.00;FS=4.233;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1223,0,1413 chrXIII 403091 . C T 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.855;DP=156;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1614,0,1752 chrXIII 403250 . A G 770.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.718;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:800,0,1022 chrXIII 403256 . A G 2140 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2173,228,0 chrXIII 403258 . A G 772.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.520;DP=92;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=3.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.219;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:802,0,1164 chrXIII 403377 . A G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.425;DP=109;Dels=0.00;FS=7.489;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1055,0,1351 chrXIII 403758 . T C 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.831;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:919,0,1141 chrXIII 403773 . G A 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.93;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2658,264,0 chrXIII 403832 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.565;DP=102;Dels=0.00;FS=1.605;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.627;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1199,0,856 chrXIII 404012 . G A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.081;DP=134;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1472,0,1375 chrXIII 404319 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.104;DP=112;Dels=0.00;FS=4.551;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1140,0,1292 chrXIII 404476 . C T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.537;DP=129;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=4.6356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1425,0,1252 chrXIII 404577 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.020;DP=140;Dels=0.00;FS=5.288;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.260;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1585,0,1368 chrXIII 404584 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.828;DP=141;Dels=0.00;FS=9.079;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.754;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1386,0,1607 chrXIII 404983 . A G 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.224;DP=112;Dels=0.00;FS=4.582;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1082,0,1309 chrXIII 405158 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.477;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.117;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1243,0,1300 chrXIII 405166 . G C 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;DP=104;Dels=0.00;FS=3.585;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.084;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.314;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:932,0,1216 chrXIII 405245 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;DP=110;Dels=0.00;FS=5.879;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.518;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.787;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1242,0,1036 chrXIII 405299 . G A 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.263;DP=108;Dels=0.00;FS=7.554;HaplotypeScore=4.8081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=9.69;ReadPosRankSum=2.703;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1076,0,1253 chrXIII 405305 . A G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=111;Dels=0.01;FS=10.743;HaplotypeScore=6.8386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.744;QD=11.00;ReadPosRankSum=-2.631;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1251,0,1174 chrXIII 405350 . C T 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.725;DP=103;Dels=0.00;FS=3.661;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.667;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1308,0,932 chrXIII 405438 . T C 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.850;DP=169;Dels=0.00;FS=1.972;HaplotypeScore=4.9634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,77:169:99:1566,0,2065 chrXIII 405459 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.418;DP=152;Dels=0.00;FS=7.289;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.541;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,66:152:99:1268,0,1978 chrXIII 405638 . G A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;DP=144;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=5.7850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.94;MQ0=0;MQRankSum=2.140;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:144:99:1304,0,1551 chrXIII 405726 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.127;DP=137;Dels=0.00;FS=4.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1404,0,1453 chrXIII 406116 . C T 1986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.860;DP=176;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.091;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,89:176:99:2016,0,1793 chrXIII 406155 . G A 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.902;DP=144;Dels=0.00;FS=4.230;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.782;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:144:99:1580,0,1357 chrXIII 406222 . A T 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.544;DP=88;Dels=0.00;FS=0.848;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.798;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:786,0,1060 chrXIII 406240 . C T 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.164;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.898;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:878,0,1047 chrXIII 406355 . T C 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.637;DP=144;Dels=0.00;FS=3.958;HaplotypeScore=5.5824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=1;MQRankSum=-0.527;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.806;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1574,0,1577 chrXIII 406917 . G C 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3233,336,0 chrXIII 407275 . A G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.029;DP=133;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.209;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1108,0,1720 chrXIII 407419 . C T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.998;DP=144;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=5.3456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.421;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.674;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1315,0,1541 chrXIII 407557 . T C 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.460;DP=150;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.417;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.017;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:150:99:1383,0,1643 chrXIII 407891 . C T 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.729;DP=164;Dels=0.00;FS=3.580;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.250;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1682,0,1703 chrXIII 407898 . T C 1699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.903;DP=172;Dels=0.00;FS=2.636;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,86:172:99:1729,0,1941 chrXIII 407930 . T C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.501;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,85:175:99:1466,0,2010 chrXIII 408326 . A G 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3721,402,0 chrXIII 408412 . G A 4309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=22.68;SB=-2.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4309,418,0 chrXIII 408413 . G A 4203.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=23.09;SB=-2.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4203,406,0 chrXIII 408552 . C T 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.714;DP=139;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.583;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1511,0,1405 chrXIII 408564 . T C 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3432,366,0 chrXIII 408620 . C A 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.079;DP=119;Dels=0.00;FS=4.515;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1045,0,1095 chrXIII 409456 . C A 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.134;DP=139;Dels=0.00;FS=6.517;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=27.49;ReadPosRankSum=1.283;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3821,347,0 chrXIII 409643 . A G 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3485,345,0 chrXIII 409821 . G A 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.391;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1420,0,1440 chrXIII 409894 . T C 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.863;DP=105;Dels=0.00;FS=3.677;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.508;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:899,0,1344 chrXIII 410026 . T C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.131;DP=142;Dels=0.00;FS=15.545;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.407;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1361,0,1629 chrXIII 410118 . C T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.945;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.622;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,66:150:99:1421,0,1752 chrXIII 410451 . A G 1585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=22.32;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1618,168,0 chrXIII 410660 . C T 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4075,394,0 chrXIII 410904 . A G 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.425;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.497;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1214,0,1464 chrXIII 411113 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.365;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=2.469;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1305,0,1179 chrXIII 411278 . G C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;DP=111;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.661;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1286,0,1013 chrXIII 411358 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;DP=122;Dels=0.00;FS=10.402;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=8.55;ReadPosRankSum=-2.130;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1073,0,1209 chrXIII 411397 . G C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;DP=121;Dels=0.00;FS=8.572;HaplotypeScore=18.6715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.910;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.921;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:121:99:1004,0,732 chrXIII 411632 . G A 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.230;DP=136;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,81:136:99:1662,0,1146 chrXIII 412134 . C T 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.837;DP=158;Dels=0.00;FS=4.732;HaplotypeScore=4.7253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:1598,0,1884 chrXIII 412177 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.719;DP=134;Dels=0.00;FS=6.639;HaplotypeScore=4.6146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.351;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,56:134:99:1169,0,1745 chrXIII 412249 . T A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.925;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:807,0,1437 chrXIII 412378 . T A 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;DP=147;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.925;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1769,0,1456 chrXIII 412745 . C T 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.867;DP=146;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.485;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1665,0,1465 chrXIII 412783 . C T 1808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.867;DP=166;Dels=0.00;FS=2.783;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.884;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.975;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:166:99:1838,0,1578 chrXIII 412878 . C G 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3286,336,0 chrXIII 413338 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.920;DP=134;Dels=0.00;FS=6.494;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1260,0,1561 chrXIII 413447 . C T 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.628;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=6.92;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:131:99:937,0,1615 chrXIII 413860 . G A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.167;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.474;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1423,0,1289 chrXIII 414299 . G A 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2948,301,0 chrXIII 414344 . G A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.086;DP=135;Dels=0.00;FS=5.287;HaplotypeScore=3.2054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1199,0,1656 chrXIII 414447 . C T 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3514,334,0 chrXIII 414592 . G A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.366;DP=124;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.014;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1468,0,1188 chrXIII 414710 . T C 2015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2048,222,0 chrXIII 414927 . A G 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.791;DP=109;Dels=0.00;FS=4.291;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.868;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:894,0,1497 chrXIII 415068 . G A 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3095,315,0 chrXIII 415385 . A G 1920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.496;DP=152;Dels=0.00;FS=8.724;HaplotypeScore=7.9281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.134;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,88:152:99:1950,0,1322 chrXIII 415404 . T A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;DP=140;Dels=0.00;FS=4.232;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,54:140:99:1102,0,1978 chrXIII 415535 . G A 2298 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=28.72;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2331,228,0 chrXIII 415566 . A G 1568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.51;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1601,168,0 chrXIII 415643 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.324;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1129,0,835 chrXIII 415772 . T G 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9080;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3554,384,0 chrXIII 415847 . A G 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.973;DP=134;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1657,0,1295 chrXIII 415927 . G A 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2671,267,0 chrXIII 416053 . T G 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.87;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3210,325,0 chrXIII 416114 . T C 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.27;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3066,330,0 chrXIII 416124 . C T 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=28.34;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3486,340,0 chrXIII 416274 . A G 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2882,303,0 chrXIII 416283 . C T 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2866,288,0 chrXIII 416781 . C T 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3182,313,0 chrXIII 416929 . C T 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2940,292,0 chrXIII 416957 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=106;Dels=0.00;FS=7.818;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1155,0,1017 chrXIII 417054 . C A 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3089,301,0 chrXIII 417062 . C T 2549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2582,255,0 chrXIII 417078 . A G 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.673;DP=84;Dels=0.00;FS=1.804;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,39:84:99:701,0,1052 chrXIII 417126 . A C 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2472,252,0 chrXIII 417249 . C T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.953;DP=105;Dels=0.00;FS=4.930;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.785;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1190,0,989 chrXIII 417403 . G A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.431;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1560,0,1448 chrXIII 417450 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.159;DP=124;Dels=0.00;FS=2.539;HaplotypeScore=5.4472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.327;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:124:99:1269,0,1266 chrXIII 417524 . C T 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.31;SB=-2.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4051,385,0 chrXIII 418089 . T C 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3232,333,0 chrXIII 418206 . T C 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.171;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.192;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,70:119:99:1615,0,1117 chrXIII 418962 . G A 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.924;DP=103;Dels=0.00;FS=7.876;HaplotypeScore=2.5165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.731;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1179,0,1038 chrXIII 418982 . C T 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.199;DP=111;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:1054,0,1309 chrXIII 419234 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.054;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1116,0,1285 chrXIII 419424 . C T 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2625,252,0 chrXIII 419718 . C A 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3403,325,0 chrXIII 419976 . G A 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3301,331,0 chrXIII 420098 . A T 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.605;DP=109;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=5.9539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=27.07;ReadPosRankSum=1.128;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2984,292,0 chrXIII 420264 . C T 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2711,276,0 chrXIII 420310 . A G 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3639,375,0 chrXIII 420380 . G A 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=26.80;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3296,322,0 chrXIII 420528 . C T 2017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.13;MQ0=0;QD=26.19;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2050,201,0 chrXIII 420568 . C T 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.70;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2838,282,0 chrXIII 420683 . C A 2546 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.89;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2579,252,0 chrXIII 420689 . C T 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.43;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2876,283,0 chrXIII 420702 . G C 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.28;MQ0=0;QD=26.43;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2491,255,0 chrXIII 420736 . A G 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.71;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2658,282,0 chrXIII 420786 . G A 2435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=158.5073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.10;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2468,243,0 chrXIII 420892 . C T 2346 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.58;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2379,234,0 chrXIII 420994 . G A 506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.35;MQ0=0;QD=10.77;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:57:539,57,0 chrXIII 421045 . G A 1706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.27;MQ0=0;QD=24.37;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1739,177,0 chrXIII 421139 . T C 1159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.678;DP=64;Dels=0.00;FS=3.912;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.18;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:1192,126,0 chrXIII 421176 . T A 533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;DP=81;Dels=0.00;FS=27.669;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=6.58;ReadPosRankSum=-7.703;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:563,0,337 chrXIII 421240 . T C 1459 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.38;MQ0=0;QD=19.20;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1492,153,0 chrXIII 421266 . T G 2462 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2495,258,0 chrXIII 421275 . A G 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.310;DP=97;Dels=0.00;FS=3.902;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.071;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:930,0,1193 chrXIII 421535 . G T 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2901,294,0 chrXIII 421708 . A C 2523 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2556,279,0 chrXIII 421766 . G A 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.47;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2548,264,0 chrXIII 421865 . G A 2322 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2355,228,0 chrXIII 421886 . A G 2159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2192,225,0 chrXIII 421952 . T C 2142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2175,216,0 chrXIII 422090 . T C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3136,318,0 chrXIII 422449 . G A 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.04;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2926,303,0 chrXIII 422548 . A G 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3468,357,0 chrXIII 422592 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.700;DP=115;Dels=0.00;FS=10.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.605;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1370,0,1127 chrXIII 422714 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.094;DP=119;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=3.4468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.088;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1162,0,1478 chrXIII 422731 . T C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.050;DP=127;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.105;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1215,0,1531 chrXIII 423169 . A G 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.452;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2519,264,0 chrXIII 423364 . C T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.164;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.4706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=8.91;ReadPosRankSum=-2.272;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1072,0,1346 chrXIII 423463 . C T 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3301,319,0 chrXIII 423541 . G A 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3830,402,0 chrXIII 423603 . A T 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2699,276,0 chrXIII 423688 . G A 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2629,258,0 chrXIII 423691 . A G 2405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2438,258,0 chrXIII 423901 . T C 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=25.84;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2979,297,0 chrXIII 423929 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.794;DP=117;Dels=0.00;FS=7.147;HaplotypeScore=8.2046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1136,0,1403 chrXIII 424537 . A G 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2983,315,0 chrXIII 424591 . G A 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.757;DP=125;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.486;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1356,0,1214 chrXIII 424785 . A C 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.00;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2945,315,0 chrXIII 424856 . A T 2252 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=17.19;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:2285,225,0 chrXIII 424897 . T G 2426 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1557;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=21.28;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2459,255,0 chrXIII 425018 . A G 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=50.6087;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=23.42;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2820,285,0 chrXIII 425033 . G T 1288 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=52.4977;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=10.06;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:1321,126,0 chrXIII 425034 . A T 1301 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=52.4977;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=10.24;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:1334,126,0 chrXIII 425035 . C T 1554 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=51.2543;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=11.18;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:1587,162,0 chrXIII 425123 . A T 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.96;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3607,364,0 chrXIII 425602 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.952;DP=129;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=2.9119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.798;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.352;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,53:129:99:1009,0,1649 chrXIII 425640 . G T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.717;DP=134;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=3.1706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.400;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1477,0,1268 chrXIII 425898 . T C 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6846;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3450,345,0 chrXIII 426159 . A C 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2908,297,0 chrXIII 426219 . T A 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.508;DP=161;Dels=0.00;FS=104.777;HaplotypeScore=99.8510;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=23.48;ReadPosRankSum=4.445;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,140:161:99:3780,391,0 chrXIII 426590 . T C 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2852,279,0 chrXIII 426685 . C T 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2999,292,0 chrXIII 426790 . G A 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.354;DP=93;Dels=0.00;FS=5.678;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.761;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:897,0,1114 chrXIII 426934 . T C 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.41;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2650,294,0 chrXIII 426949 . C A 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.41;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2727,285,0 chrXIII 427114 . C T 3886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.658;DP=141;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=3.0342;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=27.56;ReadPosRankSum=-1.511;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3886,388,0 chrXIII 428833 . A T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.802;DP=122;Dels=0.00;FS=3.321;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=2.393;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.896;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1320,0,1374 chrXIII 429465 . G C 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;DP=142;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=2.9348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=1;MQRankSum=-0.031;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.708;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1516,0,1422 chrXIII 429559 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.185;DP=148;Dels=0.00;FS=3.079;HaplotypeScore=4.2572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1501,0,1562 chrXIII 429622 . G T 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.157;DP=123;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.089;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1358,0,1305 chrXIII 429941 . A T 4331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.24;SB=-2.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4331,421,0 chrXIII 430167 . C A 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.243;DP=132;Dels=0.00;FS=4.655;HaplotypeScore=7.5479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.894;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.050;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1367,0,1452 chrXIII 430438 . A G 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.776;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:964,0,1289 chrXIII 430487 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.418;DP=113;Dels=0.00;FS=5.582;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1224,0,1223 chrXIII 430624 . A C 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3608,375,0 chrXIII 430680 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.697;DP=128;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.856;QD=8.85;ReadPosRankSum=-2.332;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1163,0,1486 chrXIII 430685 . G A 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3429,342,0 chrXIII 430694 . A G 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3528,354,0 chrXIII 430776 . G A 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=164;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:1755,0,1725 chrXIII 430800 . T C 4013.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.40;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4013,400,0 chrXIII 430847 . T C 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3717,376,0 chrXIII 430856 . G A 3862.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=28.19;SB=-2.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3862,382,0 chrXIII 430895 . A T 4308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4308,427,0 chrXIII 430948 . G C 4370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4370,436,0 chrXIII 431202 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.733;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.759;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1381,0,1657 chrXIII 431333 . C T 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.159;DP=103;Dels=0.00;FS=3.755;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.314;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:924,0,1294 chrXIII 431484 . C G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.437;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.980;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1327,0,1358 chrXIII 431689 . C T 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.43;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3866,391,0 chrXIII 431692 . A C 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.72;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3858,394,0 chrXIII 431890 . A G 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.180;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:975,0,1567 chrXIII 432019 . T A 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.820;DP=100;Dels=0.00;FS=21.083;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1247,0,992 chrXIII 432613 . G A 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3425,340,0 chrXIII 432625 . C T 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3902,382,0 chrXIII 432667 . C T 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3481,355,0 chrXIII 433010 . T A 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.53;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2978,309,0 chrXIII 433052 . T A 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2845,274,0 chrXIII 433082 . G A 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3092,295,0 chrXIII 433201 . C T 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3829,382,0 chrXIII 433223 . A G 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.96;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3700,393,0 chrXIII 433274 . T C 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3919,403,0 chrXIII 433376 . G A 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.83;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2630,273,0 chrXIII 433409 . A C 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3553,372,0 chrXIII 433422 . A G 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.49;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:145:99:3799,393,0 chrXIII 433461 . G A 3773.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.20;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3773,370,0 chrXIII 433474 . G A 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.41;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.963e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3743,367,0 chrXIII 433519 . A G 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3666,370,0 chrXIII 433544 . G T 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.63;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3667,358,0 chrXIII 433581 . A G 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.138;DP=176;Dels=0.00;FS=6.994;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.839;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,86:176:99:1836,0,1916 chrXIII 433686 . C T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.384;DP=136;Dels=0.00;FS=1.726;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.002;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1590,0,1349 chrXIII 433720 . A G 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.90;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3471,345,0 chrXIII 433952 . A G 4089.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4089,403,0 chrXIII 434151 . G A 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.69;SB=-2.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3870,373,0 chrXIII 434234 . G A 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=27.21;ReadPosRankSum=1.109;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3782,391,0 chrXIII 434450 . C T 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3928,382,0 chrXIII 434461 . T G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.843;DP=156;Dels=0.00;FS=3.772;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.549;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1388,0,1724 chrXIII 434492 . G A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.075;DP=154;Dels=0.00;FS=3.722;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.984;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1492,0,1593 chrXIII 434538 . G A 4423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8029;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=26.49;SB=-2.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4423,445,0 chrXIII 434776 . G A 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.70;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3667,367,0 chrXIII 434958 . G A 4121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.987e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4121,403,0 chrXIII 435924 . T C 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3455,349,0 chrXIII 436033 . C T 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3812,367,0 chrXIII 436081 . A G 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3037,315,0 chrXIII 436089 . A C 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3034,309,0 chrXIII 436140 . C T 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3594,364,0 chrXIII 436442 . G A 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.385;DP=141;Dels=0.00;FS=9.908;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.560;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1647,0,1365 chrXIII 436579 . C G 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;DP=101;Dels=0.00;FS=4.931;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.533;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1150,0,1020 chrXIII 436590 . C T 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.925;DP=103;Dels=0.00;FS=3.713;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=8.74;ReadPosRankSum=2.257;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:930,0,1290 chrXIII 436769 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.487;DP=132;Dels=0.00;FS=3.271;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.096;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1175,0,1688 chrXIII 437950 . A C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.018;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.579;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1461,0,1755 chrXIII 438389 . T C 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.147;DP=148;Dels=0.00;FS=2.108;HaplotypeScore=2.8807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.264;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1671,0,1491 chrXIII 438469 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.134;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=10.13;ReadPosRankSum=-2.128;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:133:99:1377,0,1334 chrXIII 438807 . C T 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7568;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3624,358,0 chrXIII 438875 . A T 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.118;DP=142;Dels=0.00;FS=4.069;HaplotypeScore=3.6837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.468;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1523,0,1705 chrXIII 439294 . A T 2167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2200,219,0 chrXIII 439527 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.010;DP=140;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1151,0,1759 chrXIII 439704 . C T 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.693;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=1;MQRankSum=-0.775;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.670;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1542,0,1710 chrXIII 439726 . T C 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.313;DP=157;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=1;MQRankSum=0.583;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.267;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,78:157:99:1645,0,1732 chrXIII 439839 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.168;DP=136;Dels=0.00;FS=7.731;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.100;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1373,0,1570 chrXIII 439990 . A G 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3509,351,0 chrXIII 440065 . T C 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.975;DP=109;Dels=0.00;FS=3.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.108;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1079,0,1337 chrXIII 440792 . T C 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3238,327,0 chrXIII 441110 . T G 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3551,366,0 chrXIII 441184 . C T 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3856,385,0 chrXIII 441996 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.949;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.340;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1096,0,1132 chrXIII 442225 . C G 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.619;DP=105;Dels=0.00;FS=1.799;HaplotypeScore=9.3861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.497;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:105:99:1095,0,949 chrXIII 442237 . T A 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;DP=118;Dels=0.00;FS=4.575;HaplotypeScore=63.5703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.140;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1305,0,1081 chrXIII 442300 . A C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;DP=110;Dels=0.00;FS=2.514;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1043,0,916 chrXIII 442338 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.253;DP=118;Dels=0.00;FS=2.457;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.979;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1084,0,1428 chrXIII 442504 . G A 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.777;DP=171;Dels=0.00;FS=1.204;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,87:171:99:1836,0,1777 chrXIII 442835 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.162;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1092,0,1587 chrXIII 442877 . C T 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.908;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.048;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1509,0,1368 chrXIII 442886 . T A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.407;DP=143;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.698;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1546,0,1559 chrXIII 442916 . A G 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.537;DP=127;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1559,0,1169 chrXIII 442976 . A C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.144;DP=127;Dels=0.00;FS=5.468;HaplotypeScore=3.7725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.557;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:127:99:1362,0,1324 chrXIII 443042 . C T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.505;DP=159;Dels=0.00;FS=1.993;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=3.451;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.849;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:159:99:1649,0,1434 chrXIII 443054 . T C 999.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.399;DP=136;Dels=0.00;FS=3.157;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.844;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1029,0,1672 chrXIII 443057 . C T 1022.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.449;DP=146;Dels=0.00;FS=3.029;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=7.00;ReadPosRankSum=-0.748;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1052,0,1647 chrXIII 443063 . G A 1183.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;DP=141;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1213,0,1610 chrXIII 443272 . T C 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.293;DP=95;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:857,0,1198 chrXIII 443318 . T C 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.878;DP=102;Dels=0.00;FS=5.499;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.569;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1103,0,1200 chrXIII 443373 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.598;DP=109;Dels=0.00;FS=3.861;HaplotypeScore=1.9048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.005;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1226,0,1241 chrXIII 443864 . T A 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.727;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.005;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1665,0,1364 chrXIII 443942 . G A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.220;DP=156;Dels=0.00;FS=5.944;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.477;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,64:156:99:1336,0,2028 chrXIII 443954 . G C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.667;DP=158;Dels=0.00;FS=6.973;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.248;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.123;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,69:157:99:1374,0,2009 chrXIII 443966 . T C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.936;DP=161;Dels=0.00;FS=2.785;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.243;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,70:161:99:1347,0,2073 chrXIII 444110 . G A 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.728;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.169;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,80:143:99:1677,0,1323 chrXIII 444158 . T C 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.061;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.759;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1678,0,1400 chrXIII 444227 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.132;DP=118;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.797;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1243,0,1241 chrXIII 444299 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.222;DP=124;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.501;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1556,0,1114 chrXIII 444383 . G A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.591;DP=141;Dels=0.00;FS=4.045;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1524,0,1462 chrXIII 444584 . T C 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.526;DP=152;Dels=0.00;FS=3.815;HaplotypeScore=5.6960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1638,0,1463 chrXIII 444677 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.898;DP=116;Dels=0.00;FS=4.535;HaplotypeScore=2.7090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.130;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1243,0,1269 chrXIII 445007 . G A 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.443;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.730;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1202,0,1535 chrXIII 445016 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.980;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1264,0,1539 chrXIII 445052 . A T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;DP=124;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1244,0,1412 chrXIII 445293 . C T 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3596,355,0 chrXIII 445366 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.167;DP=139;Dels=0.00;FS=10.669;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.269;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1337,0,1627 chrXIII 445377 . G A 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.559;DP=147;Dels=0.00;FS=11.883;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1795,0,1363 chrXIII 446935 . C T 2757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2790,277,0 chrXIII 447488 . A G 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3260,330,0 chrXIII 447795 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.167;DP=93;Dels=0.00;FS=2.757;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.983;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,55:93:99:1265,0,702 chrXIII 447895 . A G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.272;DP=134;Dels=0.00;FS=2.274;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.573;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1232,0,1575 chrXIII 448333 . G A 3906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3906,403,0 chrXIII 448334 . A G 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=151;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.970;SB=-1.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3812,396,0 chrXIII 449015 . T C 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.082;DP=145;Dels=0.00;FS=10.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1531,0,1514 chrXIII 450562 . G A 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3418,343,0 chrXIII 450640 . A G 2539 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2572,273,0 chrXIII 451024 . G A 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3567,352,0 chrXIII 451375 . A C 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3411,342,0 chrXIII 451456 . T G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.441;DP=120;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1390,0,1178 chrXIII 451494 . T C 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3464,360,0 chrXIII 451502 . T C 3617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3617,366,0 chrXIII 451599 . A C 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.119;DP=141;Dels=0.00;FS=5.032;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.693;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1471,0,1531 chrXIII 452052 . A T 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3242,319,0 chrXIII 452181 . C T 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2998,298,0 chrXIII 452871 . G A 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=27.03;ReadPosRankSum=1.704;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3379,313,0 chrXIII 453823 . G A 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=28.35;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3430,343,0 chrXIII 454515 . T C 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5769;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3162,327,0 chrXIII 454584 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.099;DP=120;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=2.812;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.131;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1383,0,1122 chrXIII 454966 . T C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.136;DP=118;Dels=0.00;FS=4.988;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1196,0,1436 chrXIII 455073 . A G 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.848;DP=105;Dels=0.00;FS=5.039;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:712,0,792 chrXIII 455166 . T C 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.374;DP=154;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.125;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1724,0,1587 chrXIII 455319 . T C 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.342;DP=144;Dels=0.00;FS=2.961;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.991;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1589,0,1509 chrXIII 455541 . A G 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.731;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1559,0,1350 chrXIII 455980 . T C 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3589,372,0 chrXIII 456133 . T C 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.340;DP=123;Dels=0.00;FS=8.773;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.874;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,78:123:99:1647,0,930 chrXIII 456227 . G A 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.194;DP=144;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.348;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1520,0,1558 chrXIII 456268 . G A 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9192;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.70;SB=-2.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3872,376,0 chrXIII 456316 . T C 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3583,372,0 chrXIII 456415 . G A 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3036,304,0 chrXIII 456517 . A G 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3274,327,0 chrXIII 456535 . A T 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3402,340,0 chrXIII 456718 . T G 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3276,328,0 chrXIII 457082 . C G 1859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.82;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1892,189,0 chrXIII 457249 . T A 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3064,310,0 chrXIII 457507 . G A 2662 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2695,267,0 chrXIII 457522 . G A 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2869,288,0 chrXIII 457570 . G A 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.674;DP=106;Dels=0.00;FS=6.425;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.291;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:996,0,1196 chrXIII 457614 . G A 2154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2187,222,0 chrXIII 457932 . C T 2521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2554,261,0 chrXIII 458051 . A G 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3435,342,0 chrXIII 458330 . A G 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=23.10;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3082,309,0 chrXIII 458366 . C A 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3319,322,0 chrXIII 458370 . C T 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3537,355,0 chrXIII 458464 . C T 4326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.760;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.162;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:4326,433,0 chrXIII 458513 . T G 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3147,330,0 chrXIII 459200 . T C 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3334,339,0 chrXIII 459369 . A G 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3217,348,0 chrXIII 459508 . T C 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3171,318,0 chrXIII 459670 . A G 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2931,306,0 chrXIII 459697 . G A 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.611;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=26.81;ReadPosRankSum=0.912;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:3089,306,0 chrXIII 459754 . A G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.623;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1304,0,1494 chrXIII 459842 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.603;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.563;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1267,0,1048 chrXIII 459995 . A C 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3200,318,0 chrXIII 460285 . A G 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3460,354,0 chrXIII 461207 . A T 3862.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3862,370,0 chrXIII 461480 . A G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.668;DP=124;Dels=0.00;FS=5.556;HaplotypeScore=5.0261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.998;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.658;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1302,0,1286 chrXIII 461530 . G A 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3781,361,0 chrXIII 461653 . A G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3113,318,0 chrXIII 461659 . C T 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2967,292,0 chrXIII 462032 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.034;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.454;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1208,0,1372 chrXIII 462232 . C T 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3399,325,0 chrXIII 462409 . A G 2578 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2611,267,0 chrXIII 462535 . G C 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2748,276,0 chrXIII 462716 . G A 514 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=1;QD=8.86;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:57:547,57,0 chrXIII 462753 . A G 2359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=21.06;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2392,258,0 chrXIII 462773 . A T 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=27.34;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2822,280,0 chrXIII 462976 . A G 2118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=85;Dels=0.00;FS=3.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=24.92;ReadPosRankSum=-1.569;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2151,197,0 chrXIII 463091 . C T 2373 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.16;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2406,237,0 chrXIII 463158 . G A 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.011;DP=75;Dels=0.00;FS=6.175;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.175;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:75:99:776,0,793 chrXIII 463170 . A C 1591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.08;MQ0=0;QD=23.75;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1624,174,0 chrXIII 463171 . C G 1568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.08;MQ0=0;QD=23.40;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1601,174,0 chrXIII 463232 . C T 1321 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=54.5485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.37;MQ0=0;QD=23.18;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1354,135,0 chrXIII 463247 . C T 1349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.33;MQ0=0;QD=21.76;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1382,138,0 chrXIII 463261 . A C 1205 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.69;MQ0=0;QD=21.52;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1238,126,0 chrXIII 463264 . G A 1318 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.78;MQ0=0;QD=23.54;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1351,132,0 chrXIII 463330 . T C 473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=32;Dels=0.00;FS=4.914;HaplotypeScore=4.8748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=14.78;ReadPosRankSum=1.621;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:32:54:506,54,0 chrXIII 463337 . A T 493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.00;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:54:526,54,0 chrXIII 463367 . C A 108.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.59;MQ0=0;QD=5.41;SB=-8.614e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:15:141,15,0 chrXIII 463374 . C T 102.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.1407;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.11;MQ0=0;QD=6.39;SB=-5.730e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:15:135,15,0 chrXIII 463395 . C G 457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.04;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:51:490,51,0 chrXIII 463407 . G A 502 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.83;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:54:535,54,0 chrXIII 463410 . G A 498 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=21.65;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:54:531,54,0 chrXIII 463412 . G A 458 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.91;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:51:491,51,0 chrXIII 463414 . G A 489 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.92;MQ0=0;QD=20.37;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:54:522,54,0 chrXIII 463419 . C T 652 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.41;MQ0=0;QD=12.07;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:69:685,69,0 chrXIII 463709 . A T 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2637,261,0 chrXIII 463745 . C T 2078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2111,207,0 chrXIII 464030 . A T 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.584;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.755;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3176,295,0 chrXIII 464149 . G A 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.005;DP=95;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.696;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:970,0,1057 chrXIII 464496 . A G 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.034;DP=90;Dels=0.00;FS=3.997;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.680;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:903,0,933 chrXIII 465031 . G A 2194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=26.43;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2227,222,0 chrXIII 465036 . C A 2146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.99;MQ0=0;QD=25.86;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2179,222,0 chrXIII 465055 . T G 2421 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2454,255,0 chrXIII 465545 . G A 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3167,295,0 chrXIII 465549 . T C 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3117,300,0 chrXIII 465802 . A T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;DP=134;Dels=0.00;FS=4.137;HaplotypeScore=4.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.434;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1543,0,1449 chrXIII 465869 . C T 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3222,325,0 chrXIII 465899 . A T 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3469,340,0 chrXIII 465931 . C T 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3646,349,0 chrXIII 466377 . G A 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3281,325,0 chrXIII 466416 . C A 4181.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4181,409,0 chrXIII 466653 . A T 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;DP=144;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.464;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1573,0,1651 chrXIII 466863 . G A 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.800;DP=162;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=5.9543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.425;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,77:162:99:1727,0,1783 chrXIII 467493 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.488;DP=138;Dels=0.00;FS=3.182;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=9.17;ReadPosRankSum=-2.019;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1296,0,1782 chrXIII 467760 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.497;DP=112;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=10.32;ReadPosRankSum=-3.299;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1186,0,1183 chrXIII 467764 . G A 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3629,373,0 chrXIII 467817 . C T 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=27.87;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2569,252,0 chrXIII 467994 . C T 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2757,279,0 chrXIII 468051 . C T 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2937,288,0 chrXIII 468142 . G T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;DP=112;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.035;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1269,0,1281 chrXIII 468156 . T C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=26.11;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2931,312,0 chrXIII 468328 . G A 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2933,292,0 chrXIII 468499 . A T 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2863,288,0 chrXIII 468500 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.587;DP=106;Dels=0.00;FS=5.155;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.670;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1143,0,1154 chrXIII 468624 . G A 3838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3838,376,0 chrXIII 468937 . T C 4000.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.48;SB=-2.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4000,391,0 chrXIII 469088 . T A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.297;DP=145;Dels=0.00;FS=7.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=9.44;ReadPosRankSum=-2.518;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1399,0,1717 chrXIII 469276 . A G 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2650,291,0 chrXIII 469282 . T A 2781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.26;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2814,291,0 chrXIII 469297 . T C 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2968,318,0 chrXIII 469459 . A G 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2731,270,0 chrXIII 469468 . C T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;DP=116;Dels=0.00;FS=7.232;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.069;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1082,0,1248 chrXIII 469503 . T G 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2523,258,0 chrXIII 469513 . C T 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2921,288,0 chrXIII 469820 . T C 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=22.34;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2736,282,0 chrXIII 469837 . C A 2259 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=21.11;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2292,228,0 chrXIII 470613 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.631;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.410;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,67:155:99:1284,0,1985 chrXIII 470646 . A G 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.575;DP=148;Dels=0.00;FS=2.932;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.068;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,82:148:99:1738,0,1415 chrXIII 470697 . A G 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3246,342,0 chrXIII 470811 . G A 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.010;DP=148;Dels=0.00;FS=13.133;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.773;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1424,0,1065 chrXIII 470817 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.503;DP=145;Dels=0.00;FS=11.933;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,62:145:99:1063,0,1511 chrXIII 470916 . T C 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3739,405,0 chrXIII 471485 . T C 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3364,331,0 chrXIII 471865 . G A 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3384,334,0 chrXIII 472484 . A G 4174.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.25;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4174,409,0 chrXIII 472763 . C T 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.32;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3276,322,0 chrXIII 473006 . A G 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.64;MQ0=0;QD=26.86;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2961,309,0 chrXIII 473109 . C T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.581;DP=101;Dels=0.00;FS=3.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.391;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1033,0,1061 chrXIII 473172 . T C 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3041,315,0 chrXIII 473211 . C T 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.770;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.481;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1603,0,1222 chrXIII 473256 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.764;DP=126;Dels=0.00;FS=17.398;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=5.873;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1541,0,1128 chrXIII 473320 . A G 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.17;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3155,333,0 chrXIII 473407 . C G 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3058,321,0 chrXIII 473450 . A G 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3299,345,0 chrXIII 473564 . A G 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3808,387,0 chrXIII 473594 . T A 4102.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4102,397,0 chrXIII 473599 . T G 3896.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3896,388,0 chrXIII 473747 . T A 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.995e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3990,397,0 chrXIII 474227 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.942;DP=152;Dels=0.00;FS=2.891;HaplotypeScore=2.7396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,66:152:99:1072,0,1760 chrXIII 474275 . C T 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3386,328,0 chrXIII 474350 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.903;DP=148;Dels=0.00;FS=1.291;HaplotypeScore=3.4282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.519;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1403,0,1690 chrXIII 474359 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.830;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=9.04;ReadPosRankSum=1.417;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:142:99:1313,0,1647 chrXIII 474399 . T C 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3468,343,0 chrXIII 474565 . G A 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.740;DP=119;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.975;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1241,0,1313 chrXIII 474624 . T C 2672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=24.07;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2705,288,0 chrXIII 474632 . T C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.338;DP=113;Dels=0.00;FS=3.613;HaplotypeScore=3.5267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.759;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.060;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1128,0,1286 chrXIII 474682 . G A 2556 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.35;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2589,249,0 chrXIII 474721 . G T 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3292,316,0 chrXIII 474893 . G A 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2832,291,0 chrXIII 474938 . C T 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.90;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3241,333,0 chrXIII 475024 . G A 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.779;DP=144;Dels=0.00;FS=6.361;HaplotypeScore=2.6503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1792,0,1256 chrXIII 475108 . G A 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.271;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.064;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1720,0,1235 chrXIII 475126 . G A 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.410;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1868,0,1257 chrXIII 475202 . A G 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.310;DP=139;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,84:139:99:1800,0,1222 chrXIII 475652 . C T 2390 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2423,237,0 chrXIII 475855 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.565;DP=110;Dels=0.00;FS=7.709;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:1055,0,1328 chrXIII 476482 . A G 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3410,348,0 chrXIII 476641 . G A 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.806;DP=168;Dels=0.00;FS=4.461;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.747;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.153;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,74:168:99:1596,0,2005 chrXIII 476767 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.561;DP=128;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1210,0,1367 chrXIII 477289 . G A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.889;DP=121;Dels=0.00;FS=3.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.679;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1130,0,1355 chrXIII 477292 . G C 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.362;DP=120;Dels=0.00;FS=4.409;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.456;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1062,0,1388 chrXIII 477340 . G A 2450 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:2483,243,0 chrXIII 477610 . A G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.653;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1261,0,1616 chrXIII 477847 . C G 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;DP=115;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=2.326;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.677;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,46:115:99:858,0,1548 chrXIII 477882 . A G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.021;DP=128;Dels=0.00;FS=4.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=3.759;QD=8.62;ReadPosRankSum=-2.052;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1133,0,1519 chrXIII 478014 . A T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;DP=145;Dels=0.00;FS=6.088;HaplotypeScore=4.5474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1585,0,1479 chrXIII 478212 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.473;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1324,0,1455 chrXIII 478296 . C G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.246;DP=138;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=63.6150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1351,0,1400 chrXIII 478297 . T C 1573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-8.060;DP=142;Dels=0.00;FS=2.134;HaplotypeScore=65.6065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=2.333;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.499;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:66,76:142:85:1606,85,0 chrXIII 478325 . T C 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.491;DP=140;Dels=0.00;FS=10.566;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1506,0,1418 chrXIII 478354 . A G 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.812;DP=126;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=2.9297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.233;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1376,0,1355 chrXIII 478463 . G A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.866;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,65:108:99:1503,0,838 chrXIII 479511 . G A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.797;DP=139;Dels=0.00;FS=4.141;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1524,0,1490 chrXIII 479746 . G C 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.207;DP=105;Dels=0.00;FS=3.650;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.338;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:105:99:1039,0,1178 chrXIII 479885 . G A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.606;DP=137;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1497,0,1470 chrXIII 479898 . C T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.088;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.925;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1492,0,1446 chrXIII 480242 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.473;DP=138;Dels=0.00;FS=2.411;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=2.257;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1376,0,1625 chrXIII 480327 . T C 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1024,0,1034 chrXIII 480404 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.990;DP=121;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=2.313;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1326,0,1249 chrXIII 480430 . G A 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.046;DP=140;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.119;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1706,0,1297 chrXIII 480440 . A C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.879;DP=139;Dels=0.00;FS=3.071;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1616,0,1322 chrXIII 480495 . C G 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.732;DP=142;Dels=0.00;FS=8.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=2.365;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1522,0,1257 chrXIII 480496 . G A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.516;DP=142;Dels=0.00;FS=8.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1486,0,1273 chrXIII 480545 . G A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.291;DP=122;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1364,0,1161 chrXIII 480549 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.577;DP=132;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1390,0,1292 chrXIII 480601 . C T 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.110;DP=106;Dels=0.00;FS=3.625;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.241;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1259,0,1048 chrXIII 480711 . C A 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.38;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2754,273,0 chrXIII 480735 . G T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.466;DP=93;Dels=0.00;FS=5.606;HaplotypeScore=38.7765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-2.945;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.073;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:905,0,1114 chrXIII 480795 . C A 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.764;DP=78;Dels=0.00;FS=7.591;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=1;MQRankSum=-1.577;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:780,0,865 chrXIII 480858 . G A 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.681;DP=78;Dels=0.00;FS=23.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=1;MQRankSum=-4.038;QD=11.26;ReadPosRankSum=-2.792;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,41:78:99:908,0,781 chrXIII 480880 . C G 536.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.497;DP=71;Dels=0.00;FS=26.295;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.73;MQ0=0;MQRankSum=-6.781;QD=7.55;ReadPosRankSum=-5.395;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,30:71:99:566,0,961 chrXIII 481004 . T G 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.811;DP=101;Dels=0.00;FS=8.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQ0=0;MQRankSum=5.719;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.592;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,65:101:99:1368,0,740 chrXIII 481006 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.418;DP=102;Dels=0.00;FS=14.641;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.46;MQ0=0;MQRankSum=5.165;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.673;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,63:102:99:1457,0,799 chrXIII 481051 . G C 1941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;QD=16.59;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:117:99:1974,207,0 chrXIII 481063 . A G 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3060,315,0 chrXIII 481095 . G A 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.569;DP=121;Dels=0.00;FS=2.563;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=8.03;ReadPosRankSum=-2.051;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:121:99:1002,0,1581 chrXIII 481103 . G A 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3256,313,0 chrXIII 481193 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.124;DP=105;Dels=0.00;FS=2.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.003;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1115,0,1061 chrXIII 481198 . T A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;DP=107;Dels=0.00;FS=2.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQ0=0;MQRankSum=-3.193;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.682;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1177,0,1150 chrXIII 481254 . T A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;DP=117;Dels=0.00;FS=1.537;HaplotypeScore=70.4698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.24;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.497;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1023,0,1106 chrXIII 481282 . A T 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.621;DP=115;Dels=0.00;FS=3.443;HaplotypeScore=17.9154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.429;QD=8.17;ReadPosRankSum=3.139;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:969,0,1309 chrXIII 481286 . T A 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3203,316,0 chrXIII 481297 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.568;DP=121;Dels=0.00;FS=2.714;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.554;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1092,0,1559 chrXIII 481412 . A T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;DP=97;Dels=0.00;FS=5.054;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=2.378;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.372;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1153,0,1032 chrXIII 481413 . A T 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.481;DP=96;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:96:99:1027,0,1144 chrXIII 481481 . G T 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.696;DP=96;Dels=0.00;FS=3.879;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.207;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.089;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:864,0,1149 chrXIII 481511 . C T 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.243;DP=100;Dels=0.00;FS=5.003;HaplotypeScore=2.4413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=2.898;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.074;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:100:99:1193,0,908 chrXIII 481531 . G T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.517;DP=103;Dels=0.00;FS=9.376;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:895,0,1265 chrXIII 481534 . G A 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.78;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2851,279,0 chrXIII 481553 . A G 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.377;DP=147;Dels=0.01;FS=4.092;HaplotypeScore=4.7051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.678;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.791;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1494,0,1658 chrXIII 481556 . G C 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.80;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3721,369,0 chrXIII 481610 . C T 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.22;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3297,330,0 chrXIII 481632 . T A 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=26.81;ReadPosRankSum=0.119;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3512,358,0 chrXIII 481645 . A T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.880;DP=122;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.358;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.227;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:122:99:1167,0,1357 chrXIII 481647 . G T 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.07;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2899,291,0 chrXIII 481735 . C T 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2934,288,0 chrXIII 481834 . G A 2628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.696;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2661,264,0 chrXIII 481860 . G C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.427;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1163,0,1160 chrXIII 482017 . A T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.347;DP=141;Dels=0.01;FS=8.327;HaplotypeScore=14.7646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.708;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1387,0,1703 chrXIII 482208 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.702;DP=123;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.297;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,74:123:99:1605,0,1069 chrXIII 482260 . G C 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;DP=123;Dels=0.00;FS=2.505;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1510,0,1153 chrXIII 482324 . A T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;DP=108;Dels=0.00;FS=1.843;HaplotypeScore=2.4637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.741;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1104,0,1382 chrXIII 482549 . C T 955.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.023;DP=113;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=5.6879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=2.553;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.775;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,44:113:99:985,0,1506 chrXIII 482555 . T C 852.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.987;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.136;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,44:107:99:882,0,1433 chrXIII 482556 . G A 1397.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.814;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.761;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.891;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:108:99:1427,0,899 chrXIII 482677 . C G 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.441;DP=130;Dels=0.00;FS=2.233;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.695;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1478,0,1199 chrXIII 482700 . C A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.065;DP=122;Dels=0.00;FS=5.556;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1482,0,1057 chrXIII 482760 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.654;DP=141;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=3.7097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.229;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1189,0,1594 chrXIII 482769 . G A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.040;DP=136;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.303;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1386,0,1459 chrXIII 482780 . T C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.644;DP=136;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.544;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1362,0,1544 chrXIII 482789 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.428;DP=136;Dels=0.00;FS=4.259;HaplotypeScore=2.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:136:99:1398,0,1472 chrXIII 482798 . T A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.138;DP=126;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=2.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=3.828;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.017;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1509,0,1263 chrXIII 482805 . T A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;DP=136;Dels=0.00;FS=4.173;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1405,0,1605 chrXIII 482985 . A G 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.364;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1385,0,1819 chrXIII 483031 . C A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.835;DP=112;Dels=0.00;FS=0.785;HaplotypeScore=7.4968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1110,0,1186 chrXIII 483157 . T G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=141;Dels=0.00;FS=3.019;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1307,0,1672 chrXIII 483470 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.187;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.508;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1403,0,1311 chrXIII 483985 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.534;DP=132;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.893;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1413,0,1333 chrXIII 484290 . C G 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3051,321,0 chrXIII 484410 . T G 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2949,306,0 chrXIII 484842 . T C 2478 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2511,258,0 chrXIII 485130 . G A 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3587,364,0 chrXIII 485430 . T C 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3634,367,0 chrXIII 485544 . A G 3930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.87;SB=-2.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3930,405,0 chrXIII 485598 . T C 4221.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.38;SB=-2.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4221,444,0 chrXIII 485622 . A T 4098.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4098,412,0 chrXIII 485712 . G A 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3605,361,0 chrXIII 485820 . G A 4316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4316,424,0 chrXIII 485832 . T C 4210.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4210,430,0 chrXIII 486270 . A G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.558;DP=124;Dels=0.00;FS=2.381;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.291;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:124:99:1304,0,1458 chrXIII 486339 . A G 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3092,315,0 chrXIII 486389 . T C 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=23.25;ReadPosRankSum=1.155;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3102,301,0 chrXIII 486464 . T C 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;DP=158;Dels=0.00;FS=3.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.206;SB=-2.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:3945,385,0 chrXIII 486465 . C T 4082.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.51;SB=-2.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4082,391,0 chrXIII 487573 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.626;DP=128;Dels=0.00;FS=3.397;HaplotypeScore=3.1810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.628;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1374,0,1383 chrXIII 487606 . A G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.492;DP=140;Dels=0.00;FS=5.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.319;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1417,0,1615 chrXIII 487633 . C T 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.166;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1245,0,1604 chrXIII 487795 . A G 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.413;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=26.11;ReadPosRankSum=-1.266;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,131:133:99:3472,363,0 chrXIII 487831 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.167;DP=113;Dels=0.00;FS=11.129;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.994;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1298,0,1188 chrXIII 487960 . A G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;DP=103;Dels=0.00;FS=2.921;HaplotypeScore=6.0400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.555;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1203,0,1072 chrXIII 488506 . A G 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.185;DP=159;Dels=0.00;FS=1.980;HaplotypeScore=4.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.098;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,78:159:99:1566,0,1762 chrXIII 489301 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.260;DP=130;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.208;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1168,0,1654 chrXIII 490110 . C T 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.344;DP=144;Dels=0.00;FS=5.238;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.112;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1749,0,1389 chrXIII 490598 . A G 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3099,312,0 chrXIII 490751 . C T 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.873;DP=151;Dels=0.00;FS=2.030;HaplotypeScore=4.1367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1604,0,1515 chrXIII 490970 . G A 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3567,355,0 chrXIII 490980 . T G 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.071;DP=133;Dels=0.00;FS=6.811;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.483;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1617,0,1280 chrXIII 491096 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.360;DP=126;Dels=0.00;FS=3.257;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1212,0,1530 chrXIII 491108 . T C 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3117,333,0 chrXIII 491129 . T C 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3207,336,0 chrXIII 491183 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.992;DP=142;Dels=0.00;FS=4.762;HaplotypeScore=4.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1546,0,1597 chrXIII 491201 . A T 4144.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4144,400,0 chrXIII 491291 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.344;DP=128;Dels=0.00;FS=4.035;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.427;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1289,0,1502 chrXIII 491444 . G A 4038.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.40;SB=-2.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4038,391,0 chrXIII 491864 . T C 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3741,369,0 chrXIII 491919 . C T 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2642,259,0 chrXIII 491997 . G T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3285,322,0 chrXIII 492111 . C T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.941;DP=89;Dels=0.00;FS=7.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=13.08;ReadPosRankSum=-2.035;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,52:89:99:1194,0,752 chrXIII 492116 . T A 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.416;DP=88;Dels=0.00;FS=8.804;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.702;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:1056,0,746 chrXIII 492202 . G A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.541;DP=111;Dels=0.00;FS=7.495;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=10.41;ReadPosRankSum=2.500;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1186,0,1330 chrXIII 492711 . C T 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3464,346,0 chrXIII 492749 . G T 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3731,370,0 chrXIII 492833 . C T 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3434,354,0 chrXIII 493007 . G A 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2883,288,0 chrXIII 493830 . A G 546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.749;DP=92;Dels=0.00;FS=1.905;HaplotypeScore=2.6221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.700;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,33:92:99:576,0,1340 chrXIII 494582 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.133;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=12.41;ReadPosRankSum=-2.283;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1619,0,1005 chrXIII 494673 . C T 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.087;DP=146;Dels=0.00;FS=3.011;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.074;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1624,0,1391 chrXIII 494734 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;DP=134;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.072;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:950,0,1791 chrXIII 494735 . G A 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.958;DP=135;Dels=0.00;FS=2.225;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.253;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,55:135:99:953,0,1760 chrXIII 494827 . T A 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;DP=106;Dels=0.00;FS=2.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:860,0,1618 chrXIII 494850 . A C 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=116;Dels=0.00;FS=11.093;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:991,0,1593 chrXIII 494957 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.712;DP=117;Dels=0.00;FS=5.889;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1378,0,1132 chrXIII 495304 . G A 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.151;DP=135;Dels=0.00;FS=6.568;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.768;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:135:99:1567,0,1309 chrXIII 495637 . A C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.262;DP=121;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1173,0,1437 chrXIII 496111 . T C 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.634;DP=138;Dels=0.00;FS=3.005;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1415,0,1567 chrXIII 496310 . T G 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.388;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.107;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,76:166:99:1478,0,2080 chrXIII 496520 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.859;DP=121;Dels=0.00;FS=5.587;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1202,0,1418 chrXIII 496537 . A T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.429;DP=129;Dels=0.00;FS=6.590;HaplotypeScore=2.3249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1361,0,1425 chrXIII 496565 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;DP=116;Dels=0.00;FS=10.292;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.753;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.066;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1279,0,1239 chrXIII 496609 . G C 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;DP=101;Dels=0.00;FS=18.452;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,64:101:99:1493,0,737 chrXIII 496640 . T G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.178;DP=94;Dels=0.00;FS=12.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.619;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,59:94:99:1312,0,740 chrXIII 496642 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.095;DP=97;Dels=0.00;FS=10.176;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.251;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,62:97:99:1466,0,694 chrXIII 496721 . G A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.799;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.405;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1471,0,883 chrXIII 496739 . C T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.423;DP=122;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.582;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,73:122:99:1564,0,893 chrXIII 496955 . A T 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;DP=132;Dels=0.00;FS=2.284;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.130;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1641,0,1331 chrXIII 497249 . A G 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.571;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.614;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,74:124:99:1572,0,1013 chrXIII 497270 . A G 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.202;DP=122;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=2.7468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,77:122:99:1783,0,866 chrXIII 497366 . G C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.370;DP=125;Dels=0.00;FS=3.268;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1304,0,1278 chrXIII 497568 . G T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.796;DP=124;Dels=0.00;FS=4.449;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1477,0,1024 chrXIII 497778 . G C 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.509;DP=137;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.747;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,81:137:99:1699,0,1163 chrXIII 498101 . G A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.036;DP=115;Dels=0.00;FS=9.954;HaplotypeScore=10.5305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.337;QD=9.81;ReadPosRankSum=-2.738;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1158,0,1203 chrXIII 498543 . G A 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.062;DP=107;Dels=0.00;FS=2.594;HaplotypeScore=3.1253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.660;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,39:107:99:782,0,1509 chrXIII 498573 . T C 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.326;DP=120;Dels=0.00;FS=1.501;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:120:99:884,0,1667 chrXIII 498745 . C T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.000;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1382,0,1080 chrXIII 499134 . A G 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.495;DP=89;Dels=0.00;FS=1.733;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.053;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:886,0,956 chrXIII 499738 . A G 705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.512;DP=99;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:735,0,1349 chrXIII 499915 . A T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;DP=130;Dels=0.00;FS=7.044;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1279,0,1518 chrXIII 499930 . A T 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.697;DP=134;Dels=0.00;FS=7.375;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.742;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1333,0,1551 chrXIII 500738 . A G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.462;DP=103;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.493;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1023,0,1213 chrXIII 500788 . G A 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2760,279,0 chrXIII 500943 . T C 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.964;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.343;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,52:129:99:947,0,1843 chrXIII 501060 . A G 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.875;DP=155;Dels=0.00;FS=6.070;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=2.792;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.734;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,59:155:99:1112,0,2074 chrXIII 501084 . T C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.575;DP=163;Dels=0.00;FS=2.787;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.030;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.709;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,70:163:99:1359,0,2022 chrXIII 501090 . C T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.842;DP=158;Dels=0.00;FS=3.712;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.862;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,69:158:99:1425,0,1896 chrXIII 501121 . C T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.775;DP=158;Dels=0.00;FS=5.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.051;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1526,0,1781 chrXIII 501143 . T G 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;DP=149;Dels=0.00;FS=27.823;HaplotypeScore=2.9297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.664;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1783,0,1492 chrXIII 501911 . T G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.729;DP=105;Dels=0.00;FS=6.250;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:943,0,1333 chrXIII 502051 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.445;DP=122;Dels=0.00;FS=5.658;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.518;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1218,0,1431 chrXIII 502860 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.070;DP=118;Dels=0.00;FS=8.505;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1229,0,1304 chrXIII 502941 . A G 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.055;DP=113;Dels=0.00;FS=3.515;HaplotypeScore=5.7087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.263;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.228;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:993,0,1436 chrXIII 503610 . C T 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.563;DP=107;Dels=0.00;FS=1.548;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=2.122;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.194;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1140,0,1191 chrXIII 503702 . C A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.904;DP=93;Dels=0.00;FS=1.776;HaplotypeScore=2.6000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.977;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,59:93:99:1427,0,646 chrXIII 504503 . A T 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;DP=109;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=1;MQRankSum=0.436;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.756;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1120,0,1255 chrXIII 505006 . C G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;DP=97;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQ0=2;MQRankSum=-0.998;QD=10.64;ReadPosRankSum=-3.114;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1062,0,885 chrXIII 505362 . G C 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;DP=64;Dels=0.00;FS=2.105;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:651,0,635 chrXIII 505551 . A G 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.126;DP=89;Dels=0.00;FS=3.993;HaplotypeScore=4.7538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:924,0,923 chrXIII 505690 . G A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.033;DP=103;Dels=0.00;FS=1.577;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.286;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1032,0,1152 chrXIII 505942 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.451;DP=115;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.493;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1222,0,1184 chrXIII 505945 . T C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.857;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=11.45;ReadPosRankSum=-2.125;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1335,0,1167 chrXIII 506166 . G C 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.786;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:925,0,1339 chrXIII 506241 . T C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.071;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.775;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:956,0,898 chrXIII 506403 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.835;DP=111;Dels=0.00;FS=2.554;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1137,0,1177 chrXIII 506838 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.148;DP=121;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.005;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1198,0,1428 chrXIII 506978 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.662;DP=157;Dels=0.00;FS=11.382;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1513,0,1690 chrXIII 507002 . C T 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.215;DP=134;Dels=0.00;FS=8.443;HaplotypeScore=2.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1216,0,1532 chrXIII 507039 . G C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;DP=113;Dels=0.00;FS=8.909;HaplotypeScore=6.9483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:113:99:1001,0,1288 chrXIII 507637 . A G 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.493;DP=133;Dels=0.00;FS=5.384;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1410,0,1539 chrXIII 507712 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.288;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1262,0,1506 chrXIII 507892 . A G 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.683;DP=152;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:1723,0,1506 chrXIII 508047 . G T 509.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;DP=127;Dels=0.00;FS=177.611;HaplotypeScore=25.4913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:539,0,1455 chrXIII 508090 . T C 606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.563;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,36:87:99:636,0,1212 chrXIII 508389 . G A 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.779;DP=155;Dels=0.00;FS=7.240;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1690,0,1422 chrXIII 508493 . G A 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.765;DP=152;Dels=0.00;FS=2.011;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.926;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:1711,0,1493 chrXIII 508552 . A G 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.056;DP=168;Dels=0.00;FS=0.568;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:168:99:1697,0,1902 chrXIII 508768 . G A 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=126;Dels=0.00;FS=3.230;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.921;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1467,0,1240 chrXIII 508918 . T G 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.428;DP=154;Dels=0.00;FS=3.775;HaplotypeScore=4.0146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1687,0,1555 chrXIII 509304 . A G 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.328;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.586;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1317,0,1651 chrXIII 509447 . G A 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.623;DP=172;Dels=0.00;FS=7.713;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=1;MQRankSum=-1.262;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.125;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,80:172:99:1697,0,1995 chrXIII 509594 . G T 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.411;DP=105;Dels=0.00;FS=2.043;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,67:105:99:1600,0,702 chrXIII 509848 . G T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.847;DP=128;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=3.2638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1061,0,1283 chrXIII 510166 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.923;DP=115;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.087;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1507,0,1075 chrXIII 510373 . A T 2396 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2429,246,0 chrXIII 510475 . C T 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.093;DP=157;Dels=0.00;FS=3.960;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.761;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1707,0,1570 chrXIII 510779 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.007;DP=123;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.322;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1413,0,1236 chrXIII 511069 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.635;DP=146;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.543;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1392,0,1664 chrXIII 511205 . G A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.829;DP=115;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1112,0,1375 chrXIII 511256 . A G 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.862;DP=128;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.893;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1230,0,1577 chrXIII 511606 . T G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.175;DP=123;Dels=0.00;FS=3.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.382;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1200,0,1341 chrXIII 511909 . A T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.046;DP=103;Dels=0.00;FS=3.733;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1279,0,948 chrXIII 512254 . C A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.548;DP=116;Dels=0.00;FS=3.502;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1370,0,1109 chrXIII 512272 . G A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1235,0,1113 chrXIII 512330 . C T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.832;DP=121;Dels=0.00;FS=8.454;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.424;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1515,0,1119 chrXIII 512343 . G T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.418;DP=116;Dels=0.00;FS=8.501;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.508;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1416,0,1121 chrXIII 512366 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.150;DP=118;Dels=0.00;FS=7.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.702;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1469,0,1145 chrXIII 512368 . A G 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.804;DP=120;Dels=0.00;FS=8.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.333;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1527,0,1186 chrXIII 512447 . A T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.907;DP=148;Dels=0.00;FS=4.917;HaplotypeScore=2.9181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.041;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1506,0,1719 chrXIII 512449 . G A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.035;DP=146;Dels=0.00;FS=3.911;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1425,0,1619 chrXIII 512520 . A G 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.601;DP=144;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.19;MQ0=0;MQRankSum=-3.892;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.638;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,60:144:99:1141,0,1787 chrXIII 512540 . G A 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.430;DP=135;Dels=0.00;FS=4.077;HaplotypeScore=51.0287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.45;MQ0=0;MQRankSum=-6.901;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1227,0,1560 chrXIII 512558 . A G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.715;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-8.788;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1105,0,1587 chrXIII 512693 . G C 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.123;DP=148;Dels=0.00;FS=2.979;HaplotypeScore=8.2651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.634;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,84:148:99:1723,0,1256 chrXIII 512725 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.331;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.735;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1235,0,1515 chrXIII 512809 . G A 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.002;DP=131;Dels=0.01;FS=4.265;HaplotypeScore=8.7891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.424;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.749;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:989,0,1757 chrXIII 512964 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.910;DP=134;Dels=0.00;FS=5.285;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.814;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1279,0,1624 chrXIII 513020 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;DP=118;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=3.4324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.097;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1339,0,1215 chrXIII 513049 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.055;DP=109;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=2.7738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.593;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1377,0,927 chrXIII 513096 . T C 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.724;DP=127;Dels=0.00;FS=3.240;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1367,0,1324 chrXIII 513097 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.026;DP=125;Dels=0.00;FS=3.268;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.052;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1366,0,1315 chrXIII 513130 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;DP=125;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.583;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:125:99:1384,0,1232 chrXIII 513160 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.500;DP=122;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.819;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1422,0,1108 chrXIII 513161 . A G 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;DP=118;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1402,0,1102 chrXIII 513259 . C A 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;DP=115;Dels=0.00;FS=6.159;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1475,0,1049 chrXIII 513285 . G A 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.941;DP=132;Dels=0.00;FS=7.209;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.499;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1506,0,1323 chrXIII 513345 . T C 1335.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.989;DP=131;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.168;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1365,0,1394 chrXIII 513350 . G A 1350.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.422;DP=127;Dels=0.00;FS=4.241;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.304;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.350;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1380,0,1239 chrXIII 513352 . G T 1363.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.164;DP=126;Dels=0.00;FS=4.282;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.996;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:126:99:1393,0,1210 chrXIII 513381 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.894;DP=119;Dels=0.00;FS=5.720;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.753;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.288;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1081,0,1230 chrXIII 513415 . G A 1092.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.232;DP=117;Dels=0.00;FS=1.516;HaplotypeScore=4.7348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQ0=0;MQRankSum=-3.760;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1122,0,1205 chrXIII 513420 . A T 973.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.873;DP=113;Dels=0.00;FS=9.492;HaplotypeScore=5.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=-5.605;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.243;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1003,0,1402 chrXIII 513425 . A T 904.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.443;DP=98;Dels=0.00;FS=1.963;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-5.525;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:934,0,1161 chrXIII 513448 . G T 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.663;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.85;MQ0=0;MQRankSum=-4.475;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.861;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1118,0,1376 chrXIII 513778 . C G 1812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.596;DP=170;Dels=0.00;FS=2.034;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:170:99:1842,0,1623 chrXIII 514118 . G A 709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.485;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.032;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:739,0,1059 chrXIII 514124 . T A 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.514;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:836,0,1213 chrXIII 514146 . C T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.970;DP=132;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=17.5484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=9.78;ReadPosRankSum=-2.333;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:131:99:1321,0,1233 chrXIII 514194 . A G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.497;DP=132;Dels=0.00;FS=2.295;HaplotypeScore=5.9542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=8.02;ReadPosRankSum=3.012;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:132:99:1089,0,1672 chrXIII 514210 . G C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;DP=131;Dels=0.00;FS=7.116;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.178;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1246,0,1549 chrXIII 514327 . T C 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.997;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.018;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,59:145:99:738,0,1715 chrXIII 514342 . C T 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.098;DP=126;Dels=0.00;FS=4.875;HaplotypeScore=2.3617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.797;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:831,0,1412 chrXIII 514631 . A T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;DP=135;Dels=0.01;FS=2.195;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=2.535;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.942;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1389,0,1445 chrXIII 515220 . G A 1864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.131;DP=170;Dels=0.00;FS=1.272;HaplotypeScore=4.6405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.212;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,86:170:99:1894,0,1681 chrXIII 515325 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.443;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.858;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.543;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1137,0,1058 chrXIII 515375 . G A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.830;DP=127;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=2.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.141;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1344,0,1025 chrXIII 515790 . G A 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.432;DP=141;Dels=0.00;FS=7.587;HaplotypeScore=6.5682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=10.84;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1558,0,1438 chrXIII 516109 . G A 4115.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4115,418,0 chrXIII 516134 . A G 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3718,388,0 chrXIII 516303 . A G 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.436;DP=154;Dels=0.00;FS=2.095;HaplotypeScore=6.2088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.034;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1707,0,1542 chrXIII 516485 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.175;DP=122;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=2.9818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1215,0,1377 chrXIII 516489 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.432;DP=113;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1096,0,1312 chrXIII 517211 . G A 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.795;DP=125;Dels=0.00;FS=3.317;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.644;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,47:125:99:903,0,1833 chrXIII 517277 . G A 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=28.05;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3674,364,0 chrXIII 517284 . G A 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.809;DP=134;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.696;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,51:134:99:949,0,1897 chrXIII 517375 . T A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;DP=126;Dels=0.00;FS=13.632;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.083;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1185,0,1506 chrXIII 517791 . G A 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.069;DP=136;Dels=0.00;FS=5.458;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.976;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:136:99:1638,0,1245 chrXIII 517795 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.702;DP=124;Dels=0.00;FS=4.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.187;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1477,0,1176 chrXIII 518064 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.949;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1113,0,1528 chrXIII 518109 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.904;DP=118;Dels=0.00;FS=9.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.304;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1073,0,1414 chrXIII 518430 . T A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;DP=116;Dels=0.00;FS=5.771;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.544;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1361,0,1236 chrXIII 518787 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.782;DP=116;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.272;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1331,0,1188 chrXIII 518835 . A G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.937;DP=127;Dels=0.00;FS=2.248;HaplotypeScore=3.3196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1165,0,1451 chrXIII 519240 . A G 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.675;DP=89;Dels=0.00;FS=9.347;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:1053,0,858 chrXIII 519372 . G T 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.270;DP=78;Dels=0.00;FS=7.677;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.281;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:940,0,726 chrXIII 519444 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.443;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.061;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1318,0,1261 chrXIII 519538 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.581;DP=111;Dels=0.00;FS=2.477;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.345;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1172,0,1240 chrXIII 519591 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.574;DP=88;Dels=0.00;FS=2.752;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:971,0,965 chrXIII 519681 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.300;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1190,0,1086 chrXIII 519722 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.097;DP=114;Dels=0.00;FS=7.379;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.378;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:114:99:1234,0,1137 chrXIII 519899 . A G 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.233;DP=124;Dels=0.00;FS=3.405;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=0.954;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.494;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,77:124:99:1637,0,947 chrXIII 519991 . C A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.806;DP=110;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=3.7990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1291,0,1093 chrXIII 520465 . C T 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.265;DP=121;Dels=0.00;FS=6.727;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.862;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.268;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,78:121:99:1800,0,795 chrXIII 520497 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;DP=96;Dels=0.00;FS=1.760;HaplotypeScore=2.8435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.558;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,59:96:99:1389,0,714 chrXIII 520680 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.444;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.612;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1482,0,1160 chrXIII 521041 . C T 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.101;DP=131;Dels=0.00;FS=4.157;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.095;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1589,0,1305 chrXIII 521861 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.840;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.160;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1456,0,1365 chrXIII 522060 . G A 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.527;DP=125;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.664;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1255,0,1479 chrXIII 522191 . C T 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.560;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.461;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.854;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1161,0,947 chrXIII 522201 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.685;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.797;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.721;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1296,0,973 chrXIII 522204 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.231;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.226;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1286,0,1138 chrXIII 522307 . A G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.140;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1233,0,1750 chrXIII 522381 . G C 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.631;DP=131;Dels=0.00;FS=5.303;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.839;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1367,0,1423 chrXIII 522692 . A G 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.241;DP=134;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1293,0,1487 chrXIII 523330 . T C 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.305;DP=85;Dels=0.00;FS=4.881;HaplotypeScore=2.6786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=10.56;ReadPosRankSum=-2.466;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:85:99:928,0,882 chrXIII 523390 . T A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;DP=116;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=2.3569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.381;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1314,0,1174 chrXIII 523523 . C T 1922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.487;DP=150;Dels=0.00;FS=4.976;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.058;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,91:150:99:1952,0,1102 chrXIII 523621 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.308;DP=110;Dels=0.00;FS=6.009;HaplotypeScore=8.9382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.420;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1246,0,1124 chrXIII 524154 . A G 1927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.357;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,92:157:99:1957,0,1327 chrXIII 524178 . T G 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.335;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1623,0,1354 chrXIII 524205 . A C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.815;DP=135;Dels=0.00;FS=2.184;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.817;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.592;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1466,0,1420 chrXIII 524221 . T G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;DP=145;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=3.6817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:145:99:1422,0,1560 chrXIII 524234 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.550;DP=125;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=2.4780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1318,0,1316 chrXIII 524320 . T A 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;DP=158;Dels=0.00;FS=1.249;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1628,0,1768 chrXIII 524617 . A C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.608;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.052;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1206,0,1110 chrXIII 525537 . C T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.508;DP=122;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.329;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1504,0,1175 chrXIII 526242 . C T 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.334;DP=132;Dels=0.00;FS=2.309;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:132:99:1482,0,1195 chrXIII 526365 . T C 688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.398;DP=102;Dels=0.00;FS=5.211;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.360;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:102:99:718,0,1507 chrXIII 526419 . A G 696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.686;DP=115;Dels=0.00;FS=11.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.151;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-1.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,40:115:99:726,0,1731 chrXIII 526584 . T A 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;DP=93;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.008;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:858,0,1248 chrXIII 526677 . T C 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.979;DP=150;Dels=0.00;FS=5.945;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.051;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1650,0,1604 chrXIII 526917 . C T 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.342;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1882,0,1337 chrXIII 526932 . T A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.296;DP=123;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1498,0,1204 chrXIII 526971 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.481;DP=117;Dels=0.00;FS=3.391;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.324;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1236,0,1234 chrXIII 527101 . C T 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.037;DP=141;Dels=0.00;FS=3.046;HaplotypeScore=6.8335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1529,0,1542 chrXIII 527163 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.334;DP=144;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1295,0,1723 chrXIII 527250 . A T 1975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;DP=153;Dels=0.00;FS=1.298;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.220;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,89:153:99:2005,0,1353 chrXIII 527389 . A T 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.449;DP=133;Dels=0.00;FS=10.736;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.558;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1548,0,1380 chrXIII 527489 . A G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.219;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1165,0,1635 chrXIII 527588 . A G 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.055;DP=133;Dels=0.00;FS=4.135;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.525;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1522,0,1387 chrXIII 527602 . A C 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.229;DP=138;Dels=0.00;FS=3.005;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.019;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.074;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1542,0,1499 chrXIII 527976 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.253;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.158;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1436,0,1465 chrXIII 528307 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.315;DP=107;Dels=0.00;FS=9.246;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.583;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1145,0,1233 chrXIII 528368 . T C 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.758;DP=110;Dels=0.00;FS=2.478;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.792;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.642;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:839,0,1429 chrXIII 528469 . A G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.136;DP=109;Dels=0.00;FS=2.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.876;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.058;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1020,0,1272 chrXIII 528484 . T C 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.148;DP=106;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1014,0,1239 chrXIII 528502 . C T 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.501;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1065,0,1168 chrXIII 529347 . A G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.746;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.267;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:99:99:934,0,1129 chrXIII 529973 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.468;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1197,0,1059 chrXIII 530330 . A G 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.710;DP=97;Dels=0.00;FS=1.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.115;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:941,0,1016 chrXIII 530518 . T A 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;DP=107;Dels=0.00;FS=3.603;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1082,0,1250 chrXIII 530525 . T G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1136,0,1184 chrXIII 530620 . C T 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.413;DP=149;Dels=0.00;FS=7.242;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=11.87;ReadPosRankSum=-2.295;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1799,0,1460 chrXIII 530897 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.754;DP=124;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.715;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1444,0,1104 chrXIII 530917 . C A 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.996;DP=84;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.608;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:1006,0,850 chrXIII 531100 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.489;DP=119;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.946;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1507,0,1093 chrXIII 531873 . G T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.771;DP=118;Dels=0.00;FS=0.881;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.649;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:1123,0,1456 chrXIII 532289 . G A 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.548;DP=153;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1683,0,1574 chrXIII 532595 . C T 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.413;DP=109;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:919,0,1474 chrXIII 532667 . A C 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.672;DP=86;Dels=0.00;FS=2.852;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:859,0,1064 chrXIII 532677 . T C 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.309;DP=86;Dels=0.00;FS=1.734;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.980;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:864,0,1027 chrXIII 532703 . A G 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.824;DP=97;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.391;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:841,0,1287 chrXIII 532942 . A G 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.159;DP=96;Dels=0.00;FS=2.727;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.963;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,38:96:99:755,0,1307 chrXIII 533018 . C G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;DP=109;Dels=0.00;FS=5.997;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.991;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1078,0,1234 chrXIII 533917 . G A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.881;DP=130;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=2.9600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.249;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.450;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1582,0,1263 chrXIII 533975 . T C 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.815;DP=123;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1529,0,1048 chrXIII 534586 . T A 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1487,0,1577 chrXIII 534609 . G T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.385;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.681;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1512,0,1305 chrXIII 534912 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.355;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.944;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1337,0,1392 chrXIII 535031 . C T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.193;DP=127;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.137;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1202,0,1430 chrXIII 535268 . G A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.426;DP=116;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=3.2933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.448;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1359,0,1171 chrXIII 535373 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.133;DP=161;Dels=0.00;FS=1.998;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.005;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,67:161:99:1399,0,2000 chrXIII 535619 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;DP=116;Dels=0.00;FS=2.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.651;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1473,0,1108 chrXIII 535737 . A C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.127;DP=121;Dels=0.00;FS=1.455;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.054;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1122,0,1406 chrXIII 535756 . A C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.973;DP=100;Dels=0.00;FS=6.603;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.875;QD=11.27;ReadPosRankSum=-2.168;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1157,0,963 chrXIII 536035 . T C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.934;DP=112;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1291,0,1067 chrXIII 536231 . A G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.634;DP=117;Dels=0.00;FS=5.722;HaplotypeScore=2.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.521;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1275,0,1181 chrXIII 536393 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.099;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1331,0,1091 chrXIII 536440 . G A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.590;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1097,0,983 chrXIII 536512 . C T 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.104;DP=84;Dels=0.00;FS=2.966;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:936,0,764 chrXIII 536833 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.718;DP=113;Dels=0.00;FS=4.894;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=1;MQRankSum=-1.078;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1199,0,1269 chrXIII 536835 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.932;DP=115;Dels=0.00;FS=6.313;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=1.601;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.655;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1275,0,1234 chrXIII 536848 . T A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;DP=113;Dels=0.00;FS=7.812;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.405;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1240,0,1312 chrXIII 536887 . A C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.850;DP=129;Dels=0.00;FS=6.806;HaplotypeScore=3.8191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1396,0,1339 chrXIII 536982 . C T 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.346;DP=148;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1523,0,1577 chrXIII 537514 . A G 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.299;DP=107;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.327;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1147,0,1206 chrXIII 537942 . G A 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.350;DP=164;Dels=0.00;FS=9.478;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,78:164:99:1703,0,1796 chrXIII 539411 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.032;DP=137;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.122;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1290,0,1563 chrXIII 540031 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.937;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.925;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1264,0,1246 chrXIII 540088 . C A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;DP=129;Dels=0.00;FS=7.007;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1466,0,1366 chrXIII 540944 . G T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.789;DP=114;Dels=0.00;FS=9.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.811;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:911,0,1555 chrXIII 541716 . C T 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.790;DP=161;Dels=0.00;FS=3.647;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1522,0,1834 chrXIII 542066 . A G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.417;DP=128;Dels=0.00;FS=5.538;HaplotypeScore=3.6520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.410;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1275,0,1529 chrXIII 542119 . T A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.610;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1411,0,1817 chrXIII 542277 . C T 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.707;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,54:142:99:1011,0,1708 chrXIII 542926 . T A 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;DP=164;Dels=0.00;FS=2.723;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.426;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:1745,0,1900 chrXIII 543392 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.419;DP=131;Dels=0.00;FS=4.160;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=2.679;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1457,0,1450 chrXIII 544007 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.801;DP=114;Dels=0.00;FS=10.590;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1109,0,1341 chrXIII 544756 . A G 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.236;DP=113;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.580;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1030,0,1386 chrXIII 545520 . C T 2782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.908;DP=217;Dels=0.00;FS=4.753;HaplotypeScore=23.8844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.954;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,127:217:99:2812,0,1740 chrXIII 547537 . C T 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.621;DP=118;Dels=0.00;FS=9.014;HaplotypeScore=4.6087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1131,0,1259 chrXIII 548657 . C T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.682;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1568,0,1137 chrXIII 551094 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.843;DP=143;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=2.8765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.714;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1461,0,1683 chrXIII 551473 . G A 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.073;DP=161;Dels=0.00;FS=2.763;HaplotypeScore=2.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.763;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1791,0,1663 chrXIII 552311 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.264;DP=122;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=3.7966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.344;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1370,0,1294 chrXIII 552364 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.901;DP=115;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1187,0,1178 chrXIII 554421 . T C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.305;DP=127;Dels=0.00;FS=5.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1143,0,1547 chrXIII 554664 . A G 1891 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.88;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1924,201,0 chrXIII 554724 . T G 2078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2111,219,0 chrXIII 554817 . G A 2356 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.857;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=25.89;ReadPosRankSum=-1.390;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2389,217,0 chrXIII 554844 . G A 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2624,237,0 chrXIII 555036 . G C 3788.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3788,370,0 chrXIII 555078 . A G 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3202,315,0 chrXIII 555522 . C T 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3099,304,0 chrXIII 555756 . G A 3720.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3720,355,0 chrXIII 555852 . G A 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3311,322,0 chrXIII 556209 . T C 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2733,294,0 chrXIII 556437 . G A 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3058,307,0 chrXIII 556842 . G A 4653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.85;SB=-2.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:180:99:4653,436,0 chrXIII 557358 . G A 4504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.632;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=26.03;ReadPosRankSum=0.431;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:4504,431,0 chrXIII 557425 . G A 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3205,324,0 chrXIII 558486 . T C 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3572,361,0 chrXIII 558853 . A G 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.21;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3850,393,0 chrXIII 558877 . G A 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=126.0116;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.29;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.965e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3560,346,0 chrXIII 558886 . A G 48.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=0.35;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:9:81,9,0 chrXIII 558987 . A G 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.47;SB=-2.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4075,417,0 chrXIII 559132 . G T 2319 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.26;MQ0=0;QD=22.74;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2352,234,0 chrXIII 559312 . A C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3136,321,0 chrXIII 559878 . G A 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8778;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3090,304,0 chrXIII 560086 . T C 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.049;DP=98;Dels=0.00;FS=4.007;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=10.87;ReadPosRankSum=-2.176;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1095,0,1102 chrXIII 560210 . A C 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2649,285,0 chrXIII 560261 . G C 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3150,324,0 chrXIII 560317 . C T 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2769,274,0 chrXIII 560337 . T C 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3198,333,0 chrXIII 560911 . G A 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3691,367,0 chrXIII 560915 . A G 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3572,378,0 chrXIII 561020 . G A 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.356;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.506;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:3502,313,0 chrXIII 561132 . G C 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.816;DP=111;Dels=0.00;FS=1.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:869,0,1421 chrXIII 561390 . C T 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3071,312,0 chrXIII 561510 . A G 2216 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2249,231,0 chrXIII 561662 . A G 2363 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.14;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2396,240,0 chrXIII 561922 . A T 1633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.7844;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=26.34;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1666,162,0 chrXIII 562601 . C T 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3876,388,0 chrXIII 562620 . T C 3802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3802,370,0 chrXIII 562752 . A G 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3158,321,0 chrXIII 562796 . T C 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3415,351,0 chrXIII 562848 . T C 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=97.4193;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2908,297,0 chrXIII 562900 . G T 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3592,349,0 chrXIII 562933 . T C 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.07;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3168,324,0 chrXIII 562955 . T C 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.07;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3083,321,0 chrXIII 563052 . C G 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3697,378,0 chrXIII 563079 . G A 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3486,349,0 chrXIII 563083 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.442;DP=129;Dels=0.00;FS=5.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.742;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1259,0,1506 chrXIII 563456 . G A 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3689,358,0 chrXIII 563599 . G A 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3511,340,0 chrXIII 563796 . G T 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=28.26;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3226,322,0 chrXIII 563800 . G T 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=28.57;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3262,322,0 chrXIII 563933 . G A 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=28.32;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3597,358,0 chrXIII 564175 . G A 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=27.01;ReadPosRankSum=1.003;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3592,355,0 chrXIII 564541 . T A 2623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.72;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2656,267,0 chrXIII 565076 . C T 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=27.17;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3777,370,0 chrXIII 565181 . T C 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2707,294,0 chrXIII 565236 . C T 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2953,298,0 chrXIII 565315 . T A 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.82;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2692,261,0 chrXIII 566017 . A G 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3080,321,0 chrXIII 566147 . G A 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=27.71;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3796,370,0 chrXIII 566257 . C T 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3642,370,0 chrXIII 566485 . T C 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3728,373,0 chrXIII 566498 . G A 4160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4160,403,0 chrXIII 566527 . T A 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=28.25;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3672,358,0 chrXIII 566650 . G A 4380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=28.08;SB=-1.934e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4380,424,0 chrXIII 566965 . A G 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3628,370,0 chrXIII 566975 . T C 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3246,354,0 chrXIII 567013 . A T 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;DP=151;Dels=0.00;FS=3.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.700;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3921,388,0 chrXIII 567075 . C T 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=1;QD=27.78;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3472,337,0 chrXIII 567163 . A G 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3176,330,0 chrXIII 567577 . C T 3863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3863,382,0 chrXIII 567592 . T A 3997.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3997,391,0 chrXIII 567978 . T C 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.72;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2833,285,0 chrXIII 568056 . C G 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.10;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2930,288,0 chrXIII 568072 . T A 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.15;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2857,279,0 chrXIII 568174 . A C 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3642,369,0 chrXIII 568210 . G C 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3705,370,0 chrXIII 568220 . G A 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3603,346,0 chrXIII 568443 . G A 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3495,337,0 chrXIII 568527 . G A 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3210,316,0 chrXIII 568577 . A G 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3732,379,0 chrXIII 568585 . A G 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3854,396,0 chrXIII 568827 . G A 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.509;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1002,0,1282 chrXIII 569109 . T A 1416 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.84;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1449,141,0 chrXIII 569174 . C A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.481;DP=108;Dels=0.00;FS=9.216;HaplotypeScore=3.9684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.555;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1210,0,1122 chrXIII 569416 . A G 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.340;DP=97;Dels=0.00;FS=3.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:900,0,1201 chrXIII 569699 . G A 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.787;DP=101;Dels=0.00;FS=4.900;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.256;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:101:99:1188,0,974 chrXIII 569786 . G A 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3549,349,0 chrXIII 569867 . C T 4483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4483,436,0 chrXIII 570272 . T C 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.296;DP=111;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=5.4643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.186;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1064,0,1204 chrXIII 570462 . A G 2279 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2312,243,0 chrXIII 571001 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.350;DP=120;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.042;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1202,0,1284 chrXIII 571024 . C T 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2904,280,0 chrXIII 571039 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.919;DP=101;Dels=0.00;FS=1.623;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1053,0,1011 chrXIII 571067 . A G 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2923,309,0 chrXIII 571144 . A G 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3398,348,0 chrXIII 571170 . G T 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3079,310,0 chrXIII 571172 . T A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;DP=117;Dels=0.00;FS=2.559;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.467;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.504;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1173,0,1297 chrXIII 571183 . T A 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3110,310,0 chrXIII 571242 . G A 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.656;DP=108;Dels=0.00;FS=5.794;HaplotypeScore=105.2048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:873,0,1151 chrXIII 571267 . G A 105.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.097;DP=118;Dels=0.01;FS=92.200;HaplotypeScore=10.0611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=0.89;ReadPosRankSum=-7.814;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,34:117:99:135,0,789 chrXIII 571441 . T C 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3044,318,0 chrXIII 571835 . G A 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3364,325,0 chrXIII 571917 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.958;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.574;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1238,0,1062 chrXIII 572003 . T C 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2972,300,0 chrXIII 572164 . A T 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.787;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=1;MQRankSum=0.911;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:841,0,1464 chrXIII 572364 . T G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.159;DP=159;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=3.7006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.573;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1516,0,1892 chrXIII 572476 . T C 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3158,333,0 chrXIII 572646 . C T 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3572,361,0 chrXIII 572799 . A G 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3233,330,0 chrXIII 572826 . T C 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.118;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.706;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1454,0,1560 chrXIII 572957 . G A 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2488,252,0 chrXIII 572966 . G T 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.453;DP=101;Dels=0.00;FS=6.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=9.79;ReadPosRankSum=2.149;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:1019,0,1195 chrXIII 572969 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.635;DP=103;Dels=0.00;FS=5.006;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.748;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:1005,0,1218 chrXIII 572995 . C T 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3186,307,0 chrXIII 573006 . C A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.325;DP=114;Dels=0.00;FS=2.380;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=11.50;ReadPosRankSum=2.217;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1341,0,1112 chrXIII 573126 . G T 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=27.30;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3172,324,0 chrXIII 573151 . C T 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3513,349,0 chrXIII 573263 . A G 3908.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6793;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=1;QD=24.43;SB=-2.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:3908,432,0 chrXIII 573340 . T A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;DP=142;Dels=0.00;FS=4.349;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.716;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1519,0,1573 chrXIII 573404 . C T 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2662,261,0 chrXIII 573842 . C T 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2964,292,0 chrXIII 573857 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.668;DP=107;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1264,0,1055 chrXIII 574079 . G A 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.46;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2757,276,0 chrXIII 574080 . C G 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.34;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2662,273,0 chrXIII 574719 . A T 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3088,310,0 chrXIII 574866 . T C 2654 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2687,294,0 chrXIII 575028 . T C 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3575,363,0 chrXIII 575060 . A G 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3469,366,0 chrXIII 575086 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.556;DP=107;Dels=0.00;FS=7.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.180;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,63:107:99:1349,0,926 chrXIII 575098 . G A 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3019,295,0 chrXIII 575128 . G T 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2918,286,0 chrXIII 575458 . A T 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.286;DP=114;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.838;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1098,0,1351 chrXIII 575668 . T C 2522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2555,264,0 chrXIII 576343 . C T 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2886,288,0 chrXIII 576367 . A G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.235;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1267,0,1157 chrXIII 577405 . C T 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.541;DP=150;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=5.8982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.312;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,63:150:99:1398,0,1842 chrXIII 577667 . G C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.919;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1134,0,1392 chrXIII 577768 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.365;DP=133;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1272,0,1567 chrXIII 578132 . T C 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.600;DP=84;Dels=0.00;FS=1.845;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.226;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:833,0,1008 chrXIII 578498 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.800;DP=106;Dels=0.00;FS=13.674;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.918;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1096,0,1200 chrXIII 578615 . T G 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.526;DP=115;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1034,0,1462 chrXIII 579159 . T C 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3326,351,0 chrXIII 579347 . T C 2498 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2531,267,0 chrXIII 579452 . T C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.34;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3076,315,0 chrXIII 579563 . C T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;DP=128;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=9.48;ReadPosRankSum=2.734;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1243,0,1527 chrXIII 579707 . A G 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3225,327,0 chrXIII 579851 . G A 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.455;DP=127;Dels=0.00;FS=4.570;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.061;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,75:127:99:1667,0,1014 chrXIII 579968 . T C 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2992,306,0 chrXIII 580121 . A G 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3625,361,0 chrXIII 580496 . A T 1887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;DP=152;Dels=0.00;FS=5.954;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.980;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1917,0,1403 chrXIII 581966 . C T 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3047,295,0 chrXIII 582482 . T C 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3494,348,0 chrXIII 582623 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=91;Dels=0.00;FS=3.961;HaplotypeScore=2.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:1068,0,935 chrXIII 582716 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.422;DP=116;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=3.8109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=2.720;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.000;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:1044,0,1522 chrXIII 582869 . A G 2083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.063;DP=83;Dels=0.00;FS=3.876;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.730;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:83:99:2116,195,0 chrXIII 582899 . G A 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.173;DP=79;Dels=0.00;FS=0.855;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.770;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:809,0,806 chrXIII 583028 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.650;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.811;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1424,0,1210 chrXIII 583133 . A T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;DP=139;Dels=0.00;FS=8.952;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1649,0,1488 chrXIII 583319 . G A 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.155;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=8.88;ReadPosRankSum=-2.348;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1105,0,952 chrXIII 583556 . A G 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.680;DP=136;Dels=0.00;FS=3.150;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.512;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:136:99:1552,0,1257 chrXIII 583831 . T C 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.546;DP=97;Dels=0.00;FS=1.640;HaplotypeScore=2.9252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:886,0,1181 chrXIII 584026 . T C 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2859,297,0 chrXIII 584211 . A C 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2752,276,0 chrXIII 584261 . A T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.648;DP=106;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=11.07;ReadPosRankSum=-2.837;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1203,0,1203 chrXIII 584279 . C G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;DP=105;Dels=0.00;FS=6.186;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.753;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1171,0,1149 chrXIII 584328 . C T 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3007,298,0 chrXIII 584406 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.873;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1260,0,1423 chrXIII 584569 . C T 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=1;QD=27.37;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2743,274,0 chrXIII 584623 . T C 2162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=1;QD=22.29;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2195,228,0 chrXIII 584832 . A G 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9537;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=1;QD=25.82;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3512,354,0 chrXIII 584970 . G A 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3592,355,0 chrXIII 585021 . T G 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:148:99:3723,375,0 chrXIII 585141 . A G 3963.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=1;QD=27.14;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3963,400,0 chrXIII 585165 . T C 4400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=1;QD=27.16;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4400,436,0 chrXIII 585555 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.167;DP=145;Dels=0.00;FS=2.106;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=1.724;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.852;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:145:99:1370,0,1801 chrXIII 585609 . A G 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=1;QD=25.32;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3292,345,0 chrXIII 585693 . C A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.097;DP=109;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.292;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1072,0,1288 chrXIII 585807 . A T 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3113,310,0 chrXIII 585859 . G A 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=1;QD=27.17;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3586,358,0 chrXIII 585987 . A G 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3395,351,0 chrXIII 586147 . C G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.45;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3181,316,0 chrXIII 586462 . G A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.339;DP=98;Dels=0.00;FS=3.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=9.82;ReadPosRankSum=2.139;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:992,0,1169 chrXIII 586528 . T C 616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.753;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.076;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,36:107:99:646,0,1657 chrXIII 586622 . T C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.435;DP=109;Dels=0.00;FS=2.505;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.429;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:956,0,1324 chrXIII 586726 . T A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;DP=112;Dels=0.00;FS=9.075;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1277,0,1214 chrXIII 586744 . C T 3496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3496,349,0 chrXIII 586753 . T C 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.954;DP=121;Dels=0.00;FS=0.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.506;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1054,0,1403 chrXIII 586759 . T C 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;QD=25.93;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3067,315,0 chrXIII 586795 . T G 2426 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2459,252,0 chrXIII 586970 . T G 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;DP=142;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1414,0,1634 chrXIII 587179 . T C 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.822;DP=112;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=3.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.636;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,44:112:99:918,0,1563 chrXIII 587257 . T G 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2646,279,0 chrXIII 587493 . T G 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=25.17;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3205,333,0 chrXIII 587559 . T G 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=24.56;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2833,303,0 chrXIII 587600 . A G 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2833,303,0 chrXIII 587658 . A G 1228 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.200;DP=82;Dels=0.00;FS=2.118;HaplotypeScore=60.9443;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.70;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.011;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,56:82:92:1261,92,0 chrXIII 587665 . T C 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.213;DP=83;Dels=0.00;FS=3.167;HaplotypeScore=54.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.670;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:814,0,156 chrXIII 587677 . C T 1070.64 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.687;DP=79;Dels=0.00;FS=1.004;HaplotypeScore=81.8881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=13.55;ReadPosRankSum=-3.202;SB=-5.806e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,58:79:11:1103,11,0 chrXIII 587679 . A G 462.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.319;DP=82;Dels=0.00;FS=13.918;HaplotypeScore=101.2022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.33;MQ0=0;MQRankSum=3.187;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.371;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:492,0,552 chrXIII 587685 . A G 176.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;DP=82;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=142.4279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.025;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.462;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,14:82:99:206,0,791 chrXIII 587686 . C T 296.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.229;DP=80;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=147.0596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.79;MQ0=0;MQRankSum=-4.227;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:80:99:326,0,676 chrXIII 587695 . T C 115.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.621;DP=86;Dels=0.00;FS=20.079;HaplotypeScore=209.2415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.23;MQ0=0;MQRankSum=2.063;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.302;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,12:86:99:145,0,903 chrXIII 587697 . A G 212.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.346;DP=84;Dels=0.00;FS=3.813;HaplotypeScore=184.5339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.91;MQ0=0;MQRankSum=-3.366;QD=2.52;ReadPosRankSum=-3.617;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,16:84:99:242,0,716 chrXIII 587703 . A G 148.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.816;DP=93;Dels=0.03;FS=6.696;HaplotypeScore=89.2668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.25;MQ0=0;MQRankSum=-3.685;QD=1.59;ReadPosRankSum=-3.116;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,12:90:99:178,0,779 chrXIII 587706 . A G 459.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.116;DP=95;Dels=0.04;FS=9.981;HaplotypeScore=82.2994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.50;MQ0=0;MQRankSum=2.174;QD=4.83;ReadPosRankSum=2.192;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,65:91:99:489,0,478 chrXIII 587715 . G A 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.386;DP=95;Dels=0.00;FS=6.944;HaplotypeScore=40.1031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.79;MQ0=0;MQRankSum=1.776;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.063;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,75:95:99:753,0,280 chrXIII 587939 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.360;DP=113;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.129;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1259,0,1210 chrXIII 587969 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.649;DP=144;Dels=0.01;FS=2.113;HaplotypeScore=11.2128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.181;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1374,0,1519 chrXIII 588112 . C T 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.269;DP=146;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1708,0,1276 chrXIII 588348 . G A 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.966;DP=90;Dels=0.00;FS=2.783;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:935,0,962 chrXIII 588573 . C T 731.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.022;DP=98;Dels=0.00;FS=22.592;HaplotypeScore=21.3485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.07;MQ0=0;MQRankSum=-3.435;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.627;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,41:98:99:761,0,1108 chrXIII 588576 . T C 685.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.314;DP=98;Dels=0.00;FS=17.655;HaplotypeScore=29.1736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.110;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,39:98:99:715,0,1171 chrXIII 588579 . A T 748.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;DP=96;Dels=0.04;FS=24.482;HaplotypeScore=29.2004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.937;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:92:99:778,0,1084 chrXIII 588585 . T C 818.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.890;DP=97;Dels=0.00;FS=12.768;HaplotypeScore=34.0598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.290;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:97:99:848,0,929 chrXIII 588597 . T C 1684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-4.867;DP=93;Dels=0.00;FS=13.466;HaplotypeScore=62.6799;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=18.11;ReadPosRankSum=3.260;SB=-5.929e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,76:93:85:1717,85,0 chrXIII 588600 . C T 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.944;DP=91;Dels=0.00;FS=27.384;HaplotypeScore=69.5559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=6.82;ReadPosRankSum=2.382;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,36:91:99:651,0,915 chrXIII 588609 . C T 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.162;DP=99;Dels=0.00;FS=5.368;HaplotypeScore=71.7450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.236;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:828,0,771 chrXIII 588618 . T C 701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.341;DP=103;Dels=0.00;FS=2.735;HaplotypeScore=74.2240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=6.81;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,39:103:99:731,0,918 chrXIII 588627 . C T 453.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.328;DP=91;Dels=0.02;FS=12.634;HaplotypeScore=128.9939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.03;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.981;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:483,0,626 chrXIII 588630 . T C 77.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.331;DP=91;Dels=0.00;FS=2.081;HaplotypeScore=162.6678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.03;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=0.85;ReadPosRankSum=0.019;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:91:99:107,0,988 chrXIII 588636 . T C 148.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.634;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=183.6638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.53;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=1.64;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,26:90:99:178,0,801 chrXIII 588639 . T C 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.614;DP=87;Dels=0.00;FS=7.636;HaplotypeScore=139.2572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.68;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=0.56;ReadPosRankSum=0.608;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:79:79,0,840 chrXIII 588645 . T C 457.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.499;DP=99;Dels=0.00;FS=36.000;HaplotypeScore=107.9669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.089;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.392;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,33:99:99:487,0,739 chrXIII 588651 . T C 106.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.253;DP=88;Dels=0.00;FS=0.866;HaplotypeScore=105.7793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.468;QD=1.20;ReadPosRankSum=-2.442;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:88:99:136,0,992 chrXIII 588660 . C T 65.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.152;DP=82;Dels=0.05;FS=6.618;HaplotypeScore=65.2775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=0.79;ReadPosRankSum=-2.057;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:78:95:95,0,825 chrXIII 588661 . T G 619.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.266;DP=82;Dels=0.00;FS=4.521;HaplotypeScore=61.3077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.39;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=7.55;ReadPosRankSum=3.873;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,40:82:99:649,0,288 chrXIII 588669 . T C 164.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.713;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.6484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.818;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.568;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:194,0,911 chrXIII 588673 . G T 187.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.335;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.134;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.846;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:217,0,879 chrXIII 588678 . A T 213.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;DP=85;Dels=0.00;FS=0.926;HaplotypeScore=7.8522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.195;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,31:85:99:243,0,998 chrXIII 588684 . G T 322.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.014;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.335;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.630;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,35:87:99:352,0,954 chrXIII 588685 . G T 321.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.977;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.601;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.801;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:88:99:351,0,1004 chrXIII 588807 . G A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.088;DP=169;Dels=0.00;FS=0.582;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.685;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,79:169:99:1553,0,1995 chrXIII 588927 . T A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.200;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1194,0,1063 chrXIII 589273 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.560;DP=91;Dels=0.00;FS=4.438;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.187;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:1042,0,974 chrXIII 589360 . A C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.969;DP=106;Dels=0.00;FS=3.613;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=11.51;ReadPosRankSum=-1.095;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1250,0,997 chrXIII 589414 . A G 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3116,315,0 chrXIII 589567 . T C 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.000;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1485,0,1486 chrXIII 589588 . T C 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3887,388,0 chrXIII 589730 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.823;DP=134;Dels=0.00;FS=14.138;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=10.60;ReadPosRankSum=-2.063;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1451,0,1362 chrXIII 589854 . A G 2394 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.60;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2427,255,0 chrXIII 589966 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.622;DP=132;Dels=0.00;FS=6.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.941;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.494;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1204,0,1545 chrXIII 590222 . T C 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.428;DP=126;Dels=0.00;FS=3.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.146;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1277,0,1428 chrXIII 590322 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.990;DP=118;Dels=0.00;FS=3.347;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.228;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1388,0,1123 chrXIII 590486 . T C 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3305,348,0 chrXIII 590607 . C T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.439;DP=113;Dels=0.00;FS=4.707;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.441;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1119,0,1279 chrXIII 590621 . T C 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.949;DP=122;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1173,0,1428 chrXIII 590776 . C T 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.618;DP=107;Dels=0.00;FS=2.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.477;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,43:107:99:737,0,1415 chrXIII 590779 . G A 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.017;DP=96;Dels=0.00;FS=1.834;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,56:96:99:1305,0,779 chrXIII 590865 . A G 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.484;DP=151;Dels=0.00;FS=5.927;HaplotypeScore=7.6907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=9.17;ReadPosRankSum=-2.392;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:151:99:1414,0,1808 chrXIII 590873 . T G 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.761;DP=159;Dels=0.00;FS=8.119;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.066;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:1780,0,1540 chrXIII 591086 . C T 1796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.538;DP=156;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1826,0,1447 chrXIII 591144 . A G 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.998;DP=99;Dels=0.00;FS=1.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.237;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:833,0,1303 chrXIII 591198 . A G 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.241;DP=109;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=2.3218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.798;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:924,0,1374 chrXIII 591204 . T C 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.137;DP=104;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.422;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:858,0,1239 chrXIII 591330 . G A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.903;DP=143;Dels=0.00;FS=4.059;HaplotypeScore=5.4506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.571;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,60:143:99:1243,0,1869 chrXIII 591533 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.667;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1165,0,1587 chrXIII 591723 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.391;DP=147;Dels=0.00;FS=3.954;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.135;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1578,0,1522 chrXIII 591795 . A G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.025;DP=130;Dels=0.00;FS=7.869;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.946;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.070;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1253,0,1505 chrXIII 591930 . G A 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.877;DP=153;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.791;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,80:153:99:1830,0,1500 chrXIII 592037 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.823;DP=124;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.317;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1371,0,1237 chrXIII 592096 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.935;DP=137;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.742;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1413,0,1465 chrXIII 592200 . C T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.557;DP=139;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.669;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1479,0,1402 chrXIII 592335 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.572;DP=137;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1233,0,1410 chrXIII 592371 . G A 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.152;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.810;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1326,0,1276 chrXIII 592658 . T G 4304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8212;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4304,442,0 chrXIII 592706 . T C 4278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.74;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4278,441,0 chrXIII 592735 . T C 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.787e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3885,391,0 chrXIII 593987 . T C 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.184;DP=116;Dels=0.00;FS=8.647;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.597;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1115,0,1366 chrXIII 594280 . T A 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3392,351,0 chrXIII 594379 . T C 1937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.051;DP=152;Dels=0.00;FS=1.301;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,92:152:99:1967,0,1214 chrXIII 595437 . C T 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3550,346,0 chrXIII 595697 . T C 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3132,327,0 chrXIII 595728 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.181;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:131:99:1280,0,1552 chrXIII 595738 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.366;DP=128;Dels=0.00;FS=4.357;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.101;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1251,0,1503 chrXIII 596239 . A G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.720;DP=115;Dels=0.00;FS=1.505;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.495;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1250,0,1242 chrXIII 596706 . A C 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=164;Dels=0.00;FS=8.049;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.883;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.107;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,80:164:99:1745,0,1923 chrXIII 596732 . T C 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.427;DP=183;Dels=0.00;FS=9.808;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.063;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,90:183:99:1865,0,2039 chrXIII 596965 . G T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.788;DP=118;Dels=0.00;FS=2.409;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.672;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1436,0,1151 chrXIII 597117 . G C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;DP=126;Dels=0.00;FS=2.287;HaplotypeScore=2.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.580;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1381,0,1262 chrXIII 597167 . A G 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8265;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3640,375,0 chrXIII 597292 . T C 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.955;DP=111;Dels=0.00;FS=3.593;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=12.72;ReadPosRankSum=2.025;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,68:111:99:1442,0,926 chrXIII 597636 . A C 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3281,336,0 chrXIII 597709 . G C 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3222,321,0 chrXIII 597926 . G T 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=28.20;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3864,382,0 chrXIII 598154 . G A 4198.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4198,421,0 chrXIII 598391 . G A 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.758;DP=148;Dels=0.00;FS=2.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1681,0,1485 chrXIII 598890 . G A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.145;DP=133;Dels=0.00;FS=9.465;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.471;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1254,0,1651 chrXIII 598971 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.248;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.882;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.955;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:123:99:1313,0,1381 chrXIII 599192 . T C 4191.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.21;SB=-2.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4191,421,0 chrXIII 599730 . A G 2992 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.62;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3025,321,0 chrXIII 599732 . C T 3230.05 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3264,330,0 chrXIII 599735 . T C 3048 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.28;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3081,315,0 chrXIII 599808 . G A 1156.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.883;DP=129;Dels=0.00;FS=4.447;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.71;MQ0=9;MQRankSum=-0.750;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1186,0,1347 chrXIII 599973 . C T 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.24;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3466,340,0 chrXIII 600354 . A G 1678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;DP=94;Dels=0.00;FS=65.870;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.77;MQ0=0;MQRankSum=7.106;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.844;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,71:94:99:1711,126,0 chrXIII 600543 . A T 1665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;MQ0=1;QD=23.79;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1698,159,0 chrXIII 600558 . C T 1428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.126;DP=62;Dels=0.00;FS=12.503;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.09;MQ0=2;MQRankSum=2.682;QD=23.03;ReadPosRankSum=0.845;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,56:62:71:1461,71,0 chrXIII 600564 . T A 1392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.519;DP=62;Dels=0.00;FS=12.503;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.09;MQ0=2;MQRankSum=2.504;QD=22.45;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,56:62:70:1425,70,0 chrXIII 600729 . C T 733 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.57;MQ0=30;QD=11.63;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,56:63:78:766,78,0 chrXIII 600819 . C T 1244 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.902;DP=92;Dels=0.00;FS=13.645;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.45;MQ0=39;MQRankSum=1.162;QD=13.52;ReadPosRankSum=-2.845;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,61:92:84:1277,84,0 chrXIII 601971 . T C 1802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=25.38;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1835,192,0 chrXIII 602082 . C T 1808 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.613;DP=95;Dels=0.00;FS=2.383;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.38;MQ0=19;MQRankSum=0.545;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,76:95:93:1841,93,0 chrXIII 602255 . G A 1900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=27.14;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1933,189,0 chrXIII 602462 . T C 2180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=95;Dels=0.00;FS=4.421;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.86;MQ0=1;MQRankSum=3.386;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.017;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,89:95:99:2213,144,0 chrXIII 602498 . C T 450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.404;DP=101;Dels=0.00;FS=18.065;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.32;MQ0=1;MQRankSum=-3.569;QD=4.46;ReadPosRankSum=-2.343;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,31:101:99:480,0,1598 chrXIII 602531 . T C 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.225;DP=91;Dels=0.00;FS=5.402;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.21;MQ0=0;MQRankSum=-3.557;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.006;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:701,0,1170 chrXIII 602939 . C T 734.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;DP=108;Dels=0.00;FS=0.896;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.11;MQ0=36;MQRankSum=-2.010;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:764,0,739 chrXIII 603083 . T C 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3234,319,0 chrXIII 603086 . T C 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3437,342,0 chrXIII 603801 . T C 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3600,378,0 chrXIII 604735 . G A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.469;DP=126;Dels=0.00;FS=4.359;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.729;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:126:99:1033,0,1690 chrXIII 604915 . T G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.694;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.895;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1174,0,1250 chrXIII 605048 . C T 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.622;DP=144;Dels=0.00;FS=3.964;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.606;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1751,0,1291 chrXIII 605161 . G A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.589;DP=132;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.411;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1448,0,1280 chrXIII 605224 . A T 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;DP=151;Dels=0.00;FS=5.060;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1738,0,1575 chrXIII 605479 . C T 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.597;DP=92;Dels=0.00;FS=4.065;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,54:92:99:1159,0,784 chrXIII 605741 . G A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.650;DP=142;Dels=0.00;FS=10.397;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.608;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:142:99:1254,0,1720 chrXIII 605879 . G T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.471;DP=106;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=7.2115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.607;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:1321,0,707 chrXIII 606680 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.586;DP=126;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1256,0,1417 chrXIII 606777 . T C 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.298;DP=152;Dels=0.00;FS=2.887;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.412;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.741;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1748,0,1584 chrXIII 606828 . C T 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.206;DP=164;Dels=0.00;FS=3.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.347;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:164:99:1647,0,1844 chrXIII 606897 . C T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.910;DP=147;Dels=0.00;FS=18.912;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=9.98;ReadPosRankSum=2.013;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1497,0,1662 chrXIII 606967 . A G 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.421;DP=107;Dels=0.00;FS=2.506;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.872;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1095,0,1142 chrXIII 607069 . T C 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.669;DP=141;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.374;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1469,0,1102 chrXIII 607203 . C T 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.108;DP=164;Dels=0.00;FS=6.847;HaplotypeScore=3.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=1;MQRankSum=-0.164;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.095;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:1834,0,1641 chrXIII 607855 . C T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.699;DP=128;Dels=0.00;FS=13.092;HaplotypeScore=9.7008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.147;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:128:99:1254,0,1410 chrXIII 608020 . T G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;DP=109;Dels=0.00;FS=4.774;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.755;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1381,0,969 chrXIII 608168 . C T 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.879;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.331;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:1068,0,892 chrXIII 608200 . A G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.536;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1344,0,1249 chrXIII 608238 . G A 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.695;DP=125;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1293,0,1378 chrXIII 608255 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.693;DP=115;Dels=0.00;FS=1.544;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.392;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:115:99:1076,0,1376 chrXIII 608340 . C T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.038;DP=112;Dels=0.00;FS=14.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1301,0,1090 chrXIII 608372 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.418;DP=130;Dels=0.00;FS=7.229;HaplotypeScore=2.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:130:99:1498,0,1161 chrXIII 608425 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.453;DP=104;Dels=0.00;FS=3.739;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=13.24;ReadPosRankSum=1.306;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,64:104:99:1407,0,817 chrXIII 608573 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.004;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.413;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:139:99:1406,0,1509 chrXIII 608937 . T C 916.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.358;DP=151;Dels=0.00;FS=11.879;HaplotypeScore=26.6037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.47;MQ0=1;MQRankSum=-6.323;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,58:151:99:946,0,1950 chrXIII 608943 . C T 788.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.540;DP=144;Dels=0.00;FS=7.760;HaplotypeScore=30.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.21;MQ0=1;MQRankSum=-6.594;QD=5.47;ReadPosRankSum=-2.134;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,53:144:99:818,0,1761 chrXIII 608947 . T G 629.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.288;DP=152;Dels=0.00;FS=15.778;HaplotypeScore=57.0061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.65;MQ0=1;MQRankSum=-4.985;QD=4.14;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,39:152:99:659,0,2248 chrXIII 608953 . G A 407.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.442;DP=159;Dels=0.00;FS=3.632;HaplotypeScore=77.6132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.58;MQ0=4;MQRankSum=-4.076;QD=2.56;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,33:159:99:437,0,2369 chrXIII 608955 . T C 1305.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.647;DP=166;Dels=0.00;FS=1.960;HaplotypeScore=73.7142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.40;MQ0=4;MQRankSum=-6.050;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,82:166:99:1335,0,1697 chrXIII 608982 . T C 646.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.134;DP=180;Dels=0.00;FS=9.902;HaplotypeScore=45.2350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.77;MQ0=4;MQRankSum=-3.111;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,57:180:99:676,0,2509 chrXIII 608989 . A G 224.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.316;DP=181;Dels=0.00;FS=6.043;HaplotypeScore=43.0946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.77;MQ0=5;MQRankSum=-2.475;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,35:181:99:254,0,3030 chrXIII 609003 . C T 52.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.849;DP=188;Dels=0.00;FS=18.922;HaplotypeScore=36.6999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.94;MQ0=5;MQRankSum=-2.276;QD=0.28;ReadPosRankSum=1.657;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,30:188:82:82,0,3191 chrXIII 609006 . C T 400.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.667;DP=193;Dels=0.00;FS=18.990;HaplotypeScore=41.3964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.10;MQ0=5;MQRankSum=-2.920;QD=2.07;ReadPosRankSum=-1.277;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,48:193:99:430,0,2898 chrXIII 609063 . G A 1382.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.715;DP=185;Dels=0.00;FS=29.856;HaplotypeScore=39.6251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.46;MQ0=7;MQRankSum=-1.575;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.999;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,81:185:99:1412,0,1605 chrXIII 609072 . C T 494.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;DP=182;Dels=0.00;FS=6.923;HaplotypeScore=36.5357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.88;MQ0=7;MQRankSum=-0.608;QD=2.71;ReadPosRankSum=-1.735;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,43:182:99:524,0,2372 chrXIII 609084 . T C 127.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.802;DP=183;Dels=0.00;FS=26.569;HaplotypeScore=43.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.45;MQ0=7;MQRankSum=-1.228;QD=0.69;ReadPosRankSum=-2.279;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,28:183:99:157,0,2814 chrXIII 609090 . T C 988.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.841;DP=183;Dels=0.00;FS=17.357;HaplotypeScore=47.0941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.92;MQ0=6;MQRankSum=-1.135;QD=5.40;ReadPosRankSum=-2.278;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,68:183:99:1018,0,1988 chrXIII 609099 . G A 918.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.447;DP=182;Dels=0.00;FS=14.470;HaplotypeScore=30.8350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.68;MQ0=6;MQRankSum=-1.055;QD=5.04;ReadPosRankSum=-2.457;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,60:182:99:948,0,1945 chrXIII 609156 . T C 449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.571;DP=178;Dels=0.00;FS=8.597;HaplotypeScore=50.2344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.240;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,37:178:99:479,0,3082 chrXIII 609317 . G A 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.256;DP=130;Dels=0.00;FS=6.945;HaplotypeScore=49.9047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.27;MQ0=3;MQRankSum=-3.154;QD=0.11;ReadPosRankSum=-2.545;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,17:130:44:44,0,1994 chrXIII 609322 . A G 52.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.699;DP=134;Dels=0.00;FS=3.910;HaplotypeScore=83.6123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.12;MQ0=3;MQRankSum=-2.283;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.250;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,14:134:82:82,0,2067 chrXIII 609330 . G A 127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.244;DP=137;Dels=0.00;FS=2.728;HaplotypeScore=73.1163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.89;MQ0=3;MQRankSum=-3.428;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.983;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,31:137:99:157,0,1654 chrXIII 609336 . T C 71.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.373;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=51.4908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.30;MQ0=6;MQRankSum=-4.431;QD=0.46;ReadPosRankSum=2.008;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,32:156:99:101,0,2381 chrXIII 609346 . G A 243.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.621;DP=158;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=48.5624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.72;MQ0=5;MQRankSum=-6.152;QD=1.54;ReadPosRankSum=2.140;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,44:158:99:273,0,2300 chrXIII 609370 . A G 219.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.954;DP=157;Dels=0.00;FS=2.850;HaplotypeScore=93.8018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.24;MQ0=6;MQRankSum=1.084;QD=1.39;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,25:157:99:249,0,2321 chrXIII 609372 . T C 425.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.422;DP=154;Dels=0.00;FS=5.007;HaplotypeScore=44.5246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.99;MQ0=6;MQRankSum=-0.485;QD=2.76;ReadPosRankSum=3.096;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,32:154:99:455,0,2043 chrXIII 609378 . A C 267.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.593;DP=149;Dels=0.00;FS=9.173;HaplotypeScore=52.4098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.54;MQ0=8;MQRankSum=0.837;QD=1.79;ReadPosRankSum=5.351;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,25:149:99:297,0,2129 chrXIII 609381 . T C 247.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.168;DP=148;Dels=0.00;FS=9.274;HaplotypeScore=33.5757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.61;MQ0=8;MQRankSum=0.252;QD=1.67;ReadPosRankSum=5.709;SB=-3.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,25:148:99:277,0,2153 chrXIII 609384 . C T 172.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.138;DP=140;Dels=0.00;FS=0.876;HaplotypeScore=47.4633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.67;MQ0=8;MQRankSum=-1.102;QD=1.23;ReadPosRankSum=-2.030;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,22:140:99:202,0,2067 chrXIII 609394 . G A 202.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.056;DP=133;Dels=0.00;FS=8.322;HaplotypeScore=34.0611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.83;MQ0=12;MQRankSum=-0.989;QD=1.52;ReadPosRankSum=-3.829;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,21:133:99:232,0,1823 chrXIII 609396 . T C 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.064;DP=135;Dels=0.00;FS=9.787;HaplotypeScore=38.0592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.60;MQ0=12;MQRankSum=-0.192;QD=0.26;ReadPosRankSum=-3.470;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,17:135:65:65,0,2093 chrXIII 609420 . G A 1141.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.144;DP=117;Dels=0.00;FS=7.841;HaplotypeScore=30.2511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.42;MQ0=12;MQRankSum=1.823;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.250;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:117:99:1171,0,664 chrXIII 609429 . C T 138.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.702;DP=110;Dels=0.00;FS=6.596;HaplotypeScore=25.6525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.93;MQ0=12;MQRankSum=1.212;QD=1.25;ReadPosRankSum=-2.640;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,20:110:99:168,0,1482 chrXIII 609441 . T C 80.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;DP=95;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=33.3957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.59;MQ0=8;MQRankSum=-1.112;QD=0.84;ReadPosRankSum=-3.325;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,16:95:99:110,0,1446 chrXIII 609447 . T C 447.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.349;DP=90;Dels=0.00;FS=15.944;HaplotypeScore=38.3023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.56;MQ0=8;MQRankSum=-0.986;QD=4.97;ReadPosRankSum=-2.911;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:477,0,932 chrXIII 609450 . C T 136.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.225;DP=86;Dels=0.00;FS=5.215;HaplotypeScore=37.3059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.09;MQ0=7;MQRankSum=-0.992;QD=1.58;ReadPosRankSum=-4.525;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:166,0,1141 chrXIII 609456 . G A 810.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.867;DP=99;Dels=0.00;FS=14.492;HaplotypeScore=35.4779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.98;MQ0=7;MQRankSum=0.280;QD=8.18;ReadPosRankSum=-6.671;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:99:99:840,0,699 chrXIII 609465 . C T 736.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.256;DP=103;Dels=0.00;FS=3.805;HaplotypeScore=14.1084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.69;MQ0=8;MQRankSum=1.960;QD=7.15;ReadPosRankSum=-5.287;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:766,0,1009 chrXIII 609489 . T C 613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.815;DP=121;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=24.7330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.24;MQ0=2;MQRankSum=1.065;QD=5.07;ReadPosRankSum=-3.551;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,42:121:99:643,0,1542 chrXIII 609501 . C T 245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.657;DP=124;Dels=0.00;FS=0.844;HaplotypeScore=8.6790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=1.98;ReadPosRankSum=-4.146;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:275,0,1954 chrXIII 609533 . G A 560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.772;DP=140;Dels=0.01;FS=1.472;HaplotypeScore=37.9398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,42:138:99:590,0,2026 chrXIII 609570 . A T 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.819;DP=100;Dels=0.05;FS=3.834;HaplotypeScore=36.3033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:962,0,1078 chrXIII 609576 . C T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.321;DP=95;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=35.2889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.23;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1021,0,937 chrXIII 609618 . T C 375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.066;DP=57;Dels=0.00;FS=1.042;HaplotypeScore=23.1350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.98;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.268;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:405,0,704 chrXIII 609630 . C T 195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;DP=43;Dels=0.00;FS=14.971;HaplotypeScore=14.7186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.96;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:225,0,559 chrXIII 609645 . T G 40.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.339;DP=31;Dels=0.00;FS=5.302;HaplotypeScore=23.8167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.23;MQ0=1;MQRankSum=0.343;QD=1.29;ReadPosRankSum=-1.904;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:31:70:70,0,350 chrXIII 609648 . T C 71.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.580;DP=30;Dels=0.00;FS=5.164;HaplotypeScore=16.8500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.80;MQ0=1;MQRankSum=-0.404;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:30:99:101,0,316 chrXIII 609654 . T C 259.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.187;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.8714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.45;MQ0=2;MQRankSum=1.680;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:43:289,0,43 chrXIII 609660 . T C 112.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;DP=24;Dels=0.00;FS=8.280;HaplotypeScore=11.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.00;MQ0=3;MQRankSum=2.218;QD=4.67;ReadPosRankSum=-2.359;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:85:142,0,85 chrXIII 609661 . G A 121.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.532;DP=23;Dels=0.00;FS=5.180;HaplotypeScore=11.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.86;MQ0=3;MQRankSum=2.230;QD=5.26;ReadPosRankSum=-2.306;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:86:151,0,86 chrXIII 609663 . T C 130.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.427;DP=22;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=13.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.14;MQ0=3;MQRankSum=1.115;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:58:160,0,58 chrXIII 609666 . T C 139.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;DP=22;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=14.9156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.14;MQ0=3;MQRankSum=1.775;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:56:169,0,56 chrXIII 609699 . T A 11.34 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.62;MQ0=3;MQRankSum=2.237;QD=0.63;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:41:41,0,98 chrXIII 609705 . T C 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.850;DP=22;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=11.6357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.30;MQ0=3;MQRankSum=1.850;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:56:56,0,166 chrXIII 609708 . C T 97.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.5818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.30;MQ0=3;MQRankSum=0.568;QD=3.73;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:99:127,0,160 chrXIII 609710 . G A 181.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;DP=26;Dels=0.00;FS=4.310;HaplotypeScore=20.5776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.30;MQ0=3;MQRankSum=3.047;QD=6.96;ReadPosRankSum=-2.554;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:70:211,0,70 chrXIII 609717 . C T 232.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;DP=40;Dels=0.00;FS=24.098;HaplotypeScore=34.7216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.85;MQ0=3;MQRankSum=2.210;QD=5.80;ReadPosRankSum=-3.246;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:262,0,219 chrXIII 609723 . G A,C 706.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.349;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.8703;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=37.20;MQ0=3;MQRankSum=3.034;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:10,36,10:59:81:766,92,81,610,0,662 chrXIII 609726 . T C 54.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.095;DP=63;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=38.8543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.33;MQ0=3;MQRankSum=-1.110;QD=0.86;ReadPosRankSum=1.949;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:84:84,0,828 chrXIII 609729 . T C 1007 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.643;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=31.3041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.31;MQ0=3;MQRankSum=1.250;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.549;SB=-4.345e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,53:64:70:1040,70,0 chrXIII 609759 . T C 2175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.5551;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.44;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.762;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,101:105:99:2208,237,0 chrXIII 609792 . C T 27.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.946;DP=151;Dels=0.00;FS=15.481;HaplotypeScore=117.0545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.12;MQ0=0;MQRankSum=-3.252;QD=0.18;ReadPosRankSum=-4.950;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,22:151:57:57,0,2502 chrXIII 609793 . G A 115.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.428;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=117.0545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.12;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=0.76;ReadPosRankSum=-5.743;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,24:151:99:145,0,2454 chrXIII 609795 . T C 64.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.346;DP=151;Dels=0.00;FS=16.346;HaplotypeScore=118.0480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.12;MQ0=0;MQRankSum=-2.408;QD=0.42;ReadPosRankSum=-4.813;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,26:151:94:94,0,2651 chrXIII 609798 . T C 80.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.266;DP=155;Dels=0.00;FS=3.028;HaplotypeScore=98.6602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.76;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=0.52;ReadPosRankSum=-3.982;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,25:155:99:110,0,2673 chrXIII 609801 . A T 620.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.232;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=157.8871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.799;QD=3.90;ReadPosRankSum=-4.248;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,45:159:99:650,0,1801 chrXIII 609834 . T C 710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.357;DP=157;Dels=0.01;FS=6.840;HaplotypeScore=19.4811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.715;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,47:156:99:740,0,2186 chrXIII 609846 . C T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.754;DP=174;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=22.5242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=6.90;ReadPosRankSum=1.155;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,68:174:99:1230,0,1893 chrXIII 609992 . G A 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.010;DP=101;Dels=0.00;FS=7.945;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=1;MQRankSum=-0.871;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.052;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:911,0,1168 chrXIII 610012 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.169;DP=103;Dels=0.00;FS=4.944;HaplotypeScore=3.8068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=1;MQRankSum=0.853;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.879;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:971,0,1227 chrXIII 610035 . T C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.508;DP=108;Dels=0.00;FS=6.055;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=1;MQRankSum=-0.620;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.150;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1092,0,1203 chrXIII 610039 . A C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.698;DP=110;Dels=0.00;FS=2.462;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=1;MQRankSum=0.332;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.154;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1292,0,1093 chrXIII 610070 . G A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.011;DP=125;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.361;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.047;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1431,0,1214 chrXIII 610248 . C A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.250;DP=114;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1328,0,1077 chrXIII 610921 . C T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.904;DP=161;Dels=0.00;FS=1.339;HaplotypeScore=2.9780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=8.19;ReadPosRankSum=-3.369;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,68:161:99:1348,0,2073 chrXIII 611653 . A G 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.646;DP=139;Dels=0.01;FS=0.629;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.286;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:138:99:1769,0,1279 chrXIII 611831 . G A 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.946;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.825;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1805,0,1389 chrXIII 611899 . C G 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.374;DP=128;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=5.9188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.333;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1600,0,1070 chrXIII 612029 . G A 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.580;DP=124;Dels=0.00;FS=8.243;HaplotypeScore=3.2371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=10.29;ReadPosRankSum=2.327;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1306,0,1317 chrXIII 612081 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.437;DP=134;Dels=0.00;FS=8.367;HaplotypeScore=6.5805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.393;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1329,0,1412 chrXIII 612679 . C A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;DP=108;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.964;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1315,0,1003 chrXIII 612861 . T C 2003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.866;DP=179;Dels=0.00;FS=12.008;HaplotypeScore=2.6493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,95:179:99:2033,0,1906 chrXIII 613041 . C G 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.211;DP=152;Dels=0.00;FS=5.070;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.263;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1557,0,1560 chrXIII 613554 . A T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.109;DP=122;Dels=0.00;FS=5.581;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1417,0,1305 chrXIII 613737 . T C 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.934;DP=134;Dels=0.00;FS=1.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.542;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1195,0,1774 chrXIII 613910 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.949;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.244;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1129,0,1516 chrXIII 614075 . C T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.968;DP=145;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=9.8943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=1;MQRankSum=0.898;QD=8.09;ReadPosRankSum=2.101;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,60:145:99:1203,0,1840 chrXIII 614076 . A T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.610;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=1;MQRankSum=0.650;QD=8.42;ReadPosRankSum=2.245;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,59:144:99:1243,0,1923 chrXIII 614358 . G A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.166;DP=139;Dels=0.00;FS=1.347;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=8.58;ReadPosRankSum=2.422;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1222,0,1756 chrXIII 614505 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.898;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.163;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1274,0,1395 chrXIII 614847 . C T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.735;DP=140;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1425,0,1589 chrXIII 615554 . T G 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3425,345,0 chrXIII 615978 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.564;DP=111;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=6.4618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:111:99:1327,0,1022 chrXIII 616433 . C G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.337;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:116:99:1375,0,1055 chrXIII 618249 . T G 2346 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=20.22;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2379,246,0 chrXIII 620044 . C T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.212;DP=136;Dels=0.00;FS=6.776;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.776;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1344,0,1598 chrXIII 620254 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.363;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.926;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1285,0,1233 chrXIII 621167 . C A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.833;DP=149;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.967;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1545,0,1636 chrXIII 621192 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.679;DP=127;Dels=0.00;FS=5.388;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1518,0,1211 chrXIII 621209 . G C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.491;DP=129;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1325,0,1344 chrXIII 622063 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.614;DP=131;Dels=0.00;FS=4.237;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.794;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1152,0,1642 chrXIII 622076 . T G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.831;DP=138;Dels=0.00;FS=3.085;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1409,0,1557 chrXIII 622209 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.876;DP=144;Dels=0.00;FS=2.134;HaplotypeScore=9.9250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=9.68;ReadPosRankSum=-2.115;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1424,0,1652 chrXIII 623039 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.495;DP=117;Dels=0.00;FS=8.459;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1341,0,1152 chrXIII 623127 . C T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.264;DP=124;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.854;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1655,0,1107 chrXIII 623240 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.839;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.926;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,52:91:99:1125,0,827 chrXIII 623868 . G A 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.263;DP=131;Dels=0.00;FS=4.152;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.777;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1589,0,1268 chrXIII 624297 . A G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.249;DP=144;Dels=0.00;FS=16.628;HaplotypeScore=4.7528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=10.64;ReadPosRankSum=-2.227;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1562,0,1580 chrXIII 624655 . G T 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.347;DP=183;Dels=0.00;FS=1.168;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,76:183:99:1464,0,2281 chrXIII 624780 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.487;DP=172;Dels=0.00;FS=5.555;HaplotypeScore=2.7152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.643;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,76:172:99:1560,0,2119 chrXIII 626430 . A G 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=22.04;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3009,309,0 chrXIII 627939 . C T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.056;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.259;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.613;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1387,0,1185 chrXIII 628017 . G C 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.316;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:888,0,973 chrXIII 628415 . G A 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3168,316,0 chrXIII 628699 . A G 2459 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:98:99:2492,273,0 chrXIII 628821 . C T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.028;DP=105;Dels=0.00;FS=2.561;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.670;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1141,0,1100 chrXIII 628982 . T A 3831.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=26.60;ReadPosRankSum=0.289;SB=-1.898e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3831,373,0 chrXIII 629724 . C T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.873;DP=162;Dels=0.00;FS=1.251;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.760;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,71:162:99:1458,0,1999 chrXIII 629793 . C T 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=27.06;SB=-2.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3734,364,0 chrXIII 630097 . C G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.299;DP=115;Dels=0.00;FS=10.516;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1349,0,1012 chrXIII 630246 . T A 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.678;DP=128;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=7.6594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=26.70;ReadPosRankSum=1.543;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3417,334,0 chrXIII 630249 . G A 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.679;DP=130;Dels=0.00;FS=3.658;HaplotypeScore=7.6594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.386;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3435,346,0 chrXIII 630414 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.631;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=2.627;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.013;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1257,0,1390 chrXIII 630613 . T G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.013;DP=110;Dels=0.00;FS=6.449;HaplotypeScore=5.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,65:110:99:1333,0,904 chrXIII 630750 . G C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.889;DP=111;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=10.21;ReadPosRankSum=2.248;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1163,0,951 chrXIII 631189 . A C 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.879;DP=140;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1240,0,1696 chrXIII 632096 . T C 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.493;DP=83;Dels=0.00;FS=0.838;HaplotypeScore=6.5679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:876,0,695 chrXIII 632244 . C A 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.825;DP=131;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=3.0926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.467;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1723,0,1072 chrXIII 633305 . G A 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.516;DP=179;Dels=0.00;FS=12.330;HaplotypeScore=4.9273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=4;MQRankSum=-5.228;QD=0.20;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,26:179:65:65,0,3689 chrXIII 634582 . G A 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.585;DP=93;Dels=0.00;FS=11.968;HaplotypeScore=5.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1137,0,899 chrXIII 634650 . C T 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.970;DP=85;Dels=0.00;FS=14.913;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:1004,0,874 chrXIII 634661 . G T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.869;DP=89;Dels=0.00;FS=9.765;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.198;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:928,0,1034 chrXIII 634668 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.445;DP=109;Dels=0.00;FS=1.717;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=12.93;ReadPosRankSum=-2.408;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1439,0,908 chrXIII 634674 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.936;DP=120;Dels=0.00;FS=2.742;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1389,0,1133 chrXIII 634748 . T A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;DP=125;Dels=0.00;FS=8.257;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=10.78;ReadPosRankSum=-3.079;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1378,0,1306 chrXIII 634784 . C T 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.841;DP=136;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=4.0149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1570,0,1199 chrXIII 634895 . T C 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.722;DP=112;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.122;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1091,0,1278 chrXIII 635063 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.911;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.594;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1197,0,1576 chrXIII 635124 . A G 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3575,369,0 chrXIII 635337 . T G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.025;DP=142;Dels=0.00;FS=3.388;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.918;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.420;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1467,0,1718 chrXIII 635402 . A G 3390.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3390,342,0 chrXIII 635406 . A G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.563;DP=125;Dels=0.00;FS=4.405;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.570;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1307,0,1388 chrXIII 635501 . G A 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.887;DP=144;Dels=0.00;FS=7.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1663,0,1468 chrXIII 635511 . A G 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.858;DP=168;Dels=0.00;FS=2.661;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,83:168:99:1667,0,1874 chrXIII 635513 . A G 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.027;DP=169;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.392;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,86:169:99:1793,0,1851 chrXIII 635544 . G A 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.327;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1626,0,1645 chrXIII 636081 . G C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.796;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1355,0,1008 chrXIII 636091 . C A 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.094;DP=95;Dels=0.00;FS=8.247;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.593;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,51:95:99:1058,0,917 chrXIII 636173 . T C 1792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.578;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,83:155:99:1822,0,1524 chrXIII 636208 . C T 3965.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=28.53;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3965,400,0 chrXIII 636252 . T G 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.797;DP=139;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1626,0,1424 chrXIII 636639 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.403;DP=119;Dels=0.00;FS=8.133;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1046,0,1581 chrXIII 636667 . A G 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.039;DP=144;Dels=0.00;FS=5.337;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.193;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1643,0,1370 chrXIII 636984 . T C 644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.297;DP=88;Dels=0.00;FS=2.851;HaplotypeScore=6.9518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,39:88:99:674,0,757 chrXIII 637013 . A T 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.982;DP=103;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.705;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:881,0,852 chrXIII 637026 . T C 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.015;DP=105;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.317;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:871,0,956 chrXIII 637028 . G A 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;DP=105;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.163;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:931,0,936 chrXIII 637066 . T C 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.275;DP=95;Dels=0.00;FS=8.190;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:843,0,1008 chrXIII 637100 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.605;DP=107;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1322,0,1130 chrXIII 637150 . A G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.719;DP=126;Dels=0.00;FS=11.124;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.054;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1276,0,1423 chrXIII 637295 . C T 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.527;DP=119;Dels=0.00;FS=3.643;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=26.45;ReadPosRankSum=1.703;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3180,288,0 chrXIII 637313 . A G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.943;DP=124;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1304,0,1379 chrXIII 637373 . C T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.019;DP=123;Dels=0.00;FS=3.298;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.215;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1435,0,1348 chrXIII 637515 . G A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.875;DP=121;Dels=0.00;FS=5.637;HaplotypeScore=5.2160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.478;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1523,0,1058 chrXIII 637712 . T C 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.504;DP=158;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=6.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1859,0,1564 chrXIII 637889 . T C 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3052,318,0 chrXIII 638009 . G A 4539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4539,466,0 chrXIII 639027 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.854;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1095,0,1073 chrXIII 639437 . A G 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.230;DP=136;Dels=0.00;FS=7.946;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.625;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1544,0,1281 chrXIII 639623 . T G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.077;DP=124;Dels=0.00;FS=5.435;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1159,0,1327 chrXIII 639659 . C T 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.426;DP=153;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.605;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,86:153:99:1756,0,1295 chrXIII 639824 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.563;DP=133;Dels=0.00;FS=4.117;HaplotypeScore=3.8414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.420;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1305,0,1587 chrXIII 640171 . G A 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.725;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.0744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.716;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1305,0,1540 chrXIII 640415 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.297;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=10.14;ReadPosRankSum=-2.714;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1531,0,1534 chrXIII 640424 . T C 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.882;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:144:99:1279,0,1764 chrXIII 640619 . T C 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.371;DP=139;Dels=0.00;FS=3.012;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.794;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1535,0,1427 chrXIII 640720 . G C 4497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4497,453,0 chrXIII 640737 . G A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.005;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:1526,0,1948 chrXIII 640783 . C T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.680;DP=130;Dels=0.00;FS=3.187;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.933;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,77:130:99:1676,0,1088 chrXIII 640978 . C T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.814;DP=112;Dels=0.00;FS=4.659;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.233;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1243,0,1215 chrXIII 641086 . G C 674.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;DP=107;Dels=0.00;FS=2.584;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:704,0,1361 chrXIII 641090 . A G 2280 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.00;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:95:99:2313,234,0 chrXIII 641091 . A G 2324 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2357,237,0 chrXIII 641160 . T C 736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.978;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:766,0,1133 chrXIII 641386 . A G 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.259;DP=96;Dels=0.00;FS=1.659;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:827,0,1167 chrXIII 641548 . A G 2283 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.03;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:95:99:2316,246,0 chrXIII 641634 . C A 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2816,280,0 chrXIII 641985 . T C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.620;DP=93;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.004;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1003,0,1012 chrXIII 642868 . G A 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3220,325,0 chrXIII 643735 . G C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.175;DP=145;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=2;MQRankSum=-1.218;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1393,0,1497 chrXIII 643985 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.527;DP=114;Dels=0.00;FS=4.489;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.970;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1375,0,1086 chrXIII 644749 . G C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;DP=142;Dels=0.00;FS=16.110;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1202,0,1537 chrXIII 644973 . T G 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3503,360,0 chrXIII 645420 . A T 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.66;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3079,310,0 chrXIII 645478 . T G 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3723,378,0 chrXIII 645592 . T C 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3120,324,0 chrXIII 645786 . G A 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=1;QD=25.60;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3258,313,0 chrXIII 645817 . A G 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3404,345,0 chrXIII 645859 . G T 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3049,306,0 chrXIII 645900 . A G 3072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3105,327,0 chrXIII 645914 . C G 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3087,315,0 chrXIII 646188 . T C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.957;DP=125;Dels=0.00;FS=11.440;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:125:99:1294,0,1311 chrXIII 646241 . A G 2861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2894,288,0 chrXIII 646285 . T C 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.560;DP=99;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1007,0,1144 chrXIII 646699 . G T 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3563,349,0 chrXIII 646831 . G A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.691;DP=116;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.08;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1336,0,1117 chrXIII 647164 . G T 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.423;DP=109;Dels=0.00;FS=3.532;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1059,0,1154 chrXIII 647320 . C T 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.285;DP=116;Dels=0.00;FS=7.442;HaplotypeScore=3.4418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.249;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1511,0,940 chrXIII 647329 . G C 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;DP=110;Dels=0.00;FS=4.856;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.461;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1211,0,1001 chrXIII 647375 . G A 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.412;DP=92;Dels=0.00;FS=1.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:946,0,970 chrXIII 647397 . C G 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;DP=97;Dels=0.00;FS=0.821;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1021,0,1028 chrXIII 647406 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.235;DP=114;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=2.6515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.138;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1128,0,1338 chrXIII 647456 . C G 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;DP=131;Dels=0.00;FS=6.658;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1557,0,1227 chrXIII 647474 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.116;DP=129;Dels=0.00;FS=3.280;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1286,0,1537 chrXIII 647504 . G T 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.572;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.894;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1600,0,1135 chrXIII 647672 . T C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;DP=115;Dels=0.00;FS=4.830;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.403;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1377,0,975 chrXIII 648168 . T A 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3085,289,0 chrXIII 648335 . A G 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.289;DP=100;Dels=0.00;FS=2.647;HaplotypeScore=3.7332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.021;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.764;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,58:100:99:1283,0,858 chrXIII 648845 . C A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.455;DP=106;Dels=0.00;FS=2.525;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.035;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1175,0,1201 chrXIII 649250 . C T 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.76;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2837,280,0 chrXIII 649430 . G A 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.538;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:984,0,1270 chrXIII 649473 . G A 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2816,288,0 chrXIII 649487 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.193;DP=97;Dels=0.00;FS=1.648;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.657;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,54:97:99:1275,0,864 chrXIII 649552 . A G 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.884;DP=146;Dels=0.00;FS=2.105;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,60:146:99:1177,0,1950 chrXIII 649796 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.258;DP=119;Dels=0.00;FS=2.323;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.636;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1226,0,1402 chrXIII 649905 . T C 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.965;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.642;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1399,0,1238 chrXIII 650144 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.982;DP=102;Dels=0.00;FS=1.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.780;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1143,0,1115 chrXIII 650336 . G C 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.448;DP=90;Dels=0.00;FS=1.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.677;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:841,0,1124 chrXIII 650714 . T C 2299 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2332,237,0 chrXIII 650853 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.170;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1234,0,943 chrXIII 650971 . A C 2528 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.48;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2561,255,0 chrXIII 650986 . C T 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.25;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3221,327,0 chrXIII 651148 . A G 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3310,330,0 chrXIII 651277 . A G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.079;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3393,333,0 chrXIII 651340 . C T 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3230,331,0 chrXIII 651388 . C A 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3037,301,0 chrXIII 651497 . C T 3633.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=116.6461;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;QD=27.95;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3633,367,0 chrXIII 651548 . C G 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;DP=118;Dels=0.00;FS=1.543;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.239;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1302,0,1119 chrXIII 651603 . A T 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.636;DP=158;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.213;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:1586,0,1918 chrXIII 651620 . T C 1950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.671;DP=164;Dels=0.00;FS=5.077;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.216;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,88:164:99:1980,0,1694 chrXIII 652003 . A G 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=23.98;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2551,267,0 chrXIII 652097 . T A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.302;DP=133;Dels=0.00;FS=5.277;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.214;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1507,0,1457 chrXIII 652137 . T A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.615;DP=121;Dels=0.00;FS=5.723;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.277;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1390,0,1373 chrXIII 652277 . T C 2292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.05;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2325,234,0 chrXIII 652386 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.483;DP=118;Dels=0.00;FS=8.719;HaplotypeScore=6.8672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=8.52;ReadPosRankSum=2.312;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:118:99:1035,0,1501 chrXIII 652690 . A C 4067.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.26;SB=-2.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4067,412,0 chrXIII 652881 . T A 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;DP=135;Dels=0.00;FS=3.413;HaplotypeScore=4.9143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=1;MQRankSum=0.569;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.605;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1549,0,1406 chrXIII 652983 . C T 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.599;DP=124;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1087,0,1514 chrXIII 653188 . T C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.229;DP=105;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.209;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1069,0,1187 chrXIII 653238 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.783;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=12.69;ReadPosRankSum=2.117;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1350,0,879 chrXIII 653353 . G A 1874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.073;DP=153;Dels=0.00;FS=4.851;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=2;MQRankSum=0.359;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.885;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,87:153:99:1904,0,1221 chrXIII 653704 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.015;DP=133;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=4.8603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.241;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1565,0,1197 chrXIII 653809 . T C 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.595;DP=120;Dels=0.00;FS=8.668;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.133;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,72:120:99:1611,0,925 chrXIII 654084 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.096;DP=122;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=9.74;ReadPosRankSum=-2.309;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1218,0,1291 chrXIII 654300 . C T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.101;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.584;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1298,0,1239 chrXIII 654327 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.044;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.752;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1238,0,1218 chrXIII 654617 . T C 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.478;DP=103;Dels=0.00;FS=2.750;HaplotypeScore=2.9378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.514;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:988,0,1188 chrXIII 654777 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.826;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.104;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1201,0,941 chrXIII 654902 . T C 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.646;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=24.05;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:2919,312,0 chrXIII 655051 . G A 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.717;DP=101;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=5.8050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.343;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1079,0,1092 chrXIII 655345 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.037;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1361,0,1294 chrXIII 655501 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.926;DP=145;Dels=0.00;FS=7.338;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.513;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1411,0,1549 chrXIII 655522 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.496;DP=129;Dels=0.00;FS=6.642;HaplotypeScore=3.8645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.911;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1418,0,1334 chrXIII 655552 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.082;DP=126;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.149;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1494,0,1188 chrXIII 655608 . G A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.805;DP=131;Dels=0.00;FS=3.345;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.371;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1382,0,1453 chrXIII 655922 . A G 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.363;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=26.11;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,112:114:99:3009,281,0 chrXIII 655948 . G A 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.123;DP=100;Dels=0.00;FS=3.762;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.744;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1137,0,1042 chrXIII 656131 . A G 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3495,357,0 chrXIII 656137 . T C 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3655,390,0 chrXIII 657020 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.129;DP=132;Dels=0.00;FS=29.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.094;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1113,0,1608 chrXIII 657064 . G A 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3591,352,0 chrXIII 657211 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.021;DP=97;Dels=0.00;FS=2.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.227;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1001,0,1112 chrXIII 657240 . G C 2335 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.84;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2368,243,0 chrXIII 657241 . C A 2461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.91;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2494,249,0 chrXIII 657406 . G A 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3040,298,0 chrXIII 657929 . C T 1812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.692;DP=132;Dels=0.01;FS=5.514;HaplotypeScore=10.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.256;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,79:131:99:1842,0,978 chrXIII 658246 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.105;DP=122;Dels=0.00;FS=2.539;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.832;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1473,0,1088 chrXIII 658293 . A C 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.117;DP=130;Dels=0.00;FS=3.204;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.244;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1422,0,1372 chrXIII 658481 . C T 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.325;DP=139;Dels=0.00;FS=16.956;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=11.30;ReadPosRankSum=2.012;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1601,0,1426 chrXIII 659356 . T C 1877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.559;DP=166;Dels=0.00;FS=2.030;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.785;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,91:166:99:1907,0,1682 chrXIII 659437 . C T 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.431;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.211;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1789,0,1468 chrXIII 659673 . T C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.261;DP=172;Dels=0.00;FS=1.904;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.518;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,83:172:99:1628,0,2115 chrXIII 659982 . A G 3999.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3999,411,0 chrXIII 660599 . A G 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.246;DP=162;Dels=0.00;FS=1.968;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.167;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1651,0,1893 chrXIII 661121 . A T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.327;DP=144;Dels=0.00;FS=7.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1560,0,1595 chrXIII 661198 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.925;DP=142;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=4.1648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.338;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.577;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1325,0,1706 chrXIII 661296 . G A 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.493;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=9.81;ReadPosRankSum=-2.895;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,85:176:99:1756,0,1898 chrXIII 661308 . G A 4557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4557,442,0 chrXIII 661676 . T C 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2992,309,0 chrXIII 661764 . G A 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.573e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3703,358,0 chrXIII 661867 . C G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.251;DP=137;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.236;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1270,0,1533 chrXIII 662256 . G T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;DP=124;Dels=0.00;FS=9.600;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=9.17;ReadPosRankSum=2.772;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1167,0,1448 chrXIII 662466 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.221;DP=90;Dels=0.00;FS=6.908;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,50:90:99:1152,0,895 chrXIII 662603 . C T 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.087;DP=145;Dels=0.00;FS=13.843;HaplotypeScore=6.0883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,87:145:99:1830,0,1184 chrXIII 662886 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.347;DP=129;Dels=0.00;FS=2.573;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1273,0,1245 chrXIII 663000 . C T 3993.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3993,397,0 chrXIII 663441 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.523;DP=142;Dels=0.00;FS=3.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.363;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1467,0,1615 chrXIII 664080 . T C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.716;DP=116;Dels=0.00;FS=4.761;HaplotypeScore=2.5597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.484;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:116:99:1206,0,1162 chrXIII 664122 . A C 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3083,327,0 chrXIII 664518 . T C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.526;DP=126;Dels=0.00;FS=2.282;HaplotypeScore=3.4321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.601;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1178,0,1549 chrXIII 664741 . A G 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.638;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2883,309,0 chrXIII 664811 . A G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.827;DP=144;Dels=0.00;FS=2.923;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.984;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1391,0,1537 chrXIII 664814 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.869;DP=149;Dels=0.00;FS=2.048;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.142;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1402,0,1515 chrXIII 665090 . T G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.008;DP=128;Dels=0.00;FS=5.404;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.122;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1362,0,1359 chrXIII 665349 . C T 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.664;DP=105;Dels=0.00;FS=8.287;HaplotypeScore=4.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.527;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.119;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:924,0,1320 chrXIII 665727 . C A 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2808,277,0 chrXIII 665763 . C A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.899;DP=120;Dels=0.00;FS=4.702;HaplotypeScore=3.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.656;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1357,0,1271 chrXIII 665980 . T C 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.050;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,42:111:99:770,0,1604 chrXIII 666112 . T C 1945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1978,204,0 chrXIII 667766 . G A 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3681,364,0 chrXIII 668247 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.551;DP=131;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=5.6714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.336;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1388,0,1238 chrXIII 668343 . C T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.945;DP=110;Dels=0.00;FS=4.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1314,0,1000 chrXIII 668408 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.157;DP=105;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.753;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1134,0,1125 chrXIII 669168 . G C 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:959,0,1152 chrXIII 669196 . T C 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.279;DP=99;Dels=0.00;FS=10.205;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.011;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,54:99:99:1153,0,894 chrXIII 669285 . A C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.793;DP=130;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.830;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1132,0,1689 chrXIII 669658 . A T 657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;DP=84;Dels=0.00;FS=2.932;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.040;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:687,0,1052 chrXIII 670147 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.747;DP=102;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=2.5220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.222;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1184,0,956 chrXIII 671518 . T G 4105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=25.18;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-2.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,161:163:99:4105,373,0 chrXIII 672129 . T C 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3084,318,0 chrXIII 672316 . A T 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.728;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=2.128;QD=15.01;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,72:111:99:1696,0,763 chrXIII 673108 . A G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.376;DP=107;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=1;MQRankSum=-0.813;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.782;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1125,0,1084 chrXIII 673803 . A G 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3451,345,0 chrXIII 673846 . A G 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3336,351,0 chrXIII 673975 . G A 4016.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=26.08;ReadPosRankSum=1.710;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:4016,370,0 chrXIII 674192 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3265,330,0 chrXIII 674283 . C T 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.609;DP=139;Dels=0.00;FS=2.135;HaplotypeScore=2.7761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.945;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1591,0,1457 chrXIII 674833 . G A 4357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.24;MQ0=0;QD=27.93;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4357,442,0 chrXIII 675083 . A C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.057;DP=145;Dels=0.00;FS=4.287;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.244;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1305,0,1778 chrXIII 675245 . G C 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3370,357,0 chrXIII 675362 . G A 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.183;DP=129;Dels=0.00;FS=2.271;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.607;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1195,0,1576 chrXIII 675617 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.646;DP=122;Dels=0.00;FS=4.413;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1148,0,1470 chrXIII 675859 . T C 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.370;DP=138;Dels=0.00;FS=2.193;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.967;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,81:138:99:1661,0,1247 chrXIII 675891 . T C 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.598;DP=138;Dels=0.00;FS=1.353;HaplotypeScore=3.8117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1499,0,1393 chrXIII 675922 . C T 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.500;DP=145;Dels=0.00;FS=4.796;HaplotypeScore=8.6294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.680;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1696,0,1375 chrXIII 676154 . G C 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.869;DP=179;Dels=0.00;FS=2.032;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=8.97;ReadPosRankSum=-2.590;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,92:179:99:1635,0,1819 chrXIII 676426 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.659;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=1;MQRankSum=0.280;QD=9.57;ReadPosRankSum=-2.126;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1332,0,1601 chrXIII 676735 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.883;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1442,0,1167 chrXIII 676801 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.883;DP=117;Dels=0.00;FS=4.582;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.444;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1128,0,1420 chrXIII 676973 . G C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.184;DP=145;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=8.06;ReadPosRankSum=2.213;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1199,0,1736 chrXIII 676978 . A G 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.542;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=8.59;ReadPosRankSum=2.174;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1147,0,1564 chrXIII 677046 . C T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.731;DP=169;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,83:169:99:1701,0,1880 chrXIII 677544 . A C 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.030;DP=157;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:1778,0,1523 chrXIII 677619 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.714;DP=118;Dels=0.00;FS=4.553;HaplotypeScore=4.3857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1358,0,1267 chrXIII 678111 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.627;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.661;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.030;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1513,0,1038 chrXIII 678117 . T C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.383;DP=115;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:892,0,1459 chrXIII 678210 . C T 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3657,370,0 chrXIII 678565 . G A 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.126;DP=185;Dels=0.00;FS=5.508;HaplotypeScore=8.0208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.139;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,85:185:99:1732,0,2085 chrXIII 678831 . G A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.006;DP=178;Dels=0.00;FS=1.856;HaplotypeScore=3.3831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.505;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,86:178:99:1676,0,1893 chrXIII 679230 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.268;DP=126;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.042;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1250,0,1488 chrXIII 679747 . A G 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.276;DP=150;Dels=0.00;FS=2.181;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.847;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1527,0,1733 chrXIII 680018 . A G 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.452;DP=144;Dels=0.00;FS=11.376;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.599;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,86:144:99:1791,0,1144 chrXIII 680063 . C T 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.468;DP=108;Dels=0.00;FS=5.032;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:900,0,1407 chrXIII 680380 . T C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.343;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.343;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1465,0,1156 chrXIII 680399 . A G 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3354,346,0 chrXIII 680463 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.462;DP=126;Dels=0.00;FS=3.338;HaplotypeScore=2.8731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.717;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1219,0,1609 chrXIII 680762 . C A 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.807;DP=156;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.330;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1677,0,1721 chrXIII 680769 . T C 4255.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.958e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4255,445,0 chrXIII 680903 . C T 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.840;DP=127;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.493;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1361,0,1391 chrXIII 680936 . T C 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1546;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=25.50;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3169,321,0 chrXIII 680940 . C T 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3184,316,0 chrXIII 681495 . C T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.610;DP=145;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=3.7104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1492,0,1365 chrXIII 681615 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.551;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.615;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.277;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1284,0,1596 chrXIII 681830 . T C 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.281;DP=150;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1477,0,1583 chrXIII 681836 . A G 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.382;DP=154;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=3.7401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1582,0,1624 chrXIII 682194 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.373;DP=150;Dels=0.00;FS=2.086;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1501,0,1725 chrXIII 682286 . T C 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.363;DP=114;Dels=0.00;FS=7.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.031;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1054,0,1318 chrXIII 682560 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.852;DP=130;Dels=0.00;FS=3.127;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.520;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1292,0,1411 chrXIII 682641 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.078;DP=144;Dels=0.00;FS=7.570;HaplotypeScore=2.9568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.624;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1619,0,1406 chrXIII 682932 . C T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.710;DP=147;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.627;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1701,0,1402 chrXIII 682985 . C G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:120:99:1287,0,1306 chrXIII 683288 . G C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.954;DP=108;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:108:99:1401,0,878 chrXIII 683334 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.692;DP=141;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=4.1257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.006;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:141:99:1409,0,1355 chrXIII 683373 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.810;DP=138;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1452,0,1323 chrXIII 683802 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.765;DP=110;Dels=0.00;FS=2.478;HaplotypeScore=2.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1039,0,1222 chrXIII 683958 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.293;DP=131;Dels=0.00;FS=6.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.791;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1264,0,1562 chrXIII 684197 . T A 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.975;DP=127;Dels=0.00;FS=4.380;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.618;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1566,0,1182 chrXIII 684262 . C T 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.720;DP=121;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.029;QD=12.20;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1506,0,1063 chrXIII 684406 . A T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.053;DP=118;Dels=0.00;FS=1.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.990;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1220,0,1291 chrXIII 684407 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.074;DP=119;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.082;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1215,0,1287 chrXIII 685051 . C T 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.805;DP=127;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=-0.572;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.205;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1569,0,1133 chrXIII 685138 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.430;DP=144;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.064;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1539,0,1437 chrXIII 685330 . T A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.734;DP=107;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:1033,0,1344 chrXIII 685585 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.288;DP=110;Dels=0.00;FS=7.770;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1272,0,1095 chrXIII 685689 . T C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.411;DP=112;Dels=0.00;FS=7.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.353;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1108,0,1318 chrXIII 686772 . C T 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3281,316,0 chrXIII 687028 . G T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.109;DP=139;Dels=0.00;FS=2.132;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.433;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1443,0,1542 chrXIII 687199 . C T 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3477,346,0 chrXIII 687277 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.675;DP=125;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=7.8975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.560;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1289,0,1434 chrXIII 687331 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.120;DP=122;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=7.4619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.859;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1436,0,1132 chrXIII 687334 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.960;DP=122;Dels=0.00;FS=4.397;HaplotypeScore=2.6711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.684;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1297,0,1109 chrXIII 687346 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.675;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.778;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1210,0,1171 chrXIII 687551 . T C 2492 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=23.73;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2525,255,0 chrXIII 688004 . G C 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.118;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,70:153:99:1474,0,1792 chrXIII 688238 . C T 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.977;DP=169;Dels=0.00;FS=1.251;HaplotypeScore=3.6506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.494;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,78:169:99:1555,0,1967 chrXIII 688319 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.497;DP=161;Dels=0.00;FS=6.813;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.864;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,71:161:99:1334,0,2092 chrXIII 688379 . A G 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.117;DP=159;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.380;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1648,0,1793 chrXIII 688587 . G A 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.405;DP=151;Dels=0.00;FS=3.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.426;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1653,0,1580 chrXIII 688814 . A G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.006;DP=110;Dels=0.00;FS=2.431;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.713;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1267,0,1145 chrXIII 688984 . C T 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.905;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=41.1648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.304;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:935,0,1035 chrXIII 688991 . A G 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.089;DP=101;Dels=0.00;FS=3.774;HaplotypeScore=54.9299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1005,0,1120 chrXIII 689009 . C T 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.339;DP=104;Dels=0.00;FS=1.615;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1083,0,1009 chrXIII 689061 . A T 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;DP=135;Dels=0.00;FS=5.695;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.250;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1573,0,1418 chrXIII 689079 . A C 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.081;DP=155;Dels=0.00;FS=4.083;HaplotypeScore=5.9114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.048;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.271;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1735,0,1535 chrXIII 689423 . C T 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.222;DP=140;Dels=0.00;FS=2.147;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.115;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1714,0,1301 chrXIII 689462 . T A 1797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.470;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1827,0,1672 chrXIII 689571 . G A 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.468;DP=96;Dels=0.00;FS=2.675;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:872,0,1242 chrXIII 689685 . G C 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;DP=157;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=2.9951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:157:99:1772,0,1500 chrXIII 689883 . A G 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.250;DP=155;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,87:155:99:1769,0,1516 chrXIII 690102 . T C 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.437;DP=154;Dels=0.00;FS=1.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.192;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1597,0,1846 chrXIII 690172 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.760;DP=163;Dels=0.00;FS=2.812;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.860;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,66:163:99:1347,0,2123 chrXIII 690225 . T C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.651;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.589;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,59:148:99:1111,0,2021 chrXIII 690252 . G A 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.162;DP=147;Dels=0.00;FS=3.014;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.598;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,61:147:99:1283,0,1928 chrXIII 690488 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.741;DP=114;Dels=0.00;FS=3.499;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1151,0,1232 chrXIII 690671 . G A 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.762;DP=139;Dels=0.00;FS=3.284;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1706,0,1318 chrXIII 690710 . A T 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.03;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3222,319,0 chrXIII 691064 . A T 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3377,322,0 chrXIII 691343 . A G 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.990;DP=167;Dels=0.00;FS=7.988;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.329;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,78:167:99:1641,0,1939 chrXIII 691697 . A G 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.262;DP=138;Dels=0.00;FS=6.353;HaplotypeScore=3.7075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.184;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1442,0,1596 chrXIII 691745 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.787;DP=146;Dels=0.00;FS=5.006;HaplotypeScore=7.5010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.776;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:146:99:1535,0,1617 chrXIII 691787 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.315;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1174,0,1597 chrXIII 691867 . T C 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.820;DP=174;Dels=0.00;FS=2.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.077;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,81:174:99:1574,0,2014 chrXIII 691976 . T C 2104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.433;DP=202;Dels=0.00;FS=4.492;HaplotypeScore=2.2880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=1;MQRankSum=2.040;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,101:202:99:2134,0,2072 chrXIII 692015 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.303;DP=170;Dels=0.00;FS=5.821;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=1;MQRankSum=1.882;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.142;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,76:170:99:1626,0,1978 chrXIII 692042 . C A 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.436;DP=159;Dels=0.00;FS=3.804;HaplotypeScore=9.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.272;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,82:159:99:1615,0,1619 chrXIII 692398 . C T 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.432;DP=122;Dels=0.00;FS=4.416;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.210;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:122:99:1614,0,1049 chrXIII 692624 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.616;DP=144;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1529,0,1554 chrXIII 692846 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.947;DP=111;Dels=0.00;FS=5.993;HaplotypeScore=2.7476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.329;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.190;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:111:99:1074,0,1344 chrXIII 692849 . C T 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.197;DP=112;Dels=0.00;FS=7.334;HaplotypeScore=2.7476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1053,0,1383 chrXIII 692858 . A G 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.135;DP=117;Dels=0.00;FS=2.415;HaplotypeScore=4.2707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.925;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:942,0,1546 chrXIII 693152 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.312;DP=123;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.584;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1369,0,1380 chrXIII 693184 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.250;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1376,0,1476 chrXIII 693249 . C T 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.831;DP=99;Dels=0.00;FS=6.982;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.867;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,38:99:99:789,0,1296 chrXIII 693352 . T C 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.763;DP=162;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=2.7114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.408;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,84:162:99:1797,0,1758 chrXIII 693410 . C T 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.528;DP=138;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.356;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1463,0,1481 chrXIII 693754 . C T 4774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:184:99:4774,478,0 chrXIII 694247 . G A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.996;DP=123;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=3.7625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.581;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1526,0,1111 chrXIII 694367 . C T 2011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.792;DP=175;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,94:175:99:2041,0,1614 chrXIII 694392 . C A 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.587;DP=134;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=3.9007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1803,0,1107 chrXIII 694403 . C A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.741;DP=138;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=3.9007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.259;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1560,0,1304 chrXIII 694404 . T C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.154;DP=134;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=3.0686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.209;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1482,0,1279 chrXIII 694464 . A T 1960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.644;DP=179;Dels=0.00;FS=4.793;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.079;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,90:179:99:1990,0,1986 chrXIII 694676 . A G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.269;DP=138;Dels=0.00;FS=6.654;HaplotypeScore=2.7145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=2.901;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.787;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1204,0,1587 chrXIII 694682 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.424;DP=141;Dels=0.00;FS=6.481;HaplotypeScore=2.7145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=8.72;ReadPosRankSum=-2.065;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1260,0,1417 chrXIII 694691 . G A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.735;DP=147;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=4.3155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.838;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1488,0,1344 chrXIII 694961 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.993;DP=140;Dels=0.00;FS=4.031;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.978;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1367,0,1609 chrXIII 695123 . A G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.220;DP=157;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=8.66;ReadPosRankSum=2.091;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1389,0,1742 chrXIII 695733 . C A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.772;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1327,0,958 chrXIII 696337 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.259;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,70:162:99:1464,0,1999 chrXIII 696515 . T C 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.806;DP=126;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.767;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:954,0,1741 chrXIII 696553 . C A 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.216;DP=123;Dels=0.00;FS=4.774;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.563;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:1053,0,1666 chrXIII 696888 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.444;DP=144;Dels=0.00;FS=1.373;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.177;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1519,0,1612 chrXIII 696957 . T C 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.684;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,83:169:99:1719,0,1878 chrXIII 697086 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.419;DP=131;Dels=0.00;FS=9.458;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.470;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1462,0,1259 chrXIII 697107 . T C 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.870;DP=144;Dels=0.00;FS=8.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.483;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1471,0,1476 chrXIII 697269 . C T 4724.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.99;SB=-2.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4724,451,0 chrXIII 697520 . A G 4066.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4066,409,0 chrXIII 697902 . C T 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3636,370,0 chrXIII 697993 . G A 4094.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2228;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4094,397,0 chrXIII 698166 . G T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.948;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=8.62;ReadPosRankSum=-1.843;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1219,0,1640 chrXIII 698195 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.875;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.264;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:137:99:1531,0,1140 chrXIII 698247 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.361;DP=153;Dels=0.00;FS=4.765;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.343;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1465,0,1738 chrXIII 698264 . C G 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;DP=154;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:154:99:1518,0,1737 chrXIII 698336 . C T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.759;DP=130;Dels=0.00;FS=2.252;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=12.45;ReadPosRankSum=-1.784;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:1649,0,1198 chrXIII 698345 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.477;DP=114;Dels=0.00;FS=2.415;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1180,0,1323 chrXIII 698372 . C A 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.584;DP=148;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=3.8657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.188;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:148:99:1703,0,1322 chrXIII 698549 . G T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.822;DP=141;Dels=0.00;FS=3.256;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:141:99:1292,0,1649 chrXIII 698569 . A G 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.689;DP=165;Dels=0.00;FS=12.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.286;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:1709,0,1896 chrXIII 698595 . G A 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.249;DP=166;Dels=0.00;FS=6.709;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.872;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.179;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1662,0,1783 chrXIII 698611 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.521;DP=148;Dels=0.00;FS=4.857;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.895;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.395;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1289,0,1777 chrXIII 698642 . T A 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.402;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.876;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1346,0,1014 chrXIII 698828 . C T 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.760;DP=135;Dels=0.00;FS=15.981;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.968;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1532,0,1279 chrXIII 698850 . G C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;DP=113;Dels=0.00;FS=3.506;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.303;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1258,0,1066 chrXIII 698988 . C T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.172;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.428;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1297,0,1227 chrXIII 699056 . C T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.237;DP=102;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:1033,0,1195 chrXIII 699315 . C A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.104;DP=140;Dels=0.00;FS=1.338;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=1;MQRankSum=-0.799;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.381;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1476,0,1398 chrXIII 699415 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.845;DP=142;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=1;MQRankSum=1.111;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.408;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1457,0,1507 chrXIII 699619 . T G 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.934;DP=132;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:132:99:935,0,1930 chrXIII 699822 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.911;DP=136;Dels=0.00;FS=6.402;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.328;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1334,0,1498 chrXIII 699964 . C T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.181;DP=150;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.158;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:150:99:1537,0,1584 chrXIII 699987 . T C 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.602;DP=147;Dels=0.00;FS=2.074;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1710,0,1529 chrXIII 700035 . A G 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.365;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1633,0,1687 chrXIII 700050 . G A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.404;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.284;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1606,0,1277 chrXIII 700452 . T A 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3702,367,0 chrXIII 700469 . C T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.506;DP=146;Dels=0.00;FS=2.098;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1478,0,1673 chrXIII 700735 . T C 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.765;DP=165;Dels=0.00;FS=5.606;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.172;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:1607,0,1920 chrXIII 700956 . A G 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.631;DP=145;Dels=0.00;FS=7.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.967;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:145:99:1419,0,1585 chrXIII 701095 . T C 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.691;DP=116;Dels=0.00;FS=3.629;HaplotypeScore=5.7514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:1387,0,1026 chrXIII 701127 . C G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.671;DP=152;Dels=0.00;FS=2.948;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.038;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1434,0,1541 chrXIII 701167 . A C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.530;DP=141;Dels=0.00;FS=1.509;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.137;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1341,0,1682 chrXIII 701244 . T C 4556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4556,471,0 chrXIII 701442 . C T 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.976e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3947,388,0 chrXIII 701468 . A T 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3603,372,0 chrXIII 701606 . T A 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.93;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2551,240,0 chrXIII 702308 . T C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.806;DP=129;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.681;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1265,0,1603 chrXIII 702551 . C T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.258;DP=137;Dels=0.00;FS=8.131;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.090;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:1158,0,1869 chrXIII 702572 . G A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.056;DP=126;Dels=0.00;FS=12.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.373;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,51:126:99:1031,0,1757 chrXIII 702605 . C T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.272;DP=135;Dels=0.00;FS=10.662;HaplotypeScore=2.6779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.742;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1352,0,1627 chrXIII 702665 . T C 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.286;DP=113;Dels=0.00;FS=2.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.801;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1408,0,1075 chrXIII 702763 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.706;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:141:99:1400,0,1650 chrXIII 703483 . A G 1505.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.528;DP=138;Dels=0.00;FS=4.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=10.91;ReadPosRankSum=2.150;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1535,0,1461 chrXIII 703487 . T C 1482.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.049;DP=137;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.642;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1512,0,1356 chrXIII 703489 . A G 1477.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.171;DP=134;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.157;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1507,0,1332 chrXIII 703549 . T C 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.948;DP=111;Dels=0.00;FS=3.834;HaplotypeScore=4.9474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.05;MQ0=0;MQRankSum=-7.845;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.287;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:967,0,1254 chrXIII 703558 . A G 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.559;DP=116;Dels=0.00;FS=2.691;HaplotypeScore=85.8187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.64;MQ0=0;MQRankSum=-8.588;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.896;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:846,0,1479 chrXIII 703588 . C T 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;DP=115;Dels=0.00;FS=1.662;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQ0=0;MQRankSum=-8.784;QD=6.90;ReadPosRankSum=-2.371;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:824,0,1464 chrXIII 703828 . A G 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-3.279;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,82:141:99:1795,0,1280 chrXIII 703858 . G A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.386;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1315,0,1278 chrXIII 703860 . A G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.527;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.045;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1320,0,1278 chrXIII 703891 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.627;DP=137;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=3.6923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.331;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.830;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:137:99:1427,0,1433 chrXIII 703913 . T G 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.768;DP=139;Dels=0.00;FS=5.539;HaplotypeScore=5.7975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=10.09;ReadPosRankSum=-4.658;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1432,0,1538 chrXIII 703969 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.783;DP=137;Dels=0.00;FS=6.556;HaplotypeScore=2.8621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1329,0,1658 chrXIII 703990 . C T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.493;DP=118;Dels=0.00;FS=4.795;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.642;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1210,0,1384 chrXIII 704074 . C T 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.864;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1683,0,1433 chrXIII 704204 . A G 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.434;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:145:99:1294,0,1840 chrXIII 704425 . A T 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.279;DP=168;Dels=0.00;FS=3.971;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,79:168:99:1739,0,1951 chrXIII 704704 . T C 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3581,381,0 chrXIII 704707 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.920;DP=131;Dels=0.00;FS=5.397;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1065,0,1699 chrXIII 704739 . T G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.091;DP=134;Dels=0.00;FS=4.763;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.984;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1271,0,1548 chrXIII 704858 . T G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.631;DP=107;Dels=0.00;FS=4.203;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.458;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1106,0,1097 chrXIII 704983 . T C 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.026;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1446,0,1411 chrXIII 704994 . T C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.368;DP=135;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=3.6453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.038;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1396,0,1496 chrXIII 705049 . T C 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.274;DP=132;Dels=0.00;FS=7.844;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.033;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1338,0,1504 chrXIII 705104 . C T 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3914,382,0 chrXIII 705307 . A G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.204;DP=115;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=10.36;ReadPosRankSum=2.140;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1221,0,1317 chrXIII 705664 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.577;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1238,0,1316 chrXIII 705665 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.429;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1325,0,1264 chrXIII 705679 . T C 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.983;DP=117;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.402;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:117:99:1062,0,1423 chrXIII 705697 . G A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.780;DP=126;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1267,0,1464 chrXIII 705701 . A C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.312;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1165,0,1607 chrXIII 705866 . T C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.090;DP=145;Dels=0.00;FS=4.979;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.096;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.102;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1343,0,1837 chrXIII 705940 . C T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.229;DP=167;Dels=0.00;FS=1.942;HaplotypeScore=5.7267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.913;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,70:167:99:1500,0,2122 chrXIII 706063 . A G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.839;DP=133;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=3.3213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1403,0,1501 chrXIII 706072 . G A 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.329;DP=134;Dels=0.00;FS=4.124;HaplotypeScore=2.6785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1554,0,1295 chrXIII 706102 . T A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.773;DP=115;Dels=0.00;FS=1.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.587;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1405,0,1072 chrXIII 706316 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.630;DP=144;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:144:99:1281,0,1884 chrXIII 706357 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;DP=109;Dels=0.00;FS=3.647;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.715;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1067,0,1341 chrXIII 706360 . C T 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.939;DP=109;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1139,0,1150 chrXIII 706368 . T G 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.477;DP=89;Dels=0.00;FS=0.806;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.751;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,49:89:99:964,0,926 chrXIII 706399 . T G 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.20;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2891,312,0 chrXIII 706672 . C T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.665;DP=141;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.830;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1445,0,1522 chrXIII 706735 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.568;DP=135;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1350,0,1517 chrXIII 706915 . T C 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.492;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.922;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1456,0,1378 chrXIII 707087 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.181;DP=116;Dels=0.00;FS=14.072;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.358;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.940;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:1036,0,1409 chrXIII 707101 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.559;DP=124;Dels=0.00;FS=11.318;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.204;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.307;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1048,0,1512 chrXIII 707120 . A G 958.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.279;DP=123;Dels=0.00;FS=5.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.71;MQ0=0;MQRankSum=-4.656;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.928;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:988,0,1594 chrXIII 707123 . C T 996.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.156;DP=125;Dels=0.00;FS=5.606;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQ0=0;MQRankSum=-5.588;QD=7.97;ReadPosRankSum=2.226;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1026,0,1544 chrXIII 707124 . T C 975.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQ0=0;MQRankSum=-4.261;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.886;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1005,0,1333 chrXIII 707161 . C A 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.142;DP=103;Dels=0.00;FS=6.291;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=0;MQRankSum=-4.436;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.749;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:987,0,1071 chrXIII 707180 . A T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;DP=93;Dels=0.00;FS=3.881;HaplotypeScore=5.9349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.206;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1025,0,935 chrXIII 707281 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.266;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.556;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,71:125:99:1473,0,1150 chrXIII 707422 . A G 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.164;DP=132;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1468,0,1427 chrXIII 707624 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.735;DP=123;Dels=0.00;FS=6.801;HaplotypeScore=2.9063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1368,0,1176 chrXIII 707825 . A G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.870;DP=130;Dels=0.00;FS=3.595;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1320,0,1363 chrXIII 707917 . G A 2096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.801;DP=173;Dels=0.00;FS=4.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,101:173:99:2126,0,1455 chrXIII 708061 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.665;DP=116;Dels=0.00;FS=7.183;HaplotypeScore=2.5015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.277;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1128,0,1367 chrXIII 708064 . C A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.118;DP=117;Dels=0.00;FS=4.584;HaplotypeScore=3.4174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.478;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1118,0,1298 chrXIII 708117 . G A 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.227;DP=133;Dels=0.00;FS=5.403;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=-4.263;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.661;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:1131,0,1785 chrXIII 708126 . A G 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.749;DP=141;Dels=0.00;FS=4.057;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQ0=0;MQRankSum=-4.746;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.469;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:982,0,1967 chrXIII 708130 . T C 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.351;DP=133;Dels=0.00;FS=9.454;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQ0=0;MQRankSum=-6.027;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.802;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:958,0,1847 chrXIII 708165 . A C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.485;DP=150;Dels=0.00;FS=11.431;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.14;MQ0=0;MQRankSum=-6.022;QD=7.73;ReadPosRankSum=-2.083;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1189,0,1943 chrXIII 708169 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.268;DP=154;Dels=0.00;FS=8.503;HaplotypeScore=2.4546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.23;MQ0=0;MQRankSum=-5.223;QD=6.51;ReadPosRankSum=-1.614;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:154:99:1032,0,2002 chrXIII 708177 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=142;Dels=0.00;FS=6.366;HaplotypeScore=3.0340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.43;MQ0=0;MQRankSum=-6.052;QD=6.93;ReadPosRankSum=-2.292;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:142:99:1014,0,1805 chrXIII 708242 . G A 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.45;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3743,370,0 chrXIII 708248 . A T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.223;DP=142;Dels=0.00;FS=6.220;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.665;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1512,0,1552 chrXIII 708259 . C A 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.065;DP=142;Dels=0.00;FS=8.724;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.265;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.845;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1557,0,1455 chrXIII 708336 . G A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.959;DP=131;Dels=0.00;FS=3.145;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.956;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1404,0,1551 chrXIII 708449 . G A 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.779;DP=137;Dels=0.00;FS=5.173;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:137:99:1601,0,1327 chrXIII 708515 . A G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.861;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1456,0,1213 chrXIII 708535 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.828;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.328;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1431,0,1136 chrXIII 708648 . G A 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.513;DP=109;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.931;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1131,0,1258 chrXIII 708659 . T C 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.487;DP=97;Dels=0.00;FS=3.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=9.27;ReadPosRankSum=2.597;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:929,0,1181 chrXIII 708678 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.681;DP=133;Dels=0.00;FS=3.169;HaplotypeScore=3.9718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.603;QD=9.08;ReadPosRankSum=2.598;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1238,0,1675 chrXIII 708752 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.935;DP=139;Dels=0.00;FS=4.095;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1329,0,1600 chrXIII 708816 . G A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.007;DP=146;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:146:99:1404,0,1701 chrXIII 708850 . G A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.484;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1497,0,1357 chrXIII 708880 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.343;DP=129;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=11.20;ReadPosRankSum=2.099;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1475,0,1397 chrXIII 709047 . A G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.087;DP=131;Dels=0.00;FS=8.011;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.925;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.413;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1422,0,1358 chrXIII 709130 . C G 2015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;DP=173;Dels=0.00;FS=3.561;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.197;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,97:173:99:2045,0,1546 chrXIII 709221 . A G 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.527;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1462,0,1664 chrXIII 709256 . A C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.853;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.929;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1405,0,1764 chrXIII 709259 . A C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.298;DP=151;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=9.19;ReadPosRankSum=-2.455;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1417,0,1727 chrXIII 709343 . C T 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.999;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1556,0,1222 chrXIII 709368 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.284;DP=129;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.803;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1376,0,1387 chrXIII 709549 . G C 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.689;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1495,0,1619 chrXIII 710293 . C T 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.293;DP=166;Dels=0.00;FS=9.452;HaplotypeScore=4.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,74:166:99:1518,0,2016 chrXIII 710381 . T C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.734;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,51:132:99:914,0,1854 chrXIII 710402 . G A 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.508;DP=123;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.797;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,46:123:99:848,0,1725 chrXIII 710597 . G A 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;DP=138;Dels=0.00;FS=8.657;HaplotypeScore=2.9586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.011;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1197,0,1594 chrXIII 710752 . T C 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.281;DP=163;Dels=0.00;FS=2.052;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=9.60;ReadPosRankSum=-2.005;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1594,0,1854 chrXIII 710845 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.485;DP=109;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=4.6212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.737;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1178,0,1143 chrXIII 710880 . T A 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;DP=101;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1208,0,1010 chrXIII 710897 . A C 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.656;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.822;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.060;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:920,0,981 chrXIII 710961 . G T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.468;DP=102;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=3.9120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.301;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1148,0,947 chrXIII 711019 . T G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.602;DP=119;Dels=0.00;FS=18.744;HaplotypeScore=4.6829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.464;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1275,0,1236 chrXIII 711139 . T C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.281;DP=125;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=2.7794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.25;ReadPosRankSum=3.091;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1436,0,1223 chrXIII 711470 . A T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;DP=125;Dels=0.00;FS=8.483;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1320,0,1433 chrXIII 711514 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.093;DP=137;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=6.3060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.054;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1408,0,1559 chrXIII 711575 . G A 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3600,364,0 chrXIII 711844 . C T 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.720;DP=115;Dels=0.00;FS=7.506;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,48:115:99:1029,0,1501 chrXIII 711900 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.396;DP=93;Dels=0.00;FS=5.343;HaplotypeScore=3.3089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:1162,0,873 chrXIII 712021 . G A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.145;DP=109;Dels=0.00;FS=1.729;HaplotypeScore=5.4063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.995;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:109:99:1299,0,879 chrXIII 712271 . A G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.346;DP=120;Dels=0.00;FS=4.526;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.460;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1125,0,1459 chrXIII 712385 . A C 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;DP=143;Dels=0.00;FS=1.362;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1442,0,1614 chrXIII 712387 . A G 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.674;DP=142;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1436,0,1637 chrXIII 712461 . G A 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.104;DP=149;Dels=0.00;FS=13.162;HaplotypeScore=2.4987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1785,0,1331 chrXIII 712539 . G C 3882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3882,399,0 chrXIII 712621 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.719;DP=131;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1327,0,1412 chrXIII 712702 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.553;DP=132;Dels=0.00;FS=4.225;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=9.50;ReadPosRankSum=2.703;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1284,0,1596 chrXIII 712889 . G T 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=1;QD=28.32;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3596,355,0 chrXIII 713044 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.378;DP=121;Dels=0.00;FS=9.865;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1417,0,1143 chrXIII 713054 . G A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;DP=122;Dels=0.00;FS=4.445;HaplotypeScore=3.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.064;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1462,0,1182 chrXIII 713074 . T A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;DP=113;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.026;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1417,0,1111 chrXIII 713194 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.484;DP=111;Dels=0.00;FS=4.782;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.121;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:111:99:1159,0,1148 chrXIII 713537 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.174;DP=121;Dels=0.00;FS=8.347;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1305,0,1268 chrXIII 713573 . A G 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;DP=90;Dels=0.00;FS=2.820;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.869;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1082,0,931 chrXIII 713731 . A C 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.816;DP=100;Dels=0.00;FS=9.570;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=8.52;ReadPosRankSum=-2.128;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:882,0,1202 chrXIII 713803 . T G 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.056;DP=106;Dels=0.00;FS=5.978;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=1.433;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.279;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1058,0,1169 chrXIII 713912 . T G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.338;DP=156;Dels=0.00;FS=8.583;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1562,0,1753 chrXIII 713980 . G T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.972;DP=110;Dels=0.00;FS=6.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.042;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1263,0,1121 chrXIII 714399 . T C 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.379;DP=169;Dels=0.00;FS=7.932;HaplotypeScore=4.2952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.533;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,83:169:99:1716,0,1843 chrXIII 714656 . G A 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.758;DP=170;Dels=0.00;FS=2.027;HaplotypeScore=4.8575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,82:170:99:1738,0,1840 chrXIII 714847 . G A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.780;DP=125;Dels=0.00;FS=5.475;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.123;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1245,0,1391 chrXIII 714945 . C T 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.236;DP=131;Dels=0.00;FS=2.286;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.596;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:131:99:1774,0,1111 chrXIII 715098 . A G 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3286,333,0 chrXIII 715145 . A G 3760.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3760,375,0 chrXIII 715457 . C T 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.472;DP=127;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.786;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1135,0,1628 chrXIII 715590 . A T 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.398;DP=157;Dels=0.00;FS=3.931;HaplotypeScore=7.6843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.107;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1653,0,1669 chrXIII 715643 . T C 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3429,345,0 chrXIII 715773 . C T 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.091;DP=145;Dels=0.00;FS=4.940;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=11.23;ReadPosRankSum=-2.135;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1659,0,1400 chrXIII 715919 . T C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.769;DP=129;Dels=0.00;FS=4.205;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1466,0,1131 chrXIII 715953 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;DP=103;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.151;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1148,0,1046 chrXIII 715971 . G A 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.272;DP=96;Dels=0.00;FS=6.798;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=9.63;ReadPosRankSum=2.166;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:954,0,1084 chrXIII 715989 . T C 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;DP=105;Dels=0.00;FS=7.991;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.328;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:860,0,1347 chrXIII 716317 . G A 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.928;DP=117;Dels=0.00;FS=5.771;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1028,0,1455 chrXIII 716342 . T C 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.776;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.067;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:907,0,1541 chrXIII 716386 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.836;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=3.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1105,0,1492 chrXIII 716494 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.494;DP=128;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.463;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1399,0,1419 chrXIII 716541 . G T 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:4011,394,0 chrXIII 716978 . C T 3868.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3868,379,0 chrXIII 717074 . C T 4691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.59;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4691,457,0 chrXIII 717136 . A G 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.354;DP=145;Dels=0.00;FS=2.089;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1639,0,1493 chrXIII 717356 . C T 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.177;DP=117;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1296,0,1222 chrXIII 717629 . T C 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5921;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3571,369,0 chrXIII 718072 . A C 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3763,390,0 chrXIII 718189 . A C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.822;DP=124;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=3.9732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.972;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.679;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1168,0,1462 chrXIII 718198 . A G 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.177;DP=108;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.740;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:975,0,1325 chrXIII 718210 . T C 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2927,312,0 chrXIII 718241 . C T 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3287,328,0 chrXIII 718396 . A G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.709;DP=133;Dels=0.00;FS=3.157;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.389;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1094,0,1680 chrXIII 718423 . G A 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.524;DP=103;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=2.9205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.070;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:918,0,1256 chrXIII 718456 . A C 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;DP=112;Dels=0.00;FS=3.548;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.117;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,44:112:99:836,0,1579 chrXIII 718505 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.516;DP=141;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.904;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,56:141:99:1136,0,1922 chrXIII 718511 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.889;DP=142;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.403;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,57:142:99:1136,0,1962 chrXIII 718535 . T A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.688;DP=136;Dels=0.00;FS=4.303;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.039;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,54:136:99:1135,0,1923 chrXIII 718679 . G A 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3000,298,0 chrXIII 718763 . T C 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;DP=127;Dels=0.00;FS=4.296;HaplotypeScore=2.8508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1318,0,1532 chrXIII 718938 . T A 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.670;DP=121;Dels=0.00;FS=5.604;HaplotypeScore=2.3574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1306,0,1373 chrXIII 718973 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.502;DP=127;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.987;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:127:99:1366,0,1396 chrXIII 719499 . A T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.819;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.957;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1654,0,1347 chrXIII 719516 . G A 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3894,391,0 chrXIII 719517 . G A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.395;DP=147;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1471,0,1626 chrXIII 719811 . A G 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.053;DP=135;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=2.6927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.645;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1480,0,1494 chrXIII 719868 . T A 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.181;DP=143;Dels=0.00;FS=8.795;HaplotypeScore=2.5740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1604,0,1470 chrXIII 720189 . A T 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;DP=152;Dels=0.00;FS=2.117;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.437;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1613,0,1604 chrXIII 720435 . C T 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.418;DP=150;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.128;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1605,0,1704 chrXIII 720657 . C G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;DP=127;Dels=0.00;FS=2.307;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.278;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1507,0,1188 chrXIII 720681 . T C 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.843;DP=152;Dels=0.00;FS=5.859;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=9.66;ReadPosRankSum=2.268;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1498,0,1666 chrXIII 721068 . T C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.260;DP=111;Dels=0.00;FS=4.775;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1265,0,1107 chrXIII 721309 . A T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;DP=156;Dels=0.00;FS=4.714;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.560;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1444,0,1828 chrXIII 721409 . A C 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.526;DP=134;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.053;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1427,0,1309 chrXIII 721557 . A G 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.549;DP=133;Dels=0.00;FS=6.575;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.244;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:133:99:1576,0,1241 chrXIII 721563 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.481;DP=129;Dels=0.00;FS=11.487;HaplotypeScore=3.5886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=11.02;ReadPosRankSum=-2.428;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1452,0,1205 chrXIII 721591 . G T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.723;DP=127;Dels=0.00;FS=14.964;HaplotypeScore=2.6927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1303,0,1342 chrXIII 721605 . G A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.686;DP=129;Dels=0.01;FS=6.689;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.659;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1289,0,1493 chrXIII 721694 . G A 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.060;DP=131;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.992;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.012;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1572,0,1349 chrXIII 721872 . C G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;DP=119;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.316;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1246,0,1278 chrXIII 722213 . G C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.315;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1135,0,1491 chrXIII 722436 . C T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.675;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=8.82;ReadPosRankSum=2.762;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,59:137:99:1239,0,1628 chrXIII 722723 . T C 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.915;DP=161;Dels=0.00;FS=6.013;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.976;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1671,0,1716 chrXIII 723405 . T C 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.587;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=3.389;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1409,0,1807 chrXIII 723430 . C T 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.903;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,75:170:99:1647,0,1995 chrXIII 723720 . G A 4055.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4055,391,0 chrXIII 723721 . C T 4092.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:4092,391,0 chrXIII 723828 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.113;DP=117;Dels=0.00;FS=10.109;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1073,0,1451 chrXIII 723996 . T C 1837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.510;DP=187;Dels=0.00;FS=1.864;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,94:187:99:1867,0,2122 chrXIII 724200 . C T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.759;DP=119;Dels=0.00;FS=3.327;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.572;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1330,0,1198 chrXIII 724434 . T C 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3465,369,0 chrXIII 724457 . C T 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.167;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.717;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.039;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1569,0,1660 chrXIII 724793 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.419;DP=141;Dels=0.00;FS=6.288;HaplotypeScore=5.7945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1366,0,1626 chrXIII 724837 . G A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.187;DP=129;Dels=0.00;FS=2.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.474;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1174,0,1442 chrXIII 724851 . T A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;DP=121;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.418;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1278,0,1370 chrXIII 726276 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.852;DP=109;Dels=0.00;FS=11.079;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.151;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:109:99:1270,0,1104 chrXIII 727001 . C T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.134;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.431;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1342,0,1346 chrXIII 727057 . A G 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2863,303,0 chrXIII 727303 . C T 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.237;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=26.33;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3502,323,0 chrXIII 727646 . G A 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3168,310,0 chrXIII 729020 . G C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.645;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,49:123:99:941,0,1601 chrXIII 729284 . T C 2495 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2528,261,0 chrXIII 729976 . A G 2094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.85;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:78:99:2127,228,0 chrXIII 730384 . A G 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3586,363,0 chrXIII 730458 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.312;DP=119;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1275,0,1381 chrXIII 730533 . T C 4001.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=166;Dels=0.00;FS=3.170;HaplotypeScore=3.8812;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=24.10;ReadPosRankSum=1.586;SB=-2.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:166:99:4001,399,0 chrXIII 730842 . C T 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.826;DP=116;Dels=0.00;FS=3.394;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1308,0,1216 chrXIII 731249 . T G 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.370;DP=112;Dels=0.01;FS=3.556;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.702;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1118,0,1217 chrXIII 731422 . A G 3935.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3935,391,0 chrXIII 731433 . G A 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3893,385,0 chrXIII 731576 . A G 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3237,339,0 chrXIII 731588 . A G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.563;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=11.02;ReadPosRankSum=-2.217;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1330,0,1234 chrXIII 731616 . C A 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=28.03;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3280,325,0 chrXIII 732070 . T A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;DP=98;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=0.112;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.509;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1115,0,1101 chrXIII 732515 . G C 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.975;DP=92;Dels=0.00;FS=12.312;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.079;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1095,0,886 chrXIII 732688 . A G 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.524;DP=111;Dels=0.00;FS=3.593;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.325;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,42:111:99:721,0,1602 chrXIII 733169 . T G 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.584;DP=89;Dels=0.00;FS=12.380;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.373;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,49:89:99:1037,0,838 chrXIII 733539 . C A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.841;DP=120;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1250,0,1386 chrXIII 733556 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.590;DP=126;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.049;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1263,0,1389 chrXIII 733977 . G A 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.236;DP=133;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=3.6064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.802;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:133:99:1707,0,1177 chrXIII 734018 . C A 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.777;DP=109;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.850;QD=9.33;ReadPosRankSum=2.144;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:1047,0,1310 chrXIII 734142 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.432;DP=119;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1302,0,1156 chrXIII 734392 . T C 2324 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2357,246,0 chrXIII 735311 . A G 664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.082;DP=88;Dels=0.00;FS=1.752;HaplotypeScore=3.9773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:694,0,1101 chrXIII 736201 . C T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.690;DP=126;Dels=0.00;FS=12.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.314;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1320,0,1489 chrXIII 736916 . A C 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.214;DP=101;Dels=0.00;FS=0.796;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.284;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:101:99:806,0,1264 chrXIII 736919 . C T 767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.316;DP=100;Dels=0.00;FS=3.959;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.337;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:797,0,1219 chrXIII 737009 . C T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.092;DP=100;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:99:99:1058,0,1117 chrXIII 737273 . C T 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.990;DP=127;Dels=0.00;FS=2.273;HaplotypeScore=2.9951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1525,0,1176 chrXIII 737783 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.904;DP=93;Dels=0.00;FS=4.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.321;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,58:93:99:1264,0,694 chrXIII 737936 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.118;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.076;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1214,0,1164 chrXIII 738224 . C A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.524;DP=112;Dels=0.00;FS=2.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.508;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1104,0,1337 chrXIII 739012 . T C 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3331,330,0 chrXIII 739474 . A G 886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.700;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.865;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.266;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,48:118:99:916,0,1631 chrXIII 739909 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.788;DP=142;Dels=0.00;FS=1.834;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.984;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1428,0,1566 chrXIII 739970 . A T 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;DP=119;Dels=0.00;FS=2.586;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.099;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1510,0,1182 chrXIII 740218 . G T 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.81;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3421,334,0 chrXIII 740429 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.662;DP=115;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.951;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1106,0,1289 chrXIII 740466 . G A 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.267;DP=100;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.705;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:100:99:1306,0,879 chrXIII 740988 . A T 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;DP=111;Dels=0.00;FS=8.834;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=8.24;ReadPosRankSum=-2.148;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:945,0,1395 chrXIII 741147 . T A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.857;DP=114;Dels=0.00;FS=3.520;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1129,0,1453 chrXIII 741694 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.396;DP=97;Dels=0.00;FS=11.610;HaplotypeScore=2.8121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.061;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1217,0,980 chrXIII 741811 . C A 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.743;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.859;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1738,0,1520 chrXIII 741880 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.009;DP=126;Dels=0.00;FS=13.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1231,0,1489 chrXIII 742214 . A G 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.095;DP=142;Dels=0.00;FS=5.072;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.781;QD=11.51;ReadPosRankSum=2.175;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1665,0,1424 chrXIII 742337 . T G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.388;DP=132;Dels=0.00;FS=2.224;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=1;MQRankSum=1.509;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:132:99:1350,0,1394 chrXIII 742393 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.050;DP=125;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=4.1138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.542;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:125:99:1350,0,1313 chrXIII 742757 . G C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.831;DP=149;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,60:149:99:1154,0,1853 chrXIII 742762 . C T 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.208;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,57:145:99:1118,0,1818 chrXIII 742863 . A G 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.690;DP=156;Dels=0.00;FS=1.267;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.271;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1678,0,1557 chrXIII 742901 . T C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.765;DP=137;Dels=0.00;FS=3.043;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1562,0,1441 chrXIII 742946 . A G 1941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.487;DP=153;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.013;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,91:153:99:1971,0,1279 chrXIII 743180 . C T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.952;DP=154;Dels=0.00;FS=2.916;HaplotypeScore=2.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.504;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1593,0,1672 chrXIII 743279 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.328;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.308;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1560,0,1376 chrXIII 743500 . C A 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3066,298,0 chrXIII 743691 . G C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.624;DP=104;Dels=0.00;FS=2.622;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1273,0,918 chrXIII 743742 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.255;DP=126;Dels=0.00;FS=4.340;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.171;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1305,0,1325 chrXIII 743928 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.875;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.319;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1353,0,1391 chrXIII 744147 . G C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;DP=115;Dels=0.00;FS=4.894;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.077;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1464,0,962 chrXIII 744231 . C T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.955;DP=112;Dels=0.00;FS=3.624;HaplotypeScore=1.9125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:112:99:1060,0,1370 chrXIII 744270 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.165;DP=131;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=4.6627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1279,0,1346 chrXIII 744435 . T A 4157.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.65;SB=-2.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4157,403,0 chrXIII 744471 . T C 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.301;DP=124;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.244;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1499,0,1231 chrXIII 745965 . T C 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.189;DP=95;Dels=0.00;FS=3.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:1070,0,1053 chrXIII 745976 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.290;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:100:99:1163,0,991 chrXIII 746043 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.609;DP=111;Dels=0.00;FS=2.989;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.218;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1234,0,1211 chrXIII 746072 . G C 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.834;DP=144;Dels=0.00;FS=1.481;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.691;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1478,0,1441 chrXIII 746108 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.021;DP=122;Dels=0.00;FS=3.610;HaplotypeScore=2.7833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1255,0,1230 chrXIII 746305 . T A 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;DP=157;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.73;ReadPosRankSum=2.968;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,78:157:99:1715,0,1755 chrXIII 746448 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.621;DP=135;Dels=0.00;FS=5.384;HaplotypeScore=4.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.115;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1198,0,1635 chrXIII 746979 . T C 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.903;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.248;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:935,0,1201 chrXIII 747051 . T C 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3102,321,0 chrXIII 747252 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.948;DP=115;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1133,0,1338 chrXIII 747330 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.920;DP=148;Dels=0.00;FS=10.059;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1263,0,1738 chrXIII 747492 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.657;DP=117;Dels=0.00;FS=3.379;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.897;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1335,0,1256 chrXIII 747983 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.898;DP=111;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=9.83;ReadPosRankSum=3.276;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1121,0,1204 chrXIII 747998 . G C 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;DP=122;Dels=0.00;FS=2.338;HaplotypeScore=4.4016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.124;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:122:99:1327,0,1236 chrXIII 748010 . G A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.682;DP=119;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=4.5112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.862;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1364,0,1189 chrXIII 748055 . C T 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.460;DP=99;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.432;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1000,0,1140 chrXIII 748185 . G T 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;DP=95;Dels=0.00;FS=0.885;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.199;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:828,0,1221 chrXIII 748748 . G A 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.325;DP=110;Dels=0.00;FS=2.514;HaplotypeScore=2.7396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.721;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,43:110:99:871,0,1494 chrXIII 750116 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.549;DP=94;Dels=0.00;FS=1.648;HaplotypeScore=2.8500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.008;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1032,0,1004 chrXIII 750175 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.487;DP=96;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1063,0,951 chrXIII 750242 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.510;DP=109;Dels=0.00;FS=2.724;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.179;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1270,0,1069 chrXIII 750743 . G A 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.526;DP=104;Dels=0.00;FS=2.545;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.451;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:951,0,1241 chrXIII 750755 . T A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.438;DP=120;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.305;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1184,0,1444 chrXIII 750779 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.584;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1272,0,1254 chrXIII 750782 . G A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.381;DP=115;Dels=0.00;FS=3.571;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=12.16;ReadPosRankSum=-1.757;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1428,0,1107 chrXIII 750890 . A G 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.426;DP=158;Dels=0.00;FS=5.809;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.470;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:158:99:1438,0,1921 chrXIII 751063 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.818;DP=100;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1200,0,958 chrXIII 751101 . C T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.947;DP=124;Dels=0.00;FS=8.284;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1299,0,1358 chrXIII 751426 . C T 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.679;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.677;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1485,0,1275 chrXIII 751451 . T C 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.140;DP=106;Dels=0.00;FS=1.810;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,63:106:99:1408,0,987 chrXIII 751455 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.462;DP=110;Dels=0.00;FS=1.782;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,65:110:99:1474,0,993 chrXIII 751599 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.307;DP=120;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1402,0,1087 chrXIII 751891 . G A 1970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.872;DP=152;Dels=0.00;FS=7.289;HaplotypeScore=3.6669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.177;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,88:152:99:2000,0,1228 chrXIII 752227 . T G 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=128;Dels=0.00;FS=3.404;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=1;MQRankSum=-0.014;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.487;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3156,330,0 chrXIII 754489 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.828;DP=131;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1474,0,1319 chrXIII 754594 . T C 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2467,249,0 chrXIII 754611 . A T 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.432;DP=113;Dels=0.00;FS=4.696;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1450,0,989 chrXIII 754630 . T C 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.070;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.279;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:129:99:1606,0,1145 chrXIII 754796 . A T 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3926,391,0 chrXIII 754943 . C A 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.645;DP=153;Dels=0.00;FS=5.174;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1581,0,1691 chrXIII 755265 . G T 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.548;DP=114;Dels=0.00;FS=10.742;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,45:114:99:927,0,1512 chrXIII 755371 . A G 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;DP=147;Dels=0.00;FS=10.695;HaplotypeScore=4.9157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.126;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:147:99:1887,0,1351 chrXIII 755483 . G A 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.150;DP=151;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.853;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1780,0,1457 chrXIII 755501 . C T 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.220;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1898,0,1605 chrXIII 755756 . G A 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.918;DP=148;Dels=0.00;FS=6.217;HaplotypeScore=4.6616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=10.64;ReadPosRankSum=-2.001;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:148:99:1604,0,1394 chrXIII 755780 . T C 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:123:99:3148,324,0 chrXIII 755942 . T A,C 2868.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4385;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.31;MQ0=0;QD=22.58;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,67,60:127:99:2928,1301,1115,1626,0,1473 chrXIII 756991 . A T 408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;DP=110;Dels=0.00;FS=25.374;HaplotypeScore=183.6279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=-3.284;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-8.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,22:110:99:438,0,935 chrXIII 757003 . A T 203.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.522;DP=109;Dels=0.00;FS=11.593;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQ0=0;MQRankSum=-3.464;QD=1.86;ReadPosRankSum=-2.649;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,14:109:99:233,0,1151 chrXIII 757200 . T C 4267.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4267,433,0 chrXIII 757281 . T C 5142.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9723;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:5142,502,0 chrXIII 757815 . G C 4516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4805;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4516,469,0 chrXIII 758268 . C T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.542;DP=69;Dels=0.00;FS=0.972;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.153;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:895,0,500 chrXIII 758394 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.099;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1212,0,1573 chrXIII 758570 . G C 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3672,361,0 chrXIII 759082 . A G 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9520;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:3944,405,0 chrXIII 760497 . G A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.430;DP=123;Dels=0.00;FS=3.259;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.170;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1252,0,1438 chrXIII 761318 . T A 3892.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3892,382,0 chrXIII 761608 . A G 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8178;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3731,399,0 chrXIII 761870 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.701;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.331;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1158,0,1304 chrXIII 763130 . T C 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.179;DP=73;Dels=0.00;FS=0.983;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.609;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,39:73:99:816,0,743 chrXIII 763154 . C T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.710;DP=87;Dels=0.00;FS=0.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.608;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:928,0,981 chrXIII 763289 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.740;DP=128;Dels=0.00;FS=3.520;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=2.493;QD=7.95;ReadPosRankSum=-2.103;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1047,0,1707 chrXIII 763537 . T C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.865;DP=145;Dels=0.00;FS=3.153;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.360;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1294,0,1848 chrXIII 763651 . A G 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;DP=122;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.556;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1292,0,1370 chrXIII 763672 . A C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;DP=118;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.100;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1210,0,1378 chrXIII 763743 . A G 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.650;DP=122;Dels=0.00;FS=5.590;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=11.11;ReadPosRankSum=-2.094;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1385,0,1273 chrXIII 763864 . G C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.954;DP=132;Dels=0.00;FS=3.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.676;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1099,0,1577 chrXIII 763944 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.992;DP=123;Dels=0.00;FS=6.829;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.199;QD=10.09;ReadPosRankSum=2.325;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1271,0,1482 chrXIII 764392 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.570;DP=133;Dels=0.00;FS=1.373;HaplotypeScore=2.5519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.164;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1565,0,1320 chrXIII 764401 . A G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.832;DP=141;Dels=0.00;FS=5.081;HaplotypeScore=3.9741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1516,0,1434 chrXIII 764512 . C T 2100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.784;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.985;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,95:159:99:2130,0,1311 chrXIII 764629 . G A 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.559;DP=84;Dels=0.00;FS=0.828;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=12.11;ReadPosRankSum=-2.253;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,47:84:99:1047,0,791 chrXIII 764669 . C T 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.505;DP=108;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=2.5450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.083;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1262,0,1048 chrXIII 764686 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.403;DP=98;Dels=0.00;FS=1.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.904;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1164,0,864 chrXIII 764881 . T C 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;DP=148;Dels=0.00;FS=10.181;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.909;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1684,0,1399 chrXIII 765034 . A G 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.716;DP=140;Dels=0.00;FS=2.275;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1664,0,1447 chrXIII 765055 . T G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.014;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1434,0,1341 chrXIII 765059 . T G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.294;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.481;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1433,0,1324 chrXIII 765109 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.824;DP=124;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=3.9453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=2.605;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.609;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1498,0,1168 chrXIII 765121 . T C 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2739,282,0 chrXIII 765247 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.630;DP=167;Dels=0.00;FS=2.716;HaplotypeScore=2.9401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.272;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,74:167:99:1577,0,1972 chrXIII 765291 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.046;DP=138;Dels=0.00;FS=15.860;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.867;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1535,0,1584 chrXIII 765334 . A G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.164;DP=150;Dels=0.00;FS=17.040;HaplotypeScore=3.8427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=1;MQRankSum=-0.827;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1458,0,1826 chrXIII 765393 . C T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.314;DP=144;Dels=0.00;FS=9.283;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.006;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:144:99:1239,0,1707 chrXIII 765542 . T C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.643;DP=161;Dels=0.00;FS=3.012;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.198;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1335,0,1922 chrXIII 765648 . G T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.590;DP=137;Dels=0.00;FS=2.180;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.931;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1303,0,1688 chrXIII 765677 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.719;DP=128;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=4.7069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1514,0,1296 chrXIII 765682 . T C 3896.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3896,402,0 chrXIII 765773 . C T 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3765,373,0 chrXIII 765790 . G A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.313;DP=130;Dels=0.00;FS=4.293;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,76:130:99:1616,0,995 chrXIII 765835 . C T 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.062;DP=119;Dels=0.00;FS=1.483;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.471;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:929,0,1514 chrXIII 765853 . C T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.407;DP=127;Dels=0.00;FS=9.597;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.066;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1538,0,1178 chrXIII 765865 . C T 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.168;DP=135;Dels=0.00;FS=7.845;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.816;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1700,0,1231 chrXIII 765900 . G T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.561;DP=110;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=2.9566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.275;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1291,0,1119 chrXIII 766029 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.314;DP=122;Dels=0.00;FS=4.663;HaplotypeScore=4.6055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.878;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1326,0,1172 chrXIII 766042 . G A 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.211;DP=120;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.664;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1396,0,1029 chrXIII 766075 . G T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.833;DP=148;Dels=0.00;FS=1.295;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.874;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1486,0,1596 chrXIII 766186 . T A 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;DP=93;Dels=0.00;FS=5.196;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQ0=0;MQRankSum=-3.586;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:974,0,1083 chrXIII 766215 . T C 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.180;DP=96;Dels=0.00;FS=2.677;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.820;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:894,0,1221 chrXIII 766216 . G A 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.910;DP=98;Dels=0.00;FS=1.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.482;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:906,0,1212 chrXIII 766244 . A T 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.208;DP=98;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=2.5946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQ0=0;MQRankSum=-4.028;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.955;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:738,0,1224 chrXIII 766245 . T C 694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQ0=0;MQRankSum=-4.532;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.754;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:724,0,1238 chrXIII 766258 . G A 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.870;DP=110;Dels=0.00;FS=9.003;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.733;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.554;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:955,0,1216 chrXIII 766305 . C T 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.981;DP=107;Dels=0.00;FS=9.092;HaplotypeScore=2.9041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.059;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1045,0,1030 chrXIII 766444 . T G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.343;DP=127;Dels=0.00;FS=6.098;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1393,0,1317 chrXIII 766566 . T C 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.922;DP=153;Dels=0.00;FS=3.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.707;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1296,0,1936 chrXIII 766609 . C T 654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.663;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.448;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,33:88:99:684,0,1208 chrXIII 766673 . T G 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.192;DP=97;Dels=0.00;FS=3.826;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.925;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.480;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1070,0,954 chrXIII 766746 . A T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.034;DP=123;Dels=0.00;FS=2.386;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.124;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1263,0,1381 chrXIII 766771 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.106;DP=125;Dels=0.00;FS=3.398;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.612;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1283,0,1482 chrXIII 766803 . C T 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.171;DP=100;Dels=0.00;FS=27.567;HaplotypeScore=4.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:919,0,1233 chrXIII 766878 . G A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.524;DP=142;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=4.7599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.881;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1512,0,1485 chrXIII 766888 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.850;DP=130;Dels=0.00;FS=8.132;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1359,0,1327 chrXIII 766972 . A T 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;DP=112;Dels=0.00;FS=6.071;HaplotypeScore=5.9395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=8.44;ReadPosRankSum=3.125;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:975,0,1471 chrXIII 767001 . G A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.697;DP=145;Dels=0.00;FS=2.079;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.311;QD=10.39;ReadPosRankSum=-3.201;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1537,0,1505 chrXIII 767075 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.093;DP=131;Dels=0.00;FS=8.225;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=10.10;ReadPosRankSum=-2.266;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1353,0,1359 chrXIII 767080 . C T 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;DP=131;Dels=0.00;FS=11.006;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.992;QD=11.95;ReadPosRankSum=-2.866;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1596,0,1229 chrXIII 767325 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.950;DP=145;Dels=0.00;FS=3.231;HaplotypeScore=3.6154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1626,0,1420 chrXIII 767419 . T G 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.439;DP=110;Dels=0.00;FS=2.565;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:965,0,1453 chrXIII 767539 . G A 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.347;DP=136;Dels=0.00;FS=3.106;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,81:136:99:1824,0,1024 chrXIII 767542 . A G 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;DP=136;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.040;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1790,0,1168 chrXIII 767901 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.347;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.876;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1236,0,1483 chrXIII 768019 . A G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.225;DP=135;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=4.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1314,0,1586 chrXIII 768108 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.738;DP=103;Dels=0.00;FS=2.545;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1228,0,1117 chrXIII 768268 . A T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.853;DP=116;Dels=0.00;FS=2.338;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.588;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1340,0,1326 chrXIII 768296 . T A 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;DP=112;Dels=0.00;FS=9.607;HaplotypeScore=5.9599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1124,0,1392 chrXIII 768312 . T A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;DP=129;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=51.2249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=2.033;QD=8.50;ReadPosRankSum=-2.406;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1126,0,1507 chrXIII 768344 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.948;DP=126;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQ0=0;MQRankSum=3.976;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1032,0,1551 chrXIII 768463 . C T 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.492;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=2.685;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1013,0,1010 chrXIII 768494 . G A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.770;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.656;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1185,0,926 chrXIII 768514 . C T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.328;DP=82;Dels=0.00;FS=6.047;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.984;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,47:82:99:990,0,614 chrXIII 768590 . C T 136.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;DP=42;Dels=0.00;FS=12.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.06;MQ0=10;MQRankSum=1.625;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-3.014e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,31:42:18:169,18,0 chrXIII 768721 . C T 434 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.03;MQ0=57;QD=5.95;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:56,17:73:48:467,48,0 chrXIII 768787 . C G 424 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.369;DP=107;Dels=0.00;FS=4.337;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.52;MQ0=87;MQRankSum=1.552;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:87,19:107:48:457,48,0 chrXIII 768872 . T G 681 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.69;MQ0=19;QD=14.49;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,28:47:75:714,75,0 chrXIII 768877 . A T 531 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.92;MQ0=18;QD=11.54;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,30:46:69:564,69,0 chrXIII 768904 . C T 159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.660;DP=62;Dels=0.00;FS=40.722;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.06;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=2.56;ReadPosRankSum=2.182;SB=-2.972e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:189,0,656 chrXIII 768939 . C T 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.629;DP=99;Dels=0.00;FS=5.265;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.83;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,57:99:99:1010,0,843 chrXIII 768951 . G A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.676;DP=108;Dels=0.00;FS=3.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.64;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.786;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1177,0,926 chrXIII 768968 . T G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.660;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.91;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.906;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1311,0,1147 chrXIII 768969 . A G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.976;DP=119;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.91;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.710;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1300,0,1131 chrXIII 769329 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.192;DP=138;Dels=0.00;FS=5.107;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=2.018;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.604;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1585,0,1330 chrXIII 769563 . T C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.899;DP=136;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=4.7530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.387;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1258,0,1618 chrXIII 770320 . T C 3825.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3825,376,0 chrXIII 770362 . A C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.951;DP=127;Dels=0.00;FS=2.344;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=8.53;ReadPosRankSum=2.248;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1113,0,1608 chrXIII 770367 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.727;DP=121;Dels=0.00;FS=3.458;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=12.30;ReadPosRankSum=-2.112;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1518,0,1069 chrXIII 771046 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.329;DP=123;Dels=0.00;FS=5.590;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.014;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1205,0,1411 chrXIII 771058 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.828;DP=119;Dels=0.00;FS=3.389;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1311,0,1150 chrXIII 771109 . G A 4044.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=26.43;ReadPosRankSum=1.551;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4044,374,0 chrXIII 771220 . T C 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.363;DP=126;Dels=0.00;FS=3.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:1043,0,1707 chrXIII 771259 . T C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.114;DP=133;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=2.9503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.071;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1051,0,1775 chrXIII 771391 . G A 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.220;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.874;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1647,0,1457 chrXIII 771409 . A G 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.788;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.253;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1600,0,1482 chrXIII 771556 . A G 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.902;DP=182;Dels=0.00;FS=0.563;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=2.064;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.447;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,81:182:99:1602,0,2187 chrXIII 771631 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.185;DP=117;Dels=0.00;FS=5.771;HaplotypeScore=2.3565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.766;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1259,0,1201 chrXIII 771742 . T C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.166;DP=138;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=2.5688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=1;MQRankSum=-1.084;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.403;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1342,0,1604 chrXIII 771775 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.883;DP=138;Dels=0.00;FS=5.135;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=1;MQRankSum=-0.205;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1308,0,1703 chrXIII 771796 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.536;DP=129;Dels=0.00;FS=7.484;HaplotypeScore=4.3099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1243,0,1572 chrXIII 771982 . G A 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.031;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=1;MQRankSum=0.092;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.307;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1396,0,1314 chrXIII 772120 . A G 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.826;DP=159;Dels=0.00;FS=2.030;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=1;MQRankSum=-1.043;QD=9.01;ReadPosRankSum=2.379;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:1462,0,1906 chrXIII 772138 . C T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.836;DP=164;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=2.7431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=1;MQRankSum=-1.714;QD=9.63;ReadPosRankSum=2.292;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,77:164:99:1609,0,1790 chrXIII 772204 . A G 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.767;DP=126;Dels=0.00;FS=10.156;HaplotypeScore=2.7233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.11;MQ0=0;MQRankSum=-5.505;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.557;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:875,0,1624 chrXIII 772205 . C T 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.461;DP=126;Dels=0.00;FS=10.156;HaplotypeScore=2.7233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.11;MQ0=0;MQRankSum=-5.421;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.636;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:933,0,1572 chrXIII 772216 . G A 761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.099;DP=132;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQ0=0;MQRankSum=-8.108;QD=5.77;ReadPosRankSum=2.598;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,51:132:99:791,0,1785 chrXIII 772219 . T C 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.178;DP=125;Dels=0.00;FS=3.274;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=-7.927;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.650;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:808,0,1620 chrXIII 772241 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.392;DP=126;Dels=0.00;FS=4.255;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=-6.669;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.853;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1145,0,1466 chrXIII 772252 . A G 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.753;DP=135;Dels=0.00;FS=4.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQ0=0;MQRankSum=-6.705;QD=7.67;ReadPosRankSum=-1.426;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1065,0,1682 chrXIII 772261 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.670;DP=148;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=0;MQRankSum=-6.448;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:99:1129,0,1926 chrXIII 772282 . A G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.826;DP=159;Dels=0.00;FS=0.605;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.566;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.741;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,67:159:99:1245,0,2117 chrXIII 772333 . C T 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.821;DP=160;Dels=0.00;FS=0.587;HaplotypeScore=2.7724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.531;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.078;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:160:99:1750,0,1587 chrXIII 772453 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.113;DP=125;Dels=0.00;FS=5.511;HaplotypeScore=3.6478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.147;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1134,0,1523 chrXIII 772454 . C T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.311;DP=124;Dels=0.00;FS=4.374;HaplotypeScore=3.6478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1147,0,1484 chrXIII 772562 . G A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.377;DP=157;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=8.9965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQ0=0;MQRankSum=-3.144;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.592;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1468,0,1632 chrXIII 772565 . A G 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.303;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=-3.258;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1458,0,1756 chrXIII 772573 . C T 1599.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.632;DP=143;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=2.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=4.395;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1629,0,1342 chrXIII 772578 . A G 1205.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.784;DP=142;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;MQ0=0;MQRankSum=-3.077;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.298;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1235,0,1729 chrXIII 772583 . G A 1191.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.798;DP=124;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.334;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1221,0,1291 chrXIII 772660 . T G 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.656;DP=167;Dels=0.00;FS=105.423;HaplotypeScore=74.4033;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.76;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=17.59;ReadPosRankSum=2.768;SB=-2.655e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,135:167:99:2971,336,0 chrXIII 772662 . G C 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.249;DP=167;Dels=0.00;FS=21.299;HaplotypeScore=76.3716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.91;MQ0=0;MQRankSum=1.372;QD=17.55;ReadPosRankSum=-2.836;SB=-4.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,134:167:99:2964,271,0 chrXIII 772684 . A T 144.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;DP=140;Dels=0.04;FS=217.192;HaplotypeScore=28.3286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.13;MQ0=0;MQRankSum=2.476;QD=1.03;ReadPosRankSum=-7.071;SB=-2.982e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,53:134:99:174,0,830 chrXIII 772685 . C T 127.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.767;DP=131;Dels=0.00;FS=187.590;HaplotypeScore=37.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=0.97;ReadPosRankSum=-6.989;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,44:131:99:157,0,778 chrXIII 772687 . A T 120.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.034;DP=112;Dels=0.01;FS=169.943;HaplotypeScore=37.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.51;MQ0=0;MQRankSum=-4.056;QD=1.07;ReadPosRankSum=-4.708;SB=-6.476e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,31:111:99:150,0,890 chrXIII 772695 . C T 26.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.241;DP=108;Dels=0.00;FS=174.017;HaplotypeScore=29.4418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQ0=0;MQRankSum=-4.973;QD=0.24;ReadPosRankSum=-4.896;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:56:56,0,948 chrXIII 772718 . A G 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0453;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=19.57;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:2518,264,0 chrXIII 772739 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.403;DP=150;Dels=0.00;FS=8.354;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=8.98;ReadPosRankSum=-2.436;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1377,0,1476 chrXIII 772763 . T C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.244;DP=148;Dels=0.00;FS=10.841;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.044;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1541,0,1695 chrXIII 772812 . T A 4313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4313,439,0 chrXIII 772822 . G A 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.651;DP=162;Dels=0.00;FS=1.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.186;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1769,0,1750 chrXIII 772883 . C T 4174.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4174,403,0 chrXIII 773055 . A G 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.634;DP=174;Dels=0.00;FS=3.490;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.297;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,87:174:99:1760,0,1919 chrXIII 773109 . C T 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.597;DP=171;Dels=0.00;FS=5.596;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,75:171:99:1546,0,2081 chrXIII 773175 . G A 2166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.417;DP=174;Dels=0.00;FS=7.853;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=12.45;ReadPosRankSum=-1.514;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,102:174:99:2196,0,1482 chrXIII 773247 . T C 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.793;DP=149;Dels=0.00;FS=2.202;HaplotypeScore=4.8396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.469;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,58:149:99:1068,0,2120 chrXIII 773268 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.168;DP=149;Dels=0.00;FS=4.918;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.334;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:1422,0,1731 chrXIII 773286 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.388;DP=148;Dels=0.00;FS=6.069;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.339;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,63:148:99:1318,0,1836 chrXIII 773388 . G C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.782;DP=135;Dels=0.00;FS=2.168;HaplotypeScore=2.4258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.736;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1381,0,1397 chrXIII 773400 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.287;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1311,0,1621 chrXIII 773415 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.358;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-3.413;QD=8.42;ReadPosRankSum=2.061;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1200,0,1777 chrXIII 773433 . C T 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;DP=148;Dels=0.00;FS=2.923;HaplotypeScore=5.9306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.367;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1410,0,1746 chrXIII 773437 . G A 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.41;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3829,382,0 chrXIII 773634 . A G 2010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.595;DP=186;Dels=0.00;FS=0.557;HaplotypeScore=5.1573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=10.81;ReadPosRankSum=-2.806;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,96:186:99:2040,0,2020 chrXIII 773689 . G A 2050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.276;DP=173;Dels=0.00;FS=0.563;HaplotypeScore=5.9113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.358;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,94:173:99:2080,0,1732 chrXIII 774011 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;DP=143;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=6.8033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1228,0,1445 chrXIII 774029 . C T 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.706;DP=160;Dels=0.05;FS=1.295;HaplotypeScore=9.3887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=6.03;ReadPosRankSum=-3.021;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:994,0,1417 chrXIII 774057 . T G 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.654;DP=174;Dels=0.00;FS=1.868;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.566;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,89:174:99:1685,0,1415 chrXIII 774106 . G A 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.760;DP=151;Dels=0.00;FS=7.138;HaplotypeScore=5.3038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1698,0,1521 chrXIII 774153 . G T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.780;DP=169;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=4.1551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,75:169:99:1442,0,1966 chrXIII 774191 . G A 2007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.778;DP=173;Dels=0.00;FS=2.644;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=11.60;ReadPosRankSum=-2.419;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,93:173:99:2037,0,1577 chrXIII 774331 . T C 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.746;DP=145;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=4.9295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.857;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:145:99:1584,0,1543 chrXIII 774688 . T A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.561;DP=92;Dels=0.00;FS=8.645;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=1;MQRankSum=-0.342;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.855;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,53:92:99:1186,0,827 chrXIII 774716 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.604;DP=120;Dels=0.00;FS=7.369;HaplotypeScore=155.5882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.215;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.992;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1257,0,1318 chrXIII 774827 . T A 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.857;DP=125;Dels=0.00;FS=4.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.588;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1280,0,1475 chrXIII 774886 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.708;DP=129;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.087;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:129:99:1078,0,1496 chrXIII 775426 . G A 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.032;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=13.06;ReadPosRankSum=1.940;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1715,0,1028 chrXIII 775628 . A T 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3132,318,0 chrXIII 775702 . G A 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3241,322,0 chrXIII 775955 . A G 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.541;DP=113;Dels=0.00;FS=3.762;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.743;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:960,0,1377 chrXIII 776036 . A G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.575;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.969;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.135;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,68:167:99:1276,0,2116 chrXIII 776054 . C T 1996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.915;DP=172;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=3.8445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,99:172:99:2026,0,1456 chrXIII 776237 . A G 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.592;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.792;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1548,0,1389 chrXIII 776609 . T C 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3171,330,0 chrXIII 776772 . G A 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.323;DP=136;Dels=0.00;FS=6.531;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1683,0,1214 chrXIII 777022 . G T 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.217;DP=122;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=2.9634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:1620,0,1037 chrXIII 777456 . A G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3466,343,0 chrXIII 777857 . G A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.703;DP=149;Dels=0.00;FS=6.185;HaplotypeScore=5.7186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1488,0,1756 chrXIII 778647 . A G 2622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;DP=103;Dels=0.00;FS=3.226;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.396;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2655,256,0 chrXIII 779263 . T A 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.008;DP=122;Dels=0.00;FS=7.471;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:821,0,1285 chrXIII 779666 . A C 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;QD=25.49;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2760,285,0 chrXIII 779842 . T C 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.200;DP=163;Dels=0.00;FS=9.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1580,0,2015 chrXIII 780034 . T A 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3221,322,0 chrXIII 780100 . G A 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.716;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.576;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:855,0,1335 chrXIII 780241 . C T 1933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.985;DP=147;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.837;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,87:147:99:1963,0,1172 chrXIII 780292 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.638;DP=112;Dels=0.00;FS=14.740;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1333,0,1059 chrXIII 780339 . T A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.952;DP=154;Dels=0.00;FS=14.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.570;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1518,0,1854 chrXIII 780712 . A G 2465 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2498,261,0 chrXIII 780735 . T A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1115,0,1224 chrXIII 780946 . G T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3163,310,0 chrXIII 781016 . C G 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3118,315,0 chrXIII 781048 . A G 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2915,300,0 chrXIII 781051 . C T 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3094,304,0 chrXIII 781183 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.572;DP=117;Dels=0.00;FS=3.462;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.418;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1336,0,1223 chrXIII 781324 . G A 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.467;DP=142;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.952;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1821,0,1205 chrXIII 781351 . C G 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3029,315,0 chrXIII 781447 . A G 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3592,357,0 chrXIII 782097 . T A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;DP=96;Dels=0.00;FS=3.903;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:1020,0,1152 chrXIII 782228 . G A 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2601,264,0 chrXIII 782267 . A G 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2573,261,0 chrXIII 782394 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.029;DP=107;Dels=0.00;FS=1.581;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.346;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1166,0,1216 chrXIII 782556 . G A 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3130,315,0 chrXIII 783184 . C T 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3114,298,0 chrXIII 783214 . T C 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2808,285,0 chrXIII 783789 . A T 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2680,262,0 chrXIII 784138 . G A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.514;DP=108;Dels=0.00;FS=1.549;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.991;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1289,0,1037 chrXIII 784210 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.674;DP=131;Dels=0.00;FS=3.183;HaplotypeScore=4.8025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.905;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.868;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1075,0,1697 chrXIII 784313 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.055;DP=131;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1239,0,1596 chrXIII 784323 . C G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;DP=135;Dels=0.00;FS=2.251;HaplotypeScore=4.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1233,0,1619 chrXIII 784371 . A C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.511;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=43.8963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.583;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1093,0,979 chrXIII 784561 . C T 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3681,364,0 chrXIII 784576 . T C 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.262;DP=139;Dels=0.00;FS=3.291;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.987;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,80:139:99:1594,0,1316 chrXIII 784723 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.841;DP=102;Dels=0.00;FS=13.367;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1269,0,908 chrXIII 784796 . G C 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3089,324,0 chrXIII 785161 . T C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.589;DP=135;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.086;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1546,0,1320 chrXIII 785216 . G A 2307 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=27.14;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2340,234,0 chrXIII 785292 . C G 692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.138;DP=98;Dels=0.00;FS=5.215;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.609;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,38:98:99:722,0,1277 chrXIII 785416 . G A 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3170,310,0 chrXIII 785575 . T C 3859.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3859,400,0 chrXIII 785591 . G A 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:3051,310,0 chrXIII 785941 . G A 2451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2484,246,0 chrXIII 785980 . G A 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.98;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3302,319,0 chrXIII 786260 . A G 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.671;DP=93;Dels=0.00;FS=1.673;HaplotypeScore=3.5065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=1;MQRankSum=0.805;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.469;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:946,0,1012 chrXIII 786415 . T A 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3201,313,0 chrXIII 786860 . A T 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.782;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.457;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1516,0,1279 chrXIII 787075 . A G 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3459,334,0 chrXIII 787310 . G A 3788.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3788,373,0 chrXIII 787408 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.483;DP=105;Dels=0.00;FS=15.388;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.139;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1327,0,946 chrXIII 787531 . C T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3354,331,0 chrXIII 787642 . C G 2688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2721,288,0 chrXIII 787876 . C G 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3575,358,0 chrXIII 787897 . T C 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3618,363,0 chrXIII 788200 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.252;DP=112;Dels=0.00;FS=0.790;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.710;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1275,0,1118 chrXIII 788573 . G T 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2840,282,0 chrXIII 788656 . T C 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3734,378,0 chrXIII 788743 . A G 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3369,348,0 chrXIII 788848 . G A 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3437,334,0 chrXIII 788915 . A G 1821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1854,198,0 chrXIII 788979 . T A 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3487,331,0 chrXIII 789063 . C T 1845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.13;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1878,192,0 chrXIII 789071 . G T 1820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.76;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:68:99:1853,186,0 chrXIII 789101 . G A 2366 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2399,231,0 chrXIII 789247 . T A 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.95;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2539,255,0 chrXIII 789267 . G T 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2913,303,0 chrXIII 789347 . G A 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3161,298,0 chrXIII 789371 . G A 2430 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:2463,240,0 chrXIII 789929 . T A 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.11;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3471,337,0 chrXIII 789945 . C G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;DP=140;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.270;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1241,0,1615 chrXIII 790001 . G A 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=25.56;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3202,321,0 chrXIII 790067 . G A 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=28.73;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3563,352,0 chrXIII 790319 . A G 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4573;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3305,339,0 chrXIII 790520 . A G 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3728,381,0 chrXIII 790550 . T C 3766.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3766,375,0 chrXIII 790559 . G A 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.634;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=26.74;ReadPosRankSum=1.683;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3770,367,0 chrXIII 790664 . A T 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.30;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2637,264,0 chrXIII 790712 . G A 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2912,279,0 chrXIII 790727 . C T 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3381,328,0 chrXIII 790832 . C T 3917.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3917,397,0 chrXIII 790870 . T C 4265.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4265,439,0 chrXIII 791636 . T C 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3040,324,0 chrXIII 791894 . A G 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2913,300,0 chrXIII 791978 . C T 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=1;QD=27.41;SB=-2.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3783,367,0 chrXIII 792077 . C T 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.341;DP=124;Dels=0.00;FS=3.153;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=27.17;ReadPosRankSum=0.698;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3369,331,0 chrXIII 792254 . A G 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3581,357,0 chrXIII 792308 . G T 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3406,340,0 chrXIII 792947 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.892;DP=129;Dels=0.00;FS=5.415;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.055;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1163,0,1591 chrXIII 793043 . G A 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.981e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3990,397,0 chrXIII 793076 . T G 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3894,405,0 chrXIII 793132 . C T 4328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4328,436,0 chrXIII 793668 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.665;DP=125;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.277;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1268,0,1388 chrXIII 793734 . A G 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.044;DP=138;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.031;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,85:138:99:1770,0,1169 chrXIII 793752 . T C 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.007;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=11.75;ReadPosRankSum=2.168;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:1793,0,1451 chrXIII 794088 . T C 4097.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=26.26;ReadPosRankSum=0.910;SB=-2.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:4097,388,0 chrXIII 794191 . C A 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.545;DP=137;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.714;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1447,0,1442 chrXIII 794202 . A G 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.156;DP=132;Dels=0.00;FS=4.157;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.786;QD=10.52;ReadPosRankSum=-2.091;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1419,0,1350 chrXIII 794310 . G A 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.597;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.386;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:145:99:1617,0,1445 chrXIII 794696 . G C 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=22.90;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3366,348,0 chrXIII 794751 . T A 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7853;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3462,349,0 chrXIII 794755 . G T 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=27.70;ReadPosRankSum=0.866;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3657,341,0 chrXIII 794820 . T A 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4114,394,0 chrXIII 794978 . T C 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.21;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3241,330,0 chrXIII 795009 . T A 2078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.58;MQ0=0;QD=23.89;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2111,210,0 chrXIII 795047 . C T 453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.213;DP=100;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=18.8992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-5.067;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.157;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:483,0,1272 chrXIII 795107 . C T 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.450;DP=114;Dels=0.00;FS=2.510;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=2.423;QD=13.35;ReadPosRankSum=-2.003;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,67:114:99:1552,0,764 chrXIII 795131 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.594;DP=126;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.348;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1067,0,1640 chrXIII 795326 . C T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.449;DP=110;Dels=0.00;FS=7.296;HaplotypeScore=6.5376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1299,0,1045 chrXIII 795449 . G A 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.204;DP=140;Dels=0.00;FS=3.389;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.039;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1669,0,1445 chrXIII 795593 . A G 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.971;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.367;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:111:99:1413,0,1010 chrXIII 795946 . T C 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3479,360,0 chrXIII 796038 . T C 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=151;Dels=0.00;FS=7.409;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.927;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,89:151:99:1851,0,1318 chrXIII 796053 . G A 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.231;DP=164;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=2.7332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1763,0,1791 chrXIII 796069 . T C 1855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.581;DP=178;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=3.7634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,91:178:99:1885,0,1993 chrXIII 796089 . C G 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;DP=170;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.061;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,84:170:99:1659,0,1823 chrXIII 796280 . T C 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.961;DP=132;Dels=0.00;FS=5.196;HaplotypeScore=6.7991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1444,0,1363 chrXIII 796362 . G A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.530;DP=122;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1374,0,1323 chrXIII 796401 . A G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.410;DP=124;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=2.8204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=3.174;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.516;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1422,0,1265 chrXIII 796431 . G A 2422 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.72;MQ0=0;QD=26.33;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2455,258,0 chrXIII 796432 . T C 2375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.72;MQ0=0;QD=25.82;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2408,255,0 chrXIII 796446 . G A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.412;DP=102;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.920;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:978,0,1168 chrXIII 796580 . C T 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=28.40;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3436,346,0 chrXIII 796629 . G T 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.146;DP=142;Dels=0.00;FS=4.009;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1685,0,1471 chrXIII 796648 . T C 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3699,369,0 chrXIII 796811 . G T 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.75;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3118,312,0 chrXIII 796868 . A T 2478 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.99;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2511,255,0 chrXIII 796877 . A T 2291 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.57;MQ0=0;QD=22.46;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2324,261,0 chrXIII 796879 . T C 2330 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.64;MQ0=0;QD=22.62;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2363,264,0 chrXIII 796885 . A G 2855 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.83;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2888,294,0 chrXIII 796957 . T C 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=25.56;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3348,369,0 chrXIII 796998 . A G 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.747e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3890,406,0 chrXIII 797041 . A T 4284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4284,403,0 chrXIII 797048 . T C 4243.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4243,421,0 chrXIII 797146 . T C 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3405,351,0 chrXIII 797223 . A C 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3424,351,0 chrXIII 797313 . G T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.946;DP=137;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=3.9505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1565,0,1453 chrXIII 797362 . T C 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3092,321,0 chrXIII 797379 . A G 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3321,345,0 chrXIII 797401 . G A 4075.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.892e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4075,403,0 chrXIII 797456 . T G 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2973,309,0 chrXIII 797542 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.467;DP=112;Dels=0.00;FS=2.445;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.121;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1522,0,816 chrXIII 797563 . A G 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3241,336,0 chrXIII 797587 . A G 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3160,324,0 chrXIII 797644 . A G 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3834,405,0 chrXIII 797666 . T C 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3672,387,0 chrXIII 797688 . G A 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.835;DP=163;Dels=0.00;FS=9.453;HaplotypeScore=5.8265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.795;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1673,0,1630 chrXIII 798060 . G C 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3017,318,0 chrXIII 798063 . T C 2751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=24.13;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2784,294,0 chrXIII 798090 . T C 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=24.26;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3066,321,0 chrXIII 798298 . A G 4348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4348,456,0 chrXIII 798332 . C G 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3475,375,0 chrXIII 798333 . T C 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3489,372,0 chrXIII 798447 . T A 3832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3832,370,0 chrXIII 798450 . C G 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3635,363,0 chrXIII 798485 . T G 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.71;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3731,390,0 chrXIII 798592 . T G 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.33;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3224,336,0 chrXIII 798593 . T G 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.67;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3360,336,0 chrXIII 798732 . A G 1768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.22;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1801,195,0 chrXIII 798739 . C A 2334 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2367,243,0 chrXIII 798826 . C T 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=22.37;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2628,261,0 chrXIII 798889 . C G 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3295,339,0 chrXIII 799519 . C T 4519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4519,439,0 chrXIII 799604 . G A 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3509,358,0 chrXIII 799605 . T C 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3329,360,0 chrXIII 799711 . A G 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2860,300,0 chrXIII 799763 . A C 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3292,333,0 chrXIII 800212 . T C 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3208,315,0 chrXIII 800233 . T C 2677 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2710,282,0 chrXIII 800264 . G A 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=26.81;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2741,267,0 chrXIII 800350 . G A 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.355;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=26.76;ReadPosRankSum=1.252;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2736,258,0 chrXIII 800368 . T C 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;DP=103;Dels=0.00;FS=3.501;HaplotypeScore=4.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=25.49;ReadPosRankSum=1.228;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2658,279,0 chrXIII 800425 . T C 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3346,339,0 chrXIII 800543 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.131;DP=116;Dels=0.00;FS=5.795;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1303,0,1113 chrXIII 800554 . C T 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3171,318,0 chrXIII 800561 . A G 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3096,315,0 chrXIII 800671 . T C 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3405,354,0 chrXIII 800698 . G A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.316;DP=153;Dels=0.00;FS=2.154;HaplotypeScore=3.3436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.549;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.801;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,66:153:99:1281,0,1980 chrXIII 800705 . A G 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3753,385,0 chrXIII 800709 . T A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.442;DP=139;Dels=0.00;FS=2.219;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=2.281;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1264,0,1882 chrXIII 800812 . T C 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3009,300,0 chrXIII 800816 . A C 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2888,291,0 chrXIII 800848 . C T 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;DP=117;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.591;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.945;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:963,0,1561 chrXIII 800866 . C A 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2988,283,0 chrXIII 800900 . T G 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2548,264,0 chrXIII 800968 . G A 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.505;DP=149;Dels=0.00;FS=2.143;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.097;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1660,0,1564 chrXIII 800977 . A G 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3780,361,0 chrXIII 801034 . T C 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3060,327,0 chrXIII 801050 . G A 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3225,316,0 chrXIII 801144 . T A 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.62;MQ0=0;QD=27.71;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2749,276,0 chrXIII 801181 . C G 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.411;DP=101;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.512;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:788,0,1177 chrXIII 801182 . G A 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.177;DP=101;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.470;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:829,0,1193 chrXIII 801226 . G A 1185 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.78;MQ0=0;QD=19.43;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1218,138,0 chrXIII 801227 . A G 1178 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.78;MQ0=0;QD=19.31;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1211,138,0 chrXIII 801232 . T C 1298 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.74;MQ0=0;QD=20.28;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1331,141,0 chrXIII 801254 . C T 1650 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.92;MQ0=0;QD=22.00;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1683,174,0 chrXIII 801280 . A G 1705 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.15;MQ0=0;QD=24.71;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1738,186,0 chrXIII 801282 . A C 1721 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.67;MQ0=0;QD=22.35;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1754,186,0 chrXIII 801283 . T A 1785 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.82;MQ0=0;QD=22.88;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1818,189,0 chrXIII 801649 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.598;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=2.143;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.450;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1155,0,1212 chrXIII 801732 . G A 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.562;DP=141;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=2.7003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.698;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.258;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1589,0,1379 chrXIII 801754 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.823;DP=108;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.761;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1337,0,1059 chrXIII 801760 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.343;DP=104;Dels=0.00;FS=6.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.908;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1259,0,979 chrXIII 801794 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.198;DP=111;Dels=0.00;FS=0.833;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.823;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1170,0,1218 chrXIII 801808 . G A 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.418;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.770;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1250,0,1207 chrXIII 801823 . C A 2573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2606,255,0 chrXIII 801852 . C T 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2797,282,0 chrXIII 801876 . C T 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3370,348,0 chrXIII 801921 . C T 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.90;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2767,277,0 chrXIII 801957 . C T 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.98;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2657,259,0 chrXIII 802071 . G A 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.49;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3002,292,0 chrXIII 802119 . C T 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=28.40;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2958,295,0 chrXIII 802161 . C T 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=27.68;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2801,285,0 chrXIII 802176 . T C 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=24.74;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2754,291,0 chrXIII 802188 . A G 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=26.81;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3062,324,0 chrXIII 802329 . A C 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2880,306,0 chrXIII 802356 . C T 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3373,331,0 chrXIII 802421 . G T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.855;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.797;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1261,0,1056 chrXIII 802432 . A G 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2843,291,0 chrXIII 802461 . A G 2766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2799,291,0 chrXIII 802543 . A G 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=22.08;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2727,270,0 chrXIII 802566 . C A 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.93;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3393,340,0 chrXIII 802576 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.200;DP=130;Dels=0.00;FS=3.801;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1285,0,1500 chrXIII 802605 . G T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.183;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1351,0,1468 chrXIII 802644 . A G 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3407,354,0 chrXIII 802701 . T A 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3320,325,0 chrXIII 802822 . T G 940.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.093;DP=103;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.703;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:970,0,1263 chrXIII 802825 . G A 2841 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2874,285,0 chrXIII 802829 . T C 1362.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.645;DP=115;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1392,0,1105 chrXIII 802854 . T C 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.71;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2762,285,0 chrXIII 802876 . G T 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.71;MQ0=0;QD=23.13;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2485,249,0 chrXIII 802880 . C T 2293 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.17;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=22.93;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2326,225,0 chrXIII 802912 . A G 2221 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.49;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2254,231,0 chrXIII 802921 . G A 2332 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.11;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2365,237,0 chrXIII 802960 . T C 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2488,258,0 chrXIII 802989 . T C 2274 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=25.27;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2307,252,0 chrXIII 803013 . G A 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=26.21;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2628,261,0 chrXIII 803021 . C T 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=25.20;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2654,261,0 chrXIII 803149 . T C 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2871,303,0 chrXIII 803154 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.072;DP=104;Dels=0.00;FS=1.698;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1216,0,996 chrXIII 803211 . T C 2520 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2553,270,0 chrXIII 803536 . T G 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2939,297,0 chrXIII 803680 . G A 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2953,298,0 chrXIII 803905 . C T 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=28.46;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2594,258,0 chrXIII 804072 . T C 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.101;DP=103;Dels=0.00;FS=2.549;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.086;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:922,0,1248 chrXIII 804103 . T C 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.18;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3027,304,0 chrXIII 804379 . C G 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.20;MQ0=0;QD=25.52;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2968,303,0 chrXIII 804397 . C A 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.93;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2945,295,0 chrXIII 804400 . G A 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.82;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2975,298,0 chrXIII 804413 . A C 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.13;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2641,279,0 chrXIII 804770 . C T 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.43;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3476,352,0 chrXIII 804774 . A T 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.46;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3629,352,0 chrXIII 804798 . G A 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3415,334,0 chrXIII 804802 . G A 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.35;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3480,343,0 chrXIII 804869 . C T 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3134,313,0 chrXIII 804888 . T A 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.913;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6369;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=26.85;ReadPosRankSum=1.543;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2986,295,0 chrXIII 804916 . A G 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.32;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2588,261,0 chrXIII 804970 . G A 1851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.35;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1884,183,0 chrXIII 804991 . G A 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2900,291,0 chrXIII 805135 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;DP=97;Dels=0.00;FS=3.696;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=11.15;ReadPosRankSum=2.357;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1112,0,1123 chrXIII 805159 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.239;DP=122;Dels=0.01;FS=12.679;HaplotypeScore=2.5981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=1.999;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.694;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1217,0,1506 chrXIII 805204 . T C 2634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2667,267,0 chrXIII 805213 . G A 2242 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=69.6719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.48;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2275,225,0 chrXIII 805270 . C A 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2679,273,0 chrXIII 805321 . C T 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3133,304,0 chrXIII 805324 . A G 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3108,327,0 chrXIII 805419 . A G 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=26.38;ReadPosRankSum=1.039;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:3067,312,0 chrXIII 805430 . T C 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.769;DP=110;Dels=0.00;FS=4.957;HaplotypeScore=1.9882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.938;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.353;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1118,0,1283 chrXIII 805436 . G A 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3035,298,0 chrXIII 805455 . A G 2428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2461,267,0 chrXIII 805482 . G A 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.33;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3187,313,0 chrXIII 805521 . C T 2563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2596,267,0 chrXIII 805587 . C T 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3435,337,0 chrXIII 805689 . C A 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=28.12;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3402,340,0 chrXIII 805724 . C T 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3547,331,0 chrXIII 805954 . A G 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3234,327,0 chrXIII 806068 . G T 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.72;SB=-2.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4168,403,0 chrXIII 806118 . A G 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3186,324,0 chrXIII 806431 . C T 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3060,298,0 chrXIII 806445 . T C 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.728;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,69:115:99:1495,0,986 chrXIII 806518 . A C 2413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.82;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2446,258,0 chrXIII 806522 . G A 2480 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.71;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2513,261,0 chrXIII 806533 . A T 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.80;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2949,306,0 chrXIII 806777 . C T 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.677;DP=122;Dels=0.00;FS=3.303;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.494;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1177,0,1365 chrXIII 807432 . T C 2248 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2281,249,0 chrXIII 807457 . T C 2455 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2488,261,0 chrXIII 807522 . C T 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3101,304,0 chrXIII 807595 . T C 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3092,324,0 chrXIII 807655 . C T 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3000,303,0 chrXIII 807742 . A G 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3344,333,0 chrXIII 807743 . T G 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3324,333,0 chrXIII 807915 . C G 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3577,366,0 chrXIII 807924 . C G 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3699,364,0 chrXIII 807956 . G A 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=28.19;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3355,337,0 chrXIII 808003 . T C 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3928,408,0 chrXIII 808040 . A G 4385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4385,447,0 chrXIII 808144 . T C 2337 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7763;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2370,255,0 chrXIII 808186 . C A 2047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=80.1454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=22.25;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2080,210,0 chrXIII 808382 . G C 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3411,345,0 chrXIII 808544 . A G 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;DP=14;Dels=0.00;FS=12.601;HaplotypeScore=4.9696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.08;MQ0=0;MQRankSum=2.475;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.625;SB=-6.512e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:103,0,117 chrXIII 808554 . A T 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=3.9799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.26;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-6.451e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:41:41,0,99 chrXIII 808603 . A G 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.36;MQ0=2;MQRankSum=0.573;QD=1.91;ReadPosRankSum=1.001;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:51:51,0,142 chrXIII 808742 . G A 66.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=14;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.69;MQ0=6;MQRankSum=-0.572;QD=4.75;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-1.655e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,11:14:12:99,12,0 chrXIII 808933 . G A 1595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.46;MQ0=0;QD=17.72;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1628,171,0 chrXIII 808942 . G A 1834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.51;MQ0=0;QD=18.71;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:1867,186,0 chrXIII 808957 . T C 2091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.04;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=19.18;ReadPosRankSum=1.128;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2124,225,0 chrXIII 809106 . G A 4235.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.79;MQ0=1;QD=26.80;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4235,406,0 chrXIII 809198 . A G 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.86;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3163,316,0 chrXIII 809204 . C T 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.58;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3189,316,0 chrXIII 809255 . G A 972.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.155;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=-4.064;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.888;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1002,0,1231 chrXIII 809257 . C T 919.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.490;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.060;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.949;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:949,0,1105 chrXIII 809261 . C T 959.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;DP=109;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=5.8946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.370;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.053;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:989,0,1151 chrXIII 809264 . A G 923.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.080;DP=114;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=5.8946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.636;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.284;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:953,0,1279 chrXIII 809275 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.953;DP=119;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.49;MQ0=0;MQRankSum=-3.522;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.864;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1111,0,1263 chrXIII 809325 . T C 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.411;DP=113;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.291;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:939,0,1322 chrXIII 809473 . C T 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2992,292,0 chrXIII 810028 . G A 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.621;DP=149;Dels=0.00;FS=2.922;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.298;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,86:149:99:1899,0,1286 chrXIII 810085 . G A 1782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.189;DP=142;Dels=0.00;FS=7.973;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,80:142:99:1812,0,1266 chrXIII 810229 . G A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.974;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1545,0,1369 chrXIII 810415 . A T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;DP=137;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.909;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1535,0,1411 chrXIII 810963 . C A 3832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3832,385,0 chrXIII 811039 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.231;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1189,0,1228 chrXIII 811119 . C T 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.387;DP=178;Dels=0.00;FS=3.341;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=1;MQRankSum=1.300;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.616;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,85:178:99:1663,0,1959 chrXIII 811161 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.311;DP=163;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=1;MQRankSum=3.700;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1612,0,1672 chrXIII 811614 . T C 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.803;DP=117;Dels=0.00;FS=1.501;HaplotypeScore=4.9562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.842;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1410,0,1045 chrXIII 811654 . T G 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.313;DP=132;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=12.6616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=0;MQRankSum=-3.253;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.617;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,80:132:99:1645,0,1093 chrXIII 811666 . G A 91.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.151;DP=121;Dels=0.00;FS=4.716;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-5.726;QD=0.75;ReadPosRankSum=-1.867;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,20:121:99:121,0,2230 chrXIII 811677 . A G 1271.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.127;DP=131;Dels=0.00;FS=7.962;HaplotypeScore=100.5412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=1;MQRankSum=-3.610;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.952;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:131:99:1301,0,1237 chrXIII 811681 . G T 210.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.886;DP=116;Dels=0.00;FS=5.994;HaplotypeScore=128.8764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQ0=1;MQRankSum=-5.970;QD=1.81;ReadPosRankSum=2.688;SB=-9.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:240,0,2012 chrXIII 811683 . G T 197.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.229;DP=118;Dels=0.00;FS=7.460;HaplotypeScore=127.8870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.22;MQ0=1;MQRankSum=-6.131;QD=1.67;ReadPosRankSum=3.432;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,24:118:99:227,0,2078 chrXIII 811684 . A T 215.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.502;DP=117;Dels=0.00;FS=7.460;HaplotypeScore=127.8870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.12;MQ0=1;MQRankSum=-5.837;QD=1.84;ReadPosRankSum=3.622;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,24:117:99:245,0,2103 chrXIII 811687 . G T 165.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.267;DP=110;Dels=0.00;FS=6.053;HaplotypeScore=120.9630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.76;MQ0=1;MQRankSum=-6.410;QD=1.50;ReadPosRankSum=4.157;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:195,0,1910 chrXIII 811688 . A G 160.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.596;DP=110;Dels=0.00;FS=6.053;HaplotypeScore=121.8297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.76;MQ0=1;MQRankSum=-5.517;QD=1.45;ReadPosRankSum=4.421;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:190,0,2010 chrXIII 811691 . T C 994.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.948;DP=113;Dels=0.00;FS=9.111;HaplotypeScore=121.8297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=1;MQRankSum=-6.426;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:113:99:1024,0,969 chrXIII 811756 . A G 672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.283;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQ0=1;MQRankSum=-3.168;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.903;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:702,0,1396 chrXIII 811875 . G A 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.826;DP=117;Dels=0.00;FS=2.389;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.096;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1044,0,1343 chrXIII 811936 . G C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;DP=136;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=2.1375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.289;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1241,0,1427 chrXIII 812113 . C G 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.39;SB=-2.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3976,394,0 chrXIII 812562 . G A 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3671,358,0 chrXIII 812580 . A G 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3314,342,0 chrXIII 812787 . T A 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.356;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7759;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=23.13;ReadPosRankSum=1.329;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3017,270,0 chrXIII 813019 . G A 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=23.70;ReadPosRankSum=-1.386;SB=-2.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:160:99:3792,402,0 chrXIII 813178 . A G 4187.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.78;SB=-2.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4187,412,0 chrXIII 813408 . A G 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3984,411,0 chrXIII 813465 . A G 4054.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:4054,415,0 chrXIII 813547 . A G 3651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8329;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3651,366,0 chrXIII 813594 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.565;DP=156;Dels=0.00;FS=6.281;HaplotypeScore=2.7214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.889;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:1400,0,1864 chrXIII 813634 . A G 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3776,402,0 chrXIII 814155 . C T 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3861,391,0 chrXIII 814204 . A G 4269.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4269,444,0 chrXIII 814438 . C T 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3797,373,0 chrXIII 814511 . T C 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3789,393,0 chrXIII 814574 . G A 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3344,334,0 chrXIII 814898 . A G 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3020,309,0 chrXIII 814931 . A G 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.829;DP=117;Dels=0.00;FS=6.533;HaplotypeScore=5.4588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.086;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:117:99:1053,0,1445 chrXIII 815081 . T G 2390 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.98;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2423,258,0 chrXIII 815338 . A G 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.574;DP=177;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.829;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,85:176:99:1841,0,2087 chrXIII 815589 . A C 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3372,369,0 chrXIII 815640 . C T 3989.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3989,388,0 chrXIII 815882 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.961;DP=128;Dels=0.00;FS=3.213;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=2.233;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.536;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1259,0,1513 chrXIII 815905 . C T 1664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.076;DP=162;Dels=0.00;FS=4.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1694,0,1663 chrXIII 815956 . A G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.652;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.983;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1337,0,1681 chrXIII 815979 . C T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.115;DP=135;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.209;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1544,0,1291 chrXIII 816075 . T C 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.196;DP=141;Dels=0.00;FS=2.158;HaplotypeScore=1.9700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1583,0,1469 chrXIII 816131 . A G 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.333;DP=135;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.561;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,82:135:99:1845,0,1094 chrXIII 816209 . A G 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.893;DP=132;Dels=0.00;FS=1.523;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=2.641;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.244;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,79:132:99:1722,0,1137 chrXIII 816212 . A G 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.993;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:131:99:1717,0,1115 chrXIII 816290 . C T 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.194;DP=139;Dels=0.00;FS=8.063;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1720,0,1382 chrXIII 816350 . A T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.142;DP=151;Dels=0.00;FS=6.023;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,63:151:99:1385,0,2023 chrXIII 816478 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.467;DP=138;Dels=0.00;FS=6.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.351;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1245,0,1686 chrXIII 816512 . G A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.805;DP=127;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=4.4000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.372;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1458,0,1270 chrXIII 817301 . C A 4277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:171:99:4277,436,0 chrXIII 817457 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.677;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.792;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1284,0,1414 chrXIII 817520 . G A 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.292;DP=170;Dels=0.00;FS=4.738;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,87:170:99:1775,0,1693 chrXIII 817706 . A C 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.181;DP=174;Dels=0.00;FS=5.781;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,87:174:99:1742,0,1789 chrXIII 817730 . C A 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.833;DP=174;Dels=0.00;FS=12.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.075;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,81:174:99:1664,0,1988 chrXIII 817903 . T C 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.063;DP=153;Dels=0.00;FS=8.345;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1569,0,1742 chrXIII 818165 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.674;DP=155;Dels=0.00;FS=2.921;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.557;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,68:155:99:1268,0,1950 chrXIII 818167 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.817;DP=172;Dels=0.00;FS=1.195;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.818;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,73:172:99:1378,0,2246 chrXIII 818204 . A G 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.512;DP=145;Dels=0.00;FS=1.365;HaplotypeScore=4.7843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.785;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1340,0,1725 chrXIII 818235 . C T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.722;DP=148;Dels=0.00;FS=3.146;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.313;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1568,0,1709 chrXIII 818309 . G T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.415;DP=115;Dels=0.00;FS=7.158;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.051;QD=11.16;ReadPosRankSum=-2.825;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1313,0,1076 chrXIII 818317 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.055;DP=134;Dels=0.00;FS=6.432;HaplotypeScore=4.7386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.016;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:134:99:1444,0,1265 chrXIII 818327 . A G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.785;DP=128;Dels=0.00;FS=6.635;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1403,0,1272 chrXIII 818360 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.793;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=11.03;ReadPosRankSum=2.393;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1519,0,1407 chrXIII 818478 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.860;DP=125;Dels=0.00;FS=3.492;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.277;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1110,0,1561 chrXIII 818504 . G A 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.585;DP=131;Dels=0.00;FS=5.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.128;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:1066,0,1587 chrXIII 818591 . G A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.995;DP=156;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=7.56;ReadPosRankSum=1.190;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,62:156:99:1209,0,2015 chrXIII 818683 . T C 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.881;DP=167;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=4.541;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.263;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,85:167:99:1820,0,1676 chrXIII 818759 . G C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.160;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,73:167:99:1421,0,2037 chrXIII 818815 . T A 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.066;DP=152;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=10.07;ReadPosRankSum=-3.366;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1561,0,1728 chrXIII 818970 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.062;DP=169;Dels=0.00;FS=5.711;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,65:169:99:1270,0,2273 chrXIII 819018 . C T 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3514,355,0 chrXIII 819065 . C G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;DP=135;Dels=0.00;FS=3.124;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.877;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.076;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1338,0,1406 chrXIII 819114 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.597;DP=147;Dels=0.00;FS=2.084;HaplotypeScore=2.6492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.654;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:147:99:1431,0,1330 chrXIII 819141 . A C 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=21.66;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2654,285,0 chrXIII 819226 . T G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.109;DP=127;Dels=0.00;FS=13.113;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1202,0,1501 chrXIII 819393 . A T 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.448;DP=144;Dels=0.00;FS=2.106;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.674;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1792,0,1341 chrXIII 819611 . C T 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.734;DP=135;Dels=0.00;FS=4.169;HaplotypeScore=4.6301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.621;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1516,0,1264 chrXIII 819633 . C T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.216;DP=120;Dels=0.00;FS=2.348;HaplotypeScore=2.7295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1247,0,1281 chrXIII 819699 . T C 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3537,357,0 chrXIII 819776 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=122;Dels=0.00;FS=3.280;HaplotypeScore=4.6220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.871;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:122:99:1112,0,1424 chrXIII 819809 . C T 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.714;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=12.40;ReadPosRankSum=-2.245;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:1555,0,975 chrXIII 819989 . C T 4407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.601;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=27.89;ReadPosRankSum=1.710;SB=-2.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:4407,439,0 chrXIII 820184 . C A 1861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.961;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:168:99:1891,0,1716 chrXIII 820187 . G A 1960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.784;DP=185;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,97:185:99:1990,0,1812 chrXIII 820241 . C T 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.395;DP=153;Dels=0.00;FS=5.881;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.462;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1625,0,1609 chrXIII 820597 . G A 1900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.630;DP=162;Dels=0.00;FS=5.852;HaplotypeScore=3.6466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:162:99:1930,0,1530 chrXIII 820753 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.661;DP=186;Dels=0.00;FS=3.397;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,81:186:99:1611,0,2067 chrXIII 821125 . G A 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.210;DP=161;Dels=0.00;FS=1.243;HaplotypeScore=7.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.134;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:161:99:1630,0,1775 chrXIII 821386 . T C 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.318;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.088;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1308,0,1355 chrXIII 821457 . G A 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.444;DP=115;Dels=0.00;FS=4.577;HaplotypeScore=5.6992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1396,0,972 chrXIII 821494 . T C 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.387;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,45:112:99:795,0,1490 chrXIII 821820 . A G 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3792,384,0 chrXIII 822331 . A G 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3718,387,0 chrXIII 822465 . G T 4339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=27.29;SB=-2.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4339,415,0 chrXIII 822473 . T C 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.41;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3434,348,0 chrXIII 822479 . C T 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.892e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3723,373,0 chrXIII 822625 . A G 298.20 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.292;DP=114;Dels=0.00;FS=37.698;HaplotypeScore=18.9657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=2.62;ReadPosRankSum=2.405;SB=11.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:114:21:331,21,0 chrXIII 822844 . A G 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3311,345,0 chrXIII 823029 . A G 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3819,399,0 chrXIII 823330 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.040;DP=119;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=2.6457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.790;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1366,0,1200 chrXIII 823583 . T C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.991;DP=139;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1428,0,1524 chrXIII 823644 . T C 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.487;DP=162;Dels=0.00;FS=2.742;HaplotypeScore=4.0588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1576,0,1832 chrXIII 823734 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.661;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1470,0,1185 chrXIII 824166 . T G 1801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.989;DP=164;Dels=0.00;FS=1.237;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1831,0,1707 chrXIII 824526 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.653;DP=125;Dels=0.00;FS=4.299;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.400;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1287,0,1279 chrXIII 824589 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=101;Dels=0.00;FS=6.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1093,0,1088 chrXIII 824598 . A G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.527;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1204,0,1163 chrXIII 824640 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.874;DP=120;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.008;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1208,0,1447 chrXIII 824795 . C A 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2620,261,0 chrXIII 824813 . A G 1916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1949,198,0 chrXIII 824825 . C T 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.633;DP=80;Dels=0.00;FS=1.845;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.546;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:924,0,794 chrXIII 824848 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.858;DP=90;Dels=0.00;FS=2.827;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,52:90:99:1101,0,745 chrXIII 824885 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.020;DP=111;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:111:99:1386,0,961 chrXIII 825080 . G A 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.272;DP=138;Dels=0.00;FS=5.181;HaplotypeScore=2.5585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1618,0,1275 chrXIII 825266 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.296;DP=110;Dels=0.00;FS=7.444;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.762;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1401,0,1008 chrXIII 825329 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.623;DP=146;Dels=0.00;FS=6.197;HaplotypeScore=5.9459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.723;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:146:99:1374,0,1612 chrXIII 825407 . G A 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.600;DP=150;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=6.8157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:150:99:1718,0,1453 chrXIII 825542 . C G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.987;DP=142;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=5.8307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1565,0,1260 chrXIII 825551 . A G 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.827;DP=150;Dels=0.00;FS=2.891;HaplotypeScore=4.8357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,84:150:99:1778,0,1418 chrXIII 825605 . T C 4105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.15;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4105,420,0 chrXIII 825734 . G A 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.339;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1424,0,1173 chrXIII 825791 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.797;DP=114;Dels=0.00;FS=2.417;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.291;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1145,0,1259 chrXIII 825884 . G T 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.908;DP=113;Dels=0.00;FS=5.834;HaplotypeScore=4.1211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.146;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1099,0,1205 chrXIII 825931 . C G 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.928;DP=113;Dels=0.00;FS=3.499;HaplotypeScore=2.8944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1334,0,959 chrXIII 826031 . A G 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.525;DP=148;Dels=0.00;FS=3.878;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.721;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1625,0,1470 chrXIII 826214 . G A 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3338,328,0 chrXIII 826499 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.800;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=4.0138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.262;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:130:99:1332,0,1470 chrXIII 826533 . A G 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3135,321,0 chrXIII 826594 . A G 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2605,267,0 chrXIII 826641 . T C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.592;DP=129;Dels=0.00;FS=5.393;HaplotypeScore=2.3569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.199;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1176,0,1383 chrXIII 826705 . C T 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.989e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3107,315,0 chrXIII 826778 . T C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.258;DP=126;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.403;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1365,0,1226 chrXIII 826818 . T G 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=26.06;ReadPosRankSum=1.698;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:104:99:2743,282,0 chrXIII 826921 . A G 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.857;DP=132;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=3.6462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:132:99:1438,0,1365 chrXIII 827091 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.776;DP=125;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=4.8902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:125:99:1081,0,1437 chrXIII 827271 . G A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.705;DP=130;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1351,0,1420 chrXIII 827328 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.925;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1148,0,1340 chrXIII 827517 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.332;DP=140;Dels=0.00;FS=2.984;HaplotypeScore=4.9565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.860;QD=8.91;ReadPosRankSum=-2.048;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1277,0,1667 chrXIII 827633 . T C 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.650;DP=117;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=2.4485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1070,0,1355 chrXIII 827669 . G A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.690;DP=118;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=3.2215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1207,0,1309 chrXIII 827682 . A G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.862;DP=119;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=5.1988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.219;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1160,0,1334 chrXIII 827691 . T C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.101;DP=126;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=3.5039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.264;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1272,0,1464 chrXIII 827739 . A G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.934;DP=135;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.452;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1221,0,1637 chrXIII 827748 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.438;DP=116;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.121;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1135,0,1341 chrXIII 827846 . A C 1035.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.928;DP=118;Dels=0.00;FS=12.444;HaplotypeScore=2.6694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.776;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1065,0,1468 chrXIII 827847 . G A 1100.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.523;DP=117;Dels=0.00;FS=10.763;HaplotypeScore=2.6694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.664;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:117:99:1130,0,1398 chrXIII 827853 . A G 1146.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.298;DP=119;Dels=0.00;FS=7.583;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.946;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1176,0,1419 chrXIII 827972 . T A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=165;Dels=0.00;FS=4.355;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.123;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1526,0,2039 chrXIII 827994 . A G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.997;DP=165;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.188;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,73:164:99:1417,0,2034 chrXIII 828032 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.440;DP=146;Dels=0.00;FS=2.098;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,63:146:99:1167,0,1945 chrXIII 828055 . T C 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3914,399,0 chrXIII 828110 . C A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.615;DP=162;Dels=0.00;FS=3.589;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.755;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.472;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1619,0,1692 chrXIII 828116 . T C 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.593;DP=154;Dels=0.00;FS=3.719;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.774;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.244;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1517,0,1640 chrXIII 828138 . A G 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.060;DP=169;Dels=0.00;FS=2.678;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.186;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.194;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,81:169:99:1615,0,1945 chrXIII 828149 . C T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.392;DP=138;Dels=0.00;FS=4.032;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.158;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1312,0,1621 chrXIII 828178 . G T 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.348;DP=117;Dels=0.00;FS=4.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=2.557;QD=13.47;ReadPosRankSum=-1.200;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:1606,0,954 chrXIII 828228 . A G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.339;DP=123;Dels=0.00;FS=1.627;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.725;QD=7.42;ReadPosRankSum=-2.102;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:943,0,1742 chrXIII 828274 . T G 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.786;DP=119;Dels=0.00;FS=2.467;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.763;QD=5.62;ReadPosRankSum=3.056;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,43:119:99:699,0,1752 chrXIII 828282 . A C 742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.831;DP=119;Dels=0.00;FS=4.625;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.973;QD=6.24;ReadPosRankSum=2.321;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,45:119:99:772,0,1705 chrXIII 828291 . C T 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.870;DP=122;Dels=0.00;FS=3.445;HaplotypeScore=4.7518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.83;MQ0=0;MQRankSum=-3.287;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.943;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,44:122:99:764,0,1784 chrXIII 828308 . C T 651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.106;DP=98;Dels=0.00;FS=8.297;HaplotypeScore=5.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.60;MQ0=0;MQRankSum=-5.057;QD=6.64;ReadPosRankSum=-2.016;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,38:98:99:681,0,1321 chrXIII 828384 . A C 532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.559;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=-4.598;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.992;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:562,0,1210 chrXIII 828518 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.960;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.000;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1183,0,1357 chrXIII 828762 . C T 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.848;DP=145;Dels=0.00;FS=3.335;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1731,0,1312 chrXIII 828775 . G A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.212;DP=145;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1501,0,1569 chrXIII 828927 . T C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.680;DP=146;Dels=0.00;FS=4.978;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1482,0,1489 chrXIII 828957 . A G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.697;DP=146;Dels=0.00;FS=3.901;HaplotypeScore=2.9136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1514,0,1632 chrXIII 829028 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.667;DP=139;Dels=0.00;FS=3.257;HaplotypeScore=9.1309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.466;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:139:99:1082,0,1835 chrXIII 829038 . A T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.868;DP=140;Dels=0.00;FS=4.280;HaplotypeScore=2.5119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.183;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:140:99:1179,0,1837 chrXIII 829110 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;DP=103;Dels=0.00;FS=2.582;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=10.35;ReadPosRankSum=2.206;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1096,0,1156 chrXIII 829176 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.964;DP=106;Dels=0.00;FS=6.158;HaplotypeScore=4.7409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.355;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1257,0,1060 chrXIII 829545 . G C 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.005;DP=167;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.986;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,89:167:99:1841,0,1576 chrXIII 830002 . G C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.662;DP=111;Dels=0.00;FS=2.479;HaplotypeScore=3.5195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:111:99:1236,0,1053 chrXIII 830235 . T C 2305 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2338,225,0 chrXIII 830265 . G A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.399;DP=93;Dels=0.00;FS=4.100;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,52:93:99:1145,0,852 chrXIII 830275 . C A 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.437;DP=90;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.667;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.317;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1061,0,884 chrXIII 830543 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.807;DP=114;Dels=0.00;FS=5.908;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.236;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1207,0,1207 chrXIII 830562 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.724;DP=109;Dels=0.00;FS=2.462;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.034;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1165,0,1076 chrXIII 830589 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.387;DP=122;Dels=0.00;FS=8.376;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.139;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1480,0,1069 chrXIII 830715 . C T 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=1;QD=26.03;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2870,300,0 chrXIII 831156 . A G 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.629;DP=121;Dels=0.00;FS=6.918;HaplotypeScore=2.6464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=2.428;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.029;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1283,0,1192 chrXIII 831366 . C A 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.150;DP=101;Dels=0.00;FS=25.527;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.848;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1148,0,978 chrXIII 831490 . T C 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=3.194;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.528;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:1095,0,852 chrXIII 831576 . T C 1775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=16.59;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:1808,195,0 chrXIII 831687 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;DP=93;Dels=0.00;FS=3.918;HaplotypeScore=5.6288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:93:99:1072,0,949 chrXIII 831723 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;DP=103;Dels=0.00;FS=4.007;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=2.064;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.707;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1164,0,1076 chrXIII 831873 . C T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;DP=119;Dels=0.00;FS=13.525;HaplotypeScore=4.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.280;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1132,0,1389 chrXIII 831921 . A G 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;DP=135;Dels=0.00;FS=30.073;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.874;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1519,0,1432 chrXIII 831989 . T C 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.445;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1503,0,1537 chrXIII 832038 . T C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.579;DP=132;Dels=0.00;FS=9.339;HaplotypeScore=5.9059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.182;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1424,0,1365 chrXIII 832077 . A T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.825;DP=107;Dels=0.00;FS=11.302;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:107:99:1080,0,1131 chrXIII 832164 . A T 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;DP=119;Dels=0.00;FS=2.433;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:849,0,1642 chrXIII 832182 . G T 546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.796;DP=101;Dels=0.00;FS=1.677;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.018;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,37:101:99:576,0,1452 chrXIII 832299 . G A 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.419;DP=121;Dels=0.00;FS=3.365;HaplotypeScore=3.8511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1599,0,939 chrXIII 832337 . A G 2058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;DP=162;Dels=0.00;FS=5.854;HaplotypeScore=3.6411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.097;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,94:162:99:2088,0,1461 chrXIII 832356 . T A 1990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.128;DP=147;Dels=0.00;FS=6.244;HaplotypeScore=2.9444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,87:147:99:2020,0,1243 chrXIII 832684 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.412;DP=136;Dels=0.00;FS=10.897;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=9.13;ReadPosRankSum=-2.579;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1271,0,1616 chrXIII 832782 . A G 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.934;DP=135;Dels=0.00;FS=6.441;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.227;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1432,0,1347 chrXIII 832917 . T A 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2821,274,0 chrXIII 833149 . A G 2525 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2558,276,0 chrXIII 833279 . A T 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7359;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=22.77;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:2902,294,0 chrXIII 833534 . C T 2174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.84;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2207,213,0 chrXIII 833648 . G A 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3137,307,0 chrXIII 833673 . T A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;DP=119;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.801;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:1080,0,1499 chrXIII 833778 . C A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.399;DP=115;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=4.6907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=11.33;ReadPosRankSum=2.067;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1333,0,1239 chrXIII 833905 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.499;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1170,0,925 chrXIII 834040 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.075;DP=123;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.695;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,74:123:99:1578,0,1009 chrXIII 834111 . G A 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.973;DP=112;Dels=0.00;FS=2.609;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=13.70;ReadPosRankSum=-1.555;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1564,0,927 chrXIII 834292 . T C 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.530;DP=109;Dels=0.00;FS=7.808;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:894,0,1329 chrXIII 834662 . C T 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=28.21;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3272,328,0 chrXIII 834670 . A G 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3398,349,0 chrXIII 834775 . C G 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3258,333,0 chrXIII 834950 . G A 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.133;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.117;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1469,0,1311 chrXIII 835125 . T G 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3072,312,0 chrXIII 835147 . A T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.932;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1345,0,1301 chrXIII 835289 . G A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;DP=105;Dels=0.00;FS=2.726;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,63:105:99:1460,0,903 chrXIII 835307 . C T 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.945;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.197;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1321,0,1005 chrXIII 835312 . T C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.504;DP=106;Dels=0.00;FS=2.543;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.976;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1165,0,1103 chrXIII 835425 . A T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.148;DP=141;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=0.637;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,58:141:99:1200,0,1804 chrXIII 835545 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.539;DP=121;Dels=0.00;FS=1.739;HaplotypeScore=8.7228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=1.789;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.647;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:121:99:1042,0,1524 chrXIII 835670 . T A 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1120,0,864 chrXIII 835676 . G A 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.191;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:871,0,1061 chrXIII 835854 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.862;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.275;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1239,0,1298 chrXIII 836162 . C A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.663;DP=154;Dels=0.00;FS=2.857;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.482;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1470,0,1819 chrXIII 836259 . T A 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.625;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1053,0,1331 chrXIII 836352 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.038;DP=122;Dels=0.00;FS=2.833;HaplotypeScore=4.5066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.243;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1422,0,1270 chrXIII 836466 . G A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.152;DP=108;Dels=0.00;FS=5.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1112,0,1321 chrXIII 836682 . A T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.156;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:1009,0,1307 chrXIII 836848 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.861;DP=121;Dels=0.00;FS=5.723;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.397;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1239,0,1362 chrXIII 837145 . C T 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.602;DP=133;Dels=0.00;FS=16.437;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.985;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1607,0,1249 chrXIII 837515 . A G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;DP=99;Dels=0.00;FS=8.068;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=1.945;QD=12.07;ReadPosRankSum=-2.785;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1225,0,900 chrXIII 837772 . C A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;DP=108;Dels=0.00;FS=25.375;HaplotypeScore=51.6622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.196;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1173,0,1145 chrXIII 837788 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.206;DP=107;Dels=0.00;FS=17.737;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1048,0,1239 chrXIII 837798 . T G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.574;DP=124;Dels=0.00;FS=3.326;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.56;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.328;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1351,0,1228 chrXIII 837907 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;DP=82;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=2.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=12.50;ReadPosRankSum=-1.624;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,48:82:99:1055,0,750 chrXIII 837971 . C T 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.236;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.806;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,34:72:99:780,0,822 chrXIII 838133 . G A 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3461,337,0 chrXIII 838192 . C G 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3078,312,0 chrXIII 838248 . C A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3297,310,0 chrXIII 838336 . G C 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2470,261,0 chrXIII 838725 . C G 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.257;DP=99;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:813,0,1179 chrXIII 838789 . G A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.687;DP=116;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.968;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1097,0,1387 chrXIII 838867 . T C 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3015,312,0 chrXIII 839086 . A G 3838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3838,408,0 chrXIII 839230 . A G 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2634,267,0 chrXIII 839353 . A C 1631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=22.65;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1664,174,0 chrXIII 839457 . A G 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.457;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:928,0,1207 chrXIII 839871 . T C 2225 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.57;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2258,234,0 chrXIII 840002 . T A 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=26.47;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2945,295,0 chrXIII 840033 . C A 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=79.1065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.91;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3576,355,0 chrXIII 840081 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.728;DP=138;Dels=0.00;FS=8.612;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.871;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,53:138:99:1112,0,1820 chrXIII 840464 . G A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.249;DP=120;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=3.4807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.963;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1275,0,1301 chrXIII 840468 . A G 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.520;DP=104;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=3.3558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,47:104:99:973,0,1325 chrXIII 840489 . G A 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.324;DP=123;Dels=0.00;FS=3.705;HaplotypeScore=4.9013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.643;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:1099,0,1528 chrXIII 840499 . T C 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.320;DP=117;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.394;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,67:117:99:1433,0,1104 chrXIII 840667 . C T 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3085,307,0 chrXIII 841022 . T C 2259 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=25.67;ReadPosRankSum=1.653;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:2292,227,0 chrXIII 841302 . G A 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2964,286,0 chrXIII 841486 . A G 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2783,282,0 chrXIII 841599 . A G 2121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2154,219,0 chrXIII 841704 . C T 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2530,255,0 chrXIII 841893 . A G 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2841,279,0 chrXIII 841905 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.033;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.215;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1334,0,1314 chrXIII 842091 . A G 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2724,276,0 chrXIII 842364 . G A 2446 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.88;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2479,249,0 chrXIII 842866 . T G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.720;DP=104;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=11.42;ReadPosRankSum=-2.091;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1218,0,1008 chrXIII 843360 . G A 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2898,288,0 chrXIII 843688 . T C 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.788;DP=131;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=4.4405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=8.37;ReadPosRankSum=-2.579;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1126,0,1702 chrXIII 843714 . G A 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.844;DP=109;Dels=0.00;FS=2.573;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:932,0,1352 chrXIII 844047 . C T 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.696;DP=131;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1627,0,1207 chrXIII 844197 . A G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.102;DP=99;Dels=0.00;FS=5.135;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.694;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1094,0,973 chrXIII 844242 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.403;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.196;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:1042,0,1409 chrXIII 844681 . T C 2294 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7387;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2327,252,0 chrXIII 845163 . G A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.091;DP=138;Dels=0.00;FS=7.790;HaplotypeScore=2.7007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.312;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1282,0,1638 chrXIII 845599 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.777;DP=117;Dels=0.00;FS=7.081;HaplotypeScore=4.8818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.666;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1512,0,953 chrXIII 846009 . G A 2385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2418,237,0 chrXIII 846119 . T C 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3125,321,0 chrXIII 846242 . C T 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3018,309,0 chrXIII 846261 . C A 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2568,252,0 chrXIII 846356 . C T 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2861,285,0 chrXIII 846359 . G A 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2916,292,0 chrXIII 846548 . T C 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2815,288,0 chrXIII 846600 . T C 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2797,291,0 chrXIII 846746 . T C 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3133,321,0 chrXIII 847205 . A G 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3604,355,0 chrXIII 847427 . T C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.517;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1375,0,995 chrXIII 847610 . T C 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.631;DP=147;Dels=0.00;FS=8.252;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=10.82;ReadPosRankSum=2.053;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1621,0,1529 chrXIII 848240 . A G 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.491;DP=134;Dels=0.00;FS=13.986;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.251;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1476,0,1492 chrXIII 848515 . A C 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2994,306,0 chrXIII 848560 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.669;DP=119;Dels=0.00;FS=6.090;HaplotypeScore=2.8741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.030;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:1095,0,1489 chrXIII 848643 . T C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.796;DP=109;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.117;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:109:99:1166,0,1099 chrXIII 848948 . A T 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.277;DP=125;Dels=0.00;FS=3.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.780;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1509,0,1244 chrXIII 849836 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.181;DP=147;Dels=0.00;FS=1.307;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.051;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1477,0,1856 chrXIII 849950 . T C 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.890;DP=144;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.272;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1419,0,1656 chrXIII 849970 . G C 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.351;DP=153;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,80:153:99:1699,0,1587 chrXIII 850030 . G T 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.536;DP=133;Dels=0.00;FS=17.568;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.088;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1711,0,1204 chrXIII 850884 . C T 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3375,348,0 chrXIII 851620 . T A 4711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=1;QD=27.55;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4711,463,0 chrXIII 851747 . T A 239.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.026;DP=154;Dels=0.01;FS=259.655;HaplotypeScore=79.4976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=1.55;ReadPosRankSum=-8.033;SB=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,84:153:99:269,0,669 chrXIII 851822 . T C 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.454;DP=143;Dels=0.00;FS=6.935;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:143:99:1620,0,1530 chrXIII 851845 . G A 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.746;DP=140;Dels=0.00;FS=6.643;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.267;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1639,0,1436 chrXIII 851869 . C T 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.892;DP=147;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=2.7635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.735;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1725,0,1425 chrXIII 851894 . A G 1876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.914;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=1;MQRankSum=1.295;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,91:173:99:1906,0,1831 chrXIII 851914 . A G 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.581;DP=151;Dels=0.00;FS=5.878;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=1;MQRankSum=0.905;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.431;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1436,0,1750 chrXIII 852052 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.997;DP=144;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1354,0,1752 chrXIII 852118 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.138;DP=116;Dels=0.00;FS=8.780;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.149;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1416,0,1159 chrXIII 852360 . T A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.700;DP=128;Dels=0.00;FS=2.312;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.471;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1371,0,1262 chrXIII 853001 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.612;DP=112;Dels=0.00;FS=0.771;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=11.07;ReadPosRankSum=3.285;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1270,0,1242 chrXIII 853271 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.458;DP=157;Dels=0.01;FS=0.631;HaplotypeScore=13.8822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.902;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1643,0,1635 chrXIII 853278 . G A 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.816;DP=176;Dels=0.00;FS=1.921;HaplotypeScore=5.9253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.777;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.863;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,86:176:99:1901,0,1882 chrXIII 853352 . C T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.701;DP=127;Dels=0.00;FS=11.138;HaplotypeScore=4.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1285,0,1494 chrXIII 853565 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.689;DP=117;Dels=0.00;FS=4.488;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1362,0,1160 chrXIII 853595 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.131;DP=111;Dels=0.00;FS=3.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1246,0,1128 chrXIII 853802 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.592;DP=141;Dels=0.00;FS=3.144;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1377,0,1725 chrXIII 854292 . T A 1836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=1;MQRankSum=-1.493;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,90:174:99:1866,0,1736 chrXIII 854373 . G T 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.186;DP=135;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=6.2958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=11.06;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:135:99:1523,0,1438 chrXIII 854452 . A G 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.673;DP=117;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.026;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:802,0,1329 chrXIII 854643 . A G 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.919;DP=110;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.747;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1174,0,1179 chrXIII 855008 . A G 2405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2438,249,0 chrXIII 855302 . T A 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3626,346,0 chrXIII 855635 . G T 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3914,397,0 chrXIII 855825 . A G 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3453,360,0 chrXIII 855975 . T C 4119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=24.81;SB=-2.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4119,421,0 chrXIII 856026 . A G 4039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.74;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4039,408,0 chrXIII 856038 . G A 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3339,316,0 chrXIII 856042 . C T 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.74;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3314,324,0 chrXIII 856275 . C T 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=26.94;ReadPosRankSum=0.011;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:4068,400,0 chrXIII 856401 . C T 4179.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=1;QD=25.80;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4179,415,0 chrXIII 856957 . T C 2271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.72;MQ0=0;QD=19.25;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2304,243,0 chrXIII 857240 . A G 3911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3911,405,0 chrXIII 857306 . A G 3975.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3975,414,0 chrXIII 857448 . C G 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2883,291,0 chrXIII 857472 . T C 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3302,342,0 chrXIII 857520 . A G 4651.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4651,463,0 chrXIII 857568 . T A 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3816,364,0 chrXIII 857676 . A G 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3985,400,0 chrXIII 857787 . G A 4056.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4056,409,0 chrXIII 857842 . T C 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8518;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3621,375,0 chrXIII 858111 . A C 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.841;DP=165;Dels=0.00;FS=3.599;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.052;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,85:165:99:1755,0,1667 chrXIII 859063 . A G 752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.744;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:782,0,682 chrXIII 859098 . G A 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.780;DP=92;Dels=0.00;FS=2.095;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:1084,0,904 chrXIII 859155 . T G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.095;DP=101;Dels=0.00;FS=4.200;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1043,0,1136 chrXIII 859362 . G A 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.825;DP=120;Dels=0.00;FS=2.346;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.494;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1455,0,1152 chrXIII 859920 . G A 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.275;DP=156;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=2.2368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.979;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,86:156:99:1786,0,1440 chrXIII 860181 . C T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.294;DP=147;Dels=0.00;FS=2.061;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1563,0,1638 chrXIII 860953 . G A 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.820;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.113;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1653,0,1376 chrXIII 861184 . G T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.332;DP=141;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=11.5888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.934;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:141:99:1331,0,1066 chrXIII 861422 . T C 1744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.066;DP=220;Dels=0.00;FS=4.818;HaplotypeScore=6.7907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.375;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,99:220:99:1774,0,2686 chrXIII 861520 . T C 3833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3833,385,0 chrXIII 861780 . C A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.825;DP=134;Dels=0.00;FS=3.171;HaplotypeScore=5.7549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=2.379;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,54:134:99:1147,0,1623 chrXIII 862005 . T C 2087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.832;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.459;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,98:170:99:2117,0,1473 chrXIII 862056 . C A 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.894;DP=147;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,82:147:99:1799,0,1256 chrXIII 862065 . T C 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.96;SB=-2.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3719,381,0 chrXIII 862092 . T C 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3281,354,0 chrXIII 862197 . A G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.036;DP=115;Dels=0.00;FS=4.571;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.020;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1207,0,1247 chrXIII 862215 . C T 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.640;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.844;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1710,0,1580 chrXIII 862224 . C T 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.687;DP=156;Dels=0.00;FS=5.390;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.752;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1705,0,1502 chrXIII 862455 . A G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.444;DP=118;Dels=0.00;FS=14.799;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.876;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1085,0,1167 chrXIII 862496 . C T 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.564;DP=122;Dels=0.00;FS=5.675;HaplotypeScore=14.1962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1093,0,1212 chrXIII 862695 . C T 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3497,349,0 chrXIII 862890 . C T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.160;DP=136;Dels=0.00;FS=6.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.191;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.248;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1429,0,1469 chrXIII 862977 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.997;DP=103;Dels=0.00;FS=1.626;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1217,0,919 chrXIII 863037 . T C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.489;DP=98;Dels=0.00;FS=3.929;HaplotypeScore=4.8368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.375;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1031,0,943 chrXIII 863097 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.771;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.097;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.957;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,67:105:99:1534,0,750 chrXIII 863208 . C T 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3077,306,0 chrXIII 863229 . T C 2784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2817,288,0 chrXIII 863304 . G A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.962;DP=114;Dels=0.00;FS=1.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.408;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1110,0,1277 chrXIII 863507 . G A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.617;DP=145;Dels=0.00;FS=3.007;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1385,0,1703 chrXIII 863526 . G A 4239.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=155;Dels=0.00;FS=3.708;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.816;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:4239,415,0 chrXIII 863539 . T C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.318;DP=130;Dels=0.00;FS=9.647;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.407;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1177,0,1699 chrXIII 863565 . G T 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.040;DP=134;Dels=0.01;FS=9.334;HaplotypeScore=7.3217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1669,0,1227 chrXIII 863622 . A T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;DP=144;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=2.315;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1478,0,1616 chrXIII 863920 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.547;DP=129;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.200;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1430,0,1298 chrXIII 864179 . G C 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.215;DP=164;Dels=0.00;FS=1.218;HaplotypeScore=3.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,88:164:99:1733,0,1574 chrXIII 864218 . G A 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.041;DP=156;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=4.4307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1683,0,1642 chrXIII 864272 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.016;DP=153;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.641;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1612,0,1625 chrXIII 864888 . G T 3865.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.81;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3865,367,0 chrXIII 865067 . A T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.494;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.254;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.798;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1425,0,1415 chrXIII 865270 . T A 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;DP=105;Dels=0.00;FS=3.622;HaplotypeScore=7.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.760;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:970,0,1345 chrXIII 865402 . A G 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.12;MQ0=0;QD=22.49;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2574,267,0 chrXIII 866108 . T C 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.879e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3846,385,0 chrXIII 866141 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.437;DP=134;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.161;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1231,0,1702 chrXIII 866213 . A G 4174.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.59;SB=-2.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4174,400,0 chrXIII 866396 . C T 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2877,286,0 chrXIII 866753 . T C 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6724;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3053,324,0 chrXIII 867104 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.040;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.481;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1435,0,1437 chrXIII 867176 . C T 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.37;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2775,288,0 chrXIII 868099 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.720;DP=121;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=5.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1172,0,1394 chrXIII 868383 . A G 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2785,294,0 chrXIII 868389 . T C 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2837,285,0 chrXIII 868542 . G A 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3600,370,0 chrXIII 868833 . T C 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3236,336,0 chrXIII 868863 . A G 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.219;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.057;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1492,0,1426 chrXIII 869058 . C T 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=144;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=25.37;ReadPosRankSum=0.120;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3653,340,0 chrXIII 869130 . G A 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.957;DP=148;Dels=0.00;FS=6.281;HaplotypeScore=11.7570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.286;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1689,0,1479 chrXIII 869428 . A G 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3192,330,0 chrXIII 869439 . G A 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3127,315,0 chrXIII 869963 . G T 1904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.639;DP=158;Dels=0.00;FS=7.087;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=0.803;QD=12.05;ReadPosRankSum=2.078;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,88:158:99:1934,0,1456 chrXIII 870003 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.457;DP=143;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=5.6793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=9.32;ReadPosRankSum=2.052;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1363,0,1702 chrXIII 870074 . C T 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3860,373,0 chrXIII 870085 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.710;DP=134;Dels=0.00;FS=11.110;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.702;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1419,0,1533 chrXIII 870328 . C T 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.697;DP=143;Dels=0.00;FS=6.210;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1705,0,1286 chrXIII 870433 . T C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.275;DP=120;Dels=0.00;FS=2.413;HaplotypeScore=5.5485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.623;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,74:120:99:1361,0,965 chrXIII 870455 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.056;DP=102;Dels=0.00;FS=10.829;HaplotypeScore=3.4347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,65:102:99:1216,0,656 chrXIII 870475 . C T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.256;DP=95;Dels=0.00;FS=12.099;HaplotypeScore=2.8121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.326;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,57:95:99:1230,0,666 chrXIII 870477 . C T 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;DP=95;Dels=0.00;FS=6.778;HaplotypeScore=2.0234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.470;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.570;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,56:95:99:1178,0,765 chrXIII 870588 . C A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.410;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:1538,0,972 chrXIII 870720 . T C 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.674;DP=90;Dels=0.00;FS=5.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,53:90:99:1064,0,832 chrXIII 870767 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.193;DP=110;Dels=0.00;FS=2.489;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.956;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1318,0,988 chrXIII 870784 . A T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;DP=114;Dels=0.00;FS=2.452;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1316,0,1090 chrXIII 870868 . C T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.344;DP=125;Dels=0.00;FS=2.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.870;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1345,0,1450 chrXIII 870888 . G A 1301.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.429;DP=131;Dels=0.00;FS=11.162;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.187;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1331,0,1520 chrXIII 870889 . G A 1303.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.415;DP=131;Dels=0.00;FS=12.948;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1333,0,1545 chrXIII 870894 . G A 1286.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.089;DP=132;Dels=0.00;FS=14.616;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.711;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1316,0,1465 chrXIII 870922 . T C 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.310;DP=141;Dels=0.00;FS=15.855;HaplotypeScore=5.2553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1288,0,1709 chrXIII 871042 . C A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.469;DP=122;Dels=0.00;FS=2.318;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=10.70;ReadPosRankSum=2.312;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1336,0,1199 chrXIII 871099 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.334;DP=128;Dels=0.00;FS=8.105;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:128:99:1352,0,1252 chrXIII 871114 . C T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.586;DP=120;Dels=0.00;FS=3.369;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=8.83;ReadPosRankSum=2.092;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1090,0,1319 chrXIII 871217 . C T 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.063;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1636,0,1427 chrXIII 871306 . T C 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.858;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.278;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1217,0,1641 chrXIII 871355 . A T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;DP=146;Dels=0.00;FS=2.986;HaplotypeScore=2.6989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,60:146:99:1212,0,1894 chrXIII 871699 . T C 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.361;DP=104;Dels=0.00;FS=9.388;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.258;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:971,0,1249 chrXIII 871808 . C A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.009;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.211;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1297,0,1656 chrXIII 872093 . G A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.045;DP=156;Dels=0.00;FS=5.167;HaplotypeScore=2.7051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,66:156:99:1389,0,1954 chrXIII 872287 . C T 1951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.887;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,84:154:99:1981,0,1436 chrXIII 872370 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.757;DP=137;Dels=0.00;FS=7.620;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.472;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1317,0,1611 chrXIII 872374 . A C 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.590;DP=138;Dels=0.00;FS=4.063;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.068;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1315,0,1603 chrXIII 872658 . G C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.068;DP=156;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=0.267;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1440,0,1521 chrXIII 872669 . T G 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.423;DP=148;Dels=0.00;FS=2.931;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=-1.080;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.034;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1345,0,1626 chrXIII 872702 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.193;DP=149;Dels=0.00;FS=3.941;HaplotypeScore=3.4894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=1;MQRankSum=0.432;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.911;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1492,0,1657 chrXIII 872820 . C A 1782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;DP=183;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=10.6351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.731;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,87:183:99:1812,0,2106 chrXIII 872821 . A G 1901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.288;DP=194;Dels=0.00;FS=3.656;HaplotypeScore=14.6041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.785;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,95:194:99:1931,0,2160 chrXIII 872837 . T C 4910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,190:190:99:4910,504,0 chrXIII 872926 . A C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.441;DP=128;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.410;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1350,0,1447 chrXIII 873141 . C T 1892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.964;DP=172;Dels=0.00;FS=0.558;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,88:172:99:1922,0,1796 chrXIII 873246 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.935;DP=129;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=4.5894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.954;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1238,0,1612 chrXIII 873591 . G A 193.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.762;DP=109;Dels=0.00;FS=24.522;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQ0=0;MQRankSum=-5.073;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.674;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,27:109:99:223,0,1736 chrXIII 873817 . G A 2072 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.73;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2105,204,0 chrXIII 873861 . T G 113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.598;DP=93;Dels=0.00;FS=28.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.32;MQ0=3;MQRankSum=-2.026;QD=1.22;ReadPosRankSum=0.925;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,26:93:99:143,0,1535 chrXIII 873882 . G A 294.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.235;DP=91;Dels=0.00;FS=17.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.57;MQ0=3;MQRankSum=-0.993;QD=3.23;ReadPosRankSum=2.390;SB=-8.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,35:91:99:324,0,1131 chrXIII 873884 . T C 269.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.464;DP=89;Dels=0.00;FS=14.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.87;MQ0=3;MQRankSum=-1.068;QD=3.02;ReadPosRankSum=2.247;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,35:89:99:299,0,1130 chrXIII 873888 . C G 295.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.294;DP=87;Dels=0.00;FS=17.041;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.56;MQ0=3;MQRankSum=-1.108;QD=3.39;ReadPosRankSum=2.097;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,36:87:99:325,0,905 chrXIII 873896 . C G 965.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;DP=92;Dels=0.00;FS=17.211;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.80;MQ0=3;MQRankSum=0.581;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,52:92:99:995,0,391 chrXIII 873897 . A G 923.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.190;DP=97;Dels=0.00;FS=15.970;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.28;MQ0=3;MQRankSum=-0.065;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:953,0,520 chrXIII 873906 . A G 819.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.147;DP=111;Dels=0.00;FS=20.165;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.70;MQ0=3;MQRankSum=-1.592;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.881;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:849,0,819 chrXIII 873909 . A C 826.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=120;Dels=0.00;FS=20.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.41;MQ0=3;MQRankSum=-2.497;QD=6.88;ReadPosRankSum=3.116;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:856,0,1031 chrXIII 873914 . G C 784.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.968;DP=126;Dels=0.00;FS=27.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.30;MQ0=2;MQRankSum=-1.303;QD=6.22;ReadPosRankSum=2.731;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:814,0,1092 chrXIII 873915 . A G 746.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.325;DP=124;Dels=0.00;FS=25.280;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.52;MQ0=1;MQRankSum=-1.763;QD=6.02;ReadPosRankSum=2.531;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:776,0,1093 chrXIII 873921 . G A 880.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;DP=125;Dels=0.00;FS=27.969;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.82;MQ0=1;MQRankSum=-2.085;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.846;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:910,0,1079 chrXIII 873922 . T C 819.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.503;DP=124;Dels=0.00;FS=28.033;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.351;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.587;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:849,0,1090 chrXIII 873996 . G A 880.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.765;DP=179;Dels=0.00;FS=1.989;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.17;MQ0=9;MQRankSum=1.777;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,65:179:99:910,0,1785 chrXIII 874092 . G A 577.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.792;DP=175;Dels=0.00;FS=22.109;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.89;MQ0=14;MQRankSum=-5.007;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.456;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,43:175:99:607,0,2426 chrXIII 874096 . T C 655.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.961;DP=181;Dels=0.00;FS=32.874;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.11;MQ0=13;MQRankSum=-5.660;QD=3.62;ReadPosRankSum=-2.437;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,51:181:99:685,0,2459 chrXIII 874104 . T G 594.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.699;DP=178;Dels=0.00;FS=49.090;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.51;MQ0=12;MQRankSum=-6.284;QD=3.34;ReadPosRankSum=-3.092;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,43:178:99:624,0,2722 chrXIII 874107 . A C 555.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.893;DP=173;Dels=0.00;FS=55.074;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.00;MQ0=11;MQRankSum=-6.503;QD=3.21;ReadPosRankSum=-4.034;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,42:173:99:585,0,2553 chrXIII 874110 . C G 513.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.565;DP=174;Dels=0.00;FS=57.946;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.67;MQ0=10;MQRankSum=-6.217;QD=2.95;ReadPosRankSum=-4.158;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,41:174:99:543,0,2644 chrXIII 874113 . G A 410.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.509;DP=169;Dels=0.00;FS=66.182;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.64;MQ0=10;MQRankSum=-6.197;QD=2.43;ReadPosRankSum=-2.713;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,32:169:99:440,0,2726 chrXIII 874114 . C G 386.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;DP=175;Dels=0.00;FS=43.117;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.71;MQ0=10;MQRankSum=-6.094;QD=2.21;ReadPosRankSum=-3.367;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,36:175:99:416,0,2755 chrXIII 874116 . G A 413.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.045;DP=176;Dels=0.00;FS=42.914;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.85;MQ0=10;MQRankSum=-6.009;QD=2.35;ReadPosRankSum=-3.485;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,36:176:99:443,0,2749 chrXIII 874125 . A C 556.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.557;DP=195;Dels=0.00;FS=31.732;HaplotypeScore=80.8334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.44;MQ0=9;MQRankSum=-6.086;QD=2.85;ReadPosRankSum=-4.385;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,47:195:99:586,0,2997 chrXIII 874128 . G A 2922.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.772;DP=206;Dels=0.00;FS=74.438;HaplotypeScore=45.1460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.53;MQ0=10;MQRankSum=2.154;QD=14.18;ReadPosRankSum=-2.193;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,138:206:99:2952,0,759 chrXIII 874140 . A C 3126.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.599;DP=191;Dels=0.01;FS=33.355;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.25;MQ0=9;MQRankSum=0.710;QD=16.37;ReadPosRankSum=-3.715;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,154:190:99:3156,0,176 chrXIII 874146 . A G 153.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.797;DP=172;Dels=0.00;FS=33.161;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.81;MQ0=5;MQRankSum=-1.745;QD=0.89;ReadPosRankSum=4.188;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,31:172:99:183,0,3138 chrXIII 874182 . A G 227.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.420;DP=166;Dels=0.00;FS=50.934;HaplotypeScore=3.1570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.07;MQ0=2;MQRankSum=-4.299;QD=1.37;ReadPosRankSum=0.841;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,35:166:99:257,0,3020 chrXIII 874287 . G A 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.437;DP=166;Dels=0.00;FS=2.687;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.448;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,86:166:99:1887,0,1600 chrXIII 874296 . T C 4294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4294,427,0 chrXIII 874543 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.362;DP=165;Dels=0.00;FS=10.912;HaplotypeScore=7.6270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.347;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,82:165:99:1626,0,1868 chrXIII 874638 . G A 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.217;DP=103;Dels=0.00;FS=0.854;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.160;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1012,0,704 chrXIII 874747 . T A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;DP=163;Dels=0.00;FS=5.747;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.879;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,73:163:99:1392,0,2043 chrXIII 874942 . T A 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3208,313,0 chrXIII 875130 . C T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.476;DP=158;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=5.7934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.549;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1554,0,1783 chrXIII 875463 . C G 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.809;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=9.94;ReadPosRankSum=2.737;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,82:163:99:1650,0,1685 chrXIII 876506 . A G 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.488;DP=151;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1574,0,1738 chrXIII 876530 . G A 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9693;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3889,382,0 chrXIII 876657 . A G 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.886;DP=147;Dels=0.00;FS=2.084;HaplotypeScore=8.8764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=1;MQRankSum=-0.077;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:147:99:1579,0,1487 chrXIII 876747 . C T 4415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.94;SB=-2.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4415,436,0 chrXIII 877079 . C T 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.749;DP=144;Dels=0.00;FS=3.980;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1850,0,1331 chrXIII 877221 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.313;DP=118;Dels=0.00;FS=4.377;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.821;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1324,0,1228 chrXIII 877657 . G A 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3255,319,0 chrXIII 877786 . A T 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3497,346,0 chrXIII 878076 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.303;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.108;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1236,0,1249 chrXIII 878152 . C A 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2803,274,0 chrXIII 878722 . T A 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;DP=97;Dels=0.00;FS=9.731;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.655;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:952,0,1124 chrXIII 878778 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.926;DP=102;Dels=0.00;FS=4.285;HaplotypeScore=3.4301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.066;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1229,0,796 chrXIII 878824 . T C 294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.224;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=35.8158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.31;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=4.98;ReadPosRankSum=-3.453;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:324,0,186 chrXIII 878834 . A G 301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.849;DP=70;Dels=0.00;FS=3.418;HaplotypeScore=10.8960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.086;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,43:70:99:331,0,277 chrXIII 878991 . T C 1970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.050;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.120;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,93:158:99:2000,0,1418 chrXIII 879141 . A G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.583;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1337,0,1671 chrXIII 879225 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.956;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=10.81;ReadPosRankSum=-2.180;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1457,0,1222 chrXIII 879402 . C T 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.614;DP=161;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.841;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.066;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1706,0,1733 chrXIII 879414 . A G 4169.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4169,421,0 chrXIII 879738 . A G 1927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.497;DP=185;Dels=0.00;FS=1.860;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.493;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,93:185:99:1957,0,1947 chrXIII 880051 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.402;DP=122;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.704;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1134,0,1444 chrXIII 880104 . G A 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=28.29;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3848,379,0 chrXIII 880179 . T A 3935.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3935,408,0 chrXIII 880236 . G T 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3733,358,0 chrXIII 880244 . G A 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3866,364,0 chrXIII 880373 . C T 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3729,373,0 chrXIII 880430 . C T 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3867,379,0 chrXIII 880469 . A T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.138;DP=143;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1527,0,1609 chrXIII 880627 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;DP=122;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.575;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1292,0,1315 chrXIII 880820 . C T 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.096;DP=138;Dels=0.00;FS=6.665;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.848;QD=12.39;ReadPosRankSum=2.774;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1740,0,1267 chrXIII 880903 . C T 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.605;DP=126;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=10.34;ReadPosRankSum=2.106;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1333,0,1289 chrXIII 881617 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.604;DP=127;Dels=0.00;FS=4.333;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.099;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1237,0,1525 chrXIII 881716 . G A 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.848;DP=99;Dels=0.00;FS=3.821;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.505;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:898,0,1280 chrXIII 882115 . G A 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3331,322,0 chrXIII 882391 . G A 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.140;DP=137;Dels=0.00;FS=9.027;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=10.80;ReadPosRankSum=2.469;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1510,0,1454 chrXIII 882406 . C T 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.409;DP=137;Dels=0.00;FS=3.059;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.360;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1534,0,1340 chrXIII 882454 . G C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;DP=127;Dels=0.00;FS=4.278;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.138;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1282,0,1382 chrXIII 882632 . G A 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.879;DP=130;Dels=0.00;FS=4.469;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.104;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,77:130:99:1696,0,1017 chrXIII 882853 . G A 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.744;DP=160;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.894;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,75:160:99:1608,0,1742 chrXIII 884262 . G A 1964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.171;DP=165;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=1.9312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.905;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:1994,0,1531 chrXIII 885079 . T C 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=119;Dels=0.01;FS=1.472;HaplotypeScore=7.8880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.565;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1094,0,1403 chrXIII 885659 . G A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.903;DP=116;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.237;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1222,0,1286 chrXIII 887633 . A G 4357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.25;SB=-2.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:166:99:4357,451,0 chrXIII 887821 . T C 4386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4386,439,0 chrXIII 887893 . C T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.170;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.619;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1701,0,1282 chrXIII 889693 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.983;DP=122;Dels=0.00;FS=4.284;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.087;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1302,0,1259 chrXIII 890059 . T A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.621;DP=115;Dels=0.00;FS=3.433;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.191;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.215;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:115:99:1175,0,1294 chrXIII 890385 . G A 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3188,307,0 chrXIII 892535 . T C 1925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=21.15;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:1958,210,0 chrXIII 892536 . G A 1954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=21.71;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1987,210,0 chrXIII 892564 . A T 1651 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=17.56;SB=-1.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:1684,168,0 chrXIII 892587 . G A 2861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7111;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=22.71;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2894,291,0 chrXIII 893651 . A G 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=26.38;ReadPosRankSum=0.025;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:3640,378,0 chrXIII 893659 . G T 4087.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4087,418,0 chrXIII 893774 . A G 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2689,285,0 chrXIII 894039 . A T 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3018,306,0 chrXIII 894275 . C T 4062.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4062,397,0 chrXIII 895914 . G A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.125;DP=156;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.716;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1587,0,1742 chrXIII 896227 . A G 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3890,399,0 chrXIII 896568 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.995;DP=131;Dels=0.00;FS=6.523;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1366,0,1380 chrXIII 896572 . C T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.689;DP=132;Dels=0.00;FS=7.725;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.919;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1393,0,1373 chrXIII 896727 . A T 1924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.398;DP=146;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.083;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:146:99:1954,0,1311 chrXIII 896918 . G T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.989;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.443;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1650,0,1459 chrXIII 897430 . C T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.006;DP=126;Dels=0.00;FS=15.287;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.441;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1655,0,1099 chrXIII 897605 . A G 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3840,399,0 chrXIII 897645 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.918;DP=128;Dels=0.00;FS=4.162;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.968;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1343,0,1437 chrXIII 897927 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.340;DP=136;Dels=0.00;FS=3.075;HaplotypeScore=3.9114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1385,0,1478 chrXIII 897937 . T C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.267;DP=121;Dels=0.00;FS=7.048;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.153;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1258,0,1378 chrXIII 898146 . C T 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3089,301,0 chrXIII 898174 . G A 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.029;DP=132;Dels=0.00;FS=3.419;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1396,0,1424 chrXIII 898282 . C T 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3904,394,0 chrXIII 898408 . G A 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3255,330,0 chrXIII 898425 . A G 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.801;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3319,333,0 chrXIII 898462 . G T 3924.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.44;SB=-2.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3924,376,0 chrXIII 898537 . A C 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8370;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3402,345,0 chrXIII 898606 . A G 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3438,357,0 chrXIII 898625 . G A 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.328;DP=119;Dels=0.00;FS=2.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.729;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1195,0,1177 chrXIII 898692 . A G 3624.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3624,360,0 chrXIII 898776 . A G 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3411,351,0 chrXIII 899002 . C A 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3468,349,0 chrXIII 899239 . T C 4120.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4120,435,0 chrXIII 899633 . A C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.492;DP=123;Dels=0.00;FS=2.316;HaplotypeScore=4.6820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.673;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1396,0,1155 chrXIII 899790 . G A 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.428;DP=96;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=2.7914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:843,0,1130 chrXIII 899811 . C T 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.079;DP=103;Dels=0.00;FS=1.582;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.307;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:103:99:836,0,1237 chrXIII 899812 . A G 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2620,288,0 chrXIII 899829 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.923;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1286,0,1098 chrXIII 899938 . T C 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.022;DP=134;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=4.7111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.765;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1383,0,1366 chrXIII 900330 . T C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.658;DP=129;Dels=0.00;FS=5.340;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1294,0,1448 chrXIII 900561 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.665;DP=130;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.746;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1406,0,1386 chrXIII 900770 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.687;DP=121;Dels=0.00;FS=2.305;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.950;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1112,0,1378 chrXIII 901451 . G A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;DP=120;Dels=0.00;FS=4.715;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1362,0,1171 chrXIII 901535 . A T 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=1;QD=27.26;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3408,337,0 chrXIII 901538 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;DP=129;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.844;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.982;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1301,0,1440 chrXIII 901637 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.326;DP=147;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.573;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,63:147:99:1297,0,1800 chrXIII 901683 . A C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.717;DP=132;Dels=0.00;FS=7.898;HaplotypeScore=2.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.871;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1105,0,1715 chrXIII 901855 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.944;DP=125;Dels=0.00;FS=3.400;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1569,0,1033 chrXIII 901903 . A G 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.063;DP=130;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.165;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1584,0,1117 chrXIII 902329 . T G 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2967,318,0 chrXIII 902549 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.273;DP=125;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.255;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1272,0,1483 chrXIII 902587 . C A 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=23.44;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3703,375,0 chrXIII 902696 . T C 3573.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3573,363,0 chrXIII 902762 . T G 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=1;QD=25.75;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3837,390,0 chrXIII 903126 . A G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3168,333,0 chrXIII 903204 . T C 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3716,364,0 chrXIII 903270 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.517;DP=130;Dels=0.00;FS=5.357;HaplotypeScore=6.0667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.219;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1273,0,1421 chrXIII 903498 . T C 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3037,312,0 chrXIII 903771 . T C 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3177,328,0 chrXIII 903804 . A G 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3640,381,0 chrXIII 903826 . T C 4293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.55;SB=-2.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4293,436,0 chrXIII 903875 . T G 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3534,372,0 chrXIII 903884 . A G 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3580,364,0 chrXIII 904006 . C T 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2717,264,0 chrXIII 904052 . G A 2147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.87;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2180,222,0 chrXIII 904069 . A C 2453 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.78;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2486,261,0 chrXIII 904139 . T C 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.752;DP=146;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=11.83;ReadPosRankSum=-2.094;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:146:99:1757,0,1298 chrXIII 904153 . T C 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.393;DP=133;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1549,0,1361 chrXIII 904347 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.238;DP=128;Dels=0.00;FS=3.251;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.010;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1654,0,1006 chrXIII 904370 . C T 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.819;DP=118;Dels=0.00;FS=10.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.569;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:1076,0,1438 chrXIII 904506 . T C 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.116;DP=172;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=2.5916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.338;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,88:172:99:1787,0,1840 chrXIII 904744 . A C 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.476;DP=104;Dels=0.00;FS=1.591;HaplotypeScore=2.9798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:999,0,1276 chrXIII 904920 . C T 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4076,397,0 chrXIII 905085 . C T 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.85;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3329,328,0 chrXIII 905328 . T G 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.963;DP=93;Dels=0.02;FS=3.940;HaplotypeScore=11.4940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.328;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1046,0,818 chrXIII 905375 . A G 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.544;DP=89;Dels=0.00;FS=4.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.654;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:848,0,1115 chrXIII 905463 . G T 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.942;DP=102;Dels=0.00;FS=5.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.508;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:1006,0,1263 chrXIII 905531 . T C 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2736,282,0 chrXIII 905771 . A G 4653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=1;QD=25.15;SB=-2.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4653,463,0 chrXIII 905852 . A G 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3127,333,0 chrXIII 905893 . A T 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3811,373,0 chrXIII 905943 . A G 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=25.92;ReadPosRankSum=1.248;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3706,367,0 chrXIII 906041 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.679;DP=118;Dels=0.00;FS=2.389;HaplotypeScore=59.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.286;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:118:99:1170,0,1325 chrXIII 906187 . G A 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;DP=120;Dels=0.00;FS=3.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=27.88;ReadPosRankSum=1.386;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3346,348,0 chrXIII 906242 . G C 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3293,339,0 chrXIII 906340 . G A 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3136,315,0 chrXIII 906416 . A G 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3672,361,0 chrXIII 906456 . C T 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3920,382,0 chrXIII 906551 . G A 4511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.54;SB=-2.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4511,418,0 chrXIII 906678 . C T 4496.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4496,457,0 chrXIII 906771 . A G 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3204,339,0 chrXIII 906784 . T C 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3127,318,0 chrXIII 906817 . G A 4101.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.964e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4101,394,0 chrXIII 907148 . G A 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.051;DP=166;Dels=0.00;FS=5.798;HaplotypeScore=4.7047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1815,0,1757 chrXIII 907438 . A G 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3258,336,0 chrXIII 907465 . T C 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3080,321,0 chrXIII 907467 . G C 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3154,327,0 chrXIII 907585 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.042;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.325;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1199,0,1448 chrXIII 907669 . T C 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.491;DP=155;Dels=0.00;FS=6.859;HaplotypeScore=2.9816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.258;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,78:155:99:1601,0,1640 chrXIII 907700 . T C 3766.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.78;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3766,382,0 chrXIII 907728 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.209;DP=131;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1284,0,1512 chrXIII 907830 . G A 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.398;DP=163;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,77:163:99:1633,0,1877 chrXIII 907907 . G A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.596;DP=125;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.722;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1517,0,1162 chrXIII 907951 . T A 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.445;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.123;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1448,0,1151 chrXIII 907958 . A G 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.388;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=1.829;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.970;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1496,0,1277 chrXIII 907995 . C G 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;DP=143;Dels=0.00;FS=3.001;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQ0=0;MQRankSum=3.866;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1558,0,1418 chrXIII 908020 . T C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.429;DP=138;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.612;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1438,0,1510 chrXIII 908047 . T C 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.32;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3652,369,0 chrXIII 908064 . C T 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.854;DP=145;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQ0=0;MQRankSum=3.267;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.938;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1747,0,1332 chrXIII 908105 . T C 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.82;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3357,357,0 chrXIII 908130 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.033;DP=115;Dels=0.00;FS=18.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.53;MQ0=0;MQRankSum=4.195;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1071,0,1187 chrXIII 908138 . C T 2547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.52;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2580,267,0 chrXIII 908143 . A G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;DP=99;Dels=0.00;FS=10.205;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.876;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.992;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,54:99:99:1060,0,837 chrXIII 908149 . A G 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.952;DP=93;Dels=0.00;FS=8.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.08;MQ0=0;MQRankSum=-4.945;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.088;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:919,0,746 chrXIII 908160 . C T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.428;DP=73;Dels=0.00;FS=1.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.851;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.437;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,45:73:99:895,0,386 chrXIII 908174 . G T 441 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.50;MQ0=0;QD=10.26;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:60:474,60,0 chrXIII 908175 . T C 439 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.84;MQ0=0;QD=10.45;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:60:472,60,0 chrXIII 908177 . A G 463 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=14.03;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:63:496,63,0 chrXIII 908179 . T A,G 385.04 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.67;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,23,10:33:48:445,99,48,347,0,335 chrXIII 908185 . A G 101.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.192;DP=37;Dels=0.00;FS=6.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.74;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.779;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:131,0,441 chrXIII 908192 . T C 635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9371;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.13;MQ0=0;QD=19.24;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:72:668,72,0 chrXIII 908196 . G T 482.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.24;MQ0=0;QD=16.07;SB=-1.652e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:30:54:515,54,0 chrXIII 908215 . G A 110.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=6.47;ReadPosRankSum=3.367;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:82:140,0,82 chrXIII 908218 . C T 222.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.93;MQ0=0;QD=13.88;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:27:255,27,0 chrXIII 908221 . G A 111.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.377;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.20;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.798;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:52:141,0,52 chrXIII 908306 . T G 182.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;DP=15;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=12.13;ReadPosRankSum=2.093;SB=-1.369e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:47:212,0,47 chrXIII 908310 . C T 202.54 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;DP=10;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.393;SB=-7.141e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:4:233,4,0 chrXIII 908311 . A T 228.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=25.33;SB=-8.289e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:261,27,0 chrXIII 908314 . T C 217.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=24.11;SB=-7.789e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:250,27,0 chrXIII 908319 . C T 220.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=24.45;SB=-8.089e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:253,27,0 chrXIII 908322 . T C 215.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=23.89;SB=-7.589e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:248,27,0 chrXIII 908323 . G A 228.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=25.33;SB=-7.889e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:261,27,0 chrXIII 908376 . T C 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:54,6,0 chrXIII 908390 . G T 27.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:59,6,0 chrXIII 908391 . T C 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:57,6,0 chrXIII 908401 . A G 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.358;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:56,6,0 chrXIII 908414 . T G 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:55,6,0 chrXIII 908418 . C T 27.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:59,6,0 chrXIII 908419 . A T 27.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.94;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:4:6:59,6,0 chrXIII 908422 . T C 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:58,6,0 chrXIII 908430 . T C 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:53,6,0 chrXIII 908431 . G A 28.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.19;ReadPosRankSum=1.026;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:60,6,0 chrXIII 908455 . A G 38.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.99;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 chrXIII 908473 . G A 113.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.36;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.736;SB=3.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:15:146,15,0 chrXIII 908527 . A G 153.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.17;MQ0=0;QD=21.87;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:186,21,0 chrXIII 908534 . T G 107.27 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:9:137,0,9 chrXIII 908535 . C T 120.34 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:8:150,0,8 chrXIII 908562 . C T 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.736;SB=1.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:58,6,0 chrXIII 908563 . A T 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.92;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:58,6,0 chrXIII 908566 . T C 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=3.11;SB=-2.864e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:53,6,0 chrXIII 908574 . T C 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.495;SB=1.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:53,6,0 chrXIII 908575 . G A 24.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-2.759e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:6:56,6,0 chrXIII 908645 . A G 160.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.56;MQ0=0;QD=7.28;SB=-1.311e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:21:193,21,0 chrXIII 908658 . T C 509 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.90;MQ0=0;QD=10.60;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:60:542,60,0 chrXIII 908660 . T C 531 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.59;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.247;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:60:564,60,0 chrXIII 908666 . G T 394.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.993;DP=59;Dels=0.00;FS=5.470;HaplotypeScore=4.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.155;QD=6.68;ReadPosRankSum=3.781;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,34:59:99:424,0,216 chrXIII 908678 . C G,T 1127.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=42.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.602;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,47,32:80:99:1187,456,363,732,0,678 chrXIII 908679 . T C 324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;DP=82;Dels=0.00;FS=4.590;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.06;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=3.95;ReadPosRankSum=-1.929;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:354,0,766 chrXIII 908689 . G A 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.402;DP=97;Dels=0.00;FS=6.764;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=8.60;ReadPosRankSum=2.793;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:864,0,580 chrXIII 908715 . T C 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.335;DP=121;Dels=0.00;FS=15.685;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQ0=1;MQRankSum=3.055;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.787;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:891,0,1191 chrXIII 908835 . C T 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=28.42;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3159,316,0 chrXIII 908906 . A T 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3640,355,0 chrXIII 908913 . G A 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3627,352,0 chrXIII 908985 . A G 4119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.466;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=24.37;ReadPosRankSum=1.076;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,168:169:99:4119,411,0 chrXIII 909413 . G A 3918.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.30;SB=-2.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3918,394,0 chrXIII 909483 . G C 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0466;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3078,321,0 chrXIII 909772 . A C 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3885,405,0 chrXIII 909781 . G C 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=25.95;ReadPosRankSum=1.264;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3840,402,0 chrXIII 909807 . G C 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:3877,387,0 chrXIII 909850 . C T 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3024,294,0 chrXIII 909879 . A G 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2933,300,0 chrXIII 909953 . C G 3973.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3973,417,0 chrXIII 910379 . G A 625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.363;DP=187;Dels=0.00;FS=21.589;HaplotypeScore=4.3365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-3.402;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,50:187:99:655,0,2772 chrXIII 910409 . C A 231.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.415;DP=163;Dels=0.00;FS=12.204;HaplotypeScore=4.3338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-5.174;QD=1.42;ReadPosRankSum=-5.208;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,32:163:99:261,0,2977 chrXIII 910413 . G C 73.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;DP=164;Dels=0.00;FS=11.030;HaplotypeScore=9.4508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=-4.509;QD=0.45;ReadPosRankSum=-4.549;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,27:164:99:103,0,3095 chrXIII 910415 . A G 66.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.066;DP=159;Dels=0.00;FS=9.232;HaplotypeScore=9.0334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-5.256;QD=0.42;ReadPosRankSum=-4.697;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,26:159:96:96,0,3175 chrXIII 910543 . T C 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2827,306,0 chrXIII 910574 . A G 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.570;DP=118;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.052;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1447,0,937 chrXIII 910629 . G A 3658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3658,352,0 chrXIII 910733 . C T 4015.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4015,391,0 chrXIII 910814 . G A 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3460;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3383,337,0 chrXIII 910852 . T C 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.27;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2923,286,0 chrXIII 910869 . T C 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8575;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.55;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2767,282,0 chrXIII 910955 . A T 3810.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.41;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3810,379,0 chrXIII 911350 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.040;DP=129;Dels=0.00;FS=9.564;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=10.56;ReadPosRankSum=2.381;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1392,0,1351 chrXIII 911382 . A T 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3304,328,0 chrXIII 911502 . T C 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2956,294,0 chrXIII 911896 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.191;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=1;MQRankSum=0.527;QD=11.74;ReadPosRankSum=2.072;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1592,0,1274 chrXIII 911901 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.980;DP=134;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=-0.111;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.196;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1218,0,1693 chrXIII 912021 . T C 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3159,321,0 chrXIII 912048 . G A 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=26.27;ReadPosRankSum=0.551;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3389,307,0 chrXIII 912213 . C G 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2704,276,0 chrXIII 912216 . T G 2675 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2708,276,0 chrXIII 912263 . T C 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2689,282,0 chrXIII 912293 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.088;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1224,0,1330 chrXIII 912411 . A G 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2798,297,0 chrXIII 912463 . C G 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3149,327,0 chrXIII 912504 . A G 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3155,309,0 chrXIII 912626 . C T 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3346,325,0 chrXIII 912804 . A G 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3197,321,0 chrXIII 912879 . G A 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3320,325,0 chrXIII 913190 . G A 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3848,379,0 chrXIII 913206 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.957;DP=145;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.743;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.929;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1475,0,1579 chrXIII 913218 . A G 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.314;DP=152;Dels=0.00;FS=3.053;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.430;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1616,0,1608 chrXIII 913429 . G A 4079.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4079,415,0 chrXIII 913447 . A G 4244.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.72;SB=-2.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4244,450,0 chrXIII 913525 . T C 3943.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3943,399,0 chrXIII 913531 . A G 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:4011,400,0 chrXIII 913648 . A G 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3261,336,0 chrXIII 913692 . C T 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3314,322,0 chrXIII 913888 . G A 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3682,364,0 chrXIII 914143 . A G 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3612,364,0 chrXIII 914575 . T C 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8930;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3449,348,0 chrXIII 914895 . A T 3271.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3271,328,0 chrXIII 914897 . T C 848.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.914;DP=135;Dels=0.00;FS=2.715;HaplotypeScore=2.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.285;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,50:135:99:878,0,1692 chrXIII 914898 . C A 1692.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.630;DP=136;Dels=0.00;FS=2.682;HaplotypeScore=2.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,85:136:99:1722,0,946 chrXIII 915128 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.901;DP=154;Dels=0.00;FS=4.888;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.392;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.066;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,63:154:99:1044,0,1846 chrXIII 915182 . A G 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.858e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3793,387,0 chrXIII 915420 . A C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.161;DP=147;Dels=0.00;FS=4.896;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.281;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1451,0,1649 chrXIII 915435 . A T 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.570;DP=148;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1552,0,1547 chrXIII 915971 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.313;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.262;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1305,0,1242 chrXIII 916788 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.614;DP=145;Dels=0.00;FS=7.661;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.032;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1382,0,1651 chrXIII 916854 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.352;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.163;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1392,0,1358 chrXIII 916879 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.924;DP=141;Dels=0.00;FS=7.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=9.77;ReadPosRankSum=-2.145;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1408,0,1446 chrXIII 916916 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3266,316,0 chrXIII 917195 . G C 2512 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2545,270,0 chrXIII 917386 . T C 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.015;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.12;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=10.26;ReadPosRankSum=-2.208;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:953,0,885 chrXIII 917437 . C T 2640 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2673,258,0 chrXIII 917493 . C T 2312 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=24.86;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2345,231,0 chrXIII 917553 . A G 423.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.684;DP=119;Dels=0.00;FS=28.512;HaplotypeScore=75.4469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQ0=1;MQRankSum=-0.914;QD=3.55;ReadPosRankSum=-1.933;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,28:119:99:453,0,1875 chrXIII 917789 . C T 719 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.15;MQ0=1;QD=22.47;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:78:752,78,0 chrXIII 918260 . T C 186.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.55;MQ0=12;QD=8.46;SB=-7.891e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:24:219,24,0 chrXIII 918537 . G A 962 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.808;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.84;MQ0=12;MQRankSum=0.808;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.577;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,45:57:77:995,77,0 chrXIII 918675 . G A 344.05 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;DP=15;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=22.94;ReadPosRankSum=1.273;SB=-6.043e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:22:377,22,0 chrXIII 919196 . T C 44.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.16;MQ0=2;QD=7.50;SB=-2.621e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:77,9,0 chrXIII 919198 . G C 10.44 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.16;MQ0=2;MQRankSum=0.727;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.727;SB=-1.702e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:20:40,0,20 chrXIII 919217 . A C 16.13 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.11;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.736;SB=-2.202e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:21:46,0,21 chrXIII 919218 . G T 17.12 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.11;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.736;SB=-2.203e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:19:47,0,19 chrXIII 919225 . C T 26.77 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=13.39;SB=-2.776e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 chrXIII 919410 . C T 1156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.11;MQ0=0;QD=24.08;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1189,120,0 chrXIII 919632 . A G 1342.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.438;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.81;MQ0=14;MQRankSum=5.875;QD=13.69;ReadPosRankSum=-2.762;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,64:98:99:1372,0,324 chrXIII 919784 . G C 1582 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;DP=93;Dels=0.00;FS=9.692;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.68;MQ0=10;MQRankSum=3.899;QD=17.01;ReadPosRankSum=2.539;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,76:93:75:1615,75,0 chrXIII 920069 . G A 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.659;DP=144;Dels=0.00;FS=22.053;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.85;MQ0=44;MQRankSum=1.876;QD=0.14;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,24:144:50:50,0,1523 chrXIII 920111 . T C 65.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.649;DP=274;Dels=0.00;FS=5.226;HaplotypeScore=7.6050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.04;MQ0=24;MQRankSum=-1.351;QD=0.24;ReadPosRankSum=2.461;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,45:274:95:95,0,4303 chrXIII 920249 . G T 30.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.208;DP=175;Dels=0.00;FS=6.991;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.75;MQ0=68;MQRankSum=-2.726;QD=0.17;ReadPosRankSum=0.254;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,48:175:60:60,0,1015 chrXIII 921385 . A G 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.429;DP=44;Dels=0.00;FS=2.048;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.26;MQ0=22;MQRankSum=1.410;QD=1.14;ReadPosRankSum=1.254;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:80:80,0,296 chrXIII 921577 . G C 13.24 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.24;MQ0=60;MQRankSum=-0.747;QD=0.19;ReadPosRankSum=-0.747;SB=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:20:43,0,20 chrXIII 921768 . G C 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.78;MQ0=34;QD=0.58;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,25:36:6:52,6,0 chrXIII 921949 . A C 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 chrXIII 921982 . G A 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 chrXIII 922056 . G A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 chrXIII 922557 . T C 41.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.24;MQ0=0;QD=10.44;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:73,6,0 chrXIII 922599 . C A 128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.08;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-7.493e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:27:158,0,27 chrXIII 922667 . C T 14.18 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=7.09;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:3:44,3,0 chrXIII 923654 . T C 213.14 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=16;Dels=0.00;FS=6.368;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.18;MQ0=3;MQRankSum=0.761;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.930;SB=-1.305e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:12:243,0,12 chrXIII 923675 . C T 158.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.754;DP=34;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=15.5849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.46;MQ0=4;MQRankSum=0.043;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:188,0,344 chrXIII 923678 . G A 276.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;DP=37;Dels=0.00;FS=9.472;HaplotypeScore=14.5911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.41;MQ0=7;MQRankSum=1.590;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.758;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:306,0,220 chrXIII 923689 . A T 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;DP=40;Dels=0.00;FS=2.560;HaplotypeScore=9.9535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.58;MQ0=8;MQRankSum=0.519;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:67:67,0,503 chrXIII 923707 . G A 69.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;DP=41;Dels=0.00;FS=8.363;HaplotypeScore=17.6114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.44;MQ0=8;MQRankSum=-2.310;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.661;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:99,0,480 chrXIII 923708 . C G 144.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;DP=41;Dels=0.00;FS=8.501;HaplotypeScore=22.2793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.44;MQ0=8;MQRankSum=1.907;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.432;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,8:41:99:174,0,289 chrXIII 923710 . G A 274.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.513;DP=41;Dels=0.00;FS=12.234;HaplotypeScore=24.2698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.44;MQ0=8;MQRankSum=2.082;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.497;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:304,0,266 chrXIII 923712 . T C 680 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=24.2698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.44;MQ0=8;QD=16.59;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:72:713,72,0 chrXIII 923738 . G A 275.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;DP=40;Dels=0.00;FS=12.305;HaplotypeScore=6.9347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.29;MQ0=8;MQRankSum=2.609;QD=6.88;ReadPosRankSum=-2.225;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:305,0,278 chrXIII 923752 . T G 80.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.107;DP=29;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=6.9438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.25;MQ0=6;MQRankSum=1.837;QD=2.76;ReadPosRankSum=-2.439;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:110,0,224 chrXIII 923767 . A C 63.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.41;MQ0=4;QD=4.89;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:12:96,12,0 chrXIII 923778 . G A 88.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;DP=16;Dels=0.00;FS=6.264;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.67;MQ0=4;MQRankSum=2.637;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.000;SB=-1.422e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:47:118,0,47 chrXIII 923782 . A G 121.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.77;MQ0=1;QD=11.01;SB=-4.311e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:18:154,18,0 chrXIII 923809 . A G 406 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9639;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.97;MQ0=1;QD=17.65;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:48:439,48,0 chrXIII 923812 . A G 148.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.072;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.97;MQ0=1;MQRankSum=0.267;QD=6.44;ReadPosRankSum=2.137;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:178,0,173 chrXIII 923819 . C A,T 193.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;DP=23;Dels=0.00;FS=8.195;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=27.97;MQ0=1;MQRankSum=0.861;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.722;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,11,8:23:86:253,86,130,108,0,158 chrXIII 923874 . G C 195.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;DP=21;Dels=0.00;FS=12.381;HaplotypeScore=6.8542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.61;MQ0=2;MQRankSum=1.445;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.858;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:225,0,162 chrXIII 923875 . T C 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.61;MQ0=2;MQRankSum=-1.350;QD=1.86;ReadPosRankSum=-2.650;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:69:69,0,274 chrXIII 923891 . C A 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;DP=24;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=13.5311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.59;MQ0=1;MQRankSum=0.037;QD=0.79;ReadPosRankSum=-2.646;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:49:49,0,397 chrXIII 923905 . G A 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.756;DP=17;Dels=0.00;FS=9.961;HaplotypeScore=4.9798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.99;MQ0=2;MQRankSum=0.184;QD=2.71;ReadPosRankSum=-3.123;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:76:76,0,221 chrXIII 923915 . C A 64.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;DP=11;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.20;MQ0=2;MQRankSum=-1.881;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.307;SB=-9.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:88:94,0,88 chrXIII 923948 . A T 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.21;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.550;SB=-2.066e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,4:7:6:43,6,0 chrXIII 923969 . A G 14.91 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.02;MQ0=0;QD=2.98;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:46,6,0 chrXIII 924014 . A G 80.46 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.29;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.747;SB=-3.795e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:1:109,0,1 chrXIII 924033 . A G 97.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.19;MQ0=0;QD=13.88;SB=-4.263e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:130,18,0 chrXIII 924037 . G C 97.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.666;SB=-4.013e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:18:130,18,0 chrXIII 924039 . A G 97.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.179;SB=-4.013e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:18:130,18,0 chrXIII 924046 . G A 153.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.66;MQ0=0;QD=19.13;SB=-4.291e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:186,24,0 chrXIII 924092 . T C 67.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.14;MQ0=1;QD=9.64;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:100,12,0 chrXIII 924098 . A G 65.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.14;MQ0=1;QD=9.36;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:98,12,0 chrXIII 924136 . C G 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.72;MQ0=1;QD=3.01;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:43,6,0 chrXIII 924140 . A G 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.72;MQ0=1;QD=3.01;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:43,6,0 chrXIII 924324 . T G 27.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.62;MQ0=2;MQRankSum=-0.259;QD=1.93;ReadPosRankSum=0.583;SB=-1.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:57:57,0,83 chrXIII 924423 . T G 60.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.95;MQ0=3;MQRankSum=-0.555;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-6.536e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:51:90,0,51 chrXIV 6602 . C A 552 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.46;MQ0=8;QD=16.24;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,30:34:66:585,66,0 chrXIV 6603 . A G 549 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.87;MQ0=7;QD=16.64;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:66:582,66,0 chrXIV 6612 . T G 498 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=6;MQRankSum=-1.595;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,25:31:38:531,38,0 chrXIV 6705 . C A 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.94;MQ0=1;QD=4.96;SB=-2.880e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:56,6,0 chrXIV 6731 . G C 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.49;MQ0=1;QD=1.52;SB=-1.757e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:54,6,0 chrXIV 6765 . C T 105.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.73;MQ0=2;QD=4.58;SB=-2.927e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:15:138,15,0 chrXIV 6781 . C T 85.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.93;MQ0=3;MQRankSum=2.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=3.047;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:60:115,0,60 chrXIV 6786 . C T 55.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.814;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.54;MQ0=3;MQRankSum=2.636;QD=2.12;ReadPosRankSum=3.008;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:83:85,0,83 chrXIV 6788 . C T 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;DP=26;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=16.3883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.54;MQ0=3;MQRankSum=2.404;QD=1.50;ReadPosRankSum=1.603;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:69:69,0,89 chrXIV 6789 . A C 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;DP=27;Dels=0.04;FS=2.993;HaplotypeScore=18.3377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.30;MQ0=3;MQRankSum=2.992;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.984;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:71:71,0,87 chrXIV 6791 . C T 51.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.765;DP=28;Dels=0.00;FS=5.849;HaplotypeScore=18.5133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.08;MQ0=3;MQRankSum=2.633;QD=1.82;ReadPosRankSum=2.236;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:81:81,0,84 chrXIV 6792 . C T 61.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.366;DP=33;Dels=0.00;FS=6.914;HaplotypeScore=25.9920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.09;MQ0=3;MQRankSum=3.146;QD=1.85;ReadPosRankSum=3.234;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:89:91,0,89 chrXIV 6800 . T A 88.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;DP=37;Dels=0.00;FS=49.755;HaplotypeScore=37.0230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.20;MQ0=3;MQRankSum=-1.964;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-1.688e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:37:99:118,0,162 chrXIV 6807 . C T 91.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.932;DP=39;Dels=0.00;FS=39.749;HaplotypeScore=10.3846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.07;MQ0=4;MQRankSum=2.079;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.515;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:121,0,217 chrXIV 6818 . A T 372 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.07;MQ0=4;QD=9.54;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:42:405,42,0 chrXIV 6832 . T C 115.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;DP=39;Dels=0.00;FS=45.278;HaplotypeScore=8.8591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.45;MQ0=4;MQRankSum=2.505;QD=2.95;ReadPosRankSum=-2.932;SB=-6.451e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:145,0,191 chrXIV 6837 . T A 46.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.039;DP=39;Dels=0.00;FS=23.278;HaplotypeScore=8.8842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.94;MQ0=3;MQRankSum=3.359;QD=1.18;ReadPosRankSum=-3.479;SB=-6.518e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:39:76:76,0,205 chrXIV 6841 . C T 48.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.829;DP=35;Dels=0.00;FS=29.915;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.99;MQ0=3;MQRankSum=2.188;QD=1.37;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:78:78,0,200 chrXIV 6844 . C T 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;DP=35;Dels=0.00;FS=24.281;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.99;MQ0=3;MQRankSum=2.766;QD=1.23;ReadPosRankSum=-2.682;SB=-6.508e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:73:73,0,200 chrXIV 6848 . T C 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.856;DP=35;Dels=0.00;FS=24.281;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.99;MQ0=3;MQRankSum=2.473;QD=1.17;ReadPosRankSum=-1.970;SB=-6.512e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:71:71,0,203 chrXIV 6906 . G C 354 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;DP=26;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.77;MQ0=1;MQRankSum=0.551;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:42:387,42,0 chrXIV 6912 . C G 61.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;DP=28;Dels=0.00;FS=9.917;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.345;QD=2.18;ReadPosRankSum=3.478;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:91:91,0,246 chrXIV 6914 . G C 60.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;DP=28;Dels=0.00;FS=9.917;HaplotypeScore=9.8956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.823;QD=2.14;ReadPosRankSum=2.947;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:90:90,0,240 chrXIV 6924 . A G 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.85;MQ0=2;MQRankSum=-0.856;QD=0.58;ReadPosRankSum=1.161;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:52:52,0,409 chrXIV 7057 . T C 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.28;MQ0=3;QD=1.89;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:52,6,0 chrXIV 7189 . C T 93.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;DP=111;Dels=0.00;FS=19.673;HaplotypeScore=8.5973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.61;MQ0=49;MQRankSum=-1.921;QD=0.84;ReadPosRankSum=-3.332;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,26:111:99:123,0,587 chrXIV 7216 . T G 76.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.303;DP=105;Dels=0.00;FS=12.889;HaplotypeScore=7.6488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.56;MQ0=46;MQRankSum=-0.311;QD=0.72;ReadPosRankSum=1.667;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,13:105:99:106,0,709 chrXIV 7221 . C T 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.447;DP=108;Dels=0.00;FS=18.917;HaplotypeScore=2.7983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.67;MQ0=46;MQRankSum=-0.121;QD=1.08;ReadPosRankSum=1.504;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,21:108:99:147,0,707 chrXIV 7229 . C T 103.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;DP=117;Dels=0.00;FS=29.851;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.51;MQ0=47;MQRankSum=0.181;QD=0.88;ReadPosRankSum=2.296;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,14:117:99:133,0,851 chrXIV 7257 . C T 137.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.703;DP=100;Dels=0.00;FS=44.112;HaplotypeScore=5.3706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.79;MQ0=43;MQRankSum=1.394;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,16:100:99:167,0,503 chrXIV 7259 . G C 134.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;DP=99;Dels=0.00;FS=49.397;HaplotypeScore=5.3706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.78;MQ0=43;MQRankSum=1.325;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:99:99:164,0,489 chrXIV 7278 . T A 166.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;DP=87;Dels=0.00;FS=2.756;HaplotypeScore=4.4055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.85;MQ0=30;MQRankSum=2.419;QD=1.91;ReadPosRankSum=-1.159;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:196,0,484 chrXIV 7289 . C T 88.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.827;DP=70;Dels=0.00;FS=39.308;HaplotypeScore=19.0070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.42;MQ0=14;MQRankSum=0.732;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:118,0,539 chrXIV 7292 . A G 84.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;DP=67;Dels=0.00;FS=38.116;HaplotypeScore=16.3348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.72;MQ0=12;MQRankSum=0.269;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.046;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:114,0,544 chrXIV 7298 . C T 473.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;DP=68;Dels=0.00;FS=22.493;HaplotypeScore=20.0752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.49;MQ0=8;MQRankSum=-0.738;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,51:68:99:503,0,216 chrXIV 7346 . C T 387.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.999;DP=160;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=3.6070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.89;MQ0=48;MQRankSum=-2.875;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.831;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,48:160:99:417,0,994 chrXIV 7353 . T C 447.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;DP=174;Dels=0.00;FS=4.714;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.08;MQ0=49;MQRankSum=-2.827;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.772;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,49:174:99:477,0,1167 chrXIV 7357 . A G 446.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;DP=177;Dels=0.00;FS=4.534;HaplotypeScore=3.5144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.38;MQ0=49;MQRankSum=-3.524;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.616;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,52:177:99:476,0,1228 chrXIV 7368 . A T 394.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.238;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.22;MQ0=48;MQRankSum=-2.981;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.584;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,53:185:99:424,0,1325 chrXIV 7370 . T C 396.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.572;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.28;MQ0=48;MQRankSum=-2.877;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.239;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,53:183:99:426,0,1277 chrXIV 7493 . G A 20.05 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;DP=53;Dels=0.00;FS=15.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.13;MQ0=15;MQRankSum=0.701;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.901;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,6:53:50:50,0,151 chrXIV 7502 . C A 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;DP=49;Dels=0.00;FS=2.682;HaplotypeScore=2.8251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.98;MQ0=25;MQRankSum=1.100;QD=0.71;ReadPosRankSum=-0.433;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,6:49:47:65,0,47 chrXIV 7519 . C A 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;DP=62;Dels=0.00;FS=5.256;HaplotypeScore=7.4762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.37;MQ0=36;MQRankSum=0.882;QD=0.52;ReadPosRankSum=2.221;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,6:62:62:62,0,85 chrXIV 7522 . T C 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.662;DP=67;Dels=0.00;FS=18.524;HaplotypeScore=7.4762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.08;MQ0=41;MQRankSum=0.606;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.659;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:56:56,0,85 chrXIV 7541 . C T 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.845;DP=83;Dels=0.00;FS=5.863;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.20;MQ0=56;MQRankSum=-0.138;QD=0.40;ReadPosRankSum=1.632;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,7:83:63:63,0,85 chrXIV 7542 . G A 29.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.645;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.20;MQ0=56;MQRankSum=0.321;QD=0.35;ReadPosRankSum=1.546;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,6:83:59:59,0,85 chrXIV 7547 . T C 21.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;DP=88;Dels=0.00;FS=6.173;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.51;MQ0=59;MQRankSum=-0.382;QD=0.24;ReadPosRankSum=1.045;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,7:88:51:51,0,143 chrXIV 7553 . A G 37.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.940;DP=100;Dels=0.00;FS=17.712;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.39;MQ0=68;MQRankSum=-0.042;QD=0.37;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,9:100:67:67,0,140 chrXIV 7557 . C T 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;DP=102;Dels=0.00;FS=12.424;HaplotypeScore=3.7812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.68;MQ0=70;MQRankSum=-0.335;QD=0.42;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,9:102:73:73,0,140 chrXIV 7564 . T C 40.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.937;DP=106;Dels=0.00;FS=12.025;HaplotypeScore=2.8233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.46;MQ0=75;MQRankSum=-0.500;QD=0.38;ReadPosRankSum=-1.675;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,18:106:70:70,0,140 chrXIV 7622 . G A 30.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.625;DP=96;Dels=0.00;FS=35.448;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.17;MQ0=65;MQRankSum=0.525;QD=0.31;ReadPosRankSum=1.725;SB=-5.974e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,13:96:60:60,0,91 chrXIV 7628 . G C 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;DP=93;Dels=0.00;FS=17.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.11;MQ0=59;MQRankSum=0.520;QD=0.14;ReadPosRankSum=1.423;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,12:93:43:43,0,189 chrXIV 7631 . G C 16.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;DP=93;Dels=0.00;FS=17.198;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.15;MQ0=58;MQRankSum=0.503;QD=0.17;ReadPosRankSum=1.510;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,12:93:46:46,0,172 chrXIV 7639 . C T 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.503;DP=101;Dels=0.00;FS=13.869;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.12;MQ0=52;MQRankSum=1.312;QD=0.43;ReadPosRankSum=0.446;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,14:101:73:73,0,331 chrXIV 8034 . C A 176.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;DP=90;Dels=0.00;FS=29.644;HaplotypeScore=7.4599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.31;MQ0=56;MQRankSum=-0.035;QD=1.96;ReadPosRankSum=4.075;SB=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:90:99:206,0,206 chrXIV 8113 . A C 109.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;DP=212;Dels=0.00;FS=34.769;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.04;MQ0=170;MQRankSum=3.976;QD=0.51;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,25:212:99:139,0,375 chrXIV 8135 . T C 194.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;DP=227;Dels=0.00;FS=19.036;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.52;MQ0=192;MQRankSum=3.717;QD=0.85;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,34:227:99:224,0,152 chrXIV 8156 . T G 161.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.823;DP=174;Dels=0.00;FS=6.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.00;MQ0=146;MQRankSum=3.179;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.553;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,31:174:99:191,0,132 chrXIV 8158 . G T 177.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.574;DP=199;Dels=0.00;FS=9.717;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.57;MQ0=170;MQRankSum=3.135;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.855;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,32:199:99:207,0,157 chrXIV 8420 . C G 125.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.472;DP=204;Dels=0.00;FS=26.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.32;MQ0=175;MQRankSum=3.746;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-2.948e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,7:204:51:155,0,51 chrXIV 8426 . A C 95.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.344;DP=204;Dels=0.00;FS=22.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.09;MQ0=174;MQRankSum=3.655;QD=0.47;ReadPosRankSum=0.233;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,6:204:78:125,0,78 chrXIV 8430 . G A 106.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;DP=203;Dels=0.00;FS=22.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.10;MQ0=173;MQRankSum=3.603;QD=0.52;ReadPosRankSum=0.181;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,7:203:80:136,0,80 chrXIV 8432 . A G 87.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;DP=200;Dels=0.00;FS=23.895;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.19;MQ0=169;MQRankSum=3.725;QD=0.44;ReadPosRankSum=0.675;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,6:200:78:117,0,78 chrXIV 8433 . G A 94.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;DP=212;Dels=0.00;FS=24.293;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.06;MQ0=178;MQRankSum=3.727;QD=0.44;ReadPosRankSum=0.881;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,6:212:80:124,0,80 chrXIV 8434 . C A 99.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.546;DP=212;Dels=0.00;FS=24.293;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.06;MQ0=178;MQRankSum=3.591;QD=0.47;ReadPosRankSum=0.926;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,6:212:78:129,0,78 chrXIV 8437 . T G 109.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;DP=210;Dels=0.00;FS=24.293;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.09;MQ0=176;MQRankSum=3.637;QD=0.52;ReadPosRankSum=1.062;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,6:210:81:139,0,81 chrXIV 8444 . T G 58.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;DP=219;Dels=0.00;FS=15.839;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.46;MQ0=184;MQRankSum=3.137;QD=0.26;ReadPosRankSum=2.048;SB=-2.501e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,4:219:84:88,0,84 chrXIV 8445 . T A 54.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.844;DP=218;Dels=0.00;FS=15.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.59;MQ0=182;MQRankSum=3.146;QD=0.25;ReadPosRankSum=1.888;SB=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,4:218:84:84,0,105 chrXIV 8446 . T G 50.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.844;DP=218;Dels=0.00;FS=15.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.59;MQ0=182;MQRankSum=2.844;QD=0.23;ReadPosRankSum=1.636;SB=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,4:218:80:80,0,106 chrXIV 8451 . A C 58.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.812;DP=216;Dels=0.00;FS=15.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.64;MQ0=179;MQRankSum=3.155;QD=0.27;ReadPosRankSum=1.834;SB=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,4:216:88:88,0,103 chrXIV 8458 . T G 47.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.217;DP=230;Dels=0.00;FS=15.386;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.59;MQ0=191;MQRankSum=3.032;QD=0.20;ReadPosRankSum=1.412;SB=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,4:230:77:77,0,131 chrXIV 8460 . A C 53.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;DP=223;Dels=0.00;FS=14.433;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.49;MQ0=186;MQRankSum=2.959;QD=0.24;ReadPosRankSum=0.905;SB=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,4:223:83:83,0,127 chrXIV 8467 . C T 108.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.238;DP=205;Dels=0.00;FS=4.270;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.87;MQ0=166;MQRankSum=3.834;QD=0.53;ReadPosRankSum=1.538;SB=-3.768e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,9:205:94:138,0,94 chrXIV 8536 . T G 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.49;MQ0=139;MQRankSum=2.917;QD=0.15;ReadPosRankSum=0.854;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,18:170:55:55,0,84 chrXIV 8563 . G T 58.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.708;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.10;MQ0=154;MQRankSum=0.142;QD=0.32;ReadPosRankSum=1.953;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,37:179:59:88,0,59 chrXIV 8573 . C T 30.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;DP=184;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=8.8955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.36;MQ0=166;MQRankSum=-0.755;QD=0.16;ReadPosRankSum=0.844;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,35:184:60:60,0,62 chrXIV 8574 . T G 29.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;DP=182;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=10.8702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.39;MQ0=164;MQRankSum=2.251;QD=0.16;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,17:182:59:59,0,62 chrXIV 8657 . G A 16.11 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.020;DP=225;Dels=0.00;FS=2.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.64;MQ0=199;MQRankSum=1.102;QD=0.07;ReadPosRankSum=2.452;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,5:225:46:46,0,192 chrXIV 8680 . T G 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.294;DP=198;Dels=0.00;FS=5.045;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.14;MQ0=152;MQRankSum=1.501;QD=0.11;ReadPosRankSum=0.448;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,7:198:52:52,0,105 chrXIV 8754 . A G 817 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;DP=82;Dels=0.00;FS=3.815;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.46;MQ0=17;MQRankSum=-1.732;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.986;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,77:82:96:850,96,0 chrXIV 8815 . A C 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.89;MQ0=12;QD=0.99;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:6:52,6,0 chrXIV 8818 . T C 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.64;MQ0=13;QD=0.95;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:6:52,6,0 chrXIV 8867 . G A 19.81 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.608;DP=39;Dels=0.00;FS=34.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.43;MQ0=25;MQRankSum=0.715;QD=0.51;ReadPosRankSum=2.285;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,8:39:6:51,6,0 chrXIV 8986 . A G 390 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.19;MQ0=21;QD=7.65;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,48:51:45:423,45,0 chrXIV 9010 . T C 345.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;DP=76;Dels=0.00;FS=107.949;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.64;MQ0=37;MQRankSum=4.493;QD=4.54;ReadPosRankSum=2.127;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:43:375,0,43 chrXIV 9014 . T G 343.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.877;DP=85;Dels=0.00;FS=100.268;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.97;MQ0=44;MQRankSum=4.610;QD=4.04;ReadPosRankSum=2.062;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:42:373,0,42 chrXIV 9017 . T C 335.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;DP=85;Dels=0.00;FS=96.928;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.97;MQ0=45;MQRankSum=5.089;QD=3.94;ReadPosRankSum=2.243;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:43:365,0,43 chrXIV 9019 . A C 326.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;DP=91;Dels=0.00;FS=95.470;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.64;MQ0=46;MQRankSum=4.807;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.796;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:91:43:356,0,43 chrXIV 9022 . G A 326.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;DP=92;Dels=0.00;FS=95.470;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.56;MQ0=47;MQRankSum=4.807;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.054;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:42:356,0,42 chrXIV 9376 . C A 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.24;MQ0=5;QD=0.42;SB=-2.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:6:50,6,0 chrXIV 9529 . A T 1922 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.84;MQ0=104;QD=9.86;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:1955,204,0 chrXIV 9651 . C T 2522 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;DP=131;Dels=0.00;FS=41.981;HaplotypeScore=10.7211;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.98;MQ0=8;MQRankSum=3.078;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,113:131:99:2555,198,0 chrXIV 9656 . G A 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=135;Dels=0.00;FS=5.895;HaplotypeScore=10.7211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.03;MQ0=11;MQRankSum=-2.375;QD=0.13;ReadPosRankSum=-1.926;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,30:135:47:47,0,2070 chrXIV 9662 . G A 300.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.987;DP=155;Dels=0.00;FS=21.303;HaplotypeScore=2.8248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.19;MQ0=16;MQRankSum=-2.285;QD=1.94;ReadPosRankSum=-4.315;SB=-8.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,51:155:99:330,0,2013 chrXIV 9739 . A G 685.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.073;DP=144;Dels=0.00;FS=39.186;HaplotypeScore=19.3451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.39;MQ0=72;MQRankSum=3.980;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.159;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:715,0,421 chrXIV 9744 . A G 244.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.792;DP=149;Dels=0.00;FS=13.393;HaplotypeScore=18.3479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.97;MQ0=77;MQRankSum=2.230;QD=1.64;ReadPosRankSum=0.202;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,36:149:99:274,0,847 chrXIV 9863 . G C 98.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.992;DP=161;Dels=0.00;FS=0.973;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.53;MQ0=53;MQRankSum=0.359;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,24:161:99:128,0,1738 chrXIV 9913 . T C 3375.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.862;DP=235;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.81;MQ0=31;MQRankSum=6.579;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.121;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,170:235:99:3375,0,429 chrXIV 9930 . A G 294.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;DP=240;Dels=0.00;FS=8.591;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.61;MQ0=27;MQRankSum=-7.563;QD=1.23;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,64:240:99:324,0,3906 chrXIV 9970 . C T 3912.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;DP=264;Dels=0.00;FS=2.857;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.47;MQ0=34;MQRankSum=4.903;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,187:264:99:3912,0,591 chrXIV 10004 . C T 3319.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;DP=251;Dels=0.00;FS=3.752;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.98;MQ0=35;MQRankSum=2.181;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.779;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,175:251:99:3319,0,812 chrXIV 10105 . A G 3076.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;DP=283;Dels=0.00;FS=15.838;HaplotypeScore=2.6984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.39;MQ0=15;MQRankSum=-1.347;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.353;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,157:283:99:3106,0,2299 chrXIV 10172 . G A 966.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.010;DP=166;Dels=0.00;FS=38.773;HaplotypeScore=6.1444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.91;MQ0=28;MQRankSum=3.452;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,72:166:99:996,0,1500 chrXIV 10441 . A G 469.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.946;DP=217;Dels=0.00;FS=73.924;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.96;MQ0=55;MQRankSum=-0.204;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,65:217:99:499,0,2460 chrXIV 10478 . A C 1097.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.567;DP=236;Dels=0.00;FS=14.627;HaplotypeScore=2.7476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.86;MQ0=56;MQRankSum=2.646;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,92:236:99:1127,0,2163 chrXIV 10567 . A G 1776.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.998;DP=250;Dels=0.00;FS=5.376;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQ0=15;MQRankSum=-4.198;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,107:250:99:1806,0,2874 chrXIV 10574 . A C 1575.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.761;DP=234;Dels=0.00;FS=5.648;HaplotypeScore=4.5438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.08;MQ0=16;MQRankSum=-2.703;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.571;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,99:234:99:1605,0,2588 chrXIV 10660 . T C 341.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.609;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.57;MQ0=36;MQRankSum=-0.142;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.424;SB=-1.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:371,0,753 chrXIV 10683 . T C 559.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.530;DP=174;Dels=0.00;FS=5.239;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.53;MQ0=29;MQRankSum=-2.793;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.070;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,63:174:99:589,0,1839 chrXIV 10694 . T C 747.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.793;DP=218;Dels=0.00;FS=5.391;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.01;MQ0=25;MQRankSum=-3.483;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.300;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,76:218:99:777,0,2652 chrXIV 10708 . A G 1031.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.155;DP=246;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.17;MQ0=21;MQRankSum=-3.592;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.054;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,87:246:99:1061,0,3071 chrXIV 10817 . C A 492.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.265;DP=207;Dels=0.00;FS=26.706;HaplotypeScore=5.4552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.47;MQ0=14;MQRankSum=-4.283;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,53:207:99:522,0,3429 chrXIV 10975 . G T 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.612;DP=232;Dels=0.00;FS=1.310;HaplotypeScore=135.7518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.96;MQ0=11;MQRankSum=-5.653;QD=0.06;ReadPosRankSum=0.960;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,50:232:43:43,0,3637 chrXIV 10981 . C T 2377.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.958;DP=236;Dels=0.00;FS=16.465;HaplotypeScore=140.5341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.55;MQ0=11;MQRankSum=1.889;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,124:236:99:2407,0,1455 chrXIV 10984 . C G 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.281;DP=231;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=141.5612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.26;MQ0=11;MQRankSum=-5.608;QD=0.06;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,53:231:43:43,0,3630 chrXIV 11007 . C G 426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.666;DP=260;Dels=0.00;FS=6.170;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.20;MQ0=1;MQRankSum=-4.018;QD=1.64;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,67:260:99:456,0,4229 chrXIV 11046 . G A 923.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.641;DP=270;Dels=0.00;FS=1.124;HaplotypeScore=5.3404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.23;MQ0=15;MQRankSum=-2.241;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.451;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,83:270:99:953,0,3801 chrXIV 11193 . G A 651.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.518;DP=247;Dels=0.00;FS=22.904;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.89;MQ0=54;MQRankSum=-0.973;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.196;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,82:247:99:681,0,2240 chrXIV 11289 . G A 203.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.784;DP=164;Dels=0.00;FS=19.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.75;MQ0=75;MQRankSum=-1.317;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.670;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,57:164:99:233,0,789 chrXIV 11336 . T C 189.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;DP=164;Dels=0.00;FS=37.612;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.73;MQ0=75;MQRankSum=-2.323;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,57:164:99:219,0,795 chrXIV 11348 . C G 484.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.280;DP=150;Dels=0.00;FS=14.209;HaplotypeScore=9.7739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.38;MQ0=60;MQRankSum=-0.921;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:514,0,639 chrXIV 11354 . T C 401.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.775;DP=153;Dels=0.00;FS=50.090;HaplotypeScore=9.8514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.64;MQ0=58;MQRankSum=-0.915;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.786;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,57:153:99:431,0,872 chrXIV 11518 . C T 615.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.919;DP=182;Dels=0.00;FS=31.918;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.50;MQ0=77;MQRankSum=-0.407;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.311;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,89:182:99:645,0,683 chrXIV 11528 . G A 81.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.561;DP=152;Dels=0.00;FS=46.531;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.17;MQ0=82;MQRankSum=-2.340;QD=0.53;ReadPosRankSum=0.419;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:111,0,461 chrXIV 11529 . G A 77.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.036;DP=153;Dels=0.00;FS=46.531;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.12;MQ0=83;MQRankSum=-1.208;QD=0.50;ReadPosRankSum=0.253;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:107,0,468 chrXIV 11758 . T C 964 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.121;DP=125;Dels=0.00;FS=12.018;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.59;MQ0=65;MQRankSum=2.707;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.990;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,82:125:42:997,42,0 chrXIV 11976 . T A 239.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;DP=181;Dels=0.00;FS=47.309;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.10;MQ0=153;MQRankSum=-1.428;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.764;SB=-3.015e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,81:181:83:269,0,83 chrXIV 11985 . C T 165.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.238;DP=164;Dels=0.00;FS=47.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.20;MQ0=139;MQRankSum=-1.664;QD=1.01;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-3.000e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,72:164:99:195,0,116 chrXIV 12034 . G A 112.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.272;DP=155;Dels=0.00;FS=36.553;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.77;MQ0=132;MQRankSum=-3.139;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,68:155:99:142,0,169 chrXIV 12174 . T C 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.980;DP=163;Dels=0.01;FS=80.231;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.34;MQ0=128;MQRankSum=-3.653;QD=0.23;ReadPosRankSum=-0.960;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,70:162:67:67,0,412 chrXIV 12185 . C T 58.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.904;DP=174;Dels=0.00;FS=62.176;HaplotypeScore=2.6496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.26;MQ0=138;MQRankSum=-3.423;QD=0.33;ReadPosRankSum=-1.769;SB=-2.750e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,74:174:88:88,0,413 chrXIV 12373 . C T 34.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.690;DP=176;Dels=0.00;FS=15.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.26;MQ0=138;MQRankSum=-1.958;QD=0.19;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,59:176:64:64,0,595 chrXIV 12418 . G A 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.399;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.72;MQ0=135;MQRankSum=-1.750;QD=0.08;ReadPosRankSum=1.383;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,68:202:47:47,0,1140 chrXIV 12750 . C T 109.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;DP=167;Dels=0.00;FS=5.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.68;MQ0=86;MQRankSum=0.110;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,52:167:99:139,0,830 chrXIV 12751 . C T 110.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.039;DP=166;Dels=0.00;FS=5.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.73;MQ0=85;MQRankSum=1.108;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,52:166:99:140,0,828 chrXIV 12847 . T C 855.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;DP=244;Dels=0.00;FS=14.470;HaplotypeScore=4.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.72;MQ0=68;MQRankSum=-0.227;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.996;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,79:244:99:885,0,2408 chrXIV 12862 . G A 902.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.840;DP=229;Dels=0.00;FS=6.606;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.68;MQ0=37;MQRankSum=-1.715;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.431;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,79:229:99:932,0,2607 chrXIV 12900 . G A 1054.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.815;DP=234;Dels=0.00;FS=8.404;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.17;MQ0=13;MQRankSum=-0.968;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.283;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,75:234:99:1084,0,3053 chrXIV 12930 . G A 694.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.946;DP=169;Dels=0.00;FS=17.320;HaplotypeScore=5.1325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.88;MQ0=5;MQRankSum=0.103;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.956;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,52:169:99:724,0,2094 chrXIV 12941 . A G 336.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.228;DP=122;Dels=0.00;FS=3.438;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.76;MQ0=5;MQRankSum=-0.975;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,34:122:99:366,0,1506 chrXIV 12971 . A G 158.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.762;DP=72;Dels=0.00;FS=23.235;HaplotypeScore=35.5008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.82;MQ0=7;MQRankSum=0.330;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:188,0,584 chrXIV 12987 . G T 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.370;DP=84;Dels=0.00;FS=56.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.88;MQ0=22;MQRankSum=-0.844;QD=0.51;ReadPosRankSum=-5.911;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:73:73,0,361 chrXIV 13008 . G A 76.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.244;DP=67;Dels=0.00;FS=22.253;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.56;MQ0=26;MQRankSum=-1.256;QD=1.13;ReadPosRankSum=1.560;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:106,0,322 chrXIV 13011 . C T 131.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;DP=75;Dels=0.00;FS=28.693;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.08;MQ0=28;MQRankSum=-0.339;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.105;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:161,0,338 chrXIV 13748 . T A 100.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;DP=136;Dels=0.00;FS=40.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.02;MQ0=117;MQRankSum=-1.342;QD=0.74;ReadPosRankSum=0.602;SB=-2.948e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,31:136:80:130,0,80 chrXIV 13845 . C G 317 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.59;MQ0=100;QD=2.46;SB=-8.000e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:39:350,39,0 chrXIV 13968 . T C 473 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.06;MQ0=19;QD=12.45;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:54:506,54,0 chrXIV 14062 . A G 1722 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.59;MQ0=9;QD=21.80;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1755,180,0 chrXIV 14155 . G A 373.76 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.183;DP=113;Dels=0.00;FS=28.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.33;MQ0=85;MQRankSum=3.396;QD=3.31;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-4.276e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:51,62:113:6:405,6,0 chrXIV 15245 . A C 14.18 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.87;MQ0=20;QD=0.53;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:27:3:44,3,0 chrXIV 15281 . C T 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.32;MQ0=33;MQRankSum=-0.656;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:99:147,0,160 chrXIV 15350 . T C 217 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.43;MQ0=41;QD=3.74;SB=-1.227e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:30:250,30,0 chrXIV 15432 . G A 829 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;DP=67;Dels=0.00;FS=3.076;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.03;MQ0=24;MQRankSum=-2.392;QD=12.37;ReadPosRankSum=2.333;SB=-4.014e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:67:44:862,44,0 chrXIV 15574 . G A 175.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.53;MQ0=3;QD=12.50;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:27:208,27,0 chrXIV 15593 . T A 262 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.92;MQ0=2;QD=16.37;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:16:36:295,36,0 chrXIV 15695 . C T 174.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;DP=35;Dels=0.00;FS=40.926;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.40;MQ0=18;MQRankSum=0.553;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-3.051e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:17:204,0,17 chrXIV 15696 . T C 172.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;DP=36;Dels=0.00;FS=45.028;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.66;MQ0=18;MQRankSum=0.272;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.543;SB=-3.051e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:17:202,0,17 chrXIV 15955 . C T 1625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.50;MQ0=0;QD=22.89;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:71:99:1658,165,0 chrXIV 15990 . T C 2015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.04;MQ0=0;QD=21.21;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2048,207,0 chrXIV 15992 . G C 2205 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.04;MQ0=0;QD=23.21;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2238,234,0 chrXIV 16090 . G A 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3149,321,0 chrXIV 16112 . C A 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.67;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3154,318,0 chrXIV 16225 . G T 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.15;MQ0=1;QD=23.89;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:2947,309,0 chrXIV 16321 . T C 3115 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8684;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=1;QD=22.57;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3148,327,0 chrXIV 16385 . T A 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.15;MQ0=1;QD=22.79;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3223,339,0 chrXIV 16410 . G T 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.561;DP=127;Dels=0.01;FS=18.673;HaplotypeScore=16.3524;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.12;MQ0=1;MQRankSum=2.883;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.446;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,119:126:99:2588,153,0 chrXIV 16421 . G A 2513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;DP=119;Dels=0.00;FS=3.352;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.509;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2546,267,0 chrXIV 16445 . T C 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.2839;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.03;MQ0=0;QD=21.31;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3059,318,0 chrXIV 16517 . C T 207.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.40;MQ0=4;MQRankSum=-2.989;QD=1.70;ReadPosRankSum=3.037;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,24:122:99:237,0,1713 chrXIV 16538 . G A 2053 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.14;MQ0=4;QD=17.40;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2086,219,0 chrXIV 16550 . G A 949.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.410;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.96;MQ0=4;MQRankSum=-0.669;QD=10.43;ReadPosRankSum=4.669;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,75:91:99:979,0,187 chrXIV 16553 . T A 887.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.060;DP=85;Dels=0.00;FS=3.009;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.82;MQ0=4;MQRankSum=-0.407;QD=10.44;ReadPosRankSum=3.798;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,73:85:99:917,0,100 chrXIV 16586 . A G 249 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.79;MQ0=1;QD=6.92;SB=-5.500e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:30:282,30,0 chrXIV 16595 . C T 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.78;MQ0=2;QD=1.39;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:9:82,9,0 chrXIV 16636 . C T 1427 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.72;MQ0=2;QD=21.30;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1460,153,0 chrXIV 16637 . G A 1404 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.72;MQ0=2;QD=20.96;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1437,153,0 chrXIV 16643 . A G 1407 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.12;MQ0=2;QD=20.10;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1440,156,0 chrXIV 16664 . A G 1509 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.400;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.42;MQ0=2;MQRankSum=0.400;QD=18.86;ReadPosRankSum=1.377;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:80:99:1542,141,0 chrXIV 16724 . G A 1733 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.275;DP=97;Dels=0.00;FS=5.300;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.37;MQ0=6;MQRankSum=1.868;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.920;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,93:97:99:1766,110,0 chrXIV 16733 . C T 1525 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;DP=88;Dels=0.00;FS=5.347;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.91;MQ0=6;MQRankSum=1.518;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,84:88:91:1558,91,0 chrXIV 16801 . T C 893 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6028;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.84;MQ0=6;MQRankSum=0.742;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.167;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,54:55:99:926,102,0 chrXIV 16869 . C T 85.64 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;DP=42;Dels=0.00;FS=6.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.62;MQ0=4;MQRankSum=-1.733;QD=2.04;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-2.039e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,41:42:5:115,0,5 chrXIV 17165 . C T 266 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.46;MQ0=2;QD=5.54;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:33:299,33,0 chrXIV 17207 . T C 1490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.53;MQ0=2;QD=18.86;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1523,165,0 chrXIV 17244 . G T 2160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.05;MQ0=2;QD=19.46;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2193,216,0 chrXIV 17342 . A G 2377 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.35;MQ0=0;QD=20.32;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2410,270,0 chrXIV 17370 . T A 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.52;MQ0=0;QD=23.20;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2840,288,0 chrXIV 17387 . T C 2261 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.63;MQ0=0;QD=22.39;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2294,240,0 chrXIV 17474 . G A 2672 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.23;MQ0=0;QD=21.90;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2705,276,0 chrXIV 17552 . A T 2751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;QD=25.95;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2784,282,0 chrXIV 17591 . C T 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.93;MQ0=0;QD=25.65;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3239,339,0 chrXIV 17598 . G C 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.09;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3399,342,0 chrXIV 17628 . T A 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.46;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3093,327,0 chrXIV 17657 . A G 2598 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.72;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2631,267,0 chrXIV 17694 . G A 127.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=228.4484;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.99;MQ0=0;QD=1.03;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:18:160,18,0 chrXIV 17773 . T C 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.96;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3538,384,0 chrXIV 17835 . A G 3960.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=23.86;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:166:99:3960,429,0 chrXIV 17899 . C A 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3469,334,0 chrXIV 17924 . G A 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3672,369,0 chrXIV 18046 . T C 4313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.51;SB=-2.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4313,468,0 chrXIV 18355 . T C 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=23.01;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3337,339,0 chrXIV 18574 . G A 4360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4360,442,0 chrXIV 18787 . C T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3354,336,0 chrXIV 18838 . C T 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3693,363,0 chrXIV 19036 . A G 4037.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4037,396,0 chrXIV 19321 . G A 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3797,385,0 chrXIV 19440 . A G 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3193,333,0 chrXIV 19517 . C T 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3113,318,0 chrXIV 19520 . T A 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3121,318,0 chrXIV 19703 . A G 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8703;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3855,402,0 chrXIV 19713 . C T 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.963e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3538,354,0 chrXIV 19742 . T C 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.388;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=24.77;ReadPosRankSum=1.594;SB=-1.777e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,150:153:99:3790,387,0 chrXIV 19886 . A C 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3291,345,0 chrXIV 19934 . G A 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3387,351,0 chrXIV 19955 . G A 3409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3409,346,0 chrXIV 19960 . G T 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=25.50;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3443,351,0 chrXIV 20018 . A G 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3439,360,0 chrXIV 20045 . A C 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=23.07;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2986,312,0 chrXIV 20114 . A G 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3322,339,0 chrXIV 20228 . C T 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3164,327,0 chrXIV 20332 . T C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2967,303,0 chrXIV 20559 . C T 2392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.45;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2425,255,0 chrXIV 20711 . A G 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3494,369,0 chrXIV 20915 . G A 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.88;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2694,282,0 chrXIV 20936 . G T 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2764,282,0 chrXIV 21401 . G A 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3730,393,0 chrXIV 21526 . C G 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.68;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3012,318,0 chrXIV 21612 . T C 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3058,318,0 chrXIV 21635 . T G 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8174;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=22.74;SB=-1.858e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3297,339,0 chrXIV 21701 . T C 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.81;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3539,363,0 chrXIV 21836 . A C 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3528,369,0 chrXIV 21949 . T C 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.63;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3058,318,0 chrXIV 21953 . A G 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.74;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3008,324,0 chrXIV 21965 . A G 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3378,345,0 chrXIV 22021 . T C 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3664,384,0 chrXIV 22090 . C T 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3246,339,0 chrXIV 22825 . A G 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3011,300,0 chrXIV 22855 . A G 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3438,339,0 chrXIV 22918 . G A 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2654,270,0 chrXIV 23134 . C G 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2972,300,0 chrXIV 23219 . T C 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=1;QD=23.62;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3009,306,0 chrXIV 23318 . G A 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.71;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3445,352,0 chrXIV 23451 . C T 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.27;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2765,285,0 chrXIV 23459 . G A 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.83;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2797,285,0 chrXIV 23495 . G A 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3987,426,0 chrXIV 23592 . C T 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.90;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3127,318,0 chrXIV 23613 . C T 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.47;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3027,318,0 chrXIV 23867 . G T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3285,339,0 chrXIV 23884 . T C 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2699,285,0 chrXIV 23905 . T A 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.596;DP=102;Dels=0.00;FS=3.751;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=23.89;ReadPosRankSum=1.291;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2470,264,0 chrXIV 24043 . C T 2258 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.83;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2291,240,0 chrXIV 24081 . A T 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=26.50;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2816,297,0 chrXIV 24221 . T C 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3223,327,0 chrXIV 24263 . T A 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3655,366,0 chrXIV 24285 . G A 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3520,349,0 chrXIV 24290 . C T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3378,342,0 chrXIV 24336 . C T 4013.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4013,411,0 chrXIV 24346 . C T 3931.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.466;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=26.38;ReadPosRankSum=0.520;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,146:149:99:3931,361,0 chrXIV 24416 . T C 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=2.259;QD=24.91;ReadPosRankSum=0.200;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,127:129:99:3247,319,0 chrXIV 24467 . C T 3452.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3452,345,0 chrXIV 24509 . T A 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3487,340,0 chrXIV 24575 . T C 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2699,294,0 chrXIV 24616 . G T 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.00;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2922,300,0 chrXIV 24641 . G A 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3118,315,0 chrXIV 24809 . T C 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3444,369,0 chrXIV 24857 . G T 2365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2398,246,0 chrXIV 24910 . G A 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2958,297,0 chrXIV 25123 . T C 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.68;MQ0=0;QD=24.52;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2485,276,0 chrXIV 25137 . G A 2445 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.04;MQ0=0;QD=24.95;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2478,267,0 chrXIV 25142 . T C 2370 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.73;MQ0=0;QD=24.18;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2403,270,0 chrXIV 25157 . G A 2254 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.96;MQ0=0;QD=23.48;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2287,252,0 chrXIV 25167 . A T 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.50;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2586,282,0 chrXIV 25197 . A G 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.97;MQ0=1;QD=23.72;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2642,297,0 chrXIV 25340 . C T 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.92;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3595,363,0 chrXIV 25369 . T C 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.10;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3212,327,0 chrXIV 25389 . A G 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3416,357,0 chrXIV 25410 . A C 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.65;MQ0=0;QD=23.64;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3225,345,0 chrXIV 25427 . A G 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.91;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3589,399,0 chrXIV 25436 . C T 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3095,330,0 chrXIV 25528 . T C 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3027,312,0 chrXIV 25559 . G T 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.00;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3138,321,0 chrXIV 25651 . T C 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3188,324,0 chrXIV 25739 . G T 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.745e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3476,348,0 chrXIV 25764 . G T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3266,325,0 chrXIV 25800 . C T 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3221,325,0 chrXIV 25936 . C T 2665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2698,279,0 chrXIV 26041 . A T 4145.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:161:99:4145,430,0 chrXIV 26085 . T C 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=23.21;SB=-2.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3713,402,0 chrXIV 26102 . C T 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3411,363,0 chrXIV 26378 . T C 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7959;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3926,417,0 chrXIV 26408 . G A 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5230;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3242,336,0 chrXIV 26480 . C T 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3564,369,0 chrXIV 26624 . C T 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.32;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2803,294,0 chrXIV 26669 . A G 1433 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.097;DP=65;Dels=0.00;FS=10.119;HaplotypeScore=5.6991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.22;MQ0=1;MQRankSum=2.254;QD=22.05;ReadPosRankSum=-1.784;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,61:65:99:1466,168,0 chrXIV 26675 . T C 1729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.947;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.64;MQ0=1;MQRankSum=1.455;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.594;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:76:99:1762,189,0 chrXIV 26681 . C T 1702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.06;MQ0=2;QD=23.32;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1735,177,0 chrXIV 26744 . G T 2398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.141;DP=156;Dels=0.00;FS=10.131;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQ0=2;MQRankSum=2.388;QD=15.37;ReadPosRankSum=3.904;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,116:156:99:2428,0,378 chrXIV 26783 . G A 2213.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.731;DP=179;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=4;MQRankSum=1.330;QD=12.36;ReadPosRankSum=-4.135;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,121:179:99:2243,0,666 chrXIV 26789 . T C 4221.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.70;MQ0=4;QD=23.45;SB=-2.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4221,421,0 chrXIV 26953 . T C 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2917,300,0 chrXIV 27007 . C T 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3365,339,0 chrXIV 27233 . C T 2202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2235,231,0 chrXIV 27266 . G T 1698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=25.73;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1731,171,0 chrXIV 27283 . T C 1774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=23.34;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1807,186,0 chrXIV 27309 . G T 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2548,258,0 chrXIV 27347 . T C 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=23.65;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2706,285,0 chrXIV 27364 . C A 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.28;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2864,294,0 chrXIV 29547 . A G 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9615;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3663,402,0 chrXIV 33272 . G A 2425 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2458,249,0 chrXIV 33359 . G A 3923.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3923,394,0 chrXIV 33540 . A G 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3570,369,0 chrXIV 33602 . T C 3661.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3661,381,0 chrXIV 33651 . T C 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.202;DP=120;Dels=0.00;FS=3.083;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=24.43;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:2965,280,0 chrXIV 33735 . G C 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3598,369,0 chrXIV 33946 . G C 4160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4160,423,0 chrXIV 34054 . G A 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3243,327,0 chrXIV 34134 . C T 3869.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3869,387,0 chrXIV 34193 . G A 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3605;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.854;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3480,340,0 chrXIV 34497 . G A 2254 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;QD=20.87;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2287,231,0 chrXIV 34590 . G A 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2997,300,0 chrXIV 34650 . T A 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3577,355,0 chrXIV 34651 . A G 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3550,360,0 chrXIV 35550 . A G 4358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=25.05;SB=-2.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4358,447,0 chrXIV 36225 . T C 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3305,327,0 chrXIV 36273 . A G 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3250,345,0 chrXIV 36441 . G A 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.277;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3423,351,0 chrXIV 36607 . A G 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=23.63;SB=-2.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3781,375,0 chrXIV 36738 . T C 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.07;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4061,414,0 chrXIV 36744 . T C 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.924e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3961,408,0 chrXIV 36849 . T A 3727.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3727,375,0 chrXIV 37063 . A G 4180.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.03;SB=-2.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4180,435,0 chrXIV 37242 . A G 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3830,396,0 chrXIV 37484 . G C 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2544,267,0 chrXIV 37492 . T A 2407 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.911;DP=97;Dels=0.00;FS=4.427;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=24.81;ReadPosRankSum=1.125;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:2440,255,0 chrXIV 37528 . A G 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2966,312,0 chrXIV 37676 . A G 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3272,348,0 chrXIV 37855 . C T 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3340,337,0 chrXIV 37986 . T C 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3023,321,0 chrXIV 38125 . G A 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2937,303,0 chrXIV 38446 . G C 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3155,324,0 chrXIV 38764 . A T 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2565,267,0 chrXIV 38784 . T C 2567 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2600,285,0 chrXIV 38851 . T C 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2743,297,0 chrXIV 38880 . A G 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3072,318,0 chrXIV 39122 . T C 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3305,348,0 chrXIV 39235 . C A 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3763,370,0 chrXIV 39282 . C T 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=118;Dels=0.00;FS=3.395;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.94;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3094,294,0 chrXIV 39538 . A G 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3096,342,0 chrXIV 39847 . G T 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3470,349,0 chrXIV 40035 . T G 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2891,303,0 chrXIV 40397 . A G 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=1;QD=25.74;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3044,324,0 chrXIV 40439 . G A 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=1;QD=26.68;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2861,303,0 chrXIV 40607 . C A 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3635,373,0 chrXIV 40627 . G A 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.34;SB=-2.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3951,408,0 chrXIV 40663 . T C 4230.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.33;SB=-2.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4230,423,0 chrXIV 40774 . C T 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3659,355,0 chrXIV 40852 . A C 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3173,324,0 chrXIV 40912 . C T 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9504;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2792,294,0 chrXIV 40918 . A G 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2937,306,0 chrXIV 41218 . C T 3921.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=26.32;ReadPosRankSum=1.662;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3921,367,0 chrXIV 41680 . C T 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.530;DP=137;Dels=0.00;FS=3.042;HaplotypeScore=5.7444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=26.28;ReadPosRankSum=1.277;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3601,357,0 chrXIV 42001 . A G 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3055,327,0 chrXIV 42031 . G A 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3218,322,0 chrXIV 42185 . G A 3833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3833,384,0 chrXIV 42331 . G C 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6478;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3096,318,0 chrXIV 42341 . G A 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=22.70;ReadPosRankSum=0.997;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3029,309,0 chrXIV 42360 . A G 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2877,312,0 chrXIV 42589 . A C 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3401,354,0 chrXIV 42594 . A T 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.981e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3889,394,0 chrXIV 42629 . C G 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3402,354,0 chrXIV 42682 . C T 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.590;DP=122;Dels=0.00;FS=3.540;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.391;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3156,298,0 chrXIV 42770 . T C 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.472;DP=120;Dels=0.00;FS=3.158;HaplotypeScore=2.3885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=24.71;ReadPosRankSum=1.472;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:2998,302,0 chrXIV 42819 . A G 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.00;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3208,336,0 chrXIV 43099 . A T 2260 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2293,237,0 chrXIV 43100 . T C 2372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2405,261,0 chrXIV 43141 . G A 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=24.66;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2893,300,0 chrXIV 43155 . T C 2596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=22.77;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2629,285,0 chrXIV 43156 . C G 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=23.58;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2674,285,0 chrXIV 43311 . A G 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=23.01;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2679,273,0 chrXIV 43402 . C T 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3084,318,0 chrXIV 43576 . G A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;DP=129;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=25.56;ReadPosRankSum=1.114;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3297,336,0 chrXIV 43810 . A G 3882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3882,423,0 chrXIV 44216 . A G 2584 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2617,276,0 chrXIV 44256 . C T 2508 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2541,267,0 chrXIV 44266 . G A 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3826;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2568,273,0 chrXIV 44605 . A G 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3468,360,0 chrXIV 44718 . G A 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0564;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3872,388,0 chrXIV 44734 . C T 3784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1968;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3784,376,0 chrXIV 44757 . T C 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6158;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3583,363,0 chrXIV 44920 . A G 2662 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.42;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2695,285,0 chrXIV 45047 . T G 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3164,336,0 chrXIV 45224 . T C 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=106;Dels=0.00;FS=4.812;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=25.50;ReadPosRankSum=0.719;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2736,266,0 chrXIV 45374 . T C 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2835,300,0 chrXIV 45407 . T C 2492 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2525,276,0 chrXIV 45479 . G T 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;DP=130;Dels=0.00;FS=3.216;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=25.22;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3279,310,0 chrXIV 45497 . A G 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=23.67;ReadPosRankSum=0.095;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3039,293,0 chrXIV 45566 . A G 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3315,360,0 chrXIV 45634 . G A 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.174e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2953,306,0 chrXIV 46130 . C T 4193.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4193,427,0 chrXIV 46179 . G A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3262,345,0 chrXIV 46184 . A G 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3157,345,0 chrXIV 46217 . A G 3760.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.924e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3760,390,0 chrXIV 46343 . A T 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3417,354,0 chrXIV 46554 . C T 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2829,291,0 chrXIV 46706 . G C 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3729,381,0 chrXIV 46870 . A G 4306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4306,435,0 chrXIV 47216 . G A 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.356;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.738;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:130:99:3316,321,0 chrXIV 47277 . C T 4940.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.70;SB=-2.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4940,493,0 chrXIV 47307 . C T 4541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.03;SB=-2.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4541,445,0 chrXIV 47497 . T C 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3465,357,0 chrXIV 47572 . A T 3913.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3913,408,0 chrXIV 47627 . G A 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3092,309,0 chrXIV 47695 . T C 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3416,348,0 chrXIV 47714 . G T 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3421,348,0 chrXIV 47746 . G A 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3273,330,0 chrXIV 48004 . C T 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3192,333,0 chrXIV 48057 . C T 2477 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.54;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2510,249,0 chrXIV 48279 . T A 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3512,355,0 chrXIV 48310 . G T 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3522,354,0 chrXIV 48338 . T C 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3411,348,0 chrXIV 48348 . T C 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3593,357,0 chrXIV 48383 . G C 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3221,339,0 chrXIV 48399 . C T 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3123,327,0 chrXIV 48463 . C T 4001.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=1;QD=25.81;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4001,402,0 chrXIV 48880 . A G 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3739,390,0 chrXIV 48883 . G A 4172.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4172,430,0 chrXIV 48964 . C T 4248.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4248,439,0 chrXIV 49325 . G A 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2614,264,0 chrXIV 49610 . A G 2355 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2388,252,0 chrXIV 49709 . C T 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3790,379,0 chrXIV 50094 . T G 2214 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2247,246,0 chrXIV 50288 . G A 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3283,321,0 chrXIV 50444 . A G 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3374,348,0 chrXIV 50452 . G A 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3335,340,0 chrXIV 50576 . A G 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3463,387,0 chrXIV 50593 . G A 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3739,382,0 chrXIV 50641 . T C 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6214;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4068,435,0 chrXIV 50736 . A G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3358,351,0 chrXIV 50744 . T C 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3328,348,0 chrXIV 50927 . G A 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=147;Dels=0.00;FS=4.683;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.473;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3836,377,0 chrXIV 51041 . G A 4300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4300,436,0 chrXIV 51050 . C A 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2596;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4150,421,0 chrXIV 51132 . T C 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3418,354,0 chrXIV 51266 . C T 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.478;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=1;MQRankSum=1.062;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.455;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3866,369,0 chrXIV 51825 . A G 4275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.20;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4275,441,0 chrXIV 52243 . C T 3839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3839,388,0 chrXIV 52659 . G T 4499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.10;SB=-2.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4499,466,0 chrXIV 52985 . C T 4690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4690,481,0 chrXIV 53150 . T G 4136.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4136,412,0 chrXIV 58049 . C T 4339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.14;SB=-2.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4339,433,0 chrXIV 58317 . T C 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.642e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3572,369,0 chrXIV 60029 . T C 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3591,372,0 chrXIV 61469 . C T 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3484,349,0 chrXIV 61689 . A G 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3664,393,0 chrXIV 63207 . T G 4199.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.570;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.266;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,170:171:99:4199,422,0 chrXIV 63403 . C T 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.14;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3195,333,0 chrXIV 64081 . G A 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.57;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3088,318,0 chrXIV 64617 . C T 2380 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.60;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2413,252,0 chrXIV 64664 . A G 2361 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2394,258,0 chrXIV 64820 . C A 2525 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.58;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2558,255,0 chrXIV 64897 . G A 2358 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.89;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2391,243,0 chrXIV 65061 . T C 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2940,309,0 chrXIV 65101 . C G 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.09;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3765,390,0 chrXIV 65107 . C T 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.09;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3982,403,0 chrXIV 65258 . C T 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.63;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3431,351,0 chrXIV 65294 . A G 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.62;MQ0=0;QD=25.33;SB=-2.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3926,393,0 chrXIV 65331 . C T 3778.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.50;MQ0=0;QD=25.88;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3778,399,0 chrXIV 65647 . A T 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3117,309,0 chrXIV 65938 . T C 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=21.96;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2822,297,0 chrXIV 66215 . C T 4118.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4118,418,0 chrXIV 66654 . T C 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3221,336,0 chrXIV 66973 . G A 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3484,363,0 chrXIV 67383 . C T 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3821,388,0 chrXIV 68188 . C G 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2623,270,0 chrXIV 69768 . A T 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3402,351,0 chrXIV 71784 . G A 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2866,288,0 chrXIV 72937 . G A 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3071,315,0 chrXIV 77017 . A T 3532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3532,363,0 chrXIV 77525 . A G 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3053,327,0 chrXIV 78583 . T C 4447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.16;SB=-2.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4447,439,0 chrXIV 78788 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.777;DP=118;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1035,0,1381 chrXIV 80433 . C G 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3204,342,0 chrXIV 81141 . T G 1872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.601;DP=79;Dels=0.00;FS=3.294;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=23.70;ReadPosRankSum=1.644;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:1905,165,0 chrXIV 81581 . T A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=4.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.720;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1087,0,1359 chrXIV 81740 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.470;DP=133;Dels=0.00;FS=4.120;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.988;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1424,0,1320 chrXIV 81857 . A C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.641;DP=113;Dels=0.00;FS=3.433;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1187,0,1172 chrXIV 82142 . C T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.333;DP=132;Dels=0.00;FS=2.235;HaplotypeScore=4.0438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.108;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:132:99:1421,0,1295 chrXIV 82505 . G T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.570;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:118:99:1064,0,1449 chrXIV 82802 . G A 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3128,324,0 chrXIV 83130 . C T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.175;DP=117;Dels=0.00;FS=2.379;HaplotypeScore=2.4640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.662;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1207,0,1184 chrXIV 83393 . T C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;DP=154;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=9.97;ReadPosRankSum=2.017;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1565,0,1707 chrXIV 83714 . G A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;DP=126;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.419;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1194,0,1418 chrXIV 84166 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.143;DP=130;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=9.49;ReadPosRankSum=2.054;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1264,0,1364 chrXIV 84464 . G C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;DP=103;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=3.3326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.149;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1057,0,1023 chrXIV 84727 . G A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;DP=135;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.403;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1359,0,1442 chrXIV 84728 . A G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.994;DP=135;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.517;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1341,0,1470 chrXIV 84859 . G A 1876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.510;DP=150;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:1906,0,1218 chrXIV 84877 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.836;DP=154;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=2.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.609;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1377,0,1708 chrXIV 85056 . A G 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;DP=144;Dels=0.00;FS=4.209;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.242;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1653,0,1375 chrXIV 85225 . G A 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.082;DP=163;Dels=0.00;FS=2.721;HaplotypeScore=3.5407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.551;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:163:99:1719,0,1595 chrXIV 85237 . A G 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.620;DP=162;Dels=0.00;FS=0.577;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.674;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:162:99:1644,0,1608 chrXIV 85261 . G A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.502;DP=143;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.187;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1565,0,1320 chrXIV 85300 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.639;DP=125;Dels=0.00;FS=2.359;HaplotypeScore=7.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.015;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1276,0,1280 chrXIV 85381 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.988;DP=156;Dels=0.00;FS=1.998;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1541,0,1731 chrXIV 85405 . A G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.889;DP=148;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.198;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1465,0,1539 chrXIV 85474 . T A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;DP=123;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1398,0,1153 chrXIV 85621 . G C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.514;DP=130;Dels=0.00;FS=1.420;HaplotypeScore=3.6784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=8.71;ReadPosRankSum=3.500;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1162,0,1432 chrXIV 85777 . T C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.479;DP=150;Dels=0.00;FS=2.042;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.554;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1324,0,1728 chrXIV 85954 . T C 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.890;DP=119;Dels=0.00;FS=5.710;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.467;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.432;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:937,0,1460 chrXIV 86042 . G T 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2999,312,0 chrXIV 86180 . T C 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.802;DP=143;Dels=0.00;FS=2.159;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1594,0,1356 chrXIV 86216 . G A 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.876;DP=149;Dels=0.00;FS=3.875;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.039;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1615,0,1501 chrXIV 86730 . A G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.272;DP=143;Dels=0.00;FS=5.155;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1551,0,1381 chrXIV 86790 . T G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.509;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.473;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1343,0,1530 chrXIV 86934 . C T 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.207;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.075;QD=10.12;ReadPosRankSum=-2.223;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1689,0,1670 chrXIV 87195 . C T 1803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;DP=169;Dels=0.00;FS=1.932;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,92:169:99:1833,0,1541 chrXIV 87229 . G T 2044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.627;DP=187;Dels=0.00;FS=2.616;HaplotypeScore=2.7622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,106:186:99:2074,0,1523 chrXIV 87310 . A G 1872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.962;DP=149;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=3.9615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.563;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,86:149:99:1902,0,1311 chrXIV 87319 . A G 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;DP=153;Dels=0.00;FS=1.683;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,86:153:99:1859,0,1427 chrXIV 87321 . G A 1849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.776;DP=150;Dels=0.00;FS=0.815;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,85:150:99:1879,0,1197 chrXIV 87439 . G C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.538;DP=121;Dels=0.00;FS=2.427;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.786;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1242,0,1266 chrXIV 87852 . G A 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.762;DP=150;Dels=0.00;FS=2.894;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.350;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1652,0,1422 chrXIV 88100 . C A 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.111;DP=146;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=2.5740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,85:146:99:1730,0,1098 chrXIV 88106 . A T 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.544;DP=136;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=2.5740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.397;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1728,0,1082 chrXIV 88388 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.736;DP=128;Dels=0.02;FS=6.732;HaplotypeScore=10.8115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1065,0,1433 chrXIV 88496 . C G 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:111:99:894,0,1307 chrXIV 88950 . C T 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.17;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2595,264,0 chrXIV 88974 . T C 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.72;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2480,255,0 chrXIV 89040 . G A 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.759;DP=91;Dels=0.00;FS=0.828;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:907,0,949 chrXIV 89169 . A G 2519 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2552,270,0 chrXIV 89336 . C T 620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.720;DP=139;Dels=0.02;FS=5.240;HaplotypeScore=33.2807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=4.46;ReadPosRankSum=-2.196;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:650,0,1257 chrXIV 89448 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.370;DP=112;Dels=0.01;FS=9.871;HaplotypeScore=3.8715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=11.23;ReadPosRankSum=2.689;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1288,0,1062 chrXIV 89451 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;DP=114;Dels=0.00;FS=8.039;HaplotypeScore=3.8715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=10.89;ReadPosRankSum=2.478;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1271,0,1063 chrXIV 89494 . A G 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3519,348,0 chrXIV 89495 . T G 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3553,351,0 chrXIV 89543 . T G 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.849;DP=143;Dels=0.00;FS=2.143;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.182;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,84:143:99:1790,0,1157 chrXIV 89675 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;DP=115;Dels=0.00;FS=3.029;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=10.63;ReadPosRankSum=2.242;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1253,0,1190 chrXIV 89762 . A G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.017;DP=138;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=2.6998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.005;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1335,0,1477 chrXIV 89776 . C T 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.933;DP=121;Dels=0.00;FS=6.127;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.345;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1146,0,1277 chrXIV 89837 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.895;DP=126;Dels=0.00;FS=2.618;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=11.08;ReadPosRankSum=1.557;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1426,0,1350 chrXIV 90029 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.110;DP=125;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.475;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1439,0,1266 chrXIV 90031 . G A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.873;DP=122;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.074;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1408,0,1239 chrXIV 90251 . T G 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.456;DP=131;Dels=0.00;FS=3.122;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1334,0,1264 chrXIV 90358 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.442;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.880;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1478,0,1275 chrXIV 90414 . T C 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3264,330,0 chrXIV 90478 . C T 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.666;DP=116;Dels=0.00;FS=3.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=-3.465;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.352;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:984,0,1378 chrXIV 90752 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.628;DP=153;Dels=0.00;FS=2.889;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.454;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1360,0,1735 chrXIV 90876 . C A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.318;DP=107;Dels=0.00;FS=3.569;HaplotypeScore=3.8662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.446;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1142,0,1094 chrXIV 90956 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.105;DP=99;Dels=0.00;FS=6.396;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.755;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:911,0,1146 chrXIV 91169 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.851;DP=143;Dels=0.00;FS=11.949;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.601;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1494,0,1482 chrXIV 91671 . C A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.944;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1225,0,1125 chrXIV 91897 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.506;DP=114;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=10.88;ReadPosRankSum=-2.131;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1270,0,1076 chrXIV 92329 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.066;DP=134;Dels=0.00;FS=5.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.455;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1269,0,1469 chrXIV 92407 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.432;DP=137;Dels=0.00;FS=2.244;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.079;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:1110,0,1803 chrXIV 92476 . T C 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.730;DP=81;Dels=0.00;FS=13.193;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-1.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:823,0,883 chrXIV 92908 . A T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1236,0,1325 chrXIV 93043 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.831;DP=99;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.047;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:963,0,1102 chrXIV 93082 . C T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;DP=108;Dels=0.00;FS=7.533;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.851;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1070,0,1246 chrXIV 93149 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.058;DP=112;Dels=0.00;FS=4.582;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.338;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1217,0,1084 chrXIV 93328 . A G 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.872;DP=123;Dels=0.00;FS=6.156;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1000,0,1486 chrXIV 93517 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.239;DP=118;Dels=0.00;FS=9.892;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.864;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1204,0,1195 chrXIV 93790 . T C 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.699;DP=80;Dels=0.00;FS=0.832;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,43:80:99:907,0,712 chrXIV 94390 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;DP=119;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.887;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1411,0,1120 chrXIV 94480 . T A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;DP=123;Dels=0.00;FS=3.250;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.727;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1478,0,1116 chrXIV 94896 . A C 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.912;DP=108;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=9.13;ReadPosRankSum=-2.036;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:108:99:1016,0,1261 chrXIV 95089 . T C 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.339;DP=118;Dels=0.00;FS=8.952;HaplotypeScore=3.2054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.065;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:845,0,1193 chrXIV 95393 . A G 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.223;DP=142;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=4.3856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=3.416;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1619,0,1232 chrXIV 95510 . C T 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3030,309,0 chrXIV 95692 . G A 2735 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2768,282,0 chrXIV 96083 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.544;DP=147;Dels=0.00;FS=2.093;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.912;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1364,0,1674 chrXIV 96132 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.069;DP=147;Dels=0.00;FS=1.298;HaplotypeScore=4.2701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.870;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1414,0,1616 chrXIV 96181 . C A 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2951,312,0 chrXIV 96218 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.651;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.066;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1111,0,1464 chrXIV 96228 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.336;DP=140;Dels=0.00;FS=2.146;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.820;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1426,0,1474 chrXIV 96324 . G A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;DP=107;Dels=0.00;FS=20.701;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.253;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,62:107:99:1281,0,847 chrXIV 96482 . T C 1342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.484;DP=64;Dels=0.00;FS=24.659;HaplotypeScore=4.6659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.47;MQ0=3;MQRankSum=3.668;QD=20.97;ReadPosRankSum=2.590;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,58:64:99:1375,138,0 chrXIV 96490 . T A 1071 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.020;DP=57;Dels=0.00;FS=29.677;HaplotypeScore=4.6659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.86;MQ0=4;MQRankSum=4.228;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.320;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,45:57:40:1104,40,0 chrXIV 97900 . C G 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.40;MQ0=34;MQRankSum=-1.231;QD=0.34;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,4:39:43:43,0,45 chrXIV 98068 . A T 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=11.39;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 chrXIV 98092 . C T 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.17;MQ0=2;QD=3.80;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:54,6,0 chrXIV 98110 . T C 66.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;DP=18;Dels=0.00;FS=10.532;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.82;MQ0=2;MQRankSum=2.729;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.303;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:14:96,0,14 chrXIV 98455 . G A 508 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.09;MQ0=1;QD=23.09;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:57:541,57,0 chrXIV 98476 . T C 275 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=22.92;SB=-8.689e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:33:308,33,0 chrXIV 98478 . C G 268 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.85;MQ0=2;QD=19.14;SB=-8.689e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:33:301,33,0 chrXIV 98839 . A G 39.04 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.20;MQ0=97;MQRankSum=-0.742;QD=0.38;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,14:104:18:69,0,18 chrXIV 99241 . G A 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.21;MQ0=11;QD=0.42;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:6:43,6,0 chrXIV 101054 . T C 39.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.98;MQ0=1;QD=5.00;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:9:72,9,0 chrXIV 101087 . G A 28.08 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.21;MQ0=1;MQRankSum=0.198;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.198;SB=-2.569e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:15:58,0,15 chrXIV 101089 . A C 28.06 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.21;MQ0=1;MQRankSum=0.198;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-2.544e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:17:58,0,17 chrXIV 101093 . G T 28.08 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.21;MQ0=1;MQRankSum=0.198;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-2.569e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:15:58,0,15 chrXIV 101111 . G A 66.34 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.791;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:8:96,0,8 chrXIV 101123 . G A 67.18 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.474;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:97,0,11 chrXIV 101126 . T A 86.42 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-2.921e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:116,0,7 chrXIV 101133 . T C 57.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;DP=12;Dels=0.00;FS=13.424;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.185;SB=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:35:87,0,35 chrXIV 101161 . A G 60.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:11:90,0,11 chrXIV 101163 . T C 60.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:11:90,0,11 chrXIV 101166 . T C 60.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:11:90,0,11 chrXIV 101168 . A G 60.22 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:10:90,0,10 chrXIV 101172 . T C 60.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:11:90,0,11 chrXIV 101174 . T C 60.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:11:90,0,11 chrXIV 101175 . G C 60.22 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:10:90,0,10 chrXIV 101195 . C G 60.27 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.40;MQ0=1;MQRankSum=0.588;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.849;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:9:90,0,9 chrXIV 101200 . A C 60.14 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.971;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.43;MQ0=1;MQRankSum=0.667;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.061;SB=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:12:90,0,12 chrXIV 101204 . T G 60.27 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.21;MQ0=1;MQRankSum=0.910;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.303;SB=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:9:90,0,9 chrXIV 101210 . T C 32.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.64;MQ0=1;MQRankSum=1.849;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,9:13:9:65,9,0 chrXIV 101211 . G A 32.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.925;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.64;MQ0=1;MQRankSum=2.034;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,9:13:9:65,9,0 chrXIV 101218 . G A 32.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.64;MQ0=1;MQRankSum=1.664;QD=2.54;ReadPosRankSum=-1.294;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,9:13:9:65,9,0 chrXIV 101236 . G T 85.79 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.332;DP=20;Dels=0.00;FS=14.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.54;MQ0=4;MQRankSum=1.790;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.813;SB=-3.670e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:4:115,0,4 chrXIV 101242 . A C 103.46 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;DP=19;Dels=0.00;FS=15.911;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.59;MQ0=4;MQRankSum=1.898;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.061;SB=-4.401e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:1:132,0,1 chrXIV 101248 . G A 119.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;DP=24;Dels=0.00;FS=11.886;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.74;MQ0=4;MQRankSum=0.579;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.656;SB=4.350e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:70:149,0,70 chrXIV 101268 . T C 218.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;DP=34;Dels=0.00;FS=14.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.36;MQ0=5;MQRankSum=0.708;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-6.799e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:60:248,0,60 chrXIV 101270 . G A 221.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.098;DP=34;Dels=0.00;FS=14.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.36;MQ0=5;MQRankSum=0.952;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.854;SB=-6.799e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:59:251,0,59 chrXIV 101325 . G T 100.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;DP=33;Dels=0.00;FS=12.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.36;MQ0=6;MQRankSum=1.868;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.558;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:94:130,0,94 chrXIV 101393 . G A 76.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.13;MQ0=1;QD=6.38;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:12:109,12,0 chrXIV 101412 . G T 89.14 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=13;Dels=0.00;FS=18.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.44;MQ0=2;MQRankSum=1.246;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.769;SB=-2.589e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:12:119,0,12 chrXIV 101416 . C T 89.27 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;DP=14;Dels=0.00;FS=18.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.81;MQ0=3;MQRankSum=1.246;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.769;SB=-2.502e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:9:119,0,9 chrXIV 101438 . C T 195.03 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;DP=23;Dels=0.00;FS=6.107;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.72;MQ0=5;MQRankSum=1.646;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:20:225,0,20 chrXIV 101454 . T C 291.34 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;DP=23;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.74;MQ0=6;MQRankSum=0.819;QD=12.67;ReadPosRankSum=-2.205;SB=-1.393e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:8:321,0,8 chrXIV 101505 . G A 308 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.22;MQ0=6;QD=14.67;SB=-7.800e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:33:341,33,0 chrXIV 101688 . A G 328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.759;DP=28;Dels=0.00;FS=5.383;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:60:358,0,60 chrXIV 101715 . G A 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;DP=33;Dels=0.00;FS=2.741;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.27;MQ0=4;MQRankSum=0.919;QD=0.67;ReadPosRankSum=0.024;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:52:52,0,195 chrXIV 101723 . T C 32.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.380;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.55;MQ0=4;MQRankSum=2.443;QD=1.03;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:62:62,0,87 chrXIV 101727 . A G 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.76;MQ0=4;MQRankSum=2.387;QD=1.17;ReadPosRankSum=-1.661;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:65:65,0,84 chrXIV 101735 . T A 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.14;MQ0=4;MQRankSum=2.822;QD=1.09;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:65:65,0,86 chrXIV 101752 . C T 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.02;MQ0=7;MQRankSum=3.520;QD=0.97;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-6.513e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:60:65,0,60 chrXIV 101852 . A T 17.84 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.58;MQ0=0;QD=1.98;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:49,6,0 chrXIV 102628 . C A 366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;DP=67;Dels=0.00;FS=18.286;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.37;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,30:67:99:396,0,746 chrXIV 102646 . G A 508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.263;DP=68;Dels=0.00;FS=6.530;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.41;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:538,0,755 chrXIV 102681 . C T 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.556;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.74;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=13.14;ReadPosRankSum=-2.363;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,44:71:99:963,0,484 chrXIV 102817 . T A 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,39:84:99:796,0,1003 chrXIV 102825 . A G 748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:778,0,948 chrXIV 102872 . T C 713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:743,0,945 chrXIV 102906 . A G 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;DP=82;Dels=0.00;FS=5.595;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,41:82:99:901,0,897 chrXIV 103108 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;DP=102;Dels=0.00;FS=9.862;HaplotypeScore=3.8723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1105,0,1026 chrXIV 103589 . A G 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;DP=114;Dels=0.00;FS=8.931;HaplotypeScore=3.3890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.504;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,45:114:99:886,0,1481 chrXIV 103662 . A T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.803;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.452;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1136,0,1151 chrXIV 103902 . T G 700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.078;DP=100;Dels=0.00;FS=2.986;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=7.00;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:730,0,1258 chrXIV 104034 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.094;DP=120;Dels=0.00;FS=4.506;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1263,0,1237 chrXIV 104153 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.008;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.716;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1200,0,1201 chrXIV 104189 . A G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.988;DP=143;Dels=0.00;FS=3.339;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.460;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1215,0,1764 chrXIV 104256 . G A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.853;DP=140;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.063;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1492,0,1482 chrXIV 104278 . C T 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3576,363,0 chrXIV 104301 . C T 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3812,376,0 chrXIV 104374 . G A 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.18;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2805,282,0 chrXIV 104378 . A G 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2743,297,0 chrXIV 104450 . C T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.444;DP=121;Dels=0.00;FS=2.451;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1225,0,1231 chrXIV 104504 . G A 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2599,267,0 chrXIV 104516 . C A 2327 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2360,243,0 chrXIV 104554 . G A 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3172,324,0 chrXIV 104577 . G A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;DP=114;Dels=0.00;FS=3.534;HaplotypeScore=7.6571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.722;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:114:99:1067,0,1266 chrXIV 104770 . G A 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.78;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2976,303,0 chrXIV 104779 . G A 2685 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.12;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2718,279,0 chrXIV 104781 . A T 2745 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.07;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2778,279,0 chrXIV 104785 . C T 2706 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.88;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2739,276,0 chrXIV 104803 . G C 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.70;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2842,294,0 chrXIV 104929 . C T 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.975;DP=142;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=6.8596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.510;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1686,0,1277 chrXIV 104993 . C T 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3425,351,0 chrXIV 105051 . A T 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.401;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=106.3072;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=26.10;ReadPosRankSum=0.828;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:3034,288,0 chrXIV 105255 . C T 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3381,330,0 chrXIV 105379 . T C 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7586;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2855,309,0 chrXIV 105689 . G C 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2822,294,0 chrXIV 105839 . G A 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.47;SB=-2.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3548,346,0 chrXIV 105923 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.007;DP=123;Dels=0.00;FS=7.487;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=9.35;ReadPosRankSum=2.147;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1180,0,1320 chrXIV 106004 . T G 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3216,342,0 chrXIV 106690 . G C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;DP=128;Dels=0.00;FS=0.789;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.694;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1154,0,1509 chrXIV 106801 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.257;DP=112;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.431;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1334,0,998 chrXIV 106872 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.619;DP=132;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=5.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1457,0,1218 chrXIV 106895 . A G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.279;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1194,0,1286 chrXIV 107060 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;DP=122;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1403,0,1191 chrXIV 107116 . C A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.361;DP=138;Dels=0.00;FS=5.079;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1419,0,1494 chrXIV 107345 . T C 664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=108;Dels=0.00;FS=0.808;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.919;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:694,0,668 chrXIV 107372 . G T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.903;DP=146;Dels=0.00;FS=3.019;HaplotypeScore=5.9607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1141,0,1032 chrXIV 107409 . T C 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.296;DP=153;Dels=0.00;FS=2.878;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=11.25;ReadPosRankSum=-1.773;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1751,0,1438 chrXIV 107444 . C T 4499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4499,448,0 chrXIV 107861 . C G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;DP=132;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=11.84;ReadPosRankSum=-1.530;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,78:132:99:1593,0,1076 chrXIV 108312 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.447;DP=97;Dels=0.00;FS=0.826;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.375;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:950,0,1016 chrXIV 108405 . A T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;DP=117;Dels=0.00;FS=2.603;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.257;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1419,0,1076 chrXIV 108436 . T A 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.907;DP=127;Dels=0.00;FS=10.466;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1527,0,1166 chrXIV 108442 . A G 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.129;DP=139;Dels=0.00;FS=15.448;HaplotypeScore=3.8911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1546,0,1247 chrXIV 108588 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,60:143:99:1182,0,1861 chrXIV 108679 . G A 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.974;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.235;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:898,0,1139 chrXIV 109033 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=138;Dels=0.00;FS=6.631;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1183,0,1689 chrXIV 109533 . G A 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=1;QD=25.16;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3346,333,0 chrXIV 109881 . A G 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.374;DP=160;Dels=0.00;FS=3.654;HaplotypeScore=2.7041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.239;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1403,0,1794 chrXIV 110451 . C T 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.776;DP=122;Dels=0.00;FS=8.348;HaplotypeScore=8.9206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=1;MQRankSum=-0.039;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.314;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1241,0,1239 chrXIV 110765 . G A 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.967;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.715;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,60:150:99:1232,0,2010 chrXIV 110786 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,56:137:99:1142,0,1769 chrXIV 111039 . A G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.948;DP=157;Dels=0.00;FS=2.189;HaplotypeScore=2.5671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1524,0,1650 chrXIV 111323 . T C 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3293,345,0 chrXIV 112698 . C T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.942;DP=135;Dels=0.00;FS=2.272;HaplotypeScore=5.5251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.527;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1425,0,1194 chrXIV 113969 . G A 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.960;DP=113;Dels=0.00;FS=1.585;HaplotypeScore=2.2282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=6.58;ReadPosRankSum=-2.621;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,40:113:99:773,0,1523 chrXIV 114342 . A C 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;DP=92;Dels=0.00;FS=0.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:887,0,1056 chrXIV 115349 . C T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.670;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1368,0,1359 chrXIV 115483 . G A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.766;DP=135;Dels=0.00;FS=3.109;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1597,0,1293 chrXIV 115637 . C T 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.076;DP=130;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=4.3328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=9.94;ReadPosRankSum=2.099;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1322,0,1286 chrXIV 115655 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.015;DP=121;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=4.2945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.842;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1260,0,1208 chrXIV 115691 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1036,0,1334 chrXIV 115809 . A G 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;DP=140;Dels=0.00;FS=11.247;HaplotypeScore=3.3779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.884;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:140:99:1359,0,1170 chrXIV 115811 . C T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.689;DP=149;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=5.8739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.675;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.832;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1348,0,1245 chrXIV 115859 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.808;DP=160;Dels=0.00;FS=1.295;HaplotypeScore=3.6456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1494,0,1383 chrXIV 115921 . G C 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=148;Dels=0.00;FS=2.931;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1524,0,1385 chrXIV 115945 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.709;DP=137;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=2.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.567;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1522,0,1336 chrXIV 116051 . C T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.475;DP=144;Dels=0.00;FS=6.106;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.654;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1652,0,1298 chrXIV 116117 . G A 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.271;DP=139;Dels=0.00;FS=4.024;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.938;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,78:139:99:1544,0,1142 chrXIV 116131 . T A,C 2837.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.63;MQ0=0;QD=22.52;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,67,59:126:99:2897,1324,1147,1573,0,1408 chrXIV 116228 . T C 1699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1729,0,1471 chrXIV 116234 . C G 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=2.133;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.920;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,86:161:99:1759,0,1494 chrXIV 116360 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.456;DP=158;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=2.6968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1404,0,1228 chrXIV 116630 . T A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;DP=157;Dels=0.00;FS=12.550;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.874;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,73:157:99:1433,0,1851 chrXIV 116676 . C T 1763.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.448;DP=162;Dels=0.00;FS=0.582;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=10.88;ReadPosRankSum=-2.757;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1793,0,1478 chrXIV 116678 . C T 1787.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.366;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=10.77;ReadPosRankSum=-2.577;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,88:166:99:1817,0,1522 chrXIV 116685 . C T 1520.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.268;DP=156;Dels=0.00;FS=1.243;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.032;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1550,0,1610 chrXIV 116758 . G A 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.396;DP=162;Dels=0.00;FS=2.451;HaplotypeScore=11.5333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=10.38;ReadPosRankSum=-2.538;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:162:99:1711,0,1296 chrXIV 116796 . A C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.522;DP=146;Dels=0.00;FS=7.458;HaplotypeScore=3.3559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQ0=0;MQRankSum=1.796;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1001,0,1302 chrXIV 116881 . T C 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3619,381,0 chrXIV 116975 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.325;DP=126;Dels=0.01;FS=4.375;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.720;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1149,0,1469 chrXIV 116976 . T C 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;DP=126;Dels=0.00;FS=5.477;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.627;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1147,0,1459 chrXIV 117009 . T G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.757;DP=135;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=9.52;ReadPosRankSum=-2.000;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1315,0,1472 chrXIV 117271 . T C 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;DP=125;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=4.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=12.58;ReadPosRankSum=2.134;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,73:125:99:1602,0,1012 chrXIV 117337 . A G 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.440;DP=134;Dels=0.00;FS=4.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,82:134:99:1738,0,983 chrXIV 117840 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.015;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.3162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.210;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.845;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:159:99:1546,0,1550 chrXIV 117954 . T C 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.830;DP=178;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=4.9139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.431;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,93:178:99:1761,0,1746 chrXIV 118227 . C T 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.004;DP=154;Dels=0.00;FS=2.849;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.458;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:154:99:1661,0,1447 chrXIV 118233 . C T 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.894;DP=152;Dels=0.00;FS=5.941;HaplotypeScore=3.7065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1722,0,1341 chrXIV 118249 . G C 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3628,396,0 chrXIV 118743 . T C 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.985;DP=124;Dels=0.00;FS=4.496;HaplotypeScore=5.4173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.018;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:124:99:1284,0,1025 chrXIV 118969 . A G 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;DP=97;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=13.1860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.935;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.434;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:821,0,696 chrXIV 119007 . G A 102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;DP=81;Dels=0.00;FS=6.567;HaplotypeScore=6.4403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.31;MQ0=0;MQRankSum=-5.572;QD=1.26;ReadPosRankSum=1.348;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,47:81:99:132,0,151 chrXIV 119025 . C T 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.560;DP=118;Dels=0.00;FS=9.064;HaplotypeScore=55.0305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.56;MQ0=0;MQRankSum=-6.129;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.591;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1029,0,889 chrXIV 119044 . T C 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;DP=108;Dels=0.00;FS=13.188;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.397;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.843;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1027,0,913 chrXIV 119074 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.691;DP=120;Dels=0.00;FS=8.409;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.270;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:120:99:1087,0,1172 chrXIV 119098 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.765;DP=130;Dels=0.00;FS=2.300;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.307;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1075,0,1511 chrXIV 119335 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.363;DP=151;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=4.9487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.527;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,66:151:99:1274,0,1770 chrXIV 119392 . G A 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.058;DP=158;Dels=0.00;FS=8.810;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.838;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,64:158:99:1167,0,1866 chrXIV 119540 . C A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.547;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=1;MQRankSum=-0.167;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.491;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1504,0,1350 chrXIV 119604 . A G 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;DP=126;Dels=0.00;FS=6.223;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=1;MQRankSum=-0.539;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1435,0,1191 chrXIV 119985 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.001;DP=100;Dels=0.00;FS=1.658;HaplotypeScore=5.7965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,60:100:99:1238,0,789 chrXIV 121619 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.908;DP=140;Dels=0.00;FS=4.337;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:140:99:1415,0,1303 chrXIV 121736 . G C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;DP=127;Dels=0.00;FS=2.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1343,0,1258 chrXIV 122217 . G A 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.218;DP=91;Dels=0.00;FS=1.715;HaplotypeScore=2.5646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.105;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:792,0,1013 chrXIV 122735 . T G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.114;DP=119;Dels=0.00;FS=10.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.994;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1078,0,1400 chrXIV 122891 . T G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.824;DP=113;Dels=0.00;FS=1.786;HaplotypeScore=4.7496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1263,0,1012 chrXIV 123158 . G C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;DP=123;Dels=0.00;FS=1.462;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.271;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1424,0,1219 chrXIV 123423 . A C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.201;DP=115;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1112,0,1226 chrXIV 123426 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.439;DP=116;Dels=0.00;FS=4.475;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.135;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1142,0,1233 chrXIV 123530 . A G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.295;DP=138;Dels=0.00;FS=2.160;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.259;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1165,0,1697 chrXIV 123533 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.068;DP=115;Dels=0.00;FS=5.902;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.934;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:1030,0,1356 chrXIV 123569 . T C 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;DP=108;Dels=0.00;FS=1.588;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:903,0,1360 chrXIV 123848 . C A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.346;DP=119;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.332;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1248,0,1255 chrXIV 123896 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.019;DP=115;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1081,0,1335 chrXIV 123919 . G A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;DP=112;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.555;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1036,0,1370 chrXIV 123935 . G A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1307,0,1092 chrXIV 124046 . G T 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.572;DP=123;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.131;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1011,0,1454 chrXIV 124139 . G A 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.186;DP=96;Dels=0.00;FS=21.929;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.022;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:774,0,1183 chrXIV 124154 . T C 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;DP=110;Dels=0.00;FS=17.430;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.279;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.360;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,43:110:99:835,0,1388 chrXIV 124235 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.300;DP=127;Dels=0.00;FS=1.813;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.700;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1343,0,1325 chrXIV 124244 . T A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.571;DP=137;Dels=0.00;FS=7.080;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.58;ReadPosRankSum=3.034;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1343,0,1542 chrXIV 124279 . G A 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.438;DP=154;Dels=0.00;FS=5.939;HaplotypeScore=4.4757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:154:99:1667,0,1524 chrXIV 124329 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.665;DP=136;Dels=0.00;FS=3.307;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1611,0,1183 chrXIV 124634 . C G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.086;DP=124;Dels=0.00;FS=2.336;HaplotypeScore=6.2834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.282;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:124:99:1026,0,1288 chrXIV 124765 . G A 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.627;DP=139;Dels=0.00;FS=2.146;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.594;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1675,0,1266 chrXIV 125337 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.734;DP=139;Dels=0.00;FS=3.028;HaplotypeScore=5.7462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1417,0,1390 chrXIV 125823 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;DP=151;Dels=0.00;FS=2.065;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,65:151:99:1264,0,1905 chrXIV 125895 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.299;DP=139;Dels=0.00;FS=8.940;HaplotypeScore=4.4948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.617;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1479,0,1218 chrXIV 125915 . A G 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.477;DP=133;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,83:133:99:1736,0,939 chrXIV 125981 . C T 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.035;DP=137;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.824;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.042;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1524,0,1121 chrXIV 126031 . T A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.497;DP=138;Dels=0.00;FS=4.056;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1338,0,1581 chrXIV 126226 . G A 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.513;DP=103;Dels=0.00;FS=6.464;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1202,0,908 chrXIV 126732 . T G 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.139;DP=105;Dels=0.00;FS=6.155;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.375;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1007,0,1211 chrXIV 126744 . G A 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2615,270,0 chrXIV 127254 . C T 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;DP=103;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=1;MQRankSum=0.132;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.956;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:915,0,1313 chrXIV 128199 . C A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.357;DP=119;Dels=0.00;FS=1.483;HaplotypeScore=2.9556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:1005,0,1449 chrXIV 128407 . A G 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.172;DP=115;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1301,0,1176 chrXIV 128581 . T C 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.610;DP=138;Dels=0.00;FS=4.042;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.768;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:138:99:1446,0,1359 chrXIV 128629 . C T 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.284;DP=136;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=11.34;ReadPosRankSum=2.279;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1572,0,1272 chrXIV 128650 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.842;DP=137;Dels=0.00;FS=3.063;HaplotypeScore=5.0551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.987;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:137:99:1426,0,1220 chrXIV 128749 . A T 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.264;DP=131;Dels=0.00;FS=10.067;HaplotypeScore=5.9461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.316;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:131:99:1682,0,1087 chrXIV 128889 . A G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.645;DP=102;Dels=0.00;FS=7.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.927;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1055,0,1131 chrXIV 128908 . G A 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3610,369,0 chrXIV 129103 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.534;DP=135;Dels=0.00;FS=13.134;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.701;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1428,0,1386 chrXIV 129119 . A T 1926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;DP=160;Dels=0.00;FS=6.238;HaplotypeScore=7.9353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=12.04;ReadPosRankSum=-3.623;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,90:160:99:1956,0,1429 chrXIV 129300 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.974;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1256,0,1383 chrXIV 129447 . C T 205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.729;DP=131;Dels=0.00;FS=8.650;HaplotypeScore=3.5522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.63;MQ0=0;MQRankSum=-7.284;QD=1.56;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:235,0,1326 chrXIV 129503 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;DP=132;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=4.3112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.011;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:132:99:1327,0,1323 chrXIV 129702 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.060;DP=148;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.501;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,59:148:99:1134,0,1880 chrXIV 129768 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.215;DP=137;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=6.3510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.613;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1248,0,1454 chrXIV 129800 . T C 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.540;DP=132;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=3.0603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=8.36;ReadPosRankSum=2.192;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1134,0,1544 chrXIV 130095 . T C 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:889,0,1393 chrXIV 130662 . T A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.554;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1386,0,1432 chrXIV 130860 . C T 2110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.775;DP=176;Dels=0.00;FS=4.449;HaplotypeScore=6.5203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.895;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.339;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,97:176:99:2140,0,1635 chrXIV 130887 . G A 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;DP=155;Dels=0.00;FS=5.899;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.262;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1726,0,1557 chrXIV 130901 . C T 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.352;DP=142;Dels=0.01;FS=10.290;HaplotypeScore=17.6577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.605;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:141:99:1578,0,1351 chrXIV 130982 . A G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.476;DP=149;Dels=0.00;FS=3.888;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1516,0,1616 chrXIV 131438 . T C 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;DP=122;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=3.1223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.219;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:957,0,1409 chrXIV 131472 . T C 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.586;DP=91;Dels=0.00;FS=0.913;HaplotypeScore=9.1599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.060;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:91:99:751,0,663 chrXIV 131511 . G A 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;DP=78;Dels=0.00;FS=8.302;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.015;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:712,0,781 chrXIV 131663 . G A 56.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.603;DP=63;Dels=0.00;FS=14.721;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.603;QD=0.89;ReadPosRankSum=-2.440;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:86:86,0,898 chrXIV 131762 . C T 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.778;DP=147;Dels=0.00;FS=1.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1584,0,1559 chrXIV 131888 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.270;DP=125;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1220,0,1426 chrXIV 132051 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.296;DP=152;Dels=0.00;FS=6.138;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.692;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1132,0,1885 chrXIV 132054 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.169;DP=157;Dels=0.00;FS=4.859;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.723;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,68:157:99:1158,0,1910 chrXIV 132063 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.468;DP=148;Dels=0.00;FS=5.090;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,63:148:99:1180,0,1700 chrXIV 132066 . T C 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.196;DP=146;Dels=0.00;FS=9.052;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.156;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:1014,0,1865 chrXIV 132228 . A T 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.474;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1703,0,1322 chrXIV 132251 . C T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.057;DP=141;Dels=0.00;FS=2.221;HaplotypeScore=2.5566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.424;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1649,0,1305 chrXIV 132374 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.429;DP=137;Dels=0.00;FS=3.052;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=1;MQRankSum=0.140;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.964;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1329,0,1576 chrXIV 132585 . T C 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.775;DP=121;Dels=0.00;FS=3.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1135,0,1402 chrXIV 132587 . G A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;DP=124;Dels=0.00;FS=4.382;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1185,0,1382 chrXIV 132646 . T C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.650;DP=117;Dels=0.00;FS=3.406;HaplotypeScore=2.6318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.478;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1339,0,1138 chrXIV 132840 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;DP=128;Dels=0.00;FS=7.181;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1375,0,1257 chrXIV 132925 . G C 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.926;DP=140;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=4.8259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=2.452;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1626,0,1234 chrXIV 132929 . C T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.153;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:145:99:1537,0,1358 chrXIV 133032 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1456,0,1419 chrXIV 133191 . C T 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;DP=152;Dels=0.00;FS=3.847;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,86:152:99:1786,0,1299 chrXIV 133521 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.438;DP=136;Dels=0.00;FS=4.138;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.835;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1481,0,1239 chrXIV 133785 . C T 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.479;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.748;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1243,0,1147 chrXIV 134391 . T A 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;DP=84;Dels=0.00;FS=15.473;HaplotypeScore=7.5200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.586;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:677,0,989 chrXIV 134481 . T C 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;DP=159;Dels=0.00;FS=6.901;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.720;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.389;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1592,0,1548 chrXIV 134870 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.728;DP=124;Dels=0.00;FS=5.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.823;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1109,0,1372 chrXIV 135264 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.633;DP=133;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.123;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1088,0,1596 chrXIV 135401 . C T 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2702,279,0 chrXIV 135436 . G A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.286;DP=121;Dels=0.00;FS=6.118;HaplotypeScore=6.6456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.845;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:1032,0,1453 chrXIV 135598 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.255;DP=141;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.135;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1192,0,1564 chrXIV 135753 . A G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.014;DP=123;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=2.4011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.505;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1044,0,1346 chrXIV 135908 . G A 71.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.919;DP=147;Dels=0.01;FS=22.508;HaplotypeScore=15.6511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=2;MQRankSum=0.401;QD=0.48;ReadPosRankSum=0.992;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,62:145:99:101,0,1874 chrXIV 136021 . G A 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.615;DP=124;Dels=0.00;FS=1.495;HaplotypeScore=4.1726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.464;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1395,0,1151 chrXIV 136113 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.819;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=8.56;ReadPosRankSum=-1.722;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1109,0,1551 chrXIV 136306 . A G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.962;DP=108;Dels=0.00;FS=2.508;HaplotypeScore=5.9751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1216,0,1016 chrXIV 136573 . C T 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.171;DP=152;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=-1.219;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.035;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1594,0,1486 chrXIV 136884 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.060;DP=173;Dels=0.00;FS=1.910;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.924;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,80:173:99:1654,0,1892 chrXIV 136999 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.361;DP=133;Dels=0.00;FS=6.717;HaplotypeScore=3.5131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.785;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1249,0,1491 chrXIV 137272 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.264;DP=126;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.637;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1373,0,1171 chrXIV 137285 . A G 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3204,342,0 chrXIV 137407 . C G 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;DP=140;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.910;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1513,0,1268 chrXIV 137715 . G A 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.922;DP=117;Dels=0.00;FS=7.539;HaplotypeScore=5.3742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=12.82;ReadPosRankSum=-2.888;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,72:117:99:1530,0,815 chrXIV 137806 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;DP=113;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=12.87;ReadPosRankSum=-1.753;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,70:113:99:1484,0,790 chrXIV 137823 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;DP=119;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=3.7061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.669;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:119:99:1399,0,1023 chrXIV 137920 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.282;DP=131;Dels=0.00;FS=3.134;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1331,0,1282 chrXIV 138022 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.732;DP=139;Dels=0.00;FS=4.079;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.640;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1200,0,1463 chrXIV 138025 . T C 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.343;DP=139;Dels=0.00;FS=4.077;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1258,0,1445 chrXIV 138079 . A C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.911;DP=129;Dels=0.00;FS=3.154;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.027;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1342,0,1191 chrXIV 138082 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;DP=122;Dels=0.00;FS=2.322;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.943;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1309,0,1137 chrXIV 138171 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.282;DP=145;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1451,0,1483 chrXIV 138172 . G T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1423,0,1438 chrXIV 138467 . C T 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.607;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1524,0,1294 chrXIV 138759 . T C 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.678;DP=144;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=3.603;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.156;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,87:144:99:1817,0,1135 chrXIV 138817 . A C 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.455;DP=141;Dels=0.00;FS=3.198;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.829;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1578,0,1227 chrXIV 138826 . A G 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.591;DP=143;Dels=0.00;FS=2.311;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:143:99:1590,0,1395 chrXIV 139125 . C T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;DP=110;Dels=0.00;FS=2.468;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.583;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1104,0,1081 chrXIV 139530 . C A 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.301;DP=120;Dels=0.00;FS=8.715;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.103;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.102;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1293,0,1114 chrXIV 139649 . A T 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.934;DP=105;Dels=0.00;FS=2.642;HaplotypeScore=3.9624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.314;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1085,0,1183 chrXIV 140230 . G A 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.175;DP=110;Dels=0.00;FS=1.544;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.271;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1183,0,1098 chrXIV 140238 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.268;DP=112;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.964;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.565;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1194,0,1115 chrXIV 140328 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.722;DP=100;Dels=0.00;FS=5.008;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.273;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1060,0,1028 chrXIV 140385 . G A 596.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.839;DP=87;Dels=0.00;FS=0.835;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.314;QD=6.85;ReadPosRankSum=2.253;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:626,0,1203 chrXIV 140391 . G A 545.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;DP=85;Dels=0.00;FS=0.856;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.430;QD=6.41;ReadPosRankSum=1.294;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,33:85:99:575,0,1193 chrXIV 140393 . A G 506.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.041;DP=86;Dels=0.00;FS=0.837;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=-3.224;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.243;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,33:86:99:536,0,1231 chrXIV 140409 . C T 662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=94;Dels=0.00;FS=8.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.58;MQ0=0;MQRankSum=-3.146;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.773;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:94:99:692,0,1230 chrXIV 140444 . T C 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.986;DP=118;Dels=0.00;FS=21.770;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=7.89;ReadPosRankSum=-2.174;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:961,0,1485 chrXIV 140585 . T C 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.925;DP=148;Dels=0.00;FS=8.773;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.391;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,58:148:99:1145,0,1972 chrXIV 140791 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.358;DP=136;Dels=0.00;FS=1.424;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.941;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,54:136:99:1035,0,1797 chrXIV 140943 . A G 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3456,360,0 chrXIV 141004 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.612;DP=141;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=2.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1397,0,1494 chrXIV 141465 . G A 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.096;DP=126;Dels=0.00;FS=6.720;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1088,0,1504 chrXIV 141630 . C A 2643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2676,279,0 chrXIV 141929 . C T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.831;DP=101;Dels=0.00;FS=9.827;HaplotypeScore=3.9588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=11.10;ReadPosRankSum=-2.132;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1151,0,932 chrXIV 142377 . C T 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.847;DP=110;Dels=0.00;FS=4.619;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.306;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1047,0,1286 chrXIV 142815 . T G 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;DP=106;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.459;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:857,0,1270 chrXIV 143011 . T G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.604;DP=131;Dels=0.00;FS=3.156;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.776;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1269,0,1357 chrXIV 144020 . G A 1864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.819;DP=153;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.780;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1894,0,1309 chrXIV 144250 . G A 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.258;DP=106;Dels=0.00;FS=2.573;HaplotypeScore=7.5645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.146;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:1043,0,1217 chrXIV 144988 . G T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.553;DP=109;Dels=0.00;FS=1.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,69:109:99:1495,0,734 chrXIV 144997 . T C 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;DP=110;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=4.5730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.357;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,70:110:99:1499,0,825 chrXIV 145227 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;DP=111;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=9.15;ReadPosRankSum=2.076;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:1046,0,1354 chrXIV 145293 . G T 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.074;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.729;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.248;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1000,0,1029 chrXIV 145312 . C G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.132;DP=102;Dels=0.00;FS=4.984;HaplotypeScore=1.9664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1091,0,1045 chrXIV 145314 . A G 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=104;Dels=0.00;FS=3.701;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.176;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1121,0,1049 chrXIV 145503 . C A 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.826;DP=154;Dels=0.00;FS=3.787;HaplotypeScore=4.9531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,85:154:99:1825,0,1316 chrXIV 146019 . G A 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;DP=94;Dels=0.00;FS=8.338;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:919,0,1055 chrXIV 146052 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.487;DP=102;Dels=0.00;FS=3.622;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.525;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1162,0,927 chrXIV 146055 . A G 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.080;DP=100;Dels=0.00;FS=2.564;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.560;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1101,0,921 chrXIV 146243 . G T 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.597;DP=98;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:887,0,1094 chrXIV 146337 . C T 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.014;DP=104;Dels=0.00;FS=1.596;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=1;MQRankSum=-0.102;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.092;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1054,0,1072 chrXIV 146766 . G A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;DP=111;Dels=0.00;FS=3.463;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:997,0,1310 chrXIV 146788 . G C 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.357;DP=113;Dels=0.00;FS=5.985;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.943;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1028,0,1366 chrXIV 146794 . T G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.283;DP=124;Dels=0.00;FS=5.619;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1215,0,1411 chrXIV 146890 . T C 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.044;DP=107;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1009,0,1169 chrXIV 146914 . T C 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;DP=113;Dels=0.00;FS=2.405;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.777;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1042,0,1340 chrXIV 146959 . G A 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;DP=118;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=2.4038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.589;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1237,0,1191 chrXIV 147716 . C G 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;DP=124;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.394;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1104,0,1375 chrXIV 147866 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.990;DP=131;Dels=0.00;FS=7.856;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.869;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1276,0,1488 chrXIV 147958 . G A 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;DP=154;Dels=0.00;FS=4.704;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.232;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1730,0,1480 chrXIV 147994 . C A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.278;DP=123;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.236;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1451,0,1200 chrXIV 148082 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.008;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1160,0,1216 chrXIV 148092 . C T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.417;DP=123;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=3.4664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.493;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1277,0,1252 chrXIV 148117 . T C 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.685;DP=142;Dels=0.00;FS=2.228;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1387,0,1410 chrXIV 148166 . T C 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.017;DP=131;Dels=0.00;FS=2.246;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.51;ReadPosRankSum=-2.317;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1145,0,1512 chrXIV 148331 . T C 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.720;DP=140;Dels=0.00;FS=5.106;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.824;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1559,0,1357 chrXIV 148608 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.599;DP=120;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1380,0,1177 chrXIV 148823 . A G 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;DP=129;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=4.5384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.097;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1293,0,1416 chrXIV 149024 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.357;DP=130;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=2.8787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1407,0,1344 chrXIV 149054 . T C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.792;DP=108;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=4.7605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1206,0,1008 chrXIV 149196 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.469;DP=98;Dels=0.00;FS=1.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,59:98:99:1283,0,679 chrXIV 149537 . T C 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.562;DP=162;Dels=0.00;FS=5.904;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,84:162:99:1749,0,1554 chrXIV 149571 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.320;DP=131;Dels=0.00;FS=4.209;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1514,0,1199 chrXIV 149943 . C T 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;DP=105;Dels=0.00;FS=10.968;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.076;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:982,0,1242 chrXIV 150192 . G A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.019;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1412,0,1300 chrXIV 150443 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.716;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.618;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.903;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1054,0,930 chrXIV 150594 . C T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;DP=110;Dels=0.00;FS=5.966;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.525;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1252,0,1029 chrXIV 150779 . G A 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3275,333,0 chrXIV 151081 . G C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;DP=137;Dels=0.00;FS=3.542;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1382,0,1479 chrXIV 151127 . C T 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3405,343,0 chrXIV 151394 . G A 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.561;DP=147;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.669;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1520,0,1515 chrXIV 151991 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.847;DP=112;Dels=0.00;FS=4.766;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.168;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,66:112:99:1434,0,900 chrXIV 152011 . A G 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.591;DP=128;Dels=0.00;FS=2.289;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.648;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.360;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,77:128:99:1572,0,1034 chrXIV 152015 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.342;DP=150;Dels=0.00;FS=5.952;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.544;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.890;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1332,0,1764 chrXIV 153222 . A G 4509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4509,474,0 chrXIV 153871 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.104;DP=126;Dels=0.00;FS=6.747;HaplotypeScore=2.6961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.317;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1280,0,1260 chrXIV 154799 . A G 1100.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.608;DP=158;Dels=0.00;FS=6.044;HaplotypeScore=1.9621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.431;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,59:158:99:1130,0,2103 chrXIV 154805 . A G 995.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.327;DP=153;Dels=0.00;FS=6.270;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.358;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,56:153:99:1025,0,2036 chrXIV 154807 . A C 973.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.384;DP=153;Dels=0.00;FS=6.270;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.275;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,56:153:99:1003,0,2034 chrXIV 154877 . A T 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.993;DP=104;Dels=0.00;FS=18.891;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=8.73;ReadPosRankSum=4.349;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:938,0,1304 chrXIV 155028 . T G 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.480;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1010,0,1043 chrXIV 155098 . A C 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.359;DP=99;Dels=0.00;FS=5.358;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.172;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1038,0,1099 chrXIV 155109 . A G 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.392;DP=103;Dels=0.00;FS=1.646;HaplotypeScore=3.5291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.284;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:982,0,1215 chrXIV 155171 . T A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;DP=106;Dels=0.00;FS=3.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1226,0,976 chrXIV 155180 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.103;DP=118;Dels=0.00;FS=2.346;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1343,0,1077 chrXIV 155190 . T C 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.095;DP=130;Dels=0.00;FS=3.169;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.909;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1379,0,1319 chrXIV 155327 . G A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.441;DP=136;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=4.1713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,55:136:99:1112,0,1657 chrXIV 155361 . C A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;DP=149;Dels=0.00;FS=4.020;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=2.103;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1484,0,1562 chrXIV 155720 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.572;DP=123;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:123:99:1440,0,1081 chrXIV 155840 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.188;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.403;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,66:150:99:1382,0,1859 chrXIV 156055 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.470;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1308,0,1320 chrXIV 156212 . T C 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.470;DP=143;Dels=0.00;FS=5.014;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.536;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1640,0,1347 chrXIV 156407 . C T 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.398;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:870,0,841 chrXIV 156524 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.100;DP=107;Dels=0.00;FS=4.014;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=12.09;ReadPosRankSum=-3.612;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,63:107:99:1324,0,851 chrXIV 156564 . G A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.385;DP=109;Dels=0.00;FS=2.533;HaplotypeScore=3.5444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=9.52;ReadPosRankSum=2.370;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:109:99:1068,0,1184 chrXIV 156565 . G A 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.825;DP=109;Dels=0.00;FS=2.490;HaplotypeScore=2.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=9.28;ReadPosRankSum=2.266;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1042,0,1201 chrXIV 156755 . C T 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.873;DP=111;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1131,0,1180 chrXIV 156760 . T C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.021;DP=122;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=48.3254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1159,0,1307 chrXIV 157216 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.307;DP=125;Dels=0.00;FS=5.625;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1199,0,1405 chrXIV 157269 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;DP=123;Dels=0.00;FS=7.410;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1302,0,1237 chrXIV 157516 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.325;DP=130;Dels=0.00;FS=9.632;HaplotypeScore=2.8930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.790;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1393,0,1225 chrXIV 157526 . C G 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.845;DP=136;Dels=0.00;FS=10.567;HaplotypeScore=2.8913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.870;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1419,0,1344 chrXIV 157531 . A T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.285;DP=125;Dels=0.00;FS=8.154;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.826;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1187,0,1437 chrXIV 157553 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.247;DP=118;Dels=0.00;FS=4.412;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1295,0,1165 chrXIV 157659 . A G 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.963;DP=151;Dels=0.00;FS=4.851;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1373,0,1677 chrXIV 157663 . C T 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.607;DP=155;Dels=0.00;FS=2.841;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1520,0,1778 chrXIV 157910 . C T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.369;DP=128;Dels=0.00;FS=8.057;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1348,0,1259 chrXIV 157917 . T G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.476;DP=125;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.141;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1259,0,1359 chrXIV 157998 . C T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.968;DP=144;Dels=0.00;FS=12.397;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1446,0,1495 chrXIV 158003 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.388;DP=138;Dels=0.00;FS=9.572;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1468,0,1268 chrXIV 158052 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;DP=128;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=3.7603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.233;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1114,0,1509 chrXIV 158538 . A G 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.281;DP=100;Dels=0.00;FS=3.798;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.266;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:939,0,1137 chrXIV 159120 . C G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.707;DP=109;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.143;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1071,0,1023 chrXIV 159157 . G A 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.080;DP=162;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=2.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.334;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:1543,0,1605 chrXIV 159166 . A T 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8853;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3566,366,0 chrXIV 159230 . T A 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.822;DP=147;Dels=0.00;FS=2.125;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.112;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,84:147:99:1787,0,1234 chrXIV 159352 . T C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;DP=113;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=3.0224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.967;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:941,0,1471 chrXIV 159540 . G A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.078;DP=120;Dels=0.00;FS=6.384;HaplotypeScore=6.7849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.125;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:120:99:1033,0,1337 chrXIV 159674 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.877;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1204,0,1272 chrXIV 159685 . T G 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.491;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1199,0,1446 chrXIV 159750 . C G 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;DP=128;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=5.4965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.286;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1292,0,1298 chrXIV 160012 . C G 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,62:106:99:1353,0,810 chrXIV 160786 . G T 2105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.150;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=14.22;ReadPosRankSum=2.260;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,97:148:99:2135,0,968 chrXIV 161070 . T C 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;DP=122;Dels=0.00;FS=2.369;HaplotypeScore=3.4826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:122:99:1458,0,1022 chrXIV 161277 . A G 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.133;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1024,0,1054 chrXIV 161874 . C T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.478;DP=105;Dels=0.00;FS=5.169;HaplotypeScore=7.1597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.293;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1156,0,924 chrXIV 162100 . C T 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.935;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=7.87;ReadPosRankSum=2.136;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:809,0,1172 chrXIV 162171 . G A 532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;DP=77;Dels=0.00;FS=8.418;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=6.91;ReadPosRankSum=2.430;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:562,0,1113 chrXIV 162224 . G A 678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.397;DP=86;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.028;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:708,0,1092 chrXIV 162248 . C A 593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.219;DP=72;Dels=0.00;FS=3.346;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.776;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:623,0,862 chrXIV 162275 . C T 615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;DP=90;Dels=0.00;FS=8.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=2.394;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.287;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,37:90:99:645,0,1170 chrXIV 162311 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.219;DP=86;Dels=0.00;FS=5.659;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.797;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1036,0,684 chrXIV 162419 . A G 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.052;DP=103;Dels=0.00;FS=3.835;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:894,0,1272 chrXIV 162485 . A G 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.102;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:862,0,1076 chrXIV 162494 . C A 2273 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2306,237,0 chrXIV 162565 . A G 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.953;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.466;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:755,0,1084 chrXIV 162614 . A C 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.316;DP=129;Dels=0.00;FS=6.836;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.284;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1119,0,1519 chrXIV 162722 . C A 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;DP=93;Dels=0.00;FS=5.415;HaplotypeScore=3.7999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.335;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,53:93:99:1156,0,749 chrXIV 162845 . C G 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.098;DP=101;Dels=0.00;FS=6.322;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.146;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:1017,0,1065 chrXIV 162932 . T A 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;DP=125;Dels=0.00;FS=3.375;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.175;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,48:125:99:960,0,1751 chrXIV 163592 . T C 706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;DP=104;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=6.79;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,39:104:99:736,0,1397 chrXIV 163817 . G A 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;DP=142;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1316,0,1631 chrXIV 163952 . G A 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.891;DP=139;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=5.2587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1193,0,1634 chrXIV 164315 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.967;DP=113;Dels=0.00;FS=3.483;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:113:99:1288,0,1023 chrXIV 165144 . T G 616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.627;DP=102;Dels=0.00;FS=8.202;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,38:102:99:646,0,1444 chrXIV 165259 . C T 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;DP=94;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=3.1278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:898,0,964 chrXIV 165261 . T A 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.922;DP=96;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,49:96:99:899,0,1023 chrXIV 165505 . A G 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;DP=120;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=2.3869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.401;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,75:120:99:1651,0,832 chrXIV 165732 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=115;Dels=0.00;FS=8.714;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.365;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1440,0,969 chrXIV 165771 . T A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;DP=116;Dels=0.00;FS=5.831;HaplotypeScore=4.7980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.017;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1402,0,1015 chrXIV 165976 . A G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.098;DP=133;Dels=0.00;FS=11.029;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=1.207;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1465,0,1323 chrXIV 165982 . T A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.680;DP=127;Dels=0.00;FS=9.871;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=0.472;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.185;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1417,0,1231 chrXIV 166155 . C T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.977;DP=126;Dels=0.00;FS=4.292;HaplotypeScore=4.5067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.786;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1119,0,1507 chrXIV 166576 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;DP=123;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1078,0,1341 chrXIV 167458 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.646;DP=114;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=3.8779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-0.263;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.080;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:114:99:1214,0,1036 chrXIV 167521 . G A 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;DP=163;Dels=0.00;FS=1.234;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.907;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1593,0,1679 chrXIV 167536 . C T 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=2.031;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.286;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1657,0,1722 chrXIV 167797 . C T 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.167;DP=122;Dels=0.00;FS=2.342;HaplotypeScore=4.3382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:1438,0,959 chrXIV 167850 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.166;DP=118;Dels=0.00;FS=3.350;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1327,0,1155 chrXIV 167984 . T G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.967;DP=122;Dels=0.00;FS=7.589;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.15;ReadPosRankSum=-2.710;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1268,0,1265 chrXIV 168133 . T C 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;DP=121;Dels=0.00;FS=3.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1120,0,1305 chrXIV 168178 . T C 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3393,360,0 chrXIV 168578 . A G 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.09;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3112,333,0 chrXIV 168712 . T C 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3295,336,0 chrXIV 168745 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;DP=108;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=3.3036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1213,0,1091 chrXIV 168853 . A G 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.869;DP=100;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:901,0,1115 chrXIV 169024 . G A 2668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2701,279,0 chrXIV 169220 . C T 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3184,318,0 chrXIV 169290 . A G 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3212,336,0 chrXIV 169469 . G T 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=1;QD=25.71;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2861,294,0 chrXIV 169528 . T G 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=21.97;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3581,351,0 chrXIV 169784 . A C 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.881;DP=106;Dels=0.00;FS=1.533;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.172;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1139,0,1128 chrXIV 169811 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.817;DP=118;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=2.9458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.214;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1163,0,1293 chrXIV 169844 . A T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.511;DP=123;Dels=0.00;FS=4.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:1025,0,1508 chrXIV 170131 . T C 589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.472;DP=93;Dels=0.00;FS=0.823;HaplotypeScore=3.9022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=6.33;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:619,0,1221 chrXIV 170305 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.736;DP=108;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.751;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1235,0,994 chrXIV 170353 . T C 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.103;DP=154;Dels=0.00;FS=7.052;HaplotypeScore=4.6185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.929;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1561,0,1610 chrXIV 170509 . C T 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.260;DP=104;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=3.9430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=3.009;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.656;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1000,0,1090 chrXIV 170628 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.143;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.571;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1107,0,1290 chrXIV 170790 . A G 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.450;DP=107;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.970;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:783,0,1394 chrXIV 171097 . C T 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2777,291,0 chrXIV 171194 . A G 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;DP=81;Dels=0.00;FS=0.901;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.724;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:801,0,860 chrXIV 171274 . C T 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.889;DP=93;Dels=0.00;FS=2.948;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1051,0,913 chrXIV 171639 . G A 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;DP=137;Dels=0.00;FS=2.336;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=9.91;ReadPosRankSum=-2.129;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1388,0,1389 chrXIV 171677 . C T 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.889;DP=138;Dels=0.00;FS=2.202;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=10.99;ReadPosRankSum=-2.279;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1546,0,1214 chrXIV 171747 . A T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.558;DP=130;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.323;QD=9.85;ReadPosRankSum=-2.071;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1310,0,1411 chrXIV 171927 . A G 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3470,357,0 chrXIV 172071 . A G 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;DP=96;Dels=0.00;FS=2.727;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.739;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:809,0,1057 chrXIV 172341 . A G 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;DP=106;Dels=0.00;FS=4.026;HaplotypeScore=3.2869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.240;SB=-6.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1056,0,1169 chrXIV 172376 . T C 146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.397;DP=139;Dels=0.00;FS=2.260;HaplotypeScore=36.6078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=1.05;ReadPosRankSum=1.545;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,51:139:99:176,0,1662 chrXIV 172441 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;DP=110;Dels=0.00;FS=9.031;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.146;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1173,0,1021 chrXIV 172603 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;DP=104;Dels=0.00;FS=4.868;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.022;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:1048,0,1185 chrXIV 173404 . G A 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.902;DP=160;Dels=0.00;FS=5.777;HaplotypeScore=5.7493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.085;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1655,0,1736 chrXIV 173599 . T C 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.794;DP=118;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.854;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1079,0,1333 chrXIV 174011 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.235;DP=109;Dels=0.00;FS=8.979;HaplotypeScore=3.6364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1165,0,1104 chrXIV 174250 . A T 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;DP=157;Dels=0.00;FS=3.761;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1541,0,1744 chrXIV 174382 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;DP=108;Dels=0.00;FS=6.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1134,0,1120 chrXIV 174584 . G C 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.636;DP=168;Dels=0.00;FS=2.753;HaplotypeScore=5.6974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.761;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,92:168:99:1839,0,1468 chrXIV 174599 . A G 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.542;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.811;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,89:162:99:1825,0,1524 chrXIV 174762 . G C 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;DP=116;Dels=0.00;FS=2.433;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.284;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:855,0,1132 chrXIV 174821 . A G 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.431;DP=112;Dels=0.00;FS=1.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1058,0,1220 chrXIV 174891 . T A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.065;DP=138;Dels=0.00;FS=3.069;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1414,0,1466 chrXIV 174916 . A T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;DP=142;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1505,0,1496 chrXIV 174930 . G A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;DP=146;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.378;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1426,0,1593 chrXIV 174935 . C T 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.118;DP=144;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=4.3742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.034;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1576,0,1401 chrXIV 174982 . G T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.559;DP=144;Dels=0.01;FS=2.158;HaplotypeScore=10.9048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.540;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1560,0,1315 chrXIV 175088 . T A 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;DP=148;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=2.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.875;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1608,0,1555 chrXIV 175091 . C T 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.049;DP=148;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=3.6336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.630;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:148:99:1603,0,1425 chrXIV 175243 . C G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1327,0,1160 chrXIV 175274 . C T 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=104;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.616;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:981,0,1093 chrXIV 175296 . C T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.398;DP=102;Dels=0.00;FS=9.248;HaplotypeScore=2.6968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.020;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1070,0,1015 chrXIV 175559 . T A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.151;DP=108;Dels=0.00;FS=10.838;HaplotypeScore=2.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=2.161;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1204,0,982 chrXIV 175973 . A G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;DP=150;Dels=0.00;FS=3.853;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.040;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1422,0,1674 chrXIV 176348 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;DP=119;Dels=0.00;FS=7.313;HaplotypeScore=2.6777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.308;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1464,0,1047 chrXIV 176366 . G A 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.029;DP=100;Dels=0.00;FS=2.622;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=9.95;ReadPosRankSum=3.080;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:1025,0,1090 chrXIV 176563 . G A 2034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.863;DP=162;Dels=0.00;FS=5.792;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.010;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,95:162:99:2064,0,1339 chrXIV 176798 . T A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.931;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.472;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1239,0,1438 chrXIV 176801 . G A 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.263;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.716;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1218,0,1457 chrXIV 177005 . C T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;DP=116;Dels=0.00;FS=2.395;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1258,0,1121 chrXIV 177137 . A G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.213;DP=120;Dels=0.00;FS=13.617;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.126;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1089,0,1396 chrXIV 177269 . G A 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.386;DP=126;Dels=0.00;FS=1.418;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.354;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1255,0,1347 chrXIV 177299 . A G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.262;DP=145;Dels=0.00;FS=5.170;HaplotypeScore=2.7396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1367,0,1620 chrXIV 177761 . G A 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.213;DP=104;Dels=0.00;FS=1.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.316;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1045,0,1137 chrXIV 177874 . T G 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.862;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=-0.848;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,81:135:99:1611,0,1026 chrXIV 177881 . T C 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;DP=126;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.208;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.333;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:817,0,1639 chrXIV 178001 . G A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;DP=111;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=2.4485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.716;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:969,0,1243 chrXIV 178272 . A G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.256;DP=106;Dels=0.00;FS=3.590;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=10.04;ReadPosRankSum=2.345;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1094,0,1094 chrXIV 178487 . G A 2231 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2264,228,0 chrXIV 178556 . C T 921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.835;DP=97;Dels=0.00;FS=6.581;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:951,0,1053 chrXIV 178580 . G A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.952;DP=99;Dels=0.00;FS=3.751;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.241;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1030,0,1047 chrXIV 178711 . C T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.107;DP=112;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1345,0,1030 chrXIV 179985 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.320;DP=134;Dels=0.00;FS=12.441;HaplotypeScore=4.7959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:134:99:1333,0,1418 chrXIV 180002 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.073;DP=113;Dels=0.00;FS=12.237;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.129;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1150,0,1208 chrXIV 180219 . G A 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;DP=133;Dels=0.00;FS=2.438;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.218;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:1066,0,1735 chrXIV 180736 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.154;DP=120;Dels=0.00;FS=13.595;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1335,0,1169 chrXIV 180742 . C A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.994;DP=123;Dels=0.00;FS=9.747;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1451,0,1124 chrXIV 180909 . G T 1699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;DP=138;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.748;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:1729,0,1112 chrXIV 180936 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.832;DP=127;Dels=0.00;FS=3.369;HaplotypeScore=3.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=12.51;ReadPosRankSum=-2.037;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,75:127:99:1619,0,941 chrXIV 181057 . A T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;DP=143;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=7.8592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1211,0,1765 chrXIV 181132 . T A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.958;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=11.64;ReadPosRankSum=-2.023;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1369,0,1097 chrXIV 181289 . G A 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;DP=147;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=3;MQRankSum=0.280;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.035;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,55:146:99:710,0,1808 chrXIV 181382 . T C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.695;DP=124;Dels=0.00;FS=4.164;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.397;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.491;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1021,0,1451 chrXIV 181532 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.055;DP=133;Dels=0.00;FS=5.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1274,0,1548 chrXIV 181565 . G A 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.481;DP=151;Dels=0.00;FS=13.068;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.352;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1546,0,1563 chrXIV 181925 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.875;DP=113;Dels=0.00;FS=3.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=10.37;ReadPosRankSum=-2.220;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1202,0,1219 chrXIV 182084 . C A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;DP=154;Dels=0.00;FS=2.905;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.312;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,63:154:99:1254,0,1952 chrXIV 182327 . G C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;DP=140;Dels=0.00;FS=6.299;HaplotypeScore=2.7537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.010;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1306,0,1401 chrXIV 182372 . G A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.767;DP=118;Dels=0.00;FS=7.164;HaplotypeScore=2.8591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.488;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1191,0,1251 chrXIV 182462 . G A 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3919,397,0 chrXIV 182621 . T G 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.151;DP=147;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=2.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.405;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1628,0,1432 chrXIV 183060 . T C 2022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.194;DP=155;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=4.6698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,95:155:99:2052,0,1115 chrXIV 183309 . A G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.481;DP=113;Dels=0.00;FS=4.634;HaplotypeScore=3.7966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.915;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1275,0,1132 chrXIV 183465 . C T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;DP=132;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1317,0,1422 chrXIV 183492 . A G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.888;DP=124;Dels=0.00;FS=2.251;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=2.543;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.248;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1235,0,1263 chrXIV 183528 . T C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.271;DP=101;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.622;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1041,0,1008 chrXIV 183866 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.884;DP=126;Dels=0.00;FS=6.792;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.093;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1309,0,1290 chrXIV 184035 . C T 4291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4291,438,0 chrXIV 184065 . C T 4049.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4049,415,0 chrXIV 184146 . G A 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.81;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3374,345,0 chrXIV 184212 . A G 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3512,369,0 chrXIV 184449 . G A 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3808,385,0 chrXIV 184629 . G A 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.04;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3958,411,0 chrXIV 184882 . T C 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2777,291,0 chrXIV 184944 . A G 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.31;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3070,336,0 chrXIV 184992 . G A 4148.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.47;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4148,430,0 chrXIV 185085 . T C 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=134;Dels=0.00;FS=3.385;HaplotypeScore=9.4147;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=23.87;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:134:99:3231,348,0 chrXIV 185179 . A G 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6145;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3474,351,0 chrXIV 185292 . A C 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.774;DP=141;Dels=0.00;FS=10.932;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1280,0,1682 chrXIV 185309 . A G 4191.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7083;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4191,447,0 chrXIV 185417 . C T 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.245;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.347;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3498,372,0 chrXIV 185512 . C T 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=138;Dels=0.00;FS=3.690;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.707;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:3549,378,0 chrXIV 185626 . A G 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3889,396,0 chrXIV 185701 . G A 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3782,382,0 chrXIV 185846 . T C 3871.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6686;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3871,399,0 chrXIV 185896 . A G 4167.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4167,423,0 chrXIV 186361 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.365;DP=122;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=3.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.989;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1360,0,1093 chrXIV 186892 . G T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.817;DP=137;Dels=0.00;FS=8.192;HaplotypeScore=9.3050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=7.78;ReadPosRankSum=2.545;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,55:137:99:1096,0,1661 chrXIV 186897 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.442;DP=132;Dels=0.00;FS=4.427;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.021;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:132:99:1189,0,1534 chrXIV 186921 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.907;DP=134;Dels=0.00;FS=6.756;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1109,0,1503 chrXIV 187030 . A G 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.623;DP=145;Dels=0.00;FS=3.056;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=1;MQRankSum=0.565;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1214,0,1734 chrXIV 187081 . A T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;DP=159;Dels=0.00;FS=6.268;HaplotypeScore=3.3227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.087;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.030;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,68:159:99:1347,0,2023 chrXIV 187260 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.718;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.782;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1375,0,1533 chrXIV 187320 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.701;DP=154;Dels=0.01;FS=6.031;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.967;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1444,0,1849 chrXIV 187353 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.550;DP=156;Dels=0.00;FS=13.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=8.97;ReadPosRankSum=-3.525;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1430,0,1877 chrXIV 187591 . G C 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;DP=118;Dels=0.00;FS=6.146;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.196;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1049,0,1365 chrXIV 187730 . T A 2140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.171;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.305;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,107:177:99:2170,0,1380 chrXIV 187782 . A G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.758;DP=148;Dels=0.00;FS=11.562;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1565,0,1450 chrXIV 187825 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=153;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=5.3799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.089;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1374,0,1619 chrXIV 187884 . A C 4046.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.37;SB=-2.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4046,420,0 chrXIV 187910 . A G 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.714;DP=148;Dels=0.00;FS=9.137;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.876;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1471,0,1386 chrXIV 187965 . A T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.482;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.804;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1311,0,1551 chrXIV 188341 . T G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.357;DP=162;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,77:162:99:1393,0,1818 chrXIV 188387 . C T 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.208;DP=147;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.716;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1249,0,1680 chrXIV 188854 . C A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.196;DP=133;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.308;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,79:133:99:1676,0,1015 chrXIV 188893 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.302;DP=116;Dels=0.00;FS=4.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1138,0,1220 chrXIV 188962 . G A 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;DP=131;Dels=0.00;FS=8.062;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:131:99:1089,0,1561 chrXIV 189004 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.469;DP=138;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.494;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1273,0,1416 chrXIV 189221 . C T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.399;DP=176;Dels=0.00;FS=4.493;HaplotypeScore=5.3159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=7.89;ReadPosRankSum=2.790;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,72:176:99:1419,0,2079 chrXIV 189381 . G A 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.981e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3821,382,0 chrXIV 189445 . T C 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.203;DP=158;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=3.3326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=2.312;QD=8.83;ReadPosRankSum=2.020;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1425,0,1712 chrXIV 189531 . A G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.340;DP=125;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.385;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1066,0,1545 chrXIV 189694 . T C 4060.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4060,432,0 chrXIV 189748 . T C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.985;DP=152;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1449,0,1642 chrXIV 189790 . C T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.254;DP=149;Dels=0.00;FS=3.842;HaplotypeScore=2.9335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.210;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1504,0,1393 chrXIV 189892 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.990;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.416;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,64:160:99:1207,0,1982 chrXIV 189922 . C G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.164;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.453;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1363,0,1689 chrXIV 189937 . G A 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.006;DP=160;Dels=0.00;FS=3.911;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:160:99:1578,0,1778 chrXIV 189981 . A G 1894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.101;DP=184;Dels=0.00;FS=14.212;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.085;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,96:184:99:1924,0,1851 chrXIV 190153 . G A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;DP=162;Dels=0.00;FS=2.036;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=8.37;ReadPosRankSum=-1.272;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:1386,0,1904 chrXIV 190426 . G A 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.550;DP=181;Dels=0.00;FS=3.464;HaplotypeScore=4.8742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,86:181:99:1660,0,2027 chrXIV 190429 . C T 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.424;DP=179;Dels=0.00;FS=4.446;HaplotypeScore=5.8689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,84:179:99:1593,0,1993 chrXIV 190588 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.821;DP=148;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.738;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1494,0,1418 chrXIV 190651 . A G 1831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.998;DP=193;Dels=0.00;FS=3.246;HaplotypeScore=3.1435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.552;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,94:192:99:1861,0,2007 chrXIV 190801 . G A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.598;DP=119;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.322;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1328,0,1149 chrXIV 190837 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;DP=131;Dels=0.00;FS=6.584;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1511,0,1256 chrXIV 190899 . C T 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.649;DP=139;Dels=0.00;FS=5.282;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1434,0,1282 chrXIV 190964 . A T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;DP=131;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.518;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1445,0,1363 chrXIV 191137 . A G 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9285;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3444,357,0 chrXIV 191180 . T G 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.622;DP=133;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1442,0,1332 chrXIV 191184 . C A 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3637,373,0 chrXIV 191241 . A G 3866.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=1;QD=26.48;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3866,408,0 chrXIV 191365 . T G 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.30;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2829,306,0 chrXIV 191560 . G A 661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.577;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.544;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.365;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:691,0,1301 chrXIV 191884 . C A 1834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.973;DP=162;Dels=0.00;FS=13.961;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.144;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,87:162:99:1864,0,1538 chrXIV 191890 . G A 1784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;DP=159;Dels=0.00;FS=5.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.754;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1814,0,1569 chrXIV 191917 . T C 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3746,402,0 chrXIV 192021 . T C 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.236;DP=119;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=5.7073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.279;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:992,0,1095 chrXIV 192177 . A C 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.119;DP=136;Dels=0.00;FS=10.719;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.305;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1340,0,1522 chrXIV 192416 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.817;DP=140;Dels=0.00;FS=4.051;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.061;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1449,0,1372 chrXIV 192445 . T C 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.246;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1490,0,1267 chrXIV 192641 . G T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.127;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.160;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,57:101:99:1201,0,849 chrXIV 193004 . G A 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.150;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:823,0,1200 chrXIV 193276 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;DP=114;Dels=0.00;FS=2.380;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1139,0,1199 chrXIV 193628 . T G 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.472;DP=140;Dels=0.00;FS=7.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=10.68;ReadPosRankSum=-2.344;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1525,0,1353 chrXIV 194047 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.132;DP=145;Dels=0.00;FS=2.077;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.654;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1511,0,1446 chrXIV 194260 . A G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=146;Dels=0.00;FS=5.699;HaplotypeScore=4.6928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1553,0,1297 chrXIV 194299 . A G 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.610;DP=121;Dels=0.00;FS=8.145;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1120,0,1155 chrXIV 194351 . G A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;DP=153;Dels=0.00;FS=6.158;HaplotypeScore=3.9641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=7.33;ReadPosRankSum=2.393;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,60:153:99:1151,0,2004 chrXIV 194419 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.627;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=6.42;ReadPosRankSum=2.110;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,63:166:99:1096,0,2336 chrXIV 194533 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;DP=108;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1149,0,1016 chrXIV 194614 . A C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.877;DP=107;Dels=0.00;FS=2.560;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:1309,0,863 chrXIV 194656 . G A 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.002;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=13.56;ReadPosRankSum=1.400;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,70:114:99:1576,0,893 chrXIV 194864 . A G 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.288;DP=146;Dels=0.00;FS=2.954;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.260;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1227,0,1692 chrXIV 194954 . A G 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.110;DP=151;Dels=0.00;FS=7.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1457,0,1667 chrXIV 195206 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.604;DP=130;Dels=0.00;FS=3.207;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.289;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1236,0,1410 chrXIV 195358 . A C 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.925;DP=168;Dels=0.00;FS=11.295;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.515;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,88:168:99:1786,0,1642 chrXIV 195373 . A C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.009;DP=150;Dels=0.00;FS=5.410;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.314;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1541,0,1705 chrXIV 195436 . G A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.809;DP=133;Dels=0.00;FS=7.845;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.333;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:133:99:1336,0,1514 chrXIV 195766 . A G 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3498,357,0 chrXIV 195994 . G A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.316;DP=137;Dels=0.00;FS=4.109;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=-0.856;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.746;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:137:99:1272,0,1410 chrXIV 196105 . A T 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.158;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.277;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1099,0,1544 chrXIV 196115 . A G 2741 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.25;MQ0=0;QD=24.26;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:113:99:2774,300,0 chrXIV 196160 . T C 573.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.101;DP=106;Dels=0.00;FS=4.999;HaplotypeScore=150.4154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.60;MQ0=0;MQRankSum=-5.267;QD=5.41;ReadPosRankSum=2.737;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,38:106:99:603,0,419 chrXIV 196164 . T C 635.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.714;DP=101;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=57.3135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.47;MQ0=0;MQRankSum=-5.885;QD=6.29;ReadPosRankSum=3.572;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,38:101:99:665,0,381 chrXIV 196170 . A C 701.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.375;DP=106;Dels=0.00;FS=4.062;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=-5.571;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.673;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:731,0,954 chrXIV 196173 . C T 875.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.459;DP=120;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=6.4409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=-6.147;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.927;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:905,0,1049 chrXIV 196197 . T C 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.979;DP=131;Dels=0.00;FS=6.845;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-3.183;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1133,0,1254 chrXIV 196288 . G C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.816;DP=144;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=3.4769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1375,0,1482 chrXIV 196326 . T G 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.020;DP=150;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.449;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1358,0,1685 chrXIV 196345 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.640;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=8.86;ReadPosRankSum=2.971;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,65:148:99:1342,0,1738 chrXIV 196819 . T C 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=171;Dels=0.00;FS=2.671;HaplotypeScore=5.6860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.851;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,85:171:99:1701,0,1827 chrXIV 197191 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.440;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:137:99:1304,0,1395 chrXIV 197620 . G C 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.113;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.776;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1630,0,1561 chrXIV 197710 . G A 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3625,372,0 chrXIV 197788 . C A 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.95;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3467,363,0 chrXIV 198249 . T C 198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=13.1697;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=1.55;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:30:231,30,0 chrXIV 198384 . T G 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.611;DP=190;Dels=0.00;FS=1.803;HaplotypeScore=3.1726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.663;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,90:190:99:1752,0,2200 chrXIV 198392 . C T 4586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.76;SB=-2.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4586,463,0 chrXIV 198443 . A G 1937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.265;DP=163;Dels=0.00;FS=1.255;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,94:163:99:1967,0,1434 chrXIV 198574 . C T 3996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.901e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3996,408,0 chrXIV 198795 . T C 1884 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;QD=20.26;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:1917,213,0 chrXIV 198796 . G C 1953 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3586;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.61;MQ0=0;QD=20.56;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:1986,219,0 chrXIV 198797 . G A 1515 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.66;MQ0=0;QD=15.78;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:96:99:1548,168,0 chrXIV 198801 . C T 856.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;DP=105;Dels=0.00;FS=12.541;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.000;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,63:105:99:886,0,425 chrXIV 198937 . G A 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3807,384,0 chrXIV 199012 . T C 4209.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.928e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4209,441,0 chrXIV 199244 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.628;DP=124;Dels=0.00;FS=8.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.198;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1172,0,1315 chrXIV 199403 . A G 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.386;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=22.73;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-1.922e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,154:156:99:3546,371,0 chrXIV 199432 . T A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.939;DP=150;Dels=0.00;FS=2.930;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:150:99:1523,0,1715 chrXIV 199570 . A G 1826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.797;DP=162;Dels=0.00;FS=7.018;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=11.27;ReadPosRankSum=2.184;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1856,0,1448 chrXIV 199813 . G C 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=24.60;ReadPosRankSum=1.057;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:3912,445,0 chrXIV 199873 . G A 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.164;DP=182;Dels=0.00;FS=1.835;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,83:182:99:1515,0,2101 chrXIV 200003 . C T 1802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.926;DP=148;Dels=0.00;FS=8.554;HaplotypeScore=4.0946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1832,0,1316 chrXIV 200101 . A G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.918;DP=114;Dels=0.00;FS=3.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.72;ReadPosRankSum=2.176;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1252,0,1129 chrXIV 200111 . A T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.141;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=9.88;ReadPosRankSum=-2.920;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1315,0,1382 chrXIV 200248 . A C 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.689;DP=168;Dels=0.00;FS=8.009;HaplotypeScore=2.6342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:168:99:1773,0,1618 chrXIV 200328 . G A 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.109;DP=123;Dels=0.00;FS=5.741;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.685;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:123:99:1573,0,967 chrXIV 200628 . C G 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.295;DP=146;Dels=0.00;FS=2.991;HaplotypeScore=6.6816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.016;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1435,0,1582 chrXIV 201078 . T G 3997.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3997,438,0 chrXIV 201183 . T C 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;DP=128;Dels=0.00;FS=3.045;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=24.10;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:128:99:3118,316,0 chrXIV 201465 . C T 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=1;QD=26.74;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3610,361,0 chrXIV 201944 . C A 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3425,355,0 chrXIV 201965 . T C 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.557;DP=119;Dels=0.00;FS=3.513;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=25.40;ReadPosRankSum=1.528;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3056,333,0 chrXIV 201973 . C T 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.87;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2984,315,0 chrXIV 201993 . C T 2747 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2780,294,0 chrXIV 202388 . G A 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3586,369,0 chrXIV 202394 . G A 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3618,367,0 chrXIV 202414 . T A 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5562;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3754,385,0 chrXIV 202510 . T C 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2993,318,0 chrXIV 202679 . A T 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4076,414,0 chrXIV 202690 . G A 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:4030,409,0 chrXIV 203039 . T A 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3375,336,0 chrXIV 203351 . C T 4313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.46;SB=-2.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4313,430,0 chrXIV 203363 . T C 4283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.61;SB=-2.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4283,447,0 chrXIV 203441 . T C 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3051,318,0 chrXIV 203744 . T G 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3811,405,0 chrXIV 204260 . G A 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3454,348,0 chrXIV 204270 . G A 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3354,342,0 chrXIV 204288 . G A 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3458,357,0 chrXIV 204319 . T C 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.93;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3124,336,0 chrXIV 204325 . T C 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3119,333,0 chrXIV 204368 . G A 4277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;QD=25.77;SB=-2.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4277,432,0 chrXIV 204375 . A G 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=23.33;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3663,390,0 chrXIV 204395 . G A 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3479,348,0 chrXIV 204437 . T A 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3378,354,0 chrXIV 204438 . T A 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3363,354,0 chrXIV 204611 . G A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;DP=148;Dels=0.00;FS=2.985;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:148:99:1436,0,1673 chrXIV 204719 . T C 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;QD=24.45;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3089,342,0 chrXIV 204752 . C T 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2482,252,0 chrXIV 204788 . C T 2655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2688,264,0 chrXIV 204840 . C G 2528 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=22.98;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2561,267,0 chrXIV 205874 . C T 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3795,387,0 chrXIV 206485 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.275;DP=140;Dels=0.00;FS=1.425;HaplotypeScore=4.4643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:140:99:1473,0,1354 chrXIV 206552 . T A 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.640;DP=149;Dels=0.00;FS=8.040;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,87:149:99:1740,0,1171 chrXIV 206555 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.946;DP=150;Dels=0.00;FS=12.188;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.221;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,63:150:99:1167,0,1804 chrXIV 206575 . G A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.141;DP=140;Dels=0.00;FS=6.361;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.522;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1177,0,1707 chrXIV 206605 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.489;DP=147;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=5.5830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,59:147:99:1132,0,1961 chrXIV 206709 . T C 4026.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4026,417,0 chrXIV 206756 . G C 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4051,426,0 chrXIV 206786 . G A 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;DP=107;Dels=0.00;FS=5.748;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1091,0,1228 chrXIV 206848 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.066;DP=137;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1369,0,1439 chrXIV 206892 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.356;DP=150;Dels=0.00;FS=1.961;HaplotypeScore=4.7962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.904;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:150:99:1280,0,1831 chrXIV 206906 . G A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;DP=154;Dels=0.00;FS=0.897;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.871;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:154:99:1389,0,1717 chrXIV 206920 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.565;DP=144;Dels=0.00;FS=1.795;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.982;QD=8.68;ReadPosRankSum=-2.226;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1280,0,1608 chrXIV 206936 . C A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;DP=134;Dels=0.00;FS=1.662;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1161,0,1552 chrXIV 206968 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.547;DP=130;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.790;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1239,0,1338 chrXIV 206986 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.815;DP=138;Dels=0.00;FS=3.279;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.937;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1330,0,1387 chrXIV 207040 . T C 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.351;DP=169;Dels=0.00;FS=1.945;HaplotypeScore=2.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.800;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,86:169:99:1676,0,1758 chrXIV 207094 . G A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.995;DP=139;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=3.6736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.923;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1351,0,1533 chrXIV 207129 . T C 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3666,393,0 chrXIV 207220 . T C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.398;DP=141;Dels=0.00;FS=5.055;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1310,0,1555 chrXIV 207283 . T G 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.525;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.363;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1356,0,1477 chrXIV 207292 . G A 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;DP=135;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=11.18;ReadPosRankSum=-2.816;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1539,0,1291 chrXIV 207346 . T C 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.975;DP=136;Dels=0.00;FS=2.215;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.680;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1367,0,1379 chrXIV 207358 . T C 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.427;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1544,0,1398 chrXIV 207451 . C T 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;DP=114;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1220,0,1112 chrXIV 207991 . G A 3832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3832,394,0 chrXIV 208195 . G A 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3237,339,0 chrXIV 208275 . C G 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3261,336,0 chrXIV 208609 . A G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.129;DP=117;Dels=0.01;FS=0.710;HaplotypeScore=6.8925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1261,0,1189 chrXIV 208820 . C T 4788.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6536;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=26.45;ReadPosRankSum=1.388;SB=-2.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,180:181:99:4788,468,0 chrXIV 209482 . A G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.643;DP=133;Dels=0.00;FS=3.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.228;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1201,0,1506 chrXIV 209761 . A T 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.041;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=12.44;ReadPosRankSum=-2.342;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,88:145:99:1834,0,1176 chrXIV 210155 . T C 4494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4494,474,0 chrXIV 210240 . G A 4966.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.29;SB=-2.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4966,499,0 chrXIV 210415 . G A 1817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.421;DP=181;Dels=0.00;FS=3.537;HaplotypeScore=9.6936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.150;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,88:181:99:1847,0,1932 chrXIV 210438 . A T 4428.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4428,445,0 chrXIV 210474 . G A 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3281,336,0 chrXIV 210617 . A G 3825.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3825,393,0 chrXIV 210688 . G A 1922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.259;DP=169;Dels=0.00;FS=1.903;HaplotypeScore=3.1378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.242;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,92:169:99:1952,0,1522 chrXIV 210763 . C T 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3830,390,0 chrXIV 210775 . G A 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6076;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.745e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3641,367,0 chrXIV 211162 . T C 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3504,363,0 chrXIV 211577 . C T 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.249;DP=150;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.938;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1680,0,1389 chrXIV 211598 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.407;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.584;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1533,0,1137 chrXIV 211824 . C T 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3601,358,0 chrXIV 211886 . A G 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.46;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2936,318,0 chrXIV 211934 . A G 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3545,372,0 chrXIV 212104 . T A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;DP=126;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.122;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1123,0,1488 chrXIV 212140 . A C 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3200,333,0 chrXIV 212538 . G A 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3519,357,0 chrXIV 213556 . T A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;DP=128;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.645;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1119,0,1636 chrXIV 213670 . G A 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.146;DP=122;Dels=0.00;FS=2.392;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.199;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,44:122:99:870,0,1626 chrXIV 213708 . C G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;DP=121;Dels=0.00;FS=7.766;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.420;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1407,0,1049 chrXIV 213764 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.418;DP=136;Dels=0.00;FS=1.361;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.223;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1536,0,1330 chrXIV 213823 . A G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.814;DP=113;Dels=0.00;FS=10.409;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1061,0,1313 chrXIV 213829 . T C 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.945;DP=100;Dels=0.00;FS=6.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.724;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:898,0,1244 chrXIV 213856 . C T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.391;DP=136;Dels=0.00;FS=1.359;HaplotypeScore=2.6904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1134,0,1577 chrXIV 213861 . T A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1205,0,1620 chrXIV 213991 . T C 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.405;DP=107;Dels=0.00;FS=3.551;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.165;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:870,0,1212 chrXIV 214019 . C A 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3185,330,0 chrXIV 214071 . G A 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2955,297,0 chrXIV 214676 . T A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.868;DP=122;Dels=0.00;FS=5.599;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=2.217;QD=9.70;ReadPosRankSum=-2.022;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1214,0,1256 chrXIV 214732 . C T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.281;DP=124;Dels=0.00;FS=22.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1072,0,1469 chrXIV 214918 . T C 4489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:179:99:4489,474,0 chrXIV 215120 . T C 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3116,333,0 chrXIV 215201 . A G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.713;DP=130;Dels=0.00;FS=6.914;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=2.351;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.816;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1445,0,1208 chrXIV 215285 . C T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.434;DP=122;Dels=0.00;FS=2.377;HaplotypeScore=2.6287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:122:99:1254,0,1239 chrXIV 215309 . C T 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.698;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1146,0,1033 chrXIV 215804 . T C 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3560,375,0 chrXIV 215887 . T A 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3548,354,0 chrXIV 216026 . T A 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3721,364,0 chrXIV 216068 . A G 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2980,315,0 chrXIV 217002 . T C 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.538;DP=105;Dels=0.00;FS=3.586;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:978,0,1239 chrXIV 217112 . G A 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.680;DP=148;Dels=0.00;FS=3.185;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.806;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1642,0,1472 chrXIV 217557 . G A 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.346;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.614;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1298,0,1199 chrXIV 217736 . G A 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.258;DP=143;Dels=0.00;FS=3.975;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1607,0,1332 chrXIV 217872 . A G 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3801,399,0 chrXIV 218071 . A G 3832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3832,399,0 chrXIV 218774 . T G 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.35;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3240,345,0 chrXIV 218831 . G T 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3946,388,0 chrXIV 218903 . A G 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.14;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3260,339,0 chrXIV 219061 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=126;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.665;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1221,0,1542 chrXIV 220228 . A T 4045.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:4045,403,0 chrXIV 220272 . G A 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3395,343,0 chrXIV 220548 . T G 2741 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.75;MQ0=0;QD=23.43;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2774,294,0 chrXIV 220550 . T G 2850 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.84;MQ0=0;QD=23.95;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2883,297,0 chrXIV 220551 . T A 2909 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=24.04;ReadPosRankSum=0.873;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:2942,297,0 chrXIV 220629 . T A 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3045,324,0 chrXIV 220632 . G A 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.41;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3217,336,0 chrXIV 220663 . A T 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3463,352,0 chrXIV 220693 . A G 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=22.79;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3715,387,0 chrXIV 220950 . C T 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3214,342,0 chrXIV 221010 . C T 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3521;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3408,357,0 chrXIV 221481 . T C 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2956,318,0 chrXIV 221673 . T A 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3535,358,0 chrXIV 221709 . T C 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3772,402,0 chrXIV 221924 . T A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.178;DP=160;Dels=0.00;FS=1.245;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.079;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1393,0,1793 chrXIV 222506 . A G 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.14;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3822,402,0 chrXIV 222725 . T C 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.46;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2859,300,0 chrXIV 222730 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;DP=120;Dels=0.00;FS=3.934;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.881;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1396,0,1047 chrXIV 222772 . C T 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2959,306,0 chrXIV 223074 . A T 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.996;DP=90;Dels=0.00;FS=4.014;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=8.76;ReadPosRankSum=-2.730;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,41:90:99:818,0,1148 chrXIV 223337 . T A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.663;DP=122;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1206,0,1378 chrXIV 223350 . A C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.802;DP=131;Dels=0.00;FS=4.264;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.698;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1262,0,1449 chrXIV 223812 . T C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.360;DP=135;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=3.5067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.649;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1160,0,1444 chrXIV 223813 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.398;DP=131;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=3.5067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.512;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:131:99:1253,0,1244 chrXIV 224148 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;DP=132;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=10.49;ReadPosRankSum=-2.009;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1415,0,1432 chrXIV 224570 . A G 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=93.1016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3368,348,0 chrXIV 224573 . G A 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=94.0963;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=24.67;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2944,312,0 chrXIV 224596 . C G 722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;DP=97;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=1.873;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:752,0,1065 chrXIV 224628 . A G 2748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.56;MQ0=0;QD=24.32;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2781,297,0 chrXIV 224654 . G A 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.643;DP=118;Dels=0.01;FS=4.054;HaplotypeScore=10.8766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=24.59;ReadPosRankSum=0.992;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2935,286,0 chrXIV 224659 . G T 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3078,324,0 chrXIV 224708 . A G 2563 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2596,291,0 chrXIV 224721 . G T 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2976,303,0 chrXIV 224875 . T C 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.945;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=8.04;ReadPosRankSum=2.403;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1003,0,1596 chrXIV 225318 . T A 2627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2660,276,0 chrXIV 225567 . G A 3898.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3898,408,0 chrXIV 225611 . C T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.484;DP=129;Dels=0.00;FS=2.258;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=8.61;ReadPosRankSum=-2.137;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1141,0,1475 chrXIV 225622 . G C 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;DP=124;Dels=0.00;FS=1.438;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.905;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:893,0,1468 chrXIV 225699 . T C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.686;DP=127;Dels=0.00;FS=4.377;HaplotypeScore=3.6433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.490;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1127,0,1401 chrXIV 226012 . A G 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.171;DP=120;Dels=0.00;FS=13.737;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.056;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:975,0,1599 chrXIV 226114 . C T 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.83;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3280,328,0 chrXIV 226164 . T C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;DP=146;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.965;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1488,0,1483 chrXIV 226403 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.876;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1001,0,1179 chrXIV 226437 . G C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;DP=121;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.218;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1111,0,1292 chrXIV 226574 . C T 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2782,291,0 chrXIV 226580 . T C 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2806,297,0 chrXIV 226724 . C T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.254;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1156,0,1529 chrXIV 226950 . A T 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3560,369,0 chrXIV 227030 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.471;DP=144;Dels=0.00;FS=6.331;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.224;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1422,0,1500 chrXIV 227151 . T C 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.100;DP=113;Dels=0.00;FS=4.613;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:940,0,1221 chrXIV 227377 . G A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;DP=100;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=4.7417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.890;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1278,0,814 chrXIV 227425 . G C 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;DP=136;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1614,0,1141 chrXIV 227444 . C T 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.555;DP=142;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.497;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1738,0,1107 chrXIV 227455 . C T 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3083,306,0 chrXIV 227510 . C A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.038;DP=111;Dels=0.00;FS=6.917;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.129;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1149,0,1178 chrXIV 227572 . A G 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0904;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=25.52;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3044,321,0 chrXIV 227577 . T G 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.973;DP=87;Dels=0.00;FS=165.493;HaplotypeScore=3.0904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=2.007;QD=0.17;ReadPosRankSum=-2.811;SB=-2.804e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,58:87:45:45,0,640 chrXIV 227933 . T C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.702;DP=93;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.767;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:990,0,883 chrXIV 229790 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;DP=123;Dels=0.00;FS=5.463;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.467;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1260,0,1320 chrXIV 229818 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.619;DP=113;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=10.11;ReadPosRankSum=2.028;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1172,0,1264 chrXIV 229890 . C T 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=118.8805;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3480,351,0 chrXIV 230182 . A G 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;DP=119;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=5.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=12.33;ReadPosRankSum=-3.518;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,71:119:99:1497,0,953 chrXIV 230577 . A G 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;DP=150;Dels=0.00;FS=7.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.203;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1547,0,1583 chrXIV 230599 . G A 3960.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=1;QD=26.76;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3960,412,0 chrXIV 230725 . T C 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2942,303,0 chrXIV 230830 . A T 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;DP=103;Dels=0.00;FS=1.735;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.558;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,43:103:99:823,0,1353 chrXIV 230962 . G T 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3990,397,0 chrXIV 231034 . G A 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3447,346,0 chrXIV 231302 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.093;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.385;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1164,0,1298 chrXIV 231326 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.594;DP=126;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.193;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1276,0,1198 chrXIV 231331 . A G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.341;DP=128;Dels=0.00;FS=3.534;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1188,0,1264 chrXIV 231344 . A T 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.745;DP=132;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.678;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1118,0,1390 chrXIV 231346 . C A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.999;DP=133;Dels=0.00;FS=2.393;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.893;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1154,0,1354 chrXIV 231426 . A G 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.78;SB=-2.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3890,396,0 chrXIV 231454 . C A 4432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.38;SB=-2.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4432,453,0 chrXIV 231474 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.990;DP=149;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1495,0,1538 chrXIV 231746 . G A 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.210;DP=113;Dels=0.00;FS=6.011;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.317;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.085;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1469,0,848 chrXIV 232094 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.176;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.007;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1337,0,1318 chrXIV 232190 . T C 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.544;DP=147;Dels=0.01;FS=2.085;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=1;MQRankSum=-0.244;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1206,0,1738 chrXIV 232241 . G A 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=1;QD=26.80;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3115,318,0 chrXIV 232256 . T G 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.254;DP=125;Dels=0.00;FS=4.375;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.936;QD=10.03;ReadPosRankSum=-2.667;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1284,0,1289 chrXIV 232298 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.454;DP=135;Dels=0.00;FS=4.095;HaplotypeScore=5.7444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=10.11;ReadPosRankSum=2.332;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1395,0,1351 chrXIV 232325 . A C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.944;DP=120;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.410;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1169,0,1211 chrXIV 232330 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.616;DP=126;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=2.019;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.049;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1373,0,1249 chrXIV 232337 . C T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.374;DP=130;Dels=0.00;FS=3.183;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.217;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1221,0,1316 chrXIV 232438 . C T 3955.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3955,403,0 chrXIV 232508 . A G 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3419,363,0 chrXIV 232598 . T C 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5968;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2838,294,0 chrXIV 232661 . G A 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.683;DP=118;Dels=0.00;FS=3.527;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1106,0,1254 chrXIV 232778 . C G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.711;DP=129;Dels=0.00;FS=4.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1211,0,1433 chrXIV 232914 . A G 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3338,339,0 chrXIV 233024 . G A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:131:99:1462,0,1205 chrXIV 233132 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.940;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1275,0,1068 chrXIV 233237 . G C 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3746,387,0 chrXIV 233293 . A T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.002;DP=124;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1229,0,1335 chrXIV 233507 . A G 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2919,309,0 chrXIV 233585 . C T 2733 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2766,294,0 chrXIV 233758 . A G 2143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2176,234,0 chrXIV 233897 . A G 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2557,270,0 chrXIV 233903 . C T 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2890,291,0 chrXIV 234264 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.712;DP=105;Dels=0.00;FS=2.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.640;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,61:105:99:1323,0,899 chrXIV 234325 . G A 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2999,309,0 chrXIV 234587 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.039;DP=139;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=2.8121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=2.277;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1529,0,1462 chrXIV 234916 . T C 2603 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2636,288,0 chrXIV 235333 . T A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;DP=118;Dels=0.00;FS=4.408;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.105;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1256,0,1207 chrXIV 235716 . G A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.284;DP=101;Dels=0.00;FS=2.581;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.900;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1112,0,995 chrXIV 235807 . T C 832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=91;Dels=0.00;FS=1.753;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:862,0,1090 chrXIV 235925 . G A 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;DP=109;Dels=0.00;FS=18.870;HaplotypeScore=6.3289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.022;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:981,0,1032 chrXIV 235956 . C T 533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.265;DP=111;Dels=0.04;FS=11.697;HaplotypeScore=55.5019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.010;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:563,0,953 chrXIV 236209 . G A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.048;DP=123;Dels=0.00;FS=6.889;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=2.306;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.437;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:1504,0,1037 chrXIV 236383 . A G 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.008;DP=119;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.189;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:969,0,1375 chrXIV 236605 . T C 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.614;DP=130;Dels=0.00;FS=2.326;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.601;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1242,0,1404 chrXIV 236685 . A G 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;DP=115;Dels=0.00;FS=7.134;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1294,0,1135 chrXIV 236740 . A G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.770;DP=113;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=2;MQRankSum=-0.369;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.513;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1086,0,1206 chrXIV 236810 . A G 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3044,318,0 chrXIV 236884 . G C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.727;DP=109;Dels=0.00;FS=6.132;HaplotypeScore=2.7022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.621;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:948,0,1301 chrXIV 237099 . T C 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.81;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3350,345,0 chrXIV 237838 . T G 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3388,360,0 chrXIV 238041 . A G 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.40;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3670,381,0 chrXIV 238429 . A G 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2985,315,0 chrXIV 238666 . A G 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3761,402,0 chrXIV 239987 . T G 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3080,333,0 chrXIV 240005 . A C 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.26;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2703,303,0 chrXIV 240009 . T C 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2830,306,0 chrXIV 240064 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.748;DP=146;Dels=0.00;FS=8.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.099;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1171,0,1636 chrXIV 240357 . C T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.067;DP=139;Dels=0.00;FS=4.220;HaplotypeScore=22.6641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=9.98;ReadPosRankSum=2.714;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1417,0,538 chrXIV 240441 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;DP=160;Dels=0.00;FS=3.458;HaplotypeScore=2.6320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.446;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,71:160:99:1485,0,1797 chrXIV 240602 . T C 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.316;DP=153;Dels=0.00;FS=14.339;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.533;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:153:99:1544,0,1576 chrXIV 240618 . G C 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;DP=161;Dels=0.00;FS=3.637;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.071;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1725,0,1545 chrXIV 241116 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.611;DP=147;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=3.6473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.425;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1579,0,1431 chrXIV 241273 . C A 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.693;DP=165;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=10.6834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.349;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:1836,0,1530 chrXIV 241408 . A G 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;DP=118;Dels=0.00;FS=5.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.236;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1421,0,1073 chrXIV 241440 . G T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.260;DP=118;Dels=0.00;FS=1.795;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.883;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1390,0,1094 chrXIV 242064 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.346;DP=161;Dels=0.00;FS=0.589;HaplotypeScore=5.7904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.922;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:161:99:1549,0,1787 chrXIV 242111 . C T 4024.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.381;DP=158;Dels=0.00;FS=3.993;HaplotypeScore=3.9723;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.052;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:4024,409,0 chrXIV 242246 . A G 2069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.565;DP=163;Dels=0.00;FS=2.805;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.358;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,96:163:99:2099,0,1314 chrXIV 242307 . T C 2184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.367;DP=190;Dels=0.00;FS=0.534;HaplotypeScore=3.3854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.904;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,104:190:99:2214,0,1792 chrXIV 242330 . A G 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.340;DP=149;Dels=0.00;FS=2.068;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.58;ReadPosRankSum=-2.017;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1755,0,1365 chrXIV 242579 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.203;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1548,0,1476 chrXIV 242589 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.393;DP=159;Dels=0.00;FS=4.653;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.281;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,74:159:99:1455,0,1811 chrXIV 242759 . C T 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.061;DP=156;Dels=0.00;FS=4.751;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=11.72;ReadPosRankSum=2.463;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:1859,0,1357 chrXIV 243194 . G T 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.166;DP=154;Dels=0.00;FS=5.075;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=1;MQRankSum=1.908;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.143;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1783,0,1469 chrXIV 243245 . A G 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.620;DP=172;Dels=0.00;FS=4.492;HaplotypeScore=6.2997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-0.794;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,92:172:99:1757,0,1625 chrXIV 243291 . G A 4183.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.66;SB=-2.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:99:4183,429,0 chrXIV 243530 . A T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.709;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1338,0,1008 chrXIV 244308 . C A 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3639,370,0 chrXIV 244768 . G C 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3408,342,0 chrXIV 244832 . G C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.710;DP=113;Dels=0.00;FS=8.961;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1294,0,1037 chrXIV 244915 . T G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.927;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.542;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1323,0,1561 chrXIV 244996 . A G 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.170;DP=115;Dels=0.00;FS=16.217;HaplotypeScore=3.8078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.930;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,68:115:99:1484,0,948 chrXIV 245307 . G A 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3482,360,0 chrXIV 245680 . A G 4053.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.33;SB=-2.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4053,411,0 chrXIV 245895 . G C 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3631,384,0 chrXIV 246138 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.124;DP=113;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1426,0,1020 chrXIV 246603 . T C 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.522;DP=143;Dels=0.00;FS=7.426;HaplotypeScore=7.9314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.572;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,49:143:99:905,0,2127 chrXIV 246634 . T A 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.970;DP=125;Dels=0.00;FS=1.509;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=6.30;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,43:125:99:817,0,1860 chrXIV 247120 . A G 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.761;DP=157;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=4.6938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.670;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:1761,0,1538 chrXIV 247217 . T A 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.241;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,80:164:99:1594,0,1781 chrXIV 247246 . T C 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;DP=160;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.403;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,83:160:99:1698,0,1572 chrXIV 247374 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.341;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.304;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1654,0,1306 chrXIV 247381 . C T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.308;DP=132;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=11.08;ReadPosRankSum=1.470;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1492,0,1283 chrXIV 247390 . T C 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.078;DP=130;Dels=0.00;FS=6.638;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.099;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1459,0,1262 chrXIV 247425 . C A 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;DP=154;Dels=0.00;FS=5.869;HaplotypeScore=5.9020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,88:154:99:1872,0,1346 chrXIV 247432 . A G 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.785;DP=145;Dels=0.00;FS=6.174;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1728,0,1298 chrXIV 247704 . A G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.034;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.988;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1221,0,1380 chrXIV 247937 . A G 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.191;DP=128;Dels=0.00;FS=6.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=2.166;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1581,0,1152 chrXIV 249114 . A T 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.632;DP=106;Dels=0.00;FS=2.858;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:957,0,1262 chrXIV 249443 . A G 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.710;DP=100;Dels=0.00;FS=5.475;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.512;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,59:100:99:1229,0,864 chrXIV 249542 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.344;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1362,0,1105 chrXIV 249569 . T A 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;DP=138;Dels=0.00;FS=4.033;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.453;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1630,0,1292 chrXIV 249918 . G A 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.32;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3388,343,0 chrXIV 250008 . G A 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.507;DP=89;Dels=0.00;FS=1.767;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.513;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:910,0,942 chrXIV 250019 . C T 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.493;DP=90;Dels=0.00;FS=1.745;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1085,0,856 chrXIV 250357 . G A 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.548;DP=145;Dels=0.00;FS=2.834;HaplotypeScore=2.5939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.362;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1783,0,1338 chrXIV 250456 . C G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.370;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.390;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:890,0,855 chrXIV 250494 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.982;DP=101;Dels=0.00;FS=1.891;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,61:101:99:1385,0,833 chrXIV 250504 . G T 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.78;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2765,291,0 chrXIV 250567 . G A 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;DP=140;Dels=0.00;FS=9.188;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:140:99:1723,0,1224 chrXIV 250619 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.827;DP=131;Dels=0.00;FS=6.557;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.167;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1409,0,1330 chrXIV 250834 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.720;DP=106;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.716;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1208,0,1024 chrXIV 250840 . T C 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:107:99:2565,270,0 chrXIV 250896 . C T 2774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2807,282,0 chrXIV 251384 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.602;DP=105;Dels=0.00;FS=9.586;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.046;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.821;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1212,0,1019 chrXIV 251975 . T C 658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.732;DP=90;Dels=0.00;FS=2.871;HaplotypeScore=7.9288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.602;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:688,0,1227 chrXIV 252203 . C G 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3747,393,0 chrXIV 252439 . C G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;DP=107;Dels=0.00;FS=7.686;HaplotypeScore=4.7157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.66;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.817;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:107:99:1160,0,1000 chrXIV 252919 . T G 431.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.266;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.22;MQ0=83;MQRankSum=-0.910;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.598;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:461,0,331 chrXIV 252933 . A G 137.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.451;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.36;MQ0=87;MQRankSum=-0.212;QD=1.00;ReadPosRankSum=1.164;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,39:137:99:167,0,572 chrXIV 253087 . T C 93.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.442;DP=82;Dels=0.00;FS=2.610;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.93;MQ0=7;MQRankSum=0.175;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:123,0,1409 chrXIV 253738 . A T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;DP=120;Dels=0.00;FS=5.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1459,0,1084 chrXIV 253777 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;DP=115;Dels=0.00;FS=14.295;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.790;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:980,0,1458 chrXIV 254264 . G C 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.829;DP=116;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=2.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=7.53;ReadPosRankSum=2.127;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:904,0,1351 chrXIV 254474 . C T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.968;DP=142;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=2.7171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.872;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1297,0,1611 chrXIV 254495 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.183;DP=127;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.152;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1295,0,1331 chrXIV 254505 . G T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.687;DP=133;Dels=0.00;FS=2.286;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.928;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.026;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1291,0,1419 chrXIV 254579 . C T 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.601;DP=159;Dels=0.00;FS=2.801;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.998;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:159:99:1555,0,1641 chrXIV 254632 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.822;DP=150;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=3.7073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.380;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1405,0,1614 chrXIV 254966 . G A 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.847;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:975,0,984 chrXIV 255077 . A G 1878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;DP=152;Dels=0.00;FS=3.838;HaplotypeScore=4.4444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=2.342;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,91:152:99:1908,0,1232 chrXIV 255165 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.989;DP=152;Dels=0.00;FS=3.845;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=2.255;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.305;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1485,0,1514 chrXIV 255178 . G A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.367;DP=130;Dels=0.00;FS=22.432;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=12.20;ReadPosRankSum=-3.156;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,80:130:99:1616,0,892 chrXIV 255189 . A T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.270;DP=95;Dels=0.00;FS=9.835;HaplotypeScore=3.4899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.928;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:95:99:1009,0,901 chrXIV 255192 . C T 2395 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.62;MQ0=0;QD=25.48;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2428,246,0 chrXIV 255215 . G A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.509;DP=102;Dels=0.00;FS=3.099;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.961;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.770;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1032,0,1007 chrXIV 255330 . C A 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.212;DP=115;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.137;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1156,0,1312 chrXIV 255754 . C A 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.676;DP=109;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.378;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,41:109:99:805,0,1403 chrXIV 256474 . G A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.496;DP=150;Dels=0.00;FS=2.984;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.304;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1225,0,1661 chrXIV 256479 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.015;DP=150;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1266,0,1769 chrXIV 256643 . G A 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.921;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1091,0,1161 chrXIV 256717 . G A 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;DP=139;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=2.586;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.009;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1348,0,1439 chrXIV 256739 . G A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;DP=122;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.405;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1244,0,1316 chrXIV 256778 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.058;DP=125;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.283;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1231,0,1380 chrXIV 256787 . G C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.854;DP=136;Dels=0.00;FS=4.132;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.013;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1322,0,1435 chrXIV 256857 . A G 4296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.55;SB=-2.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4296,447,0 chrXIV 256885 . T C 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.912;DP=159;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1632,0,1574 chrXIV 256929 . A G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.944;DP=128;Dels=0.00;FS=4.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.145;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1355,0,1306 chrXIV 257114 . C T 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3481,348,0 chrXIV 257643 . A C 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.137;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:826,0,1363 chrXIV 258010 . C T 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.037;DP=104;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:848,0,1227 chrXIV 258063 . A G 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.886;DP=95;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.344;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:935,0,1004 chrXIV 258320 . A T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;DP=120;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1225,0,1197 chrXIV 258399 . G A 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.608;DP=114;Dels=0.00;FS=7.282;HaplotypeScore=3.9343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.341;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1105,0,1282 chrXIV 258474 . G A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.332;DP=90;Dels=0.00;FS=2.800;HaplotypeScore=3.9036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.050;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.637;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,50:90:99:1116,0,789 chrXIV 258589 . T A 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.010;DP=96;Dels=0.00;FS=5.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=8.64;ReadPosRankSum=2.049;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:859,0,1221 chrXIV 258590 . G C 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2586,273,0 chrXIV 258678 . C G 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.730;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.651;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:87:99:937,0,793 chrXIV 258694 . C G 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;DP=89;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=9.8458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.851;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:945,0,869 chrXIV 258735 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.559;DP=107;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=3.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.337;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1202,0,922 chrXIV 258795 . A G 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.035;DP=151;Dels=0.00;FS=6.012;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.995;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,83:151:99:1610,0,1407 chrXIV 258883 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.912;DP=135;Dels=0.00;FS=11.275;HaplotypeScore=4.6715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=10.03;ReadPosRankSum=-2.809;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1384,0,1285 chrXIV 258894 . A G 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.16;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3029,336,0 chrXIV 259234 . C T 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.887;DP=160;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=4.7062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.030;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,90:160:99:1825,0,1307 chrXIV 259283 . A G 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3126,342,0 chrXIV 259362 . G C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.445;DP=138;Dels=0.00;FS=2.224;HaplotypeScore=2.9398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1261,0,1412 chrXIV 259404 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.070;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1452,0,1589 chrXIV 259454 . A G 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.671;DP=110;Dels=0.00;FS=2.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.006;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1118,0,1174 chrXIV 259493 . A T 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3513,349,0 chrXIV 259503 . T G 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3411,348,0 chrXIV 259519 . A G 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3284,336,0 chrXIV 259572 . G A 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.334;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.49;ReadPosRankSum=2.554;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,43:93:99:913,0,1089 chrXIV 259577 . T G 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;DP=100;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=3.3536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=7.96;ReadPosRankSum=2.649;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:826,0,1213 chrXIV 259694 . A G 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;DP=101;Dels=0.00;FS=2.620;HaplotypeScore=3.1699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=6.73;ReadPosRankSum=2.054;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:101:99:710,0,1344 chrXIV 259898 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.363;DP=104;Dels=0.00;FS=9.677;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.079;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,61:104:99:1261,0,868 chrXIV 260464 . A G 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2651,282,0 chrXIV 260586 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.671;DP=105;Dels=0.00;FS=1.792;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.288;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:105:99:1187,0,939 chrXIV 260605 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.356;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.390;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1078,0,1229 chrXIV 260618 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.526;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.576;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1002,0,1222 chrXIV 261296 . G A 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.408;DP=163;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=4.7546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.360;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,57:163:99:1012,0,2095 chrXIV 261362 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.774;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1332,0,1471 chrXIV 261659 . G A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;DP=156;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=10.21;ReadPosRankSum=2.264;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1623,0,1580 chrXIV 261740 . T C 1848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.772;DP=163;Dels=0.00;FS=1.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,93:163:99:1878,0,1450 chrXIV 261861 . G C 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.241;DP=134;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.504;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1499,0,1154 chrXIV 262265 . G A 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.523;DP=110;Dels=0.00;FS=2.593;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,65:110:99:1367,0,857 chrXIV 262301 . G A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.862;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.082;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,53:92:99:1118,0,727 chrXIV 262310 . G A 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.982;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=10.71;ReadPosRankSum=2.130;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:1015,0,881 chrXIV 262513 . T G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.283;DP=116;Dels=0.00;FS=4.702;HaplotypeScore=6.7263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.825;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:116:99:1261,0,1217 chrXIV 262697 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;DP=118;Dels=0.00;FS=12.596;HaplotypeScore=4.8779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.566;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1121,0,1276 chrXIV 263036 . A G 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=141;Dels=0.00;FS=6.006;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1502,0,1315 chrXIV 263191 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.220;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1166,0,832 chrXIV 263487 . C T 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.593;DP=83;Dels=0.00;FS=2.071;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.362;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:884,0,887 chrXIV 263592 . C T 432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.533;DP=92;Dels=0.00;FS=16.207;HaplotypeScore=2.4002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.076;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:92:99:462,0,976 chrXIV 263625 . T A 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;DP=111;Dels=0.00;FS=9.467;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.499;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:997,0,1223 chrXIV 263896 . A C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.827;DP=102;Dels=0.00;FS=2.595;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.929;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1101,0,1020 chrXIV 263968 . T C 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.761;DP=121;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=7.5928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1402,0,994 chrXIV 264232 . A G 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=21.56;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2469,264,0 chrXIV 264468 . G T 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;DP=134;Dels=0.00;FS=11.503;HaplotypeScore=3.6458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.036;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1542,0,1200 chrXIV 264537 . A G 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.382;DP=163;Dels=0.00;FS=1.262;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=1;MQRankSum=-0.276;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.037;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,89:163:99:1764,0,1566 chrXIV 265258 . G C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=115;Dels=0.00;FS=4.523;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.216;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1182,0,1133 chrXIV 265328 . C T 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.867;DP=136;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.978;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1418,0,1276 chrXIV 265514 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.687;DP=152;Dels=0.00;FS=3.798;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.802;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1643,0,1495 chrXIV 265583 . A G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.392;DP=116;Dels=0.00;FS=7.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.030;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:991,0,1392 chrXIV 265604 . T C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.157;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.616;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1128,0,1359 chrXIV 265613 . A C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;DP=128;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=3.8212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:128:99:1243,0,1423 chrXIV 265690 . G A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.793;DP=120;Dels=0.00;FS=3.652;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.715;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1359,0,1143 chrXIV 266015 . C A 1764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.755;DP=164;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=4.7720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.113;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,90:164:99:1794,0,1506 chrXIV 266598 . T C 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.164;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1532,0,1790 chrXIV 266760 . C T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;DP=107;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1058,0,1177 chrXIV 266800 . A G 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.406;DP=108;Dels=0.00;FS=2.490;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.438;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:982,0,1257 chrXIV 266808 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;DP=103;Dels=0.00;FS=3.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1090,0,1108 chrXIV 266839 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.101;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.136;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1160,0,1356 chrXIV 266907 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.263;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.278;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1044,0,1252 chrXIV 266924 . G A 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.292;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.3678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.599;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1830,0,1615 chrXIV 267161 . G A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;DP=99;Dels=0.00;FS=5.006;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.895;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:1021,0,1113 chrXIV 267262 . T G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.877;DP=122;Dels=0.00;FS=5.666;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=9.74;ReadPosRankSum=-2.582;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1218,0,1271 chrXIV 267267 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.269;DP=115;Dels=0.00;FS=5.852;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=10.49;ReadPosRankSum=-2.006;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1236,0,1168 chrXIV 268096 . T A 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.271;DP=157;Dels=0.00;FS=7.137;HaplotypeScore=6.6776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.438;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1643,0,1690 chrXIV 268265 . A G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.540;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:1350,0,1826 chrXIV 268398 . T G 3707.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;DP=143;Dels=0.00;FS=4.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=25.92;ReadPosRankSum=-1.684;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3707,374,0 chrXIV 268643 . G A 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.655;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.659;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,83:150:99:1772,0,1384 chrXIV 268898 . C T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.450;DP=112;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:112:99:1303,0,1022 chrXIV 269266 . C G 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2991,324,0 chrXIV 269607 . G C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.384;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.453;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1374,0,1511 chrXIV 270079 . C A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.066;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.190;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,75:168:99:1462,0,1761 chrXIV 270107 . T G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;DP=174;Dels=0.00;FS=1.214;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,81:174:99:1427,0,1943 chrXIV 270129 . A T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.864;DP=148;Dels=0.00;FS=3.896;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=8.91;ReadPosRankSum=2.168;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,65:148:99:1348,0,1755 chrXIV 270133 . C T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.062;DP=148;Dels=0.00;FS=4.981;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=8.53;ReadPosRankSum=3.756;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:148:99:1292,0,1744 chrXIV 270160 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.149;DP=151;Dels=0.00;FS=6.013;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,65:151:99:1259,0,1816 chrXIV 270237 . T A 257.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.769;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.327;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:287,0,1414 chrXIV 270238 . A T 279.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.520;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQ0=0;MQRankSum=-3.113;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.018;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:309,0,1362 chrXIV 270239 . C T 470.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.380;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQ0=0;MQRankSum=-3.149;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.179;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:500,0,1344 chrXIV 270241 . A T 587.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.827;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.69;MQ0=0;MQRankSum=-3.797;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:97:99:617,0,1309 chrXIV 270347 . A G 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.624;DP=98;Dels=0.00;FS=6.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.803;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1001,0,996 chrXIV 270360 . T C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.044;DP=106;Dels=0.00;FS=11.118;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.781;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.241;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:986,0,1228 chrXIV 270523 . T G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.951;DP=136;Dels=0.00;FS=2.186;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1424,0,1177 chrXIV 270998 . A C 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;DP=103;Dels=0.00;FS=1.872;HaplotypeScore=10.2820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=2.324;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:852,0,828 chrXIV 271001 . T C 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=102;Dels=0.00;FS=0.862;HaplotypeScore=8.5533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.665;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:102:99:839,0,815 chrXIV 271098 . T G 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2919,315,0 chrXIV 271256 . G C 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;DP=164;Dels=0.00;FS=1.228;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.247;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,87:164:99:1763,0,1551 chrXIV 271371 . C G 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;DP=134;Dels=0.00;FS=4.228;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.419;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1498,0,1199 chrXIV 271404 . A G 1956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.634;DP=161;Dels=0.00;FS=1.255;HaplotypeScore=5.7927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=2.311;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.720;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,92:161:99:1986,0,1397 chrXIV 271443 . T A 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;DP=148;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.630;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1731,0,1407 chrXIV 271494 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.091;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=2.6694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1137,0,1440 chrXIV 271512 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.673;DP=131;Dels=0.00;FS=6.512;HaplotypeScore=2.8400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1412,0,1329 chrXIV 271532 . C A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.044;DP=128;Dels=0.01;FS=4.342;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.743;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1522,0,1145 chrXIV 271772 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;DP=106;Dels=0.00;FS=9.335;HaplotypeScore=2.6511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.127;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1121,0,1130 chrXIV 272095 . T C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.158;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1310,0,1764 chrXIV 272165 . C T 2554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=23.43;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2587,267,0 chrXIV 273091 . C T 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.353;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.248;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1388,0,1067 chrXIV 273490 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.072;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,50:122:99:963,0,1538 chrXIV 274379 . G T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.503;DP=105;Dels=0.00;FS=3.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1141,0,1066 chrXIV 275434 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.260;DP=126;Dels=0.00;FS=7.070;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1495,0,1146 chrXIV 276550 . A G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.617;DP=110;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1087,0,1234 chrXIV 276799 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.882;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1374,0,1428 chrXIV 276831 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.743;DP=135;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1362,0,1456 chrXIV 277255 . A T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;DP=148;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1626,0,1493 chrXIV 277334 . A T 3959.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5964;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3959,405,0 chrXIV 277361 . G A 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3715,385,0 chrXIV 277454 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3267,330,0 chrXIV 279996 . G A 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.64;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2804,288,0 chrXIV 280017 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.843;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=8.59;ReadPosRankSum=-3.075;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1001,0,1334 chrXIV 280112 . C T 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.948;DP=90;Dels=0.00;FS=5.793;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:1010,0,831 chrXIV 280878 . C T 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;DP=99;Dels=0.00;FS=1.607;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1123,0,912 chrXIV 280946 . A G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.399;DP=122;Dels=0.00;FS=3.328;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.436;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1361,0,1119 chrXIV 281196 . G A 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3522,351,0 chrXIV 281634 . C T 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.509;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:1022,0,1348 chrXIV 281654 . A T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.109;DP=113;Dels=0.00;FS=1.558;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:113:99:1058,0,1302 chrXIV 282032 . C T 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3059,301,0 chrXIV 283562 . A G 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.646;DP=101;Dels=0.00;FS=1.797;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:865,0,925 chrXIV 283748 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.721;DP=142;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=8.6453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:142:99:1100,0,1713 chrXIV 284646 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.908;DP=130;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.417;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:130:99:1219,0,1217 chrXIV 284715 . T A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;DP=134;Dels=0.00;FS=2.336;HaplotypeScore=3.9090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.225;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1372,0,1381 chrXIV 284733 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.802;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.116;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1325,0,1387 chrXIV 284847 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;DP=122;Dels=0.00;FS=5.599;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.105;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1433,0,1028 chrXIV 285069 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.130;DP=111;Dels=0.00;FS=9.005;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1199,0,1101 chrXIV 285483 . C T 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;DP=110;Dels=0.00;FS=8.418;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,68:110:99:1516,0,814 chrXIV 285543 . G C 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.992;DP=142;Dels=0.00;FS=8.879;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.383;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1674,0,1221 chrXIV 285930 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.341;DP=139;Dels=0.00;FS=2.147;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.934;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1605,0,1315 chrXIV 286044 . C T 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.847;DP=141;Dels=0.00;FS=5.070;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=11.04;ReadPosRankSum=2.661;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1587,0,1457 chrXIV 286055 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.501;DP=127;Dels=0.00;FS=8.324;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=2.092;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.379;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1522,0,1162 chrXIV 286221 . T A 720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=96;Dels=0.00;FS=6.646;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=7.50;ReadPosRankSum=-1.619;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:96:99:750,0,1097 chrXIV 286433 . T C 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.146;DP=128;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=3.0544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.880;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1386,0,1217 chrXIV 286831 . A T 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;DP=111;Dels=0.00;FS=9.098;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:1002,0,1387 chrXIV 286862 . C T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;DP=109;Dels=0.01;FS=3.563;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.025;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1060,0,1114 chrXIV 287016 . C G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;DP=145;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.401;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1326,0,1680 chrXIV 287246 . G A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.146;DP=142;Dels=0.00;FS=3.035;HaplotypeScore=5.5373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1560,0,1443 chrXIV 287304 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.440;DP=135;Dels=0.00;FS=1.418;HaplotypeScore=10.3034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.245;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1274,0,1461 chrXIV 287408 . C A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.800;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.695;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.456;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1299,0,1136 chrXIV 287435 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.440;DP=117;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.308;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1216,0,1183 chrXIV 287504 . C T 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3149,330,0 chrXIV 287606 . T C 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.005;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1610,0,1486 chrXIV 287672 . T G 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.718;DP=179;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.431;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,91:179:99:1829,0,1868 chrXIV 287867 . C G 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;DP=143;Dels=0.00;FS=6.219;HaplotypeScore=4.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=10.11;ReadPosRankSum=-2.671;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1476,0,1476 chrXIV 288102 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.434;DP=137;Dels=0.00;FS=7.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.531;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1078,0,1670 chrXIV 288146 . A T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.299;DP=119;Dels=0.00;FS=3.390;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.151;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.891;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:1003,0,1497 chrXIV 288198 . A T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;DP=138;Dels=0.00;FS=13.841;HaplotypeScore=6.5840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.635;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1415,0,1495 chrXIV 288389 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.689;DP=156;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=7.8448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.152;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1492,0,1611 chrXIV 288447 . A G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.016;DP=146;Dels=0.00;FS=1.347;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.690;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1315,0,1617 chrXIV 289129 . A G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;DP=128;Dels=0.00;FS=4.198;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.739;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1250,0,1405 chrXIV 289973 . G T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.512;DP=126;Dels=0.00;FS=3.166;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.067;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.862;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1421,0,1246 chrXIV 290019 . C T 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.166;DP=93;Dels=0.00;FS=8.576;HaplotypeScore=211.7123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.63;MQ0=0;MQRankSum=-3.960;QD=7.92;ReadPosRankSum=-3.599;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:767,0,1033 chrXIV 290022 . C T 686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.940;DP=92;Dels=0.00;FS=7.057;HaplotypeScore=320.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=-5.517;QD=7.46;ReadPosRankSum=-4.013;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,35:92:99:716,0,1002 chrXIV 290038 . G A 565.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;DP=81;Dels=0.00;FS=21.017;HaplotypeScore=223.8418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQ0=0;MQRankSum=-5.465;QD=6.98;ReadPosRankSum=-5.485;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:595,0,529 chrXIV 290041 . A T 391.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.360;DP=70;Dels=0.00;FS=7.542;HaplotypeScore=128.1574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQ0=0;MQRankSum=-5.337;QD=5.59;ReadPosRankSum=-5.467;SB=-6.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:421,0,455 chrXIV 290043 . C G 401.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.842;DP=69;Dels=0.00;FS=9.530;HaplotypeScore=64.3679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-5.932;QD=5.81;ReadPosRankSum=-5.694;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:431,0,414 chrXIV 290167 . A G 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.173;DP=140;Dels=0.00;FS=3.024;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.046;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1398,0,1381 chrXIV 290265 . C T 1831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.116;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.046;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,85:154:99:1861,0,1315 chrXIV 290461 . G A 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.088;DP=99;Dels=0.00;FS=6.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.872;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:957,0,1079 chrXIV 290715 . C T 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.517;DP=143;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=11.04;ReadPosRankSum=-2.055;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1608,0,1327 chrXIV 290802 . T C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.624;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1160,0,1383 chrXIV 291136 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.456;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.365;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1014,0,1088 chrXIV 291360 . G A 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;DP=107;Dels=0.00;FS=2.588;HaplotypeScore=2.8308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:813,0,1423 chrXIV 291552 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.804;DP=119;Dels=0.00;FS=7.152;HaplotypeScore=3.7044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=9.66;ReadPosRankSum=4.208;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1179,0,1253 chrXIV 291654 . T A 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.411;DP=144;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=4.1788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.596;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1523,0,1437 chrXIV 292005 . A C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;DP=127;Dels=0.00;FS=2.391;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.036;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1370,0,1223 chrXIV 292036 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;DP=131;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.269;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1333,0,1345 chrXIV 292265 . T C 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.892;DP=116;Dels=0.00;FS=4.701;HaplotypeScore=2.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,72:116:99:1477,0,900 chrXIV 292355 . G C 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.875;DP=110;Dels=0.00;FS=4.955;HaplotypeScore=3.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:110:99:1311,0,897 chrXIV 292505 . C T 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.181;DP=94;Dels=0.00;FS=3.919;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.857;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:996,0,931 chrXIV 292683 . A T 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.032;DP=138;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.415;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1559,0,1375 chrXIV 292695 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.260;DP=143;Dels=0.00;FS=3.146;HaplotypeScore=8.8917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.467;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1507,0,1365 chrXIV 292862 . C T 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.434;DP=85;Dels=0.00;FS=0.827;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=11.47;ReadPosRankSum=2.090;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,47:85:99:1005,0,717 chrXIV 292881 . C T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.017;DP=79;Dels=0.00;FS=4.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.393;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,46:79:99:894,0,601 chrXIV 292884 . T G 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;DP=83;Dels=0.00;FS=4.270;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.381;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:973,0,644 chrXIV 292923 . C T 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;DP=99;Dels=0.00;FS=0.840;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:986,0,921 chrXIV 293015 . G T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.457;DP=114;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,67:114:99:1456,0,921 chrXIV 293042 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.825;DP=121;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=4.1434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.392;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1519,0,1063 chrXIV 293332 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.233;DP=124;Dels=0.00;FS=6.864;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1295,0,1164 chrXIV 293347 . A G 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;DP=136;Dels=0.00;FS=3.081;HaplotypeScore=3.6273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.823;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1457,0,1291 chrXIV 294292 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.303;DP=122;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1101,0,1431 chrXIV 294334 . G A 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.481;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.891;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:910,0,1515 chrXIV 294681 . A G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=127;Dels=0.00;FS=3.220;HaplotypeScore=3.4653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.246;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1072,0,1517 chrXIV 294859 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.923;DP=127;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=10.02;ReadPosRankSum=2.166;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:127:99:1303,0,1161 chrXIV 294928 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.318;DP=150;Dels=0.00;FS=10.401;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.452;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1009,0,1312 chrXIV 294973 . T C 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.466;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:963,0,948 chrXIV 295050 . T C 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;DP=139;Dels=0.00;FS=6.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.354;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1615,0,1272 chrXIV 295066 . G A 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;DP=141;Dels=0.00;FS=6.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.768;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1558,0,1373 chrXIV 295690 . C A 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.342;DP=144;Dels=0.00;FS=11.796;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.540;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1354,0,1545 chrXIV 295803 . A C 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.712;DP=179;Dels=0.00;FS=1.996;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=1;MQRankSum=-1.207;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,90:179:99:1675,0,1913 chrXIV 296137 . T C 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.608;DP=155;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1640,0,1594 chrXIV 296142 . T C 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.186;DP=154;Dels=0.00;FS=1.254;HaplotypeScore=3.5636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1605,0,1566 chrXIV 296392 . A C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.340;DP=129;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1305,0,1196 chrXIV 296416 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.200;DP=127;Dels=0.00;FS=4.857;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1376,0,1221 chrXIV 296479 . T C 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=145;Dels=0.00;FS=4.945;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1673,0,1366 chrXIV 296745 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.710;DP=133;Dels=0.00;FS=3.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.074;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1381,0,1293 chrXIV 296824 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.174;DP=144;Dels=0.00;FS=2.069;HaplotypeScore=3.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.124;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1469,0,1470 chrXIV 297016 . A G 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3534,357,0 chrXIV 297160 . A G 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.270;DP=158;Dels=0.00;FS=3.875;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.202;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1709,0,1405 chrXIV 297187 . G A 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.745e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3684,375,0 chrXIV 297196 . C T 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.632;DP=144;Dels=0.00;FS=11.821;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.691;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1534,0,1448 chrXIV 297253 . T C 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3305,336,0 chrXIV 297316 . G C 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.089;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.410;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1689,0,1359 chrXIV 297334 . G A 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3836,388,0 chrXIV 297366 . C T 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3689,384,0 chrXIV 297636 . C T 1934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.454;DP=161;Dels=0.00;FS=1.958;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.326;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,88:161:99:1964,0,1495 chrXIV 297638 . C T 1896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.824;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,89:159:99:1926,0,1395 chrXIV 297762 . G A 4969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=87.9522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.02;SB=-2.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,191:191:99:4969,496,0 chrXIV 298016 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.390;DP=134;Dels=0.00;FS=5.594;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=2.757;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.058;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1202,0,1525 chrXIV 298031 . C A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.345;DP=139;Dels=0.00;FS=2.262;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.665;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1412,0,1531 chrXIV 298065 . G A 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.006;DP=156;Dels=0.00;FS=4.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,86:156:99:1778,0,1413 chrXIV 298073 . C T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.373;DP=150;Dels=0.00;FS=2.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.153;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1517,0,1435 chrXIV 298110 . C A 3825.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.56;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3825,399,0 chrXIV 298271 . C T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.427;DP=118;Dels=0.00;FS=10.202;HaplotypeScore=5.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.780;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1393,0,1060 chrXIV 298397 . A C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.734;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1021,0,1582 chrXIV 298403 . C T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;DP=129;Dels=0.00;FS=4.201;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.528;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1543,0,1223 chrXIV 298431 . A G 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.204;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.0163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1441,0,1417 chrXIV 298460 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.216;DP=128;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=5.7696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.913;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1263,0,1411 chrXIV 298878 . T C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;DP=121;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.289;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1194,0,1360 chrXIV 299003 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;DP=120;Dels=0.00;FS=4.435;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.591;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1356,0,1108 chrXIV 299018 . C T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;DP=111;Dels=0.00;FS=8.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.239;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1152,0,1087 chrXIV 299037 . A G 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.910;DP=96;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=9.57;ReadPosRankSum=2.019;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:949,0,1007 chrXIV 299269 . C T 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.895;DP=157;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=15.3026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:1788,0,1443 chrXIV 299515 . A G 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.883;DP=91;Dels=0.00;FS=1.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1031,0,877 chrXIV 299609 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.041;DP=135;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.878;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1270,0,1512 chrXIV 299776 . T A 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;DP=131;Dels=0.00;FS=4.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=7.87;ReadPosRankSum=2.076;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1061,0,1599 chrXIV 299817 . G T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.301;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=2.065;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1042,0,1466 chrXIV 300017 . T C 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3419,357,0 chrXIV 300043 . G T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.309;DP=129;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1288,0,1397 chrXIV 300185 . G A 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.599;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1768,0,1113 chrXIV 300215 . T C 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.507;DP=124;Dels=0.00;FS=8.576;HaplotypeScore=6.9090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=2.065;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.121;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,76:124:99:1585,0,977 chrXIV 300269 . C A 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.771;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=2.244;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.770;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1495,0,1494 chrXIV 300270 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.894;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.786;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1471,0,1501 chrXIV 300432 . G A 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;DP=145;Dels=0.01;FS=0.619;HaplotypeScore=6.7070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.718;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1491,0,1522 chrXIV 300452 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.090;DP=136;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.100;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1226,0,1455 chrXIV 300720 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.753;DP=163;Dels=0.01;FS=8.357;HaplotypeScore=6.6410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=1;MQRankSum=0.964;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.753;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1479,0,1767 chrXIV 300738 . G C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;DP=158;Dels=0.00;FS=2.860;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=1;MQRankSum=-1.111;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.646;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:158:99:1381,0,1794 chrXIV 300765 . T A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.355;DP=130;Dels=0.00;FS=2.263;HaplotypeScore=105.3497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.169;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,75:130:99:1517,0,1015 chrXIV 300839 . G A 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.706;DP=110;Dels=0.00;FS=7.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.159;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:892,0,1092 chrXIV 300854 . G A 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.697;DP=109;Dels=0.00;FS=2.637;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1283,0,843 chrXIV 300894 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.090;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.218;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:129:99:1141,0,1415 chrXIV 300940 . A G 331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.000;DP=117;Dels=0.00;FS=21.050;HaplotypeScore=180.2235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQ0=1;MQRankSum=-3.662;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.150;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,41:117:99:361,0,339 chrXIV 301024 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.326;DP=128;Dels=0.00;FS=1.887;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.848;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1189,0,1415 chrXIV 301059 . A T 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;DP=144;Dels=0.00;FS=1.532;HaplotypeScore=3.8153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1638,0,1345 chrXIV 301114 . T C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.935;DP=130;Dels=0.00;FS=2.334;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1413,0,1307 chrXIV 301119 . A T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=140;Dels=0.00;FS=2.305;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1403,0,1537 chrXIV 301149 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.477;DP=147;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=0.341;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.129;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1400,0,1606 chrXIV 301186 . G T 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.284;DP=136;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=180.7370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.748;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.700;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:974,0,1351 chrXIV 301290 . T C 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3162,330,0 chrXIV 301334 . A C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.689;DP=129;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.558;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1096,0,1548 chrXIV 301506 . A G 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2990,318,0 chrXIV 301548 . T A 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3597,381,0 chrXIV 301618 . A T 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3470,354,0 chrXIV 301781 . C G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;DP=124;Dels=0.00;FS=2.496;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.719;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1136,0,1320 chrXIV 301794 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.500;DP=118;Dels=0.00;FS=4.927;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.569;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.652;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1275,0,1128 chrXIV 301887 . C G 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.618;DP=118;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1147,0,1124 chrXIV 301978 . A T 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;DP=124;Dels=0.00;FS=3.193;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:978,0,1443 chrXIV 301979 . T C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=124;Dels=0.00;FS=3.193;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.745;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:998,0,1391 chrXIV 302115 . G A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.410;DP=153;Dels=0.00;FS=1.290;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,64:153:99:1251,0,1839 chrXIV 302118 . A T 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.704;DP=154;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=3.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.250;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,88:154:99:1841,0,1360 chrXIV 302222 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.828;DP=143;Dels=0.00;FS=2.983;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.569;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1495,0,1405 chrXIV 302243 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.798;DP=142;Dels=0.00;FS=4.117;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.616;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1494,0,1445 chrXIV 302285 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.641;DP=151;Dels=0.00;FS=4.325;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.033;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1592,0,1522 chrXIV 302293 . G T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.350;DP=150;Dels=0.00;FS=6.732;HaplotypeScore=2.6624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.824;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1504,0,1537 chrXIV 302316 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.999;DP=136;Dels=0.01;FS=6.683;HaplotypeScore=17.3596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.033;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1342,0,1278 chrXIV 302384 . T C 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.369;DP=135;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=4.5012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:135:99:1422,0,1239 chrXIV 302577 . T A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.456;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.267;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1284,0,952 chrXIV 302715 . C T 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.337;DP=122;Dels=0.00;FS=2.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.308;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1245,0,1217 chrXIV 303460 . G T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.248;DP=118;Dels=0.00;FS=2.476;HaplotypeScore=2.9615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.206;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.529;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1107,0,1372 chrXIV 303465 . T G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;DP=124;Dels=0.00;FS=3.365;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.628;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1132,0,1425 chrXIV 303479 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.426;DP=143;Dels=0.00;FS=8.876;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1136,0,1651 chrXIV 303486 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.608;DP=140;Dels=0.00;FS=8.937;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1250,0,1608 chrXIV 303657 . C T 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;DP=136;Dels=0.00;FS=1.372;HaplotypeScore=2.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.895;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.137;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1491,0,1329 chrXIV 303695 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.935;DP=146;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.390;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:146:99:1519,0,1440 chrXIV 304122 . G A 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.235;DP=146;Dels=0.00;FS=20.113;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.175;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1664,0,1393 chrXIV 304222 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;DP=131;Dels=0.00;FS=7.842;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.317;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1511,0,1270 chrXIV 304693 . C T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.116;DP=135;Dels=0.00;FS=3.152;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.019;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1503,0,1254 chrXIV 305724 . A G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.536;DP=129;Dels=0.00;FS=5.496;HaplotypeScore=3.3929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1418,0,1124 chrXIV 305808 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.207;DP=132;Dels=0.00;FS=6.991;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=1;MQRankSum=-1.039;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.361;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1374,0,1377 chrXIV 305863 . A G 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;DP=158;Dels=0.00;FS=3.750;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=1;MQRankSum=0.210;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:158:99:1421,0,1800 chrXIV 305916 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;DP=128;Dels=0.00;FS=2.477;HaplotypeScore=3.6394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.215;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1091,0,1460 chrXIV 305936 . T C 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.272;DP=118;Dels=0.00;FS=3.831;HaplotypeScore=9.6459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=6.89;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:118:99:843,0,1333 chrXIV 306024 . T C 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.652;DP=138;Dels=0.00;FS=7.824;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.706;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1621,0,1285 chrXIV 306047 . G A 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.295;DP=135;Dels=0.00;FS=14.256;HaplotypeScore=2.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.278;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1698,0,1130 chrXIV 306090 . G A 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.758;DP=125;Dels=0.00;FS=27.524;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1285,0,1178 chrXIV 306244 . T C 573.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;DP=114;Dels=0.00;FS=11.344;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-6.868;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.358;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,38:114:99:603,0,1813 chrXIV 306250 . A G 536.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.152;DP=115;Dels=0.00;FS=9.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQ0=0;MQRankSum=-7.583;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.326;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,37:115:99:566,0,1831 chrXIV 306252 . C T 512.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.182;DP=114;Dels=0.00;FS=9.738;HaplotypeScore=61.8565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-8.035;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.522;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,35:114:99:542,0,1774 chrXIV 306286 . G A 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.036;DP=153;Dels=0.00;FS=9.673;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-5.460;QD=5.01;ReadPosRankSum=-2.209;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,47:153:99:796,0,2425 chrXIV 306300 . A G 534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.862;DP=128;Dels=0.00;FS=3.731;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,36:128:99:564,0,2163 chrXIV 306326 . C T 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;DP=126;Dels=0.00;FS=2.488;HaplotypeScore=15.5885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.112;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,42:126:99:751,0,1862 chrXIV 306527 . A G 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.285;DP=115;Dels=0.00;FS=3.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.598;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:926,0,1453 chrXIV 306678 . A T 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.836;DP=161;Dels=0.00;FS=2.744;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.867;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1710,0,1651 chrXIV 307339 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.215;DP=107;Dels=0.00;FS=2.506;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1160,0,1131 chrXIV 307707 . A G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=125;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.604;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1165,0,1463 chrXIV 307892 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.056;DP=115;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.764;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1216,0,1209 chrXIV 308673 . C T 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.577;DP=96;Dels=0.00;FS=0.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.429;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.415;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:760,0,1218 chrXIV 309212 . T C 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3218,333,0 chrXIV 309245 . T C 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3533,366,0 chrXIV 309362 . T C 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3006,306,0 chrXIV 309395 . C T 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.079;DP=120;Dels=0.00;FS=2.401;HaplotypeScore=3.4629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.354;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1216,0,1184 chrXIV 309497 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.142;DP=142;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=8.7208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.294;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:142:99:1349,0,1321 chrXIV 310181 . A G 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3581,369,0 chrXIV 310538 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.714;DP=128;Dels=0.00;FS=4.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1226,0,1484 chrXIV 310729 . A G 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3698,375,0 chrXIV 311357 . T G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.670;DP=109;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1085,0,1160 chrXIV 311376 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.484;DP=113;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=5.7426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:113:99:1121,0,1190 chrXIV 311487 . T C 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.569;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1469,0,1247 chrXIV 311556 . G A 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.109;DP=140;Dels=0.00;FS=4.161;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.782;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1535,0,1433 chrXIV 311614 . G A 4240.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.01;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4240,447,0 chrXIV 311651 . C T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.991;DP=177;Dels=0.00;FS=5.315;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,82:177:99:1540,0,2029 chrXIV 311670 . A T 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.252;DP=163;Dels=0.00;FS=9.733;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.011;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1724,0,1693 chrXIV 311673 . G T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.170;DP=161;Dels=0.00;FS=9.807;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.864;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1701,0,1554 chrXIV 312227 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.983;DP=104;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.118;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1202,0,1058 chrXIV 312312 . A G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.080;DP=117;Dels=0.00;FS=4.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.172;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1208,0,1213 chrXIV 312376 . C T 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.274;DP=99;Dels=0.00;FS=1.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.017;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1118,0,883 chrXIV 312912 . G A 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3575,372,0 chrXIV 313160 . G A 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3235,336,0 chrXIV 313182 . C T 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3254,324,0 chrXIV 313387 . C T 724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.918;DP=96;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:754,0,1187 chrXIV 313482 . C T 2164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2197,219,0 chrXIV 313645 . C T 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;DP=86;Dels=0.00;FS=0.855;HaplotypeScore=8.8267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=1;MQRankSum=-0.322;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,46:86:99:921,0,751 chrXIV 313665 . G A 617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.654;DP=75;Dels=0.00;FS=2.042;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=1;MQRankSum=0.620;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.783;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:647,0,867 chrXIV 313792 . C T 1742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.572;DP=65;Dels=0.00;FS=3.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.466;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:1775,183,0 chrXIV 313908 . A G 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2785,285,0 chrXIV 313965 . T C 3303.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9411;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.21;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3303,336,0 chrXIV 314221 . G C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.660;DP=113;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.117;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1160,0,1149 chrXIV 314337 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;DP=117;Dels=0.00;FS=1.833;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.563;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1473,0,1015 chrXIV 314700 . G A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;DP=95;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.814;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,60:95:99:1304,0,619 chrXIV 314885 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=10.34;ReadPosRankSum=-3.067;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1530,0,1435 chrXIV 314976 . G A 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;DP=122;Dels=0.00;FS=3.292;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.711;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1255,0,1110 chrXIV 315076 . C T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.675;DP=129;Dels=0.00;FS=3.236;HaplotypeScore=4.8871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.419;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1258,0,1472 chrXIV 315314 . C T 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.932;DP=146;Dels=0.00;FS=11.686;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.775;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1594,0,1501 chrXIV 315396 . A G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;DP=95;Dels=0.00;FS=5.722;HaplotypeScore=4.1871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.212;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1133,0,810 chrXIV 315475 . G A 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.511;DP=110;Dels=0.00;FS=2.478;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.088;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,65:110:99:1388,0,922 chrXIV 315726 . G A 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.908;DP=146;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:146:99:1778,0,1231 chrXIV 315771 . G A 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.454;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.932;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1246,0,1071 chrXIV 315912 . T C 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.225;DP=112;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:999,0,1273 chrXIV 316551 . C T 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.016;DP=136;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.331;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1545,0,1195 chrXIV 316708 . A C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.903;DP=118;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1265,0,1153 chrXIV 316782 . C T 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3375,334,0 chrXIV 316913 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;DP=143;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.948;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1266,0,1673 chrXIV 316949 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.640;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1260,0,1360 chrXIV 316955 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.764;DP=126;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.896;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1297,0,1383 chrXIV 317015 . G A 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;DP=157;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1645,0,1587 chrXIV 317754 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.332;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.547;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1133,0,1224 chrXIV 317912 . A G 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.396;DP=155;Dels=0.00;FS=22.241;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.882;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,75:155:99:1451,0,1781 chrXIV 318127 . C T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.884;DP=139;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=6.1974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=1;MQRankSum=0.408;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1526,0,1217 chrXIV 318136 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;DP=140;Dels=0.00;FS=2.395;HaplotypeScore=5.2331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=0.095;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.356;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1449,0,1365 chrXIV 318162 . T C 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.616;DP=146;Dels=0.00;FS=4.299;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.216;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1517,0,1336 chrXIV 318393 . A T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;DP=124;Dels=0.00;FS=2.382;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=10.02;ReadPosRankSum=3.082;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1272,0,1355 chrXIV 318423 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.200;DP=118;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.601;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1151,0,1264 chrXIV 318591 . G T 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3629,372,0 chrXIV 318678 . A G 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.787;DP=161;Dels=0.00;FS=2.802;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,89:161:99:1766,0,1444 chrXIV 318794 . A G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;DP=119;Dels=0.00;FS=6.971;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1348,0,1209 chrXIV 318821 . A G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.628;DP=113;Dels=0.00;FS=8.806;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.751;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1203,0,1132 chrXIV 318876 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;DP=93;Dels=0.00;FS=5.263;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.455;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1143,0,795 chrXIV 318886 . T G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.962;DP=91;Dels=0.00;FS=5.300;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:986,0,849 chrXIV 318903 . G C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.814;DP=87;Dels=0.00;FS=8.879;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.489;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:914,0,882 chrXIV 318992 . G A 2159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.177;DP=185;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=2.163;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.043;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,105:185:99:2189,0,1639 chrXIV 319024 . A T 4403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.05;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4403,457,0 chrXIV 319149 . A G 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3253,333,0 chrXIV 319551 . A T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.663;DP=142;Dels=0.00;FS=3.204;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.231;QD=9.24;ReadPosRankSum=2.203;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1342,0,1636 chrXIV 319623 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.800;DP=99;Dels=0.00;FS=9.949;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=1.950;QD=11.84;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,58:99:99:1202,0,840 chrXIV 319911 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.661;DP=145;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.948;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1476,0,1484 chrXIV 319920 . G A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;DP=148;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.212;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:148:99:1695,0,1374 chrXIV 320208 . A G 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.438;DP=114;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.155;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:924,0,1435 chrXIV 320279 . G T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.618;DP=133;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.645;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.996;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1273,0,1516 chrXIV 320393 . T C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.265;DP=156;Dels=0.00;FS=7.059;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1546,0,1581 chrXIV 320412 . G A 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.457;DP=159;Dels=0.00;FS=2.889;HaplotypeScore=5.9145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1637,0,1585 chrXIV 320522 . G A 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.259;DP=143;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=4.7829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1692,0,1325 chrXIV 320526 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.293;DP=143;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=4.7829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.053;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:143:99:1263,0,1645 chrXIV 320781 . G T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.527;DP=128;Dels=0.00;FS=1.418;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1295,0,1230 chrXIV 320967 . A G 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.693;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.060;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,88:156:99:1746,0,1472 chrXIV 321012 . C T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.113;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.697;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1394,0,1304 chrXIV 321113 . C T 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.538;DP=169;Dels=0.00;FS=2.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.699;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,76:169:99:1573,0,1991 chrXIV 321120 . G T 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.985;DP=146;Dels=0.00;FS=7.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.048;QD=11.47;ReadPosRankSum=-2.067;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1705,0,1300 chrXIV 321129 . C A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;DP=144;Dels=0.00;FS=10.243;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1432,0,1583 chrXIV 321189 . C T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.961;DP=122;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.028;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1105,0,1447 chrXIV 321214 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1074,0,1085 chrXIV 321215 . G A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1075,0,1075 chrXIV 321316 . G A 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.189;DP=156;Dels=0.00;FS=8.916;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1649,0,1565 chrXIV 321987 . T G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.669;DP=90;Dels=0.00;FS=2.891;HaplotypeScore=15.5683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=11.77;ReadPosRankSum=3.819;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,51:90:99:1089,0,523 chrXIV 322061 . A C,G 1735.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.98;MQ0=0;QD=22.24;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,42,36:78:99:1795,821,698,974,0,869 chrXIV 322462 . A G 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=23.98;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2551,276,0 chrXIV 322552 . T C 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.549;DP=89;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.086;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:851,0,948 chrXIV 322600 . T C 727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.066;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.089;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:757,0,1104 chrXIV 322774 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.520;DP=115;Dels=0.00;FS=3.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.867;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1267,0,1023 chrXIV 322827 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.497;DP=112;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.231;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1065,0,1199 chrXIV 322936 . G A 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.296;DP=109;Dels=0.00;FS=3.622;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:830,0,1360 chrXIV 323011 . T G 535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.803;DP=113;Dels=0.00;FS=1.627;HaplotypeScore=5.8734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=4.73;ReadPosRankSum=2.071;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,35:113:99:565,0,1623 chrXIV 323069 . A G 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2741,285,0 chrXIV 323136 . A G 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2736,300,0 chrXIV 323238 . A C 867.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.492;DP=121;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=2.551;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.045;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,48:121:99:897,0,1598 chrXIV 323239 . A T 1475.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.949;DP=118;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1505,0,932 chrXIV 323246 . G C 1449.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;DP=119;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.394;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,72:119:99:1479,0,945 chrXIV 323265 . G C 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.078;DP=135;Dels=0.00;FS=3.121;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=11.16;ReadPosRankSum=2.736;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1536,0,1150 chrXIV 323308 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.074;DP=146;Dels=0.00;FS=7.645;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=8.95;ReadPosRankSum=2.703;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1337,0,1662 chrXIV 323530 . A G 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3823,396,0 chrXIV 323774 . G T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;DP=149;Dels=0.00;FS=9.887;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.859;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1360,0,1819 chrXIV 323787 . A G 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.651;DP=148;Dels=0.00;FS=8.528;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.266;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1711,0,1432 chrXIV 323874 . C G 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3830,402,0 chrXIV 323947 . G T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.075;DP=165;Dels=0.00;FS=6.717;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.924;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1492,0,1860 chrXIV 324018 . G A 2171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.295;DP=192;Dels=0.00;FS=8.715;HaplotypeScore=2.8112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.860;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,102:192:99:2201,0,1744 chrXIV 324113 . A G 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.870;DP=132;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.080;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1488,0,1227 chrXIV 324247 . G C 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3406,366,0 chrXIV 324447 . C T 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3486,349,0 chrXIV 325041 . T C 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.639;DP=107;Dels=0.00;FS=3.600;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:999,0,1182 chrXIV 325094 . G A 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.002;DP=112;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=4.4481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1137,0,1117 chrXIV 325458 . C T 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.484;DP=92;Dels=0.00;FS=3.042;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.651;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:966,0,908 chrXIV 325525 . G C 678.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.372;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.601;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:708,0,1106 chrXIV 325526 . C T 642.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.924;DP=89;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.953;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,37:89:99:672,0,1101 chrXIV 325529 . G A 730.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.124;DP=92;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.161;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:760,0,1036 chrXIV 325991 . C T 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.573;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.324;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1457,0,1407 chrXIV 326003 . G A 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.380;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.553;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1610,0,1451 chrXIV 326012 . G A 1878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.908;DP=169;Dels=0.00;FS=3.557;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,88:169:99:1908,0,1623 chrXIV 326183 . T C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.773;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:132:99:1326,0,1318 chrXIV 326398 . A G 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.863;DP=103;Dels=0.00;FS=6.478;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.208;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:987,0,1137 chrXIV 326545 . C A 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;DP=114;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1016,0,1230 chrXIV 326582 . T C 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;DP=144;Dels=0.00;FS=3.105;HaplotypeScore=12.6224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.326;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,58:144:99:1006,0,1812 chrXIV 326625 . C G 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.717;DP=131;Dels=0.00;FS=2.278;HaplotypeScore=4.6129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,51:131:99:1007,0,1633 chrXIV 326711 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.844;DP=127;Dels=0.00;FS=7.031;HaplotypeScore=8.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.566;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1308,0,1410 chrXIV 326720 . T C 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.908;DP=128;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=6.9148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:128:99:1431,0,1233 chrXIV 326722 . A G 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.452;DP=137;Dels=0.00;FS=3.444;HaplotypeScore=5.9254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1464,0,1239 chrXIV 327404 . G T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.731;DP=106;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=2.833;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.561;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1132,0,1024 chrXIV 327569 . T G 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;DP=131;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.523;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1185,0,1403 chrXIV 328226 . T C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.299;DP=123;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=3.0926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.318;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:123:99:1244,0,1367 chrXIV 328483 . G A 2148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2181,222,0 chrXIV 328520 . C T 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;DP=100;Dels=0.00;FS=6.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.648;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1039,0,991 chrXIV 328646 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.772;DP=111;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1225,0,1067 chrXIV 328673 . A G 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.309;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1227,0,1191 chrXIV 328880 . C T 2398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.64;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2431,246,0 chrXIV 329177 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.506;DP=111;Dels=0.00;FS=12.420;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1160,0,1095 chrXIV 329590 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.724;DP=130;Dels=0.00;FS=7.052;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.947;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.047;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1337,0,1323 chrXIV 330120 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1081,0,1318 chrXIV 330284 . A T 1989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.83;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2022,213,0 chrXIV 330285 . T G 1917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=24.90;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:77:99:1950,210,0 chrXIV 330313 . A G 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.540;DP=75;Dels=0.00;FS=3.349;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,32:75:99:609,0,999 chrXIV 330365 . A G 2615 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2648,267,0 chrXIV 330395 . G A 2755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2788,282,0 chrXIV 330417 . T C 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.405;DP=109;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.476;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1138,0,1124 chrXIV 330863 . C T 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.721;DP=110;Dels=0.00;FS=1.578;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.925;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1213,0,1009 chrXIV 331023 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.661;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1322,0,1151 chrXIV 331098 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.104;DP=110;Dels=0.00;FS=3.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,67:110:99:1480,0,781 chrXIV 331139 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.057;DP=111;Dels=0.00;FS=2.487;HaplotypeScore=4.9073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.295;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1339,0,867 chrXIV 331401 . C T 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3171,315,0 chrXIV 331417 . T C 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.192;DP=128;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1047,0,1664 chrXIV 331514 . G A 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3372,339,0 chrXIV 331522 . C T 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3441,342,0 chrXIV 331587 . T A 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2622,267,0 chrXIV 331593 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;DP=106;Dels=0.00;FS=4.836;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.240;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1239,0,889 chrXIV 331718 . T G 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.387;DP=104;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:760,0,1266 chrXIV 331752 . T A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;DP=94;Dels=0.00;FS=4.200;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.90;MQ0=0;MQRankSum=4.465;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.344;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,56:94:99:1206,0,805 chrXIV 332278 . G A 2411 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=26.21;ReadPosRankSum=1.243;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:2444,267,0 chrXIV 332293 . T C 2329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.04;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2362,261,0 chrXIV 332613 . C G 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.65;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3331,342,0 chrXIV 332884 . A G 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;DP=141;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=22.55;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3212,333,0 chrXIV 332988 . G A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.874;DP=129;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.516;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1261,0,1343 chrXIV 334339 . G A 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.14;SB=-2.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:4051,400,0 chrXIV 334453 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.393;DP=137;Dels=0.00;FS=5.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.460;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1196,0,1529 chrXIV 334534 . C A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.579;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.154;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1296,0,1314 chrXIV 334675 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;DP=111;Dels=0.00;FS=5.969;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1073,0,1143 chrXIV 334965 . T C 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3447,354,0 chrXIV 334987 . A C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.671;DP=153;Dels=0.00;FS=10.883;HaplotypeScore=3.8388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.540;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,70:153:99:1264,0,1829 chrXIV 335000 . T A 4029.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4029,412,0 chrXIV 335033 . A G 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.80;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3181,333,0 chrXIV 335091 . A G 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6182;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=23.83;ReadPosRankSum=-1.360;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:2917,306,0 chrXIV 335092 . T A 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6182;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.64;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3015,312,0 chrXIV 335197 . G A 2160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.41;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2193,228,0 chrXIV 335243 . C A 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2658,273,0 chrXIV 335276 . A G 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3218,330,0 chrXIV 335341 . A T 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3529,369,0 chrXIV 335376 . A G 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3232,342,0 chrXIV 335395 . G A 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3300,339,0 chrXIV 335707 . T G 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=23.42;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2539,261,0 chrXIV 335910 . T C 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2602,273,0 chrXIV 336078 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.841;DP=133;Dels=0.00;FS=5.892;HaplotypeScore=7.5503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.901;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:133:99:1265,0,1458 chrXIV 336158 . T C 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3153,327,0 chrXIV 336315 . C G 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3218,360,0 chrXIV 336465 . A G 3762.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3762,393,0 chrXIV 336508 . A T 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3506,363,0 chrXIV 336617 . C T 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=1;QD=25.64;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3308,339,0 chrXIV 336941 . G A 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2985,312,0 chrXIV 336952 . A G 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2972,315,0 chrXIV 336970 . A C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2976,312,0 chrXIV 337051 . C T 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1103;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:138:99:3491,360,0 chrXIV 337168 . C T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.877;DP=138;Dels=0.00;FS=5.217;HaplotypeScore=3.7061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.477;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1564,0,1341 chrXIV 337676 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;DP=113;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.799;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,69:113:99:1475,0,886 chrXIV 337730 . T G 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.098;DP=96;Dels=0.00;FS=1.657;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.021;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:936,0,1166 chrXIV 337873 . C T 1078.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.620;DP=119;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=8.2399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.753;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.769;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1108,0,1292 chrXIV 337877 . G A 2419 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2452,255,0 chrXIV 337882 . A C 913.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.879;DP=95;Dels=0.00;FS=2.715;HaplotypeScore=3.6984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.458;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:943,0,1018 chrXIV 337949 . T C 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.31;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4122,426,0 chrXIV 338161 . T C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;DP=117;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1266,0,1118 chrXIV 338337 . G A 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3218,316,0 chrXIV 338359 . C T 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3809,390,0 chrXIV 338424 . G A 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3315,339,0 chrXIV 338522 . G T 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3477,357,0 chrXIV 338586 . G A 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3677,372,0 chrXIV 338610 . T C 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3383,339,0 chrXIV 338889 . C T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.005;DP=128;Dels=0.00;FS=2.256;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.239;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1564,0,1230 chrXIV 339253 . G A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.545;DP=127;Dels=0.00;FS=2.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.154;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1256,0,1365 chrXIV 339555 . C T 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3423,354,0 chrXIV 339596 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.658;DP=129;Dels=0.00;FS=3.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.036;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,73:129:99:1469,0,1147 chrXIV 340033 . C G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.487;DP=121;Dels=0.00;FS=3.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1171,0,1269 chrXIV 340266 . A T 2283 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=23.30;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2316,231,0 chrXIV 340286 . A T 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2755,288,0 chrXIV 340288 . A C 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2749,294,0 chrXIV 340618 . A G 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3085,303,0 chrXIV 340804 . G T 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3024,309,0 chrXIV 340805 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.432;DP=121;Dels=0.00;FS=2.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.143;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1263,0,1132 chrXIV 340840 . T C 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.301;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=24.07;ReadPosRankSum=1.589;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:2946,292,0 chrXIV 340898 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.484;DP=120;Dels=0.00;FS=5.767;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1264,0,1135 chrXIV 340939 . G A 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3051,312,0 chrXIV 340966 . C T 735.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;DP=109;Dels=0.00;FS=4.808;HaplotypeScore=2.3999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.412;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.046;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:765,0,1431 chrXIV 340970 . C T 2661 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2694,279,0 chrXIV 340976 . T C 2585 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.64;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2618,276,0 chrXIV 341067 . C A 2605 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2638,267,0 chrXIV 341155 . C T 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.728;DP=118;Dels=0.00;FS=2.488;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:968,0,1398 chrXIV 341465 . G A 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3411,345,0 chrXIV 341528 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.435;DP=142;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.274;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:142:99:1445,0,1432 chrXIV 341642 . A G 2619 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.488;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.992;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2652,255,0 chrXIV 341663 . G C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.971;DP=108;Dels=0.00;FS=3.572;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.479;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1257,0,896 chrXIV 341705 . A T 2636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2669,276,0 chrXIV 341764 . G C 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3246,342,0 chrXIV 342049 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;DP=153;Dels=0.00;FS=2.888;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=3.258;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1440,0,1650 chrXIV 342078 . C A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.517;DP=118;Dels=0.00;FS=4.309;HaplotypeScore=67.5107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.551;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.632;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1462,0,831 chrXIV 342273 . C G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.446;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.714;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1068,0,1460 chrXIV 342370 . A G 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.448;DP=160;Dels=0.00;FS=4.862;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.473;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,72:160:99:1402,0,1866 chrXIV 342707 . A G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.266;DP=127;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1355,0,1300 chrXIV 342793 . T C 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.513;DP=132;Dels=0.00;FS=4.096;HaplotypeScore=4.2491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=7.64;ReadPosRankSum=-2.082;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1038,0,1545 chrXIV 342811 . C A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.820;DP=123;Dels=0.00;FS=3.392;HaplotypeScore=2.9764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.632;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:123:99:1268,0,1375 chrXIV 342839 . T C 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.999;DP=134;Dels=0.00;FS=9.647;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1491,0,1307 chrXIV 342841 . C T 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;DP=137;Dels=0.00;FS=9.643;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.226;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1587,0,1345 chrXIV 342917 . G T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;DP=139;Dels=0.00;FS=2.191;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.676;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1515,0,1352 chrXIV 343338 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;DP=132;Dels=0.00;FS=4.185;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.127;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1341,0,1428 chrXIV 343922 . G T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.075;DP=156;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=3.9450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.212;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,62:156:99:1116,0,2034 chrXIV 344017 . C A 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.425;DP=135;Dels=0.00;FS=3.311;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.375;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1179,0,1663 chrXIV 344176 . A T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.569;DP=130;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.366;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:130:99:1149,0,1644 chrXIV 344260 . G A 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;DP=166;Dels=0.00;FS=12.111;HaplotypeScore=3.9408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.377;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1625,0,1858 chrXIV 344329 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.059;DP=132;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.043;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1364,0,1441 chrXIV 344398 . C T 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.365;DP=123;Dels=0.00;FS=4.345;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.930;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:123:99:1160,0,1317 chrXIV 344873 . T G 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.440;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=1;MQRankSum=0.371;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.940;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1647,0,1388 chrXIV 345058 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.445;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.804;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1204,0,1360 chrXIV 345099 . A G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;DP=139;Dels=0.00;FS=4.072;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.521;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1304,0,1551 chrXIV 345121 . G A 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.307;DP=151;Dels=0.00;FS=4.814;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1702,0,1442 chrXIV 345129 . T C 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.363;DP=151;Dels=0.00;FS=3.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1485,0,1767 chrXIV 345144 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.771;DP=150;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=2.4203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.893;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1444,0,1659 chrXIV 345349 . G A 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.173;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.890;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:946,0,863 chrXIV 345668 . T C 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.509;DP=153;Dels=0.00;FS=3.586;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.415;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:4011,423,0 chrXIV 345712 . A G 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3322;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3797,402,0 chrXIV 345744 . G A 4185.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.32;SB=-2.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4185,424,0 chrXIV 345915 . G A 4105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4105,412,0 chrXIV 346068 . C T 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3369,337,0 chrXIV 346103 . T G 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3495,363,0 chrXIV 346115 . A T 4463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.26;MQ0=0;QD=25.36;SB=-2.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4463,463,0 chrXIV 346414 . A C 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.283;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=25.73;ReadPosRankSum=1.632;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3576,343,0 chrXIV 346690 . T A 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.65;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3770,370,0 chrXIV 347047 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;DP=129;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=5.7452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.091;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:129:99:1082,0,1634 chrXIV 347194 . T C 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3256,336,0 chrXIV 347234 . G A 4056.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4056,397,0 chrXIV 347308 . T C 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8327;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=21.37;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3440,375,0 chrXIV 347420 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.358;DP=126;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=4.9584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1472,0,1121 chrXIV 347517 . A G 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9067;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3011,306,0 chrXIV 347576 . A C 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.126;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1031,0,873 chrXIV 347615 . T C 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.304;DP=92;Dels=0.00;FS=3.958;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=10.09;ReadPosRankSum=-2.101;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:958,0,999 chrXIV 347708 . G C 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;DP=110;Dels=0.00;FS=6.183;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:110:99:850,0,1424 chrXIV 347728 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3267,336,0 chrXIV 347745 . T C 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;DP=125;Dels=0.00;FS=11.756;HaplotypeScore=2.8898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.205;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,49:125:99:899,0,1590 chrXIV 347763 . C T 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;DP=104;Dels=0.00;FS=15.546;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.069;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:907,0,1320 chrXIV 348462 . G A 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.268;DP=163;Dels=0.00;FS=12.972;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=9.94;ReadPosRankSum=2.564;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,82:163:99:1650,0,1610 chrXIV 348465 . T C 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.819;DP=162;Dels=0.00;FS=9.924;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=10.22;ReadPosRankSum=2.507;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,82:162:99:1685,0,1526 chrXIV 348486 . C G 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.457;DP=147;Dels=0.00;FS=3.020;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=2.720;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.038;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1674,0,1331 chrXIV 348533 . G A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.541;DP=156;Dels=0.00;FS=4.747;HaplotypeScore=5.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1553,0,1665 chrXIV 348537 . A G 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.308;DP=167;Dels=0.00;FS=2.725;HaplotypeScore=7.9345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.458;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1659,0,1782 chrXIV 348669 . G A 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.982;DP=107;Dels=0.00;FS=1.698;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.265;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1159,0,1073 chrXIV 348697 . G C 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.660;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:868,0,860 chrXIV 348777 . C T 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.344;DP=124;Dels=0.00;FS=4.433;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQ0=0;MQRankSum=-3.111;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.470;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1494,0,1042 chrXIV 348823 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.391;DP=105;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.742;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1200,0,940 chrXIV 348831 . A C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.714;DP=102;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=3.5471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-6.405;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:964,0,999 chrXIV 348835 . A T 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.025;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.80;MQ0=0;MQRankSum=-6.336;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:904,0,1009 chrXIV 348847 . A G 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.519;DP=110;Dels=0.00;FS=5.849;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.67;MQ0=0;MQRankSum=-4.565;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.918;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:920,0,1118 chrXIV 348902 . A T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;DP=117;Dels=0.00;FS=2.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1134,0,1109 chrXIV 348931 . C T 1106.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=131;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=7.9331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.274;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1136,0,1275 chrXIV 348933 . T C 1088.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.761;DP=134;Dels=0.00;FS=2.194;HaplotypeScore=7.9331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.040;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1118,0,1368 chrXIV 348937 . T C 849.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.270;DP=121;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=6.9398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.514;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:879,0,1231 chrXIV 349029 . C T 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.276;DP=107;Dels=0.00;FS=30.460;HaplotypeScore=45.7344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQ0=0;MQRankSum=2.145;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.068;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:935,0,1212 chrXIV 349064 . T G 609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.727;DP=116;Dels=0.00;FS=5.640;HaplotypeScore=13.1790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=5.25;ReadPosRankSum=-2.297;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:639,0,1222 chrXIV 349259 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=110;Dels=0.00;FS=7.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.042;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1073,0,1147 chrXIV 349267 . C T 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.856;DP=143;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.500;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1282,0,1679 chrXIV 349397 . A G 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.871;DP=160;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=3.5524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.247;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,89:160:99:1748,0,1479 chrXIV 349523 . T C 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.371;DP=98;Dels=0.00;FS=2.588;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1052,0,947 chrXIV 349556 . T C 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;DP=91;Dels=0.00;FS=3.961;HaplotypeScore=2.6414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=9.00;ReadPosRankSum=2.442;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:849,0,1012 chrXIV 349628 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.438;DP=126;Dels=0.00;FS=3.462;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.349;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1424,0,1127 chrXIV 349972 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.427;DP=135;Dels=0.00;FS=9.823;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.969;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.897;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1208,0,1491 chrXIV 349976 . T A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.706;DP=134;Dels=0.00;FS=8.269;HaplotypeScore=2.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=1.314;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.461;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,59:134:99:1253,0,1460 chrXIV 350000 . C T 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.965;DP=131;Dels=0.00;FS=3.554;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=0.398;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.687;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:1032,0,1523 chrXIV 350057 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.211;DP=137;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1474,0,1425 chrXIV 350074 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.647;DP=152;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.673;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1643,0,1475 chrXIV 350165 . C T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.017;DP=121;Dels=0.00;FS=2.502;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.571;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1323,0,1002 chrXIV 350461 . T C 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.156;DP=126;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=4.6118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.378;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1223,0,1329 chrXIV 350489 . A C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;DP=149;Dels=0.00;FS=3.936;HaplotypeScore=3.1017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.718;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:149:99:1421,0,1337 chrXIV 350601 . C T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;DP=152;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=5.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1425,0,1621 chrXIV 350606 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.495;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1341,0,1492 chrXIV 350657 . G A 1826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.125;DP=158;Dels=0.00;FS=3.053;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,85:158:99:1856,0,1432 chrXIV 350676 . T C 4058.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=71.6613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=26.87;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:4058,429,0 chrXIV 350848 . A C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.281;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.506;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1270,0,1769 chrXIV 350864 . T C 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;DP=166;Dels=0.00;FS=7.079;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.201;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.898;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,72:166:99:1432,0,1990 chrXIV 350966 . C G 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;DP=115;Dels=0.00;FS=16.373;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.539;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:981,0,1401 chrXIV 350969 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;DP=104;Dels=0.00;FS=8.554;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=3.826;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.392;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,60:104:99:1228,0,884 chrXIV 350980 . T C 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.658;DP=103;Dels=0.00;FS=4.040;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.639;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:878,0,1222 chrXIV 350992 . A G 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.977;DP=105;Dels=0.00;FS=2.870;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.658;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:987,0,1190 chrXIV 351006 . C G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;DP=109;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.052;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1092,0,1143 chrXIV 351009 . A T 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=116;Dels=0.00;FS=5.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.366;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.136;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1077,0,1350 chrXIV 351050 . T G 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.828;DP=114;Dels=0.00;FS=29.744;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.521;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:958,0,1424 chrXIV 351221 . A G 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;DP=114;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.250;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,42:114:99:806,0,1586 chrXIV 351467 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.720;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1237,0,1207 chrXIV 351622 . T G 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.954;DP=110;Dels=0.00;FS=3.553;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1003,0,1326 chrXIV 351650 . C T 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;DP=138;Dels=0.00;FS=6.816;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.107;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1338,0,1454 chrXIV 351780 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;DP=123;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.676;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1113,0,1568 chrXIV 351850 . C T 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.968;DP=105;Dels=0.00;FS=6.304;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=0.234;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.663;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1135,0,1037 chrXIV 351883 . A G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=1;MQRankSum=0.746;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.179;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1060,0,902 chrXIV 351888 . T C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.603;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.523;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1112,0,940 chrXIV 352081 . C A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.438;DP=159;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.033;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1496,0,1838 chrXIV 352228 . C G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.884;DP=97;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:1039,0,936 chrXIV 352437 . C T 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;DP=125;Dels=0.00;FS=12.313;HaplotypeScore=5.8558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=2.168;QD=7.72;ReadPosRankSum=-2.986;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:995,0,1153 chrXIV 352733 . G C 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.527;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:795,0,997 chrXIV 353111 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.201;DP=137;Dels=0.00;FS=16.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.592;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1465,0,1438 chrXIV 353442 . G A 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3733,376,0 chrXIV 353488 . T A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;DP=123;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.011;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1129,0,1379 chrXIV 353490 . A G 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3128,324,0 chrXIV 353690 . C A 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.19;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3426,363,0 chrXIV 353732 . C T 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3357,334,0 chrXIV 353786 . A T 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2869,303,0 chrXIV 353834 . C T 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2888,303,0 chrXIV 353924 . G A 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3094,321,0 chrXIV 354061 . C T 4248.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.369;DP=162;Dels=0.00;FS=5.105;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.711;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:4248,405,0 chrXIV 354131 . G C 3745.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3745,411,0 chrXIV 354254 . A G 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3407,360,0 chrXIV 354632 . G A 2073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.372;DP=197;Dels=0.00;FS=4.926;HaplotypeScore=2.4591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.236;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,100:197:99:2103,0,1978 chrXIV 354641 . A G 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.190;DP=154;Dels=0.00;FS=3.163;HaplotypeScore=2.9479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.866;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1415,0,1741 chrXIV 354713 . G A 1917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.290;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,91:160:99:1947,0,1388 chrXIV 354740 . A G 3768.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3768,387,0 chrXIV 354924 . G T 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3609,364,0 chrXIV 354985 . G T 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.781;DP=133;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=3.6372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.152;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:133:99:1633,0,1123 chrXIV 354992 . A G 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6266;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3611,384,0 chrXIV 355079 . C T 4451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.73;SB=-2.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4451,439,0 chrXIV 355231 . T C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.649;DP=120;Dels=0.00;FS=15.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=1;MQRankSum=0.254;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1266,0,1151 chrXIV 355319 . C T 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.433;DP=124;Dels=0.00;FS=3.215;HaplotypeScore=6.8553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1431,0,1109 chrXIV 355347 . G A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.611;DP=147;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.146;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1404,0,1538 chrXIV 355362 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.478;DP=121;Dels=0.00;FS=1.635;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.968;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1182,0,1212 chrXIV 355386 . C G 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;DP=143;Dels=0.00;FS=2.280;HaplotypeScore=2.8689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.512;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1423,0,1231 chrXIV 355531 . T C 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.601;DP=176;Dels=0.00;FS=0.558;HaplotypeScore=7.5080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,78:176:99:1552,0,2106 chrXIV 355610 . C T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.532;DP=138;Dels=0.00;FS=4.165;HaplotypeScore=3.3007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.911;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1458,0,1480 chrXIV 355791 . A C 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;DP=145;Dels=0.00;FS=7.549;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.265;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.115;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1650,0,1397 chrXIV 355807 . A G 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.982;DP=159;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=9.2072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=2.528;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,85:159:99:1762,0,1579 chrXIV 355852 . C T 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.025;DP=120;Dels=0.00;FS=3.418;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=2.526;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.238;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1079,0,1447 chrXIV 355985 . C T 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.625;DP=141;Dels=0.00;FS=3.381;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.284;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1441,0,1545 chrXIV 356010 . C T 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.016;DP=160;Dels=0.00;FS=3.821;HaplotypeScore=4.6977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=9.30;ReadPosRankSum=3.059;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,73:160:99:1518,0,1919 chrXIV 356027 . T C 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.834;DP=149;Dels=0.00;FS=16.676;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=10.78;ReadPosRankSum=-2.408;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1636,0,1498 chrXIV 356029 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.551;DP=148;Dels=0.00;FS=14.995;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=9.03;ReadPosRankSum=2.572;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1366,0,1689 chrXIV 356080 . T G 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;DP=168;Dels=0.00;FS=5.152;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.470;QD=10.20;ReadPosRankSum=2.370;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1743,0,1689 chrXIV 356084 . A C 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.521;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,77:168:99:1554,0,1918 chrXIV 356174 . T A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;DP=128;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=4.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1311,0,1311 chrXIV 356287 . G A 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.967;DP=96;Dels=0.00;FS=5.146;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.290;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:818,0,715 chrXIV 356361 . G A 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2726,285,0 chrXIV 356370 . C T 2928 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2474;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2961,306,0 chrXIV 356376 . T C 1069.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.788;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.078;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.265;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1099,0,1114 chrXIV 356379 . A C 1053.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.051;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.534;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1083,0,1128 chrXIV 356394 . G A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.336;DP=133;Dels=0.00;FS=1.403;HaplotypeScore=5.5756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1374,0,1360 chrXIV 356454 . T C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.029;DP=140;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.399;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1122,0,1605 chrXIV 356489 . T C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.606;DP=143;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.654;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1291,0,1613 chrXIV 356515 . C T 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.511;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.242;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1282,0,1560 chrXIV 356519 . G A 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.742;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.686;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1354,0,1580 chrXIV 356549 . G A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.359;DP=147;Dels=0.00;FS=2.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.219;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1459,0,1608 chrXIV 356568 . T G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.711;DP=137;Dels=0.00;FS=7.624;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1315,0,1423 chrXIV 356615 . A C 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.068;DP=153;Dels=0.00;FS=4.767;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.035;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1507,0,1749 chrXIV 356620 . T C 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;DP=159;Dels=0.00;FS=3.674;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.241;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.725;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1598,0,1623 chrXIV 356637 . G T 4169.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4169,438,0 chrXIV 356684 . T C 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.201;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.826;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,83:174:99:1685,0,1868 chrXIV 356876 . A G 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.616;DP=140;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.501;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1245,0,1569 chrXIV 356935 . T A 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.076;DP=118;Dels=0.00;FS=2.462;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.736;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.089;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1026,0,1408 chrXIV 357333 . C G 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;DP=136;Dels=0.00;FS=13.567;HaplotypeScore=2.4612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.118;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1460,0,1369 chrXIV 357346 . C T 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.913;DP=149;Dels=0.00;FS=7.346;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1400,0,1608 chrXIV 357348 . T C 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3642,360,0 chrXIV 357413 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;DP=123;Dels=0.00;FS=6.918;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.195;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1183,0,1394 chrXIV 357854 . A G 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.495;DP=135;Dels=0.00;FS=2.301;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.839;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1447,0,1241 chrXIV 357873 . C T 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.389;DP=168;Dels=0.00;FS=1.942;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,91:168:99:1828,0,1556 chrXIV 358002 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.848;DP=165;Dels=0.00;FS=3.625;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.813;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:1477,0,1798 chrXIV 358013 . T C 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.127;DP=166;Dels=0.00;FS=1.902;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,82:166:99:1585,0,1754 chrXIV 358067 . T C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,65:151:99:1343,0,1797 chrXIV 358109 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.438;DP=141;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.214;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1324,0,1627 chrXIV 358300 . G C 2679 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2712,285,0 chrXIV 358346 . T C 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2627,288,0 chrXIV 358507 . G C 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3387,351,0 chrXIV 358519 . C G 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3433,354,0 chrXIV 358643 . A G 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3238,336,0 chrXIV 358718 . A G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;DP=152;Dels=0.00;FS=8.530;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.119;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1524,0,1661 chrXIV 358757 . C T 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.392;DP=109;Dels=0.00;FS=10.678;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.507;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1085,0,1170 chrXIV 358910 . T C 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.500;DP=157;Dels=0.00;FS=2.186;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.328;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1633,0,1612 chrXIV 358934 . C T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.749;DP=150;Dels=0.00;FS=2.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.790;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1445,0,1582 chrXIV 358991 . T A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.051;DP=120;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1413,0,1145 chrXIV 359004 . C T 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;DP=112;Dels=0.00;FS=3.767;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.888;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1128,0,1269 chrXIV 359017 . T A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;DP=114;Dels=0.00;FS=3.687;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.768;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1223,0,1189 chrXIV 359040 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.467;DP=126;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=4.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.728;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.420;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1267,0,1283 chrXIV 359088 . C G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.353;DP=121;Dels=0.00;FS=13.107;HaplotypeScore=51.6791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=8.92;ReadPosRankSum=-2.600;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1109,0,1440 chrXIV 359147 . G A 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;DP=141;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.344;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:141:99:1783,0,1202 chrXIV 359204 . T C 1924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.104;DP=161;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.951;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,92:161:99:1954,0,1447 chrXIV 359475 . T G 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;DP=112;Dels=0.00;FS=6.182;HaplotypeScore=8.7849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.858;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:112:99:1103,0,1154 chrXIV 359506 . T G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;DP=98;Dels=0.00;FS=8.082;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=1.996;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1060,0,948 chrXIV 359804 . G T 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.395;DP=122;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=5.7942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.323;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1098,0,1388 chrXIV 360024 . G A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.817;DP=125;Dels=0.00;FS=4.371;HaplotypeScore=3.9571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1110,0,1438 chrXIV 360333 . G C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;DP=122;Dels=0.00;FS=6.913;HaplotypeScore=7.0270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.541;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1184,0,1265 chrXIV 360426 . T C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.700;DP=129;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1307,0,1294 chrXIV 360781 . G A 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.590;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=69.3789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=25.40;ReadPosRankSum=-1.562;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:123:99:3157,318,0 chrXIV 360852 . T C 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.558;DP=142;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=0.828;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.827;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1300,0,1663 chrXIV 361119 . C T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.650;DP=123;Dels=0.00;FS=10.099;HaplotypeScore=5.6854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.912;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.100;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1130,0,1404 chrXIV 361125 . T C 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.922;DP=111;Dels=0.00;FS=8.834;HaplotypeScore=3.6854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.688;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1013,0,1278 chrXIV 361314 . G T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.969;DP=138;Dels=0.00;FS=11.163;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=2.013;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1299,0,1522 chrXIV 361325 . C G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;DP=136;Dels=0.00;FS=16.250;HaplotypeScore=2.8467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1220,0,1471 chrXIV 361529 . C A 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3272,331,0 chrXIV 361551 . C T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;DP=110;Dels=0.00;FS=11.230;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=9.90;ReadPosRankSum=2.225;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1119,0,1216 chrXIV 361584 . A G 726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;DP=110;Dels=0.00;FS=6.546;HaplotypeScore=11.8471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.030;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:110:99:756,0,910 chrXIV 361589 . A G 2381 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.5793;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=21.65;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:110:99:2414,264,0 chrXIV 361599 . C T 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.631;DP=100;Dels=0.00;FS=5.663;HaplotypeScore=7.8982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:100:99:917,0,857 chrXIV 361812 . G C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;DP=134;Dels=0.00;FS=8.186;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.366;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,77:134:99:1565,0,1148 chrXIV 361814 . C A 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3541,363,0 chrXIV 362136 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.940;DP=108;Dels=0.00;FS=6.105;HaplotypeScore=10.7932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.118;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1200,0,907 chrXIV 362413 . T C 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.824;DP=126;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=5.8678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:945,0,1619 chrXIV 362483 . G A 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;DP=102;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.746;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1039,0,1115 chrXIV 362538 . T C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.378;DP=119;Dels=0.00;FS=2.341;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1182,0,1245 chrXIV 362544 . C A 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3061,318,0 chrXIV 362793 . C T 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.43;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2702,285,0 chrXIV 362930 . C T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;DP=105;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=2.6882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1057,0,1099 chrXIV 363078 . T C 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;DP=127;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,76:127:99:1695,0,1020 chrXIV 363496 . T C 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3215,324,0 chrXIV 363861 . C T 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3731,370,0 chrXIV 364156 . A G 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;DP=109;Dels=0.00;FS=17.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=7.56;ReadPosRankSum=1.102;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:854,0,1426 chrXIV 364446 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;DP=120;Dels=0.00;FS=6.204;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.076;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1414,0,1156 chrXIV 364831 . C T 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.105;DP=133;Dels=0.00;FS=4.496;HaplotypeScore=3.9666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=2.265;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.368;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1525,0,1197 chrXIV 364966 . G A 2588 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2621,264,0 chrXIV 365449 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.348;DP=113;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.004;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1259,0,1101 chrXIV 365714 . C T 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3280,339,0 chrXIV 365801 . A T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.544;DP=135;Dels=0.00;FS=3.104;HaplotypeScore=5.4403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.672;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:135:99:1250,0,1523 chrXIV 365802 . T G 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.308;DP=136;Dels=0.00;FS=3.075;HaplotypeScore=4.4824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.679;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1282,0,1505 chrXIV 365824 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1387,0,1371 chrXIV 365847 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.398;DP=125;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=6.2668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.993;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1371,0,1122 chrXIV 366158 . G T 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3830,376,0 chrXIV 366426 . C A 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.224;DP=111;Dels=0.00;FS=1.533;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.440;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1034,0,1144 chrXIV 366458 . C A 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.738;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:964,0,1152 chrXIV 366581 . G T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.546;DP=112;Dels=0.00;FS=4.724;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=8.02;ReadPosRankSum=3.350;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:928,0,1392 chrXIV 366593 . A C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.407;DP=146;Dels=0.00;FS=6.370;HaplotypeScore=9.8919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.516;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1267,0,1849 chrXIV 366764 . G T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.314;DP=155;Dels=0.00;FS=3.746;HaplotypeScore=9.2715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1469,0,1747 chrXIV 367094 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.595;DP=113;Dels=0.00;FS=3.435;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.141;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1276,0,1036 chrXIV 367285 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.543;DP=146;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.435;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1414,0,1567 chrXIV 367502 . A G 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2832,303,0 chrXIV 367644 . G A 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2605,279,0 chrXIV 367843 . G A 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2907,297,0 chrXIV 367965 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.543;DP=125;Dels=0.00;FS=4.374;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.325;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1548,0,1079 chrXIV 368006 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;DP=128;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=7.2442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.280;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1184,0,1531 chrXIV 368045 . C T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;DP=116;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.798;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1382,0,1056 chrXIV 368134 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.396;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.766;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1361,0,1061 chrXIV 368183 . C T 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3351,351,0 chrXIV 368391 . G A 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2659,267,0 chrXIV 368447 . T A 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.198;DP=74;Dels=0.00;FS=1.888;HaplotypeScore=2.8471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.642;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:853,0,699 chrXIV 369029 . T A 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3224,333,0 chrXIV 370084 . T C 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;DP=107;Dels=0.00;FS=3.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=10.24;ReadPosRankSum=-2.667;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1126,0,1041 chrXIV 370511 . A C 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.670;DP=102;Dels=0.00;FS=6.696;HaplotypeScore=4.5776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.709;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:102:99:813,0,1382 chrXIV 370702 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;DP=124;Dels=0.00;FS=5.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1366,0,1241 chrXIV 370870 . C T 2631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2664,270,0 chrXIV 371082 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.226;DP=135;Dels=0.00;FS=3.419;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.667;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1434,0,1449 chrXIV 371209 . A G 2561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2594,282,0 chrXIV 371336 . C G 3702.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3702,393,0 chrXIV 371753 . A T 4723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.535;DP=176;Dels=0.00;FS=4.602;HaplotypeScore=3.9465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=26.84;ReadPosRankSum=1.201;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,175:176:99:4723,472,0 chrXIV 372259 . C T 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2650,267,0 chrXIV 372376 . G A 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.45;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3448,366,0 chrXIV 372643 . C A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.475;DP=109;Dels=0.00;FS=1.617;HaplotypeScore=2.6460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:967,0,1186 chrXIV 372690 . G T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;DP=141;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=11.67;ReadPosRankSum=-2.361;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1676,0,1311 chrXIV 372693 . G C 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3454,378,0 chrXIV 372701 . T C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.662;DP=139;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.580;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1362,0,1636 chrXIV 372758 . G T 4101.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4101,424,0 chrXIV 372919 . T A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.004;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1471,0,1686 chrXIV 373080 . T C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.699;DP=134;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1082,0,1458 chrXIV 373134 . A G 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3699,390,0 chrXIV 373375 . G A 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.806;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.333;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,81:168:99:1655,0,1853 chrXIV 373633 . T A 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.842;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=0.10;ReadPosRankSum=2.842;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,119:122:6:43,6,0 chrXIV 373701 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.283;DP=143;Dels=0.00;FS=6.168;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1498,0,1413 chrXIV 373766 . C A 4129.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;QD=27.90;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4129,427,0 chrXIV 373799 . A G 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3890,417,0 chrXIV 374054 . G A 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2883,282,0 chrXIV 374078 . G C 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1501;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3545,354,0 chrXIV 374659 . C T 4313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4313,450,0 chrXIV 374746 . G A 1789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.597;DP=149;Dels=0.00;FS=2.141;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.012;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:1819,0,1281 chrXIV 376313 . C T 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;DP=116;Dels=0.00;FS=1.676;HaplotypeScore=2.5877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.408;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,44:116:99:767,0,1540 chrXIV 376490 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.760;DP=152;Dels=0.00;FS=14.890;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1291,0,1690 chrXIV 376841 . T C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.252;DP=141;Dels=0.00;FS=3.971;HaplotypeScore=2.6451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.205;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:1131,0,1787 chrXIV 376853 . C T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.258;DP=148;Dels=0.00;FS=5.966;HaplotypeScore=4.6344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.900;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1285,0,1636 chrXIV 376874 . C T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;DP=145;Dels=0.00;FS=3.936;HaplotypeScore=3.1253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1370,0,1630 chrXIV 377057 . C T 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.229;DP=123;Dels=0.00;FS=4.415;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=1;MQRankSum=1.544;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.733;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1044,0,1462 chrXIV 377102 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;DP=126;Dels=0.00;FS=3.234;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.172;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1106,0,1475 chrXIV 377169 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.160;DP=138;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=7.7667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.437;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1219,0,1561 chrXIV 377864 . T C 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.569;DP=125;Dels=0.00;FS=4.652;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=13.26;ReadPosRankSum=-1.649;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,78:125:99:1687,0,906 chrXIV 377887 . G T 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=23.24;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3193,330,0 chrXIV 377900 . C T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;DP=140;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.272;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:140:99:1323,0,1499 chrXIV 377969 . T C 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,47:125:99:855,0,1717 chrXIV 378062 . G T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.129;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.126;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1350,0,1207 chrXIV 379436 . A T 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5311;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3087,309,0 chrXIV 379557 . G C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.252;DP=116;Dels=0.01;FS=2.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=-0.752;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.187;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1107,0,1235 chrXIV 379700 . C T 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3261,319,0 chrXIV 379831 . A G 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.568;DP=112;Dels=0.00;FS=9.253;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.746;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:959,0,1282 chrXIV 380023 . G A 634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.999;DP=96;Dels=0.00;FS=4.254;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.279;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,34:94:99:664,0,1247 chrXIV 380032 . A G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.799;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,62:97:99:1247,0,654 chrXIV 380425 . A G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.344;DP=107;Dels=0.00;FS=2.566;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.633;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1208,0,1017 chrXIV 380579 . A G 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.327;DP=132;Dels=0.00;FS=2.228;HaplotypeScore=5.7381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.856;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1538,0,1222 chrXIV 380871 . C T 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2827,303,0 chrXIV 380926 . T C 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=24.72;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2480,273,0 chrXIV 381080 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;DP=130;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.511;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:130:99:1170,0,1507 chrXIV 381267 . C A 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.155;DP=117;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.177;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:117:99:1388,0,1063 chrXIV 383709 . A T 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3299,342,0 chrXIV 383952 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;DP=133;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1222,0,1570 chrXIV 385521 . T A 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=22.46;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2886,300,0 chrXIV 385702 . A T 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3493,357,0 chrXIV 386488 . C T 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;DP=125;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.783;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1082,0,1492 chrXIV 386641 . G A 697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.147;DP=92;Dels=0.00;FS=7.063;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,40:92:99:727,0,1143 chrXIV 386765 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.667;DP=132;Dels=0.00;FS=5.300;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.499;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1364,0,1298 chrXIV 386898 . A C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.279;DP=94;Dels=0.00;FS=13.344;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.425;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1084,0,877 chrXIV 387050 . C A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;DP=129;Dels=0.00;FS=11.151;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.299;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1282,0,1335 chrXIV 387195 . C A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.892;DP=130;Dels=0.00;FS=15.114;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=9.32;ReadPosRankSum=2.916;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1242,0,1477 chrXIV 387197 . G A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.663;DP=123;Dels=0.00;FS=4.649;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=10.06;ReadPosRankSum=2.248;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1267,0,1326 chrXIV 387361 . A G 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;DP=120;Dels=0.00;FS=1.621;HaplotypeScore=4.9487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1010,0,1389 chrXIV 387524 . T C 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;DP=145;Dels=0.00;FS=7.127;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,56:145:99:975,0,2033 chrXIV 387540 . T C 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.520;DP=140;Dels=0.00;FS=4.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.985;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,57:140:99:1045,0,1920 chrXIV 387730 . A G 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.677;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1468,0,1430 chrXIV 388136 . C T 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.63;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2981,312,0 chrXIV 388654 . G T 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.938;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1067,0,1085 chrXIV 388755 . A G 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.417;DP=126;Dels=0.00;FS=4.352;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.968;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1376,0,1214 chrXIV 388819 . T C 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2625,279,0 chrXIV 388895 . G A 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;DP=110;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=2.8066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=2.944;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.546;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:962,0,1179 chrXIV 388979 . C A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.935;DP=106;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=4.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=12.47;ReadPosRankSum=2.645;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:1352,0,787 chrXIV 389017 . T C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=107;Dels=0.00;FS=0.865;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1293,0,995 chrXIV 389266 . C T 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.199;DP=80;Dels=0.00;FS=3.319;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.567;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,44:80:99:948,0,694 chrXIV 389281 . T G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;DP=85;Dels=0.00;FS=1.853;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.526;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,47:85:99:1002,0,767 chrXIV 389323 . T C 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.889;DP=88;Dels=0.00;FS=0.814;HaplotypeScore=3.4770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,49:88:99:1008,0,761 chrXIV 389356 . C T 2314 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2347,240,0 chrXIV 389396 . T C 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.531;DP=99;Dels=0.00;FS=5.003;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:888,0,1189 chrXIV 389635 . A G 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.006;DP=104;Dels=0.00;FS=1.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=7.68;ReadPosRankSum=-2.040;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,45:104:99:829,0,1293 chrXIV 389671 . G A 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.282;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.303;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:953,0,1064 chrXIV 389873 . A T 1772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.640;DP=157;Dels=0.00;FS=6.528;HaplotypeScore=4.7268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.466;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,84:157:99:1802,0,1483 chrXIV 389979 . G T 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.510;DP=135;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.319;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1487,0,1335 chrXIV 390263 . G A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.870;DP=119;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=3.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.916;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1262,0,1140 chrXIV 390377 . G A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.190;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.211;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1425,0,1023 chrXIV 390590 . G A 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.218;DP=147;Dels=0.00;FS=4.915;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.334;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,83:147:99:1756,0,1253 chrXIV 390614 . G C 1699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.058;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,83:145:99:1729,0,1188 chrXIV 390788 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.526;DP=134;Dels=0.00;FS=2.161;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1287,0,1295 chrXIV 390845 . G A 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,89:160:99:1760,0,1437 chrXIV 390893 . C T 1784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.196;DP=155;Dels=0.00;FS=9.934;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=3.633;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.846;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,83:155:99:1814,0,1446 chrXIV 390954 . T C 1899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;DP=172;Dels=0.00;FS=0.562;HaplotypeScore=6.7863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,89:172:99:1929,0,1763 chrXIV 391118 . G A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.599;DP=139;Dels=0.00;FS=3.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1450,0,1376 chrXIV 391299 . G A 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.260;DP=168;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,82:168:99:1736,0,1761 chrXIV 391358 . G C 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.788;DP=180;Dels=0.00;FS=2.619;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.859;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,88:180:99:1671,0,1897 chrXIV 391364 . T C 1661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.626;DP=171;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.984;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.968;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,86:171:99:1691,0,1767 chrXIV 391568 . G A 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.725;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.196;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:808,0,860 chrXIV 391590 . T C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.440;DP=143;Dels=0.00;FS=3.936;HaplotypeScore=9.4216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.783;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1397,0,1368 chrXIV 391634 . G A 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.802;DP=145;Dels=0.00;FS=14.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.489;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1452,0,1504 chrXIV 391752 . A G 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=1;QD=25.03;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3680,381,0 chrXIV 391796 . G A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.925;DP=156;Dels=0.00;FS=4.732;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1538,0,1523 chrXIV 391817 . T C 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.363;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:977,0,1392 chrXIV 391818 . A G 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.836;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.315;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:920,0,1390 chrXIV 391829 . G A 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.448;DP=125;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.174;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1016,0,1458 chrXIV 391871 . A G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.004;DP=134;Dels=0.00;FS=6.912;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.609;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.730;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1153,0,1508 chrXIV 391904 . G A 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.989;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.195;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1062,0,1285 chrXIV 391916 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.814;DP=125;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1176,0,1305 chrXIV 391961 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.363;DP=147;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.178;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1440,0,1450 chrXIV 391970 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;DP=136;Dels=0.00;FS=6.302;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.673;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1405,0,1306 chrXIV 392061 . T C 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.006;DP=121;Dels=0.00;FS=2.391;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1013,0,1388 chrXIV 392063 . A G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=122;Dels=0.00;FS=2.407;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.970;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.994;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1057,0,1402 chrXIV 392076 . G C 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.278;DP=133;Dels=0.00;FS=4.718;HaplotypeScore=3.9097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.827;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:914,0,1741 chrXIV 392155 . A T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.532;DP=122;Dels=0.00;FS=7.524;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.294;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1425,0,1099 chrXIV 392559 . A G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.276;DP=112;Dels=0.00;FS=5.867;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1204,0,984 chrXIV 392589 . G A 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.922;DP=131;Dels=0.00;FS=2.435;HaplotypeScore=3.7441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1609,0,1200 chrXIV 392734 . A G 822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;DP=96;Dels=0.00;FS=14.045;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.129;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:852,0,1184 chrXIV 392906 . G A 1988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;DP=168;Dels=0.00;FS=3.832;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.572;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,92:168:99:2018,0,1525 chrXIV 393022 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.905;DP=127;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1250,0,1259 chrXIV 393050 . A G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;DP=140;Dels=0.00;FS=3.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.331;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1320,0,1482 chrXIV 393053 . A C 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.487;DP=142;Dels=0.00;FS=3.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.925;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1365,0,1552 chrXIV 393101 . T G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.584;DP=130;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.898;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1336,0,1275 chrXIV 393110 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;DP=133;Dels=0.00;FS=3.149;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1396,0,1229 chrXIV 393129 . G A 1981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.461;DP=173;Dels=0.00;FS=1.954;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,95:173:99:2011,0,1537 chrXIV 393243 . C T 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.175;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.223;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1589,0,1264 chrXIV 393350 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.981;DP=139;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=7.6764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1235,0,1668 chrXIV 393398 . T C 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.483;DP=154;Dels=0.00;FS=3.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1301,0,1879 chrXIV 393425 . C T 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.131;DP=112;Dels=0.00;FS=2.431;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.155;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1046,0,1208 chrXIV 393703 . G A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.151;DP=149;Dels=0.00;FS=3.071;HaplotypeScore=5.8214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=0.731;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1438,0,1460 chrXIV 393812 . G A 1942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.619;DP=175;Dels=0.00;FS=9.017;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.110;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,91:175:99:1972,0,1635 chrXIV 393863 . C T 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.951;DP=161;Dels=0.00;FS=0.586;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,83:161:99:1695,0,1513 chrXIV 393905 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.111;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.233;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.501;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1421,0,1631 chrXIV 394023 . C G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.676;DP=161;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=6.2569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.686;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:161:99:1381,0,1768 chrXIV 394076 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.604;DP=156;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:156:99:1333,0,1661 chrXIV 394139 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.431;DP=146;Dels=0.00;FS=6.255;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.877;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1361,0,1307 chrXIV 394161 . C T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.495;DP=147;Dels=0.00;FS=6.125;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=8.15;ReadPosRankSum=2.072;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1228,0,1324 chrXIV 394167 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.070;DP=148;Dels=0.00;FS=2.955;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.583;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:148:99:1136,0,1366 chrXIV 394187 . T C 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.582;DP=156;Dels=0.00;FS=5.837;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=7.43;ReadPosRankSum=-1.783;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1189,0,1249 chrXIV 394241 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.552;DP=137;Dels=0.00;FS=4.191;HaplotypeScore=2.2788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.207;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,80:137:99:1478,0,1005 chrXIV 394440 . T C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.602;DP=99;Dels=0.00;FS=1.616;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.235;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1030,0,1146 chrXIV 394558 . A T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.925;DP=135;Dels=0.00;FS=3.144;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=2.022;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.732;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1239,0,1499 chrXIV 394559 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.438;DP=134;Dels=0.00;FS=3.188;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.669;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1228,0,1449 chrXIV 395169 . A G 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.636;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1175,0,1557 chrXIV 395338 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.447;DP=160;Dels=0.00;FS=2.871;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.162;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1461,0,1734 chrXIV 395701 . A G 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;DP=113;Dels=0.00;FS=4.579;HaplotypeScore=3.5601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.503;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1104,0,1247 chrXIV 395734 . A G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.280;DP=127;Dels=0.00;FS=1.418;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=1;MQRankSum=0.478;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1341,0,1258 chrXIV 396235 . T C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.047;DP=112;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.741;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:998,0,1376 chrXIV 396344 . G A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.592;DP=134;Dels=0.00;FS=6.564;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=9.59;ReadPosRankSum=2.226;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1315,0,1320 chrXIV 396544 . C T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.896;DP=126;Dels=0.00;FS=2.234;HaplotypeScore=3.2649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.391;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1143,0,1334 chrXIV 396569 . T C 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.090;DP=121;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1000,0,1402 chrXIV 396664 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.871;DP=126;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1049,0,1617 chrXIV 396730 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.332;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.390;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1155,0,1048 chrXIV 396742 . C T 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;DP=97;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.465;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1040,0,954 chrXIV 396880 . T C 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.200;DP=139;Dels=0.00;FS=5.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1391,0,1471 chrXIV 396967 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.075;DP=132;Dels=0.00;FS=3.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.995;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.863;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1199,0,1519 chrXIV 397958 . A G 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;DP=133;Dels=0.00;FS=6.484;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.230;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,76:133:99:1623,0,1173 chrXIV 398211 . A G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;DP=108;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:905,0,1414 chrXIV 398252 . C A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.915;DP=114;Dels=0.00;FS=2.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.160;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1314,0,1057 chrXIV 398280 . A G 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.962;DP=98;Dels=0.00;FS=2.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.623;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:927,0,1070 chrXIV 398341 . T C 792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.06;MQ0=0;MQRankSum=1.458;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.413;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:822,0,1444 chrXIV 398437 . G A 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.392;DP=112;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.130;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.562;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:806,0,1498 chrXIV 398440 . T C 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.319;DP=114;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.75;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,70:114:99:1508,0,889 chrXIV 398505 . A G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=60.1782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.257;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1077,0,1137 chrXIV 398753 . C T 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.075;DP=116;Dels=0.00;FS=3.743;HaplotypeScore=9.6386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.657;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:3111,318,0 chrXIV 398822 . A G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.581;DP=106;Dels=0.00;FS=1.559;HaplotypeScore=5.0333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.885;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.530;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:106:99:905,0,1180 chrXIV 398966 . A G 2210 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2243,234,0 chrXIV 399267 . T G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.855;DP=131;Dels=0.00;FS=5.867;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.292;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1276,0,1353 chrXIV 399354 . T A 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.304;DP=152;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.755;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1665,0,1409 chrXIV 399956 . T G 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.359;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:906,0,1086 chrXIV 400003 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;DP=110;Dels=0.00;FS=5.849;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1087,0,1147 chrXIV 400049 . T C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.666;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:952,0,1308 chrXIV 400189 . C T 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.027;DP=125;Dels=0.00;FS=3.391;HaplotypeScore=4.3406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1378,0,1086 chrXIV 400328 . A G 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.249;DP=116;Dels=0.00;FS=5.776;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:116:99:889,0,1355 chrXIV 400336 . G A 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.889;DP=97;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.340;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:813,0,1187 chrXIV 400514 . G A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.812;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1422,0,1449 chrXIV 400613 . T C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.829;DP=115;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=3.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,53:115:99:1041,0,1287 chrXIV 400694 . C G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.201;DP=131;Dels=0.01;FS=0.654;HaplotypeScore=10.6586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.033;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1139,0,1553 chrXIV 400723 . C T 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;DP=114;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.977;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1333,0,1047 chrXIV 400788 . G T 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=76.1763;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2738,279,0 chrXIV 400821 . C A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.525;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.596;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1122,0,1048 chrXIV 400901 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;DP=126;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=3.5318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.840;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1215,0,1379 chrXIV 400998 . T C 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.230;DP=113;Dels=0.00;FS=10.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.612;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1028,0,1378 chrXIV 401015 . T A 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3210,345,0 chrXIV 401165 . G A 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2595,270,0 chrXIV 401240 . C T 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3373,340,0 chrXIV 401251 . A T 3486.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3486,355,0 chrXIV 401352 . C G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.188;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1240,0,1262 chrXIV 401498 . G A 2600 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2633,273,0 chrXIV 401507 . G A 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2651,267,0 chrXIV 402266 . A G 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=101;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:923,0,1189 chrXIV 402640 . A G 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.020;DP=138;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.610;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1570,0,1327 chrXIV 403146 . T C 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;DP=124;Dels=0.00;FS=8.470;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.885;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1392,0,1194 chrXIV 403153 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;DP=117;Dels=0.00;FS=3.464;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.394;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1382,0,1119 chrXIV 403294 . T C 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1496,0,1143 chrXIV 403835 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.732;DP=163;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=2.9401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=7.71;ReadPosRankSum=3.210;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,66:163:99:1286,0,2002 chrXIV 403871 . C T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.985;DP=165;Dels=0.00;FS=1.224;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.140;QD=9.28;ReadPosRankSum=-2.244;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1562,0,1701 chrXIV 404051 . A G 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8421;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3668,381,0 chrXIV 404384 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.996;DP=113;Dels=0.00;FS=5.851;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1127,0,1175 chrXIV 404818 . G A 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.444;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.406;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,88:166:99:1887,0,1538 chrXIV 404832 . C G 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.981;DP=142;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.045;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:142:99:1681,0,1222 chrXIV 404899 . A G 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.526;DP=139;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.736;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1547,0,1464 chrXIV 404941 . C T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;DP=132;Dels=0.00;FS=3.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1493,0,1430 chrXIV 404995 . A G 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3211,336,0 chrXIV 405028 . T A 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2828,285,0 chrXIV 405043 . A C 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3321,345,0 chrXIV 405097 . G A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.160;DP=122;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=8.80;ReadPosRankSum=2.092;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1104,0,1288 chrXIV 405175 . T A 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;DP=155;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=8.9260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.570;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,85:155:99:1792,0,1390 chrXIV 405502 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.130;DP=146;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=2.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.983;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1541,0,1509 chrXIV 405756 . A T 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.941;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQ0=0;MQRankSum=-6.536;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.615;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,89:179:99:1742,0,1901 chrXIV 405787 . C T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.226;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=-7.027;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.864;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:150:99:1652,0,1352 chrXIV 405795 . A C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;DP=162;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=6.1295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=-4.798;QD=9.86;ReadPosRankSum=-2.280;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,90:162:99:1628,0,1492 chrXIV 405802 . C T 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;DP=160;Dels=0.00;FS=2.118;HaplotypeScore=4.3414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-5.845;QD=10.09;ReadPosRankSum=-2.699;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,89:160:99:1644,0,1420 chrXIV 405841 . T A,C 3453.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=159;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=53.91;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=21.72;ReadPosRankSum=-1.122;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,82,76:159:99:3453,1649,1436,1804,0,1603 chrXIV 405847 . T C 1353.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.670;DP=158;Dels=0.00;FS=12.521;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.35;MQ0=0;MQRankSum=-4.557;QD=8.56;ReadPosRankSum=2.000;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1383,0,1665 chrXIV 405849 . T C 1355.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.505;DP=162;Dels=0.00;FS=12.390;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.382;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1385,0,1707 chrXIV 406133 . A G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.364;DP=134;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=7.6810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.034;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:134:99:1225,0,1509 chrXIV 406739 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;DP=135;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1481,0,1292 chrXIV 407285 . A G 4907.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.56;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:192:99:4907,499,0 chrXIV 407287 . T C 2010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.991;DP=190;Dels=0.00;FS=0.548;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,101:190:99:2040,0,1875 chrXIV 407531 . A T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.089;DP=139;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1199,0,1605 chrXIV 407716 . C T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.707;DP=151;Dels=0.00;FS=2.082;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.769;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1564,0,1599 chrXIV 408025 . T A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.493;DP=124;Dels=0.00;FS=5.049;HaplotypeScore=3.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:124:99:1313,0,1260 chrXIV 408124 . T C 4144.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4144,420,0 chrXIV 408377 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.448;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,71:161:99:1327,0,1912 chrXIV 408444 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.257;DP=135;Dels=0.00;FS=4.123;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=2.128;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1365,0,1420 chrXIV 408505 . G A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.248;DP=126;Dels=0.00;FS=3.337;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.354;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1416,0,1077 chrXIV 408508 . G A 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3165,327,0 chrXIV 408922 . C G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.883;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=8.36;ReadPosRankSum=-2.238;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1075,0,1268 chrXIV 409114 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.363;DP=144;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1377,0,1568 chrXIV 409622 . A G 3406.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3406,357,0 chrXIV 410599 . A G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.547;DP=146;Dels=0.00;FS=3.896;HaplotypeScore=2.5395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=9.80;ReadPosRankSum=3.082;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1461,0,1488 chrXIV 410941 . A G 1914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.032;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,96:187:99:1944,0,1892 chrXIV 411667 . T A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.666;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:141:99:1394,0,1624 chrXIV 411803 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.371;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1269,0,1398 chrXIV 411899 . C T 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.856;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1496,0,1480 chrXIV 411928 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.811;DP=135;Dels=0.00;FS=4.153;HaplotypeScore=3.4259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1150,0,1504 chrXIV 411943 . G C 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3393,366,0 chrXIV 412116 . T C 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.648;DP=127;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=2.6023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=10.72;ReadPosRankSum=3.528;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1391,0,1298 chrXIV 412258 . G A 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.215;DP=156;Dels=0.00;FS=4.652;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=10.46;ReadPosRankSum=4.126;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1662,0,1649 chrXIV 412260 . A G 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;DP=152;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=10.19;ReadPosRankSum=3.421;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1579,0,1616 chrXIV 412273 . G A 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.344;DP=153;Dels=0.00;FS=2.856;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.291;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1719,0,1528 chrXIV 412313 . C T 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.270;DP=165;Dels=0.00;FS=3.687;HaplotypeScore=4.9508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-3.782;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1605,0,1765 chrXIV 412369 . A T 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.004;DP=125;Dels=0.00;FS=1.006;HaplotypeScore=5.5864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.93;MQ0=0;MQRankSum=-6.912;QD=6.90;ReadPosRankSum=-2.161;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:892,0,1634 chrXIV 412378 . T A 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;DP=121;Dels=0.00;FS=3.814;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQ0=0;MQRankSum=-5.940;QD=6.86;ReadPosRankSum=-2.542;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:860,0,1534 chrXIV 412400 . C T 721.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.612;DP=125;Dels=0.00;FS=2.165;HaplotypeScore=12.7922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.42;MQ0=0;MQRankSum=-7.569;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.016;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,45:125:99:751,0,1701 chrXIV 412403 . T C 627.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.079;DP=120;Dels=0.00;FS=3.336;HaplotypeScore=12.7922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.03;MQ0=0;MQRankSum=-7.859;QD=5.23;ReadPosRankSum=1.324;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,43:120:99:657,0,1688 chrXIV 412406 . C T 656.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.620;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.13;MQ0=0;MQRankSum=-8.010;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.887;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,46:124:99:686,0,1702 chrXIV 412417 . G A 437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.013;DP=98;Dels=0.00;FS=5.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=-5.997;QD=4.46;ReadPosRankSum=2.170;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,31:98:99:467,0,1431 chrXIV 412520 . C G 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.328;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.343;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1341,0,1097 chrXIV 412526 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.379;DP=126;Dels=0.00;FS=2.377;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.06;MQ0=0;MQRankSum=-4.053;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1289,0,1311 chrXIV 412555 . T A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.446;DP=135;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=-6.150;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.390;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1324,0,1517 chrXIV 412559 . T C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.654;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-5.405;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.127;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1140,0,1690 chrXIV 412581 . G A 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;DP=128;Dels=0.00;FS=7.060;HaplotypeScore=49.6800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQ0=1;MQRankSum=-9.396;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:991,0,1469 chrXIV 412587 . T A 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;DP=131;Dels=0.00;FS=1.666;HaplotypeScore=51.6628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.07;MQ0=1;MQRankSum=-9.442;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.295;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:131:99:818,0,1717 chrXIV 412609 . G T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.269;DP=162;Dels=0.00;FS=4.952;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.57;MQ0=1;MQRankSum=-8.945;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.033;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,63:162:99:1104,0,2086 chrXIV 412833 . C T 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.019;DP=108;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=3.312;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.109;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:108:99:999,0,1154 chrXIV 413106 . C G 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;DP=105;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1009,0,1021 chrXIV 413673 . A G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.825;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1304,0,1484 chrXIV 413686 . G T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.638;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.900;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.053;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1276,0,1657 chrXIV 414010 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.388;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1393,0,1488 chrXIV 414025 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.344;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.945;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1271,0,1220 chrXIV 415054 . C T 685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.671;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:52:718,52,0 chrXIV 415071 . C T 644 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8910;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.405;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:49:677,49,0 chrXIV 415088 . C T 226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.995;DP=107;Dels=0.00;FS=221.237;HaplotypeScore=78.7174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.457;QD=2.11;ReadPosRankSum=-2.382;SB=-3.018e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,40:107:34:256,0,34 chrXIV 415096 . C T 237.27 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.022;DP=107;Dels=0.01;FS=115.002;HaplotypeScore=95.0992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=-3.180;QD=2.22;ReadPosRankSum=-3.536;SB=-2.503e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:9:267,0,9 chrXIV 415551 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.217;DP=120;Dels=0.00;FS=5.663;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.973;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1426,0,1145 chrXIV 415606 . T G 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.14;MQ0=0;QD=26.03;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2714,285,0 chrXIV 415654 . A T 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2565,258,0 chrXIV 415788 . A G 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.89;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3062,333,0 chrXIV 415793 . A T 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.76;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3054,318,0 chrXIV 415844 . A G 2297 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.39;MQ0=0;QD=22.74;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2330,255,0 chrXIV 415849 . G A 2512 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.76;MQ0=0;QD=24.15;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2545,261,0 chrXIV 415877 . G A 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2929,312,0 chrXIV 415969 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.573;DP=154;Dels=0.00;FS=4.823;HaplotypeScore=6.7362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.071;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:1306,0,1955 chrXIV 416164 . T C 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3229,342,0 chrXIV 416179 . T C 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=23.84;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2703,297,0 chrXIV 416204 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.357;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1231,0,980 chrXIV 416620 . T G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.964;DP=125;Dels=0.00;FS=2.309;HaplotypeScore=3.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=2.307;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1348,0,1278 chrXIV 416832 . G T 4211.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.99;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4211,415,0 chrXIV 416916 . G A 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.006;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.494;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1063,0,1143 chrXIV 416991 . G A 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2828,288,0 chrXIV 417156 . T A 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3298,339,0 chrXIV 417400 . T A 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.07;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3167,319,0 chrXIV 417421 . C T 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.44;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3179,327,0 chrXIV 417439 . G A 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.10;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3034,312,0 chrXIV 417477 . T C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.672;DP=130;Dels=0.00;FS=9.484;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=3.201;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.473;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1257,0,1329 chrXIV 417496 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.830;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.513;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1357,0,1638 chrXIV 417610 . G C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;DP=120;Dels=0.00;FS=3.362;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1328,0,1090 chrXIV 417659 . G A 2754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2787,288,0 chrXIV 417758 . C T 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0622;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3099,318,0 chrXIV 418066 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3266,342,0 chrXIV 418123 . T C 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2793,285,0 chrXIV 418195 . C T 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;DP=125;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.179;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1247,0,1336 chrXIV 418291 . A G 2764 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2797,291,0 chrXIV 418300 . T C 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2827,321,0 chrXIV 418324 . A G 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2907,306,0 chrXIV 418437 . G A 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2686,282,0 chrXIV 418511 . T C 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2519,261,0 chrXIV 418723 . T A 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2794,294,0 chrXIV 418738 . G A 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3338,348,0 chrXIV 418767 . G A 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3353,339,0 chrXIV 418776 . G A 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3287,330,0 chrXIV 419029 . T C 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3140,330,0 chrXIV 419038 . C T 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3214,325,0 chrXIV 419074 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.807;DP=125;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1196,0,1280 chrXIV 419118 . C T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.203;DP=109;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1072,0,1068 chrXIV 419161 . C T 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2840,291,0 chrXIV 419170 . T C 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3047,324,0 chrXIV 419205 . G A 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3090,321,0 chrXIV 419287 . C T 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2650,276,0 chrXIV 419323 . G A 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2859,300,0 chrXIV 419479 . G A 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.640;DP=151;Dels=0.00;FS=3.728;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.677;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3897,373,0 chrXIV 419934 . G A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.976;DP=152;Dels=0.00;FS=2.005;HaplotypeScore=2.6694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.990;QD=10.45;ReadPosRankSum=2.443;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1619,0,1515 chrXIV 420029 . C T 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2580;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3398,351,0 chrXIV 420063 . T C 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3222,348,0 chrXIV 420080 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.100;DP=143;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=2.9191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.386;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1470,0,1498 chrXIV 420094 . C T 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.990e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3964,408,0 chrXIV 420283 . C G 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3443,366,0 chrXIV 420526 . A C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.414;DP=126;Dels=0.00;FS=0.959;HaplotypeScore=2.6739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.215;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1330,0,1322 chrXIV 420782 . C T 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.097;DP=125;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=2.7152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.047;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1016,0,1321 chrXIV 420944 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.306;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.565;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1400,0,1539 chrXIV 420961 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.775;DP=137;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.464;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1310,0,1547 chrXIV 421259 . C T 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.112;DP=152;Dels=0.00;FS=11.364;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.357;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:1768,0,1406 chrXIV 421631 . C T 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3444,360,0 chrXIV 421697 . T C 4074.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5082;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.25;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4074,417,0 chrXIV 421838 . T C 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0516;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3467,363,0 chrXIV 421898 . G A 4173.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.92;SB=-2.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4173,409,0 chrXIV 422066 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;DP=130;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.371;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1093,0,1637 chrXIV 422081 . A T 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3507,366,0 chrXIV 422140 . C T 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.819e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3671,370,0 chrXIV 422171 . C T 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3289,322,0 chrXIV 422213 . T A 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3141,330,0 chrXIV 422216 . A T 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3191,336,0 chrXIV 422360 . T G 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3144,336,0 chrXIV 422369 . G A 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3282,333,0 chrXIV 422402 . G A 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3162,330,0 chrXIV 422411 . A G 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3006,324,0 chrXIV 422509 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.673;DP=149;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.324;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1499,0,1558 chrXIV 422528 . A T 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3693,372,0 chrXIV 422665 . T C 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3454,348,0 chrXIV 423011 . G A 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2693,285,0 chrXIV 423164 . G A 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.764;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.332;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:839,0,898 chrXIV 423266 . C T 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3253,331,0 chrXIV 423311 . A G 2399 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2432,258,0 chrXIV 423655 . C T 4469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.25;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4469,451,0 chrXIV 423792 . C T 2580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2613,264,0 chrXIV 423965 . A G 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3193,333,0 chrXIV 424418 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.525;DP=115;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.266;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1289,0,1107 chrXIV 424894 . C A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;DP=141;Dels=0.00;FS=2.214;HaplotypeScore=3.4278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.411;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1347,0,1457 chrXIV 424906 . C T 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=144;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=11.71;ReadPosRankSum=-2.350;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1716,0,1225 chrXIV 425075 . C T 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3383,345,0 chrXIV 425219 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;DP=148;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.145;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1469,0,1530 chrXIV 425369 . A G 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3759,393,0 chrXIV 425456 . A G 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.271;DP=143;Dels=0.00;FS=2.975;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.143;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1494,0,1465 chrXIV 425480 . A G 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.346;DP=150;Dels=0.00;FS=1.285;HaplotypeScore=2.8077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.972;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1435,0,1689 chrXIV 425507 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.396;DP=146;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=3.3578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1427,0,1586 chrXIV 425525 . G C 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;DP=124;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.384;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1470,0,1076 chrXIV 425747 . G A 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.469;DP=168;Dels=0.00;FS=1.893;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.273;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,87:168:99:1724,0,1666 chrXIV 425774 . A G 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.123;DP=180;Dels=0.00;FS=1.858;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.318;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,85:180:99:1676,0,1940 chrXIV 425816 . G A 3895.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3895,388,0 chrXIV 425890 . A G 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.425;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,84:178:99:1672,0,1897 chrXIV 426089 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.931;DP=119;Dels=0.00;FS=2.361;HaplotypeScore=2.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=9.34;ReadPosRankSum=2.084;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:119:99:1141,0,1239 chrXIV 426155 . A G 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.814;DP=149;Dels=0.00;FS=10.562;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1545,0,1537 chrXIV 426161 . G A 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;DP=148;Dels=0.00;FS=10.420;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1589,0,1443 chrXIV 426226 . A T 3996.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3996,414,0 chrXIV 426290 . A G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.107;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.943;QD=8.99;ReadPosRankSum=-2.498;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1388,0,1574 chrXIV 426428 . T A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;DP=132;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.259;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1110,0,1588 chrXIV 426629 . A G 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;DP=134;Dels=0.00;FS=3.072;HaplotypeScore=3.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.361;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1450,0,1372 chrXIV 426647 . G A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.329;DP=138;Dels=0.00;FS=3.989;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.301;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1542,0,1310 chrXIV 426745 . C G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.734;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.403;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:1675,0,1212 chrXIV 426977 . C A 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.188;DP=146;Dels=0.00;FS=8.126;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1681,0,1291 chrXIV 427089 . A T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.157;DP=170;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=-0.753;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,76:170:99:1517,0,1981 chrXIV 427117 . T C 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.651;DP=179;Dels=0.00;FS=4.510;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=1.928;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.017;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,82:179:99:1639,0,2089 chrXIV 427278 . A G 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4042;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3356,363,0 chrXIV 427279 . A G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.249;DP=136;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=2.5721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.059;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1375,0,1435 chrXIV 427333 . A G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.348;DP=129;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.117;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1465,0,1261 chrXIV 427388 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.940;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1256,0,1714 chrXIV 427451 . A G 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3577,402,0 chrXIV 427601 . T G 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.460;DP=150;Dels=0.00;FS=2.897;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=1;MQRankSum=0.523;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1319,0,1720 chrXIV 427654 . C T 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.888;DP=122;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.382;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1159,0,1295 chrXIV 427693 . C A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.840;DP=114;Dels=0.00;FS=5.735;HaplotypeScore=7.4454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.761;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1100,0,1273 chrXIV 427917 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;DP=129;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.737;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1275,0,1376 chrXIV 427926 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.128;DP=128;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=2.9630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.064;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1202,0,1394 chrXIV 427944 . T C 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.680;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.573;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1156,0,1273 chrXIV 428064 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.050;DP=139;Dels=0.00;FS=4.101;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.428;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1385,0,1428 chrXIV 428138 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;DP=112;Dels=0.00;FS=11.044;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.050;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:112:99:1257,0,1013 chrXIV 428218 . G C 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;DP=132;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1450,0,1183 chrXIV 428364 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;DP=129;Dels=0.00;FS=3.631;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1256,0,1454 chrXIV 428450 . T G 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:969,0,1181 chrXIV 428493 . T C 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;DP=119;Dels=0.00;FS=6.210;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.891;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:971,0,1421 chrXIV 428659 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.729;DP=145;Dels=0.00;FS=4.442;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.311;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1383,0,1418 chrXIV 428693 . C T 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4051,400,0 chrXIV 428711 . C T 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.690;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.073;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1517,0,1598 chrXIV 428712 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.205;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.492;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1518,0,1522 chrXIV 428844 . C T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.756;DP=131;Dels=0.00;FS=4.261;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.945;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.464;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1168,0,1504 chrXIV 428861 . T C 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3254,351,0 chrXIV 428883 . T C 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3119,336,0 chrXIV 428948 . G A 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2756,282,0 chrXIV 428970 . C T 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2789,291,0 chrXIV 428978 . A G 2579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2612,279,0 chrXIV 429024 . T C 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=23.91;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2830,315,0 chrXIV 429042 . T C 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3085,330,0 chrXIV 429156 . T C 4021.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4021,414,0 chrXIV 429229 . G A 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.766;DP=135;Dels=0.00;FS=4.159;HaplotypeScore=3.1725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1393,0,1308 chrXIV 429271 . A G 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.114;DP=101;Dels=0.00;FS=8.004;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.161;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:821,0,1284 chrXIV 429321 . G A 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.866;DP=112;Dels=0.00;FS=5.069;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.076;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1052,0,1290 chrXIV 429408 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.409;DP=112;Dels=0.00;FS=2.616;HaplotypeScore=2.2168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1149,0,1029 chrXIV 429589 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.423;DP=135;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=1.882;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.626;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1280,0,1239 chrXIV 429682 . G A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.099;DP=126;Dels=0.00;FS=4.502;HaplotypeScore=3.8622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.484;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.675;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1192,0,1215 chrXIV 429773 . T G 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.285;DP=109;Dels=0.00;FS=8.061;HaplotypeScore=68.9389;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=24.09;ReadPosRankSum=2.131;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:109:99:2659,276,0 chrXIV 429959 . T A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=1;QD=24.87;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3266,330,0 chrXIV 430147 . A G 2614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2647,273,0 chrXIV 430152 . C T 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;DP=108;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:972,0,1155 chrXIV 430328 . A G 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.229;DP=146;Dels=0.00;FS=8.664;HaplotypeScore=9.9242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.536;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1459,0,1569 chrXIV 430407 . C T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.854;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.506;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1366,0,1459 chrXIV 430491 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.101;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.637;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,70:119:99:1474,0,938 chrXIV 430565 . C T 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.463;DP=93;Dels=0.00;FS=2.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:920,0,956 chrXIV 430602 . T C 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;DP=110;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.652;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1091,0,1128 chrXIV 430645 . G A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;DP=91;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:1009,0,905 chrXIV 430756 . C T 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.978;DP=108;Dels=0.00;FS=2.710;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.570;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:919,0,1330 chrXIV 430758 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;DP=104;Dels=0.00;FS=2.686;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1286,0,921 chrXIV 430773 . T C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.783;DP=100;Dels=0.00;FS=9.835;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=10.60;ReadPosRankSum=2.169;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1090,0,942 chrXIV 430815 . A G 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;DP=99;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=2.2912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.459;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:865,0,1131 chrXIV 430923 . T A 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.646;DP=121;Dels=0.00;FS=3.504;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.188;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3071,298,0 chrXIV 431004 . G A 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3080,318,0 chrXIV 431058 . A G 2688 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8684;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;QD=22.97;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2721,282,0 chrXIV 431063 . T C 2690 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=22.99;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2723,285,0 chrXIV 431064 . G A 904.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.786;DP=116;Dels=0.00;FS=5.976;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.064;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:934,0,1144 chrXIV 431072 . A G 2877 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.41;MQ0=0;QD=21.96;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2910,303,0 chrXIV 431184 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;DP=105;Dels=0.00;FS=3.888;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.112;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1236,0,987 chrXIV 431301 . T C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.016;DP=123;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=4.9320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.708;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1051,0,1470 chrXIV 431717 . A T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;DP=104;Dels=0.00;FS=1.630;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=11.89;ReadPosRankSum=2.600;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1267,0,916 chrXIV 432345 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.833;DP=117;Dels=0.00;FS=5.771;HaplotypeScore=5.6936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.102;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1377,0,1086 chrXIV 432400 . A T 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3642,352,0 chrXIV 432537 . C A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.484;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.473;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.402;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1175,0,1321 chrXIV 432822 . T C 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.131;DP=120;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1249,0,1233 chrXIV 433148 . G A 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2822,291,0 chrXIV 433269 . T C 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.991;DP=100;Dels=0.00;FS=1.659;HaplotypeScore=2.7165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=1;MQRankSum=1.187;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.327;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:902,0,1100 chrXIV 433271 . G A 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7165;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=1;QD=25.43;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2551,258,0 chrXIV 433338 . C T 2366 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.58;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2399,246,0 chrXIV 433431 . A T 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3309,333,0 chrXIV 433446 . T C 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3380,354,0 chrXIV 433506 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3048,306,0 chrXIV 433629 . A G 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3350,369,0 chrXIV 433631 . C G 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3419,363,0 chrXIV 433680 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3265,336,0 chrXIV 433706 . T A 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4489;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3311,328,0 chrXIV 434058 . T C 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3552,366,0 chrXIV 434340 . C T 2579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=23.88;ReadPosRankSum=1.379;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2612,282,0 chrXIV 434346 . A G 2410 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2443,258,0 chrXIV 434511 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.996;DP=129;Dels=0.00;FS=3.397;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=1;MQRankSum=1.399;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.776;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1314,0,1327 chrXIV 434524 . A G 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.948;DP=124;Dels=0.00;FS=4.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=1;MQRankSum=1.960;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.540;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1382,0,1130 chrXIV 434619 . T C 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.212;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=25.69;ReadPosRankSum=1.486;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:3982,375,0 chrXIV 434696 . T C 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.445;DP=117;Dels=0.00;FS=1.519;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1126,0,1258 chrXIV 434823 . C T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.430;DP=103;Dels=0.00;FS=3.732;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.099;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1155,0,1004 chrXIV 435046 . C T 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3298,333,0 chrXIV 435082 . T C 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3110,315,0 chrXIV 435457 . A G 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=23.35;SB=-2.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3782,381,0 chrXIV 435509 . C T 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3563,355,0 chrXIV 435604 . A G 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3163,336,0 chrXIV 435739 . A G 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2999,321,0 chrXIV 436441 . A G 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.668;DP=119;Dels=0.00;FS=7.181;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1118,0,1332 chrXIV 436534 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;DP=131;Dels=0.00;FS=3.141;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1351,0,1401 chrXIV 436636 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.029;DP=157;Dels=0.00;FS=2.103;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.552;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,71:157:99:1411,0,1762 chrXIV 436888 . A C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.490;DP=111;Dels=0.00;FS=6.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.186;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1163,0,1200 chrXIV 436906 . A G 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.596;DP=155;Dels=0.00;FS=4.435;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.165;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1436,0,1805 chrXIV 436918 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.053;DP=144;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.408;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1339,0,1662 chrXIV 436954 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;DP=142;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,61:142:99:1248,0,1745 chrXIV 437116 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.371;DP=118;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=5.8441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-2.094;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.283;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1205,0,1205 chrXIV 437153 . G A 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.403;DP=135;Dels=0.00;FS=6.806;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1388,0,1436 chrXIV 437345 . T C 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.426;DP=111;Dels=0.00;FS=2.624;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.134;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1281,0,1001 chrXIV 437349 . C T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.599;DP=106;Dels=0.00;FS=5.396;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:1344,0,946 chrXIV 437580 . A G 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;DP=154;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.779;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:154:99:1436,0,1639 chrXIV 437581 . G A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.885;DP=155;Dels=0.00;FS=2.036;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.693;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.770;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1431,0,1608 chrXIV 437599 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.052;DP=153;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=3.3944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=-4.274;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:153:99:1412,0,1705 chrXIV 437642 . G A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.523;DP=138;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=5.9167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.487;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.183;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1423,0,1424 chrXIV 437768 . G C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.975;DP=124;Dels=0.00;FS=4.343;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.586;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:956,0,1568 chrXIV 437783 . A G 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.201;DP=128;Dels=0.00;FS=2.294;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.743;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:964,0,1595 chrXIV 437882 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.615;DP=149;Dels=0.00;FS=5.005;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:149:99:1389,0,1681 chrXIV 437885 . T C 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.794;DP=154;Dels=0.00;FS=6.049;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.698;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1577,0,1726 chrXIV 437942 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;DP=118;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=1;MQRankSum=-0.068;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.810;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1189,0,1191 chrXIV 438050 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;DP=146;Dels=0.00;FS=4.061;HaplotypeScore=2.4866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.995;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:146:99:1536,0,1516 chrXIV 438139 . C T 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.193;DP=128;Dels=0.00;FS=4.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,78:128:99:1722,0,1017 chrXIV 438374 . T C 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.930;DP=127;Dels=0.00;FS=2.486;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.757;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.607;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1446,0,1285 chrXIV 438523 . C T 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;DP=101;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=2.3070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.90;MQ0=0;MQRankSum=-6.207;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.574;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:903,0,1032 chrXIV 438531 . T C 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.685;DP=100;Dels=0.00;FS=1.631;HaplotypeScore=3.0957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.774;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:872,0,928 chrXIV 438535 . T C 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.784;DP=104;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=5.4966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.89;MQ0=0;MQRankSum=-6.364;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:899,0,1009 chrXIV 438565 . C T 770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.034;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.49;MQ0=0;MQRankSum=-5.747;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:800,0,1107 chrXIV 438570 . C T 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.328;DP=124;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQ0=0;MQRankSum=-5.213;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:875,0,1208 chrXIV 438717 . G A 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.750;DP=148;Dels=0.00;FS=4.012;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1672,0,1327 chrXIV 439292 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.205;DP=149;Dels=0.00;FS=11.370;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1402,0,1713 chrXIV 439449 . A T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;DP=105;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=6.9357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.389;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1009,0,1260 chrXIV 439570 . G C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.866;DP=138;Dels=0.00;FS=7.661;HaplotypeScore=4.8532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1377,0,1199 chrXIV 439710 . G A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.423;DP=135;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1172,0,1322 chrXIV 439921 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.677;DP=155;Dels=0.00;FS=4.832;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.742;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,67:155:99:1392,0,1762 chrXIV 440295 . C T 1695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.203;DP=170;Dels=0.00;FS=1.235;HaplotypeScore=3.0888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,83:170:99:1725,0,1743 chrXIV 440660 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.149;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1317,0,1716 chrXIV 441013 . A T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;DP=134;Dels=0.00;FS=10.562;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.063;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.168;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1385,0,1426 chrXIV 441069 . T G 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.646;DP=152;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=2.394;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.219;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1441,0,1639 chrXIV 441185 . T G 2188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.149;DP=182;Dels=0.00;FS=2.654;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.552;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,110:182:99:2218,0,1393 chrXIV 441200 . A T 2083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.353;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,98:169:99:2113,0,1322 chrXIV 441223 . C T 1719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.758;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1749,0,1425 chrXIV 441233 . T G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.408;DP=150;Dels=0.00;FS=5.363;HaplotypeScore=3.7918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.154;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1361,0,1467 chrXIV 441408 . A G 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.939;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1544,0,1312 chrXIV 441435 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=137;Dels=0.00;FS=4.132;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.001;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1377,0,1398 chrXIV 441615 . C T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.588;DP=147;Dels=0.00;FS=1.368;HaplotypeScore=4.1221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.634;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1650,0,1388 chrXIV 441969 . T A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.538;DP=132;Dels=0.00;FS=3.259;HaplotypeScore=2.5583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1394,0,1315 chrXIV 441999 . A G 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.933;DP=139;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.567;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1359,0,1549 chrXIV 442265 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.098;DP=131;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.156;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1198,0,1509 chrXIV 442390 . C A 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.185;DP=142;Dels=0.00;FS=6.629;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.215;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.667;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1652,0,1337 chrXIV 442392 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.896;DP=147;Dels=0.00;FS=7.796;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.010;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1533,0,1490 chrXIV 442518 . G A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;DP=117;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=3.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1240,0,1180 chrXIV 442648 . T A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.420;DP=132;Dels=0.00;FS=4.185;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1376,0,1319 chrXIV 442653 . A G 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.918;DP=143;Dels=0.00;FS=4.975;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.853;QD=10.27;ReadPosRankSum=-2.950;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1499,0,1423 chrXIV 442660 . G A 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.323;DP=122;Dels=0.00;FS=7.021;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.100;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:986,0,1293 chrXIV 442665 . T C 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.744;DP=128;Dels=0.00;FS=5.435;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.955;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.474;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:930,0,1477 chrXIV 442716 . C T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;DP=167;Dels=0.00;FS=2.753;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.418;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:1454,0,1879 chrXIV 442736 . C A 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.312;DP=153;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.497;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:153:99:1378,0,1741 chrXIV 442805 . T C 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.273;DP=136;Dels=0.00;FS=2.231;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=2;MQRankSum=-0.104;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,80:136:99:1597,0,1138 chrXIV 442838 . C T 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.352;DP=137;Dels=0.00;FS=8.168;HaplotypeScore=6.9292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=1;MQRankSum=0.431;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.754;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1529,0,1318 chrXIV 442846 . C T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.545;DP=138;Dels=0.00;FS=9.429;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=1;MQRankSum=1.578;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.479;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1483,0,1379 chrXIV 442868 . T C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.198;DP=147;Dels=0.00;FS=7.332;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1449,0,1440 chrXIV 442912 . A G 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;DP=113;Dels=0.00;FS=1.499;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=2.756;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.198;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1124,0,1254 chrXIV 442949 . G T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.646;DP=126;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=2.578;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.064;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1483,0,1169 chrXIV 442970 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;DP=133;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=3.8240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=9.86;ReadPosRankSum=2.127;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1341,0,1359 chrXIV 442993 . T C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.078;DP=143;Dels=0.00;FS=3.245;HaplotypeScore=4.4441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.581;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:143:99:1437,0,1568 chrXIV 443003 . A T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=151;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=3.5792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=2;MQRankSum=-0.571;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.173;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1526,0,1525 chrXIV 443067 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.663;DP=139;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.65;MQ0=3;MQRankSum=0.683;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.209;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1365,0,1462 chrXIV 443160 . G A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.990;DP=127;Dels=0.00;FS=6.799;HaplotypeScore=2.3696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.173;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1624,0,1012 chrXIV 443191 . C T 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.464;DP=104;Dels=0.00;FS=3.755;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.563;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,60:104:99:1353,0,858 chrXIV 443303 . G A 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.314;DP=136;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=2.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,81:136:99:1803,0,1068 chrXIV 443566 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.438;DP=133;Dels=0.00;FS=9.212;HaplotypeScore=2.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.552;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1189,0,1540 chrXIV 443779 . A G 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.059;DP=95;Dels=0.00;FS=0.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.703;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:967,0,1043 chrXIV 443837 . A G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.643;DP=124;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=4.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.663;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1048,0,1399 chrXIV 443873 . A T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;DP=120;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.003;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1066,0,1412 chrXIV 443882 . T C 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.306;DP=130;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.755;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.333;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1120,0,1603 chrXIV 443895 . A C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.449;DP=137;Dels=0.00;FS=5.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.584;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1092,0,1707 chrXIV 444421 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.396;DP=145;Dels=0.00;FS=2.136;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=1;MQRankSum=-0.432;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.575;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1271,0,1597 chrXIV 444424 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.041;DP=128;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=1;MQRankSum=-1.904;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.103;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1231,0,1383 chrXIV 444446 . A G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.043;DP=117;Dels=0.00;FS=11.880;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.467;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1079,0,1322 chrXIV 444614 . A C 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.091;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.052;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:970,0,1417 chrXIV 444709 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.834;DP=113;Dels=0.00;FS=7.454;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.826;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1172,0,840 chrXIV 444853 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;DP=113;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.677;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1080,0,1327 chrXIV 445056 . G A 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.854;DP=125;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1449,0,1108 chrXIV 445139 . C A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.443;DP=130;Dels=0.00;FS=2.237;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.132;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1211,0,1449 chrXIV 445748 . T C 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.044;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1634,0,1563 chrXIV 446017 . G A 802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.126;DP=86;Dels=0.00;FS=4.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.494;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:86:99:832,0,962 chrXIV 446044 . A G 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.465;DP=81;Dels=0.00;FS=3.141;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.420;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:816,0,841 chrXIV 446331 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.826;DP=107;Dels=0.00;FS=3.764;HaplotypeScore=2.8645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.237;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:107:99:1233,0,967 chrXIV 446337 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.631;DP=112;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=3.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.626;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1178,0,1089 chrXIV 446584 . G C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.297;DP=151;Dels=0.00;FS=3.893;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.785;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1451,0,1563 chrXIV 446677 . G C 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.536;DP=103;Dels=0.00;FS=6.213;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1123,0,1025 chrXIV 446682 . T C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;DP=101;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1004,0,1059 chrXIV 446766 . T A 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.034;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.252;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1491,0,1446 chrXIV 446857 . G A 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.299;DP=148;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1528,0,1567 chrXIV 447324 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.606;DP=145;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=3.1894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.741;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1260,0,1511 chrXIV 447382 . G T 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3186,318,0 chrXIV 447433 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.957;DP=134;Dels=0.00;FS=5.861;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.086;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1303,0,1498 chrXIV 447754 . G T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.301;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.385;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1328,0,1295 chrXIV 448099 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.360;DP=117;Dels=0.00;FS=3.367;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1081,0,1366 chrXIV 448393 . C A 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3089,324,0 chrXIV 449001 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.862;DP=138;Dels=0.00;FS=5.244;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:138:99:1224,0,1584 chrXIV 449362 . G A 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3042,309,0 chrXIV 449371 . C T 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3008,309,0 chrXIV 449443 . T C 3154 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3187,336,0 chrXIV 449451 . T A 3023 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3056,306,0 chrXIV 449452 . T A 3007 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3040,306,0 chrXIV 449469 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.146;DP=132;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.583;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1236,0,1428 chrXIV 449521 . G A 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3088,324,0 chrXIV 449542 . T A 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2875,291,0 chrXIV 449640 . A G 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2597,279,0 chrXIV 449850 . G A 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3524,357,0 chrXIV 449853 . T C 3643.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3643,369,0 chrXIV 450291 . A G 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3646,372,0 chrXIV 450320 . A C 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3360,354,0 chrXIV 450515 . G A 3959.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=26.57;ReadPosRankSum=1.569;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3959,394,0 chrXIV 450550 . C G 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4629;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3276,345,0 chrXIV 450577 . G A 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2907,303,0 chrXIV 450844 . G A 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.505;DP=138;Dels=0.01;FS=3.305;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.898;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3219,307,0 chrXIV 450995 . C A 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3826,379,0 chrXIV 451131 . G A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;DP=149;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=4.9645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:1423,0,1689 chrXIV 451144 . G T 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.623;DP=145;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=2.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.220;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1732,0,1283 chrXIV 451256 . T G 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3519,360,0 chrXIV 451291 . G A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.243;DP=135;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1168,0,1603 chrXIV 451325 . T C 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;DP=114;Dels=0.00;FS=1.665;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.632;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:763,0,1494 chrXIV 451380 . T C 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3015,309,0 chrXIV 452058 . C T 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2803,291,0 chrXIV 452274 . G A 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;DP=150;Dels=0.00;FS=4.348;HaplotypeScore=3.3028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1596,0,1616 chrXIV 452401 . G A 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2823,294,0 chrXIV 452650 . C T 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3215,327,0 chrXIV 452788 . G A 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.008;DP=138;Dels=0.00;FS=12.127;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.539;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.630;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1455,0,1403 chrXIV 453168 . C G 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.66;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3046,321,0 chrXIV 453313 . T C 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3656,387,0 chrXIV 453664 . A C 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.046;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=5.4589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=2.587;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.166;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1133,0,1222 chrXIV 453766 . A G 4024.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:162:99:4024,420,0 chrXIV 453910 . A G 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;DP=159;Dels=0.00;FS=2.851;HaplotypeScore=3.6915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.491;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,82:159:99:1669,0,1474 chrXIV 453921 . T C 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.784;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:158:99:1398,0,1703 chrXIV 453937 . C T 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3626,352,0 chrXIV 454378 . G A 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;DP=118;Dels=0.00;FS=4.921;HaplotypeScore=7.7951;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=24.32;ReadPosRankSum=0.558;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2903,300,0 chrXIV 454645 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;DP=113;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,66:113:99:1397,0,1001 chrXIV 454932 . A G 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;DP=122;Dels=0.00;FS=9.059;HaplotypeScore=6.7808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=3.324;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.533;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,78:122:99:1667,0,811 chrXIV 454959 . C T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.208;DP=126;Dels=0.00;FS=14.999;HaplotypeScore=2.6421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1504,0,1080 chrXIV 454997 . C T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.575;DP=138;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.082;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1384,0,1491 chrXIV 455116 . G A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;DP=154;Dels=0.00;FS=3.789;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.984;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1471,0,1716 chrXIV 455264 . G A 4027.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4027,388,0 chrXIV 456086 . A C 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2856;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3688,396,0 chrXIV 456223 . A C 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=1;QD=25.72;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3627,378,0 chrXIV 456876 . G A 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7672;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3652,387,0 chrXIV 456993 . A G 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.10;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3471,369,0 chrXIV 457009 . G A 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.43;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3331,357,0 chrXIV 457107 . G A 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.403;DP=169;Dels=0.01;FS=5.795;HaplotypeScore=4.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.101;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,77:168:99:1515,0,1960 chrXIV 457180 . G C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.950;DP=120;Dels=0.00;FS=5.890;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1246,0,1166 chrXIV 457263 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.358;DP=123;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1248,0,1262 chrXIV 457485 . G A 2644 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=22.99;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2677,267,0 chrXIV 458177 . A G 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3178,330,0 chrXIV 458336 . A G 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.306;DP=138;Dels=0.00;FS=2.143;HaplotypeScore=2.6433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.828;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1306,0,1483 chrXIV 458449 . A G 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.335;DP=140;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.745;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1533,0,1385 chrXIV 458514 . G A 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3504,375,0 chrXIV 458669 . C T 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.820;DP=129;Dels=0.00;FS=7.496;HaplotypeScore=4.8930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.976;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,75:129:99:1683,0,1057 chrXIV 459152 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.545;DP=128;Dels=0.00;FS=3.607;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1143,0,1319 chrXIV 459806 . T G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.230;DP=120;Dels=0.00;FS=3.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.781;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.765;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1067,0,1389 chrXIV 459959 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.375;DP=138;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=3.9089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1430,0,1427 chrXIV 460406 . T C 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.068;DP=156;Dels=0.00;FS=2.022;HaplotypeScore=2.8689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,89:156:99:1712,0,1361 chrXIV 460625 . T C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.066;DP=116;Dels=0.00;FS=12.579;HaplotypeScore=4.4316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.071;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:990,0,1403 chrXIV 460850 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.245;DP=125;Dels=0.00;FS=9.662;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.557;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1191,0,1460 chrXIV 461091 . C G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.692;DP=124;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,71:124:99:1551,0,1040 chrXIV 461267 . G A 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.243;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.366;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:891,0,1310 chrXIV 461618 . T A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.675;DP=122;Dels=0.00;FS=2.371;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1382,0,1093 chrXIV 461705 . A G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.053;DP=120;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=2.8923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.011;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,69:120:99:1409,0,1019 chrXIV 461994 . A T 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;DP=135;Dels=0.00;FS=3.153;HaplotypeScore=4.9410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.854;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1330,0,1613 chrXIV 462227 . C A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.629;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.348;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:969,0,972 chrXIV 462339 . G A 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.940;DP=129;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1070,0,1508 chrXIV 462377 . G A 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.897;DP=152;Dels=0.00;FS=1.301;HaplotypeScore=75.1893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1631,0,1407 chrXIV 462443 . C G 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;DP=141;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=2.044;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:141:99:1521,0,1158 chrXIV 462447 . A G 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.604;DP=159;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=2.5395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.735;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,87:159:99:1646,0,1414 chrXIV 462572 . T C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.555;DP=118;Dels=0.00;FS=3.437;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.962;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1072,0,1381 chrXIV 462575 . A C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.916;DP=119;Dels=0.00;FS=2.408;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.412;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1137,0,1327 chrXIV 463196 . T G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.097;DP=138;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.243;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1486,0,1424 chrXIV 463310 . A G 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3179,333,0 chrXIV 463484 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.358;DP=131;Dels=0.00;FS=5.393;HaplotypeScore=3.0633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.189;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:131:99:1265,0,1345 chrXIV 463775 . C T 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.43;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2754,288,0 chrXIV 463992 . C G 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3232,333,0 chrXIV 464233 . G A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.576;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.026;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1386,0,1431 chrXIV 464483 . A G 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;DP=139;Dels=0.00;FS=4.044;HaplotypeScore=2.5704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.349;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:139:99:1415,0,1421 chrXIV 464484 . G A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.939;DP=142;Dels=0.00;FS=5.037;HaplotypeScore=2.5704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.061;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1512,0,1476 chrXIV 464541 . C G 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.743;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,85:157:99:1801,0,1414 chrXIV 464800 . A T 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.469;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.927;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1532,0,1070 chrXIV 464849 . C T 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.501;DP=96;Dels=0.00;FS=2.783;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.272;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,37:96:99:744,0,1267 chrXIV 465005 . C T 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3339,339,0 chrXIV 465029 . A T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.629;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1273,0,1161 chrXIV 465187 . A T 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;DP=95;Dels=0.00;FS=5.285;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.694;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,53:95:99:1137,0,891 chrXIV 465470 . C A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;DP=107;Dels=0.00;FS=3.551;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.781;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1108,0,1185 chrXIV 465764 . C A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.960;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.494;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1534,0,1174 chrXIV 465898 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.143;DP=128;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1349,0,1278 chrXIV 465982 . C T 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.209;DP=133;Dels=0.00;FS=7.766;HaplotypeScore=2.6777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.477;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1277,0,1437 chrXIV 466168 . T C 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;DP=120;Dels=0.00;FS=4.518;HaplotypeScore=3.7314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.094;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.108;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1153,0,1287 chrXIV 466221 . C T 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.417;DP=106;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=4.7358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.917;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1146,0,976 chrXIV 466265 . A T 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3212,321,0 chrXIV 466279 . A G 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.22;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3127,321,0 chrXIV 466363 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.663;DP=129;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.413;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1423,0,1233 chrXIV 466547 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.953;DP=133;Dels=0.00;FS=3.145;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.812;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1248,0,1427 chrXIV 466584 . G A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.066;DP=135;Dels=0.00;FS=2.217;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.341;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1355,0,1387 chrXIV 466623 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.827;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.354;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,66:153:99:1341,0,1833 chrXIV 466760 . G A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.166;DP=127;Dels=0.00;FS=3.195;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.984;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1427,0,1244 chrXIV 466878 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;DP=129;Dels=0.00;FS=1.557;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.610;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1266,0,1470 chrXIV 467022 . T C 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.800;DP=93;Dels=0.00;FS=4.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,45:93:99:865,0,1007 chrXIV 467098 . C A 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.723;DP=139;Dels=0.00;FS=7.536;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.323;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1539,0,1311 chrXIV 467219 . A G 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.958e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4068,441,0 chrXIV 467514 . G A 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;DP=129;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.567;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1454,0,1108 chrXIV 467605 . T C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.678;DP=154;Dels=0.00;FS=8.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:154:99:1385,0,1748 chrXIV 467673 . T C 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.566;DP=146;Dels=0.00;FS=3.907;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1223,0,1649 chrXIV 467765 . C T 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.481;DP=141;Dels=0.00;FS=4.138;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.899;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1628,0,1265 chrXIV 468105 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;DP=131;Dels=0.00;FS=3.165;HaplotypeScore=4.6977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.930;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:131:99:1264,0,1360 chrXIV 468108 . A G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.893;DP=118;Dels=0.00;FS=7.083;HaplotypeScore=3.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.728;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:118:99:1107,0,1190 chrXIV 468438 . A G 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.699;DP=117;Dels=0.00;FS=3.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.851;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,69:117:99:1411,0,1024 chrXIV 468488 . A G 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3193,330,0 chrXIV 468702 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.525;DP=115;Dels=0.00;FS=8.617;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.508;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1308,0,1114 chrXIV 468720 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.778;DP=125;Dels=0.00;FS=19.154;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1466,0,1189 chrXIV 468840 . C T 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;DP=95;Dels=0.00;FS=2.771;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:967,0,913 chrXIV 468861 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.218;DP=110;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.927;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1143,0,1061 chrXIV 468912 . G A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.716;DP=123;Dels=0.00;FS=4.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1205,0,1376 chrXIV 468930 . C A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;DP=122;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=9.28;ReadPosRankSum=-2.053;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1162,0,1410 chrXIV 468958 . A C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.312;DP=118;Dels=0.00;FS=2.359;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1060,0,1327 chrXIV 469102 . C T 1699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;DP=152;Dels=0.00;FS=2.247;HaplotypeScore=5.7479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:1729,0,1343 chrXIV 469108 . A G 1812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.321;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.175;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,90:158:99:1842,0,1387 chrXIV 469119 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.365;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.543;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.070;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:1472,0,1816 chrXIV 469131 . T C 1816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.856;DP=164;Dels=0.00;FS=2.551;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.928;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1846,0,1688 chrXIV 469170 . T C 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.453;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1770,0,1292 chrXIV 469224 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.291;DP=118;Dels=0.00;FS=3.327;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1067,0,1406 chrXIV 469265 . C A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;DP=144;Dels=0.00;FS=13.194;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.606;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1380,0,1645 chrXIV 469453 . A G 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.638;DP=129;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=8.16;ReadPosRankSum=2.845;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1083,0,1533 chrXIV 469909 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.446;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.589;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,57:96:99:1151,0,812 chrXIV 470015 . A C 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.806;DP=150;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=2.9708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.957;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1530,0,1662 chrXIV 470301 . C T 2562 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9547;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2595,261,0 chrXIV 470587 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;DP=129;Dels=0.00;FS=11.308;HaplotypeScore=2.7347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.674;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1237,0,1454 chrXIV 470684 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;DP=117;Dels=0.00;FS=4.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.307;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1127,0,1337 chrXIV 470756 . G T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.977;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.848;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1198,0,1221 chrXIV 470765 . T A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1382,0,1263 chrXIV 471125 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.913;DP=128;Dels=0.00;FS=6.854;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.438;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1337,0,1373 chrXIV 471383 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.231;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=2;MQRankSum=-1.133;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.627;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1042,0,1103 chrXIV 472042 . C T 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3476,339,0 chrXIV 472054 . C T 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3304,324,0 chrXIV 472094 . A G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3214,321,0 chrXIV 472403 . A G 2318 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=26.64;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2351,243,0 chrXIV 472546 . C T 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.29;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3117,309,0 chrXIV 472579 . G T 56.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.736;DP=116;Dels=0.00;FS=1.763;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.71;MQ0=0;MQRankSum=-2.425;QD=0.49;ReadPosRankSum=-3.995;SB=-7.851e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:110,6:116:12:89,12,0 chrXIV 472584 . G C 63.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.60;MQ0=0;QD=0.57;SB=-9.475e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:12:96,12,0 chrXIV 473146 . G C 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3004,324,0 chrXIV 473303 . T C 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2934,309,0 chrXIV 473321 . A G 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2964,309,0 chrXIV 473357 . A G 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3575,375,0 chrXIV 473375 . G A 3207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;DP=125;Dels=0.00;FS=3.335;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=25.66;ReadPosRankSum=-1.566;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3240,338,0 chrXIV 473389 . G C 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3078,330,0 chrXIV 473512 . A G 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3576,375,0 chrXIV 473603 . C T 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3603,355,0 chrXIV 473648 . T C 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3593,381,0 chrXIV 473723 . G C 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3363,351,0 chrXIV 473725 . T C 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3350,360,0 chrXIV 473855 . C T 3778.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.36;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3778,378,0 chrXIV 473942 . T A 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2700,288,0 chrXIV 473948 . T C 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2662,279,0 chrXIV 474098 . A G 3655.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8718;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.35;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3655,378,0 chrXIV 474101 . T C 3567.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3567,375,0 chrXIV 474104 . C T 1486.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.818;DP=143;Dels=0.00;FS=6.167;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.224;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1516,0,1407 chrXIV 474124 . G A 3727.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3727,373,0 chrXIV 474200 . G C 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3622,375,0 chrXIV 474245 . G A 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=26.71;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3285,333,0 chrXIV 474329 . T A 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3708,378,0 chrXIV 474540 . T G 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3057,336,0 chrXIV 474581 . C T 2091 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.76;MQ0=0;QD=26.14;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2124,225,0 chrXIV 474589 . C G 2108 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.35;MQ0=0;QD=25.10;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2141,237,0 chrXIV 474591 . G T 2178 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.35;MQ0=0;QD=25.93;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2211,237,0 chrXIV 474719 . C T 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.13;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3852,385,0 chrXIV 475172 . T C 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3325,348,0 chrXIV 475211 . A G 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2922,309,0 chrXIV 475334 . T C 1970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.58;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2003,213,0 chrXIV 475693 . A G 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3341,354,0 chrXIV 475712 . T G 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3028,333,0 chrXIV 475754 . G A 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3772,382,0 chrXIV 475863 . A G 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.958e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3657,366,0 chrXIV 476095 . G C 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.73;SB=-2.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3962,405,0 chrXIV 476575 . G A 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3473,357,0 chrXIV 476599 . A C 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=22.78;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3131,318,0 chrXIV 476731 . A G 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2949,306,0 chrXIV 476810 . T C 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.99;MQ0=0;QD=22.76;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3391,348,0 chrXIV 476908 . T C 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=23.10;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3327,357,0 chrXIV 477167 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.456;DP=122;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=3.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1201,0,1268 chrXIV 477259 . T C 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.420;DP=113;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:881,0,1354 chrXIV 477349 . C T 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3671,358,0 chrXIV 477388 . A G 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3122,336,0 chrXIV 477496 . C T 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3292,336,0 chrXIV 477505 . G A 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.186;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1164,0,1365 chrXIV 477523 . G T 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.552;DP=107;Dels=0.00;FS=5.947;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=8.57;ReadPosRankSum=-2.978;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:947,0,1223 chrXIV 477610 . A G 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2623,270,0 chrXIV 477622 . G A 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2943,292,0 chrXIV 477705 . C T 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;DP=133;Dels=0.00;FS=2.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.767;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,131:133:99:3364,293,0 chrXIV 477742 . G A 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.113;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.034;QD=25.17;ReadPosRankSum=-1.723;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,140:142:99:3574,301,0 chrXIV 477931 . C A 4268.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.71;SB=-2.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4268,412,0 chrXIV 478041 . T C 4443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=26.60;ReadPosRankSum=1.068;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:167:99:4443,448,0 chrXIV 478100 . A G 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.063;DP=175;Dels=0.00;FS=0.558;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,88:175:99:1754,0,1800 chrXIV 478186 . A T 4524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4524,460,0 chrXIV 478376 . C T 4017.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:159:99:4017,409,0 chrXIV 478524 . C T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.425;DP=126;Dels=0.00;FS=3.462;HaplotypeScore=2.6989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1294,0,1293 chrXIV 478547 . A T 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;DP=95;Dels=0.00;FS=10.184;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.577;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:1033,0,1043 chrXIV 478669 . T A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.559;DP=104;Dels=0.00;FS=8.282;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.640;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1087,0,1142 chrXIV 478887 . T C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.571;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.820;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1122,0,1363 chrXIV 479345 . T C 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7663;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3598,375,0 chrXIV 479395 . G A 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.819;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1588,0,1320 chrXIV 479462 . T C 486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;DP=149;Dels=0.01;FS=328.869;HaplotypeScore=73.2229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQ0=0;MQRankSum=4.304;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.807;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:42:516,0,42 chrXIV 479609 . T C 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3139,330,0 chrXIV 479674 . G A 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.512;DP=113;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.540;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1017,0,1282 chrXIV 479875 . T C 4130.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=3;QD=25.81;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4130,444,0 chrXIV 479932 . G A 4584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=2;QD=25.33;SB=-2.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4584,442,0 chrXIV 480038 . T A 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.399;DP=161;Dels=0.00;FS=2.812;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.229;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1631,0,1792 chrXIV 480082 . A T 4538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4538,462,0 chrXIV 480118 . G T 4192.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4192,441,0 chrXIV 480316 . A G 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.279;DP=163;Dels=0.00;FS=3.769;HaplotypeScore=3.7796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,88:163:99:1817,0,1540 chrXIV 480343 . C T 4155.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4155,432,0 chrXIV 480401 . C T 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.909e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3822,382,0 chrXIV 480487 . A C 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3208,333,0 chrXIV 480527 . A C 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3227,351,0 chrXIV 480558 . G C 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.442;DP=135;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1538,0,1162 chrXIV 480573 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.749;DP=168;Dels=0.00;FS=2.700;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,74:168:99:1405,0,1994 chrXIV 480622 . C A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.739;DP=169;Dels=0.00;FS=3.701;HaplotypeScore=3.3589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.414;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,81:169:99:1569,0,1739 chrXIV 480652 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.730;DP=151;Dels=0.00;FS=4.009;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.179;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1443,0,1590 chrXIV 480718 . G C 1980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.502;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.489;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,99:181:99:2010,0,1614 chrXIV 480883 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.717;DP=154;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=4.7246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.869;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1378,0,1511 chrXIV 480975 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.729;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.3115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1464,0,1239 chrXIV 481070 . T A 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.667;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.266;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,52:133:99:1037,0,1826 chrXIV 481081 . C T 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3506,343,0 chrXIV 481211 . T C 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.851;DP=164;Dels=0.00;FS=3.084;HaplotypeScore=2.9321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,87:164:99:1570,0,1615 chrXIV 481350 . A G 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.165;DP=133;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.671;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:859,0,1146 chrXIV 481402 . C T 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.533;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1008,0,1290 chrXIV 481534 . T C 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.356;DP=137;Dels=0.00;FS=5.351;HaplotypeScore=3.0888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=2.919;QD=25.50;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,134:137:99:3493,360,0 chrXIV 481576 . T C 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3022,318,0 chrXIV 481825 . C T 3617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3617,358,0 chrXIV 482039 . A G 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.839;DP=160;Dels=0.00;FS=1.248;HaplotypeScore=2.5165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1655,0,1626 chrXIV 482539 . T C 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.335;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.577;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1026,0,1552 chrXIV 482960 . G A 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.54;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3397,352,0 chrXIV 483093 . C T 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3883,379,0 chrXIV 483098 . G A 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3600,369,0 chrXIV 483163 . C G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.607;DP=110;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=51.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=9.99;ReadPosRankSum=-2.751;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1129,0,1006 chrXIV 483386 . G T 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3399,331,0 chrXIV 483741 . G A 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3226,330,0 chrXIV 483894 . G A 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3572,372,0 chrXIV 483951 . C T 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3386,357,0 chrXIV 483966 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.176;DP=139;Dels=0.00;FS=6.272;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1456,0,1324 chrXIV 483985 . C G 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.95;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2991,324,0 chrXIV 484017 . C A 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.75;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3056,312,0 chrXIV 484265 . G A 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.886;DP=158;Dels=0.00;FS=3.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.499;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1614,0,1728 chrXIV 484452 . C T 4756.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4756,493,0 chrXIV 484786 . C A 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3611,372,0 chrXIV 484851 . A G 2754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2787,294,0 chrXIV 484869 . A G 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2848,300,0 chrXIV 484904 . A G 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3029,321,0 chrXIV 485281 . C T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.919;DP=141;Dels=0.00;FS=6.538;HaplotypeScore=5.5221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.929;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,56:141:99:1060,0,1733 chrXIV 485289 . G A 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3430,348,0 chrXIV 485525 . A G 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2971,318,0 chrXIV 485799 . A G 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3016,303,0 chrXIV 485870 . C T 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3365,345,0 chrXIV 485972 . T C 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3448,369,0 chrXIV 486092 . T C 3521.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3521,381,0 chrXIV 486859 . T A 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3961,400,0 chrXIV 487177 . T G 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.169;DP=137;Dels=0.00;FS=5.236;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.447;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1191,0,1595 chrXIV 487214 . T C 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2822,300,0 chrXIV 487250 . G C 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=24.88;ReadPosRankSum=1.673;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2969,291,0 chrXIV 487393 . C G 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3534,378,0 chrXIV 487663 . T C 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2890,306,0 chrXIV 487830 . G A 3800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;DP=148;Dels=0.00;FS=3.069;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=25.68;ReadPosRankSum=-1.592;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,147:148:99:3800,374,0 chrXIV 487880 . T C 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=25.27;ReadPosRankSum=1.616;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:3765,388,0 chrXIV 487935 . C T 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3427,357,0 chrXIV 488208 . T C 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.55;SB=-2.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3961,396,0 chrXIV 488281 . C A 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3447,351,0 chrXIV 488426 . C G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;DP=103;Dels=0.00;FS=11.237;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.440;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1116,0,954 chrXIV 488587 . C T 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.74;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3765,373,0 chrXIV 488594 . A G 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.62;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3371,351,0 chrXIV 488598 . G C 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3837,396,0 chrXIV 488965 . T C 4145.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=23.69;SB=-2.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4145,444,0 chrXIV 489321 . G C 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3850,408,0 chrXIV 489385 . A G 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.38;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3718,408,0 chrXIV 489468 . G C 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3777,396,0 chrXIV 489631 . A G 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.00;SB=-2.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4150,427,0 chrXIV 489759 . A G 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.207;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:135:99:3450,372,0 chrXIV 489765 . A G 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.013;SB=-1.678e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3299,339,0 chrXIV 490190 . T A 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.493;DP=137;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=3.6655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=22.96;ReadPosRankSum=-1.669;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,134:137:99:3179,345,0 chrXIV 490203 . C A 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3160,333,0 chrXIV 490267 . T C 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3889,423,0 chrXIV 490287 . A T 4413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=25.96;ReadPosRankSum=1.202;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:4413,460,0 chrXIV 490355 . T A 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.011;DP=157;Dels=0.00;FS=3.446;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:4122,407,0 chrXIV 490406 . T G 4630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;DP=190;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=24.37;ReadPosRankSum=1.641;SB=-2.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,189:190:99:4630,443,0 chrXIV 490494 . A G 1844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.340;DP=177;Dels=0.00;FS=10.006;HaplotypeScore=5.9110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.554;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.767;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,92:177:99:1874,0,1796 chrXIV 490514 . A G 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;DP=188;Dels=0.00;FS=12.986;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,93:188:99:1901,0,1950 chrXIV 490766 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.394;DP=143;Dels=0.00;FS=8.924;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,61:143:99:1234,0,1820 chrXIV 490814 . A G 1803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.584;DP=199;Dels=0.00;FS=2.462;HaplotypeScore=6.2158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.112;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,91:199:99:1833,0,2241 chrXIV 490910 . G A 2139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.132;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.548;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,102:169:99:2169,0,1323 chrXIV 491054 . C T 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.942;DP=163;Dels=0.00;FS=7.971;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.198;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1591,0,1805 chrXIV 491097 . A G 3957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.92;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3957,411,0 chrXIV 491107 . C T 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=141;Dels=0.00;FS=4.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.57;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=23.53;ReadPosRankSum=1.708;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3318,336,0 chrXIV 491114 . G A 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.61;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3341,334,0 chrXIV 491255 . C T 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7741;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3739,399,0 chrXIV 491381 . T C 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3411,369,0 chrXIV 491385 . A C 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3298,345,0 chrXIV 491888 . T C 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3274,342,0 chrXIV 491900 . T C 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3317,351,0 chrXIV 491913 . T G 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2804,288,0 chrXIV 492185 . A G 2628 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.56;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2661,291,0 chrXIV 492190 . G C 2412 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=23.42;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2445,273,0 chrXIV 492374 . C A 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3712,378,0 chrXIV 492375 . A G 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3682,378,0 chrXIV 492521 . G A 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3242,321,0 chrXIV 492836 . G A 3778.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3778,382,0 chrXIV 492875 . G A 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3379,328,0 chrXIV 493067 . A T 1251 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-5.442;DP=102;Dels=0.00;FS=11.602;HaplotypeScore=36.0262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.03;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=12.26;ReadPosRankSum=4.744;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,83:102:99:1284,134,0 chrXIV 493069 . A C 44.11 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.225;DP=112;Dels=0.00;FS=16.767;HaplotypeScore=10.8970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=0.39;ReadPosRankSum=3.900;SB=-5.881e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,95:112:13:74,0,13 chrXIV 493333 . T G 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3449,351,0 chrXIV 494028 . T C 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2482,264,0 chrXIV 494033 . T C 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2470,270,0 chrXIV 494105 . C T 620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.001;DP=101;Dels=0.00;FS=3.849;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,35:101:99:650,0,1481 chrXIV 494368 . G A 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3088,315,0 chrXIV 494731 . T C 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3504,375,0 chrXIV 494733 . C T 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3703,379,0 chrXIV 494811 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.639;DP=134;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=1.8991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.136;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1273,0,1442 chrXIV 494948 . G A 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.530;DP=125;Dels=0.00;FS=4.474;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.677;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1016,0,1572 chrXIV 495101 . A T 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3837,385,0 chrXIV 495222 . A G 3481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=144;Dels=0.00;FS=4.025;HaplotypeScore=2.5105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=24.17;ReadPosRankSum=1.516;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3481,369,0 chrXIV 495265 . T C 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3114,336,0 chrXIV 495301 . T C 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.739e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3399,345,0 chrXIV 495319 . C A 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3502,339,0 chrXIV 495393 . A G 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=3.890;HaplotypeScore=3.3717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.97;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=23.08;ReadPosRankSum=0.722;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:121:99:2826,312,0 chrXIV 495396 . G A 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.45;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2935,306,0 chrXIV 495918 . C T 2547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2580,261,0 chrXIV 496505 . G C 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6306;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3492,372,0 chrXIV 496676 . G C 2231 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2264,243,0 chrXIV 496792 . T G 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3124,330,0 chrXIV 496892 . A C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.476;DP=141;Dels=0.00;FS=1.352;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.607;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1190,0,1730 chrXIV 497090 . C T 2271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2304,237,0 chrXIV 497099 . C T 2384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:99:2417,249,0 chrXIV 497300 . G A 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3354,337,0 chrXIV 497303 . C G 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3062,330,0 chrXIV 497324 . A G 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3375,348,0 chrXIV 497369 . G A 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3282,325,0 chrXIV 497430 . G A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.222;DP=132;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.712;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1138,0,1499 chrXIV 497484 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.088;DP=133;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.425;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1334,0,1404 chrXIV 497492 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.711;DP=128;Dels=0.00;FS=3.231;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:128:99:1272,0,1333 chrXIV 497545 . C T 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3057,309,0 chrXIV 497603 . G A 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2899,294,0 chrXIV 497780 . G A 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3490,366,0 chrXIV 497814 . G C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.134;DP=139;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=2.5795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.131;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1192,0,1645 chrXIV 498005 . T C 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3229,345,0 chrXIV 498032 . A G 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2945,312,0 chrXIV 498110 . C A 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3701,372,0 chrXIV 498469 . G C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.098;DP=136;Dels=0.00;FS=5.583;HaplotypeScore=2.7554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.973;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1373,0,1256 chrXIV 498514 . T C 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.05;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3462,369,0 chrXIV 498539 . T C 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4742;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=25.02;ReadPosRankSum=1.034;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3603,375,0 chrXIV 498573 . C T 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.28;MQ0=0;QD=26.92;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3129,315,0 chrXIV 499006 . T A 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.354;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.412;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:120:99:3029,309,0 chrXIV 499021 . C G 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.360;DP=133;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.259;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1232,0,1386 chrXIV 499075 . A C 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2716,294,0 chrXIV 499150 . T C 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3137,336,0 chrXIV 499164 . C T 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3304,340,0 chrXIV 499188 . A G 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3104,333,0 chrXIV 499291 . C T 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3108,312,0 chrXIV 499366 . G A 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3853,388,0 chrXIV 499402 . T C 4037.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.956e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4037,432,0 chrXIV 499478 . T A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.899;DP=138;Dels=0.00;FS=2.693;HaplotypeScore=4.1659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=8.95;ReadPosRankSum=-2.162;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1265,0,1563 chrXIV 499487 . C T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.370;DP=134;Dels=0.01;FS=3.234;HaplotypeScore=54.9206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=9.37;ReadPosRankSum=-2.772;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1285,0,1261 chrXIV 499520 . G T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.848;DP=130;Dels=0.00;FS=2.314;HaplotypeScore=2.8112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=8.01;ReadPosRankSum=2.175;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:130:99:1071,0,1469 chrXIV 499535 . A T 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.063;DP=104;Dels=0.00;FS=2.591;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.558;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:870,0,1237 chrXIV 499614 . G A 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.95;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2758,282,0 chrXIV 499647 . T C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.520;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=7.50;ReadPosRankSum=2.330;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,47:115:99:892,0,1484 chrXIV 499656 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.730;DP=120;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=2.2168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.951;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1073,0,1406 chrXIV 499731 . T C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.264;DP=146;Dels=0.00;FS=7.452;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.474;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:146:99:1525,0,1369 chrXIV 500157 . T A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;DP=139;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.614;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1189,0,1644 chrXIV 500387 . A G 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3110,327,0 chrXIV 500627 . T G 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2878,297,0 chrXIV 500652 . T A 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2792,279,0 chrXIV 500701 . T C 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3244,351,0 chrXIV 500711 . T C 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3540,378,0 chrXIV 500767 . A G 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=122.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3209,351,0 chrXIV 501040 . G A 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5823;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2949,303,0 chrXIV 501155 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.772;DP=139;Dels=0.00;FS=7.552;HaplotypeScore=3.8546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1136,0,1347 chrXIV 501214 . A G 1866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=24.88;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1899,207,0 chrXIV 501247 . C T 2180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=26.59;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2213,228,0 chrXIV 501320 . C T 1237 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=71.4674;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=11.67;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:1270,129,0 chrXIV 501361 . A G 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.09;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2659,282,0 chrXIV 501363 . G A 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.72;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2752,285,0 chrXIV 501440 . A T 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2990,303,0 chrXIV 501452 . T C 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3085,324,0 chrXIV 501463 . C A 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3131,313,0 chrXIV 501631 . T C 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4335;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4150,444,0 chrXIV 501828 . T C 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3575,384,0 chrXIV 501910 . A T 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2760,285,0 chrXIV 502079 . G A 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3688,384,0 chrXIV 502322 . A G 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2054;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:150:99:3630,378,0 chrXIV 502486 . C T 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3870,399,0 chrXIV 502498 . C T 4087.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4087,406,0 chrXIV 502729 . T C 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3571,378,0 chrXIV 502885 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.248;DP=140;Dels=0.00;FS=4.116;HaplotypeScore=5.4054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.655;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:140:99:1182,0,1633 chrXIV 502975 . C T 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;DP=105;Dels=0.00;FS=3.592;HaplotypeScore=2.0899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.683;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:993,0,1085 chrXIV 503187 . G A 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3590,375,0 chrXIV 503211 . G A 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.179;DP=140;Dels=0.00;FS=15.744;HaplotypeScore=2.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=1;MQRankSum=0.803;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.853;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1124,0,1435 chrXIV 503217 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.872;DP=140;Dels=0.00;FS=15.947;HaplotypeScore=2.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=1;MQRankSum=-2.728;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.060;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1257,0,1542 chrXIV 503261 . A G 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=1;QD=24.96;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3445,360,0 chrXIV 503320 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.491;DP=110;Dels=0.00;FS=2.609;HaplotypeScore=4.7363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1257,0,920 chrXIV 503386 . G T 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.521;DP=93;Dels=0.00;FS=8.311;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.864;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:908,0,949 chrXIV 503392 . G A 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.165;DP=91;Dels=0.00;FS=5.296;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.735;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:813,0,898 chrXIV 503609 . T A 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;DP=153;Dels=0.00;FS=16.556;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=10.01;ReadPosRankSum=2.179;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1561,0,1786 chrXIV 503642 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.145;DP=132;Dels=0.00;FS=3.368;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.488;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1244,0,1501 chrXIV 505233 . A C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.210;DP=113;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=2.5493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.379;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:956,0,1370 chrXIV 505410 . C T 2393 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2426,261,0 chrXIV 505418 . G T 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.009;DP=113;Dels=0.00;FS=4.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.726;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:944,0,1348 chrXIV 505867 . A T 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;DP=142;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.863;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,87:142:99:1791,0,1101 chrXIV 506324 . G A 2919 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2952,306,0 chrXIV 506438 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.203;DP=126;Dels=0.00;FS=2.452;HaplotypeScore=5.7864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=10.89;ReadPosRankSum=-2.220;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1402,0,1130 chrXIV 506768 . G A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.373;DP=108;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.790;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1110,0,1092 chrXIV 506906 . A C 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.097;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=2.295;QD=24.28;ReadPosRankSum=2.317;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,109:112:99:2752,282,0 chrXIV 506920 . G A 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.434;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=2.673;QD=25.74;ReadPosRankSum=2.142;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,111:114:99:2967,275,0 chrXIV 507053 . T G 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2693,279,0 chrXIV 507058 . G A 2755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2788,279,0 chrXIV 507351 . C T 2433 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.17;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2466,261,0 chrXIV 507355 . T A 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.67;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3002,330,0 chrXIV 507430 . G T 3478.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3478,334,0 chrXIV 507431 . A T 3486.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3486,334,0 chrXIV 507432 . A T 3508.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.928e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3508,334,0 chrXIV 507433 . A C 3454.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.928e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3454,334,0 chrXIV 507505 . T C 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;DP=176;Dels=0.00;FS=1.204;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.294;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,85:176:99:1733,0,1792 chrXIV 507570 . G T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.644;DP=164;Dels=0.00;FS=9.357;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.571;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,80:164:99:1649,0,1745 chrXIV 507599 . A T 4791.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=1;QD=26.18;SB=-1.831e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4791,493,0 chrXIV 507677 . T A 3617.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3617,366,0 chrXIV 507679 . C A 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.831;DP=144;Dels=0.00;FS=3.946;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.024;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1693,0,1228 chrXIV 507735 . A T 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;DP=100;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.193;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1077,0,1074 chrXIV 507755 . C G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.514;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.608;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1100,0,1082 chrXIV 507790 . A G 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.519;DP=110;Dels=0.00;FS=17.160;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.240;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:110:99:1137,0,1130 chrXIV 508159 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.507;DP=151;Dels=0.00;FS=4.288;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1403,0,1711 chrXIV 508321 . C T 4267.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4267,435,0 chrXIV 508617 . G A 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.61;SB=-2.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3912,397,0 chrXIV 508645 . T C 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3283,351,0 chrXIV 508667 . A G 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3285,348,0 chrXIV 508743 . T C 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2723,285,0 chrXIV 508757 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2718,276,0 chrXIV 508768 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.379;DP=111;Dels=0.00;FS=4.770;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.070;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1100,0,1162 chrXIV 509043 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.486;DP=115;Dels=0.00;FS=1.608;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1110,0,1295 chrXIV 509173 . C A 4004.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.17;SB=-2.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4004,394,0 chrXIV 509271 . C T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.169;DP=132;Dels=0.00;FS=14.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1387,0,1400 chrXIV 509283 . T C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;DP=117;Dels=0.00;FS=5.735;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.987;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1023,0,1432 chrXIV 509369 . G A 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.896;DP=103;Dels=0.00;FS=2.711;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=2.197;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.821;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:936,0,1266 chrXIV 509478 . C A 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9615;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3803,390,0 chrXIV 509580 . G T 5112.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5112,535,0 chrXIV 510203 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.764;DP=127;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=2.187;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.440;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1122,0,1612 chrXIV 510274 . C A 2665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.99;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2698,288,0 chrXIV 510285 . A G 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.812;DP=105;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.47;MQ0=0;MQRankSum=-4.185;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.654;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:945,0,986 chrXIV 510300 . T C 2246 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=104;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=3.7061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.64;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=21.60;ReadPosRankSum=-1.266;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2279,255,0 chrXIV 510362 . T A 1622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4148;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.75;MQ0=0;QD=15.90;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:1655,177,0 chrXIV 510401 . A T 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=22.96;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2605,270,0 chrXIV 510459 . C T 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3185,321,0 chrXIV 510479 . A G 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2722,294,0 chrXIV 510728 . G A 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2909,300,0 chrXIV 510803 . A G 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3293,348,0 chrXIV 510838 . T C 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3392,366,0 chrXIV 511004 . A G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.955;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.523;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1445,0,1439 chrXIV 511046 . G C 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.744;DP=122;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.510;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1047,0,1352 chrXIV 511502 . A G 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.828;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.815;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1483,0,1406 chrXIV 511580 . G A 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3155,327,0 chrXIV 511673 . C A 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.010;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1720,0,1650 chrXIV 511838 . T C 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6938;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2992,321,0 chrXIV 511916 . C T 4332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=1;QD=24.47;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4332,432,0 chrXIV 512000 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.129;DP=129;Dels=0.00;FS=5.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.732;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1245,0,1381 chrXIV 512318 . C T 655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.113;DP=73;Dels=0.00;FS=1.926;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.255;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:685,0,821 chrXIV 512351 . A G 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.647;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.511;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:817,0,1181 chrXIV 512400 . C T 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.31;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3138,313,0 chrXIV 512426 . G A 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;DP=120;Dels=0.00;FS=7.269;HaplotypeScore=100.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.977;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:959,0,1515 chrXIV 512455 . G A 2254 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=136.8644;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.69;MQ0=0;QD=23.24;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:97:99:2287,240,0 chrXIV 512617 . T C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.556;DP=121;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1348,0,1219 chrXIV 512722 . A G 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.419;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=2.277;QD=7.76;ReadPosRankSum=2.411;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:1008,0,1610 chrXIV 512905 . C T 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;DP=118;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.877;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1349,0,1020 chrXIV 513243 . T C 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3769,396,0 chrXIV 513387 . G A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.446;DP=122;Dels=0.00;FS=5.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.575;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1545,0,1032 chrXIV 513495 . G A 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.577;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.102;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1292,0,1069 chrXIV 513525 . A G 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2557,273,0 chrXIV 513589 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:1096,0,927 chrXIV 513630 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.353;DP=93;Dels=0.00;FS=3.983;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.168;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:1204,0,798 chrXIV 513783 . G A 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.99;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3256,345,0 chrXIV 513927 . A G 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2875,300,0 chrXIV 514134 . C T 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.658;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.751;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,46:122:99:927,0,1671 chrXIV 514398 . C G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;DP=122;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.572;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1169,0,1289 chrXIV 514909 . A C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.253;DP=133;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=1;MQRankSum=0.811;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.594;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1406,0,1323 chrXIV 515028 . C T 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2923,309,0 chrXIV 515081 . G A 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3592,361,0 chrXIV 515089 . C T 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;DP=138;Dels=0.00;FS=3.116;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.086;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1215,0,1647 chrXIV 515393 . C T 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7520;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3711,372,0 chrXIV 515474 . A T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.984;DP=129;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.116;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1334,0,1402 chrXIV 515478 . C A 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3046,312,0 chrXIV 515537 . C T 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3317,322,0 chrXIV 515602 . C T 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3068,312,0 chrXIV 515604 . T A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.794;DP=113;Dels=0.00;FS=14.388;HaplotypeScore=2.9022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.594;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1138,0,1235 chrXIV 516034 . A G 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2956,309,0 chrXIV 516367 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.324;DP=167;Dels=0.00;FS=0.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,71:167:99:1407,0,1997 chrXIV 516459 . A T 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;DP=118;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.606;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:965,0,1541 chrXIV 516484 . G A 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;DP=121;Dels=0.00;FS=4.781;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.662;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,74:121:99:1643,0,899 chrXIV 516536 . C T 1789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.442;DP=128;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=2.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.771;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,81:128:99:1819,0,861 chrXIV 516748 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.468;DP=160;Dels=0.00;FS=1.281;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.563;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,75:160:99:1518,0,1756 chrXIV 516755 . T C 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.327;DP=156;Dels=0.00;FS=2.921;HaplotypeScore=5.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.108;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1582,0,1699 chrXIV 516881 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.811;DP=98;Dels=0.00;FS=3.778;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.229;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.958;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1128,0,774 chrXIV 516960 . C T 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3440,348,0 chrXIV 517069 . T C 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.36;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3256,360,0 chrXIV 517494 . A G 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.620;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,154:155:99:3849,390,0 chrXIV 517634 . G A 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3634,375,0 chrXIV 517907 . C T 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4081,406,0 chrXIV 517911 . T C 4071.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4071,411,0 chrXIV 518147 . A G 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3172,330,0 chrXIV 518162 . A G 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3027,327,0 chrXIV 518600 . T C 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3558,375,0 chrXIV 518602 . G T 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3751,382,0 chrXIV 518686 . G A 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3194,327,0 chrXIV 518907 . C T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.370;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.359;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1650,0,1463 chrXIV 519058 . T C 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.06;MQ0=0;QD=23.91;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2472,264,0 chrXIV 519077 . G A 2161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.52;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2194,228,0 chrXIV 519164 . G C 42.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.59;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:75,9,0 chrXIV 519165 . T A 43.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.79;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:76,9,0 chrXIV 519166 . T C 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.99;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:77,9,0 chrXIV 521977 . A G 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.07;MQ0=46;MQRankSum=0.727;QD=0.48;ReadPosRankSum=0.727;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:38,12:50:6:55,6,0 chrXIV 522890 . T G 76.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.12;MQ0=105;MQRankSum=-0.791;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:80:106,0,80 chrXIV 523654 . G C 20.80 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.20;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:52,6,0 chrXIV 523665 . C T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.68;MQ0=2;QD=3.96;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:55,6,0 chrXIV 523677 . C T 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=4;QD=2.97;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,4:8:6:55,6,0 chrXIV 523680 . A T 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=4;QD=3.22;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,4:8:6:57,6,0 chrXIV 523685 . A G 15.88 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=4;QD=1.98;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,4:8:6:47,6,0 chrXIV 523686 . G A 15.88 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.33;MQ0=5;QD=1.76;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,4:9:6:47,6,0 chrXIV 523704 . T A 22.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.15;MQ0=8;MQRankSum=0.731;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.731;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,4:13:6:54,6,0 chrXIV 523707 . C T 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=9;MQRankSum=0.731;QD=1.70;ReadPosRankSum=0.731;SB=-1.258e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,4:14:6:55,6,0 chrXIV 523728 . A T 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.30;MQ0=20;MQRankSum=0.727;QD=1.07;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,3:24:6:57,6,0 chrXIV 523731 . G A 23.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.10;MQ0=21;MQRankSum=0.727;QD=0.95;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,3:25:6:55,6,0 chrXIV 523734 . C T 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.10;MQ0=21;MQRankSum=0.727;QD=1.03;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,3:25:6:57,6,0 chrXIV 523878 . C T 802 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.14;MQ0=31;QD=12.15;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,41:66:87:835,87,0 chrXIV 523953 . A G 755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.94;MQ0=1;MQRankSum=1.509;QD=23.59;ReadPosRankSum=1.174;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:81:788,81,0 chrXIV 525096 . A G 1151 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.14;MQ0=0;QD=18.56;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1184,132,0 chrXIV 525101 . C T 1383 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.67;MQ0=0;QD=15.72;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1416,153,0 chrXIV 525102 . G A 1380 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.67;MQ0=0;QD=15.68;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1413,153,0 chrXIV 525141 . A G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.31;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3263,351,0 chrXIV 525148 . T C 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.294;DP=133;Dels=0.00;FS=2.243;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1158,0,1534 chrXIV 525249 . C A 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.45;MQ0=0;QD=27.38;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2881,300,0 chrXIV 525271 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.124;DP=116;Dels=0.00;FS=24.099;HaplotypeScore=57.5961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.395;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1182,0,1263 chrXIV 525274 . A G 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.437;DP=120;Dels=0.00;FS=9.280;HaplotypeScore=64.4932;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.36;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=24.19;ReadPosRankSum=2.942;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,117:120:99:2936,282,0 chrXIV 525370 . C T 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.415;DP=93;Dels=0.00;FS=3.999;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:834,0,1106 chrXIV 525379 . A G 2432 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.66;MQ0=0;QD=25.07;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2465,267,0 chrXIV 525422 . G A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.923;DP=110;Dels=0.00;FS=9.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.45;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1442,0,870 chrXIV 525472 . G A 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.18;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2735,288,0 chrXIV 525484 . C T 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.263;DP=117;Dels=0.00;FS=12.031;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.39;MQ0=0;MQRankSum=-5.558;QD=7.49;ReadPosRankSum=2.227;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:906,0,1226 chrXIV 525487 . G A 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.414;DP=115;Dels=0.00;FS=5.817;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.79;MQ0=0;MQRankSum=-5.355;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.409;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:848,0,1115 chrXIV 525522 . T C 2303 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0818;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.37;MQ0=0;QD=21.52;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2336,255,0 chrXIV 525527 . A G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.006;DP=114;Dels=0.00;FS=10.751;HaplotypeScore=3.0818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.11;MQ0=0;MQRankSum=-3.811;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.324;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,67:114:99:934,0,1025 chrXIV 525553 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.090;DP=148;Dels=0.00;FS=6.101;HaplotypeScore=3.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.42;MQ0=0;MQRankSum=2.800;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.617;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1468,0,1470 chrXIV 525575 . T C 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3900,399,0 chrXIV 525857 . T C 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.682;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.984;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3528,384,0 chrXIV 525960 . T C 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=24.84;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3378,360,0 chrXIV 526229 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;DP=129;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=8.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.249;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1159,0,1531 chrXIV 526397 . G A 4193.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.965e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4193,433,0 chrXIV 526433 . C T 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.88;SB=-2.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3897,403,0 chrXIV 526658 . G A 2602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2635,276,0 chrXIV 526700 . T C 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3326,351,0 chrXIV 526742 . A T 3076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3109,321,0 chrXIV 526799 . A G 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2888,309,0 chrXIV 526838 . G A 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3137,316,0 chrXIV 526877 . T G 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3480,366,0 chrXIV 527003 . T C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.154;DP=152;Dels=0.00;FS=0.605;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.790;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1619,0,1433 chrXIV 527012 . C T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.548;DP=142;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.704;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1655,0,1295 chrXIV 527048 . G T 3762.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3762,378,0 chrXIV 527087 . T C 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.63;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3460,357,0 chrXIV 527207 . C A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.003;DP=168;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.514;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,81:168:99:1582,0,1816 chrXIV 527225 . C T 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.237;DP=176;Dels=0.00;FS=1.876;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.788;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,85:176:99:1591,0,1886 chrXIV 527291 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.068;DP=112;Dels=0.00;FS=4.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.292;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1263,0,962 chrXIV 527330 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.808;DP=133;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=2.7586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.860;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1357,0,1298 chrXIV 527794 . C T 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1876;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3425,348,0 chrXIV 528074 . C T 3852.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3852,393,0 chrXIV 528161 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.901;DP=158;Dels=0.00;FS=8.160;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.307;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:1556,0,1705 chrXIV 528195 . C T 3874.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3874,400,0 chrXIV 528343 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.075;DP=100;Dels=0.00;FS=11.173;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=10.62;ReadPosRankSum=2.122;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1092,0,945 chrXIV 528581 . T C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.095;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.015;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1023,0,1189 chrXIV 528641 . C T 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2731,279,0 chrXIV 528971 . G A 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3571,372,0 chrXIV 529082 . C T 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3322,345,0 chrXIV 529097 . C T 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3297,336,0 chrXIV 529112 . A G 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3254,339,0 chrXIV 529133 . A G 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.79;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3194,330,0 chrXIV 529136 . A G 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.85;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3085,324,0 chrXIV 529316 . T C 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.219;DP=95;Dels=0.00;FS=4.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.056;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:776,0,1186 chrXIV 529877 . A G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.493;DP=157;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=2.4203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=1;MQRankSum=0.138;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.629;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1418,0,1366 chrXIV 529951 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;DP=106;Dels=0.00;FS=2.543;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.114;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1101,0,1191 chrXIV 529971 . G A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.447;DP=143;Dels=0.00;FS=2.974;HaplotypeScore=3.9642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.698;QD=10.54;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1537,0,1440 chrXIV 530298 . T C 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7099;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:156:99:3818,402,0 chrXIV 530418 . G A 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3612,364,0 chrXIV 530856 . A G 4340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4340,453,0 chrXIV 530890 . G A 2186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.600;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.479;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,104:195:99:2216,0,1755 chrXIV 531287 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.586;DP=121;Dels=0.00;FS=5.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1373,0,1107 chrXIV 531399 . G A 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3525,360,0 chrXIV 531505 . G T 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3706,373,0 chrXIV 531520 . A G 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3386,360,0 chrXIV 531611 . G A 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2723,276,0 chrXIV 531656 . G A 3054 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3087,312,0 chrXIV 532165 . T C 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5354;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2999,318,0 chrXIV 532233 . C T 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.178;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1266,0,1511 chrXIV 532531 . C T 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.08;MQ0=0;QD=26.41;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3539,372,0 chrXIV 532649 . A C 2112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=22.23;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2145,234,0 chrXIV 532670 . G A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.013;DP=116;Dels=0.00;FS=10.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1322,0,1027 chrXIV 532716 . G A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.970;DP=123;Dels=0.00;FS=11.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1284,0,1225 chrXIV 532717 . A C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.843;DP=124;Dels=0.00;FS=9.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1306,0,1258 chrXIV 532778 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.227;DP=144;Dels=0.00;FS=7.679;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.311;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1360,0,1554 chrXIV 532790 . T A 4184.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4184,421,0 chrXIV 532945 . G A 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3241,325,0 chrXIV 533183 . A T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.701;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1468,0,1209 chrXIV 533288 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;DP=131;Dels=0.00;FS=9.776;HaplotypeScore=2.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=-2.441;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1421,0,1341 chrXIV 533519 . A G 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;DP=94;Dels=0.00;FS=5.870;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.807;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:902,0,1011 chrXIV 533533 . A G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.483;DP=98;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:998,0,977 chrXIV 533705 . T A 530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.811;DP=62;Dels=0.00;FS=3.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.079;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:560,0,746 chrXIV 533785 . G A 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.630;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,41:73:99:906,0,678 chrXIV 533821 . G C 491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;DP=66;Dels=0.00;FS=0.944;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:521,0,831 chrXIV 533912 . A G 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.575;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.015;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:982,0,1055 chrXIV 533926 . T C 2689 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2722,279,0 chrXIV 533937 . G A 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.669;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.487;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1115,0,1029 chrXIV 534041 . T A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.098;DP=93;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.320;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:1103,0,943 chrXIV 534071 . T A 1208.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.656;DP=112;Dels=0.00;FS=5.384;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQ0=0;MQRankSum=-4.024;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.009;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1238,0,1125 chrXIV 534077 . G A 1393.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;DP=121;Dels=0.00;FS=5.597;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-3.955;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1423,0,1038 chrXIV 534078 . G A 1451.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.627;DP=121;Dels=0.00;FS=5.597;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.670;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1481,0,996 chrXIV 534210 . T C 2069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2102,231,0 chrXIV 534316 . T C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.988;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=9.90;ReadPosRankSum=-2.294;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1178,0,1229 chrXIV 534658 . C T 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3417,337,0 chrXIV 534750 . C T 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.301;DP=145;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.662;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1422,0,1552 chrXIV 534849 . C T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;DP=128;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.132;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.797;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1211,0,1540 chrXIV 535368 . T G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.308;DP=137;Dels=0.00;FS=2.151;HaplotypeScore=2.1375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.743;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1378,0,1391 chrXIV 535369 . A G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1375;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3393,348,0 chrXIV 535422 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.801;DP=126;Dels=0.00;FS=4.290;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1290,0,1153 chrXIV 535542 . C A 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.707;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:1050,0,1126 chrXIV 535580 . C T 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3151,324,0 chrXIV 535584 . A G 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=22.71;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2917,306,0 chrXIV 535793 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.336;DP=143;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.585;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.430;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1117,0,1829 chrXIV 535827 . T C 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3848,408,0 chrXIV 535908 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.075;DP=119;Dels=0.00;FS=14.799;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.719;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1190,0,1212 chrXIV 536014 . T A 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.699;DP=123;Dels=0.00;FS=2.336;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,52:123:99:1062,0,1599 chrXIV 536139 . C T 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3198,330,0 chrXIV 536201 . T C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;DP=131;Dels=0.00;FS=4.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1292,0,1445 chrXIV 536292 . A C 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.139;DP=127;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=7.1831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.103;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:927,0,1383 chrXIV 536514 . G T 3967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:3967,403,0 chrXIV 536751 . C G 2344 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2377,255,0 chrXIV 536830 . G T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3019,303,0 chrXIV 536942 . T C 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3420,357,0 chrXIV 537042 . A G 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2926,306,0 chrXIV 537303 . T C 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2948,309,0 chrXIV 537423 . G A 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2821,288,0 chrXIV 537504 . A G 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2923,309,0 chrXIV 537549 . C T 2296 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.83;MQ0=0;QD=22.08;SB=-1.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2329,243,0 chrXIV 537552 . T G 2552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=22.00;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2585,282,0 chrXIV 537564 . T C 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.96;MQ0=1;QD=24.90;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2747,294,0 chrXIV 537637 . A G 3550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=2;QD=25.36;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3550,363,0 chrXIV 537756 . A G 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=25.39;SB=-2.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3961,399,0 chrXIV 537771 . A G 3903.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3903,402,0 chrXIV 537783 . T G 4413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.78;MQ0=0;QD=25.22;SB=-2.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4413,442,0 chrXIV 537806 . T C 3891.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.78;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3891,408,0 chrXIV 538122 . A G 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3176,330,0 chrXIV 538142 . G A 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2944,303,0 chrXIV 538315 . G A 4154.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3311;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:4154,424,0 chrXIV 538564 . C T 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=26.08;ReadPosRankSum=-1.540;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2850,300,0 chrXIV 538640 . A G 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70;SB=-9.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3341,348,0 chrXIV 539561 . T C 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3139,327,0 chrXIV 539576 . A T 2233 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.51;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2266,231,0 chrXIV 539639 . T C 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3327,342,0 chrXIV 539812 . G C 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.871;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=54.5648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.690;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,89:158:99:1702,0,1393 chrXIV 539903 . C T 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3533,364,0 chrXIV 539916 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.901;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.881;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1602,0,1319 chrXIV 539950 . A T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.648;DP=138;Dels=0.00;FS=4.428;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1567,0,1416 chrXIV 540184 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=145;Dels=0.00;FS=2.946;HaplotypeScore=3.6373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.852;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1451,0,1469 chrXIV 540188 . T A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.237;DP=145;Dels=0.00;FS=3.898;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.026;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1474,0,1489 chrXIV 540236 . T C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.080;DP=129;Dels=0.00;FS=1.550;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1449,0,1215 chrXIV 540589 . A G 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.397;DP=136;Dels=0.00;FS=6.629;HaplotypeScore=2.8043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.941;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1617,0,1285 chrXIV 540811 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;DP=90;Dels=0.00;FS=2.003;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.864;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1081,0,924 chrXIV 540838 . A G 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.165;DP=123;Dels=0.00;FS=2.384;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:123:99:1473,0,1061 chrXIV 540985 . G A 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.820;DP=132;Dels=0.00;FS=5.333;HaplotypeScore=4.3320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,78:132:99:1654,0,1055 chrXIV 541036 . G A 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;DP=128;Dels=0.00;FS=4.623;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1146,0,1526 chrXIV 541056 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;DP=133;Dels=0.00;FS=3.370;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1495,0,1364 chrXIV 541069 . G C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.796;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.090;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:121:99:1200,0,1291 chrXIV 541168 . T C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.526;DP=127;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1299,0,1266 chrXIV 541405 . C G 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=21.93;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3235,339,0 chrXIV 541561 . T A 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.967e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3607,363,0 chrXIV 541624 . T C 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3754,366,0 chrXIV 541746 . G A 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3819,393,0 chrXIV 541750 . T C 3863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3863,411,0 chrXIV 541799 . T C 4912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.68;SB=-2.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:4912,487,0 chrXIV 542443 . C T 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3683,381,0 chrXIV 542515 . C T 1636.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.608;DP=156;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=2.8923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.287;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1666,0,1641 chrXIV 542524 . A G 1442.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.798;DP=159;Dels=0.00;FS=1.233;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.791;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1472,0,1687 chrXIV 542525 . C T 1469.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.047;DP=159;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=9.24;ReadPosRankSum=-3.078;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:159:99:1499,0,1592 chrXIV 542570 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.599;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.372;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1178,0,1546 chrXIV 542576 . T C 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.455;DP=129;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.663;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:1110,0,1648 chrXIV 542690 . G C 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;DP=162;Dels=0.00;FS=6.947;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.455;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,79:162:99:1607,0,1692 chrXIV 542849 . C A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.602;DP=126;Dels=0.00;FS=3.397;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.430;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1097,0,1455 chrXIV 543016 . G A 3623.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3623,375,0 chrXIV 543145 . A G 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.965;DP=151;Dels=0.00;FS=22.408;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.293;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,81:151:99:1606,0,1442 chrXIV 543719 . T C 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.787;DP=148;Dels=0.00;FS=1.300;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=0.321;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.119;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1663,0,1436 chrXIV 543829 . A T 3660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3660,364,0 chrXIV 543875 . G A 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3375,342,0 chrXIV 544060 . C T 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.231;DP=126;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=3.8065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.043;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1161,0,1424 chrXIV 545273 . T C 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3737,393,0 chrXIV 545672 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.960;DP=141;Dels=0.00;FS=8.945;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1413,0,1482 chrXIV 546569 . G A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.193;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.663;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1542,0,1327 chrXIV 547464 . T C 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.283;DP=117;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.284;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:1142,0,1246 chrXIV 547691 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.180;DP=125;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.237;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1354,0,1255 chrXIV 547766 . A T 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2685,267,0 chrXIV 547915 . C T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.664;DP=124;Dels=0.00;FS=10.080;HaplotypeScore=4.5749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.832;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.771;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1021,0,1511 chrXIV 548080 . T G 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.550;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.597;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:883,0,1343 chrXIV 548091 . A G 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.336;DP=96;Dels=0.00;FS=2.889;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:821,0,1143 chrXIV 548516 . T C 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.180;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,77:163:99:1493,0,1830 chrXIV 548587 . C T 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.900;DP=166;Dels=0.00;FS=9.269;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.367;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,88:166:99:1835,0,1518 chrXIV 549448 . A C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;DP=105;Dels=0.00;FS=9.204;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1245,0,962 chrXIV 549663 . A T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.342;DP=118;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.022;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1419,0,1088 chrXIV 550177 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.671;DP=109;Dels=0.00;FS=7.724;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=1;MQRankSum=1.196;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.611;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1273,0,935 chrXIV 551646 . C T 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.539;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,42:71:99:796,0,557 chrXIV 552035 . C G 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3644,381,0 chrXIV 552403 . G A 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;DP=161;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.868;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1696,0,1716 chrXIV 552429 . G A 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.507;DP=155;Dels=0.00;FS=1.266;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.877;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1453,0,1783 chrXIV 552569 . A T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;DP=141;Dels=0.00;FS=2.992;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.237;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1383,0,1563 chrXIV 552682 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;DP=112;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.171;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1390,0,948 chrXIV 552709 . G A 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.468;DP=113;Dels=0.00;FS=3.678;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=13.27;ReadPosRankSum=-1.742;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,70:113:99:1530,0,809 chrXIV 552728 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.198;DP=98;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.111;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1164,0,860 chrXIV 553144 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.512;DP=128;Dels=0.00;FS=4.316;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1053,0,1558 chrXIV 553270 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.770;DP=94;Dels=0.00;FS=1.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.068;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1117,0,865 chrXIV 553315 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.275;DP=113;Dels=0.00;FS=7.812;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=10.20;ReadPosRankSum=-2.163;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1183,0,1131 chrXIV 553648 . G T 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.369;DP=108;Dels=0.00;FS=4.885;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:935,0,1294 chrXIV 553805 . C A 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.689;DP=156;Dels=0.01;FS=2.011;HaplotypeScore=7.6022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.278;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,84:155:99:1839,0,1443 chrXIV 554217 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.731;DP=113;Dels=0.00;FS=12.447;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.663;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1071,0,1309 chrXIV 554262 . T C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.829;DP=138;Dels=0.00;FS=3.091;HaplotypeScore=4.6668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.428;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1201,0,1556 chrXIV 554351 . G A 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.858;DP=150;Dels=0.00;FS=2.973;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.515;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1583,0,1572 chrXIV 554828 . A G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.710;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.439;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1409,0,1563 chrXIV 555137 . G A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.342;DP=105;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.161;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1109,0,962 chrXIV 555245 . T C 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=1;QD=25.17;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2827,291,0 chrXIV 555459 . G C 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;DP=85;Dels=0.00;FS=3.011;HaplotypeScore=6.9156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.904;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,39:85:99:786,0,927 chrXIV 555551 . T C 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2703,285,0 chrXIV 555641 . T C 2266 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2299,240,0 chrXIV 555698 . T C 2470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.73;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2503,255,0 chrXIV 555760 . C T 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.512;DP=112;Dels=0.00;FS=4.680;HaplotypeScore=3.4653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.079;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1209,0,1180 chrXIV 556301 . C T 3762.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3762,393,0 chrXIV 556380 . T C 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6668;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3887,411,0 chrXIV 556914 . A T 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.56;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3200,333,0 chrXIV 556974 . T C 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.13;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3809,399,0 chrXIV 557165 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.585;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.168;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1171,0,1124 chrXIV 557382 . G T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.434;DP=103;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.370;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:1003,0,1161 chrXIV 557562 . T C 3180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3213,342,0 chrXIV 557625 . G A 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3307,330,0 chrXIV 557698 . G A 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3284,334,0 chrXIV 557760 . C A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.667;DP=126;Dels=0.00;FS=4.296;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.566;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1201,0,1362 chrXIV 557959 . G A 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3095,309,0 chrXIV 558019 . T C 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3110,324,0 chrXIV 558085 . G A 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;DP=123;Dels=0.00;FS=4.412;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:123:99:1367,0,1070 chrXIV 558310 . G T 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.074;DP=145;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1704,0,1374 chrXIV 558811 . G A 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3850,388,0 chrXIV 558836 . A G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.418;DP=109;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1113,0,1071 chrXIV 559022 . A G 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3133,318,0 chrXIV 559202 . C T 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3812,388,0 chrXIV 559362 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.920;DP=122;Dels=0.00;FS=5.463;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.520;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1290,0,1255 chrXIV 559455 . A G 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.51;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3110,333,0 chrXIV 559694 . G T 2905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2938,297,0 chrXIV 559885 . C T 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3352,348,0 chrXIV 559919 . C G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.367;DP=130;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=2.5900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.295;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1074,0,1506 chrXIV 559921 . G A 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=25.02;ReadPosRankSum=0.067;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3260,345,0 chrXIV 560119 . A G 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2820,291,0 chrXIV 560302 . A G 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3169,312,0 chrXIV 560308 . T A 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3340,333,0 chrXIV 560362 . C T 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.86;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3304,337,0 chrXIV 560542 . A G 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.921;DP=96;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.073;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1070,0,961 chrXIV 560592 . A G 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.926;DP=123;Dels=0.00;FS=6.022;HaplotypeScore=109.6073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=2.550;QD=23.39;ReadPosRankSum=2.746;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,120:123:99:2910,300,0 chrXIV 560611 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.544;DP=117;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.723;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1191,0,1164 chrXIV 560883 . T C 2730 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2763,291,0 chrXIV 561056 . G A 399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.704;DP=82;Dels=0.00;FS=3.257;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.443;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:429,0,1234 chrXIV 561110 . G A 365.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.744;DP=73;Dels=0.00;FS=25.615;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQ0=0;MQRankSum=-5.036;QD=5.00;ReadPosRankSum=-3.043;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:73:99:395,0,1078 chrXIV 561323 . G A 2496 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.14;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2529,258,0 chrXIV 561446 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.983;DP=103;Dels=0.00;FS=15.656;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQ0=0;MQRankSum=1.832;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.981;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1305,0,886 chrXIV 561632 . A G 2100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.59;MQ0=1;QD=25.00;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2133,228,0 chrXIV 561711 . G A 279.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.741;DP=70;Dels=0.00;FS=20.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.49;MQ0=9;MQRankSum=-5.069;QD=3.99;ReadPosRankSum=-3.612;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,44:70:99:309,0,437 chrXIV 561771 . T C 331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.966;DP=87;Dels=0.00;FS=3.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.42;MQ0=1;MQRankSum=4.977;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:87:99:361,0,737 chrXIV 561783 . A T 664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.433;DP=82;Dels=0.00;FS=1.082;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.92;MQ0=2;MQRankSum=-4.911;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.106;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,58:82:99:694,0,396 chrXIV 561869 . G A 758 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.66;MQ0=9;QD=19.44;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,32:39:84:791,84,0 chrXIV 562037 . A G 38.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.754;SB=-1.997e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:71,9,0 chrXIV 567994 . A G 11.36 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.36;MQ0=2;MQRankSum=0.030;QD=0.26;ReadPosRankSum=2.333;SB=-3.027e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,2:44:19:41,0,19 chrXIV 568048 . A G 615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;DP=94;Dels=0.00;FS=3.465;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.113;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:645,0,756 chrXIV 568051 . A G 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.900;DP=95;Dels=0.00;FS=3.372;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.64;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:699,0,764 chrXIV 568113 . T G 829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.727;DP=91;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:859,0,1008 chrXIV 568114 . C T 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;DP=84;Dels=0.00;FS=0.823;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:823,0,876 chrXIV 568157 . C T 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.699;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.40;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:96:99:982,0,1044 chrXIV 568249 . C T 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.362;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.166;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,41:93:99:828,0,1032 chrXIV 568547 . A G 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.53;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2682,285,0 chrXIV 568887 . A G 3759.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4207;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3759,393,0 chrXIV 568967 . A G 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3334,348,0 chrXIV 568987 . G T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.342;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.027;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1263,0,1457 chrXIV 569371 . G A 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.584;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.544;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,84:155:99:1630,0,1389 chrXIV 569449 . G A 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.760;DP=132;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=7.6688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:1029,0,1569 chrXIV 569942 . C T 2527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.53;MQ0=2;QD=22.77;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2560,252,0 chrXIV 569961 . G C 2008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1756;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.45;MQ0=1;QD=21.59;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2041,201,0 chrXIV 569965 . C A 2032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1756;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.57;MQ0=1;QD=21.85;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2065,204,0 chrXIV 570002 . G A 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.88;MQ0=2;QD=25.13;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2822,288,0 chrXIV 570020 . C T 2152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.76;MQ0=1;QD=24.18;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2185,225,0 chrXIV 570034 . C A 2143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.19;MQ0=1;QD=24.63;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2176,222,0 chrXIV 570342 . A C 68.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.12;MQ0=35;MQRankSum=-0.109;QD=1.21;ReadPosRankSum=1.992;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:98:98,0,179 chrXIV 570518 . G T 852.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.826;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.27;MQ0=13;MQRankSum=-2.367;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.699;SB=-1.068e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,49:53:12:885,12,0 chrXIV 570574 . G A 77.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.17;MQ0=15;QD=3.69;SB=-3.871e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:12:110,12,0 chrXIV 571535 . C G 197.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.02;MQ0=84;QD=1.89;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:27:230,27,0 chrXIV 571751 . G A 3800.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.77;MQ0=18;QD=21.47;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:3800,382,0 chrXIV 571766 . C T 4369.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.94;MQ0=16;QD=22.07;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:4369,436,0 chrXIV 571793 . A G 3150 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.11;MQ0=25;QD=19.69;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3183,333,0 chrXIV 571841 . C T 1636 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.66;MQ0=53;QD=11.28;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:1669,171,0 chrXIV 571889 . T C 923 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.67;MQ0=56;QD=7.21;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:956,108,0 chrXIV 571940 . T C 114.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.509;DP=73;Dels=0.00;FS=25.816;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.00;MQ0=21;MQRankSum=-1.923;QD=1.56;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-7.299e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,41:73:99:144,0,429 chrXIV 571968 . T C 744 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.02;MQ0=18;QD=10.48;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:87:777,87,0 chrXIV 571979 . C T 880 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.68;MQ0=11;QD=13.75;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:913,102,0 chrXIV 571992 . T C 813 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.66;MQ0=9;QD=14.52;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:93:846,93,0 chrXIV 572008 . G A 1203 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.76;MQ0=12;QD=16.94;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1236,126,0 chrXIV 572015 . C T 1258 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.55;MQ0=14;QD=16.34;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1291,132,0 chrXIV 572063 . T C 480.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;DP=125;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.13;MQ0=9;MQRankSum=-1.189;QD=3.84;ReadPosRankSum=3.153;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,38:125:99:510,0,1546 chrXIV 572070 . C T 541.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.906;DP=127;Dels=0.00;FS=3.858;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.12;MQ0=10;MQRankSum=-1.564;QD=4.26;ReadPosRankSum=2.728;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,41:127:99:571,0,1533 chrXIV 572150 . A G 110.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;DP=113;Dels=0.00;FS=9.034;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.65;MQ0=15;MQRankSum=-3.711;QD=0.97;ReadPosRankSum=0.881;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,29:113:99:140,0,1646 chrXIV 572261 . G A 664 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=40;Dels=0.00;FS=16.163;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.47;MQ0=8;MQRankSum=2.198;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,30:40:54:697,54,0 chrXIV 572277 . C T 492 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.37;MQ0=5;QD=18.22;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:57:525,57,0 chrXIV 572311 . A G 287 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.26;MQ0=10;QD=8.44;SB=-5.100e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:36:320,36,0 chrXIV 572330 . C T 106.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.23;MQ0=10;QD=3.80;SB=-2.676e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:15:139,15,0 chrXIV 572335 . G A 135.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.51;MQ0=9;QD=5.00;SB=-5.363e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:18:168,18,0 chrXIV 572597 . T C 569.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.360;DP=133;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.06;MQ0=14;MQRankSum=-1.318;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:599,0,1220 chrXIV 572600 . A G 569.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.691;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.41;MQ0=14;MQRankSum=-1.359;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:135:99:599,0,1309 chrXIV 572643 . A G 1189.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.285;DP=139;Dels=0.00;FS=1.618;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.76;MQ0=32;MQRankSum=-1.492;QD=8.55;ReadPosRankSum=3.207;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,91:139:99:1219,0,581 chrXIV 572789 . G A 1490 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.989;DP=75;Dels=0.00;FS=41.412;HaplotypeScore=5.6823;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.21;MQ0=10;MQRankSum=4.537;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.005;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,60:75:99:1523,153,0 chrXIV 572998 . C T 577 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=11;QD=16.49;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:66:610,66,0 chrXIV 573535 . G A 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.000;SB=-1.900e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:42:44,0,42 chrXIV 573537 . T C 79.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.88;SB=-2.855e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:112,12,0 chrXIV 573581 . C G 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.63;MQ0=57;MQRankSum=0.729;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.361;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,31:66:76:76,0,111 chrXIV 573662 . C T 164.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;DP=122;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.66;MQ0=107;MQRankSum=1.709;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.295;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:194,0,115 chrXIV 573877 . C T 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.887;DP=136;Dels=0.00;FS=26.764;HaplotypeScore=3.4581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.41;MQ0=52;MQRankSum=-4.804;QD=0.43;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,40:136:89:89,0,1008 chrXIV 573939 . A C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;DP=154;Dels=0.00;FS=72.423;HaplotypeScore=67.4912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.18;MQ0=0;MQRankSum=-5.711;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,122:154:99:1011,0,648 chrXIV 573972 . C T 1273.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.823;DP=147;Dels=0.00;FS=70.856;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.98;MQ0=5;MQRankSum=-5.006;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.664;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,119:147:99:1303,0,498 chrXIV 574001 . A C 1220.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.979;DP=102;Dels=0.01;FS=36.198;HaplotypeScore=19.1468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.41;MQ0=5;MQRankSum=-2.659;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,83:101:99:1250,0,227 chrXIV 574012 . C T 728.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.837;DP=82;Dels=0.00;FS=98.385;HaplotypeScore=18.2035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.51;MQ0=5;MQRankSum=-5.019;QD=8.88;ReadPosRankSum=-2.617;SB=-6.451e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,47:82:99:758,0,548 chrXIV 574027 . G A 274.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.357;DP=51;Dels=0.00;FS=56.463;HaplotypeScore=13.0611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.01;MQ0=5;MQRankSum=-3.741;QD=5.37;ReadPosRankSum=-2.537;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:304,0,395 chrXIV 574033 . G A 431.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;DP=52;Dels=0.00;FS=41.107;HaplotypeScore=5.5859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.88;MQ0=5;MQRankSum=-1.684;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.707;SB=-7.102e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:52:99:461,0,334 chrXIV 574042 . G A 767.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;DP=64;Dels=0.00;FS=44.323;HaplotypeScore=2.3479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.48;MQ0=5;MQRankSum=0.686;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.363;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,45:64:99:797,0,228 chrXIV 574051 . G T 120.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.998;DP=64;Dels=0.00;FS=43.975;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.82;MQ0=2;MQRankSum=-1.007;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.022;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:150,0,864 chrXIV 574103 . T A 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=61.7980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.50;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,68:152:99:1068,0,1371 chrXIV 574150 . T C 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.83;MQ0=0;QD=19.07;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3027,315,0 chrXIV 574190 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.527;DP=155;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.24;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.059;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1441,0,1495 chrXIV 574466 . C T 3857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.933e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3857,385,0 chrXIV 574682 . C T 4103.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4103,412,0 chrXIV 574776 . G A 4059.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4059,420,0 chrXIV 574949 . G A 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2679,273,0 chrXIV 575525 . C T 4073.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4073,418,0 chrXIV 576310 . C T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.676;DP=126;Dels=0.00;FS=5.530;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1239,0,1159 chrXIV 576383 . A G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3231,345,0 chrXIV 576450 . C T 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3368,339,0 chrXIV 577754 . C T 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3198,328,0 chrXIV 577988 . G A 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.245;DP=121;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=3.9718;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=26.55;ReadPosRankSum=1.532;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3246,336,0 chrXIV 577997 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.044;DP=129;Dels=0.00;FS=9.819;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1360,0,1413 chrXIV 578264 . T C 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2493,264,0 chrXIV 578366 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;DP=127;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.664;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1382,0,1196 chrXIV 578399 . G A 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.820;DP=141;Dels=0.00;FS=2.248;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:141:99:1653,0,1318 chrXIV 579044 . T A 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.96;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2957,306,0 chrXIV 579121 . A G 2511 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=22.03;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2544,264,0 chrXIV 579689 . A C 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.738;DP=140;Dels=0.00;FS=6.314;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.090;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1381,0,1563 chrXIV 581872 . C T 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3188,324,0 chrXIV 582602 . C A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.299;DP=153;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=10.18;ReadPosRankSum=2.425;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1587,0,1060 chrXIV 582726 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;DP=122;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=2.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.165;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1110,0,1481 chrXIV 582846 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.589;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1402,0,1206 chrXIV 583035 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.620;DP=133;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.714;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1264,0,1529 chrXIV 583063 . G T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.004;DP=126;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=2.5615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=10.44;ReadPosRankSum=2.167;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1346,0,1354 chrXIV 583601 . A G 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.798;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.402;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1144,0,1144 chrXIV 583894 . G A 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.073;DP=85;Dels=0.00;FS=1.803;HaplotypeScore=5.1450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.253;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:738,0,942 chrXIV 583965 . A C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.269;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1114,0,952 chrXIV 584081 . A C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.443;DP=123;Dels=0.00;FS=3.253;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=8.80;ReadPosRankSum=-2.252;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1112,0,1429 chrXIV 584126 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.791;DP=137;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.511;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1364,0,1478 chrXIV 584770 . G A 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.223;DP=111;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,65:111:99:1461,0,895 chrXIV 585226 . A G 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;DP=79;Dels=0.00;FS=11.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.888;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,40:79:99:777,0,834 chrXIV 585253 . A C 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.862;DP=83;Dels=0.00;FS=6.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.590;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:83:99:728,0,1027 chrXIV 585962 . C T 3464.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3464,346,0 chrXIV 586230 . A G 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.571;DP=138;Dels=0.00;FS=4.251;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.782;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,88:138:99:1834,0,932 chrXIV 586248 . T C 1980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;DP=145;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=2.806;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.959;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,92:145:99:2010,0,1037 chrXIV 586472 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.573;DP=128;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.306;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1073,0,1497 chrXIV 586543 . G A 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;DP=140;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=3.8382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.509;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,57:140:99:1120,0,1826 chrXIV 586546 . C G 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;DP=133;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=6.97;ReadPosRankSum=1.234;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,53:133:99:957,0,1753 chrXIV 586773 . T C 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;DP=117;Dels=0.00;FS=10.224;HaplotypeScore=3.9408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.707;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1139,0,1341 chrXIV 586790 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;DP=128;Dels=0.00;FS=8.099;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.216;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1214,0,1563 chrXIV 586841 . C T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.059;DP=116;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=1.9367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:990,0,1331 chrXIV 586843 . C G 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;DP=110;Dels=0.00;FS=2.478;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:947,0,1282 chrXIV 586872 . T C 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.700;DP=112;Dels=0.00;FS=3.572;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.131;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:954,0,1358 chrXIV 587284 . G T 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.630;DP=143;Dels=0.00;FS=5.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1672,0,1375 chrXIV 587593 . T C 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.821;DP=162;Dels=0.00;FS=2.862;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1640,0,1623 chrXIV 588114 . G A 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3188,336,0 chrXIV 588130 . A C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.392;DP=133;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.549;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1369,0,1361 chrXIV 589664 . A T 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.03;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2935,297,0 chrXIV 589760 . T C 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.038;DP=147;Dels=0.00;FS=6.015;HaplotypeScore=2.9441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.553;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1575,0,1460 chrXIV 589772 . G A 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.099;DP=138;Dels=0.00;FS=6.407;HaplotypeScore=1.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.421;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1594,0,1349 chrXIV 589843 . A G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;DP=148;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=2.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=8.73;ReadPosRankSum=-2.660;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1322,0,1600 chrXIV 590444 . A C 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;DP=162;Dels=0.00;FS=1.273;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,82:162:99:1581,0,1630 chrXIV 591916 . C T 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.883;DP=129;Dels=0.00;FS=3.200;HaplotypeScore=3.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.816;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1572,0,1140 chrXIV 592909 . T C 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2793,294,0 chrXIV 593322 . C T 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.956;DP=87;Dels=0.00;FS=5.572;HaplotypeScore=4.5482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.346;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,48:87:99:997,0,777 chrXIV 595514 . A G 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;DP=151;Dels=0.00;FS=7.389;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.235;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1608,0,1508 chrXIV 595549 . A T 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3747,387,0 chrXIV 595632 . C A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.291;DP=140;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.580;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1276,0,1644 chrXIV 597474 . A G 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;DP=132;Dels=0.00;FS=4.185;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.138;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1462,0,1297 chrXIV 597669 . G A 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.378;DP=122;Dels=0.00;FS=2.433;HaplotypeScore=2.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.750;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1213,0,1218 chrXIV 597799 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.448;DP=133;Dels=0.00;FS=3.092;HaplotypeScore=2.8494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.954;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1407,0,1213 chrXIV 598176 . C T 1813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.97;MQ0=2;QD=15.77;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:1846,189,0 chrXIV 598188 . C T 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.904;DP=120;Dels=0.00;FS=31.026;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.63;MQ0=3;MQRankSum=-1.893;QD=0.30;ReadPosRankSum=0.018;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,21:120:66:66,0,1324 chrXIV 598197 . C T 87.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.820;DP=92;Dels=0.00;FS=32.472;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.35;MQ0=4;MQRankSum=-1.860;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.030;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,21:92:99:117,0,798 chrXIV 598203 . C T 165.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.757;DP=95;Dels=0.00;FS=36.087;HaplotypeScore=10.2907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.21;MQ0=4;MQRankSum=-1.798;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.485;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:195,0,888 chrXIV 598218 . G A 304.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.740;DP=102;Dels=0.00;FS=61.872;HaplotypeScore=12.4831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.72;MQ0=4;MQRankSum=-1.144;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:334,0,596 chrXIV 598229 . T G 885.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;DP=115;Dels=0.00;FS=25.390;HaplotypeScore=93.5327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.85;MQ0=4;MQRankSum=1.455;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.628;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,73:115:99:915,0,158 chrXIV 598258 . G A 1029 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=7.511;DP=120;Dels=0.00;FS=37.925;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.51;MQ0=4;MQRankSum=3.376;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.456;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:40,80:120:46:1062,46,0 chrXIV 598352 . G A 358.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.262;DP=149;Dels=0.00;FS=12.281;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.84;MQ0=62;MQRankSum=4.978;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.348;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,34:149:99:388,0,500 chrXIV 598433 . T C 55.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;DP=155;Dels=0.00;FS=1.937;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.51;MQ0=124;MQRankSum=0.883;QD=0.35;ReadPosRankSum=0.785;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,31:155:85:85,0,251 chrXIV 598446 . G A 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.625;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.88;MQ0=113;MQRankSum=0.575;QD=0.17;ReadPosRankSum=0.875;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,28:145:55:55,0,307 chrXIV 598567 . G A 217.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.623;DP=161;Dels=0.00;FS=7.287;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.14;MQ0=113;MQRankSum=-1.176;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.734;SB=-7.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,72:161:99:247,0,273 chrXIV 598648 . G C 1398.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;DP=198;Dels=0.00;FS=5.303;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.39;MQ0=63;MQRankSum=1.261;QD=7.06;ReadPosRankSum=2.304;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,99:198:99:1428,0,1277 chrXIV 598694 . C T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.948;DP=282;Dels=0.00;FS=3.317;HaplotypeScore=3.4606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.69;MQ0=1;MQRankSum=-0.615;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.155;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,75:282:99:1174,0,4588 chrXIV 598922 . A G 742.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.085;DP=204;Dels=0.00;FS=7.482;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.45;MQ0=105;MQRankSum=0.049;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.156;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,146:204:99:772,0,330 chrXIV 598955 . A G 476.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;DP=207;Dels=0.00;FS=3.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.29;MQ0=102;MQRankSum=0.864;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.493;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,94:207:99:506,0,641 chrXIV 599314 . G A 2495.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.738;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.51;MQ0=9;MQRankSum=-0.609;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.279;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,130:206:99:2525,0,1203 chrXIV 599550 . T C 1756.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.444;DP=181;Dels=0.00;FS=18.872;HaplotypeScore=5.0509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.48;MQ0=25;MQRankSum=-8.487;QD=9.70;ReadPosRankSum=2.277;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,108:181:99:1786,0,1439 chrXIV 599612 . T G 2351 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.98;MQ0=17;QD=20.62;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2384,267,0 chrXIV 599629 . C T 1436.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.141;DP=104;Dels=0.00;FS=5.862;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQ0=11;MQRankSum=-0.138;QD=13.81;ReadPosRankSum=3.932;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,74:104:99:1466,0,468 chrXIV 599632 . G A 1486.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.745;DP=104;Dels=0.00;FS=7.490;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.37;MQ0=11;MQRankSum=-0.910;QD=14.29;ReadPosRankSum=4.761;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,75:104:99:1516,0,440 chrXIV 599654 . A G 2834 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.56;MQ0=7;QD=23.23;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2867,312,0 chrXIV 599916 . C T 2136.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.759;DP=278;Dels=0.00;FS=0.959;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQ0=15;MQRankSum=2.519;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.346;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,124:278:99:2166,0,3150 chrXIV 599940 . T C 2076.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.590;DP=293;Dels=0.00;FS=2.610;HaplotypeScore=8.2433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.82;MQ0=14;MQRankSum=0.488;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.783;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,132:293:99:2106,0,3425 chrXIV 599975 . G T 926.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.210;DP=250;Dels=0.00;FS=6.428;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQ0=9;MQRankSum=2.787;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.830;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,70:250:99:956,0,3989 chrXIV 599988 . C T 203.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.728;DP=260;Dels=0.00;FS=25.230;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=8;MQRankSum=-2.516;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.365;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,35:260:99:233,0,4656 chrXIV 599990 . C T 116.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.753;DP=280;Dels=0.00;FS=32.800;HaplotypeScore=3.8142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=9;MQRankSum=-1.760;QD=0.41;ReadPosRankSum=-0.968;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,35:280:99:146,0,5392 chrXIV 600064 . T C 5768.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.83;MQ0=10;QD=24.76;SB=-2.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,233:233:99:5768,574,0 chrXIV 600154 . T G 164.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;DP=182;Dels=0.00;FS=33.522;HaplotypeScore=6.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.48;MQ0=8;MQRankSum=-7.627;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.040;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,42:182:99:194,0,3090 chrXIV 600155 . A G 146.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.024;DP=181;Dels=0.00;FS=26.719;HaplotypeScore=6.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.42;MQ0=8;MQRankSum=-8.142;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.006;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,42:181:99:176,0,3115 chrXIV 600165 . C G 251.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=186;Dels=0.00;FS=15.222;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.30;MQ0=9;MQRankSum=-6.296;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.228;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,40:186:99:281,0,3112 chrXIV 600236 . G A 5585.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.20;MQ0=4;QD=25.04;SB=-2.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,223:223:99:5585,580,0 chrXIV 600259 . A G 5732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=3;QD=24.71;SB=-2.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,232:232:99:5732,598,0 chrXIV 600272 . G A 5668.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.78;MQ0=10;QD=24.54;SB=-2.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,231:231:99:5668,589,0 chrXIV 600283 . A G 5263.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3620;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.83;MQ0=10;QD=23.71;SB=-2.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,222:222:99:5263,555,0 chrXIV 600311 . A G 2762.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.931;DP=173;Dels=0.00;FS=15.890;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.79;MQ0=20;MQRankSum=1.513;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.941;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,144:173:99:2792,0,212 chrXIV 600362 . A G 2615 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.23;MQ0=38;QD=17.20;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:2648,297,0 chrXIV 600410 . G A 1778 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.73;MQ0=34;QD=16.16;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:1811,195,0 chrXIV 600458 . T C 1752 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.30;MQ0=14;QD=19.69;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1785,195,0 chrXIV 600480 . G A 1653 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.90;MQ0=12;QD=21.47;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1686,177,0 chrXIV 600485 . G A 1840 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.25;MQ0=15;QD=20.91;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1873,207,0 chrXIV 600500 . C T 2343 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.28;MQ0=15;QD=22.75;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2376,249,0 chrXIV 600716 . G C 3692.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.39;MQ0=51;QD=16.41;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,225:225:99:3692,411,0 chrXIV 601265 . A G 2630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;DP=329;Dels=0.00;FS=18.419;HaplotypeScore=5.7546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQ0=2;MQRankSum=-3.741;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,152:329:99:2660,0,3699 chrXIV 601295 . C T 2333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.778;DP=294;Dels=0.00;FS=12.372;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.07;MQ0=2;MQRankSum=-6.153;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,135:294:99:2363,0,3391 chrXIV 601305 . G C 2025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;DP=288;Dels=0.00;FS=8.260;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQ0=2;MQRankSum=-5.747;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.126;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,131:288:99:2055,0,3348 chrXIV 601315 . C G 2015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.728;DP=290;Dels=0.00;FS=11.497;HaplotypeScore=4.6305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQ0=1;MQRankSum=-5.647;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.122;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,129:290:99:2045,0,3258 chrXIV 601316 . G A 2126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.376;DP=289;Dels=0.00;FS=11.478;HaplotypeScore=3.6372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=1;MQRankSum=-5.717;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.997;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,129:289:99:2156,0,3275 chrXIV 601488 . G A 2882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.660;DP=271;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.455;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,145:271:99:2912,0,2384 chrXIV 601519 . G A 3281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.577;DP=295;Dels=0.00;FS=0.906;HaplotypeScore=6.0957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,159:295:99:3281,0,2613 chrXIV 601733 . C A 1332.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.474;DP=226;Dels=0.00;FS=5.134;HaplotypeScore=3.8382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.15;MQ0=24;MQRankSum=-5.672;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.323;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,97:226:99:1362,0,2746 chrXIV 601742 . G A 770.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.776;DP=186;Dels=0.00;FS=10.525;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.71;MQ0=24;MQRankSum=-6.285;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.271;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,73:186:99:800,0,2498 chrXIV 601909 . T G 186.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;DP=166;Dels=0.00;FS=7.585;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.93;MQ0=48;MQRankSum=0.244;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,40:166:99:216,0,1913 chrXIV 602249 . T G 420.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.297;DP=133;Dels=0.00;FS=21.269;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.71;MQ0=4;MQRankSum=-7.582;QD=3.16;ReadPosRankSum=-3.562;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:450,0,1692 chrXIV 602250 . C T 427.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.760;DP=133;Dels=0.00;FS=19.185;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.98;MQ0=4;MQRankSum=-7.789;QD=3.21;ReadPosRankSum=-3.427;SB=-3.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:457,0,1661 chrXIV 602260 . T G 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.337;DP=118;Dels=0.00;FS=8.607;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.78;MQ0=3;MQRankSum=-8.642;QD=0.24;ReadPosRankSum=-1.147;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,40:118:58:58,0,1864 chrXIV 602277 . A G 111.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.451;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.07;MQ0=2;MQRankSum=-9.454;QD=0.83;ReadPosRankSum=-1.294;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,50:133:99:141,0,1957 chrXIV 602287 . G T 412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.315;DP=148;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=3.7671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.50;MQ0=2;MQRankSum=-8.146;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,56:148:99:442,0,2010 chrXIV 602296 . A G 513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.287;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.95;MQ0=2;MQRankSum=-7.933;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,60:146:99:543,0,2012 chrXIV 602521 . C G 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:3988,447,0 chrXIV 602658 . T C 2631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=21.57;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2664,279,0 chrXIV 602860 . A T 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3440,372,0 chrXIV 603545 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.431;DP=157;Dels=0.00;FS=2.811;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1529,0,1743 chrXIV 603709 . G A 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3000,303,0 chrXIV 603842 . C T 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.877;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.442;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1547,0,1440 chrXIV 603874 . A G 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.241;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.250;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1462,0,1480 chrXIV 604247 . G A 1573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.590;DP=105;Dels=0.00;FS=11.394;HaplotypeScore=64.5214;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.80;MQ0=0;MQRankSum=3.753;QD=14.98;ReadPosRankSum=-2.498;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,79:105:99:1606,127,0 chrXIV 604250 . A G 113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=105;Dels=0.00;FS=4.181;HaplotypeScore=46.6066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.584;QD=1.08;ReadPosRankSum=-4.934;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,29:105:99:143,0,1252 chrXIV 604753 . C T 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.683;DP=145;Dels=0.00;FS=6.203;HaplotypeScore=2.9262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=11.08;ReadPosRankSum=-2.131;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1636,0,1308 chrXIV 604916 . G C 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;DP=109;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=2.5830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.203;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:911,0,1097 chrXIV 605032 . C G 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;DP=97;Dels=0.00;FS=14.568;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.440;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,38:97:99:737,0,1282 chrXIV 605458 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.387;DP=138;Dels=0.00;FS=3.624;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1373,0,1540 chrXIV 605486 . G A 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.673;DP=141;Dels=0.00;FS=11.130;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.94;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1521,0,1385 chrXIV 606035 . C T 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.637;DP=88;Dels=0.00;FS=2.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:1182,0,709 chrXIV 606387 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.827;DP=86;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1014,0,727 chrXIV 606438 . C T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.369;DP=115;Dels=0.00;FS=3.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.337;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1417,0,920 chrXIV 606872 . G A 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3216,316,0 chrXIV 607236 . G A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.823;DP=121;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.279;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1425,0,1041 chrXIV 607874 . C T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.095;DP=162;Dels=0.00;FS=17.298;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1676,0,1700 chrXIV 607917 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.019;DP=125;Dels=0.00;FS=4.288;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1302,0,1266 chrXIV 608001 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.942;DP=126;Dels=0.00;FS=10.125;HaplotypeScore=2.4750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1331,0,1181 chrXIV 609573 . A G 575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.698;DP=95;Dels=0.00;FS=0.800;HaplotypeScore=6.8447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:605,0,1297 chrXIV 609582 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.014;DP=87;Dels=0.00;FS=3.074;HaplotypeScore=6.7673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,53:87:99:1180,0,594 chrXIV 609744 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;DP=117;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.723;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1356,0,1126 chrXIV 610138 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.246;DP=117;Dels=0.00;FS=7.193;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.226;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1232,0,1106 chrXIV 610323 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.987;DP=115;Dels=0.00;FS=4.777;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.961;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1276,0,1071 chrXIV 610397 . C A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.054;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.472;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1410,0,1260 chrXIV 610512 . A C 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.841;DP=94;Dels=0.00;FS=3.906;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.589;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1052,0,901 chrXIV 611511 . C T 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3474,357,0 chrXIV 611581 . C T 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.016;DP=167;Dels=0.00;FS=2.710;HaplotypeScore=5.9211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.446;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,80:167:99:1650,0,1703 chrXIV 612523 . T G 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3366,336,0 chrXIV 612847 . A T 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2747,285,0 chrXIV 613030 . T C 623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;DP=75;Dels=0.00;FS=1.312;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.329;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:653,0,787 chrXIV 613141 . A G 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.758;DP=124;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=1.8801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.300;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:945,0,1562 chrXIV 613268 . G A 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3049,306,0 chrXIV 613373 . C T 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=1;QD=26.34;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3424,342,0 chrXIV 613459 . A G 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3553,354,0 chrXIV 613773 . T A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;DP=101;Dels=0.00;FS=6.286;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.33;ReadPosRankSum=2.400;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:972,0,1174 chrXIV 614336 . A G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.759;DP=142;Dels=0.00;FS=10.163;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=1;MQRankSum=1.360;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1320,0,1523 chrXIV 614395 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.299;DP=127;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=-0.061;QD=11.56;ReadPosRankSum=-3.820;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1498,0,1101 chrXIV 614500 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.970;DP=119;Dels=0.00;FS=4.615;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1373,0,1043 chrXIV 614515 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.654;DP=115;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1137,0,1207 chrXIV 614559 . T C 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=78;Dels=0.00;FS=11.683;HaplotypeScore=3.1471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=8.96;ReadPosRankSum=-2.099;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:729,0,875 chrXIV 614560 . C T 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;DP=76;Dels=0.00;FS=11.981;HaplotypeScore=2.3149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.363;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:99:719,0,817 chrXIV 614583 . T C 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.042;DP=98;Dels=0.00;FS=16.126;HaplotypeScore=3.1810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:856,0,1104 chrXIV 614760 . T A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.562;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.205;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1075,0,1038 chrXIV 614792 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;DP=105;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1189,0,1076 chrXIV 614815 . G T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.893;DP=116;Dels=0.00;FS=2.858;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.442;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1228,0,1235 chrXIV 614817 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;DP=116;Dels=0.00;FS=4.045;HaplotypeScore=2.3724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.403;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1214,0,1260 chrXIV 614988 . A T 2828 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2861,297,0 chrXIV 615001 . T G 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3131,336,0 chrXIV 615141 . A T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.220;QD=10.13;ReadPosRankSum=2.539;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1236,0,1340 chrXIV 615274 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.717;DP=124;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.549;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1307,0,1211 chrXIV 615305 . A C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.143;DP=134;Dels=0.00;FS=4.464;HaplotypeScore=3.9014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1382,0,1473 chrXIV 615324 . G A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.928;DP=129;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1304,0,1429 chrXIV 615337 . C T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.066;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1152,0,912 chrXIV 615417 . A G 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;DP=84;Dels=0.00;FS=4.430;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.820;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:717,0,1019 chrXIV 615447 . T C 736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;DP=96;Dels=0.00;FS=4.079;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.337;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,38:96:99:766,0,1264 chrXIV 615459 . C T 705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.126;DP=101;Dels=0.00;FS=0.789;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.531;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,39:101:99:735,0,1288 chrXIV 615483 . T C 691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.469;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=7.20;ReadPosRankSum=-2.232;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:721,0,1119 chrXIV 615522 . A G 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.580;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,64:107:99:1272,0,887 chrXIV 615555 . G A 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.375;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.179;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,54:99:99:1200,0,879 chrXIV 615762 . A G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.411;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2995,289,0 chrXIV 616014 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.393;DP=127;Dels=0.00;FS=4.377;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.490;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1202,0,1443 chrXIV 616020 . C T 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;DP=116;Dels=0.00;FS=5.779;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.459;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1142,0,1289 chrXIV 616069 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.738;DP=142;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.210;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,58:142:99:968,0,1867 chrXIV 616166 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;DP=143;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=6.5383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=9.36;ReadPosRankSum=2.656;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1369,0,1462 chrXIV 616170 . T A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;DP=140;Dels=0.01;FS=4.002;HaplotypeScore=3.5869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=9.61;ReadPosRankSum=2.820;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1375,0,1483 chrXIV 616492 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;DP=124;Dels=0.00;FS=8.351;HaplotypeScore=3.6793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1196,0,1326 chrXIV 616622 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;DP=113;Dels=0.00;FS=3.741;HaplotypeScore=4.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:113:99:1005,0,1368 chrXIV 617398 . T C 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.056;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=9.97;ReadPosRankSum=-2.305;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:987,0,1012 chrXIV 617480 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.567;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:107:99:1190,0,942 chrXIV 617566 . A G 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2850,300,0 chrXIV 617896 . G A 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.036;DP=117;Dels=0.00;FS=3.509;HaplotypeScore=6.7080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.334;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1025,0,1437 chrXIV 618448 . A G 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.24;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2821,294,0 chrXIV 618475 . G A 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2872,276,0 chrXIV 618548 . G A 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3238,333,0 chrXIV 619101 . T A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.729;DP=122;Dels=0.00;FS=5.960;HaplotypeScore=21.6708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.169;QD=8.83;ReadPosRankSum=-3.276;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:122:99:1107,0,1064 chrXIV 619110 . T A 1560.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.962;DP=134;Dels=0.00;FS=24.811;HaplotypeScore=4.0066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.671;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.863;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,85:134:99:1590,0,851 chrXIV 619113 . T A 1483.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.869;DP=129;Dels=0.00;FS=36.621;HaplotypeScore=3.4282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,82:129:99:1513,0,822 chrXIV 619117 . G T 1656.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.695;DP=134;Dels=0.00;FS=41.715;HaplotypeScore=4.3614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.369;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.762;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,92:134:99:1686,0,653 chrXIV 619135 . G C 183.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;DP=135;Dels=0.00;FS=71.640;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.895;QD=1.36;ReadPosRankSum=-7.755;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,27:135:99:213,0,2221 chrXIV 619281 . G C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2931,309,0 chrXIV 619320 . A G 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.426;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1146,0,1173 chrXIV 619350 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;DP=130;Dels=0.00;FS=6.592;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.445;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:130:99:1397,0,1243 chrXIV 620369 . T G 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=1;QD=24.50;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3798,399,0 chrXIV 621027 . C A 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.394;DP=145;Dels=0.01;FS=0.644;HaplotypeScore=4.2666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1551,0,1318 chrXIV 621627 . G T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.892;DP=120;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=3.9817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=7.91;ReadPosRankSum=3.060;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:979,0,1410 chrXIV 621693 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;DP=138;Dels=0.00;FS=3.135;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.621;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1250,0,1594 chrXIV 622639 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.061;DP=155;Dels=0.00;FS=4.739;HaplotypeScore=2.7794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1482,0,1502 chrXIV 622973 . A G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.992;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.032;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1048,0,1563 chrXIV 623097 . G T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;DP=135;Dels=0.00;FS=2.205;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.950;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1334,0,1195 chrXIV 623253 . T G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.569;DP=127;Dels=0.00;FS=3.296;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,80:127:99:1675,0,937 chrXIV 623559 . T A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;DP=121;Dels=0.00;FS=1.442;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1248,0,1260 chrXIV 624096 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.555;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.323;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1370,0,1274 chrXIV 624270 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.703;DP=132;Dels=0.00;FS=7.898;HaplotypeScore=4.6900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=9.14;ReadPosRankSum=-2.323;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1236,0,1448 chrXIV 624279 . C T 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.717;DP=136;Dels=0.00;FS=6.457;HaplotypeScore=3.9013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.608;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1563,0,1324 chrXIV 624879 . A T 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.122;DP=109;Dels=0.00;FS=3.917;HaplotypeScore=3.8690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.074;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:109:99:991,0,1301 chrXIV 624946 . C T 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.301;DP=118;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.439;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1036,0,1350 chrXIV 625428 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.509;DP=133;Dels=0.00;FS=4.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=9.78;ReadPosRankSum=2.261;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1331,0,1411 chrXIV 625641 . T G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.257;DP=111;Dels=0.00;FS=1.674;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1212,0,935 chrXIV 625861 . C T 2654 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.77;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2687,270,0 chrXIV 625869 . C T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.679;DP=114;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1210,0,1148 chrXIV 626600 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.994;DP=114;Dels=0.00;FS=4.722;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1106,0,1281 chrXIV 627220 . A G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.301;DP=100;Dels=0.00;FS=3.901;HaplotypeScore=4.9535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.803;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1107,0,1027 chrXIV 627634 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.825;DP=118;Dels=0.00;FS=5.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.054;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1071,0,1376 chrXIV 627846 . A G 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.885;DP=131;Dels=0.00;FS=6.735;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,78:131:99:1676,0,1093 chrXIV 627878 . C T 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.242;DP=106;Dels=0.00;FS=6.331;HaplotypeScore=2.9506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:988,0,1154 chrXIV 627905 . G A 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.219;DP=91;Dels=0.00;FS=5.277;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.417;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:957,0,950 chrXIV 628112 . C T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.730;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.034;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1070,0,972 chrXIV 628503 . T C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.835;DP=116;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.099;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1294,0,1139 chrXIV 628716 . G A 2547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2580,270,0 chrXIV 628742 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;DP=100;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.899;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1077,0,1045 chrXIV 628757 . A G 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.686;DP=104;Dels=0.00;FS=1.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.454;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,42:104:99:820,0,1322 chrXIV 628804 . T A 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;DP=81;Dels=0.00;FS=0.849;HaplotypeScore=31.6950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.24;MQ0=0;MQRankSum=5.071;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.925;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,45:81:99:921,0,696 chrXIV 628840 . A T 990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.589;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.65;MQ0=0;MQRankSum=5.069;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.534;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,40:64:99:1023,102,0 chrXIV 628889 . T C 1832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=24.11;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1865,198,0 chrXIV 629098 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.742;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1265,0,1386 chrXIV 629307 . A G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.726;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1226,0,1196 chrXIV 629398 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.428;DP=135;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=2.9230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1151,0,1512 chrXIV 629464 . C T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.378;DP=146;Dels=0.00;FS=4.076;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.474;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1408,0,1466 chrXIV 629592 . G A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.934;DP=91;Dels=0.00;FS=2.967;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.647;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:956,0,913 chrXIV 629760 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.195;DP=120;Dels=0.00;FS=2.348;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.329;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1171,0,1327 chrXIV 630534 . T C 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.000;DP=85;Dels=0.00;FS=5.779;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=0.564;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.975;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:878,0,850 chrXIV 630600 . A G 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.218;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:105:99:810,0,1293 chrXIV 630991 . A G 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2812,312,0 chrXIV 631199 . G T 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.757;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:99:99:972,0,1037 chrXIV 631453 . G A 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.443;DP=84;Dels=0.00;FS=4.267;HaplotypeScore=2.8522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.226;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:826,0,893 chrXIV 631510 . T G 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;DP=113;Dels=0.00;FS=3.863;HaplotypeScore=3.9634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=11.17;ReadPosRankSum=-2.972;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1292,0,944 chrXIV 631514 . T A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.610;DP=117;Dels=0.00;FS=5.065;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=11.60;ReadPosRankSum=-2.456;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1387,0,1011 chrXIV 631556 . T A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.983;DP=103;Dels=0.00;FS=3.922;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.950;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1191,0,1002 chrXIV 631593 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.670;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=11.23;ReadPosRankSum=-2.755;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1243,0,948 chrXIV 631782 . G A 1489 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=58;Dels=0.00;FS=4.412;HaplotypeScore=30.6606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=25.67;ReadPosRankSum=1.613;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:1522,156,0 chrXIV 631792 . T C 762.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;DP=67;Dels=0.00;FS=0.924;HaplotypeScore=37.1786;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=2.502;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.646;SB=-3.082e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,33:67:16:795,16,0 chrXIV 631799 . C A 565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.545;DP=68;Dels=0.00;FS=1.956;HaplotypeScore=27.2529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.522;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:595,0,759 chrXIV 631841 . C T 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.051;DP=96;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=13.6555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.335;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,56:96:99:993,0,466 chrXIV 632045 . A C 1124.14 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.699;DP=97;Dels=0.00;FS=1.675;HaplotypeScore=27.6976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.11;MQ0=0;MQRankSum=3.870;QD=11.59;ReadPosRankSum=4.933;SB=-4.631e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,55:97:12:1154,0,12 chrXIV 632163 . G T 295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.820;DP=81;Dels=0.00;FS=22.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.04;MQ0=0;MQRankSum=-3.261;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:325,0,1094 chrXIV 632186 . A G 207.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;DP=70;Dels=0.00;FS=43.471;HaplotypeScore=4.8396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.11;MQ0=0;MQRankSum=-3.640;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.796;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:237,0,941 chrXIV 632192 . T G 1225 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.078;DP=67;Dels=0.00;FS=4.459;HaplotypeScore=6.9570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.66;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.698;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,66:67:99:1258,110,0 chrXIV 632210 . T C 292.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.323;DP=67;Dels=0.00;FS=28.420;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.05;MQ0=0;MQRankSum=-3.259;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,30:67:99:322,0,715 chrXIV 632231 . A G 366.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.098;DP=68;Dels=0.00;FS=59.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.943;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.086;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:396,0,741 chrXIV 632235 . A C 403.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=80;Dels=0.00;FS=72.352;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.965;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.778;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:433,0,945 chrXIV 632251 . G A 318.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.111;DP=70;Dels=0.00;FS=59.052;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.343;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:348,0,748 chrXIV 632295 . T A 846.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;DP=77;Dels=0.00;FS=28.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.03;MQ0=11;MQRankSum=0.578;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-3.079e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,48:77:99:876,0,264 chrXIV 633286 . G A 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3545,360,0 chrXIV 633299 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.551;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1205,0,1343 chrXIV 633940 . T C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;DP=124;Dels=0.00;FS=5.538;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=8.76;ReadPosRankSum=2.217;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1116,0,1518 chrXIV 634032 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.460;DP=122;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.617;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1231,0,1196 chrXIV 634104 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.371;DP=126;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=2.3913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.135;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1196,0,1295 chrXIV 634189 . C T 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.902;DP=125;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.555;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:805,0,1205 chrXIV 634319 . T G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;DP=123;Dels=0.00;FS=6.829;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=2.203;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.394;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1219,0,1337 chrXIV 634336 . C T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;DP=122;Dels=0.00;FS=3.570;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1348,0,1228 chrXIV 635049 . T C 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.291;DP=139;Dels=0.00;FS=5.932;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.575;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,81:139:99:1668,0,1106 chrXIV 635324 . T C 2552 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.04;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2585,276,0 chrXIV 635465 . T G 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3002,312,0 chrXIV 635640 . C T 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.39;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2851,300,0 chrXIV 635677 . T C 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.020;DP=115;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1209,0,939 chrXIV 635687 . A C 2698 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;DP=118;Dels=0.00;FS=4.486;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2731,274,0 chrXIV 635788 . C G 2182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.29;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2215,237,0 chrXIV 635793 . T A 2211 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.64;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2244,237,0 chrXIV 635840 . G C 1030.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;DP=95;Dels=0.00;FS=2.743;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-3.002;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.289;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,54:95:99:1060,0,835 chrXIV 635844 . T C 2517 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2550,267,0 chrXIV 635849 . A G 808.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.563;DP=95;Dels=0.00;FS=3.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:838,0,1107 chrXIV 635925 . A C 2861 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2894,318,0 chrXIV 635993 . A T 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3311,339,0 chrXIV 636275 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.938;DP=100;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.322;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1168,0,895 chrXIV 636356 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.659;DP=110;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:946,0,1255 chrXIV 636749 . T C 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3121,330,0 chrXIV 636914 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.600;DP=132;Dels=0.00;FS=5.709;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.446;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1117,0,1537 chrXIV 637234 . T A 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2947,300,0 chrXIV 637852 . A G 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.893;DP=101;Dels=0.00;FS=1.638;HaplotypeScore=2.8395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.712;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:101:99:854,0,1166 chrXIV 637855 . G A 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.256;DP=105;Dels=0.00;FS=3.608;HaplotypeScore=2.8395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:920,0,1175 chrXIV 638761 . G A 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.026;DP=100;Dels=0.00;FS=2.662;HaplotypeScore=2.6576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1046,0,994 chrXIV 639025 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,52:91:99:1114,0,822 chrXIV 639031 . A G 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;DP=96;Dels=0.00;FS=5.148;HaplotypeScore=2.4892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.661;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,50:96:99:1025,0,922 chrXIV 639120 . T C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.392;DP=128;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1482,0,1173 chrXIV 639165 . T G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.069;DP=139;Dels=0.00;FS=2.295;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1339,0,1477 chrXIV 639551 . C A 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.979;DP=130;Dels=0.00;FS=3.193;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.487;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1489,0,1191 chrXIV 639848 . T C 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.630;DP=107;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=9.10;ReadPosRankSum=3.550;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1004,0,1223 chrXIV 639929 . T C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.449;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1023,0,1110 chrXIV 639941 . G A 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.742;DP=106;Dels=0.00;FS=0.790;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1101,0,1080 chrXIV 640024 . C T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;DP=124;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.557;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1424,0,1164 chrXIV 640379 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.569;DP=134;Dels=0.00;FS=1.373;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.389;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1231,0,1365 chrXIV 640431 . A G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;DP=143;Dels=0.00;FS=1.349;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1315,0,1592 chrXIV 640932 . T C 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=1;QD=24.23;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3013,324,0 chrXIV 641101 . C T 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.789;DP=154;Dels=0.00;FS=8.669;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.082;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:154:99:1661,0,1457 chrXIV 641143 . G A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.038;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.887;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1119,0,1563 chrXIV 641452 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.732;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.634;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1257,0,1065 chrXIV 641784 . A G 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.076;DP=177;Dels=0.00;FS=1.913;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.372;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,88:177:99:1829,0,1848 chrXIV 641794 . G A 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.736;DP=168;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,80:168:99:1603,0,1813 chrXIV 641859 . G A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.011;DP=147;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=2.3039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.180;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1465,0,1387 chrXIV 641892 . A G 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.484;DP=169;Dels=0.00;FS=4.487;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=8.56;ReadPosRankSum=-1.503;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,78:169:99:1476,0,1988 chrXIV 642126 . G T 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.179;DP=122;Dels=0.00;FS=14.015;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.592;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:1522,0,898 chrXIV 642670 . T G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=1;MQRankSum=-0.384;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.252;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1156,0,1352 chrXIV 642774 . G A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.129;DP=151;Dels=0.00;FS=2.974;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1372,0,1580 chrXIV 642812 . G C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;DP=134;Dels=0.00;FS=3.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.318;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1475,0,1234 chrXIV 643151 . A G 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3211,339,0 chrXIV 643202 . T G 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.828e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3535,375,0 chrXIV 643259 . C G 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3946,405,0 chrXIV 643956 . T C 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.262;DP=97;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.769;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:964,0,1044 chrXIV 644197 . C A 736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.053;DP=105;Dels=0.00;FS=13.613;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=7.01;ReadPosRankSum=-1.958;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:766,0,1327 chrXIV 644271 . G A 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;DP=110;Dels=0.00;FS=11.388;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=2.151;QD=11.91;ReadPosRankSum=2.574;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1340,0,920 chrXIV 646547 . A C 735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.239;DP=87;Dels=0.00;FS=5.461;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.762;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:87:99:765,0,900 chrXIV 646799 . A G 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;DP=92;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:92:99:834,0,1041 chrXIV 646869 . T G 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3399,354,0 chrXIV 647092 . A C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.985;DP=138;Dels=0.00;FS=3.128;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.479;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:1051,0,1820 chrXIV 647174 . G A 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.616;DP=146;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.706;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1673,0,1492 chrXIV 647188 . C T 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.200;DP=145;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=3.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.210;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1635,0,1408 chrXIV 647475 . T C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;DP=116;Dels=0.00;FS=5.742;HaplotypeScore=6.9477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:116:99:1339,0,1090 chrXIV 647584 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.156;DP=130;Dels=0.00;FS=2.326;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=9.09;ReadPosRankSum=2.613;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1212,0,1471 chrXIV 647815 . G A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;DP=124;Dels=0.00;FS=5.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1229,0,1324 chrXIV 647821 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.493;DP=133;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1196,0,1521 chrXIV 647950 . C T 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.997;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.174;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:159:99:1596,0,1695 chrXIV 648040 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.136;DP=122;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=2.131;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.645;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1290,0,1236 chrXIV 648085 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.550;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=2.284;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.064;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1312,0,1469 chrXIV 648166 . T A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.433;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.720;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:1032,0,1319 chrXIV 648289 . A G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.932;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.986;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1071,0,1416 chrXIV 648473 . G A 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.586;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.436;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:136:99:1491,0,1178 chrXIV 648482 . A G 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.545;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.334;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1558,0,1298 chrXIV 648754 . G A 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;DP=114;Dels=0.00;FS=9.407;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=8.70;ReadPosRankSum=-2.045;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1022,0,1312 chrXIV 648908 . T C 3740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3740,384,0 chrXIV 648982 . G A 1817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.893;DP=166;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=10.1472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.894;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,88:166:99:1847,0,1530 chrXIV 649267 . G A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.877;DP=116;Dels=0.00;FS=3.415;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1130,0,1263 chrXIV 649979 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.557;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=1;MQRankSum=0.988;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.127;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:117:99:1370,0,1056 chrXIV 651691 . G C 1796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.585;DP=164;Dels=0.00;FS=2.142;HaplotypeScore=3.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.208;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,88:164:99:1826,0,1567 chrXIV 651849 . C T 1177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=38.3253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.33;MQ0=0;QD=18.39;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1210,132,0 chrXIV 651900 . A T 135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.679;DP=70;Dels=0.00;FS=1.021;HaplotypeScore=3.1324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.051;QD=1.93;ReadPosRankSum=-1.924;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:165,0,518 chrXIV 651906 . A G 153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;DP=59;Dels=0.00;FS=1.109;HaplotypeScore=6.3125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQ0=0;MQRankSum=-4.314;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:183,0,366 chrXIV 651963 . G A 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.059;DP=99;Dels=0.00;FS=7.593;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.94;MQ0=0;MQRankSum=-6.308;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.967;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:835,0,914 chrXIV 651964 . G A 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.35;MQ0=0;QD=22.21;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2276,234,0 chrXIV 651982 . C T 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.494;DP=107;Dels=0.00;FS=2.885;HaplotypeScore=52.9862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.97;MQ0=0;MQRankSum=-6.180;QD=7.64;ReadPosRankSum=-1.150;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:848,0,988 chrXIV 651983 . A T 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;DP=106;Dels=0.00;FS=2.876;HaplotypeScore=51.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.78;MQ0=0;MQRankSum=-6.980;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:845,0,1013 chrXIV 652036 . C T 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.219;DP=137;Dels=0.00;FS=7.904;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.26;MQ0=1;MQRankSum=-9.606;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.169;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:137:99:944,0,1616 chrXIV 652147 . A G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.029;DP=145;Dels=0.00;FS=4.025;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=-3.403;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.979;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,63:145:99:1047,0,1790 chrXIV 652238 . G A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.896;DP=149;Dels=0.00;FS=4.861;HaplotypeScore=2.7129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.819;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1442,0,1369 chrXIV 652261 . C T 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.712;DP=163;Dels=0.00;FS=2.898;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,84:163:99:1571,0,1476 chrXIV 652265 . T G 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.383;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.416;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,82:169:99:1513,0,1735 chrXIV 652305 . C T 2038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.157;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,99:196:99:2068,0,1735 chrXIV 652947 . C T 2394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.090;DP=224;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.526;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.502;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,118:224:99:2424,0,2037 chrXIV 652973 . A T 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;DP=153;Dels=0.00;FS=2.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.337;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1556,0,1549 chrXIV 653015 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.697;DP=181;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=8.16;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,82:181:99:1507,0,1924 chrXIV 653147 . C A 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;DP=178;Dels=0.00;FS=8.402;HaplotypeScore=3.1233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,86:178:99:1776,0,1835 chrXIV 653385 . T C 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQ0=0;QD=19.21;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:2627,279,0 chrXIV 653525 . G A 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3155,327,0 chrXIV 653542 . T A 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3555,363,0 chrXIV 653635 . T C 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;DP=144;Dels=0.00;FS=3.114;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.219;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,85:144:99:1750,0,1166 chrXIV 654060 . T C 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.129;DP=176;Dels=0.00;FS=1.174;HaplotypeScore=5.5683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.121;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,87:176:99:1721,0,1926 chrXIV 654088 . A G 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.389;DP=182;Dels=0.00;FS=2.598;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,95:182:99:1880,0,1686 chrXIV 654166 . T C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.982;DP=148;Dels=0.00;FS=1.298;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1324,0,1770 chrXIV 654296 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.057;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.397;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1218,0,1543 chrXIV 654392 . G A 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;DP=131;Dels=0.00;FS=8.117;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.345;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1153,0,1650 chrXIV 654448 . C T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;DP=186;Dels=0.00;FS=9.822;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.483;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,81:186:99:1609,0,2188 chrXIV 654646 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.933;DP=136;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=67.4929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.416;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1415,0,1186 chrXIV 654835 . T C 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.704;DP=145;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.168;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1477,0,1610 chrXIV 654949 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.323;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.281;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1377,0,1647 chrXIV 655138 . C T 4132.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.66;SB=-2.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4132,418,0 chrXIV 655174 . T C 3839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3839,405,0 chrXIV 655315 . A G 4234.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3168;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20;SB=-2.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4234,435,0 chrXIV 655324 . G A 4357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4357,448,0 chrXIV 655447 . G A 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3192,336,0 chrXIV 655856 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.903;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,72:116:99:1611,0,804 chrXIV 655865 . T G 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.15;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3001,315,0 chrXIV 655873 . A T 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.78;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3023,312,0 chrXIV 655918 . A T 4012.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.845e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4012,406,0 chrXIV 656020 . G A 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.965;DP=137;Dels=0.00;FS=3.040;HaplotypeScore=7.8254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=2.109;QD=25.36;ReadPosRankSum=2.109;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,135:137:99:3474,334,0 chrXIV 656089 . G A 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3156,321,0 chrXIV 656104 . A T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;DP=138;Dels=0.00;FS=4.024;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.777;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1374,0,1429 chrXIV 656134 . A G 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3785,366,0 chrXIV 656346 . T C 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.374;DP=146;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=2.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.295;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1450,0,1495 chrXIV 656419 . G A 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3824,397,0 chrXIV 656425 . G C 3923.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3923,408,0 chrXIV 656674 . A G 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3368,345,0 chrXIV 656734 . G A 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.58;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:138:99:3668,381,0 chrXIV 656773 . A G 4539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4539,474,0 chrXIV 656799 . A G 1885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.564;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,88:174:99:1915,0,1871 chrXIV 656962 . A T 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3875,400,0 chrXIV 657202 . C A 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3813,396,0 chrXIV 657547 . A G 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.170;DP=155;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=3.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=9.43;ReadPosRankSum=2.386;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:155:99:1491,0,1666 chrXIV 657606 . A C 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=-1.081;QD=24.48;ReadPosRankSum=-0.768;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3280,348,0 chrXIV 657610 . A G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.014;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=1;MQRankSum=1.123;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1307,0,1275 chrXIV 657739 . A T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;DP=120;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1200,0,1312 chrXIV 657871 . C T 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.924;DP=135;Dels=0.00;FS=6.774;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.163;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1532,0,1263 chrXIV 657913 . C T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.170;DP=143;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1467,0,1526 chrXIV 657946 . A G 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.146;DP=167;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=5.7012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:1604,0,1914 chrXIV 658012 . G A 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.167;DP=161;Dels=0.00;FS=1.339;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1793,0,1545 chrXIV 658252 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.609;DP=133;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.453;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1015,0,1688 chrXIV 658306 . T A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.726;DP=128;Dels=0.00;FS=7.025;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.385;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1168,0,1518 chrXIV 658380 . C T 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.064;DP=137;Dels=0.00;FS=6.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1409,0,1529 chrXIV 658444 . C A 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3585,375,0 chrXIV 658513 . C T 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3787,393,0 chrXIV 658624 . C T 4199.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.41;SB=-2.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4199,421,0 chrXIV 658675 . C T 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.95;SB=-2.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3793,399,0 chrXIV 658677 . G A 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3847,399,0 chrXIV 658809 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,71:119:99:1579,0,952 chrXIV 658861 . C T 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:2982,297,0 chrXIV 658915 . A G 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.19;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2914,294,0 chrXIV 659022 . G A 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.50;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2975,315,0 chrXIV 659128 . C T 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.678;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=26.51;ReadPosRankSum=1.625;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3420,315,0 chrXIV 659350 . A G 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3604,366,0 chrXIV 659362 . C T 3598.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3598,363,0 chrXIV 659467 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.750;DP=130;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.454;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1302,0,1414 chrXIV 659794 . C T 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3719,376,0 chrXIV 659821 . A G 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2915,300,0 chrXIV 659869 . C T 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.749;DP=121;Dels=0.00;FS=11.752;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.96;ReadPosRankSum=-2.119;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1235,0,1224 chrXIV 659878 . G A 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3211,324,0 chrXIV 660235 . C T 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.164;DP=156;Dels=0.00;FS=4.794;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.005;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1788,0,1428 chrXIV 660538 . G A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;DP=140;Dels=0.00;FS=5.091;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.046;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1411,0,1327 chrXIV 660562 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.365;DP=114;Dels=0.00;FS=13.161;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1397,0,945 chrXIV 660670 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.525;DP=149;Dels=0.00;FS=1.343;HaplotypeScore=4.0739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,60:149:99:1145,0,1812 chrXIV 661385 . T C 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=23.34;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3337,300,0 chrXIV 661497 . T G 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.485;DP=140;Dels=0.00;FS=18.240;HaplotypeScore=4.4870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.689;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1420,0,1647 chrXIV 661923 . G A 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.4944;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3586,372,0 chrXIV 661928 . G C 5087.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=209;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.9251;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.52;MQ0=0;QD=24.34;SB=-2.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:209:99:5087,555,0 chrXIV 662398 . C A 4672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6058;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4672,472,0 chrXIV 662512 . C A 5144.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:5144,526,0 chrXIV 662537 . G A 4649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4649,490,0 chrXIV 662542 . C T 4523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4523,478,0 chrXIV 662586 . A G 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=26.22;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3277,351,0 chrXIV 662701 . A T 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.719;DP=120;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=2.340;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.316;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1125,0,1005 chrXIV 662883 . G A 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.335;DP=177;Dels=0.00;FS=7.523;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.842;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,86:177:99:1713,0,1554 chrXIV 662978 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.435;DP=147;Dels=0.00;FS=6.036;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.925;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1245,0,1631 chrXIV 662982 . A G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.898;DP=141;Dels=0.00;FS=6.199;HaplotypeScore=3.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.632;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1270,0,1491 chrXIV 663434 . C T 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.034;DP=158;Dels=0.00;FS=6.913;HaplotypeScore=8.2463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=1;MQRankSum=-0.392;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.683;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1718,0,1426 chrXIV 663642 . C T 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.764;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.192;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1487,0,1426 chrXIV 663717 . T G 1920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.484;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=9.37;ReadPosRankSum=-2.302;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,107:205:99:1950,0,1820 chrXIV 663910 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.757;DP=150;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=3.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.326;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1218,0,1655 chrXIV 663986 . T A 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3678,381,0 chrXIV 664058 . A C 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=66.1105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3693,393,0 chrXIV 664095 . A G 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.950;DP=129;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.81;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,78:129:99:1601,0,1036 chrXIV 664122 . C G 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.438;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.434;QD=6.45;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,53:146:99:972,0,1975 chrXIV 664392 . G A 4151.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.620;DP=154;Dels=0.00;FS=3.242;HaplotypeScore=6.5277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.530;QD=26.95;ReadPosRankSum=1.530;SB=-2.070e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:4151,409,0 chrXIV 664499 . A G 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3665,390,0 chrXIV 664572 . T C 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3690,381,0 chrXIV 664887 . A G 2528 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.84;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2561,267,0 chrXIV 664923 . C T 2527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.75;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2560,261,0 chrXIV 664998 . A C 2165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.57;MQ0=0;QD=21.87;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2198,237,0 chrXIV 665001 . C T 2273 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.02;MQ0=0;QD=22.28;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2306,240,0 chrXIV 665017 . C G 2816 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.51;MQ0=0;QD=22.00;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2849,318,0 chrXIV 665036 . G T 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=21.81;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2803,300,0 chrXIV 665056 . T C 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.23;MQ0=0;QD=22.70;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2848,312,0 chrXIV 665064 . T A 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;DP=127;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQ0=0;MQRankSum=-3.977;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.592;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:908,0,1492 chrXIV 665097 . T A 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5488;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3282,336,0 chrXIV 665108 . T C 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=22.55;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3145,342,0 chrXIV 665283 . G A 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.49;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2859,291,0 chrXIV 665506 . A G 3013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9645;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.827;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:135:99:3046,321,0 chrXIV 665577 . G A 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3351,342,0 chrXIV 665889 . G A 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.484;DP=111;Dels=0.00;FS=3.210;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=24.77;ReadPosRankSum=1.389;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2783,291,0 chrXIV 665953 . C G 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0319;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3387,378,0 chrXIV 665969 . A C 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3711,393,0 chrXIV 666127 . C T 4491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=25.23;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-2.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,177:178:99:4491,456,0 chrXIV 666469 . T C 2007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.576;DP=160;Dels=0.00;FS=8.576;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.481;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,96:160:99:2037,0,1288 chrXIV 667018 . C T 4310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4310,430,0 chrXIV 667173 . T C 4178.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4178,423,0 chrXIV 667174 . C T 4157.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4157,426,0 chrXIV 667216 . C T 4207.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=26.46;ReadPosRankSum=-0.839;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:4207,436,0 chrXIV 667292 . G A 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=27.12;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3152,333,0 chrXIV 667515 . C A 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.18;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3404,363,0 chrXIV 667530 . T A 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3555,378,0 chrXIV 667575 . T C 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.25;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2702,291,0 chrXIV 667576 . C T 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.300;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.648;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1178,0,968 chrXIV 667587 . C A 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.58;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2551,264,0 chrXIV 667685 . T C 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2979,309,0 chrXIV 667710 . A G 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.393;DP=107;Dels=0.00;FS=2.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:930,0,1340 chrXIV 667737 . C T 2699 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2732,279,0 chrXIV 667749 . C T 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2559,264,0 chrXIV 667971 . T A 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=23.52;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3622,358,0 chrXIV 668110 . A T 16.85 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.935;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=0.11;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-8.638e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,157:159:6:48,6,0 chrXIV 668126 . T C 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.95;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3700,402,0 chrXIV 668179 . T C 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;QD=25.77;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3074,330,0 chrXIV 668185 . T C 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.08;MQ0=0;QD=25.37;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2671,294,0 chrXIV 668293 . T A 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;DP=127;Dels=0.00;FS=11.613;HaplotypeScore=3.6378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.137;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1024,0,1511 chrXIV 668321 . G A 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7165;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.83;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3279,339,0 chrXIV 668326 . T A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.469;DP=127;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=2.7280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1508,0,1168 chrXIV 668876 . G A 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3400,348,0 chrXIV 669030 . T C 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3222,345,0 chrXIV 669417 . C T 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.497;DP=120;Dels=0.00;FS=7.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.469;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1455,0,1037 chrXIV 669435 . A G 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.526;DP=108;Dels=0.00;FS=4.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:926,0,1312 chrXIV 669563 . A G 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2599,273,0 chrXIV 669588 . G A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.982;DP=112;Dels=0.00;FS=4.548;HaplotypeScore=4.8541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1189,0,1137 chrXIV 669629 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=122;Dels=0.00;FS=2.340;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.891;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1368,0,1267 chrXIV 669872 . C T 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.93;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2809,297,0 chrXIV 669924 . G A 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2601,270,0 chrXIV 669930 . A G 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.09;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3033,327,0 chrXIV 669943 . T C 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.88;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3159,354,0 chrXIV 669967 . A C 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3231,354,0 chrXIV 670131 . A C 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.226;DP=155;Dels=0.00;FS=3.951;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.113;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1642,0,1597 chrXIV 670369 . A G 2577 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=22.81;ReadPosRankSum=0.359;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,111:113:99:2610,261,0 chrXIV 670370 . A G 2707 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=23.75;ReadPosRankSum=0.577;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2740,288,0 chrXIV 670615 . C A 3483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3483,363,0 chrXIV 671057 . C T 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.641;DP=159;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.022;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1638,0,1614 chrXIV 671139 . A T 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3551,363,0 chrXIV 671188 . T C 4064.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9951;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.34;SB=-2.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4064,402,0 chrXIV 671317 . A G 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3597,375,0 chrXIV 671381 . A T 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.757;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.164;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1110,0,1804 chrXIV 671419 . A C 1780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.609;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.374;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,89:165:99:1810,0,1577 chrXIV 671629 . G A 3694.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3694,384,0 chrXIV 671647 . T C 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7686;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.89;SB=-2.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:4168,438,0 chrXIV 671826 . C T 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=109;Dels=0.00;FS=3.299;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=25.80;ReadPosRankSum=1.224;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2845,291,0 chrXIV 671854 . G A 2463 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2496,252,0 chrXIV 671989 . T C 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2939,315,0 chrXIV 672220 . T C 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3484,360,0 chrXIV 672239 . C T 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2872,306,0 chrXIV 672281 . T C 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3210,342,0 chrXIV 672334 . G T 3638.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3638,366,0 chrXIV 672756 . C T 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3590,363,0 chrXIV 672773 . G T 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3309,325,0 chrXIV 673073 . A G 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.58;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3419,360,0 chrXIV 673093 . G A 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3837,396,0 chrXIV 673124 . A C 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3150,339,0 chrXIV 673242 . C T 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3216,333,0 chrXIV 673326 . C T 4395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.936e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4395,451,0 chrXIV 673434 . G A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.954;DP=153;Dels=0.00;FS=8.453;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.498;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1482,0,1699 chrXIV 673486 . C T 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3554,367,0 chrXIV 673496 . C T 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3504,369,0 chrXIV 673518 . G A 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3327,345,0 chrXIV 673700 . G A 1750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;DP=160;Dels=0.00;FS=12.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.552;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1780,0,1608 chrXIV 673739 . G A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.097;DP=162;Dels=0.00;FS=5.741;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.830;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1644,0,1845 chrXIV 673832 . A G 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3294,357,0 chrXIV 674309 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.454;DP=152;Dels=0.00;FS=2.906;HaplotypeScore=3.3353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.330;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1236,0,1917 chrXIV 674338 . G C 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3237,360,0 chrXIV 674407 . T C 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.745e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3782,390,0 chrXIV 674408 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.971;DP=147;Dels=0.00;FS=2.920;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1386,0,1675 chrXIV 674483 . G A 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3897,393,0 chrXIV 674746 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.072;DP=130;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=2.8963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.321;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1283,0,1377 chrXIV 674892 . T C 4307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4307,441,0 chrXIV 674938 . C T 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.231;DP=170;Dels=0.00;FS=0.569;HaplotypeScore=4.7990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.035;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.608;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,96:170:99:1799,0,1511 chrXIV 674949 . A G 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3821,382,0 chrXIV 674958 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.333;DP=156;Dels=0.00;FS=1.987;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:1472,0,1769 chrXIV 675219 . A C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3318,354,0 chrXIV 675270 . A T 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3554,364,0 chrXIV 675306 . C T 2012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.980;DP=172;Dels=0.00;FS=3.659;HaplotypeScore=4.4795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.229;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,96:172:99:2042,0,1456 chrXIV 675462 . G A 4073.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4073,424,0 chrXIV 675489 . C G 1853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;DP=167;Dels=0.00;FS=1.933;HaplotypeScore=5.6473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,88:167:99:1883,0,1588 chrXIV 675514 . C T 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;DP=147;Dels=0.00;FS=3.886;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1714,0,1413 chrXIV 675522 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.099;DP=136;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.824;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1272,0,1487 chrXIV 675555 . G T 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3227,330,0 chrXIV 675567 . G A 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3397,340,0 chrXIV 675859 . A G 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.86;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3519,366,0 chrXIV 675908 . G T 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.705;DP=156;Dels=0.00;FS=2.998;HaplotypeScore=3.8117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.736;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,65:156:99:980,0,1978 chrXIV 675977 . C T 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.466;DP=104;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=3.7657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.861;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:104:99:1103,0,976 chrXIV 676029 . T G 2388 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2421,246,0 chrXIV 676176 . A G 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.553;DP=118;Dels=0.00;FS=2.362;HaplotypeScore=2.6707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.141;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1014,0,1443 chrXIV 676368 . A G 3905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3905,393,0 chrXIV 676470 . C T 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3834,396,0 chrXIV 676834 . A G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3466,375,0 chrXIV 676917 . A C 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3381,354,0 chrXIV 677207 . G T 1781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.198;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.344;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,80:143:99:1811,0,1183 chrXIV 677649 . C G 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7418;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3238,342,0 chrXIV 677660 . A G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;DP=141;Dels=0.00;FS=3.323;HaplotypeScore=7.3213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.520;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,55:141:99:1098,0,1828 chrXIV 677841 . A G 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3374,339,0 chrXIV 677931 . C T 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2887,294,0 chrXIV 678613 . A T 54.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;DP=114;Dels=0.00;FS=4.951;HaplotypeScore=259.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=-0.256;QD=0.47;ReadPosRankSum=-3.146;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,4:114:84:84,0,104 chrXIV 678614 . A G 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.288;DP=115;Dels=0.00;FS=5.007;HaplotypeScore=259.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=0.870;QD=0.40;ReadPosRankSum=-3.134;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,4:115:76:76,0,134 chrXIV 678759 . A G 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3666,369,0 chrXIV 678849 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.538;DP=138;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1278,0,1584 chrXIV 679026 . T C 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3498,369,0 chrXIV 679068 . A G 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3198,339,0 chrXIV 679089 . G A 2476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.613;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.541;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:97:99:2509,243,0 chrXIV 679168 . G A 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2642,270,0 chrXIV 679220 . C T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3163,324,0 chrXIV 679227 . A G 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:2872,306,0 chrXIV 679440 . C T 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.208;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.251;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,151:152:99:3951,391,0 chrXIV 679554 . T C 2470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=22.45;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2503,249,0 chrXIV 679605 . C G 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;DP=113;Dels=0.00;FS=7.309;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=24.18;ReadPosRankSum=2.036;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,111:113:99:2765,266,0 chrXIV 680022 . T C 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4551;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.64;MQ0=0;QD=23.67;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2755,297,0 chrXIV 680044 . A G 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3084,339,0 chrXIV 680049 . C T 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.29;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3107,333,0 chrXIV 680095 . T C 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3024,321,0 chrXIV 680099 . G A 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3274,336,0 chrXIV 680172 . C T 3917.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.29;SB=-2.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3917,400,0 chrXIV 680328 . A G 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;DP=157;Dels=0.00;FS=2.058;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.452;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,84:157:99:1696,0,1514 chrXIV 680383 . G A 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3049,306,0 chrXIV 680403 . C T 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.313e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3159,321,0 chrXIV 680406 . T C 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3004,321,0 chrXIV 680467 . T C 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2625,282,0 chrXIV 680684 . C T 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3419,337,0 chrXIV 680868 . A G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;DP=143;Dels=0.00;FS=4.166;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=9.76;ReadPosRankSum=1.169;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1425,0,1414 chrXIV 681117 . G A 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3666,375,0 chrXIV 681312 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;DP=158;Dels=0.00;FS=3.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,73:158:99:1498,0,1829 chrXIV 681639 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.640;DP=130;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1235,0,1479 chrXIV 681798 . C T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.509;DP=141;Dels=0.00;FS=3.013;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1342,0,1551 chrXIV 682218 . C T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.505;DP=127;Dels=0.00;FS=7.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.002;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1311,0,1351 chrXIV 682434 . A G 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3493,360,0 chrXIV 682580 . A T 4167.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.884e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4167,418,0 chrXIV 682623 . A G 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.668;DP=142;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.221;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1619,0,1350 chrXIV 682657 . G C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.195;DP=96;Dels=0.00;FS=1.649;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.695;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1107,0,914 chrXIV 682893 . C T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;DP=121;Dels=0.00;FS=2.342;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1479,0,1127 chrXIV 682898 . G A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.047;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:125:99:1405,0,1242 chrXIV 683057 . A G 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.013;DP=96;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:981,0,879 chrXIV 683189 . G A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.786;DP=123;Dels=0.00;FS=3.303;HaplotypeScore=2.9444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1114,0,1504 chrXIV 683193 . G A 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1557;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:126:99:3339,351,0 chrXIV 683256 . A C 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.637;DP=134;Dels=0.00;FS=6.493;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.192;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1450,0,1291 chrXIV 683297 . A G 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.647;DP=163;Dels=0.00;FS=1.233;HaplotypeScore=6.3697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=-0.891;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.310;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,87:163:99:1813,0,1591 chrXIV 683478 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;DP=132;Dels=0.00;FS=4.176;HaplotypeScore=2.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.980;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1218,0,1611 chrXIV 683709 . C T 2379 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7674;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=26.73;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2412,249,0 chrXIV 683786 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.267;DP=105;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=1.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.139;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.280;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:105:99:1073,0,1107 chrXIV 684087 . A G 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3226,330,0 chrXIV 684402 . T C 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.114;DP=147;Dels=0.00;FS=5.058;HaplotypeScore=3.6756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:147:99:1600,0,1545 chrXIV 684656 . A G 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=149;Dels=0.00;FS=17.075;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1557,0,1615 chrXIV 684669 . A G 3681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3681,405,0 chrXIV 684687 . T C 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;DP=152;Dels=0.00;FS=7.159;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.988;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:152:99:1592,0,1543 chrXIV 684716 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.472;DP=133;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=3.3816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1374,0,1217 chrXIV 684891 . C T 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=1;QD=25.70;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3469,366,0 chrXIV 684966 . A G 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3074,321,0 chrXIV 685065 . A T 2709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2742,285,0 chrXIV 685071 . A C 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.96;MQ0=0;QD=23.71;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2831,300,0 chrXIV 685080 . C G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;DP=122;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.739;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1262,0,1147 chrXIV 685734 . T C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.948;DP=138;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.015;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1255,0,1600 chrXIV 685773 . C T 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3307,330,0 chrXIV 685929 . A T 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.523;DP=141;Dels=0.00;FS=3.000;HaplotypeScore=3.9652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.808;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1653,0,1323 chrXIV 686126 . T C 1896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.139;DP=163;Dels=0.00;FS=2.778;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.325;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,93:163:99:1926,0,1371 chrXIV 686348 . A C 4057.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.782e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4057,417,0 chrXIV 686681 . T C 4482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.880e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4482,471,0 chrXIV 686786 . T C 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3574,390,0 chrXIV 686798 . T C 4384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4384,465,0 chrXIV 687197 . G T 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.114;DP=134;Dels=0.00;FS=5.372;HaplotypeScore=3.8705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=2.863;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.496;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:882,0,1406 chrXIV 687406 . G C 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3841,402,0 chrXIV 687513 . T C 2523 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.09;MQ0=0;QD=20.68;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2556,276,0 chrXIV 687661 . G A 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.512;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.622;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3169,308,0 chrXIV 687788 . G A 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.16;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4051,400,0 chrXIV 687853 . C T 4101.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.63;SB=-2.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4101,409,0 chrXIV 688148 . G T 737.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.042;DP=101;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.564;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:767,0,1239 chrXIV 688149 . A T 731.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;DP=104;Dels=0.00;FS=2.624;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.978;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:761,0,1437 chrXIV 688150 . A C 692.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.649;DP=105;Dels=0.00;FS=3.686;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.048;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,41:105:99:722,0,1399 chrXIV 688300 . C T 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.007;DP=151;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.675;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,65:151:99:1137,0,1764 chrXIV 688306 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.782;DP=158;Dels=0.00;FS=1.255;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.455;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,68:158:99:1341,0,1832 chrXIV 688466 . G C 4088.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4088,432,0 chrXIV 688572 . C G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3393,357,0 chrXIV 688807 . C T 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2627,270,0 chrXIV 688900 . T C 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=118;Dels=0.00;FS=3.729;HaplotypeScore=2.7933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.147;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2976,321,0 chrXIV 688924 . C T 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.443;DP=132;Dels=0.00;FS=6.586;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.420;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1604,0,1075 chrXIV 689558 . C A 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.025;DP=147;Dels=0.00;FS=5.239;HaplotypeScore=7.3289;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=24.53;ReadPosRankSum=1.167;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3606,352,0 chrXIV 689582 . C G 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3230,336,0 chrXIV 689944 . C G 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.95;MQ0=0;QD=25.69;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3013,318,0 chrXIV 689964 . A C 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.144;DP=145;Dels=0.00;FS=2.912;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=23.68;ReadPosRankSum=1.653;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,143:145:99:3433,351,0 chrXIV 689969 . T C 3635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.147;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9285;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.683;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3635,369,0 chrXIV 690162 . T G 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=23.96;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3004,318,0 chrXIV 690208 . T A 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2943,294,0 chrXIV 690239 . A G 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2955,312,0 chrXIV 690300 . A C 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2999,309,0 chrXIV 690310 . T C 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2944,303,0 chrXIV 690687 . T C 2415 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.16;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2448,258,0 chrXIV 690707 . A T 2120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.85;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2153,216,0 chrXIV 691294 . A G 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;DP=110;Dels=0.00;FS=1.593;HaplotypeScore=5.9517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=0.40;ReadPosRankSum=-3.784;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,6:110:74:74,0,91 chrXIV 691295 . T G 162.77 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=1.47;ReadPosRankSum=2.028;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,109:111:0:191,0,0 chrXIV 691402 . T C 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.06;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3665,369,0 chrXIV 691593 . G A 2525 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2349;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.51;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2558,264,0 chrXIV 691658 . A T 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3369,342,0 chrXIV 691738 . T C 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.20;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3477,360,0 chrXIV 691842 . G A 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3645,366,0 chrXIV 691892 . C G 2430 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2463,258,0 chrXIV 692461 . C T 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2909,297,0 chrXIV 692612 . C T 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2789,294,0 chrXIV 692864 . A G 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3143,318,0 chrXIV 693454 . T C 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3393,351,0 chrXIV 694273 . T C 1667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=22.23;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1700,183,0 chrXIV 694765 . A G 3551.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3551,372,0 chrXIV 694868 . C T 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3487,360,0 chrXIV 695952 . G A 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.20;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3485,351,0 chrXIV 696647 . C T 3694.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3694,373,0 chrXIV 696989 . C T 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3705,381,0 chrXIV 697058 . G A 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2671,279,0 chrXIV 697554 . A T 2781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=18.18;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:2814,282,0 chrXIV 697678 . A G 3923.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.64;SB=-2.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3923,396,0 chrXIV 698006 . C T 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3113,324,0 chrXIV 698421 . C T 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3215,321,0 chrXIV 698660 . G A 3857.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3857,385,0 chrXIV 698753 . A G 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3402,360,0 chrXIV 698781 . C T 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9341;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3397,357,0 chrXIV 699152 . C T 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;DP=142;Dels=0.00;FS=3.134;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.171;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3578,333,0 chrXIV 699663 . A T 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2867,300,0 chrXIV 699795 . T C 4402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4402,448,0 chrXIV 700166 . C T 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3035,318,0 chrXIV 700262 . A G 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3487,357,0 chrXIV 700319 . C G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3358,357,0 chrXIV 700395 . G A 3991.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3991,414,0 chrXIV 700405 . T A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3723,384,0 chrXIV 700427 . A G 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3499,369,0 chrXIV 700775 . C T 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3038,306,0 chrXIV 700796 . A G 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=22.52;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3310,339,0 chrXIV 701082 . C G 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3094,318,0 chrXIV 701168 . A G 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=130;Dels=0.00;FS=3.590;HaplotypeScore=7.9264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3150,333,0 chrXIV 701450 . T C 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.62;MQ0=0;QD=23.13;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3654,393,0 chrXIV 701567 . T A 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.21;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3475,366,0 chrXIV 701618 . G T 5205.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.15;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5205,532,0 chrXIV 701689 . T C 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4051,435,0 chrXIV 702035 . G A 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3807,396,0 chrXIV 702206 . C T 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=1;QD=26.40;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3986,400,0 chrXIV 702404 . A C 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2961,306,0 chrXIV 702719 . T C 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3576,390,0 chrXIV 702909 . A G 3654.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3654,375,0 chrXIV 702947 . A T 3819.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=26.16;SB=-2.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3819,390,0 chrXIV 702991 . A G 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3664,393,0 chrXIV 703043 . C T 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.92;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3051,315,0 chrXIV 703080 . G A 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3467,349,0 chrXIV 703250 . C T 3905.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.10;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3905,403,0 chrXIV 703315 . A G 2917 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2950,324,0 chrXIV 703322 . C T 2549 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.81;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2582,276,0 chrXIV 703323 . C A 2561 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.81;MQ0=0;QD=23.93;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2594,276,0 chrXIV 703330 . C T 2826 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.84;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2859,312,0 chrXIV 703355 . C G 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.78;MQ0=0;QD=22.65;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2864,312,0 chrXIV 703361 . G A 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.45;MQ0=0;QD=22.94;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2947,309,0 chrXIV 703454 . T C 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3226,342,0 chrXIV 703469 . G A 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3223,327,0 chrXIV 703536 . G A 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.21;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3108,321,0 chrXIV 703603 . C T 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3482,357,0 chrXIV 703674 . A G 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3611,372,0 chrXIV 703883 . G A 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3798,399,0 chrXIV 703896 . G A 4139.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7249;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.860e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4139,426,0 chrXIV 703938 . T C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.99;MQ0=0;QD=23.33;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3732,393,0 chrXIV 703949 . G C 4039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.75;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4039,411,0 chrXIV 704114 . C G 2643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.29;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2676,273,0 chrXIV 704155 . G A 1799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.98;MQ0=0;QD=26.46;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1832,189,0 chrXIV 704185 . G T 114.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.85;SB=-6.030e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:147,15,0 chrXIV 704271 . A C 101.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.396;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.8199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.20;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=4.21;ReadPosRankSum=-2.556;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:75:131,0,75 chrXIV 704274 . T A 100.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.7622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.233;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:26:99:130,0,125 chrXIV 704275 . C T 165.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.7622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.26;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-6.530e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:26:53:195,0,53 chrXIV 704280 . C T 373 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=33;Dels=0.00;FS=4.811;HaplotypeScore=23.7527;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.847;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.159;SB=-6.700e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:45:406,45,0 chrXIV 704283 . T A,G 214.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.8842;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=29.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=5.22;ReadPosRankSum=2.122;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:8,16,17:41:84:274,84,109,147,0,178 chrXIV 704301 . C T 532.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;DP=74;Dels=0.00;FS=1.064;HaplotypeScore=59.1392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=7.19;ReadPosRankSum=5.879;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,46:74:99:562,0,536 chrXIV 704304 . T G 20.05 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.731;DP=74;Dels=0.00;FS=21.095;HaplotypeScore=80.9373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.13;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=0.27;ReadPosRankSum=4.729;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:50:50,0,1023 chrXIV 704306 . C A 276.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.272;DP=80;Dels=0.00;FS=24.089;HaplotypeScore=91.8858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=3.45;ReadPosRankSum=2.628;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,28:80:99:306,0,906 chrXIV 704312 . C T 473.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.552;DP=82;Dels=0.00;FS=8.039;HaplotypeScore=96.8140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.12;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=5.77;ReadPosRankSum=-5.386;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,26:82:99:503,0,757 chrXIV 704325 . G A 825.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.105;DP=114;Dels=0.00;FS=7.669;HaplotypeScore=55.4695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.33;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.244;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:114:99:855,0,568 chrXIV 704331 . T C 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.649;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=119.0785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.65;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=0.38;ReadPosRankSum=-3.954;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,21:130:79:79,0,1797 chrXIV 704334 . C A 2156 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=126.0283;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.35;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,129:131:99:2189,216,0 chrXIV 704338 . T C 1720 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;DP=134;Dels=0.00;FS=4.017;HaplotypeScore=131.9321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.84;ReadPosRankSum=4.157;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,106:134:82:1753,82,0 chrXIV 704346 . G T 1026.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.197;DP=168;Dels=0.00;FS=48.618;HaplotypeScore=182.4759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=6.11;ReadPosRankSum=5.948;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,59:168:99:1056,0,1376 chrXIV 704348 . C A 928.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.904;DP=178;Dels=0.00;FS=36.312;HaplotypeScore=174.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.157;QD=5.21;ReadPosRankSum=6.865;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,53:178:99:958,0,1760 chrXIV 704355 . C A 302.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.186;DP=184;Dels=0.00;FS=4.171;HaplotypeScore=182.2791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=1.64;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,50:184:99:332,0,2441 chrXIV 704358 . A T 220.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;DP=206;Dels=0.00;FS=3.071;HaplotypeScore=187.9864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.56;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=1.07;ReadPosRankSum=2.404;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,47:205:99:250,0,2594 chrXIV 704359 . T C 64.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.266;DP=208;Dels=0.00;FS=10.329;HaplotypeScore=67.1678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=0.31;ReadPosRankSum=0.131;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,28:207:94:94,0,2699 chrXIV 704373 . T C 326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.944;DP=227;Dels=0.00;FS=14.074;HaplotypeScore=22.2290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,44:227:99:356,0,2762 chrXIV 704384 . G T 568.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.414;DP=229;Dels=0.00;FS=66.760;HaplotypeScore=39.8962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.02;MQ0=0;MQRankSum=-3.277;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.020;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,41:229:99:598,0,2913 chrXIV 704400 . T C 88.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.751;DP=222;Dels=0.00;FS=60.545;HaplotypeScore=74.7510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.00;MQ0=0;MQRankSum=-4.325;QD=0.40;ReadPosRankSum=-2.817;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,25:221:99:118,0,3474 chrXIV 704401 . T C 208.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.272;DP=226;Dels=0.00;FS=49.196;HaplotypeScore=73.7594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.39;MQ0=0;MQRankSum=-5.328;QD=0.92;ReadPosRankSum=-2.948;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,39:226:99:238,0,3525 chrXIV 704441 . C T 3349.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.233;DP=209;Dels=0.02;FS=1.354;HaplotypeScore=22.5872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.49;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=16.02;ReadPosRankSum=6.907;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,162:205:99:3349,0,449 chrXIV 704444 . A C,T 4230.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=206;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.3768;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=47.48;MQ0=0;QD=20.53;SB=-2.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,46,160:206:99:4230,3413,3313,797,0,415 chrXIV 704451 . T G 4325.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;DP=218;Dels=0.00;FS=36.588;HaplotypeScore=43.2386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.57;MQ0=0;MQRankSum=3.574;QD=19.84;ReadPosRankSum=6.336;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,196:218:99:4325,244,0 chrXIV 704490 . C T 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;DP=189;Dels=0.00;FS=25.994;HaplotypeScore=47.5286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=1;MQRankSum=-4.025;QD=0.15;ReadPosRankSum=0.795;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,35:189:58:58,0,3111 chrXIV 704501 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.815;DP=154;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=44.4482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.43;MQ0=1;MQRankSum=2.511;QD=5.95;ReadPosRankSum=2.139;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,55:154:99:946,0,1696 chrXIV 704544 . T C 1128 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9425;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.39;MQ0=0;QD=16.59;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:68:99:1161,129,0 chrXIV 704547 . T A 1113 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;DP=50;Dels=0.00;FS=5.763;HaplotypeScore=3.9426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.02;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=22.26;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:50:99:1146,103,0 chrXIV 704548 . G T 1089 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.88;MQ0=0;QD=23.17;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:47:99:1122,120,0 chrXIV 704553 . C T 885 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;DP=42;Dels=0.02;FS=5.336;HaplotypeScore=3.9439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=21.07;ReadPosRankSum=1.141;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:918,99,0 chrXIV 704556 . C G 816 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.222;DP=40;Dels=0.00;FS=4.449;HaplotypeScore=4.9372;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=20.40;ReadPosRankSum=-1.288;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:40:96:849,96,0 chrXIV 704559 . T A 859 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.77;MQ0=0;QD=20.95;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:96:892,96,0 chrXIV 704562 . C T 716 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.222;DP=39;Dels=0.00;FS=3.869;HaplotypeScore=12.8953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.75;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=18.36;ReadPosRankSum=-1.377;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:59:749,59,0 chrXIV 704565 . T A 728 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.9271;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.75;MQ0=0;QD=19.16;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:38:81:761,81,0 chrXIV 704569 . T C 651 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;DP=37;Dels=0.00;FS=13.973;HaplotypeScore=13.9204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.01;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.859;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,33:37:48:684,48,0 chrXIV 704572 . T A 663 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.024;DP=40;Dels=0.00;FS=7.586;HaplotypeScore=15.9084;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.389;QD=16.57;ReadPosRankSum=2.079;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:78:696,78,0 chrXIV 704573 . A G,T 529.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;DP=41;Dels=0.00;FS=10.694;HaplotypeScore=10.9386;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=30.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.391;QD=12.90;ReadPosRankSum=2.028;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,8,31:41:58:589,471,456,118,0,58 chrXIV 704577 . A G 728 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;DP=45;Dels=0.00;FS=3.882;HaplotypeScore=16.8831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.43;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:45:87:761,87,0 chrXIV 704583 . T C 754.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;DP=53;Dels=0.00;FS=37.342;HaplotypeScore=14.8630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.02;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=14.23;ReadPosRankSum=2.025;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,44:53:40:784,0,40 chrXIV 704694 . A G 4353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.33;MQ0=1;QD=24.46;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4353,459,0 chrXIV 704766 . A C 4347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.94;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4347,444,0 chrXIV 704786 . T C 4115.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.35;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4115,432,0 chrXIV 704844 . C T 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.75;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3665,378,0 chrXIV 705005 . C A 4584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4584,463,0 chrXIV 705045 . A G 3856.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.999e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3856,402,0 chrXIV 705111 . G A 4047.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4047,429,0 chrXIV 705188 . G A 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.64;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3503,375,0 chrXIV 705191 . C T 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.06;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3528,375,0 chrXIV 705204 . G A 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.37;MQ0=0;QD=22.86;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3233,345,0 chrXIV 705208 . A T 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.07;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3026,330,0 chrXIV 705221 . G A 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.82;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2887,312,0 chrXIV 705227 . T A 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.68;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2798,297,0 chrXIV 705401 . T C 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.39;MQ0=0;QD=24.02;SB=-2.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:3988,405,0 chrXIV 705451 . C T 3441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.14;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3441,354,0 chrXIV 705452 . T C 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.10;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3398,351,0 chrXIV 705531 . A G 4299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.95;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4299,450,0 chrXIV 705551 . C T 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3964,405,0 chrXIV 705568 . G A 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3272,348,0 chrXIV 705570 . C A 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3348,351,0 chrXIV 705599 . T C 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2840;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.77;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3299,360,0 chrXIV 705627 . G A 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=16.7540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.07;MQ0=0;QD=20.81;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3238,339,0 chrXIV 705631 . A G 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.72;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=21.36;ReadPosRankSum=1.148;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:160:99:3418,350,0 chrXIV 705671 . T C 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=23.30;SB=-2.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:3984,411,0 chrXIV 705870 . C T 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3540,354,0 chrXIV 705933 . C A 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3530,358,0 chrXIV 706575 . A T 4129.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4129,421,0 chrXIV 706720 . T C 4328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.76;SB=-2.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4328,438,0 chrXIV 706775 . A G 3920.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3920,411,0 chrXIV 707000 . G A 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3383,348,0 chrXIV 707011 . G C 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3254,339,0 chrXIV 707029 . T C 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.33;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3190,333,0 chrXIV 707187 . G A 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3700,375,0 chrXIV 707332 . T C 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=22.76;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3664,384,0 chrXIV 707352 . G A 4069.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.65;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4069,403,0 chrXIV 707593 . G A 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2767,288,0 chrXIV 707734 . G A 4214.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.05;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4214,439,0 chrXIV 707760 . T C 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.42;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2870,309,0 chrXIV 707765 . A G 2707 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.133;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2740,284,0 chrXIV 707772 . T A 3019 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.76;MQ0=0;QD=22.36;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3052,327,0 chrXIV 707773 . A C 3012 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.89;MQ0=0;QD=21.99;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3045,333,0 chrXIV 708561 . C G 3756.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3756,399,0 chrXIV 708645 . G A 3883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3883,408,0 chrXIV 708870 . C T 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3275,328,0 chrXIV 709011 . A G 4255.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.309;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=25.33;ReadPosRankSum=1.670;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:4255,447,0 chrXIV 709059 . T C 4441.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.95;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4441,439,0 chrXIV 709119 . G T 4143.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.22;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4143,427,0 chrXIV 709245 . G A 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.937e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4122,418,0 chrXIV 709248 . A G 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3910,417,0 chrXIV 709317 . C T 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.74;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3884,409,0 chrXIV 709540 . C T 4885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4885,499,0 chrXIV 709675 . G A 3270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3270,327,0 chrXIV 709827 . A G 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2944,321,0 chrXIV 709905 . C G 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=22.07;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2792,303,0 chrXIV 709906 . T C 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=22.33;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2869,303,0 chrXIV 709959 . T C 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2971,303,0 chrXIV 710457 . G A 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3665,375,0 chrXIV 711247 . A T 64.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.478;DP=139;Dels=0.02;FS=36.725;HaplotypeScore=127.7754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=0.46;ReadPosRankSum=1.870;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,37:136:94:94,0,698 chrXIV 712487 . G C 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3639,390,0 chrXIV 712646 . T C 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3801,405,0 chrXIV 712839 . G A 4427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4427,439,0 chrXIV 712899 . G T 4497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4497,463,0 chrXIV 713149 . G A 2222 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.69;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2255,219,0 chrXIV 713217 . C T 2294 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2327,252,0 chrXIV 713326 . A C 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.87;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3216,342,0 chrXIV 713366 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3269,333,0 chrXIV 713401 . A G 2409 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2442,255,0 chrXIV 713407 . T C 2292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2325,237,0 chrXIV 713677 . C T 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.254;DP=116;Dels=0.00;FS=3.569;HaplotypeScore=3.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.702;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:3075,294,0 chrXIV 713685 . T G 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.548;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=25.70;ReadPosRankSum=1.456;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2937,318,0 chrXIV 713775 . C T 3709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7359;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3709,381,0 chrXIV 713826 . T C 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3113,324,0 chrXIV 713844 . A C 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2764,279,0 chrXIV 713866 . G A 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2567,267,0 chrXIV 713918 . C T 2357 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2390,234,0 chrXIV 714025 . C A 2688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2721,279,0 chrXIV 714672 . C G 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3334,354,0 chrXIV 715189 . T C 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3139,321,0 chrXIV 715213 . C T 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5910;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3728,367,0 chrXIV 715430 . T C 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2916,300,0 chrXIV 715661 . G T 2292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.05;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2325,237,0 chrXIV 715791 . C T 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3309,330,0 chrXIV 716055 . G A 2935 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.177e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2968,312,0 chrXIV 716316 . C T 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=22.83;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2909,291,0 chrXIV 716325 . G A 2737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2770,276,0 chrXIV 716564 . G A 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3447,363,0 chrXIV 716990 . C T 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.57;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2557,255,0 chrXIV 717134 . A G 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3330,354,0 chrXIV 717209 . G A 2602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2635,276,0 chrXIV 717218 . C T 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2738,285,0 chrXIV 717266 . T C 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2724,288,0 chrXIV 717379 . T C 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.19;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2793,300,0 chrXIV 717380 . T C 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.16;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2812,300,0 chrXIV 717440 . G A 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3102,318,0 chrXIV 717465 . G C 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=22.06;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2945,315,0 chrXIV 717528 . T A 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4033,394,0 chrXIV 717731 . C A 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.630;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.350;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3528,351,0 chrXIV 717904 . A G 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3609,366,0 chrXIV 718496 . A G 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=104;Dels=0.00;FS=4.372;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=25.78;ReadPosRankSum=1.199;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2714,294,0 chrXIV 718667 . C T 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.92;MQ0=0;QD=26.91;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2859,303,0 chrXIV 718741 . G A 4404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.75;SB=-2.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4404,453,0 chrXIV 719201 . A C 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3586,369,0 chrXIV 719586 . G A 3970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3970,400,0 chrXIV 719595 . G A 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3748,370,0 chrXIV 719718 . A G 3862.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.95;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.882e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3862,411,0 chrXIV 719787 . C T 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.21;MQ0=0;QD=25.81;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2950,321,0 chrXIV 719790 . C T 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.12;MQ0=0;QD=26.05;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2898,315,0 chrXIV 719811 . G A 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=127;Dels=0.00;FS=6.124;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=24.35;ReadPosRankSum=0.477;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3126,339,0 chrXIV 719815 . A G 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.58;MQ0=0;QD=24.13;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2977,321,0 chrXIV 719835 . G A 2340 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.23;MQ0=0;QD=22.08;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2373,249,0 chrXIV 719841 . A G 2360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.16;MQ0=0;QD=21.07;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:112:99:2393,261,0 chrXIV 719874 . G A 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.32;MQ0=0;QD=23.08;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2733,282,0 chrXIV 719946 . G A 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.35;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3854,402,0 chrXIV 719952 . G A 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.415;DP=141;Dels=0.00;FS=2.807;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=26.23;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,139:141:99:3699,365,0 chrXIV 719985 . G A 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.93;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3769,384,0 chrXIV 720135 . T C 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3327;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.10;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3701,393,0 chrXIV 720381 . T C 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.772;DP=126;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=12.7709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.92;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=12.30;ReadPosRankSum=5.495;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1580,0,260 chrXIV 720393 . T C 558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=119;Dels=0.00;FS=3.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.77;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=4.69;ReadPosRankSum=4.200;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:588,0,1183 chrXIV 720527 . T G 2958 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6143;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.84;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2991,315,0 chrXIV 720829 . A G 3768.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3768,390,0 chrXIV 720905 . C T 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3950,403,0 chrXIV 721117 . C T 1926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=22.14;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1959,198,0 chrXIV 721369 . T C 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2733,282,0 chrXIV 721603 . A G 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3206,342,0 chrXIV 721786 . G A 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=94.7381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3035,309,0 chrXIV 721832 . T C 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.33;MQ0=0;QD=21.99;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2694,291,0 chrXIV 721842 . T G 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2739,291,0 chrXIV 721994 . A G 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2680,285,0 chrXIV 722023 . G A 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3318,339,0 chrXIV 722025 . T C 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3152,333,0 chrXIV 722083 . G T 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3849,376,0 chrXIV 722239 . A T 40.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;DP=91;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=0.44;ReadPosRankSum=2.396;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,89:91:27:70,0,27 chrXIV 722345 . A G 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=21.58;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:2990,315,0 chrXIV 722690 . A G 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3682,393,0 chrXIV 722746 . C T 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=130;Dels=0.00;FS=3.431;HaplotypeScore=7.9086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=26.01;ReadPosRankSum=1.492;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3381,332,0 chrXIV 723495 . C T 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2818,273,0 chrXIV 723580 . G A 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.66;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2493,249,0 chrXIV 723584 . G A 2504 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.63;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2537,258,0 chrXIV 723593 . C T 2404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.40;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2437,249,0 chrXIV 723614 . G A 3045 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.17;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3078,324,0 chrXIV 723962 . C T 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;QD=25.97;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2786,297,0 chrXIV 724160 . G A 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3115,321,0 chrXIV 724182 . A G 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3435,366,0 chrXIV 724277 . T C 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3347,348,0 chrXIV 724322 . T C 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2935,309,0 chrXIV 724364 . A G 2607 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2640,291,0 chrXIV 724425 . A G 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3000,318,0 chrXIV 724486 . T C 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=26.09;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2929,297,0 chrXIV 724531 . T G 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2930,309,0 chrXIV 724600 . T C 2380 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2413,252,0 chrXIV 724671 . T C 2385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=26.21;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2418,258,0 chrXIV 724673 . A T 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=26.42;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2490,255,0 chrXIV 724686 . G T 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=25.90;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2597,267,0 chrXIV 724724 . A G 2141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.21;MQ0=0;QD=22.30;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2174,219,0 chrXIV 725092 . G C 1872 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.12;MQ0=0;QD=24.00;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1905,213,0 chrXIV 725093 . C G 1865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.12;MQ0=0;QD=23.91;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1898,216,0 chrXIV 725113 . T A 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.31;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2733,285,0 chrXIV 725142 . T C 2381 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2414,258,0 chrXIV 725355 . C T 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.75;MQ0=0;QD=0.21;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:6:56,6,0 chrXIV 725367 . A G 2396 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.07;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2429,264,0 chrXIV 725420 . T A 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3012,306,0 chrXIV 725463 . T C 4318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=24.96;SB=-2.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4318,432,0 chrXIV 725512 . T C 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1278;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3209,330,0 chrXIV 725820 . T C 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.80;MQ0=0;QD=25.48;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3040,318,0 chrXIV 725867 . A G 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2650,279,0 chrXIV 725883 . A C 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.17;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2519,261,0 chrXIV 725988 . C T 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.22;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2913,288,0 chrXIV 726053 . C T 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.97;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2709,282,0 chrXIV 726058 . A C 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.97;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2806,300,0 chrXIV 726235 . G A 1090 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.205;DP=46;Dels=0.00;FS=8.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.74;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=23.70;ReadPosRankSum=1.506;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1123,117,0 chrXIV 726237 . T C 981 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;DP=46;Dels=0.00;FS=8.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.74;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=21.33;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1014,117,0 chrXIV 726242 . C T 1034 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;DP=44;Dels=0.00;FS=9.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.83;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=23.50;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:99:1067,111,0 chrXIV 726935 . T G 13.94 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.10;MQ0=5;QD=1.55;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:9:6:45,6,0 chrXIV 726939 . T A 21.79 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.93;MQ0=5;QD=1.82;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:12:6:53,6,0 chrXIV 726943 . A T 230 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.906;DP=45;Dels=0.00;FS=13.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.30;MQ0=4;MQRankSum=-1.906;QD=5.11;ReadPosRankSum=-2.149;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,39:45:33:263,33,0 chrXIV 727111 . G A 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.03;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3049,318,0 chrXIV 727112 . G A 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3056,315,0 chrXIV 727189 . G A 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3245,330,0 chrXIV 727231 . A C 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3366,354,0 chrXIV 727273 . G A 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3780,393,0 chrXIV 727466 . G A 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3221,327,0 chrXIV 727505 . T C 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2820,294,0 chrXIV 727584 . C T 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=24.77;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2832,288,0 chrXIV 727650 . A T 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=26.82;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3064,327,0 chrXIV 727684 . T C 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=25.39;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3029,324,0 chrXIV 727708 . G A 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.49;MQ0=0;QD=24.97;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2980,312,0 chrXIV 727716 . G A 1754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.84;MQ0=0;QD=22.20;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1787,189,0 chrXIV 727725 . T C 1660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.61;MQ0=0;QD=20.49;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1693,186,0 chrXIV 727758 . G A 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.22;MQ0=0;QD=23.36;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2276,237,0 chrXIV 727765 . T C 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.43;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2276,240,0 chrXIV 727778 . A G 2444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.23;MQ0=0;QD=25.46;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2477,258,0 chrXIV 727814 . G A 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.91;MQ0=0;QD=27.25;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3140,315,0 chrXIV 727862 . C T 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3077,321,0 chrXIV 728049 . C A 2368 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.397;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.695;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:2401,230,0 chrXIV 728246 . G A 2221 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.44;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2254,228,0 chrXIV 728276 . T A 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2551,246,0 chrXIV 729511 . C T 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=1;QD=25.48;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3244,324,0 chrXIV 730240 . T C 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2876,297,0 chrXIV 730427 . G A 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2566,261,0 chrXIV 730652 . G T 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.65;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2618,261,0 chrXIV 730789 . A G 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2972,312,0 chrXIV 730853 . T C 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3211,348,0 chrXIV 730973 . A G 2147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2180,231,0 chrXIV 731177 . A T 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2624,261,0 chrXIV 731231 . A G 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2885,303,0 chrXIV 731809 . T C 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.99;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3057,324,0 chrXIV 732476 . T C 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3227,342,0 chrXIV 732854 . G A 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.863e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3594,372,0 chrXIV 732856 . A C 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3478,372,0 chrXIV 733142 . C T 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3248,333,0 chrXIV 733231 . G A 4468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.10;SB=-2.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4468,436,0 chrXIV 733303 . T A 3669.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.645;DP=137;Dels=0.00;FS=3.305;HaplotypeScore=5.3667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=26.78;ReadPosRankSum=-0.797;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3669,353,0 chrXIV 733411 . T G 4329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.88;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4329,462,0 chrXIV 733695 . A G 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3250,333,0 chrXIV 734073 . C T 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.325;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=23.96;ReadPosRankSum=2.169;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,138:140:99:3355,299,0 chrXIV 734279 . G A 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2668,282,0 chrXIV 734296 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3048,312,0 chrXIV 734519 . C T 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8520;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:140:99:3639,364,0 chrXIV 734746 . G A 3544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3544,355,0 chrXIV 734887 . C T 4182.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.46;SB=-2.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4182,409,0 chrXIV 734913 . A G 4098.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4098,414,0 chrXIV 734975 . A G 3896.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3896,405,0 chrXIV 735047 . T C 3899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3899,408,0 chrXIV 735112 . A G 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4839;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=22.38;SB=-1.682e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3290,348,0 chrXIV 735174 . A G 3755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3755,390,0 chrXIV 735241 . C T 3626.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3626,381,0 chrXIV 735440 . A G 4084.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=1;QD=26.18;SB=-2.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4084,412,0 chrXIV 735817 . A G 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3663,378,0 chrXIV 735834 . A T 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3138,315,0 chrXIV 735856 . G A 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3516,354,0 chrXIV 735889 . C T 3938.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.923e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3938,385,0 chrXIV 735893 . G A 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.975e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3798,381,0 chrXIV 736014 . C T 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.33;MQ0=0;QD=25.64;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3238,336,0 chrXIV 736035 . C A 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3494,354,0 chrXIV 736065 . A G 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3091,321,0 chrXIV 736111 . C T 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.15;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3206,318,0 chrXIV 736153 . A C 2197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.88;MQ0=0;QD=17.30;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2230,240,0 chrXIV 736251 . T C 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.43;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3263,354,0 chrXIV 736287 . T C 2974 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.19;MQ0=0;QD=22.70;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3007,327,0 chrXIV 736290 . G C 2805 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.29;MQ0=0;QD=21.58;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2838,324,0 chrXIV 736291 . C G 2940 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.57;MQ0=0;QD=22.27;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:2973,330,0 chrXIV 736308 . T C 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;DP=156;Dels=0.00;FS=4.372;HaplotypeScore=4.8621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3627,371,0 chrXIV 736327 . T A 3450.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3450,360,0 chrXIV 736429 . C T 4209.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4209,423,0 chrXIV 736458 . G A 4264.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.844e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4264,435,0 chrXIV 736460 . C T 3963.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.85;MQ0=0;QD=23.31;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:3963,411,0 chrXIV 736686 . C T 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3453,351,0 chrXIV 736739 . A G 3536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3536,360,0 chrXIV 736767 . T A 3899.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.34;SB=-2.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3899,382,0 chrXIV 736790 . T C 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3700,369,0 chrXIV 736802 . A T 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=23.45;SB=-2.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:3916,402,0 chrXIV 736859 . G A 4212.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4212,439,0 chrXIV 736950 . G C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3279,345,0 chrXIV 737054 . G T 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3468,354,0 chrXIV 737061 . A G 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=23.01;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2886,309,0 chrXIV 737126 . A C 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3322,348,0 chrXIV 737156 . C T 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3227,324,0 chrXIV 737202 . A G 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.60;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2837,306,0 chrXIV 737420 . A T 2598 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.98;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2631,276,0 chrXIV 737565 . A G 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2877,303,0 chrXIV 737636 . C T 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3655,366,0 chrXIV 737846 . C T 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3253,339,0 chrXIV 737861 . T C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3176,354,0 chrXIV 737900 . A G 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3244,345,0 chrXIV 737930 . T C 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3061,339,0 chrXIV 738000 . C A 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2815,291,0 chrXIV 738020 . A G 2549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2582,279,0 chrXIV 738023 . A C 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2557,276,0 chrXIV 738132 . A G 4020.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4020,423,0 chrXIV 738251 . A T 4364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4364,436,0 chrXIV 738340 . G A 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3807,402,0 chrXIV 738443 . C T 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.21;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3581,381,0 chrXIV 738533 . C T 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.06;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3579,375,0 chrXIV 738536 . G A 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.54;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3272,342,0 chrXIV 738545 . G A 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3203,333,0 chrXIV 738554 . T G 2222 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.26;MQ0=0;QD=22.00;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2255,246,0 chrXIV 738591 . A G 1957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.83;MQ0=0;QD=21.27;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:1990,219,0 chrXIV 738603 . T C 1945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.05;MQ0=0;QD=20.69;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:1978,216,0 chrXIV 738607 . A C 2046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.99;MQ0=0;QD=21.09;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2079,225,0 chrXIV 738645 . C G 2076 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.56;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2109,228,0 chrXIV 738646 . G C 1963 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.56;MQ0=0;QD=22.56;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1996,228,0 chrXIV 738651 . C A 2256 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.17;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2289,246,0 chrXIV 738674 . T A 2291 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.94;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2324,246,0 chrXIV 738697 . C A 2335 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.94;MQ0=0;QD=24.32;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2368,255,0 chrXIV 738706 . A G 2104 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.32;MQ0=0;QD=23.91;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2137,240,0 chrXIV 738707 . C A 2281 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.32;MQ0=0;QD=25.92;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2314,240,0 chrXIV 738758 . T A 2082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.87;MQ0=0;QD=22.88;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2115,225,0 chrXIV 738768 . C A 2074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.77;MQ0=0;QD=25.29;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:82:99:2107,228,0 chrXIV 738775 . C T 2017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.85;MQ0=0;QD=25.21;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2050,216,0 chrXIV 738859 . G A 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.52;MQ0=0;QD=26.80;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2981,303,0 chrXIV 738881 . A T 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.25;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3442,352,0 chrXIV 738952 . A G 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.59;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2961,300,0 chrXIV 738960 . A G 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2983,306,0 chrXIV 739015 . T C 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.657;DP=138;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=4.3927;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=23.41;ReadPosRankSum=0.452;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:3264,317,0 chrXIV 739084 . A G 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3834,408,0 chrXIV 739126 . T C 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.909e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3733,399,0 chrXIV 739253 . A G 2697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2730,294,0 chrXIV 739568 . T C 2605 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2638,285,0 chrXIV 739896 . C T 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3011,303,0 chrXIV 740980 . G A 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.06;MQ0=0;QD=24.17;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2716,282,0 chrXIV 740985 . C T 2579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.28;ReadPosRankSum=0.917;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2612,267,0 chrXIV 741000 . T A 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.17;MQ0=0;QD=24.87;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3117,327,0 chrXIV 741004 . A G 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=24.83;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3037,321,0 chrXIV 741378 . G C 2361 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2394,246,0 chrXIV 741432 . A G 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2750,288,0 chrXIV 741663 . A G 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0290;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2911,312,0 chrXIV 742180 . G A 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3746,382,0 chrXIV 742206 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2922,312,0 chrXIV 742217 . G C 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3121,324,0 chrXIV 742235 . T A 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=25.51;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3546,366,0 chrXIV 742300 . T C 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3033,315,0 chrXIV 742451 . A G 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.69;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3316,354,0 chrXIV 742485 . T C 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3577,372,0 chrXIV 742517 . C G 4481.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4481,457,0 chrXIV 742540 . G A 4161.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.17;SB=-2.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4161,432,0 chrXIV 742753 . A G 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2757,309,0 chrXIV 742874 . T A 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=1;MQRankSum=1.684;QD=25.56;ReadPosRankSum=1.684;SB=-1.941e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3757,369,0 chrXIV 742978 . G C 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3990,408,0 chrXIV 743137 . T C 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.06;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3786,405,0 chrXIV 743177 . C T 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3300,336,0 chrXIV 743235 . T C 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3413,363,0 chrXIV 743262 . C A 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2881,294,0 chrXIV 743408 . A G 2389 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.11;MQ0=0;QD=24.63;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2422,270,0 chrXIV 743425 . A T 1769 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.26;MQ0=0;QD=20.81;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1802,195,0 chrXIV 743430 . A G 1605 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.07;MQ0=0;QD=18.45;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1638,186,0 chrXIV 743434 . T C 1595 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.03;MQ0=0;QD=18.99;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1628,183,0 chrXIV 743441 . T G 1434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.62;MQ0=0;QD=18.38;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1467,165,0 chrXIV 743474 . C T 2634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.25;MQ0=0;QD=22.51;SB=-1.399e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2667,282,0 chrXIV 743548 . T A 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3454,343,0 chrXIV 743679 . G C 2814 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.74;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2847,297,0 chrXIV 743709 . C T 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.69;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2519,255,0 chrXIV 743736 . C A 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.51;MQ0=0;QD=25.68;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2627,258,0 chrXIV 743766 . A C 2674 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.24;MQ0=0;QD=24.53;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2707,279,0 chrXIV 743791 . C T 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.26;MQ0=0;QD=25.98;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2605,273,0 chrXIV 743793 . G A 2557 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.26;MQ0=0;QD=25.83;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2590,273,0 chrXIV 743834 . T C 2124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.56;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2157,240,0 chrXIV 743855 . C T 1813 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.35;MQ0=0;QD=21.84;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1846,204,0 chrXIV 743856 . A G 1812 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.35;MQ0=0;QD=21.83;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1845,207,0 chrXIV 743863 . A G 1747 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=19.63;ReadPosRankSum=-1.538;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:1780,201,0 chrXIV 743877 . A G 2024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.99;MQ0=0;QD=21.31;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2057,231,0 chrXIV 743903 . G A 1902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.83;MQ0=0;QD=22.12;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1935,210,0 chrXIV 743905 . C A 1991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.48;MQ0=0;QD=22.62;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2024,216,0 chrXIV 743970 . C A 2167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.72;MQ0=0;QD=24.91;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2200,246,0 chrXIV 744001 . A C 2530 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.11;MQ0=0;QD=24.33;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:104:99:2563,285,0 chrXIV 744011 . T C 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.05;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2519,276,0 chrXIV 744028 . G C 2065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.29;MQ0=0;QD=23.20;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2098,237,0 chrXIV 744031 . T G 2032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.71;MQ0=0;QD=24.19;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2065,234,0 chrXIV 744101 . G A 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.29;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2634,276,0 chrXIV 744105 . G A 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.37;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2614,279,0 chrXIV 744115 . G A 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.15;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2723,282,0 chrXIV 744147 . A G 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.84;MQ0=0;QD=22.80;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2723,291,0 chrXIV 744183 . G A 2394 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.09;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2427,261,0 chrXIV 744202 . T A 2224 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2257,234,0 chrXIV 744238 . A G 2988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3021,306,0 chrXIV 744305 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.39;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=25.26;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3269,330,0 chrXIV 744345 . T C 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.52;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3332,363,0 chrXIV 744347 . T C 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3443,390,0 chrXIV 744471 . T C 2099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.163e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:2132,228,0 chrXIV 744540 . G A 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.530;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.068;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3141,301,0 chrXIV 744569 . G T 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3140,318,0 chrXIV 744823 . C T 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3063,315,0 chrXIV 744887 . T C 2463 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=20.70;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2496,264,0 chrXIV 744963 . T C 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3190,345,0 chrXIV 745002 . C T 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.38;MQ0=1;QD=24.73;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2902,291,0 chrXIV 745270 . A C 3833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.66;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3833,396,0 chrXIV 745289 . C T 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.54;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3653,367,0 chrXIV 745341 . C T 2334 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.42;MQ0=0;QD=22.44;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2367,249,0 chrXIV 745342 . A G 2266 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.58;MQ0=0;QD=21.58;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2299,249,0 chrXIV 745347 . G A 2336 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.21;MQ0=0;QD=23.13;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2369,246,0 chrXIV 745494 . A G 2283 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.94;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2316,240,0 chrXIV 745524 . A G 1737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.46;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1770,189,0 chrXIV 745595 . T C 1807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.09;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1840,195,0 chrXIV 745867 . A G 2163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2196,231,0 chrXIV 745944 . A C 2398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2431,258,0 chrXIV 746230 . T C 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.41;MQ0=0;QD=23.12;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2599,285,0 chrXIV 746238 . A G 2350 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.21;MQ0=0;QD=21.76;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2383,267,0 chrXIV 746245 . T G 2278 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.41;MQ0=0;QD=21.90;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2311,255,0 chrXIV 746254 . T G 2078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.43;MQ0=0;QD=21.20;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2111,237,0 chrXIV 746277 . G A 1862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=53.1493;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.15;MQ0=0;QD=21.91;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1895,204,0 chrXIV 746286 . T G 13.94 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.61;MQ0=0;QD=0.24;SB=-3.038e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:6:45,6,0 chrXIV 746338 . G T 1866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.23;MQ0=0;QD=24.55;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1899,201,0 chrXIV 746361 . C T 1975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.60;MQ0=0;QD=23.51;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2008,213,0 chrXIV 746386 . G A 1974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.51;MQ0=0;QD=24.07;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2007,216,0 chrXIV 746410 . T C 13.94 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=91.2483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.19;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=0.29;ReadPosRankSum=-2.399;SB=-2.876e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:46,2:48:6:45,6,0 chrXIV 746416 . G C 1109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.97;MQ0=0;QD=17.33;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1142,123,0 chrXIV 746422 . A G 1404 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.87;MQ0=0;QD=17.55;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1437,159,0 chrXIV 746431 . A G 1579 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.56;MQ0=0;QD=20.51;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1612,174,0 chrXIV 746539 . G A 2139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.21;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2172,234,0 chrXIV 746557 . A C 2229 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.37;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2262,240,0 chrXIV 746569 . C G 2457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.51;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2490,264,0 chrXIV 746594 . C T 2522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.52;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2555,270,0 chrXIV 746613 . C T 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.66;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2641,285,0 chrXIV 746653 . G A 2194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.28;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2227,237,0 chrXIV 746722 . A G 1789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.85;MQ0=0;QD=24.85;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1822,195,0 chrXIV 746741 . G A 1751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.28;MQ0=0;QD=22.74;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1784,183,0 chrXIV 746746 . C T 1887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.74;MQ0=0;QD=22.20;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1920,198,0 chrXIV 746866 . T C 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.59;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3033,324,0 chrXIV 746926 . C T 3770.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.63;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3770,384,0 chrXIV 746951 . A G 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.07;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3500,375,0 chrXIV 746952 . T C 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.25;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3507,375,0 chrXIV 747081 . A G 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.20;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3790,381,0 chrXIV 747212 . T C 2680 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.39;MQ0=0;QD=24.59;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2713,285,0 chrXIV 747242 . C T 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.60;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3627,358,0 chrXIV 747434 . A C 2997 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.92;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3030,321,0 chrXIV 747437 . T A 3067 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.61;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3100,318,0 chrXIV 747443 . T C 3351.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.81;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3351,354,0 chrXIV 747445 . C T 2867 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.16;MQ0=0;QD=24.50;SB=-9.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2900,303,0 chrXIV 747531 . A G 2803 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4927;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=24.81;ReadPosRankSum=1.487;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2836,309,0 chrXIV 747684 . C T 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3322,334,0 chrXIV 747711 . C A 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3448,360,0 chrXIV 747725 . G A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3264,342,0 chrXIV 747750 . A G 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2863,312,0 chrXIV 747936 . A G 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3353,366,0 chrXIV 748118 . T C 2423 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=21.07;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:115:99:2456,249,0 chrXIV 748253 . G A 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3386,336,0 chrXIV 748614 . T A 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3045,300,0 chrXIV 748720 . T G 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2839,309,0 chrXIV 748773 . T C 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3437,357,0 chrXIV 748858 . T C 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3107,327,0 chrXIV 748885 . T G 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3009,315,0 chrXIV 748937 . A G 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3611,390,0 chrXIV 749032 . G A 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7605;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.15;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3257,345,0 chrXIV 749042 . A G 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.88;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2804,300,0 chrXIV 749048 . A G 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.25;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3151,336,0 chrXIV 749073 . T C 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=25.19;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2880,306,0 chrXIV 749402 . T C 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.13;MQ0=0;QD=23.67;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3086,318,0 chrXIV 749410 . G A 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3475,345,0 chrXIV 749415 . C T 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3487,351,0 chrXIV 749467 . G T 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.32;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3241,339,0 chrXIV 749472 . T C 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3104,336,0 chrXIV 749513 . C G 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3323,339,0 chrXIV 749541 . T C 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3146,330,0 chrXIV 749652 . G A 2573 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2606,273,0 chrXIV 749661 . C A 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2897,297,0 chrXIV 749724 . A G 2521 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2554,279,0 chrXIV 749727 . A C 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2679,285,0 chrXIV 750028 . C T 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3454,337,0 chrXIV 750232 . T G 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.60;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3527,366,0 chrXIV 750252 . G T 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.02;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3476,360,0 chrXIV 750427 . T C 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2974,318,0 chrXIV 750473 . T C 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.22;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3287,354,0 chrXIV 750684 . T C 1922 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.151;DP=90;Dels=0.00;FS=12.804;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.07;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.068;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,88:90:99:1955,171,0 chrXIV 750686 . G A 1870 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.952;DP=89;Dels=0.00;FS=12.706;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.56;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=21.01;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,87:89:99:1903,166,0 chrXIV 750691 . T C 1681 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;DP=85;Dels=0.00;FS=14.191;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.03;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,83:85:99:1714,143,0 chrXIV 750702 . C T 1428 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.231;DP=80;Dels=0.00;FS=23.236;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.92;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,78:80:99:1461,117,0 chrXIV 750706 . A T 1283 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;DP=78;Dels=0.00;FS=42.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.61;MQ0=1;MQRankSum=1.227;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-1.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,74:78:70:1316,70,0 chrXIV 750714 . C T 1139 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;DP=64;Dels=0.00;FS=45.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.68;MQ0=1;MQRankSum=0.307;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-6.537e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,60:64:57:1172,57,0 chrXIV 750716 . T C 1090 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.469;DP=64;Dels=0.00;FS=45.989;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.68;MQ0=1;MQRankSum=0.823;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-6.537e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,60:64:57:1123,57,0 chrXIV 750721 . T C 883 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.916;DP=60;Dels=0.00;FS=45.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=1;MQRankSum=0.224;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,56:60:42:916,42,0 chrXIV 750732 . A G 828.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;DP=57;Dels=0.00;FS=38.407;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.64;MQ0=1;MQRankSum=0.748;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-7.983e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,52:57:10:861,10,0 chrXIV 750743 . C A 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;DP=62;Dels=0.00;FS=77.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.66;MQ0=1;MQRankSum=1.780;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.811;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,55:62:60:715,0,60 chrXIV 750744 . C T 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.306;DP=62;Dels=0.00;FS=77.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.66;MQ0=1;MQRankSum=0.690;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.714;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,55:62:55:714,0,55 chrXIV 750761 . C T 423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.846;DP=53;Dels=0.02;FS=63.261;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.45;MQ0=2;MQRankSum=-0.614;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.032;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,45:52:68:453,0,68 chrXIV 750775 . A G 360.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.250;DP=48;Dels=0.00;FS=51.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.08;MQ0=3;MQRankSum=-0.658;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,41:48:53:390,0,53 chrXIV 750776 . T C 363.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.290;DP=48;Dels=0.00;FS=51.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.08;MQ0=3;MQRankSum=0.219;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.020;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,41:48:53:393,0,53 chrXIV 750779 . T A,G 468.04 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=28.12;MQ0=3;QD=9.36;SB=-8.405e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,43,7:50:48:528,99,48,429,0,417 chrXIV 750800 . T C 368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;DP=52;Dels=0.00;FS=52.513;HaplotypeScore=4.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.31;MQ0=3;MQRankSum=0.133;QD=7.08;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,45:52:50:398,0,50 chrXIV 750821 . T C 389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;DP=49;Dels=0.00;FS=33.545;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.74;MQ0=2;MQRankSum=1.023;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,42:49:62:419,0,62 chrXIV 750833 . A G 258.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.370;DP=37;Dels=0.00;FS=48.797;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.93;MQ0=4;MQRankSum=-2.252;QD=6.97;ReadPosRankSum=2.448;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:288,0,209 chrXIV 750840 . G A 216.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;DP=31;Dels=0.00;FS=35.288;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.52;MQ0=4;MQRankSum=-0.186;QD=6.97;ReadPosRankSum=1.991;SB=-3.006e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:246,0,158 chrXIV 750848 . G A 233.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;DP=30;Dels=0.00;FS=31.088;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.43;MQ0=4;MQRankSum=-0.867;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.751;SB=-3.006e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:263,0,140 chrXIV 750850 . A G 222.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;DP=29;Dels=0.00;FS=31.088;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.88;MQ0=3;MQRankSum=-1.387;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.000;SB=-3.006e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:252,0,141 chrXIV 750867 . G A 328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;DP=37;Dels=0.00;FS=38.639;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.35;MQ0=3;MQRankSum=-1.789;QD=8.87;ReadPosRankSum=-2.556;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:358,0,123 chrXIV 750875 . A C 284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;DP=33;Dels=0.00;FS=30.355;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.61;MQ0=2;MQRankSum=-0.700;QD=8.61;ReadPosRankSum=-3.228;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:314,0,129 chrXIV 750888 . G A 310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;DP=35;Dels=0.00;FS=42.015;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.69;MQ0=2;MQRankSum=-1.533;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.575;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:340,0,145 chrXIV 750902 . A G 255.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;DP=35;Dels=0.00;FS=40.198;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.33;MQ0=2;MQRankSum=-0.586;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.627;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:285,0,177 chrXIV 750904 . A G 103.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;DP=35;Dels=0.00;FS=44.479;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.20;MQ0=2;MQRankSum=2.037;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-2.982e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:133,0,298 chrXIV 750905 . A G 482 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.33;MQ0=2;QD=14.61;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:57:515,57,0 chrXIV 750914 . C T 206.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.572;DP=27;Dels=0.00;FS=41.256;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.89;MQ0=2;MQRankSum=-3.056;QD=7.63;ReadPosRankSum=2.512;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:236,0,139 chrXIV 750915 . C T 205.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.420;DP=27;Dels=0.00;FS=41.256;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.89;MQ0=2;MQRankSum=-1.785;QD=7.59;ReadPosRankSum=2.572;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:235,0,139 chrXIV 750961 . C T 478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;DP=28;Dels=0.00;FS=31.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.57;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.295;SB=-1.602e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:34:508,0,34 chrXIV 751004 . T C 631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:664,72,0 chrXIV 751013 . A G 612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:72:645,72,0 chrXIV 751019 . A T 429.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;DP=33;Dels=0.00;FS=34.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.73;MQ0=7;MQRankSum=-0.213;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-5.602e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:92:459,0,92 chrXIV 751040 . G T 97.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;DP=23;Dels=0.00;FS=16.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.78;MQ0=10;MQRankSum=-1.791;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.791;SB=-2.875e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:127,0,119 chrXIV 751052 . G A 74.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;DP=26;Dels=0.00;FS=12.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.84;MQ0=15;MQRankSum=-1.408;QD=2.85;ReadPosRankSum=1.532;SB=-3.250e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:104,0,108 chrXIV 751070 . C G 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;DP=32;Dels=0.00;FS=1.913;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.77;MQ0=15;MQRankSum=-2.001;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:147,0,146 chrXIV 751090 . C T 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;DP=44;Dels=0.00;FS=3.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.24;MQ0=15;MQRankSum=-3.005;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.161;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:89:89,0,437 chrXIV 751148 . C T 80.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.958;DP=52;Dels=0.00;FS=1.301;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.31;MQ0=0;MQRankSum=-4.168;QD=1.54;ReadPosRankSum=-1.501;SB=-4.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:110,0,951 chrXIV 751151 . C T 80.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;DP=52;Dels=0.00;FS=1.301;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.31;MQ0=0;MQRankSum=-4.347;QD=1.54;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:110,0,928 chrXIV 751159 . A G 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.381;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.47;MQ0=0;MQRankSum=-4.448;QD=0.90;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,10:51:76:76,0,990 chrXIV 751238 . C T 78.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.85;MQ0=0;QD=11.22;SB=-2.655e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:111,12,0 chrXIV 751241 . G T 75.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.85;MQ0=0;QD=10.79;SB=-2.755e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:108,12,0 chrXIV 751246 . G T 81.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.30;MQ0=0;QD=9.06;SB=-2.755e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:114,12,0 chrXIV 751250 . A G 77.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.30;MQ0=0;QD=8.61;SB=-2.655e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:110,12,0 chrXIV 751256 . T C 75.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.30;MQ0=0;QD=8.39;SB=-2.755e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:108,12,0 chrXIV 751258 . G A 84.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.30;MQ0=0;QD=9.39;SB=-2.955e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:117,12,0 chrXIV 751264 . C T 79.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.30;MQ0=0;QD=8.83;SB=-2.755e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:112,12,0 chrXIV 751286 . G A 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;DP=28;Dels=0.00;FS=18.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.22;MQ0=7;MQRankSum=-1.258;QD=1.39;ReadPosRankSum=1.617;SB=-2.188e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:37:69,0,37 chrXIV 751289 . C T 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;DP=27;Dels=0.00;FS=18.016;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.41;MQ0=7;MQRankSum=-1.323;QD=0.53;ReadPosRankSum=1.449;SB=-2.188e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:41:44,0,41 chrXIV 751291 . T G 14.18 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;DP=27;Dels=0.00;FS=18.016;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.41;MQ0=7;MQRankSum=-1.701;QD=0.53;ReadPosRankSum=1.323;SB=-2.088e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:44:44,0,44 chrXIV 751308 . T C 35.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;DP=30;Dels=0.00;FS=22.482;HaplotypeScore=2.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.17;MQ0=7;MQRankSum=1.050;QD=1.17;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-6.411e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,3:30:65:65,0,67 chrXIV 751313 . C G 63.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;DP=29;Dels=0.00;FS=6.435;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.79;MQ0=7;MQRankSum=-1.734;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.946;SB=-9.809e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,28:29:10:93,0,10 chrXIV 751373 . G A 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.679;DP=47;Dels=0.00;FS=41.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.22;MQ0=26;MQRankSum=-2.052;QD=0.55;ReadPosRankSum=1.455;SB=-1.175e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:56:56,0,139 chrXIV 751385 . A C 84.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;DP=48;Dels=0.00;FS=36.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.84;MQ0=26;MQRankSum=-0.627;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.392;SB=-1.600e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:82:114,0,82 chrXIV 751529 . A G 595.02 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;DP=94;Dels=0.00;FS=44.338;HaplotypeScore=1.9664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.05;MQ0=50;MQRankSum=-0.796;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.469;SB=-1.503e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,60:94:21:625,0,21 chrXIV 751540 . C T 647.20 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.122;DP=99;Dels=0.00;FS=46.271;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.32;MQ0=50;MQRankSum=-1.515;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-1.721e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,63:99:2:676,0,2 chrXIV 751553 . C T 568.02 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;DP=89;Dels=0.00;FS=39.153;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.72;MQ0=46;MQRankSum=-1.317;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.439;SB=-1.503e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,57:89:22:598,0,22 chrXIV 751703 . C A 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.389;DP=147;Dels=0.00;FS=2.942;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.37;MQ0=1;MQRankSum=0.951;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,145:147:99:3418,354,0 chrXIV 751721 . G A 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.11;MQ0=1;QD=21.89;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3076,327,0 chrXIV 751757 . G A 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.75;MQ0=1;QD=23.17;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3823,420,0 chrXIV 751807 . G A 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.96;MQ0=0;QD=25.50;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3646,375,0 chrXIV 751913 . T G 1132 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.94;MQ0=5;QD=15.51;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1165,135,0 chrXIV 751925 . C G 1719 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.66;MQ0=4;QD=17.72;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:97:99:1752,207,0 chrXIV 752030 . A G 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=24.28;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2801,312,0 chrXIV 752069 . A G 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.66;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3117,327,0 chrXIV 752082 . G A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.44;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3263,327,0 chrXIV 752111 . T A 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3397,331,0 chrXIV 752169 . C T 4220.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4220,424,0 chrXIV 752223 . C G 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3751,414,0 chrXIV 752316 . C T 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2750,276,0 chrXIV 752591 . A G 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3313,354,0 chrXIV 752737 . T C 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.27;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3299,345,0 chrXIV 752756 . T C 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.79;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2758,303,0 chrXIV 752936 . A T 3826.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3826,411,0 chrXIV 752968 . C T 4417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.03;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.992e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4417,453,0 chrXIV 753269 . C T 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.43;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2859,306,0 chrXIV 753290 . G A 2529 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.06;MQ0=0;QD=25.55;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2562,273,0 chrXIV 753318 . T G 1911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.09;MQ0=0;QD=22.75;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1944,225,0 chrXIV 753325 . C T 1783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.11;MQ0=0;QD=21.23;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1816,198,0 chrXIV 753336 . G A 1834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5327;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.28;MQ0=0;QD=20.15;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:1867,201,0 chrXIV 753372 . G C 1629 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.14;MQ0=0;QD=18.51;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1662,183,0 chrXIV 753373 . T A 1668 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=19.62;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1701,183,0 chrXIV 753377 . T G 1601 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=18.84;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1634,183,0 chrXIV 753378 . T C 1627 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=19.14;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1660,180,0 chrXIV 753380 . A G 1676 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=19.72;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:1709,183,0 chrXIV 753430 . A G 1873 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.64;MQ0=0;QD=21.04;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1906,204,0 chrXIV 753431 . G A 1867 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.92;MQ0=0;QD=20.74;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:1900,204,0 chrXIV 753436 . G C 1908 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.22;MQ0=0;QD=20.08;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:1941,219,0 chrXIV 753470 . A T 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.64;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2903,300,0 chrXIV 753530 . C A 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.48;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3603,367,0 chrXIV 753532 . C T 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.30;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3742,382,0 chrXIV 753596 . A G 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=27.49;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3381,354,0 chrXIV 753659 . A T 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2995,306,0 chrXIV 753727 . A C 2611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2644,285,0 chrXIV 753903 . G A 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3241,325,0 chrXIV 754144 . G C 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=23.42;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3054,321,0 chrXIV 754211 . G A 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3799,390,0 chrXIV 754288 . A G 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3790,382,0 chrXIV 754294 . T C 3780.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3780,387,0 chrXIV 754488 . A G 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2919,309,0 chrXIV 754560 . G A 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.21;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3180,321,0 chrXIV 754593 . T G 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.59;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2826,303,0 chrXIV 754667 . C T 3957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=26.21;SB=-2.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3957,411,0 chrXIV 754752 . T A 2828 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.04;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2861,288,0 chrXIV 754753 . G A 2820 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.04;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2853,288,0 chrXIV 754756 . T C 2727 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2760,291,0 chrXIV 754761 . A G 2810 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:2843,300,0 chrXIV 754857 . G A 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.12;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3433,349,0 chrXIV 754862 . T C 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.24;MQ0=0;QD=23.63;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3152,336,0 chrXIV 754875 . T C 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.09;MQ0=0;QD=20.45;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2569,273,0 chrXIV 754876 . G T 2513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.09;MQ0=0;QD=20.27;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2546,273,0 chrXIV 754942 . G A 3934.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=1;QD=24.90;SB=-2.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3934,391,0 chrXIV 755024 . G A 3772.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3772,388,0 chrXIV 755152 . C T 1574 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=0;QD=23.49;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:67:99:1607,171,0 chrXIV 755218 . T C 2391 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.51;MQ0=0;QD=24.40;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2424,258,0 chrXIV 755323 . A C 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.44;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2958,312,0 chrXIV 755359 . G A 2790 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=1;QD=23.85;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2823,294,0 chrXIV 755402 . T C 2001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.11;MQ0=1;QD=18.70;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2034,237,0 chrXIV 755412 . G C 1845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=77.1157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.89;MQ0=1;QD=18.09;SB=-9.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:1878,213,0 chrXIV 755437 . C T 2051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.96;MQ0=1;QD=17.68;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2084,231,0 chrXIV 755451 . T C 2177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7474;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.83;MQ0=0;QD=19.10;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2210,249,0 chrXIV 755457 . A T 2290 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.34;MQ0=0;QD=20.45;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2323,252,0 chrXIV 755545 . T C 2585 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.47;MQ0=0;QD=23.29;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2618,273,0 chrXIV 755548 . T C 2415 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=0;QD=22.78;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2448,264,0 chrXIV 755549 . A G 2406 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.08;MQ0=0;QD=22.91;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2439,261,0 chrXIV 755567 . C A 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.32;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2467,261,0 chrXIV 755572 . T G 2306 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.06;MQ0=0;QD=23.53;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2339,258,0 chrXIV 755706 . G A 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.13;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2864,291,0 chrXIV 755761 . G T 2327 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.93;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2360,249,0 chrXIV 755812 . C T 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3085,321,0 chrXIV 755864 . A T 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2870,288,0 chrXIV 756613 . C G 3912.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;DP=156;Dels=0.00;FS=3.419;HaplotypeScore=4.9588;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=25.08;ReadPosRankSum=1.021;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3912,405,0 chrXIV 756837 . T C 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3151,327,0 chrXIV 756903 . G A 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3578,358,0 chrXIV 756985 . G A 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3735,373,0 chrXIV 757123 . C T 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5525;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3023,303,0 chrXIV 757207 . G A 3764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3764,379,0 chrXIV 757236 . T C 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3737,375,0 chrXIV 757477 . T A 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3235,316,0 chrXIV 757822 . A G 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=1;QD=23.91;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3299,360,0 chrXIV 757885 . A T 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2805,294,0 chrXIV 757912 . T C 2607 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2640,288,0 chrXIV 757924 . C T 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2848,294,0 chrXIV 757948 . G A 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3246,333,0 chrXIV 758102 . A G 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3170,333,0 chrXIV 758123 . C T 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3101,312,0 chrXIV 758159 . G A 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3527,361,0 chrXIV 758169 . G A 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3407,343,0 chrXIV 758211 . T C 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3518,357,0 chrXIV 758263 . A G 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3419,360,0 chrXIV 758397 . C T 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.594;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=26.29;ReadPosRankSum=1.400;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3286,329,0 chrXIV 758547 . A G 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7176;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3401,342,0 chrXIV 758691 . G C 3271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3271,342,0 chrXIV 758804 . A G 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3413,354,0 chrXIV 759022 . T A 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.89;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2937,309,0 chrXIV 759078 . G T 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2771,291,0 chrXIV 759107 . G T 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3055,315,0 chrXIV 759188 . A G 4114.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=167;Dels=0.00;FS=4.719;HaplotypeScore=3.3213;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=24.63;ReadPosRankSum=-1.169;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:167:99:4114,429,0 chrXIV 759584 . A T 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3231,345,0 chrXIV 759591 . G A 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3295,348,0 chrXIV 759701 . G C 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.028;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.110;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3156,313,0 chrXIV 759712 . G C 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.516;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3145,315,0 chrXIV 759743 . A G 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.045;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=25.95;ReadPosRankSum=-1.463;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:3043,288,0 chrXIV 759935 . C T 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3543,360,0 chrXIV 759988 . T C 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3100,342,0 chrXIV 760061 . C A 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3280,333,0 chrXIV 760229 . C T 2461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.655;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.116;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,94:96:99:2494,226,0 chrXIV 760237 . G A 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=26.41;ReadPosRankSum=-1.012;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2700,255,0 chrXIV 760326 . G A 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:150:99:4033,406,0 chrXIV 760406 . C T 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2868,291,0 chrXIV 760578 . G A 2325 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.12;SB=-9.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2358,231,0 chrXIV 761002 . G T 4580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.59;SB=-2.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4580,468,0 chrXIV 761005 . C T 4724.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.24;SB=-2.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4724,472,0 chrXIV 761123 . C G 4490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.37;SB=-2.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4490,456,0 chrXIV 761147 . G A 4664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.49;SB=-2.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4664,448,0 chrXIV 761384 . C T 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3919,394,0 chrXIV 761636 . A G 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=1;QD=24.42;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3012,318,0 chrXIV 761851 . C T 2343 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2376,246,0 chrXIV 761972 . G A 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.33;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2745,282,0 chrXIV 762120 . C T 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3068,309,0 chrXIV 762153 . T A 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3309,336,0 chrXIV 762280 . G C 2539 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2572,273,0 chrXIV 762368 . T C 2669 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2702,282,0 chrXIV 762433 . A C 2365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=20.93;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2398,258,0 chrXIV 762511 . T C 2524 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2557,273,0 chrXIV 762827 . G A 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3277,339,0 chrXIV 762860 . T G 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2964,300,0 chrXIV 763243 . G A 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=26.86;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3014,312,0 chrXIV 763381 . A C 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.23;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3542,366,0 chrXIV 763402 . C G 4039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4039,423,0 chrXIV 763497 . T A 3930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5134;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3930,403,0 chrXIV 763540 . C G 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:3926,411,0 chrXIV 763583 . C T 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3188,318,0 chrXIV 763742 . T C 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.05;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3457,369,0 chrXIV 763906 . C T 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.247;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=25.41;ReadPosRankSum=-1.411;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:109:99:2803,259,0 chrXIV 763922 . C T 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9571;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=26.04;ReadPosRankSum=1.674;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3158,305,0 chrXIV 764011 . C T 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2853,285,0 chrXIV 764082 . T A 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.63;SB=-8.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3355,345,0 chrXIV 764145 . A T 3859.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3859,405,0 chrXIV 764239 . C T 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3572,360,0 chrXIV 764357 . G A 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.39;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3546,363,0 chrXIV 764395 . T C 2820 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.52;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2853,318,0 chrXIV 764481 . G A 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3644,364,0 chrXIV 764538 . T G 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3424,363,0 chrXIV 764587 . T C 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3237,345,0 chrXIV 764608 . C T 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2976,297,0 chrXIV 764643 . G A 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2642,279,0 chrXIV 764688 . A G 2969 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3002,306,0 chrXIV 764938 . T C 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.36;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2899,309,0 chrXIV 764974 . A G 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2890,315,0 chrXIV 765005 . A C 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2908,309,0 chrXIV 765218 . A T 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3506,366,0 chrXIV 765247 . C T 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3602,361,0 chrXIV 765330 . T G 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=25.06;ReadPosRankSum=1.364;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3534,351,0 chrXIV 765430 . T A 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3028,309,0 chrXIV 765537 . T C 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3232,339,0 chrXIV 766895 . A T 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.94;SB=-2.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3741,367,0 chrXIV 766976 . C A 4277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4277,430,0 chrXIV 767726 . A C 3495.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=2;QD=25.33;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3495,363,0 chrXIV 767811 . C A 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3064,309,0 chrXIV 768365 . A T 3074 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3107,306,0 chrXIV 768478 . G A 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2897,303,0 chrXIV 768575 . C T 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3751,378,0 chrXIV 768845 . A C 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2694,282,0 chrXIV 768862 . C T 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2988,306,0 chrXIV 768903 . A G 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7687;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2599,267,0 chrXIV 769375 . A G 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2858,297,0 chrXIV 769532 . G A 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:2588,264,0 chrXIV 769720 . T C 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2513;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3477,351,0 chrXIV 769918 . G C 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3703,372,0 chrXIV 770149 . A G 1914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=25.18;ReadPosRankSum=1.504;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:76:99:1947,204,0 chrXIV 770174 . A G 2004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.05;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2037,219,0 chrXIV 770228 . C T 2139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.46;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2172,228,0 chrXIV 770313 . A G 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2614,270,0 chrXIV 770350 . T C 2383 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4963;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2416,255,0 chrXIV 770389 . A G 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3095,330,0 chrXIV 770491 . C T 2792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2825,297,0 chrXIV 770599 . G A 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3351,342,0 chrXIV 770689 . G A 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3499,354,0 chrXIV 770920 . T C 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3052,318,0 chrXIV 770992 . G A 3941.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6908;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.93;SB=-2.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3941,385,0 chrXIV 771471 . C T 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.09;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2887,294,0 chrXIV 772084 . A T 2549 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2582,273,0 chrXIV 772118 . T G 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=24.07;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2946,309,0 chrXIV 772160 . A G 2702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=14.3630;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=21.97;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2735,291,0 chrXIV 772254 . G C 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.19;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2743,276,0 chrXIV 772272 . A G 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.88;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2686,273,0 chrXIV 772275 . T C 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2679,273,0 chrXIV 772440 . C T 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.69;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3056,315,0 chrXIV 772448 . G C 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.93;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2881,309,0 chrXIV 772480 . G A 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.14;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2871,303,0 chrXIV 772489 . C T 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.94;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2812,288,0 chrXIV 772516 . A G 2737 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.26;MQ0=0;QD=22.43;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2770,288,0 chrXIV 772541 . C A 2358 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.40;MQ0=0;QD=22.89;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2391,246,0 chrXIV 772544 . T G 2239 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.71;MQ0=0;QD=22.39;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2272,240,0 chrXIV 772633 . G A 102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.297;DP=102;Dels=0.01;FS=181.772;HaplotypeScore=3.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.05;MQ0=0;MQRankSum=-3.244;QD=1.00;ReadPosRankSum=-6.136;SB=-2.948e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,32:101:99:132,0,295 chrXIV 772690 . C T 1080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.05;MQ0=0;QD=16.87;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1113,126,0 chrXIV 772697 . G C 1158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.09;MQ0=0;QD=20.68;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1191,135,0 chrXIV 772716 . C T 1289 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.21;MQ0=1;QD=23.02;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1322,147,0 chrXIV 772728 . C T 1342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.21;MQ0=2;QD=22.00;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:61:99:1375,153,0 chrXIV 772737 . A G 1358 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;DP=73;Dels=0.00;FS=6.628;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.27;MQ0=4;MQRankSum=-0.025;QD=18.60;ReadPosRankSum=1.381;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,71:73:99:1391,133,0 chrXIV 772740 . G A 1671 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.854;DP=80;Dels=0.00;FS=20.144;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.32;MQ0=4;MQRankSum=2.241;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.267;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,74:80:99:1704,164,0 chrXIV 772770 . C T 1467 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=78;Dels=0.00;FS=23.756;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.52;MQ0=4;MQRankSum=1.614;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.542;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,73:78:93:1500,93,0 chrXIV 772834 . T C 530 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=1;QD=9.30;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:63:563,63,0 chrXIV 772854 . C T 435 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.58;MQ0=5;QD=7.77;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:51:468,51,0 chrXIV 772971 . C T 553.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.765;DP=149;Dels=0.00;FS=16.734;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.05;MQ0=19;MQRankSum=1.454;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.980;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,41:149:99:583,0,1882 chrXIV 773034 . T C 171.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.684;DP=222;Dels=0.00;FS=12.345;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.47;MQ0=12;MQRankSum=-5.704;QD=0.77;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,43:222:99:201,0,3983 chrXIV 773076 . A G 80.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;DP=224;Dels=0.00;FS=9.424;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.05;MQ0=13;MQRankSum=-4.606;QD=0.36;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,38:224:99:110,0,4074 chrXIV 773172 . T C 1376.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.166;DP=232;Dels=0.00;FS=12.868;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.16;MQ0=6;MQRankSum=1.426;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.065;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,88:232:99:1406,0,2625 chrXIV 773196 . G A 1039.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.400;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.43;MQ0=6;MQRankSum=0.133;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,67:198:99:1069,0,2327 chrXIV 773217 . A G 2417.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.018;DP=189;Dels=0.00;FS=7.102;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.67;MQ0=6;MQRankSum=-0.519;QD=12.79;ReadPosRankSum=-1.125;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,133:189:99:2447,0,915 chrXIV 773226 . T C 4078.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.62;MQ0=6;QD=21.92;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:4078,417,0 chrXIV 773244 . A T 5065.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.45;MQ0=7;QD=22.71;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,223:223:99:5065,484,0 chrXIV 773265 . T G 4356.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.78;MQ0=8;QD=22.11;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:197:99:4356,435,0 chrXIV 773346 . C G 522 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.27;MQ0=19;QD=9.00;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:60:555,60,0 chrXIV 773349 . A C 456 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.88;MQ0=19;QD=8.14;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:54:489,54,0 chrXIV 773371 . A G 327 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=16;QD=6.96;SB=-1.689e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:39:360,39,0 chrXIV 773382 . C T 367.05 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.997;DP=52;Dels=0.00;FS=22.330;HaplotypeScore=7.6939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.10;MQ0=16;MQRankSum=2.371;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.284;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,30:52:22:400,22,0 chrXIV 773389 . G A 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;DP=59;Dels=0.00;FS=8.929;HaplotypeScore=6.8618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.48;MQ0=16;MQRankSum=-0.963;QD=0.22;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:43:43,0,406 chrXIV 773424 . T G 252.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.644;DP=85;Dels=0.00;FS=1.943;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.40;MQ0=9;MQRankSum=-3.634;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.211;SB=-1.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,34:85:99:282,0,885 chrXIV 773456 . C T 495.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;DP=84;Dels=0.00;FS=0.853;HaplotypeScore=11.4287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.21;MQ0=7;MQRankSum=-2.621;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.657;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,39:84:99:525,0,701 chrXIV 773466 . C T 224.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.473;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.4287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.82;MQ0=6;MQRankSum=-1.676;QD=2.60;ReadPosRankSum=-1.051;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,25:86:99:254,0,1014 chrXIV 773498 . G A 414.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;DP=85;Dels=0.00;FS=2.991;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.33;MQ0=6;MQRankSum=-3.603;QD=4.87;ReadPosRankSum=1.516;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:444,0,898 chrXIV 773511 . G A 355.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;DP=77;Dels=0.00;FS=4.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.29;MQ0=6;MQRankSum=-3.375;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.725;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:77:99:385,0,821 chrXIV 773539 . G T 77.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.628;DP=72;Dels=0.00;FS=1.036;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.49;MQ0=7;MQRankSum=-3.277;QD=1.07;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-3.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:107,0,1032 chrXIV 773556 . A G 220.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.561;DP=73;Dels=0.00;FS=0.935;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.81;MQ0=6;MQRankSum=-4.162;QD=3.01;ReadPosRankSum=-1.628;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:250,0,964 chrXIV 773562 . T C 215.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.374;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.31;MQ0=6;MQRankSum=-4.167;QD=2.87;ReadPosRankSum=-1.344;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:245,0,992 chrXIV 773592 . T A 224.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.768;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.83;MQ0=8;MQRankSum=-4.446;QD=3.29;ReadPosRankSum=1.921;SB=-1.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:254,0,889 chrXIV 773664 . T C 492 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.04;MQ0=6;QD=14.06;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:57:525,57,0 chrXIV 773697 . C T 390 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.853;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.01;MQ0=5;MQRankSum=2.254;QD=13.00;ReadPosRankSum=-1.553;SB=-8.600e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,23:30:45:423,45,0 chrXIV 773700 . T G 402 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.24;MQ0=5;MQRankSum=0.873;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,21:29:48:435,48,0 chrXIV 773730 . T C 293 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.77;MQ0=5;QD=13.32;SB=-2.800e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:36:326,36,0 chrXIV 773751 . T C 268 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.58;MQ0=7;QD=11.65;SB=-1.089e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:33:301,33,0 chrXIV 773805 . T A,G 987.01 filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=28.67;MQ0=23;QD=11.48;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,74,12:86:80:1047,179,80,868,0,847 chrXIV 773806 . T C 865.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.582;DP=92;Dels=0.00;FS=10.201;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.19;MQ0=23;MQRankSum=-2.598;QD=9.40;ReadPosRankSum=2.778;SB=-5.019e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,78:92:99:895,0,133 chrXIV 773862 . G A 196.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.221;DP=148;Dels=0.00;FS=8.707;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.81;MQ0=23;MQRankSum=1.331;QD=1.32;ReadPosRankSum=1.037;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,25:148:99:226,0,1784 chrXIV 773901 . A G 2152 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.68;MQ0=20;QD=16.06;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:2185,222,0 chrXIV 773949 . T C 563 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.09;MQ0=21;QD=8.53;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:66:596,66,0 chrXIV 774012 . G A 74.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.32;MQ0=10;QD=4.38;SB=-5.355e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,11:17:12:107,12,0 chrXIV 774018 . A G 45.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.74;MQ0=8;QD=3.28;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:9:78,9,0 chrXIV 774024 . G A 21.79 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.51;MQ0=7;QD=1.98;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:53,6,0 chrXIV 774057 . G A 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.67;MQ0=7;QD=2.64;SB=-2.676e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:55,6,0 chrXIV 774075 . G T 160.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.46;MQ0=7;QD=11.43;SB=-2.794e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:21:193,21,0 chrXIV 774126 . G T 1847 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.71;MQ0=36;QD=16.79;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:1880,183,0 chrXIV 774219 . T C 1014 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.59;MQ0=5;QD=20.28;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1047,120,0 chrXIV 774280 . C T 372 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.32;MQ0=10;QD=12.40;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:36:405,36,0 chrXIV 774367 . G T 268 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.91;MQ0=17;QD=7.66;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,19:35:30:301,30,0 chrXIV 774368 . C T 218.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.39;MQ0=16;MQRankSum=-0.116;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.504;SB=-8.625e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:3:248,3,0 chrXIV 774399 . T G 134.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.80;MQ0=20;QD=4.63;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:18:167,18,0 chrXIV 774421 . C T 53.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.48;MQ0=18;QD=2.25;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:9:86,9,0 chrXIV 774484 . T C 16.85 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.82;MQ0=13;QD=0.77;SB=-2.076e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:6:48,6,0 chrXIV 774495 . G A 95.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.81;MQ0=13;QD=3.66;SB=-2.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:15:128,15,0 chrXIV 774504 . T C 175.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.19;MQ0=10;QD=5.83;SB=-4.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:24:208,24,0 chrXIV 774507 . T C 146.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.19;MQ0=10;QD=4.87;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:21:179,21,0 chrXIV 774529 . A G 115.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;DP=40;Dels=0.00;FS=16.790;HaplotypeScore=5.3193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.61;MQ0=11;MQRankSum=0.546;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.720;SB=-4.554e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:145,0,146 chrXIV 774533 . C A 145.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.943;DP=43;Dels=0.00;FS=23.100;HaplotypeScore=5.3193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.64;MQ0=11;MQRankSum=0.475;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.268;SB=-1.000e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:43:99:175,0,123 chrXIV 774556 . T G 47.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.723;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.4052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.18;MQ0=14;MQRankSum=-1.231;QD=0.90;ReadPosRankSum=3.292;SB=-7.008e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:33:77,0,33 chrXIV 774577 . G A 64.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.05;MQ0=12;MQRankSum=-3.225;QD=1.39;ReadPosRankSum=1.488;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:94:94,0,214 chrXIV 774589 . C A 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.014;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.0944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.89;MQ0=8;MQRankSum=-2.250;QD=0.89;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:80:80,0,431 chrXIV 774736 . A G 1491.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;DP=148;Dels=0.00;FS=4.756;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.39;MQ0=5;MQRankSum=-4.917;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1521,0,1412 chrXIV 774840 . A G 584.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.873;DP=115;Dels=0.00;FS=1.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.71;MQ0=18;MQRankSum=-7.873;QD=5.08;ReadPosRankSum=2.221;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:614,0,1180 chrXIV 774888 . G A 796.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.043;DP=115;Dels=0.00;FS=3.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.67;MQ0=12;MQRankSum=-7.378;QD=6.92;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:826,0,1085 chrXIV 774924 . G A 835.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.544;DP=156;Dels=0.00;FS=6.556;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.00;MQ0=24;MQRankSum=-8.238;QD=5.35;ReadPosRankSum=2.415;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:865,0,1603 chrXIV 774977 . G C 1008.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;DP=169;Dels=0.00;FS=2.998;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.92;MQ0=28;MQRankSum=-5.580;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,92:169:99:1038,0,1446 chrXIV 775031 . G A 1205.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.412;DP=149;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.99;MQ0=18;MQRankSum=-3.472;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.327;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,86:149:99:1235,0,1138 chrXIV 775082 . C T 341.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;DP=127;Dels=0.00;FS=5.208;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.23;MQ0=25;MQRankSum=-7.535;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.197;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:371,0,1546 chrXIV 775095 . T C 206.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.028;DP=123;Dels=0.00;FS=5.674;HaplotypeScore=3.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.46;MQ0=28;MQRankSum=-7.410;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:236,0,1432 chrXIV 775104 . A G 600.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.037;DP=146;Dels=0.00;FS=12.053;HaplotypeScore=5.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.81;MQ0=29;MQRankSum=-7.394;QD=4.11;ReadPosRankSum=-3.766;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:146:99:630,0,1421 chrXIV 775127 . G A 1267.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.048;DP=142;Dels=0.00;FS=21.404;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.50;MQ0=24;MQRankSum=-5.843;QD=8.92;ReadPosRankSum=-3.180;SB=-1.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,89:142:99:1297,0,944 chrXIV 775230 . A G 1073.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.004;DP=153;Dels=0.00;FS=19.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.27;MQ0=46;MQRankSum=-3.065;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-5.214e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,98:153:99:1103,0,462 chrXIV 775251 . T C 418.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.000;DP=164;Dels=0.00;FS=18.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.06;MQ0=60;MQRankSum=3.198;QD=2.55;ReadPosRankSum=2.734;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,55:164:99:448,0,963 chrXIV 775280 . G A 298.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.248;DP=171;Dels=0.00;FS=12.181;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.71;MQ0=79;MQRankSum=-5.843;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.059;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,82:171:99:328,0,802 chrXIV 775314 . C T 479.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;DP=131;Dels=0.00;FS=16.157;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.96;MQ0=61;MQRankSum=2.568;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.887;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:131:99:509,0,289 chrXIV 775332 . G A 304.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.044;DP=132;Dels=0.00;FS=13.818;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.26;MQ0=82;MQRankSum=1.317;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:334,0,144 chrXIV 775697 . G A 391.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.043;DP=122;Dels=0.00;FS=5.305;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.07;MQ0=94;MQRankSum=3.331;QD=3.21;ReadPosRankSum=-1.144;SB=-1.095e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,101:122:1:420,1,0 chrXIV 775773 . A G 99.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.93;MQ0=53;QD=1.65;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:15:132,15,0 chrXIV 775974 . A G 189.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.75;MQ0=5;QD=14.54;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:24:222,24,0 chrXIV 775996 . G A 248.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;DP=26;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.86;MQ0=6;MQRankSum=-0.079;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.109;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:278,0,139 chrXIV 776073 . T C 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.145;DP=59;Dels=0.00;FS=34.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.07;MQ0=3;MQRankSum=-5.144;QD=0.37;ReadPosRankSum=0.148;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:52:52,0,893 chrXIV 776103 . A G 344.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;DP=75;Dels=0.00;FS=71.466;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.52;MQ0=5;MQRankSum=-5.163;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:374,0,878 chrXIV 776172 . G T 148.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.131;DP=121;Dels=0.00;FS=58.027;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.90;MQ0=7;MQRankSum=-1.981;QD=1.22;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,23:121:99:178,0,1760 chrXIV 776214 . A G 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.369;DP=142;Dels=0.00;FS=78.229;HaplotypeScore=2.7369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.57;MQ0=2;MQRankSum=-2.431;QD=0.09;ReadPosRankSum=0.557;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,20:142:43:43,0,2272 chrXIV 776227 . G C 1964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;DP=137;Dels=0.00;FS=91.977;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.44;MQ0=1;MQRankSum=3.294;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.902;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,107:137:99:1994,0,254 chrXIV 776259 . G A 1972.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.423;DP=120;Dels=0.00;FS=52.528;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.59;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.033;SB=-4.341e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,110:120:21:2005,21,0 chrXIV 776395 . G A 2344 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.24;MQ0=0;QD=24.16;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2377,252,0 chrXIV 776401 . G A 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=1;QD=25.06;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2639,279,0 chrXIV 776430 . C G 2470 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=1;QD=23.30;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2503,276,0 chrXIV 776452 . A G 2342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.23;MQ0=1;QD=23.90;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2375,258,0 chrXIV 776456 . A G 2339 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.35;MQ0=1;QD=24.11;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2372,258,0 chrXIV 776505 . T C 786 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.2180;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.18;MQ0=0;QD=17.47;SB=-7.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:93:819,93,0 chrXIV 776524 . T C 352 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.75;MQ0=0;QD=16.76;SB=-6.793e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:42:385,42,0 chrXIV 776526 . T C 322 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.75;MQ0=0;QD=15.33;SB=-6.793e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:42:355,42,0 chrXIV 776533 . G A 396 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.03;MQ0=0;QD=10.15;SB=-6.657e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:48:429,48,0 chrXIV 776535 . T A 413 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.03;MQ0=0;QD=10.59;SB=-6.657e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:48:446,48,0 chrXIV 776538 . A G 408 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.87;MQ0=0;QD=9.27;SB=-6.657e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:48:441,48,0 chrXIV 776546 . C T 352 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.5811;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.77;MQ0=0;QD=8.59;SB=-7.067e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:42:385,42,0 chrXIV 776549 . G A 377 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=40.4719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.60;MQ0=0;QD=8.57;SB=-6.794e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:45:410,45,0 chrXIV 776558 . T G 320 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.89;MQ0=1;QD=7.27;SB=-7.613e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:39:353,39,0 chrXIV 776562 . C G 314 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.89;MQ0=1;QD=7.14;SB=-7.613e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:39:347,39,0 chrXIV 776563 . T G 304 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.89;MQ0=1;QD=6.91;SB=-7.613e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:39:337,39,0 chrXIV 776568 . G A 318 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=46.9282;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.92;MQ0=1;QD=6.36;SB=-7.613e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:39:351,39,0 chrXIV 776608 . 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T A 103.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=1;QD=3.44;SB=-1.420e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:18:136,18,0 chrXIV 776631 . G A 103.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.29;MQ0=1;QD=4.13;SB=-1.418e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:18:136,18,0 chrXIV 776633 . G A 103.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.29;MQ0=1;QD=4.13;SB=-1.418e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:18:136,18,0 chrXIV 776636 . A G 102.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.63;MQ0=1;QD=3.93;SB=-1.419e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:18:135,18,0 chrXIV 776641 . A T 75.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.29;MQ0=1;QD=3.01;SB=-2.726e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:15:108,15,0 chrXIV 776651 . C T 54.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.20;MQ0=0;QD=3.63;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12:87,12,0 chrXIV 776653 . T C 54.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.20;MQ0=0;QD=3.63;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12:87,12,0 chrXIV 776655 . C T 54.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.20;MQ0=0;QD=3.63;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12:87,12,0 chrXIV 776658 . A G 54.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.20;MQ0=0;QD=3.63;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12:87,12,0 chrXIV 776683 . C T 119.06 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.59;MQ0=0;QD=5.95;SB=-7.470e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:21:152,21,0 chrXIV 776688 . G T 75.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.39;MQ0=0;QD=4.43;SB=-2.718e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:15:108,15,0 chrXIV 776691 . G A 75.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.39;MQ0=0;QD=4.43;SB=-2.718e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:15:108,15,0 chrXIV 776696 . G A 54.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.39;MQ0=0;QD=3.21;SB=-5.215e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:87,12,0 chrXIV 776699 . G A 54.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.20;MQ0=0;QD=3.63;SB=-5.183e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12:87,12,0 chrXIV 776727 . A C 115.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.43;MQ0=0;QD=9.59;SB=-1.247e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:18:148,18,0 chrXIV 776729 . A G 112.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5721;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.43;MQ0=0;QD=9.34;SB=-1.247e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:18:145,18,0 chrXIV 776735 . G C 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.42;MQ0=0;QD=7.50;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:77,9,0 chrXIV 776736 . T G 47.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.42;MQ0=0;QD=8.00;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:80,9,0 chrXIV 776754 . T A 52.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=6.62;SB=-9.134e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:85,9,0 chrXIV 776758 . C T 54.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=6.87;SB=-9.134e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:87,9,0 chrXIV 776762 . G A 50.97 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=6.37;SB=-8.463e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:8:9:83,9,0 chrXIV 776771 . A G 70.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.26;MQ0=0;QD=7.83;SB=-4.882e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:103,12,0 chrXIV 776773 . G A 72.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.26;MQ0=0;QD=8.06;SB=-4.882e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:105,12,0 chrXIV 776775 . T C 73.51 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.26;MQ0=0;QD=8.17;SB=-4.882e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:106,12,0 chrXIV 776784 . C T 75.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.63;MQ0=0;QD=7.55;SB=-5.053e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:108,12,0 chrXIV 776788 . T C 68.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.8639;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.17;MQ0=0;QD=6.23;SB=-5.053e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:101,12,0 chrXIV 776798 . A T 67.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.41;MQ0=0;QD=7.50;SB=-5.053e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:100,12,0 chrXIV 776799 . A G 69.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.41;MQ0=0;QD=7.72;SB=-5.053e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:102,12,0 chrXIV 776809 . C T 73.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.41;MQ0=0;QD=8.17;SB=-5.053e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:106,12,0 chrXIV 781298 . A T 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.36;MQ0=1;QD=3.35;SB=-1.508e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:6:58,6,0 chrXIV 781360 . G A 235.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.18;MQ0=1;MQRankSum=1.519;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.651;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:24:268,24,0 chrXIV 781372 . G C 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;DP=16;Dels=0.00;FS=2.060;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.87;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=1.44;ReadPosRankSum=-2.039;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:53:53,0,185 chrXIV 781391 . C A 114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.361;DP=26;Dels=0.00;FS=1.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=4.38;ReadPosRankSum=2.917;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:144,0,389 chrXIV 781523 . T A 385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.08;MQ0=1;QD=8.95;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:51:418,51,0 chrXIV 781540 . G A 377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.295;DP=42;Dels=0.00;FS=7.740;HaplotypeScore=2.8233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.59;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-2.707e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,35:42:29:410,29,0 chrXIV 781550 . C A 369.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.618;DP=37;Dels=0.00;FS=8.095;HaplotypeScore=2.6984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.86;MQ0=0;MQRankSum=2.075;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.795;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,30:37:27:402,27,0 chrXIV 781551 . G A 397 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.59;MQ0=0;QD=11.03;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:51:430,51,0 chrXIV 781557 . G A 394 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.86;MQ0=0;QD=10.65;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:51:427,51,0 chrXIV 781560 . C G 389 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.86;MQ0=0;QD=10.51;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:51:422,51,0 chrXIV 781598 . T A 414 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=36;Dels=0.00;FS=3.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=2;MQRankSum=1.019;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.325;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:57:447,57,0 chrXIV 781601 . C A 393 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;DP=33;Dels=0.00;FS=3.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.86;MQ0=2;MQRankSum=1.398;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.286;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:54:426,54,0 chrXIV 781606 . T C 386 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;DP=34;Dels=0.00;FS=3.590;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.72;MQ0=2;MQRankSum=0.325;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.516;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:54:419,54,0 chrXIV 781633 . G A 1364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=3;QD=15.33;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,88:89:99:1397,153,0 chrXIV 781636 . T C 1352 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.21;MQ0=3;MQRankSum=0.697;QD=15.02;ReadPosRankSum=0.418;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,88:90:99:1385,153,0 chrXIV 781691 . A G 1789 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6311;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.07;MQ0=6;QD=13.15;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:1822,180,0 chrXIV 781770 . A G 351 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.420;DP=36;Dels=0.03;FS=9.553;HaplotypeScore=2.5802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=6;MQRankSum=2.281;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.850;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,31:35:42:384,42,0 chrXIV 781783 . T A 258.79 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.939;DP=39;Dels=0.00;FS=2.382;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.72;MQ0=7;MQRankSum=-0.631;QD=6.64;ReadPosRankSum=1.719;SB=-2.279e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,27:39:10:291,10,0 chrXIV 781799 . A G 188.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.72;MQ0=6;MQRankSum=-1.238;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.495;SB=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:24:221,24,0 chrXIV 781950 . T C 53.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=68;Dels=0.00;FS=18.195;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.49;MQ0=57;MQRankSum=0.278;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.000;SB=-2.502e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:31:83,0,31 chrXIV 781953 . C T 62.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;DP=68;Dels=0.00;FS=18.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.49;MQ0=57;MQRankSum=0.278;QD=0.91;ReadPosRankSum=0.000;SB=-2.502e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:31:92,0,31 chrXIV 781974 . C T 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;DP=108;Dels=0.00;FS=11.886;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.84;MQ0=88;MQRankSum=-1.216;QD=0.33;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-5.837e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:57:66,0,57 chrXIV 782046 . C A 53.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.922;DP=131;Dels=0.00;FS=26.945;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.76;MQ0=107;MQRankSum=2.087;QD=0.40;ReadPosRankSum=2.504;SB=-5.228e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,24:131:37:83,0,37 chrXIV 782160 . T C 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;DP=141;Dels=0.00;FS=5.639;HaplotypeScore=2.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.23;MQ0=114;MQRankSum=1.399;QD=0.18;ReadPosRankSum=1.263;SB=-6.302e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,15:141:55:55,0,82 chrXIV 782193 . A C 41.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.83;MQ0=93;MQRankSum=0.000;QD=0.39;ReadPosRankSum=-1.488;SB=-2.321e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:9:74,9,0 chrXIV 782336 . A G 602.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.481;DP=273;Dels=0.00;FS=4.931;HaplotypeScore=59.5797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.61;MQ0=119;MQRankSum=-2.169;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.702;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,112:273:99:632,0,1246 chrXIV 782375 . T A 2007 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.20;MQ0=45;QD=11.67;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:2040,219,0 chrXIV 782924 . G A 43.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;DP=124;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=6.4111;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.93;MQ0=113;MQRankSum=0.791;QD=0.35;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:9:76,9,0 chrXIV 782932 . C T 10.45 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;DP=122;Dels=0.01;FS=3.522;HaplotypeScore=15.3190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=4.97;MQ0=111;MQRankSum=-0.851;QD=0.09;ReadPosRankSum=0.103;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,33:121:18:40,0,18 chrXIV 783032 . A C 196.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;DP=110;Dels=0.00;FS=1.584;HaplotypeScore=5.5749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.36;MQ0=80;MQRankSum=2.972;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.395;SB=-5.655e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,21:110:38:226,0,38 chrXIV 783076 . T G 282.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.049;DP=85;Dels=0.00;FS=2.495;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.35;MQ0=35;MQRankSum=-2.492;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.830;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,61:85:99:312,0,266 chrXIV 783105 . A G 165.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.818;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.28;MQ0=15;MQRankSum=2.025;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.465;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:195,0,323 chrXIV 783137 . G A 73.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.612;DP=35;Dels=0.00;FS=16.246;HaplotypeScore=7.3357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.07;MQ0=13;MQRankSum=0.394;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.985;SB=-6.465e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:103,0,122 chrXIV 783150 . G T 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;DP=31;Dels=0.00;FS=24.720;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.83;MQ0=14;MQRankSum=-1.203;QD=1.00;ReadPosRankSum=2.358;SB=-2.042e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:61:61,0,108 chrXIV 783181 . A T 49.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=22;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.94;MQ0=15;MQRankSum=0.742;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,11:22:9:82,9,0 chrXIV 783186 . T A 51.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=18;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.86;MQ0=12;MQRankSum=0.736;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,8:18:9:84,9,0 chrXIV 783187 . A C 47.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=15;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.18;MQ0=9;MQRankSum=0.736;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,5:15:9:80,9,0 chrXIV 783196 . C T 53.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=16;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.17;MQ0=9;MQRankSum=0.742;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,6:16:9:86,9,0 chrXIV 783359 . G A 10.44 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;DP=14;Dels=0.00;FS=6.154;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.45;MQ0=3;MQRankSum=0.717;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.143;SB=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:19:40,0,19 chrXIV 783361 . A C 10.44 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.88;MQ0=2;MQRankSum=-0.869;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.579;SB=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:19:40,0,19 chrXIV 783370 . G A 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=29;Dels=0.00;FS=1.792;HaplotypeScore=7.5240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.03;MQ0=2;MQRankSum=-1.949;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.617;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:69:69,0,222 chrXIV 783376 . A T 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.20;MQ0=2;MQRankSum=-1.196;QD=0.78;ReadPosRankSum=1.149;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:55:55,0,328 chrXIV 783507 . T A 249.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.626;DP=61;Dels=0.00;FS=5.893;HaplotypeScore=6.3618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.31;MQ0=8;MQRankSum=-3.746;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.760;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,37:61:99:279,0,418 chrXIV 783551 . G A 748.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.341;DP=119;Dels=0.00;FS=1.573;HaplotypeScore=13.0575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.19;MQ0=10;MQRankSum=-5.726;QD=6.29;ReadPosRankSum=3.004;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,73:119:99:778,0,756 chrXIV 783584 . T C 751.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.307;DP=119;Dels=0.00;FS=1.551;HaplotypeScore=12.5495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.33;MQ0=8;MQRankSum=-6.348;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,72:119:99:781,0,864 chrXIV 783643 . T C 68.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.082;DP=51;Dels=0.00;FS=4.193;HaplotypeScore=18.6202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.78;MQ0=0;MQRankSum=-4.198;QD=1.33;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:98:98,0,653 chrXIV 783694 . G A 37.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;DP=65;Dels=0.02;FS=3.539;HaplotypeScore=36.2720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.26;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=0.57;ReadPosRankSum=-2.839;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,7:64:67:67,0,876 chrXIV 783722 . A G 299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.374;DP=82;Dels=0.00;FS=8.369;HaplotypeScore=14.3991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.10;MQ0=1;MQRankSum=0.584;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.319;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:329,0,954 chrXIV 783737 . G C 278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.132;DP=76;Dels=0.00;FS=9.832;HaplotypeScore=12.7382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.79;MQ0=1;MQRankSum=-1.557;QD=3.66;ReadPosRankSum=2.487;SB=-6.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:308,0,922 chrXIV 783740 . C T 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;DP=76;Dels=0.00;FS=11.238;HaplotypeScore=12.7382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.79;MQ0=1;MQRankSum=-0.129;QD=0.67;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:81:81,0,1185 chrXIV 783758 . T C 107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.401;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.00;MQ0=1;MQRankSum=-0.448;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.533;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:137,0,1214 chrXIV 783780 . A G 222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;DP=66;Dels=0.00;FS=2.534;HaplotypeScore=12.5236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.136;QD=3.36;ReadPosRankSum=-2.226;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:252,0,842 chrXIV 783789 . C G 77.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;DP=54;Dels=0.00;FS=7.775;HaplotypeScore=19.1799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.38;MQ0=1;MQRankSum=-1.195;QD=1.43;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-1.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:107,0,774 chrXIV 783791 . G C 78.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=54;Dels=0.00;FS=8.023;HaplotypeScore=11.6949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.45;MQ0=1;MQRankSum=-1.148;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:108,0,760 chrXIV 783796 . G T 38.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;DP=51;Dels=0.00;FS=1.243;HaplotypeScore=16.2418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.16;MQ0=1;MQRankSum=-2.720;QD=0.75;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:68:68,0,683 chrXIV 783823 . T C 160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.405;DP=37;Dels=0.00;FS=3.235;HaplotypeScore=32.0041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.00;MQ0=3;MQRankSum=1.249;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.104;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:94:190,0,94 chrXIV 783832 . G A 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.2135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.01;MQ0=3;MQRankSum=-0.581;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.249;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:74:74,0,204 chrXIV 783867 . G A 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.638;DP=37;Dels=0.00;FS=5.663;HaplotypeScore=8.7948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.70;MQ0=3;MQRankSum=0.331;QD=0.38;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:44:44,0,291 chrXIV 783871 . G A 295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;DP=37;Dels=0.00;FS=3.666;HaplotypeScore=14.6161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.70;MQ0=3;MQRankSum=0.176;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.430;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:37:325,0,37 chrXIV 783914 . T G 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.795;DP=30;Dels=0.00;FS=10.772;HaplotypeScore=9.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=0.41;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,7:30:42:42,0,464 chrXIV 783929 . A G 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.678;DP=27;Dels=0.00;FS=14.328;HaplotypeScore=10.6672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=1.63;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-6.518e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:74:74,0,374 chrXIV 783968 . C A,G 264.14 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.1143;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=26.65;MQ0=0;QD=7.77;SB=-3.021e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,8,26:34:42:324,249,240,75,0,42 chrXIV 783972 . A T 287 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.4924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.07;MQ0=0;QD=10.25;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:28:36:320,36,0 chrXIV 783973 . A G 254.64 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;DP=28;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=18.4712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.07;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-2.606e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:11:287,11,0 chrXIV 783977 . A G 59.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.865;DP=34;Dels=0.00;FS=3.382;HaplotypeScore=34.7860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.09;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=1.74;ReadPosRankSum=-2.396;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:89:89,0,135 chrXIV 783984 . T G 51.04 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.3063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.63;MQ0=0;QD=2.13;SB=-4.428e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:24:9:83,9,0 chrXIV 783985 . A G 40.22 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.053;DP=24;Dels=0.00;FS=2.580;HaplotypeScore=33.1723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.63;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=1.68;ReadPosRankSum=2.363;SB=-6.218e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:10:70,0,10 chrXIV 783997 . T G 40.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.321;DP=20;Dels=0.00;FS=2.694;HaplotypeScore=42.6079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.85;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.510;SB=-2.105e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:20:17:70,0,17 chrXIV 784006 . G T 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;DP=18;Dels=0.00;FS=13.667;HaplotypeScore=53.2568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.71;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=0.73;ReadPosRankSum=-1.545;SB=-1.006e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:43:43,0,43 chrXIV 784056 . T G 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;DP=55;Dels=0.02;FS=4.570;HaplotypeScore=87.1015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.92;MQ0=4;MQRankSum=1.282;QD=0.35;ReadPosRankSum=0.979;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,5:54:49:49,0,142 chrXIV 784082 . G T 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;DP=80;Dels=0.03;FS=5.656;HaplotypeScore=110.2040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.46;MQ0=10;MQRankSum=1.056;QD=0.13;ReadPosRankSum=-1.875;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,9:78:40:40,0,392 chrXIV 784253 . G T 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;DP=77;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=92.4029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.26;MQ0=10;MQRankSum=0.533;QD=0.16;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,6:75:42:42,0,225 chrXV 467 . T C 60.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.19;MQ0=0;QD=10.09;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:93,12,0 chrXV 475 . C T 33.24 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.35;MQ0=1;QD=4.16;SB=15.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:8:9:65,9,0 chrXV 483 . C A 88.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.82;MQ0=1;QD=9.81;SB=-5.576e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:15:121,15,0 chrXV 495 . T C 86.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.45;MQ0=1;QD=7.84;SB=-8.176e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:119,15,0 chrXV 525 . T C 115.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.45;MQ0=1;QD=10.47;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:18:148,18,0 chrXV 529 . C T 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;DP=11;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=3.7474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.45;MQ0=1;MQRankSum=2.383;QD=3.55;ReadPosRankSum=-2.383;SB=-6.476e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:47:69,0,47 chrXV 587 . G T 84.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.17;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.736;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:12:117,12,0 chrXV 594 . G A 80.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.10;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:113,12,0 chrXV 618 . T G 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.39;SB=-2.676e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 chrXV 732 . G A 13.94 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.82;MQ0=1;QD=2.79;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:45,6,0 chrXV 818 . T C 81.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;DP=23;Dels=0.00;FS=7.911;HaplotypeScore=2.9419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.61;MQ0=6;MQRankSum=-0.151;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.256;SB=-3.684e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:70:111,0,70 chrXV 819 . T C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.434;DP=23;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=2.9419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.61;MQ0=6;MQRankSum=0.283;QD=0.49;ReadPosRankSum=-1.755;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:41:41,0,140 chrXV 851 . A G 32.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.81;MQ0=2;QD=4.71;SB=-4.221e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:65,9,0 chrXV 884 . T A 32.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.72;MQ0=1;QD=8.24;SB=-2.121e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:65,9,0 chrXV 11068 . G A 32.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.72;MQ0=1;QD=8.24;SB=-2.121e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:65,9,0 chrXV 11114 . T C 32.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.13;MQ0=4;QD=4.71;SB=-2.121e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,4:7:9:65,9,0 chrXV 11127 . G A 32.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.36;MQ0=14;MQRankSum=1.231;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.231;SB=-2.121e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,4:19:9:65,9,0 chrXV 11147 . G A 32.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.84;MQ0=17;MQRankSum=1.231;QD=1.50;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-2.121e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,4:22:9:65,9,0 chrXV 11158 . C T 32.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.00;MQ0=16;MQRankSum=1.231;QD=1.57;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-2.121e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,3:21:9:65,9,0 chrXV 11627 . G A 28.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=3;QD=4.79;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:6:60,6,0 chrXV 11648 . G C 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=3;QD=4.13;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:56,6,0 chrXV 11662 . A C 137.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.58;MQ0=3;QD=12.46;SB=-4.053e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:21:170,21,0 chrXV 11720 . G A 119.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.99;MQ0=31;MQRankSum=-2.589;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.555;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:45:149,0,45 chrXV 11723 . T C 121.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;DP=43;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.99;MQ0=31;MQRankSum=-1.239;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.468;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:26:151,0,26 chrXV 11735 . A C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.62;MQ0=34;MQRankSum=1.557;QD=0.24;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,9:48:41:41,0,202 chrXV 11804 . C T 232.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.644;DP=60;Dels=0.00;FS=3.163;HaplotypeScore=4.7718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.92;MQ0=31;MQRankSum=0.720;QD=3.87;ReadPosRankSum=-1.637;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:262,0,250 chrXV 11810 . C A 576 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.435;DP=58;Dels=0.00;FS=18.304;HaplotypeScore=4.7718;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.22;MQ0=29;MQRankSum=1.423;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.739;SB=-6.692e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,26:58:44:609,44,0 chrXV 11862 . C G 228.19 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.18;MQ0=1;MQRankSum=-1.735;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.531;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:260,8,0 chrXV 11863 . C T 254 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.86;MQ0=1;QD=14.94;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:33:287,33,0 chrXV 11876 . G A 178.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.68;MQ0=0;QD=11.87;SB=-3.228e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:24:211,24,0 chrXV 11888 . A G 142.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.77;MQ0=0;QD=8.88;SB=-7.062e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:21:175,21,0 chrXV 11913 . A G 422 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.97;MQ0=0;QD=16.23;SB=-6.586e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:51:455,51,0 chrXV 11924 . G A 456 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.09;MQ0=0;QD=16.89;SB=-6.553e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:54:489,54,0 chrXV 11930 . T C 486 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.20;MQ0=0;QD=17.36;SB=-6.536e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:57:519,57,0 chrXV 11935 . C T 608 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.31;MQ0=0;QD=21.71;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:69:641,69,0 chrXV 11940 . A G 587 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=0;QD=20.24;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:69:620,69,0 chrXV 11962 . G A 597 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.275;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=21.32;ReadPosRankSum=2.275;SB=4.400e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:66:630,66,0 chrXV 11966 . A G 570 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=0;QD=21.92;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:66:603,66,0 chrXV 11969 . A G 586 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=0;QD=22.54;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:66:619,66,0 chrXV 11970 . A G 567 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=0;QD=21.81;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:66:600,66,0 chrXV 11972 . A T 589 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=0;QD=22.65;SB=-6.521e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:66:622,66,0 chrXV 11984 . A G 481 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.66;MQ0=0;QD=17.18;SB=-6.537e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:57:514,57,0 chrXV 11989 . C T 367 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.68;SB=-7.065e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:42:400,42,0 chrXV 11990 . A G 352 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=16.00;SB=-7.065e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:42:385,42,0 chrXV 11992 . T A 375 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.05;SB=-7.065e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:42:408,42,0 chrXV 11998 . C T 619 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.30;MQ0=0;QD=15.10;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:72:652,72,0 chrXV 12017 . G T 1460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.59;MQ0=0;QD=21.16;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1493,156,0 chrXV 12027 . G A 1394 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.72;MQ0=0;QD=20.20;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1427,153,0 chrXV 12028 . T C 1341 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.72;MQ0=0;QD=19.43;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1374,153,0 chrXV 12048 . T C 1601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=20.79;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1634,180,0 chrXV 12243 . T C 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=25.07;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3535,378,0 chrXV 12324 . G C 2203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.81;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2236,231,0 chrXV 12517 . G A 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.48;SB=-2.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3695,361,0 chrXV 12807 . C T 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.624;DP=82;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.487;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,42:82:99:960,0,839 chrXV 12820 . C T 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=1;QD=26.79;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2953,297,0 chrXV 12966 . T C 292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9369;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.18;MQ0=0;QD=2.39;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:36:325,36,0 chrXV 12983 . G A 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.839;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=8.77;ReadPosRankSum=3.134;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1153,0,1527 chrXV 13203 . G A 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3239,339,0 chrXV 13517 . A C 2229 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2262,228,0 chrXV 13893 . C T 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.70;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3545,355,0 chrXV 14011 . G A 162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.421;DP=125;Dels=0.02;FS=4.435;HaplotypeScore=114.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.414;QD=1.30;ReadPosRankSum=-3.960;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:192,0,532 chrXV 14017 . G A 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;DP=124;Dels=0.01;FS=144.169;HaplotypeScore=85.0587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.32;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=0.18;ReadPosRankSum=-6.790;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,37:123:52:52,0,593 chrXV 14028 . A G 149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;DP=104;Dels=0.00;FS=14.578;HaplotypeScore=83.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=1.43;ReadPosRankSum=2.812;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,101:104:47:179,0,47 chrXV 14057 . T A 2277 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.13;MQ0=0;QD=20.15;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2310,234,0 chrXV 14112 . T C 3748.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3748,384,0 chrXV 14199 . C T 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.09;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2689,270,0 chrXV 14200 . T C 2530 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.69;MQ0=0;QD=25.30;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2563,267,0 chrXV 14256 . A G 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.87;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2601,276,0 chrXV 14268 . A T 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.65;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2578,264,0 chrXV 14482 . T C 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2896,303,0 chrXV 14491 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.758;DP=100;Dels=0.00;FS=3.905;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.393;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1050,0,1051 chrXV 14852 . A G 2329 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2362,246,0 chrXV 14884 . G A 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2747,270,0 chrXV 14977 . G T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.688;DP=116;Dels=0.00;FS=3.397;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.629;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:1062,0,1327 chrXV 15083 . G A 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3597,340,0 chrXV 15156 . G C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.059;DP=123;Dels=0.00;FS=2.528;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=8.57;ReadPosRankSum=-2.051;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1084,0,1492 chrXV 15180 . G C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.031;DP=132;Dels=0.00;FS=6.863;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1136,0,1648 chrXV 15182 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.182;DP=134;Dels=0.00;FS=8.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.152;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1612,0,1267 chrXV 15215 . G T 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.937e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3801,376,0 chrXV 15225 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.332;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:139:99:1565,0,1364 chrXV 15266 . T G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.606;DP=114;Dels=0.00;FS=3.417;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1220,0,1246 chrXV 15440 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.215;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.169;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1162,0,1524 chrXV 15476 . C A 558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.988;DP=87;Dels=0.00;FS=13.803;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=6.41;ReadPosRankSum=1.567;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:588,0,1179 chrXV 15520 . C A 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.522;DP=108;Dels=0.00;FS=5.965;HaplotypeScore=4.5795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:935,0,1303 chrXV 15534 . G A 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3085,306,0 chrXV 15548 . T C 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2908,300,0 chrXV 15566 . T C 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.931;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:892,0,1153 chrXV 15624 . T C 916.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.704;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.812;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:946,0,1382 chrXV 15625 . G C 945.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;DP=116;Dels=0.00;FS=1.672;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.974;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.192;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:975,0,1352 chrXV 15630 . G C 2879 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.47;MQ0=0;QD=24.61;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2912,300,0 chrXV 15658 . T C 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.033;DP=138;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.520;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1318,0,1435 chrXV 15682 . G A 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.740;DP=104;Dels=0.00;FS=7.527;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.362;QD=9.54;ReadPosRankSum=3.134;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1022,0,1028 chrXV 15708 . C T 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.018;DP=113;Dels=0.00;FS=10.676;HaplotypeScore=5.6840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQ0=0;MQRankSum=3.149;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.692;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:937,0,1368 chrXV 15796 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.642;DP=109;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=8.7600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.385;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1173,0,1134 chrXV 15833 . C A 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.277;DP=112;Dels=0.00;FS=12.370;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.289;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1225,0,1148 chrXV 16092 . G T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.384;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.792;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1423,0,1061 chrXV 16128 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.366;DP=121;Dels=0.00;FS=1.573;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1386,0,1173 chrXV 16186 . T C 1386.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.752;DP=134;Dels=0.00;FS=5.289;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.361;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1416,0,1223 chrXV 16191 . C T 1532.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.245;DP=127;Dels=0.00;FS=11.323;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.373;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1562,0,1088 chrXV 16195 . G T 877.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.913;DP=114;Dels=0.00;FS=3.547;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.603;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,45:114:99:907,0,1419 chrXV 16225 . A C 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.076;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.911;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,83:141:99:1755,0,1168 chrXV 16271 . T C 1814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.574;DP=148;Dels=0.00;FS=9.140;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.117;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,89:148:99:1844,0,1237 chrXV 16294 . C T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.698;DP=152;Dels=0.00;FS=15.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.102;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,59:152:99:1225,0,2049 chrXV 16325 . T C 739.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.634;DP=134;Dels=0.00;FS=17.673;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=5.51;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,45:134:99:769,0,2109 chrXV 16329 . T A 3154 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.05;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3187,333,0 chrXV 16330 . T C 3080 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.05;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3113,330,0 chrXV 16388 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.810;DP=111;Dels=0.00;FS=12.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQ0=0;MQRankSum=1.990;QD=12.16;ReadPosRankSum=-1.579;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:111:99:1380,0,928 chrXV 16421 . T C 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2910,297,0 chrXV 16550 . G C 2717 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.36;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2750,297,0 chrXV 16553 . G A 2803 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2836,297,0 chrXV 16560 . C T 2921 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.36;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2954,303,0 chrXV 16657 . C T 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.60;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2839,291,0 chrXV 16901 . T C 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3682,378,0 chrXV 16948 . T C 3820.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.18;MQ0=0;QD=25.81;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3820,402,0 chrXV 16960 . A G 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=24.73;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3198,354,0 chrXV 16970 . T C 3171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.92;MQ0=0;QD=25.17;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3204,339,0 chrXV 17051 . G A 3705.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3705,370,0 chrXV 17074 . C T 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3644,367,0 chrXV 17077 . A G 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3662,378,0 chrXV 17174 . G C 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3336,342,0 chrXV 17278 . C T 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2767,294,0 chrXV 17315 . G A 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2769,273,0 chrXV 17341 . T A 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2627,258,0 chrXV 17360 . T C 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2696,273,0 chrXV 17381 . T C 2354 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2387,252,0 chrXV 17422 . T G 2607 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2640,279,0 chrXV 17449 . T C 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.90;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2866,309,0 chrXV 17527 . A T 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.26;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3329,340,0 chrXV 17596 . C T 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.36;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3369,336,0 chrXV 17634 . A C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.87;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2967,315,0 chrXV 17668 . T G 2367 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.77;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2400,249,0 chrXV 17719 . G A 2132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.23;MQ0=0;QD=25.08;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2165,231,0 chrXV 17727 . T C 1617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.92;MQ0=0;QD=21.00;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1650,180,0 chrXV 17746 . T A 1180 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.03;MQ0=0;QD=19.67;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1213,129,0 chrXV 17749 . T G 1051 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.09;MQ0=0;QD=16.42;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1084,123,0 chrXV 17753 . T C 1002 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.69;MQ0=0;QD=16.43;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1035,114,0 chrXV 17771 . C T 966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.84;MQ0=0;QD=16.66;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:999,108,0 chrXV 17782 . A G 890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.65;MQ0=0;QD=16.18;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:923,99,0 chrXV 17797 . T A 570 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.62;MQ0=0;QD=11.40;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:78:603,78,0 chrXV 17800 . T C 240 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=12.63;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:36:273,36,0 chrXV 17802 . A T 240 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=12.63;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:36:273,36,0 chrXV 17803 . C T 269 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=14.16;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:39:302,39,0 chrXV 17807 . G C 319 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=16.79;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:39:352,39,0 chrXV 17809 . C T 323 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=17.00;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:39:356,39,0 chrXV 17811 . C T 332 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=17.47;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:39:365,39,0 chrXV 17813 . C A 329 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=17.32;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:39:362,39,0 chrXV 17816 . C G 308 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=16.21;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:39:341,39,0 chrXV 17831 . T C 318 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=9.94;SB=-7.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:39:351,39,0 chrXV 17848 . T A 229.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9227;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.56;MQ0=0;QD=10.41;SB=-8.302e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:27:262,27,0 chrXV 17850 . G C,T 164.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9227;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=28.56;MQ0=0;QD=7.45;SB=-7.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,14,8:22:81:224,128,116,96,0,81 chrXV 17867 . T A 256 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=0;QD=9.85;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:30:289,30,0 chrXV 17868 . G A 251 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.63;MQ0=0;QD=9.65;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:30:284,30,0 chrXV 17901 . G C 194.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=24.8050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=5.88;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:24:227,24,0 chrXV 17907 . G T 256 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.26;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:30:289,30,0 chrXV 17908 . T C 246 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.94;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:30:279,30,0 chrXV 17911 . T A 253 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=7.91;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:30:286,30,0 chrXV 17917 . A G 264 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=0;QD=9.10;SB=-1.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:33:297,33,0 chrXV 17923 . C T 356 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;QD=10.79;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:42:389,42,0 chrXV 17928 . C T 332 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.38;MQ0=0;QD=10.71;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:39:365,39,0 chrXV 17929 . C T 330 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.38;MQ0=0;QD=10.65;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:39:363,39,0 chrXV 17935 . A G 301 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=0;QD=11.15;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:27:36:334,36,0 chrXV 17938 . G A 299 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=0;QD=11.07;SB=-8.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:36:332,36,0 chrXV 17942 . T A 333 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;QD=10.09;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:39:366,39,0 chrXV 17945 . T A 335 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=10.47;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:39:368,39,0 chrXV 17955 . A G 308 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.45;MQ0=0;QD=8.80;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:39:341,39,0 chrXV 17958 . T G 292 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.36;MQ0=0;QD=9.73;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:36:325,36,0 chrXV 17960 . A C 294 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.36;MQ0=0;QD=9.80;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:36:327,36,0 chrXV 17964 . T G 283 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=8.84;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:36:316,36,0 chrXV 17966 . A C 274 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.40;MQ0=0;QD=8.56;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:36:307,36,0 chrXV 18001 . A G 246 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.600;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:30:279,30,0 chrXV 18005 . C G 262 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.88;MQ0=0;QD=10.08;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:33:295,33,0 chrXV 18013 . T C 115.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=5.76;SB=-5.514e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:18:148,18,0 chrXV 18015 . C T 115.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=5.76;SB=-5.714e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:18:148,18,0 chrXV 18016 . C T 115.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=5.76;SB=-5.814e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:18:148,18,0 chrXV 18017 . G A 125.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=0;QD=6.26;SB=-5.514e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:18:158,18,0 chrXV 18020 . T G 127.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.60;MQ0=0;QD=5.30;SB=-8.314e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:18:160,18,0 chrXV 18026 . T C 116.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.60;MQ0=0;QD=4.84;SB=-8.514e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:18:149,18,0 chrXV 18028 . A G 123.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.60;MQ0=0;QD=5.13;SB=-8.314e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:18:156,18,0 chrXV 18031 . C G 124.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.60;MQ0=0;QD=5.17;SB=-8.314e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:18:157,18,0 chrXV 18045 . G A 160.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=8.42;SB=-1.721e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:193,21,0 chrXV 18046 . G C 156.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=8.21;SB=-1.641e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:189,21,0 chrXV 18051 . T C 130.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=6.85;SB=-1.921e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:18:163,18,0 chrXV 18056 . C T 130.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=6.20;SB=-2.551e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:18:163,18,0 chrXV 18058 . A G 129.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=6.15;SB=-2.521e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:18:162,18,0 chrXV 18067 . G A 162.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=8.53;SB=-2.281e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:195,21,0 chrXV 18074 . C G 159.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=8.37;SB=-2.221e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:192,21,0 chrXV 18076 . G T 159.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=8.37;SB=-2.261e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:192,21,0 chrXV 18079 . T C 157.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=8.27;SB=-2.191e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:190,21,0 chrXV 18081 . T A 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;DP=20;Dels=0.00;FS=16.665;HaplotypeScore=11.5981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.52;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=1.75;ReadPosRankSum=2.279;SB=-2.600e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:65:65,0,85 chrXV 18084 . C T 131.13 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.49;MQ0=0;QD=6.90;SB=-2.601e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:18:164,18,0 chrXV 18103 . A G 104.26 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.13;SB=-1.633e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:15:137,15,0 chrXV 18107 . A G 152.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=8.00;SB=-1.901e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:185,21,0 chrXV 18113 . C T 194.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.78;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:24:227,24,0 chrXV 18115 . T C 186.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.34;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:24:219,24,0 chrXV 18134 . G A 246 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.18;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:30:279,30,0 chrXV 18141 . T A 199.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=9.95;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:24:232,24,0 chrXV 18144 . G T 193.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.16;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:24:226,24,0 chrXV 18146 . A G 191.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.05;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:24:224,24,0 chrXV 18149 . C T 196.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.9013;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=10.32;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:24:229,24,0 chrXV 18154 . G A 195.03 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.9013;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=11.47;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:24:228,24,0 chrXV 18171 . T C 201.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.09;MQ0=0;QD=9.14;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:27:234,27,0 chrXV 18193 . G A 673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.20;MQ0=0;QD=18.69;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:75:706,75,0 chrXV 18200 . G T 902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.64;MQ0=0;QD=22.00;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:96:935,96,0 chrXV 18217 . A G 412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.602;DP=58;Dels=0.00;FS=2.250;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:442,0,728 chrXV 18351 . A C 252 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=16.80;SB=-1.060e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:33:285,33,0 chrXV 19033 . A G 14.18 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=7.09;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:3:44,3,0 chrXV 19145 . A G 727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.01;MQ0=0;QD=18.17;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:40:84:760,84,0 chrXV 19187 . C T 126.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=38.4739;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.74;MQ0=0;QD=2.87;SB=-8.614e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:18:159,18,0 chrXV 19219 . A G 577 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.38;MQ0=0;QD=15.18;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:69:610,69,0 chrXV 19243 . G T 649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.79;MQ0=0;QD=17.08;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:72:682,72,0 chrXV 19244 . T C 627 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.79;MQ0=0;QD=16.50;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:72:660,72,0 chrXV 19273 . G T 1291 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.03;MQ0=0;QD=22.65;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1324,138,0 chrXV 19279 . A G 1407 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.30;MQ0=0;QD=22.33;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1440,156,0 chrXV 19349 . G A 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.008;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=25.83;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2874,258,0 chrXV 19449 . A G 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=1;MQRankSum=-0.920;QD=24.65;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3237,312,0 chrXV 19593 . G A 2548 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2581,261,0 chrXV 19641 . G C 2708 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2741,294,0 chrXV 19682 . C A 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.496;DP=134;Dels=0.00;FS=5.265;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=1;MQRankSum=-0.358;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.634;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,78:134:99:1715,0,1105 chrXV 19911 . G A 3401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3401,348,0 chrXV 20036 . T G 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3300,324,0 chrXV 20317 . T C 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.379;DP=118;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.547;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.012;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1063,0,1455 chrXV 20373 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.424;DP=116;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.715;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1114,0,1248 chrXV 20385 . C T 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.413;DP=94;Dels=0.00;FS=2.726;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=10.71;ReadPosRankSum=2.324;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1037,0,941 chrXV 20454 . G A 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.761;DP=86;Dels=0.00;FS=0.856;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.709;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:796,0,1046 chrXV 20484 . A T 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;DP=95;Dels=0.00;FS=6.580;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.247;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:910,0,1163 chrXV 20532 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.037;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.703;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1286,0,1300 chrXV 20557 . C T 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.294;DP=111;Dels=0.00;FS=3.996;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.280;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1211,0,1189 chrXV 20583 . C T 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.460;DP=123;Dels=0.00;FS=5.639;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1349,0,1203 chrXV 20601 . T G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.329;DP=117;Dels=0.00;FS=7.218;HaplotypeScore=2.8807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=9.86;ReadPosRankSum=2.009;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1184,0,1317 chrXV 20673 . A G 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.509;DP=144;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.874;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.488;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1463,0,1583 chrXV 20846 . A G 845.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.276;DP=124;Dels=0.00;FS=1.537;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.89;MQ0=0;MQRankSum=-8.113;QD=6.81;ReadPosRankSum=-1.557;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,48:124:99:875,0,1752 chrXV 20854 . G C 679.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.457;DP=123;Dels=0.00;FS=5.989;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=-8.576;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.435;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,44:123:99:709,0,1763 chrXV 20855 . A C 691.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.255;DP=123;Dels=0.00;FS=5.945;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=-8.466;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.562;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,44:123:99:721,0,1867 chrXV 20859 . C T 793.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.951;DP=135;Dels=0.00;FS=3.172;HaplotypeScore=2.4805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.84;MQ0=0;MQRankSum=-9.173;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.438;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:135:99:823,0,1666 chrXV 20865 . A T 587.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.803;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQ0=0;MQRankSum=-9.782;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.405;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,52:136:99:617,0,1972 chrXV 20868 . A G 578.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.450;DP=132;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.42;MQ0=0;MQRankSum=-9.688;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.051;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:608,0,1823 chrXV 20871 . A G 539.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.782;DP=131;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=0;MQRankSum=-9.691;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.270;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:569,0,1808 chrXV 20889 . A C 524.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.919;DP=122;Dels=0.00;FS=2.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQ0=1;MQRankSum=-9.298;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,50:122:99:554,0,1659 chrXV 20891 . T C 507.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.305;DP=127;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=1;MQRankSum=-9.462;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.716;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,50:127:99:537,0,1752 chrXV 20898 . G A 865.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.333;DP=141;Dels=0.00;FS=8.883;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.90;MQ0=1;MQRankSum=-10.094;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.520;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,63:141:99:895,0,1707 chrXV 20904 . A C 740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.586;DP=129;Dels=0.00;FS=14.895;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.51;MQ0=1;MQRankSum=-9.617;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:770,0,1661 chrXV 20913 . A G 688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;DP=125;Dels=0.00;FS=13.493;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.55;MQ0=1;MQRankSum=-9.455;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:718,0,1627 chrXV 20931 . T C 664.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.547;DP=119;Dels=0.00;FS=21.138;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQ0=1;MQRankSum=-9.261;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.362;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:694,0,1577 chrXV 20937 . C T 720.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.817;DP=116;Dels=0.00;FS=19.205;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.04;MQ0=1;MQRankSum=-9.179;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:750,0,1423 chrXV 20940 . A G 687.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.762;DP=115;Dels=0.00;FS=19.184;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.18;MQ0=1;MQRankSum=-9.158;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:717,0,1474 chrXV 20943 . A C 671.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.207;DP=114;Dels=0.00;FS=19.757;HaplotypeScore=4.6503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.06;MQ0=1;MQRankSum=-9.125;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.251;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:701,0,1429 chrXV 20946 . T C 759.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.770;DP=122;Dels=0.00;FS=20.660;HaplotypeScore=3.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.16;MQ0=1;MQRankSum=-8.222;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.195;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:789,0,1521 chrXV 21003 . C T 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.640;DP=159;Dels=0.00;FS=0.582;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQ0=0;MQRankSum=-4.163;QD=11.17;ReadPosRankSum=2.558;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1806,0,1473 chrXV 21119 . C T 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.549;DP=153;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.308;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1480,0,1505 chrXV 21156 . G A 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.832;DP=150;Dels=0.00;FS=2.056;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.647;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1639,0,1539 chrXV 21216 . G A 1834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.952;DP=151;Dels=0.00;FS=2.058;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.984;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.789;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,89:151:99:1864,0,1268 chrXV 21418 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.657;DP=135;Dels=0.00;FS=11.283;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.565;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1449,0,1309 chrXV 21432 . A G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.770;DP=129;Dels=0.00;FS=9.904;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.564;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1375,0,1213 chrXV 21512 . A G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.611;DP=135;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.517;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1316,0,1332 chrXV 21536 . G A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.803;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.915;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.366;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1266,0,1557 chrXV 21545 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.250;DP=139;Dels=0.00;FS=7.642;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.273;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.963;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1290,0,1419 chrXV 21557 . C T 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.996;DP=160;Dels=0.00;FS=3.682;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.290;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1519,0,1609 chrXV 21565 . G A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.532;DP=156;Dels=0.00;FS=2.842;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.573;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.673;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1504,0,1524 chrXV 21624 . T G 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.341;DP=128;Dels=0.00;FS=5.536;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=8.34;ReadPosRankSum=3.057;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1097,0,1566 chrXV 21662 . G A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;DP=116;Dels=0.00;FS=4.080;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.370;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:1075,0,1443 chrXV 21803 . T A 533.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;DP=70;Dels=0.00;FS=1.953;HaplotypeScore=11.0859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.89;MQ0=0;MQRankSum=-6.894;QD=7.61;ReadPosRankSum=-2.612;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:563,0,615 chrXV 21804 . T A 529.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;DP=69;Dels=0.00;FS=0.917;HaplotypeScore=11.0859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.64;MQ0=0;MQRankSum=-7.129;QD=7.67;ReadPosRankSum=-2.834;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,37:69:99:559,0,650 chrXV 21807 . A G 499.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;DP=70;Dels=0.00;FS=1.950;HaplotypeScore=10.3520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.915;QD=7.13;ReadPosRankSum=-2.250;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:529,0,618 chrXV 21835 . C T 697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.386;DP=97;Dels=0.00;FS=2.810;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQ0=0;MQRankSum=-6.923;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.945;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:727,0,1055 chrXV 21866 . A G 853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.907;DP=104;Dels=0.00;FS=15.357;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.75;MQ0=0;MQRankSum=-4.528;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:883,0,1206 chrXV 21902 . G A 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.340;DP=121;Dels=0.00;FS=4.490;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=-4.108;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.645;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:928,0,1501 chrXV 21909 . T C 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.176;DP=135;Dels=0.00;FS=4.261;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.111;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.781;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,51:135:99:913,0,1842 chrXV 21973 . A T 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.208;DP=141;Dels=0.00;FS=5.256;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=8.62;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,61:141:99:1245,0,1703 chrXV 22018 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.880;DP=127;Dels=0.00;FS=6.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.030;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.956;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1163,0,1433 chrXV 22043 . T A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;DP=120;Dels=0.00;FS=5.526;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.910;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1166,0,1362 chrXV 22094 . T A 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.260;DP=125;Dels=0.00;FS=1.420;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQ0=0;MQRankSum=-5.696;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:125:99:1065,0,1462 chrXV 22105 . T A 739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;DP=102;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQ0=0;MQRankSum=-5.361;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:769,0,1286 chrXV 22110 . A G 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.407;DP=106;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.28;MQ0=0;MQRankSum=-5.733;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.933;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,43:106:99:767,0,1413 chrXV 22116 . G A 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.389;DP=118;Dels=0.00;FS=4.661;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-6.528;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.545;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:776,0,1343 chrXV 22150 . A G 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.100;DP=141;Dels=0.00;FS=12.508;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.71;MQ0=0;MQRankSum=-6.165;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.817;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1009,0,1421 chrXV 22181 . T C 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.857;DP=116;Dels=0.00;FS=7.423;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.77;MQ0=0;MQRankSum=-6.667;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.543;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:763,0,1180 chrXV 22183 . A G 704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.075;DP=121;Dels=0.00;FS=7.148;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.14;MQ0=0;MQRankSum=-7.131;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.971;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:734,0,1285 chrXV 22194 . G T 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.577;DP=112;Dels=0.00;FS=6.338;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQ0=0;MQRankSum=-6.518;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-1.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:112:99:714,0,1075 chrXV 22209 . G A 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.207;DP=108;Dels=0.00;FS=1.714;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.69;MQ0=0;MQRankSum=-6.398;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.993;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:728,0,1205 chrXV 22235 . T G 292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.442;DP=102;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-7.760;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.317;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,35:102:99:322,0,1602 chrXV 22262 . A G 89.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.831;DP=101;Dels=0.00;FS=3.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.86;MQ0=0;MQRankSum=-7.577;QD=0.88;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,26:101:99:119,0,1753 chrXV 22264 . T C 98.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.943;DP=102;Dels=0.00;FS=3.030;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.95;MQ0=0;MQRankSum=-7.590;QD=0.96;ReadPosRankSum=-1.294;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:128,0,1785 chrXV 22272 . G A 49.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.064;DP=105;Dels=0.00;FS=1.921;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQ0=0;MQRankSum=-7.421;QD=0.47;ReadPosRankSum=-2.812;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:79:79,0,1871 chrXV 22651 . A G 154.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.389;DP=98;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.91;MQ0=7;MQRankSum=-5.075;QD=1.57;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,29:98:99:184,0,1541 chrXV 22720 . C A 416.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.841;DP=157;Dels=0.00;FS=28.924;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.64;MQ0=10;MQRankSum=-4.878;QD=2.65;ReadPosRankSum=3.537;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,50:157:99:446,0,2026 chrXV 22864 . T C 675.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.872;DP=159;Dels=0.00;FS=38.855;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.01;MQ0=21;MQRankSum=-3.756;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.476;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,55:159:99:705,0,1717 chrXV 22907 . G A 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.425;DP=109;Dels=0.00;FS=5.585;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.23;MQ0=31;MQRankSum=1.032;QD=0.46;ReadPosRankSum=1.212;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:80:80,0,1087 chrXV 23197 . C T 438.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.774;DP=132;Dels=0.00;FS=26.736;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.53;MQ0=1;MQRankSum=-8.202;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.901;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,29:132:99:468,0,2381 chrXV 23200 . A G 400.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.768;DP=134;Dels=0.00;FS=26.796;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.54;MQ0=1;MQRankSum=-8.220;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.722;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,29:134:99:430,0,2462 chrXV 23611 . G A 983.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.702;DP=158;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.26;MQ0=4;MQRankSum=-1.602;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.905;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,71:158:99:1013,0,1579 chrXV 23614 . T C 886.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.785;DP=161;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.03;MQ0=5;MQRankSum=-1.655;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.868;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,72:161:99:916,0,1652 chrXV 23863 . G A 350.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.871;DP=84;Dels=0.00;FS=5.427;HaplotypeScore=3.9909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.89;MQ0=24;MQRankSum=-1.783;QD=4.17;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,39:84:99:380,0,566 chrXV 24109 . G A 191.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.002;DP=179;Dels=0.00;FS=39.151;HaplotypeScore=9.4692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.39;MQ0=11;MQRankSum=-4.907;QD=1.07;ReadPosRankSum=1.141;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,25:179:99:221,0,3076 chrXV 24115 . T C 194.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.841;DP=168;Dels=0.00;FS=35.192;HaplotypeScore=5.5008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.03;MQ0=11;MQRankSum=-5.628;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.426;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,26:168:99:224,0,2817 chrXV 24134 . G A 443.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.010;DP=149;Dels=0.00;FS=32.311;HaplotypeScore=16.4109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.85;MQ0=8;MQRankSum=-3.085;QD=2.97;ReadPosRankSum=2.672;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,48:149:99:473,0,2184 chrXV 24145 . T C 641.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.410;DP=149;Dels=0.00;FS=14.342;HaplotypeScore=34.2073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.94;MQ0=7;MQRankSum=-5.890;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,61:149:99:671,0,1974 chrXV 24151 . A G 212.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.778;DP=142;Dels=0.00;FS=58.424;HaplotypeScore=25.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQ0=4;MQRankSum=-6.068;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.466;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,26:142:99:242,0,2461 chrXV 24168 . C A 165.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.868;DP=149;Dels=0.00;FS=31.432;HaplotypeScore=16.4989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQ0=3;MQRankSum=-2.399;QD=1.11;ReadPosRankSum=-1.648;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,28:149:99:195,0,2541 chrXV 24190 . C A,G 2757.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=45.87;MQ0=2;QD=18.88;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,40,105:146:99:2817,2122,2038,695,0,452 chrXV 24352 . C T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.940;DP=158;Dels=0.00;FS=7.280;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.21;MQ0=0;MQRankSum=-8.109;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:158:99:1301,0,1764 chrXV 24376 . G C 706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.254;DP=157;Dels=0.00;FS=2.135;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.859;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,52:156:99:736,0,2344 chrXV 24407 . T C 2232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.007;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.08;MQ0=0;MQRankSum=-5.819;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.388;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,111:167:99:2262,0,1106 chrXV 24486 . G C 2578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.392;DP=216;Dels=0.00;FS=0.561;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.55;MQ0=3;MQRankSum=-1.916;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.492;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,135:216:99:2608,0,1414 chrXV 24539 . T G 502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.460;DP=172;Dels=0.00;FS=4.019;HaplotypeScore=41.5324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.15;MQ0=3;MQRankSum=-2.734;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-6.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,44:172:99:532,0,2852 chrXV 24543 . C A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.329;DP=180;Dels=0.00;FS=2.474;HaplotypeScore=42.4989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.50;MQ0=2;MQRankSum=-0.979;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.965;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,63:180:99:1077,0,2408 chrXV 24561 . A G 466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.401;DP=196;Dels=0.00;FS=5.365;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.66;MQ0=0;MQRankSum=-3.823;QD=2.38;ReadPosRankSum=-2.338;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,45:196:99:496,0,3554 chrXV 24576 . A C 112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.667;DP=185;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.72;MQ0=0;MQRankSum=-5.121;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.902;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,34:185:99:142,0,3573 chrXV 24577 . G C 133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;DP=180;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=-6.078;QD=0.74;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,29:180:99:163,0,3515 chrXV 24588 . G T 190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.472;DP=172;Dels=0.00;FS=1.633;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.61;MQ0=0;MQRankSum=-5.145;QD=1.10;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,29:172:99:220,0,3200 chrXV 24590 . C A 205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.996;DP=172;Dels=0.00;FS=2.587;HaplotypeScore=2.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.61;MQ0=0;MQRankSum=-5.728;QD=1.19;ReadPosRankSum=-1.249;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,30:172:99:235,0,3207 chrXV 24640 . G A 203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.225;DP=205;Dels=0.00;FS=7.451;HaplotypeScore=3.7603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-5.424;QD=0.99;ReadPosRankSum=-1.945;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,35:205:99:233,0,3859 chrXV 24643 . C T 94.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.944;DP=203;Dels=0.00;FS=4.855;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-6.309;QD=0.46;ReadPosRankSum=-2.171;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,33:203:99:124,0,3844 chrXV 24824 . T C 488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.084;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQ0=1;MQRankSum=-3.376;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.989;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,36:89:99:518,0,1237 chrXV 24827 . G A 662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.311;DP=94;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.45;MQ0=1;MQRankSum=-5.084;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.590;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:94:99:692,0,1192 chrXV 24873 . A G 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.713;DP=95;Dels=0.00;FS=6.733;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.71;MQ0=2;MQRankSum=-4.752;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.535;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:858,0,1022 chrXV 24924 . G T 84.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.166;DP=83;Dels=0.00;FS=24.226;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.19;MQ0=1;MQRankSum=-4.858;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.348;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,15:83:99:114,0,1539 chrXV 24981 . A T 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.974;DP=115;Dels=0.00;FS=4.531;HaplotypeScore=22.9417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.94;MQ0=0;MQRankSum=-9.054;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.324;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,48:115:99:712,0,1461 chrXV 24986 . C G 441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.130;DP=126;Dels=0.01;FS=4.788;HaplotypeScore=34.7156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.57;MQ0=0;MQRankSum=-7.320;QD=3.50;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,42:125:99:471,0,1677 chrXV 25015 . A G 511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.045;DP=135;Dels=0.00;FS=4.473;HaplotypeScore=3.5532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.22;MQ0=1;MQRankSum=-9.296;QD=3.79;ReadPosRankSum=-1.010;SB=-1.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,53:135:99:541,0,1782 chrXV 25068 . A G 462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.467;DP=140;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=8.4777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.61;MQ0=1;MQRankSum=-8.377;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.486;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,46:140:99:492,0,1918 chrXV 25071 . G C 526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.908;DP=156;Dels=0.00;FS=4.996;HaplotypeScore=10.4587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.61;MQ0=2;MQRankSum=-9.684;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.412;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,57:156:99:556,0,2019 chrXV 25092 . G A 499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.653;DP=140;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=5.5867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.68;MQ0=1;MQRankSum=-8.515;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.218;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,47:140:99:529,0,2036 chrXV 25130 . T A 347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;DP=117;Dels=0.00;FS=6.441;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.24;MQ0=1;MQRankSum=-8.976;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.750;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,44:117:99:377,0,1743 chrXV 25136 . G A 336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.355;DP=129;Dels=0.00;FS=10.007;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.10;MQ0=1;MQRankSum=-8.279;QD=2.60;ReadPosRankSum=-1.251;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,43:129:99:366,0,1876 chrXV 25152 . T C 469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.916;DP=131;Dels=0.00;FS=9.433;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.73;MQ0=1;MQRankSum=-8.091;QD=3.58;ReadPosRankSum=-2.827;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:499,0,1751 chrXV 25175 . C G 582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;DP=121;Dels=0.00;FS=7.923;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-5.545;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.232;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,48:121:99:612,0,1589 chrXV 25176 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.074;DP=128;Dels=0.00;FS=5.909;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=7.836;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.168;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,77:128:99:1492,0,711 chrXV 25318 . A G 2745 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.39;MQ0=5;QD=24.29;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2778,294,0 chrXV 25319 . T A 3020 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.24;MQ0=5;QD=24.96;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3053,312,0 chrXV 25395 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.179;DP=134;Dels=0.00;FS=3.259;HaplotypeScore=29.5199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.30;MQ0=0;MQRankSum=-3.452;QD=8.28;ReadPosRankSum=2.431;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:134:99:1139,0,1171 chrXV 25407 . G A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.657;DP=125;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=31.7443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.970;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.926;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1353,0,976 chrXV 25443 . G A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.578;DP=81;Dels=0.00;FS=7.483;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.98;MQ0=2;MQRankSum=4.195;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,71:81:33:1492,0,33 chrXV 25464 . G A 424 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.43;MQ0=4;QD=16.31;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:48:457,48,0 chrXV 25488 . C T 77.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.42;MQ0=6;QD=5.17;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12:110,12,0 chrXV 25614 . C T 288.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;DP=39;Dels=0.00;FS=5.999;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.12;MQ0=9;MQRankSum=-0.418;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:75:318,0,75 chrXV 25647 . C A 129.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.347;DP=55;Dels=0.00;FS=3.157;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.31;MQ0=10;MQRankSum=-0.391;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.771;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:159,0,475 chrXV 25680 . T C 359.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.701;DP=55;Dels=0.00;FS=6.930;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.99;MQ0=11;MQRankSum=2.077;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.279;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:389,0,271 chrXV 25722 . T C 112.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.766;DP=52;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=7.7992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.56;MQ0=11;MQRankSum=-2.232;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:142,0,464 chrXV 25724 . T G 292.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;DP=53;Dels=0.00;FS=6.740;HaplotypeScore=7.7992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.49;MQ0=11;MQRankSum=3.088;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:322,0,292 chrXV 25746 . T C 671 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.57;MQ0=13;QD=12.43;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:78:704,78,0 chrXV 25749 . C A 232.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.471;DP=57;Dels=0.00;FS=6.922;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.15;MQ0=13;MQRankSum=1.567;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.410;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:262,0,318 chrXV 25753 . A G 247.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;DP=60;Dels=0.00;FS=6.651;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.14;MQ0=15;MQRankSum=1.518;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.405;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:277,0,329 chrXV 25797 . A C 611.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.18;MQ0=19;MQRankSum=-1.461;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.333;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:92:99:641,0,523 chrXV 25809 . C T 411.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;DP=97;Dels=0.00;FS=0.945;HaplotypeScore=5.7405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.48;MQ0=21;MQRankSum=1.185;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:97:99:441,0,824 chrXV 25821 . T C 780.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.260;DP=92;Dels=0.00;FS=0.943;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.23;MQ0=20;MQRankSum=-0.115;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.700;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:810,0,423 chrXV 25824 . C T 759.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.761;DP=91;Dels=0.00;FS=0.935;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.21;MQ0=20;MQRankSum=-0.076;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.211;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:789,0,417 chrXV 25839 . T C 315.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.756;DP=95;Dels=0.00;FS=3.489;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.50;MQ0=18;MQRankSum=0.716;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.626;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,32:95:99:345,0,989 chrXV 25860 . C T 393.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.043;DP=106;Dels=0.00;FS=8.085;HaplotypeScore=7.3505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.82;MQ0=18;MQRankSum=1.305;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,37:106:99:423,0,1171 chrXV 25869 . T C 1464 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3909;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.15;MQ0=24;QD=15.57;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:1497,156,0 chrXV 25917 . A T 481.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;DP=99;Dels=0.00;FS=89.978;HaplotypeScore=12.5168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.38;MQ0=19;MQRankSum=-0.596;QD=4.86;ReadPosRankSum=2.453;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:511,0,934 chrXV 25923 . T C 245.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.306;DP=100;Dels=0.00;FS=41.444;HaplotypeScore=12.5168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.32;MQ0=19;MQRankSum=0.871;QD=2.45;ReadPosRankSum=2.262;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:100:99:275,0,1236 chrXV 25952 . A C 251.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.411;DP=115;Dels=0.00;FS=13.291;HaplotypeScore=19.3378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.53;MQ0=23;MQRankSum=2.058;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,31:115:99:281,0,1382 chrXV 25954 . G A 215.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.303;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.3311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.77;MQ0=23;MQRankSum=0.249;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,20:114:99:245,0,1379 chrXV 25974 . C T 899.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.557;DP=113;Dels=0.00;FS=8.066;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.25;MQ0=12;MQRankSum=1.129;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:929,0,1000 chrXV 26016 . A G 898.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.299;DP=132;Dels=0.00;FS=7.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.15;MQ0=10;MQRankSum=3.257;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.891;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:928,0,1347 chrXV 26196 . T C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.262;DP=101;Dels=0.00;FS=2.495;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.66;MQ0=14;MQRankSum=-2.420;QD=0.11;ReadPosRankSum=0.387;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:41:41,0,1665 chrXV 26223 . C T 1311.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.357;DP=117;Dels=0.00;FS=5.627;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.99;MQ0=25;MQRankSum=2.980;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1341,0,447 chrXV 26358 . C T 605.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.082;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.58;MQ0=17;MQRankSum=-0.907;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:635,0,1055 chrXV 26465 . C T 537 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.30;MQ0=29;MQRankSum=-0.657;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.375;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,53:58:40:570,40,0 chrXV 26538 . C A 363 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.52;MQ0=23;QD=7.89;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:46:42:396,42,0 chrXV 26574 . C T 140.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;DP=36;Dels=0.00;FS=10.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.21;MQ0=18;MQRankSum=0.903;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.690;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:26:170,0,26 chrXV 26613 . C T 69.14 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;DP=28;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.52;MQ0=15;MQRankSum=0.231;QD=2.47;ReadPosRankSum=-2.855;SB=-2.907e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:12:99,0,12 chrXV 26643 . G A 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.53;MQ0=12;QD=2.94;SB=-2.821e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:9:82,9,0 chrXV 26706 . T C 39.05 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.51;MQ0=8;MQRankSum=0.736;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:17:69,0,17 chrXV 26718 . A G 16.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.74;MQ0=7;MQRankSum=0.731;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:20:46,0,20 chrXV 26744 . A T 19.08 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.42;MQ0=11;MQRankSum=0.736;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:20:49,0,20 chrXV 26754 . C T 139.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.99;MQ0=24;QD=3.98;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:18:172,18,0 chrXV 26877 . G A 261.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.109;DP=104;Dels=0.00;FS=19.924;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.15;MQ0=33;MQRankSum=-3.786;QD=2.51;ReadPosRankSum=2.211;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,34:104:99:291,0,978 chrXV 26889 . G A 874.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.889;DP=99;Dels=0.00;FS=27.894;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.99;MQ0=34;MQRankSum=4.069;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.865;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:904,0,290 chrXV 27029 . C T 116.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;DP=51;Dels=0.00;FS=8.475;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.44;MQ0=27;MQRankSum=-3.708;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:146,0,147 chrXV 27045 . C T 475 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.71;MQ0=36;QD=7.66;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:54:508,54,0 chrXV 27070 . T A 136.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;DP=77;Dels=0.00;FS=21.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.45;MQ0=51;MQRankSum=-1.765;QD=1.77;ReadPosRankSum=1.297;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:166,0,262 chrXV 27098 . C T 137.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.330;DP=84;Dels=0.00;FS=26.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.98;MQ0=56;MQRankSum=-1.612;QD=1.63;ReadPosRankSum=-2.672;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:167,0,237 chrXV 27129 . C T 52.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.506;DP=89;Dels=0.00;FS=20.288;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.12;MQ0=56;MQRankSum=-1.351;QD=0.58;ReadPosRankSum=2.252;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,13:89:82:82,0,376 chrXV 27136 . C A 32.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.394;DP=81;Dels=0.00;FS=17.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.77;MQ0=51;MQRankSum=-1.177;QD=0.40;ReadPosRankSum=3.168;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,9:81:62:62,0,321 chrXV 27137 . A T 29.01 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;DP=81;Dels=0.00;FS=17.723;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.77;MQ0=51;MQRankSum=-1.177;QD=0.36;ReadPosRankSum=2.987;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,9:81:59:59,0,344 chrXV 27140 . C T 41.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.009;DP=78;Dels=0.00;FS=13.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.83;MQ0=51;MQRankSum=-0.437;QD=0.53;ReadPosRankSum=2.186;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,9:78:71:71,0,261 chrXV 27153 . T G 53.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;DP=70;Dels=0.00;FS=11.812;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.52;MQ0=39;MQRankSum=-1.259;QD=0.76;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,11:70:83:83,0,317 chrXV 27157 . G A 44.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.074;DP=74;Dels=0.00;FS=15.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.06;MQ0=37;MQRankSum=-1.313;QD=0.59;ReadPosRankSum=0.515;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,12:74:74:74,0,382 chrXV 27175 . C T 611.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.930;DP=83;Dels=0.00;FS=6.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.35;MQ0=39;MQRankSum=0.922;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.623;SB=-7.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,70:83:93:641,0,93 chrXV 27232 . T C 1671 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.731;DP=97;Dels=0.00;FS=7.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=17;MQRankSum=2.840;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,83:97:77:1704,77,0 chrXV 27481 . T C 1407.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.367;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.04;MQ0=11;MQRankSum=0.727;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1437,0,981 chrXV 27515 . A G 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.27;MQ0=2;QD=24.15;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2786,288,0 chrXV 27549 . C T 982.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.258;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.52;MQ0=32;MQRankSum=0.512;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.353;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1012,0,635 chrXV 27705 . T C 557.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.300;DP=107;Dels=0.00;FS=11.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.37;MQ0=60;MQRankSum=0.624;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.777;SB=-3.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,67:107:99:587,0,246 chrXV 27793 . C G 273.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;DP=74;Dels=0.00;FS=3.174;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.01;MQ0=47;MQRankSum=-0.607;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,31:74:99:303,0,275 chrXV 27863 . T A 235.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.89;MQ0=16;MQRankSum=0.623;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:37:265,0,37 chrXV 27928 . T A 525 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=5;QD=19.44;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:60:558,60,0 chrXV 28075 . G A 500.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.448;DP=128;Dels=0.00;FS=2.057;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.71;MQ0=38;MQRankSum=0.749;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,42:128:99:530,0,1351 chrXV 28127 . G T 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.032;DP=85;Dels=0.00;FS=1.773;HaplotypeScore=2.6960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.97;MQ0=55;MQRankSum=-0.688;QD=0.14;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,28:85:42:42,0,474 chrXV 28285 . A T 48.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.28;MQ0=24;MQRankSum=2.236;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:78:78,0,604 chrXV 28352 . T C 164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.594;DP=82;Dels=0.00;FS=4.193;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.12;MQ0=3;MQRankSum=2.231;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.594;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:194,0,1432 chrXV 28368 . T C 243.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.588;DP=78;Dels=0.00;FS=7.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.82;MQ0=5;MQRankSum=1.235;QD=3.12;ReadPosRankSum=-1.939;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:273,0,1247 chrXV 28386 . A G 269.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.846;DP=86;Dels=0.01;FS=9.366;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.65;MQ0=13;MQRankSum=1.515;QD=3.13;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-7.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:299,0,1123 chrXV 28401 . A T 323.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;DP=102;Dels=0.00;FS=23.431;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.18;MQ0=19;MQRankSum=1.075;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,34:102:99:353,0,1152 chrXV 28454 . C T 947.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.534;DP=120;Dels=0.00;FS=14.634;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.74;MQ0=42;MQRankSum=2.357;QD=7.89;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,78:120:99:977,0,367 chrXV 28456 . A T 922.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;DP=128;Dels=0.00;FS=13.707;HaplotypeScore=3.8056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.09;MQ0=42;MQRankSum=2.043;QD=7.20;ReadPosRankSum=-2.795;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,85:128:99:952,0,394 chrXV 28462 . C T 1075.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;DP=124;Dels=0.00;FS=11.956;HaplotypeScore=3.8056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.43;MQ0=41;MQRankSum=2.590;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.658;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,82:124:99:1105,0,375 chrXV 28503 . G A 1262.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.795;DP=105;Dels=0.00;FS=4.340;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.15;MQ0=32;MQRankSum=1.464;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.786;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,85:105:79:1292,0,79 chrXV 28544 . G T 203.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.314;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.97;MQ0=17;MQRankSum=-3.806;QD=1.90;ReadPosRankSum=-2.145;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:233,0,1555 chrXV 28627 . A G 132.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.637;DP=62;Dels=0.00;FS=18.980;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.98;MQ0=2;MQRankSum=-2.945;QD=2.13;ReadPosRankSum=-2.071;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:162,0,1104 chrXV 28642 . C T 554.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.672;DP=78;Dels=0.00;FS=46.724;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.06;MQ0=2;MQRankSum=-1.305;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.021;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,31:78:99:584,0,978 chrXV 28683 . T C 533.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.144;DP=109;Dels=0.00;FS=15.599;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.81;MQ0=18;MQRankSum=0.498;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.737;SB=-2.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,37:109:99:563,0,1409 chrXV 28693 . G A 564.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.383;DP=121;Dels=0.00;FS=15.299;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.77;MQ0=22;MQRankSum=0.072;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.426;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,40:121:99:594,0,1422 chrXV 28873 . T A 1352.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;DP=245;Dels=0.00;FS=4.027;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.95;MQ0=13;MQRankSum=0.821;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,73:245:99:1382,0,3657 chrXV 28944 . A G 1068.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.999;DP=236;Dels=0.00;FS=1.113;HaplotypeScore=2.0321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=6;MQRankSum=0.744;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,68:236:99:1098,0,3601 chrXV 29123 . G A 1298.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.524;DP=202;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.60;MQ0=9;MQRankSum=-5.389;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.015;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,78:202:99:1328,0,2467 chrXV 29144 . A G 1663.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.992;DP=178;Dels=0.00;FS=28.965;HaplotypeScore=6.1766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.62;MQ0=6;MQRankSum=-4.171;QD=9.34;ReadPosRankSum=2.184;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,89:178:99:1693,0,1809 chrXV 29207 . A G 245.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.335;DP=240;Dels=0.00;FS=64.399;HaplotypeScore=9.1492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.58;MQ0=36;MQRankSum=-0.879;QD=1.02;ReadPosRankSum=0.813;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,31:240:99:275,0,3870 chrXV 29219 . G A 128.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.996;DP=216;Dels=0.00;FS=55.492;HaplotypeScore=6.8030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.47;MQ0=38;MQRankSum=-0.122;QD=0.59;ReadPosRankSum=0.885;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,24:215:99:158,0,3262 chrXV 29224 . C T 138.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.155;DP=210;Dels=0.00;FS=52.369;HaplotypeScore=4.5311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.96;MQ0=38;MQRankSum=-1.283;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.029;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,23:209:99:168,0,3105 chrXV 29234 . A G 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.771;DP=188;Dels=0.00;FS=43.145;HaplotypeScore=6.9527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.15;MQ0=37;MQRankSum=-1.451;QD=0.13;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,17:188:54:54,0,3024 chrXV 29592 . A G 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.652;DP=161;Dels=0.00;FS=15.737;HaplotypeScore=13.6803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.013;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1618,0,1642 chrXV 29642 . A G 340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.080;DP=199;Dels=0.00;FS=4.776;HaplotypeScore=104.6090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQ0=0;MQRankSum=-5.900;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,51:199:99:370,0,3307 chrXV 29645 . G C 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.526;DP=195;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=52.4384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.661;QD=3.43;ReadPosRankSum=-1.458;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,50:195:99:699,0,1974 chrXV 29654 . A T 661.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;DP=207;Dels=0.00;FS=16.327;HaplotypeScore=45.5024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=-5.537;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.541;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,64:207:99:691,0,3096 chrXV 29669 . G A 3396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.549;DP=185;Dels=0.00;FS=4.042;HaplotypeScore=26.7638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=2.676;QD=18.36;ReadPosRankSum=6.011;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,159:185:62:3396,0,62 chrXV 29670 . A G 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.155;DP=185;Dels=0.00;FS=9.001;HaplotypeScore=26.7638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.777;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.392;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,72:185:99:936,0,2531 chrXV 29810 . G A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.702;DP=216;Dels=0.00;FS=0.515;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=2.395;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,81:216:99:1468,0,2878 chrXV 29825 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.079;DP=224;Dels=0.00;FS=5.874;HaplotypeScore=3.8555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.138;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,76:224:99:1377,0,3179 chrXV 29909 . G T 3149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.600;DP=221;Dels=0.00;FS=3.965;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.316;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,140:221:99:3179,0,1487 chrXV 29976 . G C 5666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=24.74;SB=-2.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,229:229:99:5666,597,0 chrXV 29984 . T A 6023.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6708;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=26.77;SB=-2.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,225:225:99:6023,610,0 chrXV 30149 . G T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.298;DP=227;Dels=0.00;FS=1.731;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.476;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,74:227:99:1310,0,3279 chrXV 30179 . C T 3718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.128;DP=255;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,173:255:99:3718,0,1452 chrXV 30248 . G A 4289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.557;DP=271;Dels=0.00;FS=4.565;HaplotypeScore=4.3470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.698;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,190:271:99:4289,0,1338 chrXV 30265 . C G 3690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.257;DP=252;Dels=0.00;FS=3.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.425;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,170:252:99:3690,0,1457 chrXV 30338 . G T 4231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.225;DP=258;Dels=0.00;FS=4.806;HaplotypeScore=2.7007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=16.40;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,182:258:99:4231,0,1220 chrXV 30485 . G A 3068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.345;DP=215;Dels=0.00;FS=5.647;HaplotypeScore=4.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.244;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,147:215:99:3098,0,1194 chrXV 30575 . G A 3918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.472;DP=248;Dels=0.00;FS=15.622;HaplotypeScore=5.1419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=15.80;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,170:248:99:3918,0,1302 chrXV 30707 . A G 2860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.910;DP=197;Dels=0.00;FS=13.017;HaplotypeScore=5.3600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=14.52;ReadPosRankSum=2.491;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,142:196:99:2890,0,881 chrXV 30844 . C T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.775;DP=229;Dels=0.00;FS=8.230;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.19;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,77:229:99:1342,0,3090 chrXV 30904 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.704;DP=156;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=47.4309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.602;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.587;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,70:156:99:1439,0,1795 chrXV 30945 . T G 260.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.807;DP=115;Dels=0.00;FS=3.735;HaplotypeScore=16.6247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.625;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,40:115:99:290,0,1645 chrXV 30946 . C T 247.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.600;DP=117;Dels=0.00;FS=4.927;HaplotypeScore=14.6353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.962;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.876;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,40:117:99:277,0,1621 chrXV 30947 . T A 417.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.348;DP=102;Dels=0.00;FS=6.696;HaplotypeScore=14.6353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.834;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.202;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,40:102:99:447,0,1294 chrXV 30948 . G A 326.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.629;DP=101;Dels=0.00;FS=4.138;HaplotypeScore=19.3885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.966;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.553;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:356,0,1402 chrXV 30952 . C A 521.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.353;DP=99;Dels=0.00;FS=7.282;HaplotypeScore=34.0498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.026;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.977;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,31:99:99:551,0,1359 chrXV 30955 . A T 471.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.244;DP=103;Dels=0.00;FS=5.576;HaplotypeScore=50.7031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.996;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,31:103:99:501,0,1534 chrXV 30958 . A T 1195.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.458;DP=125;Dels=0.00;FS=14.304;HaplotypeScore=68.6684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.97;MQ0=0;MQRankSum=4.349;QD=9.56;ReadPosRankSum=4.099;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:125:99:1225,0,692 chrXV 30986 . T A 309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.560;DP=99;Dels=0.03;FS=4.974;HaplotypeScore=91.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.07;MQ0=0;MQRankSum=-3.354;QD=3.12;ReadPosRankSum=2.076;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,31:96:99:339,0,805 chrXV 30992 . A G 203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.927;DP=96;Dels=0.00;FS=12.062;HaplotypeScore=189.0288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.835;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:233,0,825 chrXV 30997 . A T 722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.882;DP=99;Dels=0.00;FS=37.470;HaplotypeScore=170.5363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.49;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=7.29;ReadPosRankSum=-2.218;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:752,0,105 chrXV 31008 . A G 285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.421;DP=89;Dels=0.00;FS=0.984;HaplotypeScore=169.5814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.59;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=3.20;ReadPosRankSum=-3.105;SB=-1.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:89:99:315,0,489 chrXV 31010 . T G 272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=157.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=3.09;ReadPosRankSum=-3.873;SB=-1.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:302,0,482 chrXV 31030 . C A 56.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.822;DP=77;Dels=0.00;FS=4.331;HaplotypeScore=197.7011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.446;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.827;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:86:86,0,557 chrXV 31031 . A G 73.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.771;DP=80;Dels=0.00;FS=3.713;HaplotypeScore=201.6347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.547;QD=0.91;ReadPosRankSum=0.998;SB=-6.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:103,0,608 chrXV 31033 . A T 170.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.553;DP=79;Dels=0.00;FS=1.003;HaplotypeScore=197.7727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.45;MQ0=1;MQRankSum=-1.799;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.006;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:79:99:200,0,560 chrXV 31036 . A T 152.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;DP=98;Dels=0.04;FS=3.723;HaplotypeScore=131.2149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.42;MQ0=1;MQRankSum=4.109;QD=1.55;ReadPosRankSum=3.962;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:182,0,756 chrXV 31043 . G T 575.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.608;DP=97;Dels=0.04;FS=0.784;HaplotypeScore=134.1635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.20;MQ0=1;MQRankSum=-2.786;QD=5.93;ReadPosRankSum=-2.802;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:605,0,469 chrXV 31047 . G A 203.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.686;DP=94;Dels=0.04;FS=32.984;HaplotypeScore=101.7406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.79;MQ0=1;MQRankSum=1.749;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.838;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:233,0,863 chrXV 31049 . G T 311.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.613;DP=109;Dels=0.04;FS=22.151;HaplotypeScore=95.9965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.42;MQ0=1;MQRankSum=2.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.632;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,22:105:99:341,0,824 chrXV 31064 . A T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;DP=138;Dels=0.00;FS=4.143;HaplotypeScore=91.0293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,77:138:99:1355,0,628 chrXV 31070 . A G 309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.943;DP=163;Dels=0.00;FS=7.911;HaplotypeScore=130.6448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.934;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,36:163:99:339,0,2237 chrXV 31075 . A T 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.381;DP=176;Dels=0.00;FS=17.738;HaplotypeScore=99.9890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.90;MQ0=0;MQRankSum=4.936;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,95:176:99:1636,0,1246 chrXV 31101 . T G 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.821;DP=254;Dels=0.00;FS=58.396;HaplotypeScore=141.5483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.002;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,69:254:99:941,0,3508 chrXV 31136 . C T 4506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.326;DP=308;Dels=0.00;FS=81.584;HaplotypeScore=118.7955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.92;MQ0=0;MQRankSum=-5.803;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.958;SB=-2.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,242:308:99:4506,0,882 chrXV 31142 . A T 779.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;DP=291;Dels=0.00;FS=33.840;HaplotypeScore=78.8358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.75;MQ0=0;MQRankSum=-7.124;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.108;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,86:290:99:809,0,4511 chrXV 31148 . G A 758.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.061;DP=312;Dels=0.00;FS=35.174;HaplotypeScore=23.6694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.34;MQ0=0;MQRankSum=-7.682;QD=2.43;ReadPosRankSum=3.092;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,89:312:99:788,0,4365 chrXV 31151 . G A 765.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.306;DP=315;Dels=0.00;FS=39.057;HaplotypeScore=80.9668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.92;MQ0=0;MQRankSum=-7.196;QD=2.43;ReadPosRankSum=3.463;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,92:315:99:795,0,4388 chrXV 31160 . T C 698.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.790;DP=324;Dels=0.00;FS=55.050;HaplotypeScore=102.9334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.92;MQ0=0;MQRankSum=4.355;QD=2.15;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,62:324:99:728,0,4355 chrXV 31172 . A G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.074;DP=290;Dels=0.00;FS=19.244;HaplotypeScore=70.4525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.78;MQ0=0;MQRankSum=-5.640;QD=3.30;ReadPosRankSum=3.842;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,105:290:99:986,0,3511 chrXV 31184 . G T 868.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.490;DP=241;Dels=0.00;FS=18.342;HaplotypeScore=58.0428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.14;MQ0=0;MQRankSum=-3.514;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.838;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,92:241:99:898,0,2567 chrXV 31187 . G T 478.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;DP=238;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=61.0202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=2.01;ReadPosRankSum=-5.200;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,42:238:99:508,0,2903 chrXV 31188 . A G 795.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.192;DP=227;Dels=0.00;FS=16.141;HaplotypeScore=59.0297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.89;MQ0=0;MQRankSum=-4.978;QD=3.50;ReadPosRankSum=2.544;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,84:227:99:825,0,2537 chrXV 31190 . T G 792.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.578;DP=212;Dels=0.00;FS=13.464;HaplotypeScore=64.8896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.61;MQ0=0;MQRankSum=-3.286;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.180;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,84:212:99:822,0,2212 chrXV 31199 . C T 2145.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.227;DP=176;Dels=0.00;FS=12.915;HaplotypeScore=135.0607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.253;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,154:176:99:2175,0,113 chrXV 31203 . T G 63.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.472;DP=156;Dels=0.00;FS=34.436;HaplotypeScore=130.2157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=0.40;ReadPosRankSum=3.675;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,33:156:93:93,0,2084 chrXV 31204 . C T 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;DP=153;Dels=0.00;FS=34.108;HaplotypeScore=151.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=0.25;ReadPosRankSum=3.498;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,33:153:69:69,0,2026 chrXV 31205 . A T 903.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.768;DP=140;Dels=0.00;FS=77.194;HaplotypeScore=152.9262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=6.45;ReadPosRankSum=-3.761;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:933,0,959 chrXV 31206 . G A 108.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.809;DP=140;Dels=0.00;FS=38.157;HaplotypeScore=174.7420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=0.77;ReadPosRankSum=2.764;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,33:140:99:138,0,1685 chrXV 31209 . G A 168.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.882;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=180.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.414;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,19:135:99:198,0,1505 chrXV 31210 . C A 98.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.901;DP=134;Dels=0.00;FS=35.502;HaplotypeScore=199.6186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=0.73;ReadPosRankSum=4.534;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,33:134:99:128,0,1502 chrXV 31211 . G A 722.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.404;DP=130;Dels=0.00;FS=67.731;HaplotypeScore=198.6944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.17;MQ0=0;MQRankSum=-2.165;QD=5.55;ReadPosRankSum=-4.869;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:752,0,872 chrXV 31213 . A T 107.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.471;DP=128;Dels=0.00;FS=35.203;HaplotypeScore=277.8039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.94;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=0.84;ReadPosRankSum=4.961;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,32:128:99:137,0,1518 chrXV 31214 . G A 1350.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.950;DP=128;Dels=0.02;FS=12.349;HaplotypeScore=287.3174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.55;ReadPosRankSum=3.809;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,106:126:99:1380,0,206 chrXV 31216 . A T 60.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;DP=147;Dels=0.01;FS=4.833;HaplotypeScore=237.0765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.46;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=0.41;ReadPosRankSum=4.958;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,21:146:90:90,0,1537 chrXV 31220 . A G 490.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.184;DP=145;Dels=0.01;FS=10.726;HaplotypeScore=291.9374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.668;QD=3.38;ReadPosRankSum=-5.970;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,44:144:99:520,0,1048 chrXV 31222 . C T 247.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.164;DP=145;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=240.2402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=1.70;ReadPosRankSum=0.815;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,19:144:99:277,0,1268 chrXV 31223 . G T 523.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.680;DP=134;Dels=0.01;FS=3.622;HaplotypeScore=217.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=3.90;ReadPosRankSum=-1.665;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,70:133:99:553,0,634 chrXV 31227 . G A 185.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.534;DP=100;Dels=0.01;FS=2.465;HaplotypeScore=90.1604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=1.85;ReadPosRankSum=-2.853;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,17:99:99:215,0,718 chrXV 31242 . T G 313.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.876;DP=89;Dels=0.00;FS=18.443;HaplotypeScore=74.4687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.81;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.299;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,27:88:99:343,0,735 chrXV 31243 . C T 51.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;DP=89;Dels=0.00;FS=11.236;HaplotypeScore=76.4514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=0.57;ReadPosRankSum=0.773;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,15:89:81:81,0,956 chrXV 31244 . A T 688.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;DP=88;Dels=0.00;FS=23.966;HaplotypeScore=77.4179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.207;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,59:88:99:718,0,373 chrXV 31245 . G A 57.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.526;DP=88;Dels=0.00;FS=11.296;HaplotypeScore=93.2699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.411;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,15:88:87:87,0,955 chrXV 31249 . C A 68.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.052;DP=95;Dels=0.00;FS=3.708;HaplotypeScore=127.8791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.823;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:98:98,0,1039 chrXV 31252 . A T 62.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.802;DP=97;Dels=0.00;FS=3.470;HaplotypeScore=132.7385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.592;QD=0.64;ReadPosRankSum=-1.039;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,20:97:92:92,0,1139 chrXV 31257 . G A 831.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.079;DP=96;Dels=0.01;FS=16.929;HaplotypeScore=65.7783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.70;MQ0=0;MQRankSum=1.737;QD=8.66;ReadPosRankSum=4.745;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:861,0,315 chrXV 31259 . A G 828.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.896;DP=96;Dels=0.01;FS=6.818;HaplotypeScore=62.5187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.08;MQ0=0;MQRankSum=2.377;QD=8.63;ReadPosRankSum=4.339;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,58:95:99:858,0,418 chrXV 31261 . T C 157.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.792;DP=94;Dels=0.01;FS=7.674;HaplotypeScore=53.5647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.188;QD=1.67;ReadPosRankSum=-3.051;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,27:93:99:187,0,1089 chrXV 31281 . G T 280.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.407;DP=111;Dels=0.01;FS=2.870;HaplotypeScore=13.7941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.140;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,29:110:99:310,0,1466 chrXV 31282 . A C 223.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.643;DP=115;Dels=0.01;FS=4.090;HaplotypeScore=14.7874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.531;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,29:114:99:253,0,1653 chrXV 31283 . A T 263.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;DP=115;Dels=0.01;FS=2.887;HaplotypeScore=14.7874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:293,0,1586 chrXV 31286 . A G 236.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.719;DP=118;Dels=0.00;FS=4.060;HaplotypeScore=14.7874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.131;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.081;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,29:118:99:266,0,1691 chrXV 31288 . T C 230.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.321;DP=120;Dels=0.00;FS=5.390;HaplotypeScore=20.7250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.654;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.748;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,29:120:99:260,0,1720 chrXV 31298 . G A 290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.158;DP=131;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=18.4369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.405;QD=2.21;ReadPosRankSum=1.106;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,36:131:99:320,0,1881 chrXV 31300 . C T 387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.733;DP=137;Dels=0.00;FS=2.425;HaplotypeScore=10.5141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.570;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,40:137:99:417,0,1838 chrXV 31369 . A T 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.11;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3231,333,0 chrXV 31394 . C T 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.99;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3256,339,0 chrXV 31429 . T C 2347 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.33;MQ0=0;QD=20.77;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2380,267,0 chrXV 31440 . A G 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=113.3251;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.85;MQ0=0;QD=21.36;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2682,306,0 chrXV 31466 . G A 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.12;MQ0=0;QD=23.93;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3637,384,0 chrXV 31493 . G A 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.84;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3751,396,0 chrXV 31639 . T G 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.51;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3889,417,0 chrXV 31707 . G A 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.144;DP=151;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.672;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,84:151:99:1851,0,1278 chrXV 31776 . A G 2940 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.23;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2973,321,0 chrXV 31789 . G A 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.24;MQ0=0;QD=23.23;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2588,273,0 chrXV 31790 . T A 2558 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.85;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2591,273,0 chrXV 31801 . C T 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.46;MQ0=0;QD=23.76;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:113:99:2718,288,0 chrXV 31814 . A C 3362.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.67;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3362,369,0 chrXV 31817 . C A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.676;DP=128;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.57;MQ0=0;MQRankSum=-3.460;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.720;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1130,0,1372 chrXV 31883 . G A 1938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.365;DP=183;Dels=0.00;FS=2.697;HaplotypeScore=2.7776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.89;MQ0=0;MQRankSum=0.001;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.802;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,92:183:99:1968,0,1768 chrXV 31946 . C T 3904.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.30;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3904,423,0 chrXV 31959 . C T 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.99;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3421,360,0 chrXV 31977 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.81;MQ0=0;QD=22.63;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3201,351,0 chrXV 32012 . G A 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.92;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3164,336,0 chrXV 32058 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.277;DP=156;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.79;MQ0=0;MQRankSum=2.364;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.537;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,60:156:99:1091,0,1841 chrXV 32149 . T C 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.81;MQ0=0;QD=23.46;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3472,357,0 chrXV 32177 . G C 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2832,303,0 chrXV 32330 . G A 2683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.07;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2716,276,0 chrXV 32374 . A G 2207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.96;MQ0=0;QD=21.64;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2240,243,0 chrXV 32379 . C T 2171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.02;MQ0=0;QD=23.34;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2204,231,0 chrXV 32386 . C A 2245 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=75.4532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.49;MQ0=0;QD=21.80;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2278,240,0 chrXV 32395 . A G 1837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=22.68;ReadPosRankSum=1.689;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:81:99:1870,204,0 chrXV 32622 . C T 1808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.138;DP=176;Dels=0.00;FS=1.851;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.749;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,89:176:99:1838,0,1605 chrXV 32720 . C G 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.65;MQ0=0;QD=25.82;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2796,303,0 chrXV 32791 . A G 1365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8295;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.07;MQ0=0;QD=20.07;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:68:99:1398,153,0 chrXV 32803 . T C 1398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.39;MQ0=0;QD=19.69;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1431,162,0 chrXV 32809 . C T 1438 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.4098;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.88;MQ0=0;QD=20.54;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1471,159,0 chrXV 32838 . C T 1934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.32;MQ0=0;QD=23.59;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1967,210,0 chrXV 32855 . A G 2735 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.16;MQ0=0;QD=24.42;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2768,306,0 chrXV 32865 . C T 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.44;MQ0=0;QD=26.43;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3072,318,0 chrXV 33217 . A C 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3813,402,0 chrXV 33489 . C T 3476.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.680;QD=26.14;ReadPosRankSum=1.393;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3476,343,0 chrXV 33511 . C G 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3098,321,0 chrXV 33546 . T C 2761 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2794,297,0 chrXV 33670 . A C 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.523;DP=148;Dels=0.00;FS=2.176;HaplotypeScore=6.6647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.852;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:148:99:1054,0,1864 chrXV 33671 . T A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.670;DP=143;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=6.6647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.705;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1126,0,1824 chrXV 34039 . A G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.565;DP=116;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.596;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1405,0,1102 chrXV 34103 . C G 2221 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=25.24;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2254,237,0 chrXV 34108 . G C 2210 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=25.70;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2243,237,0 chrXV 34772 . C T 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3422,343,0 chrXV 34951 . T C 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.089e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2812,303,0 chrXV 35297 . A G 3991.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.979e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3991,417,0 chrXV 35401 . C A 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2987,309,0 chrXV 35414 . C T 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2940,303,0 chrXV 35486 . A T 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2967,294,0 chrXV 35544 . G T 3784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.92;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3784,385,0 chrXV 35596 . A T 3900.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3900,400,0 chrXV 35666 . A G 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3615,357,0 chrXV 35718 . T C 2774 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2807,297,0 chrXV 35742 . G C 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=24.51;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2876,309,0 chrXV 35747 . G T 2879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=25.03;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2912,300,0 chrXV 35779 . T C 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=23.41;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2795,288,0 chrXV 35788 . T A 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=25.08;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3017,298,0 chrXV 35855 . T C 2017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2050,219,0 chrXV 35866 . A C 2292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2325,237,0 chrXV 35915 . T C 2047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.59;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2080,213,0 chrXV 36047 . A G 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0290;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3179,333,0 chrXV 36091 . C G 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3005,306,0 chrXV 36403 . A G 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2467,258,0 chrXV 36415 . C T 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.818;DP=91;Dels=0.00;FS=2.815;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,52:91:99:1131,0,708 chrXV 36550 . C G 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2727,282,0 chrXV 36551 . G A 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2767,282,0 chrXV 36606 . T G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3177,330,0 chrXV 36648 . G C 2963 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.32;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2996,318,0 chrXV 36760 . C T 2538 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2571,261,0 chrXV 36786 . T G 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2985,309,0 chrXV 37042 . T G 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.20;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2578,273,0 chrXV 37059 . A G 2353 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=23.77;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2386,264,0 chrXV 37107 . C T 1915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.53;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1948,192,0 chrXV 37205 . T C 2799 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2832,303,0 chrXV 37274 . A C 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3019,312,0 chrXV 37458 . A G 2652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2685,294,0 chrXV 37620 . G C 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=24.78;ReadPosRankSum=1.680;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3320,354,0 chrXV 37725 . G A 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2925,282,0 chrXV 37742 . G A 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3167,319,0 chrXV 37749 . A G 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2659,285,0 chrXV 37812 . C T 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3131,321,0 chrXV 38001 . C G 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3870,387,0 chrXV 38127 . G A 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.207;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3473,321,0 chrXV 38177 . A C 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3533,363,0 chrXV 38224 . T G 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3096,327,0 chrXV 38574 . G A 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.623;DP=128;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=26.06;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,126:128:99:3336,300,0 chrXV 38675 . T C 3737.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.13;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3737,387,0 chrXV 38726 . T G 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3172,318,0 chrXV 38741 . A C 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3317,327,0 chrXV 38791 . A C 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6342;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2755,300,0 chrXV 38812 . A G 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2485,270,0 chrXV 38827 . G A 2622 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.698;QD=25.71;ReadPosRankSum=1.698;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2655,251,0 chrXV 38891 . G A 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3110,306,0 chrXV 39064 . A G 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3152,333,0 chrXV 39352 . T G 2345 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.63;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2378,264,0 chrXV 39353 . G A 2358 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.63;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2391,264,0 chrXV 39380 . C T 2183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.86;MQ0=0;QD=24.81;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2216,240,0 chrXV 39382 . G A 2173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.49;MQ0=0;QD=24.98;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2206,234,0 chrXV 39402 . G C 1285 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.68;MQ0=0;QD=21.78;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1318,147,0 chrXV 39403 . T C 1306 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.68;MQ0=0;QD=22.14;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1339,147,0 chrXV 39405 . T A 1364 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.68;MQ0=0;QD=23.12;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1397,147,0 chrXV 39407 . T C 1409 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.76;MQ0=0;QD=22.37;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1442,159,0 chrXV 39416 . A G 1327 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.51;MQ0=0;QD=16.59;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1360,156,0 chrXV 39418 . G C 1344 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.01;MQ0=0;QD=16.59;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1377,153,0 chrXV 39421 . A G 1427 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.92;MQ0=0;QD=16.99;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1460,159,0 chrXV 39499 . A T 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3716,376,0 chrXV 39574 . T C 3151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.653;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3184,321,0 chrXV 39595 . A G 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2990,318,0 chrXV 39607 . A C 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.02;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2792,288,0 chrXV 39625 . T C 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.59;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2699,273,0 chrXV 39657 . C T 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.09;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3159,318,0 chrXV 39668 . C G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.556;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1202,0,1339 chrXV 39701 . A C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.778;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.255;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1222,0,1371 chrXV 39768 . C T 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=28.11;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3069,315,0 chrXV 39805 . C T 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.133;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=26.37;ReadPosRankSum=-1.602;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3507,324,0 chrXV 39855 . T C 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3400,351,0 chrXV 39893 . G A 2682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2715,276,0 chrXV 40198 . A G 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.532e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3388,369,0 chrXV 40227 . G A 3548.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3548,358,0 chrXV 40304 . T C 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3461,363,0 chrXV 40440 . C T 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3419,337,0 chrXV 40513 . G A 3534.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3534,367,0 chrXV 40593 . A G 4019.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4019,403,0 chrXV 40684 . C A 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.683;DP=112;Dels=0.00;FS=6.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1278,0,1096 chrXV 40739 . A T 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.590;DP=118;Dels=0.00;FS=5.901;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1114,0,1313 chrXV 40807 . C T 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.224;DP=115;Dels=0.00;FS=3.555;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.069;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,45:115:99:941,0,1552 chrXV 40848 . C T 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3621,375,0 chrXV 41023 . A C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.671;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,55:92:99:1207,0,787 chrXV 41050 . A G 2874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2907,309,0 chrXV 41255 . C T 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.563;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:957,0,1318 chrXV 41308 . G T 2680 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2713,264,0 chrXV 41396 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.246;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.526;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1426,0,1061 chrXV 41470 . T C 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0622;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=24.95;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2877,318,0 chrXV 41495 . C T 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.54;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2870,288,0 chrXV 41669 . T C 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.601;DP=144;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.125;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1485,0,1560 chrXV 41788 . A T 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=141;Dels=0.00;FS=3.266;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.247;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3506,344,0 chrXV 41838 . G A 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2883,294,0 chrXV 42175 . G A 4024.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4024,411,0 chrXV 42219 . A C 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3808,393,0 chrXV 42230 . A C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.001;DP=125;Dels=0.00;FS=4.409;HaplotypeScore=3.9732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.111;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1354,0,1259 chrXV 42290 . A G 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2717,294,0 chrXV 42291 . T C 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2689,291,0 chrXV 42529 . C T 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3145,321,0 chrXV 42705 . G T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.834;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=11.50;ReadPosRankSum=3.017;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1341,0,1000 chrXV 42832 . A G 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.98;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2675,273,0 chrXV 42859 . A G 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8348;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.70;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3156,333,0 chrXV 42969 . C T 2743 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.99;MQ0=0;QD=26.12;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2776,291,0 chrXV 43092 . A G 984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.45;MQ0=0;QD=15.62;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1017,114,0 chrXV 43143 . A G 1398 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.63;MQ0=0;QD=23.30;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1431,156,0 chrXV 43151 . C G 534.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.455;DP=59;Dels=0.00;FS=12.559;HaplotypeScore=26.0957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.64;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:564,0,480 chrXV 43153 . A G 1365 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=26.0957;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.64;MQ0=0;QD=23.14;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1398,156,0 chrXV 43170 . T C 1533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.95;MQ0=0;QD=22.22;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1566,177,0 chrXV 43176 . A C 1294 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.31;MQ0=0;QD=21.57;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1327,150,0 chrXV 43183 . A G 419.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.060;DP=65;Dels=0.00;FS=6.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.84;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=6.45;ReadPosRankSum=-1.349;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:65:99:449,0,644 chrXV 43187 . A G 1057 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.22;MQ0=0;QD=17.33;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1090,123,0 chrXV 43188 . A G 1105 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.75;MQ0=0;QD=17.54;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1138,129,0 chrXV 43223 . G A 1897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.76;MQ0=0;QD=24.32;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1930,204,0 chrXV 43312 . G A 1647 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.28;MQ0=0;QD=23.53;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1680,198,0 chrXV 43313 . A G 1612 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.28;MQ0=0;QD=23.03;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1645,195,0 chrXV 43318 . A G 1705 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.91;MQ0=0;QD=23.36;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1738,195,0 chrXV 43337 . C T 1451 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.25;MQ0=0;QD=23.03;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1484,162,0 chrXV 43351 . C T 1158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.96;MQ0=0;QD=21.44;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1191,135,0 chrXV 43360 . A G 960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.95;MQ0=0;QD=20.87;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:993,111,0 chrXV 43366 . A G 874 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.99;MQ0=0;QD=18.21;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:907,108,0 chrXV 43374 . A G 972 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.23;MQ0=0;QD=18.34;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1005,120,0 chrXV 43376 . T C 1045 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.96;MQ0=0;QD=19.35;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1078,123,0 chrXV 43415 . A G 1948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.38;MQ0=0;QD=24.05;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1981,216,0 chrXV 43444 . T C 2182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.25;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2215,237,0 chrXV 43479 . A T 2228 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=23.8446;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.72;MQ0=0;QD=26.84;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2261,231,0 chrXV 43511 . A G 2103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.02;MQ0=0;QD=24.74;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2136,228,0 chrXV 43599 . C T 1688 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.24;MQ0=0;QD=22.21;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1721,186,0 chrXV 43623 . T C 1080 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.81;MQ0=0;QD=18.95;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1113,126,0 chrXV 43625 . T C 1072 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.81;MQ0=0;QD=18.81;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1105,126,0 chrXV 43626 . C T 1115 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.81;MQ0=0;QD=19.56;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1148,126,0 chrXV 43628 . C G 1084 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.81;MQ0=0;QD=19.02;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1117,126,0 chrXV 43648 . G A 1376 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=21.17;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1409,156,0 chrXV 43650 . A T 1415 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=21.44;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1448,159,0 chrXV 43663 . A G 1211 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.32;MQ0=0;QD=18.92;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1244,144,0 chrXV 43666 . C A 1364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.12;MQ0=0;QD=20.67;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1397,153,0 chrXV 43688 . G T 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.13;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2679,285,0 chrXV 43705 . C T 2331 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.27;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2364,249,0 chrXV 43753 . G A 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.04;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3026,318,0 chrXV 43786 . C T 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.84;MQ0=0;QD=26.31;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2559,264,0 chrXV 43834 . C T 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.84;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2875,300,0 chrXV 43840 . A C 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.45;MQ0=0;QD=23.59;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2840,303,0 chrXV 43853 . G A 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.66;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2795,291,0 chrXV 43873 . G A 2734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.26;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2767,291,0 chrXV 43915 . T G 2757 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.79;MQ0=0;QD=22.79;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2790,291,0 chrXV 44065 . C G 3901.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3901,405,0 chrXV 44092 . T C 3944.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=25.12;ReadPosRankSum=1.247;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,156:157:99:3944,402,0 chrXV 44113 . G A 3906.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3906,391,0 chrXV 44149 . T A 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=27.02;SB=-2.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3945,385,0 chrXV 44176 . A G 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=22.10;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2641,285,0 chrXV 44181 . A G 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3003,318,0 chrXV 44249 . T G 2727 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2760,300,0 chrXV 44385 . A G 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.321;DP=123;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.328;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1166,0,1271 chrXV 44491 . G A 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2984,306,0 chrXV 44546 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.783;DP=112;Dels=0.00;FS=5.953;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.785;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1271,0,1083 chrXV 44548 . T C 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2916,306,0 chrXV 44724 . C T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.441;DP=103;Dels=0.00;FS=0.795;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.493;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1030,0,1184 chrXV 44787 . A G 2160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2193,237,0 chrXV 44801 . C T 2365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2398,246,0 chrXV 44819 . A G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.760;DP=119;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=9.34;ReadPosRankSum=2.672;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1142,0,1307 chrXV 45048 . A G 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.146;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.267;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1345,0,1446 chrXV 45210 . A G 2069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.99;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2102,225,0 chrXV 45492 . G A 2580 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=1;QD=24.57;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2613,252,0 chrXV 45808 . C A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;DP=97;Dels=0.00;FS=17.403;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.322;SB=-1.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:973,0,1125 chrXV 45813 . T C 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.331;DP=95;Dels=0.00;FS=14.825;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.288;SB=-1.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:867,0,1126 chrXV 46201 . T A 2387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.266e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2420,240,0 chrXV 46204 . C T 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.708;DP=97;Dels=0.00;FS=2.668;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.993;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1142,0,772 chrXV 46508 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.050;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:1387,0,778 chrXV 46512 . T C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.383;DP=106;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:1335,0,837 chrXV 46521 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.942;DP=103;Dels=0.00;FS=1.632;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.269;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,63:103:99:1235,0,790 chrXV 46903 . G A 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3040,315,0 chrXV 46963 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.984;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.076;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1087,0,1328 chrXV 47272 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.890;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.338;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1238,0,884 chrXV 47332 . T C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.612;DP=135;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=10.87;ReadPosRankSum=2.050;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1497,0,1273 chrXV 47652 . A C 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3276,333,0 chrXV 47662 . G T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.744;DP=122;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.326;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1348,0,1182 chrXV 47740 . G A 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3376,337,0 chrXV 47758 . A G 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.732;DP=143;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1576,0,1515 chrXV 47785 . C T 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.995e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3860,393,0 chrXV 47793 . A G 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.674;DP=146;Dels=0.00;FS=4.908;HaplotypeScore=3.1322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.732;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1668,0,1405 chrXV 48065 . T A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.878;DP=139;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.297;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:139:99:1444,0,1464 chrXV 48109 . G A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.208;DP=147;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1503,0,1611 chrXV 48217 . G A 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.788;DP=127;Dels=0.00;FS=3.299;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=2.485;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,50:127:99:977,0,1636 chrXV 48311 . C T 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.081;DP=114;Dels=0.00;FS=1.523;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.910;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:912,0,1408 chrXV 48326 . A G 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.279;DP=110;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:913,0,1306 chrXV 48344 . A C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.732;DP=94;Dels=0.00;FS=4.012;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.938;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1057,0,847 chrXV 48470 . G C 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;DP=143;Dels=0.00;FS=2.143;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.703;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1580,0,1320 chrXV 48688 . G T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.733;DP=145;Dels=0.00;FS=5.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1702,0,1398 chrXV 48997 . G A 2161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.5537;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;QD=19.29;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:112:99:2194,231,0 chrXV 49109 . G C 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.481;DP=108;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1265,0,934 chrXV 49259 . C T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.276;DP=140;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=3.9682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1386,0,1412 chrXV 49316 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.642;DP=130;Dels=0.00;FS=4.213;HaplotypeScore=2.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.960;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1430,0,1226 chrXV 49373 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.785;DP=126;Dels=0.00;FS=4.352;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1278,0,1124 chrXV 49403 . T G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.925;DP=116;Dels=0.00;FS=4.535;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.960;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1235,0,1130 chrXV 49477 . A G 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.753;DP=139;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=9.4226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=9.51;ReadPosRankSum=2.364;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1352,0,1576 chrXV 49546 . C G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.196;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1357,0,1624 chrXV 50002 . C T 3181 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.37;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3214,330,0 chrXV 50010 . A T 3192 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.37;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=25.74;ReadPosRankSum=1.313;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3225,333,0 chrXV 50012 . C T 3215.99 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=12.6353;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.49;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3249,325,0 chrXV 50220 . A G 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3417,363,0 chrXV 50224 . T C 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.67;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3114,333,0 chrXV 50257 . T C 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3542,372,0 chrXV 50638 . A G 3762.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3762,399,0 chrXV 50721 . C T 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3255,334,0 chrXV 50942 . C G 4128.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8527;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4128,426,0 chrXV 51031 . T C 3817.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=21.32;SB=-2.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:3817,417,0 chrXV 51148 . T A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3540,360,0 chrXV 51298 . C T 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3076,306,0 chrXV 51432 . G A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.958;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.453;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.889;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1364,0,1617 chrXV 51466 . A G 4353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02;SB=-2.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:174:99:4353,444,0 chrXV 51535 . G A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.786;DP=124;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1465,0,1105 chrXV 51697 . A G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3214,339,0 chrXV 51718 . T C 2576 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=23.63;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2609,294,0 chrXV 52021 . A G 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3659,390,0 chrXV 52036 . A G 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3039,324,0 chrXV 52057 . G A 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3298,342,0 chrXV 52306 . G A 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:3841,388,0 chrXV 52333 . A G 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3670,384,0 chrXV 52372 . T C 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=23.37;SB=-2.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3763,387,0 chrXV 52465 . T C 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9574;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:172:99:3867,411,0 chrXV 52540 . C T 3940.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3940,406,0 chrXV 52864 . A C 2954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2987,318,0 chrXV 53014 . C T 3988.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.77;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3988,409,0 chrXV 53115 . A G 3756.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.45;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3756,390,0 chrXV 53263 . G A 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3100,309,0 chrXV 53283 . A G 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.690e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3353,336,0 chrXV 53357 . G C 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3053,324,0 chrXV 53391 . A G 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3311,357,0 chrXV 53718 . T C 3901.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3901,399,0 chrXV 53742 . G A 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3493,352,0 chrXV 53781 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.503;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=26.07;ReadPosRankSum=0.782;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3268,309,0 chrXV 53853 . C T 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3227,325,0 chrXV 54004 . A G 267 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.64;MQ0=0;QD=4.31;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:33:300,33,0 chrXV 54505 . T C 3659.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3659,360,0 chrXV 54522 . G A 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3499,340,0 chrXV 54678 . C T 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.944;DP=107;Dels=0.00;FS=7.601;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.840;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:901,0,1359 chrXV 54736 . A G 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.624;DP=153;Dels=0.00;FS=4.802;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1573,0,1612 chrXV 54757 . T C 3927.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.534;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=24.70;ReadPosRankSum=1.645;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:3927,367,0 chrXV 54770 . T C 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.100;DP=151;Dels=0.00;FS=2.922;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.710;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1496,0,1582 chrXV 54872 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.588;DP=117;Dels=0.00;FS=2.431;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.953;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1002,0,1425 chrXV 54952 . A C 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3096,315,0 chrXV 54970 . G A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.915;DP=124;Dels=0.00;FS=1.475;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1189,0,1384 chrXV 54979 . T C 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.203;DP=120;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=2.019;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1045,0,1388 chrXV 54997 . C T 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3144,318,0 chrXV 55275 . C T 2623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.04;MQ0=0;QD=23.85;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2656,279,0 chrXV 55310 . C T 2186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.97;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2219,234,0 chrXV 55311 . C T 2199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.11;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2232,234,0 chrXV 55328 . C T 1860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.97;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1893,204,0 chrXV 55330 . T C 1754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.28;MQ0=0;QD=22.78;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1787,201,0 chrXV 55349 . T C 2228 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.98;MQ0=0;QD=22.06;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2261,252,0 chrXV 55390 . T G 2483 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.20;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2516,273,0 chrXV 55394 . G C 2466 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.28;MQ0=0;QD=22.83;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2499,273,0 chrXV 55398 . C T 2608 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.60;MQ0=0;QD=23.50;SB=-1.403e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2641,282,0 chrXV 55421 . T C 737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.668;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.53;MQ0=0;MQRankSum=-4.155;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.195;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,48:125:99:767,0,1637 chrXV 55423 . C T 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.66;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3094,321,0 chrXV 55488 . T C 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.36;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3395,339,0 chrXV 55506 . G A 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.42;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.843e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3812,376,0 chrXV 55563 . T C 3395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.26;MQ0=0;QD=25.34;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3395,354,0 chrXV 56070 . C T 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3502,358,0 chrXV 56211 . C A 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2709,273,0 chrXV 56311 . C T 4065.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4065,412,0 chrXV 56322 . T C 3667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3667,381,0 chrXV 56429 . C A 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3258,336,0 chrXV 56450 . C T 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3322,333,0 chrXV 56600 . G C 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2993,303,0 chrXV 56604 . G A 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3062,306,0 chrXV 56640 . G A 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3545,352,0 chrXV 56987 . A G 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3042,315,0 chrXV 57010 . A T 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3438,334,0 chrXV 57309 . T C 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.875e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3779,393,0 chrXV 57448 . C T 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3367,343,0 chrXV 57609 . C A 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3744,367,0 chrXV 57629 . T C 3797.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3797,390,0 chrXV 57711 . C T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3048,318,0 chrXV 57712 . T C 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2980,318,0 chrXV 57789 . A T 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.245;DP=125;Dels=0.00;FS=6.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.082;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1400,0,1135 chrXV 57800 . G A 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2911,289,0 chrXV 57877 . A G 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2659,276,0 chrXV 57888 . G C 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;DP=113;Dels=0.00;FS=4.759;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,64:113:99:1338,0,996 chrXV 57978 . T C 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.187;DP=122;Dels=0.00;FS=8.348;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.749;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1158,0,1431 chrXV 57992 . C T 3387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3387,348,0 chrXV 58067 . T C 4365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.53;SB=-2.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4365,447,0 chrXV 58160 . C T 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=1;QD=26.72;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3473,363,0 chrXV 58218 . G A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.944;DP=103;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.854;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1133,0,1027 chrXV 58361 . C T 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3519,348,0 chrXV 58608 . T A 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=26.06;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3701,355,0 chrXV 58669 . T C 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.932;DP=118;Dels=0.00;FS=1.658;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.869;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:992,0,1526 chrXV 58673 . A G 2937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2970,321,0 chrXV 58899 . C T 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3777,385,0 chrXV 58998 . T A 3473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3473,355,0 chrXV 59008 . G A 3621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3621,369,0 chrXV 59467 . G A 3407.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3407,337,0 chrXV 59544 . T C 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2869,315,0 chrXV 59664 . C T 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3143,321,0 chrXV 59737 . G A 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.89;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3010,309,0 chrXV 59847 . G A 3382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8673;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3382,339,0 chrXV 60000 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.139;DP=114;Dels=0.00;FS=2.453;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1071,0,1261 chrXV 60030 . A G 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3052,315,0 chrXV 60045 . T A 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=23.70;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2711,273,0 chrXV 60310 . T C 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2793,294,0 chrXV 61111 . A G 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.595;DP=142;Dels=0.00;FS=5.227;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.043;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1519,0,1521 chrXV 61160 . C G 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.329;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.673;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1761,0,1341 chrXV 61409 . A G 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.458;DP=138;Dels=0.00;FS=5.175;HaplotypeScore=3.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.024;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1130,0,1618 chrXV 61694 . A G 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=1;QD=24.49;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3241,357,0 chrXV 61748 . C T 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3307,336,0 chrXV 61766 . T C 3430.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3430,372,0 chrXV 61901 . G A 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.092;DP=145;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.533;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,83:145:99:1764,0,1224 chrXV 62039 . G A 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.288;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.685;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1755,0,1507 chrXV 62062 . G A 3824.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3824,376,0 chrXV 62108 . A G 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3200,342,0 chrXV 62432 . C T 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3328,342,0 chrXV 62744 . G A 2905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2938,291,0 chrXV 62866 . C A 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.994;DP=140;Dels=0.00;FS=5.109;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.851;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1618,0,1358 chrXV 63524 . C T 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3207,333,0 chrXV 63560 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.214;DP=134;Dels=0.00;FS=1.376;HaplotypeScore=4.4058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.658;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1263,0,1592 chrXV 63707 . G A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.532;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.625;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1563,0,1166 chrXV 63965 . T A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.095;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.454;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1402,0,1097 chrXV 63998 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.535;DP=126;Dels=0.00;FS=2.374;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.149;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1280,0,1241 chrXV 64043 . T G 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.013;DP=138;Dels=0.00;FS=2.327;HaplotypeScore=7.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.892;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1200,0,1558 chrXV 64300 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.946;DP=114;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=12.46;ReadPosRankSum=2.287;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1451,0,957 chrXV 64397 . A G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.927;DP=119;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=2.026;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.259;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1057,0,1470 chrXV 64481 . G A 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.634;DP=125;Dels=0.00;FS=5.550;HaplotypeScore=3.8242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.078;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1148,0,1397 chrXV 64577 . A G 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.515;DP=158;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.515;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:158:99:1356,0,1816 chrXV 65216 . T C 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.457;DP=152;Dels=0.00;FS=2.046;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1580,0,1645 chrXV 65318 . G C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.627;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.014;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,64:99:99:1299,0,655 chrXV 65336 . T C 597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.742;DP=95;Dels=0.00;FS=1.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.925;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,35:95:99:627,0,1349 chrXV 65376 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.117;DP=112;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=1.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.569;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1331,0,1054 chrXV 65555 . G A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.203;DP=121;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.330;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1336,0,1219 chrXV 65559 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.643;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1270,0,1405 chrXV 65716 . A G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.712;DP=125;Dels=0.00;FS=8.461;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.885;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1106,0,1468 chrXV 65740 . T C 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.002;DP=133;Dels=0.00;FS=1.406;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,78:133:99:1600,0,1172 chrXV 65800 . G A 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3168,318,0 chrXV 65818 . A G 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.777;DP=126;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.363;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1177,0,1402 chrXV 66022 . A T 2728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.326e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2761,273,0 chrXV 66373 . A G 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.240;DP=95;Dels=0.00;FS=1.690;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.011;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:760,0,1078 chrXV 66421 . G A 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.675;DP=104;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=2.6227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.806;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:882,0,1285 chrXV 66616 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.680;DP=128;Dels=0.00;FS=8.788;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.414;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1128,0,1532 chrXV 66667 . T A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;DP=135;Dels=0.00;FS=10.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.090;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1582,0,1340 chrXV 66814 . C G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.814;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1128,0,1608 chrXV 66938 . G A 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.256;DP=151;Dels=0.00;FS=7.449;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.628;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1552,0,1558 chrXV 67090 . A T 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.79;MQ0=0;QD=27.91;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3823,394,0 chrXV 67130 . C G 2392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.98;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2425,264,0 chrXV 67143 . T G 1896 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.92;MQ0=0;QD=23.41;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1929,213,0 chrXV 67145 . G A 1910 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.23;MQ0=0;QD=24.49;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1943,207,0 chrXV 67147 . A G 583.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.753;DP=81;Dels=0.00;FS=5.838;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=7.20;ReadPosRankSum=2.295;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:613,0,850 chrXV 67149 . C T 1866 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.51;MQ0=0;QD=23.04;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1899,201,0 chrXV 67175 . C G 2193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.92;MQ0=0;QD=21.29;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2226,246,0 chrXV 67207 . G A 1037.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.079;DP=100;Dels=0.00;FS=15.018;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.726;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1067,0,765 chrXV 67209 . G A 2419 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.14;MQ0=0;QD=24.43;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2452,255,0 chrXV 67210 . G A 2363 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.662;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=23.87;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:99:99:2396,229,0 chrXV 67223 . A G 2574 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.47;MQ0=0;QD=22.98;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2607,291,0 chrXV 67274 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.613;DP=114;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=1.926;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.153;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1276,0,1063 chrXV 67367 . A G 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.314;DP=107;Dels=0.00;FS=6.039;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.792;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:944,0,1386 chrXV 67451 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.518;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=1.937;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1400,0,1616 chrXV 67526 . T C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.092;DP=101;Dels=0.00;FS=3.681;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.656;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:986,0,1150 chrXV 67744 . A G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.540;DP=123;Dels=0.00;FS=3.583;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.281;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1316,0,1274 chrXV 67774 . G A 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2989,315,0 chrXV 67780 . T C 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2916,324,0 chrXV 67816 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.156;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1280,0,1099 chrXV 67831 . A G 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3526,360,0 chrXV 68383 . C T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.291;DP=108;Dels=0.00;FS=2.535;HaplotypeScore=5.9306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.181;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1136,0,1055 chrXV 68407 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.107;DP=113;Dels=0.00;FS=9.444;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1276,0,1081 chrXV 68602 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.211;DP=127;Dels=0.00;FS=8.595;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1242,0,1291 chrXV 69357 . A G 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2926,303,0 chrXV 69484 . C G 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3375,354,0 chrXV 69757 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.168;DP=130;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.299;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1349,0,1160 chrXV 69894 . T C 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.126e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3133,324,0 chrXV 69921 . C T 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3249,336,0 chrXV 69940 . T C 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3111,321,0 chrXV 70127 . C A 2712 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2745,282,0 chrXV 70183 . C A 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3328,339,0 chrXV 70221 . T A 2707 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.30;SB=-9.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2740,285,0 chrXV 70222 . C G 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2694,285,0 chrXV 70322 . A G 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2844,306,0 chrXV 70393 . C T 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3023,300,0 chrXV 70813 . T G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.463;DP=121;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,73:121:99:1532,0,965 chrXV 70894 . C T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.071;DP=132;Dels=0.00;FS=4.166;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=10.27;ReadPosRankSum=2.788;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1385,0,1367 chrXV 70941 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.416;DP=131;Dels=0.00;FS=2.274;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.674;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1354,0,1387 chrXV 70998 . T C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.596;DP=144;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.561;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1511,0,1618 chrXV 71024 . T C 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.198;DP=134;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=3.3036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.443;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1472,0,1424 chrXV 71038 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.311;DP=139;Dels=0.00;FS=6.262;HaplotypeScore=3.4648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1429,0,1517 chrXV 71084 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.127;DP=138;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=4.6841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=1;MQRankSum=-0.763;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.367;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1242,0,1691 chrXV 71245 . A G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.851;DP=97;Dels=0.00;FS=3.266;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:1133,0,961 chrXV 71578 . C T 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.480;DP=139;Dels=0.00;FS=9.190;HaplotypeScore=1.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1547,0,1342 chrXV 71623 . C T 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.863;DP=119;Dels=0.00;FS=8.502;HaplotypeScore=5.7038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=12.50;ReadPosRankSum=2.309;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1518,0,1054 chrXV 71659 . C G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.278;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.564;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:121:99:1386,0,1071 chrXV 71682 . C A 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.374;DP=121;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=9.53;ReadPosRankSum=2.760;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1183,0,1375 chrXV 71725 . G A 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.972;DP=122;Dels=0.00;FS=4.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=9.40;ReadPosRankSum=2.073;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1177,0,1357 chrXV 71821 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.320;DP=111;Dels=0.00;FS=3.593;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.504;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1169,0,1164 chrXV 72351 . C T 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.845;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.424;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1213,0,1313 chrXV 72741 . A C 4167.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4167,426,0 chrXV 72797 . T C 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3932,408,0 chrXV 73040 . A G 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.952;DP=136;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1462,0,1479 chrXV 73175 . A G 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.316;DP=141;Dels=0.00;FS=2.993;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1548,0,1442 chrXV 73180 . G A 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.989;DP=144;Dels=0.00;FS=2.973;HaplotypeScore=2.7537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1707,0,1397 chrXV 73327 . T C 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3345,363,0 chrXV 73383 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.976;DP=110;Dels=0.00;FS=6.044;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.666;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1109,0,1074 chrXV 73395 . T G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.751;DP=114;Dels=0.00;FS=5.824;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.117;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1171,0,1103 chrXV 73503 . T A 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;DP=155;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=4.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.295;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1745,0,1628 chrXV 73628 . A T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.413;DP=125;Dels=0.00;FS=5.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.635;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1372,0,1316 chrXV 73823 . A G 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.868;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=10.11;ReadPosRankSum=2.580;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1527,0,1551 chrXV 73868 . C A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.093;DP=129;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.905;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1361,0,1365 chrXV 73877 . T C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.693;DP=131;Dels=0.00;FS=2.267;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1361,0,1414 chrXV 74126 . C T 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.665;DP=114;Dels=0.00;FS=8.635;HaplotypeScore=5.9486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.841;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1102,0,1392 chrXV 74338 . G T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3605,375,0 chrXV 74458 . T C 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.376;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1230,0,1181 chrXV 74588 . T G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.587;DP=152;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.250;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1437,0,1592 chrXV 74693 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.959;DP=133;Dels=0.00;FS=9.259;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.091;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1370,0,1279 chrXV 74698 . G A 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.350;DP=146;Dels=0.00;FS=8.695;HaplotypeScore=12.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.460;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1477,0,1465 chrXV 74792 . T C 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.380;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.399;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1490,0,1713 chrXV 74821 . T C 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.906;DP=162;Dels=0.00;FS=4.568;HaplotypeScore=9.1667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.580;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,83:162:99:1515,0,1670 chrXV 74828 . A C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.151;DP=139;Dels=0.00;FS=3.035;HaplotypeScore=13.3007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.592;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1430,0,1300 chrXV 75015 . G A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.189;DP=132;Dels=0.00;FS=8.287;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,54:132:99:1085,0,1658 chrXV 75126 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.725;DP=142;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=4.8416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1368,0,1534 chrXV 75161 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.099;DP=107;Dels=0.00;FS=2.625;HaplotypeScore=4.5426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=10.84;ReadPosRankSum=-2.004;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1190,0,994 chrXV 75243 . T C 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.835;DP=143;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=9.7111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.495;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,81:143:99:1705,0,1327 chrXV 75413 . A C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.486;DP=125;Dels=0.00;FS=4.380;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=2.483;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1468,0,1203 chrXV 75434 . A G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.907;DP=119;Dels=0.00;FS=4.656;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=1;MQRankSum=0.577;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1252,0,1199 chrXV 75605 . G A 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.903;DP=158;Dels=0.00;FS=8.227;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.612;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.932;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1720,0,1437 chrXV 75631 . A C 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.683;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=9.40;ReadPosRankSum=-2.150;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1497,0,1520 chrXV 75674 . T G 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.178;DP=151;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=3.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.342;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1418,0,1596 chrXV 75941 . G A 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.639;DP=136;Dels=0.00;FS=1.547;HaplotypeScore=4.9338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.735;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.548;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:136:99:1430,0,1422 chrXV 75953 . A G 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.887;DP=134;Dels=0.00;FS=2.663;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.761;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1354,0,1390 chrXV 75968 . C T 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.800;DP=137;Dels=0.00;FS=3.417;HaplotypeScore=3.6690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.205;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1556,0,1342 chrXV 76001 . C T 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3743,367,0 chrXV 76115 . T A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;DP=145;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.632;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1368,0,1704 chrXV 76139 . A G 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.681;DP=142;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.937;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1307,0,1673 chrXV 76208 . A C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.971;DP=115;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=5.1801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=9.90;ReadPosRankSum=-2.278;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1169,0,1175 chrXV 76376 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.690;DP=124;Dels=0.00;FS=8.269;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=8.40;ReadPosRankSum=1.358;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1072,0,1409 chrXV 76379 . G A 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.676;DP=134;Dels=0.00;FS=5.260;HaplotypeScore=2.6882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-2.060;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.897;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1020,0,1567 chrXV 76391 . T C 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.383;DP=144;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.709;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:744,0,1752 chrXV 76547 . A G 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.573;DP=170;Dels=0.00;FS=9.039;HaplotypeScore=3.9145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,88:170:99:1737,0,1731 chrXV 77265 . A G 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.996;DP=142;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=5.2064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.061;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1358,0,1532 chrXV 77289 . T C 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.021;DP=119;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.242;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1035,0,1305 chrXV 77319 . G A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.771;DP=113;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.880;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1110,0,1220 chrXV 77399 . A G 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.930;DP=134;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1080,0,1630 chrXV 77404 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.469;DP=139;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1242,0,1556 chrXV 77925 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.030;DP=127;Dels=0.00;FS=13.109;HaplotypeScore=11.1832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=10.51;ReadPosRankSum=-2.763;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:127:99:1365,0,1057 chrXV 77984 . A C 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.658;DP=154;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.830;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:154:99:1574,0,1602 chrXV 78123 . G C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.929;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:1021,0,1527 chrXV 78139 . G A 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.902;DP=138;Dels=0.00;FS=2.157;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1283,0,1533 chrXV 78272 . T G 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.243;DP=153;Dels=0.00;FS=2.076;HaplotypeScore=7.1797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.979;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:153:99:1654,0,1502 chrXV 78338 . G T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.037;DP=139;Dels=0.00;FS=4.214;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1377,0,1456 chrXV 78367 . C T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.401;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.687;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1544,0,1380 chrXV 78910 . C T 1845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.191;DP=151;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=3.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=2.364;QD=12.22;ReadPosRankSum=1.972;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,88:151:99:1875,0,1163 chrXV 79026 . G A 4764.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:177:99:4764,487,0 chrXV 79159 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.357;DP=107;Dels=0.00;FS=1.590;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.717;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1334,0,915 chrXV 79199 . C T 1981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.563;DP=161;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=2.957;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.479;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,90:161:99:2011,0,1431 chrXV 79278 . G A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.012;DP=132;Dels=0.00;FS=7.450;HaplotypeScore=3.7296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.893;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:132:99:1460,0,988 chrXV 79286 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.367;DP=124;Dels=0.00;FS=15.438;HaplotypeScore=2.7508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.191;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.445;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1218,0,1109 chrXV 79297 . C G 2356 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.21;MQ0=0;QD=20.67;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2389,261,0 chrXV 79304 . A T 2421 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.91;MQ0=0;QD=21.05;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2454,261,0 chrXV 79305 . T A 2429 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.59;MQ0=0;QD=21.50;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2462,264,0 chrXV 79311 . G C 579.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.692;DP=121;Dels=0.00;FS=3.589;HaplotypeScore=3.4752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.083;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:121:99:609,0,1276 chrXV 79585 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.705;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=8.94;ReadPosRankSum=-2.060;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1406,0,1523 chrXV 79627 . G A 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.168;DP=158;Dels=0.00;FS=5.763;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.956;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.751;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,78:158:99:1739,0,1669 chrXV 79906 . C T 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.594;DP=145;Dels=0.00;FS=5.030;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.254;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,84:145:99:1755,0,1230 chrXV 79930 . C T 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.996;DP=135;Dels=0.00;FS=3.109;HaplotypeScore=2.3002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.158;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:135:99:1541,0,1198 chrXV 79941 . T G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.714;DP=139;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.853;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1516,0,1336 chrXV 79976 . T C 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.883;DP=155;Dels=0.00;FS=1.264;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.321;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,83:155:99:1571,0,1561 chrXV 79987 . T C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.194;DP=161;Dels=0.00;FS=2.781;HaplotypeScore=4.6318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.111;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:161:99:1417,0,1648 chrXV 80008 . A G 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3746,390,0 chrXV 80022 . C G 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.759;DP=157;Dels=0.00;FS=0.601;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1610,0,1363 chrXV 80113 . C A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.209;DP=139;Dels=0.00;FS=3.065;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.071;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1352,0,1563 chrXV 80409 . G A 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3510,349,0 chrXV 80423 . G C 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3351,348,0 chrXV 80449 . C T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3163,315,0 chrXV 80451 . A G 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.151;DP=119;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.474;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:1329,0,1065 chrXV 80586 . T C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.502;DP=108;Dels=0.00;FS=6.326;HaplotypeScore=2.8153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=2.412;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1157,0,1092 chrXV 80641 . T C 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.820;DP=99;Dels=0.00;FS=2.702;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.025;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:960,0,1054 chrXV 80664 . C T 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2559,252,0 chrXV 80741 . G A 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.418;DP=116;Dels=0.00;FS=2.481;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=10.16;ReadPosRankSum=-2.071;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1208,0,1192 chrXV 80920 . T C 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3475,384,0 chrXV 80986 . G A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.849;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.769;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1344,0,1401 chrXV 81306 . G A 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.697;DP=121;Dels=0.00;FS=8.962;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.381;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.715;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:121:99:1079,0,1339 chrXV 81355 . T C 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.695;DP=127;Dels=0.00;FS=14.887;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=-5.772;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1038,0,1555 chrXV 81364 . G T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.524;DP=123;Dels=0.00;FS=9.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.72;MQ0=0;MQRankSum=-6.127;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.335;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:979,0,1475 chrXV 81387 . T A 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;DP=127;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-7.641;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.424;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:855,0,1707 chrXV 81404 . T C 455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.607;DP=108;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.32;MQ0=0;MQRankSum=-7.800;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,38:108:99:485,0,1578 chrXV 81409 . T G 504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.604;DP=112;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.18;MQ0=0;MQRankSum=-8.225;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.932;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,40:112:99:534,0,1675 chrXV 81416 . G A 452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.025;DP=105;Dels=0.00;FS=1.699;HaplotypeScore=2.7150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.31;MQ0=0;MQRankSum=-7.064;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.719;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,40:105:99:482,0,1460 chrXV 81436 . C T 363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.578;DP=97;Dels=0.00;FS=0.807;HaplotypeScore=4.9519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQ0=0;MQRankSum=-6.028;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.702;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,35:97:99:393,0,1441 chrXV 81481 . C T 695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.639;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=1;MQRankSum=-3.212;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.239;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,40:98:99:725,0,1285 chrXV 81707 . C T 2010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.363;DP=162;Dels=0.00;FS=5.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.608;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,91:162:99:2040,0,1348 chrXV 81796 . T A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;DP=107;Dels=0.00;FS=4.996;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.706;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:107:99:1319,0,1012 chrXV 81934 . T C 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.519;DP=128;Dels=0.00;FS=4.836;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.419;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1520,0,1137 chrXV 81988 . T C 1778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.258;DP=148;Dels=0.00;FS=2.971;HaplotypeScore=5.3980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,85:148:99:1808,0,1219 chrXV 82212 . G T 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.090;DP=140;Dels=0.00;FS=6.133;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.405;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1552,0,1439 chrXV 82213 . A G 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.94;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3684,396,0 chrXV 82531 . A G 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3138,342,0 chrXV 82666 . T C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.408;DP=150;Dels=0.00;FS=11.702;HaplotypeScore=3.4542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.598;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,63:150:99:1180,0,1849 chrXV 82852 . A G 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.291;DP=135;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=6.7500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=7.47;ReadPosRankSum=2.539;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,56:135:99:1038,0,1688 chrXV 82988 . C T 3734.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3734,373,0 chrXV 83018 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.966;DP=122;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=2.8959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.033;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1318,0,1267 chrXV 83041 . A T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.545;DP=133;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.660;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1332,0,1516 chrXV 83069 . T C 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.580;DP=148;Dels=0.00;FS=8.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,82:148:99:1770,0,1389 chrXV 83112 . G C 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.867;DP=129;Dels=0.00;FS=3.273;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=13.01;ReadPosRankSum=2.623;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,79:129:99:1708,0,937 chrXV 83162 . A C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.328;DP=131;Dels=0.00;FS=11.385;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.578;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1185,0,1581 chrXV 83189 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.899;DP=116;Dels=0.00;FS=26.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.127;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1155,0,1320 chrXV 83321 . G A 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.184;DP=137;Dels=0.00;FS=4.063;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=10.13;ReadPosRankSum=2.310;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1418,0,1432 chrXV 83325 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.154;DP=136;Dels=0.00;FS=4.112;HaplotypeScore=2.6884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.351;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1414,0,1356 chrXV 83349 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.525;DP=134;Dels=0.00;FS=3.153;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=10.33;ReadPosRankSum=-2.103;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1414,0,1368 chrXV 83518 . G A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.133;DP=116;Dels=0.00;FS=5.144;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.103;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,73:116:99:1229,0,843 chrXV 83622 . T C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.840;DP=104;Dels=0.00;FS=4.856;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.970;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1012,0,1046 chrXV 83646 . T A 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;DP=107;Dels=0.00;FS=4.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1042,0,1197 chrXV 83647 . T C 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.527;DP=112;Dels=0.00;FS=2.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=8.72;ReadPosRankSum=-2.045;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1007,0,1241 chrXV 83697 . G A 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.059;DP=153;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=2.4511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1566,0,1520 chrXV 83714 . A C 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.391;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.126;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1459,0,1601 chrXV 83725 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.888;DP=137;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.777;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1365,0,1425 chrXV 84850 . A G 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.253;DP=157;Dels=0.00;FS=2.858;HaplotypeScore=3.7971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=1;MQRankSum=0.589;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.007;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:157:99:1552,0,1722 chrXV 84910 . C T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.808;DP=130;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=3.9544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=1;MQRankSum=1.851;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.143;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1212,0,1491 chrXV 84998 . C A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.978;DP=132;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.663;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1462,0,1283 chrXV 85000 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.095;DP=133;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.914;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1466,0,1279 chrXV 85011 . G C 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.399;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1573,0,1257 chrXV 85038 . C A 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.386;DP=128;Dels=0.00;FS=1.453;HaplotypeScore=2.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.082;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1521,0,1095 chrXV 85161 . T C 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.261;DP=164;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.042;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1693,0,1629 chrXV 85270 . T A 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.425;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.620;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,76:129:99:1671,0,1050 chrXV 85327 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.042;DP=117;Dels=0.00;FS=2.543;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=12.66;ReadPosRankSum=-2.154;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,72:117:99:1511,0,901 chrXV 85440 . G T 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.718;DP=108;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=2.8706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=1;MQRankSum=-1.180;QD=11.44;ReadPosRankSum=3.300;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:108:99:1265,0,904 chrXV 85524 . A G 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.690;DP=117;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=2.4397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1150,0,1350 chrXV 85612 . T C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.469;DP=111;Dels=0.00;FS=4.762;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1128,0,1215 chrXV 85809 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.511;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1322,0,1770 chrXV 85891 . C T 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.560;DP=117;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=3.4630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1083,0,1405 chrXV 85960 . G A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.222;DP=153;Dels=0.00;FS=2.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.858;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,61:153:99:1252,0,2004 chrXV 86056 . C A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.587;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.766;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1077,0,1630 chrXV 86182 . G A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.106;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.596;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1405,0,1395 chrXV 86221 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.779;DP=126;Dels=0.00;FS=2.280;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.794;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1403,0,1159 chrXV 86817 . G T 3335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3335,342,0 chrXV 87033 . C T 2772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2805,279,0 chrXV 87062 . G A 2377 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2410,246,0 chrXV 87079 . C A 2468 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.85;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2501,255,0 chrXV 87126 . G T 2668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.080e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2701,273,0 chrXV 87163 . T A 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.34;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2795,297,0 chrXV 87202 . G A 2379 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2412,249,0 chrXV 87280 . A T 2012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.79;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2045,210,0 chrXV 87288 . T G 2048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=66.4815;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.98;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2081,222,0 chrXV 87344 . T C 1803 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;QD=24.36;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1836,195,0 chrXV 88067 . G A 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.438;DP=122;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.577;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:1047,0,1531 chrXV 88251 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.069;DP=123;Dels=0.00;FS=5.463;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.214;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1278,0,1191 chrXV 88299 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.454;DP=125;Dels=0.00;FS=3.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.477;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1379,0,1136 chrXV 88413 . C A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.591;DP=108;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.221;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1118,0,1175 chrXV 88578 . C A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.604;DP=123;Dels=0.00;FS=11.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.863;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1248,0,1332 chrXV 88659 . G T 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3207,319,0 chrXV 88887 . C T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.055;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=0.361;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1109,0,1578 chrXV 89001 . A G 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3674,369,0 chrXV 89207 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;DP=126;Dels=0.00;FS=3.567;HaplotypeScore=3.7286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1171,0,1323 chrXV 89223 . T A 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;DP=119;Dels=0.00;FS=12.218;HaplotypeScore=3.5544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:966,0,1260 chrXV 89229 . A C 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=22.46;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2728,276,0 chrXV 89445 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.816;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.618;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1276,0,1248 chrXV 89473 . A T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1460,0,1388 chrXV 89587 . C T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.665;DP=128;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.752;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1108,0,1349 chrXV 89865 . C G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;DP=120;Dels=0.00;FS=4.433;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.265;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1241,0,1174 chrXV 89883 . A G 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.006;DP=111;Dels=0.00;FS=2.435;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1119,0,1228 chrXV 90174 . A C 1387 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.23;MQ0=0;QD=11.75;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:1420,156,0 chrXV 90232 . C T 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.588;DP=141;Dels=0.00;FS=5.230;HaplotypeScore=3.8078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=2.025;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.578;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,85:141:99:1779,0,1088 chrXV 90250 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.838;DP=147;Dels=0.00;FS=2.947;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.257;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,62:147:99:1214,0,1736 chrXV 90313 . A G 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.644;DP=151;Dels=0.00;FS=5.927;HaplotypeScore=6.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.101;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.746;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1436,0,1742 chrXV 90328 . C T 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;DP=132;Dels=0.00;FS=3.221;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.891;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.882;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1308,0,1444 chrXV 90466 . C T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.730;DP=130;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.384;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1312,0,1426 chrXV 90505 . T A 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.28;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3142,321,0 chrXV 90508 . A T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.506;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1363,0,1184 chrXV 90526 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.823;DP=121;Dels=0.00;FS=4.459;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.828;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1134,0,1270 chrXV 90565 . A T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;DP=123;Dels=0.00;FS=9.947;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.468;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1151,0,1460 chrXV 90661 . C A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.237;DP=128;Dels=0.00;FS=2.248;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.382;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1351,0,1365 chrXV 90685 . A G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.076;DP=115;Dels=0.00;FS=1.484;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1201,0,1291 chrXV 90781 . G A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.726;DP=131;Dels=0.00;FS=4.164;HaplotypeScore=4.9621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1404,0,1367 chrXV 90802 . A C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.067;DP=130;Dels=0.00;FS=3.115;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.738;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1339,0,1267 chrXV 90886 . C T 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3501,355,0 chrXV 90949 . A G 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3344,339,0 chrXV 90982 . A G 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.366;DP=141;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=5.2619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,81:141:99:1664,0,1267 chrXV 90999 . G T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.533;DP=123;Dels=0.00;FS=3.392;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.779;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.809;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:1499,0,964 chrXV 91012 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.988;DP=122;Dels=0.00;FS=2.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.903;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:122:99:1388,0,1036 chrXV 91030 . C T 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.677;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.569;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,78:133:99:1659,0,1067 chrXV 91150 . G A 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.777;DP=145;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=10.93;ReadPosRankSum=-2.252;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1615,0,1449 chrXV 91298 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.903;DP=108;Dels=0.00;FS=2.489;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.012;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1050,0,1129 chrXV 91399 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.280;DP=119;Dels=0.00;FS=4.423;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1183,0,1270 chrXV 91424 . A C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.593;DP=125;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1326,0,1187 chrXV 91434 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.723;DP=135;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=7.4046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.703;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,56:135:99:1204,0,1593 chrXV 91507 . G A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.884;DP=118;Dels=0.00;FS=2.376;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1394,0,1071 chrXV 91589 . A C 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.886;DP=108;Dels=0.00;FS=4.883;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=7.50;ReadPosRankSum=-1.340;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:840,0,1327 chrXV 91599 . T C 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.067;DP=111;Dels=0.00;FS=6.198;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=7.45;ReadPosRankSum=-1.722;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:857,0,1416 chrXV 91615 . C G 693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.675;DP=106;Dels=0.00;FS=4.997;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.403;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:723,0,1280 chrXV 91618 . C G 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;DP=98;Dels=0.00;FS=6.484;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:809,0,1054 chrXV 91656 . C A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.232;DP=115;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.535;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1145,0,1272 chrXV 91680 . A G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.327;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.791;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1087,0,1326 chrXV 91686 . G A 3111 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.67;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3144,324,0 chrXV 91693 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.554;DP=114;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=1.541;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.159;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1215,0,1177 chrXV 91707 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.266;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1162,0,1265 chrXV 91732 . C A 1472.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.518;DP=110;Dels=0.00;FS=2.536;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=13.38;ReadPosRankSum=-2.015;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,67:110:99:1502,0,849 chrXV 91733 . T A 795.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;DP=104;Dels=0.00;FS=1.663;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=7.64;ReadPosRankSum=2.202;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:825,0,1509 chrXV 91740 . A T 897.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.252;DP=100;Dels=0.00;FS=6.901;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:927,0,1261 chrXV 91777 . C T 2917 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.670;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.392;QD=26.04;ReadPosRankSum=1.299;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2950,284,0 chrXV 91780 . C T 990.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.691;DP=120;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1020,0,1444 chrXV 91783 . G T 1481.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.866;DP=120;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=2.428;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.124;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1511,0,989 chrXV 91813 . A T 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=2.406;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,79:138:99:1550,0,1211 chrXV 91823 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.474;DP=127;Dels=0.00;FS=4.318;HaplotypeScore=6.0054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1015,0,1543 chrXV 91826 . C G 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.749;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.968;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,43:116:99:710,0,1494 chrXV 91862 . A G 693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.539;DP=108;Dels=0.00;FS=2.658;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.656;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:723,0,1298 chrXV 91895 . G C 536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;DP=98;Dels=0.00;FS=5.610;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.278;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:566,0,1028 chrXV 91910 . T C 728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.393;DP=111;Dels=0.00;FS=5.135;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.832;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:758,0,1204 chrXV 92017 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.007;DP=112;Dels=0.00;FS=2.565;HaplotypeScore=4.6714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.643;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.460;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1109,0,1109 chrXV 92185 . C T 2636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2669,273,0 chrXV 92619 . C T 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.64;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3350,357,0 chrXV 92649 . A C 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.65;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2747,303,0 chrXV 92652 . T C 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.68;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2866,312,0 chrXV 92669 . T C 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.69;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2925,330,0 chrXV 92690 . G A 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.39;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2642,279,0 chrXV 92712 . A C 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.49;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2957,315,0 chrXV 92889 . G A 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.89;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3307,328,0 chrXV 92900 . A G 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.735;DP=116;Dels=0.00;FS=2.499;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.748;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1123,0,1322 chrXV 92914 . G T 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.21;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3040,309,0 chrXV 92932 . C T 3482.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3482,357,0 chrXV 93037 . A C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.167;DP=124;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.499;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1389,0,1156 chrXV 93082 . T C 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.41;MQ0=0;QD=25.38;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3426,363,0 chrXV 93097 . T G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.642;DP=117;Dels=0.00;FS=2.716;HaplotypeScore=2.3336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:986,0,1438 chrXV 93135 . C T 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.40;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3017,312,0 chrXV 93137 . G A 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.366;DP=118;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.950;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:905,0,1485 chrXV 93152 . A G 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.168;DP=129;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1120,0,1523 chrXV 93175 . C T 3740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3740,376,0 chrXV 93191 . G A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.712;DP=147;Dels=0.00;FS=2.147;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=2.522;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,61:147:99:1266,0,1830 chrXV 93859 . G A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.113;DP=129;Dels=0.01;FS=10.151;HaplotypeScore=20.5759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.409;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:128:99:1122,0,582 chrXV 93950 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.288;DP=128;Dels=0.00;FS=14.305;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.508;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1468,0,1301 chrXV 93980 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.739;DP=110;Dels=0.00;FS=24.487;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1234,0,1114 chrXV 94048 . T G 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.870;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.472;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1165,0,1242 chrXV 94056 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.234;DP=108;Dels=0.00;FS=3.574;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.687;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1311,0,960 chrXV 94140 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.267;DP=130;Dels=0.00;FS=8.220;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1257,0,1487 chrXV 94227 . T C 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.952;DP=137;Dels=0.00;FS=2.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=1.742;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.536;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1447,0,1460 chrXV 94445 . A C,T 3132.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8310;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=55.76;MQ0=0;QD=22.37;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,58,82:140:99:3192,1976,1835,1216,0,997 chrXV 94450 . G A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.901;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.528;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,63:149:99:1205,0,1816 chrXV 94574 . C A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.894;DP=111;Dels=0.00;FS=3.748;HaplotypeScore=3.0766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.37;MQ0=0;MQRankSum=2.492;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.265;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1186,0,1073 chrXV 94646 . T A 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;DP=92;Dels=0.00;FS=2.755;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.82;MQ0=0;MQRankSum=3.135;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.042;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,46:92:99:796,0,842 chrXV 94657 . G A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.387;DP=89;Dels=0.00;FS=1.783;HaplotypeScore=82.5358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.131;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,51:89:99:969,0,521 chrXV 94686 . T A 2433 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.98;MQ0=0;QD=23.17;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2466,255,0 chrXV 94688 . A T 2382 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.46;MQ0=0;QD=23.13;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2415,255,0 chrXV 94694 . G A 2417 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.59;MQ0=0;QD=20.48;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2450,261,0 chrXV 94697 . G A 2865 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.675;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=23.48;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:2898,281,0 chrXV 94761 . T C 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3462,372,0 chrXV 94782 . T C 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6194;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3066,330,0 chrXV 94810 . G A 2684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=111.7740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=23.14;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2717,282,0 chrXV 95393 . A G 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3101,321,0 chrXV 95687 . T G 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=22.78;ReadPosRankSum=-0.581;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,106:108:99:2493,223,0 chrXV 95736 . G A 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.589;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.652;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1191,0,1417 chrXV 95966 . T A 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3657,367,0 chrXV 96017 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.610;DP=122;Dels=0.00;FS=6.877;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.786;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1111,0,1447 chrXV 96035 . C T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.585;DP=115;Dels=0.00;FS=20.668;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.516;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1105,0,1244 chrXV 96219 . G T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3605,358,0 chrXV 96634 . C A 1777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.915;DP=159;Dels=0.00;FS=4.555;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=1;MQRankSum=-0.496;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,86:159:99:1807,0,1474 chrXV 96781 . G A 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.286;DP=114;Dels=0.00;FS=1.529;HaplotypeScore=3.5054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.034;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:971,0,1342 chrXV 96853 . T C 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.28;MQ0=0;QD=24.55;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3249,348,0 chrXV 96855 . G A 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.64;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3241,328,0 chrXV 96867 . A G 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;QD=25.37;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3229,342,0 chrXV 96979 . A G 2832 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2865,300,0 chrXV 96983 . T A 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2977,297,0 chrXV 97058 . C T 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.643;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=26.06;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3082,292,0 chrXV 97129 . T A 2437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2470,243,0 chrXV 97195 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.937;DP=129;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=2.250;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.157;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1366,0,1337 chrXV 97199 . G A 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=27.43;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3429,346,0 chrXV 97442 . G C 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.692;DP=90;Dels=0.00;FS=10.440;HaplotypeScore=2.5750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.149;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:877,0,1005 chrXV 97637 . T G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.134;DP=110;Dels=0.00;FS=9.258;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.239;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1036,0,1171 chrXV 97885 . G A 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.078;DP=95;Dels=0.00;FS=1.654;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.048;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1019,0,912 chrXV 97910 . A G 2306 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.53;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2339,252,0 chrXV 97994 . A G 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.577;DP=86;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.793;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:904,0,905 chrXV 98162 . T G 2232 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.95;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2265,231,0 chrXV 98544 . T A 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.740e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3283,339,0 chrXV 98627 . G A 3741.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=1;QD=26.91;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3741,364,0 chrXV 98723 . G A 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2526,255,0 chrXV 98780 . C T 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3312,336,0 chrXV 98921 . G A 1863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.033;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.991;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,86:153:99:1893,0,1357 chrXV 98981 . G A 3911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.73;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3911,400,0 chrXV 99027 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.344;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.027;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:137:99:1122,0,1743 chrXV 99167 . A G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.661;DP=111;Dels=0.00;FS=8.289;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.006;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1039,0,1213 chrXV 99391 . G A 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3682,370,0 chrXV 99398 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.199;DP=127;Dels=0.00;FS=3.212;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1333,0,1382 chrXV 99428 . T C 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3514,366,0 chrXV 99445 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.043;DP=132;Dels=0.00;FS=2.264;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.913;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:132:99:1311,0,1487 chrXV 99594 . T C 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3312,342,0 chrXV 99654 . C T 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3591,367,0 chrXV 99664 . A T 2971 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3004,306,0 chrXV 99690 . T C 2909 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.329e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2942,309,0 chrXV 99844 . A G 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3774,396,0 chrXV 99913 . T C 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3322;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4109,438,0 chrXV 100003 . G A 2682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2715,270,0 chrXV 100171 . G A 4312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.82;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4312,436,0 chrXV 100194 . A G 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3711,393,0 chrXV 100228 . A G 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=23.06;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3552,363,0 chrXV 100273 . T C 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;DP=150;Dels=0.00;FS=3.128;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=24.49;ReadPosRankSum=0.947;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3673,353,0 chrXV 100316 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.234;DP=114;Dels=0.00;FS=2.491;HaplotypeScore=6.4252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.904;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.562;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1394,0,1075 chrXV 100319 . T C 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.134;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=22.50;ReadPosRankSum=-1.903;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,115:117:99:2665,247,0 chrXV 100547 . T G 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.470;DP=159;Dels=0.00;FS=2.780;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,82:159:99:1655,0,1627 chrXV 100603 . A G 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.060;DP=140;Dels=0.00;FS=2.134;HaplotypeScore=4.7099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1496,0,1364 chrXV 100629 . G A 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.008;DP=160;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1568,0,1676 chrXV 100717 . T C 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3683,387,0 chrXV 100884 . A G 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.307;DP=120;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.881;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1413,0,1046 chrXV 101077 . C T 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=25.67;ReadPosRankSum=1.024;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3388,334,0 chrXV 101279 . G C 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;DP=91;Dels=0.00;FS=0.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.711;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:949,0,839 chrXV 101328 . T C 2047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.4637;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=24.08;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2080,225,0 chrXV 101400 . A G 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2936,306,0 chrXV 101463 . T C 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.639;DP=98;Dels=0.00;FS=5.217;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.339;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:780,0,1285 chrXV 101577 . C A 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3264,316,0 chrXV 101984 . C T 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.723;DP=108;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.498;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1158,0,1159 chrXV 102078 . C A 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3332,334,0 chrXV 102107 . C T 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3189,318,0 chrXV 102146 . A G 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3199,336,0 chrXV 102204 . G A 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.78;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2808,279,0 chrXV 102305 . C T 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=21.97;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2889,288,0 chrXV 102386 . A T 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3330,336,0 chrXV 102500 . T C 1957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=24.16;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1990,210,0 chrXV 102671 . A T 2797 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2830,282,0 chrXV 102760 . A G 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3206,330,0 chrXV 102989 . C T 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.854e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3704,364,0 chrXV 103443 . A G 2614 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2647,282,0 chrXV 103521 . C T 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3420,351,0 chrXV 103524 . A G 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3230,348,0 chrXV 104098 . G A 3998.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.30;SB=-2.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3998,400,0 chrXV 104119 . A G 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.958e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3964,414,0 chrXV 104628 . A G 2759 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.08;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2792,297,0 chrXV 104807 . C G 1436.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;DP=132;Dels=0.00;FS=4.193;HaplotypeScore=2.8077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.714;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1466,0,1170 chrXV 104808 . G C 3293.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8288;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.91;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3293,339,0 chrXV 104814 . C T 3755.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.55;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3755,373,0 chrXV 104826 . A G 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.71;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3719,378,0 chrXV 104856 . A G 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.25;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.880e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3877,405,0 chrXV 105006 . A G 3923.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=1;QD=25.31;SB=-2.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3923,396,0 chrXV 105232 . T G 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3432,366,0 chrXV 105242 . G A 3731.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3731,376,0 chrXV 105283 . C T 3345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3345,337,0 chrXV 105291 . T G 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3329,348,0 chrXV 105423 . T A 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.76;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2977,309,0 chrXV 105555 . A G 2292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2325,246,0 chrXV 105680 . T C 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.272;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.948;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,88:150:99:1756,0,1287 chrXV 105728 . C T 4711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.23;SB=-2.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4711,490,0 chrXV 106127 . A G 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.166;DP=134;Dels=0.00;FS=2.197;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.045;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1430,0,1439 chrXV 106151 . C G 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.57;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3070,336,0 chrXV 106156 . C G 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.550;DP=114;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=25.22;ReadPosRankSum=1.489;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2908,312,0 chrXV 106264 . C G 4032.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=22.91;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4032,412,0 chrXV 107219 . T C 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3030,318,0 chrXV 107378 . A G 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.774;DP=137;Dels=0.00;FS=2.147;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.373;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1292,0,1521 chrXV 107539 . A G 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.663;DP=140;Dels=0.00;FS=10.951;HaplotypeScore=3.5333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,82:140:99:1799,0,1205 chrXV 107546 . C T 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4051,415,0 chrXV 107676 . G A 4381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.71;SB=-2.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4381,430,0 chrXV 107690 . A G 4561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6885;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=25.06;SB=-2.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4561,459,0 chrXV 107858 . A G 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3449,354,0 chrXV 107861 . C T 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3458,354,0 chrXV 108074 . G A 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.911;DP=160;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.648;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1753,0,1647 chrXV 108139 . C G 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.823;DP=137;Dels=0.00;FS=4.045;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.46;MQ0=0;MQRankSum=-3.055;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.098;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1672,0,1112 chrXV 108245 . A G 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.10;MQ0=0;QD=23.49;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3016,321,0 chrXV 108354 . A G 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3055,327,0 chrXV 108394 . G A 3128 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2691;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3161,327,0 chrXV 108789 . C T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.244;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.635;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1198,0,1307 chrXV 108911 . A G 941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.432;DP=135;Dels=0.00;FS=8.014;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.282;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,53:135:99:971,0,1855 chrXV 108930 . A G 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.987;DP=114;Dels=0.00;FS=1.507;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:917,0,1433 chrXV 108945 . C T 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3027,312,0 chrXV 108950 . T A 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2976,309,0 chrXV 109106 . G A 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.11;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3525,357,0 chrXV 109424 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.960;DP=147;Dels=0.00;FS=3.859;HaplotypeScore=3.5524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=9.29;ReadPosRankSum=-4.506;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1395,0,1494 chrXV 109511 . G A 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.058;DP=160;Dels=0.00;FS=2.784;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.969;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1662,0,1543 chrXV 109676 . C A 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.892;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.783;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1386,0,1604 chrXV 109765 . T C 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.734;DP=143;Dels=0.00;FS=6.140;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1620,0,1352 chrXV 109895 . C T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.924;DP=122;Dels=0.00;FS=3.289;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1240,0,1119 chrXV 109914 . C A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.628;DP=122;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.070;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.655;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1172,0,1242 chrXV 109945 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.367;DP=113;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.226;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1333,0,1014 chrXV 110152 . C A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.134;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1301,0,1358 chrXV 110203 . T C 3790.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3790,393,0 chrXV 110413 . T C 2129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=23.14;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2162,231,0 chrXV 110483 . G A 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.935;DP=80;Dels=0.00;FS=7.675;HaplotypeScore=5.7950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,48:80:99:998,0,596 chrXV 110509 . C T 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.424;DP=61;Dels=0.00;FS=3.609;HaplotypeScore=4.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.516;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,33:61:99:719,0,494 chrXV 110676 . T C 1402 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.114;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=25.04;ReadPosRankSum=1.485;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:1435,144,0 chrXV 110791 . C A 668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.23;MQ0=0;QD=16.29;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:72:701,72,0 chrXV 110809 . A G 20.05 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.375;DP=42;Dels=0.00;FS=6.711;HaplotypeScore=8.9366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.25;MQ0=0;MQRankSum=-3.082;QD=0.48;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:50:50,0,456 chrXV 110812 . A G 93.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.650;DP=49;Dels=0.00;FS=10.571;HaplotypeScore=5.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.330;QD=1.90;ReadPosRankSum=-1.730;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:123,0,376 chrXV 110815 . A G 120.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.549;DP=51;Dels=0.00;FS=19.203;HaplotypeScore=5.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.940;QD=2.35;ReadPosRankSum=-1.467;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:150,0,329 chrXV 110818 . A G 571 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.023;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9735;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.47;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:69:604,69,0 chrXV 110842 . A G 174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.369;DP=73;Dels=0.00;FS=43.143;HaplotypeScore=63.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=2.38;ReadPosRankSum=-2.508;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:204,0,116 chrXV 110844 . A G 104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.552;DP=73;Dels=0.00;FS=31.693;HaplotypeScore=62.6144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.32;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=1.42;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-3.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,44:73:99:134,0,206 chrXV 110864 . T A 52.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;DP=73;Dels=0.00;FS=1.739;HaplotypeScore=7.8389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.888;QD=0.71;ReadPosRankSum=-2.553;SB=-7.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:82:82,0,650 chrXV 111070 . T C 1750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.12;MQ0=0;QD=24.31;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1783,198,0 chrXV 111076 . T G 1844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.10;MQ0=0;QD=25.97;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1877,204,0 chrXV 111086 . G A 1937 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=50.2584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.28;MQ0=0;QD=26.53;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1970,207,0 chrXV 111105 . C T 1649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.74;MQ0=0;QD=24.61;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1682,180,0 chrXV 111160 . T A 1360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.92;MQ0=0;QD=18.89;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1393,141,0 chrXV 111161 . G A 1296 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.099;DP=72;Dels=0.00;FS=56.924;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.92;MQ0=0;MQRankSum=2.709;QD=18.00;ReadPosRankSum=5.073;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,52:72:99:1329,118,0 chrXV 111207 . A G 1772 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=66.6891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.49;MQ0=0;QD=22.72;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1805,192,0 chrXV 111244 . A G 2636 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.11;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2669,285,0 chrXV 111282 . A C 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.23;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3091,318,0 chrXV 111293 . C T 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.87;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:140:99:3699,370,0 chrXV 111761 . A G 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2870,306,0 chrXV 111851 . C T 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3446,345,0 chrXV 112082 . A T 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2603,276,0 chrXV 112572 . C T 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3192,315,0 chrXV 112722 . A T 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;DP=106;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=8.5295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=2.104;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.603;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:925,0,1269 chrXV 113042 . G A 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.734;DP=126;Dels=0.00;FS=17.503;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.727;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1053,0,1532 chrXV 113148 . C T 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.884;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=10.61;ReadPosRankSum=3.035;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:1027,0,885 chrXV 113233 . A G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.295;DP=114;Dels=0.04;FS=1.563;HaplotypeScore=8.7215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.269;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1094,0,1129 chrXV 113253 . A G 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=23.11;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2668,276,0 chrXV 113304 . G A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.302;DP=132;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.898;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1565,0,1172 chrXV 113345 . G C 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2971,318,0 chrXV 113612 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.832;DP=127;Dels=0.00;FS=4.315;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.340;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:127:99:1529,0,1201 chrXV 113653 . C T 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.60;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3179,327,0 chrXV 113780 . G T 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.548e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2979,306,0 chrXV 113917 . A C 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.308;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=2.363;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.070;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:878,0,1412 chrXV 113919 . A G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.938;DP=113;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,68:113:99:1394,0,927 chrXV 113956 . T A 1073.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.062;DP=109;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.933;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.015;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,64:109:99:1103,0,955 chrXV 113957 . T A 2473 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.55;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2506,255,0 chrXV 113958 . T C 1013.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.914;DP=101;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQ0=0;MQRankSum=-4.214;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.622;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:101:99:1043,0,915 chrXV 114097 . C T 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3492,334,0 chrXV 114519 . C A 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3380,339,0 chrXV 114736 . G A 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.174;DP=116;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.497;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1223,0,1142 chrXV 114813 . G A 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3056,301,0 chrXV 114935 . C T 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.163;DP=135;Dels=0.00;FS=2.202;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1374,0,1422 chrXV 115050 . G A 115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.970;DP=170;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=31.4028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.63;MQ0=1;MQRankSum=-1.526;QD=0.68;ReadPosRankSum=-4.682;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,36:170:99:145,0,2757 chrXV 115059 . A G 127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.641;DP=177;Dels=0.00;FS=1.640;HaplotypeScore=45.1559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.77;MQ0=1;MQRankSum=-3.480;QD=0.72;ReadPosRankSum=-4.024;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,32:177:99:157,0,2960 chrXV 115062 . G A 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.356;DP=178;Dels=0.00;FS=2.035;HaplotypeScore=56.2439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.87;MQ0=1;MQRankSum=-0.742;QD=4.27;ReadPosRankSum=-5.356;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,63:178:99:790,0,2232 chrXV 115071 . A G 428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.299;DP=184;Dels=0.00;FS=2.232;HaplotypeScore=51.0065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.64;MQ0=1;MQRankSum=1.002;QD=2.33;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,47:184:99:458,0,2786 chrXV 115074 . A G 2195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.105;DP=182;Dels=0.00;FS=2.792;HaplotypeScore=60.8987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.46;MQ0=1;MQRankSum=-1.279;QD=12.06;ReadPosRankSum=-3.416;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,109:182:99:2225,0,1064 chrXV 115083 . A G 110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.318;DP=178;Dels=0.00;FS=2.678;HaplotypeScore=112.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.03;MQ0=1;MQRankSum=-3.350;QD=0.62;ReadPosRankSum=6.055;SB=-6.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,33:178:99:140,0,3127 chrXV 115092 . G A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.747;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=92.6594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.08;MQ0=1;MQRankSum=-5.143;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.837;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,88:160:99:1482,0,1263 chrXV 115095 . A G 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.265;DP=158;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=61.6422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.05;MQ0=1;MQRankSum=-4.042;QD=5.49;ReadPosRankSum=-3.428;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,51:158:99:898,0,1937 chrXV 115104 . G A 825.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=64.2361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.69;MQ0=1;MQRankSum=-7.161;QD=5.85;ReadPosRankSum=-4.285;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,52:141:99:855,0,1602 chrXV 115107 . A G 38.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.949;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=66.8813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.78;MQ0=1;MQRankSum=-4.432;QD=0.27;ReadPosRankSum=-3.341;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,18:140:68:68,0,2460 chrXV 115110 . A G 15.14 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.398;DP=136;Dels=0.00;FS=0.980;HaplotypeScore=63.8314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.94;MQ0=1;MQRankSum=-4.191;QD=0.11;ReadPosRankSum=-3.978;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,18:136:45:45,0,2392 chrXV 115116 . G A 447.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;DP=132;Dels=0.00;FS=3.695;HaplotypeScore=61.0596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.49;MQ0=0;MQRankSum=-5.516;QD=3.39;ReadPosRankSum=-5.265;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,38:132:99:477,0,1789 chrXV 115128 . G A 263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.758;DP=134;Dels=0.00;FS=17.867;HaplotypeScore=45.5048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.25;MQ0=0;MQRankSum=-6.853;QD=1.96;ReadPosRankSum=-3.819;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,35:134:99:293,0,1901 chrXV 115164 . A G,T 913.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.103;DP=63;Dels=0.00;FS=81.254;HaplotypeScore=41.1408;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=49.16;MQ0=0;MQRankSum=4.792;QD=14.49;ReadPosRankSum=-5.550;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:16,18,29:63:99:973,578,582,328,0,298 chrXV 115167 . A T 440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;DP=61;Dels=0.00;FS=22.111;HaplotypeScore=71.8823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.366;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:61:99:470,0,483 chrXV 115253 . C T 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.581;DP=127;Dels=0.00;FS=11.960;HaplotypeScore=5.6270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.013;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1229,0,1425 chrXV 115336 . G T 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2778,276,0 chrXV 115412 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.641;DP=150;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=2.086;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.954;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1585,0,1653 chrXV 115446 . T C 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3593,381,0 chrXV 115837 . A T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.538;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1390,0,1101 chrXV 115967 . A G 2446 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.59;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2479,258,0 chrXV 116289 . C T 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3110,303,0 chrXV 116543 . A G 2349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2382,255,0 chrXV 116712 . C T 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.613;DP=116;Dels=0.00;FS=4.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=27.19;ReadPosRankSum=0.986;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:3187,307,0 chrXV 116735 . G A 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3275,334,0 chrXV 116873 . C T 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3539,355,0 chrXV 117048 . C T 4192.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.22;SB=-2.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4192,418,0 chrXV 117077 . A G 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=23.43;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2727,300,0 chrXV 117111 . T C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.729;DP=128;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=8.57;ReadPosRankSum=-2.007;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1127,0,1435 chrXV 117153 . T C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.755;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.729;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1224,0,1257 chrXV 117295 . A G 3949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.999e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3949,408,0 chrXV 117367 . A G 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3821,405,0 chrXV 117509 . C T 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.01;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3947,388,0 chrXV 117678 . C T 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.184;DP=70;Dels=0.00;FS=6.381;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,38:70:99:812,0,543 chrXV 117689 . C A 1149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.03;MQ0=0;QD=22.10;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1182,126,0 chrXV 117698 . C T 863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.648;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.56;MQ0=1;MQRankSum=-1.479;QD=20.55;ReadPosRankSum=-1.648;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:73:896,73,0 chrXV 123705 . A G 2131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.64;MQ0=0;QD=22.67;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2164,231,0 chrXV 124336 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.068;DP=121;Dels=0.00;FS=7.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1498,0,1061 chrXV 125062 . G A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.369;DP=123;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1353,0,1243 chrXV 125287 . A G 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.56;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3629,387,0 chrXV 125569 . C T 2375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=24.48;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2408,267,0 chrXV 125570 . T C 2369 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=24.42;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2402,267,0 chrXV 125599 . G A 3409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3409,342,0 chrXV 125641 . C A 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3286,328,0 chrXV 126162 . T A 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.576e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3274,333,0 chrXV 126255 . C T 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3082,315,0 chrXV 126462 . C T 4106.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.01;SB=-2.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4106,412,0 chrXV 126522 . C G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;DP=154;Dels=0.00;FS=2.818;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.805;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1322,0,1700 chrXV 126617 . T C 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3515,369,0 chrXV 126866 . C G 2463 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2496,267,0 chrXV 126868 . T G 2433 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2466,264,0 chrXV 126993 . A G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.490;DP=106;Dels=0.00;FS=7.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.573;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1179,0,1107 chrXV 127093 . G A 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.878;DP=104;Dels=0.00;FS=5.020;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.255;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1277,0,939 chrXV 127096 . A G 2719 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2752,294,0 chrXV 127202 . T C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.043;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.161;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1291,0,1289 chrXV 127240 . G A 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3262,322,0 chrXV 128067 . G A 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.986;DP=100;Dels=0.00;FS=2.663;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.635;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1193,0,968 chrXV 128405 . G A 3610.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3610,349,0 chrXV 128523 . C G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.617;DP=140;Dels=0.00;FS=9.014;HaplotypeScore=4.7875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.510;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:140:99:1258,0,1550 chrXV 128537 . A G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.789;DP=146;Dels=0.00;FS=11.824;HaplotypeScore=4.0622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.740;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1437,0,1494 chrXV 128564 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.664;DP=124;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1214,0,1180 chrXV 128581 . C T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.062;DP=118;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.489;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1111,0,1179 chrXV 128588 . T C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.328;DP=117;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.401;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1078,0,1221 chrXV 128693 . G A 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.798;DP=134;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=7.6593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.712;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:134:99:1557,0,1204 chrXV 129023 . A T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.702;DP=143;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=9.48;ReadPosRankSum=2.078;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1385,0,1691 chrXV 129347 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.185;DP=126;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.017;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1145,0,1489 chrXV 129440 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.796;DP=119;Dels=0.00;FS=5.613;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.072;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1170,0,1380 chrXV 129926 . C G 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.068;DP=114;Dels=0.00;FS=5.336;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.994;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.082;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,43:114:99:818,0,1425 chrXV 130049 . A G 3037 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=-0.228;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.363;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3070,318,0 chrXV 130079 . A C 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.062;DP=171;Dels=0.00;FS=4.466;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.901;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,86:171:99:1634,0,1825 chrXV 130106 . C A 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.984;DP=142;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=2.5121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.785;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1595,0,1436 chrXV 130136 . T C 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.724;DP=156;Dels=0.00;FS=3.323;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.014;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1535,0,1777 chrXV 130271 . G A 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.108;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.303;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1227,0,1456 chrXV 130283 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.265;DP=134;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1219,0,1424 chrXV 130289 . A C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.398;DP=133;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.894;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1140,0,1610 chrXV 130337 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.304;DP=117;Dels=0.00;FS=3.367;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=9.90;ReadPosRankSum=2.047;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1188,0,1282 chrXV 130811 . T C 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.952;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1013,0,1631 chrXV 131195 . A T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;DP=111;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.361;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1299,0,1091 chrXV 131226 . T C 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.361;DP=137;Dels=0.00;FS=3.658;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:137:99:1314,0,1537 chrXV 131249 . T G 2720 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.29;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2753,297,0 chrXV 131283 . A G 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.716;DP=96;Dels=0.00;FS=1.681;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:882,0,1176 chrXV 131327 . C T 2197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2230,225,0 chrXV 131334 . C T 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.686;DP=85;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.930;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:844,0,936 chrXV 131361 . A C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.856;DP=104;Dels=0.00;FS=7.687;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=10.67;ReadPosRankSum=2.159;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1140,0,990 chrXV 131471 . T G 2755 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2788,285,0 chrXV 131661 . G A 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.423;DP=90;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.489;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:889,0,990 chrXV 131688 . T A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.829;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.734;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:99:99:1112,0,1010 chrXV 131694 . A G 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2835,300,0 chrXV 131747 . T C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.533;DP=115;Dels=0.00;FS=3.423;HaplotypeScore=3.4543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.700;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1159,0,1138 chrXV 131825 . T C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.746;DP=93;Dels=0.00;FS=6.697;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.80;ReadPosRankSum=2.363;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:941,0,948 chrXV 131858 . G A 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2941,294,0 chrXV 131916 . C T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.379;DP=135;Dels=0.00;FS=4.112;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=10.33;ReadPosRankSum=2.035;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1425,0,1424 chrXV 131978 . G A 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2654,273,0 chrXV 131990 . T A 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.12;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2662,270,0 chrXV 132000 . G A 2748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2781,282,0 chrXV 132086 . T A 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3225,330,0 chrXV 132089 . T C 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3149,327,0 chrXV 132152 . A G 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2855,300,0 chrXV 132179 . A T 2481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2514,255,0 chrXV 132180 . C T 2487 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:98:99:2520,255,0 chrXV 132221 . C T 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2917,300,0 chrXV 132419 . G A 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2802,291,0 chrXV 132501 . G A 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.810e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3378,334,0 chrXV 132527 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.085;DP=118;Dels=0.00;FS=13.904;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.951;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1253,0,1178 chrXV 132600 . A G 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3225,345,0 chrXV 132710 . A G 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2875,309,0 chrXV 132713 . G A 2997 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3030,309,0 chrXV 132965 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.230;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.104;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1399,0,1399 chrXV 133226 . G A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.472;DP=121;Dels=0.00;FS=5.570;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=9.62;ReadPosRankSum=2.254;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1194,0,1282 chrXV 133313 . G A 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.283;DP=136;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.921;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1709,0,1053 chrXV 133472 . C A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.315;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1308,0,1246 chrXV 133533 . T G 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.245;DP=125;Dels=0.00;FS=4.692;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1377,0,1213 chrXV 133823 . A C 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.518;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=3.001;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.625;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1604,0,1627 chrXV 134036 . G A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.403;DP=119;Dels=0.00;FS=4.414;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.179;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1162,0,1353 chrXV 134063 . G A 3223.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3256,330,0 chrXV 135032 . T C 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.170;DP=140;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=9.31;ReadPosRankSum=2.022;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1333,0,1632 chrXV 135170 . A T 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.702;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1776,0,1283 chrXV 135182 . G A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.355;DP=133;Dels=0.00;FS=5.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.572;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1502,0,1220 chrXV 135275 . C G 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=1;QD=25.48;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3142,333,0 chrXV 135770 . G A 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3964,388,0 chrXV 135875 . A G 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.627;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.203;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,72:165:99:1482,0,1920 chrXV 135911 . C T 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3344,334,0 chrXV 136052 . A T 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.38;MQ0=0;QD=26.65;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3678,373,0 chrXV 136235 . T A 2904 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2937,294,0 chrXV 136327 . G A 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.17;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3194,316,0 chrXV 136508 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.437;DP=131;Dels=0.00;FS=9.300;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1276,0,1506 chrXV 136512 . A G 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3798,396,0 chrXV 137115 . G A 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3803,388,0 chrXV 137304 . G T 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3502,358,0 chrXV 137682 . G A 3399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3399,336,0 chrXV 137942 . G T 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4011,415,0 chrXV 138302 . G A 2822 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2855,285,0 chrXV 138390 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.520;DP=115;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=5.2964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.014;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1233,0,1249 chrXV 138746 . T C 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;DP=141;Dels=0.00;FS=3.499;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3449,335,0 chrXV 138754 . G A 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.239;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-1.554e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,138:140:99:3465,295,0 chrXV 138839 . T C 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3559,372,0 chrXV 138847 . T C 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3468,369,0 chrXV 139001 . T C 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.58;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3321,342,0 chrXV 139013 . A G 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.93;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3110,315,0 chrXV 139015 . T C 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3097,318,0 chrXV 139359 . T G 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3361,351,0 chrXV 139408 . T C 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3787,387,0 chrXV 139908 . A G 2161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2194,237,0 chrXV 140012 . T C 2916 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=1;QD=23.52;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:2949,330,0 chrXV 140220 . T C 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2775,294,0 chrXV 140557 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.990;DP=110;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.320;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1127,0,1180 chrXV 140619 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3267,336,0 chrXV 140746 . C T 1931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.45;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1964,198,0 chrXV 140760 . A G 2066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.15;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2099,219,0 chrXV 141126 . A G 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3081,309,0 chrXV 141147 . T A 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3855,364,0 chrXV 141207 . C T 2993 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3026,301,0 chrXV 141311 . T G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.809;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=10.18;ReadPosRankSum=-2.918;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1404,0,1383 chrXV 141395 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.279;DP=146;Dels=0.04;FS=5.609;HaplotypeScore=23.1962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.356;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1205,0,1704 chrXV 141441 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=118;Dels=0.00;FS=1.877;HaplotypeScore=2.5243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.295;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:950,0,1430 chrXV 141471 . G A 99.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.389;DP=122;Dels=0.00;FS=3.382;HaplotypeScore=92.6423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=0.81;ReadPosRankSum=-5.195;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:129,0,1099 chrXV 141631 . G A 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6421;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2583,264,0 chrXV 141689 . T C 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.778;DP=103;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1013,0,1196 chrXV 141731 . T C 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3281,342,0 chrXV 141818 . T C 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.044;DP=143;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=4.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.865;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.846;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1267,0,1733 chrXV 142001 . C T 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3571,358,0 chrXV 142296 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.764;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=8.08;ReadPosRankSum=2.755;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1218,0,1820 chrXV 142461 . C T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.457;DP=134;Dels=0.00;FS=7.881;HaplotypeScore=4.1713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.447;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1310,0,1434 chrXV 142608 . C A 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.649;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=1;MQRankSum=1.704;QD=26.67;ReadPosRankSum=0.956;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3361,323,0 chrXV 142614 . G A 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=1.677;QD=26.28;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3338,328,0 chrXV 142645 . A G 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3505,363,0 chrXV 142732 . G A 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2983,309,0 chrXV 142835 . C G 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9459;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3673,396,0 chrXV 143022 . A G 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7843;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2955,309,0 chrXV 143072 . C T 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3183,321,0 chrXV 143222 . G A 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.428;DP=115;Dels=0.00;FS=1.643;HaplotypeScore=2.9261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=1;MQRankSum=1.800;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.652;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:115:99:1158,0,1185 chrXV 143229 . C T 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.227;DP=116;Dels=0.00;FS=1.681;HaplotypeScore=2.9261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.076;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.187;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1144,0,1247 chrXV 143401 . A G 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.301;DP=128;Dels=0.00;FS=2.259;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.803;QD=7.23;ReadPosRankSum=-2.378;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:955,0,1556 chrXV 143405 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.843;DP=128;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1103,0,1522 chrXV 143597 . C T 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2910,288,0 chrXV 143696 . G A 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=27.25;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3542,364,0 chrXV 143727 . G T 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;DP=111;Dels=0.00;FS=4.019;HaplotypeScore=5.7966;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=26.88;ReadPosRankSum=1.482;SB=-1.233e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:3017,306,0 chrXV 143755 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.562;DP=138;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.683;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1318,0,1598 chrXV 143787 . C T 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3418,340,0 chrXV 143811 . G A 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3305,339,0 chrXV 143876 . A G 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.276;DP=112;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1170,0,1080 chrXV 143890 . T C 2492 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2525,273,0 chrXV 143915 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.845;DP=96;Dels=0.00;FS=2.614;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.598;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:968,0,1034 chrXV 143927 . G T 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.366;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.265;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:900,0,981 chrXV 143959 . G T 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.015;DP=90;Dels=0.00;FS=0.821;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.499;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:90:99:808,0,1018 chrXV 143977 . T C 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.448;DP=99;Dels=0.00;FS=2.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQ0=0;MQRankSum=-3.854;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:851,0,1223 chrXV 143987 . C T 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.509;DP=95;Dels=0.00;FS=4.375;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.34;MQ0=0;MQRankSum=-4.609;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:874,0,1106 chrXV 143989 . T C 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.692;DP=95;Dels=0.00;FS=4.375;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.34;MQ0=0;MQRankSum=-5.208;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:866,0,1191 chrXV 144008 . A G 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.63;MQ0=0;QD=24.87;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2744,294,0 chrXV 144117 . C T 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=1;QD=23.44;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2775,276,0 chrXV 144215 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.584;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.125;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1397,0,1001 chrXV 144354 . G A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.617;DP=136;Dels=0.00;FS=3.137;HaplotypeScore=3.5541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.048;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1563,0,1298 chrXV 144655 . C T 2415 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2448,243,0 chrXV 144676 . A C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.409;DP=111;Dels=0.00;FS=2.627;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.003;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:111:99:1152,0,1102 chrXV 145028 . T C 2180 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=24.49;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:2213,240,0 chrXV 145140 . T C 2001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.65;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2034,219,0 chrXV 145222 . A G 1545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.604;DP=81;Dels=0.00;FS=3.174;HaplotypeScore=4.0447;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.920;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:81:99:1578,174,0 chrXV 145302 . T G 2411 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.21;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2444,258,0 chrXV 145310 . C A 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.39;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2833,291,0 chrXV 145331 . A G 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;QD=23.09;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2965,315,0 chrXV 145384 . A G 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.801;DP=162;Dels=0.00;FS=6.897;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.056;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:1441,0,1847 chrXV 145519 . T C 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2969,303,0 chrXV 145551 . G A 2571 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.51;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2604,267,0 chrXV 146203 . C T 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3039,309,0 chrXV 146225 . G A 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.220;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=25.04;ReadPosRankSum=1.642;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2913,294,0 chrXV 146231 . T C 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9654;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.618;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:2959,309,0 chrXV 146368 . C T 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3118,324,0 chrXV 146472 . G A 2852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;DP=109;Dels=0.00;FS=4.354;HaplotypeScore=4.7585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.383;SB=-1.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2885,271,0 chrXV 146551 . T A 2123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.54;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2156,222,0 chrXV 146599 . G A 2344 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.04;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2377,249,0 chrXV 146782 . A G 2443 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.93;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2476,267,0 chrXV 147007 . C T 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.22;SB=-9.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2946,295,0 chrXV 147162 . G A 2528 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.97;MQ0=1;QD=27.18;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2561,264,0 chrXV 147274 . T A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.246;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.14;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.788;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1234,0,1313 chrXV 147540 . G T 3963.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3963,400,0 chrXV 147582 . C T 4125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4125,412,0 chrXV 147591 . C T 1913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.908;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.772;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,88:158:99:1943,0,1398 chrXV 147687 . G A 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.898;DP=100;Dels=0.00;FS=3.854;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=1;MQRankSum=-0.900;QD=8.14;ReadPosRankSum=2.031;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:844,0,1246 chrXV 147699 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.658;DP=105;Dels=0.00;FS=1.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=1;MQRankSum=2.562;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.657;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1106,0,1111 chrXV 147729 . A T 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;DP=106;Dels=0.00;FS=3.605;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=1;MQRankSum=-0.305;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1144,0,1072 chrXV 147735 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.565;DP=104;Dels=0.00;FS=4.875;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=1;MQRankSum=-0.993;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.142;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1101,0,1001 chrXV 147750 . C T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.922;DP=114;Dels=0.00;FS=1.501;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.660;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.198;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1294,0,1165 chrXV 147783 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.815;DP=126;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.334;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.569;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1071,0,1619 chrXV 147840 . A G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.394;DP=132;Dels=0.00;FS=6.901;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.712;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1251,0,1591 chrXV 147891 . A C 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.980;DP=127;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.508;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.267;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,75:127:99:1553,0,1116 chrXV 147981 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.268;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=11.54;ReadPosRankSum=2.335;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1380,0,1154 chrXV 148131 . A G 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.661;DP=132;Dels=0.00;FS=5.517;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.745;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1234,0,1561 chrXV 148159 . T C 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3169,345,0 chrXV 148176 . C T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.864;DP=127;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=3.9740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.120;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1459,0,1134 chrXV 148362 . G A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.206;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.323;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1375,0,914 chrXV 148695 . C T 2849 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.38;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2882,303,0 chrXV 148704 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.019;DP=128;Dels=0.00;FS=3.213;HaplotypeScore=2.0641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.358;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1185,0,1289 chrXV 148719 . C G 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.42;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3236,345,0 chrXV 148731 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.235;DP=130;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1359,0,1181 chrXV 148734 . C T 3124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.80;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3157,324,0 chrXV 148894 . A G 1918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.99;MQ0=0;QD=25.24;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1951,210,0 chrXV 148900 . C T 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.975;DP=78;Dels=0.00;FS=4.295;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.271;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:714,0,823 chrXV 148914 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.629;DP=109;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.133;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:962,0,1314 chrXV 148926 . T A 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.79;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3084,324,0 chrXV 148966 . C T 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.672;DP=116;Dels=0.00;FS=24.033;HaplotypeScore=4.5816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=8.95;ReadPosRankSum=3.076;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:1068,0,1408 chrXV 149046 . G A 2668 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.109;DP=100;Dels=0.00;FS=3.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.524;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2701,273,0 chrXV 149214 . A G 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3287,327,0 chrXV 149247 . G C 3379.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3379,348,0 chrXV 149394 . T C 2942 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=1;QD=24.11;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:121:99:2975,306,0 chrXV 149499 . A G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.842;DP=125;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1456,0,1195 chrXV 149706 . A T 3594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3594,367,0 chrXV 150111 . G A 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2984,297,0 chrXV 150293 . A C 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.829;DP=104;Dels=0.00;FS=6.291;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=1;MQRankSum=0.524;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.323;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:992,0,1161 chrXV 150300 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.127;DP=107;Dels=0.00;FS=3.691;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=1;MQRankSum=-0.534;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.438;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1072,0,1167 chrXV 150390 . G C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.742;DP=119;Dels=0.00;FS=5.712;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.795;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1129,0,1318 chrXV 150501 . C G 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.638;DP=112;Dels=0.00;FS=3.485;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.091;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1223,0,1069 chrXV 150543 . C T 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2866,291,0 chrXV 150554 . A G 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.780;DP=110;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=7.9406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.873;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:934,0,1358 chrXV 150653 . T C 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.08;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3006,309,0 chrXV 150756 . T A 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.459;DP=86;Dels=0.00;FS=0.838;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:830,0,1017 chrXV 150803 . G A 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.769;DP=107;Dels=0.00;FS=6.118;HaplotypeScore=2.7374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.926;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1112,0,1080 chrXV 150859 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.564;DP=116;Dels=0.00;FS=12.231;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=9.11;ReadPosRankSum=2.564;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:1087,0,1331 chrXV 150962 . A G 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3426,360,0 chrXV 151016 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.834;DP=110;Dels=0.00;FS=4.681;HaplotypeScore=4.3679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.013;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1220,0,1057 chrXV 151148 . C A 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3467,349,0 chrXV 151176 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.766;DP=123;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1278,0,1226 chrXV 151183 . T C 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3149,339,0 chrXV 151251 . T A 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;DP=166;Dels=0.00;FS=4.952;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.653;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,90:166:99:1918,0,1635 chrXV 151265 . A G 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.444;DP=160;Dels=0.00;FS=6.026;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.323;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,86:160:99:1759,0,1537 chrXV 151304 . C T 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3677,358,0 chrXV 151369 . T C 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3360,360,0 chrXV 151684 . G C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.512;DP=140;Dels=0.00;FS=8.953;HaplotypeScore=4.8635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1248,0,1596 chrXV 151709 . A T 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.457;DP=128;Dels=0.00;FS=8.053;HaplotypeScore=2.7902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.946;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1384,0,1332 chrXV 151910 . T A 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3363,351,0 chrXV 151997 . G A 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3138,303,0 chrXV 152054 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;DP=117;Dels=0.00;FS=7.438;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1377,0,1000 chrXV 152141 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.087;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.780;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1366,0,1145 chrXV 152215 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.189;DP=111;Dels=0.00;FS=2.491;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.442;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1278,0,1049 chrXV 152301 . C T 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.133;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:1034,0,1469 chrXV 152407 . T G 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4190;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3384,348,0 chrXV 152424 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.512;DP=143;Dels=0.00;FS=5.337;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1462,0,1499 chrXV 152922 . C T 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.478;DP=172;Dels=0.00;FS=4.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=10.24;ReadPosRankSum=2.507;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,86:172:99:1792,0,1735 chrXV 153116 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.034;DP=127;Dels=0.00;FS=4.081;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.248;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1163,0,1427 chrXV 153180 . T G 3838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3838,393,0 chrXV 153242 . C T 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.597;DP=156;Dels=0.00;FS=4.794;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.073;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,72:156:99:1547,0,1729 chrXV 153262 . T C 4381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4381,465,0 chrXV 153279 . A T 4231.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4231,424,0 chrXV 153317 . T C 3794.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3794,402,0 chrXV 153362 . G A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.010;DP=136;Dels=0.00;FS=1.506;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,80:136:99:1695,0,1065 chrXV 153513 . G C 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;DP=137;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.208;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.494;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1605,0,1243 chrXV 153516 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.317;DP=143;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=2.990;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.964;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1178,0,1781 chrXV 153615 . T C 3321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3321,345,0 chrXV 153722 . A C 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.956;DP=144;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,81:144:99:1731,0,1224 chrXV 153761 . A G 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.685;DP=142;Dels=0.00;FS=1.375;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.381;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1685,0,1241 chrXV 154056 . T C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.918;DP=130;Dels=0.00;FS=9.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1179,0,1542 chrXV 154073 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.419;DP=125;Dels=0.00;FS=7.369;HaplotypeScore=4.6196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:125:99:1214,0,1335 chrXV 154165 . T C 3177 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3210,333,0 chrXV 154180 . T C 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.318;DP=130;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=10.60;ReadPosRankSum=-2.123;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1408,0,1269 chrXV 154310 . T C 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.806;DP=135;Dels=0.00;FS=3.452;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.381;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1538,0,1455 chrXV 154799 . T G 2423 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=104;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=4.7616;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=23.30;ReadPosRankSum=1.232;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2456,243,0 chrXV 154898 . A G 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3052,306,0 chrXV 154904 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.195;DP=128;Dels=0.00;FS=3.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.824;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1183,0,1437 chrXV 154995 . A T 3775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6002;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3775,373,0 chrXV 155098 . C A 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.755;DP=117;Dels=0.00;FS=5.889;HaplotypeScore=3.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.957;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:117:99:976,0,1510 chrXV 155221 . G A 2467 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.82;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2500,255,0 chrXV 155276 . A T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.388;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.257;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1217,0,1340 chrXV 155288 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.340;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1427,0,1254 chrXV 155308 . G A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;DP=102;Dels=0.00;FS=1.565;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1104,0,1092 chrXV 155589 . C A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.570;DP=118;Dels=0.00;FS=1.535;HaplotypeScore=4.1030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.292;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1267,0,1219 chrXV 155716 . G A 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.914;DP=113;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.807;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1253,0,1155 chrXV 155779 . C T 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.494;DP=130;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.920;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1161,0,1553 chrXV 155863 . A G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;DP=134;Dels=0.00;FS=2.417;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.082;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1507,0,1307 chrXV 155997 . C A 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3783,373,0 chrXV 156059 . T C 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.20;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3203,357,0 chrXV 156082 . A G 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.381;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.921;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:3487,372,0 chrXV 156178 . G A 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3738,376,0 chrXV 156337 . T C 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2893,306,0 chrXV 156482 . T C 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.843;DP=174;Dels=0.00;FS=5.379;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.428;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.521;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,91:174:99:1843,0,1783 chrXV 156508 . A G 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3884,426,0 chrXV 156746 . A G 4000.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4000,420,0 chrXV 156784 . A G 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3338,354,0 chrXV 156847 . T C 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.13;SB=-1.635e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3122,330,0 chrXV 156898 . C T 4557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4557,466,0 chrXV 156979 . T C 1974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.482;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=9.92;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,97:199:99:2004,0,2191 chrXV 157101 . C T 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3968,400,0 chrXV 157207 . A G 3100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3133,330,0 chrXV 157219 . T C 3296.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3296,348,0 chrXV 157586 . T A 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.230;DP=169;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.769;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,87:169:99:1892,0,1733 chrXV 157639 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.407;DP=149;Dels=0.00;FS=5.193;HaplotypeScore=3.5159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.965;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1413,0,1608 chrXV 158074 . T C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.310;DP=149;Dels=0.00;FS=12.111;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:1310,0,1792 chrXV 158197 . G A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.352;DP=134;Dels=0.00;FS=13.000;HaplotypeScore=3.4308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.731;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1377,0,1508 chrXV 158239 . A G 3658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3658,384,0 chrXV 158453 . T C 3820.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.978e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3820,402,0 chrXV 158575 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.261;DP=112;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=2.7622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1354,0,901 chrXV 158650 . A G 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3591,375,0 chrXV 158717 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.168;DP=121;Dels=0.00;FS=7.029;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.331;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1096,0,1270 chrXV 158754 . A C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.263;DP=108;Dels=0.00;FS=12.748;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1114,0,1104 chrXV 158838 . G A 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.702;DP=163;Dels=0.00;FS=6.999;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1754,0,1646 chrXV 158872 . T C 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.823;DP=156;Dels=0.00;FS=1.280;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.675;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.321;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1560,0,1640 chrXV 158905 . G T 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.16;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3569,355,0 chrXV 159062 . G T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.983;DP=145;Dels=0.00;FS=3.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.532;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1527,0,1132 chrXV 159066 . G A 3814.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=23.12;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3814,393,0 chrXV 159092 . G A 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3101,318,0 chrXV 159120 . T C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.427;DP=123;Dels=0.04;FS=0.749;HaplotypeScore=65.3535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.213;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1215,0,1205 chrXV 159369 . G A 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2848,282,0 chrXV 159583 . T C 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.148;DP=102;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.037;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:983,0,1121 chrXV 159655 . C T 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.651;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.049;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1196,0,1277 chrXV 159827 . A G 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.875;DP=148;Dels=0.00;FS=36.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.46;MQ0=0;MQRankSum=4.548;QD=20.40;ReadPosRankSum=3.257;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,132:148:99:3052,163,0 chrXV 159884 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.558;DP=176;Dels=0.00;FS=5.574;HaplotypeScore=6.5531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQ0=0;MQRankSum=2.547;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.365;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,67:176:99:1308,0,2076 chrXV 160139 . G A 2142 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.672;DP=116;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.18;MQ0=1;MQRankSum=0.708;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.136;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:2175,222,0 chrXV 160141 . T C 1815 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.633;DP=116;Dels=0.00;FS=2.077;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.18;MQ0=1;MQRankSum=-1.549;QD=15.65;ReadPosRankSum=2.541;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,112:116:99:1848,213,0 chrXV 160142 . G T 1810 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.758;DP=114;Dels=0.00;FS=2.068;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.29;MQ0=1;MQRankSum=-1.530;QD=15.88;ReadPosRankSum=2.649;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,110:114:99:1843,210,0 chrXV 160153 . G C 1705 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.96;MQ0=1;QD=14.70;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:1738,195,0 chrXV 160154 . G A 1744 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.96;MQ0=1;QD=15.03;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:1777,195,0 chrXV 160163 . G A 1700 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.83;MQ0=1;QD=14.29;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:1733,192,0 chrXV 160213 . G C 682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.432;DP=114;Dels=0.00;FS=10.958;HaplotypeScore=2.8494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.65;MQ0=0;MQRankSum=-3.950;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.366;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:712,0,876 chrXV 160253 . G A 189.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.919;DP=121;Dels=0.00;FS=37.932;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.84;MQ0=11;MQRankSum=-2.397;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.502;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,24:121:99:219,0,1722 chrXV 160349 . G A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.557;DP=109;Dels=0.00;FS=56.331;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.51;MQ0=14;MQRankSum=-0.244;QD=0.10;ReadPosRankSum=-1.781;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,15:109:40:40,0,1601 chrXV 160397 . A C 528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.709;DP=88;Dels=0.00;FS=1.880;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.44;MQ0=2;MQRankSum=-0.631;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.615;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:558,0,767 chrXV 160403 . G A 571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.924;DP=79;Dels=0.00;FS=6.130;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.22;MQ0=1;MQRankSum=-0.861;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.470;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:601,0,558 chrXV 160414 . G A 1474 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.25;MQ0=1;QD=18.42;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1507,159,0 chrXV 160419 . A G 1466 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.51;MQ0=1;QD=18.56;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1499,162,0 chrXV 160420 . C T 1503 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.51;MQ0=1;QD=19.03;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1536,162,0 chrXV 160454 . G A 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.904;DP=107;Dels=0.00;FS=2.777;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.358;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:950,0,1008 chrXV 160457 . A G 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=103;Dels=0.00;FS=1.749;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.31;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.973;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:884,0,1057 chrXV 160472 . A G 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.072;DP=125;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=3.2272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:996,0,1392 chrXV 160664 . A T 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.986;DP=161;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:161:99:1671,0,1768 chrXV 160688 . G A 3756.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;QD=23.19;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3756,376,0 chrXV 161134 . T A 2152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;DP=181;Dels=0.00;FS=1.202;HaplotypeScore=5.7826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=1;MQRankSum=3.027;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.453;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,102:181:99:2182,0,1666 chrXV 161464 . C T 1946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.730;DP=148;Dels=0.00;FS=8.840;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.282;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,89:148:99:1976,0,1132 chrXV 161509 . T C 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.574;DP=149;Dels=0.00;FS=8.652;HaplotypeScore=11.3229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.280;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,84:149:99:1712,0,1354 chrXV 161624 . C T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.249;DP=152;Dels=0.00;FS=5.073;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.873;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1702,0,1496 chrXV 161768 . T G 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3373,354,0 chrXV 161785 . C T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.518;DP=112;Dels=0.00;FS=2.508;HaplotypeScore=3.2215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1357,0,926 chrXV 161853 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.180;DP=118;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.599;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1163,0,1174 chrXV 161922 . C T 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.632;DP=121;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.199;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,44:121:99:881,0,1501 chrXV 161975 . T C 2780 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2813,297,0 chrXV 161986 . C T 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.66;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2911,294,0 chrXV 162027 . C T 2392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.86;MQ0=0;QD=23.92;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2425,240,0 chrXV 162043 . T C 2570 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.474;DP=116;Dels=0.00;FS=6.849;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=2.026;QD=22.16;ReadPosRankSum=1.220;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,114:116:99:2603,264,0 chrXV 162065 . C T 2632 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.22;MQ0=0;QD=22.69;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2665,267,0 chrXV 162176 . G A 237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.838;DP=159;Dels=0.00;FS=0.583;HaplotypeScore=11.7112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,70:159:99:267,0,2073 chrXV 162197 . G T 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3364,339,0 chrXV 162352 . T C 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.44;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3297,354,0 chrXV 162379 . G A 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3411,351,0 chrXV 162419 . G C 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2977,306,0 chrXV 162766 . C T 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.362;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.934;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1724,0,1374 chrXV 163253 . T C 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=23.40;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3122,333,0 chrXV 163510 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.774;DP=120;Dels=0.00;FS=4.422;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.118;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1212,0,1310 chrXV 163567 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.052;DP=153;Dels=0.00;FS=12.837;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=9.82;ReadPosRankSum=-2.186;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1533,0,1688 chrXV 163690 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.285;DP=123;Dels=0.00;FS=9.870;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1200,0,1325 chrXV 163702 . T C 4132.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4132,429,0 chrXV 163708 . G C 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.347;DP=166;Dels=0.00;FS=19.038;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.050;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,86:166:99:1714,0,1630 chrXV 163748 . G A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.319;DP=145;Dels=0.00;FS=13.480;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.030;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1538,0,1320 chrXV 163776 . C G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.198;DP=147;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=2.6559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1585,0,1386 chrXV 163799 . G A 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8633;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3474,354,0 chrXV 163912 . A T 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;DP=124;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.150;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1122,0,1382 chrXV 163943 . A C,G 3441.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.91;MQ0=0;QD=22.64;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,75,77:152:99:3441,1726,1533,1715,0,1514 chrXV 163945 . A G 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.505;DP=151;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.609;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1501,0,1661 chrXV 164284 . T A 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;DP=107;Dels=0.00;FS=2.485;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.021;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1213,0,1061 chrXV 164491 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.530;DP=133;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=3.7087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1445,0,1311 chrXV 164632 . C T 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.356;DP=127;Dels=0.00;FS=5.495;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:1133,0,1587 chrXV 164679 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.058;DP=137;Dels=0.00;FS=4.179;HaplotypeScore=2.9506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.163;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.766;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:137:99:1390,0,1376 chrXV 164683 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.761;DP=137;Dels=0.00;FS=3.198;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.938;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:137:99:1484,0,1376 chrXV 164708 . A G 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3860,408,0 chrXV 164737 . T A 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.597;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1750,0,1328 chrXV 164935 . T C 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=24.20;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3315,363,0 chrXV 164993 . T G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.703;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.869;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1434,0,1446 chrXV 165025 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.065;DP=130;Dels=0.00;FS=1.374;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.839;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1280,0,1394 chrXV 165055 . T A 1747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.704;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,85:172:99:1777,0,1801 chrXV 165133 . T C 1933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.170;DP=201;Dels=0.00;FS=4.021;HaplotypeScore=8.9935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=4.209;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.847;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,101:201:99:1963,0,2223 chrXV 165232 . T C 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.076;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.106;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1125,0,1177 chrXV 165358 . T C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.933;DP=140;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=3.8687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.033;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1124,0,1679 chrXV 165453 . A G 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.636;DP=128;Dels=0.00;FS=1.451;HaplotypeScore=4.9609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=1;MQRankSum=-1.076;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,76:128:99:1516,0,1086 chrXV 165456 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.680;DP=124;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=1;MQRankSum=-0.453;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:1433,0,1083 chrXV 165488 . T C 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.968;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1363,0,1162 chrXV 165497 . T C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.483;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1343,0,1131 chrXV 165557 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.670;DP=95;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.289;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:95:99:1143,0,773 chrXV 165639 . A G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.514;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=2;MQRankSum=0.511;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.663;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1111,0,878 chrXV 165707 . A G 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.234;DP=103;Dels=0.00;FS=0.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.925;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1241,0,963 chrXV 165725 . G C 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;DP=124;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:1489,0,969 chrXV 165776 . T G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.205;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1218,0,1163 chrXV 165827 . C T 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.895;DP=141;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.089;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1482,0,1524 chrXV 165915 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.122;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.304;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1331,0,805 chrXV 165923 . C T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.793;DP=98;Dels=0.00;FS=2.735;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=1;MQRankSum=-1.456;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.795;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1153,0,891 chrXV 165953 . G A 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.202;DP=80;Dels=0.00;FS=5.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.85;MQ0=1;MQRankSum=-1.107;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,43:80:99:866,0,752 chrXV 165984 . G A 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.156;DP=79;Dels=0.00;FS=4.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=1;MQRankSum=-3.768;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:806,0,845 chrXV 165998 . A G 925.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.676;DP=95;Dels=0.00;FS=4.145;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.61;MQ0=1;MQRankSum=-6.623;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.173;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:955,0,957 chrXV 166007 . A G 778.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.211;DP=89;Dels=0.00;FS=1.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.32;MQ0=1;MQRankSum=-7.765;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.155;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:808,0,1007 chrXV 166008 . A G 754.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.690;DP=89;Dels=0.00;FS=1.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.32;MQ0=1;MQRankSum=-7.715;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.054;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:784,0,1016 chrXV 166009 . A C 771.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.661;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.14;MQ0=1;MQRankSum=-7.776;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:801,0,971 chrXV 166055 . T C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.788;DP=124;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.801;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.547;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1161,0,1268 chrXV 166076 . A G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.472;DP=138;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=3.6449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.181;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.108;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1336,0,1442 chrXV 166081 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.175;DP=137;Dels=0.00;FS=2.169;HaplotypeScore=4.9661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQ0=0;MQRankSum=2.479;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.234;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:137:99:1249,0,1453 chrXV 166088 . G A 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3502,352,0 chrXV 166163 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.999;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1171,0,1656 chrXV 166172 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.308;DP=132;Dels=0.00;FS=2.638;HaplotypeScore=2.9568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1140,0,1623 chrXV 166324 . G A 2513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2546,252,0 chrXV 166482 . G A 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.317;DP=130;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=2.8334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1588,0,1198 chrXV 166700 . A T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;DP=104;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=2.6445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.557;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,65:104:99:1465,0,787 chrXV 166989 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.239;DP=122;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=4.4768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=10.61;ReadPosRankSum=2.025;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1325,0,1276 chrXV 167021 . A T 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2969,291,0 chrXV 167078 . A T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;DP=122;Dels=0.00;FS=8.655;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-3.543;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.732;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1187,0,1348 chrXV 167081 . T G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.969;DP=115;Dels=0.00;FS=10.659;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.866;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.244;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:115:99:1102,0,1187 chrXV 167102 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.127;DP=101;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=-3.332;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.914;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,57:101:99:1205,0,932 chrXV 167109 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.621;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.406;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.912;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1401,0,1091 chrXV 167129 . C T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.738;DP=132;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=2.2426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.604;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1501,0,1192 chrXV 167270 . A T 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;DP=129;Dels=0.00;FS=6.764;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.910;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1168,0,1559 chrXV 167319 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.197;DP=105;Dels=0.00;FS=2.521;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.356;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1111,0,1123 chrXV 167344 . T A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.923;DP=96;Dels=0.00;FS=8.088;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1142,0,915 chrXV 167483 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.014;DP=116;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.577;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1231,0,1273 chrXV 167627 . G A 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.431;DP=101;Dels=0.00;FS=5.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.071;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.281;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:880,0,1230 chrXV 167650 . T C 842.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.795;DP=105;Dels=0.00;FS=8.940;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-3.947;QD=8.02;ReadPosRankSum=-2.362;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:872,0,1309 chrXV 167656 . A G 716.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.374;DP=100;Dels=0.00;FS=6.570;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.534;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:746,0,1334 chrXV 167658 . T C 739.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.673;DP=99;Dels=0.00;FS=1.935;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.47;MQ0=0;MQRankSum=-5.922;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:769,0,1300 chrXV 167659 . A G 703.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.167;DP=101;Dels=0.00;FS=1.951;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQ0=0;MQRankSum=-4.490;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:733,0,1286 chrXV 167688 . A T 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;DP=89;Dels=0.00;FS=0.816;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.33;MQ0=0;MQRankSum=-5.114;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.774;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:761,0,1120 chrXV 167717 . A C 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;DP=78;Dels=0.00;FS=3.046;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.398;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.009;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:812,0,858 chrXV 167735 . T C 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.687;DP=91;Dels=0.00;FS=6.820;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:952,0,971 chrXV 167761 . A G 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.371;DP=84;Dels=0.00;FS=4.224;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.360;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,43:84:99:874,0,897 chrXV 167794 . A G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.619;DP=100;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1194,0,953 chrXV 167815 . C G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;DP=104;Dels=0.00;FS=1.785;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.392;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1143,0,1011 chrXV 167840 . G C 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;DP=86;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.872;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:928,0,919 chrXV 167922 . C T 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.163;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=10.31;ReadPosRankSum=2.174;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,40:78:99:834,0,801 chrXV 167933 . C T 2240 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.89;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2273,234,0 chrXV 167975 . C T 1050.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.221;DP=111;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1080,0,1193 chrXV 167980 . G C 923.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.363;DP=103;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.359;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:953,0,1162 chrXV 167983 . T C 881.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.693;DP=99;Dels=0.00;FS=1.612;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:911,0,1202 chrXV 168074 . A G 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.227;DP=81;Dels=0.00;FS=2.952;HaplotypeScore=3.9322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.184;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:763,0,849 chrXV 168117 . C T 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.174;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=10.22;ReadPosRankSum=-2.063;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:980,0,939 chrXV 168202 . T C 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.059;DP=102;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.484;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:835,0,1354 chrXV 168209 . G A 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.330;DP=96;Dels=0.00;FS=2.629;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:939,0,1010 chrXV 168263 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.043;DP=111;Dels=0.00;FS=3.545;HaplotypeScore=3.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.227;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1220,0,1121 chrXV 168294 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.382;DP=137;Dels=0.00;FS=5.131;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.882;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.688;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1479,0,1363 chrXV 168347 . C G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.284;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1261,0,1176 chrXV 168382 . A G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.265;DP=146;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.247;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.848;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1444,0,1466 chrXV 168383 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.898;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.411;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1362,0,1456 chrXV 168404 . A C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.872;DP=141;Dels=0.00;FS=1.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.83;MQ0=0;MQRankSum=-3.026;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1292,0,1543 chrXV 168429 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.305;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.82;MQ0=0;MQRankSum=-4.087;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.791;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1309,0,1550 chrXV 168445 . T C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.956;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQ0=0;MQRankSum=-4.080;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1243,0,1587 chrXV 168455 . A G 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.333;DP=135;Dels=0.00;FS=4.084;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQ0=0;MQRankSum=-4.488;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.169;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1191,0,1529 chrXV 168532 . T C 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.029;DP=137;Dels=0.00;FS=1.344;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.227;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1554,0,1334 chrXV 168592 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;DP=130;Dels=0.00;FS=9.393;HaplotypeScore=2.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.598;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1392,0,1357 chrXV 168708 . C T 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.095;DP=139;Dels=0.00;FS=4.158;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1259,0,1581 chrXV 168744 . T C 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.812;DP=124;Dels=0.00;FS=5.575;HaplotypeScore=5.1502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:124:99:977,0,1467 chrXV 168885 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.562;DP=100;Dels=0.00;FS=5.077;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.467;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,60:100:99:1279,0,781 chrXV 169071 . C T 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.664;DP=134;Dels=0.00;FS=9.407;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.085;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1617,0,1158 chrXV 169152 . A G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.032;DP=124;Dels=0.00;FS=6.730;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1322,0,1224 chrXV 169251 . T C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.974;DP=150;Dels=0.00;FS=3.820;HaplotypeScore=5.6113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.497;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:150:99:1347,0,1738 chrXV 169261 . T A 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;DP=148;Dels=0.00;FS=2.064;HaplotypeScore=2.6742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1567,0,1452 chrXV 169333 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.487;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1452,0,1423 chrXV 169359 . G A 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.585;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1575,0,1595 chrXV 169572 . C T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.625;DP=142;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.335;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1252,0,1537 chrXV 169704 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.856;DP=133;Dels=0.00;FS=4.272;HaplotypeScore=6.0927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1091,0,1578 chrXV 169718 . C G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;DP=128;Dels=0.00;FS=3.251;HaplotypeScore=7.5008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.744;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1107,0,1370 chrXV 169840 . T G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.395;DP=138;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1258,0,1641 chrXV 169869 . C T 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.062;DP=127;Dels=0.00;FS=2.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1642,0,1036 chrXV 169896 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.625;DP=135;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=2.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.077;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1380,0,1323 chrXV 170103 . T C 1208.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.787;DP=121;Dels=0.00;FS=10.127;HaplotypeScore=2.6492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.164;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1238,0,1210 chrXV 170107 . C T 1313.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.681;DP=118;Dels=0.00;FS=7.086;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.431;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1343,0,1050 chrXV 170109 . C T 1178.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.467;DP=129;Dels=0.00;FS=6.604;HaplotypeScore=3.6471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.785;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1208,0,1419 chrXV 170126 . C T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.008;DP=133;Dels=0.00;FS=7.823;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.187;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1299,0,1347 chrXV 170199 . A G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.478;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1201,0,1707 chrXV 170344 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.658;DP=129;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1180,0,1464 chrXV 170361 . G C 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.776;DP=138;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=2.4203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1355,0,1269 chrXV 170368 . T C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.667;DP=133;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=4.1536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.627;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1185,0,1419 chrXV 170583 . T C 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.64;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3436,360,0 chrXV 170607 . G A 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.319;DP=139;Dels=0.00;FS=3.469;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1626,0,1285 chrXV 170671 . T C 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2988,324,0 chrXV 170682 . T A 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;DP=118;Dels=0.00;FS=4.553;HaplotypeScore=2.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.514;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:118:99:991,0,1440 chrXV 170746 . A T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.269;DP=159;Dels=0.00;FS=1.309;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:1481,0,1866 chrXV 170921 . A G 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.405;DP=151;Dels=0.00;FS=2.190;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.948;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:151:99:1444,0,1754 chrXV 170927 . A C 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.761;DP=147;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.904;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1445,0,1754 chrXV 171150 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.148;DP=151;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.152;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,66:151:99:1225,0,1828 chrXV 171213 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.779;DP=144;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=4.4018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.405;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1369,0,1513 chrXV 171278 . G A 1803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.847;DP=175;Dels=0.00;FS=1.872;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.102;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,87:175:99:1833,0,1704 chrXV 171288 . T C 4448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1309;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.31;SB=-2.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4448,465,0 chrXV 171306 . C T 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.638;DP=171;Dels=0.00;FS=1.911;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,89:171:99:1859,0,1672 chrXV 171511 . A C 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.837;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,77:162:99:1587,0,1931 chrXV 171515 . G A 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.401;DP=163;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.822;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,74:163:99:1554,0,1958 chrXV 171745 . C T 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.667;DP=147;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.963;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:858,0,715 chrXV 171973 . T C 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.635;DP=173;Dels=0.00;FS=2.796;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.686;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,82:173:99:1580,0,2001 chrXV 171981 . C T 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.554;DP=175;Dels=0.00;FS=1.991;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.046;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,81:175:99:1575,0,1977 chrXV 171985 . C G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.560;DP=170;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.012;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.324;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,81:170:99:1565,0,1845 chrXV 172515 . T C 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:3818,399,0 chrXV 172581 . T C 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.794;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.136;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:151:99:1435,0,1677 chrXV 172615 . C T 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.455;DP=170;Dels=0.00;FS=0.564;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.011;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,90:170:99:1848,0,1477 chrXV 172704 . C A 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.252;DP=138;Dels=0.00;FS=4.040;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.381;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1427,0,1228 chrXV 172752 . C T 1929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.208;DP=167;Dels=0.00;FS=12.183;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,88:167:99:1959,0,1502 chrXV 172768 . G A 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.586;DP=172;Dels=0.00;FS=7.749;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=11.08;ReadPosRankSum=1.279;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,88:172:99:1935,0,1695 chrXV 172825 . C T 1921.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.123;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.943;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:170:99:1951,0,1647 chrXV 172882 . C G 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.060;DP=192;Dels=0.00;FS=4.217;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.047;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,80:192:99:1455,0,2401 chrXV 172956 . A G 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.445;DP=161;Dels=0.00;FS=19.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.08;ReadPosRankSum=-3.256;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1653,0,1737 chrXV 173022 . A G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.117;DP=146;Dels=0.00;FS=3.300;HaplotypeScore=6.7363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.410;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,64:146:99:1188,0,1815 chrXV 173080 . G A 4202.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4202,427,0 chrXV 173105 . A T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;DP=169;Dels=0.00;FS=3.114;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.529;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,69:169:99:1204,0,2233 chrXV 173112 . T C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.832;DP=173;Dels=0.00;FS=4.374;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.719;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,72:173:99:1316,0,2272 chrXV 173127 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.106;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.997;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,66:158:99:1205,0,2067 chrXV 173169 . T C 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.340;DP=160;Dels=0.00;FS=1.241;HaplotypeScore=4.5461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:160:99:1603,0,1861 chrXV 173202 . A G 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.447;DP=196;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,90:196:99:1801,0,2371 chrXV 173326 . A G 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.041;DP=151;Dels=0.00;FS=3.928;HaplotypeScore=4.1116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:151:99:1542,0,1495 chrXV 173391 . A G 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.997;DP=159;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=2.6274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.535;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1454,0,1646 chrXV 173762 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.499;DP=137;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1181,0,1586 chrXV 173907 . G A 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3283,330,0 chrXV 174201 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.155;DP=128;Dels=0.00;FS=11.384;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1448,0,1163 chrXV 174294 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.230;DP=133;Dels=0.00;FS=3.161;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.359;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1224,0,1606 chrXV 174364 . C T 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3840,385,0 chrXV 174465 . G T 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:3958,406,0 chrXV 174472 . C T 4269.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4269,421,0 chrXV 174675 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.392;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.128;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,73:162:99:1374,0,1979 chrXV 174678 . T C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.026;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.028;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,75:167:99:1443,0,2065 chrXV 175135 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.341;DP=163;Dels=0.00;FS=2.015;HaplotypeScore=4.3684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=1;MQRankSum=-0.925;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.712;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,63:163:99:1172,0,2225 chrXV 175142 . C T 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.251;DP=167;Dels=0.00;FS=1.257;HaplotypeScore=6.9576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.117;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.778;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,63:167:99:1202,0,2241 chrXV 175290 . T C 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.640;DP=162;Dels=0.00;FS=5.767;HaplotypeScore=2.3002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=1;MQRankSum=-0.171;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.212;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,76:162:99:1450,0,1893 chrXV 175332 . A G 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.908;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=1;MQRankSum=-0.668;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.319;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,53:129:99:1026,0,1667 chrXV 175458 . A C 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;DP=154;Dels=0.00;FS=3.773;HaplotypeScore=3.8736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.777;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1633,0,1438 chrXV 175470 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.627;DP=131;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.355;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:131:99:1356,0,1189 chrXV 175512 . C T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;DP=125;Dels=0.00;FS=7.102;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=11.74;ReadPosRankSum=-1.808;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1497,0,1046 chrXV 175584 . G A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.043;DP=127;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=10.72;ReadPosRankSum=-2.424;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1391,0,1256 chrXV 175588 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.005;DP=123;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.11;ReadPosRankSum=-2.790;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1274,0,1293 chrXV 175815 . G C 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.512;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=9.77;ReadPosRankSum=2.143;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:1662,0,1655 chrXV 175992 . C G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;DP=131;Dels=0.00;FS=3.187;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.367;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1348,0,1237 chrXV 176091 . G A 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.734;DP=136;Dels=0.00;FS=3.035;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.084;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1495,0,1367 chrXV 176117 . C T 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.133;DP=149;Dels=0.00;FS=8.609;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.177;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1718,0,1322 chrXV 176217 . G A 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.740;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.340;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1632,0,1412 chrXV 176239 . G T 1998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.323;DP=166;Dels=0.00;FS=2.716;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.553;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,90:166:99:2028,0,1427 chrXV 176268 . A T 1855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=159;Dels=0.00;FS=7.191;HaplotypeScore=3.6416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.286;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,88:159:99:1885,0,1407 chrXV 176298 . A G 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.662;DP=143;Dels=0.00;FS=14.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=12.58;ReadPosRankSum=-1.799;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,88:143:99:1829,0,1130 chrXV 176348 . A G 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.496;DP=112;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.123;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,71:112:99:1550,0,803 chrXV 176425 . C T 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.710;DP=158;Dels=0.00;FS=4.755;HaplotypeScore=4.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1715,0,1523 chrXV 176441 . C T 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.842;DP=137;Dels=0.00;FS=3.339;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.451;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1547,0,1296 chrXV 176466 . C T 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.553;DP=134;Dels=0.00;FS=19.827;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.078;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1443,0,1257 chrXV 176469 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.343;DP=126;Dels=0.00;FS=17.038;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.662;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1423,0,1128 chrXV 176517 . T C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.727;DP=116;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.213;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1099,0,1336 chrXV 176547 . C T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.235;DP=127;Dels=0.00;FS=4.391;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1419,0,1204 chrXV 176616 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.100;DP=103;Dels=0.00;FS=3.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.204;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1187,0,992 chrXV 177015 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.174;DP=166;Dels=0.00;FS=9.644;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.658;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,70:166:99:1326,0,2055 chrXV 177067 . T G 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.953;DP=153;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.374;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1520,0,1622 chrXV 177226 . A G 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.892;DP=156;Dels=0.00;FS=5.819;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,84:156:99:1687,0,1508 chrXV 177336 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.480;DP=123;Dels=0.00;FS=7.021;HaplotypeScore=5.7309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.908;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:123:99:1088,0,1493 chrXV 177351 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.289;DP=134;Dels=0.00;FS=7.876;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.424;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1181,0,1695 chrXV 177495 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.671;DP=130;Dels=0.00;FS=3.267;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.045;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1297,0,1395 chrXV 177738 . G A 2716 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=1;QD=26.89;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2749,276,0 chrXV 177798 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.594;DP=117;Dels=0.00;FS=12.245;HaplotypeScore=2.8033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=0.126;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:117:99:1172,0,1303 chrXV 178021 . C T 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3178,316,0 chrXV 178128 . T C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.177;DP=114;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.320;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,68:114:99:1377,0,932 chrXV 178159 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.617;DP=133;Dels=0.00;FS=10.974;HaplotypeScore=6.7495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.205;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:133:99:1236,0,1450 chrXV 178180 . G T 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;DP=133;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.886;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1490,0,1318 chrXV 178287 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.041;DP=142;Dels=0.00;FS=4.190;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.118;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1347,0,1735 chrXV 178296 . C T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.041;DP=140;Dels=0.00;FS=4.201;HaplotypeScore=5.9388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1426,0,1478 chrXV 178440 . T C 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.740;DP=125;Dels=0.01;FS=0.670;HaplotypeScore=5.5830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.623;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1127,0,1404 chrXV 178474 . T C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.327;DP=108;Dels=0.00;FS=6.398;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.089;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1090,0,1150 chrXV 178587 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.894;DP=130;Dels=0.00;FS=7.123;HaplotypeScore=5.3736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.621;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:1095,0,1677 chrXV 178620 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.066;DP=134;Dels=0.00;FS=5.562;HaplotypeScore=4.1276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.823;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1207,0,1627 chrXV 178731 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.401;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.685;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1334,0,906 chrXV 178876 . A G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.755;DP=140;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1485,0,1416 chrXV 178888 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.328;DP=134;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=3.4596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.955;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.077;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1449,0,1299 chrXV 179031 . T C 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.596;DP=107;Dels=0.00;FS=11.516;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.796;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1165,0,1071 chrXV 179238 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.818;DP=95;Dels=0.00;FS=1.866;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.360;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,57:95:99:1187,0,821 chrXV 179481 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.062;DP=106;Dels=0.00;FS=4.880;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.485;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.537;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1149,0,988 chrXV 179760 . C T 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.18;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2697,282,0 chrXV 179850 . A G 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.88;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3287,351,0 chrXV 180056 . A C 2415 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2448,258,0 chrXV 180123 . G C 1792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.35;MQ0=0;QD=25.24;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1825,192,0 chrXV 180159 . A G 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2777,291,0 chrXV 180162 . C T 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.573;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.906;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:111:99:1114,0,1151 chrXV 180177 . G A 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2851,288,0 chrXV 180210 . C T 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2764,279,0 chrXV 180228 . T G 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3199,342,0 chrXV 180534 . A G 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,150:151:99:3789,393,0 chrXV 180685 . C G,T 3181.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.04;MQ0=0;QD=23.05;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,72,66:138:99:3241,1580,1384,1662,0,1487 chrXV 180968 . G A 3694.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3694,370,0 chrXV 181062 . G A 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3371,331,0 chrXV 181290 . G A 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3527,363,0 chrXV 181326 . C G 3832.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3832,384,0 chrXV 181433 . C T 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3488,352,0 chrXV 181436 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.274;DP=137;Dels=0.00;FS=2.222;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=8.64;ReadPosRankSum=-2.384;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1213,0,1486 chrXV 181452 . T A 3312.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3312,334,0 chrXV 181602 . C A 2535 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.47;MQ0=0;QD=25.10;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2568,261,0 chrXV 181614 . G A 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=88.4534;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.12;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2472,255,0 chrXV 181640 . A G 2694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.37;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2727,297,0 chrXV 181747 . T C 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3104,306,0 chrXV 181856 . T C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.534;DP=166;Dels=0.00;FS=6.203;HaplotypeScore=4.5474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.816;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1546,0,1773 chrXV 181861 . A G 3953.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3953,414,0 chrXV 181960 . A G 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2686,267,0 chrXV 182074 . A G 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3006,312,0 chrXV 182089 . A G 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3136,342,0 chrXV 182185 . T C 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3511,372,0 chrXV 182299 . T C 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3342,354,0 chrXV 182374 . C T 2626 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2659,270,0 chrXV 182386 . C T 2660 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.71;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2693,273,0 chrXV 182946 . T C 2431 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2464,267,0 chrXV 183493 . T C 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.204;DP=162;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.761;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1631,0,1692 chrXV 183562 . C A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.684;DP=132;Dels=0.00;FS=5.412;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1464,0,1323 chrXV 183788 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.107;DP=95;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.113;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,57:95:99:1172,0,796 chrXV 183869 . G C 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;DP=95;Dels=0.00;FS=1.674;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.569;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:887,0,963 chrXV 184074 . G T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.372;DP=125;Dels=0.00;FS=3.463;HaplotypeScore=2.4432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1108,0,1444 chrXV 184115 . G C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;DP=112;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.018;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1290,0,1010 chrXV 184291 . A C 4326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4326,436,0 chrXV 184636 . G A 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.831;DP=108;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:941,0,1319 chrXV 185195 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.931;DP=120;Dels=0.00;FS=7.013;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1078,0,1442 chrXV 185330 . A C 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.251;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.501;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:777,0,1296 chrXV 185333 . G T 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.526;DP=100;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=2.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:816,0,1185 chrXV 185473 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.569;DP=125;Dels=0.00;FS=11.364;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.122;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1475,0,1085 chrXV 185951 . T G 2578 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=1;QD=24.55;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2611,282,0 chrXV 186109 . A G 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.403;DP=145;Dels=0.00;FS=3.217;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.975;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1607,0,1311 chrXV 186208 . A G 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.906;DP=150;Dels=0.00;FS=8.616;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.275;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1656,0,1520 chrXV 186481 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.453;DP=142;Dels=0.00;FS=8.861;HaplotypeScore=5.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=10.61;ReadPosRankSum=1.271;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1536,0,1411 chrXV 186751 . C T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.240;DP=123;Dels=0.00;FS=4.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.423;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1408,0,1143 chrXV 186759 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.467;DP=119;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=10.12;ReadPosRankSum=2.161;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1234,0,1249 chrXV 186810 . T C 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.863;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.427;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1149,0,1283 chrXV 186970 . T G 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.660;DP=143;Dels=0.00;FS=5.575;HaplotypeScore=3.7519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.183;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1515,0,1285 chrXV 187008 . A G 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.222;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.778;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,87:163:99:1614,0,1585 chrXV 187179 . T C 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.327;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.254;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.367;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:876,0,1195 chrXV 187188 . T C 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.315;DP=90;Dels=0.00;FS=2.799;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:863,0,984 chrXV 187197 . A G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.930;DP=97;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:890,0,1069 chrXV 187293 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.956;DP=105;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.209;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1224,0,1041 chrXV 187423 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.042;DP=122;Dels=0.00;FS=3.344;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1290,0,1262 chrXV 187590 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.067;DP=127;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.075;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1237,0,1481 chrXV 187975 . T C 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.272;DP=155;Dels=0.00;FS=8.292;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.825;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.381;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1717,0,1463 chrXV 188321 . C T 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.783;DP=156;Dels=0.00;FS=2.937;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.217;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1709,0,1471 chrXV 188616 . A C 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.823;DP=153;Dels=0.00;FS=5.942;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.048;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1523,0,1565 chrXV 188662 . A T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;DP=123;Dels=0.00;FS=7.097;HaplotypeScore=2.8938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.757;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1386,0,1235 chrXV 188862 . G T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.713;DP=111;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1370,0,1002 chrXV 189144 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.557;DP=100;Dels=0.00;FS=15.871;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.873;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1113,0,1053 chrXV 189176 . G A 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.375;DP=127;Dels=0.00;FS=5.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.187;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.904;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1300,0,1396 chrXV 189231 . G A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.406;DP=140;Dels=0.00;FS=6.460;HaplotypeScore=4.2909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.046;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1116,0,1730 chrXV 189241 . A G 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3375,357,0 chrXV 189256 . G A 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.433;DP=133;Dels=0.00;FS=14.360;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.436;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1681,0,1155 chrXV 189304 . A C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.150;DP=118;Dels=0.00;FS=2.725;HaplotypeScore=4.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=12.18;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:1467,0,1056 chrXV 189446 . G A 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.270;DP=102;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.188;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1169,0,994 chrXV 189504 . G A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.506;DP=102;Dels=0.00;FS=1.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.114;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1221,0,941 chrXV 189573 . T C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.910;DP=130;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=3.9453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=-1.133;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.667;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1313,0,1397 chrXV 189615 . A G 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.789;DP=125;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=2.8840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=1;MQRankSum=0.705;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.361;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1054,0,1506 chrXV 189653 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.188;DP=118;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1306,0,1152 chrXV 189700 . T A 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3287,339,0 chrXV 189822 . A G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.387;DP=141;Dels=0.00;FS=8.832;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1467,0,1482 chrXV 189860 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.055;DP=136;Dels=0.00;FS=3.419;HaplotypeScore=2.4366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.403;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1471,0,1415 chrXV 189928 . T C 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.171;DP=142;Dels=0.00;FS=7.594;HaplotypeScore=3.7826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.288;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1477,0,1581 chrXV 190009 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.133;DP=149;Dels=0.00;FS=6.025;HaplotypeScore=5.8569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.188;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:1337,0,1714 chrXV 191548 . T C 570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.050;DP=80;Dels=0.00;FS=3.134;HaplotypeScore=4.9441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:600,0,1162 chrXV 192870 . T C 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.640;DP=115;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.110;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:994,0,1439 chrXV 193911 . C T 2624 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2657,270,0 chrXV 194198 . T C 2892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2925,306,0 chrXV 194515 . A G 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.393;DP=141;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.332;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1398,0,1579 chrXV 194759 . G A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;DP=118;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1366,0,1170 chrXV 194853 . A G 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.945;DP=122;Dels=0.00;FS=2.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1042,0,1381 chrXV 194959 . G A 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.687;DP=116;Dels=0.00;FS=5.928;HaplotypeScore=5.4919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.386;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:872,0,843 chrXV 194961 . T G 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;DP=111;Dels=0.00;FS=4.644;HaplotypeScore=5.4919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.369;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:773,0,893 chrXV 195051 . A C 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.350;DP=136;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=3.8086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1229,0,1513 chrXV 195072 . A C 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3009,315,0 chrXV 195170 . C A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.454;DP=114;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=3.6387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1290,0,1126 chrXV 195188 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.017;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1362,0,1147 chrXV 195644 . A C 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;DP=127;Dels=0.00;FS=3.114;HaplotypeScore=7.9517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=26.14;ReadPosRankSum=0.968;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:3320,351,0 chrXV 195929 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.806;DP=126;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1291,0,1367 chrXV 195938 . T C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.380;DP=125;Dels=0.00;FS=1.418;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1161,0,1386 chrXV 196055 . A G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.131;DP=107;Dels=0.00;FS=2.482;HaplotypeScore=2.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:986,0,1313 chrXV 196088 . G A 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.781;DP=106;Dels=0.00;FS=1.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.444;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:742,0,1451 chrXV 196465 . C T 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.580;DP=116;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.956;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,42:116:99:831,0,1541 chrXV 196663 . G T 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.322;DP=130;Dels=0.00;FS=2.654;HaplotypeScore=5.3587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:130:99:1437,0,1096 chrXV 196695 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.296;DP=135;Dels=0.00;FS=4.394;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1105,0,1407 chrXV 196803 . G A 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.156;DP=121;Dels=0.00;FS=7.492;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1002,0,1460 chrXV 197127 . G T 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.204;DP=134;Dels=0.00;FS=4.317;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.073;QD=8.20;ReadPosRankSum=2.330;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,56:134:99:1129,0,1694 chrXV 197146 . A T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.225;DP=142;Dels=0.00;FS=3.271;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1383,0,1687 chrXV 197158 . A T 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.227;DP=157;Dels=0.00;FS=4.076;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.313;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:157:99:1887,0,1511 chrXV 197164 . T A 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.441;DP=157;Dels=0.00;FS=4.076;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.524;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,70:157:99:1452,0,1902 chrXV 197183 . C T 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.834;DP=158;Dels=0.00;FS=3.022;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.236;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:158:99:1561,0,1711 chrXV 197943 . T C 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.428;DP=150;Dels=0.00;FS=4.967;HaplotypeScore=3.7723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.713;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:150:99:1650,0,1378 chrXV 197955 . G C 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.535;DP=158;Dels=0.00;FS=1.992;HaplotypeScore=6.4024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.916;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,86:158:99:1734,0,1335 chrXV 198003 . G A 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.048;DP=137;Dels=0.00;FS=5.672;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.280;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,78:137:99:1746,0,1068 chrXV 198093 . C T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.230;DP=126;Dels=0.00;FS=10.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.503;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1105,0,1361 chrXV 198105 . T A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.924;DP=139;Dels=0.00;FS=7.148;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-3.254;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.124;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1185,0,1680 chrXV 198108 . T A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.982;DP=144;Dels=0.00;FS=13.153;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.955;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1184,0,1796 chrXV 198213 . A C 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.014;DP=116;Dels=0.00;FS=5.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.740;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.353;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1010,0,1355 chrXV 198587 . T G 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.170;DP=95;Dels=0.00;FS=6.818;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.071;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:939,0,1015 chrXV 198690 . C A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.950;DP=148;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=4.8370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1504,0,1502 chrXV 198700 . C T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.126;DP=128;Dels=0.00;FS=3.151;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.805;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1370,0,1355 chrXV 198772 . A G 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.324;DP=139;Dels=0.00;FS=3.643;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=2.209;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1238,0,1739 chrXV 199130 . T C 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.999;DP=172;Dels=0.00;FS=4.599;HaplotypeScore=5.4302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.382;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,73:172:99:1419,0,2197 chrXV 199186 . T C 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3386,354,0 chrXV 199322 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.655;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1401,0,1363 chrXV 199391 . G A 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.901;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1407,0,1450 chrXV 199433 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.783;DP=109;Dels=0.00;FS=1.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.113;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1285,0,1089 chrXV 199933 . A G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.072;DP=119;Dels=0.00;FS=5.635;HaplotypeScore=2.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=9.97;ReadPosRankSum=-2.091;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1216,0,1279 chrXV 200346 . T G 92.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=151;Dels=0.00;FS=22.632;HaplotypeScore=154.0475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=0.61;ReadPosRankSum=-3.189;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,12:151:99:122,0,671 chrXV 200443 . C T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.026;DP=119;Dels=0.00;FS=15.524;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.656;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1299,0,1210 chrXV 200482 . A G 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.043;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.167;SB=-8.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,90:168:99:1824,0,1734 chrXV 200683 . G A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.671;DP=133;Dels=0.00;FS=6.898;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.672;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:1129,0,1612 chrXV 201043 . T C 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.857;DP=162;Dels=0.00;FS=1.962;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1615,0,1790 chrXV 201256 . G A 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.980;DP=150;Dels=0.00;FS=2.032;HaplotypeScore=3.4348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=11.19;ReadPosRankSum=-2.115;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1709,0,1338 chrXV 201531 . C T 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.577;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1476,0,1340 chrXV 201792 . T C 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.542;DP=167;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.698;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,96:167:99:1806,0,1511 chrXV 202012 . C T 1905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.128;DP=191;Dels=0.00;FS=2.488;HaplotypeScore=7.0423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.531;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,92:191:99:1935,0,1983 chrXV 202087 . C T 4149.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.77;SB=-2.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4149,418,0 chrXV 202213 . T A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;DP=147;Dels=0.00;FS=10.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1259,0,1822 chrXV 202330 . C T 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.251;DP=129;Dels=0.00;FS=8.101;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.855;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.783;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,76:129:99:1551,0,1014 chrXV 202368 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.381;DP=115;Dels=0.00;FS=1.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.680;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,65:115:99:1376,0,985 chrXV 202496 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.593;DP=120;Dels=0.00;FS=1.433;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.509;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1259,0,1237 chrXV 202575 . G A 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.220;DP=121;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1082,0,1408 chrXV 202640 . G A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.154;DP=124;Dels=0.00;FS=8.431;HaplotypeScore=5.2374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.415;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1423,0,1188 chrXV 202662 . G T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.730;DP=115;Dels=0.00;FS=8.681;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.525;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1309,0,1053 chrXV 203056 . T G 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.266;DP=170;Dels=0.00;FS=2.117;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.209;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,81:170:99:1583,0,1960 chrXV 203132 . C T 4098.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.961e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4098,409,0 chrXV 203233 . A G 3657.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3657,378,0 chrXV 203284 . A G 3882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3882,420,0 chrXV 203344 . G A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.339;DP=159;Dels=0.00;FS=1.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.653;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1545,0,1756 chrXV 203386 . A C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.524;DP=152;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.158;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1452,0,1671 chrXV 203632 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.510;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.674;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1368,0,1243 chrXV 203890 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.062;DP=133;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=10.10;ReadPosRankSum=-2.172;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1373,0,1505 chrXV 203923 . T C 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.898;DP=153;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.363;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1548,0,1692 chrXV 203947 . T C 4257.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9164;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4257,450,0 chrXV 204409 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.538;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=9.29;ReadPosRankSum=-2.299;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1145,0,1247 chrXV 204475 . G A 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.146;DP=97;Dels=0.00;FS=3.159;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:907,0,1193 chrXV 204502 . G A 710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.319;DP=89;Dels=0.01;FS=4.711;HaplotypeScore=6.5177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-1.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:88:99:740,0,1148 chrXV 204531 . C T 683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.107;DP=96;Dels=0.00;FS=20.405;HaplotypeScore=4.8238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:713,0,1039 chrXV 204903 . G A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.718;DP=135;Dels=0.00;FS=4.261;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1370,0,1339 chrXV 204904 . T C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.803;DP=140;Dels=0.00;FS=6.365;HaplotypeScore=5.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.069;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1347,0,1461 chrXV 205095 . T A 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3083,309,0 chrXV 205106 . T A 2960 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2993,300,0 chrXV 205126 . T C 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3366,345,0 chrXV 205153 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.194;DP=125;Dels=0.00;FS=4.283;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.072;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1321,0,1309 chrXV 205234 . T C 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3611,387,0 chrXV 205237 . T A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.912;DP=140;Dels=0.00;FS=6.288;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.338;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1422,0,1563 chrXV 205475 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.955;DP=140;Dels=0.00;FS=3.338;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.132;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1334,0,1596 chrXV 205496 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.094;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:145:99:1387,0,1507 chrXV 205541 . A T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1527,0,1646 chrXV 205572 . G C 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.500;DP=137;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=2.7289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1279,0,1400 chrXV 205574 . C T 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.145;DP=151;Dels=0.00;FS=0.603;HaplotypeScore=13.5110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.011;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1587,0,1552 chrXV 205656 . G A 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.850;DP=145;Dels=0.00;FS=3.963;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1454,0,1528 chrXV 205723 . C G 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3134,342,0 chrXV 205739 . C T 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3554,372,0 chrXV 205799 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.409;DP=133;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.115;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1484,0,1273 chrXV 205904 . T A 2491 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2524,249,0 chrXV 205985 . T C 4197.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=23.85;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4197,426,0 chrXV 206110 . T A 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.598;DP=154;Dels=0.00;FS=2.994;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.772;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.264;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1625,0,1631 chrXV 206166 . T A 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3236,321,0 chrXV 206259 . T A 4149.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4149,418,0 chrXV 206268 . A G 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3836,411,0 chrXV 206718 . A G 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3231,351,0 chrXV 206970 . T C 2293 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.66;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2326,252,0 chrXV 206985 . A G 2798 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2917;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=24.33;ReadPosRankSum=-0.738;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:2831,294,0 chrXV 207058 . T C 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3961,417,0 chrXV 207114 . A G 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.017;DP=160;Dels=0.00;FS=1.975;HaplotypeScore=2.7685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.350;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,71:160:99:1398,0,1887 chrXV 207219 . C T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.836;DP=111;Dels=0.00;FS=4.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1210,0,1153 chrXV 207397 . G A 4957.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.23;SB=-2.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:4957,481,0 chrXV 207408 . C T 4489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.921e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4489,436,0 chrXV 207452 . T G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.131;DP=157;Dels=0.00;FS=2.078;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.765;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,67:157:99:1321,0,1982 chrXV 207840 . A G 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.802;DP=150;Dels=0.00;FS=1.272;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1450,0,1645 chrXV 208002 . G A 4435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.40;SB=-2.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4435,442,0 chrXV 208010 . T C 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3812,381,0 chrXV 208100 . A G 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3353,354,0 chrXV 208106 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.821;DP=118;Dels=0.00;FS=10.188;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.505;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1190,0,1339 chrXV 208220 . C T 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.56;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2982,306,0 chrXV 208309 . T A 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3197,333,0 chrXV 208421 . A G 2433 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6766;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:95:99:2466,264,0 chrXV 208452 . G A 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=27.69;ReadPosRankSum=1.131;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3350,346,0 chrXV 208517 . A C 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3618,396,0 chrXV 208556 . T C 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=23.17;SB=-1.803e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3522,366,0 chrXV 208643 . G A 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3590,361,0 chrXV 208655 . C T 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.780;DP=143;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.785;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1602,0,1437 chrXV 208678 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.082;DP=143;Dels=0.00;FS=1.327;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=2.441;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.253;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1298,0,1724 chrXV 208737 . C G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;DP=124;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=5.2028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.153;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1267,0,1188 chrXV 208904 . C T 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3072,318,0 chrXV 208980 . A G 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3315,357,0 chrXV 209102 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.660;DP=128;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.491;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1172,0,1517 chrXV 209157 . A G 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2955,306,0 chrXV 209222 . A G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.799;DP=153;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=4.7326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=2.082;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.577;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,70:153:99:1351,0,1826 chrXV 209279 . T A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.990;DP=170;Dels=0.00;FS=0.573;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=1.900;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.850;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,79:170:99:1623,0,2009 chrXV 209318 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.022;DP=154;Dels=0.01;FS=0.602;HaplotypeScore=4.8462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1268,0,1865 chrXV 209483 . G A 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3040,303,0 chrXV 209501 . A T 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3154,321,0 chrXV 209579 . C T 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.669;DP=181;Dels=0.00;FS=3.478;HaplotypeScore=3.9264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=1;MQRankSum=-1.145;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,79:181:99:1620,0,2149 chrXV 209582 . T C 4210.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=1;QD=25.06;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4210,456,0 chrXV 209698 . T C 3480.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3480,360,0 chrXV 209762 . G A 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.306;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1594,0,1438 chrXV 209771 . G A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.394;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1582,0,1581 chrXV 209867 . T G 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3343,351,0 chrXV 209869 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.390;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1342,0,1491 chrXV 209903 . T C 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3342,366,0 chrXV 209951 . C T 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.236;DP=129;Dels=0.00;FS=3.163;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.288;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:129:99:1480,0,1157 chrXV 209963 . C T 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.65;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3326,334,0 chrXV 209967 . A G 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.93;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3041,318,0 chrXV 210056 . A G 2548 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.80;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2581,279,0 chrXV 210115 . T C 3361.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.46;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3361,357,0 chrXV 210116 . T C 3305.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.029;DP=133;Dels=0.00;FS=5.675;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=24.85;ReadPosRankSum=1.185;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3305,334,0 chrXV 210122 . A G 2957 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.59;MQ0=0;QD=23.66;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2990,324,0 chrXV 210327 . C A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;DP=130;Dels=0.00;FS=4.218;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.081;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1423,0,1310 chrXV 210619 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.386;DP=141;Dels=0.00;FS=4.043;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,55:141:99:1054,0,1761 chrXV 210811 . G A 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.427;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1492,0,1532 chrXV 210847 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.844;DP=145;Dels=0.00;FS=6.185;HaplotypeScore=2.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1349,0,1658 chrXV 210877 . T C 4468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3294;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4468,454,0 chrXV 211015 . C T 4448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4448,463,0 chrXV 211081 . A G 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3319,369,0 chrXV 211160 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.500;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.961;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1331,0,1234 chrXV 211164 . C G 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=24.31;ReadPosRankSum=1.608;SB=-8.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3403,341,0 chrXV 211180 . C T 4185.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.689;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.097;SB=-1.025e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,160:161:99:4185,412,0 chrXV 211399 . A T 3622.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3622,373,0 chrXV 211444 . A G 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.267;DP=145;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=7.9437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.701;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:145:99:1381,0,1710 chrXV 211464 . T G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.216;DP=163;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=8.40;ReadPosRankSum=1.545;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,71:163:99:1400,0,1943 chrXV 211986 . C T 2207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.688;DP=193;Dels=0.00;FS=2.503;HaplotypeScore=5.1383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.801;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,106:193:99:2237,0,1745 chrXV 212114 . C T 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.015;DP=146;Dels=0.00;FS=7.846;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1623,0,1410 chrXV 212282 . G A 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.364;DP=128;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.319;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1521,0,1050 chrXV 212813 . T C 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.137;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,86:160:99:1649,0,1578 chrXV 212987 . C T 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.113;DP=153;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=1;MQRankSum=1.642;QD=10.76;ReadPosRankSum=2.763;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1677,0,1435 chrXV 213206 . G C 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.959;DP=141;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=1;MQRankSum=-0.287;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.449;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1433,0,1250 chrXV 213212 . A G 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.804;DP=143;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=1.935;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1471,0,1479 chrXV 213233 . A T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1467,0,1468 chrXV 213488 . T C 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.886;DP=179;Dels=0.00;FS=1.873;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.397;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,78:179:99:1578,0,2217 chrXV 213775 . G A 3941.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3941,391,0 chrXV 213834 . T C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.883;DP=112;Dels=0.00;FS=14.916;HaplotypeScore=2.6979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.547;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.766;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,68:112:99:1178,0,868 chrXV 213920 . T C 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.505;DP=151;Dels=0.00;FS=8.766;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.311;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1022,0,1530 chrXV 213976 . G T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.918;DP=133;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=8.95;ReadPosRankSum=2.149;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1221,0,1543 chrXV 214077 . G A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.226;DP=92;Dels=0.00;FS=8.669;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1138,0,861 chrXV 214472 . C T 2197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.711;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,103:182:99:2227,0,1483 chrXV 214604 . G A 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.638;DP=148;Dels=0.00;FS=2.091;HaplotypeScore=2.5160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=-0.851;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.820;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1515,0,1571 chrXV 214699 . A G 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3191,351,0 chrXV 214734 . G A 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.627;DP=174;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,84:174:99:1719,0,1946 chrXV 215175 . G A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.259;DP=146;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=3.9411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=2.646;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.054;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,69:146:99:1426,0,1650 chrXV 215715 . C T 1960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.606;DP=176;Dels=0.00;FS=1.874;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.894;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,93:176:99:1990,0,1633 chrXV 215865 . G A 5178.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.914e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5178,496,0 chrXV 216247 . G A 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.908;DP=117;Dels=0.00;FS=6.081;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.102;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.178;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:609,0,1395 chrXV 216376 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.904;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.292;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:147:99:1412,0,1576 chrXV 216399 . C A 2065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.282;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.640;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.500;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,95:169:99:2095,0,1510 chrXV 216566 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.185;DP=167;Dels=0.00;FS=4.560;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:1634,0,1724 chrXV 216757 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.814;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.861;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:153:99:1364,0,1843 chrXV 216932 . T A 504.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;DP=126;Dels=0.00;FS=89.761;HaplotypeScore=270.5141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.45;MQ0=0;MQRankSum=3.779;QD=4.00;ReadPosRankSum=-2.014;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,37:126:81:534,0,81 chrXV 216949 . C T 105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.179;DP=111;Dels=0.01;FS=206.815;HaplotypeScore=58.4728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.65;MQ0=0;MQRankSum=-5.909;QD=0.95;ReadPosRankSum=-4.113;SB=-3.010e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:135,0,962 chrXV 216952 . G T 134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.989;DP=110;Dels=0.00;FS=244.491;HaplotypeScore=33.1046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.77;MQ0=0;MQRankSum=-6.840;QD=1.22;ReadPosRankSum=-6.761;SB=-2.881e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,42:110:99:164,0,963 chrXV 216964 . C T 156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.600;DP=100;Dels=0.00;FS=217.154;HaplotypeScore=40.1968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.83;MQ0=0;MQRankSum=-6.061;QD=1.56;ReadPosRankSum=-8.058;SB=-2.989e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,35:100:99:186,0,997 chrXV 217113 . C G 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=24.20;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3460,378,0 chrXV 217434 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.639;DP=133;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=2.7819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.077;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1249,0,1523 chrXV 217521 . G A 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=1;QD=26.33;SB=-1.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3976,394,0 chrXV 217538 . G A 2046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.469;DP=166;Dels=0.00;FS=4.975;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=-0.510;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,93:166:99:2076,0,1395 chrXV 217830 . G A 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.006;DP=146;Dels=0.00;FS=2.975;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=3.264;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.544;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1590,0,1431 chrXV 218142 . G A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.304;DP=153;Dels=0.00;FS=2.985;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,60:153:99:1181,0,2004 chrXV 218248 . T C 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.100;DP=144;Dels=0.00;FS=7.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=2.018;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1732,0,1221 chrXV 218327 . A G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.991;DP=142;Dels=0.00;FS=10.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.220;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1271,0,1692 chrXV 218388 . C T 693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.448;DP=117;Dels=0.00;FS=12.775;HaplotypeScore=3.9655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=5.92;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,45:117:99:723,0,1535 chrXV 218547 . C T 2179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2212,219,0 chrXV 219107 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.561;DP=153;Dels=0.00;FS=8.780;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1549,0,1736 chrXV 219124 . G T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.696;DP=158;Dels=0.00;FS=4.742;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1568,0,1752 chrXV 219832 . T C 3160 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3193,339,0 chrXV 220335 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.019;DP=139;Dels=0.00;FS=4.594;HaplotypeScore=2.3070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.722;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1354,0,1590 chrXV 220341 . G A 3990.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3990,409,0 chrXV 220371 . T A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.721;DP=157;Dels=0.00;FS=3.777;HaplotypeScore=2.5707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.284;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,68:157:99:1429,0,1944 chrXV 220591 . T C 1602.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.657;DP=159;Dels=0.00;FS=2.818;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1632,0,1826 chrXV 220730 . A G 62.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.496;DP=170;Dels=0.00;FS=46.246;HaplotypeScore=92.6954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=0.36;ReadPosRankSum=-5.541;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,14:170:92:92,0,1711 chrXV 220880 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.836;DP=122;Dels=0.00;FS=2.324;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.295;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1444,0,1109 chrXV 220974 . A G 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.144;DP=133;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=10.9114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.412;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1242,0,1546 chrXV 221075 . G C 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3043,318,0 chrXV 221112 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.764;DP=111;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1202,0,1199 chrXV 221465 . C T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.698;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1477,0,1272 chrXV 221858 . C T 1037.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.603;DP=138;Dels=0.00;FS=2.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:1067,0,1722 chrXV 221859 . T C 1710.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.914;DP=141;Dels=0.00;FS=1.589;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.516;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,85:141:99:1740,0,1083 chrXV 221862 . C T 1061.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.224;DP=140;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,54:140:99:1091,0,1831 chrXV 221900 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.598;DP=146;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.846;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:1106,0,1895 chrXV 222131 . C T 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.340;DP=107;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.495;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1196,0,1122 chrXV 222860 . C T 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6912;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.902;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3243,327,0 chrXV 222869 . T C 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3272,339,0 chrXV 222935 . C T 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.667;DP=141;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.552;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1656,0,1334 chrXV 223392 . G A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.611;DP=111;Dels=0.00;FS=3.487;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=10.74;ReadPosRankSum=2.934;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1222,0,521 chrXV 223554 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.967;DP=116;Dels=0.00;FS=2.442;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=0.393;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.341;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1349,0,1001 chrXV 223663 . A G 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=125;Dels=0.00;FS=3.893;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=25.32;ReadPosRankSum=0.956;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3198,348,0 chrXV 223864 . A G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.440;DP=147;Dels=0.01;FS=6.188;HaplotypeScore=8.2400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.686;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1267,0,1718 chrXV 224038 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.187;DP=110;Dels=0.00;FS=1.570;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.828;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1185,0,1148 chrXV 224217 . C T 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.165;DP=80;Dels=0.00;FS=7.701;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.313;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:858,0,784 chrXV 224972 . C T 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.176;DP=165;Dels=0.00;FS=1.927;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,79:165:99:1596,0,1812 chrXV 225841 . C T 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.699;DP=136;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.884;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1487,0,1352 chrXV 227001 . T C 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.639;DP=146;Dels=0.00;FS=3.894;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.409;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1521,0,1507 chrXV 227150 . A C 2473 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.42;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2506,273,0 chrXV 227165 . A G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.436;DP=109;Dels=0.00;FS=2.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1115,0,1118 chrXV 227462 . C T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.380;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.270;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1111,0,1094 chrXV 227560 . T A 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;DP=96;Dels=0.00;FS=2.810;HaplotypeScore=2.1500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.165;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:696,0,996 chrXV 227572 . T A 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.9170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.089;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:942,0,1090 chrXV 227884 . T G 274.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.317;DP=87;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.42;MQ0=0;MQRankSum=-6.528;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:87:99:304,0,1466 chrXV 227885 . C G 291.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.417;DP=87;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.42;MQ0=0;MQRankSum=-6.616;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:87:99:321,0,1412 chrXV 227894 . G T 303.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.742;DP=106;Dels=0.00;FS=24.677;HaplotypeScore=45.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.51;MQ0=0;MQRankSum=-5.854;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.627;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:333,0,1385 chrXV 227897 . G A 253.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.617;DP=106;Dels=0.00;FS=25.841;HaplotypeScore=98.9262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=0;MQRankSum=-5.713;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.618;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:283,0,1421 chrXV 227898 . G A 242.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.569;DP=106;Dels=0.00;FS=25.841;HaplotypeScore=98.9262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=0;MQRankSum=-5.786;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.416;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:272,0,1396 chrXV 227906 . T A 240.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.567;DP=108;Dels=0.00;FS=25.741;HaplotypeScore=90.9464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.55;MQ0=0;MQRankSum=-5.714;QD=2.22;ReadPosRankSum=-2.424;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:270,0,1550 chrXV 227916 . T G 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.970;DP=95;Dels=0.00;FS=4.375;HaplotypeScore=32.7041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.19;MQ0=0;MQRankSum=-7.199;QD=0.41;ReadPosRankSum=-2.356;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,27:95:69:69,0,1610 chrXV 227937 . A G 50.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.154;DP=78;Dels=0.00;FS=24.194;HaplotypeScore=7.9500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=-6.286;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.548;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:80:80,0,1352 chrXV 227940 . T C 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.060;DP=73;Dels=0.00;FS=15.949;HaplotypeScore=3.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-5.967;QD=0.18;ReadPosRankSum=-2.687;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:43:43,0,1352 chrXV 227968 . A T 173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=82;Dels=0.00;FS=11.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.73;MQ0=0;MQRankSum=-4.348;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.738;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:203,0,1411 chrXV 228001 . A C 541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.093;DP=93;Dels=0.00;FS=18.540;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.892;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.051;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:571,0,1250 chrXV 228070 . C T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.117;DP=102;Dels=0.00;FS=7.773;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.634;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:1104,0,1066 chrXV 228074 . C T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.568;DP=105;Dels=0.00;FS=7.756;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=2.670;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.420;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1107,0,1125 chrXV 228290 . A C 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.209;DP=121;Dels=0.00;FS=2.407;HaplotypeScore=3.8491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.317;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,48:121:99:881,0,1582 chrXV 228291 . T C 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.040;DP=115;Dels=0.00;FS=3.514;HaplotypeScore=3.8491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.395;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,70:115:99:1394,0,946 chrXV 228509 . T A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;DP=132;Dels=0.00;FS=3.318;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.228;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1429,0,1450 chrXV 229235 . A G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.631;DP=129;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=4.1066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.512;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,49:129:99:986,0,1797 chrXV 229291 . C A 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.112;DP=121;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.767;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.945;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1162,0,1321 chrXV 229462 . T C 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.916;DP=130;Dels=0.00;FS=8.259;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=1;MQRankSum=-0.251;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.103;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:913,0,1669 chrXV 229649 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.290;DP=130;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.712;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1296,0,1469 chrXV 229674 . G A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.793;DP=138;Dels=0.00;FS=1.373;HaplotypeScore=4.9637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.959;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:138:99:1347,0,1461 chrXV 229744 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.136;DP=171;Dels=0.00;FS=1.898;HaplotypeScore=5.9017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.774;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,78:171:99:1433,0,1942 chrXV 229828 . T G 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.162;DP=129;Dels=0.00;FS=8.076;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.38;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1127,0,1566 chrXV 229900 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.012;DP=127;Dels=0.00;FS=8.075;HaplotypeScore=2.8640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.075;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1245,0,1409 chrXV 230066 . C T 1419 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQ0=0;QD=14.33;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:1452,150,0 chrXV 230105 . G T 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3328,337,0 chrXV 230282 . C T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.059;DP=133;Dels=0.00;FS=6.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1205,0,1528 chrXV 230379 . A G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.677;DP=120;Dels=0.00;FS=10.586;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=8.32;ReadPosRankSum=-2.349;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1028,0,1422 chrXV 230491 . G A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.910;DP=144;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=1;MQRankSum=-1.604;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.776;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1380,0,1570 chrXV 230592 . T A 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;DP=157;Dels=0.00;FS=14.217;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,84:157:99:1627,0,1496 chrXV 230614 . G A 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.973;DP=154;Dels=0.00;FS=11.469;HaplotypeScore=4.2287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.234;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1660,0,1522 chrXV 230706 . G A 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.611;DP=151;Dels=0.00;FS=3.864;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.944;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,83:151:99:1843,0,1230 chrXV 230756 . C T 1766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.541;DP=154;Dels=0.00;FS=1.282;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,82:154:99:1796,0,1325 chrXV 230792 . A T 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=158;Dels=0.00;FS=5.679;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.953;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1658,0,1689 chrXV 230852 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.441;DP=154;Dels=0.00;FS=9.854;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.740;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1414,0,1821 chrXV 230877 . G C 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;DP=164;Dels=0.00;FS=5.803;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.352;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1620,0,1749 chrXV 231018 . G T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.888;DP=153;Dels=0.00;FS=5.001;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1486,0,1609 chrXV 231024 . T C 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.005;DP=140;Dels=0.00;FS=2.328;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.537;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1467,0,1480 chrXV 231041 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.192;DP=139;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.940;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.586;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:139:99:1414,0,1382 chrXV 231231 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.837;DP=130;Dels=0.00;FS=14.660;HaplotypeScore=12.7517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.145;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1136,0,1596 chrXV 231453 . A G 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.809;DP=108;Dels=0.00;FS=3.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=3.015;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.055;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1223,0,1080 chrXV 231541 . C T 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.496;DP=131;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.478;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1721,0,1129 chrXV 232193 . A G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.756;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.064;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1551,0,1121 chrXV 232336 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.975;DP=179;Dels=0.00;FS=10.168;HaplotypeScore=7.0135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=3.842;QD=8.84;ReadPosRankSum=-2.676;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,91:179:99:1612,0,1741 chrXV 232608 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.965;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.206;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1421,0,1483 chrXV 232710 . A G 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.924;DP=185;Dels=0.00;FS=4.774;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.238;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,90:185:99:1789,0,2066 chrXV 232797 . C T 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.203;DP=139;Dels=0.00;FS=8.228;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1635,0,1254 chrXV 233370 . G T 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.957;DP=111;Dels=0.00;FS=4.770;HaplotypeScore=5.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:1008,0,1276 chrXV 233424 . A G 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.367;DP=117;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.058;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,68:117:99:1419,0,1068 chrXV 233436 . C A 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.635;DP=113;Dels=0.01;FS=2.473;HaplotypeScore=2.8271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:996,0,1397 chrXV 233724 . G A 1914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.923;DP=160;Dels=0.00;FS=5.716;HaplotypeScore=2.4485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.815;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,88:160:99:1944,0,1413 chrXV 234020 . T C 4180.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=167;Dels=0.00;FS=3.535;HaplotypeScore=2.9642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=25.03;ReadPosRankSum=1.068;SB=-1.999e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,166:167:99:4180,429,0 chrXV 234113 . T A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;DP=161;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.012;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,72:160:99:1526,0,1916 chrXV 234283 . A G 4141.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=24.36;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:4141,414,0 chrXV 234574 . C G 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.162;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1488,0,1318 chrXV 234731 . A G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.083;DP=154;Dels=0.01;FS=8.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=1;MQRankSum=2.402;QD=8.71;ReadPosRankSum=1.747;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1371,0,1760 chrXV 234932 . A T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.316;DP=152;Dels=0.00;FS=9.891;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.799;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1445,0,1802 chrXV 235022 . T A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;DP=168;Dels=0.00;FS=12.246;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.714;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,74:168:99:1486,0,2117 chrXV 235143 . C T 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.274;DP=145;Dels=0.00;FS=3.078;HaplotypeScore=4.5761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.869;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,54:145:99:986,0,1957 chrXV 235233 . A C 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.453;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,91:158:99:1557,0,1370 chrXV 235401 . G A 540.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.339;DP=146;Dels=0.00;FS=7.382;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQ0=0;MQRankSum=-5.610;QD=3.70;ReadPosRankSum=-7.387;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,37:146:99:570,0,1696 chrXV 235404 . G A 515.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.090;DP=146;Dels=0.00;FS=7.633;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQ0=0;MQRankSum=-6.222;QD=3.53;ReadPosRankSum=-8.016;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,36:146:99:545,0,1697 chrXV 235407 . G A 400.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.601;DP=149;Dels=0.00;FS=3.650;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQ0=0;MQRankSum=-6.439;QD=2.68;ReadPosRankSum=-7.501;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,34:149:99:430,0,1875 chrXV 235904 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.602;DP=111;Dels=0.00;FS=3.610;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.328;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1276,0,1042 chrXV 236253 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.074;DP=146;Dels=0.00;FS=5.053;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=8.97;ReadPosRankSum=-3.006;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1339,0,1514 chrXV 236313 . A G 119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.851;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=1;MQRankSum=1.035;QD=0.89;ReadPosRankSum=-4.775;SB=-3.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,20:134:99:149,0,1996 chrXV 236967 . A G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.474;DP=123;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=131.3771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.498;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:117:99:1208,0,1028 chrXV 237048 . T G 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.213;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.53;MQ0=0;MQRankSum=2.230;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:929,0,973 chrXV 237076 . G A 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.007;DP=105;Dels=0.00;FS=3.665;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1241,0,876 chrXV 237471 . A C 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;DP=160;Dels=0.00;FS=2.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.458;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:1647,0,1820 chrXV 237769 . G C 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;DP=135;Dels=0.00;FS=1.648;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,78:135:99:1629,0,1093 chrXV 237861 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.163;DP=131;Dels=0.00;FS=3.346;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.829;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1181,0,1647 chrXV 238149 . T C 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2586,291,0 chrXV 238367 . A G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.236;DP=121;Dels=0.00;FS=1.516;HaplotypeScore=9.9299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=2.633;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.188;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:940,0,1335 chrXV 238432 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.032;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1331,0,1122 chrXV 238504 . C A 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.501e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3013,300,0 chrXV 238720 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.812;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.664;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1399,0,1144 chrXV 238753 . A G 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2982,321,0 chrXV 238779 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.272;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.235;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1318,0,1333 chrXV 238924 . A C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.140;DP=144;Dels=0.00;FS=2.120;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.963;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1511,0,1537 chrXV 240094 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.523;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.207;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1074,0,1011 chrXV 240215 . T C 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.541;DP=149;Dels=0.00;FS=6.384;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.853;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1591,0,1552 chrXV 240239 . T A 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3636,370,0 chrXV 240351 . C T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.737;DP=111;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=3.6284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=0.185;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1199,0,1065 chrXV 241070 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.424;DP=104;Dels=0.00;FS=4.890;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.319;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1203,0,952 chrXV 241147 . A C 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;DP=85;Dels=0.00;FS=0.822;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.225;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:99:853,0,956 chrXV 241207 . T G 2401 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2434,261,0 chrXV 241259 . A G 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=1;QD=25.12;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2771,288,0 chrXV 241442 . C G 693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;DP=87;Dels=0.00;FS=1.823;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:723,0,1022 chrXV 241632 . A G 588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.784;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=6.68;ReadPosRankSum=1.167;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,36:88:99:618,0,1162 chrXV 241636 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.309;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1064,0,789 chrXV 241704 . A G 636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.790;DP=102;Dels=0.00;FS=7.307;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=6.24;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:666,0,1359 chrXV 242049 . C T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.094;DP=126;Dels=0.00;FS=13.150;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.227;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1467,0,1099 chrXV 242267 . T C 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3403,354,0 chrXV 242641 . C G 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.703;DP=134;Dels=0.00;FS=11.464;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.336;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,78:134:99:1545,0,1110 chrXV 242786 . C T 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.22;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3538,355,0 chrXV 243072 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.937;DP=113;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=2.5465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.158;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1190,0,1122 chrXV 243303 . T C 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2857,297,0 chrXV 243332 . C A 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3150,316,0 chrXV 243335 . C G 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3229,333,0 chrXV 243462 . T C 2588 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2621,285,0 chrXV 243471 . G A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.880;DP=108;Dels=0.00;FS=4.747;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.954;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1090,0,1102 chrXV 243670 . T C 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=24.38;ReadPosRankSum=-1.675;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3007,318,0 chrXV 244063 . C T 1826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.01;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1859,192,0 chrXV 244192 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.619;DP=107;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.816;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1178,0,1029 chrXV 244291 . A T 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.091;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:1005,0,1472 chrXV 244324 . T A 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3192,330,0 chrXV 244393 . C T 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.958e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3728,367,0 chrXV 244528 . A T 3457.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3457,337,0 chrXV 244783 . G A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.924;DP=108;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=11.31;ReadPosRankSum=2.286;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1251,0,1073 chrXV 244803 . T C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.905;DP=108;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=2.303;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.275;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1244,0,1011 chrXV 244855 . A C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.212;DP=103;Dels=0.00;FS=0.868;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1051,0,1056 chrXV 245116 . A C 555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.453;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:585,0,938 chrXV 245216 . A T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.886;DP=101;Dels=0.00;FS=13.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1062,0,1123 chrXV 245875 . G C 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2997,324,0 chrXV 245914 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.533;DP=110;Dels=0.00;FS=2.664;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,66:110:99:1490,0,885 chrXV 245956 . G A 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3186,327,0 chrXV 246022 . T C 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2955,300,0 chrXV 246067 . A G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.564;DP=123;Dels=0.00;FS=4.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.399;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:991,0,1445 chrXV 246081 . G A 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3445,346,0 chrXV 246115 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.663;DP=124;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.484;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1403,0,1314 chrXV 246346 . T C 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.088;DP=136;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=3.2332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.290;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1146,0,1568 chrXV 246679 . G A 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3101,309,0 chrXV 246993 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.926;DP=128;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1283,0,1344 chrXV 247074 . A G 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.601;DP=131;Dels=0.00;FS=4.303;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.681;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1257,0,1547 chrXV 247083 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.387;DP=131;Dels=0.00;FS=3.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1233,0,1482 chrXV 247141 . C T 1975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.309;DP=140;Dels=0.00;FS=9.846;HaplotypeScore=2.5239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.205;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,92:140:99:2005,0,921 chrXV 247228 . T C 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.147;DP=94;Dels=0.00;FS=2.720;HaplotypeScore=3.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:834,0,1137 chrXV 247346 . C T 732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;DP=83;Dels=0.00;FS=4.350;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.563;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:83:99:762,0,985 chrXV 247349 . A T 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.042;DP=84;Dels=0.00;FS=3.084;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.890;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:733,0,1063 chrXV 247390 . A G 689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.494;DP=84;Dels=0.00;FS=4.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,36:84:99:719,0,1095 chrXV 247461 . G A 1076.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.749;DP=94;Dels=0.00;FS=2.725;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.300;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1106,0,845 chrXV 247462 . A G 1057.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.865;DP=95;Dels=0.00;FS=1.663;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,54:95:99:1087,0,831 chrXV 247466 . A G 812.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.874;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:842,0,1103 chrXV 247525 . C T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.508;DP=101;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.221;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1108,0,1042 chrXV 247572 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.127;DP=92;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.383;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1101,0,888 chrXV 247746 . G A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.741;DP=121;Dels=0.00;FS=1.442;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.557;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1272,0,1260 chrXV 247923 . T C 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;DP=109;Dels=0.00;FS=7.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:941,0,1048 chrXV 248073 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.591;DP=126;Dels=0.00;FS=1.515;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=1;MQRankSum=0.396;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.318;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1110,0,1560 chrXV 248100 . T C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.734;DP=124;Dels=0.00;FS=5.681;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.227;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1168,0,1339 chrXV 248262 . C T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.318;DP=167;Dels=0.00;FS=0.572;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.906;QD=8.16;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,75:167:99:1393,0,1998 chrXV 248290 . G A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.451;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.180;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1658,0,1376 chrXV 248295 . T C 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.171;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:145:99:1571,0,1377 chrXV 248365 . C G 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=104;Dels=0.00;FS=3.938;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=25.88;ReadPosRankSum=1.299;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2725,282,0 chrXV 248560 . C T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.149;DP=108;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.541;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1130,0,1075 chrXV 248578 . G A 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.831;DP=108;Dels=0.00;FS=1.564;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=11.68;ReadPosRankSum=-2.006;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1291,0,950 chrXV 248750 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.712;DP=141;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1369,0,1538 chrXV 248887 . G A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;DP=126;Dels=0.00;FS=4.316;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1212,0,1418 chrXV 248980 . C T 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2871,288,0 chrXV 248992 . T C 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2961,303,0 chrXV 249082 . A G 992.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.430;DP=136;Dels=0.00;FS=4.180;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,54:136:99:1022,0,1846 chrXV 249246 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.510;DP=127;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.311;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1302,0,1401 chrXV 249416 . T C 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.480;DP=110;Dels=0.00;FS=1.548;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.012;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1320,0,915 chrXV 249478 . C T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.522;DP=106;Dels=0.00;FS=3.969;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.016;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,58:106:99:1233,0,1009 chrXV 249516 . A G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.388;DP=115;Dels=0.00;FS=3.646;HaplotypeScore=1.5253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.586;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1236,0,1076 chrXV 249558 . C T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.121;DP=132;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.032;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1253,0,1479 chrXV 249588 . C T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.437;DP=123;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.365;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1352,0,1162 chrXV 249830 . T C 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.132;DP=88;Dels=0.00;FS=6.813;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.937;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:823,0,1026 chrXV 249980 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.868;DP=131;Dels=0.00;FS=2.764;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.233;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1481,0,1325 chrXV 250175 . A C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.154;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=2.843;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.209;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1107,0,1694 chrXV 250385 . C T 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.247;DP=143;Dels=0.00;FS=2.161;HaplotypeScore=4.8635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.718;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,83:143:99:1850,0,1161 chrXV 250527 . C T 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.34;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2904,294,0 chrXV 251243 . G A 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:3864,388,0 chrXV 251372 . T C 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.211;DP=101;Dels=0.00;FS=4.951;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:795,0,1234 chrXV 252485 . A G 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.87;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2868,318,0 chrXV 252721 . G A 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.013;DP=93;Dels=0.00;FS=5.197;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.073;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:988,0,902 chrXV 252899 . C A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.314;DP=114;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=3.9413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.995;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,57:114:99:1252,0,1176 chrXV 253558 . G A 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.556;DP=137;Dels=0.00;FS=6.367;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.502;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1513,0,1352 chrXV 253651 . T C 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.908;DP=146;Dels=0.00;FS=2.217;HaplotypeScore=3.3499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.259;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,84:146:99:1776,0,1299 chrXV 253929 . C A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.985;DP=94;Dels=0.00;FS=12.793;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.742;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:1145,0,622 chrXV 253930 . A C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=94;Dels=0.00;FS=12.793;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.758;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.959;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1084,0,669 chrXV 253966 . A C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.672;DP=117;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.134;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1332,0,1074 chrXV 253998 . T G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.499;DP=107;Dels=0.00;FS=9.108;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.520;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1100,0,1114 chrXV 254016 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.296;DP=113;Dels=0.00;FS=3.502;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.713;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1170,0,1170 chrXV 254050 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.636;DP=131;Dels=0.00;FS=4.175;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1264,0,1369 chrXV 254194 . C T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.878;DP=108;Dels=0.00;FS=2.503;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.998;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1390,0,923 chrXV 254203 . T A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.918;DP=110;Dels=0.00;FS=3.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,65:110:99:1409,0,946 chrXV 254241 . A G 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.231;DP=116;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1000,0,1381 chrXV 254857 . C G 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=22.87;SB=-1.639e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3097,327,0 chrXV 254858 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.481;DP=127;Dels=0.00;FS=3.248;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1283,0,1146 chrXV 254919 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.875;DP=123;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.268;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1307,0,1152 chrXV 255018 . T C 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3246,333,0 chrXV 255031 . T C 3277.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=1;QD=24.64;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3277,327,0 chrXV 255163 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.092;DP=122;Dels=0.00;FS=4.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.894;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1476,0,1106 chrXV 255181 . A G 1916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.883;DP=178;Dels=0.00;FS=8.806;HaplotypeScore=4.7602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.661;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,93:178:99:1946,0,1765 chrXV 255268 . G A 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.234;DP=138;Dels=0.00;FS=3.048;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.915;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:138:99:1627,0,1209 chrXV 256190 . T A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.775;DP=140;Dels=0.00;FS=3.012;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1419,0,1591 chrXV 256322 . A C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.008;DP=119;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1246,0,1257 chrXV 256343 . T C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.763;DP=112;Dels=0.00;FS=5.922;HaplotypeScore=2.7942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.315;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1184,0,1168 chrXV 256353 . C T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.393;DP=124;Dels=0.00;FS=8.233;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.840;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1320,0,1321 chrXV 256395 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.277;DP=129;Dels=0.00;FS=5.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.039;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1275,0,1397 chrXV 256446 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.558;DP=119;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.826;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1261,0,1198 chrXV 256457 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.390;DP=126;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=8.9058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.638;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1167,0,1394 chrXV 256919 . G A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.875;DP=118;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=5.8964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.249;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:118:99:1126,0,1268 chrXV 257252 . A G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.631;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.223;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1371,0,1362 chrXV 257311 . G A 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.555;DP=153;Dels=0.00;FS=2.049;HaplotypeScore=3.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.943;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1302,0,1830 chrXV 257356 . C T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.485;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1417,0,1464 chrXV 257374 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.089;DP=130;Dels=0.00;FS=3.131;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.970;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1186,0,1468 chrXV 257550 . C T 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.191;DP=135;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.214;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1542,0,1232 chrXV 257554 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.492;DP=133;Dels=0.00;FS=3.228;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.579;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1395,0,1307 chrXV 257615 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.571;DP=156;Dels=0.00;FS=2.842;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=7.94;ReadPosRankSum=-2.854;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,68:156:99:1268,0,1957 chrXV 257695 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.760;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.130;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1208,0,1453 chrXV 257751 . A G 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.231;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.917;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1656,0,1542 chrXV 257954 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.225;DP=157;Dels=0.00;FS=10.510;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.633;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.088;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,74:157:99:1370,0,1874 chrXV 257968 . C T 4113.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4113,418,0 chrXV 257986 . A G 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.391;DP=149;Dels=0.00;FS=4.850;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1340,0,1705 chrXV 258043 . C T 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.136;DP=138;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.873;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1398,0,1534 chrXV 258539 . G C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.386;DP=147;Dels=0.00;FS=4.915;HaplotypeScore=5.7831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.308;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1372,0,1625 chrXV 258788 . T C 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.265;DP=150;Dels=0.00;FS=3.867;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.739;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1333,0,1802 chrXV 258913 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.042;DP=147;Dels=0.00;FS=0.660;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1490,0,1557 chrXV 259287 . T C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.230;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.638;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1116,0,945 chrXV 259315 . C T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.255;DP=109;Dels=0.00;FS=11.492;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.306;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1225,0,1050 chrXV 259644 . T G 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.692e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3584,357,0 chrXV 259691 . A G 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.172;DP=152;Dels=0.00;FS=7.625;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.921;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.553;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1606,0,1492 chrXV 259706 . A G 1765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.574;DP=151;Dels=0.00;FS=7.338;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1795,0,1369 chrXV 259721 . C T 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.138;DP=139;Dels=0.00;FS=11.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1617,0,1180 chrXV 259741 . A G 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.880;DP=118;Dels=0.00;FS=7.877;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.824;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1358,0,1081 chrXV 259779 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.753;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.841;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.391;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1217,0,1242 chrXV 259780 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.630;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.543;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1233,0,1239 chrXV 259797 . G A 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.380;DP=117;Dels=0.00;FS=4.669;HaplotypeScore=2.4557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.603;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.387;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1218,0,1201 chrXV 259967 . T C 889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.816;DP=117;Dels=0.00;FS=4.787;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:919,0,1527 chrXV 260018 . T C 621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.115;DP=106;Dels=0.00;FS=2.649;HaplotypeScore=4.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,39:106:99:651,0,1525 chrXV 260138 . A G 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.532;DP=121;Dels=0.00;FS=4.460;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.613;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:987,0,1459 chrXV 260153 . T C 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.380;DP=103;Dels=0.00;FS=5.088;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.771;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:897,0,1227 chrXV 260285 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.131;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=9.51;ReadPosRankSum=2.147;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1171,0,1302 chrXV 260340 . A G 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.354;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.434;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:965,0,959 chrXV 260366 . G A 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.679;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=8.34;ReadPosRankSum=2.069;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:847,0,1152 chrXV 260399 . G A 943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.711;DP=108;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=5.6896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:973,0,1231 chrXV 260576 . A G 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.843;DP=116;Dels=0.00;FS=7.140;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.773;SB=-1.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:954,0,1478 chrXV 260613 . T G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.974;DP=120;Dels=0.00;FS=6.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1125,0,1485 chrXV 260759 . A G 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.255;DP=156;Dels=0.00;FS=2.018;HaplotypeScore=2.7914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.377;SB=-9.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,86:156:99:1797,0,1469 chrXV 260837 . A G 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.087;DP=122;Dels=0.00;FS=7.034;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.874;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1142,0,1423 chrXV 260864 . A G 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.351;DP=107;Dels=0.00;FS=9.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.092;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:910,0,1431 chrXV 260906 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.714;DP=122;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.013;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1044,0,1520 chrXV 261263 . T C 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.168;DP=152;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.518;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.574;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1439,0,1714 chrXV 261556 . C A 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=23.33;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2902,288,0 chrXV 261583 . G A 3036 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3069,297,0 chrXV 261665 . A G 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2628,279,0 chrXV 261696 . T C 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2704,279,0 chrXV 262076 . A G 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2895,312,0 chrXV 263223 . T A 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2945,294,0 chrXV 263259 . C T 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2957,291,0 chrXV 263312 . C T 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3297,328,0 chrXV 263552 . G A 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3284,339,0 chrXV 263564 . G A 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3090,321,0 chrXV 263881 . A T 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3347,319,0 chrXV 264290 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.448;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.282;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,58:146:99:1132,0,1981 chrXV 264596 . A G 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.039;DP=175;Dels=0.00;FS=7.816;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.812;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,89:175:99:1882,0,1810 chrXV 264888 . G A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.960;DP=110;Dels=0.00;FS=4.697;HaplotypeScore=5.9522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.631;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1129,0,1159 chrXV 264910 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.638;DP=106;Dels=0.00;FS=9.273;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.571;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1276,0,891 chrXV 264924 . A C 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.139;DP=109;Dels=0.01;FS=7.497;HaplotypeScore=5.8509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,57:108:99:1070,0,1119 chrXV 264971 . T G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.997;DP=101;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1036,0,1091 chrXV 265232 . T A 3953.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3953,391,0 chrXV 265602 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.718;DP=120;Dels=0.00;FS=2.308;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.416;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1081,0,1479 chrXV 266130 . C T 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6036;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3143,312,0 chrXV 266157 . A G 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2954,309,0 chrXV 266234 . T C 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.70;MQ0=0;QD=23.94;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2786,294,0 chrXV 266235 . A G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.348;DP=115;Dels=0.00;FS=7.189;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:890,0,1369 chrXV 266279 . G A 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2950,291,0 chrXV 266777 . T G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.716;DP=113;Dels=0.00;FS=6.276;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.665;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1264,0,1173 chrXV 266933 . G T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;DP=117;Dels=0.00;FS=2.699;HaplotypeScore=6.5254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.477;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1307,0,1151 chrXV 266991 . G A 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.974;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=1;MQRankSum=0.966;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1726,0,1572 chrXV 267165 . C T 3985.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.57;SB=-2.085e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3985,388,0 chrXV 267359 . G A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.589;DP=177;Dels=0.00;FS=2.683;HaplotypeScore=6.4839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,76:177:99:1537,0,2057 chrXV 267498 . G A 1814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.549;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.617;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:1844,0,1445 chrXV 268345 . C T 1983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.725;DP=151;Dels=0.00;FS=2.095;HaplotypeScore=5.6427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,91:151:99:2013,0,1190 chrXV 268924 . C G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;DP=115;Dels=0.00;FS=4.577;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.770;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1197,0,1110 chrXV 269477 . G A 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.415;DP=123;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.351;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1041,0,1298 chrXV 270070 . A G 2551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.005;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2584,254,0 chrXV 270281 . C T 1946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.893;DP=163;Dels=0.00;FS=4.183;HaplotypeScore=5.3628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.069;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,93:163:99:1976,0,1375 chrXV 270422 . G A 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.235;DP=165;Dels=0.00;FS=5.567;HaplotypeScore=4.7038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,78:165:99:1669,0,1808 chrXV 270435 . T C 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.727;DP=165;Dels=0.00;FS=7.982;HaplotypeScore=3.6443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.021;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1543,0,1917 chrXV 270497 . G T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.489;DP=155;Dels=0.00;FS=0.596;HaplotypeScore=6.6510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1521,0,1726 chrXV 270526 . C G 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.339;DP=148;Dels=0.00;FS=1.295;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.205;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1531,0,1420 chrXV 270620 . G C 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.825;DP=142;Dels=0.00;FS=1.464;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1300,0,1621 chrXV 270687 . A G 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.086;DP=165;Dels=0.00;FS=2.012;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.217;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1631,0,1893 chrXV 270735 . T C 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.122;DP=111;Dels=0.00;FS=3.478;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.057;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:963,0,1416 chrXV 270906 . C T 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.328;DP=154;Dels=0.00;FS=4.888;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.450;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:154:99:1620,0,1734 chrXV 271041 . C T 928.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.693;DP=147;Dels=0.00;FS=3.898;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.717;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:958,0,1714 chrXV 271045 . T C 946.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.008;DP=131;Dels=0.00;FS=2.235;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.390;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:976,0,1542 chrXV 271047 . A G 1062.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.672;DP=129;Dels=0.00;FS=3.160;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.357;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1092,0,1509 chrXV 271107 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.673;DP=132;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.329;QD=8.74;ReadPosRankSum=-2.084;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:132:99:1184,0,1400 chrXV 271365 . T C 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3342,345,0 chrXV 271895 . G C 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.94;MQ0=0;QD=26.68;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3575,375,0 chrXV 272022 . A G 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3259,333,0 chrXV 272201 . G A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.276;DP=118;Dels=0.00;FS=2.418;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.673;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1328,0,1049 chrXV 272231 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.779;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.951;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.030;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1366,0,1234 chrXV 272235 . G A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.526;DP=131;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=2.5015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1186,0,1337 chrXV 272255 . G C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.641;DP=123;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.657;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1306,0,1071 chrXV 272275 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.596;DP=134;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1384,0,1411 chrXV 272432 . A G 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.866;DP=143;Dels=0.00;FS=4.049;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1358,0,1510 chrXV 272573 . A G 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.034;DP=156;Dels=0.00;FS=5.683;HaplotypeScore=5.2000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,90:156:99:1770,0,1344 chrXV 272726 . A G 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.242;DP=158;Dels=0.00;FS=15.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1560,0,1537 chrXV 273227 . T C 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.079;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.559;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:152:99:1561,0,1483 chrXV 273332 . C T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.570;DP=152;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=3.4835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1258,0,1861 chrXV 273621 . G A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.835;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1476,0,1212 chrXV 273775 . G C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;DP=117;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:117:99:1336,0,1114 chrXV 273944 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.060;DP=118;Dels=0.00;FS=3.771;HaplotypeScore=3.9671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=2.255;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.523;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1040,0,1278 chrXV 274033 . C T 2088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.751;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,100:177:99:2118,0,1505 chrXV 274195 . G A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.854;DP=162;Dels=0.00;FS=5.778;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.464;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1471,0,1558 chrXV 274222 . G A 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.054;DP=127;Dels=0.00;FS=19.980;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.362;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1276,0,1144 chrXV 274261 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.551;DP=119;Dels=0.00;FS=13.561;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=3.865;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.912;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1242,0,1152 chrXV 274354 . A C 1986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;DP=154;Dels=0.00;FS=3.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.267;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,96:154:99:2016,0,1141 chrXV 274517 . A G 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.653;DP=145;Dels=0.00;FS=10.130;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.117;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1371,0,1555 chrXV 274546 . G T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.960;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.67;MQ0=0;MQRankSum=-5.308;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1256,0,1367 chrXV 274550 . T G 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.184;DP=137;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=2.9173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=-6.593;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.961;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1121,0,1632 chrXV 274565 . A G 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.670;DP=123;Dels=0.00;FS=4.349;HaplotypeScore=9.0250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.19;MQ0=0;MQRankSum=-7.423;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.482;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:963,0,1468 chrXV 274586 . A G 982.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.603;DP=133;Dels=0.00;FS=5.221;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.95;MQ0=0;MQRankSum=-9.095;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1012,0,1575 chrXV 274592 . T C 806.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.139;DP=133;Dels=0.00;FS=4.189;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.81;MQ0=0;MQRankSum=-9.258;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.543;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:836,0,1735 chrXV 274593 . A G 779.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.188;DP=130;Dels=0.00;FS=5.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQ0=0;MQRankSum=-9.194;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.192;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:809,0,1658 chrXV 274608 . C T 788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.713;DP=139;Dels=0.00;FS=2.205;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.80;MQ0=0;MQRankSum=-8.686;QD=5.67;ReadPosRankSum=1.040;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:139:99:818,0,1784 chrXV 274651 . G C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.150;DP=149;Dels=0.00;FS=5.028;HaplotypeScore=6.5916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.32;MQ0=0;MQRankSum=-3.591;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.114;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:1023,0,1793 chrXV 274657 . C T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.546;DP=146;Dels=0.00;FS=6.207;HaplotypeScore=10.3630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.401;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1090,0,1728 chrXV 274793 . C T 739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.471;DP=148;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.804;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,47:148:99:769,0,2162 chrXV 274962 . C T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.688;DP=148;Dels=0.00;FS=4.945;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1326,0,1450 chrXV 275073 . T C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.871;DP=137;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.269;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:137:99:998,0,1846 chrXV 275122 . A C 773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.939;DP=119;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.803;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,44:119:99:803,0,1714 chrXV 275485 . C A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.427;DP=149;Dels=0.00;FS=13.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=1;MQRankSum=-0.533;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,65:149:99:1272,0,1787 chrXV 275793 . G A 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.432;DP=134;Dels=0.00;FS=6.486;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1513,0,1189 chrXV 275863 . A T 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.081;DP=137;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1313,0,1491 chrXV 276021 . C T 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.227;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.154;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1182,0,1206 chrXV 276033 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.732;DP=114;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=2.6882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.088;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1122,0,1158 chrXV 276153 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.399;DP=127;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.791;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1207,0,1277 chrXV 276436 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.762;DP=102;Dels=0.00;FS=3.959;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=10.00;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1050,0,1049 chrXV 276471 . A G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3302,333,0 chrXV 276679 . T C 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.02;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2895,306,0 chrXV 276774 . C G 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.941;DP=145;Dels=0.00;FS=1.337;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.469;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1421,0,1543 chrXV 276997 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.608;DP=148;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=8.12;ReadPosRankSum=-1.722;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:99:1232,0,1698 chrXV 277059 . T G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.926;DP=129;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.269;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1207,0,1414 chrXV 277115 . C T 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.738;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.438;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1664,0,1605 chrXV 277382 . G A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.899;DP=115;Dels=0.00;FS=12.756;HaplotypeScore=3.8427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.749;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1256,0,1108 chrXV 277395 . C G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.372;DP=112;Dels=0.00;FS=8.041;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.915;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1312,0,973 chrXV 277461 . G A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.316;DP=126;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1563,0,1095 chrXV 277467 . C G 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3361,345,0 chrXV 277667 . C T 533.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.291;DP=93;Dels=0.00;FS=0.853;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.29;MQ0=0;MQRankSum=-4.396;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:563,0,1273 chrXV 277668 . A T 543.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.811;DP=93;Dels=0.00;FS=0.853;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.29;MQ0=0;MQRankSum=-4.856;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,32:93:99:573,0,1324 chrXV 277673 . A G 596.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.668;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.60;MQ0=0;MQRankSum=-5.815;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.413;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,38:101:99:626,0,1366 chrXV 277693 . G C 637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.709;DP=89;Dels=0.00;FS=4.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.97;MQ0=0;MQRankSum=-4.291;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-2.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,37:89:99:667,0,1001 chrXV 277699 . C A 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.979;DP=91;Dels=0.00;FS=5.916;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.845;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:710,0,1020 chrXV 277705 . T C 658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.669;DP=89;Dels=0.00;FS=4.745;HaplotypeScore=2.7568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.38;MQ0=0;MQRankSum=-4.014;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.442;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:89:99:688,0,972 chrXV 277819 . T A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.308;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.069;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1299,0,1311 chrXV 277840 . G C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.704;DP=122;Dels=0.00;FS=1.475;HaplotypeScore=3.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=2.980;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1255,0,1165 chrXV 277905 . T C 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.178;DP=92;Dels=0.00;FS=1.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.668;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:910,0,965 chrXV 277941 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.562;DP=109;Dels=0.00;FS=4.760;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1103,0,1073 chrXV 278097 . C T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.859;DP=135;Dels=0.00;FS=3.221;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.209;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1467,0,1357 chrXV 278142 . G A 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.663;DP=155;Dels=0.00;FS=4.162;HaplotypeScore=3.6425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,84:155:99:1820,0,1419 chrXV 278259 . G A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.055;DP=122;Dels=0.00;FS=4.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1211,0,1434 chrXV 278268 . G A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.389;DP=120;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.846;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1136,0,1389 chrXV 278358 . A G 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.458;DP=127;Dels=0.00;FS=2.247;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1387,0,1326 chrXV 278901 . A G 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.978;DP=107;Dels=0.00;FS=3.717;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.745;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1018,0,1161 chrXV 279324 . T C 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.732;DP=99;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=3.6326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.067;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1005,0,1087 chrXV 279501 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.530;DP=116;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.973;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1224,0,1160 chrXV 279807 . T C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.503;DP=106;Dels=0.00;FS=6.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.555;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1029,0,1174 chrXV 279819 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.405;DP=110;Dels=0.00;FS=19.870;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.719;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1182,0,1092 chrXV 279839 . G A 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.060;DP=97;Dels=0.00;FS=12.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.332;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:993,0,989 chrXV 279879 . G A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.088;DP=110;Dels=0.00;FS=3.536;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1212,0,1080 chrXV 279942 . T A 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2889,285,0 chrXV 280789 . C T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.774;DP=89;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.379;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1021,0,808 chrXV 280902 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.830;DP=127;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=6.9218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.399;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.131;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1415,0,1232 chrXV 281034 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.420;DP=121;Dels=0.01;FS=2.346;HaplotypeScore=11.5991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.237;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1434,0,1044 chrXV 281328 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.272;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1466,0,1179 chrXV 281493 . G A 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.254;DP=118;Dels=0.00;FS=5.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1369,0,1147 chrXV 281671 . C G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.335;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1255,0,1602 chrXV 281680 . C T 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.316;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1302,0,1528 chrXV 281784 . G C 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.360;DP=137;Dels=0.00;FS=4.142;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=1;MQRankSum=0.169;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.755;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,78:137:99:1702,0,1111 chrXV 281820 . G C 1659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.387;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,86:148:99:1689,0,1267 chrXV 281854 . C T 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.988;DP=128;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,78:128:99:1764,0,920 chrXV 281915 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.590;DP=100;Dels=0.00;FS=1.641;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,59:100:99:1286,0,843 chrXV 281945 . A C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.444;DP=110;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.247;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1286,0,1058 chrXV 282038 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.169;DP=114;Dels=0.00;FS=31.771;HaplotypeScore=3.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.213;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1158,0,1174 chrXV 282101 . A G 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.565;DP=123;Dels=0.00;FS=5.728;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.984;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1216,0,1349 chrXV 282314 . C G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.000;DP=130;Dels=0.00;FS=4.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.332;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1079,0,1469 chrXV 282519 . G C 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.925;DP=123;Dels=0.00;FS=7.343;HaplotypeScore=6.0949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.573;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,75:123:99:1602,0,922 chrXV 282549 . A G 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.377;DP=145;Dels=0.00;FS=2.154;HaplotypeScore=9.7298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.109;QD=8.06;ReadPosRankSum=-1.880;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,61:145:99:1198,0,1825 chrXV 282703 . C T 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.041;DP=117;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.498;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:941,0,1537 chrXV 283315 . A G 1116.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.168;DP=130;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1146,0,1359 chrXV 283744 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.292;DP=148;Dels=0.00;FS=2.044;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.180;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1494,0,1546 chrXV 284515 . C T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.987;DP=146;Dels=0.00;FS=4.178;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.229;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1528,0,1510 chrXV 284521 . A T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.243;DP=147;Dels=0.00;FS=3.147;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.785;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1590,0,1538 chrXV 284659 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.149;DP=125;Dels=0.00;FS=2.359;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1214,0,1388 chrXV 284943 . G A 1937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.503;DP=187;Dels=0.00;FS=1.137;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.744;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,95:187:99:1967,0,1820 chrXV 284983 . A G 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.638;DP=174;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=3.7125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.723;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,94:174:99:1898,0,1694 chrXV 285010 . A G 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.924;DP=142;Dels=0.00;FS=5.636;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.301;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1584,0,1310 chrXV 285417 . G A 4025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4025,400,0 chrXV 285557 . C A 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.622;DP=118;Dels=0.00;FS=2.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.474;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1210,0,1295 chrXV 285663 . A G 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.327;DP=84;Dels=0.00;FS=5.831;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.273;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:863,0,925 chrXV 286242 . G A 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.715;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.397;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,78:162:99:1549,0,1801 chrXV 286319 . A C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.812;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1227,0,1661 chrXV 286370 . T C 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.777;DP=154;Dels=0.00;FS=3.025;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.086;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,72:154:99:1418,0,1762 chrXV 286414 . T C 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.627;DP=138;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=2.5633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.713;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:138:99:1300,0,1605 chrXV 286504 . T A 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.510;DP=140;Dels=0.00;FS=12.081;HaplotypeScore=3.5806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.035;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1683,0,1269 chrXV 286528 . T C 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.409;DP=148;Dels=0.00;FS=2.949;HaplotypeScore=8.2186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.323;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1558,0,1502 chrXV 286585 . G C 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;DP=134;Dels=0.00;FS=7.838;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1091,0,1529 chrXV 286630 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.022;DP=129;Dels=0.00;FS=5.367;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.158;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1259,0,1321 chrXV 286759 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.598;DP=123;Dels=0.00;FS=5.999;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.904;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1183,0,1337 chrXV 286781 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.045;DP=137;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=10.62;ReadPosRankSum=-2.073;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1485,0,1387 chrXV 286903 . C T 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.617;DP=115;Dels=0.00;FS=4.678;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1077,0,1230 chrXV 286975 . C T 688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.193;DP=99;Dels=0.00;FS=8.105;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.881;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:718,0,1139 chrXV 287386 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.516;DP=133;Dels=0.00;FS=2.387;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=10.08;ReadPosRankSum=-2.058;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:133:99:1370,0,1307 chrXV 287557 . T A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.633;DP=135;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=2.8349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1313,0,1601 chrXV 287697 . G A 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.908;DP=111;Dels=0.00;FS=4.084;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.406;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1073,0,1314 chrXV 287762 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.035;DP=124;Dels=0.00;FS=3.257;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1289,0,1173 chrXV 288023 . A T 742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;DP=96;Dels=0.00;FS=6.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.546;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:772,0,1243 chrXV 288113 . G A 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.210;DP=103;Dels=0.00;FS=22.518;HaplotypeScore=3.5770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.775;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:976,0,1025 chrXV 288164 . C T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.701;DP=101;Dels=0.00;FS=2.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.148;QD=10.09;ReadPosRankSum=2.605;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1049,0,1009 chrXV 288307 . G C 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;DP=110;Dels=0.00;FS=3.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.767;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1102,0,1117 chrXV 288309 . C T 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.686;DP=112;Dels=0.00;FS=2.436;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.313;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1186,0,1117 chrXV 288644 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.107;DP=115;Dels=0.01;FS=0.699;HaplotypeScore=9.8416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1077,0,1317 chrXV 288781 . G A 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.668;DP=100;Dels=0.00;FS=1.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:989,0,1103 chrXV 288813 . A T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;DP=101;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.608;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1064,0,1101 chrXV 288828 . A T 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;DP=114;Dels=0.00;FS=8.584;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.507;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1292,0,1215 chrXV 288918 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.481;DP=139;Dels=0.00;FS=4.240;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.710;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1529,0,1303 chrXV 289132 . A G 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.320;DP=129;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1286,0,1476 chrXV 289218 . C T 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.031;DP=128;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1345,0,1353 chrXV 289275 . T C 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.662;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.166;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:985,0,1179 chrXV 289578 . C T 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.760;DP=148;Dels=0.00;FS=5.991;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.776;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1734,0,1301 chrXV 289728 . T C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.990;DP=155;Dels=0.00;FS=3.756;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.059;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1518,0,1665 chrXV 289797 . C A 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.401;DP=133;Dels=0.00;FS=7.888;HaplotypeScore=4.9649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.196;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1156,0,1565 chrXV 289957 . A G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.279;DP=140;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.471;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1194,0,1677 chrXV 290078 . A T 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.739;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.056;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1333,0,1315 chrXV 290199 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.171;DP=161;Dels=0.00;FS=6.051;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.939;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:1499,0,1493 chrXV 290233 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.548;DP=148;Dels=0.00;FS=4.913;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.212;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.180;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:148:99:1308,0,1587 chrXV 290259 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.725;DP=122;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=3.7665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=1.987;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.362;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1067,0,1286 chrXV 290268 . G C 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=23.68;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3253,345,0 chrXV 290676 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.586;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.816;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1323,0,1302 chrXV 290681 . T C 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.458;DP=124;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.315;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1344,0,1363 chrXV 290723 . T A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;DP=125;Dels=0.00;FS=6.827;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.499;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1314,0,1429 chrXV 290790 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.965;DP=112;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1127,0,1263 chrXV 290809 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.278;DP=118;Dels=0.00;FS=5.853;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1204,0,1342 chrXV 290822 . T G 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3083,324,0 chrXV 290826 . C T 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.544;DP=117;Dels=0.00;FS=5.873;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.146;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:978,0,1518 chrXV 290902 . A T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;DP=123;Dels=0.00;FS=6.809;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.529;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1253,0,1308 chrXV 290908 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.097;DP=127;Dels=0.00;FS=6.678;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.567;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1244,0,1345 chrXV 290923 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.928;DP=133;Dels=0.00;FS=7.800;HaplotypeScore=4.8849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1366,0,1366 chrXV 291010 . A G 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.558;DP=118;Dels=0.00;FS=5.703;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1186,0,1220 chrXV 291072 . A G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.801;DP=132;Dels=0.00;FS=20.828;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=-0.169;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.114;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1071,0,1638 chrXV 291394 . A G 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.383;DP=132;Dels=0.00;FS=13.104;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.834;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1294,0,1352 chrXV 291397 . G A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.498;DP=135;Dels=0.00;FS=8.014;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.209;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1261,0,1370 chrXV 291412 . G A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.162;DP=126;Dels=0.00;FS=9.699;HaplotypeScore=2.6075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1185,0,1284 chrXV 291472 . T G 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.523;DP=149;Dels=0.00;FS=9.270;HaplotypeScore=3.3464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=10.07;ReadPosRankSum=2.273;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1531,0,1504 chrXV 291517 . G A 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.992;DP=144;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,77:144:99:1748,0,1390 chrXV 291532 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.691;DP=136;Dels=0.00;FS=1.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=11.38;ReadPosRankSum=-2.420;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1578,0,1283 chrXV 291562 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.298;DP=126;Dels=0.00;FS=4.284;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.039;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1291,0,1229 chrXV 291583 . G A 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.907;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.400;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1564,0,1291 chrXV 291594 . G A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.567;DP=145;Dels=0.00;FS=3.117;HaplotypeScore=8.6397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.567;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1462,0,1390 chrXV 291607 . A G 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.981;DP=148;Dels=0.00;FS=7.695;HaplotypeScore=2.8804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.541;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1531,0,1519 chrXV 291799 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.598;DP=132;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.275;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1305,0,1342 chrXV 292136 . T C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.265;DP=131;Dels=0.00;FS=1.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1428,0,1224 chrXV 292858 . G T 4098.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4098,421,0 chrXV 292883 . A G 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3758,402,0 chrXV 293123 . C T 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3084,312,0 chrXV 293132 . A G 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3042,312,0 chrXV 293590 . A G 3109 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3142,324,0 chrXV 293822 . G A 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.871;DP=151;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=4.6993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,85:151:99:1733,0,1254 chrXV 294178 . C T 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3718,369,0 chrXV 294284 . A G 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.134;DP=151;Dels=0.00;FS=2.111;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.073;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1598,0,1532 chrXV 294323 . C G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.946;DP=155;Dels=0.00;FS=2.819;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.654;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1565,0,1524 chrXV 294330 . G A 4271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=27.20;SB=-2.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4271,433,0 chrXV 294382 . G A 4463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:178:99:4463,448,0 chrXV 294448 . T G 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.463;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.233;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1229,0,1635 chrXV 294529 . T C 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.477;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1564,0,1729 chrXV 294547 . C T 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.791;DP=163;Dels=0.00;FS=3.657;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=11.26;ReadPosRankSum=-2.958;SB=-9.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,89:163:99:1865,0,1488 chrXV 294553 . C T 4174.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.59;SB=-2.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4174,427,0 chrXV 294636 . A G 1725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.650;DP=151;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=3.8349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=0.797;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,84:151:99:1755,0,1410 chrXV 294723 . T C 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.089;DP=143;Dels=0.00;FS=2.978;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.242;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,80:143:99:1645,0,1339 chrXV 294840 . A G 704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.587;DP=96;Dels=0.00;FS=2.743;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:96:99:734,0,1199 chrXV 294882 . A G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.033;DP=107;Dels=0.00;FS=2.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.172;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:983,0,1221 chrXV 295059 . T C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.809;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.881;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1166,0,1303 chrXV 295077 . C T 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.254;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.948;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1169,0,1284 chrXV 295275 . A G 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3488,360,0 chrXV 295276 . A G 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3392,360,0 chrXV 296918 . A C 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.256;DP=139;Dels=0.00;FS=6.358;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.836;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:139:99:1145,0,1713 chrXV 297107 . C T 4275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=1;QD=26.72;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4275,433,0 chrXV 297528 . T C 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3170,318,0 chrXV 297608 . G A 2378 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.57;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2411,249,0 chrXV 297937 . G A 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.425;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.300;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:843,0,1183 chrXV 298630 . C T 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.600;DP=135;Dels=0.00;FS=3.371;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.737;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1201,0,1589 chrXV 298656 . A G 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.977;DP=121;Dels=0.00;FS=4.380;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.807;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1182,0,1392 chrXV 298844 . G T 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.74;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3034,307,0 chrXV 298850 . T A 2910 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2943,300,0 chrXV 298872 . C T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.405;DP=133;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=4.9654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1366,0,1482 chrXV 298882 . A G 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3273,348,0 chrXV 299064 . C T 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.117;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=6.70;ReadPosRankSum=-1.108;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:914,0,1630 chrXV 299136 . A G 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3338,351,0 chrXV 299161 . T G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.870;DP=131;Dels=0.00;FS=8.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.127;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1077,0,1644 chrXV 299502 . G A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.341;DP=101;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.016;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1147,0,1052 chrXV 299512 . C G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;DP=97;Dels=0.00;FS=1.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.503;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.037;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1076,0,1017 chrXV 299731 . G T 773.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.095;DP=121;Dels=0.00;FS=4.720;HaplotypeScore=6.6764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.38;MQ0=0;MQRankSum=-9.000;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:121:99:803,0,1589 chrXV 299739 . C T 714.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.958;DP=112;Dels=0.00;FS=3.627;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.92;MQ0=0;MQRankSum=-8.266;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.082;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,43:112:99:744,0,1420 chrXV 299741 . G A 679.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.612;DP=104;Dels=0.00;FS=8.005;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQ0=0;MQRankSum=-8.335;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:709,0,1332 chrXV 299751 . G A 778.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.925;DP=98;Dels=0.00;FS=9.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.73;MQ0=0;MQRankSum=-8.189;QD=7.94;ReadPosRankSum=-2.425;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:808,0,1129 chrXV 299757 . A G 447.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.561;DP=83;Dels=0.00;FS=0.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-7.216;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.521;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,29:83:99:477,0,1209 chrXV 299759 . A T 463.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;DP=83;Dels=0.00;FS=0.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-7.216;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.702;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,29:83:99:493,0,1183 chrXV 299762 . G C 433.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;DP=84;Dels=0.00;FS=0.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=-7.244;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.790;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,29:84:99:463,0,1174 chrXV 299764 . A T 462.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;DP=84;Dels=0.00;FS=0.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=-7.244;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.677;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,29:84:99:492,0,1207 chrXV 299765 . G T 476.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.937;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-7.187;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.543;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,29:82:99:506,0,1123 chrXV 299766 . A T 480.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.957;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-7.187;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.747;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,29:82:99:510,0,1149 chrXV 299771 . C G 456.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.755;DP=92;Dels=0.00;FS=2.802;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.07;MQ0=0;MQRankSum=-7.785;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:486,0,1164 chrXV 299774 . G A 470.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.430;DP=94;Dels=0.00;FS=3.989;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.32;MQ0=0;MQRankSum=-7.886;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,37:94:99:500,0,1191 chrXV 299775 . C A 454.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.794;DP=93;Dels=0.00;FS=3.955;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.20;MQ0=0;MQRankSum=-7.853;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.287;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:484,0,1160 chrXV 299778 . A G 415.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.108;DP=98;Dels=0.00;FS=5.196;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.95;MQ0=0;MQRankSum=-7.893;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.065;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,41:98:99:445,0,1268 chrXV 299793 . G C 565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;DP=109;Dels=0.00;FS=7.579;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.80;MQ0=0;MQRankSum=-8.636;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:595,0,1324 chrXV 299796 . C A 583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.850;DP=110;Dels=0.00;FS=9.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQ0=0;MQRankSum=-8.650;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.688;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:613,0,1343 chrXV 299808 . C A 542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.401;DP=102;Dels=0.00;FS=6.339;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQ0=0;MQRankSum=-7.731;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.763;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:572,0,1188 chrXV 299839 . A G 366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.740;DP=79;Dels=0.00;FS=9.694;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-6.273;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.280;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:396,0,996 chrXV 299855 . G A 360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.573;DP=74;Dels=0.00;FS=17.818;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.30;MQ0=0;MQRankSum=-5.647;QD=4.86;ReadPosRankSum=2.181;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,29:74:99:390,0,999 chrXV 299876 . C T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.728;DP=99;Dels=0.00;FS=7.939;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQ0=0;MQRankSum=-3.556;QD=8.74;ReadPosRankSum=-3.178;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:895,0,1065 chrXV 299879 . G A 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.601;DP=95;Dels=0.00;FS=8.207;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.894;QD=9.05;ReadPosRankSum=-3.298;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:890,0,1043 chrXV 299931 . G A 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.834;DP=99;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=8.75;ReadPosRankSum=3.180;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:896,0,1136 chrXV 299935 . G A 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.412;DP=98;Dels=0.00;FS=1.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=9.00;ReadPosRankSum=2.360;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:912,0,1052 chrXV 299976 . A G 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.108;DP=112;Dels=0.00;FS=8.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.566;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1011,0,1334 chrXV 300004 . G A 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;DP=100;Dels=0.00;FS=3.739;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1042,0,1144 chrXV 300055 . C T 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.609;DP=134;Dels=0.00;FS=3.154;HaplotypeScore=3.8250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.427;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1358,0,1413 chrXV 300097 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.553;DP=109;Dels=0.00;FS=9.610;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.958;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:109:99:1248,0,1051 chrXV 300301 . G T 2586 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2619,261,0 chrXV 300392 . G A 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.348;DP=130;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=2.7227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1530,0,1232 chrXV 300653 . A G 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.557;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.214;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,53:95:99:1099,0,897 chrXV 300670 . A G 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.587;DP=98;Dels=0.00;FS=2.707;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.556;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,57:98:99:1135,0,844 chrXV 300865 . T C 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.668;DP=120;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=3.9547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.048;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,71:120:99:1515,0,975 chrXV 300871 . C A 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.704;DP=130;Dels=0.00;FS=2.288;HaplotypeScore=5.9438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=2.565;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.586;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:981,0,1636 chrXV 300887 . C T 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.27;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3140,318,0 chrXV 300895 . T A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;DP=118;Dels=0.00;FS=1.551;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.220;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,71:118:99:1504,0,926 chrXV 300918 . A T 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=128;Dels=0.00;FS=4.713;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.581;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,74:128:99:1597,0,1066 chrXV 300972 . G A 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.262;DP=122;Dels=0.00;FS=10.190;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=2.412;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1028,0,1497 chrXV 300985 . C T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=111;Dels=0.00;FS=24.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1390,0,967 chrXV 301024 . A G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.886;DP=113;Dels=0.00;FS=1.621;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.372;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.364;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:113:99:1250,0,1024 chrXV 301044 . G A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.528;DP=113;Dels=0.00;FS=1.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.531;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1203,0,1122 chrXV 301075 . T G 2375 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.50;MQ0=0;QD=22.62;SB=-1.138e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2408,255,0 chrXV 301083 . T C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.644;DP=109;Dels=0.00;FS=2.602;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:956,0,1094 chrXV 301153 . G A 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2926,288,0 chrXV 301406 . G A 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.603;DP=104;Dels=0.00;FS=1.687;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.419;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1004,0,1085 chrXV 301621 . C G 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3552,396,0 chrXV 301631 . T C 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.516;DP=147;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=9.90;ReadPosRankSum=-2.071;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1485,0,1655 chrXV 301679 . A G 1798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.832;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.991;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,92:182:99:1828,0,1955 chrXV 301703 . C T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.085;DP=154;Dels=0.00;FS=4.791;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.500;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1489,0,1733 chrXV 302184 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.392;DP=122;Dels=0.00;FS=3.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-1.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1117,0,1455 chrXV 302514 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.221;DP=123;Dels=0.00;FS=4.568;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.772;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1234,0,1202 chrXV 302730 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.178;DP=119;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=2.7232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1114,0,1404 chrXV 302844 . T C 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.916;DP=90;Dels=0.00;FS=2.820;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.007;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:934,0,922 chrXV 303067 . C T 2243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2276,228,0 chrXV 303214 . G T 2198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1980;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=20.93;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2231,231,0 chrXV 303991 . A T 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3250,325,0 chrXV 304893 . C T 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.555;DP=158;Dels=0.00;FS=9.746;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.358;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,78:158:99:1656,0,1697 chrXV 305375 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.954;DP=139;Dels=0.00;FS=5.175;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=1;MQRankSum=1.042;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1141,0,1695 chrXV 305436 . A G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.441;DP=140;Dels=0.00;FS=5.185;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.640;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1355,0,1423 chrXV 305531 . G A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.589;DP=144;Dels=0.00;FS=17.114;HaplotypeScore=2.3039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.285;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1375,0,1663 chrXV 305540 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.306;DP=154;Dels=0.00;FS=17.896;HaplotypeScore=4.6981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:154:99:1464,0,1797 chrXV 305554 . G A 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.951;DP=138;Dels=0.00;FS=15.352;HaplotypeScore=4.6355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.162;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1241,0,1708 chrXV 305582 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.803;DP=116;Dels=0.00;FS=6.391;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.160;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1263,0,1166 chrXV 305678 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.775;DP=129;Dels=0.00;FS=3.865;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1218,0,1376 chrXV 305753 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.234;DP=131;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=2.388;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.112;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1414,0,1214 chrXV 305915 . T A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.730;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1342,0,1620 chrXV 306068 . A G 1919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.601;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=3.534;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.571;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,92:152:99:1949,0,1200 chrXV 306086 . C T 780.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.511;DP=149;Dels=0.00;FS=3.336;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.543;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.983;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,50:149:99:810,0,2134 chrXV 306087 . C T 813.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.147;DP=146;Dels=0.00;FS=2.396;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.281;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,48:146:99:843,0,2168 chrXV 306089 . G A 847.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.725;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.610;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.535;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,47:136:99:877,0,1951 chrXV 306699 . T C 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.491;DP=158;Dels=0.00;FS=18.277;HaplotypeScore=3.0716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,85:158:99:1700,0,1509 chrXV 307004 . T C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.808;DP=106;Dels=0.00;FS=10.887;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1061,0,1128 chrXV 307049 . A G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.292;DP=122;Dels=0.00;FS=8.534;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.165;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.688;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1390,0,1192 chrXV 307256 . A T 1656.03 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.679;DP=115;Dels=0.00;FS=7.725;HaplotypeScore=215.0293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=6.823;QD=14.40;ReadPosRankSum=-1.235;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:20:1686,0,20 chrXV 307589 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.937;DP=137;Dels=0.00;FS=1.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1401,0,1483 chrXV 307601 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.449;DP=130;Dels=0.00;FS=5.038;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1395,0,1430 chrXV 307640 . T C 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.129;DP=139;Dels=0.00;FS=4.563;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.697;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1496,0,1533 chrXV 307672 . C T 1996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.101;DP=156;Dels=0.00;FS=2.401;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,91:156:99:2026,0,1233 chrXV 307849 . A T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.479;DP=157;Dels=0.00;FS=9.958;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.946;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1521,0,1741 chrXV 307879 . T C 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.113;DP=139;Dels=0.00;FS=6.460;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.801;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1251,0,1678 chrXV 308195 . A G 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.410;DP=111;Dels=0.00;FS=3.455;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:915,0,1351 chrXV 308212 . G A 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.429;DP=119;Dels=0.00;FS=5.927;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.456;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1103,0,1381 chrXV 308234 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.754;DP=127;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=2.393;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.377;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1219,0,1421 chrXV 308387 . C T 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.149;DP=136;Dels=0.00;FS=3.179;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.277;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,53:136:99:933,0,1812 chrXV 308420 . A C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.860;DP=127;Dels=0.00;FS=8.105;HaplotypeScore=3.5588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=8.00;ReadPosRankSum=1.303;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,53:127:99:1046,0,1545 chrXV 308513 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.968;DP=145;Dels=0.01;FS=8.824;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.481;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1362,0,1599 chrXV 308645 . G A 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.678;DP=142;Dels=0.00;FS=3.903;HaplotypeScore=5.7488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.724;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1513,0,1527 chrXV 308792 . G A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;DP=119;Dels=0.00;FS=4.470;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.040;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1262,0,1276 chrXV 308876 . T C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.644;DP=116;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:986,0,1519 chrXV 308969 . G A 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.978;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1659,0,1240 chrXV 309144 . A G 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.852;DP=157;Dels=0.00;FS=4.703;HaplotypeScore=2.8466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.094;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,80:157:99:1704,0,1641 chrXV 309237 . A G 627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.832;DP=94;Dels=0.00;FS=4.670;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.743;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,35:94:99:657,0,1345 chrXV 309247 . A C 531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.666;DP=80;Dels=0.00;FS=4.856;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.422;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:561,0,1140 chrXV 309334 . C T 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.396;DP=86;Dels=0.00;FS=4.238;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=12.28;ReadPosRankSum=2.715;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:1086,0,796 chrXV 309504 . G A 2045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.517;DP=162;Dels=0.00;FS=12.598;HaplotypeScore=3.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=12.62;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,94:162:99:2075,0,1353 chrXV 309615 . T C 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.661;DP=123;Dels=0.00;FS=14.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=2.183;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.146;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1264,0,1380 chrXV 309869 . T C 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.609;DP=127;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.82;ReadPosRankSum=2.565;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1277,0,1296 chrXV 309954 . G A 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.878;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.740;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1463,0,1271 chrXV 310257 . A G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8343;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3302,333,0 chrXV 310258 . A G 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8343;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3366,342,0 chrXV 310430 . C T 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.474;DP=169;Dels=0.00;FS=2.011;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.763;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,71:169:99:1393,0,2112 chrXV 311056 . T C 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.064;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.616;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,87:161:99:1678,0,1654 chrXV 311157 . A G 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3500,381,0 chrXV 311334 . G A 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.039;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.829;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,70:136:99:1530,0,1376 chrXV 312416 . A G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.384;DP=165;Dels=0.00;FS=5.730;HaplotypeScore=7.9325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1524,0,1978 chrXV 312454 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.703;DP=128;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:128:99:1424,0,1253 chrXV 312534 . T C 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.291;DP=147;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=9.49;ReadPosRankSum=2.174;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1425,0,1742 chrXV 312575 . C A 1854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.050;DP=185;Dels=0.00;FS=1.169;HaplotypeScore=4.9185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=10.02;ReadPosRankSum=-2.235;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,87:185:99:1884,0,1970 chrXV 312818 . A C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.911;DP=139;Dels=0.00;FS=2.129;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.960;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1236,0,1234 chrXV 312919 . A G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.704;DP=178;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=5.1717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQ0=0;MQRankSum=2.151;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.069;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,80:178:99:1467,0,2144 chrXV 313126 . T C 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.490;DP=121;Dels=0.00;FS=2.313;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.080;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1213,0,1290 chrXV 313924 . T G 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.701;DP=160;Dels=0.00;FS=5.430;HaplotypeScore=5.9556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.215;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1747,0,1601 chrXV 313945 . T C 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.089;DP=151;Dels=0.00;FS=2.318;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.956;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,83:151:99:1788,0,1412 chrXV 314041 . A G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.515;DP=120;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.601;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1077,0,1470 chrXV 314050 . T C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.983;DP=121;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=3.8751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.089;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1011,0,1528 chrXV 314073 . G T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.571;DP=138;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=6.8546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.423;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1354,0,1524 chrXV 314395 . G A 2053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=161;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=3.6107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.140;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,95:161:99:2083,0,1268 chrXV 314514 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.420;DP=127;Dels=0.00;FS=9.891;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.553;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1288,0,1371 chrXV 315191 . G C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;DP=152;Dels=0.00;FS=4.083;HaplotypeScore=10.0439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=1;MQRankSum=-1.668;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.024;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:152:99:1224,0,1740 chrXV 315481 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.177;DP=155;Dels=0.00;FS=2.065;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.024;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.781;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,63:155:99:1349,0,1983 chrXV 315627 . T A 539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.498;DP=107;Dels=0.01;FS=27.205;HaplotypeScore=114.2589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.312;SB=-8.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:569,0,527 chrXV 315691 . A G 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.109;DP=132;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=2.9677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.903;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:132:99:947,0,1328 chrXV 315748 . T C 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.110;DP=183;Dels=0.00;FS=5.262;HaplotypeScore=3.7182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,83:183:99:1551,0,2214 chrXV 315837 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.067;DP=136;Dels=0.00;FS=3.735;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.158;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1384,0,1391 chrXV 316312 . C A 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.022;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.485;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.316;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:151:99:1543,0,1494 chrXV 316327 . A C 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.384;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.433;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1551,0,1703 chrXV 316342 . T C 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.516;DP=165;Dels=0.00;FS=0.573;HaplotypeScore=3.5320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1688,0,1643 chrXV 316361 . T A 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;DP=157;Dels=0.00;FS=1.998;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.316;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,80:157:99:1637,0,1576 chrXV 316412 . C T 697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.309;DP=128;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=2.9577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=0;MQRankSum=-8.112;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,51:128:99:727,0,1547 chrXV 316483 . A T 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.915;DP=175;Dels=0.00;FS=1.202;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.267;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,85:175:99:1669,0,1872 chrXV 316591 . A T 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;DP=154;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=5.0635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-1.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:154:99:1636,0,1670 chrXV 316611 . A G 1826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.599;DP=175;Dels=0.00;FS=5.527;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.253;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,89:175:99:1856,0,1832 chrXV 316646 . C T 1920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.458;DP=169;Dels=0.00;FS=3.070;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,93:169:99:1950,0,1463 chrXV 316958 . T G 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.747;DP=120;Dels=0.00;FS=7.549;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=12.99;ReadPosRankSum=-2.022;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,73:120:99:1589,0,962 chrXV 317034 . T A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.463;DP=152;Dels=0.00;FS=12.535;HaplotypeScore=4.5683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,63:152:99:1240,0,1923 chrXV 317149 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.846;DP=150;Dels=0.00;FS=9.994;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1415,0,1704 chrXV 317483 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.030;DP=123;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.786;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1197,0,1101 chrXV 317789 . A T 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.414;DP=148;Dels=0.00;FS=7.282;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=10.86;ReadPosRankSum=2.809;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1638,0,1402 chrXV 317798 . C T 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.375;DP=158;Dels=0.00;FS=2.815;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.894;SB=-9.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:158:99:1740,0,1498 chrXV 317858 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.118;DP=119;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.296;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:993,0,1376 chrXV 318136 . C T 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2795,288,0 chrXV 318359 . T C 1991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.663;DP=165;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=2.3919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.366;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,98:165:99:2021,0,1300 chrXV 318648 . T G 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.908;DP=137;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1322,0,1450 chrXV 318668 . C G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;DP=140;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=2.306;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1324,0,1426 chrXV 318818 . T C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.678;DP=120;Dels=0.00;FS=4.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.189;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:120:99:1160,0,1300 chrXV 319505 . C T 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.948;DP=126;Dels=0.00;FS=3.228;HaplotypeScore=6.8733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.038;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1655,0,999 chrXV 319628 . G A 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.907;DP=151;Dels=0.00;FS=0.598;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.790;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1499,0,1693 chrXV 320015 . C G 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.036;DP=157;Dels=0.00;FS=1.249;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.915;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,80:157:99:1573,0,1486 chrXV 320174 . T G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.957;DP=135;Dels=0.00;FS=2.195;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=8.36;ReadPosRankSum=-2.225;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1158,0,1511 chrXV 320437 . G A 720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.348;DP=83;Dels=0.00;FS=5.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.311;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.381;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,36:83:99:750,0,1033 chrXV 320726 . G A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.895;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1555,0,1023 chrXV 321352 . C T 1987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.490;DP=162;Dels=0.00;FS=4.629;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=12.27;ReadPosRankSum=-2.382;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,92:162:99:2017,0,1403 chrXV 321368 . A C 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.480;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,80:149:99:1650,0,1465 chrXV 321655 . C G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.389;DP=164;Dels=0.00;FS=3.902;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.740;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.973;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:164:99:1507,0,1860 chrXV 321766 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.548;DP=146;Dels=0.00;FS=6.527;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=7.64;ReadPosRankSum=1.294;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,56:146:99:1145,0,1928 chrXV 321844 . C A 1869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.643;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=2.500;QD=13.35;ReadPosRankSum=-1.327;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,85:140:99:1899,0,1031 chrXV 321972 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.345;DP=109;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=3.4883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1198,0,934 chrXV 322108 . C T 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.096;DP=136;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1434,0,1388 chrXV 322124 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.981;DP=130;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.565;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1262,0,1389 chrXV 322138 . G T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.733;DP=129;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.538;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1397,0,1337 chrXV 322263 . G A 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.516;DP=111;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.351;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1179,0,1202 chrXV 322341 . A G 503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.328;DP=70;Dels=0.00;FS=0.926;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.155;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:533,0,817 chrXV 322691 . G A 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.851;DP=76;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.935;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,39:76:99:792,0,763 chrXV 322692 . G A 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.701;DP=83;Dels=0.00;FS=4.251;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,42:82:99:783,0,825 chrXV 322741 . C T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.639;DP=111;Dels=0.00;FS=5.903;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.042;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1090,0,1188 chrXV 322819 . C T 716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.163;DP=102;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.054;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,39:102:99:746,0,1360 chrXV 323130 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.478;DP=137;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.749;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1407,0,1555 chrXV 323315 . G A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.640;DP=102;Dels=0.00;FS=6.299;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.081;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1130,0,1028 chrXV 323316 . C T 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.170;DP=104;Dels=0.00;FS=9.129;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:996,0,1206 chrXV 323398 . T A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.783;DP=97;Dels=0.00;FS=1.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:956,0,1105 chrXV 323552 . G A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.033;DP=126;Dels=0.00;FS=3.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=2.137;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1228,0,1336 chrXV 323591 . G C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.320;DP=103;Dels=0.00;FS=0.858;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.089;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1116,0,844 chrXV 323813 . C G 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.066;DP=148;Dels=0.00;FS=2.973;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=2.299;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.632;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1528,0,1486 chrXV 323906 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.355;DP=110;Dels=0.00;FS=3.777;HaplotypeScore=4.8820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=9.83;ReadPosRankSum=2.314;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1111,0,1180 chrXV 323974 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.668;DP=126;Dels=0.00;FS=4.283;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.983;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1255,0,1352 chrXV 324302 . T G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.505;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1156,0,1096 chrXV 324679 . T C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.205;DP=110;Dels=0.00;FS=13.490;HaplotypeScore=3.6196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.368;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1180,0,1199 chrXV 324875 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.224;DP=127;Dels=0.00;FS=1.432;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.244;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1337,0,1201 chrXV 325269 . A C 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.814;DP=95;Dels=0.00;FS=5.145;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.391;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:996,0,951 chrXV 325359 . G A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.967;DP=122;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.077;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1412,0,1091 chrXV 325987 . C T 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.326;DP=103;Dels=0.00;FS=4.838;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.745;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:1042,0,1135 chrXV 326239 . G A 806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.884;DP=87;Dels=0.00;FS=7.298;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:836,0,871 chrXV 326267 . T C 734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.890;DP=88;Dels=0.00;FS=5.515;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.563;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:764,0,973 chrXV 326369 . A G 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.037;DP=102;Dels=0.00;FS=15.513;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.29;MQ0=1;MQRankSum=-1.049;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1038,0,1077 chrXV 326393 . A G 636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.997;DP=75;Dels=0.00;FS=7.693;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,34:75:99:666,0,886 chrXV 326413 . A G 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.304;DP=83;Dels=0.00;FS=9.002;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:815,0,927 chrXV 326418 . T C 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.017;DP=83;Dels=0.00;FS=10.943;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.616;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,39:83:99:793,0,947 chrXV 326558 . G A 258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.876;DP=71;Dels=0.00;FS=4.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-7.042;QD=3.63;ReadPosRankSum=-3.287;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:288,0,931 chrXV 326567 . A C 307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.168;DP=71;Dels=0.00;FS=10.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-7.042;QD=4.32;ReadPosRankSum=-1.877;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:337,0,1031 chrXV 326583 . T A 291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;DP=70;Dels=0.00;FS=12.792;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=-7.010;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.122;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,27:70:99:321,0,997 chrXV 326614 . T C 456.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.069;DP=63;Dels=0.00;FS=10.165;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-6.785;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.892;SB=-8.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:486,0,793 chrXV 326619 . A T 496.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.681;DP=58;Dels=0.00;FS=13.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.61;MQ0=0;MQRankSum=-6.512;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.821;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:526,0,711 chrXV 326623 . C A 495.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.924;DP=59;Dels=0.00;FS=10.931;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQ0=0;MQRankSum=-6.557;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.664;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,26:59:99:525,0,715 chrXV 326651 . T C 422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.962;DP=53;Dels=0.00;FS=5.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-5.321;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.211;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:452,0,687 chrXV 326653 . T A 420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.936;DP=53;Dels=0.00;FS=6.047;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-5.195;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.898;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:450,0,699 chrXV 326670 . C T 265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.363;DP=49;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=-3.875;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:295,0,643 chrXV 326879 . G A 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.120;DP=107;Dels=0.00;FS=0.767;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.798;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:107:99:889,0,1322 chrXV 326915 . A G 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.023;DP=110;Dels=0.00;FS=1.603;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:873,0,1251 chrXV 326918 . C G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;DP=105;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=5.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.556;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:940,0,1129 chrXV 327002 . C T 819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.490;DP=82;Dels=0.00;FS=5.944;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=9.99;ReadPosRankSum=2.730;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:849,0,814 chrXV 327020 . T C 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.391;DP=92;Dels=0.00;FS=8.913;HaplotypeScore=3.6347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.256;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:876,0,910 chrXV 327197 . T C 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.851;DP=108;Dels=0.00;FS=9.019;HaplotypeScore=2.4805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1120,0,1206 chrXV 327314 . A C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.367;DP=113;Dels=0.00;FS=7.210;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.434;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1097,0,1116 chrXV 327917 . T C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.281;DP=127;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=2.6938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.190;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:127:99:1122,0,1339 chrXV 328029 . A C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.182;DP=109;Dels=0.00;FS=1.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.132;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1256,0,1010 chrXV 328049 . C T 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.779;DP=126;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=4.9576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.608;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1611,0,1067 chrXV 328373 . C T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.245;DP=136;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.998;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1301,0,1529 chrXV 328457 . C T 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.448;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.576;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:137:99:1500,0,1323 chrXV 328464 . G A 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.629;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.784;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1585,0,1301 chrXV 328714 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.115;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.837;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1451,0,1195 chrXV 328719 . C G 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.576;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1531,0,1150 chrXV 328747 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.115;DP=125;Dels=0.00;FS=2.510;HaplotypeScore=2.2967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.042;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1619,0,1020 chrXV 328791 . C A 3735.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3735,385,0 chrXV 329046 . A T 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.816;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1804,0,1211 chrXV 329473 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.937;DP=151;Dels=0.00;FS=1.315;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.318;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1473,0,1536 chrXV 329561 . C G 3699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3699,390,0 chrXV 330217 . T C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.076;DP=148;Dels=0.00;FS=7.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.878;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1518,0,1519 chrXV 330438 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.741;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1175,0,1017 chrXV 330566 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.781;DP=132;Dels=0.00;FS=1.600;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.655;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1495,0,1195 chrXV 330787 . C G 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;DP=138;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.450;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1229,0,1366 chrXV 330823 . A G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.203;DP=117;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1422,0,1124 chrXV 331119 . A T 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.480;DP=121;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1434,0,1194 chrXV 331262 . T C 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.903;DP=141;Dels=0.00;FS=4.005;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.330;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1218,0,1728 chrXV 331265 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.460;DP=137;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1275,0,1597 chrXV 331409 . G A 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.073;DP=161;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,80:161:99:1671,0,1707 chrXV 331520 . T A 2781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2814,285,0 chrXV 331655 . T A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.277;DP=155;Dels=0.00;FS=1.270;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.776;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:155:99:1464,0,1816 chrXV 331767 . A G 3126 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.05;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3159,327,0 chrXV 331799 . A C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.475;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.492;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1316,0,1280 chrXV 331895 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.408;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=8.47;ReadPosRankSum=-2.646;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:962,0,1407 chrXV 332096 . A T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;DP=123;Dels=0.00;FS=8.223;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.416;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1311,0,1228 chrXV 332111 . G A 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.199;DP=122;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.914;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1307,0,1164 chrXV 332162 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.928;DP=123;Dels=0.00;FS=2.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.223;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1373,0,1161 chrXV 332378 . G A 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.721;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1302,0,1392 chrXV 334926 . A G 2367 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.062e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2400,243,0 chrXV 335413 . A G 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3680,387,0 chrXV 336813 . G A 3802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3802,382,0 chrXV 337020 . T A 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3439,348,0 chrXV 337882 . G A 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3893,391,0 chrXV 337970 . G C 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3928,382,0 chrXV 338019 . A G 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2799;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3442,369,0 chrXV 338412 . G A 2390 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:90:99:2423,255,0 chrXV 339007 . T C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.855;DP=136;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=10.17;ReadPosRankSum=2.156;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1413,0,1296 chrXV 339985 . G A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.487;DP=145;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=9.86;ReadPosRankSum=-2.049;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1460,0,1593 chrXV 340251 . A G 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.216;DP=133;Dels=0.00;FS=7.860;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:133:99:1345,0,1367 chrXV 340281 . T C 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=50.8441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3202,336,0 chrXV 340390 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.739;DP=113;Dels=0.00;FS=5.987;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.397;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1171,0,1213 chrXV 340430 . G C 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;DP=109;Dels=0.00;FS=2.573;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.405;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.645;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:891,0,1398 chrXV 340587 . T G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.376;DP=120;Dels=0.01;FS=0.680;HaplotypeScore=8.8953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=10.93;ReadPosRankSum=3.194;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1342,0,1188 chrXV 340588 . T G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.722;DP=120;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=10.88;ReadPosRankSum=3.374;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1335,0,1172 chrXV 340625 . T C 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=23.73;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3260,345,0 chrXV 340701 . T C 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.870;DP=133;Dels=0.00;FS=7.775;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.088;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1476,0,1373 chrXV 340736 . A G 2482 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2515,270,0 chrXV 340936 . T A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1157,0,1192 chrXV 340969 . G A 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2704,270,0 chrXV 341165 . G A 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.199;DP=109;Dels=0.00;FS=6.086;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.746;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1340,0,999 chrXV 341179 . G A 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.383;DP=95;Dels=0.00;FS=2.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.693;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:881,0,1163 chrXV 341821 . C A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.665;DP=134;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.463;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1207,0,1626 chrXV 342446 . A C 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.033;DP=139;Dels=0.00;FS=7.697;HaplotypeScore=2.6287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.477;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1618,0,1347 chrXV 343177 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.903;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.773;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1237,0,1401 chrXV 343279 . C T 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.263;DP=134;Dels=0.00;FS=2.173;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1558,0,1362 chrXV 343319 . T C 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.693;DP=144;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1706,0,1345 chrXV 343550 . A G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.458;DP=150;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:150:99:1369,0,1845 chrXV 343770 . G A 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.981;DP=158;Dels=0.00;FS=2.844;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.316;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,85:158:99:1782,0,1408 chrXV 343785 . A T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.444;DP=156;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=10.49;ReadPosRankSum=-2.426;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1666,0,1604 chrXV 344423 . T C 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.259;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.82;MQ0=0;MQRankSum=-5.060;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.687;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:840,0,1725 chrXV 344438 . A T 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;DP=139;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.81;MQ0=0;MQRankSum=-8.410;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:978,0,1750 chrXV 344449 . G A 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.398;DP=127;Dels=0.00;FS=3.198;HaplotypeScore=3.7718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQ0=0;MQRankSum=-8.058;QD=7.31;ReadPosRankSum=-1.270;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:958,0,1505 chrXV 344450 . C A 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.085;DP=126;Dels=0.00;FS=2.273;HaplotypeScore=4.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-8.015;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:917,0,1485 chrXV 344470 . T A,G 2661.01 SnpCluster AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=49.95;MQ0=0;QD=21.12;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,46,80:126:99:2721,1784,1670,937,0,724 chrXV 344471 . A G 657.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.761;DP=124;Dels=0.00;FS=10.448;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.77;MQ0=0;MQRankSum=-9.006;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.177;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,45:124:99:687,0,1783 chrXV 344472 . C A 1740.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.750;DP=132;Dels=0.00;FS=3.201;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.77;MQ0=0;MQRankSum=9.470;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.643;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,79:132:99:1770,0,672 chrXV 344488 . T C 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.567;DP=134;Dels=0.00;FS=2.221;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.15;MQ0=0;MQRankSum=-9.173;QD=5.66;ReadPosRankSum=-1.547;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:788,0,1813 chrXV 344505 . G T 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.018;DP=143;Dels=0.00;FS=3.058;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.86;MQ0=0;MQRankSum=-8.357;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,60:142:99:923,0,1760 chrXV 344523 . T C 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.216;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=-7.749;QD=6.41;ReadPosRankSum=1.186;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,63:152:99:1005,0,1954 chrXV 344531 . C G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.184;DP=163;Dels=0.00;FS=4.719;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=-7.370;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1249,0,1760 chrXV 344539 . G C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;DP=152;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.97;MQ0=0;MQRankSum=-6.669;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.093;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:1196,0,1689 chrXV 344620 . G C 1865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;DP=161;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.293;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.420;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,89:161:99:1895,0,1454 chrXV 344777 . T C 483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.830;DP=138;Dels=0.00;FS=3.535;HaplotypeScore=3.1458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQ0=0;MQRankSum=-4.268;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.769;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,37:138:99:513,0,2270 chrXV 344798 . C A 182.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;DP=140;Dels=0.00;FS=12.040;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=4;MQRankSum=-3.280;QD=1.30;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-3.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,23:140:99:212,0,2288 chrXV 344810 . T C 14.18 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.364;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.9439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.56;MQ0=4;MQRankSum=-4.022;QD=0.10;ReadPosRankSum=-1.663;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,16:137:44:44,0,2279 chrXV 344813 . T C 210.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.658;DP=137;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=14.9439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.35;MQ0=4;MQRankSum=-5.597;QD=1.53;ReadPosRankSum=-3.888;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,29:137:99:240,0,2091 chrXV 344846 . T C 25.02 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.297;DP=138;Dels=0.00;FS=11.012;HaplotypeScore=29.6455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.21;MQ0=10;MQRankSum=-2.800;QD=0.18;ReadPosRankSum=3.124;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,13:138:55:55,0,1948 chrXV 344849 . T C 410.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.354;DP=133;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=66.7082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.89;MQ0=10;MQRankSum=-5.043;QD=3.08;ReadPosRankSum=2.849;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,45:133:99:440,0,1455 chrXV 344856 . T C 111.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.581;DP=116;Dels=0.00;FS=6.157;HaplotypeScore=94.0755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.87;MQ0=10;MQRankSum=-1.666;QD=0.96;ReadPosRankSum=4.411;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,13:116:99:141,0,1464 chrXV 344865 . T A 371.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.963;DP=104;Dels=0.00;FS=17.505;HaplotypeScore=84.2310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.79;MQ0=10;MQRankSum=0.190;QD=3.57;ReadPosRankSum=1.238;SB=-1.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,27:104:99:401,0,573 chrXV 344866 . T C 280.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.194;DP=99;Dels=0.00;FS=20.363;HaplotypeScore=83.2363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.44;MQ0=10;MQRankSum=0.589;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.771;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,26:99:99:310,0,860 chrXV 344872 . T A 235.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;DP=106;Dels=0.00;FS=39.545;HaplotypeScore=62.3642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.79;MQ0=10;MQRankSum=-0.949;QD=2.22;ReadPosRankSum=3.767;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:265,0,915 chrXV 344882 . T C 254.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.853;DP=94;Dels=0.00;FS=16.105;HaplotypeScore=10.8445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.02;MQ0=8;MQRankSum=1.308;QD=2.70;ReadPosRankSum=3.933;SB=-1.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,35:94:99:284,0,700 chrXV 344884 . G A 271.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.789;DP=94;Dels=0.00;FS=37.793;HaplotypeScore=10.8277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.02;MQ0=8;MQRankSum=0.405;QD=2.88;ReadPosRankSum=3.669;SB=-3.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:94:99:301,0,675 chrXV 344901 . G A 764.76 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.484;DP=67;Dels=0.00;FS=5.738;HaplotypeScore=7.2899;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.06;MQ0=5;MQRankSum=3.561;QD=11.41;ReadPosRankSum=3.023;SB=-4.753e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,51:67:6:796,6,0 chrXV 344907 . C T 236.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.006;DP=63;Dels=0.00;FS=10.606;HaplotypeScore=4.9005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.58;MQ0=5;MQRankSum=2.988;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.509;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:266,0,473 chrXV 344910 . A G 211.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.685;DP=62;Dels=0.00;FS=10.823;HaplotypeScore=3.9111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.36;MQ0=5;MQRankSum=0.691;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.220;SB=-6.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:241,0,500 chrXV 344917 . G A 235.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.635;DP=61;Dels=0.00;FS=6.396;HaplotypeScore=9.7401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.09;MQ0=4;MQRankSum=1.488;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.505;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:265,0,531 chrXV 344920 . G T 230.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.093;DP=63;Dels=0.00;FS=12.936;HaplotypeScore=16.6476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.32;MQ0=3;MQRankSum=0.076;QD=3.65;ReadPosRankSum=-1.414;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:260,0,610 chrXV 344921 . T C 544.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.332;DP=61;Dels=0.00;FS=9.245;HaplotypeScore=16.6476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.45;MQ0=3;MQRankSum=-1.940;QD=8.92;ReadPosRankSum=3.245;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,43:61:99:574,0,250 chrXV 344928 . T C 186.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.649;DP=47;Dels=0.00;FS=4.590;HaplotypeScore=74.8683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=3.96;ReadPosRankSum=-3.627;SB=-5.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:216,0,574 chrXV 344944 . T A 228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;DP=53;Dels=0.00;FS=2.449;HaplotypeScore=18.2016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.79;MQ0=0;MQRankSum=-4.428;QD=4.30;ReadPosRankSum=3.319;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:258,0,562 chrXV 344954 . T C 285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.705;DP=56;Dels=0.00;FS=9.871;HaplotypeScore=10.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.134;QD=5.09;ReadPosRankSum=-2.785;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:315,0,576 chrXV 344956 . G A 214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.902;DP=58;Dels=0.00;FS=1.061;HaplotypeScore=10.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.03;MQ0=0;MQRankSum=-4.065;QD=3.69;ReadPosRankSum=-2.233;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:244,0,676 chrXV 344973 . G A 180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.199;DP=64;Dels=0.00;FS=8.419;HaplotypeScore=15.4541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.27;MQ0=0;MQRankSum=-4.788;QD=2.81;ReadPosRankSum=-2.204;SB=-2.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:210,0,886 chrXV 344979 . C T 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;DP=72;Dels=0.00;FS=3.884;HaplotypeScore=19.4639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.47;MQ0=2;MQRankSum=-2.193;QD=0.21;ReadPosRankSum=-3.230;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,7:72:45:45,0,1104 chrXV 344999 . C T 1121.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.011;DP=85;Dels=0.00;FS=1.040;HaplotypeScore=5.2970;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.48;MQ0=5;MQRankSum=3.869;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,67:85:28:1154,28,0 chrXV 345029 . T C 61.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.333;DP=105;Dels=0.00;FS=6.695;HaplotypeScore=8.5207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.10;MQ0=8;MQRankSum=-0.139;QD=0.58;ReadPosRankSum=-3.023;SB=-3.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,14:105:91:91,0,1087 chrXV 345052 . T A 133.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.023;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.41;MQ0=8;MQRankSum=-0.178;QD=1.16;ReadPosRankSum=-2.772;SB=-1.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,23:115:99:163,0,1150 chrXV 345062 . T C 212.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.850;DP=120;Dels=0.00;FS=3.164;HaplotypeScore=1.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.35;MQ0=8;MQRankSum=-0.150;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-1.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,27:120:99:242,0,1170 chrXV 345064 . G A 222.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.787;DP=125;Dels=0.00;FS=4.473;HaplotypeScore=1.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.84;MQ0=9;MQRankSum=-0.327;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.346;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,28:125:99:252,0,1194 chrXV 345081 . G A,T 2245.01 SnpCluster;filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.813;DP=141;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=40.95;MQ0=7;MQRankSum=4.322;QD=15.92;ReadPosRankSum=2.062;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:13,42,86:141:99:2305,1545,1477,741,0,583 chrXV 345082 . C T 1531.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.611;DP=142;Dels=0.00;FS=7.210;HaplotypeScore=12.8187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.42;MQ0=7;MQRankSum=5.342;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,87:142:99:1561,0,563 chrXV 345087 . C T 609.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.977;DP=143;Dels=0.00;FS=15.073;HaplotypeScore=11.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.96;MQ0=6;MQRankSum=-3.990;QD=4.26;ReadPosRankSum=2.055;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,45:143:99:639,0,1604 chrXV 345090 . A G 498.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.380;DP=144;Dels=0.00;FS=11.536;HaplotypeScore=10.5042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.66;MQ0=6;MQRankSum=-4.728;QD=3.46;ReadPosRankSum=2.884;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,45:144:99:528,0,1762 chrXV 345097 . G A 578.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.591;DP=149;Dels=0.00;FS=20.849;HaplotypeScore=2.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.39;MQ0=4;MQRankSum=-5.699;QD=3.88;ReadPosRankSum=3.312;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,46:149:99:608,0,1917 chrXV 345100 . G T 558.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.980;DP=146;Dels=0.00;FS=19.066;HaplotypeScore=3.6347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.74;MQ0=3;MQRankSum=-5.678;QD=3.82;ReadPosRankSum=3.236;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,45:146:99:588,0,1863 chrXV 345101 . T C 542.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.245;DP=145;Dels=0.00;FS=19.131;HaplotypeScore=3.6347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.90;MQ0=2;MQRankSum=-5.875;QD=3.74;ReadPosRankSum=2.962;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,46:145:99:572,0,1926 chrXV 345108 . T C 637.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.522;DP=146;Dels=0.00;FS=17.560;HaplotypeScore=5.5278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-7.265;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.571;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,51:146:99:667,0,2026 chrXV 345111 . C T 657.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.742;DP=146;Dels=0.00;FS=19.533;HaplotypeScore=4.6119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.27;MQ0=0;MQRankSum=-7.146;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.115;SB=-1.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,51:146:99:687,0,1901 chrXV 345165 . C T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.643;DP=133;Dels=0.00;FS=12.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.89;MQ0=0;MQRankSum=-5.473;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.782;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1195,0,1473 chrXV 345177 . T C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.066;DP=132;Dels=0.00;FS=14.412;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.563;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.053;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1292,0,1436 chrXV 345183 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.479;DP=130;Dels=0.00;FS=11.042;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.801;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1289,0,1294 chrXV 345678 . C T 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.901;DP=152;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1509,0,1561 chrXV 345689 . T C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.444;DP=140;Dels=0.00;FS=5.414;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.096;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1176,0,1674 chrXV 345954 . C T 1906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.143;DP=153;Dels=0.00;FS=5.939;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.094;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,85:153:99:1936,0,1369 chrXV 345964 . T C 1782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.456;DP=149;Dels=0.00;FS=4.841;HaplotypeScore=2.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.063;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1812,0,1438 chrXV 346309 . A G 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.239;DP=126;Dels=0.00;FS=6.792;HaplotypeScore=4.9405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:126:99:1301,0,1038 chrXV 346416 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.614;DP=128;Dels=0.00;FS=1.462;HaplotypeScore=4.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=9.16;ReadPosRankSum=2.047;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:128:99:1203,0,1266 chrXV 346417 . G A 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.482;DP=128;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=4.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=9.20;ReadPosRankSum=2.190;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1208,0,1372 chrXV 346438 . A G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.522;DP=139;Dels=0.00;FS=7.119;HaplotypeScore=5.7541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.452;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1300,0,1469 chrXV 346486 . A G 549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;DP=85;Dels=0.00;FS=4.286;HaplotypeScore=31.3843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.189;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:99:579,0,816 chrXV 346506 . T A 649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.489;DP=93;Dels=0.00;FS=27.487;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.57;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=6.98;ReadPosRankSum=-4.319;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:679,0,945 chrXV 346509 . C T 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.688;DP=92;Dels=0.00;FS=28.129;HaplotypeScore=18.8977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.180;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:937,0,657 chrXV 346519 . G A 117.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.432;DP=88;Dels=0.00;FS=11.667;HaplotypeScore=18.8946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.01;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=1.33;ReadPosRankSum=2.627;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:147,0,1465 chrXV 346525 . G A 388.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.451;DP=79;Dels=0.00;FS=24.828;HaplotypeScore=19.4729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=4.91;ReadPosRankSum=-5.634;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:418,0,1019 chrXV 346528 . G A 241.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.001;DP=73;Dels=0.00;FS=31.207;HaplotypeScore=48.1903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.901;QD=3.30;ReadPosRankSum=-5.279;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:271,0,1043 chrXV 346531 . A G 47.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.757;DP=69;Dels=0.00;FS=16.480;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.939;QD=0.68;ReadPosRankSum=-4.852;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,12:69:77:77,0,1092 chrXV 347109 . C A 1714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.246;DP=169;Dels=0.00;FS=3.823;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.209;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,84:169:99:1744,0,1817 chrXV 347473 . C T 1866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.732;DP=151;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=3.6819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.513;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,86:151:99:1896,0,1309 chrXV 347505 . G A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.727;DP=139;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=11.98;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1695,0,1223 chrXV 347793 . A G 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3255,342,0 chrXV 348039 . G T 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.295;DP=136;Dels=0.01;FS=5.491;HaplotypeScore=9.6560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.958;QD=13.16;ReadPosRankSum=1.754;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,81:135:99:1820,0,1043 chrXV 348182 . A G 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3140,321,0 chrXV 348449 . A G 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.201;DP=137;Dels=0.00;FS=13.944;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.437;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1480,0,1442 chrXV 348935 . G A 4822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.92;SB=-2.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:186:99:4822,463,0 chrXV 349076 . A G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.720;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1585,0,1754 chrXV 349081 . G T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.968;DP=156;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=4.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.902;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1619,0,1698 chrXV 349153 . G C 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.631;DP=113;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=2.774;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:944,0,1441 chrXV 349164 . T C 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3183,339,0 chrXV 349188 . A C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.643;DP=119;Dels=0.00;FS=8.909;HaplotypeScore=4.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.492;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1101,0,1437 chrXV 349292 . T G 1853.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.060;DP=164;Dels=0.00;FS=7.380;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=1;MQRankSum=1.196;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.169;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,90:164:99:1883,0,1362 chrXV 349427 . T A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;DP=164;Dels=0.00;FS=11.224;HaplotypeScore=4.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.407;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,76:164:99:1509,0,1965 chrXV 349515 . C T 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.477;DP=100;Dels=0.00;FS=1.623;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:715,0,1233 chrXV 349766 . G T 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3112,315,0 chrXV 349987 . A C 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3262,333,0 chrXV 350020 . A G 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.648e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3226,333,0 chrXV 350053 . A G 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2718,288,0 chrXV 350129 . C T 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2765,279,0 chrXV 350275 . T A 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2675,270,0 chrXV 350302 . C G 2512 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.63;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2545,270,0 chrXV 350368 . C T 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3229,319,0 chrXV 350863 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.576;DP=105;Dels=0.00;FS=11.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.536;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1171,0,976 chrXV 351070 . C T 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.847;DP=153;Dels=0.00;FS=2.151;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.257;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1584,0,1590 chrXV 351238 . G T 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.607;DP=146;Dels=0.00;FS=8.707;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.365;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1688,0,1305 chrXV 351265 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.097;DP=122;Dels=0.00;FS=4.459;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1187,0,1398 chrXV 351325 . C A 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.919;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1583,0,1479 chrXV 351470 . A G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.713;DP=169;Dels=0.00;FS=2.753;HaplotypeScore=5.2193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=2.379;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.088;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,70:169:99:1236,0,2228 chrXV 351541 . C T 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.129;DP=125;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=4.5482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.530;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,46:125:99:823,0,1653 chrXV 351607 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.887;DP=167;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.246;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,74:167:99:1514,0,2003 chrXV 351661 . T C 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.557;DP=157;Dels=0.00;FS=2.910;HaplotypeScore=4.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.431;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,80:157:99:1675,0,1693 chrXV 351721 . A G 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.798;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.145;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1678,0,1515 chrXV 351780 . T C 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.723;DP=144;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=4.8653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.475;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,81:144:99:1599,0,1264 chrXV 351787 . C T 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.919;DP=132;Dels=0.00;FS=5.247;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=11.97;ReadPosRankSum=1.807;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1610,0,1203 chrXV 351845 . A G 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.289;DP=135;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1520,0,1318 chrXV 351979 . T C 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.099;DP=125;Dels=0.00;FS=6.771;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.055;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1273,0,1275 chrXV 352012 . C T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.104;DP=108;Dels=0.00;FS=8.899;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.621;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1119,0,1093 chrXV 352075 . T C 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.386;DP=134;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=3.6433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.633;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,79:134:99:1615,0,1135 chrXV 352138 . G A 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.767;DP=139;Dels=0.00;FS=3.108;HaplotypeScore=5.0389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.580;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1547,0,1263 chrXV 352379 . C T 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.302;DP=116;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.512;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,65:116:99:1420,0,1003 chrXV 352665 . A G 3970.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3970,417,0 chrXV 352707 . T G 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.224;DP=143;Dels=0.00;FS=3.146;HaplotypeScore=8.5062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,84:143:99:1639,0,1207 chrXV 352775 . A G 1730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.901;DP=141;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.879;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1760,0,1237 chrXV 352864 . G A 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.203;DP=133;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.057;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1506,0,1248 chrXV 353226 . C G 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3150,321,0 chrXV 353934 . C T 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.819;DP=131;Dels=0.00;FS=2.601;HaplotypeScore=9.2623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1596,0,1222 chrXV 354129 . T C 584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.772;DP=94;Dels=0.00;FS=2.012;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.410;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,37:94:99:614,0,1273 chrXV 354156 . G A 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.255;DP=120;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=3.2355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:120:99:1224,0,1250 chrXV 354230 . C G 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.173;DP=126;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.351;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1591,0,1002 chrXV 354233 . A G 3051 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7663;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.139e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3084,306,0 chrXV 354288 . A G 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2953,300,0 chrXV 354569 . C T 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3182,315,0 chrXV 354577 . G A 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3205,313,0 chrXV 354657 . T C 2574 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.54;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2607,279,0 chrXV 354680 . A T 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.32;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2519,258,0 chrXV 354739 . T C 2299 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=24.46;ReadPosRankSum=1.437;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:2332,243,0 chrXV 354846 . A T 1992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.90;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2025,210,0 chrXV 354963 . G A 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.354;DP=84;Dels=0.00;FS=4.167;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,46:84:99:988,0,785 chrXV 355038 . G A 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.710;DP=86;Dels=0.00;FS=0.843;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.165;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,39:86:99:839,0,967 chrXV 355424 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.684;DP=115;Dels=0.00;FS=2.510;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1092,0,1342 chrXV 355477 . A G 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3079,324,0 chrXV 355517 . C T 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.35;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3282,336,0 chrXV 355645 . A T 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3089,309,0 chrXV 355779 . A G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.132;DP=118;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.329;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1132,0,1400 chrXV 355841 . G A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.512;DP=112;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1110,0,1231 chrXV 355981 . G A 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3025,312,0 chrXV 356056 . T A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.190;DP=131;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.109;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1233,0,1510 chrXV 356119 . T G 2643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.17;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2676,276,0 chrXV 356150 . C T 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.895;DP=117;Dels=0.00;FS=2.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=1;MQRankSum=-0.219;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.353;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1175,0,1245 chrXV 356384 . A G 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.578;DP=127;Dels=0.00;FS=1.597;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.317;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1421,0,1277 chrXV 356416 . T C 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.165;DP=100;Dels=0.00;FS=1.773;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.528;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1091,0,1014 chrXV 356505 . C T 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2627,264,0 chrXV 356560 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.393;DP=104;Dels=0.00;FS=2.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.853;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1138,0,1100 chrXV 356783 . G A 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.642;DP=129;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.257;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1390,0,1327 chrXV 357029 . C T 2745 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2778,285,0 chrXV 357107 . T C 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.484;DP=141;Dels=0.00;FS=5.143;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.89;ReadPosRankSum=-2.310;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1565,0,1413 chrXV 357164 . A G 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:2840,303,0 chrXV 357194 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.711;DP=111;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.473;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:918,0,1399 chrXV 357276 . A G 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=24.22;SB=-1.331e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3061,330,0 chrXV 357287 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.433;DP=125;Dels=0.00;FS=5.543;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1092,0,1414 chrXV 357367 . C T 2610 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.10;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2643,267,0 chrXV 357437 . C A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;DP=105;Dels=0.00;FS=4.149;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=1;MQRankSum=1.032;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.176;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:992,0,1226 chrXV 357574 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.136;DP=134;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=2.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1183,0,1619 chrXV 357894 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.357;DP=143;Dels=0.00;FS=2.131;HaplotypeScore=3.7396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.815;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1381,0,1713 chrXV 357984 . G A 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3283,328,0 chrXV 357991 . T C 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3001,318,0 chrXV 358111 . A C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=23.85;SB=-9.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2967,309,0 chrXV 358116 . C T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.644;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.994;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1187,0,1233 chrXV 358252 . T A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.860;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.920;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1501,0,1423 chrXV 358597 . A G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.495;DP=101;Dels=0.00;FS=5.105;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.460;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1153,0,975 chrXV 359068 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.179;DP=138;Dels=0.00;FS=1.359;HaplotypeScore=3.3036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.722;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.360;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:138:99:1352,0,1521 chrXV 359602 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.817;DP=114;Dels=0.00;FS=2.380;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.792;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1183,0,1226 chrXV 359899 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.067;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1440,0,1344 chrXV 360479 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.603;DP=154;Dels=0.00;FS=8.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.939;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1611,0,1504 chrXV 360593 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.941;DP=162;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=3.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:1313,0,2036 chrXV 360797 . C T 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3319,337,0 chrXV 360995 . T A 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3385,345,0 chrXV 361051 . T C 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.299;DP=125;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.739;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1085,0,1513 chrXV 361401 . T C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.305;DP=131;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.453;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1362,0,1391 chrXV 361461 . C A,G 2530.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.21;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,55,54:109:99:2590,1238,1081,1352,0,1202 chrXV 361558 . A T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.628;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1406,0,1227 chrXV 361719 . A G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.383;DP=113;Dels=0.00;FS=3.568;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=10.43;ReadPosRankSum=-2.392;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1209,0,1237 chrXV 361741 . G A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.158;DP=110;Dels=0.00;FS=1.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=-1.154;QD=8.52;ReadPosRankSum=2.317;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,45:110:99:967,0,1416 chrXV 361759 . G A 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.106;DP=108;Dels=0.00;FS=4.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=1;MQRankSum=0.349;QD=8.91;ReadPosRankSum=2.111;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:992,0,1361 chrXV 362126 . A G 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.674;DP=100;Dels=0.00;FS=1.805;HaplotypeScore=3.7691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.841;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,60:100:99:1136,0,797 chrXV 362429 . G C 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;DP=106;Dels=0.00;FS=4.823;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=1;MQRankSum=-0.670;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:907,0,1179 chrXV 363346 . T C 647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.030;DP=111;Dels=0.00;FS=4.977;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=5.83;ReadPosRankSum=-1.025;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,39:111:99:677,0,1667 chrXV 363397 . A G 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.934;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.200;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,52:144:99:891,0,1956 chrXV 363413 . T A 1966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.259;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.038;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,95:149:99:1996,0,1012 chrXV 363553 . A G 1734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1767,186,0 chrXV 363824 . G A 2497 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.28;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2530,255,0 chrXV 363851 . G A 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.823;DP=105;Dels=0.00;FS=0.747;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.954;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,41:105:99:842,0,1423 chrXV 363974 . C A 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3097,313,0 chrXV 364072 . T C 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.980;DP=92;Dels=0.00;FS=0.797;HaplotypeScore=3.3060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.380;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:1062,0,966 chrXV 364095 . A G 2496 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.27;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2529,273,0 chrXV 364302 . T A 3011 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3044,306,0 chrXV 364509 . G A 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.142;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6386;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=25.55;ReadPosRankSum=1.708;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3603,369,0 chrXV 364586 . T A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.919;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.566;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1318,0,1051 chrXV 364772 . G A 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.010;DP=89;Dels=0.01;FS=0.916;HaplotypeScore=2.8290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.194;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:921,0,903 chrXV 364854 . C T 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2828,276,0 chrXV 364961 . C T 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.786;DP=129;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=8.80;ReadPosRankSum=2.314;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1165,0,1361 chrXV 365208 . G A 2388 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2421,246,0 chrXV 365560 . G A 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.931;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.625;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1305,0,1266 chrXV 365700 . A G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.212;DP=129;Dels=0.00;FS=6.775;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.225;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1428,0,1239 chrXV 365792 . T C 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2840,303,0 chrXV 365917 . G A 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2872,294,0 chrXV 366010 . A G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.293;DP=124;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.001;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1209,0,1401 chrXV 366186 . A G 2923 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2956,327,0 chrXV 366204 . A G 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.895;DP=129;Dels=0.00;FS=5.319;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.800;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1464,0,1273 chrXV 366395 . G T 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.715;DP=106;Dels=0.00;FS=6.843;HaplotypeScore=3.9408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:961,0,1194 chrXV 366495 . T C 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3690,399,0 chrXV 366618 . C T 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3206,333,0 chrXV 366628 . A G 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.053;DP=99;Dels=0.00;FS=4.042;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.768;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1084,0,949 chrXV 366780 . C T 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2900,297,0 chrXV 366884 . C T 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3322,328,0 chrXV 366982 . T C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.568;DP=137;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.024;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1417,0,1528 chrXV 367187 . T G 2123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1907;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=21.23;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:100:99:2156,234,0 chrXV 367217 . C T 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2974,315,0 chrXV 367255 . G A 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.795;DP=101;Dels=0.00;FS=6.406;HaplotypeScore=4.0642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.663;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:835,0,1208 chrXV 367258 . G A 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.30;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2682,282,0 chrXV 367288 . A G 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:105:99:2812,291,0 chrXV 367292 . T C 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2868,303,0 chrXV 367410 . T C 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2739,297,0 chrXV 367673 . A G 2372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=1;QD=25.23;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2405,258,0 chrXV 367742 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.751;DP=125;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=1;MQRankSum=0.133;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1339,0,1211 chrXV 367959 . A T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.193;DP=142;Dels=0.00;FS=2.118;HaplotypeScore=2.5664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=10.35;ReadPosRankSum=4.103;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1499,0,1631 chrXV 368025 . A G 3695.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6865;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3695,369,0 chrXV 368035 . G C 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.577;DP=140;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=11.77;ReadPosRankSum=2.194;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:140:99:1678,0,1121 chrXV 368190 . C T 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.932;DP=105;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1367,0,905 chrXV 368375 . C T 1924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.432;DP=167;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=11.52;ReadPosRankSum=2.140;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,88:167:99:1954,0,1559 chrXV 368402 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.490;DP=164;Dels=0.00;FS=1.365;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.591;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,74:164:99:1496,0,1819 chrXV 368964 . A C 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.060;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1174,0,1255 chrXV 369030 . G A 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.604;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:912,0,856 chrXV 369163 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.348;DP=124;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=8.44;ReadPosRankSum=-2.344;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1076,0,1373 chrXV 369165 . C T 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3263,336,0 chrXV 369329 . A G 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.472;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3042,318,0 chrXV 369380 . C T 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3073,324,0 chrXV 369488 . C T 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3229,336,0 chrXV 369542 . C T 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3220,321,0 chrXV 369848 . T G 2751 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2784,303,0 chrXV 369905 . C T 4040.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.93;SB=-2.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4040,412,0 chrXV 370126 . G A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.902;DP=128;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.023;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1459,0,1222 chrXV 370186 . G A 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.35;SB=-9.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3042,312,0 chrXV 370229 . T C 2390 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.16;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2423,264,0 chrXV 370296 . T C 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.939;DP=113;Dels=0.00;FS=1.645;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.148;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:933,0,1310 chrXV 371014 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.748;DP=124;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1202,0,1283 chrXV 371124 . G A 1836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=13.30;ReadPosRankSum=-3.224;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,82:138:99:1866,0,1121 chrXV 371158 . A G 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3278,336,0 chrXV 371246 . A G 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.256;DP=106;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=7.4211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.956;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1149,0,644 chrXV 371543 . G T 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3641,376,0 chrXV 371632 . G C 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3579,387,0 chrXV 372056 . C T 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2874,288,0 chrXV 372211 . T C 2169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.125e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2202,237,0 chrXV 372255 . T G 2827 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.017e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2860,297,0 chrXV 372266 . C T 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2854,282,0 chrXV 372353 . C T 2151 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.72;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2184,222,0 chrXV 372369 . G T 676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;DP=79;Dels=0.00;FS=7.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=8.56;ReadPosRankSum=-1.260;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:706,0,814 chrXV 372375 . G T 1883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=24.78;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1916,192,0 chrXV 372460 . T C 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2834,288,0 chrXV 372477 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.739;DP=119;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=3.4539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=2.212;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.686;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1112,0,1324 chrXV 372557 . A G 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2467,267,0 chrXV 372664 . T A 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;DP=101;Dels=0.00;FS=7.273;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.988;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1080,0,1073 chrXV 372761 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.035;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.323;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1187,0,1463 chrXV 373459 . T A 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.819;DP=138;Dels=0.00;FS=4.082;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.093;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:138:99:1192,0,1768 chrXV 373468 . G T 3823.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.889e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3823,379,0 chrXV 373539 . A G 2357 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.90;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2390,252,0 chrXV 373552 . A G 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3336,333,0 chrXV 373586 . T C 3492.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3492,342,0 chrXV 373701 . G A 3943.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3943,400,0 chrXV 374373 . G A 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3591,358,0 chrXV 374442 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2922,306,0 chrXV 374481 . C T 2345 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2378,243,0 chrXV 374598 . C G 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.66;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3115,330,0 chrXV 374613 . C T 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3925;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3438,343,0 chrXV 374669 . G A 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3111,307,0 chrXV 374709 . G T 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3436,337,0 chrXV 374751 . G A 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3187,319,0 chrXV 374763 . T C 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3006,318,0 chrXV 374879 . C T 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.684;DP=145;Dels=0.00;FS=3.163;HaplotypeScore=9.4465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.541;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,144:145:99:3730,339,0 chrXV 374882 . T A 3562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=147;Dels=0.00;FS=3.161;HaplotypeScore=7.4491;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=24.23;ReadPosRankSum=1.402;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,146:147:99:3562,346,0 chrXV 375158 . A G 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3215,324,0 chrXV 375226 . A T 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;DP=105;Dels=0.00;FS=18.850;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1100,0,1133 chrXV 375315 . G A 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3145,315,0 chrXV 375420 . T C 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2692,300,0 chrXV 375457 . A C 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.094;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.458;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,73:121:99:1500,0,978 chrXV 375648 . C T 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3793,370,0 chrXV 375894 . C A 3101 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3134,318,0 chrXV 376190 . C A 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3634,364,0 chrXV 376252 . C T 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.87;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3880,402,0 chrXV 376371 . T C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.132;DP=113;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1307,0,1066 chrXV 376576 . G A 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3440,352,0 chrXV 376674 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.368;DP=108;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.494;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1078,0,1234 chrXV 376957 . G A 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3110,318,0 chrXV 377032 . T C 2554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=24.32;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2587,276,0 chrXV 377037 . G A 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2663,264,0 chrXV 377072 . T C 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.389;DP=121;Dels=0.00;FS=5.637;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1245,0,1245 chrXV 377174 . C G 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2931,306,0 chrXV 377281 . G A 4326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.38;SB=-2.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4326,436,0 chrXV 377284 . A G 4237.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.15;SB=-2.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4237,438,0 chrXV 377515 . C T 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.632;DP=126;Dels=0.00;FS=7.261;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.626;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,49:126:99:955,0,1642 chrXV 377548 . G A 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3798,378,0 chrXV 377605 . C T 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.656e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3380,349,0 chrXV 377656 . G A 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4076,409,0 chrXV 377730 . C T 3948.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7223;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.31;SB=-2.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3948,411,0 chrXV 377760 . G A 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3675,370,0 chrXV 377877 . T C 3469.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.60;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3469,363,0 chrXV 377924 . T C 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3597,372,0 chrXV 378043 . T A 3650.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.105e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3650,367,0 chrXV 378090 . G A 4160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4160,418,0 chrXV 378122 . C G 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3560,384,0 chrXV 378126 . T C 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3664,399,0 chrXV 378233 . G A 2139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.93;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:113:99:2172,234,0 chrXV 378285 . T C 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=23.27;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2919,306,0 chrXV 378723 . T C 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3721,381,0 chrXV 378827 . C T 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3402,342,0 chrXV 378890 . A G 3946.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3946,408,0 chrXV 378902 . C T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.150;DP=154;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1553,0,1691 chrXV 379161 . C T 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.69;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3076,312,0 chrXV 379178 . T C 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=25.46;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2859,300,0 chrXV 379232 . A C 3873.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3873,396,0 chrXV 379268 . G A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.057;DP=141;Dels=0.00;FS=8.659;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1359,0,1499 chrXV 379289 . A G 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3018,303,0 chrXV 379310 . G T 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3416,345,0 chrXV 379448 . T C 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.646;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.757;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,50:122:99:981,0,1565 chrXV 379461 . C T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.424;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.938;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:1105,0,1619 chrXV 379502 . C T 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.363;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:821,0,1291 chrXV 379747 . G C 3890.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2446;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:3890,390,0 chrXV 379841 . C T 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3520,361,0 chrXV 379848 . A G 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3421,354,0 chrXV 379879 . C T 4148.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.09;SB=-2.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4148,415,0 chrXV 379978 . C T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3605,369,0 chrXV 380023 . T C 3137 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.50;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3170,327,0 chrXV 380143 . T C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.135;DP=150;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=9.8949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.687;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1324,0,1610 chrXV 380192 . G C 4036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=23.74;SB=-2.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4036,412,0 chrXV 380297 . C A 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7016;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=21.80;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2627,276,0 chrXV 380309 . C A 2434 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.81;MQ0=0;QD=17.77;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:2467,261,0 chrXV 380446 . T C 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8082;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3692,381,0 chrXV 380513 . T C 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6250;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3752,366,0 chrXV 380677 . A G 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.66;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2829,294,0 chrXV 380683 . T C 2505 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.50;MQ0=0;QD=21.05;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2538,270,0 chrXV 380689 . G T 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.92;MQ0=0;QD=23.51;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2901,300,0 chrXV 380728 . C T 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3038,312,0 chrXV 380751 . A G 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3449,366,0 chrXV 380814 . G A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.771;DP=129;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.871;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,49:129:99:1010,0,1687 chrXV 380935 . G C 2415 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.312;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=24.15;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2448,267,0 chrXV 380964 . A G 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3115,324,0 chrXV 381124 . G C 3991.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5009;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:155:99:3991,417,0 chrXV 381361 . G A 4471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.61;SB=-2.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4471,439,0 chrXV 381445 . G A 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3104,312,0 chrXV 381487 . A G 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.699;DP=104;Dels=0.00;FS=3.638;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.599;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:104:99:2700,276,0 chrXV 381497 . C G 2469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=24.45;ReadPosRankSum=1.698;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:2502,273,0 chrXV 381556 . A G 1262 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.655;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=24.2174;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.375;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,73:74:99:1295,144,0 chrXV 381571 . T C 1236 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.0268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.53;MQ0=0;QD=10.39;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:1269,138,0 chrXV 381739 . C T 2435 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2468,249,0 chrXV 381777 . A G 1437 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=22.81;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1470,153,0 chrXV 382144 . C T 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3082,306,0 chrXV 382459 . A G 3599.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.861e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3599,366,0 chrXV 382531 . A G 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3847,402,0 chrXV 382535 . G A 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3837,394,0 chrXV 382582 . C T 4065.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.10;SB=-2.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4065,412,0 chrXV 382678 . G A 2988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=1;QD=26.44;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3021,306,0 chrXV 382816 . C T 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:129:99:3316,318,0 chrXV 382819 . C T 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.283;DP=124;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.851;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1147,0,1441 chrXV 383156 . C T 1805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=19.84;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:1838,192,0 chrXV 383527 . A T 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2971,303,0 chrXV 383827 . C T 3959.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3959,394,0 chrXV 383867 . G C 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.67;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3306,366,0 chrXV 383951 . T C 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.685;DP=151;Dels=0.00;FS=0.599;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.534;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1535,0,1475 chrXV 383991 . A G 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.890e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3982,399,0 chrXV 384208 . C T 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3462,334,0 chrXV 384292 . A G 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.960;DP=148;Dels=0.00;FS=2.954;HaplotypeScore=5.7298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.335;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,61:148:99:1052,0,1939 chrXV 384314 . G T 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3330,348,0 chrXV 384316 . A G 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3284,354,0 chrXV 384545 . T C 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.90;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3524,363,0 chrXV 384569 . A G 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.689;DP=127;Dels=0.00;FS=1.541;HaplotypeScore=2.7648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.85;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1186,0,1391 chrXV 384592 . C A 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.654;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.88;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.576;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3529,358,0 chrXV 384665 . A G 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.71;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3315,372,0 chrXV 384669 . A G 3110 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.04;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3143,351,0 chrXV 384678 . T C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.80;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2931,327,0 chrXV 384696 . A G 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.28;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2964,336,0 chrXV 384702 . G A 3049 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.15;MQ0=0;QD=24.39;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3082,333,0 chrXV 384732 . T A 2056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.96;MQ0=0;QD=23.10;SB=-1.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2089,228,0 chrXV 384747 . A G 2030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.33;MQ0=0;QD=22.56;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2063,234,0 chrXV 384775 . C T 1985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.42;MQ0=0;QD=22.30;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2018,222,0 chrXV 384785 . C A 1864 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.85;MQ0=0;QD=22.19;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1897,210,0 chrXV 384786 . G A 1930 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.58;MQ0=0;QD=22.18;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1963,219,0 chrXV 384791 . G C 1831 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.22;MQ0=0;QD=20.57;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1864,216,0 chrXV 384864 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.675;DP=109;Dels=0.00;FS=2.706;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.785;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,64:109:99:1290,0,704 chrXV 384919 . C A 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.18;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3090,315,0 chrXV 384942 . A G 2578 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.78;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2611,270,0 chrXV 384993 . G A 1366 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.22;MQ0=0;QD=22.03;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1399,153,0 chrXV 384994 . A G 1349 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.22;MQ0=0;QD=21.76;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1382,153,0 chrXV 385004 . G A 1546 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.59;MQ0=0;QD=24.54;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:63:99:1579,168,0 chrXV 385035 . C T 1283 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.59;MQ0=0;QD=22.91;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:56:99:1316,147,0 chrXV 385049 . A T 1248 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.43;MQ0=0;QD=22.29;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1281,147,0 chrXV 385051 . C T 1269 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.43;MQ0=0;QD=22.66;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1302,147,0 chrXV 385066 . G A 1241 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.31;MQ0=0;QD=20.02;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1274,153,0 chrXV 385067 . A G 1233 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.95;MQ0=0;QD=17.87;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1266,153,0 chrXV 385112 . C T 2587 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.92;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2620,279,0 chrXV 385137 . C G 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;DP=101;Dels=0.00;FS=2.628;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:846,0,1158 chrXV 385189 . C T 1243 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.77;MQ0=0;QD=22.60;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1276,141,0 chrXV 385199 . T C 1261 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.97;MQ0=0;QD=19.40;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1294,147,0 chrXV 385213 . G A 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.765;DP=95;Dels=0.00;FS=16.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.108;QD=8.61;ReadPosRankSum=4.797;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:848,0,298 chrXV 385320 . A T 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=110.9723;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.90;MQ0=0;QD=0.22;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:6:58,6,0 chrXV 385326 . A T 2938 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.67;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2971,294,0 chrXV 385377 . C T 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.22;MQ0=0;QD=26.54;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3165,330,0 chrXV 385418 . A G 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.97;MQ0=0;QD=25.28;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2738,297,0 chrXV 385443 . C A 2607 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.93;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2640,273,0 chrXV 385483 . T A 617.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;DP=83;Dels=0.00;FS=12.152;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.33;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.264;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:99:647,0,890 chrXV 385488 . G A 1875 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.12;MQ0=0;QD=22.59;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1908,204,0 chrXV 385489 . T C 1784 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.12;MQ0=0;QD=21.49;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:1817,201,0 chrXV 385492 . T A 1862 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.57;MQ0=0;QD=22.71;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:1895,201,0 chrXV 385510 . A G 1921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=0;QD=21.83;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1954,210,0 chrXV 385526 . G A 2503 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.21;MQ0=0;QD=23.39;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2536,267,0 chrXV 385570 . A T 2173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.56;MQ0=0;QD=24.14;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:90:99:2206,231,0 chrXV 385575 . T A 2106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.95;MQ0=0;QD=24.21;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2139,225,0 chrXV 385581 . T A 2141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.62;MQ0=0;QD=23.79;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2174,231,0 chrXV 385641 . G C 1869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=55.9871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.19;MQ0=0;QD=24.27;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1902,210,0 chrXV 385716 . A T 1943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.78;MQ0=0;QD=25.23;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:1976,207,0 chrXV 385782 . C T 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.56;MQ0=0;QD=27.20;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2862,288,0 chrXV 385790 . A G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.926;DP=115;Dels=0.00;FS=18.266;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=1.295;QD=8.68;ReadPosRankSum=-2.245;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1028,0,1437 chrXV 385806 . G A 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.35;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2785,279,0 chrXV 385865 . A G 2068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.56;MQ0=0;QD=22.48;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2101,228,0 chrXV 385907 . C A 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.56;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2709,285,0 chrXV 385934 . G A 2378 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.42;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2411,252,0 chrXV 385938 . G C 900.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;DP=89;Dels=0.00;FS=2.816;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.03;MQ0=0;MQRankSum=-3.571;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.514;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:930,0,831 chrXV 385940 . G A 2289 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.03;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.140e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2322,246,0 chrXV 385971 . T A 2395 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.14;MQ0=0;QD=20.65;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2428,252,0 chrXV 385998 . G A 2255 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.85;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2288,243,0 chrXV 385999 . A G 2211 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.03;MQ0=0;QD=23.27;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2244,243,0 chrXV 386061 . A T 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.25;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3218,333,0 chrXV 386067 . A G 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.42;MQ0=0;QD=21.84;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:2959,318,0 chrXV 386119 . C G 2365 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.38;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2398,252,0 chrXV 386156 . A C 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.26;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2532,264,0 chrXV 386205 . T C 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.60;MQ0=0;QD=25.75;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2762,282,0 chrXV 386216 . G T 2582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.13;MQ0=0;QD=25.82;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2615,273,0 chrXV 386226 . A G 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.68;MQ0=0;QD=25.93;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2548,267,0 chrXV 386292 . C T 2390 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2423,237,0 chrXV 386310 . G A 698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.102;DP=102;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,37:102:99:728,0,1421 chrXV 386386 . G A 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.084;DP=119;Dels=0.00;FS=2.541;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.158;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1039,0,1484 chrXV 386436 . C T 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.295;DP=97;Dels=0.00;FS=5.761;HaplotypeScore=2.7075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:962,0,1134 chrXV 386470 . A C 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.494;DP=104;Dels=0.00;FS=19.996;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:905,0,1203 chrXV 386503 . T A 833.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.217;DP=89;Dels=0.00;FS=1.707;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.524;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:863,0,1092 chrXV 386524 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.937;DP=114;Dels=0.00;FS=2.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1093,0,1365 chrXV 386540 . G A 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.438;DP=113;Dels=0.00;FS=1.550;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1184,0,1262 chrXV 387059 . C A 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3037,312,0 chrXV 387926 . T C 2505 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:95:99:2538,270,0 chrXV 388702 . A G 2431 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.59;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2464,261,0 chrXV 388869 . T G 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.676e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3458,366,0 chrXV 388886 . C T 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.79;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3552,355,0 chrXV 388890 . A T 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.95;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3427,349,0 chrXV 389116 . A G 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3433,351,0 chrXV 389141 . A G 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=24.45;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2845,306,0 chrXV 389171 . T C 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3411,363,0 chrXV 389237 . T G 3726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3726,372,0 chrXV 389611 . G A 220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.599;DP=110;Dels=0.00;FS=15.652;HaplotypeScore=161.0131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=2.00;ReadPosRankSum=4.061;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,104:110:30:253,30,0 chrXV 389628 . C A 2715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.62;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2748,279,0 chrXV 390047 . T C 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.022;DP=111;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=3.7133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.823;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1188,0,1099 chrXV 390103 . A C 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.047;DP=106;Dels=0.00;FS=2.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:943,0,1087 chrXV 390169 . A G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.195;DP=113;Dels=0.00;FS=4.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.896;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1122,0,1222 chrXV 390355 . T A 4129.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4129,406,0 chrXV 390363 . G C 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3519,372,0 chrXV 390445 . A G 2588 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2621,264,0 chrXV 390481 . C T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.845;DP=115;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.314;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1340,0,1068 chrXV 390482 . G T 3038 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3071,300,0 chrXV 390617 . G T 1218.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.376;DP=152;Dels=0.00;FS=4.530;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1248,0,1834 chrXV 390618 . C T 1237.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.887;DP=152;Dels=0.00;FS=4.530;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,64:152:99:1267,0,1847 chrXV 390622 . T C 1685.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.204;DP=145;Dels=0.00;FS=3.371;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.146;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,85:145:99:1715,0,1179 chrXV 390669 . G T 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.334;DP=146;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=3.743;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.533;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1559,0,1388 chrXV 390692 . A G 3507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3507,354,0 chrXV 390795 . G T 4074.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:155:99:4074,418,0 chrXV 390919 . A C 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.025;DP=137;Dels=0.00;FS=5.205;HaplotypeScore=4.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=-1.549;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.094;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1503,0,1360 chrXV 390986 . A G 3006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3039,339,0 chrXV 391153 . G T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.368;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=9.74;ReadPosRankSum=-2.147;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1335,0,1353 chrXV 391170 . A T 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.983;DP=146;Dels=0.00;FS=4.983;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.812;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1742,0,1451 chrXV 391198 . G A 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.997;DP=149;Dels=0.00;FS=13.397;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.412;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1785,0,1292 chrXV 391203 . A T 4064.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9342;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:4064,415,0 chrXV 391236 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.546;DP=149;Dels=0.00;FS=8.585;HaplotypeScore=2.7994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1351,0,1724 chrXV 391341 . G A 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.45;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3568,378,0 chrXV 391349 . T C 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.73;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3224,351,0 chrXV 391445 . C A 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3405,337,0 chrXV 391446 . G A 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3357,339,0 chrXV 391475 . A G 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6674;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.63;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3062,333,0 chrXV 391647 . C G 4063.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4063,420,0 chrXV 391813 . T G 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3219,339,0 chrXV 391860 . C T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.358;DP=123;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.134;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,62:123:99:1183,0,1185 chrXV 391953 . C T 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3063,312,0 chrXV 391965 . C G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.275;DP=131;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1203,0,1426 chrXV 392258 . G A 4294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.01;SB=-2.204e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4294,442,0 chrXV 392500 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.948;DP=120;Dels=0.00;FS=3.379;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1128,0,1348 chrXV 392644 . T C 4031.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4031,414,0 chrXV 392686 . G A 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.214;DP=163;Dels=0.00;FS=6.766;HaplotypeScore=3.0396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.431;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,86:163:99:1786,0,1569 chrXV 392767 . A T 4392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=26.62;SB=-2.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4392,436,0 chrXV 392814 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.728;DP=141;Dels=0.00;FS=2.174;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=8.82;ReadPosRankSum=2.854;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1274,0,1660 chrXV 392912 . T C 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.178;DP=152;Dels=0.00;FS=2.908;HaplotypeScore=9.2476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,87:152:99:1787,0,1329 chrXV 392963 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.506;DP=121;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.185;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1395,0,1111 chrXV 393061 . A G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.682;DP=136;Dels=0.00;FS=4.080;HaplotypeScore=2.4052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.612;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.940;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1456,0,1342 chrXV 393076 . G T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.491;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=1;MQRankSum=0.535;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.709;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1478,0,1293 chrXV 393128 . A G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.260;DP=137;Dels=0.00;FS=2.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=2.005;QD=10.80;ReadPosRankSum=2.449;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1510,0,1443 chrXV 393162 . C T 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3502,352,0 chrXV 393187 . T C 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.839e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3541,369,0 chrXV 393217 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3266,328,0 chrXV 393292 . G A 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3093,315,0 chrXV 393310 . T C 2644 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.67;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2677,282,0 chrXV 393383 . G C 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3208,339,0 chrXV 393430 . T C 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3713,393,0 chrXV 393703 . T C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.845;DP=130;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.489;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1326,0,1396 chrXV 394003 . G A 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3045,298,0 chrXV 394090 . T G 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3328,354,0 chrXV 394234 . T C 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.546;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1147,0,1092 chrXV 394456 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.369;DP=145;Dels=0.00;FS=2.086;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1370,0,1663 chrXV 394567 . A G 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3582,360,0 chrXV 394696 . T A 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.877;DP=108;Dels=0.00;FS=20.921;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.157;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1088,0,1280 chrXV 395160 . C T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.949;DP=155;Dels=0.00;FS=4.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.787;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1619,0,1370 chrXV 395268 . C T 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3047,318,0 chrXV 395279 . A G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.094;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=2.567;QD=10.72;ReadPosRankSum=2.254;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1434,0,1317 chrXV 395321 . T C 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2874,309,0 chrXV 395734 . T G 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=128;Dels=0.00;FS=4.170;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=24.70;ReadPosRankSum=0.298;SB=-1.288e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3195,324,0 chrXV 396070 . T C 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=1;QD=24.80;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3423,381,0 chrXV 396438 . C T 1939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.789;DP=193;Dels=0.00;FS=5.400;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.581;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,91:193:99:1969,0,2060 chrXV 396447 . A C 4585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4585,483,0 chrXV 396793 . A G 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3141,318,0 chrXV 396805 . G A 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3662,358,0 chrXV 397084 . C T 3749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3749,373,0 chrXV 397192 . A G 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3162,330,0 chrXV 397607 . G A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.317;DP=128;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=6.8865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.272;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:128:99:1310,0,1314 chrXV 398023 . G A 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.447;DP=109;Dels=0.00;FS=4.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.028;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:941,0,1293 chrXV 398425 . G A 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.261;DP=131;Dels=0.00;FS=2.254;HaplotypeScore=4.4190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.977;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:1447,0,1120 chrXV 398467 . A G 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3444,348,0 chrXV 398785 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.110;DP=128;Dels=0.00;FS=15.074;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.627;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1398,0,1246 chrXV 398901 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.698;DP=129;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=2.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1321,0,1401 chrXV 399358 . T A 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;DP=139;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=4.6820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.050;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:139:99:1513,0,1395 chrXV 399481 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.702;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=11.74;ReadPosRankSum=2.703;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1451,0,1242 chrXV 399619 . G A 2070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.103;DP=166;Dels=0.00;FS=6.534;HaplotypeScore=4.9250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.752;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,91:166:99:2100,0,1469 chrXV 399654 . T C 4642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=188;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,188:188:99:4642,492,0 chrXV 400131 . T C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.692;DP=152;Dels=0.00;FS=5.029;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.059;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1413,0,1832 chrXV 400890 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.616;DP=126;Dels=0.00;FS=8.197;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=2.171;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1197,0,1479 chrXV 401243 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.722;DP=167;Dels=0.00;FS=9.729;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,72:167:99:1408,0,1998 chrXV 401275 . G A 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3587,369,0 chrXV 402311 . A G 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.599;DP=117;Dels=0.00;FS=3.357;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1167,0,1307 chrXV 402457 . G A 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.693;DP=123;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=2.7171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1063,0,1424 chrXV 402498 . A G 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.734;DP=108;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.320;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:887,0,1391 chrXV 402509 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.586;DP=127;Dels=0.00;FS=3.214;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1187,0,1509 chrXV 403103 . T G 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.340;DP=116;Dels=0.00;FS=3.480;HaplotypeScore=6.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.644;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,48:116:99:923,0,1513 chrXV 403168 . A G 3007 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3040,321,0 chrXV 403351 . T C 3835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3835,381,0 chrXV 403639 . G A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.011;DP=140;Dels=0.00;FS=4.005;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.884;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1514,0,1483 chrXV 404477 . C T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.760;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.340;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1286,0,1173 chrXV 404516 . A G 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.876;DP=140;Dels=0.00;FS=2.174;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.151;QD=10.45;ReadPosRankSum=-3.497;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1493,0,1391 chrXV 404582 . A G 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.121;DP=130;Dels=0.00;FS=5.357;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=11.32;ReadPosRankSum=3.159;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1501,0,1286 chrXV 405179 . A G 2074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.352;DP=174;Dels=0.00;FS=11.967;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=-0.363;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.477;SB=-1.036e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,103:174:99:2104,0,1449 chrXV 405484 . A G 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.544;DP=132;Dels=0.00;FS=2.728;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.243;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,75:132:99:1665,0,1145 chrXV 405487 . T G 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.770;DP=133;Dels=0.00;FS=2.826;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.633;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1647,0,1171 chrXV 405535 . T C 2389 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2422,255,0 chrXV 405701 . A G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.973;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.610;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1289,0,1385 chrXV 405935 . T C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.070;DP=159;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=3.0544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=8.85;ReadPosRankSum=2.517;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1437,0,1708 chrXV 406046 . T C 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.883;DP=162;Dels=0.00;FS=10.723;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.121;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1648,0,1770 chrXV 406547 . A G 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.736;DP=91;Dels=0.00;FS=1.918;HaplotypeScore=5.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.584;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:977,0,936 chrXV 406655 . T C 694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.263;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.897;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:724,0,916 chrXV 406682 . A G 726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.793;DP=106;Dels=0.00;FS=5.236;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-2.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,43:106:99:756,0,1416 chrXV 406687 . A G 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.495;DP=106;Dels=0.00;FS=6.765;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:823,0,1415 chrXV 406821 . A G 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.764;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,54:132:99:906,0,1720 chrXV 406857 . T C 1063.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.897;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.468;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1093,0,1637 chrXV 406862 . T C 1068.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.829;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-3.214;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.640;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1098,0,1552 chrXV 406864 . G C 1042.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.601;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1072,0,1504 chrXV 406895 . G A 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.531;DP=113;Dels=0.00;FS=3.530;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.834;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.135;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1140,0,1133 chrXV 406909 . C A 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.676;DP=82;Dels=0.00;FS=2.862;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=9.55;ReadPosRankSum=1.461;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,40:82:99:813,0,903 chrXV 407036 . T C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=22.71;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3076,315,0 chrXV 407061 . G A 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.649;DP=126;Dels=0.00;FS=4.439;HaplotypeScore=2.4326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:1682,0,897 chrXV 407249 . T C 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.097;DP=167;Dels=0.00;FS=6.875;HaplotypeScore=2.3924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1506,0,1805 chrXV 407363 . T G 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.437;DP=138;Dels=0.00;FS=2.169;HaplotypeScore=3.8673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.738;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:138:99:1122,0,1703 chrXV 407624 . G A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.273;DP=145;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.465;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1465,0,1567 chrXV 407687 . C T 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.903;DP=158;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.529;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1736,0,1656 chrXV 407738 . G A 2099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.618;DP=177;Dels=0.00;FS=3.461;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=1;MQRankSum=-0.372;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.208;SB=-9.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,98:177:99:2129,0,1604 chrXV 407771 . C T 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.775;DP=171;Dels=0.00;FS=13.407;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=1;MQRankSum=-0.388;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.254;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,88:171:99:1898,0,1635 chrXV 407992 . T C 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.254;DP=113;Dels=0.00;FS=7.292;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:917,0,1240 chrXV 408140 . T C 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.358;DP=192;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=6.7833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=7.88;ReadPosRankSum=-2.288;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,80:192:99:1543,0,2540 chrXV 408177 . T C 2069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.174;DP=165;Dels=0.00;FS=3.718;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.54;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,99:165:99:2099,0,1312 chrXV 408490 . T G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.676;DP=139;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=2.292;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.080;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1278,0,1671 chrXV 408523 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.393;DP=156;Dels=0.00;FS=1.259;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.091;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1448,0,1814 chrXV 408658 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.146;DP=129;Dels=0.00;FS=2.279;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:968,0,1657 chrXV 408668 . C A 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.078;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=7.76;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:954,0,1440 chrXV 408874 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.918;DP=122;Dels=0.00;FS=3.302;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1078,0,1490 chrXV 408919 . A G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.459;DP=133;Dels=0.00;FS=6.542;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.016;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1261,0,1418 chrXV 408953 . C A 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3718,370,0 chrXV 409147 . C T 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3286,339,0 chrXV 409478 . A G 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.775;DP=157;Dels=0.00;FS=5.814;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,88:157:99:1766,0,1439 chrXV 409785 . G C 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.491;DP=139;Dels=0.00;FS=7.552;HaplotypeScore=6.3645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=10.49;ReadPosRankSum=-2.148;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1488,0,1311 chrXV 410064 . A G 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.915;DP=117;Dels=0.00;FS=0.688;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.123;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1310,0,1184 chrXV 410118 . A T 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3283,328,0 chrXV 410132 . G A 3884.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3884,402,0 chrXV 410340 . T C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.728;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=9.18;ReadPosRankSum=-2.890;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1122,0,1532 chrXV 410471 . G A 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3830,382,0 chrXV 410731 . A T 2896 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2929,294,0 chrXV 410754 . G C 2553 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=24.08;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2586,288,0 chrXV 410873 . G A 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5823;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.798e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3444,346,0 chrXV 410981 . G A 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.532;DP=171;Dels=0.00;FS=16.744;HaplotypeScore=7.3940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.233;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,84:171:99:1651,0,1703 chrXV 411025 . C T 4135.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.855e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4135,400,0 chrXV 411026 . A G 3994.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.771e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:3994,402,0 chrXV 411119 . A G 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3728,375,0 chrXV 411250 . A G 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3202,333,0 chrXV 411283 . A G 3042 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.694e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3075,318,0 chrXV 411421 . C T 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.426;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=26.21;ReadPosRankSum=1.630;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2706,261,0 chrXV 411579 . G A 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3029,303,0 chrXV 411673 . C T 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2622,270,0 chrXV 411900 . C A 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.542;DP=122;Dels=0.00;FS=4.627;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,78:122:99:1723,0,800 chrXV 412159 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.659;DP=116;Dels=0.00;FS=3.429;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.156;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1100,0,1327 chrXV 412174 . C T 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.315e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2793,279,0 chrXV 412369 . C A 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3043,309,0 chrXV 412390 . A T 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3583,361,0 chrXV 412468 . A G 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4970;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3518,357,0 chrXV 412539 . C T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.654;DP=110;Dels=0.00;FS=1.670;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.711;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,45:110:99:928,0,1436 chrXV 412613 . G T 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.428;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.557;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:948,0,1318 chrXV 412659 . G A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.500;DP=89;Dels=0.00;FS=4.147;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.763;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:850,0,1033 chrXV 412664 . A G 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.252;DP=92;Dels=0.00;FS=5.445;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.269;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,46:92:99:962,0,903 chrXV 412752 . C T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;DP=126;Dels=0.00;FS=14.788;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.639;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1271,0,1198 chrXV 412938 . G A 3802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3802,376,0 chrXV 412945 . G C 3694.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3694,384,0 chrXV 413171 . T C 3886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.834e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3886,387,0 chrXV 413284 . A G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.065;DP=153;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.202;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1276,0,1823 chrXV 413350 . A G 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.089;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1030,0,1045 chrXV 413362 . G A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.975;DP=120;Dels=0.00;FS=2.293;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1264,0,1222 chrXV 413669 . G A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.863;DP=122;Dels=0.00;FS=1.447;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1104,0,1357 chrXV 413773 . G A 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.545;DP=104;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:868,0,1393 chrXV 413792 . T C 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.035;DP=97;Dels=0.00;FS=8.289;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.469;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.216;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,40:97:99:699,0,1302 chrXV 413908 . A T 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.633;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:954,0,1142 chrXV 414172 . A T 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.034;DP=117;Dels=0.00;FS=48.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=0.31;ReadPosRankSum=-6.840;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,19:117:66:66,0,1969 chrXV 414198 . A T 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.034;DP=104;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.278;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1044,0,1220 chrXV 414403 . G C 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2932,306,0 chrXV 414442 . G T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.405;DP=113;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1203,0,1193 chrXV 414454 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.439;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.859;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1234,0,1149 chrXV 415035 . A C 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3578,387,0 chrXV 415167 . C T 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.905;DP=144;Dels=0.00;FS=4.018;HaplotypeScore=2.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.414;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1508,0,1478 chrXV 415283 . C A 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.518e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2967,300,0 chrXV 415299 . T C 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3225,339,0 chrXV 415373 . G A 2717 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=25.88;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2750,279,0 chrXV 415419 . T C 2791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2824,303,0 chrXV 415455 . C T 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=119;Dels=0.00;FS=3.197;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.645;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:3164,310,0 chrXV 415503 . A G 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2845,312,0 chrXV 415560 . G T 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.56;MQ0=0;QD=26.35;SB=-2.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3742,367,0 chrXV 415569 . T C 3682.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.30;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3682,369,0 chrXV 415593 . C T 2989 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=23.72;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3022,297,0 chrXV 415599 . T C 2949 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.76;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:2982,306,0 chrXV 415601 . G A 3168 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.80;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3201,318,0 chrXV 415659 . G A 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3165,327,0 chrXV 415689 . A G 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3582,378,0 chrXV 415710 . T C 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.89;MQ0=0;QD=26.82;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3567,363,0 chrXV 415728 . T C 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3574,369,0 chrXV 415842 . C T 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.97;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.365e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2764,276,0 chrXV 415943 . C T 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2974,298,0 chrXV 416019 . T C 3107 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.29;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3140,336,0 chrXV 416056 . T A 3523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.18;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3523,352,0 chrXV 416083 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.475;DP=107;Dels=0.00;FS=8.142;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.75;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.377;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1073,0,1057 chrXV 416118 . T C 2689 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.65;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.371e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2722,297,0 chrXV 416122 . T G 2048 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.12;MQ0=0;QD=19.69;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2081,228,0 chrXV 416124 . G A 555.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.977;DP=105;Dels=0.00;FS=1.671;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.367;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,36:105:99:585,0,1043 chrXV 416125 . G C 2009 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.07;MQ0=0;QD=20.93;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2042,225,0 chrXV 416158 . G A 1263 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.282;DP=108;Dels=0.01;FS=2.539;HaplotypeScore=54.8050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.72;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.687;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:47,60:107:99:1296,138,0 chrXV 416444 . G A 2422 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.82;MQ0=0;QD=27.21;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2455,252,0 chrXV 416506 . A G 3485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3485,348,0 chrXV 416605 . C T 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7028;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:112:99:2959,312,0 chrXV 416779 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.793;DP=123;Dels=0.00;FS=5.463;HaplotypeScore=2.5619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:123:99:1110,0,1292 chrXV 416880 . T C 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.301;DP=112;Dels=0.00;FS=6.022;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.760;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:851,0,1638 chrXV 416915 . C T 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.131;DP=123;Dels=0.00;FS=3.253;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,53:123:99:1064,0,1543 chrXV 416920 . G A 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.142;DP=120;Dels=0.00;FS=4.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.564;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1481,0,1014 chrXV 417133 . A G 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.777;DP=141;Dels=0.00;FS=3.963;HaplotypeScore=4.5813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1240,0,1636 chrXV 417161 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.414;DP=141;Dels=0.00;FS=2.982;HaplotypeScore=4.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.272;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:141:99:1205,0,1737 chrXV 417167 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.008;DP=146;Dels=0.00;FS=1.307;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.230;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1349,0,1700 chrXV 417236 . G A 3886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.91;SB=-2.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3886,394,0 chrXV 417328 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.716;DP=152;Dels=0.00;FS=8.401;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1511,0,1602 chrXV 417481 . A G 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2961,315,0 chrXV 417628 . T C 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3080,312,0 chrXV 417693 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.935;DP=138;Dels=0.00;FS=2.218;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.671;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1345,0,1523 chrXV 417733 . T C 4276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.45;SB=-2.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4276,444,0 chrXV 417786 . C T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.105;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,75:166:99:1590,0,1798 chrXV 417792 . G A 2087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.680;DP=165;Dels=0.00;FS=1.975;HaplotypeScore=3.4282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=12.65;ReadPosRankSum=-2.470;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,98:165:99:2117,0,1298 chrXV 417801 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.869;DP=136;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=4.0574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1370,0,1424 chrXV 417871 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.142;DP=128;Dels=0.00;FS=11.341;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1333,0,1333 chrXV 418052 . C T 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.514;DP=128;Dels=0.00;FS=4.064;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.488;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1128,0,1568 chrXV 418252 . C A 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=60.5467;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.15;MQ0=0;QD=26.21;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3591,352,0 chrXV 418324 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.807;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.689;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,53:90:99:1073,0,764 chrXV 418384 . A C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.787;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.273;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1286,0,1620 chrXV 418470 . T C 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.455;DP=131;Dels=0.00;FS=2.217;HaplotypeScore=2.9378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=7.66;ReadPosRankSum=-2.412;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1033,0,1646 chrXV 418511 . T C 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.384;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.758;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:839,0,1437 chrXV 418530 . G A 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.517;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=7.70;ReadPosRankSum=2.483;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:954,0,1512 chrXV 418885 . T A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;DP=121;Dels=0.00;FS=9.882;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1319,0,1280 chrXV 418912 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.390;DP=116;Dels=0.00;FS=10.274;HaplotypeScore=3.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.870;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1167,0,1235 chrXV 419065 . C T 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.574;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.449;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1362,0,1144 chrXV 419095 . C T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.159;DP=107;Dels=0.00;FS=2.663;HaplotypeScore=2.4896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1136,0,1107 chrXV 419347 . T C 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.989;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1150,0,1423 chrXV 419359 . T C 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.744;DP=121;Dels=0.00;FS=1.604;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.222;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.932;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1055,0,1365 chrXV 419365 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.263;DP=117;Dels=0.00;FS=2.689;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.589;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.709;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1073,0,1319 chrXV 419377 . A G 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.765;DP=128;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.807;QD=8.74;ReadPosRankSum=-3.246;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1149,0,1450 chrXV 419404 . A T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.271;DP=124;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.321;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.232;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1264,0,1360 chrXV 419419 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.749;DP=135;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=8.99;ReadPosRankSum=2.035;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1244,0,1562 chrXV 419521 . G A 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.449;DP=134;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=4.6408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.859;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1563,0,1295 chrXV 419928 . G A 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4041,406,0 chrXV 420061 . A T 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;DP=124;Dels=0.00;FS=5.501;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=10.53;ReadPosRankSum=3.424;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1336,0,1340 chrXV 420114 . T G 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3448,366,0 chrXV 420128 . A G 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.858;DP=151;Dels=0.00;FS=5.989;HaplotypeScore=4.9582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=-2.200;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.515;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,73:151:99:1422,0,1677 chrXV 420184 . T C 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.856;DP=152;Dels=0.01;FS=14.938;HaplotypeScore=4.5203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=1;MQRankSum=0.382;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.774;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1678,0,1519 chrXV 420262 . C T 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.412;DP=131;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=5.3944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.922;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1268,0,1300 chrXV 420334 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.885;DP=119;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1331,0,1057 chrXV 420367 . C T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.047;DP=124;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.474;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1553,0,1117 chrXV 420715 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.837;DP=123;Dels=0.00;FS=4.402;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1280,0,1327 chrXV 420844 . A G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.893;DP=105;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1087,0,1021 chrXV 420889 . A G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.437;DP=142;Dels=0.00;FS=7.184;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.457;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1342,0,1527 chrXV 421051 . G A 1879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.424;DP=191;Dels=0.00;FS=2.624;HaplotypeScore=6.9434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.081;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,92:191:99:1909,0,2146 chrXV 421339 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.565;DP=147;Dels=0.00;FS=1.306;HaplotypeScore=6.6443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=3.097;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1401,0,1357 chrXV 421402 . A G 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.140;DP=166;Dels=0.00;FS=1.232;HaplotypeScore=2.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,94:166:99:1630,0,1386 chrXV 421530 . A G 3611.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3611,384,0 chrXV 421685 . A G 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.996;DP=143;Dels=0.00;FS=3.100;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.039;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1684,0,1340 chrXV 421698 . C G 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;DP=143;Dels=0.00;FS=4.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1643,0,1344 chrXV 421788 . T C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.223;DP=128;Dels=0.00;FS=5.573;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.274;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1377,0,1328 chrXV 421850 . T C 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.348;DP=127;Dels=0.00;FS=5.575;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.859;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:995,0,1440 chrXV 421884 . C T 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.947;DP=131;Dels=0.00;FS=1.441;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.664;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:950,0,1699 chrXV 422015 . T C 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.788;DP=101;Dels=0.00;FS=2.590;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1007,0,987 chrXV 422038 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.696;DP=119;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.197;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1387,0,1195 chrXV 422213 . G A 138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.026;DP=88;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=38.7644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.08;MQ0=0;MQRankSum=-5.814;QD=1.57;ReadPosRankSum=1.427;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:99:168,0,1090 chrXV 422245 . T C 569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.670;DP=97;Dels=0.00;FS=9.764;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.66;MQ0=0;MQRankSum=-6.919;QD=5.87;ReadPosRankSum=-3.988;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:599,0,1056 chrXV 422248 . G A 627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.168;DP=97;Dels=0.00;FS=9.764;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.66;MQ0=0;MQRankSum=-6.818;QD=6.46;ReadPosRankSum=-3.721;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:657,0,1004 chrXV 422316 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.433;DP=115;Dels=0.00;FS=3.379;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1005,0,1212 chrXV 422344 . C T 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.021;DP=105;Dels=0.00;FS=2.565;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.920;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:936,0,1197 chrXV 422464 . A C 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.530;DP=156;Dels=0.00;FS=5.316;HaplotypeScore=2.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,83:156:99:1649,0,1636 chrXV 422594 . G A 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.004;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=37.7406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.868;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:979,0,1063 chrXV 422665 . T C 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.063;DP=101;Dels=0.00;FS=1.595;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.698;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:935,0,1060 chrXV 422667 . A G 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.337;DP=101;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1005,0,1022 chrXV 422859 . C G 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.560;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.127;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1164,0,1399 chrXV 422862 . G A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.636;DP=141;Dels=0.00;FS=2.968;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.292;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:141:99:1486,0,1505 chrXV 422905 . A G 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.789;DP=153;Dels=0.00;FS=2.024;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.108;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1398,0,1802 chrXV 423001 . A C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.079;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.249;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1129,0,1463 chrXV 423064 . T C 823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;DP=97;Dels=0.00;FS=5.145;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.373;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:853,0,1153 chrXV 423361 . G A 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3490,357,0 chrXV 423370 . T C 3519.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=22.27;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3519,369,0 chrXV 423406 . A G 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.087;DP=149;Dels=0.00;FS=1.286;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1366,0,1589 chrXV 423589 . A G 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.792;DP=127;Dels=0.00;FS=1.538;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.568;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1164,0,1510 chrXV 423598 . A C 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.66;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3061,324,0 chrXV 423658 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.680;DP=137;Dels=0.00;FS=2.164;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.666;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1530,0,1351 chrXV 423805 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.588;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=10.63;ReadPosRankSum=-2.150;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1380,0,1403 chrXV 423829 . A G 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.847;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.433;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,79:146:99:1611,0,1460 chrXV 424102 . A G 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3688,381,0 chrXV 424140 . G C 3349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3349,363,0 chrXV 424199 . G A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.859;DP=148;Dels=0.00;FS=2.083;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=9.92;ReadPosRankSum=2.400;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1498,0,1529 chrXV 424216 . A C 1746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.823;DP=176;Dels=0.00;FS=1.843;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,91:176:99:1776,0,1748 chrXV 424297 . T A 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;DP=142;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.924;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1412,0,1598 chrXV 424341 . T C 4091.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=23.78;SB=-2.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4091,406,0 chrXV 424523 . G T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.656;DP=146;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=3.8673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.953;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1676,0,1347 chrXV 424582 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.143;DP=125;Dels=0.00;FS=12.031;HaplotypeScore=3.0457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.229;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1393,0,1273 chrXV 424606 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.234;DP=141;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.24;ReadPosRankSum=2.145;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1474,0,1530 chrXV 424630 . C T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.913;DP=153;Dels=0.00;FS=2.081;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=9.96;ReadPosRankSum=3.299;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1554,0,1676 chrXV 424697 . A G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.288;DP=123;Dels=0.00;FS=6.915;HaplotypeScore=3.3829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.770;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:123:99:1337,0,1209 chrXV 424705 . G C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.716;DP=125;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=3.3829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.142;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:125:99:1167,0,1372 chrXV 424779 . G C 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3150,333,0 chrXV 424815 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.112;DP=110;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=39.6268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1077,0,1219 chrXV 424847 . C T 797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.572;DP=95;Dels=0.00;FS=2.764;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:827,0,1175 chrXV 424870 . G C 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.439;DP=97;Dels=0.00;FS=1.775;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.445;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,39:97:99:777,0,1229 chrXV 424894 . A G 872.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.869;DP=124;Dels=0.00;FS=4.383;HaplotypeScore=7.4923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.078;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,52:124:99:902,0,1622 chrXV 424963 . G A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.216;DP=123;Dels=0.00;FS=3.541;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1108,0,1493 chrXV 425041 . T C 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.437;DP=118;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.426;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:959,0,1472 chrXV 425090 . G A 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.622;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:990,0,1064 chrXV 425092 . G A 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.496;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.261;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:928,0,1016 chrXV 425121 . C T 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.116;DP=124;Dels=0.00;FS=5.632;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.132;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1034,0,1345 chrXV 425127 . C T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.988;DP=116;Dels=0.00;FS=5.915;HaplotypeScore=3.5059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:116:99:1057,0,1133 chrXV 425146 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.905;DP=120;Dels=0.00;FS=2.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQ0=0;MQRankSum=5.178;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.047;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1263,0,1122 chrXV 425151 . A G 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.398;DP=106;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQ0=0;MQRankSum=-3.147;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.049;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:989,0,1107 chrXV 425184 . G A 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.458;DP=93;Dels=0.00;FS=2.790;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.594;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.617;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:846,0,1089 chrXV 425185 . G A 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.788;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.90;MQ0=0;MQRankSum=-3.365;QD=7.78;ReadPosRankSum=1.513;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:816,0,1206 chrXV 425221 . G T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;DP=120;Dels=0.00;FS=3.379;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.759;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.959;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1214,0,1196 chrXV 425229 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.367;DP=126;Dels=0.00;FS=2.346;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.436;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.392;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,69:126:99:1328,0,1155 chrXV 425239 . T A 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.893;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.440;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.581;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1627,0,1308 chrXV 425266 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.326;DP=133;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=4.066;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1141,0,1640 chrXV 425281 . G A 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.854;DP=141;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.870;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.908;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,82:141:99:1750,0,1109 chrXV 425287 . C G 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.708e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3730,393,0 chrXV 425338 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.917;DP=122;Dels=0.00;FS=13.488;HaplotypeScore=2.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.395;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1163,0,1479 chrXV 425464 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.514;DP=158;Dels=0.00;FS=2.967;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.448;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1455,0,1849 chrXV 425503 . A G 716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.012;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:746,0,1426 chrXV 425669 . C T 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.300;DP=105;Dels=0.00;FS=2.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.080;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,48:105:99:959,0,1264 chrXV 425800 . A G 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.954;DP=137;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.835;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,77:137:99:1653,0,1268 chrXV 425872 . G A 1792.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.240;DP=154;Dels=0.00;FS=6.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.918;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,84:154:99:1822,0,1337 chrXV 425929 . G A 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.688;DP=128;Dels=0.00;FS=6.583;HaplotypeScore=3.5363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=2.121;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1384,0,1149 chrXV 426333 . G A 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.413;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:1006,0,962 chrXV 426355 . G A 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.100;DP=91;Dels=0.00;FS=1.733;HaplotypeScore=5.8546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:981,0,956 chrXV 426558 . G A 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.653;DP=156;Dels=0.00;FS=7.582;HaplotypeScore=2.8082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=2.221;QD=10.88;ReadPosRankSum=3.303;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1727,0,1503 chrXV 426621 . G C 324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;DP=135;Dels=0.00;FS=11.814;HaplotypeScore=12.4306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=2;MQRankSum=0.091;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:135:99:354,0,317 chrXV 426624 . G C 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;DP=137;Dels=0.01;FS=2.294;HaplotypeScore=19.1922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=2;MQRankSum=-0.919;QD=5.92;ReadPosRankSum=-1.031;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:136:99:841,0,419 chrXV 426633 . C G 601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;DP=156;Dels=0.00;FS=2.919;HaplotypeScore=8.5657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=2;MQRankSum=2.638;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.669;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:156:99:631,0,1367 chrXV 426759 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.107;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.379;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,74:171:99:1579,0,2022 chrXV 426767 . G C 4350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.1855;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:175:99:4350,450,0 chrXV 426787 . T C 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.547;DP=170;Dels=0.00;FS=1.225;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,77:170:99:1433,0,2064 chrXV 426838 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.755;DP=132;Dels=0.00;FS=3.132;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.603;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1470,0,1260 chrXV 427159 . C T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.005;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.410;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1453,0,1587 chrXV 427268 . C T 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.584;DP=136;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=4.0894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1607,0,1200 chrXV 427369 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.147;DP=143;Dels=0.00;FS=3.002;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1579,0,1364 chrXV 427400 . A G 1426.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.316;DP=134;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=63.4301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1456,0,1291 chrXV 427406 . T C 3606.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3606,381,0 chrXV 427407 . A C 1258.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.563;DP=142;Dels=0.00;FS=1.359;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.024;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1288,0,1679 chrXV 427559 . T C 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.205;DP=141;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.034;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1607,0,1288 chrXV 427697 . C T 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.605;DP=136;Dels=0.00;FS=16.670;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1283,0,1586 chrXV 427713 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.700;DP=138;Dels=0.00;FS=13.416;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=1.840;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.515;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:138:99:1152,0,1733 chrXV 427817 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.727;DP=111;Dels=0.00;FS=12.170;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.756;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1273,0,1050 chrXV 427884 . T G 283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.670;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.8711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.36;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=2.95;ReadPosRankSum=-3.518;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,28:96:99:313,0,1378 chrXV 427887 . A G 227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.407;DP=94;Dels=0.00;FS=1.091;HaplotypeScore=19.8711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.949;QD=2.41;ReadPosRankSum=-2.339;SB=-8.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,35:94:99:257,0,1379 chrXV 427911 . G T 946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.523;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.6235;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.82;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.189;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,46:55:99:979,111,0 chrXV 427941 . A G 152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.166;DP=48;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=108.9184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.22;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=3.17;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-2.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,32:46:99:182,0,106 chrXV 427953 . A G 16.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.670;DP=33;Dels=0.00;FS=3.064;HaplotypeScore=40.1368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=0.49;ReadPosRankSum=-2.802;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:46:46,0,118 chrXV 427956 . A G 16.11 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.856;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=56.7811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.56;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=0.50;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-6.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:46:46,0,117 chrXV 427959 . A G 11.34 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.751;DP=33;Dels=0.00;FS=8.478;HaplotypeScore=84.9281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.79;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=0.34;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:33:41:41,0,136 chrXV 428016 . A G 56.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.568;DP=72;Dels=0.03;FS=8.020;HaplotypeScore=51.2004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.87;MQ0=2;MQRankSum=-4.023;QD=0.78;ReadPosRankSum=2.196;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:86:86,0,616 chrXV 428019 . A G 71.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.049;DP=70;Dels=0.00;FS=7.849;HaplotypeScore=41.5460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.70;MQ0=2;MQRankSum=-4.419;QD=1.01;ReadPosRankSum=1.541;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:70:99:101,0,658 chrXV 428022 . A G 131.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.313;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.6884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.85;MQ0=2;MQRankSum=-4.377;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:75:99:161,0,587 chrXV 428028 . A G 151.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.033;DP=74;Dels=0.00;FS=0.957;HaplotypeScore=8.8735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQ0=2;MQRankSum=-3.172;QD=2.04;ReadPosRankSum=-1.231;SB=-1.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:181,0,603 chrXV 428241 . G C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.183;DP=135;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=3.7561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.173;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1358,0,1359 chrXV 428453 . G A 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.383;DP=177;Dels=0.00;FS=1.193;HaplotypeScore=3.4404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=1;MQRankSum=-0.713;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.148;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,83:177:99:1765,0,1815 chrXV 428661 . T A 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;DP=122;Dels=0.00;FS=1.651;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,75:122:99:1701,0,893 chrXV 429063 . G C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.813;DP=159;Dels=0.00;FS=4.976;HaplotypeScore=6.1211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=2.330;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.052;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1461,0,1593 chrXV 429156 . T C 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.824;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.646;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,83:172:99:1530,0,1901 chrXV 429210 . T C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.247;DP=146;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.695;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.399;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1437,0,1573 chrXV 429219 . G A 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.81;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3928,411,0 chrXV 429222 . T C 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.888;DP=145;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.782;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1347,0,1644 chrXV 429552 . C T 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.317;DP=162;Dels=0.00;FS=1.943;HaplotypeScore=3.4553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.097;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1892,0,1481 chrXV 429767 . C T 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.754;DP=139;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.974;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.162;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1475,0,1469 chrXV 429834 . C T 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.318;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.502;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1663,0,1595 chrXV 429969 . A G 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.085;DP=181;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=4.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=2.093;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.455;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,89:181:99:1785,0,1946 chrXV 430035 . G C 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.401;DP=175;Dels=0.00;FS=8.059;HaplotypeScore=4.4294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,82:175:99:1593,0,1978 chrXV 430182 . A G 82.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.427;DP=159;Dels=0.00;FS=84.928;HaplotypeScore=86.3695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=0.52;ReadPosRankSum=0.904;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,53:159:99:112,0,529 chrXV 430183 . A G 63.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.286;DP=160;Dels=0.00;FS=48.566;HaplotypeScore=87.3562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=3.068;QD=0.39;ReadPosRankSum=3.424;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,56:160:93:93,0,548 chrXV 430188 . G A 52.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;DP=169;Dels=0.01;FS=315.782;HaplotypeScore=116.8845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=0.31;ReadPosRankSum=-6.008;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,33:168:82:82,0,862 chrXV 430194 . G A 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;DP=164;Dels=0.01;FS=263.580;HaplotypeScore=15.7896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=0.13;ReadPosRankSum=-7.093;SB=-8.884e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,26:163:51:51,0,900 chrXV 430481 . G A 1834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.921;DP=162;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.158;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,87:162:99:1864,0,1487 chrXV 430964 . A G 655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.656;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.613;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:685,0,1044 chrXV 431264 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.597;DP=155;Dels=0.00;FS=2.875;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.421;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,71:155:99:1356,0,1869 chrXV 431558 . G T 1930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.486;DP=181;Dels=0.00;FS=1.153;HaplotypeScore=6.2703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=10.66;ReadPosRankSum=2.373;SB=-9.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,90:181:99:1960,0,1907 chrXV 431700 . G A 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.968;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1510,0,1660 chrXV 431849 . G C 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4041,414,0 chrXV 432164 . G T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.295;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.677;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1619,0,1544 chrXV 432275 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.306;DP=127;Dels=0.00;FS=5.467;HaplotypeScore=3.5792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1460,0,1198 chrXV 432347 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.001;DP=129;Dels=0.00;FS=7.219;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.853;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.235;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1509,0,1242 chrXV 432461 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.138;DP=134;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=4.0538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=10.77;ReadPosRankSum=2.618;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:134:99:1473,0,1381 chrXV 432563 . A C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.347;DP=143;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:143:99:1352,0,1599 chrXV 432630 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.462;DP=146;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.354;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1514,0,1563 chrXV 432666 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.959;DP=125;Dels=0.00;FS=6.931;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=9.34;ReadPosRankSum=-2.116;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1198,0,1413 chrXV 432698 . A G 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.061;DP=149;Dels=0.00;FS=11.904;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=1;MQRankSum=-0.823;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.246;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1359,0,1646 chrXV 432763 . G C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.686;DP=135;Dels=0.01;FS=3.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=1;MQRankSum=-2.005;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1428,0,1283 chrXV 432824 . T C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.875;DP=134;Dels=0.00;FS=7.948;HaplotypeScore=6.9450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.699;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1424,0,1269 chrXV 433405 . T C 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=25.39;ReadPosRankSum=1.336;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:140:99:3555,387,0 chrXV 433431 . T A 4395.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4395,439,0 chrXV 433548 . A T 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.490;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=11.18;ReadPosRankSum=-2.932;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1550,0,1354 chrXV 433573 . A G 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.651;DP=145;Dels=0.00;FS=5.752;HaplotypeScore=8.2542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.733;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1356,0,1559 chrXV 433580 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.137;DP=133;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=7.0862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=9.46;ReadPosRankSum=2.007;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1288,0,1361 chrXV 433633 . C A 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.104;DP=146;Dels=0.01;FS=11.783;HaplotypeScore=14.6589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.436;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:793,0,1193 chrXV 433635 . C A 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.461;DP=146;Dels=0.00;FS=17.018;HaplotypeScore=19.8544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-2.050;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.053;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:784,0,1170 chrXV 433685 . A T 2819 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.598;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=21.85;ReadPosRankSum=1.195;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:2852,291,0 chrXV 433769 . T C 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.351;DP=122;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.374;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1121,0,1473 chrXV 433937 . G A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.848;DP=122;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1364,0,1224 chrXV 433987 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.364;DP=101;Dels=0.00;FS=6.406;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1071,0,1097 chrXV 434141 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.602;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1040,0,1216 chrXV 434336 . G A 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.688;DP=127;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.004;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1375,0,1367 chrXV 434999 . A T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.052;DP=113;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1121,0,1166 chrXV 435038 . A G 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.416;DP=96;Dels=0.00;FS=1.647;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.584;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:749,0,1148 chrXV 435055 . T C 742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.566;DP=87;Dels=0.00;FS=4.080;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.151;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:772,0,1055 chrXV 435177 . A G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.508;DP=104;Dels=0.00;FS=5.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.350;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1153,0,993 chrXV 435266 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.902;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1002,0,1364 chrXV 435528 . A G 2216 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2249,234,0 chrXV 435862 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.744;DP=133;Dels=0.00;FS=7.826;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.596;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1445,0,1435 chrXV 436196 . C T 2575 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.82;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2608,261,0 chrXV 436490 . C G 1356 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.58;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1389,144,0 chrXV 436610 . G C 1734 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.13;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1767,180,0 chrXV 436680 . A G 656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.589;DP=88;Dels=0.00;FS=2.833;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,36:88:99:686,0,1158 chrXV 436826 . T C 1693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=25.65;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1726,183,0 chrXV 436846 . C A 23.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.25;MQ0=0;QD=0.36;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:66:6:55,6,0 chrXV 436910 . A G 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.50;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3187,333,0 chrXV 436950 . A G 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.27;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3336,351,0 chrXV 437000 . T C 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3320,342,0 chrXV 437034 . T C 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3676,375,0 chrXV 437180 . A C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.895;DP=112;Dels=0.00;FS=9.217;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.166;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1259,0,1115 chrXV 437266 . A T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;DP=114;Dels=0.00;FS=7.397;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1071,0,1354 chrXV 437320 . T C 1234.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.982;DP=114;Dels=0.00;FS=10.424;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.284;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1264,0,1048 chrXV 437324 . A G 2958 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9760;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.057;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:2991,285,0 chrXV 437329 . C T 1154.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.902;DP=123;Dels=0.00;FS=5.555;HaplotypeScore=3.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.820;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1184,0,1271 chrXV 437342 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.752;DP=118;Dels=0.00;FS=1.495;HaplotypeScore=3.9558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.184;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1032,0,1440 chrXV 437427 . G A 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.975;DP=145;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.208;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1584,0,1484 chrXV 437430 . C G 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;DP=138;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.389;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1427,0,1512 chrXV 437491 . G A 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.366;DP=141;Dels=0.00;FS=3.454;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.234;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,80:141:99:1679,0,1228 chrXV 438026 . T A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;DP=124;Dels=0.00;FS=2.352;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.46;ReadPosRankSum=-2.121;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1327,0,1223 chrXV 438117 . A G 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.070;DP=165;Dels=0.00;FS=0.587;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.847;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,84:165:99:1712,0,1786 chrXV 438148 . T G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.597;DP=135;Dels=0.00;FS=3.232;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.222;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1346,0,1486 chrXV 438163 . T C 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.000;DP=125;Dels=0.00;FS=4.349;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=7.87;ReadPosRankSum=2.187;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1014,0,1566 chrXV 438188 . G A 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.147;DP=125;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=2.167;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.519;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1153,0,1446 chrXV 438210 . A T 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.629;DP=137;Dels=0.00;FS=2.180;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=12.07;ReadPosRankSum=3.052;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:137:99:1684,0,1240 chrXV 438262 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.400;DP=134;Dels=0.00;FS=2.222;HaplotypeScore=3.3929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=1;MQRankSum=-0.411;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.439;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1081,0,1665 chrXV 438541 . G C 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;DP=101;Dels=0.00;FS=3.783;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.114;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:817,0,1295 chrXV 438561 . C T 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.533;DP=105;Dels=0.00;FS=1.581;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.482;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:875,0,1254 chrXV 438605 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.476;DP=104;Dels=0.00;FS=2.492;HaplotypeScore=3.9128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.263;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1164,0,1125 chrXV 438827 . G A 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.909;DP=125;Dels=0.00;FS=1.463;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.549;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,49:125:99:815,0,1663 chrXV 438841 . A G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.905;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1061,0,1690 chrXV 438948 . A G 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.290;DP=139;Dels=0.00;FS=9.061;HaplotypeScore=4.5509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.963;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1390,0,1551 chrXV 438975 . A T 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3786,379,0 chrXV 439047 . A T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.984;DP=132;Dels=0.00;FS=3.980;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=9.65;ReadPosRankSum=-3.921;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1304,0,1600 chrXV 439785 . G A 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.689;DP=167;Dels=0.01;FS=4.757;HaplotypeScore=9.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=2;MQRankSum=0.816;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.096;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,86:166:99:1823,0,1490 chrXV 440015 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.338;DP=131;Dels=0.00;FS=2.246;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.889;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,71:131:99:1429,0,1251 chrXV 440365 . C A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.400;DP=153;Dels=0.00;FS=5.027;HaplotypeScore=4.9651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.341;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1435,0,1649 chrXV 440656 . C T 2590 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.43;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2623,267,0 chrXV 440747 . A C 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.419;DP=133;Dels=0.00;FS=6.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=1;MQRankSum=-1.775;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.749;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1194,0,1520 chrXV 440825 . G A 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.690;DP=105;Dels=0.00;FS=7.621;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.061;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1189,0,1040 chrXV 440873 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.092;DP=149;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.368;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,82:149:99:1634,0,1235 chrXV 440883 . A G 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.277;DP=150;Dels=0.00;FS=2.218;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.123;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,83:150:99:1715,0,1379 chrXV 441214 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.752;DP=124;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=4.1302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1169,0,1344 chrXV 441222 . G C 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=9.60;ReadPosRankSum=-2.919;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1220,0,1298 chrXV 441341 . A G 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.483;DP=90;Dels=0.00;FS=4.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.808;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:792,0,1006 chrXV 441463 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.614;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1074,0,1149 chrXV 441487 . C T 3858.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3858,388,0 chrXV 441770 . A G 1873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.015;DP=147;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.449;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,91:147:99:1903,0,1146 chrXV 442209 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.217;DP=132;Dels=0.00;FS=5.291;HaplotypeScore=4.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.340;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1228,0,1459 chrXV 442427 . C T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.355;DP=110;Dels=0.00;FS=3.620;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=12.65;ReadPosRankSum=-2.004;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,66:110:99:1421,0,852 chrXV 442592 . A T 3190 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3223,325,0 chrXV 442786 . T C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=1;QD=24.04;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3318,354,0 chrXV 442841 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.103;DP=139;Dels=0.00;FS=6.659;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1511,0,1460 chrXV 442914 . G A 3028 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3061,295,0 chrXV 442941 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.611;DP=111;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.330;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1076,0,1080 chrXV 442944 . T C 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.727;DP=113;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.536;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1122,0,1126 chrXV 443031 . T C 904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.342;DP=117;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.621;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:934,0,1447 chrXV 443051 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.839;DP=136;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.903;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1406,0,1294 chrXV 443071 . G C 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3992,405,0 chrXV 443155 . T G 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.765;DP=146;Dels=0.00;FS=2.942;HaplotypeScore=3.9447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.661;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1389,0,1542 chrXV 443357 . T G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.126;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.219;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:1261,0,1821 chrXV 443358 . T C 3891.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3891,393,0 chrXV 443424 . G T 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.655;DP=114;Dels=0.00;FS=6.294;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,44:114:99:844,0,1479 chrXV 443587 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.172;DP=156;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=3.9593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.142;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1592,0,1707 chrXV 443601 . G A 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.827;DP=148;Dels=0.00;FS=1.291;HaplotypeScore=2.9246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.818;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,79:148:99:1720,0,1327 chrXV 443634 . A C 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.588;DP=141;Dels=0.00;FS=3.074;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.927;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.572;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1588,0,1373 chrXV 443686 . C G 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9112;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=22.31;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3000,309,0 chrXV 443717 . T A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.098;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.679;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1333,0,1683 chrXV 443793 . C A 2572 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.173;DP=111;Dels=0.00;FS=6.010;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=23.17;ReadPosRankSum=2.573;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,108:111:99:2605,270,0 chrXV 443794 . T C 2539 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;DP=114;Dels=0.00;FS=3.037;HaplotypeScore=9.8301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=22.27;ReadPosRankSum=1.845;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,112:114:99:2572,270,0 chrXV 444024 . G A 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.215;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.621;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1051,0,1327 chrXV 444102 . C T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.582;DP=115;Dels=0.00;FS=7.222;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1306,0,1072 chrXV 444178 . T C 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3322,351,0 chrXV 444289 . G A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.273;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=9.81;ReadPosRankSum=-2.355;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1345,0,1424 chrXV 444406 . A G 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.493;DP=168;Dels=0.00;FS=1.922;HaplotypeScore=10.6673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.787;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,81:168:99:1590,0,1907 chrXV 445216 . T C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.374;DP=128;Dels=0.00;FS=2.253;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=0.129;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.204;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1051,0,1599 chrXV 445648 . C T 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3176,322,0 chrXV 445852 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.984;DP=153;Dels=0.00;FS=2.014;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1588,0,1587 chrXV 445941 . C T 4370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.41;SB=-2.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4370,441,0 chrXV 445992 . G A 2013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.989;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.824;SB=-9.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,96:186:99:2043,0,1843 chrXV 446000 . G A 1946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.988;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.728;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,96:184:99:1976,0,1724 chrXV 446451 . T C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3076,324,0 chrXV 446484 . C T 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3854,379,0 chrXV 446992 . C T 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.727;DP=160;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=4.9701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.984;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,83:160:99:1412,0,1540 chrXV 447093 . T C 1533.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.667;DP=150;Dels=0.00;FS=7.926;HaplotypeScore=3.6839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=10.22;ReadPosRankSum=-2.336;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1563,0,1589 chrXV 447365 . T A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;DP=126;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=2.117;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1443,0,1290 chrXV 447858 . A G 3152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3185,348,0 chrXV 447942 . C T 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3894,399,0 chrXV 448221 . T C 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.899;DP=132;Dels=0.00;FS=9.352;HaplotypeScore=3.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.139;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1228,0,1418 chrXV 448386 . A C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.414;DP=112;Dels=0.00;FS=2.559;HaplotypeScore=3.4308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.617;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1106,0,857 chrXV 448985 . A G 3016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.72;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3049,318,0 chrXV 449075 . C A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;DP=103;Dels=0.00;FS=7.739;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.281;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1108,0,1045 chrXV 449105 . C T 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2682,267,0 chrXV 449205 . A C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2967,312,0 chrXV 449353 . A G 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.496;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.338;SB=-1.003e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3433,366,0 chrXV 449765 . G A 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.83;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2796,291,0 chrXV 449867 . A C 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2578,273,0 chrXV 450010 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.831;DP=113;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.836;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1332,0,1087 chrXV 450043 . G A 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.31;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3304,331,0 chrXV 450086 . T C 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.33;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3022,324,0 chrXV 450158 . G T 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.252;DP=135;Dels=0.00;FS=4.109;HaplotypeScore=3.7661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.158;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1228,0,1559 chrXV 450216 . C T 3538.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3538,346,0 chrXV 450301 . T C 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=22.60;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3062,324,0 chrXV 450315 . A C 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3146,327,0 chrXV 450461 . G A 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.4844;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2828,294,0 chrXV 450491 . G A 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.432;DP=116;Dels=0.00;FS=3.404;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.728;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1089,0,1299 chrXV 450650 . C T 3093 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3126,318,0 chrXV 450833 . A G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.453;DP=89;Dels=0.00;FS=4.259;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=10.26;ReadPosRankSum=-2.212;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:943,0,1007 chrXV 450923 . T C 2366 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=16.32;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:2399,258,0 chrXV 450930 . T C 2775 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=18.50;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:2808,303,0 chrXV 451145 . A G 4189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4189,438,0 chrXV 451154 . A G 4451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=179;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.87;SB=-2.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,179:179:99:4451,480,0 chrXV 451172 . A C 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.53;SB=-2.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3932,411,0 chrXV 451367 . C A 3648.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3648,367,0 chrXV 451373 . A G 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.139;DP=171;Dels=0.00;FS=0.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.114;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,83:171:99:1593,0,1954 chrXV 451509 . A G 4107.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4107,447,0 chrXV 451606 . A G 2384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.91;SB=-9.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2417,252,0 chrXV 452290 . G A 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3609,358,0 chrXV 452446 . T C 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;DP=111;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.389;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2859,294,0 chrXV 452821 . G A 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.059;DP=136;Dels=0.00;FS=4.167;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1686,0,1083 chrXV 452881 . A G 4232.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4232,424,0 chrXV 453055 . A G 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.43;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3304,342,0 chrXV 453067 . C T 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3233,330,0 chrXV 453073 . G A 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3365,337,0 chrXV 453417 . C G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.924;DP=146;Dels=0.00;FS=9.128;HaplotypeScore=5.1726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.448;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1336,0,1333 chrXV 453707 . T C 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.498;DP=151;Dels=0.00;FS=2.043;HaplotypeScore=5.8139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1588,0,1585 chrXV 453762 . C T 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.309;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,77:134:99:1757,0,1158 chrXV 453897 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.803;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.264;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,68:157:99:1409,0,1976 chrXV 453974 . T C 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.018;DP=123;Dels=0.00;FS=4.338;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:998,0,1494 chrXV 454256 . C T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.908;DP=143;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.061;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1676,0,1305 chrXV 454325 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.083;DP=130;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.180;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1305,0,1334 chrXV 454559 . A G 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.740;DP=161;Dels=0.00;FS=1.960;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.056;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,85:161:99:1601,0,1649 chrXV 454610 . C T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.482;DP=151;Dels=0.00;FS=6.372;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.431;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,69:151:99:1419,0,1770 chrXV 454944 . A G 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.62;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2902,312,0 chrXV 455108 . T C 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.786;DP=129;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.564;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1431,0,1360 chrXV 455183 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.786;DP=128;Dels=0.00;FS=1.418;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=2.153;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.561;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1356,0,1363 chrXV 455193 . G C 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.795;DP=136;Dels=0.00;FS=2.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.714;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1446,0,1319 chrXV 455286 . G A 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.710;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,52:130:99:1011,0,1703 chrXV 455342 . T C 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.715;DP=173;Dels=0.00;FS=3.519;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=2;MQRankSum=1.662;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.191;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,79:173:99:1597,0,1944 chrXV 455594 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.516;DP=114;Dels=0.00;FS=4.666;HaplotypeScore=2.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1370,0,1103 chrXV 455641 . C T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.029;DP=121;Dels=0.00;FS=4.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1402,0,1111 chrXV 455964 . C A 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.477;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.318;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1458,0,1786 chrXV 456978 . G A 3197 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3230,322,0 chrXV 457157 . G A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.423;DP=113;Dels=0.00;FS=2.527;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.460;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,61:113:99:1320,0,1009 chrXV 457245 . T C 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.515;DP=154;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=3.4166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.863;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,89:154:99:1698,0,1380 chrXV 457470 . A G 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.52;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2681,297,0 chrXV 457531 . T C 4099.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4099,438,0 chrXV 457599 . T C 1486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.872;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1516,0,1658 chrXV 458312 . G A 2675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.389;DP=214;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,124:214:99:2705,0,1679 chrXV 458453 . G A 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.449;DP=174;Dels=0.00;FS=15.272;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.505;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,79:174:99:1554,0,2056 chrXV 458517 . A G 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.354;DP=146;Dels=0.00;FS=4.917;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.179;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1590,0,1439 chrXV 458617 . T G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.722;DP=161;Dels=0.00;FS=1.978;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=8.66;ReadPosRankSum=2.282;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,75:161:99:1425,0,1893 chrXV 458665 . G T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.126;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.923;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1306,0,1507 chrXV 458852 . C T 633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.542;DP=121;Dels=0.00;FS=1.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.317;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,35:121:99:663,0,1903 chrXV 458886 . T C 560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.238;DP=94;Dels=0.00;FS=2.889;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=5.96;ReadPosRankSum=-3.092;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,32:94:99:590,0,1357 chrXV 459056 . T A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;DP=138;Dels=0.00;FS=4.536;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1426,0,1510 chrXV 459134 . C T 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.256;DP=110;Dels=0.00;FS=3.557;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.257;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1191,0,1122 chrXV 459560 . C T 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.540;DP=132;Dels=0.00;FS=1.397;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1115,0,1700 chrXV 459563 . A G 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.035;DP=134;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.016;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,78:134:99:1586,0,1134 chrXV 459638 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.662;DP=140;Dels=0.00;FS=1.342;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.894;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1462,0,1391 chrXV 459732 . G A 334.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.333;DP=193;Dels=0.00;FS=110.889;HaplotypeScore=7.6375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.38;MQ0=0;MQRankSum=-6.462;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.453;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,57:193:99:364,0,3076 chrXV 459751 . C T 544.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.635;DP=175;Dels=0.00;FS=91.194;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.49;MQ0=0;MQRankSum=-7.149;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,62:175:99:574,0,2567 chrXV 459777 . G A 575.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.677;DP=186;Dels=0.00;FS=40.519;HaplotypeScore=5.8567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.442;QD=3.09;ReadPosRankSum=4.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,43:186:99:605,0,3158 chrXV 459779 . C T 563.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.365;DP=192;Dels=0.00;FS=33.299;HaplotypeScore=4.8651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.815;QD=2.93;ReadPosRankSum=4.624;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,44:192:99:593,0,3315 chrXV 459780 . A G 612.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.102;DP=189;Dels=0.00;FS=26.236;HaplotypeScore=4.8651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=-4.474;QD=3.24;ReadPosRankSum=3.401;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,47:189:99:642,0,3256 chrXV 459840 . G A 2244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.990;DP=213;Dels=0.00;FS=1.760;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.821;SB=-1.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,127:213:99:2274,0,1713 chrXV 459980 . G A 3726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.461;DP=262;Dels=0.00;FS=3.718;HaplotypeScore=3.8649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.761;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,180:262:99:3726,0,1514 chrXV 460089 . T C 383.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.283;DP=172;Dels=0.00;FS=78.503;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=1;MQRankSum=-1.232;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.887;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,37:172:99:413,0,3230 chrXV 460430 . A T 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3950,403,0 chrXV 460514 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.755;DP=142;Dels=0.00;FS=3.966;HaplotypeScore=2.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.261;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1353,0,1599 chrXV 460848 . T A 2618 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.99;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2651,264,0 chrXV 461014 . G A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.240;DP=111;Dels=0.00;FS=12.182;HaplotypeScore=4.2998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1010,0,1274 chrXV 461164 . G T 4192.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=1;QD=27.40;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:4192,415,0 chrXV 461250 . C T 4235.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=1;QD=26.47;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4235,418,0 chrXV 461411 . A G 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.428;DP=125;Dels=0.00;FS=4.552;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,53:125:99:1081,0,1648 chrXV 461434 . A G 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3139,330,0 chrXV 461473 . C T 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.959;DP=130;Dels=0.01;FS=0.658;HaplotypeScore=18.3905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.378;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1077,0,1492 chrXV 461644 . T C 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.38;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3245,357,0 chrXV 461659 . T C 3380.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.63;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3380,369,0 chrXV 461660 . T C 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3371,366,0 chrXV 461683 . G A 4132.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4132,424,0 chrXV 461696 . G C 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.62;MQ0=0;QD=22.42;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3497,381,0 chrXV 461760 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.009;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=8.17;ReadPosRankSum=2.761;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1092,0,1719 chrXV 461793 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.839;DP=104;Dels=0.00;FS=1.605;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.059;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1187,0,1014 chrXV 462083 . T C 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3520,372,0 chrXV 462447 . T A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.410;DP=131;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.827;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1262,0,1443 chrXV 462566 . A C 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.459;DP=134;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.972;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.977;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:1005,0,1791 chrXV 462586 . G A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.693;DP=125;Dels=0.00;FS=2.304;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1211,0,1395 chrXV 462625 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.579;DP=122;Dels=0.00;FS=11.752;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.796;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1231,0,1332 chrXV 462628 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.021;DP=123;Dels=0.00;FS=11.890;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.597;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.792;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1248,0,1390 chrXV 462683 . T A 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;DP=103;Dels=0.00;FS=31.882;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:873,0,1333 chrXV 462717 . C T 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.016;DP=83;Dels=0.00;FS=24.372;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.813;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:1076,0,681 chrXV 462747 . C G 403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.138;DP=88;Dels=0.00;FS=39.889;HaplotypeScore=8.2543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQ0=0;MQRankSum=-4.708;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-5.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,34:88:99:433,0,1064 chrXV 462957 . A T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;DP=102;Dels=0.00;FS=1.646;HaplotypeScore=5.4430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQ0=0;MQRankSum=3.117;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.603;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1343,0,876 chrXV 462964 . C T 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.89;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2704,276,0 chrXV 463112 . A C 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.432;DP=132;Dels=0.00;FS=9.459;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=1;MQRankSum=0.997;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.766;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1120,0,1617 chrXV 463185 . G A 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.655;DP=129;Dels=0.00;FS=5.628;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.809;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:129:99:1161,0,1531 chrXV 463240 . T C 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3619,369,0 chrXV 463343 . T A 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.645;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1094,0,1204 chrXV 463455 . T A 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;DP=103;Dels=0.00;FS=1.601;HaplotypeScore=10.7931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:932,0,1162 chrXV 463462 . G A 2377 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;DP=92;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=10.7945;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=25.84;ReadPosRankSum=1.428;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:92:99:2410,249,0 chrXV 463640 . T A 3072 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3105,310,0 chrXV 463641 . G A 3079 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3112,313,0 chrXV 463642 . G A 3048 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3081,312,0 chrXV 463787 . A C 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3348,336,0 chrXV 463865 . G A 3402.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3402,337,0 chrXV 463866 . C A 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.994;DP=127;Dels=0.00;FS=3.353;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.675;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1241,0,1478 chrXV 463933 . G T 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.18;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3475,349,0 chrXV 464006 . C T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.670;DP=89;Dels=0.00;FS=4.555;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.423;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,49:89:99:1111,0,791 chrXV 464113 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.679;DP=141;Dels=0.00;FS=6.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.507;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1498,0,1532 chrXV 464133 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.990;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=2.173;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.680;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1172,0,991 chrXV 464158 . C G,T 2527.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=48.41;MQ0=0;QD=23.84;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,50,56:106:99:2587,1379,1232,1208,0,1043 chrXV 464164 . G T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.840;DP=110;Dels=0.00;FS=2.904;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.58;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.123;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1294,0,1060 chrXV 464215 . A C 295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.869;DP=56;Dels=0.00;FS=3.757;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.48;MQ0=0;MQRankSum=-4.165;QD=5.27;ReadPosRankSum=-2.062;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:325,0,491 chrXV 464237 . T C 252.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.471;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.41;MQ0=0;MQRankSum=-5.643;QD=3.36;ReadPosRankSum=2.426;SB=-1.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:282,0,988 chrXV 464238 . A G 238.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.035;DP=76;Dels=0.00;FS=0.949;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.63;MQ0=0;MQRankSum=-5.655;QD=3.13;ReadPosRankSum=1.952;SB=-1.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,32:76:99:268,0,1000 chrXV 464242 . C T 846.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.892;DP=80;Dels=0.00;FS=2.133;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.95;MQ0=0;MQRankSum=5.259;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.803;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:876,0,406 chrXV 464244 . G T 338.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=78;Dels=0.00;FS=3.465;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.67;MQ0=0;MQRankSum=-5.374;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:368,0,883 chrXV 464262 . T C 371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.135;DP=83;Dels=0.00;FS=5.040;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.376;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.263;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:401,0,1097 chrXV 464274 . G A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.715;DP=85;Dels=0.00;FS=13.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQ0=0;MQRankSum=4.618;QD=12.12;ReadPosRankSum=2.655;SB=-1.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1060,0,525 chrXV 464290 . T C 633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.717;DP=86;Dels=0.00;FS=11.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.477;QD=7.36;ReadPosRankSum=-3.106;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:663,0,943 chrXV 464324 . G A 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.667;DP=92;Dels=0.00;FS=21.610;HaplotypeScore=49.6556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=9.18;ReadPosRankSum=4.801;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:92:99:875,0,963 chrXV 464339 . A T 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;DP=96;Dels=0.00;FS=6.903;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=8.11;ReadPosRankSum=-2.430;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:809,0,1145 chrXV 464414 . A G 418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=139;Dels=0.00;FS=6.322;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=3.01;ReadPosRankSum=2.640;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:448,0,630 chrXV 464415 . C G 408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;DP=139;Dels=0.00;FS=8.933;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=2.94;ReadPosRankSum=2.518;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:438,0,690 chrXV 464562 . G A 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=82;Dels=0.00;FS=2.074;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,49:82:99:1061,0,657 chrXV 464863 . C T 2500 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2533,249,0 chrXV 465127 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.460;DP=137;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=5.7060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.364;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:137:99:1393,0,1509 chrXV 465226 . C A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.818;DP=126;Dels=0.00;FS=5.517;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.515;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1212,0,1380 chrXV 465313 . T C 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2871,306,0 chrXV 465319 . G A 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2764,285,0 chrXV 465398 . G A 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.994;DP=125;Dels=0.00;FS=5.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.230;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1419,0,1106 chrXV 465410 . C G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;DP=114;Dels=0.00;FS=4.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.414;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:943,0,1365 chrXV 465440 . C G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;DP=120;Dels=0.00;FS=1.465;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.178;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,67:120:99:1388,0,1035 chrXV 465458 . T A 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;DP=153;Dels=0.00;FS=3.869;HaplotypeScore=3.7149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.993;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1453,0,1746 chrXV 465622 . A G 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.123;DP=156;Dels=0.00;FS=2.873;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=1.945;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,84:156:99:1759,0,1505 chrXV 465655 . G A 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3171,330,0 chrXV 465661 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.857;DP=116;Dels=0.00;FS=8.785;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=10.22;ReadPosRankSum=2.051;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1216,0,1200 chrXV 465693 . C G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;DP=130;Dels=0.00;FS=6.684;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1335,0,1293 chrXV 465823 . C A 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.331;DP=106;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.722;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.490;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:905,0,1343 chrXV 466112 . A G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.820;DP=92;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.362;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,57:92:99:1211,0,741 chrXV 466157 . A G 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=25.40;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2624,273,0 chrXV 466340 . A G 2124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.29;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2157,234,0 chrXV 466369 . C T 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.742;DP=89;Dels=0.00;FS=0.863;HaplotypeScore=2.8540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.214;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,54:89:99:1230,0,690 chrXV 466738 . C T 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.364;DP=102;Dels=0.00;FS=9.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1061,0,1082 chrXV 466809 . T A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.084;DP=111;Dels=0.00;FS=9.168;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.366;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,61:111:99:1201,0,1058 chrXV 466810 . G A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.238;DP=104;Dels=0.00;FS=18.516;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.511;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1209,0,1017 chrXV 467065 . C T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=127;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=4.5510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:127:99:1221,0,1322 chrXV 467149 . T A 3351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.93;SB=-9.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3351,334,0 chrXV 467239 . G A 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3919,391,0 chrXV 467407 . A G 3559.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3559,357,0 chrXV 467424 . G A 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.058;DP=132;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1064,0,1577 chrXV 467591 . C A 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=154;Dels=0.00;FS=3.125;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-2.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,153:154:99:3961,400,0 chrXV 467624 . T C 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3341,345,0 chrXV 467792 . T A 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.673;DP=132;Dels=0.00;FS=3.146;HaplotypeScore=4.8435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.226;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,79:132:99:1759,0,1045 chrXV 467820 . G A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.733;DP=140;Dels=0.00;FS=5.086;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.550;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1315,0,1617 chrXV 467878 . C T 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.653;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1549,0,1072 chrXV 467983 . G A 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.626;DP=100;Dels=0.00;FS=3.732;HaplotypeScore=3.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=10.68;ReadPosRankSum=2.007;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1098,0,1018 chrXV 468018 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.189;DP=133;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.492;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1530,0,1251 chrXV 468109 . C T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.479;DP=95;Dels=0.00;FS=10.955;HaplotypeScore=3.6298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQ0=0;MQRankSum=-6.224;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.619;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,52:95:99:922,0,941 chrXV 468121 . A G 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.552;DP=101;Dels=0.00;FS=10.230;HaplotypeScore=3.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.21;MQ0=0;MQRankSum=-7.198;QD=7.66;ReadPosRankSum=-1.115;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:804,0,1059 chrXV 468133 . A G 603.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.764;DP=100;Dels=0.00;FS=13.541;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.33;MQ0=0;MQRankSum=-7.902;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.993;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:633,0,1209 chrXV 468134 . T C 590.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.122;DP=101;Dels=0.00;FS=11.326;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQ0=0;MQRankSum=-7.950;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.117;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:620,0,1198 chrXV 468143 . A G 638.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.604;DP=105;Dels=0.00;FS=17.220;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQ0=0;MQRankSum=-7.126;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.680;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:668,0,1288 chrXV 468169 . G A 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.766;DP=109;Dels=0.00;FS=3.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.90;MQ0=0;MQRankSum=-4.966;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1006,0,1057 chrXV 468172 . G C 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;DP=107;Dels=0.00;FS=3.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-4.167;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.184;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:926,0,1089 chrXV 468284 . G A 3554.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.378;DP=133;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.873;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3554,360,0 chrXV 468336 . A G 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3250,330,0 chrXV 468355 . G C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.860;DP=122;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.425;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1171,0,1327 chrXV 468364 . T C 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3197,324,0 chrXV 468374 . T A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=118;Dels=0.00;FS=1.474;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=2.030;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1251,0,1310 chrXV 468391 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.669;DP=99;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.387;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:99:99:1072,0,1026 chrXV 468511 . A G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.426;DP=105;Dels=0.00;FS=2.600;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.685;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1108,0,1058 chrXV 468561 . A G 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2851,303,0 chrXV 468674 . T C 3280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3280,342,0 chrXV 468739 . C T 665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.764;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.011;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:695,0,1152 chrXV 469093 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.983;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.167;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1319,0,1123 chrXV 469298 . C G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.330;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:998,0,1130 chrXV 469469 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.715;DP=106;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=11.42;ReadPosRankSum=2.021;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1241,0,1054 chrXV 469545 . C T 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.186;DP=109;Dels=0.00;FS=3.750;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.678;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,43:109:99:839,0,1405 chrXV 469548 . G A 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.233;DP=110;Dels=0.00;FS=3.692;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.619;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:110:99:875,0,1371 chrXV 469816 . G C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=110;Dels=0.00;FS=2.497;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.269;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1157,0,1075 chrXV 469994 . T C 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.643;DP=125;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.763;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1166,0,1450 chrXV 470004 . C T 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3580,355,0 chrXV 470406 . A T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.088;DP=132;Dels=0.00;FS=4.165;HaplotypeScore=3.5089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.530;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1371,0,1403 chrXV 470451 . C T 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2662,279,0 chrXV 470804 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.449;DP=100;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:1040,0,1150 chrXV 470911 . G C 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.418;DP=138;Dels=0.00;FS=9.265;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.193;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,80:138:99:1566,0,1174 chrXV 471038 . G T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.973;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1415,0,1567 chrXV 471089 . A G 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.23;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2733,288,0 chrXV 471091 . A G 2643 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2676,291,0 chrXV 471228 . C T 2416 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.84;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2449,258,0 chrXV 471315 . G T 3198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3231,328,0 chrXV 471366 . T C 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2992,318,0 chrXV 471799 . A G 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.213;DP=179;Dels=0.00;FS=12.028;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.326;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.728;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,86:179:99:1714,0,2014 chrXV 471859 . G A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.275;DP=110;Dels=0.00;FS=2.544;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.411;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1404,0,904 chrXV 472448 . A C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.366;DP=120;Dels=0.00;FS=4.345;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1184,0,1313 chrXV 472579 . T A 3560.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.849e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3560,352,0 chrXV 472668 . C T 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.79;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3353,351,0 chrXV 472765 . A C 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3774,393,0 chrXV 473069 . A G 3205.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3239,339,0 chrXV 473696 . G A 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6015;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=2;QD=25.62;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2954,289,0 chrXV 473826 . A G 3088 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3121,324,0 chrXV 474069 . A G 3607.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3607,387,0 chrXV 474477 . C A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.494;DP=114;Dels=0.00;FS=2.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.502;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1211,0,1238 chrXV 474686 . T C 3994.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3994,405,0 chrXV 474687 . T C 3984.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3984,399,0 chrXV 474768 . G T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.793;DP=134;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.401;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1478,0,1227 chrXV 475114 . T C 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=1;QD=24.67;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3577,369,0 chrXV 475155 . G T 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.9928;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=1;QD=23.93;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3422,340,0 chrXV 475268 . G T 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3867,399,0 chrXV 475608 . A G 4470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4470,459,0 chrXV 475727 . G A 4193.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.899e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4193,421,0 chrXV 475733 . A C 3886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3886,396,0 chrXV 475778 . T C 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3169,351,0 chrXV 475809 . T C 3788.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3788,411,0 chrXV 475816 . C T 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3542,372,0 chrXV 475934 . A G 4175.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.30;SB=-2.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4175,435,0 chrXV 476009 . G A 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.813e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3329,319,0 chrXV 476169 . G A 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3156,336,0 chrXV 476205 . G A 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3834,391,0 chrXV 476276 . A G 3787.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3787,411,0 chrXV 476321 . C T 4349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.68;SB=-2.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4349,433,0 chrXV 476397 . A G 3997.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3997,426,0 chrXV 476414 . G C 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3504,372,0 chrXV 476855 . C A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.091;DP=137;Dels=0.00;FS=3.137;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.119;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1286,0,1588 chrXV 476956 . C G 1884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;DP=163;Dels=0.00;FS=9.517;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.759;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,92:163:99:1914,0,1396 chrXV 476972 . A G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.395;DP=155;Dels=0.00;FS=7.067;HaplotypeScore=3.2857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:155:99:1276,0,1877 chrXV 477077 . T C 2693 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=24.71;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2726,275,0 chrXV 477610 . A G 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.16;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3295,354,0 chrXV 477611 . G A 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3314,351,0 chrXV 477629 . G A 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.80;MQ0=0;QD=26.59;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3829,397,0 chrXV 477659 . A G 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.69;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3916,414,0 chrXV 477680 . A G 4076.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.33;MQ0=0;QD=25.01;SB=-2.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4076,438,0 chrXV 477707 . T C 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3530,393,0 chrXV 477734 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.472;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.779;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,74:158:99:1443,0,1775 chrXV 477773 . A G 4391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.0593;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=24.67;SB=-2.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4391,477,0 chrXV 478004 . G A 4229.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=1;QD=27.64;SB=-2.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4229,439,0 chrXV 478033 . G A 1852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.971;DP=166;Dels=0.00;FS=3.603;HaplotypeScore=1.9577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=1;MQRankSum=0.315;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.726;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,85:166:99:1882,0,1535 chrXV 478679 . A G 5322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.34;SB=-2.200e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,210:210:99:5322,538,0 chrXV 478868 . G A 2252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.335;DP=195;Dels=0.00;FS=5.956;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,101:195:99:2282,0,1912 chrXV 479060 . C T 4854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4854,505,0 chrXV 479293 . G T 741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.912;DP=135;Dels=0.01;FS=71.870;HaplotypeScore=79.2875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=5.49;ReadPosRankSum=-5.058;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,84:134:99:771,0,432 chrXV 479299 . T C 1157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.28;MQ0=0;QD=13.77;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1190,129,0 chrXV 479421 . A C 23.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.969;DP=150;Dels=0.00;FS=11.685;HaplotypeScore=159.4339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=0.15;ReadPosRankSum=-4.328;SB=-6.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,8:150:53:53,0,217 chrXV 479529 . G C 4297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.28;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:175:99:4297,459,0 chrXV 479598 . G A 325.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.526;DP=199;Dels=0.00;FS=9.896;HaplotypeScore=128.2479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.63;MQ0=0;MQRankSum=-6.255;QD=1.63;ReadPosRankSum=-7.102;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,34:199:99:355,0,2923 chrXV 479601 . G A 260.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.700;DP=195;Dels=0.00;FS=11.939;HaplotypeScore=126.2574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=-6.854;QD=1.33;ReadPosRankSum=-7.933;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,32:195:99:290,0,2930 chrXV 479603 . T A 260.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.775;DP=198;Dels=0.00;FS=8.480;HaplotypeScore=124.2680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=-6.027;QD=1.31;ReadPosRankSum=-7.614;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,31:198:99:290,0,3078 chrXV 479604 . A G 555.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.475;DP=201;Dels=0.00;FS=13.729;HaplotypeScore=124.2680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.730;QD=2.76;ReadPosRankSum=2.664;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,72:201:99:585,0,2775 chrXV 479709 . G A 5848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=24.27;SB=-2.304e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,239:241:99:5848,583,0 chrXV 480012 . G A 1600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.296;DP=160;Dels=0.00;FS=2.034;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.763;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.285;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,87:160:99:1630,0,1388 chrXV 480090 . C T 4903.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.94;SB=-2.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4903,493,0 chrXV 480144 . G A 4749.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.67;SB=-2.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4749,481,0 chrXV 480186 . T C 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.91;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3801,402,0 chrXV 480336 . A G 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=23.17;SB=-2.078e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:3776,399,0 chrXV 480519 . C G 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;DP=148;Dels=0.00;FS=2.132;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.985;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1617,0,1398 chrXV 480576 . C A 2063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;DP=197;Dels=0.00;FS=4.380;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.856;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.567;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,103:197:99:2093,0,1942 chrXV 480866 . C T 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.743;DP=158;Dels=0.00;FS=11.195;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.097;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1572,0,1648 chrXV 480906 . G A 3845.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3845,403,0 chrXV 480946 . C T 4180.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4180,439,0 chrXV 481165 . A G 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=21.28;SB=-2.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:3618,393,0 chrXV 481267 . G A 2179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.304;DP=170;Dels=0.00;FS=2.772;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.231;SB=-9.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,102:170:99:2209,0,1167 chrXV 481308 . C T 4663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.20;SB=-2.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4663,469,0 chrXV 481447 . T C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.235;DP=161;Dels=0.00;FS=2.009;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.498;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,69:161:99:1350,0,1961 chrXV 481588 . C T 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.416;DP=140;Dels=0.00;FS=2.157;HaplotypeScore=3.6221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1518,0,1195 chrXV 481714 . T A 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;DP=181;Dels=0.00;FS=5.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.796;SB=-8.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,84:181:99:1675,0,2104 chrXV 481731 . C T 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.548;DP=169;Dels=0.00;FS=2.018;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.604;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,78:169:99:1523,0,1801 chrXV 481843 . T C 4805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:199:99:4805,486,0 chrXV 481860 . T A 1947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.279;DP=186;Dels=0.00;FS=1.825;HaplotypeScore=4.8238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.059;SB=-9.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,93:186:99:1977,0,1904 chrXV 481885 . C T 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.668;DP=164;Dels=0.00;FS=2.789;HaplotypeScore=2.9195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.609;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1707,0,1721 chrXV 482096 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.383;DP=143;Dels=0.00;FS=4.991;HaplotypeScore=2.3056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1522,0,1364 chrXV 482179 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.079;DP=167;Dels=0.00;FS=0.573;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=0.173;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.431;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,71:167:99:1439,0,1991 chrXV 482267 . C T 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.493;DP=149;Dels=0.00;FS=2.087;HaplotypeScore=2.7622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.320;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:149:99:1645,0,1403 chrXV 482608 . G A 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.37;SB=-2.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3875,388,0 chrXV 483363 . A G 4423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.17;SB=-2.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:4423,465,0 chrXV 483751 . T C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.084;DP=127;Dels=0.00;FS=8.118;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.138;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:127:99:1201,0,1537 chrXV 483960 . T A 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.520;DP=145;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.360;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1606,0,1514 chrXV 483971 . C T 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3795,379,0 chrXV 484011 . T C 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.655;DP=128;Dels=0.00;FS=5.358;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=9.54;ReadPosRankSum=-2.543;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1251,0,1533 chrXV 484137 . T C 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.044;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1180,0,1532 chrXV 484175 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.707;DP=148;Dels=0.00;FS=1.285;HaplotypeScore=2.4805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1484,0,1605 chrXV 484332 . T C 2807 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2840,294,0 chrXV 484466 . G A 1819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.622;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=11.16;ReadPosRankSum=2.508;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1849,0,1642 chrXV 484571 . G C 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3368,357,0 chrXV 484584 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.406;DP=127;Dels=0.00;FS=11.529;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.775;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1478,0,1237 chrXV 484716 . A G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.916;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:983,0,1266 chrXV 485031 . A G 4103.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.921;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,157:158:99:4103,426,0 chrXV 485065 . G A 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.755;DP=156;Dels=0.00;FS=4.791;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=10.03;ReadPosRankSum=-2.328;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1595,0,1653 chrXV 485175 . G A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.738;DP=133;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.471;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1327,0,1392 chrXV 485226 . T C 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.494;DP=113;Dels=0.00;FS=3.508;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:938,0,1412 chrXV 485252 . A G 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.649e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3248,336,0 chrXV 485322 . C T 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.579;DP=113;Dels=0.00;FS=4.849;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2911,267,0 chrXV 485478 . G A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.982;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.122;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,59:143:99:1145,0,1691 chrXV 485571 . C T 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3461,343,0 chrXV 485898 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.292;DP=120;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=10.66;ReadPosRankSum=2.044;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:120:99:1309,0,1141 chrXV 485952 . C T 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.926;DP=134;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.667;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1417,0,1331 chrXV 486108 . C T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.294;DP=128;Dels=0.00;FS=2.270;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,53:128:99:1143,0,1566 chrXV 486135 . A G 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3201,336,0 chrXV 486141 . G A 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3197,330,0 chrXV 486192 . T C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.788;DP=126;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.389;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1114,0,1452 chrXV 486303 . T C 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.195;DP=127;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=2.044;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.387;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1215,0,1390 chrXV 486327 . T C 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.776;DP=105;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.479;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1103,0,1035 chrXV 486494 . C T 3511.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3511,349,0 chrXV 486511 . G C 3697.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3697,384,0 chrXV 487275 . C T 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.830;DP=103;Dels=0.00;FS=8.086;HaplotypeScore=2.8494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.555;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:932,0,1229 chrXV 487362 . T A 2358 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.49;MQ0=0;QD=27.42;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2391,240,0 chrXV 487374 . C T 2268 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.20;MQ0=0;QD=26.37;SB=-9.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2301,234,0 chrXV 487406 . G C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.071;DP=90;Dels=0.00;FS=39.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=6.384;QD=11.44;ReadPosRankSum=2.503;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:1060,0,802 chrXV 487418 . T C 696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.237;DP=83;Dels=0.00;FS=28.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-5.960;QD=8.39;ReadPosRankSum=-5.272;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:83:99:726,0,1060 chrXV 487663 . T A 750.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.358;DP=99;Dels=0.00;FS=16.320;HaplotypeScore=7.5969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.400;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:780,0,1336 chrXV 487679 . A G 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.023;DP=103;Dels=0.00;FS=7.969;HaplotypeScore=2.5562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.292;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:710,0,1405 chrXV 487689 . T C 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.541;DP=105;Dels=0.00;FS=24.993;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.363;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:869,0,1310 chrXV 487727 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.513;DP=112;Dels=0.00;FS=8.978;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.538;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1162,0,1218 chrXV 487809 . A G 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2771,285,0 chrXV 487952 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.044;DP=133;Dels=0.00;FS=5.243;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.780;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1234,0,1523 chrXV 488270 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.703;DP=135;Dels=0.00;FS=3.581;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1306,0,1657 chrXV 488280 . T C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.313;DP=143;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.060;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1370,0,1737 chrXV 488285 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.516;DP=145;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.542;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,66:145:99:1279,0,1777 chrXV 488300 . A G 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.743;DP=158;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,70:158:99:1348,0,2024 chrXV 488333 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.683;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.929;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1325,0,1824 chrXV 488360 . A G 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.621;DP=93;Dels=0.00;FS=5.456;HaplotypeScore=4.4928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.127;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:975,0,961 chrXV 488366 . A G 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.433;DP=103;Dels=0.00;FS=7.706;HaplotypeScore=4.5463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.700;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:869,0,1233 chrXV 488381 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.266;DP=114;Dels=0.00;FS=12.048;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.614;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1149,0,1261 chrXV 488435 . C T 902.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.313;DP=107;Dels=0.00;FS=7.679;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.091;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:932,0,1343 chrXV 488780 . A G 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.873;DP=144;Dels=0.00;FS=3.770;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.931;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,78:144:99:1540,0,1411 chrXV 489305 . G A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.529;DP=143;Dels=0.00;FS=12.453;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.763;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,67:143:99:1334,0,1650 chrXV 489366 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.513;DP=149;Dels=0.00;FS=2.992;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.803;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1345,0,1743 chrXV 489440 . G A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.281;DP=129;Dels=0.00;FS=2.239;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1258,0,1452 chrXV 489488 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.800;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.244;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1192,0,1090 chrXV 489491 . C A 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.642;DP=105;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:984,0,1242 chrXV 489625 . C T 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.981;DP=94;Dels=0.00;FS=3.995;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:1016,0,963 chrXV 489674 . C G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;DP=126;Dels=0.00;FS=8.171;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.725;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.412;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1195,0,1461 chrXV 489831 . C A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.446;DP=122;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1147,0,1344 chrXV 489938 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.847;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=10.04;ReadPosRankSum=2.158;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1456,0,1503 chrXV 489971 . T C 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=49.2919;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.267e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2795,309,0 chrXV 490226 . C G 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.860;DP=100;Dels=0.00;FS=6.443;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=7.19;ReadPosRankSum=3.083;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:749,0,1258 chrXV 490253 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.526;DP=115;Dels=0.00;FS=3.472;HaplotypeScore=2.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.608;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1401,0,1020 chrXV 490304 . C T 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.575;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7879;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.286;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3477,328,0 chrXV 490328 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.554;DP=122;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.157;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1415,0,1089 chrXV 490397 . T C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.913;DP=135;Dels=0.00;FS=3.093;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.138;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1377,0,1296 chrXV 490463 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.838;DP=131;Dels=0.00;FS=8.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.043;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1409,0,1292 chrXV 490844 . A T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.525;DP=115;Dels=0.00;FS=6.242;HaplotypeScore=4.9640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.193;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1252,0,1212 chrXV 490882 . T C 615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.687;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQ0=0;MQRankSum=2.597;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.682;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,34:85:99:645,0,1079 chrXV 490896 . T C 1777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.74;MQ0=0;QD=25.39;SB=-8.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1810,183,0 chrXV 490941 . C T 308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.119;DP=58;Dels=0.00;FS=12.530;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.093;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:338,0,822 chrXV 491077 . A G 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.536;DP=99;Dels=0.00;FS=5.254;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1053,0,827 chrXV 491183 . G T 1576.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.291;DP=144;Dels=0.00;FS=2.945;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.510;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1606,0,1357 chrXV 491189 . A G 2874 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=20.53;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:2907,306,0 chrXV 491190 . A G 3053 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.30;MQ0=0;QD=21.06;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3086,318,0 chrXV 491204 . A G 2516 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.16;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2549,273,0 chrXV 491429 . T C 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.357;DP=115;Dels=0.00;FS=3.472;HaplotypeScore=4.5548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.619;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:115:99:1008,0,1372 chrXV 491450 . A G 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.093;DP=114;Dels=0.00;FS=7.711;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.942;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1009,0,1415 chrXV 491483 . C T 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2666,273,0 chrXV 491573 . C G 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;DP=130;Dels=0.00;FS=1.512;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,79:130:99:1673,0,908 chrXV 491651 . T G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.172;DP=110;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.009;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1273,0,959 chrXV 491788 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.250;DP=122;Dels=0.00;FS=2.374;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.371;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:122:99:1401,0,999 chrXV 491810 . T C 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3139,330,0 chrXV 491843 . T A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.115;DP=135;Dels=0.00;FS=5.577;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.380;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1362,0,1581 chrXV 492116 . T C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.049;DP=131;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.375;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1041,0,1685 chrXV 492191 . C G 2731 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2764,297,0 chrXV 492545 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.363;DP=157;Dels=0.00;FS=2.840;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.890;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1376,0,1835 chrXV 492719 . G A 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.027;DP=160;Dels=0.00;FS=2.038;HaplotypeScore=5.6834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.682;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,85:160:99:1843,0,1522 chrXV 492749 . G T 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.749;DP=156;Dels=0.00;FS=2.794;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.454;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1727,0,1500 chrXV 492776 . A G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.355;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.492;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:1309,0,1856 chrXV 492846 . A G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.840;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.328;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1331,0,1407 chrXV 492851 . G A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.789;DP=135;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=2.3609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=11.53;ReadPosRankSum=-2.019;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:135:99:1587,0,1312 chrXV 492941 . C T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.903;DP=112;Dels=0.00;FS=6.011;HaplotypeScore=4.0391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1205,0,1169 chrXV 492962 . C A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.997;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.500;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1171,0,1024 chrXV 493146 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.139;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1219,0,1229 chrXV 493152 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.062;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1132,0,1191 chrXV 493324 . T A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;DP=118;Dels=0.00;FS=3.426;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.869;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:1362,0,995 chrXV 493331 . A G 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.154;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,49:116:99:970,0,1352 chrXV 493377 . T G 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2889,309,0 chrXV 493684 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.696;DP=105;Dels=0.00;FS=1.573;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.901;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1171,0,896 chrXV 493846 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.081;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.839;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.051;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1263,0,1136 chrXV 493903 . G T 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;DP=106;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=3.4540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.771;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1021,0,946 chrXV 493975 . T C 2639 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=24.21;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2672,273,0 chrXV 494161 . T C 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.192;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.670;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,48:87:99:991,0,833 chrXV 494217 . A T 732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.844;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:762,0,1249 chrXV 494571 . A G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.820;DP=141;Dels=0.00;FS=5.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1392,0,1437 chrXV 494719 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.758;DP=139;Dels=0.00;FS=2.266;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.013;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1283,0,1268 chrXV 494952 . C T 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.799;DP=85;Dels=0.00;FS=4.201;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.314;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,51:85:99:1105,0,638 chrXV 495045 . C T 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.786;DP=77;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.553;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,45:77:99:966,0,581 chrXV 495292 . T C 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.196;DP=151;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1582,0,1630 chrXV 495525 . A C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.667;DP=129;Dels=0.00;FS=2.300;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1360,0,1409 chrXV 495702 . A G 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.244;DP=129;Dels=0.00;FS=5.367;HaplotypeScore=4.9182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.366;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1350,0,1228 chrXV 495861 . C T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.036;DP=165;Dels=0.00;FS=3.691;HaplotypeScore=8.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1489,0,1816 chrXV 496393 . C T 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.580;DP=130;Dels=0.00;FS=11.566;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.358;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1043,0,1571 chrXV 496482 . G A 3117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.702;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=26.87;ReadPosRankSum=1.613;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:116:99:3150,316,0 chrXV 496563 . T G 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.333;DP=103;Dels=0.00;FS=4.897;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.624;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1046,0,1086 chrXV 496695 . G A 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.697;DP=119;Dels=0.00;FS=1.495;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.036;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,69:119:99:1570,0,944 chrXV 496731 . A G 1590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.082;DP=147;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.060;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1620,0,1500 chrXV 496734 . G A 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.170;DP=141;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.423;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1554,0,1359 chrXV 496782 . C T 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.338;DP=154;Dels=0.00;FS=1.267;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.973;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.603;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1400,0,1794 chrXV 496813 . T C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.946;DP=138;Dels=0.00;FS=4.154;HaplotypeScore=4.7568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.459;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1417,0,1373 chrXV 497083 . T C 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.303;DP=96;Dels=0.00;FS=2.706;HaplotypeScore=2.9401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.422;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:821,0,1263 chrXV 497186 . T C 625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.597;DP=73;Dels=0.00;FS=4.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.272;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:655,0,921 chrXV 497240 . T A 640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.314;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-2.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:670,0,782 chrXV 497271 . A G 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.805;DP=92;Dels=0.00;FS=2.773;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.269;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.235;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,43:92:99:834,0,1049 chrXV 497288 . G A 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.348;DP=95;Dels=0.00;FS=2.818;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.541;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:893,0,1071 chrXV 497299 . A C 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.069;DP=92;Dels=0.00;FS=2.929;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.156;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:928,0,1000 chrXV 497301 . C A 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;DP=92;Dels=0.00;FS=2.929;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,45:92:99:944,0,980 chrXV 497400 . T C 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.429;DP=105;Dels=0.00;FS=3.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=2.230;QD=7.19;ReadPosRankSum=2.657;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,41:105:99:785,0,1460 chrXV 497401 . C T 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.429;DP=111;Dels=0.00;FS=4.980;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=6.98;ReadPosRankSum=2.885;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,42:111:99:805,0,1514 chrXV 497456 . C G 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.575;DP=96;Dels=0.00;FS=5.158;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1161,0,882 chrXV 497758 . A G 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.306;DP=140;Dels=0.00;FS=7.970;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.670;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1554,0,1375 chrXV 497904 . G A 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.862;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.656;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1226,0,1219 chrXV 498007 . A G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.611;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.213;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1061,0,1797 chrXV 498055 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.295;DP=129;Dels=0.00;FS=5.609;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.512;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1307,0,1455 chrXV 498202 . A G 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.338;DP=124;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1306,0,1235 chrXV 498820 . A T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.950;DP=141;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.245;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1392,0,1584 chrXV 498939 . G A 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.973;DP=145;Dels=0.00;FS=7.594;HaplotypeScore=1.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.718;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1666,0,1427 chrXV 499432 . T C 592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.895;DP=81;Dels=0.00;FS=0.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,35:81:99:622,0,1065 chrXV 499893 . A G 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.665;DP=94;Dels=0.00;FS=0.919;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.465;SB=-2.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:871,0,1076 chrXV 500359 . C A 3079 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3112,310,0 chrXV 500665 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.789;DP=139;Dels=0.00;FS=1.359;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=3.023;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.603;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1466,0,1475 chrXV 501732 . A C 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3491,366,0 chrXV 501919 . T C 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.405e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:2923,309,0 chrXV 502060 . C T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.254;DP=130;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.244;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1391,0,1400 chrXV 502258 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.756;DP=136;Dels=0.00;FS=2.242;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1286,0,1533 chrXV 502423 . A T 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;DP=150;Dels=0.00;FS=3.005;HaplotypeScore=5.7963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.448;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1728,0,1458 chrXV 502474 . G C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.844;DP=146;Dels=0.00;FS=3.930;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.232;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.922;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1436,0,1362 chrXV 502484 . A G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.935;DP=144;Dels=0.00;FS=3.933;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.526;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1337,0,1546 chrXV 502590 . G A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.255;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.758;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.583;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1030,0,1527 chrXV 502621 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.820;DP=136;Dels=0.00;FS=5.387;HaplotypeScore=2.3196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.732;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,55:136:99:1114,0,1830 chrXV 502942 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.542;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.391;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,64:110:99:1415,0,789 chrXV 503533 . G A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.948;DP=115;Dels=0.00;FS=5.847;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=9.37;ReadPosRankSum=-2.121;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1107,0,1287 chrXV 503561 . G C 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;DP=128;Dels=0.00;FS=11.245;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.983;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1130,0,1330 chrXV 503873 . A G 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.686;DP=169;Dels=0.00;FS=10.812;HaplotypeScore=2.5061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.269;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,89:169:99:1839,0,1707 chrXV 503975 . T C 3637.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3637,372,0 chrXV 504206 . A T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;DP=135;Dels=0.00;FS=4.084;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.652;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1397,0,1444 chrXV 504284 . G A 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.489;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.411;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1530,0,1502 chrXV 504323 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.438;DP=144;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1489,0,1503 chrXV 504745 . C G 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.660;DP=146;Dels=0.01;FS=2.151;HaplotypeScore=15.7948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.078;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,87:145:99:1880,0,1039 chrXV 504774 . T C 1854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=1;MQRankSum=0.693;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.386;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,89:151:99:1884,0,1272 chrXV 504794 . A T 4059.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=1;QD=27.43;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4059,409,0 chrXV 504874 . A G 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.624;DP=140;Dels=0.00;FS=2.133;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1540,0,1437 chrXV 504884 . A G 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.447;DP=139;Dels=0.00;FS=6.280;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.435;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1550,0,1405 chrXV 504928 . T G 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.875;DP=141;Dels=0.00;FS=0.639;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.852;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1382,0,1500 chrXV 504931 . T A 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=143;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.411;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1525,0,1493 chrXV 504988 . A G 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.656;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.967;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1393,0,1359 chrXV 504994 . T A 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.884;DP=133;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=2.403;QD=10.18;ReadPosRankSum=2.362;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:133:99:1384,0,1411 chrXV 505011 . C G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;DP=111;Dels=0.01;FS=0.733;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=9.28;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1060,0,1164 chrXV 505109 . T C 1598.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.077;DP=175;Dels=0.00;FS=3.467;HaplotypeScore=4.1420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,85:175:99:1628,0,1824 chrXV 505164 . A T 1764.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.301;DP=161;Dels=0.00;FS=2.828;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.164;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1794,0,1573 chrXV 505308 . T G 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.217;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=1;MQRankSum=-1.882;QD=10.46;ReadPosRankSum=2.564;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1411,0,1369 chrXV 505358 . A G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.802;DP=146;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=1;MQRankSum=-3.420;QD=8.62;ReadPosRankSum=-1.781;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,63:146:99:1288,0,1788 chrXV 505372 . A C 983.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.082;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.67;MQ0=1;MQRankSum=-5.408;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.087;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,56:141:99:1013,0,1867 chrXV 505374 . C T 1014.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.148;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=1;MQRankSum=-6.758;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,53:140:99:1044,0,1783 chrXV 505376 . T C 938.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.898;DP=142;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=1;MQRankSum=-5.456;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,54:142:99:968,0,1917 chrXV 505381 . A G 972.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.424;DP=142;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQ0=1;MQRankSum=-6.517;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,54:142:99:1002,0,1961 chrXV 505415 . G A 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.876;DP=115;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.94;MQ0=0;MQRankSum=-5.373;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.136;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,43:115:99:850,0,1536 chrXV 505483 . G A 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3414,340,0 chrXV 505528 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.115;DP=165;Dels=0.00;FS=1.961;HaplotypeScore=4.3407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=8.96;ReadPosRankSum=2.431;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,76:165:99:1508,0,1730 chrXV 505541 . C G 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4168,426,0 chrXV 505980 . T G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;DP=135;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.412;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1249,0,1574 chrXV 506101 . C A 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.799;DP=133;Dels=0.00;FS=6.058;HaplotypeScore=3.9482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.493;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1125,0,1691 chrXV 506166 . T C 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.511;DP=145;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=-0.124;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1589,0,1411 chrXV 506209 . T C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.701;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=1;MQRankSum=-1.186;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.564;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1310,0,1679 chrXV 507053 . G A 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.975;DP=144;Dels=0.00;FS=7.365;HaplotypeScore=4.7577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,73:144:99:1582,0,1467 chrXV 507079 . C T 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.110;DP=131;Dels=0.00;FS=2.273;HaplotypeScore=5.5190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.422;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1262,0,1480 chrXV 507308 . A G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.205;DP=126;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.086;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1320,0,1355 chrXV 507600 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.186;DP=117;Dels=0.00;FS=3.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.992;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1112,0,1299 chrXV 507793 . A G 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.658;DP=170;Dels=0.00;FS=7.080;HaplotypeScore=4.6285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.772;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,91:170:99:1892,0,1754 chrXV 507805 . T C 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.881;DP=162;Dels=0.00;FS=4.750;HaplotypeScore=3.7457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.955;QD=8.43;ReadPosRankSum=-3.458;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,74:162:99:1396,0,1945 chrXV 508131 . G A 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.462;DP=145;Dels=0.00;FS=0.634;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.125;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1540,0,1455 chrXV 508178 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.361;DP=133;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1327,0,1454 chrXV 508274 . G A 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.119;DP=135;Dels=0.00;FS=4.437;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.321;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,79:135:99:1742,0,1063 chrXV 508404 . A C 2890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.324e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:115:99:2923,306,0 chrXV 508412 . C T 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.851;DP=123;Dels=0.00;FS=6.936;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=12.97;ReadPosRankSum=-1.553;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:1625,0,985 chrXV 508557 . T C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.990;DP=118;Dels=0.00;FS=6.915;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.049;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.623;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1160,0,1269 chrXV 508682 . T C 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.928;DP=166;Dels=0.00;FS=2.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.148;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,82:166:99:1595,0,1715 chrXV 508701 . A T 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=159;Dels=0.00;FS=1.243;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.186;QD=10.94;ReadPosRankSum=-2.086;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1770,0,1530 chrXV 508868 . A G 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.735;DP=132;Dels=0.00;FS=3.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=25.03;ReadPosRankSum=0.787;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:3304,318,0 chrXV 509034 . T G 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3590,384,0 chrXV 509214 . G C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.004;DP=129;Dels=0.01;FS=3.261;HaplotypeScore=9.5660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.792;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1326,0,1267 chrXV 509620 . T C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.964;DP=100;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.207;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1090,0,1102 chrXV 509802 . T C 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.089;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.411;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:847,0,993 chrXV 509804 . C T 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.519;DP=97;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=20.7461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.665;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:845,0,947 chrXV 509814 . C T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.400;DP=97;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=2.9288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=10.03;ReadPosRankSum=2.007;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,45:97:99:1003,0,1100 chrXV 509969 . T C 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.154;DP=92;Dels=0.00;FS=9.420;HaplotypeScore=3.7828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.787;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:92:99:1111,0,797 chrXV 510299 . C T 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.363;DP=139;Dels=0.00;FS=2.204;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.681;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,83:139:99:1824,0,1114 chrXV 510435 . C T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.959;DP=148;Dels=0.00;FS=6.158;HaplotypeScore=5.7695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.693;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,61:148:99:1232,0,1860 chrXV 510505 . T G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.627;DP=115;Dels=0.00;FS=5.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1168,0,1087 chrXV 510586 . C T 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.511;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.235;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1140,0,1210 chrXV 510649 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.685;DP=137;Dels=0.00;FS=4.111;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.005;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:1124,0,1697 chrXV 510684 . G A 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.128;DP=122;Dels=0.00;FS=2.432;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.718;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1216,0,1255 chrXV 510696 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.681;DP=127;Dels=0.00;FS=2.412;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.779;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:127:99:1176,0,1406 chrXV 510977 . C T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.471;DP=143;Dels=0.00;FS=5.738;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.113;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1387,0,1655 chrXV 511142 . G A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.947;DP=130;Dels=0.00;FS=4.779;HaplotypeScore=3.9118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.196;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:1075,0,1562 chrXV 511243 . T A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.454;DP=135;Dels=0.00;FS=1.382;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.253;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1373,0,1522 chrXV 511380 . T C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.815;DP=116;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.137;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:931,0,1502 chrXV 511443 . T C 4225.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4225,438,0 chrXV 511893 . C T 3885.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.79;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3885,396,0 chrXV 511995 . A G 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.448;DP=152;Dels=0.00;FS=6.138;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1535,0,1597 chrXV 512025 . C T 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.197;DP=165;Dels=0.00;FS=9.786;HaplotypeScore=2.8104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.632;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,87:165:99:1825,0,1533 chrXV 512238 . A G 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.209;DP=140;Dels=0.00;FS=2.123;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.422;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1565,0,1373 chrXV 512256 . G T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.315;DP=140;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.726;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1466,0,1506 chrXV 512566 . G T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.238;DP=123;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:990,0,1554 chrXV 512726 . G A 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.211;DP=110;Dels=0.00;FS=6.135;HaplotypeScore=6.5284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:987,0,1126 chrXV 512793 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.590;DP=134;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.771;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1377,0,1302 chrXV 512820 . C T 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.350;DP=113;Dels=0.00;FS=5.851;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1305,0,1047 chrXV 513015 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.108;DP=117;Dels=0.00;FS=0.745;HaplotypeScore=3.5355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.077;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1198,0,1221 chrXV 513219 . A G 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.628;DP=108;Dels=0.00;FS=1.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.114;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,60:108:99:1256,0,1018 chrXV 513337 . A G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.815;DP=93;Dels=0.00;FS=8.568;HaplotypeScore=6.3977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.963;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,54:93:99:1072,0,817 chrXV 513394 . A G 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.074;DP=117;Dels=0.00;FS=1.577;HaplotypeScore=3.2980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:938,0,1285 chrXV 513607 . A T 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.950;DP=123;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=3.4880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=2.965;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1083,0,1594 chrXV 513637 . A T 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.419;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1030,0,1562 chrXV 513691 . A C 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.042;DP=124;Dels=0.00;FS=3.255;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1335,0,1152 chrXV 514239 . T C 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.336;DP=101;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.450;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:101:99:1104,0,903 chrXV 514344 . T C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.074;DP=139;Dels=0.00;FS=2.212;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1346,0,1466 chrXV 514366 . C T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.690;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1629,0,1457 chrXV 514397 . A C 1517.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.618;DP=141;Dels=0.00;FS=1.321;HaplotypeScore=6.5903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.749;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:141:99:1547,0,1405 chrXV 514400 . C T 1651.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.758;DP=140;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=7.1687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.381;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1681,0,1218 chrXV 514405 . G T 1180.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.572;DP=137;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=4.7661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=2.029;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.000;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:1210,0,1739 chrXV 514435 . T G 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.244;DP=133;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=4.5199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.207;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,80:133:99:1711,0,1088 chrXV 514625 . C T 3227.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6076;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.23;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.325e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3260,327,0 chrXV 514713 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.737;DP=129;Dels=0.00;FS=30.928;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.28;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.555;SB=-1.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1263,0,1370 chrXV 514715 . T C 3059 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.16;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3092,336,0 chrXV 514738 . G C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.357;DP=133;Dels=0.00;FS=16.420;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1205,0,1359 chrXV 514746 . T C 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.113;DP=125;Dels=0.00;FS=8.279;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1105,0,1519 chrXV 514832 . G A 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.385;DP=133;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=2.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.33;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.016;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1672,0,1108 chrXV 514879 . A G 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.108;DP=67;Dels=0.00;FS=93.025;HaplotypeScore=44.7574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.19;MQ0=0;MQRankSum=-4.770;QD=0.58;ReadPosRankSum=2.589;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:69:69,0,681 chrXV 514882 . T A 466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.130;DP=61;Dels=0.00;FS=21.152;HaplotypeScore=46.4425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.97;MQ0=0;MQRankSum=-3.168;QD=7.64;ReadPosRankSum=2.435;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:496,0,411 chrXV 514929 . G A 60.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.241;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=116.3710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.62;MQ0=0;MQRankSum=-4.658;QD=0.73;ReadPosRankSum=-4.312;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:90:90,0,758 chrXV 514939 . G A 92.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;DP=81;Dels=0.00;FS=65.682;HaplotypeScore=33.7381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.990;QD=1.14;ReadPosRankSum=-5.987;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:122,0,736 chrXV 514953 . T C 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.736;DP=60;Dels=0.00;FS=16.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.63;MQ0=0;MQRankSum=-3.989;QD=0.20;ReadPosRankSum=-4.068;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:42:42,0,897 chrXV 514974 . A G 34.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.275;DP=77;Dels=0.00;FS=16.026;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQ0=0;MQRankSum=-3.126;QD=0.44;ReadPosRankSum=-1.541;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:64:64,0,1394 chrXV 515034 . G A 1753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.77;MQ0=0;QD=25.04;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1786,186,0 chrXV 515073 . T A 1484 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.05;MQ0=0;QD=20.90;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1517,159,0 chrXV 515077 . A C 1449 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=61.6061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;QD=23.00;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1482,159,0 chrXV 515081 . C T 1457 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=61.6061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;QD=23.13;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1490,156,0 chrXV 515090 . G C 1369 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=59.5955;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.04;MQ0=0;QD=22.08;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1402,153,0 chrXV 515094 . T C 1377 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=58.6290;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.03;MQ0=0;QD=20.86;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1410,156,0 chrXV 515098 . A C 1398 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.03;MQ0=0;QD=20.56;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1431,156,0 chrXV 515105 . A G 1384 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.90;MQ0=0;QD=19.77;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1417,156,0 chrXV 515116 . T C 1890 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.79;MQ0=0;QD=21.24;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:1923,213,0 chrXV 515119 . G A 1611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.74;MQ0=0;QD=21.77;SB=-9.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1644,174,0 chrXV 515138 . G A 1722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.62;MQ0=0;QD=22.96;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1755,189,0 chrXV 515159 . C T 1631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.14;MQ0=0;QD=23.64;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1664,177,0 chrXV 515214 . G A 1925 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.11;MQ0=0;QD=22.92;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1958,207,0 chrXV 515215 . T C 584.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.350;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.413;SB=-2.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,39:84:99:614,0,909 chrXV 515219 . C G 552.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.704;DP=85;Dels=0.00;FS=0.918;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.045;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.179;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,39:85:99:582,0,906 chrXV 515252 . A C 2014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.99;MQ0=0;QD=21.89;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2047,219,0 chrXV 515279 . G A 2317 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9458;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.48;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=22.50;ReadPosRankSum=0.992;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2350,217,0 chrXV 515324 . A G 2134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.99;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2167,225,0 chrXV 515378 . T C 1925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.82;MQ0=0;QD=22.38;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:1958,201,0 chrXV 515441 . T C 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.65;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2469,267,0 chrXV 515471 . A G 2826 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2859,303,0 chrXV 515506 . T C 3612.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.99;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3612,378,0 chrXV 515571 . G A 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.317;DP=135;Dels=0.00;FS=4.208;HaplotypeScore=4.7976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.742;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1521,0,1338 chrXV 515672 . G A 2220 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.56;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2253,234,0 chrXV 515705 . G C 2182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.45;MQ0=0;QD=22.73;SB=-1.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2215,240,0 chrXV 515720 . C T 2268 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:98:99:2301,240,0 chrXV 515726 . C T 2078 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.76;MQ0=0;QD=21.42;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2111,219,0 chrXV 515728 . A G 1982 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.76;MQ0=0;QD=20.43;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2015,216,0 chrXV 515780 . T C 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.78;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2668,285,0 chrXV 515805 . A T 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.94;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3355,334,0 chrXV 515884 . T C 2593 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.254;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.9707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.82;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=24.23;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,105:107:99:2626,288,0 chrXV 515885 . C T 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.3924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.45;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=25.62;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:104:99:2697,288,0 chrXV 515918 . C T 2489 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.630;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.645;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2522,276,0 chrXV 515927 . G A 2070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.78;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2103,228,0 chrXV 515935 . T C 2003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.22;MQ0=0;QD=23.29;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2036,231,0 chrXV 515948 . T C 2053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.69;MQ0=0;QD=23.33;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2086,243,0 chrXV 515981 . C T 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.177;DP=121;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=3.8242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.261;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,71:121:99:1601,0,904 chrXV 516043 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.258;DP=109;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.03;MQ0=0;MQRankSum=2.257;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.149;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1309,0,966 chrXV 516055 . G A 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.412;DP=103;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.500;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:864,0,1261 chrXV 516062 . T C 640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.270;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,38:99:99:670,0,1291 chrXV 516077 . C T 526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.657;DP=89;Dels=0.00;FS=2.878;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.600;QD=5.91;ReadPosRankSum=-2.406;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,35:89:99:556,0,1148 chrXV 516084 . T G 532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.739;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.82;MQ0=0;MQRankSum=-3.161;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,35:92:99:562,0,1278 chrXV 516118 . A G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.729;DP=111;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1028,0,1197 chrXV 516136 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.109;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.173;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1368,0,1336 chrXV 516140 . A G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.978;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.714;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1287,0,1323 chrXV 516181 . C T 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.17;MQ0=0;QD=25.35;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2974,309,0 chrXV 516212 . G A 2006 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.79;MQ0=0;QD=24.77;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2039,222,0 chrXV 516229 . T A 1752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.61;MQ0=0;QD=23.68;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1785,195,0 chrXV 516230 . G A 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.973;DP=74;Dels=0.00;FS=4.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.61;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.076;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,39:74:99:715,0,651 chrXV 516244 . A G 1607 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.39;MQ0=0;QD=22.01;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1640,192,0 chrXV 516246 . C T 1676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.37;MQ0=0;QD=23.28;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1709,189,0 chrXV 516270 . C T 1981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.58;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2014,216,0 chrXV 516275 . C T 1728 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.12;MQ0=0;QD=22.74;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1761,189,0 chrXV 516335 . A C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.648;DP=108;Dels=0.00;FS=1.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.54;MQ0=0;MQRankSum=-3.317;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.206;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1021,0,1136 chrXV 516336 . C T 2746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.84;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2779,288,0 chrXV 516351 . C T 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.93;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2928,303,0 chrXV 516357 . T G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.050;DP=110;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.33;MQ0=0;MQRankSum=1.543;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.473;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1064,0,1204 chrXV 516412 . T C 3875.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.53;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3875,417,0 chrXV 516432 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.596;DP=138;Dels=0.00;FS=0.886;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=2.123;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.561;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1481,0,1472 chrXV 516539 . A G 1918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.25;MQ0=0;QD=25.24;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1951,213,0 chrXV 516665 . C T 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.24;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3564,358,0 chrXV 516689 . G A 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.43;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:106:99:2841,288,0 chrXV 516707 . T C 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.92;MQ0=0;QD=24.86;SB=-8.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2668,282,0 chrXV 516828 . G A 2262 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.93;MQ0=0;QD=26.00;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2295,240,0 chrXV 516832 . C T 2168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.14;MQ0=0;QD=25.81;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:84:99:2201,228,0 chrXV 516857 . C T 1688 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.94;MQ0=0;QD=25.58;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1721,180,0 chrXV 516859 . C G 1620 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.94;MQ0=0;QD=24.55;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:1653,180,0 chrXV 516864 . C T 1668 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.31;MQ0=0;QD=24.53;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1701,180,0 chrXV 516871 . T C 1715 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.64;MQ0=0;QD=24.86;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1748,189,0 chrXV 516893 . G A 1782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.90;MQ0=0;QD=25.83;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1815,192,0 chrXV 516896 . G A 1874 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.27;MQ0=0;QD=25.32;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1907,201,0 chrXV 517028 . A G 724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.958;DP=89;Dels=0.00;FS=5.333;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.179;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:754,0,1095 chrXV 517039 . C G 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;DP=99;Dels=0.00;FS=3.772;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.57;MQ0=0;MQRankSum=4.637;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.940;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1094,0,844 chrXV 517060 . C T 599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.411;DP=89;Dels=0.00;FS=7.086;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=0;MQRankSum=-4.973;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,33:89:99:629,0,1140 chrXV 517074 . T C 591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.088;DP=96;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQ0=0;MQRankSum=-6.255;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,36:96:99:621,0,1330 chrXV 517088 . C G 537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.814;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=-6.897;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.043;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,35:96:99:567,0,1284 chrXV 517101 . T C 586.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.831;DP=89;Dels=0.00;FS=0.827;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.90;MQ0=0;MQRankSum=-7.925;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.941;SB=-2.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:616,0,1139 chrXV 517102 . T C 567.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.220;DP=89;Dels=0.00;FS=0.827;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.90;MQ0=0;MQRankSum=-7.270;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.668;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:597,0,1148 chrXV 517105 . T C 1081.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.956;DP=93;Dels=0.00;FS=1.726;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQ0=0;MQRankSum=6.895;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.128;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:1111,0,658 chrXV 517115 . C G 699.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;DP=97;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=2.9050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.91;MQ0=0;MQRankSum=-6.163;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:729,0,1177 chrXV 517134 . C T 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.717;DP=96;Dels=0.00;FS=6.959;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.01;MQ0=0;MQRankSum=-2.408;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.621;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,44:96:99:834,0,1047 chrXV 517167 . G T 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.623;DP=90;Dels=0.00;FS=3.017;HaplotypeScore=6.8669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.561;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:954,0,959 chrXV 517216 . T C 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3968;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.27;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2755,294,0 chrXV 517243 . A G 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.412;DP=88;Dels=0.00;FS=2.850;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=8.80;ReadPosRankSum=-2.307;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:804,0,1022 chrXV 517285 . C T 552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.278;DP=95;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.544;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.097;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:582,0,1217 chrXV 517286 . T C 571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.153;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:601,0,1046 chrXV 517301 . T C 525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.275;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.773;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.395;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:555,0,859 chrXV 517404 . C T 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.077;DP=87;Dels=0.00;FS=0.849;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=2.556;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.422;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,39:87:99:777,0,1028 chrXV 517410 . C G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1069,0,919 chrXV 517420 . C T 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.671;DP=90;Dels=0.00;FS=1.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.557;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1077,0,799 chrXV 517528 . C T 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.461;DP=100;Dels=0.00;FS=0.837;HaplotypeScore=3.6672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.095;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:100:99:1089,0,875 chrXV 517533 . C A 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.907;DP=90;Dels=0.00;FS=1.844;HaplotypeScore=3.6672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=-4.158;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.743;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,47:90:99:908,0,797 chrXV 517619 . G A 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.356;DP=110;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=3.5601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.62;MQ0=0;MQRankSum=-4.119;QD=6.64;ReadPosRankSum=-1.577;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:110:99:760,0,1304 chrXV 517635 . C T 518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.795;DP=116;Dels=0.00;FS=10.859;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQ0=0;MQRankSum=-4.886;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.601;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,41:116:99:548,0,1652 chrXV 517639 . G A 348.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.974;DP=85;Dels=0.00;FS=14.498;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.76;MQ0=0;MQRankSum=-4.630;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.933;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,29:85:99:378,0,1252 chrXV 517647 . C T 349.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.789;DP=82;Dels=0.00;FS=12.167;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.14;MQ0=0;MQRankSum=-4.043;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.912;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:379,0,1193 chrXV 517648 . G A 394.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.745;DP=78;Dels=0.00;FS=14.907;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.49;MQ0=0;MQRankSum=-3.765;QD=5.05;ReadPosRankSum=1.338;SB=-1.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,28:78:99:424,0,1021 chrXV 517707 . A C 709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.503;DP=126;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,42:126:99:739,0,1718 chrXV 517775 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.938;DP=118;Dels=0.00;FS=2.362;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1411,0,1027 chrXV 517989 . G A 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.059;DP=135;Dels=0.00;FS=5.497;HaplotypeScore=9.9240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,55:135:99:1106,0,1737 chrXV 518151 . A G 3671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.49;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3671,367,0 chrXV 518299 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.529;DP=115;Dels=0.00;FS=1.510;HaplotypeScore=2.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:115:99:1150,0,1192 chrXV 518346 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.578;DP=137;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=2.7714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1287,0,1615 chrXV 518509 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.828;DP=135;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=2.678;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1444,0,1453 chrXV 518604 . T G 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.095;DP=101;Dels=0.00;FS=3.675;HaplotypeScore=3.9506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.834;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:101:99:978,0,1088 chrXV 518700 . A G 1917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;QD=23.67;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1950,219,0 chrXV 518701 . C T 1988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.10;MQ0=0;QD=24.54;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2021,210,0 chrXV 518717 . T C 769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.203;DP=86;Dels=0.00;FS=3.298;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.28;MQ0=0;MQRankSum=-4.255;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:86:99:799,0,859 chrXV 518743 . G A 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.235;DP=122;Dels=0.00;FS=2.586;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.65;MQ0=0;MQRankSum=-6.630;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.673;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1282,0,1119 chrXV 518748 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.223;DP=116;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.29;MQ0=0;MQRankSum=-7.488;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1015,0,1241 chrXV 518763 . G A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.742;DP=133;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=5.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-6.769;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.478;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,59:133:99:1086,0,1496 chrXV 518776 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.767;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=0;MQRankSum=-5.130;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.617;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1093,0,1540 chrXV 518808 . G A 1006.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;DP=129;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=6.6797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQ0=0;MQRankSum=-4.889;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1036,0,1627 chrXV 518810 . T C 949.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.903;DP=130;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=7.6531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.41;MQ0=0;MQRankSum=-4.446;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:130:99:979,0,1684 chrXV 518814 . T C 1069.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.660;DP=136;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=6.8209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.77;MQ0=0;MQRankSum=-4.607;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.336;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:136:99:1099,0,1725 chrXV 518865 . A G 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.736;DP=139;Dels=0.00;FS=2.457;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,82:139:99:1678,0,1181 chrXV 518877 . C G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.963;DP=134;Dels=0.00;FS=1.635;HaplotypeScore=4.2444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.340;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,51:134:99:1036,0,1726 chrXV 519037 . A C 2740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2773,309,0 chrXV 519048 . T A 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3025,309,0 chrXV 519085 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.511;DP=101;Dels=0.00;FS=5.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1164,0,953 chrXV 519111 . A C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.15;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2931,324,0 chrXV 519348 . G A 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.472;DP=129;Dels=0.00;FS=1.396;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.067;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:855,0,1637 chrXV 519349 . G T 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.622;DP=128;Dels=0.00;FS=1.414;HaplotypeScore=2.7258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.608;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:848,0,1621 chrXV 519471 . T C 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.365;DP=99;Dels=0.02;FS=0.759;HaplotypeScore=9.6446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.712;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1053,0,974 chrXV 519516 . C G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;DP=147;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=2.3235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.974;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.385;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1425,0,1464 chrXV 519651 . A G 4257.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.04;SB=-2.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4257,435,0 chrXV 520009 . G A 4438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=1;QD=25.80;SB=-2.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4438,445,0 chrXV 520142 . G C 4039.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.984e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4039,408,0 chrXV 520262 . A T 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=120;Dels=0.00;FS=2.394;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.726;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:120:99:967,0,1570 chrXV 520282 . G A 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.798;DP=132;Dels=0.00;FS=2.220;HaplotypeScore=2.6365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,75:132:99:1636,0,1131 chrXV 520321 . C G 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.897e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3786,396,0 chrXV 520330 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.355;DP=136;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1365,0,1554 chrXV 520372 . G A 2961 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2994,318,0 chrXV 520488 . G T 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.257;DP=125;Dels=0.00;FS=9.728;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.462;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1139,0,1351 chrXV 520499 . A T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.058;DP=120;Dels=0.00;FS=5.595;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1423,0,1082 chrXV 520515 . T G 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=61.7935;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.49;MQ0=0;QD=24.12;SB=-1.408e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3072,327,0 chrXV 520530 . G C 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.497;DP=139;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.916;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1507,0,1244 chrXV 520650 . T C 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.75;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2986,315,0 chrXV 520667 . G T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.163;DP=124;Dels=0.00;FS=5.610;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=8.99;ReadPosRankSum=-2.093;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1145,0,1258 chrXV 520674 . C A 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.02;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3447,357,0 chrXV 520701 . A T 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3743,387,0 chrXV 520730 . G A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.170;DP=121;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.718;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,73:121:99:1504,0,838 chrXV 520731 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.609;DP=125;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.078;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,74:125:99:1469,0,938 chrXV 520774 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.838;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1351,0,857 chrXV 520872 . T C 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.415;DP=102;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:850,0,1282 chrXV 520899 . A G 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.517;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:966,0,1306 chrXV 521151 . T C 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.941;DP=147;Dels=0.00;FS=1.366;HaplotypeScore=2.4485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.258;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:147:99:1711,0,1358 chrXV 521161 . C T 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.500;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.825;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1662,0,1739 chrXV 521292 . C T 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;DP=136;Dels=0.00;FS=4.259;HaplotypeScore=2.2702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.676;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1308,0,1469 chrXV 521415 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.190;DP=154;Dels=0.00;FS=7.132;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.701;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1579,0,1579 chrXV 521442 . G C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.766;DP=157;Dels=0.00;FS=8.436;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1562,0,1670 chrXV 521445 . G A 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.941;DP=155;Dels=0.00;FS=10.051;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.768;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1600,0,1673 chrXV 521470 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.358;DP=127;Dels=0.00;FS=10.005;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1413,0,1290 chrXV 521639 . A T 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.743;DP=112;Dels=0.00;FS=4.952;HaplotypeScore=3.6795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=9.86;ReadPosRankSum=2.454;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1134,0,1196 chrXV 521647 . T A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.849;DP=114;Dels=0.00;FS=4.818;HaplotypeScore=4.4838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=9.11;ReadPosRankSum=3.246;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1069,0,1300 chrXV 521652 . T A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;DP=118;Dels=0.01;FS=4.652;HaplotypeScore=8.4086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.775;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1136,0,1278 chrXV 521664 . C G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.020;DP=122;Dels=0.00;FS=3.304;HaplotypeScore=4.6019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=1;MQRankSum=-0.725;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1235,0,1093 chrXV 521727 . T C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.896;DP=127;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=3.8422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=1;MQRankSum=0.592;QD=10.10;ReadPosRankSum=3.256;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1313,0,1256 chrXV 521781 . A G 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.630;DP=135;Dels=0.00;FS=6.442;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.033;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1420,0,1397 chrXV 521864 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.927;DP=133;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1170,0,1625 chrXV 521919 . G T 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.049;DP=142;Dels=0.00;FS=5.029;HaplotypeScore=1.9411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.125;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1389,0,1538 chrXV 522110 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.216;DP=119;Dels=0.00;FS=1.700;HaplotypeScore=4.5992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.372;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:119:99:1237,0,1231 chrXV 522406 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.723;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.527;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1325,0,1188 chrXV 522411 . T A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.883;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:1060,0,1404 chrXV 522422 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.082;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.250;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:112:99:1268,0,1024 chrXV 522848 . G T 351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;DP=94;Dels=0.00;FS=2.100;HaplotypeScore=44.8599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=3.73;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-2.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:381,0,494 chrXV 523000 . G A,T 2956.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.23;MQ0=0;QD=23.28;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,74,53:127:99:3016,1293,1095,1723,0,1576 chrXV 523506 . C T 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3614,370,0 chrXV 523527 . C T 3192 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3225,327,0 chrXV 523905 . C T 3463.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.888e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3463,351,0 chrXV 524124 . T C 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2953,315,0 chrXV 524250 . C T 4040.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4040,400,0 chrXV 524322 . T C 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.611;DP=141;Dels=0.00;FS=20.300;HaplotypeScore=4.3571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.671;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:141:99:1524,0,1356 chrXV 524541 . G A 4354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.17;SB=-2.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4354,415,0 chrXV 524664 . T C 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.03;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3508,363,0 chrXV 524711 . T A 4189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4189,418,0 chrXV 524727 . T C 4092.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4092,429,0 chrXV 524780 . A T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.514;DP=145;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=4.7459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=10.24;ReadPosRankSum=2.256;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1515,0,1545 chrXV 524958 . A C 2318 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=23.90;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2351,240,0 chrXV 525016 . T C 2347 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.15;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=25.79;ReadPosRankSum=1.428;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2380,255,0 chrXV 525148 . T A 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3860,385,0 chrXV 525158 . G A 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3746,370,0 chrXV 525307 . A G 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.961;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1521,0,1429 chrXV 525323 . G C 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.869;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:127:99:1503,0,1049 chrXV 525385 . T A 3417.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3417,342,0 chrXV 525506 . G A 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.488;DP=107;Dels=0.00;FS=6.222;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1063,0,1088 chrXV 525568 . T C 2836 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:113:99:2869,300,0 chrXV 525601 . T C 2692 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=23.82;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2725,288,0 chrXV 525838 . T C 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=25.65;ReadPosRankSum=1.707;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:137:99:3514,357,0 chrXV 525859 . A T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;DP=152;Dels=0.00;FS=3.374;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=10.67;ReadPosRankSum=3.132;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1652,0,1620 chrXV 525985 . T C 2875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.78;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2908,300,0 chrXV 526015 . A T 3132 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.23;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3165,333,0 chrXV 526144 . A C 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3752,387,0 chrXV 526210 . C T 4352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4352,439,0 chrXV 526270 . C T 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.51;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3439,343,0 chrXV 526288 . G A 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.478;DP=129;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.797;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1174,0,1460 chrXV 526291 . A G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.835;DP=127;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.577;QD=8.49;ReadPosRankSum=-2.287;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1108,0,1561 chrXV 526390 . T C 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.33;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2743,285,0 chrXV 526435 . C T 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=27.36;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3530,366,0 chrXV 526561 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.119;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.474;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1033,0,1075 chrXV 526628 . A G 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.087e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3478,363,0 chrXV 526705 . T A 2793 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2826,291,0 chrXV 527008 . C A 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3491,355,0 chrXV 527017 . A G 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3243,336,0 chrXV 527323 . T C 2393 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2426,273,0 chrXV 527497 . G C 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3129,324,0 chrXV 527698 . C T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.127;DP=109;Dels=0.00;FS=1.555;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.843;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.545;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,64:109:99:1460,0,816 chrXV 527986 . C T 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.323;DP=144;Dels=0.00;FS=4.970;HaplotypeScore=4.6271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.278;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:144:99:1675,0,1271 chrXV 528073 . T A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:128:99:1180,0,1374 chrXV 528085 . G T 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3250,322,0 chrXV 528112 . T G 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.695;DP=135;Dels=0.00;FS=4.140;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1072,0,1509 chrXV 528237 . C T 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.360;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=0.931;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:962,0,1172 chrXV 528349 . A T 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;DP=129;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.880;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1150,0,1623 chrXV 528477 . C T 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2893,297,0 chrXV 528487 . C T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.377;DP=109;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:922,0,1327 chrXV 528799 . A T 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1038,0,1594 chrXV 528813 . A G 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.298;DP=113;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:968,0,1465 chrXV 529055 . C T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.076;DP=119;Dels=0.00;FS=3.503;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.388;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,68:119:99:1453,0,1039 chrXV 529675 . G A 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3053,312,0 chrXV 529807 . G C 2551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=24.53;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2584,282,0 chrXV 529863 . G A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.408;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.747;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1180,0,1013 chrXV 529919 . C T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.920;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.487;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1190,0,1469 chrXV 530019 . C G 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.435;DP=92;Dels=0.00;FS=5.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.028;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:1070,0,861 chrXV 530063 . G A 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.015;DP=111;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:938,0,1332 chrXV 530757 . G A 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;DP=125;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.677;QD=27.50;ReadPosRankSum=0.873;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3438,332,0 chrXV 530989 . G A 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.85;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3286,334,0 chrXV 531055 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.895;DP=130;Dels=0.00;FS=2.265;HaplotypeScore=4.5509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=9.92;ReadPosRankSum=1.695;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1319,0,1438 chrXV 531184 . C A 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.609;DP=162;Dels=0.00;FS=2.786;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1690,0,1631 chrXV 531232 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.635;DP=127;Dels=0.00;FS=3.220;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.439;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1080,0,1591 chrXV 531295 . A G 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.623;DP=130;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1256,0,1480 chrXV 531421 . A G 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.326;DP=107;Dels=0.00;FS=1.559;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=9.39;ReadPosRankSum=-2.529;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1035,0,1291 chrXV 531587 . C A 804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.133;DP=94;Dels=0.00;FS=8.366;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.156;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:834,0,1145 chrXV 531643 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.906;DP=126;Dels=0.00;FS=9.721;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.078;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1263,0,1469 chrXV 531654 . A C 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.065;DP=147;Dels=0.00;FS=13.457;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.110;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1552,0,1569 chrXV 532110 . C T 4106.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4106,427,0 chrXV 532281 . C T 770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.685;DP=70;Dels=0.00;FS=6.531;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.421;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,35:70:99:800,0,724 chrXV 532438 . G A 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.141;DP=143;Dels=0.00;FS=10.142;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=11.77;ReadPosRankSum=-2.849;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1713,0,1287 chrXV 532911 . G A 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3283,331,0 chrXV 533064 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.043;DP=137;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1196,0,1721 chrXV 533224 . A G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.688;DP=125;Dels=0.00;FS=4.299;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1154,0,1398 chrXV 533280 . A G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.804;DP=131;Dels=0.00;FS=2.397;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1434,0,1231 chrXV 533325 . T C 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.914;DP=118;Dels=0.00;FS=4.575;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.685;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:900,0,1448 chrXV 533375 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.864;DP=124;Dels=0.00;FS=1.576;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.434;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1484,0,1040 chrXV 533398 . A C 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3448,363,0 chrXV 533423 . G A 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3861,399,0 chrXV 533487 . T C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.751;DP=124;Dels=0.00;FS=4.284;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1316,0,1197 chrXV 533520 . A G 2981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3014,327,0 chrXV 533544 . G A 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.339;DP=117;Dels=0.00;FS=4.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.501;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:1019,0,1406 chrXV 533625 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.229;DP=132;Dels=0.00;FS=2.228;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQ0=0;MQRankSum=3.614;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.518;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1219,0,1387 chrXV 533636 . T C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.912;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=56.5929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.825;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1299,0,1263 chrXV 533658 . C A 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.203;DP=124;Dels=0.00;FS=6.836;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.343;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1152,0,1288 chrXV 533670 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.439;DP=125;Dels=0.00;FS=3.265;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1273,0,1152 chrXV 533847 . C A 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;DP=149;Dels=0.00;FS=11.196;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1471,0,1691 chrXV 533983 . T C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2313;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3176,336,0 chrXV 534213 . C T 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.119;DP=122;Dels=0.00;FS=8.365;HaplotypeScore=3.5628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.125;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1245,0,1277 chrXV 534218 . T C 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.796;DP=122;Dels=0.00;FS=6.913;HaplotypeScore=2.6961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1139,0,1302 chrXV 534242 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.754;DP=138;Dels=0.00;FS=3.059;HaplotypeScore=5.8129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=2.667;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.205;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1401,0,1299 chrXV 534491 . G A 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.802;DP=127;Dels=0.00;FS=2.253;HaplotypeScore=2.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.408;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.586;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1110,0,1407 chrXV 534542 . C T 587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.914;DP=108;Dels=0.00;FS=3.686;HaplotypeScore=4.5513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQ0=0;MQRankSum=-5.846;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,39:108:99:617,0,1469 chrXV 534841 . C T 1943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.163;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,91:172:99:1973,0,1686 chrXV 534846 . G A 4467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4467,463,0 chrXV 534977 . G A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.829;DP=134;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.867;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1441,0,1279 chrXV 535005 . C T 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.369;DP=147;Dels=0.00;FS=4.080;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.862;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1524,0,1389 chrXV 535103 . T C 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.05;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3461,366,0 chrXV 535208 . C T 4098.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.035;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7871;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=25.77;ReadPosRankSum=1.667;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,158:159:99:4098,415,0 chrXV 535304 . A G 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3732,387,0 chrXV 535406 . A G 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.748;DP=173;Dels=0.00;FS=2.682;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.486;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,75:173:99:1491,0,2188 chrXV 535467 . C T 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.704;DP=178;Dels=0.00;FS=1.175;HaplotypeScore=2.5608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,79:178:99:1617,0,2111 chrXV 535577 . A G 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=23.68;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:3718,375,0 chrXV 535782 . C G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;DP=119;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.510;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1090,0,1397 chrXV 535793 . A G 2911 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2944,321,0 chrXV 535943 . T C 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2920,318,0 chrXV 536145 . C T 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3236,325,0 chrXV 536192 . A G 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2598,267,0 chrXV 536237 . T C 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.420;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=25.41;ReadPosRankSum=1.514;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2854,300,0 chrXV 536384 . G A 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2960,294,0 chrXV 536410 . C T 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.07;SB=-9.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3187,319,0 chrXV 536558 . C T 1561.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.573;DP=132;Dels=0.00;FS=1.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.483;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1591,0,1160 chrXV 536798 . G A 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.119;DP=99;Dels=0.00;FS=5.006;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=2.607;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.879;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:873,0,1016 chrXV 536862 . A G 627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.159;DP=80;Dels=0.00;FS=4.299;HaplotypeScore=56.7226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:657,0,484 chrXV 536881 . C T 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.166;DP=75;Dels=0.00;FS=7.837;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=10.77;ReadPosRankSum=-2.008;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:838,0,602 chrXV 536918 . C T 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.326;DP=86;Dels=0.00;FS=13.757;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,37:86:99:703,0,1028 chrXV 537053 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.857;DP=104;Dels=0.00;FS=5.928;HaplotypeScore=223.8859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.070;SB=-2.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,58:104:99:1065,0,736 chrXV 537121 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.601;DP=145;Dels=0.00;FS=12.526;HaplotypeScore=2.6392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.484;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1393,0,1782 chrXV 537181 . C T 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.971;DP=102;Dels=0.00;FS=3.173;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.570;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:989,0,1227 chrXV 537445 . C T 3567.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3567,343,0 chrXV 537484 . T C 3023 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8026;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.400e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3056,324,0 chrXV 537556 . C T 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.558;DP=110;Dels=0.00;FS=2.541;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1031,0,1259 chrXV 537611 . T C 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.543e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3350,351,0 chrXV 537738 . C T 3524.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3524,349,0 chrXV 537790 . G C 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.99;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3224,348,0 chrXV 538068 . G C 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=23.19;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2862,297,0 chrXV 538230 . G A 2583 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;DP=97;Dels=0.00;FS=4.070;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=26.63;ReadPosRankSum=1.696;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:2616,239,0 chrXV 538299 . A G 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.070;DP=121;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.189;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.013;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1253,0,1204 chrXV 538389 . A G 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.705;DP=108;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.227;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1177,0,1109 chrXV 538395 . G A 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.357;DP=120;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1364,0,1148 chrXV 538466 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.572;DP=132;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.275;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1306,0,1418 chrXV 538489 . A G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.940;DP=118;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=2.7833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.616;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1100,0,1292 chrXV 538583 . A G 984.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;DP=108;Dels=0.01;FS=0.727;HaplotypeScore=17.3740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=1;MQRankSum=-1.010;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.907;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:107:99:1014,0,1094 chrXV 538584 . C A 1076.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.589;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.3812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=1;MQRankSum=-0.041;QD=9.96;ReadPosRankSum=2.377;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1106,0,1071 chrXV 538585 . C T 1063.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.746;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.3812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQ0=1;MQRankSum=-1.477;QD=9.93;ReadPosRankSum=2.355;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:107:99:1093,0,1060 chrXV 538758 . G A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.382;DP=107;Dels=0.00;FS=1.568;HaplotypeScore=4.6533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=10.76;ReadPosRankSum=-2.409;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1181,0,1071 chrXV 538794 . G A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.662;DP=107;Dels=0.00;FS=4.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.420;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.544;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:980,0,1229 chrXV 538866 . C T 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.001;DP=125;Dels=0.00;FS=2.284;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.820;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.496;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1309,0,1306 chrXV 539133 . C T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.334;DP=130;Dels=0.00;FS=1.739;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.626;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1311,0,1237 chrXV 539577 . T C 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.201;DP=110;Dels=0.00;FS=4.948;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.963;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1153,0,1033 chrXV 539639 . A T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;DP=90;Dels=0.00;FS=2.805;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.002;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,51:90:99:1084,0,820 chrXV 539640 . A C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.777;DP=92;Dels=0.00;FS=2.769;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.894;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,52:92:99:1037,0,857 chrXV 539719 . G A 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.487;DP=105;Dels=0.00;FS=6.280;HaplotypeScore=4.1314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.442;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:873,0,1336 chrXV 540873 . A G 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.502;DP=121;Dels=0.00;FS=4.717;HaplotypeScore=3.6324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.723;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,48:121:99:872,0,1562 chrXV 540930 . T C 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.702;DP=147;Dels=0.01;FS=9.131;HaplotypeScore=14.7007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.634;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:1179,0,1921 chrXV 540998 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=113;Dels=0.00;FS=3.885;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=0.282;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.765;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1035,0,1346 chrXV 541182 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.656;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.242;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1100,0,1152 chrXV 541377 . A G 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.606;DP=115;Dels=0.00;FS=2.458;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.008;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:918,0,1278 chrXV 541437 . C T 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.823;DP=103;Dels=0.00;FS=3.674;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=2.413;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.447;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:947,0,1046 chrXV 541647 . C T 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.279;DP=90;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=4.8298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=9.67;ReadPosRankSum=-2.042;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:900,0,897 chrXV 541674 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.041;DP=101;Dels=0.00;FS=1.643;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.713;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1226,0,845 chrXV 541939 . T C 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6347;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2848,300,0 chrXV 542199 . G A 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.040;DP=102;Dels=0.00;FS=1.828;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.660;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:938,0,1145 chrXV 542472 . T G 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3273,330,0 chrXV 542699 . A G 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.676;DP=142;Dels=0.00;FS=3.008;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.412;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1572,0,1340 chrXV 542841 . T C 742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.450;DP=110;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=3.9140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.163;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:772,0,1398 chrXV 542889 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.504;DP=105;Dels=0.00;FS=6.138;HaplotypeScore=2.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.664;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1036,0,1154 chrXV 542952 . A G 2185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:2218,237,0 chrXV 543081 . T C 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.891;DP=125;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1216,0,1308 chrXV 543282 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.841;DP=147;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=1;MQRankSum=0.611;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.187;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1643,0,1358 chrXV 543498 . T C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.583;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.437;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1541,0,1386 chrXV 544166 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.853;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.823;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1269,0,1081 chrXV 544532 . G C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.627;DP=125;Dels=0.00;FS=2.460;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.951;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1196,0,1197 chrXV 544630 . T C 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.745;DP=144;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=7.4770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.583;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1544,0,1365 chrXV 544702 . C A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.679;DP=140;Dels=0.00;FS=6.349;HaplotypeScore=5.2366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.990;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.573;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1382,0,1401 chrXV 544718 . C A 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.870;DP=124;Dels=0.00;FS=22.499;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.78;MQ0=0;MQRankSum=-4.269;QD=7.87;ReadPosRankSum=2.602;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1006,0,1409 chrXV 544722 . A G 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.614;DP=129;Dels=0.00;FS=21.701;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=0;MQRankSum=-5.518;QD=7.11;ReadPosRankSum=2.359;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:947,0,1555 chrXV 544732 . T C 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.972;DP=125;Dels=0.00;FS=21.418;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=-5.032;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.823;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:937,0,1537 chrXV 544740 . A G 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.377;DP=124;Dels=0.00;FS=17.935;HaplotypeScore=3.4371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=-3.888;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.428;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:949,0,1592 chrXV 544812 . C T 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.144;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.445;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1016,0,1432 chrXV 544857 . C A 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.498;DP=108;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=3.6520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.422;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1148,0,1126 chrXV 544972 . C T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.177;DP=128;Dels=0.00;FS=9.431;HaplotypeScore=5.7466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.293;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1363,0,1282 chrXV 545015 . G A 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.183;DP=124;Dels=0.00;FS=9.035;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1376,0,1268 chrXV 545340 . T C 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.700;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.909;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.950;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,83:148:99:1704,0,1303 chrXV 545736 . G A 1634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.959;DP=153;Dels=0.00;FS=10.016;HaplotypeScore=4.4702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:153:99:1664,0,1339 chrXV 546123 . A C 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.843;DP=132;Dels=0.00;FS=15.847;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1573,0,1149 chrXV 546489 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.153;DP=134;Dels=0.00;FS=4.938;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.93;ReadPosRankSum=2.840;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1092,0,1720 chrXV 547232 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.207;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1168,0,1277 chrXV 547442 . G A 2107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.876;DP=194;Dels=0.00;FS=7.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=10.86;ReadPosRankSum=-2.241;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,99:194:99:2137,0,1938 chrXV 547477 . T C 2103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.425;DP=207;Dels=0.00;FS=6.245;HaplotypeScore=4.6016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.436;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,114:207:99:2133,0,1984 chrXV 547558 . C T 1947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.638;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=1;MQRankSum=0.414;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.525;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,92:165:99:1977,0,1343 chrXV 547969 . A G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.032;DP=148;Dels=0.00;FS=4.998;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.927;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1507,0,1642 chrXV 548158 . C T 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.070;DP=149;Dels=0.00;FS=4.143;HaplotypeScore=4.9513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.473;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,59:149:99:1154,0,1931 chrXV 548302 . T G 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.659;DP=151;Dels=0.00;FS=4.810;HaplotypeScore=3.9554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.099;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1466,0,1613 chrXV 548428 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.115;DP=116;Dels=0.00;FS=2.348;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1200,0,1278 chrXV 548471 . C G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.430;DP=139;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.424;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1344,0,1501 chrXV 548602 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.079;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.574;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1106,0,1347 chrXV 548616 . A G 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.364;DP=126;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=2.8402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1090,0,1488 chrXV 548673 . C A 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.334;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1219,0,1031 chrXV 549034 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.571;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.363;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:110:99:1037,0,1180 chrXV 549059 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.734;DP=123;Dels=0.00;FS=2.320;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1439,0,1118 chrXV 549127 . G A 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.204;DP=103;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.453;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1209,0,965 chrXV 549314 . C T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3354,331,0 chrXV 549622 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.955;DP=141;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=5.2077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1404,0,1477 chrXV 549734 . C T 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.655;DP=125;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.519;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.357;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:125:99:1597,0,1017 chrXV 549899 . G A 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.246;DP=155;Dels=0.00;FS=2.837;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=10.74;ReadPosRankSum=2.668;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1695,0,1549 chrXV 549932 . C T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.852;DP=161;Dels=0.00;FS=0.587;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.787;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.869;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,72:161:99:1489,0,1865 chrXV 550196 . C T 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.071;DP=147;Dels=0.00;FS=4.911;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.268;SB=-8.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1723,0,1342 chrXV 550403 . A T 1819.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;DP=149;Dels=0.01;FS=2.085;HaplotypeScore=5.4155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-9.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,82:148:99:1849,0,1349 chrXV 550436 . A G 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.972;DP=142;Dels=0.00;FS=15.750;HaplotypeScore=6.4565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.374;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,82:142:99:1793,0,1034 chrXV 550493 . G C 1808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;DP=147;Dels=0.00;FS=5.220;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=12.30;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,85:147:99:1838,0,1110 chrXV 550623 . T C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=19.94;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:3389,357,0 chrXV 550812 . C T 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.532;DP=129;Dels=0.00;FS=5.425;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.014;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1485,0,1257 chrXV 551039 . A G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.570;DP=134;Dels=0.00;FS=5.243;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1222,0,1448 chrXV 551128 . A G 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.885;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.842;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,89:151:99:1835,0,1197 chrXV 551234 . A G 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.247;DP=120;Dels=0.00;FS=4.541;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=12.33;ReadPosRankSum=1.073;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,70:120:99:1509,0,1028 chrXV 551353 . A G 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.229;DP=164;Dels=0.00;FS=5.007;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.510;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,70:164:99:1406,0,2069 chrXV 551437 . A G 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.605;DP=166;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=1;MQRankSum=-0.852;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,76:166:99:1513,0,1960 chrXV 551813 . G A 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.804;DP=131;Dels=0.00;FS=3.185;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.154;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1185,0,1521 chrXV 551830 . G A 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.711;DP=126;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1059,0,1466 chrXV 551881 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.727;DP=131;Dels=0.00;FS=9.458;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.072;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1490,0,1301 chrXV 551928 . A T 995.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.710;DP=113;Dels=0.00;FS=4.578;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.927;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1025,0,1397 chrXV 552069 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.189;DP=118;Dels=0.00;FS=4.591;HaplotypeScore=3.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.192;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1218,0,1188 chrXV 552367 . G A 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.019;DP=100;Dels=0.00;FS=1.697;HaplotypeScore=2.6432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.253;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,52:100:99:1048,0,930 chrXV 552421 . A T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.812;DP=122;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.061;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:122:99:1326,0,1233 chrXV 552775 . C G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.993;DP=102;Dels=0.00;FS=3.797;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=11.58;ReadPosRankSum=-2.095;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1211,0,875 chrXV 553072 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.295;DP=128;Dels=0.00;FS=2.629;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1433,0,1280 chrXV 553085 . C T 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.468;DP=144;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.384;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1682,0,1339 chrXV 553150 . T C 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.037;DP=142;Dels=0.00;FS=4.077;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1440,0,1482 chrXV 553386 . C T 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.257;DP=131;Dels=0.00;FS=12.597;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.098;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1339,0,1297 chrXV 553641 . C A 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;DP=131;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1356,0,1378 chrXV 553642 . C A 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.178;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.052;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1372,0,1366 chrXV 553950 . C T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.305;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:1003,0,1511 chrXV 554068 . A T 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.263;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1308,0,1090 chrXV 554076 . G A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.358;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.231;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1114,0,1397 chrXV 554353 . T A 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.492;DP=107;Dels=0.00;FS=12.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1001,0,1288 chrXV 554402 . C A 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.207;DP=107;Dels=0.00;FS=16.943;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1152,0,1023 chrXV 554618 . A G 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.655;DP=117;Dels=0.01;FS=2.460;HaplotypeScore=2.5981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.820;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1144,0,1249 chrXV 554842 . C T 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.904;DP=147;Dels=0.00;FS=2.932;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.595;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1520,0,1621 chrXV 554893 . T C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.872;DP=149;Dels=0.00;FS=2.919;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=8.61;ReadPosRankSum=2.290;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1313,0,1793 chrXV 554987 . C T 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.577;DP=150;Dels=0.00;FS=4.787;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.365;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1512,0,1538 chrXV 555037 . G A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.722;DP=121;Dels=0.00;FS=2.312;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.211;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1138,0,1320 chrXV 555166 . G A 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.816;DP=132;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.581;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1550,0,1130 chrXV 555261 . A G 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.704;DP=116;Dels=0.00;FS=2.470;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.968;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1306,0,1193 chrXV 555451 . A G 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.246;DP=159;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1560,0,1829 chrXV 556870 . T G 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.809;DP=86;Dels=0.00;FS=7.182;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.032;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:961,0,712 chrXV 557021 . T A 2480 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2513,252,0 chrXV 557056 . T C 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.084;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.588;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:110:99:930,0,1337 chrXV 557194 . T G 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.426;DP=86;Dels=0.00;FS=2.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:830,0,978 chrXV 557623 . T C 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2864,318,0 chrXV 557722 . T C 2309 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2342,240,0 chrXV 557758 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.455;DP=119;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.573;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1139,0,1390 chrXV 557821 . T G 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.819;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.134;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:992,0,1006 chrXV 557831 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.930;DP=125;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=2.1623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.797;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1260,0,1307 chrXV 557867 . C A 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.049;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1019,0,1243 chrXV 558155 . G C 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.944;DP=105;Dels=0.00;FS=22.450;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1182,0,913 chrXV 558381 . T A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.386;DP=112;Dels=0.00;FS=3.426;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1136,0,1213 chrXV 558497 . G A 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3055,309,0 chrXV 558913 . G C 3696.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.49;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3696,384,0 chrXV 558953 . G A 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.74;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3449,340,0 chrXV 559459 . T C 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8382;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=25.31;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2918,300,0 chrXV 559465 . C T 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.672;DP=107;Dels=0.00;FS=1.729;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:857,0,1323 chrXV 559477 . T C 2623 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=24.98;SB=-8.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2656,282,0 chrXV 559591 . A G 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.363;DP=102;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=3.5117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.221;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1152,0,919 chrXV 559714 . T A 701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;DP=95;Dels=0.00;FS=1.658;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.976;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:731,0,1309 chrXV 559768 . T G 2744 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2777,297,0 chrXV 560189 . T A 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.720;DP=97;Dels=0.00;FS=3.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.545;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:871,0,1254 chrXV 560432 . G A 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.927;DP=121;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1169,0,1301 chrXV 560585 . A G 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.156;DP=131;Dels=0.00;FS=9.733;HaplotypeScore=2.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.624;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:131:99:976,0,1739 chrXV 560610 . A G 3411.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3411,345,0 chrXV 560807 . A G 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.906;DP=141;Dels=0.00;FS=46.280;HaplotypeScore=75.5362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=21.04;ReadPosRankSum=4.221;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,132:141:99:2999,318,0 chrXV 561511 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.283;DP=138;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.067;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.299;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1371,0,1419 chrXV 562082 . C T 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.134;DP=163;Dels=0.00;FS=6.783;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.761;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1805,0,1782 chrXV 562162 . C T 4164.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:4164,423,0 chrXV 562357 . G A 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2983,309,0 chrXV 562468 . A G 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3363,351,0 chrXV 562487 . A C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.401;DP=137;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.049;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1199,0,1633 chrXV 562567 . C T 3086 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=26.38;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3119,301,0 chrXV 562672 . G C 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2969,315,0 chrXV 562688 . A C 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=117;Dels=0.00;FS=3.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.199;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2921,287,0 chrXV 562716 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.996;DP=122;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.976;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1338,0,1211 chrXV 562828 . G A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.604;DP=117;Dels=0.00;FS=1.479;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.443;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1136,0,1419 chrXV 563008 . G A 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3072,315,0 chrXV 563766 . T C 2968 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.74;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3001,324,0 chrXV 563862 . A G 3668.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=25.12;ReadPosRankSum=1.685;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3668,375,0 chrXV 563917 . G A 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.029e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3910,382,0 chrXV 563945 . A G 4154.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4154,432,0 chrXV 564195 . G A 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.941;DP=148;Dels=0.00;FS=4.166;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=9.64;ReadPosRankSum=-2.148;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1457,0,1523 chrXV 564207 . T G 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.78;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3508,372,0 chrXV 564208 . C A 3616.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.78;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3616,370,0 chrXV 564258 . C T 1912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.141;DP=147;Dels=0.00;FS=2.996;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=2.481;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.653;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,85:147:99:1942,0,1191 chrXV 564299 . G C 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.947e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3807,393,0 chrXV 564451 . A G 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2789,306,0 chrXV 564554 . T C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.106;DP=127;Dels=0.00;FS=6.927;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,76:127:99:1586,0,1067 chrXV 564575 . C T 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.04;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2845,282,0 chrXV 565820 . A G 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.084;DP=103;Dels=0.00;FS=2.564;HaplotypeScore=8.1815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.664;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1129,0,858 chrXV 565891 . T C 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3329,342,0 chrXV 566126 . T A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.903;DP=115;Dels=0.00;FS=3.394;HaplotypeScore=2.6077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.618;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1143,0,1288 chrXV 566165 . T C 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6313;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3434,360,0 chrXV 566210 . A G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=18.1213;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3214,333,0 chrXV 566306 . T A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;DP=147;Dels=0.00;FS=3.898;HaplotypeScore=3.8889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.888;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:147:99:1397,0,1611 chrXV 566353 . G A 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3502,352,0 chrXV 566373 . A C 3597.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3597,366,0 chrXV 566430 . G T 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3325,325,0 chrXV 566502 . A G 2396 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2429,261,0 chrXV 566542 . A C 2198 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4511;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.48;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:83:99:2231,231,0 chrXV 566564 . A C 1649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:1682,180,0 chrXV 566820 . A T 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3222,316,0 chrXV 567085 . T C 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9336;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3357,348,0 chrXV 567230 . C G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.793;DP=126;Dels=0.00;FS=6.674;HaplotypeScore=5.8364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.518;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1203,0,1314 chrXV 567262 . G A 3167 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3200,325,0 chrXV 567267 . C T 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.17;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2886,291,0 chrXV 567276 . A G 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2786,291,0 chrXV 567367 . C T 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.116e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3445,340,0 chrXV 568141 . T C 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=24.94;SB=-1.452e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2901,300,0 chrXV 568292 . C T 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.042;DP=97;Dels=0.00;FS=6.480;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.386;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:957,0,985 chrXV 568373 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.442;DP=111;Dels=0.00;FS=3.519;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=9.41;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1075,0,1073 chrXV 568707 . G A 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3214,316,0 chrXV 568994 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.335;DP=127;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=2;MQRankSum=1.168;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1295,0,1275 chrXV 569058 . T A 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=26.44;ReadPosRankSum=-1.303;SB=-1.090e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3232,302,0 chrXV 569259 . A G 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.435e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3316,333,0 chrXV 569690 . G A 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=79.8993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=22.59;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3015,306,0 chrXV 569770 . C T 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.20;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2574,273,0 chrXV 569787 . A G 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3388,363,0 chrXV 569825 . C T 3896.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3896,399,0 chrXV 570373 . A T 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2601,261,0 chrXV 571079 . T C 3556.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3556,378,0 chrXV 571108 . C T 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3215,324,0 chrXV 571191 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.137;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1321,0,1453 chrXV 571256 . A C 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3458,351,0 chrXV 571300 . G T 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.854e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3779,361,0 chrXV 571406 . A G 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3461,360,0 chrXV 571445 . G C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;DP=153;Dels=0.00;FS=6.405;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,60:153:99:1198,0,1961 chrXV 571487 . G A 4211.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.65;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4211,409,0 chrXV 571939 . G A 995.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.384;DP=99;Dels=0.00;FS=5.093;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.673;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:1025,0,1048 chrXV 571944 . C G 954.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;DP=98;Dels=0.00;FS=3.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=3.180;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:984,0,1048 chrXV 571945 . C T 2555 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2588,261,0 chrXV 572041 . G A 2287 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2320,234,0 chrXV 572050 . T G 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.214;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.259;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:847,0,949 chrXV 572098 . G A 2279 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2312,237,0 chrXV 572102 . C T 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.21;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2835,291,0 chrXV 572407 . T C 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3077,327,0 chrXV 572419 . T C 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2934,321,0 chrXV 572849 . T C 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.648;DP=137;Dels=0.00;FS=0.633;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.071;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1380,0,1536 chrXV 572941 . A G 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3466,357,0 chrXV 573228 . T C 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.82;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.495e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3525,351,0 chrXV 573248 . A G 3057 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.40;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3090,327,0 chrXV 573308 . G A 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.373;DP=126;Dels=0.00;FS=1.516;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.738;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.430;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,53:126:99:1034,0,1605 chrXV 573312 . T C 2768 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.53;MQ0=0;QD=25.39;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2801,309,0 chrXV 573320 . C A 732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.572;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=-4.038;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:762,0,1393 chrXV 573324 . A T 2678 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.24;MQ0=0;QD=26.25;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2711,285,0 chrXV 573358 . A G 2482 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.32;MQ0=0;QD=23.64;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2515,270,0 chrXV 573377 . A G 2647 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.882;DP=110;Dels=0.00;FS=4.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.46;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=24.06;ReadPosRankSum=1.669;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:2680,279,0 chrXV 573378 . A G 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.53;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.168e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2654,276,0 chrXV 573442 . C T 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3081,312,0 chrXV 574266 . A T 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3641,361,0 chrXV 574378 . G A 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3050,300,0 chrXV 574383 . A T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.198;DP=118;Dels=0.00;FS=13.899;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.860;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1057,0,1462 chrXV 574716 . C T 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3686,363,0 chrXV 574776 . T C 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3489,360,0 chrXV 574821 . C T 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.07;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3264,336,0 chrXV 575075 . A G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.495;DP=157;Dels=0.00;FS=1.292;HaplotypeScore=10.7453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,72:157:99:1409,0,1717 chrXV 575076 . G T 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;DP=161;Dels=0.00;FS=1.241;HaplotypeScore=10.7467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.621;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1473,0,1749 chrXV 575376 . C G 72.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.25;MQ0=85;MQRankSum=0.616;QD=0.67;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,31:107:99:102,0,276 chrXV 575544 . A G 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=12.49;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:82,9,0 chrXV 577242 . C T 499 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.27;MQ0=1;QD=24.95;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:57:532,57,0 chrXV 577461 . C T 414.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.744;DP=92;Dels=0.00;FS=71.431;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.32;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,24:92:99:444,0,1349 chrXV 577639 . A G 2211 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=23.77;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2244,234,0 chrXV 577770 . T A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;DP=128;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1199,0,1618 chrXV 577787 . G C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQ0=0;MQRankSum=2.469;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.356;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1429,0,1067 chrXV 577827 . C T 3194 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3227,322,0 chrXV 577890 . C T 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=56.8172;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.60;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3422,337,0 chrXV 577985 . G T 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3478,337,0 chrXV 578058 . G A 3458.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3458,342,0 chrXV 578644 . T C 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3645,387,0 chrXV 578704 . A T 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3479,337,0 chrXV 578986 . T C 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.0427;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3364,357,0 chrXV 579050 . T C 4144.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.968e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4144,435,0 chrXV 579079 . A G 3690.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3690,381,0 chrXV 579389 . A G 4007.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.86;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4007,405,0 chrXV 579864 . G T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.384;DP=122;Dels=0.00;FS=8.273;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.409;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.029;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1396,0,995 chrXV 580033 . C A 784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.111;DP=94;Dels=0.00;FS=2.849;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=1.803;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.819;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:94:99:814,0,1211 chrXV 580144 . T A 2873 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2906,300,0 chrXV 580206 . A G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.65;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3214,336,0 chrXV 580333 . C G 2239 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=90;Dels=0.00;FS=3.415;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=24.88;ReadPosRankSum=1.694;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:90:99:2272,217,0 chrXV 580495 . G A 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.223;DP=94;Dels=0.00;FS=2.756;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.176;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,48:94:99:981,0,938 chrXV 580579 . T C 2821 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=24.11;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2854,306,0 chrXV 580595 . T C 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.10;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3139,324,0 chrXV 580924 . G A 3494.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3494,352,0 chrXV 580957 . T C 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.365;DP=124;Dels=0.00;FS=10.189;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.455;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1163,0,1440 chrXV 581173 . G A 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.990;DP=166;Dels=0.00;FS=0.570;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.636;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1604,0,1771 chrXV 581278 . A T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;DP=117;Dels=0.00;FS=2.400;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.360;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1479,0,1027 chrXV 581305 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.395;DP=117;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.297;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1286,0,1168 chrXV 581450 . T C 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=1;QD=25.26;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3064,318,0 chrXV 581692 . A G 419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.574;DP=101;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=13.8107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.969;QD=4.15;ReadPosRankSum=2.431;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:449,0,559 chrXV 581732 . G A 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.726;DP=110;Dels=0.00;FS=2.566;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.446;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:110:99:838,0,877 chrXV 582005 . C T 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2848,285,0 chrXV 582590 . G A 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3332,334,0 chrXV 582755 . T C 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.787;DP=108;Dels=0.00;FS=3.533;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=2;MQRankSum=1.705;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.006;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:933,0,1254 chrXV 582812 . G C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.571;DP=87;Dels=0.00;FS=4.656;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.440;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,53:87:99:1129,0,635 chrXV 583246 . G A 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.807;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.354;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1466,0,1302 chrXV 583307 . T C 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.078;DP=137;Dels=0.00;FS=4.118;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1226,0,1697 chrXV 583591 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.818;DP=133;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=4.3032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.816;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:133:99:1413,0,1352 chrXV 584081 . T C 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.514;DP=128;Dels=0.00;FS=15.102;HaplotypeScore=8.4505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=1.793;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1097,0,1524 chrXV 584102 . T C 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.143;DP=144;Dels=0.00;FS=2.933;HaplotypeScore=9.2366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.732;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1426,0,1573 chrXV 584552 . G A 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.165;DP=145;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=4.3418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=1;MQRankSum=0.022;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.663;SB=-9.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,84:145:99:1768,0,1120 chrXV 584993 . C T 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.634;DP=168;Dels=0.00;FS=4.497;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.813;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:168:99:1701,0,1700 chrXV 585188 . A G 1806.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.978;DP=177;Dels=0.00;FS=0.574;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,91:177:99:1836,0,1823 chrXV 585293 . A G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.084;DP=138;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.293;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1363,0,1422 chrXV 585299 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.495;DP=159;Dels=0.00;FS=1.243;HaplotypeScore=2.2702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.297;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:159:99:1511,0,1677 chrXV 585314 . T C 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.197;DP=142;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=5.0900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1531,0,1453 chrXV 585644 . T C 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.18;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.597e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3609,375,0 chrXV 585678 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.862;DP=164;Dels=0.00;FS=2.025;HaplotypeScore=3.8651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.450;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,72:164:99:1403,0,1836 chrXV 585683 . T C 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.84;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:166:99:3877,414,0 chrXV 585698 . T C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.039;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.615;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,75:169:99:1351,0,1894 chrXV 585722 . A G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.460;DP=151;Dels=0.00;FS=2.042;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.591;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.445;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1405,0,1574 chrXV 585728 . T C 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.33;MQ0=0;QD=22.60;SB=-1.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3219,348,0 chrXV 585808 . T C 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.917e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3629,381,0 chrXV 585970 . T C 1857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.029;DP=192;Dels=0.00;FS=2.545;HaplotypeScore=4.5996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.747;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,98:192:99:1887,0,1986 chrXV 586076 . A T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.940;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,68:162:99:1276,0,1949 chrXV 586108 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;DP=145;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=2.6744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1272,0,1514 chrXV 586109 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.143;DP=146;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=4.5618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1257,0,1490 chrXV 586143 . G A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.370;DP=135;Dels=0.00;FS=1.477;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.566;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1299,0,1404 chrXV 586164 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.720;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.200;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1241,0,1460 chrXV 586304 . T C 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3703,387,0 chrXV 586345 . T C 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.361;DP=187;Dels=0.00;FS=0.540;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.900;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,88:187:99:1709,0,2178 chrXV 586402 . T C 2098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.043;DP=163;Dels=0.00;FS=8.289;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.108;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,99:163:99:2128,0,1321 chrXV 586515 . C T 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.785;DP=149;Dels=0.00;FS=0.672;HaplotypeScore=3.6461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.298;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:149:99:1392,0,1623 chrXV 586551 . C G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;DP=184;Dels=0.00;FS=0.553;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,84:184:99:1529,0,1868 chrXV 586600 . A G 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.745;DP=176;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=0.459;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.195;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,93:176:99:1703,0,1708 chrXV 586731 . G A 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.714;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1868,0,1546 chrXV 586800 . C T 2081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.929;DP=172;Dels=0.00;FS=22.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.260;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,98:172:99:2111,0,1511 chrXV 586806 . C T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.472;DP=176;Dels=0.00;FS=26.338;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.998;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-1.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,75:176:99:1513,0,2052 chrXV 586839 . A G 1943.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.870;DP=175;Dels=0.00;FS=14.688;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,98:175:99:1973,0,1584 chrXV 587140 . C T 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.494;DP=153;Dels=0.00;FS=4.889;HaplotypeScore=3.0224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.653;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.167;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,70:153:99:1276,0,1665 chrXV 587142 . A G 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.888;DP=157;Dels=0.00;FS=5.930;HaplotypeScore=3.4681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,73:157:99:1237,0,1651 chrXV 587265 . T C 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.724;DP=182;Dels=0.00;FS=9.029;HaplotypeScore=3.4063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=1;MQRankSum=0.907;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.836;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,83:182:99:1584,0,2087 chrXV 587316 . C T 4937.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.69;SB=-2.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4937,487,0 chrXV 587394 . T C 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.525;DP=163;Dels=0.00;FS=6.782;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.602;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1599,0,1691 chrXV 587400 . C T 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.091;DP=164;Dels=0.00;FS=7.990;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.569;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,83:164:99:1789,0,1561 chrXV 587428 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.341;DP=156;Dels=0.00;FS=2.070;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=9.28;ReadPosRankSum=-3.088;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1477,0,1684 chrXV 587460 . T C 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.120;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1394,0,1203 chrXV 587490 . C G 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;DP=138;Dels=0.00;FS=4.085;HaplotypeScore=6.2291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.625;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:138:99:1161,0,1655 chrXV 587565 . C T 3449.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3449,354,0 chrXV 587691 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.817;DP=149;Dels=0.01;FS=1.301;HaplotypeScore=12.8560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.188;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1485,0,1490 chrXV 587816 . C T 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.935;DP=99;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.838;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:813,0,1230 chrXV 587817 . C T 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.913;DP=99;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.831;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:841,0,1279 chrXV 588288 . C T 1656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.073;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.878;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:137:99:1686,0,1189 chrXV 588300 . G A 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.947;DP=139;Dels=0.00;FS=5.261;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.885;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1315,0,1469 chrXV 588470 . T A 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.538;DP=164;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=1.091;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.254;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:1839,0,1591 chrXV 588514 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.664;DP=156;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=4.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=2.028;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.585;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1408,0,1720 chrXV 588565 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.215;DP=123;Dels=0.00;FS=1.550;HaplotypeScore=3.7390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.900;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1132,0,1390 chrXV 588756 . G A 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8096;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3308,328,0 chrXV 588933 . T A,C 2577.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9363;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=23.64;ReadPosRankSum=1.637;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,65,43:109:99:2637,1037,862,1601,0,1475 chrXV 589016 . C T 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.250;DP=118;Dels=0.00;FS=2.449;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1214,0,1118 chrXV 589018 . G C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;DP=119;Dels=0.00;FS=3.444;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.744;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1160,0,1165 chrXV 589146 . T C 4141.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4141,438,0 chrXV 589189 . T C 1778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.183;DP=156;Dels=0.00;FS=5.848;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.650;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,86:156:99:1808,0,1527 chrXV 589221 . C T 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.173;DP=141;Dels=0.00;FS=2.259;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1464,0,1478 chrXV 589248 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.985;DP=165;Dels=0.00;FS=8.137;HaplotypeScore=4.6520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=1;MQRankSum=-0.112;QD=9.13;ReadPosRankSum=2.998;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:1536,0,1869 chrXV 589259 . C T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.376;DP=165;Dels=0.00;FS=15.807;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=1;MQRankSum=0.530;QD=9.30;ReadPosRankSum=1.680;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1565,0,1811 chrXV 589272 . T C 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.898;DP=161;Dels=0.00;FS=17.978;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=1;MQRankSum=0.721;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.359;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1538,0,1800 chrXV 589303 . G A 4413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=1;QD=26.27;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4413,433,0 chrXV 589370 . T C 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=141;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.811;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1472,0,1472 chrXV 589429 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.099;DP=117;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=4.2031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.590;QD=9.99;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1199,0,1239 chrXV 589545 . C T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.877;DP=127;Dels=0.00;FS=1.558;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.075;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1136,0,1466 chrXV 589621 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.487;DP=149;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.276;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1269,0,1733 chrXV 589839 . C T 1830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.013;DP=152;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=3.9620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1860,0,1406 chrXV 589882 . C T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.665;DP=152;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.079;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1337,0,1747 chrXV 589883 . G T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.049;DP=152;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.039;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1341,0,1685 chrXV 590260 . A T 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3241,328,0 chrXV 590443 . A G 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.881;DP=158;Dels=0.00;FS=3.904;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.426;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,62:158:99:1040,0,2169 chrXV 590452 . G T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.124;DP=145;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=4.9617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.982;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,62:145:99:1164,0,1753 chrXV 590730 . T G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.590;DP=140;Dels=0.00;FS=6.291;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1236,0,1685 chrXV 590749 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.054;DP=139;Dels=0.00;FS=13.979;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.006;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1531,0,1300 chrXV 591118 . G A 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.880e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3711,382,0 chrXV 591121 . A G 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3512,375,0 chrXV 591202 . G A 4042.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4042,400,0 chrXV 591532 . C T 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.454;DP=167;Dels=0.00;FS=1.928;HaplotypeScore=4.7586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:1684,0,1840 chrXV 591630 . A G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.917;DP=167;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.582;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,72:167:99:1425,0,2105 chrXV 591684 . G A 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.138;DP=140;Dels=0.00;FS=2.147;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.966;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1388,0,1468 chrXV 591751 . C T 2118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.418;DP=188;Dels=0.01;FS=0.576;HaplotypeScore=4.8731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.665;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,101:187:99:2148,0,1760 chrXV 591787 . T A 1844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;DP=196;Dels=0.00;FS=1.855;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,90:196:99:1874,0,2274 chrXV 591850 . C T 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.153;DP=139;Dels=0.00;FS=3.986;HaplotypeScore=8.9094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:139:99:1588,0,1227 chrXV 591904 . G A 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.192;DP=145;Dels=0.00;FS=2.353;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1752,0,1276 chrXV 592238 . C T 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.426;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1200,0,1423 chrXV 592245 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.919;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1236,0,1458 chrXV 592540 . A G 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.137;DP=150;Dels=0.00;FS=0.624;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.342;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1317,0,1822 chrXV 592588 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.538;DP=147;Dels=0.00;FS=6.074;HaplotypeScore=3.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=2.295;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1533,0,1522 chrXV 592592 . G C 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.159;DP=146;Dels=0.00;FS=3.923;HaplotypeScore=3.9567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=2.816;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1385,0,1498 chrXV 592815 . A T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;DP=166;Dels=0.00;FS=7.658;HaplotypeScore=3.9411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.933;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.060;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,78:166:99:1590,0,1918 chrXV 592848 . C A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.229;DP=125;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=4.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.261;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1157,0,1449 chrXV 592863 . T G 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.564;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1394,0,1130 chrXV 592976 . T A 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.078;DP=171;Dels=0.00;FS=2.741;HaplotypeScore=3.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=8.63;ReadPosRankSum=-4.128;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,77:171:99:1506,0,2101 chrXV 593587 . A G 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.180;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.887;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1413,0,1375 chrXV 593851 . G T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.367;DP=148;Dels=0.00;FS=4.921;HaplotypeScore=4.9424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.760;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1416,0,1582 chrXV 593956 . A G 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.846;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1214,0,1158 chrXV 593957 . C A 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.401;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.296;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1284,0,1126 chrXV 594020 . C T 898.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.446;DP=112;Dels=0.00;FS=18.859;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.102;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:928,0,1394 chrXV 594089 . T C 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.248;DP=107;Dels=0.00;FS=15.048;HaplotypeScore=3.7385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.740;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1174,0,1086 chrXV 594122 . G A 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.621;DP=111;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.239;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1351,0,1090 chrXV 594267 . C T 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.964;DP=127;Dels=0.00;FS=12.080;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:1034,0,1701 chrXV 594278 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.016;DP=102;Dels=0.00;FS=2.411;HaplotypeScore=39.7938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.82;MQ0=0;MQRankSum=3.492;QD=13.44;ReadPosRankSum=-1.162;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,62:102:99:1401,0,699 chrXV 594437 . T C 1048.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.299;DP=101;Dels=0.00;FS=6.620;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.05;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.372;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1078,0,819 chrXV 594439 . T A 2414 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.13;MQ0=0;QD=23.67;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2447,255,0 chrXV 594446 . A G 814.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.144;DP=103;Dels=0.00;FS=4.900;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=7.90;ReadPosRankSum=-2.009;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:844,0,998 chrXV 594454 . C G 798.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.329;DP=117;Dels=0.00;FS=3.378;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.58;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=6.82;ReadPosRankSum=2.042;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:828,0,1147 chrXV 594455 . G C 2565 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.12;MQ0=0;QD=21.92;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2598,285,0 chrXV 594499 . G C 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.510;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.69;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=25.59;ReadPosRankSum=1.554;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3992,414,0 chrXV 594557 . C T 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.563;DP=141;Dels=0.00;FS=3.519;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.353;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1504,0,1507 chrXV 594578 . C T 1803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.095;DP=161;Dels=0.00;FS=0.595;HaplotypeScore=1.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.92;MQ0=1;MQRankSum=-0.110;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,89:161:99:1833,0,1420 chrXV 594586 . G A 4136.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.88;MQ0=1;QD=27.03;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4136,421,0 chrXV 594661 . G T 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.993;DP=97;Dels=0.00;FS=3.846;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.376;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,54:97:99:956,0,858 chrXV 594667 . A G 1954 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.41;MQ0=0;QD=23.26;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:1987,216,0 chrXV 594673 . T C 1607 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.50;MQ0=0;QD=21.72;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:1640,177,0 chrXV 594677 . G A 1876 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.16;MQ0=0;QD=21.56;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1909,189,0 chrXV 594684 . A G 1817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.44;MQ0=0;QD=20.89;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:1850,183,0 chrXV 594720 . A C 1738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.29;MQ0=0;QD=21.46;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1771,195,0 chrXV 594737 . C T 1783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.67;MQ0=0;QD=23.46;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1816,192,0 chrXV 594821 . T C 491 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.83;MQ0=1;MQRankSum=-0.559;QD=16.37;ReadPosRankSum=2.281;SB=2.154e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:63:524,63,0 chrXV 594897 . T C 44.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.28;MQ0=61;QD=0.70;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:61,3:64:9:77,9,0 chrXV 594909 . T A 82.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.21;MQ0=76;QD=1.02;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:75,5:81:12:115,12,0 chrXV 594918 . G A 135.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.37;MQ0=77;QD=1.61;SB=-7.359e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:77,7:84:18:168,18,0 chrXV 594936 . G C 121.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.71;MQ0=92;QD=1.22;SB=-7.359e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:92,7:99:18:154,18,0 chrXV 594946 . G A 138.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.49;MQ0=98;QD=1.32;SB=-7.359e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:97,8:105:18:171,18,0 chrXV 594962 . T C 173.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.81;MQ0=115;QD=1.40;SB=-2.367e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:115,9:124:24:206,24,0 chrXV 594970 . G T 58.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.69;MQ0=119;MQRankSum=-0.361;QD=0.45;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,5:128:88:88,0,90 chrXV 594982 . T C 160.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.52;MQ0=111;QD=1.35;SB=-4.053e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:111,8:119:21:193,21,0 chrXV 594990 . G A 109.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.87;MQ0=101;QD=1.02;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:100,7:107:15:142,15,0 chrXV 594993 . A G 105.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.30;MQ0=101;QD=0.99;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:100,6:106:15:138,15,0 chrXV 594994 . T G 105.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.24;MQ0=103;QD=0.97;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:103,5:108:15:138,15,0 chrXV 594998 . G A 114.26 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.13;MQ0=107;QD=1.02;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:106,6:112:15:147,15,0 chrXV 595006 . G A 83.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.48;MQ0=108;QD=0.75;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:108,4:112:12:116,12,0 chrXV 595009 . A G 77.51 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.56;MQ0=105;QD=0.71;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:105,4:109:12:110,12,0 chrXV 595015 . G T 25.78 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.88;MQ0=110;QD=0.23;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:109,3:112:6:57,6,0 chrXV 595029 . A C 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.00;MQ0=103;QD=0.18;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:102,3:105:6:50,6,0 chrXV 595036 . A T 25.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.98;MQ0=104;QD=0.24;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:104,2:106:6:57,6,0 chrXV 600544 . T C 15.15 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.22;MQ0=67;MQRankSum=0.572;QD=0.20;ReadPosRankSum=1.067;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,6:75:22:45,0,22 chrXV 600552 . G T 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.74;MQ0=62;MQRankSum=1.480;QD=0.14;ReadPosRankSum=-0.691;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,2:75:40:40,0,69 chrXV 600564 . T C 87.18 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.56;MQ0=57;MQRankSum=0.579;QD=1.21;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-6.424e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:11:117,0,11 chrXV 600572 . G A 93.34 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.58;MQ0=64;MQRankSum=1.504;QD=1.18;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-3.240e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:8:123,0,8 chrXV 600575 . A G 92.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.83;MQ0=61;MQRankSum=1.504;QD=1.21;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-2.973e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:11:122,0,11 chrXV 600576 . T G 89.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.42;MQ0=66;MQRankSum=1.504;QD=1.10;ReadPosRankSum=-1.273;SB=-2.973e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,14:81:11:119,0,11 chrXV 600580 . G A 96.22 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.68;MQ0=67;MQRankSum=1.519;QD=1.16;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-3.143e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,15:83:10:126,0,10 chrXV 600588 . G A 94.34 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.24;MQ0=73;MQRankSum=1.519;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-3.294e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,15:89:8:124,0,8 chrXV 600591 . A G 94.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.53;MQ0=69;MQRankSum=1.519;QD=1.11;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-3.078e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,15:85:11:124,0,11 chrXV 600597 . G T 94.18 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.38;MQ0=71;MQRankSum=1.519;QD=1.08;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-3.078e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,15:87:11:124,0,11 chrXV 600611 . A C 93.22 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.76;MQ0=66;MQRankSum=1.519;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.868;SB=-3.143e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:10:123,0,10 chrXV 600618 . A T 93.18 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.15;MQ0=65;MQRankSum=1.531;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.714;SB=-3.132e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:11:123,0,11 chrXV 600687 . A G 94.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;DP=55;Dels=0.00;FS=26.107;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.98;MQ0=37;MQRankSum=-2.536;QD=1.71;ReadPosRankSum=-3.532;SB=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:99:124,0,159 chrXV 600688 . T C 91.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.532;DP=55;Dels=0.00;FS=26.107;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.98;MQ0=37;MQRankSum=-2.808;QD=1.65;ReadPosRankSum=-3.532;SB=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:99:121,0,164 chrXV 600701 . C G 95.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;DP=47;Dels=0.00;FS=23.173;HaplotypeScore=2.6998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.90;MQ0=28;MQRankSum=-2.353;QD=2.02;ReadPosRankSum=-2.849;SB=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:125,0,156 chrXV 600706 . C A 105.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;DP=44;Dels=0.00;FS=27.433;HaplotypeScore=6.6657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.57;MQ0=25;MQRankSum=-2.662;QD=2.39;ReadPosRankSum=-3.592;SB=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:135,0,155 chrXV 600798 . T C 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.373;DP=73;Dels=0.00;FS=5.466;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=2.909;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.925;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:710,0,844 chrXV 600811 . C G 2129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.54;MQ0=0;QD=26.95;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2162,231,0 chrXV 600853 . A T 931.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.425;DP=106;Dels=0.00;FS=36.829;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.47;MQ0=0;MQRankSum=-3.631;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.013;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:961,0,1319 chrXV 600857 . A C 861.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;DP=108;Dels=0.00;FS=31.475;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.311;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:891,0,1351 chrXV 600864 . A T 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.644;DP=106;Dels=0.00;FS=16.195;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=-3.866;QD=7.71;ReadPosRankSum=-2.139;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:106:99:847,0,1344 chrXV 600887 . G T 729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.914;DP=101;Dels=0.00;FS=6.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.89;MQ0=0;MQRankSum=-5.695;QD=7.22;ReadPosRankSum=-3.462;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:759,0,1193 chrXV 600978 . G C 1052.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;DP=109;Dels=0.00;FS=11.030;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.461;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1082,0,1065 chrXV 601015 . G A 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.989;DP=108;Dels=0.00;FS=2.449;HaplotypeScore=2.3056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.416;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1003,0,1258 chrXV 601070 . A T 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.958;DP=93;Dels=0.00;FS=14.158;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.09;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.529;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1076,0,888 chrXV 601141 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.755;DP=112;Dels=0.00;FS=8.883;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.026;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1166,0,1255 chrXV 601181 . G A 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.639;DP=98;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.555;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:991,0,1092 chrXV 601201 . G A 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.608;DP=118;Dels=0.00;FS=3.448;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1475,0,1056 chrXV 601255 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.836;DP=127;Dels=0.00;FS=6.029;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,73:127:99:1592,0,1127 chrXV 601297 . G T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.171;DP=106;Dels=0.00;FS=4.868;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.364;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:1351,0,912 chrXV 601307 . C T 2124 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.64;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2157,222,0 chrXV 601325 . C G 666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=95;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=3.3326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:95:99:696,0,1191 chrXV 601382 . T A 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;DP=101;Dels=0.00;FS=2.819;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.921;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:993,0,1186 chrXV 601406 . C G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;DP=110;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.119;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1113,0,1176 chrXV 601463 . T C 738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.145;DP=84;Dels=0.00;FS=7.382;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.768;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:768,0,1045 chrXV 601482 . A G 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.111;DP=87;Dels=0.00;FS=11.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.132;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:820,0,1050 chrXV 601569 . C T 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2829,291,0 chrXV 601702 . C T 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3301,334,0 chrXV 601749 . C T 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3432,334,0 chrXV 601761 . A G 3400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.11;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3400,348,0 chrXV 601776 . T C 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3217,327,0 chrXV 601817 . A G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3358,348,0 chrXV 601911 . A G 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3173,333,0 chrXV 602113 . T C 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.481;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.316;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:865,0,1432 chrXV 602229 . G A 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3493,351,0 chrXV 602250 . G A 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3311,328,0 chrXV 602578 . A G 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.64;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2700,285,0 chrXV 602676 . A T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;DP=126;Dels=0.00;FS=3.236;HaplotypeScore=4.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.219;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:126:99:1141,0,1562 chrXV 602686 . C A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.020;DP=129;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.767;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:1130,0,1586 chrXV 602888 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.238;DP=114;Dels=0.00;FS=5.963;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.477;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1248,0,1124 chrXV 602945 . C T 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.120;DP=98;Dels=0.00;FS=2.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:917,0,1134 chrXV 603046 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.855;DP=98;Dels=0.00;FS=1.644;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.025;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1071,0,939 chrXV 603257 . C G 2861 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2894,306,0 chrXV 603264 . A G 855.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.168;DP=122;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.889;QD=7.01;ReadPosRankSum=1.282;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:885,0,1617 chrXV 603266 . C T 2897 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.86;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2930,303,0 chrXV 603325 . G A 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.911;DP=99;Dels=0.00;FS=10.563;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=2.536;QD=13.24;ReadPosRankSum=-1.587;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,61:99:99:1341,0,673 chrXV 603468 . A G 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.328;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.980;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,81:136:99:1671,0,1104 chrXV 603549 . T C 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2548,267,0 chrXV 603564 . C G 526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;DP=84;Dels=0.00;FS=3.208;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.213;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,31:84:99:556,0,1170 chrXV 603740 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.112;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=12.54;ReadPosRankSum=-1.892;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,70:122:99:1560,0,1022 chrXV 603949 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.798;DP=125;Dels=0.00;FS=4.313;HaplotypeScore=3.8902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1297,0,1336 chrXV 603953 . G A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.712;DP=118;Dels=0.00;FS=2.376;HaplotypeScore=3.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:1385,0,1106 chrXV 603992 . A G 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3068,309,0 chrXV 604007 . C T 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.952;DP=127;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.360;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1185,0,1545 chrXV 604096 . G T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.962;DP=105;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=12.43;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,63:105:99:1335,0,812 chrXV 604119 . C G 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.946;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1140,0,1033 chrXV 604154 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.758;DP=112;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.168;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.160;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1279,0,1034 chrXV 604256 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.137;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.080;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.209;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1274,0,1040 chrXV 604265 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.818;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.5841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.633;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1127,0,1179 chrXV 604413 . A G 2519 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2552,276,0 chrXV 604415 . C G 2223 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.165e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2256,252,0 chrXV 604521 . G C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.014;DP=136;Dels=0.00;FS=2.219;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.378;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1546,0,1165 chrXV 604538 . A G 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.272;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.032;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1345,0,1164 chrXV 604572 . A T 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.270e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2918,309,0 chrXV 604757 . C T 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.317;DP=102;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1087,0,1041 chrXV 604762 . G C 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.657;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1089,0,1012 chrXV 605280 . T C 2608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=26.6744;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=23.08;SB=-1.107e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2641,282,0 chrXV 605290 . T C 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.587;DP=118;Dels=0.00;FS=3.525;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.008;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:984,0,1326 chrXV 605294 . C T 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2738,279,0 chrXV 605497 . G A 942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.840;DP=97;Dels=0.00;FS=1.647;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:972,0,997 chrXV 605911 . T C 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.35;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2614,285,0 chrXV 605978 . G A 2433 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2466,255,0 chrXV 606232 . G A 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3466,342,0 chrXV 606245 . G A 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.981;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.478;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1169,0,1212 chrXV 606303 . T A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;DP=141;Dels=0.00;FS=4.056;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.164;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:1151,0,1771 chrXV 606329 . G T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;DP=132;Dels=0.00;FS=9.651;HaplotypeScore=47.3589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.616;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1132,0,1569 chrXV 606373 . A G 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.293;DP=105;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=-3.171;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.475;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:105:99:880,0,1059 chrXV 606393 . T G 2540 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.86;MQ0=0;QD=23.09;SB=-1.238e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2573,270,0 chrXV 606412 . T G 3040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.57;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3073,309,0 chrXV 606630 . C T 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.972;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.593;SB=-8.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,75:132:99:1607,0,1127 chrXV 606707 . A C 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.142;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.395;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1526,0,1349 chrXV 606849 . G T 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3079,304,0 chrXV 606886 . C T 2880 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2913,294,0 chrXV 606945 . T C 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.917;DP=100;Dels=0.00;FS=3.260;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.772;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1018,0,1134 chrXV 607357 . G A 987.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.946;DP=95;Dels=0.00;FS=2.740;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.918;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1017,0,1032 chrXV 607617 . T C 813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.604;DP=77;Dels=0.00;FS=1.989;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.816;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,42:77:99:843,0,754 chrXV 607837 . G A 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.066;DP=123;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1097,0,1407 chrXV 607979 . C A 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.032;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.383;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1235,0,1280 chrXV 608130 . C A 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.624;DP=121;Dels=0.00;FS=2.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.418;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1334,0,1236 chrXV 608199 . C T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.862;DP=106;Dels=0.00;FS=17.142;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.388;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1297,0,1004 chrXV 608418 . A G 1493.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.973;DP=136;Dels=0.00;FS=2.185;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.343;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1523,0,1303 chrXV 608505 . T C 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2588,273,0 chrXV 608673 . A G 3896.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6368;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.959e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3896,384,0 chrXV 608682 . T C 3929.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3929,382,0 chrXV 608836 . T C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.068;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.355;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1316,0,1753 chrXV 608850 . T C 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.976;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=2.298;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,92:173:99:1568,0,1732 chrXV 608958 . A G 2729 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.52;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2762,297,0 chrXV 609109 . G A 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.259;DP=85;Dels=0.00;FS=0.818;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=2.255;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.954;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:812,0,843 chrXV 609135 . C T 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.452;DP=111;Dels=0.01;FS=0.757;HaplotypeScore=7.2785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:938,0,898 chrXV 609276 . C T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.103;DP=120;Dels=0.00;FS=5.753;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1097,0,1302 chrXV 609306 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.312;DP=114;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.513;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1233,0,1014 chrXV 609344 . G T 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;DP=101;Dels=0.00;FS=3.802;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.702;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:979,0,1026 chrXV 609537 . C T 1928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.227;DP=173;Dels=0.00;FS=3.534;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=2.326;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.394;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,96:173:99:1958,0,1579 chrXV 609542 . C G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.886;DP=159;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,70:159:99:1388,0,1911 chrXV 609550 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.645;DP=163;Dels=0.00;FS=2.001;HaplotypeScore=4.5106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.986;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,71:163:99:1439,0,2012 chrXV 609558 . A G 1922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.603;DP=170;Dels=0.00;FS=3.618;HaplotypeScore=3.6785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,92:170:99:1952,0,1620 chrXV 609743 . A G 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.997;DP=150;Dels=0.00;FS=3.836;HaplotypeScore=3.8396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,77:150:99:1598,0,1625 chrXV 609836 . T C 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;DP=156;Dels=0.00;FS=3.066;HaplotypeScore=7.9406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=25.44;ReadPosRankSum=1.355;SB=-2.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,155:156:99:3968,423,0 chrXV 609918 . A T 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;DP=153;Dels=0.00;FS=3.857;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.272;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1604,0,1709 chrXV 610300 . T C 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2881,303,0 chrXV 610420 . C A 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.791;DP=102;Dels=0.00;FS=4.894;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.314;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1202,0,922 chrXV 610496 . G C 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;DP=144;Dels=0.00;FS=4.117;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.188;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:144:99:1575,0,1361 chrXV 610549 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.707;DP=140;Dels=0.00;FS=14.690;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.585;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:140:99:1296,0,1604 chrXV 610554 . C G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.912;DP=135;Dels=0.00;FS=9.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1211,0,1569 chrXV 610660 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.164;DP=97;Dels=0.01;FS=7.379;HaplotypeScore=3.7944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.725;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1054,0,956 chrXV 610708 . T C 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.081;DP=89;Dels=0.00;FS=7.326;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.040;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:89:99:885,0,1006 chrXV 610718 . G A 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.722;DP=82;Dels=0.00;FS=1.950;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:1002,0,781 chrXV 610864 . A G 2800 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2833,291,0 chrXV 610882 . A C 2738 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2771,279,0 chrXV 610892 . A T 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;DP=106;Dels=0.00;FS=2.517;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1063,0,1180 chrXV 610939 . T C 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.621;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.784;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:2706,288,0 chrXV 611029 . T G 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3064,327,0 chrXV 611065 . T A 2905 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2938,289,0 chrXV 611163 . C T 3061 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3094,304,0 chrXV 611203 . G A 2724 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2757,279,0 chrXV 611430 . T A 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8096;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.10;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3744,373,0 chrXV 611434 . A G 3512.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.146;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.212;SB=-1.194e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,141:143:99:3512,369,0 chrXV 611572 . A G 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7020;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.39;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3008,327,0 chrXV 611599 . T C 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.041e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3020,321,0 chrXV 611617 . T C 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:2837,306,0 chrXV 611686 . A G 3208 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3241,336,0 chrXV 611688 . A C 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3291,339,0 chrXV 611712 . A G 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=24.36;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2810,288,0 chrXV 611714 . C G 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3015,315,0 chrXV 611752 . A G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.64;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3113,336,0 chrXV 611842 . A G 2565 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2598,270,0 chrXV 611904 . A T 2736 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.359;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.358;SB=-1.483e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2769,259,0 chrXV 612123 . G A 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3381,343,0 chrXV 612770 . T A 2287 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2320,237,0 chrXV 612840 . G A 2313 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2346,240,0 chrXV 612859 . G A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.634;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.995;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1142,0,1091 chrXV 612914 . C G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.298;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,58:97:99:1270,0,753 chrXV 613096 . G A 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.347;DP=102;Dels=0.00;FS=4.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:876,0,1273 chrXV 614146 . G A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.818;DP=103;Dels=0.00;FS=3.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.733;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1228,0,943 chrXV 614212 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.074;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.719;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1220,0,1356 chrXV 614917 . A C 3815.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9529;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3815,405,0 chrXV 614998 . C T 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3746,364,0 chrXV 615019 . C T 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2019;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.913e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3639,355,0 chrXV 615172 . G A 3744.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3744,375,0 chrXV 615175 . A G 3552.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2692;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.41;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.461e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3552,366,0 chrXV 615199 . G A 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7516;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3677,364,0 chrXV 615307 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.311;DP=112;Dels=0.00;FS=4.683;HaplotypeScore=3.9413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.148;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1162,0,1135 chrXV 615325 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.349;DP=96;Dels=0.00;FS=3.879;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.021;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1072,0,888 chrXV 615643 . A G 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=26.00;SB=-9.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3179,321,0 chrXV 616123 . C T 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.812;DP=106;Dels=0.00;FS=2.764;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:106:99:1028,0,1192 chrXV 616666 . T A 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.687e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3242,324,0 chrXV 616693 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.994;DP=114;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=2.6514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.847;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1242,0,1191 chrXV 616760 . G A 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.301;DP=107;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.590;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.870;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1127,0,1190 chrXV 616762 . C A 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.037;DP=110;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1130,0,1196 chrXV 616818 . A T 3688.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.54;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3688,364,0 chrXV 616830 . T C 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.44;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3477,345,0 chrXV 616831 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.384;DP=141;Dels=0.00;FS=4.057;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.953;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1188,0,1666 chrXV 616846 . C T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.304;DP=133;Dels=0.00;FS=7.894;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.084;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1197,0,1563 chrXV 616906 . C T 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.179;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=2.361;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.139;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1669,0,1159 chrXV 617001 . T A 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.398;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.778;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:805,0,1291 chrXV 617162 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.881;DP=116;Dels=0.00;FS=10.345;HaplotypeScore=3.5855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=9.67;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1152,0,1184 chrXV 617274 . T A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=1;MQRankSum=-0.021;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.622;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1444,0,1290 chrXV 617336 . G A 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.072;DP=99;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.698;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:998,0,1005 chrXV 617676 . A G 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.827;DP=127;Dels=0.00;FS=2.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.810;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1518,0,1152 chrXV 617717 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.833;DP=125;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.346;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1399,0,1291 chrXV 617892 . A G 2655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2688,279,0 chrXV 617915 . G A 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.285;DP=104;Dels=0.00;FS=2.591;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.780;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1101,0,1104 chrXV 618091 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.747;DP=127;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1343,0,1240 chrXV 618586 . A G 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3440,354,0 chrXV 618618 . G T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.354;DP=148;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.149;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.806;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1468,0,1581 chrXV 618629 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.702;DP=130;Dels=0.00;FS=7.013;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=0.445;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1289,0,1339 chrXV 618723 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.083;DP=112;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=2.5787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1175,0,1166 chrXV 618863 . C T 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.497;DP=78;Dels=0.00;FS=2.144;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.249;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:876,0,862 chrXV 618889 . G A 2056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6605;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=27.41;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2089,216,0 chrXV 618906 . T C 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.548;DP=105;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=6.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.208;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:105:99:893,0,1288 chrXV 618941 . G A 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.084;DP=108;Dels=0.00;FS=3.596;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:1059,0,1297 chrXV 618973 . A T 185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.887;DP=149;Dels=0.00;FS=5.584;HaplotypeScore=6.4954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.436;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:215,0,1840 chrXV 619031 . C G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.50;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3269,348,0 chrXV 619220 . G A 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.856;DP=107;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.639;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1121,0,1166 chrXV 619398 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.920;DP=139;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1386,0,1573 chrXV 619429 . T A 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=112;Dels=0.00;FS=3.460;HaplotypeScore=6.4354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1241,0,1134 chrXV 619517 . G A 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.107;DP=160;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,80:160:99:1441,0,1644 chrXV 619601 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.740;DP=128;Dels=0.00;FS=5.313;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1273,0,1410 chrXV 619636 . C T 1642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.407;DP=157;Dels=0.00;FS=4.921;HaplotypeScore=3.8698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.830;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:1672,0,1482 chrXV 619647 . T C 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:141:99:3656,366,0 chrXV 619784 . A G 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.192;DP=129;Dels=0.00;FS=8.113;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.130;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1263,0,1482 chrXV 619861 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.68;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3269,339,0 chrXV 619880 . C G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;DP=116;Dels=0.00;FS=6.680;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1408,0,970 chrXV 620025 . A G 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.660e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3779,408,0 chrXV 620334 . A G 2972 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3005,312,0 chrXV 620397 . T C 2233 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.09;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2266,258,0 chrXV 620433 . C T 3105 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3138,321,0 chrXV 620620 . G A 3113 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3146,321,0 chrXV 620881 . A G 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8499;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.969e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3752,381,0 chrXV 621416 . T G 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.932;DP=175;Dels=0.00;FS=1.899;HaplotypeScore=6.4605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.079;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,81:175:99:1575,0,2067 chrXV 621951 . T C 4197.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4197,441,0 chrXV 621972 . A G 3532.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.765e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3532,366,0 chrXV 622006 . G A 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.844;DP=172;Dels=0.00;FS=1.226;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.271;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,77:172:99:1590,0,1852 chrXV 622271 . G C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;DP=166;Dels=0.00;FS=1.231;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,71:166:99:1362,0,2081 chrXV 622303 . C T 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3564,358,0 chrXV 622399 . T G 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.596;DP=105;Dels=0.00;FS=3.656;HaplotypeScore=3.3464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,47:105:99:871,0,1326 chrXV 622413 . A G 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2728,282,0 chrXV 623349 . G C 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3738,387,0 chrXV 623422 . C T 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3160,322,0 chrXV 623562 . G A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3540,363,0 chrXV 623604 . C T 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3297,328,0 chrXV 623860 . A G 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2839,294,0 chrXV 623880 . A T 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3000,297,0 chrXV 623925 . G A 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:107:99:2844,294,0 chrXV 623931 . A T 2547 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2580,270,0 chrXV 624091 . G A 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3584,349,0 chrXV 624279 . C T 3515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3515,349,0 chrXV 624391 . G T 3149 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.224e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3182,318,0 chrXV 624473 . T C 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.690;DP=90;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.910;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:911,0,1036 chrXV 624491 . T A 2469 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;QD=27.13;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2502,258,0 chrXV 624522 . G A 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=27.17;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2804,285,0 chrXV 624582 . C T 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.03;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2628,264,0 chrXV 624626 . T A 3834.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7563;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:157:99:3834,385,0 chrXV 624648 . T C 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3169,324,0 chrXV 624930 . A G 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=24.38;SB=-2.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3779,378,0 chrXV 625213 . A G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.753;DP=128;Dels=0.00;FS=3.201;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1235,0,1525 chrXV 625559 . A C 2784 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2817,306,0 chrXV 625581 . A G 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3035,321,0 chrXV 625595 . A G 3021 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3054,330,0 chrXV 625596 . C T 3106 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3139,330,0 chrXV 625649 . C T 3429.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.193e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3429,343,0 chrXV 626502 . G C 2230 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=95;Dels=0.00;FS=3.664;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=23.47;ReadPosRankSum=1.173;SB=-1.012e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:95:99:2263,255,0 chrXV 626508 . T G 2568 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.03;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2601,273,0 chrXV 626516 . A T 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.11;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2480,255,0 chrXV 626519 . C T 2460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.11;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2493,255,0 chrXV 626602 . C T 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2950,283,0 chrXV 626907 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.194;DP=119;Dels=0.00;FS=1.575;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.775;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1176,0,1409 chrXV 627234 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.524;DP=127;Dels=0.00;FS=2.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.080;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1138,0,1538 chrXV 627315 . C T 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3583,364,0 chrXV 627476 . C A 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.758;DP=147;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=4.5117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.103;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1631,0,1408 chrXV 627639 . A C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.445;DP=126;Dels=0.00;FS=4.429;HaplotypeScore=3.9563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1184,0,1436 chrXV 627894 . T C 3803.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3803,387,0 chrXV 628108 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.488;DP=142;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=-1.144;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.028;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1588,0,1354 chrXV 628209 . G A 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.637;DP=169;Dels=0.00;FS=3.061;HaplotypeScore=4.6710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.840;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,84:169:99:1835,0,1808 chrXV 628280 . G A 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3363,340,0 chrXV 628416 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.334;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1248,0,1523 chrXV 628552 . C T 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3683,370,0 chrXV 628909 . A G 3726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=25.88;ReadPosRankSum=-0.457;SB=-1.958e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3726,384,0 chrXV 629011 . C T 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3016,306,0 chrXV 629110 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.820;DP=117;Dels=0.00;FS=8.632;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.757;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:117:99:1248,0,1182 chrXV 630082 . A G 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.00;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3081,330,0 chrXV 630687 . T C 2944 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=23.37;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2977,327,0 chrXV 630810 . A G 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.957;DP=101;Dels=0.00;FS=2.859;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.288;SB=-2.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:869,0,1054 chrXV 630812 . A G 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.942;DP=91;Dels=0.00;FS=2.910;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.790;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:866,0,972 chrXV 630899 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.216;DP=108;Dels=0.00;FS=7.531;HaplotypeScore=3.7391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.177;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1411,0,875 chrXV 630972 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.437;DP=108;Dels=0.00;FS=4.756;HaplotypeScore=7.4183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.950;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1084,0,672 chrXV 631072 . T G 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.110;DP=130;Dels=0.00;FS=7.858;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.111;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1309,0,1421 chrXV 631073 . C A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.827;DP=130;Dels=0.00;FS=7.858;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.087;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1429,0,1350 chrXV 631653 . T C 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.920;DP=101;Dels=0.00;FS=7.816;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1109,0,999 chrXV 631968 . T A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.139;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1090,0,1262 chrXV 632000 . G T 1254.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.514;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.194;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1284,0,1139 chrXV 632289 . G A 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=1;QD=23.61;SB=-1.539e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3008,303,0 chrXV 632436 . A G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.990;DP=135;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.607;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1197,0,1597 chrXV 632498 . G A 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.776;DP=123;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=2.9163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.296;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1396,0,1163 chrXV 632634 . C T 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3686,376,0 chrXV 633253 . T C 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.703;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1539,0,1651 chrXV 633267 . G A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.724;DP=147;Dels=0.00;FS=3.923;HaplotypeScore=2.7398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.099;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1545,0,1438 chrXV 633420 . G A 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.716;DP=144;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.262;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,90:144:99:1918,0,1075 chrXV 633453 . T C 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5149;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3080,321,0 chrXV 633727 . G A 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.765;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3415,326,0 chrXV 634051 . T C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.249;DP=124;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.112;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1289,0,1366 chrXV 634307 . T C 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=21.86;SB=-1.650e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:3673,375,0 chrXV 634428 . G A 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.586;DP=153;Dels=0.00;FS=5.864;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.141;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1710,0,1538 chrXV 634711 . T C 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3663,387,0 chrXV 634951 . A G 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=22.94;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2625,276,0 chrXV 635083 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.285;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.495;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:142:99:1588,0,1381 chrXV 635241 . C G 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;DP=154;Dels=0.00;FS=6.041;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=11.82;ReadPosRankSum=2.134;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,86:154:99:1851,0,1323 chrXV 635897 . C T 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2828,291,0 chrXV 635982 . C T 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.859;DP=119;Dels=0.00;FS=7.204;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.778;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1073,0,949 chrXV 636558 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.725;DP=131;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.127;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,72:131:99:1384,0,1273 chrXV 636741 . A G 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.529;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.387;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,58:138:99:1096,0,1808 chrXV 636791 . A G 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2658,291,0 chrXV 636833 . C A 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.730;DP=98;Dels=0.00;FS=3.798;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.960;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1137,0,882 chrXV 636908 . G A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.545;DP=92;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.282;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,46:91:99:978,0,918 chrXV 637471 . T C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.347;DP=147;Dels=0.01;FS=1.360;HaplotypeScore=4.6060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=-0.108;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,91:145:99:1482,0,875 chrXV 637488 . C T 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.706;DP=134;Dels=0.00;FS=3.188;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=1;MQRankSum=3.465;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,52:134:99:1045,0,1736 chrXV 638136 . T C 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.577;DP=180;Dels=0.00;FS=2.592;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.855;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,93:180:99:1871,0,1845 chrXV 638187 . C T 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.074;DP=146;Dels=0.00;FS=6.277;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=11.21;ReadPosRankSum=-2.944;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1666,0,1308 chrXV 638499 . G A 4192.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.05;SB=-2.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4192,415,0 chrXV 638526 . C T 3786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.612;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6008;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=26.29;ReadPosRankSum=1.010;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:144:99:3786,384,0 chrXV 638603 . A G 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3822,405,0 chrXV 638733 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.602;DP=159;Dels=0.00;FS=3.637;HaplotypeScore=120.2855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.585;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,70:159:99:1449,0,1792 chrXV 638859 . C A 1924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.676;DP=165;Dels=0.00;FS=2.099;HaplotypeScore=6.5021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.059;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,90:165:99:1954,0,1535 chrXV 639000 . G A 3306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.741e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3306,342,0 chrXV 639041 . T C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.802;DP=139;Dels=0.00;FS=3.998;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.993;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1294,0,1585 chrXV 639239 . G T 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.638;DP=152;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.535;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1457,0,1506 chrXV 639299 . T C 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3111,330,0 chrXV 639307 . T C 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.42;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3394,360,0 chrXV 639391 . A T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.707;DP=141;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=2.7823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:141:99:1298,0,1699 chrXV 639445 . G A 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.548;DP=115;Dels=0.00;FS=10.386;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.544;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1290,0,1075 chrXV 639610 . T G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.743;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:117:99:1116,0,1345 chrXV 639648 . T G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.855;DP=127;Dels=0.00;FS=5.713;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.837;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.138;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1416,0,1287 chrXV 639675 . G A 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.352;DP=126;Dels=0.00;FS=7.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1195,0,1516 chrXV 639717 . A G 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.717e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3284,336,0 chrXV 639862 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.038;DP=137;Dels=0.00;FS=1.438;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.091;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.357;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1323,0,1331 chrXV 639978 . A G 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3421,363,0 chrXV 640033 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.374;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.695;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1424,0,1466 chrXV 640481 . A G 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3221,333,0 chrXV 640487 . T C 909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.237;DP=128;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.065;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,52:128:99:939,0,1678 chrXV 641229 . G A 2416 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2449,252,0 chrXV 641510 . T C 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.323;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.949;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:146:99:1436,0,1518 chrXV 641909 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.519;DP=116;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=9.5678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1040,0,1075 chrXV 642138 . T C 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.63;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3211,336,0 chrXV 642164 . A G 3191 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3224,339,0 chrXV 642294 . G C 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.391;DP=144;Dels=0.00;FS=1.305;HaplotypeScore=8.9794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=10.77;ReadPosRankSum=2.603;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1581,0,1417 chrXV 642380 . G A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3723,375,0 chrXV 642482 . C T 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.515;DP=141;Dels=0.00;FS=4.242;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1558,0,1339 chrXV 642699 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.987;DP=133;Dels=0.00;FS=3.156;HaplotypeScore=3.2228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.052;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1378,0,1298 chrXV 642716 . G A 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.2626;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.732e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3372,337,0 chrXV 643019 . C T 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;DP=74;Dels=0.00;FS=0.973;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.811;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,44:74:99:926,0,594 chrXV 643206 . C T 2245 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.692;DP=86;Dels=0.00;FS=6.123;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.410;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:2278,234,0 chrXV 643604 . G A 2100 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.58;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2133,216,0 chrXV 643727 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.542;DP=109;Dels=0.00;FS=3.106;HaplotypeScore=6.3653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.585;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1076,0,1176 chrXV 643871 . C T 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.447;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1278,0,1102 chrXV 643999 . A G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.093;DP=115;Dels=0.00;FS=4.804;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1288,0,1223 chrXV 644337 . T C 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.981;DP=107;Dels=0.00;FS=3.665;HaplotypeScore=4.6243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.941;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:954,0,1296 chrXV 644371 . C T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.177;DP=113;Dels=0.00;FS=1.568;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.702;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1360,0,994 chrXV 644421 . T C 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.820;DP=93;Dels=0.00;FS=6.833;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=9.11;ReadPosRankSum=2.308;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,43:93:99:877,0,1130 chrXV 644459 . C G 2267 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2300,243,0 chrXV 644486 . T C 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.903;DP=107;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=5.0073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.327;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:107:99:847,0,1306 chrXV 644548 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.328;DP=112;Dels=0.00;FS=3.694;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1141,0,1181 chrXV 644569 . G A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.634;DP=115;Dels=0.00;FS=1.502;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1067,0,1279 chrXV 644578 . C T 3170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3203,321,0 chrXV 644937 . A G 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.074;DP=107;Dels=0.00;FS=3.600;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1143,0,1121 chrXV 645045 . C T 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.822e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3680,370,0 chrXV 646069 . A G 679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.617;DP=81;Dels=0.00;FS=7.397;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.222;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:709,0,904 chrXV 646152 . G A 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.182;DP=126;Dels=0.00;FS=1.524;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.092;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:1123,0,1534 chrXV 646402 . G C 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;DP=114;Dels=0.00;FS=3.448;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.761;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1358,0,1008 chrXV 648978 . G T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.279;DP=119;Dels=0.00;FS=10.568;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:119:99:1183,0,1368 chrXV 650349 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.453;DP=139;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.837;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1359,0,1379 chrXV 652283 . G A 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.428;DP=131;Dels=0.00;FS=11.344;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.885;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:131:99:1505,0,1181 chrXV 652418 . C T 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.794;DP=112;Dels=0.00;FS=11.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1189,0,1165 chrXV 652485 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.786;DP=118;Dels=0.00;FS=3.325;HaplotypeScore=4.9641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.718;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1231,0,1273 chrXV 652895 . G A 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.507;DP=110;Dels=0.00;FS=1.535;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.125;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1028,0,1201 chrXV 652952 . A T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;DP=102;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=5.2436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=1;MQRankSum=-0.597;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.483;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1126,0,967 chrXV 653138 . T C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.605;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:1012,0,858 chrXV 653186 . A T 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.847;DP=88;Dels=0.00;FS=4.311;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=13.47;ReadPosRankSum=2.525;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:1215,0,731 chrXV 653618 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.807;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.473;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1251,0,1244 chrXV 653625 . A G 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.993;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.390;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1063,0,1280 chrXV 653775 . G T 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.960;DP=139;Dels=0.00;FS=18.175;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=7.08;ReadPosRankSum=-2.487;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,53:139:99:1014,0,1887 chrXV 653896 . G A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.139;DP=147;Dels=0.00;FS=2.986;HaplotypeScore=5.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.184;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.331;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1423,0,1719 chrXV 653929 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.062;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1365,0,1463 chrXV 653975 . A T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.343;DP=133;Dels=0.00;FS=1.442;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.780;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1287,0,1634 chrXV 654118 . C T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.895;DP=113;Dels=0.00;FS=3.499;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.703;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1174,0,1195 chrXV 654602 . A G 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.317;DP=164;Dels=0.00;FS=25.228;HaplotypeScore=11.9167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.285;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,76:164:99:1463,0,1981 chrXV 654692 . C A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.630;DP=143;Dels=0.00;FS=1.358;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.966;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:143:99:1313,0,1572 chrXV 654883 . G A 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.001;DP=111;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1182,0,1169 chrXV 654940 . G A 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.894;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.772;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1125,0,1242 chrXV 655035 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.437;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.776;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1411,0,1413 chrXV 655064 . T C 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.596;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1083,0,1319 chrXV 655070 . A G 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=119;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=8.92;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1092,0,1364 chrXV 655136 . C T 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.897;DP=121;Dels=0.00;FS=5.742;HaplotypeScore=8.7109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.543;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1175,0,1250 chrXV 655223 . A G 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.522;DP=128;Dels=0.00;FS=5.419;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.060;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1442,0,1263 chrXV 655239 . A G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.702;DP=116;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1296,0,1161 chrXV 655286 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.620;DP=126;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=2.7073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.249;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1346,0,1300 chrXV 655560 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.260;DP=128;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:1170,0,1477 chrXV 655601 . C A 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.513;DP=144;Dels=0.00;FS=3.017;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.242;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1425,0,1573 chrXV 655671 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.444;DP=112;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=2.238;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.758;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1197,0,1056 chrXV 655796 . T C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.442;DP=122;Dels=0.00;FS=5.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.500;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1184,0,1397 chrXV 656069 . T C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.734;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.515;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1261,0,1198 chrXV 656165 . T G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.157;DP=135;Dels=0.00;FS=6.556;HaplotypeScore=4.4331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.663;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1321,0,1451 chrXV 656264 . G C 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3347,348,0 chrXV 656389 . C T 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.645;DP=121;Dels=0.00;FS=5.656;HaplotypeScore=5.9561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.090;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1473,0,976 chrXV 656534 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.031;DP=117;Dels=0.00;FS=1.692;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1263,0,1088 chrXV 656567 . G A 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3642,369,0 chrXV 656602 . G A 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.288;DP=132;Dels=0.00;FS=4.195;HaplotypeScore=2.8195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1447,0,1148 chrXV 656633 . T A 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:987,0,1083 chrXV 656694 . G A 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.994;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.199;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:888,0,839 chrXV 656887 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.167;DP=94;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,57:94:99:1189,0,705 chrXV 657104 . A G 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3394,348,0 chrXV 657159 . A G 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.526;DP=103;Dels=0.00;FS=2.664;HaplotypeScore=37.3412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.902;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.960;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:886,0,1102 chrXV 657188 . C T 648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.651;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQ0=0;MQRankSum=-7.673;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.152;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:678,0,1114 chrXV 657190 . A G 613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.445;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.02;MQ0=0;MQRankSum=-7.360;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.468;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:643,0,1225 chrXV 657201 . G A 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.763;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQ0=0;MQRankSum=-8.063;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:749,0,1232 chrXV 657204 . C T 735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.422;DP=94;Dels=0.00;FS=3.185;HaplotypeScore=3.9499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQ0=0;MQRankSum=-7.054;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:765,0,1141 chrXV 657216 . A G 641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.448;DP=98;Dels=0.00;FS=6.983;HaplotypeScore=2.2857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-6.493;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.520;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:671,0,1220 chrXV 657269 . T A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.439;DP=139;Dels=0.00;FS=3.271;HaplotypeScore=4.7050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.941;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.763;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1102,0,1702 chrXV 657752 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.059;DP=143;Dels=0.00;FS=2.091;HaplotypeScore=6.7948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.743;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1304,0,1624 chrXV 658010 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.154;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.145;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1539,0,1664 chrXV 658022 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.752;DP=166;Dels=0.00;FS=0.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=8.28;ReadPosRankSum=3.729;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,72:166:99:1404,0,2086 chrXV 658026 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.099;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=8.61;ReadPosRankSum=3.461;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,72:165:99:1451,0,2002 chrXV 658040 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.129;DP=159;Dels=0.00;FS=1.976;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.983;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,69:159:99:1319,0,2032 chrXV 658097 . A G 652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.601;DP=105;Dels=0.00;FS=2.603;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,39:105:99:682,0,1526 chrXV 658201 . T G 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.531;DP=131;Dels=0.00;FS=7.203;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.357;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1336,0,1474 chrXV 658500 . T C 1797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.995;DP=155;Dels=0.00;FS=11.271;HaplotypeScore=4.7479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=11.59;ReadPosRankSum=-3.518;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,87:155:99:1827,0,1418 chrXV 658645 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.515;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1318,0,1233 chrXV 658711 . G A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.474;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.742;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1109,0,1237 chrXV 658744 . G A 3434.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3434,342,0 chrXV 659697 . A G 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.539;DP=142;Dels=0.00;FS=7.519;HaplotypeScore=9.9296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.553;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1441,0,1491 chrXV 660570 . G A 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.073;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.944;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1218,0,1153 chrXV 660805 . G A 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.760e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3603,367,0 chrXV 660868 . T C 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.942;DP=116;Dels=0.00;FS=3.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.830;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,74:116:99:1634,0,819 chrXV 661003 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.802;DP=110;Dels=0.00;FS=10.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1044,0,1411 chrXV 661009 . A G 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.031;DP=114;Dels=0.00;FS=8.779;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.750;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:945,0,1420 chrXV 661258 . A G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.965;DP=132;Dels=0.00;FS=2.247;HaplotypeScore=3.7980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.102;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1300,0,1507 chrXV 661967 . G A 531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.577;DP=70;Dels=0.00;FS=0.913;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,33:70:99:561,0,815 chrXV 662174 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.916;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1298,0,1126 chrXV 662272 . C A 2661 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2694,282,0 chrXV 663812 . C T 2996 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3029,303,0 chrXV 664038 . G A 4057.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.178e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4057,412,0 chrXV 664146 . A C 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.180e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3619,366,0 chrXV 664259 . C T 2829 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.604;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=26.19;ReadPosRankSum=1.315;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2862,275,0 chrXV 667693 . G C 2372 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.615;DP=94;Dels=0.00;FS=9.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.248;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:93:99:2405,240,0 chrXV 669720 . G A 1581.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.915;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=2.232;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,81:166:99:1611,0,1769 chrXV 670051 . C A 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.845;DP=114;Dels=0.00;FS=0.694;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=2.319;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1363,0,1032 chrXV 670150 . A G 1756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.251;DP=162;Dels=0.00;FS=9.970;HaplotypeScore=7.9098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,97:162:99:1786,0,1312 chrXV 670200 . C T 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.559;DP=125;Dels=0.00;FS=2.309;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.958;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,75:125:99:1697,0,923 chrXV 670328 . A G 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.874;DP=154;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.938;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.360;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:1609,0,1537 chrXV 670522 . A G 1901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.026;DP=158;Dels=0.00;FS=1.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.933;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,88:158:99:1931,0,1454 chrXV 670894 . A T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.720;DP=129;Dels=0.00;FS=5.617;HaplotypeScore=2.2329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=2.024;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.108;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:129:99:1489,0,1103 chrXV 670961 . T A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;DP=132;Dels=0.00;FS=5.356;HaplotypeScore=3.3197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1533,0,1240 chrXV 671651 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.381;DP=156;Dels=0.00;FS=7.252;HaplotypeScore=3.7068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-4.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,64:156:99:1231,0,1938 chrXV 672026 . C G 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;DP=124;Dels=0.00;FS=6.974;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1208,0,1352 chrXV 672196 . C A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.653;DP=143;Dels=0.00;FS=3.008;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.258;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1597,0,1470 chrXV 674078 . G T 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.046;DP=88;Dels=0.00;FS=4.189;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.280;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:88:99:970,0,824 chrXV 675070 . A C 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.995;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1377,0,1804 chrXV 675191 . T C 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.445;DP=175;Dels=0.00;FS=7.872;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,94:175:99:1892,0,1705 chrXV 675206 . C T 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.193;DP=166;Dels=0.00;FS=11.119;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=9.43;ReadPosRankSum=2.759;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,77:166:99:1596,0,1886 chrXV 675246 . T C 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3472,363,0 chrXV 675258 . G A 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.10;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3124,313,0 chrXV 675304 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.541;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.258;SB=-1.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1287,0,1427 chrXV 675643 . A T 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.33;SB=-9.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3608,373,0 chrXV 675665 . A T 3827.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7840;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3827,399,0 chrXV 675701 . T C 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.11;SB=-2.101e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4068,432,0 chrXV 675894 . C G 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3202,327,0 chrXV 676391 . A G 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.36;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3525,372,0 chrXV 676406 . A G 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4003,420,0 chrXV 676532 . C T 3642.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3642,367,0 chrXV 676724 . C T 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3604;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:3010,303,0 chrXV 676799 . C T 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3799,379,0 chrXV 676817 . A G 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3425,366,0 chrXV 677286 . G A 2845 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2878,306,0 chrXV 677365 . C T 2271 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=17.34;SB=-1.802e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2304,231,0 chrXV 677540 . C T 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.704;DP=122;Dels=0.00;FS=5.859;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.008;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1188,0,1288 chrXV 677733 . C G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.031;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1335,0,1378 chrXV 677846 . T A 3348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.758e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3348,340,0 chrXV 677995 . C T 4104.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4104,409,0 chrXV 678058 . G T 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3664,373,0 chrXV 678070 . A G 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3577,375,0 chrXV 678100 . C G 1682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=148.8423;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=11.68;SB=-1.679e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:1715,177,0 chrXV 678248 . A G 3504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3504,372,0 chrXV 678382 . A G 2610 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2643,267,0 chrXV 678575 . C G 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3836,390,0 chrXV 678916 . A G 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.97;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.383e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2876,309,0 chrXV 678936 . G A 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2980,303,0 chrXV 678995 . G T 2304 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=91.8451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.34;MQ0=0;QD=22.59;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2337,240,0 chrXV 679042 . C A 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.32;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3408,346,0 chrXV 679088 . A G 3656.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3656,381,0 chrXV 679101 . C T 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.400;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.793;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,79:158:99:1635,0,1598 chrXV 679323 . T G 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.345;DP=138;Dels=0.00;FS=1.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.424;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1438,0,1451 chrXV 679386 . T C 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3167,330,0 chrXV 679406 . A T 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2964,303,0 chrXV 679488 . T C 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3292,330,0 chrXV 679794 . G A 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.454e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3342,331,0 chrXV 679983 . C T 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=25.37;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2875,300,0 chrXV 680430 . G A 2181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2214,222,0 chrXV 680491 . G A 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.53;SB=-9.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2765,279,0 chrXV 680797 . T C 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3718,372,0 chrXV 680922 . C T 4187.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4187,409,0 chrXV 680951 . T A 4507.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7189;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=25.32;SB=-2.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:178:99:4507,445,0 chrXV 681208 . A G 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3209,342,0 chrXV 681324 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.288;DP=109;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.595;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:109:99:1138,0,1011 chrXV 681357 . T C 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.129;DP=102;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=9.31;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:102:99:980,0,956 chrXV 681389 . T C 80.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.571;DP=107;Dels=0.00;FS=4.866;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.632;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,48:107:99:110,0,993 chrXV 681468 . A C 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.996;DP=115;Dels=0.00;FS=1.675;HaplotypeScore=2.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=1.065;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.686;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1114,0,1262 chrXV 681597 . T C 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.614;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=2.574;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.557;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:912,0,1466 chrXV 681705 . G A 3467.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3467,352,0 chrXV 682254 . G A 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4068,406,0 chrXV 682318 . A T 4422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4422,442,0 chrXV 682434 . A G 1849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.909;DP=162;Dels=0.00;FS=0.590;HaplotypeScore=147.7399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.48;MQ0=0;MQRankSum=2.224;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.326;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,96:162:99:1879,0,1327 chrXV 682481 . G A 60.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.789;DP=111;Dels=0.00;FS=8.711;HaplotypeScore=205.7319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.59;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=0.54;ReadPosRankSum=-3.272;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,34:111:90:90,0,385 chrXV 682726 . C T 2159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.826;DP=170;Dels=0.00;FS=1.905;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.242;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,97:170:99:2189,0,1296 chrXV 682961 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.703;DP=127;Dels=0.00;FS=3.299;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1341,0,1300 chrXV 682981 . G T 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.085;DP=132;Dels=0.00;FS=6.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.909;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1347,0,1381 chrXV 683095 . G T 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3278,334,0 chrXV 683158 . G A 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4061,415,0 chrXV 683295 . A G 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.358e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3250,345,0 chrXV 683302 . G A 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3365,342,0 chrXV 683351 . T C 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.788e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3565,372,0 chrXV 683410 . C T 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3191,327,0 chrXV 683489 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.087;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.460;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1304,0,1205 chrXV 683563 . G A 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.11;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3233,319,0 chrXV 683598 . T C 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.270;DP=160;Dels=0.01;FS=0.654;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.333;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1732,0,1573 chrXV 683694 . C T 3974.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.11;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3974,406,0 chrXV 683698 . A C 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.12;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3366,357,0 chrXV 683731 . C T 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.10;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3393,351,0 chrXV 683778 . T C 3350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=25.57;ReadPosRankSum=-1.600;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3350,322,0 chrXV 684078 . T C 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3364,342,0 chrXV 684335 . A G 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3893,423,0 chrXV 684467 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.817;DP=154;Dels=0.00;FS=3.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:154:99:1371,0,1911 chrXV 684893 . C T 4339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.95;SB=-2.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4339,451,0 chrXV 685474 . G A 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2969,286,0 chrXV 685969 . A G 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.390;DP=137;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=2.6548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.351;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1300,0,1529 chrXV 686417 . T C 2513 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2546,285,0 chrXV 686985 . G A 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2793,270,0 chrXV 687317 . A G 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3309,342,0 chrXV 687338 . C T 482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.084;DP=113;Dels=0.00;FS=3.683;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=4.27;ReadPosRankSum=-2.746;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:512,0,1574 chrXV 687346 . A G 610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.329;DP=112;Dels=0.00;FS=1.555;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=5.45;ReadPosRankSum=-1.490;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:640,0,1603 chrXV 687593 . C A 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.076;DP=168;Dels=0.00;FS=1.919;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=1;MQRankSum=-0.444;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.371;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,78:168:99:1667,0,1826 chrXV 687739 . A G 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3739,387,0 chrXV 688033 . C T 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.446e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3163,315,0 chrXV 688166 . G A 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.982;DP=149;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1408,0,1472 chrXV 688425 . G A 4275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6924;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.55;SB=-2.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4275,436,0 chrXV 688433 . T A 4562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.99;SB=-2.323e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4562,460,0 chrXV 688554 . T A 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3357,322,0 chrXV 688671 . C G 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.405;DP=143;Dels=0.00;FS=7.428;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=2.188;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.951;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,69:143:99:1328,0,1514 chrXV 688719 . T C 2957 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.66;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2990,318,0 chrXV 688811 . G A 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.879;DP=146;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.038;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1627,0,1391 chrXV 688973 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.456;DP=165;Dels=0.00;FS=3.697;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.739;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,78:165:99:1373,0,1723 chrXV 688982 . T C 3523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=23.03;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3523,360,0 chrXV 689078 . A G 3497.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3497,360,0 chrXV 689217 . T C 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.590;DP=146;Dels=0.00;FS=4.831;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.566;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3718,372,0 chrXV 689383 . C T 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.671e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3474,349,0 chrXV 689499 . T G 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.711;DP=119;Dels=0.00;FS=3.407;HaplotypeScore=7.7649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.296;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:891,0,1664 chrXV 689599 . A G 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3392,348,0 chrXV 689641 . T C 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3517,375,0 chrXV 689875 . A G 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.415;DP=121;Dels=0.00;FS=6.918;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.724;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1097,0,1378 chrXV 690070 . A G 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.303;DP=112;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:894,0,1512 chrXV 690110 . T A 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.580;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:925,0,1123 chrXV 690197 . G C 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.125;DP=118;Dels=0.00;FS=4.391;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.508;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1145,0,1326 chrXV 690202 . C T 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2953,294,0 chrXV 690359 . A G 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.169e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2978,318,0 chrXV 690477 . T C 2785 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.585;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=23.60;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2818,269,0 chrXV 690980 . G C 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.441;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1272,0,1625 chrXV 691288 . A C 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3569;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:2992,321,0 chrXV 691480 . C T 3800.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.756e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3800,385,0 chrXV 691690 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.756;DP=135;Dels=0.00;FS=5.640;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.606;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1452,0,1316 chrXV 691852 . A G 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.811;DP=152;Dels=0.00;FS=7.565;HaplotypeScore=9.1096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=2;MQRankSum=2.480;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.153;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,87:152:99:1756,0,1333 chrXV 691977 . T A 3945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.862e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3945,400,0 chrXV 692038 . T C 3133 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3166,339,0 chrXV 692169 . A C 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.820e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3547,366,0 chrXV 692189 . T C 3491.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.41;SB=-1.939e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3491,351,0 chrXV 692352 . A T 3446.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.903e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3446,337,0 chrXV 693049 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.026;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.746;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1360,0,1269 chrXV 693110 . A C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.847;DP=119;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.642;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,68:119:99:1362,0,1061 chrXV 693170 . A T 1514.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.697;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1544,0,1111 chrXV 693526 . C T 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3152,321,0 chrXV 693634 . T C 2073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.599;DP=190;Dels=0.00;FS=1.178;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=10.91;ReadPosRankSum=2.069;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,105:190:99:2103,0,1781 chrXV 693930 . T G 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.700;DP=164;Dels=0.00;FS=1.969;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.322;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,69:164:99:1338,0,2090 chrXV 694031 . T C 1388.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.890;DP=147;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=9.44;ReadPosRankSum=2.649;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1418,0,1595 chrXV 694231 . C T 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3305,340,0 chrXV 694271 . G A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.172;DP=132;Dels=0.00;FS=1.386;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.450;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:132:99:1512,0,1249 chrXV 694391 . G A 1752.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.703;DP=168;Dels=0.00;FS=0.610;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.688;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:168:99:1782,0,1733 chrXV 694394 . G A 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.713;DP=165;Dels=0.00;FS=1.252;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.886;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,86:165:99:1851,0,1670 chrXV 694427 . C G 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;DP=159;Dels=0.00;FS=4.653;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:159:99:1677,0,1671 chrXV 694439 . G A 1802.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.739;DP=160;Dels=0.00;FS=4.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:1832,0,1603 chrXV 694457 . T C 1832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.323;DP=181;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.234;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,89:181:99:1862,0,2015 chrXV 694471 . T C 4232.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=25.65;ReadPosRankSum=-0.577;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:4232,435,0 chrXV 694574 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.740;DP=141;Dels=0.00;FS=1.329;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1634,0,1302 chrXV 694591 . G A 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.162;DP=135;Dels=0.00;FS=6.460;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.647;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1335,0,1575 chrXV 694619 . A G 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.169;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.000;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1732,0,1777 chrXV 694776 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.418;DP=142;Dels=0.00;FS=6.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=9.88;ReadPosRankSum=-2.011;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1433,0,1478 chrXV 695116 . T C 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.851e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:3877,417,0 chrXV 695150 . C T 3977.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.945e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3977,415,0 chrXV 695231 . A G 4145.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=25.43;SB=-2.120e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:163:99:4145,426,0 chrXV 695402 . G A 4432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=27.19;SB=-2.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4432,439,0 chrXV 695613 . G A 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.511;DP=131;Dels=0.00;FS=2.232;HaplotypeScore=3.9735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.095;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1303,0,1455 chrXV 696447 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.085;DP=126;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.296;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1400,0,1294 chrXV 696549 . C G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.637;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1226,0,1347 chrXV 697431 . C T 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.151;DP=138;Dels=0.00;FS=5.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.855;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,75:138:99:1665,0,1253 chrXV 697632 . C A 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.695;DP=140;Dels=0.00;FS=7.582;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=11.07;ReadPosRankSum=-2.428;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1580,0,1308 chrXV 697666 . G C 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.377;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1472,0,1414 chrXV 697884 . G C 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.417;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9380;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=23.99;ReadPosRankSum=0.730;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:2936,312,0 chrXV 697906 . G A 3221.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3255,327,0 chrXV 697921 . A C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.248;DP=129;Dels=0.00;FS=0.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.955;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1361,0,1237 chrXV 698025 . T C 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.758;DP=160;Dels=0.00;FS=8.128;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=3.268;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.604;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,83:160:99:1791,0,1555 chrXV 698268 . T C 638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.391;DP=80;Dels=0.00;FS=5.932;HaplotypeScore=2.4923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.005;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,34:80:99:668,0,971 chrXV 698300 . T A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;DP=102;Dels=0.00;FS=2.541;HaplotypeScore=10.0155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=10.39;ReadPosRankSum=2.614;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1090,0,794 chrXV 698306 . T C 2367 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=23.44;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:101:99:2400,255,0 chrXV 698343 . C T 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.977;DP=113;Dels=0.00;FS=1.504;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.303;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1216,0,1026 chrXV 698579 . T G 3274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.58;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3274,345,0 chrXV 698916 . C A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.462;DP=141;Dels=0.00;FS=11.135;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.670;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.320;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1518,0,1469 chrXV 698953 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.383;DP=139;Dels=0.00;FS=6.524;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1615,0,1333 chrXV 698995 . T G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.884;DP=146;Dels=0.00;FS=7.400;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,68:146:99:1297,0,1717 chrXV 699146 . A T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;DP=133;Dels=0.00;FS=9.986;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:1107,0,1736 chrXV 699147 . G A 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.380;DP=133;Dels=0.00;FS=9.951;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1101,0,1693 chrXV 699646 . T G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.076;DP=141;Dels=0.00;FS=1.382;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.585;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1219,0,1703 chrXV 699816 . C T 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.940;DP=164;Dels=0.00;FS=5.619;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.016;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,83:164:99:1787,0,1629 chrXV 699869 . G A 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.172;DP=130;Dels=0.00;FS=7.944;HaplotypeScore=3.5342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.809;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:130:99:1592,0,1168 chrXV 699977 . A G 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.810;DP=125;Dels=0.00;FS=5.569;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.550;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1546,0,1106 chrXV 700407 . A T 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;DP=119;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.969;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,70:119:99:1617,0,997 chrXV 700514 . A G 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.97;SB=-9.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3097,321,0 chrXV 700968 . G A 3619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.850e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3619,361,0 chrXV 701028 . T C 3842.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=2;QD=24.01;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3842,393,0 chrXV 701042 . A G 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.758;DP=151;Dels=0.00;FS=1.314;HaplotypeScore=4.3909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=2;MQRankSum=-2.246;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.696;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:151:99:1359,0,1574 chrXV 701137 . C G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;DP=167;Dels=0.00;FS=3.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.313;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,76:167:99:1374,0,1837 chrXV 701156 . T C 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.117;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.740;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1550,0,1563 chrXV 701208 . C T 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.323;DP=110;Dels=0.00;FS=6.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.292;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1231,0,1098 chrXV 701218 . C A 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.588;DP=102;Dels=0.00;FS=13.325;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.532;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1122,0,997 chrXV 701256 . C T 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.331;DP=113;Dels=0.00;FS=10.970;HaplotypeScore=5.8572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.094;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1237,0,1122 chrXV 701365 . T A 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;DP=114;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=7.58;ReadPosRankSum=-1.334;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:894,0,1524 chrXV 701450 . A G 870.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.547;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=6.69;ReadPosRankSum=-2.303;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,52:130:99:900,0,1727 chrXV 701551 . A G 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.763;DP=117;Dels=0.00;FS=17.883;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.432;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1078,0,1346 chrXV 701614 . G A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.544;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=9.20;ReadPosRankSum=-1.803;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1180,0,1476 chrXV 701714 . A G 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.741;DP=147;Dels=0.00;FS=3.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.647;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1564,0,1416 chrXV 701781 . G A 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.470;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=1;MQRankSum=1.143;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.626;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1519,0,1448 chrXV 701849 . G C 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.824;DP=109;Dels=0.00;FS=1.626;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=-1.057;QD=12.87;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,67:109:99:1433,0,767 chrXV 701869 . G A 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.976;DP=131;Dels=0.00;FS=4.337;HaplotypeScore=2.8477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.482;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:131:99:1615,0,1083 chrXV 702216 . A C 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.911;DP=133;Dels=0.00;FS=1.783;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1398,0,1360 chrXV 702245 . T A 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.543;DP=160;Dels=0.01;FS=7.286;HaplotypeScore=2.7510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.150;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1839,0,1616 chrXV 702475 . T C 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.414;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,83:161:99:1489,0,1707 chrXV 702493 . C G 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.560;DP=137;Dels=0.00;FS=4.305;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.439;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:1161,0,1666 chrXV 702546 . G T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.663;DP=129;Dels=0.00;FS=4.192;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.088;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1205,0,1525 chrXV 702754 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.227;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.515;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.879;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1349,0,1562 chrXV 702764 . A C 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.733;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.239;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1524,0,1498 chrXV 702861 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.926;DP=108;Dels=0.00;FS=1.775;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=10.31;ReadPosRankSum=2.081;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1143,0,1100 chrXV 702862 . G A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.468;DP=106;Dels=0.00;FS=1.783;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=10.51;ReadPosRankSum=2.004;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1144,0,1067 chrXV 702970 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.022;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.703;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1159,0,1083 chrXV 703124 . C G 2866 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2899,306,0 chrXV 703231 . T G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.107;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=2.566;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.821;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:131:99:1524,0,1203 chrXV 703501 . A C 680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.758;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=7.16;ReadPosRankSum=2.122;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:710,0,1230 chrXV 703915 . C A 1093 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.69;MQ0=21;QD=16.07;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:1126,117,0 chrXV 704035 . G A 594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;DP=42;Dels=0.00;FS=29.313;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.70;MQ0=2;MQRankSum=2.818;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.134;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,31:42:73:624,0,73 chrXV 704052 . G A 850.52 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.936;DP=43;Dels=0.00;FS=17.930;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.08;MQ0=0;MQRankSum=1.951;QD=19.78;ReadPosRankSum=2.709;SB=-3.615e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,38:43:6:880,0,6 chrXV 704068 . A G 852 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;DP=41;Dels=0.00;FS=6.591;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.43;MQ0=1;MQRankSum=1.831;QD=20.78;ReadPosRankSum=1.645;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:41:40:885,40,0 chrXV 704070 . G A 982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.55;MQ0=1;QD=25.18;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:39:99:1015,99,0 chrXV 704157 . A G 131.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.26;MQ0=9;QD=8.20;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,7:16:18:164,18,0 chrXV 704175 . G A 114.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.03;MQ0=11;QD=6.01;SB=-2.384e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,13:19:15:147,15,0 chrXV 709439 . A G 43.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=251;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.27;MQ0=246;MQRankSum=0.731;QD=0.18;ReadPosRankSum=0.731;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:247,4:251:9:76,9,0 chrXV 709696 . A G 539.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;DP=128;Dels=0.00;FS=2.359;HaplotypeScore=33.5772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.63;MQ0=66;MQRankSum=-0.120;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:569,0,511 chrXV 709698 . G T 647.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.970;DP=127;Dels=0.00;FS=4.130;HaplotypeScore=33.5772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.73;MQ0=66;MQRankSum=2.826;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.731;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:127:99:677,0,385 chrXV 709700 . G T 635.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.933;DP=125;Dels=0.00;FS=1.086;HaplotypeScore=31.7454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.89;MQ0=65;MQRankSum=1.696;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.418;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:125:99:665,0,483 chrXV 709766 . T A 1093.64 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.790;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.28;MQ0=13;MQRankSum=0.649;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.649;SB=-3.146e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,53:64:11:1126,11,0 chrXV 709785 . A G 93.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.81;MQ0=16;QD=4.05;SB=-2.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,15:23:15:126,15,0 chrXV 709803 . G A 51.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.94;MQ0=17;QD=2.26;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,18:23:9:84,9,0 chrXV 710065 . A C 59.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;DP=21;Dels=0.00;FS=7.701;HaplotypeScore=3.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.44;MQ0=1;MQRankSum=-0.416;QD=2.81;ReadPosRankSum=-2.079;SB=-7.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:89:89,0,232 chrXV 710067 . T C 43.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.715;DP=20;Dels=0.00;FS=7.701;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.14;MQ0=1;MQRankSum=-0.531;QD=2.15;ReadPosRankSum=-2.000;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:73:73,0,241 chrXV 710069 . T C 34.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.735;DP=20;Dels=0.00;FS=7.701;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.14;MQ0=1;MQRankSum=-0.041;QD=1.70;ReadPosRankSum=-2.409;SB=-7.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:64:64,0,235 chrXV 710167 . A G 45.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;DP=30;Dels=0.00;FS=14.039;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.20;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=1.50;ReadPosRankSum=-2.415;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:75:75,0,379 chrXV 710305 . A G 713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.568;DP=85;Dels=0.00;FS=0.859;HaplotypeScore=15.8924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.748;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,36:85:99:743,0,981 chrXV 710553 . C T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.853;DP=101;Dels=0.00;FS=1.631;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.493;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,59:101:99:1303,0,811 chrXV 710559 . G A 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.796;DP=100;Dels=0.00;FS=3.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.843;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:820,0,1291 chrXV 710606 . T A 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;DP=103;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.255;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:995,0,1212 chrXV 710609 . T C 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.315;DP=107;Dels=0.00;FS=2.485;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:987,0,1283 chrXV 710699 . G A 3091 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3124,318,0 chrXV 710933 . A T 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;DP=74;Dels=0.00;FS=4.494;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.611;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,43:74:99:887,0,643 chrXV 711140 . A T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.798;DP=94;Dels=0.00;FS=6.859;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.579;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1097,0,860 chrXV 711252 . A G 1759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.380;DP=167;Dels=0.00;FS=4.513;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,86:167:99:1789,0,1657 chrXV 711312 . A G 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.480;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.363;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:999,0,1266 chrXV 711322 . T C 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.092;DP=103;Dels=0.00;FS=1.576;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.810;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:963,0,1225 chrXV 711414 . A G 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.812;DP=103;Dels=0.01;FS=1.570;HaplotypeScore=3.1888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=9.59;ReadPosRankSum=-2.008;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1018,0,1131 chrXV 711467 . C T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.019;DP=110;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=11.55;ReadPosRankSum=2.400;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1301,0,1058 chrXV 711533 . G A 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.263e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2570,261,0 chrXV 711599 . C T 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.903;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.325;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1036,0,1259 chrXV 711643 . G C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;DP=125;Dels=0.00;FS=6.814;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.492;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1058,0,1243 chrXV 711654 . T C 876.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.030;DP=114;Dels=0.00;FS=8.836;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.055;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:906,0,1254 chrXV 711719 . T G 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.811;DP=107;Dels=0.00;FS=2.503;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.081;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:826,0,1320 chrXV 712214 . C G 3119 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3152,327,0 chrXV 712477 . C T 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.088;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=1;MQRankSum=-0.427;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,78:162:99:1654,0,1720 chrXV 713486 . A T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;DP=108;Dels=0.00;FS=10.940;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.662;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1049,0,1258 chrXV 713729 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.849;DP=113;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.152;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1187,0,1106 chrXV 713926 . T C 1953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.70;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:1986,219,0 chrXV 714510 . A G 508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.534;DP=90;Dels=0.00;FS=0.826;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.574;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:538,0,1311 chrXV 714990 . A G 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.084;DP=118;Dels=0.00;FS=1.500;HaplotypeScore=4.7610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.076;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,69:118:99:1450,0,1018 chrXV 715235 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.722;DP=89;Dels=0.00;FS=10.470;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.787;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,52:89:99:1076,0,780 chrXV 715376 . A T 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.321;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,38:77:99:806,0,769 chrXV 716103 . T C 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.372;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.440;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1346,0,1524 chrXV 716298 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.576;DP=133;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.5756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,77:133:99:1578,0,1122 chrXV 716400 . C T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.229;DP=135;Dels=0.00;FS=3.079;HaplotypeScore=2.5657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.782;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1527,0,1367 chrXV 716951 . G C 831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.588;DP=105;Dels=0.00;FS=3.894;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.480;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:861,0,1327 chrXV 716978 . C T 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.285;DP=112;Dels=0.00;FS=2.536;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.309;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,45:112:99:904,0,1438 chrXV 716999 . T C 601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.293;DP=95;Dels=0.00;FS=2.804;HaplotypeScore=4.9645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=6.33;ReadPosRankSum=1.057;SB=-2.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:631,0,1309 chrXV 717277 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.489;DP=124;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.602;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1221,0,1267 chrXV 717398 . G T 2040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.425;DP=168;Dels=0.00;FS=8.024;HaplotypeScore=6.6892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,98:168:99:2070,0,1281 chrXV 718180 . T C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.197;DP=154;Dels=0.00;FS=25.515;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.694;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1339,0,1882 chrXV 718599 . G A 2595 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=15.3860;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=21.10;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2628,264,0 chrXV 718605 . T A 613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=107;Dels=0.00;FS=3.812;HaplotypeScore=5.1657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=5.73;ReadPosRankSum=2.502;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:643,0,1477 chrXV 718650 . G C 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.600;DP=111;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=2.5508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:970,0,1106 chrXV 719184 . A G 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.004;DP=131;Dels=0.00;FS=5.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.551;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1354,0,1341 chrXV 720164 . A G 2152 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.65;MQ0=0;QD=25.62;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2185,240,0 chrXV 720202 . G C 385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=110.1692;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.16;MQ0=0;QD=2.96;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:130:45:418,45,0 chrXV 720923 . A G 4041.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=24.34;SB=-2.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4041,423,0 chrXV 721121 . C T 3855.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.664;DP=153;Dels=0.00;FS=3.586;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.460;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:153:99:3855,368,0 chrXV 721219 . G T 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4003,412,0 chrXV 721240 . A T 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.10;SB=-2.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3915,394,0 chrXV 721322 . G A 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3324,345,0 chrXV 723226 . A C 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3419,342,0 chrXV 724989 . A G 2084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=21.94;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2117,228,0 chrXV 725113 . T C 2260 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2293,243,0 chrXV 725167 . C T 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.81;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2703,273,0 chrXV 725266 . T A 3708.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.26;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3708,382,0 chrXV 725758 . T G 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6868;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3330,360,0 chrXV 726294 . A G 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3122,321,0 chrXV 726893 . G A 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2918,300,0 chrXV 727008 . G A 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3172,321,0 chrXV 727788 . A C 2044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.55;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2077,222,0 chrXV 727969 . G A 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2948,300,0 chrXV 728063 . G A 2346 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2379,237,0 chrXV 728105 . A G 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.55;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2588,282,0 chrXV 729380 . A T 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2699,270,0 chrXV 730011 . C T 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3310,337,0 chrXV 730479 . G A 3799.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3799,367,0 chrXV 731742 . A T 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3738,376,0 chrXV 732030 . C T 1538.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.641;DP=142;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1568,0,1452 chrXV 732609 . A G 2696 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;DP=112;Dels=0.00;FS=3.551;HaplotypeScore=5.8197;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=24.07;ReadPosRankSum=1.358;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:112:99:2729,288,0 chrXV 733519 . C T 2527 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.487;DP=113;Dels=0.00;FS=3.629;HaplotypeScore=4.9579;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=22.36;ReadPosRankSum=1.211;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:2560,264,0 chrXV 733533 . T A 2656 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.099e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2689,273,0 chrXV 733608 . A G 2936 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.26;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:2969,318,0 chrXV 733667 . C G 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3405,360,0 chrXV 733949 . C G 4063.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:161:99:4063,411,0 chrXV 733953 . A G 3949.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3949,396,0 chrXV 734684 . C T 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2961,300,0 chrXV 735107 . T A 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;DP=107;Dels=0.00;FS=3.051;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.923;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:2821,264,0 chrXV 735678 . T C 3327.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3327,348,0 chrXV 735873 . G A 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2982,306,0 chrXV 735877 . G T 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.97;SB=-9.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2864,294,0 chrXV 741440 . T C 3691.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3691,390,0 chrXV 741453 . C T 3582.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3582,361,0 chrXV 742836 . C A 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3174,319,0 chrXV 743167 . C A 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2841,282,0 chrXV 747087 . T C 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3628,372,0 chrXV 748605 . T C 2964 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.12;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2997,318,0 chrXV 748650 . C T 3474.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=23.79;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3474,331,0 chrXV 748655 . G A 3750.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3750,366,0 chrXV 748737 . T G 3527.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3527,369,0 chrXV 751442 . G A 3716.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.929e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3716,370,0 chrXV 752064 . G A 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3190,318,0 chrXV 755003 . C T 2868 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2901,300,0 chrXV 755444 . A T 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.55;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2639,267,0 chrXV 755735 . C T 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3564,361,0 chrXV 756163 . G A 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3211,316,0 chrXV 756252 . C A 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=1;QD=25.83;SB=-1.691e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3513,340,0 chrXV 757677 . C T 3164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3197,322,0 chrXV 757746 . A G 2908 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.820;DP=114;Dels=0.00;FS=3.409;HaplotypeScore=3.6492;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=25.51;ReadPosRankSum=0.243;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:2941,303,0 chrXV 757952 . C T 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3393,340,0 chrXV 758539 . A G 3614.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3614,375,0 chrXV 759214 . T C 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=1;QD=24.33;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2904,300,0 chrXV 759381 . A G 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3106,333,0 chrXV 759629 . T C 2171 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=100;Dels=0.00;FS=3.665;HaplotypeScore=2.4052;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.866;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:2204,217,0 chrXV 759919 . A G 2721 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=23.87;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2754,306,0 chrXV 759944 . C T 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3311,339,0 chrXV 760240 . C T 3713.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3713,373,0 chrXV 760339 . G A 3529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3529,358,0 chrXV 760354 . A G 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3580,369,0 chrXV 761321 . C T 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7145;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.03;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3514,352,0 chrXV 761610 . T C 2889 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2922,309,0 chrXV 761634 . T C 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2872,297,0 chrXV 763017 . C T 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.047;DP=112;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=24.11;ReadPosRankSum=1.233;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,110:112:99:2733,255,0 chrXV 763368 . A C 2658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2691,279,0 chrXV 763531 . C T 3606.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.430e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3606,346,0 chrXV 763613 . C T 3558.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=28.02;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3558,361,0 chrXV 763671 . T C 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.042e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3683,390,0 chrXV 763679 . C G 3509.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=25.61;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3509,369,0 chrXV 764698 . G A 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3853,379,0 chrXV 765690 . A C 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3477,378,0 chrXV 766681 . G A 2994 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3027,315,0 chrXV 766799 . G A 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3290,319,0 chrXV 767198 . C G 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3816,390,0 chrXV 767955 . G A 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3763,379,0 chrXV 768716 . G A 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:137:99:3320,336,0 chrXV 774673 . A G 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3318,363,0 chrXV 776223 . A G 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3425,363,0 chrXV 776725 . C T 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3870,394,0 chrXV 776874 . C T 4364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61;SB=-2.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4364,442,0 chrXV 776943 . A C 3755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3755,390,0 chrXV 777123 . G A 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3701,367,0 chrXV 777138 . G A 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.494e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3718,379,0 chrXV 777201 . G A 3317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3317,345,0 chrXV 777225 . C T 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.595;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=25.62;ReadPosRankSum=1.677;SB=-1.320e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:126:99:3261,313,0 chrXV 777268 . A G 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3342,360,0 chrXV 777290 . G C 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3436,348,0 chrXV 777461 . C T 4485.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.38;SB=-2.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4485,445,0 chrXV 777483 . C T 4096.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4096,427,0 chrXV 777500 . A C 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3192,345,0 chrXV 777645 . G A 4387.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.27;SB=-2.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4387,439,0 chrXV 778024 . C T 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3010,292,0 chrXV 778545 . T C 3000 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;DP=117;Dels=0.00;FS=4.247;HaplotypeScore=1.8628;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.466;SB=-1.183e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3033,321,0 chrXV 779051 . C T 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.94;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3340,339,0 chrXV 779089 . A C 3565.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3565,363,0 chrXV 779097 . G T 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3217,327,0 chrXV 779132 . C T 2711 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2744,276,0 chrXV 779174 . T C 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=24.08;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3019,312,0 chrXV 779194 . A G 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=24.73;ReadPosRankSum=-1.614;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:2926,297,0 chrXV 779252 . C T 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3067,306,0 chrXV 779309 . G C 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3433,360,0 chrXV 779611 . G A 4321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4321,430,0 chrXV 779663 . A G 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.50;MQ0=0;QD=23.81;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3176,330,0 chrXV 779773 . T C 2139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.26;MQ0=0;QD=22.05;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2172,240,0 chrXV 779788 . T A 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.12;MQ0=0;QD=22.38;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2696,285,0 chrXV 779801 . C T 2555 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.31;MQ0=0;QD=22.61;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2588,276,0 chrXV 779815 . A T 215 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.29;MQ0=0;QD=2.05;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:33:248,33,0 chrXV 779821 . A T 1986 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.32;MQ0=0;QD=20.69;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2019,213,0 chrXV 779822 . T C 2015 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.56;MQ0=0;QD=19.95;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2048,225,0 chrXV 780064 . T C 3073 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=23.46;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3106,330,0 chrXV 780221 . C T 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=21.66;ReadPosRankSum=0.173;SB=-2.170e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:160:99:3466,354,0 chrXV 780477 . G A 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3894,394,0 chrXV 781222 . T C 3184 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3217,348,0 chrXV 781811 . G C 3634.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3634,381,0 chrXV 781897 . C A 3540.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.67;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3540,375,0 chrXV 781909 . C T 3374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=107.3350;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.57;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.343e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3374,354,0 chrXV 781943 . G A 2817 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.29;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2850,303,0 chrXV 781954 . C T 2769 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.700;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.064;SB=-1.487e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2802,291,0 chrXV 782167 . G T 3564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3564,361,0 chrXV 782356 . A C 3997.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.601e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3997,420,0 chrXV 782474 . G C 3848.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3848,384,0 chrXV 782578 . G A 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3531,355,0 chrXV 782587 . C T 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3836,390,0 chrXV 782716 . G A 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3692,361,0 chrXV 782821 . A T 3099 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3132,312,0 chrXV 782910 . A G 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.347e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2988,315,0 chrXV 783400 . G T 2518 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=24.69;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2551,252,0 chrXV 783414 . T G 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3035,309,0 chrXV 783444 . C G 2739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2772,288,0 chrXV 783455 . A G 2609 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2642,282,0 chrXV 783522 . C G 1875 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.94;MQ0=0;QD=21.31;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1908,201,0 chrXV 783587 . G A 2308 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.51;MQ0=0;QD=22.85;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2341,240,0 chrXV 783659 . G A 3089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.31;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.338e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3122,310,0 chrXV 783669 . T C 2740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.01;MQ0=0;QD=23.22;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2773,300,0 chrXV 783674 . T C 2611 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.33;MQ0=0;QD=22.70;SB=-1.271e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2644,279,0 chrXV 783919 . G A 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.66;MQ0=0;QD=25.45;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3639,364,0 chrXV 784606 . A G 3712.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:3712,390,0 chrXV 784642 . G A 4154.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4154,427,0 chrXV 784734 . C T 3796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.868e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3796,373,0 chrXV 784813 . C G 2943 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.190e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2976,321,0 chrXV 785050 . T C 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3330,342,0 chrXV 785112 . G A 2486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2519,255,0 chrXV 785151 . A C 2289 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=24.61;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2322,252,0 chrXV 785154 . T G 2320 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=24.95;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:93:99:2353,252,0 chrXV 785163 . G A 1988 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.72;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2021,210,0 chrXV 785203 . A C 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.268e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2703,285,0 chrXV 785252 . A G 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2881,309,0 chrXV 785674 . A G 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3290,351,0 chrXV 785982 . C T 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3500,361,0 chrXV 786510 . T C 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2704,303,0 chrXV 786645 . A G 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3453,333,0 chrXV 786708 . C T 2458 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.87;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2491,255,0 chrXV 786732 . C T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3285,336,0 chrXV 786840 . T C 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;DP=128;Dels=0.00;FS=3.513;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.407;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3232,330,0 chrXV 786986 . T A 3775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3775,393,0 chrXV 787002 . A T 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=98.5907;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.257e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3489,361,0 chrXV 787138 . A G 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3323,336,0 chrXV 787507 . G A 3715.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3715,367,0 chrXV 787600 . C T 2575 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=26.82;ReadPosRankSum=-0.325;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,95:96:99:2608,244,0 chrXV 787943 . C T 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2822,291,0 chrXV 788235 . T C 4127.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.661e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4127,441,0 chrXV 788275 . C T 4202.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4202,418,0 chrXV 788305 . G A 4382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.93;SB=-2.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4382,430,0 chrXV 788819 . G A 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.808e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3666,367,0 chrXV 789076 . T A 3461.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3461,360,0 chrXV 789087 . G A 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.718e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3423,349,0 chrXV 789595 . T C 3740.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3740,381,0 chrXV 789672 . A G 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=24.83;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3187,366,0 chrXV 789673 . C T 3468.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=27.74;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3468,369,0 chrXV 789699 . T C 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.29;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3864,414,0 chrXV 789868 . T A 2927 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.436e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2960,297,0 chrXV 790068 . C A 4401.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.84;SB=-2.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4401,427,0 chrXV 790680 . A C 3589.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7083;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.529e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3589,378,0 chrXV 790834 . G T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3605,370,0 chrXV 790997 . T C 3728.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.08;MQ0=0;QD=23.75;SB=-1.942e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3728,396,0 chrXV 791104 . T A 4065.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=1;QD=25.89;SB=-2.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4065,412,0 chrXV 791449 . C T 3755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.81;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3755,385,0 chrXV 791498 . T C 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3493,366,0 chrXV 791600 . A G 3147 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.40;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3180,342,0 chrXV 791960 . G A 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.796e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3644,364,0 chrXV 792220 . T C 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=23.15;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3043,333,0 chrXV 792267 . C T 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3208,319,0 chrXV 792500 . C G 3769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3769,381,0 chrXV 792544 . G A 3094 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3127,304,0 chrXV 792948 . T C 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.569;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.603;QD=25.15;ReadPosRankSum=1.499;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3370,351,0 chrXV 793037 . A G 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3018,306,0 chrXV 794866 . T A 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3484,352,0 chrXV 795366 . T C 3954.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.975e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3954,408,0 chrXV 795456 . A G 3754.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.552;DP=184;Dels=0.02;FS=3.298;HaplotypeScore=9.6029;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.359;SB=-1.842e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,171:180:99:3754,305,0 chrXV 795596 . C T 3840.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.95;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3840,373,0 chrXV 796275 . C T 4161.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2018;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4161,421,0 chrXV 796340 . T G 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:3861,384,0 chrXV 796472 . C A 4000.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.986e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4000,400,0 chrXV 796728 . T C 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3261,348,0 chrXV 796760 . G C 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=23.39;SB=-1.996e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3579,387,0 chrXV 796774 . A C 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=23.84;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3647,381,0 chrXV 796810 . G A 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.11;SB=-1.874e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3640,372,0 chrXV 797158 . C T 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3513,346,0 chrXV 797268 . C T 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3487,354,0 chrXV 797335 . C T 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.824;DP=110;Dels=0.00;FS=2.968;HaplotypeScore=8.6561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=2.382;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.011;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:110:99:2863,242,0 chrXV 797933 . C G 2630 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=22.87;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2663,279,0 chrXV 798206 . A T 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.886e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3809,385,0 chrXV 799117 . C T 3562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3562,337,0 chrXV 802185 . C T 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2682,261,0 chrXV 802360 . C T 2831 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2864,291,0 chrXV 802374 . T C 2544 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2577,276,0 chrXV 802400 . T C 2348 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:99:2381,252,0 chrXV 802722 . G C 2599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2632,279,0 chrXV 802733 . G A 2794 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2827,279,0 chrXV 802913 . G A 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:129:99:3249,319,0 chrXV 804146 . T C 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=1;QD=25.79;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3585,363,0 chrXV 804694 . C T 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2947,303,0 chrXV 805074 . G A 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.13;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3752,373,0 chrXV 806960 . G T 2431 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2464,243,0 chrXV 807285 . T G 1027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.34;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1060,117,0 chrXV 807948 . A G 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2775,285,0 chrXV 807956 . A G 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2953,303,0 chrXV 807993 . G A 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2569,261,0 chrXV 808281 . T C 3008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=1;QD=25.93;SB=-1.513e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3041,315,0 chrXV 810364 . G T 3282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3282,330,0 chrXV 810448 . A G 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.51;SB=-1.007e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3219,348,0 chrXV 812018 . A G 3102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.64;SB=-9.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3135,336,0 chrXV 812662 . G A 3644.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3644,364,0 chrXV 813776 . T A 2385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.979;DP=92;Dels=0.00;FS=3.727;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.979;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:2418,246,0 chrXV 814261 . G A 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3813,370,0 chrXV 814826 . C T 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3066,309,0 chrXV 814857 . C T 3339.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3339,340,0 chrXV 815003 . T C 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3283,348,0 chrXV 815030 . C T 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.607e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3365,346,0 chrXV 815061 . T C 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.159e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3305,351,0 chrXV 815222 . A G 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=24.24;ReadPosRankSum=0.646;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2893,312,0 chrXV 815249 . G A 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=26.05;ReadPosRankSum=1.359;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3386,309,0 chrXV 815267 . C T 3377.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3377,337,0 chrXV 815595 . G A 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3451,360,0 chrXV 815746 . T C 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.23;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3111,327,0 chrXV 815934 . C T 3500.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4858;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.77;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3500,346,0 chrXV 816109 . C T 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2909,294,0 chrXV 816176 . A G 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3539,369,0 chrXV 816215 . C G 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3386,360,0 chrXV 816326 . G A 4069.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4069,403,0 chrXV 816467 . A T 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.743e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:127:99:3293,324,0 chrXV 816611 . A G 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.135e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2811,300,0 chrXV 816620 . G A 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2955,297,0 chrXV 816745 . A G 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.644e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3539,357,0 chrXV 816857 . C T 3625.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3625,370,0 chrXV 816997 . G A 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3516,357,0 chrXV 817129 . T C 3376.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3376,360,0 chrXV 817342 . C T 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.39;SB=-2.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4081,406,0 chrXV 817750 . C T 2545 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.71;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2578,261,0 chrXV 817819 . A G 3842.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3842,390,0 chrXV 818426 . A G 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=1;QD=24.83;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3526,381,0 chrXV 818797 . A G 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.473e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2838,303,0 chrXV 819302 . T C 2752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:111:99:2785,291,0 chrXV 819325 . C T 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3104,306,0 chrXV 819348 . C T 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.774e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3302,322,0 chrXV 819402 . G A 3112 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=26.60;ReadPosRankSum=1.022;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:3145,324,0 chrXV 819414 . G C 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3346;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3257,339,0 chrXV 819520 . G A 2447 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2480,246,0 chrXV 819711 . C T 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=1;QD=26.85;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3437,349,0 chrXV 819720 . C T 3451.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=1;QD=26.34;SB=-1.053e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3451,360,0 chrXV 819872 . C T 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3522,361,0 chrXV 819966 . G T 3514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3514,337,0 chrXV 820165 . T C 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=1;QD=25.89;SB=-1.360e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3444,351,0 chrXV 820353 . C T 3493.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3493,358,0 chrXV 820399 . T C 3881.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9479;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3881,396,0 chrXV 820504 . T C 2915 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4923;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:2948,309,0 chrXV 820636 . A G 2931 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.551e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2964,309,0 chrXV 820643 . A T 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3097,304,0 chrXV 820854 . C G 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=65.18;MQ0=0;QD=24.33;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3196,330,0 chrXV 820953 . A G 2705 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.026;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2738,306,0 chrXV 821142 . C T 3674.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3674,370,0 chrXV 821187 . G T 4086.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.755e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4086,415,0 chrXV 821223 . C T 4043.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4043,412,0 chrXV 821660 . T C 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2972,318,0 chrXV 821758 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3266,342,0 chrXV 822154 . T C 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.15;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3195,321,0 chrXV 822156 . G C 3185 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.432e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3218,321,0 chrXV 822171 . A G 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=23.21;SB=-8.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2795,297,0 chrXV 822605 . C G 2758 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.27;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2791,300,0 chrXV 822681 . G T 3533.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3533,346,0 chrXV 822963 . T C 367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.183;DP=99;Dels=0.00;FS=23.053;HaplotypeScore=3.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.38;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=3.71;ReadPosRankSum=-3.717;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,25:99:99:397,0,860 chrXV 822978 . T C 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;DP=97;Dels=0.00;FS=32.120;HaplotypeScore=4.6269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=10.25;ReadPosRankSum=6.226;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,81:97:99:1024,0,134 chrXV 823408 . G A 2787 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=26.29;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2820,285,0 chrXV 823625 . C T 3159 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3192,324,0 chrXV 823902 . C T 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3273,333,0 chrXV 823938 . G A 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=25.54;ReadPosRankSum=-0.953;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:121:99:3123,327,0 chrXV 823983 . A G 2941 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2974,312,0 chrXV 824184 . G T 2990 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:117:99:3023,315,0 chrXV 824287 . A C 3743.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3743,381,0 chrXV 824472 . A G 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.334e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3117,315,0 chrXV 824520 . A G 2985 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3018,318,0 chrXV 824910 . G A 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3753,376,0 chrXV 824928 . T C 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.664e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3453,351,0 chrXV 825198 . G A 3829.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.78;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3829,388,0 chrXV 825345 . A G 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.47;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3490,363,0 chrXV 826024 . C T 2566 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.89;MQ0=0;QD=22.91;SB=-1.214e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2599,270,0 chrXV 826032 . A G 2283 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=21.14;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2316,246,0 chrXV 826034 . C T 2479 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.38;MQ0=0;QD=21.56;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2512,258,0 chrXV 826120 . T C 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3329,366,0 chrXV 826212 . A T 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3601,361,0 chrXV 826325 . G A 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3404,337,0 chrXV 826784 . A G 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.68;SB=-1.307e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3356,360,0 chrXV 827016 . A T 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3057,304,0 chrXV 827048 . A G 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5031;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=24.69;ReadPosRankSum=1.614;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2946,315,0 chrXV 827194 . A T 3779.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.961e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3779,376,0 chrXV 827284 . T A 4337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4337,439,0 chrXV 827386 . G A 4306.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.211;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.4169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.091;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,172:173:99:4306,415,0 chrXV 828050 . A G 4174.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4174,426,0 chrXV 828529 . T C 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=23.48;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3085,333,0 chrXV 828544 . A T 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3423,348,0 chrXV 828571 . C T 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3685,381,0 chrXV 828897 . G A 2791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2824,288,0 chrXV 828922 . A G 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=22.58;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2630,276,0 chrXV 829039 . A G 3976.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.866e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3976,429,0 chrXV 829111 . A G 4504.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.988e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4504,460,0 chrXV 829210 . G A 4915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.71;SB=-2.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4915,478,0 chrXV 829348 . T C 4635.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,185:185:99:4635,477,0 chrXV 829528 . C T 4272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4272,439,0 chrXV 829621 . C G 3416.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3416,360,0 chrXV 830314 . G A 4385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.24;SB=-2.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4385,454,0 chrXV 830744 . T A 4300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4300,453,0 chrXV 830783 . C A 3730.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5017;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.63;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3730,388,0 chrXV 830933 . A G 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=25.36;SB=-7.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3101,339,0 chrXV 830980 . T C 3488.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.716e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3488,375,0 chrXV 831051 . C T 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.637e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3202,301,0 chrXV 831980 . A G 3887.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.619e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3887,411,0 chrXV 832089 . A C 94.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.72;MQ0=0;QD=0.72;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:15:127,15,0 chrXV 832222 . G T 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.93;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2834,294,0 chrXV 832277 . G A 3766.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3766,364,0 chrXV 832328 . A G 3747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.98;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3747,393,0 chrXV 832576 . G A 2483 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=23.65;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2516,255,0 chrXV 832664 . T A 4273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7323;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4273,430,0 chrXV 832805 . A G 4109.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.68;SB=-2.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:4109,423,0 chrXV 832871 . T C 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.330e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3686,387,0 chrXV 833004 . A G 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3571,375,0 chrXV 833028 . G A 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3051,303,0 chrXV 833065 . G T 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3381,337,0 chrXV 833083 . A G 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3294,342,0 chrXV 833338 . G A 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3968,391,0 chrXV 833472 . A G 4152.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4152,438,0 chrXV 833904 . C T 4412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=25.95;SB=-2.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:170:99:4412,436,0 chrXV 834267 . G T 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3103,315,0 chrXV 834436 . C T 3968.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.970e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3968,397,0 chrXV 834662 . G A 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.85;SB=-2.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3774,379,0 chrXV 834738 . C T 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3711,379,0 chrXV 834976 . C T 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3932,409,0 chrXV 835187 . T C 3726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:3726,384,0 chrXV 835445 . T G 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3364,339,0 chrXV 836249 . C A 3014 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3047,312,0 chrXV 836272 . G A 2685 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2718,270,0 chrXV 836294 . T C 2520 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.258e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2553,270,0 chrXV 837032 . G T 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;DP=83;Dels=0.00;FS=121.433;HaplotypeScore=3.3737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=0.34;ReadPosRankSum=-5.306;SB=-5.149e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:58:58,0,1310 chrXV 837056 . A G 1486 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1519,171,0 chrXV 837126 . G A 2913 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=1;QD=27.22;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2946,303,0 chrXV 837247 . G A 2695 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2728,270,0 chrXV 837632 . A C 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=24.07;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3066,321,0 chrXV 837685 . A G 3186 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3219,339,0 chrXV 839332 . G A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3297,324,0 chrXV 839433 . C T 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2911,291,0 chrXV 839444 . G T 2952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2985,297,0 chrXV 839744 . G A 2266 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2299,240,0 chrXV 839828 . A G 2686 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=25.34;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2719,285,0 chrXV 839885 . G A 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2983,303,0 chrXV 839947 . A T 3802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.971e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3802,373,0 chrXV 840149 . C T 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3408,340,0 chrXV 840176 . T C 2987 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3020,315,0 chrXV 840302 . A G 3911.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=1;QD=25.40;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3911,417,0 chrXV 840713 . C T 3880.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3880,391,0 chrXV 840781 . T A 4061.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6457;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=1;QD=25.07;SB=-2.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4061,403,0 chrXV 841378 . T G 3172 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3205,330,0 chrXV 841710 . T C 2885 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.379e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2918,303,0 chrXV 841912 . G T 3726.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.56;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.005e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3726,366,0 chrXV 841930 . A C 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3427,351,0 chrXV 842069 . A G 3342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.427;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=24.22;ReadPosRankSum=1.481;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,137:138:99:3342,336,0 chrXV 842085 . C T 3471.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.70;MQ0=0;QD=24.44;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3471,369,0 chrXV 842104 . G A 2919 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.36;MQ0=0;QD=23.54;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2952,315,0 chrXV 842107 . C T 2762 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.14;MQ0=0;QD=23.21;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2795,297,0 chrXV 842131 . T C 2355 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.55;MQ0=0;QD=21.81;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2388,261,0 chrXV 842137 . C A 2453 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.18;MQ0=0;QD=22.71;SB=-9.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2486,255,0 chrXV 842270 . C G 2032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=23.36;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2065,213,0 chrXV 842383 . T C 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=25.33;ReadPosRankSum=-1.289;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3199,316,0 chrXV 842666 . A G 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.152e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3285,357,0 chrXV 843103 . C G 3683.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3683,384,0 chrXV 843225 . A T 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9385;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.910e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3653,373,0 chrXV 843670 . T C 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3315,330,0 chrXV 843892 . A G 2932 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.78;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2965,315,0 chrXV 844310 . A C 3453.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3453,384,0 chrXV 844440 . T C 2898 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2931,315,0 chrXV 844466 . T A 2606 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2639,267,0 chrXV 844759 . C T 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3392,357,0 chrXV 844770 . A G 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3583,387,0 chrXV 845043 . A G 3121 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3154,327,0 chrXV 845199 . G A 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.11;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3062,312,0 chrXV 845250 . T C 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=23.98;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2983,318,0 chrXV 845796 . A G 3813.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3813,387,0 chrXV 845957 . C G 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3329,351,0 chrXV 845995 . C T 2803 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.470e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2836,276,0 chrXV 846027 . G A 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3397,337,0 chrXV 846110 . A C 4215.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.55;SB=-2.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:165:99:4215,435,0 chrXV 846148 . A G 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3549,351,0 chrXV 846321 . C T 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3104,315,0 chrXV 846446 . T C 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.013e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2703,291,0 chrXV 846491 . C T 3020 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3053,309,0 chrXV 846521 . C T 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.451e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3051,315,0 chrXV 846548 . C T 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.387e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2697,279,0 chrXV 846599 . T G 3162 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3195,327,0 chrXV 846676 . T C 4195.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4195,444,0 chrXV 846731 . G C 4308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.11;SB=-2.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4308,465,0 chrXV 846763 . C T 4033.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.577e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4033,417,0 chrXV 847382 . A C 3314.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.503e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3314,345,0 chrXV 847716 . A G 3963.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.477e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3963,411,0 chrXV 848614 . G A 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3131,315,0 chrXV 848635 . G C 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2982,306,0 chrXV 848658 . C T 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3549,352,0 chrXV 848780 . G C 2948 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2981,321,0 chrXV 848890 . T G 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=25.50;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3545,354,0 chrXV 848963 . C T 3837.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3837,388,0 chrXV 849243 . T C 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3174,327,0 chrXV 849621 . G A 2920 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2953,294,0 chrXV 849841 . T C 2733 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2766,294,0 chrXV 849847 . A G 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2668,291,0 chrXV 850120 . G A 3718.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3718,381,0 chrXV 850123 . A G 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.75;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3366,369,0 chrXV 850168 . G C 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=23.34;SB=-1.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3338,354,0 chrXV 850266 . G C 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.46;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3067,327,0 chrXV 850435 . A G 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3590,375,0 chrXV 850811 . C T 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3318,328,0 chrXV 851118 . T C 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3420,354,0 chrXV 851249 . T A 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3194,310,0 chrXV 851261 . C T 3305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3305,328,0 chrXV 851396 . C T 2912 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.067e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2945,292,0 chrXV 851461 . C T 2476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.261e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2509,252,0 chrXV 851557 . G T 3505.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.871e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3505,358,0 chrXV 851570 . C G 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3229,357,0 chrXV 851662 . C T 2818 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2851,294,0 chrXV 852451 . G A 2676 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2709,270,0 chrXV 852538 . C T 2851 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2884,297,0 chrXV 853420 . G T 2848 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.128;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.620;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2881,303,0 chrXV 854412 . A C 18.82 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=10;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.14;MQ0=6;MQRankSum=0.727;QD=1.88;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-7.990e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,3:10:6:50,6,0 chrXV 854423 . C A 53.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=14;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.69;MQ0=9;MQRankSum=0.731;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,6:14:9:86,9,0 chrXV 854464 . C T 96.14 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=27;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.78;MQ0=20;MQRankSum=0.198;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.922;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,7:27:12:126,0,12 chrXV 854509 . T A 289.03 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.302;DP=31;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.62;MQ0=15;MQRankSum=1.985;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:20:319,0,20 chrXV 854531 . T C 271.04 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.311;DP=26;Dels=0.00;FS=9.574;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.36;MQ0=9;MQRankSum=1.714;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.373;SB=-9.605e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:18:301,0,18 chrXV 854577 . T C 202.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.12;MQ0=0;QD=20.20;SB=-2.702e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:24:235,24,0 chrXV 854622 . C A 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.78;MQ0=0;QD=0.57;SB=-5.028e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:6:58,6,0 chrXV 854667 . G A 1102 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.63;MQ0=0;QD=13.60;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1135,117,0 chrXV 854717 . C T 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.74;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3099,309,0 chrXV 854873 . A G 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.44;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3055,312,0 chrXV 854883 . C T 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3058,295,0 chrXV 854955 . T C 2196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.19;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2229,231,0 chrXV 855037 . A G 1791 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.67;MQ0=0;QD=22.11;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1824,189,0 chrXV 855289 . C T 3156 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3189,304,0 chrXV 855747 . T C 2358 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.06;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2391,255,0 chrXV 856028 . C T 3465.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3465,361,0 chrXV 856254 . G A 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3742,376,0 chrXV 856383 . T G 2474 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2507,273,0 chrXV 856831 . C G 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.563e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3099,324,0 chrXV 857553 . C T 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2930,297,0 chrXV 858511 . T C 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3163,333,0 chrXV 858879 . A T 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3685,355,0 chrXV 859245 . A G 3802.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.911e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3802,402,0 chrXV 859338 . T G 2714 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=127;Dels=0.00;FS=4.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.132;SB=-1.166e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,126:127:99:2747,294,0 chrXV 859706 . A G 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=1;QD=24.01;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3250,345,0 chrXV 859857 . T C 2781 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;QD=24.61;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2814,306,0 chrXV 860178 . G A 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.287e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3248,325,0 chrXV 860275 . A G 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.570e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2919,300,0 chrXV 860337 . T A 3703.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3703,361,0 chrXV 860397 . A G 2597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2630,282,0 chrXV 860578 . T C 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.19;MQ0=0;QD=23.89;SB=-1.262e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:109:99:2637,270,0 chrXV 860613 . A C 2326 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2359,243,0 chrXV 860651 . T G 2634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.77;MQ0=0;QD=24.85;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2667,279,0 chrXV 860762 . C A 2569 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.32;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2602,267,0 chrXV 860904 . G A 446.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.100;DP=111;Dels=0.03;FS=49.661;HaplotypeScore=17.3478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.86;MQ0=0;MQRankSum=-3.464;QD=4.02;ReadPosRankSum=-3.339;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,43:108:99:476,0,822 chrXV 860906 . G A 327.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.148;DP=108;Dels=0.03;FS=44.947;HaplotypeScore=14.5760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.63;MQ0=0;MQRankSum=-5.080;QD=3.03;ReadPosRankSum=-5.964;SB=-8.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,36:105:99:357,0,912 chrXV 860908 . G A 305.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.668;DP=107;Dels=0.00;FS=52.636;HaplotypeScore=14.5760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.274;QD=2.85;ReadPosRankSum=-6.893;SB=-6.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,37:107:99:335,0,934 chrXV 860912 . T A 207.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;DP=100;Dels=0.00;FS=70.164;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.33;MQ0=0;MQRankSum=-4.512;QD=2.07;ReadPosRankSum=-7.414;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,29:100:99:237,0,1039 chrXV 861103 . A G 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=24.59;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2959,306,0 chrXV 861110 . A G 3178 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.84;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3211,324,0 chrXV 861195 . C T 3195 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3228,324,0 chrXV 861653 . T C 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2876,306,0 chrXV 861709 . G A 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3034,315,0 chrXV 862059 . C A 3525.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3525,358,0 chrXV 862092 . G A 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3576,367,0 chrXV 862212 . C G 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2622,261,0 chrXV 862224 . A T 2877 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2910,288,0 chrXV 862275 . T C 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.196e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2933,321,0 chrXV 862485 . C G 3939.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3939,414,0 chrXV 862815 . G C 3935.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3935,396,0 chrXV 863103 . T C 2814 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=24.05;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2847,318,0 chrXV 863148 . C T 3022 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.447e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3055,315,0 chrXV 863403 . G A 2700 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2733,267,0 chrXV 863724 . A G 2321 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2354,252,0 chrXV 863813 . G A 2771 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2804,282,0 chrXV 863988 . G A 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.26;SB=-1.221e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3141,319,0 chrXV 864240 . A G 2682 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.30;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2715,279,0 chrXV 864477 . A C 4226.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4226,423,0 chrXV 864723 . G A 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.675;DP=121;Dels=0.00;FS=4.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=26.44;ReadPosRankSum=1.618;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3232,310,0 chrXV 865020 . G A 2884 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2917,294,0 chrXV 865788 . A G 2673 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2706,285,0 chrXV 869837 . T C 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.82;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2692,291,0 chrXV 872742 . G A 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3149,327,0 chrXV 873866 . T C 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3181,333,0 chrXV 874326 . C A 2591 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91;SB=-9.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2624,264,0 chrXV 874378 . T A 2125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2158,219,0 chrXV 874406 . T C 2382 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2415,255,0 chrXV 874602 . A G 3785.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:3785,405,0 chrXV 874666 . T C 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3120,321,0 chrXV 875313 . C T 3660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3660,375,0 chrXV 875332 . A T 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3572,364,0 chrXV 875886 . G A 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2876,297,0 chrXV 876222 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=1;QD=25.86;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3265,336,0 chrXV 877198 . G A 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3574,361,0 chrXV 877812 . C T 2778 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.71;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2811,288,0 chrXV 878583 . C T 3839.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3839,397,0 chrXV 879088 . A C 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.218e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3201,336,0 chrXV 879343 . T A 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.997e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3867,394,0 chrXV 879406 . C T 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.27;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3763,390,0 chrXV 879904 . A G 3926.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.00;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3926,402,0 chrXV 880027 . G A 3297.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.231e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3297,328,0 chrXV 880789 . C T 4535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9438;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4535,471,0 chrXV 882091 . A G 2863 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.527e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2896,303,0 chrXV 884523 . C G 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;DP=120;Dels=0.00;FS=2.969;HaplotypeScore=12.6370;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=2.327;QD=23.67;ReadPosRankSum=1.138;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,118:120:99:2874,303,0 chrXV 885437 . T C 2835 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2868,300,0 chrXV 885669 . A G 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2958,315,0 chrXV 885692 . A G 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3499,375,0 chrXV 885914 . A G 3758.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3758,396,0 chrXV 887066 . C T 2782 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=25.29;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2815,282,0 chrXV 887264 . T C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=24.31;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3265,336,0 chrXV 887295 . G A 3069 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3102,312,0 chrXV 887669 . A G 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3632,375,0 chrXV 888126 . A G 2604 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2637,282,0 chrXV 888445 . A G 2564 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2597,279,0 chrXV 888479 . A G 3706.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3706,375,0 chrXV 888521 . C T 3629.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3629,358,0 chrXV 888666 . T C 2539 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.89;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2572,270,0 chrXV 888854 . T C 330.09 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.094;DP=117;Dels=0.01;FS=37.303;HaplotypeScore=59.2587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=2.82;ReadPosRankSum=-4.869;SB=-9.212e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,21:116:14:360,0,14 chrXV 888888 . G A 2013 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.94;MQ0=0;QD=19.93;SB=-1.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2046,213,0 chrXV 888891 . C A 1981 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=18.01;SB=-1.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2014,210,0 chrXV 889219 . C T 2843 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.25;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2876,294,0 chrXV 889336 . A G 3078 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=23.32;SB=-1.217e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3111,336,0 chrXV 889418 . T C 3029 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3062,330,0 chrXV 889442 . T C 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=23.01;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3186,336,0 chrXV 889462 . A G 2998 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.12;MQ0=0;QD=21.57;SB=-1.280e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3031,339,0 chrXV 889468 . A T 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.31;MQ0=0;QD=23.30;SB=-1.459e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3309,343,0 chrXV 889474 . T C 2886 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.73;MQ0=0;QD=21.54;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:2919,315,0 chrXV 889495 . A G 2664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.26;MQ0=0;QD=22.39;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2697,294,0 chrXV 889642 . T C 2691 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2724,279,0 chrXV 889741 . G A 1726 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=31.8135;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.73;MQ0=0;QD=27.84;SB=-5.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1759,186,0 chrXV 889988 . A T 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.47;MQ0=0;QD=26.73;SB=-2.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:146:99:3902,394,0 chrXV 890036 . C G 3230.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=25.64;SB=-1.683e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3263,345,0 chrXV 890314 . A T 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3216,327,0 chrXV 890409 . T C 3586.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.753;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=25.25;ReadPosRankSum=-1.047;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,140:142:99:3586,322,0 chrXV 890476 . C T 3083 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3116,315,0 chrXV 890575 . A C 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=24.19;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3386,357,0 chrXV 890776 . G A 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.540e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3372,342,0 chrXV 890797 . A G 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3199,345,0 chrXV 890957 . G A 3445.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.631;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=26.71;ReadPosRankSum=-1.088;SB=-1.772e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3445,314,0 chrXV 891275 . G A 3919.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3919,385,0 chrXV 891444 . T C 2655 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.333e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2688,270,0 chrXV 891508 . A G 3300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3300,345,0 chrXV 891597 . A G 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.791;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:937,0,1521 chrXV 891617 . G A 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2872,297,0 chrXV 891758 . C T 2933 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.587;DP=119;Dels=0.00;FS=3.274;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.499;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:2966,293,0 chrXV 891827 . G C 3385.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3435;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3385,348,0 chrXV 891907 . C G 709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;DP=97;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.453;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:739,0,1117 chrXV 892191 . G A 2713 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.89;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2746,270,0 chrXV 892195 . T C 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.066;DP=111;Dels=0.00;FS=0.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.206;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1150,0,1104 chrXV 892286 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.544;DP=117;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.780;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1311,0,1138 chrXV 892301 . C T 2765 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2798,282,0 chrXV 892334 . T G 2804 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.04;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2837,294,0 chrXV 892464 . C T 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;DP=102;Dels=0.00;FS=4.898;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.736;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:924,0,1212 chrXV 892598 . G A 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.896;DP=118;Dels=0.01;FS=2.355;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.728;QD=11.29;ReadPosRankSum=-2.963;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1362,0,1014 chrXV 892935 . C A 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.794;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.911;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1327,0,1472 chrXV 893238 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.909;DP=115;Dels=0.00;FS=12.024;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1214,0,1096 chrXV 893457 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.236;DP=138;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.409;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1456,0,1388 chrXV 893595 . C T 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.668;DP=80;Dels=0.00;FS=5.876;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.140;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:873,0,792 chrXV 893597 . T G 741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.651;DP=77;Dels=0.00;FS=5.892;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=2.455;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:771,0,760 chrXV 893796 . T A 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.941;DP=137;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.620;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,56:137:99:1104,0,1788 chrXV 893919 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.463;DP=127;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.384;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1464,0,1210 chrXV 894236 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.076;DP=144;Dels=0.01;FS=5.232;HaplotypeScore=3.6549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.588;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1424,0,1562 chrXV 894483 . A G 1854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.078;DP=192;Dels=0.00;FS=0.531;HaplotypeScore=3.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.989;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,94:192:99:1884,0,2121 chrXV 894519 . C A 1928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.239;DP=166;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=4.4788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-9.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,88:166:99:1958,0,1549 chrXV 894566 . T G 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.322;DP=146;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=2.3459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.268;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1369,0,1765 chrXV 894726 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.704;DP=104;Dels=0.00;FS=2.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1138,0,1047 chrXV 894913 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.479;DP=146;Dels=0.00;FS=4.985;HaplotypeScore=2.6469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,63:146:99:1318,0,1687 chrXV 895029 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.352;DP=115;Dels=0.00;FS=3.480;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=1;MQRankSum=1.669;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.400;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1073,0,1285 chrXV 895062 . G A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.256;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=0.349;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.785;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1410,0,1323 chrXV 895152 . T C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.499;DP=134;Dels=0.00;FS=1.388;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.328;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1438,0,1301 chrXV 895158 . G A 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3602,366,0 chrXV 895193 . G T 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.192;DP=135;Dels=0.00;FS=4.329;HaplotypeScore=2.8343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.892;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1336,0,1458 chrXV 895667 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.201;DP=150;Dels=0.00;FS=1.307;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.409;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1539,0,1567 chrXV 895706 . T G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.242;DP=123;Dels=0.00;FS=1.577;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1195,0,1404 chrXV 896048 . C T 667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.256;DP=97;Dels=0.00;FS=3.902;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.178;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:697,0,1161 chrXV 896084 . T C 656.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.001;DP=89;Dels=0.00;FS=15.163;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=3.322;QD=7.37;ReadPosRankSum=-2.152;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:686,0,1153 chrXV 896125 . G A 837.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.060;DP=117;Dels=0.00;FS=2.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:117:99:867,0,1477 chrXV 896376 . C G 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;DP=118;Dels=0.00;FS=2.392;HaplotypeScore=2.6464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=-0.172;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.951;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1127,0,1172 chrXV 896873 . T C 612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.937;DP=81;Dels=0.00;FS=4.592;HaplotypeScore=39.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.280;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:642,0,873 chrXV 896888 . C T 645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.867;DP=78;Dels=0.00;FS=1.940;HaplotypeScore=31.8047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.889;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,39:78:99:675,0,856 chrXV 897596 . A G 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.603;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.690;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1256,0,1410 chrXV 897953 . T C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.868;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.991;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1155,0,1586 chrXV 898428 . C T 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.942;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.003;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:104:99:974,0,1190 chrXV 898703 . A C 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.719;DP=136;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1496,0,1165 chrXV 898841 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.540;DP=127;Dels=0.00;FS=5.575;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:127:99:1366,0,1176 chrXV 898990 . C A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.782;DP=130;Dels=0.00;FS=3.218;HaplotypeScore=4.5342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.606;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1391,0,1275 chrXV 899008 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.783;DP=109;Dels=0.00;FS=7.534;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.559;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1255,0,1015 chrXV 899059 . T C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.935;DP=135;Dels=0.00;FS=7.786;HaplotypeScore=4.7296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.842;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:135:99:1417,0,1441 chrXV 899349 . C A 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3310,330,0 chrXV 899806 . T A,C 2644.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.28;MQ0=0;QD=23.61;SB=-9.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,60,52:112:99:2704,1244,1079,1460,0,1316 chrXV 899885 . T C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.590;DP=136;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=7.7442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1073,0,1756 chrXV 900646 . G A 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.724;DP=110;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.342;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:920,0,1424 chrXV 900929 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.478;DP=140;Dels=0.00;FS=3.171;HaplotypeScore=4.7069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.212;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.794;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1455,0,1477 chrXV 900947 . T C 3024 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=24.59;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3057,324,0 chrXV 901125 . T C 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.165;DP=113;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.041;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1038,0,1371 chrXV 901562 . A G 1831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.552;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,93:163:99:1861,0,1477 chrXV 902098 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.626;DP=107;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1145,0,1129 chrXV 902485 . T A 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.181;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.584;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,80:161:99:1707,0,1729 chrXV 902951 . T A 594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.553;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.217;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:624,0,1280 chrXV 903202 . T C 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.146;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.361;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1085,0,1381 chrXV 903301 . G C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;DP=114;Dels=0.00;FS=4.487;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=9.50;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1113,0,1022 chrXV 903467 . C T 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.348;DP=111;Dels=0.00;FS=5.183;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.253;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:969,0,1371 chrXV 904263 . A G 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.521;DP=154;Dels=0.00;FS=0.721;HaplotypeScore=2.7586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1635,0,1603 chrXV 904817 . A G 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.330;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=2.147;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.064;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:960,0,627 chrXV 904872 . G C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;DP=102;Dels=0.00;FS=2.601;HaplotypeScore=4.8884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=9.79;ReadPosRankSum=2.277;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:102:99:1029,0,884 chrXV 904900 . C T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.049;DP=98;Dels=0.00;FS=0.767;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.692;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:894,0,1112 chrXV 905482 . C T 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.927;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:952,0,769 chrXV 905715 . G T 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.560;DP=128;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=1.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.924;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,75:128:99:1738,0,884 chrXV 905751 . G A 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.748;DP=135;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=2.5141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.780;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:1659,0,1150 chrXV 905801 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.879;DP=112;Dels=0.00;FS=3.109;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=13.44;ReadPosRankSum=-2.213;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,68:112:99:1535,0,882 chrXV 905805 . G C 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.651;DP=111;Dels=0.00;FS=3.257;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=6.96;ReadPosRankSum=2.485;SB=-1.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,43:111:99:802,0,1502 chrXV 905824 . G A 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.098;DP=130;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.255;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1561,0,1161 chrXV 905895 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.810;DP=112;Dels=0.00;FS=9.598;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.224;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1134,0,1213 chrXV 906155 . G A 652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.543;DP=162;Dels=0.00;FS=4.751;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=4.02;ReadPosRankSum=0.239;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,62:162:99:682,0,2234 chrXV 907013 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.436;DP=136;Dels=0.00;FS=6.726;HaplotypeScore=4.7038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.113;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1269,0,1527 chrXV 907181 . C A 3334.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.606e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3334,337,0 chrXV 907487 . G A 3104 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3137,307,0 chrXV 907666 . C G 3127 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4293;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3160,324,0 chrXV 907705 . T C 2887 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2920,306,0 chrXV 908003 . C T 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.702;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=12.74;ReadPosRankSum=2.966;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,70:117:99:1520,0,931 chrXV 908239 . A C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.904;DP=119;Dels=0.00;FS=5.044;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1072,0,1427 chrXV 908616 . G A 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.526;DP=151;Dels=0.00;FS=9.812;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.471;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1486,0,1588 chrXV 908634 . A G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.048;DP=153;Dels=0.00;FS=5.929;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.241;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,67:153:99:1275,0,1889 chrXV 908860 . T A 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.555;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1437,0,1543 chrXV 909313 . C G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.818;DP=147;Dels=0.00;FS=2.121;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.904;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,62:147:99:1171,0,1805 chrXV 910829 . G A 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.381;DP=99;Dels=0.00;FS=0.758;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.746;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1021,0,1039 chrXV 911208 . A C 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.925;DP=153;Dels=0.00;FS=6.054;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.816;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1332,0,1779 chrXV 911587 . C G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.390;DP=105;Dels=0.00;FS=1.620;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.132;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1049,0,1183 chrXV 911596 . C T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.432;DP=121;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.103;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1394,0,1218 chrXV 911731 . T A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;DP=133;Dels=0.00;FS=9.961;HaplotypeScore=4.9461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.949;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1317,0,1491 chrXV 912281 . C G 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.589;DP=149;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.692;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,69:149:99:1417,0,1686 chrXV 912336 . G T 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.098;DP=168;Dels=0.00;FS=1.209;HaplotypeScore=11.7255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.391;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,86:168:99:1618,0,1773 chrXV 912637 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.473;DP=117;Dels=0.00;FS=4.658;HaplotypeScore=3.2577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=9.97;ReadPosRankSum=2.075;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1196,0,1229 chrXV 915406 . T C 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.970;DP=94;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.507;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:1000,0,1040 chrXV 915498 . T C 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.065;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,46:112:99:925,0,1442 chrXV 915576 . C T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.721;DP=146;Dels=0.00;FS=2.174;HaplotypeScore=3.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.615;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1537,0,1514 chrXV 915687 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.790;DP=139;Dels=0.00;FS=4.000;HaplotypeScore=2.8759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=8.86;ReadPosRankSum=-2.298;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1262,0,1555 chrXV 915995 . T C 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.487;DP=133;Dels=0.00;FS=4.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.821;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1049,0,1743 chrXV 916094 . C G 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3630,375,0 chrXV 916166 . T C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.296;DP=134;Dels=0.00;FS=2.526;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.225;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1155,0,1679 chrXV 916299 . T A 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.448;DP=155;Dels=0.00;FS=3.831;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.446;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,79:155:99:1675,0,1526 chrXV 916839 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.928;DP=122;Dels=0.00;FS=6.190;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1288,0,1248 chrXV 917139 . A G 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.778;DP=150;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.659;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:150:99:1562,0,1560 chrXV 918527 . G C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.304;DP=130;Dels=0.00;FS=6.642;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1190,0,1525 chrXV 919242 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.635;DP=137;Dels=0.00;FS=1.462;HaplotypeScore=3.3196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=2.004;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.874;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:1208,0,1525 chrXV 919489 . G A 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.229;DP=136;Dels=0.00;FS=5.198;HaplotypeScore=4.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.130;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1181,0,1013 chrXV 920394 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.493;DP=122;Dels=0.00;FS=15.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.539;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1485,0,1074 chrXV 920814 . A C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.279;DP=137;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.075;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1364,0,1457 chrXV 921242 . C A 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.604;DP=124;Dels=0.00;FS=5.940;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1267,0,1355 chrXV 921271 . G T 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.915;DP=121;Dels=0.00;FS=18.929;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.661;SB=-1.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1233,0,1315 chrXV 922090 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.107;DP=122;Dels=0.00;FS=29.228;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.543;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1260,0,1287 chrXV 922306 . G A 1968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.419;DP=176;Dels=0.00;FS=4.374;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=11.18;ReadPosRankSum=2.762;SB=-9.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,92:176:99:1998,0,1672 chrXV 922399 . G A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.646;DP=166;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=5.7743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=8.66;ReadPosRankSum=2.813;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,74:166:99:1468,0,1965 chrXV 922866 . C G 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.491;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:1115,0,1683 chrXV 922992 . T C 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.124;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.774;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1143,0,1129 chrXV 923567 . T C 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.261;DP=105;Dels=0.00;FS=4.967;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1304,0,951 chrXV 925103 . G A 535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.902;DP=92;Dels=0.00;FS=2.052;HaplotypeScore=7.2702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=1.975;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.075;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:565,0,663 chrXV 925293 . G C 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;DP=154;Dels=0.00;FS=9.760;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.162;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.036;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,84:154:99:1598,0,1364 chrXV 925297 . G A 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.446;DP=157;Dels=0.00;FS=13.012;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;MQ0=0;MQRankSum=-3.581;QD=11.00;ReadPosRankSum=-2.052;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,93:157:99:1757,0,1260 chrXV 925310 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.725;DP=132;Dels=0.00;FS=18.365;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.534;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1384,0,1168 chrXV 925586 . A T 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.485;DP=175;Dels=0.00;FS=0.585;HaplotypeScore=3.7630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,92:175:99:1892,0,1768 chrXV 926126 . C T 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.514e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3719,373,0 chrXV 926531 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.145;DP=135;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=9.11;ReadPosRankSum=-2.618;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1260,0,1513 chrXV 926881 . G A 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.234;DP=113;Dels=0.00;FS=3.474;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.025;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1265,0,1188 chrXV 926925 . G A 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2954,291,0 chrXV 928129 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.770;DP=105;Dels=0.00;FS=7.781;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.211;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,61:105:99:1309,0,897 chrXV 928162 . G A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.469;DP=132;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.915;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1472,0,1266 chrXV 928275 . T C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.258;DP=141;Dels=0.01;FS=0.630;HaplotypeScore=8.4441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.115;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1443,0,1458 chrXV 928405 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.402;DP=121;Dels=0.00;FS=3.306;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.314;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1508,0,1037 chrXV 928450 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.605;DP=138;Dels=0.01;FS=3.106;HaplotypeScore=6.7924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.973;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1375,0,1430 chrXV 928483 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.918;DP=128;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1269,0,1404 chrXV 928570 . G A 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.405;DP=118;Dels=0.00;FS=8.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.488;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1260,0,1222 chrXV 928579 . T C 3143 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3176,336,0 chrXV 928755 . A G 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.904;DP=165;Dels=0.00;FS=0.589;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,68:165:99:1352,0,2143 chrXV 928965 . C T 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.190;DP=168;Dels=0.00;FS=1.349;HaplotypeScore=5.8335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.503;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,78:168:99:1603,0,1913 chrXV 929121 . C T 3942.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3942,391,0 chrXV 929509 . G A 1708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.625;DP=142;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.593;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1738,0,1289 chrXV 929593 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.919;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.840;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.442;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,65:117:99:1436,0,1040 chrXV 929887 . T C 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.451;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1601,0,1378 chrXV 929923 . A G 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.025;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.486;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,82:139:99:1659,0,1144 chrXV 930026 . T C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.594;DP=135;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.394;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1465,0,1402 chrXV 930118 . A G 3304.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3304,336,0 chrXV 930310 . T C 1960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.881;DP=194;Dels=0.00;FS=5.032;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.512;SB=-1.022e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,99:194:99:1990,0,2056 chrXV 930491 . G A 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.694;DP=132;Dels=0.01;FS=3.206;HaplotypeScore=19.3644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=6.68;ReadPosRankSum=-3.555;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:131:99:912,0,939 chrXV 930799 . A G 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.810;DP=113;Dels=0.00;FS=12.176;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.072;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:997,0,1330 chrXV 931046 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.968;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.996;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1176,0,1303 chrXV 931313 . T C 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.082;DP=134;Dels=0.00;FS=4.386;HaplotypeScore=3.7378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=12.93;ReadPosRankSum=2.165;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,84:134:99:1762,0,992 chrXV 931380 . A C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.528;DP=125;Dels=0.00;FS=2.356;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1023,0,1382 chrXV 931409 . C G 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;DP=150;Dels=0.00;FS=6.138;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.244;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,84:150:99:1668,0,1278 chrXV 931516 . A G 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.210;DP=153;Dels=0.00;FS=5.054;HaplotypeScore=8.2809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.080;QD=11.95;ReadPosRankSum=2.283;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,88:153:99:1859,0,1418 chrXV 931550 . A C 2002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.729;DP=179;Dels=0.00;FS=14.731;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.228;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,100:179:99:2032,0,1525 chrXV 931562 . T C 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.498;DP=179;Dels=0.00;FS=14.680;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.527;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,80:179:99:1483,0,2173 chrXV 931581 . C T 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.536;DP=169;Dels=0.00;FS=13.579;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,79:169:99:1587,0,1873 chrXV 931616 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.136;DP=154;Dels=0.00;FS=4.704;HaplotypeScore=2.6739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.977;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1473,0,1509 chrXV 931623 . A G 3443.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6739;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.13;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3443,366,0 chrXV 931656 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.418;DP=118;Dels=0.00;FS=11.734;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.53;MQ0=0;MQRankSum=3.150;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.381;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1399,0,1009 chrXV 931662 . G A 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.112;DP=115;Dels=0.00;FS=10.386;HaplotypeScore=4.9641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.762;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1083,0,1277 chrXV 931681 . T C 74.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.598;DP=117;Dels=0.00;FS=2.373;HaplotypeScore=58.3922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=0.63;ReadPosRankSum=-5.454;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,14:117:99:104,0,1424 chrXV 932032 . T C 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=23.78;SB=-1.449e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:2887,309,0 chrXV 932075 . A G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.408;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1335,0,1545 chrXV 932327 . C T 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.807e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3501,349,0 chrXV 932424 . C T 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.382;DP=128;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.484;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1171,0,1345 chrXV 932642 . A G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.013;DP=128;Dels=0.00;FS=6.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=10.05;ReadPosRankSum=2.313;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1316,0,1296 chrXV 932744 . C T 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.107;DP=161;Dels=0.00;FS=2.774;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-9.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1834,0,1559 chrXV 932930 . T C 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.571;DP=132;Dels=0.00;FS=9.430;HaplotypeScore=6.7768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=8.34;ReadPosRankSum=4.325;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1131,0,984 chrXV 933245 . G A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.835;DP=147;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.041;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1296,0,1764 chrXV 933254 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.214;DP=155;Dels=0.00;FS=2.853;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.797;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1531,0,1725 chrXV 933398 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.336;DP=173;Dels=0.00;FS=10.549;HaplotypeScore=5.6254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.187;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,70:173:99:1263,0,2340 chrXV 933425 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.960;DP=155;Dels=0.00;FS=2.051;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=0.221;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,66:155:99:1275,0,1909 chrXV 933470 . C A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=150;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.029;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.100;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,59:150:99:1163,0,1997 chrXV 933473 . G A 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.359;DP=139;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=0.424;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.359;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,57:139:99:1142,0,1748 chrXV 933555 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.912;DP=160;Dels=0.00;FS=2.815;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.632;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.781;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,69:160:99:1377,0,2018 chrXV 933560 . C T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.182;DP=159;Dels=0.00;FS=3.715;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.303;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1461,0,1879 chrXV 933602 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.856;DP=120;Dels=0.00;FS=2.339;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1312,0,1253 chrXV 933746 . A T 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;DP=152;Dels=0.00;FS=12.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1548,0,1593 chrXV 933812 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.608;DP=146;Dels=0.00;FS=7.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1556,0,1407 chrXV 933920 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.915;DP=102;Dels=0.00;FS=4.854;HaplotypeScore=3.2768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.302;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:908,0,1265 chrXV 934022 . C T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.973;DP=141;Dels=0.00;FS=2.760;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.886;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:141:99:1454,0,1419 chrXV 934060 . T C 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.307;DP=140;Dels=0.00;FS=2.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.138;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1460,0,1436 chrXV 934286 . T C 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.567;DP=159;Dels=0.00;FS=2.844;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,76:159:99:1275,0,1926 chrXV 934518 . A C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.758;DP=127;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=3.8867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1170,0,1556 chrXV 934730 . C T 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.029;DP=159;Dels=0.00;FS=2.780;HaplotypeScore=3.9141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,83:159:99:1727,0,1548 chrXV 935126 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.555;DP=109;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.824;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1055,0,1259 chrXV 935276 . T C 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.315;DP=156;Dels=0.00;FS=4.736;HaplotypeScore=6.3618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.722;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1710,0,1587 chrXV 935480 . G C 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.216;DP=160;Dels=0.00;FS=1.241;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.318;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,75:160:99:1518,0,1725 chrXV 935504 . C T 4209.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=26.14;SB=-2.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4209,427,0 chrXV 935702 . G A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.125;DP=153;Dels=0.00;FS=7.255;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.171;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.341;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1537,0,1654 chrXV 936362 . T C 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.170;DP=143;Dels=0.00;FS=5.101;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.043;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,85:143:99:1601,0,1226 chrXV 936376 . A T 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.828;DP=131;Dels=0.00;FS=9.709;HaplotypeScore=2.5525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,76:131:99:1693,0,1135 chrXV 936401 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.049;DP=123;Dels=0.00;FS=13.478;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.571;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:123:99:1162,0,1414 chrXV 936409 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.759;DP=117;Dels=0.00;FS=13.806;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.780;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1150,0,1397 chrXV 936652 . A C 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.106;DP=126;Dels=0.00;FS=1.549;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1224,0,1419 chrXV 936863 . T C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.598;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.831;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:1084,0,1588 chrXV 936913 . G A 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.833;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.841;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:1211,0,1657 chrXV 937100 . G A 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.424;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.230;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1588,0,1296 chrXV 937262 . A G 1970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.704;DP=165;Dels=0.00;FS=4.653;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.504;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,92:165:99:2000,0,1497 chrXV 937658 . C G 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.517e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3678,387,0 chrXV 937693 . G A 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.768;DP=170;Dels=0.00;FS=2.792;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.171;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,74:170:99:1491,0,2047 chrXV 937997 . G T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.906;DP=133;Dels=0.00;FS=6.501;HaplotypeScore=5.6699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.339;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1428,0,1359 chrXV 938096 . T A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;DP=133;Dels=0.00;FS=6.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.886;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1248,0,1581 chrXV 938134 . G T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.609;DP=124;Dels=0.00;FS=5.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.993;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.678;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1035,0,1464 chrXV 938149 . T C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.461;DP=137;Dels=0.00;FS=4.171;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,59:137:99:1040,0,1614 chrXV 938213 . C T 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.282;DP=123;Dels=0.00;FS=3.405;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.562;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,46:123:99:910,0,1583 chrXV 938431 . C T 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.321;DP=139;Dels=0.00;FS=3.072;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.350;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,79:139:99:1699,0,1264 chrXV 938432 . T G 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.152;DP=142;Dels=0.00;FS=5.072;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.114;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.414;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:1649,0,1296 chrXV 938929 . G A 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.985;DP=141;Dels=0.00;FS=14.133;HaplotypeScore=4.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=11.08;ReadPosRankSum=2.362;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:141:99:1592,0,1363 chrXV 939148 . A C 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.149;DP=157;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=3.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.769;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1496,0,1746 chrXV 939870 . C T 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.696;DP=135;Dels=0.00;FS=7.897;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.076;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1455,0,1291 chrXV 940002 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.777;DP=113;Dels=0.00;FS=3.546;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.740;QD=11.50;ReadPosRankSum=-1.711;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1329,0,1039 chrXV 940429 . T C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.038;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,65:151:99:1256,0,1844 chrXV 940454 . A G 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.387;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,73:160:99:1264,0,1940 chrXV 940838 . G A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.261;DP=163;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.347;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,70:163:99:1438,0,1936 chrXV 941405 . C T 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9951;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:102:99:2696,279,0 chrXV 941514 . C T 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.658;DP=146;Dels=0.00;FS=2.073;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=2.910;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.272;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,81:146:99:1745,0,1295 chrXV 941592 . C A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.768;DP=128;Dels=0.00;FS=12.903;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=8.48;ReadPosRankSum=2.987;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1116,0,1584 chrXV 941694 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.400;DP=146;Dels=0.00;FS=0.706;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.852;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.252;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1434,0,1556 chrXV 941706 . C G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.540;DP=144;Dels=0.00;FS=3.435;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.028;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1331,0,1469 chrXV 941715 . G A 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.621;DP=148;Dels=0.00;FS=6.758;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQ0=0;MQRankSum=-2.043;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.199;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1593,0,1535 chrXV 941765 . G T 1464.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.277;DP=141;Dels=0.00;FS=10.520;HaplotypeScore=2.7233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.83;MQ0=0;MQRankSum=-3.208;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.118;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1494,0,1512 chrXV 941767 . G A 1337.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.294;DP=139;Dels=0.00;FS=10.654;HaplotypeScore=2.7233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.72;MQ0=0;MQRankSum=-5.068;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.230;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1367,0,1477 chrXV 941769 . T C 1276.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.953;DP=138;Dels=0.00;FS=10.735;HaplotypeScore=2.7233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.66;MQ0=0;MQRankSum=-3.486;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.284;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1306,0,1660 chrXV 941796 . G A 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.944;DP=149;Dels=0.00;FS=2.909;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.018;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.755;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1463,0,1563 chrXV 941898 . C T 1554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.861;DP=139;Dels=0.00;FS=3.056;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=1;MQRankSum=-1.223;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.771;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:1584,0,1331 chrXV 942153 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.429;DP=136;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=9.12;ReadPosRankSum=-2.043;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1270,0,1603 chrXV 942165 . C T 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.536;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1219,0,1485 chrXV 942192 . C T 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.025;DP=122;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=9.87;ReadPosRankSum=2.707;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1234,0,1352 chrXV 942317 . C T 2583 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2616,255,0 chrXV 942594 . T C 2873 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.102e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2906,300,0 chrXV 942722 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.457;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.875;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1473,0,1861 chrXV 942759 . T C 3204.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.654;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=24.10;ReadPosRankSum=1.393;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3238,334,0 chrXV 943167 . A C 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.749;DP=189;Dels=0.00;FS=0.538;HaplotypeScore=5.6869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.543;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,90:189:99:1804,0,2136 chrXV 943283 . T C 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.400;DP=140;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,79:140:99:1613,0,1159 chrXV 943688 . C T 1822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.855;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,88:193:99:1852,0,2066 chrXV 944039 . A T 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.275;DP=128;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.391;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1394,0,1318 chrXV 944430 . T C 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.2301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=25.38;ReadPosRankSum=1.556;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3028,324,0 chrXV 944698 . A T 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.057;DP=147;Dels=0.00;FS=1.303;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.107;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1684,0,1484 chrXV 945000 . C T 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.514;DP=133;Dels=0.00;FS=7.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.316;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1447,0,1323 chrXV 945252 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.747;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.988;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1166,0,1463 chrXV 945621 . G A 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3098,304,0 chrXV 945624 . T C 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.25;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2870,306,0 chrXV 945647 . C T 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.675;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-1.520e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3221,311,0 chrXV 945663 . T G 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.589;DP=131;Dels=0.00;FS=5.304;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=8.63;ReadPosRankSum=-2.336;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1161,0,1480 chrXV 945784 . C T 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.759;DP=104;Dels=0.00;FS=11.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:869,0,1298 chrXV 945918 . G A 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.787;DP=118;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.861;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1126,0,1319 chrXV 946466 . A G 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.488;DP=140;Dels=0.00;FS=7.976;HaplotypeScore=2.8452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.029;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1531,0,1362 chrXV 946490 . A C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.553;DP=140;Dels=0.00;FS=6.257;HaplotypeScore=2.5885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1353,0,1521 chrXV 946686 . C T 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.108;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.420;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:927,0,1009 chrXV 947021 . T G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.669;DP=126;Dels=0.00;FS=17.038;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1313,0,1352 chrXV 947081 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.411;DP=125;Dels=0.00;FS=2.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.363;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1451,0,1206 chrXV 947688 . G A 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.580;DP=119;Dels=0.00;FS=12.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.540;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1166,0,1257 chrXV 947817 . C T 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.649;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:998,0,1227 chrXV 947892 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.847;DP=122;Dels=0.00;FS=10.214;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1162,0,1410 chrXV 948120 . G A 3292.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3292,342,0 chrXV 948744 . T G 1075.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.602;DP=130;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.671;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1105,0,1627 chrXV 948819 . A G 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.718;DP=106;Dels=0.00;FS=1.576;HaplotypeScore=4.9575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.142;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1019,0,1207 chrXV 950741 . T C 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.390;DP=120;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=5.6915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.801;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.171;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1061,0,1494 chrXV 950909 . G A 2117 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2150,213,0 chrXV 951396 . G A 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.022;DP=87;Dels=0.00;FS=4.135;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.106;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:831,0,949 chrXV 951586 . C T 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.395;DP=83;Dels=0.00;FS=7.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=-1.798;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.205;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,37:83:99:733,0,940 chrXV 951788 . A C 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.516;DP=163;Dels=0.00;FS=5.986;HaplotypeScore=2.6196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,67:162:99:1315,0,2133 chrXV 951816 . G T 1919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.894;DP=148;Dels=0.00;FS=2.140;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.173;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,87:148:99:1949,0,1198 chrXV 952140 . G A 2810 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2843,288,0 chrXV 952331 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.627;DP=136;Dels=0.00;FS=3.950;HaplotypeScore=4.8473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.572;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1384,0,1522 chrXV 952413 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.581;DP=104;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=9.77;ReadPosRankSum=-2.332;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,54:104:99:1046,0,1123 chrXV 952533 . C T 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.342;DP=125;Dels=0.00;FS=1.428;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.852;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1332,0,1326 chrXV 952628 . A G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.897;DP=124;Dels=0.00;FS=5.724;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.183;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1314,0,1266 chrXV 952654 . A G 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.303;DP=118;Dels=0.00;FS=2.381;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1317,0,1144 chrXV 952737 . A G 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.258;DP=119;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.226;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1329,0,1169 chrXV 952931 . C T 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.178;DP=128;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.472;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1588,0,1001 chrXV 953097 . G A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.566;DP=112;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=2.6124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.984;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1114,0,1302 chrXV 953151 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.433;DP=106;Dels=0.00;FS=2.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.130;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1183,0,1079 chrXV 953577 . T C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.926;DP=111;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=2.6865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.647;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1040,0,1331 chrXV 953837 . C T 1709.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.016;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.924;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1739,0,1360 chrXV 953899 . C T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.745;DP=113;Dels=0.00;FS=12.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1344,0,1029 chrXV 954013 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.884;DP=127;Dels=0.00;FS=8.701;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.502;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1534,0,1230 chrXV 954038 . T C 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;DP=106;Dels=0.00;FS=32.033;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.022;SB=-2.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,56:106:99:1024,0,1139 chrXV 954231 . A T 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.406;DP=164;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.283;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,73:164:99:1360,0,1960 chrXV 954310 . G A 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.913;DP=165;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=1.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-8.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,80:165:99:1683,0,1854 chrXV 954766 . A G 4276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.57;SB=-1.920e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4276,444,0 chrXV 955039 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.464;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1158,0,1064 chrXV 955118 . G A 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.690;DP=159;Dels=0.00;FS=4.829;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.475;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,84:159:99:1767,0,1475 chrXV 955327 . T A 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.028;DP=132;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.704;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1479,0,1340 chrXV 955486 . G A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.858;DP=125;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.563;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1389,0,1105 chrXV 955573 . T C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.754;DP=150;Dels=0.00;FS=3.840;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1546,0,1436 chrXV 956019 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.665;DP=133;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=5.4740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=10.02;ReadPosRankSum=-3.059;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1362,0,1298 chrXV 956028 . G A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.677;DP=120;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=3.2215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=9.39;ReadPosRankSum=2.541;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:120:99:1157,0,1239 chrXV 956123 . A G 1844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.810;DP=180;Dels=0.00;FS=15.436;HaplotypeScore=5.6540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.494;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,94:180:99:1874,0,1888 chrXV 956137 . C T 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.358;DP=184;Dels=0.00;FS=13.494;HaplotypeScore=6.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.295;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,92:184:99:1859,0,1877 chrXV 956617 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.653;DP=123;Dels=0.00;FS=4.373;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.610;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1168,0,1260 chrXV 956880 . G C 3353.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3353,345,0 chrXV 957207 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.347;DP=112;Dels=0.00;FS=5.978;HaplotypeScore=2.7440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.197;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1238,0,1041 chrXV 957391 . A C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.028;DP=122;Dels=0.00;FS=2.439;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.794;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1302,0,1271 chrXV 957460 . A G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.188;DP=125;Dels=0.00;FS=8.279;HaplotypeScore=2.7568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:125:99:1160,0,1524 chrXV 957501 . G A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.206;DP=128;Dels=0.00;FS=12.742;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1244,0,1404 chrXV 957854 . C G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;DP=113;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1125,0,1211 chrXV 958080 . T A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.790;DP=140;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=2.6421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.460;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,59:140:99:1228,0,1786 chrXV 958154 . T C 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.237;DP=144;Dels=0.00;FS=3.412;HaplotypeScore=4.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,83:144:99:1756,0,1266 chrXV 958310 . G A 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.086;DP=109;Dels=0.00;FS=14.496;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1255,0,1075 chrXV 958333 . C T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.750;DP=112;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.560;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1057,0,1276 chrXV 958391 . C T 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.767;DP=107;Dels=0.00;FS=10.910;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.909;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:921,0,1283 chrXV 958407 . G A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.633;DP=101;Dels=0.00;FS=6.306;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.408;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,44:101:99:807,0,1237 chrXV 958713 . G A 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.242;DP=127;Dels=0.00;FS=9.813;HaplotypeScore=3.5327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.403;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1508,0,1245 chrXV 958743 . C A 1811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.654;DP=150;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.332;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,86:150:99:1841,0,1196 chrXV 958860 . A G 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.336;DP=118;Dels=0.00;FS=4.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.709;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1491,0,885 chrXV 958901 . T C 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.783;DP=107;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.358;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,63:107:99:1419,0,877 chrXV 959086 . G A 1910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.086;DP=168;Dels=0.00;FS=3.767;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,86:168:99:1940,0,1685 chrXV 959231 . T C 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3692,396,0 chrXV 959394 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.350;DP=106;Dels=0.00;FS=11.050;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.337;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1033,0,1210 chrXV 959412 . G T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.812;DP=84;Dels=0.00;FS=6.200;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.793;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,47:84:99:1062,0,722 chrXV 959511 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.537;DP=126;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.038;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1178,0,1404 chrXV 959637 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.098;DP=114;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.350;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1151,0,1153 chrXV 959820 . G A 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.29;SB=-1.486e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2681,270,0 chrXV 960113 . C G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;DP=114;Dels=0.00;FS=7.642;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-3.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1210,0,1182 chrXV 960152 . G T 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.062;DP=147;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.459;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1441,0,1533 chrXV 960232 . A C 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.674;DP=130;Dels=0.00;FS=3.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.444;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1468,0,1228 chrXV 960346 . C A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.672;DP=118;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.692;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1261,0,1123 chrXV 960384 . G A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.129;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.943;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1289,0,1018 chrXV 960428 . G A 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=1;QD=26.48;SB=-1.415e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3337,336,0 chrXV 960490 . C G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.925;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=0.011;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.073;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1218,0,1562 chrXV 960509 . A C 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.012;DP=153;Dels=0.00;FS=8.401;HaplotypeScore=9.6878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=1;MQRankSum=-0.085;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.135;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1486,0,1691 chrXV 960613 . C T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.706;DP=140;Dels=0.00;FS=3.026;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.346;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1599,0,1405 chrXV 961004 . G A 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.046;DP=112;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=4.7599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.380;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1304,0,894 chrXV 961391 . A G 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.770;DP=122;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.989;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.822;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:122:99:1191,0,1371 chrXV 961458 . A G 1941.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.180;DP=161;Dels=0.00;FS=2.027;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,93:161:99:1971,0,1416 chrXV 961586 . C T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.143;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.874;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1483,0,1035 chrXV 961841 . C T 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.403;DP=108;Dels=0.00;FS=1.621;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.437;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:978,0,1247 chrXV 961932 . T C 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.168;DP=129;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=4.9366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.184;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:129:99:1553,0,1192 chrXV 962816 . C T 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.999;DP=114;Dels=0.00;FS=7.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=9.85;ReadPosRankSum=-2.079;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1153,0,1250 chrXV 962933 . C T 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.581;DP=123;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.386;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,65:123:99:1327,0,1160 chrXV 963149 . G A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.334;DP=129;Dels=0.00;FS=8.010;HaplotypeScore=1.6439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.615;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1229,0,1158 chrXV 963377 . G A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.911;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1497,0,1595 chrXV 964208 . C T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.279;DP=130;Dels=0.00;FS=9.426;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1419,0,1232 chrXV 964349 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.019;DP=115;Dels=0.00;FS=4.534;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=9.90;ReadPosRankSum=-3.147;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1169,0,1307 chrXV 964421 . A G 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.357;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1538,0,1134 chrXV 964661 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.045;DP=133;Dels=0.00;FS=4.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.444;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1302,0,1479 chrXV 964869 . A G 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.453;DP=118;Dels=0.00;FS=7.056;HaplotypeScore=4.8701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.092;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1127,0,1294 chrXV 965123 . A G 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.310;DP=119;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1130,0,1340 chrXV 965240 . G A 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.194;DP=107;Dels=0.00;FS=3.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,39:107:99:777,0,1531 chrXV 965984 . G A 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.508;DP=115;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=1;MQRankSum=0.453;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.402;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1102,0,1234 chrXV 966067 . C A 2290 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2323,228,0 chrXV 966276 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.697;DP=131;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.534;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1162,0,1667 chrXV 966317 . C T 938.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.398;DP=95;Dels=0.00;FS=8.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-3.785;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.041;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:968,0,1042 chrXV 966318 . A G 897.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.963;DP=95;Dels=0.00;FS=8.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-4.457;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.324;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:927,0,1085 chrXV 966325 . A G 2372 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=46.1237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.29;MQ0=0;QD=23.49;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2405,267,0 chrXV 966369 . G A 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.662;DP=93;Dels=0.00;FS=1.732;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.85;MQ0=0;MQRankSum=-4.203;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.667;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,50:93:99:948,0,866 chrXV 966428 . C T 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.526;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.739;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:842,0,1271 chrXV 966472 . G T 888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.469;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:918,0,1679 chrXV 966542 . G A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.180;DP=133;Dels=0.00;FS=5.225;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1254,0,1481 chrXV 966610 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.655;DP=138;Dels=0.00;FS=2.172;HaplotypeScore=5.2085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.006;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1297,0,1697 chrXV 966621 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.042;DP=139;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.503;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1489,0,1441 chrXV 966732 . C T 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.153;DP=106;Dels=0.00;FS=1.604;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=2.700;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.942;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1161,0,1024 chrXV 966892 . A G 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.825;DP=106;Dels=0.00;FS=4.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.672;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:952,0,1197 chrXV 967170 . G A 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.487;DP=113;Dels=0.00;FS=11.383;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.997;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1176,0,1153 chrXV 967253 . T G 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.403;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.447;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1329,0,1425 chrXV 967353 . G A 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.366;DP=93;Dels=0.00;FS=2.743;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.050;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:1152,0,776 chrXV 967506 . C T 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.009;DP=119;Dels=0.00;FS=1.456;HaplotypeScore=3.9712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.746;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.364;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1365,0,1196 chrXV 967667 . T C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.601;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1128,0,1727 chrXV 967862 . G A 2723 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2756,270,0 chrXV 968047 . C T 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.940;DP=91;Dels=0.00;FS=1.814;HaplotypeScore=7.2487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.506;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:891,0,1044 chrXV 968067 . G A 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.659;DP=98;Dels=0.00;FS=0.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.895;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:930,0,1030 chrXV 968186 . G A 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.435;DP=137;Dels=0.00;FS=7.510;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.659;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,78:137:99:1506,0,1115 chrXV 968231 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.916;DP=119;Dels=0.00;FS=6.053;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.179;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.409;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1096,0,1409 chrXV 968286 . T A 1652 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.118;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5382;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=20.40;ReadPosRankSum=1.601;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:81:99:1685,177,0 chrXV 968332 . T G 2053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.62;MQ0=0;QD=22.32;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2086,231,0 chrXV 968360 . C T 2488 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.254e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2521,258,0 chrXV 968440 . A G 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.070;DP=104;Dels=0.00;FS=0.802;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=3.135;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:894,0,1219 chrXV 968476 . G A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.552;DP=96;Dels=0.00;FS=1.702;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,58:96:99:1187,0,734 chrXV 968483 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.323;DP=94;Dels=0.00;FS=0.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.784;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:1134,0,851 chrXV 968504 . T C 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.524;DP=126;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=2.5585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.595;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1098,0,1461 chrXV 968586 . T C 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.434;DP=151;Dels=0.00;FS=3.832;HaplotypeScore=3.8082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.306;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1555,0,1616 chrXV 968617 . C T 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.675;DP=128;Dels=0.00;FS=5.736;HaplotypeScore=2.8841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=1.926;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.688;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1240,0,1465 chrXV 968647 . T C 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.609;DP=110;Dels=0.00;FS=7.770;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.377;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1008,0,1210 chrXV 968667 . T A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.658;DP=119;Dels=0.00;FS=3.350;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.173;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1032,0,1454 chrXV 968773 . C T 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.693;DP=147;Dels=0.00;FS=8.821;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=11.14;ReadPosRankSum=-2.317;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1668,0,1230 chrXV 968822 . G A 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.266;DP=143;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=6.0328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.378;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1484,0,1435 chrXV 968865 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.373;DP=110;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQ0=0;MQRankSum=3.665;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.353;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1180,0,1128 chrXV 968882 . C T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.343;DP=113;Dels=0.00;FS=11.692;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQ0=0;MQRankSum=4.613;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1280,0,1083 chrXV 968918 . A T 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.382;DP=122;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=4.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.14;MQ0=0;MQRankSum=-3.487;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.349;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:1089,0,1463 chrXV 968934 . T C 766.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.339;DP=102;Dels=0.00;FS=2.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.265;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:796,0,1291 chrXV 968938 . G A 757.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.859;DP=101;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=-5.213;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:787,0,1214 chrXV 968942 . C T 2708 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.59;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.065e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2741,279,0 chrXV 968970 . C T 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.94;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.052e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2857,294,0 chrXV 968991 . C T 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.56;MQ0=0;QD=25.54;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2893,300,0 chrXV 969023 . A G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.189;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.90;MQ0=0;MQRankSum=5.757;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1305,0,1203 chrXV 969024 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.058;DP=124;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-4.623;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.638;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1170,0,1308 chrXV 969036 . C T 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.242;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQ0=0;MQRankSum=-3.804;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.147;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1179,0,1484 chrXV 969046 . G A 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.42;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3095,318,0 chrXV 969062 . A G 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.223;DP=117;Dels=0.00;FS=5.873;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=0;MQRankSum=-4.026;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:897,0,1460 chrXV 969067 . T C 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3412,366,0 chrXV 969164 . A G 2635 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.37;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.203e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2668,285,0 chrXV 969177 . C T 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.638;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.847;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.993;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:858,0,793 chrXV 969193 . T C 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.733;DP=102;Dels=0.00;FS=2.674;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.75;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.834;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:931,0,935 chrXV 969198 . T C 2235 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.13;MQ0=0;QD=20.69;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2268,243,0 chrXV 969233 . C T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.459;DP=110;Dels=0.00;FS=6.267;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQ0=0;MQRankSum=3.716;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:1218,0,972 chrXV 969237 . C T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.152;DP=108;Dels=0.00;FS=3.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.80;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.327;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1174,0,971 chrXV 969272 . G A 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.27;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3365,333,0 chrXV 969284 . C G 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=151;Dels=0.00;FS=11.632;HaplotypeScore=3.8047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.902;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,62:151:99:1175,0,1892 chrXV 969326 . T G 653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.004;DP=110;Dels=0.00;FS=3.666;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.878;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:683,0,1582 chrXV 969361 . T G 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.936;DP=143;Dels=0.01;FS=4.056;HaplotypeScore=14.2244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.282;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:858,0,1816 chrXV 969363 . C T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.594;DP=151;Dels=0.01;FS=6.230;HaplotypeScore=20.1744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.349;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,59:149:99:894,0,1983 chrXV 969390 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.455;DP=137;Dels=0.00;FS=11.292;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.764;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1113,0,1645 chrXV 969500 . A G 354.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.350;DP=79;Dels=0.00;FS=1.905;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.44;MQ0=0;MQRankSum=-5.276;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:384,0,1134 chrXV 969502 . T C 392.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.760;DP=77;Dels=0.00;FS=0.911;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.57;MQ0=0;MQRankSum=-6.136;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.450;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:422,0,1177 chrXV 969510 . G A 432.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.470;DP=87;Dels=0.00;FS=0.856;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQ0=0;MQRankSum=-6.448;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.040;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:462,0,1280 chrXV 969519 . G A 465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.977;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.95;MQ0=0;MQRankSum=-4.490;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,30:86:99:495,0,1281 chrXV 969549 . A T 445.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;DP=80;Dels=0.00;FS=6.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.789;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.495;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:475,0,1264 chrXV 969551 . G A 406.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.604;DP=77;Dels=0.00;FS=11.255;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQ0=0;MQRankSum=-5.248;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-5.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:436,0,1204 chrXV 969557 . C A 460.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.490;DP=81;Dels=0.00;FS=6.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.45;MQ0=0;MQRankSum=-3.950;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.543;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,26:81:99:490,0,1184 chrXV 969591 . C T 513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.682;DP=104;Dels=0.00;FS=8.178;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.634;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:543,0,1541 chrXV 969855 . T C 546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.567;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=49.3745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.62;MQ0=0;MQRankSum=-5.855;QD=4.33;ReadPosRankSum=-1.106;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,43:126:99:576,0,1916 chrXV 969857 . G T 590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.418;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=48.4080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.93;MQ0=0;MQRankSum=-7.037;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.361;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,43:131:99:620,0,1918 chrXV 969868 . A G 280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.789;DP=139;Dels=0.00;FS=14.892;HaplotypeScore=48.2973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.97;MQ0=0;MQRankSum=-5.092;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.157;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,27:139:99:310,0,2332 chrXV 969870 . T C 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.474;DP=141;Dels=0.00;FS=6.004;HaplotypeScore=84.3180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.98;MQ0=0;MQRankSum=-6.247;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,56:141:99:776,0,2018 chrXV 969879 . C T 241.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.072;DP=145;Dels=0.01;FS=28.118;HaplotypeScore=141.6399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.354;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.209;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:271,0,1981 chrXV 969896 . T C 103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.106;DP=140;Dels=0.00;FS=13.702;HaplotypeScore=53.6185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQ0=0;MQRankSum=-6.751;QD=0.74;ReadPosRankSum=-2.335;SB=-1.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,32:140:99:133,0,2349 chrXV 969904 . G A 148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.723;DP=141;Dels=0.00;FS=13.282;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.33;MQ0=0;MQRankSum=-6.332;QD=1.05;ReadPosRankSum=-2.163;SB=-1.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,32:141:99:178,0,2342 chrXV 969909 . C A 115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.687;DP=146;Dels=0.00;FS=15.733;HaplotypeScore=172.7255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQ0=0;MQRankSum=-7.041;QD=0.79;ReadPosRankSum=-3.598;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,32:146:99:145,0,2421 chrXV 969916 . A G 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.911;DP=141;Dels=0.00;FS=35.907;HaplotypeScore=176.4147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.623;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:141:99:745,0,1603 chrXV 969961 . A G 961.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.473;DP=114;Dels=0.00;FS=27.505;HaplotypeScore=39.4652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.60;MQ0=0;MQRankSum=-4.224;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.681;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:991,0,1283 chrXV 969966 . A G 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.215;DP=131;Dels=0.00;FS=11.783;HaplotypeScore=42.7152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=6.85;ReadPosRankSum=3.243;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,46:131:99:927,0,1352 chrXV 969988 . C T 169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.485;DP=154;Dels=0.00;FS=2.523;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-3.759;QD=1.10;ReadPosRankSum=-1.740;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,36:154:99:199,0,2636 chrXV 970020 . G T 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.068;DP=147;Dels=0.00;FS=6.709;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.654;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.785;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1576,0,1286 chrXV 970025 . C T 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.686;DP=148;Dels=0.00;FS=7.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.407;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.472;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,83:148:99:1621,0,1370 chrXV 970097 . T C 417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.243;DP=104;Dels=0.00;FS=1.788;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.505;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.090;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,30:104:99:447,0,1764 chrXV 970105 . A T 459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.146;DP=121;Dels=0.00;FS=2.675;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.958;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.026;SB=-2.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,32:121:99:489,0,2108 chrXV 970110 . G A 444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.115;DP=121;Dels=0.00;FS=3.870;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.159;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,32:121:99:474,0,1927 chrXV 970127 . A G 2172.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.019;DP=128;Dels=0.00;FS=11.112;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.14;MQ0=0;MQRankSum=3.137;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,103:128:99:2202,0,240 chrXV 970129 . C A 135.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.847;DP=133;Dels=0.00;FS=14.539;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.42;MQ0=0;MQRankSum=-2.831;QD=1.02;ReadPosRankSum=1.517;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,22:133:99:165,0,2460 chrXV 970135 . T C 2454.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;DP=143;Dels=0.00;FS=29.942;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.78;MQ0=0;MQRankSum=3.750;QD=17.16;ReadPosRankSum=1.227;SB=-1.242e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,112:143:99:2484,0,390 chrXV 970141 . C T 343.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.418;DP=130;Dels=0.00;FS=40.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.14;MQ0=0;MQRankSum=-3.771;QD=2.64;ReadPosRankSum=-2.429;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,30:130:99:373,0,2241 chrXV 970171 . C G 209.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;DP=127;Dels=0.00;FS=76.018;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.76;MQ0=0;MQRankSum=-5.357;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.330;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,25:127:99:239,0,2353 chrXV 970172 . C T 236.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.848;DP=128;Dels=0.00;FS=75.322;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.92;MQ0=0;MQRankSum=-5.794;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.481;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,25:128:99:266,0,2327 chrXV 970181 . C T 247.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.704;DP=119;Dels=0.00;FS=64.353;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.10;MQ0=0;MQRankSum=-5.752;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.408;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,26:119:99:277,0,2080 chrXV 970186 . G A 187.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.139;DP=125;Dels=0.00;FS=52.641;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.92;MQ0=0;MQRankSum=-4.527;QD=1.50;ReadPosRankSum=1.845;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,23:125:99:217,0,2354 chrXV 970213 . A G 315.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;DP=100;Dels=0.00;FS=61.883;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.93;MQ0=0;MQRankSum=-4.601;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.607;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:345,0,1749 chrXV 970228 . T A 173.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.046;DP=80;Dels=0.00;FS=34.876;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.02;MQ0=0;MQRankSum=-3.964;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:203,0,1475 chrXV 970235 . T C 172.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;DP=69;Dels=0.00;FS=28.489;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.83;MQ0=0;MQRankSum=-3.462;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:202,0,1220 chrXV 970257 . G T 503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.953;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.6421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.347;SB=-1.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,30:75:99:533,0,884 chrXV 970266 . A G 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.743;DP=79;Dels=0.00;FS=6.064;HaplotypeScore=16.8658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.561;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.652;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,49:79:99:960,0,605 chrXV 970270 . A T 473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;DP=74;Dels=0.00;FS=1.588;HaplotypeScore=15.8743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,30:74:99:503,0,964 chrXV 973326 . T C 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;DP=120;Dels=0.00;FS=18.177;HaplotypeScore=6.7567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.40;MQ0=95;MQRankSum=1.965;QD=0.10;ReadPosRankSum=0.376;SB=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,13:120:42:42,0,64 chrXV 973677 . C T 560.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.845;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.12;MQ0=99;MQRankSum=2.353;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.056;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,30:147:99:590,0,142 chrXV 973693 . A T 13.22 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.25;MQ0=91;MQRankSum=2.048;QD=0.09;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,6:143:43:43,0,713 chrXV 974076 . C T 609 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.43;MQ0=13;QD=12.69;SB=-6.520e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:66:642,66,0 chrXV 974082 . C T 135.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.12;MQ0=21;MQRankSum=-0.342;QD=2.50;ReadPosRankSum=-1.135;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:165,0,271 chrXV 974083 . A G 103.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.917;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.52;MQ0=20;MQRankSum=-0.811;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:133,0,312 chrXV 974088 . C T 110.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.370;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.21;MQ0=21;MQRankSum=-2.104;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.744;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:140,0,298 chrXV 974121 . G T 132.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.381;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.67;MQ0=29;MQRankSum=-1.028;QD=1.94;ReadPosRankSum=1.845;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:162,0,294 chrXV 974123 . A G 123.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.738;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.68;MQ0=28;MQRankSum=-0.894;QD=1.81;ReadPosRankSum=1.625;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:153,0,308 chrXV 974127 . T C 139.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.672;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.1125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.98;MQ0=27;MQRankSum=-0.705;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.264;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:169,0,207 chrXV 974193 . G A 141.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.797;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.14;MQ0=45;MQRankSum=2.049;QD=1.64;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-6.444e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,37:86:53:171,0,53 chrXV 974247 . A G 243 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.41;MQ0=61;MQRankSum=1.849;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.792;SB=-1.085e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:50,44:94:30:276,30,0 chrXV 974250 . G A 258 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.647;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.59;MQ0=61;MQRankSum=2.232;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.988;SB=-1.302e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:50,45:95:30:291,30,0 chrXV 976257 . G C 184.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.71;MQ0=0;QD=9.69;SB=-2.904e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:24:217,24,0 chrXV 976308 . T C 81.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;DP=36;Dels=0.00;FS=20.796;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.49;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=2.25;ReadPosRankSum=1.839;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:111,0,530 chrXV 976367 . C T 702 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.038;DP=39;Dels=0.00;FS=4.987;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.73;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.400;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,29:39:52:735,52,0 chrXV 976373 . A C 657 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;DP=40;Dels=0.00;FS=8.239;HaplotypeScore=5.9383;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.299;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:75:690,75,0 chrXV 976385 . T A 620.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;DP=53;Dels=0.00;FS=2.025;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.03;MQ0=0;MQRankSum=-3.312;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.761;SB=-4.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,33:53:99:650,0,195 chrXV 976389 . G A 522.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;DP=50;Dels=0.00;FS=2.548;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.802;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.505;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:552,0,202 chrXV 976390 . C G 484.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.300;DP=51;Dels=0.00;FS=2.317;HaplotypeScore=5.9560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.611;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.107;SB=-1.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:51:99:514,0,242 chrXV 976397 . T A 509.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.28;MQ0=0;MQRankSum=-4.099;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.127;SB=-9.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:539,0,367 chrXV 976399 . C A 509.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.384;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.305;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:539,0,349 chrXV 976400 . A G 470.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.28;MQ0=0;MQRankSum=-4.377;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-9.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:55:99:500,0,367 chrXV 976404 . C A 495.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.230;DP=58;Dels=0.00;FS=1.514;HaplotypeScore=5.9466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.42;MQ0=0;MQRankSum=-3.250;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-1.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,29:58:99:525,0,392 chrXV 976637 . G A 1090.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.054;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.903;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.372;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1120,0,1003 chrXV 976869 . C T 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.809;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,44:87:99:905,0,891 chrXV 976923 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.651;DP=111;Dels=0.00;FS=6.311;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1139,0,1179 chrXV 978537 . A G 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.962;DP=147;Dels=0.00;FS=1.291;HaplotypeScore=4.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=1;MQRankSum=-0.781;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.599;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1528,0,1497 chrXV 978614 . T G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.838;DP=133;Dels=0.00;FS=3.153;HaplotypeScore=5.5507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=1;MQRankSum=-0.151;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1194,0,1605 chrXV 978665 . G A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.048;DP=154;Dels=0.00;FS=1.275;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=1;MQRankSum=1.243;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.031;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:154:99:1474,0,1782 chrXV 978778 . A C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;DP=127;Dels=0.00;FS=1.536;HaplotypeScore=4.2180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.192;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:990,0,1655 chrXV 978860 . T G 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.681;DP=176;Dels=0.00;FS=1.888;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=2.605;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.197;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,84:176:99:1567,0,1965 chrXV 978953 . C A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.258;DP=137;Dels=0.00;FS=8.011;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=3.434;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.837;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1514,0,1323 chrXV 979379 . C T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.137;DP=126;Dels=0.00;FS=1.457;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.674;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1194,0,1245 chrXV 979419 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.842;DP=131;Dels=0.00;FS=5.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1319,0,1454 chrXV 979457 . C T 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.346;DP=128;Dels=0.00;FS=3.206;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.972;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1274,0,1383 chrXV 979605 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.766;DP=115;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.855;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1219,0,1129 chrXV 979746 . C T 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.170;DP=121;Dels=0.00;FS=12.102;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.528;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1470,0,1077 chrXV 979760 . C G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.121;DP=120;Dels=0.00;FS=8.589;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.693;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1176,0,1194 chrXV 979929 . G C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.016;DP=158;Dels=0.00;FS=1.424;HaplotypeScore=2.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,66:158:99:1276,0,2035 chrXV 979973 . T A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.319;DP=152;Dels=0.00;FS=3.641;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.583;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,62:152:99:1222,0,1941 chrXV 979981 . A G 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.851;DP=110;Dels=0.00;FS=3.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=7.72;ReadPosRankSum=-2.144;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:879,0,1199 chrXV 980032 . G A 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.226;DP=100;Dels=0.00;FS=3.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=1;MQRankSum=0.165;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.319;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:1019,0,1102 chrXV 980197 . C T 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.481;DP=85;Dels=0.00;FS=0.813;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:921,0,847 chrXV 980242 . A T 567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.314;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.041;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.805;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,31:60:99:597,0,600 chrXV 980396 . A G 36.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;DP=47;Dels=0.00;FS=1.740;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.02;MQ0=27;MQRankSum=-1.273;QD=0.77;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:66:66,0,169 chrXV 980604 . C T 355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.402;DP=88;Dels=0.00;FS=4.262;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.33;MQ0=1;MQRankSum=-1.649;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.744;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,35:88:99:385,0,638 chrXV 980701 . A T 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3423,357,0 chrXV 980913 . C A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.569;DP=111;Dels=0.00;FS=2.436;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.534;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1116,0,1194 chrXV 981009 . T C 3684.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3684,381,0 chrXV 981018 . G A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.340;DP=131;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.537;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1553,0,1313 chrXV 981230 . C T 1551.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.002;DP=145;Dels=0.00;FS=2.117;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1581,0,1318 chrXV 981231 . C G 1315.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;DP=137;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=2.3937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=3.147;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.773;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1345,0,1321 chrXV 981233 . C T 1449.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.645;DP=141;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,73:141:99:1479,0,1318 chrXV 981273 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.247;DP=133;Dels=0.00;FS=2.187;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.119;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1183,0,1397 chrXV 981291 . T G 2746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.52;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2779,300,0 chrXV 981304 . A T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;DP=132;Dels=0.00;FS=4.115;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.910;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1094,0,1583 chrXV 981359 . A G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.278;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.912;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1247,0,1436 chrXV 981378 . C T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.269;DP=128;Dels=0.00;FS=4.170;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.409;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.046;SB=-6.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1316,0,1331 chrXV 981382 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.837;DP=133;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.070;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1325,0,1356 chrXV 981410 . C A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.460;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1383,0,1123 chrXV 981447 . T C 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.171;DP=113;Dels=0.00;FS=7.245;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.714;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,63:113:99:1132,0,1080 chrXV 981456 . A G 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.308;DP=110;Dels=0.00;FS=2.665;HaplotypeScore=7.6879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.568;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,58:110:99:1132,0,1164 chrXV 981571 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.081;DP=130;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=3.9585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.81;MQ0=0;MQRankSum=-4.603;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.065;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:990,0,1302 chrXV 981589 . C A 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.107;DP=128;Dels=0.00;FS=5.788;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.902;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.458;SB=-1.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,55:128:99:847,0,1438 chrXV 981687 . C T 1546.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.317;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1576,0,1331 chrXV 981708 . T C 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.842;DP=166;Dels=0.00;FS=4.154;HaplotypeScore=1.8490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.799;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,82:166:99:1674,0,1850 chrXV 981745 . T C 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.352;DP=152;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.124;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1653,0,1543 chrXV 981779 . C T 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.839;DP=139;Dels=0.00;FS=2.131;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1432,0,1425 chrXV 981860 . G A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.632;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.037;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1116,0,1366 chrXV 981961 . G A 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.631;DP=110;Dels=0.00;FS=1.541;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1042,0,1258 chrXV 982089 . A G 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.904;DP=117;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=2.593;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.443;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:117:99:1229,0,1211 chrXV 982131 . G A 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3830,384,0 chrXV 982135 . A T 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.399;DP=152;Dels=0.00;FS=7.648;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.388;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1513,0,1628 chrXV 982145 . T C 3572.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.69;MQ0=0;QD=24.63;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:145:99:3572,366,0 chrXV 982160 . C T 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.386;DP=135;Dels=0.00;FS=9.486;HaplotypeScore=3.0396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.234;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:135:99:1427,0,1309 chrXV 982250 . C A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.982;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:978,0,1243 chrXV 982533 . G A 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.634;DP=133;Dels=0.00;FS=5.683;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=4.226;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.197;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1654,0,1162 chrXV 982665 . G A 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.654;DP=129;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.196;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1279,0,1442 chrXV 982860 . C A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.065;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1133,0,1158 chrXV 983117 . A G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.845;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=9.71;ReadPosRankSum=-2.279;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1224,0,1293 chrXV 983290 . G A 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.134;DP=131;Dels=0.00;FS=3.134;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.145;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1479,0,1273 chrXV 983423 . G A 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.972;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.476;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,81:170:99:1669,0,1753 chrXV 983694 . T C 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.359;DP=141;Dels=0.00;FS=5.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,56:141:99:1116,0,1907 chrXV 983798 . A C 4110.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4110,423,0 chrXV 983849 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.122;DP=124;Dels=0.00;FS=5.739;HaplotypeScore=3.6919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1359,0,1164 chrXV 983852 . T C 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.746;DP=128;Dels=0.00;FS=3.234;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.253;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1325,0,1405 chrXV 983939 . T C 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.337;DP=132;Dels=0.00;FS=2.334;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.590;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1098,0,1713 chrXV 984011 . T C 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.902;DP=142;Dels=0.00;FS=2.150;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1214,0,1724 chrXV 984169 . A T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;DP=146;Dels=0.00;FS=1.349;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,67:146:99:1317,0,1674 chrXV 984290 . A G 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.646;DP=131;Dels=0.00;FS=2.361;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.334;SB=-2.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:1015,0,1740 chrXV 984300 . A G 3818.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3818,399,0 chrXV 984317 . G A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.836;DP=158;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.815;QD=8.84;ReadPosRankSum=-1.629;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,70:158:99:1426,0,1888 chrXV 984323 . C T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.495;DP=151;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.419;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,65:151:99:1342,0,1870 chrXV 984607 . T C 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.112;DP=128;Dels=0.00;FS=3.214;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.078;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1009,0,1619 chrXV 984651 . G A 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.117;DP=162;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.310;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:162:99:1639,0,1625 chrXV 984859 . T C 2449 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.01;SB=-8.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2482,270,0 chrXV 984910 . T A 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;DP=148;Dels=0.00;FS=8.579;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1641,0,1532 chrXV 984992 . C T 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3591,364,0 chrXV 985158 . C T 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.088;DP=157;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=11.90;ReadPosRankSum=-2.555;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:157:99:1898,0,1347 chrXV 985377 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.837;DP=103;Dels=0.00;FS=7.706;HaplotypeScore=2.5594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.354;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1110,0,953 chrXV 985518 . A G 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.819;DP=149;Dels=0.00;FS=5.487;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.093;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.908;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1319,0,1685 chrXV 985926 . T C 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.358;DP=147;Dels=0.00;FS=1.293;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=10.07;ReadPosRankSum=-2.166;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,77:147:99:1510,0,1427 chrXV 985932 . A G 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.969;DP=145;Dels=0.00;FS=0.612;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=8.03;ReadPosRankSum=-2.471;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1194,0,1496 chrXV 985938 . G A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.283;DP=143;Dels=0.00;FS=7.469;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.193;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:1329,0,1537 chrXV 986764 . C T 464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.382;DP=94;Dels=0.00;FS=7.606;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.058;QD=4.94;ReadPosRankSum=-2.026;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,35:94:99:494,0,1340 chrXV 986792 . T C 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.241;DP=126;Dels=0.00;FS=6.919;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,50:126:99:953,0,1722 chrXV 986838 . A G 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.212;DP=129;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1212,0,1408 chrXV 986977 . C T 1909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.557;DP=204;Dels=0.00;FS=0.555;HaplotypeScore=2.9133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.254;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.303;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,96:204:99:1939,0,2237 chrXV 986991 . A G 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.676;DP=194;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.657;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,92:194:99:1751,0,2164 chrXV 987106 . A T 1957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.532;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,95:167:99:1987,0,1517 chrXV 987547 . A G 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.110;DP=158;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.295;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1727,0,1606 chrXV 987667 . G A 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3992,406,0 chrXV 987753 . T C 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.289;DP=172;Dels=0.00;FS=6.635;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.002;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,86:172:99:1682,0,1821 chrXV 987985 . C A 1775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.863;DP=159;Dels=0.00;FS=1.242;HaplotypeScore=5.9592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=2.190;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.081;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,82:159:99:1805,0,1542 chrXV 988096 . G A 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6710;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=22.93;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:148:99:3394,360,0 chrXV 988311 . T C 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.623;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.154;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,87:176:99:1758,0,1919 chrXV 988494 . C T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.487;DP=131;Dels=0.00;FS=11.029;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.709;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1368,0,1260 chrXV 988671 . C T 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.408;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.065;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:841,0,887 chrXV 988711 . A T 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=109;Dels=0.00;FS=3.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.286;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1053,0,1075 chrXV 988936 . G A 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.927;DP=150;Dels=0.00;FS=2.084;HaplotypeScore=7.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=1.348;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:1234,0,1850 chrXV 988993 . C T 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.983;DP=162;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=1;MQRankSum=-0.119;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.682;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,66:162:99:1350,0,2032 chrXV 989061 . T C 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.571;DP=173;Dels=0.00;FS=1.224;HaplotypeScore=5.8750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=1;MQRankSum=-1.554;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.176;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,73:173:99:1279,0,2165 chrXV 989106 . G T 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.891;DP=163;Dels=0.00;FS=1.273;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.029;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,77:163:99:1599,0,1881 chrXV 989204 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.216;DP=146;Dels=0.00;FS=6.198;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.020;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1494,0,1604 chrXV 989216 . C T 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.633;DP=146;Dels=0.00;FS=8.838;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.603;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,71:146:99:1505,0,1547 chrXV 989343 . G C 1971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.637;DP=171;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.132;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,96:171:99:2001,0,1455 chrXV 989396 . C A 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.090;DP=148;Dels=0.00;FS=1.390;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,84:148:99:1843,0,1186 chrXV 989690 . A G 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.189;DP=159;Dels=0.00;FS=1.256;HaplotypeScore=4.3966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.914;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,81:159:99:1625,0,1648 chrXV 989742 . A G 443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.404;DP=161;Dels=0.00;FS=4.071;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.866;SB=-1.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,71:161:99:473,0,1135 chrXV 989750 . G T 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.150;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.101;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,70:154:99:609,0,987 chrXV 990426 . A T 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.178;DP=160;Dels=0.00;FS=7.268;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.535;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1566,0,1859 chrXV 991809 . G A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3268,325,0 chrXV 992008 . T C 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.78;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3419,363,0 chrXV 992356 . C G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.641;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=7.95;ReadPosRankSum=-2.220;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1111,0,1538 chrXV 992728 . C T 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.994;DP=150;Dels=0.00;FS=3.940;HaplotypeScore=5.6928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.500;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1603,0,1368 chrXV 992948 . A G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.453;DP=140;Dels=0.00;FS=2.315;HaplotypeScore=2.7022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=9.16;ReadPosRankSum=2.382;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,65:140:99:1312,0,1661 chrXV 993116 . C G 3215.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.416e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3249,342,0 chrXV 993617 . G A 4588.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.693;DP=177;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4238;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.812;SB=-2.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,176:177:99:4588,457,0 chrXV 993703 . G A 3894.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3894,400,0 chrXV 994342 . T C 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2839,291,0 chrXV 994833 . T C 3224.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.00;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3257,345,0 chrXV 995180 . A G 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3841,414,0 chrXV 995633 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.432;DP=132;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.841;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1171,0,1572 chrXV 995834 . G A 3173 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3206,330,0 chrXV 996026 . T C 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.04;SB=-1.112e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3812,393,0 chrXV 996329 . C T 4351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=25.90;SB=-2.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4351,430,0 chrXV 996335 . A G 4112.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.795e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4112,418,0 chrXV 996448 . C G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.384;DP=164;Dels=0.00;FS=9.920;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,69:164:99:1333,0,1927 chrXV 996462 . A G 4102.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4102,447,0 chrXV 997055 . A C 1733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.612;DP=171;Dels=0.00;FS=1.889;HaplotypeScore=2.1461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.751;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,92:171:99:1763,0,1609 chrXV 997483 . C G 2603 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=23.45;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2636,282,0 chrXV 997902 . G C 2015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=24.28;SB=-1.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2048,219,0 chrXV 998245 . C A 1599 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.21;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:1632,168,0 chrXV 998921 . G A 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.896e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3579,355,0 chrXV 999338 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.538;DP=134;Dels=0.00;FS=5.530;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.718;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1382,0,1410 chrXV 999385 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.202;DP=126;Dels=0.00;FS=2.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:1329,0,1163 chrXV 999460 . C T 1611.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.079;DP=152;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.8770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.271;SB=-7.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1641,0,1495 chrXV 999645 . G A 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.187e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3356,337,0 chrXV 999686 . T C 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.82;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3666,384,0 chrXV 1000192 . G A 4317.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1093;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.812e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4317,421,0 chrXV 1000993 . A T 158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.389;DP=121;Dels=0.01;FS=259.798;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=1.31;ReadPosRankSum=-5.127;SB=-2.982e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,35:120:99:188,0,721 chrXV 1000999 . A T 67.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.564;DP=133;Dels=0.00;FS=224.612;HaplotypeScore=5.0946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=0.50;ReadPosRankSum=-5.793;SB=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,32:133:97:97,0,1110 chrXV 1001534 . G C 844.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;DP=99;Dels=0.00;FS=6.341;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.395;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:874,0,1117 chrXV 1001814 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.277;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.572;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1167,0,1460 chrXV 1002323 . C G 2625 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2658,273,0 chrXV 1002519 . C T 4528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.864e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4528,436,0 chrXV 1003210 . C T 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.089;DP=141;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.327;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1239,0,1753 chrXV 1004149 . T C 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.652;DP=153;Dels=0.00;FS=3.138;HaplotypeScore=3.7029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.153;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1597,0,1650 chrXV 1004168 . A T 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;DP=129;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.107;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1526,0,1244 chrXV 1004312 . A C 587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.583;DP=68;Dels=0.03;FS=23.654;HaplotypeScore=33.5502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.328;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:617,0,442 chrXV 1004313 . C G 593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;DP=65;Dels=0.03;FS=29.572;HaplotypeScore=31.5653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.565;SB=-3.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:623,0,208 chrXV 1004484 . C T 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.223;DP=88;Dels=0.00;FS=7.326;HaplotypeScore=6.2925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.322;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:921,0,751 chrXV 1004505 . C T 959.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.118;DP=98;Dels=0.00;FS=5.397;HaplotypeScore=2.3140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.448;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:989,0,857 chrXV 1004534 . T C 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.035;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:749,0,862 chrXV 1004813 . T C 883.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.540;DP=88;Dels=0.00;FS=14.238;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.272;SB=-1.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:913,0,875 chrXV 1004868 . A T 1892 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=24.26;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1925,198,0 chrXV 1005814 . C A 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.209;DP=183;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.075;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,78:183:99:1625,0,2224 chrXV 1007117 . C T 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.836;DP=125;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.537;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,75:125:99:1621,0,1014 chrXV 1007259 . C G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;DP=107;Dels=0.00;FS=6.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.159;SB=-4.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1154,0,1069 chrXV 1007685 . G C 2773 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.68;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2806,297,0 chrXV 1008432 . A G 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.044;DP=152;Dels=0.00;FS=5.954;HaplotypeScore=4.6029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.532;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1655,0,1539 chrXV 1008669 . C T 1972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.118;DP=138;Dels=0.00;FS=0.780;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,86:138:99:2002,0,1001 chrXV 1009002 . A G 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.656;DP=124;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1385,0,1238 chrXV 1009187 . A T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.928;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.819;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1275,0,1157 chrXV 1009233 . A G 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.002;DP=96;Dels=0.00;FS=2.673;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.198;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:962,0,1042 chrXV 1009862 . T C 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.30;SB=-2.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3846,396,0 chrXV 1009919 . C T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.405;DP=154;Dels=0.00;FS=4.989;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1386,0,1814 chrXV 1009927 . G T 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.705;DP=162;Dels=0.00;FS=5.932;HaplotypeScore=1.9265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.808;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,73:162:99:1545,0,1797 chrXV 1009965 . A G 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.184;DP=155;Dels=0.00;FS=1.334;HaplotypeScore=2.4441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.349;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1666,0,1702 chrXV 1009993 . G A 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.530;DP=168;Dels=0.00;FS=5.590;HaplotypeScore=2.8230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.069;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,76:168:99:1618,0,1843 chrXV 1010000 . A C 1536.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.058;DP=167;Dels=0.00;FS=6.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.860;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.021;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,77:167:99:1566,0,1997 chrXV 1010077 . A G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.058;DP=134;Dels=0.00;FS=7.701;HaplotypeScore=4.9656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=3.245;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.621;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1342,0,1477 chrXV 1010114 . G A 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.494;DP=164;Dels=0.00;FS=5.690;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.182;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:1731,0,1729 chrXV 1010122 . T C 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.519;DP=148;Dels=0.00;FS=2.156;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1473,0,1660 chrXV 1010331 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.945;DP=159;Dels=0.00;FS=1.259;HaplotypeScore=3.5565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.630;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,68:159:99:1217,0,1943 chrXV 1010424 . A G 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.603;DP=165;Dels=0.00;FS=11.138;HaplotypeScore=4.5187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=8.39;ReadPosRankSum=2.611;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,73:165:99:1414,0,1957 chrXV 1010999 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.485;DP=168;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,78:168:99:1522,0,1864 chrXV 1011045 . C T 1976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.125;DP=176;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.846;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,89:176:99:2006,0,1805 chrXV 1011440 . C T 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.309;DP=152;Dels=0.00;FS=6.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1679,0,1526 chrXV 1011580 . C G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.175;DP=141;Dels=0.00;FS=5.080;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.655;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:141:99:1308,0,1367 chrXV 1012127 . G A 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.050;DP=131;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.261;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,52:131:99:1016,0,1661 chrXV 1012249 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.552;DP=168;Dels=0.00;FS=6.677;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.828;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,78:168:99:1536,0,1836 chrXV 1013025 . C G 566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;DP=118;Dels=0.00;FS=1.665;HaplotypeScore=360.7873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.00;MQ0=0;MQRankSum=4.232;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,70:118:99:596,0,872 chrXV 1013328 . T C 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.160;DP=98;Dels=0.00;FS=8.391;HaplotypeScore=1.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.662;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1229,0,854 chrXV 1013721 . G A 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.780;DP=138;Dels=0.00;FS=5.418;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=11.30;ReadPosRankSum=-2.141;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1590,0,1298 chrXV 1013769 . T G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;DP=128;Dels=0.00;FS=15.665;HaplotypeScore=3.6975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.801;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1224,0,1456 chrXV 1014123 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.189;DP=118;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.005;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1256,0,1239 chrXV 1014141 . C A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.239;DP=127;Dels=0.00;FS=3.202;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.059;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1311,0,1300 chrXV 1014216 . T A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;DP=109;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.513;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1310,0,1098 chrXV 1014504 . A G 836.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.458;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.142;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:121:99:866,0,1613 chrXV 1014513 . A C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.410;DP=123;Dels=0.00;FS=2.424;HaplotypeScore=3.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,72:123:99:1360,0,1023 chrXV 1014524 . G A 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.559;DP=103;Dels=0.00;FS=8.410;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.891;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,40:103:99:787,0,1355 chrXV 1014907 . C A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.189;DP=138;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.347;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:138:99:1295,0,1571 chrXV 1015011 . C T 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.699;DP=109;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.917;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1045,0,1263 chrXV 1015451 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.531;DP=118;Dels=0.00;FS=3.371;HaplotypeScore=4.8985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1087,0,1322 chrXV 1015648 . A G 2776 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=25.01;ReadPosRankSum=1.295;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,110:111:99:2809,294,0 chrXV 1015982 . C T 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.511;DP=104;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,64:104:99:1468,0,724 chrXV 1015988 . A G 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.412;DP=103;Dels=0.00;FS=3.146;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.983;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,61:103:99:1318,0,845 chrXV 1016156 . A G 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.127;DP=124;Dels=0.00;FS=2.287;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=1;MQRankSum=1.968;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.282;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1130,0,1486 chrXV 1016429 . A G 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.043;DP=150;Dels=0.00;FS=2.915;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.050;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.044;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,84:150:99:1654,0,1435 chrXV 1016525 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.459;DP=126;Dels=0.00;FS=4.392;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.456;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1265,0,1335 chrXV 1016606 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.446;DP=144;Dels=0.00;FS=21.241;HaplotypeScore=2.9370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.880;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1529,0,1436 chrXV 1016726 . A G 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.453;DP=106;Dels=0.01;FS=1.722;HaplotypeScore=3.8715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.951;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:105:99:1266,0,961 chrXV 1017021 . C T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.749;DP=155;Dels=0.00;FS=2.006;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.845;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1537,0,1682 chrXV 1017143 . G T 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.261;DP=115;Dels=0.00;FS=2.399;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=2.005;QD=10.03;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1184,0,1207 chrXV 1017296 . G A 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.699;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:83:99:988,0,780 chrXV 1017530 . A T 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;DP=99;Dels=0.00;FS=6.569;HaplotypeScore=3.4885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=11.65;ReadPosRankSum=2.306;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1183,0,845 chrXV 1017579 . A T 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.469;DP=138;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=6.1652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.619;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,51:138:99:1004,0,1943 chrXV 1017967 . G A 1884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.173;DP=174;Dels=0.00;FS=3.690;HaplotypeScore=6.7648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.411;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,88:174:99:1914,0,1665 chrXV 1018423 . G T 1831.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.224;DP=166;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=-0.803;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.772;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:1861,0,1600 chrXV 1018594 . T C 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.962;DP=116;Dels=0.00;FS=9.076;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1101,0,1392 chrXV 1018794 . G A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.586;DP=141;Dels=0.00;FS=3.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.656;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1391,0,1584 chrXV 1019036 . C G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.641;DP=122;Dels=0.00;FS=7.329;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.083;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1247,0,1183 chrXV 1019095 . A G 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.529;DP=128;Dels=0.00;FS=10.232;HaplotypeScore=36.7707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.21;MQ0=0;MQRankSum=-6.290;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1058,0,1587 chrXV 1019356 . C T 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.250;DP=104;Dels=0.00;FS=1.584;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.173;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:946,0,1288 chrXV 1019408 . G T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.222;DP=123;Dels=0.00;FS=0.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1261,0,1372 chrXV 1019470 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.300;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.013;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1414,0,1343 chrXV 1019659 . C T 607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.430;DP=79;Dels=0.00;FS=5.851;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:637,0,743 chrXV 1019882 . T C 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.477;DP=126;Dels=0.00;FS=5.794;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1240,0,1313 chrXV 1019978 . A G 1089 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;DP=121;Dels=0.00;FS=15.227;HaplotypeScore=161.3451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-7.718;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.280;SB=-7.900e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:75,46:121:47:1122,47,0 chrXV 1019998 . A T 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.853;DP=127;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=52.3318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.54;MQ0=0;MQRankSum=-8.639;QD=8.36;ReadPosRankSum=-3.365;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1092,0,1606 chrXV 1020013 . T C 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.282;DP=132;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=2.9544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=-8.301;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:897,0,1791 chrXV 1020132 . A G 976.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.741;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=1;MQRankSum=-2.812;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.204;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:1006,0,1613 chrXV 1020191 . T C 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.177;DP=129;Dels=0.00;FS=7.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=8.31;ReadPosRankSum=3.318;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1102,0,1570 chrXV 1020208 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.226;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=8.97;ReadPosRankSum=2.007;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1304,0,1694 chrXV 1020452 . C A 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.503;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.370;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1275,0,1629 chrXV 1020508 . C T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.398;DP=148;Dels=0.00;FS=3.905;HaplotypeScore=10.7935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.423;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1477,0,1585 chrXV 1020567 . A G 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=24.86;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3066,342,0 chrXV 1020659 . G C 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.362;SB=-4.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,42:108:99:717,0,1434 chrXV 1020660 . G A 733.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.847;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.522;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:763,0,1416 chrXV 1020710 . A G 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.281;DP=115;Dels=0.00;FS=9.213;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.370;SB=-2.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,45:115:99:851,0,1540 chrXV 1020911 . A G 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.769;DP=88;Dels=0.00;FS=5.534;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:930,0,890 chrXV 1020933 . G A 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.126;DP=94;Dels=0.00;FS=8.460;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.685;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:952,0,1049 chrXV 1021150 . G C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.522;DP=125;Dels=0.00;FS=4.066;HaplotypeScore=3.0357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.168;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1172,0,1335 chrXV 1021484 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.910;DP=122;Dels=0.00;FS=5.807;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.745;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1478,0,1013 chrXV 1021815 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.382;DP=148;Dels=0.00;FS=2.972;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.383;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1416,0,1728 chrXV 1021914 . T A 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.876;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.109;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:1010,0,1735 chrXV 1021923 . G T 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.854e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3547,343,0 chrXV 1022145 . T C 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.309;DP=136;Dels=0.00;FS=9.142;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:1448,0,1287 chrXV 1022157 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.398;DP=134;Dels=0.00;FS=6.394;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.025;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1376,0,1311 chrXV 1022325 . G A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.279;DP=154;Dels=0.00;FS=3.929;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=9.00;ReadPosRankSum=-0.718;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1416,0,1694 chrXV 1022391 . A G 840.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.131;DP=102;Dels=0.00;FS=4.905;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=-0.187;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.752;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,47:102:99:870,0,1171 chrXV 1022713 . C G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.865;DP=109;Dels=0.00;FS=9.382;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.831;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1171,0,1075 chrXV 1023000 . T C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.652;DP=107;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.510;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:107:99:1232,0,978 chrXV 1023159 . C T 1091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.060;DP=110;Dels=0.00;FS=1.537;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.332;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1121,0,1186 chrXV 1023174 . T C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.494;DP=136;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=5.6235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.790;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:136:99:1345,0,1396 chrXV 1023213 . C A 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.949;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=76.5634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.387;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,75:141:99:1635,0,1268 chrXV 1023427 . T C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.14;SB=-1.622e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3369,348,0 chrXV 1023697 . T C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.496;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.273;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,60:160:99:1048,0,2282 chrXV 1023944 . A T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1377,0,1089 chrXV 1024047 . G T 4535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.378;DP=178;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=4.7612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.04;MQ0=1;MQRankSum=1.437;QD=25.48;ReadPosRankSum=1.555;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,176:178:99:4535,445,0 chrXV 1024262 . A G 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.485;DP=129;Dels=0.00;FS=5.568;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.478;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1250,0,1433 chrXV 1024298 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.035;DP=130;Dels=0.00;FS=8.155;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.449;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.886;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1539,0,1264 chrXV 1024308 . G A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.797;DP=123;Dels=0.00;FS=4.571;HaplotypeScore=5.5368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.437;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.614;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,69:123:99:1512,0,1081 chrXV 1024343 . T C 1331.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.429;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.46;MQ0=0;MQRankSum=-3.957;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.198;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1361,0,1590 chrXV 1024346 . C T 1379.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.998;DP=136;Dels=0.00;FS=1.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.22;MQ0=0;MQRankSum=-5.754;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.503;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1409,0,1527 chrXV 1024352 . T C 1201.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.149;DP=134;Dels=0.00;FS=0.846;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQ0=0;MQRankSum=-4.600;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.366;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1231,0,1588 chrXV 1024379 . T C 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.113;DP=135;Dels=0.00;FS=7.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.90;MQ0=0;MQRankSum=-3.063;QD=10.06;ReadPosRankSum=-2.160;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1388,0,1424 chrXV 1024421 . T G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;DP=108;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.32;ReadPosRankSum=2.106;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1145,0,1152 chrXV 1024460 . T C 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.632;DP=86;Dels=0.00;FS=4.365;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.596;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1024,0,793 chrXV 1024543 . A G 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.409;DP=118;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.255;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:1475,0,1098 chrXV 1024625 . C G 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;DP=161;Dels=0.00;FS=2.891;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,80:161:99:1695,0,1720 chrXV 1024678 . C T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.826;DP=159;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=2.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:159:99:1540,0,1656 chrXV 1024766 . A G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.039;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1079,0,1212 chrXV 1024870 . C T 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.479;DP=102;Dels=0.00;FS=10.434;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=1;MQRankSum=-1.540;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.692;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:847,0,1252 chrXV 1024935 . A G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.089;DP=135;Dels=0.00;FS=5.354;HaplotypeScore=2.5465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=1;MQRankSum=0.813;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.214;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,61:135:99:1169,0,1615 chrXV 1025742 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.237;DP=134;Dels=0.00;FS=5.110;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1445,0,1262 chrXV 1025760 . G A 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.733;DP=143;Dels=0.00;FS=0.703;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.144;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1571,0,1294 chrXV 1025797 . C G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;DP=152;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=7.5688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.100;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1424,0,1569 chrXV 1026012 . T C 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.530;DP=111;Dels=0.00;FS=5.115;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.149;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1323,0,1061 chrXV 1026039 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.065;DP=131;Dels=0.00;FS=1.402;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.270;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:131:99:1530,0,1174 chrXV 1026427 . A C 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.73;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2828,297,0 chrXV 1026836 . T C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.092;DP=128;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.876;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1395,0,1280 chrXV 1026977 . G C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.326;DP=134;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.824;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1479,0,1204 chrXV 1027094 . A G 3189 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.201;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.313;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:3222,333,0 chrXV 1028028 . G A 606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.452;DP=84;Dels=0.00;FS=5.718;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.202;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:636,0,1153 chrXV 1028039 . A T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.514;DP=75;Dels=0.00;FS=7.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:75:99:911,0,715 chrXV 1028073 . C A 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.899;DP=100;Dels=0.00;FS=8.429;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.081;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,55:100:99:1188,0,880 chrXV 1028091 . A T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;DP=107;Dels=0.00;FS=2.630;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.860;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,58:107:99:1280,0,1030 chrXV 1028135 . T G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;DP=115;Dels=0.00;FS=5.312;HaplotypeScore=6.5982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:115:99:1276,0,1084 chrXV 1028753 . A G 972.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.225;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1002,0,1353 chrXV 1028900 . C G 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.324;DP=128;Dels=0.00;FS=19.191;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.206;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1330,0,1292 chrXV 1029077 . A C 695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.780;DP=108;Dels=0.00;FS=1.598;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.247;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:725,0,1537 chrXV 1029127 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.497;DP=136;Dels=0.00;FS=5.394;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1238,0,1598 chrXV 1029174 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.019;DP=131;Dels=0.00;FS=3.256;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.449;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1373,0,1389 chrXV 1029896 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.981;DP=108;Dels=0.00;FS=5.965;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.420;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1049,0,1210 chrXV 1029990 . C T 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.45;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3518,363,0 chrXV 1030149 . A T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.475;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:134:99:1444,0,1428 chrXV 1030315 . C A 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3229,327,0 chrXV 1030847 . A G 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.265;DP=137;Dels=0.00;FS=6.510;HaplotypeScore=2.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.559;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,64:137:99:999,0,1361 chrXV 1030941 . G A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;DP=119;Dels=0.00;FS=13.874;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.008;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1036,0,1456 chrXV 1031126 . T C 2566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.133e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2599,291,0 chrXV 1031150 . G A 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.690;DP=139;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=2.274;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.307;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1180,0,1657 chrXV 1031271 . G A 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.443;DP=175;Dels=0.00;FS=14.722;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=2.559;QD=9.06;ReadPosRankSum=2.223;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,78:175:99:1615,0,2036 chrXV 1031275 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.814;DP=176;Dels=0.00;FS=13.220;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.829;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,79:176:99:1585,0,2028 chrXV 1031303 . A G 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.218;DP=172;Dels=0.00;FS=7.739;HaplotypeScore=3.6619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.997;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,79:172:99:1583,0,2073 chrXV 1031520 . A G 2021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.671;DP=176;Dels=0.00;FS=8.717;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,104:176:99:2051,0,1462 chrXV 1031564 . G A 1929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.394;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,90:166:99:1959,0,1362 chrXV 1031632 . C T 1942.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.987;DP=166;Dels=0.00;FS=2.812;HaplotypeScore=4.6696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,88:166:99:1972,0,1459 chrXV 1031715 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.788;DP=128;Dels=0.00;FS=11.433;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.101;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1530,0,1143 chrXV 1031840 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.798;DP=118;Dels=0.00;FS=12.490;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.890;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1159,0,1237 chrXV 1032017 . T C 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.944;DP=180;Dels=0.00;FS=0.558;HaplotypeScore=6.4338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.491;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,86:180:99:1622,0,2012 chrXV 1032089 . T C 4280.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9312;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=23.26;SB=-2.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4280,429,0 chrXV 1032092 . A C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.653;DP=169;Dels=0.00;FS=1.198;HaplotypeScore=3.9039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=8.78;ReadPosRankSum=2.212;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,83:169:99:1513,0,1880 chrXV 1032122 . C T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.206;DP=142;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.129;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,74:142:99:1497,0,1438 chrXV 1032162 . T C 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.249;DP=142;Dels=0.00;FS=5.563;HaplotypeScore=2.6487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.837;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1351,0,1576 chrXV 1032200 . C T 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.239;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.187;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1388,0,1317 chrXV 1032434 . T G 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.242;DP=135;Dels=0.00;FS=4.094;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.327;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1296,0,1440 chrXV 1032536 . C A 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.742;DP=131;Dels=0.00;FS=1.421;HaplotypeScore=2.4900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.834;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1084,0,1496 chrXV 1032998 . G A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.473;DP=137;Dels=0.00;FS=3.168;HaplotypeScore=4.5845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.749;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1616,0,865 chrXV 1033339 . C G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.304;DP=110;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.646;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1156,0,973 chrXV 1033361 . A T 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;DP=100;Dels=0.00;FS=6.530;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.038;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1100,0,1040 chrXV 1033381 . C T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.529;DP=111;Dels=0.00;FS=5.921;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1141,0,1162 chrXV 1033439 . T G 994.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.838;DP=117;Dels=0.00;FS=3.891;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1024,0,1389 chrXV 1033446 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.512;DP=122;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.551;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1149,0,1361 chrXV 1034108 . G T 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;DP=130;Dels=0.00;FS=8.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.300;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1467,0,1303 chrXV 1034149 . G C 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;DP=166;Dels=0.00;FS=10.548;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=10.14;ReadPosRankSum=-2.429;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,89:166:99:1713,0,1584 chrXV 1034515 . G A 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.000;DP=113;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.962;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1283,0,1176 chrXV 1034658 . T G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.881;DP=129;Dels=0.01;FS=3.366;HaplotypeScore=24.4806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1188,0,1432 chrXV 1034876 . G A 1563.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.798;DP=112;Dels=0.00;FS=2.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=2.329;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.412;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,70:112:99:1593,0,771 chrXV 1035275 . A G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.733;DP=132;Dels=0.00;FS=3.319;HaplotypeScore=5.5008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.256;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:132:99:1375,0,1351 chrXV 1035304 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.669;DP=133;Dels=0.00;FS=6.734;HaplotypeScore=4.7261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.583;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1485,0,1374 chrXV 1035608 . G A 3569.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.753e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3569,349,0 chrXV 1035923 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.347;DP=143;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.116;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1162,0,1796 chrXV 1036082 . C T 1618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.873;DP=144;Dels=0.00;FS=4.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.431;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1648,0,1358 chrXV 1036163 . T C 107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.294;DP=179;Dels=0.01;FS=15.198;HaplotypeScore=19.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=0.60;ReadPosRankSum=-0.362;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,75:178:99:137,0,2352 chrXV 1036343 . A G 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.087;DP=134;Dels=0.00;FS=5.431;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.929;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1233,0,1591 chrXV 1036829 . C T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.998;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=1;MQRankSum=0.339;QD=10.48;ReadPosRankSum=1.456;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1497,0,1363 chrXV 1037510 . A G 747.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.759;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=28.5586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.90;MQ0=0;MQRankSum=-6.272;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,44:114:99:777,0,1371 chrXV 1037514 . A C 2389 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=36.4900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=21.72;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:110:99:2422,255,0 chrXV 1037520 . T C 307.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.257;DP=110;Dels=0.00;FS=9.823;HaplotypeScore=26.8058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=-6.745;QD=2.79;ReadPosRankSum=2.843;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:337,0,1642 chrXV 1037522 . A C 206.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.918;DP=110;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=22.8480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=-6.515;QD=1.87;ReadPosRankSum=4.140;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,27:110:99:236,0,1671 chrXV 1037523 . T C 191.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.718;DP=110;Dels=0.00;FS=9.823;HaplotypeScore=22.8480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=-6.854;QD=1.74;ReadPosRankSum=2.336;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:221,0,1647 chrXV 1037526 . T C 163.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.450;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.8540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQ0=0;MQRankSum=-6.941;QD=1.63;ReadPosRankSum=4.208;SB=-2.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:100:99:193,0,1524 chrXV 1037595 . G C 810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.184;DP=123;Dels=0.00;FS=10.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=6.59;ReadPosRankSum=-1.091;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:840,0,1528 chrXV 1037678 . C T 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;DP=138;Dels=0.00;FS=9.221;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.330;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:138:99:1311,0,1526 chrXV 1037757 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.326;DP=131;Dels=0.00;FS=4.157;HaplotypeScore=4.3229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.735;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1168,0,1479 chrXV 1038438 . A T 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;DP=138;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.454;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.711;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:1597,0,1282 chrXV 1038535 . C T 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.578;DP=117;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=2.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.864;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1036,0,1277 chrXV 1038607 . C A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.536;DP=112;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=2.357;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1187,0,1200 chrXV 1038675 . T C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.824;DP=136;Dels=0.00;FS=6.319;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1424,0,1331 chrXV 1038711 . T C 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.679;DP=155;Dels=0.00;FS=8.238;HaplotypeScore=4.9078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.915;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1722,0,1477 chrXV 1038714 . A G 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.226;DP=140;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=4.7049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1520,0,1469 chrXV 1038761 . G A 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.724;DP=139;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.571;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1678,0,1078 chrXV 1038822 . G T 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.225;DP=112;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1207,0,1162 chrXV 1038866 . G A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.062;DP=118;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.043;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1186,0,1300 chrXV 1039264 . C T 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.943;DP=128;Dels=0.00;FS=1.470;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=-0.842;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.117;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1084,0,1273 chrXV 1039474 . T C 4282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4282,427,0 chrXV 1039520 . T A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.777;DP=153;Dels=0.00;FS=5.193;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,65:153:99:1353,0,1962 chrXV 1039586 . A G 4202.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=23.88;SB=-1.894e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4202,447,0 chrXV 1039786 . A G 3455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.07;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:141:99:3455,360,0 chrXV 1043118 . T C 3003 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3036,324,0 chrXV 1044933 . G A 3528.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7711;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3528,352,0 chrXV 1045139 . C T 4085.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.02;SB=-2.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4085,400,0 chrXV 1045703 . A C 3775.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=26.40;SB=-1.759e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3775,376,0 chrXV 1046300 . T C 3346.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.113e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3346,372,0 chrXV 1048800 . C T 4137.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3204;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.574e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:4137,421,0 chrXV 1049615 . G A 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3487,360,0 chrXV 1050023 . C T 3052 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9853;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3085,312,0 chrXV 1053754 . A T 2422 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2455,246,0 chrXV 1053855 . T C 2116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.51;SB=-8.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2149,228,0 chrXV 1054666 . C T 2806 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2839,285,0 chrXV 1057321 . C T 3199 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.530e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3232,337,0 chrXV 1058834 . A G 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.28;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2789,297,0 chrXV 1060135 . C T 2858 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2891,291,0 chrXV 1063895 . C T 3833.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9600;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.219e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3833,385,0 chrXV 1063956 . T C 3347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.284e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3347,339,0 chrXV 1064573 . T G 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.840e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3608,390,0 chrXV 1065772 . T C 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.24;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2821,306,0 chrXV 1069278 . G A 3410.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3410,340,0 chrXV 1070618 . G C 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;DP=166;Dels=0.00;FS=80.030;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.42;MQ0=0;MQRankSum=-7.337;QD=0.13;ReadPosRankSum=1.904;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,28:166:52:52,0,3278 chrXV 1070622 . G A 21.04 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.420;DP=178;Dels=0.00;FS=67.466;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQ0=0;MQRankSum=-7.614;QD=0.12;ReadPosRankSum=1.816;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,29:178:51:51,0,3479 chrXV 1070645 . C G 28.01 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;DP=152;Dels=0.00;FS=40.464;HaplotypeScore=1.5650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-7.412;QD=0.18;ReadPosRankSum=-2.127;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,28:152:58:58,0,2945 chrXV 1070698 . A G 89.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.598;DP=169;Dels=0.00;FS=43.639;HaplotypeScore=5.3443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQ0=0;MQRankSum=-8.901;QD=0.53;ReadPosRankSum=0.050;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,33:169:99:119,0,3127 chrXV 1070724 . A C 77.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.068;DP=151;Dels=0.00;FS=42.867;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQ0=0;MQRankSum=-8.467;QD=0.51;ReadPosRankSum=-1.756;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,30:151:99:107,0,2838 chrXV 1070796 . G A 357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.343;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.67;MQ0=0;MQRankSum=-5.170;QD=2.59;ReadPosRankSum=-1.498;SB=-1.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,35:138:99:387,0,2187 chrXV 1070806 . G A 628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.594;DP=157;Dels=0.00;FS=4.221;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.62;MQ0=0;MQRankSum=-6.143;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,49:157:99:658,0,2316 chrXV 1070807 . A G 645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.617;DP=157;Dels=0.00;FS=2.231;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.62;MQ0=0;MQRankSum=-6.535;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.831;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,51:157:99:675,0,2498 chrXV 1070834 . G A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.153;DP=192;Dels=0.00;FS=16.991;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.29;MQ0=0;MQRankSum=-6.760;QD=6.68;ReadPosRankSum=2.125;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,74:192:99:1312,0,2407 chrXV 1070850 . C A 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.963;DP=191;Dels=0.00;FS=22.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.48;MQ0=0;MQRankSum=-6.243;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.665;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,85:191:99:1610,0,2300 chrXV 1070955 . C G 583.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.945;DP=211;Dels=0.00;FS=67.578;HaplotypeScore=1.8773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.19;MQ0=0;MQRankSum=-7.394;QD=2.76;ReadPosRankSum=3.085;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,68:211:99:613,0,3178 chrXV 1070965 . G T 571.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.902;DP=209;Dels=0.00;FS=77.560;HaplotypeScore=3.6057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.60;MQ0=0;MQRankSum=-6.684;QD=2.73;ReadPosRankSum=2.648;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,63:209:99:601,0,3304 chrXV 1071005 . G T 31.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.950;DP=199;Dels=0.00;FS=87.562;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=-6.984;QD=0.16;ReadPosRankSum=-3.428;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,37:199:61:61,0,3664 chrXV 1072171 . A C 84.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.318;DP=216;Dels=0.00;FS=29.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.37;MQ0=132;MQRankSum=2.279;QD=0.39;ReadPosRankSum=-1.418;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,53:216:99:114,0,826 chrXV 1072243 . C T 637.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.604;DP=221;Dels=0.00;FS=38.985;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.18;MQ0=150;MQRankSum=2.802;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.566;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,86:221:99:667,0,472 chrXV 1072515 . T C 493.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.824;DP=174;Dels=0.00;FS=1.585;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.21;MQ0=39;MQRankSum=0.712;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,39:174:99:523,0,2221 chrXV 1072891 . G A 80.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.74;MQ0=8;QD=6.71;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:12:113,12,0 chrXV 1073052 . C T 100.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.55;MQ0=14;QD=5.28;SB=-5.230e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:15:133,15,0 chrXV 1074569 . G A 49.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.87;MQ0=51;QD=0.93;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:9:82,9,0 chrXV 1074669 . C A,G 709.01 filter AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=28.82;MQ0=10;QD=15.76;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,14,31:45:99:769,517,487,252,0,189 chrXV 1074671 . T C 755 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.68;MQ0=8;QD=18.87;SB=-2.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:84:788,84,0 chrXV 1074706 . C T 117.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.383;DP=51;Dels=0.00;FS=4.028;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.37;MQ0=11;MQRankSum=-2.317;QD=2.29;ReadPosRankSum=-1.727;SB=-4.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:147,0,621 chrXV 1074721 . A G 851 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.95;MQ0=8;QD=21.27;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:96:884,96,0 chrXV 1074725 . A G 818 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.95;MQ0=8;QD=20.45;SB=-1.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:93:851,93,0 chrXV 1074746 . C T 526 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.52;MQ0=10;QD=17.53;SB=-8.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:60:559,60,0 chrXV 1074764 . C T 226.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.970;DP=35;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.84;MQ0=15;MQRankSum=0.347;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.042;SB=-1.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:256,0,167 chrXV 1074803 . A G 363 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.88;MQ0=10;QD=14.52;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:45:396,45,0 chrXV 1074980 . C A 125.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.923;DP=160;Dels=0.00;FS=70.346;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.97;MQ0=92;MQRankSum=-0.817;QD=0.78;ReadPosRankSum=-0.687;SB=-8.884e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,50:160:99:155,0,944 chrXV 1075116 . G C 731.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.699;DP=151;Dels=0.00;FS=1.727;HaplotypeScore=7.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.44;MQ0=11;MQRankSum=2.490;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,43:151:99:761,0,2028 chrXV 1075223 . C T 1535.08 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.720;DP=114;Dels=0.00;FS=22.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.05;MQ0=11;MQRankSum=5.644;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.993;SB=-6.791e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,86:114:20:1568,20,0 chrXV 1075226 . C T 1660 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.786;DP=108;Dels=0.00;FS=27.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.97;MQ0=11;MQRankSum=5.540;QD=15.37;ReadPosRankSum=1.686;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,82:108:73:1693,73,0 chrXV 1075230 . C T 1570 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.233;DP=108;Dels=0.00;FS=26.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.84;MQ0=12;MQRankSum=5.670;QD=14.54;ReadPosRankSum=2.070;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,80:108:45:1603,45,0 chrXV 1075231 . A G 1527 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.437;DP=111;Dels=0.00;FS=26.220;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.42;MQ0=13;MQRankSum=5.610;QD=13.76;ReadPosRankSum=2.104;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,81:111:48:1560,48,0 chrXV 1075245 . A G 2057 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.07;MQ0=19;QD=16.72;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:2090,222,0 chrXV 1075409 . T G 372.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.141;DP=192;Dels=0.00;FS=64.889;HaplotypeScore=4.8376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.84;MQ0=7;MQRankSum=-2.333;QD=1.94;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,41:192:99:402,0,3401 chrXV 1075521 . A G 4568.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.93;MQ0=34;QD=20.58;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,222:222:99:4568,504,0 chrXV 1075581 . T C 9455.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=407;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.61;MQ0=7;QD=23.23;SB=-5.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,407:407:99:9455,940,0 chrXV 1075593 . C G 8766.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=402;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.61;MQ0=6;QD=21.81;SB=-4.672e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,402:402:99:8766,898,0 chrXV 1075610 . T C 7681.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=357;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.88;MQ0=0;QD=21.52;SB=-3.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,357:357:99:7681,825,0 chrXV 1075718 . G T 543 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.88;MQ0=5;QD=11.31;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:60:576,60,0 chrXV 1075738 . C T 53.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.11;MQ0=4;QD=1.64;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:9:86,9,0 chrXV 1075768 . C A 53.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.50;MQ0=18;MQRankSum=1.528;QD=0.71;ReadPosRankSum=0.425;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,10:75:83:83,0,520 chrXV 1075901 . A G 1469 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.94;MQ0=0;QD=25.33;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:1502,168,0 chrXV 1076094 . C A 339 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.88;MQ0=7;QD=12.56;SB=-7.338e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:39:372,39,0 chrXV 1076122 . A G 189.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.75;MQ0=0;QD=14.54;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:24:222,24,0 chrXV 1076193 . G T 12.27 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.61;MQ0=36;MQRankSum=1.067;QD=0.28;ReadPosRankSum=0.572;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,9:44:42:42,0,70 chrXV 1077340 . A G 110.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.312;DP=250;Dels=0.00;FS=1.048;HaplotypeScore=7.8454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.77;MQ0=93;MQRankSum=-0.593;QD=0.44;ReadPosRankSum=0.082;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,38:250:99:140,0,2640 chrXV 1077385 . C T 855.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.715;DP=266;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.58;MQ0=117;MQRankSum=0.618;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.729;SB=-2.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,99:266:99:885,0,1699 chrXV 1077431 . T C 718 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.36;MQ0=118;QD=4.57;SB=-2.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:84:751,84,0 chrXV 1077750 . A G 629.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.832;DP=359;Dels=0.00;FS=0.540;HaplotypeScore=5.2744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.82;MQ0=21;MQRankSum=0.826;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.462;SB=-2.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,62:359:99:659,0,6153 chrXV 1077929 . T G 626.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.768;DP=269;Dels=0.00;FS=1.381;HaplotypeScore=92.4745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.80;MQ0=5;MQRankSum=-0.190;QD=2.33;ReadPosRankSum=-4.259;SB=-1.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,57:269:99:656,0,4346 chrXV 1077970 . A T 43.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.442;DP=318;Dels=0.01;FS=337.743;HaplotypeScore=46.5129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.04;MQ0=6;MQRankSum=-2.282;QD=0.14;ReadPosRankSum=-11.101;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,66:316:73:73,0,1564 chrXV 1077971 . A T 63.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;DP=297;Dels=0.01;FS=292.095;HaplotypeScore=46.5129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.77;MQ0=6;MQRankSum=-2.830;QD=0.21;ReadPosRankSum=-9.978;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,52:295:93:93,0,1242 chrXV 1078198 . T A 1302.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;DP=170;Dels=0.01;FS=3.711;HaplotypeScore=28.8472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.58;MQ0=10;MQRankSum=0.593;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.444;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,80:169:99:1332,0,1556 chrXV 1078360 . A G 1156 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.35;MQ0=4;QD=12.70;SB=-2.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:1189,129,0 chrXV 1078444 . C T 201.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.925;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.10;MQ0=46;MQRankSum=-1.526;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,39:81:99:231,0,305 chrXV 1078509 . A G 265 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.94;MQ0=37;QD=4.49;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:33:298,33,0 chrXV 1078930 . G A 266.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.222;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.61;MQ0=34;MQRankSum=0.544;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,25:119:99:296,0,1491 chrXV 1078958 . C T 2381 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.90;MQ0=8;QD=23.81;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:100:99:2414,258,0 chrXV 1078971 . G A 242.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.892;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.49;MQ0=17;MQRankSum=0.609;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.642;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,23:101:99:272,0,1507 chrXV 1079195 . C T 2207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.640;DP=263;Dels=0.00;FS=3.655;HaplotypeScore=3.3989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.400;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,116:263:99:2237,0,3087 chrXV 1079490 . T C 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.179;DP=348;Dels=0.00;FS=0.980;HaplotypeScore=184.7659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.88;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.335;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,79:348:99:1638,0,1760 chrXV 1079606 . G T 149.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.379;DP=199;Dels=0.00;FS=1.060;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.81;MQ0=82;MQRankSum=0.538;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-9.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,38:199:99:179,0,2046 chrXV 1079730 . G A 138.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.650;DP=193;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.65;MQ0=118;MQRankSum=-0.591;QD=0.72;ReadPosRankSum=1.095;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,39:193:99:168,0,1232 chrXV 1079816 . G T 709 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.81;MQ0=98;QD=5.50;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:78:742,78,0 chrXV 1079855 . G C 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.83;MQ0=96;MQRankSum=-0.753;QD=0.16;ReadPosRankSum=0.336;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,28:138:52:52,0,747 chrXV 1079904 . T C 1308 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.38;MQ0=122;QD=7.43;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:1341,147,0 chrXV 1080001 . A G 22.03 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.023;DP=191;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.90;MQ0=146;MQRankSum=0.282;QD=0.12;ReadPosRankSum=1.440;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,32:191:52:52,0,733 chrXV 1080257 . G A 15.16 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.82;MQ0=85;MQRankSum=-0.736;QD=0.17;ReadPosRankSum=0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:20:45,0,20 chrXV 1091079 . C G 16.16 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=5.98;MQ0=77;MQRankSum=-0.742;QD=0.19;ReadPosRankSum=0.742;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,25:84:17:46,0,17 chrXV 1091190 . G A 108.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.62;MQ0=79;MQRankSum=1.692;QD=1.07;ReadPosRankSum=2.679;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,23:101:99:138,0,210 chrXV 1091240 . T A 283.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;DP=81;Dels=0.00;FS=5.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.37;MQ0=58;MQRankSum=0.945;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.035;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,35:81:52:313,0,52 chrXV 1091241 . A G 278.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;DP=78;Dels=0.00;FS=5.679;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.68;MQ0=55;MQRankSum=0.805;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.455;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:50:308,0,50 chrXV 1091267 . G A 430 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.53;MQ0=23;QD=9.56;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:48:463,48,0 chrXVI 6103 . T C 24.78 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.50;MQ0=81;QD=0.30;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:77,6:83:6:56,6,0 chrXVI 6850 . G T 55.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=9;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.31;MQ0=2;MQRankSum=1.754;QD=6.22;ReadPosRankSum=-1.754;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,4:9:9:88,9,0 chrXVI 6879 . T C 56.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.18;MQ0=4;QD=5.18;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:89,9,0 chrXVI 9183 . C G 109.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.67;MQ0=82;QD=1.20;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,76:91:15:142,15,0 chrXVI 9344 . G A 100.52 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.25;MQ0=67;MQRankSum=-0.158;QD=1.29;ReadPosRankSum=1.423;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:6:130,0,6 chrXVI 9535 . A G 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.909;DP=160;Dels=0.00;FS=13.051;HaplotypeScore=9.6505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.68;MQ0=61;MQRankSum=-2.439;QD=0.11;ReadPosRankSum=-1.643;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,5:160:47:47,0,108 chrXVI 11402 . G C 425 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.68;MQ0=102;QD=3.60;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:101,16:118:48:458,48,0 chrXVI 11491 . C T 146.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.65;MQ0=108;QD=1.28;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:102,12:114:18:179,18,0 chrXVI 11526 . G A 119.26 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.53;MQ0=109;QD=1.03;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:101,15:116:15:152,15,0 chrXVI 11556 . G A 260 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.45;MQ0=91;QD=2.50;SB=-1.529e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:84,20:104:30:293,30,0 chrXVI 11565 . G C 254 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.67;MQ0=82;QD=2.70;SB=-1.149e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:77,17:94:30:287,30,0 chrXVI 11566 . G A 258 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.79;MQ0=80;QD=2.80;SB=-1.179e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:75,17:92:30:291,30,0 chrXVI 11741 . G A 1045 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.70;MQ0=4;QD=24.88;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1078,108,0 chrXVI 11748 . C A 921 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.65;MQ0=2;QD=25.58;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:96:954,96,0 chrXVI 11749 . T G 868 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.80;MQ0=2;QD=24.80;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:93:901,93,0 chrXVI 12701 . G A 359.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.802;DP=257;Dels=0.00;FS=1.525;HaplotypeScore=2.9110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.51;MQ0=83;MQRankSum=-5.796;QD=1.40;ReadPosRankSum=-2.003;SB=-3.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,71:257:99:389,0,2697 chrXVI 12908 . T C 121.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;DP=50;Dels=0.00;FS=1.744;HaplotypeScore=8.5472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.65;MQ0=22;MQRankSum=2.161;QD=2.42;ReadPosRankSum=-3.484;SB=-4.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,9:50:99:151,0,297 chrXVI 12999 . A G 173.03 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.30;MQ0=7;QD=7.87;SB=-2.497e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:24:206,24,0 chrXVI 13064 . T C 120.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.473;DP=65;Dels=0.00;FS=2.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.05;MQ0=30;MQRankSum=2.501;QD=1.85;ReadPosRankSum=1.661;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:150,0,488 chrXVI 13130 . C G 420 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.90;MQ0=3;QD=17.50;SB=-6.653e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:48:453,48,0 chrXVI 13133 . T C 125.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.76;MQ0=3;MQRankSum=2.381;QD=5.44;ReadPosRankSum=2.230;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:155,0,211 chrXVI 13200 . G A 262 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.13;MQ0=4;QD=12.48;SB=-5.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:30:295,30,0 chrXVI 13203 . C T 283 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.327;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.49;MQ0=4;MQRankSum=1.531;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.714;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:33:316,33,0 chrXVI 13207 . A G 261 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.44;MQ0=5;QD=14.50;SB=-5.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:30:294,30,0 chrXVI 13243 . A G 51.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.09;MQ0=4;QD=5.77;SB=-7.155e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:84,9,0 chrXVI 13304 . C G 137.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.69;MQ0=5;QD=9.80;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:14:18:170,18,0 chrXVI 13728 . C T 74.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.46;MQ0=123;QD=0.57;SB=-5.255e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:12:107,12,0 chrXVI 13754 . G A 51.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;DP=161;Dels=0.00;FS=11.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.82;MQ0=141;MQRankSum=-0.760;QD=0.32;ReadPosRankSum=-1.444;SB=-6.088e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,62:161:60:81,0,60 chrXVI 13799 . T C 54.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.391;DP=124;Dels=0.00;FS=4.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.41;MQ0=101;MQRankSum=2.124;QD=0.44;ReadPosRankSum=-2.124;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,15:124:84:84,0,86 chrXVI 14361 . C T 1203.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;DP=356;Dels=0.00;FS=1.666;HaplotypeScore=130.6881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.96;MQ0=51;MQRankSum=-3.910;QD=3.38;ReadPosRankSum=3.611;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,103:356:99:1233,0,5106 chrXVI 14366 . C T 4771.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.801;DP=388;Dels=0.00;FS=0.449;HaplotypeScore=142.6411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.02;MQ0=50;MQRankSum=-1.865;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,257:388:99:4771,0,2033 chrXVI 14369 . G A 403.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.317;DP=363;Dels=0.00;FS=1.167;HaplotypeScore=141.8398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.30;MQ0=28;MQRankSum=-3.036;QD=1.11;ReadPosRankSum=0.706;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,61:363:99:433,0,5959 chrXVI 14379 . A G 4295.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.683;DP=325;Dels=0.00;FS=2.781;HaplotypeScore=56.5031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.18;MQ0=20;MQRankSum=-2.043;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,218:325:99:4295,0,1938 chrXVI 14667 . G T 4750.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.034;DP=415;Dels=0.00;FS=4.264;HaplotypeScore=17.4755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.122;SB=-2.095e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,214:415:99:4750,0,4389 chrXVI 14802 . A G 331.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.401;DP=264;Dels=0.00;FS=2.258;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.75;MQ0=38;MQRankSum=0.352;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.222;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,46:264:99:361,0,4377 chrXVI 14828 . T A 5592.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.717;DP=274;Dels=0.00;FS=3.205;HaplotypeScore=2.7738;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.54;MQ0=46;MQRankSum=-0.122;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.942;SB=-2.885e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,273:274:99:5592,571,0 chrXVI 14947 . C A 407.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.409;DP=416;Dels=0.00;FS=3.447;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.95;MQ0=34;MQRankSum=0.859;QD=0.98;ReadPosRankSum=2.324;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:360,56:416:99:437,0,7720 chrXVI 15039 . G T 5931.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.352;DP=386;Dels=0.00;FS=2.959;HaplotypeScore=6.1871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.88;MQ0=12;MQRankSum=-2.645;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.264;SB=-3.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,268:386:99:5931,0,2228 chrXVI 15343 . T C 136.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.976;DP=255;Dels=0.00;FS=3.682;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.55;MQ0=46;MQRankSum=-0.038;QD=0.53;ReadPosRankSum=0.799;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,38:255:99:166,0,3360 chrXVI 15372 . G T 293.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.510;DP=221;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.51;MQ0=23;MQRankSum=-0.955;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.888;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,39:221:99:323,0,3411 chrXVI 15669 . C A 106.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.625;DP=197;Dels=0.00;FS=26.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.41;MQ0=10;MQRankSum=-3.088;QD=0.54;ReadPosRankSum=0.534;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,39:197:99:136,0,3287 chrXVI 15762 . C A 2558 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.36;MQ0=54;QD=14.37;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:2591,264,0 chrXVI 16068 . A T 395.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;DP=231;Dels=0.00;FS=15.793;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.46;MQ0=79;MQRankSum=0.558;QD=1.71;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-9.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,46:231:99:425,0,2523 chrXVI 16098 . G T 1184.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.930;DP=243;Dels=0.00;FS=26.483;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.88;MQ0=87;MQRankSum=-0.339;QD=4.87;ReadPosRankSum=1.702;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,91:243:99:1214,0,1575 chrXVI 16314 . G A 2055.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.645;DP=348;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=5.5715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.51;MQ0=9;MQRankSum=2.826;QD=5.91;ReadPosRankSum=2.288;SB=-1.010e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,116:348:99:2085,0,5128 chrXVI 16412 . T C 1116.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.095;DP=318;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.3774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.97;MQ0=14;MQRankSum=-1.885;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.503;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,85:318:99:1146,0,5047 chrXVI 16482 . G A 1397.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.987;DP=265;Dels=0.00;FS=5.856;HaplotypeScore=3.9909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.73;MQ0=40;MQRankSum=2.227;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.426;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,91:265:99:1427,0,2778 chrXVI 16500 . A G 4111.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.5220;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.93;MQ0=43;QD=17.87;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,229:230:99:4111,456,0 chrXVI 16802 . A C 2539.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-16.249;DP=426;Dels=0.00;FS=5.104;HaplotypeScore=5.3926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=2.465;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.116;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,147:426:99:2569,0,6548 chrXVI 16827 . T A 901.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.105;DP=455;Dels=0.00;FS=0.964;HaplotypeScore=11.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.823;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:379,76:455:99:931,0,9203 chrXVI 16950 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;DP=262;Dels=0.00;FS=1.608;HaplotypeScore=37.4078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=2;MQRankSum=3.051;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,92:261:99:1401,0,2518 chrXVI 16980 . T A 4234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.016;DP=238;Dels=0.00;FS=1.630;HaplotypeScore=15.5233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=1;MQRankSum=1.038;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.808;SB=-9.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,198:238:99:4234,0,312 chrXVI 17205 . A T 652.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.842;DP=374;Dels=0.00;FS=2.551;HaplotypeScore=4.4011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=1.74;ReadPosRankSum=-1.721;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:312,61:374:99:682,0,7874 chrXVI 17345 . G A 3898.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.111;DP=374;Dels=0.00;FS=1.214;HaplotypeScore=9.6133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.145;SB=-2.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,196:374:99:3898,0,3879 chrXVI 17412 . A T 4378.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.517;DP=398;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.258;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,205:398:99:4378,0,4287 chrXVI 17634 . T G 10330.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.501;DP=388;Dels=0.00;FS=6.733;HaplotypeScore=13.8882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.02;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=26.62;ReadPosRankSum=2.026;SB=-5.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,386:388:99:10330,993,0 chrXVI 17787 . C T 7195.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.761;DP=356;Dels=0.00;FS=5.557;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.02;MQ0=16;MQRankSum=-2.983;QD=20.21;ReadPosRankSum=1.010;SB=-3.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,307:356:99:7195,0,350 chrXVI 18543 . C T 193.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.45;MQ0=136;MQRankSum=1.092;QD=1.10;ReadPosRankSum=-0.213;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,41:176:99:223,0,561 chrXVI 18942 . C G 368 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.66;MQ0=3;QD=17.52;SB=-8.700e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:21:42:401,42,0 chrXVI 19105 . G A 422.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.817;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.07;MQ0=110;MQRankSum=0.347;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.109;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,45:186:99:452,0,818 chrXVI 19196 . G A 682.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.781;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.13;MQ0=76;MQRankSum=0.377;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,53:165:99:712,0,947 chrXVI 19271 . A G 397.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.7439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.16;MQ0=39;MQRankSum=-0.243;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.896;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,32:105:99:427,0,901 chrXVI 19275 . A G 408.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.7277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.16;MQ0=37;MQRankSum=1.442;QD=3.43;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,39:119:99:438,0,1189 chrXVI 19354 . C T 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.729;DP=177;Dels=0.00;FS=2.787;HaplotypeScore=9.7494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.11;MQ0=2;MQRankSum=-0.481;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.928;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,61:177:99:1039,0,2652 chrXVI 19476 . G C 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.561;DP=189;Dels=0.00;FS=2.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.453;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,72:189:99:1411,0,2575 chrXVI 19555 . G T 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.376;DP=221;Dels=0.00;FS=4.075;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,77:221:99:1448,0,3100 chrXVI 19561 . G T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=208;Dels=0.00;FS=2.584;HaplotypeScore=1.7753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.04;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,73:208:99:1354,0,3085 chrXVI 19582 . C T 5189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.483;DP=195;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.11;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=26.61;ReadPosRankSum=0.222;SB=-2.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,194:195:99:5189,483,0 chrXVI 19918 . T C 407.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.451;DP=207;Dels=0.00;FS=18.772;HaplotypeScore=5.1957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.976;QD=1.97;ReadPosRankSum=3.493;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,40:207:99:437,0,3938 chrXVI 19964 . T C 736.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.594;DP=174;Dels=0.00;FS=57.169;HaplotypeScore=105.3982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.409;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.535;SB=-1.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,52:174:99:766,0,2339 chrXVI 19968 . G A 739.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.661;DP=164;Dels=0.00;FS=3.104;HaplotypeScore=51.4748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=4.51;ReadPosRankSum=1.189;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,49:164:99:769,0,2206 chrXVI 19969 . T A 741.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.172;DP=160;Dels=0.00;FS=2.197;HaplotypeScore=46.7198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQ0=0;MQRankSum=3.184;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.095;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,49:160:99:771,0,2124 chrXVI 20018 . C G 517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;DP=153;Dels=0.00;FS=13.907;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=-3.575;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.728;SB=-1.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,38:153:99:547,0,2562 chrXVI 20036 . G T 609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.754;DP=196;Dels=0.00;FS=4.140;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQ0=0;MQRankSum=-4.912;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.432;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,44:196:99:639,0,3579 chrXVI 20054 . T G 522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.098;DP=220;Dels=0.00;FS=4.132;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=-5.443;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.528;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,45:220:99:552,0,4195 chrXVI 20075 . T G 323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.858;DP=222;Dels=0.00;FS=2.383;HaplotypeScore=3.6036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-4.256;QD=1.45;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-8.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,39:222:99:353,0,4561 chrXVI 20093 . G C 270.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=228;Dels=0.00;FS=7.695;HaplotypeScore=1.9048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQ0=0;MQRankSum=-6.295;QD=1.18;ReadPosRankSum=-1.421;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,38:228:99:300,0,4648 chrXVI 20127 . T A 182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.031;DP=231;Dels=0.00;FS=1.637;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-7.483;QD=0.79;ReadPosRankSum=0.060;SB=-1.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,33:231:99:212,0,4886 chrXVI 20134 . C T 149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.049;DP=205;Dels=0.00;FS=1.705;HaplotypeScore=2.9032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-7.630;QD=0.73;ReadPosRankSum=-0.498;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,29:205:99:179,0,4027 chrXVI 20140 . G T 38.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.716;DP=229;Dels=0.00;FS=3.649;HaplotypeScore=4.8884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-8.792;QD=0.17;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,31:229:68:68,0,4793 chrXVI 20220 . A G 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.648;DP=283;Dels=0.00;FS=2.209;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=-3.546;QD=0.09;ReadPosRankSum=0.491;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,38:283:56:56,0,6066 chrXVI 20272 . C T 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.668;DP=278;Dels=0.00;FS=4.577;HaplotypeScore=10.9300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.552;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.772;SB=-1.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,58:278:99:795,0,5155 chrXVI 20283 . C T 815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.740;DP=249;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-3.109;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.171;SB=-2.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,56:249:99:845,0,4575 chrXVI 20295 . A G 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.629;DP=260;Dels=0.00;FS=1.263;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.164;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.788;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,60:260:99:915,0,4960 chrXVI 20347 . T C 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.660;DP=263;Dels=0.00;FS=0.538;HaplotypeScore=2.9063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.234;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.264;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,60:263:99:890,0,4902 chrXVI 20495 . G C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;DP=270;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.456;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,72:270:99:1205,0,4682 chrXVI 20668 . G A 6594.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=270;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=24.42;SB=-3.292e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,269:270:99:6594,649,0 chrXVI 20670 . A C 4119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.458;DP=258;Dels=0.00;FS=6.261;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.577;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,196:258:99:4119,0,1103 chrXVI 20683 . A T 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=268;Dels=0.00;FS=5.225;HaplotypeScore=3.6195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=1.887;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.956;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,62:268:99:1041,0,5008 chrXVI 20725 . T C 2846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.063;DP=265;Dels=0.00;FS=2.049;HaplotypeScore=3.2938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=2.150;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,136:265:99:2876,0,2996 chrXVI 20774 . T A 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.107;DP=283;Dels=0.00;FS=6.523;HaplotypeScore=3.4291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,77:283:99:1328,0,5053 chrXVI 20793 . G T 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.043;DP=269;Dels=0.00;FS=6.974;HaplotypeScore=2.6141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.666;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,67:269:99:1090,0,4808 chrXVI 20853 . C T 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.052;DP=266;Dels=0.00;FS=0.509;HaplotypeScore=9.0672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.360;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.464;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,77:266:99:1409,0,4500 chrXVI 20867 . T C 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.890;DP=234;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=53.6717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-6.079;QD=3.37;ReadPosRankSum=2.949;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,57:234:99:819,0,4360 chrXVI 20903 . T A 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;DP=206;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=-6.264;QD=3.77;ReadPosRankSum=-3.094;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,49:206:99:806,0,3851 chrXVI 20916 . T C 520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.763;DP=215;Dels=0.00;FS=1.358;HaplotypeScore=3.7180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-7.542;QD=2.42;ReadPosRankSum=-3.408;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,45:215:99:550,0,4195 chrXVI 20924 . T C 147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.174;DP=217;Dels=0.00;FS=4.902;HaplotypeScore=7.6968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQ0=0;MQRankSum=-8.088;QD=0.68;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-6.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,32:217:99:177,0,4679 chrXVI 20927 . C T 232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.882;DP=212;Dels=0.00;FS=4.653;HaplotypeScore=3.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=-7.837;QD=1.09;ReadPosRankSum=-1.753;SB=-1.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,34:212:99:262,0,4255 chrXVI 20947 . C T 252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.726;DP=205;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=1;MQRankSum=-5.396;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.603;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,34:204:99:282,0,4045 chrXVI 20964 . G A 310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.155;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=1;MQRankSum=-4.189;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-2.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,31:171:99:340,0,3496 chrXVI 21007 . T C 716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.040;DP=231;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=1;MQRankSum=-4.835;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.601;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,51:231:99:746,0,4380 chrXVI 21048 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.051;DP=230;Dels=0.00;FS=1.193;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=-8.548;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.213;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,62:230:99:1139,0,4003 chrXVI 21070 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.707;DP=241;Dels=0.00;FS=1.912;HaplotypeScore=8.7224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=-8.824;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,65:241:99:1159,0,4392 chrXVI 21082 . G C 821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.170;DP=245;Dels=0.00;FS=7.879;HaplotypeScore=12.0097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.88;MQ0=0;MQRankSum=-9.901;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.362;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,58:245:99:851,0,4587 chrXVI 21094 . T C 880.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.463;DP=246;Dels=0.00;FS=15.847;HaplotypeScore=7.5788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.06;MQ0=0;MQRankSum=-11.578;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.210;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,61:246:99:910,0,4695 chrXVI 21096 . A G 883.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.937;DP=242;Dels=0.00;FS=12.903;HaplotypeScore=8.5704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQ0=0;MQRankSum=-11.612;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.324;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,60:242:99:913,0,4595 chrXVI 21102 . G A 901.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.911;DP=213;Dels=0.00;FS=13.097;HaplotypeScore=4.3198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=-11.111;QD=4.23;ReadPosRankSum=-1.032;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,60:213:99:931,0,3618 chrXVI 21105 . G T 889.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.568;DP=213;Dels=0.00;FS=11.779;HaplotypeScore=5.3064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=-11.277;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.017;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,59:213:99:919,0,3624 chrXVI 21112 . T C 773.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.254;DP=222;Dels=0.00;FS=7.676;HaplotypeScore=5.3612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.96;MQ0=0;MQRankSum=-10.489;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.211;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,59:222:99:803,0,4097 chrXVI 21163 . C T 791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.703;DP=273;Dels=0.00;FS=3.388;HaplotypeScore=6.7476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.790;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.245;SB=-3.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,62:272:99:821,0,4929 chrXVI 21172 . T A 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.930;DP=273;Dels=0.00;FS=3.401;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-3.888;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.027;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,60:273:99:842,0,5132 chrXVI 21201 . A G 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.896;DP=273;Dels=0.00;FS=6.158;HaplotypeScore=4.4545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,59:273:99:869,0,5201 chrXVI 21234 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.562;DP=257;Dels=0.00;FS=1.125;HaplotypeScore=4.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.259;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,72:257:99:1219,0,4510 chrXVI 21263 . T C 651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.929;DP=231;Dels=0.00;FS=2.007;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=-3.737;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.739;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,51:231:99:681,0,4465 chrXVI 21314 . C A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.084;DP=254;Dels=0.00;FS=8.373;HaplotypeScore=5.8287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=1;MQRankSum=-1.612;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.450;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,63:254:99:1075,0,4414 chrXVI 21346 . G A 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.834;DP=250;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=1;MQRankSum=-1.328;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.718;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,62:250:99:1058,0,4357 chrXVI 21363 . A T 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.523;DP=246;Dels=0.00;FS=5.232;HaplotypeScore=2.9497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=1;MQRankSum=-2.247;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.009;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,62:246:99:1072,0,4312 chrXVI 21507 . G A 649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.233;DP=212;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=3.06;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,48:211:99:679,0,4005 chrXVI 21518 . A G 700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.484;DP=223;Dels=0.00;FS=3.933;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=3.14;ReadPosRankSum=-2.196;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,56:223:99:730,0,4251 chrXVI 21542 . C T 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.054;DP=224;Dels=0.00;FS=0.563;HaplotypeScore=2.8863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.080;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,57:224:99:983,0,4074 chrXVI 21578 . G A 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.269;DP=277;Dels=0.00;FS=8.543;HaplotypeScore=5.6386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=3.493;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.206;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,59:277:99:899,0,4960 chrXVI 21603 . C T 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.514;DP=287;Dels=0.00;FS=2.298;HaplotypeScore=2.9011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.443;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,73:287:99:1216,0,4728 chrXVI 21607 . T C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.081;DP=299;Dels=0.00;FS=0.493;HaplotypeScore=7.8709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.934;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,72:299:99:1084,0,5383 chrXVI 21630 . T C 772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.201;DP=259;Dels=0.00;FS=2.591;HaplotypeScore=3.6527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.619;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,59:259:99:802,0,4815 chrXVI 21642 . T A 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.626;DP=256;Dels=0.00;FS=6.384;HaplotypeScore=8.6999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=3.31;ReadPosRankSum=-2.368;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,61:256:99:878,0,4679 chrXVI 21690 . A C 378.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.345;DP=255;Dels=0.00;FS=6.009;HaplotypeScore=7.2964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=1.48;ReadPosRankSum=2.475;SB=-1.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,44:255:99:408,0,5161 chrXVI 21691 . G A 374.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.962;DP=255;Dels=0.00;FS=6.009;HaplotypeScore=9.2631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=1.47;ReadPosRankSum=2.257;SB=-1.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,44:255:99:404,0,5003 chrXVI 21700 . C G 595.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.207;DP=254;Dels=0.00;FS=2.740;HaplotypeScore=5.4879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,51:254:99:625,0,4792 chrXVI 21726 . T C 2423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.176;DP=232;Dels=0.00;FS=1.014;HaplotypeScore=4.4628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.096;SB=-1.151e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,119:232:99:2453,0,2400 chrXVI 21806 . G T 703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.873;DP=250;Dels=0.00;FS=8.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.382;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,49:250:99:733,0,4860 chrXVI 21810 . C T 721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.419;DP=247;Dels=0.00;FS=11.027;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.044;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,49:247:99:751,0,4434 chrXVI 21824 . G C 820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.299;DP=281;Dels=0.00;FS=19.448;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=2.92;ReadPosRankSum=-1.073;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,67:280:99:850,0,5006 chrXVI 21870 . A G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.457;DP=260;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=56.2178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.072;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,75:260:99:1188,0,4622 chrXVI 21876 . A G 3208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.804;DP=286;Dels=0.00;FS=0.447;HaplotypeScore=57.1315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-1.161e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,144:286:99:3238,0,3244 chrXVI 21970 . C A 5842.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.509;DP=217;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6859;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=26.92;ReadPosRankSum=1.285;SB=-2.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,216:217:99:5842,543,0 chrXVI 22192 . C T 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.033;DP=266;Dels=0.00;FS=3.814;HaplotypeScore=5.9531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=5.85;ReadPosRankSum=-1.690;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,80:266:99:1587,0,4443 chrXVI 22304 . T A 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.541;DP=227;Dels=0.00;FS=1.849;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,65:227:99:1229,0,3968 chrXVI 22333 . A G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.290;DP=228;Dels=0.00;FS=4.419;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=4.18;ReadPosRankSum=-3.047;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,60:228:99:983,0,4032 chrXVI 22373 . A T 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.824;DP=214;Dels=0.00;FS=5.477;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=2.512;QD=4.17;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,58:214:99:922,0,3881 chrXVI 22388 . C T 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.654;DP=214;Dels=0.00;FS=6.401;HaplotypeScore=2.2931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.878;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,61:214:99:1100,0,3657 chrXVI 22477 . T C 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.932;DP=286;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=3.49;ReadPosRankSum=-1.731;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,71:286:99:1028,0,5199 chrXVI 22543 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.142;DP=258;Dels=0.00;FS=3.223;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.213;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,75:258:99:1338,0,4270 chrXVI 22544 . T C 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.691;DP=258;Dels=0.00;FS=2.427;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.149;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,76:258:99:1329,0,4476 chrXVI 22571 . A G 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.405;DP=263;Dels=0.00;FS=0.510;HaplotypeScore=8.9942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.964;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,71:263:99:1207,0,4772 chrXVI 22695 . T A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.117;DP=265;Dels=0.00;FS=9.129;HaplotypeScore=3.8449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=3;MQRankSum=0.666;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.129;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,72:265:99:1240,0,4096 chrXVI 22739 . G A 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.600;DP=245;Dels=0.00;FS=8.432;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=4.19;ReadPosRankSum=-1.216;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,63:245:99:1056,0,3956 chrXVI 22763 . C G 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.481;DP=270;Dels=0.00;FS=1.228;HaplotypeScore=3.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.993;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,56:270:99:779,0,5050 chrXVI 22824 . G A 7295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=257;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8452;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=28.39;SB=-2.781e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,257:257:99:7295,712,0 chrXVI 22826 . A T 600.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.062;DP=259;Dels=0.00;FS=7.213;HaplotypeScore=2.8452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.665;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,48:259:99:630,0,5216 chrXVI 22892 . T C 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.227;DP=215;Dels=0.00;FS=10.256;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,59:215:99:997,0,3881 chrXVI 23027 . T G 2570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.794;DP=275;Dels=0.00;FS=17.942;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.924;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,129:275:99:2600,0,3393 chrXVI 23051 . G A 1364.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.547;DP=252;Dels=0.00;FS=5.712;HaplotypeScore=8.4453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=0.113;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.826;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,74:252:99:1394,0,4183 chrXVI 23122 . A G 862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.189;DP=264;Dels=0.00;FS=4.076;HaplotypeScore=5.8648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.584;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.531;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,66:263:99:892,0,4931 chrXVI 23151 . C T 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.220;DP=260;Dels=0.00;FS=1.198;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.833;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.302;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,61:260:99:961,0,4694 chrXVI 23217 . G T 2535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.712;DP=248;Dels=0.00;FS=9.047;HaplotypeScore=4.1498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.891;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.745;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,124:248:99:2565,0,2564 chrXVI 23219 . A T 2668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.650;DP=256;Dels=0.00;FS=11.103;HaplotypeScore=4.1498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.356;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,130:256:99:2698,0,2734 chrXVI 23234 . A G 2608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.296;DP=276;Dels=0.00;FS=9.270;HaplotypeScore=3.3957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,138:276:99:2638,0,3027 chrXVI 23380 . T A 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.009;DP=310;Dels=0.00;FS=8.239;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.676;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,82:310:99:1320,0,5538 chrXVI 23426 . G A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.867;DP=270;Dels=0.00;FS=2.463;HaplotypeScore=2.5096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=5.20;ReadPosRankSum=-1.127;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,78:270:99:1433,0,4516 chrXVI 23456 . A G 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=284;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.132;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,87:284:99:1524,0,4697 chrXVI 23495 . G T 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.627;DP=284;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.3518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.372;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,90:284:99:1745,0,4266 chrXVI 23512 . G A 615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.969;DP=261;Dels=0.00;FS=3.738;HaplotypeScore=5.5411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-2.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,48:261:99:645,0,4991 chrXVI 23600 . T C 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.911;DP=251;Dels=0.00;FS=8.894;HaplotypeScore=3.7594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.021;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,75:251:99:1333,0,4229 chrXVI 23750 . C T 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.452;DP=292;Dels=0.00;FS=1.110;HaplotypeScore=2.5221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=0.631;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.865;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,61:292:99:910,0,5283 chrXVI 23779 . G A 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.682;DP=262;Dels=0.00;FS=5.566;HaplotypeScore=7.9197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=1;MQRankSum=0.101;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.713;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,54:262:99:787,0,4694 chrXVI 23815 . A T 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;DP=250;Dels=0.00;FS=6.790;HaplotypeScore=4.6576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=1;MQRankSum=-0.968;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.793;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,54:250:99:835,0,4810 chrXVI 23831 . A T 3103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.460;DP=302;Dels=0.00;FS=4.622;HaplotypeScore=9.6392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=0.835;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.329;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,154:302:99:3133,0,3173 chrXVI 23849 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.386;DP=303;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.988;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,86:303:99:1434,0,4837 chrXVI 23890 . T C 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.767;DP=316;Dels=0.00;FS=0.502;HaplotypeScore=2.7213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.610;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,76:316:99:1193,0,5784 chrXVI 23904 . G A 1614.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.810;DP=312;Dels=0.00;FS=2.942;HaplotypeScore=74.2040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=5.17;ReadPosRankSum=-2.204;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,88:312:99:1644,0,4971 chrXVI 23906 . A G 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;DP=312;Dels=0.00;FS=0.515;HaplotypeScore=73.2124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.727;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,72:312:99:1043,0,5641 chrXVI 23952 . G A 884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.711;DP=299;Dels=0.00;FS=4.145;HaplotypeScore=7.6662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,62:299:99:914,0,5673 chrXVI 24044 . G A 673.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.256;DP=281;Dels=0.00;FS=2.777;HaplotypeScore=6.6661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.281;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.473;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,54:281:99:703,0,4999 chrXVI 24047 . T C 708.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.795;DP=266;Dels=0.00;FS=1.211;HaplotypeScore=5.6745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.649;QD=2.66;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,56:266:99:738,0,5033 chrXVI 24050 . G A 762.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.592;DP=257;Dels=0.00;FS=3.506;HaplotypeScore=4.6010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.237;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,56:257:99:792,0,4617 chrXVI 24053 . A T 817.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;DP=242;Dels=0.00;FS=2.704;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-3.563;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,54:242:99:847,0,4404 chrXVI 24083 . A G 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.452;DP=252;Dels=0.00;FS=5.327;HaplotypeScore=49.2415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.723;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,61:252:99:908,0,4604 chrXVI 24087 . C A 693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.218;DP=250;Dels=0.00;FS=12.960;HaplotypeScore=52.2915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-7.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,52:250:99:723,0,4604 chrXVI 24125 . G A 713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.000;DP=234;Dels=0.00;FS=2.917;HaplotypeScore=3.5794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.147;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,51:234:99:743,0,4123 chrXVI 24338 . A G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.030;DP=262;Dels=0.00;FS=10.341;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,71:262:99:1061,0,4674 chrXVI 24363 . T G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.023;DP=289;Dels=0.00;FS=5.479;HaplotypeScore=1.9833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.601;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,76:289:99:1061,0,5207 chrXVI 24480 . T C 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.991;DP=270;Dels=0.00;FS=4.769;HaplotypeScore=6.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,72:270:99:1080,0,4624 chrXVI 24494 . A G 2856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.603;DP=291;Dels=0.00;FS=3.891;HaplotypeScore=5.7930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=2.592;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.301;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,139:291:99:2886,0,3434 chrXVI 24524 . T C 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.202;DP=287;Dels=0.00;FS=0.511;HaplotypeScore=3.9703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.957;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,67:287:99:1023,0,5125 chrXVI 24530 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.224;DP=286;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.477;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,65:286:99:1046,0,5173 chrXVI 24539 . T C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.665;DP=283;Dels=0.00;FS=0.513;HaplotypeScore=7.7630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=3.69;ReadPosRankSum=1.315;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,66:282:99:1073,0,5107 chrXVI 24572 . G A 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.210;DP=284;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=68.6356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.513;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,67:284:99:1188,0,5106 chrXVI 24575 . T C 2811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.970;DP=279;Dels=0.00;FS=0.910;HaplotypeScore=66.6490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQ0=0;MQRankSum=2.307;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.284;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,138:279:99:2841,0,3079 chrXVI 24587 . G T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.116;DP=290;Dels=0.00;FS=6.694;HaplotypeScore=7.9162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-2.941;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.978;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,70:290:99:1058,0,5268 chrXVI 24614 . A G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.572;DP=270;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-5.086;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,68:270:99:1071,0,4967 chrXVI 24629 . A G 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.264;DP=286;Dels=0.00;FS=1.049;HaplotypeScore=3.9740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQ0=0;MQRankSum=-5.211;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.370;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,72:286:99:1061,0,5151 chrXVI 24634 . A G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.109;DP=288;Dels=0.00;FS=0.500;HaplotypeScore=6.9547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-4.667;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.768;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,71:288:99:1060,0,5401 chrXVI 24645 . G A 7796.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=278;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=28.04;SB=-3.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,278:278:99:7796,752,0 chrXVI 24701 . G A 1060.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.254;DP=260;Dels=0.00;FS=22.083;HaplotypeScore=133.1021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.699;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,68:260:99:1090,0,4790 chrXVI 24708 . C T 1179.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.307;DP=284;Dels=0.00;FS=12.754;HaplotypeScore=139.1823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=4.15;ReadPosRankSum=2.710;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,71:284:99:1209,0,5087 chrXVI 24710 . C A 1357.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;DP=281;Dels=0.00;FS=2.253;HaplotypeScore=137.1898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,79:281:99:1387,0,4941 chrXVI 24809 . T C 2232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.367;DP=230;Dels=0.00;FS=2.295;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=1;MQRankSum=-0.301;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.383;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,111:230:99:2262,0,2519 chrXVI 24836 . G T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.031;DP=263;Dels=0.00;FS=1.656;HaplotypeScore=59.0868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=1;MQRankSum=-0.021;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.633;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,75:263:99:1314,0,4309 chrXVI 24844 . T C 789.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.407;DP=280;Dels=0.00;FS=0.535;HaplotypeScore=122.8452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.659;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,60:280:99:819,0,5297 chrXVI 24847 . G T 843.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.584;DP=281;Dels=0.00;FS=1.788;HaplotypeScore=3.3688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=1;MQRankSum=-1.116;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.202;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,60:281:99:873,0,4879 chrXVI 24865 . G A 782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.541;DP=300;Dels=0.00;FS=3.235;HaplotypeScore=6.4828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=2.61;ReadPosRankSum=2.051;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,61:300:99:812,0,5653 chrXVI 24867 . G A 790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.935;DP=294;Dels=0.00;FS=4.975;HaplotypeScore=5.6941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.681;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,62:294:99:820,0,5497 chrXVI 24950 . G A 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.683;DP=293;Dels=0.00;FS=6.821;HaplotypeScore=15.8776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=3.11;ReadPosRankSum=2.079;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,65:293:99:941,0,5372 chrXVI 24955 . A G 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.581;DP=283;Dels=0.00;FS=3.387;HaplotypeScore=16.8531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=1.737;QD=2.54;ReadPosRankSum=3.414;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,58:283:99:749,0,5565 chrXVI 24966 . A T 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;DP=240;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.307;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,55:240:99:753,0,4624 chrXVI 24974 . G T 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.410;DP=245;Dels=0.00;FS=0.578;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.054;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,53:245:99:745,0,4360 chrXVI 24980 . A T 662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;DP=245;Dels=0.00;FS=0.584;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=2.70;ReadPosRankSum=1.599;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,53:245:99:692,0,4890 chrXVI 25057 . G A 2003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=12.261;DP=204;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=2.769;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.358;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,97:204:99:2033,0,2232 chrXVI 25069 . T C 501.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.765;DP=209;Dels=0.00;FS=2.109;HaplotypeScore=2.6660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.018;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,45:209:99:531,0,3949 chrXVI 25078 . T C 559.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.736;DP=207;Dels=0.00;FS=9.665;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.847;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,40:207:99:589,0,4055 chrXVI 25079 . G A 550.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.036;DP=207;Dels=0.00;FS=9.665;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.755;SB=-9.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,40:207:99:580,0,3872 chrXVI 25149 . C T 746.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.971;DP=235;Dels=0.00;FS=1.238;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.166;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,51:235:99:776,0,4195 chrXVI 25159 . G T 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.062;DP=259;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=2.8173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,61:259:99:970,0,4646 chrXVI 25185 . C T 3285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.839;DP=261;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=61.5952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.073;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,142:261:99:3285,0,2604 chrXVI 25194 . A G 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.198;DP=259;Dels=0.00;FS=3.409;HaplotypeScore=54.6995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.030;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,58:259:99:809,0,4995 chrXVI 25200 . C T 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.722;DP=253;Dels=0.00;FS=3.429;HaplotypeScore=2.6707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.828;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,58:253:99:857,0,4403 chrXVI 25209 . T G 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.045;DP=247;Dels=0.00;FS=4.565;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.570;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,54:247:99:689,0,4689 chrXVI 25248 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.340;DP=275;Dels=0.00;FS=9.817;HaplotypeScore=6.5696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=4.73;ReadPosRankSum=2.024;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,76:275:99:1330,0,4576 chrXVI 25258 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.763;DP=247;Dels=0.00;FS=9.122;HaplotypeScore=60.4196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.350;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,72:246:99:1278,0,4173 chrXVI 25268 . T C 928.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.890;DP=241;Dels=0.00;FS=11.132;HaplotypeScore=117.3165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.690;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,62:241:99:958,0,4285 chrXVI 25269 . T C 2256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.721;DP=238;Dels=0.00;FS=4.402;HaplotypeScore=61.5865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.217;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,111:238:99:2286,0,2844 chrXVI 25297 . A C 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.906;DP=261;Dels=0.00;FS=0.527;HaplotypeScore=3.1643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,64:261:99:1048,0,4655 chrXVI 25365 . C T 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.883;DP=223;Dels=0.00;FS=5.443;HaplotypeScore=9.2711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.396;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,57:223:99:855,0,3999 chrXVI 25407 . G A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.661;DP=332;Dels=0.00;FS=0.963;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=4.00;ReadPosRankSum=2.029;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,85:332:99:1359,0,5799 chrXVI 25470 . A G 554.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.460;DP=280;Dels=0.00;FS=3.549;HaplotypeScore=7.9364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=2.956;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.424;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,52:280:99:584,0,5650 chrXVI 25497 . T C 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.566;DP=209;Dels=0.00;FS=1.296;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.026;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,48:209:99:753,0,4013 chrXVI 25524 . A G 2421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.105;DP=238;Dels=0.00;FS=6.605;HaplotypeScore=4.7957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=1.891;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.115;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,121:238:99:2451,0,2741 chrXVI 25536 . C T 865.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.839;DP=243;Dels=0.00;FS=3.774;HaplotypeScore=5.7760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.276;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,54:243:99:895,0,4494 chrXVI 25566 . T C 2639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.400;DP=262;Dels=0.00;FS=3.387;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.472;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,131:262:99:2669,0,2830 chrXVI 25623 . T C 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.723;DP=298;Dels=0.00;FS=1.366;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.562;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,62:298:99:833,0,5513 chrXVI 25632 . A G 7531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=291;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7359;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,291:291:99:7531,754,0 chrXVI 25657 . A G 711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.766;DP=281;Dels=0.00;FS=2.118;HaplotypeScore=4.9087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-1.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,58:281:99:741,0,5421 chrXVI 25933 . G A 919.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.191;DP=191;Dels=0.00;FS=4.673;HaplotypeScore=4.7563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.60;MQ0=21;MQRankSum=0.487;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.819;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,55:191:99:949,0,2549 chrXVI 26069 . G C 24.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;DP=47;Dels=0.00;FS=27.963;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.62;MQ0=1;MQRankSum=-4.786;QD=0.51;ReadPosRankSum=-4.301;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:54:54,0,645 chrXVI 26081 . G A 26.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.19;MQ0=1;MQRankSum=-3.468;QD=0.63;ReadPosRankSum=-2.022;SB=-1.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:56:56,0,542 chrXVI 26082 . T C 19.06 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.438;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.19;MQ0=1;MQRankSum=-3.379;QD=0.46;ReadPosRankSum=-1.461;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:49:49,0,600 chrXVI 26104 . T C 1027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=42.3083;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.24;MQ0=1;QD=17.12;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:1060,111,0 chrXVI 26130 . T C 474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.350;DP=69;Dels=0.00;FS=18.542;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-8.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,31:69:99:504,0,580 chrXVI 26200 . C T 628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.033;DP=81;Dels=0.00;FS=6.164;HaplotypeScore=33.6666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.151;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.347;SB=-1.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:658,0,932 chrXVI 26204 . G A 612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.514;DP=77;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.23;MQ0=0;MQRankSum=-3.463;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-1.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,35:77:99:642,0,873 chrXVI 26222 . T C 642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.114;DP=78;Dels=0.00;FS=0.846;HaplotypeScore=2.6175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.454;QD=8.23;ReadPosRankSum=-2.604;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:672,0,770 chrXVI 26261 . A G 664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.451;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.410;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.085;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,44:73:99:694,0,586 chrXVI 26265 . G C 644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;DP=72;Dels=0.00;FS=0.970;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.194;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.445;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,44:72:99:674,0,538 chrXVI 26289 . G A 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.612;DP=92;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.59;MQ0=0;MQRankSum=-4.220;QD=11.25;ReadPosRankSum=2.828;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,56:92:99:1065,0,691 chrXVI 26299 . T A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.00;MQ0=0;MQRankSum=-4.676;QD=10.76;ReadPosRankSum=2.329;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,58:97:99:1074,0,819 chrXVI 26330 . C T 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.362;DP=104;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-6.009;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.646;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1114,0,991 chrXVI 26358 . C G 627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.184;DP=101;Dels=0.00;FS=8.278;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.69;MQ0=0;MQRankSum=-5.211;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-1.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:657,0,1206 chrXVI 26365 . G A 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.436;DP=114;Dels=0.00;FS=13.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQ0=0;MQRankSum=-6.249;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.812;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:957,0,1324 chrXVI 26373 . A G 634.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.773;DP=104;Dels=0.00;FS=5.128;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQ0=0;MQRankSum=-6.751;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.626;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:664,0,1286 chrXVI 26397 . A G 2385 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.95;MQ0=0;QD=24.34;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2418,249,0 chrXVI 26402 . G A 569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.547;DP=97;Dels=0.00;FS=4.089;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.68;MQ0=0;MQRankSum=-5.985;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.720;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,41:97:99:599,0,1190 chrXVI 26429 . T C 747.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.13;MQ0=0;MQRankSum=-6.264;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.112;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:777,0,1194 chrXVI 26433 . T C 755.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.251;DP=111;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQ0=0;MQRankSum=-6.749;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.419;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:785,0,1383 chrXVI 26434 . G A 721.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;DP=111;Dels=0.00;FS=2.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQ0=0;MQRankSum=-6.256;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.436;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,49:111:99:751,0,1337 chrXVI 26575 . C T 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.929;DP=119;Dels=0.00;FS=2.365;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=3.450;QD=10.04;ReadPosRankSum=-2.891;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1225,0,1298 chrXVI 26592 . T C 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.901;DP=134;Dels=0.00;FS=9.311;HaplotypeScore=7.6807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=11.84;ReadPosRankSum=2.468;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1617,0,1227 chrXVI 26641 . A G 1809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.251;DP=140;Dels=0.00;FS=2.245;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.623;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,83:140:99:1839,0,1193 chrXVI 26688 . G A 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.771;DP=114;Dels=0.00;FS=3.579;HaplotypeScore=6.3634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:114:99:1478,0,969 chrXVI 26755 . T C 1108.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.306;DP=151;Dels=0.00;FS=18.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.409;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,64:151:99:1138,0,2027 chrXVI 26758 . C T 1195.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.275;DP=141;Dels=0.00;FS=19.064;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.445;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1225,0,1786 chrXVI 26764 . T C 1160.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.166;DP=137;Dels=0.00;FS=12.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.612;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1190,0,1844 chrXVI 26802 . A G 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.20;MQ0=0;QD=24.34;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3432,336,0 chrXVI 26818 . A G 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.460;DP=97;Dels=0.00;FS=1.664;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.040;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:999,0,980 chrXVI 27022 . C T 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.743;DP=102;Dels=0.00;FS=2.564;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.156;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:1005,0,1176 chrXVI 27058 . G A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.335;DP=117;Dels=0.00;FS=2.554;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.790;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1143,0,1341 chrXVI 27128 . C T 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.384;DP=129;Dels=0.00;FS=1.594;HaplotypeScore=2.1010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,47:129:99:923,0,1849 chrXVI 27168 . T C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;DP=133;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.436;QD=9.06;ReadPosRankSum=2.443;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1235,0,1654 chrXVI 27221 . G A 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.706;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.849;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1659,0,1612 chrXVI 27460 . A G 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.650;DP=123;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.790;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1431,0,1305 chrXVI 27466 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.937;DP=121;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.363;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1535,0,1134 chrXVI 27543 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.342;DP=122;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=1.5518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.635;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:122:99:1274,0,1344 chrXVI 27655 . T C 4266.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.85;SB=-2.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4266,426,0 chrXVI 27841 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.264;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.361;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.324;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1347,0,1732 chrXVI 27877 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.436;DP=139;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=1.9882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.565;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,63:139:99:1346,0,1693 chrXVI 27919 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.289;DP=124;Dels=0.00;FS=1.444;HaplotypeScore=2.6616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=1;MQRankSum=-1.166;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.700;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:124:99:1159,0,1460 chrXVI 27981 . G A 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.013;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.048;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1415,0,1590 chrXVI 28006 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.222;DP=124;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=1;MQRankSum=-0.119;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.257;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1141,0,1600 chrXVI 28011 . C T 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.719;DP=114;Dels=0.00;FS=2.470;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=1;MQRankSum=1.297;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1352,0,1062 chrXVI 28054 . A G 779.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.887;DP=99;Dels=0.00;FS=2.788;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:809,0,1396 chrXVI 28147 . T G 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.967;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.993;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,88:176:99:1848,0,1905 chrXVI 28214 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.895;DP=151;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=3.6893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.53;MQ0=0;MQRankSum=-3.641;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:151:99:1337,0,1920 chrXVI 28237 . C T 878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.257;DP=130;Dels=0.00;FS=8.322;HaplotypeScore=91.6836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.26;MQ0=0;MQRankSum=-7.041;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.300;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,52:130:99:908,0,1751 chrXVI 28261 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.807;DP=129;Dels=0.00;FS=0.697;HaplotypeScore=54.0475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.87;MQ0=0;MQRankSum=-5.073;QD=8.48;ReadPosRankSum=-2.820;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1124,0,1484 chrXVI 28312 . C A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.437;DP=143;Dels=0.00;FS=3.120;HaplotypeScore=6.2914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.452;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,66:143:99:1336,0,1650 chrXVI 28339 . A G 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.882;DP=137;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1598,0,1420 chrXVI 28486 . A G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.370;DP=120;Dels=0.00;FS=7.231;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.709;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1098,0,1451 chrXVI 28513 . T A 1373.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=130;Dels=0.00;FS=4.145;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.199;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,69:130:99:1403,0,1313 chrXVI 28514 . T G 1350.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.744;DP=131;Dels=0.00;FS=4.176;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.027;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1380,0,1330 chrXVI 28521 . T G 1379.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.101;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.199;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.148;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1409,0,1265 chrXVI 28641 . A G 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.987;DP=135;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.865;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,62:135:99:1410,0,1649 chrXVI 28674 . G A 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.473;DP=133;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.227;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1586,0,1373 chrXVI 28686 . C T 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.814;DP=129;Dels=0.00;FS=4.192;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.471;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1600,0,1220 chrXVI 28695 . G A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.130;DP=147;Dels=0.00;FS=4.910;HaplotypeScore=6.6294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.929;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1465,0,1709 chrXVI 28821 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;DP=116;Dels=0.00;FS=4.545;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.777;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,67:116:99:1511,0,1058 chrXVI 28890 . T C 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.458;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.242;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1404,0,1261 chrXVI 29021 . T C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.347;DP=128;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.098;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1362,0,1201 chrXVI 29036 . T C 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.696;DP=139;Dels=0.00;FS=2.133;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-7.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1433,0,1384 chrXVI 29041 . T A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;DP=131;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=0;MQRankSum=-2.724;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.260;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1317,0,1460 chrXVI 29091 . A G 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.506;DP=156;Dels=0.00;FS=2.001;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.085;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,68:156:99:1295,0,2032 chrXVI 29134 . A G 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.451;DP=167;Dels=0.00;FS=3.621;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.421;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1734,0,1787 chrXVI 29156 . T G 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.665;DP=154;Dels=0.00;FS=2.917;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.303;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1622,0,1594 chrXVI 29188 . A G 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.284;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.398;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1258,0,1424 chrXVI 29202 . A C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.665;DP=114;Dels=0.00;FS=4.605;HaplotypeScore=2.4820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.826;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1001,0,1493 chrXVI 29222 . G A 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.374;DP=131;Dels=0.00;FS=1.495;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-2.518;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,54:131:99:1165,0,1789 chrXVI 29253 . T A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.139;DP=146;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.189;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,65:146:99:1431,0,1881 chrXVI 29282 . T C 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.162;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.840;QD=8.83;ReadPosRankSum=1.645;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1187,0,1720 chrXVI 29290 . A G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.039;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.975;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:1288,0,1743 chrXVI 29296 . T C 1131.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.926;DP=122;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.602;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1161,0,1561 chrXVI 29325 . T A 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;DP=113;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.393;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1154,0,1321 chrXVI 29370 . C T 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.990;DP=105;Dels=0.00;FS=4.806;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.267;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1091,0,1002 chrXVI 29433 . T G 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;DP=139;Dels=0.00;FS=2.256;HaplotypeScore=3.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.070;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1534,0,1471 chrXVI 29599 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=103.3669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.308;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1381,0,1369 chrXVI 29625 . G T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.878;DP=124;Dels=0.00;FS=4.244;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.212;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1395,0,1247 chrXVI 29749 . C T 2914 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2947,283,0 chrXVI 29835 . G A 1667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.540;DP=132;Dels=0.00;FS=5.543;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.062;SB=-9.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,84:132:99:1697,0,854 chrXVI 30029 . A G 1243.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.229;DP=120;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.969;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1273,0,1226 chrXVI 30031 . G T 1326.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.262;DP=119;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.053;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1356,0,1184 chrXVI 30033 . A G 1239.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.912;DP=119;Dels=0.00;FS=2.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.436;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.829;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1269,0,1227 chrXVI 30188 . A G 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.745;DP=139;Dels=0.00;FS=9.309;HaplotypeScore=7.5163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=1.243;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,60:139:99:1273,0,1738 chrXVI 30270 . T A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;DP=101;Dels=0.00;FS=2.581;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.595;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1067,0,1167 chrXVI 30634 . G T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.206;DP=122;Dels=0.00;FS=1.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.717;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1288,0,1393 chrXVI 30844 . A G 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.630;DP=152;Dels=0.00;FS=5.020;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.903;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1622,0,1626 chrXVI 31264 . G T 1718.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;DP=124;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=13.85;ReadPosRankSum=-1.704;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,78:124:99:1748,0,932 chrXVI 32485 . C T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.259;DP=131;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=1.9638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.746;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1300,0,1585 chrXVI 32598 . A T 686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;DP=99;Dels=0.00;FS=2.746;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-2.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:716,0,1514 chrXVI 32599 . G T 716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.530;DP=101;Dels=0.00;FS=2.743;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.243;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,37:101:99:746,0,1497 chrXVI 33213 . C A 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.460;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=13.40;ReadPosRankSum=1.461;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,70:120:99:1638,0,971 chrXVI 33386 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.158;DP=103;Dels=0.00;FS=4.886;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.967;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:103:99:1134,0,1126 chrXVI 33547 . A C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.688;DP=110;Dels=0.00;FS=7.428;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1246,0,1196 chrXVI 33753 . T C 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.772;DP=103;Dels=0.00;FS=10.227;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.537;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:714,0,1593 chrXVI 33804 . T C 658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;DP=87;Dels=0.00;FS=29.124;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.840;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-2.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,34:87:99:688,0,1278 chrXVI 33858 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.324;DP=119;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.189;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1362,0,1205 chrXVI 33951 . T C 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.188;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.061;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1627,0,1167 chrXVI 34128 . A G 892.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.104;DP=110;Dels=0.00;FS=3.733;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=1;MQRankSum=-0.376;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:922,0,1440 chrXVI 34194 . T C 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.307;DP=103;Dels=0.00;FS=6.451;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.839;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1229,0,943 chrXVI 34248 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.052;DP=109;Dels=0.00;FS=9.451;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:1436,0,951 chrXVI 34350 . A T 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;DP=109;Dels=0.00;FS=10.936;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.782;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1306,0,1143 chrXVI 34401 . T C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;DP=98;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.659;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1078,0,1066 chrXVI 34470 . T C 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.664;DP=111;Dels=0.00;FS=7.470;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1077,0,1295 chrXVI 34506 . C T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.463;DP=105;Dels=0.00;FS=8.060;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.986;SB=-3.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1124,0,1211 chrXVI 34547 . A C 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.390;DP=85;Dels=0.00;FS=7.133;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.770;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:976,0,902 chrXVI 34574 . G A 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.893;DP=91;Dels=0.00;FS=12.368;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.840;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:921,0,992 chrXVI 34625 . G A 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=92;Dels=0.00;FS=10.347;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.209;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,39:92:99:796,0,1096 chrXVI 34641 . A G 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;DP=90;Dels=0.00;FS=0.834;HaplotypeScore=2.7404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=8.47;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,37:90:99:792,0,1155 chrXVI 34674 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.095;DP=129;Dels=0.00;FS=3.359;HaplotypeScore=2.7196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.497;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1298,0,1495 chrXVI 34787 . T C 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.131;DP=113;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=5.3382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.830;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1155,0,1253 chrXVI 34790 . C T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.559;DP=117;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=5.3382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.913;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1250,0,1268 chrXVI 34988 . C T 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.691;DP=109;Dels=0.00;FS=4.917;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.356;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,65:109:99:1069,0,838 chrXVI 34989 . T C 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.642;DP=105;Dels=0.00;FS=2.646;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.476;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,62:105:99:1040,0,884 chrXVI 35005 . C T 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.647;DP=115;Dels=0.00;FS=5.975;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.906;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,71:115:99:1572,0,851 chrXVI 35208 . G A 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.631;DP=132;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1149,0,1644 chrXVI 35220 . C T 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.860;DP=133;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=2.8131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.303;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,77:133:99:1820,0,1132 chrXVI 35313 . G T 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.117;DP=149;Dels=0.00;FS=1.364;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.101;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.936;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1613,0,1593 chrXVI 35338 . T A 1371.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.002;DP=124;Dels=0.00;FS=6.730;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.83;MQ0=0;MQRankSum=-4.115;QD=11.06;ReadPosRankSum=-2.377;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1401,0,1286 chrXVI 35342 . A G 1178.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.232;DP=115;Dels=0.00;FS=3.409;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.26;MQ0=0;MQRankSum=-4.099;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.312;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1208,0,1276 chrXVI 35346 . T C 1136.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;DP=114;Dels=0.00;FS=4.512;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQ0=0;MQRankSum=-4.882;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.713;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1166,0,1266 chrXVI 35385 . C T 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.377;DP=124;Dels=0.00;FS=5.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.90;MQ0=0;MQRankSum=-3.663;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.405;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1390,0,1245 chrXVI 35391 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.446;DP=127;Dels=0.00;FS=5.484;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.185;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.683;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1400,0,1333 chrXVI 35451 . C T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.340;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.324;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1444,0,1162 chrXVI 35711 . C T 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.541e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3343,331,0 chrXVI 35712 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.330;DP=137;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.025;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1297,0,1492 chrXVI 35772 . G T 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;DP=129;Dels=0.00;FS=4.212;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.187;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,69:129:99:1493,0,1328 chrXVI 35776 . G A 3182 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.693e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3215,322,0 chrXVI 36781 . C T 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.867e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3601,349,0 chrXVI 36977 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.324;DP=126;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=2.6968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.303;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1244,0,1447 chrXVI 37113 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.746;DP=122;Dels=0.00;FS=4.402;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1088,0,1565 chrXVI 37419 . T C 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.424;DP=98;Dels=0.00;FS=7.234;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.838;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1060,0,911 chrXVI 37438 . G A 2621 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=24.50;SB=-1.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2654,259,0 chrXVI 37721 . A C 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.553;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,74:132:99:1543,0,1259 chrXVI 38385 . A G 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.031;DP=128;Dels=0.00;FS=7.171;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.652;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,47:128:99:888,0,1910 chrXVI 38391 . G A 3381.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3381,328,0 chrXVI 38493 . T G 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3291,310,0 chrXVI 38802 . A G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.970;DP=154;Dels=0.00;FS=12.090;HaplotypeScore=5.5818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=1;MQRankSum=1.874;QD=8.02;ReadPosRankSum=-3.116;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:154:99:1265,0,1783 chrXVI 38851 . A C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.352;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.71;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.141;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1096,0,1505 chrXVI 38894 . G A 402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.442;DP=108;Dels=0.00;FS=2.508;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.141;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.018;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:432,0,1328 chrXVI 38907 . G T 606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;DP=79;Dels=0.00;FS=1.855;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.452;SB=-3.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:79:99:636,0,1008 chrXVI 39105 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.261;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.578;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1397,0,1710 chrXVI 39420 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;DP=131;Dels=0.00;FS=2.449;HaplotypeScore=1.8947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.610;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:131:99:1430,0,1381 chrXVI 39840 . T C 527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.408;DP=71;Dels=0.00;FS=2.065;HaplotypeScore=2.6493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.043;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.029;SB=-1.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,30:71:99:557,0,942 chrXVI 40510 . C G 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;DP=139;Dels=0.00;FS=7.592;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=9.71;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1380,0,1630 chrXVI 40677 . G A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.250;DP=129;Dels=0.00;FS=5.557;HaplotypeScore=4.6665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.907;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:129:99:1228,0,1633 chrXVI 40694 . G A 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.836;DP=119;Dels=0.00;FS=7.379;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.446;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1570,0,1112 chrXVI 40755 . T A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;DP=128;Dels=0.00;FS=4.261;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.509;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:128:99:1337,0,1533 chrXVI 40976 . T C 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.972;DP=126;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.167;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1149,0,1558 chrXVI 40996 . T C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.267;DP=122;Dels=0.00;FS=2.436;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.064;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1129,0,1558 chrXVI 41008 . G C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.840;DP=143;Dels=0.00;FS=3.130;HaplotypeScore=58.6533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.913;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,63:143:99:1204,0,1795 chrXVI 41264 . T C 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.273;DP=168;Dels=0.00;FS=1.207;HaplotypeScore=3.4083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.400;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,79:168:99:1508,0,1911 chrXVI 41379 . T A 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.285;DP=132;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.574;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,65:132:99:1420,0,1549 chrXVI 41672 . T C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.382;DP=141;Dels=0.00;FS=7.944;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.215;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1443,0,1729 chrXVI 42125 . G T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.875;DP=139;Dels=0.00;FS=2.176;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.701;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1460,0,1458 chrXVI 42254 . A G 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.724;DP=153;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=1;MQRankSum=1.310;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.330;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,86:153:99:1791,0,1464 chrXVI 42680 . T A 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;DP=145;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.730;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1572,0,1650 chrXVI 42781 . T G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.789;DP=128;Dels=0.00;FS=2.406;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.446;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1477,0,1326 chrXVI 42915 . T A 760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;DP=82;Dels=0.00;FS=2.902;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.499;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.042;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:790,0,1042 chrXVI 42980 . C T 582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.265;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.99;MQ0=0;MQRankSum=-6.548;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.406;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:612,0,933 chrXVI 42995 . T C 491.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.511;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.44;MQ0=0;MQRankSum=-6.039;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-2.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:521,0,741 chrXVI 43001 . C T 407.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.565;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.04;MQ0=0;MQRankSum=-5.426;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.201;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:437,0,680 chrXVI 43003 . A T 396.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.04;MQ0=0;MQRankSum=-5.560;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.469;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:426,0,662 chrXVI 43043 . G T 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;DP=76;Dels=0.00;FS=1.897;HaplotypeScore=3.7365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.526;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.425;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,43:76:99:732,0,706 chrXVI 43053 . A G 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.453;DP=76;Dels=0.00;FS=1.926;HaplotypeScore=2.8082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.855;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.585;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:75:99:923,0,733 chrXVI 43122 . A G 704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.636;DP=70;Dels=0.00;FS=0.910;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.56;MQ0=0;MQRankSum=-5.247;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.580;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:734,0,750 chrXVI 43184 . T G 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.603;DP=124;Dels=0.00;FS=19.354;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.69;MQ0=0;MQRankSum=-3.753;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.893;SB=-1.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:864,0,1453 chrXVI 43388 . A G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.426;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1153,0,1408 chrXVI 44122 . G T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.986;DP=116;Dels=0.00;FS=5.853;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.373;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1372,0,1257 chrXVI 44191 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.814;DP=116;Dels=0.00;FS=4.731;HaplotypeScore=4.9724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.486;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1178,0,1388 chrXVI 44258 . A G 922.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.363;DP=101;Dels=0.00;FS=1.625;HaplotypeScore=3.3285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.090;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:952,0,1219 chrXVI 44367 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,58:137:99:1206,0,1768 chrXVI 44377 . T G 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.279;DP=136;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.874;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1375,0,1650 chrXVI 44552 . T C 1161.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.848;DP=129;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.045;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,57:129:99:1191,0,1404 chrXVI 44755 . T C 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.828;DP=143;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.757;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1569,0,1719 chrXVI 44764 . T C 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.878;DP=131;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.661;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1283,0,1568 chrXVI 44799 . G A 1832.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.428;DP=152;Dels=0.00;FS=3.873;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.534;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,87:152:99:1862,0,1347 chrXVI 44845 . G C 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.658;DP=136;Dels=0.00;FS=6.433;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.858;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1560,0,1232 chrXVI 44920 . C G 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.424;DP=140;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=3.9399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.322;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1351,0,1451 chrXVI 44929 . G A 1682.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.169;DP=148;Dels=0.00;FS=2.924;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1712,0,1313 chrXVI 45292 . C T 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.612;DP=133;Dels=0.00;FS=3.835;HaplotypeScore=4.9746;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.107;SB=-1.610e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3549,343,0 chrXVI 45800 . G T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.725;DP=107;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=9.9411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.895;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1251,0,1100 chrXVI 45934 . G A 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.369;DP=122;Dels=0.00;FS=4.493;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.842;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1188,0,1541 chrXVI 45952 . C T 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.956;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=1;MQRankSum=0.102;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1217,0,1197 chrXVI 45974 . A G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.854;DP=139;Dels=0.00;FS=2.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=1;MQRankSum=1.161;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1388,0,1540 chrXVI 46114 . C A 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.22;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.441e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4081,388,0 chrXVI 46273 . A G 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=139;Dels=0.00;FS=3.506;HaplotypeScore=3.3409;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;MQRankSum=1.458;QD=26.62;ReadPosRankSum=1.109;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:139:99:3700,379,0 chrXVI 46282 . T C 3363.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.67;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3363,345,0 chrXVI 46291 . A G 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.09;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.562e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3396,363,0 chrXVI 46435 . T C 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.748;DP=142;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=3.9776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.934;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1508,0,1619 chrXVI 46547 . A G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;DP=136;Dels=0.00;FS=4.919;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.361;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.248;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:136:99:1428,0,1560 chrXVI 46548 . T C 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.106;DP=138;Dels=0.00;FS=4.813;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.625;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1400,0,1648 chrXVI 46638 . T A 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;DP=154;Dels=0.00;FS=1.614;HaplotypeScore=3.7990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.500;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1258,0,1438 chrXVI 46747 . A T 1904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.238;DP=151;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=12.61;ReadPosRankSum=-1.098;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,83:151:99:1934,0,1475 chrXVI 46798 . G T 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.148;DP=174;Dels=0.00;FS=5.378;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,84:174:99:1820,0,2003 chrXVI 46831 . A G 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.893;DP=162;Dels=0.00;FS=5.872;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.790;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,75:162:99:1449,0,2047 chrXVI 47155 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.190;DP=135;Dels=0.00;FS=3.340;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=1;MQRankSum=0.761;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.831;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,51:135:99:1095,0,1837 chrXVI 47208 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.827;DP=122;Dels=0.00;FS=10.257;HaplotypeScore=4.0550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.425;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1352,0,1207 chrXVI 47273 . T C 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.529;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.604;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1438,0,1621 chrXVI 47305 . T G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.737;DP=130;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.124;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1201,0,1646 chrXVI 47641 . C T 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.678;DP=125;Dels=0.00;FS=2.287;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1270,0,1385 chrXVI 48109 . T C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=1;MQRankSum=0.096;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.580;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1201,0,1749 chrXVI 48265 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.119;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=8.01;ReadPosRankSum=-2.446;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:142:99:1167,0,1816 chrXVI 48472 . T G 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;DP=121;Dels=0.00;FS=3.283;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1088,0,1351 chrXVI 48853 . A G 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.834;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=-7.354;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.142;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,46:120:99:813,0,1640 chrXVI 48861 . A G 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.71;MQ0=0;MQRankSum=-7.530;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.768;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,48:127:99:886,0,1753 chrXVI 48872 . G C 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;DP=119;Dels=0.00;FS=2.454;HaplotypeScore=3.0453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=-8.274;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,46:119:99:779,0,1570 chrXVI 48882 . G A 778.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.591;DP=118;Dels=0.00;FS=4.857;HaplotypeScore=3.0453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.87;MQ0=0;MQRankSum=-8.993;QD=6.59;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:808,0,1508 chrXVI 48890 . A G 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.927;DP=117;Dels=0.00;FS=4.923;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.77;MQ0=0;MQRankSum=-9.115;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.811;SB=-2.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:117:99:749,0,1586 chrXVI 48893 . G A 673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.296;DP=113;Dels=0.00;FS=9.842;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.86;MQ0=0;MQRankSum=-8.941;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.746;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,44:113:99:703,0,1479 chrXVI 48901 . C T 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.207;DP=112;Dels=0.00;FS=4.997;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.76;MQ0=0;MQRankSum=-8.916;QD=6.03;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,44:112:99:705,0,1337 chrXVI 48910 . C T 667.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.985;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.09;MQ0=0;MQRankSum=-9.123;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.063;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,48:115:99:697,0,1427 chrXVI 48912 . C T 662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.916;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.98;MQ0=0;MQRankSum=-9.094;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.697;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:692,0,1308 chrXVI 48923 . A G 666.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.670;DP=108;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.56;MQ0=0;MQRankSum=-8.196;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:108:99:696,0,1241 chrXVI 48925 . T C 703.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.894;DP=108;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.56;MQ0=0;MQRankSum=-8.337;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.012;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:733,0,1248 chrXVI 48927 . A C 720.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;DP=109;Dels=0.00;FS=1.570;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.68;MQ0=0;MQRankSum=-8.501;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.503;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:750,0,1249 chrXVI 48951 . A G 828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;DP=104;Dels=0.00;FS=9.213;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.01;MQ0=0;MQRankSum=-4.428;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.700;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:858,0,1098 chrXVI 48995 . A G 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.180;DP=94;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.626;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.334;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:813,0,1062 chrXVI 49593 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.397;DP=152;Dels=0.00;FS=16.205;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.918;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,57:152:99:1219,0,2211 chrXVI 49779 . C T 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.747;DP=113;Dels=0.00;FS=2.412;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.651;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1255,0,1166 chrXVI 49902 . C T 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.009;DP=145;Dels=0.00;FS=6.146;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=1;MQRankSum=0.140;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1773,0,1388 chrXVI 50083 . A G 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.783;DP=104;Dels=0.00;FS=4.963;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=1.007;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:1048,0,1287 chrXVI 50217 . G A 859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.426;DP=104;Dels=0.00;FS=3.721;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=2.228;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.789;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:889,0,1428 chrXVI 50298 . A G 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.332;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1463,0,1001 chrXVI 50505 . A T 877.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.857;DP=99;Dels=0.00;FS=19.208;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.083;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:907,0,1393 chrXVI 50580 . G A 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;DP=105;Dels=0.00;FS=3.601;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.531;SB=-4.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:105:99:1167,0,1117 chrXVI 50685 . A G 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.028;DP=165;Dels=0.00;FS=12.335;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.295;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,82:165:99:1761,0,1841 chrXVI 50846 . A G 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.104;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=9.21;ReadPosRankSum=-2.385;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1154,0,1615 chrXVI 50873 . G A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.436;DP=131;Dels=0.00;FS=2.255;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.010;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1114,0,1710 chrXVI 50917 . T A 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.215;DP=106;Dels=0.00;FS=2.543;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1094,0,1216 chrXVI 51084 . T A 747.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;DP=78;Dels=0.00;FS=7.680;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.135;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:777,0,1027 chrXVI 51403 . C T 816.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.905;DP=76;Dels=0.00;FS=3.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,39:76:99:846,0,786 chrXVI 51430 . C T 1752 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1785,177,0 chrXVI 51535 . T A 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.262;DP=89;Dels=0.00;FS=14.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.201;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,44:89:99:950,0,941 chrXVI 51730 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.688;DP=92;Dels=0.00;FS=7.394;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,54:92:99:1267,0,750 chrXVI 51958 . T C 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.451;DP=71;Dels=0.00;FS=0.916;HaplotypeScore=10.7433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.225;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:71:99:795,0,615 chrXVI 52021 . C T 2381 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=27.69;SB=-1.212e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2414,237,0 chrXVI 52042 . T C 845.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.748;DP=95;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=3.1800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=2.312;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.154;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:875,0,1176 chrXVI 52066 . G A 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.404;DP=83;Dels=0.00;FS=0.832;HaplotypeScore=2.8846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.159;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,41:83:99:901,0,894 chrXVI 52180 . G A 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.886;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.990;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,67:114:99:1554,0,986 chrXVI 52231 . G A 3211.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3245,313,0 chrXVI 52291 . T A 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;DP=122;Dels=0.00;FS=11.434;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.306;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1389,0,1324 chrXVI 52375 . A C 2901 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2934,294,0 chrXVI 52500 . G A 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3095,295,0 chrXVI 52930 . A C 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;DP=109;Dels=0.00;FS=11.818;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.324;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,65:109:99:1459,0,944 chrXVI 52935 . A T 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.714;DP=110;Dels=0.00;FS=10.149;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.101;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,66:110:99:1564,0,938 chrXVI 52965 . A G 2801 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.93;MQ0=0;QD=26.42;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2834,294,0 chrXVI 53017 . C G 2654 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.80;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2687,270,0 chrXVI 53041 . T A 2603 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.55;MQ0=0;QD=27.11;SB=-9.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2636,258,0 chrXVI 53120 . A T 1725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.90;MQ0=0;QD=21.56;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:1758,177,0 chrXVI 53198 . T A 599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.879;DP=82;Dels=0.00;FS=3.070;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=1;MQRankSum=1.222;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.985;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:629,0,976 chrXVI 53226 . G A 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2887,274,0 chrXVI 53320 . G A 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9416;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3212,310,0 chrXVI 53378 . A G 2493 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=25.44;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2526,261,0 chrXVI 53381 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.864;DP=98;Dels=0.00;FS=19.763;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.169;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1205,0,959 chrXVI 53424 . G T 633.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.723;DP=82;Dels=0.00;FS=0.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.291;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,31:82:99:663,0,1198 chrXVI 53425 . A T 2371 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=28.91;SB=-9.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2404,237,0 chrXVI 53429 . C T 2346 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=0;QD=26.07;SB=-9.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2379,234,0 chrXVI 53867 . A G 2707 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2740,279,0 chrXVI 53893 . A G 1080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.374;DP=104;Dels=0.00;FS=3.666;HaplotypeScore=2.6565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1110,0,1282 chrXVI 53945 . C T 2307 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2340,231,0 chrXVI 54065 . G T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.714;DP=110;Dels=0.00;FS=1.558;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=1;MQRankSum=1.015;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1172,0,1208 chrXVI 54119 . G A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.562;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.695;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,49:101:99:1069,0,1137 chrXVI 54374 . G A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.961;DP=112;Dels=0.00;FS=12.063;HaplotypeScore=3.3293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.858;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1160,0,949 chrXVI 54467 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.226;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1514,0,1286 chrXVI 54515 . G A 1805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;DP=144;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,84:144:99:1835,0,1286 chrXVI 54725 . G A 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.100;DP=136;Dels=0.00;FS=3.314;HaplotypeScore=3.6784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.948;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,51:136:99:1033,0,1945 chrXVI 54755 . T C 559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.225;DP=116;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=4.7135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=2.290;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.714;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,44:116:99:589,0,1704 chrXVI 54955 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.160;DP=111;Dels=0.00;FS=8.956;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.557;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1261,0,1195 chrXVI 55079 . T C 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.307;DP=145;Dels=0.00;FS=7.420;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.026;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1449,0,1532 chrXVI 55135 . T C 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.756;DP=117;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.204;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:117:99:1229,0,1331 chrXVI 55209 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.142;DP=129;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:1114,0,1713 chrXVI 55232 . C T 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.60;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3821,367,0 chrXVI 55247 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.565;DP=123;Dels=0.00;FS=4.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.111;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1189,0,1454 chrXVI 55257 . G T 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.77;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.631e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3171,310,0 chrXVI 55293 . G T 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.133;DP=117;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1157,0,1309 chrXVI 55297 . G A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.838;DP=119;Dels=0.00;FS=3.501;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1222,0,1366 chrXVI 55362 . C T 3285.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.07;MQ0=0;QD=28.57;SB=-1.667e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3285,328,0 chrXVI 55419 . C T 3027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.97;MQ0=0;QD=23.83;SB=-1.564e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3060,306,0 chrXVI 55431 . A T 684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.199;DP=114;Dels=0.00;FS=3.453;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.807;QD=6.00;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,50:114:99:714,0,1541 chrXVI 55474 . G A 2871 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=26.83;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2904,292,0 chrXVI 55535 . T C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.419;DP=106;Dels=0.00;FS=1.985;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.808;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.468;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1124,0,1286 chrXVI 55625 . C T 2834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=26.49;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2867,280,0 chrXVI 55837 . C T 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.999;DP=130;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=3.206;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.273;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1596,0,1298 chrXVI 55961 . T C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.395;DP=121;Dels=0.00;FS=4.429;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.698;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1117,0,1505 chrXVI 55962 . A C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;DP=118;Dels=0.00;FS=5.733;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.531;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1405,0,1174 chrXVI 55990 . G T 3161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.30;MQ0=0;QD=28.48;SB=-1.239e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3194,304,0 chrXVI 56011 . C A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.172;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.513;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:1036,0,1485 chrXVI 56103 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.547;DP=110;Dels=0.00;FS=2.466;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.56;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.536;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1091,0,1285 chrXVI 56116 . A G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.038;DP=109;Dels=0.00;FS=3.502;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.81;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1221,0,1168 chrXVI 56137 . C T 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.825;DP=105;Dels=0.00;FS=7.606;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1156,0,1154 chrXVI 56154 . G A 1143.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.137;DP=100;Dels=0.00;FS=2.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1173,0,964 chrXVI 56155 . G A 1138.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.026;DP=100;Dels=0.00;FS=2.617;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.252;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1168,0,986 chrXVI 56156 . G A 967.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.686;DP=99;Dels=0.00;FS=2.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.291;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:997,0,1130 chrXVI 56219 . G T 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.254;DP=86;Dels=0.00;FS=9.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQ0=2;MQRankSum=-0.005;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.023;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,54:86:99:1205,0,620 chrXVI 56290 . T C 2130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.65;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:2163,225,0 chrXVI 56313 . G C 690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.382;DP=100;Dels=0.00;FS=25.882;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.29;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,41:100:99:720,0,1264 chrXVI 56344 . C T 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.117;DP=76;Dels=0.00;FS=38.100;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.15;MQ0=0;MQRankSum=2.908;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.716;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,47:76:99:1045,0,454 chrXVI 56346 . T A 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.020;DP=77;Dels=0.00;FS=35.111;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.48;MQ0=0;MQRankSum=2.728;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.531;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,48:77:99:1081,0,457 chrXVI 56356 . A T 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.726;DP=78;Dels=0.00;FS=41.389;HaplotypeScore=4.9645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.06;MQ0=0;MQRankSum=2.827;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.921;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,53:78:99:1252,0,338 chrXVI 56381 . A T 118.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;DP=73;Dels=0.00;FS=17.861;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.86;MQ0=0;MQRankSum=-3.941;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.974;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:148,0,1288 chrXVI 56383 . C T 95.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.084;DP=70;Dels=0.00;FS=17.890;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.97;MQ0=0;MQRankSum=-3.890;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.646;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:125,0,1227 chrXVI 56388 . C A 76.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.648;DP=69;Dels=0.00;FS=18.455;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.544;QD=1.10;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:106,0,1219 chrXVI 56389 . G C 77.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.304;DP=69;Dels=0.00;FS=18.455;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.036;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.321;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:107,0,1249 chrXVI 56392 . G A 99.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.344;DP=67;Dels=0.00;FS=17.993;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.771;QD=1.48;ReadPosRankSum=-1.935;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:129,0,1232 chrXVI 56397 . C T 104.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=63;Dels=0.00;FS=18.747;HaplotypeScore=2.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.93;MQ0=0;MQRankSum=-3.447;QD=1.65;ReadPosRankSum=-3.513;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:134,0,1163 chrXVI 56462 . G A 120.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.96;MQ0=0;QD=13.36;SB=-6.120e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:15:153,15,0 chrXVI 56495 . A G 106.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;DP=9;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.96;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-5.026e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,5:9:15:139,15,0 chrXVI 62301 . T C 51.97 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.15;MQ0=9;MQRankSum=0.727;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.727;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,3:13:9:84,9,0 chrXVI 62311 . C A 84.51 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.50;MQ0=8;MQRankSum=0.736;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.736;SB=-2.563e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,6:14:12:117,12,0 chrXVI 62341 . T C 93.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.11;MQ0=2;QD=11.66;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,6:8:15:126,15,0 chrXVI 62359 . C A 116.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.11;MQ0=2;QD=14.53;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:15:149,15,0 chrXVI 62370 . T A 112.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.85;MQ0=1;QD=16.04;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:15:145,15,0 chrXVI 62720 . A T 70.07 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.38;MQ0=2;MQRankSum=-0.822;QD=4.38;ReadPosRankSum=-2.282;SB=-8.507e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:15:100,0,15 chrXVI 62777 . C T 1204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.28;MQ0=0;QD=22.30;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:1237,120,0 chrXVI 62944 . G A 1187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.8759;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.07;MQ0=0;QD=26.38;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1220,123,0 chrXVI 62972 . T C 1008 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=48;Dels=0.00;FS=4.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.55;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=21.00;ReadPosRankSum=0.217;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:1041,126,0 chrXVI 62987 . A C 1311 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.52;MQ0=0;QD=23.41;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1344,138,0 chrXVI 63000 . C T 1163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.77;MQ0=0;QD=22.80;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1196,123,0 chrXVI 63005 . C T 1217 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.68;MQ0=0;QD=23.40;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1250,126,0 chrXVI 63101 . T A 1662 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=65;Dels=0.00;FS=2.712;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=1.994;QD=25.57;ReadPosRankSum=1.045;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,63:65:99:1695,162,0 chrXVI 63210 . T C 1584 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.99;MQ0=0;QD=25.14;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:1617,165,0 chrXVI 63276 . A G 79.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;DP=77;Dels=0.00;FS=5.078;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.273;QD=1.03;ReadPosRankSum=-3.224;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,11:77:99:109,0,1622 chrXVI 63327 . A G 223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQ0=0;MQRankSum=-5.481;QD=3.23;ReadPosRankSum=4.258;SB=-7.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:253,0,1310 chrXVI 63351 . T G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.109;DP=76;Dels=0.00;FS=2.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQ0=0;MQRankSum=5.141;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.306;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,60:76:99:1433,0,234 chrXVI 63384 . G A 1479.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.799;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=5.007;QD=20.54;ReadPosRankSum=2.337;SB=-7.922e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,62:72:17:1512,17,0 chrXVI 63416 . C T 65.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.253;DP=79;Dels=0.00;FS=7.654;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.47;MQ0=0;MQRankSum=-6.078;QD=0.82;ReadPosRankSum=-3.024;SB=-6.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:95:95,0,1454 chrXVI 63429 . C A 193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.474;DP=81;Dels=0.00;FS=5.266;HaplotypeScore=2.9669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQ0=0;MQRankSum=-6.358;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.947;SB=-8.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:223,0,1483 chrXVI 63455 . T C 302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=81;Dels=0.00;FS=6.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=-6.583;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.958;SB=-1.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,23:81:99:332,0,1456 chrXVI 63459 . G A 301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.177;DP=83;Dels=0.00;FS=8.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.75;MQ0=0;MQRankSum=-6.741;QD=3.63;ReadPosRankSum=2.142;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:331,0,1407 chrXVI 63473 . T C 438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.720;DP=100;Dels=0.00;FS=30.784;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.08;MQ0=0;MQRankSum=-7.683;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.869;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,30:100:99:468,0,1668 chrXVI 63532 . A G 140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.287;DP=66;Dels=0.00;FS=5.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.21;MQ0=0;MQRankSum=-5.978;QD=2.12;ReadPosRankSum=1.608;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:170,0,1241 chrXVI 63549 . G A 102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.929;DP=64;Dels=0.00;FS=4.219;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.30;MQ0=0;MQRankSum=-5.753;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-4.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:132,0,1161 chrXVI 63550 . G A 99.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.644;DP=64;Dels=0.00;FS=4.219;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.30;MQ0=0;MQRankSum=-5.801;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.856;SB=-4.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:129,0,1157 chrXVI 63565 . A G 63.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.800;DP=63;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQ0=0;MQRankSum=-5.785;QD=1.00;ReadPosRankSum=-3.252;SB=-6.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:93:93,0,1152 chrXVI 63681 . T A 10.42 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=73;Dels=0.00;FS=15.969;HaplotypeScore=2.3609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.062;QD=0.14;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,10:73:40:40,0,1574 chrXVI 63723 . T A 1846 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.13;MQ0=0;QD=26.37;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:1879,189,0 chrXVI 64140 . A C 346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.507;DP=94;Dels=0.00;FS=19.582;HaplotypeScore=3.7833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.19;MQ0=0;MQRankSum=-5.017;QD=3.68;ReadPosRankSum=-2.980;SB=-5.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,26:94:99:376,0,1622 chrXVI 64155 . T C 263.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.779;DP=90;Dels=0.00;FS=22.208;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.337;QD=2.92;ReadPosRankSum=-2.521;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:293,0,1603 chrXVI 64165 . G A 137.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.932;DP=92;Dels=0.00;FS=17.003;HaplotypeScore=4.8925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQ0=0;MQRankSum=-5.131;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:167,0,1688 chrXVI 64166 . T G 131.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;DP=92;Dels=0.00;FS=17.003;HaplotypeScore=4.8925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.09;MQ0=0;MQRankSum=-5.681;QD=1.42;ReadPosRankSum=-0.637;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:161,0,1748 chrXVI 64182 . C T 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;DP=89;Dels=0.00;FS=3.588;HaplotypeScore=12.4922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQ0=0;MQRankSum=5.512;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.857;SB=-8.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,70:89:99:1622,0,188 chrXVI 64204 . C T 365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.015;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.05;MQ0=0;MQRankSum=-4.849;QD=4.40;ReadPosRankSum=-2.228;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:395,0,1331 chrXVI 64229 . G C,T 2040.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=51.87;MQ0=0;QD=23.18;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,25,63:88:99:2100,1537,1468,563,0,395 chrXVI 64299 . C T 353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.841;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-5.643;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.905;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:383,0,1594 chrXVI 64309 . G T 301.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.528;DP=89;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=-5.909;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.970;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:331,0,1558 chrXVI 64310 . C T 303.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.443;DP=89;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=-6.106;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.876;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:333,0,1541 chrXVI 64316 . G A 446.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.560;DP=113;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.99;MQ0=0;MQRankSum=-6.408;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.011;SB=-1.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,30:113:99:476,0,1917 chrXVI 64326 . T C 456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.474;DP=105;Dels=0.00;FS=4.541;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.68;MQ0=0;MQRankSum=-6.357;QD=4.34;ReadPosRankSum=1.298;SB=-8.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,29:105:99:486,0,1789 chrXVI 64400 . C T 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;DP=112;Dels=0.00;FS=14.496;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.33;MQ0=0;MQRankSum=2.560;QD=14.26;ReadPosRankSum=3.425;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,72:112:99:1627,0,656 chrXVI 64409 . C T 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.958;DP=116;Dels=0.00;FS=18.963;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.32;MQ0=0;MQRankSum=2.442;QD=12.64;ReadPosRankSum=2.564;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,76:116:99:1496,0,654 chrXVI 64426 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.286;DP=139;Dels=0.00;FS=17.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=9.45;ReadPosRankSum=3.066;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:1343,0,1271 chrXVI 64440 . A C 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.005;DP=133;Dels=0.00;FS=10.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.102;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1359,0,1180 chrXVI 64540 . A C 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.058e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2999,292,0 chrXVI 64673 . C A 3967.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=28.34;SB=-1.525e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3967,373,0 chrXVI 64722 . A G 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.278;DP=119;Dels=0.00;FS=8.499;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1181,0,1519 chrXVI 64832 . C G 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.322;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1237,0,1179 chrXVI 65188 . G A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.543;DP=150;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.096;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,67:150:99:1443,0,1775 chrXVI 65735 . A G 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.524;DP=114;Dels=0.00;FS=3.417;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.766;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.522;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1186,0,1301 chrXVI 66210 . A G 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.414;DP=122;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.529;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,71:122:99:1519,0,1088 chrXVI 66237 . C T 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.129;DP=114;Dels=0.00;FS=1.490;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1473,0,997 chrXVI 66393 . C T 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.515;DP=103;Dels=0.00;FS=4.897;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:986,0,1170 chrXVI 66527 . A G 2413 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.23;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2446,243,0 chrXVI 66703 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=89;Dels=0.00;FS=3.142;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,52:89:99:1145,0,800 chrXVI 66802 . T G 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.518;DP=133;Dels=0.00;FS=8.187;HaplotypeScore=7.4603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.064;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1621,0,1281 chrXVI 67558 . T C 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.765;DP=117;Dels=0.00;FS=12.929;HaplotypeScore=4.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.786;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:117:99:1158,0,1311 chrXVI 67723 . C A 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.710;DP=137;Dels=0.00;FS=13.303;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.037;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,80:137:99:1773,0,1211 chrXVI 68389 . C T 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;DP=146;Dels=0.01;FS=2.963;HaplotypeScore=10.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=12.32;ReadPosRankSum=-2.092;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1829,0,1299 chrXVI 68882 . G C 3287.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=24.71;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3287,345,0 chrXVI 68997 . G A 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.636;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.032;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.436;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1698,0,1761 chrXVI 69209 . G T 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.612;DP=93;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=1;MQRankSum=-0.223;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:983,0,986 chrXVI 69311 . A T 3015 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=28.71;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:3048,304,0 chrXVI 69355 . T G 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.454;DP=116;Dels=0.00;FS=2.383;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.025;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:116:99:1305,0,1274 chrXVI 69402 . T A 3291.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3291,310,0 chrXVI 69450 . G A 846.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.502;DP=101;Dels=0.00;FS=8.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.575;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,42:101:99:876,0,1310 chrXVI 69892 . T A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.955;DP=115;Dels=0.00;FS=4.550;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.579;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1399,0,1226 chrXVI 70402 . A G 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=162;Dels=0.00;FS=3.834;HaplotypeScore=2.3838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=24.42;ReadPosRankSum=1.433;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:3956,376,0 chrXVI 70567 . A C 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.37;SB=-1.457e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3250,313,0 chrXVI 70705 . A G 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.684;DP=148;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=1;MQRankSum=1.441;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.634;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,70:148:99:1402,0,1801 chrXVI 70768 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.644;DP=141;Dels=0.00;FS=1.356;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.575;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:1159,0,1969 chrXVI 72276 . T C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.685;DP=137;Dels=0.00;FS=1.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1372,0,1451 chrXVI 72506 . G T 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.706;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.217;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,52:126:99:1099,0,1568 chrXVI 72592 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.012;DP=110;Dels=0.00;FS=3.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.166;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:962,0,1391 chrXVI 72835 . C G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.746;DP=112;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.986;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:998,0,1365 chrXVI 72872 . T C 2838 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.429e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2871,285,0 chrXVI 72884 . C T 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.182;DP=106;Dels=0.00;FS=9.420;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.768;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1203,0,1196 chrXVI 72995 . C A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.709;DP=134;Dels=0.00;FS=5.678;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.889;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1556,0,1408 chrXVI 73017 . G C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.145;DP=131;Dels=0.02;FS=23.998;HaplotypeScore=5.7990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=9.40;ReadPosRankSum=2.958;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1262,0,1490 chrXVI 73047 . T G 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.114;DP=122;Dels=0.00;FS=23.977;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=10.32;ReadPosRankSum=-2.159;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1289,0,1425 chrXVI 73071 . G A 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=27.41;ReadPosRankSum=-1.141;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3372,331,0 chrXVI 73217 . G A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.481;DP=122;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=5.4478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1359,0,1327 chrXVI 73249 . T A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;DP=127;Dels=0.00;FS=3.187;HaplotypeScore=5.7077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1565,0,1397 chrXVI 73338 . C G 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.23;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3489,340,0 chrXVI 73426 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.208;DP=108;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1141,0,1188 chrXVI 73808 . G A 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.691;DP=172;Dels=0.00;FS=7.738;HaplotypeScore=5.3910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.555;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,83:172:99:1736,0,2002 chrXVI 74040 . G C 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:131:99:3605,355,0 chrXVI 74089 . A C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.873;DP=122;Dels=0.00;FS=4.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.166;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1184,0,1356 chrXVI 74327 . C T 4545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.915e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4545,454,0 chrXVI 74379 . G A 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.677;DP=152;Dels=0.00;FS=1.451;HaplotypeScore=2.9586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.179;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:1612,0,1774 chrXVI 74459 . C A 3915.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3915,373,0 chrXVI 74678 . G A 1896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.108;DP=157;Dels=0.00;FS=1.993;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.867;SB=-9.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,83:157:99:1926,0,1459 chrXVI 74884 . G C 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3952,406,0 chrXVI 74885 . C T 4064.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.951e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4064,406,0 chrXVI 75307 . G C 4361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9858;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4361,427,0 chrXVI 75329 . T C 3891.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.132e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3891,402,0 chrXVI 75355 . A G 4755.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4755,493,0 chrXVI 75433 . C T 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.268;DP=150;Dels=0.00;FS=3.940;HaplotypeScore=1.8136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.569;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1618,0,1564 chrXVI 76763 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.203;DP=142;Dels=0.00;FS=5.040;HaplotypeScore=4.5791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.183;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1286,0,1784 chrXVI 77440 . A G 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.109;DP=117;Dels=0.00;FS=4.947;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1244,0,1220 chrXVI 77446 . C T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.882;DP=121;Dels=0.00;FS=10.863;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=2.019;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.588;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1386,0,1260 chrXVI 78094 . T G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.430;DP=132;Dels=0.00;FS=4.248;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1262,0,1721 chrXVI 78691 . T A 3289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3289,331,0 chrXVI 78719 . T C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.383;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:948,0,1568 chrXVI 78752 . G T 664.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.531;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.367;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:694,0,1196 chrXVI 79268 . C A 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=25.35;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3177,304,0 chrXVI 79487 . G C 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.001;DP=136;Dels=0.00;FS=5.624;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.245;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,53:136:99:1072,0,1739 chrXVI 79492 . A G 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;DP=139;Dels=0.00;FS=6.703;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,57:139:99:1064,0,1934 chrXVI 79670 . T A 5515.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=205;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.90;SB=-2.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,205:205:99:5515,532,0 chrXVI 80834 . T C 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.672;DP=124;Dels=0.00;FS=6.959;HaplotypeScore=2.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.904;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,51:124:99:1058,0,1659 chrXVI 81157 . G A 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.129;DP=139;Dels=0.00;FS=4.049;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1603,0,1540 chrXVI 82074 . C G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.842;DP=157;Dels=0.00;FS=19.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.125;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,79:157:99:1551,0,1705 chrXVI 82177 . C T 2023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.934;DP=147;Dels=0.00;FS=5.173;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.409;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,88:147:99:2053,0,1198 chrXVI 82212 . G A 1979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.564;DP=139;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=5.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-1.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,87:139:99:2009,0,1016 chrXVI 82718 . T C 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.636;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.387;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,76:136:99:1573,0,1322 chrXVI 83595 . C T 1855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.858;DP=172;Dels=0.00;FS=2.671;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.006;SB=-9.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,84:172:99:1885,0,1848 chrXVI 84945 . G A 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.603;DP=161;Dels=0.00;FS=1.296;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.377;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1679,0,1767 chrXVI 85843 . A G 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.916e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4150,406,0 chrXVI 86406 . C T 1823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.249;DP=155;Dels=0.00;FS=3.068;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.490;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,84:155:99:1853,0,1555 chrXVI 89283 . T C 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.115;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.474;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1540,0,1521 chrXVI 90265 . G A 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.572;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.694;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1817,0,1415 chrXVI 90431 . T C 4159.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.493e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4159,406,0 chrXVI 90760 . G A 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=1;QD=27.06;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:108:99:2955,280,0 chrXVI 90904 . A T 3889.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.01;SB=-2.026e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3889,379,0 chrXVI 91018 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6974;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.17;SB=-9.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3268,328,0 chrXVI 91109 . T C 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.991;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,45:112:99:899,0,1644 chrXVI 91219 . G A 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3438,346,0 chrXVI 91357 . C T 3142 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3175,307,0 chrXVI 91540 . T C 3742.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=25.81;SB=-1.775e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3742,364,0 chrXVI 91564 . G A 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.22;SB=-2.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3723,358,0 chrXVI 91792 . A G 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.382e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3129,333,0 chrXVI 91999 . T C 2709 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2742,276,0 chrXVI 92122 . A G 3328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3328,334,0 chrXVI 92131 . C T 3331.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.727e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3331,325,0 chrXVI 92515 . T A 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.438e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3100,310,0 chrXVI 92608 . G A 4104.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=28.50;SB=-2.137e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:4104,394,0 chrXVI 93103 . C A 4258.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.95;SB=-2.134e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4258,400,0 chrXVI 93137 . T A 4393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.62;SB=-2.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4393,412,0 chrXVI 93364 . G A 4400.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=1;QD=27.50;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4400,427,0 chrXVI 93505 . A G 4156.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=26.30;SB=-1.997e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4156,423,0 chrXVI 93641 . T A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;DP=111;Dels=0.00;FS=1.511;HaplotypeScore=2.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.730;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1352,0,1160 chrXVI 93676 . G A 3969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3969,385,0 chrXVI 93712 . T C 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.162e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3253,345,0 chrXVI 93759 . G C 3836.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3836,391,0 chrXVI 93841 . C T 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.389;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=26.45;ReadPosRankSum=1.188;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3233,303,0 chrXVI 93996 . A G 3393.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=25.51;SB=-1.310e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3393,334,0 chrXVI 94145 . G A 3315.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3315,313,0 chrXVI 94218 . T C 2382 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.100e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:2415,243,0 chrXVI 94717 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.749;DP=123;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1471,0,1268 chrXVI 95333 . A G 3479.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3479,349,0 chrXVI 95804 . A G 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3583,355,0 chrXVI 96457 . T A 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3539,346,0 chrXVI 96976 . C T 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.415;DP=150;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=8.7783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=1;MQRankSum=0.699;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1757,0,1393 chrXVI 97006 . T C 2671 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.92;MQ0=1;QD=26.19;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2704,279,0 chrXVI 97582 . A G 424 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.29;MQ0=14;QD=4.99;SB=-1.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:48:457,48,0 chrXVI 97609 . A G 173.06 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.23;MQ0=11;QD=2.11;SB=-2.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:21:206,21,0 chrXVI 97621 . T C 524 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.689;DP=87;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.52;MQ0=7;MQRankSum=-1.083;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.823;SB=-2.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:60:557,60,0 chrXVI 97633 . C T 953 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.69;MQ0=5;QD=10.25;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:986,99,0 chrXVI 98068 . T C 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.04;MQ0=0;QD=25.01;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3652,367,0 chrXVI 98236 . A G 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.49;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3179,309,0 chrXVI 98320 . T C 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3051,309,0 chrXVI 98464 . C T 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3678,364,0 chrXVI 98717 . G A 4961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=26.53;SB=-2.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:4961,481,0 chrXVI 98825 . A T 3590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=27.83;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3590,358,0 chrXVI 98881 . G T 3423.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3423,322,0 chrXVI 98916 . A C 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.849;DP=118;Dels=0.00;FS=2.753;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.463;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1026,0,1339 chrXVI 98933 . T C 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.93;MQ0=0;QD=27.21;SB=-9.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3108,313,0 chrXVI 99028 . C G 3386.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=122.4792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.42;MQ0=0;QD=25.08;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3386,345,0 chrXVI 99055 . G A 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.31;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3751,376,0 chrXVI 99062 . C T 4134.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.01;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.699e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4134,406,0 chrXVI 99097 . A G 4099.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4099,400,0 chrXVI 99124 . A G 3767.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3767,358,0 chrXVI 99139 . C T 4024.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.40;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.853e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4024,382,0 chrXVI 99211 . G C 2825 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2858,294,0 chrXVI 99227 . T A 3201 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.571e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3234,316,0 chrXVI 99253 . C G 3141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.32;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.397e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3174,318,0 chrXVI 99260 . A C 2975 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3008,300,0 chrXVI 99402 . C A 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.73;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3902,388,0 chrXVI 99579 . T C 4685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=26.03;SB=-2.235e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:4685,454,0 chrXVI 99582 . A C 4470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=25.84;SB=-2.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4470,439,0 chrXVI 99598 . G A 4455.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=27.16;SB=-2.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4455,415,0 chrXVI 99819 . G C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.116;DP=128;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=4.8137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.168;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1525,0,1240 chrXVI 100197 . T C 4216.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=28.68;SB=-1.963e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4216,418,0 chrXVI 100419 . T C 3854.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3854,385,0 chrXVI 100535 . G A 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.526e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3987,397,0 chrXVI 100561 . G A 3664.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55;SB=-1.094e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3664,355,0 chrXVI 101471 . T A 3220.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.16;SB=-1.301e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3253,319,0 chrXVI 101504 . G A 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.07;MQ0=0;QD=25.95;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3043,307,0 chrXVI 101698 . C T 3609.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3029;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.907e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3609,349,0 chrXVI 101755 . A G 3636.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3636,352,0 chrXVI 101782 . C T 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.790e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3666,349,0 chrXVI 101890 . C T 4055.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=28.36;SB=-2.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:4055,394,0 chrXVI 101962 . T C 3202 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=25.62;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3235,325,0 chrXVI 102121 . G A 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3375,337,0 chrXVI 102244 . A C 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3951,385,0 chrXVI 102331 . T C 3562.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.793e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3562,361,0 chrXVI 102343 . G T 4125.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.78;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4125,417,0 chrXVI 102370 . C T 3910.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3910,382,0 chrXVI 102421 . A G 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.685;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=25.50;ReadPosRankSum=0.854;SB=-1.703e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,145:146:99:3723,373,0 chrXVI 102546 . A G 4330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.89;SB=-2.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4330,412,0 chrXVI 102652 . T C 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.832e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3581,361,0 chrXVI 102764 . C T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.696;DP=128;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1366,0,1453 chrXVI 102792 . T C 3301.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.589e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3301,322,0 chrXVI 102899 . A G 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3568,352,0 chrXVI 102946 . G C 3097 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.270;DP=120;Dels=0.00;FS=3.468;HaplotypeScore=3.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.472;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:3130,294,0 chrXVI 103007 . A C 2950 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.18;SB=-9.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:2983,318,0 chrXVI 103016 . A T 3660.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=28.15;SB=-9.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3660,358,0 chrXVI 103114 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.068;DP=105;Dels=0.00;FS=6.522;HaplotypeScore=3.5096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.157;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1202,0,1117 chrXVI 103137 . A G 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2485,255,0 chrXVI 103531 . T C 3332.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3332,337,0 chrXVI 103537 . G A 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.083e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3167,310,0 chrXVI 103612 . C T 3157 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8368;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=25.88;ReadPosRankSum=-1.562;SB=-1.729e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3190,283,0 chrXVI 103942 . C T 3148 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.686e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3181,316,0 chrXVI 104047 . G A 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.381e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2816,268,0 chrXVI 104203 . T C 2594 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.462e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2627,264,0 chrXVI 104284 . A G 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.524e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3074,315,0 chrXVI 104305 . T C 3867.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78;SB=-2.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3867,376,0 chrXVI 104428 . C T 3118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3151,310,0 chrXVI 104443 . T C 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.410e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3089,312,0 chrXVI 104754 . T C 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.90;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2649,270,0 chrXVI 104784 . C T 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.39;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3155,304,0 chrXVI 104905 . A T 4122.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.249;DP=160;Dels=0.00;FS=13.245;HaplotypeScore=4.6762;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=2.264;QD=25.76;ReadPosRankSum=2.388;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,157:160:99:4122,403,0 chrXVI 105255 . A T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;DP=131;Dels=0.00;FS=1.399;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1375,0,1542 chrXVI 105267 . C T 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.162;DP=128;Dels=0.00;FS=3.203;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.239;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1490,0,1251 chrXVI 105282 . C T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.024;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=13.27;ReadPosRankSum=-1.579;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:111:99:1503,0,899 chrXVI 105285 . C T 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.422e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3080,301,0 chrXVI 105527 . G A 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6248;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=23.95;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3098,295,0 chrXVI 105791 . G C 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3830,379,0 chrXVI 105814 . A G 1130.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.448;DP=133;Dels=0.00;FS=3.019;HaplotypeScore=3.7797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.337;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,60:133:99:1160,0,1571 chrXVI 105817 . T A 3352.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7840;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=25.39;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3352,337,0 chrXVI 105820 . C G 1362.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.306;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.531;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1392,0,1280 chrXVI 105834 . A C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.093;DP=134;Dels=0.00;FS=5.657;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.723;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1368,0,1492 chrXVI 105948 . T C 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.452;DP=170;Dels=0.00;FS=2.094;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.397;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,73:170:99:1569,0,2238 chrXVI 105953 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.420;DP=164;Dels=0.00;FS=1.322;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.098;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,72:164:99:1548,0,2036 chrXVI 105960 . T C 4436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.60;MQ0=0;QD=25.79;SB=-1.821e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4436,433,0 chrXVI 105969 . A T 4238.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.84;MQ0=0;QD=25.08;SB=-2.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4238,400,0 chrXVI 106014 . A C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.673;DP=136;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1093,0,1771 chrXVI 106082 . C T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.217;DP=132;Dels=0.00;FS=2.207;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.859;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:132:99:1370,0,1347 chrXVI 106109 . C T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.215;DP=143;Dels=0.00;FS=2.090;HaplotypeScore=5.6735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.270;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:143:99:1460,0,1594 chrXVI 106351 . T C 3662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3662,367,0 chrXVI 106450 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.669;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:123:99:1054,0,1514 chrXVI 106464 . A C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.749;DP=113;Dels=0.00;FS=8.730;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1368,0,1154 chrXVI 106600 . G A 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3585,349,0 chrXVI 106651 . T C 3398.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3398,354,0 chrXVI 106953 . C A 2638 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2671,270,0 chrXVI 106996 . G A 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.073e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3108,307,0 chrXVI 107325 . C T 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=28.16;SB=-1.542e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3074,307,0 chrXVI 107437 . A G 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3475,363,0 chrXVI 107490 . A G 2592 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=23.14;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2625,273,0 chrXVI 107496 . T C 2481 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=18.94;SB=-1.658e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2514,264,0 chrXVI 107538 . G A 2414 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=19.31;SB=-1.579e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2447,246,0 chrXVI 107715 . G A 2983 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=21.31;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3016,301,0 chrXVI 107736 . G A 2740 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=22.83;SB=-1.128e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2773,277,0 chrXVI 107814 . T A 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=22.72;SB=-2.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:3545,349,0 chrXVI 108230 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.534e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3265,325,0 chrXVI 108300 . A G 3060 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.50;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3093,309,0 chrXVI 108350 . T C 2602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2635,267,0 chrXVI 108611 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.642;DP=135;Dels=0.00;FS=11.526;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.716;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.140;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1349,0,1547 chrXVI 108820 . G A 3571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=27.68;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3571,349,0 chrXVI 108924 . C T 3700.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.684;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=25.87;ReadPosRankSum=1.320;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3700,364,0 chrXVI 108940 . C T 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.173e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3419,331,0 chrXVI 108966 . G A 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=23.55;SB=-1.222e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3118,304,0 chrXVI 109055 . C G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;DP=114;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1201,0,1117 chrXVI 109104 . G A 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.611e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3420,334,0 chrXVI 110058 . T C 4351.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.71;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4351,427,0 chrXVI 110256 . C A 3882.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.983e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3882,376,0 chrXVI 110310 . A G 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3721,387,0 chrXVI 110345 . G A 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.902e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:144:99:4030,394,0 chrXVI 110658 . C T 4431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.32;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4431,436,0 chrXVI 110811 . C A 3709.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3709,361,0 chrXVI 110925 . T C 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.940e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3821,396,0 chrXVI 110946 . A G 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.953e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3753,379,0 chrXVI 111609 . T C 3631.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.724e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3631,370,0 chrXVI 111675 . G T 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.740;DP=110;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=10.02;ReadPosRankSum=-1.078;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:110:99:1132,0,1253 chrXVI 111711 . A G 2379 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=25.86;SB=-9.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2412,243,0 chrXVI 111813 . C T 4068.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4068,394,0 chrXVI 111924 . C T 5163.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.938;DP=198;Dels=0.00;FS=6.545;HaplotypeScore=4.5403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=2.400;QD=26.08;ReadPosRankSum=2.412;SB=-2.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,195:197:99:5163,455,0 chrXVI 111979 . T C 3897.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.20;SB=-1.979e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:3897,403,0 chrXVI 112440 . C T 3438.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.1403;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3438,322,0 chrXVI 112935 . T C 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-1.943e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3462,354,0 chrXVI 113074 . G A 2867 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2900,271,0 chrXVI 113130 . C T 4239.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=28.84;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4239,415,0 chrXVI 113838 . C T 4842.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=28.15;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4842,475,0 chrXVI 113880 . T C 4249.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=27.41;SB=-2.021e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4249,424,0 chrXVI 114050 . G A 4692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7063;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.12;SB=-2.523e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4692,463,0 chrXVI 114105 . T A 4566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4566,454,0 chrXVI 114171 . A G 3431.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3431,346,0 chrXVI 114192 . A G 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5678;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=24.01;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2914,309,0 chrXVI 114225 . T A 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.48;MQ0=0;QD=25.42;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3007,298,0 chrXVI 114231 . A G 3323.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=24.61;SB=-1.283e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3323,336,0 chrXVI 114414 . C T 4129.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.09;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4129,391,0 chrXVI 114421 . C T 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.31;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.785e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3809,361,0 chrXVI 114437 . G A 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.91;MQ0=0;QD=24.54;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3484,346,0 chrXVI 114578 . T C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;DP=121;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=4.4303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.029;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1299,0,1266 chrXVI 115128 . T C 4170.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.58;SB=-1.521e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,163:163:99:4170,412,0 chrXVI 115153 . T C 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:150:99:3932,396,0 chrXVI 115170 . G T 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.99;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3156,310,0 chrXVI 115252 . G A 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3647,358,0 chrXVI 115323 . C A 3792.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3792,367,0 chrXVI 115934 . C T 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.64;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.428e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3739,358,0 chrXVI 116036 . C T 3077 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3110,307,0 chrXVI 116082 . G A 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3439,331,0 chrXVI 116203 . C A 3344.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.5055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.87;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=26.13;ReadPosRankSum=1.705;SB=-9.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3344,306,0 chrXVI 116214 . A G 3179 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.706;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3458;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=23.55;ReadPosRankSum=1.424;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:3212,348,0 chrXVI 116308 . G C 2176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2209,231,0 chrXVI 116322 . T C 2391 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.48;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2424,249,0 chrXVI 116448 . C T 3435.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3435,340,0 chrXVI 116499 . T C 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=24.93;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3074,315,0 chrXVI 116689 . A G 2613 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=27.51;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:95:99:2646,270,0 chrXVI 116904 . C T 3595.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.88;MQ0=0;QD=28.31;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3595,361,0 chrXVI 116947 . T G 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.84;MQ0=0;QD=26.19;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3326,331,0 chrXVI 117148 . G A 3031 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.40;MQ0=0;QD=24.84;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3064,313,0 chrXVI 117201 . G A 1408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.755;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=29.5846;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.68;MQ0=0;MQRankSum=2.013;QD=13.41;ReadPosRankSum=-7.949;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,74:105:99:1441,147,0 chrXVI 117204 . G A 1081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.082;DP=95;Dels=0.00;FS=5.725;HaplotypeScore=31.5724;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.943;QD=11.38;ReadPosRankSum=3.555;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,79:95:99:1114,114,0 chrXVI 117213 . G C 732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;DP=109;Dels=0.00;FS=2.566;HaplotypeScore=46.4552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.725;QD=6.72;ReadPosRankSum=-8.581;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,38:109:40:762,0,40 chrXVI 117215 . A T 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.144;DP=109;Dels=0.00;FS=2.566;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.771;QD=7.00;ReadPosRankSum=-8.581;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,38:109:39:793,0,39 chrXVI 117225 . C T 233.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.35;MQ0=0;QD=3.11;SB=-9.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:27:266,27,0 chrXVI 117230 . C T 290.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.311;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=3.93;ReadPosRankSum=1.545;SB=-7.838e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,73:74:10:323,10,0 chrXVI 117298 . A G 2654 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.65;MQ0=0;QD=20.42;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2687,276,0 chrXVI 117481 . C T 4030.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4030,373,0 chrXVI 119014 . G A 2939 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=28.26;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2972,286,0 chrXVI 119106 . G A 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3067,304,0 chrXVI 120257 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.703;DP=116;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.624;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,63:116:99:1445,0,1156 chrXVI 120608 . A G 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.430;DP=113;Dels=0.00;FS=4.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.449;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:948,0,1534 chrXVI 120832 . C T 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.223;DP=97;Dels=0.00;FS=7.024;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=12.01;ReadPosRankSum=2.019;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1195,0,954 chrXVI 120838 . G C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.680;DP=98;Dels=0.00;FS=8.485;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.975;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1198,0,938 chrXVI 120844 . C T 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.196;DP=97;Dels=0.00;FS=4.100;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.505;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,54:97:99:1294,0,861 chrXVI 121129 . A G 2945 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.39;SB=-9.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2978,309,0 chrXVI 121136 . C T 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3354,319,0 chrXVI 121193 . G A 2710 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2743,270,0 chrXVI 121484 . A G 3575.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7945;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.09;SB=-1.964e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3575,352,0 chrXVI 121557 . G A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.936;DP=121;Dels=0.00;FS=5.479;HaplotypeScore=4.3375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.376;SB=-2.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1465,0,1272 chrXVI 121751 . G A 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.623;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.961;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1526,0,1608 chrXVI 121974 . A G 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;DP=125;Dels=0.00;FS=4.288;HaplotypeScore=1.9053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.082;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,65:125:99:1480,0,1354 chrXVI 122105 . A G 3653.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5484;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3653,361,0 chrXVI 122198 . T C 3203 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9807;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.221;SB=-1.327e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:3236,319,0 chrXVI 122473 . T C 3356.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.778e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3356,349,0 chrXVI 122545 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.763;DP=145;Dels=0.00;FS=1.308;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=9.84;ReadPosRankSum=2.051;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1457,0,1603 chrXVI 122553 . T C 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.874;DP=139;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.644;QD=10.95;ReadPosRankSum=-2.926;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1552,0,1493 chrXVI 122567 . A G 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3389,337,0 chrXVI 122768 . G A 3561.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3561,349,0 chrXVI 122948 . A G 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3058,310,0 chrXVI 123092 . G A 3067 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.061e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3100,310,0 chrXVI 123188 . G A 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3392,322,0 chrXVI 123251 . C T 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=28.17;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3244,316,0 chrXVI 123279 . G A 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.861;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.579;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:1012,0,1416 chrXVI 123366 . G A 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.372e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2566,243,0 chrXVI 123448 . A G 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.790;DP=116;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=3.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1166,0,1396 chrXVI 123457 . C T 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;DP=130;Dels=0.00;FS=3.224;HaplotypeScore=2.9524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:130:99:1248,0,1540 chrXVI 123705 . T C 3145 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3178,319,0 chrXVI 123818 . T C 2551 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2584,270,0 chrXVI 124031 . C T 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.06;MQ0=0;QD=28.73;SB=-1.374e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3763,370,0 chrXVI 124049 . G A 3602.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3602,349,0 chrXVI 124058 . T C 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3329,340,0 chrXVI 124079 . A T 3675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3675,364,0 chrXVI 124091 . G A 4350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.94;MQ0=0;QD=27.02;SB=-2.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4350,427,0 chrXVI 124217 . A G 4011.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=24.16;SB=-2.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4011,382,0 chrXVI 124241 . A G 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.63;SB=-1.962e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3861,373,0 chrXVI 124331 . G A 3776.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.794e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3776,373,0 chrXVI 124436 . T C 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.123e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2957,309,0 chrXVI 124589 . G A 3568.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3568,352,0 chrXVI 124718 . T C 2642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2675,276,0 chrXVI 124850 . T C 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.55;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3501,352,0 chrXVI 125264 . G A 3176 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3209,325,0 chrXVI 125270 . C T 3424.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3424,343,0 chrXVI 125654 . G A 2808 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.584e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2841,282,0 chrXVI 125670 . T C 929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.627;DP=100;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:959,0,1280 chrXVI 125732 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;DP=126;Dels=0.00;FS=2.271;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.532;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1421,0,1356 chrXVI 125867 . G A 4149.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.686;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7794;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=27.85;ReadPosRankSum=1.616;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:4149,385,0 chrXVI 125957 . C T 4018.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.71;SB=-1.744e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4018,397,0 chrXVI 126095 . T C 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2786,285,0 chrXVI 126582 . A G 3439.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3751;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.25;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.412e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3439,319,0 chrXVI 126808 . C T 3090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3123,298,0 chrXVI 126838 . A G 3150 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=1;QD=24.61;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3183,315,0 chrXVI 127009 . C A 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.797e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3947,379,0 chrXVI 127059 . A G 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.509;DP=166;Dels=0.00;FS=0.582;HaplotypeScore=5.0885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=10.10;ReadPosRankSum=-2.057;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,83:166:99:1706,0,1878 chrXVI 127372 . G A 4062.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4329;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4062,385,0 chrXVI 127391 . G A 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.689;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=24.39;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-1.826e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:160:99:3902,379,0 chrXVI 127855 . C T 1777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.607;DP=183;Dels=0.00;FS=0.545;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=2.194;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.471;SB=-9.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,86:183:99:1807,0,2013 chrXVI 127859 . C T 1858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.745;DP=170;Dels=0.00;FS=1.183;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.393;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,87:170:99:1888,0,1842 chrXVI 127901 . C T 4409.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.927e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4409,436,0 chrXVI 127985 . C T 4571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9595;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.12;SB=-2.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4571,439,0 chrXVI 128020 . A G 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.684;DP=157;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=2.6538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.916;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,66:157:99:1323,0,2141 chrXVI 128382 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.527;DP=131;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.790;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1530,0,1361 chrXVI 128545 . A C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.989;DP=103;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.645;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:962,0,1266 chrXVI 128692 . A G 3368.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.88;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3368,348,0 chrXVI 128710 . G A 3210.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.87;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.792e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3244,316,0 chrXVI 128722 . T C 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.703;DP=118;Dels=0.00;FS=3.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2902,300,0 chrXVI 128735 . C T 3053 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.676;DP=123;Dels=0.00;FS=3.656;HaplotypeScore=4.8553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.74;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=24.82;ReadPosRankSum=1.366;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:3086,298,0 chrXVI 128864 . G A 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.797;DP=145;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=5.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=1;MQRankSum=0.818;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.312;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:1421,0,1748 chrXVI 129873 . G C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.684;DP=121;Dels=0.00;FS=1.480;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.253;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1108,0,1519 chrXVI 130093 . G A 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.351;DP=141;Dels=0.00;FS=2.998;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=10.77;ReadPosRankSum=3.734;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1548,0,1299 chrXVI 132625 . A G 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=22.79;SB=-1.709e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3373,351,0 chrXVI 132681 . G T 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.82;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3307,325,0 chrXVI 132683 . C T 3367.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=25.90;SB=-1.689e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3367,334,0 chrXVI 132693 . C T 3442.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.82;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3442,346,0 chrXVI 132779 . C A 4104.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=27.92;SB=-2.024e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4104,400,0 chrXVI 132838 . A C 3336.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.94;MQ0=0;QD=28.03;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3336,337,0 chrXVI 132855 . T C 2917 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.377e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2950,306,0 chrXVI 132863 . A T 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.968;DP=127;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=8.61;ReadPosRankSum=-1.365;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:1124,0,1684 chrXVI 132909 . A G 2966 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2999,321,0 chrXVI 132915 . A G 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=25.69;SB=-1.557e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3141,319,0 chrXVI 133186 . G A 4300.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.54;SB=-2.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4300,415,0 chrXVI 133388 . C G 4235.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=1;QD=25.21;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4235,435,0 chrXVI 134182 . G A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.298;DP=162;Dels=0.00;FS=3.653;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-9.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,79:162:99:1623,0,1868 chrXVI 135960 . T C 2444 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.83;MQ0=8;QD=24.20;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2477,255,0 chrXVI 136535 . A G 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.183;DP=147;Dels=0.00;FS=2.094;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.037;SB=-9.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,85:147:99:1767,0,1380 chrXVI 137712 . G A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.239;DP=104;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=2.7933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=10.22;ReadPosRankSum=2.787;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:1093,0,1188 chrXVI 137748 . T C 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.990;DP=99;Dels=0.00;FS=3.813;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.488;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:950,0,1254 chrXVI 138435 . G A 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.343;DP=119;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.625;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1410,0,1284 chrXVI 138601 . A G 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.760;DP=99;Dels=0.00;FS=2.643;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1035,0,1114 chrXVI 138747 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.351;DP=108;Dels=0.01;FS=9.692;HaplotypeScore=2.9297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.78;MQ0=0;MQRankSum=2.005;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.550;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1111,0,1188 chrXVI 139660 . C T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.237;DP=132;Dels=0.00;FS=8.111;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-2.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:132:99:1383,0,1439 chrXVI 139685 . G T 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.576;DP=126;Dels=0.00;FS=1.700;HaplotypeScore=2.7213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1452,0,1361 chrXVI 139893 . T A 1726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;DP=137;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.097;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1756,0,1280 chrXVI 140178 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.835;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1033,0,1213 chrXVI 140259 . A G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;DP=136;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.155;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,66:136:99:1474,0,1568 chrXVI 140372 . A G 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.646;DP=106;Dels=0.00;FS=3.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.967;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1243,0,1068 chrXVI 140784 . G A 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.037;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.173;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1400,0,1163 chrXVI 141211 . C T 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.938;DP=104;Dels=0.00;FS=0.750;HaplotypeScore=4.2745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.457;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,44:104:99:955,0,1385 chrXVI 141213 . T G 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.310;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.310;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:844,0,1380 chrXVI 141255 . G A 726.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;DP=104;Dels=0.00;FS=5.197;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:756,0,1492 chrXVI 141321 . A G 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.242;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=11.80;ReadPosRankSum=-2.409;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,56:98:99:1186,0,940 chrXVI 141645 . G C 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;DP=103;Dels=0.00;FS=1.633;HaplotypeScore=3.7039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:985,0,1067 chrXVI 141675 . G A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.999;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.617;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1172,0,1001 chrXVI 141900 . C T 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.721;DP=133;Dels=0.00;FS=1.367;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1175,0,1626 chrXVI 141903 . A C 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.154;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.308;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1117,0,1626 chrXVI 142077 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;DP=100;Dels=0.00;FS=11.544;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.156;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1256,0,1013 chrXVI 142384 . A T 1871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;DP=142;Dels=0.00;FS=16.212;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.266;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.369;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1901,0,1270 chrXVI 142584 . C T 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.996;DP=152;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.692;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1815,0,1406 chrXVI 143261 . C T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.051;DP=117;Dels=0.00;FS=3.579;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.264;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1151,0,1459 chrXVI 143293 . C T 900.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.779;DP=115;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.175;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,47:115:99:930,0,1552 chrXVI 143341 . C G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.206;DP=131;Dels=0.00;FS=6.430;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.015;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1285,0,1401 chrXVI 143342 . T A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.642;DP=132;Dels=0.00;FS=6.476;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.174;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1330,0,1414 chrXVI 143363 . T C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.840;DP=133;Dels=0.00;FS=3.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.293;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.957;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1241,0,1505 chrXVI 143447 . A T 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.025;DP=111;Dels=0.00;FS=6.254;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=1;MQRankSum=-1.137;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.267;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,45:111:99:872,0,1555 chrXVI 143547 . T G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;DP=164;Dels=0.00;FS=1.247;HaplotypeScore=6.8019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,73:164:99:1514,0,2099 chrXVI 143626 . A C 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;DP=120;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=2.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.228;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1210,0,1451 chrXVI 143745 . A G 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.523;DP=116;Dels=0.00;FS=4.881;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.837;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,72:116:99:1537,0,972 chrXVI 143773 . T C 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.979;DP=123;Dels=0.00;FS=2.326;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.637;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1546,0,1128 chrXVI 143839 . A G 395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.697;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.837;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,42:110:99:425,0,1591 chrXVI 143841 . G A 384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.587;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.806;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,43:115:99:414,0,1642 chrXVI 143864 . G A 953.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.530;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,44:107:99:983,0,1452 chrXVI 143869 . T G 762.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.056;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.415;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,41:103:99:792,0,1459 chrXVI 143870 . C T 2800 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.18;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.393e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2833,280,0 chrXVI 143935 . G A 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.409;DP=111;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=2.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,46:111:99:936,0,1498 chrXVI 143952 . G A 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.906;DP=105;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1037,0,1177 chrXVI 143955 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.436;DP=107;Dels=0.00;FS=3.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.215;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1036,0,1222 chrXVI 144102 . C T 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.497;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.231;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:857,0,1510 chrXVI 144148 . G A 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.861;DP=104;Dels=0.00;FS=0.733;HaplotypeScore=2.5689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.160;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:1000,0,1214 chrXVI 144194 . G A 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.144;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.764;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:1054,0,1001 chrXVI 144259 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.917;DP=103;Dels=0.00;FS=3.719;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.750;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1305,0,952 chrXVI 144415 . C T 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.389;DP=105;Dels=0.00;FS=1.567;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1008,0,1207 chrXVI 144429 . G A 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.878;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.730;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:999,0,1255 chrXVI 144486 . T C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.983;DP=133;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.088;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,58:133:99:1199,0,1675 chrXVI 144828 . C T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.759;DP=106;Dels=0.00;FS=2.657;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1236,0,1035 chrXVI 145251 . A G 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.255;DP=126;Dels=0.00;FS=2.888;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.146;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,71:126:99:1587,0,1251 chrXVI 145367 . T G 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3131,321,0 chrXVI 145599 . C G 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;DP=135;Dels=0.00;FS=2.269;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.788;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1718,0,1221 chrXVI 145885 . A G 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3058,309,0 chrXVI 145943 . T C 3462.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3462,346,0 chrXVI 145985 . T A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;DP=138;Dels=0.00;FS=10.414;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.611;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1360,0,1681 chrXVI 146064 . C T 3692.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7306;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3692,352,0 chrXVI 146345 . T C 2847 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2880,294,0 chrXVI 146933 . C T 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.534;DP=107;Dels=0.00;FS=2.905;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1355,0,913 chrXVI 146953 . G A 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.111;DP=122;Dels=0.00;FS=2.603;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=12.51;ReadPosRankSum=2.335;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:1556,0,1201 chrXVI 146964 . G A 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.846;DP=138;Dels=0.00;FS=0.727;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=11.88;ReadPosRankSum=2.146;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1669,0,1418 chrXVI 147091 . C T 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.061;DP=135;Dels=0.00;FS=2.204;HaplotypeScore=4.3282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.143;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:135:99:1502,0,1308 chrXVI 147195 . T C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.155;DP=109;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.852;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:1044,0,1300 chrXVI 147209 . C T 2869 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.99;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2902,280,0 chrXVI 147215 . T C 981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.976;DP=114;Dels=0.00;FS=3.511;HaplotypeScore=3.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.581;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1011,0,1390 chrXVI 147254 . T C 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.590;DP=97;Dels=0.00;FS=15.854;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.682;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:1018,0,1096 chrXVI 147305 . C T 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.950;DP=119;Dels=0.00;FS=5.682;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.114;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1349,0,1255 chrXVI 147862 . A G 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.590;DP=146;Dels=0.00;FS=10.130;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.944;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1055,0,1400 chrXVI 147893 . A T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.322;DP=139;Dels=0.00;FS=10.429;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.94;ReadPosRankSum=2.033;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1272,0,1386 chrXVI 147934 . C T 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.334;DP=111;Dels=0.00;FS=4.795;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.912;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1378,0,1089 chrXVI 148159 . T C 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.477;DP=157;Dels=0.00;FS=1.302;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1522,0,1837 chrXVI 149067 . G A 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.731;DP=112;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.725;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1141,0,1185 chrXVI 149280 . T C 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.982;DP=113;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.708;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1077,0,1467 chrXVI 149427 . T G 3413.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3413,340,0 chrXVI 149499 . A T 3723.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.636e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:3723,358,0 chrXVI 149586 . C T 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.087;DP=143;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.035;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1790,0,1238 chrXVI 150165 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.656;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.617;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1075,0,1418 chrXVI 150219 . C A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.288;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.910;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1365,0,1337 chrXVI 150295 . C T 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.611;DP=106;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1130,0,1083 chrXVI 150328 . A G 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.957;DP=111;Dels=0.00;FS=2.436;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.941;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1172,0,1192 chrXVI 150444 . G C 945.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=110;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.300;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:975,0,1469 chrXVI 150500 . T C 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.307;DP=94;Dels=0.00;FS=0.856;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.205;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,41:94:99:833,0,1231 chrXVI 151045 . A G 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=2.392;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.899;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1280,0,1603 chrXVI 151111 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.030;DP=135;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.746;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1499,0,1395 chrXVI 151173 . G A 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.724;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.232;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1094,0,1671 chrXVI 151359 . C T 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.361;DP=150;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1533,0,1653 chrXVI 151370 . A G 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.305;DP=155;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.117;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:155:99:1410,0,1851 chrXVI 151590 . A C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;DP=121;Dels=0.00;FS=1.461;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.946;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1393,0,1184 chrXVI 151591 . G T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.714;DP=119;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1453,0,1136 chrXVI 151839 . C T 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.459;DP=99;Dels=0.00;FS=0.746;HaplotypeScore=2.8246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:842,0,1169 chrXVI 152392 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.746;DP=118;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.323;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1279,0,1322 chrXVI 152472 . A G 3012 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.066e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3045,306,0 chrXVI 153638 . C G 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;DP=121;Dels=0.00;FS=4.603;HaplotypeScore=4.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.499;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.252;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:962,0,1523 chrXVI 153797 . T C 1526.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.427;DP=119;Dels=0.00;FS=8.833;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,70:119:99:1556,0,995 chrXVI 154089 . C T 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.619;DP=147;Dels=0.00;FS=6.011;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.541;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1765,0,1388 chrXVI 154283 . A C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;DP=110;Dels=0.00;FS=3.557;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=2.164;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.281;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1231,0,1225 chrXVI 154404 . T C 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.057;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.710;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1472,0,1281 chrXVI 155088 . T G 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.306;DP=118;Dels=0.00;FS=5.792;HaplotypeScore=2.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=7.74;ReadPosRankSum=1.633;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,47:118:99:943,0,1685 chrXVI 155901 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.637;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.178;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1401,0,1536 chrXVI 156304 . T A 675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;DP=97;Dels=0.00;FS=2.715;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=1.982;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.091;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,53:97:99:705,0,958 chrXVI 156322 . A C 829.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.850;DP=100;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.892;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:859,0,1234 chrXVI 156324 . A T 868.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;DP=100;Dels=0.00;FS=1.607;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.109;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.870;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:100:99:898,0,1251 chrXVI 156325 . A T 894.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;DP=99;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.460;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:924,0,1242 chrXVI 156326 . A T 883.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;DP=99;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.708;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:913,0,1249 chrXVI 156328 . G T 880.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.323;DP=102;Dels=0.00;FS=0.732;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.555;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,46:102:99:910,0,1212 chrXVI 156745 . A G 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.434;DP=129;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.817;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1076,0,1713 chrXVI 156772 . C T 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.600;DP=126;Dels=0.00;FS=5.662;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.857;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1319,0,1460 chrXVI 157351 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.359;DP=100;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.596;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1127,0,1068 chrXVI 157382 . C T 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.985;DP=82;Dels=0.00;FS=1.832;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.640;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,46:82:99:1106,0,772 chrXVI 157615 . T C 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.498;DP=130;Dels=0.00;FS=4.290;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.902;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,74:130:99:1627,0,1174 chrXVI 157667 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.146;DP=111;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.646;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1376,0,1033 chrXVI 157671 . T C 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.541;DP=113;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.148;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:1263,0,1033 chrXVI 157700 . G A 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.365;DP=120;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=9.2144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.730;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1262,0,1234 chrXVI 158238 . A T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;DP=126;Dels=0.00;FS=3.235;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.856;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1459,0,1438 chrXVI 159936 . T A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;DP=155;Dels=0.00;FS=1.271;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=2.205;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.486;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:155:99:1531,0,1929 chrXVI 160037 . C G 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;DP=120;Dels=0.00;FS=4.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.055;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1237,0,1350 chrXVI 160318 . T C 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;DP=99;Dels=0.00;FS=3.847;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.020;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:779,0,1356 chrXVI 160357 . G A 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.660;DP=104;Dels=0.00;FS=0.753;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.363;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,39:104:99:784,0,1459 chrXVI 160565 . T A 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;DP=151;Dels=0.00;FS=3.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.717;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1646,0,1787 chrXVI 160706 . A G 891.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.210;DP=121;Dels=0.00;FS=5.781;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.984;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,47:121:99:921,0,1723 chrXVI 160743 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.127;DP=147;Dels=0.00;FS=6.136;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=7.53;ReadPosRankSum=-2.632;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,61:147:99:1137,0,2069 chrXVI 160790 . C T 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.758;DP=140;Dels=0.00;FS=7.913;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=9.29;ReadPosRankSum=2.962;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:1331,0,1847 chrXVI 160868 . A G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.691;DP=104;Dels=0.01;FS=5.005;HaplotypeScore=14.3147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.255;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:890,0,1310 chrXVI 160904 . T C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.934;DP=123;Dels=0.00;FS=5.631;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.918;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:924,0,1632 chrXVI 160964 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.141;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.322;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1267,0,1232 chrXVI 160974 . A T 1250.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;DP=125;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=10.00;ReadPosRankSum=2.022;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1280,0,1489 chrXVI 161120 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.708;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=2.602;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.115;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:129:99:1208,0,1493 chrXVI 161456 . C T 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.942;DP=120;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.472;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1260,0,1366 chrXVI 161462 . C T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.732;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.504;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1119,0,1314 chrXVI 161489 . C T 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.007;DP=112;Dels=0.00;FS=4.660;HaplotypeScore=3.1507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1152,0,1220 chrXVI 161510 . T C 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.214;DP=121;Dels=0.00;FS=5.677;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.065;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1115,0,1446 chrXVI 161519 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.266;DP=120;Dels=0.00;FS=4.480;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1178,0,1253 chrXVI 161768 . A G 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.771;DP=100;Dels=0.00;FS=5.223;HaplotypeScore=2.5309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:998,0,1185 chrXVI 161856 . G A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.889;DP=115;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=1.9861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.122;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1295,0,1161 chrXVI 161895 . G A 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.763;DP=113;Dels=0.00;FS=3.499;HaplotypeScore=2.6377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.139;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.497;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1164,0,1247 chrXVI 161906 . A G 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.502;DP=115;Dels=0.00;FS=6.045;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.464;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.031;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,57:115:99:1074,0,1413 chrXVI 161921 . G A 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.437;DP=121;Dels=0.00;FS=8.764;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1221,0,1308 chrXVI 161945 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.122;DP=128;Dels=0.00;FS=5.765;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1262,0,1482 chrXVI 161957 . G A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.792;DP=129;Dels=0.00;FS=3.395;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.714;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1422,0,1456 chrXVI 161996 . A T 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.196;DP=109;Dels=0.00;FS=11.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.794;SB=-3.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1301,0,1158 chrXVI 162203 . A G 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.456;DP=110;Dels=0.00;FS=4.681;HaplotypeScore=2.9833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.323;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1163,0,1145 chrXVI 162442 . T G 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.714;DP=97;Dels=0.00;FS=3.266;HaplotypeScore=1.8154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.366;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.533;SB=-1.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:839,0,1214 chrXVI 162451 . A G 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.844;DP=96;Dels=0.00;FS=7.026;HaplotypeScore=2.5606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.508;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.852;SB=-1.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:96:99:878,0,1125 chrXVI 162487 . G A 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;DP=83;Dels=0.00;FS=13.322;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=10.94;ReadPosRankSum=-3.505;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,47:83:99:938,0,783 chrXVI 162525 . G A 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.018;DP=102;Dels=0.00;FS=11.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=11.83;ReadPosRankSum=3.420;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1237,0,978 chrXVI 162596 . A G 755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.679;DP=87;Dels=0.00;FS=2.897;HaplotypeScore=38.7538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.970;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.464;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,37:87:99:785,0,1156 chrXVI 162746 . T C 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.276;DP=139;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.621;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1519,0,1574 chrXVI 162788 . A G 1685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.358;DP=154;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1715,0,1610 chrXVI 162815 . A G 1478.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.690;DP=133;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=4.6071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.721;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.523;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:133:99:1508,0,1273 chrXVI 162884 . A T 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.008;DP=140;Dels=0.00;FS=4.109;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.396;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,78:140:99:1724,0,1308 chrXVI 163022 . G A 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.294;DP=140;Dels=0.00;FS=5.071;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1437,0,1672 chrXVI 163025 . G A 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.905;DP=137;Dels=0.00;FS=4.097;HaplotypeScore=1.9203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.302;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1299,0,1592 chrXVI 163124 . G A 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.252;DP=106;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1077,0,1312 chrXVI 163127 . A G 1023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.041;DP=112;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1053,0,1423 chrXVI 163169 . C T 1018.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.045;DP=100;Dels=0.00;FS=5.474;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1048,0,1164 chrXVI 163239 . A G 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.560;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.114;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1519,0,1244 chrXVI 163301 . T A 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;DP=141;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1753,0,1366 chrXVI 163323 . G A 1768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.076;DP=146;Dels=0.00;FS=0.614;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.185;SB=-9.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1798,0,1377 chrXVI 163406 . G T 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.889;DP=132;Dels=0.00;FS=7.809;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.404;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1515,0,1257 chrXVI 163412 . C A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.034;DP=132;Dels=0.00;FS=14.518;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.542;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1494,0,1318 chrXVI 163460 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.506;DP=134;Dels=0.00;FS=4.156;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:133:99:1462,0,1385 chrXVI 163478 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.105;DP=121;Dels=0.00;FS=10.566;HaplotypeScore=6.1191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.109;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1259,0,1448 chrXVI 163627 . C A 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.230;DP=110;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=10.38;ReadPosRankSum=2.057;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1172,0,1252 chrXVI 163732 . T C 874.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.264;DP=106;Dels=0.00;FS=15.334;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.023;SB=-2.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,44:106:99:904,0,1423 chrXVI 163733 . G T 2841 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.413e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2874,274,0 chrXVI 163777 . C A 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.269;DP=129;Dels=0.00;FS=11.251;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.869;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:129:99:1594,0,1199 chrXVI 163842 . G A 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.387;DP=128;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.590;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1416,0,1385 chrXVI 163851 . C T 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.917;DP=138;Dels=0.00;FS=7.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.524;SB=-8.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:1693,0,1346 chrXVI 163861 . G A 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.937;DP=134;Dels=0.00;FS=5.308;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.416;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,56:134:99:1220,0,1654 chrXVI 164063 . G A 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.542;DP=121;Dels=0.00;FS=11.766;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.714;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1231,0,1416 chrXVI 164740 . A G 710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.033;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.718;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:740,0,1294 chrXVI 164845 . A G 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.943;DP=93;Dels=0.00;FS=1.714;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.770;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:93:99:1073,0,943 chrXVI 165213 . T C 2844 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=25.39;ReadPosRankSum=1.330;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:2877,285,0 chrXVI 165244 . T C 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7371;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.18;SB=-1.375e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3155,315,0 chrXVI 165388 . T C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.664;DP=118;Dels=0.00;FS=3.322;HaplotypeScore=2.4960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.563;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1330,0,1179 chrXVI 165419 . T C 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.411;DP=115;Dels=0.00;FS=3.434;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.048;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1298,0,1212 chrXVI 165659 . A T 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.108;DP=108;Dels=0.00;FS=3.588;HaplotypeScore=4.7270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=8.81;ReadPosRankSum=-2.156;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:981,0,1464 chrXVI 165730 . T C 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.943;DP=144;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.752;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.629;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1395,0,1493 chrXVI 165775 . T A 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.788;DP=135;Dels=0.00;FS=8.327;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=1.965;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.799;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1355,0,1495 chrXVI 165823 . C T 588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.739;DP=138;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=2.9263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.312;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:618,0,1618 chrXVI 165899 . C G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.554;DP=136;Dels=0.00;FS=0.922;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQ0=0;MQRankSum=2.099;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.640;SB=-1.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,62:136:99:1269,0,1727 chrXVI 165921 . T A 913.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.542;DP=109;Dels=0.01;FS=1.090;HaplotypeScore=6.5692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.728;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:943,0,1522 chrXVI 165930 . A T 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.995;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.706;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:963,0,1275 chrXVI 166118 . A C 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.130;DP=131;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.291;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.505;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1517,0,1381 chrXVI 166158 . G A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.427;DP=141;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.678;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1587,0,1451 chrXVI 166274 . A G 978.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.904;DP=107;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.846;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1008,0,1349 chrXVI 166465 . C T 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.597;DP=132;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=5.2066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1625,0,1333 chrXVI 166645 . G A 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=10.840;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.246;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1688,0,1313 chrXVI 166927 . G C 2262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.211;DP=164;Dels=0.00;FS=10.250;HaplotypeScore=4.3958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,101:164:99:2292,0,1188 chrXVI 166977 . C T 2349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.908;DP=179;Dels=0.00;FS=7.695;HaplotypeScore=2.9025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.900;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,101:179:99:2379,0,1563 chrXVI 167227 . T C 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.231;DP=149;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=3.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.571;SB=-8.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1564,0,1703 chrXVI 167661 . A C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;DP=123;Dels=0.00;FS=4.346;HaplotypeScore=2.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=1;MQRankSum=1.129;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1207,0,1501 chrXVI 167832 . T C 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.764;DP=105;Dels=0.00;FS=4.856;HaplotypeScore=2.7761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=8.11;ReadPosRankSum=-2.839;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:105:99:882,0,1286 chrXVI 167905 . C G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;DP=142;Dels=0.00;FS=1.327;HaplotypeScore=2.3937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.980;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1397,0,1541 chrXVI 167998 . G A 1014.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.235;DP=123;Dels=0.00;FS=0.677;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-7.759;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.930;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1044,0,1567 chrXVI 167999 . A G 960.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.581;DP=125;Dels=0.00;FS=1.436;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=-7.434;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.730;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:990,0,1694 chrXVI 168007 . G T 1029.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.816;DP=137;Dels=0.00;FS=4.061;HaplotypeScore=2.4167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.48;MQ0=0;MQRankSum=-8.818;QD=7.51;ReadPosRankSum=-1.221;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:1059,0,1829 chrXVI 168021 . T C 816.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.397;DP=135;Dels=0.00;FS=17.280;HaplotypeScore=2.3565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.92;MQ0=0;MQRankSum=-9.303;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.634;SB=-2.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,55:135:99:846,0,1935 chrXVI 168022 . C T 841.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;DP=134;Dels=0.00;FS=15.184;HaplotypeScore=2.3565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.84;MQ0=0;MQRankSum=-9.299;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.796;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:871,0,1862 chrXVI 168031 . C T 1094.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;DP=131;Dels=0.00;FS=5.586;HaplotypeScore=3.5593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQ0=0;MQRankSum=-9.501;QD=8.35;ReadPosRankSum=-2.071;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1124,0,1609 chrXVI 168037 . T C 928.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.179;DP=128;Dels=0.00;FS=14.126;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.09;MQ0=0;MQRankSum=-8.612;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.072;SB=-2.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:958,0,1606 chrXVI 168040 . T C 990.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.539;DP=130;Dels=0.00;FS=14.063;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.28;MQ0=0;MQRankSum=-8.248;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-2.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1020,0,1635 chrXVI 168073 . T G 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.766;DP=123;Dels=0.00;FS=4.813;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.54;MQ0=0;MQRankSum=-5.668;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.195;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1035,0,1464 chrXVI 168076 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.319;DP=124;Dels=0.00;FS=3.572;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.61;MQ0=0;MQRankSum=-6.037;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.281;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1036,0,1458 chrXVI 168242 . G C 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;DP=111;Dels=0.00;FS=2.488;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=3.259;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.045;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1330,0,1033 chrXVI 168354 . T A 1929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;DP=155;Dels=0.00;FS=1.284;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.106;SB=-9.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1959,0,1532 chrXVI 168374 . C T 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.179;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.394;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:150:99:1824,0,1475 chrXVI 168450 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.799;DP=136;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.959;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.536;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1369,0,1654 chrXVI 168717 . G A 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.028;DP=133;Dels=0.00;FS=5.556;HaplotypeScore=4.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,79:133:99:1670,0,1061 chrXVI 168925 . T C 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.464;DP=155;Dels=0.00;FS=7.198;HaplotypeScore=5.8396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.136;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,70:155:99:1398,0,1983 chrXVI 169035 . A G 4036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4036,397,0 chrXVI 169463 . C T 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.111;DP=127;Dels=0.00;FS=6.471;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.060;SB=-8.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1542,0,1285 chrXVI 169475 . G A 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9579;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.30;MQ0=0;QD=28.02;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3419,334,0 chrXVI 169613 . C T 486.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.338;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQ0=0;MQRankSum=-3.866;QD=5.65;ReadPosRankSum=-3.017;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:86:99:516,0,1001 chrXVI 169653 . A G 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.328;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1149,0,1273 chrXVI 169654 . A T 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.619;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1232,0,1252 chrXVI 169696 . G C 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.769;DP=125;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.697;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1297,0,1311 chrXVI 169731 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.935;DP=136;Dels=0.00;FS=2.184;HaplotypeScore=6.7253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1588,0,1347 chrXVI 169938 . G A 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.411;DP=135;Dels=0.00;FS=4.068;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.127;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1603,0,1340 chrXVI 170172 . A G 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.694;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.219;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:896,0,1542 chrXVI 170236 . T C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.200;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.737;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1437,0,1189 chrXVI 170247 . C T 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.725;DP=121;Dels=0.00;FS=8.552;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.505;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1537,0,1024 chrXVI 170630 . T C 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.984;DP=119;Dels=0.00;FS=3.586;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.159;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,48:119:99:942,0,1659 chrXVI 170647 . C T 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.328;DP=110;Dels=0.00;FS=2.539;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.191;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,42:110:99:920,0,1550 chrXVI 170718 . A G 3309.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.58;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3309,328,0 chrXVI 170759 . A G 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.468;DP=110;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,53:110:99:1118,0,1294 chrXVI 170830 . C T 741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.392;DP=82;Dels=0.00;FS=18.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.168;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,37:82:99:771,0,1064 chrXVI 170832 . T C 753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.604;DP=83;Dels=0.00;FS=18.018;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:783,0,1057 chrXVI 170955 . A T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.760;DP=127;Dels=0.00;FS=13.968;HaplotypeScore=1.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.466;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1479,0,1306 chrXVI 170964 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.230;DP=133;Dels=0.00;FS=10.113;HaplotypeScore=2.8097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:133:99:1370,0,1263 chrXVI 171033 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.059;DP=112;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.555;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.555;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:112:99:1365,0,1038 chrXVI 171059 . C T 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.908;DP=130;Dels=0.00;FS=5.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=2.734;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:1138,0,1594 chrXVI 171185 . G A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.456;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.462;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1553,0,1179 chrXVI 171270 . A T 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3281,319,0 chrXVI 171422 . T C 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.471;DP=123;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.436;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.084;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1570,0,1098 chrXVI 171554 . A C 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.651;DP=142;Dels=0.01;FS=10.607;HaplotypeScore=6.8780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.545;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1229,0,1786 chrXVI 171729 . T C 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.160;DP=118;Dels=0.00;FS=2.380;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1157,0,1405 chrXVI 171822 . G A 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.019;DP=138;Dels=0.00;FS=3.084;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.536;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,67:138:99:1531,0,1550 chrXVI 171885 . G A 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.242;DP=122;Dels=0.00;FS=1.547;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.799;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1405,0,1162 chrXVI 171898 . T C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.769;DP=115;Dels=0.00;FS=5.085;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1342,0,1163 chrXVI 171982 . C T 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.239;DP=106;Dels=0.00;FS=1.656;HaplotypeScore=3.7868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.314;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:106:99:1357,0,951 chrXVI 172031 . C T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.259;DP=128;Dels=0.00;FS=9.613;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.376;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1250,0,1609 chrXVI 172109 . C T 2007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.819;DP=168;Dels=0.00;FS=4.876;HaplotypeScore=2.8424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=2.225;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.466;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,90:168:99:2037,0,1589 chrXVI 172126 . A G 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.520;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1324,0,1771 chrXVI 172141 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.998;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.539;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1273,0,1768 chrXVI 172192 . A G 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;DP=145;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=9.5772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.436;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:145:99:1496,0,1641 chrXVI 172402 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.962;DP=123;Dels=0.00;FS=8.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.854;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1297,0,1424 chrXVI 172453 . T C 1573.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.510;DP=135;Dels=0.00;FS=4.313;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.598;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1603,0,1346 chrXVI 172579 . A G 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.539;DP=134;Dels=0.00;FS=10.811;HaplotypeScore=4.4796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=8.89;ReadPosRankSum=-1.828;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,60:134:99:1221,0,1718 chrXVI 172768 . G A 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.833;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1489,0,1383 chrXVI 172786 . T C 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=26.76;SB=-9.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3425,348,0 chrXVI 172925 . G A 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.273;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.397;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.474;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1423,0,1249 chrXVI 172976 . C A 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.456;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.607;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1312,0,1424 chrXVI 173054 . A T 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.700;DP=132;Dels=0.00;FS=0.638;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.599;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1503,0,1471 chrXVI 173169 . C G 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;DP=117;Dels=0.00;FS=6.062;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.822;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:117:99:1342,0,1109 chrXVI 173330 . C T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.851;DP=121;Dels=0.00;FS=11.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.268;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,66:121:99:1469,0,1120 chrXVI 173383 . T C 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.592;DP=123;Dels=0.00;FS=3.406;HaplotypeScore=3.4308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=6.98;ReadPosRankSum=2.996;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,45:123:99:888,0,1772 chrXVI 173535 . T G 2687 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9465;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.223;SB=-1.185e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:102:99:2720,279,0 chrXVI 173979 . C T 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.67;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2678,259,0 chrXVI 173981 . T C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.002;DP=102;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=2.6961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQ0=0;MQRankSum=1.901;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.968;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,57:102:99:1171,0,950 chrXVI 174059 . G A 2408 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.27;MQ0=0;QD=28.00;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2441,240,0 chrXVI 174069 . T C 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.603;DP=115;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=2.394;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.126;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1027,0,1401 chrXVI 174154 . A C 1163.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.279;DP=130;Dels=0.00;FS=3.311;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.71;MQ0=9;MQRankSum=0.682;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.490;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1193,0,1435 chrXVI 174252 . T C 386.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.123;DP=83;Dels=0.00;FS=8.733;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.13;MQ0=9;MQRankSum=-3.901;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-9.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:416,0,1181 chrXVI 174447 . A G 910.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.037;DP=139;Dels=0.00;FS=11.935;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.74;MQ0=21;MQRankSum=2.584;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.743;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,50:139:99:940,0,1335 chrXVI 174479 . C T 639.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;DP=117;Dels=0.00;FS=12.439;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.22;MQ0=25;MQRankSum=0.474;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.387;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,39:117:99:669,0,900 chrXVI 174715 . T A 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.106;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1241,0,1214 chrXVI 174782 . T C 3909.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9796;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.94;MQ0=0;QD=24.90;SB=-2.160e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:3909,373,0 chrXVI 174835 . T C 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.893;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=11.96;ReadPosRankSum=-2.338;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1752,0,1347 chrXVI 175312 . G A 4786.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.186e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4786,457,0 chrXVI 175582 . A G 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.423;DP=103;Dels=0.00;FS=0.741;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.023;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1027,0,1251 chrXVI 175606 . A G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.643;DP=133;Dels=0.00;FS=5.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.260;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1236,0,1620 chrXVI 175997 . C T 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.250;DP=114;Dels=0.00;FS=10.115;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.852;SB=-1.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:1078,0,1507 chrXVI 177360 . G A 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;DP=96;Dels=0.00;FS=5.437;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:1114,0,1031 chrXVI 177572 . C T 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.411;DP=123;Dels=0.00;FS=4.343;HaplotypeScore=3.3846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=12.29;ReadPosRankSum=-2.393;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,70:123:99:1542,0,1168 chrXVI 177590 . C T 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.929;DP=115;Dels=0.00;FS=4.833;HaplotypeScore=2.9539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.272;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1359,0,1182 chrXVI 177989 . T A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.949;DP=110;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1325,0,1148 chrXVI 178167 . T C 3646.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3646,370,0 chrXVI 178232 . C G 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.753;DP=124;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1314,0,1407 chrXVI 178256 . C G 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;DP=100;Dels=0.00;FS=9.675;HaplotypeScore=3.0199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.958;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:937,0,1188 chrXVI 178288 . A G 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.569;DP=86;Dels=0.00;FS=2.896;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,46:86:99:935,0,923 chrXVI 178519 . G A 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.630;DP=111;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=9.96;ReadPosRankSum=2.482;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1135,0,1377 chrXVI 178540 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.914;DP=109;Dels=0.00;FS=2.460;HaplotypeScore=3.1930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.373;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1307,0,1113 chrXVI 178571 . A G 916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.977;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.918;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:946,0,1426 chrXVI 178695 . C G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;DP=127;Dels=0.00;FS=15.397;HaplotypeScore=2.6077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.547;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1303,0,1398 chrXVI 179066 . G A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.178;DP=121;Dels=0.00;FS=7.312;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-1.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1295,0,1393 chrXVI 179572 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.603;DP=116;Dels=0.00;FS=5.801;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.941;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1456,0,1151 chrXVI 180092 . C A 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.396;DP=129;Dels=0.00;FS=3.167;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.664;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1683,0,1281 chrXVI 180392 . A G 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.913;DP=120;Dels=0.00;FS=3.515;HaplotypeScore=1.9468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.129;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:1451,0,1250 chrXVI 180404 . T C 3065 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3098,310,0 chrXVI 180436 . A G 2897 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2930,289,0 chrXVI 180654 . G A 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.947;DP=124;Dels=0.00;FS=4.610;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.223;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.225;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,49:124:99:1051,0,1668 chrXVI 180789 . G T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.769;DP=120;Dels=0.00;FS=5.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.505;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1318,0,1391 chrXVI 180808 . G A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.917;DP=124;Dels=0.00;FS=5.636;HaplotypeScore=2.0508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1537,0,1263 chrXVI 180828 . A G 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3316,345,0 chrXVI 180851 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.875;DP=133;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.9814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.900;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,56:133:99:1106,0,1770 chrXVI 180971 . G T 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.994;DP=126;Dels=0.00;FS=8.137;HaplotypeScore=6.1079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.484;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:126:99:1368,0,1381 chrXVI 180989 . G A 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.535;DP=143;Dels=0.00;FS=4.044;HaplotypeScore=2.9503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.624;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:143:99:1460,0,1584 chrXVI 181373 . C G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;DP=143;Dels=0.00;FS=9.312;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.391;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,56:143:99:1087,0,2007 chrXVI 181552 . T C 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.386;DP=157;Dels=0.00;FS=8.292;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.480;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1610,0,1805 chrXVI 181811 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.370;DP=115;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.448;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1533,0,1077 chrXVI 181857 . T C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;DP=113;Dels=0.00;FS=4.574;HaplotypeScore=3.9505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.710;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1343,0,1165 chrXVI 182353 . C T 1510.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.551;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.633;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1540,0,1359 chrXVI 182784 . G A 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.988;DP=124;Dels=0.00;FS=5.874;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.998;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1598,0,1019 chrXVI 182927 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.682;DP=119;Dels=0.00;FS=3.327;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.023;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,58:119:99:1267,0,1306 chrXVI 182943 . C G 2840 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2873,285,0 chrXVI 183101 . T C 995.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.619;DP=110;Dels=0.00;FS=4.734;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.211;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,47:110:99:1025,0,1493 chrXVI 183107 . T A 999.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;DP=107;Dels=0.00;FS=4.727;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1029,0,1395 chrXVI 183111 . T C 1260.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.812;DP=107;Dels=0.00;FS=4.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.053;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1290,0,1100 chrXVI 183364 . G A 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.200;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.467;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,50:91:99:1136,0,848 chrXVI 183385 . A G 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.259e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2614,264,0 chrXVI 183482 . A G 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3250,333,0 chrXVI 183484 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.509;DP=134;Dels=0.00;FS=7.937;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.941;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1285,0,1496 chrXVI 183510 . G A 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.267;DP=153;Dels=0.00;FS=12.843;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1592,0,1612 chrXVI 185186 . C T 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.839;DP=128;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=3.2090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=2.086;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,59:128:99:1346,0,1433 chrXVI 185261 . A G 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=25.97;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3019,312,0 chrXVI 185404 . T C 183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.653;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=122.8662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.50;MQ0=0;MQRankSum=2.810;QD=1.54;ReadPosRankSum=3.549;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,52:119:99:213,0,761 chrXVI 185416 . T C 404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.050;DP=130;Dels=0.00;FS=2.358;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQ0=0;MQRankSum=3.164;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.058;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:434,0,718 chrXVI 185503 . A G 1371.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.697;DP=157;Dels=0.00;FS=3.731;HaplotypeScore=2.5540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.722;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.648;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,80:157:99:1401,0,1824 chrXVI 185506 . G A 1664.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.889;DP=148;Dels=0.00;FS=4.910;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:148:99:1694,0,1448 chrXVI 185512 . G T 1484.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.945;DP=143;Dels=0.00;FS=6.169;HaplotypeScore=2.7989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.801;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1514,0,1604 chrXVI 186136 . C G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.121;DP=128;Dels=0.00;FS=2.266;HaplotypeScore=3.5444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.746;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:128:99:1298,0,1358 chrXVI 186190 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.332;DP=135;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.830;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1303,0,1737 chrXVI 186214 . C T 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.379;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.606;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,78:173:99:1554,0,2101 chrXVI 186540 . G A 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.602;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.282;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1482,0,1389 chrXVI 186706 . C T 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.005;DP=143;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=1;MQRankSum=2.985;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.193;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1740,0,1404 chrXVI 186736 . T C 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.492;DP=146;Dels=0.01;FS=3.958;HaplotypeScore=5.8050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=2;MQRankSum=2.350;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.094;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1666,0,1423 chrXVI 186760 . C T 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.528;DP=128;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=1;MQRankSum=-1.110;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1647,0,1199 chrXVI 186772 . A G 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.640;DP=135;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=1;MQRankSum=0.296;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:135:99:1569,0,1335 chrXVI 186790 . G A 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.842;DP=140;Dels=0.00;FS=3.061;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=1;MQRankSum=1.848;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.133;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1635,0,1425 chrXVI 186811 . T C 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.946;DP=127;Dels=0.00;FS=5.453;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=1;MQRankSum=0.656;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.290;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1416,0,1369 chrXVI 186844 . A G 2989 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=23.17;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3022,303,0 chrXVI 186862 . T C 1569.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.814;DP=142;Dels=0.00;FS=6.268;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1599,0,1588 chrXVI 186924 . C A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.357;DP=131;Dels=0.00;FS=2.198;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.259;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1269,0,1461 chrXVI 186940 . G A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.201;DP=127;Dels=0.00;FS=3.182;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1322,0,1547 chrXVI 187045 . A G 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.804;DP=127;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=1;MQRankSum=-0.160;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.886;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1411,0,1349 chrXVI 187240 . T C 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3600,367,0 chrXVI 187312 . G A 4006.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.272;DP=160;Dels=0.00;FS=4.911;HaplotypeScore=295.8881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.09;MQ0=2;MQRankSum=-0.263;QD=25.04;ReadPosRankSum=1.688;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,159:160:99:4006,391,0 chrXVI 187673 . A T 3778.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3778,373,0 chrXVI 187711 . G A 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.79;SB=-2.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3777,373,0 chrXVI 187839 . C T 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.727;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:994,0,1400 chrXVI 187869 . A G 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;DP=131;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=2.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.607;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:131:99:1558,0,1202 chrXVI 187919 . T C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.333;DP=134;Dels=0.00;FS=9.706;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.318;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,56:134:99:1144,0,1790 chrXVI 188250 . A C 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=133;Dels=0.00;FS=3.385;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=25.44;ReadPosRankSum=1.524;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,132:133:99:3383,348,0 chrXVI 188367 . C T 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.03;SB=-1.569e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3237,319,0 chrXVI 188889 . T C 2254 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=12.4694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=21.88;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2287,243,0 chrXVI 189099 . C T 3506.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=28.74;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3506,343,0 chrXVI 189266 . A G 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.36;SB=-1.110e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3849,390,0 chrXVI 189282 . G A 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.439;DP=143;Dels=0.00;FS=2.528;HaplotypeScore=2.5997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.153;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1787,0,1391 chrXVI 189297 . T A 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.160;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.085;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:141:99:1804,0,1377 chrXVI 189314 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.588;DP=142;Dels=0.00;FS=9.684;HaplotypeScore=3.3304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.284;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:142:99:1375,0,1658 chrXVI 189430 . T C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.016;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.369;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.239;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,82:160:99:1619,0,1719 chrXVI 189500 . T C 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.911;DP=133;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.165;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1184,0,1617 chrXVI 189526 . C G 2837 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2870,294,0 chrXVI 189639 . C A 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.297;DP=89;Dels=0.00;FS=1.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:89:99:937,0,998 chrXVI 189738 . G A 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.548;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.379;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:125:99:1450,0,1167 chrXVI 189850 . C T 3989.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.42;SB=-2.119e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:3989,391,0 chrXVI 189878 . G A 1996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.985;DP=185;Dels=0.00;FS=12.282;HaplotypeScore=8.1893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=10.79;ReadPosRankSum=2.225;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,94:185:99:2026,0,1970 chrXVI 189891 . A C 1855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.329;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.300;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1885,0,1343 chrXVI 190020 . A G 2974 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3007,298,0 chrXVI 190367 . A T 4084.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.859e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4084,391,0 chrXVI 190389 . C T 4382.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4382,412,0 chrXVI 190515 . A G 3757.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.489e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3757,387,0 chrXVI 190807 . G C 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3397,337,0 chrXVI 191038 . T C 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=103;Dels=0.00;FS=4.943;HaplotypeScore=5.9711;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.295;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:2674,288,0 chrXVI 191167 . T G 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3076,324,0 chrXVI 191183 . T C 3063 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.444e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3096,324,0 chrXVI 191290 . C T 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3286,313,0 chrXVI 191540 . T C 3055 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3088,309,0 chrXVI 191741 . C T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.097;DP=131;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.339;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1376,0,1396 chrXVI 191944 . C T 4268.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=28.26;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4268,409,0 chrXVI 192002 . C T 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.015;DP=156;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:156:99:1687,0,1666 chrXVI 192044 . A G 3444.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=28.23;SB=-1.056e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3444,337,0 chrXVI 192260 . T C 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.535;DP=154;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=2.7209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=2.034;QD=11.66;ReadPosRankSum=-2.070;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1825,0,1582 chrXVI 192834 . C G 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;DP=125;Dels=0.00;FS=4.993;HaplotypeScore=2.7728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.634;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1589,0,1219 chrXVI 193082 . C T 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.596;DP=127;Dels=0.00;FS=3.212;HaplotypeScore=2.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.584;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,74:127:99:1704,0,1040 chrXVI 193187 . C T 1501.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.115;DP=121;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1531,0,1149 chrXVI 193455 . C T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.151;DP=127;Dels=0.00;FS=2.323;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.022;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1267,0,1450 chrXVI 193574 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.129;DP=109;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=4.1663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1322,0,1138 chrXVI 193737 . G C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;DP=98;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:948,0,1077 chrXVI 193773 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.302;DP=125;Dels=0.00;FS=1.416;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.581;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1269,0,1461 chrXVI 193935 . A G 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.450;DP=159;Dels=0.00;FS=4.923;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.89;MQ0=3;MQRankSum=-2.616;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.342;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,61:159:99:854,0,2281 chrXVI 193968 . A C 1480.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.216;DP=181;Dels=0.00;FS=0.564;HaplotypeScore=3.3881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQ0=4;MQRankSum=-3.793;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.567;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,106:181:99:1510,0,1508 chrXVI 193987 . C T 946.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.439;DP=190;Dels=0.00;FS=2.630;HaplotypeScore=11.5193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.07;MQ0=4;MQRankSum=-5.775;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.696;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,74:190:99:976,0,2287 chrXVI 193998 . G A 818.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.761;DP=192;Dels=0.00;FS=4.571;HaplotypeScore=7.5428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.41;MQ0=4;MQRankSum=-3.424;QD=4.26;ReadPosRankSum=2.723;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,64:192:99:848,0,2446 chrXVI 194019 . A G 618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.210;DP=199;Dels=0.00;FS=7.253;HaplotypeScore=10.6900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=3;MQRankSum=-5.009;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.886;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,75:199:99:648,0,2609 chrXVI 194152 . C T 3295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=27.23;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3295,316,0 chrXVI 194347 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.221;DP=115;Dels=0.00;FS=5.220;HaplotypeScore=2.7772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:115:99:1220,0,1264 chrXVI 194832 . T C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.864;DP=125;Dels=0.00;FS=3.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.071;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1457,0,1303 chrXVI 195093 . T C 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.960;DP=120;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=3.8927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.954;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:120:99:992,0,1720 chrXVI 195109 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.152;DP=125;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=3.5135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.877;SB=-2.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:125:99:1132,0,1421 chrXVI 195142 . G A 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.619;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1343,0,1561 chrXVI 195253 . A G 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.756;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.695;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1278,0,1437 chrXVI 195279 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.586;DP=132;Dels=0.00;FS=2.289;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.362;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1452,0,1523 chrXVI 195558 . G A 2136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.331;DP=162;Dels=0.00;FS=3.697;HaplotypeScore=1.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.420;SB=-1.104e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,93:162:99:2166,0,1483 chrXVI 195564 . C A 2024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;DP=159;Dels=0.00;FS=3.746;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,94:159:99:2054,0,1351 chrXVI 195811 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.563;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1324,0,1180 chrXVI 195862 . C G 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.127;DP=138;Dels=0.00;FS=0.771;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.138;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1437,0,1537 chrXVI 195879 . C T 3932.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.071e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3932,382,0 chrXVI 196580 . A G 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.790;DP=127;Dels=0.00;FS=3.254;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.477;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1501,0,1251 chrXVI 196727 . A T 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.880;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1402,0,1183 chrXVI 197015 . C T 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.740;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.746;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:1034,0,1188 chrXVI 197348 . T A 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.466;DP=131;Dels=0.00;FS=2.378;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.530;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,59:131:99:1295,0,1626 chrXVI 197471 . A G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.355;DP=106;Dels=0.00;FS=7.652;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.080;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1133,0,1209 chrXVI 197495 . A G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.763;DP=131;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.787;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:131:99:1331,0,1510 chrXVI 197509 . C T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.721;DP=144;Dels=0.00;FS=3.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=9.83;ReadPosRankSum=2.103;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1446,0,1588 chrXVI 197602 . C G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;DP=117;Dels=0.00;FS=2.490;HaplotypeScore=4.7644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=1;MQRankSum=-0.378;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.017;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:117:99:1337,0,1188 chrXVI 197642 . G A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.462;DP=110;Dels=0.00;FS=5.017;HaplotypeScore=2.5981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=-0.021;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.501;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1207,0,1100 chrXVI 197735 . A G 41.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;DP=145;Dels=0.00;FS=4.230;HaplotypeScore=39.5938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=0.28;ReadPosRankSum=-2.159;SB=-4.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,25:145:71:71,0,2852 chrXVI 198072 . G A 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.631;DP=95;Dels=0.00;FS=2.776;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.549;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:1047,0,1148 chrXVI 198264 . C T 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.324;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=1;MQRankSum=0.092;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.861;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,81:154:99:1854,0,1451 chrXVI 198304 . A T 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;DP=130;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=2.277;QD=10.99;ReadPosRankSum=-2.025;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:130:99:1459,0,1349 chrXVI 198355 . A T 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.217;DP=174;Dels=0.00;FS=3.671;HaplotypeScore=8.9396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=-0.129;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,80:174:99:1818,0,2128 chrXVI 198419 . C G 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.980;DP=153;Dels=0.00;FS=13.735;HaplotypeScore=3.3726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=1;MQRankSum=0.426;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.173;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1447,0,1729 chrXVI 198546 . C A 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.973;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.543;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1305,0,988 chrXVI 198590 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.952;DP=121;Dels=0.00;FS=3.861;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.169;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1218,0,1348 chrXVI 198637 . A G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.713;DP=124;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.923;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1287,0,1383 chrXVI 198641 . C T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.583;DP=116;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.180;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1256,0,1264 chrXVI 198653 . G A 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.387;DP=117;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.275;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1202,0,1354 chrXVI 198685 . G A 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.040;DP=154;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.447;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,66:154:99:1318,0,1926 chrXVI 198733 . C G 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.869;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.060;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,60:146:99:1201,0,1879 chrXVI 198801 . A G 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.562;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1400,0,1726 chrXVI 198876 . G A 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.822;DP=147;Dels=0.00;FS=1.485;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=1.987;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.188;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1762,0,1468 chrXVI 199057 . A G 1564.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.102;DP=143;Dels=0.00;FS=4.002;HaplotypeScore=2.7568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=0.078;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.343;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,73:143:99:1594,0,1536 chrXVI 199138 . T C 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3546,363,0 chrXVI 199191 . C T 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.809;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.322;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1343,0,1479 chrXVI 199239 . C T 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.373;DP=149;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.646;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,74:149:99:1662,0,1563 chrXVI 199576 . T A 2760 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9751;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.700;QD=25.32;ReadPosRankSum=1.669;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:2793,279,0 chrXVI 199685 . A G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.947;DP=115;Dels=0.00;FS=14.761;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.407;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,59:115:99:1259,0,1291 chrXVI 199717 . C T 3096 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3129,310,0 chrXVI 199738 . T A 1743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-8.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,78:131:99:1773,0,1056 chrXVI 199801 . T C 3989.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;QD=26.59;SB=-1.509e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3989,394,0 chrXVI 199855 . A G 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.558;DP=146;Dels=0.00;FS=4.088;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.507;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1552,0,1532 chrXVI 199875 . G A 3956.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.91;SB=-2.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3956,388,0 chrXVI 199884 . C T 3876.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=27.30;SB=-1.784e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3876,382,0 chrXVI 199920 . C T 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.772;DP=149;Dels=0.00;FS=7.320;HaplotypeScore=3.0689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.519;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1545,0,1610 chrXVI 199941 . C G 1886.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.559;DP=162;Dels=0.00;FS=1.251;HaplotypeScore=2.7537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.992;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,93:162:99:1916,0,1325 chrXVI 199975 . C T 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.749;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.822;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1290,0,1471 chrXVI 200221 . T C 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.477;DP=158;Dels=0.00;FS=3.760;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.309;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,83:158:99:1787,0,1695 chrXVI 200253 . A G 4347.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=28.23;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4347,433,0 chrXVI 200302 . T C 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.045;DP=160;Dels=0.00;FS=11.151;HaplotypeScore=7.3952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.354;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1765,0,1646 chrXVI 200410 . C T 2148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.831;DP=170;Dels=0.00;FS=14.497;HaplotypeScore=3.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.443;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,94:170:99:2178,0,1624 chrXVI 200431 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.169;DP=164;Dels=0.00;FS=8.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.304;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,73:164:99:1643,0,2045 chrXVI 200515 . A G 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.257;DP=111;Dels=0.00;FS=2.461;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.254;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1044,0,1452 chrXVI 200873 . C T 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.833;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1055,0,1082 chrXVI 200920 . A G 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.644;DP=99;Dels=0.00;FS=10.239;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.979;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:885,0,1240 chrXVI 200944 . T G 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.018;DP=95;Dels=0.00;FS=22.552;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.913;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:933,0,1154 chrXVI 200953 . C A 973.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.919;DP=97;Dels=0.00;FS=24.718;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.501;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.393;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:1003,0,1064 chrXVI 200962 . G A 922.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;DP=94;Dels=0.00;FS=12.374;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,46:94:99:952,0,1038 chrXVI 200963 . T C 890.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;DP=101;Dels=0.00;FS=9.800;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.151;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.124;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:101:99:920,0,1145 chrXVI 201034 . C T 1087.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.773;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1117,0,1347 chrXVI 201192 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.312;DP=107;Dels=0.00;FS=0.778;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.346;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1202,0,1255 chrXVI 201198 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.042;DP=121;Dels=0.00;FS=4.545;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.993;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1428,0,1296 chrXVI 201262 . A T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;DP=116;Dels=0.00;FS=4.777;HaplotypeScore=1.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.833;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:116:99:1344,0,1173 chrXVI 201309 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.913;DP=118;Dels=0.00;FS=8.124;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.358;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1329,0,1298 chrXVI 201474 . T A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;DP=115;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.101;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1086,0,1400 chrXVI 201553 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.582;DP=150;Dels=0.00;FS=10.334;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.199;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,60:150:99:1307,0,2040 chrXVI 201606 . T C 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.421;DP=131;Dels=0.00;FS=5.440;HaplotypeScore=1.9436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.965;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,51:131:99:986,0,1873 chrXVI 201616 . G A 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.409;DP=118;Dels=0.00;FS=3.437;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.666;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,70:118:99:1577,0,975 chrXVI 201652 . T C 1445.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=149;Dels=0.00;FS=1.304;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=2.224;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1475,0,1800 chrXVI 201694 . G A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.906;DP=130;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.62;ReadPosRankSum=2.250;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1281,0,1475 chrXVI 201697 . T C 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.400;DP=133;Dels=0.00;FS=2.215;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=10.72;ReadPosRankSum=-2.082;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:1456,0,1400 chrXVI 201742 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.907;DP=142;Dels=0.00;FS=2.979;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.685;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1452,0,1675 chrXVI 201745 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.861;DP=147;Dels=0.00;FS=2.089;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1541,0,1566 chrXVI 201985 . A G 1924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.610;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.334;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,94:172:99:1954,0,1701 chrXVI 202036 . G A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.572;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,73:168:99:1541,0,2102 chrXVI 202051 . G A 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.934;DP=165;Dels=0.00;FS=5.772;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-7.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,77:165:99:1711,0,1960 chrXVI 202160 . A G 1607.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.267;DP=167;Dels=0.00;FS=4.003;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=9.62;ReadPosRankSum=-2.258;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,82:167:99:1637,0,1940 chrXVI 202188 . T C 924.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.994;DP=117;Dels=0.00;FS=0.690;HaplotypeScore=1.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.421;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,51:117:99:954,0,1552 chrXVI 202189 . T C 872.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.538;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.036;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:902,0,1391 chrXVI 202192 . C G 883.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;DP=112;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.910;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:913,0,1404 chrXVI 202249 . A T 1085.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.611;DP=127;Dels=0.00;FS=3.285;HaplotypeScore=3.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.651;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1115,0,1688 chrXVI 202399 . G A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.608;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,60:124:99:1344,0,1381 chrXVI 202426 . C T 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.804;DP=154;Dels=0.00;FS=4.025;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.274;SB=-6.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,65:154:99:1363,0,1945 chrXVI 202457 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.547;DP=159;Dels=0.00;FS=3.719;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.989;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,71:159:99:1424,0,2170 chrXVI 202483 . A G 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.688;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.042;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,75:158:99:1629,0,1986 chrXVI 202594 . A G 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.669;DP=112;Dels=0.00;FS=1.003;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.259;SB=-2.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1128,0,1373 chrXVI 202693 . C T 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.294;DP=158;Dels=0.00;FS=12.561;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.147;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1851,0,1144 chrXVI 202708 . T C 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;DP=153;Dels=0.01;FS=8.848;HaplotypeScore=12.8190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.099;SB=-8.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1204,0,1753 chrXVI 202791 . C T 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.475;DP=170;Dels=0.00;FS=1.215;HaplotypeScore=3.2391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,76:170:99:1578,0,2006 chrXVI 202808 . C T 4658.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3080;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.948e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:168:99:4658,448,0 chrXVI 202853 . A G 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.681;DP=162;Dels=0.00;FS=6.998;HaplotypeScore=2.3113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,86:162:99:1743,0,1640 chrXVI 202889 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.382;DP=128;Dels=0.00;FS=4.420;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=9.98;ReadPosRankSum=-2.042;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:128:99:1308,0,1494 chrXVI 202900 . C T 4119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8558;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.957e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4119,388,0 chrXVI 203051 . G A 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.975;DP=156;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=3.9110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.155;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1710,0,1502 chrXVI 203462 . T C 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;DP=156;Dels=0.00;FS=1.311;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=3;MQRankSum=0.131;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.182;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,81:156:99:1614,0,1685 chrXVI 203574 . G T 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.776;DP=137;Dels=0.00;FS=7.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-8.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1734,0,1235 chrXVI 203660 . C G 1821.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.873;DP=158;Dels=0.00;FS=3.931;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.943;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,84:158:99:1851,0,1459 chrXVI 203903 . T A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.248;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.469;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1377,0,1395 chrXVI 203921 . A G 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.156;DP=142;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=2.6355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.649;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:142:99:1421,0,1524 chrXVI 204008 . G A 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.890;DP=136;Dels=0.00;FS=14.134;HaplotypeScore=3.7707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.838;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1597,0,1280 chrXVI 204012 . G T 1859.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.570;DP=148;Dels=0.00;FS=13.264;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.077;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,83:148:99:1889,0,1363 chrXVI 204038 . G A 1768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.506;DP=145;Dels=0.00;FS=5.489;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.395;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1798,0,1404 chrXVI 204206 . A G 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.841;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.755;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1281,0,1615 chrXVI 204410 . T A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;DP=131;Dels=0.00;FS=2.235;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=10.04;ReadPosRankSum=1.743;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:1345,0,1463 chrXVI 204451 . C T 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.036;DP=138;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=4.1716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=10.73;ReadPosRankSum=-3.208;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:138:99:1511,0,1306 chrXVI 204458 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.955;DP=135;Dels=0.00;FS=5.332;HaplotypeScore=6.0790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=1.971;QD=10.78;ReadPosRankSum=-2.464;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1485,0,1309 chrXVI 204854 . T G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.254;DP=155;Dels=0.00;FS=2.895;HaplotypeScore=3.5636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=9.55;ReadPosRankSum=-2.310;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1511,0,1813 chrXVI 205023 . C A 4345.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4345,430,0 chrXVI 205903 . G A 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.918;DP=123;Dels=0.00;FS=1.644;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.762;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1440,0,1346 chrXVI 206053 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.527;DP=145;Dels=0.00;FS=6.146;HaplotypeScore=3.7515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.548;SB=-8.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,73:145:99:1455,0,1600 chrXVI 206075 . G A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.116;DP=160;Dels=0.00;FS=3.686;HaplotypeScore=2.9799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.145;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1658,0,1711 chrXVI 206195 . T G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.436;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=1;MQRankSum=-1.403;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1532,0,1756 chrXVI 206288 . T C 3487.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.38;SB=-1.873e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3487,352,0 chrXVI 206456 . G A 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.852;DP=108;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.258;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1148,0,1171 chrXVI 206683 . T C 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.486;DP=141;Dels=0.00;FS=3.004;HaplotypeScore=5.6355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.726;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.683;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1387,0,1602 chrXVI 206738 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.361;DP=133;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.898;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1577,0,1411 chrXVI 206753 . C A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.161;DP=131;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.973;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.140;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1287,0,1451 chrXVI 206771 . T A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;DP=134;Dels=0.00;FS=0.669;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.704;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1411,0,1526 chrXVI 206835 . C T 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.314;DP=143;Dels=0.00;FS=4.129;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.689;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1681,0,1478 chrXVI 206880 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.699;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1417,0,1429 chrXVI 206912 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.060;DP=132;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=2.8863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.564;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1373,0,1492 chrXVI 206948 . C T 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.928;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.253;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1580,0,1556 chrXVI 207254 . C G 1179.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.763;DP=131;Dels=0.00;FS=2.236;HaplotypeScore=3.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=9.00;ReadPosRankSum=-1.104;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1209,0,1478 chrXVI 207664 . G A 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.714;DP=154;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.895;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,74:154:99:1552,0,1685 chrXVI 207823 . A T 1741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;DP=154;Dels=0.00;FS=6.925;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1771,0,1723 chrXVI 207893 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.593;DP=102;Dels=0.00;FS=0.737;HaplotypeScore=3.4778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:102:99:1270,0,885 chrXVI 208076 . C T 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.086;DP=136;Dels=0.00;FS=7.944;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.128;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1143,0,1688 chrXVI 208681 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.403;DP=109;Dels=0.00;FS=3.512;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1251,0,1107 chrXVI 208687 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.313;DP=110;Dels=0.00;FS=5.844;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.269;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1114,0,1207 chrXVI 208811 . A G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.776;DP=117;Dels=0.00;FS=10.111;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.385;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1396,0,1186 chrXVI 208908 . G A 947.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.554;DP=86;Dels=0.00;FS=5.394;HaplotypeScore=1.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=11.01;ReadPosRankSum=-2.032;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:977,0,1005 chrXVI 209011 . T C 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.478;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.903;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:864,0,1240 chrXVI 209434 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.114;DP=114;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.175;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1442,0,969 chrXVI 209602 . T C 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.379;DP=77;Dels=0.00;FS=0.876;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.642;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.281;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,42:77:99:974,0,771 chrXVI 209844 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.508;DP=82;Dels=0.00;FS=4.615;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.724;QD=13.05;ReadPosRankSum=2.014;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,46:82:99:1100,0,758 chrXVI 209982 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.684;DP=80;Dels=0.00;FS=10.876;HaplotypeScore=7.4812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.693;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:80:99:911,0,718 chrXVI 210131 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;DP=101;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.983;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,61:101:99:1395,0,784 chrXVI 210171 . C T 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.723;DP=125;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.713;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,77:125:99:1684,0,902 chrXVI 210288 . T G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;DP=115;Dels=0.00;FS=3.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.702;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,58:115:99:1346,0,1213 chrXVI 210366 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.170;DP=127;Dels=0.00;FS=0.812;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=10.25;ReadPosRankSum=-2.108;SB=-2.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,60:127:99:1332,0,1455 chrXVI 210433 . A G 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;DP=97;Dels=0.00;FS=10.071;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.235;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:976,0,1185 chrXVI 210669 . A G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.168;DP=147;Dels=0.00;FS=11.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=9.70;ReadPosRankSum=1.833;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1456,0,1756 chrXVI 210711 . T G 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.811;DP=144;Dels=0.00;FS=2.098;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=9.94;ReadPosRankSum=-2.122;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1461,0,1732 chrXVI 210762 . C T 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.617;DP=105;Dels=0.00;FS=5.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.921;QD=12.90;ReadPosRankSum=2.438;SB=-2.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1385,0,976 chrXVI 210783 . T C 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.069;DP=106;Dels=0.00;FS=2.856;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.703;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,61:106:99:1352,0,1011 chrXVI 210832 . C T 2924 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=28.12;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2957,283,0 chrXVI 210930 . G A 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.981;DP=91;Dels=0.00;FS=8.886;HaplotypeScore=5.8491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:91:99:949,0,1067 chrXVI 211043 . C T 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.925;DP=113;Dels=0.00;FS=5.974;HaplotypeScore=3.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.670;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1365,0,1162 chrXVI 211065 . C G 990.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.126;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.665;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:1020,0,763 chrXVI 211075 . G A 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.271;DP=99;Dels=0.00;FS=5.074;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.215;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1228,0,916 chrXVI 211078 . G A 858.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.382;DP=102;Dels=0.00;FS=4.947;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.602;SB=-3.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,42:102:99:888,0,1303 chrXVI 211158 . C T 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.637;DP=117;Dels=0.00;FS=4.553;HaplotypeScore=5.0692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1551,0,1043 chrXVI 211190 . T A 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;DP=109;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.392;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1032,0,1383 chrXVI 211577 . T A 1224 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.98;MQ0=0;QD=24.98;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1257,126,0 chrXVI 211951 . T A 221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.546;DP=78;Dels=0.00;FS=1.907;HaplotypeScore=8.3051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.042;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.320;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:251,0,448 chrXVI 212295 . C A 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.208;DP=94;Dels=0.00;FS=4.322;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.789;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1205,0,900 chrXVI 212370 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.773;DP=104;Dels=0.00;FS=2.639;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.619;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1206,0,1089 chrXVI 212526 . T C 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.523;DP=115;Dels=0.00;FS=2.385;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.507;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1128,0,1169 chrXVI 212736 . A G 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.952;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.703;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,71:132:99:1397,0,1327 chrXVI 212773 . G A 3672.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.23;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3672,352,0 chrXVI 213354 . C T 1896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.105;DP=134;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.692;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,80:134:99:1926,0,1070 chrXVI 213381 . T C 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.210;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.224;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,80:131:99:1695,0,1118 chrXVI 213411 . G A 748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.591;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.368;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,37:98:99:778,0,1378 chrXVI 213593 . G A 1120.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.262;DP=117;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,54:117:99:1150,0,1333 chrXVI 213597 . T A 1066.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.381;DP=118;Dels=0.00;FS=1.478;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.022;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1096,0,1452 chrXVI 213603 . A G 916.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.346;DP=113;Dels=0.00;FS=1.508;HaplotypeScore=3.3282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:946,0,1383 chrXVI 214028 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.036;DP=122;Dels=0.00;FS=2.512;HaplotypeScore=2.1790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.745;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1369,0,1337 chrXVI 214333 . G A 912.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.608;DP=88;Dels=0.00;FS=0.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.985;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:942,0,1020 chrXVI 214358 . A C 2420 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2453,258,0 chrXVI 214684 . T G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;DP=129;Dels=0.00;FS=9.959;HaplotypeScore=14.0846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.505;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:129:99:1357,0,1268 chrXVI 214724 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.406;DP=109;Dels=0.00;FS=6.091;HaplotypeScore=2.7128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.992;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1341,0,921 chrXVI 214791 . C T 803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.791;DP=95;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.670;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:833,0,1248 chrXVI 214866 . T C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.062;DP=107;Dels=0.00;FS=7.673;HaplotypeScore=2.8832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1041,0,1166 chrXVI 214888 . T A 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;DP=115;Dels=0.00;FS=4.779;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1199,0,1318 chrXVI 214963 . A G 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.818;DP=120;Dels=0.00;FS=4.409;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.084;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1304,0,1259 chrXVI 215126 . A G 2922 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.091e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2955,303,0 chrXVI 215183 . T C 3294.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.58;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3294,330,0 chrXVI 215271 . T C 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.644;DP=126;Dels=0.00;FS=2.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=10.74;ReadPosRankSum=-1.227;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1383,0,1395 chrXVI 215329 . A T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;DP=121;Dels=0.00;FS=4.599;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.164;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1458,0,1226 chrXVI 215338 . G A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.897;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.535;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1374,0,1251 chrXVI 215584 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.856;DP=95;Dels=0.00;FS=2.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.362;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1071,0,910 chrXVI 215587 . G C 2506 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2539,249,0 chrXVI 215778 . C T 1370.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.452;DP=120;Dels=0.00;FS=5.857;HaplotypeScore=2.9064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=11.42;ReadPosRankSum=1.200;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1400,0,1145 chrXVI 216015 . A G 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.955;DP=170;Dels=0.00;FS=1.255;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,78:170:99:1701,0,2086 chrXVI 216037 . T C 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.692;DP=168;Dels=0.00;FS=3.592;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,80:168:99:1657,0,1890 chrXVI 216100 . G A 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.220;DP=125;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.110;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1485,0,1298 chrXVI 217075 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.898;DP=115;Dels=0.00;FS=1.503;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.520;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1171,0,1376 chrXVI 217929 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.536;DP=150;Dels=0.00;FS=6.074;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1443,0,1797 chrXVI 220856 . C T 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.911;DP=99;Dels=0.00;FS=2.706;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.711;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.360;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:1005,0,1201 chrXVI 220879 . T C 918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.253;DP=89;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=4.7061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.990;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:948,0,1111 chrXVI 221591 . G T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.249;DP=103;Dels=0.00;FS=7.773;HaplotypeScore=3.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.455;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:1174,0,1116 chrXVI 222598 . G A 3388.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=28.47;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3388,331,0 chrXVI 222732 . C A 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3570,355,0 chrXVI 223947 . G A 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;DP=106;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.197;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1352,0,1049 chrXVI 225044 . G A 4305.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7847;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.688e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4305,427,0 chrXVI 225206 . T C 3649.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3649,364,0 chrXVI 226571 . C A 4057.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.865e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4057,391,0 chrXVI 226573 . A C 3738.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3738,373,0 chrXVI 226979 . G A 1739.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.162;DP=151;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.513;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1769,0,1461 chrXVI 227345 . C T 1786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.701;DP=144;Dels=0.00;FS=8.811;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.867;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1816,0,1359 chrXVI 227693 . C G 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.276;DP=123;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,71:123:99:1259,0,1057 chrXVI 227828 . A G 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=155;Dels=0.00;FS=7.557;HaplotypeScore=2.7873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,73:155:99:1652,0,1827 chrXVI 227923 . G T 1904.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.407;DP=166;Dels=0.00;FS=0.575;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.790;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,86:166:99:1934,0,1721 chrXVI 228950 . G A 4057.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.87;SB=-1.711e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4057,391,0 chrXVI 229636 . T C 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.616;DP=140;Dels=0.00;FS=9.061;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:140:99:1362,0,1546 chrXVI 229768 . C T 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.806;DP=144;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=3.7201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=2.603;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.312;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1645,0,1491 chrXVI 229945 . T C 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.703;DP=127;Dels=0.00;FS=4.465;HaplotypeScore=1.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1577,0,1224 chrXVI 229960 . A G 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.556;DP=144;Dels=0.00;FS=8.781;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.962;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1467,0,1525 chrXVI 229981 . A G 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.191;DP=115;Dels=0.00;FS=7.166;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1219,0,1364 chrXVI 230063 . G C 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;DP=133;Dels=0.00;FS=10.834;HaplotypeScore=5.6017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.722;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.362;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1333,0,1361 chrXVI 230442 . G A 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.678;DP=121;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.532;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1308,0,1323 chrXVI 230687 . T A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.458;DP=115;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.171;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,54:115:99:1096,0,1454 chrXVI 230852 . A T 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.460;DP=150;Dels=0.00;FS=2.023;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.528;SB=-9.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1680,0,1645 chrXVI 231052 . T C 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.53;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3414,355,0 chrXVI 231144 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.235;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.721;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1271,0,1500 chrXVI 231179 . T G 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.472;DP=119;Dels=0.00;FS=0.774;HaplotypeScore=2.3586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.919;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1108,0,1553 chrXVI 231457 . A G 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.524;DP=121;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.636;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1352,0,1398 chrXVI 231483 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.071;DP=138;Dels=0.00;FS=5.223;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.997;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1329,0,1508 chrXVI 232109 . G T 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.645;DP=131;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=6.6641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1271,0,1587 chrXVI 232116 . T C 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;DP=134;Dels=0.00;FS=1.620;HaplotypeScore=8.6535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-3.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1702,0,1255 chrXVI 232287 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.298;DP=109;Dels=0.00;FS=10.696;HaplotypeScore=2.7255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.884;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1207,0,1194 chrXVI 232382 . A G 1470.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.814;DP=119;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.014;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,72:119:99:1500,0,1066 chrXVI 232435 . C T 1623.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.496;DP=127;Dels=0.00;FS=4.282;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=12.78;ReadPosRankSum=-1.355;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1653,0,1193 chrXVI 232560 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.328;DP=139;Dels=0.00;FS=3.074;HaplotypeScore=5.2362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.407;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1439,0,1627 chrXVI 232568 . T G 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.483;DP=128;Dels=0.00;FS=4.233;HaplotypeScore=3.2762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.244;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1275,0,1555 chrXVI 232619 . C T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.098;DP=151;Dels=0.00;FS=8.411;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.609;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1460,0,1796 chrXVI 232653 . G A 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.192;DP=130;Dels=0.00;FS=4.194;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,72:130:99:1658,0,1202 chrXVI 232790 . G C 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3673,370,0 chrXVI 232961 . T C 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=109;Dels=0.00;FS=2.500;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.550;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1342,0,1026 chrXVI 233007 . G A 2895 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7209;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.418e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:114:99:2928,286,0 chrXVI 233462 . T C 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;DP=84;Dels=0.00;FS=5.973;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.704;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,51:84:99:1088,0,675 chrXVI 233717 . C T 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.950;DP=119;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1289,0,1367 chrXVI 233841 . C T 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=28.26;SB=-1.008e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3198,307,0 chrXVI 234054 . G A 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.351;DP=147;Dels=0.00;FS=4.985;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.570;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,65:147:99:1337,0,1805 chrXVI 234100 . A G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.400;DP=126;Dels=0.00;FS=2.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=8.39;ReadPosRankSum=-2.033;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,51:126:99:1087,0,1760 chrXVI 234114 . C G 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;DP=114;Dels=0.00;FS=1.674;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,45:114:99:945,0,1610 chrXVI 234171 . C T 3961.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.29;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.626e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3961,385,0 chrXVI 234188 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.648;DP=118;Dels=0.00;FS=3.423;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.575;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1480,0,1211 chrXVI 234189 . C A 3330.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=28.46;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3330,322,0 chrXVI 234333 . C T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.458;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.603;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:1435,0,1520 chrXVI 234336 . A T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.563;DP=133;Dels=0.02;FS=0.736;HaplotypeScore=17.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.125;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1424,0,1494 chrXVI 234405 . A G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.746;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.295;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1486,0,1332 chrXVI 234417 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.158;DP=141;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,67:141:99:1518,0,1564 chrXVI 234527 . A G 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.310;DP=107;Dels=0.00;FS=9.192;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.306;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:909,0,1496 chrXVI 234528 . T C 830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.683;DP=107;Dels=0.00;FS=9.192;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:860,0,1480 chrXVI 234591 . A G 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.922;DP=137;Dels=0.00;FS=5.135;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.726;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1360,0,1585 chrXVI 234789 . C T 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.183;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.067;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:886,0,895 chrXVI 234836 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.086;DP=87;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=11.98;ReadPosRankSum=3.283;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:1072,0,909 chrXVI 235149 . A G 3477.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3477,351,0 chrXVI 235155 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.146;DP=129;Dels=0.00;FS=4.508;HaplotypeScore=5.9646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.516;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1444,0,1332 chrXVI 235215 . A G 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.415;DP=113;Dels=0.00;FS=7.393;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.712;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:1001,0,1477 chrXVI 235371 . C T 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.266;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1732,0,1209 chrXVI 235523 . C T 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.383;DP=119;Dels=0.00;FS=4.596;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.816;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1175,0,1275 chrXVI 235565 . G A 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.776;DP=108;Dels=0.00;FS=2.440;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.737;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1170,0,1090 chrXVI 235830 . A C 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;DP=138;Dels=0.00;FS=10.718;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:138:99:1345,0,1506 chrXVI 236129 . C T 1448.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.302;DP=162;Dels=0.00;FS=0.588;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.526;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.650;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,77:162:99:1478,0,1909 chrXVI 236142 . C A 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.941;DP=148;Dels=0.00;FS=3.941;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1701,0,1553 chrXVI 236348 . T C 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.589;DP=171;Dels=0.00;FS=9.034;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,86:171:99:1764,0,1928 chrXVI 236471 . C A 1696.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.575;DP=126;Dels=0.00;FS=12.182;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.431;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1726,0,1132 chrXVI 236844 . T A 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;DP=138;Dels=0.00;FS=5.285;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=11.75;ReadPosRankSum=-3.041;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1651,0,1424 chrXVI 236868 . A T 3846.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:99:3846,373,0 chrXVI 236973 . A G 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.596;DP=152;Dels=0.00;FS=0.600;HaplotypeScore=2.9882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.092;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,73:152:99:1520,0,1735 chrXVI 237068 . C G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;DP=116;Dels=0.00;FS=2.401;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.563;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1067,0,1346 chrXVI 237125 . C T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.663;DP=123;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=2.9539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.484;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1253,0,1427 chrXVI 237126 . G A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.668;DP=124;Dels=0.01;FS=0.667;HaplotypeScore=2.9539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.415;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1428,0,1216 chrXVI 237141 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.622;DP=130;Dels=0.00;FS=2.202;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.995;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1246,0,1561 chrXVI 237218 . C A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.131;DP=138;Dels=0.00;FS=0.636;HaplotypeScore=6.5489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.111;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1371,0,1678 chrXVI 237235 . G A 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.622;DP=142;Dels=0.00;FS=7.591;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.330;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,58:142:99:1237,0,1753 chrXVI 237288 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.005;DP=130;Dels=0.00;FS=13.486;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1407,0,1439 chrXVI 237294 . G A 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.181;DP=141;Dels=0.00;FS=10.731;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.767;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1600,0,1618 chrXVI 237332 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.958;DP=121;Dels=0.00;FS=3.348;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.148;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1407,0,1305 chrXVI 237340 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=131;Dels=0.00;FS=9.509;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.852;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:131:99:1496,0,1409 chrXVI 237387 . G A 4616.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=27.98;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4616,448,0 chrXVI 237675 . C T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.821;DP=125;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1371,0,1383 chrXVI 237695 . A G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.594;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=10.64;ReadPosRankSum=2.364;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1179,0,1223 chrXVI 237745 . T C 2517 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.118e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2550,267,0 chrXVI 237880 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.502;DP=135;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=5.0298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,73:135:99:1605,0,1390 chrXVI 237971 . C T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;DP=105;Dels=0.00;FS=2.529;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.850;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1180,0,1132 chrXVI 238002 . T A 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.460;DP=98;Dels=0.00;FS=5.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.991;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:935,0,1204 chrXVI 238051 . A G 1158.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.259;DP=115;Dels=0.00;FS=5.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1188,0,1296 chrXVI 238061 . C A 1271.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.735;DP=111;Dels=0.00;FS=3.552;HaplotypeScore=2.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=11.45;ReadPosRankSum=-1.407;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1301,0,1088 chrXVI 238082 . C T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.167;DP=122;Dels=0.00;FS=1.450;HaplotypeScore=2.5922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.408;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1433,0,1300 chrXVI 238111 . T C 3273.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.640e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:126:99:3273,328,0 chrXVI 238341 . G A 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.439;DP=147;Dels=0.00;FS=8.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.251;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,80:147:99:1829,0,1421 chrXVI 238515 . G A 1834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.923;DP=149;Dels=0.00;FS=7.531;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,85:149:99:1864,0,1345 chrXVI 238556 . G A 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.594;DP=118;Dels=0.00;FS=12.073;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.239;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:1536,0,1065 chrXVI 238578 . C T 3909.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12;SB=-1.870e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3909,376,0 chrXVI 238659 . T G 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;DP=146;Dels=0.00;FS=2.944;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1652,0,1542 chrXVI 238781 . T C 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.634;DP=139;Dels=0.00;FS=2.125;HaplotypeScore=2.7635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.946;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,76:139:99:1679,0,1357 chrXVI 238845 . T C 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.55;SB=-1.423e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3372,337,0 chrXVI 238991 . A G 690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.284;DP=73;Dels=0.00;FS=7.888;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.392;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:720,0,844 chrXVI 239140 . T C 56.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.931;DP=102;Dels=0.00;FS=3.738;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.834;QD=0.55;ReadPosRankSum=-0.600;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:86:86,0,1146 chrXVI 239186 . C T 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.572;DP=87;Dels=0.00;FS=2.816;HaplotypeScore=2.3046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.921;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.582;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:1001,0,881 chrXVI 239318 . C T 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.285;DP=96;Dels=0.00;FS=7.311;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.403;SB=-2.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1066,0,996 chrXVI 239611 . G T 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;DP=113;Dels=0.00;FS=2.438;HaplotypeScore=4.6360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=13.43;ReadPosRankSum=-2.346;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1548,0,969 chrXVI 239629 . A T 3221.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.453e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3254,331,0 chrXVI 240133 . C G 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=152;Dels=0.00;FS=4.855;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.503;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,76:152:99:1613,0,1686 chrXVI 240184 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.774;DP=132;Dels=0.00;FS=1.401;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=3.379;QD=10.05;ReadPosRankSum=1.076;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1357,0,1510 chrXVI 240215 . G A 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.433e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2696,268,0 chrXVI 240217 . G A 825.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.620;DP=102;Dels=0.00;FS=7.912;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.672;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:102:99:855,0,1176 chrXVI 240237 . T C 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.572;DP=108;Dels=0.00;FS=2.504;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.345;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:999,0,1442 chrXVI 240445 . C T 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;DP=127;Dels=0.00;FS=2.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=10.06;ReadPosRankSum=1.025;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:1308,0,1403 chrXVI 240478 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.312;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.692;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1511,0,1382 chrXVI 240583 . G A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.998;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.093;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1129,0,1162 chrXVI 240681 . C G 2490 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.15;SB=-1.210e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2523,264,0 chrXVI 240946 . A G 3923.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.900e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3923,376,0 chrXVI 241053 . G C 3032 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3065,310,0 chrXVI 241174 . A C 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.730;DP=152;Dels=0.00;FS=7.098;HaplotypeScore=2.8149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.242;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.317;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,79:152:99:1745,0,1585 chrXVI 241200 . G A 1800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.575;DP=156;Dels=0.00;FS=8.277;HaplotypeScore=9.3571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.692;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.368;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1830,0,1608 chrXVI 241467 . C T 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.595;DP=98;Dels=0.00;FS=5.079;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:1015,0,1153 chrXVI 241650 . T C 640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;DP=89;Dels=0.00;FS=1.954;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-2.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,35:89:99:670,0,1240 chrXVI 241683 . C A 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.420;DP=99;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.186;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:1018,0,1203 chrXVI 241702 . A G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.955;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1023,0,1179 chrXVI 241801 . A G 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.976;DP=120;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.544;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1262,0,1377 chrXVI 241902 . G A 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.171;DP=112;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.676;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1349,0,1086 chrXVI 241984 . T A 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.349;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1502,0,1740 chrXVI 242019 . C G 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;DP=133;Dels=0.00;FS=7.948;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1415,0,1361 chrXVI 242099 . A G 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.839;DP=99;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.054;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:811,0,1146 chrXVI 242227 . G A 948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.485;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.279;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:81:99:978,0,776 chrXVI 242375 . G C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.629;DP=102;Dels=0.00;FS=3.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1319,0,919 chrXVI 242446 . T C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.642;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.132;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1291,0,1511 chrXVI 242449 . A G 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.542;DP=132;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.720;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1321,0,1540 chrXVI 242716 . A T 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=28.13;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3404,331,0 chrXVI 242761 . G A 4081.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.39;SB=-2.006e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4081,382,0 chrXVI 242816 . C T 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.308;DP=119;Dels=0.00;FS=1.509;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.506;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1425,0,1216 chrXVI 242835 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.118;DP=110;Dels=0.00;FS=4.619;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.240;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1076,0,1349 chrXVI 243021 . A G 3047 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.38;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3080,321,0 chrXVI 243206 . C T 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.332;DP=95;Dels=0.00;FS=1.664;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.620;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1013,0,1056 chrXVI 243242 . C T 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.421;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.530;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1221,0,1157 chrXVI 243248 . A G 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.748;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.057;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1297,0,1281 chrXVI 243265 . C T 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.275;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.151;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1685,0,1271 chrXVI 243433 . A G 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.654;DP=112;Dels=0.00;FS=1.663;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.729;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,69:112:99:1506,0,896 chrXVI 243601 . T A 1113.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;DP=104;Dels=0.00;FS=4.895;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.300;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1143,0,1084 chrXVI 244200 . C T 851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.179;DP=110;Dels=0.00;FS=1.569;HaplotypeScore=3.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.529;QD=7.74;ReadPosRankSum=-1.007;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:881,0,1143 chrXVI 244301 . G A 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.738;DP=124;Dels=0.00;FS=13.716;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-1.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1331,0,1364 chrXVI 244391 . G T 771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.014;DP=105;Dels=0.00;FS=3.623;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.658;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,42:105:99:801,0,1476 chrXVI 244502 . A G 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;DP=91;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:893,0,1075 chrXVI 244633 . A G 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.390;DP=116;Dels=0.00;FS=3.458;HaplotypeScore=1.9411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.900;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.044;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1268,0,1263 chrXVI 244785 . G A 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3618,352,0 chrXVI 244939 . T C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;DP=113;Dels=0.00;FS=2.430;HaplotypeScore=4.9387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.203;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1169,0,1266 chrXVI 244964 . C T 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;DP=109;Dels=0.00;FS=12.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.909;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1266,0,1126 chrXVI 245159 . T C 1189.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.640;DP=140;Dels=0.00;FS=2.140;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.458;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,64:140:99:1219,0,1778 chrXVI 245345 . G A 1594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.918;DP=134;Dels=0.00;FS=3.273;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.094;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1624,0,1354 chrXVI 245420 . C T 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.374;DP=139;Dels=0.00;FS=3.065;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1626,0,1511 chrXVI 245496 . C T 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.612;DP=119;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.762;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1472,0,1302 chrXVI 245982 . A T 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3103,301,0 chrXVI 246191 . C G 1165.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.319;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.990;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1195,0,1281 chrXVI 246320 . C T 1321.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.241;DP=109;Dels=0.00;FS=5.987;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1351,0,1123 chrXVI 246480 . G A 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.211;DP=128;Dels=0.00;FS=2.291;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.536;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1087,0,1450 chrXVI 246509 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.521;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.352;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,52:117:99:1171,0,1476 chrXVI 246539 . A T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;DP=123;Dels=0.00;FS=2.354;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.714;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1236,0,1576 chrXVI 246558 . C T 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.572;DP=115;Dels=0.00;FS=1.556;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.756;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1058,0,1367 chrXVI 246640 . G A 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.109;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.620;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:1059,0,1652 chrXVI 246945 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.726;DP=142;Dels=0.00;FS=2.184;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.843;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1376,0,1802 chrXVI 247112 . A C 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.985;DP=178;Dels=0.00;FS=2.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,93:178:99:1843,0,1908 chrXVI 247153 . C A 3982.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=28.24;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3982,397,0 chrXVI 247661 . C T 1516.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.582;DP=144;Dels=0.00;FS=3.933;HaplotypeScore=3.6416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.927;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,71:144:99:1546,0,1594 chrXVI 247710 . G A 1626.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.662;DP=156;Dels=0.00;FS=0.592;HaplotypeScore=2.7264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.718;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:1656,0,1726 chrXVI 247766 . T C 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.489;DP=137;Dels=0.00;FS=4.034;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=9.87;ReadPosRankSum=-2.343;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1382,0,1610 chrXVI 247847 . A G 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;DP=153;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.626;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,76:153:99:1706,0,1670 chrXVI 247931 . G A 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.135;DP=132;Dels=0.00;FS=7.031;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.855;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1578,0,1238 chrXVI 248123 . C T 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.258;DP=128;Dels=0.00;FS=7.543;HaplotypeScore=3.9804;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.373;QD=21.14;ReadPosRankSum=2.104;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,126:128:99:2739,240,0 chrXVI 248287 . A C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;DP=136;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.863;QD=9.79;ReadPosRankSum=2.165;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1361,0,1677 chrXVI 248288 . C T 1599.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.532;DP=136;Dels=0.00;FS=4.452;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=11.76;ReadPosRankSum=-2.274;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:1629,0,1307 chrXVI 249056 . G A 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.996;DP=124;Dels=0.00;FS=3.268;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.988;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1270,0,1539 chrXVI 249300 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.063;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=10.73;ReadPosRankSum=-2.502;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1393,0,1388 chrXVI 249821 . A G 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.404;DP=116;Dels=0.00;FS=3.343;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.565;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1229,0,1274 chrXVI 250684 . A C 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.808;DP=109;Dels=0.00;FS=6.204;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.258;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,59:109:99:1196,0,1092 chrXVI 250784 . G A 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.894;DP=131;Dels=0.00;FS=1.709;HaplotypeScore=3.4184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.503;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1565,0,1453 chrXVI 251053 . C T 1152.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.787;DP=114;Dels=0.00;FS=0.738;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=10.11;ReadPosRankSum=-2.102;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1182,0,1387 chrXVI 251068 . T C 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.913;DP=105;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=8.65;ReadPosRankSum=-2.884;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:938,0,1410 chrXVI 251210 . A T 1753.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.414;DP=134;Dels=0.00;FS=2.200;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.651;SB=-8.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1783,0,1206 chrXVI 251236 . T A 1662.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.470;DP=130;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1692,0,1158 chrXVI 251405 . C T 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.153;DP=145;Dels=0.00;FS=5.040;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=11.37;ReadPosRankSum=-2.975;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1678,0,1470 chrXVI 251559 . C T 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.811;DP=101;Dels=0.00;FS=2.589;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.296;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,54:101:99:1150,0,1041 chrXVI 251641 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.417;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.219;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:1035,0,1525 chrXVI 251738 . A G 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.854;DP=137;Dels=0.00;FS=6.459;HaplotypeScore=1.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,57:137:99:1075,0,1864 chrXVI 252004 . A G 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.784;DP=145;Dels=0.00;FS=2.071;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.145;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1717,0,1450 chrXVI 252084 . T C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.479;DP=136;Dels=0.00;FS=2.158;HaplotypeScore=4.7624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQ0=0;MQRankSum=2.013;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.763;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1326,0,1692 chrXVI 252117 . G A 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.42;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3714,367,0 chrXVI 252262 . T A 144.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;DP=79;Dels=0.00;FS=10.904;HaplotypeScore=17.6408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.49;MQ0=0;MQRankSum=-4.248;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-5.601e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:174,0,1226 chrXVI 252265 . A T 68.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;DP=78;Dels=0.00;FS=7.242;HaplotypeScore=18.5075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.04;MQ0=0;MQRankSum=-4.100;QD=0.87;ReadPosRankSum=0.338;SB=-5.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:98:98,0,1272 chrXVI 252271 . T A 118.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;DP=79;Dels=0.04;FS=3.558;HaplotypeScore=22.4301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.82;MQ0=0;MQRankSum=-5.332;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.670;SB=-9.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:148,0,1292 chrXVI 252274 . T A 55.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;DP=80;Dels=0.00;FS=6.761;HaplotypeScore=30.5430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=0;MQRankSum=-5.305;QD=0.69;ReadPosRankSum=0.670;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:85:85,0,1345 chrXVI 252362 . G A 712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;DP=108;Dels=0.00;FS=4.235;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:742,0,1485 chrXVI 252372 . T A 3154 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9852;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.43;SB=-1.164e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3187,313,0 chrXVI 252434 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.465;DP=145;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=2.177;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.255;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1529,0,1540 chrXVI 252490 . A G 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.056;DP=154;Dels=0.00;FS=1.268;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1532,0,1694 chrXVI 252501 . A G,T 3093.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.24;MQ0=0;QD=23.61;SB=-1.681e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,66,64:131:99:3153,1596,1430,1558,0,1386 chrXVI 252511 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.754;DP=122;Dels=0.00;FS=5.606;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.787;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1138,0,1477 chrXVI 252550 . T C 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.529;DP=123;Dels=0.00;FS=21.798;HaplotypeScore=1.9833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=10.78;ReadPosRankSum=-2.340;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1356,0,1390 chrXVI 252578 . T C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.437;DP=129;Dels=0.00;FS=19.206;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.922;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1389,0,1430 chrXVI 252618 . C T 3632.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.974e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3632,352,0 chrXVI 252946 . G T 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.323;DP=126;Dels=0.00;FS=4.252;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.742;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1337,0,1301 chrXVI 252991 . A G 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.398;DP=163;Dels=0.00;FS=1.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,75:163:99:1517,0,1900 chrXVI 253090 . G A 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=27.61;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3043,298,0 chrXVI 253126 . A G 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.166;DP=132;Dels=0.00;FS=4.428;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.857;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1392,0,1407 chrXVI 253207 . A G 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.064;DP=140;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.119;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1549,0,1556 chrXVI 253285 . T A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.567;DP=113;Dels=0.00;FS=1.565;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.733;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.348;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,54:113:99:1133,0,1410 chrXVI 253286 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.409;DP=114;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=1.7998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.857;QD=9.18;ReadPosRankSum=-2.244;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1076,0,1406 chrXVI 253297 . G A 975.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.524;DP=113;Dels=0.00;FS=2.412;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.803;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.846;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1005,0,1379 chrXVI 253375 . C T 2690 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=24.23;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2723,271,0 chrXVI 253678 . A G 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.182;DP=108;Dels=0.00;FS=2.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.218;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1086,0,1232 chrXVI 253842 . T C 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.924;DP=133;Dels=0.00;FS=9.244;HaplotypeScore=2.9067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1580,0,1283 chrXVI 253892 . T C 3281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.485;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.400;SB=-1.345e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:125:99:3281,311,0 chrXVI 254020 . C T 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.123;DP=122;Dels=0.00;FS=2.295;HaplotypeScore=2.9693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1447,0,1210 chrXVI 254053 . G A 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.046;DP=125;Dels=0.00;FS=4.369;HaplotypeScore=4.9325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.639;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1436,0,1352 chrXVI 254101 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.849;DP=142;Dels=0.00;FS=12.289;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.237;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1364,0,1552 chrXVI 254117 . G A 3930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=27.48;SB=-1.918e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3930,379,0 chrXVI 254474 . G A 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;DP=132;Dels=0.00;FS=4.157;HaplotypeScore=3.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.949;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:1399,0,1617 chrXVI 254494 . A C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;DP=131;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=10.50;ReadPosRankSum=2.467;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1406,0,1606 chrXVI 254530 . C T 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.328;DP=131;Dels=0.00;FS=5.071;HaplotypeScore=3.5117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.836;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:131:99:1442,0,1501 chrXVI 254541 . T C 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;DP=112;Dels=0.00;FS=3.042;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=2.088;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1203,0,1401 chrXVI 254741 . C T 4029.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=28.78;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:4029,409,0 chrXVI 254772 . A T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.458;DP=142;Dels=0.00;FS=7.037;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.810;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.644;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,66:142:99:1387,0,1812 chrXVI 254778 . G A 4072.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.25;MQ0=0;QD=28.48;SB=-8.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:4072,400,0 chrXVI 254813 . G A 4263.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.45;MQ0=0;QD=28.23;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4263,421,0 chrXVI 254822 . G A 2064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.135;DP=161;Dels=0.00;FS=12.476;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=2.953;QD=12.82;ReadPosRankSum=1.015;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,86:161:99:2094,0,1587 chrXVI 254974 . A G 4228.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.893e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4228,421,0 chrXVI 255112 . G A 1839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.401;DP=198;Dels=0.00;FS=5.194;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.094;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,89:197:99:1869,0,2351 chrXVI 255175 . A G 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.177;DP=143;Dels=0.00;FS=6.567;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.087;SB=-2.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,77:143:99:1680,0,1472 chrXVI 255611 . C T 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.647;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1451,0,953 chrXVI 255696 . A G 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.123;DP=137;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=3.3442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.083;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1451,0,1558 chrXVI 255726 . G A 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.657;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.629;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,89:189:99:1727,0,2096 chrXVI 255750 . G C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.724;DP=149;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.749;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1619,0,1589 chrXVI 255854 . T C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;DP=112;Dels=0.00;FS=1.823;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=3.818;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.467;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1331,0,1258 chrXVI 256359 . T G 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.912e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3679,375,0 chrXVI 256410 . T G 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.296;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.932;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1485,0,1429 chrXVI 256420 . T C 3643.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.114e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3643,373,0 chrXVI 256672 . G A 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.086;DP=125;Dels=0.00;FS=3.281;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.186;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1426,0,1244 chrXVI 257678 . T G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.621;DP=126;Dels=0.00;FS=1.417;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.395;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1260,0,1394 chrXVI 257972 . C T 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8094;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3261,325,0 chrXVI 258041 . A G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.019;DP=159;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=2.6176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.277;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,69:159:99:1405,0,2076 chrXVI 258271 . T C 1562.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.360;DP=144;Dels=0.00;FS=2.128;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.076;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.242;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1592,0,1563 chrXVI 258272 . A T 1580.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;DP=145;Dels=0.00;FS=2.092;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.129;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1610,0,1535 chrXVI 258278 . T C 1502.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.990;DP=148;Dels=0.00;FS=3.967;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1532,0,1601 chrXVI 258329 . G A 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.757;DP=147;Dels=0.00;FS=4.241;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:945,0,1625 chrXVI 258364 . C T 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.418;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.653;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1381,0,1491 chrXVI 258521 . T C 1627.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.020;DP=148;Dels=0.00;FS=5.231;HaplotypeScore=5.9187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.480;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,81:148:99:1657,0,1545 chrXVI 258554 . C A 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.992;DP=160;Dels=0.00;FS=1.301;HaplotypeScore=7.6285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.280;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1742,0,1833 chrXVI 258984 . C T 2273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.296;DP=164;Dels=0.00;FS=7.225;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=1;MQRankSum=-0.784;QD=13.86;ReadPosRankSum=-2.788;SB=-1.034e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,96:164:99:2303,0,1140 chrXVI 259360 . T C 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.391;DP=141;Dels=0.00;FS=2.168;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.186;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1521,0,1596 chrXVI 259417 . G T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.550;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.272;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1391,0,1105 chrXVI 259430 . C G 1100.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.572;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.452;SB=-4.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:106:99:1130,0,1032 chrXVI 259921 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.059;DP=133;Dels=0.00;FS=4.266;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=9.45;ReadPosRankSum=1.189;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1287,0,1654 chrXVI 259987 . C A 2097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.992;DP=176;Dels=0.00;FS=2.190;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=1;MQRankSum=-0.337;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.148;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,95:176:99:2127,0,1731 chrXVI 260089 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.806;DP=123;Dels=0.00;FS=8.396;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.617;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1494,0,1256 chrXVI 260176 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.848;DP=140;Dels=0.00;FS=1.340;HaplotypeScore=2.8983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.917;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1539,0,1528 chrXVI 260252 . C T 1245.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.263;DP=144;Dels=0.00;FS=7.542;HaplotypeScore=6.4531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.249;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,60:144:99:1275,0,1852 chrXVI 260393 . T C 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.423;DP=146;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=2.6175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.282;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1793,0,1423 chrXVI 260560 . G C 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.642;DP=148;Dels=0.00;FS=15.315;HaplotypeScore=3.8322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=2.644;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.088;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1427,0,1713 chrXVI 261034 . T A 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=2.121;QD=11.27;ReadPosRankSum=2.704;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,55:105:99:1213,0,1018 chrXVI 261137 . C G 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3478,337,0 chrXVI 261329 . T C 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.678;DP=135;Dels=0.00;FS=2.208;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.752;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1474,0,1282 chrXVI 261357 . T A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.926;DP=116;Dels=0.00;FS=2.456;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1242,0,1288 chrXVI 261631 . A C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;DP=113;Dels=0.00;FS=1.530;HaplotypeScore=10.6719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.157;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1375,0,981 chrXVI 261906 . C T 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.042;DP=98;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.321;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:997,0,1102 chrXVI 262228 . G A 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=28.03;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3448,351,0 chrXVI 262452 . T G 2970 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3003,300,0 chrXVI 262502 . T G 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.132;DP=150;Dels=0.00;FS=4.948;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.640;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,71:150:99:1481,0,1721 chrXVI 262681 . A G 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.039;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.829;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1067,0,1367 chrXVI 262948 . T C 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.657;DP=136;Dels=0.00;FS=3.205;HaplotypeScore=4.6585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.523;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1243,0,1614 chrXVI 263263 . A G 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3243,322,0 chrXVI 263290 . C T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.879;DP=130;Dels=0.00;FS=7.915;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=10.60;ReadPosRankSum=2.632;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1408,0,1457 chrXVI 263635 . C A 1721.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.968;DP=165;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=2.3149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=10.43;ReadPosRankSum=2.195;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1751,0,1882 chrXVI 263710 . A G 1929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.895;DP=176;Dels=0.00;FS=0.565;HaplotypeScore=7.3262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.566;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,93:176:99:1959,0,1908 chrXVI 263733 . A T 4604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.952e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4604,439,0 chrXVI 263788 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.613;DP=145;Dels=0.00;FS=3.915;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.240;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1383,0,1628 chrXVI 263800 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.118;DP=128;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.532;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1333,0,1461 chrXVI 263823 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.161;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.251;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:132:99:1456,0,1491 chrXVI 263857 . A G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.121;DP=148;Dels=0.00;FS=0.602;HaplotypeScore=5.9394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:1486,0,1627 chrXVI 264124 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.766;DP=147;Dels=0.00;FS=8.722;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.487;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:1452,0,1772 chrXVI 264248 . T A 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;DP=111;Dels=0.00;FS=3.756;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.439;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:1028,0,1530 chrXVI 264333 . A T 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.950;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1054,0,1228 chrXVI 264524 . A C 2749 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2782,282,0 chrXVI 264525 . C A 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.473;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.454;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,52:103:99:1107,0,1071 chrXVI 264572 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.512;DP=124;Dels=0.00;FS=3.256;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.746;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1285,0,1473 chrXVI 264609 . T C 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.234;DP=140;Dels=0.00;FS=5.315;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=7.49;ReadPosRankSum=3.537;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,55:140:99:1078,0,1968 chrXVI 264688 . C T 973.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.936;DP=109;Dels=0.00;FS=9.451;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.752;QD=8.93;ReadPosRankSum=3.617;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:1003,0,1406 chrXVI 264689 . C T 982.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.126;DP=109;Dels=0.00;FS=9.451;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.67;MQ0=0;MQRankSum=-3.954;QD=9.01;ReadPosRankSum=3.893;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:1012,0,1423 chrXVI 264690 . A G 932.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.246;DP=108;Dels=0.00;FS=9.421;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.948;QD=8.63;ReadPosRankSum=3.899;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:962,0,1412 chrXVI 264705 . G A 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.493;DP=123;Dels=0.00;FS=2.364;HaplotypeScore=4.7756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=9.87;ReadPosRankSum=2.387;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:123:99:1244,0,1489 chrXVI 264726 . T C 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.343;DP=137;Dels=0.00;FS=3.100;HaplotypeScore=4.8775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=12.07;ReadPosRankSum=-2.425;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1683,0,1474 chrXVI 264796 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.334;DP=117;Dels=0.00;FS=1.491;HaplotypeScore=4.6678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.179;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1257,0,949 chrXVI 264839 . A C 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.730;DP=95;Dels=0.00;FS=2.810;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.562;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:835,0,748 chrXVI 264882 . T A 2541 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.26;MQ0=0;QD=23.97;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2574,247,0 chrXVI 264964 . C T 2536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2569,252,0 chrXVI 265144 . T C 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.596;DP=131;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=2.6761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.081;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:131:99:1587,0,1262 chrXVI 265153 . C T 3908.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.764e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3908,376,0 chrXVI 265208 . C G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.858;DP=115;Dels=0.00;FS=5.776;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.960;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,60:115:99:1396,0,1158 chrXVI 265753 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.043;DP=122;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1309,0,1296 chrXVI 266023 . C T 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.624e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3670,349,0 chrXVI 266311 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.061;DP=104;Dels=0.00;FS=3.650;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.225;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:1076,0,1293 chrXVI 266771 . G A 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.094;DP=156;Dels=0.00;FS=3.877;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.883;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1743,0,1603 chrXVI 266858 . C G 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.146;DP=125;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,54:125:99:1084,0,1568 chrXVI 267131 . G A 1766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.123;DP=137;Dels=0.00;FS=2.171;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-9.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,78:137:99:1796,0,1195 chrXVI 267269 . A T 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;DP=112;Dels=0.00;FS=14.146;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=11.33;ReadPosRankSum=-2.424;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,59:112:99:1299,0,1226 chrXVI 267298 . C T 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.569;DP=121;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=2.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1315,0,1393 chrXVI 267512 . G C 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;DP=123;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=10.38;ReadPosRankSum=2.149;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1307,0,1313 chrXVI 267830 . T C 1107.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.814;DP=118;Dels=0.00;FS=10.144;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=1;MQRankSum=0.375;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.599;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1137,0,1452 chrXVI 267899 . C T 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.101;DP=127;Dels=0.00;FS=3.288;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.493;SB=-9.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,75:127:99:1758,0,1096 chrXVI 268117 . G A 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.274;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.249;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,48:128:99:925,0,1861 chrXVI 268208 . C T 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6982;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.448e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3717,364,0 chrXVI 268398 . A G 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.919;DP=142;Dels=0.00;FS=6.098;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.022;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,72:142:99:1405,0,1650 chrXVI 268907 . G A 1838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.474;DP=178;Dels=0.00;FS=3.447;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=10.33;ReadPosRankSum=1.147;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,87:178:99:1868,0,1912 chrXVI 269012 . C T 3384.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3384,322,0 chrXVI 269260 . A C 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.065;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=12.53;ReadPosRankSum=1.972;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,73:126:99:1609,0,1140 chrXVI 269345 . C T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.108;DP=112;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.332;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1354,0,1106 chrXVI 269803 . C T 996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.348;DP=112;Dels=0.00;FS=3.524;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.223;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:1026,0,1422 chrXVI 270158 . C T 3322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3322,328,0 chrXVI 270454 . C G 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;DP=131;Dels=0.00;FS=3.151;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.963;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:1227,0,1559 chrXVI 270592 . G T 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.558;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1256,0,1648 chrXVI 270630 . T C 3308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3308,342,0 chrXVI 270689 . C T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.778;DP=138;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=9.83;ReadPosRankSum=-2.167;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1387,0,1614 chrXVI 270728 . T C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.289;DP=129;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=4.9696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.586;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1059,0,1569 chrXVI 270942 . G A 1924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.155;DP=141;Dels=0.00;FS=15.878;HaplotypeScore=3.6440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.917;SB=-9.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,82:141:99:1954,0,1281 chrXVI 270991 . T C 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.263;DP=111;Dels=0.00;FS=1.558;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.268;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1279,0,1129 chrXVI 271044 . A G 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.011;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1536,0,1336 chrXVI 271054 . T A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;DP=118;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.518;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1380,0,1188 chrXVI 271083 . T A 2902 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.215e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2935,291,0 chrXVI 271095 . C T 3064 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=28.64;SB=-1.306e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3097,301,0 chrXVI 271127 . G T 896.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.800;DP=109;Dels=0.00;FS=9.585;HaplotypeScore=3.3618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.711;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:926,0,1450 chrXVI 271149 . A G 1198.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.190;DP=122;Dels=0.00;FS=4.314;HaplotypeScore=3.8863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=9.82;ReadPosRankSum=-2.031;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1228,0,1369 chrXVI 271460 . C T 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=28.92;SB=-1.833e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3615,358,0 chrXVI 271555 . G A 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=28.15;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3490,343,0 chrXVI 271666 . C T 2842 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2875,283,0 chrXVI 272032 . A G 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.920;DP=142;Dels=0.00;FS=1.329;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.816;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,71:142:99:1489,0,1622 chrXVI 272038 . C T 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.611;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.242;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:148:99:1730,0,1575 chrXVI 272093 . C G 1325.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.429;DP=130;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.296;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1355,0,1430 chrXVI 272321 . T C 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.469;DP=103;Dels=0.00;FS=1.589;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.932;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1151,0,1110 chrXVI 272485 . G A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.838;DP=128;Dels=0.00;FS=4.417;HaplotypeScore=2.8603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.319;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1518,0,1292 chrXVI 272587 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.369;DP=146;Dels=0.00;FS=5.507;HaplotypeScore=4.7050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.289;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1376,0,1911 chrXVI 272608 . T C 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.370;DP=129;Dels=0.00;FS=2.338;HaplotypeScore=4.7633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.360;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1366,0,1490 chrXVI 272771 . C T 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.078;DP=125;Dels=0.00;FS=1.433;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:125:99:1264,0,1529 chrXVI 272942 . A G 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.806;DP=105;Dels=0.00;FS=6.250;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1196,0,1086 chrXVI 273202 . A G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.475;DP=100;Dels=0.00;FS=3.832;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.293;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1116,0,1075 chrXVI 273221 . A T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;DP=109;Dels=0.00;FS=7.790;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.689;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1141,0,1278 chrXVI 273229 . G T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;DP=131;Dels=0.00;FS=1.498;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.181;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1453,0,1394 chrXVI 273874 . T C 2033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.79;SB=-9.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2066,207,0 chrXVI 273875 . T C 1959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19;SB=-8.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:1992,201,0 chrXVI 274025 . T C 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.909;DP=116;Dels=0.00;FS=2.499;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.428;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,58:116:99:1172,0,1308 chrXVI 274031 . T C 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.682;DP=119;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1093,0,1324 chrXVI 274331 . A T 1067.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.906;DP=109;Dels=0.00;FS=0.724;HaplotypeScore=1.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=9.79;ReadPosRankSum=2.098;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1097,0,1333 chrXVI 274370 . T C 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.690;DP=122;Dels=0.00;FS=2.329;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.548;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1229,0,1436 chrXVI 274407 . G A 3498.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3498,337,0 chrXVI 274818 . C T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.674;DP=79;Dels=0.00;FS=0.872;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.734;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,50:79:99:1254,0,594 chrXVI 274932 . A C 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;DP=124;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=3.8856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.372;SB=-8.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,76:124:99:1732,0,855 chrXVI 275039 . C T 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;DP=141;Dels=0.00;FS=2.208;HaplotypeScore=2.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.363;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1524,0,1543 chrXVI 275246 . G A 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.330;DP=129;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=11.78;ReadPosRankSum=2.930;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1549,0,1326 chrXVI 275384 . G A 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.669;DP=101;Dels=0.00;FS=10.327;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=6.78;ReadPosRankSum=-1.249;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,37:101:99:715,0,1419 chrXVI 275387 . G A 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.53;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2739,267,0 chrXVI 275615 . G C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.674;DP=122;Dels=0.00;FS=3.731;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.786;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1256,0,1394 chrXVI 275804 . A T 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.624;DP=91;Dels=0.00;FS=0.783;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.075;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,45:91:99:1034,0,1079 chrXVI 275818 . G A 2812 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=28.40;SB=-1.368e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2845,280,0 chrXVI 275836 . C A 2956 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.37;SB=-1.476e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2989,292,0 chrXVI 275908 . A T 809.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;DP=103;Dels=0.00;FS=7.964;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.657;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,44:103:99:839,0,1362 chrXVI 275911 . T C 856.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.196;DP=98;Dels=0.00;FS=5.204;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:886,0,1238 chrXVI 275926 . T C 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.401;DP=82;Dels=0.00;FS=2.943;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.923;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:1009,0,834 chrXVI 276005 . G A 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.557;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,77:158:99:1709,0,1703 chrXVI 276276 . A G 768.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.450;DP=117;Dels=0.00;FS=1.531;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=6.56;ReadPosRankSum=-2.312;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:798,0,1616 chrXVI 276463 . G T 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;DP=130;Dels=0.00;FS=2.251;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.975;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1376,0,1605 chrXVI 276934 . G A 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.632;DP=117;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=4.4461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=1;MQRankSum=0.019;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.113;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1387,0,1158 chrXVI 277322 . T C 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.903;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.703;SB=-3.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1107,0,1275 chrXVI 277436 . C T 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.344;DP=148;Dels=0.00;FS=2.095;HaplotypeScore=7.5736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=9.68;ReadPosRankSum=-1.054;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:148:99:1463,0,1779 chrXVI 277547 . A G 2340 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.48;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.148e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:2373,246,0 chrXVI 277562 . G T 2583 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.96;MQ0=0;QD=25.57;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:101:99:2616,258,0 chrXVI 277570 . C T 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.759;DP=88;Dels=0.00;FS=5.495;HaplotypeScore=2.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.889;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:755,0,1166 chrXVI 277737 . G A 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.359;DP=146;Dels=0.00;FS=2.265;HaplotypeScore=5.7532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,60:146:99:1233,0,1875 chrXVI 277807 . G A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.473;DP=168;Dels=0.00;FS=1.217;HaplotypeScore=3.6447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,72:168:99:1472,0,2072 chrXVI 277951 . A T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.771;DP=149;Dels=0.00;FS=5.528;HaplotypeScore=4.5296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.222;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1539,0,1829 chrXVI 278223 . T C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.300;DP=124;Dels=0.00;FS=6.841;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.886;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,65:124:99:1376,0,1312 chrXVI 278872 . T C 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.740;DP=147;Dels=0.00;FS=9.089;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.874;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,82:147:99:1823,0,1443 chrXVI 279235 . A G 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3258,325,0 chrXVI 279259 . G C 2234 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:2267,228,0 chrXVI 279412 . T C 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8505;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.43;SB=-1.734e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3753,385,0 chrXVI 279637 . A G 3587.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.60;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3587,381,0 chrXVI 279722 . A G 3212.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3246,333,0 chrXVI 279843 . C T 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3420,328,0 chrXVI 280007 . A G 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.805e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3922,403,0 chrXVI 280399 . A T 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.287;DP=123;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=4.8550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=2.467;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.281;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,57:123:99:1254,0,1511 chrXVI 280422 . A G 3166 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8494;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.618e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:118:99:3199,327,0 chrXVI 280470 . A G 3447.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3447,346,0 chrXVI 280623 . C A 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.751e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3958,385,0 chrXVI 280692 . T G 4326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.87;SB=-2.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4326,421,0 chrXVI 280860 . A G 3711.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.0199;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3711,373,0 chrXVI 280872 . T C 3517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5443;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3517,361,0 chrXVI 281659 . T C 3371.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3371,334,0 chrXVI 281703 . G A 4142.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=28.37;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:146:99:4142,409,0 chrXVI 281721 . T G 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.463e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2890,303,0 chrXVI 281838 . C A 3276.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=24.27;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3276,322,0 chrXVI 281885 . G T 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;QD=26.06;SB=-2.097e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3987,385,0 chrXVI 281895 . A G 3863.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=26.64;SB=-2.044e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3863,385,0 chrXVI 281956 . C A 4374.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=28.59;SB=-1.719e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4374,430,0 chrXVI 281975 . G A 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.466;DP=144;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.467;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,80:144:99:1693,0,1322 chrXVI 282264 . T C 2982 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.16;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3015,333,0 chrXVI 282326 . C G 3893.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3893,394,0 chrXVI 282360 . A G 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.766e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3490,346,0 chrXVI 282453 . T G 2525 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2558,249,0 chrXVI 282491 . T C 2183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.103e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:2216,231,0 chrXVI 282972 . T C 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.13;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3099,304,0 chrXVI 283161 . G A 2526 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=22.55;SB=-1.427e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2559,261,0 chrXVI 283162 . A T 2557 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2590,261,0 chrXVI 283198 . G C 2979 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.42;MQ0=0;QD=24.62;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:121:99:3012,286,0 chrXVI 285744 . G C 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;DP=129;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.065;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,76:129:99:1735,0,1104 chrXVI 286491 . G A 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.049;DP=95;Dels=0.00;FS=1.695;HaplotypeScore=1.9931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:896,0,1090 chrXVI 287349 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.486;DP=128;Dels=0.00;FS=1.463;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.903;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,71:128:99:1560,0,1149 chrXVI 289053 . G T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.013;DP=100;Dels=0.00;FS=0.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.631;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1060,0,1190 chrXVI 289247 . C T 3005 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.144e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3038,286,0 chrXVI 289873 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.629;DP=106;Dels=0.00;FS=0.728;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=2.536;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.309;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1172,0,1123 chrXVI 290015 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.754;DP=122;Dels=0.00;FS=2.406;HaplotypeScore=3.7164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.946;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,64:122:99:1295,0,1372 chrXVI 291046 . G A 3436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:132:99:3436,340,0 chrXVI 292699 . C G 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.49;SB=-1.499e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3391,340,0 chrXVI 293566 . A T 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=1;MQRankSum=-0.682;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,62:116:99:1323,0,1228 chrXVI 295944 . A G 3686.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=24.57;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-1.546e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3686,378,0 chrXVI 295972 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.225;DP=126;Dels=0.00;FS=6.017;HaplotypeScore=1.9577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.691;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1037,0,1624 chrXVI 296606 . C T 1666.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.508;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.307;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,80:140:99:1696,0,1305 chrXVI 299678 . G T 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.80;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2897,277,0 chrXVI 299735 . A T 2697 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.52;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2730,274,0 chrXVI 300745 . G A 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.697e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3042,298,0 chrXVI 301187 . A G 3809.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3809,373,0 chrXVI 301995 . G A 1706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.515;DP=148;Dels=0.00;FS=6.582;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.388;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1736,0,1529 chrXVI 302738 . A G 4557.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=176;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.87;MQ0=0;QD=25.89;SB=-2.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:176:99:4557,451,0 chrXVI 303070 . G A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.196;DP=139;Dels=0.00;FS=2.140;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.107;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1464,0,1495 chrXVI 303354 . C T 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.34;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3663,352,0 chrXVI 304984 . A G 3290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3290,331,0 chrXVI 305933 . G C 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;DP=122;Dels=0.00;FS=1.446;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,67:122:99:1372,0,1167 chrXVI 306237 . C A 1013.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.440;DP=121;Dels=0.00;FS=3.427;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.024;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1043,0,1587 chrXVI 306386 . C G 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.811;DP=133;Dels=0.00;FS=5.287;HaplotypeScore=2.6297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.408;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1518,0,1214 chrXVI 309089 . G T 3577.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.150e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3577,358,0 chrXVI 310970 . A C 4571.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:172:99:4571,451,0 chrXVI 313263 . G T 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.747;DP=120;Dels=0.00;FS=5.740;HaplotypeScore=2.3983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.463;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1181,0,1426 chrXVI 314083 . C G 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=23.90;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2758,273,0 chrXVI 314443 . A G 2706 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2739,279,0 chrXVI 315484 . T A 1488.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;DP=137;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.289;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1518,0,1516 chrXVI 315978 . C A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.528;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.252;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1201,0,1224 chrXVI 316651 . T A 834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.814;DP=90;Dels=0.00;FS=2.773;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.629;SB=-3.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:864,0,1159 chrXVI 318049 . C T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.092;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=11.17;ReadPosRankSum=1.967;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,68:120:99:1382,0,1165 chrXVI 318072 . T G 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.911;DP=99;Dels=0.00;FS=0.893;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.053;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,59:99:99:1252,0,903 chrXVI 318814 . C T 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.514;DP=126;Dels=0.00;FS=2.027;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.653;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1530,0,1156 chrXVI 321220 . C G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.940;DP=109;Dels=0.00;FS=3.645;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.622;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1062,0,1271 chrXVI 323707 . C A 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.057;DP=112;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=13.23;ReadPosRankSum=1.776;SB=-7.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:111:99:1512,0,1006 chrXVI 324163 . C T 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;DP=121;Dels=0.00;FS=6.890;HaplotypeScore=1.8893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.139;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1210,0,1371 chrXVI 324393 . G C 2850 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2883,294,0 chrXVI 325231 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.663;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.160;QD=8.16;ReadPosRankSum=-2.255;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1148,0,1729 chrXVI 326226 . G A 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.922;DP=96;Dels=0.00;FS=3.853;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=-1.053;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:1035,0,972 chrXVI 326955 . T G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.871;DP=142;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=2.7537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.749;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1469,0,1517 chrXVI 326956 . A G 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;DP=138;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.679;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1477,0,1500 chrXVI 327318 . A G 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.652;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.377;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1320,0,1859 chrXVI 328317 . G A 4020.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.545;DP=149;Dels=0.00;FS=5.682;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.843;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:4020,397,0 chrXVI 329374 . A G 1253.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.687;DP=115;Dels=0.00;FS=3.588;HaplotypeScore=2.5769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.100;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:115:99:1283,0,1152 chrXVI 329486 . T C 2589 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.047e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2622,267,0 chrXVI 330238 . A G 2824 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=24.14;SB=-1.409e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:2857,288,0 chrXVI 330424 . A G 2040 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=25.19;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2073,204,0 chrXVI 331774 . C G 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.511;DP=117;Dels=0.00;FS=0.822;HaplotypeScore=3.4090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=10.99;ReadPosRankSum=2.027;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:117:99:1316,0,1207 chrXVI 333067 . G C 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.39;SB=-1.332e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3226,324,0 chrXVI 333143 . T A 1885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.328;DP=134;Dels=0.00;FS=7.330;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.002;QD=14.07;ReadPosRankSum=2.038;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,82:134:99:1915,0,1055 chrXVI 333762 . T C 1649.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=145;Dels=0.00;FS=3.996;HaplotypeScore=2.6542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.224;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1679,0,1430 chrXVI 333767 . T G 1235.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.805;DP=137;Dels=0.00;FS=5.268;HaplotypeScore=2.6542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.084;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1265,0,1646 chrXVI 334207 . A G 2300 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.73;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2333,240,0 chrXVI 334494 . A G 3140 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=24.92;SB=-1.590e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3173,327,0 chrXVI 334924 . A G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.537;DP=124;Dels=0.00;FS=8.284;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.645;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1274,0,1430 chrXVI 335267 . C T 706.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=78;Dels=0.00;FS=4.350;HaplotypeScore=3.7544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:736,0,985 chrXVI 337021 . C T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.640;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.517;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,55:102:99:1226,0,981 chrXVI 337162 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.640;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1260,0,1423 chrXVI 337961 . G A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.924;DP=106;Dels=0.00;FS=1.549;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.45;ReadPosRankSum=2.106;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1138,0,1269 chrXVI 338165 . A G 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.389;DP=102;Dels=0.00;FS=2.595;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,45:102:99:974,0,1343 chrXVI 338182 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.999;DP=117;Dels=0.00;FS=3.428;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1128,0,1376 chrXVI 338332 . G A 3313.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3313,310,0 chrXVI 338426 . T C 2681 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.318e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2714,285,0 chrXVI 338429 . T C 2666 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.99;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2699,273,0 chrXVI 338640 . A T 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=28.39;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2986,289,0 chrXVI 338828 . T C 3704.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.460e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3704,369,0 chrXVI 338889 . G A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.876;DP=131;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.804;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1239,0,1608 chrXVI 338953 . A G 3698.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3698,358,0 chrXVI 339175 . G A 3456.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=27.87;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3456,337,0 chrXVI 339202 . A G 2907 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.96;SB=-1.189e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2940,312,0 chrXVI 339231 . G T 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.302e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3216,319,0 chrXVI 339266 . C T 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.638;DP=125;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1279,0,1403 chrXVI 339275 . G T 3319.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=26.77;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3319,324,0 chrXVI 339477 . C T 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3579,346,0 chrXVI 339486 . G A 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.757e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3470,337,0 chrXVI 339516 . T A 3002 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=28.32;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:3035,301,0 chrXVI 339589 . G A 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;DP=107;Dels=0.00;FS=3.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.684;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1084,0,1271 chrXVI 340393 . T C 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.964;DP=153;Dels=0.00;FS=1.294;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=1;MQRankSum=1.863;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1670,0,1584 chrXVI 341700 . C T 1585.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.292;DP=159;Dels=0.00;FS=8.268;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:1615,0,1958 chrXVI 342072 . G T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.648;DP=134;Dels=0.00;FS=3.050;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.508;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1408,0,1404 chrXVI 342089 . T A 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;DP=138;Dels=0.00;FS=5.259;HaplotypeScore=2.5942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1443,0,1406 chrXVI 344589 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.875;DP=120;Dels=0.00;FS=2.444;HaplotypeScore=6.8770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.377;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1413,0,1250 chrXVI 344783 . G A 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.914;DP=106;Dels=0.00;FS=3.605;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.174;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1070,0,1152 chrXVI 344885 . A T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.863;DP=107;Dels=0.00;FS=7.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQ0=0;MQRankSum=2.863;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.393;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1218,0,1195 chrXVI 345191 . G A 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.574;DP=122;Dels=0.00;FS=3.338;HaplotypeScore=4.7623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=1;MQRankSum=0.222;QD=11.08;ReadPosRankSum=-2.573;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,69:122:99:1382,0,1132 chrXVI 345435 . A G 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;DP=148;Dels=0.00;FS=3.624;HaplotypeScore=3.7718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQ0=0;MQRankSum=2.415;QD=9.32;ReadPosRankSum=3.405;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1409,0,1861 chrXVI 345821 . A G 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.318;DP=128;Dels=0.00;FS=3.543;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=12.41;ReadPosRankSum=-1.323;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1619,0,1220 chrXVI 346505 . A G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.321;DP=118;Dels=0.00;FS=1.449;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.939;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1179,0,1303 chrXVI 346506 . C A 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.417;DP=120;Dels=0.00;FS=3.266;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=2.105;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.845;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1266,0,1268 chrXVI 346570 . T A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;DP=117;Dels=0.00;FS=2.636;HaplotypeScore=3.9392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.908;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1353,0,1298 chrXVI 347399 . G A 1938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.447;DP=182;Dels=0.00;FS=1.175;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.498;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.203;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,90:182:99:1968,0,2035 chrXVI 347435 . T C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.485;DP=137;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.557;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1428,0,1606 chrXVI 347437 . A G 1380.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.835;DP=140;Dels=0.00;FS=2.131;HaplotypeScore=2.7502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.471;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.777;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1410,0,1674 chrXVI 347451 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.261;DP=126;Dels=0.00;FS=4.277;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.371;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,66:126:99:1361,0,1298 chrXVI 347463 . G A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.029;DP=129;Dels=0.00;FS=7.013;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.238;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1157,0,1473 chrXVI 347719 . T A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.697;DP=120;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=1;MQRankSum=0.524;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.497;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1366,0,1197 chrXVI 347757 . C G 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;DP=134;Dels=0.00;FS=4.115;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=1;MQRankSum=-0.169;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.803;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1447,0,1429 chrXVI 347759 . C T 1406.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.648;DP=132;Dels=0.00;FS=5.284;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=1;MQRankSum=-0.440;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.328;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1436,0,1342 chrXVI 347790 . A C 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.980;DP=118;Dels=0.00;FS=3.546;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.808;SB=-3.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:995,0,1666 chrXVI 347814 . G A 1300.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.626;DP=125;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.184;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1330,0,1434 chrXVI 347838 . A G 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.241;DP=133;Dels=0.00;FS=4.143;HaplotypeScore=3.7878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.591;SB=-7.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1487,0,1402 chrXVI 347993 . T C 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.557;DP=156;Dels=0.00;FS=2.826;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1651,0,1668 chrXVI 348034 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;DP=137;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.450;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1360,0,1585 chrXVI 348151 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.478;DP=112;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.053;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1305,0,1192 chrXVI 348228 . G A 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.818;DP=128;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.22;MQ0=0;MQRankSum=-3.230;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1294,0,1382 chrXVI 348243 . A C 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.327;DP=124;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.71;MQ0=0;MQRankSum=-5.513;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1168,0,1402 chrXVI 348244 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.267;DP=125;Dels=0.00;FS=2.307;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.78;MQ0=0;MQRankSum=-5.154;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.254;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1167,0,1441 chrXVI 348254 . T G 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.103;DP=118;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.71;MQ0=0;MQRankSum=-6.437;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.294;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1016,0,1427 chrXVI 348268 . T C 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;DP=119;Dels=0.00;FS=7.826;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.38;MQ0=0;MQRankSum=-5.826;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.718;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:868,0,1476 chrXVI 348285 . T C 855.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.681;DP=105;Dels=0.00;FS=12.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.77;MQ0=0;MQRankSum=-5.091;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.651;SB=-1.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:885,0,1297 chrXVI 348351 . A T 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.824;DP=108;Dels=0.00;FS=0.770;HaplotypeScore=3.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.648;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,48:108:99:1049,0,1347 chrXVI 348505 . A T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.221;SB=-2.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:106:99:894,0,1398 chrXVI 348547 . T C 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.355;DP=96;Dels=0.00;FS=6.537;HaplotypeScore=5.8628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:816,0,1190 chrXVI 348646 . A G 2631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.147e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2664,279,0 chrXVI 348690 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.866;DP=110;Dels=0.00;FS=4.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.030;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1271,0,1095 chrXVI 348739 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.363;DP=141;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,65:141:99:1413,0,1658 chrXVI 348815 . T C 2811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.43;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2844,309,0 chrXVI 349012 . T G 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.789;DP=148;Dels=0.00;FS=4.991;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.345;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1525,0,1607 chrXVI 349570 . C T 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3605,343,0 chrXVI 349595 . T C 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.165;DP=119;Dels=0.00;FS=8.662;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.996;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,49:119:99:961,0,1656 chrXVI 349717 . G C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.131;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1302,0,1121 chrXVI 349901 . A T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.999;DP=109;Dels=0.00;FS=1.625;HaplotypeScore=2.9427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.640;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1273,0,1193 chrXVI 350090 . T A 2899 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=28.70;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2932,292,0 chrXVI 350204 . T C 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.800;DP=90;Dels=0.00;FS=7.120;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.462;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:901,0,1130 chrXVI 350221 . G A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.598;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.183;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1108,0,1215 chrXVI 350251 . T A 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;DP=121;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1422,0,1305 chrXVI 350341 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.830;DP=107;Dels=0.00;FS=1.642;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.196;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,67:107:99:1492,0,823 chrXVI 350422 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.375;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.938;QD=9.98;ReadPosRankSum=-3.271;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1277,0,1475 chrXVI 350434 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.586;DP=126;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.306;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.056;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1176,0,1477 chrXVI 350446 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.538;DP=142;Dels=0.00;FS=1.326;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.848;QD=9.70;ReadPosRankSum=3.310;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:1407,0,1556 chrXVI 350455 . C T 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.016;DP=130;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.254;QD=10.14;ReadPosRankSum=3.432;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1348,0,1361 chrXVI 350476 . C T 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.934;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.031;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,81:149:99:1854,0,1349 chrXVI 350533 . C T 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.966;DP=145;Dels=0.00;FS=2.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.836;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1770,0,1377 chrXVI 350638 . C T 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.879;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=10.44;ReadPosRankSum=2.334;SB=-1.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,85:170:99:1804,0,1830 chrXVI 350654 . C G 1782.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;DP=165;Dels=0.00;FS=2.746;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.795;SB=-9.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,88:165:99:1812,0,1644 chrXVI 350773 . A G 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.145;DP=151;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.792;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,74:151:99:1585,0,1803 chrXVI 350968 . C T 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.759;DP=121;Dels=0.00;FS=10.157;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.658;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1118,0,1444 chrXVI 351571 . C T 1893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.498;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.499;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1923,0,1475 chrXVI 352084 . A G 1637.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.393;DP=150;Dels=0.00;FS=2.960;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.241;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:1667,0,1540 chrXVI 352228 . A C 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.33;SB=-1.437e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3361,340,0 chrXVI 352479 . C T 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7957;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=22.16;SB=-1.763e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:2914,277,0 chrXVI 352604 . T G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.762;DP=134;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=2.8846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.403;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.412;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1490,0,1444 chrXVI 352789 . G A 1817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.919;DP=137;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=13.26;ReadPosRankSum=-2.304;SB=-9.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,85:137:99:1847,0,1084 chrXVI 352962 . A G 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.427;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.039;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1605,0,1749 chrXVI 353307 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.306;DP=158;Dels=0.00;FS=1.289;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,66:158:99:1392,0,1889 chrXVI 353312 . A G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.134;DP=165;Dels=0.00;FS=3.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.163;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,71:165:99:1465,0,2125 chrXVI 353360 . A G 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.368;DP=126;Dels=0.00;FS=9.656;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=1.801;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.342;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1463,0,1325 chrXVI 353391 . G C 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.807;DP=138;Dels=0.00;FS=4.142;HaplotypeScore=2.4919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,74:137:99:1529,0,1346 chrXVI 353608 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.832;DP=103;Dels=0.00;FS=1.650;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.575;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1233,0,1045 chrXVI 353638 . C T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.571;DP=114;Dels=0.00;FS=4.644;HaplotypeScore=3.6904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.055;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,64:113:99:1483,0,1076 chrXVI 353909 . T C 867.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.241;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.564;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,45:99:99:897,0,1261 chrXVI 353939 . G A 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.281;DP=107;Dels=0.00;FS=1.724;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.097;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1050,0,1353 chrXVI 354275 . C T 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=120;Dels=0.00;FS=4.926;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.520;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,51:120:99:1076,0,1559 chrXVI 354421 . G T 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.868;DP=151;Dels=0.00;FS=4.896;HaplotypeScore=4.8731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,70:151:99:1404,0,1785 chrXVI 354489 . G T 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.255;DP=123;Dels=0.00;FS=10.118;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.738;SB=-6.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1371,0,1355 chrXVI 354498 . A G 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.856;DP=108;Dels=0.00;FS=10.940;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.808;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:108:99:1329,0,1044 chrXVI 354544 . T A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;DP=118;Dels=0.00;FS=1.633;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.643;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1409,0,1313 chrXVI 354697 . G A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.239;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1342,0,1183 chrXVI 354978 . T C 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.310;DP=155;Dels=0.00;FS=1.256;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.927;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.993;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1597,0,1660 chrXVI 355413 . C T 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.030;DP=132;Dels=0.00;FS=5.478;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=11.82;ReadPosRankSum=-2.252;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1590,0,1329 chrXVI 355469 . C T 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.506;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:114:99:1111,0,1356 chrXVI 355544 . C A 984.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.133;DP=104;Dels=0.00;FS=11.361;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:1014,0,1285 chrXVI 355697 . A G 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.219;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.046;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1493,0,1765 chrXVI 355834 . T C 1236.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.070;DP=149;Dels=0.00;FS=13.050;HaplotypeScore=2.5619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,65:149:99:1266,0,1970 chrXVI 356245 . T G 989.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.123;DP=108;Dels=0.00;FS=11.952;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.188;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1019,0,1323 chrXVI 356341 . T C 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;DP=131;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=4.8183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.193;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:1252,0,1661 chrXVI 356407 . T C 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.879;DP=152;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=2.6500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.522;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,66:152:99:1270,0,1930 chrXVI 356553 . G A 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.252;DP=170;Dels=0.00;FS=1.239;HaplotypeScore=2.5015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.990;SB=-7.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,79:170:99:1626,0,1948 chrXVI 356572 . C T 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.884;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.079;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1746,0,1792 chrXVI 356680 . C T 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.866;DP=150;Dels=0.00;FS=8.293;HaplotypeScore=8.9503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=9.67;ReadPosRankSum=2.341;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1480,0,1507 chrXVI 356776 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;DP=113;Dels=0.00;FS=3.431;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.043;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1096,0,1386 chrXVI 356805 . G A 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.752;DP=110;Dels=0.00;FS=4.939;HaplotypeScore=1.9048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.653;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1236,0,1180 chrXVI 356893 . A T 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.761;DP=110;Dels=0.00;FS=8.857;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.795;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,38:110:99:804,0,1717 chrXVI 356972 . C T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.518;DP=116;Dels=0.00;FS=13.098;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.982;SB=-2.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1119,0,1445 chrXVI 356993 . C T 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.829;DP=96;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.861;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:1140,0,1039 chrXVI 357136 . T C 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.261;DP=103;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=1;MQRankSum=0.176;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.834;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,43:103:99:872,0,1364 chrXVI 357242 . C T 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.214;DP=109;Dels=0.00;FS=1.723;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:109:99:1004,0,1336 chrXVI 357296 . T C 695.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.311;DP=92;Dels=0.00;FS=2.790;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.119;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:725,0,1313 chrXVI 357327 . G A 677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.641;DP=89;Dels=0.00;FS=7.215;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=7.61;ReadPosRankSum=-1.068;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,34:89:99:707,0,1219 chrXVI 357802 . T C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.419;DP=103;Dels=0.00;FS=4.114;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.822;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1129,0,1135 chrXVI 358537 . A G 953.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.826;DP=87;Dels=0.00;FS=5.427;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.960;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.965;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:983,0,895 chrXVI 358804 . T C 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.504;DP=133;Dels=0.00;FS=17.042;HaplotypeScore=2.4011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.158;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1538,0,1370 chrXVI 358908 . G A 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.774;DP=119;Dels=0.00;FS=7.013;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.694;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1404,0,1198 chrXVI 358961 . C G 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.681;DP=133;Dels=0.00;FS=4.587;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.582;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1428,0,1387 chrXVI 359182 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.447;DP=144;Dels=0.00;FS=5.205;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.066;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1466,0,1636 chrXVI 359224 . A T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=11.58;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1223,0,1066 chrXVI 359258 . C G 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.503;DP=127;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.118;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1465,0,1283 chrXVI 359449 . C G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;DP=121;Dels=0.00;FS=8.379;HaplotypeScore=47.6771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.30;MQ0=0;MQRankSum=7.123;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.570;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:1279,0,958 chrXVI 359468 . C A 423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;DP=96;Dels=0.00;FS=14.843;HaplotypeScore=6.1173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.79;MQ0=1;MQRankSum=-5.540;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.264;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:453,0,1204 chrXVI 359487 . G T 148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.067;DP=94;Dels=0.00;FS=32.069;HaplotypeScore=28.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=1;MQRankSum=-5.355;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:94:99:178,0,1095 chrXVI 359501 . G T 555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;DP=88;Dels=0.01;FS=208.955;HaplotypeScore=2.9545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.54;MQ0=1;MQRankSum=0.996;QD=6.31;ReadPosRankSum=-6.586;SB=-3.017e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:585,0,455 chrXVI 359574 . T A 2533 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2566,244,0 chrXVI 359596 . G A 2894 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7560;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.54;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.623e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2927,277,0 chrXVI 359608 . A C 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.614;DP=116;Dels=0.00;FS=3.389;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=1;MQRankSum=-0.856;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.328;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:968,0,1256 chrXVI 359680 . G T 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.791;DP=119;Dels=0.00;FS=2.400;HaplotypeScore=3.4571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQ0=1;MQRankSum=-2.099;QD=11.13;ReadPosRankSum=2.806;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1354,0,1018 chrXVI 359694 . C T 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.923;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=10.53;ReadPosRankSum=3.349;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,67:127:99:1367,0,1257 chrXVI 359890 . T A 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.966;DP=163;Dels=0.01;FS=5.735;HaplotypeScore=82.5627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.571;SB=-9.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,82:161:99:1767,0,1858 chrXVI 359938 . T C 1542.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.566;DP=176;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=2.194;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.243;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,81:176:99:1572,0,2217 chrXVI 359939 . T C 1534.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.733;DP=174;Dels=0.00;FS=1.186;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.617;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,79:174:99:1564,0,2256 chrXVI 359989 . T C 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.849;DP=150;Dels=0.00;FS=2.879;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.008;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1645,0,1571 chrXVI 360040 . T C 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.552;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.126;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1683,0,1510 chrXVI 360114 . A G 1234.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.106;DP=141;Dels=0.00;FS=8.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.43;MQ0=0;MQRankSum=-5.940;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.068;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,64:141:99:1264,0,1736 chrXVI 360123 . G A 1176.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;DP=136;Dels=0.00;FS=9.270;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.90;MQ0=0;MQRankSum=-5.502;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.337;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,58:136:99:1206,0,1722 chrXVI 360124 . A C 1119.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.176;DP=135;Dels=0.00;FS=10.799;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQ0=0;MQRankSum=-4.941;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.287;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1149,0,1787 chrXVI 360138 . G A 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.051;DP=120;Dels=0.00;FS=7.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=-5.652;QD=8.70;ReadPosRankSum=-1.344;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1074,0,1438 chrXVI 360139 . G A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.857;DP=120;Dels=0.00;FS=7.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=-5.252;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.302;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1093,0,1474 chrXVI 360170 . A G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.719;DP=142;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQ0=0;MQRankSum=-3.007;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.322;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1202,0,1752 chrXVI 360191 . C T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.624;DP=144;Dels=0.00;FS=8.977;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.434;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1528,0,1458 chrXVI 360192 . C T 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.793;DP=144;Dels=0.00;FS=8.977;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.322;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1514,0,1484 chrXVI 360315 . G C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;DP=129;Dels=0.00;FS=4.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.142;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1413,0,1277 chrXVI 360607 . T C 763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.866;DP=87;Dels=0.00;FS=8.042;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=2.289;QD=8.77;ReadPosRankSum=-2.084;SB=-1.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:793,0,1146 chrXVI 360643 . A G 1053.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.640;DP=106;Dels=0.00;FS=13.674;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.679;SB=-2.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1083,0,1228 chrXVI 360727 . A G 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.190;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.063;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1218,0,1411 chrXVI 360769 . T G 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.716;DP=110;Dels=0.00;FS=3.747;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.450;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1331,0,1132 chrXVI 360991 . A T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.351;DP=126;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=3.7567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.372;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1481,0,1338 chrXVI 361001 . G A 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.550;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.060;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1491,0,1226 chrXVI 361070 . A G 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.880;DP=142;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.029;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1687,0,1431 chrXVI 361102 . G A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.648;DP=148;Dels=0.00;FS=2.105;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.396;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:148:99:1717,0,1430 chrXVI 361351 . C T 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.884;DP=120;Dels=0.00;FS=4.560;HaplotypeScore=6.7197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.641;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1197,0,1431 chrXVI 361590 . C T 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.586;DP=157;Dels=0.00;FS=1.991;HaplotypeScore=10.6397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.044;SB=-8.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1785,0,1607 chrXVI 361836 . C G 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;DP=101;Dels=0.00;FS=0.810;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=14.22;ReadPosRankSum=-2.139;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,64:101:99:1466,0,660 chrXVI 361856 . A G 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.107;DP=98;Dels=0.00;FS=1.741;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.661;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,58:98:99:1361,0,801 chrXVI 362022 . T A 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.536;DP=125;Dels=0.00;FS=1.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=1;MQRankSum=0.048;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.158;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1573,0,1183 chrXVI 362249 . T A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.575;DP=105;Dels=0.00;FS=0.786;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.851;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,45:105:99:969,0,1439 chrXVI 362269 . G C 3284.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=27.83;SB=-1.359e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3284,322,0 chrXVI 362462 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.906;DP=125;Dels=0.00;FS=5.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.018;SB=-8.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,77:125:99:1616,0,1069 chrXVI 362469 . A C 1577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;DP=127;Dels=0.00;FS=5.717;HaplotypeScore=3.9746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=1;MQRankSum=1.842;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.766;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,77:127:99:1607,0,1088 chrXVI 362546 . T C 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.129;DP=101;Dels=0.00;FS=5.104;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=1;MQRankSum=0.566;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1091,0,1047 chrXVI 363066 . T G 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3214,325,0 chrXVI 363218 . T C 4265.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.09;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4265,438,0 chrXVI 363237 . T C 1828.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.346;DP=169;Dels=0.00;FS=6.522;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,87:169:99:1858,0,1797 chrXVI 363411 . G T 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.877;DP=106;Dels=0.00;FS=4.773;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=11.67;ReadPosRankSum=2.154;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1267,0,1030 chrXVI 363484 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.877;DP=130;Dels=0.00;FS=3.161;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.059;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1384,0,1502 chrXVI 363609 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.888;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.078;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:135:99:1577,0,1340 chrXVI 363652 . C T 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.893;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=2.438;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.232;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,46:100:99:966,0,1236 chrXVI 363799 . C G 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.149;DP=101;Dels=0.00;FS=3.736;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=2.295;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.360;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:937,0,1187 chrXVI 363893 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.150;DP=100;Dels=0.00;FS=5.187;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.400;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:993,0,1183 chrXVI 363977 . A G 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.571;DP=96;Dels=0.00;FS=2.651;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=3.194;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1021,0,989 chrXVI 364060 . T G 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.137;DP=113;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=10.08;ReadPosRankSum=-2.148;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1169,0,1257 chrXVI 364156 . T G 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.359;DP=104;Dels=0.00;FS=9.358;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1085,0,1220 chrXVI 364396 . C T 4025.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.982e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:4025,394,0 chrXVI 364453 . T C 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.047;DP=144;Dels=0.00;FS=10.036;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.736;SB=-7.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,75:144:99:1626,0,1500 chrXVI 364525 . C G 1769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.705;DP=155;Dels=0.00;FS=4.795;HaplotypeScore=2.5608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.450;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,88:155:99:1799,0,1367 chrXVI 364574 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.971;DP=148;Dels=0.00;FS=2.076;HaplotypeScore=5.8369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=-0.834;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.029;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,67:148:99:1465,0,1706 chrXVI 364729 . A G 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.852;DP=156;Dels=0.00;FS=4.829;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.691;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,77:156:99:1588,0,1735 chrXVI 365764 . C G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;DP=121;Dels=0.00;FS=0.674;HaplotypeScore=2.1445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=2.763;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.689;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1313,0,1100 chrXVI 365920 . T C 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.704;DP=104;Dels=0.00;FS=2.622;HaplotypeScore=3.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.142;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1036,0,1156 chrXVI 365980 . T A 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.131;DP=145;Dels=0.00;FS=2.946;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.374;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1501,0,1737 chrXVI 366437 . G T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.522;DP=138;Dels=0.00;FS=3.334;HaplotypeScore=9.2990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.036;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.769;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:138:99:1285,0,1697 chrXVI 366522 . T C 2190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.776;DP=191;Dels=0.00;FS=1.767;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.032;SB=-1.043e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,102:191:99:2220,0,1945 chrXVI 366649 . G A 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.886;DP=164;Dels=0.00;FS=7.915;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1765,0,1920 chrXVI 366773 . C T 1909.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.611;DP=146;Dels=0.00;FS=2.987;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.127;SB=-9.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,85:146:99:1939,0,1273 chrXVI 367091 . C T 1490.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.713;DP=162;Dels=0.00;FS=4.862;HaplotypeScore=3.9517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=2.445;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.231;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,72:162:99:1520,0,2046 chrXVI 367127 . C A 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.526;DP=145;Dels=0.00;FS=4.229;HaplotypeScore=3.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=7.10;ReadPosRankSum=3.464;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,51:145:99:1060,0,2223 chrXVI 367562 . C T 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.672;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.488;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:117:99:949,0,1629 chrXVI 368066 . C A 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.742;DP=127;Dels=0.00;FS=13.628;HaplotypeScore=2.8547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.798;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:127:99:1300,0,1523 chrXVI 368095 . G A 3760.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3760,373,0 chrXVI 368135 . C T 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9570;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.651;SB=-1.662e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3522,340,0 chrXVI 368308 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.487;DP=113;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=12.05;ReadPosRankSum=-2.170;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1392,0,1096 chrXVI 368611 . T G 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.472;DP=129;Dels=0.00;FS=11.227;HaplotypeScore=7.6727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.968;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:129:99:1224,0,1447 chrXVI 368905 . T C 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.649;DP=131;Dels=0.00;FS=7.088;HaplotypeScore=3.1869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,49:131:99:811,0,1806 chrXVI 368962 . A G 1163.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.504;DP=126;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.962;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1193,0,1576 chrXVI 368980 . A G 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.317;DP=126;Dels=0.00;FS=3.284;HaplotypeScore=2.7156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.370;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1102,0,1556 chrXVI 369001 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.36;SB=-1.216e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3265,316,0 chrXVI 369255 . A G 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.736;DP=122;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=2.9054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.652;SB=-7.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1474,0,1234 chrXVI 369350 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.664;DP=143;Dels=0.00;FS=3.100;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1287,0,1811 chrXVI 369456 . T C 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.901;DP=154;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=3.8790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.504;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1549,0,1786 chrXVI 369476 . A G 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.976;DP=152;Dels=0.00;FS=2.037;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.346;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1578,0,1765 chrXVI 369483 . T C 1417.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.696;DP=147;Dels=0.00;FS=2.114;HaplotypeScore=2.9813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.149;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1447,0,1737 chrXVI 369585 . T G 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;DP=135;Dels=0.00;FS=9.460;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.220;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.177;SB=-4.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,55:135:99:938,0,1969 chrXVI 369665 . C T 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.913;DP=138;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.488;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:1198,0,1845 chrXVI 369748 . G A 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.873;DP=133;Dels=0.00;FS=3.961;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.654;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.308;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1417,0,1449 chrXVI 370190 . G A 1251.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.611;DP=133;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=9.41;ReadPosRankSum=0.074;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1281,0,1492 chrXVI 370280 . A G 3811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3811,376,0 chrXVI 370484 . C G 1810.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.822;DP=179;Dels=0.00;FS=1.169;HaplotypeScore=5.5956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,88:179:99:1840,0,1942 chrXVI 370692 . C G 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;DP=148;Dels=0.00;FS=2.070;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.824;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,78:148:99:1533,0,1464 chrXVI 370772 . T A 1671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.746;DP=158;Dels=0.00;FS=14.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=10.58;ReadPosRankSum=-3.414;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:1701,0,1749 chrXVI 370936 . T C 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.283;DP=150;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.652;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1588,0,1633 chrXVI 371029 . C T 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.633;DP=133;Dels=0.00;FS=4.236;HaplotypeScore=3.9762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.056;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,72:133:99:1639,0,1217 chrXVI 371082 . T C 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.295;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.092;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1412,0,1525 chrXVI 371406 . G A 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.803;DP=120;Dels=0.00;FS=5.965;HaplotypeScore=2.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.391;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1363,0,1321 chrXVI 371445 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.099;DP=122;Dels=0.00;FS=5.517;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.940;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1263,0,1490 chrXVI 371571 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.249;DP=147;Dels=0.00;FS=1.328;HaplotypeScore=1.9638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.604;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:1378,0,1848 chrXVI 371706 . T C 1772.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.549;DP=136;Dels=0.00;FS=10.975;HaplotypeScore=3.3923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=13.03;ReadPosRankSum=2.927;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,81:136:99:1802,0,1185 chrXVI 372243 . A G 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.784;DP=132;Dels=0.00;FS=7.897;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.337;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1237,0,1618 chrXVI 372267 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.906;DP=119;Dels=0.00;FS=5.613;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.472;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1170,0,1460 chrXVI 372742 . C T 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.054;DP=116;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.042;SB=-3.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,46:116:99:824,0,1552 chrXVI 373029 . C T 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.317;DP=75;Dels=0.00;FS=7.837;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.560;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:75:99:990,0,697 chrXVI 373168 . A G 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.573;DP=106;Dels=0.00;FS=9.960;HaplotypeScore=2.6912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.566;SB=-2.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1051,0,1198 chrXVI 373351 . T C 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.414e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2890,312,0 chrXVI 373399 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;DP=101;Dels=0.00;FS=2.862;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,61:101:99:1365,0,785 chrXVI 373419 . T A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.015;DP=110;Dels=0.00;FS=0.731;HaplotypeScore=4.9162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=1.704;QD=11.87;ReadPosRankSum=2.067;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,63:110:99:1336,0,826 chrXVI 373422 . T A 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.161;DP=109;Dels=0.00;FS=0.743;HaplotypeScore=2.9288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=11.74;ReadPosRankSum=2.181;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,62:109:99:1310,0,828 chrXVI 373452 . C G 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;DP=113;Dels=0.00;FS=8.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.857;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:872,0,1337 chrXVI 373522 . T C 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.861;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.116;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1046,0,1349 chrXVI 373560 . A T 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.075;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=9.55;ReadPosRankSum=2.111;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:966,0,1264 chrXVI 373641 . T G 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.541;DP=119;Dels=0.00;FS=3.448;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.721;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,47:119:99:981,0,1634 chrXVI 373674 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.550;DP=130;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=10.48;ReadPosRankSum=-2.394;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1392,0,1382 chrXVI 373946 . G A 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.103;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.749;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1521,0,1253 chrXVI 374061 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.123;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.779;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:1145,0,1391 chrXVI 374156 . G T 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.123;DP=129;Dels=0.00;FS=4.201;HaplotypeScore=2.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.800;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1314,0,1490 chrXVI 374261 . C T 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.112;DP=138;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=3.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=2.530;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.750;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1382,0,1428 chrXVI 374282 . T C 1558.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.224;DP=136;Dels=0.00;FS=3.240;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.924;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:1588,0,1376 chrXVI 374399 . T A 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;DP=143;Dels=0.00;FS=0.622;HaplotypeScore=5.8380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1498,0,1700 chrXVI 374422 . C T 1740.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.291;DP=162;Dels=0.00;FS=1.234;HaplotypeScore=4.8861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.414;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,79:162:99:1770,0,1777 chrXVI 375193 . A T 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;DP=154;Dels=0.00;FS=1.250;HaplotypeScore=1.8288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.172;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,76:154:99:1705,0,1792 chrXVI 375203 . C T 1818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.664;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.044;SB=-9.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1848,0,1710 chrXVI 375375 . T A 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=1;MQRankSum=-0.586;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.307;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1411,0,1361 chrXVI 375533 . G A 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.631;DP=147;Dels=0.00;FS=0.618;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.037;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1635,0,1563 chrXVI 375534 . T A 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-8.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1600,0,1527 chrXVI 375693 . G A 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.714;DP=109;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,68:109:99:1553,0,760 chrXVI 376113 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.658;DP=104;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=12.54;ReadPosRankSum=-1.105;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1334,0,932 chrXVI 376180 . A G 1799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.081;DP=151;Dels=0.00;FS=2.875;HaplotypeScore=2.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.002;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,84:151:99:1829,0,1469 chrXVI 376312 . G A 1315.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.684;DP=139;Dels=0.00;FS=0.668;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.386;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,61:139:99:1345,0,1794 chrXVI 376755 . G A 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.593;DP=122;Dels=0.00;FS=2.597;HaplotypeScore=3.2847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.008;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1506,0,1280 chrXVI 376862 . T C 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.016;DP=103;Dels=0.00;FS=2.611;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.548;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.842;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,60:103:99:1299,0,964 chrXVI 377062 . T A 3891.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.33;MQ0=0;QD=25.60;SB=-2.016e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3891,382,0 chrXVI 377179 . G C 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.292;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.300;SB=-3.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:1095,0,1171 chrXVI 377330 . A G 730.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.697;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.76;MQ0=3;MQRankSum=0.497;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.076;SB=-3.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,42:74:99:760,0,636 chrXVI 377336 . C T 1811 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.52;MQ0=3;QD=22.92;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:1844,177,0 chrXVI 377648 . C T 1664 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.29;MQ0=3;QD=26.84;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:1697,174,0 chrXVI 378085 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.328;DP=124;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQ0=0;MQRankSum=2.343;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.273;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1255,0,1401 chrXVI 378124 . T C 3954.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2635;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=27.85;ReadPosRankSum=1.073;SB=-1.356e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,141:142:99:3954,391,0 chrXVI 378130 . C A 4036.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.52;MQ0=0;QD=28.22;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:4036,394,0 chrXVI 378167 . T C 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.645;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQ0=0;MQRankSum=2.450;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.260;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1513,0,1449 chrXVI 378223 . C T 1707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.198;DP=146;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=2.372;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.061;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,78:146:99:1737,0,1408 chrXVI 378249 . C T 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.312;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.262;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1562,0,1618 chrXVI 378260 . C A,G 3756.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.53;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.023e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,74,77:153:99:3756,1887,1689,1869,0,1670 chrXVI 378492 . T C 1191.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.982;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.438;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,62:145:99:1221,0,1939 chrXVI 378635 . G C 1387.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.821;DP=140;Dels=0.00;FS=8.963;HaplotypeScore=3.8779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=2.093;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.086;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:140:99:1417,0,1497 chrXVI 378640 . G T 1447.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.987;DP=137;Dels=0.00;FS=6.345;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=1.995;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.665;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,69:137:99:1477,0,1456 chrXVI 378721 . G A 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.14;MQ0=0;QD=27.81;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3037,304,0 chrXVI 378794 . G A 1293.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.773;DP=132;Dels=0.00;FS=7.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1323,0,1421 chrXVI 378809 . A T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;DP=124;Dels=0.00;FS=9.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.815;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1429,0,1318 chrXVI 378865 . A G 1019.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.866;DP=107;Dels=0.00;FS=2.506;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.732;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,54:107:99:1049,0,1166 chrXVI 378927 . T C 374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.157;DP=111;Dels=0.00;FS=4.611;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.855;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.784;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:404,0,784 chrXVI 378939 . C T 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.510;DP=133;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=6.15;ReadPosRankSum=-2.478;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:133:99:848,0,1064 chrXVI 378951 . C T 1357.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.847;DP=151;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=4.6605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.773;SB=-8.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1387,0,1242 chrXVI 379018 . C T 3888.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.55;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3888,379,0 chrXVI 379192 . T C 1617.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.281;DP=132;Dels=0.00;FS=3.564;HaplotypeScore=8.6434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=12.25;ReadPosRankSum=-2.045;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,74:132:99:1647,0,1154 chrXVI 379218 . G A 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.482;DP=118;Dels=0.00;FS=4.453;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=11.04;ReadPosRankSum=2.067;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1333,0,1297 chrXVI 379335 . C G 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=133;Dels=0.00;FS=4.213;HaplotypeScore=2.6992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.092;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1456,0,1444 chrXVI 379460 . C T 608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.995;DP=126;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=-3.527;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.510;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:638,0,1525 chrXVI 379477 . G T 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.031;DP=135;Dels=0.00;FS=2.225;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.695;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.342;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:936,0,1576 chrXVI 379573 . C T 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.078;DP=133;Dels=0.00;FS=4.282;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.281;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1416,0,1365 chrXVI 379971 . T C 3914.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.811e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3914,394,0 chrXVI 380250 . A G 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=25.75;SB=-1.559e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3425,345,0 chrXVI 380502 . G A 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.354;DP=154;Dels=0.00;FS=1.323;HaplotypeScore=3.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.320;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:1459,0,1916 chrXVI 380513 . T C 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.257;DP=152;Dels=0.00;FS=2.171;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=2.677;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.591;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,71:152:99:1253,0,1899 chrXVI 380527 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.127;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1318,0,1825 chrXVI 380674 . G C 3579.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.72;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.846e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3579,358,0 chrXVI 380801 . A G 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.482;DP=115;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.576;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,48:115:99:868,0,1552 chrXVI 380806 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.023;DP=114;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=9.35;ReadPosRankSum=-2.613;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1096,0,1363 chrXVI 381121 . T C 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.746;DP=133;Dels=0.00;FS=4.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.850;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,54:133:99:1029,0,1822 chrXVI 381495 . G C 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;DP=107;Dels=0.00;FS=9.438;HaplotypeScore=6.3157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.145;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,55:107:99:1112,0,1077 chrXVI 381557 . T C 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;DP=103;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=4.8647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=8.71;ReadPosRankSum=1.818;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:927,0,1320 chrXVI 381682 . C T 925.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;DP=88;Dels=0.00;FS=5.461;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.481;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:88:99:955,0,887 chrXVI 381702 . C T 968.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.836;DP=88;Dels=0.00;FS=5.500;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.204;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:998,0,904 chrXVI 381741 . G A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.253;DP=103;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=2.274;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.974;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:103:99:1465,0,826 chrXVI 381922 . A C 3123 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8586;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.081e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3156,298,0 chrXVI 382024 . G A 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.398;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1583,0,1366 chrXVI 382120 . A C 1793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.745;DP=160;Dels=0.00;FS=7.587;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.067;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,85:160:99:1823,0,1630 chrXVI 382203 . G A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.400;DP=135;Dels=0.00;FS=4.261;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.962;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1538,0,1520 chrXVI 382213 . A G 3163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=28.24;SB=-8.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3196,328,0 chrXVI 382287 . T C 4020.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.35;SB=-2.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4020,397,0 chrXVI 382450 . A G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.082;DP=168;Dels=0.00;FS=1.950;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.032;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,69:168:99:1344,0,2270 chrXVI 382708 . G A 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.628;DP=135;Dels=0.00;FS=1.365;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.861;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1254,0,1630 chrXVI 382832 . C A 3739.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.90;SB=-1.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3739,364,0 chrXVI 382997 . A G 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.467;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.934;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,87:157:99:1872,0,1498 chrXVI 383245 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.141;DP=122;Dels=0.00;FS=3.442;HaplotypeScore=8.4371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.981;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1189,0,1411 chrXVI 383361 . T C 2360 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=19.83;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2393,246,0 chrXVI 383778 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.522;DP=131;Dels=0.00;FS=1.540;HaplotypeScore=3.4743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.048;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,53:131:99:1036,0,1745 chrXVI 383928 . G A 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.204;DP=114;Dels=0.00;FS=3.400;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.648;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1116,0,1386 chrXVI 384709 . A G 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.854;DP=115;Dels=0.00;FS=1.501;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.344;SB=-7.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1370,0,1222 chrXVI 385232 . T C 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.880;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1357,0,1457 chrXVI 385271 . C T 1815.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.218;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.970;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,80:135:99:1845,0,1216 chrXVI 385391 . G A 2147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.344;DP=158;Dels=0.00;FS=2.035;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-1.142e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,95:158:99:2177,0,1258 chrXVI 385957 . A G 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.033;DP=174;Dels=0.00;FS=4.255;HaplotypeScore=5.1704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.871;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,83:174:99:1750,0,2041 chrXVI 386168 . T C 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.117e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3578,369,0 chrXVI 386225 . T G 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.300;DP=143;Dels=0.00;FS=6.364;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.140;SB=-8.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:1580,0,1275 chrXVI 386264 . C T 1911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.839;DP=155;Dels=0.00;FS=8.421;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.237;SB=-9.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,88:155:99:1941,0,1424 chrXVI 386485 . T C 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.007;DP=112;Dels=0.00;FS=6.374;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.438;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1160,0,1458 chrXVI 386639 . A G 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.141;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=2.548;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1013,0,1338 chrXVI 386960 . C T 4278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4278,418,0 chrXVI 386966 . T G 3974.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.03;SB=-1.754e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3974,403,0 chrXVI 387009 . C T 3663.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.960e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3663,364,0 chrXVI 387248 . C T 1290.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.030;DP=148;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=6.9379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,62:148:99:1320,0,1990 chrXVI 387471 . C T 1650.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.874;DP=135;Dels=0.00;FS=6.465;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.558;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,77:135:99:1680,0,1096 chrXVI 387550 . A G 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.214;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,66:147:99:1372,0,1824 chrXVI 387747 . C A 1222.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.251;DP=122;Dels=0.00;FS=3.279;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.124;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1252,0,1473 chrXVI 387762 . C T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.942;DP=117;Dels=0.00;FS=3.391;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=9.89;ReadPosRankSum=-2.116;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1187,0,1284 chrXVI 387786 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.402;DP=135;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=10.03;ReadPosRankSum=-3.220;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1384,0,1636 chrXVI 388066 . A G 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.232;DP=135;Dels=0.00;FS=2.166;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.597;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1535,0,1523 chrXVI 388241 . T A 3830.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.933e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3830,379,0 chrXVI 388417 . A G 1738.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.200;DP=153;Dels=0.00;FS=4.381;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,80:153:99:1768,0,1634 chrXVI 388527 . A C 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;DP=124;Dels=0.00;FS=2.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.142;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1261,0,1384 chrXVI 388558 . A G 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.599;DP=138;Dels=0.00;FS=12.191;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.590;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1547,0,1499 chrXVI 388560 . T C 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.017;DP=140;Dels=0.00;FS=12.087;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.580;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1545,0,1527 chrXVI 388922 . A T 4676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4676,454,0 chrXVI 389144 . A G,T 3638.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.60;MQ0=0;QD=24.09;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,81,70:151:99:3638,1699,1483,1940,0,1753 chrXVI 389191 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.234;DP=145;Dels=0.00;FS=6.076;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.122;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1529,0,1636 chrXVI 389519 . T C 3761.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3761,387,0 chrXVI 389620 . C T 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.580;DP=144;Dels=0.00;FS=1.320;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1465,0,1578 chrXVI 389644 . T A 4117.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=28.20;SB=-1.779e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4117,394,0 chrXVI 389702 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.004;DP=142;Dels=0.00;FS=10.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=2.710;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.547;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1511,0,1636 chrXVI 389708 . G A 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.521;DP=138;Dels=0.00;FS=9.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:1517,0,1517 chrXVI 389788 . G A 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.278;DP=130;Dels=0.00;FS=17.167;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,51:130:99:1027,0,1677 chrXVI 389817 . A G 1628.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;DP=137;Dels=0.00;FS=2.251;HaplotypeScore=5.4608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.872;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,78:137:99:1658,0,1024 chrXVI 389821 . T C 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.668;DP=142;Dels=0.00;FS=4.041;HaplotypeScore=5.9918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,60:142:99:1108,0,1785 chrXVI 389858 . C T 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.874;DP=119;Dels=0.00;FS=2.403;HaplotypeScore=6.9156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.841;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,65:119:99:1139,0,883 chrXVI 389951 . T C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.468;DP=145;Dels=0.00;FS=1.322;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.002;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1465,0,1520 chrXVI 390062 . G A 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.474;DP=146;Dels=0.00;FS=4.128;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,75:146:99:1635,0,1546 chrXVI 390074 . A G 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.436;DP=136;Dels=0.00;FS=8.510;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.057;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1469,0,1437 chrXVI 390234 . A G 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.006;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=1;MQRankSum=-0.688;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.716;SB=-8.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1470,0,1595 chrXVI 390500 . A G 1610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.227;DP=184;Dels=0.00;FS=1.174;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.301;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,81:184:99:1640,0,2331 chrXVI 390526 . A T 2390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;DP=197;Dels=0.00;FS=3.325;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.337;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,112:197:99:2420,0,1875 chrXVI 390621 . T A 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;DP=161;Dels=0.00;FS=8.319;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.065;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,76:161:99:1699,0,1998 chrXVI 390636 . C T 4619.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=27.99;SB=-2.171e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4619,448,0 chrXVI 390896 . G A 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.844;DP=138;Dels=0.00;FS=5.154;HaplotypeScore=1.8910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1614,0,1426 chrXVI 391587 . G A 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.58;MQ0=0;QD=26.27;SB=-2.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4150,388,0 chrXVI 391605 . G A 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.102;DP=139;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.323;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1348,0,1639 chrXVI 392013 . C T 1762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.892;DP=148;Dels=0.00;FS=11.902;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.787;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,80:148:99:1792,0,1482 chrXVI 392071 . T C 2057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.924;DP=189;Dels=0.00;FS=4.175;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,95:189:99:2087,0,1960 chrXVI 392179 . A G 1803.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.822;DP=168;Dels=0.00;FS=6.695;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,87:168:99:1833,0,1831 chrXVI 392213 . T C 3853.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.829e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3853,391,0 chrXVI 392272 . A G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;DP=139;Dels=0.00;FS=3.134;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.647;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1510,0,1518 chrXVI 392447 . T C 1043.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.311;DP=132;Dels=0.00;FS=6.790;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.609;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,56:132:99:1073,0,1761 chrXVI 392460 . G A 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.631;DP=122;Dels=0.00;FS=3.399;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:122:99:1198,0,1379 chrXVI 392538 . T C 1397.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.305;DP=126;Dels=0.00;FS=8.158;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.049;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1427,0,1298 chrXVI 392874 . A G 3969.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.985e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:3969,391,0 chrXVI 393134 . C T 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.986;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.927;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,77:133:99:1765,0,1213 chrXVI 393285 . T C 3593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.735e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3593,351,0 chrXVI 393808 . T A 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.656;DP=91;Dels=0.00;FS=3.793;HaplotypeScore=4.9724;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=26.77;ReadPosRankSum=1.123;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2469,234,0 chrXVI 393858 . A G 915.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.779;DP=82;Dels=0.00;FS=2.878;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:945,0,807 chrXVI 393869 . T A 955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.877;DP=85;Dels=0.00;FS=0.818;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,44:85:99:985,0,915 chrXVI 394442 . T A 4311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.370e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4311,415,0 chrXVI 394592 . T C 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.271;DP=145;Dels=0.00;FS=4.283;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.881;QD=10.62;ReadPosRankSum=-2.775;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1570,0,1644 chrXVI 394937 . G A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.293;DP=112;Dels=0.00;FS=7.364;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.525;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1360,0,1056 chrXVI 395630 . T C 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.449;DP=128;Dels=0.00;FS=2.415;HaplotypeScore=2.6102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=-0.592;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.020;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1434,0,1278 chrXVI 395723 . C T 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.143;DP=138;Dels=0.00;FS=4.510;HaplotypeScore=3.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,65:138:99:1495,0,1550 chrXVI 395775 . G A 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.191;DP=108;Dels=0.00;FS=2.529;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:1321,0,951 chrXVI 395998 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.436;DP=94;Dels=0.00;FS=3.910;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=12.00;ReadPosRankSum=2.421;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1158,0,949 chrXVI 396203 . A G 3357.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.90;MQ0=0;QD=25.63;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3357,333,0 chrXVI 396917 . C T 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.184;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.230;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1501,0,1789 chrXVI 396929 . G T 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.337;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.295;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,78:149:99:1681,0,1537 chrXVI 397584 . T C 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.590;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.112;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1369,0,1408 chrXVI 397587 . C T 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=27.95;SB=-1.274e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3298,325,0 chrXVI 397779 . G A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;DP=140;Dels=0.00;FS=3.014;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.485;SB=-8.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1555,0,1434 chrXVI 398119 . A G 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.859;DP=129;Dels=0.00;FS=4.249;HaplotypeScore=5.6112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.632;SB=-6.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1424,0,1284 chrXVI 398362 . G A 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.684e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3630,358,0 chrXVI 398561 . G A 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3229,313,0 chrXVI 398626 . C T 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.884;DP=137;Dels=0.00;FS=2.158;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.611;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,59:137:99:1257,0,1691 chrXVI 398858 . T C 796.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.869;DP=115;Dels=0.00;FS=0.725;HaplotypeScore=6.6285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=1;MQRankSum=-0.750;QD=6.92;ReadPosRankSum=-0.687;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,49:115:99:826,0,1523 chrXVI 399602 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.807;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.136;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1324,0,1325 chrXVI 400049 . G A 2949 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.550e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2982,292,0 chrXVI 400178 . A G 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;DP=124;Dels=0.00;FS=8.226;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:124:99:1426,0,1301 chrXVI 400646 . C T 2977 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.82;SB=-9.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3010,295,0 chrXVI 400751 . A G 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=1;QD=26.38;SB=-1.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3120,301,0 chrXVI 400919 . C T 2161 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:2194,216,0 chrXVI 401426 . C T 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.643e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2998,286,0 chrXVI 401993 . A G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.134;DP=141;Dels=0.00;FS=5.261;HaplotypeScore=4.9754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.032;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,52:141:99:1023,0,2061 chrXVI 402020 . T C 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=1;QD=26.21;SB=-1.596e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3460,348,0 chrXVI 402026 . G A 1787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.567;DP=130;Dels=0.00;FS=2.302;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=1;MQRankSum=0.297;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.143;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,79:130:99:1817,0,1031 chrXVI 402100 . G A 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=28.96;SB=-1.634e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3302,319,0 chrXVI 402323 . C T 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3059,298,0 chrXVI 402331 . T C 1170.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.046;DP=98;Dels=0.00;FS=24.251;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.996;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1200,0,1005 chrXVI 402496 . A G 1946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.95;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:1979,198,0 chrXVI 402848 . T C 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.246e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2892,291,0 chrXVI 403026 . C T 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.125;DP=138;Dels=0.00;FS=6.619;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.628;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,56:138:99:1187,0,1758 chrXVI 403028 . G A 3673.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21;SB=-1.511e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3673,349,0 chrXVI 403061 . C T 4059.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=1;QD=27.61;SB=-2.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4059,385,0 chrXVI 403097 . G A 1474.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.214;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=1;MQRankSum=1.144;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.089;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1504,0,1250 chrXVI 403300 . G T 179.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.734;DP=103;Dels=0.00;FS=125.218;HaplotypeScore=5.0004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.947;QD=1.74;ReadPosRankSum=-5.184;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:209,0,1349 chrXVI 403307 . A G 1967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.1298;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;QD=25.22;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2000,204,0 chrXVI 403383 . C T 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=28.28;SB=-1.882e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3591,343,0 chrXVI 403502 . G A 3950.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=28.21;SB=-2.035e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3950,391,0 chrXVI 403562 . T C 4247.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.76;SB=-2.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4247,430,0 chrXVI 403691 . C T 4097.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3724;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=27.31;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4097,397,0 chrXVI 403823 . A G 3727.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88;SB=-1.857e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3727,381,0 chrXVI 403919 . C A 3472.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=28.23;SB=-1.814e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3472,334,0 chrXVI 404106 . A G 3655.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=24.86;SB=-1.234e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3655,375,0 chrXVI 404554 . T C 3026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3059,312,0 chrXVI 404569 . C T 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=25.93;SB=-1.496e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3067,301,0 chrXVI 404588 . C T 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.867;DP=120;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.580;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1373,0,1203 chrXVI 404596 . A G 3392.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.620e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3392,343,0 chrXVI 404634 . C A 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.466e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3268,313,0 chrXVI 404753 . C T 3010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=64.7468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.57;MQ0=0;QD=27.87;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3043,307,0 chrXVI 404802 . C A 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.817;DP=72;Dels=0.00;FS=2.048;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.788;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,40:72:99:717,0,609 chrXVI 404878 . T C 3122 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.09;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.155e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3155,321,0 chrXVI 404886 . C T 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7592;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.92;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2979,292,0 chrXVI 404891 . T C 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.698;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.196;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1437,0,972 chrXVI 405054 . T G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.668;DP=108;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1179,0,1155 chrXVI 405804 . A G 3298.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.384e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3298,337,0 chrXVI 405816 . C T 2003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.357;DP=138;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,86:138:99:2033,0,1058 chrXVI 405840 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.244;DP=132;Dels=0.00;FS=3.262;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,51:132:99:1075,0,1929 chrXVI 405846 . G A 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.688;DP=138;Dels=0.00;FS=2.191;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.935;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,55:138:99:1144,0,1903 chrXVI 406226 . G A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.077;DP=111;Dels=0.00;FS=3.620;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1286,0,1147 chrXVI 406247 . A G 3092 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3125,310,0 chrXVI 406317 . G A 3062 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.282e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3095,307,0 chrXVI 406455 . C T 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.576;DP=141;Dels=0.00;FS=5.024;HaplotypeScore=12.8425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=12.04;ReadPosRankSum=-2.374;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1728,0,1340 chrXVI 406822 . G A 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;DP=135;Dels=0.00;FS=3.316;HaplotypeScore=72.5009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=12.58;ReadPosRankSum=-2.212;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:135:99:1728,0,1241 chrXVI 406902 . A G 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.436;DP=132;Dels=0.03;FS=12.967;HaplotypeScore=52.5009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1517,0,1284 chrXVI 406922 . G T 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.907;DP=137;Dels=0.00;FS=5.152;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.148;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1582,0,1459 chrXVI 406979 . T C 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=24.10;SB=-1.585e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3118,309,0 chrXVI 407033 . T C 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.869;DP=154;Dels=0.00;FS=1.278;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.164;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.107;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,81:154:99:1742,0,1613 chrXVI 407036 . G A 1788.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.755;DP=154;Dels=0.00;FS=2.859;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.919;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1818,0,1631 chrXVI 407388 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.314;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.6621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.957;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,62:141:99:1364,0,1746 chrXVI 407494 . C A 1791.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.541;DP=172;Dels=0.00;FS=0.562;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.994;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,88:172:99:1821,0,1745 chrXVI 407712 . T C 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.009;DP=161;Dels=0.00;FS=6.792;HaplotypeScore=2.8002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,72:161:99:1406,0,2112 chrXVI 408303 . G A 1135.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.897;DP=99;Dels=0.00;FS=1.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1165,0,934 chrXVI 408319 . G A 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.651;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=2.158;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.767;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:108:99:1361,0,958 chrXVI 408400 . A G 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.250;DP=113;Dels=0.00;FS=5.838;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.227;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1148,0,1326 chrXVI 408581 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.634;DP=141;Dels=0.00;FS=14.132;HaplotypeScore=2.3937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:1441,0,1534 chrXVI 408835 . T C 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.758;DP=113;Dels=0.00;FS=3.666;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.021;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1360,0,1234 chrXVI 408842 . C T 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=27.73;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3272,328,0 chrXVI 408877 . C T 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.757;DP=130;Dels=0.00;FS=2.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.107;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1445,0,1411 chrXVI 408889 . G A 3789.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.50;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3789,358,0 chrXVI 408904 . A T 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.646;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.235;SB=-7.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1433,0,1821 chrXVI 408975 . G A 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.567;DP=107;Dels=0.00;FS=1.599;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.446;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1186,0,1131 chrXVI 409143 . T A 1767.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=1.834;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.240;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,79:134:99:1797,0,1184 chrXVI 409177 . T G 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;DP=130;Dels=0.00;FS=4.604;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.788;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,73:130:99:1534,0,1244 chrXVI 409216 . G A 1686.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.847;DP=154;Dels=0.00;FS=2.088;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.599;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.776;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,83:154:99:1716,0,1504 chrXVI 409716 . T C 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;DP=128;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.893;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.433;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,70:128:99:1515,0,1249 chrXVI 410004 . G C 1688.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;DP=127;Dels=0.00;FS=6.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.051;SB=-8.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,75:127:99:1718,0,1086 chrXVI 410261 . C G 1703.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;DP=142;Dels=0.00;FS=5.154;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.151;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,82:142:99:1733,0,1269 chrXVI 410480 . A G 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.943;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=9.91;ReadPosRankSum=1.097;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1269,0,1587 chrXVI 410487 . G A 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.483;DP=128;Dels=0.00;FS=1.405;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.572;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1439,0,1417 chrXVI 410627 . C G 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;DP=103;Dels=0.00;FS=1.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.021;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1290,0,964 chrXVI 410721 . A T 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=105;Dels=0.00;FS=9.226;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1250,0,1120 chrXVI 410778 . A T 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;DP=135;Dels=0.00;FS=4.135;HaplotypeScore=1.9301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.569;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:135:99:1401,0,1650 chrXVI 410844 . A G 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.340;DP=159;Dels=0.00;FS=2.851;HaplotypeScore=3.9492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,77:159:99:1635,0,1889 chrXVI 411027 . A G 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.732;DP=147;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.465;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1825,0,1450 chrXVI 411358 . C T 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.100;DP=105;Dels=0.00;FS=2.542;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.215;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,51:105:99:1140,0,1198 chrXVI 411579 . G A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.592;DP=128;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=2.285;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.255;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1514,0,1278 chrXVI 411583 . C A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.820;DP=128;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.717;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.523;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1456,0,1287 chrXVI 411924 . G A 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.436;DP=111;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:111:99:1431,0,937 chrXVI 412010 . C T 1381.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.318;DP=111;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.979;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.205;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1411,0,1019 chrXVI 412217 . A G 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.362;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.744;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,52:120:99:1036,0,1529 chrXVI 412556 . C T 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.108;DP=115;Dels=0.00;FS=4.599;HaplotypeScore=1.8606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.518;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1235,0,1351 chrXVI 413039 . C A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1616,0,1784 chrXVI 413248 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.143;DP=108;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1155,0,1225 chrXVI 413484 . G A 1466.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.572;DP=147;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=2.242;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.409;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,69:147:99:1496,0,1724 chrXVI 413865 . C A 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.466;DP=98;Dels=0.00;FS=7.827;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.018;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1133,0,961 chrXVI 413894 . T A 3181 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.450e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3214,310,0 chrXVI 414143 . C G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.561;DP=140;Dels=0.00;FS=12.131;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.044;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1510,0,1336 chrXVI 414403 . C T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.056;DP=158;Dels=0.00;FS=2.800;HaplotypeScore=6.7585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=10.42;ReadPosRankSum=-2.557;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,75:158:99:1676,0,1755 chrXVI 414483 . A G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.704;DP=121;Dels=0.00;FS=10.018;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.086;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1213,0,1420 chrXVI 414605 . G A 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.855;DP=145;Dels=0.00;FS=10.199;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.781;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1642,0,1356 chrXVI 414884 . A G 1471.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.958;DP=153;Dels=0.00;FS=1.354;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,73:153:99:1501,0,1783 chrXVI 415024 . C G 93.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.741;DP=72;Dels=0.00;FS=142.339;HaplotypeScore=4.6426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=1.29;ReadPosRankSum=-5.933;SB=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:123,0,987 chrXVI 415343 . G A 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.029;DP=109;Dels=0.00;FS=0.936;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-1.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1064,0,1431 chrXVI 415381 . C T 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.775;DP=112;Dels=0.00;FS=3.473;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.777;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1162,0,1190 chrXVI 415490 . T G 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.637;DP=140;Dels=0.00;FS=2.146;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.832;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1494,0,1546 chrXVI 415608 . T C 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.619;DP=110;Dels=0.00;FS=1.729;HaplotypeScore=2.9693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1123,0,1359 chrXVI 415720 . G A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.764;DP=129;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=2.6722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.840;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1446,0,1356 chrXVI 416230 . T A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;DP=111;Dels=0.00;FS=2.450;HaplotypeScore=1.9134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1093,0,1247 chrXVI 416247 . A G 3196 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3229,321,0 chrXVI 416425 . T A 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;DP=153;Dels=0.00;FS=2.014;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.502;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,74:153:99:1682,0,1822 chrXVI 416451 . A G 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.771;DP=126;Dels=0.00;FS=4.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.804;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.788;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1402,0,1304 chrXVI 416547 . G A 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.593;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1503,0,1299 chrXVI 416638 . A C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.438;DP=136;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.407;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:1205,0,1665 chrXVI 417248 . T C 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.815;DP=139;Dels=0.00;FS=1.385;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=10.95;ReadPosRankSum=-1.225;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,72:139:99:1552,0,1538 chrXVI 417505 . T C 1519.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.296;DP=142;Dels=0.00;FS=8.867;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.321;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,75:142:99:1549,0,1468 chrXVI 418090 . T C 857.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.487;DP=109;Dels=0.00;FS=3.551;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.108;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,45:109:99:887,0,1485 chrXVI 418457 . T C 1291.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.019;DP=129;Dels=0.00;FS=13.192;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.062;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1321,0,1561 chrXVI 418474 . C T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.045;DP=119;Dels=0.00;FS=10.190;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-6.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1405,0,1250 chrXVI 418475 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.759;DP=121;Dels=0.00;FS=11.766;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1349,0,1284 chrXVI 418598 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.080;DP=126;Dels=0.00;FS=0.702;HaplotypeScore=4.9673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.269;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,57:126:99:1065,0,1575 chrXVI 418853 . A G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.622;DP=116;Dels=0.00;FS=1.614;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=1;MQRankSum=1.173;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.677;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1210,0,1353 chrXVI 418993 . C T 2951 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6003;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.555e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2984,295,0 chrXVI 419078 . C G 1180.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.256;DP=115;Dels=0.01;FS=2.434;HaplotypeScore=2.6387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=1;MQRankSum=-0.985;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.756;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1210,0,1170 chrXVI 419190 . A C 2978 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.02;SB=-1.547e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3011,303,0 chrXVI 419338 . G A 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.759;DP=109;Dels=0.00;FS=1.577;HaplotypeScore=2.7129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,61:109:99:1451,0,1095 chrXVI 419387 . G A 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;DP=120;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=9.23;ReadPosRankSum=-1.522;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1138,0,1443 chrXVI 419431 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.729;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.417;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1208,0,1248 chrXVI 419444 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.721;DP=120;Dels=0.00;FS=2.351;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.232;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1358,0,1179 chrXVI 419475 . C A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.517;DP=105;Dels=0.00;FS=3.737;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.716;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1401,0,941 chrXVI 419514 . G T 1430.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.282;DP=113;Dels=0.00;FS=14.076;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1460,0,1140 chrXVI 420042 . A G 3641.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6281;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=26.77;ReadPosRankSum=0.790;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3641,355,0 chrXVI 420178 . T C 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.061;DP=113;Dels=0.00;FS=2.535;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:994,0,1463 chrXVI 420351 . A G 1352.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.953;DP=131;Dels=0.00;FS=1.448;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.891;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1382,0,1527 chrXVI 420360 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.965;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.613;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1279,0,1511 chrXVI 420386 . T C 1463.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.435;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.624;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1493,0,1473 chrXVI 420405 . A G 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.093;DP=135;Dels=0.00;FS=4.378;HaplotypeScore=5.6098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.024;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:1328,0,1539 chrXVI 420501 . T A 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.359;DP=106;Dels=0.00;FS=6.062;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,54:106:99:1239,0,1142 chrXVI 420632 . T C 1520.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.514;DP=143;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=3.9486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.094;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:1550,0,1533 chrXVI 420721 . A G 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.003;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.8328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=9.22;ReadPosRankSum=-2.425;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,71:143:99:1349,0,1620 chrXVI 421049 . T C 1260.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.048;DP=119;Dels=0.00;FS=5.640;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.517;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1290,0,1246 chrXVI 421124 . A G 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.437;DP=104;Dels=0.00;FS=2.551;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,53:104:99:1181,0,1134 chrXVI 421833 . A G 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.538;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.289;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1062,0,1487 chrXVI 421854 . C A 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;DP=125;Dels=0.00;FS=4.277;HaplotypeScore=2.9072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-7.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1470,0,1240 chrXVI 422582 . T G 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.694;DP=149;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=1.8888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.223;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:149:99:1344,0,1748 chrXVI 422588 . A G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.130;DP=145;Dels=0.00;FS=2.241;HaplotypeScore=7.8794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,70:145:99:1337,0,1669 chrXVI 422674 . A G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.952;DP=96;Dels=0.00;FS=1.831;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.768;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1106,0,1026 chrXVI 422730 . T C 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.376e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3136,310,0 chrXVI 422802 . T G 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.173;DP=98;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.271;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.293;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1116,0,1044 chrXVI 423599 . G A 1795.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.844;DP=151;Dels=0.00;FS=9.770;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.089;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1825,0,1500 chrXVI 423742 . T C 1895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.364;DP=128;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.267;SB=-8.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,84:128:99:1925,0,879 chrXVI 423815 . A G 1956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.567;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=12.62;ReadPosRankSum=-1.780;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,95:155:99:1986,0,1298 chrXVI 423898 . T C 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.011;DP=133;Dels=0.00;FS=6.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.740;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,68:133:99:1492,0,1552 chrXVI 423957 . T A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;DP=113;Dels=0.00;FS=1.589;HaplotypeScore=2.9639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=9.22;ReadPosRankSum=2.405;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1072,0,1421 chrXVI 423962 . G T 1188.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.913;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=10.70;ReadPosRankSum=1.613;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1218,0,1196 chrXVI 424096 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.074;DP=138;Dels=0.00;FS=4.250;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=9.77;ReadPosRankSum=-2.359;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1378,0,1625 chrXVI 424137 . G A 1850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.946;DP=168;Dels=0.00;FS=5.801;HaplotypeScore=8.3448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.778;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.061;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,84:168:99:1880,0,1871 chrXVI 424230 . G A 1702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.764;DP=152;Dels=0.00;FS=4.013;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=1;MQRankSum=2.209;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.591;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1732,0,1643 chrXVI 424251 . A G 1691.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.391;DP=163;Dels=0.00;FS=1.392;HaplotypeScore=6.3440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=0.797;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.047;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,79:163:99:1721,0,1855 chrXVI 424350 . G T 460.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.915;DP=115;Dels=0.00;FS=246.654;HaplotypeScore=23.5476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=4.00;ReadPosRankSum=-6.164;SB=-1.068e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,40:115:99:490,0,1660 chrXVI 424365 . A G 756.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.064;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-6.801e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,38:80:99:786,0,850 chrXVI 424542 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.312;DP=109;Dels=0.00;FS=1.563;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.703;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,60:109:99:1306,0,1096 chrXVI 424578 . G A 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.827;DP=111;Dels=0.00;FS=4.660;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1279,0,1191 chrXVI 424588 . G A 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.855;DP=113;Dels=0.00;FS=7.292;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=11.05;ReadPosRankSum=-2.442;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1279,0,1121 chrXVI 424851 . T C 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.303;DP=121;Dels=0.00;FS=5.813;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=11.26;ReadPosRankSum=-2.891;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1392,0,1183 chrXVI 424858 . A G 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.443;DP=110;Dels=0.00;FS=0.772;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=10.82;ReadPosRankSum=-2.026;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1220,0,1152 chrXVI 424956 . A G 818.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.200;DP=87;Dels=0.00;FS=7.415;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-9.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:87:99:848,0,946 chrXVI 424965 . T C 568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.076;DP=85;Dels=0.00;FS=3.470;HaplotypeScore=2.4673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.196;SB=-1.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:99:598,0,1041 chrXVI 424987 . T G 458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.724;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.445;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:488,0,1032 chrXVI 425023 . G A 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.222;DP=111;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1056,0,1176 chrXVI 425055 . T C 899.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.915;DP=97;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.498;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,50:97:99:929,0,1041 chrXVI 425121 . G A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.554;DP=122;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=2.094;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.906;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1368,0,1362 chrXVI 425275 . T C 687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=83;Dels=0.00;FS=14.990;HaplotypeScore=3.6805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.113;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,42:83:99:717,0,459 chrXVI 425287 . A G 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.646;DP=102;Dels=0.00;FS=3.816;HaplotypeScore=3.6071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.613;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:960,0,752 chrXVI 425377 . T A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.235;DP=128;Dels=0.00;FS=3.303;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.029;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1314,0,1546 chrXVI 425451 . A G 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.761;DP=134;Dels=0.00;FS=6.877;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.550;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1535,0,1410 chrXVI 425480 . T G 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.373;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.216;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,70:126:99:1435,0,1270 chrXVI 425481 . C T 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3427,340,0 chrXVI 425740 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.673e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3267,322,0 chrXVI 426328 . G A 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=28.58;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3801,373,0 chrXVI 426370 . A T 3343.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.355e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3343,319,0 chrXVI 426445 . C T 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.870;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1139,0,1389 chrXVI 426447 . C T 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.893;DP=123;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.099;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1413,0,1231 chrXVI 426505 . C T 4003.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.276e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4003,391,0 chrXVI 426991 . A G 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.479e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3639,366,0 chrXVI 427075 . C T 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=29.10;SB=-1.464e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2914,283,0 chrXVI 427120 . G A 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.351e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3207,310,0 chrXVI 427130 . A G 3187 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.373e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3220,330,0 chrXVI 427238 . G T 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3168,313,0 chrXVI 427708 . G A 2991 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3024,295,0 chrXVI 427730 . C A 3087 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.395e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3120,301,0 chrXVI 427890 . G A 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.392;DP=82;Dels=0.00;FS=9.305;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.848;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:898,0,791 chrXVI 428058 . T C 3732.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3732,376,0 chrXVI 428065 . G A 4050.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.930e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4050,397,0 chrXVI 428130 . T C 4028.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=1;QD=27.40;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4028,409,0 chrXVI 428253 . G A 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=28.10;SB=-1.647e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3793,361,0 chrXVI 428330 . C T 1505.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.727;DP=141;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=9.6802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.561;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1535,0,1597 chrXVI 428479 . T C 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.616e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3964,397,0 chrXVI 428562 . C G 3228.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.715e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3262,327,0 chrXVI 428616 . A G 3574.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.286e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3574,352,0 chrXVI 428691 . A G 4031.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.881e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4031,400,0 chrXVI 428880 . A G 3095 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.17;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.580e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3128,316,0 chrXVI 428904 . G A 3175 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.17;MQ0=0;QD=28.86;SB=-1.522e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3208,316,0 chrXVI 428908 . C T 3116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3149,316,0 chrXVI 428918 . A G 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.91;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.561e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3179,316,0 chrXVI 429004 . C G 3870.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=28.46;SB=-1.184e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3870,394,0 chrXVI 429187 . C T 3414.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.70;MQ0=0;QD=28.21;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3414,331,0 chrXVI 429229 . C G 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.379;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9408;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=24.56;ReadPosRankSum=1.199;SB=-1.837e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,168:169:99:4150,412,0 chrXVI 429479 . T C 4150.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=25.15;SB=-2.115e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4150,411,0 chrXVI 429656 . C T 5123.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:183:99:5123,490,0 chrXVI 429659 . G T 5326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:5326,514,0 chrXVI 429704 . A T 3050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.314e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3083,300,0 chrXVI 429834 . A C 2746 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.89;MQ0=0;QD=24.52;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2779,288,0 chrXVI 429879 . C T 3714.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8047;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.72;SB=-1.954e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3714,358,0 chrXVI 429951 . T C 3546.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.202e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3546,361,0 chrXVI 430031 . A G 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.181;DP=162;Dels=0.00;FS=2.019;HaplotypeScore=7.4494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,82:162:99:1596,0,1771 chrXVI 430091 . G A 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.39;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.780e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3537,346,0 chrXVI 430100 . C T 3922.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.776e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3922,385,0 chrXVI 430227 . T A 2903 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2936,283,0 chrXVI 430271 . G A 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.67;SB=-2.033e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3947,376,0 chrXVI 430797 . A G 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.701;DP=139;Dels=0.00;FS=0.628;HaplotypeScore=7.9525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=3.029;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.542;SB=-6.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1454,0,1628 chrXVI 430826 . T C 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.299e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3721,379,0 chrXVI 431458 . C T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.052;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=1;MQRankSum=-0.008;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.555;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1609,0,1523 chrXVI 431644 . A G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.079;DP=117;Dels=0.00;FS=1.578;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.079;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1364,0,1247 chrXVI 432057 . G C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.888;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,72:127:99:1479,0,1158 chrXVI 432226 . C G 3286.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3286,336,0 chrXVI 432236 . C T 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;DP=119;Dels=0.00;FS=1.527;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.072;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1251,0,1354 chrXVI 432277 . T C 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.081;DP=125;Dels=0.00;FS=2.262;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.473;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1414,0,1213 chrXVI 432810 . G A 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;DP=147;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=2.4573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,73:147:99:1521,0,1550 chrXVI 432881 . C T 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3522,340,0 chrXVI 433074 . A G 1794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.398;DP=150;Dels=0.00;FS=2.081;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.584;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,85:150:99:1824,0,1433 chrXVI 433340 . A G 3847.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.955e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3847,405,0 chrXVI 433400 . G A 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.109;DP=129;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=1.7653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.817;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1559,0,1317 chrXVI 433481 . T C 3647.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.05;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3647,361,0 chrXVI 434157 . C T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.531;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=9.81;ReadPosRankSum=-2.705;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1148,0,1350 chrXVI 434179 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.653;DP=105;Dels=0.00;FS=2.875;HaplotypeScore=2.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.203;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1109,0,1082 chrXVI 434269 . A T 3585.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3585,349,0 chrXVI 434405 . G A 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=27.90;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3432,325,0 chrXVI 434418 . G T 3403.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.23;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.838e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3403,319,0 chrXVI 434432 . T C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.545;DP=147;Dels=0.00;FS=5.032;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.917;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,61:147:99:1238,0,1901 chrXVI 434506 . C A 2750 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.098e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:103:99:2783,276,0 chrXVI 434613 . C T 3555.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.93;SB=-1.600e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3555,331,0 chrXVI 435056 . C T 2554 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.000e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2587,255,0 chrXVI 435173 . G A 2955 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2988,301,0 chrXVI 435332 . C T 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=27.13;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3207,310,0 chrXVI 435413 . C G 3033 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3066,309,0 chrXVI 435620 . T C 2934 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=23.47;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:2967,300,0 chrXVI 435711 . A T 2853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.17;SB=-9.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2886,292,0 chrXVI 435860 . C A 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.705;DP=98;Dels=0.00;FS=0.777;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.451;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1085,0,993 chrXVI 435866 . T G 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.245;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.486;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1030,0,1103 chrXVI 436158 . T C 3391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.26;MQ0=0;QD=27.80;SB=-9.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3391,351,0 chrXVI 436358 . T C 2854 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.94;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2887,283,0 chrXVI 436359 . T C 2795 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.72;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.322e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2828,282,0 chrXVI 436450 . T C 1207 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.61;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1240,129,0 chrXVI 436464 . G A 524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;DP=47;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.436;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.543;SB=-4.401e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:554,0,489 chrXVI 436465 . A C 1311 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.69;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1344,138,0 chrXVI 436481 . A G 1153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.64;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1186,120,0 chrXVI 436907 . A T 86.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.17;MQ0=0;QD=21.63;SB=-3.055e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:119,12,0 chrXVI 443066 . T C 17.09 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=16;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.20;MQ0=9;MQRankSum=-0.550;QD=1.07;ReadPosRankSum=-1.754;SB=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:47:47,0,55 chrXVI 443075 . A T 19.06 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=15;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.83;MQ0=8;MQRankSum=-0.550;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.754;SB=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:15:49:49,0,55 chrXVI 443076 . G T 19.06 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=14;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.53;MQ0=7;MQRankSum=0.550;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.754;SB=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:49:49,0,55 chrXVI 443131 . A G 78.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.36;MQ0=0;QD=9.81;SB=-3.145e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:12:111,12,0 chrXVI 443196 . G A 692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.342;DP=79;Dels=0.00;FS=7.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.074;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,34:79:99:722,0,934 chrXVI 443445 . C T 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.610;DP=102;Dels=0.00;FS=9.577;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1173,0,1106 chrXVI 443745 . A G 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.362;DP=117;Dels=0.00;FS=6.453;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.248;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,58:117:99:1231,0,1340 chrXVI 443804 . T A 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.168;DP=105;Dels=0.00;FS=3.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.815;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.279;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1194,0,1138 chrXVI 443905 . T G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.704;DP=118;Dels=0.00;FS=1.476;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.930;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1138,0,1449 chrXVI 443916 . A C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.072;DP=112;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1370,0,1149 chrXVI 443969 . G C 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.378e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2736,273,0 chrXVI 444034 . C T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.354;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:1116,0,1382 chrXVI 444118 . T C 3001 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.484e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3034,306,0 chrXVI 444290 . C T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.782;DP=114;Dels=0.00;FS=1.487;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-2.454;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1341,0,1031 chrXVI 444303 . T C 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.098;DP=118;Dels=0.00;FS=3.528;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.485;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1419,0,1126 chrXVI 444306 . T C 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.223;DP=116;Dels=0.00;FS=2.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:1413,0,1109 chrXVI 444321 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.213;DP=117;Dels=0.00;FS=3.462;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.696;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1409,0,1212 chrXVI 444354 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.371;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.482;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1127,0,1397 chrXVI 444367 . A T 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;DP=87;Dels=0.00;FS=1.750;HaplotypeScore=3.8779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:1046,0,941 chrXVI 444434 . A G 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.025;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.697;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,39:93:99:810,0,1267 chrXVI 444490 . G A 1056.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.117;DP=101;Dels=0.00;FS=0.748;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.030;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:1086,0,1214 chrXVI 444685 . A G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.787;DP=100;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=10.29;ReadPosRankSum=-2.065;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1059,0,1037 chrXVI 444755 . G A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.402;DP=100;Dels=0.00;FS=9.765;HaplotypeScore=4.9680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=2.273;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.171;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1319,0,804 chrXVI 444899 . A G 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.801;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,53:113:99:1113,0,1311 chrXVI 444920 . T A 1210.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.228;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1240,0,1137 chrXVI 444980 . A G 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.391;DP=89;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=1;MQRankSum=-1.553;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.561;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:961,0,1023 chrXVI 445300 . T C 547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.764;DP=78;Dels=0.00;FS=0.897;HaplotypeScore=4.3509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.607;SB=-2.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:78:99:577,0,1021 chrXVI 445378 . G T 2423 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=23.30;SB=-1.455e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2456,238,0 chrXVI 445425 . T C 894.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.730;DP=104;Dels=0.00;FS=1.595;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.771;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:924,0,1234 chrXVI 445607 . G A 2888 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2921,286,0 chrXVI 445861 . T C 1878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=27.22;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:1911,192,0 chrXVI 445985 . C T 2680 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9074;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.65;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.317e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2713,265,0 chrXVI 446280 . A T 1710.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;DP=110;Dels=0.00;FS=3.850;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.288;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,76:110:99:1740,0,640 chrXVI 446457 . T C 3628.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3628,372,0 chrXVI 446612 . A G 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.964;DP=143;Dels=0.00;FS=6.358;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=1;MQRankSum=0.362;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.275;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:143:99:1542,0,1487 chrXVI 446756 . T C 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.585;DP=140;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.417;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1238,0,1671 chrXVI 446931 . T C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.183;DP=121;Dels=0.00;FS=6.885;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.377;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,58:121:99:1177,0,1440 chrXVI 447294 . G T 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.283;DP=114;Dels=0.00;FS=4.583;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1405,0,1142 chrXVI 447414 . T C 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.791;DP=134;Dels=0.00;FS=6.327;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.533;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1420,0,1488 chrXVI 448074 . G A 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.429;DP=186;Dels=0.00;FS=0.544;HaplotypeScore=8.1823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.729;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.412;SB=-8.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,85:186:99:1681,0,2257 chrXVI 448089 . T C 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.929;DP=152;Dels=0.00;FS=2.064;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=8.21;ReadPosRankSum=-2.899;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,66:152:99:1278,0,2094 chrXVI 448143 . G A 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.762;DP=160;Dels=0.00;FS=14.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.377;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,61:160:99:1271,0,2081 chrXVI 448407 . A G 1093.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.385;DP=130;Dels=0.00;FS=9.417;HaplotypeScore=3.5501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.474;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1123,0,1577 chrXVI 448559 . T C 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.181;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=1;MQRankSum=1.227;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.478;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,78:147:99:1532,0,1640 chrXVI 448698 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.616;DP=138;Dels=0.00;FS=7.638;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.759;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,60:138:99:1176,0,1793 chrXVI 449133 . C T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.323;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.771;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1060,0,1103 chrXVI 449860 . G A 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.760;DP=100;Dels=0.00;FS=5.371;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=10.39;ReadPosRankSum=1.588;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,47:100:99:1069,0,1224 chrXVI 450060 . T C 1570.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.739;DP=151;Dels=0.00;FS=14.987;HaplotypeScore=3.5521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.908;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.173;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,77:151:99:1600,0,1667 chrXVI 450160 . T C 3041 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=24.72;SB=-1.480e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3074,324,0 chrXVI 450252 . T C 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.454;DP=109;Dels=0.00;FS=10.735;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=11.06;ReadPosRankSum=2.272;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1236,0,1132 chrXVI 450430 . G A 2280 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.53;MQ0=0;QD=27.47;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:2313,228,0 chrXVI 450581 . C T 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.494;DP=101;Dels=0.00;FS=2.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.591;SB=-4.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,56:101:99:1262,0,926 chrXVI 450675 . C T 3136 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.75;SB=-1.109e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3169,313,0 chrXVI 450699 . A T 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;DP=122;Dels=0.00;FS=1.438;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1119,0,1515 chrXVI 450731 . T A 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.444;DP=121;Dels=0.00;FS=3.346;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=26.35;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-1.587e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3221,286,0 chrXVI 450744 . G A 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.165;DP=118;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=2.9205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.244;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,51:118:99:1111,0,1486 chrXVI 450830 . C T 1071.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.831;DP=104;Dels=0.00;FS=6.270;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.221;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:1101,0,1151 chrXVI 450989 . G T 1228.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.132;DP=118;Dels=0.00;FS=9.928;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.129;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1258,0,1328 chrXVI 451153 . T G 3135 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7286;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=23.57;SB=-1.746e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3168,318,0 chrXVI 451219 . T C 3592.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3592,361,0 chrXVI 451317 . A G 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=25.73;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3172,309,0 chrXVI 452126 . C T 4328.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.54;MQ0=0;QD=27.74;SB=-2.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4328,409,0 chrXVI 452140 . A G 3958.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.77;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.931e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3958,408,0 chrXVI 452142 . T G 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.569;DP=152;Dels=0.00;FS=1.291;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.606;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:152:99:1570,0,1835 chrXVI 452342 . C T 1901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.785;DP=164;Dels=0.00;FS=1.249;HaplotypeScore=8.5850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.903;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,84:164:99:1931,0,1712 chrXVI 452400 . G C 4236.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=25.83;SB=-2.031e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:4236,418,0 chrXVI 452714 . T G 1774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.398;DP=163;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=10.88;ReadPosRankSum=-2.285;SB=-8.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,86:163:99:1804,0,1716 chrXVI 452827 . T C 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.055;DP=127;Dels=0.00;FS=1.412;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.866;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1424,0,1405 chrXVI 452986 . G A 3293.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.67;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3293,313,0 chrXVI 453010 . C T 3584.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.57;SB=-1.420e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3584,352,0 chrXVI 453106 . C T 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.099;DP=110;Dels=0.00;FS=6.044;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1268,0,1083 chrXVI 453290 . C G 638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;DP=106;Dels=0.00;FS=5.130;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.940;SB=-2.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:668,0,1459 chrXVI 453333 . A G 1047.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.383;DP=94;Dels=0.00;FS=8.422;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.610;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:1077,0,918 chrXVI 453447 . A G 544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.363;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:574,0,548 chrXVI 453508 . C T 1566 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.54;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1599,159,0 chrXVI 453647 . A G 1475 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.485;DP=85;Dels=0.01;FS=3.561;HaplotypeScore=27.7426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.68;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.691;SB=-9.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,83:84:99:1508,156,0 chrXVI 453659 . G A 89.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.962;DP=80;Dels=0.00;FS=6.244;HaplotypeScore=3.2248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.512;QD=1.11;ReadPosRankSum=-3.010;SB=-1.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,33:80:99:119,0,1053 chrXVI 453873 . C T 1952 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.62;MQ0=0;QD=27.11;SB=-9.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:1985,198,0 chrXVI 453887 . T A 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.142;DP=84;Dels=0.00;FS=13.784;HaplotypeScore=3.5566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=11.33;ReadPosRankSum=-1.433;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,48:84:99:982,0,830 chrXVI 454180 . T G 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.639;DP=93;Dels=0.00;FS=6.882;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,57:93:99:1214,0,767 chrXVI 454184 . G A 618.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.395;DP=83;Dels=0.00;FS=7.636;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.918;SB=-2.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,31:83:99:648,0,1153 chrXVI 454244 . T C 1657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.741;DP=146;Dels=0.00;FS=3.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.040;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,80:146:99:1687,0,1485 chrXVI 454319 . G A 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.660;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.458;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,65:152:99:1397,0,1866 chrXVI 454487 . G A 1780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.293;DP=150;Dels=0.00;FS=14.282;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.243;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:1810,0,1477 chrXVI 454517 . A G 4009.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.385e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4009,397,0 chrXVI 454555 . G C 1211.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.222;DP=114;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=10.62;ReadPosRankSum=2.423;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1241,0,1184 chrXVI 454578 . T G 2499 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2532,261,0 chrXVI 454587 . C T 2855 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.531e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2888,280,0 chrXVI 454958 . T C 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.435;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.115;SB=-3.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:884,0,1071 chrXVI 455063 . G C 2616 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=26.42;SB=-1.019e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2649,261,0 chrXVI 455086 . A G 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;DP=84;Dels=0.00;FS=3.175;HaplotypeScore=42.5264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=11.40;ReadPosRankSum=2.108;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,47:84:99:988,0,809 chrXVI 455098 . A C 16.85 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=0.20;SB=-7.748e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:6:48,6,0 chrXVI 455322 . T C 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.434;DP=139;Dels=0.00;FS=3.097;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.517;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:139:99:1247,0,1679 chrXVI 455359 . T A 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3781,373,0 chrXVI 455395 . T A 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.432;DP=158;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=5.0399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.660;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,72:158:99:1465,0,1985 chrXVI 455475 . T A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=2.278;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.281;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1151,0,1101 chrXVI 455516 . G T 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.972;DP=117;Dels=0.00;FS=7.205;HaplotypeScore=3.8480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.738;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:1122,0,1480 chrXVI 455615 . G A 946.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.567;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.911;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,50:129:99:976,0,1816 chrXVI 455657 . A G 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.295;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,73:117:99:1596,0,893 chrXVI 455724 . T C 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.477;DP=117;Dels=0.00;FS=4.588;HaplotypeScore=3.9749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.883;QD=11.97;ReadPosRankSum=2.427;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,66:117:99:1431,0,1138 chrXVI 455725 . T A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;DP=115;Dels=0.00;FS=3.485;HaplotypeScore=3.9749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.776;QD=12.56;ReadPosRankSum=2.840;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1474,0,1149 chrXVI 455737 . A C 3084 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8519;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.89;MQ0=0;QD=25.92;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3117,321,0 chrXVI 455846 . T C 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.515;DP=112;Dels=0.00;FS=5.980;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.385;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1202,0,1127 chrXVI 455851 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.740;DP=111;Dels=0.00;FS=3.542;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.920;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1339,0,1089 chrXVI 455955 . G A 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.202;DP=109;Dels=0.00;FS=2.509;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.095;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:1031,0,1268 chrXVI 456024 . C T 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.191;DP=164;Dels=0.00;FS=4.589;HaplotypeScore=2.5646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.318;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,77:164:99:1700,0,1960 chrXVI 456292 . C T 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.629;DP=134;Dels=0.00;FS=5.152;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.078;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1446,0,1412 chrXVI 456419 . T C 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.824;DP=130;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=2.7490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=-0.601;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.408;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1371,0,1527 chrXVI 456456 . G A 4173.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=1;QD=28.39;SB=-1.669e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:147:99:4173,403,0 chrXVI 456878 . T A 1557.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;DP=135;Dels=0.00;FS=0.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.116;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1587,0,1525 chrXVI 456975 . T A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.728;DP=113;Dels=0.00;FS=3.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=2.303;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.938;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,68:113:99:1488,0,888 chrXVI 457330 . G A 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.040;DP=154;Dels=0.00;FS=2.159;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=1.909;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.654;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1764,0,1688 chrXVI 457391 . C T 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.690;DP=105;Dels=0.00;FS=23.045;HaplotypeScore=2.7811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.055;SB=-1.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1076,0,1135 chrXVI 457634 . C T 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.765;DP=145;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=2.7666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.054;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1643,0,1510 chrXVI 458206 . C T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.045;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=10.64;ReadPosRankSum=2.440;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1317,0,1314 chrXVI 458497 . T C 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.565;DP=116;Dels=0.00;FS=5.785;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=2.351;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.518;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,52:116:99:1051,0,1526 chrXVI 458548 . G A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.070;DP=132;Dels=0.00;FS=10.020;HaplotypeScore=5.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.621;SB=-2.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,66:132:99:1579,0,1475 chrXVI 458635 . G C 3596.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.197e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3596,352,0 chrXVI 458653 . G T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=11.54;ReadPosRankSum=-2.106;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,72:128:99:1507,0,1194 chrXVI 458912 . A G 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.752;DP=123;Dels=0.00;FS=4.389;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.379;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1352,0,1252 chrXVI 458921 . A G 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.984;DP=142;Dels=0.00;FS=5.144;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.524;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1552,0,1504 chrXVI 458976 . G A 1407.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.072;DP=129;Dels=0.00;FS=6.723;HaplotypeScore=3.3314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.345;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1437,0,1388 chrXVI 459034 . A G 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.617;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.366;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1459,0,1643 chrXVI 459228 . A G 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.269;DP=119;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.657;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1326,0,1271 chrXVI 459330 . T G 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.556e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3188,304,0 chrXVI 459604 . A G 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.721;DP=100;Dels=0.00;FS=3.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.351;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:927,0,1289 chrXVI 459917 . A T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;DP=111;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=2.8184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.286;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1297,0,1198 chrXVI 459929 . A G 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.288;DP=111;Dels=0.00;FS=1.528;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.540;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1100,0,1290 chrXVI 460152 . G C 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.800;DP=125;Dels=0.00;FS=4.375;HaplotypeScore=4.9571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.939;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1569,0,1049 chrXVI 460340 . A G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.498;DP=121;Dels=0.00;FS=1.460;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.590;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,65:121:99:1379,0,1198 chrXVI 460602 . C T 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.482;DP=96;Dels=0.00;FS=6.842;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.344;SB=-3.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,51:96:99:1167,0,959 chrXVI 460613 . A T 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;DP=83;Dels=0.00;FS=4.673;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-2.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,44:83:99:1032,0,864 chrXVI 460630 . T C 827.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.414;DP=75;Dels=0.00;FS=0.940;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=11.03;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-2.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,37:75:99:857,0,840 chrXVI 460696 . G A 1042.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.069;DP=93;Dels=0.00;FS=2.739;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.328;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1072,0,882 chrXVI 460761 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.491;DP=119;Dels=0.00;FS=7.106;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.869;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1141,0,1309 chrXVI 461198 . T C 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.359;DP=161;Dels=0.00;FS=1.391;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.861;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,80:161:99:1619,0,1850 chrXVI 462045 . C T 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.927;DP=127;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.807;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,61:127:99:1367,0,1371 chrXVI 462073 . G A 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.463;DP=103;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1139,0,1165 chrXVI 462121 . C G 2857 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4303;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.504e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2890,294,0 chrXVI 462153 . C A 2883 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2916,289,0 chrXVI 462164 . C T 2634 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.442e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2667,259,0 chrXVI 462319 . A G 2405 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.46;MQ0=0;QD=17.06;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:2438,252,0 chrXVI 462499 . A G 4526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,175:175:99:4526,448,0 chrXVI 462656 . G A 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=27.81;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3782,370,0 chrXVI 462756 . T C 4111.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.709;DP=154;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=26.69;ReadPosRankSum=0.170;SB=-2.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:154:99:4111,406,0 chrXVI 462814 . T G 4811.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.92;MQ0=0;QD=26.15;SB=-2.388e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:4811,481,0 chrXVI 462835 . G A 4886.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.99;SB=-2.295e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4886,481,0 chrXVI 462843 . T C 4621.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.39;SB=-2.175e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:182:99:4621,477,0 chrXVI 462936 . C T 4593.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.605e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4593,448,0 chrXVI 463061 . T C 4844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.348e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4844,481,0 chrXVI 463075 . C T 5100.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:5100,490,0 chrXVI 463543 . G A 4436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:162:99:4436,439,0 chrXVI 463609 . C G 4218.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.04;SB=-1.872e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:162:99:4218,430,0 chrXVI 463700 . C T 4945.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=184;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=26.88;ReadPosRankSum=-1.243;SB=-2.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,183:184:99:4945,457,0 chrXVI 463745 . G C 2153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;DP=189;Dels=0.00;FS=5.138;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.074;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,102:189:99:2183,0,1850 chrXVI 464070 . G A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.357;DP=163;Dels=0.00;FS=8.328;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.558;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,81:163:99:1442,0,1837 chrXVI 464145 . G A 1812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;DP=179;Dels=0.00;FS=2.602;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,93:179:99:1842,0,1848 chrXVI 464146 . C T 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.693;DP=178;Dels=0.00;FS=2.592;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.874;SB=-8.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,85:178:99:1854,0,1894 chrXVI 464194 . A G 3375.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.108e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3375,351,0 chrXVI 464559 . G A 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.114;DP=129;Dels=0.00;FS=3.863;HaplotypeScore=3.9785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.410;SB=-1.468e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3405,334,0 chrXVI 464709 . C T 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.707e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3640,361,0 chrXVI 465116 . A G 606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.991;DP=90;Dels=0.00;FS=0.801;HaplotypeScore=1.8533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.867;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:636,0,588 chrXVI 465255 . A G 1711.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.821;DP=152;Dels=0.00;FS=2.095;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.430;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1741,0,1601 chrXVI 465889 . A G 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=26.61;SB=-2.074e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3992,394,0 chrXVI 465930 . A G 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.910;DP=144;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=4.5402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.124;SB=-9.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:1775,0,1426 chrXVI 466112 . G T 4085.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4085,400,0 chrXVI 466538 . A T 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;DP=164;Dels=0.00;FS=9.414;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.673;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,78:164:99:1685,0,1982 chrXVI 466588 . C T 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.501;DP=166;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.527;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,79:166:99:1676,0,1944 chrXVI 466824 . G C 3652.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.05;SB=-1.593e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3652,367,0 chrXVI 467054 . C T 2976 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=20.52;SB=-1.389e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3009,286,0 chrXVI 467066 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.856;DP=149;Dels=0.00;FS=3.280;HaplotypeScore=10.4431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.694;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,83:149:99:1499,0,1344 chrXVI 467077 . T C 3466.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=23.26;SB=-1.054e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3466,340,0 chrXVI 467087 . G C 3513.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=23.42;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:150:99:3513,346,0 chrXVI 467237 . C T 3545.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.70;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3545,355,0 chrXVI 467571 . T C 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.149e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:130:99:3104,327,0 chrXVI 467632 . T C 3422.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=28.05;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3422,355,0 chrXVI 467771 . A G 2805 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2838,297,0 chrXVI 468177 . C T 3326.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=26.82;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:124:99:3326,325,0 chrXVI 468262 . T C 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.535e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3427,343,0 chrXVI 468415 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.060;DP=109;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.912;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1184,0,1213 chrXVI 468512 . A C 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=25.17;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3600,384,0 chrXVI 468648 . C G 3144 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2611;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.491e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3177,316,0 chrXVI 469012 . C A 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.11;MQ0=0;QD=28.43;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3781,373,0 chrXVI 469693 . C T 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.3272;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.275e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3299,322,0 chrXVI 469730 . G C 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=24.75;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3052,318,0 chrXVI 470616 . A G 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.143e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2472,252,0 chrXVI 470860 . C G 2641 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.028e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2674,273,0 chrXVI 471189 . G T 2733 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=28.18;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2766,271,0 chrXVI 471267 . T C 3299.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.510e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3299,334,0 chrXVI 471834 . A G 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2933,303,0 chrXVI 471891 . A G 2602 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=24.55;SB=-1.252e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2635,264,0 chrXVI 472110 . A G 3366.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.621e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3366,340,0 chrXVI 472490 . G A 3394.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=28.28;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3394,340,0 chrXVI 472568 . G A 4105.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.74;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:4105,391,0 chrXVI 472696 . A C 3333.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3333,334,0 chrXVI 472808 . A T 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.18;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.260e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:3131,307,0 chrXVI 472825 . T C 2992 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.390e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3025,304,0 chrXVI 472894 . G T 3591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.28;MQ0=0;QD=27.84;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3591,346,0 chrXVI 473286 . T C 3370.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3370,340,0 chrXVI 473391 . T C 3693.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.439e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3693,370,0 chrXVI 473481 . A G 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.281e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3531,375,0 chrXVI 473594 . G A 3860.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=1;QD=27.38;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:3860,370,0 chrXVI 473877 . A C 2400 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=26.97;SB=-9.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:2433,243,0 chrXVI 473892 . G A 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.675;DP=105;Dels=0.00;FS=2.578;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.358;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:979,0,1330 chrXVI 474003 . T C 3389.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.363e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3389,345,0 chrXVI 474526 . C T 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.20;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3248,319,0 chrXVI 474750 . G A 3816.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.490e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3816,373,0 chrXVI 475326 . C T 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.723;DP=151;Dels=0.00;FS=2.060;HaplotypeScore=3.9698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=1;MQRankSum=0.803;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,62:151:99:1335,0,1974 chrXVI 475484 . G C 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;DP=141;Dels=0.00;FS=4.147;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.584;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1434,0,1503 chrXVI 475496 . G A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.705;DP=138;Dels=0.00;FS=4.382;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.070;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.239;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,71:138:99:1534,0,1429 chrXVI 476232 . G T 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.936;DP=144;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=3.7725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.769;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,62:144:99:1291,0,1833 chrXVI 476694 . C G 3580.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.16;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.583e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3580,358,0 chrXVI 476826 . G A 3233.06 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8173;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.78;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.625e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3268,307,0 chrXVI 476833 . T C 2919 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.78;MQ0=0;QD=24.74;SB=-1.346e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:2952,288,0 chrXVI 476836 . T C 2900 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.26;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.421e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2933,285,0 chrXVI 476851 . A T 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.93;MQ0=0;QD=24.82;SB=-1.500e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2986,292,0 chrXVI 476932 . G A 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.409;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,61:126:99:1309,0,1355 chrXVI 477202 . A T 4171.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.711;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=25.91;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-2.208e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,160:161:99:4171,400,0 chrXVI 477321 . T C 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.076e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3233,319,0 chrXVI 477478 . T A 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.843;DP=127;Dels=0.00;FS=1.522;HaplotypeScore=3.3809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=10.94;ReadPosRankSum=-3.559;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:127:99:1420,0,1436 chrXVI 477481 . C G 3618.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3809;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.41;SB=-1.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3618,352,0 chrXVI 478120 . G A 4172.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.35;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.950e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:4172,400,0 chrXVI 478141 . G A 4121.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.964e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4121,391,0 chrXVI 478144 . A T 3997.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.59;MQ0=0;QD=27.38;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3997,397,0 chrXVI 478228 . G A 3601.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.70;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3601,340,0 chrXVI 478277 . T C 3583.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.62;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.502e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3583,360,0 chrXVI 478288 . T C 3018 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.64;MQ0=0;QD=26.02;SB=-9.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3051,307,0 chrXVI 478558 . C T 2753 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2786,277,0 chrXVI 478657 . G A 3158 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3191,307,0 chrXVI 478714 . G A 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2692,265,0 chrXVI 478917 . A G 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.285e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3247,330,0 chrXVI 479396 . G A 4274.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.71;SB=-2.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:160:99:4274,415,0 chrXVI 479770 . A G 2882 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2915,294,0 chrXVI 479826 . C T 3324.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3324,328,0 chrXVI 479899 . C T 3719.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=25.83;SB=-1.993e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3719,352,0 chrXVI 479920 . A C 3798.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=24.99;SB=-1.818e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3798,381,0 chrXVI 479932 . G T 3947.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.836e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3947,373,0 chrXVI 480296 . C A 347 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=12.2371;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.66;MQ0=0;QD=3.13;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:39:380,39,0 chrXVI 480301 . G A 40.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;DP=96;Dels=0.01;FS=78.198;HaplotypeScore=12.2371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.235;QD=0.42;ReadPosRankSum=-4.660;SB=-6.175e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,11:95:70:70,0,155 chrXVI 480383 . T A 3272.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.349e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3272,319,0 chrXVI 480441 . T G 4322.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.548;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=25.57;ReadPosRankSum=1.630;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,168:169:99:4322,397,0 chrXVI 480754 . A G 3993.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9318;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.76;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.926e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:156:99:3993,409,0 chrXVI 480795 . T C 3522.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3522,346,0 chrXVI 481072 . T G 4106.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4106,403,0 chrXVI 481833 . A G 3639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.37;SB=-1.598e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3639,367,0 chrXVI 481955 . G T 3510.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.633e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3510,355,0 chrXVI 481979 . C T 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3269,331,0 chrXVI 482109 . T C 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.444;DP=151;Dels=0.00;FS=1.513;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.850;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,85:151:99:1793,0,1392 chrXVI 482155 . G A 3838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.944e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3838,373,0 chrXVI 482212 . G A 4270.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.91;SB=-1.949e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4270,406,0 chrXVI 482234 . T C 3721.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.654e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3721,370,0 chrXVI 482239 . A G 1440.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.810;DP=140;Dels=0.00;FS=5.179;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=2.046;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.083;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1470,0,1583 chrXVI 482354 . A T 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.588;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1685,0,1408 chrXVI 482429 . A G 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=24.48;SB=-1.394e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2848,294,0 chrXVI 482737 . G C 4146.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4146,412,0 chrXVI 482770 . C T 3383.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=109.0060;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.092e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:136:99:3383,337,0 chrXVI 482968 . T G 2789 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=22.49;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:2822,294,0 chrXVI 483004 . G A 2859 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=22.34;SB=-1.407e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:2892,274,0 chrXVI 483027 . A T 2986 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=22.97;SB=-1.201e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3019,295,0 chrXVI 483116 . G A 4032.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6482;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=28.39;SB=-2.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:4032,388,0 chrXVI 483298 . T G 2581 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2614,267,0 chrXVI 483319 . T A 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.568e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2914,285,0 chrXVI 483355 . T C 2653 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6259;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=24.56;SB=-1.305e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2686,288,0 chrXVI 483359 . G T 3131 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.599e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3164,310,0 chrXVI 483739 . T C 2878 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.505e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2911,291,0 chrXVI 483904 . T C 3861.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=25.74;SB=-2.001e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3861,394,0 chrXVI 483961 . G C 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.96;MQ0=0;QD=24.96;SB=-1.674e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3470,352,0 chrXVI 484285 . C T 3751.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.877e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,139:141:99:3751,376,0 chrXVI 484327 . A G 3134 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.720e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3167,324,0 chrXVI 484357 . C T 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.706e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3364,331,0 chrXVI 484429 . T C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.32;SB=-1.721e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3369,334,0 chrXVI 484915 . T C 1981.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.345;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.789;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-1.064e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,100:180:99:2011,0,1648 chrXVI 485015 . A G 1605.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.029;DP=126;Dels=0.00;FS=3.362;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.180;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,72:126:99:1635,0,1192 chrXVI 485045 . C T 3448.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=28.50;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3448,337,0 chrXVI 485132 . A G 3666.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=27.36;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3666,376,0 chrXVI 485137 . T C 3437.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.84;SB=-8.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3437,366,0 chrXVI 485355 . T C 2881 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.81;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2914,294,0 chrXVI 485697 . C T 2571 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.68;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.141e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2604,255,0 chrXVI 485698 . A G 2450 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.68;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.077e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2483,252,0 chrXVI 485788 . T G 3025 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=27.01;SB=-8.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:3058,301,0 chrXVI 485801 . G A 3030 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=27.30;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3063,304,0 chrXVI 485873 . T G 4083.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=63.65;MQ0=0;QD=26.17;SB=-1.722e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:156:99:4083,400,0 chrXVI 485898 . C T 3777.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=62.55;MQ0=0;QD=25.52;SB=-1.628e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:3777,370,0 chrXVI 486011 . C A 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;DP=151;Dels=0.00;FS=0.763;HaplotypeScore=3.5101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.364;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,76:151:99:1666,0,1664 chrXVI 486231 . G T 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.963;DP=127;Dels=0.00;FS=9.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.472;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1180,0,1661 chrXVI 486281 . G A 1781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.681;DP=153;Dels=0.00;FS=9.759;HaplotypeScore=3.7946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.564;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1811,0,1604 chrXVI 486307 . G A 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.063;DP=121;Dels=0.00;FS=4.428;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.499;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,61:121:99:1367,0,1296 chrXVI 486334 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.724;DP=120;Dels=0.00;FS=0.679;HaplotypeScore=3.1542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.003;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1311,0,1249 chrXVI 486489 . T C 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.616;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.568;SB=-9.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,86:160:99:1765,0,1651 chrXVI 486595 . A G 1249.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.582;DP=158;Dels=0.00;FS=3.947;HaplotypeScore=2.9721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.143;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,66:158:99:1279,0,2174 chrXVI 486612 . A G 1278.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.627;DP=166;Dels=0.00;FS=2.765;HaplotypeScore=4.9694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.013;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,71:166:99:1308,0,2189 chrXVI 486646 . G A 4590.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.65;SB=-2.265e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:4590,430,0 chrXVI 486789 . T G 3605.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3605,381,0 chrXVI 486969 . A T 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8896;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=27.94;SB=-1.456e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3079,304,0 chrXVI 487204 . C T 3781.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=109.7461;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=61.33;MQ0=0;QD=29.08;SB=-8.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3781,364,0 chrXVI 487322 . C T 3432.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.663e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:128:99:3432,331,0 chrXVI 487504 . T C 3043 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3076,321,0 chrXVI 488115 . A G 3213.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=25.71;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3247,325,0 chrXVI 488130 . G A 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.88;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3072,307,0 chrXVI 488374 . C T 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.047;DP=108;Dels=0.00;FS=4.829;HaplotypeScore=4.8723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1052,0,1200 chrXVI 488493 . A G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.651;DP=89;Dels=0.00;FS=8.553;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.840;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,50:89:99:1079,0,810 chrXVI 488516 . A C 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.161;DP=117;Dels=0.00;FS=28.411;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.464;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1178,0,1259 chrXVI 488578 . G A 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.951;DP=123;Dels=0.00;FS=7.528;HaplotypeScore=9.6821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=7.10;ReadPosRankSum=2.496;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,48:123:99:903,0,1567 chrXVI 488646 . G T 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.505;DP=111;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.239;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1226,0,1246 chrXVI 488655 . A C 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.178;DP=110;Dels=0.00;FS=0.730;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.547;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.078;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1169,0,1279 chrXVI 489145 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.891;DP=134;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=10.10;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1383,0,1446 chrXVI 489307 . T A 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;DP=105;Dels=0.00;FS=1.567;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.402;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1342,0,1049 chrXVI 489538 . T C 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.653;DP=155;Dels=0.00;FS=5.130;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.863;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.131;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,69:155:99:1458,0,2034 chrXVI 489543 . G A 4699.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0463;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=28.14;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:167:99:4699,457,0 chrXVI 489607 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.167;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.679;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.046;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,72:160:99:1507,0,1912 chrXVI 490120 . C T 197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.735;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQ0=0;MQRankSum=-4.379;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.260;SB=-3.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,34:115:99:227,0,1984 chrXVI 490131 . G T 239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;DP=110;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-4.176;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.621;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,36:110:99:269,0,1845 chrXVI 490135 . G A 299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.346;DP=110;Dels=0.00;FS=5.032;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-4.081;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.671;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,37:110:99:329,0,1721 chrXVI 490450 . C T 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.019;DP=113;Dels=0.00;FS=3.486;HaplotypeScore=5.0496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.142;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1375,0,1157 chrXVI 490554 . G A 1910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.157;DP=148;Dels=0.00;FS=2.062;HaplotypeScore=2.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.989;SB=-9.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,83:148:99:1940,0,1358 chrXVI 490756 . G A 1575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.157;DP=124;Dels=0.00;FS=4.332;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=12.70;ReadPosRankSum=-1.746;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,70:124:99:1605,0,1162 chrXVI 490906 . T C 3962.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=26.95;SB=-1.082e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3962,409,0 chrXVI 491068 . C T 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.804;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.957;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1428,0,1093 chrXVI 491113 . G A 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.432;DP=136;Dels=0.00;FS=7.865;HaplotypeScore=7.7713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.508;SB=-5.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,72:136:99:1638,0,1419 chrXVI 491133 . C T 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.055;DP=138;Dels=0.00;FS=6.336;HaplotypeScore=2.7396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.192;SB=-6.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1575,0,1451 chrXVI 491370 . T G 4097.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.98;MQ0=0;QD=26.26;SB=-2.038e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4097,400,0 chrXVI 491388 . G A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.299;DP=136;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=1.5572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.183;SB=-6.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1456,0,1512 chrXVI 491959 . T C 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.774;DP=140;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=2.3770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.037;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,68:140:99:1327,0,1685 chrXVI 492242 . G A 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.482;DP=97;Dels=0.00;FS=1.686;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.540;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:894,0,1190 chrXVI 492354 . C T 811.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.496;DP=90;Dels=0.00;FS=0.887;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-2.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:841,0,934 chrXVI 493097 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.414;DP=144;Dels=0.00;FS=2.157;HaplotypeScore=8.9475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=2.639;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.868;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1529,0,1567 chrXVI 493194 . G T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.293;DP=130;Dels=0.00;FS=2.290;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.711;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1426,0,1471 chrXVI 493279 . A G 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=138;Dels=0.00;FS=2.226;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.26;ReadPosRankSum=2.103;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1446,0,1709 chrXVI 493408 . T C 799.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.858;DP=89;Dels=0.00;FS=2.861;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:829,0,1142 chrXVI 493521 . A G 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.205;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1149,0,1439 chrXVI 493986 . T C 1421.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.229;DP=139;Dels=0.00;FS=3.024;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1451,0,1669 chrXVI 494184 . G C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.654;DP=129;Dels=0.00;FS=1.394;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.379;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1286,0,1375 chrXVI 494210 . C T 1423.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.042;DP=137;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.360;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1453,0,1516 chrXVI 494455 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.725;DP=125;Dels=0.00;FS=4.342;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=0.941;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.800;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,56:125:99:1198,0,1518 chrXVI 494742 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.228;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.368;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1242,0,1401 chrXVI 494922 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.285;DP=144;Dels=0.00;FS=3.115;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1452,0,1688 chrXVI 495156 . A G 1418.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.479;DP=135;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=1.9705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.984;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1448,0,1461 chrXVI 495265 . A G 3821.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.97;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:3821,385,0 chrXVI 495832 . G A 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.038;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1089,0,1365 chrXVI 496180 . G A 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.759;DP=127;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.624;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1401,0,1292 chrXVI 496405 . T C 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.603;DP=125;Dels=0.00;FS=4.353;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.228;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1421,0,1389 chrXVI 496459 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.919;DP=134;Dels=0.00;FS=6.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,62:134:99:1303,0,1750 chrXVI 496486 . A G 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.604;DP=135;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,75:135:99:1730,0,1363 chrXVI 496633 . T C 2319 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=25.48;SB=-1.018e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:2352,249,0 chrXVI 496734 . A G 765.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.102;DP=109;Dels=0.00;FS=11.363;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.193;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,46:109:99:795,0,1462 chrXVI 496807 . G A 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.271;DP=146;Dels=0.00;FS=4.775;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.426;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,59:146:99:1227,0,1810 chrXVI 497024 . G A 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;DP=106;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=2.7476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=1;MQRankSum=-0.052;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.693;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:106:99:987,0,1219 chrXVI 497140 . T C 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.701;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.509;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1350,0,1282 chrXVI 497425 . C T 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.311e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3302,328,0 chrXVI 497707 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.472;DP=130;Dels=0.00;FS=3.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.766;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1384,0,1477 chrXVI 497758 . T C 1757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.466;DP=157;Dels=0.00;FS=12.542;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.266;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,85:157:99:1787,0,1620 chrXVI 498269 . C T 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.191;DP=120;Dels=0.00;FS=4.410;HaplotypeScore=2.7591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.874;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1497,0,1080 chrXVI 498386 . A G 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.781;DP=138;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.522;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1365,0,1568 chrXVI 498437 . A G 3765.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.51;SB=-1.908e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3765,376,0 chrXVI 498617 . T C 3783.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=27.22;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:139:99:3783,385,0 chrXVI 498689 . C T 897.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.674;DP=111;Dels=0.00;FS=7.878;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,43:111:99:927,0,1515 chrXVI 498788 . A G 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.608;DP=141;Dels=0.00;FS=5.132;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,79:141:99:1671,0,1394 chrXVI 499073 . G A 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.203;DP=170;Dels=0.00;FS=8.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=9.98;ReadPosRankSum=-2.492;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,84:170:99:1727,0,1755 chrXVI 499315 . G A 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.71;SB=-1.519e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3081,298,0 chrXVI 499388 . G A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.857;DP=117;Dels=0.00;FS=10.622;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.247;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,45:117:99:967,0,1612 chrXVI 499635 . C T 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.133;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.143;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,54:135:99:1108,0,1782 chrXVI 499664 . A G 749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.155;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQ0=0;MQRankSum=-4.116;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.176;SB=-3.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,45:130:99:779,0,2043 chrXVI 499678 . A G 766.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.263;DP=137;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=31.3798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.24;MQ0=0;MQRankSum=-6.221;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.194;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,50:137:99:796,0,2091 chrXVI 499684 . G A 625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.394;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=57.4994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.52;MQ0=0;MQRankSum=-7.920;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.785;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:655,0,1569 chrXVI 499739 . A G 328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.411;DP=123;Dels=0.00;FS=4.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.84;MQ0=0;MQRankSum=-5.596;QD=2.67;ReadPosRankSum=-2.530;SB=-3.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,58:123:99:358,0,1591 chrXVI 499915 . T C 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.749;DP=105;Dels=0.00;FS=1.731;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=7.44;ReadPosRankSum=-2.131;SB=-2.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,41:105:99:811,0,1544 chrXVI 500000 . G A 1624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.265;DP=144;Dels=0.00;FS=2.550;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.279;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.302;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1654,0,1451 chrXVI 500007 . G A 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.989;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.332;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.291;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1598,0,1422 chrXVI 500189 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.513;DP=126;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.881;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1176,0,1636 chrXVI 500244 . C T 881.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.786;DP=116;Dels=0.00;FS=0.700;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.018;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,51:116:99:911,0,1488 chrXVI 500345 . T A 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;DP=104;Dels=0.00;FS=2.664;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.731;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1207,0,1191 chrXVI 500351 . C T 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.579;DP=109;Dels=0.00;FS=4.925;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.445;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1287,0,1180 chrXVI 500426 . C G 3518.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=25.31;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3518,355,0 chrXVI 500683 . C T 4591.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=29.62;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:4591,448,0 chrXVI 500726 . A C 5335.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=26.94;SB=-2.011e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:5335,544,0 chrXVI 500964 . G T 1783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.610;DP=162;Dels=0.00;FS=7.287;HaplotypeScore=1.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.485;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.718;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,85:162:99:1813,0,1697 chrXVI 500975 . G C 1641.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;DP=160;Dels=0.00;FS=4.996;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.956;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,81:160:99:1671,0,1695 chrXVI 500988 . T C 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.408;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.928;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1509,0,1732 chrXVI 501187 . A G 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.988;DP=155;Dels=0.00;FS=1.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.197;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,77:155:99:1639,0,1650 chrXVI 501255 . A G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.778;DP=151;Dels=0.00;FS=2.166;HaplotypeScore=4.3929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.955;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:151:99:1514,0,1551 chrXVI 501323 . T A 4483.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=26.68;SB=-2.220e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4483,433,0 chrXVI 501461 . G C 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;DP=168;Dels=0.00;FS=1.211;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,75:168:99:1506,0,2062 chrXVI 501575 . G A 1609.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.371;DP=177;Dels=0.00;FS=8.844;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-7.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,78:177:99:1639,0,2065 chrXVI 501709 . G C 4675.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=26.87;SB=-2.059e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:174:99:4675,451,0 chrXVI 501909 . G A 1830.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.885;DP=160;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.998;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,80:160:99:1860,0,1667 chrXVI 502052 . G A 3929.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.199e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3929,385,0 chrXVI 502088 . C A 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.430;DP=146;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.084;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:146:99:1547,0,1608 chrXVI 502118 . T C 1596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.673;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.887;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,75:150:99:1626,0,1608 chrXVI 502255 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.360;DP=125;Dels=0.00;FS=3.405;HaplotypeScore=2.8868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.699;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1178,0,1642 chrXVI 502502 . T C 1137.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.480;DP=149;Dels=0.00;FS=3.902;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.129;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:1167,0,2083 chrXVI 502697 . G A 522 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.04;MQ0=0;QD=4.24;SB=-1.725e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:57:555,57,0 chrXVI 502739 . T G 339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.043;DP=89;Dels=0.00;FS=1.313;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-9.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,45:89:99:369,0,496 chrXVI 503041 . A T 1784.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;DP=174;Dels=0.00;FS=2.923;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=3.138;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.918;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,87:174:99:1814,0,1770 chrXVI 503157 . C G 4473.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.61;MQ0=1;QD=25.13;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:178:99:4473,477,0 chrXVI 503305 . A C 1318.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.539;DP=139;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.874;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1348,0,1629 chrXVI 503313 . A G 1257.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.288;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.549;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,75:151:99:1287,0,1735 chrXVI 503314 . A G 3532.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=23.86;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:148:99:3532,366,0 chrXVI 503433 . A C 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;DP=154;Dels=0.00;FS=6.952;HaplotypeScore=12.8694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.750;SB=-1.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:880,0,1187 chrXVI 503488 . C A 2457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.746;DP=187;Dels=0.00;FS=5.078;HaplotypeScore=3.4308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=13.14;ReadPosRankSum=1.106;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,102:187:99:2487,0,1883 chrXVI 503888 . T C 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.194;DP=155;Dels=0.00;FS=3.754;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=1;MQRankSum=0.503;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.695;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,74:155:99:1571,0,1714 chrXVI 504262 . G A 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.452;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.780;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1255,0,1508 chrXVI 504666 . G A 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.106;DP=133;Dels=0.00;FS=5.453;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.277;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,79:133:99:1850,0,1029 chrXVI 505053 . C T 1742.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.318;DP=140;Dels=0.00;FS=6.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=1;MQRankSum=1.098;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:1772,0,1276 chrXVI 505150 . G A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.879;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.702;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1438,0,1510 chrXVI 505245 . C T 1885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.462;DP=153;Dels=0.00;FS=5.981;HaplotypeScore=2.4993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.419;SB=-9.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1915,0,1432 chrXVI 505698 . C G 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.582;DP=131;Dels=0.00;FS=1.523;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.238;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:1379,0,1287 chrXVI 505721 . A G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.391;DP=120;Dels=0.00;FS=3.266;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.378;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1176,0,1306 chrXVI 505749 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.418;DP=110;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=2.4696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=10.51;ReadPosRankSum=-2.542;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:110:99:1186,0,1096 chrXVI 505836 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.181;DP=117;Dels=0.00;FS=1.595;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.639;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,73:117:99:1612,0,888 chrXVI 505893 . G A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.275;DP=124;Dels=0.00;FS=1.439;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.080;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:1533,0,1204 chrXVI 506058 . T G 3801.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.552e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3801,394,0 chrXVI 506129 . T C 4119.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.970e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4119,409,0 chrXVI 506265 . C A 2125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.978;DP=150;Dels=0.00;FS=2.173;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.141;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,92:150:99:2155,0,1102 chrXVI 506274 . A C 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.201;DP=151;Dels=0.00;FS=2.181;HaplotypeScore=1.8245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.353;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,92:151:99:1918,0,1227 chrXVI 506349 . G T 1851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.532;DP=167;Dels=0.00;FS=1.980;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.738;SB=-8.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,84:167:99:1881,0,1703 chrXVI 506369 . T C 1574.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.701;DP=156;Dels=0.00;FS=0.593;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.791;SB=-7.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1604,0,1842 chrXVI 506806 . C T 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.280;DP=183;Dels=0.00;FS=7.425;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,91:183:99:1865,0,2023 chrXVI 507005 . A G 1128.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.747;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.455;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.838;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1158,0,1456 chrXVI 507023 . A G 1103.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.725;DP=133;Dels=0.00;FS=2.246;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.301;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.851;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1133,0,1742 chrXVI 507026 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.648;DP=133;Dels=0.00;FS=3.179;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.255;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1166,0,1681 chrXVI 507047 . A C 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.229;DP=139;Dels=0.00;FS=4.063;HaplotypeScore=2.9336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.904;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:139:99:1339,0,1672 chrXVI 507169 . A G 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.13;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.723e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3258,337,0 chrXVI 507201 . A G 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.951;DP=129;Dels=0.00;FS=5.861;HaplotypeScore=2.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.893;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,66:129:99:1514,0,1434 chrXVI 507218 . C A 3387.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.32;MQ0=0;QD=28.46;SB=-9.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3387,343,0 chrXVI 507220 . A G 1237.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.719;DP=122;Dels=0.00;FS=1.626;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.037;SB=-3.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1267,0,1435 chrXVI 507225 . A G 3610.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.11;MQ0=0;QD=27.56;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3610,370,0 chrXVI 507248 . A C 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.437;DP=132;Dels=0.00;FS=2.366;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.172;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,57:131:99:1095,0,1733 chrXVI 507296 . T C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.562;DP=126;Dels=0.00;FS=11.221;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.42;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=9.78;ReadPosRankSum=3.570;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1262,0,1414 chrXVI 507326 . C T 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.165;DP=134;Dels=0.00;FS=17.354;HaplotypeScore=3.8135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.202;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1481,0,1289 chrXVI 507350 . A G 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.422;DP=124;Dels=0.00;FS=16.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.282;SB=-2.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1155,0,1564 chrXVI 507401 . G C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;DP=125;Dels=0.00;FS=5.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=1.740;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.463;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1364,0,1160 chrXVI 507608 . A G 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.407;DP=113;Dels=0.00;FS=11.383;HaplotypeScore=5.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.579;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,64:113:99:1312,0,1048 chrXVI 507635 . T C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;DP=92;Dels=0.00;FS=2.769;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:1057,0,999 chrXVI 507830 . G C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;DP=102;Dels=0.00;FS=11.045;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.487;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,53:102:99:1144,0,1014 chrXVI 507854 . A G 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.623;DP=105;Dels=0.00;FS=6.225;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1303,0,1026 chrXVI 507917 . G A 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;DP=105;Dels=0.00;FS=1.601;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.338;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1178,0,1097 chrXVI 508199 . C T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.907;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=2.398;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.986;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1269,0,1545 chrXVI 508243 . A G 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.209;DP=118;Dels=0.00;FS=1.645;HaplotypeScore=4.6571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.781;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1347,0,1310 chrXVI 508553 . C T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.409;DP=113;Dels=0.00;FS=0.764;HaplotypeScore=5.8026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.681;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:113:99:1192,0,1245 chrXVI 508697 . C T 3419.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.700e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3419,340,0 chrXVI 508709 . G A 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.695e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3404,334,0 chrXVI 508790 . C A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.455;DP=129;Dels=0.00;FS=1.415;HaplotypeScore=1.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.612;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,55:129:99:1150,0,1731 chrXVI 508976 . G A 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=28.85;SB=-1.341e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3549,346,0 chrXVI 509014 . A G 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.515;DP=124;Dels=0.00;FS=1.541;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.605;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1239,0,1545 chrXVI 509084 . G A 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.638;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.976;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,62:113:99:1319,0,1079 chrXVI 509591 . C T 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.213;DP=129;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=-0.496;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.682;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1490,0,1347 chrXVI 509606 . A G 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.844;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=1;MQRankSum=-0.164;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.347;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1521,0,1498 chrXVI 509658 . G A 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.052;DP=173;Dels=0.00;FS=4.456;HaplotypeScore=5.8033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=2.247;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.578;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,74:173:99:1505,0,2158 chrXVI 509810 . T C 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.535;DP=110;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=4.8452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.631;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1071,0,1369 chrXVI 509832 . C T 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.844;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.953;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:896,0,1192 chrXVI 509846 . A G 814.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.964;DP=87;Dels=0.00;FS=0.866;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=9.36;ReadPosRankSum=-2.178;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:87:99:844,0,1011 chrXVI 510020 . A G 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.473;DP=138;Dels=0.00;FS=9.075;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.100;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1386,0,1636 chrXVI 510238 . A G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.962;DP=111;Dels=0.00;FS=1.521;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.593;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1089,0,1343 chrXVI 510285 . G T 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.798;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.360;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,48:103:99:1075,0,1154 chrXVI 510291 . A G 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.912;DP=108;Dels=0.00;FS=1.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.043;SB=-2.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1042,0,1319 chrXVI 510338 . G T 1055.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.693;DP=90;Dels=0.00;FS=1.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.283;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,50:90:99:1085,0,868 chrXVI 510355 . A G 657.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.257;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.504;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,35:93:99:687,0,1294 chrXVI 510403 . A G 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.852;DP=103;Dels=0.00;FS=1.735;HaplotypeScore=2.7736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.248;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,39:103:99:753,0,1561 chrXVI 510469 . A T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;DP=130;Dels=0.00;FS=3.241;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.681;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1223,0,1716 chrXVI 510522 . T C 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.324;DP=124;Dels=0.00;FS=5.526;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.929;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1271,0,1471 chrXVI 510564 . T A 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.870;DP=103;Dels=0.00;FS=6.329;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.113;SB=-3.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,49:103:99:1099,0,1196 chrXVI 510580 . T C 2631 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.53;MQ0=0;QD=26.31;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2664,273,0 chrXVI 510650 . C T 3114 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=11.8096;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.458e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3147,301,0 chrXVI 510652 . T C 1073.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.592;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.496;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1103,0,1427 chrXVI 510663 . G A 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.150;DP=115;Dels=0.00;FS=0.710;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.126;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:953,0,1455 chrXVI 510713 . A T 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;DP=86;Dels=0.00;FS=0.861;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.242;SB=-2.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,40:86:99:835,0,1076 chrXVI 510773 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.666;DP=115;Dels=0.00;FS=8.593;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.816;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1324,0,1098 chrXVI 510816 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.193;DP=94;Dels=0.00;FS=3.896;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.108;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,51:94:99:1173,0,929 chrXVI 510863 . C T 1619.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.669;DP=126;Dels=0.00;FS=10.270;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.611;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,75:126:99:1649,0,1057 chrXVI 510900 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.209;DP=119;Dels=0.00;FS=7.200;HaplotypeScore=1.9612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.493;SB=-7.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,69:119:99:1401,0,1111 chrXVI 510985 . A G 3475.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.33;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3475,346,0 chrXVI 511038 . C T 1672.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.037;DP=147;Dels=0.00;FS=0.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=11.37;ReadPosRankSum=2.208;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1702,0,1496 chrXVI 511076 . A G 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.565;DP=124;Dels=0.00;FS=8.383;HaplotypeScore=2.5093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.884;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,52:124:99:1107,0,1716 chrXVI 511406 . A G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;DP=121;Dels=0.00;FS=3.320;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1217,0,1319 chrXVI 511425 . T A 1390.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;DP=117;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-6.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1420,0,1149 chrXVI 511469 . A T 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.41;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.609e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2995,282,0 chrXVI 511583 . T C 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.340;DP=111;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.068;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1175,0,1289 chrXVI 511623 . T A 1096.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;DP=115;Dels=0.00;FS=2.501;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.210;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1126,0,1341 chrXVI 511625 . C T 1084.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.746;DP=115;Dels=0.00;FS=1.549;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.266;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1114,0,1251 chrXVI 511628 . T G 963.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.101;DP=111;Dels=0.00;FS=1.558;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.357;SB=-4.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:993,0,1308 chrXVI 511707 . C G 2212 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.12;MQ0=0;QD=26.02;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2245,231,0 chrXVI 511744 . T A 960.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.498;DP=90;Dels=0.00;FS=1.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.012;SB=-3.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:990,0,1012 chrXVI 511751 . A C 895.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.881;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.270;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.480;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:925,0,1111 chrXVI 511752 . A C 897.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.157;DP=97;Dels=0.00;FS=0.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.909;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.126;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:927,0,1118 chrXVI 511769 . T A 1031.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;DP=101;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.391;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1061,0,1088 chrXVI 511809 . A T 594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.985;DP=74;Dels=0.00;FS=2.143;HaplotypeScore=3.2489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.406;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.173;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:624,0,874 chrXVI 511842 . C A 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.539;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.496;SB=-2.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:884,0,1215 chrXVI 511946 . G A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.640;DP=143;Dels=0.00;FS=1.325;HaplotypeScore=4.2457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.278;SB=-6.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1462,0,1553 chrXVI 511983 . T A 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;DP=133;Dels=0.00;FS=0.762;HaplotypeScore=3.8990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.990;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1619,0,1485 chrXVI 512028 . C T 3677.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4507;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.65;SB=-1.063e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3677,352,0 chrXVI 512102 . T A 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.171;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1289,0,1343 chrXVI 512105 . C T 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.850;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1285,0,1191 chrXVI 512148 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.112;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.355;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1050,0,1190 chrXVI 512149 . G A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.673;DP=99;Dels=0.00;FS=0.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.444;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1118,0,1058 chrXVI 512216 . A C 3275.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3275,319,0 chrXVI 512235 . T C 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.624;DP=106;Dels=0.00;FS=3.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.849;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,52:106:99:1152,0,1270 chrXVI 512517 . C T 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.919;DP=133;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=1.9248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.380;SB=-7.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,66:133:99:1538,0,1446 chrXVI 512556 . A G 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.470;DP=129;Dels=0.00;FS=2.298;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,70:129:99:1541,0,1359 chrXVI 512760 . T C 2550 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=25.50;SB=-8.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2583,279,0 chrXVI 512940 . G A 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.462;DP=123;Dels=0.00;FS=6.716;HaplotypeScore=3.8793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.722;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.247;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1339,0,1344 chrXVI 513013 . T C 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.486;DP=117;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.910;SB=-6.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1338,0,1180 chrXVI 513417 . G A 1467.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.279;DP=128;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.822;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1497,0,1308 chrXVI 513619 . G A 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.772;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.087;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:1340,0,1072 chrXVI 513702 . A C 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;DP=131;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.495;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1412,0,1359 chrXVI 513862 . T C 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.043;DP=128;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.251;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1434,0,1337 chrXVI 514290 . T A 2732 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4608;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2765,273,0 chrXVI 514323 . C A 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.155;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.781;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,60:108:99:1287,0,969 chrXVI 514359 . A G 1237.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.358;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.466;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,58:105:99:1267,0,1101 chrXVI 514415 . G A 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.435;DP=133;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.042;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1554,0,1403 chrXVI 514428 . T C 1175.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.486;DP=125;Dels=0.00;FS=1.471;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.876;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,63:125:99:1205,0,1470 chrXVI 514493 . T C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.470;DP=148;Dels=0.00;FS=0.620;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.902;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,68:148:99:1465,0,1797 chrXVI 514583 . A G 1061.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.944;DP=93;Dels=0.00;FS=5.309;HaplotypeScore=2.8684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.735;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:1091,0,955 chrXVI 514990 . G A 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.265;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.863;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,53:100:99:1212,0,888 chrXVI 515057 . T C 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.050;DP=132;Dels=0.00;FS=1.467;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.998;SB=-4.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1326,0,1640 chrXVI 515122 . A G 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.143;DP=86;Dels=0.00;FS=4.270;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.506;SB=-3.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,46:86:99:980,0,868 chrXVI 515138 . A G 2256 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=25.64;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2289,246,0 chrXVI 515185 . C T 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.288;DP=116;Dels=0.00;FS=8.668;HaplotypeScore=3.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.276;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1324,0,1119 chrXVI 515189 . G A 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.419;DP=116;Dels=0.00;FS=8.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=-3.317;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.039;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:1322,0,1171 chrXVI 515196 . T C 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.621;DP=128;Dels=0.00;FS=5.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQ0=0;MQRankSum=-3.108;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.786;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1324,0,1449 chrXVI 515221 . C T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.473;DP=131;Dels=0.00;FS=4.246;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=3.096;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.840;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1421,0,1445 chrXVI 515243 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.730;DP=123;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.742;SB=-6.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1134,0,1431 chrXVI 515276 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;DP=108;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.216;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,64:108:99:1378,0,922 chrXVI 515495 . C G 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;DP=122;Dels=0.00;FS=4.578;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.972;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1157,0,1409 chrXVI 516047 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.382;DP=129;Dels=0.00;FS=1.463;HaplotypeScore=2.5326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=1.846;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.360;SB=-4.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,58:129:99:1207,0,1721 chrXVI 516356 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.970;DP=107;Dels=0.00;FS=9.092;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.490;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1094,0,1259 chrXVI 516710 . T C 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.850;DP=127;Dels=0.00;FS=1.429;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.040;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,70:127:99:1570,0,1242 chrXVI 516780 . T C 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.933;DP=131;Dels=0.00;FS=4.157;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.904;QD=8.79;ReadPosRankSum=-2.378;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1181,0,1461 chrXVI 516862 . C T 1595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.985;DP=145;Dels=0.00;FS=3.975;HaplotypeScore=2.8731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=11.00;ReadPosRankSum=-1.659;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1625,0,1634 chrXVI 516903 . C T 1576.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.211;DP=149;Dels=0.00;FS=9.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1606,0,1736 chrXVI 517099 . C G 3951.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=25.66;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:154:99:3951,400,0 chrXVI 517188 . C T 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.950;DP=139;Dels=0.00;FS=1.353;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.807;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1396,0,1408 chrXVI 517281 . T C 3278.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=25.41;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3278,342,0 chrXVI 517540 . A G 4281.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=27.27;SB=-2.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4281,430,0 chrXVI 517615 . G T 4245.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=29.28;SB=-1.122e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4245,415,0 chrXVI 517688 . C T 1655.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.189;DP=156;Dels=0.00;FS=4.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.278;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1685,0,1548 chrXVI 517746 . A G 3361.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5848;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.702e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3361,354,0 chrXVI 517881 . G A 1238.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.938;DP=144;Dels=0.00;FS=3.141;HaplotypeScore=14.1193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.160;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,60:144:99:1268,0,1742 chrXVI 517980 . C T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.544;DP=125;Dels=0.00;FS=4.299;HaplotypeScore=3.8698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=11.98;ReadPosRankSum=2.116;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,64:125:99:1528,0,1326 chrXVI 518014 . C G 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;DP=131;Dels=0.00;FS=3.141;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.570;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1445,0,1227 chrXVI 518057 . A T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;DP=144;Dels=0.00;FS=4.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.334;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1499,0,1607 chrXVI 518479 . A G 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.310;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=10.04;ReadPosRankSum=2.069;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1376,0,1555 chrXVI 518518 . A G 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.676;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1251,0,1199 chrXVI 518836 . A G 3098 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.34;MQ0=0;QD=25.82;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3131,307,0 chrXVI 518986 . C T 1409.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.399;DP=147;Dels=0.00;FS=3.087;HaplotypeScore=2.8668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.816;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,70:147:99:1439,0,1748 chrXVI 518997 . G A 1450.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.300;DP=145;Dels=0.00;FS=6.357;HaplotypeScore=2.8604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:145:99:1480,0,1564 chrXVI 519038 . C T 1015.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.049;DP=121;Dels=0.00;FS=2.324;HaplotypeScore=3.1946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.690;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,51:121:99:1045,0,1486 chrXVI 519322 . A G 4529.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.64;SB=-2.309e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:4529,451,0 chrXVI 519355 . G A 1572.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.899;DP=153;Dels=0.00;FS=0.607;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=10.27;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-7.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1602,0,1671 chrXVI 519435 . T C 1532.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.791;DP=162;Dels=0.00;FS=0.581;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.623;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,81:162:99:1562,0,1773 chrXVI 519721 . T C 1669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.999;DP=155;Dels=0.00;FS=6.989;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.187;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,80:155:99:1699,0,1689 chrXVI 519727 . A G 1631.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.069;DP=149;Dels=0.00;FS=4.852;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.569;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,79:149:99:1661,0,1509 chrXVI 519754 . G T 1489.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.611;DP=128;Dels=0.00;FS=3.247;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.426;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1519,0,1254 chrXVI 519953 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.544;DP=157;Dels=0.00;FS=2.911;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.571;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,69:157:99:1393,0,1957 chrXVI 520069 . G A 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.022;DP=117;Dels=0.00;FS=3.367;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.462;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1313,0,1048 chrXVI 520114 . G A 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.275;DP=153;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=1;MQRankSum=-0.656;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,75:153:99:1700,0,1555 chrXVI 520118 . G A 1508.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.440;DP=140;Dels=0.00;FS=2.199;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=1;MQRankSum=-0.971;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:140:99:1538,0,1384 chrXVI 520138 . T C 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.998;DP=136;Dels=0.00;FS=1.427;HaplotypeScore=4.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=1;MQRankSum=1.064;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:136:99:1403,0,1362 chrXVI 520162 . A C 1252.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.169;DP=125;Dels=0.00;FS=2.343;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=1;MQRankSum=0.812;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.291;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1282,0,1263 chrXVI 520194 . A T 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.864;DP=126;Dels=0.00;FS=4.206;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1341,0,1392 chrXVI 520226 . C T 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.493;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.206;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1071,0,1356 chrXVI 520400 . T C 2534 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.277e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2567,264,0 chrXVI 520404 . G A 2633 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.443e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:2666,262,0 chrXVI 520428 . A G 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.887;DP=107;Dels=0.00;FS=3.588;HaplotypeScore=4.7691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.890;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,61:107:99:1236,0,939 chrXVI 520764 . G A 2452 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.153e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2485,235,0 chrXVI 520832 . T C 2200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.12;MQ0=0;QD=27.50;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2233,225,0 chrXVI 521048 . A C 135.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.546;DP=67;Dels=0.00;FS=3.092;HaplotypeScore=77.3828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.226;QD=2.02;ReadPosRankSum=-4.027;SB=-6.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:165,0,398 chrXVI 521051 . A C 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.415;DP=74;Dels=0.00;FS=10.196;HaplotypeScore=42.5070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.313;QD=0.49;ReadPosRankSum=-2.904;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:66:66,0,614 chrXVI 521057 . C A 13.22 LowQual;SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.365;DP=72;Dels=0.00;FS=9.187;HaplotypeScore=25.7953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.568;QD=0.18;ReadPosRankSum=3.450;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:43:43,0,751 chrXVI 521292 . T C 3146 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.28;MQ0=0;QD=26.89;SB=-1.272e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3179,315,0 chrXVI 521328 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.360;DP=98;Dels=0.00;FS=8.102;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,54:98:99:1273,0,861 chrXVI 521580 . T C 1601.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.610;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.388;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:1631,0,984 chrXVI 521626 . C A 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.150;DP=119;Dels=0.00;FS=2.335;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.063;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,55:119:99:1187,0,1452 chrXVI 521737 . A G 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.281;DP=131;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=3.5264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.068;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,61:131:99:1288,0,1574 chrXVI 521945 . C G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.512e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3302,333,0 chrXVI 522033 . G A 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.342;DP=130;Dels=0.00;FS=3.169;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.040;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,62:130:99:1298,0,1551 chrXVI 522075 . A G 59.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.652;DP=140;Dels=0.00;FS=20.590;HaplotypeScore=129.7979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.16;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=0.42;ReadPosRankSum=-3.278;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,22:140:89:89,0,2144 chrXVI 522429 . C T 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.068;DP=124;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.143;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1457,0,1283 chrXVI 522564 . G A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.681;DP=138;Dels=0.00;FS=8.195;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.885;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,64:138:99:1347,0,1716 chrXVI 522654 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.508;DP=118;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.526;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1207,0,1235 chrXVI 523095 . A C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.044;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.2511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.682;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,67:160:99:1294,0,2171 chrXVI 523110 . G A 1797.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.469;DP=155;Dels=0.00;FS=2.872;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.310;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,82:155:99:1827,0,1505 chrXVI 523158 . A G 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.701;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.864;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1551,0,1501 chrXVI 523243 . A G 1305.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.968;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,62:129:99:1335,0,1557 chrXVI 523433 . C G 4192.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.41;SB=-2.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:4192,412,0 chrXVI 523446 . G A 3793.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=27.49;SB=-1.935e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3793,367,0 chrXVI 523482 . A G 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.577;DP=132;Dels=0.00;FS=5.628;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.102;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1416,0,1418 chrXVI 523494 . A G 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.143;DP=133;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=2.618;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.612;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1291,0,1550 chrXVI 523583 . C T 3844.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.738e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3844,379,0 chrXVI 523689 . G A 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.181;DP=111;Dels=0.00;FS=6.066;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.221;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:111:99:1246,0,1186 chrXVI 523692 . T C 2767 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.39;SB=-1.279e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2800,291,0 chrXVI 523749 . T C 2659 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=27.13;SB=-9.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2692,273,0 chrXVI 524127 . C T 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.974;DP=121;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.436;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,49:121:99:967,0,1559 chrXVI 524220 . C T 847.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.853;DP=115;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=3.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.294;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,47:115:99:877,0,1550 chrXVI 524507 . G A 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.342;DP=115;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=4.3233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=2;MQRankSum=-0.674;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.960;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,71:115:99:1728,0,766 chrXVI 524743 . T C 933.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.647;DP=128;Dels=0.00;FS=6.615;HaplotypeScore=2.8558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.142;SB=-8.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,49:128:99:963,0,1887 chrXVI 524894 . A C 577.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.069;DP=79;Dels=0.00;FS=6.219;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=7.30;ReadPosRankSum=-2.023;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:607,0,1213 chrXVI 524953 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.269;DP=135;Dels=0.00;FS=3.076;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.504;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1383,0,1588 chrXVI 525166 . T A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.933;DP=134;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=6.6383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.624;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1464,0,1387 chrXVI 525272 . A G 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.240;DP=143;Dels=0.00;FS=7.749;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.465;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,59:143:99:1173,0,1846 chrXVI 525308 . G T 1248.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.301;DP=135;Dels=0.00;FS=9.170;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.517;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1278,0,1596 chrXVI 525339 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.962;DP=122;Dels=0.00;FS=10.280;HaplotypeScore=2.9348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.523;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1238,0,1443 chrXVI 525445 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.732;DP=124;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=2.5964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-4.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,52:124:99:1094,0,1555 chrXVI 525509 . G A 727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.084;DP=104;Dels=0.00;FS=6.503;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-2.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,38:104:99:757,0,1388 chrXVI 525725 . T G 496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.046;DP=127;Dels=0.00;FS=11.929;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.753;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.828;SB=-1.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:526,0,1939 chrXVI 525874 . C T 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.987;DP=138;Dels=0.00;FS=3.104;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQ0=1;MQRankSum=-1.605;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,62:138:99:1288,0,1709 chrXVI 526107 . C T 1310.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.604;DP=124;Dels=0.00;FS=9.885;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.301;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:124:99:1340,0,1354 chrXVI 526115 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.038;DP=133;Dels=0.00;FS=6.474;HaplotypeScore=4.9436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.484;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1356,0,1436 chrXVI 526176 . T C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.976;DP=128;Dels=0.00;FS=5.416;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.884;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1177,0,1595 chrXVI 526257 . T C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.967;DP=118;Dels=0.00;FS=2.519;HaplotypeScore=3.3962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.733;SB=-3.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1176,0,1344 chrXVI 526381 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.376;DP=123;Dels=0.00;FS=4.400;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.348;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1362,0,1189 chrXVI 526602 . A G 1460.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.937;DP=160;Dels=0.00;FS=2.813;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.801;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,79:160:99:1490,0,1749 chrXVI 526767 . A G 3771.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=24.81;SB=-1.824e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:152:99:3771,387,0 chrXVI 527231 . G A 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.878;DP=138;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.184;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1598,0,1415 chrXVI 527307 . T C 3676.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=26.64;SB=-1.440e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3676,367,0 chrXVI 528025 . C G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;DP=132;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=10.41;ReadPosRankSum=-2.440;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1404,0,1260 chrXVI 528593 . T C 3877.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.425e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3877,391,0 chrXVI 529663 . G A 2725 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2758,268,0 chrXVI 529749 . T C 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.604;DP=128;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.272;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1515,0,1354 chrXVI 529905 . T A 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.904;DP=135;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.439;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1709,0,1299 chrXVI 530286 . A G 3752.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=26.61;SB=-1.545e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3752,376,0 chrXVI 530370 . A G 4138.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=26.53;SB=-2.192e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:4138,397,0 chrXVI 530438 . G A 1735.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.953;DP=166;Dels=0.00;FS=3.177;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.029;SB=-4.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,77:166:99:1765,0,1918 chrXVI 530472 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.703;DP=133;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.691;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.722;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,69:133:99:1585,0,1358 chrXVI 530487 . G A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.207;DP=131;Dels=0.00;FS=7.923;HaplotypeScore=3.8476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.569;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,69:131:99:1616,0,1349 chrXVI 530576 . A G 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.224;DP=144;Dels=0.00;FS=7.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=10.52;ReadPosRankSum=2.523;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,76:144:99:1545,0,1527 chrXVI 530645 . A T 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.336;DP=148;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=4.4208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.247;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1663,0,1626 chrXVI 530697 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.227;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.610;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1298,0,1428 chrXVI 530807 . G C 4141.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.993e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4141,415,0 chrXVI 531193 . A G 3746.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.973e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:3746,376,0 chrXVI 531384 . G A 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.125;DP=124;Dels=0.00;FS=7.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.459;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,56:124:99:1242,0,1460 chrXVI 531420 . T C 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.920;DP=144;Dels=0.00;FS=1.435;HaplotypeScore=2.6616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=10.40;ReadPosRankSum=1.493;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1528,0,1634 chrXVI 531431 . G A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.163;DP=128;Dels=0.00;FS=1.535;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.515;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,67:128:99:1468,0,1263 chrXVI 531585 . G C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;DP=110;Dels=0.00;FS=3.664;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.544;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,68:110:99:1466,0,917 chrXVI 531957 . G A 3543.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=28.12;SB=-1.039e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3543,346,0 chrXVI 532319 . T C 3081 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.05;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3114,310,0 chrXVI 532338 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.942;DP=136;Dels=0.00;FS=6.517;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.043;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.958;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,71:136:99:1183,0,1554 chrXVI 533085 . G T 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.619;DP=150;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.266;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1720,0,1474 chrXVI 533286 . A C 3188 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.35;SB=-1.565e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3221,321,0 chrXVI 533457 . T G 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.101;DP=93;Dels=0.00;FS=3.277;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.114;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,44:93:99:905,0,1095 chrXVI 533561 . G A 3340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=25.89;SB=-1.852e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3340,319,0 chrXVI 533565 . G A 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.21;SB=-1.848e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3378,328,0 chrXVI 533798 . C A 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.093;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:108:99:1464,0,946 chrXVI 533807 . A G 1332.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.253;DP=115;Dels=0.00;FS=3.514;HaplotypeScore=2.5555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.171;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:1362,0,1149 chrXVI 533888 . T G 3302.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.665e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3302,328,0 chrXVI 534038 . G A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.535;DP=133;Dels=0.00;FS=5.247;HaplotypeScore=6.9560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.371;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:133:99:1238,0,1560 chrXVI 534427 . A C 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=25.46;SB=-1.651e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3265,333,0 chrXVI 534572 . C T 3440.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.85;MQ0=0;QD=27.97;SB=-1.657e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3440,334,0 chrXVI 534574 . A G 3308.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.92;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3308,334,0 chrXVI 534581 . T C 3444.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.18;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.602e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3444,354,0 chrXVI 534748 . A T 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;DP=141;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=2.3294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1524,0,1604 chrXVI 534749 . G A 3928.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3294;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.629e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3928,391,0 chrXVI 534782 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.853;DP=123;Dels=0.00;FS=3.259;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,60:123:99:1293,0,1438 chrXVI 534894 . T C 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.557;DP=114;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.159;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.640;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,62:114:99:1096,0,863 chrXVI 535611 . A G 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.413;DP=163;Dels=0.00;FS=6.119;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.507;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.470;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:1666,0,2045 chrXVI 535724 . A G 935.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.699;DP=91;Dels=0.00;FS=3.162;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.354;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:965,0,936 chrXVI 535979 . G T 2748 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2781,268,0 chrXVI 536008 . T C 835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.124;DP=100;Dels=0.00;FS=1.935;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.793;SB=-1.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:865,0,1387 chrXVI 536180 . T C 1363.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.331;DP=134;Dels=0.00;FS=5.470;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.718;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1393,0,1448 chrXVI 536238 . C T 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.629;DP=102;Dels=0.00;FS=3.714;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=11.12;ReadPosRankSum=4.317;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1164,0,1065 chrXVI 536707 . T C 785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.218;DP=112;Dels=0.00;FS=24.883;HaplotypeScore=16.9074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=7.01;ReadPosRankSum=-4.487;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:112:99:815,0,1313 chrXVI 536723 . T C 568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.763;DP=112;Dels=0.00;FS=10.313;HaplotypeScore=8.9611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.795;SB=-1.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,31:112:99:598,0,1435 chrXVI 536747 . T C 192.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.566;DP=89;Dels=0.00;FS=22.775;HaplotypeScore=28.7756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=2.16;ReadPosRankSum=4.086;SB=-1.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,35:89:99:222,0,1129 chrXVI 536750 . T C 580.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.489;DP=90;Dels=0.00;FS=19.609;HaplotypeScore=34.7492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=6.44;ReadPosRankSum=-3.231;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:90:99:610,0,885 chrXVI 536756 . C T 1671.05 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;DP=84;Dels=0.00;FS=4.241;HaplotypeScore=29.8538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.462;SB=-7.891e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:84:99:1704,150,0 chrXVI 538056 . A T 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=1;QD=26.58;SB=-1.823e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3615,343,0 chrXVI 538210 . A G 1582.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.043;DP=149;Dels=0.00;FS=3.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.579;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,75:149:99:1612,0,1737 chrXVI 538347 . G A 1402.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.744;DP=152;Dels=0.00;FS=6.095;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.234;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,78:152:99:1432,0,1234 chrXVI 538772 . A T 1880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;DP=152;Dels=0.00;FS=16.945;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.147;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:152:99:1910,0,1529 chrXVI 538784 . A G 3499.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.11;SB=-1.167e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3499,357,0 chrXVI 539891 . G C 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.002;DP=121;Dels=0.00;FS=4.590;HaplotypeScore=4.6447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=11.07;ReadPosRankSum=-1.332;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1370,0,1145 chrXVI 539991 . A G 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.397;DP=112;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=2.6517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.185;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1388,0,1011 chrXVI 540266 . T C 3784.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.545;DP=143;Dels=0.00;FS=3.995;HaplotypeScore=7.5909;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=26.46;ReadPosRankSum=1.393;SB=-1.581e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:3784,376,0 chrXVI 540311 . C G 3454.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.63;SB=-1.106e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3454,349,0 chrXVI 541191 . G A 3604.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=28.38;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3604,349,0 chrXVI 541340 . T C 3729.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.336e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3729,379,0 chrXVI 541882 . A G 3085 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7718;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=24.88;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3118,321,0 chrXVI 542071 . C T 4200.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.938e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:4200,376,0 chrXVI 542081 . C T 3992.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=26.61;ReadPosRankSum=1.293;SB=-1.869e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,149:150:99:3992,347,0 chrXVI 542298 . T C 3679.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.66;SB=-1.362e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3679,373,0 chrXVI 542310 . C T 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.10;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.249e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3774,373,0 chrXVI 542371 . T C 3425.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.705;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=26.76;ReadPosRankSum=0.622;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:3425,345,0 chrXVI 542599 . T A 3120 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=27.61;SB=-1.575e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3153,301,0 chrXVI 543428 . C T 2779 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25;SB=-1.251e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2812,277,0 chrXVI 543686 . A G 2928 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.40;MQ0=0;QD=26.38;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2961,300,0 chrXVI 543937 . A G 3325.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9726;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.60;SB=-1.762e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3325,337,0 chrXVI 543981 . C T 3547.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.88;MQ0=0;QD=25.70;SB=-1.641e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3547,349,0 chrXVI 544798 . A T 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.945;DP=127;Dels=0.00;FS=5.511;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.226;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:1575,0,1254 chrXVI 545953 . A T 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.889;DP=143;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.943;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,78:143:99:1788,0,1469 chrXVI 546814 . C T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.935;DP=116;Dels=0.00;FS=4.857;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=10.47;ReadPosRankSum=1.266;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,55:116:99:1244,0,1320 chrXVI 547351 . C T 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;DP=131;Dels=0.00;FS=1.526;HaplotypeScore=2.9847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.136;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1329,0,1481 chrXVI 547624 . A G 3046 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=26.03;SB=-1.594e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3079,303,0 chrXVI 548210 . G A 1379.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.277;DP=149;Dels=0.00;FS=2.068;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=1.825;QD=9.26;ReadPosRankSum=1.060;SB=-6.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1409,0,1851 chrXVI 548301 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.544;DP=126;Dels=0.00;FS=3.270;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=8.88;ReadPosRankSum=2.241;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1149,0,1639 chrXVI 548516 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.536;DP=134;Dels=0.00;FS=8.004;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.963;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,55:134:99:1170,0,1818 chrXVI 549254 . A G 3080 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=26.10;SB=-1.507e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:3113,315,0 chrXVI 549578 . C T 3168 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.62;SB=-1.350e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:119:99:3201,310,0 chrXVI 549673 . G A 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2986,289,0 chrXVI 549709 . T C 826.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.422;DP=95;Dels=0.00;FS=6.048;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:856,0,1141 chrXVI 549715 . T C 850.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.384;DP=88;Dels=0.00;FS=12.864;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.305;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,41:88:99:880,0,1046 chrXVI 549906 . G C 4113.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.58;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.072e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:155:99:4113,415,0 chrXVI 550167 . A T 1668.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;DP=136;Dels=0.00;FS=0.687;HaplotypeScore=5.9489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.630;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1698,0,1336 chrXVI 550760 . T C 1375.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.726;DP=133;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.160;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1405,0,1446 chrXVI 550866 . G A 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.229;DP=125;Dels=0.00;FS=6.791;HaplotypeScore=5.7209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.110;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1171,0,1448 chrXVI 551764 . T A 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.843;DP=126;Dels=0.00;FS=6.920;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.640;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,59:126:99:1293,0,1557 chrXVI 551858 . C A 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.469;DP=136;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=3.5413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.031;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1677,0,1289 chrXVI 552585 . C T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.809;DP=125;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=2.6670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.562;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1312,0,1440 chrXVI 554563 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.306;DP=98;Dels=0.00;FS=5.169;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.355;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1088,0,1127 chrXVI 554595 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.577;DP=109;Dels=0.00;FS=6.110;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.902;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1298,0,1207 chrXVI 554599 . A G 2962 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.290e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2995,318,0 chrXVI 554689 . G A 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.981;DP=141;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=3.8128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.300;SB=-8.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,78:141:99:1731,0,1327 chrXVI 557265 . A T 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.108;DP=154;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.583;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,62:154:99:1310,0,2068 chrXVI 559966 . G A 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.564;DP=86;Dels=0.00;FS=0.818;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.917;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:1001,0,959 chrXVI 560045 . G T 2295 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=27.32;SB=-1.111e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2328,225,0 chrXVI 560179 . A C 2251 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.50;MQ0=0;QD=26.48;SB=-1.050e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2284,225,0 chrXVI 560314 . T G 475 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.78;MQ0=0;QD=9.69;SB=-1.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:51:508,51,0 chrXVI 560326 . C T 853 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.73;MQ0=0;QD=14.96;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:81:886,81,0 chrXVI 560353 . G A 1383 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.38;MQ0=0;QD=18.95;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:1416,135,0 chrXVI 560372 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.021;DP=95;Dels=0.00;FS=9.327;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=2.217;QD=11.22;ReadPosRankSum=2.845;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,52:95:99:1096,0,820 chrXVI 560764 . C T 2777 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.490;DP=115;Dels=0.00;FS=9.277;HaplotypeScore=9.8849;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.41;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=24.15;ReadPosRankSum=2.787;SB=-8.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,107:115:99:2810,113,0 chrXVI 560903 . G A 3570.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.16;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3570,346,0 chrXVI 560953 . C T 2788 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.49;MQ0=0;QD=25.12;SB=-1.198e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2821,288,0 chrXVI 560971 . G A 355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.732;DP=80;Dels=0.00;FS=4.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.37;MQ0=0;MQRankSum=-4.248;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.576;SB=-2.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,33:80:99:385,0,1050 chrXVI 561014 . A C 421.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.97;MQ0=0;MQRankSum=-4.106;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.975;SB=-1.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:451,0,1132 chrXVI 561017 . T A 416.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.442;DP=77;Dels=0.00;FS=3.089;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.63;MQ0=0;MQRankSum=-4.396;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.498;SB=-1.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,34:77:99:446,0,1025 chrXVI 561023 . A T 407.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.776;DP=75;Dels=0.00;FS=6.098;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.75;MQ0=0;MQRankSum=-5.065;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.133;SB=-1.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:437,0,1034 chrXVI 561032 . G A 1921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6652;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.03;MQ0=0;QD=24.63;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1954,201,0 chrXVI 561045 . A T 1770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.57;MQ0=0;QD=24.93;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:1803,180,0 chrXVI 561098 . T G 2515 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.29;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.172e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2548,249,0 chrXVI 561100 . T C 2537 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.09;MQ0=0;QD=25.37;SB=-1.121e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2570,255,0 chrXVI 561360 . G A 3066 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.516e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3099,301,0 chrXVI 561434 . T A 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.419e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3077,298,0 chrXVI 561445 . C T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.181;DP=118;Dels=0.00;FS=23.801;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.802;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,53:118:99:1126,0,1356 chrXVI 561478 . C T 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.392;DP=145;Dels=0.00;FS=11.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.492;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1553,0,1616 chrXVI 562779 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.543;DP=98;Dels=0.00;FS=2.629;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.126;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1206,0,959 chrXVI 562968 . G A 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.067;DP=146;Dels=0.00;FS=3.129;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.163;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.724;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,74:146:99:1669,0,1555 chrXVI 563019 . A G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.484;DP=98;Dels=0.00;FS=2.606;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.946;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1226,0,983 chrXVI 563274 . A G 3987.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.478e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:3987,382,0 chrXVI 563424 . A G 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.486;DP=121;Dels=0.00;FS=3.337;HaplotypeScore=4.6796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=9.43;ReadPosRankSum=-2.069;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1171,0,1319 chrXVI 563468 . A C 2532 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=25.07;SB=-1.093e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2565,255,0 chrXVI 563864 . C T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.585;DP=106;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.807;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1094,0,1263 chrXVI 564223 . G A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.068;DP=110;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.858;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:110:99:1132,0,1314 chrXVI 564521 . A C 962.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.826;DP=129;Dels=0.00;FS=2.347;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:992,0,1739 chrXVI 564550 . T C 1592.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.639;DP=125;Dels=0.00;FS=6.956;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.739;SB=-8.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1622,0,1157 chrXVI 564703 . T C 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.240;DP=101;Dels=0.00;FS=0.773;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.641;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:101:99:1035,0,1048 chrXVI 564724 . T C 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.179;DP=109;Dels=0.00;FS=3.536;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=9.42;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,55:109:99:1057,0,1239 chrXVI 564765 . T C 758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;DP=85;Dels=0.00;FS=15.184;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.415;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,39:85:99:788,0,1009 chrXVI 565119 . T A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.330;DP=109;Dels=0.00;FS=2.493;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.368;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1096,0,1301 chrXVI 565474 . C T 2953 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=28.12;SB=-1.303e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:2986,298,0 chrXVI 565601 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.475;DP=120;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=3.1913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=10.78;ReadPosRankSum=-1.410;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,62:120:99:1324,0,1202 chrXVI 565603 . T A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;DP=116;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=3.1913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.494;SB=-6.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1371,0,1190 chrXVI 565674 . G A 1008.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.105;DP=108;Dels=0.00;FS=7.536;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.214;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1038,0,1182 chrXVI 565677 . C A 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.892;DP=120;Dels=0.00;FS=5.628;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.543;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1222,0,1291 chrXVI 565783 . T A 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.92;MQ0=0;QD=24.16;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3077,298,0 chrXVI 566571 . A G 2864 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=22.73;SB=-1.801e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:2897,291,0 chrXVI 566725 . T C 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.365;DP=144;Dels=0.00;FS=2.993;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.593;QD=9.72;ReadPosRankSum=-2.052;SB=-7.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1430,0,1756 chrXVI 567069 . G A 4396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4396,424,0 chrXVI 567139 . T G 3183 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=25.67;SB=-1.474e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3216,324,0 chrXVI 567183 . A G 3039 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.812;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=26.89;ReadPosRankSum=-1.609;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:3072,280,0 chrXVI 567216 . A G 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.065;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.229;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:127:99:1364,0,1432 chrXVI 567350 . G A 3311.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.73;MQ0=0;QD=27.14;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3311,319,0 chrXVI 567531 . G A 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.321;DP=138;Dels=0.00;FS=1.369;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.869;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1515,0,1478 chrXVI 567590 . G A 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.806;DP=109;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.798;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1206,0,1148 chrXVI 567702 . G A 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.451;DP=129;Dels=0.00;FS=5.348;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.958;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:129:99:1444,0,1342 chrXVI 567707 . C T 3645.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6639;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.731e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3645,355,0 chrXVI 567746 . T C 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.65;SB=-1.335e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3188,327,0 chrXVI 567767 . A G 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3680,373,0 chrXVI 567974 . T C 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.344;DP=134;Dels=0.00;FS=2.365;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1259,0,1647 chrXVI 568866 . A G 3986.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.94;MQ0=0;QD=26.57;SB=-1.773e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3986,394,0 chrXVI 568952 . C A 4038.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4038,394,0 chrXVI 568979 . G T 4149.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=28.81;SB=-2.157e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:4149,403,0 chrXVI 569375 . A G 3004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=27.06;SB=-1.469e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3037,304,0 chrXVI 569786 . A G 2862 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2215;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.11;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2895,294,0 chrXVI 570088 . T G 2381 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:2414,252,0 chrXVI 570110 . A T 2783 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2816,279,0 chrXVI 571446 . T A 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=6.6931;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3763,364,0 chrXVI 571717 . A G 2830 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=26.20;ReadPosRankSum=0.866;SB=-1.179e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2863,271,0 chrXVI 571946 . C T 3338.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.81;MQ0=0;QD=27.59;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3338,322,0 chrXVI 572263 . T C 2809 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.78;MQ0=0;QD=26.25;SB=-1.256e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2842,291,0 chrXVI 572440 . A G 2925 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.00;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:2958,292,0 chrXVI 572662 . T A 3310.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9687;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.36;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3310,331,0 chrXVI 572673 . T A 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.28;SB=-1.205e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3081,307,0 chrXVI 572884 . T C 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1.498e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:3068,298,0 chrXVI 572917 . C A 2557 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.273e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:2590,255,0 chrXVI 573096 . G T 4101.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6605;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.90;SB=-1.472e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4101,406,0 chrXVI 573380 . C T 4069.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9597;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.497e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:156:99:4069,379,0 chrXVI 573511 . C T 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.009e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3753,370,0 chrXVI 573609 . A G 2027 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=21.34;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2060,213,0 chrXVI 574660 . A G 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.438;DP=126;Dels=0.00;FS=1.488;HaplotypeScore=2.8275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-3.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,43:126:99:745,0,1960 chrXVI 575465 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.742;DP=130;Dels=0.00;FS=4.220;HaplotypeScore=4.8926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=8.85;ReadPosRankSum=-2.027;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1180,0,1667 chrXVI 575759 . C T 4671.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.16;MQ0=0;QD=27.64;SB=-1.244e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:4671,445,0 chrXVI 576040 . C A 3174 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4444;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.668e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3207,322,0 chrXVI 576057 . C T 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.756;DP=102;Dels=0.00;FS=10.073;HaplotypeScore=8.6902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.010;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:872,0,1318 chrXVI 576347 . G C 2865 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=50.2584;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.417e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2898,306,0 chrXVI 576663 . G T 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.410;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.370;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1378,0,1380 chrXVI 577272 . C T 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.377;DP=94;Dels=0.00;FS=3.882;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.847;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,47:94:99:1113,0,1028 chrXVI 577411 . G A 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.757;DP=125;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.599;SB=-5.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,70:125:99:1539,0,1151 chrXVI 577654 . C T 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3916,394,0 chrXVI 578941 . T C 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.201;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,68:143:99:1461,0,1582 chrXVI 579790 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.870;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.130;SB=-7.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,65:118:99:1494,0,1142 chrXVI 579913 . G A 1606.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.606;DP=143;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,72:143:99:1636,0,1579 chrXVI 581662 . T G 2444 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.77;SB=-9.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:2477,249,0 chrXVI 581829 . A G 3364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=26.08;SB=-1.615e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3364,337,0 chrXVI 582272 . T C 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.801;DP=122;Dels=0.00;FS=1.685;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.337;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:1079,0,1730 chrXVI 582448 . A G 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.768;DP=99;Dels=0.00;FS=0.754;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.732;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1042,0,1070 chrXVI 582741 . A T 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.410;DP=123;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.129;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1386,0,1269 chrXVI 585153 . A G 2870 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.46;MQ0=0;QD=25.86;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2903,285,0 chrXVI 586275 . G A 1620.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.358;DP=132;Dels=0.00;FS=1.408;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.140;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1650,0,1127 chrXVI 586446 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.048;DP=120;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=9.15;ReadPosRankSum=-2.992;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,55:120:99:1128,0,1416 chrXVI 586468 . C T 1389.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.364;DP=125;Dels=0.00;FS=0.760;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.018;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.380;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1419,0,1415 chrXVI 586527 . C T 1461.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.769;DP=147;Dels=0.00;FS=7.281;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.262;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,67:147:99:1491,0,1812 chrXVI 586678 . A G 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.998;DP=142;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=3.9791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=11.38;ReadPosRankSum=-2.714;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,77:142:99:1646,0,1346 chrXVI 586809 . G A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.604;DP=160;Dels=0.00;FS=2.039;HaplotypeScore=3.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.525;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:160:99:1462,0,1960 chrXVI 586836 . G C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.575;DP=125;Dels=0.00;FS=19.160;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.818;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,60:125:99:1343,0,1430 chrXVI 587355 . T A 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;DP=149;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.420;SB=-8.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1674,0,1624 chrXVI 588172 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.072;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,61:110:99:1358,0,1085 chrXVI 588173 . A G 1269.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.742;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.299;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,63:112:99:1299,0,1103 chrXVI 588777 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;DP=170;Dels=0.00;FS=2.729;HaplotypeScore=3.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=1;MQRankSum=-0.931;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.186;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,73:170:99:1560,0,2135 chrXVI 588825 . G A 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.254;DP=145;Dels=0.00;FS=1.318;HaplotypeScore=1.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=1;MQRankSum=0.296;QD=10.45;ReadPosRankSum=0.240;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,69:145:99:1545,0,1578 chrXVI 588877 . A G 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.984;DP=124;Dels=0.00;FS=3.274;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.370;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1276,0,1371 chrXVI 588898 . C T 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.304;DP=128;Dels=0.00;FS=5.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.043;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,61:128:99:1316,0,1426 chrXVI 588931 . G A 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.086;DP=126;Dels=0.00;FS=5.453;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=10.50;ReadPosRankSum=-1.213;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1353,0,1339 chrXVI 588991 . A G 3165 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.68;MQ0=0;QD=26.16;SB=-1.595e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3198,316,0 chrXVI 589172 . C T 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.789;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,64:130:99:1379,0,1439 chrXVI 589257 . G A 952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.388;DP=102;Dels=0.00;FS=2.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=0;MQRankSum=-4.140;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,48:102:99:982,0,1127 chrXVI 589268 . A G 842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.818;DP=95;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=-4.780;QD=8.86;ReadPosRankSum=-2.429;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:872,0,1147 chrXVI 589366 . A T 65.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;DP=108;Dels=0.00;FS=7.007;HaplotypeScore=34.5138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.560;QD=0.60;ReadPosRankSum=-2.769;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,18:108:95:95,0,1480 chrXVI 589367 . C G 71.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.364;DP=90;Dels=0.00;FS=2.233;HaplotypeScore=33.7251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=-4.353;QD=0.79;ReadPosRankSum=-4.766;SB=-2.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:101,0,1215 chrXVI 589369 . C T 137.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.082;DP=91;Dels=0.00;FS=10.818;HaplotypeScore=56.5586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQ0=0;MQRankSum=-4.334;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.270;SB=-2.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:167,0,1246 chrXVI 589380 . A G 713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.471;DP=112;Dels=0.00;FS=13.970;HaplotypeScore=4.6956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=-5.634;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-2.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:743,0,1276 chrXVI 589494 . C T 1663.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.399;DP=145;Dels=0.00;FS=6.920;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.112;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.132;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1693,0,1435 chrXVI 589510 . T A 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.859;DP=119;Dels=0.00;FS=8.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.891;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1368,0,1285 chrXVI 589604 . A G 1736.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.825;DP=151;Dels=0.00;FS=2.873;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.462;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,80:151:99:1766,0,1526 chrXVI 589740 . A G 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.550;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.69;MQ0=0;MQRankSum=-5.233;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.632;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:1249,0,1722 chrXVI 589747 . A G 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.837;DP=139;Dels=0.00;FS=2.176;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=-5.537;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.056;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1134,0,1679 chrXVI 589764 . T C 769.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.470;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.23;MQ0=0;MQRankSum=-8.276;QD=7.06;ReadPosRankSum=-2.379;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:799,0,1313 chrXVI 589765 . T C 741.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.658;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.23;MQ0=0;MQRankSum=-8.167;QD=6.80;ReadPosRankSum=-2.415;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,54:109:99:771,0,1294 chrXVI 589781 . T A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.49;MQ0=0;MQRankSum=-9.056;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.315;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1095,0,1402 chrXVI 589795 . G C 898.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.955;DP=120;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.06;MQ0=0;MQRankSum=-9.123;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.284;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:928,0,1445 chrXVI 589798 . G A 730.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.828;DP=111;Dels=0.00;FS=2.573;HaplotypeScore=2.7220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-8.520;QD=6.58;ReadPosRankSum=4.500;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,41:111:99:760,0,1627 chrXVI 589800 . C T 700.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.197;DP=119;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=3.7153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=-8.486;QD=5.88;ReadPosRankSum=5.008;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,41:119:99:730,0,1806 chrXVI 589802 . T G 714.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-8.664;QD=6.05;ReadPosRankSum=4.940;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,41:118:99:744,0,1838 chrXVI 589805 . A G 691.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;DP=125;Dels=0.00;FS=3.295;HaplotypeScore=6.6974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.77;MQ0=0;MQRankSum=-9.069;QD=5.53;ReadPosRankSum=3.231;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,48:125:99:721,0,1822 chrXVI 589811 . C T 777.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.048;DP=113;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=2.9008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.78;MQ0=0;MQRankSum=-9.070;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.428;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:807,0,1448 chrXVI 589832 . T C 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.373;DP=137;Dels=0.00;FS=16.947;HaplotypeScore=5.6076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.24;MQ0=0;MQRankSum=-9.775;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.477;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:137:99:1032,0,1743 chrXVI 589870 . T C 980.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.438;DP=143;Dels=0.00;FS=22.712;HaplotypeScore=64.0374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.83;MQ0=0;MQRankSum=-10.204;QD=6.85;ReadPosRankSum=2.020;SB=-1.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,64:143:99:1010,0,1584 chrXVI 590012 . C T 1689.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.731;DP=137;Dels=0.00;FS=6.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.442;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,72:137:99:1719,0,1404 chrXVI 590060 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.458;DP=115;Dels=0.00;FS=1.968;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.531;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,61:115:99:1286,0,1222 chrXVI 590196 . A G 1834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.301;DP=163;Dels=0.00;FS=11.035;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.286;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,89:162:99:1864,0,1711 chrXVI 590239 . T G 1560.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.547;DP=145;Dels=0.00;FS=5.511;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.865;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,76:145:99:1590,0,1532 chrXVI 590262 . A T 2005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.198;DP=160;Dels=0.00;FS=2.982;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.962;SB=-8.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,89:160:99:2035,0,1527 chrXVI 590543 . G C 1392.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;DP=142;Dels=0.00;FS=2.184;HaplotypeScore=3.9226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.195;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1422,0,1419 chrXVI 590563 . A G 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.614;DP=124;Dels=0.00;FS=8.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1151,0,1566 chrXVI 590589 . C T 1194.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.239;DP=130;Dels=0.00;FS=4.328;HaplotypeScore=1.9363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.014;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,58:130:99:1224,0,1535 chrXVI 590724 . A G 1382.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.575;DP=154;Dels=0.00;FS=13.007;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=1;MQRankSum=-0.391;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.612;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,73:154:99:1412,0,1777 chrXVI 591000 . A G 1632.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.410;DP=134;Dels=0.00;FS=21.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.533;SB=-8.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,75:134:99:1662,0,1278 chrXVI 591009 . C T 1647.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.823;DP=137;Dels=0.00;FS=16.450;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.097;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,76:137:99:1677,0,1278 chrXVI 591334 . G A 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.288;DP=133;Dels=0.00;FS=4.269;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=9.68;ReadPosRankSum=-2.240;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1317,0,1640 chrXVI 591540 . G A 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.686;DP=119;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=5.6751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-3.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,53:119:99:1088,0,1487 chrXVI 591603 . T G 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.933;DP=99;Dels=0.00;FS=0.800;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.060;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:949,0,1285 chrXVI 591618 . T G 1333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;DP=100;Dels=0.00;FS=1.661;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1363,0,900 chrXVI 591748 . T C 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.125;DP=100;Dels=0.00;FS=0.775;HaplotypeScore=2.6511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.161;SB=-5.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,54:100:99:1170,0,825 chrXVI 591766 . C T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.405;DP=125;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=2.994;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.086;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:1364,0,1183 chrXVI 591786 . C A 1516.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.188;DP=143;Dels=0.00;FS=3.217;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.211;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,75:143:99:1546,0,1370 chrXVI 591790 . A G 1336.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.831;DP=157;Dels=0.00;FS=3.096;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=8.51;ReadPosRankSum=-2.196;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,81:157:99:1366,0,1552 chrXVI 591791 . C T 1337.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.856;DP=156;Dels=0.00;FS=6.327;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=8.57;ReadPosRankSum=-2.661;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,80:156:99:1367,0,1475 chrXVI 591826 . A G 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.648;DP=138;Dels=0.00;FS=3.116;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.590;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1441,0,1457 chrXVI 591845 . T A 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.493;DP=140;Dels=0.00;FS=5.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=11.31;ReadPosRankSum=2.117;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1613,0,1364 chrXVI 591899 . G A 1512.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.693;DP=125;Dels=0.00;FS=2.301;HaplotypeScore=1.9290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.305;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,69:125:99:1542,0,1193 chrXVI 591926 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.118;DP=118;Dels=0.00;FS=2.361;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=2.445;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.582;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,61:118:99:1311,0,1284 chrXVI 591978 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.520;DP=112;Dels=0.00;FS=6.113;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.999;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,61:112:99:1373,0,1132 chrXVI 591996 . G A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.367;DP=116;Dels=0.00;FS=3.544;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.287;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1468,0,1096 chrXVI 592063 . A C 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.690;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=11.82;ReadPosRankSum=2.220;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:1129,0,977 chrXVI 592088 . C A 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.498;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.535;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1098,0,702 chrXVI 592112 . G A 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.020;DP=105;Dels=0.00;FS=1.589;HaplotypeScore=10.5986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.960;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1030,0,832 chrXVI 592115 . A G 781.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.269;DP=101;Dels=0.00;FS=2.705;HaplotypeScore=11.3873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.822;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,56:101:99:811,0,729 chrXVI 592674 . T C 1842.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.176;DP=181;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.417;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,90:181:99:1872,0,1931 chrXVI 593007 . A G 1612.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.143;DP=142;Dels=0.00;FS=3.976;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1642,0,1421 chrXVI 593197 . G T 1077.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.792;DP=105;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.562;SB=-3.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1107,0,1123 chrXVI 593199 . T C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;DP=105;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.665;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:105:99:1069,0,1297 chrXVI 593234 . T C 1177.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.425;DP=104;Dels=0.00;FS=2.962;HaplotypeScore=2.4900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.817;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1207,0,1114 chrXVI 593316 . T C 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.736;DP=118;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.606;SB=-3.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1139,0,1454 chrXVI 593317 . A G 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.666;DP=118;Dels=0.00;FS=0.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.520;SB=-3.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1159,0,1438 chrXVI 593372 . C T 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.451;DP=106;Dels=0.00;FS=6.023;HaplotypeScore=1.9699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=9.48;ReadPosRankSum=0.418;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,49:106:99:1035,0,1289 chrXVI 593408 . T C 997.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.809;DP=134;Dels=0.00;FS=4.697;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.456;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,53:134:99:1027,0,1916 chrXVI 593438 . T C 3503.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.707;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=25.57;ReadPosRankSum=1.226;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:3503,345,0 chrXVI 593464 . T C 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.575;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.164;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1144,0,1433 chrXVI 593478 . C T 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.956;DP=125;Dels=0.00;FS=3.339;HaplotypeScore=3.5142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.141;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1157,0,1475 chrXVI 593569 . T G 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.775;DP=109;Dels=0.00;FS=1.545;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.670;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,47:109:99:994,0,1477 chrXVI 593582 . A G 1005.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.875;DP=115;Dels=0.00;FS=4.617;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.357;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,52:115:99:1035,0,1501 chrXVI 593633 . A G 1159.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.723;DP=125;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=1.7046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.311;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1189,0,1639 chrXVI 593663 . G A 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.973;DP=127;Dels=0.00;FS=1.426;HaplotypeScore=3.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.150;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,51:127:99:1003,0,1735 chrXVI 593867 . G C 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.737;DP=136;Dels=0.00;FS=2.210;HaplotypeScore=2.6855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=2.127;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.844;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,75:136:99:1528,0,1216 chrXVI 593876 . T C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.217;DP=142;Dels=0.00;FS=0.623;HaplotypeScore=2.8480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.323;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1233,0,1723 chrXVI 593884 . G A 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.123;DP=142;Dels=0.00;FS=0.617;HaplotypeScore=3.8173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.133;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,76:142:99:1742,0,1395 chrXVI 594005 . T C 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.979;DP=145;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=3.6626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.490;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,67:145:99:1401,0,1778 chrXVI 594078 . G A 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.856;DP=121;Dels=0.00;FS=3.669;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.065;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,64:121:99:1406,0,1171 chrXVI 594115 . G A 1697.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.516;DP=164;Dels=0.00;FS=0.597;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.910;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,86:164:99:1727,0,1730 chrXVI 594355 . T C 702.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.837;DP=108;Dels=0.00;FS=11.507;HaplotypeScore=8.8508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.057;SB=-2.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:732,0,1595 chrXVI 594386 . G A 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.080;DP=108;Dels=0.00;FS=9.854;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.791;SB=-2.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,44:108:99:890,0,1503 chrXVI 594625 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.326;DP=137;Dels=0.00;FS=1.348;HaplotypeScore=4.6657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.456;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:137:99:1239,0,1736 chrXVI 594633 . G A 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.931;DP=150;Dels=0.00;FS=1.272;HaplotypeScore=4.8728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.185;SB=-7.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,69:150:99:1472,0,1852 chrXVI 594667 . G A 1690.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;DP=153;Dels=0.00;FS=1.269;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.210;SB=-8.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,77:153:99:1720,0,1733 chrXVI 594669 . A C 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.486;DP=153;Dels=0.00;FS=1.279;HaplotypeScore=3.9757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.341;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.240;SB=-7.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:153:99:1623,0,1750 chrXVI 594747 . A G 1506.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.840;DP=121;Dels=0.00;FS=12.088;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=3.122;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.419;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:1536,0,1109 chrXVI 594764 . C G 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.021;DP=138;Dels=0.00;FS=13.943;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=11.32;ReadPosRankSum=2.368;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,72:138:99:1592,0,1416 chrXVI 594861 . A G 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.598;DP=136;Dels=0.00;FS=0.657;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=10.63;ReadPosRankSum=2.673;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1476,0,1529 chrXVI 599378 . G A 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.396;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=28.01;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-1.294e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3753,356,0 chrXVI 600285 . T G 3155 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07;SB=-1.398e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3188,307,0 chrXVI 600385 . A G 2352 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.02;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2385,246,0 chrXVI 600533 . G T 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=26.68;SB=-1.815e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3415,325,0 chrXVI 600670 . G A 3307.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.27;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3307,319,0 chrXVI 600877 . C A 2389 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=24.89;SB=-1.298e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2422,243,0 chrXVI 602623 . C T 3058 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.85;MQ0=0;QD=28.06;SB=-1.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3091,298,0 chrXVI 603616 . G A 2926 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7858;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.22;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2959,292,0 chrXVI 603836 . A T 4010.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.19;MQ0=0;QD=27.66;SB=-1.354e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4010,391,0 chrXVI 604022 . G A 2485 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.386e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:99:99:2518,247,0 chrXVI 604091 . C T 3916.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=28.17;SB=-2.030e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3916,376,0 chrXVI 604106 . G T 3835.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62;SB=-1.713e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3835,376,0 chrXVI 605672 . T C 3337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=24.18;SB=-1.804e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3337,331,0 chrXVI 606386 . C T 1090 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.127;DP=132;Dels=0.00;FS=20.302;HaplotypeScore=120.3772;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=8.26;ReadPosRankSum=-3.128;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:60,72:132:35:1123,35,0 chrXVI 606392 . C T 328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;DP=133;Dels=0.00;FS=17.358;HaplotypeScore=249.3071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.127;QD=2.47;ReadPosRankSum=-2.503;SB=-4.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,28:133:99:358,0,1880 chrXVI 606398 . C T 333.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;DP=131;Dels=0.00;FS=15.673;HaplotypeScore=114.7827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.887;QD=2.54;ReadPosRankSum=-5.987;SB=-4.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,26:131:99:363,0,1955 chrXVI 606404 . C T 295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;DP=130;Dels=0.00;FS=13.082;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.511;QD=2.27;ReadPosRankSum=-7.130;SB=-4.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,25:130:99:325,0,2010 chrXVI 606814 . C T 2995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.27;MQ0=0;QD=26.98;SB=-1.404e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3028,295,0 chrXVI 606832 . C G 2138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9799;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=23.49;ReadPosRankSum=1.351;SB=-1.255e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:2171,219,0 chrXVI 607109 . A G 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.598;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=6.91;ReadPosRankSum=2.540;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,52:139:99:990,0,1969 chrXVI 607353 . C T 3070 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=26.70;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:3103,304,0 chrXVI 607493 . G A 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.006;DP=123;Dels=0.00;FS=2.390;HaplotypeScore=53.1579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.257;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,54:123:99:1088,0,1303 chrXVI 607737 . A G 1028.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.879;DP=121;Dels=0.00;FS=1.534;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1058,0,1544 chrXVI 607854 . C T 2421 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=2;QD=18.48;SB=-1.206e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:2454,243,0 chrXVI 607904 . G A 863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.756;DP=120;Dels=0.00;FS=2.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.230;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:893,0,1520 chrXVI 607906 . G A 849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.832;DP=120;Dels=0.00;FS=2.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.612;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.101;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,49:120:99:879,0,1488 chrXVI 607921 . C T 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.898;DP=134;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.490;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-6.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:954,0,1775 chrXVI 607926 . A G 1095.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.158;DP=142;Dels=0.00;FS=6.257;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.195;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:1125,0,1993 chrXVI 608055 . G A 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.515;DP=152;Dels=0.00;FS=2.875;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.723;SB=-7.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,66:152:99:1391,0,1838 chrXVI 608142 . C T 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.116;DP=144;Dels=0.00;FS=0.630;HaplotypeScore=1.8583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.614;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1498,0,1685 chrXVI 608268 . T C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.761;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=9.87;ReadPosRankSum=3.023;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1511,0,1760 chrXVI 608269 . T C 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.641;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=9.47;ReadPosRankSum=3.034;SB=-7.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1450,0,1741 chrXVI 608318 . G T 1424.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.669;DP=131;Dels=0.00;FS=1.393;HaplotypeScore=4.6804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.176;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1454,0,1345 chrXVI 608420 . T A 2151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.735;DP=176;Dels=0.01;FS=3.562;HaplotypeScore=20.6926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.488;SB=-8.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,94:175:99:2181,0,1767 chrXVI 608465 . C T 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;DP=174;Dels=0.00;FS=2.646;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.586;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,81:174:99:1651,0,2050 chrXVI 608537 . G A 1957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.779;DP=157;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.726;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,86:157:99:1987,0,1581 chrXVI 608778 . C T 2046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.204;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.928;SB=-9.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,92:171:99:2076,0,1598 chrXVI 608924 . C T 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.119;DP=160;Dels=0.00;FS=0.591;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.983;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1752,0,1681 chrXVI 609195 . G A 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.191;DP=166;Dels=0.00;FS=5.575;HaplotypeScore=13.5918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.266;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,85:166:99:1722,0,1649 chrXVI 609390 . G A 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.475;DP=83;Dels=0.00;FS=9.758;HaplotypeScore=2.6166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.469;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,51:82:99:1213,0,634 chrXVI 609399 . A G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.243;DP=98;Dels=0.00;FS=5.029;HaplotypeScore=3.8159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.582;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1160,0,952 chrXVI 609546 . A G 3841.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=22.73;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:169:99:3841,388,0 chrXVI 609547 . A G 3850.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=22.65;SB=-1.612e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:3850,382,0 chrXVI 609630 . A G 1680.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.849;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.211;SB=-5.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,79:154:99:1710,0,1737 chrXVI 610018 . T C 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.658;DP=142;Dels=0.00;FS=3.079;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.300;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,56:142:99:969,0,2039 chrXVI 610056 . C T 4189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=27.20;SB=-1.742e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:4189,406,0 chrXVI 610123 . A T 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.466;DP=134;Dels=0.00;FS=3.648;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.986;SB=-4.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,69:134:99:1616,0,1484 chrXVI 610143 . G T 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.482;DP=107;Dels=0.00;FS=7.141;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.364;SB=-4.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1298,0,1034 chrXVI 610223 . C T 3872.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.361e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3872,370,0 chrXVI 610248 . T G 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.441;DP=150;Dels=0.00;FS=4.328;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.605;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,73:150:99:1429,0,1691 chrXVI 610298 . G A 4318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4318,427,0 chrXVI 610341 . G T 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.645;DP=142;Dels=0.00;FS=3.054;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.104;SB=-7.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1616,0,1631 chrXVI 610635 . A C 1487.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.980;DP=155;Dels=0.00;FS=4.730;HaplotypeScore=4.3502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,72:155:99:1517,0,1870 chrXVI 610702 . A T 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.910;DP=126;Dels=0.00;FS=1.430;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.193;SB=-5.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1155,0,1543 chrXVI 610743 . C A 3408.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.80;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.391e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3408,331,0 chrXVI 610855 . C T 1940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.842;DP=161;Dels=0.00;FS=8.184;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.069;SB=-1.049e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,91:161:99:1970,0,1503 chrXVI 610921 . G A 2080.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.469;DP=147;Dels=0.00;FS=9.572;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-9.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,92:147:99:2110,0,1061 chrXVI 610981 . G A 2398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.873;DP=176;Dels=0.00;FS=3.154;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.210;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,103:176:99:2428,0,1402 chrXVI 611132 . C T 1776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.472;DP=160;Dels=0.00;FS=1.978;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.606;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,76:160:99:1806,0,1768 chrXVI 612448 . C T 4271.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.919e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4271,415,0 chrXVI 613067 . A C 1884.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.519;DP=178;Dels=0.00;FS=5.198;HaplotypeScore=8.7623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.217;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,92:178:99:1914,0,1837 chrXVI 613614 . G A 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.665;DP=107;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-3.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,47:107:99:1009,0,1370 chrXVI 613633 . G A 958.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.449;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.101;SB=-3.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,45:107:99:988,0,1401 chrXVI 613725 . C T 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.543;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.389;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1204,0,1218 chrXVI 613884 . G A 1229.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.197;DP=123;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.330;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1259,0,1510 chrXVI 613944 . C T 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.449;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.520;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1328,0,1110 chrXVI 614016 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.894;DP=121;Dels=0.00;FS=1.445;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.403;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:121:99:1414,0,1325 chrXVI 614103 . A G 1468.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.735;DP=118;Dels=0.00;FS=5.925;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.499;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.734;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1498,0,1169 chrXVI 614187 . A G 1026.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.831;DP=95;Dels=0.00;FS=0.766;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-5.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1056,0,1001 chrXVI 614283 . A G 1021.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.057;DP=116;Dels=0.01;FS=4.498;HaplotypeScore=6.5793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1051,0,1475 chrXVI 614380 . T A 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.194;DP=124;Dels=0.00;FS=5.608;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.328;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1305,0,1487 chrXVI 614400 . A G 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.821;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.235;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1260,0,1695 chrXVI 614501 . A T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.314;SB=-3.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,67:125:99:1521,0,1295 chrXVI 614563 . T C 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.877;DP=128;Dels=0.00;FS=5.402;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.695;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1374,0,1525 chrXVI 614587 . T C 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.743;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.581;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,80:158:99:1767,0,1829 chrXVI 614631 . C G 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.293;DP=166;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.114;SB=-7.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,83:166:99:1742,0,1870 chrXVI 614654 . A T 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;DP=162;Dels=0.00;FS=0.579;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.144;SB=-8.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:1665,0,1822 chrXVI 614659 . A T 1713.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.333;SB=-8.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,85:168:99:1743,0,1850 chrXVI 614701 . A G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.134;DP=128;Dels=0.00;FS=2.367;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.718;SB=-4.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1222,0,1532 chrXVI 614881 . C T 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.974;DP=129;Dels=0.00;FS=3.196;HaplotypeScore=4.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.789;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,63:129:99:1312,0,1487 chrXVI 615151 . A C 1203.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.663;DP=127;Dels=0.00;FS=10.682;HaplotypeScore=7.0457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.129;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.552;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1233,0,1457 chrXVI 615159 . G A 1004.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.870;DP=110;Dels=0.00;FS=6.525;HaplotypeScore=2.0756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.402;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1034,0,1223 chrXVI 615302 . T C 453.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.279;DP=99;Dels=0.00;FS=5.115;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.537;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.059;SB=-2.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:483,0,579 chrXVI 615308 . G C 479.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.247;DP=102;Dels=0.00;FS=4.685;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.152;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.813;SB=-2.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:509,0,599 chrXVI 615310 . C T 512.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.320;DP=109;Dels=0.00;FS=1.852;HaplotypeScore=6.5365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=4.70;ReadPosRankSum=2.245;SB=-3.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:542,0,786 chrXVI 615470 . G A 3888.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.05;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.806e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3888,373,0 chrXVI 615756 . T C 1292.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.760;DP=148;Dels=0.00;FS=8.242;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.692;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,72:148:99:1322,0,1670 chrXVI 615999 . T C 1319.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.298;DP=135;Dels=0.01;FS=6.609;HaplotypeScore=9.7346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.599;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:1349,0,1627 chrXVI 616089 . G A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.603;DP=149;Dels=0.00;FS=7.530;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1522,0,1870 chrXVI 616149 . C T 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.986;DP=138;Dels=0.00;FS=1.400;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.175;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1578,0,1504 chrXVI 616401 . T C 1748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.703;DP=153;Dels=0.00;FS=14.775;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.731;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1778,0,1608 chrXVI 616422 . T G 1879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.421;DP=161;Dels=0.00;FS=4.708;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.633;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,87:161:99:1909,0,1709 chrXVI 616534 . G A 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.429;DP=143;Dels=0.00;FS=3.038;HaplotypeScore=4.2125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.899;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:143:99:1435,0,1662 chrXVI 616661 . G A 1996.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.897;DP=169;Dels=0.00;FS=1.200;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.160;SB=-1.060e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,92:169:99:2026,0,1654 chrXVI 616836 . T C 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.226;DP=129;Dels=0.00;FS=2.441;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.125;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1208,0,1561 chrXVI 616899 . T C 1209.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.769;DP=127;Dels=0.00;FS=1.437;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.574;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1239,0,1417 chrXVI 617121 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.992;DP=149;Dels=0.00;FS=6.067;HaplotypeScore=3.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.622;SB=-7.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,70:149:99:1378,0,1817 chrXVI 617135 . T A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;DP=135;Dels=0.00;FS=7.797;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.402;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:1428,0,1528 chrXVI 617352 . C T 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;DP=129;Dels=0.00;FS=8.171;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-4.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,56:129:99:1149,0,1626 chrXVI 617481 . T C 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.154;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.239;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,78:156:99:1731,0,1776 chrXVI 617643 . G A 1548.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.025;DP=128;Dels=0.00;FS=0.704;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.142;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1578,0,1195 chrXVI 618129 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.864;DP=130;Dels=0.00;FS=11.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:130:99:1298,0,1480 chrXVI 618231 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.294;DP=134;Dels=0.00;FS=9.287;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.597;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1407,0,1506 chrXVI 618312 . T C 1272.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.700;DP=123;Dels=0.00;FS=1.431;HaplotypeScore=4.2961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.642;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1302,0,1315 chrXVI 618453 . G A 983.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.278;DP=97;Dels=0.00;FS=11.806;HaplotypeScore=1.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.618;SB=-1.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1013,0,1128 chrXVI 618523 . A G 920.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.443;DP=91;Dels=0.00;FS=6.783;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.592;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:950,0,1098 chrXVI 618585 . G A 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.636;DP=111;Dels=0.00;FS=0.794;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.482;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:1357,0,1115 chrXVI 618855 . G A 1484.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.836;DP=140;Dels=0.00;FS=4.008;HaplotypeScore=3.6868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,74:140:99:1514,0,1353 chrXVI 618915 . G A 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.119;DP=137;Dels=0.00;FS=5.359;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.909;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.705;SB=-7.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,73:137:99:1608,0,1370 chrXVI 619062 . G A 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.523;DP=110;Dels=0.00;FS=3.602;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.660;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,60:110:99:1288,0,1110 chrXVI 619158 . G A 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.539;DP=148;Dels=0.00;FS=1.384;HaplotypeScore=70.3496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=10.90;ReadPosRankSum=-2.426;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1643,0,1506 chrXVI 619169 . A G 1658.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.060;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.118;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1688,0,1605 chrXVI 619252 . T G 1531.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.502;DP=135;Dels=0.00;FS=10.698;HaplotypeScore=2.6187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.059;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:1561,0,1516 chrXVI 619267 . C T 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.894;DP=147;Dels=0.00;FS=14.969;HaplotypeScore=2.3924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.603;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:1706,0,1555 chrXVI 619292 . C T 1715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;DP=140;Dels=0.00;FS=9.505;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.107;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1745,0,1368 chrXVI 619344 . C A 1350.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.833;DP=122;Dels=0.00;FS=0.846;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.618;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.394;SB=-2.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1380,0,1397 chrXVI 619457 . C T 1339.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.027;DP=131;Dels=0.00;FS=6.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,63:131:99:1369,0,1441 chrXVI 619477 . A G 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.449;DP=112;Dels=0.00;FS=2.469;HaplotypeScore=1.9066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.006;SB=-4.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1084,0,1325 chrXVI 619527 . G T 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.395;DP=101;Dels=0.00;FS=4.931;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.309;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,53:101:99:1212,0,909 chrXVI 619549 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.330;DP=119;Dels=0.00;FS=8.437;HaplotypeScore=2.5584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.132;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:119:99:1285,0,1207 chrXVI 619565 . G C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.440;DP=118;Dels=0.00;FS=9.913;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.490;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1293,0,1174 chrXVI 619612 . A T 1822.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.235;DP=157;Dels=0.00;FS=5.181;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.237;SB=-5.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,82:157:99:1852,0,1617 chrXVI 619659 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.409;DP=119;Dels=0.00;FS=6.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.386;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1452,0,1225 chrXVI 619680 . C T 1498.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.717;DP=138;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.796;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1528,0,1454 chrXVI 619704 . A G 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;DP=139;Dels=0.00;FS=7.821;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.377;SB=-4.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1384,0,1650 chrXVI 619747 . A G 1465.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.576;DP=142;Dels=0.00;FS=8.841;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.222;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.908;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1495,0,1553 chrXVI 619779 . T C 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.752;DP=134;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.192;SB=-8.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,74:134:99:1583,0,1304 chrXVI 619798 . G A 2670 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.95;MQ0=0;QD=26.44;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2703,268,0 chrXVI 619887 . A G 1176.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;DP=103;Dels=0.00;FS=3.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.632;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.908;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1206,0,1051 chrXVI 619894 . G A 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.288;DP=103;Dels=0.00;FS=4.861;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.550;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.478;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,50:103:99:1197,0,1119 chrXVI 619910 . C A 1022.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.561;DP=97;Dels=0.00;FS=0.791;HaplotypeScore=2.8580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.96;MQ0=0;MQRankSum=-5.509;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.285;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1052,0,973 chrXVI 619974 . A G 808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.276;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.19;MQ0=0;MQRankSum=-6.660;QD=8.00;ReadPosRankSum=-2.231;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:838,0,1152 chrXVI 620016 . C A 743.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.180;DP=81;Dels=0.00;FS=16.779;HaplotypeScore=2.8096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQ0=0;MQRankSum=-3.937;QD=9.17;ReadPosRankSum=-2.609;SB=-1.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,39:81:99:773,0,859 chrXVI 620115 . A G 727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.981;DP=73;Dels=0.00;FS=15.095;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.916;QD=9.96;ReadPosRankSum=-2.799;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,38:73:99:757,0,820 chrXVI 620227 . C T 986.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.244;DP=104;Dels=0.00;FS=3.014;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.806;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:1016,0,1292 chrXVI 620246 . A C 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;DP=129;Dels=0.00;FS=1.730;HaplotypeScore=65.1101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=10.67;ReadPosRankSum=3.790;SB=-3.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:1407,0,1402 chrXVI 620274 . T C 11.34 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.726;DP=95;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.3031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=0.12;ReadPosRankSum=0.310;SB=-3.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:95:41:41,0,373 chrXVI 620415 . G A 1918.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=14.00;ReadPosRankSum=0.447;SB=-1.027e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,83:137:99:1948,0,1123 chrXVI 620644 . G T 970.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.351;DP=95;Dels=0.00;FS=0.803;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=10.21;ReadPosRankSum=3.227;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:1000,0,980 chrXVI 620737 . C T 1555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.115;DP=151;Dels=0.00;FS=6.032;HaplotypeScore=7.7543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.151;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.820;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,72:151:99:1585,0,1632 chrXVI 620821 . G T 1824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.772;DP=138;Dels=0.00;FS=1.395;HaplotypeScore=5.6272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,79:138:99:1854,0,1144 chrXVI 620863 . T C 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.431;DP=139;Dels=0.00;FS=5.242;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1494,0,1546 chrXVI 621160 . G A 1099.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.154;DP=117;Dels=0.00;FS=6.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.738;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,50:117:99:1129,0,1575 chrXVI 621305 . T G 1948.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.559;DP=162;Dels=0.00;FS=1.990;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=1;MQRankSum=1.778;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,88:162:99:1978,0,1630 chrXVI 621334 . T G 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.399;SB=-8.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1678,0,1597 chrXVI 621480 . T C 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.557;DP=134;Dels=0.00;FS=2.196;HaplotypeScore=9.5462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.282;SB=-5.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1246,0,1728 chrXVI 621612 . C G 930.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=108;Dels=0.00;FS=6.304;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.706;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,47:108:99:960,0,1379 chrXVI 621836 . G C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.642;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.887;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-1.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,66:155:99:1373,0,2074 chrXVI 621849 . T C 1790.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.449;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.37;MQ0=0;MQRankSum=2.116;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.752;SB=-2.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:1820,0,1339 chrXVI 621855 . A T 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.449;DP=149;Dels=0.00;FS=3.195;HaplotypeScore=4.9318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.648;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.067;SB=-1.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,62:149:99:1136,0,2099 chrXVI 622050 . G A 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.072;DP=122;Dels=0.00;FS=2.393;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.73;MQ0=0;MQRankSum=-5.191;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,53:122:99:1098,0,1565 chrXVI 622057 . A G 780.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.191;DP=119;Dels=0.00;FS=6.124;HaplotypeScore=1.9747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.51;MQ0=0;MQRankSum=-6.720;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,48:119:99:810,0,1662 chrXVI 622071 . A G 838.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.856;DP=128;Dels=0.00;FS=5.829;HaplotypeScore=5.2486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-7.515;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:868,0,1652 chrXVI 622074 . T C 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.523;DP=137;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=4.2512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-7.963;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.477;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,62:137:99:920,0,1758 chrXVI 622087 . T G 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.735;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.4085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.90;MQ0=0;MQRankSum=-6.317;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.629;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,58:149:99:744,0,2149 chrXVI 622097 . T A 824.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.297;DP=135;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQ0=0;MQRankSum=-6.506;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.483;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,54:135:99:854,0,1898 chrXVI 622243 . T C 1571.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.331;DP=157;Dels=0.00;FS=8.120;HaplotypeScore=4.7566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.576;SB=-3.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:157:99:1601,0,1864 chrXVI 622365 . G C 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;DP=134;Dels=0.00;FS=2.204;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.512;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.186;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,76:134:99:1559,0,1184 chrXVI 622376 . A C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.333;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.43;MQ0=0;MQRankSum=-4.140;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.698;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,73:139:99:1312,0,1499 chrXVI 622409 . G T 1431.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.820;DP=141;Dels=0.00;FS=2.113;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.17;MQ0=0;MQRankSum=-5.408;QD=10.15;ReadPosRankSum=-2.930;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,71:141:99:1461,0,1492 chrXVI 622429 . A G 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.824;DP=124;Dels=0.00;FS=5.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQ0=0;MQRankSum=-4.873;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.491;SB=-4.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1139,0,1537 chrXVI 622481 . A G 1681.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.606;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.898;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1711,0,1522 chrXVI 622681 . G C 1261.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;DP=139;Dels=0.00;FS=9.239;HaplotypeScore=3.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.649;SB=-4.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1291,0,1644 chrXVI 622687 . A T 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.149;DP=137;Dels=0.00;FS=6.451;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.683;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1366,0,1662 chrXVI 622781 . G C 1259.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;DP=130;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=2.7412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.509;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1289,0,1554 chrXVI 622904 . T A 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.302;DP=131;Dels=0.00;FS=4.175;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1370,0,1434 chrXVI 622919 . A C 1356.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.877;DP=148;Dels=0.00;FS=2.969;HaplotypeScore=2.9458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-6.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,71:148:99:1386,0,1747 chrXVI 622932 . T C 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.110;DP=136;Dels=0.00;FS=10.746;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-6.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1287,0,1688 chrXVI 623041 . T G 1546.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.161;DP=162;Dels=0.00;FS=6.797;HaplotypeScore=3.9737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.925;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,79:162:99:1576,0,1753 chrXVI 623043 . T C 1430.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.654;DP=165;Dels=0.00;FS=4.599;HaplotypeScore=3.9737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.045;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,81:165:99:1460,0,1774 chrXVI 623045 . C T 1461.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.738;DP=161;Dels=0.00;FS=3.711;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.364;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:1491,0,1744 chrXVI 623051 . A C 1631.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.071;DP=159;Dels=0.00;FS=4.787;HaplotypeScore=2.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.763;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,78:159:99:1661,0,1742 chrXVI 623220 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.248;DP=119;Dels=0.00;FS=0.705;HaplotypeScore=6.3417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.343;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1163,0,1129 chrXVI 623258 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.329;DP=121;Dels=0.01;FS=4.423;HaplotypeScore=13.6091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=1;MQRankSum=0.603;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.098;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1173,0,1227 chrXVI 623271 . T A 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;DP=117;Dels=0.00;FS=3.427;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=1;MQRankSum=0.136;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.529;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1256,0,1300 chrXVI 623671 . A C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.906;DP=133;Dels=0.00;FS=7.043;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.543;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,70:133:99:1452,0,1462 chrXVI 623705 . C T 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.044;DP=125;Dels=0.01;FS=17.303;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=1.926;QD=10.61;ReadPosRankSum=2.146;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,62:124:99:1356,0,1394 chrXVI 623824 . C G 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;DP=99;Dels=0.00;FS=3.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,54:99:99:1176,0,903 chrXVI 624175 . T C 1518.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.392;DP=140;Dels=0.00;FS=2.161;HaplotypeScore=3.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.999;SB=-7.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1548,0,1548 chrXVI 624238 . G C 3354.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.60;SB=-1.481e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3354,325,0 chrXVI 624388 . A T 1773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;DP=144;Dels=0.00;FS=3.032;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.313;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,82:144:99:1803,0,1362 chrXVI 624466 . T A 1550.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.304;DP=152;Dels=0.00;FS=3.152;HaplotypeScore=3.5536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.20;ReadPosRankSum=-2.548;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:1580,0,1718 chrXVI 624496 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.200;DP=135;Dels=0.01;FS=0.710;HaplotypeScore=7.4745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.443;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:134:99:1383,0,1407 chrXVI 624739 . G A 4337.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.191e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,156:156:99:4337,421,0 chrXVI 624882 . C G 1241.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.249;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.573;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:1271,0,1193 chrXVI 625038 . G A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.246;DP=112;Dels=0.00;FS=0.735;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.504;SB=-6.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,67:112:99:1676,0,912 chrXVI 625108 . C A 1117.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.936;DP=103;Dels=0.00;FS=2.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.914;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1147,0,1139 chrXVI 625483 . C A 777.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.089;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.294;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,36:71:99:807,0,748 chrXVI 625519 . G C 707.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;DP=76;Dels=0.00;FS=6.637;HaplotypeScore=3.7045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=9.30;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:99:737,0,864 chrXVI 625590 . A G 1429.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.457;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.743;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,69:142:99:1459,0,1595 chrXVI 625606 . A T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;DP=133;Dels=0.00;FS=1.466;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.736;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,61:133:99:1317,0,1569 chrXVI 626374 . G A 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.27;MQ0=0;QD=26.78;SB=-1.827e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:3615,355,0 chrXVI 627372 . T C 3549.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.55;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.825e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3549,346,0 chrXVI 627426 . G A 3805.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:3805,370,0 chrXVI 627537 . C G 3352.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.59;SB=-1.515e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3352,333,0 chrXVI 627554 . G T 3537.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3537,346,0 chrXVI 627833 . G A 1215.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.435;DP=121;Dels=0.00;FS=15.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.921;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1245,0,1459 chrXVI 627865 . T C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.193;DP=138;Dels=0.00;FS=3.228;HaplotypeScore=5.5538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=2.159;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.026;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1373,0,1627 chrXVI 628182 . G A 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.338;DP=134;Dels=0.00;FS=4.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.792;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-6.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,61:134:99:1040,0,1652 chrXVI 628335 . G A 1762.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.116;DP=142;Dels=0.00;FS=0.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.308;SB=-8.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,79:142:99:1792,0,1172 chrXVI 628338 . A C 1536.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.755;DP=145;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=1.865;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-9.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,81:145:99:1566,0,1317 chrXVI 628342 . C A 1553.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.506;DP=153;Dels=0.00;FS=1.272;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=2.426;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.569;SB=-1.014e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,83:153:99:1583,0,1395 chrXVI 629640 . G C 2770 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2803,291,0 chrXVI 629712 . G A 2921 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=28.09;SB=-1.278e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2954,283,0 chrXVI 629722 . A C 2856 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.94;SB=-1.228e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2889,282,0 chrXVI 630078 . T C 3936.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.84;MQ0=0;QD=26.96;SB=-1.705e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3936,385,0 chrXVI 631047 . G A 2649 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=27.59;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:2682,262,0 chrXVI 631122 . C T 2439 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=26.80;SB=-1.127e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:91:99:2472,240,0 chrXVI 631250 . T C 1704 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.90;MQ0=0;QD=25.43;SB=-7.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:1737,165,0 chrXVI 631283 . C T 62.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;DP=74;Dels=0.00;FS=29.407;HaplotypeScore=29.6388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.89;MQ0=0;MQRankSum=-4.841;QD=0.84;ReadPosRankSum=-5.351;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:92:92,0,1391 chrXVI 631285 . C T 46.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;DP=72;Dels=0.00;FS=31.299;HaplotypeScore=28.6521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.58;MQ0=0;MQRankSum=-5.116;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.938;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:76:76,0,1354 chrXVI 631328 . A C 112.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.644;DP=116;Dels=0.00;FS=5.172;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=0.97;ReadPosRankSum=-2.272;SB=-6.523e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,8:116:58:142,0,58 chrXVI 631883 . A T 3075 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=0;QD=28.74;SB=-1.588e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3108,307,0 chrXVI 631944 . G A 4364.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.28;SB=-2.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4364,433,0 chrXVI 635876 . T C 4019.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=27.34;SB=-2.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:4019,412,0 chrXVI 640589 . A G 3035 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=23.17;SB=-1.603e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3068,324,0 chrXVI 640757 . G A 3630.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.39;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.308e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3630,346,0 chrXVI 645773 . C T 4563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=28.34;SB=-2.247e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:161:99:4563,445,0 chrXVI 647721 . T C 3685.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.69;MQ0=1;QD=27.30;SB=-1.130e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3685,367,0 chrXVI 648617 . C T 3516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.51;MQ0=0;QD=26.84;SB=-1.830e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3516,355,0 chrXVI 651288 . G A 3130 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=26.75;SB=-1.670e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3163,319,0 chrXVI 652919 . A T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.658;DP=133;Dels=0.00;FS=2.196;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.848;SB=-6.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,57:133:99:1199,0,1747 chrXVI 653703 . T A 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.990;DP=151;Dels=0.00;FS=2.954;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.695;SB=-6.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,65:151:99:1456,0,1953 chrXVI 653824 . C T 1749.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.346;DP=143;Dels=0.00;FS=1.653;HaplotypeScore=1.7791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.298;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,83:142:99:1779,0,1273 chrXVI 654359 . A G 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.305;DP=138;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=1.8188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.434;SB=-7.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1511,0,1520 chrXVI 655978 . C T 1112.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.248;DP=110;Dels=0.00;FS=0.720;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.779;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1142,0,1236 chrXVI 657221 . G A 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.115;DP=110;Dels=0.00;FS=4.849;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.171;SB=-3.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1095,0,1254 chrXVI 657450 . G T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.608;DP=105;Dels=0.00;FS=1.592;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.200;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,64:105:99:1429,0,726 chrXVI 659088 . A G 1698.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;DP=120;Dels=0.00;FS=15.135;HaplotypeScore=7.3641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.319;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,80:120:99:1728,0,723 chrXVI 659394 . C T 979.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.924;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.615;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,46:110:99:1009,0,1549 chrXVI 659469 . C G 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-4.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,57:113:99:1329,0,1098 chrXVI 661094 . C T 1097.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.239;DP=91;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.641;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1127,0,908 chrXVI 662450 . C T 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.681;DP=112;Dels=0.00;FS=2.409;HaplotypeScore=2.8215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=9.52;ReadPosRankSum=2.736;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:1096,0,1433 chrXVI 663036 . A G 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.241;DP=110;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.155;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1093,0,1273 chrXVI 663399 . G T 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;DP=93;Dels=0.00;FS=1.673;HaplotypeScore=5.7725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.652;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,51:93:99:1113,0,928 chrXVI 663549 . C T 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.618;DP=103;Dels=0.00;FS=3.733;HaplotypeScore=5.8856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.933;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:103:99:1440,0,840 chrXVI 664333 . T G 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.643;DP=117;Dels=0.00;FS=2.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.064;SB=-4.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:915,0,1647 chrXVI 664479 . T C 1106.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.063;DP=106;Dels=0.00;FS=1.562;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.088;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,53:106:99:1136,0,1152 chrXVI 664738 . T C 1452.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.409;DP=160;Dels=0.00;FS=4.686;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=2.698;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.996;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,70:160:99:1482,0,1981 chrXVI 665441 . A G 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.60;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3000,303,0 chrXVI 665472 . T C 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.21;MQ0=0;QD=24.70;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2775,291,0 chrXVI 665628 . T C 2601 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.223e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2634,273,0 chrXVI 665970 . A G 3225.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=1;QD=25.20;SB=-9.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3258,330,0 chrXVI 666286 . T C 3341.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.87;MQ0=0;QD=26.52;SB=-1.645e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3341,342,0 chrXVI 666763 . G A 873.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.014;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:903,0,1063 chrXVI 666924 . T C 3129 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.15;MQ0=0;QD=25.65;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:122:99:3162,318,0 chrXVI 667335 . T C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;DP=114;Dels=0.00;FS=6.814;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.454;SB=-3.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,53:114:99:1065,0,1316 chrXVI 667416 . C T 1212.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.747;DP=134;Dels=0.00;FS=18.145;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.761;SB=-6.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,58:134:99:1242,0,1751 chrXVI 667477 . G T 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.630;DP=132;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=1.9861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.847;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,73:132:99:1589,0,1288 chrXVI 668437 . C T 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.505;DP=121;Dels=0.00;FS=5.702;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.620;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1479,0,1146 chrXVI 668452 . A G 1442.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.694;DP=125;Dels=0.00;FS=3.340;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.053;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,76:125:99:1472,0,1130 chrXVI 668458 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.357;DP=119;Dels=0.00;FS=5.754;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.514;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,72:119:99:1569,0,992 chrXVI 668615 . C T 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.182;DP=114;Dels=0.00;FS=3.563;HaplotypeScore=1.6584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.216;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,46:114:99:961,0,1488 chrXVI 669067 . C T 2984 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.22;MQ0=0;QD=27.89;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:3017,306,0 chrXVI 672182 . T C 923.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.128;DP=106;Dels=0.00;FS=2.550;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.082;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:953,0,1233 chrXVI 672581 . T C 1226.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.969;DP=110;Dels=0.00;FS=14.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.253;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1256,0,1240 chrXVI 672774 . G A 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.442;DP=133;Dels=0.00;FS=4.196;HaplotypeScore=4.6544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=13.04;ReadPosRankSum=-1.232;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,75:133:99:1764,0,1227 chrXVI 672815 . G C 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.661;DP=121;Dels=0.00;FS=1.494;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.146;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,74:121:99:1638,0,944 chrXVI 672828 . G A 1863.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.840;DP=126;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=4.7100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=2.562;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.120;SB=-8.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,77:126:99:1893,0,969 chrXVI 672860 . C G 1523.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;DP=123;Dels=0.00;FS=7.066;HaplotypeScore=2.6306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:123:99:1553,0,1066 chrXVI 672902 . A T 1588.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;DP=125;Dels=0.00;FS=9.733;HaplotypeScore=3.8491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.345;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,68:125:99:1618,0,1210 chrXVI 672946 . A G 1722.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.541;DP=131;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.556;SB=-8.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,78:131:99:1752,0,1129 chrXVI 672984 . A G 1665.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.922;DP=131;Dels=0.00;FS=0.663;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.035;SB=-8.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,78:131:99:1695,0,1134 chrXVI 672989 . T C 1704.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.493;DP=134;Dels=0.00;FS=2.231;HaplotypeScore=6.6754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.359;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,79:134:99:1734,0,1143 chrXVI 673059 . A C 2072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.651;DP=138;Dels=0.00;FS=2.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.325;SB=-7.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,89:138:99:2102,0,1028 chrXVI 673106 . C T 2233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.762;DP=159;Dels=0.00;FS=1.291;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.073;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,99:159:99:2263,0,1241 chrXVI 673127 . T A 1219.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;DP=146;Dels=0.00;FS=3.947;HaplotypeScore=2.9824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.146;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,62:146:99:1249,0,2001 chrXVI 673135 . A G 1814.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.177;DP=137;Dels=0.00;FS=7.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.116;SB=-8.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,81:137:99:1844,0,1225 chrXVI 673136 . A T 1867.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.273;DP=137;Dels=0.00;FS=7.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.125;SB=-8.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,81:137:99:1897,0,1245 chrXVI 673223 . T C 1338.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.947;DP=129;Dels=0.00;FS=7.957;HaplotypeScore=1.6545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.252;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1368,0,1431 chrXVI 673254 . C T 1296.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.515;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=9.39;ReadPosRankSum=3.007;SB=-6.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,66:138:99:1326,0,1625 chrXVI 673427 . T C 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.939;DP=126;Dels=0.00;FS=0.666;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.351;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,65:126:99:1336,0,1312 chrXVI 673484 . C T 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.474;DP=128;Dels=0.00;FS=3.258;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.137;SB=-4.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1295,0,1539 chrXVI 673534 . A G 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.875;DP=129;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=6.9426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=7.66;ReadPosRankSum=-2.006;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,51:129:99:1018,0,1863 chrXVI 673678 . A G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.382;DP=125;Dels=0.00;FS=2.279;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1226,0,1436 chrXVI 673689 . A T 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.059;DP=128;Dels=0.00;FS=0.684;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.938;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1383,0,1573 chrXVI 673927 . A G 1597.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.972;DP=137;Dels=0.00;FS=10.817;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.386;SB=-6.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,80:137:99:1627,0,1260 chrXVI 674290 . A G 1660.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;DP=146;Dels=0.00;FS=7.340;HaplotypeScore=2.9195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.239;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,77:146:99:1690,0,1501 chrXVI 674320 . A G 1217.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.475;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.217;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1247,0,1435 chrXVI 674371 . C T 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.105;DP=141;Dels=0.00;FS=6.179;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.085;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,66:141:99:1397,0,1623 chrXVI 674569 . G A 773.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.692;DP=95;Dels=0.00;FS=0.781;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.639;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.283;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:803,0,1285 chrXVI 674810 . G A 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.159;DP=152;Dels=0.00;FS=2.319;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=1;MQRankSum=1.509;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,71:152:99:1511,0,1765 chrXVI 674847 . G C 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;DP=166;Dels=0.00;FS=6.418;HaplotypeScore=3.9798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=2.212;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.817;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,80:166:99:1708,0,1928 chrXVI 675659 . T A 1745.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.149;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,80:140:99:1775,0,1350 chrXVI 675869 . A C 1608 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.91;MQ0=0;QD=18.27;SB=-7.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:1641,174,0 chrXVI 676149 . C T 1616.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.256;DP=139;Dels=0.00;FS=5.086;HaplotypeScore=3.8313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.596;SB=-7.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,69:139:99:1646,0,1422 chrXVI 676681 . C T 1092.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.029;DP=126;Dels=0.00;FS=8.492;HaplotypeScore=3.6471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.741;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,58:126:99:1122,0,1436 chrXVI 676735 . G T 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.989;DP=120;Dels=0.01;FS=0.710;HaplotypeScore=2.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=9.26;ReadPosRankSum=2.398;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1141,0,1497 chrXVI 676907 . C T 1358.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.158;DP=140;Dels=0.00;FS=1.336;HaplotypeScore=4.2444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.219;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.577;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1388,0,1494 chrXVI 677178 . G A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.740;DP=139;Dels=0.00;FS=0.661;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=11.01;ReadPosRankSum=2.454;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,70:139:99:1560,0,1517 chrXVI 678569 . T C 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.394;DP=132;Dels=0.00;FS=2.240;HaplotypeScore=6.8564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.221;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1079,0,1724 chrXVI 679094 . T C 1190.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.782;DP=119;Dels=0.00;FS=8.506;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.730;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.922;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1220,0,1324 chrXVI 679300 . A C 1849.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.935;DP=152;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=4.4733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=12.16;ReadPosRankSum=-1.113;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,85:152:99:1879,0,1471 chrXVI 679524 . T G 1366.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;DP=117;Dels=0.00;FS=3.643;HaplotypeScore=5.9631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.293;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:1396,0,1119 chrXVI 679897 . G A 1299.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.190;DP=120;Dels=0.01;FS=7.339;HaplotypeScore=8.8355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.523;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,60:119:99:1329,0,1289 chrXVI 680046 . A G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.080;DP=143;Dels=0.00;FS=1.424;HaplotypeScore=1.7853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.726;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1433,0,1608 chrXVI 680526 . A C 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.844;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,71:149:99:1533,0,1836 chrXVI 681149 . T A 1862.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=138;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=1.8614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,84:138:99:1892,0,1167 chrXVI 681810 . A G 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.225;DP=129;Dels=0.00;FS=2.377;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.279;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,65:129:99:1378,0,1434 chrXVI 682840 . G A 1539.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.832;DP=122;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.611;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,68:122:99:1569,0,1178 chrXVI 684164 . A G 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.470;DP=108;Dels=0.00;FS=1.547;HaplotypeScore=4.9767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=9.51;ReadPosRankSum=-1.198;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1057,0,1252 chrXVI 684460 . A G 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.449;DP=102;Dels=0.00;FS=3.755;HaplotypeScore=7.4653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.780;SB=-3.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:935,0,1259 chrXVI 686122 . G A 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.615;DP=87;Dels=0.00;FS=0.824;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.642;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,36:87:99:761,0,1153 chrXVI 687687 . C T 1439.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.846;DP=137;Dels=0.00;FS=5.264;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.014;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1469,0,1503 chrXVI 688163 . A T 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.965;DP=81;Dels=0.00;FS=2.208;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.921;SB=-1.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:915,0,935 chrXVI 688677 . G A 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.166;DP=107;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=7.9194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=1;MQRankSum=0.428;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.714;SB=-5.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1067,0,1196 chrXVI 688937 . C A 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.514;DP=120;Dels=0.00;FS=8.450;HaplotypeScore=3.8571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1272,0,1261 chrXVI 689525 . T A 1416.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.233;DP=140;Dels=0.00;FS=0.626;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=2.344;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.923;SB=-7.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:1446,0,1538 chrXVI 689786 . C T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.732;DP=127;Dels=0.00;FS=2.268;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.671;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1423,0,1429 chrXVI 689835 . G A 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.611;DP=112;Dels=0.00;FS=0.726;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=10.12;ReadPosRankSum=2.585;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1163,0,1342 chrXVI 691402 . A G 1482.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.589;DP=147;Dels=0.00;FS=2.107;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.482;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1512,0,1644 chrXVI 691472 . G C 3489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.20;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1.878e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3489,354,0 chrXVI 691826 . T G 1823.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.314;DP=158;Dels=0.00;FS=3.031;HaplotypeScore=4.9086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.245;QD=11.54;ReadPosRankSum=-2.590;SB=-6.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,87:158:99:1853,0,1574 chrXVI 692056 . A G 1956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.623;DP=179;Dels=0.00;FS=2.775;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.126;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,95:179:99:1986,0,1830 chrXVI 693567 . T G 1755.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;DP=147;Dels=0.00;FS=11.006;HaplotypeScore=7.6934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.554;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:1785,0,1478 chrXVI 693600 . C T 4168.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7019;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.55;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.817e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4168,409,0 chrXVI 693603 . A G 1654.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.027;DP=150;Dels=0.00;FS=2.960;HaplotypeScore=5.7019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=2.496;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.980;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,81:150:99:1684,0,1567 chrXVI 693803 . A G 3396.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.17;SB=-1.037e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:125:99:3396,346,0 chrXVI 694928 . G A 1494.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.333;DP=150;Dels=0.00;FS=2.032;HaplotypeScore=2.7579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.042;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,70:150:99:1524,0,1688 chrXVI 695201 . A C 4190.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.19;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:4190,430,0 chrXVI 695332 . C T 2079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.924;DP=179;Dels=0.00;FS=3.753;HaplotypeScore=3.6122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=3.150;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.684;SB=-7.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,103:179:99:2109,0,1596 chrXVI 695418 . G C 985.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;DP=112;Dels=0.00;FS=10.963;HaplotypeScore=3.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1015,0,1373 chrXVI 695543 . G C 1232.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;DP=123;Dels=0.00;FS=0.673;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=10.02;ReadPosRankSum=1.131;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1262,0,1371 chrXVI 697060 . C T 1419.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.676;DP=155;Dels=0.00;FS=2.030;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.873;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,68:155:99:1449,0,1879 chrXVI 697573 . A T 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;DP=117;Dels=0.00;FS=8.755;HaplotypeScore=2.5608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.587;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1269,0,1350 chrXVI 697775 . C T 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3460;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3822,382,0 chrXVI 698008 . T C 908.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.433;DP=110;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.305;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:938,0,1491 chrXVI 698565 . A G 2004 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=17.43;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2037,210,0 chrXVI 698637 . A C 1435.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.384;DP=129;Dels=0.00;FS=5.471;HaplotypeScore=5.4667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.897;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,71:129:99:1465,0,1308 chrXVI 699079 . G A 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.908;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.060;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1374,0,1285 chrXVI 700042 . A G 3490.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.09;MQ0=0;QD=26.24;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3490,352,0 chrXVI 700069 . T G 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.957;DP=143;Dels=0.01;FS=3.014;HaplotypeScore=5.8293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=8.21;ReadPosRankSum=-3.480;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1204,0,1748 chrXVI 700101 . A G 1524.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.506;DP=153;Dels=0.00;FS=4.871;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.465;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,78:153:99:1554,0,1664 chrXVI 700285 . T C 3318.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.32;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.227e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3318,337,0 chrXVI 700475 . A T 1393.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;DP=93;Dels=0.00;FS=4.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.489;SB=-7.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,61:93:99:1423,0,660 chrXVI 700480 . C T 2612 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.06;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.240e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2645,261,0 chrXVI 702998 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.347;DP=124;Dels=0.00;FS=1.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.150;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1237,0,1505 chrXVI 703365 . G A 1143.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.338;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=9.37;ReadPosRankSum=1.080;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1173,0,1469 chrXVI 704396 . G C 1673.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;DP=135;Dels=0.00;FS=2.211;HaplotypeScore=2.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.728;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,76:135:99:1703,0,1268 chrXVI 706194 . C T 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.151;DP=148;Dels=0.00;FS=0.637;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.054;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,69:148:99:1559,0,1732 chrXVI 707772 . C A 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.861;DP=148;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.582;SB=-4.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,63:148:99:1255,0,1834 chrXVI 707796 . T A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.553;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,59:137:99:1251,0,1808 chrXVI 711113 . A G 3526.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5675;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.582e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3526,355,0 chrXVI 711308 . G T 1186.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.732;DP=173;Dels=0.00;FS=4.006;HaplotypeScore=4.1373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.726;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,74:173:99:1216,0,1912 chrXVI 711619 . C G 2756 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.673;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.382;SB=-1.319e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:2789,265,0 chrXVI 711637 . T G 786.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.174;DP=111;Dels=0.00;FS=2.536;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.646;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.969;SB=-3.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,42:111:99:816,0,1589 chrXVI 715387 . A G 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.300;DP=111;Dels=0.00;FS=4.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.820;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.723;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1192,0,1317 chrXVI 717249 . C T 2796 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.38;SB=-1.131e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2829,279,0 chrXVI 718261 . G C 3329.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.51;SB=-1.685e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3329,334,0 chrXVI 720561 . C A 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.16;SB=-1.328e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2939,289,0 chrXVI 720834 . A T 3044 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.79;MQ0=0;QD=27.42;SB=-1.129e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3077,298,0 chrXVI 722078 . C G 1995 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.71;MQ0=0;QD=24.94;SB=-8.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:2028,207,0 chrXVI 723065 . T C 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.211;DP=114;Dels=0.00;FS=1.561;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1225,0,1382 chrXVI 724121 . A G 3017 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.64;MQ0=0;QD=26.01;SB=-1.586e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3050,312,0 chrXVI 724279 . T C 2663 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=25.61;SB=-1.241e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2696,279,0 chrXVI 724286 . C T 2763 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=24.67;SB=-1.411e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:112:99:2796,282,0 chrXVI 725082 . A T 4022.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81;SB=-1.816e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:4022,391,0 chrXVI 725291 . T A 3108 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.43;MQ0=0;QD=28.00;SB=-1.592e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:3141,301,0 chrXVI 725710 . G A 2959 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=27.40;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2992,289,0 chrXVI 726358 . G A 3103 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=24.43;SB=-1.566e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3136,307,0 chrXVI 726386 . C T 3502.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.66;MQ0=0;QD=27.15;SB=-9.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3502,346,0 chrXVI 726480 . A G 2648 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.42;MQ0=0;QD=23.86;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2681,279,0 chrXVI 729101 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.860;DP=139;Dels=0.00;FS=2.162;HaplotypeScore=5.6250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.808;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,66:139:99:1263,0,1470 chrXVI 729430 . T G 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.374;DP=120;Dels=0.00;FS=1.473;HaplotypeScore=5.8059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.260;SB=-5.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1203,0,1357 chrXVI 730198 . A G 1529.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.821;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.033;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,72:134:99:1559,0,1408 chrXVI 730292 . T C 2813 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=2;QD=25.12;SB=-1.312e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2846,291,0 chrXVI 730803 . A G 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.122;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.286;SB=-6.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1343,0,1207 chrXVI 732154 . C T 3806.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=28.19;SB=-1.800e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3806,370,0 chrXVI 732636 . T G 1761.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.719;DP=152;Dels=0.00;FS=2.119;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.794;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,85:152:99:1791,0,1477 chrXVI 733425 . G A 4188.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=28.68;SB=-1.891e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4188,406,0 chrXVI 733512 . A G 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.497;DP=157;Dels=0.00;FS=11.498;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.823;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,77:157:99:1597,0,1811 chrXVI 734148 . T A 3953.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.47;MQ0=0;QD=26.53;SB=-2.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:3953,385,0 chrXVI 735023 . T C 1155.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.160;DP=146;Dels=0.00;FS=1.371;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.028;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,57:146:99:1185,0,2024 chrXVI 735669 . A T 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;DP=116;Dels=0.00;FS=2.435;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.163;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:984,0,1607 chrXVI 736455 . A G 3440.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.841e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3440,357,0 chrXVI 736469 . T C 3019 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.434e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3052,307,0 chrXVI 736718 . C G 3553.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.71;SB=-1.124e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:133:99:3553,352,0 chrXVI 737218 . C T 4031.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80;SB=-1.677e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4031,391,0 chrXVI 738241 . A G 3782.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8857;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=27.01;SB=-1.783e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3782,367,0 chrXVI 739339 . C T 3678.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.30;MQ0=0;QD=26.46;SB=-1.847e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3678,361,0 chrXVI 739468 . C T 1469.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.263;DP=129;Dels=0.00;FS=4.202;HaplotypeScore=1.7074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.422;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1499,0,1396 chrXVI 739602 . A G 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.419;DP=111;Dels=0.00;FS=6.011;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=9.50;ReadPosRankSum=2.114;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1084,0,1255 chrXVI 739738 . G A 3169 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=25.76;SB=-1.352e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3202,313,0 chrXVI 740140 . G A 3807.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=27.99;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3807,361,0 chrXVI 741532 . T C 2906 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;QD=26.91;SB=-1.380e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2939,297,0 chrXVI 741944 . C G 2667 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.26;MQ0=0;QD=24.47;SB=-1.145e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2700,270,0 chrXVI 742069 . T A 3209.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=26.97;SB=-1.578e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3243,313,0 chrXVI 742334 . A G 2946 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.572e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:2979,312,0 chrXVI 742567 . T C 3530.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=27.15;SB=-1.467e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3530,355,0 chrXVI 743245 . A G 2487 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=25.38;SB=-7.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2520,264,0 chrXVI 743344 . C T 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.739;DP=111;Dels=0.00;FS=0.739;HaplotypeScore=4.9656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.279;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,45:111:99:894,0,1451 chrXVI 743518 . C T 3209 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7700;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1.506e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:120:99:3242,322,0 chrXVI 743973 . G A 2367 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8706;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.91;MQ0=0;QD=26.60;SB=-7.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:89:99:2400,243,0 chrXVI 743974 . C T 936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.920;DP=85;Dels=0.00;FS=3.095;HaplotypeScore=5.8706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=11.01;ReadPosRankSum=2.008;SB=-2.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,42:85:99:966,0,945 chrXVI 744198 . A C 1936.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.489;DP=168;Dels=0.00;FS=4.639;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.046;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1966,0,1754 chrXVI 744403 . A C 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=26.18;ReadPosRankSum=-0.719;SB=-1.213e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:3404,315,0 chrXVI 744410 . A C 3217.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=24.94;ReadPosRankSum=-1.061;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,128:129:99:3250,295,0 chrXVI 744459 . A G 3009 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.664;SB=-9.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3042,289,0 chrXVI 744531 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.29;SB=-1.536e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3265,342,0 chrXVI 744598 . C T 3531.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.82;MQ0=0;QD=28.25;SB=-1.736e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3531,349,0 chrXVI 744716 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.490;DP=107;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=2.5584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.150;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,65:107:99:1494,0,881 chrXVI 744835 . G T 1629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.862;DP=125;Dels=0.00;FS=2.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.392;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,72:125:99:1659,0,1105 chrXVI 744935 . C A 2973 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28;SB=-1.269e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:3006,298,0 chrXVI 745623 . C T 1454.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;DP=116;Dels=0.00;FS=1.624;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.257;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.036;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,66:116:99:1484,0,1079 chrXVI 745701 . T C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.377;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.114;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:1081,0,1561 chrXVI 745879 . C T 2016 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.88;SB=-1.032e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2049,195,0 chrXVI 745885 . G A 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.720;DP=74;Dels=0.00;FS=4.893;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=15.07;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,49:74:99:1145,0,436 chrXVI 745923 . C A 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.149;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=2.620;QD=13.11;ReadPosRankSum=1.253;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,50:84:99:1131,0,644 chrXVI 746245 . C T 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.088;DP=121;Dels=0.00;FS=0.681;HaplotypeScore=6.6987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.091;SB=-5.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,53:121:99:1081,0,1485 chrXVI 746530 . G A 3125 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.80;MQ0=0;QD=25.20;SB=-1.553e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3158,322,0 chrXVI 747237 . G A 3048 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=24.98;SB=-1.750e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3081,304,0 chrXVI 747480 . G A 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.086;DP=107;Dels=0.00;FS=3.717;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.153;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1071,0,1331 chrXVI 747487 . A G 2703 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99;SB=-1.156e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2736,276,0 chrXVI 748400 . C T 3520.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.94;SB=-1.666e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3520,343,0 chrXVI 748650 . C T 3733.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8513;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.36;MQ0=0;QD=28.72;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3733,370,0 chrXVI 748874 . C T 3616.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.82;SB=-1.445e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3616,343,0 chrXVI 748946 . C T 3680.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=27.46;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3680,364,0 chrXVI 749787 . A G 3082 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34;SB=-1.549e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3115,324,0 chrXVI 749875 . C T 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.452;DP=140;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.842;SB=-8.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1567,0,1530 chrXVI 750029 . C T 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.985;DP=145;Dels=0.00;FS=5.105;HaplotypeScore=4.8427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=1;MQRankSum=0.642;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-9.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,79:145:99:1610,0,1404 chrXVI 750118 . C T 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.058;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.464;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1175,0,1648 chrXVI 750180 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.478;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=2.402;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.696;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,62:155:99:1295,0,2163 chrXVI 750369 . C T 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.615;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.250;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:1458,0,1461 chrXVI 750465 . A G 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.035;DP=132;Dels=0.00;FS=7.866;HaplotypeScore=3.7523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.860;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1414,0,1410 chrXVI 750588 . T C 1207.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.685;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.203;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1237,0,1544 chrXVI 750734 . A G 3774.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=26.21;SB=-1.488e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3774,373,0 chrXVI 750943 . C G 2766 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2799,288,0 chrXVI 751080 . C G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.978;DP=133;Dels=0.00;FS=4.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.507;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1246,0,1538 chrXVI 751272 . A G 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.531;DP=149;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.550;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:1332,0,1962 chrXVI 751308 . T A 1866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.660;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,81:147:99:1896,0,1476 chrXVI 751988 . A T 1603.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.945;DP=156;Dels=0.00;FS=13.764;HaplotypeScore=3.9416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.464;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1633,0,1929 chrXVI 752166 . C A 2967 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=27.47;SB=-1.086e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:3000,286,0 chrXVI 752508 . T C 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=26.44;SB=-1.424e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3259,319,0 chrXVI 753099 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.205;DP=123;Dels=0.00;FS=3.305;HaplotypeScore=2.5577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.272;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1215,0,1475 chrXVI 753173 . G A 2646 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=87.9522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=27.00;SB=-1.482e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2679,259,0 chrXVI 753479 . A C 2980 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=10.8926;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.402e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:3013,306,0 chrXVI 753634 . G A 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.519;DP=140;Dels=0.00;FS=3.998;HaplotypeScore=3.4423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.113;SB=-8.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:1595,0,1483 chrXVI 753640 . C T 4051.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=28.13;SB=-2.069e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:4051,403,0 chrXVI 754681 . G A 4883.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7187;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=26.98;SB=-2.264e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:181:99:4883,472,0 chrXVI 754744 . T A 4171.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.44;SB=-1.883e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:152:99:4171,421,0 chrXVI 754869 . A G 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.095;DP=148;Dels=0.00;FS=14.956;HaplotypeScore=2.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.892;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,76:148:99:1452,0,1682 chrXVI 755194 . C T 4084.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.63;MQ0=1;QD=25.85;SB=-2.316e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:4084,400,0 chrXVI 755227 . G T 1565.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.541;DP=141;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=1;MQRankSum=-1.040;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.848;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,70:141:99:1595,0,1570 chrXVI 755422 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.545;DP=104;Dels=0.00;FS=2.809;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.078;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,49:104:99:1145,0,1200 chrXVI 755594 . T G 1240.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;DP=122;Dels=0.00;FS=2.330;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.646;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1270,0,1400 chrXVI 755692 . C T 3934.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.62;MQ0=0;QD=26.76;SB=-2.068e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3934,382,0 chrXVI 755818 . C T 4089.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=25.72;SB=-1.761e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4089,388,0 chrXVI 756190 . C T 4043.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.54;MQ0=0;QD=27.88;SB=-1.342e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:4043,403,0 chrXVI 756770 . G A 3412.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.08;SB=-1.749e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3412,316,0 chrXVI 757135 . G T 2893 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=25.38;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2926,280,0 chrXVI 757653 . T C 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.960;DP=154;Dels=0.00;FS=17.970;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=9.56;ReadPosRankSum=-1.276;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,71:154:99:1502,0,1926 chrXVI 757669 . A G 1457.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.541;DP=144;Dels=0.00;FS=11.637;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.010;SB=-5.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1487,0,1800 chrXVI 758082 . A G 1701.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.294;DP=174;Dels=0.00;FS=0.570;HaplotypeScore=4.4341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=1;MQRankSum=1.727;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.997;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,87:174:99:1731,0,1863 chrXVI 758116 . G A 1485.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.296;DP=147;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=1;MQRankSum=-0.131;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.190;SB=-6.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,72:147:99:1515,0,1470 chrXVI 758284 . G A 1294.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.069;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=11.16;ReadPosRankSum=2.253;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1324,0,1248 chrXVI 758383 . C T 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.058;DP=103;Dels=0.00;FS=7.936;HaplotypeScore=5.7575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.429;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:995,0,1342 chrXVI 758616 . T C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.163;DP=170;Dels=0.00;FS=4.627;HaplotypeScore=2.9776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.098;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,66:170:99:1232,0,2320 chrXVI 758638 . A C 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.975;DP=167;Dels=0.00;FS=3.611;HaplotypeScore=3.6718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.498;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,67:167:99:1328,0,2266 chrXVI 758717 . T C 1258.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.897;DP=118;Dels=0.00;FS=21.432;HaplotypeScore=1.8633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.873;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.249;SB=-1.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:118:99:1288,0,1285 chrXVI 758824 . G T 2629 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.229e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2662,256,0 chrXVI 758917 . G C 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.196;DP=105;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.890;SB=-4.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1293,0,933 chrXVI 759062 . G A 1368.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.175;DP=131;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,62:131:99:1398,0,1513 chrXVI 759355 . C G 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.592;DP=132;Dels=0.00;FS=3.148;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.039;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,68:132:99:1492,0,1293 chrXVI 759400 . T G 4489.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.72;SB=-1.701e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4489,439,0 chrXVI 759469 . T G 3358.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.65;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3358,337,0 chrXVI 759538 . T A 1234.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;DP=115;Dels=0.00;FS=3.521;HaplotypeScore=7.7429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQ0=1;MQRankSum=0.060;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.468;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1264,0,1233 chrXVI 759544 . A T 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;DP=118;Dels=0.00;FS=8.823;HaplotypeScore=2.8467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=1;MQRankSum=-1.441;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.563;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,57:118:99:1100,0,1312 chrXVI 759776 . C A 1734.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.253;DP=154;Dels=0.00;FS=2.943;HaplotypeScore=3.5880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.350;SB=-7.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,78:154:99:1764,0,1649 chrXVI 759895 . C G 1712.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.122;DP=185;Dels=0.00;FS=1.958;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,86:185:99:1742,0,2205 chrXVI 759936 . G A 1677.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.254;DP=156;Dels=0.00;FS=1.258;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.142;SB=-8.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,75:156:99:1707,0,1796 chrXVI 760007 . C T 1633.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;DP=150;Dels=0.00;FS=4.092;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:1663,0,1647 chrXVI 760748 . T A 1458.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.005;DP=121;Dels=0.00;FS=0.713;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.254;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1488,0,1212 chrXVI 761009 . G C 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;DP=128;Dels=0.00;FS=1.410;HaplotypeScore=2.8212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:1089,0,1550 chrXVI 761136 . G A 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.337;DP=137;Dels=0.00;FS=2.149;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=9.00;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-7.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1263,0,1490 chrXVI 761180 . G A 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.954;DP=138;Dels=0.00;FS=3.098;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.558;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1429,0,1572 chrXVI 761580 . C T 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.928;DP=172;Dels=0.00;FS=15.262;HaplotypeScore=11.5711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=1;MQRankSum=0.377;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.222;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,78:172:99:1560,0,2076 chrXVI 761684 . T C 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.223;DP=150;Dels=0.00;FS=2.285;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.687;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,78:150:99:1714,0,1610 chrXVI 761833 . A T 1105.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;DP=102;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.321;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,51:102:99:1135,0,1105 chrXVI 761875 . T C 1323.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.671;DP=109;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.629;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,59:109:99:1353,0,1106 chrXVI 761908 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.285;DP=113;Dels=0.00;FS=2.412;HaplotypeScore=1.9512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.411;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,59:113:99:1295,0,1247 chrXVI 761972 . T A 1566.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.835;DP=154;Dels=0.00;FS=1.591;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.440;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,75:154:99:1596,0,1803 chrXVI 762178 . T C 1072.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.490;DP=94;Dels=0.00;FS=2.714;HaplotypeScore=2.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=1;MQRankSum=-0.219;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.227;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:1102,0,1009 chrXVI 762278 . C A 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.508;DP=144;Dels=0.00;FS=10.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=2.804;QD=11.64;ReadPosRankSum=-2.244;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1706,0,1510 chrXVI 762631 . A G 956.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.611;DP=94;Dels=0.00;FS=8.661;HaplotypeScore=1.9841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.322;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:986,0,969 chrXVI 762781 . T C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.517;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=1;MQRankSum=-0.975;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.136;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,69:132:99:1397,0,1429 chrXVI 763440 . T C 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.653;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.700;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1730,0,1529 chrXVI 763968 . G A 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.119;DP=136;Dels=0.00;FS=9.334;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.553;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,71:135:99:1660,0,1402 chrXVI 766166 . T A 1306.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.317;DP=121;Dels=0.00;FS=1.475;HaplotypeScore=3.9346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.859;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1336,0,1231 chrXVI 766340 . C A 3420.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.32;MQ0=0;QD=27.80;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3420,340,0 chrXVI 767513 . C T 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.932;DP=120;Dels=0.00;FS=11.751;HaplotypeScore=3.2328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.042;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,61:120:99:1435,0,1219 chrXVI 768045 . G A 3539.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.959;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=1;MQRankSum=1.626;QD=27.02;ReadPosRankSum=1.332;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,130:131:99:3539,337,0 chrXVI 769084 . A G 3138 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6585;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.75;MQ0=0;QD=21.49;SB=-1.154e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3171,318,0 chrXVI 769532 . G A 1582 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.83;MQ0=13;QD=16.14;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:1615,165,0 chrXVI 770162 . A T 1579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.379;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:128:99:1609,0,1340 chrXVI 770429 . A G 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.065;DP=113;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.379;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:994,0,1541 chrXVI 770664 . G A 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;DP=138;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=2.7499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1581,0,1497 chrXVI 770699 . T A 1760.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;DP=145;Dels=0.00;FS=6.202;HaplotypeScore=3.0818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.057;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.527;SB=-7.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,80:145:99:1790,0,1422 chrXVI 771896 . A C 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.800;DP=106;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.288;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,50:106:99:1018,0,1277 chrXVI 772265 . A G 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.017;DP=107;Dels=0.00;FS=1.580;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.543;QD=10.56;ReadPosRankSum=-1.256;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1160,0,1237 chrXVI 775111 . C T 3470.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=27.54;SB=-1.431e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3470,328,0 chrXVI 775873 . T G 3993.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.44;MQ0=0;QD=27.73;SB=-1.972e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3993,394,0 chrXVI 776032 . C A 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.913;DP=113;Dels=0.00;FS=3.711;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.096;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1616,0,961 chrXVI 776361 . G C 3369.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=26.53;SB=-1.340e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:3369,340,0 chrXVI 777332 . C T 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.757;DP=111;Dels=0.00;FS=4.724;HaplotypeScore=7.2005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.133;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,55:111:99:1070,0,1132 chrXVI 777410 . C T 2965 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.339e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:2998,295,0 chrXVI 777676 . C T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.316;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=10.55;ReadPosRankSum=2.254;SB=-4.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1190,0,1209 chrXVI 780119 . A C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;DP=126;Dels=0.00;FS=3.515;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.167;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:1231,0,1602 chrXVI 780140 . G A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.254;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.011;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,58:123:99:1347,0,1332 chrXVI 780448 . T C 1318.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.826;DP=120;Dels=0.00;FS=7.226;HaplotypeScore=2.4440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.144;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1348,0,1190 chrXVI 780642 . C A 1330.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.050;DP=109;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.246;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,58:109:99:1360,0,1099 chrXVI 780950 . G T 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;DP=99;Dels=0.00;FS=3.736;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=10.26;ReadPosRankSum=1.620;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1046,0,1141 chrXVI 781309 . A G 1257.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.954;DP=107;Dels=0.00;FS=1.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.260;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,59:107:99:1287,0,1025 chrXVI 782283 . A C 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.207;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1065,0,1503 chrXVI 783694 . G A 841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.373;DP=98;Dels=0.00;FS=2.750;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.371;SB=-3.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:871,0,1189 chrXVI 785197 . A G 3478.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15;SB=-1.630e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3478,345,0 chrXVI 785692 . G A 1437.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.702;DP=132;Dels=0.00;FS=4.629;HaplotypeScore=4.8600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.481;SB=-4.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:132:99:1467,0,1294 chrXVI 785737 . A G 3153 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=25.63;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:123:99:3186,330,0 chrXVI 786450 . T G 169.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=159;Dels=0.00;FS=27.484;HaplotypeScore=5.6235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.16;MQ0=0;MQRankSum=-6.406;QD=1.06;ReadPosRankSum=-6.941;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,26:159:99:199,0,2744 chrXVI 787292 . G A 1851.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.994;DP=141;Dels=0.00;FS=7.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.084;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.504;SB=-1.075e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,85:141:99:1881,0,1211 chrXVI 789289 . G A 1166.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;DP=142;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=4.0386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.129;SB=-6.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:142:99:1196,0,1137 chrXVI 789402 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.894;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.480;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:1001,0,1330 chrXVI 789549 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.243;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-4.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,60:121:99:1201,0,1438 chrXVI 789570 . T G 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.964;DP=139;Dels=0.00;FS=5.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.749;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1274,0,1726 chrXVI 789596 . A G 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.361;DP=124;Dels=0.00;FS=11.312;HaplotypeScore=1.8801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.663;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1060,0,1664 chrXVI 789769 . A C 696.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.378;DP=101;Dels=0.00;FS=14.105;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=6.89;ReadPosRankSum=2.767;SB=-3.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,40:101:99:726,0,1249 chrXVI 789770 . T C 628.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.781;DP=99;Dels=0.00;FS=10.524;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.968;QD=6.34;ReadPosRankSum=3.169;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,38:99:99:658,0,1238 chrXVI 789772 . A C 653.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.700;DP=101;Dels=0.00;FS=10.380;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.695;QD=6.47;ReadPosRankSum=2.934;SB=-3.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,38:101:99:683,0,1272 chrXVI 789773 . A T 678.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;DP=101;Dels=0.00;FS=10.300;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=6.71;ReadPosRankSum=2.745;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,38:101:99:708,0,1272 chrXVI 789774 . G T 693.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.309;DP=102;Dels=0.00;FS=10.403;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=6.79;ReadPosRankSum=2.848;SB=-3.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,38:102:99:723,0,1224 chrXVI 789776 . G A 698.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.867;DP=99;Dels=0.00;FS=14.262;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.209;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.973;SB=-3.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:728,0,1138 chrXVI 789777 . G T 727.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.029;DP=99;Dels=0.00;FS=12.090;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.967;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.203;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:757,0,1120 chrXVI 790006 . G A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.677;DP=111;Dels=0.00;FS=4.982;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=10.68;ReadPosRankSum=2.760;SB=-4.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,53:111:99:1215,0,1312 chrXVI 790106 . C G 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;DP=133;Dels=0.00;FS=0.651;HaplotypeScore=2.9602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.455;SB=-6.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,72:133:99:1574,0,1189 chrXVI 790606 . A G 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.392;DP=119;Dels=0.00;FS=5.965;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.826;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1023,0,1407 chrXVI 790660 . A C 3822.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.293e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:3822,388,0 chrXVI 790673 . C G 1480.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.995;DP=131;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=2.212;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.559;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1510,0,1436 chrXVI 790742 . A G 1517.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.049;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.968;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.341;SB=-5.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,75:132:99:1547,0,1304 chrXVI 790766 . A C 1684.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.335;DP=125;Dels=0.00;FS=0.756;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.179;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,75:125:99:1714,0,1119 chrXVI 790820 . C T 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.961;DP=128;Dels=0.00;FS=2.437;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.036;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1543,0,1299 chrXVI 790856 . T C 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.293;DP=122;Dels=0.00;FS=4.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.456;SB=-3.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1190,0,1521 chrXVI 790859 . A G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.747;DP=125;Dels=0.00;FS=3.397;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.763;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1156,0,1520 chrXVI 790872 . G A 1048.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.242;DP=125;Dels=0.00;FS=6.146;HaplotypeScore=4.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.931;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1078,0,1580 chrXVI 791229 . C G 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;DP=92;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.129;SB=-4.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,46:92:99:937,0,1004 chrXVI 791329 . A G 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.362;DP=152;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=4.8047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.004;SB=-7.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1571,0,1748 chrXVI 791787 . G A 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.728;DP=132;Dels=0.00;FS=4.140;HaplotypeScore=4.9718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,62:132:99:1373,0,1523 chrXVI 792404 . C A 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.746;DP=129;Dels=0.00;FS=6.001;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=1;MQRankSum=1.133;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.783;SB=-3.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1261,0,1486 chrXVI 792460 . C T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.840;DP=172;Dels=0.00;FS=13.796;HaplotypeScore=7.1725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-3.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,73:172:99:1527,0,2117 chrXVI 792467 . C T 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.952;DP=181;Dels=0.00;FS=10.441;HaplotypeScore=2.5310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.140;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,74:181:99:1507,0,2393 chrXVI 792647 . G A 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.580;DP=153;Dels=0.00;FS=3.803;HaplotypeScore=3.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.902;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,71:153:99:1462,0,1835 chrXVI 793048 . T C 971.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.094;DP=89;Dels=0.00;FS=0.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1001,0,914 chrXVI 793049 . T C 982.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.818;DP=89;Dels=0.00;FS=1.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,47:89:99:1012,0,899 chrXVI 793313 . A T 1086.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.065;DP=112;Dels=0.00;FS=5.819;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.076;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1116,0,1410 chrXVI 793555 . T G 2617 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.59;MQ0=0;QD=24.46;SB=-1.297e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:2650,273,0 chrXVI 793650 . G A 1372.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.367;DP=92;Dels=0.00;FS=1.720;HaplotypeScore=6.5418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=14.91;ReadPosRankSum=1.536;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,57:92:99:1402,0,661 chrXVI 793761 . T A 1213.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.795;DP=120;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.815;SB=-2.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1243,0,1395 chrXVI 793854 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.124;DP=130;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.017;SB=-8.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,72:129:99:1634,0,1248 chrXVI 793867 . G A 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.257;DP=124;Dels=0.00;FS=0.670;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.550;SB=-7.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,68:124:99:1529,0,1170 chrXVI 794337 . T C 1758.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.166;DP=153;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=2.503;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.421;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,84:153:99:1788,0,1482 chrXVI 794367 . G A 1694.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.664;DP=134;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.667;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,78:134:99:1724,0,1189 chrXVI 794674 . T A 1503.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;DP=164;Dels=0.00;FS=12.444;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=2.089;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.270;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,81:164:99:1533,0,1913 chrXVI 794702 . A T 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;DP=127;Dels=0.00;FS=3.195;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.760;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1408,0,1373 chrXVI 794728 . A G 1371.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.434;DP=138;Dels=0.00;FS=6.413;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.799;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:1401,0,1579 chrXVI 795138 . A G 2292 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.66;MQ0=0;QD=20.84;SB=-1.396e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:2325,264,0 chrXVI 795139 . G A 2293 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.63;MQ0=0;QD=21.04;SB=-1.353e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:2326,264,0 chrXVI 795157 . G A 2487 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.36;MQ0=0;QD=27.94;SB=-1.250e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:2520,244,0 chrXVI 795291 . G A 608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;DP=80;Dels=0.00;FS=1.866;HaplotypeScore=2.7139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:80:99:638,0,1115 chrXVI 795527 . T C 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.740;DP=136;Dels=0.00;FS=14.269;HaplotypeScore=2.8212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.905;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1334,0,1550 chrXVI 795782 . C T 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.205;DP=130;Dels=0.00;FS=5.259;HaplotypeScore=2.9858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.522;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1522,0,1263 chrXVI 796098 . A G 1374.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.400;DP=159;Dels=0.00;FS=1.997;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.275;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,70:159:99:1404,0,2065 chrXVI 796236 . T C 1034.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.242;DP=112;Dels=0.00;FS=0.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.776;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:1064,0,1452 chrXVI 796263 . T C 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;DP=109;Dels=0.00;FS=3.551;HaplotypeScore=2.9774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.361;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1222,0,1201 chrXVI 796824 . T C 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.113;DP=144;Dels=0.00;FS=6.269;HaplotypeScore=2.5494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.348;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,61:144:99:1285,0,1917 chrXVI 796878 . A T 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.956;DP=133;Dels=0.00;FS=3.140;HaplotypeScore=2.5395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.011;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:1303,0,1680 chrXVI 797063 . T C 555.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=74;Dels=0.00;FS=1.966;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.962;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.272;SB=-2.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:74:99:585,0,878 chrXVI 797065 . C T 130.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.671;DP=79;Dels=0.00;FS=1.880;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=-2.629;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.462;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:160,0,1068 chrXVI 797066 . C T 91.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.224;DP=79;Dels=0.00;FS=1.880;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=-2.092;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.621;SB=-2.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:121,0,1066 chrXVI 797069 . T C 144.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.627;DP=85;Dels=0.00;FS=2.909;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.73;MQ0=0;MQRankSum=-3.787;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.650;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:174,0,1158 chrXVI 797136 . C A 950.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.754;DP=113;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.742;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,45:113:99:980,0,1523 chrXVI 797247 . G A 1127.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.804;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.353;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1157,0,1407 chrXVI 797516 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.260;DP=111;Dels=0.00;FS=3.545;HaplotypeScore=2.8467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.343;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1273,0,1062 chrXVI 797530 . T C 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.140;DP=97;Dels=0.00;FS=1.680;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.220;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:1037,0,980 chrXVI 797712 . C T 931.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.067;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.193;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:961,0,1041 chrXVI 797859 . A G 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.664;DP=152;Dels=0.00;FS=1.282;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.711;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:1709,0,1664 chrXVI 797962 . A G 1639.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.913;DP=155;Dels=0.00;FS=6.996;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.628;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,81:155:99:1669,0,1572 chrXVI 797994 . G A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.223;DP=122;Dels=0.00;FS=8.236;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.426;SB=-7.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1438,0,1172 chrXVI 798071 . C T 1373.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.595;DP=119;Dels=0.00;FS=5.642;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.348;SB=-5.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1403,0,1265 chrXVI 798448 . A G 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.746;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.167;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,69:128:99:1413,0,1262 chrXVI 798490 . A C 1500.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.834;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.487;SB=-6.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1530,0,1409 chrXVI 798639 . G A 974.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.922;DP=131;Dels=0.00;FS=1.434;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.414;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,50:131:99:1004,0,1751 chrXVI 798827 . A G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.177;DP=136;Dels=0.00;FS=1.389;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.579;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:1315,0,1525 chrXVI 798911 . G A 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.946;DP=123;Dels=0.00;FS=5.696;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.607;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1217,0,1529 chrXVI 798952 . T C 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.438;DP=145;Dels=0.00;FS=0.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.707;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1462,0,1804 chrXVI 798977 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.880;DP=141;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.267;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.892;SB=-5.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,69:141:99:1466,0,1617 chrXVI 799015 . T A 1442.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.051;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.300;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.413;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1472,0,1633 chrXVI 799022 . A G 1230.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.255;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.103;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.376;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,65:135:99:1260,0,1595 chrXVI 799025 . C T 1307.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.598;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=-2.705;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.203;SB=-7.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1337,0,1580 chrXVI 799043 . G A 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.265;DP=119;Dels=0.00;FS=2.349;HaplotypeScore=1.5362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.320;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.545;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1150,0,1329 chrXVI 799159 . T C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.579;DP=160;Dels=0.00;FS=11.129;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.946;SB=-4.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,74:160:99:1312,0,2021 chrXVI 799215 . A G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.401;DP=140;Dels=0.00;FS=7.851;HaplotypeScore=1.8561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=8.21;ReadPosRankSum=-2.030;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,61:140:99:1180,0,1832 chrXVI 799432 . C T 1136.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;DP=124;Dels=0.00;FS=6.027;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.822;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.315;SB=-4.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1166,0,1568 chrXVI 799593 . T C 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.611;DP=106;Dels=0.00;FS=12.518;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-4.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,52:106:99:1059,0,1315 chrXVI 799713 . A C 1301.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.885;SB=-2.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,65:130:99:1331,0,1471 chrXVI 799851 . T C 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.154;DP=130;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.063;SB=-5.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1197,0,1496 chrXVI 799871 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.171;DP=125;Dels=0.00;FS=6.873;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.052;SB=-5.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,61:125:99:1304,0,1335 chrXVI 799893 . A G 1410.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.616;DP=153;Dels=0.00;FS=8.673;HaplotypeScore=2.5677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.782;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,70:153:99:1440,0,1831 chrXVI 799899 . T C 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.617;DP=146;Dels=0.00;FS=8.882;HaplotypeScore=2.3070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.643;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:1337,0,1824 chrXVI 800037 . C A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.021;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.983;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,67:123:99:1474,0,1228 chrXVI 800109 . G C 1000.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;DP=111;Dels=0.00;FS=4.625;HaplotypeScore=2.5243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.811;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1030,0,1168 chrXVI 800157 . C A 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.608;DP=109;Dels=0.00;FS=3.587;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.708;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1089,0,1242 chrXVI 800175 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.047;DP=144;Dels=0.00;FS=2.104;HaplotypeScore=2.7802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.634;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,66:144:99:1381,0,1724 chrXVI 800298 . A G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.633;DP=114;Dels=0.00;FS=4.579;HaplotypeScore=5.2653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.108;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1168,0,1360 chrXVI 800388 . G A 1545.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.353;DP=148;Dels=0.00;FS=0.619;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.684;SB=-7.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,75:148:99:1575,0,1573 chrXVI 800421 . A G 1216.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.032;DP=112;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=4.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=10.86;ReadPosRankSum=1.998;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:1246,0,1129 chrXVI 800486 . G A 1221.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.801;DP=119;Dels=0.00;FS=6.957;HaplotypeScore=2.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1251,0,1316 chrXVI 800493 . A G 1038.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.393;DP=110;Dels=0.00;FS=10.725;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.138;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1068,0,1385 chrXVI 800601 . G A 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.167;DP=98;Dels=0.00;FS=0.801;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=1;MQRankSum=1.289;QD=8.23;ReadPosRankSum=-2.180;SB=-3.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:837,0,1235 chrXVI 800727 . A G 1247.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.555;DP=123;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.058;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1277,0,1429 chrXVI 800844 . C T 1559.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.377;DP=142;Dels=0.00;FS=2.170;HaplotypeScore=4.8965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.657;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:1589,0,1374 chrXVI 800883 . A G 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.292;DP=123;Dels=0.00;FS=0.744;HaplotypeScore=4.9707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.718;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:1385,0,1387 chrXVI 800985 . C T 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.877;DP=138;Dels=0.00;FS=0.667;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1273,0,1588 chrXVI 801066 . G A 1317.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.276;DP=122;Dels=0.00;FS=0.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.056;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,63:122:99:1347,0,1282 chrXVI 801138 . C T 1820.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.734;DP=154;Dels=0.00;FS=2.020;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.338;SB=-8.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,82:154:99:1850,0,1481 chrXVI 801336 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;DP=135;Dels=0.00;FS=1.509;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.460;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1466,0,1533 chrXVI 801399 . A T 2023.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;DP=166;Dels=0.00;FS=3.710;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.240;SB=-8.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,93:165:99:2053,0,1510 chrXVI 801603 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.747;DP=111;Dels=0.00;FS=2.592;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.848;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,63:111:99:1407,0,987 chrXVI 801614 . T C 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;DP=100;Dels=0.00;FS=0.755;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.372;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:894,0,1347 chrXVI 801650 . C T 1133.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.731;DP=117;Dels=0.00;FS=10.224;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.194;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1163,0,1322 chrXVI 801741 . G A 1729.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.547;DP=164;Dels=0.00;FS=5.790;HaplotypeScore=1.6671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.438;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:1759,0,1814 chrXVI 801756 . C G 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.272;DP=161;Dels=0.00;FS=12.646;HaplotypeScore=5.3135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=1;MQRankSum=1.569;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.398;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,78:161:99:1675,0,1662 chrXVI 801885 . G A 1679.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.973;DP=141;Dels=0.00;FS=8.972;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.525;SB=-8.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1709,0,1359 chrXVI 801978 . T C 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.751;DP=106;Dels=0.00;FS=7.642;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.197;SB=-6.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,59:106:99:1300,0,1037 chrXVI 802039 . G A 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.439;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.476;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,72:119:99:1652,0,925 chrXVI 802139 . T G 1150.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.363;DP=105;Dels=0.00;FS=3.584;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.832;SB=-4.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1180,0,1079 chrXVI 802415 . A G 1954 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=25.05;SB=-8.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:1987,219,0 chrXVI 802526 . T G 642.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;DP=91;Dels=0.00;FS=5.270;HaplotypeScore=7.7317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.544;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:672,0,848 chrXVI 802577 . T C 817.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.034;DP=88;Dels=0.00;FS=7.019;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.217;SB=-4.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:847,0,829 chrXVI 802797 . C A 1504.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.028;DP=152;Dels=0.00;FS=0.604;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.636;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:1534,0,1686 chrXVI 802871 . C T 1462.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.273;DP=132;Dels=0.00;FS=1.407;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.343;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,70:132:99:1492,0,1305 chrXVI 802959 . A G 1307.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.372;DP=152;Dels=0.00;FS=0.594;HaplotypeScore=3.7962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.397;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:1337,0,1827 chrXVI 803543 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.218;DP=135;Dels=0.01;FS=0.675;HaplotypeScore=4.6154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.683;SB=-4.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:1333,0,1584 chrXVI 803590 . T C 3542.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.46;MQ0=0;QD=26.83;SB=-1.748e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3542,360,0 chrXVI 804027 . T C 1324.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.804;DP=115;Dels=0.00;FS=7.311;HaplotypeScore=2.5802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.881;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:1354,0,1146 chrXVI 804108 . G A 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.250;SB=-5.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,51:112:99:1075,0,1344 chrXVI 804249 . A T 1044.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=126;Dels=0.00;FS=2.287;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.457;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,51:126:99:1074,0,1702 chrXVI 804258 . T C 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.506;DP=112;Dels=0.00;FS=7.572;HaplotypeScore=3.6130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=2.461;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.173;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:933,0,1507 chrXVI 804292 . A T 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;DP=95;Dels=0.00;FS=3.969;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.715;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1023,0,1122 chrXVI 804352 . C T 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.245;DP=118;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=2.2859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.678;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1377,0,1287 chrXVI 804481 . T C 1054.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.624;DP=112;Dels=0.00;FS=3.426;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.66;MQ0=0;MQRankSum=1.952;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.435;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1084,0,1343 chrXVI 804583 . A G 812.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.468;DP=95;Dels=0.00;FS=8.398;HaplotypeScore=4.8414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.84;MQ0=1;MQRankSum=0.422;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.608;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:842,0,1187 chrXVI 810553 . T A 16.85 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.736;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:48,6,0 chrXVI 810562 . A G 80.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=13.42;SB=-8.555e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:113,12,0 chrXVI 810620 . G A 459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.810;DP=85;Dels=0.00;FS=0.866;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.82;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.372;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:85:99:489,0,963 chrXVI 810641 . A G 708.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.448;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.74;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.137;SB=-3.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,42:111:99:738,0,1558 chrXVI 810752 . T A 1597 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;DP=112;Dels=0.00;FS=1.518;HaplotypeScore=53.5991;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.55;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.140;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:51,61:112:99:1630,136,0 chrXVI 810774 . T G 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.603;DP=113;Dels=0.00;FS=0.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=10.66;ReadPosRankSum=-2.433;SB=-6.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,58:113:99:1235,0,1242 chrXVI 810785 . G A 1308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.544;DP=116;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.12;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.409;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1338,0,1253 chrXVI 811578 . A G 1181.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.815;DP=127;Dels=0.00;FS=0.664;HaplotypeScore=5.3300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.988;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1211,0,1652 chrXVI 812990 . T C 2665 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.146e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:2698,285,0 chrXVI 813147 . T C 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.70;MQ0=0;QD=27.02;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3404,343,0 chrXVI 813289 . T A 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.79;SB=-1.627e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3501,343,0 chrXVI 813347 . A T 3459.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.08;MQ0=0;QD=27.45;SB=-1.617e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3459,343,0 chrXVI 813633 . G A 4289.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=159;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.24;MQ0=0;QD=26.97;SB=-2.225e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,159:159:99:4289,409,0 chrXVI 814026 . A T 3753.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.28;MQ0=0;QD=27.60;SB=-1.230e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3753,364,0 chrXVI 814111 . T C 2707 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.45;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.537e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2740,276,0 chrXVI 816226 . G A 1464.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.897;DP=137;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1494,0,1403 chrXVI 816544 . T C 3689.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.84;MQ0=0;QD=25.27;SB=-1.475e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3689,373,0 chrXVI 818228 . G A 1551.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.171;DP=141;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.292;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,73:140:99:1581,0,1480 chrXVI 818309 . G T 1731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.458;DP=156;Dels=0.00;FS=2.879;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.177;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1761,0,1634 chrXVI 818975 . A G 907.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.557;DP=87;Dels=0.00;FS=7.086;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.497;SB=-3.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:937,0,993 chrXVI 819815 . T C 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.957;DP=111;Dels=0.00;FS=11.668;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-2.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1087,0,1330 chrXVI 820254 . T A 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.138;DP=108;Dels=0.00;FS=0.785;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.160;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,55:108:99:1215,0,1121 chrXVI 820797 . C T 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.050;DP=129;Dels=0.00;FS=9.426;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=11.97;ReadPosRankSum=1.685;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1574,0,1253 chrXVI 821253 . C T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.154;DP=113;Dels=0.00;FS=2.508;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.325;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1391,0,1102 chrXVI 821446 . T C 1134.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.960;DP=115;Dels=0.00;FS=4.571;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=9.86;ReadPosRankSum=-1.123;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:115:99:1164,0,1379 chrXVI 821491 . T G 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.747;DP=127;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=4.4588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=10.22;ReadPosRankSum=1.235;SB=-5.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1328,0,1284 chrXVI 821526 . C T 362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.151;DP=110;Dels=0.00;FS=4.731;HaplotypeScore=59.7436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.241;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,62:110:99:392,0,905 chrXVI 821582 . G A 1066.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.874;DP=107;Dels=0.00;FS=9.555;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.238;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,56:107:99:1096,0,1010 chrXVI 821586 . A G 885.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.030;DP=110;Dels=0.00;FS=10.842;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.241;SB=-4.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:915,0,1170 chrXVI 821598 . G C 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.937;DP=115;Dels=0.00;FS=5.856;HaplotypeScore=2.4471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.505;SB=-5.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,59:114:99:1176,0,1180 chrXVI 821710 . G T 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;DP=100;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.331;SB=-5.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1075,0,1096 chrXVI 821711 . A G 1035.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.041;DP=100;Dels=0.00;FS=0.749;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.028;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1065,0,1111 chrXVI 821888 . A G 1309.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.464;DP=119;Dels=0.00;FS=4.547;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.721;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:1339,0,1261 chrXVI 822003 . T C 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.216;DP=122;Dels=0.00;FS=7.090;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.129;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:984,0,1734 chrXVI 822297 . C G 2585 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.86;MQ0=0;QD=21.54;SB=-1.426e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:2618,261,0 chrXVI 822502 . C T 1400.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.061;DP=117;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.421;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.616;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1430,0,1175 chrXVI 822514 . G A 1479.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.298;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.990;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1509,0,1321 chrXVI 822549 . C G 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.529;DP=159;Dels=0.00;FS=1.309;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.719;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,75:159:99:1577,0,1854 chrXVI 822901 . A G 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.467;DP=152;Dels=0.00;FS=9.850;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.581;SB=-6.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,69:152:99:1406,0,1898 chrXVI 824056 . A G 1378.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.190;DP=127;Dels=0.00;FS=1.404;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.548;SB=-6.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1408,0,1322 chrXVI 824110 . C T 969.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.981;DP=112;Dels=0.00;FS=3.471;HaplotypeScore=2.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.132;SB=-5.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:999,0,1280 chrXVI 824182 . A C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.059;DP=117;Dels=0.00;FS=3.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.143;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,61:117:99:1316,0,1249 chrXVI 824188 . G A 1438.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.747;DP=117;Dels=0.00;FS=1.505;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=2.560;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.851;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,64:117:99:1468,0,1097 chrXVI 824466 . T C 1449.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.099;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.405;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:1479,0,1114 chrXVI 824483 . A T 1340.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.455;DP=111;Dels=0.00;FS=0.757;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.142;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.522;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1370,0,1133 chrXVI 824738 . C T 1906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.397;DP=137;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=13.91;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-9.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,82:137:99:1936,0,1095 chrXVI 824853 . G A 1604.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.809;DP=149;Dels=0.00;FS=2.048;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.244;SB=-8.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1634,0,1500 chrXVI 825000 . T C 1700.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.822;DP=186;Dels=0.01;FS=0.542;HaplotypeScore=17.9186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.569;SB=-9.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,90:185:99:1730,0,1901 chrXVI 825040 . C G 1224.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;DP=164;Dels=0.00;FS=2.904;HaplotypeScore=2.8212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.457;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,76:164:99:1254,0,1724 chrXVI 825051 . A G 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.337;DP=148;Dels=0.00;FS=0.648;HaplotypeScore=3.7516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.313;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,59:148:99:956,0,1834 chrXVI 825320 . G C 754.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.581;DP=113;Dels=0.00;FS=0.707;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.712;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,48:113:99:784,0,1298 chrXVI 825536 . C T 1568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;DP=156;Dels=0.00;FS=8.374;HaplotypeScore=5.5979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=1;MQRankSum=0.500;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.436;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,73:156:99:1598,0,1888 chrXVI 825738 . G A 1353.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.611;DP=139;Dels=0.00;FS=2.166;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.485;SB=-7.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:1383,0,1706 chrXVI 826071 . C T 1365.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.246;DP=134;Dels=0.00;FS=0.645;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.328;SB=-7.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,66:134:99:1395,0,1501 chrXVI 826128 . A C 3405.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=26.19;SB=-1.638e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3405,357,0 chrXVI 826190 . G A 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.515;DP=116;Dels=0.00;FS=8.653;HaplotypeScore=2.8100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=9.66;ReadPosRankSum=2.139;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1151,0,1346 chrXVI 826395 . C T 871.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;DP=105;Dels=0.00;FS=9.559;HaplotypeScore=3.4753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.238;SB=-3.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:105:99:901,0,1347 chrXVI 826410 . A C 1051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.752;DP=120;Dels=0.00;FS=10.066;HaplotypeScore=9.6820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.339;SB=-4.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:1081,0,1508 chrXVI 826518 . C T 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.194;DP=157;Dels=0.00;FS=4.841;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.014;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,68:157:99:1474,0,1917 chrXVI 826577 . C A 1476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.794;DP=122;Dels=0.00;FS=3.324;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.365;SB=-5.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1506,0,1244 chrXVI 826664 . C G 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.463;DP=124;Dels=0.00;FS=13.220;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.661;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:1213,0,1461 chrXVI 826923 . T C 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.679;DP=132;Dels=0.00;FS=1.380;HaplotypeScore=2.6342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.296;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1483,0,1471 chrXVI 826929 . C T 1527.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;DP=133;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:1557,0,1469 chrXVI 827031 . A T 1653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.391;DP=145;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.319;SB=-8.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,75:145:99:1683,0,1571 chrXVI 827037 . A G 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.432;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.143;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,70:137:99:1443,0,1496 chrXVI 827142 . C T 1312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.233;DP=134;Dels=0.00;FS=2.188;HaplotypeScore=1.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.579;SB=-7.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1342,0,1481 chrXVI 827271 . T C 1481.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.148;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=10.01;ReadPosRankSum=-1.003;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,74:148:99:1511,0,1618 chrXVI 827306 . C T 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.791;DP=149;Dels=0.00;FS=4.973;HaplotypeScore=2.5395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.466;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:1486,0,1728 chrXVI 827379 . G A 1383.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.105;DP=152;Dels=0.00;FS=2.057;HaplotypeScore=3.9255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.546;SB=-6.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,66:152:99:1413,0,1870 chrXVI 827703 . C T 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.299;DP=113;Dels=0.00;FS=0.715;HaplotypeScore=2.2426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.668;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1087,0,1266 chrXVI 827715 . A G 1024.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.793;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.189;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,56:119:99:1054,0,1319 chrXVI 827752 . C T 1426.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.633;DP=131;Dels=0.00;FS=15.619;HaplotypeScore=1.9581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.154;SB=-7.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1456,0,1251 chrXVI 827997 . G A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.822;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,72:144:99:1579,0,1625 chrXVI 828006 . T C 1645.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.295;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.89;ReadPosRankSum=-3.208;SB=-8.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:151:99:1675,0,1581 chrXVI 828087 . G A 1507.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.029;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.233;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,69:121:99:1537,0,1108 chrXVI 828223 . T A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;DP=109;Dels=0.00;FS=7.579;HaplotypeScore=1.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.574;SB=-3.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1132,0,1287 chrXVI 828256 . T G 3200 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=26.45;SB=-1.752e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3233,304,0 chrXVI 828477 . A G 1652.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.167;DP=143;Dels=0.00;FS=0.616;HaplotypeScore=3.7487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.184;SB=-8.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,74:143:99:1682,0,1475 chrXVI 828484 . G A 1687.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.568;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.646;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1717,0,1469 chrXVI 828711 . T C 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.884;DP=134;Dels=0.00;FS=0.641;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.027;SB=-7.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,67:134:99:1099,0,1058 chrXVI 829002 . T C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.114;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.802;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,70:134:99:1452,0,1394 chrXVI 829285 . A T 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.055;DP=136;Dels=0.00;FS=5.231;HaplotypeScore=2.1514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.759;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:136:99:1317,0,1413 chrXVI 829325 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.965;DP=104;Dels=0.00;FS=2.669;HaplotypeScore=2.3081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.118;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,56:104:99:1201,0,979 chrXVI 829372 . G A 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.822;DP=122;Dels=0.00;FS=2.342;HaplotypeScore=4.4029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.371;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:122:99:1201,0,1379 chrXVI 829418 . A C 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.524;DP=127;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.278;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:1090,0,1693 chrXVI 829459 . T C 991.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.378;DP=118;Dels=0.00;FS=3.685;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.356;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:118:99:1021,0,1604 chrXVI 829624 . T C 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.374;DP=127;Dels=0.00;FS=6.465;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.470;SB=-2.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,65:127:99:1429,0,1450 chrXVI 829698 . C T 685.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.329;DP=85;Dels=0.00;FS=20.965;HaplotypeScore=5.5854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=8.06;ReadPosRankSum=-2.175;SB=-2.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,42:85:99:715,0,867 chrXVI 831601 . G A 1683.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.601;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.817;SB=-6.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,75:123:99:1713,0,978 chrXVI 831855 . G A 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.065;DP=149;Dels=0.00;FS=9.919;HaplotypeScore=2.8226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.031;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,68:149:99:1434,0,1744 chrXVI 832034 . A C 1434.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.598;DP=149;Dels=0.00;FS=7.819;HaplotypeScore=3.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=1;MQRankSum=0.652;QD=9.62;ReadPosRankSum=-1.831;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,72:149:99:1464,0,1570 chrXVI 832084 . T C 775.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.137;DP=123;Dels=0.00;FS=22.681;HaplotypeScore=25.4317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=1;MQRankSum=-1.676;QD=6.30;ReadPosRankSum=-1.478;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:805,0,1470 chrXVI 832297 . C T 1121.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.184;DP=123;Dels=0.00;FS=6.053;HaplotypeScore=2.7761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-3.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,55:123:99:1151,0,1577 chrXVI 832392 . T A 957.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.814;DP=114;Dels=0.00;FS=5.985;HaplotypeScore=2.4063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.754;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:987,0,1508 chrXVI 832535 . T C 1345.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.092;DP=144;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=2.5677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.965;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,67:144:99:1375,0,1731 chrXVI 832685 . A G 1255.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.725;DP=150;Dels=0.00;FS=5.917;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.308;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:1285,0,1737 chrXVI 832790 . G A 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.787;DP=123;Dels=0.00;FS=0.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=2.985;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.336;SB=-5.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1119,0,1625 chrXVI 832863 . A G 1167.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.133;DP=132;Dels=0.00;FS=7.051;HaplotypeScore=1.7719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.55;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.916;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:1197,0,1808 chrXVI 833201 . A T 1804.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.724;DP=174;Dels=0.00;FS=1.891;HaplotypeScore=8.5675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.460;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,84:174:99:1834,0,1954 chrXVI 833262 . T C 3851.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.91;MQ0=0;QD=27.12;SB=-1.932e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3851,382,0 chrXVI 833375 . T C 1182.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.707;DP=120;Dels=0.00;FS=2.303;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.027;SB=-5.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,58:120:99:1212,0,1407 chrXVI 833382 . C T 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.760;DP=119;Dels=0.00;FS=0.685;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.948;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1429,0,1224 chrXVI 833507 . A T 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.473;DP=124;Dels=0.00;FS=2.537;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.225;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,74:124:99:1678,0,1125 chrXVI 834128 . T A 1266.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.795;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.517;SB=-5.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:127:99:1296,0,1431 chrXVI 834185 . A G 954.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.427;DP=128;Dels=0.00;FS=10.726;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.779;SB=-2.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,50:128:99:984,0,1775 chrXVI 834327 . C T 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.550;DP=118;Dels=0.00;FS=4.661;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.527;SB=-3.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1089,0,1438 chrXVI 834353 . T C 905.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.338;DP=104;Dels=0.00;FS=2.523;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=2.020;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.537;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:935,0,1217 chrXVI 834533 . A G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.650;DP=144;Dels=0.00;FS=5.163;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.942;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,60:144:99:1225,0,1903 chrXVI 834629 . G A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.631;DP=129;Dels=0.00;FS=2.227;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.676;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,64:129:99:1414,0,1395 chrXVI 834888 . C G 1473.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.233;DP=140;Dels=0.00;FS=2.112;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=10.52;ReadPosRankSum=-0.501;SB=-6.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,67:140:99:1503,0,1608 chrXVI 835119 . C T 1032.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.315;DP=114;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.066;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,55:114:99:1062,0,1261 chrXVI 835149 . T A 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.476;DP=101;Dels=0.00;FS=3.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.985;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,45:101:99:962,0,1207 chrXVI 835242 . T G 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.323;DP=108;Dels=0.00;FS=6.055;HaplotypeScore=3.6740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.252;SB=-5.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:108:99:1089,0,1251 chrXVI 835306 . C T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.850;DP=122;Dels=0.00;FS=0.683;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.417;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1406,0,1253 chrXVI 835446 . A T 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.702;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:138:99:1391,0,1749 chrXVI 835496 . C A 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;DP=118;Dels=0.00;FS=0.782;HaplotypeScore=3.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.125;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,66:118:99:1476,0,1079 chrXVI 835552 . C T 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.319;DP=137;Dels=0.00;FS=1.486;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.669;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1466,0,1440 chrXVI 835623 . T A 1173.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;DP=113;Dels=0.00;FS=2.765;HaplotypeScore=2.7164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.427;QD=10.38;ReadPosRankSum=2.180;SB=-2.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,55:113:99:1203,0,1301 chrXVI 836042 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.815;DP=118;Dels=0.00;FS=8.772;HaplotypeScore=2.5657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQ0=1;MQRankSum=-0.675;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.424;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1170,0,1440 chrXVI 836056 . G A 1415.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.810;DP=144;Dels=0.00;FS=1.355;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=1;MQRankSum=1.534;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.005;SB=-6.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,68:144:99:1445,0,1645 chrXVI 836340 . C T 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.141;DP=146;Dels=0.00;FS=0.632;HaplotypeScore=4.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.891;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:146:99:1723,0,1532 chrXVI 836521 . C T 1050.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.567;DP=113;Dels=0.00;FS=1.520;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.580;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1080,0,1358 chrXVI 836810 . C T 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.651;DP=120;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.441;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1235,0,1344 chrXVI 837009 . C T 1608.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.381;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=1.881;QD=11.40;ReadPosRankSum=2.058;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,74:141:99:1638,0,1465 chrXVI 837087 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.543;DP=140;Dels=0.00;FS=6.645;HaplotypeScore=2.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.352;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1407,0,1730 chrXVI 837416 . A C 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;DP=108;Dels=0.00;FS=2.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.219;SB=-5.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,50:108:99:1069,0,1362 chrXVI 837483 . A G 934.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.861;DP=107;Dels=0.00;FS=5.061;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.481;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,46:107:99:964,0,1385 chrXVI 837622 . G A 880.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.043;DP=101;Dels=0.00;FS=0.742;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.295;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,48:101:99:910,0,1146 chrXVI 837894 . G A 887.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.853;DP=100;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.847;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-3.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:917,0,1242 chrXVI 838043 . G A 397.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.727;DP=69;Dels=0.00;FS=29.494;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.27;MQ0=1;MQRankSum=-1.258;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.505;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:427,0,1066 chrXVI 838104 . T C 486.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;DP=72;Dels=0.00;FS=23.545;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.66;MQ0=11;MQRankSum=0.495;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.144;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:516,0,791 chrXVI 838274 . A G 348 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.74;MQ0=3;QD=17.40;SB=-7.544e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:39:381,39,0 chrXVI 838362 . C T 28.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.61;MQ0=2;QD=3.60;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:60,6,0 chrXVI 838443 . G A 26.77 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.59;MQ0=1;QD=3.82;SB=-2.776e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:58,6,0 chrXVI 838604 . C T 107.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.96;MQ0=2;QD=11.92;SB=-1.373e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:15:140,15,0 chrXVI 838614 . A G 55.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.95;MQ0=10;MQRankSum=0.922;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.000;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:68:85,0,68 chrXVI 838833 . A G 204.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.291;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.03;MQ0=57;MQRankSum=3.121;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.720;SB=-2.901e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:234,0,225 chrXVI 838845 . A G 174.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.289;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.13;MQ0=52;MQRankSum=1.632;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.029;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:204,0,256 chrXVI 838970 . T A 341.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;DP=64;Dels=0.00;FS=64.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.12;MQ0=0;MQRankSum=2.143;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.261;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:371,0,920 chrXVI 839079 . C T 287.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.645;DP=81;Dels=0.00;FS=62.032;HaplotypeScore=5.0189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.61;MQ0=15;MQRankSum=-4.725;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.660;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:317,0,857 chrXVI 839142 . T A 624.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.003;DP=87;Dels=0.00;FS=42.608;HaplotypeScore=5.3645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.10;MQ0=2;MQRankSum=-3.514;QD=7.17;ReadPosRankSum=-3.144;SB=-1.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,46:87:99:654,0,786 chrXVI 839169 . C T 868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.065;DP=81;Dels=0.00;FS=0.921;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.70;MQ0=2;MQRankSum=0.916;QD=10.72;ReadPosRankSum=2.490;SB=-2.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,45:81:99:898,0,536 chrXVI 839190 . A G 1108.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.851;DP=81;Dels=0.00;FS=10.409;HaplotypeScore=4.9676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.83;MQ0=0;MQRankSum=4.349;QD=13.68;ReadPosRankSum=5.097;SB=-4.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,55:81:99:1138,0,397 chrXVI 839193 . C A 327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.604;DP=86;Dels=0.00;FS=7.930;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.29;MQ0=0;MQRankSum=-3.899;QD=3.80;ReadPosRankSum=-4.299;SB=-1.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,25:86:99:357,0,1356 chrXVI 839202 . G A 104.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;DP=79;Dels=0.00;FS=54.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.37;MQ0=0;MQRankSum=-5.303;QD=1.32;ReadPosRankSum=-2.774;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:134,0,1426 chrXVI 839205 . A G 76.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.102;DP=79;Dels=0.00;FS=54.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.37;MQ0=0;MQRankSum=-5.327;QD=0.96;ReadPosRankSum=-1.986;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:106,0,1479 chrXVI 839220 . T G 154.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;DP=80;Dels=0.00;FS=55.540;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.35;MQ0=0;MQRankSum=-5.010;QD=1.93;ReadPosRankSum=1.400;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:184,0,1517 chrXVI 839225 . G A 134.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.232;DP=95;Dels=0.00;FS=45.598;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.49;MQ0=0;MQRankSum=-5.501;QD=1.41;ReadPosRankSum=2.955;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,18:95:99:164,0,1771 chrXVI 839226 . T C 115.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.643;DP=93;Dels=0.00;FS=47.911;HaplotypeScore=2.1330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.66;MQ0=0;MQRankSum=-5.097;QD=1.24;ReadPosRankSum=2.314;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:145,0,1718 chrXVI 839240 . T C 579.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.299;DP=122;Dels=0.00;FS=30.894;HaplotypeScore=2.2931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.115;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.182;SB=-1.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,42:122:99:609,0,1854 chrXVI 839265 . A G 965.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;DP=144;Dels=0.00;FS=8.430;HaplotypeScore=1.8874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.43;MQ0=1;MQRankSum=-1.297;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.035;SB=-1.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,57:144:99:995,0,1997 chrXVI 839292 . A G 910.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.426;DP=130;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQ0=1;MQRankSum=-0.308;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.000;SB=-1.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,54:130:99:940,0,1717 chrXVI 839313 . C T 1178.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.109;DP=133;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=2.7568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=1;MQRankSum=-0.579;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.697;SB=-3.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1208,0,1460 chrXVI 839436 . A G 919.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.430;DP=138;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=4.9681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.204;SB=-4.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,52:138:99:949,0,1971 chrXVI 839469 . A G 774.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.688;DP=115;Dels=0.00;FS=6.017;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.805;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,45:115:99:804,0,1557 chrXVI 839499 . T C 787.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;DP=135;Dels=0.00;FS=3.187;HaplotypeScore=1.9650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.549;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,52:135:99:817,0,1904 chrXVI 839670 . A G 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;DP=122;Dels=0.00;FS=1.443;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.940;SB=-6.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1162,0,1336 chrXVI 840101 . G C 1141.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;DP=125;Dels=0.00;FS=0.676;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.255;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1171,0,1474 chrXVI 840103 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.656;DP=118;Dels=0.00;FS=2.381;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1155,0,1311 chrXVI 840213 . T A 1007.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.965;DP=126;Dels=0.00;FS=9.796;HaplotypeScore=5.6604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.432;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:126:99:1037,0,1334 chrXVI 840263 . T A 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.105;DP=112;Dels=0.00;FS=5.969;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.041;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,55:112:99:1028,0,1205 chrXVI 840461 . G A 1578.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.557;DP=152;Dels=0.00;FS=5.942;HaplotypeScore=4.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.442;SB=-6.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,75:152:99:1608,0,1711 chrXVI 840482 . C G 1675.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.774;DP=163;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=3.9514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.048;SB=-7.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,80:163:99:1705,0,1722 chrXVI 840560 . A T 1589.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;DP=149;Dels=0.00;FS=3.976;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=10.66;ReadPosRankSum=-1.164;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,73:149:99:1619,0,1717 chrXVI 840672 . G C 653.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.445;DP=92;Dels=0.00;FS=2.878;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.575;SB=-1.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,54:92:99:683,0,469 chrXVI 841075 . T A 1593.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.718;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.804;SB=-7.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,73:169:99:1623,0,2218 chrXVI 841392 . G A 1932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.309;DP=179;Dels=0.00;FS=5.318;HaplotypeScore=4.5603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.281;SB=-9.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,88:179:99:1962,0,1863 chrXVI 841449 . T C 4316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.17;MQ0=0;QD=24.95;SB=-1.835e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,173:173:99:4316,412,0 chrXVI 841684 . G A 1104.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.781;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.453;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,53:120:99:1134,0,1502 chrXVI 841702 . A G 1717.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.839;DP=155;Dels=0.00;FS=1.292;HaplotypeScore=1.8835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.045;SB=-7.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1747,0,1530 chrXVI 842051 . A G 1888.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.994;DP=154;Dels=0.00;FS=2.081;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=12.26;ReadPosRankSum=2.223;SB=-8.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,87:154:99:1918,0,1400 chrXVI 842073 . A G 2059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.562;DP=173;Dels=0.00;FS=1.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-9.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,97:173:99:2089,0,1602 chrXVI 842447 . T C 1280.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.766;DP=148;Dels=0.00;FS=8.693;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=1.379;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.783;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:148:99:1310,0,1815 chrXVI 842864 . A T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;DP=112;Dels=0.00;FS=1.489;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.792;SB=-6.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,57:112:99:1253,0,1227 chrXVI 843072 . G T 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.793;DP=110;Dels=0.00;FS=11.545;HaplotypeScore=1.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.524;SB=-2.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1109,0,1328 chrXVI 843336 . C T 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.988;DP=118;Dels=0.00;FS=7.293;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.649;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:1261,0,1174 chrXVI 843391 . T C 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.933;DP=127;Dels=0.00;FS=11.410;HaplotypeScore=2.8015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.957;SB=-6.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1248,0,1346 chrXVI 843464 . A G 1002.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.173;DP=128;Dels=0.00;FS=5.514;HaplotypeScore=6.4797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.055;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1032,0,1683 chrXVI 843595 . C T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.852;DP=132;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=1.9559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.697;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1421,0,1577 chrXVI 844001 . G A 1243.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.071;DP=151;Dels=0.00;FS=0.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.447;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,60:151:99:1273,0,2092 chrXVI 844011 . T C 1246.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.110;DP=153;Dels=0.00;FS=1.288;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.304;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,64:153:99:1276,0,2048 chrXVI 844046 . T C 1124.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.699;DP=132;Dels=0.00;FS=8.269;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.771;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,61:132:99:1154,0,1553 chrXVI 844058 . T C 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.961;DP=128;Dels=0.00;FS=5.886;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.75;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=8.68;ReadPosRankSum=-2.165;SB=-3.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:1141,0,1633 chrXVI 844407 . G T 268.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;DP=50;Dels=0.00;FS=10.230;HaplotypeScore=4.9736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.58;MQ0=1;MQRankSum=-1.036;QD=5.36;ReadPosRankSum=-1.077;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:298,0,559 chrXVI 844409 . A G 255.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.926;DP=50;Dels=0.00;FS=7.779;HaplotypeScore=3.9820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.45;MQ0=2;MQRankSum=-3.141;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.181;SB=-2.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:50:99:285,0,589 chrXVI 844413 . G T 37.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.16;MQ0=4;QD=4.75;SB=-4.657e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,4:8:9:70,9,0 chrXVI 844416 . G A 44.97 SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.22;MQ0=4;QD=6.42;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:77,9,0 chrXVI 846518 . G A 15.14 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.59;MQ0=78;MQRankSum=0.404;QD=0.16;ReadPosRankSum=-0.673;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,3:94:45:45,0,270 chrXVI 847127 . T A 96.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.37;MQ0=45;MQRankSum=-0.883;QD=1.28;ReadPosRankSum=2.599;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,7:75:99:126,0,568 chrXVI 847128 . G A 92.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.629;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.25;MQ0=46;MQRankSum=-1.030;QD=1.21;ReadPosRankSum=2.354;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,7:76:99:122,0,536 chrXVI 847130 . G C 93.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.01;MQ0=45;MQRankSum=-0.229;QD=1.26;ReadPosRankSum=1.809;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,7:74:99:123,0,535 chrXVI 847140 . C T 84.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.918;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.05;MQ0=45;MQRankSum=-0.341;QD=1.06;ReadPosRankSum=0.213;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,7:79:99:114,0,648 chrXVI 847144 . C T 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.17;MQ0=44;MQRankSum=-0.339;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.158;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,6:78:66:66,0,686 chrXVI 847145 . T C 39.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.170;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.13;MQ0=43;MQRankSum=-0.117;QD=0.51;ReadPosRankSum=-0.303;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,6:76:69:69,0,687 chrXVI 847151 . T A 45.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.905;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.74;MQ0=43;MQRankSum=-0.309;QD=0.56;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,6:80:75:75,0,781 chrXVI 847156 . G A 35.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.13;MQ0=41;MQRankSum=-0.781;QD=0.44;ReadPosRankSum=-1.261;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,6:79:65:65,0,767 chrXVI 847158 . A G 36.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.53;MQ0=39;MQRankSum=-0.136;QD=0.46;ReadPosRankSum=-1.693;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,6:78:66:66,0,846 chrXVI 847160 . A T 33.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.936;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.47;MQ0=39;MQRankSum=-0.133;QD=0.42;ReadPosRankSum=-1.799;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,6:79:63:63,0,860 chrXVI 850463 . A C 2999 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.35;MQ0=0;QD=23.25;SB=-1.528e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3032,312,0 chrXVI 850487 . T G 1206.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.921;DP=116;Dels=0.00;FS=8.501;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=10.40;ReadPosRankSum=4.468;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1236,0,1348 chrXVI 850488 . G A 3196 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.29;MQ0=0;QD=27.55;SB=-1.560e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:3229,325,0 chrXVI 850493 . G T 1325.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.518;DP=124;Dels=0.00;FS=2.296;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.69;ReadPosRankSum=2.541;SB=-7.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:1355,0,1218 chrXVI 850634 . A T 200.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.95;MQ0=2;QD=14.29;SB=-3.004e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,12:14:24:233,24,0 chrXVI 856531 . C T 73.14 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=12;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.82;MQ0=3;MQRankSum=1.179;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.666;SB=-3.083e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:12:103,0,12 chrXVI 856535 . A T 77.07 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=11;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.88;MQ0=2;MQRankSum=0.762;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.067;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:15:107,0,15 chrXVI 856538 . G T 77.09 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=11;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.88;MQ0=2;MQRankSum=0.762;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.067;SB=-3.034e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:14:107,0,14 chrXVI 856543 . T C 67.06 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=9;Dels=0.00;FS=9.031;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.34;MQ0=1;MQRankSum=0.747;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.747;SB=-3.003e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:16:97,0,16 chrXVI 856656 . T G 283 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.02;MQ0=94;MQRankSum=2.807;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.240;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:81,28:109:33:316,33,0 chrXVI 856761 . T C 561 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.506;DP=111;Dels=0.00;FS=65.862;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.48;MQ0=78;MQRankSum=4.485;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.469;SB=-6.523e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:83,28:111:63:594,63,0 chrXVI 857345 . T A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;DP=119;Dels=0.00;FS=4.597;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.149;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:1023,0,1571 chrXVI 857396 . A C 1282.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.481;DP=115;Dels=0.00;FS=5.566;HaplotypeScore=2.7217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.181;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,66:115:99:1312,0,1017 chrXVI 857654 . C A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.029;DP=127;Dels=0.00;FS=0.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.538;SB=-5.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1438,0,1309 chrXVI 857667 . G C 1313.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.328;DP=127;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=1;MQRankSum=0.800;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.054;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,63:127:99:1343,0,1343 chrXVI 857684 . T A 1183.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;DP=113;Dels=0.00;FS=2.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=1;MQRankSum=0.917;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.818;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1213,0,1321 chrXVI 857864 . A T 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;DP=135;Dels=0.00;FS=0.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.663;SB=-6.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,64:135:99:1444,0,1605 chrXVI 858557 . G C 1716.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;DP=175;Dels=0.00;FS=3.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.698;SB=-7.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,83:175:99:1746,0,1867 chrXVI 858788 . T C 3541.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.680;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=26.43;ReadPosRankSum=1.629;SB=-1.567e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:134:99:3541,327,0 chrXVI 858824 . T C 1411.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.159;DP=139;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=2.7413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.520;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1441,0,1585 chrXVI 859747 . C T 1058.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.271;DP=110;Dels=0.00;FS=1.579;HaplotypeScore=5.4563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.462;SB=-4.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1088,0,1164 chrXVI 860197 . G A 1349.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.757;DP=135;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.716;QD=9.99;ReadPosRankSum=2.256;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,60:135:99:1379,0,1502 chrXVI 860239 . T A 3316.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.18;SB=-1.696e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3316,325,0 chrXVI 860540 . A G 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.031;DP=138;Dels=0.00;FS=3.109;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=1;MQRankSum=-0.441;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.301;SB=-5.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,63:138:99:1255,0,1732 chrXVI 861210 . C T 1193.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.756;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=10.46;ReadPosRankSum=-2.162;SB=-4.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,56:114:99:1223,0,1266 chrXVI 861771 . A G 1640.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.621;DP=124;Dels=0.00;FS=3.371;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.025;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,73:124:99:1670,0,1115 chrXVI 862368 . C G 1728.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.059;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.810;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,77:145:99:1758,0,1489 chrXVI 862439 . T C 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.593;DP=139;Dels=0.00;FS=4.214;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=10.17;ReadPosRankSum=-1.178;SB=-6.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,71:139:99:1444,0,1536 chrXVI 863288 . G A 1955.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.561;DP=168;Dels=0.00;FS=6.681;HaplotypeScore=2.4485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.892;SB=-1.055e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,87:168:99:1985,0,1672 chrXVI 863294 . A G 1813.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.626;DP=160;Dels=0.00;FS=5.741;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.243;SB=-9.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,83:160:99:1843,0,1734 chrXVI 863372 . G A 3427.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=28.56;SB=-1.406e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3427,343,0 chrXVI 863788 . A G 1966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.184;DP=154;Dels=0.00;FS=3.896;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.842;SB=-9.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,88:154:99:1996,0,1416 chrXVI 863829 . C T 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.041;DP=147;Dels=0.00;FS=0.608;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.211;SB=-8.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,71:147:99:1579,0,1686 chrXVI 863903 . A G 1192.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.317;DP=153;Dels=0.00;FS=11.409;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.254;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,68:153:99:1222,0,1887 chrXVI 864016 . T C 1094.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.621;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=49.7236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=9.43;ReadPosRankSum=-2.032;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,57:116:99:1124,0,1274 chrXVI 864243 . G A 1098.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.733;DP=144;Dels=0.00;FS=4.056;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.025;SB=-5.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,55:144:99:1128,0,2033 chrXVI 864258 . A G 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.374;DP=122;Dels=0.00;FS=5.829;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.201;SB=-3.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,49:122:99:925,0,1638 chrXVI 864283 . C T 1140.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.812;DP=144;Dels=0.00;FS=7.554;HaplotypeScore=1.9692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-5.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,59:144:99:1170,0,1923 chrXVI 864303 . G A 1341.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.089;DP=145;Dels=0.01;FS=2.108;HaplotypeScore=5.8809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.597;SB=-7.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,64:144:99:1371,0,1774 chrXVI 864330 . T C 1220.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.554;DP=129;Dels=0.00;FS=1.409;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.822;SB=-6.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1250,0,1577 chrXVI 864668 . A G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.727;DP=131;Dels=0.00;FS=12.850;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.320;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:131:99:1156,0,1336 chrXVI 864677 . C T 3204 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=23.56;SB=-1.680e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3237,325,0 chrXVI 864798 . T C 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.746;DP=113;Dels=0.00;FS=0.701;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.348;SB=-6.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1327,0,1201 chrXVI 864815 . T C 1348.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.277;DP=135;Dels=0.00;FS=0.646;HaplotypeScore=4.9704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.728;SB=-6.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1378,0,1584 chrXVI 864893 . G A 1540.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.000;DP=142;Dels=0.00;FS=3.970;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=10.85;ReadPosRankSum=2.596;SB=-7.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1570,0,1400 chrXVI 864958 . T C 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.103;DP=121;Dels=0.00;FS=0.722;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.404;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1092,0,1551 chrXVI 865226 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.731;DP=135;Dels=0.00;FS=2.177;HaplotypeScore=6.6177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.752;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1307,0,1655 chrXVI 865268 . T C 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;DP=142;Dels=0.00;FS=2.122;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.786;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,65:142:99:1313,0,1779 chrXVI 865361 . C T 1164.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.864;DP=112;Dels=0.00;FS=4.551;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.207;SB=-5.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1194,0,1217 chrXVI 865382 . T A 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;DP=122;Dels=0.00;FS=0.716;HaplotypeScore=4.9715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=10.30;ReadPosRankSum=2.053;SB=-4.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:1286,0,1432 chrXVI 865441 . T C 1168.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.932;DP=122;Dels=0.00;FS=0.675;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.031;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,57:122:99:1198,0,1450 chrXVI 865451 . C T 1270.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.389;DP=129;Dels=0.00;FS=4.192;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.418;SB=-6.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,60:129:99:1300,0,1497 chrXVI 865498 . C T 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.847;DP=110;Dels=0.00;FS=3.526;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.246;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,51:110:99:1092,0,1302 chrXVI 866267 . C G 1123.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;DP=128;Dels=0.00;FS=0.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.236;SB=-6.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1153,0,1461 chrXVI 866381 . T C 1513.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.078;DP=145;Dels=0.00;FS=5.059;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.129;SB=-7.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,74:145:99:1543,0,1610 chrXVI 866682 . G A 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.621;DP=131;Dels=0.00;FS=0.647;HaplotypeScore=5.2062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.370;SB=-7.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,68:131:99:1463,0,1235 chrXVI 866895 . G A 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.736;DP=108;Dels=0.00;FS=12.611;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.901;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1257,0,1106 chrXVI 867397 . G A 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.039;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.174;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1248,0,1305 chrXVI 867451 . A T 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.390;DP=107;Dels=0.00;FS=6.233;HaplotypeScore=3.3362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.340;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1087,0,1182 chrXVI 867780 . A G 1196.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.413;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.933;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.422;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,62:122:99:1226,0,1330 chrXVI 868093 . A G 1114.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.769;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,53:109:99:1144,0,1274 chrXVI 868287 . A G 1036.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.074;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.685;SB=-4.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1066,0,1283 chrXVI 868344 . T C 940.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.773;DP=81;Dels=0.00;FS=0.973;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=2.665;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.596;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,46:81:99:970,0,706 chrXVI 868671 . T C 861.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.480;DP=91;Dels=0.00;FS=6.764;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.203;SB=-4.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:891,0,1135 chrXVI 868942 . T C 879.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.206;DP=95;Dels=0.00;FS=2.683;HaplotypeScore=18.2354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.310;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:909,0,1118 chrXVI 868999 . A G 759.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.358;DP=75;Dels=0.00;FS=0.895;HaplotypeScore=2.9756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.487;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.687;SB=-3.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:75:99:789,0,808 chrXVI 869017 . G A 839.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.393;DP=72;Dels=0.00;FS=3.100;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.698;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.344;SB=-4.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:869,0,700 chrXVI 869020 . A G 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.380;DP=72;Dels=0.00;FS=1.962;HaplotypeScore=1.6567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.079;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.882;SB=-3.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,39:72:99:813,0,706 chrXVI 869053 . C T 807.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.205;DP=72;Dels=0.00;FS=10.062;HaplotypeScore=1.9924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.288;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.824;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:837,0,677 chrXVI 869068 . A G 890.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.595;DP=77;Dels=0.00;FS=20.345;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.169;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:920,0,742 chrXVI 869074 . A G 800.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.312;DP=76;Dels=0.00;FS=24.029;HaplotypeScore=5.9685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.827;SB=-1.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:830,0,757 chrXVI 869167 . G A 596.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.691;DP=76;Dels=0.00;FS=5.963;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=7.84;ReadPosRankSum=-2.400;SB=-2.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:626,0,862 chrXVI 869176 . G A 671.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.540;DP=79;Dels=0.00;FS=5.932;HaplotypeScore=4.9756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=8.49;ReadPosRankSum=-2.064;SB=-2.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,34:79:99:701,0,828 chrXVI 869329 . T A 1088.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.999;DP=108;Dels=0.00;FS=1.554;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.061;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1118,0,1276 chrXVI 869386 . A G 1041.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.357;DP=124;Dels=0.00;FS=13.128;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.333;SB=-4.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,58:124:99:1071,0,1550 chrXVI 869496 . A G 1029.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.423;DP=88;Dels=0.00;FS=6.945;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.507;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,51:88:99:1059,0,807 chrXVI 869698 . A G 1615.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.666;DP=140;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.801;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,76:140:99:1645,0,1419 chrXVI 869818 . G A 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.603;DP=128;Dels=0.00;FS=6.797;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=10.92;ReadPosRankSum=-2.216;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1428,0,1340 chrXVI 870043 . G A 1584.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.138;DP=147;Dels=0.00;FS=2.081;HaplotypeScore=6.5909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.499;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,76:147:99:1614,0,1491 chrXVI 870338 . A G 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.940;DP=109;Dels=0.00;FS=13.018;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.230;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,70:109:99:1507,0,806 chrXVI 870491 . C T 1385.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.868;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.347;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:121:99:1415,0,1272 chrXVI 870525 . G C 1343.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.348;DP=128;Dels=0.00;FS=1.419;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=2;MQRankSum=0.535;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,68:128:99:1373,0,1311 chrXVI 870673 . C G 1834.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.841;DP=148;Dels=0.00;FS=1.496;HaplotypeScore=2.3894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.119;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,88:148:99:1864,0,1265 chrXVI 870828 . A G 1316.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.013;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.214;SB=-6.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,63:130:99:1346,0,1470 chrXVI 871215 . A G 1771.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.906;DP=150;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.761;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-8.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,82:150:99:1801,0,1388 chrXVI 871222 . G T 1835.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.846;DP=151;Dels=0.00;FS=2.894;HaplotypeScore=3.3688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.074;SB=-9.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:1865,0,1315 chrXVI 871361 . T C 3849.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.13;MQ0=0;QD=26.92;SB=-1.726e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:143:99:3849,388,0 chrXVI 871689 . A C 1556.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.645;DP=147;Dels=0.00;FS=7.359;HaplotypeScore=4.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.633;SB=-8.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,86:147:99:1586,0,1389 chrXVI 871860 . T C 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.551;DP=113;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-7.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,67:113:99:1555,0,958 chrXVI 871965 . C A 1326.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.338;DP=128;Dels=0.00;FS=2.206;HaplotypeScore=2.5458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.696;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,63:128:99:1356,0,1447 chrXVI 872166 . A G 1154.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.673;DP=97;Dels=0.00;FS=6.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.843;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1184,0,995 chrXVI 872172 . G A 1139.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.446;DP=85;Dels=0.00;FS=2.905;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-5.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,49:85:99:1169,0,766 chrXVI 872245 . G A 1219.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.221;DP=103;Dels=0.00;FS=1.586;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.129;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,55:103:99:1249,0,970 chrXVI 872338 . T A 3484.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=28.10;SB=-1.632e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3484,337,0 chrXVI 872655 . T G 1199.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.296;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.539;SB=-5.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1229,0,965 chrXVI 872691 . A G 1630.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;DP=154;Dels=0.01;FS=0.595;HaplotypeScore=5.8740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=2.192;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.276;SB=-8.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1660,0,1573 chrXVI 872757 . T A 1889.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.852;DP=152;Dels=0.00;FS=2.973;HaplotypeScore=6.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=1.824;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.292;SB=-6.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,83:152:99:1919,0,1481 chrXVI 872987 . G A 1737.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.668;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.703;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,76:158:99:1767,0,1802 chrXVI 872991 . T A 1553.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.319;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,72:145:99:1583,0,1686 chrXVI 873070 . T C 1414.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.754;DP=144;Dels=0.00;FS=0.621;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.176;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,69:144:99:1444,0,1720 chrXVI 873134 . T A 1528.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;DP=147;Dels=0.00;FS=0.613;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=10.39;ReadPosRankSum=-1.335;SB=-8.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,75:147:99:1558,0,1661 chrXVI 873246 . A G 2742 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.29;MQ0=0;QD=25.87;SB=-1.471e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2775,282,0 chrXVI 873343 . A G 1285.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.967;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-5.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1315,0,1407 chrXVI 873345 . C T 1369.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.721;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.007;SB=-6.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:1399,0,1401 chrXVI 873415 . A T 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.15;MQ0=0;QD=27.10;SB=-1.245e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3360,331,0 chrXVI 873426 . T C 1472.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.905;DP=114;Dels=0.00;FS=7.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.353;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,67:114:99:1502,0,1051 chrXVI 873450 . A C 1401.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.432;DP=119;Dels=0.00;FS=0.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.143;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,70:119:99:1431,0,1108 chrXVI 873499 . C T 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.566;DP=105;Dels=0.00;FS=12.371;HaplotypeScore=2.9259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.112;SB=-4.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,53:105:99:1145,0,1169 chrXVI 873630 . T C 1273.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;DP=109;Dels=0.00;FS=1.583;HaplotypeScore=6.8232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.955;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:99:1303,0,1204 chrXVI 873684 . T C 944.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.419;DP=101;Dels=0.00;FS=12.110;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.549;SB=-2.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:974,0,1205 chrXVI 874128 . T C 1621.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.302;DP=149;Dels=0.00;FS=8.504;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.712;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,76:149:99:1651,0,1646 chrXVI 874146 . A C 1651.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.522;DP=153;Dels=0.00;FS=4.773;HaplotypeScore=7.9371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.761;SB=-7.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,79:153:99:1681,0,1616 chrXVI 874530 . C A 2436 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.56;MQ0=0;QD=25.91;SB=-1.232e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2469,237,0 chrXVI 874564 . T C 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.181;DP=111;Dels=0.00;FS=0.714;HaplotypeScore=11.0178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.056;SB=-4.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:957,0,1213 chrXVI 874996 . A G 2426 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=25.01;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:2459,267,0 chrXVI 875078 . T G 917.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=1.971;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.473;SB=-2.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:947,0,1396 chrXVI 875380 . G A 903.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.487;DP=120;Dels=0.00;FS=5.758;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=1;MQRankSum=-0.199;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.510;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,46:120:99:933,0,1709 chrXVI 876034 . G C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.238;DP=127;Dels=0.00;FS=6.594;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=10.32;ReadPosRankSum=-1.901;SB=-6.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,64:127:99:1341,0,1386 chrXVI 876278 . T A 776.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;DP=99;Dels=0.00;FS=1.705;HaplotypeScore=2.8034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.032;SB=-3.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,46:99:99:806,0,1177 chrXVI 876279 . T A 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=99;Dels=0.00;FS=2.728;HaplotypeScore=2.8034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.256;SB=-3.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:792,0,1176 chrXVI 876647 . T C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.449;DP=125;Dels=0.00;FS=8.783;HaplotypeScore=6.4240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.679;SB=-3.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,62:125:99:1316,0,1413 chrXVI 876811 . T C 3795.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.96;MQ0=0;QD=27.11;SB=-1.079e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3795,379,0 chrXVI 876853 . A G 1705.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.059;DP=152;Dels=0.00;FS=1.383;HaplotypeScore=5.9606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=2;MQRankSum=0.206;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,88:152:99:1735,0,1397 chrXVI 876931 . T C 1225.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.757;DP=142;Dels=0.00;FS=2.953;HaplotypeScore=3.7949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=8.63;ReadPosRankSum=-2.072;SB=-6.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,68:142:99:1255,0,1624 chrXVI 877297 . A G 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.309;DP=98;Dels=0.00;FS=1.657;HaplotypeScore=1.7834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.949;SB=-4.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:98:99:923,0,1125 chrXVI 877459 . G A 1724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.353;DP=136;Dels=0.00;FS=5.421;HaplotypeScore=3.4503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=12.68;ReadPosRankSum=-1.253;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,79:136:99:1754,0,1019 chrXVI 877504 . G A 1025.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.674;DP=124;Dels=0.00;FS=0.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.461;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1055,0,1263 chrXVI 877603 . T A 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;DP=133;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.335;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,65:133:99:1438,0,1567 chrXVI 877710 . C T 1502.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.351;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-7.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,71:134:99:1532,0,1407 chrXVI 877869 . A T 1206.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.307;DP=104;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=1.943;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.208;SB=-6.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1236,0,1096 chrXVI 878117 . A G 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.603;DP=113;Dels=0.00;FS=1.553;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.847;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1183,0,1307 chrXVI 878300 . T C 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.237;DP=120;Dels=0.00;FS=3.282;HaplotypeScore=4.6416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.724;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.725;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,63:120:99:1244,0,1255 chrXVI 878378 . G A 1062.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.761;DP=107;Dels=0.00;FS=3.873;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.052;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.116;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,50:107:99:1092,0,1251 chrXVI 878600 . T A 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;DP=110;Dels=0.00;FS=11.211;HaplotypeScore=5.0360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.290;SB=-5.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1109,0,1188 chrXVI 878986 . T G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.473;DP=110;Dels=0.00;FS=3.567;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.527;SB=-4.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1225,0,1138 chrXVI 879007 . G T 3320.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.57;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1.786e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:3320,310,0 chrXVI 879520 . G A 966.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.551;DP=110;Dels=0.00;FS=3.702;HaplotypeScore=2.7253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.048;SB=-4.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:996,0,1318 chrXVI 879550 . C T 895.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.372;DP=97;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.153;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.367;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,43:97:99:925,0,1146 chrXVI 879742 . T C 1119.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.662;DP=113;Dels=0.00;FS=1.712;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.009;SB=-3.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,56:113:99:1149,0,1369 chrXVI 879779 . A G 1157.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.509;DP=114;Dels=0.00;FS=0.768;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=2.024;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.100;SB=-3.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,58:114:99:1187,0,1313 chrXVI 879958 . A T 1010.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;DP=111;Dels=0.00;FS=12.478;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.121;SB=-4.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1040,0,1436 chrXVI 880130 . C G 499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.798;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.431;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,32:82:99:529,0,1140 chrXVI 880193 . A G 783.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.275;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.369;SB=-3.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:813,0,1167 chrXVI 880238 . T G 567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.947;DP=84;Dels=0.00;FS=3.006;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.313;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:597,0,1163 chrXVI 880287 . G A 714.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.129;DP=122;Dels=0.00;FS=7.853;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.773;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.547;SB=-1.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,47:122:99:744,0,1729 chrXVI 880371 . T C 375.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.789;DP=90;Dels=0.00;FS=23.855;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.244;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.553;SB=-1.301e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,28:90:99:405,0,1549 chrXVI 880373 . A C 370.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;DP=88;Dels=0.00;FS=24.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.389;SB=-2.001e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,27:88:99:400,0,1504 chrXVI 880381 . A G 287.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;DP=79;Dels=0.00;FS=25.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.023;SB=-9.007e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:317,0,1426 chrXVI 880390 . G A 283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.035;DP=74;Dels=0.00;FS=20.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.103;SB=-1.701e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:313,0,1297 chrXVI 880514 . A T 185.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;DP=70;Dels=0.00;FS=13.717;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.874;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.741;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:215,0,1363 chrXVI 880533 . C A 308.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.486;DP=66;Dels=0.00;FS=18.378;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.160;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.858;SB=-3.101e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:338,0,1096 chrXVI 880557 . T A 279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;DP=70;Dels=0.00;FS=12.525;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.24;MQ0=0;MQRankSum=-4.010;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.477;SB=-3.501e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:70:99:309,0,1222 chrXVI 880688 . T C 203.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.440;DP=78;Dels=0.00;FS=37.073;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.279;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.698;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:233,0,1319 chrXVI 880741 . G A 949.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.574;DP=114;Dels=0.00;FS=0.734;HaplotypeScore=3.7935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.050;SB=-3.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:979,0,1420 chrXVI 880820 . A G 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.703;DP=104;Dels=0.00;FS=1.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=8.59;ReadPosRankSum=-1.294;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,51:104:99:923,0,1236 chrXVI 880865 . A G 590.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.196;DP=82;Dels=0.00;FS=0.854;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.351;SB=-1.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:620,0,1112 chrXVI 880901 . T C 805.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.048;DP=111;Dels=0.00;FS=2.452;HaplotypeScore=3.6408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.165;SB=-3.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,45:111:99:835,0,1500 chrXVI 880941 . A T 794.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;DP=102;Dels=0.00;FS=4.955;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.478;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,41:102:99:824,0,1440 chrXVI 881145 . T C 1398.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.396;DP=142;Dels=0.00;FS=1.350;HaplotypeScore=7.7868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.218;SB=-5.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:1428,0,1631 chrXVI 881189 . C T 927.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.119;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.399;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,47:113:99:957,0,1565 chrXVI 881280 . A T 977.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.629;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.733;SB=-5.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,51:134:99:1007,0,1942 chrXVI 881287 . A G 999.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.168;DP=131;Dels=0.00;FS=1.398;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=7.63;ReadPosRankSum=-2.089;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,52:131:99:1029,0,1845 chrXVI 881367 . A C 964.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;DP=106;Dels=0.00;FS=9.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.107;SB=-5.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,47:106:99:994,0,1356 chrXVI 881834 . C A 3808.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=1;QD=28.21;SB=-1.088e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:135:99:3808,358,0 chrXVI 882057 . T A 1102.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.945;DP=107;Dels=0.00;FS=2.490;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=1.705;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.919;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1132,0,1207 chrXVI 882087 . A G 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.268;DP=107;Dels=0.00;FS=2.542;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.297;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1003,0,1342 chrXVI 882103 . T A 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.810;DP=124;Dels=0.00;FS=5.706;HaplotypeScore=8.4185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.005;SB=-6.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,57:124:99:1238,0,1559 chrXVI 882225 . A G 1218.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.568;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.976;SB=-5.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,61:137:99:1248,0,1838 chrXVI 882292 . A C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.860;DP=131;Dels=0.00;FS=14.529;HaplotypeScore=1.6498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.997;SB=-6.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,65:131:99:1364,0,1517 chrXVI 882337 . C A 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.068;DP=122;Dels=0.00;FS=5.579;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.353;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,59:122:99:1344,0,1312 chrXVI 882493 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.077;DP=118;Dels=0.00;FS=2.421;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.381;SB=-4.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:1069,0,1490 chrXVI 882509 . T A 1200.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.387;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.161;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1230,0,1482 chrXVI 882555 . T C 864.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.733;DP=118;Dels=0.00;FS=7.164;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-6.510;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.005;SB=-4.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:894,0,1637 chrXVI 882567 . A G 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.866;DP=136;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.58;MQ0=0;MQRankSum=-7.421;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.859;SB=-4.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,51:136:99:890,0,2075 chrXVI 882576 . C T 782.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.080;DP=124;Dels=0.00;FS=1.517;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.81;MQ0=0;MQRankSum=-9.116;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.381;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,47:124:99:812,0,1817 chrXVI 882583 . T C 766.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.244;DP=132;Dels=0.00;FS=3.351;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-9.340;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.513;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,48:132:99:796,0,2034 chrXVI 882586 . C A 818.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.508;DP=137;Dels=0.00;FS=4.380;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-9.491;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.537;SB=-4.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,49:137:99:848,0,2061 chrXVI 882590 . C T 775.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.401;DP=136;Dels=0.00;FS=4.376;HaplotypeScore=1.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=-9.469;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.480;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,49:136:99:805,0,1953 chrXVI 882596 . A G 731.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.960;DP=133;Dels=0.00;FS=3.283;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=-9.432;QD=5.50;ReadPosRankSum=-1.280;SB=-4.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,50:133:99:761,0,1992 chrXVI 882608 . T C 562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.382;DP=133;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.01;MQ0=0;MQRankSum=-9.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=-1.488;SB=-3.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,46:133:99:592,0,2081 chrXVI 882609 . C G 555.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.472;DP=133;Dels=0.00;FS=0.709;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.01;MQ0=0;MQRankSum=-9.028;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.393;SB=-3.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,46:133:99:585,0,2044 chrXVI 882632 . A C 875.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=-6.297;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.936;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,54:137:99:905,0,1880 chrXVI 882654 . C T 1096.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.536;DP=135;Dels=0.00;FS=4.088;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQ0=0;MQRankSum=-2.819;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.856;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:1126,0,1652 chrXVI 882679 . T C 1156.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.345;DP=116;Dels=0.00;FS=0.692;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.804;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,60:116:99:1186,0,1239 chrXVI 882721 . T C 1311.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.815;DP=128;Dels=0.00;FS=3.239;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:1341,0,1391 chrXVI 882746 . C T 1562.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.660;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,69:138:99:1592,0,1545 chrXVI 882768 . G T 1396.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.441;DP=137;Dels=0.00;FS=1.351;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.075;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,71:137:99:1426,0,1479 chrXVI 882787 . G A 1362.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.553;DP=147;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=3.8557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.156;SB=-8.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,73:147:99:1392,0,1686 chrXVI 882893 . C T 1391.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.169;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.473;SB=-5.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,69:155:99:1421,0,1851 chrXVI 882903 . T G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.438;DP=143;Dels=0.00;FS=4.282;HaplotypeScore=9.6867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.120;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,62:143:99:1217,0,1837 chrXVI 882906 . T C 1265.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.375;DP=144;Dels=0.00;FS=3.151;HaplotypeScore=5.4502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:144:99:1295,0,1847 chrXVI 882932 . T A 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.285;DP=140;Dels=0.00;FS=3.226;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.168;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1414,0,1733 chrXVI 882949 . G A 1295.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.208;DP=144;Dels=0.00;FS=0.644;HaplotypeScore=2.3001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.821;SB=-5.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,70:144:99:1325,0,1620 chrXVI 883117 . G A 1320.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.165;DP=102;Dels=0.00;FS=2.650;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.603;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:1350,0,898 chrXVI 883313 . C T 1304.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.095;DP=123;Dels=0.00;FS=3.312;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.873;SB=-5.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:1334,0,1317 chrXVI 883526 . C G 1763.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=1.870;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.526;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:1793,0,1288 chrXVI 883797 . G A 1145.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.376;DP=109;Dels=0.00;FS=0.798;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.623;SB=-3.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1175,0,1287 chrXVI 884015 . G C 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.651;DP=112;Dels=0.00;FS=5.908;HaplotypeScore=2.4056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=12.91;ReadPosRankSum=-1.126;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,65:112:99:1476,0,1001 chrXVI 884350 . G A 1125.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.762;DP=92;Dels=0.00;FS=0.810;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=1;MQRankSum=-0.748;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.531;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1155,0,814 chrXVI 885178 . A G 1499.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.976;DP=115;Dels=0.00;FS=2.450;HaplotypeScore=4.9718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,69:115:99:1529,0,974 chrXVI 885320 . C T 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.988;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.174;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,65:120:99:1407,0,1195 chrXVI 885499 . G A 2110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.657;DP=165;Dels=0.00;FS=0.580;HaplotypeScore=2.8782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.808;SB=-1.051e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,94:165:99:2140,0,1434 chrXVI 885704 . A G 1456.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.387;DP=124;Dels=0.00;FS=2.371;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.010;SB=-5.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,67:124:99:1486,0,1217 chrXVI 885718 . T C 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.543;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.643;SB=-8.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,85:154:99:1673,0,1445 chrXVI 885979 . T A 3938.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=27.35;SB=-1.653e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3938,385,0 chrXVI 886471 . A T 151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;DP=105;Dels=0.02;FS=185.617;HaplotypeScore=3.3435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=1.44;ReadPosRankSum=-5.089;SB=-3.016e+00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,40:103:99:181,0,535 chrXVI 886478 . A T 53.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.188;DP=107;Dels=0.00;FS=167.575;HaplotypeScore=3.9219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=0.50;ReadPosRankSum=-7.222;SB=1.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,40:107:83:83,0,632 chrXVI 887244 . A G 1404.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.554;DP=128;Dels=0.00;FS=9.934;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.138;SB=-4.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1434,0,1384 chrXVI 888040 . T C 1693.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.345;DP=170;Dels=0.00;FS=0.567;HaplotypeScore=3.3485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,92:170:99:1723,0,1792 chrXVI 888534 . G A 1770.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.989;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.142;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:1800,0,1368 chrXVI 888868 . A T 1376.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.176;DP=108;Dels=0.00;FS=8.149;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.165;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,63:108:99:1406,0,948 chrXVI 889084 . A C 1227.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.861;DP=132;Dels=0.00;FS=1.387;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.418;SB=-5.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,60:132:99:1257,0,1648 chrXVI 889176 . C T 914.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.232;DP=116;Dels=0.00;FS=7.102;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.466;SB=-4.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:944,0,1447 chrXVI 889177 . A C 893.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.784;DP=115;Dels=0.00;FS=5.857;HaplotypeScore=1.8625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.561;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,50:115:99:923,0,1481 chrXVI 889287 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.759;DP=110;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.604;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,55:110:99:1183,0,1192 chrXVI 889681 . A G 1544.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.403;DP=151;Dels=0.00;FS=0.615;HaplotypeScore=2.6414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.212;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:1574,0,1612 chrXVI 889864 . A C 1331.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.821;DP=135;Dels=0.00;FS=4.079;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.814;SB=-5.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,63:135:99:1361,0,1629 chrXVI 889879 . T C 1289.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.538;DP=136;Dels=0.00;FS=3.186;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.174;SB=-4.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:1319,0,1592 chrXVI 889936 . G A 1475.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.047;SB=-7.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,67:130:99:1505,0,1404 chrXVI 890080 . C T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.413;SB=-5.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,56:103:99:1238,0,946 chrXVI 890262 . C G 1172.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=125;Dels=0.00;FS=10.585;HaplotypeScore=2.9807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=1.938;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.087;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,58:125:99:1202,0,1488 chrXVI 890346 . T A 3566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=27.22;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3566,355,0 chrXVI 890490 . A G 1149.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.004;DP=147;Dels=0.00;FS=3.911;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=1;MQRankSum=0.452;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.501;SB=-6.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,64:147:99:1179,0,1902 chrXVI 890535 . A G 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.824;DP=145;Dels=0.00;FS=6.298;HaplotypeScore=7.2956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=1;MQRankSum=-0.881;QD=7.42;ReadPosRankSum=-2.227;SB=-5.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,60:145:99:1106,0,1984 chrXVI 890666 . G T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.358;DP=132;Dels=0.00;FS=0.659;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.655;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:1424,0,1427 chrXVI 890686 . C T 1274.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.921;DP=119;Dels=0.00;FS=0.699;HaplotypeScore=3.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=10.71;ReadPosRankSum=2.034;SB=-6.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,61:119:99:1304,0,1262 chrXVI 890693 . T G 1068.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.250;DP=119;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.204;SB=-4.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1098,0,1502 chrXVI 890698 . A G 1040.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.588;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.253;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,57:130:99:1070,0,1683 chrXVI 890723 . G C 1674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;DP=124;Dels=0.00;FS=1.493;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=13.50;ReadPosRankSum=-1.041;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,73:124:99:1704,0,1055 chrXVI 890904 . C T 1432.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.792;DP=127;Dels=0.00;FS=2.293;HaplotypeScore=4.8101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.152;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:1462,0,1267 chrXVI 891130 . A C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.736;DP=101;Dels=0.00;FS=4.931;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.289;SB=-5.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:1106,0,1166 chrXVI 891335 . A G 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.988;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.812;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,53:132:99:1028,0,1878 chrXVI 891344 . T C 906.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.198;DP=128;Dels=0.00;FS=1.440;HaplotypeScore=2.8251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.450;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,49:128:99:936,0,1809 chrXVI 891407 . T C 1120.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.223;DP=130;Dels=0.00;FS=4.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.890;SB=-4.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,60:130:99:1150,0,1607 chrXVI 891619 . A G 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.142;DP=132;Dels=0.00;FS=1.413;HaplotypeScore=8.3213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=2.483;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.534;SB=-5.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,58:132:99:1214,0,1762 chrXVI 891652 . A T 1214.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.507;SB=-5.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1244,0,1520 chrXVI 891701 . G A 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.396;DP=120;Dels=0.00;FS=2.396;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.222;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:968,0,1617 chrXVI 892106 . G A 1587.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.549;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.447;SB=-8.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1617,0,1194 chrXVI 892169 . T C 1197.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.572;DP=124;Dels=0.00;FS=9.915;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.120;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:1227,0,1431 chrXVI 892211 . A C 3670.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=26.99;SB=-1.906e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3670,355,0 chrXVI 892306 . A G 1395.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.365;DP=111;Dels=0.00;FS=0.719;HaplotypeScore=1.8273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.936;SB=-7.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,65:111:99:1425,0,967 chrXVI 892406 . C T 1829.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.576;DP=138;Dels=0.00;FS=4.147;HaplotypeScore=2.3548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.631;SB=-9.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,83:138:99:1859,0,1011 chrXVI 892576 . T G 1322.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.659;DP=137;Dels=0.00;FS=3.070;HaplotypeScore=2.7896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.362;SB=-6.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,65:137:99:1352,0,1629 chrXVI 892709 . T A 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;DP=137;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=1;MQRankSum=0.407;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.413;SB=-7.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1541,0,1603 chrXVI 892994 . C T 1497.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.505;DP=116;Dels=0.00;FS=1.495;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.883;SB=-8.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,69:116:99:1527,0,958 chrXVI 893092 . G A 1477.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.751;DP=137;Dels=0.00;FS=3.103;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=10.78;ReadPosRankSum=2.284;SB=-7.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1507,0,1496 chrXVI 893345 . C T 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.339;DP=126;Dels=0.00;FS=1.423;HaplotypeScore=5.8457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=10.43;ReadPosRankSum=2.132;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:1344,0,1317 chrXVI 893394 . G A 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.112;DP=121;Dels=0.00;FS=0.686;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.096;SB=-6.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,67:121:99:1610,0,1091 chrXVI 893447 . C G 3717.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.57;MQ0=0;QD=26.18;SB=-1.558e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3717,355,0 chrXVI 893672 . T C 4391.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.59;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.977e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:4391,436,0 chrXVI 893675 . T C 1916.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.491;DP=168;Dels=0.00;FS=1.217;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.213;SB=-8.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,89:168:99:1946,0,1671 chrXVI 893806 . T G 1195.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.538;DP=111;Dels=0.00;FS=10.384;HaplotypeScore=2.7446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-3.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:1225,0,1216 chrXVI 893821 . C T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.498;DP=110;Dels=0.00;FS=3.609;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.959;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1263,0,1081 chrXVI 893822 . C T 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.894;DP=110;Dels=0.00;FS=3.609;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.972;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.809;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,59:110:99:1297,0,1085 chrXVI 893913 . C T 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.605;DP=89;Dels=0.00;FS=0.793;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.489;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,43:89:99:774,0,1023 chrXVI 893914 . T C 731.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;DP=88;Dels=0.00;FS=0.804;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.192;SB=-4.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:761,0,1064 chrXVI 894005 . T C 757.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.909;DP=96;Dels=0.00;FS=3.904;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.552;SB=-3.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,39:96:99:787,0,1283 chrXVI 894011 . T C 1037.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.962;DP=88;Dels=0.00;FS=4.091;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.904;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,51:88:99:1067,0,814 chrXVI 894042 . G T 901.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.097;DP=88;Dels=0.00;FS=3.392;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.906;SB=-1.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:931,0,970 chrXVI 894144 . C A 1773.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.913;DP=163;Dels=0.00;FS=6.810;HaplotypeScore=4.9732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.602;SB=-8.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,83:163:99:1803,0,1691 chrXVI 894150 . C T 1454.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.399;DP=160;Dels=0.00;FS=6.753;HaplotypeScore=2.9852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.645;SB=-8.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,79:160:99:1484,0,1759 chrXVI 894151 . C T 1484.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.018;DP=159;Dels=0.00;FS=5.716;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=2.438;QD=9.33;ReadPosRankSum=-1.566;SB=-8.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,78:159:99:1514,0,1770 chrXVI 894337 . T G 2475 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2944;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.211e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:98:99:2508,258,0 chrXVI 894511 . T C 1046.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.708;DP=124;Dels=0.00;FS=13.283;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.532;SB=-3.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,54:124:99:1076,0,1551 chrXVI 894838 . T C 1451.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.666;DP=138;Dels=0.00;FS=5.141;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQ0=0;MQRankSum=2.286;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.034;SB=-7.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,73:138:99:1481,0,1462 chrXVI 894844 . T A 1635.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;DP=142;Dels=0.00;FS=5.056;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.729;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,77:142:99:1665,0,1445 chrXVI 895022 . C G 3373.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9765;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.38;MQ0=0;QD=25.95;SB=-1.364e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3373,345,0 chrXVI 895084 . C T 1643.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.414;DP=144;Dels=0.00;FS=3.018;HaplotypeScore=1.9402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.318;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,74:144:99:1673,0,1533 chrXVI 895777 . T C 1279.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.165;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.567;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1309,0,1410 chrXVI 895801 . T C 1515.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.508;DP=141;Dels=0.00;FS=1.324;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=10.74;ReadPosRankSum=2.353;SB=-7.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,69:141:99:1545,0,1649 chrXVI 896683 . A G 3864.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.88;MQ0=0;QD=25.25;SB=-1.710e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:3864,376,0 chrXVI 896710 . G C 3365.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.72;MQ0=0;QD=25.11;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:3365,334,0 chrXVI 896989 . A T 3930.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.07;MQ0=0;QD=27.29;SB=-1.769e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3930,376,0 chrXVI 897219 . C A 3460.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=27.90;SB=-1.544e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3460,334,0 chrXVI 897538 . T C 3279.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.49;MQ0=0;QD=26.02;SB=-1.655e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3279,327,0 chrXVI 899997 . A G 1808.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.042;DP=184;Dels=0.00;FS=11.675;HaplotypeScore=1.9106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,88:184:99:1838,0,2186 chrXVI 900472 . C T 1509.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.747;DP=169;Dels=0.00;FS=5.674;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.506;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,78:169:99:1539,0,2078 chrXVI 901643 . C T 1142.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.744;DP=109;Dels=0.00;FS=1.683;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.769;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1172,0,1317 chrXVI 902163 . C G 1929.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;DP=154;Dels=0.00;FS=0.606;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-1.057e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,92:154:99:1959,0,1327 chrXVI 903094 . G A 1412.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.495;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-3.059;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.423;SB=-5.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1442,0,1281 chrXVI 904893 . C T 1223.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.349;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.716;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,59:136:99:1253,0,1735 chrXVI 907652 . T C 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.590;DP=135;Dels=0.00;FS=1.360;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.865;SB=-8.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:1573,0,1478 chrXVI 907667 . C T 1455.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.040;DP=131;Dels=0.00;FS=2.206;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.721;SB=-7.370e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,67:131:99:1485,0,1408 chrXVI 907771 . C T 3378.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.92;SB=-1.608e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3378,316,0 chrXVI 907772 . C T 3355.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.50;SB=-1.613e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:122:99:3355,316,0 chrXVI 907815 . T C 2722 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.99;MQ0=0;QD=25.68;SB=-1.337e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:2755,282,0 chrXVI 908134 . A C 2116 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.81;MQ0=0;QD=22.04;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:2149,225,0 chrXVI 908156 . G A 2512 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.46;MQ0=0;QD=22.63;SB=-1.253e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:2545,255,0 chrXVI 908173 . A T 1834 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.633;DP=105;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.65;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=17.47;ReadPosRankSum=1.402;SB=-1.084e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,104:105:99:1867,165,0 chrXVI 908210 . C T 1030.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.603;DP=107;Dels=0.00;FS=3.699;HaplotypeScore=1.7356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-2.194;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.884;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,55:107:99:1060,0,831 chrXVI 908318 . A G 2802 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7868;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.61;MQ0=0;QD=24.80;SB=-1.300e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2835,285,0 chrXVI 908498 . C T 3535.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=27.19;SB=-1.243e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3535,346,0 chrXVI 908706 . C T 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.83;MQ0=0;QD=28.68;SB=-1.401e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2872,280,0 chrXVI 908852 . T C 3421.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.73;MQ0=0;QD=24.79;SB=-1.728e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3421,348,0 chrXVI 910201 . C T 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.762;DP=137;Dels=0.00;FS=6.399;HaplotypeScore=2.4095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.628;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,59:137:99:1046,0,1704 chrXVI 910375 . T C 2645 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.226e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2678,273,0 chrXVI 911554 . C T 1446.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.214;DP=114;Dels=0.00;FS=4.662;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.370;SB=-7.550e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1476,0,1124 chrXVI 914589 . A G 1670.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.780;DP=148;Dels=0.00;FS=1.297;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.128;SB=-7.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:1700,0,1584 chrXVI 914775 . C T 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.832;DP=122;Dels=0.00;FS=1.459;HaplotypeScore=2.9628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.938;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,56:122:99:941,0,1507 chrXVI 914981 . A G 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.163;DP=133;Dels=0.00;FS=6.554;HaplotypeScore=3.9765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.120;SB=-5.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1311,0,1670 chrXVI 915200 . G C 3939.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=26.26;SB=-1.975e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:150:99:3939,400,0 chrXVI 916021 . A G 1537.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.188;DP=137;Dels=0.00;FS=6.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.002;SB=-8.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,75:137:99:1567,0,1338 chrXVI 916067 . G A 3397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.768e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3397,328,0 chrXVI 916184 . A G 1303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.327;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.552;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1333,0,1286 chrXVI 916564 . C T 1059.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.958;DP=114;Dels=0.00;FS=0.723;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.137;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,51:114:99:1089,0,1439 chrXVI 916791 . A G 1298.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.073;DP=120;Dels=0.00;FS=5.513;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.220;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1328,0,1355 chrXVI 916830 . A T 2900 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.65;MQ0=0;QD=26.85;SB=-1.533e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:2933,283,0 chrXVI 916924 . A G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.069;DP=122;Dels=0.00;FS=2.321;HaplotypeScore=2.6543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.319;SB=-6.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,62:122:99:1327,0,1373 chrXVI 916990 . A C 1511.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.960;DP=146;Dels=0.00;FS=3.097;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=10.35;ReadPosRankSum=-2.589;SB=-7.490e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,82:146:99:1541,0,1374 chrXVI 918199 . C A 1525.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.172;DP=123;Dels=0.00;FS=3.253;HaplotypeScore=2.6040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.394;SB=-8.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,68:123:99:1555,0,1188 chrXVI 918292 . G A 1174.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.869;DP=111;Dels=0.00;FS=3.688;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:1204,0,1242 chrXVI 918370 . T C 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.631;DP=96;Dels=0.00;FS=4.052;HaplotypeScore=4.7627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.462;SB=-3.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,54:96:99:1148,0,939 chrXVI 918379 . T C 1012.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.198;DP=94;Dels=0.00;FS=1.786;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQ0=0;MQRankSum=2.316;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-3.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1042,0,932 chrXVI 918448 . T C 1287.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.329;DP=136;Dels=0.00;FS=7.967;HaplotypeScore=5.3416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.177;SB=-4.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,63:136:99:1317,0,1630 chrXVI 918505 . C T 1288.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.447;DP=130;Dels=0.00;FS=9.462;HaplotypeScore=4.2315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.079;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,61:130:99:1318,0,1428 chrXVI 918565 . A G 1613.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.922;DP=145;Dels=0.00;FS=1.357;HaplotypeScore=1.7480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.410;SB=-7.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,78:145:99:1643,0,1499 chrXVI 918772 . G A 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.194;DP=132;Dels=0.00;FS=6.674;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.329;SB=-6.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,76:132:99:1753,0,1090 chrXVI 918807 . A G 1552.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.951;DP=141;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.415;SB=-5.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1582,0,1527 chrXVI 918999 . T C 1386.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.444;DP=122;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.529;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,65:122:99:1416,0,1290 chrXVI 919046 . A G 1583.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.040;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.795;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,77:149:99:1613,0,1626 chrXVI 919665 . G A 3763.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.37;MQ0=0;QD=27.07;SB=-1.392e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3763,367,0 chrXVI 919704 . G A 4566.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8529;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.34;SB=-2.366e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:4566,454,0 chrXVI 919752 . G A 2051.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;DP=169;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=12.14;ReadPosRankSum=-1.563;SB=-1.002e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,96:169:99:2081,0,1428 chrXVI 919776 . G C 2017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;DP=180;Dels=0.00;FS=1.169;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.550;SB=-1.048e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,100:180:99:2047,0,1563 chrXVI 919848 . A G 3940.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.85;MQ0=0;QD=25.42;SB=-2.046e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:155:99:3940,388,0 chrXVI 919896 . C T 4399.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.69;MQ0=0;QD=29.13;SB=-1.538e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,150:151:99:4399,436,0 chrXVI 920048 . T C 3665.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.33;MQ0=0;QD=27.98;SB=-1.791e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:131:99:3665,367,0 chrXVI 920052 . T C 3627.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=26.67;SB=-1.876e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:3627,361,0 chrXVI 920178 . G C 3995.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=25.94;SB=-1.946e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:154:99:3995,400,0 chrXVI 920191 . A C 4066.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.52;MQ0=0;QD=26.58;SB=-1.895e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4066,409,0 chrXVI 920242 . T G 1841.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.923;DP=170;Dels=0.00;FS=3.571;HaplotypeScore=1.5700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.468;SB=-1.015e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,92:170:99:1871,0,1638 chrXVI 920519 . A C 3056 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.22;MQ0=0;QD=26.12;SB=-1.289e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:3089,315,0 chrXVI 920598 . C T 4250.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.67;MQ0=0;QD=26.90;SB=-2.158e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:158:99:4250,406,0 chrXVI 920758 . C T 2410 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.92;MQ0=0;QD=25.64;SB=-9.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:2443,252,0 chrXVI 920779 . T C 2141 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.67;MQ0=0;QD=25.19;SB=-7.860e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:2174,243,0 chrXVI 920827 . G A 3142 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.63;MQ0=0;QD=23.80;SB=-1.296e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3175,330,0 chrXVI 920829 . C T 3035 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.81;MQ0=0;QD=22.82;SB=-1.176e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:133:99:3068,324,0 chrXVI 920832 . G C 3367.01 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.39;MQ0=0;QD=23.38;SB=-1.369e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3367,354,0 chrXVI 920869 . A T 2918 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.21;MQ0=0;QD=22.45;SB=-8.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:2951,294,0 chrXVI 920877 . G A 3578.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.49;MQ0=0;QD=25.56;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3578,372,0 chrXVI 920890 . C T 3508.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.77;MQ0=0;QD=25.06;SB=-1.737e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3508,363,0 chrXVI 920957 . A G 3200 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.15;MQ0=0;QD=25.40;SB=-1.182e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:3233,345,0 chrXVI 920958 . C T 3204.99 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.94;MQ0=0;QD=25.85;SB=-1.209e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:3238,342,0 chrXVI 920964 . T C 3115 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.93;MQ0=0;QD=25.33;SB=-1.096e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3148,339,0 chrXVI 920999 . C T 2076 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=71.3593;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.57;MQ0=0;QD=24.71;SB=-7.160e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:2109,225,0 chrXVI 921020 . G T 596 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.31;MQ0=0;QD=6.70;SB=-1.236e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:63:629,63,0 chrXVI 921116 . A G 3426.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.03;MQ0=0;QD=24.83;SB=-1.789e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3426,337,0 chrXVI 921117 . A C 3283.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.17;MQ0=0;QD=23.96;SB=-1.730e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3283,333,0 chrXVI 921271 . A C 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.33;MQ0=0;QD=22.98;SB=-1.767e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:3067,306,0 chrXVI 921352 . A C 2860 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.80;MQ0=0;QD=24.87;SB=-1.181e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:115:99:2893,294,0 chrXVI 921475 . C T 4217.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.67;MQ0=0;QD=28.30;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:4217,409,0 chrXVI 921485 . T C 4564.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.32;MQ0=0;QD=26.69;SB=-1.809e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4564,454,0 chrXVI 921548 . C T 3999.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=234.8883;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.72;MQ0=0;QD=27.39;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:3999,400,0 chrXVI 921595 . C A 3952.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.70;MQ0=0;QD=28.23;SB=-1.652e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3952,388,0 chrXVI 921639 . T C 3902.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=26.54;SB=-1.704e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:147:99:3902,385,0 chrXVI 921661 . T C 3563.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.47;MQ0=0;QD=26.20;SB=-1.659e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3563,363,0 chrXVI 921692 . C T 3360.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=27.77;SB=-1.207e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:3360,346,0 chrXVI 921728 . C T 2947 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4133;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.68;MQ0=0;QD=25.85;SB=-8.650e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2980,292,0 chrXVI 921737 . G A 3139 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.474;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.703;SB=-1.045e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,120:121:99:3172,313,0 chrXVI 921739 . T G 3034 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;Dels=0.01;FS=0.000;HaplotypeScore=7.3217;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.80;MQ0=0;QD=25.07;SB=-9.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:3067,309,0 chrXVI 921845 . G A 3964.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.53;MQ0=0;QD=27.53;SB=-1.508e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3964,394,0 chrXVI 921937 . C T 3433.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.71;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=26.21;ReadPosRankSum=1.412;SB=-1.291e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,129:131:99:3433,315,0 chrXVI 921984 . G A 3640.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=26.76;SB=-1.646e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3640,355,0 chrXVI 921985 . G A 3600.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.05;MQ0=0;QD=26.47;SB=-1.591e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:3600,355,0 chrXVI 921998 . G A 3603.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5731;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.18;MQ0=0;QD=25.74;SB=-1.856e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3603,346,0 chrXVI 922017 . T C 3071 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=23.62;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:3104,307,0 chrXVI 922220 . A G 2839 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;QD=24.90;SB=-1.321e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:2872,297,0 chrXVI 922297 . T C 3418.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.77;SB=-1.614e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3418,345,0 chrXVI 922477 . T C 3404.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9743;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.37;MQ0=0;QD=24.49;SB=-1.712e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:3404,342,0 chrXVI 922541 . G C 2876 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=24.17;SB=-1.604e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:2909,312,0 chrXVI 922561 . C T 3608.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8212;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.98;MQ0=0;QD=25.77;SB=-1.799e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,140:140:99:3608,352,0 chrXVI 922622 . A C 3615.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.12;MQ0=0;QD=25.10;SB=-1.905e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:3615,349,0 chrXVI 922830 . C T 3701.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8730;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.59;MQ0=0;QD=26.06;SB=-1.925e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:142:99:3701,367,0 chrXVI 922903 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.528;DP=176;Dels=0.00;FS=1.194;HaplotypeScore=2.9741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.895;SB=-8.010e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,75:176:99:1269,0,2110 chrXVI 922942 . G A 4348.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.31;MQ0=0;QD=25.43;SB=-1.887e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4348,424,0 chrXVI 922958 . T A 1952.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.191;DP=179;Dels=0.00;FS=1.184;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.019;SB=-8.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,93:179:99:1982,0,1816 chrXVI 923041 . G C 1521.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.169;DP=166;Dels=0.00;FS=1.966;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.638;SB=-7.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,77:166:99:1551,0,1854 chrXVI 923109 . T A 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.056;DP=119;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.104;SB=-6.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,62:119:99:1377,0,1266 chrXVI 923131 . A G 1115.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.198;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.474;SB=-4.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1145,0,1050 chrXVI 923240 . C T 973.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.073;DP=88;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.931;SB=-4.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:1003,0,903 chrXVI 923279 . T G 1187.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.489;DP=116;Dels=0.00;FS=7.161;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.478;SB=-5.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,56:116:99:1217,0,1351 chrXVI 923349 . C T 1567.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.156;DP=156;Dels=0.00;FS=2.203;HaplotypeScore=2.9528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.147;SB=-5.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,74:156:99:1597,0,1686 chrXVI 923356 . G A,T 3788.01 PASS AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.71;MQ0=0;QD=24.76;SB=-1.344e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,84,69:153:99:3788,1669,1434,2119,0,1945 chrXVI 923402 . C A 1492.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.279;DP=153;Dels=0.00;FS=4.862;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.091;SB=-7.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,69:153:99:1522,0,1805 chrXVI 923584 . A G 141.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.30;MQ0=0;QD=0.99;SB=-1.904e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:143:18:174,18,0 chrXVI 923850 . C G 3576.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.53;MQ0=0;QD=27.94;SB=-1.136e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3576,358,0 chrXVI 923967 . A T 1074.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;DP=95;Dels=0.00;FS=1.673;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQ0=0;MQRankSum=2.141;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.220;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,49:95:99:1104,0,989 chrXVI 923983 . C G 1151.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;DP=108;Dels=0.00;FS=0.769;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.038;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.686;SB=-3.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:1181,0,1114 chrXVI 924094 . G A 3372.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=26.14;SB=-1.485e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:3372,328,0 chrXVI 924165 . T C 4040.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=153;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5320;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.95;MQ0=0;QD=26.41;SB=-1.675e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:153:99:4040,426,0 chrXVI 924180 . C T 3980.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.82;MQ0=0;QD=29.05;SB=-1.714e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,137:137:99:3980,391,0 chrXVI 924428 . G A 3193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01;SB=-1.248e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:3226,319,0 chrXVI 924612 . T C 1405.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.375;DP=145;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.060;SB=-4.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,68:145:99:1435,0,1802 chrXVI 924658 . G A 1785.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.295;DP=152;Dels=0.00;FS=1.319;HaplotypeScore=2.9838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.761;SB=-7.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:1815,0,1567 chrXVI 924915 . A G 3415.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.81;MQ0=0;QD=27.76;SB=-1.465e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:3415,340,0 chrXVI 924973 . T C 1648.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.028;DP=155;Dels=0.00;FS=0.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.163;SB=-6.300e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,76:155:99:1678,0,1764 chrXVI 925093 . T C 1020.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.022;DP=98;Dels=0.00;FS=1.609;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.103;SB=-4.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:1050,0,1146 chrXVI 925112 . T A 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.788;DP=109;Dels=0.00;FS=2.465;HaplotypeScore=1.7262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.515;SB=-5.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,51:109:99:1183,0,1348 chrXVI 925138 . A G 1636.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.539;DP=150;Dels=0.00;FS=1.282;HaplotypeScore=4.5386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.059;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.607;SB=-8.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,79:150:99:1666,0,1554 chrXVI 925172 . C G 1337.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;DP=129;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQ0=1;MQRankSum=0.926;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.336;SB=-4.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,67:129:99:1367,0,1331 chrXVI 925240 . T A 1078.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.517;DP=139;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.441;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,55:139:99:1108,0,1979 chrXVI 925300 . A G 1079.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.331;DP=143;Dels=0.00;FS=1.345;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.339;SB=-5.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,59:143:99:1109,0,1923 chrXVI 925559 . T C 1367.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.579;DP=135;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.240;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,66:135:99:1397,0,1538 chrXVI 925572 . C T 4308.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7792;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.19;MQ0=0;QD=25.19;SB=-2.367e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:4308,403,0 chrXVI 925584 . T C 1586.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.972;DP=160;Dels=0.00;FS=1.973;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=9.91;ReadPosRankSum=2.678;SB=-8.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,78:160:99:1616,0,1839 chrXVI 925593 . G C 1496.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.754;DP=154;Dels=0.00;FS=3.783;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=9.71;ReadPosRankSum=1.207;SB=-7.610e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,77:154:99:1526,0,1655 chrXVI 925734 . C T 1543.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.551;DP=134;Dels=0.00;FS=2.229;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.670;SB=-6.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,68:134:99:1573,0,1444 chrXVI 925746 . T A 1336.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;DP=122;Dels=0.00;FS=5.773;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.919;SB=-4.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:1366,0,1402 chrXVI 925939 . T C 1360.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.741;DP=121;Dels=0.00;FS=1.458;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.184;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,63:121:99:1390,0,1316 chrXVI 926039 . T A 801.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.583;DP=109;Dels=0.00;FS=1.866;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.908;SB=-2.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,43:109:99:831,0,1547 chrXVI 926181 . C T 3812.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.74;MQ0=0;QD=27.62;SB=-1.770e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:3812,376,0 chrXVI 926195 . G C 1732.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.740;DP=141;Dels=0.00;FS=6.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.465;SB=-7.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,76:141:99:1762,0,1356 chrXVI 926233 . C T 1720.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.367;DP=157;Dels=0.00;FS=9.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.402;SB=-8.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,78:157:99:1750,0,1714 chrXVI 926272 . G T 1109.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.592;DP=107;Dels=0.00;FS=5.224;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=10.36;ReadPosRankSum=-2.236;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1139,0,1316 chrXVI 926283 . T C 1153.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.484;DP=122;Dels=0.00;FS=4.511;HaplotypeScore=5.7744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.896;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:122:99:1183,0,1491 chrXVI 926322 . T A 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.321;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.789;SB=-6.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,67:136:99:1560,0,1549 chrXVI 926351 . T C 1530.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.117;DP=140;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.610;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:1560,0,1478 chrXVI 926352 . T C 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.257;DP=141;Dels=0.00;FS=0.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.527;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.399;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,75:141:99:1577,0,1505 chrXVI 926512 . A G 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.375;DP=118;Dels=0.00;FS=3.360;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=9.73;ReadPosRankSum=-2.535;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:1178,0,1407 chrXVI 926562 . C T 1263.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.352;DP=130;Dels=0.00;FS=0.654;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.024;SB=-6.980e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:1293,0,1615 chrXVI 926649 . T C 1171.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.561;DP=121;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-5.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,56:121:99:1201,0,1461 chrXVI 926851 . A G 1344.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.295;DP=106;Dels=0.00;FS=6.510;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.264;SB=-4.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,63:106:99:1374,0,980 chrXVI 927065 . G A 1646.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.301;DP=155;Dels=0.00;FS=3.745;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.20;MQ0=0;MQRankSum=-4.773;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.408;SB=-9.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,85:155:99:1676,0,1478 chrXVI 927096 . G A 1284.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;DP=118;Dels=0.00;FS=4.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.49;MQ0=0;MQRankSum=-5.781;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.634;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:1314,0,1086 chrXVI 927116 . A G 1065.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.196;DP=111;Dels=0.00;FS=0.718;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.49;MQ0=0;MQRankSum=-6.292;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.013;SB=-6.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,62:111:99:1095,0,1103 chrXVI 927120 . C G 1081.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.61;MQ0=0;MQRankSum=-5.721;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,62:112:99:1111,0,1113 chrXVI 927142 . T A 1060.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;DP=103;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.76;MQ0=0;MQRankSum=-5.365;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.463;SB=-6.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1090,0,1144 chrXVI 927175 . A G 1126.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.362;DP=95;Dels=0.00;FS=2.110;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.927;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.084;SB=-2.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:1156,0,1060 chrXVI 927353 . T G 303.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=5.22;ReadPosRankSum=-2.904;SB=-1.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:333,0,717 chrXVI 927492 . G A 1561 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.38;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1594,156,0 chrXVI 927612 . G A 1351.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.946;DP=120;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.454;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,64:120:99:1381,0,1102 chrXVI 927681 . A T 1541.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.086;DP=142;Dels=0.00;FS=1.333;HaplotypeScore=5.6844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.898;SB=-7.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,73:142:99:1571,0,1495 chrXVI 927723 . T C 1425.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.841;DP=130;Dels=0.00;FS=1.396;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQ0=0;MQRankSum=3.650;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.688;SB=-7.630e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1455,0,1309 chrXVI 927761 . T C 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.703;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=1.507;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.315;SB=-6.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,74:147:99:1610,0,1652 chrXVI 927827 . T G 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.627;DP=126;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.225;SB=-7.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,67:126:99:1433,0,1363 chrXVI 927881 . T C 1132.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.198;DP=105;Dels=0.00;FS=1.587;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.724;SB=-6.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,57:105:99:1162,0,1106 chrXVI 927907 . A C 3501.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.14;MQ0=0;QD=26.13;SB=-1.492e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:134:99:3501,363,0 chrXVI 927942 . T C 1011.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.268;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.366;SB=-4.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,55:125:99:1041,0,1589 chrXVI 927952 . A G 1084.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.578;DP=124;Dels=0.00;FS=0.678;HaplotypeScore=1.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=2.223;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.986;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1114,0,1530 chrXVI 927980 . A G 3233.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2392;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.35;MQ0=0;QD=25.26;SB=-1.733e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:128:99:3269,333,0 chrXVI 928020 . G T 1064.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.731;DP=113;Dels=0.00;FS=3.661;HaplotypeScore=1.9861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=2.566;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.487;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1094,0,1316 chrXVI 928107 . C T 1678.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.396;DP=151;Dels=0.00;FS=1.276;HaplotypeScore=2.9022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.274;SB=-7.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,79:151:99:1708,0,1573 chrXVI 928226 . T C 1275.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.128;DP=124;Dels=0.00;FS=0.665;HaplotypeScore=1.8410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=10.28;ReadPosRankSum=2.134;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,63:124:99:1305,0,1439 chrXVI 928342 . A G 1327.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.893;DP=142;Dels=0.00;FS=1.346;HaplotypeScore=4.9613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.076;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,64:142:99:1357,0,1762 chrXVI 928457 . C T 723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.274;DP=75;Dels=0.00;FS=1.940;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.037;SB=-3.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,33:75:99:753,0,895 chrXVI 928512 . T G 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.185;DP=118;Dels=0.00;FS=0.689;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.746;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1168,0,1307 chrXVI 928517 . A G 1231.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.025;DP=114;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.173;SB=-5.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1261,0,1192 chrXVI 928541 . T C 1230.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.834;DP=113;Dels=0.00;FS=2.559;HaplotypeScore=2.4932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.337;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,60:113:99:1260,0,1229 chrXVI 928546 . C A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.353;DP=117;Dels=0.00;FS=3.508;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.145;SB=-4.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,60:117:99:1269,0,1271 chrXVI 928569 . T A 1403.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.218;DP=130;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=2.8267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.221;SB=-4.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,66:130:99:1433,0,1487 chrXVI 928648 . G A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.604;DP=119;Dels=0.00;FS=3.668;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.168;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:1311,0,1383 chrXVI 928675 . T C 1428.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.985;DP=128;Dels=0.00;FS=4.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.825;SB=-6.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,65:128:99:1458,0,1451 chrXVI 928687 . A G 1408.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.572;DP=138;Dels=0.00;FS=3.166;HaplotypeScore=2.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=10.20;ReadPosRankSum=2.326;SB=-6.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,67:138:99:1438,0,1636 chrXVI 928823 . G A 798.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.402;DP=112;Dels=0.00;FS=2.672;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=1;MQRankSum=-2.405;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.514;SB=-3.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,42:112:99:828,0,1631 chrXVI 928847 . C T 793.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.792;DP=98;Dels=0.00;FS=2.857;HaplotypeScore=2.6078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.41;MQ0=0;MQRankSum=-6.027;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.762;SB=-3.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:823,0,1342 chrXVI 928867 . G A 719.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.980;DP=96;Dels=0.01;FS=8.133;HaplotypeScore=9.6095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQ0=0;MQRankSum=-6.381;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.708;SB=-3.850e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,42:95:99:749,0,1162 chrXVI 928877 . T C 669.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.728;DP=103;Dels=0.00;FS=7.826;HaplotypeScore=4.2270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.60;MQ0=0;MQRankSum=-6.547;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.500;SB=-3.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:699,0,1475 chrXVI 928880 . A G 725.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.029;DP=103;Dels=0.00;FS=6.247;HaplotypeScore=4.2270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=0;MQRankSum=-6.991;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.662;SB=-4.020e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:755,0,1409 chrXVI 929418 . A T 1453.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=103;Dels=0.00;FS=9.669;HaplotypeScore=2.7178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.126;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.401;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,62:103:99:1483,0,834 chrXVI 929428 . A G 1283.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.577;DP=101;Dels=0.00;FS=11.442;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.844;SB=-5.350e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,59:101:99:1313,0,855 chrXVI 929492 . A G 1049.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.976;DP=90;Dels=0.00;FS=4.054;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.350;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.810;SB=-5.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:1079,0,892 chrXVI 929522 . C T 2309 SnpCluster AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.53;MQ0=0;QD=28.16;SB=-1.188e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:2342,234,0 chrXVI 929529 . C A 968.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.322;DP=83;Dels=0.00;FS=9.002;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.597;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.449;SB=-4.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,45:83:99:998,0,832 chrXVI 929531 . C T 777.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.157;DP=79;Dels=0.00;FS=11.306;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.52;MQ0=0;MQRankSum=4.799;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.344;SB=-3.420e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,36:79:99:807,0,923 chrXVI 929551 . T C 951.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.134;DP=89;Dels=0.00;FS=10.694;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.41;MQ0=0;MQRankSum=-4.524;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.120;SB=-3.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,49:89:99:981,0,855 chrXVI 929556 . C T 1001.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.614;DP=85;Dels=0.00;FS=11.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=-4.472;QD=11.78;ReadPosRankSum=-1.245;SB=-2.970e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,48:85:99:1031,0,749 chrXVI 929580 . C T 882.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.304;DP=95;Dels=0.00;FS=5.254;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.12;MQ0=0;MQRankSum=-5.035;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.421;SB=-3.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:912,0,1030 chrXVI 929586 . T C 860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.668;DP=102;Dels=0.00;FS=1.574;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQ0=0;MQRankSum=-4.320;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.040;SB=-4.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,49:102:99:890,0,1177 chrXVI 929606 . A T 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;DP=118;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.913;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.750;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1199,0,1318 chrXVI 929675 . A G 1216.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.498;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=6.484;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.626;SB=-6.290e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1246,0,1216 chrXVI 929678 . C T 1156.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.481;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-6.065;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.298;SB=-5.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1186,0,1317 chrXVI 929679 . C T 1151.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.081;DP=106;Dels=0.00;FS=0.712;HaplotypeScore=1.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.89;MQ0=0;MQRankSum=-5.596;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.828;SB=-5.830e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,51:106:99:1181,0,1118 chrXVI 929692 . C A 1122.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.15;MQ0=0;MQRankSum=-6.888;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.044;SB=-5.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1152,0,1284 chrXVI 929716 . T C 748.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.890;DP=97;Dels=0.00;FS=0.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.94;MQ0=0;MQRankSum=-7.893;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.170;SB=-4.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,47:97:99:778,0,1107 chrXVI 929721 . A T 854.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.578;DP=97;Dels=0.00;FS=1.634;HaplotypeScore=118.8805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.03;MQ0=0;MQRankSum=-8.179;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.605;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,49:97:99:884,0,1086 chrXVI 929744 . C T 594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.022;DP=98;Dels=0.00;FS=8.010;HaplotypeScore=8.7287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.85;MQ0=0;MQRankSum=-7.378;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.317;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:624,0,1112 chrXVI 929748 . T C 594.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.239;DP=98;Dels=0.00;FS=11.473;HaplotypeScore=7.7890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.85;MQ0=0;MQRankSum=-7.499;QD=6.06;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,46:98:99:624,0,1165 chrXVI 929755 . T C 762.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;DP=97;Dels=0.00;FS=9.761;HaplotypeScore=2.9547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.30;MQ0=0;MQRankSum=-6.542;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.672;SB=-4.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,51:97:99:792,0,1036 chrXVI 929769 . C T 1069.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.659;DP=109;Dels=0.00;FS=2.500;HaplotypeScore=2.9796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-5.025;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.773;SB=-5.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:109:99:1099,0,1064 chrXVI 929896 . T G 1591.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.371;DP=128;Dels=0.00;FS=1.472;HaplotypeScore=7.9452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-7.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,77:128:99:1621,0,1159 chrXVI 929996 . G C 1422.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;DP=123;Dels=0.00;FS=0.717;HaplotypeScore=2.4551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.562;SB=-4.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,64:123:99:1452,0,1332 chrXVI 930048 . T C 1495.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.384;DP=146;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.162;SB=-7.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,72:146:99:1525,0,1664 chrXVI 930071 . C T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.615;DP=128;Dels=0.00;FS=1.411;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.273;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,57:128:99:1176,0,1577 chrXVI 930148 . A C 1205.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;DP=114;Dels=0.00;FS=3.520;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.096;SB=-6.450e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1235,0,1180 chrXVI 930167 . T C 1244.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.997;DP=114;Dels=0.00;FS=4.643;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.081;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.842;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,64:114:99:1274,0,1119 chrXVI 930175 . A T 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.195;DP=118;Dels=0.00;FS=6.014;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.532;SB=-6.280e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,63:118:99:1364,0,1244 chrXVI 930183 . C A 1444.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.506;DP=114;Dels=0.00;FS=6.391;HaplotypeScore=1.7608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.040;SB=-6.480e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,65:114:99:1474,0,1041 chrXVI 930263 . G A 800.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.673;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.884;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.561;SB=-3.190e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:830,0,1323 chrXVI 930264 . T A 785.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.531;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:815,0,1344 chrXVI 930266 . T C 744.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.248;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.634;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.643;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:774,0,1381 chrXVI 930298 . C T 998.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.193;DP=115;Dels=0.00;FS=1.497;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-5.380e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,51:115:99:1028,0,1463 chrXVI 930341 . A G 1361.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.133;DP=128;Dels=0.00;FS=5.533;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=10.63;ReadPosRankSum=1.743;SB=-4.600e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,66:128:99:1391,0,1411 chrXVI 930425 . C T 1547.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.826;DP=145;Dels=0.00;FS=2.139;HaplotypeScore=1.8288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.897;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:1577,0,1469 chrXVI 930448 . G C 1359.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=141;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=9.64;ReadPosRankSum=-1.058;SB=-5.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,68:141:99:1389,0,1557 chrXVI 930496 . T C 1413.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.755;DP=139;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.452;SB=-6.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,67:139:99:1443,0,1605 chrXVI 930549 . A T 1208.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;DP=118;Dels=0.00;FS=8.525;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=10.24;ReadPosRankSum=-2.237;SB=-4.760e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,60:118:99:1238,0,1346 chrXVI 930581 . A T 1118.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;DP=125;Dels=0.00;FS=4.576;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.299;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1148,0,1548 chrXVI 930801 . C T 988.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;DP=124;Dels=0.00;FS=13.526;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.111;SB=-3.740e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:1018,0,1638 chrXVI 930805 . T C 932.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.174;DP=115;Dels=0.00;FS=7.378;HaplotypeScore=2.5173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.555;SB=-3.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:115:99:962,0,1545 chrXVI 930863 . T C 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.319;DP=116;Dels=0.00;FS=2.718;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.296;SB=-3.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,50:116:99:956,0,1595 chrXVI 930946 . A T 1233.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;DP=103;Dels=0.00;FS=13.321;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=11.97;ReadPosRankSum=-2.274;SB=-5.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,56:103:99:1263,0,1064 chrXVI 930978 . A G 659.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.658;DP=101;Dels=0.00;FS=9.832;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=6.52;ReadPosRankSum=2.016;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:689,0,1456 chrXVI 930986 . G A 674.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.203;DP=68;Dels=0.00;FS=6.976;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.135;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,33:68:99:704,0,772 chrXVI 931061 . G C 960.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.697;DP=103;Dels=0.00;FS=1.696;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.993;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.408;SB=-2.910e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,46:103:99:990,0,1251 chrXVI 931077 . T C 963.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.967;DP=109;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.070;SB=-2.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,48:109:99:993,0,1511 chrXVI 931141 . T C 610.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.285;DP=100;Dels=0.00;FS=1.641;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=-3.149;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.298;SB=-3.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:100:99:640,0,1473 chrXVI 931146 . C A 595.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.601;DP=100;Dels=0.00;FS=5.172;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQ0=0;MQRankSum=-4.714;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.827;SB=-3.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,39:100:99:625,0,1451 chrXVI 931153 . A G 575.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.699;DP=95;Dels=0.00;FS=5.295;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.20;MQ0=0;MQRankSum=-3.080;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.295;SB=-2.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,36:95:99:605,0,1471 chrXVI 931293 . T C 97.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.633;DP=95;Dels=0.00;FS=47.749;HaplotypeScore=9.9179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQ0=0;MQRankSum=-4.554;QD=1.02;ReadPosRankSum=-1.379;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,38:95:99:127,0,1357 chrXVI 931361 . C G 848.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.293;DP=117;Dels=0.00;FS=4.636;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQ0=1;MQRankSum=-2.520;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.652;SB=-4.200e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,46:117:99:878,0,1581 chrXVI 931531 . C T 1342.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.366;DP=134;Dels=0.00;FS=1.370;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.004;SB=-6.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1372,0,1494 chrXVI 931535 . G A 1184.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.659;DP=103;Dels=0.00;FS=3.703;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.538;SB=-6.060e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1214,0,1147 chrXVI 931814 . G A 1580.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.026;DP=134;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.139;SB=-8.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,73:134:99:1610,0,1245 chrXVI 931903 . T C 1436.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.488;DP=131;Dels=0.00;FS=0.655;HaplotypeScore=7.7538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=10.96;ReadPosRankSum=-2.207;SB=-6.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,68:131:99:1466,0,1384 chrXVI 931921 . T C 1286.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.126;DP=133;Dels=0.00;FS=0.640;HaplotypeScore=10.9538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.304;SB=-6.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,62:133:99:1316,0,1558 chrXVI 931948 . C T 1242.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.241;DP=120;Dels=0.00;FS=3.512;HaplotypeScore=8.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.189;SB=-4.230e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1272,0,1318 chrXVI 932289 . G A 1549.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.769;DP=150;Dels=0.00;FS=3.784;HaplotypeScore=7.5273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=2.097;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.671;SB=-7.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,72:150:99:1579,0,1526 chrXVI 932310 . T C 1692.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.018;DP=160;Dels=0.00;FS=11.009;HaplotypeScore=27.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.666;SB=-8.770e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,90:160:99:1722,0,1525 chrXVI 932313 . G C 1723.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.049;DP=166;Dels=0.00;FS=15.437;HaplotypeScore=30.5407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.827;SB=-7.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,92:166:99:1753,0,1565 chrXVI 932535 . T G 1055.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;DP=177;Dels=0.00;FS=13.261;HaplotypeScore=43.2112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQ0=0;MQRankSum=-3.367;QD=5.96;ReadPosRankSum=2.846;SB=-3.320e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,80:177:99:1085,0,1899 chrXVI 932536 . G C 1013.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.058;DP=177;Dels=0.00;FS=3.158;HaplotypeScore=43.2112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.83;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=5.72;ReadPosRankSum=3.311;SB=-2.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,59:177:99:1043,0,1909 chrXVI 932537 . A G 985.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.501;DP=180;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=45.1269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.65;MQ0=0;MQRankSum=2.742;QD=5.47;ReadPosRankSum=3.145;SB=-3.240e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,60:180:99:1015,0,1935 chrXVI 932542 . A G 1084.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.770;DP=180;Dels=0.00;FS=1.377;HaplotypeScore=110.5675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.96;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=6.02;ReadPosRankSum=2.048;SB=-4.580e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,73:180:99:1114,0,1814 chrXVI 932586 . G A 39.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.243;DP=155;Dels=0.00;FS=32.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.38;MQ0=1;MQRankSum=-7.873;QD=0.25;ReadPosRankSum=2.561;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,36:155:69:69,0,2741 chrXVI 932662 . A G 933.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.140;DP=312;Dels=0.00;FS=16.367;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.64;MQ0=7;MQRankSum=4.916;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-4.110e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,63:312:99:963,0,3251 chrXVI 932770 . A C 1427.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.003;DP=127;Dels=0.00;FS=11.510;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.848;SB=-5.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,68:127:99:1457,0,1320 chrXVI 932832 . G A 1070.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.813;SB=-5.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,51:98:99:1100,0,1036 chrXVI 932855 . C T 1082.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.442;DP=107;Dels=0.00;FS=1.559;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.468;SB=-4.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1112,0,1125 chrXVI 932882 . C A 939.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.467;DP=95;Dels=0.00;FS=5.865;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.646;SB=-2.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:969,0,1134 chrXVI 933076 . A G 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.378;DP=132;Dels=0.00;FS=0.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.40;MQ0=0;MQRankSum=-3.472;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.080;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,63:132:99:1190,0,1656 chrXVI 933079 . T C 1076.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.010;DP=133;Dels=0.00;FS=0.643;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=-3.697;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.106;SB=-5.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1106,0,1625 chrXVI 933090 . C G 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.120;DP=143;Dels=0.00;FS=2.969;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQ0=0;MQRankSum=-2.498;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.265;SB=-7.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,70:143:99:1131,0,1688 chrXVI 933168 . T C 1676.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.312;DP=156;Dels=0.00;FS=1.317;HaplotypeScore=1.6828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.585;SB=-6.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,79:156:99:1706,0,1747 chrXVI 933190 . A G 1625.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.278;DP=156;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.555;SB=-5.990e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,82:156:99:1655,0,1671 chrXVI 933205 . C T 1622.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.896;DP=130;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=1.875;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.010;SB=-6.150e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1652,0,1321 chrXVI 933437 . A G 1016.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.832;DP=122;Dels=0.00;FS=3.305;HaplotypeScore=4.8107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=8.33;ReadPosRankSum=-2.634;SB=-5.950e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1046,0,1575 chrXVI 933501 . C T 1459.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.249;DP=124;Dels=0.01;FS=4.317;HaplotypeScore=3.4838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.306;SB=-6.570e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,66:123:99:1489,0,1190 chrXVI 933516 . A T 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;DP=130;Dels=0.00;FS=9.505;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.175;SB=-7.800e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,70:130:99:1552,0,1265 chrXVI 933628 . A G 1057.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;DP=104;Dels=0.00;FS=0.736;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.263;SB=-5.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,52:104:99:1087,0,1171 chrXVI 933766 . T C 1334.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.973;DP=124;Dels=0.00;FS=4.353;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=10.76;ReadPosRankSum=-2.793;SB=-6.070e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,64:124:99:1364,0,1345 chrXVI 933773 . C A 1281.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.101;DP=128;Dels=0.00;FS=2.253;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=10.01;ReadPosRankSum=3.393;SB=-6.870e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1311,0,1553 chrXVI 933827 . T C 938.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.603;DP=96;Dels=0.00;FS=2.651;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=9.77;ReadPosRankSum=-2.100;SB=-4.050e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:968,0,1232 chrXVI 934582 . C T 724.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.807;DP=79;Dels=0.00;FS=1.881;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.055;SB=-3.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,34:79:99:754,0,969 chrXVI 934801 . G A 1328.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.923;DP=126;Dels=0.00;FS=5.422;HaplotypeScore=3.4616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.017;SB=-5.360e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1358,0,1271 chrXVI 934877 . T C 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.428;DP=116;Dels=0.00;FS=3.325;HaplotypeScore=2.6147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.121;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,59:116:99:1192,0,1227 chrXVI 934884 . C T 3068 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=26.22;SB=-1.698e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:117:99:3101,298,0 chrXVI 935125 . A G 1268.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.497;DP=103;Dels=0.00;FS=3.932;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.070;SB=-5.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1298,0,998 chrXVI 935140 . C G 1297.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.623;DP=105;Dels=0.00;FS=4.899;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.670;SB=-7.100e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,60:105:99:1327,0,958 chrXVI 935143 . C T 1384.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.824;DP=108;Dels=0.00;FS=4.826;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.649;SB=-7.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,62:108:99:1414,0,968 chrXVI 935215 . C A 1006.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.929;DP=93;Dels=0.00;FS=5.430;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.442;SB=-3.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:1036,0,930 chrXVI 935251 . A T 2833 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.24;SB=-1.237e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:2866,283,0 chrXVI 935320 . T G 1347.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.460;DP=133;Dels=0.00;FS=3.102;HaplotypeScore=3.9771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.038;SB=-6.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:1377,0,1510 chrXVI 935931 . G T 1146.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.685;DP=140;Dels=0.00;FS=5.545;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=8.19;ReadPosRankSum=-3.255;SB=-5.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,63:140:99:1176,0,1738 chrXVI 936081 . C T 1277.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.260;DP=118;Dels=0.00;FS=10.183;HaplotypeScore=2.5873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.212;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,57:118:99:1307,0,1302 chrXVI 936124 . T C 1314.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.980;DP=126;Dels=0.00;FS=4.285;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.510;SB=-6.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,62:126:99:1344,0,1394 chrXVI 936303 . C T 1441.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.095;DP=128;Dels=0.00;FS=8.080;HaplotypeScore=2.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.206;SB=-6.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,69:128:99:1471,0,1283 chrXVI 936393 . G C 1169.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;DP=89;Dels=0.00;FS=2.780;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.211;SB=-5.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,50:89:99:1199,0,841 chrXVI 936431 . G A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.886;DP=117;Dels=0.00;FS=7.039;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.439;SB=-5.560e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:1385,0,1186 chrXVI 936638 . G C 1014.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;DP=101;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.078;SB=-4.710e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1044,0,1059 chrXVI 936666 . A G 715.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.090;DP=87;Dels=0.00;FS=0.922;HaplotypeScore=1.9827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.705;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.563;SB=-1.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,35:87:99:745,0,1239 chrXVI 936758 . T C 1045.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.991;DP=91;Dels=0.00;FS=0.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.418;SB=-2.260e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1075,0,971 chrXVI 936797 . C G 1111.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.004;DP=88;Dels=0.00;FS=1.765;HaplotypeScore=1.6006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.507;SB=-5.040e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,51:88:99:1141,0,771 chrXVI 936816 . G A 1335.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.225;DP=93;Dels=0.00;FS=2.733;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.856;SB=-6.730e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:1365,0,779 chrXVI 936866 . T C 1201.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.187;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.946;SB=-5.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,56:110:99:1231,0,1190 chrXVI 936922 . G A 1138.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.846;DP=110;Dels=0.00;FS=2.473;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.604;SB=-5.670e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,57:110:99:1168,0,1196 chrXVI 936956 . T C 1204.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.409;DP=104;Dels=0.00;FS=13.165;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.685;SB=-4.460e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:1234,0,1028 chrXVI 937087 . A G 1377.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.178;DP=139;Dels=0.00;FS=5.287;HaplotypeScore=7.5056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQ0=0;MQRankSum=1.518;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.450;SB=-6.220e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1407,0,1660 chrXVI 937101 . G C 1202.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;DP=129;Dels=0.00;FS=2.224;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=1.337;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.875;SB=-6.780e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,61:129:99:1232,0,1479 chrXVI 937257 . A G 1101.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.601;DP=146;Dels=0.00;FS=0.691;HaplotypeScore=3.6353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.238;SB=-3.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,58:146:99:1131,0,2045 chrXVI 937324 . T C 1354.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.419;DP=151;Dels=0.00;FS=3.843;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.683;SB=-6.440e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,68:151:99:1384,0,1895 chrXVI 937373 . A G 1399.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.636;DP=148;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.023;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.523;SB=-4.120e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,66:148:99:1429,0,1829 chrXVI 937470 . A C 1129.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.452;DP=119;Dels=0.00;FS=5.733;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=9.49;ReadPosRankSum=-1.364;SB=-5.680e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1159,0,1483 chrXVI 937542 . G A 1355.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.403;DP=115;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.750;SB=-6.700e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,63:115:99:1385,0,1099 chrXVI 937701 . A T 1162.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.977;DP=119;Dels=0.00;FS=0.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.204;SB=-6.500e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:1192,0,1320 chrXVI 937774 . G A 937.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.571;DP=88;Dels=0.00;FS=8.704;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.366;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,46:88:99:967,0,927 chrXVI 937790 . A G 866.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.621;DP=82;Dels=0.00;FS=9.025;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.683;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,44:82:99:896,0,829 chrXVI 937822 . G T 1027.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.296;DP=98;Dels=0.00;FS=1.666;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.185;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,50:98:99:1057,0,1080 chrXVI 937854 . G T 1394.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.859;DP=137;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.222;SB=-7.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,68:137:99:1424,0,1480 chrXVI 937874 . A G 1420.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.613;DP=134;Dels=0.00;FS=1.379;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.556;SB=-5.900e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,65:134:99:1450,0,1547 chrXVI 938038 . T G 1017.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.097;DP=145;Dels=0.00;FS=0.631;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.092;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,65:145:99:1047,0,1806 chrXVI 938071 . T G 1009.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;DP=109;Dels=0.00;FS=0.711;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.344;SB=-5.690e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,50:109:99:1039,0,1295 chrXVI 938107 . A T 1144.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.674;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.916;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.019;SB=-5.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1174,0,1226 chrXVI 938152 . A G 1185.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;DP=107;Dels=0.00;FS=10.328;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=11.07;ReadPosRankSum=1.069;SB=-2.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1215,0,1182 chrXVI 938304 . C T 1644.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.407;DP=140;Dels=0.00;FS=1.719;HaplotypeScore=1.9298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.340;SB=-3.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,72:140:99:1674,0,1330 chrXVI 938410 . G C 1110.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.576;DP=127;Dels=0.00;FS=5.946;HaplotypeScore=1.8899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=8.74;ReadPosRankSum=2.066;SB=-5.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,56:127:99:1140,0,1563 chrXVI 938441 . T C 1276.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.273;DP=133;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.273;SB=-6.250e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,71:133:99:1306,0,1400 chrXVI 938531 . G C 1147.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.066;DP=127;Dels=0.00;FS=4.362;HaplotypeScore=1.8055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.125;SB=-5.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,58:127:99:1177,0,1555 chrXVI 938716 . C T 1860.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.304;DP=147;Dels=0.00;FS=2.113;HaplotypeScore=3.2735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.141;SB=-1.020e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,87:147:99:1890,0,1228 chrXVI 938727 . A G 1522.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.653;DP=133;Dels=0.00;FS=0.649;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.536;SB=-7.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,74:133:99:1552,0,1296 chrXVI 938739 . G A 1302.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;DP=111;Dels=0.00;FS=8.854;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.711;SB=-5.430e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,58:111:99:1332,0,1191 chrXVI 939003 . G A 1063.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;DP=98;Dels=0.00;FS=5.065;HaplotypeScore=1.9874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.641;SB=-5.310e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,52:98:99:1093,0,1030 chrXVI 939137 . G A 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.800;DP=82;Dels=0.00;FS=1.003;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.854;SB=-2.090e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:1023,0,897 chrXVI 939206 . T C 153.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;DP=81;Dels=0.00;FS=6.361;HaplotypeScore=17.9178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.867;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.829;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:81:99:183,0,630 chrXVI 939248 . A T 476.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.933;DP=81;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.474;SB=-6.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,34:81:99:506,0,985 chrXVI 939489 . G C 2815 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.77;MQ0=0;QD=24.91;SB=-1.357e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:2848,294,0 chrXVI 939501 . A T 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;DP=107;Dels=0.00;FS=0.729;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.309;SB=-6.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1286,0,1137 chrXVI 939609 . A G 967.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;DP=105;Dels=0.00;FS=4.784;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.024;SB=-4.410e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:997,0,1333 chrXVI 939714 . T A 926.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;DP=99;Dels=0.00;FS=1.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.060;SB=-3.620e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,44:99:99:956,0,1355 chrXVI 939734 . G A 852.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.859;DP=96;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.570;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:882,0,1204 chrXVI 939747 . T C 744.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.376;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.444;SB=-2.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:774,0,1351 chrXVI 939830 . A G 869.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.912;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.488;SB=-3.130e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:899,0,1476 chrXVI 939832 . A T 911.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.411;SB=-3.640e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,46:107:99:941,0,1451 chrXVI 939982 . A G 1039.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.962;DP=109;Dels=0.00;FS=1.546;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.755;SB=-4.390e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,52:109:99:1069,0,1226 chrXVI 939993 . G T 1160.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.238;DP=118;Dels=0.00;FS=3.375;HaplotypeScore=2.9810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.413;SB=-6.330e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1190,0,1404 chrXVI 939999 . G A 1033.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.524;DP=110;Dels=0.00;FS=1.572;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.003;SB=-5.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,48:110:99:1063,0,1324 chrXVI 940653 . A G 1003.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.736;DP=99;Dels=0.00;FS=1.619;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.815;SB=-5.340e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1033,0,1079 chrXVI 941049 . G A 1267.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.834;DP=125;Dels=0.00;FS=3.303;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.555;SB=-4.820e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:1297,0,1370 chrXVI 941176 . A G 1089.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.639;DP=130;Dels=0.00;FS=15.039;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.360;SB=-4.810e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:1119,0,1875 chrXVI 941186 . A T 1868.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.406;DP=136;Dels=0.00;FS=11.309;HaplotypeScore=3.7129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.498;SB=-5.660e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,78:136:99:1898,0,1266 chrXVI 941337 . G A 1329.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.539;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=10.38;ReadPosRankSum=2.385;SB=-5.920e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,60:128:99:1359,0,1563 chrXVI 941366 . C T 1433.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.686;DP=104;Dels=0.00;FS=4.954;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.118;SB=-7.140e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,59:104:99:1463,0,937 chrXVI 941559 . G A 1727.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.424;DP=128;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.669;SB=-8.170e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1757,0,1121 chrXVI 941642 . C T 1443.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.377;DP=139;Dels=0.00;FS=1.335;HaplotypeScore=1.5741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.263;SB=-7.790e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,68:139:99:1473,0,1440 chrXVI 941677 . C T 993.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.607;DP=112;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.764;SB=-5.000e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,50:112:99:1023,0,1336 chrXVI 941772 . A T 1535.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.693;DP=170;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.652;SB=-5.530e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,73:170:99:1565,0,2176 chrXVI 941801 . T C 1264.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.991;DP=144;Dels=0.01;FS=3.573;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=8.78;ReadPosRankSum=-1.696;SB=-2.590e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,60:143:99:1294,0,1905 chrXVI 941879 . A G 1483.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.482;DP=131;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.311;SB=-7.470e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,66:131:99:1513,0,1335 chrXVI 942010 . G C 1346.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.269;DP=172;Dels=0.00;FS=5.698;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.177;SB=-4.960e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,71:172:99:1376,0,2273 chrXVI 942021 . T C 1262.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.073;DP=147;Dels=0.00;FS=6.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.155;SB=-4.400e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,62:147:99:1292,0,1980 chrXVI 942078 . T A 1130.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.782;DP=108;Dels=0.00;FS=4.693;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.665;SB=-4.750e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,51:108:99:1160,0,1309 chrXVI 942107 . G T 1148.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;DP=116;Dels=0.00;FS=0.695;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.303;SB=-5.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1178,0,1416 chrXVI 942124 . A T 1491.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;DP=136;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.667;SB=-7.210e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,65:136:99:1521,0,1614 chrXVI 942158 . T C 1256.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.684;DP=139;Dels=0.00;FS=5.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.638;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.621;SB=-5.930e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:1286,0,1820 chrXVI 942173 . G A 1239.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.502;DP=145;Dels=0.00;FS=10.382;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.038;SB=-4.880e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,60:145:99:1269,0,1960 chrXVI 942206 . T C 1083.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.609;DP=132;Dels=0.00;FS=16.307;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.777;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.071;SB=-3.840e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1113,0,1849 chrXVI 942253 . A G 1638.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.337;DP=127;Dels=0.00;FS=17.026;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQ0=0;MQRankSum=5.528;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.753;SB=-7.180e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,75:127:99:1668,0,1079 chrXVI 942307 . G A 778.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;DP=110;Dels=0.00;FS=5.055;HaplotypeScore=3.9687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQ0=0;MQRankSum=-5.434;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.662;SB=-2.030e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,40:110:99:808,0,1698 chrXVI 942311 . A G 756.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.775;DP=123;Dels=0.00;FS=5.045;HaplotypeScore=1.9905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQ0=0;MQRankSum=-5.646;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.289;SB=-1.520e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,43:123:99:786,0,1904 chrXVI 942315 . A G 632.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.854;DP=120;Dels=0.00;FS=0.761;HaplotypeScore=2.8571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.989;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.309;SB=-2.270e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,40:120:99:662,0,1936 chrXVI 942317 . G A 678.01 SnpCluster AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.415;DP=117;Dels=0.00;FS=2.675;HaplotypeScore=2.8571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQ0=0;MQRankSum=-3.900;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.176;SB=-1.940e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,39:117:99:708,0,1794 chrXVI 942354 . G T 629.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.892;DP=92;Dels=0.00;FS=10.813;HaplotypeScore=28.0287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.19;MQ0=0;MQRankSum=-5.448;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.562;SB=-2.890e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,34:92:99:659,0,1376 chrXVI 942414 . C T 568.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;DP=105;Dels=0.00;FS=0.808;HaplotypeScore=1.8824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.37;MQ0=1;MQRankSum=-6.174;QD=5.41;ReadPosRankSum=-2.257;SB=-2.720e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,30:105:99:598,0,1748 chrXVI 942427 . G A 312.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.599;DP=103;Dels=0.00;FS=5.964;HaplotypeScore=20.5473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.13;MQ0=1;MQRankSum=-6.792;QD=3.03;ReadPosRankSum=-2.522;SB=-1.080e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,26:103:99:342,0,1754 chrXVI 942440 . G A 189.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.451;DP=99;Dels=0.00;FS=31.694;HaplotypeScore=19.6861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=1;MQRankSum=-6.840;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.428;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:219,0,1720 chrXVI 942453 . T A 184.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.775;DP=99;Dels=0.00;FS=34.533;HaplotypeScore=3.6811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.47;MQ0=1;MQRankSum=-7.371;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.549;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,27:99:99:214,0,1748 chrXVI 942471 . T A 248.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.233;DP=92;Dels=0.00;FS=19.836;HaplotypeScore=3.7867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=1;MQRankSum=-7.033;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.294;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,26:92:99:278,0,1584 chrXVI 942476 . T C 179.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.258;DP=96;Dels=0.00;FS=19.664;HaplotypeScore=4.4517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.72;MQ0=1;MQRankSum=-7.108;QD=1.86;ReadPosRankSum=0.430;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:209,0,1679 chrXVI 942479 . C A 229.01 SnpCluster;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.930;DP=97;Dels=0.00;FS=22.359;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=1;MQRankSum=-7.127;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.400;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,26:97:99:259,0,1706 chrXVI 942488 . G A 175.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.875;DP=90;Dels=0.00;FS=39.641;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.49;MQ0=1;MQRankSum=-6.864;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.920;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,24:90:99:205,0,1573 chrXVI 942573 . C G 2091.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.376;DP=123;Dels=0.00;FS=0.784;HaplotypeScore=9.6013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.82;MQ0=1;MQRankSum=5.763;QD=17.00;ReadPosRankSum=3.558;SB=-1.040e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,92:123:99:2121,0,266 chrXVI 942580 . T G 1878.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.779;DP=125;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.7253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQ0=2;MQRankSum=4.420;QD=15.02;ReadPosRankSum=2.616;SB=-8.540e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,91:125:99:1908,0,384 chrXVI 942589 . G A 2504 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.046;DP=122;Dels=0.00;FS=19.886;HaplotypeScore=14.8962;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.46;MQ0=2;MQRankSum=-0.426;QD=20.52;ReadPosRankSum=1.825;SB=-1.004e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,114:122:69:2537,69,0 chrXVI 942826 . C G 924.01 PASS AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.481;DP=333;Dels=0.00;FS=3.190;HaplotypeScore=11.1285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.94;MQ0=1;MQRankSum=2.435;QD=2.77;ReadPosRankSum=-3.834;SB=-2.510e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,70:333:99:954,0,5300 chrXVI 942869 . T C 2943.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-12.213;DP=344;Dels=0.00;FS=3.166;HaplotypeScore=5.6742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.01;MQ0=47;MQRankSum=-0.072;QD=8.56;ReadPosRankSum=-2.410;SB=-1.195e+03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,155:344:99:2973,0,2830 chrXVI 942936 . G A 1055.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.618;DP=212;Dels=0.00;FS=3.279;HaplotypeScore=9.7816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.99;MQ0=112;MQRankSum=-0.180;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.048;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,66:212:99:1085,0,869 chrXVI 943050 . C A 322.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.588;DP=147;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.7035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.09;MQ0=99;MQRankSum=1.826;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.214;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,39:147:99:352,0,485 chrXVI 943052 . T C 25.02 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;DP=150;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.5367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.15;MQ0=100;MQRankSum=1.448;QD=0.17;ReadPosRankSum=0.433;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,6:150:55:55,0,864 chrXVI 943114 . T C 144.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.503;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.88;MQ0=75;MQRankSum=2.198;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.152;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,12:106:99:174,0,285 chrXVI 943147 . C G 86.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.108;DP=56;Dels=0.00;FS=3.047;HaplotypeScore=17.4921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.91;MQ0=21;MQRankSum=1.369;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.734;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:116,0,267 chrXVI 943166 . G T 366.13 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=29;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=11.6733;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=4;MQRankSum=0.578;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.589;SB=-1.247e-01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:18:399,18,0 chrXVI 943171 . C T 17.09 LowQual;filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.167;DP=29;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=13.6064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.51;MQ0=4;MQRankSum=-0.100;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.567;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:47:47,0,302 chrXVI 943259 . C T 235.01 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=3;QD=14.69;SB=-1.514e-02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:27:268,27,0 chrXVI 946261 . T C 108.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.236;DP=61;Dels=0.00;FS=11.800;HaplotypeScore=14.3059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.44;MQ0=24;MQRankSum=2.906;QD=1.77;ReadPosRankSum=3.142;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:61:99:138,0,143 chrXVI 946274 . A G 97.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.502;DP=91;Dels=0.00;FS=28.261;HaplotypeScore=15.3155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.67;MQ0=35;MQRankSum=3.568;QD=1.07;ReadPosRankSum=-0.917;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,10:91:99:127,0,217 chrXVI 946275 . G C 56.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;DP=99;Dels=0.00;FS=17.743;HaplotypeScore=18.2357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.88;MQ0=34;MQRankSum=2.027;QD=0.57;ReadPosRankSum=-3.345;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,8:99:86:86,0,321 chrXVI 946297 . T G 362.10 filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.841;DP=131;Dels=0.00;FS=2.114;HaplotypeScore=1.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.02;MQ0=59;MQRankSum=3.430;QD=2.76;ReadPosRankSum=1.724;SB=-1.316e+02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:61,69:131:19:395,19,0 chrXVI 946329 . G A 214.01 filter AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.649;DP=173;Dels=0.00;FS=4.419;HaplotypeScore=6.0572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.18;MQ0=102;MQRankSum=3.764;QD=1.24;ReadPosRankSum=4.562;SB=-2.201e+01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,33:173:94:244,0,94 chrXVI 946388 . A G 12.04 LowQual;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.40;MQ0=97;MQRankSum=1.666;QD=0.11;ReadPosRankSum=1.666;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:104,2:106:6:43,6,0 chrXVI 946395 . G A 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=106;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.65;MQ0=95;MQRankSum=0.715;QD=0.11;ReadPosRankSum=1.931;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:77,29:106:6:43,6,0 chrXVI 946401 . A G 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.6321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.64;MQ0=97;MQRankSum=1.186;QD=0.11;ReadPosRankSum=1.408;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:98,10:108:6:43,6,0 chrXVI 946405 . T C 12.04 LowQual;SnpCluster;filter AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=102;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.52;MQ0=93;MQRankSum=1.203;QD=0.12;ReadPosRankSum=1.203;SB=-6.519e-03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:84,13:102:6:43,6,0